View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF17601_low_9 (Length: 254)

Name: NF17601_low_9
Description: NF17601
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF17601_low_9
NF17601_low_9
[»] chr6 (54 HSPs)
chr6 (15-254)||(29518839-29519078)
chr6 (29-254)||(2378059-2378284)
chr6 (47-254)||(3409611-3409818)
chr6 (88-254)||(29518495-29518661)
chr6 (88-254)||(32741171-32741337)
chr6 (26-254)||(10073991-10074219)
chr6 (51-254)||(2578443-2578647)
chr6 (30-254)||(16454838-16455065)
chr6 (88-244)||(3409251-3409407)
chr6 (56-246)||(10074371-10074560)
chr6 (88-254)||(35210196-35210362)
chr6 (88-254)||(3058218-3058384)
chr6 (88-254)||(14748342-14748504)
chr6 (98-254)||(2377756-2377912)
chr6 (24-246)||(2579500-2579722)
chr6 (96-254)||(2579872-2580030)
chr6 (87-254)||(3415449-3415618)
chr6 (25-253)||(16107990-16108208)
chr6 (89-254)||(1846741-1846906)
chr6 (25-252)||(10073618-10073843)
chr6 (88-244)||(26544041-26544197)
chr6 (98-254)||(16454577-16454733)
chr6 (98-245)||(16107680-16107827)
chr6 (88-254)||(1127352-1127518)
chr6 (102-254)||(2843560-2843713)
chr6 (56-254)||(2579109-2579305)
chr6 (71-254)||(2578835-2579016)
chr6 (98-254)||(5832027-5832182)
chr6 (99-251)||(6999799-6999951)
chr6 (96-254)||(593707-593867)
chr6 (99-239)||(1950200-1950340)
chr6 (101-204)||(32460630-32460733)
chr6 (96-250)||(10911565-10911720)
chr6 (102-221)||(9062383-9062501)
chr6 (30-228)||(6071064-6071264)
chr6 (58-215)||(8481888-8482045)
chr6 (91-248)||(5958613-5958766)
chr6 (96-254)||(12071691-12071849)
chr6 (96-254)||(12092482-12092640)
chr6 (96-251)||(12085037-12085191)
chr6 (56-169)||(35210449-35210551)
chr6 (26-212)||(2975482-2975668)
chr6 (96-251)||(31714671-31714823)
chr6 (26-155)||(33605906-33606034)
chr6 (100-254)||(17135069-17135223)
chr6 (164-208)||(22605301-22605345)
chr6 (200-247)||(3409405-3409452)
chr6 (164-215)||(11637760-11637811)
chr6 (133-179)||(14789279-14789325)
chr6 (103-237)||(30618634-30618766)
chr6 (164-208)||(21130103-21130147)
chr6 (188-246)||(10902438-10902496)
chr6 (30-87)||(12092201-12092261)
chr6 (172-214)||(11638053-11638095)
[»] chr8 (82 HSPs)
chr8 (19-250)||(3669982-3670214)
chr8 (19-246)||(1013879-1014107)
chr8 (87-254)||(3669678-3669845)
chr8 (26-252)||(40518512-40518738)
chr8 (47-254)||(34835160-34835367)
chr8 (51-254)||(34835427-34835633)
chr8 (51-254)||(34835693-34835899)
chr8 (98-252)||(3038292-3038446)
chr8 (86-247)||(30441071-30441236)
chr8 (46-254)||(9309303-9309512)
chr8 (26-254)||(45122560-45122782)
chr8 (29-250)||(30359539-30359763)
chr8 (98-246)||(34834878-34835026)
chr8 (26-254)||(45122933-45123164)
chr8 (26-254)||(8918764-8918994)
chr8 (26-250)||(9482608-9482829)
chr8 (48-246)||(6731856-6732045)
chr8 (96-244)||(45122067-45122215)
chr8 (88-252)||(20870575-20870741)
chr8 (88-246)||(1014253-1014411)
chr8 (96-254)||(6876862-6877021)
chr8 (98-253)||(33113368-33113523)
chr8 (98-254)||(40518071-40518229)
chr8 (96-254)||(9608745-9608903)
chr8 (98-254)||(25561815-25561972)
chr8 (98-254)||(37544490-37544646)
chr8 (46-247)||(45121663-45121865)
chr8 (99-254)||(147454-147609)
chr8 (96-254)||(45121910-45122068)
chr8 (121-250)||(9483191-9483320)
chr8 (98-254)||(1513915-1514071)
chr8 (98-246)||(30359273-30359421)
chr8 (26-244)||(147757-147968)
chr8 (103-251)||(70277-70425)
chr8 (30-250)||(18371665-18371881)
chr8 (90-248)||(40579512-40579670)
chr8 (96-254)||(5915872-5916025)
chr8 (96-252)||(5420651-5420807)
chr8 (96-251)||(41972158-41972316)
chr8 (67-254)||(6651476-6651652)
chr8 (106-250)||(18371998-18372142)
chr8 (45-168)||(18372342-18372465)
chr8 (96-254)||(9308977-9309139)
chr8 (99-244)||(32640542-32640682)
chr8 (45-168)||(18372785-18372907)
chr8 (30-200)||(18372988-18373157)
chr8 (100-253)||(18380020-18380171)
chr8 (90-254)||(32305478-32305635)
chr8 (96-244)||(4154678-4154824)
chr8 (30-254)||(4154281-4154506)
chr8 (96-247)||(9507777-9507933)
chr8 (119-233)||(9609108-9609222)
chr8 (45-140)||(18372485-18372580)
chr8 (88-174)||(41416251-41416335)
chr8 (99-209)||(43274824-43274934)
chr8 (98-214)||(8794113-8794229)
chr8 (171-254)||(40579269-40579352)
chr8 (96-245)||(12283873-12284021)
chr8 (178-254)||(8919144-8919220)
chr8 (98-204)||(18372656-18372758)
chr8 (96-254)||(9620678-9620834)
chr8 (174-254)||(41129066-41129146)
chr8 (99-186)||(3037776-3037865)
chr8 (100-245)||(43398077-43398225)
chr8 (106-169)||(25561729-25561792)
chr8 (101-201)||(20130454-20130553)
chr8 (96-228)||(5274775-5274907)
chr8 (26-84)||(3038099-3038157)
chr8 (173-237)||(20995433-20995497)
chr8 (190-254)||(43274635-43274699)
chr8 (177-234)||(16524446-16524503)
chr8 (132-188)||(18373236-18373292)
chr8 (99-195)||(40991756-40991852)
chr8 (207-254)||(3037969-3038016)
chr8 (150-237)||(40417733-40417820)
chr8 (46-122)||(43274699-43274777)
chr8 (196-250)||(18372288-18372342)
chr8 (167-204)||(12156708-12156745)
chr8 (96-153)||(20995502-20995559)
chr8 (96-173)||(33831978-33832055)
chr8 (154-195)||(11442911-11442952)
chr8 (96-128)||(18645713-18645745)
[»] chr3 (86 HSPs)
chr3 (23-254)||(22304495-22304727)
chr3 (19-254)||(37990639-37990875)
chr3 (30-254)||(54017816-54018042)
chr3 (50-252)||(42342092-42342296)
chr3 (98-252)||(43346793-43346947)
chr3 (42-254)||(21832345-21832554)
chr3 (46-248)||(15773140-15773346)
chr3 (98-254)||(35946524-35946680)
chr3 (98-253)||(37990978-37991133)
chr3 (45-254)||(41359765-41359971)
chr3 (96-252)||(15772854-15773010)
chr3 (47-237)||(4823606-4823796)
chr3 (96-254)||(29644902-29645060)
chr3 (96-254)||(32589704-32589861)
chr3 (96-254)||(33803252-33803410)
chr3 (87-246)||(39934963-39935124)
chr3 (46-254)||(29644581-29644792)
chr3 (26-254)||(32462558-32462790)
chr3 (96-254)||(12114562-12114720)
chr3 (96-254)||(42342388-42342546)
chr3 (96-254)||(54018198-54018356)
chr3 (61-246)||(22303963-22304143)
chr3 (88-245)||(39389062-39389219)
chr3 (34-228)||(3135099-3135293)
chr3 (96-254)||(25739425-25739583)
chr3 (98-251)||(32462903-32463057)
chr3 (98-254)||(52634678-52634833)
chr3 (88-254)||(50612447-50612618)
chr3 (19-253)||(11661871-11662108)
chr3 (26-247)||(9240079-9240300)
chr3 (96-254)||(53577364-53577522)
chr3 (96-254)||(31190017-31190167)
chr3 (98-254)||(25755396-25755552)
chr3 (96-251)||(45395656-45395811)
chr3 (98-254)||(3135454-3135617)
chr3 (96-254)||(1634315-1634473)
chr3 (58-151)||(22304208-22304301)
chr3 (98-254)||(45901715-45901872)
chr3 (97-254)||(53117975-53118131)
chr3 (96-243)||(39914252-39914399)
chr3 (96-254)||(8327904-8328066)
chr3 (88-254)||(37726496-37726654)
chr3 (98-246)||(49336694-49336843)
chr3 (88-250)||(51886553-51886709)
chr3 (96-254)||(44160547-44160702)
chr3 (154-251)||(22303662-22303759)
chr3 (98-254)||(33175659-33175820)
chr3 (77-228)||(47964544-47964694)
chr3 (106-249)||(42584829-42584970)
chr3 (85-203)||(3384317-3384435)
chr3 (122-220)||(33362327-33362425)
chr3 (96-254)||(39336232-39336387)
chr3 (170-254)||(41359491-41359575)
chr3 (166-254)||(54017548-54017636)
chr3 (96-254)||(47964915-47965073)
chr3 (99-188)||(7767380-7767469)
chr3 (98-214)||(11661537-11661638)
chr3 (99-204)||(46546375-46546480)
chr3 (96-152)||(43346650-43346706)
chr3 (138-224)||(39336000-39336086)
chr3 (138-243)||(12749211-12749316)
chr3 (146-206)||(52634990-52635050)
chr3 (200-253)||(8328374-8328427)
chr3 (205-254)||(22304302-22304351)
chr3 (99-228)||(25317161-25317290)
chr3 (98-214)||(25991405-25991521)
chr3 (163-214)||(53596027-53596078)
chr3 (163-214)||(53596342-53596393)
chr3 (151-208)||(17731950-17732007)
chr3 (151-208)||(19033181-19033238)
chr3 (176-254)||(43978865-43978947)
chr3 (163-214)||(53596542-53596593)
chr3 (178-254)||(7766783-7766857)
chr3 (26-85)||(8328308-8328368)
chr3 (163-210)||(48127859-48127906)
chr3 (50-92)||(52634889-52634931)
chr3 (51-120)||(2299930-2300000)
chr3 (96-128)||(12747878-12747910)
chr3 (164-208)||(16871005-16871049)
chr3 (164-208)||(17735037-17735081)
chr3 (164-208)||(19036306-19036350)
chr3 (163-208)||(16143505-16143550)
chr3 (167-208)||(16869843-16869884)
chr3 (101-162)||(36986040-36986101)
chr3 (101-162)||(37011479-37011540)
chr3 (159-195)||(50329391-50329427)
[»] chr1 (81 HSPs)
chr1 (23-254)||(44290458-44290690)
chr1 (19-251)||(48588491-48588724)
chr1 (19-254)||(26661522-26661760)
chr1 (46-253)||(41157323-41157532)
chr1 (86-254)||(44290824-44290993)
chr1 (26-246)||(34364852-34365075)
chr1 (26-245)||(37556038-37556260)
chr1 (88-254)||(41759475-41759641)
chr1 (29-254)||(22077495-22077719)
chr1 (96-254)||(41142372-41142531)
chr1 (88-254)||(3537599-3537765)
chr1 (30-175)||(3537226-3537372)
chr1 (96-254)||(41156991-41157149)
chr1 (88-250)||(3550712-3550871)
chr1 (69-254)||(11977251-11977438)
chr1 (98-251)||(17294579-17294733)
chr1 (96-254)||(29798199-29798357)
chr1 (96-254)||(31767161-31767319)
chr1 (98-254)||(34649440-34649596)
chr1 (87-254)||(45493974-45494146)
chr1 (96-254)||(5319965-5320123)
chr1 (104-254)||(14318875-14319025)
chr1 (96-246)||(34364507-34364657)
chr1 (88-254)||(50052024-50052189)
chr1 (97-246)||(40082408-40082556)
chr1 (90-222)||(32594748-32594880)
chr1 (96-252)||(3875333-3875489)
chr1 (88-254)||(32168698-32168853)
chr1 (29-243)||(66100-66314)
chr1 (93-239)||(38804370-38804516)
chr1 (98-231)||(26661921-26662054)
chr1 (100-254)||(9955911-9956067)
chr1 (45-244)||(30630648-30630846)
chr1 (96-254)||(45084382-45084534)
chr1 (26-254)||(22077110-22077349)
chr1 (99-245)||(37555733-37555878)
chr1 (96-254)||(37850600-37850758)
chr1 (96-247)||(24600321-24600472)
chr1 (96-250)||(66476-66630)
chr1 (96-254)||(39066201-39066358)
chr1 (96-190)||(41184489-41184583)
chr1 (23-128)||(50051777-50051883)
chr1 (96-248)||(24131994-24132143)
chr1 (87-216)||(44043810-44043944)
chr1 (102-246)||(5575110-5575252)
chr1 (97-248)||(22793279-22793431)
chr1 (106-246)||(5528762-5528902)
chr1 (98-244)||(45839629-45839779)
chr1 (96-252)||(22077831-22077986)
chr1 (96-254)||(19283455-19283613)
chr1 (167-254)||(11977015-11977102)
chr1 (96-244)||(44685456-44685605)
chr1 (26-148)||(47379891-47380012)
chr1 (27-155)||(50469180-50469306)
chr1 (96-254)||(21378059-21378199)
chr1 (96-254)||(1188588-1188746)
chr1 (166-254)||(50051689-50051776)
chr1 (30-245)||(24448212-24448426)
chr1 (111-253)||(44091909-44092051)
chr1 (138-214)||(10351202-10351278)
chr1 (96-254)||(1187363-1187522)
chr1 (123-243)||(4956218-4956340)
chr1 (30-81)||(41184198-41184249)
chr1 (179-254)||(41184408-41184486)
chr1 (96-143)||(35154150-35154197)
chr1 (96-162)||(4878803-4878869)
chr1 (145-190)||(41184152-41184197)
chr1 (195-254)||(4266798-4266855)
chr1 (151-211)||(35154046-35154106)
chr1 (16-81)||(3537495-3537562)
chr1 (167-254)||(47380167-47380254)
chr1 (26-92)||(1188392-1188457)
chr1 (96-254)||(5996872-5997029)
chr1 (88-161)||(4266875-4266948)
chr1 (137-253)||(9499020-9499136)
chr1 (178-214)||(12466365-12466401)
chr1 (105-164)||(30630912-30630972)
chr1 (50-114)||(47380258-47380323)
chr1 (169-215)||(9956212-9956258)
chr1 (178-214)||(31973375-31973411)
chr1 (96-232)||(50556451-50556587)
[»] chr7 (74 HSPs)
chr7 (16-225)||(7553943-7554154)
chr7 (19-251)||(14681431-14681663)
chr7 (63-254)||(37533011-37533201)
chr7 (96-254)||(1085616-1085774)
chr7 (48-254)||(30244220-30244428)
chr7 (45-254)||(30245024-30245231)
chr7 (96-254)||(7517580-7517738)
chr7 (96-254)||(23377-23535)
chr7 (88-254)||(37533364-37533530)
chr7 (33-254)||(45434572-45434794)
chr7 (90-251)||(29157559-29157720)
chr7 (103-254)||(11845198-11845349)
chr7 (98-254)||(6054562-6054718)
chr7 (96-254)||(40094774-40094932)
chr7 (46-215)||(22566702-22566872)
chr7 (98-254)||(45433243-45433399)
chr7 (96-254)||(22567039-22567196)
chr7 (96-246)||(36939741-36939891)
chr7 (98-243)||(45754718-45754862)
chr7 (104-244)||(19122740-19122879)
chr7 (96-254)||(24177435-24177593)
chr7 (102-252)||(34218036-34218186)
chr7 (98-254)||(47129097-47129253)
chr7 (96-254)||(118299-118459)
chr7 (96-254)||(8128441-8128599)
chr7 (101-254)||(30032572-30032725)
chr7 (96-253)||(36622960-36623117)
chr7 (99-252)||(9901648-9901799)
chr7 (26-222)||(1085280-1085482)
chr7 (96-216)||(16569196-16569316)
chr7 (96-216)||(16596346-16596466)
chr7 (96-250)||(40230295-40230449)
chr7 (99-231)||(24838724-24838857)
chr7 (26-166)||(30244628-30244771)
chr7 (99-251)||(20599317-20599471)
chr7 (26-169)||(30245421-30245567)
chr7 (96-245)||(36534795-36534942)
chr7 (96-254)||(41854635-41854792)
chr7 (117-252)||(37167808-37167937)
chr7 (138-254)||(30253534-30253646)
chr7 (67-169)||(30255308-30255412)
chr7 (99-248)||(41910592-41910749)
chr7 (142-252)||(28300255-28300366)
chr7 (96-217)||(43241495-43241616)
chr7 (177-254)||(47129450-47129527)
chr7 (96-184)||(28301613-28301701)
chr7 (26-146)||(40094502-40094621)
chr7 (26-214)||(37345846-37346036)
chr7 (179-253)||(28300569-28300644)
chr7 (96-164)||(36109007-36109075)
chr7 (184-252)||(37532753-37532821)
chr7 (101-201)||(44361517-44361616)
chr7 (50-214)||(4124128-4124293)
chr7 (163-214)||(21416181-21416232)
chr7 (165-213)||(23569043-23569091)
chr7 (197-253)||(30244453-30244509)
chr7 (197-254)||(30245256-30245313)
chr7 (197-254)||(30253671-30253728)
chr7 (26-115)||(45697841-45697929)
chr7 (90-133)||(14681281-14681324)
chr7 (164-243)||(40094424-40094503)
chr7 (45-92)||(48243241-48243288)
chr7 (179-241)||(45755010-45755072)
chr7 (163-208)||(21619091-21619136)
chr7 (30-109)||(10342192-10342271)
chr7 (151-254)||(37393114-37393216)
chr7 (98-148)||(36967335-36967385)
chr7 (138-254)||(15902342-15902457)
chr7 (164-208)||(27391815-27391859)
chr7 (191-245)||(4719305-4719359)
chr7 (206-254)||(7517767-7517815)
chr7 (206-254)||(7518033-7518081)
chr7 (163-203)||(27598052-27598092)
chr7 (49-89)||(28300365-28300405)
[»] chr2 (78 HSPs)
chr2 (23-254)||(5542625-5542857)
chr2 (64-252)||(37106156-37106344)
chr2 (87-254)||(36178605-36178772)
chr2 (30-251)||(40679632-40679852)
chr2 (88-254)||(14745667-14745833)
chr2 (88-254)||(41283475-41283641)
chr2 (24-247)||(14745300-14745524)
chr2 (92-254)||(37105920-37106082)
chr2 (86-250)||(5543002-5543166)
chr2 (68-248)||(15880233-15880415)
chr2 (45-254)||(6422066-6422268)
chr2 (98-254)||(6421387-6421543)
chr2 (96-251)||(962598-962753)
chr2 (30-249)||(7598543-7598754)
chr2 (29-254)||(40733813-40734040)
chr2 (48-252)||(28531316-28531519)
chr2 (96-254)||(42514649-42514807)
chr2 (53-254)||(40733472-40733675)
chr2 (103-254)||(15511495-15511646)
chr2 (96-254)||(35580724-35580881)
chr2 (114-254)||(36178171-36178311)
chr2 (63-203)||(36178320-36178460)
chr2 (98-254)||(6712978-6713135)
chr2 (98-247)||(36005887-36006035)
chr2 (96-253)||(38796619-38796778)
chr2 (46-253)||(29676851-29677065)
chr2 (101-252)||(33731653-33731804)
chr2 (19-254)||(3673005-3673226)
chr2 (26-153)||(36785664-36785793)
chr2 (96-249)||(37632602-37632755)
chr2 (88-244)||(1769884-1770040)
chr2 (100-235)||(28254258-28254391)
chr2 (107-243)||(40163383-40163520)
chr2 (30-254)||(30313110-30313335)
chr2 (96-254)||(7598228-7598386)
chr2 (109-251)||(23346250-23346391)
chr2 (26-174)||(38796298-38796450)
chr2 (98-240)||(5367457-5367599)
chr2 (76-204)||(31468800-31468926)
chr2 (30-213)||(30323396-30323581)
chr2 (158-254)||(6421793-6421889)
chr2 (46-214)||(33561491-33561658)
chr2 (96-203)||(16542449-16542556)
chr2 (104-254)||(29676543-29676687)
chr2 (96-244)||(12529038-12529186)
chr2 (99-184)||(31899496-31899581)
chr2 (60-228)||(29873563-29873732)
chr2 (26-158)||(42514943-42515078)
chr2 (30-204)||(33953821-33953994)
chr2 (56-214)||(37894732-37894889)
chr2 (96-247)||(16590888-16591034)
chr2 (30-203)||(41678419-41678593)
chr2 (98-254)||(29874023-29874179)
chr2 (104-208)||(37895107-37895211)
chr2 (168-250)||(3672773-3672855)
chr2 (99-212)||(31259658-31259774)
chr2 (158-250)||(6421688-6421780)
chr2 (149-241)||(36784273-36784365)
chr2 (99-254)||(9231252-9231407)
chr2 (97-227)||(31385738-31385868)
chr2 (112-201)||(28254165-28254254)
chr2 (99-252)||(3594180-3594333)
chr2 (160-250)||(35580443-35580534)
chr2 (99-203)||(12910231-12910335)
chr2 (186-254)||(31899102-31899170)
chr2 (51-118)||(40734231-40734300)
chr2 (98-144)||(6421306-6421352)
chr2 (96-237)||(33954279-33954419)
chr2 (138-214)||(30312831-30312907)
chr2 (150-209)||(25390313-25390372)
chr2 (163-214)||(28226404-28226455)
chr2 (138-195)||(2336666-2336723)
chr2 (40-92)||(34481589-34481642)
chr2 (166-214)||(8904498-8904546)
chr2 (167-214)||(28226726-28226772)
chr2 (163-212)||(13792536-13792585)
chr2 (49-107)||(35580532-35580592)
chr2 (96-132)||(3672719-3672755)
[»] chr5 (82 HSPs)
chr5 (23-254)||(6500749-6500980)
chr5 (26-254)||(3295015-3295246)
chr5 (27-250)||(624128-624350)
chr5 (88-254)||(6500443-6500608)
chr5 (26-240)||(13415774-13415990)
chr5 (96-254)||(40296315-40296473)
chr5 (88-250)||(18603124-18603286)
chr5 (88-254)||(27502036-27502202)
chr5 (88-254)||(32487386-32487551)
chr5 (89-254)||(41170627-41170792)
chr5 (93-253)||(36492218-36492378)
chr5 (26-245)||(26074539-26074761)
chr5 (96-254)||(15370099-15370257)
chr5 (99-254)||(3295345-3295498)
chr5 (33-253)||(24489207-24489424)
chr5 (69-245)||(26074155-26074330)
chr5 (99-254)||(25327938-25328093)
chr5 (87-254)||(9498655-9498821)
chr5 (96-254)||(41632782-41632940)
chr5 (98-254)||(42405598-42405752)
chr5 (103-254)||(11416977-11417128)
chr5 (45-228)||(26074807-26074993)
chr5 (97-254)||(299490-299647)
chr5 (106-250)||(34753029-34753173)
chr5 (96-254)||(12662652-12662810)
chr5 (98-247)||(26075168-26075318)
chr5 (98-254)||(1028517-1028673)
chr5 (98-254)||(6224198-6224354)
chr5 (96-254)||(36568569-36568725)
chr5 (96-254)||(35150007-35150164)
chr5 (88-254)||(623810-623976)
chr5 (122-252)||(15370428-15370558)
chr5 (108-250)||(33747783-33747925)
chr5 (93-231)||(29549278-29549416)
chr5 (30-228)||(36521922-36522120)
chr5 (88-234)||(5723811-5723957)
chr5 (57-246)||(38427518-38427697)
chr5 (30-214)||(31509555-31509742)
chr5 (33-214)||(36522277-36522459)
chr5 (96-246)||(26590918-26591068)
chr5 (98-252)||(300961-301107)
chr5 (98-254)||(35167838-35167994)
chr5 (99-254)||(2411010-2411165)
chr5 (99-254)||(35914852-35915007)
chr5 (88-171)||(7768842-7768925)
chr5 (98-191)||(42508614-42508707)
chr5 (182-254)||(26900017-26900089)
chr5 (98-176)||(26074320-26074398)
chr5 (99-233)||(41635212-41635346)
chr5 (26-131)||(13785732-13785837)
chr5 (98-253)||(13786002-13786157)
chr5 (110-221)||(31509745-31509857)
chr5 (163-214)||(13042606-13042657)
chr5 (183-254)||(38427306-38427377)
chr5 (98-177)||(39309686-39309764)
chr5 (180-232)||(795254-795306)
chr5 (154-254)||(13785632-13785732)
chr5 (167-234)||(9498343-9498410)
chr5 (153-232)||(36527117-36527196)
chr5 (23-91)||(9498411-9498480)
chr5 (98-191)||(42524719-42524811)
chr5 (154-214)||(32445943-32446003)
chr5 (163-210)||(13112604-13112651)
chr5 (99-156)||(6225047-6225104)
chr5 (88-136)||(5660290-5660338)
chr5 (133-221)||(19275566-19275653)
chr5 (176-214)||(13042784-13042822)
chr5 (176-214)||(13112782-13112820)
chr5 (96-138)||(35150747-35150789)
chr5 (96-138)||(35151038-35151080)
chr5 (154-252)||(42435486-42435583)
chr5 (198-250)||(24489583-24489635)
chr5 (64-108)||(15370380-15370426)
chr5 (163-214)||(36389016-36389067)
chr5 (178-208)||(5963765-5963795)
chr5 (150-228)||(9510546-9510624)
chr5 (88-145)||(22298956-22299014)
chr5 (194-230)||(795152-795189)
chr5 (186-250)||(5660340-5660405)
chr5 (167-208)||(34103625-34103666)
chr5 (201-254)||(35150810-35150863)
chr5 (164-208)||(41341523-41341567)
[»] chr4 (106 HSPs)
chr4 (31-253)||(36629172-36629394)
chr4 (26-253)||(39404327-39404555)
chr4 (26-244)||(54108845-54109060)
chr4 (30-254)||(44620592-44620817)
chr4 (96-251)||(25483336-25483491)
chr4 (88-254)||(41370349-41370515)
chr4 (86-252)||(50630755-50630921)
chr4 (88-254)||(55933122-55933288)
chr4 (29-254)||(18932747-18932983)
chr4 (96-251)||(54017596-54017751)
chr4 (96-253)||(1731646-1731803)
chr4 (93-254)||(50002423-50002584)
chr4 (96-251)||(3340807-3340962)
chr4 (96-254)||(10245920-10246077)
chr4 (98-252)||(39792860-39793014)
chr4 (23-205)||(2740997-2741180)
chr4 (96-244)||(52884695-52884844)
chr4 (66-244)||(52884856-52885038)
chr4 (45-249)||(20826167-20826370)
chr4 (65-253)||(22027960-22028150)
chr4 (96-254)||(36608659-36608817)
chr4 (98-254)||(39404020-39404176)
chr4 (98-253)||(34646648-34646803)
chr4 (88-234)||(49880152-49880297)
chr4 (99-253)||(50459724-50459878)
chr4 (106-254)||(54343006-54343147)
chr4 (105-254)||(44620362-44620511)
chr4 (98-254)||(36572021-36572177)
chr4 (96-254)||(22183262-22183420)
chr4 (45-254)||(3244449-3244657)
chr4 (96-237)||(4955332-4955473)
chr4 (105-254)||(44621011-44621160)
chr4 (115-254)||(54936215-54936353)
chr4 (96-254)||(49076829-49076986)
chr4 (96-254)||(22028367-22028527)
chr4 (96-247)||(32941128-32941279)
chr4 (99-254)||(49302907-49303064)
chr4 (95-254)||(54108537-54108694)
chr4 (97-253)||(16889535-16889691)
chr4 (102-254)||(20825842-20825994)
chr4 (26-254)||(49076449-49076679)
chr4 (96-254)||(2740700-2740856)
chr4 (111-225)||(45496820-45496934)
chr4 (97-254)||(16888814-16888971)
chr4 (53-254)||(3341083-3341286)
chr4 (26-253)||(45489331-45489561)
chr4 (96-251)||(4390102-4390257)
chr4 (72-250)||(43174480-43174661)
chr4 (150-254)||(23817679-23817783)
chr4 (30-162)||(44621358-44621492)
chr4 (98-214)||(41707503-41707618)
chr4 (88-219)||(6975489-6975620)
chr4 (96-251)||(34004586-34004739)
chr4 (98-242)||(19504707-19504842)
chr4 (96-251)||(51768061-51768216)
chr4 (96-238)||(54741194-54741334)
chr4 (96-251)||(3700365-3700512)
chr4 (142-252)||(18879852-18879962)
chr4 (136-254)||(43827480-43827597)
chr4 (147-248)||(31691203-31691306)
chr4 (109-204)||(54017750-54017845)
chr4 (98-233)||(40067045-40067181)
chr4 (96-254)||(28034229-28034387)
chr4 (117-254)||(48111696-48111833)
chr4 (68-185)||(10246317-10246436)
chr4 (118-254)||(3271806-3271947)
chr4 (101-228)||(760194-760320)
chr4 (138-237)||(15841383-15841482)
chr4 (88-148)||(50788087-50788147)
chr4 (104-162)||(44620304-44620362)
chr4 (96-228)||(23556890-23557022)
chr4 (102-254)||(45489712-45489864)
chr4 (188-254)||(43174233-43174299)
chr4 (163-214)||(11197293-11197344)
chr4 (99-214)||(34544107-34544225)
chr4 (30-214)||(15841023-15841208)
chr4 (121-252)||(39698944-39699077)
chr4 (80-162)||(44620926-44621011)
chr4 (30-92)||(16889315-16889378)
chr4 (67-133)||(41370673-41370738)
chr4 (176-250)||(41370738-41370812)
chr4 (96-184)||(11348396-11348484)
chr4 (163-214)||(10396198-10396249)
chr4 (163-214)||(10396483-10396534)
chr4 (159-254)||(11783551-11783646)
chr4 (209-250)||(23817457-23817498)
chr4 (163-215)||(922485-922537)
chr4 (164-203)||(1868119-1868158)
chr4 (206-245)||(19895406-19895445)
chr4 (154-212)||(11706584-11706641)
chr4 (162-208)||(51681604-51681650)
chr4 (150-210)||(2891864-2891924)
chr4 (210-254)||(11702297-11702341)
chr4 (26-77)||(41707340-41707392)
chr4 (96-144)||(45050601-45050649)
chr4 (174-250)||(50787996-50788072)
chr4 (163-214)||(11197003-11197054)
chr4 (88-119)||(18933103-18933134)
chr4 (151-194)||(45484774-45484817)
chr4 (53-83)||(5882092-5882122)
chr4 (140-214)||(31249896-31249970)
chr4 (172-214)||(41707279-41707321)
chr4 (96-137)||(11706636-11706677)
chr4 (207-244)||(19895533-19895570)
chr4 (159-192)||(29802604-29802637)
chr4 (178-214)||(34946151-34946187)
[»] scaffold0734 (2 HSPs)
scaffold0734 (16-245)||(5695-5931)
scaffold0734 (96-245)||(5396-5546)
[»] scaffold0391 (4 HSPs)
scaffold0391 (26-250)||(1110-1337)
scaffold0391 (26-147)||(3092-3216)
scaffold0391 (143-214)||(1731-1802)
scaffold0391 (45-90)||(1464-1509)
[»] scaffold0078 (2 HSPs)
scaffold0078 (23-216)||(5281-5477)
scaffold0078 (96-247)||(4982-5133)
[»] scaffold0702 (2 HSPs)
scaffold0702 (29-254)||(147-367)
scaffold0702 (98-254)||(514-670)
[»] scaffold0171 (1 HSPs)
scaffold0171 (49-212)||(17496-17663)
[»] scaffold0027 (1 HSPs)
scaffold0027 (96-254)||(47360-47518)
[»] scaffold0504 (1 HSPs)
scaffold0504 (98-173)||(10192-10267)
[»] scaffold0113 (2 HSPs)
scaffold0113 (30-221)||(39771-39963)
scaffold0113 (98-228)||(39459-39588)
[»] scaffold0807 (1 HSPs)
scaffold0807 (90-174)||(2869-2953)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (134-174)||(10406-10446)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 228; Significance: 1e-126; HSPs: 54)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 15 - 254
Target Start/End: Original strand, 29518839 - 29519078
Alignment:
Q  15 agacacatgcaaagtaagagcttctgcttgagggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatg 114  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29518839 agacacatgcaaagtaagagcttccgcttgagggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatg 29518938  T
Q  115 tcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29518939 tcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 29519038  T
Q  215 tgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 254  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29519039 tgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 29519078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 29 - 254
Target Start/End: Original strand, 2378059 - 2378284
Alignment:
Q  29 taagagcttctgcttga-gggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggat 127  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||| |||||||  ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2378059 taagagcttccgcttgaagggggagcatgatgaataaatggactcacatttg-gggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggat 2378157  T
Q  128 aaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggtt 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  2378158 aaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttaggtaagaatgtggtgtctctcttgcttgagtggtt 2378257  T
Q  228 gttctagcctcgatgtggacggtcccc 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  2378258 gttctagcctcgatgtggacggtcccc 2378284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 164; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 47 - 254
Target Start/End: Original strand, 3409611 - 3409818
Alignment:
Q  47 ggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaac 146  Q
    |||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  3409611 ggggagcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtaccacatcagataaaatagtaaaagttgaac 3409710  T
Q  147 accttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgga 246  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3409711 atcttataagtaagaggacccataaacccattgcctttattttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtgga 3409810  T
Q  247 cggtcccc 254  Q
    ||||||||    
T  3409811 cggtcccc 3409818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 88 - 254
Target Start/End: Original strand, 29518495 - 29518661
Alignment:
Q  88 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 187  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  29518495 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaagg 29518594  T
Q  188 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29518595 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 29518661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 88 - 254
Target Start/End: Original strand, 32741171 - 32741337
Alignment:
Q  88 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 187  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  32741171 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaagg 32741270  T
Q  188 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32741271 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 32741337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 26 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 10074219 - 10073991
Alignment:
Q  26 aagtaagagcttctgcttga-gggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcg 124  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  10074219 aagtaagagcttccgcttgaagggggagcatgatgaattgatagactcgcacttgagggggagtgttg-tgtgcaagggtgagttatatatcccacatcg 10074121  T
Q  125 gataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtg 224  Q
    |||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| | ||    
T  10074120 gatagaaaagtaaacgttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaaaagtgtggtgtctctctcgcttatttg 10074021  T
Q  225 gttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 254  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  10074020 gttgttctagcctcgacgtggacggtcccc 10073991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 51 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 2578647 - 2578443
Alignment:
Q  51 agcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttg--caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacac 148  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  2578647 agcatgatgaatagatggactcacacttgagggggagtgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccaca-cggataaaagagtaaaggttgaacac 2578549  T
Q  149 cttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacg 248  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  2578548 tttataagtaagaggacccataaacccatagccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctcttttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacg 2578449  T
Q  249 gtcccc 254  Q
    ||||||    
T  2578448 gtcccc 2578443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 30 - 254
Target Start/End: Original strand, 16454838 - 16455065
Alignment:
Q  30 aagagcttctgcttga-gggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttg--caagtgtgagttatatgtcccacatcgga 126  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||| | |||||||||||| ||||| |||||||||||||||| | ||  ||| |||||||||| ||||||||||| ||    
T  16454838 aagagcttccgcttgaagggggagcatgctgaattgatggagtcacagttgagggggagtgttgttgtgtacaaatgtgagttatgtgtcccacatcaga 16454937  T
Q  127 taaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggt 226  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  16454938 taaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaataggacccataaacctattgccttaaggttttgggtaagagtgtggcgtctctcttgcttgtgcggt 16455037  T
Q  227 tgttctagcctcgatgtggacggtcccc 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16455038 tgttctagcctcgatgtggacggtcccc 16455065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 88 - 244
Target Start/End: Original strand, 3409251 - 3409407
Alignment:
Q  88 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 187  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3409251 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaagg 3409350  T
Q  188 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtg 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3409351 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtg 3409407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 56 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 10074560 - 10074371
Alignment:
Q  56 gatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataa 155  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  10074560 gatgaattgatggactcacacttaagggggagtgttg-tgtgcaagtgtgagttagaggtcccacatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataa 10074462  T
Q  156 gtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgga 246  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||    
T  10074461 gtaagaggacccataaactcattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctctcactagtgtggttgttctagcctcgatgtgga 10074371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 88 - 254
Target Start/End: Original strand, 35210196 - 35210362
Alignment:
Q  88 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 187  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  35210196 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaaaccattgccttaagg 35210295  T
Q  188 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 254  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  35210296 ttttgggtaagagtgtggtgtttcttttgcttgtgcggttgctctagcctcgatgtggacggtcccc 35210362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 88 - 254
Target Start/End: Original strand, 3058218 - 3058384
Alignment:
Q  88 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 187  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3058218 tgttggtttgcaagtgttagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtatgaggatccataaacccattgccttaagg 3058317  T
Q  188 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  3058318 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtagggtggttctaacctcgatgtggaccgtcccc 3058384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 88 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 14748504 - 14748342
Alignment:
Q  88 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 187  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  14748504 tgttgatttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataaataagaggacccataaactcattgcgttaagg 14748405  T
Q  188 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 254  Q
    ||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14748404 ttttgggtaagagtgtgg----tctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 14748342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 98 - 254
Target Start/End: Original strand, 2377756 - 2377912
Alignment:
Q  98 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2377756 caagtgtgagttatatgtcccacatcggttaaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 2377855  T
Q  198 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 254  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  2377856 gagtgtggtgtctttcttgcttgagtggtttttctagcctcgatgtggaaggtcccc 2377912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 24 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 2579722 - 2579500
Alignment:
Q  24 caaagtaagagcttctgcttga-gggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacat 122  Q
    ||||||||||||||  |||||| |||||| || ||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||    
T  2579722 caaagtaagagctttcgcttgaagggggaccatgatgaatagacggactcacacttgagggagagtgttg-ttagcaggtgtgagttatatgtcccacat 2579624  T
Q  123 cggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtg 222  Q
    |||| |||| ||||||||| | | ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  2579623 cggacaaaaaagtaaaggtcggataccttataagtaagagggcccataaactcattgccttaaggttttgggtaaaagtatggtgtctctcttgcttgtg 2579524  T
Q  223 tggttgttctagcctcgatgtgga 246  Q
    ||||||||||| ||||||||||||    
T  2579523 tggttgttctaacctcgatgtgga 2579500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 96 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 2580030 - 2579872
Alignment:
Q  96 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 195  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  2580030 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacacattataagtaagaggacccataaacccacagccttaaggttttgggt 2579931  T
Q  196 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 254  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2579930 aagaatgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggaaggtcccc 2579872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 87 - 254
Target Start/End: Original strand, 3415449 - 3415618
Alignment:
Q  87 gtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaag 186  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3415449 gtgttggtttgcgagtgtgagttatatgtcccacatcacataaaatagtaaaggttgaacaccatataagtaagaggacccataaacccattgccttaag 3415548  T
Q  187 gttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgt--tctagcctcgatgtggacggtcccc 254  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||||||    
T  3415549 gtttttggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctctagcctcgatgtggaaggtcccc 3415618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 25 - 253
Target Start/End: Original strand, 16107990 - 16108208
Alignment:
Q  25 aaagtaagagcttctgcttgagggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttg--caagtgtgagttatatgtcccacat 122  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||| ||||||    
T  16107990 aaagtaagagcttccgcttgaaggggagcatgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgttccacat 16108089  T
Q  123 cggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtg 222  Q
    | ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||            |||||||||||||||||||||||    
T  16108090 cagataaaagagtaaatgttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg------------gtgtggtgtctctcttgcttgtg 16108177  T
Q  223 tggttgttctagcctcgatgtggacggtccc 253  Q
     ||||||| || |||||||||||||||||||    
T  16108178 gggttgttataacctcgatgtggacggtccc 16108208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 89 - 254
Target Start/End: Original strand, 1846741 - 1846906
Alignment:
Q  89 gttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggt 188  Q
    ||||| |||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  1846741 gttgggttgcaagtgtgaattctatgtctcacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagcacccataaatccattgccttaaggt 1846840  T
Q  189 tttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 254  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1846841 tttggataagagtgtggtgtctcttttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 1846906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 25 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 10073843 - 10073618
Alignment:
Q  25 aaagtaagagcttctgcttga-gggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatc 123  Q
    ||||||||| |||| |||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||| || ||| |||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10073843 aaagtaagaccttccgcttgaagggggaacatgatgaattgatggactcacacttaagagggggtgttg-tgtgcaagtgttagttatatgtcccacatc 10073745  T
Q  124 ggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgt 223  Q
    ||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||  || ||||    
T  10073744 ggagaaaa--gtaaaggttgaacaccttataagtaagaggatccataaactcattggcttaagattttgggtaagagtgtggtgtctctctcactagtgt 10073647  T
Q  224 ggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 252  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10073646 ggttgttctagcatcgatgtggacggtcc 10073618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 88 - 244
Target Start/End: Original strand, 26544041 - 26544197
Alignment:
Q  88 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 187  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  26544041 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacacgttataagtaagaggacccataaacccaccgccttaagg 26544140  T
Q  188 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtg 244  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||    
T  26544141 ttttgagtaagagtgtgatgtctctcttgcttgtgcgattgttctagcctcaatgtg 26544197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 98 - 254
Target Start/End: Original strand, 16454577 - 16454733
Alignment:
Q  98 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 197  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  16454577 caagtgtgagttatgtgtcccacatcagataaaagaataaaagttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagattttggataa 16454676  T
Q  198 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 254  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16454677 gagtgtggcgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 16454733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 98 - 245
Target Start/End: Original strand, 16107680 - 16107827
Alignment:
Q  98 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 197  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16107680 caagtgtgagttatatgtgtcacatcggataaaaaagtaaaggttaaacaccttataagtaagaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaa 16107779  T
Q  198 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgg 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  16107780 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgctctagcctcgatgtgg 16107827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 88 - 254
Target Start/End: Original strand, 1127352 - 1127518
Alignment:
Q  88 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 187  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  1127352 tgttggtttgcaactgtgagttatatatcccacatcgggtaaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggactcataaacccattaccttaagg 1127451  T
Q  188 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 254  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||| |||| |||||||||||  |||||||    
T  1127452 ttttgggtaagagtgtggcgtctctcttacttatgtggttgctctaacctcgatgtgggtggtcccc 1127518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 102 - 254
Target Start/End: Original strand, 2843560 - 2843713
Alignment:
Q  102 tgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggaccc-ataaacccattgccttaaggttttgggtaagag 200  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2843560 tgtgagttatatgtttcacatcggataaaataataaaagttgaacaccttataagtaagaggaccccataaactcattgccttaaggttttgggtaagag 2843659  T
Q  201 tgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 254  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2843660 tgtggtatctctcttgcttgagtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 2843713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 56 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 2579305 - 2579109
Alignment:
Q  56 gatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttg--caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttat 153  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  2579305 gatgaatagatggactcacacttgagggggagtgttgttgtgtacaagtgttagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaagttgaacaccttat 2579206  T
Q  154 aagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccc 253  Q
    |||    |||| ||||||||||||  | |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2579205 aag----aggaaccataaacccataactttaaggctttggctaagagtgtggtgtctctcttgctcgtgtggttgttctagcctcgatgtgcacggtccc 2579110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 71 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 2579016 - 2578835
Alignment:
Q  71 tcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccata 170  Q
    |||||||||||||||||||||| |  |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||| ||||||||| |||||||| |||||    
T  2579016 tcacacttgagggggagtgttg-tgagcaagtgtgatttatatgtccctcatcggataaaa-agtaaatgttgaataccttataaataagaggatccata 2578919  T
Q  171 aacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 254  Q
    ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  2578918 aactcattaccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctcttttgcttgtgtggttgttctgacctcgatgtggacggtcccc 2578835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 98 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 5832182 - 5832027
Alignment:
Q  98 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 197  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   ||||||| ||||||||||    
T  5832182 caagtgtaagttatatgtcccacattggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaagcca-ccccttaagattttgggtaa 5832084  T
Q  198 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 254  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5832083 aagtgtggtgtctctcttacttgtgtggttgttctagcctcgatgtagacggtcccc 5832027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 99 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 6999951 - 6999799
Alignment:
Q  99 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaag 198  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| || |||||||||||||||| ||||    
T  6999951 aagtgtgagttatatgtcctacatcggataaaaaagtaaaagttgaacaccttatatgtaagaggatccataaactcactgccttaaggttttggataag 6999852  T
Q  199 agtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtc 251  Q
    ||||||| ||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6999851 agtgtggcgtctctcttgctaatgtggttgttctagtctcgatgtggacggtc 6999799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 96 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 593867 - 593707
Alignment:
Q  96 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 195  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||    
T  593867 tgcaagtgtgagttgtatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggactcataaaccgactgccttaaggttttgggt 593768  T
Q  196 aagagtgtgg--tgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 254  Q
    || |||||||  | |||||||| |||||  ||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  593767 aatagtgtggtatctctctcttacttgtacggttgttctaggctcgatgttgacggtcccc 593707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 99 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 1950340 - 1950200
Alignment:
Q  99 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaag 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| | | ||||||||||||||| |||||    
T  1950340 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttacaagtaagaggagccataaatctaatgccttaaggttttgagtaag 1950241  T
Q  199 agtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcg 239  Q
    ||||||  ||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  1950240 agtgtgacgtctctcttacttgtgcggttgttctagcctcg 1950200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 101 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 32460733 - 32460630
Alignment:
Q  101 gtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagag 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32460733 gtgtgagttatatgtcccacatcgtataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaagag 32460634  T
Q  201 tgtg 204  Q
    ||||    
T  32460633 tgtg 32460630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 96 - 250
Target Start/End: Original strand, 10911565 - 10911720
Alignment:
Q  96 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaata-gtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttggg 194  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||      
T  10911565 tgcaagtgtgagttatatgtcctacatcagataaaaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggactcataaactcattgccttaaagttttgaa 10911664  T
Q  195 taagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt 250  Q
    |||||||||| |||||||||| ||  ||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  10911665 taagagtgtgatgtctctcttactaatgttgttgttcaagcctcgatgtggacggt 10911720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 102 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 9062501 - 9062383
Alignment:
Q  102 tgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||    
T  9062501 tgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggactcataaactcattgtcttaa-gttttgggtaaaagt 9062403  T
Q  202 gtggtgtctctcttgcttgt 221  Q
    ||||| |||||||| |||||    
T  9062402 gtggtatctctcttacttgt 9062383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 30 - 228
Target Start/End: Original strand, 6071064 - 6071264
Alignment:
Q  30 aagagcttctgcttgagggg-gagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggag--tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcgga 126  Q
    ||||||||| | || ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||  ||||| | ||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  6071064 aagagcttccgtttaaggggtgagcatgatgaattgatggactcacatttgaggggaagattgttg-tgtgcaagtgtgagttatatgtcccacattgaa 6071162  T
Q  127 taaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggt 226  Q
    || || |||  ||||||||||| |||||||| ||| || |||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||| |||||| ||||    
T  6071163 tagaaaagtggaggttgaacactttataagtgagatgatccataaactcattgccttaagattttggataagagtgtggcgtctctctcgcttgtatggt 6071262  T
Q  227 tg 228  Q
    ||    
T  6071263 tg 6071264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 58 - 215
Target Start/End: Original strand, 8481888 - 8482045
Alignment:
Q  58 tgaattgatggactcacacttgagggggag--tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataa 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||| |||| || |||  ||||||||||| ||||||    
T  8481888 tgaattgatggactcacacttgagggggagattgttg-tgtgcaagtgtgagttatatgtcc-acatcagatataaaagtggaggttgaacactttataa 8481985  T
Q  156 gtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctctt 215  Q
     | ||| ||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8481986 atgagatgactcataaactcattgccttaagattttgggtaagagtgtggtgtctctctt 8482045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 91 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 5958766 - 5958613
Alignment:
Q  91 tggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttt 190  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||   ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||| ||||| ||||| ||||    
T  5958766 tggtgtgcaattgtgagttatatgtgttacatcggataaaacagtaaaggttgaacaccttataaataagagaactcataaactcattgtcttaaagttt 5958667  T
Q  191 tgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacg 248  Q
    ||||  |||||||| |||||||    |||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  5958666 tgggatagagtgtgatgtctct----cttgtgtgattgttctaacctcgatgtggacg 5958613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 96 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 12071849 - 12071691
Alignment:
Q  96 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 195  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||| |||| || | |  || |||||||| ||||||   | ||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  12071849 tgcaagtgtgagttatatgtctcgcatcagatagaaaaatggagtttgaacactttataatagaaaggactcataaacctatgaccttaaggttttgggt 12071750  T
Q  196 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 254  Q
    |||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12071749 aagagtgtggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgtgaacggtcccc 12071691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 96 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 12092640 - 12092482
Alignment:
Q  96 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 195  Q
    |||||| ||| |||| ||||||||||||||||| || |||  ||||||| ||| |||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  12092640 tgcaagggtgtgttagatgtcccacatcggatagaaaagtggaggttgagcactttataagtgagaggatccataaactcattgccttaaggttttgagt 12092541  T
Q  196 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 254  Q
    |||| ||||||||||||||  |||||| ||||| ||| |||| |||||||  |||||||    
T  12092540 aagactgtggtgtctctctcacttgtgaggttgctctggcctggatgtgggtggtcccc 12092482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 96 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 12085191 - 12085037
Alignment:
Q  96 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 195  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||| |||| || |||  || |||||||| ||||||   | ||||| |||||| |||| |||||||||||||||||    
T  12085191 tgcaagtgtgagttatatgtcctgcatcagatagaa-agtggagtttgaacactttataatagaaaggactcataaaaccatggccttaaggttttgggt 12085093  T
Q  196 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtc 251  Q
    |||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  12085092 aagagtgtggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgcgaacggtc 12085037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 56 - 169
