View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF17569_high_28 (Length: 306)

Name: NF17569_high_28
Description: NF17569
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF17569_high_28
NF17569_high_28
[»] chr6 (67 HSPs)
chr6 (3-288)||(32993017-32993302)
chr6 (4-288)||(34994383-34994667)
chr6 (4-288)||(5937816-5938100)
chr6 (1-288)||(34890807-34891093)
chr6 (1-288)||(9046249-9046536)
chr6 (3-288)||(5310989-5311274)
chr6 (1-288)||(3423170-3423457)
chr6 (1-288)||(7270116-7270403)
chr6 (1-288)||(7270792-7271079)
chr6 (3-288)||(32753340-32753621)
chr6 (1-288)||(2517165-2517452)
chr6 (1-288)||(21856555-21856842)
chr6 (1-288)||(35167490-35167779)
chr6 (1-288)||(31247279-31247566)
chr6 (1-288)||(6235921-6236208)
chr6 (1-288)||(31237909-31238196)
chr6 (1-288)||(18053119-18053403)
chr6 (1-288)||(26957125-26957411)
chr6 (1-288)||(6137379-6137665)
chr6 (3-288)||(25176665-25176944)
chr6 (13-288)||(26600520-26600785)
chr6 (1-288)||(24744491-24744770)
chr6 (122-287)||(5639294-5639459)
chr6 (6-163)||(5938101-5938258)
chr6 (1-164)||(978415-978578)
chr6 (1-163)||(34890644-34890806)
chr6 (3-164)||(15932843-15933004)
chr6 (3-163)||(6137666-6137825)
chr6 (1-144)||(21856862-21857005)
chr6 (6-163)||(2517007-2517164)
chr6 (1-163)||(6532192-6532354)
chr6 (1-163)||(18052956-18053118)
chr6 (1-163)||(32753177-32753339)
chr6 (3-160)||(6236212-6236369)
chr6 (1-163)||(9046086-9046248)
chr6 (13-163)||(32993303-32993453)
chr6 (1-163)||(21540265-21540428)
chr6 (1-163)||(26600357-26600519)
chr6 (6-160)||(31247121-31247275)
chr6 (1-163)||(34994668-34994830)
chr6 (6-163)||(31237751-31237908)
chr6 (1-163)||(5310826-5310988)
chr6 (6-163)||(24744334-24744490)
chr6 (4-136)||(14276402-14276534)
chr6 (6-163)||(5639461-5639618)
chr6 (1-163)||(7269951-7270115)
chr6 (1-129)||(17244664-17244792)
chr6 (1-96)||(15932730-15932825)
chr6 (54-163)||(26957015-26957124)
chr6 (1-144)||(34517999-34518142)
chr6 (3-144)||(10412808-10412949)
chr6 (55-163)||(3423458-3423566)
chr6 (1-129)||(6228730-6228857)
chr6 (1-109)||(7438804-7438912)
chr6 (54-144)||(3035933-3036024)
chr6 (209-288)||(21540185-21540264)
chr6 (13-123)||(29261279-29261389)
chr6 (1-95)||(34517272-34517366)
chr6 (78-162)||(25176946-25177030)
chr6 (40-163)||(7270668-7270791)
chr6 (1-76)||(25180223-25180298)
chr6 (6-109)||(29260536-29260638)
chr6 (6-76)||(15286350-15286420)
chr6 (1-73)||(35167833-35167905)
chr6 (1-87)||(27829329-27829414)
chr6 (106-163)||(35167780-35167837)
chr6 (1-131)||(6229643-6229772)
[»] chr7 (72 HSPs)
chr7 (1-288)||(48626063-48626350)
chr7 (1-287)||(35146699-35146984)
chr7 (1-288)||(7578872-7579159)
chr7 (1-288)||(41453005-41453292)
chr7 (1-288)||(10526474-10526760)
chr7 (2-288)||(19681496-19681782)
chr7 (1-286)||(21391190-21391475)
chr7 (3-286)||(8542664-8542946)
chr7 (1-287)||(8936849-8937135)
chr7 (1-288)||(6356448-6356735)
chr7 (4-288)||(31637946-31638230)
chr7 (1-288)||(41191683-41191972)
chr7 (19-288)||(36423532-36423801)
chr7 (1-288)||(28286117-28286404)
chr7 (1-288)||(6356928-6357215)
chr7 (1-253)||(17749935-17750187)
chr7 (23-288)||(28297982-28298247)
chr7 (29-288)||(33716751-33717005)
chr7 (20-286)||(41751815-41752081)
chr7 (1-237)||(1114259-1114495)
chr7 (4-248)||(17363437-17363683)
chr7 (3-288)||(40673014-40673292)
chr7 (99-288)||(17359344-17359537)
chr7 (1-163)||(10526311-10526473)
chr7 (1-163)||(44332807-44332969)
chr7 (155-288)||(44332673-44332806)
chr7 (1-159)||(31075485-31075643)
chr7 (6-163)||(1114059-1114216)
chr7 (6-159)||(4931565-4931718)
chr7 (1-163)||(6356765-6356927)
chr7 (13-163)||(33716600-33716750)
chr7 (1-163)||(48626351-48626513)
chr7 (1-161)||(21391480-21391640)
chr7 (156-288)||(43247578-43247710)
chr7 (6-163)||(41191973-41192130)
chr7 (6-163)||(41453293-41453450)
chr7 (1-161)||(31638233-31638393)
chr7 (1-163)||(8542499-8542661)
chr7 (1-129)||(4155598-4155726)
chr7 (148-288)||(34037058-34037198)
chr7 (1-161)||(41751650-41751810)
chr7 (13-163)||(8937137-8937287)
chr7 (25-163)||(17359205-17359343)
chr7 (6-144)||(35146996-35147134)
chr7 (12-161)||(7909297-7909446)
chr7 (23-163)||(36423391-36423531)
chr7 (1-163)||(19681783-19681945)
chr7 (20-157)||(7909460-7909597)
chr7 (6-163)||(28286405-28286562)
chr7 (4-163)||(6356289-6356447)
chr7 (1-134)||(16867707-16867840)
chr7 (22-163)||(28297840-28297981)
chr7 (6-163)||(34037199-34037356)
chr7 (1-109)||(8416485-8416593)
chr7 (2-124)||(36673976-36674098)
chr7 (1-144)||(41891966-41892109)
chr7 (25-163)||(27738953-27739090)
chr7 (6-163)||(7579160-7579317)
chr7 (13-140)||(43247427-43247555)
chr7 (1-123)||(29277671-29277793)
chr7 (1-95)||(8417292-8417386)
chr7 (1-123)||(36282786-36282908)
chr7 (74-163)||(40673293-40673382)
chr7 (3-87)||(29276877-29276961)
chr7 (11-144)||(28264595-28264728)
chr7 (6-109)||(36283547-36283651)
chr7 (1-61)||(36423790-36423850)
chr7 (1-87)||(36674095-36674179)
chr7 (4-97)||(38447689-38447778)
chr7 (54-123)||(32946669-32946738)
chr7 (13-76)||(41893450-41893513)
chr7 (12-82)||(43050395-43050465)
[»] chr4 (86 HSPs)
chr4 (1-288)||(38339655-38339942)
chr4 (1-288)||(14985494-14985781)
chr4 (1-288)||(44991279-44991565)
chr4 (3-288)||(50768984-50769269)
chr4 (1-288)||(24898352-24898639)
chr4 (1-288)||(33091453-33091740)
chr4 (2-288)||(1433272-1433558)
chr4 (2-288)||(53750903-53751189)
chr4 (1-288)||(15477645-15477932)
chr4 (1-288)||(6712126-6712411)
chr4 (5-288)||(42855343-42855626)
chr4 (1-287)||(6505537-6505822)
chr4 (4-288)||(43734289-43734573)
chr4 (1-288)||(8592132-8592419)
chr4 (1-288)||(23755418-23755705)
chr4 (3-288)||(36122435-36122720)
chr4 (3-288)||(52557089-52557374)
chr4 (4-288)||(19088344-19088628)
chr4 (1-288)||(16037794-16038081)
chr4 (3-288)||(39448490-39448775)
chr4 (2-288)||(30683527-30683815)
chr4 (1-288)||(46849669-46849956)
chr4 (1-288)||(53994934-53995221)
chr4 (1-284)||(12817973-12818256)
chr4 (1-288)||(41877860-41878146)
chr4 (3-288)||(43566380-43566665)
chr4 (1-288)||(19508413-19508700)
chr4 (1-288)||(25181812-25182099)
chr4 (1-288)||(623679-623966)
chr4 (1-288)||(37206428-37206714)
chr4 (1-288)||(41751818-41752103)
chr4 (1-288)||(21763180-21763468)
chr4 (54-288)||(53259191-53259425)
chr4 (56-288)||(50508512-50508744)
chr4 (1-235)||(8398031-8398264)
chr4 (1-144)||(25269307-25269450)
chr4 (1-163)||(14985331-14985493)
chr4 (1-163)||(21763469-21763631)
chr4 (1-163)||(53751190-53751352)
chr4 (1-161)||(623969-624129)
chr4 (6-160)||(24898194-24898348)
chr4 (1-163)||(39448776-39448938)
chr4 (1-161)||(50768821-50768981)
chr4 (1-163)||(1433559-1433721)
chr4 (1-163)||(8591969-8592131)
chr4 (1-163)||(19088629-19088791)
chr4 (14-163)||(41752104-41752253)
chr4 (6-161)||(52557377-52557532)
chr4 (1-144)||(55022284-55022426)
chr4 (1-163)||(12817806-12817968)
chr4 (1-163)||(15477933-15478095)
chr4 (1-163)||(16038082-16038244)
chr4 (13-163)||(43734574-43734724)
chr4 (6-160)||(53259429-53259583)
chr4 (179-288)||(44957552-44957661)
chr4 (1-163)||(25182100-25182262)
chr4 (1-163)||(38339492-38339654)
chr4 (1-163)||(44991566-44991728)
chr4 (13-161)||(44957401-44957549)
chr4 (6-161)||(20888148-20888303)
chr4 (1-144)||(44125777-44125920)
chr4 (13-163)||(30683816-30683966)
chr4 (1-163)||(37206715-37206877)
chr4 (1-140)||(44957668-44957807)
chr4 (13-163)||(6711975-6712125)
chr4 (186-288)||(23755985-23756087)
chr4 (1-163)||(42855627-42855789)
chr4 (6-163)||(33091741-33091898)
chr4 (6-163)||(46849957-46850114)
chr4 (1-163)||(53995222-53995385)
chr4 (1-157)||(36122727-36122882)
chr4 (6-161)||(23756090-23756245)
chr4 (1-163)||(50508745-50508907)
chr4 (54-163)||(19508701-19508810)
chr4 (3-134)||(44125624-44125755)
chr4 (1-163)||(41878147-41878308)
chr4 (1-109)||(4513258-4513366)
chr4 (1-144)||(47602943-47603086)
chr4 (37-163)||(43566666-43566792)
chr4 (4-156)||(49135928-49136084)
chr4 (1-95)||(47603717-47603811)
chr4 (1-109)||(52692782-52692889)
chr4 (6-95)||(52692029-52692118)
chr4 (2-87)||(55022424-55022508)
chr4 (1-89)||(31214162-31214250)
chr4 (13-42)||(43734942-43734971)
[»] chr5 (37 HSPs)
chr5 (1-288)||(36440200-36440487)
chr5 (2-288)||(32288079-32288364)
chr5 (20-288)||(9989486-9989754)
chr5 (1-288)||(27186036-27186323)
chr5 (3-286)||(24040087-24040372)
chr5 (1-288)||(37424262-37424549)
chr5 (3-288)||(35569777-35570067)
chr5 (1-288)||(38958724-38959011)
chr5 (1-286)||(16860303-16860588)
chr5 (22-288)||(2183106-2183372)
chr5 (29-288)||(11316121-11316376)
chr5 (3-195)||(39325414-39325606)
chr5 (1-288)||(34264351-34264635)
chr5 (4-194)||(25182910-25183100)
chr5 (20-286)||(29198971-29199237)
chr5 (6-163)||(37424553-37424709)
chr5 (1-160)||(38959015-38959173)
chr5 (1-163)||(9989323-9989485)
chr5 (1-161)||(39325645-39325805)
chr5 (1-163)||(27185874-27186035)
chr5 (1-143)||(36440508-36440650)
chr5 (13-163)||(34264636-34264790)
chr5 (175-286)||(16860594-16860705)
chr5 (13-163)||(2182955-2183105)
chr5 (1-163)||(24040375-24040537)
chr5 (6-163)||(32288365-32288521)
chr5 (13-159)||(11315970-11316116)
chr5 (2-129)||(19184598-19184725)
chr5 (13-160)||(35570071-35570218)
chr5 (1-160)||(25567279-25567438)
chr5 (1-144)||(1140080-1140215)
chr5 (208-288)||(25567195-25567275)
chr5 (1-70)||(19128434-19128503)
chr5 (6-79)||(33817656-33817729)
chr5 (1-131)||(19185504-19185634)
chr5 (4-87)||(31756666-31756749)
chr5 (6-94)||(2597377-2597465)
[»] chr1 (82 HSPs)
chr1 (1-288)||(20306165-20306452)
chr1 (1-288)||(1762674-1762961)
chr1 (2-288)||(44322823-44323109)
chr1 (1-288)||(16024060-16024347)
chr1 (1-288)||(26707196-26707483)
chr1 (4-288)||(35612085-35612369)
chr1 (1-288)||(23476341-23476628)
chr1 (13-288)||(37304191-37304466)
chr1 (4-287)||(49643674-49643957)
chr1 (2-288)||(12481060-12481346)
chr1 (1-288)||(4696882-4697169)
chr1 (1-288)||(45052690-45052976)
chr1 (1-288)||(49140143-49140430)
chr1 (4-288)||(9006194-9006478)
chr1 (1-288)||(12127057-12127340)
chr1 (4-288)||(37585696-37585980)
chr1 (1-288)||(27547669-27547956)
chr1 (3-288)||(6797809-6798094)
chr1 (1-288)||(37576344-37576631)
chr1 (13-288)||(37284740-37285015)
chr1 (1-288)||(31703777-31704063)
chr1 (6-288)||(39486207-39486480)
chr1 (105-288)||(25995947-25996130)
chr1 (1-163)||(1762962-1763124)
chr1 (1-163)||(12481347-12481509)
chr1 (4-157)||(38000492-38000645)
chr1 (1-160)||(23476632-23476791)
chr1 (1-144)||(26723108-26723251)
chr1 (1-163)||(2064499-2064661)
chr1 (1-163)||(45052977-45053139)
chr1 (1-163)||(8762687-8762849)
chr1 (6-161)||(25995789-25995944)
chr1 (1-144)||(27547976-27548119)
chr1 (6-144)||(35612389-35612527)
chr1 (175-288)||(27400598-27400711)
chr1 (2-163)||(38127710-38127871)
chr1 (6-163)||(45843405-45843562)
chr1 (1-164)||(8760272-8760435)
chr1 (1-163)||(16023897-16024059)
chr1 (1-163)||(37304028-37304190)
chr1 (175-288)||(2064385-2064498)
chr1 (6-163)||(4330125-4330282)
chr1 (4-160)||(20306005-20306161)
chr1 (170-288)||(8762568-8762686)
chr1 (1-163)||(49140431-49140592)
chr1 (171-284)||(3089509-3089622)
chr1 (1-161)||(3089342-3089502)
chr1 (1-163)||(37576181-37576343)
chr1 (1-163)||(49643959-49644120)
chr1 (1-163)||(9006479-9006640)
chr1 (6-163)||(6798095-6798252)
chr1 (1-140)||(23598072-23598213)
chr1 (1-163)||(37285016-37285177)
chr1 (190-288)||(38127872-38127970)
chr1 (54-163)||(31703667-31703776)
chr1 (6-163)||(37585981-37586138)
chr1 (6-163)||(12127341-12127501)
chr1 (1-87)||(13183766-13183852)
chr1 (5-163)||(39486481-39486638)
chr1 (1-109)||(10831131-10831239)
chr1 (1-117)||(37467554-37467670)
chr1 (1-109)||(46593573-46593680)
chr1 (60-163)||(27400712-27400815)
chr1 (1-87)||(32047743-32047829)
chr1 (6-95)||(10831942-10832031)
chr1 (13-109)||(5537146-5537242)
chr1 (4-123)||(28884020-28884139)
chr1 (6-109)||(34966308-34966411)
chr1 (1-123)||(5536398-5536520)
chr1 (1-87)||(13109191-13109277)
chr1 (1-95)||(34967078-34967172)
chr1 (6-109)||(46592817-46592920)
chr1 (4-74)||(46289327-46289397)
chr1 (209-286)||(4330045-4330122)
chr1 (3-123)||(28884751-28884871)
chr1 (3-123)||(32048510-32048630)
chr1 (6-87)||(4697163-4697244)
chr1 (1-81)||(49838756-49838835)
chr1 (54-109)||(49837424-49837479)
chr1 (1-145)||(37466802-37466944)
chr1 (1-42)||(45843320-45843360)
chr1 (6-94)||(43727278-43727366)
[»] chr2 (53 HSPs)
chr2 (1-288)||(13193151-13193438)
chr2 (1-288)||(15405756-15406043)
chr2 (1-288)||(29472405-29472692)
chr2 (2-288)||(26181701-26181987)
chr2 (1-286)||(41474247-41474532)
chr2 (4-288)||(19815707-19815991)
chr2 (4-288)||(2147888-2148173)
chr2 (1-288)||(34735343-34735630)
chr2 (4-288)||(8173888-8174172)
chr2 (1-287)||(7495980-7496265)
chr2 (1-288)||(24371967-24372254)
chr2 (5-288)||(16305188-16305471)
chr2 (6-288)||(17052221-17052499)
chr2 (12-288)||(36713751-36714024)
chr2 (54-288)||(10992014-10992248)
chr2 (1-288)||(15744620-15744897)
chr2 (2-288)||(12860381-12860654)
chr2 (1-215)||(24138068-24138282)
chr2 (4-288)||(7469329-7469605)
chr2 (1-163)||(33470211-33470373)
chr2 (1-163)||(36713588-36713750)
chr2 (3-157)||(38332974-38333128)
chr2 (6-163)||(15744462-15744619)
chr2 (1-160)||(15406047-15406205)
chr2 (1-160)||(29472242-29472401)
chr2 (1-163)||(10991851-10992013)
chr2 (1-159)||(13192988-13193146)
chr2 (1-163)||(34735631-34735793)
chr2 (1-163)||(7496267-7496429)
chr2 (1-163)||(19847606-19847768)
chr2 (1-163)||(24372255-24372417)
chr2 (1-163)||(26181988-26182150)
chr2 (1-163)||(38332704-38332866)
chr2 (4-163)||(2148174-2148333)
chr2 (1-163)||(19815992-19816154)
chr2 (6-163)||(7469171-7469328)
chr2 (4-164)||(30898588-30898748)
chr2 (1-163)||(16305025-16305187)
chr2 (177-288)||(19847495-19847605)
chr2 (1-163)||(8174173-8174335)
chr2 (31-161)||(42834452-42834582)
chr2 (1-163)||(24138794-24138957)
chr2 (54-163)||(12860655-12860764)
chr2 (6-163)||(41474087-41474244)
chr2 (1-109)||(17050929-17051037)
chr2 (4-130)||(8444825-8444951)
chr2 (207-288)||(38332867-38332948)
chr2 (1-109)||(17032593-17032701)
chr2 (209-288)||(24138714-24138793)
chr2 (1-95)||(8963173-8963267)
chr2 (6-109)||(8962365-8962468)
chr2 (6-109)||(8445131-8445234)
chr2 (12-104)||(23992189-23992281)
[»] chr8 (61 HSPs)
chr8 (3-288)||(15048562-15048847)
chr8 (3-286)||(5434902-5435185)
chr8 (3-288)||(38588750-38589035)
chr8 (1-288)||(15871621-15871908)
chr8 (1-288)||(27473072-27473358)
chr8 (2-288)||(5152536-5152821)
chr8 (1-287)||(37569314-37569601)
chr8 (1-288)||(45276597-45276883)
chr8 (1-281)||(34470714-34470994)
chr8 (4-288)||(40048218-40048501)
chr8 (1-286)||(11707750-11708035)
chr8 (1-285)||(1870099-1870385)
chr8 (5-288)||(1739952-1740235)
chr8 (4-288)||(44594604-44594888)
chr8 (1-288)||(1646501-1646794)
chr8 (1-288)||(45077221-45077490)
chr8 (4-288)||(7534845-7535120)
chr8 (2-288)||(27669579-27669868)
chr8 (1-191)||(33819785-33819975)
chr8 (1-201)||(40659983-40660183)
chr8 (1-160)||(7535124-7535283)
chr8 (1-139)||(1646818-1646956)
chr8 (1-163)||(45077491-45077653)
chr8 (4-163)||(1651860-1652018)
chr8 (4-163)||(1740236-1740394)
chr8 (1-163)||(15048399-15048561)
chr8 (1-163)||(38588588-38588749)
chr8 (6-163)||(1432136-1432293)
chr8 (6-163)||(7949417-7949574)
chr8 (4-158)||(40660179-40660333)
chr8 (176-288)||(33295859-33295971)
chr8 (161-288)||(1432294-1432421)
chr8 (1-160)||(33295975-33296134)
chr8 (1-163)||(15871909-15872071)
chr8 (1-159)||(27473363-27473521)
chr8 (1-163)||(45276884-45277046)
chr8 (148-288)||(7949575-7949715)
chr8 (1-144)||(1869934-1870076)
chr8 (1-163)||(5435188-5435350)
chr8 (6-144)||(11173941-11174079)
chr8 (6-163)||(5152822-5152978)
chr8 (1-161)||(44594891-44595050)
chr8 (25-163)||(27669440-27669578)
chr8 (138-288)||(1651709-1651859)
chr8 (170-284)||(24659365-24659479)
chr8 (14-144)||(37569622-37569752)
chr8 (69-160)||(18298520-18298611)
chr8 (1-109)||(22763275-22763383)
chr8 (1-87)||(11920136-11920222)
chr8 (1-87)||(24666042-24666128)
chr8 (1-159)||(40048067-40048217)
chr8 (1-79)||(12643888-12643966)
chr8 (1-83)||(24652823-24652905)
chr8 (4-127)||(33295739-33295862)
chr8 (3-89)||(33819975-33820062)
chr8 (1-80)||(15741603-15741682)
chr8 (13-95)||(22762525-22762607)
chr8 (177-288)||(18298416-18298516)
chr8 (1-93)||(15740613-15740705)
chr8 (225-288)||(11173858-11173921)
chr8 (1-60)||(11920076-11920135)
[»] chr3 (94 HSPs)
chr3 (3-288)||(54752326-54752611)
chr3 (1-288)||(26318182-26318469)
chr3 (1-288)||(51509119-51509406)
chr3 (1-288)||(54107902-54108189)
chr3 (1-288)||(39664184-39664471)
chr3 (1-288)||(42591947-42592234)
chr3 (4-288)||(10505951-10506235)
chr3 (1-289)||(12203551-12203839)
chr3 (1-288)||(22201779-22202066)
chr3 (1-288)||(53716456-53716743)
chr3 (1-288)||(27801652-27801939)
chr3 (3-288)||(29818340-29818625)
chr3 (20-288)||(8473865-8474133)
chr3 (1-281)||(18464626-18464906)
chr3 (2-288)||(16931769-16932055)
chr3 (1-288)||(22152008-22152297)
chr3 (5-288)||(11256266-11256549)
chr3 (1-288)||(21568908-21569195)
chr3 (1-288)||(24428730-24429017)
chr3 (4-288)||(44893903-44894187)
chr3 (1-288)||(4757494-4757780)
chr3 (1-288)||(4773405-4773692)
chr3 (1-288)||(5900423-5900710)
chr3 (1-288)||(47303019-47303305)
chr3 (1-288)||(47669422-47669709)
chr3 (68-288)||(39241521-39241741)
chr3 (54-286)||(41834979-41835211)
chr3 (1-288)||(1994169-1994455)
chr3 (1-287)||(15986399-15986684)
chr3 (4-284)||(19883406-19883686)
chr3 (3-288)||(21969792-21970079)
chr3 (3-288)||(21992228-21992515)
chr3 (29-286)||(46152778-46153032)
chr3 (74-288)||(32633138-32633352)
chr3 (1-207)||(1999328-1999534)
chr3 (1-163)||(10506236-10506398)
chr3 (6-163)||(39241363-39241520)
chr3 (56-284)||(39951524-39951748)
chr3 (1-163)||(4757781-4757943)
chr3 (1-163)||(54108190-54108352)
chr3 (6-163)||(47669264-47669421)
chr3 (1-163)||(5900711-5900873)
chr3 (1-159)||(18464456-18464614)
chr3 (1-163)||(42591784-42591946)
chr3 (1-163)||(44893740-44893902)
chr3 (3-163)||(1994456-1994616)
chr3 (6-162)||(12203840-12203996)
chr3 (13-161)||(27801501-27801649)
chr3 (6-160)||(22201621-22201775)
chr3 (1-163)||(26318470-26318632)
chr3 (1-163)||(32633353-32633515)
chr3 (6-163)||(8474134-8474291)
chr3 (102-236)||(28986261-28986395)
chr3 (1-163)||(39664472-39664634)
chr3 (1-163)||(54752163-54752325)
chr3 (1-161)||(21568746-21568906)
chr3 (1-157)||(46152615-46152771)
chr3 (4-144)||(47303323-47303463)
chr3 (1-160)||(11256103-11256262)
chr3 (6-157)||(29818182-29818333)
chr3 (1-144)||(45306999-45307142)
chr3 (1-139)||(4773243-4773381)
chr3 (12-162)||(53716305-53716455)
chr3 (1-154)||(12791473-12791626)
chr3 (6-163)||(21969634-21969791)
chr3 (6-163)||(21992070-21992227)
chr3 (1-161)||(24428567-24428727)
chr3 (1-144)||(45306832-45306975)
chr3 (1-163)||(15986235-15986397)
chr3 (1-157)||(28986436-28986591)
chr3 (1-129)||(44317537-44317665)
chr3 (6-144)||(41835233-41835371)
chr3 (1-129)||(49528149-49528277)
chr3 (1-163)||(16931606-16931768)
chr3 (4-129)||(13866023-13866148)
chr3 (14-163)||(51509407-51509555)
chr3 (1-163)||(22151845-22152007)
chr3 (14-119)||(7163463-7163568)
chr3 (1-163)||(39951357-39951519)
chr3 (1-131)||(20963545-20963675)
chr3 (1-95)||(28985509-28985603)
chr3 (1-127)||(7681447-7681574)
chr3 (1-87)||(30681781-30681867)
chr3 (6-118)||(15790684-15790796)
chr3 (13-95)||(15791465-15791542)
chr3 (1-87)||(30681029-30681115)
chr3 (1-87)||(42853246-42853331)
chr3 (251-288)||(28986392-28986429)
chr3 (25-82)||(43839984-43840041)
chr3 (13-94)||(43844392-43844473)
chr3 (13-131)||(13866920-13867038)
chr3 (13-131)||(49529076-49529194)
chr3 (2-34)||(42853342-42853374)
chr3 (6-78)||(50394333-50394405)
[»] scaffold0134 (2 HSPs)
scaffold0134 (1-288)||(14135-14422)
scaffold0134 (1-163)||(14423-14585)
[»] scaffold0340 (2 HSPs)
scaffold0340 (1-288)||(18436-18723)
scaffold0340 (13-163)||(18285-18435)
[»] scaffold0221 (2 HSPs)
scaffold0221 (5-288)||(8591-8874)
scaffold0221 (1-163)||(8429-8590)
[»] scaffold0072 (2 HSPs)
scaffold0072 (1-288)||(15611-15898)
scaffold0072 (6-163)||(15458-15610)
[»] scaffold0003 (4 HSPs)
scaffold0003 (1-288)||(349236-349522)
scaffold0003 (1-288)||(113529-113816)
scaffold0003 (13-163)||(349085-349235)
scaffold0003 (13-130)||(113405-113522)
[»] scaffold0019 (2 HSPs)
scaffold0019 (3-288)||(50478-50763)
scaffold0019 (1-163)||(50764-50927)
[»] scaffold0032 (3 HSPs)
scaffold0032 (1-288)||(81858-82145)
scaffold0032 (78-163)||(82146-82231)
scaffold0032 (13-95)||(90794-90876)
[»] scaffold0182 (2 HSPs)
scaffold0182 (4-288)||(19871-20155)
scaffold0182 (6-163)||(19713-19870)
[»] scaffold0029 (2 HSPs)
scaffold0029 (1-288)||(72925-73211)
scaffold0029 (1-163)||(72762-72924)
[»] scaffold0186 (2 HSPs)
scaffold0186 (1-288)||(24325-24612)
scaffold0186 (1-163)||(24162-24324)
[»] scaffold0246 (2 HSPs)
scaffold0246 (4-288)||(6161-6439)
scaffold0246 (54-161)||(6051-6158)
[»] scaffold0115 (3 HSPs)
scaffold0115 (1-142)||(22462-22603)
scaffold0115 (1-163)||(21512-21673)
scaffold0115 (147-288)||(21674-21815)
[»] scaffold0220 (2 HSPs)
scaffold0220 (1-163)||(20751-20913)
scaffold0220 (113-288)||(20914-21088)
[»] scaffold0037 (4 HSPs)
scaffold0037 (4-192)||(56395-56583)
scaffold0037 (4-192)||(63520-63708)
scaffold0037 (1-163)||(45756-45918)
scaffold0037 (187-288)||(45919-46020)
[»] scaffold0260 (1 HSPs)
scaffold0260 (54-160)||(14244-14350)
[»] scaffold0225 (2 HSPs)
scaffold0225 (1-144)||(9782-9924)
scaffold0225 (12-93)||(10914-10995)
[»] scaffold0001 (2 HSPs)
scaffold0001 (9-158)||(147133-147281)
scaffold0001 (20-95)||(144039-144114)
[»] scaffold0526 (2 HSPs)
scaffold0526 (1-34)||(4030-4063)
scaffold0526 (1-34)||(4084-4117)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 234; Significance: 1e-129; HSPs: 67)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 3 - 288
Target Start/End: Original strand, 32993017 - 32993302
Alignment:
Q  3 cttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattattac 102  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  32993017 cttaattaccttcttggtcctctaactatttaattggtattagattggtcatctaagtaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattgttac 32993116  T
Q  103 tacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggtatatgtcctcatgtttcacacatacatatgaaccataac 202  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32993117 tacatttggtcctttctgttagttttattcaaataaacgttaggatttgtgttatgtaggtacctgtcctcatgtttcacacatacatatgaaccataac 32993216  T
Q  203 agttaccaataatatcagtcattatttaatcataacaccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 288  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32993217 agttaccaataatatcagtcattatttaatcataacaccttaacaaggcataagaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 32993302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 4 - 288
Target Start/End: Original strand, 34994383 - 34994667
Alignment:
Q  4 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattattact 103  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||    
T  34994383 ttaattacctttttggtcctttaactatttaattggtattggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttact 34994482  T
Q  104 acatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggtatatgtcctcatgtttcacacatacatatgaaccataaca 203  Q
    | ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  || |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  34994483 atatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagaatttgtgttatgtgggtacttgacctcgtgtttcacacatacatatgaaccataaca 34994582  T
Q  204 gttaccaataatatcagtcattatttaatcataacaccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 288  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  34994583 gttaccaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaggcataagaccaaaatgatactaataaatcaagttagagg 34994667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 4 - 288
Target Start/End: Original strand, 5937816 - 5938100
Alignment:
Q  4 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattattact 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||    
T  5937816 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattgattctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttact 5937915  T
Q  104 acatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggtatatgtcctcatgtttcacacatacatatgaaccataaca 203  Q
    ||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||  || |||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  5937916 acatttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtacctgacctcctgtttcacacatacatatgaaccataata 5938015  T
Q  204 gttaccaataatatcagtcattatttaatcataacaccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 288  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5938016 gttaccaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaggcatagaaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 5938100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 34891093 - 34890807
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   |||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||    
T  34891093 ggcttaattac-tttttggtcctctaactatttaattggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgtt 34890995  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggtatatgtcctcatgtttcacacatacatatgaaccata 200  Q
    |||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  || |||  ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  34890994 actacatttagtcttttctgttagttttattcaaataaacgttaggatttgtgttatgtgggtacctgaccttctgtttcacacacacatatgaatcata 34890895  T
Q  201 acagttaccaataatatcagtcattatttaatcataacaccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 288  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34890894 acagttaccaataatatcagtcattatttaatcataatactttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 34890807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 9046536 - 9046249
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    |    
T  9046536 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtccgctaagtttctcaccgct 9046437  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggtatatgtcctcatgtttcacacatacatatgaaccata 200  Q
    |||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||   |||||||||||||||||  || |||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  9046436 actacatttagtcctttctgttagttctattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtacctgacctcctgtttcacacatacatatgaatcata 9046337  T
Q  201 acagttaccaataatatcagtcattatttaatcataacaccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 288  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9046336 acagttaccaataatatcagtcactatttaatcataatagcttaacaaggcataagaccaaaatgatactaataaataaatttagagg 9046249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 3 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 5311274 - 5310989
Alignment:
Q  3 cttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattattac 102  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||| || ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||  ||||    
T  5311274 cttagttacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtgctctaagtttctcatcgttac 5311175  T
Q  103 tacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggtatatgtcctcatgtttcacacatacatatgaaccataac 202  Q
    |||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||  || |||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  5311174 tacatttagtcctttatgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtgggtacctgacctcctgtttcacacatacatatgaaccataat 5311075  T
Q  203 agttaccaataatatcagtcattatttaatcataacaccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 288  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5311074 agttaccaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaatgaatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 5310989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 288
Target Start/End: Original strand, 3423170 - 3423457
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| | |||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||    
T  3423170 ggcttaattaccattttggttctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgtt 3423269  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggtatatgtcctcatgtttcacacatacatatgaaccata 200  Q
    |||||||||  || ||||| ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||  || |||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  3423270 actacatttagtcttttctattagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtacctgacctcctgtttaacacatacatatgaaccata 3423369  T
Q  201 acagttaccaataatatcagtcattatttaatcataacaccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 288  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3423370 acagttaccaataatatcggtcactatttaatcgtaataccttaacaaggcataagaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 3423457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 7270403 - 7270116
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||| |||||| ||||||||  ||    
T  7270403 ggcttaattatctttttggtcctttaactatttaattggtatcgaattgatcctctaactaaaaattaattttttttggttctctaaatttctcatcgtt 7270304  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggtatatgtcctcatgtttcacacatacatatgaaccata 200  Q
    |||||||||  || ||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||  || |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  7270303 actacatttagtcttttctgttaattttattcaaataaacgttagagtttgtggtatgtgggtacctgacctcctgtttcacacatacatatgaaccata 7270204  T
Q  201 acagttaccaataatatcagtcattatttaatcataacaccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 288  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7270203 acagttatcaacaatatcagtcactatttaatcataatactttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 7270116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 7271079 - 7270792
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||   |||  || |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  ||    
T  7271079 ggcttaattgcctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattagtcctctaactaaaaattgatttatttcagtcctctaagtttctcatcgtt 7270980  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggtatatgtcctcatgtttcacacatacatatgaaccata 200  Q
    |||| ||||  |||||||| ||||||||||| |||||||||||    ||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  7270979 actatatttagtcctttctattagttttatttaaataaacgttggggtttgtgttatgtgagtacatgacctcctgtttcacacatacatatgaaccata 7270880  T
Q  201 acagttaccaataatatcagtcattatttaatcataacaccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 288  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7270879 acagttaccaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 7270792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 181; E-Value: 8e-98
Query Start/End: Original strand, 3 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 32753621 - 32753340
Alignment:
Q  3 cttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattattac 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||    
T  32753621 cttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcggattgatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttac 32753522  T
Q  103 tacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggtatatgtcctcatgtttcacacatacatatgaaccataac 202  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||  || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  32753521 tacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgtcagagtttgtgttatgtgggtacctgacctcctgtttcacacatacatatgaatcataac 32753422  T
Q  203 agttaccaataatatcagtcattatttaatcataacaccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 288  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    | ||||||||||||| |||||||||    
T  32753421 acttaccaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaggcataggacc----ttatactaataaatacagttagagg 32753340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 2517452 - 2517165
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   ||    
T  2517452 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 2517353  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggtatatgtcctcatgtttcacacatacatatgaaccata 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||  || ||||||||||| |||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2517352 actacatttaatcctttctgttagttttatttaaataaacgttatgatctgtgttatgtgagtatctgacctcttgtttcacacatacatatgaaccata 2517253  T
Q  201 acagttaccaataatatcagtcattatttaatcataacaccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 288  Q
    ||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||| || |||||||||||| ||||    
T  2517252 acaattaccactaatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaagaatatgaccaaaatgattcttataaataaagttggagg 2517165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 288
Target Start/End: Original strand, 21856555 - 21856842
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| | |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||    
T  21856555 ggcttaattacatttttggtcctctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcaccgtt 21856654  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggtatatgtcctcatgtttcacacatacatatgaaccata 200  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||  || |||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  21856655 actacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatatgggtacctgacctcctatttcacacatacatatgaaccata 21856754  T
Q  201 acagttaccaataatatcagtcattatttaatcataacaccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 288  Q
    ||||||| |||||||||| |||| | ||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21856755 acagttatcaataatatccgtcactgtttaatcataataccttaacaaggaataagaccaaaatgatgctaataaataaagttagagg 21856842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 288
Target Start/End: Original strand, 35167490 - 35167779
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   ||    
T  35167490 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcggattgatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 35167589  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggtatatgtcctcatgtttcacacatacatatgaaccata 200  Q
    |||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||  || |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  35167590 actacatttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtacctgacctcctgtttcacacatacatatgaaccata 35167689  T
Q  201 acagttaccaataatatcagtcattatttaatc--ataacaccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 288  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||  |||| ||||||||||||  || ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  35167690 acagttaccattaatatcagtcactatttaatcatataataccttaacaaggattaggactaaaatgatactaataaataaagttagagg 35167779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 31247566 - 31247279
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctct-aagtttctcattat 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||| || |||||||||||||| ||||||||  ||||||| |||||| |||   |    
T  31247566 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattaatttatttcagtcctcttaagtttttcaccgt 31247467  T
Q  100 tactacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggtatatgtcctcatgtttcacacatacatatgaaccat 199  Q
    ||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  || | || |||||||||||||||||||||||||    
T  31247466 tactacattag-tcatttctgttagttttattcaaataaacgttaaagtttgtgttatgtgggtacctgacttcctgtttcacacatacatatgaaccat 31247368  T
Q  200 aacagttaccaataatatcagtcattatttaatcataacaccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 288  Q
    || |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31247367 aatagttaccaataatatctgtcattatttaatcataataccttaacaaggaatatgatcaaaatgatactaataaataaagttagagg 31247279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 288
Target Start/End: Original strand, 6235921 - 6236208
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||  || | ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   ||    
T  6235921 ggctaaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattagtcctataattaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 6236020  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggtatatgtcctcatgtttcacacatacatatgaaccata 200  Q
    ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  6236021 actgcatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtatctgacctcctgtttcacacatacatatgaaccata 6236120  T
Q  201 acagttaccaataatatcagtcattatttaatcataacaccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 288  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| | |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  6236121 acagttaccaataatatcggtcactatttaatcataatatcttaacaaggcataggaccaagatgatactaataaatgaagttagagg 6236208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 31238196 - 31237909
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctct-aagtttctcattat 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||   |    
T  31238196 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcggattggtc-tctaactaaaaattgatttatttcggtcctcttaagtttttcaccgt 31238098  T
Q  100 tactacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggtatatgtcctcatgtttcacacatacatatgaaccat 199  Q
    ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||  || | || |||||| ||||||||||||||||||    
T  31238097 tactacatttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtgggtacctgacttcctgtttctcacatacatatgaaccat 31237998  T
Q  200 aacagttaccaataatatcagtcattatttaatcataacaccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 288  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| | |||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31237997 aacagttaacaataatatctgtcattatttaatcataataccttaacaaggaacatgatcaaaataatactaataaataaagttagagg 31237909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 18053403 - 18053119
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||| || ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||   ||    
T  18053403 ggcttagttacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtactctaagtttctcaccgtt 18053304  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggtatatgtcctcatgtttcacacatacatatgaaccata 200  Q
    |||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||| |||| ||||||| || | || ||||||||||||||||   |||||||    
T  18053303 actacatttagtcctttctattagttttattcaaataaacgttagagtttgttttatatgggtatctgacatcctgtttcacacatacat---aaccata 18053207  T
Q  201 acagttaccaataatatcagtcattatttaatcataacaccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 288  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18053206 acaattaccaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaagcatagaaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 18053119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 26957411 - 26957125
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||  |||| || | ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||   ||    
T  26957411 ggcttaattatctttttggtcatctaactatttaattggtattagattggtcctttaactaaaaattgatttatttcggtcctttaagtttttcaccgtt 26957312  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggtatatgtcctcatgtttcacacatacatatgaaccata 200  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| |||||| ||  || |||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  26957311 actacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgt-atgtggctacctgacctcctgtttcacacatacatatgaatcata 26957213  T
Q  201 acagttaccaataatatcagtcattatttaatcataacaccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 288  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26957212 acacttaccaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaagacataggaccaaaatgatactaataaataaagctagagg 26957125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 288
Target Start/End: Original strand, 6137379 - 6137665
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| || ||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| | ||    
T  6137379 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaattaaaaat-gatttatttcggtcctctaagtttctcactgtt 6137477  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggtatatgtcctcatgtttcacacatacatatgaaccata 200  Q
    |||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||| | | || |||| | ||||||||| ||| ||||| ||||    
T  6137478 actacatttagtcttttctgttagttttattcaaataaacgtcaaggtttgtgttatgtggatgtctgacctcctatttcacacagacaaatgaaacata 6137577  T
Q  201 acagttaccaataatatcagtcattatttaatcataacaccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 288  Q
    ||| |||| |||||||||| ||| ||||||||||||| | |||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6137578 acaattacaaataatatcactcactatttaatcataatatcttaacgagatatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 6137665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 3 - 288
Target Start/End: Original strand, 25176665 - 25176944
Alignment:
Q  3 cttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattattac 102  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| | |||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   ||||    
T  25176665 cttaattacatttttggtcctctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttattatggtcctctaagtttctcaccgttac 25176764  T
Q  103 tacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggtatatgtcctcatgtttcacacatacatatgaaccataac 202  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||| ||| ||  || ||      |||||||||||||||||||||||||    
T  25176765 tacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatatggatacctgacc------ttcacacatacatatgaaccataac 25176858  T
Q  203 agttaccaataatatcagtcattatttaatcataacaccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 288  Q
    |||||||||||||||  |||| ||||||||||||| | |||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25176859 agttaccaataatatttgtcactatttaatcataatatcttaacaaggaataggaccaaaatgatgctaataaataaagttagagg 25176944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 13 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 26600785 - 26600520
Alignment:
Q  13 tttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattattactacatttgat 112  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||  |    
T  26600785 ttttttgtcctctaactatttagttggtattggattggtcttctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactacatttagt 26600686  T
Q  113 cctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggtatatgtcctcatgtttcacacatacatatgaaccataacagttaccaat 212  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||  || || | |||||||||||||          |||||||||||||||    
T  26600685 catttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtacctgaccccctgtttcacacata----------ataacagttaccaat 26600596  T
Q  213 aatatcagtcattatttaatcataacaccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 288  Q
    |||||| |||| ||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26600595 aatatcggtcactatttaatcataataccttaataaggaatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 26600520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 24744770 - 24744491
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||   | || ||||||||||| | ||    
T  24744770 ggcttaattatctttttggtcctctaactatttagttggtatt-aattggtcctctaactaaaaattgatttatttccattctttaagtttctcactgtt 24744672  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggtatatgtcctcatgtttcacacatacatatgaaccata 200  Q
    | |||||||  || ||||| ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||  || |||  ||||||||||||||| |||      |    
T  24744671 attacatttagtcttttctattagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtacctgaccttctgtttcacacataca-atg------a 24744579  T
Q  201 acagttaccaataatatcagtcattatttaatcataacaccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 288  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24744578 acagttaccaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaagaaataggaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 24744491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 122 - 287
Target Start/End: Original strand, 5639294 - 5639459
Alignment:
Q  122 tagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggtatatgtcctcatgtttcacacatacatatgaaccataacagttaccaataatatcagt 221  Q
    |||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||   | |||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5639294 tagttttattcaaataaatgttagagtttgtgttatgtgggtacccgacctcctatttcacacatacatatgaaccataacaattaccaataatatcagt 5639393  T
Q  222 cattatttaatcataacaccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagag 287  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5639394 cactatttaatcataataccttaacaaggaatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagag 5639459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 6 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 5938258 - 5938101
Alignment:
Q  6 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattattactac 105  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | |||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||    
T  5938258 aattacctttttggtcatctaattatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcacaattactac 5938159  T
Q  106 atttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggt 163  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  5938158 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaggtttgtgttatgtgggt 5938101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 164
Target Start/End: Original strand, 978415 - 978578
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   ||    
T  978415 ggcttaattacatttttggtcctctaactatttagttggtatcgtattgatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 978514  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggta 164  Q
    |||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  978515 actacatttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggta 978578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Original strand, 34890644 - 34890806
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||    
T  34890644 ggctaaattacctttttgttcctctaactatttaattggtattggattggtcctctaactaaaaattgatttattttggtcctcaaagtttctcactgtt 34890743  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggt 163  Q
    | |||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  34890744 attacatttagtcttttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 34890806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 3 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 15933004 - 15932843
Alignment:
Q  3 cttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattattac 102  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| | |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||    
T  15933004 cttaattacatttttggtcctctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcaccgttac 15932905  T
Q  103 tacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggta 164  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||| ||||||    
T  15932904 tacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatatgggta 15932843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 3 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 6137825 - 6137666
Alignment:
Q  3 cttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattattac 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| || | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   ||||    
T  6137825 cttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctttaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttac 6137726  T
Q  103 tacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggt 163  Q
    |||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||    
T  6137725 tacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttagattttgtgttatgtgggt 6137666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 21857005 - 21856862
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| | |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||    
T  21857005 ggctaaattacctttttggtcctctaagtatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcaccgtt 21856906  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgtta 144  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21856905 actacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgtta 21856862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 6 - 163
Target Start/End: Original strand, 2517007 - 2517164
Alignment:
Q  6 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattattactac 105  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||  || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | | |||||||    
T  2517007 aattacatttttggtcctctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctgactgttactac 2517106  T
Q  106 atttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggt 163  Q
    ||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  2517107 atttagtcttttctgttagttttattcaaataaacgttagtgtttgtgttatgtgggt 2517164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Original strand, 6532192 - 6532354
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||   ||    
T  6532192 ggcttaattaccttttttgtcctctaactatttaatttgtatcggattgatcctctaactaaaaattgatttatttcggttctctaaatttctcaccgtt 6532291  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggt 163  Q
    |||||||||  |  ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  6532292 actacatttagtgatttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 6532354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Original strand, 18052956 - 18053118
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    |||| |||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| | |||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||    
T  18052956 ggctaaattacttttttgatcctttaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgtt 18053055  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggt 163  Q
    |||||||||  || ||| ||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  18053056 actacatttagtcatttatgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 18053118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Original strand, 32753177 - 32753339
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||   ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   ||    
T  32753177 ggctaaattacatttttggtcctctaactatttaattagtatcagattgatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 32753276  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggt 163  Q
    | |||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  32753277 attacatttagtcatttctgttagttttattcaaataaatgttaaggtttgtgttatgtgggt 32753339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 3 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 6236369 - 6236212
Alignment:
Q  3 cttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattattac 102  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||  |||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |   ||||    
T  6236369 cttaattacttttttggtcccctaactatttaattgatatttgattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctaacagttac 6236270  T
Q  103 tacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtg 160  Q
    || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  6236269 taaatttaatcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtg 6236212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Original strand, 9046086 - 9046248
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   |||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||   ||    
T  9046086 ggctaaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcagattggtcctctaagtaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttgtcaccgtt 9046185  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggt 163  Q
    |||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||    
T  9046186 actacatttagtcttttctgttagttttattcaaataaatgttagagtttgtgttatgtgggt 9046248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 13 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 32993453 - 32993303
Alignment:
Q  13 tttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattattactacatttgat 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||| || ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||   || ||||||||  |    
T  32993453 tttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctataagtttctcaccgtttctacatttagt 32993354  T
Q  113 cctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggt 163  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| ||||||||||    
T  32993353 cctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtattatgtgggt 32993303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 21540428 - 21540265
Alignment:
Q  1 ggcttaattaccttttt-ggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattat 99  Q
    |||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||   |||  || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |    
T  21540428 ggctaaattaccttttttggtcctttaactatttaattggtatcagattagtcctctaattaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcatcgt 21540329  T
Q  100 tactacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggt 163  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||   |||| |||||||||||    
T  21540328 tactacatttaatcatttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgcgttatgtgggt 21540265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Original strand, 26600357 - 26600519
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||  || |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||   ||    
T  26600357 ggctaaattatctttttggtcctctaactattaaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattaatttatttcggtcctctaagtttatcaccgtt 26600456  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggt 163  Q
    |||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  26600457 actacatttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 26600519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 6 - 160
Target Start/End: Original strand, 31247121 - 31247275
Alignment:
Q  6 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattattactac 105  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||  |  ||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||   |||||||    
T  31247121 aattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattagttctctaactaaaaattgatttatttcggtgttctaagtttctcaccgttactac 31247220  T
Q  106 atttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtg 160  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||    
T  31247221 atttaatcttttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgttttatgtg 31247275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 34994830 - 34994668
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    |||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| | ||    
T  34994830 ggctaaattacctttttagtcatctaactatttaattggtattagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcgatcctctaagtttctcactgtt 34994731  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggt 163  Q
    ||| |||||  || ||| ||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| ||||    
T  34994730 actgcatttagtcttttatgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgcgggt 34994668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 6 - 163
Target Start/End: Original strand, 31237751 - 31237908
Alignment:
Q  6 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattattactac 105  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||  |  ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||   |||||||    
T  31237751 aattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattagttctctaactaaaaattgatttatttcggtcttctaagtttctcaccgttactac 31237850  T
Q  106 atttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggt 163  Q
    ||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||| ||||||||||    
T  31237851 atttagtcatttctgttagttttattcaaataaatgttagagtttgttttatgtgggt 31237908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Original strand, 5310826 - 5310988
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||   | |  || | ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| | ||    
