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 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF17572_low_3 (Length: 258)

Name: NF17572_low_3
Description: NF17572
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF17572_low_3
NF17572_low_3
[»] chr7 (15 HSPs)
chr7 (1-248)||(31080659-31080907)
chr7 (1-248)||(31092588-31092836)
chr7 (1-248)||(26264601-26264848)
chr7 (1-248)||(26324633-26324880)
chr7 (1-248)||(31120053-31120301)
chr7 (1-248)||(4134994-4135242)
chr7 (1-248)||(4149920-4150168)
chr7 (1-248)||(31134228-31134476)
chr7 (1-248)||(21541952-21542200)
chr7 (1-248)||(24582352-24582600)
chr7 (1-248)||(26430385-26430637)
chr7 (1-248)||(26445823-26446075)
chr7 (1-248)||(26697020-26697272)
chr7 (2-248)||(45382475-45382722)
chr7 (2-248)||(45397330-45397577)
[»] chr4 (7 HSPs)
chr4 (1-248)||(34178889-34179137)
chr4 (1-248)||(40564814-40565062)
chr4 (5-248)||(3912262-3912507)
chr4 (1-248)||(39847167-39847415)
chr4 (1-248)||(39860778-39861026)
chr4 (1-248)||(5016097-5016346)
chr4 (1-248)||(5001031-5001280)
[»] chr2 (11 HSPs)
chr2 (1-248)||(34154208-34154456)
chr2 (1-248)||(34165064-34165312)
chr2 (1-248)||(25909403-25909652)
chr2 (1-248)||(16160767-16161018)
chr2 (1-248)||(16171668-16171919)
chr2 (1-248)||(16859784-16860036)
chr2 (1-248)||(27798792-27799044)
chr2 (1-248)||(27813881-27814133)
chr2 (1-248)||(2731526-2731774)
chr2 (1-248)||(37920597-37920845)
chr2 (1-248)||(37935535-37935783)
[»] chr3 (13 HSPs)
chr3 (1-248)||(28016349-28016597)
chr3 (1-248)||(28031667-28031915)
chr3 (1-248)||(16602705-16602953)
chr3 (1-248)||(51777091-51777338)
chr3 (1-248)||(51792177-51792424)
chr3 (1-248)||(5710374-5710626)
chr3 (1-248)||(5721284-5721536)
chr3 (1-248)||(5732187-5732439)
chr3 (1-248)||(5759929-5760181)
chr3 (1-248)||(47018552-47018800)
chr3 (1-248)||(47033466-47033714)
chr3 (1-248)||(26295999-26296247)
chr3 (90-248)||(5769388-5769551)
[»] chr1 (6 HSPs)
chr1 (1-248)||(10936119-10936367)
chr1 (1-248)||(10955310-10955558)
chr1 (1-248)||(9079646-9079893)
chr1 (1-248)||(36508074-36508320)
chr1 (5-248)||(14413701-14413944)
chr1 (1-248)||(48095116-48095364)
[»] chr5 (9 HSPs)
chr5 (1-248)||(13432313-13432562)
chr5 (1-248)||(13443207-13443456)
chr5 (5-248)||(31816199-31816442)
chr5 (1-248)||(6869431-6869679)
chr5 (1-248)||(6884555-6884803)
chr5 (5-248)||(31831228-31831472)
chr5 (1-248)||(5633020-5633268)
chr5 (1-248)||(5647894-5648142)
chr5 (1-248)||(32596532-32596780)
[»] chr8 (8 HSPs)
chr8 (5-248)||(29825856-29826099)
chr8 (5-248)||(29839581-29839824)
chr8 (1-248)||(19198141-19198389)
chr8 (1-248)||(19213206-19213454)
chr8 (1-248)||(19283333-19283581)
chr8 (1-248)||(19684913-19685161)
chr8 (1-248)||(19669551-19669799)
chr8 (1-248)||(15902607-15902863)
[»] scaffold0336 (1 HSPs)
scaffold0336 (1-248)||(3344-3597)
[»] chr6 (4 HSPs)
chr6 (1-248)||(8188693-8188948)
chr6 (6-248)||(27618989-27619236)
chr6 (6-248)||(27634599-27634846)
chr6 (1-248)||(4728986-4729223)
[»] scaffold1648 (1 HSPs)
scaffold1648 (1-248)||(247-484)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 233; Significance: 1e-129; HSPs: 15)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 31080907 - 31080659
Alignment:
Q  1 aatgttcgtgttcgtcatgtttgatttgcatactattccatgtgaattttgctactgtttgctatgcatatgtcactgttttgatgtgttgagttttatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31080907 aatgttcgtgttcgtcatgtttgatttgcatactattccatgtgaattttgctactgtttgctatgcatatgtcactgttttgatgtgttgagttttatt 31080808  T
Q  101 cttgcatcatgcgcattatccatcacatgtttccggcttattttcatcgtcactttaccgtctcatgccatactttcttctatcgctttatgccatattc 200  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31080807 cttgcatcatgcgcattattcatcacatgtttccggcttattttcatcgtcactttaccgtcttatgccatactttcttctatcgctttatgccatattc 31080708  T
Q  201 tt-ttttaccattttctactaacatttcctttcatgttgatcacttcat 248  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31080707 tttttttaccattttctactaacatttcctttcatgttgatcacttcat 31080659  T

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Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 31092836 - 31092588
Alignment:
Q  1 aatgttcgtgttcgtcatgtttgatttgcatactattccatgtgaattttgctactgtttgctatgcatatgtcactgttttgatgtgttgagttttatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31092836 aatgttcgtgttcgtcatgtttgatttgcatactattccatgtgaattttgctactgtttgctatgcatatgtcacttttttgatgtgttgagttttatt 31092737  T
Q  101 cttgcatcatgcgcattatccatcacatgtttccggcttattttcatcgtcactttaccgtctcatgccatactttcttctatcgctttatgccatattc 200  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31092736 cttgcatcatgcgcattattcatcacatgtttccggcttattttcatcgtcactttaccgtcttatgccatactttcttctatcgctttatgccatattc 31092637  T
Q  201 tt-ttttaccattttctactaacatttcctttcatgttgatcacttcat 248  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31092636 tttttttaccattttctactaacatttcctttcatgttgatcacttcat 31092588  T

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Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 26264848 - 26264601
Alignment:
Q  1 aatgttcgtgttcgtcatgtttgatttgcatactattccatgtgaattttgctactgtttgctatgcatatgtcactgttttgatgtgttgagttttatt 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  26264848 aatgtccgtgttcgtcatgtttgatttgcatactattccatgtgaattttgctactgtttgctatgcatatgtcactgttttgatgtgttgagttttgtt 26264749  T
Q  101 cttgcatcatgcgcattatccatcacatgtttccggcttattttcatcgtcacttt-accgtctcatgccatactttcttctatcgctttatgccatatt 199  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  26264748 cttgcatcatgcgcattattcatcacatgtttccggcttattttcaccgtcattttaaccgtcttatgccatactttcttctatcactttatgccatttt 26264649  T
Q  200 cttttttaccattttctactaacatttcctttcatgttgatcacttcat 248  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  26264648 c-tttttaccattttctactaacatttcctttcatattgatcacttcat 26264601  T

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Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 26324880 - 26324633
Alignment:
Q  1 aatgttcgtgttcgtcatgtttgatttgcatactattccatgtgaattttgctactgtttgctatgcatatgtcactgttttgatgtgttgagttttatt 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  26324880 aatgtccgtgttcgtcatgtttgatttgcatactattccatgtgaattttgctactgtttgctatgcatatgtcactgttttgatgtgttgagttttgtt 26324781  T
Q  101 cttgcatcatgcgcattatccatcacatgtttccggcttattttcatcgtcacttt-accgtctcatgccatactttcttctatcgctttatgccatatt 199  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  26324780 cttgcatcatgcgcattattcatcacatgtttccggcttattttcaccgtcattttaaccgtcttatgccatactttcttctatcactttatgccatttt 26324681  T
Q  200 cttttttaccattttctactaacatttcctttcatgttgatcacttcat 248  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  26324680 c-tttttaccattttctactaacatttcctttcatattgatcacttcat 26324633  T

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Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Original strand, 31120053 - 31120301
Alignment:
Q  1 aatgttcgtgttcgtcatgtttgatttgcatactattccatgtgaattttgctactgtttgctatgcatatgtcactgttttgatgtgttgagttttatt 100  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  31120053 aatgttcgtattcgtcatgtttaatttgcatactatttcatatgaattttgctactgtttgctatgcatatgtcactgttttgatgtgttgggttttatt 31120152  T
Q  101 cttgcatcatgcgcattatccatcacatgtttccggcttattttcatcgtcactttaccgtctcatgccatactttcttctatcgctttatgccatattc 200  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31120153 cttgcatcatacgcattattcatcacatgtgtccggcttattttcatcgtcactctaccgtcttatgccatactttcttctatcgctttatgccatattc 31120252  T
Q  201 tt-ttttaccattttctactaacatttcctttcatgttgatcacttcat 248  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31120253 ttcttttaccactttctactaacatttcctttcatgttgatcacttcat 31120301  T

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Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 4135242 - 4134994
Alignment:
Q  1 aatgttcgtgttcgtcatgtttgatttgcatactattccatgtgaattttgctactgtttgctatgcatatgtcactgttttgatgtgttgagttttatt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  4135242 aatgttcgtattcgtcatgtttgatttgcatactatttcatatgaattttgctactgtttgctatgcatatgtcactgttttgacgtattgagttttatt 4135143  T
Q  101 cttgcatcatgcgcattatccatcacatgtttccggcttattttcatcgtcactttaccgtctcatgccatactttcttctatcgctttatgccatattc 200  Q
    |||||||| | |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4135142 cttgcatcgtacgcattattcatcacacgtttccggcttattttcatcgtcactctaccgtcttatgccatactttcttctatcactttatgccatattc 4135043  T
Q  201 tt-ttttaccattttctactaacatttcctttcatgttgatcacttcat 248  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4135042 ttcttttaccattttctactaacatttcctttcatgttgatcacttcat 4134994  T