Target Start/End: Original strand, 35210449 - 35210551
Alignment:
Q  56 gatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataa 155  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||            |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  35210449 gatggattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgc-----------cccacatcggataaaatagtaaaggttgaataccttgtaa 35210537  T
Q  156 gtaagaggacccat 169  Q
    ||||||||||||||    
T  35210538 gtaagaggacccat 35210551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 26 - 212
Target Start/End: Original strand, 2975482 - 2975668
Alignment:
Q  26 aagtaagagcttctgcttga-gggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttg-gtttgcaagtgtgagttat-atgtcccacat 122  Q
    ||||||||||||| |||| | |||||| || ||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||| ||||  |||||| ||| || |||||||||||    
T  2975482 aagtaagagcttccgcttaaagggggaacatgatgaatagatgcactcacacttg-gggggagtgttgtgttt--aagtgtaagtaattatgtcccacat 2975578  T
Q  123 cggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctct 212  Q
    |  ||| || |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||| || ||| ||||| ||||||  |||||||||| |||||||    
T  2975579 caaatagaaaagtaaatgttgaacaccttataagcaagatgacccataaatcctttgtcttaaagttttgaataagagtgtgatgtctct 2975668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 96 - 251
Target Start/End: Original strand, 31714671 - 31714823
Alignment:
Q  96 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 195  Q
    ||||||||||| | |||||||| |||||||||| || |||  |||||||||    ||||| | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||    
T  31714671 tgcaagtgtgact-atatgtcctacatcggatagaaaagtggaggttgaacgttatataa-tgagaggacccattaactcattgccttaaggttttgagt 31714768  T
Q  196 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtc 251  Q
    |||||||||| || | | | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31714769 aagagtgtggcgt-tttttcgcttgtgtggttgctctagcctcgatgtggacggtc 31714823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 26 - 155
Target Start/End: Original strand, 33605906 - 33606034
Alignment:
Q  26 aagtaagagcttctgcttgagggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcgg 125  Q
    ||||||||||||| ||| || |  | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||| ||| |||||||||||||||||||     
T  33605906 aagtaagagcttccgctcgaagaagggcacggtgaattgatggactcacacttgagggggagtgat-gtgtgcaaatgtaagttatatgtcccacatcga 33606004  T
Q  126 ataaaatagtaaaggttgaacaccttataa 155  Q
    ||| || |||  ||||||||||| ||||||    
T  33606005 atagaaaagtggaggttgaacactttataa 33606034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 100 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 17135223 - 17135069
Alignment:
Q  100 agtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaaga 199  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |  |||||| ||| || |||||||||| |||||||  ||||||| |||||    || ||||||| |||||    
T  17135223 agtgtgagttatatgtctcacatcggatagagaagtaaatgtttaataccttataagcaagaggattcataaactcattgttagaaagttttggataaga 17135124  T
Q  200 gtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 254  Q
    |||||  | |||| | ||||||| ||||||||  |||| ||||||||||||||||    
T  17135123 gtgtgacggctctttcgcttgtgcggttgttccggccttgatgtggacggtcccc 17135069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 164 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 22605345 - 22605301
Alignment:
Q  164 acccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgt 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22605345 acccataaacccattgccttaaggttttgggtaagaatgtggtgt 22605301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 200 - 247
Target Start/End: Original strand, 3409405 - 3409452
Alignment:
Q  200 gtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggac 247  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  3409405 gtgtggtgtctctcttgcttatgcggttgttctagcctcgatgtggac 3409452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 164 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 11637811 - 11637760
Alignment:
Q  164 acccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctctt 215  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  11637811 acccataaacccattgtcttaagattttggataagagtgtggtgtctctctt 11637760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 133 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 14789325 - 14789279
Alignment:
Q  133 agtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattg 179  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  14789325 agtaaaggttgaacaccttacaagtaagaggacccataaaccaattg 14789279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 103 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 30618766 - 30618634
Alignment:
Q  103 gtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtg 202  Q
    |||||||| | |||| ||||||| | ||| |||  ||| ||||||| |||||||||||| |||| |||||||  ||| ||||||||| ||||||| | ||    
T  30618766 gtgagttagaagtcctacatcggttgaaaaagtggaggatgaacactttataagtaagatgacc-ataaaccg-ttgtcttaaggttatgggtaaaaatg 30618669  T
Q  203 tggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcct 237  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||| ||| ||||    
T  30618668 tggtgtctctcttacttatgtggttgctcttgcct 30618634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 164 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 21130147 - 21130103
Alignment:
Q  164 acccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgt 208  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21130147 acccataaatccattgccttaaggttttggataagagtgtggtgt 21130103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 188 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 10902496 - 10902438
Alignment:
Q  188 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgga 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||  ||| ||||||||    
T  10902496 ttttgggtaagagtgtggtgtctctctcacttgtatggttgttctgacctagatgtgga 10902438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 30 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 12092261 - 12092201
Alignment:
Q  30 aagagcttctgcttgaggggg---agcacgatgaattgatggactcacacttgagggggag 87  Q
    ||||||||| ||| |||||||   |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12092261 aagagcttccgctagaggggggtgagcatgatgaattgatggactcacacttgagggggag 12092201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 172 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 11638095 - 11638053
Alignment:
Q  172 acccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 214  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||    
T  11638095 acccattgccttaggattttgggtaagagtatggtgtctctct 11638053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 82)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 19 - 250
Target Start/End: Original strand, 3669982 - 3670214
Alignment:
Q  19 acatgcaaagtaagagcttctgcttgagggg-gagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcc 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3669982 acatgcaaagtaagagcttctgcttgaagggtgagcatgatgaattgatggactcacacttgagggggactgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcc 3670081  T
Q  118 cacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgc 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3670082 cacatcggataaaatagtaaaggtttaacaccttataagtatgaggacccataaacctatttccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgc 3670181  T
Q  218 ttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt 250  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  3670182 ttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggt 3670214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 19 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 1014107 - 1013879
Alignment:
Q  19 acatgcaaagtaagagcttctgcttga-gggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcc 117  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  1014107 acatgcaaagtaagagcttccgcttgaagggggagtatgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgttc 1014008  T
Q  118 cacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgc 217  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||| ||||||||||| ||||||| || |    
T  1014007 cacatcggataaaatagtaaaagttgaacaccctataagtaagaggaccaataaacccattgccttagagttttgagtaagagtgtgttgtctcttttac 1013908  T
Q  218 ttgtgtggttgttctagcctcgatgtgga 246  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1013907 ttgtgcggttgttctagcctcgatgtgga 1013879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 87 - 254
Target Start/End: Original strand, 3669678 - 3669845
Alignment:
Q  87 gtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaag 186  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  3669678 gtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggactcataaactcattgccttaag 3669777  T
Q  187 gttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3669778 gttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtcccc 3669845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 26 - 252
Target Start/End: Original strand, 40518512 - 40518738
Alignment:
Q  26 aagtaagagcttctgcttgaggggg-agcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcg 124  Q
    |||||||||||||  |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||||||||     
T  40518512 aagtaagagcttccacttgaggggggagcatgatgaattgatggactcacacttgagggggagtattgtgtt-caagtgtgagttatatgtcccacatca 40518610  T
Q  125 gataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtg 224  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||    
T  40518611 gatagaaaagtaaaggttgaacaccttataaataagaggacccataaacccaatgacttaaggttttgggtaagagtgtgacgtcactcttgcttgtgtg 40518710  T
Q  225 gttgttctagcctcgatgtggacggtcc 252  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||    
T  40518711 gttgttctagcctcaatgtggacggtcc 40518738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 47 - 254
Target Start/End: Original strand, 34835160 - 34835367
Alignment:
Q  47 ggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttg--caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttga 144  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||| | ||  |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  34835160 ggggggcatgatgaattgatggactcac--ttgagggggagtgttgctgtgtacaagggtgagttatatgtcccacatccgataaaatagtaaaggttga 34835257  T
Q  145 acaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtg 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  34835258 acaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaagttttgggtaagagtgtggtgtcactcttgcttgtgtggttattctagcctcgatgta 34835357  T
Q  245 gacggtcccc 254  Q
    ||||||||||    
T  34835358 gacggtcccc 34835367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 51 - 254
Target Start/End: Original strand, 34835427 - 34835633
Alignment:
Q  51 agcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttg--caagtgtgagttatatgtcccacatcg-gataaaatagtaaaggttgaaca 147  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||  |||| |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||||    
T  34835427 agcatgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttgctgtgtacaagggtgagttatatgtcccacgtcccgataaaatagtaaaggtttaaca 34835526  T
Q  148 ccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggac 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  34835527 ccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaagttttgggtaagagtgtggtgtcactcttgcttgtgtggttattctagcctcgatgtagac 34835626  T
Q  248 ggtcccc 254  Q
    |||||||    
T  34835627 ggtcccc 34835633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 51 - 254
Target Start/End: Original strand, 34835693 - 34835899
Alignment:
Q  51 agcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttg--caagtgtgagttatatgtcccacatcg-gataaaatagtaaaggttgaaca 147  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||  |||| |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||||    
T  34835693 agcatgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttgctgtgtacaagggtgagttatatgtcccacgtcccgataaaatagtaaaggtttaaca 34835792  T
Q  148 ccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggac 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  34835793 ccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaagttttgggtaagagtgtggtgtcactcttgcttgtgtggttattctagcctcgatgtagac 34835892  T
Q  248 ggtcccc 254  Q
    |||||||    
T  34835893 ggtcccc 34835899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 98 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 3038446 - 3038292
Alignment:
Q  98 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3038446 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacactttataagtaaaaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 3038347  T
Q  198 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 252  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3038346 gagtgtggcatctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 3038292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 86 - 247
Target Start/End: Original strand, 30441071 - 30441236
Alignment:
Q  86 agtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacacctta----taagtaagaggacccataaacccattgcc 181  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  30441071 agtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggctaaaatagtaaaggttgaacaccttaattataagtaagagggcccataaacccattgcc 30441170  T
Q  182 ttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggac 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  30441171 ttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggac 30441236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 46 - 254
Target Start/End: Original strand, 9309303 - 9309512
Alignment:
Q  46 gggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttg 143  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  9309303 gggggagcacgataaagtgatggactcacaattgagggggagtgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaatgttg 9309402  T
Q  144 aacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgt 243  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |   | |||||||||||||||||||||||    
T  9309403 aacaccttataagtaagaggacccttaaactcattgccttaaggtgtcgggtaagagtgtggtgtctctc-tcagtatgtggttgttctagcctcgatgt 9309501  T
Q  244 ggacggtcccc 254  Q
    |||||||||||    
T  9309502 ggacggtcccc 9309512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 26 - 254
Target Start/End: Original strand, 45122560 - 45122782
Alignment:
Q  26 aagtaagagcttctgcttga-gggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcg 124  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||||| ||||||| || | |||||||||||||||||||||||| | ||||||||      ||||| ||| |||||    
T  45122560 aagtaagagcttccgctggaagggggagcatgatgaatagaagaactcacacttgagggggagtgttg-tgtgcaagtg------atatggcccgcatcg 45122652  T
Q  125 gataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtg 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  45122653 gataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgtcttaaggttttgggtatgagtgtggcgtctctcttgcttgtgtg 45122752  T
Q  225 gttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 254  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  45122753 gttgttcaagcctcgatgtggaaggtcccc 45122782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 29 - 250
Target Start/End: Original strand, 30359539 - 30359763
Alignment:
Q  29 taagagcttctgcttga-gggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttg--caagtgtgagttatatgtcccacatcgg 125  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||  ||||||||||||||||||| |||||| |    
T  30359539 taagagcttccgcttgaagggggagcatgataaattgatggactcacacttgagggggaatgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtctcacatcag 30359638  T
Q  126 ataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtgg 225  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||    
T  30359639 ataaaagagtaaaagttgaacaccttataagtaagaggactcataaacccataaccttaagattttgggtaagagtgtggtgtctctcttacttatgcgg 30359738  T
Q  226 ttgttctagcctcgatgtggacggt 250  Q
    |||||||| | ||||||||||||||    
T  30359739 ttgttctaacttcgatgtggacggt 30359763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 98 - 246
Target Start/End: Original strand, 34834878 - 34835026
Alignment:
Q  98 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  34834878 caagtgtgagttatatgtcccacattggataaaatagtaaaggttaaacaccttataagtaagatgactcataaactcattgccttaaggttttgggtaa 34834977  T
Q  198 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgga 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34834978 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgga 34835026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 26 - 254
Target Start/End: Original strand, 45122933 - 45123164
Alignment:
Q  26 aagtaagagcttctgcttga-gggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacat 122  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||| || ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||    
T  45122933 aagtaagagcttccgcttgaagggggaacatgatgaatagatggacttacacttgagggggagtgttgctgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacat 45123032  T
Q  123 cggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggta--agagtgtggtgtctctcttgcttg 220  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||| |||||||||||| |||  ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||  |||    
T  45123033 cggataaaatagtaaaggttaaacacct--taagtaagatgacccataaacctattttcttaaggttttgggtaagagagtgtggtgtctctcttatttg 45123130  T
Q  221 tgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 254  Q
    || ||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  45123131 tggggttgttctaatctcgatgtggacggtcccc 45123164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 26 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 8918994 - 8918764
Alignment:
Q  26 aagtaagagcttctgcttgagggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatc 123  Q
    |||| |||||||| |||| | ||||  || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8918994 aagttagagcttccgcttaaagggggacatgatgaatagatggactcacacttgagggggagtgttgttgtgtgcaagtgtgagttacatgtcccacatc 8918895  T
Q  124 ggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgt 223  Q
     ||||  | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||| |||||    
T  8918894 agatagcagagtaaaggttgaacactttataagtaagaggacccataaacctattgacttaaggttttgggtaagagtgtgacgtctttcttgcgtgtgt 8918795  T
Q  224 ggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 254  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  8918794 ggttgttttaacctcgatgtggacggtcccc 8918764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 26 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 9482829 - 9482608
Alignment:
Q  26 aagtaagagcttctgcttgagggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcgg 125  Q
    ||||||||||||| |||||| |||| ||||  ||||||| |||||||||  |||||||||||||||| | || |   ||||||||||||| |||||| ||    
T  9482829 aagtaagagcttccgcttgaagggg-gcacagtgaattgttggactcac--ttgagggggagtgttgttgtgtacaagtgagttatatgttccacatggg 9482733  T
Q  126 ataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtgg 225  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  9482732 ataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgcctaaagattttgtataagagtgtggtatctctcttgcttgtgcgg 9482633  T
Q  226 ttgttctagcctcgatgtggacggt 250  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  9482632 ttgttctagcctcgatgtggacggt 9482608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 48 - 246
Target Start/End: Original strand, 6731856 - 6732045
Alignment:
Q  48 gggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaaca 147  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       
T  6731856 gggagcatgatgaatagatggactcacatttgagggggagtgttgttttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttga--- 6731952  T
Q  148 ccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgga 246  Q
          ||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||    
T  6731953 ------aagtaagagaacccataaattcattgccttaaggttttgagtaagagtgtggtgtctctcttgcttatgcggttgttctaacctcgatgtgga 6732045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 96 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 45122215 - 45122067
Alignment:
Q  96 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 195  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||  |||||||||||||||    
T  45122215 tgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagaacccataaactcattttcttaaggttttgggt 45122116  T
Q  196 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtg 244  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  45122115 aagagtgtggtgtctctcttacttgtggggttgttctagcctcgatgtg 45122067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 88 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 20870741 - 20870575
Alignment:
Q  88 tgttggtttgcaagtgtgagttatat--gtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaa 185  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20870741 tgttggtttgcaagtgtgagttatatatgttccacatcagataaaatagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggacccataaacccactgccttaa 20870642  T
Q  186 ggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 252  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  20870641 gattttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctaaccttgatatggacggtcc 20870575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 88 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 1014411 - 1014253
Alignment:
Q  88 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 187  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | || |||||| |    
T  1014411 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccgtaaactcgttaccttaaag 1014312  T
Q  188 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgga 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1014311 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcctgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtgga 1014253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 96 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 6877021 - 6876862
Alignment:
Q  96 tgcaagtgtgagttatat-gtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttggg 194  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| |||| |||||||||    
T  6877021 tgcaagtgtgagttatatagtcccacatcggataaaaaagtaaaggttgaacaccttataaataagatgacccatacactcattgtcttagggttttggg 6876922  T
Q  195 taagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 254  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6876921 taagagtgtggtgtttctcttgtttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 6876862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 98 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 33113523 - 33113368
Alignment:
Q  98 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 197  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  33113523 caagtttgagttatatgtcctacatcggataaaatagtaaaggttgaacgtcttataagtaagaggacccataaactcattgccttaagattttgggtaa 33113424  T
Q  198 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccc 253  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  33113423 gagtgtggtgtctctcttgctagtgtggttgttctaggctcaatgcggacggtccc 33113368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 98 - 254
Target Start/End: Original strand, 40518071 - 40518229
Alignment:
Q  98 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaata--gtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 195  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  40518071 caagtgtgagttatatgttccacattggataaaaaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaaatggacccataaacccaatgccttaaggttttgggt 40518170  T
Q  196 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 254  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  40518171 aagagtgtggcgtctctcttgcttgtgtggttgttctagccttgatgtggacggtcccc 40518229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 96 - 254
Target Start/End: Original strand, 9608745 - 9608903
Alignment:
Q  96 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 195  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  9608745 tgcaagtgtgagttatatgtcccatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcaccttaaggttttgggt 9608844  T
Q  196 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 254  Q
    | |||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9608845 atgagtgtggcgtctctcttgctagtgaggttgttctagcctcgatgtggacggccccc 9608903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 98 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 25561972 - 25561815
Alignment:
Q  98 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggtttt-gggta 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  25561972 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaacgttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgtcttaaggttttggggta 25561873  T
Q  197 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 254  Q
    ||||||||   ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  25561872 agagtgtgacatctctcttgcttgtgtggttgctctagcctcgatgtggaaggtcccc 25561815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 98 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 37544646 - 37544490
Alignment:
Q  98 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 197  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||    
T  37544646 caagtgtgagttataagtcgcacatcggataaaatagtaaaggttgaacacattataagaaagaggacccataaatccattactttaaggttttgggtaa 37544547  T
Q  198 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 254  Q
    ||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  37544546 gagtgtggtgtctttcttacttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacgatcccc 37544490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 46 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 45121865 - 45121663
Alignment:
Q  46 gggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttg--caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttg 143  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||| | ||  |||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  45121865 gggggagcacgataaagtgatggactcacacttaagggggagtgttgttgtgtacaagtgtgagttgt-tgtcccacatcggataaaagagtaaaggttg 45121767  T
Q  144 aacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgt 243  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||| | |||||||| ||| || ||||||||||||||||||||    
T  45121766 atcaccttataagtaagaggatccataaacctacagccttaaggttttgagtaagagtgtgatatctctcttacttatggggttgttctagcctcgatgt 45121667  T
Q  244 ggac 247  Q
    ||||    
T  45121666 ggac 45121663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 99 - 254
Target Start/End: Original strand, 147454 - 147609
Alignment:
Q  99 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaag 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  147454 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataaataagaggacccataaacctattgccttaaagttttgggtaag 147553  T
Q  199 agtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 254  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||| | |||||||  |||||||    
T  147554 agtgtggcgtctctcttgcttgtgcggtagttctagcattgatgtgggtggtcccc 147609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 96 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 45122068 - 45121910
Alignment:
Q  96 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  45122068 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcgcataaaatagtaaaggttgaacactttataagtaagaggactcataaactcattgccttaagattttgggt 45121969  T
Q  196 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 254  Q
    || ||||||| |||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||||||| |||||||    
T  45121968 aacagtgtggcgtctcttttgctcgtgtggttattcaagcctcgatgtggaaggtcccc 45121910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 121 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 9483320 - 9483191
Alignment:
Q  121 atcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttg 220  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  9483320 atcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgtcttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctcttttgctcg 9483221  T
Q  221 tgtggttgttctagcctcgatgtggacggt 250  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||    
T  9483220 tgcggttgttctagcctcgatgtggacggt 9483191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 98 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 1514071 - 1513915
Alignment:
Q  98 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 197  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||    
T  1514071 caagtatgagttatatatcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccttaaacccataaccttaaggttttgggtaa 1513972  T
Q  198 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 254  Q
     |||||||| |||||||| | |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  1513971 aagtgtggtatctctcttacatgtggggttattctagcctcgatgtggacggtcccc 1513915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 98 - 246
Target Start/End: Original strand, 30359273 - 30359421
Alignment:
Q  98 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 197  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  30359273 caagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttataagcaagaggacccataaacccatagccttaaggttttgggtaa 30359372  T
Q  198 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgga 246  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||||||| |||||||    
T  30359373 gagtgtggtgtctctctttcttgtgatgttgttttagcctcaatgtgga 30359421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 26 - 244
Target Start/End: Original strand, 147757 - 147968
Alignment:
Q  26 aagtaagagcttctgcttga-gggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacat 122  Q
    ||||||||||||| |||| | ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||    
T  147757 aagtaagagcttccgcttaaagggggagct-gatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacat 147855  T
Q  123 cggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtg 222  Q
    | ||||||| |||||| |||||||| | ||||         ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  147856 ctgataaaaaagtaaatgttgaacaacatata---------acccataaacctattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttacttgtg 147946  T
Q  223 tggttgttctagcctcgatgtg 244  Q
      |||||||||||||| |||||    
T  147947 cagttgttctagcctcaatgtg 147968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 103 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 70425 - 70277
Alignment:
Q  103 gtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtg 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  70425 gtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaatgttgaacatcttataagtaagaggacccataaacccactgccttaaggttttaggtaagagtg 70326  T
Q  203 tggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtc 251  Q
    ||  |||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||    
T  70325 tgacgtctatcttgcttgtgtggttgttctaacctcaatgcggacggtc 70277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 30 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 18371881 - 18371665
Alignment:
Q  30 aagagcttctgcttga-gggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggata 128  Q
    ||||||||| |||||| ||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| || | || |   |||||||||||||| |||||||||||    
T  18371881 aagagcttccgcttgaagggggggcacgataaagtgatggactcacacttgagggggagtgctgttgtgtagaagtgagttatatgtcacacatcggata 18371782  T
Q  129 aaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttg 228  Q
    |||||||||||||||||||     ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   ||||| |||||    
T  18371781 aaatagtaaaggttgaaca----ttaagtaagaagacccataaaccca-tgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtgtctctcatttgtgcggttg 18371687  T
Q  229 ttctagcctcgatgtggacggt 250  Q
     |||||| ||||||||||||||    
T  18371686 ctctagcttcgatgtggacggt 18371665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 90 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 40579670 - 40579512
Alignment:
Q  90 ttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggtt 189  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||  || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||    
T  40579670 ttggtttccaagtgtgaattatatgtttcatattggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacttattgctttaaggtt 40579571  T
Q  190 ttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacg 248  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||| ||||||||||||||    
T  40579570 ttaggtaagagtgtggtgtctctattgcttgtacggttgttctatcctcgatgtggacg 40579512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 96 - 254
Target Start/End: Original strand, 5915872 - 5916025
Alignment:
Q  96 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 195  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||||| ||| ||||| |||    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5915872 tgcaagtgtgagttatatgtcctacattggataaaaatgtaaa-gtttaacacttta----taagaggacccataaactcattgccttaaggttttgggt 5915966  T
Q  196 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5915967 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 5916025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 96 - 252
Target Start/End: Original strand, 5420651 - 5420807
Alignment:
Q  96 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 195  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||    
T  5420651 tgcaagtgtgtattatatgtcccacatcggatagaatagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggactcataaacccattgccttaaggttttttgt 5420750  T
Q  196 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 252  Q
    |||||||||  ||||| ||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  5420751 aagagtgtgacgtctccctcacttgtgtggttgttcaagcctcgatgtggaccgtcc 5420807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 96 - 251
Target Start/End: Original strand, 41972158 - 41972316
Alignment:
Q  96 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggtt---ttg 192  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||| |||   |||    
T  41972158 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtgataggacccataaacccattgccataaagttttgttg 41972257  T
Q  193 ggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtc 251  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||    
T  41972258 ggtaagagtgtggcgtcactcttgcttgtgtggttgttccagcctcaatatggacggtc 41972316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 67 - 254
Target Start/End: Original strand, 6651476 - 6651652
Alignment:
Q  67 ggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacc 166  Q
    ||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |         |||||| |||    
T  6651476 ggactcacacttgaggggaggtgttgttttgcaagtg--agttatatgtctcacatcggataaaatagtaaaggttgaaaa---------taagagaacc 6651564  T
Q  167 cataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 254  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||| |||||||    
T  6651565 cataaattcattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcgattgttctaacctcgatgtggatggtcccc 6651652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 106 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 18372142 - 18371998
Alignment:
Q  106 agttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtgg 205  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18372142 agttatatgtaccacatccaataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggatccataaactcattgctttaaggttttgggtaagagtgtgg 18372043  T
Q  206 tgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt 250  Q
    ||| ||||| ||||||| ||||| ||||||||| ||||| |||||    
T  18372042 tgtttctctcgcttgtgcggttgctctagcctcaatgtgaacggt 18371998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 45 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 18372465 - 18372342
Alignment:
Q  45 agggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttga 144  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18372465 agggggagcacgataaagtgatggactcacacttgagggggagtgttgttgtgaaagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaatagtaaaggttga 18372366  T
Q  145 acaccttataagtaagaggaccca 168  Q
    ||||||||||||||||| ||||||    
T  18372365 acaccttataagtaagaagaccca 18372342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 96 - 254
Target Start/End: Original strand, 9308977 - 9309139
Alignment:
Q  96 tgcaagtgtgagttatatgtcc--cacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgg 193  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| |||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9308977 tgcaagtgtgagttatatgtcctacacatcagataaaagagtaaaagttgaacatgttataagtaagaggacccataaacccattgcctaaaggttttgg 9309076  T
Q  194 gtaag---agtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 254  Q
    | |||   ||||||||||||||||  | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9309077 gcaagagtagtgtggtgtctctctcac-tatgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 9309139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 99 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 32640682 - 32640542
Alignment:
Q  99 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaag 198  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||     || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32640682 aagtgtgagttatctgtctcacatcggataaaagagtaaaggttgaaca-----taggtaagaggaccgataaacccattgccttaaggttttgggtaag 32640588  T
Q  199 agtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtg 244  Q
    ||||| | ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  32640587 agtgttgcgtctctcttgcttttgtgattgttctagcctcgatgtg 32640542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 45 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 18372907 - 18372785
Alignment:
Q  45 agggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttga 144  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||| | || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18372907 agggggagcacgataaagtgatggactcacacttgaggag-agtgttgttgtgaaagtgtgagttatatgtcacacatcggataaaatagtaaaggttga 18372809  T
Q  145 acaccttataagtaagaggaccca 168  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  18372808 acaccttataagtaagaggaccca 18372785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 30 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 18373157 - 18372988
Alignment:
Q  30 aagagcttctgcttga-gggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgca-agtgtgagttatatgtcccacatcggat 127  Q
    |||||||||  ||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||  ||||||||| | || | ||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  18373157 aagagcttccccttgatgggggagcacgataaagtgatggactcacacttgagatggagtgttgttgtgtacagtgtgatttatatgtcccacttcggat 18373058  T
Q  128 aaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagag 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||   ||||||||||||||||    
T  18373057 aaaatagtaaaggttgaacaccttataaataagaggactcataaactcattgcc---aggttttgggtaagag 18372988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 100 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 18380171 - 18380020
Alignment:
Q  100 agtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaaga 199  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||| | ||||||||||||| ||||||    
T  18380171 agtgtgagttatatatcccacatcgaataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagggggcctataaacccactaccttaaggttttgagtaaga 18380072  T
Q  200 gtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccc 253  Q
    ||||||||   |||||||||||| | || ||||||| ||||||||||| |||||    
T  18380071 gtgtggtg--cctcttgcttgtgcgattcttctagcttcgatgtggacagtccc 18380020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 90 - 254
Target Start/End: Original strand, 32305478 - 32305635
Alignment:
Q  90 ttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggtt 189  Q
    |||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||    
T  32305478 ttggtttgcaagtgtgagttatatgtc-------ggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaagacctataaacccattaccttaagatt 32305570  T
Q  190 ttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 254  Q
    |||| ||||||||||| |||| | || ||| ||  ||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  32305571 ttggataagagtgtggcgtctttattacttatgcagttgttctaaccttgatgtggacggtcccc 32305635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 96 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 4154824 - 4154678
Alignment:
Q  96 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 195  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||  ||||||||||| |||||||| | ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||    
T  4154824 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatctgatagaaaagtggaggttgaacactttataagtgaaaggacccataaactcattgccccaaggttttgggt 4154725  T
Q  196 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtg 244  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||||||| ||| |||| ||||||    
T  4154724 aagagtgtggcgtctctc--gcttgtgtggttgctctggcctagatgtg 4154678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 30 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 4154506 - 4154281
Alignment:
Q  30 aagagcttctgcttgagggg-gagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggag--tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcgga 126  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || |  |||||||||||||||||||||||||   ||||| | ||||| |||||||||||||||| ||||| ||    
T  4154506 aagagcttctgcttgaggggtgagcatgaagttttgatggactcacacttgagggggaaattgttg-tgtgcaaatgtgagttatatgtcctacatcaga 4154408  T
Q  127 taaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggt 226  Q
    || || |||  ||||||||||| |||||||| |||| |||||||||| |||||||||||  ||||||||||| ||||| |||||||||   |||| ||||    
T  4154407 tagaaaagtggaggttgaacactttataagtgagag-acccataaactcattgccttaatattttgggtaagtgtgtgatgtctctctcaattgtttggt 4154309  T
Q  227 tgttctagcctcgatgtggacggtcccc 254  Q
    || ||| |||| |||||||  |||||||    
T  4154308 tgctctggcctagatgtgggtggtcccc 4154281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 96 - 247
Target Start/End: Original strand, 9507777 - 9507933
Alignment:
Q  96 tgcaagtgtgagttatatgtcc--cacatcggataaaat---agtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttt 190  Q
    |||||||||||||||||| |||  || || ||||||||    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  9507777 tgcaagtgtgagttatatctcctccatattggataaaagtacagtaaaggttgaataccttataagtaagaggactcataaacccattaccttaaggttt 9507876  T
Q  191 tgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggac 247  Q
    ||||||||||||||| |||||| |  ||| | ||||||||| |||||||||||||||    
T  9507877 tgggtaagagtgtggcgtctctatctcttatatggttgttcaagcctcgatgtggac 9507933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 119 - 233
Target Start/End: Original strand, 9609108 - 9609222
Alignment:
Q  119 acatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgct 218  Q
    ||||| |||| || ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  9609108 acatcagatagaaaagtaaaggttgaacatcttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaatgttttcggtaagagtgtggcgtctctcttgct 9609207  T
Q  219 tgtgtggttgttcta 233  Q
     ||||||||||||||    
T  9609208 agtgtggttgttcta 9609222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 45 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 18372580 - 18372485
Alignment:
Q  45 agggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaagg 140  Q
    ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18372580 aggggaagcacgataaagtgatggactcacacttgagggggagtgttgttgtgaaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaagg 18372485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 88 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 41416335 - 41416251
Alignment:
Q  88 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacc 174  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  41416335 tgttggtttgcaagtg--agttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggatccataaacc 41416251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 99 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 43274934 - 43274824
Alignment:
Q  99 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaag 198  Q
    |||||||||||||||||  |||||| ||||||| ||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||    
T  43274934 aagtgtgagttatatgtttcacatcagataaaagagtaaaggttgaatatattataagtaagaggacccataaacctattgtcttaaggttttgagtaag 43274835  T
Q  199 agtgtggtgtc 209  Q
    |||||||||||    
T  43274834 agtgtggtgtc 43274824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 98 - 214
Target Start/End: Original strand, 8794113 - 8794229
Alignment:
Q  98 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 197  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| | |  ||||||||||||||| |    
T  8794113 caagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaagaataaatgttgaacatcttataagtaagaggactcataaacctaatatcttaaggttttgggtga 8794212  T
Q  198 gagtgtggtgtctctct 214  Q
    ||||| |||||||||||    
T  8794213 gagtgcggtgtctctct 8794229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 171 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 40579352 - 40579269
Alignment:
Q  171 aacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 254  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  40579352 aacccattgccttaggattttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggactgtcccc 40579269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 96 - 245
Target Start/End: Original strand, 12283873 - 12284021
Alignment:
Q  96 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 195  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| || ||||||| |||||| |||||| | |||| |||||| | ||| ||||||| ||  | ||||||||||||| |    
T  12283873 tgcaagtgtaagttatatgtcccacgtcagataaaaaagtaaatgttgaatatcttaaaagtaaaatgacacataaactcaa-gtcttaaggttttggat 12283971  T
Q  196 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgg 245  Q
    |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12283972 aagagtgtagtgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctctatgtgg 12284021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 178 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 8919220 - 8919144
Alignment:
Q  178 tgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 254  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8919220 tgccttaaggttttggataagagtgtggtgtctcttttgcttgtgtggttgttctagcttcgatgtggacggtcccc 8919144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 98 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 18372758 - 18372656
Alignment:
Q  98 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 197  Q
    ||||||||| |||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||    
T  18372758 caagtgtgatttatatgttccatttcggataaaatagtaaaggttgaaca-cttataagtaagaggactcataaacccattgcc---aggttttgggtaa 18372663  T
Q  198 gagtgtg 204  Q
    |||||||    
T  18372662 gagtgtg 18372656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 96 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 9620834 - 9620678
Alignment:
Q  96 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 195  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| | |||| || |||| | ||||| ||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||   |    
T  9620834 tgcaagtgtgagttatatgtctcacaacagatagaaaagtagaagttgatcactttataagtgagaggacccataaactcattgccttaagatttt--at 9620737  T
Q  196 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 254  Q
    |||||| || |||||||||  |||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||    
T  9620736 aagagtttgatgtctctctcacttgtgtggttgctcaggcctggatgtggacggtcccc 9620678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 174 - 254
Target Start/End: Original strand, 41129066 - 41129146
Alignment:
Q  174 ccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 254  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  41129066 ccattgtcttaaggttttgggtatgagtgtggtgtctctcttacttgtgtggttgttcaaacctcgatgtggacggtcccc 41129146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 99 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 3037865 - 3037776
Alignment:
Q  99 aagtgtgagttatat--gtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaag 186  Q
    |||||||||||||||  || ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  3037865 aagtgtgagttatatatgttccacatcggatgaaatagtaaatgttgaacaccttataagtaagaggactcataaacccattgtcttaag 3037776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 100 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 43398225 - 43398077
Alignment:
Q  100 agtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaa---gaggacccataaacccattgccttaaggttttgggta 196  Q
    |||||||||||||| || || |||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||   |||||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||    
T  43398225 agtgtgagttatatatctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataaataagaggaggacccataaattcattgccttaaagttttggata 43398126  T
Q  197 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgg 245  Q
    ||| ||||| || ||| || || ||| ||||| |||| |||||||||||    
T  43398125 agaatgtggcgtttcttttactagtgcggttgctctaacctcgatgtgg 43398077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 106 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 25561792 - 25561729
Alignment:
Q  106 agttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccat 169  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25561792 agttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagagtacccat 25561729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 101 - 201
Target Start/End: Original strand, 20130454 - 20130553
Alignment:
Q  101 gtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagag 200  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||    
T  20130454 gtgtgagatatatgtctcacatcggataaaagagtaaaagttgaacacctt-taagtaagatgatccataaacccataaccttacggttttaggtaagag 20130552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 96 - 228
Target Start/End: Original strand, 5274775 - 5274907
Alignment:
Q  96 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 195  Q
    ||||||| |||||||||||| | |||| | |||||| || | ||||||||||| |||||| |  || ||||||||||  |||||||||||| ||||| ||    
T  5274775 tgcaagtatgagttatatgttctacattgaataaaaaaggagaggttgaacactttataaatgggaagacccataaaatcattgccttaagattttgagt 5274874  T
Q  196 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttg 228  Q
    ||||||||| ||||||| | |||||||| ||||    
T  5274875 aagagtgtgatgtctctatcgcttgtgttgttg 5274907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 26 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 3038157 - 3038099
Alignment:
Q  26 aagtaagagcttctgcttgagggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggg 84  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3038157 aagtaagagcttccgcttgagggggagctcgatgaattgatggactcacactttagggg 3038099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 173 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 20995497 - 20995433
Alignment:
Q  173 cccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcct 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||| ||| ||||    
T  20995497 cccattgccttaaggttttgggtaagaatgtggtgtctctctcacttgtgtggttgctctggcct 20995433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 190 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 43274699 - 43274635
Alignment:
Q  190 ttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 254  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  43274699 ttgggtatgagtgtggtgtctctcttacttatggggttgttccagcctcgatgtggacggtcccc 43274635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 177 - 234
Target Start/End: Original strand, 16524446 - 16524503
Alignment:
Q  177 ttgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctag 234  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  16524446 ttgctttaaggttttgagtaagagtgtggtgtctctcttacttgtgtggttgctctag 16524503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 132 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 18373292 - 18373236
Alignment:
Q  132 tagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggt 188  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| ||||||||    
T  18373292 tagtaaaggttgaacaccttataaataagaggatccattaacccattgtcttaaggt 18373236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 99 - 195
Target Start/End: Original strand, 40991756 - 40991852
Alignment:
Q  99 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 195  Q
    |||||||||||| | ||||||||| |  || || |||  ||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  40991756 aagtgtgagttagaagtcccacattgcttagaaaagtggaggttgaacacttcataagtgagaggacccataaacccaatgcctcaaggttttgggt 40991852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 207 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 3038016 - 3037969
Alignment:
Q  207 gtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 254  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3038016 gtctctctatcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 3037969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 150 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 40417820 - 40417733
Alignment:
Q  150 ttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcct 237  Q
    |||||||||||| ||| | |||| ||||||| ||||| |||||| ||| ||||||||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||    
T  40417820 ttataagtaagatgactcgtaaatccattgcgttaagattttggataaaagtgtggtgtctctctcacttgtgtgattgctcttgcct 40417733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 46 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 43274777 - 43274699
Alignment:
Q  46 gggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacat 122  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||  |||||||  || | |||||||||||||||| || |||||    
T  43274777 gggggagcacgataaagtgatggactcacacttgagggacagtgttgttgtgtacaagtgtgagttatatatctcacat 43274699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 196 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 18372342 - 18372288
Alignment:
Q  196 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt 250  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | ||| |||||||||||||||    
T  18372342 aagagtgtggtgtctctctcgcttgtgcggttgctttagtctcgatgtggacggt 18372288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 167 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 12156745 - 12156708
Alignment:
Q  167 cataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 204  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12156745 cataaacccattgtcttaaggttttgggtaagagtgtg 12156708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 96 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 20995559 - 20995502
Alignment:
Q  96 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttat 153  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||  ||||||||||| ||||    
T  20995559 tgcaagtgtgagttatatgtctcacatcagataaaaaagtggaggttgaacactttat 20995502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 96 - 173
Target Start/End: Original strand, 33831978 - 33832055
Alignment:
Q  96 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaac 173  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| | | | | || |||| | ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  33831978 tgcaagtgtgagttatatgtctcacgttgaagagaaaagtagaagttgaacactttataagtaagaggacctataaac 33832055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 154 - 195
Target Start/End: Original strand, 11442911 - 11442952
Alignment:
Q  154 aagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 195  Q
    |||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  11442911 aagtgagaggacccataaactcaatgccttaaggttttgggt 11442952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 96 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 18645745 - 18645713
Alignment:
Q  96 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggata 128  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18645745 tgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggata 18645713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 86)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 23 - 254
Target Start/End: Original strand, 22304495 - 22304727
Alignment:
Q  23 gcaaagtaagagcttctgcttga-gggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccaca 121  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22304495 gcaaagtaagagcttccgcttgaagggggagcatgatgaatagatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagctatatgtcccaca 22304594  T
Q  122 tcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgt 221  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22304595 tcggataaaatagtaaaggttgaataccttataagtaagaggacccataaacacattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgt 22304694  T
Q  222 gtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 254  Q
    | ||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  22304695 gcggttgttctagtctcgatgtggacagtcccc 22304727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 19 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 37990875 - 37990639
Alignment:
Q  19 acatgcaaagtaagagcttctgcttgagggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttg--caagtgtgagttatatgtc 116  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||     
T  37990875 acatgcaaagtaaaagcttccgcttgaggggg-gcatgatgaattgatggactcacagttgagggggagtgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtt 37990777  T
Q  117 ccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttg 216  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37990776 ccacatcggataaaatagtaaatgttgaacaccttataagtaagaggactcataaactcattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttg 37990677  T
Q  217 cttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 254  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  37990676 cttgtgtgattgttctagcctcgatgtggacggtcccc 37990639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 30 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 54018042 - 54017816
Alignment:
Q  30 aagagcttctgcttgagggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggat 127  Q
    ||||||||| |||||||||||| || ||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||  || |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  54018042 aagagcttccgcttgagggggaacatgatgaaaagatggactcacacttgagggggagtattgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcctacatcggat 54017943  T
Q  128 aaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggtt 227  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  54017942 aaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggactcataaacctaacgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttacttgtgtggtt 54017843  T
Q  228 gttctagcctcgatgtggacggtcccc 254  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||    
T  54017842 gttctagcttcgatgtgggcggtcccc 54017816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 50 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 42342296 - 42342092
Alignment:
Q  50 gagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaaca 147  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| | |||||| ||||||||||||||| |||||| ||| ||      
T  42342296 gagcatgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttgttgtgtgcaagtgtgattcatatgttccacatcggataaaagagtaaatgttcaatg 42342197  T
Q  148 ccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggac 247  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  42342196 ccttataagtaagaggactcataaactcattgccttaaggttttgggtaagagtgtggcgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggac 42342097  T
Q  248 ggtcc 252  Q
    |||||    
T  42342096 ggtcc 42342092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 98 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 43346947 - 43346793
Alignment:
Q  98 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  43346947 caagtgtgagttatatgtcccacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagaacccataaactcattgccttaaggttttgggtaa 43346848  T
Q  198 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 252  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  43346847 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctctatgtggacggtcc 43346793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 42 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 21832554 - 21832345
Alignment:
Q  42 ttgagggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggt 141  Q
    |||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||    
T  21832554 ttgatggggagcatgatgaatagatggactcacacttgaggcggagtgtta-tgtgcaagtgtgagttatatgtcccacattggatagaaaagtaaaggt 21832456  T
Q  142 tgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgat 241  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21832455 tgaacaccttataagtaagaggactcataaactcatagccttaaggttttgggtaaga--gtggcgtctctcttgcttgtctggttgttctagcctcgat 21832358  T
Q  242 gtggacggtcccc 254  Q
    |||||| ||||||    
T  21832357 gtggacagtcccc 21832345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 46 - 248
Target Start/End: Original strand, 15773140 - 15773346
Alignment:
Q  46 gggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttg 143  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||    
T  15773140 gggggagcacgataaagtgatggactcacacttgagggggagtgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcgaataaaagagtaaaagttg 15773239  T
Q  144 aacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctct--cttgcttgtgtggttgttctagcctcgat 241  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15773240 aacatcttataagtaagaggactcataagctcattgccttaaagttttgggtaagagtgtgatgtctcttgcttgcttgtgtggttgttctaacctcgat 15773339  T
Q  242 gtggacg 248  Q
    |||||||    
T  15773340 gtggacg 15773346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 98 - 254
Target Start/End: Original strand, 35946524 - 35946680
Alignment:
Q  98 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  35946524 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaacagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccgttgccttaaggttttgggtaa 35946623  T
Q  198 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 254  Q
     ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  35946624 aagtgtggtgtctctcttgcttgtgcaattgttctagcctcgatgtggacggtcccc 35946680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 98 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 37991133 - 37990978
Alignment:
Q  98 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 197  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  37991133 caagtgtgagttatatgtctcacattggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacctataaactcatcgccttaaggttttgggtaa 37991034  T
Q  198 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccc 253  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37991033 gagtgtggtgtctctcttgcttatgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccc 37990978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 45 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 41359971 - 41359765
Alignment:
Q  45 agggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggtt 142  Q
    |||| ||||| ||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||  || ||||||||||||||||    ||||||||||||| |||||||||||||    
T  41359971 agggagagcatgatgaatagatg-actcacacttaagggggagtgttgttgtgtgcaagtgtgagttat----cccacatcggatacaatagtaaaggtt 41359877  T
Q  143 gaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatg 242  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  41359876 gaataccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagaatgtggcgtctctctcgcttgtgtggttgttctagcctcgatg 41359777  T
Q  243 tggacggtcccc 254  Q
    ||| ||||||||    
T  41359776 tgggcggtcccc 41359765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 96 - 252
Target Start/End: Original strand, 15772854 - 15773010
Alignment:
Q  96 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 195  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |    
T  15772854 tgcaagtgtgagttatatgtcccatatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgctttaaggttttggat 15772953  T
Q  196 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 252  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15772954 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctaacctcgatgtggacggtcc 15773010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 47 - 237
Target Start/End: Original strand, 4823606 - 4823796
Alignment:
Q  47 ggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaac 146  Q
    |||||||||| | || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  4823606 ggggagcacgttaaagtgatggactcacacttgaaggggagtgttggtttgcaagtgtgagttataagtctcacatcggataaaatagtaaaagttaaac 4823705  T
Q  147 accttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcct 237  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||| || || |||||||||||    
T  4823706 accttataagtaggaggacccataaactcattgccttaagattttgggtaagagtgtggtgtcttttttgcttatgcggatgttctagcct 4823796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 96 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 29645060 - 29644902
Alignment:
Q  96 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 195  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  29645060 tgcaagtgtaagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttaaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgtcttaaggttttgggt 29644961  T
Q  196 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 254  Q
    |||||||||| ||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  29644960 aagagtgtggcgtctctcttgcttatgcggttgttttagcctcgatgtggacggtcccc 29644902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 96 - 254
Target Start/End: Original strand, 32589704 - 32589861
Alignment:
Q  96 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 195  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32589704 tgcaagtgtgagt-atatgtcccacataagataaaataataaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 32589802  T
Q  196 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 254  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  32589803 aagagtgcgatgtctctcttgcttgtgtggttgttctaggctcgatgtggacggtcccc 32589861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 96 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 33803410 - 33803252
Alignment:
Q  96 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 195  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  33803410 tgcaattgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccatataagtaagaggacccataaacccattgcattaaggtattgggt 33803311  T
Q  196 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 254  Q
    |||||||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33803310 aagagtgtggcgtctccctctcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 33803252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 87 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 39935124 - 39934963
Alignment:
Q  87 gtgttggtttgcaagtgtgag--ttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgcctta 184  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  39935124 gtgttggtttgcaagtgtgagagttatatgtcctacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggatccataaacccattgcctta 39935025  T
Q  185 aggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgga 246  Q
    | |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39935024 aagttttgagtaagagtgtgatgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgga 39934963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 46 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 29644792 - 29644581
Alignment:
Q  46 gggggagcacgatgaattgatggactcacacttgaggggga---gtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggtt 142  Q
    ||||||||||||| || ||||| | |||||||||||||||    || || || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  29644792 gggggagcacgataaagtgatgaagtcacacttgaggggggaatgtttttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggattaaagagtaaaggtt 29644693  T
Q  143 gaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatg 242  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||| |||| ||||||    
T  29644692 gaacaccttataagtaagagaacccataaacccattgtcttaaggttttgggtaagagtgtggcgtctctcttgcttatgcggttgttttagcttcgatg 29644593  T
Q  243 tggacggtcccc 254  Q
    |||| |||||||    
T  29644592 tggatggtcccc 29644581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 26 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 32462790 - 32462558
Alignment:
Q  26 aagtaagagcttctgcttga-gggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttg--caagtgtgagttatatgtcccacat 122  Q
    ||||||||||||  |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||||||||||    
T  32462790 aagtaagagctttcgcttgaagggggagcatgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacat 32462691  T
Q  123 cggataaaatagtaaa-ggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgt 221  Q
    || || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||    
T  32462690 cgaatgaaagagtaaaaggttgaacaccttataagtaagatgatccataaacctattgctttaaggttttggataagagtgtggggtctctcttgtttgt 32462591  T
Q  222 gtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 254  Q
    | | ||||| |||||||||||| ||||| ||||    
T  32462590 gggattgttttagcctcgatgtagacggccccc 32462558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 96 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 12114720 - 12114562
Alignment:
Q  96 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 195  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12114720 tgcaagtgtaagttatatatcccacatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgtcttaaggttttgggt 12114621  T
Q  196 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 254  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  12114620 aagagtgtggtgtctctcttacttgtgcggttgttctagccacgatgtggtcggtcccc 12114562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 96 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 42342546 - 42342388
Alignment:
Q  96 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 195  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  42342546 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatccgataaaagagtaaaggttcaacaccttataagtaagaggacccataaatccattgtcttaaggttttgggt 42342447  T
Q  196 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 254  Q
    |||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  42342446 aagagtgtgacgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcaatgtggacggtcccc 42342388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 96 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 54018356 - 54018198
Alignment:
Q  96 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 195  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||    
T  54018356 tgcaagtgtgagttatatgtcctgcatcggataaaagagtaaagattgaacaccttataagtaagaggacccataaacctaacgccttaaggttttgggt 54018257  T
Q  196 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 254  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  54018256 aagagtgtggtgtctctcatgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgggcggtcccc 54018198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 61 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 22304143 - 22303963
Alignment:
Q  61 attgatggactcacacttgagggggagtgttggtttg--caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagta 158  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||| | ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||       ||||||||||    
T  22304143 attgatggactcacacttgagggagaatgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacatcagataaaatagtaaaggt-------cttataagta 22304051  T
Q  159 agaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgga 246  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22304050 agcggacccataaacccattgccttaaggttttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgagtggttgttctagcctcgatgtgga 22303963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 88 - 245
Target Start/End: Original strand, 39389062 - 39389219
Alignment:
Q  88 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 187  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  39389062 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcctacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttaaaactaagaggacccataaacccattgtcttaagg 39389161  T
Q  188 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgg 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||   |||||||||||| |||||||    
T  39389162 ttttgggtaagagtgtggtgtctcttttgcctgtgcaattgttctagccttgatgtgg 39389219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 34 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 3135293 - 3135099
Alignment:
Q  34 gcttctgcttgagggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtt-tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaat 132  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||| ||| || |   ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3135293 gcttccgctagagggggagcacgatgaattgatg-actcacacttgatggtgagtgtttgttgtgtacaagtgagttatatgtcccacatcggataaaat 3135195  T
Q  133 agtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttg 228  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3135194 agtaaatgttgaacaccttataagtaaaagaacccataaacccactgccataaggttttgagtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttg 3135099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 96 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 25739583 - 25739425
Alignment:
Q  96 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||    
T  25739583 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaagttgaacatcatataagtaagaggacccataaactcattgcttttaggttttgggt 25739484  T
Q  196 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 254  Q
    |||||||||  |||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  25739483 aagagtgtgacgtctctctagcttgtgcggtagttctagcctcgatgtggacggtcccc 25739425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 98 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 32463057 - 32462903
Alignment:
Q  98 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaa-ggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggta 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  32463057 caagtgtgagttatatgtcccacatcggatagaagagtaaaaggttgaataccttataagtaagaagactcataaacccattgccttaaggttttgagta 32462958  T
Q  197 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtc 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  32462957 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtgtacggtc 32462903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 98 - 254
Target Start/End: Original strand, 52634678 - 52634833
Alignment:
Q  98 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52634678 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaacagtaaaggttgaacgccttataagtaagag-acccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 52634776  T
Q  198 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 254  Q
    |||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| ||| ||||||    
T  52634777 gagtgtgacgtctctcttgcttgtgcagttgttctagccttgatgtagactgtcccc 52634833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 88 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 50612618 - 50612447
Alignment:
Q  88 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccata-----aacccattgcct 182  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||     |||  |||  ||    
T  50612618 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaagattgaacaccttataagtaagaggactcataaatctaacatattatct 50612519  T
Q  183 taaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 254  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| | |||||| |||||||||||||    
T  50612518 taaggttttgggtaagagtgtgatgtctctcttgcttgagtggttgttccatcctcgacgtggacggtcccc 50612447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 19 - 253
Target Start/End: Original strand, 11661871 - 11662108
Alignment:
Q  19 acatgcaaagtaaga-gcttctgcttgagggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgt 115  Q
    ||||||||||||| | ||||| |||  ||| |||||||||| || ||||||||||||||||  ||||||||||||  || || |||||||||||| |||     
T  11661871 acatgcaaagtaaaaagcttccgctctaggaggagcacgataaagtgatggactcacacttttgggggagtgttgttgtatgtaagtgtgagttaaatgc 11661970  T
Q  116 cccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg-ttttgggtaagagtgtggtgtctctct 214  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||| | |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||     
T  11661971 cccacattggataaaagagtaaaggttgaacaccttaaaagtgagaggcctcataaaccaattgccttaaggtttttgggtaagagtgaggtgtctctc- 11662069  T
Q  215 tgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccc 253  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  11662070 tcattgtgtggttgttctagcctcgatgtgaacagtccc 11662108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 26 - 247
Target Start/End: Original strand, 9240079 - 9240300
Alignment:
Q  26 aagtaagagcttctgcttgagggg-gagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcg 124  Q
    ||||||||| ||| |||||||||| |||||  | |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  9240079 aagtaagagtttccgcttgaggggagagcataacgaatggatggactcacacttgaggaggagtgttg-tgtgcaagtgtgagttatatgttccacatcg 9240177  T
Q  125 gataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtg 224  Q
    |||| |  |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| || ||||| ||||||||||||||   | ||| |    
T  9240178 gatagagaagtaaaagctgaacaccttataagtaagaggacccataaatccattaccttaagatttcggataagaatgtggtgtctctctcaatagtgcg 9240277  T
Q  225 gttgttctagcctcgatgtggac 247  Q
    ||| |||||||||||||||||||    
T  9240278 gttattctagcctcgatgtggac 9240300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 96 - 254
Target Start/End: Original strand, 53577364 - 53577522
Alignment:
Q  96 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 195  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| || |||| ||| ||||||||  ||||||||||||| ||||||    
T  53577364 tgcaagtgtgagttatatgtcacacatcggataaaacagtaaaggttgaacatcttaaaaataagtggatccataaacatattgccttaaggtcttgggt 53577463  T
Q  196 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 254  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  53577464 aagagtgtggtgtctctcttgcaagtgtggttgttctagcctcggtgtggatggtcccc 53577522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 96 - 254
Target Start/End: Original strand, 31190017 - 31190167
Alignment:
Q  96 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 195  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||        |||||||||||||||||    
T  31190017 tgcaagtgtgagtgatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagttagaggacccata--------gccttaaggttttgggt 31190108  T
Q  196 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  31190109 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtcgggttgttctagcctcgatttggacgctcccc 31190167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 98 - 254
Target Start/End: Original strand, 25755396 - 25755552
Alignment:
Q  98 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 197  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||| | ||| ||| |||||||    
T  25755396 caagtgtgagttatatgtctcacatcagataaaagagtaaaggttgaataccttataagtaagaggactcataaatccattgtcctaaagttgtgggtaa 25755495  T
Q  198 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 254  Q
     ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  25755496 aagtgtggcgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtcccc 25755552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 96 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 45395811 - 45395656
Alignment:
Q  96 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 195  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  45395811 tgcaagtgtaagttatatatcccacatcgaataaaagagtaaaggttaaacacgttataagtaagaggatccataaacccattgtcttaatgttttgggt 45395712  T
Q  196 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtc 251  Q
    |||||||||||||||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  45395711 aagagtgtggtgtctctctcacttgtggggttgctctagcctcgatgtggagggtc 45395656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 98 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 3135617 - 3135454
Alignment:
Q  98 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataa-----gtaagaggaccc--ataaacccattgccttaaggttt 190  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||| |||||||||||||| |     ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  3135617 caagtgtgagttatatgtcccacctcagataaaagagtaaaagttgaacaccttattatattagtaagaggacccccataaacccattgccttaaggttt 3135518  T
Q  191 tgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 254  Q
    | | |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3135517 tagataagagtgtggtgtctcttttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 3135454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 96 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 1634473 - 1634315
Alignment:
Q  96 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaa-ggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttggg 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1634473 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggatagaaaaataaaaggttaaacacattataagtaagaggacccataaacccattggcttaaggttttggg 1634374  T
Q  195 taagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 254  Q
    |||||||| ||| |||||||  | | | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1634373 taagagtgcggtatctctctcac-tatatggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 1634315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 58 - 151
Target Start/End: Original strand, 22304208 - 22304301
Alignment:
Q  58 tgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacacctt 151  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22304208 tgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacacctt 22304301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 98 - 254
Target Start/End: Original strand, 45901715 - 45901872
Alignment:
Q  98 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaa-ggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggta 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||| ||||    
T  45901715 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagaaaaaaaggttgaacaccttataagtaagaggacgcataaactcatggccttaaagtttttggta 45901814  T
Q  197 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 254  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |  |||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  45901815 agagtgtggtgtctctcttacttatagggttgttctaacttcgatgtggacggtcccc 45901872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 97 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 53118131 - 53117975
Alignment:
Q  97 gcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggta 196  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||  || ||||||||||||||||| |||||||||    
T  53118131 gcaagtgtgagttatatgttccatatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtgagaggattca-aaacccattgccttaagattttgggta 53118033  T
Q  197 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 254  Q
    ||||||| ||||||||||  |  |||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  53118032 agagtgtagtgtctctctcacaagtgtggttgttctagcatcgatgtgaacggtcccc 53117975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 96 - 243
Target Start/End: Original strand, 39914252 - 39914399
Alignment:
Q  96 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 195  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||  |||||| |    
T  39914252 tgcaagtgtgagttatatgtctcacatcagataaaacagtagaggttgaacaccttataaataagaggacccataaacctaatgccttaatattttggat 39914351  T
Q  196 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgt 243  Q
    |||||||||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||||||    
T  39914352 aagagtgtggtgtctctctcacttatgcggttgttctagcctcgatgt 39914399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 96 - 254
Target Start/End: Original strand, 8327904 - 8328066
Alignment:
Q  96 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 195  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| | |||||||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  8327904 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggatgaatatcttataagtaagagaacccataaacgtaatgccttaaggttttgggt 8328003  T
Q  196 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtg----gttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 254  Q
    |||||||||||||||||||  |  ||| |    |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  8328004 aagagtgtggtgtctctctcacaagtgagtgcagttgttctagcctcgatgtggacgctcccc 8328066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 88 - 254
Target Start/End: Original strand, 37726496 - 37726654
Alignment:
Q  88 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 187  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||        | |||||||||| |||    
T  37726496 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaatagtaaatgttgaataccttataagtaagagg--------atccattgcctttagg 37726587  T
Q  188 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 254  Q
    |||||| ||||||||||  || | |||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37726588 ttttggataagagtgtgacgtttatcttacttgtatagttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 37726654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 98 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 49336843 - 49336694
Alignment:
Q  98 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 197  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||    
T  49336843 caagtgtgagttacatgtctcacatcggatagaaaagtaaaggttgaccaccttataagtaagaggacccataaacccatagtcttaaagttctgggtaa 49336744  T
Q  198 gagtgtggtgtctctc-ttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgga 246  Q
    |||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||| |||| |||||||    
T  49336743 gagtgtggtgtctctctttttttgtgcggttgttctatcctcaatgtgga 49336694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 88 - 250
Target Start/End: Original strand, 51886553 - 51886709
Alignment:
Q  88 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 187  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||      |    
T  51886553 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtctcacatcgaataaaatagtaaaggttgaacatcatataagtaagaggacccataaactcattgc------g 51886646  T
Q  188 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt 250  Q
    |||||| |||||||||| ||||||| ||||  ||||| ||||||||  ||||||||| |||||    
T  51886647 ttttggataagagtgtgatgtctcttttgcaagtgtgattgttctaatctcgatgtgaacggt 51886709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 96 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 44160702 - 44160547
Alignment:
Q  96 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 195  Q
    ||||||||| ||||||||||  || || |||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  44160702 tgcaagtgtcagttatatgtttcatattggataaaacaataaaggttgaacaccttataaataagaggatccataaacccattgtcttaaggtttt-ggt 44160604  T
Q  196 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 254  Q
    |||| ||||| ||||||||| ||  || | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  44160603 aagaatgtggcgtctctcttact--tgcgattgttctagcctcgatgtggacggtcccc 44160547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 154 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 22303759 - 22303662
Alignment:
Q  154 aagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtc 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| | |||||||||||||||||| |||||||    
T  22303759 aagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtttctcttacttgtgcgattgttctagcctcgatgtagacggtc 22303662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 98 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 33175820 - 33175659
Alignment:
Q  98 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggaccc---ataaacccattgccttaaggttttggg 194  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||   |||||| ||| ||||||||||||||||    
T  33175820 caagtgtgagttatatgtctcacatcagatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagagaacccataataaactcatagccttaaggttttggg 33175721  T
Q  195 taaga--gtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 254  Q
    |||||  |||||  ||||||||  |||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||    
T  33175720 taagagtgtgtgacgtctctctcacttgtgtgattgttctagcctcggtgtgggcagtcccc 33175659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 77 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 47964694 - 47964544
Alignment:
Q  77 ttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaaccca 176  Q
    ||||||| |||||||| | |||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||  ||  ||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||| |    
T  47964694 ttgagggcgagtgttg-tgtgcaagtgtgagttgtatgtcccgcatcggatagaaatgtggaggttgaacgctatataagtgagaggacccataaaccta 47964596  T
Q  177 ttgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttg 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||    
T  47964595 ttgccttaaggttttgggtaagagtgtggcgtctctctcacttgtgtggttg 47964544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 106 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 42584970 - 42584829
Alignment:
Q  106 agttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtgg 205  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||| ||||| | ||||||||||    
T  42584970 agttatatgtcccacatcggatagaagagtaaagattgaacaccttataagtaagaggatccataaaccaattgtcttaagattttgagaaagagtgtgg 42584871  T
Q  206 tgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacgg 249  Q
    |||  ||||| ||| || |||||||||||  || ||||||||||    
T  42584870 tgt--ctcttacttatgcggttgttctagtttcaatgtggacgg 42584829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 85 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 3384435 - 3384317
Alignment:
Q  85 gagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgcctta 184  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| |||| ||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||  | |||||||    
T  3384435 gagtgttggtgtgcaagcgtgagttatatgtcccacatatgataaaacagtataggttaaacactttataaggaagaggacccataaacttaatgcctta 3384336  T
Q  185 aggttttgggtaagagtgt 203  Q
    | |||||||||||||||||    
T  3384335 aagttttgggtaagagtgt 3384317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 122 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 33362425 - 33362327
Alignment:
Q  122 tcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttg 220  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||  || |||||||||||||    
T  33362425 tcggataaaataataaaggttgaataccttataagtaagaggacccataaacccatttccttaagattttgggtaagtgtggcgtctctctcttgcttg 33362327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 96 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 39336387 - 39336232
Alignment:
Q  96 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   |  ||||||||||| |||||||| |||||| |||||||| |||||| |||||||||||| |    
T  39336387 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggatagaaagttggaggttgaacactttataagtgagaggatccataaactcattgctttaaggttttggat 39336288  T
Q  196 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 254  Q
    || |||||  || |||||| ||| ||||||||| ||| |||| |||||||| |||||||    
T  39336287 aatagtgt--tgcctctctcgctcgtgtggttgctct-gcctggatgtggatggtcccc 39336232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 170 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 41359575 - 41359491
Alignment:
Q  170 aaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 254  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  41359575 aaacccataaccttaaggttttgggtaagagtgtggcgtctcttttgcttgtgcggttgttctagcctcaatgtggacggtcccc 41359491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 166 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 54017636 - 54017548
Alignment:
Q  166 ccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||| ||||| | |||||||||||| ||||||||    
T  54017636 ccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctattacttatgtgattgttttggcctcgatgtggtcggtcccc 54017548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 96 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 47965073 - 47964915
Alignment:
Q  96 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 195  Q
    ||||||||||||||||||||   |||||||||| || |||  ||||| ||||   ||||||| ||||| | ||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  47965073 tgcaagtgtgagttatatgttttacatcggatagaaaagtggaggttaaacattatataagtgagagggctcataagcccattgccttaagattttgggt 47964974  T
Q  196 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 254  Q
    |||||||||| ||||||||  ||| | || ||||||| |||| |||||||||| |||||    
T  47964973 aagagtgtggcgtctctctcacttatatgattgttctggcctagatgtggacgttcccc 47964915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 99 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 7767469 - 7767380
Alignment:
Q  99 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggt 188  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||| |||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  7767469 aagtctgagttatatgtcccacatcggatagaaaagtaaaggttggacactttataactaagaggactcataaacccattgtcttaaggt 7767380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 98 - 214
Target Start/End: Original strand, 11661537 - 11661638
Alignment:
Q  98 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||               |||||||||||||||||||    
T  11661537 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaacggttaaacatcttataagtaagagg---------------gccttaaggttttgggtaa 11661621  T
Q  198 gagtgtggtgtctctct 214  Q
    |||||||||||||||||    
T  11661622 gagtgtggtgtctctct 11661638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 99 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 46546480 - 46546375
Alignment:
Q  99 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaag 198  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||  ||  ||  ||||||||||| |||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  46546480 aagtgtgagttatatgtcctacattggattgaaatgtggaggttgaacactttataagttagagaatccataaacccattgccttaaggttttgtgtaag 46546381  T
Q  199 agtgtg 204  Q
    ||||||    
T  46546380 agtgtg 46546375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 96 - 152
Target Start/End: Original strand, 43346650 - 43346706
Alignment:
Q  96 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacacctta 152  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43346650 tgcaagtgtgagttgtatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacacctta 43346706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 138 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 39336086 - 39336000
Alignment:
Q  138 aggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtg 224  Q
    ||||||||||| |||||| | | | ||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  39336086 aggttgaacactttataaatgataagactcataaaatcattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctctcgcttgtgtg 39336000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 138 - 243
Target Start/End: Original strand, 12749211 - 12749316
Alignment:
Q  138 aggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcct 237  Q
    ||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| ||||| |||||||||| | |||||||||||  || ||||| ||| |||||||||||||| ||    
T  12749211 aggttgaacactttataagtgtgaggacccataaaccaattgcattaaggtttttgataagagtgtggactcactcttacttatgtggttgttctagtct 12749310  T
Q  238 cgatgt 243  Q
     |||||    
T  12749311 ggatgt 12749316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 146 - 206
Target Start/End: Original strand, 52634990 - 52635050
Alignment:
Q  146 caccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggt 206  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  52634990 caccttataaataagaggacccataaactcattgccttaagattttgggtaagagtgtggt 52635050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 200 - 253
Target Start/End: Original strand, 8328374 - 8328427
Alignment:
Q  200 gtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccc 253  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8328374 gtgtggtgtctctcttgcttgtggggttgttttagcctcgatgtggacggtccc 8328427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 205 - 254
Target Start/End: Original strand, 22304302 - 22304351
Alignment:
Q  205 gtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 254  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22304302 gtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 22304351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 99 - 228
Target Start/End: Original strand, 25317161 - 25317290
Alignment:
Q  99 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaag 198  Q
    ||||||||||||| ||||||||| | |||  || |||  ||||||| ||| || ||| | |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||     
T  25317161 aagtgtgagttatgtgtcccacaccagatggaaaagtggaggttgagcactttgtaactgagaggacccataaacttgttgccttaaggttttgggtaaa 25317260  T
Q  199 agtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttg 228  Q
    ||||| |||| |||||  ||||||||||||    
T  25317261 agtgtagtgtgtctctcacttgtgtggttg 25317290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 98 - 214
Target Start/End: Original strand, 25991405 - 25991521
Alignment:
Q  98 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 197  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||  |||||  ||| || ||| ||||  |||||||| |||| ||| ||||||| | |||||||||||||||||| |    
T  25991405 caagtgtgagtaatatgtcccacatcaaataaacaagttaatgttaaacattttataagtgagagaacctataaacctaatgccttaaggttttgggtta 25991504  T
Q  198 gagtgtggtgtctctct 214  Q
     |||||||| |||||||    
T  25991505 aagtgtggtctctctct 25991521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 163 - 214
Target Start/End: Original strand, 53596027 - 53596078
Alignment:
Q  163 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 214  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53596027 gacccataaacccgttaccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 53596078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 163 - 214
Target Start/End: Original strand, 53596342 - 53596393
Alignment:
Q  163 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 214  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53596342 gacccataaacccgttaccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 53596393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 151 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 17732007 - 17731950
Alignment:
Q  151 tataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgt 208  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17732007 tataagaaagggaacccataaacccattgccttaaggttttgagtaagagtgtggtgt 17731950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 151 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 19033238 - 19033181
Alignment:
Q  151 tataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgt 208  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19033238 tataagaaagggaacccataaacccattgccttaaggttttgagtaagagtgtggtgt 19033181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 176 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 43978947 - 43978865
Alignment:
Q  176 attgccttaaggttttgggtaag----agtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 254  Q
    |||||||||||||||||||||||    ||||||| ||||||||  |||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  43978947 attgccttaaggttttgggtaagctagagtgtggcgtctctctcacttgtgtgtttgttctaacctcgatgtggactgtcccc 43978865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 163 - 214
Target Start/End: Original strand, 53596542 - 53596593
Alignment:
Q  163 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 214  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  53596542 gacccataaacccattgacttaagattttaggtaagagtgtggtgtctctct 53596593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 178 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 7766857 - 7766783
Alignment:
Q  178 tgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 254  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||   ||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  7766857 tgccttaaggttttaggtaagattgtggcgtctctca--cttgtatggttgttctagcctcgatgtagatggtcccc 7766783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 26 - 85
Target Start/End: Original strand, 8328308 - 8328368
Alignment:
Q  26 aagtaagagcttctgcttga-gggggagcacgatgaattgatggactcacacttgaggggg 85  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8328308 aagtaagagcttccgcttgaagggggagatcgatgcattgatggactcacacttgaggggg 8328368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 163 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 48127906 - 48127859
Alignment:
Q  163 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtct 210  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  48127906 gacccataaacccattgctttaatgttttggataagagtgtggtgtct 48127859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 50 - 92
Target Start/End: Original strand, 52634889 - 52634931
Alignment:
Q  50 gagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttg 92  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  52634889 gagcacgatgaattgattgactcacacttgagggagagtgttg 52634931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 51 - 120