T  5310826 ggctaaattatctttttggtcctctaactatttaattgatatcagagtagtcctataactaaaaattgatttatttcggtcatctaagtttctcactgtt 5310925  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggt 163  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||   ||||||||||||||||    
T  5310926 actacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaatgttagggtttgtgttatgtgggt 5310988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 6 - 163
Target Start/End: Original strand, 24744334 - 24744490
Alignment:
Q  6 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattattactac 105  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||  || ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||   ||||| |    
T  24744334 aattacctttttg-tcctctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaactttcacaccgttactgc 24744432  T
Q  106 atttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggt 163  Q
    ||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  24744433 atttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 24744490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 4 - 136
Target Start/End: Original strand, 14276402 - 14276534
Alignment:
Q  4 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattattact 103  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||   |||||    
T  14276402 ttaattacctttttggtcctctacctatttaattggtatcggattgatcctctaactaaaaattgatttacttcggtcctctaaatttctcaccgttact 14276501  T
Q  104 acatttgatcctttctgttagttttattcaaat 136  Q
    ||||||  |||||| | ||||||||||||||||    
T  14276502 acatttagtcctttgtattagttttattcaaat 14276534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 6 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 5639618 - 5639461
Alignment:
Q  6 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattattactac 105  Q
    |||||| |||||| || |||||||||||||||||||| | |||  || |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |   |||||||    
T  5639618 aattacatttttgatcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaatttatttatttcggtcctctaagtttcttaccgttactac 5639519  T
Q  106 atttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggt 163  Q
    ||||  |||||| |||||||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||||    
T  5639518 atttagtcctttttgttagttttattcaaataaacattatggtttgtgttatgtgggt 5639461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Original strand, 7269951 - 7270115
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    |||| |||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||   ||    
T  7269951 ggctaaattacttttttaatcctctaactatttaattggtattggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggttctctaagtttctcaccgtt 7270050  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttag--ttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggt 163  Q
    |||||||||  || ||||||||||  ||||||| ||||||| ||||   ||||||||||||||||    
T  7270051 actacatttagtcatttctgttagttttttatttaaataaatgttagggtttgtgttatgtgggt 7270115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 129
Target Start/End: Original strand, 17244664 - 17244792
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   ||    
T  17244664 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcggtttggtcctctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttatcaccgtt 17244763  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagtttta 129  Q
    | || ||||  || |||||||||||||||    
T  17244764 attatatttcgtcatttctgttagtttta 17244792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 96
Target Start/End: Original strand, 15932730 - 15932825
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcat 96  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15932730 ggctaaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttattttgatcctctaagtttctcat 15932825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 54 - 163
Target Start/End: Original strand, 26957015 - 26957124
Alignment:
Q  54 tctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattattactacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtg 153  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |   |||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  26957015 tctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttcttaccgttactacatttagtcctttatgttagttttattcaaataaacgttaaagtttatg 26957114  T
Q  154 ttatgtgggt 163  Q
    ||||| ||||    
T  26957115 ttatgggggt 26957124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 34518142 - 34517999
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| || || |||||||||||||||||||| | |||  ||||||||||||  ||    
T  34518142 ggctaaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctcaaactaaaaattgatttatttcgatcccttaagtttctcatcgtt 34518043  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgtta 144  Q
    |||||||||  ||||||| ||||  |||| | ||| ||||||||    
T  34518042 actacatttagtcctttccgttaaatttaattaaaaaaacgtta 34517999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 3 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 10412949 - 10412808
Alignment:
Q  3 cttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattattac 102  Q
    |||||||| |||||||||| | |||||||||| ||||||| | |||  |  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   ||||    
T  10412949 cttaattatctttttggtcttttaactatttagttggtatcggattagttctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttac 10412850  T
Q  103 tacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgtta 144  Q
    || ||||  || ||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  10412849 tatatttagtcatttctattaattttattcaaataaacgtta 10412808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 55 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 3423566 - 3423458
Alignment:
Q  55 ctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattattactacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgt 154  Q
    |||| ||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||   |||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||     
T  3423566 ctaattaaaaattggtttatttcggtcctctaattttctcaccgttactacatttagtcttttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtga 3423467  T
Q  155 tatgtgggt 163  Q
    |||||||||    
T  3423466 tatgtgggt 3423458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 129
Target Start/End: Original strand, 6228730 - 6228857
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||   ||    
T  6228730 ggcttaattacctttttagtcctctaattatttaattggtatcggtttggtcctctaactaaaaattgatttattttggtcc-ctaagtttatcaccgtt 6228828  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagtttta 129  Q
    |||| ||||  || |||||||| ||||||    
T  6228829 actatatttcgtcatttctgtttgtttta 6228857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 109
Target Start/End: Original strand, 7438804 - 7438912
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   |||| || ||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||   ||    
T  7438804 ggctaaattatctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcccttaagtttctcaccgtt 7438903  T
Q  101 actacattt 109  Q
    |||||||||    
T  7438904 actacattt 7438912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 54 - 144
Target Start/End: Original strand, 3035933 - 3036024
Alignment:
Q  54 tctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattattactacatttgatc-ctttctgttagttttattcaaataaacgtta 144  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||  ||  ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3035933 tctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactcttactacatttagtcattttctgttaattttattcaaataaacgtta 3036024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 209 - 288
Target Start/End: Original strand, 21540185 - 21540264
Alignment:
Q  209 caataatatcagtcattatttaatcataacaccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 288  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||| | |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21540185 caataatatcaatcactatttaatcataatatcttaacaaggcataggatcaaaatgatactaataaataaagttagagg 21540264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 13 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 29261389 - 29261279
Alignment:
Q  13 tttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattattactacatttgat 112  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||||||||||||||| | |||||  ||||||||||| | |||||||||||  |    
T  29261389 tttttagtcctctaactatttaattggtattagattggtcctctaactaaaaattgatttatgtcggtcccttaagtttctcactgttactacatttagt 29261290  T
Q  113 cctttctgtta 123  Q
    |||||| ||||    
T  29261289 cctttccgtta 29261279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Original strand, 34517272 - 34517366
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctca 95  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| | | |||| || ||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  34517272 ggctaaattacttttttggtcctctaactatttaattggtgtcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcccttaagtttctca 34517366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 78 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 25177030 - 25176946
Alignment:
Q  78 ggtcctctaagtttctcattattactacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtggg 162  Q
    ||||||||||||||||||   |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||    
T  25177030 ggtcctctaagtttctcaccgttactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtggg 25176946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 40 - 163
Target Start/End: Original strand, 7270668 - 7270791
Alignment:
Q  40 tattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattattactacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaa 139  Q
    ||||| |||| || ||||| ||||||||||||||||||| || | ||||||||| |   |||||| ||||  || ||| |||||||||||||||||||||    
T  7270668 tattggattggtcctctaattaaaaattgatttattttgatcttttaagtttcttaccgttactatatttagtcttttttgttagttttattcaaataaa 7270767  T
Q  140 cgttaaaatttgtgttatgtgggt 163  Q
    |||||   ||||||||||||||||    
T  7270768 cgttagggtttgtgttatgtgggt 7270791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 25180298 - 25180223
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattt 76  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| | |||| || |||||||||||||||||||||||    
T  25180298 ggctaaattacctttctggtcctctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttattt 25180223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 6 - 109
Target Start/End: Original strand, 29260536 - 29260638
Alignment:
Q  6 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattattactac 105  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   |||| || || ||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||||  ||||||||    
T  29260536 aattacctttctggtcctctaactatttaattggtatcagattggtcctcaaactaaaaattaatttatttcggtcccttaagtttctca-cattactac 29260634  T
Q  106 attt 109  Q
    ||||    
T  29260635 attt 29260638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 6 - 76
Target Start/End: Original strand, 15286350 - 15286420
Alignment:
Q  6 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattt 76  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | | |||| || ||| |||||||||||||||||||    
T  15286350 aattacctttttgatcctctaactatttaattggtgtcggattggtcctctgactaaaaattgatttattt 15286420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 35167905 - 35167833
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgattta 73  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   |||  || ||||||||||||||||||||    
T  35167905 ggctaaattacatttttggtcctctaactatttaattggtatcagattagtcctctaactaaaaattgattta 35167833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 27829414 - 27829329
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaa 87  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||     ||| || ||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  27829414 ggcttaattacctttt-ggtcctccaactatttaattggtaacagtttggtcctctaattaaaaaatgatttattttggtcctctaa 27829329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 106 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 35167837 - 35167780
Alignment:
Q  106 atttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggt 163  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||   ||||||||||||||||    
T  35167837 atttaatcctttctgttagttttattcaagtaaacgttagggtttgtgttatgtgggt 35167780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 6229772 - 6229643
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||| |  ||| ||  |||||||||| |||||||||||||||||  ||| ||||||  | ||    
T  6229772 ggctaaattgcctttttggtcccttaactatttaattagtatcggtttggtcc-ctaactaaaatttgatttattttggtcccttaaatttctctctgtt 6229674  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttatt 131  Q
    ||||| |||  ||||||| |||| |||||||    
T  6229673 actacttttagtcctttccgttaattttatt 6229643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 204; Significance: 1e-111; HSPs: 72)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 288
Target Start/End: Original strand, 48626063 - 48626350
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||| |  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||    
T  48626063 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggttctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgtt 48626162  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggtatatgtcctcatgtttcacacatacatatgaaccata 200  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  48626163 actacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttatgatttgtgttatgtgagtatctgacctcttgtttcacacatacatatgaaccata 48626262  T
Q  201 acagttaccaataatatcagtcattatttaatcataacaccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 288  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48626263 acagttaccaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaggaatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 48626350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 287
Target Start/End: Original strand, 35146699 - 35146984
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| | |||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||    
T  35146699 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttagtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgtt 35146798  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggtatatgtcctcatgtttcacacatacatatgaaccata 200  Q
    |||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| || |||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  35146799 actacatttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtatctgacctc-tgtttcacacttacatatgaaccata 35146897  T
Q  201 acagttaccaataatatcagtcattatttaatcataacaccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagag 287  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  35146898 acagttaccaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaggaatatgaccaaaatgatattgataaataaagttagag 35146984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 288
Target Start/End: Original strand, 7578872 - 7579159
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| | |||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||    
T  7578872 ggcttaattacttttttggtcctctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaatgtt 7578971  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggtatatgtcctcatgtttcacacatacatatgaaccata 200  Q
    ||| |||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||  || |||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  7578972 acttcatttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtacctgacctcctgttttacacatacatatgaaccata 7579071  T
Q  201 acagttaccaataatatcagtcattatttaatcataacaccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 288  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7579072 acagttaccaataatatcaatcactatttaatcataataccttaacaaggaataagaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 7579159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 288
Target Start/End: Original strand, 41453005 - 41453292
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| | |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||    
T  41453005 ggcttaattacatttttggtcctctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcaccgtt 41453104  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggtatatgtcctcatgtttcacacatacatatgaaccata 200  Q
    |||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||  || |||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  41453105 actacatttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttaggatttgtgttatatgggtacctgacctcctatttcacacatacatatgaaccata 41453204  T
Q  201 acagttaccaataatatcagtcattatttaatcataacaccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 288  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  41453205 acagttaccaataatatccgtcactatttaatcataataccttaacaaggaataggaccaaaatgatgctaataaataaagttagagg 41453292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 10526760 - 10526474
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| | |||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   ||    
T  10526760 ggcttaattatcttttttgtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 10526661  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggtatatgtcctcatgtttcacacatacatatgaaccata 200  Q
    |||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||  || |||| ||||||||| ||||||||||| ||||    
T  10526660 actacatttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttaagttttgtgttatgtgggtacctggcctcttgtttcacaaatacatatgaaacata 10526561  T
Q  201 acagttaccaataatatcagtcattatttaatcataacaccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 288  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10526560 acagttaccaataatatcagtcaatatttaatcataataccttaac-aggcattggaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 10526474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 2 - 288
Target Start/End: Original strand, 19681496 - 19681782
Alignment:
Q  2 gcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatta 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |     |||    
T  19681496 gcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtattggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagttttttgccgtta 19681595  T
Q  102 ctacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggtatatgtcctcatgtttcacacatacatatgaaccataa 201  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||| || |||||||||||   |||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19681596 ctacatttattcctttctgttagttttagtcgaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtatttgacctcctgtttcacacatacatatgaaccataa 19681695  T
Q  202 cagttaccaataatatcagtcattatttaatcataacaccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 288  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||  | ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19681696 cagttaccaataatatcagtcaatatttaatcataatgcattaacaagaaatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 19681782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 286
Target Start/End: Original strand, 21391190 - 21391475
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||  || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    |    
T  21391190 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgct 21391289  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggtatatgtcctcatgtttcacacatacatatgaaccata 200  Q
    |||||||||  || ||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||  || |||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  21391290 actacatttagtcttttctgttaattttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtggatacctgacctcctgtttcacacatatatatgaaccata 21391389  T
Q  201 acagttaccaataatatcagtcattatttaatcataacaccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttaga 286  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21391390 acagttaccaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaggcataagatcaaaatgatactaataaataaagttaga 21391475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 3 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 8542946 - 8542664
Alignment:
Q  3 cttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattattac 102  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||    
T  8542946 cttaattacatttttggtcctctaactatttagttggtatcggattgatcctctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcactgtgac 8542847  T
Q  103 tacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggtatatgtcctcatgtttcacacatacatatgaaccataac 202  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||   |||||||||| ||| ||| || |||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  8542846 tacatttaatcctttctgt-agttttattcaaataaatgttagggtttgtgttatatggatatctgacctcctatttcacacatacatatgaaccataac 8542748  T
Q  203 agttaccaataatatcagtcattatttaatcataacaccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttaga 286  Q
    |||||||| ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8542747 agttaccagtaatatccgtcaatatttaatcataataccttaacaaggaatatgaccaaaatgatgctaataaataaagttaga 8542664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 287
Target Start/End: Original strand, 8936849 - 8937135
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||| | |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  8936849 ggcttaattatctttttagtcctctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcactttt 8936948  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggtatatgtcctcatgtttcacacatacatatgaaccata 200  Q
    |||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||  || |||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  8936949 actacatttagtcatttctgttagttttattcaaataaatgttagggtttgtgttatgtgggtacctgacctcctgtttcacacatacatatgaaccaaa 8937048  T
Q  201 acagttaccaataatatcagtcattatttaatcataacaccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagag 287  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||| || |||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  8937049 acagttaccaataatatcaatcactatttaatcacaataccttaacaaggaatatgaccaacatgatattaataaataaagttagag 8937135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 6356735 - 6356448
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||    
T  6356735 ggcttaattacctttttggtcctataactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgtt 6356636  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggtatatgtcctcatgtttcacacatacatatgaaccata 200  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||| ||||||||| | || |||| | ||||||||||||| ||||| ||||    
T  6356635 actacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgtcaaggtttgtgctatgtgggtgtctgacctcctatttcacacatacaaatgaaacata 6356536  T
Q  201 acagttaccaataatatcagtcattatttaatcataacaccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 288  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||| ||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6356535 acaattaccaataatatcagtcactatttaatcataatatcttaacgagatataggaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 6356448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 4 - 288
Target Start/End: Original strand, 31637946 - 31638230
Alignment:
Q  4 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattattact 103  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   |||| || ||||||||||||||||||||||| |  || ||||||||||||   |||||    
T  31637946 ttaattacctttttagtcctctaactatttaattggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcgaaccactaagtttctcaccgttact 31638045  T
Q  104 acatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggtatatgtcctcatgtttcacacatacatatgaaccataaca 203  Q
    ||||||  || ||||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||| |||| ||  || |||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  31638046 acatttagtcatttctgttagttttattcatataaacgttagggtttgtgttacgtggatacctgacctcctatttcacacatacatatgaaccataaca 31638145  T
Q  204 gttaccaataatatcagtcattatttaatcataacaccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 288  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31638146 gttaccaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 31638230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 288
Target Start/End: Original strand, 41191683 - 41191972
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||| ||||| |||| || ||||||||||||||| |||||||  || ||||||||||||||   ||    
T  41191683 ggcttaattaccttttta-tcctctaactatttagttgatattggattggtcctctaactaaaaattggtttatttcagttctctaagtttctcaccgtt 41191781  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggtatatgtcctcatgtttcacacatacatatgaaccata 200  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41191782 actacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtatctgacctcatgtttcacacatacatatgaaccata 41191881  T
Q  201 acagttacc---aataatatcagtcattatttaatcataacaccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 288  Q
    | |||||||   |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41191882 atagttaccaataataatatcagtcactatttaatcataataccttaataagaaatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 41191972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 19 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 36423801 - 36423532
Alignment:
Q  19 gtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattattactacatttgatcctttc 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||   |||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   ||| |||||||  |||||||    
T  36423801 gtcctctaactatttaattggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttattacatttagtcctttc 36423702  T
Q  119 tgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggtatatgtcctcatgtttcacacatacatatgaaccataacagttaccaataatatc 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||  ||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  36423701 tgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtgggtacctgatctcctgtttcacacatacatatgaaccataacagttaccgatagtatc 36423602  T
Q  219 agtcattatttaatcataacaccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 288  Q
    ||||| ||||| ||||||| |||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36423601 agtcactatttgatcataataccttaaccaggtataggaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 36423532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 288
Target Start/End: Original strand, 28286117 - 28286404
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    ||||||||||  ||||||||| |||||||||||| |||||||   |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  28286117 ggcttaattatatttttggtcttctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcatcgtt 28286216  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggtatatgtcctcatgtttcacacatacatatgaaccata 200  Q
    |||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||| | || |||| ||||||||||||| |||||||||||     
T  28286217 actacatttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtgtctgacctcctgtttcacacatagatatgaaccatt 28286316  T
Q  201 acagttaccaataatatcagtcattatttaatcataacaccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 288  Q
    |||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| |||| |||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28286317 acagttgccaataatatcggtcactatttaatcataataccttaagaaggaatagttccaaaatgatactaataaataaagttagagg 28286404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 6357215 - 6356928
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||| |||||| || |||| | |||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   ||    
T  6357215 ggcttaattacatttttgatcctctaattatttagttagtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcacagtt 6357116  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggtatatgtcctcatgtttcacacatacatatgaaccata 200  Q
    |||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||   |||||| ||||||| ||  || |||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  6357115 actacatttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgctatgtggatacctgacctcctctttcacacatacatatgaaccata 6357016  T
Q  201 acagttaccaataatatcagtcattatttaatcataacaccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 288  Q
    ||||||| ||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6357015 acagttatcaataatatcaatcactgtttaatcataataccttaacaaggaatagaaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 6356928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Original strand, 17749935 - 17750187
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   |||| |  |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||   ||    
T  17749935 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattgatatcagattggttctctaactaaaaattaatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 17750034  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggtatatgtcctcatgtttcacacatacatatgaaccata 200  Q
    |||||||||  || ||| ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||| |||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  17750035 actacatttagtcatttatgttagttttattcaaataaacgttatggtttgtgttatatgggtacatgacctcttgtttcacacatacatatgaactata 17750134  T
Q  201 acagttaccaataatatcagtcattatttaatcataacaccttaacaaggcat 253  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17750135 aaagttatcaataatatcagtcattatttaatcataataccttaacaaggcat 17750187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 23 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 28298247 - 28297982
Alignment:
Q  23 tctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattattactacatttgatcctttctgtt 122  Q
    ||||||||||||||||||||   ||| | | ||||| ||||||||||||||||| | | ||||||||||||||   |||||||||||  || ||||||||    
T  28298247 tctaactatttaattggtatcagatttaccctctaattaaaaattgatttatttcgattctctaagtttctcaccgttactacatttagtcatttctgtt 28298148  T
Q  123 agttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggtatatgtcctcatgtttcacacatacatatgaaccataacagttaccaataatatcagtc 222  Q
    | |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||  || |||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||    
T  28298147 aattttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtgggtacttgacctcctgtttcacagatacatatgaaccataaaagttattaataatatcagtc 28298048  T
Q  223 attatttaatcataacaccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 288  Q
    | ||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28298047 actatttaatcataataccttaactagtcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 28297982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 29 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 33717005 - 33716751
Alignment:
Q  29 tatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattattactacatttgatcctttctgttagtttt 128  Q
    |||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||| |||||||| |||| | ||||||||||||| |||||||||| | || ||| ||||| ||||    
T  33717005 tatttaattgatatcggattgatcatctaactaaaaattaatttatttcggtcatttaagtttctcattgttactacattag-tcatttatgttaatttt 33716907  T
Q  129 attcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggtatatgtcctcatgtttcacacatacatatgaaccataacagttaccaataatatcagtcattatt 228  Q
     |||||||||||||||   || ||||||||||||||  || |||| |||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33716906 gttcaaataaacgttagggttggtgttatgtgggtacctgacctcctgtttcacacata----tgaaccataacagttaccaataatatcagtcattatt 33716811  T
Q  229 taatcataacaccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 288  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33716810 taatcataataccttaacaagacataggaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 33716751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 20 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 41752081 - 41751815
Alignment:
Q  20 tcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattattactacatttgatcctttct 119  Q
    |||||||||||||||||||||||   |||| || |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||   | |||| | ||||  | ||||||    
T  41752081 tcctctaactatttaattggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcagtcctctaagtttctatctgttaccatatttagttctttct 41751982  T
Q  120 gttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggtatatgtcctcatgtttcacacatacatatgaaccataacagttaccaataatatca 219  Q
    |||||||||| |||||||||| |||   ||| || |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  41751981 gttagttttaatcaaataaacattagggtttatgctatgtgggtatatgacctcctgtttcacacatacatatgaatcataacagttaccaataatatca 41751882  T
Q  220 gtcattatttaatcataacaccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttaga 286  Q
    |||| ||||||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  41751881 gtcactatttaatcataataacttaacaagacataggaccaaaataatactaataaataaagttaga 41751815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 1114495 - 1114259
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||| | |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||    
T  1114495 ggcttaattacatttttggtcctctaactatttagttgttatcggattggtcctctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcaccgtt 1114396  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggtatatgtcctcatgtttcacacatacatatgaaccata 200  Q
    |||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||| ||||||  || |||| | ||||||||||| ||||||||||||    
T  1114395 actacatttactcttttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatatgggtacctgacctcctatttcacacatatatatgaaccata 1114296  T
Q  201 acagttaccaataatatcagtcattatttaatcataa 237  Q
    |||||||||||||||| | |||| |||||||||||||    
T  1114295 acagttaccaataatacccgtcactatttaatcataa 1114259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 4 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 17363683 - 17363437
Alignment:
Q  4 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattattact 103  Q
    |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||  | | |||||    
T  17363683 ttaattatatttttggttctctaactatttaattggtattggatttgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctttaagtttc--aatgttact 17363586  T
Q  104 acatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggtatatgtcctcatgtttcacacatacatat----gaaccat 199  Q
    ||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||| ||| ||| || |||| | ||||||||||||||||    |||||||    
T  17363585 acatttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatatggatatctgacctcctctttcacacatacatatatatgaaccat 17363486  T
Q  200 aacagttaccaataatatcagtcattatttaatcataacaccttaacaa 248  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  17363485 aacagttaccaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaa 17363437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 3 - 288
Target Start/End: Original strand, 40673014 - 40673292
Alignment:
Q  3 cttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattattac 102  Q
    ||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||    |||||| ||||||||||| || ||||||||  || || ||||||| ||||| ||||    
T  40673014 cttaattacatttttg-tcctctatctatttaattggtatc---ttgatcctctaactaaaatttaatttatttgagttctgtaagtttttcattgttac 40673109  T
Q  103 tacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaac--gttaaaatttgtgttatgtgggtatatgtcctcatgtttcacacatacatatgaaccata 200  Q
    |||||||  |||||||||||||||||   |||||||||  ||||  ||||||||||||||||| | || |||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  40673110 tacatttagtcctttctgttagtttt---caaataaacacgttaggatttgtgttatgtgggtgtctgacctcctgtttcacacatacatatgaatcata 40673206  T
Q  201 acagttaccaataatatcagtcattatttaatcataacaccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 288  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| || ||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  40673207 acacttaccaataatatcagtcactatttaattctaatactttaacaaggcatatgactaaaat--tactaataaataaagttagagg 40673292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 99 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 17359537 - 17359344
Alignment:
Q  99 ttactacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggtatatgtcctcatgtttcacacatacatat----ga 194  Q
    |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||| ||| ||| || |||| | ||||||||||||||||    ||    
T  17359537 ttactacatttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatatggatatctgacctcctctttcacacatacatatatatga 17359438  T
Q  195 accataacagttaccaataatatcagtcattatttaatcataacaccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 288  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17359437 accataacagttaccaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaagaaataggaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 17359344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Original strand, 10526311 - 10526473
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   ||    
T  10526311 ggctaaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 10526410  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggt 163  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  10526411 actacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtgggt 10526473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 44332969 - 44332807
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   ||    
T  44332969 ggctaaattacatttttggtcctctaactatttaattggtatcaaattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 44332870  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggt 163  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||    
T  44332869 actacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttctgttatgtgggt 44332807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 155 - 288
Target Start/End: Original strand, 44332673 - 44332806
Alignment:
Q  155 tatgtgggtatatgtcctcatgtttcacacatacatatgaaccataacagttaccaataatatcagtcattatttaatcataacaccttaacaaggcata 254  Q
    ||||||||||  || |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  44332673 tatgtgggtacctgacctcctatttcacacatacatatgaaccataacagttaccaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaggcata 44332772  T
Q  255 tgaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 288  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44332773 ggaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 44332806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 31075643 - 31075485
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || || || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   ||    
T  31075643 ggcttaattatctttttggtcctctaactatttaattggtattggattggtcctccaattaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 31075544  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgt 159  Q
    |||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  31075543 actacatttagtcctttctgtttgttttattcaaataaacgttaggatttgtgttatgt 31075485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 6 - 163
Target Start/End: Original strand, 1114059 - 1114216
Alignment:
Q  6 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattattactac 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||   ||||||     
T  1114059 aattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttcacacagttactaa 1114158  T
Q  106 atttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggt 163  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  1114159 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtgggt 1114216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 6 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 4931718 - 4931565
Alignment:
Q  6 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattattactac 105  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||   ||||||     
T  4931718 aattacatttttggtcctctaactatttaattggtatcgaattggtcctctaactaaaaattgaattatttcggtcctctaagtttctcaccgttactat 4931619  T
Q  106 atttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgt 159  Q
    |||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4931618 attcagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagaatttgtgttatgt 4931565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Original strand, 6356765 - 6356927
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||   ||    
T  6356765 ggctaaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgtt 6356864  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggt 163  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||   ||||||||||||||||    
T  6356865 actacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaatgttagtgtttgtgttatgtgggt 6356927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 13 - 163
Target Start/End: Original strand, 33716600 - 33716750
Alignment:
Q  13 tttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattattactacatttgat 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||||||  |    
T  33716600 tttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttactacatttagt 33716699  T
Q  113 cctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggt 163  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||    
T  33716700 catttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggt 33716750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 48626513 - 48626351
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||  || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |   ||    
T  48626513 ggctaaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattagtcctctaactaaaaattgatttattttggtcctttaagtttctgaccgtt 48626414  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggt 163  Q
     ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  48626413 gctacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttaggatttgtgttatgtgggt 48626351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 21391640 - 21391480
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    |||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| | |||| || |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| | ||    
T  21391640 ggctaaattacatttttggtcatctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattaatttatttcggtcctctaagtttctcactctt 21391541  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgg 161  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||   ||||||||||||||    
T  21391540 actacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaatgttagtgtttgtgttatgtgg 21391480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 156 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 43247710 - 43247578
Alignment:
Q  156 atgtgggtatatgtcctcatgtttcacacatacatatgaaccataacagttaccaataatatcagtcattatttaatcataacaccttaacaaggcatat 255  Q
    |||||||||  || |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||     
T  43247710 atgtgggtacctgacctcctgtttcacacatacatatgaaccataccagttaccagtaatatcagtcactatttaatcataataccttaacaatgcataa 43247611  T
Q  256 gaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 288  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43247610 gaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 43247578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 6 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 41192130 - 41191973
Alignment:
Q  6 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattattactac 105  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||  || ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| | |||||||    
T  41192130 aattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattagtcctctaagtaaaaattgatttatttcggtcatctaagtttctcactgttactac 41192031  T
Q  106 atttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggt 163  Q
    ||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  41192030 atttagtcttttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 41191973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 6 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 41453450 - 41453293
Alignment:
Q  6 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattattactac 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||| || ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||   |||||||    
T  41453450 aattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcgatcctctaagtttctcaccgttactac 41453351  T
Q  106 atttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggt 163  Q
    ||||  || ||||||||||||||||||||||||| ||||   ||||||||||||||||    
T  41453350 atttagtcatttctgttagttttattcaaataaatgttagggtttgtgttatgtgggt 41453293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 31638393 - 31638233
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||| || ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||  ||    
T  31638393 ggctaaattacctttttggttctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctttaaatttctcatcgtt 31638294  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgg 161  Q
    |||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||   ||||||| ||||||    
T  31638293 actacatttagtcctttctattagttttattcaaataaacgttatggtttgtgtcatgtgg 31638233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Original strand, 8542499 - 8542661
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    |||| |||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||| | |||| || |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||   ||    
T  8542499 ggctaaattacctttttcgtcttctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcagtcctctaagtttctcaccgtt 8542598  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggt 163  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||| |||||||    
T  8542599 actacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgtcagagtttgtgttgtgtgggt 8542661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 129
Target Start/End: Original strand, 4155598 - 4155726
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   ||    
T  4155598 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcggtttgatcctctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttatcaccgtt 4155697  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagtttta 129  Q
    |||| ||||  ||||||||||||||||||    
T  4155698 actatatttcgtcctttctgttagtttta 4155726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 148 - 288
Target Start/End: Original strand, 34037058 - 34037198
Alignment:
Q  148 tttgtgttatgtgggtatatgtcctcatgtttcacacatacatatgaaccataacagttaccaataatatcagtcattatttaatcataacaccttaaca 247  Q
    ||||||||||||| |||  || |||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  34037058 tttgtgttatgtgagtacctgacctcctgttttacacatacatatgaatcataacagttacaaataatatcagtcactatttaatcataataccttaaca 34037157  T
Q  248 aggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 288  Q
    |   ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  34037158 aaaaatatgaccaaaatgatattaataaataaagttagagg 34037198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 161
Target Start/End: Original strand, 41751650 - 41751810
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    |||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||  || |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |   ||    
T  41751650 ggctaaattatctttttggtcctttaactatttaattgatattggattagtcctctaactaaaaattgacttatttcggtcctctaagtttctaaccgtt 41751749  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgg 161  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||    
T  41751750 actacatttaatcctttttgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgg 41751810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 13 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 8937287 - 8937137
Alignment:
Q  13 tttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattattactacatttgat 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||   |||  || ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||  |    
T  8937287 tttttggtcctctaactatttaattagtatcagatttgtcctctaattaaaagttgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactacatttagt 8937188  T
Q  113 cctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggt 163  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  8937187 cctttctgttagttttattcaaataaacgttatggtttgtgttatgtgggt 8937137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 25 - 163
Target Start/End: Original strand, 17359205 - 17359343
Alignment:
Q  25 taactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattattactacatttgatcctttctgttag 124  Q
    |||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||||||  || ||||||||||    
T  17359205 taactatttaattggtattggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttactacatttagtcatttctgttag 17359304  T
Q  125 ttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggt 163  Q
    |||||||||||||||| |||   ||||||||||||||||    
T  17359305 ttttattcaaataaacattagggtttgtgttatgtgggt 17359343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 6 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 35147134 - 35146996
Alignment:
Q  6 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattattactac 105  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  || ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |   |||||||    
T  35147134 aattatctttttggtcctctaactatttaattggtattggattagtcctctaactaaaatttgatttatttcggtcctctaagtttcttaccgttactac 35147035  T
Q  106 atttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgtta 144  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  35147034 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaatgtta 35146996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 12 - 161
Target Start/End: Original strand, 7909297 - 7909446
Alignment:
Q  12 ctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattattactacatttga 111  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||   |||| |  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||   |||||||||||      
T  7909297 cttttttgtcctttaactatttaattggtatcagattggttttctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgttactacatttag 7909396  T
Q  112 tcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgg 161  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  7909397 tcctttctgttagttttattcaaataaacgttatagtttgtgttatgtgg 7909446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 23 - 163
Target Start/End: Original strand, 36423391 - 36423531
Alignment:
Q  23 tctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattattactacatttgatcctttctgtt 122  Q
    ||||||||||||||||| |||  |||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | || | || |||| | |||||||||    
T  36423391 tctaactatttaattggcattagattggtcctctaactaaaaattaatttattttggtcctctaagtttctcactgttgccacttttggttctttctgtt 36423490  T
Q  123 agttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggt 163  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  36423491 agttttattcaaataaacgttaggatttgtgttatgtgggt 36423531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 19681945 - 19681783
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   |||  || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||   ||    
T  19681945 ggctaaattacctttttggtcctctgactatttaattggtatcagattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgtt 19681846  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggt 163  Q
    |||||||||  || ||||| ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||||||||||    
T  19681845 actacatttagtcatttctcttagttttattcaaataaatgttagggtttgtgttatgtgggt 19681783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 20 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 7909597 - 7909460
Alignment:
Q  20 tcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattattactacatttgatcctttct 119  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||| || ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||   ||| |||||||  || |||||    
T  7909597 tcctctaactatttaattgatattggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcttctaagtttctcaccgttagtacatttagtcatttct 7909498  T
Q  120 gttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttat 157  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  7909497 gttagttttattcaaataaacgttaggatttgtgttat 7909460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 6 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 28286562 - 28286405
Alignment:
Q  6 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattattactac 105  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | |||  || | |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||   |||||||    
T  28286562 aattacatttttggtcctctaactttttaattggtatcggattagtcctttaactaaaaattgattgatttcggtcctctaagtttctcaccgttactac 28286463  T
Q  106 atttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggt 163  Q
    ||||  | |||| | |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  28286462 atttagttctttatattagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtgggt 28286405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 4 - 163
Target Start/End: Original strand, 6356289 - 6356447
Alignment:
Q  4 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattattact 103  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| | |   |||||    
T  6356289 ttaattacctttttggtcatctaactatttaattggtatcggattggtcctctaattaaaaattgatttatttcggtcctctaagttttttaccgttact 6356388  T
Q  104 acatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggt 163  Q
    ||||||  || ||| ||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||| |||||    
T  6356389 acatttagtcatttttgttagttttattcaaataaa-gttagattttgtgttatatgggt 6356447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Original strand, 16867707 - 16867840
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   |||| || |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| | | ||    
T  16867707 ggctaaattacctttttggtcctctaactatataattggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcagtcctctaagtttcttactgtt 16867806  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttattcaa 134  Q
    |||||||||  || ||||||||||||||||||||    
T  16867807 actacatttagtcatttctgttagttttattcaa 16867840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 22 - 163
Target Start/End: Original strand, 28297840 - 28297981
Alignment:
Q  22 ctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattattactacatttgatcctttctgt 121  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||| || |||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||   |||||| ||||  || |||||||    
T  28297840 ctctaactatttaattggtattagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcagttctctaagtttctcaccgttactatatttagtcatttctgt 28297939  T
Q  122 tagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggt 163  Q
    |||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  28297940 tagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 28297981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 6 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 34037356 - 34037199
Alignment:
Q  6 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattattactac 105  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   |||  || ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    ||||| |    
T  34037356 aattatctttttggtcctctaactatttaattggtatatgattagtcctctgactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatctccgttactgc 34037257  T
Q  106 atttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggt 163  Q
    ||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||    
T  34037256 atttagtcctttttgttagttttattcaaataaacgttagagtttatgttatgtgggt 34037199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 109
Target Start/End: Original strand, 8416485 - 8416593
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||| | ||    
T  8416485 ggctaaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcggattgatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcccttaagtttctcactgtt 8416584  T
Q  101 actacattt 109  Q
    |||||||||    
T  8416585 actacattt 8416593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 2 - 124
Target Start/End: Original strand, 36673976 - 36674098
Alignment:
