View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF17580_low_14 (Length: 337)

Name: NF17580_low_14
Description: NF17580
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF17580_low_14
NF17580_low_14
[»] chr7 (14 HSPs)
chr7 (10-319)||(4698011-4698320)
chr7 (13-319)||(4862875-4863181)
chr7 (12-317)||(4784658-4784963)
chr7 (12-317)||(4817087-4817392)
chr7 (10-306)||(4846842-4847138)
chr7 (10-306)||(4712887-4713183)
chr7 (94-317)||(4652508-4652731)
chr7 (11-319)||(4642690-4642998)
chr7 (61-319)||(4671626-4671884)
chr7 (94-302)||(4629912-4630120)
chr7 (172-290)||(4635872-4635990)
chr7 (11-317)||(4665923-4666229)
chr7 (116-266)||(4660843-4660993)
chr7 (169-239)||(27539502-27539572)
[»] chr4 (2 HSPs)
chr4 (12-319)||(18926562-18926869)
chr4 (169-239)||(46271740-46271810)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 298; Significance: 1e-167; HSPs: 14)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 10 - 319
Target Start/End: Original strand, 4698011 - 4698320
Alignment:
Q  10 gcagagatgattctcgtttacgacttcatggaacgtggcactcttcgtgaatatctctatggttcggataacgaacctcttacttggaagaagagactcg 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4698011 gcagagatgattctcgtttacgacttcatggaacgtggcactcttcgtgaatatctctatggttcggataacgaacctcttacttggaagaagagactcg 4698110  T
Q  110 agattttattgggtgctgcaagaggcctacattatcttcatgcaggtgcgaagcacaatatcatacaccgtgatgtgaagagtaccaacatattgttaga 209  Q
    ||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4698111 agattctattgggggcagcaagaggcctacattatcttcatgcaggtgcgaagcacaatatcatacaccgtgatgtgaagagtaccaacatattgttaga 4698210  T
Q  210 tgataaatgggtggctaaggtttctgatttcgggttatcaaaagtgggaccaacaggaatgtcgatgacccacgtcagcactaaggtgaagggtagtctc 309  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4698211 tgataaatgggtggctaaggtttctgatttcgggttatcaaaagtgggaccaacaggaatgtcgatgacccacgtcagcactaaggtgaagggtagtctc 4698310  T
Q  310 gggtatttag 319  Q
    ||||||||||    
T  4698311 gggtatttag 4698320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 13 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 4863181 - 4862875
Alignment:
Q  13 gagatgattctcgtttacgacttcatggaacgtggcactcttcgtgaatatctctatggttcggataacgaacctcttacttggaagaagagactcgaga 112  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4863181 gagatgattctcgtttatgacttcatgcaacgtggcactctccgtgaatatctttatggttcggataatgaacctcttacttggaagaagagacttgaga 4863082  T
Q  113 ttttattgggtgctgcaagaggcctacattatcttcatgcaggtgcgaagcacaatatcatacaccgtgatgtgaagagtaccaacatattgttagatga 212  Q
    || | ||||| || ||||| ||  |||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  4863081 ttctgttgggggcagcaagggggttacattatcttcatgctggtgtaaagcacaatatcatacaccgtgacgtgaagagtaccaacatattgttggatga 4862982  T
Q  213 taaatgggtggctaaggtttctgatttcgggttatcaaaagtgggaccaacaggaatgtcgatgacccacgtcagcactaaggtgaagggtagtctcggg 312  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||   ||||||||||||||| ||     
T  4862981 aaaatgggtggctaaggtgtctgatttcgggttatcaaaagtgggaccaacaggaatgtctatcactcacgtcagcaccgtggtgaagggtagtcttgga 4862882  T
Q  313 tatttag 319  Q
    |||||||    
T  4862881 tatttag 4862875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 12 - 317
Target Start/End: Original strand, 4784658 - 4784963
Alignment:
Q  12 agagatgattctcgtttacgacttcatggaacgtggcactcttcgtgaatatctctatggttcggataacgaacctcttacttggaagaagagactcgag 111  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||  |||||||||| ||||| || |||||| |||||||||| |||||| |||| || |||    