Target Start/End: Original strand, 2299930 - 2300000
Alignment:
Q  51 agcacgatgaattgatggactcacacttgagggggag--tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccac 120  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||   ||||| | |||||||||| ||||||||||||||    
T  2299930 agcatgataaattgatggactcacacttgagggggatattgttg-tgtgcaagtgtgggttatatgtcccac 2300000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 96 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 12747910 - 12747878
Alignment:
Q  96 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggata 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12747910 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggata 12747878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 164 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 16871049 - 16871005
Alignment:
Q  164 acccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgt 208  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  16871049 acccataaactcattgccttaaggttttaggtaagagtgtcgtgt 16871005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 164 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 17735081 - 17735037
Alignment:
Q  164 acccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgt 208  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  17735081 acccataaactcattgacttaaggttttgggtaagagtgcggtgt 17735037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 164 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 19036350 - 19036306
Alignment:
Q  164 acccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgt 208  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  19036350 acccataaactcattgacttaaggttttgggtaagagtgcggtgt 19036306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 163 - 208
Target Start/End: Original strand, 16143505 - 16143550
Alignment:
Q  163 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgt 208  Q
    ||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  16143505 gacccataagctcattgccttaaagttttgggtaagagtgtagtgt 16143550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 167 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 16869884 - 16869843
Alignment:
Q  167 cataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgt 208  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  16869884 cataaactcattgccttaaggttttgagcaagagtgtggtgt 16869843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 101 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 36986101 - 36986040
Alignment:
Q  101 gtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagag 162  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| || ||| ||||||||  || |||||||| ||||    
T  36986101 gtgtgagttatatgtcccacatcgaatagaaaagtgaaggttgagaactttataagtgagag 36986040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 101 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 37011540 - 37011479
Alignment:
Q  101 gtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagag 162  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| || ||| ||||||||  || |||||||| ||||    
T  37011540 gtgtgagttatatgtcccacatcgaatagaaaagtgaaggttgagaactttataagtgagag 37011479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 159 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 50329427 - 50329391
Alignment:
Q  159 agaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 195  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  50329427 agaggacccataaatccaatgccttaaggttttgggt 50329391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 81)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 23 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 44290690 - 44290458
Alignment:
Q  23 gcaaagtaagagcttctgcttga-gggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccaca 121  Q
    ||||||||||||||||  ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44290690 gcaaagtaagagcttccccttgaagggggagcatgatgaatagatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccaca 44290591  T
Q  122 tcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgt 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  44290590 tcggataaaatagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtatggtgtctttcttgcttgt 44290491  T
Q  222 gtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 254  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44290490 acggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 44290458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 19 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 48588724 - 48588491
Alignment:
Q  19 acatgcaaagtaagagcttctgcttgaggggg-agcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcc 117  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||| |||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  48588724 acatgcaaaataagagcttccgcttgaaggggtagcatgatgaatagatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttctatgtcc 48588625  T
Q  118 cacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgc 217  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  48588624 gacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaagacccgtaaattcattgccttaaggttttgggtaagagtgcggtgtctctcttac 48588525  T
Q  218 ttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtc 251  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  48588524 ttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtc 48588491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 19 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 26661760 - 26661522
Alignment:
Q  19 acatgcaaagtaagagcttctgcttgagggg-gagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttg--caagtgtgagttatatgt 115  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||| ||| | ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||    
T  26661760 acatgcaaagtaagagcttccgcttgaagggagagtatgatgaatagatggactcacacttaagggggagtgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgt 26661661  T
Q  116 cccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctctt 215  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  26661660 cccacatcgggtaaaagagtaaaggttgaacaccttataagtgagaggacccataaactcattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctctc 26661561  T
Q  216 gcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 254  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  26661560 gcttgtgtggttgttcaagcctcgatatggacggtcccc 26661522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 46 - 253
Target Start/End: Original strand, 41157323 - 41157532
Alignment:
Q  46 gggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttg 143  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||  || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  41157323 gggggagcacgataaattgatggactcacacttaagggggagtattgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagataaaagagtaaaagttg 41157422  T
Q  144 aacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgt 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41157423 aacaccttataagtaagaggacccataaacccattgcctttaggttttgagtaagagtgtggtgtctgtcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgt 41157522  T
Q  244 ggacggtccc 253  Q
    || |||||||    
T  41157523 gggcggtccc 41157532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 86 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 44290993 - 44290824
Alignment:
Q  86 agtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaa 185  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44290993 agtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaa 44290894  T
Q  186 ggttttgggt-aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 254  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44290893 ggttttgggtaaagagtgtggtgtatctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 44290824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 26 - 246
Target Start/End: Original strand, 34364852 - 34365075
Alignment:
Q  26 aagtaagagcttctgcttgagggggagcacgatgaatt-gatggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacat 122  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||   |||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||| |||||    
T  34364852 aagtaagagcttccgattgagggggagcatgatgaaaaagatggactcacacttgagggggagtgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcacacat 34364951  T
Q  123 cggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtg 222  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  34364952 cggataaaataataaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccatagccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctctcgcttatg 34365051  T
Q  223 tggttgttctagcctcgatgtgga 246  Q
      |||| |||| ||||||||||||    
T  34365052 cagttgctctaacctcgatgtgga 34365075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 26 - 245
Target Start/End: Original strand, 37556038 - 37556260
Alignment:
Q  26 aagtaagagcttctgcttga-gggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttg--caagtgtgagttatatgtcccacat 122  Q
    ||||||||||||  |||||| ||||| ||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||||||||||    
T  37556038 aagtaagagctttagcttgaagggggggcaggataaagtgatggactcacacttgagggggagtgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacat 37556137  T
Q  123 cggataaaa-tagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37556138 cggataaaaatagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggacc-ataaacccatagccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgt 37556236  T
Q  222 gtggttgttctagcctcgatgtgg 245  Q
    |||||||||| |||||||||||||    
T  37556237 gtggttgttcaagcctcgatgtgg 37556260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 88 - 254
Target Start/End: Original strand, 41759475 - 41759641
Alignment:
Q  88 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 187  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||    
T  41759475 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcacacatcggataaaatagtaaaagttgaacaccttataagtaagatgatccataaatccattgccttaagg 41759574  T
Q  188 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  41759575 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttatgtggttgttctagccttgatgtggacggtcccc 41759641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 29 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 22077719 - 22077495
Alignment:
Q  29 taagagcttctgcttgagggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggata 128  Q
    |||||||||| |||||| |||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22077719 taagagcttccgcttgatggggagcatgatgaatacatggactcacacttgagggggagtgttg-tgtgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggata 22077621  T
Q  129 aaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttg 228  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||| || |||||    
T  22077620 gaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcgtagccttaaggttttgggtaagagtgtggcgtctctctcacttatgcggttg 22077521  T
Q  229 ttctagcctcgatgtggacggtcccc 254  Q
    ||| ||| ||||| ||||||||||||    
T  22077520 ttcaagcatcgatatggacggtcccc 22077495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 96 - 254
Target Start/End: Original strand, 41142372 - 41142531
Alignment:
Q  96 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 195  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  41142372 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaacagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggacccataaacccattgccttaaggtttttggt 41142471  T
Q  196 -aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 254  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41142472 aaagagtgtggcgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 41142531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 88 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 3537765 - 3537599
Alignment:
Q  88 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 187  Q
    |||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  3537765 tgttggtttgtacgtgttagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttatgagtaagaggacctataaacccattggcttaagg 3537666  T
Q  188 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 254  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3537665 ttttgggtaagagtgtggcgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 3537599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 30 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 3537372 - 3537226
Alignment:
Q  30 aagagcttctgcttga-gggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggata 128  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3537372 aagagcttccgcttgaagggggagcaagatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggata 3537273  T
Q  129 aaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaaccc 175  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3537272 aaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaaccc 3537226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 96 - 254
Target Start/End: Original strand, 41156991 - 41157149
Alignment:
Q  96 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 195  Q
    ||||||||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  41156991 tgcaagtgtgaattatatgtcccataacggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgctttaaggttttgggt 41157090  T
Q  196 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 254  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  41157091 aagagtgtggtgtctctattgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgggcggtcccc 41157149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 88 - 250
Target Start/End: Original strand, 3550712 - 3550871
Alignment:
Q  88 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 187  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  3550712 tgttggttggcaagtgtgagttatatgtcccacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggactcataaacccattgccttaaag 3550811  T
Q  188 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||   |  |||||||||||||||||||||||||||    
T  3550812 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgc---tacggttgttctagcctcgatgtggacggt 3550871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 69 - 254
Target Start/End: Original strand, 11977251 - 11977438
Alignment:
Q  69 actcacacttgagggggagtgttggtttg--caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacc 166  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||     
T  11977251 actcacacttgagggggagtgttgctgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacatcgggtaaaacagtaaatgttgaacaccttataagtaagagcact 11977350  T
Q  167 cataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 254  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11977351 cataaacctaatgccttaaggttttgggtaagagtgtgatgtctctcttgcaagtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 11977438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 98 - 251
Target Start/End: Original strand, 17294579 - 17294733
Alignment:
Q  98 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17294579 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacactttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 17294678  T
Q  198 gagtgtggtgtctctcttgcttgtg-tggttgttctagcctcgatgtggacggtc 251  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||  ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17294679 gagtgtggtgtctctctcgcttatgcaggttgctctagcctcgatgtggacggtc 17294733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 96 - 254
Target Start/End: Original strand, 29798199 - 29798357
Alignment:
Q  96 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 195  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |    
T  29798199 tgcaagtgtgagttatatgtcctacattggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggactcataaacccattgccttaaggtcttggat 29798298  T
Q  196 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 254  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| | ||||||||||    
T  29798299 aagagtgtggtgtctctcttgcaagtgtggttgttctaacctcgatatagacggtcccc 29798357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 96 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 31767319 - 31767161
Alignment:
Q  96 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 195  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||    
T  31767319 tgcaagtgtgggttatatgttccacatcggataaaacagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccattaacctaatgccttaaggttttgggt 31767220  T
Q  196 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 254  Q
    |||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  31767219 aagagtgtgacgtctatcttgcttgtgtggttgttctagactcgatgtggacggtcccc 31767161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 98 - 254
Target Start/End: Original strand, 34649440 - 34649596
Alignment:
Q  98 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   || ||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  34649440 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtgcaagaacccataaacctaatgccttaaggttttgggtaa 34649539  T
Q  198 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 254  Q
    ||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34649540 gagtgaggcgtctctcttgctagtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 34649596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 87 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 45494146 - 45493974
Alignment:
Q  87 gtgttggtttgcaagtgtgagtt-atatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacacc----ttataagtaagaggacccataaacccattgcc 181  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  45494146 gtgttggtttgcaagtgtgagtttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccatatatataagtaagatgatccataaacccattgcc 45494047  T
Q  182 ttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 254  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  45494046 ttaaagttttggataagagtgtggtgtctctcttccttatgtggttgttcaagcctcgatgtggacggtcccc 45493974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 96 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 5320123 - 5319965
Alignment:
Q  96 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 195  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  5320123 tgcaagtgtgagttatatgttccacatcggatagaaaagtaaaagttgaacaccttataagtgagaggacccataaactcatagccttaaggttttgggt 5320024  T
Q  196 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 254  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  5320023 aagagtgtagtgtctctcttgcttatgtggttgttctagcctcaatgtagacggtcccc 5319965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 104 - 254
Target Start/End: Original strand, 14318875 - 14319025
Alignment:
Q  104 tgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgt 203  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14318875 tgagttatatgttccacgtcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaagacccataaatctattgccttaaggttttgggtaagagtgt 14318974  T
Q  204 ggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 254  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14318975 ggtgtctctcttatttgtgcggttgttctagcctcaatgtggacggtcccc 14319025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 96 - 246
Target Start/End: Original strand, 34364507 - 34364657
Alignment:
Q  96 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 195  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||    
T  34364507 tgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggatccgtaaacccatagccttaaggttttgggt 34364606  T
Q  196 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgga 246  Q
    ||||||||| ||||||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||    
T  34364607 aagagtgtgatgtctctctcgcttatgcggttgctctagcctcgatgtgga 34364657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 88 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 50052189 - 50052024
Alignment:
Q  88 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 187  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||  ||||| |    
T  50052189 tgttggtttttaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggacccataaacctattttcttaaag 50052090  T
Q  188 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  50052089 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgtttatgt-gttgttctaacctcgatgtggacagtcccc 50052024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 97 - 246
Target Start/End: Original strand, 40082408 - 40082556
Alignment:
Q  97 gcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggta 196  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  40082408 gcaagtgtgagttatatgtcctacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagga-tcataaattcattgccttaaggttttgggta 40082506  T
Q  197 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgga 246  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  40082507 agagtgtggtatctctcttgcttgtgcgtttgttctagcctcgatgtgga 40082556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 90 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 32594880 - 32594748
Alignment:
Q  90 ttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggtt 189  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  32594880 ttggtttgcaagtgtgagttatatgtcctacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgtcttaaggtt 32594781  T
Q  190 ttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtg 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  32594780 ttgggtaagagtgtggtgtctctcttacttgtg 32594748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 96 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 3875489 - 3875333
Alignment:
Q  96 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 195  Q
    |||||| || ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  3875489 tgcaagagtcagttatatgtcacacatcggataaaaaagtaaaggttgtacaccttataagtaagaggactcataaacccattgccttaaggttttaggt 3875390  T
Q  196 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 252  Q
    |||| ||||| ||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3875389 aagaatgtggagtctctctcactagtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 3875333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 88 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 32168853 - 32168698
Alignment:
Q  88 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 187  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  32168853 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtccc-----ggataaaatagtaaaggttgaacacctta------agaggacccataaacccattgccttgagg 32168765  T
Q  188 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 254  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  32168764 ttttgggtaagagtgtggcgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacagtcccc 32168698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 29 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 66314 - 66100
Alignment:
Q  29 taagagcttctgcttga-gggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttat-atgtcccacatcgga 126  Q
    |||||||||| |||||| |||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||| || ||||| |||||||||    
T  66314 taagagcttccgcttgatgggggaacatgatgaatagatggactcacacttgaggggaagtgttg-tgtgcaagtgtgagtaatcatgtctcacatcgga 66216  T
Q  127 taaaatagtaaaggtt-gaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtgg 225  Q
    || || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| | |||||   ||||| |||    
T  66215 tagaaaagtaaaggtttgaacaccttataagtaagaggacccataaacctatggccttaaggttttgggtaagagtgtggcgcctctc--acttgtatgg 66118  T
Q  226 ttgttctagcctcgatgt 243  Q
    ||||||| ||||||||||    
T  66117 ttgttctggcctcgatgt 66100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 93 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 38804516 - 38804370
Alignment:
Q  93 gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttg 192  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  38804516 gtttacaagtgtgagttatacgtcccacatcgaataaaagagtaaaggttgaacacattataagtaagaggatccataaacccataaccttaaggttttg 38804417  T
Q  193 ggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcg 239  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  38804416 ggtaagagtgtagtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcg 38804370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 98 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 26662054 - 26661921
Alignment:
Q  98 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 197  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26662054 caagtgtgagttatatatcccatatcagataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtgagaagacccataaaccgattgccttaaggttttgggtaa 26661955  T
Q  198 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttc 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26661954 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttc 26661921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 100 - 254
Target Start/End: Original strand, 9955911 - 9956067
Alignment:
Q  100 agtgtgagttatatgtcccacatcggataaaata-gtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccat-aaacccattgccttaaggttttgggtaa 197  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9955911 agtgtgagttatatgtcccacatcagataaaaaaagtaaaggttgaacacattataagtaagaggacccattaaaccaattgccttaaggttttgggtaa 9956010  T
Q  198 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 254  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||  ||||||||    
T  9956011 gagtgtgatgtctctcttgcttgtgcggttgctctagcctcgatgtgagcggtcccc 9956067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 45 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 30630846 - 30630648
Alignment:
Q  45 agggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttga 144  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||  | ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| | ||||||||      
T  30630846 agggggagcatgatgaattgatggactcacacttgagagggagtgtta-tgtgcaagtgtgatttatatgtctcacatcggataaaaaattaaaggtttg 30630748  T
Q  145 acaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtg 244  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| || ||| || |  ||| |||||||||||| |||||||||||    
T  30630747 acactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgggtaagagtggggcgtccctatcacttatgtggttgttctggcctcgatgtg 30630648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 96 - 254
Target Start/End: Original strand, 45084382 - 45084534
Alignment:
Q  96 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 195  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       | |||||||||||||||    
T  45084382 tgcaagtgtgagttatatctcccacatcggataaaacagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataa------cgtcttaaggttttgggt 45084475  T
Q  196 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 254  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  45084476 aagagagtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctaacctcgatgcggacggtcccc 45084534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 26 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 22077349 - 22077110
Alignment:
Q  26 aagtaagagcttctgcttgagggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcgg 125  Q
    ||||||||||||  ||||||  | ||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22077349 aagtaagagctttcgcttgatagcgagcatgatgaatagatggacacacacttgagggggagtgttg-tgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcgg 22077251  T
Q  126 ata--aaat----------agtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctc 213  Q
    |||  ||||          ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||| |    
T  22077250 atagaaaatcggatagaaaagtaaaggttgaataccttataagtaagaggacccataaactcattgccctaaggttttggataagagtgtgacgtctccc 22077151  T
Q  214 ttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 254  Q
    |  ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22077150 tcacttatgcggttgttcaagcctcgatgtggacggtcccc 22077110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 99 - 245
Target Start/End: Original strand, 37555733 - 37555878
Alignment:
Q  99 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaag 198  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||  |||| || | ||||||||||||||||||||    
T  37555733 aagtgtgagttataagtcccacatcggataaaatagtgaaggttgaatacattataagtaagaggacct-taaatccttagccttaaggttttgggtaag 37555831  T
Q  199 agtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgg 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  37555832 agtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcaagcctcgatgtgg 37555878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 96 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 37850758 - 37850600
Alignment:
Q  96 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||  ||||||||| || |    
T  37850758 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcgcataaaacagtagaggttgaacaccttataagtaagagaacccataaacctaatgttttaaggtttcggat 37850659  T
Q  196 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 254  Q
    |||||||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  37850658 aagagtgtggtgtctctctcacttgtgcggttgctctagcctcgatgtggacggtcccc 37850600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 96 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 24600472 - 24600321
Alignment:
Q  96 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 195  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||  ||||||||||||| || ||||||| ||||| |||||||||||| ||    
T  24600472 tgcaagtgtgagttatatgtcccatatcggatagaaaagtaaaggttgaacatattataagtaagagaactcataaactcattgtcttaaggttttgtgt 24600373  T
Q  196 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggac 247  Q
    ||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  24600372 aagagtgtggtgtctctctcgctagtatggttgttctagcctcgatgtggac 24600321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 96 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 66630 - 66476
Alignment:
Q  96 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 195  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  || |||||||||||||||||    
T  66630 tgcaagtgtgagttatatgttccatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggatccataaacatatggccttaaggttttgggt 66531  T
Q  196 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt 250  Q
    |||||| | | |||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  66530 aagagtatagcgtctctctcgcttgtgcggttgttctagcctcaatgtggacggt 66476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 96 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 39066358 - 39066201
Alignment:
Q  96 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 195  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||| |    
T  39066358 tgcaagtgtgagttatatattccacatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagatgacccataaaatcattgtcttaaggttttggat 39066259  T
Q  196 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 254  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  39066258 aagagtgtggtgtctctcttacttatgtggttgttctagccttgatgt-gacggtcccc 39066201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 96 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 41184583 - 41184489
Alignment:
Q  96 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttt 190  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41184583 tgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaatagtaaaggttgaacactttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttt 41184489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 23 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 50051883 - 50051777
Alignment:
Q  23 gcaaagtaagagcttctgcttga-gggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccaca 121  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50051883 gcaaagtaagagcttctgcttgaagggggagcatgatgaattaatggactcacacttgagggggaatgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccaca 50051784  T
Q  122 tcggata 128  Q
    |||||||    
T  50051783 tcggata 50051777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 96 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 24132143 - 24131994
Alignment:
Q  96 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 195  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  24132143 tgcaactgtgagttatatgtccctcatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataaataaggggatccataaactcattgccttaagg-tttgggt 24132045  T
Q  196 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacg 248  Q
    |  ||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24132044 a--agtgtggtgtctctctcactagtgtggttgttctagcctcgatgtagacg 24131994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 87 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 44043944 - 44043810
Alignment:
Q  87 gtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaa------aggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgc 180  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||      | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  44043944 gtgttggtttgcaagtgt-agttatatgtcccacatcgaataaaatagtaatagtaaatgttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccattgt 44043846  T
Q  181 cttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttg 216  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  44043845 cttaagattttgggtaagagtgtggtgtctctcttg 44043810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 102 - 246
Target Start/End: Original strand, 5575110 - 5575252
Alignment:
Q  102 tgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagt 201  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| || |||||||||||| |||||||    
T  5575110 tgtgaattatatgtcccacgtcggatagaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacctataaatccatagctttaaggttttggataagagt 5575209  T
Q  202 gtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgga 246  Q
    |||| ||||||||  ||| || ||| |||||||||||||||||||    
T  5575210 gtggcgtctctct--cttatgaggtagttctagcctcgatgtgga 5575252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 97 - 248
Target Start/End: Original strand, 22793279 - 22793431
Alignment:
Q  97 gcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaaccca-ttgccttaaggttttgggt 195  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||| |||||||| || |||||||| |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| ||    
T  22793279 gcaagtgtgagttatatgtcccacatcgtatagaaaagtagaggttgaaaactttataagtgagaggatccataaacccatttgccttacggttttgagt 22793378  T
Q  196 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacg 248  Q
    |||||||||  ||||||||| |||||||||||||||| ||||| || ||||||    
T  22793379 aagagtgtgacgtctctcttacttgtgtggttgttctggcctcaatatggacg 22793431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 106 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 5528902 - 5528762
Alignment:
Q  106 agttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtgg 205  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||| ||||  |||||||||||||||||  ||||||    
T  5528902 agttatatgtctcacatcggataaaagagtaaaggttgaacatcttataaataagaggactcataaactcattttcttaaggttttgggtaaatgtgtgg 5528803  T
Q  206 tgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgga 246  Q
     |||||||||  || || |||||||||| ||||||||||||    
T  5528802 cgtctctcttctttatgcggttgttctatcctcgatgtgga 5528762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 98 - 244
Target Start/End: Original strand, 45839629 - 45839779
Alignment:
Q  98 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggtt-----gaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttg 192  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||     ||||||||||||||||||| ||||||||||   | |||||||||||||||    
T  45839629 caagtatgagttatatgtcccacatcggatagaa-aataaaggttgaatcgaacaccttataagtaagaagacccataaatgtaatgccttaaggttttg 45839727  T
Q  193 ggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtg 244  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||    
T  45839728 ggtaagattgtggtgtctctcttgcttgtgggattgttctggcctcgatgtg 45839779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 96 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 22077986 - 22077831
Alignment:
Q  96 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 195  Q
    ||||||||||||||||||||   | |||||||| || | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||    
T  22077986 tgcaagtgtgagttatatgttttaaatcggatagaaaaataaaggttgaacatcttataagtaagaggacccataaactcatagcc-taaggtttggggt 22077888  T
Q  196 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 252  Q
    |||||||||| |||||| |  ||| || |||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  22077887 aagagtgtggcgtctctttcacttatgcggttgttcaagcatcgatgtggacggtcc 22077831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 96 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 19283613 - 19283455
Alignment:
Q  96 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 195  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||  ||||||| ||| || ||| | ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| |    
T  19283613 tgcaagtgtgagttatatgtcccacaccggatagaaaagtggaggttgagcactttgtaaatgagaggacacataaactcatcgccttaaggttttggat 19283514  T
Q  196 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 254  Q
    |||||||||| ||||||||  |||||| ||||| |||||||| |||||||  |||||||    
T  19283513 aagagtgtggcgtctctctcacttgtgcggttgctctagcctggatgtgggaggtcccc 19283455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 167 - 254
Target Start/End: Original strand, 11977015 - 11977102
Alignment:
Q  167 cataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 254  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  11977015 cataaacctaatgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcaagtgcggtagttctagcctcgatgtggacggtcccc 11977102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 96 - 244
Target Start/End: Original strand, 44685456 - 44685605
Alignment:
Q  96 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaagg-ttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttggg 194  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| | ||||||    
T  44685456 tgcaagtgtgagttatatgtcccatatcggatagaaaagtaaaggtttgaaaaccttataagtaagaggaccaataaactcattgccttaatg-tttggg 44685554  T
Q  195 taagagtgtggtgtctctcttgcttgt-gtggttgttctagcctcgatgtg 244  Q
    ||| ||||||  |||| |||  ||||| | ||| |||||| ||||||||||    
T  44685555 taacagtgtgacgtctttctctcttgtgggggtagttctaacctcgatgtg 44685605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 26 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 47380012 - 47379891
Alignment:
Q  26 aagtaagagcttctgcttgaggggg-agcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcg 124  Q
    |||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  47380012 aagtaagaacttccgcttgaggggggagcacgatgaattgttggacttacatttgagggggagtgttg--atgcaagtgtgagttatatatcccacatcg 47379915  T
Q  125 gataaaatagtaaaggttgaacac 148  Q
    |||| || |||  |||||||||||    
T  47379914 gatagaaaagtggaggttgaacac 47379891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 27 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 50469306 - 50469180
Alignment:
Q  27 agtaagagcttctgcttgagggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcgga 126  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| | ||||||| |||  ||| ||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  50469306 agtaagagcttctgcttgaggaggagtatgatgaatagataaactgacact-gagggggagtgttg-tgtgcaagtgtgagttatatgtcctacatcaga 50469209  T
Q  127 taaaatagtaaaggttgaacaccttataa 155  Q
    ||| | |||||||||||||||| ||||||    
T  50469208 taataaagtaaaggttgaacactttataa 50469180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 96 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 21378199 - 21378059
Alignment:
Q  96 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 195  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||                  |    
T  21378199 tgcaagtgtcagttatatgtcccagatcggatagaacagtaaaggttgaatatcttataagtaagaggacccataaaccca------------------t 21378118  T
Q  196 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 254  Q
    |||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21378117 aagagtgtggcgtctatattgcttgtgtggttgttctagcctcaatgtggacggtcccc 21378059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 96 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 1188746 - 1188588
Alignment:
Q  96 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 195  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||| || |||  |||||||| |  |||||||| ||| ||| ||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  1188746 tgcaagtgtgagttatatgttccatatcggatagaaaagtggaggttgaatattttataagtgagaagactcataaactcattgctttaaggttttgggt 1188647  T
Q  196 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 254  Q
    || ||||||| ||||||||  ||| |||||||| |||  ||| ||||||  ||||||||    
T  1188646 aaaagtgtggcgtctctctcacttatgtggttgctctgacctagatgtgtgcggtcccc 1188588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 166 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 50051776 - 50051689
Alignment:
Q  166 ccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 254  Q
    |||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  50051776 ccataaacccattatcttaaggttttgcgtaagagtgtggtgtctctcttgtttatgt-gttgttctagcatcgatgtggacggtcccc 50051689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 30 - 245
Target Start/End: Original strand, 24448212 - 24448426
Alignment:
Q  30 aagagcttctgcttgagggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataa 129  Q
    ||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||   |||||  | |     
T  24448212 aagagctttcgcttgagggaaagcacgatgaattgatgggctcacaattgagggggagtgtt-gtgtgcaagtgtaagttatatgttagacatctcaaag 24448310  T
Q  130 aatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgt 229  Q
    || |||  | ||||||||  |||||||| ||||| | ||||||| ||||| |||||| |||||| ||| ||||||| || |||||  ||| || ||||||    
T  24448311 aaaagtggaagttgaacattttataagtgagagggctcataaactcattgtcttaagattttggataaaagtgtggcgtgtctctcacttatgaggttgt 24448410  T
Q  230 tctagcctcgatgtgg 245  Q
    ||  |||| |||||||    
T  24448411 tcaggcctagatgtgg 24448426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 111 - 253
Target Start/End: Original strand, 44091909 - 44092051
Alignment:
Q  111 tatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtct 210  Q
    |||||| |||||| |||  || |||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| | | |   ||||| || ||||||||||||||| ||||    
T  44091909 tatgtcacacatcagatgtaaaagtaaaggttgaacactttataagtgagagaacccataaatctaatattttaagattgtgggtaagagtgtggcgtct 44092008  T
Q  211 ctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccc 253  Q
     |||  ||||| | |||||||| |||||||||| |||||||||    
T  44092009 ttctcacttgttttgttgttctggcctcgatgtagacggtccc 44092051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 138 - 214
Target Start/End: Original strand, 10351202 - 10351278
Alignment:
Q  138 aggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 214  Q
    ||||||||||| |||||||| |||| |||||||||| |||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  10351202 aggttgaacactttataagtgagagaacccataaacacattactttaagattttgggtaagagtgtggcgtctctct 10351278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 96 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 1187522 - 1187363
Alignment:
Q  96 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 195  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||| ||| || |||  ||||| ||||  |||||||| ||| ||||||||||| |||| ||||||| ||||| ||    
T  1187522 tgcaagtgtgaattatatgtctcacatcgaatataaaagtggaggttaaacattttataagtgagaagacccataaactcattaccttaagattttgagt 1187423  T
Q  196 aagagtgtggtgtctctcttgc-ttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 254  Q
    || ||||||  ||||||||  | || | | ||||||||  ||| ||||||||||||||||    
T  1187422 aaaagtgtgacgtctctctcactttttatagttgttctgacctagatgtggacggtcccc 1187363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 123 - 243
Target Start/End: Original strand, 4956218 - 4956340
Alignment:
Q  123 cggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg--gtgtctctcttgcttg 220  Q
    |||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||  ||| ||||| ||||| ||||||  || | |||||||||||    
T  4956218 cggatagaaaagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggatccataaactcattgctctaaagttttaggtaaaagtgtgacgtctatctcttgcttg 4956317  T
Q  221 tgtggttgttctagcctcgatgt 243  Q
    || | ||| | || |||||||||    
T  4956318 tgcgattgctttaacctcgatgt 4956340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 30 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 41184249 - 41184198
Alignment:
Q  30 aagagcttctgcttgagggggagcacgatgaattgatggactcacacttgag 81  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  41184249 aagagcttccgcttgagggggagcacgatgaagtgatggactcacacttgag 41184198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 179 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 41184486 - 41184408
Alignment:
Q  179 gccttaaggttttgggtaagagtgtggt---gtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |   ||| ||||| |||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  41184486 gccttaaggttttgggtaagagtgtgatattgtcgctcttacttgtgcggttgttccagcctcgatgtcgacggtcccc 41184408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 96 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 35154197 - 35154150
Alignment:
Q  96 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttg 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  35154197 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagataaaagagtaaaggttg 35154150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 96 - 162
Target Start/End: Original strand, 4878803 - 4878869
Alignment:
Q  96 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagag 162  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||  |||||||| ||||    
T  4878803 tgcaattgtgagttatatgttccacatcggataaaatagtgaagcttgaacattttataagtgagag 4878869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 145 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 41184197 - 41184152
Alignment:
Q  145 acaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttt 190  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  41184197 acactttataagtaagaggatccataaacccattgccttaaggttt 41184152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 195 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 4266855 - 4266798
Alignment:
Q  195 taagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 254  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4266855 taagagtgtgatgtctctcttacttgtg--gttgttctagcctcgatgtgggcggtcccc 4266798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 151 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 35154106 - 35154046
Alignment:
Q  151 tataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctc 211  Q
    ||||||||||||| |||||||||  |||| ||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  35154106 tataagtaagagggcccataaactgattgtcttaaggtttttggcaagagtgtggtgtctc 35154046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 3537562 - 3537495
Alignment:
Q  16 gacacatgcaaagtaa-gagcttctgcttga-gggggagcacgatgaattgatggactcacacttgag 81  Q
    ||||||||||| |||| ||||||| |||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  3537562 gacacatgcaaggtaaagagcttccgcttgaagggggagcatgatgatttgatggactcacacttgag 3537495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 167 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 47380254 - 47380167
Alignment:
Q  167 cataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 254  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||  ||||| |||||| || ||||| |||||||  |||||||    
T  47380254 cataaactcattgccttaaagttttgggtaagagtgtgacatctctctcacttgtctggttgctcaagcctagatgtgggtggtcccc 47380167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 26 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 1188457 - 1188392
Alignment:
Q  26 aagtaagagcttctgcttgagggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttg 92  Q
    |||||||||||||  ||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  1188457 aagtaagagcttccacttgaaggg-agcatgatgaattgatggactcacacttgaggatgagtgttg 1188392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 96 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 5997029 - 5996872
Alignment:
Q  96 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 195  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||  | || || |||   | |||||||  |||||| | |||||| ||||| | ||||||  ||||||||||| ||    
T  5997029 tgcaagcgtgggttatatgtcccacataagttagaaaagtggtgcttgaacattttataaatgagaggatccatatatccattgt-ttaaggttttgagt 5996931  T
Q  196 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 254  Q
     ||||||||||||||||||   ||||||||||| |||||||  ||||||| | ||||||    
T  5996930 gagagtgtggtgtctctctcatttgtgtggttgctctagccgagatgtgggcagtcccc 5996872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 88 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 4266948 - 4266875
Alignment:
Q  88 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaga 161  Q
    ||||| ||| ||| |||||||||||||||| ||||  ||||||| |||||| ||||||||| ||| ||||||||    
T  4266948 tgttgttttacaaatgtgagttatatgtcctacattagataaaagagtaaatgttgaacacattagaagtaaga 4266875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 137 - 253
Target Start/End: Original strand, 9499020 - 9499136
Alignment:
Q  137 aaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcc 236  Q
    |||||||||||  ||||| || ||| |||| |||||  |||| |||| |  |||||| ||| ||||||||||| || || |||||||||||||| || ||    
T  9499020 aaggttgaacattttatatgttagatgacctataaattcattaccttcaaattttggataaaagtgtggtgtcacttttacttgtgtggttgttttatcc 9499119  T
Q  237 tcgatgtggacggtccc 253  Q
    |  ||||||||||||||    
T  9499120 tatatgtggacggtccc 9499136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 178 - 214
Target Start/End: Original strand, 12466365 - 12466401
Alignment:
Q  178 tgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 214  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12466365 tgccttaaggtttttggtaagagtgtggtgtctctct 12466401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 105 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 30630972 - 30630912
Alignment:
Q  105 gagttatatgtcccacatcggataaaatagt-aaaggttgaacaccttataagtaagagga 164  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||| | | ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  30630972 gagttatatgtcttacatcggataaaaaaattaaaggctgaacaccttataagtaagagga 30630912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 50 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 47380323 - 47380258
Alignment:
Q  50 gagcacgatgaattgatggactcacacttgagggg--gagtgttggtttgcaagtgtgagttatatg 114  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  || |||| || |||||||||||||||||||    
T  47380323 gagcatgatgaattgatggattcacacttgaggggaagattgtt-gtgtgcaagtgtgagttatatg 47380258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 169 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 9956258 - 9956212