Q  2 gcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatta 101  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| | |||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||   |||    
T  36673976 gcttaattacctttatggtcctctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgtta 36674075  T
Q  102 ctacatttgatcctttctgttag 124  Q
    ||||||||  |||||||||||||    
T  36674076 ctacatttagtcctttctgttag 36674098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 144
Target Start/End: Original strand, 41891966 - 41892109
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||| || ||||||||||||||||||| ||| |||||  ||||||||| | | ||    
T  41891966 ggctaaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttctttcggtcccttaagtttcttaatgtt 41892065  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgtta 144  Q
    |||||||||  ||||||||||||  |||||| ||| ||||||||    
T  41892066 actacatttagtcctttctgttaaatttatttaaaaaaacgtta 41892109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 25 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 27739090 - 27738953
Alignment:
Q  25 taactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattattactacatttgatcctttctgttag 124  Q
    |||||||||| |||||||   |||||||  |||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||   |||||| |||| ||| ||||||||||    
T  27739090 taactatttatttggtatcagattgatcccctaactaaaaattgatttatttcggtccttttagtttctcaccgttactatatttaatc-tttctgttag 27738992  T
Q  125 ttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggt 163  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  27738991 ttttattcaaataaacgttaaggtttgtgttatgtgggt 27738953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 6 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 7579317 - 7579160
Alignment:
Q  6 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattattactac 105  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| | |||  || ||||||||||||||||||||||| | || ||||| |||||||   |||||||    
T  7579317 aattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcgatcatctaattttctcaccgttactac 7579218  T
Q  106 atttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggt 163  Q
    ||||  |||||| | |||||| |||||||||||||||||   ||| ||||||||||||    
T  7579217 atttagtcctttattttagttatattcaaataaacgttatggtttttgttatgtgggt 7579160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 13 - 140
Target Start/End: Original strand, 43247427 - 43247555
Alignment:
Q  13 tttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattattactacatttgat 112  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||| | |||| || ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||   |||||||||||  |    
T  43247427 ttttttgtcctctaactatttaattgatatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcgatcctctaagtttctcaccgttactacatttact 43247526  T
Q  113 -cctttctgttagttttattcaaataaac 140  Q
     ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  43247527 ccctttctattagttttattcaaataaac 43247555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 29277793 - 29277671
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |  ||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||| | ||    
T  29277793 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttatttggtaacggtttggtcctctaactaaaaaatgatttattttggtcctctaactttatcactgtt 29277694  T
Q  101 actacatttgatcctttctgtta 123  Q
    || | ||||  ||||||||||||    
T  29277693 accatatttcgtcctttctgtta 29277671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 8417386 - 8417292
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctca 95  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   |||| || | |||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||    
T  8417386 ggctaaattatctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattggtcctttaactaaaaattaatttattttggtcccttaagtttctca 8417292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 123
Target Start/End: Original strand, 36282786 - 36282908
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    |||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||   |||| || | ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||   ||    
T  36282786 ggctaaattacatttttagtcctctaactatttaattggtatcagattggtcctttaactaaaaattgatttatttcggtcccttaagtttctcaccgtt 36282885  T
Q  101 actacatttgatcctttctgtta 123  Q
    |||||||||| || |||| ||||    
T  36282886 actacatttggtcttttccgtta 36282908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 74 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 40673382 - 40673293
Alignment:
Q  74 ttttggtcctctaagtttctcattattactacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggt 163  Q
    ||||||||||||||||||||||   |||||| ||||  || ||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  40673382 ttttggtcctctaagtttctcaccgttactatatttagtcatttatgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtgggt 40673293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 3 - 87
Target Start/End: Original strand, 29276877 - 29276961
Alignment:
Q  3 cttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaa 87  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |  ||| || ||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  29276877 cttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtaacggtttggtcctctaattaaaaaatgatttattttggtcctctaa 29276961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 11 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 28264728 - 28264595
Alignment:
Q  11 cctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattattactacatttg 110  Q
    ||||||| ||||  ||||||||||||| ||||  | ||| || | ||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||  | ||||||| |||     
T  28264728 cctttttagtccattaactatttaattagtatcaatttggtcttttaactaaaatttgatttattttggtcccttaagtttctctatgttactactttta 28264629  T
Q  111 atcctttctgttagttttattcaaataaacgtta 144  Q
    ||||||||  ||||||||||| ||| ||||||||    
T  28264628 atcctttccattagttttatttaaaaaaacgtta 28264595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 6 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 36283651 - 36283547
Alignment:
Q  6 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaatt-gatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattattacta 104  Q
    |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | ||| |||| |||||||||||||||||||||||  ||||  ||| ||||||| | ||||||    
T  36283651 aattacattttttgttctctaactatttaattggtatcggatttgatcctctaactaaaaattgatttatttccgtcccttaaatttctcactgttacta 36283552  T
Q  105 cattt 109  Q
    |||||    
T  36283551 cattt 36283547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 36423850 - 36423790
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaacta 61  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  || ||||||||    
T  36423850 ggctaaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattggatttgtcctctaacta 36423790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 36674179 - 36674095
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaa 87  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |  ||  ||   ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  36674179 ggctaaattacctttttggtcctctgactatttaattggtatcgggttagtc--ttaactaaaaattgatttatttcggtcctctaa 36674095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 4 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 38447778 - 38447689
Alignment:
Q  4 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcatt 97  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||     | |||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||    
T  38447778 ttaattatctttttggtcctctaactatttaattgatattagattgatc----cattaaaaattgatttatttcagtcccttaagtttctcatt 38447689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 54 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 32946738 - 32946669
Alignment:
Q  54 tctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattattactacatttgatcctttctgtta 123  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||| ||| | ||| |||||||  ||||||||||||    
T  32946738 tctaactaaaaattgatttatttcggttttctaagtttttcactgttagtacatttagtcctttctgtta 32946669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 13 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 41893513 - 41893450
Alignment:
Q  13 tttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattt 76  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||  ||| | |||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  41893513 ttttttgtcctttaactatttaattaatatcggattggtcatctaactaaaaatttatttattt 41893450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 12 - 82
Target Start/End: Original strand, 43050395 - 43050465
Alignment:
Q  12 ctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcc 82  Q
    |||||||||||  |||||||||||||  |||||  ||| ||  |||| |||||||||||||||||||||||    
T  43050395 ctttttggtcccttaactatttaattaatattggtttggtcccctaattaaaaattgatttattttggtcc 43050465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 204; Significance: 1e-111; HSPs: 86)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 38339942 - 38339655
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| || | ||    
T  38339942 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcggattgatcctctaactaaaaattgatttatttcgatcctctaagtttcacactgtt 38339843  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggtatatgtcctcatgtttcacacatacatatgaaccata 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||  || |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  38339842 actacatttaatcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtggatacctgacctcctgtttcacacatacatatgaaccata 38339743  T
Q  201 acagttaccaataatatcagtcattatttaatcataacaccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 288  Q
    |||||||||||||||||  |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38339742 acagttaccaataatatgtgtcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 38339655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 14985781 - 14985494
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||    
T  14985781 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaatttgtatcagattggtcatctaactaaaaattgatttattttgatcctctaagtttctcactgtt 14985682  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggtatatgtcctcatgtttcacacatacatatgaaccata 200  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||  || |||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  14985681 actacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtacctgacctcctgtttcacacatacatatgagccata 14985582  T
Q  201 acagttaccaataatatcagtcattatttaatcataacaccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 288  Q
    | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14985581 agagttaccaataatatcagtcactatttaatcataatactttaacaaggcataggaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 14985494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 288
Target Start/End: Original strand, 44991279 - 44991565
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   ||    
T  44991279 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 44991378  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggtatatgtcctcatgtttcacacatacatatgaaccata 200  Q
    |||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||  || |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  44991379 actacatttagtcatttctgttagttttattcaaataaatgttagggtttgtgttatgtgggtacctgacctc-tgtttcacacatacatatgaaccata 44991477  T
Q  201 acagttaccaataatatcagtcattatttaatcataacaccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 288  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44991478 acagttaccaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaggcataagaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 44991565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 3 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 50769269 - 50768984
Alignment:
Q  3 cttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattattac 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||   ||||    
T  50769269 cttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcggattgatcctctaactaaaaattgatttatttcgatcctctaagtttctcaccgttac 50769170  T
Q  103 tacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggtatatgtcctcatgtttcacacatacatatgaaccataac 202  Q
    |||||||  || ||||| ||||||||||||||||||||||||   ||| ||||||||| |||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  50769169 tacatttagtcatttcttttagttttattcaaataaacgttagggtttttgttatgtgtgtatctgacctcctgtttcacacatacatatgaaccataac 50769070  T
Q  203 agttaccaataatatcagtcattatttaatcataacaccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 288  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50769069 agttaccaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaggcataagaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 50768984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 24898639 - 24898352
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   ||    
T  24898639 ggcttaattactttttttgtcctctaactatttaattggtattggattggtcctctaactaaaaattgatttattttgatcctctaagtttctcaccgtt 24898540  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggtatatgtcctcatgtttcacacatacatatgaaccata 200  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||| | || |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24898539 actacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtgtctgacctcctgtttcacacatacatatgaaccata 24898440  T
Q  201 acagttaccaataatatcagtcattatttaatcataacaccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 288  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| || |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24898439 acagttaccaataatattagtcactatttaatcataatacattaacaagacatgtgaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 24898352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 288
Target Start/End: Original strand, 33091453 - 33091740
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||  |||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||    
T  33091453 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaatcagtattagattggtcctctaactaaaaattgatttattttgatcctctaagtttctcaccatt 33091552  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggtatatgtcctcatgtttcacacatacatatgaaccata 200  Q
    ||| |||||  || |||||||||||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  33091553 actgcatttagtcttttctgttagttttattcaaataaacattagggtttgtgttatgtgggtacatgacctcctgtttcacacatacatatgaaccata 33091652  T
Q  201 acagttaccaataatatcagtcattatttaatcataacaccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 288  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33091653 acagttaccaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaagcataggaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 33091740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 2 - 288
Target Start/End: Original strand, 1433272 - 1433558
Alignment:
Q  2 gcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatta 101  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||    
T  1433272 gcttaattatctttttggtcctctaactatttcattggtattggattggtcctctaactaaaaattgatttattttggttctctaagtttctcatcgtta 1433371  T
Q  102 ctacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggtatatgtcctcatgtttcacacatacatatgaaccataa 201  Q
     |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| |||| || |||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  1433372 ttacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgagtatctgacctcttatttcacacatacatatgaaccataa 1433471  T
Q  202 cagttaccaataatatcagtcattatttaatcataacaccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 288  Q
     ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1433472 tagttaccaataatatcagtcactatttaatcataataccataacaaggcataagaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 1433558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 2 - 288
Target Start/End: Original strand, 53750903 - 53751189
Alignment:
Q  2 gcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatta 101  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| | |||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||    
T  53750903 gcttaattacctttttagtcctctaactattaaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgtta 53751002  T
Q  102 ctacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggtatatgtcctcatgtttcacacatacatatgaaccataa 201  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  53751003 ctacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtaggtatctgacctcctgtttcacacatacatatgaatcataa 53751102  T
Q  202 cagttaccaataatatcagtcattatttaatcataacaccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 288  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  53751103 cagttaccaataatataagtcactatttaatcataataccttaacaaggcataagaccaaaattatactaataaataaagttagagg 53751189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 288
Target Start/End: Original strand, 15477645 - 15477932
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| || |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||  ||    
T  15477645 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaacattgatttatttcggtcctctaagtttctcatcgtt 15477744  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggtatatgtcctcatgtttcacacatacatatgaaccata 200  Q
    |||||||||  ||| |||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||  || |||  ||||||| ||||||||||||||||||    
T  15477745 actacatttagtccattctgttagttttattaaaataaacgttagtgtttgtgttatgtgggtacctgaccttctgtttcatacatacatatgaaccata 15477844  T
Q  201 acagttaccaataatatcagtcattatttaatcataacaccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 288  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15477845 acagttaccaataatatgagtcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaacaaagttagagg 15477932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 6712411 - 6712126
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| ||| | ||    
T  6712411 ggcttaattacctttttggtc-tctaactatttaattggtaatggattgatcctctaactacaaattgatttatttcggtcctctaaattt-tcactgtt 6712314  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggtatatgtcctcatgtttcacacatacatatgaaccata 200  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  6712313 actacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttaggatttgtgttatgtgggtatctgacctcctgtttcacacatacatatgaaccata 6712214  T
Q  201 acagttaccaataatatcagtcattatttaatcataacaccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 288  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6712213 acatttaccaataatatcagtcactatttaatcataatatcttaataaggcacaggaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 6712126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 5 - 288
Target Start/End: Original strand, 42855343 - 42855626
Alignment:
Q  5 taattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattattacta 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | | || || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   ||||||    
T  42855343 taattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcggagtggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttacta 42855442  T
Q  105 catttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggtatatgtcctcatgtttcacacatacatatgaaccataacag 204  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  42855443 catttagtcctttctgttagttttattcaaataaaggttagggtttgtgttatgtgggtatctgacctcctgtttcacacatatatatgaaccacaacag 42855542  T
Q  205 ttaccaataatatcagtcattatttaatcataacaccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 288  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42855543 ttaccaataatatcagtcattatttaatcataataccttaacgaggaataggaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 42855626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 287
Target Start/End: Original strand, 6505537 - 6505822
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||| | |||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||    
T  6505537 ggcttaattacatttttgatcctctaactatttaattgatatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgtt 6505636  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggtatatgtcctcatgtttcacacatacatatgaaccata 200  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||  || | || ||||||||||||||||||||||||||    
T  6505637 actacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaa-gttagggtttgtgttatgtgggtacctgacttcctgtttcacacatacatatgaaccata 6505735  T
Q  201 acagttaccaataatatcagtcattatttaatcataacaccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagag 287  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6505736 acagttaccaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaggcataggaccaaaatgatactaataaataaaattagag 6505822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 181; E-Value: 8e-98
Query Start/End: Original strand, 4 - 288
Target Start/End: Original strand, 43734289 - 43734573
Alignment:
Q  4 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattattact 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||| || ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| | |||||    
T  43734289 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattggtcctctaactaaaaatagatttatttcggtcctctaagtttctcactgttact 43734388  T
Q  104 acatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggtatatgtcctcatgtttcacacatacatatgaaccataaca 203  Q
    ||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||  ||| | |||||||||||||||| ||||||||||    
T  43734389 acatttagtcctttatgttagttttattcaaataaacgttaggatttgtgttatgtgggtatctgatctcctatttcacacatacatataaaccataaca 43734488  T
Q  204 gttaccaataatatcagtcattatttaatcataacaccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 288  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43734489 gttacaaataatatcagtcactatttaatcataatattttaacaaggcataagaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 43734573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 8592419 - 8592132
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| | |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||    
T  8592419 ggcttaattacatttttggtcctctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcaccgtt 8592320  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggtatatgtcctcatgtttcacacatacatatgaaccata 200  Q
    |||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||   |||||||||| ||||||  || |||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  8592319 actacatttagtcctttctgtttgttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatatgggtacctgacctcctatttcacacatacatatgaaccata 8592220  T
Q  201 acagttaccaataatatcagtcattatttaatcataacaccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 288  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  8592219 acagttaccaataatatccgtcactatttaatcataataccttaacaaggaataggaccaaaatgatgctaataaataaagttagagg 8592132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 288
Target Start/End: Original strand, 23755418 - 23755705
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    |||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||| ||  ||    
T  23755418 ggcttaattaacttattcgtcctctaactatttaattggtattggattggtcctctaactaaaaattaatttatttcggttctctaagtttcttatcgtt 23755517  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggtatatgtcctcatgtttcacacatacatatgaaccata 200  Q
    |||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||  || |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  23755518 actacatttagtcctttatgttagttttattcaaataaacgttaaagtttgtgttacgtggctacctgacctcctgtttcacacatacatatgaaccata 23755617  T
Q  201 acagttaccaataatatcagtcattatttaatcataacaccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 288  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23755618 acaattaccaataatatcagtcactatttaatcataatacattaacaaagcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 23755705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 3 - 288
Target Start/End: Original strand, 36122435 - 36122720
Alignment:
Q  3 cttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattattac 102  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   |||| || |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| | ||||    
T  36122435 cttaattacctttttggtcctctgactatttaattggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttttgtcatctaagtttttcactgttac 36122534  T
Q  103 tacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggtatatgtcctcatgtttcacacatacatatgaaccataac 202  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||  ||  ||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  36122535 tacatttaatcctttatgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtgggtacctgatctcctgtttcacacatacatatgaaccatatc 36122634  T
Q  203 agttaccaataatatcagtcattatttaatcataacaccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 288  Q
    || |||||||||||||| ||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  36122635 agctaccaataatatcaatcactatttagtcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaatatagttagagg 36122720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 3 - 288
Target Start/End: Original strand, 52557089 - 52557374
Alignment:
Q  3 cttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattattac 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| | | ||||    
T  52557089 cttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcgaattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctataagtttcttactgttac 52557188  T
Q  103 tacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggtatatgtcctcatgtttcacacatacatatgaaccataac 202  Q
    |||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||  || ||   ||||||| |||||||||||||  |||||    
T  52557189 tacatttagtcttttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtgggtacttgaccgtctgtttcagacatacatatgaattataac 52557288  T
Q  203 agttaccaataatatcagtcattatttaatcataacaccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 288  Q
    | ||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52557289 aattaccaataatatcagttactatttaatcataataccttaacaagacatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 52557374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 4 - 288
Target Start/End: Original strand, 19088344 - 19088628
Alignment:
Q  4 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattattact 103  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| | | ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   |   |||||    
T  19088344 ttaattatctttttggtcctctaactatttagttggtatcggaatgatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttaataccgttact 19088443  T
Q  104 acatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggtatatgtcctcatgtttcacacatacatatgaaccataaca 203  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||  || |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19088444 acatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtacctgacctcctgtttcacacatacatatgaaccataaca 19088543  T
Q  204 gttaccaataatatcagtcattatttaatcataacaccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 288  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19088544 gttaccaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaggaataagatcaaaatgatactaataaataaagttagagg 19088628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 288
Target Start/End: Original strand, 16037794 - 16038081
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||   |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  16037794 ggcttaattacatttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcactgtt 16037893  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggtatatgtcctcatgtttcacacatacatatgaaccata 200  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||  |  |||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  16037894 actacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatatgggtacctaacctcctatttcacacatacatatgaaccata 16037993  T
Q  201 acagttaccaataatatcagtcattatttaatcataacaccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 288  Q
    ||| |||||||||||||| |||| || |||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16037994 acaattaccaataatatccgtcactacttaatcataataccttaacaaggaataggaccaaaatgatgctaataaataaagttagagg 16038081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 3 - 288
Target Start/End: Original strand, 39448490 - 39448775
Alignment:
Q  3 cttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattattac 102  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||   ||||    
T  39448490 cttaattatctgtttggtcctctaactatttaattggtatcgaattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctttaagtttctcaccgttac 39448589  T
Q  103 tacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggtatatgtcctcatgtttcacacatacatatgaaccataac 202  Q
    |||||||  |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| | |||||||||||||||||| || | || |||||||||||||||||||||||||||     
T  39448590 tacatttagtcctttttgttagttttatttaaataagcgttagagtttgtgttatgtgggtatctgacatcttgtttcacacatacatatgaaccataag 39448689  T
Q  203 agttaccaataatatcagtcattatttaatcataacaccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 288  Q
    |||||||||||||||  |||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  39448690 agttaccaataatatttgtcactatttaatcataataccttaacaaggcataagaccaaaatgatgctaataaataaagttagagg 39448775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 2 - 288
Target Start/End: Original strand, 30683527 - 30683815
Alignment:
Q  2 gcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatta 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   |||    
T  30683527 gcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattgatcctccaattaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtta 30683626  T
Q  102 ctacatttgatcctttctgttagtttt-attcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtg-ggtatatgtcctcatgtttcacacatacatatgaaccat 199  Q
    ||||||||  || |||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||  ||  ||  |||||||||||||||||||||||||    
T  30683627 ctacatttagtcatttctgttagtttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtgaggtacctgatcttctgtttcacacatacatatgaaccat 30683726  T
Q  200 aacagttaccaataatatcagtcattatttaatcataacaccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 288  Q
    ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30683727 aacagttgccaataatataagtcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 30683815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 288
Target Start/End: Original strand, 46849669 - 46849956
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||   |||| || ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| | ||    
T  46849669 ggcttaattacctttttcgtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcgatcctctaagtttctcactgtt 46849768  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggtatatgtcctcatgtttcacacatacatatgaaccata 200  Q
    |||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||  ||  | | ||||||||||||||||||||||||||    
T  46849769 actatatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtacctgaacccctgtttcacacatacatatgaaccata 46849868  T
Q  201 acagttaccaataatatcagtcattatttaatcataacaccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 288  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| | |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46849869 acagttaccaataatatcggtcactatttaatcataatatcttaacaaggaataagaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 46849956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 288
Target Start/End: Original strand, 53994934 - 53995221
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||| || | ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||   ||    
T  53994934 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctttaactaaaaattgatttatttcggtcctttaagtttctcaccgtt 53995033  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggtatatgtcctcatgtttcacacatacatatgaaccata 200  Q
    |||||||||  || ||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||  || |||  | ||||||||||||||||||||||||    
T  53995034 actacatttagtcttttctattagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtgggtacttgaccttctatttcacacatacatatgaaccata 53995133  T
Q  201 acagttaccaataatatcagtcattatttaatcataacaccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 288  Q
     |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  53995134 tcagttaccaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaggaataggaccaaaatgatattaataaataaagttagagg 53995221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 12818256 - 12817973
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| | |||| |  ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  12818256 ggcttacttatctttttggtcctctaattatttaattggtatcggattggtgctctaactaaaacttgatttatttcggtcctctaagtttctcattgtt 12818157  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggtatatgtcctcatgtttcacacatacatatgaaccata 200  Q
    |||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||| | || |||  | ||||||||||| ||||||||||||    
T  12818156 actacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtctctgaccttctctttcacacatatatatgaaccata 12818057  T
Q  201 acagttaccaataatatcagtcattatttaatcataacaccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagtta 284  Q
    ||| ||| |||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12818056 acatttaacaataatatccgtcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactgataaataaagtta 12817973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 288
Target Start/End: Original strand, 41877860 - 41878146
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| |||||| |||||||   |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| | ||    
T  41877860 ggcttagttacctttttggtcatctaattatttagttggtatcagattggtcatctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtt-ctcactgtt 41877958  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggtatatgtcctcatgtttcacacatacatatgaaccata 200  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||| ||||  || | || ||||||||||||||||||||||||||    
T  41877959 actacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaatgttagggtttgtgttatgtaggtacctgacatcctgtttcacacatacatatgaaccata 41878058  T
Q  201 acagttaccaataatatcagtcattatttaatcataacaccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 288  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  41878059 acagttaccaataatatcagtcaatatttaatcataataccttaacaaataatatgaccaaaatgatactaataaataaagttggagg 41878146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 3 - 288
Target Start/End: Original strand, 43566380 - 43566665
Alignment:
Q  3 cttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattattac 102  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||   |||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   ||||    
T  43566380 cttaattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttac 43566479  T
Q  103 tacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggtatatgtcctcatgtttcacacatacatatgaaccataac 202  Q
    |||| ||  || ||||| ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||  || |||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  43566480 tacaattagtcatttctattagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtggctacttgacctcctgtttcacacatatatatgaaccataac 43566579  T
Q  203 agttaccaataatatcagtcattatttaatcataacaccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 288  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  43566580 agttaccaataatatcaatcactatttaatcataataccttaacaagacataggaccaaaatgatactaataaataaagtttgagg 43566665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 288
Target Start/End: Original strand, 19508413 - 19508700
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| | |||| || ||||||||| ||||||||||| | || ||||||||||||||| | |     
T  19508413 ggcttaattac-tttttgatcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaacaattgatttatgtcggccctctaagtttctcactgtg 19508511  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaa-tttgtgttatgtgggtatatgtcctcatgtttcacacatacatatgaaccat 199  Q
    |||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||  || |||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  19508512 actacatttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttaggggtttgtgttatgtgggtacctgacctcctgtttcacacatacatgtgaaccat 19508611  T
Q  200 aacagttaccaataatatcagtcattatttaatcataacaccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 288  Q
    ||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19508612 aacagttactaataatatcagtcactgtttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatcatactaataaataaagttagagg 19508700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 288
Target Start/End: Original strand, 25181812 - 25182099
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||| | |||| || | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||    
T  25181812 ggcttaattacatttttggtcctctaactatttagtttgtatcggattggtcctttaactaaaaattgatttattttggtcttctaagtttctcactgtt 25181911  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggtatatgtcctcatgtttcacacatacatatgaaccata 200  Q
    | |||||||  || ||||||||||||||||||||||||| ||||   |||||||||| ||||||| || |||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  25181912 attacatttagtcatttctgttagttttattcaaataaatgttagggtttgtgttatatgggtatctgacctcctatttcacacatacatatgaaccata 25182011  T
Q  201 acagttaccaataatatcagtcattatttaatcataacaccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 288  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| | |||||||||| ||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  25182012 acagttaccaataatatccgtcactatttaatcataatatcttaacaaggaataggaccaaaatgatgttaataaataaagttagagg 25182099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 288
Target Start/End: Original strand, 623679 - 623966
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    ||||||||||  ||||||||||| |||||||||| ||||||| | |||| || ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |   ||    
T  623679 ggcttaattatatttttggtcctttaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgttttattttggtcctataagtttcttaccgtt 623778  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggtatatgtcctcatgtttcacacatacatatgaaccata 200  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||| ||||||  || |||| | ||||||||||| ||||||||||||    
T  623779 actacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaggtttatgttatatgggtacctgacctcctatttcacacatatatatgaaccata 623878  T
Q  201 acagttaccaataatatcagtcattatttaatcataacaccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 288  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| | |||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  623879 acagttaccaataatatctgtcactatttaatcataatatcttaacaaggaataagaccaaaatgatgctaataaataaagttagagg 623966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 288
Target Start/End: Original strand, 37206428 - 37206714
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||| | ||| |||   ||| ||| ||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| | ||    
T  37206428 ggcttaattacctttt-gatcctctaactattcagttgatatcagattaatcctctagttaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcactgtt 37206526  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggtatatgtcctcatgtttcacacatacatatgaaccata 200  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||  || |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  37206527 actacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtggatacctgacctcctgtttcacacatacatatgaaccata 37206626  T
Q  201 acagttaccaataatatcagtcattatttaatcataacaccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 288  Q
    | |||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37206627 aaagttaccaataatatcagccactatttaatcataataccttaacaaagaatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 37206714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 288
Target Start/End: Original strand, 41751818 - 41752103
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| | |||| || |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| | ||    
T  41751818 ggcttaattacctttttg-tcctttaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttattttggtctt-taagtttctcactgtt 41751915  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggtatatgtcctcatgtttcacacatacatatgaaccata 200  Q
    |||||||||  || || |||||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||  || | || ||||||||| ||||||||||| ||||    
T  41751916 actacatttagtctttactgttagttttattcaaataaatgttagggtttgtgttatgtgggtacctgacatcctgtttcacaaatacatatgaatcata 41752015  T
Q  201 acagttaccaataatatcagtcattatttaatcataacaccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 288  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  41752016 acagttaccaataatatcagtcactatttaatcataataccttagcaaggcatatgatcaaaatgatattaataaataaaattagagg 41752103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 288
Target Start/End: Original strand, 21763180 - 21763468
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| | |||| || || |||||||||||||||||||| ||||||| | |||| |||   ||    
T  21763180 ggcttaattatctttttggtcctctaattatttaattggtatcggattggtcctccaactaaaaattgatttatttcggtcctccaggtttttcaccgtt 21763279  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagtttt-attcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggtatatgtcctcatgtttcacacatacatatgaaccat 199  Q
    |||||||||  || |||||||| ||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||  || |||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  21763280 actacatttagtcatttctgtttgtttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtgggtacctgacctcctgtttcacacatagatatgaaccat 21763379  T
Q  200 aacagttaccaataatatcagtcattatttaatcataacaccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 288  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||  |||  | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21763380 aacagttaccaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaagaaataaaaacaaaatgatactaataaataaagttagagg 21763468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 54 - 288
Target Start/End: Original strand, 53259191 - 53259425
Alignment:
Q  54 tctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattattactacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtg 153  Q
    |||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||| | |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||    
T  53259191 tctaactaaaaattaattaatttcggtcctctaagtttctcactgttactacatttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtg 53259290  T
Q  154 ttatgtgggtatatgtcctcatgtttcacacatacatatgaaccataacagttaccaataatatcagtcattatttaatcataacaccttaacaaggcat 253  Q
    |||||||||||  || |||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  53259291 ttatgtgggtacctgacctcctgtttcacacatacatatgaaccataataattaccaataatatcactcattgtttaatcataataccttaacaaggcat 53259390  T
Q  254 atgaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 288  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53259391 aagaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 53259425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 56 - 288
Target Start/End: Original strand, 50508512 - 50508744
Alignment:
Q  56 taactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattattactacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgtt 155  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||   |||||||||||  || ||| ||||||||||||||||||||||||||   ||||||||    
T  50508512 taactaaaaattgatttatttcggtcctttaagtttctcaccgttactacatttagtcatttttgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgtt 50508611  T
Q  156 atgtgggtatatgtcctcatgtttcacacatacatatgaaccataacagttaccaataatatcagtcattatttaatcataacaccttaacaaggcatat 255  Q
    |||| ||||  || |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  50508612 atgtaggtacctgacctcctgtttcgcacatacatatgaaccataacagttaccaataatattagtcactatttaatcataataccttaacaaggcatat 50508711  T
Q  256 gaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 288  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  50508712 gaccaaaataatactaataaataaagttagagg 50508744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 8398031 - 8398264
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||| || ||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||| ||    
T  8398031 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcgatcctctaactttctcattgtt 8398130  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggtatatgtcctcatgtttcacacatacatatgaaccata 200  Q
    |||||||||  || ||||| ||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||  || |||| |||| ||||||||||||| |||||||    
T  8398131 actacatttagtcatttctattagttttattcaaataaatgttagggtttgtgttatgtgggta-ctgacctcctgttccacacatacatataaaccata 8398229  T
Q  201 acagttaccaataatatcagtcattatttaatcat 235  Q
    | ||||| ||||||||||||||| |||||| ||||    
T  8398230 atagttatcaataatatcagtcactatttagtcat 8398264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 25269450 - 25269307
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||    
T  25269450 ggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattgatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgtt 25269351  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgtta 144  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25269350 actacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgtta 25269307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Original strand, 14985331 - 14985493
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||    
T  14985331 ggctaaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccatt 14985430  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggt 163  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||||||||    
T  14985431 actacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggttcgtgttatgtgggt 14985493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 21763631 - 21763469
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   |||  || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||    
T  21763631 ggctaaattacatttttggtcctctaactatttaattggtataagattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgtt 21763532  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggt 163  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  21763531 actacatttaatcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtgggt 21763469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 53751352 - 53751190
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||    
T  53751352 ggctaaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgtt 53751253  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggt 163  Q
    |||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  53751252 actacatttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttatgatttgtgttatgtgggt 53751190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 624129 - 623969
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| | |||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  624129 ggctaaattacatttttggtcctctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcattgtt 624030  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgg 161  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||    
T  624029 actacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaatgttagagtttgtgttatgtgg 623969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 6 - 160
Target Start/End: Original strand, 24898194 - 24898348
Alignment:
Q  6 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattattactac 105  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||    
T  24898194 aattacatttttggtcctctaactatttaattggtatcggattgatcctctaattaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttactac 24898293  T
Q  106 atttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtg 160  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  24898294 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtg 24898348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 39448938 - 39448776
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   ||    
T  39448938 ggctaaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcggattgatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 39448839  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggt 163  Q
    |||||||||  || ||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||    
T  39448838 actacatttagtcatttttgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatctgggt 39448776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 161
Target Start/End: Original strand, 50768821 - 50768981
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   ||    
T  50768821 ggcttaattacctttttgatcctttaactatttaattggtatcgaattggtcatctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 50768920  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgg 161  Q
    |||||||||  | |||||| ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||    
T  50768921 actacatttagtactttctattagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgg 50768981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 1433721 - 1433559
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||    
T  1433721 ggctaaattacatttttggtcctctaactatttaattggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttattttggtcctctaattttctcactgtt 1433622  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggt 163  Q
    |||||||||  || ||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  1433621 actacatttagtcttttctattagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtgggt 1433559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Original strand, 8591969 - 8592131
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| | |||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   ||    
T  8591969 ggctaaattacctttttagtcctctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 8592068  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggt 163  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  8592069 actacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 8592131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 19088791 - 19088629
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||    
T  19088791 ggctaaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgtt 19088692  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggt 163  Q
    |||| ||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  19088691 actatatttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 19088629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 14 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 41752253 - 41752104
Alignment:
Q  14 ttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattattactacatttgatc 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |  ||    
T  41752253 ttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattcatttattttggtcctctaagtttctcactgttactacatgtagtc 41752154  T
Q  114 ctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggt 163  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  41752153 ctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 41752104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 6 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 52557532 - 52557377
Alignment:
Q  6 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattattactac 105  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||    
T  52557532 aattatctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattggtcttctaactaaaaattgatttattttggtcctctaaatttctcaccgttactac 52557433  T
Q  106 atttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgg 161  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||    
T  52557432 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgg 52557377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 144
Target Start/End: Original strand, 55022284 - 55022426
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| | ||    
T  55022284 ggctaaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattgatcctctaactaaaaattgatttatttcgatcctctaagtttctcactgtt 55022383  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgtta 144  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  55022384 actacattt-atcctttctgttagttttattaaaataaacgtta 55022426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Original strand, 12817806 - 12817968
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||| || ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| | ||    
T  12817806 ggctaaattacctttttggttctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctttaagtttatcactgtt 12817905  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggt 163  Q
    |||||||||   ||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  12817906 actacatttagccctttctattagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtgggt 12817968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 15478095 - 15477933
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||| || |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||   ||    
T  15478095 ggctaaattacctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgattaatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 15477996  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggt 163  Q
    |||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||    
T  15477995 actacatttagtcttttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttacgtgggt 15477933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 16038244 - 16038082
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   ||    
T  16038244 ggctaaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 16038145  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggt 163  Q
    |||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  16038144 actacatttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 16038082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 13 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 43734724 - 43734574
Alignment:
Q  13 tttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattattactacatttgat 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||   |||| || ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||   ||| |||||||  |    
T  43734724 tttttggtcctctaactatttaattggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctataagtttctcaccgttattacatttagt 43734625  T
Q  113 cctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggt 163  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  43734624 cctttctgttagttttattcaaataaacgttaagatttgtgttatgtgggt 43734574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 6 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 53259583 - 53259429
Alignment:
Q  6 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattattactac 105  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||    
T  53259583 aattatctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattgatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttactac 53259484  T
Q  106 atttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtg 160  Q
    ||||  || ||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||    
T  53259483 atttagtcatttctgttagttttattcaaatacacgttagagtttgtgttatgtg 53259429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 179 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 44957661 - 44957552
Alignment:
Q  179 tcacacatacatatgaaccataacagttaccaataatatcagtcattatttaatcataacaccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaata 278  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44957661 tcacacatacatatgaaccataacagttaccaataatatcagtcactatttaatcataatacattatcaaggcatatgaccaaaatgatactaataaata 44957562  T
Q  279 aagttagagg 288  Q
    ||||||||||    
T  44957561 aagttagagg 44957552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 25182262 - 25182100
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    |||| ||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||   ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   ||    