T  4784658 agagatgattctcgtttatgacttcatgcaacgtggcagtctatgtgaatatctttatggatcagataacaaacctcttacctggaagcagaggcttgag 4784757  T
Q  112 attttattgggtgctgcaagaggcctacattatcttcatgcaggtgcgaagcacaatatcatacaccgtgatgtgaagagtaccaacatattgttagatg 211  Q
    ||| |||| ||||| ||  | ||  | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  4784758 attctattaggtgccgcgcgggggttgcattatctgcatgcaggtgcgaagcacaatatcatacaccgtgacgtgaagagtacaaacatattgttggatg 4784857  T
Q  212 ataaatgggtggctaaggtttctgatttcgggttatcaaaagtgggaccaacaggaatgtcgatgacccacgtcagcactaaggtgaagggtagtctcgg 311  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||    
T  4784858 aaaaatgggtggctaaggtttctgattttgggttatcaaaagtgggacctacagggatgtcgatgacccatgtcagcactatggtgaaaggtagtctcgg 4784957  T
Q  312 gtattt 317  Q
    ||||||    
T  4784958 gtattt 4784963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 12 - 317
Target Start/End: Original strand, 4817087 - 4817392
Alignment:
Q  12 agagatgattctcgtttacgacttcatggaacgtggcactcttcgtgaatatctctatggttcggataacgaacctcttacttggaagaagagactcgag 111  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||  |||||||||| ||||| || |||||| |||||||||| |||||| |||| || |||    
T  4817087 agagatgattctcgtttatgacttcatgcaacgtggcagtctatgtgaatatctttatggatcagataacaaacctcttacctggaagcagaggcttgag 4817186  T
Q  112 attttattgggtgctgcaagaggcctacattatcttcatgcaggtgcgaagcacaatatcatacaccgtgatgtgaagagtaccaacatattgttagatg 211  Q
    ||| |||| ||||| ||  | ||  | |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  4817187 attctattaggtgccgcgcgggggttgcattatttgcatgcaggtgcgaagcacaatatcatacaccgtgatgtgaagagtacaaacatattgttggatg 4817286  T
Q  212 ataaatgggtggctaaggtttctgatttcgggttatcaaaagtgggaccaacaggaatgtcgatgacccacgtcagcactaaggtgaagggtagtctcgg 311  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||    
T  4817287 aaaaatgggtggctaaggtttctgattttgggttatcaaaagtgggacctacagggatgtcgatgacccatgtcagcactatggtgaaaggtagtctcgg 4817386  T
Q  312 gtattt 317  Q
    ||||||    
T  4817387 gtattt 4817392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 10 - 306
Target Start/End: Original strand, 4846842 - 4847138
Alignment:
Q  10 gcagagatgattctcgtttacgacttcatggaacgtggcactcttcgtgaatatctctatggttcggataacgaacctcttacttggaagaagagactcg 109  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||  ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||  | |||||||    
T  4846842 gcagagatgattctagtttatgacttcatgcaacgtggtactctcagtgaacatctctatggttcggataatgaacctcttaggtggaatcaaagactcg 4846941  T
Q  110 agattttattgggtgctgcaagaggcctacattatcttcatgcaggtgcgaagcacaatatcatacaccgtgatgtgaagagtaccaacatattgttaga 209  Q
    ||||| |||| ||||| ||||| ||  |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||||||||| ||    
T  4846942 agattctattaggtgcagcaagggggttgaattatcttcatgaaggtgcgaagcacaatatcatacatcgtgacgttaagagtacaaacatattgttgga 4847041  T
Q  210 tgataaatgggtggctaaggtttctgatttcgggttatcaaaagtgggaccaacaggaatgtcgatgacccacgtcagcactaaggtgaagggtagt 306  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || || ||||| || || ||||||| |||||||||||||    
T  4847042 tgaaaaatgggtggctaaggtttctgatttcgggttatcaaaagtgggaccaaccgggatatcaatgactcatgtaagcactatggtgaagggtagt 4847138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 10 - 306
Target Start/End: Original strand, 4712887 - 4713183