Alignment:
Q  169 taaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctctt 215  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9956258 taaacacattgtcttaatgttttgggtaagagtgtgatgtctctctt 9956212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 178 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 31973411 - 31973375
Alignment:
Q  178 tgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 214  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  31973411 tgccttaagattttgggtaagagtgtgatgtctctct 31973375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 96 - 232
Target Start/End: Original strand, 50556451 - 50556587
Alignment:
Q  96 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 195  Q
    |||||||||| ||||||| || ||||||  ||| || ||   ||||||||||  |||||||| |||| | || |||||| |||  ||||||||||||  |    
T  50556451 tgcaagtgtgggttatatatcacacatcatatagaaaagcggaggttgaacaatttataagtgagagaatccgtaaacctattttcttaaggttttgaat 50556550  T
Q  196 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttct 232  Q
    || ||| |||| |||||||  |||||||| |||||||    
T  50556551 aaaagtttggtatctctctcacttgtgtgattgttct 50556587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 181; Significance: 7e-98; HSPs: 74)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 7e-98
Query Start/End: Original strand, 16 - 225
Target Start/End: Original strand, 7553943 - 7554154
Alignment:
Q  16 gacacatgcaaagtaagagcttctgcttgagggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatat 113  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||    
T  7553943 gacacatgcaaagtaagagcttccgcttgagggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttgttgtgtgcaagtgtgagttatat 7554042  T
Q  114 gtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctc 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7554043 gtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggatccataaacccatagccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctc 7554142  T
Q  214 ttgcttgtgtgg 225  Q
    | ||||||||||    
T  7554143 tcgcttgtgtgg 7554154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 19 - 251
Target Start/End: Original strand, 14681431 - 14681663
Alignment:
Q  19 acatgcaaagtaagagcttctgcttga--gggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtc 116  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14681431 acatgcaaagtaagagcttccgcttgaaggggggagcatgatgaatagatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtaagttatatgtc 14681530  T
Q  117 ccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttg 216  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||       
T  14681531 ccacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttgtaagtaagagggcccataaacccattgtcttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctca-- 14681628  T
Q  217 cttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtc 251  Q
    |  |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14681629 caagtgtggttgttctagccttgatgtggacggtc 14681663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 63 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 37533201 - 37533011
Alignment:
Q  63 tgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagag 162  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37533201 tgatggactcacgcttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacattggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagag 37533102  T
Q  163 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 254  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  37533101 gacccataaactcattgccttaaggttttgggtaa-agtgtggtgtctctcttgcttgtgcgcttgttctaacctcgatgtggacggtcccc 37533011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 96 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 1085774 - 1085616
Alignment:
Q  96 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1085774 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacactttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 1085675  T
Q  196 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 254  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1085674 aagagtgtggcgtctctcttacttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 1085616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 48 - 254
Target Start/End: Original strand, 30244220 - 30244428
Alignment:
Q  48 gggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttg--caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaa 145  Q
    ||||||| ||||| | |||| |||||||||||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  30244220 gggagcatgatgactagatgaactcacacttgagggggagtgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaa 30244319  T
Q  146 caccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgg 245  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  30244320 gaccttataagtaagaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctctcacttgtgtggttgttcaagcctcgatgtgg 30244419  T
Q  246 acggtcccc 254  Q
    | |||||||    
T  30244420 atggtcccc 30244428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 45 - 254
Target Start/End: Original strand, 30245024 - 30245231
Alignment:
Q  45 agggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttg--caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggtt 142  Q
    |||||||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  30245024 agggggagcatgatgattagatggactcgcacttgagggggagtgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgttccacatcggataaaagagtaaaggtt 30245123  T
Q  143 gaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatg 242  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||| ||||||||||    
T  30245124 gaacaccttataagtaagacgacccataaactcattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctct----cttgtgtggttgttcaagcctcgatg 30245219  T
Q  243 tggacggtcccc 254  Q
    |||| |||||||    
T  30245220 tggatggtcccc 30245231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 96 - 254
Target Start/End: Original strand, 7517580 - 7517738
Alignment:
Q  96 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 195  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7517580 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 7517679  T
Q  196 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 254  Q
    ||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  7517680 aagagtgtggtgtctgtctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgtgggtggtcccc 7517738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 96 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 23535 - 23377
Alignment:
Q  96 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 195  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23535 tgcaattgtgagttatatgttccacatcggatacaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacctattgccttaaggttttgggt 23436  T
Q  196 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 254  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23435 aagagtgtggtgtctctcttgcatgtgcggttgttctagcctcgatttggacggtcccc 23377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 88 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 37533530 - 37533364
Alignment:
Q  88 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 187  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||| | |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  37533530 tgttgatttgtaagtgtgagttatatgttctacattgaataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaatccattgccttaagg 37533431  T
Q  188 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37533430 ttttgggtaagagtgtggtgtctcttttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 37533364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 33 - 254
Target Start/End: Original strand, 45434572 - 45434794
Alignment:
Q  33 agcttctgcttga-gggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaa 131  Q
    |||||| |||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||| ||  | || | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  45434572 agcttccgcttgaagggggagcatgatgaattgaaggactcacacttgggggggtgttgttgtgtacaagtgtaagttatatgtcccacatcggataaaa 45434671  T
Q  132 tagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttc 231  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||||||    
T  45434672 aagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacttactgccttaaggttttgggtaagagtgtgatgtctctcttacttgtggagttgttc 45434771  T
Q  232 tagcctcgatgtggacggtcccc 254  Q
    |||||||||||||  ||||||||    
T  45434772 tagcctcgatgtgatcggtcccc 45434794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 90 - 251
Target Start/End: Original strand, 29157559 - 29157720
Alignment:
Q  90 ttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggtt 189  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  29157559 ttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacaccggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagacgacccataaatccattgccttaaggtt 29157658  T
Q  190 ttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtc 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||| || |||||||||||||    
T  29157659 ttgggtaagagtgtggtgtctctcttgctcgtgtagttgctctagtcttgatgtggacggtc 29157720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 103 - 254
Target Start/End: Original strand, 11845198 - 11845349
Alignment:
Q  103 gtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtg 202  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11845198 gtgagttatatgttccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaatccattgccttaaggttttggataagagtg 11845297  T
Q  203 tggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 254  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11845298 tggtgtctctcttgcttgtgcagttgttctagcctcgatgtagacggtcccc 11845349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 98 - 254
Target Start/End: Original strand, 6054562 - 6054718
Alignment:
Q  98 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 197  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6054562 caagtgttagttatatgtctcacatcggataaaatagtaaatgttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgccttaaggttttgggtaa 6054661  T
Q  198 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 254  Q
    |||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6054662 gagtgtggtgtctctcctacttgtatggttgttctagccttgatgtggacggtcccc 6054718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 96 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 40094932 - 40094774
Alignment:
Q  96 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 195  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  40094932 tgcaagtgtgagttatatgtctcacatcgaataaaagagtaaaggttcaacaccttataagtaagaggacccataaacccatcgtcttaaggttttgggt 40094833  T
Q  196 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 254  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  40094832 aagagtgtggcgtctctcttgcttgtgaggttgttctagcctcgatgtggtcggtcccc 40094774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 46 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 22566872 - 22566702
Alignment:
Q  46 gggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttg 143  Q
    ||||||||||||| || |||| |||| ||| ||||||||||||||||  || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22566872 gggggagcacgataaagtgatagactaacatttgagggggagtgttgttgtatgcaagtgtgagtaatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttg 22566773  T
Q  144 aacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctctt 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22566772 aacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtgg-gtctctctt 22566702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 98 - 254
Target Start/End: Original strand, 45433243 - 45433399
Alignment:
Q  98 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 197  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  45433243 caagtgtgagttatatgatccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagagaactcataaacctattgccttaagattttgggtaa 45433342  T
Q  198 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  45433343 gagtgtggtgtctctcttgcttgtggggttgttctagcctcgatgtggtcggtcccc 45433399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 96 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 22567196 - 22567039
Alignment:
Q  96 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 195  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  22567196 tgcaagtgtgagtaatatgtcc-acatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggtttttggt 22567098  T
Q  196 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||| |||||||    
T  22567097 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtggggttgttcgggcctcgatgtggatggtcccc 22567039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 96 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 36939891 - 36939741
Alignment:
Q  96 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 195  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  36939891 tgcaagtgtgagttatatgtcccaaatcgtataaaatagtaaaagttgaacaccttataagtaagaggacccataaatccattgccttaaggttttgggt 36939792  T
Q  196 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgga 246  Q
    || |||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  36939791 aaaagtgtggtgtttctcttgcttatgcggttgttctagcctcgatgtgga 36939741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 98 - 243
Target Start/End: Original strand, 45754718 - 45754862
Alignment:
Q  98 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 197  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  45754718 caagtgtgagttatatgtcc-acatcggataaaatagtaaatgttgaacaccttataagtaagatgactcataaacccatagccttaaggttttgggtaa 45754816  T
Q  198 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgt 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  45754817 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcaagcctcgatgt 45754862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 104 - 244
Target Start/End: Original strand, 19122740 - 19122879
Alignment:
Q  104 tgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgt 203  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19122740 tgagttatatgtcc-acatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggactcataaatccattgccttaaggttttgggtaagagtgt 19122838  T
Q  204 ggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtg 244  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19122839 ggtgtctatcttgcttgtgtggttgttctagtctcgatgtg 19122879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 96 - 254
Target Start/End: Original strand, 24177435 - 24177593
Alignment:
Q  96 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 195  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  24177435 tgcaagtatgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggctgaacaccttataagtaagcggacccataaacccattgccttaaagtttttggt 24177534  T
Q  196 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 254  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||||||||| |||||||||||||    
T  24177535 aagagtgtggcgtctctcttgcttgtgcggttgtcttagcctcgacgtggacggtcccc 24177593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 102 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 34218186 - 34218036
Alignment:
Q  102 tgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagt 201  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  34218186 tgtgagttatatgtctcacatcggataaaaaagtaaatgttgaacaccttataagtgagaggactcataaacccattgtcttaaggttttgggtaagagt 34218087  T
Q  202 gtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 252  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  34218086 gtggtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcc 34218036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 98 - 254
Target Start/End: Original strand, 47129097 - 47129253
Alignment:
Q  98 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 197  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||     
T  47129097 caagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaatagtaaaggttgaacctcttataagtaagaggacccataaacccatcgctttaaggttttgggtag 47129196  T
Q  198 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 254  Q
    |||||||||||||||||  |  ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  47129197 gagtgtggtgtctctctcacaagtgtggttgttctagcctcaatgtagacggtcccc 47129253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 96 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 118459 - 118299
Alignment:
Q  96 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 195  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||    
T  118459 tgcaagtgtaagttatatgtcccacatcagatagaaaagtaaaggttgaacacctaataagtaagaggatccataaacccattaccgtaaggttttgggt 118360  T
Q  196 aagagtgtggtgtc--tctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 254  Q
    |||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  118359 aagagtgtggcgtctatctcttgcttgtgtggttgttctagctttgatgtggacggtcccc 118299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 96 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 8128599 - 8128441
Alignment:
Q  96 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 195  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| || | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |    
T  8128599 tgcaagtgtgagttatatgtcccatatcggatagaaaaataaaggttgaacaccttatatgtaagaggacccataaacccataaccttaaggttttggtt 8128500  T
Q  196 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 254  Q
    |||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||| |||||||| || ||||||    
T  8128499 aagagtgtggtgtcactctcgcttatgtggttgttctagcatcgatgtgaacagtcccc 8128441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 101 - 254
Target Start/End: Original strand, 30032572 - 30032725
Alignment:
Q  101 gtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagag 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  30032572 gtgtgagttatatgtcccacatcgaataaaagagtaagtgttgaacaccttataagtaagagtatccataaacctatagccttaaggttttgggtaagag 30032671  T
Q  201 tgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 254  Q
    ||||   ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  30032672 tgtgacatctctcttgcttgtgcggttgttctatcctcgatgtggacggtcccc 30032725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 96 - 253
Target Start/End: Original strand, 36622960 - 36623117
Alignment:
Q  96 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  36622960 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttaaacattttataagtaggaggatccataaatccattgccttaaggttttgggt 36623059  T
Q  196 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccc 253  Q
    | |||| ||||| ||||||| |||||||| |||||||  ||| |||||||||||||||    
T  36623060 aggagtatggtgcctctcttacttgtgtgattgttctgaccttgatgtggacggtccc 36623117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 99 - 252
Target Start/End: Original strand, 9901648 - 9901799
Alignment:
Q  99 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaag 198  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  9901648 aagtgtgagttatatgtcc-acatcggataaaacagtaaaggttgaacatcttatacgta-gaggatccataaactcattgtcttaaggttttgggtaag 9901745  T
Q  199 agtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 252  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  9901746 agtgtggtgtctctcttgctagtgcggttgttctagcctcggtgtggactgtcc 9901799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 26 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 1085482 - 1085280
Alignment:
Q  26 aagtaagagcttctgcttgaggggg-agcacgatgaattgatggac--tcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttat-atgtccca 119  Q
    |||||||||||||  ||||| |||| |||| ||||||  |||||||  |||||||||| |||||||||||  || |||||||||||||| | ||||||||    
T  1085482 aagtaagagcttccccttgaaggggtagcatgatgaaaagatggacactcacacttgaaggggagtgttgttgtgtgcaagtgtgagtttttatgtccca 1085383  T
Q  120 catcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgctt 219  Q
     |||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  1085382 tatcggataaaatagtaaaagttgaacaactcataagtaagagaacccataaactcattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtttctcttcctt 1085283  T
Q  220 gtg 222  Q
    |||    
T  1085282 gtg 1085280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 96 - 216
Target Start/End: Original strand, 16569196 - 16569316
Alignment:
Q  96 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 195  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16569196 tgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggatagaacagtaaaggttgaataccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggtttttggt 16569295  T
Q  196 aagagtgtggtgtctctcttg 216  Q
    ||||||| |||||||||||||    
T  16569296 aagagtgcggtgtctctcttg 16569316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 96 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 16596466 - 16596346
Alignment:
Q  96 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 195  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16596466 tgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggatagaacagtaaaggttgaataccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggtttttggt 16596367  T
Q  196 aagagtgtggtgtctctcttg 216  Q
    ||||||| |||||||||||||    
T  16596366 aagagtgcggtgtctctcttg 16596346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 96 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 40230449 - 40230295
Alignment:
Q  96 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 195  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  40230449 tgcaagtgtaagttatatgtcccacatcgaataaaaaagtaaaagttgaacatcttataagtaagaggacccataaacccatagtcttaaggttttgggt 40230350  T
Q  196 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt 250  Q
    || ||| |||||||||||||||  |||| ||| ||||| |||| |||||||||||    
T  40230349 aaaagtctggtgtctctcttgcaagtgtagttattctaacctctatgtggacggt 40230295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 99 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 24838857 - 24838724
Alignment:
Q  99 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaga-ggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 197  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  24838857 aagtgtaagttatatgtctcacatcgaataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaaggatccataaacccgttgtcttaaggttttgggtaa 24838758  T
Q  198 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttc 231  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  24838757 gagtgtgacgtctctcttgcttgtgtggttgttc 24838724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 26 - 166
Target Start/End: Original strand, 30244628 - 30244771
Alignment:
Q  26 aagtaagagcttctgcttgagggggagcacgatgaatt-gatggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacat 122  Q
    ||||||||||||| |||| | |||||||| ||||||   |||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||    
T  30244628 aagtaagagcttccgcttcaaggggagcatgatgaaaaagatggactcacacttgagggggagtgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacat 30244727  T
Q  123 cggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacc 166  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  30244728 tggataaaagagtaaaggttgaacaccttataaataagaggacc 30244771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 99 - 251
Target Start/End: Original strand, 20599317 - 20599471
Alignment:
Q  99 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggta-- 196  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | ||||| |||||| |||||||||  |||||| ||||||||||| ||||||||||      
T  20599317 aagtgtgagttatatgtcccatatcggataaaaaagtaaaggataaacactttataaataagaggacatataaactcattgccttaacgttttgggtaag 20599416  T
Q  197 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtc 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| |||||| ||||||    
T  20599417 agagtgtggtgtctctcttgcttgtatggttgttttaaccttgatgtgaacggtc 20599471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 26 - 169
Target Start/End: Original strand, 30245421 - 30245567
Alignment:
Q  26 aagtaagagcttctgcttgagggggagcacgatgaatt-gatggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacat 122  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||   || |||| ||||||||||||||| |||||  || |||||||||||||||||||||||||||    
T  30245421 aagtaagagcttccgcttgagggggagcatgatgaaaaagacggacacacacttgagggggactgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacat 30245520  T
Q  123 cggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccat 169  Q
    | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  30245521 cagataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagagggcccat 30245567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 96 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 36534942 - 36534795
Alignment:
Q  96 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 195  Q
    ||||||||| | ||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  | |||||||||||||||    
T  36534942 tgcaagtgtaacttatatgtcccacctcggataaaacagtagaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacctaaagtcttaaggttttgggt 36534843  T
Q  196 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgg 245  Q
    |||||||||| |||||||   |  |||||||||||| |||||||||||||    
T  36534842 aagagtgtggcgtctctc--acaagtgtggttgttccagcctcgatgtgg 36534795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 96 - 254
Target Start/End: Original strand, 41854635 - 41854792
Alignment:
Q  96 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 195  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||   | ||||||||||||||||||    
T  41854635 tgcaagtatgagttatatgtcccacatcag-taaaagagtaaaggttgaacaccttataagcaagatgacctataaatataatgccttaaggttttgggt 41854733  T
Q  196 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 254  Q
    |||||||||  |||| |||| |||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  41854734 aagagtgtgacgtctttcttacttgtgcggttgttctagcctcaatgtagacggtcccc 41854792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 117 - 252
Target Start/End: Original strand, 37167808 - 37167937
Alignment:
Q  117 ccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttg 216  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||       |||||||||| ||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37167808 ccacatcagataaaatagtaaatgttgaacag------agtaagaggatccataaatccattgacttaaagttttgggtaagagtgtggtgtctctcttg 37167901  T
Q  217 cttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 252  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  37167902 cttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 37167937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 138 - 254
Target Start/End: Original strand, 30253534 - 30253646
Alignment:
Q  138 aggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcct 237  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||| |||||    
T  30253534 aggttgaagaccttataagtaagagaacccataaactcattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctct----cttgtgtggttgttcaagcct 30253629  T
Q  238 cgatgtggacggtcccc 254  Q
    ||||||||| |||||||    
T  30253630 cgatgtggatggtcccc 30253646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 67 - 169
Target Start/End: Original strand, 30255308 - 30255412
Alignment:
Q  67 ggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagga 164  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  30255308 ggactcacacttgagggggagtgttgttgtgtgcaagtgtgcgttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggg 30255407  T
Q  165 cccat 169  Q
    |||||    
T  30255408 cccat 30255412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 99 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 41910749 - 41910592
Alignment:
Q  99 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaa--------ggttt 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||        | |||    
T  41910749 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaataccttataactgagaggacccataaacccattggcttaagatttttggattt 41910650  T
Q  191 tgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacg 248  Q
    | |||||||||||||||| |||||  |  |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  41910649 ttggtaagagtgtggtgtttctctcacaagtgtggttgttctaacctcgatgtggacg 41910592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 142 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 28300366 - 28300255
Alignment:
Q  142 tgaacaccttataagtaagaggaccc-ataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcga 240  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||  |||||||    
T  28300366 tgaacaccttataagtaagagaaccccataaacccattgccttaagattttgggtaagagtgtggcgtctctcttgcaagtgtggttgttcgggcctcga 28300267  T
Q  241 tgtggacggtcc 252  Q
    ||||||||||||    
T  28300266 tgtggacggtcc 28300255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 96 - 217
Target Start/End: Original strand, 43241495 - 43241616
Alignment:
Q  96 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 195  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  |||| ||||||||||| |||    
T  43241495 tgcaagtgtgagttatatgttccacatcggataaaaaaataaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacttattgacttaaggttttaggt 43241594  T
Q  196 aagagtgtggtgtctctcttgc 217  Q
    || ||| || ||||||||||||    
T  43241595 aaaagtatgatgtctctcttgc 43241616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 177 - 254
Target Start/End: Original strand, 47129450 - 47129527
Alignment:
Q  177 ttgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  47129450 ttgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgatctagcctcgatgtggacggtcccc 47129527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 96 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 28301701 - 28301613
Alignment:
Q  96 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgcctta 184  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28301701 tgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggatagaaaagtaaaagctgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgcctta 28301613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 26 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 40094621 - 40094502
Alignment:
Q  26 aagtaagagcttctgcttgagggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcgg 125  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||  ||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  40094621 aagtaagagcttccgcttgagggagagcgtgatgaatagatggactcacactttaggaggagtgttg-tgtgcaagtgtgagttatatgtccaacatcag 40094523  T
Q  126 ataaaatagtaaaggttgaac 146  Q
    |||||| ||||||||||||||    
T  40094522 ataaaagagtaaaggttgaac 40094502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 26 - 214
Target Start/End: Original strand, 37345846 - 37346036
Alignment:
Q  26 aagtaagagcttctgcttga-gggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatat--gtcccacat 122  Q
    |||||| ||||||  ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||  |||  | ||    
T  37345846 aagtaaaagcttccacttgacgggggagcacgatgaattgatgaactcacacttgaaggggagtgttg-tgtgcaagtgtgagttatatatgtcatatat 37345944  T
Q  123 cggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 214  Q
    | |||| || |||  ||||| ||||  |||||||| ||| |||||||||||  |||||||||| |||||| |||||||||||  ||||||||    
T  37345945 ctgatagaaaagtggaggttaaacattttataagtgagaagacccataaacatattgccttaaagttttgagtaagagtgtgacgtctctct 37346036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 179 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 28300644 - 28300569
Alignment:
Q  179 gccttaaggttttggg-taagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccc 253  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  28300644 gccttaaggttttggggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttattctagcctcgatgtggacgatccc 28300569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 96 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 36109075 - 36109007
Alignment:
Q  96 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagga 164  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36109075 tgcaagtgtgagttatatttctcacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagagga 36109007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 184 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 37532821 - 37532753
Alignment:
Q  184 aaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 252  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  37532821 aaggttttgggtaagagtgtggtgtctctctagcttgtgctgttgttctagcctcgatgtggacggtcc 37532753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 101 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 44361616 - 44361517
Alignment:
Q  101 gtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagag 200  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||    
T  44361616 gtgtgagatatatgtctcacatcggataaaagagtaaaagttgaacacctt-taagtaagatgatccataaacccataaccttacggttttaggtaagag 44361518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 50 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 4124293 - 4124128
Alignment:
Q  50 gagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgt-tggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacac 148  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||| | | ||| | | || ||||| ||||| ||| |||||| ||||||| || || | |  |||||  ||||    
T  4124293 gagcatgatgaattgatgggctcacacttgatgtgaagtttgttgtgtgcaactgtgaattacatgtcctacatcggttagaaaatttgaggtttgacac 4124194  T
Q  149 cttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 214  Q
     |||||||| |||||||| |||||| |||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  4124193 tttataagtgagaggaccaataaactcattgcattaaggttttggataaaagtgtggtgtctctct 4124128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 163 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 21416232 - 21416181
Alignment:
Q  163 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 214  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21416232 gacccataaacccattgccttagggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 21416181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 165 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 23569091 - 23569043
Alignment:
Q  165 cccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctc 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23569091 cccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtgatgtctctc 23569043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 197 - 253
Target Start/End: Original strand, 30244453 - 30244509
Alignment:
Q  197 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccc 253  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  30244453 agagtgtggtgtctctctcacttgtgtggttgttcaagcctcgatgtggacggtccc 30244509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 197 - 254
Target Start/End: Original strand, 30245256 - 30245313
Alignment:
Q  197 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 254  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  30245256 agagtgtggtgtctctctcacttgtgtggttgttcaagcctcaatgtggacggtcccc 30245313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 197 - 254
Target Start/End: Original strand, 30253671 - 30253728
Alignment:
Q  197 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 254  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  30253671 agagtgtggtgtctctctcacttgtgtggttgttcaagcctcgatgtggactgtcccc 30253728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 26 - 115
Target Start/End: Original strand, 45697841 - 45697929
Alignment:
Q  26 aagtaagagcttctgcttgagggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgt 115  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||| |||  |||||||||||||| |||||||| || ||||||||| | ||||||||    
T  45697841 aagtaagagcttccgcttgaaggggagcatgatgaatagataaactcacacttgaggaggagtgtt-gtgtgcaagtgtcatttatatgt 45697929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 90 - 133
Target Start/End: Original strand, 14681281 - 14681324
Alignment:
Q  90 ttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaata 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14681281 ttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacattggataaaata 14681324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 164 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 40094503 - 40094424
Alignment:
Q  164 acccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgt 243  Q
    |||||||||| |||| | |||| ||||||||||||||||||  |||| |||| ||| |||||||||||||||| ||||||    
T  40094503 acccataaactcattactttaaagttttgggtaagagtgtgacgtctttcttacttatgtggttgttctagccccgatgt 40094424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 45 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 48243288 - 48243241
Alignment:
Q  45 agggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttg 92  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  48243288 agggggagcatgatgaattgatggattcacacttgagggggagtgttg 48243241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 179 - 241
Target Start/End: Original strand, 45755010 - 45755072
Alignment:
Q  179 gccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgat 241  Q
    |||||||  |||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  45755010 gccttaaaattttgggtaaaagtgtggtgtctcccttacttgtgtggttgttcaagcctcgat 45755072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 163 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 21619136 - 21619091
Alignment:
Q  163 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgt 208  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21619136 gacccataaacccattgtcttaaggttttgggtaaaagtgtggtgt 21619091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 30 - 109
Target Start/End: Original strand, 10342192 - 10342271
Alignment:
Q  30 aagagcttctgcttgaggggg-agcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagtt 109  Q
    |||||||||  |||||||||| |||| |||||||||  ||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  10342192 aagagcttccacttgagggggcagcatgatgaattggcggactcatacttgagggggagtg-tggtgtgcaagtgtgagtt 10342271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 151 - 254
Target Start/End: Original strand, 37393114 - 37393216
Alignment:
Q  151 tataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt 250  Q
    ||||||||||| |||| |||||| || |||||| |||||||| |||| ||||||| ||||||    ||| |||||||| |||| |||||||||||||| |    
T  37393114 tataagtaagatgacc-ataaactcaatgccttgaggttttgagtaaaagtgtggcgtctcttccacttatgtggttgctctaacctcgatgtggacgat 37393212  T
Q  251 cccc 254  Q
    ||||    
T  37393213 cccc 37393216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 98 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 36967385 - 36967335
Alignment:
Q  98 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacac 148  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| || |||||    
T  36967385 caagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaaaagtaaagattaaacac 36967335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 138 - 254
Target Start/End: Original strand, 15902342 - 15902457
Alignment:
Q  138 aggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcct 237  Q
    ||||||||||| |||||||| | |  || ||||| | | ||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||  |||||||| ||||||| ||||    
T  15902342 aggttgaacactttataagtgaaatcacacataagctcgttgtcttaaggttttggataaaagtgtggtgtcgctctcacttgtgtgattgttct-gcct 15902440  T
Q  238 cgatgtggacggtcccc 254  Q
     |||||||  |||||||    
T  15902441 ggatgtgggtggtcccc 15902457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 164 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 27391859 - 27391815
Alignment:
Q  164 acccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgt 208  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27391859 acccataaatccactgccttaaggttttaggtaagagtgtggtgt 27391815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 191 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 4719359 - 4719305
Alignment:
Q  191 tgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgg 245  Q
    |||||||||||||||| | ||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||||    
T  4719359 tgggtaagagtgtggtatttctcttgtttgtgcggttgctctagcctcgttgtgg 4719305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 206 - 254
Target Start/End: Original strand, 7517767 - 7517815
Alignment:
Q  206 tgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 254  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||    
T  7517767 tgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatatgggtggtcccc 7517815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 206 - 254
Target Start/End: Original strand, 7518033 - 7518081
Alignment:
Q  206 tgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 254  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||    
T  7518033 tgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatatgggtggtcccc 7518081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 163 - 203
Target Start/End: Original strand, 27598052 - 27598092
Alignment:
Q  163 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgt 203  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||    
T  27598052 gacccataaacccattgtcttagggttttgcgtaagagtgt 27598092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 49 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 28300405 - 28300365
Alignment:
Q  49 ggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtg 89  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  28300405 ggagcatgatgaatagatggactcacacttgagagggagtg 28300365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 177; Significance: 2e-95; HSPs: 78)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 23 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 5542857 - 5542625
Alignment:
Q  23 gcaaagtaagagcttctgcttgaggggga-gcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccaca 121  Q
    ||||||| |||||||| |||||| ||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  5542857 gcaaagttagagcttccgcttgaaggggaagcatgatgaatagatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccata 5542758  T
Q  122 tcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgt 221  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5542757 tcgaataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacctattgccttaaggtttttggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgt 5542658  T
Q  222 gtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 254  Q
    | |||||||| || |||||||||||||||||||    
T  5542657 gcggttgttcaagtctcgatgtggacggtcccc 5542625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 64 - 252
Target Start/End: Original strand, 37106156 - 37106344
Alignment:
Q  64 gatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagg 163  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37106156 gatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagg 37106255  T
Q  164 acccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 252  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  37106256 acccataaacccatttccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtttctcttgcttgtgcgattgttctagcctcgatgtggacggtcc 37106344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 87 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 36178772 - 36178605
Alignment:
Q  87 gtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaag 186  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36178772 gtgttagtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaag 36178673  T
Q  187 gttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  36178672 gttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctctatgtggacgatcccc 36178605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 30 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 40679852 - 40679632
Alignment:
Q  30 aagagcttctgcttgagggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataa 129  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||||||     
T  40679852 aagagcttccgcttgagggggagcatgatgaatagatggactcacacttgagggggagtgttg-tgtgcaaatgtgagttatatgtcccatatcggatag 40679754  T
Q  130 aatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgt 229  Q
    || ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||    
T  40679753 aaaagtaagggttgaacaccttataagtaagagaacccataaacccatcgccttaagattttgggtaagagtgtggcgtctctcttacttgtggggttgt 40679654  T
Q  230 tctagcctcgatgtggacggtc 251  Q
    ||||| ||||||||||||||||    
T  40679653 tctagtctcgatgtggacggtc 40679632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 88 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 14745833 - 14745667
Alignment:
Q  88 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 187  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14745833 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacattggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 14745734  T
Q  188 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 254  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14745733 ttttgggtaagagtgtggcgtctctcttgcaagtgtggttgttctagcctcgatgtggacagtcccc 14745667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 88 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 41283641 - 41283475
Alignment:
Q  88 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 187  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  41283641 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccatatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaagg 41283542  T
Q  188 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 254  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  41283541 ttttaggtaagagtgtggcgtctctcttgtttgtgtggttgttctagccttgatgtggacggtcccc 41283475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 24 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 14745524 - 14745300
Alignment:
Q  24 caaagtaagagcttctgcttga-gggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacat 122  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| |||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14745524 caaagtaagagcttccgcttgaagggggagcatgatgaatagatgtactcaaacttgagggg-agtgttggtttgcaactgtgagttatatgtcccacat 14745426  T
Q  123 cggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgt- 221  Q
    || |||||||||||| ||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   ||     
T  14745425 cgaataaaatagtaatggttgaacatcttgtaagtatgaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggcgtctctcttgtaagtg 14745326  T
Q  222 gtggttgttctagcctcgatgtggac 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  14745325 gtggttgttctagcctcgatgtggac 14745300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 92 - 254
Target Start/End: Original strand, 37105920 - 37106082
Alignment:
Q  92 ggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggtttt 191  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  37105920 ggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcgaataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaggggacccataaactcattgccttaagatttt 37106019  T
Q  192 gggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37106020 gggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtacggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 37106082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 86 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 5543166 - 5543002
Alignment:
Q  86 agtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaa 185  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  5543166 agtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatccgataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggatccataaacctattgccttaa 5543067  T
Q  186 ggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt 250  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  5543066 gattttgggtaagagtgtggtgtctctattgcttgtgcggttgttcaagcctcgatgtggacggt 5543002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 68 - 248
Target Start/End: Original strand, 15880233 - 15880415
Alignment:
Q  68 gactcacacttgagggggagtgttggtttg--caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggac 165  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||| | ||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15880233 gactcacacttaaggggaagtgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgttccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggac 15880332  T
Q  166 ccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacg 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  15880333 ccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggcgtctctcttgcttgtgcggttgttttagcctcgatgtggacg 15880415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 45 - 254
Target Start/End: Original strand, 6422066 - 6422268
Alignment:
Q  45 agggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttga 144  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| |||||      ||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  6422066 agggggagcatgatgaattgatggactcacacttgagggggagtcttg-tgtgcaaatgtga------tgtcccacatcagataaaaaagtaaaggttga 6422158  T
Q  145 acaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtg 244  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6422159 acacattataattaagaggacccataaacccatagccttaaggttttaggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtg 6422258  T
Q  245 gacggtcccc 254  Q
    ||| ||||||    
T  6422259 gactgtcccc 6422268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 98 - 254
Target Start/End: Original strand, 6421387 - 6421543
Alignment:
Q  98 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  6421387 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggactcataaactcattgccttgaggttttgggtaa 6421486  T
Q  198 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6421487 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagtctcgatgtggacggtcccc 6421543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 96 - 251
Target Start/End: Original strand, 962598 - 962753
Alignment:
Q  96 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  962598 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtgagaggacccataaacccattgtcttaaggttttgggt 962697  T
Q  196 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtc 251  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  962698 aagagtgtgttgtcactcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtc 962753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 30 - 249
Target Start/End: Original strand, 7598543 - 7598754
Alignment:
Q  30 aagagcttctgcttgagggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataa 129  Q
    ||||||||| |||||| |||| ||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  7598543 aagagcttccgcttgaaggggggcatgatgaatagatggactcacacttgagagggagtgttggtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagataa 7598642  T