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Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 4150168 - 4149920
Alignment:
Q  1 aatgttcgtgttcgtcatgtttgatttgcatactattccatgtgaattttgctactgtttgctatgcatatgtcactgttttgatgtgttgagttttatt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  4150168 aatgttcgtattcgtcatgtttgatttgcatactatttcatatgaattttgctactgtttgctatgcatatgtcactgttttgacgtattgagttttatt 4150069  T
Q  101 cttgcatcatgcgcattatccatcacatgtttccggcttattttcatcgtcactttaccgtctcatgccatactttcttctatcgctttatgccatattc 200  Q
    |||||||| | |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4150068 cttgcatcgtacgcattattcatcacacgtttccggcttattttcatcgtcactctaccgtcttatgccatactttcttctatcactttatgccatattc 4149969  T
Q  201 tt-ttttaccattttctactaacatttcctttcatgttgatcacttcat 248  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4149968 ttcttttaccattttctactaacatttcctttcatgttgatcacttcat 4149920  T

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Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Original strand, 31134228 - 31134476
Alignment:
Q  1 aatgttcgtgttcgtcatgtttgatttgcatactattccatgtgaattttgctactgtttgctatgcatatgtcactgttttgatgtgttgagttttatt 100  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  31134228 aatgttcgtattcgtcatgtttaatttgcatactatttcatatgaattttgctactgtttgctatgcatatgtcactgttttgatgtgttgggttttatt 31134327  T
Q  101 cttgcatcatgcgcattatccatcacatgtttccggcttattttcatcgtcactttaccgtctcatgccatactttcttctatcgctttatgccatattc 200  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31134328 cttgcatcatacgcattattcatcacatgtgtccggcttattttcatcgtcactctactgtcttatgccatactttcttctatcgctttatgccatattc 31134427  T
Q  201 tt-ttttaccattttctactaacatttcctttcatgttgatcacttcat 248  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31134428 ttcttttaccactttctactaacatttcctttcatgttgatcacttcat 31134476  T

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Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Original strand, 21541952 - 21542200
Alignment:
Q  1 aatgttcgtgttcgtcatgtttgatttgcatactattccatgtgaattttgctactgtttgctatgcatatgtcactgttttgatgtgttgagttttatt 100  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  21541952 aatgtttgtattcgtcatgtttgatttgcatactatttcatatgaattttgctactgtttgctatgcatatgtcactgttttggtgtgttgggttttatt 21542051  T
Q  101 cttgcatcatgcgcattatccatcacatgtttccggcttattttcatcgtcactttaccgtctcatgccatactttcttctatcgctttatgccatattc 200  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  21542052 cttgcatcatacgcattattcatcacatgtttccggcttattttcatcgtcactctatcgtcttatgccatactttcttctatcactttatgccgtattc 21542151  T
Q  201 tt-ttttaccattttctactaacatttcctttcatgttgatcacttcat 248  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21542152 ttcttttaccattttctactaacatttcctttcatgttgatcacttcat 21542200  T

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Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 24582600 - 24582352
Alignment:
Q  1 aatgttcgtgttcgtcatgtttgatttgcatactattccatgtgaattttgctactgtttgctatgcatatgtcactgttttgatgtgttgagttttatt 100  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24582600 aatgtacgtattcgtcatgtttgatttgcatactatttcatatgaattttgctactgtttgctatgcatatgtcactgttttgatgtgttgggttttatt 24582501  T
Q  101 cttgcatcatgcgcattatccatcacatgtttccggcttattttcatcgtcactttaccgtctcatgccatactttcttctatcgctttatgccatattc 200  Q
    ||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  24582500 cttgcatcatgcgcattattcaccacacgtttccggcttattttcatcgtcactctaccgtcttatgccatactttcttctatcgctttatgccatatcc 24582401  T
Q  201 tt-ttttaccattttctactaacatttcctttcatgttgatcacttcat 248  Q
    || ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24582400 ttcttttaccatttcctactaacatttccttccatgttgatcacttcat 24582352  T

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Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Original strand, 26430385 - 26430637
Alignment:
Q  1 aatgttcgtgttcgtcatgtttgatttgcatactattccatgtgaattttgctactgtttgctatgcatatgtcactgttttgatgtgttgagttttatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  26430385 aatgttcgtgttcgtcatgtttgatttgcatactattccatatgaattttgctactgtttgctatgcatatgtcactgttttgatgtgttgagttttgtt 26430484  T
Q  101 cttgcatcatgcgcattatccatcacatgtttccggcttattttcatcgtcactttaccgtctcatgccatactttcttctatcgctttatgccatattc 200  Q
    ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  26430485 cttgcatcatgtgcattattcattacatgtttccggcttattttcatcgtcactttaccgttttatgccgtactttcttccatcgcttcatgccatattc 26430584  T
Q  201 -----ttttttaccattttctactaacatttcctttcatgttgatcacttcat 248  Q
         |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  26430585 tttctttttttaccattttctactaacatttcctttcatattgatcacttcat 26430637  T

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Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Original strand, 26445823 - 26446075
Alignment:
Q  1 aatgttcgtgttcgtcatgtttgatttgcatactattccatgtgaattttgctactgtttgctatgcatatgtcactgttttgatgtgttgagttttatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  26445823 aatgttcgtgttcgtcatgtttgatttgcatactattccatatgaattttgctactgtttgctatgcatatgtcactgttttgatgtgttgagttttgtt 26445922  T
Q  101 cttgcatcatgcgcattatccatcacatgtttccggcttattttcatcgtcactttaccgtctcatgccatactttcttctatcgctttatgccatattc 200  Q
    ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  26445923 cttgcatcatgtgcattattcattacatgtttccggcttattttcatcgtcactttaccgttttatgccgtactttcttccatcgcttcatgccatattc 26446022  T
Q  201 -----ttttttaccattttctactaacatttcctttcatgttgatcacttcat 248  Q
         |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  26446023 tttctttttttaccattttctactaacatttcctttcatattgatcacttcat 26446075  T

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Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 181; E-Value: 7e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Original strand, 26697020 - 26697272
Alignment:
Q  1 aatgttcgtgttcgtcatgtttgatttgcatactattccatgtgaattttgctactgtttgctatgcatatgtcactgttttgatgtgttgagttttatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  26697020 aatgttcgtgttcgtcatgtttgatttgcatactattccatatgaattttgctactgtttgctatgcatatgtcactgttttgatgtgttgaattttgtt 26697119  T
Q  101 cttgcatcatgcgcattatccatcacatgtttccggcttattttcatcgtcactttaccgtctcatgccatactttcttctatcgctttatgccatatt- 199  Q
    ||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||     
T  26697120 cttacatcatgtgcattattcattacatgtttccggcttattttcatcgtcactttactgttttatgccatactttcttccatcgcttcatgccatattc 26697219  T
Q  200 ----cttttttaccattttctactaacatttcctttcatgttgatcacttcat 248  Q
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  26697220 tttccttttttaccattttctactaacatttcctttcatattgatcacttcat 26697272  T

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Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 2 - 248
Target Start/End: Original strand, 45382475 - 45382722
Alignment:
Q  2 atgttcgtgttcgtcatgtttgatttgcatactattccatgtgaattttgctactgtttgctatgcatatgtcactgttttgatgtgttgagttttattc 101  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||    
T  45382475 atgttcgtattcgtcatgtttgatttgcatactatttcatatgaattttgctactgattgctatgcatatgtcactgttttggcgtgttgggttttattc 45382574  T
Q  102 ttgcatcatgcgcattatccatcacatgtttccggcttattttcatcgtcactttaccgtctcatgccatactttcttctatcgctttatgccatattct 201  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  45382575 ttgcatcatacgcattattcatcacatatttccggctcattttcatcgtcactctaccgtcttatgccatactttcttccatcactttatgccatattct 45382674  T
Q  202 t-ttttaccattttctactaacatttcctttcatgttgatcacttcat 248  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45382675 tcttttaccattttctactaacatttcctttcatgttgatcacttcat 45382722  T

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Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 2 - 248
Target Start/End: Original strand, 45397330 - 45397577
Alignment:
Q  2 atgttcgtgttcgtcatgtttgatttgcatactattccatgtgaattttgctactgtttgctatgcatatgtcactgttttgatgtgttgagttttattc 101  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||    
T  45397330 atgttcgtattcgtcatgtttgatttgcatactatttcatatgaattttgctactgattgctatgcatatgtcactgttttggcgtgttgggttttattc 45397429  T
Q  102 ttgcatcatgcgcattatccatcacatgtttccggcttattttcatcgtcactttaccgtctcatgccatactttcttctatcgctttatgccatattct 201  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  45397430 ttgcatcatacgcattattcatcacatatttccggctcattttcatcgtcactctaccgtcttatgccatactttcttccatcactttatgccatattct 45397529  T
Q  202 t-ttttaccattttctactaacatttcctttcatgttgatcacttcat 248  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45397530 tcttttaccattttctactaacatttcctttcatgttgatcacttcat 45397577  T

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Target: chr4 (Bit Score: 229; Significance: 1e-126; HSPs: 7)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 34179137 - 34178889
Alignment:
Q  1 aatgttcgtgttcgtcatgtttgatttgcatactattccatgtgaattttgctactgtttgctatgcatatgtcactgttttgatgtgttgagttttatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34179137 aatgttcgtgttcgtcatgtttgatttgcatactattccatgtgaattttgctactgtttgctatgcatatgtcactgttttgatgtgttgagttttatt 34179038  T
Q  101 cttgcatcatgcgcattatccatcacatgtttccggcttattttcatcgtcactttaccgtctcatgccatactttcttctatcgctttatgccatatt- 199  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  34179037 cttgcatcatgcgcattattcatcacatgtttccggcttattttcatcgtcactttaccgtcttatgccatactttcttccatcgctttatgccatattc 34178938  T
Q  200 cttttttaccattttctactaacatttcctttcatgttgatcacttcat 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34178937 cttttttaccattttctactaacatttcctttcatgttgatcacttcat 34178889  T

