View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF17604_low_3 (Length: 537)

Name: NF17604_low_3
Description: NF17604
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF17604_low_3
NF17604_low_3
[»] chr3 (34 HSPs)
chr3 (10-519)||(52418673-52419181)
chr3 (10-512)||(36947035-36947536)
chr3 (10-519)||(38655801-38656310)
chr3 (10-510)||(18198437-18198937)
chr3 (10-519)||(31486949-31487457)
chr3 (10-474)||(49562287-49562751)
chr3 (10-469)||(35716084-35716543)
chr3 (10-474)||(36087468-36087932)
chr3 (10-350)||(26951401-26951741)
chr3 (10-350)||(36091306-36091646)
chr3 (10-274)||(13454761-13455024)
chr3 (10-273)||(4594084-4594346)
chr3 (12-274)||(16651391-16651652)
chr3 (10-274)||(12260798-12261062)
chr3 (10-274)||(12825171-12825434)
chr3 (134-519)||(18255958-18256344)
chr3 (10-266)||(854554-854809)
chr3 (10-232)||(11826489-11826710)
chr3 (31-232)||(33003784-33003984)
chr3 (66-274)||(26947819-26948026)
chr3 (10-231)||(859838-860069)
chr3 (163-355)||(18201248-18201441)
chr3 (10-76)||(29864704-29864770)
chr3 (31-91)||(47726776-47726836)
chr3 (264-350)||(26951026-26951113)
chr3 (137-173)||(36006257-36006293)
chr3 (329-407)||(24759089-24759167)
chr3 (329-407)||(24826847-24826925)
chr3 (334-401)||(20370864-20370931)
chr3 (264-350)||(36091934-36092021)
chr3 (134-173)||(53521066-53521105)
chr3 (329-407)||(33648448-33648526)
chr3 (329-407)||(37984693-37984771)
chr3 (351-407)||(53025016-53025072)
[»] chr1 (25 HSPs)
chr1 (10-519)||(29245166-29245675)
chr1 (10-519)||(50708587-50709096)
chr1 (10-519)||(48650730-48651238)
chr1 (10-474)||(45503411-45503875)
chr1 (10-519)||(13926180-13926685)
chr1 (10-396)||(38210872-38211258)
chr1 (25-396)||(39513149-39513520)
chr1 (10-350)||(2045127-2045467)
chr1 (10-274)||(2047378-2047641)
chr1 (10-274)||(36866789-36867052)
chr1 (10-274)||(49787237-49787498)
chr1 (10-231)||(45501166-45501386)
chr1 (10-256)||(26211630-26211874)
chr1 (134-519)||(37891536-37891922)
chr1 (10-232)||(15691472-15691693)
chr1 (31-232)||(48960726-48960926)
chr1 (66-274)||(7480470-7480677)
chr1 (66-274)||(9533846-9534053)
chr1 (66-274)||(42496554-42496761)
chr1 (140-416)||(23086202-23086479)
chr1 (161-368)||(35593894-35594102)
chr1 (412-511)||(23089555-23089654)
chr1 (114-172)||(21056874-21056932)
chr1 (364-450)||(12852797-12852883)
chr1 (329-407)||(25226590-25226668)
[»] chr7 (22 HSPs)
chr7 (10-519)||(45115541-45116050)
chr7 (10-519)||(26168555-26169064)
chr7 (10-474)||(32659983-32660444)
chr7 (10-350)||(7893637-7893977)
chr7 (10-350)||(22006861-22007200)
chr7 (10-274)||(27715901-27716163)
chr7 (10-273)||(29956435-29956697)
chr7 (10-274)||(17696872-17697135)
chr7 (10-274)||(16719857-16720121)
chr7 (10-274)||(31100097-31100358)
chr7 (10-258)||(32038416-32038663)
chr7 (31-232)||(13398313-13398513)
chr7 (10-231)||(46909348-46909567)
chr7 (66-274)||(7888824-7889031)
chr7 (31-232)||(5093569-5093769)
chr7 (10-154)||(20955637-20955780)
chr7 (159-368)||(3595423-3595634)
chr7 (156-280)||(35102927-35103051)
chr7 (264-350)||(7893262-7893349)
chr7 (264-350)||(22006486-22006573)
chr7 (329-407)||(14231820-14231898)
chr7 (329-407)||(26906868-26906946)
[»] chr8 (14 HSPs)
chr8 (10-519)||(19961340-19961849)
chr8 (10-519)||(23827480-23827980)
chr8 (10-474)||(22729765-22730229)
chr8 (10-274)||(406042-406305)
chr8 (11-350)||(14994359-14994698)
chr8 (10-274)||(18265880-18266140)
chr8 (10-274)||(18274893-18275153)
chr8 (10-273)||(41376299-41376561)
chr8 (10-232)||(37983325-37983546)
chr8 (10-232)||(24011736-24011955)
chr8 (31-172)||(18492360-18492500)
chr8 (190-513)||(37589301-37589625)
chr8 (10-110)||(21640000-21640100)
chr8 (330-496)||(35351053-35351219)
[»] chr6 (15 HSPs)
chr6 (10-519)||(2280657-2281163)
chr6 (10-232)||(33004650-33004871)
chr6 (10-232)||(24458658-24458879)
chr6 (31-229)||(29369412-29369609)
chr6 (31-232)||(29371967-29372167)
chr6 (134-519)||(25971041-25971427)
chr6 (66-274)||(33045715-33045922)
chr6 (134-519)||(25975481-25975867)
chr6 (10-141)||(349252-349382)
chr6 (10-128)||(29924870-29924987)
chr6 (163-362)||(3591093-3591293)
chr6 (200-332)||(34265227-34265359)
chr6 (317-484)||(34417123-34417291)
chr6 (329-437)||(25169444-25169552)
chr6 (375-407)||(31891629-31891661)
[»] chr2 (27 HSPs)
chr2 (10-519)||(5013445-5013955)
chr2 (10-519)||(1512485-1512994)
chr2 (10-504)||(35432053-35432548)
chr2 (10-474)||(207504-207968)
chr2 (10-350)||(40605250-40605590)
chr2 (10-350)||(26455788-26456128)
chr2 (10-274)||(13905287-13905549)
chr2 (10-274)||(6123670-6123934)
chr2 (10-350)||(13908143-13908482)
chr2 (10-274)||(2300779-2301039)
chr2 (10-220)||(27997369-27997578)
chr2 (10-220)||(28098739-28098948)
chr2 (10-232)||(36437521-36437742)
chr2 (10-232)||(42109348-42109569)
chr2 (31-232)||(19821904-19822104)
chr2 (31-232)||(19842125-19842325)
chr2 (66-274)||(184091-184298)
chr2 (66-274)||(2449325-2449532)
chr2 (10-213)||(20890699-20890901)
chr2 (10-225)||(1916687-1916901)
chr2 (66-274)||(976020-976225)
chr2 (10-193)||(25647555-25647734)
chr2 (10-141)||(1273025-1273155)
chr2 (114-233)||(23455676-23455795)
chr2 (264-350)||(13907768-13907855)
chr2 (10-58)||(21589022-21589070)
chr2 (264-350)||(26455413-26455500)
[»] chr4 (20 HSPs)
chr4 (10-519)||(28389115-28389624)
chr4 (10-519)||(21382362-21382870)
chr4 (10-519)||(16908777-16909277)
chr4 (10-519)||(29359092-29359590)
chr4 (10-474)||(30387908-30388372)
chr4 (10-350)||(52682614-52682954)
chr4 (10-350)||(41859751-41860091)
chr4 (10-274)||(19515106-19515369)
chr4 (10-274)||(21581496-21581759)
chr4 (10-232)||(42347739-42347960)
chr4 (31-232)||(53288309-53288509)
chr4 (37-229)||(31448360-31448555)
chr4 (137-506)||(36895658-36896026)
chr4 (10-166)||(25839384-25839539)
chr4 (159-280)||(41944034-41944155)
chr4 (264-350)||(52682239-52682326)
chr4 (134-173)||(8121116-8121155)
chr4 (330-496)||(38465927-38466093)
chr4 (134-173)||(26602412-26602451)
chr4 (375-437)||(24262368-24262430)
[»] scaffold0097 (3 HSPs)
scaffold0097 (10-519)||(51796-52304)
scaffold0097 (10-248)||(48973-49210)
scaffold0097 (66-274)||(40379-40586)
[»] chr5 (13 HSPs)
chr5 (10-274)||(20104973-20105235)
chr5 (10-350)||(32674778-32675117)
chr5 (10-274)||(3607817-3608080)
chr5 (10-274)||(30090232-30090495)
chr5 (134-519)||(38095512-38095898)
chr5 (66-274)||(12655177-12655384)
chr5 (66-274)||(23183962-23184169)
chr5 (66-274)||(23188229-23188436)
chr5 (66-274)||(34761223-34761430)
chr5 (66-274)||(39878057-39878264)
chr5 (134-481)||(16678766-16679113)
chr5 (124-173)||(37609741-37609790)
chr5 (134-173)||(38936314-38936353)
[»] scaffold0642 (1 HSPs)
scaffold0642 (10-274)||(3356-3619)
[»] scaffold0345 (1 HSPs)
scaffold0345 (10-274)||(13268-13531)
[»] scaffold0105 (1 HSPs)
scaffold0105 (10-274)||(25450-25713)
[»] scaffold0121 (1 HSPs)
scaffold0121 (10-260)||(45548-45797)
[»] scaffold0374 (1 HSPs)
scaffold0374 (26-231)||(1971-2175)
[»] scaffold0119 (2 HSPs)
scaffold0119 (10-141)||(27936-28066)
scaffold0119 (10-141)||(34337-34467)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 423; Significance: 0; HSPs: 34)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 423; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 519
Target Start/End: Original strand, 52418673 - 52419181
Alignment:
Q  10 ataattctagtacgtagttcatgttagtttaacataacatataattttaaaagggaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaa 109  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52418673 ataattctagtacgtagttcctgttactttaacataacatataattttaaaagggaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaa 52418772  T
Q  110 aatgaatagtacataaaaaagtcttacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgatgcaacatcggtaccatcgccgtccttgtcattaatca 209  Q
    | ||||||||||| ||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  52418773 a-tgaatagtacacaaaaaagtcctatacattacagaaaacttctctgtagaccacatttgatgcaacatcggtaccatcgccgtcctcgtcattaatca 52418871  T
Q  210 atatctttaaatcacccctcgaagcaacccgtgatattgtgacgtacaactgtccatgtgaaaaaataggaaacggtaggtagacaccaacatattctag 309  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52418872 atatctttaaaacacccctcgaagtaacccgtgatattgtgacgtacaactgtcaatgtgaaaaa-taggaaacggtaggtagacaccaacatattctag 52418970  T
Q  310 cgactgaccctgacccttgtta-tggtcattgcaaatgagacagatatcggaaactgcctccgtttaaatttgaaaggaattctattatcagatggtgtt 408  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52418971 cgactgaccctgacccttgttaatagtcattgcaaatgagacagatatcggaaactgccttcgtttaaatttgaaaggaattctattatcagatggtgtt 52419070  T
Q  409 agcgataaccttggaataaacaccttctcaccgatattacaaccagatattacccgtccttcgagcacaaattttctcatctttgtaatgatcaatctcg 508  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  52419071 agcgataaccttggaataaacaccttctcaacgatattacaaccagatattacccgtccttcgagcacaaattttctcatatttgtaatgatcaatctag 52419170  T
Q  509 tacccttacat 519  Q
    |||| ||||||    
T  52419171 taccgttacat 52419181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 376; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 512
Target Start/End: Original strand, 36947035 - 36947536
Alignment:
Q  10 ataattctagtacgtagttcatgttagtttaacataacatataattttaaaagggaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaa 109  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36947035 ataattctagtacgtagttcctgttactttaacataacatataattttaaaagggaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaa 36947134  T
Q  110 aatgaatagtacataaaaaagtcttacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgatgcaacatcggtaccatcgccgtccttgtcattaatca 209  Q
    | ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||    
T  36947135 a-tgaatagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaaattctctgtagaccacatttgatgcaacatcggtatcatcgtcgtcctcgtcattaatca 36947233  T
Q  210 atatctttaaatcacccctcgaagcaacccgtgatattgtgacgtacaactgtccatgtgaaaaaataggaaacggtaggtagacaccaacatattctag 309  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  36947234 atatctttaaaccacccctcgaagtaacccgtgatattgcgacgtacaactgtccatgtgaaaaac-aggagacggtaggtagacaccaacatgttctag 36947332  T
Q  310 cgactgaccctgacccttgtta-tggtcattgcaaatgagacagatatcggaaactgcctccgtttaaatttgaaaggaattctattatcagatggtgtt 408  Q
    |||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36947333 cgactgaccctgactcttgttaatagtcattgcaaatgagacacatatcggaaactgccttcgtttaaatttgaaaggaattctattatcagatggtgtt 36947432  T
Q  409 agcgataaccttggaataaacaccttctcaccgatattacaaccagatattacccgtccttcgagcacaaattttctcatctttgtaatgatcaatctcg 508  Q
    |  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  36947433 aaagataacctcggaataaacaccttctcaccgatattagaaccagatattacacgtcctttcagcacaaattttcccatctttgtaatgatcaatctcg 36947532  T
Q  509 tacc 512  Q
    ||||    
T  36947533 tacc 36947536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 367; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 519
Target Start/End: Original strand, 38655801 - 38656310
Alignment:
Q  10 ataattctagtacgtagttcatgttagtttaacataacatataattttaaaagggaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaa 109  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38655801 ataattctagtacgtagttcctgttactttaaaataacatataattttgaaagggaaattgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaa 38655900  T
Q  110 aatgaatagtacataaaaaagtcttacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgatgcaacatcggtaccatcgccgtccttgtcattaatca 209  Q
    | |||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| | ||||  |||||    
T  38655901 a-tgaacagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgatgcaacatcgatatcatcgccgtcgtcgtcagcaatca 38655999  T
Q  210 atatctttaaatcacccctcgaagcaacccgtgatattgtgacgtacaactgtccatgtgaaaaaataggaaacggtaggtagacaccaacatattctag 309  Q
    |||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  38656000 atatttttaaaccacccctcgaagtaacccgtgatattgcgacgtacaactgtccatgtgaaaaaataggagacggtaggtagacaccaacatgttctag 38656099  T
Q  310 cgactgaccctgacccttgtta-tggtcattgcaaatgagacagatatcggaaactgcctccgtttaaatttgaaaggaattctattatcagatggtgtt 408  Q
    ||||| ||||| || ||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38656100 cgactaaccctaactcttgttaatagtcattgcaaatgagacaaatatcggaaactgccttcgtttaaatttgaaaggaattctattatcagatggtgtt 38656199  T
Q  409 agcgataaccttggaataaacaccttctcaccgatattacaaccagatattacccgtccttcgagcacaaattttctcatctttgtaatgatcaatctcg 508  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  38656200 agcgataaccttggaataaacaccttctcaatgatattagaaccagatattacccgtccttcgagcataaattttcccatctttgtaatgatcaatctcg 38656299  T
Q  509 tacccttacat 519  Q
    |||| ||||||    
T  38656300 taccgttacat 38656310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 366; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 18198937 - 18198437
Alignment:
Q  10 ataattctagtacgtagttcatgttagtttaacataacatataattttaaaagggaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaa 109  Q
    |||||||||||||||||||| |||||  |||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18198937 ataattctagtacgtagttcctgttacattaaaataacatataattttgaaagggaaattgaagtttgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaa 18198838  T
Q  110 aatgaatagtacataaaaaagtcttacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgatgcaacatcggtaccatcgccgtccttgtcattaatca 209  Q
    | ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||    
T  18198837 a-tgaatagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgatgcaacatcggtatcatcgccgtcgtcgtcattaatca 18198739  T
Q  210 atatctttaaatcacccctcgaagcaacccgtgatattgtgacgtacaactgtccatgtgaaaaaataggaaacggtaggtagacaccaacatattctag 309  Q
    |||| |||||| |||||||||||| | ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18198738 atatttttaaaccacccctcgaagtagcccgtgatagtgcgacgtacaactgtccatgtgaaaaaataggagacggtaggtagacaccaacatgttctag 18198639  T
Q  310 cgactgaccctgacccttgtt-atggtcattgcaaatgagacagatatcggaaactgcctccgtttaaatttgaaaggaattctattatcagatggtgtt 408  Q
    ||||||||| |||| |||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18198638 cgactgaccttgactcttgttaatagtcattgcaaatgagaaagatatcggaaactaccttcgtttaaatttgaaaggaattctattatcagatggtgtt 18198539  T
Q  409 agcgataaccttggaataaacaccttctcaccgatattacaaccagatattacccgtccttcgagcacaaattttctcatctttgtaatgatcaatctcg 508  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18198538 agcgataaccttggaataaacaccttttcaccgatattagaatcagatattacccgtccttcgagcacaaattttcccatctttgtaatgatcaatctcg 18198439  T
Q  509 ta 510  Q
    ||    
T  18198438 ta 18198437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 347; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 519
Target Start/End: Complemental strand, 31487457 - 31486949
Alignment:
Q  10 ataattctagtacgtagttcatgttagtttaacataacatataattttaaaagggaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaa 109  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31487457 ataattctagtatgtagttcctgttactttaaaataacatataattttgaaagggaaattgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaa 31487358  T
Q  110 aatgaatagtacataaaaaagtcttacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgatgcaacatcggtaccatcgccgtccttgtcattaatca 209  Q
    | ||||||||||| ||||| ||| |||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | |||||||||||    
T  31487357 a-tgaatagtacacaaaaa-gtcctacacattaccgaaaacttctcaatagaccacatttgatgcaacatcggtatcatcgctgtcgtcgtcattaatca 31487260  T
Q  210 atatctttaaatcacccctcgaagcaacccgtgatattgtgacgtacaactgtccatgtgaaaaaataggaaacggtaggtagacaccaacatattctag 309  Q
    |||| |||||| || ||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31487259 atatttttaaaccagccctcgaagtaacctgtgatattgcgacgtacaactgtccatgtgaaaaaataggagacggtaggtagacaccaacatgttctag 31487160  T
Q  310 cgactgaccctgacccttgtta-tggtcattgcaaatgagacagatatcggaaactgcctccgtttaaatttgaaaggaattctattatcagatggtgtt 408  Q
    |||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  31487159 cgactgaccctgactcttgttaatagtcattgcaaatgagacagatatcggaaactgccttcgtttaaatttgaaaggaattatattatcagatggtgtt 31487060  T
Q  409 agcgataaccttggaataaacaccttctcaccgatattacaaccagatattacccgtccttcgagcacaaattttctcatctttgtaatgatcaatctcg 508  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  31487059 agcgataaccttgaaataaacaccttctcaccgatatttgaaccatatattatccgtccttcgagcacaaatgttcccatctttgtaatgatcaatctcg 31486960  T
Q  509 tacccttacat 519  Q
    |||| ||||||    
T  31486959 taccgttacat 31486949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 330; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 474
Target Start/End: Original strand, 49562287 - 49562751
Alignment:
Q  10 ataattctagtacgtagttcatgttagtttaacataacatataattttaaaagggaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaa 109  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49562287 ataattctagtacgtagttcttgttactttaaaataacatataattttgaaagggaaattgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaa 49562386  T
Q  110 aatgaatagtacataaaaaagtcttacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgatgcaacatcggtaccatcgccgtccttgtcattaatca 209  Q
    | |||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||| | || ||||||||    
T  49562387 a-tgaacagtacacaaaaaagtcatacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgatgcaacatcgatatcatcgtcgtcgtcgttattaatca 49562485  T
Q  210 atatctttaaatcacccctcgaagcaacccgtgatattgtgacgtacaactgtccatgtgaaaaaataggaaacggtaggtagacaccaacatattctag 309  Q
    |||| |||||| ||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  49562486 atatttttaaaccaccccttgaagtaacccgtgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaaataggagacggtaggtagacaccaacatgttctag 49562585  T
Q  310 cgactgaccctgacccttgtt-atggtcattgcaaatgagacagatatcggaaactgcctccgtttaaatttgaaaggaattctattatcagatggtgtt 408  Q
    |||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49562586 cgactgaccctgactcttgttaatagtcattgcaaatgagacagatatcgaaaattgcctttgtttaaatttgaaaggaattctattatcagatggtgtt 49562685  T
Q  409 agcgataaccttggaataaacaccttctcaccgatattacaaccagatattacccgtccttcgagc 474  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  49562686 agcgataaccttgaaataaacaccttctcaccgatattagaaccagatattacccgtccttcgagc 49562751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 329; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 35716543 - 35716084
Alignment:
Q  10 ataattctagtacgtagttcatgttagtttaacataacatataattttaaaagggaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaa 109  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35716543 ataattctagtacgtagttcctgttactttaaaataacatataattttgaaagggaaattgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaa 35716444  T
Q  110 aatgaatagtacataaaaaagtcttacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgatgcaacatcggtaccatcgccgtccttgtcattaatca 209  Q
    | |||| |||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||  |||| |||| | |||||||||||    
T  35716443 a-tgaacagtacacaaaaaagtcctacagattacggaaaacttctctgtaaaccacatttgatgcaacatcgatattatcgtcgtcgtcgtcattaatca 35716345  T
Q  210 atatctttaaatcacccctcgaagcaacccgtgatattgtgacgtacaactgtccatgtgaaaaaataggaaacggtaggtagacaccaacatattctag 309  Q
    |||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  35716344 atatttttaaaccacccctcgaagtaacccgtgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaaataggagacggtaggtagacaccaacatgttctag 35716245  T
Q  310 cgactgaccctgacccttgtt-atggtcattgcaaatgagacagatatcggaaactgcctccgtttaaatttgaaaggaattctattatcagatggtgtt 408  Q
    |||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35716244 cgactgaccctgactcttgttaatagtcattgcaaatgagacagatatcggaaattgcctttgtttaaatttgaaaggaattctattatcagatggtgtt 35716145  T
Q  409 agcgataaccttggaataaacaccttctcaccgatattacaaccagatattacccgtcctt 469  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  35716144 agcgataaccttggaataaacaccttctcaccgatattagaaccagatattacccgtcctt 35716084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 474
Target Start/End: Original strand, 36087468 - 36087932
Alignment:
Q  10 ataattctagtacgtagttcatgttagtttaacataacatataattttaaaagggaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaa 109  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36087468 ataattctagtacgtagttcctgttactttaaaataacatataattttgaaagggaaattgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaa 36087567  T
Q  110 aatgaatagtacataaaaaagtcttacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgatgcaacatcggtaccatcgccgtccttgtcattaatca 209  Q
    | |||| |||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || | |||||||||||    
T  36087568 a-tgaacagtatacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgatgcaacatcgatatcatcgccatcgtcgtcattaatca 36087666  T
Q  210 atatctttaaatcacccctcgaagcaacccgtgatattgtgacgtacaactgtccatgtgaaaaaataggaaacggtaggtagacaccaacatattctag 309  Q
    |||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  36087667 atatttttaaaccacccctcgaagtaacccgtgatattgcgacgtaaaattgtccatgtgaaaaaataggagacggtaggtagacaccaacatgttctag 36087766  T
Q  310 cgactgaccctgacccttgtt-atggtcattgcaaatgagacagatatcggaaactgcctccgtttaaatttgaaaggaattctattatcagatggtgtt 408  Q
    |||||||||| ||| |||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  36087767 cgactgacccggactcttgttaatagtgattgcaaatgagacagatatcggaaactgtcttcgtttaaatttgaatggaattctattatcagatggtgtt 36087866  T
Q  409 agcgataaccttggaataaacaccttctcaccgatattacaaccagatattacccgtccttcgagc 474  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  36087867 agcgataaccttggaataaacaccttctcactgatattagaaccagatattacccgtccttcgagc 36087932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 10 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 26951741 - 26951401
Alignment:
Q  10 ataattctagtacgtagttcatgttagtttaacataacatataattttaaaagggaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaa 109  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26951741 ataattctagtacgtagttcctgttactttaaaataacatataattttgaaagggaaattgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaa 26951642  T
Q  110 aatgaatagtacataaaaaagtcttacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgatgcaacatcggtaccatcgccgtccttgtcattaatca 209  Q
    | |||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||| | |||||||||||    
T  26951641 a-tgaacagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgatgcaatatcgatatcatcgccgtcgtcgtcattaatca 26951543  T
Q  210 atatctttaaatcacccctcgaagcaacccgtgatattgtgacgtacaactgtccatgtgaaaaaataggaaacggtaggtagacaccaacatattctag 309  Q
    |||| |||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| || |||||||||| ||  |     
T  26951542 atatttttaaaccacctctcgaagtaacccgtgatattgtgacgtacaactgtccatgtgaaaaaacaggagacggtagataaacaccaacatgtttcaa 26951443  T
Q  310 cgactgaccctgacccttgtt-atggtcattgcaaatgagac 350  Q
    ||||||||||| || |||||| || |||| ||||||||||||    
T  26951442 cgactgaccctaactcttgttaatagtcactgcaaatgagac 26951401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 10 - 350
Target Start/End: Original strand, 36091306 - 36091646
Alignment:
Q  10 ataattctagtacgtagttcatgttagtttaacataacatataattttaaaagggaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaa 109  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36091306 ataattctagtacgtagttcctgttactttaaaataacatataattttgaaagggaaattgaatttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaa 36091405  T
Q  110 aatgaatagtacataaaaaagtcttacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgatgcaacatcggtaccatcgccgtccttgtcattaatca 209  Q
    | |||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| | |||||||||||    
T  36091406 a-tgaacagtacacaaaaaagtcatacacattacggaaaacttctttgtagaccacatttgatgcaacatcgatatcatcgccgtcgtcgtcattaatca 36091504  T
Q  210 atatctttaaatcacccctcgaagcaacccgtgatattgtgacgtacaactgtccatgtgaaaaaataggaaacggtaggtagacaccaacatattctag 309  Q
    |||| |||||| |||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| || |||||||||| ||  |     
T  36091505 atatttttaaaacacctctcgaagtaacccgtgatattgcgacgtacaactgtccatgtgaaaaaacaggagacggtagataaacaccaacatgtttcaa 36091604  T