Q  130 aatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgt 229  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  7598643 aaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataa--------ccttaacgtttttggtaagagtgtggtgtctctctcacttgtgtggttgt 7598734  T
Q  230 tctagcctcgatgtggacgg 249  Q
    || ||| |||||||||||||    
T  7598735 tcaagcatcgatgtggacgg 7598754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 29 - 254
Target Start/End: Original strand, 40733813 - 40734040
Alignment:
Q  29 taagagcttctgcttga-gggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttg--caagtgtgagttatatgtcccacatcgg 125  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||  |||||||||||||||||||||||||||     
T  40733813 taagagcttccgcttgaagggggagcatgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttattgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacatcga 40733912  T
Q  126 ataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtgg 225  Q
    |||||| ||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||| || |  ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  40733913 ataaaagagtaaagatttaacaccttataagtaagagggctcataa-cctacagccttaaagttttgggtaagagtgtggtgtctgtctcgcttgtgtgg 40734011  T
Q  226 ttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 254  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||    
T  40734012 ttgttcaagtctcgatgtggacggtcccc 40734040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 48 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 28531519 - 28531316
Alignment:
Q  48 gggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaaca 147  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||    
T  28531519 gggagcatgatgaactgatggactcacacttgagggggagtgttg-tgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggatagaaaagcaaaggttgaaca 28531421  T
Q  148 ccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggac 247  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||   || ||  |||| |||||||||||||||||     
T  28531420 ccttataagtaagaggtcccataaactcattgccttaagattttgggtaagagtgtggtgactctctcagttatgcagttgctctagcctcgatgtggat 28531321  T
Q  248 ggtcc 252  Q
    |||||    
T  28531320 ggtcc 28531316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 96 - 254
Target Start/End: Original strand, 42514649 - 42514807
Alignment:
Q  96 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 195  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  42514649 tgcaagtgtgagttatatgtcctacatcagatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccatcgccttaagattttgggt 42514748  T
Q  196 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 254  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42514749 aagagtgtggcgtctctcttacttgtggggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 42514807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 53 - 254
Target Start/End: Original strand, 40733472 - 40733675
Alignment:
Q  53 cacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttg--caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacacct 150  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||  | ||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||    
T  40733472 cacgatgaattgatagactcacacttgaggggaagtgttattgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacatcagataaaaaagtaaatgttgaacacct 40733571  T
Q  151 tataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt 250  Q
    |||||||||||||||||||||||| |   |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| || ||||||||||| |||    
T  40733572 tataagtaagaggacccataaacctacaaccttaaagttttgggtaagagtgtggtgtctctctcgcttgtgtggtagttcaagtctcgatgtggatggt 40733671  T
Q  251 cccc 254  Q
    ||||    
T  40733672 cccc 40733675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 103 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 15511646 - 15511495
Alignment:
Q  103 gtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtg 202  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  15511646 gtgagttatatgtcacacaacggataaaagagtaaaggttgaacacgttataagtaagaggacccataaacccattgtcttaagattttgggtaagagtg 15511547  T
Q  203 tggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  15511546 tggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagtctcgatgtggacgatcccc 15511495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 96 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 35580881 - 35580724
Alignment:
Q  96 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 195  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  35580881 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaacaataaatgttgaacaccttataagtgagaggacc-ataaacccattgccttaaggttttgggt 35580783  T
Q  196 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 254  Q
    ||||||| || |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35580782 aagagtgcggcgtctctcttgtttgtggggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 35580724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 114 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 36178311 - 36178171
Alignment:
Q  114 gtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctc 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  36178311 gtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagggaacccataaacccattgccttaagattttgggtaagagtgtggtgcctctc 36178212  T
Q  214 ttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 254  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  36178211 ttgcttgtgtggttgttatagcctcgatgtagacggtcccc 36178171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 63 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 36178460 - 36178320
Alignment:
Q  63 tgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagag 162  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  36178460 tgatggactcacacttgagggggactgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacttcggataaaatagtaaaggtggaacaccttataagtaaggg 36178361  T
Q  163 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgt 203  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  36178360 gactcataaacccattgtcttaaggttttgggtaagagtgt 36178320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 98 - 254
Target Start/End: Original strand, 6712978 - 6713135
Alignment:
Q  98 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg-ttttgggta 196  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||    
T  6712978 caagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaacagtaaatgttgaacaccttataagtaagaggacccataaacctattgctttaaggtttttgggta 6713077  T
Q  197 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 254  Q
    |||||||| |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6713078 agagtgtgatgtctctcttgcttatgggattgttctagcctcgatgtggacggtcccc 6713135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 98 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 36006035 - 36005887
Alignment:
Q  98 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  36006035 caagtgtgagttatatgtcccacatcgaatagaa-agtaaaagttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttttgggtaa 36005937  T
Q  198 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggac 247  Q
     ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  36005936 aagtgtggcgtctctcttgcttgtggggttgttctagcctcgatgtggac 36005887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 96 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 38796778 - 38796619
Alignment:
Q  96 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 195  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  38796778 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatctgataaaacaataaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacctaatgccttaaggttttgggt 38796679  T
Q  196 aagag--tgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccc 253  Q
    |||||  ||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  38796678 aagagtatgtggcgtctctattgcttgtgtggttgttcaagcctcgatgtcgacggtccc 38796619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 46 - 253
Target Start/End: Original strand, 29676851 - 29677065
Alignment:
Q  46 gggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttg 143  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||  || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  29676851 gggggagcacgataaagtgatggactcacacttgagggggtgtgttgttgtgtgcaggtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttt 29676950  T
Q  144 aacaccttataagtaagagga-----cccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctc 238  Q
    ||||||||||| || ||||||     ||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| | ||||    
T  29676951 aacaccttataggtgagaggagaagacccataaacccattgccttaaggctttaagtaagagtgtggtgtctctcttaattgtggggttgttccaacctc 29677050  T
Q  239 gatgtggacggtccc 253  Q
    |||||||| ||||||    
T  29677051 gatgtggatggtccc 29677065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 101 - 252
Target Start/End: Original strand, 33731653 - 33731804
Alignment:
Q  101 gtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagag 200  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33731653 gtgtgagttatatatctcacatcggataaaagagtaaaggttgagcaccttataagtaagaggatccataaacctattgccttaaggttttgggtaagag 33731752  T
Q  201 tgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 252  Q
    | ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||  |||||||    
T  33731753 tatggtgtctctcttgcttatgcggttgttctagcctcgatgtaaacggtcc 33731804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 19 - 254
Target Start/End: Original strand, 3673005 - 3673226
Alignment:
Q  19 acatgcaaagtaagagcttctgcttgagg-gggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgt 115  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||||||||||||||    
T  3673005 acatgcaaagtaaaagcttccgcttgaagagggagcatgatgaattgatggactcacacttgaggaggagtgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgt 3673104  T
Q  116 cccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctctt 215  Q
    ||||||| |||||||||                 ||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||| |||||| |||||||||| ||||||||||    
T  3673105 cccacattggataaaat-----------------ttataagtaagaggatccataaactcattgctttaagattttggctaagagtgtgatgtctctctt 3673187  T
Q  216 gcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 254  Q
     || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3673188 actagtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 3673226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 26 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 36785793 - 36785664
Alignment:
Q  26 aagtaagagcttctgcttgagggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatc 123  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  36785793 aagtaagagcttccgcttgagggggagcatgatgaattgatggactcacactttagggggagtgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatc 36785694  T
Q  124 ggataaaatagtaaaggttgaacaccttat 153  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36785693 ggataaaatagtaaaggttgaacaccttat 36785664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 96 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 37632755 - 37632602
Alignment:
Q  96 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 195  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||    
T  37632755 tgcaagtgtgagttatatgtcctacatcggataaaatagtaaaggtttgacattttataagtaagaggacccataaacccataactttaaggttttgggt 37632656  T
Q  196 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacgg 249  Q
    ||||||||||||| |||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  37632655 aagagtgtggtgtatctcttacaagtgtgattgttctagcctcgatgtggacgg 37632602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 88 - 244
Target Start/End: Original strand, 1769884 - 1770040
Alignment:
Q  88 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 187  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| || || | |    
T  1769884 tgttggtgtgcaagtgtgagttatatgtcacacatcggataaaagagtaaaagttgaacaccttataagtaagaggactcataaactcatagctttgaag 1769983  T
Q  188 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtg 244  Q
     ||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1769984 ctttgaataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgaggttgttctagcctcgatgtg 1770040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 100 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 28254391 - 28254258
Alignment:
Q  100 agtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaaga 199  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  28254391 agtgtgacttatatgtcccacatcggatagaaaagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttttgggtaaga 28254292  T
Q  200 gtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagc 235  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||||||||||    
T  28254291 gtgtggtgtctctct--cttgtggggttgttctagc 28254258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 107 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 40163520 - 40163383
Alignment:
Q  107 gttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgcctt-aaggttttgggtaagagtgtgg 205  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| | || ||| |||||||||||||| |||||||    
T  40163520 gttatatgtcccacatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccattaacctagtgtctttaaggttttgggtaaaagtgtgg 40163421  T
Q  206 tgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgt 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  40163420 tgtctctcttgcttgtgtggttgttctaacctcgatgt 40163383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 30 - 254
Target Start/End: Original strand, 30313110 - 30313335
Alignment:
Q  30 aagagcttctgcttgagggg-gagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggag--tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcgga 126  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||  ||||| | |||||| ||| |||||||||| |||||||||    
T  30313110 aagagcttccgcttgaggggtgagcatgatgaattgttggactcacacttgaggggaagattgttg-tgtgcaagcgtgtgttatatgtctcacatcgga 30313208  T
Q  127 taaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggt 226  Q
    || || |||  ||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||    
T  30313209 tagaaaagtggaggttgaacac-ttataagtgagaggacccaaaaactcattgccttaagattttgggtaagagtgtggcgtctctctcacttgtgtggt 30313307  T
Q  227 tgttctagcctcgatgtggacggtcccc 254  Q
    || ||| |||| ||| | |||| |||||    
T  30313308 tgctctggcctggattttgacgatcccc 30313335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 96 - 254
Target Start/End: Original strand, 7598228 - 7598386
Alignment:
Q  96 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 195  Q
    ||||||||||| |||||||| | |||||| ||| || |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  7598228 tgcaagtgtgaattatatgttctacatcgaatagaaaagtaaaggttcaacaccttataaataagaggacccataaactcatagccttaaggttttgggt 7598327  T
Q  196 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 254  Q
    |||| | ||||||||||||  |||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  7598328 aagaatatggtgtctctctcacttgtgcggttgttcaagcctcgatgtgaacggtcccc 7598386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 109 - 251
Target Start/End: Original strand, 23346250 - 23346391
Alignment:
Q  109 tatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgt 208  Q
    |||||||| ||||||| ||| || |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  23346250 tatatgtctcacatcgtatagaaaagtaaaggttaaacaccttataa-taagagggcccataaacccatagccttaaggttttcggtaagagtgtgatgt 23346348  T
Q  209 ctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtc 251  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  23346349 ctctcttgcttgtgcggttgttctagcctagatgtggacggtc 23346391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 26 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 38796450 - 38796298
Alignment:
Q  26 aagtaagagcttctgcttga-gggggagcacgatgaatt-gatggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtcccaca 121  Q
    |||||||| |||| |||||| ||||||||| ||||||   |||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||    
T  38796450 aagtaagatcttccgcttgaagggggagcatgatgaaaaagatggactcacacttgagggggagtgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccaca 38796351  T
Q  122 tcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacc 174  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  38796350 tcggataaaacagtaaatgttgaacaccttataagtaagaggacctataaacc 38796298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 98 - 240
Target Start/End: Original strand, 5367457 - 5367599
Alignment:
Q  98 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 197  Q
    |||||||||  ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || |||| ||| |||  ||||||||||||||||||    
T  5367457 caagtgtgatatatatgtcccagatcggataaaagagcaaaggttgaacaccttataagtaagatgatccatgaacacataaccttaaggttttgggtaa 5367556  T
Q  198 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcga 240  Q
    |||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  5367557 gagtgtggcgtctctcttgcttgtgcagttgttctagcctcga 5367599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 76 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 31468926 - 31468800
Alignment:
Q  76 cttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaac 173  Q
    |||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    |||||||||||||||||    
T  31468926 cttgagggggagtgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaatatctta----taagaggacccataaac 31468831  T
Q  174 ccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 204  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31468830 tcattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 31468800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 30 - 213
Target Start/End: Original strand, 30323396 - 30323581
Alignment:
Q  30 aagagcttctgcttgagggg-gagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggag--tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcgga 126  Q
    |||||| || |||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | |||||||||| ||||||||||||| ||| ||    
T  30323396 aagagcatccgcttgagggatgagcatgatgaattgatggactcacacttgagggggagattgttg-tgtgcaagtgtgtgttatatgtcccaaatcaga 30323494  T
Q  127 taaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctc 213  Q
    || || | |  ||||||||||| ||| |||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  30323495 tagaaaattggaggttgaacactttagaagtgagaggacctataaactcattgccttaaggttttgggtaagagtgtggcgtctctc 30323581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 158 - 254
Target Start/End: Original strand, 6421793 - 6421889
Alignment:
Q  158 aagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 254  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6421793 aagaggacccataaacctattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctctaacttgtgtggttgttctggcctcgatgtggacggtcccc 6421889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 46 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 33561658 - 33561491
Alignment:
Q  46 gggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaa 145  Q
    |||||||  |||||||||||||||| | ||||||| ||||| ||||| | |||||||||||||||||||| ||||||| |||| || |||  ||||| ||    
T  33561658 gggggagtgcgatgaattgatggacacgcacttgatggggaatgttg-tgtgcaagtgtgagttatatgttccacatcagatagaaaagtggaggttaaa 33561560  T
Q  146 caccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 214  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  33561559 cactttataagtgagaggacccataaactcattgtcttaaggttttgggtaagagtgtgatatctctct 33561491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 96 - 203
Target Start/End: Original strand, 16542449 - 16542556
Alignment:
Q  96 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 195  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||| |||||||||||| ||||| ||    
T  16542449 tgcaagtgtgagttataagtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataaataagaggacttataaactcattgccttaagattttgagt 16542548  T
Q  196 aagagtgt 203  Q
    ||||||||    
T  16542549 aagagtgt 16542556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 104 - 254
Target Start/End: Original strand, 29676543 - 29676687
Alignment:
Q  104 tgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgt 203  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||| |||||||| |||| |||||||||| |||||||||      ||||||||||||||    
T  29676543 tgagttatatgtctcacattggataaaagagtaaagattgaacacattataagtgagagaacccataaactcattgcctt------ttgggtaagagtgt 29676636  T
Q  204 ggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 254  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||| | ||||||||||||||||||||    
T  29676637 ggtgtctctcttgcttgtggggttattcaaacctcgatgtggacggtcccc 29676687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 96 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 12529186 - 12529038
Alignment:
Q  96 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 195  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||  |||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| | |    
T  12529186 tgcaagtgtgagttatatgtcctacatcaaataaaacagtaaagattgaacaccgtataagtaagaggactcataaactcattgccttaaagttttagat 12529087  T
Q  196 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtg 244  Q
    ||||  || |||||||||||| ||||| |||||||||| |||| |||||    
T  12529086 aagaacgtagtgtctctcttgtttgtgcggttgttctaacctcaatgtg 12529038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 99 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 31899581 - 31899496
Alignment:
Q  99 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgcctta 184  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31899581 aagtgtgagttatatgttccacatcggataaaatagtaaatgttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgcctta 31899496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 60 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 29873732 - 29873563
Alignment:
Q  60 aattgatggactcacacttgagggggag--tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagt 157  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | |||||| ||| |||| |||||||||||| |||| || |||  ||||||||||  ||||||||    
T  29873732 aattgatggactcacacttgagggggagattgttg-tgtgcaagggtgtgttacatgtcccacatcagatagaaaagtggaggttgaacattttataagt 29873634  T
Q  158 aagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttg 228  Q
      |||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||  ||||||||||||    
T  29873633 gggaggactcataaactcattgccttaaggttttgagtaagagtgtgacgtctctctcacttgtgtggttg 29873563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 26 - 158
Target Start/End: Original strand, 42514943 - 42515078
Alignment:
Q  26 aagtaagagcttctgcttgagggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagtta----tatgtcccaca 121  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| || |||| ||||||||||    |||||||||||    
T  42514943 aagtaagagcttccgcttgagagggagcatgatgaatagatggactcacatttgagggggagtgtt-gtgtgcaggtgtgagttatatgtatgtcccaca 42515041  T
Q  122 tcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagta 158  Q
    ||||||| || |||||||||| |||||||||||||||    
T  42515042 tcggatagaaaagtaaaggttaaacaccttataagta 42515078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 30 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 33953994 - 33953821
Alignment:
Q  30 aagagcttctgcttgagggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataa 129  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||| |   |||||   |||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| |||||||||| ||||     
T  33953994 aagagcttcctcttgagggggagcacgatgaattaacatactcaattttgagggggagtgttg-tgtgcaaatgtgagttataagtcccacatcagatag 33953896  T
Q  130 aatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 204  Q
    || |||  |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||    
T  33953895 aaaagtggaggttgaacactatataagtgagaggacccataaacctgttgccttaaaattttgggtaagagtgtg 33953821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 56 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 37894889 - 37894732
Alignment:
Q  56 gatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataa 155  Q
    ||||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||| | ||||| ||||||||||||||||||||| | ||| || |||||||| | || |||||||||    
T  37894889 gatgaatagatggactcatacttaagggggagtattg-tgtgcaaatgtgagttatatgtcccacattgaatagaaaagtaaaggctaaaaaccttataa 37894791  T
Q  156 gtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 214  Q
    |||||| ||| |||||| ||||||||||||| |||||| ||| |||||||||| |||||    
T  37894790 gtaagaagactcataaatccattgccttaagattttggttaaaagtgtggtgtgtctct 37894732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 96 - 247
Target Start/End: Original strand, 16590888 - 16591034
Alignment:
Q  96 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaata-gtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttggg 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||| | ||||||||||||||      |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |    
T  16590888 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcaaataaaaaaagtaaaggttgaaca------aagtaagaggacccataaacacattgccttaaggttttaag 16590981  T
Q  195 taagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggac 247  Q
    ||||| | |  |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  16590982 taagaatctaatgtctctcttacttgtggggttgttctagcctcaatgtggac 16591034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 30 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 41678593 - 41678419
Alignment:
Q  30 aagagcttctgcttgagggg-gagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagt--tatatgtcccacatcgga 126  Q
    ||||||||| |||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||  |||||||| |||||| ||    
T  41678593 aagagcttccgcttgaggagagagcattatgaattgatggactcacacttgaaggggagtgtt-gtgtgcaagtgtgagttatatatgtctcacatcaga 41678495  T
Q  127 taaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgt 203  Q
    || || ||   ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||    
T  41678494 tagaaaaggggaggttaaacactttataagtgagaggacccataaa-cctttgccttaaggttttgagtaagagtgt 41678419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 98 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 29874179 - 29874023
Alignment:
Q  98 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 197  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||| || |||  ||||||||||| |||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  29874179 caagtgtgtgttatatgtcccacatcagatagaaaagtggaggttgaacactttataattgggaggacccataaacccattgccttaaggttttggataa 29874080  T
Q  198 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 254  Q
    |||||||| |||| ||   |||||| ||||| | | |||| ||||||| ||||||||    
T  29874079 gagtgtggcgtctatcccacttgtgcggttgctttggcctggatgtgggcggtcccc 29874023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 104 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 37895211 - 37895107
Alignment:
Q  104 tgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgt 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || | |||| |||||| |||||| |||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37895211 tgagttatatgtcccacatcggatagaaaaataaaagttgaaaaccttaaaagtaaaagaacacataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgt 37895112  T
Q  204 ggtgt 208  Q
    |||||    
T  37895111 ggtgt 37895107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 168 - 250
Target Start/End: Original strand, 3672773 - 3672855
Alignment:
Q  168 ataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt 250  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3672773 ataaacccattgccttaagattttgggtaagagtgtggtgtctctcttaattgtgtggttgttctagtctcgatgtggacggt 3672855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 99 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 31259774 - 31259658
Alignment:
Q  99 aagtgtgagttatatgtcccacatc---ggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 195  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||   |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  31259774 aagtgcgagttatatgtctcacatcatcggataaaagagtaaaggttcaacaccttataagtaagatgacccataaacctatcaccttaaggttttgggt 31259675  T
Q  196 aagagtgtggtgtctct 212  Q
    ||||||||||| |||||    
T  31259674 aagagtgtggtatctct 31259658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 158 - 250
Target Start/End: Original strand, 6421688 - 6421780
Alignment:
Q  158 aagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt 250  Q
    ||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  6421688 aagaggacccataaacctattgactaaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctctaacttgtgtggttgttccggcctcgatgtggacggt 6421780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 149 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 36784365 - 36784273
Alignment:
Q  149 cttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgat 241  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  36784365 cttataagtaagatgacccataaaccctttgtcttaaggttttggataaaagtgttgtgtctctcttgcttgtgtggttattcaagcctcgat 36784273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 99 - 254
Target Start/End: Original strand, 9231252 - 9231407
Alignment:
Q  99 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaag 198  Q
    |||| ||||||||||||| || ||| |||| || |||||||||||||||  |||||| |||||||| |||| ||||||  ||||||| ||||||| ||||    
T  9231252 aagtatgagttatatgtctcatatcagatagaaaagtaaaggttgaacatattataaataagaggatccatcaacccaccgccttaaagttttggttaag 9231351  T
Q  199 agtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 254  Q
    ||||| || |||||||  ||| || |||| ||||| ||| |||||||||| |||||    
T  9231352 agtgtagtatctctctaacttatgcggttattctaaccttgatgtggacgatcccc 9231407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 97 - 227
Target Start/End: Original strand, 31385738 - 31385868
Alignment:
Q  97 gcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggta 196  Q
    |||||||||||||| | |||  ||||||| || || | |  ||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  31385738 gcaagtgtgagttagaagtctgacatcggttagaaaaatggaggttgagcaccttataagtgaaaggacccataaacccattgccttaaggttttgggaa 31385837  T
Q  197 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggtt 227  Q
      |||||||||||||| |  |||||||||||    
T  31385838 taagtgtggtgtctctttcacttgtgtggtt 31385868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 112 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 28254254 - 28254165
Alignment:
Q  112 atgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagt 201  Q
    ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||    
T  28254254 atgtctcacatcggatagaaaagtaaaggttgaacactttataagtaagaggactcataaacactttgccttaaagtttagggtaagagt 28254165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 99 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 3594333 - 3594180
Alignment:
Q  99 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaag 198  Q
    ||||||||||| |||||  |||| || ||| || |||  |||| |||||| |||||||| | |||| |||||||| |||||| ||||| ||||| |||||    
T  3594333 aagtgtgagttgtatgtttcacaacgaatagaaaagtggaggtcgaacactttataagtgataggatccataaacacattgctttaagattttgagtaag 3594234  T
Q  199 agtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 252  Q
    |||||| | |||||| | || ||||| || ||||| |||||||||| |||||||    
T  3594233 agtgtgatatctctcatactagtgtgtttattctaacctcgatgtgaacggtcc 3594180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 160 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 35580534 - 35580443
Alignment:
Q  160 gaggacccataaacccattgccttaaggttttgggta--agagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt 250  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| | | | |||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  35580534 gaggacccataaactcattgccttaaggttttgggtaagagagtgtggcgtctctc-tccctatgtgattgttttagcctcgatgtggacggt 35580443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 99 - 203
Target Start/End: Original strand, 12910231 - 12910335
Alignment:
Q  99 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaag 198  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||  || |||| ||||||||| |||||||||| | | |||  |||||  ||||| ||||||||||||||||||    
T  12910231 aagtttgagttatatgttccacatcggatggaaaagtacaggttgaaccccttataagtgaaatgacttataaattcattgtcttaaggttttgggtaag 12910330  T
Q  199 agtgt 203  Q
    |||||    
T  12910331 agtgt 12910335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 186 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 31899170 - 31899102
Alignment:
Q  186 ggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 254  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||| |||||||||    
T  31899170 ggttttgggtaagagtgaggtatctctcttgcttgtggggttcttctaacctcgatgtgaacggtcccc 31899102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 51 - 118
Target Start/End: Original strand, 40734231 - 40734300
Alignment:
Q  51 agcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgt--tggtttgcaagtgtgagttatatgtccc 118  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  | || | |||||||||||||||||||||    
T  40734231 agcacgatgaattgatggaatcacacttgagggggagtgttattgtgtacaagtgtgagttatatgtccc 40734300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 98 - 144
Target Start/End: Original strand, 6421306 - 6421352
Alignment:
Q  98 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttga 144  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  6421306 caagtgtaagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttga 6421352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 96 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 33954419 - 33954279
Alignment:
Q  96 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 195  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||  ||||| ||||   ||||| | | | ||| |||||| | | ||||||| | ||||||||    
T  33954419 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagatagaaaagttgaggttaaacattatataacttaaatgactcataaatcta-tgccttacgattttgggt 33954321  T
Q  196 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcct 237  Q
    |||||||||| ||||||||  ||| | |||||||||| ||||    
T  33954320 aagagtgtggcgtctctctcacttatatggttgttctggcct 33954279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 138 - 214
Target Start/End: Original strand, 30312831 - 30312907
Alignment:
Q  138 aggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 214  Q
    ||||||||||| |||||| | ||| |||||||||||  ||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  30312831 aggttgaacactttataacttagatgacccataaacttatttccttaaggttttgggtaaaagtgtgtagtctctct 30312907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 150 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 25390372 - 25390313
Alignment:
Q  150 ttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtc 209  Q
    |||||| ||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||  |||||||||||    
T  25390372 ttataactaagaagacccataaacctattgtcttaaggttttgggtagaagtgtggtgtc 25390313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 163 - 214
Target Start/End: Original strand, 28226404 - 28226455
Alignment:
Q  163 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 214  Q
    ||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28226404 gacccataaacacattgtcttagggttttaggtaagagtgtggtgtctctct 28226455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 138 - 195
Target Start/End: Original strand, 2336666 - 2336723
Alignment:
Q  138 aggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 195  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||  || ||||||||| ||||||||    
T  2336666 aggttgaacactttataagtgagaggacccataaattcaatgccttaagattttgggt 2336723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 40 - 92
Target Start/End: Original strand, 34481589 - 34481642
Alignment:
Q  40 gcttgagg-gggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttg 92  Q
    |||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  34481589 gcttgaggcgggagcgtgatgaattgatggactcacacttgagggagagtgttg 34481642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 166 - 214
Target Start/End: Original strand, 8904498 - 8904546
Alignment:
Q  166 ccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 214  Q
    ||||||||| |||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8904498 ccataaaccaattgccatatggttttgggtaaaagtgtggtgtctctct 8904546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 167 - 214
Target Start/End: Original strand, 28226726 - 28226772
Alignment:
Q  167 cataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 214  Q
    ||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28226726 cataaacccattgtctta-ggtttttggtaagagtgtggtgtctctct 28226772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 163 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 13792585 - 13792536
Alignment:
Q  163 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctct 212  Q
    ||||| || |||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  13792585 gacccgtacacccattgacttgaggttttgggtaagagtgtgatgtctct 13792536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 49 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 35580592 - 35580532
Alignment:
Q  49 ggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgag 107  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||  || ||||||||||||    
T  35580592 ggagcatgatgaatagatggactcacacttgagggagagtgctgttgtgtgcaagtgtgag 35580532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 96 - 132
Target Start/End: Original strand, 3672719 - 3672755
Alignment:
Q  96 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaat 132  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3672719 tgcaagtatgagttatatgtcccacatcgaataaaat 3672755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 169; Significance: 1e-90; HSPs: 82)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 23 - 254
Target Start/End: Original strand, 6500749 - 6500980
Alignment:
Q  23 gcaaagtaagagcttctgcttga-gggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccaca 121  Q
    ||||||||||||||||  ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  6500749 gcaaagtaagagcttccccttgaagggggagcatgatgaatagatggactcacacttgatggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcc-aca 6500847  T
Q  122 tcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgt 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  6500848 tcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataaataaaaggacccataaactcattgccttaaggttttggataagagtgtggtgtctctcttacttgt 6500947  T
Q  222 gtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 254  Q
    | |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  6500948 gcggttattctagcctcgatgtggacggtcccc 6500980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 26 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 3295246 - 3295015
Alignment:
Q  26 aagtaagagcttctgcttgagggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttg----gtttgcaagtgtgagttatatgtcccaca 121  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||    || ||||||||||||| ||||||||||||    
T  3295246 aagtaagagcttccgcttaagggggagcacgaaaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttgttgtgtgtgcaagtgtgagt-atatgtcccaca 3295148  T
Q  122 tcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgt 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  3295147 tcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaagacccataaacccattgccttgaggttttgggtatgagtgtggtgtctctcttggttgt 3295048  T
Q  222 gtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 254  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  3295047 gtggttgttgtagcctcgatgtggacagtcccc 3295015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 27 - 250
Target Start/End: Original strand, 624128 - 624350
Alignment:
Q  27 agtaagagcttctgcttgagggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcgga 126  Q
    |||||||||||| |||| | |||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  624128 agtaagagcttccgcttaaaggggagcatgatgaatagatgga-tcacacttgaggggaagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacattgta 624226  T
Q  127 taaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggt 226  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||    
T  624227 taaaatagtaaaggttgaacacgttataagtaagatgacccataaacccatagccttgaggttttgggtaagagtgtggtgtctctctcacttgtggggt 624326  T
Q  227 tgttctagcctcgatgtggacggt 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  624327 tgttctagcctcgatgtggacggt 624350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 88 - 254
Target Start/End: Original strand, 6500443 - 6500608
Alignment:
Q  88 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 187  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  6500443 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcc-acatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacctttaaacccattgccttaagg 6500541  T
Q  188 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6500542 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 6500608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 26 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 13415990 - 13415774
Alignment:
Q  26 aagtaagagcttctgcttga-gggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacat 122  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||  || |||||||||||||||||||||||||||    
T  13415990 aagtaagagcttccgcttgaagggggagcatgctgaatagatggactcacacttgagggg-agtgctgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacat 13415892  T
Q  123 cggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtg 222  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13415891 cggataaattagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacctattaccttaaggttttgggtaagagtgtggcgtctctcttgcttgtg 13415792  T
Q  223 tggttgttctagcctcga 240  Q
     |||||||||||||||||    
T  13415791 cggttgttctagcctcga 13415774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 96 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 40296473 - 40296315
Alignment:
Q  96 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  40296473 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagaaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttgaggttttgggt 40296374  T
Q  196 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40296373 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 40296315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 88 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 18603286 - 18603124
Alignment:
Q  88 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 187  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18603286 tgttagttttcaagtgtgagttatatgtcccacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 18603187  T
Q  188 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt 250  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18603186 ttttgggtaagagtgtggcatctctcttgcttgtgtggtagttctagcctcgatgtggacggt 18603124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 88 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 27502202 - 27502036
Alignment:
Q  88 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 187  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  27502202 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacattggataaaatagtaaaggttaaacaccttataagtaagaggacccataaacctattgccttaaga 27502103  T
Q  188 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 254  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27502102 tttttggtaaaagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctatcctcgatgtggacggtcccc 27502036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 88 - 254
Target Start/End: Original strand, 32487386 - 32487551
Alignment:
Q  88 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 187  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32487386 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacacct-ataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 32487484  T
Q  188 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 254  Q
    |||||||||||||||||  || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  32487485 ttttgggtaagagtgtgacgtatctcttgcttatgtggttgttctagcctcgatgtggatggtcccc 32487551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 89 - 254
Target Start/End: Original strand, 41170627 - 41170792
Alignment:
Q  89 gttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggt 188  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41170627 gttggtttgtaattgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggt 41170726  T
Q  189 tttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 254  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  41170727 tttgggtaagagtgtggtgtttttcttgcttgtgtggttgttctagcctcggtgtagacggtcccc 41170792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 93 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 36492378 - 36492218
Alignment:
Q  93 gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttg 192  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||| ||||||||    
T  36492378 gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggaccaataaacacattacctttaggttttg 36492279  T
Q  193 ggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccc 253  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36492278 gataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccc 36492218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 26 - 245
Target Start/End: Original strand, 26074539 - 26074761
Alignment:
Q  26 aagtaagagcttctgcttgaggggg-agcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttg--caagtgtgagttatatgtcccacat 122  Q
    |||||||||||||  ||||| || | |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||  |||||||||||||||||| ||| ||    
T  26074539 aagtaagagcttccacttgaaggagtagcatgatcaattgatggactcacacttgagggggagtgtttttgtgtacaagtgtgagttatatgttccatat 26074638  T
Q  123 cggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtg 222  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||    
T  26074639 cggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctctcactagtg 26074738  T
Q  223 tggttgttctagcctcgatgtgg 245  Q
    |||||| |||| |||||||||||    
T  26074739 tggttgctctaacctcgatgtgg 26074761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 96 - 254
Target Start/End: Original strand, 15370099 - 15370257
Alignment:
Q  96 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||    
T  15370099 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcgaataaaatagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggacccataaatccacagccttaaggttttgggt 15370198  T
Q  196 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15370199 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgggattgttctagcctcgatgtggacggtcccc 15370257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 99 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 3295498 - 3295345
Alignment:
Q  99 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaag 198  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  3295498 aagtgtgagt-atatgttccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaaccaattgccttaaggtttt-ggtaag 3295401  T
Q  199 agtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 254  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3295400 agtgtgttgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 3295345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 33 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 24489424 - 24489207
Alignment:
Q  33 agcttctgcttgagggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaat 132  Q
    |||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||| |||| ||     
T  24489424 agcttctggttgaggggtagcatgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttgtgtt-caagtgtgagttatatgtcccacatcagatagaaa 24489326  T
Q  133 agtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttct 232  Q
    || ||||||| |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| || |||||| |||||||||    
T  24489325 agaaaaggttaaacaccttattagtaaga--acccataaacccattgccttaagattttgcgtaagagtgtggcgtctcttttacttgtgcggttgttct 24489228  T
Q  233 agcctcgatgtggacggtccc 253  Q
    || |||||||||| |||||||    
T  24489227 agtctcgatgtgggcggtccc 24489207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 69 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 26074330 - 26074155
Alignment:
Q  69 actcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggaccca 168  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  26074330 actcacacttgagggggagtgttg-tgtgcaagtgtgagttatatgtcacacatcggataaaaaagtaaaggttgaacacctcatatgtaagaggaccca 26074232  T
Q  169 taaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgg 245  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||| |||| |||||||||||    
T  26074231 tgaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctctcactagtgtggttgctctaacctcgatgtgg 26074155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 99 - 254
Target Start/End: Original strand, 25327938 - 25328093
Alignment:
Q  99 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaag 198  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  25327938 aagtgtgagttatatgtcctacatcggataaaacagtaaaagttgaacaccttataagtaagaggacccataaacctaatgccttaaggttttgggtaag 25328037  T
Q  199 agtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 254  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25328038 agtgtggtgtctctcttgcaagtgtggttgttctagcctcaatgtggacggtcccc 25328093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 87 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 9498821 - 9498655
Alignment:
Q  87 gtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaag 186  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9498821 gtgttggtttgcaaatgtgagttatatgtctcacatcagatagaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaag 9498722  T
Q  187 gttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 254  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| | || ||||||||| |||||||||||||||    
T  9498721 attttgggtaagagtgtggtgtctctcttgtttatgt-gctggtctagcctcaatgtggacggtcccc 9498655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 96 - 254
Target Start/End: Original strand, 41632782 - 41632940
Alignment:
Q  96 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 195  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||    
T  41632782 tgcaagtgtaagttatatgtctcacatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccaatgctttaagattttgggt 41632881  T
Q  196 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  41632882 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttttagtctcgatgtggacggtcccc 41632940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 98 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 42405752 - 42405598
Alignment:
Q  98 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 197  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  42405752 caagtgtgagttatatgtccaacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttacaagtaaaaggactcataaacctaatgccttaaggttttgggtaa 42405653  T
Q  198 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 254  Q