Alignment:
Q  10 gcagagatgattctcgtttacgacttcatggaacgtggcactcttcgtgaatatctctatggttcggataacgaacctcttacttggaagaagagactcg 109  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||  | |||||      
T  4712887 gcagagatgattcttgtttatgactttatggaacatggcactctccgtgaacatctctatggttcggataacgaacctcttaggtggaatcaaagactta 4712986  T
Q  110 agattttattgggtgctgcaagaggcctacattatcttcatgcaggtgcgaagcacaatatcatacaccgtgatgtgaagagtaccaacatattgttaga 209  Q
    | ||| ||||  |||| ||||| ||  | ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| || |||||||| ||    
T  4712987 atattctattatgtgcagcaaggggattgcattatcttcatgaaggtgcgaagcataatatcatacaccgtgacgttaagagtacaaatatattgttgga 4713086  T
Q  210 tgataaatgggtggctaaggtttctgatttcgggttatcaaaagtgggaccaacaggaatgtcgatgacccacgtcagcactaaggtgaagggtagt 306  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || ||||| || |||||||||| |||||||||||||    
T  4713087 tgaaaaatgggtggctaaggtttctgatttcggtttatcaaaagtgggaccaacagggatatcaatgactcatgtcagcactatggtgaagggtagt 4713183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 94 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 4652731 - 4652508
Alignment:
Q  94 tggaagaagagactcgagattttattgggtgctgcaagaggcctacattatcttcatgcaggtgcgaagcacaatatcatacaccgtgatgtgaagagta 193  Q
    ||||||||||| || |||||| |||||||| | || ||||| ||  |||||||||||||||  | ||| ||||| || ||||||||||| |||||||| |    
T  4652731 tggaagaagaggcttgagattctattgggttccgcgagagggctgaattatcttcatgcagaggtgaaacacaagataatacaccgtgacgtgaagagca 4652632  T
Q  194 ccaacatattgttagatgataaatgggtggctaaggtttctgatttcgggttatcaaaagtgggaccaacaggaatgtcgatgacccacgtcagcactaa 293  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||| | ||||| |  ||||| || ||||| |     
T  4652631 ccaacatattgttggatgagaaatgggtggctaaggtttctgattttggattatcgaaagtgggaccgacaaggatgtctacaacccatgttagcacgat 4652532  T
Q  294 ggtgaagggtagtctcgggtattt 317  Q
    |||||||||||| || ||||||||    
T  4652531 ggtgaagggtagcctagggtattt 4652508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 11 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 4642998 - 4642690
Alignment:
Q  11 cagagatgattctcgtttacgacttcatggaacgtggcactcttcgtgaatatctctatggttcggataacgaacctcttacttggaagaagagactcga 110  Q
    ||||||||||| | ||||| || |||||| | |  || |||||| |||| ||||| ||||||||  ||||||| || ||  |||||| | |||| || ||    
T  4642998 cagagatgattttggtttatgagttcatgcagcacggtactctttgtgagtatctttatggttctaataacgagccactaccttggaggcagaggcttga 4642899  T
Q  111 gattttattgggtgctgcaagaggcctacattatcttcatgcaggtgcgaagcacaatatcatacaccgtgatgtgaagagtaccaacatattgttagat 210  Q
     ||| |||| ||||| |||||||| ||  ||||||||||||| |  | ||||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||    
T  4642898 aattctattaggtgccgcaagagggctgaattatcttcatgctgaggtgaagcacaaaataatacatcgtgacgtgaagagcaccaacatattgttggat 4642799  T
Q  211 gataaatgggtggctaaggtttctgatttcgggttatcaaaagtgggaccaacaggaatgtcgatgacccacgtcagcactaaggtgaagggtagtctcg 310  Q
    || |||||| | ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||||| || ||||  |||||| ||||||| | |||||| || || || |    
T  4642798 gaaaaatggatagctaaggtttccgacttcgggttatccaaggtgggacctacagggatatcgactacccacatcagcacaatggtgaaaggaagccttg 4642699  T
Q  311 ggtatttag 319  Q
    |||||||||    
T  4642698 ggtatttag 4642690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 61 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 4671884 - 4671626