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Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 40565062 - 40564814
Alignment:
Q  1 aatgttcgtgttcgtcatgtttgatttgcatactattccatgtgaattttgctactgtttgctatgcatatgtcactgttttgatgtgttgagttttatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40565062 aatgttcgtgttcgtcatgtttgatttgcatactattccatgtgaattttgctactgtttgctatgcatatgtcactgttttgatgtgttgagttttatt 40564963  T
Q  101 cttgcatcatgcgcattatccatcacatgtttccggcttattttcatcgtcactttaccgtctcatgccatactttcttctatcgctttatgccatatt- 199  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  40564962 cttgcatcatgcgcattattcatcacatgtttccggcttattttcatcgtcactttaccgtcttatgccatactttcttccatcgctttatgccatattc 40564863  T
Q  200 cttttttaccattttctactaacatttcctttcatgttgatcacttcat 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40564862 cttttttaccattttctactaacatttcctttcatgttgatcacttcat 40564814  T

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Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 5 - 248
Target Start/End: Original strand, 3912262 - 3912507
Alignment:
Q  5 ttcgtgttcgtcatgtttgatttgcatactattccatgtgaattttgctactgtttgctatgcatatgtcactgttttgatgtgttgagttttattcttg 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3912262 ttcgtgttcgtcatgtttgatttgcatactattccatgtgaattttgctactgtttgctatgcatatgtcactgttttgatgtgttgagttttattcttg 3912361  T
Q  105 catcatgcgcattatccatcacatgtttccggcttattttcatcgtcactttaccgtctcatgccatactttcttctatcgctttatgccatattctt-- 202  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||      
T  3912362 catcatgcgcattattcatcacatgtttccggcttattttcatcgtcactttaccgtcttatgccatactttcttctatcgcttcatgccatattctttg 3912461  T
Q  203 ttttaccattttctactaacatttcctttcatgttgatcacttcat 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3912462 ttttaccattttctactaacatttcctttcatgttgatcacttcat 3912507  T

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Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 221; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Original strand, 39847167 - 39847415
Alignment:
Q  1 aatgttcgtgttcgtcatgtttgatttgcatactattccatgtgaattttgctactgtttgctatgcatatgtcactgttttgatgtgttgagttttatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39847167 aatgttcgtgttcgtcatgtttgatttgcatgctattccatgtgaattttgctactgtttgctatgcatatgtcactgttttgatgtgttgagttttatt 39847266  T
Q  101 cttgcatcatgcgcattatccatcacatgtttccggcttattttcatcgtcactttaccgtctcatgccatactttcttctatcgctttatgccatatt- 199  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  39847267 cttgcatcatgcgcattattcatcacatgtttctggcttattttcatcgtcactttaccgtcttatgccatactttcttccatcgctttatgccatattc 39847366  T
Q  200 cttttttaccattttctactaacatttcctttcatgttgatcacttcat 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39847367 cttttttaccattttctactaacatttcctttcatgttgatcacttcat 39847415  T

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Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 221; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Original strand, 39860778 - 39861026
Alignment:
Q  1 aatgttcgtgttcgtcatgtttgatttgcatactattccatgtgaattttgctactgtttgctatgcatatgtcactgttttgatgtgttgagttttatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39860778 aatgttcgtgttcgtcatgtttgatttgcatgctattccatgtgaattttgctactgtttgctatgcatatgtcactgttttgatgtgttgagttttatt 39860877  T
Q  101 cttgcatcatgcgcattatccatcacatgtttccggcttattttcatcgtcactttaccgtctcatgccatactttcttctatcgctttatgccatatt- 199  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  39860878 cttgcatcatgcgcattattcatcacatgtttctggcttattttcatcgtcactttaccgtcttatgccatactttcttccatcgctttatgccatattc 39860977  T
Q  200 cttttttaccattttctactaacatttcctttcatgttgatcacttcat 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39860978 cttttttaccattttctactaacatttcctttcatgttgatcacttcat 39861026  T

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Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Original strand, 5016097 - 5016346
Alignment:
Q  1 aatgttcgtgttcgtcatgtttgatttgcatactattccatgtgaattttgctactgtttgctatgcatatgtcactgttttgatgtgttgagttttatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5016097 aatgttcgtgttcgtcatgtttgatttgcatactattccatgtgaattttgctactgtttgctatgcatatgtcactgttttgatgtgttgagttttatt 5016196  T
Q  101 cttgcatcatgcgcattatccatcacatgtttccggcttattttcatcgtcactttaccgtctcatgccatactttcttctatcgctttatgccatattc 200  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||| ||||||||||     
T  5016197 cttgcatcatgcgcattattcatcacatgtttccggcttattttcatcgtcactttaccgtcttatgccatacttttttctattgcttcatgccatattt 5016296  T
Q  201 tttt--ttaccattttctactaacatttcctttcatgttgatcacttcat 248  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5016297 tttttgttaccattctctactaacatttcctttcatgatgatcacttcat 5016346  T

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Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Original strand, 5001031 - 5001280
Alignment:
Q  1 aatgttcgtgttcgtcatgtttgatttgcatactattccatgtgaattttgctactgtttgctatgcatatgtcactgttttgatgtgttgagttttatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5001031 aatgttcgtgttcgtcatgtttgatttgcatactattccatgtgaattttgctactgtttgctatgcatatgtcactgttttgatgtgttgagttttatt 5001130  T
Q  101 cttgcatcatgcgcattatccatcacatgtttccggcttattttcatcgtcactttaccgtctcatgccatactttcttctatcgctttatgccatattc 200  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||| |||| ||||||||||     
T  5001131 cttgcatcatgcgcattattcatcacatgtttccggcttattttcatcgtcactttaccgtcttatgccatacttttttttattgcttcatgccatattt 5001230  T
Q  201 tttt--ttaccattttctactaacatttcctttcatgttgatcacttcat 248  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5001231 tttttgttaccattctctactaacatttcctttcatgatgatcacttcat 5001280  T

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Target: chr2 (Bit Score: 229; Significance: 1e-126; HSPs: 11)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Original strand, 34154208 - 34154456
Alignment:
Q  1 aatgttcgtgttcgtcatgtttgatttgcatactattccatgtgaattttgctactgtttgctatgcatatgtcactgttttgatgtgttgagttttatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34154208 aatgttcgtgttcgtcatgtttgatttgcatactattccatgtgaattttgctactgtttgctatgcatatgtcactgttttgatgtgttgagttttatt 34154307  T
Q  101 cttgcatcatgcgcattatccatcacatgtttccggcttattttcatcgtcactttaccgtctcatgccatactttcttctatcgctttatgccatatt- 199  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  34154308 cttgcatcatgcgcattattcatcacatgtttccggcttattttcatcgtcactttaccgtcttatgccatactttcttccatcgctttatgccatattc 34154407  T
Q  200 cttttttaccattttctactaacatttcctttcatgttgatcacttcat 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34154408 cttttttaccattttctactaacatttcctttcatgttgatcacttcat 34154456  T

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Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Original strand, 34165064 - 34165312
Alignment:
Q  1 aatgttcgtgttcgtcatgtttgatttgcatactattccatgtgaattttgctactgtttgctatgcatatgtcactgttttgatgtgttgagttttatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34165064 aatgttcgtgttcgtcatgtttgatttgcatactattccatgtgaattttgctactgtttgctatgcatatgtcactgttttgatgtgttgagttttatt 34165163  T
Q  101 cttgcatcatgcgcattatccatcacatgtttccggcttattttcatcgtcactttaccgtctcatgccatactttcttctatcgctttatgccatatt- 199  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  34165164 cttgcatcatgcgcattattcatcacatgtttccggcttattttcatcgtcactttaccgtcttatgccatactttcttccatcgctttatgccatattc 34165263  T
Q  200 cttttttaccattttctactaacatttcctttcatgttgatcacttcat 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34165264 cttttttaccattttctactaacatttcctttcatgttgatcacttcat 34165312  T

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Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 25909652 - 25909403
Alignment:
Q  1 aatgttcgtgttcgtcatgtttgatttgcatactattccatgtgaattttgctactgtttgctatgcatatgtcactgttttgatgtgttgagttttatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25909652 aatgttcgtgttcgtcatgtttgatttgcatgctattccatgtgaattttgctactgtttgctatgcatatgtcactgttttgatgtgttgagttttatt 25909553  T
Q  101 cttgcatcatgcgcattatccatcacatgtttccggcttattttcatcgtcactttaccgtctcatgccatactttcttctatcgctttatgccatattc 200  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25909552 cttgcatcatgcgcattattcatcacatgtttctggcttattttcatcgtcactttaccgtcttatgccatactttcttccatcgctttatgccatattc 25909453  T
Q  201 --ttttttaccattttctactaacatttcctttcatgttgatcacttcat 248  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25909452 ctttttttaccattttctactaacatttcctttcatgttgatcacttcat 25909403  T

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Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Original strand, 16160767 - 16161018
Alignment:
Q  1 aatgttcgtgttcgtcatgtttgatttgcatactattccatgtgaattttgctactgtttgctatgcatatgtcactgttttgatgtgttgagttttatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16160767 aatgttcgtgttcgtcatgtttgatttgcatactattccatatgaattttgctactgtttgctatgcatatgtcactgttttgatgtgttgagttttgtt 16160866  T
Q  101 cttgcatcatgcgcattatccatcacatgtttccggcttattttcatcgtcactttaccgtctcatgccatactttcttctatcgctttatgccata--- 197  Q
    ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||| ||||||| ||||||||       
T  16160867 cttgcatcatgtgcattattcattacatgtttccggcttattttcatcgtcactttaccgttttatgccgtactttcttccatcgcttcatgccatattc 16160966  T
Q  198 -ttcttttttaccattttctactaacatttcctttcatgttgatcacttcat 248  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16160967 tttcttttttaccattttctactaacatttcctttcatattgatcacttcat 16161018  T