Q  310 cgactgaccctgacccttgtt-atggtcattgcaaatgagac 350  Q
    |||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||    
T  36091605 cgactgaccctgactcttgttaatagtcattgcaaatgagac 36091646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 10 - 274
Target Start/End: Original strand, 13454761 - 13455024
Alignment:
Q  10 ataattctagtacgtagttcatgttagtttaacataacatataattttaaaagggaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaa 109  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13454761 ataattctagtacgtagttcctgttactttaacataacatataattttaaaagggaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaa 13454860  T
Q  110 aatgaatagtacataaaaaagtcttacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgatgcaacatcggtaccatcgccgtccttgtcattaatca 209  Q
    | ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||||||    
T  13454861 a-tgaatagtacacaaaaaagtcctacacattacgaaaaacttctctgtagaccacacttgatgcaacatcggtatcatcgccgtcgtcatcattaatca 13454959  T
Q  210 atatctttaaatcacccctcgaagcaacccgtgatattgtgacgtacaactgtccatgtgaaaaa 274  Q
    ||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13454960 atatctttaaaccacccctcaaagtaacccgtgatattgcgacgtacaactgtccatgtgaaaaa 13455024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 10 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 4594346 - 4594084
Alignment:
Q  10 ataattctagtacgtagttcatgttagtttaacataacatataattttaaaagggaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaa 109  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4594346 ataattctagtacgtagttcctgttactttaacataacatataattttaaaagagaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaa 4594247  T
Q  110 aatgaatagtacataaaaaagtcttacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgatgcaacatcggtaccatcgccgtccttgtcattaatca 209  Q
    | ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| | |||||||||||    
T  4594246 a-tgaatagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagaccacacttgatgcaacatcggtatcatcgtcgtcgtcgtcattaatca 4594148  T
Q  210 atatctttaaatcacccctcgaagcaacccgtgatattgtgacgtacaactgtccatgtgaaaa 273  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  4594147 atatctttaaaccacccctcgaagtaacccgtgatattgcgacgtacaactgtctatgtgaaaa 4594084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 12 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 16651652 - 16651391
Alignment:
Q  12 aattctagtacgtagttcatgttagtttaacataacatataattttaaaagggaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaaa 111  Q
    |||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  16651652 aattctagtacgtagtacctgttactttaacataacatataattttaaaagggaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaa- 16651554  T
Q  112 tgaatagtacataaaaaagtcttacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgatgcaacatcggtaccatcgccgtccttgtcattaatcaat 211  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| |  ||||||||||||    
T  16651553 tgaatagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagaccacacttgatgcaacatcggtatcatcaccgtcgtcatcattaatcaat 16651454  T
Q  212 atctttaaatcacccctcgaagcaacccgtgatattgtgacgtacaactgtccatgtgaaaaa 274  Q
    ||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16651453 atctttaaaccacccctcaaagtaacccgtgatattgcgacgtacaactgtccatgtgaaaaa 16651391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 10 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 12261062 - 12260798
Alignment:
Q  10 ataattctagtacgtagttcatgttagtttaacataacatataattttaaaagggaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaa 109  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12261062 ataattctagtacgtagttcctgttactttaacataacatataattttaaaagggaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataaataagaaa 12260963  T
Q  110 aatgaatagtacataaaaaagtc-ttacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgatgcaacatcggtaccatcgccgtccttgtcattaatc 208  Q
    | ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||    
T  12260962 a-tgaatagtacacaaaaaagtccttacacattacggaaaacttctctgtagatcacacttgatgcaacatcggtatcatcgccgtcgtcgtcattaatc 12260864  T
Q  209 aatatctttaaatcacccctcgaagcaacccgtgatattgtgacgtacaactgtccatgtgaaaaa 274  Q
    ||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  12260863 aatatttttaaaccacccctcgaagtaacccgtgatattgcaacgtacaactgtccatgtgaaaaa 12260798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 10 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 12825434 - 12825171
Alignment:
Q  10 ataattctagtacgtagttcatgttagtttaacataacatataattttaaaagggaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaa 109  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12825434 ataattttagtacgtagttcctgttactttaacataacatataattttaaaagggaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaa 12825335  T
Q  110 aatgaatagtacataaaaaagtcttacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgatgcaacatcggtaccatcgccgtccttgtcattaatca 209  Q
    | ||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||| || |||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||    
T  12825334 a-tgaatagtacacaaaaaagtcctacacattatggaaaatttatctgtagatcacacttgatgcaacatcggtatcatcgccgtcgtcgtcattaatca 12825236  T
Q  210 atatctttaaatcacccctcgaagcaacccgtgatattgtgacgtacaactgtccatgtgaaaaa 274  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12825235 atatctttaaaccacccctcgaagtaacccgtgatattgcgacgtacaactgtccatgtgaaaaa 12825171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 134 - 519
Target Start/End: Complemental strand, 18256344 - 18255958
Alignment:
Q  134 tacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgatgcaacatcggtaccatcgccgtccttgtcattaatcaatatctttaaatcacccctcgaag 233  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||| | | |||||||| |||||| ||||| ||||||||| || |||| ||||    
T  18256344 tacacattatggaaaacttctctgtagaccacatttgatgtcacatcagtatcttggccgtcctcgtcattgatcaacatctttaaaccatcccttgaag 18256245  T
Q  234 caacccgtgatattgtgacgtacaactgtccatgtgaaaaaataggaaacggtaggtagacaccaacatattctagcgactgaccctgacccttgtta-t 332  Q
     |||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||| ||  |  ||||||||||||| ||||||| |    
T  18256244 taaccctcgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaaacaggagacggtagatagacaccaacatttttcaaagactgaccctgactcttgttaat 18256145  T
Q  333 ggtcattgcaaatgagacagatatcggaaactgcctccgtttaaatttgaaaggaattctattatcagatggtgttagcgataaccttggaataaacacc 432  Q
     |||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||   ||||||||| |||||||||||||||    
T  18256144 agtcattgcaaatgagacagacaacggaaactgccttcgtttaaacttgaacggaattctagtatcagacggctgtagcgataatcttggaataaacacc 18256045  T
Q  433 ttctcaccgatattacaaccagatattacccgtccttcgagcacaaattttctcatctttgtaatgatcaatctcgtacccttacat 519  Q
    || ||||| |||||| | ||||||||||||  | | |||||||||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||| ||||||    
T  18256044 ttttcacctatattagatccagatattacctctgcctcgagcacaaatttacccatctttgtaataatcaatcttgtaccgttacat 18255958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 10 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 854809 - 854554
Alignment:
Q  10 ataattctagtacgtagttcatgttagtttaacataacatataattttaaaagggaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaa 109  Q
    |||||||||||||||||||| | ||| ||||| ||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  854809 ataattctagtacgtagttcctattactttaaaataacatataattttgaaggggaaattgaagttcgttgacatgcaaatactttcaataagtaagaaa 854710  T
Q  110 aatgaatagtacataaaaaagtcttacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgatgcaacatcggtaccatcgccgtccttgtcattaatca 209  Q
    | |||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||| | |||||||||||    
T  854709 a-tgaacagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgatgcaacattgatatcatcgccgtcgtcgtcattaatca 854611  T
Q  210 atatctttaaatcacccctcgaagcaacccgtgatattgtgacgtacaactgtccat 266  Q
    |||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  854610 atatttttaaaccacccctcgaagtaacccgtgatattgcgacgtacaattgtccat 854554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 10 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 11826710 - 11826489
Alignment:
Q  10 ataattctagtacgtagttcatgttagtttaacataacatataattttaaaagggaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaa 109  Q
    |||||||||  ||| ||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11826710 ataattctaagacgcagtttctgttactttaacataacatataattttaaaaggaaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaa 11826611  T
Q  110 aatgaatagtacataaaaaagtcttacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgatgcaacatcggtaccatcgccgtccttgtcattaatca 209  Q
    | ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||    
T  11826610 a-tgaatagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctttgtagaccacatttgatgcaacatcggtataatcgccgtcctcgtcattaatca 11826512  T
Q  210 atatctttaaatcacccctcgaa 232  Q
    |||| |||||| |||||||||||    
T  11826511 atatttttaaaccacccctcgaa 11826489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 31 - 232
Target Start/End: Original strand, 33003784 - 33003984
Alignment:
Q  31 tgttagtttaacataacatataattttaaaagggaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaaatgaatagtacataaaaaag 130  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  33003784 tgttactttaacataacatataattttaaaagggaaactgaagttcgttgacatgcaaataatttcaataagtaagaaaa-tgaatagtacacaaaaaag 33003882  T
Q  131 tcttacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgatgcaacatcggtaccatcgccgtccttgtcattaatcaatatctttaaatcacccctcg 230  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  33003883 tcatacacattacggaaaacttctttgtagaccatatttgatgcaacatcggtataatcgccgtcctcgtcattaatcaatatttttaaatcacccctcg 33003982  T
Q  231 aa 232  Q
    ||    
T  33003983 aa 33003984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 66 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 26948026 - 26947819
Alignment:
Q  66 aactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaaatgaatagtacataaaaaagtcttacacattacggaaaacttctctgtagaccac 165  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26948026 aactgaagttcgttgacatgcaaatactttcaataagtaagaaaa-tgaatagtacccaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagaccac 26947928  T
Q  166 atttgatgcaacatcggtaccatcgccgtccttgtcattaatcaatatctttaaatcacccctcgaagcaacccgtgatattgtgacgtacaactgtcca 265  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||  | |||||||||||||    
T  26947927 acttgatgcaacatcggtatcatcgccgtcgtcgtcattaatcaatatctttaaaccacccctcgaagtaacctgtgatattgcaatgtacaactgtcca 26947828  T
Q  266 tgtgaaaaa 274  Q
    |||||||||    
T  26947827 tgtgaaaaa 26947819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 10 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 860069 - 859838
Alignment:
Q  10 ataattctagtacgtagttcatgttagtttaacataacatataattttaaaagggaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaa 109  Q
    |||||||||  ||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  860069 ataattctaagacgcagttcctgttactttaacataacatataattttaaaagggaaattgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataaataag-aa 859971  T
Q  110 aatgaatagtacataaaaaagtcttacacattacggaaaactt---------ctctgtagaccacatttgatgcaacatcggtaccatcgccgtccttgt 200  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||         || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  859970 aatgaatagtacacaaaaaagtcatacacattacggaaaacttctatgtagactatgtagaccacatttgatgcaacatcggtatcatcgccgtcctcgt 859871  T
Q  201 cattaatca--atatctttaaatcacccctcga 231  Q
    |||||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  859870 cattaatcaatatatctttaaaccacccctcga 859838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 163 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 18201441 - 18201248
Alignment:
Q  163 cacatttgatgcaacatcggtaccatcgccgtccttgtcattaatcaatatctttaaatcacccctcgaagcaacccgtgatattgtgacgtacaactgt 262  Q
    |||||||||||  ||||||||| | ||||||||||  ||||| ||||||||||||||| || || | |||| ||||| | |||||| ||||||||| |||    
T  18201441 cacatttgatgtcacatcggtatcttcgccgtcctcatcattgatcaatatctttaaaccatcctttgaagtaaccctttatattgcgacgtacaattgt 18201342  T
Q  263 ccatgtgaaaaaataggaaacggtaggtagacaccaacatattctagcgactgaccctgacccttgtt-atggtcattgcaaatgagacagata 355  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||| || |||||||||| ||  | |||||||||||||| |||||| || || |||||||||||||||||||    
T  18201341 ccatgtgaaaaaacaggagacggtagataaacaccaacatgtttcaacgactgaccctgactcttgttaatagttattgcaaatgagacagata 18201248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 10 - 76
Target Start/End: Original strand, 29864704 - 29864770
Alignment:
Q  10 ataattctagtacgtagttcatgttagtttaacataacatataattttaaaagggaaactgaagttc 76  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29864704 ataattctagtacgtagttcctgttactttaacataacatataattttaaaagggaaactgaagttc 29864770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 31 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 47726836 - 47726776
Alignment:
Q  31 tgttagtttaacataacatataattttaaaagggaaactgaagttcgttgacatgcaaata 91  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47726836 tgttactttaacataacatataattttaaaagggaaactgaagttcgttgacatgcaaata 47726776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 264 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 26951113 - 26951026
Alignment:
Q  264 catgtgaaaaaataggaaacggtaggtagacaccaacatattctagcgactgaccctgacccttgtt-atggtcattgcaaatgagac 350  Q
    |||||||||||| |||| ||||||| || |||||||||| ||  | |||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||    
T  26951113 catgtgaaaaaacaggagacggtagataaacaccaacatgtttcaacgactgaccctgactcttgttaatagtcattgcaaatgagac 26951026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 137 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 36006293 - 36006257
Alignment:
Q  137 acattacggaaaacttctctgtagaccacatttgatg 173  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36006293 acattacggaaaacttctctgtagaccacatttgatg 36006257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 329 - 407
Target Start/End: Original strand, 24759089 - 24759167
Alignment:
Q  329 ttatggtcattgcaaatgagacagatatcggaaactgcctccgtttaaatttgaaaggaattctattatcagatggtgt 407  Q
    |||| |||||||||||  | | ||||||  |||||||||| |||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  24759089 ttatagtcattgcaaaacacaaagatataagaaactgcctacgttgaaatttgaaaggaattctggtatcagatggtgt 24759167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 329 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 24826925 - 24826847
Alignment:
Q  329 ttatggtcattgcaaatgagacagatatcggaaactgcctccgtttaaatttgaaaggaattctattatcagatggtgt 407  Q
    |||| |||||||||||  | | ||||||  |||||||||| |||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  24826925 ttatagtcattgcaaaacacaaagatataagaaactgcctacgttgaaatttgaaaggaattctggtatcagatggtgt 24826847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 334 - 401
Target Start/End: Original strand, 20370864 - 20370931
Alignment:
Q  334 gtcattgcaaatgagacagatatcggaaactgcctccgtttaaatttgaaaggaattctattatcaga 401  Q
    |||||||||||  | |||||||| ||||||||||||||||  |||||||| || |||||| |||||||    
T  20370864 gtcattgcaaaacaaacagatataggaaactgcctccgttggaatttgaacggtattctagtatcaga 20370931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 264 - 350
Target Start/End: Original strand, 36091934 - 36092021
Alignment:
Q  264 catgtgaaaaaataggaaacggtaggtagacaccaacatattctagcgactgaccctgacccttgtt-atggtcattgcaaatgagac 350  Q
    |||||||||||| |||| | | ||| || |||||||||| ||  | |||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||    
T  36091934 catgtgaaaaaacaggagaagatagataaacaccaacatgtttcaacgactgaccctgactcttgttaatagtcattgcaaatgagac 36092021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 134 - 173
Target Start/End: Original strand, 53521066 - 53521105
Alignment:
Q  134 tacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgatg 173  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  53521066 tacacattaccaaaaacttctctgtagaccacatttgatg 53521105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 329 - 407
Target Start/End: Original strand, 33648448 - 33648526
Alignment:
Q  329 ttatggtcattgcaaatgagacagatatcggaaactgcctccgtttaaatttgaaaggaattctattatcagatggtgt 407  Q
    |||| |||||||||||  | | |||||| |||||||| || |||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||    
T  33648448 ttatagtcattgcaaaacacaaagatataggaaactgactacgttgaaatttgaaaggaattatggtatcagatggtgt 33648526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 329 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 37984771 - 37984693
Alignment:
Q  329 ttatggtcattgcaaatgagacagatatcggaaactgcctccgtttaaatttgaaaggaattctattatcagatggtgt 407  Q
    |||| |||||||||||  | | || ||| |||||||| || |||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  37984771 ttatagtcattgcaaaacacaaagctataggaaactgtctgcgttgaaatttgaaaggaattctggtatcagatggtgt 37984693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 351 - 407
Target Start/End: Original strand, 53025016 - 53025072
Alignment:
Q  351 agatatcggaaactgcctccgtttaaatttgaaaggaattctattatcagatggtgt 407  Q
    |||||| ||||| || || |||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  53025016 agatataggaaattgtctgcgttgaaatttgaaaggaattctgctatcagatggtgt 53025072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 395; Significance: 0; HSPs: 25)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 395; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 519
Target Start/End: Complemental strand, 29245675 - 29245166
Alignment:
Q  10 ataattctagtacgtagttcatgttagtttaacataacatataattttaaaagggaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaa 109  Q
    ||||||||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  29245675 ataattctagtatttagttcctgttattttaacataacatataattttaaaagggaaactgaagttcgttgacatgcaaatagttttaataagtaagaaa 29245576  T
Q  110 aatgaatagtacataaaaaagtcttacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgatgcaacatcggtaccatcgccgtccttgtcattaatca 209  Q
    | ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  29245575 a-tgaatagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagatcacatttgatgcaacatcggtatcatcgccgtcctcgtcattaatca 29245477  T
Q  210 atatctttaaatcacccctcgaagcaacccgtgatattgtgacgtacaactgtccatgtgaaaaaataggaaacggtaggtagacaccaacatattctag 309  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  29245476 atatctttaaaccacccctcgaagtaacccgtgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaaataggagacggtaggtagacaccaacatgttctag 29245377  T
Q  310 cgactgaccctgacccttgtt-atggtcattgcaaatgagacagatatcggaaactgcctccgtttaaatttgaaaggaattctattatcagatggtgtt 408  Q
    |||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29245376 cgactgaccctgactcttgttaatagtcattgcaaatgaggcagatatcggaaactgtcttcgtttaaatttgaaaggaattctattatcagatggtgtt 29245277  T
Q  409 agcgataaccttggaataaacaccttctcaccgatattacaaccagatattacccgtccttcgagcacaaattttctcatctttgtaatgatcaatctcg 508  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29245276 agcgataaccttggaataaacaccttctcaccgatattagaaccagatattacccgttcttcgagcaaaaattttctcatctttgtaatgatcaatctcg 29245177  T
Q  509 tacccttacat 519  Q
    |||| ||||||    
T  29245176 taccgttacat 29245166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 383; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 519
Target Start/End: Complemental strand, 50709096 - 50708587
Alignment:
Q  10 ataattctagtacgtagttcatgttagtttaacataacatataattttaaaagggaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaa 109  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  50709096 ataattctagtacgtagttcctgttactttaaaataacatataattttgaaagggaaattgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaaaaagtaagaaa 50708997  T
Q  110 aatgaatagtacataaaaaagtcttacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgatgcaacatcggtaccatcgccgtccttgtcattaatca 209  Q
    | ||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||    
T  50708996 a-tgaatagtacacaaaaaagtcctacacattacagaaaacttctctgtagaccacatttgatgcaacatcggtatcatcgccgtcgtcgtcattaatca 50708898  T
Q  210 atatctttaaatcacccctcgaagcaacccgtgatattgtgacgtacaactgtccatgtgaaaaaataggaaacggtaggtagacaccaacatattctag 309  Q
    |||| |||||| |||||||||| | ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  50708897 atatttttaaaccacccctcgatgtaacacgtgatattgcgacgtacaactgtccatgtgaaaaaataggagacggtaggtagacaccaacatgttctag 50708798  T
Q  310 cgactgaccctgacccttgtt-atggtcattgcaaatgagacagatatcggaaactgcctccgtttaaatttgaaaggaattctattatcagatggtgtt 408  Q
    |||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  50708797 cgactgaccctgactcttgttaatagtcattgcaaatgagacagatatcggaaactaccttcgtttaaatttgaaatgaattctattatcagatggtgtt 50708698  T
Q  409 agcgataaccttggaataaacaccttctcaccgatattacaaccagatattacccgtccttcgagcacaaattttctcatctttgtaatgatcaatctcg 508  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  50708697 agcgataaccttggaataaacaccttctcaccgatattagaaccagatattacccgtccttcgagcacaaattttcacatctttgtaatgatcaatctcg 50708598  T
Q  509 tacccttacat 519  Q
    |||| ||||||    
T  50708597 taccgttacat 50708587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 347; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 519
Target Start/End: Complemental strand, 48651238 - 48650730
Alignment:
Q  10 ataattctagtacgtagttcatgttagtttaacataacatataattttaaaagggaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaa 109  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48651238 ataattctagtatgtagttcctgttactttaaaataacatataattttgaaagggaaattgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaa 48651139  T
Q  110 aatgaatagtacataaaaaagtcttacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgatgcaacatcggtaccatcgccgtccttgtcattaatca 209  Q
    | ||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||| | |||||||||||    
T  48651138 a-tgaatagtacacaaaaa-gtcctacacattacggaaaacttctctatagaccacatttgatgcaacatcggtatcatctctgtcgtcgtcattaatca 48651041  T
Q  210 atatctttaaatcacccctcgaagcaacccgtgatattgtgacgtacaactgtccatgtgaaaaaataggaaacggtaggtagacaccaacatattctag 309  Q
    |||| |||||| || ||||| ||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||    
T  48651040 atatttttaaaccagccctcaaagtaacctgtgatattgcgacgtacaactgtccatgtgaaaaaataggagacagtaggtagacaccaacatgttctag 48650941  T
Q  310 cgactgaccctgacccttgtta-tggtcattgcaaatgagacagatatcggaaactgcctccgtttaaatttgaaaggaattctattatcagatggtgtt 408  Q
    |||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48650940 cgactgaccctgactcttgttaatagtcattgcaaatgagacagatatcggaaactgccttcgtttaaatttgaaaggaattctattatcagatggtgtt 48650841  T
Q  409 agcgataaccttggaataaacaccttctcaccgatattacaaccagatattacccgtccttcgagcacaaattttctcatctttgtaatgatcaatctcg 508  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  48650840 agcgataaccttgtaataaacactttctcaccgatatttgaaccatatattatccgtccttcgagcacaaattttcccatctttgtaatgatcaatctcg 48650741  T
Q  509 tacccttacat 519  Q
    |||| ||||||    
T  48650740 taccgttacat 48650730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 346; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 474
Target Start/End: Original strand, 45503411 - 45503875
Alignment:
Q  10 ataattctagtacgtagttcatgttagtttaacataacatataattttaaaagggaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaa 109  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45503411 ataattctagtacgtagttcctgttactttaaaataacatataattttgaaagggaaattgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaa 45503510  T
Q  110 aatgaatagtacataaaaaagtcttacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgatgcaacatcggtaccatcgccgtccttgtcattaatca 209  Q
    | |||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| | |||||||||||    
T  45503511 a-tgaacagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctccgtagaccacatttgatgcaacatcgatatcatcgccgtcgtcgtcattaatca 45503609  T