Alignment:
Q  61 tatctctatggttcggataacgaacctcttacttggaagaagagactcgagattttattgggtgctgcaagaggcctacattatcttcatgcaggtgcga 160  Q
    ||||| ||||||||  ||||||| || ||  |||||| | |||| || |||||| ||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||| |  | ||    
T  4671884 tatctttatggttctaataacgagccactaccttggaggcagaggcttgagattctattgggtgctgcgagagggctaaattatcttcatgctgaggtga 4671785  T
Q  161 agcacaatatcatacaccgtgatgtgaagagtaccaacatattgttagatgataaatgggtggctaaggtttctgatttcgggttatcaaaagtgggacc 260  Q
    ||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||| | ||||||||||| || ||||||||||| || ||||||||    
T  4671784 agcacaaaataatacatcgtgacgtgaagagcaccaacatattgttggatgagaaatggatagctaaggtttccgacttcgggttatccaaggtgggacc 4671685  T
Q  261 aacaggaatgtcgatgacccacgtcagcactaaggtgaagggtagtctcgggtatttag 319  Q
     || || ||  | |  |||||||||||||| | |||||| || || || ||||||||||    
T  4671684 cacggggataacaactacccacgtcagcacaatggtgaaaggaagccttgggtatttag 4671626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 94 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 4630120 - 4629912
Alignment:
Q  94 tggaagaagagactcgagattttattgggtgctgcaagaggcctacattatcttcatgcaggtgcgaagcacaatatcatacaccgtgatgtgaagagta 193  Q
    |||||| |||| || |||||  |||||||||| || ||||| ||  ||||||||||| | |  | ||||||||| || ||||| ||||| || ||||| |    
T  4630120 tggaagcagaggcttgagatcctattgggtgcagcgagagggctgaattatcttcattctgaggtgaagcacaagataatacatcgtgacgtaaagagca 4630021  T
Q  194 ccaacatattgttagatgataaatgggtggctaaggtttctgatttcgggttatcaaaagtgggaccaacaggaatgtcgatgacccacgtcagcactaa 293  Q
    |||||||| |||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||  |||  ||||| |||||||| |     
T  4630020 ccaacatactgttggatgagaaatgggtagctaaggtttctgatttcgggttatccaaggtgggacctacaggaataacgactacccatgtcagcacgat 4629921  T
Q  294 ggtgaaggg 302  Q
    |||||||||    
T  4629920 ggtgaaggg 4629912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 172 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 4635990 - 4635872
Alignment:
Q  172 atacaccgtgatgtgaagagtaccaacatattgttagatgataaatgggtggctaaggtttctgatttcgggttatcaaaagtgggaccaacaggaatgt 271  Q
    ||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| |||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || |    
T  4635990 atacatcgtgacgtaaagagcaccaacatattgttggatgagaaatggatagctaaggtttctgattttgggttatcaaaggtgggaccgacaggtatat 4635891  T
Q  272 cgatgacccacgtcagcac 290  Q
    |||  ||||||||||||||    
T  4635890 cgactacccacgtcagcac 4635872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 11 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 4666229 - 4665923
Alignment:
Q  11 cagagatgattctcgtttacgacttcatggaacgtggcactcttcgtgaatatctctatggttcggataacgaacctcttacttggaagaagagactcga 110  Q
    ||||||||||||| ||||| || |||||| | |  || |||||| | || ||||| ||||||||  ||||| | || ||  | |||||| |||| || ||    
T  4666229 cagagatgattctggtttatgagttcatgcagcacggtactctttgcgagtatctttatggttctaataaccagcccctatcatggaagcagaggcttga 4666130  T
Q  111 gattttattgggtgctgcaagaggcctacattatcttcatgcaggtgcgaagcacaatatcatacaccgtgatgtgaagagtaccaacatattgttagat 210  Q
    |||| | |||||||| || ||||| ||  ||||||||||| | |  | ||| || || || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||    
T  4666129 gattcttttgggtgcagcgagagggctgaattatcttcatactgaggtgaaacagaagataatacaccgtgacgtgaagagcaccaacatattgttggat 4666030  T