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Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Original strand, 16171668 - 16171919
Alignment:
Q  1 aatgttcgtgttcgtcatgtttgatttgcatactattccatgtgaattttgctactgtttgctatgcatatgtcactgttttgatgtgttgagttttatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16171668 aatgttcgtgttcgtcatgtttgatttgcatactattccatatgaattttgctactgtttgctatgcatatgtcactgttttgatgtgttgagttttgtt 16171767  T
Q  101 cttgcatcatgcgcattatccatcacatgtttccggcttattttcatcgtcactttaccgtctcatgccatactttcttctatcgctttatgccata--- 197  Q
    ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||| ||||||| ||||||||       
T  16171768 cttgcatcatgtgcattattcattacatgtttccggcttattttcatcgtcactttaccgttttatgccgtactttcttccatcgcttcatgccatattc 16171867  T
Q  198 -ttcttttttaccattttctactaacatttcctttcatgttgatcacttcat 248  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16171868 tttcttttttaccattttctactaacatttcctttcatattgatcacttcat 16171919  T

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Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 16860036 - 16859784
Alignment:
Q  1 aatgttcgtgttcgtcatgtttgatttgcatactattccatgtgaattttgctactgtttgctatgcatatgtcactgttttgatgtgttgagttttatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16860036 aatgttcgtgttcgtcatgtttgatttgcatactattccatatgaattttgctactgtttgctatgcatatgtcactgttttgatgtgttgagttttgtt 16859937  T
Q  101 cttgcatcatgcgcattatccatcacatgtttccggcttattttcatcgtcactttaccgtctcatgccatactttcttctatcgctttatgccatattc 200  Q
    ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  16859936 cttgcatcatgtgcattattcattacatgtttccggcttattttcatcgtcactttaccgttttatgccgtactttcttccatcgcttcatgccatattc 16859837  T
Q  201 -----ttttttaccattttctactaacatttcctttcatgttgatcacttcat 248  Q
         |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16859836 ttcttttttttaccattttctactaacatttcctttcatattgatcacttcat 16859784  T

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Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Original strand, 27798792 - 27799044
Alignment:
Q  1 aatgttcgtgttcgtcatgtttgatttgcatactattccatgtgaattttgctactgtttgctatgcatatgtcactgttttgatgtgttgagttttatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  27798792 aatgttcgtgttcgtcatgtttgatttgcatactattccatatgaattttgctactgtttgctatgcatatgtcactgttttgatgtgttgagttttgtt 27798891  T
Q  101 cttgcatcatgcgcattatccatcacatgtttccggcttattttcatcgtcactttaccgtctcatgccatactttcttctatcgctttatgccatattc 200  Q
    ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  27798892 cttgcatcatgtgcattattcattacatgtttccggcttattttcatcgtcactttaccgttttatgccgtactttcttccatcgcttcatgccatattc 27798991  T
Q  201 -----ttttttaccattttctactaacatttcctttcatgttgatcacttcat 248  Q
         |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27798992 tttctttttttaccattttctactaacatttcctttcatattgatcacttcat 27799044  T

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Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Original strand, 27813881 - 27814133
Alignment:
Q  1 aatgttcgtgttcgtcatgtttgatttgcatactattccatgtgaattttgctactgtttgctatgcatatgtcactgttttgatgtgttgagttttatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  27813881 aatgttcgtgttcgtcatgtttgatttgcatactattccatatgaattttgctactgtttgctatgcatatgtcactgttttgatgtgttgagttttgtt 27813980  T
Q  101 cttgcatcatgcgcattatccatcacatgtttccggcttattttcatcgtcactttaccgtctcatgccatactttcttctatcgctttatgccatattc 200  Q
    ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  27813981 cttgcatcatgtgcattattcattacatgtttccggcttattttcatcgtcactttaccgttttatgccgtactttcttccatcgcttcatgccatattc 27814080  T
Q  201 -----ttttttaccattttctactaacatttcctttcatgttgatcacttcat 248  Q
         |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27814081 tttctttttttaccattttctactaacatttcctttcatattgatcacttcat 27814133  T

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Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Original strand, 2731526 - 2731774
Alignment:
Q  1 aatgttcgtgttcgtcatgtttgatttgcatactattccatgtgaattttgctactgtttgctatgcatatgtcactgttttgatgtgttgagttttatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  2731526 aatgttcgtgttcgtcatgtttgatttgcataccattccatgtgaactttgctactgtttgctatgtgtatgtcactgttttgatgtgttgggtcttatt 2731625  T
Q  101 cttgcatcatgcgcattatccatcacatgtttccggcttattttcatcgtcactttaccgtctcatgccatactttcttctatcgctttatgccatattc 200  Q
     | || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  2731626 ttagcttcatgcgcattattcatcacatgtttccggcttattttcatcgtcactttaccgtcttatgccatactttcttctatcgcttcatgccatattc 2731725  T
Q  201 ttttttaccatttt-ctactaacatttcctttcatgttgatcacttcat 248  Q
    |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  2731726 ttttttactattttgctactaacgtttcctttcatgttgatcacttcat 2731774  T

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Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Original strand, 37920597 - 37920845
Alignment:
Q  1 aatgttcgtgttcgtcatgtttgatttgcatactattccatgtgaattttgctactgtttgctatgcatatgtcactgttttgatgtgttgagttttatt 100  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  37920597 aatgtttgtattcgtcatgtttgatttgcatactatttcatatgaattttgctactgtttgctatgcgtatgtcactgttttgatgtgttaggttttatt 37920696  T
Q  101 cttgcatcatgcgcattatccatcacatgtttccggcttattttcatcgtcactttaccgtctcatgccatactttcttctatcgctttatgccatattc 200  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  37920697 cttgcatcatacgcattattcatcacatgtttccggcttattttcatcgtcactctatcgtcttatgccatactttcttctatcactttatgccgtattc 37920796  T
Q  201 tt-ttttaccattttctactaacatttcctttcatgttgatcacttcat 248  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37920797 ttcttttaccattttctactaacatttcctttcatgttgatcacttcat 37920845  T

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Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Original strand, 37935535 - 37935783
Alignment:
Q  1 aatgttcgtgttcgtcatgtttgatttgcatactattccatgtgaattttgctactgtttgctatgcatatgtcactgttttgatgtgttgagttttatt 100  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  37935535 aatgtttgtattcgtcatgtttgatttgcatactatttcatatgaattttgctactgtttgctatgcgtatgtcactgttttgatgtgttaggttttatt 37935634  T
Q  101 cttgcatcatgcgcattatccatcacatgtttccggcttattttcatcgtcactttaccgtctcatgccatactttcttctatcgctttatgccatattc 200  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  37935635 cttgcatcatacgcattattcatcacatgtttccggcttattttcatcgtcactctatcgtcttatgccatactttcttctatcactttatgccgtattc 37935734  T
Q  201 tt-ttttaccattttctactaacatttcctttcatgttgatcacttcat 248  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37935735 ttcttttaccattttctactaacatttcctttcatgttgatcacttcat 37935783  T

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Target: chr3 (Bit Score: 225; Significance: 1e-124; HSPs: 13)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Original strand, 28016349 - 28016597
Alignment:
Q  1 aatgttcgtgttcgtcatgtttgatttgcatactattccatgtgaattttgctactgtttgctatgcatatgtcactgttttgatgtgttgagttttatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28016349 aatgttcgtgttcgtcatgtttgatttgcatactattccatgtgaattttgctactgtttgctatgcatatgtcactgttttgatgtgttgagttttatt 28016448  T
Q  101 cttgcatcatgcgcattatccatcacatgtttccggcttattttcatcgtcactttaccgtctcatgccatactttcttctatcgctttatgccatattc 200  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  28016449 cttgcatcatgcgcattattcatcacatgtttccggcttattttcatcgtcactttaccgtcttatgccatgctttcttctatcgctttatgccatatcc 28016548  T
Q  201 -ttttttaccattttctactaacatttcctttcatgttgatcacttcat 248  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28016549 tttttttaccattttctactaacatttcctttcatgttgatcacttcat 28016597  T

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Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Original strand, 28031667 - 28031915
Alignment:
Q  1 aatgttcgtgttcgtcatgtttgatttgcatactattccatgtgaattttgctactgtttgctatgcatatgtcactgttttgatgtgttgagttttatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28031667 aatgttcgtgttcgtcatgtttgatttgcatactattccatgtgaattttgctactgtttgctatgcatatgtcactgttttgatgtgttgagttttatt 28031766  T
Q  101 cttgcatcatgcgcattatccatcacatgtttccggcttattttcatcgtcactttaccgtctcatgccatactttcttctatcgctttatgccatattc 200  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  28031767 cttgcatcatgcgcattattcatcacatgtttccggcttattttcatcgtcactttaccgtcttatgccatgctttcttctatcgctttatgccatatcc 28031866  T
Q  201 -ttttttaccattttctactaacatttcctttcatgttgatcacttcat 248  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28031867 tttttttaccattttctactaacatttcctttcatgttgatcacttcat 28031915  T