Q  210 atatctttaaatcacccctcgaagcaacccgtgatattgtgacgtacaactgtccatgtgaaaaaataggaaacggtaggtagacaccaacatattctag 309  Q
    |||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  45503610 atatttttaaaccacccctcgaagtaacccgtgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaaataggagacggtaggtagacaccaacatgttctag 45503709  T
Q  310 cgactgaccctgacccttgtt-atggtcattgcaaatgagacagatatcggaaactgcctccgtttaaatttgaaaggaattctattatcagatggtgtt 408  Q
    |||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45503710 cgactgaccctgactcttgttaatagtcattgcaaatgagacagattacggaaactgccttcgtttaaatttgaaaggaattctattatcagatggtgtt 45503809  T
Q  409 agcgataaccttggaataaacaccttctcaccgatattacaaccagatattacccgtccttcgagc 474  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  45503810 agcgataaccttggaataaacaccttctcaccgatattagaaccagatattacccgtccttcgagc 45503875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 337; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 519
Target Start/End: Original strand, 13926180 - 13926685
Alignment:
Q  10 ataattctagtacgtagttcatgttagtttaacataacatataattttaaaagggaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaa 109  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||| ||| | ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13926180 ataattctattacgtagttcctgttacttttaaataacatataattttgaaagggaaattgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataaataagaaa 13926279  T
Q  110 aatgaatagtacataaaaaagtcttacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgatgcaacatcggtaccatcgccgtccttgtcattaatca 209  Q
    | ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | |||||||||||    
T  13926280 a-tgaatagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctttgtagaccacatttgatgcaacatcggtatcatcaccgtcgtcgtcattaatca 13926378  T
Q  210 atatctttaaatcacccctcgaagcaacccgtgatattgtgacgtacaactgtccatgtgaaaaaataggaaacggtaggtagacaccaacatattctag 309  Q
    |||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||   | ||||||    
T  13926379 atatttttaaaccacccctcgaagtaacccgtgatattgcgacgtacaactgtgcatgtgaaaaa-taggagacggtagatagacacca---tgttctag 13926474  T
Q  310 cgactgaccctgacccttgtta-tggtcattgcaaatgagacagatatcggaaactgcctccgtttaaatttgaaaggaattctattatcagatggtgtt 408  Q
    |||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  13926475 cgactgaccctgactcttgttaatagtcattgcaaatgagacagatgtcggaaactgccttcgtttaaatttgaaaggaattctattatcacatgatgtt 13926574  T
Q  409 agcgataaccttggaataaacaccttctcaccgatattacaaccagatattacccgtccttcgagcacaaattttctcatctttgtaatgatcaatctcg 508  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  13926575 agtgataaccttggaataaacaccttctcaccgatattagaaccagatattacccgtccttcgagcacaaattttcccatctttgtaatgatcaatctcc 13926674  T
Q  509 tacccttacat 519  Q
    |||| ||||||    
T  13926675 taccattacat 13926685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 10 - 396
Target Start/End: Original strand, 38210872 - 38211258
Alignment:
Q  10 ataattctagtacgtagttcatgttagtttaacataacatataattttaaaagggaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaa 109  Q
    |||||||||  ||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38210872 ataattctaagacgcagttcctgttactttaacataacatataattttaaaagggaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaa 38210971  T
Q  110 aatgaatagtacataaaaaagtcttacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgatgcaacatcggtaccatcgccgtccttgtcattaatca 209  Q
    | |||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  38210972 a-tgaacagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctttgtagaccacatttgatgcaacatcggtatcatcgccgtcctcgtcattaatca 38211070  T
Q  210 atatctttaaatcacccctcgaagcaacccgtgatattgtgacgtacaactgtccatgtgaaaaaataggaaacggtaggtagacaccaacatattctag 309  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||    
T  38211071 atatctttaaaccacccctcgaagtaactcgtgatattgcgacgtacaactgtccatgtgaaaaaataggagacagtaggtagacaccaacatgttctag 38211170  T
Q  310 cgactgaccctgacccttgtt-atggtcattgcaaatgagacagatatcggaaactgcctccgtttaaatttgaaaggaattctatta 396  Q
    ||| |||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  38211171 cgattgaccctgactcttgttaatagtcattgcaaatgagacagatatcggaaactgccttcgtttaaatttgaaaggaattctatta 38211258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 25 - 396
Target Start/End: Original strand, 39513149 - 39513520
Alignment:
Q  25 agttcatgttagtttaacataacatataattttaaaagggaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaaatgaatagtacata 124  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||| |    
T  39513149 agttcctgttactttaacataacatataattttaaaaggaaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataaataagaaaa-tgaacagtacaca 39513247  T
Q  125 aaaaagtcttacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgatgcaacatcggtaccatcgccgtccttgtcattaatcaatatctttaaatcac 224  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  39513248 aaaaagtcctacacattacggaaaacttatctgtagaccacatttgatgcaacatcggtatcatcgccgtcctcgtcattaatcaatatctttaaaccac 39513347  T
Q  225 ccctcgaagcaacccgtgatattgtgacgtacaactgtccatgtgaaaaaataggaaacggtaggtagacaccaacatattctagcgactgaccctgacc 324  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  39513348 ccctcgaagtaacccgtgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaaataggagacggtaggtagacaccaacatgttctagcgactgaccctgact 39513447  T
Q  325 cttgtt-atggtcattgcaaatgagacagatatcggaaactgcctccgtttaaatttgaaaggaattctatta 396  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||    
T  39513448 cttgttaatagtcattgcaaatgagacagatatcggaaactgccttcgtttaactttgaaaggaattatatta 39513520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 10 - 350
Target Start/End: Original strand, 2045127 - 2045467
Alignment:
Q  10 ataattctagtacgtagttcatgttagtttaacataacatataattttaaaagggaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaa 109  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2045127 ataattctagtacgtagttcctgttactttaaaataacatataattttgaaagggaaattgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaa 2045226  T
Q  110 aatgaatagtacataaaaaagtcttacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgatgcaacatcggtaccatcgccgtccttgtcattaatca 209  Q
    | |||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| | |||||||||||    
T  2045227 a-tgaacagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgatgcaacatcgatatcatcgccgtcgtcgtcattaatca 2045325  T
Q  210 atatctttaaatcacccctcgaagcaacccgtgatattgtgacgtacaactgtccatgtgaaaaaataggaaacggtaggtagacaccaacatattctag 309  Q
    |||| |||||| |||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| || |||||||||| ||  |     
T  2045326 atatttttaaaccacctctcgaagtaacccgtgatattgcgacgtacaactgtccatgtgaaaaaacaggagacggtagataaacaccaacatgtttcaa 2045425  T
Q  310 cgactgaccctgacccttgtt-atggtcattgcaaatgagac 350  Q
    |||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||    
T  2045426 cgactgaccctgactcttgttaatagtcattgcaaatgagac 2045467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 10 - 274
Target Start/End: Original strand, 2047378 - 2047641
Alignment:
Q  10 ataattctagtacgtagttcatgttagtttaacataacatataattttaaaagggaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaa 109  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2047378 ataattctagtacgtagttcctgttactttaacataacatataattttaaaagggaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaa 2047477  T
Q  110 aatgaatagtacataaaaaagtcttacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgatgcaacatcggtaccatcgccgtccttgtcattaatca 209  Q
    | ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||| |||||||||| | |||||||||||    
T  2047478 a-tgaatagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagatcacacttgatgcaacattggtatcatcgccgtcgtcgtcattaatca 2047576  T
Q  210 atatctttaaatcacccctcgaagcaacccgtgatattgtgacgtacaactgtccatgtgaaaaa 274  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2047577 atatctttaaaccacccctcgaagtaacccgtgatattgtgacgtacaactgtccatgtgaaaaa 2047641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 10 - 274
Target Start/End: Original strand, 36866789 - 36867052
Alignment:
Q  10 ataattctagtacgtagttcatgttagtttaacataacatataattttaaaagggaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaa 109  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36866789 ataattctagtacgtagttcctgttactttaacataacatataattttaaaagggaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaa 36866888  T
Q  110 aatgaatagtacataaaaaagtcttacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgatgcaacatcggtaccatcgccgtccttgtcattaatca 209  Q
    | ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||| |||||||||| | |||||||||||    
T  36866889 a-tgaatagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagatcacacttgatgcaacattggtatcatcgccgtcgtcgtcattaatca 36866987  T
Q  210 atatctttaaatcacccctcgaagcaacccgtgatattgtgacgtacaactgtccatgtgaaaaa 274  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36866988 atatctttaaaccacccctcgaagtaacccgtgatattgtgacgtacaactgtccatgtgaaaaa 36867052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 182; E-Value: 4e-98
Query Start/End: Original strand, 10 - 274
Target Start/End: Original strand, 49787237 - 49787498
Alignment:
Q  10 ataattctagtacgtagttcatgttagtttaacataacatataattttaaaagggaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaa 109  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  49787237 ataattctagtacgtagttcctgttactttaacataacata--attttaaaagggaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaatatgtaagaaa 49787334  T
Q  110 aatgaatagtacataaaaaagtcttacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgatgcaacatcggtaccatcgccgtccttgtcattaatca 209  Q
    | |||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||  | | |||||||||||    
T  49787335 a-tgaagagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagaccacacttgatgcaacatcggtatcattgccaccgtcgtcattaatca 49787433  T
Q  210 atatctttaaatcacccctcgaagcaacccgtgatattgtgacgtacaactgtccatgtgaaaaa 274  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  49787434 atatctttaaaccacccctcgaagtaacccgtgatattgcgacgtacaactgtccatgtgaaaaa 49787498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 10 - 231
Target Start/End: Original strand, 45501166 - 45501386
Alignment:
Q  10 ataattctagtacgtagttcatgttagtttaacataacatataattttaaaagggaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaa 109  Q
    |||||||||  ||| ||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45501166 ataattctaagacgcagttcctgttacattaacataacatataattttaaaaggaaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaa 45501265  T
Q  110 aatgaatagtacataaaaaagtcttacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgatgcaacatcggtaccatcgccgtccttgtcattaatca 209  Q
    | ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  45501266 a-tgaatagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgatgcaacatcggtatcatcgccgtcctcgtcattaatca 45501364  T
Q  210 atatctttaaatcacccctcga 231  Q
    |||| |||||| ||||||||||    
T  45501365 atatatttaaaccacccctcga 45501386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 10 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 26211874 - 26211630
Alignment:
Q  10 ataattctagtacgtagttcatgttagtttaacataacatataattttaaaagggaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaa 109  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26211874 ataattctagtacgtagttcctgttactttaacataacatatcattttaaa-gggaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaa 26211776  T
Q  110 aatgaatagtacataaaaaagtcttacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgatgcaacatcggtaccatcgccgtccttgtcattaatca 209  Q
    | ||||| ||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||  |||| ||||||  ||||||||||    
T  26211775 a-tgaatggtacacaaaaaagtcctatacattacggaaaacttctttgtagaccacatttgatgcaacatcagtattatcgtcgtcctcatcattaatca 26211677  T
Q  210 atatctttaaatcacccctcgaagcaacccgtgatattgtgacgtac 256  Q
    |||||||| || |||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  26211676 atatcttttaaccacccctcgaagtaacccgtgatattgcgacgtac 26211630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 134 - 519
Target Start/End: Original strand, 37891536 - 37891922
Alignment:
Q  134 tacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgatgcaacatcggtaccatcgccgtccttgtcattaatcaatatctttaaatcacccctcgaag 233  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||| ||| | | |||||||| |||||| ||||| ||||||||| || |||| ||||    
T  37891536 tacacattgcggaaaacttctttgtagaccacatttgatgtcacatcagtatcttggccgtcctcgtcattgatcaacatctttaaaccatcccttgaag 37891635  T
Q  234 caacccgtgatattgtgacgtacaactgtccatgtgaaaaaataggaaacggtaggtagacaccaacatattctagcgactgaccctgacccttgtta-t 332  Q
     |||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||| || | ||||||| ||||||||||||| ||  |  ||||||||||||| ||||||| |    
T  37891636 taaccctcgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaaacagaagacggtagatagacaccaacatttttcaaagactgaccctgactcttgttaat 37891735  T
Q  333 ggtcattgcaaatgagacagatatcggaaactgcctccgtttaaatttgaaaggaattctattatcagatggtgttagcgataaccttggaataaacacc 432  Q
     |||||||||||||||||||| | ||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||   ||||||||| |||||||||||||||    
T  37891736 agtcattgcaaatgagacagacaacggaaactgtcttcgtttaaacttgaacggaattctagtatcagacggctgtagcgataatcttggaataaacacc 37891835  T
Q  433 ttctcaccgatattacaaccagatattacccgtccttcgagcacaaattttctcatctttgtaatgatcaatctcgtacccttacat 519  Q
    || ||||| |||||| | ||||||||||||  | | |||||||||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||| ||||||    
T  37891836 ttttcacctatattagatccagatattacctctgcctcgagcacaaatttacccatctttgtaataatcaatcttgtaccgttacat 37891922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 10 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 15691693 - 15691472
Alignment:
Q  10 ataattctagtacgtagttcatgttagtttaacataacatataattttaaaagggaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaa 109  Q
    |||||||||  ||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15691693 ataattctaagacgcagtttatgttactttaacataacatataattttaaaagggaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaa 15691594  T
Q  110 aatgaatagtacataaaaaagtcttacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgatgcaacatcggtaccatcgccgtccttgtcattaatca 209  Q
    | ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| |||||||||||    
T  15691593 a-tgaatagtacacaaaaaagtcatacacattacggaaaacttctttgtacaccacatttgatgcaacattggtataatcgccgtcctcgtcattaatca 15691495  T
Q  210 atatctttaaatcacccctcgaa 232  Q
    |||| |||||| |||||||||||    
T  15691494 atatttttaaaccacccctcgaa 15691472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 31 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 48960926 - 48960726
Alignment:
Q  31 tgttagtttaacataacatataattttaaaagggaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaaatgaatagtacataaaaaag 130  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  48960926 tgttactttaacataacatataattttaaaagggaaactgaagttcgttgacatgcaaataatttcaataagtaagaaaa-tgaatagtacacaaaaaag 48960828  T
Q  131 tcttacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgatgcaacatcggtaccatcgccgtccttgtcattaatcaatatctttaaatcacccctcg 230  Q
    || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  48960827 tcctacacattacggaaaacttctttgtagaccacatttgatgcaacatcggtataatcgtcgtcctcgtcattaatcaatatttttaaatcacctctcg 48960728  T
Q  231 aa 232  Q
    ||    
T  48960727 aa 48960726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 66 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 7480677 - 7480470
Alignment:
Q  66 aactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaaatgaatagtacataaaaaagtcttacacattacggaaaacttctctgtagaccac 165  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7480677 aactgaagttcgttgacatgcaaatactttcaataagtaagaaaa-tgaatagtacccaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagaccac 7480579  T
Q  166 atttgatgcaacatcggtaccatcgccgtccttgtcattaatcaatatctttaaatcacccctcgaagcaacccgtgatattgtgacgtacaactgtcca 265  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||  | |||||||||||||    
T  7480578 acttgatgcaacatcggtatcatcgccgtcgtcgtcattaatcaatatctttaaaccacccctcgaagtaacctgtgatattgcaatgtacaactgtcca 7480479  T
Q  266 tgtgaaaaa 274  Q
    |||||||||    
T  7480478 tgtgaaaaa 7480470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 66 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 9534053 - 9533846
Alignment:
Q  66 aactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaaatgaatagtacataaaaaagtcttacacattacggaaaacttctctgtagaccac 165  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9534053 aactgaagttcgttgacatgcaaatactttcaataagtaagaaaa-tgaatagtacccaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagaccac 9533955  T
Q  166 atttgatgcaacatcggtaccatcgccgtccttgtcattaatcaatatctttaaatcacccctcgaagcaacccgtgatattgtgacgtacaactgtcca 265  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||  | |||||||||||||    
T  9533954 acttgatgcaacatcggtatcatcgccgtcgtcgtcattaatcaatatctttaaaccacccctcgaagtaacctgtgatattgcaatgtacaactgtcca 9533855  T
Q  266 tgtgaaaaa 274  Q
    |||||||||    
T  9533854 tgtgaaaaa 9533846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 66 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 42496761 - 42496554
Alignment:
Q  66 aactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaaatgaatagtacataaaaaagtcttacacattacggaaaacttctctgtagaccac 165  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42496761 aactgaagttcgttgacatgcaaatactttcaataagtaagaaaa-tgaatagtacccaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagaccac 42496663  T
Q  166 atttgatgcaacatcggtaccatcgccgtccttgtcattaatcaatatctttaaatcacccctcgaagcaacccgtgatattgtgacgtacaactgtcca 265  Q
    | |||||||||||||| || |||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||  | |||||||||||||    
T  42496662 acttgatgcaacatcgatatcatcgccgtcgtcgtcattaatcaatatctttaaaccacccctcgaagtaacctgtgatattgcaatgtacaactgtcca 42496563  T
Q  266 tgtgaaaaa 274  Q
    |||||||||    
T  42496562 tgtgaaaaa 42496554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 140 - 416
Target Start/End: Original strand, 23086202 - 23086479
Alignment:
Q  140 ttacggaaaacttctctgtagaccacatttgatgcaacatcggtaccatcgccgtccttgtcattaatcaatatctttaaatcacccctcgaagcaaccc 239  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||  ||||| ||| | | | ||||||  ||||| ||||||||||||||| || |||| |||| ||||     
T  23086202 ttacgaaaaacttctctgtaaaccacatttgatgtcacatcagtatcttggtcgtcctcatcattgatcaatatctttaaaccatcccttgaagtaacca 23086301  T
Q  240 gtgatattgtgacgtacaactgtccatgtgaaaaaataggaaacggtaggtagacaccaacatattctagcgactgaccctgacccttgtt-atggtcat 338  Q
      ||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||| ||  |  || ||||||  || |||||| || |||||    
T  23086302 tcgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaaacaggagacggtagatagacaccaacatttttcaaagattgaccccaactcttgttaatagtcat 23086401  T
Q  339 tgcaaatgagacagatatcggaaactgcctccgtttaaatttgaaaggaattctattatcagatggtgttagcgataa 416  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||| || |||||| ||||||| |||  |||||||||    
T  23086402 tgcaaatgagacagacaacggaaactgccttcgtttaaacttgaacgggattctagtatcagacggttgtagcgataa 23086479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 161 - 368
Target Start/End: Original strand, 35593894 - 35594102
Alignment:
Q  161 accacatttgatgcaacatcggtaccatcgccgtccttgtcattaatcaatatctttaaatcacccctcgaagcaacccgtgatattgtgacgtacaact 260  Q
    |||||||||||||  ||||||||| | ||||||||||  ||||| ||||||||||||||| || |||| |||| ||||| |||||||| ||||||||| |    
T  35593894 accacatttgatgtcacatcggtatcttcgccgtcctcatcattgatcaatatctttaaaccatcccttgaagtaacccttgatattgcgacgtacaatt 35593993  T
Q  261 gtccatgtgaaaaaataggaaacggtaggtagacaccaacatattctagcgactgaccctgacccttgtt-atggtcattgcaaatgagacagatatcgg 359  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||| || |||||||||| ||  | |||||||| ||||| |||||| || |||||||||||||||||||||| |||    
T  35593994 gtccatgtgaaaaaacaggagacggtagataaacaccaacatgtttcaacgactgactctgactcttgttaatagtcattgcaaatgagacagataacgg 35594093  T
Q  360 aaactgcct 368  Q
    ||| |||||    
T  35594094 aaattgcct 35594102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 412 - 511
Target Start/End: Original strand, 23089555 - 23089654
Alignment:
Q  412 gataaccttggaataaacaccttctcaccgatattacaaccagatattacccgtccttcgagcacaaattttctcatctttgtaatgatcaatctcgtac 511  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||| |||||| | ||||||||||||  | |||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||    
T  23089555 gataaccttggaataaacacattttcacctatattagatccagatattacctctgcttcgagcacaaatttacccatctttgtaataatcaatcttgtac 23089654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 114 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 21056932 - 21056874
Alignment:
Q  114 aatagtacataaaaaagtcttacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgat 172  Q
    |||| |||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21056932 aatactacaaaacaaagtgttacacattacggaaaacttctctgtagagcacatttgat 21056874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 364 - 450
Target Start/End: Original strand, 12852797 - 12852883
Alignment:
Q  364 tgcctccgtttaaatttgaaaggaattctattatcagatggtgttagcgataaccttggaataaacaccttctcaccgatattacaa 450  Q
    ||||| |||| ||| ||||||||||||||| |||| || ||||| |  ||||| |||| |||||||| ||| ||||| |||||||||    
T  12852797 tgccttcgttgaaacttgaaaggaattctagtatctgacggtgtcaaagataatcttgtaataaacatcttatcacctatattacaa 12852883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 329 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 25226668 - 25226590
Alignment:
Q  329 ttatggtcattgcaaatgagacagatatcggaaactgcctccgtttaaatttgaaaggaattctattatcagatggtgt 407  Q
    |||| |||||||||||  | | || ||| |||||||| || |||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  25226668 ttatagtcattgcaaaacacaaagctataggaaactgtctacgttgaaatttgaaaggaattctggtatcagatggtgt 25226590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 387; Significance: 0; HSPs: 22)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 387; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 519
Target Start/End: Complemental strand, 45116050 - 45115541
Alignment:
Q  10 ataattctagtacgtagttcatgttagtttaacataacatataattttaaaagggaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaa 109  Q
    |||||||||||||||||||| | ||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45116050 ataattctagtacgtagttcctattactttaaaataacatataattttgaaagggaaattgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaa 45115951  T
Q  110 aatgaatagtacataaaaaagtcttacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgatgcaacatcggtaccatcgccgtccttgtcattaatca 209  Q
    | ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||    
T  45115950 a-tgaatagtacacaaaaaagtcatacacattacggaaaacttctctatagaccacatttgatgcaacatcggtatcatcgccgtcgtcgtcattaatca 45115852  T
Q  210 atatctttaaatcacccctcgaagcaacccgtgatattgtgacgtacaactgtccatgtgaaaaaataggaaacggtaggtagacaccaacatattctag 309  Q
    |||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  45115851 atatttttaaaccacccctcgaagtaacccgtgatattgcgacgtacaactgtccatgtgaaaaaataggagacggtaggtagacaccaacatgttctag 45115752  T
Q  310 cgactgaccctgacccttgtt-atggtcattgcaaatgagacagatatcggaaactgcctccgtttaaatttgaaaggaattctattatcagatggtgtt 408  Q
    |||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  45115751 cgactgaccctgactcttgttaatagtcattgcaaatgagacagatatcggaaactgccttcgtttaaatttgaaaggaattctattatcagatgttgtt 45115652  T
Q  409 agcgataaccttggaataaacaccttctcaccgatattacaaccagatattacccgtccttcgagcacaaattttctcatctttgtaatgatcaatctcg 508  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  45115651 agcgataaccttggaatcaacaccttctcaccgatattagaacctgatattacccgtccttcgagcacaaattttcccatctttgtaatgatcaatctcg 45115552  T
Q  509 tacccttacat 519  Q
    |||| ||||||    