T  25182262 ggctaaattatctttttggtcttctaactatttagttggtatcagattgatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 25182163  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggt 163  Q
    |||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||    
T  25182162 actacatttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgtttgagtttgtgttatgtgggt 25182100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Original strand, 38339492 - 38339654
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   |||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   ||    
T  38339492 ggctgaattacctttttggtcctctaactatttaactggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttaggtcctctaagtttctcaccgtt 38339591  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggt 163  Q
     ||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  38339592 gctacatttagtcctttcggttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 38339654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 44991728 - 44991566
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||    
T  44991728 ggctaaattatctttttggtcctctaactatttaattggtatcggattgatcctctaactgaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgtt 44991629  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggt 163  Q
    | |||||||  || ||| |||||||||| |||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  44991628 attacatttagtcttttttgttagttttgttcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 44991566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 13 - 161
Target Start/End: Original strand, 44957401 - 44957549
Alignment:
Q  13 tttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattattactacatttgat 112  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| | |||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| |||||  |    
T  44957401 tttttggtcctctaactattttattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactgcatttagt 44957500  T
Q  113 cctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgg 161  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||    
T  44957501 cctttatgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgg 44957549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 6 - 161
Target Start/End: Original strand, 20888148 - 20888303
Alignment:
Q  6 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattattactac 105  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| |    
T  20888148 aattaccttttaggtactctaactatttaattggtatcggattgatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactgc 20888247  T
Q  106 atttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgg 161  Q
    ||||  || |||||||||||||||||||||| || ||||   ||||||||||||||    
T  20888248 atttagtcatttctgttagttttattcaaatgaatgttagggtttgtgttatgtgg 20888303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 44125920 - 44125777
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    |||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||| | | |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  44125920 ggctaaattacatttttggtcatctaactatttaattggtgtcggattggtcttctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcactgtt 44125821  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgtta 144  Q
    | |||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44125820 attacatttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgtta 44125777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 13 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 30683966 - 30683816
Alignment:
Q  13 tttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattattactacatttgat 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| | |||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||   ||| |||||||  |    
T  30683966 tttttggtcctctaaatatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttcgcaccgttattacatttagt 30683867  T
Q  113 cctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggt 163  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  30683866 cctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 30683816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 37206877 - 37206715
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||   |||  || ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||  ||    
T  37206877 ggctaaattaccttttttgttctctaactatttaattgatatcagattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggttctctaagtttttcatcgtt 37206778  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggt 163  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  37206777 actacatttaatcttttctgttagttttattcaaataaacgttaggatttgtgttatgtgggt 37206715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 44957807 - 44957668
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||| || | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||   ||    
T  44957807 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattgatatcaaattggtcctttaactaaaaattgatttatttcgatcctctaagtttctcacattt 44957708  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaac 140  Q
    |||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  44957707 actacatttagtcctttctattagttttattcaaataaac 44957668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 13 - 163
Target Start/End: Original strand, 6711975 - 6712125
Alignment:
Q  13 tttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattattactacatttgat 112  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||   |||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||||||  |    
T  6711975 tttttggccctctaactatttaattggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttactacatttagt 6712074  T
Q  113 cctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggt 163  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||   ||| ||||||||||||    
T  6712075 cctttatgttagttttattcaaataaacgttagggtttctgttatgtgggt 6712125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 186 - 288
Target Start/End: Original strand, 23755985 - 23756087
Alignment:
Q  186 tacatatgaaccataacagttaccaataatatcagtcattatttaatcataacaccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttag 285  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23755985 tacatatgaaccataacagttatcaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaaacatatgaccaaaatgatactaataaataaagttag 23756084  T
Q  286 agg 288  Q
    |||    
T  23756085 agg 23756087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 42855789 - 42855627
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    |||| |||||||||||| ||| | ||||||||||||| |||| | |||| || || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   ||    
T  42855789 ggctaaattacctttttagtcatttaactatttaattagtatcggattggtcctccaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 42855690  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggt 163  Q
    |||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  42855689 actacatttagtcttttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 42855627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 6 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 33091898 - 33091741
Alignment:
Q  6 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattattactac 105  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||  |||| || |||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||   |||||||    
T  33091898 aattacatttttagtcctctaactatttaattagtattagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcagtcatctaagtttctcaccgttactac 33091799  T
Q  106 atttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggt 163  Q
    ||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  33091798 atttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 33091741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 6 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 46850114 - 46849957
Alignment:
Q  6 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattattactac 105  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||   |||  || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||   |||||||    
T  46850114 aattatctttttggtcatctaactattaaattggtatcagattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactac 46850015  T
Q  106 atttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggt 163  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  46850014 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 46849957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 53995385 - 53995222
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||  || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   ||    
T  53995385 ggctaaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcgcattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 53995286  T
Q  101 actacatttgatcc--tttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggt 163  Q
    |||||||||  |||  ||| |||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||    
T  53995285 actacatttagtcctttttatgttagttttattcaaat-aacgttagggtttgtgttatgtgggt 53995222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 36122882 - 36122727
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    |||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| | |||| || |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| | ||    
T  36122882 ggctaaattacatttttgatcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatt-atttcggtcctctaagtttctcactgtt 36122784  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttat 157  Q
    | |||||||  || ||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  36122783 attacatttagtcatttctattagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttat 36122727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 6 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 23756245 - 23756090
Alignment:
Q  6 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattattactac 105  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||| || | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||   ||||||     
T  23756245 aattacatttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctttaactaaaaattaatttattttggtcctctaagtttctcaccgttactat 23756146  T
Q  106 atttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgg 161  Q
    ||||  || ||||||||||||||||||||||||| ||||   |||| |||||||||    
T  23756145 atttagtcatttctgttagttttattcaaataaatgttagggtttgcgttatgtgg 23756090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 50508907 - 50508745
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    |||| ||||| |||||||||  ||||| ||||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   ||    
T  50508907 ggctaaattatctttttggttttctaattatttaattggtatcagattggtcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttttcaccgtt 50508808  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggt 163  Q
    ||| |||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||   ||| ||||||||||||    
T  50508807 actgcatttagtcttttctgttagttttattcaaataaacgttatggtttatgttatgtgggt 50508745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 54 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 19508810 - 19508701
Alignment:
Q  54 tctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattattactacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtg 153  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||   |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  19508810 tctaactaaaaattgatttatttcggtcctccaagtttctcacccttactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtg 19508711  T
Q  154 ttatgtgggt 163  Q
    ||||||||||    
T  19508710 ttatgtgggt 19508701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 3 - 134
Target Start/End: Original strand, 44125624 - 44125755
Alignment:
Q  3 cttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattattac 102  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||||| ||| |||  |||||||||||||   ||||    
T  44125624 cttaattatctttttggtcctttaactatttaattggtattaaattggttctctaactaaaaattgatttttttcggttttctaagtttctcaccgttac 44125723  T
Q  103 tacatttgatcctttctgttagttttattcaa 134  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  44125724 tacatttaatcatttctgttagttttattcaa 44125755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 41878308 - 41878147
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||   |||  || ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| | ||    
T  41878308 ggctaaattacttttttggtcctctaactatataattggaatcagattagtcctctaactaaaaattgatttattgcggtcctctaagtttctcactgtt 41878209  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggt 163  Q
    |||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||| ||||   ||| ||||||||||||    
T  41878208 actacattag-tcctttctgctagttttattcaaataaatgttagggtttatgttatgtgggt 41878147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 4513366 - 4513258
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||   ||    
T  4513366 ggctaaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcggattgatcctctaactaaaaattaatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 4513267  T
Q  101 actacattt 109  Q
    |||||||||    
T  4513266 actacattt 4513258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 144
Target Start/End: Original strand, 47602943 - 47603086
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| || ||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||| | ||    
T  47602943 ggctaaattatctttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaattaaaaattgatttattttggtcccttaagtttctcactgtt 47603042  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgtta 144  Q
    |||||||||  ||||||| ||||  |||| | ||| ||||||||    
T  47603043 actacatttagtcctttccgttaaatttaattaaaaaaacgtta 47603086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 37 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 43566792 - 43566666
Alignment:
Q  37 tggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattattactacatttgatcctttctgttagttttattcaaat 136  Q
    |||||| | |||| || |||||||||||||||||||||||  ||| | |||||||||||   |||||||||||  || ||||||||||||||||| ||||    
T  43566792 tggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcagtcttttaagtttctcaccgttactacatttagtcatttctgttagttttatttaaat 43566693  T
Q  137 aaacgttaaaatttgtgttatgtgggt 163  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||    
T  43566692 aaacgttaggatttgtgttatgtgggt 43566666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 4 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 49136084 - 49135928
Alignment:
Q  4 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattattact 103  Q
    |||||||| |||||  || ||||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||   |||||    
T  49136084 ttaattactttttttatcgtctaactatttaattggtatcagattgatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctttaagtttctcaccgttact 49135985  T
Q  104 acat----ttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgtta 156  Q
    ||||    ||  | |||| ||| | ||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  49135984 acatttagttatttctttatgtcaattttattcaaataaacgttaggatttgtgtta 49135928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 47603811 - 47603717
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctca 95  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||| || |||||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||||    
T  47603811 ggctaaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattggtcctctaactaaaaattaatttatttcggtcccttaagtttctca 47603717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 52692889 - 52692782
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| || ||| || |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||   ||    
T  52692889 ggctaaattacctttttggtcctttagctatttaattgctatcga-ttggtcctctaactaaaaattgatttattttggtcccttaagtttctcaccgtt 52692791  T
Q  101 actacattt 109  Q
    |||||||||    
T  52692790 actacattt 52692782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 6 - 95
Target Start/End: Original strand, 52692029 - 52692118
Alignment:
Q  6 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctca 95  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||   |||| || ||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  52692029 aattatctttttgatcctctaactatttaattggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcccttaagtttctca 52692118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 2 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 55022508 - 55022424
Alignment:
Q  2 gcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaa 87  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||| ||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||    
T  55022508 gcttaattatctttttg-tcctctaactatttaattggtatcggattaatcctctaattaaaaattgatttatttcgatcctctaa 55022424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 89
Target Start/End: Original strand, 31214162 - 31214250
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagt 89  Q
    |||| |||||| |||||| || ||||||||||||||||||||   |||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||    
T  31214162 ggctaaattacatttttgatcatctaactatttaattggtatcagattggtcctctaactaaaaattaatttatttcggtcctcaaagt 31214250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 42
Target Start/End: Complemental strand, 43734971 - 43734942
Alignment:
Q  13 tttttggtcctctaactatttaattggtat 42  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43734971 tttttggtcctctaactatttaattggtat 43734942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 37)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 288
Target Start/End: Original strand, 36440200 - 36440487
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||   ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||    
T  36440200 ggcttaattacctttttgatcctctaactatttagttggtatcagattgatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgtt 36440299  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggtatatgtcctcatgtttcacacatacatatgaaccata 200  Q
    | |||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  36440300 attacatttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtgggtatctgacctcctgtttcacacatacatatgaaccata 36440399  T
Q  201 acagttaccaataatatcagtcattatttaatcataacaccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 288  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36440400 acagttaccaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaatgaatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 36440487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 2 - 288
Target Start/End: Original strand, 32288079 - 32288364
Alignment:
Q  2 gcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatta 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| | |||    
T  32288079 gcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattagattggtcatctaactaaaaattgatttatttcggtcatctaagtttctcactgtta 32288178  T
Q  102 ctacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggtatatgtcctcatgtttcacacatacatatgaaccataa 201  Q
    ||||||||  || ||||| ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| || ||| |||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  32288179 ctacatttagtcatttctattagttttattcaaataaacgttagg-tttgtgttatgtggatacatgacctcttgcttcacacatacatatgaaccataa 32288277  T
Q  202 cagttaccaataatatcagtcattatttaatcataacaccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 288  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  32288278 cagttaccaataatatcaatcactatttaatcataatactttaacaaggcatatgaccaaaataatactaataaataaagttagagg 32288364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 20 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 9989754 - 9989486
Alignment:
Q  20 tcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattattactacatttgatcctttct 119  Q
    ||||||| ||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||  ||||||||    
T  9989754 tcctctacctatttaattggtatcggattgatcttctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactacatttagtcctttct 9989655  T
Q  120 gttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggtatatgtcctcatgtttcacacatacatatgaaccataacagttaccaataatatca 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| | || |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  9989654 gttagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtgggtgtctgacctcctgtttcacacatacatatgaaccataacaattaccaataatatta 9989555  T
Q  220 gtcattatttaatcataacaccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 288  Q
    |||| | ||||||||||| ||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9989554 gtcactgtttaatcataataccttaataagacataggaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 9989486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 27186323 - 27186036
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   |||| || |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | ||    
T  27186323 ggctaaattacatttttggtcctctaactatttaattggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcagtcctctaagtttctcactgtt 27186224  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggtatatgtcctcatgtttcacacatacatatgaaccata 200  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||| ||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27186223 actacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatatgggtatctgacctcctgtttcacacatacatatgaaccata 27186124  T
Q  201 acagttaccaataatatcagtcattatttaatcataacaccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 288  Q
    ||| |||||||||||| || ||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  27186123 acaattaccaataataccattcactatttaatcataataccttaacaaggcataagaccaaaatgatactaattaataaaattagagg 27186036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 3 - 286
Target Start/End: Original strand, 24040087 - 24040372
Alignment:
Q  3 cttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattattac 102  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| | |||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||   ||||    
T  24040087 cttaattatctttttggtcctttaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtccactaagtttctcaccgttac 24040186  T
Q  103 tacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggtatatgtcctcatgtttcacacatacatatgaaccataac 202  Q
    |||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||  || |||| ||||| |||||||||||||||| ||||     
T  24040187 tacatttagtcctttctattagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtgggtacctgacctcctgttttacacatacatatgaacaataat 24040286  T
Q  203 agttaccaataatatcagtcattatttaatcataacaccttaacaaggcatatgaccaaa--atgatactaataaataaagttaga 286  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  24040287 agttaccaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatatgatactaataaataaagttaga 24040372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 288
Target Start/End: Original strand, 37424262 - 37424549
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||   |||| || ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| | ||    
T  37424262 ggcttaattatctttttgatcctctaactatttatttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcttctaagtttctcactgtt 37424361  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggtatatgtcctcatgtttcacacatacatatgaaccata 200  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||  || |||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  37424362 actacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatttgggtacctgacctcctgtttcacagatacatatgaaccata 37424461  T
Q  201 acagttaccaataatatcagtcattatttaatcataacaccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 288  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||   ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  37424462 acagttaccaataatatcagtcactatttaatcataatatcttaacaaaaaataggaccaaaatgatattaataaataaagttagagg 37424549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 3 - 288
Target Start/End: Original strand, 35569777 - 35570067
Alignment:
Q  3 cttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattattac 102  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| | |||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||    
T  35569777 cttaattacctttttggtcttctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttac 35569876  T
Q  103 tacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggtatatgtcctcatgtttcacac------atacatatgaac 196  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| || | || |||| ||||||||||      ||||||||||||    
T  35569877 tacatttaatcttttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgagt-tctgacctcctgtttcacacatacatatacatatgaac 35569975  T
Q  197 cataacagttaccaataatatcagtcattatttaatcataacaccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 288  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  35569976 cataacagttaccaataatatcagtcactatttaatcataataacttaacaaggaataagaccgaaatgatactaataaataaagttagagg 35570067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 288
Target Start/End: Original strand, 38958724 - 38959011
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||    
T  38958724 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgtt 38958823  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggtatatgtcctcatgtttcacacatacatatgaaccata 200  Q
    |||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||| ||||||||| | || |||| | ||||||||||||| ||||| | ||    
T  38958824 actacatttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgtcaaggtttgtgctatgtgggtgtctgacctcctatttcacacatacaaatgaaacgta 38958923  T
Q  201 acagttaccaataatatcagtcattatttaatcataacaccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 288  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||| ||  ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  38958924 acaattaccaataatatcagtcactatttaatcataatatcttaacgagatataagaccaaaatgatacttataaataaagttagagg 38959011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 286
Target Start/End: Original strand, 16860303 - 16860588
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||   |||| || ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||   ||    
T  16860303 ggctaaattatctttttggtcctctaactatttaatcggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctttaagtttctcaccgtt 16860402  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggtatatgtcctcatgtttcacacatacatatgaaccata 200  Q
    |||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||| || |||| ||||||| |||| |||||||||||||    
T  16860403 actacatttagtcttttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtgtgtatctgacctcctgtttcaaacatgcatatgaaccata 16860502  T
Q  201 acagttaccaataatatcagtcattatttaatcataacaccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttaga 286  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16860503 acagttaccaataatatcagtcactatttaatcataatatcttaacaagacatggaaccaaaatgatactaataaataaagttaga 16860588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 22 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 2183372 - 2183106
Alignment:
Q  22 ctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattattactacatttgatcctttctgt 121  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||| | ||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||   |||||||||||  |||||||| |    
T  2183372 ctctaactatttaattggtatcggattgatcctttaactaaaaattgatttatttcggttctgtaagtttctcaccgttactacatttagtcctttctat 2183273  T
Q  122 tagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggtatatgtcctcatgtttcacacatacatatgaaccataacagttaccaataatatcagt 221  Q
    ||||||||||||||||||| ||||  ||||| |||||||||| | || |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  2183272 tagttttattcaaataaacattaaggtttgtcttatgtgggtgtctgacctcctgtttcacacatacatataaaccataacagttaccaataatattagt 2183173  T
Q  222 cattatttaatcataacaccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 288  Q
    || ||||||||||||| || ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2183172 cactatttaatcataatactttaacaagatatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 2183106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 29 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 11316376 - 11316121
Alignment:
Q  29 tatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattattactacatttgatcctttctgttagtttt 128  Q
    |||||||||||||| | |||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||  |||||||| ||| ||||    
T  11316376 tatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactacatttagtcctttctattaatttt 11316277  T
Q  129 attcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggtatatgtcctcatgtttcacacatacatatgaaccataacagttaccaataatatcagtcattatt 228  Q
    |||| |||||||||||   |||||||||||||| ||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  11316276 attcgaataaacgttagggtttgtgttatgtggatatttgacctcatgttttacacatacatatgaaccataacagttaccaataatataagtcaatatt 11316177  T
Q  229 taatcataacaccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 288  Q
    |||||||||    ||   ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11316176 taatcataa----ttgttaagacataggaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 11316121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 3 - 195
Target Start/End: Original strand, 39325414 - 39325606
Alignment:
Q  3 cttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattattac 102  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||    
T  39325414 cttaattacctttttggtcctctgactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttac 39325513  T
Q  103 tacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggtatatgtcctcatgtttcacacatacatatgaa 195  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| ||||||||||| || ||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  39325514 tacatttaatcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttctgttatgtgggcatctgatctcctgtttcacacatacatatgaa 39325606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 288
Target Start/End: Original strand, 34264351 - 34264635
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgat-----------catctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagt 89  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||| |           | ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  34264351 ggcttaattacctttttgatcctctaactatttaattggtgttggattggtgttggattggccctctaactaaaaattgatttatttcgatcctctaagt 34264450  T
Q  90 ttctcattattactacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggtatatgtcctcatgtttcacacataca 189  Q
    ||||||   |||||||||||  |||||||              ||||||||||||   |||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||    
T  34264451 ttctcaccgttactacatttagtcctttc--------------aaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtacctgacctcatgtttcacacataca 34264536  T
Q  190 tatgaaccataacagttaccaataatatcagtcattatttaatcataacaccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 288  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  34264537 tatgaaccataacagttaccaataatatcagtcactatttaatcataatatcttaacaaggcatagaaccaaaatgatattaataaataaagttagagg 34264635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 4 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 25183100 - 25182910
Alignment:
Q  4 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattattact 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| | || ||    
T  25183100 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagcttctcaatgttgct 25183001  T
Q  104 acatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggtatatgtcctcatgtttcacacatacatatga 194  Q
    | ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||  ||  ||||||||||||||||||||    
T  25183000 atatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtatctgatcttctgtttcacacatacatatga 25182910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 20 - 286
Target Start/End: Original strand, 29198971 - 29199237
Alignment:
Q  20 tcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattattactacatttgatcctttct 119  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||  || ||||| ||||||||||||||||| | | || |||||||||||   |||||||||||  || |||||    
T  29198971 tcctctaactatttaattgatattaaattagtcctctaattaaaaattgatttatttcgattctttaagtttctcaccgttactacatttagtcatttct 29199070  T
Q  120 gttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggtatatgtcctcatgtttcacacatacatatgaaccataacagttaccaataatatca 219  Q
    ||||||||||||||||||||  |||   |||||||||||  ||||  ||  ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  29199071 gttagttttattcaaataaagtttagggtttgtgttatgaaggtacctgagctcctgtttcacacatacatatgaatcataacagttatcaataacatca 29199170  T
Q  220 gtcattatttaatcataacaccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttaga 286  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||| |||||  |  |||||||||||||||||||| ||||||    
T  29199171 gtcactatttaatcataataccttaacaaagcatagaattaaaatgatactaataaataatgttaga 29199237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 6 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 37424709 - 37424553
Alignment:
Q  6 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattattactac 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||    
T  37424709 aattacctttttggtcctctaactatttaattg-tattggattagtcctctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcaccgttactac 37424611  T
Q  106 atttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggt 163  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  37424610 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtgggt 37424553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 38959173 - 38959015
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   ||    
T  38959173 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 38959074  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtg 160  Q
    |||||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||| |||| | |||||||||||||    
T  38959073 actacatttagtcctttttgttaattttattcaaataaa-gttagattttgtgttatgtg 38959015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Original strand, 9989323 - 9989485
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    |||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| | |||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   ||    
T  9989323 ggctaaattacttttttggtcatctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 9989422  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggt 163  Q
    |||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  9989423 actacatttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 9989485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 39325805 - 39325645
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    |||| |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||| | |||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  39325805 ggctaaattacatttttagtcctctaattatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcattgtt 39325706  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgg 161  Q
    | |||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||    
T  39325705 attacatttagtactttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgg 39325645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Original strand, 27185874 - 27186035
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  27185874 ggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcagattggtcttctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcactttt 27185973  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggt 163  Q
    |||||||||  ||||| ||| |||||||||||||||||| ||||   ||||| ||||||||||    
T  27185974 actacatttagtccttcctg-tagttttattcaaataaatgttagggtttgttttatgtgggt 27186035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 36440650 - 36440508
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||  || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||     
T  36440650 ggctaaattatctttttggtcctctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactata 36440551  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgtt 143  Q
    |||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36440550 actatatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgtt 36440508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 13 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 34264790 - 34264636
Alignment:
Q  13 tttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgattta----ttttggtcctctaagtttctcattattactacatt 108  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    ||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  34264790 tttttggtcctccaactatttaattggtattgaattggtcctctaactaaaaattgatttaattatttcggtcctctaagtttctcattgttattacatt 34264691  T
Q  109 tgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggt 163  Q
    |  || |||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  34264690 tagtcatttctgttggttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtgggt 34264636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 175 - 286
Target Start/End: Original strand, 16860594 - 16860705
Alignment:
Q  175 tgtttcacacatacatatgaaccataacagttaccaataatatcagtcattatttaatcataacaccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaata 274  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| || |||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  16860594 tgtttcacacatacatatgaaccataacagttaccaataatatcagtcactaattaatcataatacattaacaagacataagaccaaaatgatactaata 16860693  T
Q  275 aataaagttaga 286  Q
    ||||||||||||    
T  16860694 aataaagttaga 16860705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 13 - 163
Target Start/End: Original strand, 2182955 - 2183105
Alignment:
Q  13 tttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattattactacatttgat 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||| || |||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||   |||||||||||  |    
T  2182955 tttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttatgtcgtctaagtttctcaccgttactacatttagt 2183054  T
Q  113 cctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggt 163  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  2183055 cctttatgttagctttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 2183105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 24040537 - 24040375
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||||| |||||||||||   ||    
T  24040537 ggctaaattacttttttggtcctctaactatttaattagtatcggattgatcctctaactaaaaattgacttatttcagtcctttaagtttctcaccgtt 24040438  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggt 163  Q
     ||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  24040437 cctacatttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 24040375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 6 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 32288521 - 32288365
Alignment:
Q  6 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattattactac 105  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||  |||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| | ||| |||    
T  32288521 aattacctttttgatcctctaactatttaattgatattagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcactgttaatac 32288422  T
Q  106 atttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggt 163  Q
    ||||  || |||||||||||||||||||||| || |||| | ||||||||||||||||    
T  32288421 atttagtcatttctgttagttttattcaaat-aatgttagagtttgtgttatgtgggt 32288365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 13 - 159
Target Start/End: Original strand, 11315970 - 11316116
Alignment:
Q  13 tttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattattactacatttgat 112  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||| | |||| || ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| | |||||||||||||  |    
T  11315970 ttttttgtcctttaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcgatcctctaagtttcttactattactacatttagt 11316069  T
Q  113 cctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgt 159  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||   ||||||||||||    
T  11316070 catttctgttagttttattccaataaacgttagggtttgtgttatgt 11316116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 2 - 129
Target Start/End: Original strand, 19184598 - 19184725
Alignment:
Q  2 gcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatta 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||   |||    
T  19184598 gcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcggtttggtcctctaactaaaaattgatttattttggtcctttaagtttatcaccgtta 19184697  T
Q  102 ctacatttgatcctttctgttagtttta 129  Q
    ||| ||||  ||||||||||||||||||    
T  19184698 ctatatttcgtcctttctgttagtttta 19184725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 13 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 35570218 - 35570071
Alignment:
Q  13 tttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattattactacatttgat 112  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||  || |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||   |||||||||||  |    
T  35570218 ttttttgtcctctaactatttaattggtatttgattactcctctaactaaaaattgatttattttagtcttctaagtttctcaccgttactacatttagt 35570119  T
Q  113 cctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtg 160  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  35570118 cacttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtg 35570071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 25567438 - 25567279
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    |||| |||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| | |||| |  | ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||   ||    
T  25567438 ggctaaattacttttttagtcctttaactatttaattggtatcggattggttctttaactaaaaattgatttattttgatcctttaagtttttcaccgtt 25567339  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtg 160  Q
    |||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||    
T  25567338 actacatttagtcttttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttttgttatgtg 25567279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 1140215 - 1140080
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   ||    
T  1140215 ggcttaattgcctttttggtcctctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 1140116  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgtta 144  Q
    ||||||        ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  1140115 actaca--------tttatgttagttttattcaaataaacgtta 1140080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 208 - 288
Target Start/End: Original strand, 25567195 - 25567275
Alignment:
Q  208 ccaataatatcagtcattatttaatcataacaccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 288  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25567195 ccaataatattagtcactatttaatcataatactttaacaaggcatatgactaaaataatactaataaataaagttagagg 25567275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 19128503 - 19128434
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgat 70  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   ||||||| |||||||||||||||||    
T  19128503 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattagtatcagattgatcctctaactaaaaattgat 19128434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 6 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 33817729 - 33817656
Alignment:
Q  6 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttgg 79  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  33817729 aattacctttttgattctctaactatttaattggtatcggattgatcctctaactaaaaatttatttattttgg 33817656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 19185634 - 19185504
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||  ||| ||  |||||||||| |||||||||||||||||  ||| ||||||  | ||    
T  19185634 ggctaaattacctttttggtcccttaactatttaattagtattggtttggtcccctaactaaaatttgatttattttggtcccttaaatttctctctgtt 19185535  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttatt 131  Q
    ||||| |||  ||||||| |||| |||||||    
T  19185534 actacttttagtcctttccgttaattttatt 19185504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 4 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 31756749 - 31756666
Alignment:
Q  4 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaa 87  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  |  ||  || |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  31756749 ttaattacctttttggtctcctaactatttaattggtaacggtttagtcctctaactaaaaaatgatttattttggtcctctaa 31756666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 6 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 2597465 - 2597377
Alignment:
Q  6 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctc 94  Q
    ||||| |||||||||||  |||||||||||||||| |||  ||| ||   ||||||||  |||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  2597465 aattatctttttggtcccttaactatttaattggttttggtttggtctcttaactaaattttgatttattttggtcctttaactttctc 2597377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 82)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 20306452 - 20306165
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||   ||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||    
T  20306452 ggcttaattacctctttggtcctctaactagttaattggtatcagattgatcctccaactaaagattgatttattttggtcctttaagtttctcactgtt 20306353  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggtatatgtcctcatgtttcacacatacatatgaaccata 200  Q
    |||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20306352 actacatttagtcctttctattagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtacttgacctcatgtttcacacatacatatgaaccata 20306253  T
Q  201 acagttaccaataatatcagtcattatttaatcataacaccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 288  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20306252 acagttaccaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 20306165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 288
Target Start/End: Original strand, 1762674 - 1762961
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||    
T  1762674 ggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgtt 1762773  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggtatatgtcctcatgtttcacacatacatatgaaccata 200  Q
    || |||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||| |||   ||||| |||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  1762774 acaacatttaatcatttatgttagttttattcaaataaacattagggtttgtattatgtgggtatttgacctcctgtttcacacatacatatgaaccata 1762873  T
Q  201 acagttaccaataatatcagtcattatttaatcataacaccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 288  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1762874 acagttaccaataatatcagtcactatttaatcagaacactttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 1762961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 2 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 44323109 - 44322823
Alignment:
Q  2 gcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatta 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   |||    
T  44323109 gcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtta 44323010  T
Q  102 ctacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggtatatgtcctcatgtttcacacatacatatgaaccataa 201  Q
    ||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||  || |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  44323009 ctacatttagtcatttctgttagttttattcaaataaatgttagggtttgtgttatgtgggtacgtgacctcctgtttcacacatacatatgaaccataa 44322910  T
Q  202 cagttaccaataatatcagtcattatttaatcataacaccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 288  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44322909 cagttaccaataatatcagtcacaatttaatcataataccttaacaaggcataggaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 44322823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 16024347 - 16024060
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   ||    
T  16024347 ggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattgatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 16024248  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggtatatgtcctcatgtttcacacatacatatgaaccata 200  Q
    |||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||   ||| ||||||||||||   || |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16024247 actacatttagtcctttctggtagttttattcaaataaacgttagggtttatgttatgtgggtgcctgacctcctgtttcacacatacatatgaaccata 16024148  T
Q  201 acagttaccaataatatcagtcattatttaatcataacaccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 288  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16024147 acagttaccaataatattagtcactatttaatcataatacctcaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 16024060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 288
Target Start/End: Original strand, 26707196 - 26707483
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   || | || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    ||    
T  26707196 ggcttaaatacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagatcggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctccccgtt 26707295  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggtatatgtcctcatgtttcacacatacatatgaaccata 200  Q
    |||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||| || |||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  26707296 actacatttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttggagtttgtgttatgtgggtatctgacctcctatttcacacatacatatgaaccata 26707395  T
Q  201 acagttaccaataatatcagtcattatttaatcataacaccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 288  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26707396 acagttaccaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 26707483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 4 - 288
Target Start/End: Original strand, 35612085 - 35612369
Alignment:
Q  4 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattattact 103  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||    
T  35612085 ttaattacctttttggtcctctaagtatttaattggtatcggattgatcctctaactaaaaattgatttattttgttcctctaagtttctcactgttact 35612184  T
Q  104 acatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggtatatgtcctcatgtttcacacatacatatgaaccataaca 203  Q
    ||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| |||  || |||  ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  35612185 acatttagtcctttcttttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgtgtacttgaccttctgtttcacacatacatatgaatcataaca 35612284  T
Q  204 gttaccaataatatcagtcattatttaatcataacaccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 288  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35612285 tttaccaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaagacatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 35612369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 288
Target Start/End: Original strand, 23476341 - 23476628
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||   ||    
T  23476341 ggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtattagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtccactaagtttctcaccgtt 23476440  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggtatatgtcctcatgtttcacacatacatatgaaccata 200  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||  || |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  23476441 actacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagaatctgtgttatgtgggtacctgacctcctgtttcacacatacatatgaaccata 23476540  T
Q  201 acagttaccaataatatcagtcattatttaatcataacaccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 288  Q
    ||| ||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23476541 acaattatcaataatatcaatcactatttaatcataataccttaacaagacataggaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 23476628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 13 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 37304466 - 37304191
Alignment:
Q  13 tttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattattactacatttgat 112  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||||||  |    
T  37304466 tttttggccctctaactatttaattggtatcggattgatcctataactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttactacatttagt 37304367  T
Q  113 cctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggtatatgtcctcatgtttcacacatacatatgaaccataacagttaccaat 212  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||| | || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37304366 cctttatgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtgtctgacctcctgtttcacacatacatatgaaccataacagttaccaat 37304267  T
Q  213 aatatcagtcattatttaatcataacaccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 288  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37304266 aatattagtcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 37304191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 4 - 287
Target Start/End: Original strand, 49643674 - 49643957
Alignment:
Q  4 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattattact 103  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||    
T  49643674 ttaattacatttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttact 49643773  T
Q  104 acatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggtatatgtcctcatgtttcacacatacatatgaaccataaca 203  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||||||||||||| || |||| ||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  49643774 acatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacattagggtttgtgttatgtgggtatttgacctcctgtttcatacatacatatgaaccatagca 49643873  T
Q  204 gttaccaataatatcagtcattatttaatcataacaccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagag 287  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  49643874 gttaccaataatatcactcactatttaatcataataccttaacaaggcataggatcaaaatgatactaataaataaagttagag 49643957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 2 - 288
Target Start/End: Original strand, 12481060 - 12481346
Alignment:
Q  2 gcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatta 101  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| | |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||    
T  12481060 gcttaattacatttttggtcctctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcaccgtta 12481159  T
Q  102 ctacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggtatatgtcctcatgtttcacacatacatatgaaccataa 201  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||| ||||||| || |||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  12481160 ctacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatatgggtatctgacctcctatttcacacatacatatgaaccataa 12481259  T
Q  202 cagttaccaataatatcagtcattatttaatcataacaccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 288  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12481260 cagttaccaataatatccgtcactatttaatcataataccttaacaaggaataggaccaaaatgatgctaataaataaagttagagg 12481346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 288
Target Start/End: Original strand, 4696882 - 4697169
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    |||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| | |||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  4696882 ggctaaattatctttttagtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctataactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcactgtt 4696981  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggtatatgtcctcatgtttcacacatacatatgaaccata 200  Q
    |||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||  || |||| | ||||||||||||||||||| ||||    
T  4696982 actacatttagtcctttctgttagtttaattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtgggtacctgacctcctatttcacacatacatatgaatcata 4697081  T
Q  201 acagttaccaataatatcagtcattatttaatcataacaccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 288  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4697082 acagttaccaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaagacataggatcaaaatgatactaataaataaagttagagg 4697169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 288