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Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 221; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Original strand, 16602705 - 16602953
Alignment:
Q  1 aatgttcgtgttcgtcatgtttgatttgcatactattccatgtgaattttgctactgtttgctatgcatatgtcactgttttgatgtgttgagttttatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16602705 aatgttcgtgttcgtcatgtttgatttgcatgctattccatgtgaattttgctactgtttgctatgcatatgtcactgttttgatgtgttgagttttatt 16602804  T
Q  101 cttgcatcatgcgcattatccatcacatgtttccggcttattttcatcgtcactttaccgtctcatgccatactttcttctatcgctttatgccatatt- 199  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  16602805 cttgcatcatgcgcattattcatcacatgtttctggcttattttcatcgtcactttaccgtcttatgccatactttcttccatcgctttatgccatattc 16602904  T
Q  200 cttttttaccattttctactaacatttcctttcatgttgatcacttcat 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16602905 cttttttaccattttctactaacatttcctttcatgttgatcacttcat 16602953  T

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Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Original strand, 51777091 - 51777338
Alignment:
Q  1 aatgttcgtgttcgtcatgtttgatttgcatactattccatgtgaattttgctactgtttgctatgcatatgtcactgttttgatgtgttgagttttatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  51777091 aatgttcgtgttcgtcatgtttgatttgcatactattccatgtgaattttgctactgtttgctatgcatatgtcactgttttgatgtgttgagttttgtt 51777190  T
Q  101 cttgcatcatgcgcattatccatcacatgtttccggcttattttcatcgtcacttt-accgtctcatgccatactttcttctatcgctttatgccatatt 199  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  51777191 cttgcatcatgcgcattattcatcacatgtttccggcttattttcaccgtcattttaaccgtcttatgccatactttcttctatcactttatgccatttt 51777290  T
Q  200 cttttttaccattttctactaacatttcctttcatgttgatcacttcat 248  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  51777291 c-tttttaccattttctactaacatttcctttcatattgatcacttcat 51777338  T

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Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Original strand, 51792177 - 51792424
Alignment:
Q  1 aatgttcgtgttcgtcatgtttgatttgcatactattccatgtgaattttgctactgtttgctatgcatatgtcactgttttgatgtgttgagttttatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  51792177 aatgttcgtgttcgtcatgtttgatttgcatactattccatgtgaattttgctactgtttgctatgcatatgtcactgttttgatgtgttgagttttgtt 51792276  T
Q  101 cttgcatcatgcgcattatccatcacatgtttccggcttattttcatcgtcacttt-accgtctcatgccatactttcttctatcgctttatgccatatt 199  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  51792277 cttgcatcatgcgcattattcatcacatgtttccggcttattttcaccgtcattttaaccgtcttatgccatactttcttctatcactttatgccatttt 51792376  T
Q  200 cttttttaccattttctactaacatttcctttcatgttgatcacttcat 248  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  51792377 c-tttttaccattttctactaacatttcctttcatattgatcacttcat 51792424  T

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Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Original strand, 5710374 - 5710626
Alignment:
Q  1 aatgttcgtgttcgtcatgtttgatttgcatactattccatgtgaattttgctactgtttgctatgcatatgtcactgttttgatgtgttgagttttatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  5710374 aatgttcgtgttcgtcatgtttgatttgcatactattccatatgaattttgctactgtttgctatgcatatgtcactgttttgatgtgttgagttttgtt 5710473  T
Q  101 cttgcatcatgcgcattatccatcacatgtttccggcttattttcatcgtcactttaccgtctcatgccatactttcttctatcgctttatgccatattc 200  Q
    ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  5710474 cttgcatcatgtgcattattcattacatgtttccggcttattttcatcgtcactttaccgttttatgccgtactttcttccatcgcttcatgccatattc 5710573  T
Q  201 -----ttttttaccattttctactaacatttcctttcatgttgatcacttcat 248  Q
         |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5710574 tttctttttttaccattttctactaacatttcctttcatattgatcacttcat 5710626  T

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Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Original strand, 5721284 - 5721536
Alignment:
Q  1 aatgttcgtgttcgtcatgtttgatttgcatactattccatgtgaattttgctactgtttgctatgcatatgtcactgttttgatgtgttgagttttatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  5721284 aatgttcgtgttcgtcatgtttgatttgcatactattccatatgaattttgctactgtttgctatgcatatgtcactgttttgatgtgttgagttttgtt 5721383  T
Q  101 cttgcatcatgcgcattatccatcacatgtttccggcttattttcatcgtcactttaccgtctcatgccatactttcttctatcgctttatgccatattc 200  Q
    ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  5721384 cttgcatcatgtgcattattcattacatgtttccggcttattttcatcgtcactttaccgttttatgccgtactttcttccatcgcttcatgccatattc 5721483  T
Q  201 -----ttttttaccattttctactaacatttcctttcatgttgatcacttcat 248  Q
         |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5721484 tttctttttttaccattttctactaacatttcctttcatattgatcacttcat 5721536  T

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Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Original strand, 5732187 - 5732439
Alignment:
Q  1 aatgttcgtgttcgtcatgtttgatttgcatactattccatgtgaattttgctactgtttgctatgcatatgtcactgttttgatgtgttgagttttatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  5732187 aatgttcgtgttcgtcatgtttgatttgcatactattccatatgaattttgctactgtttgctatgcatatgtcactgttttgatgtgttgagttttgtt 5732286  T
Q  101 cttgcatcatgcgcattatccatcacatgtttccggcttattttcatcgtcactttaccgtctcatgccatactttcttctatcgctttatgccatattc 200  Q
    ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  5732287 cttgcatcatgtgcattattcattacatgtttccggcttattttcatcgtcactttaccgttttatgccgtactttcttccatcgcttcatgccatattc 5732386  T
Q  201 -----ttttttaccattttctactaacatttcctttcatgttgatcacttcat 248  Q
         |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5732387 tttctttttttaccattttctactaacatttcctttcatattgatcacttcat 5732439  T

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Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 5760181 - 5759929
Alignment:
Q  1 aatgttcgtgttcgtcatgtttgatttgcatactattccatgtgaattttgctactgtttgctatgcatatgtcactgttttgatgtgttgagttttatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  5760181 aatgttcgtgttcgtcatgtttgatttgcatactattccatatgaattttgctactgtttgctatgcatatgtcactgttttgatgtgttgagttttgtt 5760082  T
Q  101 cttgcatcatgcgcattatccatcacatgtttccggcttattttcatcgtcactttaccgtctcatgccatactttcttctatcgctttatgccatattc 200  Q
    ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  5760081 cttgcatcatgtgcattattcattacatgtttccggcttattttcatcgtcactttaccgttttatgccgtactttcttccatcgcttcatgccatattc 5759982  T
Q  201 -----ttttttaccattttctactaacatttcctttcatgttgatcacttcat 248  Q
         |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5759981 tttctttttttaccattttctactaacatttcctttcatattgatcacttcat 5759929  T

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Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 181; E-Value: 7e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Original strand, 47018552 - 47018800
Alignment:
Q  1 aatgttcgtgttcgtcatgtttgatttgcatactattccatgtgaattttgctactgtttgctatgcatatgtcactgttttgatgtgttgagttttatt 100  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  47018552 aatgtttgtattcgtcatgtttgatttgcatactatttcatatgaattttgctactgtttgctatgcgtatgtcactgttttgatgtgttaggttttatt 47018651  T
Q  101 cttgcatcatgcgcattatccatcacatgtttccggcttattttcatcgtcactttaccgtctcatgccatactttcttctatcgctttatgccatattc 200  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  47018652 cttgcatcatacgcattattcatcacatgtttccggcttattttcatcgtcactctatcgtcttatgccatactttcttctatcactttatgccgtattc 47018751  T
Q  201 tt-ttttaccattttctactaacatttcctttcatgttgatcacttcat 248  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  47018752 ttcttttaccattttctactaacatttcctttcatgttgatcatttcat 47018800  T

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Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 181; E-Value: 7e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Original strand, 47033466 - 47033714
Alignment:
Q  1 aatgttcgtgttcgtcatgtttgatttgcatactattccatgtgaattttgctactgtttgctatgcatatgtcactgttttgatgtgttgagttttatt 100  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  47033466 aatgtttgtattcgtcatgtttgatttgcatactatttcatatgaattttgctactgtttgctatgcgtatgtcactgttttgatgtgttaggttttatt 47033565  T
Q  101 cttgcatcatgcgcattatccatcacatgtttccggcttattttcatcgtcactttaccgtctcatgccatactttcttctatcgctttatgccatattc 200  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  47033566 cttgcatcatacgcattattcatcacatgtttccggcttattttcatcgtcactctatcgtcttatgccatactttcttctatcactttatgccgtattc 47033665  T
Q  201 tt-ttttaccattttctactaacatttcctttcatgttgatcacttcat 248  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  47033666 ttcttttaccattttctactaacatttcctttcatgttgatcatttcat 47033714  T

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Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Original strand, 26295999 - 26296247
Alignment:
Q  1 aatgttcgtgttcgtcatgtttgatttgcatactattccatgtgaattttgctactgtttgctatgcatatgtcactgttttgatgtgttgagttttatt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  26295999 aatgttcgtattcgtcatgtttgatttgcatactatttcatatgaattttgctactgtttgctatgcatatgtcactgttttgatgttttgtgttttatt 26296098  T
Q  101 cttgcatcatgcgcattatccatcacatgtttccggcttattttcatcgtcactttaccgtctcatgccatactttcttctatcgctttatgccatattc 200  Q
    |||||||| | | |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||| || | ||    
T  26296099 cttgcatctttctcattattcatcacacgtttccggcttattttcatcgtcactctaccgtcttatgccatactttattctatcactttatgtcacactc 26296198  T
Q  201 tt-ttttaccattttctactaacatttcctttcatgttgatcacttcat 248  Q
    || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26296199 ttcttttaccattttatactaacatttcctttcatgttgatcacttcat 26296247  T