T  45115551 taccgttacat 45115541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 359; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 519
Target Start/End: Complemental strand, 26169064 - 26168555
Alignment:
Q  10 ataattctagtacgtagttcatgttagtttaacataacatataattttaaaagggaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaa 109  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26169064 ataattctagtacgtagttcctgttactttaaaataacatataattttgaaagggaaattgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaa 26168965  T
Q  110 aatgaatagtacataaaaaagtcttacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgatgcaacatcggtaccatcgccgtccttgtcattaatca 209  Q
    | |||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| | ||||  |||||    
T  26168964 a-tgaacagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgatgcaacatcgatatcatcgccgtcgtcgtcagcaatca 26168866  T
Q  210 atatctttaaatcacccctcgaagcaacccgtgatattgtgacgtacaactgtccatgtgaaaaaataggaaacggtaggtagacaccaacatattctag 309  Q
    |||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26168865 atatttttaaaccacccctcgaagtaacccgtgatattgcgacgtacaactgtccatgtgaaaaaataggagacggtaggtagacaccaacatgttctag 26168766  T
Q  310 cgactgaccctgacccttgtt-atggtcattgcaaatgagacagatatcggaaactgcctccgtttaaatttgaaaggaattctattatcagatggtgtt 408  Q
    ||||||||||| || |||||| || |||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26168765 cgactgaccctaactcttgttaatagtcattgcaaatgagacaaatatcagaaactgccttcgtttaaatttgataggaattctattatcagatggtgtt 26168666  T
Q  409 agcgataaccttggaataaacaccttctcaccgatattacaaccagatattacccgtccttcgagcacaaattttctcatctttgtaatgatcaatctcg 508  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26168665 agcgataaccttggaataaacatcttctcaacgatattagaaccagatattacccgttcttcgagcacgaattttcccatctttgtaatgatcaatctcg 26168566  T
Q  509 tacccttacat 519  Q
    |||| ||||||    
T  26168565 taccattacat 26168555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 320; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 10 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 32660444 - 32659983
Alignment:
Q  10 ataattctagtacgtagttcatgttagtttaacataacatataattttaaaagggaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaa 109  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||| | ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32660444 ataattctagcacgtagttcctgttactataaaataacatataattttgaaagggaaattgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaa 32660345  T
Q  110 aatgaatagtacataaaaaagtcttacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgatgcaacatcggtaccatcgccgtccttgtcattaatca 209  Q
    | |||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||| ||||   |||||||||||    
T  32660344 a-tgaacagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgatgcaacatcgatatcgtcgtcgtc---gtcattaatca 32660249  T
Q  210 atatctttaaatcacccctcgaagcaacccgtgatattgtgacgtacaactgtccatgtgaaaaaataggaaacggtaggtagacaccaacatattctag 309  Q
    |||| ||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  32660248 atatttttaaactacccctcgaagtaacccgtgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaaataggagacggtaggtagacaccaacatgttctag 32660149  T
Q  310 cgactgaccctgacccttgtta-tggtcattgcaaatgagacagatatcggaaactgcctccgtttaaatttgaaaggaattctattatcagatggtgtt 408  Q
    ||||||||| |||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32660148 cgactgaccatgactcttgttaatagtcattgcaaatgagacagatattggaaactgccttcgtttaaatttgaaaggaattctattatcagatggtgtt 32660049  T
Q  409 agcgataaccttggaataaacaccttctcaccgatattacaaccagatattacccgtccttcgagc 474  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  32660048 agcgatgaccttggaataaacaccttctcaccgatattagaaccagatattacccgtccttcgagc 32659983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 10 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 7893977 - 7893637
Alignment:
Q  10 ataattctagtacgtagttcatgttagtttaacataacatataattttaaaagggaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaa 109  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7893977 ataattctagtacgtagttcctgttactttaaaataacatataattttgaaagggaaattgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaa 7893878  T
Q  110 aatgaatagtacataaaaaagtcttacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgatgcaacatcggtaccatcgccgtccttgtcattaatca 209  Q
    | |||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| | |||||||||||    
T  7893877 a-tgaacagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgatgcaacatcgatatcatcgccgtcgtcgtcattaatca 7893779  T
Q  210 atatctttaaatcacccctcgaagcaacccgtgatattgtgacgtacaactgtccatgtgaaaaaataggaaacggtaggtagacaccaacatattctag 309  Q
    |||| |||||| |||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| || |||||||||| ||  |     
T  7893778 atatttttaaaccacctctcgaagtaacccgtgatattgcgacgtacaactgtccatgtgaaaaaacaggagacggtagataaacaccaacatgtttcaa 7893679  T
Q  310 cgactgaccctgacccttgtt-atggtcattgcaaatgagac 350  Q
    |||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||    
T  7893678 cgactgaccctgactcttgttaatagtcattgcaaatgagac 7893637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 10 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 22007200 - 22006861
Alignment:
Q  10 ataattctagtacgtagttcatgttagtttaacataacatataattttaaaagggaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaa 109  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22007200 ataattctggtacgtagttcctgttactttaaaataatatataattttgaaagggaaattgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaa 22007101  T
Q  110 aatgaatagtacataaaaaagtcttacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgatgcaacatcggtaccatcgccgtccttgtcattaatca 209  Q
    | |||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| | |||||||||||    
T  22007100 a-tgaacagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgatgcaacatcgatatcatcgccgtcgtcgtcattaatca 22007002  T
Q  210 atatctttaaatcacccctcgaagcaacccgtgatattgtgacgtacaactgtccatgtgaaaaaataggaaacggtaggtagacaccaacatattctag 309  Q
    |||| |||||| |||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| || |||||||||| ||  |     
T  22007001 atatttttaaaccacctctcgaagtaacccgtgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaaacaggagacggtagataaacaccaacatgtttcaa 22006902  T
Q  310 cgactgaccctgacccttgtt-atggtcattgcaaatgagac 350  Q
    ||| |||||||||| |||||| || |||||||||||||||||    
T  22006901 cga-tgaccctgactcttgttaatagtcattgcaaatgagac 22006861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 10 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 27716163 - 27715901
Alignment:
Q  10 ataattctagtacgtagttcatgttagtttaacataacatataattttaaaagggaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaa 109  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27716163 ataattctagtacgtagttcctgttactttaacataacatataattttaaaagggaaactgaagttcgttgacatgcaaatcgtttcaataagtaagaaa 27716064  T
Q  110 aatgaatagtacataaaaaagtcttacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgatgcaacatcggtaccatcgccgtccttgtcattaatca 209  Q
    | ||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||    
T  27716063 a-tgaatagtacacaaaaa-gtcctacacattacggaaaacttctctgtagatcacacttgatgcaacatcggtatcatcgccgtcgtcgtcattaatca 27715966  T
Q  210 atatctttaaatcacccctcgaagcaacccgtgatattgtgacgtacaactgtccatgtgaaaaa 274  Q
    |||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27715965 atatatttaaaccacccctcgaagtaacccgtgatattgcgacgtacaactgtccatgtgaaaaa 27715901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 10 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 29956697 - 29956435
Alignment:
Q  10 ataattctagtacgtagttcatgttagtttaacataacatataattttaaaagggaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaa 109  Q
    ||||||||||  |||| ||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29956697 ataattctagatcgtacttcctgttactttaacataacttataattttaaaagggaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaa 29956598  T
Q  110 aatgaatagtacataaaaaagtcttacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgatgcaacatcggtaccatcgccgtccttgtcattaatca 209  Q
    | ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |    
T  29956597 a-tgaatagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgatgcaacatcggtatcatcgccgtcctcgtcattaatta 29956499  T
Q  210 atatctttaaatcacccctcgaagcaacccgtgatattgtgacgtacaactgtccatgtgaaaa 273  Q
    ||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  29956498 atatctttaaaccacccctcaaagtaacccgtgatattgcgacgtacaactatccatgtgaaaa 29956435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 10 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 17697135 - 17696872
Alignment:
Q  10 ataattctagtacgtagttcatgttagtttaacataacatataattttaaaagggaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaa 109  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  17697135 ataattctagtacgtagttcctgttactttaacataacatataattttaaaagggaaactgaagttcattgacatgtaaatagtttcaataaataagaaa 17697036  T
Q  110 aatgaatagtacataaaaaagtcttacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgatgcaacatcggtaccatcgccgtccttgtcattaatca 209  Q
    | ||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||    
T  17697035 a-tgaatagtacacaaaaaagtcctacacattacgggaaacttctctgtagatcacacttgatgcaacatcggtatcatcgccgtcgtcgtcattaatca 17696937  T
Q  210 atatctttaaatcacccctcgaagcaacccgtgatattgtgacgtacaactgtccatgtgaaaaa 274  Q
    |||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17696936 atatttttaaaccacccctcgaagtaacccgtgatattgcgacgtacaactgtccatgtgaaaaa 17696872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 10 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 16720121 - 16719857
Alignment:
Q  10 ataattctagtacgtagttcatgttagtttaacataacatataattttaaaagggaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaa 109  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  16720121 ataattctagtacgtagttcctgttactttaacataacatataattttaaaagggaaactgaagttcattgacatgtaaatagtttcaataaataagaaa 16720022  T
Q  110 aatgaatagtacataaaaaagtc-ttacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgatgcaacatcggtaccatcgccgtccttgtcattaatc 208  Q
    | ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||    
T  16720021 a-tgaatagtacacaaaaaagtccttacacattacggaaaacttctctgtagatcacacttgatgcaacatcggtatcatcgccgtcgtcgtcattaatc 16719923  T
Q  209 aatatctttaaatcacccctcgaagcaacccgtgatattgtgacgtacaactgtccatgtgaaaaa 274  Q
    ||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  16719922 aatatttttaaaccacccctcgaagtaacccgtgatattgcaacgtacaactgtccatgtgaaaaa 16719857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 177; E-Value: 4e-95
Query Start/End: Original strand, 10 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 31100358 - 31100097
Alignment:
Q  10 ataattctagtacgtagttcatgttagtttaacataacatataattttaaaagggaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaa 109  Q
    |||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  31100358 ataattctagtacgtagttcctattactttaacataacatataattttaaaagggaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaag-aa 31100260  T
Q  110 aatgaatagtacataaaaaagtcttacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgatgcaacatcggtaccatcgccgtccttgtcattaatca 209  Q
    ||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||    
T  31100259 aatgaatagtatacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttatctgtagaccacatttg-tccaacatcggtatcatcg-cgtcctcgtcattaatca 31100162  T
Q  210 atatctttaaatcacccctcgaagcaacccgtgatattgtgacgtacaactgtccatgtgaaaaa 274  Q
    ||||||||||| |||||||| ||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  31100161 atatctttaaaccacccctcaaagtaacccatgatattgcgacgtacaactctccatgtgaaaaa 31100097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 10 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 32038663 - 32038416
Alignment:
Q  10 ataattctagtacgtagttcatgttagtttaacataacatataattttaaaagggaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaa 109  Q
    |||||||||||||||||||| | ||| ||||| ||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  32038663 ataattctagtacgtagttcctattactttaaaataacatataattttgaaggggaaattgaagttcgttgacatgcaaatactttcaataagtaagaaa 32038564  T
Q  110 aatgaatagtacataaaaaagtcttacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgatgcaacatcggtaccatcgccgtccttgtcattaatca 209  Q
    | |||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| | |||||||||||    
T  32038563 a-tgaacagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgatgcaacatcgatatcatcgccgtcgtcgtcattaatca 32038465  T
Q  210 atatctttaaatcacccctcgaagcaacccgtgatattgtgacgtacaa 258  Q
    |||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  32038464 atatttttaaaccacccctcgaagtaacccgtgatattgcgacgtacaa 32038416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 31 - 232
Target Start/End: Original strand, 13398313 - 13398513
Alignment:
Q  31 tgttagtttaacataacatataattttaaaagggaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaaatgaatagtacataaaaaag 130  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  13398313 tgttactttaacataacatataattttaaaagggaaactaaagttcgttgacatacaaatagtttcaataagtaagaaaa-tgaatagtacacaaaaaag 13398411  T
Q  131 tcttacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgatgcaacatcggtaccatcgccgtccttgtcattaatcaatatctttaaatcacccctcg 230  Q
    || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13398412 tcctacacattacggaaaacttctttgtagaccacatttgatgcaacatcgatacaatcgccgtcctcgtcattaatcaatatctttaaaccacccctcg 13398511  T
Q  231 aa 232  Q
    ||    
T  13398512 aa 13398513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 10 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 46909567 - 46909348
Alignment:
Q  10 ataattctagtacgtagttcatgttagtttaacataacatataattttaaaagggaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaa 109  Q
    |||||||||  ||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  46909567 ataattctaagacgcagttcctgttactttaacataacatataattttaaaagggaaactgaagttcgttgacatgtaaatagtttcaataagtaag-aa 46909469  T
Q  110 aatgaatagtacataaaaaagtcttacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgatgcaacatcggtaccatcgccgtccttgtcattaatca 209  Q
    ||||||||| ||| |||||| || ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||    
T  46909468 aatgaataggacacaaaaaa-tcctacacattatggaaaacttctatgtagaccacatttgatgcaacatcggtatcatcgtcgtcctcgtcattaatca 46909370  T
Q  210 atatctttaaatcacccctcga 231  Q
    ||||||||||| ||||||||||    
T  46909369 atatctttaaaccacccctcga 46909348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 66 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 7889031 - 7888824
Alignment:
Q  66 aactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaaatgaatagtacataaaaaagtcttacacattacggaaaacttctctgtagaccac 165  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7889031 aactgaagttcgttgacatgcaaatactttcaataagtaagaaaa-tgaatagtacccaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagaccac 7888933  T
Q  166 atttgatgcaacatcggtaccatcgccgtccttgtcattaatcaatatctttaaatcacccctcgaagcaacccgtgatattgtgacgtacaactgtcca 265  Q
    | ||||||||||||||||| |||| ||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||  | |||||||||||||    
T  7888932 acttgatgcaacatcggtatcatcaccgtcgtcgtcattaatcaatatctttaaaccacccctcgaagtaacctgtgatattgcaatgtacaactgtcca 7888833  T
Q  266 tgtgaaaaa 274  Q
    |||||||||    
T  7888832 tgtgaaaaa 7888824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 138; E-Value: 7e-72
Query Start/End: Original strand, 31 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 5093769 - 5093569
Alignment:
Q  31 tgttagtttaacataacatataattttaaaagggaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaaatgaatagtacataaaaaag 130  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||    
T  5093769 tgttattttaacataacatataattttaaaagggaaactgaagtacgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaa-tgaataatacaaaaaaaag 5093671  T
Q  131 tcttacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgatgcaacatcggtaccatcgccgtccttgtcattaatcaatatctttaaatcacccctcg 230  Q
    || |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||  || | |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5093670 tcatacacattacagaaaacttctttgtagaccacatttgatgcaacatcgataaaatagacgtcctcgtcattaatcaatatctttaaaccacccctcg 5093571  T
Q  231 aa 232  Q
    ||    
T  5093570 aa 5093569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 10 - 154
Target Start/End: Original strand, 20955637 - 20955780
Alignment:
Q  10 ataattctagtacgtagttcatgttagtttaacataacatataattttaaaagggaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaa 109  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  20955637 ataattctagtacgtagttcctgttactttaaaataacatataattttgaaagggaaattgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaag-aa 20955735  T
Q  110 aatgaatagtacataaaaaagtcttacacattacggaaaacttct 154  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20955736 aatgaatagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttct 20955780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 159 - 368
Target Start/End: Original strand, 3595423 - 3595634
Alignment:
Q  159 agaccacatttgatgcaacatcggtaccatcgccgtccttgtcattaatcaatat-ctttaaatcacccctcgaagcaacccgtgatattgtgacgtaca 257  Q
    |||||||||||||||  ||||  ||| | ||||||||||  ||||| |||||||| ||||||| || |||| |||| ||||| |||||||| || |||||    
T  3595423 agaccacatttgatgtcacataagtatcttcgccgtcctcatcattgatcaatatactttaaaccatcccttgaagtaacccttgatattgcgatgtaca 3595522  T
Q  258 actgtccatgtgaaaaaataggaaacggtaggtagacaccaacatattctagcgactgaccctgacccttgtt-atggtcattgcaaatgagacagatat 356  Q
    | |||||||||||||||| |||| || |||| |||| |||||||| ||  | |||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||     
T  3595523 attgtccatgtgaaaaaacaggagacagtagatagataccaacatgtttcaacgactgaccctgactcttgttaatagtcattgcaaatgagacagataa 3595622  T
Q  357 cggaaactgcct 368  Q
    |||||| |||||    
T  3595623 cggaaattgcct 3595634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 156 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 35103051 - 35102927
Alignment:
Q  156 tgtagaccacatttgatgcaacatcggtaccatcgccgtccttgtcattaatcaatatctttaaatcacccctcgaagcaacccgtgatattgtgacgta 255  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| ||| | | ||||||||  ||||| |||||||||||||||||| |||| |||| |||||  ||||||| ||||||    
T  35103051 tgtagaccacatttgatgtcacatcagtatcttggccgtcctcatcattgatcaatatctttaaatcatcccttgaagtaaccctcgatattgcgacgta 35102952  T
Q  256 caactgtccatgtgaaaaaatagga 280  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||    
T  35102951 caattgtccatgtgaaaaaacagga 35102927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 264 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 7893349 - 7893262
Alignment:
Q  264 catgtgaaaaaataggaaacggtaggtagacaccaacatattctagcgactgaccctgacccttgtt-atggtcattgcaaatgagac 350  Q
    |||||||||||| |||| ||||||| || |||||||||| ||  | |||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||    
T  7893349 catgtgaaaaaacaggagacggtagataaacaccaacatgtttcaacgactgaccctgactcttgttaatagtcattgcaaatgagac 7893262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 264 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 22006573 - 22006486
Alignment:
Q  264 catgtgaaaaaataggaaacggtaggtagacaccaacatattctagcgactgaccctgacccttgtt-atggtcattgcaaatgagac 350  Q
    |||||||||||| |||| ||||||| || |||||||||| ||  | |||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||    
T  22006573 catgtgaaaaaacaggagacggtagataaacaccaacatgtttcaacgactgaccctgactcttgttaatagtcattgcaaatgagac 22006486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 329 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 14231898 - 14231820
Alignment:
Q  329 ttatggtcattgcaaatgagacagatatcggaaactgcctccgtttaaatttgaaaggaattctattatcagatggtgt 407  Q
    |||| |||||||||||  | | || ||| |||||||| || |||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  14231898 ttatagtcattgcaaaacacaaagctataggaaactgtctgcgttgaaatttgaaaggaattctggtatcagatggtgt 14231820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 329 - 407
Target Start/End: Original strand, 26906868 - 26906946
Alignment:
Q  329 ttatggtcattgcaaatgagacagatatcggaaactgcctccgtttaaatttgaaaggaattctattatcagatggtgt 407  Q
    |||| |||||||||||  | | || ||| |||||||| || |||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  26906868 ttatagtcattgcaaaacacaaagctataggaaactgtctgcgttgaaatttgaaaggaattctggtatcagatggtgt 26906946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 383; Significance: 0; HSPs: 14)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 383; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 519
Target Start/End: Complemental strand, 19961849 - 19961340
Alignment:
Q  10 ataattctagtacgtagttcatgttagtttaacataacatataattttaaaagggaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaa 109  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  19961849 ataattctagtacgtagttcctgttactttaaaataacatataattttgaaagggaaattgaagttcgttgacatgcaaatagtttcagcaagtaagaaa 19961750  T
Q  110 aatgaatagtacataaaaaagtcttacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgatgcaacatcggtaccatcgccgtccttgtcattaatca 209  Q
    | ||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||    
T  19961749 a-tgaatagtacacaaaaaagtcctacacattacagaaaacttctctgtagaccacatttgatgcaacatcggtatcatcgccgtcgtcgtcattaatca 19961651  T
Q  210 atatctttaaatcacccctcgaagcaacccgtgatattgtgacgtacaactgtccatgtgaaaaaataggaaacggtaggtagacaccaacatattctag 309  Q
    |||| |||||| |||||||||| | ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19961650 atatttttaaaccacccctcgatgtaactcgtgatattgcgacgtacaactgtccatgtgaaaaaataggagacggtaggtagacaccaacatgttctag 19961551  T
Q  310 cgactgaccctgacccttgtta-tggtcattgcaaatgagacagatatcggaaactgcctccgtttaaatttgaaaggaattctattatcagatggtgtt 408  Q
    |||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19961550 cgactgaccctgactcttgttaatagtcattgcaaatgagacagatatcggaaactaccttcgtttaaatttgaaatgaattctattatcagatggtgtt 19961451  T
Q  409 agcgataaccttggaataaacaccttctcaccgatattacaaccagatattacccgtccttcgagcacaaattttctcatctttgtaatgatcaatctcg 508  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19961450 agcgataaccttggaataaacaccttctcaccgatattagaaccagatattacccgtccttcgagcacaaattttctcatctttgtaatgatcaatctcg 19961351  T
Q  509 tacccttacat 519  Q
    |||| ||||||    
T  19961350 taccgttacat 19961340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 351; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 519
Target Start/End: Complemental strand, 23827980 - 23827480
Alignment:
Q  10 ataattctagtacgtagttcatgttagtttaacataacatataattttaaaagggaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaa 109  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23827980 ataattctagtacatagttcctgttactttaaaataacatataattttgaaagggaaattgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaa 23827881  T
Q  110 aatgaatagtacataaaaaagtcttacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgatgcaacatcggtaccatcgccgtccttgtcattaatca 209  Q
    | ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||          |||| |||||||||||||    
T  23827880 a-tgaatagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgatgcatcatcgt---------cgtcgttgtcattaatca 23827791  T
Q  210 atatctttaaatcacccctcgaagcaacccgtgatattgtgacgtacaactgtccatgtgaaaaaataggaaacggtaggtagacaccaacatattctag 309  Q
    |||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23827790 atatttttaaaccacccctcgaagtaacccgtgatattgcgacgtacaactgtccatgtgaaaaaataggagacggtaggtagacaccaacatgttctag 23827691  T
Q  310 cgactgaccctgacccttgtta-tggtcattgcaaatgagacagatatcggaaactgcctccgtttaaatttgaaaggaattctattatcagatggtgtt 408  Q
    |||| ||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23827690 cgaccgaccctgactcttgttaatagtcattgcaaatgagacagatatcggaaaccgccttcgtttaaatttgaaaggaattctattatcagatggtgtt 23827591  T