    |||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42405652 gagtgtggtgt--ctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 42405598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 103 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 11417128 - 11416977
Alignment:
Q  103 gtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtg 202  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11417128 gtgagttatatgttccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggatccataaacccattgccttaaggttttgtgtaagagtg 11417029  T
Q  203 tggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 254  Q
    || | ||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||| |||||||    
T  11417028 tgatctctctcttgcttgtgggattgttctagcttcgatgtggatggtcccc 11416977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 45 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 26074993 - 26074807
Alignment:
Q  45 agggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttg--caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggtt 142  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26074993 agggggagcttgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggtt 26074894  T
Q  143 gaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt-aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttg 228  Q
    ||||||  |||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||  |||||||||    
T  26074893 gaacacaatataagtaggaggacccataaacctattgtcttaaggttttgggtaaagagtgtggcgtctctcttgcaagtgtggttg 26074807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 97 - 254
Target Start/End: Original strand, 299490 - 299647
Alignment:
Q  97 gcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggta 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| |||    
T  299490 gcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaacagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaactcatagccttaaggttttgtgta 299589  T
Q  197 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 254  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||  |||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  299590 agagtgtggcgtctctattgcttgtacggttgttctagcatcgatgtggacagtcccc 299647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 106 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 34753173 - 34753029
Alignment:
Q  106 agttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtgg 205  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34753173 agttatatgtcccacattggatagaaaagtaaaagttgaacaccttataagtaagaagacccataaaccgattgccttaaggttttgggtaagagtgtgg 34753074  T
Q  206 tgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt 250  Q
     |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  34753073 cgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggt 34753029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 96 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 12662810 - 12662652
Alignment:
Q  96 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||| |||||| |||||| ||||||||    
T  12662810 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacattttataagtaagaaaacccataaatccattgtcttaagtttttgggt 12662711  T
Q  196 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 254  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  12662710 aagagtgtggtgcctttcttgcttgtggggttcttctagcctcgatgtggtcggtcccc 12662652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 98 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 26075318 - 26075168
Alignment:
Q  98 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt-a 196  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  26075318 caagtgtgatttatatgtctcacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 26075219  T
Q  197 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggac 247  Q
    ||||||||  |||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26075218 agagtgtgtcgtctctcttgcaagtgtggttgttttagcctcgatgtggac 26075168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 98 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 1028673 - 1028517
Alignment:
Q  98 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||| |||||    
T  1028673 caagtgtgagttatatgtcccacatcggatagaaaagtaaaggatgaacactttataagtaagaggacccataaacctataaccttaaggtttttggtaa 1028574  T
Q  198 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 254  Q
    |||||||| ||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1028573 gagtgtggcgtctctctcacttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 1028517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 98 - 254
Target Start/End: Original strand, 6224198 - 6224354
Alignment:
Q  98 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 197  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||    
T  6224198 caagtgtgagttatatgtcccacttcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcatcgccttaaggtttttggtaa 6224297  T
Q  198 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 254  Q
    |||||||||| |||  ||||||||| ||||| ||||||||| || ||||||||||||    
T  6224298 gagtgtggtgcctcagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatatggacggtcccc 6224354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 96 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 36568725 - 36568569
Alignment:
Q  96 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  36568725 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggatagaaaagtaaaagttgaacaccttataagtgagatgacccgtaaacccattgccttaaggtttttggt 36568626  T
Q  196 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 254  Q
    |||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  36568625 aagagtgtggcgtctctct--cttgtgtggttgttctatcctcgatgtggaaggtcccc 36568569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 96 - 254
Target Start/End: Original strand, 35150007 - 35150164
Alignment:
Q  96 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 195  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  35150007 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtcaaggttgaacaccttataagtaaga-gacccataaatccattgtcttaaggttttgggt 35150105  T
Q  196 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 254  Q
    || ||||||||||||||||  || |||||||||||||| |||| |||||||| ||||||    
T  35150106 aaaagtgtggtgtctctctcactagtgtggttgttctaacctcaatgtggaccgtcccc 35150164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 88 - 254
Target Start/End: Original strand, 623810 - 623976
Alignment:
Q  88 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 187  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||  || ||||||||  || |||||||||    
T  623810 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggatataatagtaaaggttgaacactttacaagtaagttgagccataaacttatagccttaagg 623909  T
Q  188 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 254  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  623910 ttttgagtaagagtgtggtgtctctctcacttgtggggttgttctagcctcaatgtagacggtcccc 623976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 122 - 252
Target Start/End: Original strand, 15370428 - 15370558
Alignment:
Q  122 tcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgt 221  Q
    |||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||    
T  15370428 tcggatgaaacagtaaatgttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccatagccttaaggttttgcgtaagagtgtggcgtctctcttgtttgt 15370527  T
Q  222 gtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 252  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15370528 ggggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 15370558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 108 - 250
Target Start/End: Original strand, 33747783 - 33747925
Alignment:
Q  108 ttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtg 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  33747783 ttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttaaatactttataagtaagaggatccataaactcattgccttaagattttggataagagtgtggtg 33747882  T
Q  208 tctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt 250  Q
    |||||||| ||| || |||||||||||||| ||||||||||||    
T  33747883 tctctcttccttatgcggttgttctagccttgatgtggacggt 33747925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 93 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 29549416 - 29549278
Alignment:
Q  93 gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttg 192  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  29549416 gtttgcaagtgtgagttatatgttccatatcagataaaatagtaaaggatgaacaccatataagtaagaagacccataaacacattaccttaaggttttg 29549317  T
Q  193 ggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttc 231  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  29549316 gataagagtgtggcgtctctcttgcttatgtggttgttc 29549278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 30 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 36522120 - 36521922
Alignment:
Q  30 aagagcttctgcttgagg-gggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggata 128  Q
    ||||||||| |||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  36522120 aagagcttccgcttgaggtgggataacgatgaattgatggactcacacttgagggagagtgttg-tgcgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagata 36522022  T
Q  129 aaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttg 228  Q
     || |||  |||||||||||  | ||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   |||||||   |||||||||||    
T  36522021 gaaaagttgaggttgaacactctttaaatgagaggacccataaaccaattgccttaaggttttgggtaagagtgtgtcatctctctcatttgtgtggttg 36521922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 88 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 5723957 - 5723811
Alignment:
Q  88 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 187  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| ||||||| |||||| ||   |||| |||||||    
T  5723957 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaataataaaagttgaacacattatatgtaagagaacccattaatttattgtcttaagg 5723858  T
Q  188 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctag 234  Q
    ||||||| |||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5723857 ttttgggaaagagtatagtgtctctcttgcttgtgcggttgttctag 5723811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 57 - 246
Target Start/End: Original strand, 38427518 - 38427697
Alignment:
Q  57 atgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataag 156  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||| ||||||||    
T  38427518 atgaatagatggactcacacttgagggggagtgttg---------tgtgagttatatgtcccacattggatagaaaagtaaaggttgaacatcttataag 38427608  T
Q  157 taagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgga 246  Q
    || |||||||||| || |||||| |||||||||||| |||||||||||  ||||||||  |||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  38427609 ta-gaggacccattaatccattgtcttaaggttttgtgtaagagtgtgacgtctctctcacttgtgcggttgttctaacctcgatgtgga 38427697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 30 - 214
Target Start/End: Original strand, 31509555 - 31509742
Alignment:
Q  30 aagagcttctgcttgagggg-gagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggag--tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcgga 126  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  31509555 aagagcttccgcttgaggggtgagcatgatgaattgatggactcacacttgagggagagattgttg-tgtgcaagtgtgagttatatgtctcacatcgga 31509653  T
Q  127 taaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg-ttttgggtaagagtgtggtgtctctct 214  Q
    || || |||  ||||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||| |||| ||||||| ||| ||||||||||    
T  31509654 tagaaaagtggaggttgagcactttataagtgagaggactcataaactcattgccttgaggttttttggtaagaatgtagtgtctctct 31509742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 33 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 36522459 - 36522277
Alignment:
Q  33 agcttctgcttgagggg--gagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaa 130  Q
    |||||| ||||||||||  || ||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||| | || |||||||||||||||||| ||||| ||||| |    
T  36522459 agcttccgcttgaggggaggaacacgatgaattgatggatttacaattgagggggagtgttg-tatgaaagtgtgagttatatgtctcacattggataga 36522361  T
Q  131 atagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 214  Q
    | | |  | ||||||||  |||||||| |||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36522360 aaaatggaagttgaacattttataagtgagaggaccaataaacccattatcttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 36522277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 96 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 26591068 - 26590918
Alignment:
Q  96 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 195  Q
    ||||||||||| ||| |||| ||| |||| ||  || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  || ||||||||||||||| ||    
T  26591068 tgcaagtgtgatttaaatgttccatatcgaatcgaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggatccataaattcaatgccttaaggttttgagt 26590969  T
Q  196 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgga 246  Q
    |||||||||| ||||||||  || |||||||||||||| ||||||||||||    
T  26590968 aagagtgtggcgtctctctcactagtgtggttgttctaacctcgatgtgga 26590918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 98 - 252
Target Start/End: Original strand, 300961 - 301107
Alignment:
Q  98 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 197  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||        || ||||||||||||| |||| |||||    
T  300961 caagtgtgggttatatgtcccacatcagataaaacagtaaaggttgaataccttataagtaagag--------aatccattgccttaagatttttggtaa 301052  T
Q  198 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 252  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||| |||||||    
T  301053 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggctgttcaagtctcgacgtgaacggtcc 301107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 98 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 35167994 - 35167838
Alignment:
Q  98 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 197  Q
    ||||| |||||||| | || |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| | |||||||| | ||||| |||||    
T  35167994 caagtatgagttatgtatctcacatcagataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaggatgacccataaatctattgccttgatgtttttggtaa 35167895  T
Q  198 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 254  Q
    ||||||| ||||||||   || |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  35167894 gagtgtgatgtctctcacactagtgtggttgttctagcatcgatgtggactgtcccc 35167838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 99 - 254
Target Start/End: Original strand, 2411010 - 2411165
Alignment:
Q  99 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaag 198  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||| |  |||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  2411010 aagtgtgagttatatgtcctacattggatagagaagtaaaagttgaacatcttgtaagtaagagaacccataaacttattgccttaaggttttgagtaag 2411109  T
Q  199 agtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 254  Q
    ||||| || ||||| || ||||  || |||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  2411110 agtgtagtttctctattacttgaatgattgttctaacctcgatatggacggtcccc 2411165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 99 - 254
Target Start/End: Original strand, 35914852 - 35915007
Alignment:
Q  99 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaag 198  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||  | |||| ||||    
T  35914852 aagtatgagttatatgtcacacatcggataaaagagtaaaggttgaacattttataagtaagaagacccgtaaatccattgccctaaattattggataag 35914951  T
Q  199 agtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 254  Q
    | |||||| |||||||||||| | || ||| || | |||| |||||||||||||||    
T  35914952 aatgtggtatctctcttgcttatatgattggtcaaacctcaatgtggacggtcccc 35915007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 88 - 171
Target Start/End: Original strand, 7768842 - 7768925
Alignment:
Q  88 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataa 171  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7768842 tgttggttttcaagtgtgagttatatatcctacatcggataaaataataaaggttgaacaccttataagtaaaaggacccataa 7768925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 98 - 191
Target Start/End: Original strand, 42508614 - 42508707
Alignment:
Q  98 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggtttt 191  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||| || |||||||||| |||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  42508614 caagtgtgaattatatatcccacatcggatagaaaagtaaaggttaaacatctaataagtaagaggactcataaacccattgccttaaggtttt 42508707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 182 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 26900089 - 26900017
Alignment:
Q  182 ttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26900089 ttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgggtttgttctagccttgatgtggacggtcccc 26900017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 98 - 176
Target Start/End: Original strand, 26074320 - 26074398
Alignment:
Q  98 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaaccca 176  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| || | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26074320 caagtgtgagttatatgtcccacatcagatagaaaactaaagattgaacaccttataagtaagaggacccataaaccca 26074398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 99 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 41635346 - 41635212
Alignment:
Q  99 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaag 198  Q
    |||| ||||||||||||  | |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| |||||  |||| ||||||    
T  41635346 aagtatgagttatatgtttcccatcagataaaagagtaaatgttgaacaccttataaataagaggatccataaatccattgtcttaaaattttaggtaag 41635247  T
Q  199 agtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 233  Q
    ||||| || ||||| || ||||| |||||| ||||    
T  41635246 agtgtagtatctcttttacttgtatggttgctcta 41635212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 26 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 13785837 - 13785732
Alignment:
Q  26 aagtaagagcttctgcttgagggggag-cacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcg 124  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||  || ||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||| ||||    
T  13785837 aagtaagagcttccgcttgaaggggaaacatgatgaatagatagactcacatttgagggggagtgttg-tgtggaagtgtgagttatatgtcccaaatcg 13785739  T
Q  125 gataaaa 131  Q
    |||||||    
T  13785738 gataaaa 13785732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 98 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 13786157 - 13786002
Alignment:
Q  98 caagtgtgagttat-atgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggta 196  Q
    ||||||||||| || ||||  |||||||||||||| ||| | |||||||||| |||||||||||| ||||| |||| | |||| |||||| |||||| ||    
T  13786157 caagtgtgagtaattatgtttcacatcggataaaa-agtgatggttgaacactttataagtaagatgacccgtaaatctattgtcttaagattttggata 13786059  T
Q  197 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccc 253  Q
    |||||||| |||||||||  ||  | || ||||||| |||||| ||| |||||||||    
T  13786058 agagtgtgatgtctctctcactattatgattgttctggcctcgttgtcgacggtccc 13786002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 110 - 221
Target Start/End: Original strand, 31509745 - 31509857
Alignment:
Q  110 atatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg-ttttgggtaagagtgtggtgt 208  Q
    ||||||| ||||||||||| || |||  ||||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||| |||| ||||||| ||||||||    
T  31509745 atatgtctcacatcggatagaaaagtggaggttgagcactttataagtgagaggactcataaactcattgccttgaggttttttggtaagaatgtggtgt 31509844  T
Q  209 ctctcttgcttgt 221  Q
    |||||| ||||||    
T  31509845 ctctctcgcttgt 31509857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 163 - 214
Target Start/End: Original strand, 13042606 - 13042657
Alignment:
Q  163 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13042606 gacccataaacccattgccttaaggttttggataagagtgtggtgtctctct 13042657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 183 - 254
Target Start/End: Original strand, 38427306 - 38427377
Alignment:
Q  183 taaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 254  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| | ||||||||    
T  38427306 taagattttgggtaagagtgtggcgtctctcttgcttgtgcggttgttctaacctcgatgttggcggtcccc 38427377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 98 - 177
Target Start/End: Original strand, 39309686 - 39309764
Alignment:
Q  98 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccat 177  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||    
T  39309686 caagtatgagttatatgtcccacatcggataaaagggtaaatgttgaacacattataaataagagga-ccataaacccat 39309764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 180 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 795306 - 795254
Alignment:
Q  180 ccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttct 232  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  795306 ccttaaggttttaggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttct 795254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 154 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 13785732 - 13785632
Alignment:
Q  154 aagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccc 253  Q
    |||||| |||| | ||||||||||  ||||||||||||  |||| |||||||||| ||||| | |||| ||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  13785732 aagtaataggatctataaacccataaccttaaggttttaagtaaaagtgtggtgtttctctcgtttgtatggttgttctaacttcgatgtggacggtccc 13785633  T
Q  254 c 254  Q
    |    
T  13785632 c 13785632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 167 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 9498410 - 9498343
Alignment:
Q  167 cataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctag 234  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||    
T  9498410 cataaacccattgccttaagcatttgagtaagagtgtggcgtctctcttgcaagtgtggttgttctag 9498343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 153 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 36527196 - 36527117
Alignment:
Q  153 taagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttct 232  Q
    ||||| |||||| |||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||  ||||||||| ||||||    
T  36527196 taagtgagaggatccataaacgcattgccttaagattttggataagagtgtgctgtctctctcacttgtgtggctgttct 36527117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 23 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 9498480 - 9498411
Alignment:
Q  23 gcaaagtaagagcttctgcttga-gggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgtt 91  Q
    ||||||||||||||||  ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  9498480 gcaaagtaagagcttccccttgaagggggagcatgatgaatagatggactcacacttgagggggtgtgtt 9498411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 98 - 191
Target Start/End: Original strand, 42524719 - 42524811
Alignment:
Q  98 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggtttt 191  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||| |||||||| ||||| | ||||||||| |||||| |||||| || ||||||||    
T  42524719 caagtgtgaattatatgtctcacatcggatagaaaagtaaa-gttgaacatcttatgaataagaggactcataaatccattgtctgaaggtttt 42524811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 154 - 214
Target Start/End: Original strand, 32445943 - 32446003
Alignment:
Q  154 aagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 214  Q
    |||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  32445943 aagtgagaggacccataaacccaacgccttaaggttttgggttaaagtgtggtgtctctct 32446003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 163 - 210
Target Start/End: Original strand, 13112604 - 13112651
Alignment:
Q  163 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtct 210  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13112604 gacccataaacccattgtcttaaggttttggataagagtgtggtgtct 13112651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 99 - 156
Target Start/End: Original strand, 6225047 - 6225104
Alignment:
Q  99 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataag 156  Q
    |||| |||||||||| ||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  6225047 aagtctgagttatatatcccacatcagataaaagaataaaggttgaacaccttataag 6225104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 88 - 136
Target Start/End: Original strand, 5660290 - 5660338
Alignment:
Q  88 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagta 136  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  5660290 tgttggtttgcaaatgtgagttatatgttccacatcgaataaaatagta 5660338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 133 - 221
Target Start/End: Original strand, 19275566 - 19275653
Alignment:
Q  133 agtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgt 221  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||  ||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||    
T  19275566 agtagaggttgaacac-ttataaggaagaagacccataaattcattgtcttaagattttgggtaagattgtggcgtctgtctcgcttgt 19275653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 176 - 214
Target Start/End: Original strand, 13042784 - 13042822
Alignment:
Q  176 attgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 214  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13042784 attgccttaaggttttgggtaagaatgtggtgtctctct 13042822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 176 - 214
Target Start/End: Original strand, 13112782 - 13112820
Alignment:
Q  176 attgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 214  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13112782 attgccttaaggttttgggtaagaatgtggtgtctctct 13112820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 96 - 138
Target Start/End: Original strand, 35150747 - 35150789
Alignment:
Q  96 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaa 138  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  35150747 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcgaataaaagagtaaa 35150789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 96 - 138
Target Start/End: Original strand, 35151038 - 35151080
Alignment:
Q  96 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaa 138  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  35151038 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcgaataaaagagtaaa 35151080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 154 - 252
Target Start/End: Original strand, 42435486 - 42435583
Alignment:
Q  154 aagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 252  Q
    ||||||||||| |||||| |  ||| |||||||||||||  | |||||||| |||||||||     |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  42435486 aagtaagaggatccataatct-attaccttaaggttttgaatcagagtgtgatgtctctctcataagtgtggttgttctagcatcgatgtggacggtcc 42435583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 198 - 250
Target Start/End: Original strand, 24489583 - 24489635
Alignment:
Q  198 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt 250  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| || |||||    
T  24489583 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcagttgttctaacctcgatatgaacggt 24489635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 64 - 108
Target Start/End: Original strand, 15370380 - 15370426
Alignment:
Q  64 gatggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagt 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||    
T  15370380 gatggactcacacttgagggggagtgttgttgtgtgcaagtgtgagt 15370426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 163 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 36389067 - 36389016
Alignment:
Q  163 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 214  Q
    ||||||||||| || ||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||    
T  36389067 gacccataaactcagtgccttagggttttgggtcagagtgtggtgtttctct 36389016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 178 - 208
Target Start/End: Original strand, 5963765 - 5963795
Alignment:
Q  178 tgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgt 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5963765 tgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgt 5963795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 150 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 9510624 - 9510546
Alignment:
Q  150 ttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttg 228  Q
    |||||||| |||||| ||||||||| | ||||||||  |||| ||||| | | | ||||||||||| ||||||||||||    
T  9510624 ttataagtgagaggagccataaacctaatgccttaaaattttaggtaaaaatatagtgtctctcttacttgtgtggttg 9510546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 88 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 22299014 - 22298956
Alignment:
Q  88 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggat-aaaatagtaaaggttgaa 145  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||| |||||| |||||||||||    
T  22299014 tgttggtttgcatgtgtgggttatatgtctcacatcagataaaaataataaaggttgaa 22298956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 194 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 795189 - 795152
Alignment:
Q  194 gtaagagtgtggtgtctctcttgc-ttgtgtggttgtt 230  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  795189 gtaagagtgtggtgtctctcttgctttgtgtggttgtt 795152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 186 - 250
Target Start/End: Original strand, 5660340 - 5660405
Alignment:
Q  186 ggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctc-gatgtggacggt 250  Q
    |||||||| ||| ||| |||||| | ||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  5660340 ggttttggataaaagtatggtgtttttcttgtttgtgtggttgttctagcctcaaatgtggacggt 5660405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 167 - 208
Target Start/End: Original strand, 34103625 - 34103666
Alignment:
Q  167 cataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgt 208  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  34103625 cataaactcattgccttaaggttttgaataagagtgtggtgt 34103666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 201 - 254
Target Start/End: Original strand, 35150810 - 35150863
Alignment:
Q  201 tgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 254  Q
    ||||||||||||||  || ||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  35150810 tgtggtgtctctctcactagtgtgattgttttagcctcgatgtggatggtcccc 35150863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 164 - 208
Target Start/End: Original strand, 41341523 - 41341567
Alignment:
Q  164 acccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgt 208  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  41341523 acccatacactcattgccttaaggtttttggtaagaatgtggtgt 41341567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 164; Significance: 9e-88; HSPs: 106)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 31 - 253
Target Start/End: Original strand, 36629172 - 36629394
Alignment:
Q  31 agagcttctgcttgaggg-ggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataa 129  Q
    |||||||| |||||| || |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  36629172 agagcttccgcttgaaggtggagcatgatgaattgatgggctcacacttgagggggagtgttgtgtt-caagtgtgagttatatgtcccacatcggatag 36629270  T
Q  130 aatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgt 229  Q
    || |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36629271 aaaagtaaaagttaaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgt 36629370  T
Q  230 tctagcctcgatgtggacggtccc 253  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  36629371 tctagcctcgatgtggacggtccc 36629394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 26 - 253
Target Start/End: Original strand, 39404327 - 39404555
Alignment:
Q  26 aagtaagagcttctgcttgagggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttg--caagtgtgagttatatgtcccacatc 123  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| | ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  39404327 aagtaagagcttccgcttgagggagagcacgatgaattgatggact-acacttgaggaggagtgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacatc 39404425  T
Q  124 ggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgt 223  Q
     ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  39404426 agataaaagagtaaaggtggaacaccttataagtaagaggacccataaacctatagccttaaggttttgggcaagaatgtggtgtctctcttgcttgtgt 39404525  T
Q  224 ggttgttctagcctcgatgtggacggtccc 253  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  39404526 ggttgttctagcctcgatgtgaacggtccc 39404555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 26 - 244
Target Start/End: Original strand, 54108845 - 54109060
Alignment:
Q  26 aagtaagagcttctgcttga-gggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcg 124  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||| ||||||  |||||||||||    
T  54108845 aagtaagagcttccgcttgaagggggagcatgatgaattaatagactcacacttaagggggagtgttg-tgtgcaagtgtcagttat--gtcccacatcg 54108941  T
Q  125 gataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtg 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  54108942 gataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaa-gttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcg 54109040  T
Q  225 gttgttctagcctcgatgtg 244  Q
    ||||||||||| ||||||||    
T  54109041 gttgttctagcttcgatgtg 54109060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 30 - 254
Target Start/End: Original strand, 44620592 - 44620817
Alignment:
Q  30 aagagcttctgcttgagggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggat 127  Q
    ||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44620592 aagagcttccgcttttgggggagcacgatgaattgatggactcacacttgaggtggagtgtcgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggat 44620691  T
Q  128 aaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggtt 227  Q
     |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  44620692 gaaatagtagaggttgaacactttataagtaagaggacccataaa-ccataaccttaaggttttgggtaagagtgtggtttctctcttgcttgtgcggtt 44620790  T
Q  228 gttctagcctcgatgtggacggtcccc 254  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||    
T  44620791 gttatatcctcgatgtggacggtcccc 44620817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 96 - 251
Target Start/End: Original strand, 25483336 - 25483491
Alignment:
Q  96 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 195  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25483336 tgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaatagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggatccataaacccattgccttaaggttttgggt 25483435  T
Q  196 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtc 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25483436 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtc 25483491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 88 - 254
Target Start/End: Original strand, 41370349 - 41370515
Alignment:
Q  88 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 187  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  41370349 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccaaatcggataaaatagtaaatgttgaaaaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaag 41370448  T
Q  188 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 254  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41370449 ttttgggtaagagtgtagtgtctctcttgcttgagtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 41370515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 86 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 50630921 - 50630755
Alignment:
Q  86 agtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaa 185  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50630921 agtgttggtttgcaagcgtgagttatatgtcctacatcggataaaatagtaaaggttgaacacattataagtaagaggacccataaacccattgccttaa 50630822  T
Q  186 ggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 252  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  50630821 ggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttttagcctcgatgtgggcggtcc 50630755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 88 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 55933288 - 55933122
Alignment:
Q  88 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 187  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  55933288 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcctacatcggataaaatagtaagggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaag 55933189  T
Q  188 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||   ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55933188 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttacttgtacagttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 55933122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 29 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 18932983 - 18932747
Alignment:
Q  29 taagagcttctgcttga-gggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcgg-- 125  Q
    |||||| ||| |||||| ||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||      
T  18932983 taagagtttccgcttgaagggggagcatgatgaatagatagactcacacttgaggggg-gtgttggtttgcaagtctgagttatatgtcccacatcggtc 18932885  T
Q  126 ---------ataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttg 216  Q
             |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  18932884 ctacatcggataaaatagtaaaggttgaataccttataaataagaggacccataaacccattgccttaaggttttaggtaagagtgtggtgtctctctta 18932785  T
Q  217 cttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 254  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  18932784 cttgagtggttgttatagcctcgatgtgtacggtcccc 18932747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 96 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 54017751 - 54017596
Alignment:
Q  96 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  54017751 tgcaagtgtgagttatatgtcccacgtcagataaaatagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttaggt 54017652  T
Q  196 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtc 251  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54017651 aagagtgtgatgtctctcttgcttatgtggttgttctagcctcgatgtggacggtc 54017596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 96 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 1731803 - 1731646
Alignment:
Q  96 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 195  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1731803 tgcaaatgtgagttatatgtcccacatcagataaaacagtaaaggttgaacatcttataaataagaggacccataaaccaattgccttaaggttttgggt 1731704  T
Q  196 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccc 253  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1731703 aagagtgtggtgtttctcttgcttgtgtggttgttctagcctcaatgtggacggtccc 1731646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 93 - 254
Target Start/End: Original strand, 50002423 - 50002584
Alignment:
Q  93 gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttg 192  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  50002423 gtttgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaaggttgaacactttttaagtaagaggacccataaatccattgtcttaaggttttg 50002522  T
Q  193 ggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 254  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  50002523 ggtaagagtgtggtgtctctcttacttgtgcggttgttctagcctcgatgtgggcggtcccc 50002584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 96 - 251
Target Start/End: Original strand, 3340807 - 3340962
Alignment:
Q  96 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 195  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3340807 tgcaagtgtgagttatatgtcccgcatcagatgaaagagtaaaggttgagcaccttataagtaagaggacccataaacccactgccttaaggttttgggt 3340906  T
Q  196 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtc 251  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3340907 aagagtgtggtgtctttcttgcttgtggggttgttctagcctcgatgtggacggtc 3340962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 96 - 254
Target Start/End: Original strand, 10245920 - 10246077
Alignment:
Q  96 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 195  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||    
T  10245920 tgcaagtgtgagttatatgccccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacc-ataaacccaaagccttaaggttttgggt 10246018  T
Q  196 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 254  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10246019 aagagtgtggtgtctcccttgcttgtctggttgttctagcctcgatgtggacgctcccc 10246077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 98 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 39793014 - 39792860
Alignment:
Q  98 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||| ||||||||||||||||| ||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  39793014 caagtgtgagttatatgtcccacatcagatagaaaagtaaatgttgaacaccttataagaaagaggaaccgtaaactcattgccttaaggttttgggtaa 39792915  T
Q  198 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 252  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39792914 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 39792860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 23 - 205
Target Start/End: Original strand, 2740997 - 2741180
Alignment:
Q  23 gcaaagtaagagcttctgcttgagggggag--cacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccac 120  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||  || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||    
T  2740997 gcaaagtaagagcttccgcttgaaggggagagcatgatgaattgatggactcacacttgaaggggagtgtta-tgtgcaagtgtgagttatatgtcccac 2741095  T
Q  121 atcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtgg 205  Q
    ||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2741096 atcagatagaatagtaaaggttgaataccttataagtaagaggacccataactccattgccttaaggttttgggtaagagtgtgg 2741180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 96 - 244
Target Start/End: Original strand, 52884695 - 52884844
Alignment:
Q  96 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggtttt-ggg 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||| |||    
T  52884695 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgatcgataaacccattgccttaaggttttgggg 52884794  T
Q  195 taagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtg 244  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  52884795 taagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgatctagcctcgatgtg 52884844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 66 - 244
Target Start/End: Original strand, 52884856 - 52885038
Alignment:
Q  66 tggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagg 163  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52884856 tggactcacacttgagggg-agtgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagg 52884954  T
Q  164 acccataaacccattgccttaaggtttt-gggtaagagtgtggtg--tctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtg 244  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||    
T  52884955 atccataaacccattgccttaaggttttggggtaagaatgtggtgtctctctcttatttgtgtggttgatctagcctcgatgtg 52885038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 45 - 249
Target Start/End: Original strand, 20826167 - 20826370
Alignment:
Q  45 agggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttga 144  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||   | | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20826167 agggggagcatgatgaatagatggactcacacttgagggggagtgttatgtagaaa-tgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaagttga 20826265  T
Q  145 acaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtg 244  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||  |||| |||||||||||| |||||||||| ||| || | |||||||||||||||||||    
T  20826266 acacgttataagtaagagaacccataaacccatagccttaacattttaggtaagagtgtgatgtctctcttccttatgcgattgttctagcctcgatgtg 20826365  T
Q  245 gacgg 249  Q
    |||||    
T  20826366 gacgg 20826370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 65 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 22028150 - 22027960
Alignment:
Q  65 atggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagag 162  Q
    |||||||||||||| ||| || ||||||  || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  22028150 atggactcacacttaaggaggggtgttgttgtgtgcaagtgtgacttatatgtcccacatcggataaaatacgaaaggttgaacaccttataagtaagag 22028051  T
Q  163 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccc 253  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||| ||| |||||||||||| |||||    
T  22028050 gacccataaacatattgccttaaggttttgggtaagaatgtggtgtctctctcgcttatgtggttgttttagtctcgatgtggacagtccc 22027960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 96 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 36608817 - 36608659
Alignment:
Q  96 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 195  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  36608817 tgcaagtgtgagttatatgtccaacatcggataaaagagtaaaagttgaacacctcataagtaagaggatccataaatccattgtcttaaggttttgggt 36608718  T
Q  196 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 254  Q
    |||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36608717 aagagtgtggtgtctctctcactagtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 36608659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 98 - 254
Target Start/End: Original strand, 39404020 - 39404176
Alignment:
Q  98 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 197  Q
    |||||||||||||||||||| |||| | |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||| || ||||||||||||||||    
T  39404020 caagtgtgagttatatgtcctacattgaataaaagagtaaaggttgaacactttataagtaagaggactcataaactcatagcattaaggttttgggtaa 39404119  T
Q  198 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 254  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39404120 gagtgtggcgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 39404176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 98 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 34646803 - 34646648
Alignment:
Q  98 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  34646803 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaacagtaaatgttgaacaccttataactaagaggactcataaactcattgccttaaggttttgggtaa 34646704  T
Q  198 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccc 253  Q
    ||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  34646703 gagtgtggtgtctctctggtctgtgtggttgttctagccttgttgtggacggtccc 34646648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 88 - 234
Target Start/End: Original strand, 49880152 - 49880297
Alignment:
Q  88 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 187  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  49880152 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacattgaataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccactgccttaagg 49880251  T
Q  188 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctag 234  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||||||    
T  49880252 ttttgggtaagagcgtggtgtctctcttgtttatgt-gttgttctag 49880297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 99 - 253
Target Start/End: Original strand, 50459724 - 50459878
Alignment:
Q  99 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaag 198  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||| ||||||    
T  50459724 aagtgtgagttatatgttccacatcggttaaaagagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggactcataaacccattatcttaaggttttaggtaag 50459823  T
Q  199 agtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccc 253  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  50459824 agcgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgcacggtccc 50459878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 106 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 54343147 - 54343006
Alignment:
Q  106 agttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtgg 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54343147 agttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggaccc-------cattgccttaaggttttgggtaagagtgtgg 54343055  T
Q  206 tgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 254  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  54343054 tgtctctcttgcttgagtggttgttctagcctcgatgtggatggtcccc 54343006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 105 - 254
Target Start/End: Original strand, 44620362 - 44620511
Alignment:
Q  105 gagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 204  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44620362 gagttatatgttccacatcggataaaacagtaaaggttgaacaccttataaataagagagcccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 44620461  T
Q  205 gtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 254  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  44620462 atgtttctcttgcttgtgtggttgttctaaccttgatgtggacggtcccc 44620511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 98 - 254
Target Start/End: Original strand, 36572021 - 36572177
Alignment:
Q  98 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  36572021 caagtgtgagttatatgtcccacatcgaataaaagagtaaatgttgaacaccttataagtaagaagacccataaatccattgccttaaggttttgggtta 36572120  T
Q  198 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 254  Q
    |||| |||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  36572121 gagtatggtgtctctctcgcttgtgcggttgttcaagcctcgatgtgaacggtcccc 36572177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 96 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 22183420 - 22183262
Alignment:
Q  96 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 195  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22183420 tgcaagtgtgagttatatatcccacatcggataaaagagtaaatgttgaacaatttataagtaaaaggacccataaacccattgccttaaggttttggat 22183321  T
Q  196 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 254  Q
    |||||||||| ||||||||  |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22183320 aagagtgtggcgtctctctcacttgtacggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 22183262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 45 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 3244657 - 3244449
Alignment:
Q  45 agggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttga 144  Q
    ||||||| || ||||||| ||||||||||| ||| |||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||    
T  3244657 agggggaacatgatgaatagatggactcacgcttaagggagagtgttg-tgtgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggatagaaaagtaaaggttga 3244559  T
Q  145 acaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtg 244  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| ||||  ||||||||  ||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  3244558 acatcttataagtaagaggacccataaactcattgtcttaaagttttgggtaagaatgtgtcgtctctctcacttgtatggttgttccagcctcgatgtg 3244459  T
Q  245 gacggtcccc 254  Q
    | | ||||||    
T  3244458 ggcagtcccc 3244449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 96 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 4955473 - 4955332