Target Start/End: Original strand, 45052690 - 45052976
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    |||||||||| ||||||| || || |||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| | ||    
T  45052690 ggcttaattatctttttgatcttcaaactatttaattggtatcagattgatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctataagtttctcactgtt 45052789  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggtatatgtcctcatgtttcacacatacatatgaaccata 200  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| ||| || |||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  45052790 actacatttaatcatttctgttagttttattcaaataaacgttaaggttt-tgttatgtggatatttgacctcttgtttcacacatacatataaaccata 45052888  T
Q  201 acagttaccaataatatcagtcattatttaatcataacaccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 288  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45052889 acagttaccaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaggcataggaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 45052976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 288
Target Start/End: Original strand, 49140143 - 49140430
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||   |||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   ||    
T  49140143 ggcttaattatctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 49140242  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggtatatgtcctcatgtttcacacatacatatgaaccata 200  Q
    |||||||||  || ||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||  || |||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  49140243 actacatttagtcatttctcttagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtgggtacctgacctcctgtttcacacatacatatgaatcata 49140342  T
Q  201 acagttaccaataatatcagtcattatttaatcataacaccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 288  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49140343 acagttaccaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaggaatataaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 49140430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 181; E-Value: 8e-98
Query Start/End: Original strand, 4 - 288
Target Start/End: Original strand, 9006194 - 9006478
Alignment:
Q  4 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattattact 103  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| | ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||   ||| |    
T  9006194 ttaattatctttttggtcctctaactatttaattggtatcggattgatcctttaactaaaaattgatttatttcggtcatctaagtttatcaccgttagt 9006293  T
Q  104 acatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggtatatgtcctcatgtttcacacatacatatgaaccataaca 203  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||  || |||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  9006294 acatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtacctgacctcctgtttcacacatacatatgaactataaca 9006393  T
Q  204 gttaccaataatatcagtcattatttaatcataacaccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 288  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9006394 gttaccaataatatcagtcactatttaatcataatacattaacaaggcataggaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 9006478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 288
Target Start/End: Original strand, 12127057 - 12127340
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||| |  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   ||    
T  12127057 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcggattggttctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 12127156  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggtatatgtcctcatgtttcacacatacatatgaaccata 200  Q
     ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||  ||| || |||| ||||||||    ||||||||||||||    
T  12127157 tctacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttatgatttgtgttatgtgaatatctgacctcttgtttcac----acatatgaaccata 12127252  T
Q  201 acagttaccaataatatcagtcattatttaatcataacaccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 288  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12127253 acagttaccaataatatcaatcactatttaatcataataccttaacaaggaatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 12127340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 4 - 288
Target Start/End: Original strand, 37585696 - 37585980
Alignment:
Q  4 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattattact 103  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||   ||| |    
T  37585696 ttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtattagattgatcctctaactaaaaattgatttatttcgatcctctaaatttctcaccgttatt 37585795  T
Q  104 acatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggtatatgtcctcatgtttcacacatacatatgaaccataaca 203  Q
    | ||||  || |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| | ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37585796 atatttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtagctacctgacctcatgtttcacacatacatatgaaccataaca 37585895  T
Q  204 gttaccaataatatcagtcattatttaatcataacaccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 288  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  37585896 gttactaataatatcagtcactatttaatcataatatcttaacaagacatatgaccaaaataatactaataaataaagttagagg 37585980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 288
Target Start/End: Original strand, 27547669 - 27547956
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| | |||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   ||    
T  27547669 ggcttaattacctttttggtcttttaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 27547768  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggtatatgtcctcatgtttcacacatacatatgaaccata 200  Q
    | |||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||  || |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27547769 aatacatttagtcctttctgttggttttattcaaataaacgttagggtttgtgtcatgtgggtacctgacctcttgtttcacacatacatatgaaccata 27547868  T
Q  201 acagttaccaataatatcagtcattatttaatcataacaccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 288  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || ||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27547869 acagttaccaatagtatcagtcactatttaatcataatactttaacaaagcatagtaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 27547956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 3 - 288
Target Start/End: Original strand, 6797809 - 6798094
Alignment:
Q  3 cttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattattac 102  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||   ||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   ||||    
T  6797809 cttaattacttttttggttctctaactatttaattgatatcagattgatcttctaattaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttac 6797908  T
Q  103 tacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggtatatgtcctcatgtttcacacatacatatgaaccataac 202  Q
    | |||||  || |||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||   || |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6797909 tccatttagtcatttctgttagttttgttcaaataaacgttagagtttgtgttatgtgggtgcctgacctcctgtttcacacatacatatgaaccataac 6798008  T
Q  203 agttaccaataatatcagtcattatttaatcataacaccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 288  Q
    | ||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6798009 aattaccaataatattagtcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaaattagagg 6798094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 37576631 - 37576344
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||| || ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| | ||    
T  37576631 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggttctctaagtttctcactgtt 37576532  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggtatatgtcctcatgtttcacacatacatatgaaccata 200  Q
    |||||||||  || |||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||||||||||||  || || | ||||||||||||||||||||| ||||    
T  37576531 actacatttagtcttttctgttagttttattcaaataaacattagggtttgtgttatgtgggtacctgaccccctgtttcacacatacatatgaatcata 37576432  T
Q  201 acagttaccaataatatcagtcattatttaatcataacaccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 288  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  37576431 acagttaccaataatatcggtcactatttaatcctaataccttaacaaggaataggaccaaaatgatacttataaataaagttagagg 37576344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 13 - 288
Target Start/End: Original strand, 37284740 - 37285015
Alignment:
Q  13 tttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattattactacatttgat 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| | |||| |  ||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||   |||||||||||  |    
T  37284740 tttttggtcctctaactatttaattgatatcggattggttctctaactaaaaattgatttatttcggtcatttaagtttctcaccgttactacatttagt 37284839  T
Q  113 cctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggtatatgtcctcatgtttcacacatacatatgaaccataacagttaccaat 212  Q
    | ||| ||||||||||||||||||||  ||||   |||||||||||| ||||  || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37284840 cttttttgttagttttattcaaataagagttatggtttgtgttatgttggtacctgacctcctgtttcacacatacatatgaaccataacagttaccaat 37284939  T
Q  213 aatatcagtcattatttaatcataacaccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 288  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37284940 aatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 37285015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 31704063 - 31703777
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| | |||| || |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| | ||    
T  31704063 ggcttaattacatttttggtcctctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttattttggacctataagtttctcactgtt 31703964  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggtatatgtcctcatgtttcacacatacatatgaaccata 200  Q
    |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||   ||| |||||| ||||||  || |||| | |||||||||||||| |||||||||    
T  31703963 actacatttagtcctttctgttaattttattcaaataaacgttaggctttatgttatatgggtacctgacctcctatttcacacatacat-tgaaccata 31703865  T
Q  201 acagttaccaataatatcagtcattatttaatcataacaccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 288  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||| |||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  31703864 acagttaccaataatatccgtcactatttaatcataataccttaacaaggaatagaaccaaaatgatgctaataaataaagttagagg 31703777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 6 - 288
Target Start/End: Original strand, 39486207 - 39486480
Alignment:
Q  6 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattattactac 105  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||   ||||| |    
T  39486207 aattatctttttggttctctaactatttaattggtattggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcgtttaagtttctcacatttactgc 39486306  T
Q  106 atttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggtatatgtcctcatgtttcacacatacatatgaaccataacagt 205  Q
    ||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||  || |||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  39486307 atttggtcttttctgttagttctattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtgggtacctgacctcctgtttcacacatatatatgaaccataatagt 39486406  T
Q  206 taccaataatatcagtcattatttaatcataacaccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 288  Q
    ||| |||||||||| ||| ||||||||||||| ||         ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39486407 tactaataatatcaatcactatttaatcataatac---------gcataggaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 39486480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 105 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 25996130 - 25995947
Alignment:
Q  105 catttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggtatatgtcctcatgtttcacacatacatatgaaccataacag 204  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| || |||| | ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  25996130 catttaatcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtatctgacctcctatttcacacatacatatgaatcataacag 25996031  T
Q  205 ttaccaataatatcagtcattatttaatcataacaccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 288  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25996030 ttaccaataatatcagccactatttaatcatattaccttaacaaggcataggaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 25995947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 1763124 - 1762962
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||    
T  1763124 ggctaaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcaaattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcatcgtt 1763025  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggt 163  Q
    |||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  1763024 actacatttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 1762962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 12481509 - 12481347
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||    
T  12481509 ggctaaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgtt 12481410  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggt 163  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  12481409 actacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 12481347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 4 - 157
Target Start/End: Original strand, 38000492 - 38000645
Alignment:
Q  4 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattattact 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  38000492 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcttctaattaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcattgttact 38000591  T
Q  104 acatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttat 157  Q
    ||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  38000592 acatttagtcctttctattagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttat 38000645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 23476791 - 23476632
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  23476791 ggctaaattacatttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcattgtt 23476692  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtg 160  Q
    ||| |||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  23476691 acttcatttagtcttttctgttagttttattcaaataaacgttaatgtttgtgttatgtg 23476632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 26723251 - 26723108
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||    
T  26723251 ggctaaattacctttttgatcctctaactatttaattggtatcagattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcaccgtt 26723152  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgtta 144  Q
    | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26723151 attacatttaatcctttctgttagttttattcaaataaacgtta 26723108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 2064661 - 2064499
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    |||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| | ||    
T  2064661 ggctaaattacatttttgatcctctaactatttaattggtatcggattgatcctctaactaaaaattgatttatttcggttctctaagtttctcactgtt 2064562  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggt 163  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||    
T  2064561 actacatttaatcatttctgttagttttattcaaataaatgttagagtttgtgttatgtgggt 2064499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 45053139 - 45052977
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   |||| || ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| | ||    
T  45053139 ggctaaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcatctaagtttctcagtgtt 45053040  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggt 163  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  45053039 actacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtgggt 45052977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 8762849 - 8762687
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    |||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| | |||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   |    
T  8762849 ggctaaattacatttttggtcatctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcatcggt 8762750  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggt 163  Q
    |||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  8762749 actacatttagtcctttctgttagctttattcaaataaacgttaagagttgtgttatgtgggt 8762687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 6 - 161
Target Start/End: Original strand, 25995789 - 25995944
Alignment:
Q  6 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattattactac 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||| || | ||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| | |||||||    
T  25995789 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattggtcctttaattaaaaattgatttatttcggtcctttaagtttctcactgttactac 25995888  T
Q  106 atttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgg 161  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  25995889 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttgagatttgtgttatgtgg 25995944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 27548119 - 27547976
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   |||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   ||    
T  27548119 ggctaaattaccttttttgtcctctaactatttaattggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 27548020  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgtta 144  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27548019 actacatttaatcctttctgttagttttattcaaataaacgtta 27547976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 6 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 35612527 - 35612389
Alignment:
Q  6 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattattactac 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| || |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| | |||||||    
T  35612527 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcagtcctctaagtttatcactgttactac 35612428  T
Q  106 atttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgtta 144  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35612427 atttattcctttctgttagttttattcaaataaacgtta 35612389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 175 - 288
Target Start/End: Original strand, 27400598 - 27400711
Alignment:
Q  175 tgtttcacacatacatatgaaccataacagttaccaataatatcagtcattatttaatcataacaccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaata 274  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  27400598 tgtttcacacatacatatgaaccataacagttaccaataatatcagtcactatttaatcataatacattaacaaggcataagactaaaatgatactaata 27400697  T
Q  275 aataaagttagagg 288  Q
    ||||||||||||||    
T  27400698 aataaagttagagg 27400711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 2 - 163
Target Start/End: Original strand, 38127710 - 38127871
Alignment:
Q  2 gcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatta 101  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | | |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||    
T  38127710 gcttaattacctttttggttctctaactatttaattggtttcggattggtcatctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcactgtta 38127809  T
Q  102 ctacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggt 163  Q
    ||| ||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||   ||||| ||||||||||    
T  38127810 ctatatttagtccttgctgttagttttattcaaataaacgttatggtttgttttatgtgggt 38127871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 6 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 45843562 - 45843405
Alignment:
Q  6 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattattactac 105  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||   |||||||    
T  45843562 aattacatttttggtcctctaactatttaattggtattagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcgatcctctaagtttctcaccgttactac 45843463  T
Q  106 atttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggt 163  Q
    ||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  45843462 atttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 45843405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 164
Target Start/End: Original strand, 8760272 - 8760435
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| | ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||| | ||    
T  8760272 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcggattgaccctctaactaaaaattgatttatttcgatcctctaagtttttcagtgtt 8760371  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggta 164  Q
    |||||||||  || ||| |||||| ||||||||||||||| |||   |||||||||||||||||    
T  8760372 actacatttagtcatttatgttagctttattcaaataaacattagggtttgtgttatgtgggta 8760435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Original strand, 16023897 - 16024059
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   ||    
T  16023897 ggctaaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 16023996  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggt 163  Q
    |||||||||  || ||||||||||| ||||||||||||||||||   ||||||||||| ||||    
T  16023997 actacatttagtcttttctgttagtcttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgagggt 16024059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Original strand, 37304028 - 37304190
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| || |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||   ||    
T  37304028 ggctaaattacctttttggtcctctaaccatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcagtcctctaagtttctcaccgtt 37304127  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggt 163  Q
    |||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| ||||    
T  37304128 actatatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgagggt 37304190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 175 - 288
Target Start/End: Original strand, 2064385 - 2064498
Alignment:
Q  175 tgtttcacacatacatatgaaccataacagttaccaataatatcagtcattatttaatcataacaccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaata 274  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  2064385 tgtttcacacatacatatgaaccataacagttaccaataatagtagtcactatttaatcataataccttaacaagacataagaccaaaatgatactaata 2064484  T
Q  275 aataaagttagagg 288  Q
    ||||||||||||||    
T  2064485 aataaagttagagg 2064498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 6 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 4330282 - 4330125
Alignment:
Q  6 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattattactac 105  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| | ||| | | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | | |||||||    
T  4330282 aattaccttttttgtcctctaattatttaattggtatcggattaaccctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttcttactgttactac 4330183  T
Q  106 atttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggt 163  Q
    ||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  4330182 atttagtcctttctcttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 4330125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 4 - 160
Target Start/End: Original strand, 20306005 - 20306161
Alignment:
Q  4 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattattact 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| || ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||   ||| |    
T  20306005 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggttctctaagtttcccaccgttatt 20306104  T
Q  104 acatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtg 160  Q
    ||||||  || |||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  20306105 acatttagtcatttctgttggttttattcaaataaacgttaggatttgtgttatgtg 20306161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 170 - 288
Target Start/End: Original strand, 8762568 - 8762686
Alignment:
Q  170 cctcatgtttcacacatacatatgaaccataacagttaccaataatatcagtcattatttaatcataacaccttaacaaggcatatgaccaaaatgatac 269  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| | |||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8762568 cctcctgtttcacacatacatatgaactataacatttaccaataatatcagttactatttattcataataccttaacaagacatatgaccaaaatgatac 8762667  T
Q  270 taataaataaagttagagg 288  Q
    |||||||||||||||||||    
T  8762668 taataaataaagttagagg 8762686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 49140592 - 49140431
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   |||  || ||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||| | ||    
T  49140592 ggctaaattatctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattagtcctctaactaaaa-ttgatttatttcggtcctataagtttctcactgtt 49140494  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggt 163  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  49140493 actacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 49140431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 171 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 3089622 - 3089509
Alignment:
Q  171 ctcatgtttcacacatacatatgaaccataacagttaccaataatatcagtcattatttaatcataacaccttaacaaggcatatgaccaaaatgatact 270  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3089622 ctcatgtttcacatatacatatgaatcataacagttatcaataatatcagtcactatttaatcataatactttaacaagacatatgaccaaaatgatact 3089523  T
Q  271 aataaataaagtta 284  Q
    ||||||||||||||    
T  3089522 aataaataaagtta 3089509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 161
Target Start/End: Original strand, 3089342 - 3089502
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| || | |||| |  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   ||    
T  3089342 ggctaaattaccttttgggtcctctaactatttaattggcatcggattggtactctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 3089441  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgg 161  Q
    | |||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||    
T  3089442 attacatttagtcctttctgttagtttaattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgg 3089502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Original strand, 37576181 - 37576343
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| | |||  || ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||   ||    
T  37576181 ggctaaattacctttttggtcctttaactattaaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaaatttatcaaagtt 37576280  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggt 163  Q
    |||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  37576281 actaaatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 37576343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 49644120 - 49643959
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcat-tat 99  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   |||| || ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||| |||  ||    
T  49644120 ggctaaattatctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattggtcctctaattaaaaattgatttaattcggtcctctaagtttc-catccat 49644022  T
Q  100 tactacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggt 163  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  49644021 tactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgtt-aggtttgtgttatgtgggt 49643959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 9006640 - 9006479
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    |||| ||||| |||||||||| |||||||||||||| | ||| | |||| || ||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||   ||    
T  9006640 ggctaaattatctttttggtcttctaactatttaatcgttatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttggatcctccaagtttctca-cctt 9006542  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggt 163  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||    
T  9006541 actacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggt 9006479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 6 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 6798252 - 6798095
Alignment:
Q  6 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattattactac 105  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||   |||| || ||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||   |||||||    
T  6798252 aattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcgatcctctaaatttctcaccgttactac 6798153  T
Q  106 atttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggt 163  Q
    ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| ||||    
T  6798152 atttagtcctttatgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgagggt 6798095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Original strand, 23598072 - 23598213
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||   ||    
T  23598072 ggctaaattatctttttggtcctctaactatttaattggtatcgaattggtcctctaactaaaaattgatttatttcagtcctctaaatttctcaccgtt 23598171  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttt--tattcaaataaac 140  Q
    |||||||||  || ||| |||||||||  |||||||||||||    
T  23598172 actacatttagtcatttttgttagttttatattcaaataaac 23598213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 37285177 - 37285016
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||  |||| || ||||||||||||||||||||||| | | |||||| |||||||  |||    
T  37285177 ggctaaattacatttttggtcctttaactatttaattggtattagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcgattctctaaatttctcacaatt 37285078  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggt 163  Q
    |||||||||  ||| || ||||||||||||| ||||||| ||||   ||||||||||||||||    
T  37285077 actacatttagtcc-ttatgttagttttatttaaataaatgttagggtttgtgttatgtgggt 37285016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 190 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 38127970 - 38127872
Alignment:
Q  190 tatgaaccataacagttaccaataatatcagtcattatttaatcataacaccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 288  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38127970 tatgaactataacagttactaataatatcattcactatttaatcataataccttaataaggcataagaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 38127872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 54 - 163
Target Start/End: Original strand, 31703667 - 31703776
Alignment:
Q  54 tctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattattactacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtg 153  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||   |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||    
T  31703667 tctaactaaaaattgatttatttcggtcctttaagtttctcaccgttactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttggggtttgtg 31703766  T
Q  154 ttatgtgggt 163  Q
    ||||||||||    
T  31703767 ttatgtgggt 31703776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 6 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 37586138 - 37585981
Alignment:
Q  6 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattattactac 105  Q
    ||||| |||||| ||| |||||||| ||||||||||| | ||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||| ||||||||| |||   |||||||    
T  37586138 aattatcttttttgtcatctaactacttaattggtatcggattgatcctctaattaaaaattaatttatttcggtcttctaagtttttcaccgttactac 37586039  T
Q  106 atttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggt 163  Q
    ||||  || ||| |||||||||||||||||||||||||| | ||| | ||||||||||    
T  37586038 atttagtcatttatgttagttttattcaaataaacgttagagtttatattatgtgggt 37585981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 6 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 12127501 - 12127341
Alignment:
Q  6 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgat---catctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattattac 102  Q
    |||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| | |||  |   | ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |   ||||    
T  12127501 aattacattttttatcctctaactatttaattggtatcggattagttctcctctaattaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctgaccgttac 12127402  T
Q  103 tacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggt 163  Q
    |||||||  || |||||||||||||| |||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  12127401 tacatttagtcatttctgttagttttgttcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 12127341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 87
Target Start/End: Original strand, 13183766 - 13183852
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaa 87  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13183766 ggctaaattacctttttgatcctctaactatttaattggtattgaattagtcttctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaa 13183852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 5 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 39486638 - 39486481
Alignment:
Q  5 taattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattattacta 104  Q
    ||||||| |||||  || ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||| | |   ||||||    
T  39486638 taattacttttttaatcatctaactatttaattggtattgaattgttcctctaactaaaaattgatttatttccgttttctaagttttttaccgttacta 39486539  T
Q  105 catttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggt 163  Q
    |||||  ||||||| |||||||||||||||| ||||||||   |||||||||| |||||    
T  39486538 catttagtcctttcagttagttttattcaaa-aaacgttagggtttgtgttatatgggt 39486481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 109
Target Start/End: Original strand, 10831131 - 10831239
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||| ||| |  ||||||| |||   ||    
T  10831131 ggctaaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcgaattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggttccttaagtttttcaccgtt 10831230  T
Q  101 actacattt 109  Q
    |||||||||    
T  10831231 actacattt 10831239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 37467670 - 37467554
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||| || |||||||||||||| |||||||| |||||  ||||||||||| | ||    
T  37467670 ggctaaattacctttttggtcatctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattaatttatttaggtcccttaagtttctcactgtt 37467571  T
Q  101 actacatttgatccttt 117  Q
    |||||||| | ||||||    
T  37467570 actacattcggtccttt 37467554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 46593680 - 46593573
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||| || ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| | ||    
T  46593680 ggctaaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcct-taagtttctcactgtt 46593582  T
Q  101 actacattt 109  Q
    |||| ||||    
T  46593581 actatattt 46593573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 60 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 27400815 - 27400712
Alignment:
Q  60 taaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattattactacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgt 159  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||   |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||    
T  27400815 taaaaattgatttattttgttcctctaaatttctcaccgttactacatttagtcttttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgt 27400716  T
Q  160 gggt 163  Q
    ||||    
T  27400715 gggt 27400712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 87
Target Start/End: Original strand, 32047743 - 32047829
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaa 87  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  32047743 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtaacggtttggtcctctaactaaaaaatgatttattttggtcctctaa 32047829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 6 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 10832031 - 10831942
Alignment:
Q  6 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctca 95  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  10832031 aattacttttttggtcctctaactatttaactggtattggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcccttaagtttctca 10831942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 13 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 5537242 - 5537146
Alignment:
Q  13 tttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattattactacattt 109  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| | |||| || ||||||||||||||||||||||| |||||  |||| |||||| | |||||||||||    
T  5537242 tttttggtcctctaactatttaatcggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcccttaagattctcactgttactacattt 5537146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 4 - 123
Target Start/End: Original strand, 28884020 - 28884139
Alignment:
Q  4 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattattact 103  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |  ||| || |||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||| ||| | ||||     
T  28884020 ttaattacctttttggtcctctaattatttaattggtaacggtttggtcctctaactaaaaaataatttattttggtcctctaactttatcactgttacc 28884119  T
Q  104 acatttgatcctttctgtta 123  Q
    | |||| ||| |||||||||    
T  28884120 atatttcatcatttctgtta 28884139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 6 - 109
Target Start/End: Original strand, 34966308 - 34966411
Alignment:
Q  6 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattattactac 105  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||| || ||||||||||| |||||||||||  ||||  ||||||||||| | ||||| |    
T  34966308 aattacctttttggacctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaacttgatttatttcagtcccttaagtttctcactgttactgc 34966407  T
Q  106 attt 109  Q
    ||||    
T  34966408 attt 34966411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 123
Target Start/End: Original strand, 5536398 - 5536520
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| | |||| || |||| |||||| ||||||||||| ||||   ||||||||||||  ||    
T  5536398 ggctaaattacatttttggccctctaactatttaattggtatcggattggtcctctacctaaaatttgatttatttgggtctcttaagtttctcatcgtt 5536497  T
Q  101 actacatttgatcctttctgtta 123  Q
    |||||||||  ||||||| ||||    
T  5536498 actacatttagtcctttccgtta 5536520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 13109277 - 13109191
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaa 87  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   |||  || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13109277 ggctaaattacctttttagtcctctaactatttaattggtatccgattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaa 13109191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 34967172 - 34967078
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctca 95  Q
    |||| |||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| | |||| || ||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  34967172 ggctaaattacatttttgattctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtccattaagtttctca 34967078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 6 - 109
Target Start/End: Original strand, 46592817 - 46592920
Alignment:
Q  6 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattattactac 105  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||   ||||||| |||||||||||| |||||||||| | |||  ||||||||||| | ||||| |    
T  46592817 aattacctttttggccctctaactatttaattgatatcagattgatcctctaactaaaaaatgatttatttcgatcccttaagtttctcactgttactgc 46592916  T
Q  106 attt 109  Q
    ||||    
T  46592917 attt 46592920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 4 - 74
Target Start/End: Original strand, 46289327 - 46289397
Alignment:
Q  4 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttat 74  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  46289327 ttaattatctttttgatcctctaactatttaattggtatcagattggtcatctaactaaaaattgatttat 46289397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 209 - 286
Target Start/End: Original strand, 4330045 - 4330122
Alignment:
Q  209 caataatatcagtcattatttaatcataacaccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttaga 286  Q
    |||| ||||||| || ||||||| ||||| |||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  4330045 caatgatatcagccactatttaaccataataccttaacaaggaatatgattaaaatgatactaataaataaagttaga 4330122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 3 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 28884871 - 28884751
Alignment:
Q  3 cttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattattac 102  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||   |  ||| || |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||| ||| | ||||    
T  28884871 cttaattgcttttttggtcctctaactatttaattggttacggtttggtcctctaactaaaaaatgatttattttagtcctctaactttatcactgttac 28884772  T
Q  103 tacatttgatcctttctgtta 123  Q
     | ||||  ||||||||||||    
T  28884771 catatttcgtcctttctgtta 28884751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 3 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 32048630 - 32048510
Alignment:
Q  3 cttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattattac 102  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||  |  ||| || |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||| |||   ||||    
T  32048630 cttaattacttttttggtcctctaactatttatttgataacggtttggtcctctaactaaaaaatgatttatttttgtcctctaactttatcacagttac 32048531  T
Q  103 tacatttgatcctttctgtta 123  Q
     | |||| |||||||||||||    
T  32048530 catatttcatcctttctgtta 32048510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 6 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 4697244 - 4697163
Alignment:
Q  6 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaa 87  Q
    ||||||||||||  | | ||| |||||||||||||||   |||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4697244 aattacctttttaattcgctatctatttaattggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaa 4697163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 49838835 - 49838756
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtc 81  Q
    |||| |||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||   |||| || ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  49838835 ggctaaattacctttttgg-cctttaattatttaattggtatcagattggtcttctaactaaaaattgatttatttcggtc 49838756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 54 - 109
Target Start/End: Original strand, 49837424 - 49837479
Alignment:
Q  54 tctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattattactacattt 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||   |||||||||||    
T  49837424 tctaactaaaaattgatttatttcggtcccttaagtttctcaccgttactacattt 49837479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Original strand, 37466802 - 37466944
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    |||| |||||| |||||  | ||||||  ||||||||||||| | |||  |  |||||||||||||||||||||||  |||  | |||||| ||||| ||    
T  37466802 ggctaaattacattttttattctctaatcatttaattggtatcggattactgctctaactaaaaattgatttatttccgtc--ccaagtttttcattgtt 37466899  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaa 145  Q
    |||||||||  || |||||||||  |||| | ||| |||||||||    
T  37466900 actacatttagtcttttctgttaaatttaattaaaaaaacgttaa 37466944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 42
Target Start/End: Original strand, 45843320 - 45843360
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtat 42  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  45843320 ggcttaattacctttt-gatcctctaactatttaattggtat 45843360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 6 - 94
Target Start/End: Original strand, 43727278 - 43727366
Alignment:
Q  6 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctc 94  Q
    |||||||||||| ||||  |||||||||||||||| | |  ||||||   ||||||||  ||||||||||||| |||| ||| ||||||    
T  43727278 aattacctttttagtcccttaactatttaattggtttcggtttgatcccttaactaaattttgatttattttgatcctttaactttctc 43727366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 196; Significance: 1e-107; HSPs: 53)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 13193438 - 13193151
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   ||    
T  13193438 ggcttaattatatttttggtcctctaactatttaattggtatcagattgatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 13193339  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggtatatgtcctcatgtttcacacatacatatgaaccata 200  Q
    |||||||||  || ||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||  || |||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  13193338 actacatttagtcttttctattagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtgggtacctgacctcctatttcacacatacatatgaaccata 13193239  T
Q  201 acagttaccaataatatcagtcattatttaatcataacaccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 288  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13193238 acagttaccaataatatgagtcattatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 13193151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 288
Target Start/End: Original strand, 15405756 - 15406043
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||| || ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||   ||    
T  15405756 ggcttaattacatttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcttctaagtttctcaccgtt 15405855  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggtatatgtcctcatgtttcacacatacatatgaaccata 200  Q
    |||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15405856 actacatttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtgggtatctgacctcctgtttcacacatacatatgaaccata 15405955  T
Q  201 acagttaccaataatatcagtcattatttaatcataacaccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 288  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15405956 acagttaccaataatatcagtcactgtttaatcataataccttaacaagacatatgaccaaaataatactaataaataaagttagagg 15406043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 29472692 - 29472405
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||    
T  29472692 ggcttaaatacctttttggtcctctaactatttaattggtattggattgatcctctaacaaaaaattgatttattttggtcctctaaatttctcaccgtt 29472593  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggtatatgtcctcatgtttcacacatacatatgaaccata 200  Q
    |||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| |||  || |||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  29472592 actacatttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgagtacctgacctcctgtttcacacatacatatgaactata 29472493  T
Q  201 acagttaccaataatatcagtcattatttaatcataacaccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 288  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29472492 acaattaccaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 29472405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 2 - 288
Target Start/End: Original strand, 26181701 - 26181987
Alignment:
Q  2 gcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatta 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   |||    
T  26181701 gcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggaattggattggtccactaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtta 26181800  T
Q  102 ctacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggtatatgtcctcatgtttcacacatacatatgaaccataa 201  Q
    |||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||| |||| ||  ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26181801 ctacatatattcctttctgttagttttattcaaataaaccttaaggtttgtgttatgtgtgtatctgatctcctgtttcacacatacatatgaaccataa 26181900  T
Q  202 cagttaccaataatatcagtcattatttaatcataacaccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 288  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26181901 cagttactaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 26181987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 41474532 - 41474247
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| | |||  || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| | ||    
T  41474532 ggcttaattatctttttggtcctctaattatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctgagtttctcactgtt 41474433  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggtatatgtcctcatgtttcacacatacatatgaaccata 200  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  41474432 actacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtgagtatctgacctcctgtttcacacatacatatgaaccata 41474333  T
Q  201 acagttaccaataatatcagtcattatttaatcataacaccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttaga 286  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  41474332 acagttaccaatactatcagtcactatttaattataataccttaacaaggcataggatcaaaatgatactaataaataaagttaga 41474247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 4 - 288
Target Start/End: Original strand, 19815707 - 19815991
Alignment:
Q  4 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattattact 103  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| | |||| |  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||    
T  19815707 ttaattacatttttggtcctctaactatttagttggtatcggattggttctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttact 19815806  T
Q  104 acatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggtatatgtcctcatgtttcacacatacatatgaaccataaca 203  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||  ||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19815807 acatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttatgatttgtgttatgtgactatctgacctcttgtttcacacatacatatgaaccataaca 19815906  T
Q  204 gttaccaataatatcagtcattatttaatcataacaccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 288  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19815907 gttaccaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaggaatatgagcaaaatgatactaataaataaagtcagagg 19815991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 4 - 288
Target Start/End: Original strand, 2147888 - 2148173
Alignment:
Q  4 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaat-tgatttattttggtcctctaagtttctcattattac 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   |||| || ||||||||||||  |||||||||| || |||||||||||||||   ||||    
T  2147888 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattagtatcagattggtcctctaactaaaaaaatgatttatttcgggcctctaagtttctcaccgttac 2147987  T
Q  103 tacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggtatatgtcctcatgtttcacacatacatatgaaccataac 202  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||  || |||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  2147988 tacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtgggtacctgacctcctatttcacacatacatatgaaccataac 2148087  T
Q  203 agttaccaataatatcagtcattatttaatcataacaccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 288  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2148088 agttaccaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaagacatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 2148173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 288
Target Start/End: Original strand, 34735343 - 34735630
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   ||    
T  34735343 ggcttaataatctttttggtcctctaactatttagttggtatcgaattgatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 34735442  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggtatatgtcctcatgtttcacacatacatatgaaccata 200  Q
    |||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||  |  |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  34735443 actacatttagtcctttctattagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtacctagcctcctgtttcacacatacatatgaaccata 34735542  T
Q  201 acagttaccaataatatcagtcattatttaatcataacaccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 288  Q
    ||||||| |||| |||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34735543 acagttatcaattatatcagtcactatttaatcctaataccttaacaaggaataggaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 34735630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 4 - 288
Target Start/End: Original strand, 8173888 - 8174172
Alignment:
Q  4 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattattact 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   |||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||    
T  8173888 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattgatatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttact 8173987  T
Q  104 acatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggtatatgtcctcatgtttcacacatacatatgaaccataaca 203  Q
    ||||||  |||||||||||| |||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||  || |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8173988 acatttagtcctttctgttaattttattcaaatgaacgttagggtttgtgttatgtgggtacctgacctcctgtttcacacatacatatgaaccataaca 8174087  T
Q  204 gttaccaataatatcagtcattatttaatcataacaccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 288  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||  | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8174088 attaccaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaggaataaaaacaaaatgatactaataaataaagttagagg 8174172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 287
Target Start/End: Original strand, 7495980 - 7496265
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| | |||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||    
T  7495980 ggcttaattacatttttggtcctctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgtt 7496079  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggtatatgtcctcatgtttcacacatacatatgaaccata 200  Q
    |||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| || |||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  7496080 actatatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatatgggtatctgacctcctatttcacacatacatatgaaccata 7496179  T
Q  201 acagttaccaataatatcagtcattatttaatcataacaccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagag 287  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||   |||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  7496180 acagttaccaataatatcggtcactatttactcataa-ttcttaacaaggaataggaccaaaatgatgctaataaataaagttagag 7496265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 288
Target Start/End: Original strand, 24371967 - 24372254
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   ||    
T  24371967 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 24372066  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggtatatgtcctcatgtttcacacatacatatgaaccata 200  Q
    |||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| |||||||||||   | |||  |||||||||||||||||||||||| |    
T  24372067 actacatttagttctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtattatgtgggtacccgaccttctgtttcacacatacatatgaaccaaa 24372166  T
Q  201 acagttaccaataatatcagtcattatttaatcataacaccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 288  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||| || |||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24372167 acagttaccaataatatcagtcacaatttaatcataatactttaaaaaggaataggaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 24372254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 5 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 16305471 - 16305188
Alignment:
Q  5 taattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattattacta 104  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||| || |||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||   ||||||    
T  16305471 taattatctttttgatcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcaatcctctaagtttctcaccgttacta 16305372  T
Q  105 catttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggtatatgtcctcatgtttcacacatacatatgaaccataacag 204  Q
    |||||  || ||| ||||||||||||||||||||  ||||   |||||||||||||||||  || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16305371 catttagtcttttttgttagttttattcaaataagagttatggtttgtgttatgtgggtacctgacctcctgtttcacacatacatatgaaccataacag 16305272  T