Q  409 agcgataaccttggaataaacaccttctcaccgatattacaaccagatattacccgtccttcgagcacaaattttctcatctttgtaatgatcaatctcg 508  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  23827590 agcgataaccttggaatcaacaccttctcaccgatattagaacctgatattacccgtccttcgagcacaaattttcctatctttgtaatgatcaatctcg 23827491  T
Q  509 tacccttacat 519  Q
    |||| ||||||    
T  23827490 taccgttacat 23827480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 330; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 474
Target Start/End: Original strand, 22729765 - 22730229
Alignment:
Q  10 ataattctagtacgtagttcatgttagtttaacataacatataattttaaaagggaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaa 109  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22729765 ataattctagtacgtagttcctgttactttaaaataacatataattttgaaagggaaattgaatttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaa 22729864  T
Q  110 aatgaatagtacataaaaaagtcttacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgatgcaacatcggtaccatcgccgtccttgtcattaatca 209  Q
    | |||| |||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||| | |||||||||||    
T  22729865 a-tgaacagtacacaaaaaagtcctacacattacgtaaaacttttctgtagaccacatttgatgcaacatcgatatcatcgtcgtcgtcgtcattaatca 22729963  T
Q  210 atatctttaaatcacccctcgaagcaacccgtgatattgtgacgtacaactgtccatgtgaaaaaataggaaacggtaggtagacaccaacatattctag 309  Q
    |||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22729964 atatttttaaaccacccctcgaagtaacccgtgatattgcgacgtacaattgtccatttgaaaaaataggagacggtaggtagacaccaacatgttctag 22730063  T
Q  310 cgactgaccctgacccttgtta-tggtcattgcaaatgagacagatatcggaaactgcctccgtttaaatttgaaaggaattctattatcagatggtgtt 408  Q
    |||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22730064 cgactgaccctgactcttgttagtagtcattgcaaatgagacagatatcggaaactgccttcgtttaaatttgaaaggaattctattatcagatggtgtt 22730163  T
Q  409 agcgataaccttggaataaacaccttctcaccgatattacaaccagatattacccgtccttcgagc 474  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||    
T  22730164 agcgataaccttggaataaacaccttctcaccgatattagaaccagatattacctgtccctcgagc 22730229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 10 - 274
Target Start/End: Original strand, 406042 - 406305
Alignment:
Q  10 ataattctagtacgtagttcatgttagtttaacataacatataattttaaaagggaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaa 109  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  406042 ataattctagtacgtagttcctgttactttaacataacatataattttaaaagggaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaa 406141  T
Q  110 aatgaatagtacataaaaaagtcttacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgatgcaacatcggtaccatcgccgtccttgtcattaatca 209  Q
    | ||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||    
T  406142 a-tgaatagtacgcaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagatcacacttgatgcaacatcggtatcatcgccgtcgtcgtcattaatca 406240  T
Q  210 atatctttaaatcacccctcgaagcaacccgtgatattgtgacgtacaactgtccatgtgaaaaa 274  Q
    ||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  406241 atatctttaaaccatccctcgaagtaacccgtgatattgcgacgtacaactgtccatgtgaaaaa 406305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 11 - 350
Target Start/End: Original strand, 14994359 - 14994698
Alignment:
Q  11 taattctagtacgtagttcatgttagtttaacataacatataattttaaaagggaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaa 110  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14994359 taattctagtacgtagttcctgttactttaaaataacatataattttgaaagggaaattgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaa 14994458  T
Q  111 atgaatagtacataaaaaagtcttacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgatgcaacatcggtaccatcgccgtccttgtcattaatcaa 210  Q
     |||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||| | ||||||||||||    
T  14994459 -tgaacagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagaccatatttgatgcaacatcgatatcatcgccgtcgtcgtcattaatcaa 14994557  T
Q  211 tatctttaaatcacccctcgaagcaacccgtgatattgtgacgtacaactgtccatgtgaaaaaataggaaacggtaggtagacaccaacatattctagc 310  Q
    ||| || ||| |||| ||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||| || |||||||||| ||  | |    
T  14994558 tattttaaaaccacctctcgaagtaacccgtgatattgtcacgtacgactgtccatgtgaaaaaacaggagacggtagataaacaccaacatgtttcaac 14994657  T
Q  311 gactgaccctgacccttgtt-atggtcattgcaaatgagac 350  Q
    ||||||||||||| |||||| ||  ||||||||||||||||    
T  14994658 gactgaccctgactcttgttaataatcattgcaaatgagac 14994698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 183; E-Value: 9e-99
Query Start/End: Original strand, 10 - 274
Target Start/End: Original strand, 18265880 - 18266140
Alignment:
Q  10 ataattctagtacgtagttcatgttagtttaacataacatataattttaaaagggaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaa 109  Q
    |||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  18265880 ataattctagtacgtagttcctattactttaacataacatataattttaaaagggaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaag-aa 18265978  T
Q  110 aatgaatagtacataaaaaagtcttacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgatgcaacatcggtaccatcgccgtccttgtcattaatca 209  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||||| ||||||||   | |||||||||||    
T  18265979 aatgaatagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagaccacact---tgcaacatcggtatcatcgccgctgtcgtcattaatca 18266075  T
Q  210 atatctttaaatcacccctcgaagcaacccgtgatattgtgacgtacaactgtccatgtgaaaaa 274  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  18266076 atatctttaaaccacccctcgaagtaacccgtgatattgcgatgtacaactgtccatgtgaaaaa 18266140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 183; E-Value: 9e-99
Query Start/End: Original strand, 10 - 274
Target Start/End: Original strand, 18274893 - 18275153
Alignment:
Q  10 ataattctagtacgtagttcatgttagtttaacataacatataattttaaaagggaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaa 109  Q
    |||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  18274893 ataattctagtacgtagttccttttactttaacataacatataattttaaaagggaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaag-aa 18274991  T
Q  110 aatgaatagtacataaaaaagtcttacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgatgcaacatcggtaccatcgccgtccttgtcattaatca 209  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||||| ||||||||   | |||||||||||    
T  18274992 aatgaatagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagaccacact---tgcaacatcggtatcatcgccgctgtcgtcattaatca 18275088  T
Q  210 atatctttaaatcacccctcgaagcaacccgtgatattgtgacgtacaactgtccatgtgaaaaa 274  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  18275089 atatctttaaaccacccctcgaagtaacccgtgatattgttatgtacaactgtccatgtgaaaaa 18275153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 10 - 273
Target Start/End: Original strand, 41376299 - 41376561
Alignment:
Q  10 ataattctagtacgtagttcatgttagtttaacataacatataattttaaaagggaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaa 109  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  41376299 ataattctagtacgtagttcttgttactttaaaataacatataattttgaaagggaaattgaagttcgttgacatgcaaatattttcaataagtaagaaa 41376398  T
Q  110 aatgaatagtacataaaaaagtcttacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgatgcaacatcggtaccatcgccgtccttgtcattaatca 209  Q
    | ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| | |||||||||| | |||||||||||    
T  41376399 a-tgaatagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttttctgtagatcacacttgatgcaacatcggcatcatcgccgtcgtcgtcattaatca 41376497  T
Q  210 atatctttaaatcacccctcgaagcaacccgtgatattgtgacgtacaactgtccatgtgaaaa 273  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||    
T  41376498 atatctttaaaccacccctcgaagtaacccgtgatattgcgacgtacaactgcccatgtaaaaa 41376561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 10 - 232
Target Start/End: Original strand, 37983325 - 37983546
Alignment:
Q  10 ataattctagtacgtagttcatgttagtttaacataacatataattttaaaagggaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaa 109  Q
    |||||||||  ||| ||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  37983325 ataattctaagacgcagtttctgttactttaacataacatataattttaaaagggaaactgaagttcgttgacatgcaaataatttcaataagtaagaaa 37983424  T
Q  110 aatgaatagtacataaaaaagtcttacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgatgcaacatcggtaccatcgccgtccttgtcattaatca 209  Q
    | ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||    
T  37983425 a-tgaatagtacacaaaaaagtcatacacattacggaaaacttctttgtagaccacatttgatgcaacatcggtataatcgccgtcctcgtcattaatca 37983523  T
Q  210 atatctttaaatcacccctcgaa 232  Q
    |||| ||||||||||||||||||    
T  37983524 atatttttaaatcacccctcgaa 37983546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 148; E-Value: 7e-78
Query Start/End: Original strand, 10 - 232
Target Start/End: Original strand, 24011736 - 24011955
Alignment:
Q  10 ataattctagtacgtagttcatgttagtttaacataacatataattttaaaagggaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaa 109  Q
    |||||||||  ||| ||||  ||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24011736 ataattctaaaacgcagtttctgttactttaacataacata--attttaaaagggaaactgaagttcgttgacatgcaaataatttcaataagtaagaaa 24011833  T
Q  110 aatgaatagtacataaaaaagtcttacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgatgcaacatcggtaccatcgccgtccttgtcattaatca 209  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||| |||||||||||    
T  24011834 a-tgaatagtacacaaaaaagtcttacacattacggaaaacttctttgtagaccacatttgatgcaacatcggtataatcgtcgtcctcgtcattaatca 24011932  T
Q  210 atatctttaaatcacccctcgaa 232  Q
    |||| ||||||||||||||||||    
T  24011933 atatttttaaatcacccctcgaa 24011955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 31 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 18492500 - 18492360
Alignment:
Q  31 tgttagtttaacataacatataattttaaaagggaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaaatgaatagtacataaaaaag 130  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  18492500 tgttactttaacataacatataattttaaaagggaaactgaagttcgttgacatgcaaataatttcaataagtaag-aaaatgaatagtacacaaaaaag 18492402  T
Q  131 tcttacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgat 172  Q
    || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18492401 tcctacacattacggaaaacttctttgtagaccacatttgat 18492360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 190 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 37589625 - 37589301
Alignment:
Q  190 gccgtccttgtcattaatcaatatctttaaatcacccctcgaagcaacccgtgatattgtgacgtacaactgtccatgtgaaaaaataggaaacggtagg 289  Q
    ||||||||  ||||| |||||||||||||||||| |||| |||| ||||   |||||||  || ||||| |||||||||||||||| |||| |||||||     
T  37589625 gccgtcctcatcattgatcaatatctttaaatcatcccttgaagtaaccatcgatattgcaacatacaattgtccatgtgaaaaaacaggagacggtaga 37589526  T
Q  290 tagacaccaacatattctagcgactgaccctgacccttgtta-tggtcattgcaaatgagacagatatcggaaactgcctccgtttaaatttgaaaggaa 388  Q
    |||| |||||||| ||  |  ||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||| || || |||||||| ||||||||||    
T  37589525 tagataccaacatttttcatagactgaccctgactcttgttaatagtcattgcaaatgagacagataacggaaattgtcttcgtttaaacttgaaaggaa 37589426  T
Q  389 ttctattatcagatggtgttagcgataaccttggaataaacaccttctcaccgatattacaaccagatattacccgtccttcgagcacaaattttctcat 488  Q
    ||||| ||||| | |||  |||||||||| || ||||||||||||| | ||| |||||| |  |||||||||||  | | |||||||||||||| | |||    
T  37589425 ttctagtatcaaacggttgtagcgataactttagaataaacacctttttacctatattagattcagatattacctctgcctcgagcacaaatttacccat 37589326  T
Q  489 ctttgtaatgatcaatctcgtaccc 513  Q
    |||| |||| |||||||| ||||||    
T  37589325 ctttataataatcaatcttgtaccc 37589301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 10 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 21640100 - 21640000
Alignment:
Q  10 ataattctagtacgtagttcatgttagtttaacataacatataattttaaaagggaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaa 109  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21640100 ataattctagtacgtagttcctgttactttaaaataacatataattttgaaagggaaattgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaa 21640001  T
Q  110 a 110  Q
    |    
T  21640000 a 21640000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 330 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 35351219 - 35351053
Alignment:
Q  330 tatggtcattgcaaatgagacagatatcggaaactgcctccgtttaaatttgaaaggaattctattatcagatggtgttagcgataaccttggaataaac 429  Q
    |||||||||||||||  | ||| |||| ||||||||| | || | ||||||||||||||||||  ||||||| || || | |||||| ||||| ||| |     
T  35351219 tatggtcattgcaaagcatacaaatataggaaactgcttacgctgaaatttgaaaggaattcttgtatcagacggcgtcatcgataatcttggtatatat 35351120  T
Q  430 accttctcaccgatattacaaccagatattacccgtccttcgagcacaaattttctcatctttgtaa 496  Q
    |||||||| || ||||| | ||| ||||| ||||  ||||| || | | || |||||||||||||||    
T  35351119 accttctccccaatattgctacctgatataaccctgccttcaagaatatatattctcatctttgtaa 35351053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 373; Significance: 0; HSPs: 15)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 373; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 519
Target Start/End: Complemental strand, 2281163 - 2280657
Alignment:
Q  10 ataattctagtacgtagttcatgttagtttaacataacatataattttaaaagggaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaa 109  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2281163 ataattctagtacgtagttcctgttactttaaaataacatataattttgaaagggaaattgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaa 2281064  T
Q  110 aatgaatagtacataaaaaagtcttacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgatgcaacatcggtaccatcgccgtccttgtcattaatca 209  Q
    | ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||   |||||||||||    
T  2281063 a-tgaatagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgatgcaacatcggtatcatcgtcgtc---gtcattaatca 2280968  T
Q  210 atatctttaaatcacccctcgaagcaacccgtgatattgtgacgtacaactgtccatgtgaaaaaataggaaacggtaggtagacaccaacatattctag 309  Q
    |||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2280967 atatttttaaaccacccctcgaagtaacccgtgatattgcgacgtacaactgtccatgtgaaaaaataggagacggtaggtagacaccaacatgttctag 2280868  T
Q  310 cgactgaccctgacccttgtta-tggtcattgcaaatgagacagatatcggaaactgcctccgtttaaatttgaaaggaattctattatcagatggtgtt 408  Q
    |||| ||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2280867 cgaccgaccctgactcttgttaatagtcattgcaaatgagacagatatcggaaaccgccttcgtttaaatttgaaaggaattctattatcagatggtgtt 2280768  T
Q  409 agcgataaccttggaataaacaccttctcaccgatattacaaccagatattacccgtccttcgagcacaaattttctcatctttgtaatgatcaatctcg 508  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  2280767 agcgataatcttggaatcaacaccttctcaccgatattagaacctgatattacccgtccttcgagcacaaattttcctatctttgtaatgatcaatctcg 2280668  T
Q  509 tacccttacat 519  Q
    |||| ||||||    
T  2280667 taccgttacat 2280657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 10 - 232
Target Start/End: Original strand, 33004650 - 33004871
Alignment:
Q  10 ataattctagtacgtagttcatgttagtttaacataacatataattttaaaagggaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaa 109  Q
    |||||||||  ||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33004650 ataattctaagacgcagtttatgttactttaacataacatataattttaaaagggaaactgaagtttgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaa 33004749  T
Q  110 aatgaatagtacataaaaaagtcttacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgatgcaacatcggtaccatcgccgtccttgtcattaatca 209  Q
    | ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| |||||||||||    
T  33004750 a-tgaatagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctttgtagaccacatttgatgcaacatcggtataattgccgtcctcgtcattaatca 33004848  T
Q  210 atatctttaaatcacccctcgaa 232  Q
    ||||||||||| |||||||||||    
T  33004849 atatctttaaaccacccctcgaa 33004871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 10 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 24458879 - 24458658
Alignment:
Q  10 ataattctagtacgtagttcatgttagtttaacataacatataattttaaaagggaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaa 109  Q
    |||||||||  ||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24458879 ataattctaagacgcagtttatgttactttaacataacatataattttaaaagggaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaa 24458780  T
Q  110 aatgaatagtacataaaaaagtcttacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgatgcaacatcggtaccatcgccgtccttgtcattaatca 209  Q
    | ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| |||||||||||    
T  24458779 a-tgaatagtacacaaaaaagtcatacacattacggaaaacttctttgtacaccacatttgatgcaacattggtataatcgccgtcctcgtcattaatca 24458681  T
Q  210 atatctttaaatcacccctcgaa 232  Q
    |||| |||||| |||||||||||    
T  24458680 atatttttaaaccacccctcgaa 24458658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 31 - 229
Target Start/End: Original strand, 29369412 - 29369609
Alignment:
Q  31 tgttagtttaacataacatataattttaaaagggaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaaatgaatagtacataaaaaag 130  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  29369412 tgttactttaacataacatataattttaaaagggaaactgaagttcgttgacatgcaaataatttcaataagtaagaaaa-tgaatagtacacaaaaaag 29369510  T
Q  131 tcttacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgatgcaacatcggtaccatcgccgtccttgtcattaatcaatatctttaaatcacccctc 229  Q
    || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  29369511 tcctacacattacggaaaacttctttgtagaccacatttgatgcaacatcggtataatcgccgtcctcgtcattaatcaatatttttaaatcacccctc 29369609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 31 - 232
Target Start/End: Original strand, 29371967 - 29372167
Alignment:
Q  31 tgttagtttaacataacatataattttaaaagggaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaaatgaatagtacataaaaaag 130  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  29371967 tgttactttaacataacatataattttaaaagggaaactgaagttcgttgacatgcaaataatttcaataagtaagaaaa-tgaatagtacacaaaaaag 29372065  T
Q  131 tcttacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgatgcaacatcggtaccatcgccgtccttgtcattaatcaatatctttaaatcacccctcg 230  Q
    || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  29372066 tcctacacattacggaaaacttctttgtagaccacatttgatgcaacatcggtataatcgtcgtcctcgtcattaatcaatatttttatatcacccctcg 29372165  T
Q  231 aa 232  Q
    ||    
T  29372166 aa 29372167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 134 - 519
Target Start/End: Original strand, 25971041 - 25971427
Alignment:
Q  134 tacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgatgcaacatcggtaccatcgccgtccttgtcattaatcaatatctttaaatcacccctcgaag 233  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||| | | | |||||| |||||| ||||| ||||||||| || |||| ||||    
T  25971041 tacacattacggaaaacttctctctagaccacatttgatgtcacatcagtatcttggtcgtcctcgtcattgatcaacatctttaaaccatcccttgaag 25971140  T
Q  234 caacccgtgatattgtgacgtacaactgtccatgtgaaaaaataggaaacggtaggtagacaccaacatattctagcgactgaccctgacccttgtt-at 332  Q
     |||||  ||||||| || |||||| ||| |||||||||||| |||| | ||||| ||||||||||||| ||  |  ||||||||||||| |||||| ||    
T  25971141 taaccctcgatattgcgatgtacaattgttcatgtgaaaaaacaggagatggtagatagacaccaacatttttcaaagactgaccctgactcttgttaat 25971240  T
Q  333 ggtcattgcaaatgagacagatatcggaaactgcctccgtttaaatttgaaaggaattctattatcagatggtgttagcgataaccttggaataaacacc 432  Q
     |||||||||||||||||||| | | |||||||||| |||||||| ||||| ||||||||| |||||||  |   ||||||||| |||||||||||||||    
T  25971241 agtcattgcaaatgagacagacaacagaaactgccttcgtttaaacttgaacggaattctagtatcagacagctgtagcgataatcttggaataaacacc 25971340  T
Q  433 ttctcaccgatattacaaccagatattacccgtccttcgagcacaaattttctcatctttgtaatgatcaatctcgtacccttacat 519  Q
    || ||||| |||||| | ||||||||||||  | | |||||||||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||| ||||||    
T  25971341 ttttcacctatattagatccagatattacctctgcctcgagcacaaatttacccatctttgtaataatcaatcttgtaccgttacat 25971427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 66 - 274
Target Start/End: Original strand, 33045715 - 33045922
Alignment:
Q  66 aactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaaatgaatagtacataaaaaagtcttacacattacggaaaacttctctgtagaccac 165  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33045715 aactgaagttcgttgacatgcaaatactttcaataagtaagaaaa-tgaatagtacccaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagaccac 33045813  T
Q  166 atttgatgcaacatcggtaccatcgccgtccttgtcattaatcaatatctttaaatcacccctcgaagcaacccgtgatattgtgacgtacaactgtcca 265  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||  | |||||||||||||    
T  33045814 acttgatgcaacatcggtatcatcgccgtcgtcgtcattaatcaatatctttaaaccacccctcgaagtaacctgtgatattgcaatgtacaactgtcca 33045913  T
Q  266 tgtgaaaaa 274  Q
    |||||||||    
T  33045914 tgtgaaaaa 33045922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 134 - 519
Target Start/End: Original strand, 25975481 - 25975867
Alignment:
Q  134 tacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgatgcaacatcggtaccatcgccgtccttgtcattaatcaatatctttaaatcacccctcgaag 233  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||| | | | |||||| |||||| ||||| ||||||||| || |||| ||||    
T  25975481 tacacattacggaaaacttctctctagaccacatttgatgtcacatcagtatcttggtcgtcctcgtcattgatcaacatctttaaaccatcccttgaag 25975580  T
Q  234 caacccgtgatattgtgacgtacaactgtccatgtgaaaaaataggaaacggtaggtagacaccaacatattctagcgactgaccctgacccttgtt-at 332  Q
     |||||  ||||||| || |||||| ||| |||||||||||| || | | ||||| ||||||||||||| ||  |  ||||||||||||| |||||| ||    
T  25975581 taaccctcgatattgcgatgtacaattgttcatgtgaaaaaacagtagatggtagatagacaccaacatttttcaaagactgaccctgactcttgttaat 25975680  T
Q  333 ggtcattgcaaatgagacagatatcggaaactgcctccgtttaaatttgaaaggaattctattatcagatggtgttagcgataaccttggaataaacacc 432  Q
     |||||||||||||||||||| | | ||||||| || |||||||| ||||| ||||||||| |||||||  |   ||||||||| |||||||||||||||    
T  25975681 agtcattgcaaatgagacagacaactgaaactgtcttcgtttaaacttgaacggaattctagtatcagacagctgtagcgataatcttggaataaacacc 25975780  T
Q  433 ttctcaccgatattacaaccagatattacccgtccttcgagcacaaattttctcatctttgtaatgatcaatctcgtacccttacat 519  Q
    || ||||| |||||| | ||||||||||||  | | |||||| ||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||| ||||||    
T  25975781 ttttcacctatattagatccagatattacctctgcctcgagctcaaatttacccatctttgtaataatcaatcttgtaccgttacat 25975867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 10 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 349382 - 349252
Alignment:
Q  10 ataattctagtacgtagttcatgttagtttaacataacatataattttaaaagggaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaa 109  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  349382 ataattctagtacgtagttcctgttactttaatataacatataattttaaaagggaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaag-aa 349284  T
Q  110 aatgaatagtacataaaaaagtcttacacatt 141  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  349283 aatgaatagtacacaaaaaagtcctacacatt 349252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 10 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 29924987 - 29924870
Alignment:
Q  10 ataattctagtacgtagttcatgttagtttaacataacatataattttaaaagggaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaa 109  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  29924987 ataattctagtacgtagttcttgttactttaacataacatataattttaaaagggaaactgaaattcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaag-aa 29924889  T
Q  110 aatgaatagtacataaaaa 128  Q
    ||||||||||||| |||||    
T  29924888 aatgaatagtacacaaaaa 29924870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 163 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 3591293 - 3591093
Alignment:
Q  163 cacatttgatgcaacatcggtaccatcgccgtccttgtcattaatcaatatctttaaatcacccctcgaagcaacccgtgatattgtgacgtacaactgt 262  Q
    |||||||||||  |||||| || | ||||||||||  ||||| ||||||||||||||| || || | |||| ||||| |||||||| ||||||||| |||    
T  3591293 cacatttgatgtcacatcgatatcttcgccgtcctcatcattgatcaatatctttaaaccatcctttgaagtaacccttgatattgcgacgtacaattgt 3591194  T
Q  263 ccatgtgaaaaaataggaaacggtaggtagacaccaacatattctagcgactgaccctgacccttgtt-atggtcattgcaaatgagacagatatcggaa 361  Q