Alignment:
Q  96 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 195  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4955473 tgcaagtgtgagttatatgtctcatatcggataaaatagttaaggttgaacaccttataagtaagaggactcataaacccattgccttaaggttttgggt 4955374  T
Q  196 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcct 237  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||    
T  4955373 aagagtgtggcgtctctcttacttgtgcggttgctctagcct 4955332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 105 - 254
Target Start/End: Original strand, 44621011 - 44621160
Alignment:
Q  105 gagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 204  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  44621011 gagttgtatgacccacatcggataaaacagtaaaggttgaacaccttataagtaagagggcacataaactcattgtcttaaggttttgggtaagagtgtg 44621110  T
Q  205 gtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 254  Q
    |||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  44621111 gtgtttctcttgcttgtgcggttattctagcctcgatgtggacggtcccc 44621160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 115 - 254
Target Start/End: Original strand, 54936215 - 54936353
Alignment:
Q  115 tcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 214  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54936215 tcccacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttgtaagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 54936314  T
Q  215 tgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 254  Q
      | | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  54936315 cac-tatgtggttgttctagcctcgatgtggacagtcccc 54936353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 96 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 49076986 - 49076829
Alignment:
Q  96 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 195  Q
    |||||||||||||||||||| ||| || || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  49076986 tgcaagtgtgagttatatgttccatattggctaaaatagtaaaggttgaacaccttata-gtaagagaacccataaacccataaccttaaggttttgggt 49076888  T
Q  196 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 254  Q
     |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  49076887 tagagtgtggtgtctttcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggactgtcccc 49076829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 96 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 22028527 - 22028367
Alignment:
Q  96 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatag--taaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgg 193  Q
    ||||||||| | |||||||||| ||||||||||||| |   ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||    
T  22028527 tgcaagtgttacttatatgtcctacatcggataaaaaaaaataaaggttgaacaccttattagtaagaggacccataaactcattgtcttaatgttttgg 22028428  T
Q  194 gtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22028427 gtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgaggttgttctagcctcaatgtggacggtcccc 22028367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 96 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 32941279 - 32941128
Alignment:
Q  96 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 195  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||| | || ||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  32941279 tgcaagtgtgagttatatgtcttacatcggaaagaacagtaaaggttgaacaccttataaataagagggctcataaactcattgccttaaggttttgggt 32941180  T
Q  196 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggac 247  Q
    |||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  32941179 aagagtgtgacgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggac 32941128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 99 - 254
Target Start/End: Original strand, 49302907 - 49303064
Alignment:
Q  99 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataa--gtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggta 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49302907 aagtgtgagttatatgtcccacatcaaataaaaaagtaaaggttgaacatcttataaaagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggta 49303006  T
Q  197 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 254  Q
    |||||||||||| |||||| ||| || | |||||||| |||||||||||||| |||||    
T  49303007 agagtgtggtgtatctcttacttatgcgattgttctatcctcgatgtggacgatcccc 49303064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 95 - 254
Target Start/End: Original strand, 54108537 - 54108694
Alignment:
Q  95 ttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacc-cattgccttaaggttttgg 193  Q
    |||||||||||||||||  |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  54108537 ttgcaagtgtgagttat--gtcccatataggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggacccataaaattcattgccttaaggttttgg 54108634  T
Q  194 gtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 254  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  54108635 ctaagagtgtggtgtctatcttgcttgtgtggttgttctagcctcaatgtgg-cggtcccc 54108694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 97 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 16889691 - 16889535
Alignment:
Q  97 gcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggta 196  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||| | |||||||| ||||||||||    
T  16889691 gcaagtgtgagttatatgtctcaaatcggatagaaaagtaaaggttgaataccttataagtaagaggattcataaacctactgccttaaagttttgggta 16889592  T
Q  197 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccc 253  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  16889591 agagtatggtgtctctcttccttgtgtgattgttctaacctcgatgtggacggtccc 16889535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 102 - 254
Target Start/End: Original strand, 20825842 - 20825994
Alignment:
Q  102 tgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagt 201  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||  | |||||||||||||||||||||||    
T  20825842 tgtgagttatatgttccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataaataagagcacccataaacctttagccttaaggttttgggtaagagt 20825941  T
Q  202 gtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 254  Q
    ||||||| |||||| ||| || |||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  20825942 gtggtgtttctcttccttatgcggttgttctagccttgatgtggacagtcccc 20825994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 26 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 49076679 - 49076449
Alignment:
Q  26 aagtaagagcttctgcttga-gggggagcacgatgaat--tgatggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtcccac 120  Q
    ||||||||| ||| |||||| |||||| || ||||||   |||||||||||||||||||| |||||||||  || |||||||||||||||||||| |||     
T  49076679 aagtaagagtttccgcttgaagggggaacatgatgaaaagtgatggactcacacttgaggaggagtgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtaccat 49076580  T
Q  121 atcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttg 220  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| | ||||||||  || | ||||||| ||| ||||     
T  49076579 atcggataaaacagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacctataaacccattgtcttaaag-tttgggta--agggcggtgtctgtctcgctta 49076483  T
Q  221 tgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 254  Q
    || | ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  49076482 tgcgattgttatagcctcgatgtggacggtcccc 49076449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 96 - 254
Target Start/End: Original strand, 2740700 - 2740856
Alignment:
Q  96 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||  ||    
T  2740700 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggatagaacagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacctataaacccagagccttaaggttttacgt 2740799  T
Q  196 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 254  Q
    |||||||||| ||||||||  ||  ||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  2740800 aagagtgtggcgtctctctcact--tgtggttgttctagcctcgatatggatggtcccc 2740856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 111 - 225
Target Start/End: Original strand, 45496820 - 45496934
Alignment:
Q  111 tatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtct 210  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45496820 tatgtcccacatcggataaaatcgtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacctataaactcattgtcttaaggttttgggtaagagtgtggtgtct 45496919  T
Q  211 ctcttgcttgtgtgg 225  Q
    |||||||||||||||    
T  45496920 ctcttgcttgtgtgg 45496934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 97 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 16888971 - 16888814
Alignment:
Q  97 gcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggta 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||| ||||| |||| |||||||||||    
T  16888971 gcaagtgtgagttatatgtcccacatcggatagaaaagtaaaggttgaataccttataagtaagagaacctataaactcattgtcttacggttttgggta 16888872  T
Q  197 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 254  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| | |||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  16888871 agagtgtgatgtctctcttgtttgtgcgattgttctagtttcgatgtagacggtcccc 16888814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 53 - 254
Target Start/End: Original strand, 3341083 - 3341286
Alignment:
Q  53 cacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacacct 150  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||  ||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| |    
T  3341083 cacgataaagtgatggactcacacttgaggcagagtgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacattggataaaagagtaaaggttaaacactt 3341182  T
Q  151 tataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt 250  Q
    |||||||||||||||||||||   |||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||  || ||||||| || || ||||||||| ||||||    
T  3341183 tataagtaagaggacccataacatcattgttttaagattttgggtaagagtgtgatgtctttcttaattatgtggttattttaacctcgatgtagacggt 3341282  T
Q  251 cccc 254  Q
    ||||    
T  3341283 cccc 3341286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 26 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 45489561 - 45489331
Alignment:
Q  26 aagtaagagcttctgcttgagggggagcacgatgaatt-gatggactcacacttgaggggg-agtgttggtttg--caagtgtgagttatatgtcccaca 121  Q
    ||||||||||||| |||||| | |||||| ||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||| | ||  ||||||||| ||||||||| ||||    
T  45489561 aagtaagagcttccgcttgaagaggagcatgatgaaaacgatggactcacacttgaggggggagtgttgttgtgtacaagtgtgaattatatgtctcaca 45489462  T
Q  122 tcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgt 221  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| || | |||||| | ||  ||||| |||| |||||||||||| ||||||| ||||| ||    
T  45489461 tcggataaaagagtaaaggttgaacaccatataagtaagagaactcttaaacctactg-tttaagatttttggtaagagtgtgatgtctcttttgctagt 45489363  T
Q  222 gtggttgttctagcctcgatgtggacggtccc 253  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  45489362 gtgattgttctagcctcgatgtggatggtccc 45489331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 96 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 4390257 - 4390102
Alignment:
Q  96 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 195  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || | | | |||||| ||||||||||||||    
T  4390257 tgcaagtgtgagttacatatcccacatcagataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggatcctttagcacattgcgttaaggttttgggt 4390158  T
Q  196 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtc 251  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||    
T  4390157 aagagtgtgacgtctctcttgcttgtgcagttgttctagcctcgatgcggacggtc 4390102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 72 - 250
Target Start/End: Original strand, 43174480 - 43174661
Alignment:
Q  72 cacacttgagggggagtgttggtttg--caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaat-agtaaaggttgaacaccttataagtaagaggaccca 168  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||| | |||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  43174480 cacacttgagggggagtgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgccacacatcagataaaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacaca 43174579  T
Q  169 taaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt 250  Q
    |||||| ||  |||||| || |||||||||||||||| |||||||||| || | |||||||| |||||| ||||||||||||    
T  43174580 taaacctatgaccttaaagtgttgggtaagagtgtggcgtctctcttgtttatatggttgttgtagccttgatgtggacggt 43174661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 150 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 23817783 - 23817679
Alignment:
Q  150 ttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacgg 249  Q
    |||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23817783 ttataagtaagaggattcataaactcattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgctagtgtggttgttctagcctcgatgtggacgg 23817684  T
Q  250 tcccc 254  Q
    |||||    
T  23817683 tcccc 23817679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 30 - 162
Target Start/End: Original strand, 44621358 - 44621492
Alignment:
Q  30 aagagcttctgcttgagggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggat 127  Q
    ||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  44621358 aagagcttccgcttttgggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgtcgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtccaacatgggat 44621457  T
Q  128 aaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagag 162  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  44621458 aaaacagtaaaggttaaacaccttataagtaagag 44621492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 98 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 41707618 - 41707503
Alignment:
Q  98 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  41707618 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccatataagtaaaagaacccataaactcattgtcttaaggtttt-ggtaa 41707520  T
Q  198 gagtgtggtgtctctct 214  Q
    |||||||||||||||||    
T  41707519 gagtgtggtgtctctct 41707503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 88 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 6975620 - 6975489
Alignment:
Q  88 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 187  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||| |||||  ||||||     
T  6975620 tgttagtttgcaaatgtgagttatatgtctcacatccgataaaatagtaaaggttgaatatcttataagtaagaggactcataaatccattatcttaaga 6975521  T
Q  188 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgctt 219  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6975520 ttttgggtaagagtgtggcgtctctcttgctt 6975489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 96 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 34004739 - 34004586
Alignment:
Q  96 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 195  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | |    
T  34004739 tgcaagtgtgagttatatgtcacacatatgataaaa-actaaaggttgaacaacttataagtaagaggacccataaactcatt-ccttaaggttttcgat 34004642  T
Q  196 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtc 251  Q
    |||||||||  ||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  34004641 aagagtgtgccgtctctctcccttgtgcggttgttctagcctcgatgtgaacggtc 34004586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 98 - 242
Target Start/End: Original strand, 19504707 - 19504842
Alignment:
Q  98 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 197  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||         ||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||    
T  19504707 caagtatgagttatatgtcccatatcggataaaatagtaaaagttgaacac---------aagaggacccataaatctattgccttaaagttttgggtaa 19504797  T
Q  198 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatg 242  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19504798 gagtgtggcgtctatcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatg 19504842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 96 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 51768216 - 51768061
Alignment:
Q  96 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 195  Q
    ||||| |||||||||||||||| | |||| ||| || |||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  51768216 tgcaaatgtgagttatatgtcctatatcgaatataagagtaaatgttgaacaccttataaataagaggactcataaactcattgtcttaaggttttgggt 51768117  T
Q  196 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtc 251  Q
    || |||  | |||||||||| ||| || | |||||||| |||||||||||||||||    
T  51768116 aaaagtacgatgtctctcttacttatgggattgttctaacctcgatgtggacggtc 51768061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 96 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 54741334 - 54741194
Alignment:
Q  96 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 195  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||| |    
T  54741334 tgcaagtgtgaattatatgtctcacatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccatacacagattgtcttaaggttttggat 54741235  T
Q  196 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctc 238  Q
    |||||||| || |||||||  |  |||| ||||||||||||||    
T  54741234 aagagtgtagtctctctct--cacgtgttgttgttctagcctc 54741194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 96 - 251
Target Start/End: Original strand, 3700365 - 3700512
Alignment:
Q  96 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 195  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||        || ||||||||||||||||||| |    
T  3700365 tgcaagtgtgagttatatgtcctacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttataagtaaaagg--------actcattgccttaaggttttggat 3700456  T
Q  196 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtc 251  Q
    |||||| || |||||||||   |||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  3700457 aagagtatgatgtctctctcatttgtgtggttattcaagcctcgatgtggacggtc 3700512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 142 - 252
Target Start/End: Original strand, 18879852 - 18879962
Alignment:
Q  142 tgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgat 241  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| ||| |||||||||||||||||| |||||    
T  18879852 tgaacaccttataagtaagatgacctataaacctatttccttaaggttttgggtaagagtgtgacgtctcttttggttgtgtggttgttctagcttcgat 18879951  T
Q  242 gtggacggtcc 252  Q
    |||||||||||    
T  18879952 gtggacggtcc 18879962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 136 - 254
Target Start/End: Original strand, 43827480 - 43827597
Alignment:
Q  136 aaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagc 235  Q
    |||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |    
T  43827480 aaagattgaactccttataaataagaggacccataaattcattgccttaaggttt-ggataagagtgtggtgtctctcttacttgtgcggttgttctaac 43827578  T
Q  236 ctcgatgtggacggtcccc 254  Q
    |||||||||||||||||||    
T  43827579 ctcgatgtggacggtcccc 43827597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 147 - 248
Target Start/End: Original strand, 31691203 - 31691306
Alignment:
Q  147 accttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtc--tctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtg 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||  | |||||||||||||||||||    
T  31691203 accttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttttgggtaagagtgtggcgtctatctcttgcttgtacgattgttctagcctcgatgtg 31691302  T
Q  245 gacg 248  Q
    ||||    
T  31691303 gacg 31691306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 109 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 54017845 - 54017750
Alignment:
Q  109 tatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 204  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  54017845 tatatatcccacatcggataaaacagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccatattcccattgtcttaaggttttaggtaagagtgtg 54017750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 98 - 233
Target Start/End: Original strand, 40067045 - 40067181
Alignment:
Q  98 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaag-gttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggta 196  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||  |||||  ||||||||| |||||||||||||||| |||| | ||| | ||||||| |||||||||    
T  40067045 caagtgtgagttatatgttctacatcggataaaagtgtaaaaagttgaacacattataagtaagaggacacatagatccactaccttaagattttgggta 40067144  T
Q  197 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 233  Q
    | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  40067145 aaagtgtgatgtctctcttgcttatgtggttgttcta 40067181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 96 - 254
Target Start/End: Original strand, 28034229 - 28034387
Alignment:
Q  96 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 195  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| || |||  ||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||  ||||| |||||||||| |||    
T  28034229 tgcaagtgtgaattatatgtcccgcatcggatagaaaagtggaggttgaacactttataagtgagagaacccataaacttattgctttaaggttttaggt 28034328  T
Q  196 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 254  Q
    |||||||||| ||||||||  ||| || ||||| ||| | || |||||||| |||||||    
T  28034329 aagagtgtggcgtctctctcacttatgcggttgctctggtctggatgtggatggtcccc 28034387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 117 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 48111833 - 48111696
Alignment:
Q  117 ccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttg 216  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||  ||||| ||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||      
T  48111833 ccacctcggataaaagagtaaaggttgaacacattataagtaaaaggacttataaatccattaccttaaggttttaggtatgagtgtggtgtctctctca 48111734  T
Q  217 cttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 254  Q
    |   ||||||| ||||| |||| |||||||||||||||    
T  48111733 caaatgtggtttttctaacctcaatgtggacggtcccc 48111696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 68 - 185
Target Start/End: Original strand, 10246317 - 10246436
Alignment:
Q  68 gactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggac 165  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||  || |||||||||  |||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  10246317 gactcacgcttgagggggagtgctgttgtgtgcaagtgtctgttatatgtctcaaatcggataaaagagtaaaggttgaacatcttataagttagaggac 10246416  T
Q  166 ccataaacccattgccttaa 185  Q
    |||||||||||| |||||||    
T  10246417 ccataaacccatagccttaa 10246436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 118 - 254
Target Start/End: Original strand, 3271806 - 3271947
Alignment:
Q  118 cacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttat---aagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg-gtgtctctc 213  Q
    |||||| |||| || |||||| ||| ||||||||||   ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  3271806 cacatcagatagaaaagtaaaagttaaacaccttattataagtaagagaacccataaacctattgccttaaggttttgggtaagagtgtgtgtctctctc 3271905  T
Q  214 -ttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 254  Q
     ||  || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3271906 gtttattatgtggttgttctagcctcgatgtggacagtcccc 3271947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 101 - 228
Target Start/End: Original strand, 760194 - 760320
Alignment:
Q  101 gtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagag 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| || | | ||||||||  || |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||| ||    
T  760194 gtgtgagttatatgtcccacatcgaatagaaaaatgaaggttgagaactttataagtgagaggacccataaactcattgccttaagatttt-ggtaaaag 760292  T
Q  201 tgtggtgtctctcttgcttgtgtggttg 228  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||    
T  760293 tgtggtgtctctctcatttgtgtggttg 760320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 138 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 15841482 - 15841383
Alignment:
Q  138 aggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcct 237  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||    
T  15841482 aggttgaacactttgtaagtgagaggattcataaacacattgccttaaggttttgggtaagagtgtgatgtctctctcacttgtgtggttgctctagcct 15841383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 88 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 50788147 - 50788087
Alignment:
Q  88 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacac 148  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50788147 tgttggtttgcaagtgtaagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacac 50788087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 104 - 162
Target Start/End: Original strand, 44620304 - 44620362
Alignment:
Q  104 tgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagag 162  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44620304 tgagttatatgtcccacatgggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagag 44620362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 96 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 23557022 - 23556890
Alignment:
Q  96 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 195  Q
    ||||||||||||||| ||||   |||||||||| || |||  ||||||||||  |||||| |||||| | |||||||  ||||||||||| ||||||| |    
T  23557022 tgcaagtgtgagttaaatgttttacatcggatagaaaagtggaggttgaacattttataaataagagaatccataaaatcattgccttaaagttttggat 23556923  T
Q  196 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttg 228  Q
    |||||||||  ||||||||| ||||||||||||    
T  23556922 aagagtgtgacgtctctcttacttgtgtggttg 23556890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 102 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 45489864 - 45489712
Alignment:
Q  102 tgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagt 201  Q
    ||||||||||||||  ||||| |||||||| ||||||| ||||| | | ||||||||||| || || ||||||       |||||||||||||||| |||    
T  45489864 tgtgagttatatgtatcacattggataaaagagtaaagattgaatatcatataagtaagatgatccttaaaccttaaagtttaaggttttgggtaatagt 45489765  T
Q  202 gtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 254  Q
    ||||||||||||| |||||  |||||||||||| |||||||||| || |||||    
T  45489764 gtggtgtctctctcgcttgcatggttgttctagtctcgatgtggccgatcccc 45489712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 188 - 254
Target Start/End: Original strand, 43174233 - 43174299
Alignment:
Q  188 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  43174233 ttttgggtaagagtgtggtgtctctctcacttgtgtggttgttcaagccttgatgtggacggtcccc 43174299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 163 - 214
Target Start/End: Original strand, 11197293 - 11197344
Alignment:
Q  163 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 214  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11197293 gacccataaacccattgccttagggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 11197344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 99 - 214
Target Start/End: Original strand, 34544107 - 34544225
Alignment:
Q  99 aagtgtgagttatatgt--cccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg-ttttgggt 195  Q
    ||||||||||||||| |  | ||||||| ||| || |||  ||||||| ||| |||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  34544107 aagtgtgagttatatatatctcacatcgaatagaaaagtggaggttgatcactttataaatgagaggacccataaactcattgccttaaggtttttgggt 34544206  T
Q  196 aagagtgtggtgtctctct 214  Q
    ||||||||||| |||||||    
T  34544207 aagagtgtggtatctctct 34544225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 30 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 15841208 - 15841023
Alignment:
Q  30 aagagcttctgcttgagggg-gagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggag-tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggat 127  Q
    ||||||||| ||||||| || ||| | |||||||||||||| |||||||||| | |||| |  | || | ||| ||||| |||||||||||| ||| |||    
T  15841208 aagagcttccgcttgagtggtgagaatgatgaattgatggagtcacacttgacgaggagatcgttgtgtacaaatgtgaattatatgtcccatatcagat 15841109  T
Q  128 aaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 214  Q
    | || |||  ||| ||||||  |||||||| |||||| | ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||  |||||||||    
T  15841108 agaaaagtggaggctgaacattttataagtgagaggatctataaacccattgctttaa-gttttgggtaagagtgtattgtctctct 15841023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 121 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 39699077 - 39698944
Alignment:
Q  121 atcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgcctt--aaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgct 218  Q
    |||||||| || |||||||||||||||  || |||||||||||| ||||||| || |  | ||  ||||||||| |||||||||| |  |||||||||||    
T  39699077 atcggatataaaagtaaaggttgaacatattctaagtaagaggatccataaatccgtgtcgttttaaggttttgagtaagagtgtagcatctctcttgct 39698978  T
Q  219 tgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 252  Q
    |||| |||| |||||| |||||||||||| ||||    
T  39698977 tgtgcggttattctagtctcgatgtggacagtcc 39698944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 80 - 162
Target Start/End: Original strand, 44620926 - 44621011
Alignment:
Q  80 agggggagtgttggtttg--caagtgtgagttatatgtccca-catcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagag 162  Q
    ||||||||||||| | ||  ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  44620926 agggggagtgttgttgtggacaagtgtgagttagatgtcccaacatcggataaaactgtaaaggttgaacaccttataagtaagag 44621011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 30 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 16889378 - 16889315
Alignment:
Q  30 aagagcttctgcttgagggggagcacgatgaat-tgatggactcacacttgagggggagtgttg 92  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16889378 aagagcttccgcttgagggggagcacgattaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttg 16889315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 67 - 133
Target Start/End: Original strand, 41370673 - 41370738
Alignment:
Q  67 ggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaata 133  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  41370673 ggactcacacttgagggg-agtgttggtttgaaagagtgagttatatatcccatatcggataaaata 41370738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 176 - 250
Target Start/End: Original strand, 41370738 - 41370812
Alignment:
Q  176 attgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt 250  Q
    ||||||||||| |||| ||||| | |||| |||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  41370738 attgccttaagattttaggtaaaaatgtgatgtctctcttacttgagtggttgttctaacctcgatgtggacggt 41370812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 96 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 11348484 - 11348396
Alignment:
Q  96 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgcctta 184  Q
    ||||| |||||||||||||| | ||||| |||||||||||  ||||||||||| |||||||| |||||| ||||| |  ||||||||||    
T  11348484 tgcaattgtgagttatatgttctacatcagataaaatagtggaggttgaacactttataagtgagaggatccatatattcattgcctta 11348396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 163 - 214
Target Start/End: Original strand, 10396198 - 10396249
Alignment:
Q  163 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 214  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||    
T  10396198 gacccataaacccattgccttagggttttaggtaagagggtggtgtctctct 10396249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 163 - 214
Target Start/End: Original strand, 10396483 - 10396534
Alignment:
Q  163 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 214  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||    
T  10396483 gacccataaacccattgccttagggttttggataagagtgtggtctctctct 10396534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 159 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 11783646 - 11783551
Alignment:
Q  159 agaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 254  Q
    |||||||||||| ||| |||||| ||| ||||||||||||||||||  || ||||| |||||| | |||| |||||||| |||||||  |||||||    
T  11783646 agaggacccatacacctattgccataaagttttgggtaagagtgtgtcgtttctctcgcttgtatagttgctctagcctagatgtgggtggtcccc 11783551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 209 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 23817498 - 23817457
Alignment:
Q  209 ctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt 250  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23817498 ctctcttgctagtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt 23817457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 163 - 215
Target Start/End: Original strand, 922485 - 922537
Alignment:
Q  163 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctctt 215  Q
    ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||||||    
T  922485 gacccataaacccattgtcttaggggtttggataagagtgtggtgtctctctt 922537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 164 - 203
Target Start/End: Original strand, 1868119 - 1868158
Alignment:
Q  164 acccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgt 203  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1868119 acccataaacccattgccttaaagttttgggtaagagtgt 1868158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 206 - 245
Target Start/End: Original strand, 19895406 - 19895445
Alignment:
Q  206 tgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgg 245  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19895406 tgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtgg 19895445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 154 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 11706641 - 11706584
Alignment:
Q  154 aagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctct 212  Q
    ||||||||||||  |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11706641 aagtaagaggact-ataaactcattgctttaaggttttgggtaagagtgtggcgtctct 11706584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 162 - 208
Target Start/End: Original strand, 51681604 - 51681650
Alignment:
Q  162 ggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgt 208  Q
    |||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  51681604 ggactcatatacccattgccttaagattttgggtaagagtgtggtgt 51681650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 150 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 2891924 - 2891864
Alignment:
Q  150 ttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtct 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| | || ||||||||||||||| | |||||| |||||    
T  2891924 ttataagtaagaggatccataaacctaatgtcttaaggttttgggttaaagtgtgatgtct 2891864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 210 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 11702341 - 11702297
Alignment:
Q  210 tctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 254  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  11702341 tctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtgaacagtcccc 11702297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 26 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 41707392 - 41707340
Alignment:
Q  26 aagtaagagcttctgcttga-gggggagcacgatgaattgatggactcacact 77  Q
    |||||||||||||  ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  41707392 aagtaagagcttccccttgaagggggagcatgatgaattgatggactcacact 41707340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 96 - 144
Target Start/End: Original strand, 45050601 - 45050649
Alignment:
Q  96 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttga 144  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||||||||||||    
T  45050601 tgcaagtgtgagttatatgtctcacatcaaataaaagagtaaaggttga 45050649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 174 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 50788072 - 50787996
Alignment:
Q  174 ccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt 250  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| | |||| | |||||| |||| | || |||| ||||||    
T  50788072 ccattgccttaaggttttagataagagtgtggtgtctctgtcgcttatttggttgctctaacttcaatgtagacggt 50787996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 163 - 214
Target Start/End: Original strand, 11197003 - 11197054
Alignment:
Q  163 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 214  Q
    ||||| |||||||||||||||| | |||| |||||||||| |||||||||||    
T  11197003 gacccttaaacccattgccttaggattttaggtaagagtgaggtgtctctct 11197054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 88 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 18933134 - 18933103
Alignment:
Q  88 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtccca 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18933134 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtccca 18933103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 151 - 194
Target Start/End: Original strand, 45484774 - 45484817
Alignment:
Q  151 tataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttggg 194  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  45484774 tataagtgagagaacccataaacccaatgccttaaggttttggg 45484817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 53 - 83
Target Start/End: Original strand, 5882092 - 5882122
Alignment:
Q  53 cacgatgaattgatggactcacacttgaggg 83  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5882092 cacgatgaattgatggactcacacttgaggg 5882122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 140 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 31249970 - 31249896
Alignment:
Q  140 gttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 214  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | || | | | ||||||||| | |||||||| |||||||    
T  31249970 gttgaacactttataagttagaggacccataaacctaatgacgtcaagttttgggttaaagtgtggtctctctct 31249896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 172 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 41707321 - 41707279
Alignment:
Q  172 acccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 214  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  41707321 acccattaccttaaggttttgggtaaaagtgtggtatctctct 41707279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 96 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 11706677 - 11706636
Alignment:
Q  96 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaa 137  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  11706677 tgcaagggtgagttgtatgtcccacatcggataaaaaagtaa 11706636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 207 - 244
Target Start/End: Original strand, 19895533 - 19895570
Alignment:
Q  207 gtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtg 244  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19895533 gtctatcttgcttgtgtggttgttctagcttcgatgtg 19895570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 159 - 192
Target Start/End: Original strand, 29802604 - 29802637
Alignment:
Q  159 agaggacccataaacccattgccttaaggttttg 192  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  29802604 agaggacccataaacccaatgccttaaggttttg 29802637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 178 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 34946187 - 34946151
Alignment:
Q  178 tgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 214  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  34946187 tgccttaggattttgggtaagagtgtggtgtctctct 34946151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0734 (Bit Score: 158; Significance: 4e-84; HSPs: 2)
Name: scaffold0734
Description:

Target: scaffold0734; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 16 - 245
Target Start/End: Original strand, 5695 - 5931
Alignment:
Q  16 gacacatgcaaagtaagagcttctgcttgagggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatat 113  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||    
T  5695 gacacatgcaaagtaagagcttccgcttgagggggagcaagatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttgttgtgtgcaagtgtgagttatat 5794  T
Q  114 gtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaag-----gttttgggtaagagtgtggtgt 208  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||||||||    
T  5795 gtcgcacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagattaaattttgagtaagagtgtggtgt 5894  T
Q  209 ctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgg 245  Q
    |||| || |||||| |||||||| | | |||||||||    
T  5895 ctcttttacttgtggggttgttcaaacttcgatgtgg 5931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0734; HSP #2
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 96 - 245
Target Start/End: Original strand, 5396 - 5546
Alignment:
Q  96 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgcctt-aaggttttggg 194  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||| ||| ||| |||||||    
T  5396 tgcaagtgtgagttatatgtcctacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagggcccataaacatattgtcttaaagtttttggg 5495  T
Q  195 taagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgg 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  5496 taagagtgtggtgtctctcttgcttgtggggttgttcaagcctcgatgtgg 5546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0391 (Bit Score: 141; Significance: 5e-74; HSPs: 4)
Name: scaffold0391
Description:

Target: scaffold0391; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 26 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 1337 - 1110
Alignment:
Q  26 aagtaagagcttctgcttga-gggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttg--caagtgtgagttatatgtcccacat 122  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||| ||||| | ||  |||||||||||||||||||||||||    
T  1337 aagtaagagcttccgctcgaagggggagcatgatcaaaagatggactcacacttgagggggaatgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacat 1238  T
Q  123 cggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtg 222  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||    
T  1237 tggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagaaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtatggtgtctctcttgtttatg 1138  T
Q  223 tggttgttctagcctcgatgtggacggt 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1137 tggttgttctagcctcgatgtggacggt 1110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0391; HSP #2
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 26 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 3216 - 3092
Alignment:
Q  26 aagtaagagcttctgcttga-gggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacat 122  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  || |||| ||||||||||||||||||||||    
T  3216 aagtaagagcttccgcttgaagggggagcatgatgagttgatggactcacacttgagggggagtgttgttgtgtgcaggtgtgagttatatgtcccacat 3117  T
Q  123 cggataaaatagtaaaggttgaaca 147  Q
    ||||||||| |||||||||||||||    
T  3116 cggataaaagagtaaaggttgaaca 3092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0391; HSP #3
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 143 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 1802 - 1731
Alignment:
Q  143 gaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 214  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1802 gaacaccttataagtgagaggacccataaacccattgccttaaggtttttggtaagagtgtggtgtctctct 1731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0391; HSP #4
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 45 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 1509 - 1464
Alignment:
Q  45 agggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgt 90  Q
    |||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  1509 agggggagcatgatgaatcgattgactcacacttgagggggagtgt 1464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 138; Significance: 3e-72; HSPs: 2)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 23 - 216
Target Start/End: Original strand, 5281 - 5477
Alignment:
Q  23 gcaaagtaagagcttctgcttga-gggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtccca 119  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||  || |||||||||||||||||||| |||    
T  5281 gcaaagtaagagcttccgcttgaagggggagcacgatgaactgatggactcacacttgagggagagttttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgttcca 5380  T
Q  120 catcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttg 216  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5381 catcggatagaacagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagattttggataagagtgtggtgtctctcttg 5477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078; HSP #2
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 96 - 247
Target Start/End: Original strand, 4982 - 5133
Alignment:
Q  96 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 195  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||| | || |||||||||| || | ||||||||||| | ||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  4982 tgcaagtgtgaattatatgtctcacatcggagagaacagtaaaggtttaatatcttataagtaaaaagacccataaactcattgccttatggttttgggt 5081  T
Q  196 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggac 247  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || ||||| ||||||||||||||||||    
T  5082 aagagtgtggtgtctctctcgcttatgcggttgctctagcctcgatgtggac 5133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0702 (Bit Score: 136; Significance: 5e-71; HSPs: 2)
Name: scaffold0702
Description:

Target: scaffold0702; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 29 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 367 - 147
Alignment:
Q  29 taagagcttctgcttga-gggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggat 127  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||| |||||||  ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  367 taagagcttccgcttgaagggggagcatgatgaataaatggactcacatttg-gggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggat 269  T
Q  128 aaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggtt 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||   ||| ||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  268 aaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagga-ccataaa-ccat--actttagg-tttaggtaagaatgtggtgtctctcttgcttgagtggtt 174  T
Q  228 gttctagcctcgatgtggacggtcccc 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  173 gttctagcctcgatgtggacggtcccc 147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0702; HSP #2
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 98 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 670 - 514
Alignment:
Q  98 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  670 caagtgtgagttatatgtcccacatcggttaaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 571  T
Q  198 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 254  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  570 gagtgtggtgtctttcttgcttgagtggtttttctagcctcgatgtggaaggtcccc 514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0171 (Bit Score: 114; Significance: 6e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0171
Description:

Target: scaffold0171; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 49 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 17663 - 17496
Alignment:
Q  49 ggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaac 146  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17663 ggagcatgatgaatagatggactcacacttgagggggagtgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcacacatcagataaaatagtaaaggttgaac 17564  T
Q  147 accttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg--ttttgggtaagagtgtggtgtctct 212  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  17563 accttgtaagtaagaggacccataaacccatagccttaaggttttttgggtaagagtatggtgtctct 17496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0027 (Bit Score: 107; Significance: 1e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0027
Description:

Target: scaffold0027; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 96 - 254
Target Start/End: Original strand, 47360 - 47518
Alignment:
Q  96 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 195  Q
    ||||||||||| ||| ||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  47360 tgcaagtgtgaattaaatgtctcacatccgataaaatagtaaagtttgaacaccttataagtaagagaatccataaacccattgccttaaagttttgggt 47459  T
Q  196 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 254  Q
    || | |||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  47460 aaaaatgtggtgtctctcttgcttgcgcggttgttctaacctcgatgtggacggtcccc 47518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0504 (Bit Score: 64; Significance: 4e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0504
Description:

Target: scaffold0504; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 98 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 10267 - 10192
Alignment:
Q  98 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaac 173  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10267 caagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaatggtaaaagttgaacaccttataagtaagaggacccataaac 10192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 2)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 30 - 221
Target Start/End: Original strand, 39771 - 39963
Alignment:
Q  30 aagagcttctgcttgagggg-gagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggata 128  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |  | || | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39771 aagagcttccgcttgaggggtgagcatgatgaattgatgaactcacacttgagggggaattgttgtgttcaagtgtgagttatatgtcccacatcggata 39870  T
Q  129 aaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgt 221  Q
     || |||   ||||| || | |||||||| ||| ||   ||||||  ||| ||||||  |||||| ||| | |||||||||||||| ||||||    
T  39871 gaaaagtggtggttggactctttataagtgagatgagatataaacttattaccttaaaattttggttaaaaatgtggtgtctctctcgcttgt 39963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 98 - 228
Target Start/End: Original strand, 39459 - 39588
Alignment:
Q  98 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 197  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || ||| || |||  ||||||||| |||||||||| |||||| | ||||||   |||||||||| ||||||||||    
T  39459 caagtgtgagttatatgtctcaca-cgcatagaaaagtggaggttgaactccttataagtgagaggaactataaacatgttgccttaag-ttttgggtaa 39556  T
Q  198 gagtgt-ggtgtctctcttgcttgtgtggttg 228  Q
     ||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  39557 aagtgttggcgtctctcttgcttgtgtggttg 39588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0807 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0807
Description:

Target: scaffold0807; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 90 - 174
Target Start/End: Original strand, 2869 - 2953
Alignment:
Q  90 ttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacc 174  Q
    |||| |||||||| ||||||||| ||  ||||| |  |||||  ||||||||||||||| |||||  |||||||| |||||||||    
T  2869 ttggattgcaagtatgagttataagtttcacattgtttaaaaatgtaaaggttgaacactttatatataagaggatccataaacc 2953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 134 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 10446 - 10406
Alignment:
Q  134 gtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacc 174  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||    
T  10446 gtaaaggttgaacactttatatgtaagaggatccataaacc 10406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University