Q  205 ttaccaataatatcagtcattatttaatcataacaccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 288  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||| | ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16305271 ttaccaataatatcaatcactatttaatcataatatcttaacaagacataagaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 16305188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 6 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 17052499 - 17052221
Alignment:
Q  6 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattattactac 105  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||    
T  17052499 aattacatgtttggtcctctaactatttaattggtattagattggtcctctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcaccnttactac 17052400  T
Q  106 atttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggtatatgtcctcatgtttcacacatacatatgaaccataacagt 205  Q
    ||||  || ||||||||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||   | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17052399 atttagtcatttctgttagtttcattcaaataaacgttagtgtttgtgttatgtgggtacccgacctcctgtttcacacatacatatgaaccataacagt 17052300  T
Q  206 taccaataatatcagtcattatttaatcataacaccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 288  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||      || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17052299 tatctataatatcagtcattatttaatcataataccttaac----gttaagaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 17052221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 12 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 36714024 - 36713751
Alignment:
Q  12 ctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattattactacatttga 111  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||   |||| ||| ||      
T  36714024 ctttttggttctctaactatttaattggtattgaattggtcctcaaactaaaaattgatttattttcgtcatctaggtttctcaccgttaccacacttag 36713925  T
Q  112 tcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggtatatgtcctcatgtttcacacatacatatgaaccataacagttaccaa 211  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36713924 tcatttctgtttgttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtgggtatctgacctcctgtttcacacatacatatgaaccataacagttaccaa 36713825  T
Q  212 taatatcagtcattatttaatcataacaccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 288  Q
    |||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  36713824 taatatcagtcacta-ttaatcataataccttaacaaggcatagaaccaaaatg--actaataaataaagttagagg 36713751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 54 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 10992248 - 10992014
Alignment:
Q  54 tctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattattactacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtg 153  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  10992248 tctaattaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtg 10992149  T
Q  154 ttatgtgggtatatgtcctcatgtttcacacatacatatgaaccataacagttaccaataatatcagtcattatttaatcataacaccttaacaaggcat 253  Q
    |||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||| ||||||||||||| | |||| |||| |||    
T  10992148 ttatgtgggtatctgacctcctgtttcacacatacatatgaaccataagagttaccaataatatttgtcactatttaatcataatatcttagcaagacat 10992049  T
Q  254 atgaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 288  Q
    | |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10992048 aggaccaaaatgatgctaataaataaagttagagg 10992014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 15744897 - 15744620
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||   |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||    
T  15744897 ggcttaattacatttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcaccgtt 15744798  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggtatatgtcctcatgtttcacacatacatatgaaccata 200  Q
    |||||||||  ||          |||||||| ||||||||||||   |||||||||| ||||||  || |||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  15744797 actacatttagtc----------gttttatttaaataaacgttagggtttgtgttatatgggtacctgacctcctatttcacacatacatatgaaccata 15744708  T
Q  201 acagttaccaataatatcagtcattatttaatcataacaccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 288  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15744707 acagttaccaataatatccgtcactatttaatcataataccttaacaaggaatatgaccaaaatgatgctaataaataaagttagagg 15744620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 2 - 288
Target Start/End: Original strand, 12860381 - 12860654
Alignment:
Q  2 gcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatta 101  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| | |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||    
T  12860381 gcttaattacatttttggtcctctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcaccgtta 12860480  T
Q  102 ctacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggtatatgtcctcatgtttcacacatacatatgaaccataa 201  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||| ||||||  || |||| | |||||||||||||||||||||        
T  12860481 ctacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatatgggtacctgacctcctatttcacacatacatatgaacc---- 12860576  T
Q  202 cagttaccaataatatcagtcattatttaatcataacaccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 288  Q
             |||||| | |||| ||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12860577 ---------ataatacccgtcactatttaatcataataccttaacaaggaataggaccaaaatgatgctaataaataaagttagagg 12860654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 24138068 - 24138282
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||   ||    
T  24138068 ggctaaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtccactaagtttctcaccgtt 24138167  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggtatatgtcctcatgtttcacacatacatatgaaccata 200  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||   ||||||||||||| ||| ||| |||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  24138168 actacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaatgttagggtttgtgttatgtgtgtacatgacctcctgtttcacacatacatatgagccata 24138267  T
Q  201 acagttaccaataat 215  Q
    |||||||||||||||    
T  24138268 acagttaccaataat 24138282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 4 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 7469605 - 7469329
Alignment:
Q  4 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattattact 103  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||   |||| |  |||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||           
T  7469605 ttaattacctttttggttctctaactatttagttggtatcagattggttctctaactaaaaattgatttatttcagtcgtctaagtttctcat------- 7469513  T
Q  104 acatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggtatatgtcctcatgtttcacacatacatatgaaccataaca 203  Q
     | |||  || ||| ||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||  |||| || |||| | ||||||||||||||||||||||||||     
T  7469512 -cgtttagtcatttatgttagttttattcaaataaacgttatggtttgtgttatgtaagtatctgacctcctctttcacacatacatatgaaccataacg 7469414  T
Q  204 gttaccaataatatcagtcattatttaatcataacaccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 288  Q
    |||| ||||||||||| | | ||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7469413 gttaacaataatatcactaactatttaatcataataccttaacaaggaataggaccaaaatgatactagtaaataaagttagagg 7469329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 33470373 - 33470211
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||    
T  33470373 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattgatcctctgactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgtt 33470274  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggt 163  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  33470273 actacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 33470211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Original strand, 36713588 - 36713750
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| | ||    
T  36713588 ggctaaattacctttttgatcctctaactatttaattggtatcggattgatcttctaactaaaaattgatttatttatgtcctctaaatttctcagtgtt 36713687  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggt 163  Q
    |||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  36713688 actacatttagtcttttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtgggt 36713750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 3 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 38333128 - 38332974
Alignment:
Q  3 cttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattattac 102  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||    
T  38333128 cttaattatctttttggtcctctaactatttaattggtatcggattgatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttac 38333029  T
Q  103 tacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttat 157  Q
    |||||||  || ||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  38333028 tacatttagtcatttctattagttttattcaaataaacgttaggatttgtgttat 38332974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 6 - 163
Target Start/End: Original strand, 15744462 - 15744619
Alignment:
Q  6 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattattactac 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | | |||||||    
T  15744462 aattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctaactgttactac 15744561  T
Q  106 atttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggt 163  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  15744562 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 15744619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 15406205 - 15406047
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | | ||    
T  15406205 ggctaaattacctttttg-tcctctaactatttaattggtattggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttcttactgtt 15406107  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtg 160  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  15406106 actacatttaatcttttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtg 15406047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Original strand, 29472242 - 29472401
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||   ||    
T  29472242 ggctcaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattggtcctctaactaaaaatagatttattttggtcctctaagtttctcaccgtt 29472341  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtg 160  Q
     ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  29472342 cctacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaggtttgtgttatgtg 29472401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Original strand, 10991851 - 10992013
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||   ||    
T  10991851 ggctaaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattgatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaaatttttcaccgtt 10991950  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggt 163  Q
    |||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  10991951 actacatttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttacagtttgtgttatgtgggt 10992013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 159
Target Start/End: Original strand, 13192988 - 13193146
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   |||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||    
T  13192988 ggctaaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgtt 13193087  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgt 159  Q
    |||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  13193088 actacatttagtcttttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgt 13193146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 34735793 - 34735631
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||  || ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| | ||    
T  34735793 ggctaaattacatttttggtcctctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctttaagtttctcactgtt 34735694  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggt 163  Q
    |||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  34735693 actatatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtgggt 34735631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 7496429 - 7496267
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||| | |||| || ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||   ||    
T  7496429 ggcttaattacatttttagtcctctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctttaagtttctcaccgtt 7496330  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggt 163  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  7496329 actacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 7496267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 19847768 - 19847606
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||| || |||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||   ||    
T  19847768 ggcttaattacatttttggtcatctaactatttagttggtattggattggtcctctaactaaaaattaatttatttcggtcttctaagtttctcaccgtt 19847669  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggt 163  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  19847668 actacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 19847606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 24372417 - 24372255
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   |||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||    
T  24372417 ggctaaattacatttttggtcctctaactatttaattggtatcagattagtcctctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcaccgtt 24372318  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggt 163  Q
    |||||||||  || |||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||    
T  24372317 actacatttagtcatttctgttagttttattcaaataaacattaggatttgtgttatgtgggt 24372255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 26182150 - 26181988
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    |||| |||||| ||||||||||| ||| |||||||||| ||| | |||| || ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | ||    
T  26182150 ggctaaattacatttttggtcctttaattatttaattgatatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggccctctaagtttctcactgtt 26182051  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggt 163  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  26182050 actacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtgggt 26181988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Original strand, 38332704 - 38332866
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    |||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   ||    
T  38332704 ggctaaattacatttttggttctctaactatttaattggtattggattgatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 38332803  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggt 163  Q
    |||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||   ||||| ||||||||||    
T  38332804 actatatttagtcctttctgttagttttattcaaataaatgttagggtttgttttatgtgggt 38332866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 4 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 2148333 - 2148174
Alignment:
Q  4 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattattact 103  Q
    |||| ||| ||||| ||| | |||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||    
T  2148333 ttaaatacattttttgtcatttaactatttaattggtatcggattgatcctctaactaaaaattgatttattttggtcctttaagtttctcatcgttact 2148234  T
Q  104 acatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggt 163  Q
    ||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||    
T  2148233 acatttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttctgttatgtgggt 2148174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 19816154 - 19815992
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||  || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |  |||    
T  19816154 ggctaaattacctttttggtcctcaaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttcagaccatt 19816055  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggt 163  Q
    |||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||    
T  19816054 actacatttagtcctttctgctagttttattcaaataaacgttagagtctgtgttatgtgggt 19815992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 6 - 163
Target Start/End: Original strand, 7469171 - 7469328
Alignment:
Q  6 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattattactac 105  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   |||  || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||    
T  7469171 aattacctttttggccctctaactatttaattggtatcagattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttactac 7469270  T
Q  106 atttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggt 163  Q
    ||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  7469271 atttagtcttttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 7469328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 4 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 30898748 - 30898588
Alignment:
Q  4 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattattact 103  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| | |||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   |||||    
T  30898748 ttaattacatttttggtcctctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttattttgttcctctaagtttctcaccgttact 30898649  T
Q  104 acatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggta 164  Q
    ||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||| ||||||    
T  30898648 acatttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttcgggtttgtgttatatgggta 30898588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Original strand, 16305025 - 16305187
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaatt-gatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattat 99  Q
    |||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| | ||| | || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||    
T  16305025 ggctaaattacatttttg-tcctctaactatttaattggtatcggatttggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcacaat 16305123  T
Q  100 tactacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggt 163  Q
    ||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  16305124 tactacatttagttctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 16305187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 177 - 288
Target Start/End: Original strand, 19847495 - 19847605
Alignment:
Q  177 tttcacacatacatatgaaccataacagttaccaataatatcagtcattatttaatcataacaccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaa 276  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||   |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  19847495 tttcacacatacatatgaaccataacagttaccaataatatcggtcactatttaatcataa-ttcttaacaaggaatatgaccaaaatgatgctaataaa 19847593  T
Q  277 taaagttagagg 288  Q
    ||||||||||||    
T  19847594 taaagttagagg 19847605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 8174335 - 8174173
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   |||| || |||||||||||||| |||||||| |||||| ||| |||||||   ||    
T  8174335 ggctaaattatctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattggtcctctaactaaaaattaatttatttcggtcctttaaatttctcaccgtt 8174236  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggt 163  Q
     ||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  8174235 tctacatttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 8174173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 31 - 161
Target Start/End: Original strand, 42834452 - 42834582
Alignment:
Q  31 tttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattattactacatttgatcctttctgttagttttat 130  Q
    |||||||||||| | |||| || ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||  || ||||||||||||||||    
T  42834452 tttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggttctctaagtttctcactattactacatttagtcttttctgttagttttat 42834551  T
Q  131 tcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgg 161  Q
    ||||||||||||||   ||||||||||||||    
T  42834552 tcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgg 42834582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 24138957 - 24138794
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  ||||  |  | ||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| | ||    
T  24138957 ggcttaattacctttttggtattctaactatttaattggtatcaaattagtactttaattaaaaattgatttatttcggtcttctaagtttctcactgtt 24138858  T
Q  101 actacatttgatccttt-ctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggt 163  Q
    |||||||||  || ||| |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  24138857 actacatttagtctttttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 24138794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 54 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 12860764 - 12860655
Alignment:
Q  54 tctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattattactacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtg 153  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||   |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||    
T  12860764 tctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgttactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttacggtttgtg 12860665  T
Q  154 ttatgtgggt 163  Q
    ||||||||||    
T  12860664 ttatgtgggt 12860655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 6 - 163
Target Start/End: Original strand, 41474087 - 41474244
Alignment:
Q  6 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattattactac 105  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| | || | || | ||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||| | ||| |||    
T  41474087 aattacatttttggtcttctaactatttaattggtatcggatcggtcctgtaattaaaaatttatttatttcggtcctctaagtttctcactgttattac 41474186  T
Q  106 atttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggt 163  Q
    ||||  || ||| ||||||||||||| ||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  41474187 atttagtcttttatgttagttttatttaaataaacgttagtgtttgtgttatgtgggt 41474244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 109
Target Start/End: Original strand, 17050929 - 17051037
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||   ||    
T  17050929 ggctaaattatctttttggtcctctaactatttaattggtattggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctcgaagtttctcaccgtt 17051028  T
Q  101 actacattt 109  Q
    |||||||||    
T  17051029 actacattt 17051037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 4 - 130
Target Start/End: Original strand, 8444825 - 8444951
Alignment:
Q  4 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattattact 103  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||| | |||| | ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||   |||||    
T  8444825 ttaattacctttttggtcttctaactatttagttgatatcggattggttatctaactaaaaattaatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttact 8444924  T
Q  104 acatttgatcctttctgttagttttat 130  Q
    ||||||  || ||||||||||||||||    
T  8444925 acatttagtcatttctgttagttttat 8444951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 207 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 38332948 - 38332867
Alignment:
Q  207 accaataatatcagtcattatttaatcataacaccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 288  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38332948 accaataatatcagtcactatttaatcataatatcttaacaaggcataggaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 38332867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 109
Target Start/End: Original strand, 17032593 - 17032701
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||   ||    
T  17032593 ggctaaattatctttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctcgaagtttctcaccgtt 17032692  T
Q  101 actacattt 109  Q
    |||||||||    
T  17032693 actacattt 17032701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 209 - 288
Target Start/End: Original strand, 24138714 - 24138793
Alignment:
Q  209 caataatatcagtcattatttaatcataacaccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 288  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24138714 caataatatcagtcactatttaatcataatatcttaacaaggcataggaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 24138793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 8963267 - 8963173
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctca 95  Q
    |||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| | |||| |  |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  8963267 ggctaaattacttttttggttctctaactatttaattggtatcggattggttctctaactaaaaattgatttattttggtcccttaagtttctca 8963173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 6 - 109
Target Start/End: Original strand, 8962365 - 8962468
Alignment:
Q  6 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattattactac 105  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||   |||| || ||||||||||||||||||||||| |||||   ||||||||||   |||||||    
T  8962365 aattatctttttggtcctctaactatttaattagtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtccctcaagtttctcaccgttactac 8962464  T
Q  106 attt 109  Q
    ||||    
T  8962465 attt 8962468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 6 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 8445234 - 8445131
Alignment:
Q  6 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatca-tctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattattacta 104  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||| | || ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| |||   ||||||    
T  8445234 aattaccttttttgtcctctaactatttaattggtatcggatt-agcactctaattaaaaattgatttacttcggtcctctaagtttatcacagttacta 8445136  T
Q  105 cattt 109  Q
    |||||    
T  8445135 cattt 8445131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 12 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 23992281 - 23992189
Alignment:
Q  12 ctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattattacta 104  Q
    |||||||||||   |||||||||||| |||| |  ||| ||  |||||||||| |||||||||||||||||  ||| |||||| || ||||||    
T  23992281 ctttttggtccctgaactatttaattagtatcggtttggtcccctaactaaaatttgatttattttggtcccttaaatttctctttgttacta 23992189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 61)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 3 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 15048847 - 15048562
Alignment:
Q  3 cttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattattac 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   ||||    
T  15048847 cttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttac 15048748  T
Q  103 tacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggtatatgtcctcatgtttcacacatacatatgaaccataac 202  Q
    |||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15048747 tacatttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttatgatttgtgttatgtgagtatctgacctcttgtttcacacatacatatgaaccataac 15048648  T
Q  203 agttaccaataatatcagtcattatttaatcataacaccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 288  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15048647 agttaccaataatatcaatcattatttaatcataataccttaacaaataatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 15048562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 3 - 286
Target Start/End: Original strand, 5434902 - 5435185
Alignment:
Q  3 cttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattattac 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||  |||||||||||||   ||||    
T  5434902 cttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcggattgatcctctacctaaaatttgatttatttcggttttctaagtttctcaccgttac 5435001  T
Q  103 tacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggtatatgtcctcatgtttcacacatacatatgaaccataac 202  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  5435002 tacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtatctgacctcctgtttcacacatacatatgaaccataac 5435101  T
Q  203 agttaccaataatatcagtcattatttaatcataacaccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttaga 286  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5435102 agttaccaataatatttgtcattatttaattataataccttaactaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttaga 5435185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 3 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 38589035 - 38588750
Alignment:
Q  3 cttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattattac 102  Q
    ||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   ||||    
T  38589035 cttaattatttttttggttctctaactatttaattggtattggattgatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttac 38588936  T
Q  103 tacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggtatatgtcctcatgtttcacacatacatatgaaccataac 202  Q
    || ||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||||   ||||| |||||||||||  || |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  38588935 tagatttagtcctttatgttaattttattcaaataaacgttagggtttgtattatgtgggtacctgacctcttgtttcacacatacatatgaaccataac 38588836  T
Q  203 agttaccaataatatcagtcattatttaatcataacaccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 288  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38588835 agttaccaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaggcataggaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 38588750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 288
Target Start/End: Original strand, 15871621 - 15871908
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| | ||    
T  15871621 ggcttaattacctttttggtcctttaactatttaattgatatcggattggtcctctaactaaaaattaatttattttggtcctctaaatttctcactgtt 15871720  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggtatatgtcctcatgtttcacacatacatatgaaccata 200  Q
    |||||||||  || ||| ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||  || |||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  15871721 actacatttagtcatttatgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtacctgacctcctgtttcacacatacacatgaaccata 15871820  T
Q  201 acagttaccaataatatcagtcattatttaatcataacaccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 288  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15871821 acagttaccaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaagacataggaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 15871908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 288
Target Start/End: Original strand, 27473072 - 27473358
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||   |||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   ||    
T  27473072 ggcttaattatctttttggtcctctaactatttagttgatatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcacg-tt 27473170  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggtatatgtcctcatgtttcacacatacatatgaaccata 200  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| || |||| || |||||||||||||||||||||||    
T  27473171 actacatttaatcatttctgttagttttattcaaataaacattatgatttgtgttatgtgggtatctgacctcttgcttcacacatacatatgaaccata 27473270  T
Q  201 acagttaccaataatatcagtcattatttaatcataacaccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 288  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27473271 acagttaccaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaggaataagaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 27473358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 2 - 288
Target Start/End: Original strand, 5152536 - 5152821
Alignment:
Q  2 gcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatta 101  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||   |||| || ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  5152536 gcttaattacctttttgatcctctaactgtttaattggtatcagattggtcctctgactaaaaattgatttattt-ggtcctctaagtttctcattgtta 5152634  T
Q  102 ctacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggtatatgtcctcatgtttcacacatacatatgaaccataa 201  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| || |||| ||||||| | |||||||||||||||||    
T  5152635 ctacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtatctgacctcctgtttcatatatacatatgaaccataa 5152734  T
Q  202 cagttaccaataatatcagtcattatttaatcataacaccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 288  Q
    ||||||||||||||||  |||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5152735 cagttaccaataatatttgtcactatttaatcataataccttaagaaggcatatgaccaaaatgatactagtaaataaagttagagg 5152821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 287
Target Start/End: Original strand, 37569314 - 37569601
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   ||    
T  37569314 ggcttgattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 37569413  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggtatatgtcctcatgtttcacacatacatatgaaccata 200  Q
    |||||||||  || |||||||||||||||||| |||||||||||   ||| |||||||||||||  || |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  37569414 actacatttagtcatttctgttagttttattcgaataaacgttatggtttttgttatgtgggtacctgacctcctgtttcacacatacatatgaaccata 37569513  T
Q  201 acagttaccaataatatcagtcatta-tttaatcataacaccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagag 287  Q
    |||||||||||| |||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37569514 acagttaccaatcatatcagtcactattttaatcataataccttaacaagacatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagag 37569601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 288
Target Start/End: Original strand, 45276597 - 45276883
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||    
T  45276597 ggcttaattatctttttggtcctctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcatcgtt 45276696  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggtatatgtcctcatgtttcacacatacatatgaaccata 200  Q
    |||||||||  || ||| | ||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||  || |||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  45276697 actacatttagtcatttatattagttttattcaaataaatgttagggtttgtgttatgtgggta-ctgacctcctgttccacacatacatatgaaccata 45276795  T
Q  201 acagttaccaataatatcagtcattatttaatcataacaccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 288  Q
    | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45276796 atagttaccaataatatcagtcactatttaatcataatactttaacaaggaatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 45276883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 34470994 - 34470714
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   ||    
T  34470994 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttttcaccgtt 34470895  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggtatatgtcctcatgtttcacacatacatatgaaccata 200  Q
     ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||  ||   || ||||||||||||||||| ||| ||||    
T  34470894 gctacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaggtttgtgttatgtgggtacctgagttcctgtttcacacatacataagaatcata 34470795  T
Q  201 acagttaccaataatatcagtcattatttaatcataacaccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaag 281  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  34470794 acagttaccaataatatctgtcactatttaatcataataccttaacaaggaatatgatcaaaatgatactaataaataaag 34470714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 4 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 40048501 - 40048218
Alignment:
Q  4 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattattact 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||  |||||| ||||||| | ||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||   |||||    
T  40048501 ttaattacctttttgatcctctagttatttagttggtatcgtattgatcctctaactaaaaattgttttattttgatcctctaagtttctcaccgttact 40048402  T
Q  104 acatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggtatatgtcctcatgtttcacacatacatatgaaccataaca 203  Q
    ||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||  || |||| ||||||||||||||| ||||||||||||     
T  40048401 acatttagtcttttctgttagttttattcaaataaacgttaaggtttgtgttatgtgggtacctgacctcctgtttcacacataca-atgaaccataacg 40048303  T
Q  204 gttaccaataatatcagtcattatttaatcataacaccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 288  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40048302 gttatcaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaatgaatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 40048218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 286
Target Start/End: Original strand, 11707750 - 11708035
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||   |||| || ||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||| | ||    
T  11707750 ggcttaattatctttttgatcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttgtttcgatcctctaagtttctcactgtt 11707849  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggtatatgtcctcatgtttcacacatacatatgaaccata 200  Q
    | |||||||  || ||||| ||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  11707850 aatacatttagtcatttctcttagttttattcaaataaatgttagggtttgtgttatgtgggtatttgtccttctgtttcacacatacatatgaaccata 11707949  T
Q  201 acagttaccaataatatcagtcattatttaatcataacaccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttaga 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11707950 acagttaccaataatatcagtcattatttaatcataataccttaacaaaacataagatcaaaatgatactaataaataaagttaga 11708035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 1870385 - 1870099
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   || |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   ||    
T  1870385 ggcttaattacatttttggtcctctaactatttaattggtataagatagatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaaagtt 1870286  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggtatatgtcctcatgtttcacacatacatatgaaccata 200  Q
    |||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| |   | |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  1870285 actacatttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggcaccagacctcctgtttcacacatacatatgaaccata 1870186  T
Q  201 acagttaccaataatatcagtcattatttaatc--ataacaccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttag 285  Q
    || ||||| |||||||||||||| |||||||||  |||| || |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1870185 acggttactaataatatcagtcactatttaatcatataatacattaataaggcataagaccaaaatgatactaataaataaagttag 1870099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 5 - 288
Target Start/End: Original strand, 1739952 - 1740235
Alignment:
Q  5 taattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattattacta 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||  || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||| ||    
T  1739952 taattacctttttggtcctctaactatttaatcggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttatta 1740051  T
Q  105 catttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggtatatgtcctcatgtttcacacatacatatgaaccataacag 204  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||   || |||| | ||||||||||||| ||||| ||||| |     
T  1740052 catttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgtcaagatttgtgctatgtgggtgcctgacctcctatttcacacatacaaatgaaacataagaa 1740151  T
Q  205 ttaccaataatatcagtcattatttaatcataacaccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 288  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||| ||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1740152 ttaccaataatatcagtcactatttaatcataatatcttaacgagatatatgaccaaaatgatactaacaaataaagttagagg 1740235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 4 - 288
Target Start/End: Original strand, 44594604 - 44594888
Alignment:
Q  4 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattattact 103  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||  |||| || | ||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||| |  |  |||||    
T  44594604 ttaattacatttttggtcctctaattatttaattgctattagattggtcctttaactaaaaattgatttatttcggtcctttaaatttatattcgttact 44594703  T
Q  104 acatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggtatatgtcctcatgtttcacacatacatatgaaccataaca 203  Q
    ||||||  |  ||||||||||||||||||| |||||| ||| | |||||| ||||||||||  || |||| | ||||||||||| |||||||||||||||    
T  44594704 acatttagttatttctgttagttttattcatataaacattagagtttgtgctatgtgggtacttgacctcctatttcacacatatatatgaaccataaca 44594803  T
Q  204 gttaccaataatatcagtcattatttaatcataacaccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 288  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  44594804 gttaccaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaagacatagaaccaaaataatactaataaataaagttagagg 44594888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 288
Target Start/End: Original strand, 1646501 - 1646794
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||| |  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||    
T  1646501 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattggttctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgtt 1646600  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggtatatgtcctcatgtttcacac------atacatatga 194  Q
    |||| ||||  || |||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||| |||||||||   || |||| | ||||||||      ||||| ||||    
T  1646601 actatatttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgtcaaggtttgtgctatgtgggtgcctgacctcctatttcacacatacaaatacaaatga 1646700  T
Q  195 accataacagttaccaataatatcagtcattatttaatcataacaccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 288  Q
    | ||| ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| | |||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1646701 aacattacaattacccataatatcagtcactatttaatcataatatcttaacgagatatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 1646794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 288
Target Start/End: Original strand, 45077221 - 45077490
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||                 
T  45077221 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattgatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaa------------- 45077307  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggtatatgtcctcatgtttcacacatacatatgaaccata 200  Q
          |||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| || |||| | |||||||||||||| || ||||||    
T  45077308 ------tttagtcctttatgttagttttattcaaataaacgttatggtttgtgttatgtgggtatctgacctcctctttcacacatacatgtggaccata 45077401  T
Q  201 aca-gttaccaataatatcagtcattatttaatcataacaccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 288  Q
    | | |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45077402 aaaagttaccaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaggcataagaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 45077490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 4 - 288
Target Start/End: Original strand, 7534845 - 7535120
Alignment:
Q  4 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattattact 103  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| ||| | |||  || | ||| ||||||||||||||||| |||| | |||||||||||   ||| |    
T  7534845 ttaattacctttttggtcttctaattatttagttgatatcggattagtcctttaattaaaaattgatttatttcggtcatttaagtttctcaccgttagt 7534944  T
Q  104 acatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggtatatgtcctcatgtttcacacatacatatgaaccataaca 203  Q
             ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  7534945 ---------cctttctgttagttttattcaaataaacgttaggatttgtgttatgtgggtatctggcctcctgtttcacacatacatatgaaccataaca 7535035  T
Q  204 gttaccaataatatcagtcattatttaatcataacaccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 288  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  7535036 gttacaaataatatcagtcattatttaatcataatacgttaacgaggaataagaccaaaatgatactaataaataaagctagagg 7535120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 2 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 27669868 - 27669579
Alignment:
Q  2 gcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatta 101  Q
    ||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||   |||| || ||||||||||||||||||||||| | || | |||||||| || | |||    
T  27669868 gcttaattatcttttta-tcctctaactatttaattggtatcagattggtcttctaactaaaaattgatttatttcgatctt-taagtttcacactgtta 27669771  T
Q  102 ctacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggtatatgtcctcatgtttcacacatacatatgaaccataa 201  Q
    ||||||||  || |||||||||||||||||||||||| | |||   |||||||||||||||||  || |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27669770 ctacatttagtcatttctgttagttttattcaaataatcattagggtttgtgttatgtgggtacctgacctcctgtttcacacatacatatgaaccataa 27669671  T
Q  202 -----cagttaccaataatatcagtcattatttaatcataacaccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 288  Q
         ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27669670 attaacagttaccaataacatcagtcactatttaatcataataatttaacaaggtatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 27669579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Original strand, 33819785 - 33819975
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   ||    
T  33819785 ggctaaattacctttttggtcctctaattatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 33819884  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggtatatgtcctcatgtttcacacatacata 191  Q
    |||||||||  || ||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  33819885 actacatttagtcatttctattagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtgggtatatgacctcctgtttcacacatacata 33819975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 40659983 - 40660183
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | ||    
T  40659983 ggctaaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcgaattagtcatctaactaaaaattgatttatttcagtcctctaagtttctcactgtt 40660082  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggtatatgtcctcatgtttcacacatacatatgaaccata 200  Q
    |||||||||  || |||||  |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||  || |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  40660083 actacatttagtcttttctaatagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtggatacctgacctcctgtttcacacatacatatgaaccata 40660182  T
Q  201 a 201  Q
    |    
T  40660183 a 40660183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 7535283 - 7535124
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   |||  || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||    
T  7535283 ggctaaattatctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcatcgtt 7535184  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtg 160  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  7535183 actacatttaatcctttatgttagttttattcaaataaacgttatagtttgtgttatgtg 7535124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 1646956 - 1646818
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||    
T  1646956 ggcttaattacctttttcgtcctctaactatttaattggtatcggattggtcatctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgtt 1646857  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaa 139  Q
    |||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||    
T  1646856 actacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa 1646818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 45077653 - 45077491
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||   |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  45077653 ggctaaattacctttttggtcctctaactatttgattagtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcactgtt 45077554  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggt 163  Q
    |||||||||  || ||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  45077553 actacatttagtcatttctattagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtgggt 45077491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 4 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 1652018 - 1651860
Alignment:
Q  4 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattattact 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||    
T  1652018 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttact 1651919  T
Q  104 acatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggt 163  Q
    ||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| ||||   ||||||||||||||||    
T  1651918 acatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggt 1651860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 4 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 1740394 - 1740236
Alignment:
Q  4 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattattact 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||    
T  1740394 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttact 1740295  T
Q  104 acatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggt 163  Q
    ||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| ||||   ||||||||||||||||    
T  1740294 acatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggt 1740236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Original strand, 15048399 - 15048561
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||  || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |   ||    
T  15048399 ggctaaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctgaccgtt 15048498  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggt 163  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| ||||||||||||    
T  15048499 actacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttttgttatgtgggt 15048561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Original strand, 38588588 - 38588749
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    |||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   ||    
T  38588588 ggctaaattaccttttcg-tcctctaactatttaattggtattagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 38588686  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggt 163  Q
    |||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  38588687 actacatttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtgggt 38588749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 6 - 163
Target Start/End: Original strand, 1432136 - 1432293
Alignment:
Q  6 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattattactac 105  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   |||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||    
T  1432136 aattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttactac 1432235  T
Q  106 atttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggt 163  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||| |||||    
T  1432236 atttaatcatttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatttgggt 1432293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 6 - 163
Target Start/End: Original strand, 7949417 - 7949574
Alignment:
Q  6 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattattactac 105  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   |||| || | ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||    
T  7949417 aattatctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattggtcttttaattaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttactac 7949516  T
Q  106 atttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggt 163  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  7949517 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtgggt 7949574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 4 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 40660333 - 40660179
Alignment:
Q  4 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattattact 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||    
T  40660333 ttaattacctttttggtcctctaactatttagttgttatcgaattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttact 40660234  T
Q  104 acatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatg 158  Q
    | ||||  || |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||    
T  40660233 atatttagtcttttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatg 40660179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 176 - 288
Target Start/End: Original strand, 33295859 - 33295971
Alignment:
Q  176 gtttcacacatacatatgaaccataacagttaccaataatatcagtcattatttaatcataacaccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataa 275  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  33295859 gtttcacacatacatatgaatcataacagttatcaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaggaatatgatcaaaatgatactaataa 33295958  T
Q  276 ataaagttagagg 288  Q
    |||||||||||||    
T  33295959 ataaagttagagg 33295971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 161 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 1432421 - 1432294
Alignment:
Q  161 ggtatatgtcctcatgtttcacacatacatatgaaccataacagttaccaataatatcagtcattatttaatcataacaccttaacaaggcatatgacca 260  Q
    ||||| || |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| || |||||||||||||||| ||    
T  1432421 ggtatctgacctcctgtttcacacgtacatatgaaccataacagttaccaataatatcagtcactatttaaacataatacattaacaaggcatatgatca 1432322  T
Q  261 aaatgatactaataaataaagttagagg 288  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||    
T  1432321 aaatgatattaataaataaagttagagg 1432294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 33296134 - 33295975
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||  || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||   ||    
T  33296134 ggctaaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattagtcctctaactaaaaattaatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 33296035  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtg 160  Q
    |||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  33296034 actacatttagtcttttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtg 33295975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 15872071 - 15871909
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||   |||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||    
T  15872071 ggctaaattacatttttggtcctctaactatttaatttgtatcagattggtcctctaaataaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgtt 15871972  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggt 163  Q
    |||||||||  || ||| |||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  15871971 actacatttagtcttttttgttagttttattcaaataaacgttagagcttgtgttatgtgggt 15871909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 27473521 - 27473363
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   |||  || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   ||    
T  27473521 ggctaaattacctttttggtcctctaacaatttaattggtatcagattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 27473422  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgt 159  Q
    |||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||    
T  27473421 actacatttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgt 27473363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 45277046 - 45276884
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||  || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||   ||    
T  45277046 ggctaaattatctttttggtcctctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaatttatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 45276947  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggt 163  Q
    |||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||    
T  45276946 actacatttagtcttttctgttagttttattcaaataaacgttagggattgtgttatgtgggt 45276884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 148 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 7949715 - 7949575
Alignment:
Q  148 tttgtgttatgtgggtatatgtcctcatgtttcacac-atacatatgaaccataacagttaccaataatatcagtcattatttaatcataacaccttaac 246  Q
    |||||||||||||||||| || |||| | ||||| || |||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  7949715 tttgtgttatgtgggtatctgacctcctatttcagaccatacatatgaacaata-cagttatcaataatatcagtcactatttaatcataataccttaac 7949617  T
Q  247 aaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 288  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7949616 aaggcataagaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 7949575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 144