    ||||||||||||| |||| | ||||| || |||||||||| ||  | |||||||||||||| |||||| || || ||||||||||||||||||| |||||    
T  3591193 ccatgtgaaaaaacaggagatggtagataaacaccaacatgtttcaacgactgaccctgactcttgttaatagttattgcaaatgagacagataacggaa 3591094  T
Q  362 a 362  Q
    |    
T  3591093 a 3591093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 200 - 332
Target Start/End: Original strand, 34265227 - 34265359
Alignment:
Q  200 tcattaatcaatatctttaaatcacccctcgaagcaacccgtgatattgtgacgtacaactgtccatgtgaaaaaataggaaacggtaggtagacaccaa 299  Q
    ||||| ||||| ||||||||| || |||| |||| |||||   |||||| ||||||||| ||||||||| |||||| |||| ||| ||| ||||||||||    
T  34265227 tcattgatcaacatctttaaaccatcccttgaagtaaccctcaatattgcgacgtacaattgtccatgtcaaaaaacaggagacgttagatagacaccaa 34265326  T
Q  300 catattctagcgactgaccctgacccttgttat 332  Q
    ||| ||  |  ||||||||||||| ||||||||    
T  34265327 cattttacaaagactgaccctgactcttgttat 34265359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 317 - 484
Target Start/End: Original strand, 34417123 - 34417291
Alignment:
Q  317 ccctgacccttgtt-atggtcattgcaaatgagacagatatcggaaactgcctccgtttaaatttgaaaggaattctattatcagatggtgttagcgata 415  Q
    ||||||| |||||| || ||||| |||||||| |||||||| ||||| || || | || ||| |||||||||||| || ||||||| ||||  || ||||    
T  34417123 ccctgactcttgttgattgtcatggcaaatgaaacagatattggaaattgtcttctttgaaacttgaaaggaattttaatatcagacggtgaaagagata 34417222  T
Q  416 accttggaataaacaccttctcaccgatattacaaccagatattacccgtccttcgagcacaaattttc 484  Q
    |||| || || ||||| || || || |||||||  ||||| || |||| |||||| || ||||||||||    
T  34417223 acctgggtatgaacactttttcgccaatattacttccagaaataacccttccttcaagaacaaattttc 34417291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 329 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 25169552 - 25169444
Alignment:
Q  329 ttatggtcattgcaaatgagacagatatcggaaactgcctccgtttaaatttgaaaggaattctattatcagatggtgttagcgataaccttggaataaa 428  Q
    |||| |||||||||||  ||||| |||| | ||||||  | || | ||||||||||||||||||  ||||||| || || || ||||| ||||||||| |    
T  25169552 ttattgtcattgcaaagcagacaaatatagaaaactgtttacgctaaaatttgaaaggaattcttgtatcagacggcgtcagtgataatcttggaatata 25169453  T
Q  429 caccttctc 437  Q
    ||| |||||    
T  25169452 cacgttctc 25169444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 375 - 407
Target Start/End: Original strand, 31891629 - 31891661
Alignment:
Q  375 aaatttgaaaggaattctattatcagatggtgt 407  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  31891629 aaatttgaaaggaattctagtatcagatggtgt 31891661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 372; Significance: 0; HSPs: 27)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 372; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 519
Target Start/End: Original strand, 5013445 - 5013955
Alignment:
Q  10 ataattctagtacgtagttcatgttagtttaacataacatataattttaaaagggaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaa 109  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5013445 ataattctagtacgtagttcctgttactttaaaataacatataattttgaaagggaaattgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaa 5013544  T
Q  110 aatgaatagtacataaaaaagtcttacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgatgcaacatcggtaccatcgccgtccttgtcattaatca 209  Q
    | |||| |||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||| | |||||||||||    
T  5013545 a-tgaacagtacacaaaaaagtcctacacattacgaaaaacttctctgtagaccacatttgatgcaacatcgatatcatcgtcgtcgtcgtcattaatca 5013643  T
Q  210 atatctttaaatcacccctcgaagcaacccgtgatattgtgacgtacaactgtccatgt-gaaaaaataggaaacggtaggtagacaccaacatattcta 308  Q
    |||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  5013644 atatttttaaaccacccctcgaagtaacccgtgatattgcgacgtacaattgtccatgtagaaaaaataggagacggtaggtagacaccaacatgttcta 5013743  T
Q  309 gcgactgaccctgacccttgtta-tggtcattgcaaatgagacagatatcggaaactgcctccgtttaaatttgaaaggaattctattatcagatggtgt 407  Q
    ||||||||||||||| ||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5013744 gcgactgaccctgactcttgttaatagtcattgaaaatgagacagatatcggaaactgccttcgtttaaatttgaaaggaattctattatcagatggtgt 5013843  T
Q  408 tagcgataaccttggaataaacaccttctcaccgatattacaaccagatattacccgtccttcgagcacaaattttctcatctttgtaatgatcaatctc 507  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  5013844 tagcgataaccttggaataaacaccttctcaccgatattagaaccagatattacccgtccttcgagcacaaattttcccatctttgtaattatcaatctc 5013943  T
Q  508 gtacccttacat 519  Q
    ||||| ||||||    
T  5013944 gtaccgttacat 5013955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 371; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 519
Target Start/End: Complemental strand, 1512994 - 1512485
Alignment:
Q  10 ataattctagtacgtagttcatgttagtttaacataacatataattttaaaagggaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaa 109  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1512994 ataattctagtacgtagttcctgttactttaaaataacatataattttgaaagggaaattgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaa 1512895  T
Q  110 aatgaatagtacataaaaaagtcttacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgatgcaacatcggtaccatcgccgtccttgtcattaatca 209  Q
    | |||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| | ||||  |||||    
T  1512894 a-tgaacagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgatgcaacatcgatatcatcgccgtcgtcgtcagcaatca 1512796  T
Q  210 atatctttaaatcacccctcgaagcaacccgtgatattgtgacgtacaactgtccatgtgaaaaaataggaaacggtaggtagacaccaacatattctag 309  Q
    |||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1512795 atatttttaaaccacccctcgaagtaacccgtgatattgcgacgtacaactgtccatgtgaaaaaataggagacggtaggtagacaccaacatgttctag 1512696  T
Q  310 cgactgaccctgacccttgtt-atggtcattgcaaatgagacagatatcggaaactgcctccgtttaaatttgaaaggaattctattatcagatggtgtt 408  Q
    ||||||||||| || |||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1512695 cgactgaccctaactcttgttaatagtcattgcaaatgagacaaatatcggaaactgccttcgtttaaatttgaaaggaattctattatcagatggtgtt 1512596  T
Q  409 agcgataaccttggaataaacaccttctcaccgatattacaaccagatattacccgtccttcgagcacaaattttctcatctttgtaatgatcaatctcg 508  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1512595 agcgataaccttggaataaacaccttctcaatgatattagaaccagatattacccgtccttcaagcacaaattttcccatctttgtaatgatcaatctcg 1512496  T
Q  509 tacccttacat 519  Q
    |||| ||||||    
T  1512495 taccgttacat 1512485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 354; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 504
Target Start/End: Original strand, 35432053 - 35432548
Alignment:
Q  10 ataattctagtacgtagttcatgttagtttaacataacatataattttaaaagggaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaa 109  Q
    |||||||||  ||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35432053 ataattctaaaacgaagttcctgttactttaacataacatataattttaaaagggaaactaaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaa 35432152  T
Q  110 aatgaatagtacataaaaaa-gtcttacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgatgcaacatcggtaccatcgccgtccttgtcattaatc 208  Q
    | ||||||||||| |||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||    
T  35432153 a-tgaatagtacacaaaaaaagtcctacacattatggaaaacttctctgtag-ccacatttgatgcaacatcgctatcatcgccgtcctcgtcattaatc 35432250  T
Q  209 aatatctttaaatcacccctcgaagcaacccgtgatattgtgacgtacaactgtccatgtgaaaaaataggaaacggtaggtagacaccaacatattcta 308  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  35432251 aatatctttaaaccacccctcgaagtaacccgtgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaaataggagacggtaggtagacaccaacatgttcta 35432350  T
Q  309 gcgactgaccctgacccttgtta-tggtcattgcaaatgagacagatatcggaaactgcctccgtttaaatttgaaaggaattctattatcagatggtgt 407  Q
    ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35432351 gcgactgaccctgactcttgttaatagtcattgcaaatgagacagatatcggaaactgccttcgtttaaatttgaaaggaattctattatcagatggtgt 35432450  T
Q  408 tagcgataaccttggaataaacaccttctcaccgatattacaaccagatattacccgtccttcgagcacaaattttctcatctttgt-aatgatcaat 504  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| | ||||||||||    
T  35432451 tagcgataaccttggaataaacatcttctcaccgatattagaaccagatattacccgtccttcgagaacaaattttcccatctttataaatgatcaat 35432548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 338; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 207968 - 207504
Alignment:
Q  10 ataattctagtacgtagttcatgttagtttaacataacatataattttaaaagggaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaa 109  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  207968 ataattctagtacgtagttcctgttactttaaaataacatataattttgaaagggaaattgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaa 207869  T
Q  110 aatgaatagtacataaaaaagtcttacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgatgcaacatcggtaccatcgccgtccttgtcattaatca 209  Q
    | |||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||| | |||||||||||    
T  207868 a-tgaacagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgatgcaacatcgatatcatcgtcgtcgtcgtcattaatca 207770  T
Q  210 atatctttaaatcacccctcgaagcaacccgtgatattgtgacgtacaactgtccatgtgaaaaaataggaaacggtaggtagacaccaacatattctag 309  Q
    |||| |||||| |||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  207769 atatttttaaaccacccctcgaagtaacctgtgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaaataggagacggtaggtagacaccaacatgttctag 207670  T
Q  310 cgactgaccctgacccttgtt-atggtcattgcaaatgagacagatatcggaaactgcctccgtttaaatttgaaaggaattctattatcagatggtgtt 408  Q
    |||||||||||||| |||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  207669 cgactgaccctgactcttgttaataatcattgcaaatgagacagatatcggaaactgtcttcgtttaaatttgaaaggaattctattatcagatggtgtt 207570  T
Q  409 agcgataaccttggaataaacaccttctcaccgatattacaaccagatattacccgtccttcgagc 474  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  207569 agcgataaccttggaataaacaccttctcatcgatattagaaccagatattacccgtccttcgagc 207504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 10 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 40605590 - 40605250
Alignment:
Q  10 ataattctagtacgtagttcatgttagtttaacataacatataattttaaaagggaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaa 109  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40605590 ataattctagtacgtagttcctgttactttaaaataacatataattttgaaagggaaattgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaa 40605491  T
Q  110 aatgaatagtacataaaaaagtcttacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgatgcaacatcggtaccatcgccgtccttgtcattaatca 209  Q
    | |||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| | |||||||||||    
T  40605490 a-tgaacagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgatgcaacatcgatatcatcgccgtcgtcgtcattaatca 40605392  T
Q  210 atatctttaaatcacccctcgaagcaacccgtgatattgtgacgtacaactgtccatgtgaaaaaataggaaacggtaggtagacaccaacatattctag 309  Q
    |||| |||||| |||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| || |||||||||| ||  |     
T  40605391 atatttttaaaccacctctcgaagtaacccgtgatattgcgacgtacaactgtccatgtgaaaaaacaggagacggtagataaacaccaacatgtttcaa 40605292  T
Q  310 cgactgaccctgacccttgtt-atggtcattgcaaatgagac 350  Q
    ||||||||||| || |||||| || |||||||||||||||||    
T  40605291 cgactgaccctaactcttgttaatagtcattgcaaatgagac 40605250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 10 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 26456128 - 26455788
Alignment:
Q  10 ataattctagtacgtagttcatgttagtttaacataacatataattttaaaagggaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaa 109  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26456128 ataattctagtacgtagtttctgttactttaaaataacatataattttgaaagggaaattgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaa 26456029  T
Q  110 aatgaatagtacataaaaaagtcttacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgatgcaacatcggtaccatcgccgtccttgtcattaatca 209  Q
    | |||| |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||| | |||||||||||    
T  26456028 a-tgaacagtacacaaaaaagtactacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgatgcaacatcgatatcatcgtcgtcgtcgtcattaatca 26455930  T
Q  210 atatctttaaatcacccctcgaagcaacccgtgatattgtgacgtacaactgtccatgtgaaaaaataggaaacggtaggtagacaccaacatattctag 309  Q
    |||| |||||| |||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| || |||||||||| ||  |     
T  26455929 atatttttaaaccacctctcgaagtaacccgtgatattgcgacgtacaactgtccatgtgaaaaaacaggagacggtagataaacaccaacatgtttcaa 26455830  T
Q  310 cgactgaccctgacccttgtt-atggtcattgcaaatgagac 350  Q
    |||| ||||||||| |||||| || |||||||||||||||||    
T  26455829 cgaccgaccctgactcttgttaatagtcattgcaaatgagac 26455788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 10 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 13905549 - 13905287
Alignment:
Q  10 ataattctagtacgtagttcatgttagtttaacataacatataattttaaaagggaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaa 109  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13905549 ataattctagtacgtagttcctgttactttaacataacatataattttaaaagggaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaa 13905450  T
Q  110 aatgaatagtacataaaaaagtcttacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgatgcaacatcggtaccatcgccgtccttgtcattaatca 209  Q
    | ||||||||||| ||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||    
T  13905449 a-tgaatagtacacaaaaa-gtcctacatattacggaaaacttctctgtagaccacacttgatgcaacatcggtatcatcgccgtcgtcgtcattaatca 13905352  T
Q  210 atatctttaaatcacccctcgaagcaacccgtgatattgtgacgtacaactgtccatgtgaaaaa 274  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13905351 atatctttaaaccacccctcgaagtaacccgtgatattgcgacgtacaactgtccatgtgaaaaa 13905287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 10 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 6123934 - 6123670
Alignment:
Q  10 ataattctagtacgtagttcatgttagtttaacataacatataattttaaaagggaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaa 109  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6123934 ataattctagtacgtagttcctgttactttaacataacatataattttaaaagggaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataaataagaaa 6123835  T
Q  110 aatgaatagtacataaaaaagtc-ttacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgatgcaacatcggtaccatcgccgtccttgtcattaatc 208  Q
    | ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||    
T  6123834 a-tgaatagtacacaaaaaagtccttacacattacggaaaacttctctgtagatcacacttgatgcaacatcggtatcatcgccgtcgtcgtcattaatc 6123736  T
Q  209 aatatctttaaatcacccctcgaagcaacccgtgatattgtgacgtacaactgtccatgtgaaaaa 274  Q
    ||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  6123735 aatatttttaaaccacccctcgaagtaacccgtgatattgcaacgtacaactgtccatgtgaaaaa 6123670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 10 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 13908482 - 13908143
Alignment:
Q  10 ataattctagtacgtagttcatgttagtttaacataacatataattttaaaagggaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaa 109  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||| |||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13908482 ataattctagtacgtagttcctgttactttaaaataatatataattttgaaagggaaattgaagtttgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaa 13908383  T
Q  110 aatgaatagtacataaaaaagtcttacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgatgcaacatcggtaccatcgccgtccttgtcattaatca 209  Q
    | |||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||| | |||||||||||    
T  13908382 a-tgaacagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttttctatagaccacatttgatgcaacatcgatatcatcgccgtcgtcgtcattaatca 13908284  T
Q  210 atatctttaaatcacccctcgaagcaacccgtgatattgtgacgtacaactgtccatgtgaaaaaataggaaacggtaggtagacaccaacatattctag 309  Q
    |||| |||||| |||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| || |||||||||| ||  |     
T  13908283 atatttttaaaccacctctcgaagtaacccgtgatattgcgacgtacaactgtccatgtgaaaaaacaggagacggtagataaacaccaacatgtttcaa 13908184  T
Q  310 cgactgaccctgacccttgtt-atggtcattgcaaatgagac 350  Q
    ||| |||||||||| |||||| || |||||||||||||||||    
T  13908183 cga-tgaccctgactcttgttaatagtcattgcaaatgagac 13908143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 175; E-Value: 6e-94
Query Start/End: Original strand, 10 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 2301039 - 2300779
Alignment:
Q  10 ataattctagtacgtagttcatgttagtttaacataacatataattttaaaagggaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaa 109  Q
    |||||||||||||||||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  2301039 ataattctagtacgtagttcctattactttaacaaaacatataattttaaaagggaaactgaagttcgttgatatgcaaatagtttcaataagtaag-aa 2300941  T
Q  110 aatgaatagtacataaaaaagtcttacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgatgcaacatcggtaccatcgccgtccttgtcattaatca 209  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |   ||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||    
T  2300940 aatgaatagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttttctgtagaccacact---tgcaacatcggtatcatcgccgtcgtcgtcattaatca 2300844  T
Q  210 atatctttaaatcacccctcgaagcaacccgtgatattgtgacgtacaactgtccatgtgaaaaa 274  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||    
T  2300843 atatctttaaaccacccctcgaagtaacccgtgatattgccatgtacaactgtccatgtgaaaaa 2300779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 10 - 220
Target Start/End: Original strand, 27997369 - 27997578
Alignment:
Q  10 ataattctagtacgtagttcatgttagtttaacataacatataattttaaaagggaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaa 109  Q
    |||||||||  ||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27997369 ataattctaagacgcagttcctgttactttaacataacatataattttaaaagggaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaa 27997468  T
Q  110 aatgaatagtacataaaaaagtcttacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgatgcaacatcggtaccatcgccgtccttgtcattaatca 209  Q
    | ||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  27997469 a-tgaatagtacacaaaaaagttctacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgatgctacatcggtatcatcgccgtcctcgtcattaatca 27997567  T
Q  210 atatctttaaa 220  Q
    |||||||||||    
T  27997568 atatctttaaa 27997578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 10 - 220
Target Start/End: Original strand, 28098739 - 28098948
Alignment:
Q  10 ataattctagtacgtagttcatgttagtttaacataacatataattttaaaagggaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaa 109  Q
    |||||||||  ||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28098739 ataattctaagacgcagttcctgttactttaacataacatataattttaaaagggaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaa 28098838  T
Q  110 aatgaatagtacataaaaaagtcttacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgatgcaacatcggtaccatcgccgtccttgtcattaatca 209  Q
    | ||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  28098839 a-tgaatagtacacaaaaaagttctacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgatgctacatcggtatcatcgccgtcctcgtcattaatca 28098937  T
Q  210 atatctttaaa 220  Q
    |||||||||||    
T  28098938 atatctttaaa 28098948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 10 - 232
Target Start/End: Original strand, 36437521 - 36437742
Alignment:
Q  10 ataattctagtacgtagttcatgttagtttaacataacatataattttaaaagggaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaa 109  Q
    |||||||||  ||| ||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  36437521 ataattctaagacgcagtttctgttactttaacataacatataattttaaaagggaaactgaagttcgttgacatacaaatagtttcaataagtaagaaa 36437620  T
Q  110 aatgaatagtacataaaaaagtcttacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgatgcaacatcggtaccatcgccgtccttgtcattaatca 209  Q
    | ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||    
T  36437621 a-tgaatagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctttgtagaccacatttgatgcaacatcgatacaatcgccgtcctcgtcattaatca 36437719  T
Q  210 atatctttaaatcacccctcgaa 232  Q
    ||||||||||| |||||||||||    
T  36437720 atatctttaaaccacccctcgaa 36437742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 10 - 232
Target Start/End: Original strand, 42109348 - 42109569
Alignment:
Q  10 ataattctagtacgtagttcatgttagtttaacataacatataattttaaaagggaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaa 109  Q
    |||||||||  ||| ||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  42109348 ataattctaagacgcagtttctgttactttaacataacatataattttaaaagggaaactgaagttcgttgacatgcaaataatttcaataagtaagaaa 42109447  T
Q  110 aatgaatagtacataaaaaagtcttacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgatgcaacatcggtaccatcgccgtccttgtcattaatca 209  Q
    | ||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||    
T  42109448 a-tgaatagtacacaaaaaggtcctacacattacggaaaacttttttgtagaccacatttgatgcaacatcggtataatcgccgtcctcgtcattaatca 42109546  T
Q  210 atatctttaaatcacccctcgaa 232  Q
    |||| ||||||||||||||||||    
T  42109547 atatttttaaatcacccctcgaa 42109569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 31 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 19822104 - 19821904
Alignment:
Q  31 tgttagtttaacataacatataattttaaaagggaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaaatgaatagtacataaaaaag 130  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  19822104 tgttactttaacataacatataattttaaaagggaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaatcagtaagaaaa-tgaatagtacacaaaaaag 19822006  T
Q  131 tcttacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgatgcaacatcggtaccatcgccgtccttgtcattaatcaatatctttaaatcacccctcg 230  Q
    || |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  19822005 tcctacacattccggaaaacttctttgtagaccacatttgatgcaacatcggtataatcgccgtcctcgtcattaatcaatatttttaaaccacccctcg 19821906  T
Q  231 aa 232  Q
    ||    
T  19821905 aa 19821904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 31 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 19842325 - 19842125
Alignment:
Q  31 tgttagtttaacataacatataattttaaaagggaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaaatgaatagtacataaaaaag 130  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  19842325 tgttactttaacataacatataattttaaaagggaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaatcagtaagaaaa-tgaatagtacacaaaaaag 19842227  T
Q  131 tcttacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgatgcaacatcggtaccatcgccgtccttgtcattaatcaatatctttaaatcacccctcg 230  Q
    || |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  19842226 tcctacacattccggaaaacttctttgtagaccacatttgatgcaacatcggtataatcgccgtcctcgtcattaatcaatatttttaaaccacccctcg 19842127  T
Q  231 aa 232  Q
    ||    
T  19842126 aa 19842125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 66 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 184298 - 184091
Alignment:
Q  66 aactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaaatgaatagtacataaaaaagtcttacacattacggaaaacttctctgtagaccac 165  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  184298 aactgaagttcgttgacatgcaaatactttcaataagtaagaaaa-tgaatagtacccaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagaccac 184200  T
Q  166 atttgatgcaacatcggtaccatcgccgtccttgtcattaatcaatatctttaaatcacccctcgaagcaacccgtgatattgtgacgtacaactgtcca 265  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||  | |||||||||||||    
T  184199 acttgatgcaacatcggtatcatcgccgtcgtcgtcattaatcaatatctttaaaccacccctcgaagtaacctgtgatattgcaatgtacaactgtcca 184100  T
Q  266 tgtgaaaaa 274  Q
    |||||||||    
T  184099 tgtgaaaaa 184091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 66 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 2449532 - 2449325
Alignment:
Q  66 aactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaaatgaatagtacataaaaaagtcttacacattacggaaaacttctctgtagaccac 165  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2449532 aactgaagttcgttgacatgcaaatactttcaataagtaagaaaa-tgaatagtacccaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagaccac 2449434  T