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Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 90 - 248
Target Start/End: Original strand, 5769388 - 5769551
Alignment:
Q  90 tgagttttattcttgcatcatgcgcattatccatcacatgtttccggcttattttcatcgtcactttaccgtctcatgccatactttcttctatcgcttt 189  Q
    |||||||| ||||||| ||| | ||||||| ||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||| |||||||     
T  5769388 tgagttttgttcttgcgtcaggtgcattattcattacatgattgcggcttattttcatcgtcactttaccgttttatgccgtactttcttccatcgcttc 5769487  T
Q  190 atgccatattc-----ttttttaccattttctactaacatttcctttcatgttgatcacttcat 248  Q
    |||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5769488 atgccatattctttctttttttaccattttctactaacatttcctttcatattgatcacttcat 5769551  T

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Target: chr1 (Bit Score: 225; Significance: 1e-124; HSPs: 6)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Original strand, 10936119 - 10936367
Alignment:
Q  1 aatgttcgtgttcgtcatgtttgatttgcatactattccatgtgaattttgctactgtttgctatgcatatgtcactgttttgatgtgttgagttttatt 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10936119 aatgttcgtgctcgtcatgtttgatttgcatactattccatgtgaattttgctactgtttgctatgcatatgtcactgttttgatgtgttgagttttatt 10936218  T
Q  101 cttgcatcatgcgcattatccatcacatgtttccggcttattttcatcgtcactttaccgtctcatgccatactttcttctatcgctttatgccatattc 200  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10936219 cttgcatcatgcgcattattcatcacatgtttccggcttattttcatcgtcactttaccgtcttatgccatactttcttctatcgctttatgccatattc 10936318  T
Q  201 -ttttttaccattttctactaacatttcctttcatgttgatcacttcat 248  Q
     ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10936319 tttttttatcattttctactaacatttcctttcatgttgatcacttcat 10936367  T

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Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Original strand, 10955310 - 10955558
Alignment:
Q  1 aatgttcgtgttcgtcatgtttgatttgcatactattccatgtgaattttgctactgtttgctatgcatatgtcactgttttgatgtgttgagttttatt 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10955310 aatgttcgtgctcgtcatgtttgatttgcatactattccatgtgaattttgctactgtttgctatgcatatgtcactgttttgatgtgttgagttttatt 10955409  T
Q  101 cttgcatcatgcgcattatccatcacatgtttccggcttattttcatcgtcactttaccgtctcatgccatactttcttctatcgctttatgccatattc 200  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10955410 cttgcatcatgcgcattattcatcacatgtttccggcttattttcatcgtcactttaccgtcttatgccatactttcttctatcgctttatgccatattc 10955509  T
Q  201 -ttttttaccattttctactaacatttcctttcatgttgatcacttcat 248  Q
     ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10955510 tttttttatcattttctactaacatttcctttcatgttgatcacttcat 10955558  T

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Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Original strand, 9079646 - 9079893
Alignment:
Q  1 aatgttcgtgttcgtcatgtttgatttgcatactattccatgtgaattttgctactgtttgctatgcatatgtcactgttttgatgtgttgagttttatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9079646 aatgttcgtgttcgtcatgtttgatttgtatactattccatgtgaattttgctactgtttgctatgcatatgtcactgttttgatgtgttgagttttatt 9079745  T
Q  101 cttgcatcatgcgcattatccatcacatgtttccggcttattttcatcgtcactttaccgtctcatgccatactttcttctatcgctttatgccatattc 200  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9079746 cttgcatcatgcgcattattcatcacatgtttccggcttatttttatcgtcactttaccgtcttatgccatactttcttctatcgctttatgccatattc 9079845  T
Q  201 ttttttaccattttctactaacatttcctttcatgttgatcacttcat 248  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  9079846 ttttttatcattttctactaacatttcctttcgtgttgatcacttcat 9079893  T

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Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 206; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Original strand, 36508074 - 36508320
Alignment:
Q  1 aatgttcgtgttcgtcatgtttgatttgcata-ctattccatgtgaattttgctactgtttgctatgcatatgtcactgttttgatgtgttgagttttat 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36508074 aatgttcgtgttcgtcatgtttgatttgcataactattccatgggagttttgctactgtttgccatgcatatgtcactgttttgatgtgttgagttttat 36508173  T
Q  100 tcttgcatcatgcgcattatccatcacatgtttccggcttattttcatcgtcactttaccgtctcatgccatactttcttctatcgctttatgccatatt 199  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  36508174 tcttgcatcctgcgcattatccatcacatgtttccggcttattttcatcgtcactttaccgtctcatgccatactttcttatatcgctttatgccatatt 36508273  T
Q  200 cttttttaccattttctactaacatttcctttcatgttgatcacttcat 248  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  36508274 c--ttttaccattttctactaacatttcctttcgtgttgatcacttcat 36508320  T

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Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 5 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 14413944 - 14413701
Alignment:
Q  5 ttcgtgttcgtcatgtttgatttgcatactattccatgtgaattttgctactgtttgctatgcatatgtcactgttttgatgtgttgagttttattcttg 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14413944 ttcgtgttcgtcatgtttgatttgcatacttttccatgtgaattttgctactgtttgctatgcatatgtcactgttttgatgtgttgagttttattcttg 14413845  T
Q  105 catcatgcgcattatccatcacatgtttccggcttattttcatcgtcactttaccgtctcatgccatactttcttctatcgctttatgccatattctttt 204  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14413844 catcatgcgcattattcatcacatgtttccggcttattcttatcgtcactttaccgtcttacgccatactttcttctatcgcttcatgccatattctttt 14413745  T
Q  205 ttaccattttctactaacatttcctttcatgttgatcacttcat 248  Q
    |||| | || || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14413744 ttactacttgctgctaacatttcctttcatgttgatcacttcat 14413701  T

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Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Original strand, 48095116 - 48095364
Alignment:
Q  1 aatgttcgtgttcgtcatgtttgatttgcatactattccatgtgaattttgctactgtttgctatgcatatgtcactgttttgatgtgttgagttttatt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  48095116 aatgttcgtattcgtcatgtttgatttgcatactatttcatatgaattatgctactgtttgctatgcatatgtcactgttttgatgtgttgggttttatt 48095215  T
Q  101 cttgcatcatgcgcattatccatcacatgtttccggcttattttcatcgtcactttaccgtctcatgccatactttcttctatcgctttatgccatattc 200  Q
    ||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||    
T  48095216 cttgcatcatgcgcattattcaccacacgtttccggcttattttcatcgtcactctatcgtcttatgccatactttcttctatcactttatgtcatactc 48095315  T
Q  201 tt-ttttaccattttctactaacatttcctttcatgttgatcacttcat 248  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48095316 ttcttttaccattttctactaacatttcctttcatgttgatcacttcat 48095364  T

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Target: chr5 (Bit Score: 223; Significance: 1e-123; HSPs: 9)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 13432562 - 13432313
Alignment:
Q  1 aatgttcgtgttcgtcatgtttgatttgcatactattccatgtgaattttgctactgtttgctatgcatatgtcactgttttgatgtgttgagttttatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13432562 aatgttcgtgttcgtcatgtttgatttgcatactattccatgtgaattttgctactgtttgctatgcatatgtcactgttttgatgtgttgagttttatt 13432463  T
Q  101 cttgcatcatgcgcattatccatcacatgtttccggcttattttcatcgtcactttaccgtctcatgccatactttcttctatcgctttatgccatattc 200  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13432462 cttgcatcatgcgcattattcatcacatgtttccggcttattttcatcgtcactttaccgtcttatgccatactttcttctatcgcttcatgccatattc 13432363  T
Q  201 tt--ttttaccattttctactaacatttcctttcatgttgatcacttcat 248  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13432362 ttttttttaccattttctactaacatttcctttcatgttgattacttcat 13432313  T

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Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 13443456 - 13443207
Alignment:
Q  1 aatgttcgtgttcgtcatgtttgatttgcatactattccatgtgaattttgctactgtttgctatgcatatgtcactgttttgatgtgttgagttttatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13443456 aatgttcgtgttcgtcatgtttgatttgcatactattccatgtgaattttgctactgtttgctatgcatatgtcactgttttgatgtgttgagttttatt 13443357  T
Q  101 cttgcatcatgcgcattatccatcacatgtttccggcttattttcatcgtcactttaccgtctcatgccatactttcttctatcgctttatgccatattc 200  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13443356 cttgcatcatgcgcattattcatcacatgtttccggcttattttcatcgtcactttaccgtcttatgccatactttcttctatcgcttcatgccatattc 13443257  T
Q  201 tt--ttttaccattttctactaacatttcctttcatgttgatcacttcat 248  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13443256 ttttttttaccattttctactaacatttcctttcatgttgattacttcat 13443207  T

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Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 5 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 31816442 - 31816199
Alignment:
Q  5 ttcgtgttcgtcatgtttgatttgcatactattccatgtgaattttgctactgtttgctatgcatatgtcactgttttgatgtgttgagttttattcttg 104  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31816442 ttcgtgctcgtcatgtttgatttgcatactactccatgtgaattttgctactgtttgctatgcatatgtcactgttttgatgtgttgagttttattcttg 31816343  T
Q  105 catcatgcgcattatccatcacatgtttccggcttattttcatcgtcactttaccgtctcatgccatactttcttctatcgctttatgccatattctttt 204  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31816342 catcatgcgcattattcatcacatgtttccgacttattttcatcgtcacttcgccgtcttatgccatactttcttctatcgctttatgccatattttttt 31816243  T
Q  205 ttaccattttctactaacatttcctttcatgttgatcacttcat 248  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  31816242 ttattattttctactaacatttcctttcatgttgattacttcat 31816199  T