Target Start/End: Original strand, 1869934 - 1870076
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||   ||    
T  1869934 ggctaaattacctttttg-tcctctaactatttaattggtatcagattgatcctctaactaaaaattaatttatttcggttctctaagtttctcaccgtt 1870032  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgtta 144  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1870033 actacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgtta 1870076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 5435350 - 5435188
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| | |||| |  ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||   ||    
T  5435350 ggctaaattatctttttggtcctctaactatataattggtatcggattggtgctctaactaaaaattgatttatttcggtcctttaagtttctcaccgtt 5435251  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggt 163  Q
    |||||||||  ||  || |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  5435250 actacatttagtcacttttgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtgggt 5435188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 6 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 11174079 - 11173941
Alignment:
Q  6 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattattactac 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||    
T  11174079 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatctgattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttactac 11173980  T
Q  106 atttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgtta 144  Q
    ||||  || ||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  11173979 atttagtcttttatgttagttttattcaaataaatgtta 11173941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 6 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 5152978 - 5152822
Alignment:
Q  6 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattattactac 105  Q
    ||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| | |||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   ||| |||    
T  5152978 aattacctttttg-tcctctgactgtttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttattac 5152880  T
Q  106 atttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggt 163  Q
    ||||  |  |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||    
T  5152879 atttagttttttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatatgggt 5152822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 44595050 - 44594891
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    |||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||  || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |   ||    
T  44595050 ggctaaattatctttttg-tcctctaactatttaattgatattggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctaaccgtt 44594952  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgg 161  Q
    |||||||||  || |||| |||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||    
T  44594951 actacatttagtcatttcggttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgg 44594891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 25 - 163
Target Start/End: Original strand, 27669440 - 27669578
Alignment:
Q  25 taactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattattactacatttgatcctttctgttag 124  Q
    |||||||||||||||||| | |||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| | ||| |||||||  |||||||||||||    
T  27669440 taactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaaatttctcactgttagtacatttagtcctttctgttag 27669539  T
Q  125 ttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggt 163  Q
    ||||||| ||||||||||||   ||| ||||||||||||    
T  27669540 ttttattgaaataaacgttagggtttatgttatgtgggt 27669578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 138 - 288
Target Start/End: Original strand, 1651709 - 1651859
Alignment:
Q  138 aacgttaaaatttgtgttatgtgggtatatgtcctcatgtttcacacatacatatgaaccataacagttaccaataatatcagtcattatttaatcataa 237  Q
    ||||| || ||||||| |||||||||   || |||| | ||||||||||||| ||||| ||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1651709 aacgtcaagatttgtgctatgtgggtgcctgacctcctatttcacacatacaaatgaaacataagaattaccaataatatcagtcactatttaatcataa 1651808  T
Q  238 caccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 288  Q
     | |||||| ||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1651809 tatcttaacgagatatatgaccaaaatgatactaacaaataaagttagagg 1651859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 170 - 284
Target Start/End: Original strand, 24659365 - 24659479
Alignment:
Q  170 cctcatgtttcacacatacatatgaaccataacagttaccaataatatcagtcattatttaatcataacaccttaacaaggcatatgaccaaaatgatac 269  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||  |||||||||||||| |||||||||| || ||||||| |||||| | ||||||||||||||    
T  24659365 cctcctgtttcacacatacatattaactataacagttagtaataatatcagtcactatttaatcagaataccttaataaggcagaggaccaaaatgatac 24659464  T
Q  270 taataaataaagtta 284  Q
    |||||||||||||||    
T  24659465 taataaataaagtta 24659479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 14 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 37569752 - 37569622
Alignment:
Q  14 ttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattattactacatttgatc 113  Q
    ||||| || ||||| |||||||||| ||| | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||| || |||||| ||||  ||    
T  37569752 ttttgatcttctaagtatttaattgatatcggattgatcatctaattaaaaatttatttattttggtcctctaaatttctcgttgttactatatttagtc 37569653  T
Q  114 ctttctgttagttttattcaaataaacgtta 144  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  37569652 ttttcagttagttttattcaaataaacgtta 37569622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 69 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 18298611 - 18298520
Alignment:
Q  69 atttattttggtcctctaagtttctcattattactacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtg 160  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  18298611 atttattttggtcctctaagtttctcacaattactacatttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtg 18298520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 22763383 - 22763275
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||| || ||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||   ||    
T  22763383 ggctaaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcccttaagtttctcaccgtt 22763284  T
Q  101 actacattt 109  Q
    |||||||||    
T  22763283 actacattt 22763275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 11920222 - 11920136
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaa 87  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11920222 ggctaaattacctttttggtcatctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttgggtcctctaa 11920136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 24666128 - 24666042
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaa 87  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  ||| || | |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24666128 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtaacggtttggtcctttaactaaaaaatgatttattttggtcctctaa 24666042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 159
Target Start/End: Original strand, 40048067 - 40048217
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    |||| |||||| |||||| |  |||||||||||||||| ||||| |||  || |||||||||||||| |||||||||| | |||||| | |        |    
T  40048067 ggctaaattacttttttgataatctaactatttaattgatattggattagtcctctaactaaaaattaatttattttgattctctaactgt--------t 40048158  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgt 159  Q
    |||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  40048159 actacatttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttaaagtttgtgttatgt 40048217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 12643966 - 12643888
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttgg 79  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| || ||| || |||||||||| |||||||||||||||    
T  12643966 ggcttaattatctttttggtcctctaactatttaatttgtatcgatttggtcctctaactaaatattgatttattttgg 12643888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 83
Target Start/End: Original strand, 24652823 - 24652905
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcct 83  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |  ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24652823 ggcttaattacatttttggtcctctaactatttaattggtaacggtttggtcctctaactaaaaaatgatttattttggtcct 24652905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 4 - 127
Target Start/End: Original strand, 33295739 - 33295862
Alignment:
Q  4 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattattact 103  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||| || ||||| ||||||||||||||||| |||  ||||||||| |||   ||| |    
T  33295739 ttaatgacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcttctaattaaaaattgatttatttcggtattctaagtttgtcaccgttatt 33295838  T
Q  104 acatttgatcctttctgttagttt 127  Q
    ||||||  || |||||||||||||    
T  33295839 acatttagtcatttctgttagttt 33295862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 3 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 33820062 - 33819975
Alignment:
Q  3 cttaattacctttttgg-tcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagt 89  Q
    |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||    
T  33820062 cttaattacctttttttatcctctaactatttaattggtatcggattgatcatctaactaaaaattaatttatttcagtcttctaagt 33819975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 15741682 - 15741603
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggt 80  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |  ||| || ||||||||||  |||||||||||||||    
T  15741682 ggcttaattacctttttggtcccttaactatttaattggtatcggtttggtcctctaactaaattttgatttattttggt 15741603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 95
Target Start/End: Original strand, 22762525 - 22762607
Alignment:
Q  13 tttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctca 95  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| ||| ||||| ||||||||||||||||| | |||  |||||||||||    
T  22762525 tttttggtcatctaactatttaattggtatcggattaatcctctaattaaaaattgatttatttcgatcccttaagtttctca 22762607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 177 - 288
Target Start/End: Original strand, 18298416 - 18298516
Alignment:
Q  177 tttcacacatacatatgaaccataacagttaccaataatatcagtcattatttaatcataacaccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaa 276  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||  |||| ||||||||||||| ||||           ||||  |||||||||||||||||    
T  18298416 tttcacacatacatatgaatcataacagttactaataatatttgtcactatttaatcataatacct-----------atgattaaaatgatactaataaa 18298504  T
Q  277 taaagttagagg 288  Q
    ||||||||||||    
T  18298505 taaagttagagg 18298516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Original strand, 15740613 - 15740705
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttct 93  Q
    ||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||| |  ||| ||  |||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||    
T  15740613 ggcttaattgcctttttggtccattaactatttaattagtatcggtttggtcccctaactaaaatttgatttattttggtcccttaagtttct 15740705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 225 - 288
Target Start/End: Original strand, 11173858 - 11173921
Alignment:
Q  225 tatttaatcataacaccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 288  Q
    |||||| |||||| |||||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11173858 tatttattcataataccttaacaaagcatagaacccaaatgatactaataaataaagttagagg 11173921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 60
Target Start/End: Original strand, 11920076 - 11920135
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaact 60  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||| || |||||||    
T  11920076 ggcttaattacatttttggtcctctaactatttatttggttttggattggtcctctaact 11920135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 94)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 3 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 54752611 - 54752326
Alignment:
Q  3 cttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattattac 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||| |  ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||  ||||    
T  54752611 cttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggttctctaactaaaaattgatttatttcggtgctctaagtttctcatcgttac 54752512  T
Q  103 tacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggtatatgtcctcatgtttcacacatacatatgaaccataac 202  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||  || |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  54752511 tacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtgggtacctgacctcctgtttcacacatacatatgaaccataac 54752412  T
Q  203 agttaccaataatatcagtcattatttaatcataacaccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 288  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54752411 agttaccaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaagaatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 54752326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 288
Target Start/End: Original strand, 26318182 - 26318469
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| | |||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   ||    
T  26318182 ggcttaattacctttttagtcctctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 26318281  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggtatatgtcctcatgtttcacacatacatatgaaccata 200  Q
    |||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  26318282 actacatttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttatgatttgtgttatgtgagtatttgacctcttgtttcacacatacatatgaaccata 26318381  T
Q  201 acagttaccaataatatcagtcattatttaatcataacaccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 288  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26318382 acagttaccaataatattagtcactatttaatcataataccttaacaaagaatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 26318469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 288
Target Start/End: Original strand, 51509119 - 51509406
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||| || ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||   ||    
T  51509119 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcgatcctctaagtttctcaccgtt 51509218  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggtatatgtcctcatgtttcacacatacatatgaaccata 200  Q
     ||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| || |||| | |||||||| |||||||||||||||    
T  51509219 cctacatttagtcctttatgttagttttattcaaataaacgttaggatttgtgttatgtgggtatctgacctcctatttcacacgtacatatgaaccata 51509318  T
Q  201 acagttaccaataatatcagtcattatttaatcataacaccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 288  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51509319 acagttaccaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaggaatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 51509406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 288
Target Start/End: Original strand, 54107902 - 54108189
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   ||    
T  54107902 ggctttattacctttttggtcatctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 54108001  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggtatatgtcctcatgtttcacacatacatatgaaccata 200  Q
    |||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||  ||  ||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  54108002 actacatttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtgggtacctgagctcctgtttcacacatacctatgaaccata 54108101  T
Q  201 acagttaccaataatatcagtcattatttaatcataacaccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 288  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54108102 acagttaccaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaagacatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 54108189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 288
Target Start/End: Original strand, 39664184 - 39664471
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| || |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||   ||    
T  39664184 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaaatgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 39664283  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggtatatgtcctcatgtttcacacatacatatgaaccata 200  Q
    |||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||  || |||| | |||||||||||||||||||| |||    
T  39664284 actacatttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtacctgacctcttatttcacacatacatatgaactata 39664383  T
Q  201 acagttaccaataatatcagtcattatttaatcataacaccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 288  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39664384 acatttaccaataatatcagtcattatttaatcataataccttaacaaggcatagaaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 39664471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 42592234 - 42591947
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| || ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||   ||    
T  42592234 ggcttaattacatttttggtcctctaactatttagttggtatcaaattggtcctctaactaaaaattgatttatttcgatcctctaagtttctcaccgtt 42592135  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggtatatgtcctcatgtttcacacatacatatgaaccata 200  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| |||||||| ||| || |||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  42592134 actacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgttttatgtggatatctgacctcctctttcacacatacatatgaaccata 42592035  T
Q  201 acagttaccaataatatcagtcattatttaatcataacaccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 288  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42592034 acagttaccaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaggaatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 42591947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 4 - 288
Target Start/End: Original strand, 10505951 - 10506235
Alignment:
Q  4 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattattact 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||  || | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||    
T  10505951 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattagtcctttaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccattact 10506050  T
Q  104 acatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggtatatgtcctcatgtttcacacatacatatgaaccataaca 203  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| || ||||||  || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10506051 acatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgtcatatgggtacctgacctcctgtttcacatatacatatgaaccataaca 10506150  T
Q  204 gttaccaataatatcagtcattatttaatcataacaccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 288  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10506151 attaccaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 10506235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 289
Target Start/End: Original strand, 12203551 - 12203839
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||| | ||    
T  12203551 ggcttaattaccttttttatcctctaactatttaattggtatcggattggtcatctaactaaaaattggtatatttcggtcctctaagtttctcactgtt 12203650  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggtatatgtcctcatgtttcacacatacatatgaaccata 200  Q
    |||||||||  || ||||||||| ||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  12203651 actacatttagtcttttctgttaattttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtatctgacctcctgtttcacacatacatatgaaccata 12203750  T
Q  201 acagttaccaataatatcagtcattatttaatcataacaccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggt 289  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12203751 acagttaccaataatatcagtcactgtttaatcataataccttaacaaaacatattaccaaaatgatactaataaataaagttagaggt 12203839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 22202066 - 22201779
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   |||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   ||    
T  22202066 ggcttaattatctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcacggtt 22201967  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggtatatgtcctcatgtttcacacatacatatgaaccata 200  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||   ||| || |||||||||| ||| | || ||||||| ||||||||||||||||||    
T  22201966 actacatttaatcatttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttatgctatgtgggtacatgacatcctgtttcatacatacatatgaaccata 22201867  T
Q  201 acagttaccaataatatcagtcattatttaatcataacaccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 288  Q
    | ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22201866 atagttaccaataatattagtcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 22201779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 53716743 - 53716456
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||| || ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||| |||    
T  53716743 ggcttaattacctttttggtcatctaactatttaattggtatcagattggtcttctaactaaaaattgatttatttcggtcctttaagtttatcatcatt 53716644  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggtatatgtcctcatgtttcacacatacatatgaaccata 200  Q
    |||||||||  || ||| |||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||  || |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  53716643 actacatttagtcatttatgttagttttattcaaattaacgttagggtttgtgttatgtgggtacctgacctcctgtttcacacatacatatgaaccata 53716544  T
Q  201 acagttaccaataatatcagtcattatttaatcataacaccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 288  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53716543 acagttaccaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaagacataggaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 53716456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 27801939 - 27801652
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||| | ||    
T  27801939 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcgaattggtcctctaattaaaaaatgatttatttcggtcctctaagtttctcactgtt 27801840  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggtatatgtcctcatgtttcacacatacatatgaaccata 200  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||  || |||  | ||||||||||||||||||||||||    
T  27801839 actacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtacctgaccttctatttcacacatacatatgaaccata 27801740  T
Q  201 acagttaccaataatatcagtcattatttaatcataacaccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 288  Q
    ||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27801739 acaattatcaataatatcagtcactatttaatcataatactttaacaaggcatagaaccaaaatgatattaataaataaagttagagg 27801652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 3 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 29818625 - 29818340
Alignment:
Q  3 cttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattattac 102  Q
    |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||   |||| || ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||   ||||    
T  29818625 cttaattacctttttgatcttctaattatttaattggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctttaagtttctcaccgttac 29818526  T
Q  103 tacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggtatatgtcctcatgtttcacacatacatatgaaccataac 202  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  29818525 tacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggattgtgttatgtgggtatttgacctcctgtttcacacatacatatgaaccataac 29818426  T
Q  203 agttaccaataatatcagtcattatttaatcataacaccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 288  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29818425 agttaccaataatatcagtcactatttaatcataataccttaataaaacatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 29818340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 20 - 288
Target Start/End: Original strand, 8473865 - 8474133
Alignment:
Q  20 tcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattattactacatttgatcctttct 119  Q
    ||||||||||||||| ||||||| | |||| || ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| | |||||||||||  || |||||    
T  8473865 tcctctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtactctaagtttctcactgttactacatttagtcatttct 8473964  T
Q  120 gttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggtatatgtcctcatgtttcacacatacatatgaaccataacagttaccaataatatca 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8473965 gttagttttattcaaataaacgttatgatttgtgttatgtgagtatctgacctcttgtttcacacatacatatgaaccataacagttatcaataatatca 8474064  T
Q  220 gtcattatttaatcataacaccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 288  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8474065 gtcactatttaatcataataccttaacaaagaatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 8474133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 18464906 - 18464626
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||   ||    
T  18464906 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcgaattggtcttctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgtt 18464807  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggtatatgtcctcatgtttcacacatacatatgaaccata 200  Q
    |||||||||  || ||||| |||||||||||||||||||| |||   |||||||||||||||||  || |||  ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  18464806 actacatttagtcatttctattagttttattcaaataaacattagggtttgtgttatgtgggtacctgaccttctgtttcacatatacataggaaccata 18464707  T
Q  201 acagttaccaataatatcagtcattatttaatcataacaccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaag 281  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18464706 acagttaccaataatatcagtcactatttaaccataataccttaacaatgcatatgaccaaaatgatactaataaataaag 18464626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 2 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 16932055 - 16931769
Alignment:
Q  2 gcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatta 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||  || |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||   |||    
T  16932055 gcttaattacctttttggtcctctaactttttaattggtatcggatttgtcctctaactaaaaattgatttatttctgtcctctaagtttctcaccgtta 16931956  T
Q  102 ctacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggtatatgtcctcatgtttcacacatacatatgaaccataa 201  Q
    ||||||||  || ||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||| || ||| ||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16931955 ctacatttagtcttttctgttagtcttattcaaataaacgttagagtttgtgtcatatggctatctgacctcctgtttcacacatacatatgaaccataa 16931856  T
Q  202 cagttaccaataatatcagtcattatttaatcataacaccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 288  Q
    ||| |||||||||||||||| | ||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16931855 cagctaccaataatatcagtaactatttaatcttaataccttaacaagacatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 16931769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 22152297 - 22152008
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactat--ttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcatta 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||   ||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| |     
T  22152297 ggcttaattacctttttggtcctctaactatatttagttggtatcagattgatcctctaactaaaaattgatttatttcagtcctctgagtttctcactg 22152198  T
Q  99 ttactacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggtatatgtcctcatgtttcacacatacatatgaacca 198  Q
    |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||| ||||||| || |||  ||||||||||||||||||||||||    
T  22152197 ttactacatttagtcgtttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatatgggtatctgaccttctgtttcacacatacatatgaacca 22152098  T
Q  199 taacagttaccaataatatcagtcattatttaatcataacaccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 288  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22152097 taatagttaccaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaatgaataggaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 22152008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 5 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 11256549 - 11256266
Alignment:
Q  5 taattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattattacta 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||| || |||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||   ||||||    
T  11256549 taattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattggtcctctaactaaaaaatgatttatttcggtcctttaagtttctcaccgttacta 11256450  T
Q  105 catttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggtatatgtcctcatgtttcacacatacatatgaaccataacag 204  Q
     ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||   ||| || |||||||| |  || |||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11256449 aatttagtcctttttgttagttttattcaaataaacgttagggtttatgctatgtgggcacttgacctcctatttcacacatacatatgaaccataacag 11256350  T
Q  205 ttaccaataatatcagtcattatttaatcataacaccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 288  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11256349 ttaccaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaggcataggaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 11256266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 21569195 - 21568908
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||  || ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||   ||    
T  21569195 ggcttgattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcgatcctctaagtttctcaccgtt 21569096  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggtatatgtcctcatgtttcacacatacatatgaaccata 200  Q
    |||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||  || |||  |||||||||||||||||||||||||     
T  21569095 actacatttagtcttttctgttagttttattcaaataaatgttagggtttgtgttatgtgggtacttgaccttctgtttcacacatacatatgaaccatt 21568996  T
Q  201 acagttaccaataatatcagtcattatttaatcataacaccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 288  Q
    | ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21568995 atagttaccaataatattagtcactatttaatcataatatcttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaggttagagg 21568908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 24429017 - 24428730
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||| || ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||   ||    
T  24429017 ggcttaattacctttttggtcatctaactatttaattggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcttctaagtttctcaccgtt 24428918  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggtatatgtcctcatgtttcacacatacatatgaaccata 200  Q
    |||||||||  || ||| ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||  || |||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  24428917 actacatttagtcttttatgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtacctgacctcctgtttcacacatacatatgaagcata 24428818  T
Q  201 acagttaccaataatatcagtcattatttaatcataacaccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 288  Q
    | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24428817 atagttaccaataatatcagtcactatttaatcataataccttaagaaggcataggagcaaaatgatactaataaattaagttagagg 24428730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 4 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 44894187 - 44893903
Alignment:
Q  4 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattattact 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||  || ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||   |||||    
T  44894187 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggacctctaagtttctcaccgttact 44894088  T
Q  104 acatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggtatatgtcctcatgtttcacacatacatatgaaccataaca 203  Q
    ||||||  || ||| |||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||| ||| || |||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  44894087 acatttagtcttttatgttagttttattcaaataaacattagagtttgtgttatgtggatatctgacctcctatttcacacatacatatgaaccataaca 44893988  T
Q  204 gttaccaataatatcagtcattatttaatcataacaccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 288  Q
     |||||||| |||||||||| ||||| ||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44893987 attaccaatgatatcagtcactatttgatcataatatcttaacaagacatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 44893903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 288
Target Start/End: Original strand, 4757494 - 4757780
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| || | |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  4757494 ggcttaattacatttttggtcctctaactatttagttggaatcggattggtcctctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcaccatt 4757593  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggtatatgtcctcatgtttcacacatacatatgaaccata 200  Q
    |||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| || |||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  4757594 actacatttattcttttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtatctgacctcctatttcacacatacatatgaaccata 4757693  T
Q  201 acagttaccaataatatcagtcattatttaatcataacaccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 288  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||   |||| ||||| |||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4757694 acagttaccaataatatcggtcactatttgatcataa-ttcttatcaaggaatagaaccaaaatgatgctaataaataaagttagagg 4757780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 4773692 - 4773405
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||    
T  4773692 ggcttaatcatctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattgatcctctaactaaaaattgatttattttggtcttctaagtttctcactgtt 4773593  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggtatatgtcctcatgtttcacacatacatatgaaccata 200  Q
    |||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||| ||  |||||| ||||||||| | || |||| | ||||||||||||| ||||| ||||    
T  4773592 actacatttagtcctttatgttagttttattcaaataaacgtcaaggtttgtgctatgtgggtgtctgacctcctatttcacacatacaaatgaaacata 4773493  T
Q  201 acagttaccaataatatcagtcattatttaatcataacaccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 288  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||| ||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4773492 acaattaccaataatatcagtcactatttaatcataatatcttaacgagatataggaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 4773405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 288
Target Start/End: Original strand, 5900423 - 5900710
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||| | |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||    
T  5900423 ggcttaattacatttttggtcatctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcaccgtt 5900522  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggtatatgtcctcatgtttcacacatacatatgaaccata 200  Q
    |||||||||  || ||||| ||||||||||||||||||||||||   |||||||||| ||||||  || |||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  5900523 actacatttagtcatttctattagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatatgggtacctgacctcctatttcacacatacatatgaaccata 5900622  T
Q  201 acagttaccaataatatcagtcattatttaatcataacaccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 288  Q
    ||| ||||||| |||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5900623 acaattaccaaaaatatccgtcactatttaatcataataccttaacaaggaataggaccaaaatgatgctaataaataaagttagagg 5900710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 288
Target Start/End: Original strand, 47303019 - 47303305
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    ||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||   || ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||   ||    
T  47303019 ggcttaattacttttttgatcatctaactatttaattggtattgaatcagtcctctaattaaaaattaatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 47303118  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggtatatgtcctcatgtttcacacatacatatgaaccata 200  Q
    |||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||| || |||| ||||||||| ||||||||||| ||||    
T  47303119 actacatttagtcatttctgttagttttattcaaataaatgttagggtttgtgttatgtgggtatctgacctcctgtttcacatatacatatgaatcata 47303218  T
Q  201 acagttaccaataatatcagtcattatttaatcataacaccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 288  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  47303219 acagttaccaataatatcagtcactatttaatcataataccttaataaggcatatgatcaaaatgata-taataaataaagttagagg 47303305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 47669709 - 47669422
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||| |  |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||   ||    
T  47669709 ggcttaattatctttttggtcctctaactatttatttggtatcggattggttctctaactaaaaattaatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 47669610  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggtatatgtcctcatgtttcacacatacatatgaaccata 200  Q
    |||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| |  || |||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  47669609 actacatttagtccttactgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggcacctgacctcctgtttcacacacacatatgaaccata 47669510  T
Q  201 acagttaccaataatatcagtcattatttaatcataacaccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 288  Q
    ||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47669509 acagttatcaataatatctatcactatttaatcataatatcttaacaaggaatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 47669422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 68 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 39241741 - 39241521
Alignment:
Q  68 gatttattttggtcctctaagtttctcattattactacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggtatat 167  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |    
T  39241741 gatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagaatttgtgttatgtgggtacct 39241642  T
Q  168 gtcctcatgtttcacacatacatatgaaccataacagttaccaataatatcagtcattatttaatcataacaccttaacaaggcatatgaccaaaatgat 267  Q
    | |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  39241641 gacctcctgtttcacacatacatatgaaccataacaattatcaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaagacataagaccaaaatgat 39241542  T
Q  268 actaataaataaagttagagg 288  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  39241541 actaataaataaagttagagg 39241521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 54 - 286
Target Start/End: Original strand, 41834979 - 41835211
Alignment:
Q  54 tctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattattactacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtg 153  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   ||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||   ||||||    
T  41834979 tctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttactacatttaatcctttctgttagttgtatttaaataaacgttagggtttgtg 41835078  T
Q  154 ttatgtgggtatatgtcctcatgtttcacacatacatatgaaccataacagttaccaataatatcagtcattatttaatcataacaccttaacaaggcat 253  Q
    |||||||||||  || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || || ||||||||| ||    
T  41835079 ttatgtgggtacttgacctcctgtttcacacatacatatgaaccataacagttaccaataatatcagtcactatttaatcaaaatacattaacaaggaat 41835178  T
Q  254 atgaccaaaatgatactaataaataaagttaga 286  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41835179 atgaccaaaatgatactaataaataaagttaga 41835211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 288
Target Start/End: Original strand, 1994169 - 1994455
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| | |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||    
T  1994169 ggcttaattacatttttggtcctctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcaccgtt 1994268  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggtatatgtcctcatgtttcacacatacatatgaaccata 200  Q
     ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||| ||||||  || |||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  1994269 gctacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttcgggtttgtgttatatgggtacctgacctcctatttcacacatacatatgaaccata 1994368  T
Q  201 acagttaccaataatatcagtcattatttaatcataacaccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 288  Q
    ||||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||   |||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1994369 acagttatcaataatatcgctcactatttaatcataa-ttcttaacaaggaataggaccaaaatgatgctaataaataaagttagagg 1994455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 15986684 - 15986399
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||| | |||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   ||    
T  15986684 ggcttaattaactttttggtcctctaattatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 15986585  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggtatatgtcctcatgtttcacacatacatatgaaccata 200  Q
    |||||||||  |||||||  | ||||||||||||||||||||||   |||||||||||| ||||  || |||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  15986584 actacatttagtcctttcaataagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtaggtacctgacctcctgtatcacacatacatatgaaccata 15986485  T
Q  201 acagttaccaataatatcagtcattatttaatcataacaccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagag 287  Q
    | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15986484 atagttaccaataatatcagtcactatttaatcataataccttaac-acgaataggaccaaaatgatactaataaataaagttagag 15986399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 4 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 19883686 - 19883406
Alignment:
Q  4 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattattact 103  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| | |||| |  |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||   |||||    
T  19883686 ttaattaccttttta-tcctctaactatttaattggtatcggattggttctctaactaaaaaatgatttatttcggtcctctaagtttctcacagttact 19883588  T
Q  104 acatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggtatatgtcctcatgtttcacacatacatatgaaccataaca 203  Q
    |||||| ||| ||| | ||| ||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||  || |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19883587 acatttaatcgtttttattaattttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtacctgacctcctgtttcacacatacatatgaaccataaca 19883488  T
Q  204 gttaccaa-taatatcagtcattatttaatcataacaccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagtta 284  Q
     ||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19883487 tttaccaattaatatcagtcactatttaatcataataccttaacaagacttagaaccaaaatgatactaataaataaagtta 19883406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 3 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 21970079 - 21969792
Alignment:
Q  3 cttaattacctttttggtcctctaactat--ttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||  ||| |||||||   |||| || |||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||||||| | ||    
T  21970079 cttaattacatttttggtcctctaactatatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattcatttatttcagtcctctgagtttctcactgtt 21969980  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggtatatgtcctcatgtttcacacatacatatgaaccata 200  Q
    |||||||||  || ||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||  || |||  | ||||||||||||||||||||||||    
T  21969979 actacatttagtcatttctgttagttttatttaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtacctgaccttctatttcacacatacatatgaaccata 21969880  T
Q  201 acagttaccaataatatcagtcattatttaatcataacaccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 288  Q
    | ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21969879 atagttaccaataatatcagtcactatttaaacataataccttaacaaggaataagaccaaaacgatactaataaataaagttagagg 21969792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 3 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 21992515 - 21992228
Alignment:
Q  3 cttaattacctttttggtcctctaactat--ttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||  ||| |||||||   |||| || |||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||||||| | ||    
T  21992515 cttaattacatttttggtcctctaactatatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattcatttatttcagtcctctgagtttctcactgtt 21992416  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggtatatgtcctcatgtttcacacatacatatgaaccata 200  Q
    |||||||||  || ||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||  || |||  | ||||||||||||||||||||||||    
T  21992415 actacatttagtcatttctgttagttttatttaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtacctgaccttctatttcacacatacatatgaaccata 21992316  T
Q  201 acagttaccaataatatcagtcattatttaatcataacaccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 288  Q
    | ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21992315 atagttaccaataatatcagtcactatttaaacataataccttaacaaggaataagaccaaaacgatactaataaataaagttagagg 21992228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 29 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 46153032 - 46152778
Alignment:
Q  29 tatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattattactacatttgatcctttctgttagtttt 128  Q
    |||||| ||||||| |||||| |  ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||   ||||||||  || ||| ||||||||||    
T  46153032 tatttagttggtatcgaattggttctctaactaaaaattgatttatttcggtcctataagtttctcacta---ctacatttagtcatttatgttagtttt 46152936  T
Q  129 attcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggtatatgtcctcatgtttcacacatacatatgaaccataacagttaccaataatatcagtcattatt 228  Q
    ||||||||||||||| |  ||||||||||||| |||| || |||| | |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  46152935 attcaaataaacgttgaggtttgtgttatgtgagtatctgacctcctctttcacacgtacatatgaaccataaccgttaccaataatatcagtcactatt 46152836  T
Q  229 taatcataacaccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttaga 286  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46152835 taatcataataccttaacaaggaatatgaccaaaatgatactaataaataaagttaga 46152778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 74 - 288
Target Start/End: Original strand, 32633138 - 32633352
Alignment:
Q  74 ttttggtcctctaagtttctcattattactacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggtatatgtcctc 173  Q
    |||| ||||| |||||||||||   |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||   ||| || ||||||||||  || ||||    
T  32633138 tttttgtcctttaagtttctcaccgttactacatttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttatgatatgtgggtacctgacctc 32633237  T
Q  174 atgtttcacacatacatatgaaccataacagttaccaataatatcagtcattatttaatcataacaccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaat 273  Q
     ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  32633238 ctgtttcacacatacatatgaatcataacagttaccaataatatcagtcactatttaatcataatatcttaacaagaaatatgaccaaaatgatactaat 32633337  T
Q  274 aaataaagttagagg 288  Q
    |||||||||||||||    
T  32633338 aaataaagttagagg 32633352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Original strand, 1999328 - 1999534
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| | |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||    
T  1999328 ggcttaattacatttttggtcctctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcaccgtt 1999427  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggtatatgtcctcatgtttcacacatacatatgaaccata 200  Q
     ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||| ||||||  || |||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  1999428 gctacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttcgggtttgtgttatatgggtacctgacctcctatttcacacatacatatgaaccata 1999527  T
Q  201 acagtta 207  Q
    |||||||    
T  1999528 acagtta 1999534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 10506398 - 10506236
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||    
T  10506398 ggctaaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgtt 10506299  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggt 163  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  10506298 actacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 10506236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 6 - 163
Target Start/End: Original strand, 39241363 - 39241520
Alignment:
Q  6 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattattactac 105  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||    
T  39241363 aattacatttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactac 39241462  T
Q  106 atttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggt 163  Q
    ||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  39241463 atttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttaatgtttgtgttatgtgggt 39241520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 56 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 39951748 - 39951524
Alignment:
Q  56 taactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattattactacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgtt 155  Q
    |||||||||||||||||||||   | |||||||||| |||   ||| |||||||  || ||||||||    | |||| ||||||| |||   |||| |||    
T  39951748 taactaaaaattgatttatttcaattctctaagtttttcaacgttattacatttagtcatttctgtt----tcattcgaataaacattaggttttgagtt 39951653  T
Q  156 atgtgggtatatgtcctcatgtttcacacatacatatgaaccataacagttaccaataatatcagtcattatttaatcataacaccttaacaaggcatat 255  Q
    |||||||||| || |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  39951652 atgtgggtatctgacctcctgtttcacacatatatatgaaccataacagttatcaataatatcagtcactatttaatcataatatcttaacaaggcatat 39951553  T
Q  256 gaccaaaatgatactaataaataaagtta 284  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  39951552 gaccaaaatgatactaataaataaagtta 39951524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 4757943 - 4757781
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| | |||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   ||    
T  4757943 ggcttaattacatttttggtcctctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 4757844  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggt 163  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  4757843 actacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 4757781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 54108352 - 54108190
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||    
T  54108352 ggctaaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcagtgtt 54108253  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggt 163  Q
    | |||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  54108252 attacatttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 54108190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 6 - 163
Target Start/End: Original strand, 47669264 - 47669421
Alignment:
Q  6 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattattactac 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||  || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||   |||||||    
T  47669264 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattaatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttactac 47669363  T
Q  106 atttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggt 163  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  47669364 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaggtttgtgttatgtgggt 47669421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 5900873 - 5900711
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| | |||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   ||    
T  5900873 ggctaaattacatttttggtcctctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 5900774  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggt 163  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  5900773 actacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 5900711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 159
Target Start/End: Original strand, 18464456 - 18464614
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    |||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||    
T  18464456 ggctaaattacatttttgctcctctaactatttaattggtattggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgtt 18464555  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgt 159  Q
    |||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||    
T  18464556 actacatttagtcctttatgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgt 18464614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Original strand, 42591784 - 42591946
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||  || ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| | ||    
T  42591784 ggctaaattacctttttggtcctctaactatttaatcggtatcggatttgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcttctaagtttctcactgtt 42591883  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggt 163  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  42591884 actacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 42591946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Original strand, 44893740 - 44893902
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    |||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   ||    
T  44893740 ggctaaattatctttttggttctctaactatttaattggtatcggattggtcttctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 44893839  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggt 163  Q
    |||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  44893840 actacatttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtgggt 44893902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 3 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 1994616 - 1994456
Alignment:
Q  3 cttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattattac 102  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||   |||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||    
T  1994616 cttaattacatttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttac 1994517  T
Q  103 tacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggt 163  Q
    |||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  1994516 tacatttagtcctttctgttatttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 1994456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 6 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 12203996 - 12203840
Alignment:
Q  6 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattattactac 105  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||    
T  12203996 aattaccgttttggtcccctaactatttaattggtatcggattgatcctctaattaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttactac 12203897  T
Q  106 atttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtggg 162  Q
    ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  12203896 atttagtcctttctgatagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtggg 12203840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 13 - 161
Target Start/End: Original strand, 27801501 - 27801649
Alignment:
Q  13 tttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattattactacatttgat 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||| ||||  |    
T  27801501 tttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactagatttatt 27801600  T
Q  113 cctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgg 161  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||    
T  27801601 cctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttctgttatgtgg 27801649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 6 - 160
Target Start/End: Original strand, 22201621 - 22201775
Alignment:
Q  6 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattattactac 105  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||   |||||||    
T  22201621 aattacatttttggtcctctaactatttaattggtatcggattgatcctctaaataaaaattgatttatttctgtcctctaagtttctcaccgttactac 22201720  T
Q  106 atttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtg 160  Q
    ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  22201721 atttagtcctttctgttaggtttattcaaataaacgttaaggtttgtgttatgtg 22201775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 26318632 - 26318470
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |   ||    
T  26318632 ggctaaattacctttttggtcatctaactatttaattggtatcggattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctgaccgtt 26318533  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggt 163  Q
    |||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  26318532 actacatttagtcttttctgttagttttattcaaataaacgttagtgtttgtgttatgtgggt 26318470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 32633515 - 32633353
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||| || | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   ||    
T  32633515 ggctaaattatctttttggtcctctaactatttaattgttatcggattggtcctttaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 32633416  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggt 163  Q
    |||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  32633415 actacatttagtcctttatgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtgggt 32633353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 6 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 8474291 - 8474134
Alignment:
Q  6 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattattactac 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| | |   |||||||    
T  8474291 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcgaattagtcctctaattaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatgaccgttactac 8474192  T
Q  106 atttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggt 163  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  8474191 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagtgtttgtgttatgtgggt 8474134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 102 - 236
Target Start/End: Original strand, 28986261 - 28986395
Alignment:
Q  102 ctacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggtatatgtcctcatgtttcacacatacatatgaaccataa 201  Q
    ||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| || |||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  28986261 ctacatttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggtatctgacctcctctttcacacatacatatgaaccataa 28986360  T
Q  202 cagttaccaataatatcagtcattatttaatcata 236  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28986361 cagttaccaataatatcagtcactatttaatcata 28986395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 39664634 - 39664472
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||   ||    
T  39664634 ggctaaattacatttttggtcctctaactatttaattggtatcagattgatcctctaactaaaaattaatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 39664535  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggt 163  Q
    |||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||| | ||| ||||||||||||    
T  39664534 actacatttagtcttttctgttagttttattcaaataaatgttagagtttctgttatgtgggt 39664472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Original strand, 54752163 - 54752325
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   |||| || | ||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||   ||    
T  54752163 ggctaaattatctttttggtcctctaactatttaattggtataagattggtcctgtaactaaaaattgatttatttcggtcatataagtttctcaccgtt 54752262  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggt 163  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||||    
T  54752263 actacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacattatggtttgtgttatgtgggt 54752325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 161
Target Start/End: Original strand, 21568746 - 21568906
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    |||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   ||    
T  21568746 ggctaaattatctttttgatcctctaactatttaattggtatcggattgatcctctaattaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 21568845  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgg 161  Q
    |||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| ||||   ||||||||||||||    
T  21568846 actacatttagtcatttctgttagttttattcaaataaatgttagggtttgtgttatgtgg 21568906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Original strand, 46152615 - 46152771
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    |||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||| || |||||  || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||     
T  46152615 ggctaaattacatctttggtcctctaactatttaattggcatcgaattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccatc 46152714  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttat 157  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||    
T  46152715 actacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttat 46152771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 4 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 47303463 - 47303323
Alignment:
Q  4 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattattact 103  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||| || ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||   |||||    
T  47303463 ttaattacatttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaagtaaaaattgatttattttggtcctttaagtttctcaccgttact 47303364  T
Q  104 acatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgtta 144  Q
    ||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47303363 acatttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgtta 47303323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Original strand, 11256103 - 11256262
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||| | |||||||| | |||| ||||||||||||  ||    
T  11256103 ggcttaattacctttttagtcctctaactatttaattggtatcggattgatcctctaactaaaaaataatttatttcgatcctttaagtttctcatcgtt 11256202  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtg 160  Q
    |||||||||  |||||| || ||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||    
T  11256203 actacatttagtcctttttgatagttttattcaaataaacgttagagtttctgttatgtg 11256262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 6 - 157
Target Start/End: Original strand, 29818182 - 29818333
Alignment:
Q  6 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattattactac 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||  || ||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| | |||||||    
T  29818182 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattagtcctctaaataaaaattgatttatttcgatcctctaagtttctcactgttactac 29818281  T
Q  106 atttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttat 157  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||    
T  29818282 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttat 29818333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 45307142 - 45306999
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   ||    
T  45307142 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattgatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 45307043  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgtta 144  Q
    |||||||||  || ||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  45307042 actacatttagtcatttttgttagttttattcaaataaatgtta 45306999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Original strand, 4773243 - 4773381
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   ||    
T  4773243 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattgatcctctaattaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 4773342  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaa 139  Q
    |||| ||||  |||||| |||||||||||||||||||||    
T  4773343 actatatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa 4773381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 12 - 162
Target Start/End: Original strand, 53716305 - 53716455
Alignment:
Q  12 ctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattattactacatttga 111  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||   |||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||| |||||     
T  53716305 cttttttgtcctctaactatttaattggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttactatatttgg 53716404  T
Q  112 tcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtggg 162  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||    
T  53716405 tcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttacgtggg 53716455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 12791626 - 12791473
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||   ||    
T  12791626 ggctaaattatctttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaattaaaaattgatttatttcggtcctctaaatttctcaccgtt 12791527  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgt 154  Q
    |||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  12791526 actacatttagtcttttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtgt 12791473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 6 - 163
Target Start/End: Original strand, 21969634 - 21969791
Alignment:
Q  6 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattattactac 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||  || ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||   |||||||    
T  21969634 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtaacagattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcttctaagtttctcaccgttactac 21969733  T
Q  106 atttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggt 163  Q
    ||||  |||||| ||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  21969734 atttagtcctttttgttacttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtgggt 21969791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 6 - 163
Target Start/End: Original strand, 21992070 - 21992227
Alignment:
Q  6 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattattactac 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||  || ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||   |||||||    
T  21992070 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtaacagattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcttctaagtttctcaccgttactac 21992169  T
Q  106 atttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggt 163  Q
    ||||  |||||| ||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  21992170 atttagtcctttttgttacttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtgggt 21992227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 161
Target Start/End: Original strand, 24428567 - 24428727
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||   |||| || ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| | ||    
T  24428567 ggctaaattatctttttggtcctctaactattcaattggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcgatcctctaagtttctcactgtt 24428666  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgg 161  Q
    |||||||||  || ||||| |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||    
T  24428667 actacatttagtcatttctattagttttattcaaataaacgttgggatttgtgttatgtgg 24428727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 144
Target Start/End: Original strand, 45306832 - 45306975
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||  || ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| | ||    
T  45306832 ggctaaattacctttttgatcctctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaatttgatttatttcggtcctctaagtttctcactgtt 45306931  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgtta 144  Q
    |||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  45306932 actatatttagtcctttctgttagttttattcaaataaatgtta 45306975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Original strand, 15986235 - 15986397
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    |||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||  ||  ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   ||    
T  15986235 ggctaaattatctttttgatcctctaactatttaattggtatcggattagtcccctagctaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 15986334  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggt 163  Q
    ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||    
T  15986335 actgcatttagtcctttctgttagttttattcaaataaatgttagagtttgtgttatgtgggt 15986397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 28986591 - 28986436
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||| || | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||    
T  28986591 ggctaaattacctttttggtcctctaattatttaattggtatcggattggtcctttaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgtt 28986492  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttat 157  Q
    |||| ||||  || ||||| ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||    
T  28986491 acta-atttagtcatttctattagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttat 28986436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 44317665 - 44317537
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   ||    
T  44317665 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcggtttggtcctctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttatcaccgtt 44317566  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagtttta 129  Q
    |||| ||||  ||||||||||||||||||    
T  44317565 actatatttcgtcctttctgttagtttta 44317537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 6 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 41835371 - 41835233
Alignment:
Q  6 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattattactac 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |  | ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||    
T  41835371 aattacctttttggtcctctaactatttaattgatattgaattagttctttaattaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttactac 41835272  T
Q  106 atttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgtta 144  Q
    ||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  41835271 atttagtcctttctattagttttatttaaataaacgtta 41835233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 129
Target Start/End: Original strand, 49528149 - 49528277
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   ||    
T  49528149 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcggtttggtcctctagctaaaaattgatttattttggtcctctaagtttatcaccgtt 49528248  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagtttta 129  Q
    |||| ||||  ||||||||||||||||||    
T  49528249 actatatttcgtcctttctgttagtttta 49528277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Original strand, 16931606 - 16931768
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaatt-ggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattat 99  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||  || ||| |  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   |    
T  16931606 ggctaaattacatttttggtcctctaactatttaatttggtacgga-ttggtgctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgt 16931704  T
Q  100 tactacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggt 163  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| ||||||   ||||||||||||||||    
T  16931705 tactacatttagtcctttctgttagttttatacaaatatacgttagggtttgtgttatgtgggt 16931768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 4 - 129
Target Start/End: Original strand, 13866023 - 13866148
Alignment:
Q  4 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattattact 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||   |||||    
T  13866023 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcggtttggtcctctaactaaaaattgatttattttggtcctttaagtttatcaccgttact 13866122  T
Q  104 acatttgatcctttctgttagtttta 129  Q
    | ||||  ||||||||||||||||||    
T  13866123 atatttcgtcctttctgttagtttta 13866148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 14 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 51509555 - 51509407
Alignment:
Q  14 ttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattattactacatttgatc 113  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| | |||||||||||  ||    
T  51509555 tttttgtcctccaactatttaattggtattggattagtc-tctaactaaaaattgatttatttcggtcatctaagtttctcactgttactacatttagtc 51509457  T
Q  114 ctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggt 163  Q
     ||||||||||||||||||||||||| ||||   ||||| ||||||||||    
T  51509456 ttttctgttagttttattcaaataaatgttagggtttgtattatgtgggt 51509407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Original strand, 22151845 - 22152007
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    |||  || ||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||   ||    
T  22151845 ggctaaattacatttttggtcctataactatttaattggtaacagattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggttttctaagtttctcaccgtt 22151944  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggt 163  Q
    |||||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||    
T  22151945 actacatttagtcctttttgttaattttattcaaataaacgatagagtttgtgttatgtgggt 22152007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 14 - 119
Target Start/End: Original strand, 7163463 - 7163568
Alignment:
Q  14 ttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattattactacatttgatc 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||   |||||||||||  ||    
T  7163463 ttttggtcctctaactatttaattggtattggattggtcatctaactaaaaattaatttatttcggtcctctaagtttctcacagttactacatttagtc 7163562  T
Q  114 ctttct 119  Q
    ||||||    
T  7163563 ctttct 7163568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Original strand, 39951357 - 39951519
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    |||| ||||||| ||||| || ||| |||||||||||||||| | |||  || ||||| ||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||  ||    
T  39951357 ggctaaattacccttttgatcatctgactatttaattggtatcggattagtcctctaattaaaaattgatttatttcgatcctttaagtttctcatcgtt 39951456  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggt 163  Q
    |||| ||||  | |||| ||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||    
T  39951457 actatatttagttctttatgttagttttattcaaataaatgttagagtttgtgttatgtgggt 39951519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 20963675 - 20963545
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||| |  |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||  | ||    
T  20963675 ggcttaattgcctttttggtcccttaactatttaattagtatcggtttgatcctctaactaaaatttgatttattttggtcctttaagtttctctctgtt 20963576  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttatt 131  Q
    ||| | |||  ||||||| ||||||||||||    
T  20963575 acttcttttagtcctttccgttagttttatt 20963545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Original strand, 28985509 - 28985603
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctca 95  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   |||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  28985509 ggcttaattacccttttggtcctctaactatttaattggtatcagattggtcctctaactaaaatttgatttatttcggtcctataagtttctca 28985603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 7681574 - 7681447
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatca-tctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattat 99  Q
    |||| ||||||  |||||||||||||| |||||||||||||| | |||  ||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   |    
T  7681574 ggctaaattacacttttggtcctctaattatttaattggtatcggattagtccctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgt 7681475  T
Q  100 tactacatttgatcctttctgttagttt 127  Q
    |||||||||   ||||||||||||||||    
T  7681474 tactacattcagtcctttctgttagttt 7681447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 30681867 - 30681781
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaa 87  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  30681867 ggcttaattatctttttggtcctctaactatttaattggtaacagtttggtcctctaactaaaaaatgatttattttggtcctctaa 30681781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 6 - 118
Target Start/End: Original strand, 15790684 - 15790796
Alignment:
Q  6 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattattactac 105  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||   |||| || |||||||||||||||||||||||   |||  |||||||||||   |||||||    
T  15790684 aattatctttttggtcatctaactatttaattggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttccatcccttaagtttctcaccgttactac 15790783  T
Q  106 atttgatcctttc 118  Q
    ||||  |||||||    
T  15790784 atttagtcctttc 15790796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 13 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 15791542 - 15791465
Alignment:
Q  13 tttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctca 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  15791542 tttttggtcctctaactatttaattggtatcg----gatc-tctaactaaaaattgatttatttcggtcccttaagtttctca 15791465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 87
Target Start/End: Original strand, 30681029 - 30681115
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaa 87  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||  |  ||| |  ||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  30681029 ggcttaattacatttttggtcatctaactatttaattggtaacggtttggttctctaactaaaaaaatatttattttggtcctctaa 30681115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 87
Target Start/End: Original strand, 42853246 - 42853331
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaa 87  Q
    |||| |||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||| | |||| |  ||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  42853246 ggctaaattacctttttggtc-tctatctatttagttggtatcggattggttctctaactaaaaattgatttatgtgggtcctctaa 42853331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 251 - 288
Target Start/End: Original strand, 28986392 - 28986429
Alignment:
Q  251 catatgaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 288  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28986392 catatgaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 28986429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 25 - 82
Target Start/End: Original strand, 43839984 - 43840041
Alignment:
Q  25 taactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcc 82  Q
    ||||||||||||| |||| |  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  43839984 taactatttaattagtatcggtttgatcctctaactaaaaattgatttattttggtcc 43840041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 43844473 - 43844392
Alignment:
Q  13 tttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctc 94  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||| |  ||| ||  ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||    
T  43844473 tttttggtcctttaactatttaattagtatcggtttggtcccctaactaaaaattgatttatttttgtcctttaaatttctc 43844392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 13867038 - 13866920
Alignment:
Q  13 tttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattattactacatttgat 112  Q
    ||||||||||  ||||||||||||| |||| |  ||| ||  |||||||||| |||||||||||||||||  ||| ||||||    ||||||| ||| ||    
T  13867038 tttttggtcccttaactatttaattagtatcggtttggtcccctaactaaaatttgatttattttggtcccttaaatttctctcagttactacttttaat 13866939  T
Q  113 cctttctgttagttttatt 131  Q
    |||||| |||| |||||||    
T  13866938 cctttccgttaattttatt 13866920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 49529194 - 49529076
Alignment:
Q  13 tttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattattactacatttgat 112  Q
    ||||||||||  ||||||||||||| |||| |  ||| ||  |||||||||| |||||||||||||||||  ||| ||||||  | ||||||| |||  |    
T  49529194 tttttggtcccttaactatttaattagtatcggtttggtcccctaactaaaatttgatttattttggtcccttaaatttctctctgttactacttttagt 49529095  T
Q  113 cctttctgttagttttatt 131  Q
    |||||| |||| |||||||    
T  49529094 cctttccgttaattttatt 49529076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 2 - 34
Target Start/End: Complemental strand, 42853374 - 42853342
Alignment:
Q  2 gcttaattacctttttggtcctctaactattta 34  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  42853374 gcttaattacatttttggtcctctaactattta 42853342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 6 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 50394405 - 50394333
Alignment:
Q  6 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttg 78  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||  ||| ||   ||||||||  |||||||||||||    
T  50394405 aattacctttttggtcccttaactatttaattggttttggtttggtcccttaactaaattttgatttattttg 50394333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 2)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 288
Target Start/End: Original strand, 14135 - 14422
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||   |||| || ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||   ||    
T  14135 ggcttaattacctgtttggtcctctaactatttaattggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctttaagtttctcaccgtt 14234  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggtatatgtcctcatgtttcacacatacatatgaaccata 200  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  14235 actacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtgggtatctgacctcttgtttcacacatacatatgaaccata 14334  T
Q  201 acagttaccaataatatcagtcattatttaatcataacaccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 288  Q
    | |||||||||||||||  |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14335 agagttaccaataatatttgtcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatgctaataaataaagttagagg 14422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134; HSP #2
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 14585 - 14423
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||   ||    
T  14585 ggctaaattacctttttggtcctctaactatttaattgatatcggattgatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctatgtttctcaccgtt 14486  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggt 163  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||    
T  14485 actacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatctgggt 14423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0340 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 2)
Name: scaffold0340
Description:

Target: scaffold0340; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 18723 - 18436
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| | |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||    
T  18723 ggcttaattacatttttggtcctttaattatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttttcactgtt 18624  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggtatatgtcctcatgtttcacacatacatatgaaccata 200  Q
    |||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||  || || | ||||||||||||||||||||||||||    
T  18623 actacatttagtcttttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtacctgaccgcctgtttcacacatacatatgaaccata 18524  T
Q  201 acagttaccaataatatcagtcattatttaatcataacaccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 288  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18523 acagttaccaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaagacatatgaccaaaatgatactaataaataaaattagagg 18436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0340; HSP #2
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 13 - 163
Target Start/End: Original strand, 18285 - 18435
Alignment:
Q  13 tttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattattactacatttgat 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    ||||||||||  |    
T  18285 tttttggtcctctaactatttaattggtattagattggtcctctaactaaaaattgatttatttaggtcttctaagtttctcaccgctactacatttagt 18384  T
Q  113 cctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggt 163  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  18385 cctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 18435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0221 (Bit Score: 184; Significance: 1e-99; HSPs: 2)
Name: scaffold0221
Description:

Target: scaffold0221; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 5 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 8874 - 8591
Alignment:
Q  5 taattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattattacta 104  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||| || |||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||   ||||||    
T  8874 taattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttatgttctctaagtttctcaccgttacta 8775  T
Q  105 catttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggtatatgtcctcatgtttcacacatacatatgaaccataacag 204  Q
    |||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| |||||| || |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  8774 catttagtcttttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgcgggtatctgacctcctgtttcacacatacacatgaaccataacag 8675  T
Q  205 ttaccaataatatcagtcattatttaatcataacaccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 288  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8674 ttaccaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaggcataggaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 8591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0221; HSP #2
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Original strand, 8429 - 8590
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| | ||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||| | ||    
T  8429 ggctaaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattgatc-tttaactaaaaattgatttatttcgatcctttaagtttctcactgtt 8527  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggt 163  Q
    || | ||||  |  ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  8528 acaatatttagtattttctgttagttttattcaaataaacgttgaggtttgtgttatgtgggt 8590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0072 (Bit Score: 184; Significance: 1e-99; HSPs: 2)
Name: scaffold0072
Description:

Target: scaffold0072; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 15898 - 15611
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||     
T  15898 ggcttaattacttttttgatcctctaactatttaactggtatcggattggtcatctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccatg 15799  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggtatatgtcctcatgtttcacacatacatatgaaccata 200  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||  || |||| ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  15798 actacatttaatcccttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtacctgacctcctgtttcacatatacatacgaaccata 15699  T
Q  201 acagttaccaataatatcagtcattatttaatcataacaccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 288  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15698 acagttaccaataatatcagtcactatttaatcataatatcttaacaaggcataggacaaaaatgatactaataaataaagttagagg 15611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0072; HSP #2
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 6 - 163
Target Start/End: Original strand, 15458 - 15610
Alignment:
Q  6 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattattactac 105  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||| | ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| | |||||||    
T  15458 aattaccttttttatcctctaactattcaattggtatcggattgatcctctaattaaaaattgatttattttggtcatttaagtttctcactgttactac 15557  T
Q  106 atttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggt 163  Q
    ||||  || |||||||||     ||||||||||| |||  | ||||||||||||||||    
T  15558 atttagtcatttctgtta-----attcaaataaatgtttgagtttgtgttatgtgggt 15610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 184; Significance: 1e-99; HSPs: 4)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 349522 - 349236
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||   |||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| | ||    
T  349522 ggcttagttacctttttggtcccctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtt-ctcactttt 349424  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggtatatgtcctcatgtttcacacatacatatgaaccata 200  Q
    |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  349423 actacatttagtcctttctgttaattttattcaaataaatgttagggtttgtgttatgtgggtatctgacctcctgtttcacacatacatatgaaccata 349324  T
Q  201 acagttaccaataatatcagtcattatttaatcataacaccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 288  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  349323 acagttaccaataatatcagtcaatatttaatcataataccttaacaaggaatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 349236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 113816 - 113529
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||   |||| || | ||||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||||||| | ||    
T  113816 ggcttaattacatttttggtcctctaactatttaagtgctatcagattggtcctgtaactaaaaattgatttctttcggtcatctaaatttctcactgtt 113717  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggtatatgtcctcatgtttcacacatacatatgaaccata 200  Q
    |||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||| ||| || |||    
T  113716 actacatttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttaaggttagtgttatgtgggtatctgacctcttgtttcacacatacaaatgcactata 113617  T
Q  201 acagttaccaataatatcagtcattatttaatcataacaccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 288  Q
    ||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  113616 acaattagcaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaggcatagaaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 113529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #3
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 13 - 163
Target Start/End: Original strand, 349085 - 349235
Alignment:
Q  13 tttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattattactacatttgat 112  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||  |||  || ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||   ||  |||||||  |    
T  349085 ttttttgtcctctaactatttaattagtattagattagtcctctaactaaaaattgatttatttcgatcctctaagtttctcaccgtttttacatttagt 349184  T
Q  113 cctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggt 163  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||    
T  349185 catttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgcgttatgtgggt 349235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #4
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 13 - 130
Target Start/End: Original strand, 113405 - 113522
Alignment:
Q  13 tttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattattactacatttgat 112  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||   |||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||  ||| || ||||  |    
T  113405 tttttggtcctctaactgtttaattggtatccgattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcatcgttagtaaatttatt 113504  T
Q  113 cctttctgttagttttat 130  Q
    |||||| |||||||||||    
T  113505 cctttccgttagttttat 113522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 178; Significance: 5e-96; HSPs: 2)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 3 - 288
Target Start/End: Original strand, 50478 - 50763
Alignment:
Q  3 cttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattattac 102  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||   |||| || ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||   ||||    
T  50478 cttaattatctttttggtcctctacctatttaattggtatctgattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctttaagtttctcaccgttac 50577  T
Q  103 tacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggtatatgtcctcatgtttcacacatacatatgaaccataac 202  Q
    |||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||  || |||| | ||||||||||||||| ||||||||||    
T  50578 tacatttagtcctttctgttatttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtacctgacctcctctttcacacatacataagaaccataac 50677  T
Q  203 agttaccaataatatcagtcattatttaatcataacaccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 288  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50678 agttaccaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaggcataggaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 50763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019; HSP #2
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 50927 - 50764
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactattt-aattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattat 99  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||   ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||   |    
T  50927 ggctaaattacatttttggtcctctaactattttaattggtatcagattgatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcttctaagtttctcaccgt 50828  T
Q  100 tactacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggt 163  Q
    ||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  50827 tactacatttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 50764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 168; Significance: 5e-90; HSPs: 3)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 288
Target Start/End: Original strand, 81858 - 82145
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||   |||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||    
T  81858 ggcttaattatctttttgatcctctaactatttatttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgtt 81957  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggtatatgtcctcatgtttcacacatacatatgaaccata 200  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| || ||||||  || |||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  81958 actacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgtaatttgggtacctgacctcctgtttcacagatacatatgaaccata 82057  T
Q  201 acagttaccaataatatcagtcattatttaatcataacaccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 288  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||  ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  82058 acagttaccaataatatcagtcactatttaatcataatatcttaacaagaaataggaccaaaatgatattaataaataaagttagagg 82145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 78 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 82231 - 82146
Alignment:
Q  78 ggtcctctaagtttctcattattactacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggt 163  Q
    ||||||||||||||||||   |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  82231 ggtcctctaagtttctcaccgttactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtgggt 82146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #3
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 13 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 90876 - 90794
Alignment:
Q  13 tttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctca 95  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||| | |||  || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  90876 tttttcgtcctctaactatttagttggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctca 90794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0182 (Bit Score: 165; Significance: 3e-88; HSPs: 2)
Name: scaffold0182
Description:

Target: scaffold0182; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 4 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 20155 - 19871
Alignment:
Q  4 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattattact 103  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| | |||| || ||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||   |||||    
T  20155 ttaattacatttttggtcctctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgattattttttgtcctctaagtttctcaccgttact 20056  T
Q  104 acatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggtatatgtcctcatgtttcacacatacatatgaaccataaca 203  Q
    ||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||| ||||||  || |||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  20055 acatttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatatgggtacctgacctcctatttcacacatacatatgaaccataaca 19956  T
Q  204 gttaccaataatatcagtcattatttaatcataacaccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 288  Q
    |||| |||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19955 gttatcaataatatccgtcactatttaatcataaaaccttaacaaggaatatgaccaaaatgatgctaataaataaagttagagg 19871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0182; HSP #2
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 6 - 163
Target Start/End: Original strand, 19713 - 19870
Alignment:
Q  6 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattattactac 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |   |||||||    
T  19713 aattacctttttggtcctctaactatttagttggtattggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttcttaccgttactac 19812  T
Q  106 atttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggt 163  Q
    ||||  || |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||    
T  19813 atttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggt 19870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 164; Significance: 1e-87; HSPs: 2)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 73211 - 72925
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| | |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||    
T  73211 ggcttaattacatttttggtcctctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcaccgtt 73112  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggtatatgtcctcatgtttcacacatacatatgaaccata 200  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||| ||||||  || |||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  73111 actacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttcgggtttgtgttatatgggtacctggcctcctatttcacacatacatatgaaccata 73012  T
Q  201 acagttaccaataatatcagtcattatttaatcataacaccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 288  Q
    |||||||||||||||||  |||| |||||||||||||   |||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  73011 acagttaccaataatattggtcactatttaatcataa-ttcttaacaaggaataagaccaaaatgatgctaataaataaagttagagg 72925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Original strand, 72762 - 72924
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   ||    
T  72762 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 72861  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggt 163  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  72862 actacatttattcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 72924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0186 (Bit Score: 156; Significance: 7e-83; HSPs: 2)
Name: scaffold0186
Description:

Target: scaffold0186; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 24612 - 24325
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||| | |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  24612 ggcttaattacatttttggtactctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcactgtt 24513  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggtatatgtcctcatgtttcacacatacatatgaaccata 200  Q
    |||||||||  || ||||||||| ||||||||||||||||||||   |||||||||| ||| ||| ||   || | ||||||||||||||||||||||||    
T  24512 actacatttagtcatttctgttaattttattcaaataaacgttagggtttgtgttatatggatatctgatatcctatttcacacatacatatgaaccata 24413  T
Q  201 acagttaccaataatatcagtcattatttaatcataacaccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 288  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| | |||||||||| | | ||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  24412 acagttaccaataatatccgtcactatttaatcataatatcttaacaaggaacaggaccaaaatgatgttaataaataaagttagagg 24325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0186; HSP #2
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Original strand, 24162 - 24324
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||   ||    
T  24162 ggctaaattacctttttggtcctctaactatttagttggtattgaattggtcctctaactaaaaattgatttatttcgatcctctaagtttctcaccgtt 24261  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggt 163  Q
    | |||||||  || |||||||||||||| |||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  24262 attacatttagtcatttctgttagtttttttcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 24324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0246 (Bit Score: 136; Significance: 6e-71; HSPs: 2)
Name: scaffold0246
Description:

Target: scaffold0246; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 4 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 6439 - 6161
Alignment:
Q  4 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattattact 103  Q
    |||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||| | |||| || |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||   |||||    
T  6439 ttaattacctttt--gtcctttaactaattaattggtatcgtattggtcctctaactaaaaattgatt-atttcggtcctctaagtttctcaccgttact 6343  T
Q  104 acatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggtatatgtcctcatgtttcacacatacatatgaaccataaca 203  Q
    ||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || | || |||||||||||| |||| ||| ||||| |    
T  6342 acatttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtgggtatctgacatcttgtttcacacatccataagaaacataata 6243  T
Q  204 gttaccaataatatcagtcattatttaatcataacaccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 288  Q
     ||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||    
T  6242 attatcaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaagacatatgatcaaaatga---taataaataaagttagagg 6161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0246; HSP #2
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 54 - 161
Target Start/End: Original strand, 6051 - 6158
Alignment:
Q  54 tctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattattactacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtg 153  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||| ||||  || |||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||    
T  6051 tctaactaaaaattgatttatttcggtcttctaagtttctcattgttactatatttagtcatttctgttagttttattcaaataaacattagagtttgtg 6150  T
Q  154 ttatgtgg 161  Q
    ||||||||    
T  6151 ttatgtgg 6158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0115 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 3)
Name: scaffold0115
Description:

Target: scaffold0115; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 22603 - 22462
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  22603 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactatt 22504  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgt 142  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22503 actacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgt 22462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0115; HSP #2
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Original strand, 21512 - 21673
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||  || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   ||    
T  21512 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 21611  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggt 163  Q
    |||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| ||||   ||||||||||||||||    
T  21612 actacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggt 21673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0115; HSP #3
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 147 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 21815 - 21674
Alignment:
Q  147 atttgtgttatgtgggtatatgtcctcatgtttcacacatacatatgaaccataacagttaccaataatatcagtcattatttaatcataacaccttaac 246  Q
    ||||||||||||||||| | || |||| | ||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |  |||||    
T  21815 atttgtgttatgtgggtgtctgacctcctatttcacacatacaaatgaaacataacaattaccaataatatcagtcactatttaatcataatattttaac 21716  T
Q  247 aaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 288  Q
     ||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21715 gagatataggaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 21674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 103; Significance: 3e-51; HSPs: 2)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Original strand, 20751 - 20913
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||| | |||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || | ||    
T  20751 ggcttaattacatttttggtcatctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttcacactgtt 20850  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggt 163  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  20851 actacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtgggt 20913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220; HSP #2
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 113 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 21088 - 20914
Alignment:
Q  113 cctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggtatatgtcctcatgtttcacacatacatatgaaccataacagttaccaat 212  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||    |||||||||| ||||||  || |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21088 cctttctattagttttattcaaataaacgttcgggtttgtgttatatgggtacctgacctcctatttcacacatacatatgaaccataacagttaccaat 20989  T
Q  213 aatatcagtcattatttaatcataacaccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagagg 288  Q
    |||||| |||| |||||||||||||   |||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20988 aatatcggtcactatttaatcataa-ttcttaacaaggaataggaccaaaatgatgctaataaataaagttagagg 20914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 4)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 4 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 56583 - 56395
Alignment:
Q  4 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattattact 103  Q
    ||||||| ||||||  ||||||||||||||| ||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||    
T  56583 ttaattatcttttttatcctctaactatttagttggtatttgattggtcatctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttact 56484  T
Q  104 acatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggtatatgtcctcatgtttcacacatacatat 192  Q
    ||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| |||||||||||  |  |||| ||||||||||||||||||    
T  56483 acatttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgttttatgtgggtacctaacctcctgtttcacacatacatat 56395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 4 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 63708 - 63520
Alignment:
Q  4 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattattact 103  Q
    ||||||| ||||||  ||||||||||||||| ||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||    
T  63708 ttaattatcttttttatcctctaactatttagttggtatttgattggtcatctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttact 63609  T
Q  104 acatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggtatatgtcctcatgtttcacacatacatat 192  Q
    ||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| |||||||||||  |  |||| ||||||||||||||||||    
T  63608 acatttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgttttatgtgggtacctaacctcctgtttcacacatacatat 63520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #3
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Original strand, 45756 - 45918
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    |||| ||||||  |||||||||||||| |||||||||||||| | |||  || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   ||    
T  45756 ggctaaattactattttggtcctctaattatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcacggtt 45855  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatgtgggt 163  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  45856 actacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 45918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #4
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 187 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 46020 - 45919
Alignment:
Q  187 acatatgaaccataacagttaccaataatatcagtcattatttaatcataacaccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaataaagttaga 286  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  46020 acatataaatcataacagttaccaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaggaatatgaccaaaatgaaactaataagtaaagttaga 45921  T
Q  287 gg 288  Q
    ||    
T  45920 gg 45919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0260 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0260
Description:

Target: scaffold0260; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 54 - 160
Target Start/End: Original strand, 14244 - 14350
Alignment:
Q  54 tctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattattactacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtg 153  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   || ||| ||||  || |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  14244 tctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttgctatatttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtg 14343  T
Q  154 ttatgtg 160  Q
    |||||||    
T  14344 ttatgtg 14350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0225 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0225
Description:

Target: scaffold0225; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 144
Target Start/End: Original strand, 9782 - 9924
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattatt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||     ||    
T  9782 ggcttaattgcctttttggtcccttaactatttaattggtatcggtttgctcctctaactaaaatttgatttattttggtcctttaagtttctatccgtt 9881  T
Q  101 actacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgtta 144  Q
    ||||| |||  ||||||| |||||||||||| ||| ||||||||    
T  9882 actacttttagtcctttccgttagttttatt-aaaaaaacgtta 9924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0225; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 12 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 10995 - 10914
Alignment:
Q  12 ctttttggtcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttct 93  Q
    |||||||||||  ||||||||||||| |||| |  ||| ||  |||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||    
T  10995 ctttttggtcccttaactatttaattagtatcggtttggtcccctaactaaaatttgatttattttggtcccttaagtttct 10914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 9 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 147281 - 147133
Alignment:
Q  9 tacctttttggtcctctaactat--ttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattattactaca 106  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||   ||||||||| || || |||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||  |||||| |    
T  147281 tacctttttggtcctctaactatatttaatt---attgaattggtcctcgaactaaaaattgatttatttcggtccgttaagtttctcatcgttactata 147185  T
Q  107 tttgatcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaaatttgtgttatg 158  Q
    |||  || |||| |||| |||||||| |||||||||||  |||| |||||||    
T  147184 tttagtcatttccgttaattttattcgaataaacgttaggatttatgttatg 147133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 20 - 95
Target Start/End: Original strand, 144039 - 144114
Alignment:
Q  20 tcctctaactatttaattggtattgaattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctca 95  Q
    |||||||||||||||||||||||   |||| |  ||||||||||||||||||||||| |||||  ||| |||||||    
T  144039 tcctctaactatttaattggtatcatattggttctctaactaaaaattgatttatttcggtcccttaaatttctca 144114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0526 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0526
Description:

Target: scaffold0526; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 34
Target Start/End: Original strand, 4030 - 4063
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactattta 34  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4030 ggcttaattacctttttggtcctctaactattta 4063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0526; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 34
Target Start/End: Complemental strand, 4117 - 4084
Alignment:
Q  1 ggcttaattacctttttggtcctctaactattta 34  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4117 ggctaaattacctttttggtcctctaactattta 4084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University