Q  166 atttgatgcaacatcggtaccatcgccgtccttgtcattaatcaatatctttaaatcacccctcgaagcaacccgtgatattgtgacgtacaactgtcca 265  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||  | |||||||||||||    
T  2449433 acttgatgcaacatcggtatcatcgccgtcgtcgtcattaatcaatatctttaaaccacccctcgaagtaacctgtgatattgcaatgtacaactgtcca 2449334  T
Q  266 tgtgaaaaa 274  Q
    |||||||||    
T  2449333 tgtgaaaaa 2449325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 10 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 20890901 - 20890699
Alignment:
Q  10 ataattctagtacgtagttcatgttagtttaacataacatataattttaaaagggaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaa 109  Q
    |||||||||  ||| ||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20890901 ataattctaagacgcagtttctgttactttaacataacatataattttaaaagggaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaa 20890802  T
Q  110 aatgaatagtacataaaaaagtcttacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgatgcaacatcggtaccatcgccgtccttgtcattaatca 209  Q
    | ||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||    
T  20890801 a-tgaatagtacacaaaaatgtcctacacattacggaaaacttctttgtagaccacatttgatgcaacatcggtataatcgccgtcctcgtcattaatca 20890703  T
Q  210 atat 213  Q
    ||||    
T  20890702 atat 20890699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 10 - 225
Target Start/End: Original strand, 1916687 - 1916901
Alignment:
Q  10 ataattctagtacgtagttcatgttagtttaacataacatataattttaaaagggaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaa 109  Q
    |||||||||  ||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  1916687 ataattctaagacgcagttcctgttactttaacataacatataattttaaaagggaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaag-aa 1916785  T
Q  110 aatgaatagtacataaaaaagtcttacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgatgcaacatcggtaccatcgccgtccttgtcattaatca 209  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||  ||||| |||||||||||    
T  1916786 aatgaatagtacacaaaaaagtcctacatattatggaaaacttctatgtagaccacatttgatgcaacattggtatcatcgttgtcctcgtcattaatca 1916885  T
Q  210 atatctttaaatcacc 225  Q
    ||| ||||||| ||||    
T  1916886 ataactttaaaccacc 1916901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 66 - 274
Target Start/End: Original strand, 976020 - 976225
Alignment:
Q  66 aactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaaatgaatagtacataaaaaagtcttacacattacggaaaacttctctgtagaccac 165  Q
    ||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  976020 aactgaagttcgtt--catgcaaatactttcaataagtaagaaaa-tgaatagtacccaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagaccac 976116  T
Q  166 atttgatgcaacatcggtaccatcgccgtccttgtcattaatcaatatctttaaatcacccctcgaagcaacccgtgatattgtgacgtacaactgtcca 265  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||  | |||||||||||||    
T  976117 acttgatgcaacatcggtatcatcgccgtcgtcgtcattaatcaatatctttaaaccacccctcgaagtaacctgtgatattgcaatgtacaactgtcca 976216  T
Q  266 tgtgaaaaa 274  Q
    |||||||||    
T  976217 tgtgaaaaa 976225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 10 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 25647734 - 25647555
Alignment:
Q  10 ataattctagtacgtagttcatgttagtttaacataacatataattttaaaagggaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaa 109  Q
    |||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  25647734 ataattctagtacgtagttcctattactttaacataacatataattttaaaagggaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaag-aa 25647636  T
Q  110 aatgaatagtacataaaaaagtcttacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgatgcaacatcggtaccatcgccg 193  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |   ||||||||||||| ||||||||    
T  25647635 aatgaatagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttttctgtagaccacact---tgcaacatcggtatcatcgccg 25647555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 10 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 1273155 - 1273025
Alignment:
Q  10 ataattctagtacgtagttcatgttagtttaacataacatataattttaaaagggaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaa 109  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  1273155 ataattctagtacgtagttcctgttactttaacataacatataattttaaaagggaaactgaagtttgttgacatgcatatagtttcaataagtaag-aa 1273057  T
Q  110 aatgaatagtacataaaaaagtcttacacatt 141  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  1273056 aatgaatagtacacaaaaaagtcctacacatt 1273025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 114 - 233
Target Start/End: Original strand, 23455676 - 23455795
Alignment:
Q  114 aatagtacataaaaaagtcttacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgatgcaacatcggtaccatcgccgtccttgtcattaatcaatat 213  Q
    |||| |||| || |||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||  ||||| ||| | | ||| ||||  ||||| ||||||||    
T  23455676 aatactacaaaacaaagtcctacacattacggaaaaattctctgtagactacatttgatgtcacatcagtatcttggccatcctcatcattgatcaatat 23455775  T
Q  214 ctttaaatcacccctcgaag 233  Q
    ||||||| || |||| ||||    
T  23455776 ctttaaaccatcccttgaag 23455795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 264 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 13907855 - 13907768
Alignment:
Q  264 catgtgaaaaaataggaaacggtaggtagacaccaacatattctagcgactgaccctgacccttgtt-atggtcattgcaaatgagac 350  Q
    |||||||||||| |||| ||||||| || |||||||||| ||  | |||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||    
T  13907855 catgtgaaaaaacaggagacggtagataaacaccaacatgtttcaacgactgaccctgactcttgttaatagtcattgcaaatgagac 13907768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 10 - 58
Target Start/End: Original strand, 21589022 - 21589070
Alignment:
Q  10 ataattctagtacgtagttcatgttagtttaacataacatataatttta 58  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  21589022 ataattctagtacgtagttcctgttactttaaaataacatataatttta 21589070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 264 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 26455500 - 26455413
Alignment:
Q  264 catgtgaaaaaataggaaacggtaggtagacaccaacatattctagcgactgaccctgacccttgtt-atggtcattgcaaatgagac 350  Q
    |||||||||||| |||| ||||||| || |||||||||| ||  | |||| ||||||||| |||||| || |||||||||||||||||    
T  26455500 catgtgaaaaaacaggagacggtagataaacaccaacatgtttcaacgaccgaccctgactcttgttaatagtcattgcaaatgagac 26455413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 371; Significance: 0; HSPs: 20)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 371; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 519
Target Start/End: Complemental strand, 28389624 - 28389115
Alignment:
Q  10 ataattctagtacgtagttcatgttagtttaacataacatataattttaaaagggaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaa 109  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28389624 ataattctagtacgtagttcctgttactttaaaataacatataattttgaaagggaaattgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaa 28389525  T
Q  110 aatgaatagtacataaaaaagtcttacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgatgcaacatcggtaccatcgccgtccttgtcattaatca 209  Q
    | ||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| | |||||||||||    
T  28389524 a-tgaatagtacacaaaaaagtccaacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgatgcaacatcggtatcatcgtcgtcgtcgtcattaatca 28389426  T
Q  210 atatctttaaatcacccctcgaagcaacccgtgatattgtgacgtacaactgtccatgtgaaaaaataggaaacggtaggtagacaccaacatattctag 309  Q
    |||| || ||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  28389425 atattttaaaaccacccctcgaagtaacccgtgatattgcgacgtacaactgtccatgtgaaaaaataggagacggtaggtagacaccaacatgttctag 28389326  T
Q  310 cgactgaccctgacccttgtt-atggtcattgcaaatgagacagatatcggaaactgcctccgtttaaatttgaaaggaattctattatcagatggtgtt 408  Q
    |||| ||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28389325 cgaccgaccctgactcttgttaatagtcattgcaaatgagacagatatcgaaaaccgccttcgtttaaatttgaaaggaattctattatcagatggtgtt 28389226  T
Q  409 agcgataaccttggaataaacaccttctcaccgatattacaaccagatattacccgtccttcgagcacaaattttctcatctttgtaatgatcaatctcg 508  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  28389225 agcgataaccttggaatcaacaccttctcaccgatattagaacctgatattacccgtccttcgagcacaaattttcctatctttgtaatgatcaatctcg 28389126  T
Q  509 tacccttacat 519  Q
    |||| ||||||    
T  28389125 taccgttacat 28389115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 355; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 519
Target Start/End: Complemental strand, 21382870 - 21382362
Alignment:
Q  10 ataattctagtacgtagttcatgttagtttaacataacatataattttaaaagggaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaa 109  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21382870 ataattctagtatgtagttcctgttactttaaaataacatataattttgaaagggaaattgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaa 21382771  T
Q  110 aatgaatagtacataaaaaagtcttacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgatgcaacatcggtaccatcgccgtccttgtcattaatca 209  Q
    | ||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||| | |||||||||||    
T  21382770 a-tgaatagtacacaaaaa-gtcctacacattacggaaaacttctctatagaccacatttgatgcaacatcggtatcatcactgtcgtcgtcattaatca 21382673  T
Q  210 atatctttaaatcacccctcgaagcaacccgtgatattgtgacgtacaactgtccatgtgaaaaaataggaaacggtaggtagacaccaacatattctag 309  Q
    |||| |||||| || ||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21382672 atatttttaaaccagccctcgaagtaacctgtgatattgcgacgtacaactgtccatgtgaaaaaataggagacggtaggtagacaccaacatgttctag 21382573  T
Q  310 cgactgaccctgacccttgtta-tggtcattgcaaatgagacagatatcggaaactgcctccgtttaaatttgaaaggaattctattatcagatggtgtt 408  Q
    |||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21382572 cgactgaccctgactcttgttaatagtcattgcaaatgagacagaaatcggaaactgccttcgtttaaatttgaaaggaattctattatcagatggtgtt 21382473  T
Q  409 agcgataaccttggaataaacaccttctcaccgatattacaaccagatattacccgtccttcgagcacaaattttctcatctttgtaatgatcaatctcg 508  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21382472 agcgataaccttgaaataaacaccttctcaccgatatttgaaccatatattatccgtccttcgagcacaaattttcccatctttgtaatgatcaatctcg 21382373  T
Q  509 tacccttacat 519  Q
    |||| ||||||    
T  21382372 taccgttacat 21382362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 342; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 519
Target Start/End: Complemental strand, 16909277 - 16908777
Alignment:
Q  10 ataattctagtacgtagttcatgttagtttaacataacatataattttaaaagggaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaa 109  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16909277 ataattctagtacgtagttcctgttactttaaaataacatataattttgaaagggaaattgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaa 16909178  T
Q  110 aatgaatagtacataaaaaagtcttacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgatgcaacatcggtaccatcgccgtccttgtcattaatca 209  Q
    | ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||      ||| ||||   |||||||||||    
T  16909177 a-tgaatagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgatgcatcgtcg------tcgtcgtc---gtcattaatca 16909088  T
Q  210 atatctttaaatcacccctcgaagcaacccgtgatattgtgacgtacaactgtccatgtgaaaaaataggaaacggtaggtagacaccaacatattctag 309  Q
    |||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16909087 atatttttaaaccacccctcgaagtaacccgtgatattgcgacgtacaactgtccatgtgaaaaaataggagacggtaggtagacaccaacatgttctag 16908988  T
Q  310 cgactgaccctgacccttgtta-tggtcattgcaaatgagacagatatcggaaactgcctccgtttaaatttgaaaggaattctattatcagatggtgtt 408  Q
    |||| |||| |||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16908987 cgaccgaccttgactcttgttaatagtcattgcaaatgagacagatatcggaaaccgccttcgtttaaatttgaaaggaattctattatcagatggtgtt 16908888  T
Q  409 agcgataaccttggaataaacaccttctcaccgatattacaaccagatattacccgtccttcgagcacaaattttctcatctttgtaatgatcaatctcg 508  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  16908887 agcgataaccttgaaatcaacaccttctcaccgatattagaacctgatattacccgtccttcgagcacaaattttcctatctttgtaatgatcaatctcg 16908788  T
Q  509 tacccttacat 519  Q
    |||| ||||||    
T  16908787 taccgttacat 16908777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 337; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 519
Target Start/End: Original strand, 29359092 - 29359590
Alignment:
Q  10 ataattctagtacgtagttcatgttagtttaacataacatataattttaaaagggaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaa 109  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29359092 ataattctagtacgtagttcctgttactttaaaataacatataattttggaaggcaaattgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaa 29359191  T
Q  110 aatgaatagtacataaaaaagtcttacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgatgcaacatcggtaccatcgccgtccttgtcattaatca 209  Q
    | |||| | |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| | |||||||||||    
T  29359192 a-tgaacaatacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctttgtagaccacatttgatgcaacatcgatatcatcgccgtcgtcgtcattaatca 29359290  T
Q  210 atatctttaaatcacccctcgaagcaacccgtgatattgtgacgtacaactgtccatgtgaaaaaataggaaacggtaggtagacaccaacatattctag 309  Q
    |||| |||||| |||||||           ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  29359291 atatttttaaaccacccct-----------gtgatattgcgacgtacaactgtccatatgaaaaaataggagacggtaggtagacaccaacatgttctag 29359379  T
Q  310 cgactgaccctgacccttgtta-tggtcattgcaaatgagacagatatcggaaactgcctccgtttaaatttgaaaggaattctattatcagatggtgtt 408  Q
    ||||||||||| || ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29359380 cgactgaccctcactcttgttaatagtcattgcaaatgagacagatatcggaaactgccttcgtttaaatttgaaaggaattctattatcagatggtgtt 29359479  T
Q  409 agcgataaccttggaataaacaccttctcaccgatattacaaccagatattacccgtccttcgagcacaaattttctcatctttgtaatgatcaatctcg 508  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  29359480 agcgataaccttggaataaacactttctcaccgatattagaaccagatattacccgtccttcgagcacaaattttcccatctttgtaatgatcaatctcg 29359579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 474
Target Start/End: Original strand, 30387908 - 30388372
Alignment:
Q  10 ataattctagtacgtagttcatgttagtttaacataacatataattttaaaagggaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaa 109  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||| | ||| ||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30387908 ataattctagcacgtagttcctgttactataaaataacatataattttgaaaggaaaattgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaa 30388007  T
Q  110 aatgaatagtacataaaaaagtcttacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgatgcaacatcggtaccatcgccgtccttgtcattaatca 209  Q
    | |||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||| |||| | |||||||||||    
T  30388008 a-tgaacagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgatgcaacatcgatatcgtcgtcgtcgtcgtcattaatca 30388106  T
Q  210 atatctttaaatcacccctcgaagcaacccgtgatattgtgacgtacaactgtccatgtgaaaaaataggaaacggtaggtagacaccaacatattctag 309  Q
    |||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  30388107 atatttttaaaccacccctcgaagtaacccgtgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaaataggagacggtaggtagacaccaacatgttctag 30388206  T
Q  310 cgactgaccctgacccttgtt-atggtcattgcaaatgagacagatatcggaaactgcctccgtttaaatttgaaaggaattctattatcagatggtgtt 408  Q
    ||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30388207 cgactgaccatgactcttgttaatagtcattgcaaatgagacagatatcggaaactgccttcgattaaatttgaaaggaattctattatcagatggtgtt 30388306  T
Q  409 agcgataaccttggaataaacaccttctcaccgatattacaaccagatattacccgtccttcgagc 474  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  30388307 agcgataaccttgaaataaacaccttctcaccgatattagaactagatattacccgtccttcgagc 30388372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 10 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 52682954 - 52682614
Alignment:
Q  10 ataattctagtacgtagttcatgttagtttaacataacatataattttaaaagggaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaa 109  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52682954 ataattctagtacgtagttcctgttactttaaaataacatataattttgaaagggaaattgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaa 52682855  T
Q  110 aatgaatagtacataaaaaagtcttacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgatgcaacatcggtaccatcgccgtccttgtcattaatca 209  Q
    | |||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| | |||||||||||    
T  52682854 a-tgaacagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgatgcaacatcgatatcatcgccgtcgtcgtcattaatca 52682756  T
Q  210 atatctttaaatcacccctcgaagcaacccgtgatattgtgacgtacaactgtccatgtgaaaaaataggaaacggtaggtagacaccaacatattctag 309  Q
    |||| |||||| |||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| || |||| ||||| ||  |     
T  52682755 atatttttaaaccacctctcgaagtaacccgtgatattgcgacgtacaactgtccatgtgaaaaaacaggagacggtagataaacacgaacatgtttcaa 52682656  T
Q  310 cgactgaccctgacccttgtt-atggtcattgcaaatgagac 350  Q
    |||||||||||||| |||||| || |||||| ||||||||||    
T  52682655 cgactgaccctgactcttgttaatagtcattacaaatgagac 52682614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 10 - 350
Target Start/End: Original strand, 41859751 - 41860091
Alignment:
Q  10 ataattctagtacgtagttcatgttagtttaacataacatataattttaaaagggaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaa 109  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41859751 ataattctagtacatagttcctgttactttaaaataacatataattttgaaagggaaattgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaa 41859850  T
Q  110 aatgaatagtacataaaaaagtcttacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgatgcaacatcggtaccatcgccgtccttgtcattaatca 209  Q
    | |||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| | |||||||||||    
T  41859851 a-tgaacagtacacaaaaaagtcttacacattacgaaaaacttcactgtagaccacatttgatgcaacatcgatatcatcgccgtcgtcgtcattaatca 41859949  T
Q  210 atatctttaaatcacccctcgaagcaacccgtgatattgtgacgtacaactgtccatgtgaaaaaataggaaacggtaggtagacaccaacatattctag 309  Q
    |||| |||||| |||| ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| || |||||||||| ||  |     
T  41859950 atatttttaaaccacctctcgaagtaacccgtgatattacgacgtacaactgtccatgtgaaaaaacaggagacggtagataaacaccaacatgtttcaa 41860049  T
Q  310 cgactgaccctgacccttgtt-atggtcattgcaaatgagac 350  Q
    |||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||    
T  41860050 cgactgaccctgactcttgttaatagtcattgcaaatgagac 41860091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 10 - 274
Target Start/End: Original strand, 19515106 - 19515369
Alignment:
Q  10 ataattctagtacgtagttcatgttagtttaacataacatataattttaaaagggaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaa 109  Q
    |||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  19515106 ataattctagtacgtagttcctattactttaacataacatataattttaaaagggaaactgaagttcattgacatgtaaatagtttcaataaataagaaa 19515205  T
Q  110 aatgaatagtacataaaaaagtcttacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgatgcaacatcggtaccatcgccgtccttgtcattaatca 209  Q
    | ||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||    
T  19515206 a-tgaatagtacacaaaaaagtcctacacattacgggaaacttctctgtagatcacacttgatgcaacatcggtatcatcgccgtcgtcgtcattaatca 19515304  T
Q  210 atatctttaaatcacccctcgaagcaacccgtgatattgtgacgtacaactgtccatgtgaaaaa 274  Q
    |||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19515305 atatttttaaaccacccctcgaagtaacccgtgatattgcgacgtacaactgtccatgtgaaaaa 19515369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 10 - 274
Target Start/End: Original strand, 21581496 - 21581759
Alignment:
Q  10 ataattctagtacgtagttcatgttagtttaacataacatataattttaaaagggaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaa 109  Q
    |||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  21581496 ataattctagtacgtagttcctattactttaacataacatataattttaaaagggaaactgaagttcattgacatgtaaatagtttcaataaataagaaa 21581595  T
Q  110 aatgaatagtacataaaaaagtcttacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgatgcaacatcggtaccatcgccgtccttgtcattaatca 209  Q
    | ||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||    
T  21581596 a-tgaatagtacacaaaaaagtcctacacattacgggaaacttctctgtagatcacacttgatgcaacatcggtatcatcgccgtcgtcgtcattaatca 21581694  T
Q  210 atatctttaaatcacccctcgaagcaacccgtgatattgtgacgtacaactgtccatgtgaaaaa 274  Q
    |||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21581695 atatttttaaaccacccctcgaagtaacccgtgatattgcgacgtacaactgtccatgtgaaaaa 21581759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 10 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 42347960 - 42347739
Alignment:
Q  10 ataattctagtacgtagttcatgttagtttaacataacatataattttaaaagggaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaa 109  Q
    |||||||||  ||| ||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42347960 ataattctaagacgcagtttttgttactttaacataacatataattttaaaagggaaactgaagtttgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaa 42347861  T
Q  110 aatgaatagtacataaaaaagtcttacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgatgcaacatcggtaccatcgccgtccttgtcattaatca 209  Q
    | ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||| |||||||||||    
T  42347860 a-tgaatagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctttgtagaccacatttgatgcaacatcggtataatcgtcgtcctcgtcattaatca 42347762  T
Q  210 atatctttaaatcacccctcgaa 232  Q
    ||||||||||| |||||||||||    
T  42347761 atatctttaaaccacccctcgaa 42347739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 31 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 53288509 - 53288309
Alignment:
Q  31 tgttagtttaacataacatataattttaaaagggaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaaatgaatagtacataaaaaag 130  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||    
T  53288509 tgttattttaacataacatataattttaaaagggaaactgaagtacgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaa-tgaataatacaaaaaaaag 53288411  T
Q  131 tcttacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgatgcaacatcggtaccatcgccgtccttgtcattaatcaatatctttaaatcacccctcg 230  Q
    || |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  53288410 tcatacacattacagaaaacttctttgtagaccacatttgatgcaacatcggtataatcgccgtcctcgtcattaatcaatatctttaaaccacccctcg 53288311  T
Q  231 aa 232  Q
    ||    
T  53288310 aa 53288309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 37 - 229
Target Start/End: Original strand, 31448360 - 31448555
Alignment:
Q  37 tttaacataacatataatttt--aaaagggaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaaatgaatagtacataaaaaagtct- 133  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  ||     
T  31448360 tttaacataacatataattttttaaaagggaaactgaagttcgttgacatgcaaataatttcaataagtaagaaaa-tgaatagtacacaaaaaaagctc 31448458  T
Q  134 -tacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgatgcaacatcggtaccatcgccgtccttgtcattaatcaatatctttaaatcacccctc 229  Q
     ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  31448459 ctacacattacggaaaacttctttgtagaccacatttgatgcaacatcggtataatcgccgtcctcgtcattaatcaatatttttaaatcacccctc 31448555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 137 - 506
Target Start/End: Original strand, 36895658 - 36896026
Alignment:
Q  137 acattacggaaaacttctctgtagaccacatttgatgcaacatcggtaccatcgccgtccttgtcattaatcaatatctttaaatcacccctcgaagcaa 236  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||| ||| | | ||||||||  ||||| ||||||||||||||| || |||| ||||  |    
T  36895658 acattacggaaaacttctctgtagaccacatttgatgtcatatcagtatcttggccgtcctcatcattgatcaatatctttaaaccatcccttgaagtta 36895757  T
Q  237 cccgtgatattgtgacgtacaactgtccatgtgaaaaaataggaaacggtaggtagacaccaacatattctagcgactgaccctgacccttgtta-tggt 335  Q
    |||  ||||||| ||||||||| || ||||||||||||  |||| ||||||| ||||||||||||| ||  |  || |||||||||  ||||||| | ||    
T  36895758 ccctcgatattgcgacgtacaattggccatgtgaaaaac-aggagacggtagatagacaccaacatttttcaaagattgaccctgaatcttgttaatagt 36895856  T
Q  336 cattgcaaatgagacagatatcggaaactgcctccgtttaaatttgaaaggaattctattatcagatggtgttagcgataaccttggaataaacaccttc 435  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||| || |||||| ||||||| |||    |||||||||||| ||||||||||||     