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Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Original strand, 6869431 - 6869679
Alignment:
Q  1 aatgttcgtgttcgtcatgtttgatttgcatactattccatgtgaattttgctactgtttgctatgcatatgtcactgttttgatgtgttgagttttatt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  6869431 aatgttcgtattcgtcatgtttgatttgcatactatttcatatgaattttgctactgtttgctatgcatatgtcactgttttgacgtattgagttttatt 6869530  T
Q  101 cttgcatcatgcgcattatccatcacatgtttccggcttattttcatcgtcactttaccgtctcatgccatactttcttctatcgctttatgccatattc 200  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  6869531 cttgcatcatacgcattattcatcacacgtttccggcttattttcatcgtcactctaccgtcttatgccatactttcttctatcactttatgccatattc 6869630  T
Q  201 tt-ttttaccattttctactaacatttcctttcatgttgatcacttcat 248  Q
    || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6869631 ttcttttaccatcttctactaacatttcctttcatgttgatcacttcat 6869679  T

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Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Original strand, 6884555 - 6884803
Alignment:
Q  1 aatgttcgtgttcgtcatgtttgatttgcatactattccatgtgaattttgctactgtttgctatgcatatgtcactgttttgatgtgttgagttttatt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  6884555 aatgttcgtattcgtcatgtttgatttgcatactatttcatatgaattttgctactgtttgctatgcatatgtcactgttttgacgtattgagttttatt 6884654  T
Q  101 cttgcatcatgcgcattatccatcacatgtttccggcttattttcatcgtcactttaccgtctcatgccatactttcttctatcgctttatgccatattc 200  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  6884655 cttgcatcatacgcattattcatcacacgtttccggcttattttcatcgtcactctaccgtcttatgccatactttcttctatcactttatgccatattc 6884754  T
Q  201 tt-ttttaccattttctactaacatttcctttcatgttgatcacttcat 248  Q
    || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6884755 ttcttttaccatcttctactaacatttcctttcatgttgatcacttcat 6884803  T

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Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 5 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 31831472 - 31831228
Alignment:
Q  5 ttcgtgttcgtcatgtttgatttgcatactattccatgtgaattttgctactgtttgctatgcatatgtcactgttttgatgtgttgagttttattcttg 104  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31831472 ttcgtgctcgtcatgtttgatttgcatactactccatgtgaattttgctactgtttgctatgcatatgtcactgttttgatgtgttgagttttattcttg 31831373  T
Q  105 catcatgcgcattatccatcacatgtttccggcttattttcatcgtcactttaccgtctcatgccatactttcttctatcgctttatgccata-ttcttt 203  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  31831372 catcatgcgcattattcatcacatgtttccgacttattttcatcgtcacttcgccgtcttatgccatactttcttctatcgctttatgccatattttttt 31831273  T
Q  204 tttaccattttctactaacatttcctttcatgttgatcacttcat 248  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  31831272 tttattattttctactaacatttcctttcatgttgattacttcat 31831228  T

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Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Original strand, 5633020 - 5633268
Alignment:
Q  1 aatgttcgtgttcgtcatgtttgatttgcatactattccatgtgaattttgctactgtttgctatgcatatgtcactgttttgatgtgttgagttttatt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5633020 aatgttcgtattcgtcatgtttgatttgcatactatttcatatgaattttgctactgtttgctatgcatatgtcactgttttgatgtgttgggttttatt 5633119  T
Q  101 cttgcatcatgcgcattatccatcacatgtttccggcttattttcatcgtcactttaccgtctcatgccatactttcttctatcgctttatgccatattc 200  Q
    ||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||    
T  5633120 cttgcatcatgcgcattattcaccacacgtttccggcttattttcatcgtcactctatcgtcttatgccatactttcttctatcactttatgtcatactc 5633219  T
Q  201 tt-ttttaccattttctactaacatttcctttcatgttgatcacttcat 248  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5633220 ttcttttaccattttctactaacatttcctttcatgttgatcacttcat 5633268  T

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Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Original strand, 5647894 - 5648142
Alignment:
Q  1 aatgttcgtgttcgtcatgtttgatttgcatactattccatgtgaattttgctactgtttgctatgcatatgtcactgttttgatgtgttgagttttatt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5647894 aatgttcgtattcgtcatgtttgatttgcatactatttcatatgaattttgctactgtttgctatgcatatgtcactgttttgatgtgttgggttttatt 5647993  T
Q  101 cttgcatcatgcgcattatccatcacatgtttccggcttattttcatcgtcactttaccgtctcatgccatactttcttctatcgctttatgccatattc 200  Q
    ||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||    
T  5647994 cttgcatcatgcgcattattcaccacacgtttccggcttattttcatcgtcactctatcgtcttatgccatactttcttctatcactttatgtcatactc 5648093  T
Q  201 tt-ttttaccattttctactaacatttcctttcatgttgatcacttcat 248  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5648094 ttcttttaccattttctactaacatttcctttcatgttgatcacttcat 5648142  T

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Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 32596780 - 32596532
Alignment:
Q  1 aatgttcgtgttcgtcatgtttgatttgcatactattccatgtgaattttgctactgtttgctatgcatatgtcactgttttgatgtgttgagttttatt 100  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  32596780 aatgtttgtattcgtcatgtttgatttgcatactatttcatatgaattttgctactgtttgctatgcgtatgtcactgttttgatgtgttaggttttatt 32596681  T
Q  101 cttgcatcatgcgcattatccatcacatgtttccggcttattttcatcgtcactttaccgtctcatgccatactttcttctatcgctttatgccatattc 200  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  32596680 cttgcatcatacgcattattcatcacatgtttccggcttattttcatcgtcactctatcgtcttatgccatactttcttctatcactttatgccgtattc 32596581  T
Q  201 tt-ttttaccattttctactaacatttcctttcatgttgatcacttcat 248  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32596580 ttcttttaccattttctactaacatttcctttcatgttgatcacttcat 32596532  T

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Target: chr8 (Bit Score: 204; Significance: 1e-111; HSPs: 8)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 5 - 248
Target Start/End: Original strand, 29825856 - 29826099
Alignment:
Q  5 ttcgtgttcgtcatgtttgatttgcatactattccatgtgaattttgctactgtttgctatgcatatgtcactgttttgatgtgttgagttttattcttg 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29825856 ttcgtgttcgtcatgtttgatttgcatacttttccatgtgaatcttgctactgtttgctatgcatatgtcactgttttgatgtgttgagttttattcttg 29825955  T
Q  105 catcatgcgcattatccatcacatgtttccggcttattttcatcgtcactttaccgtctcatgccatactttcttctatcgctttatgccatattctttt 204  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  29825956 catcatgcgcattattcatcacatgtttccggcttattcttatcgtcactttaccgtcttatgccatactttcttctatcgcttcatgccatattctttt 29826055  T
Q  205 ttaccattttctactaacatttcctttcatgttgatcacttcat 248  Q
    |||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29826056 ttactatttgctgctaacatttcctttcatgttgatcacttcat 29826099  T

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Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 5 - 248
Target Start/End: Original strand, 29839581 - 29839824
Alignment:
Q  5 ttcgtgttcgtcatgtttgatttgcatactattccatgtgaattttgctactgtttgctatgcatatgtcactgttttgatgtgttgagttttattcttg 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29839581 ttcgtgttcgtcatgtttgatttgcatacttttccatgtgaatcttgctactgtttgctatgcatatgtcactgttttgatgtgttgagttttattcttg 29839680  T
Q  105 catcatgcgcattatccatcacatgtttccggcttattttcatcgtcactttaccgtctcatgccatactttcttctatcgctttatgccatattctttt 204  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  29839681 catcatgcgcattattcatcacatgtttccggcttattcttatcgtcactttaccgtcttatgccatactttcttctatcgcttcatgccatattctttt 29839780  T
Q  205 ttaccattttctactaacatttcctttcatgttgatcacttcat 248  Q
    |||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29839781 ttactatttgctgctaacatttcctttcatgttgatcacttcat 29839824  T

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Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 19198389 - 19198141
Alignment:
Q  1 aatgttcgtgttcgtcatgtttgatttgcatactattccatgtgaattttgctactgtttgctatgcatatgtcactgttttgatgtgttgagttttatt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  19198389 aatgttcgtattcgtcatgtttgatttgcatactatttcatatgaattttgctactgtttgctatgcatatgtcactgttttgatgtgctgggttttatt 19198290  T
Q  101 cttgcatcatgcgcattatccatcacatgtttccggcttattttcatcgtcactttaccgtctcatgccatactttcttctatcgctttatgccatattc 200  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19198289 cttgcatcatacgcattattcatcacacgtttccggcttattttcatcgtcactctaccgtcttatgccatactttcttctatcactttatgccatattc 19198190  T
Q  201 tt-ttttaccattttctactaacatttcctttcatgttgatcacttcat 248  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19198189 ttcttttaccattttctactaacatttcctttcatgttgatcacttcat 19198141  T

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Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 19213454 - 19213206
Alignment:
Q  1 aatgttcgtgttcgtcatgtttgatttgcatactattccatgtgaattttgctactgtttgctatgcatatgtcactgttttgatgtgttgagttttatt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  19213454 aatgttcgtattcgtcatgtttgatttgcatactatttcatatgaattttgctactgtttgctatgcatatgtcactgttttgatgtgctgggttttatt 19213355  T
Q  101 cttgcatcatgcgcattatccatcacatgtttccggcttattttcatcgtcactttaccgtctcatgccatactttcttctatcgctttatgccatattc 200  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19213354 cttgcatcatacgcattattcatcacacgtttccggcttattttcatcgtcactctaccgtcttatgccatactttcttctatcactttatgccatattc 19213255  T
Q  201 tt-ttttaccattttctactaacatttcctttcatgttgatcacttcat 248  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19213254 ttcttttaccattttctactaacatttcctttcatgttgatcacttcat 19213206  T