Q  211 gataaatgggtggctaaggtttctgatttcgggttatcaaaagtgggaccaacaggaatgtcgatgacccacgtcagcactaaggtgaagggtagtctcg 310  Q
    || |||||| |||| |||||||| || || |||||||| || |||||||| ||||| || || |  ||||| |||||||| | ||||||||| || ||||    
T  4666029 gaaaaatggatggcaaaggtttccgactttgggttatccaaggtgggaccgacagggatatcaactacccatgtcagcacgatggtgaaggggagcctcg 4665930  T
Q  311 ggtattt 317  Q
    | |||||    
T  4665929 gatattt 4665923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 116 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 4660993 - 4660843
Alignment:
Q  116 tattgggtgctgcaagaggcctacattatcttcatgcaggtgcgaagcacaatatcatacaccgtgatgtgaagagtaccaacatattgttagatgataa 215  Q
    |||||||| | ||||||||  | |||||||||||||| |  | ||| ||||| || |||||||| || || ||||| |||||||||||||| ||| | ||    
T  4660993 tattgggttcagcaagagggttgcattatcttcatgctgaggtgaaacacaaaataatacaccgcgacgtaaagagcaccaacatattgttggatcacaa 4660894  T
Q  216 atgggtggctaaggtttctgatttcgggttatcaaaagtgggaccaacagg 266  Q
    |||||| ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| |||||    
T  4660893 atgggtagctaaggtttccgacttcgggttatccaaggtgggaccgacagg 4660843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 169 - 239
Target Start/End: Original strand, 27539502 - 27539572
Alignment:
Q  169 atcatacaccgtgatgtgaagagtaccaacatattgttagatgataaatgggtggctaaggtttctgattt 239  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||| ||||| ||  ||||||| || |||||||| ||||||||||||||    
T  27539502 atcatccaccgtgatgtgaagactacaaacattttactagatgagaagtgggtggccaaggtttctgattt 27539572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 96; Significance: 5e-47; HSPs: 2)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 12 - 319
Target Start/End: Original strand, 18926562 - 18926869
Alignment:
Q  12 agagatgattctcgtttacgacttcatggaacgtggcactcttcgtgaatatctctatggttcggataacgaacctcttacttggaagaagagactcgag 111  Q
    ||||||||||||  |||| || |||||| ||||||| |||||| |||| ||||| ||||||||  ||||| |||| ||   ||||||| | || || |||    
T  18926562 agagatgattctgatttatgagttcatgcaacgtggtactctttgtgagtatctatatggttccaataaccaacccctactttggaagcaaaggcttgag 18926661  T
Q  112 attttattgggtgctgcaagaggcctacattatcttcatgcaggtgcgaagcacaatatcatacaccgtgatgtgaagagtaccaacatattgttagatg 211  Q
    ||| |||||||||| |||||||| ||  ||||||||||||| |  | ||| ||||| || ||||| ||||||||||| || ||||||||||| || ||||    
T  18926662 attgtattgggtgccgcaagagggctgaattatcttcatgctgaggtgaaacacaagataatacatcgtgatgtgaaaagcaccaacatattattggatg 18926761  T
Q  212 ataaatgggtggctaaggtttctgatttcgggttatcaaaagtgggaccaacaggaatgtcgatgacccacgtcagcactaaggtgaagggtagtctcgg 311  Q
    | |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||||||||| || || || |  ||||| |||||||| | ||||||||| ||||| ||    
T  18926762 agaaatgggtggctaaggtttccgacttcgggttatccaaggtgggaccaacggggatatcaactacccatgtcagcacaatggtgaaggggagtcttgg 18926861  T
Q  312 gtatttag 319  Q
    ||||||||    
T  18926862 gtatttag 18926869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 169 - 239
Target Start/End: Original strand, 46271740 - 46271810
Alignment:
Q  169 atcatacaccgtgatgtgaagagtaccaacatattgttagatgataaatgggtggctaaggtttctgattt 239  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||| ||||| ||  ||||||| || |||||||| ||||||||||||||    
T  46271740 atcatccaccgtgatgtgaagactacaaacattttactagatgagaagtgggtggccaaggtttctgattt 46271810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University