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Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 19283581 - 19283333
Alignment:
Q  1 aatgttcgtgttcgtcatgtttgatttgcatactattccatgtgaattttgctactgtttgctatgcatatgtcactgttttgatgtgttgagttttatt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  19283581 aatgttcgtattcgtcatgtttgatttgcatactatttcatatgaattttgctactgtttgctatgcatatgtcactgttttgatgtgctgggttttatt 19283482  T
Q  101 cttgcatcatgcgcattatccatcacatgtttccggcttattttcatcgtcactttaccgtctcatgccatactttcttctatcgctttatgccatattc 200  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19283481 cttgcatcatacgcattattcatcacacgtttccggcttattttcatcgtcactctaccgtcttatgccatactttcttctatcactttatgccatattc 19283382  T
Q  201 tt-ttttaccattttctactaacatttcctttcatgttgatcacttcat 248  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19283381 ttcttttaccattttctactaacatttcctttcatgttgatcacttcat 19283333  T

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Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Original strand, 19684913 - 19685161
Alignment:
Q  1 aatgttcgtgttcgtcatgtttgatttgcatactattccatgtgaattttgctactgtttgctatgcatatgtcactgttttgatgtgttgagttttatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  19684913 aatgttcgtgttcgtcatgtttgatttgcataccattccatgtgaactttgctactgtttgctatgtgtatgtcactgttttgatgtgttgggtcttatt 19685012  T
Q  101 cttgcatcatgcgcattatccatcacatgtttccggcttattttcatcgtcactttaccgtctcatgccatactttcttctatcgctttatgccatattc 200  Q
     | || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19685013 ttagcttcatgcgcattattcatcacatgtttccggcttattttcatcgtcactttaccgtcttatgccatactttcttctatcgcttcatgccatattc 19685112  T
Q  201 ttttttaccatttt-ctactaacatttcctttcatgttgatcacttcat 248  Q
    |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19685113 ttttttactattttgctactaacgtttcctttcatgttgatcacttcat 19685161  T

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Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 181; E-Value: 7e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Original strand, 19669551 - 19669799
Alignment:
Q  1 aatgttcgtgttcgtcatgtttgatttgcatactattccatgtgaattttgctactgtttgctatgcatatgtcactgttttgatgtgttgagttttatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  19669551 aatgttcgtgttcgtcatgtttgatttgcataccattccatgtgaactttgctactgtttgctatgtgtatgtcactgttttgatgtgttgggtcttatt 19669650  T
Q  101 cttgcatcatgcgcattatccatcacatgtttccggcttattttcatcgtcactttaccgtctcatgccatactttcttctatcgctttatgccatattc 200  Q
     | || ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19669651 ttagcttcatgcgtattattcatcacatgtttccggcttattttcatcgtcactttaccgtcttatgccatactttcttctatcgcttcatgccatattc 19669750  T
Q  201 ttttttaccatttt-ctactaacatttcctttcatgttgatcacttcat 248  Q
    |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19669751 ttttttactattttgctactaacgtttcctttcatgttgatcacttcat 19669799  T

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Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 15902863 - 15902607
Alignment:
Q  1 aatgttcgtgttcgtcatgtttgatttgcatactattccatgtgaattttgctactgtttgctatgcatatgtcactgttttgatgtgttgagttttatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  15902863 aatgttcgtgttcgtcatgtttgatttgcatactattccatatgaattttgctactgtttgctatgcatatgtcactgttttgatgtgttgagttttgtt 15902764  T
Q  101 cttgcatcatgcgcattatccatcacatgtttccggcttattttcatcgtcactttaccgtctcatgccatactttcttctatcgctttatgccatatt- 199  Q
    ||||| ||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||     
T  15902763 cttgcgtcatgtgcattattcattacatgtttccggcttatttttatcgtcactttaccgttttatgccatactttcttccatcgcttcatgccatattc 15902664  T
Q  200 --------cttttttaccattttctactaacatttcctttcatgttgatcacttcat 248  Q
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15902663 tttctttccttttttaccattttctactaacatttcctttcatattgatcacttcat 15902607  T

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Target: scaffold0336 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 1)
Name: scaffold0336
Description:

Target: scaffold0336; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Original strand, 3344 - 3597
Alignment:
Q  1 aatgttcgtgttcgtcatgtttgatttgcatactattccatgtgaattttgctactgtttgctatgcatatgtcactgttttgatgtgttgagttttatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  3344 aatgttcgtgttcgtcatgtttgatttgcatactattccatatgaattttgctactgtttgctatgcatatgtcactgttttgatgtgttgaattttgtt 3443  T
Q  101 cttgcatcatgcgcattatccatcacatgtttccggcttattttcatcgtcactttaccgtctcatgccatactttcttctatcgctttatgccatattc 200  Q
    ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  3444 cttgcatcatgtgcattattcattacatgtttccggcttattttcatcgtcactttaccgttttatgccatactttcttccatcgcttcatgccatattc 3543  T
Q  201 ------ttttttaccattttctactaacatttcctttcatgttgatcacttcat 248  Q
          |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3544 tttcttttttttaccattttctactaacatttcctttcatattgatcacttcat 3597  T

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Target: chr6 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 4)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 8188948 - 8188693
Alignment:
Q  1 aatgttcgtgttcgtcatgtttgatttgcatactattccatgtgaattttgctactgtttgctatgcatatgtcactgttttgatgtgttgagttttatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8188948 aatgttcgtgttcgtcatgtttgatttgcatactattccatatgaattttgctactgtttgctatgcatatgtcactgttttgatgtgttgagttttatt 8188849  T
Q  101 cttgcatcatgcgcattatccatcacatgtttccggcttattttcatcgtcactttaccgtctcatgccatactttcttctatcgctttatgccatattc 200  Q
    ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  8188848 cttgcatcatgtgcattattcattacatgtttccggcttattttcatcgccactttaccgttttatgccatactttcttccatcgcttcatgccatattc 8188749  T
Q  201 --------ttttttaccattttctactaacatttcctttcatgttgatcacttcat 248  Q
            |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8188748 tttcttttttttttaccattttctactaacatttcctttcatattgatcacttcat 8188693  T

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Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 6 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 27619236 - 27618989
Alignment:
Q  6 tcgtgttcgtcatgtttgatttgcatactattccatgtgaattttgctactgtttgctatgcatatgtcactgttttgatgtgttgagttttattcttgc 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  27619236 tcgtgttcgtcatgtttgatttgcatactattccatatgaattttgctactgtttgctatgcatacgccactgttctgatgtgttgagttttgttcttgc 27619137  T
Q  106 atcatgcgcattatccatcacatgtttccggcttattttcatcgtcactttaccgtctcatgccatactttcttctatcgctttatgccatattc----- 200  Q
    |||||| ||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||         
T  27619136 atcatgtgcattattcgttacatgtttccggcttattttcatcgtcactttactgttttatgccatactttcttccatcgcttcatgccacattctttct 27619037  T
Q  201 ttttttaccattttctactaacatttcctttcatgttgatcacttcat 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27619036 ttttttaccattttctactaacatttcctttcatattgatcacttcat 27618989  T

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Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 6 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 27634846 - 27634599
Alignment:
Q  6 tcgtgttcgtcatgtttgatttgcatactattccatgtgaattttgctactgtttgctatgcatatgtcactgttttgatgtgttgagttttattcttgc 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  27634846 tcgtgttcgtcatgtttgatttgcatactattccatatgaattttgctactgtttgctatgcatacgccactgttctgatgtgttgagttttgttcttgc 27634747  T
Q  106 atcatgcgcattatccatcacatgtttccggcttattttcatcgtcactttaccgtctcatgccatactttcttctatcgctttatgccatattc----- 200  Q
    |||||| ||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||         
T  27634746 atcatgtgcattattcgttacatgtttccggcttattttcatcgtcactttactgttttatgccatactttcttccatcgcttcatgccacattctttct 27634647  T
Q  201 ttttttaccattttctactaacatttcctttcatgttgatcacttcat 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27634646 ttttttaccattttctactaacatttcctttcatattgatcacttcat 27634599  T

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Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 4729223 - 4728986
Alignment:
Q  1 aatgttcgtgttcgtcatgtttgatttgcatactattccatgtgaattttgctactgtttgctatgcatatgtcactgttttgatgtgttgagttttatt 100  Q
    |||| |||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||          |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  4729223 aatgctcgtattcgtcatgtctgatttgcatactatcccatgtgaattttgcta----------tgcatatgtcactgttttgatgtgctgagtgttatt 4729134  T
Q  101 cttgcatcatgcgcattatccatcacatgtttccggcttattttcatcgtcacttt-accgtctcatgccatactttcttctatcgctttatgccatatt 199  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  4729133 cttgcatcatgcgcattattcatcacatgtttccggtttattttcatcgtcactttaaccgtcttatgccatactttcttctattgctttatgccataat 4729034  T
Q  200 cttttttaccattttctactaacatttcctttcatg-ttgatcacttcat 248  Q
    |  ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  4729033 c--ttttaccgttttctactaacatttcctttcatgattgatcacctcat 4728986  T

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Target: scaffold1648 (Bit Score: 136; Significance: 5e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold1648
Description:

Target: scaffold1648; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 484 - 247
Alignment:
Q  1 aatgttcgtgttcgtcatgtttgatttgcatactattccatgtgaattttgctactgtttgctatgcatatgtcactgttttgatgtgttgagttttatt 100  Q
    |||| |||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||          |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  484 aatgctcgtattcgtcatgtctgatttgcatactatcccatgtgaattttgcta----------tgcatatgtcactgttttgatgtgctgagtgttatt 395  T
Q  101 cttgcatcatgcgcattatccatcacatgtttccggcttattttcatcgtcacttt-accgtctcatgccatactttcttctatcgctttatgccatatt 199  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  394 cttgcatcatgcgcattattcatcacatgtttccggtttattttcatcgtcactttaaccgtcttatgccatactttcttctattgctttatgccataat 295  T
Q  200 cttttttaccattttctactaacatttcctttcatg-ttgatcacttcat 248  Q
    |  ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  294 c--ttttaccgttttctactaacatttcctttcatgattgatcacctcat 247  T

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