T  36895857 cattgcaaatgagacagacaacggaaactgccttcgtttaaacttgaacgggattctagtatcagacggttgaggcgataaccttg-aataaacaccttt 36895955  T
Q  436 tcaccgatattacaaccagatattacccgtccttcgagcacaaattttctcatctttgtaatgatcaatct 506  Q
    ||||| |||||| | | ||||||||||  | |||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||    
T  36895956 tcacctatattagatctagatattacctctgcttcgagcacaaatttacccatctttgtaataatcaatct 36896026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 10 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 25839539 - 25839384
Alignment:
Q  10 ataattctagtacgtagttcatgttagtttaacataacatataattttaaaagggaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaa 109  Q
    |||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  25839539 ataattctagtacgtagttcctattactttaacataacatataattttaaaagggaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaag-aa 25839441  T
Q  110 aatgaatagtacataaaaaagtcttacacattacggaaaacttctctgtagaccaca 166  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  25839440 aatgaatagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttttctgtagaccaca 25839384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 159 - 280
Target Start/End: Original strand, 41944034 - 41944155
Alignment:
Q  159 agaccacatttgatgcaacatcggtaccatcgccgtccttgtcattaatcaatatctttaaatcacccctcgaagcaacccgtgatattgtgacgtacaa 258  Q
    |||||||||||||||  ||||||||| | ||||||||||  ||||| ||||||||||||||| || |||| |||| ||||| |||||||| |||||||||    
T  41944034 agaccacatttgatgtcacatcggtatcttcgccgtcctcatcattgatcaatatctttaaaccatcccttgaagtaacccttgatattgcgacgtacaa 41944133  T
Q  259 ctgtccatgtgaaaaaatagga 280  Q
     |||||||||||||||| ||||    
T  41944134 ttgtccatgtgaaaaaacagga 41944155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 264 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 52682326 - 52682239
Alignment:
Q  264 catgtgaaaaaataggaaacggtaggtagacaccaacatattctagcgactgaccctgacccttgtt-atggtcattgcaaatgagac 350  Q
    |||||||||||| |||| ||||||| || |||||||||| ||  | |||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||    
T  52682326 catgtgaaaaaacaggagacggtagataaacaccaacatgtttcaacgactgaccctgactcttgttaatagtcattgcaaatgagac 52682239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 134 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 8121155 - 8121116
Alignment:
Q  134 tacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgatg 173  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8121155 tacacattacggaaaacttctctgtagaccatatttgatg 8121116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 330 - 496
Target Start/End: Original strand, 38465927 - 38466093
Alignment:
Q  330 tatggtcattgcaaatgagacagatatcggaaactgcctccgtttaaatttgaaaggaattctattatcagatggtgttagcgataaccttggaataaac 429  Q
    |||||||||||||||  | ||| |||| ||||||||| | || | |||||||||| |||||||  ||||||| || || |||||||| ||||| ||| |     
T  38465927 tatggtcattgcaaaacatacaaatataggaaactgcttacgctgaaatttgaaaagaattcttgtatcagacggcgtcagcgataatcttggtatatat 38466026  T
Q  430 accttctcaccgatattacaaccagatattacccgtccttcgagcacaaattttctcatctttgtaa 496  Q
    ||||||||  | ||||| | ||||||||| ||||  ||||| || | | || ||| |||||||||||    
T  38466027 accttctcctcaatattgctaccagatataaccccgccttcaagaatatatattcccatctttgtaa 38466093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 134 - 173
Target Start/End: Original strand, 26602412 - 26602451
Alignment:
Q  134 tacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgatg 173  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26602412 tacacattatagaaaacttctctgtagaccacatttgatg 26602451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 375 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 24262430 - 24262368
Alignment:
Q  375 aaatttgaaaggaattctattatcagatggtgttagcgataaccttggaataaacaccttctc 437  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||| |||||||| ||| | ||||||||    
T  24262430 aaatttgaaaggaattctcgtatcagacggtgtcagcgacaaccttggtatatataccttctc 24262368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0097 (Bit Score: 343; Significance: 0; HSPs: 3)
Name: scaffold0097
Description:

Target: scaffold0097; HSP #1
Raw Score: 343; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 519
Target Start/End: Original strand, 51796 - 52304
Alignment:
Q  10 ataattctagtacgtagttcatgttagtttaacataacatataattttaaaagggaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaa 109  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51796 ataattctagtaagtagttcctgttactttaaaataacatataattttgaaagggaaattgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaa 51895  T
Q  110 aatgaatagtacataaaaaagtcttacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgatgcaacatcggtaccatcgccgtccttgtcattaatca 209  Q
    |  |||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||| | |||| ||||||    
T  51896 ac-gaatagtacacaaaaa-gtcctacacattacggaaaacttctctatagaccacatttgatgcaacatcgatatcatcgctgtcgtcgtcaataatca 51993  T
Q  210 atatctttaaatcacccctcgaagcaacccgtgatattgtgacgtacaactgtccatgtgaaaaaataggaaacggtaggtagacaccaacatattctag 309  Q
    |||| |||||| |||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  51994 atatttttaaaccacccctcgaagtaacctgtgatattgcgacgtacaactgtccatgtgaaaaaataggagacggtaggtagacaccaacatgttctag 52093  T
Q  310 cgactgaccctgacccttgtt-atggtcattgcaaatgagacagatatcggaaactgcctccgtttaaatttgaaaggaattctattatcagatggtgtt 408  Q
    |||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  52094 cgactgaccctgactcttgttaatagtcattgcaaatgagacagaaatcggaaactgccttcgtttaaatttgaaaggaattttattatcagatggtgtt 52193  T
Q  409 agcgataaccttggaataaacaccttctcaccgatattacaaccagatattacccgtccttcgagcacaaattttctcatctttgtaatgatcaatctcg 508  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  52194 agtgataaccttggaataaacaccttctcactgatatttgaaccatatattatccgtccttcgagcacaaattttcccatctttgtaatgatcaatctcg 52293  T
Q  509 tacccttacat 519  Q
    |||| ||||||    
T  52294 taccgttacat 52304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0097; HSP #2
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 10 - 248
Target Start/End: Original strand, 48973 - 49210
Alignment:
Q  10 ataattctagtacgtagttcatgttagtttaacataacatataattttaaaagggaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaa 109  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  48973 ataattctagtaggtagttcctgttactttaaaataacatataattttgaatgggaaattgaagttcgttgacatggaaatagtttcaataagtaagaaa 49072  T
Q  110 aatgaatagtacataaaaaagtcttacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgatgcaacatcggtaccatcgccgtccttgtcattaatca 209  Q
    | |||| |||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||| | |||||||||||    
T  49073 a-tgaacagtacacaaaaaattcctacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgatgcaacatcgatatcatcgctgtcgtcgtcattaatca 49171  T
Q  210 atatctttaaatcacccctcgaagcaacccgtgatattg 248  Q
    |||| |||||| |||| ||||||| ||||||||||||||    
T  49172 atatttttaaaccacctctcgaagtaacccgtgatattg 49210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0097; HSP #3
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 66 - 274
Target Start/End: Original strand, 40379 - 40586
Alignment:
Q  66 aactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaaatgaatagtacataaaaaagtcttacacattacggaaaacttctctgtagaccac 165  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40379 aactgaagttcgttgacatgcaaatactttcaataagtaagaaaa-tgaatagtacccaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagaccac 40477  T
Q  166 atttgatgcaacatcggtaccatcgccgtccttgtcattaatcaatatctttaaatcacccctcgaagcaacccgtgatattgtgacgtacaactgtcca 265  Q
    | |||||||||||||| || |||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||  | |||||||||||||    
T  40478 acttgatgcaacatcgatatcatcgccgtcgtcgtcattaatcaatatctttaaaccacccctcgaagtaacctgtgatattgcaatgtacaactgtcca 40577  T
Q  266 tgtgaaaaa 274  Q
    |||||||||    
T  40578 tgtgaaaaa 40586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 205; Significance: 1e-112; HSPs: 13)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 10 - 274
Target Start/End: Original strand, 20104973 - 20105235
Alignment:
Q  10 ataattctagtacgtagttcatgttagtttaacataacatataattttaaaagggaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaa 109  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20104973 ataattctagtacgtagttcctgttactttaacataacatataattttaaaagggaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaa 20105072  T
Q  110 aatgaatagtacataaaaaagtcttacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgatgcaacatcggtaccatcgccgtccttgtcattaatca 209  Q
    | ||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||    
T  20105073 a-tgaatagtacacaaaaa-gtcctacacattacggaaaacttctctgtagaccacacttgatgcaacatcggtatcatcgccgtcgtcgtcattaatca 20105170  T
Q  210 atatctttaaatcacccctcgaagcaacccgtgatattgtgacgtacaactgtccatgtgaaaaa 274  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20105171 atatctttaaaccacccctcgaagtaacccgtgatattgcgacgtacaactgtccatgtgaaaaa 20105235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 10 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 32675117 - 32674778
Alignment:
Q  10 ataattctagtacgtagttcatgttagtttaacataacatataattttaaaagggaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaa 109  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32675117 ataattctagtacgtagttcctgttactttaaaataacatataattttgaaagggaaattgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaa 32675018  T
Q  110 aatgaatagtacataaaaaagtcttacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgatgcaacatcggtaccatcgccgtccttgtcattaatca 209  Q
    | |||| |||||| ||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| | |||||||||||    
T  32675017 a-tgaacagtacacaaaaa-gtcctacacattatggaaaacttctctgtagaccacatttgatgcaacatcgatatcatcgccgtcgtcgtcattaatca 32674920  T
Q  210 atatctttaaatcacccctcgaagcaacccgtgatattgtgacgtacaactgtccatgtgaaaaaataggaaacggtaggtagacaccaacatattctag 309  Q
    |||| |||||| |||| ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| || |||||||||| ||  |     
T  32674919 atatttttaaaccacctctcgaagtaacccttgatattgcgacgtacaactgtccatgtgaaaaaacaggagacggtagataaacaccaacatgtttcaa 32674820  T
Q  310 cgactgaccctgacccttgtt-atggtcattgcaaatgagac 350  Q
    |||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||    
T  32674819 cgactgaccctgactcttgttaatagtcattgcaaatgagac 32674778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 10 - 274
Target Start/End: Original strand, 3607817 - 3608080
Alignment:
Q  10 ataattctagtacgtagttcatgttagtttaacataacatataattttaaaagggaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaa 109  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3607817 ataattctagtacgtagttcctgttactttaacataacatataattttaaaagggaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaa 3607916  T
Q  110 aatgaatagtacataaaaaagtcttacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgatgcaacatcggtaccatcgccgtccttgtcattaatca 209  Q
    | ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||||||    
T  3607917 a-tgaatagtacacaaaaaagtcctacacattacgaaaaacttctctgtagaccacacttgatgcaacatcggtatcatcgccgtcgtcatcattaatca 3608015  T
Q  210 atatctttaaatcacccctcgaagcaacccgtgatattgtgacgtacaactgtccatgtgaaaaa 274  Q
    ||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  3608016 atatctttaaaccacccctcaaagtaacccgtgatattgcgacgtacaactgtccatgtgaaaaa 3608080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 10 - 274
Target Start/End: Original strand, 30090232 - 30090495
Alignment:
Q  10 ataattctagtacgtagttcatgttagtttaacataacatataattttaaaagggaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaa 109  Q
    |||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30090232 ataattctagtacgtagtacctgttactttaacataacatataattttaaaagggaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaa 30090331  T
Q  110 aatgaatagtacataaaaaagtcttacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgatgcaacatcggtaccatcgccgtccttgtcattaatca 209  Q
    | ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| |  ||||||||||    
T  30090332 a-tgaatagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagaccacacttgatgcaacatcggtatcatcaccgtcgtcatcattaatca 30090430  T
Q  210 atatctttaaatcacccctcgaagcaacccgtgatattgtgacgtacaactgtccatgtgaaaaa 274  Q
    ||||||||||| |||||||| ||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  30090431 atatctttaaaccacccctcaaagtaacccgcgatattgcgacgtacaactgtccatgtgaaaaa 30090495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 134 - 519
Target Start/End: Original strand, 38095512 - 38095898
Alignment:
Q  134 tacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgatgcaacatcggtaccatcgccgtccttgtcattaatcaatatctttaaatcacccctcgaag 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||| | | || |||||  ||||| ||||| ||||||||| || |||| ||||    
T  38095512 tacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgatgtcacatcagtatcttggctgtcctcatcattgatcaacatctttaaaccatcccttgaag 38095611  T
Q  234 caacccgtgatattgtgacgtacaactgtccatgtgaaaaaataggaaacggtaggtagacaccaacatattctagcgactgaccctgacccttgtta-t 332  Q
     |||||  ||||||| ||| ||||| |||||||||||||||| | || ||||||| |||||||||| || ||  |  ||||||||||||| ||||||| |    
T  38095612 taaccctcgatattgcgacatacaattgtccatgtgaaaaaacaagagacggtagatagacaccaatatttttcaaagactgaccctgactcttgttaat 38095711  T
Q  333 ggtcattgcaaatgagacagatatcggaaactgcctccgtttaaatttgaaaggaattctattatcagatggtgttagcgataaccttggaataaacacc 432  Q
     |||||||||||||||||||| | |||||||| ||| |||||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||  |||| |||| |||||||||||||||    
T  38095712 agtcattgcaaatgagacagacaacggaaactaccttcgtttaaacttgaacggaattctagtatcagacggttgtagcaataatcttggaataaacacc 38095811  T
Q  433 ttctcaccgatattacaaccagatattacccgtccttcgagcacaaattttctcatctttgtaatgatcaatctcgtacccttacat 519  Q
    || ||||| |||||| | ||||||||||||  | | |||||||||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||| ||||||    
T  38095812 ttttcacctatattagatccagatattacctctgcctcgagcacaaatttacccatctttgtaataatcaatcttgtaccgttacat 38095898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 66 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 12655384 - 12655177
Alignment:
Q  66 aactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaaatgaatagtacataaaaaagtcttacacattacggaaaacttctctgtagaccac 165  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12655384 aactgaagttcgttgacatgcaaatactttcaataagtaagaaaa-tgaatagtacccaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagaccac 12655286  T
Q  166 atttgatgcaacatcggtaccatcgccgtccttgtcattaatcaatatctttaaatcacccctcgaagcaacccgtgatattgtgacgtacaactgtcca 265  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||  | |||||||||||||    
T  12655285 acttgatgcaacatcggtatcatcgccgtcgtcgtcattaatcaatatctttaaaccacccctcgaagtaacctgtgatattgcaatgtacaactgtcca 12655186  T
Q  266 tgtgaaaaa 274  Q
    |||||||||    
T  12655185 tgtgaaaaa 12655177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 66 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 23184169 - 23183962
Alignment:
Q  66 aactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaaatgaatagtacataaaaaagtcttacacattacggaaaacttctctgtagaccac 165  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23184169 aactgaagttcgttgacatgcaaatactttcaataagtaagaaaa-tgaatagtacccaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagaccac 23184071  T
Q  166 atttgatgcaacatcggtaccatcgccgtccttgtcattaatcaatatctttaaatcacccctcgaagcaacccgtgatattgtgacgtacaactgtcca 265  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||  | |||||||||||||    
T  23184070 acttgatgcaacatcggtatcatcgccgtcgtcgtcattaatcaatatctttaaaccacccctcgaagtaacctgtgatattgcaatgtacaactgtcca 23183971  T
Q  266 tgtgaaaaa 274  Q
    |||||||||    
T  23183970 tgtgaaaaa 23183962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 66 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 23188436 - 23188229
Alignment:
Q  66 aactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaaatgaatagtacataaaaaagtcttacacattacggaaaacttctctgtagaccac 165  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23188436 aactgaagttcgttgacatgcaaatactttcaataagtaagaaaa-tgaatagtacccaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagaccac 23188338  T
Q  166 atttgatgcaacatcggtaccatcgccgtccttgtcattaatcaatatctttaaatcacccctcgaagcaacccgtgatattgtgacgtacaactgtcca 265  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||  | |||||||||||||    
T  23188337 acttgatgcaacatcggtatcatcgccgtcgtcgtcattaatcaatatctttaaaccacccctcgaagtaacctgtgatattgcaatgtacaactgtcca 23188238  T
Q  266 tgtgaaaaa 274  Q
    |||||||||    
T  23188237 tgtgaaaaa 23188229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 66 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 34761430 - 34761223
Alignment:
Q  66 aactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaaatgaatagtacataaaaaagtcttacacattacggaaaacttctctgtagaccac 165  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34761430 aactgaagttcgttgacatgcaaatactttcaataagtaagaaaa-tgaatagtacccaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagaccac 34761332  T
Q  166 atttgatgcaacatcggtaccatcgccgtccttgtcattaatcaatatctttaaatcacccctcgaagcaacccgtgatattgtgacgtacaactgtcca 265  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||  | |||||||||||||    
T  34761331 acttgatgcaacatcggtatcatcgccgtcgtcgtcattaatcaatatctttaaaccacccctcgaagtaacctgtgatattgcaatgtacaactgtcca 34761232  T
Q  266 tgtgaaaaa 274  Q
    |||||||||    
T  34761231 tgtgaaaaa 34761223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 66 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 39878264 - 39878057
Alignment:
Q  66 aactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaaatgaatagtacataaaaaagtcttacacattacggaaaacttctctgtagaccac 165  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39878264 aactgaagttcgttgacatgcaaatactttcaataagtaagaaaa-tgaatagtacccaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagaccac 39878166  T
Q  166 atttgatgcaacatcggtaccatcgccgtccttgtcattaatcaatatctttaaatcacccctcgaagcaacccgtgatattgtgacgtacaactgtcca 265  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||  | |||||||||||||    
T  39878165 acttgatgcaacatcggtatcatcgccgtcgtcgtcattaatcaatatctttaaaccacccctcgaagtaacctgtgatattgcaatgtacaactgtcca 39878066  T
Q  266 tgtgaaaaa 274  Q
    |||||||||    
T  39878065 tgtgaaaaa 39878057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 133; E-Value: 7e-69
Query Start/End: Original strand, 134 - 481
Target Start/End: Original strand, 16678766 - 16679113
Alignment:
Q  134 tacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgatgcaacatcggtaccatcgccgtccttgtcattaatcaatatctttaaatcacccctcgaag 233  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||| | | | ||||||  ||||| ||||||||||||||| || |||| ||||    
T  16678766 tacacattacgaaaaacttctctgtagaccacatttgatgtcacatcagtatcttagtcgtcctcatcattgatcaatatctttaaaccatcccttgaag 16678865  T
Q  234 caacccgtgatattgtgacgtacaactgtccatgtgaaaaaataggaaacggtaggtagacaccaacatattctagcgactgaccctgacccttgtta-t 332  Q
     ||||   |||||||  |||||||| ||||||||| |||||| |||| ||||||| ||||||||||||| ||  |  ||||||||||||| ||||||| |    
T  16678866 taacctc-gatattgcaacgtacaattgtccatgtaaaaaaacaggagacggtagatagacaccaacatttttcaaagactgaccctgactcttgttaat 16678964  T
Q  333 ggtcattgcaaatgagacagatatcggaaactgcctccgtttaaatttgaaaggaattctattatcagatggtgttagcgataaccttggaataaacacc 432  Q
     |||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||  ||||||||||||| |||||||||||    
T  16678965 agtcattgcaaatgagacagataacgaaaactgccttcgtttaaacttgaaaggaattctagtatcagacggttgtagcgataaccttagaataaacacc 16679064  T
Q  433 ttctcaccgatattacaaccagatattacccgtccttcgagcacaaatt 481  Q
    || ||||  || ||| | ||||||||||||  | | |||||||||||||    
T  16679065 ttttcacttattttagatccagatattacctctgcctcgagcacaaatt 16679113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 124 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 37609790 - 37609741
Alignment:
Q  124 aaaaaagtcttacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgatg 173  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37609790 aaaaaagtgttacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgatg 37609741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 134 - 173
Target Start/End: Original strand, 38936314 - 38936353
Alignment:
Q  134 tacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgatg 173  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  38936314 tacacattacggaaaacttctctatagaccacatttgatg 38936353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0642 (Bit Score: 201; Significance: 1e-109; HSPs: 1)
Name: scaffold0642
Description:

Target: scaffold0642; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 10 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 3619 - 3356
Alignment:
Q  10 ataattctagtacgtagttcatgttagtttaacataacatataattttaaaagggaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaa 109  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3619 ataattctagtacgtagttcctgttactttaacataacatataattttaaaagggaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataaataagaaa 3520  T
Q  110 aatgaatagtacataaaaaagtcttacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgatgcaacatcggtaccatcgccgtccttgtcattaatca 209  Q
    | ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||    
T  3519 a-tgaatagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagatcacacttgatgcaacatcggtatcatcgccgtcgtcgtcattaatca 3421  T
Q  210 atatctttaaatcacccctcgaagcaacccgtgatattgtgacgtacaactgtccatgtgaaaaa 274  Q
    |||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  3420 atatttttaaaccacccctcgaagtaacccgtgatattgcgacgtacaactgtccatgtgaaaaa 3356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0345 (Bit Score: 201; Significance: 1e-109; HSPs: 1)
Name: scaffold0345
Description:

Target: scaffold0345; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 10 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 13531 - 13268
Alignment:
Q  10 ataattctagtacgtagttcatgttagtttaacataacatataattttaaaagggaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaa 109  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13531 ataattctagtacgtagttcctgttactttaacataacatataattttaaaagggaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataaataagaaa 13432  T
Q  110 aatgaatagtacataaaaaagtcttacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgatgcaacatcggtaccatcgccgtccttgtcattaatca 209  Q
    | ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||    
T  13431 a-tgaatagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagatcacacttgatgcaacatcggtatcatcgccgtcgtcgtcattaatca 13333  T
Q  210 atatctttaaatcacccctcgaagcaacccgtgatattgtgacgtacaactgtccatgtgaaaaa 274  Q
    |||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13332 atatttttaaaccacccctcgaagtaacccgtgatattgcgacgtacaactgtccatgtgaaaaa 13268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0105 (Bit Score: 201; Significance: 1e-109; HSPs: 1)
Name: scaffold0105
Description:

Target: scaffold0105; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 10 - 274
Target Start/End: Original strand, 25450 - 25713
Alignment:
Q  10 ataattctagtacgtagttcatgttagtttaacataacatataattttaaaagggaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaa 109  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  25450 ataattctagtacgtagttcctgttactttaacataacatataattttaaaagggaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataaataagaaa 25549  T
Q  110 aatgaatagtacataaaaaagtcttacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgatgcaacatcggtaccatcgccgtccttgtcattaatca 209  Q
    | ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||    
T  25550 a-tgaatagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagatcacacttgatgcaacatcggtatcatcgccgtcgtcgtcattaatca 25648  T
Q  210 atatctttaaatcacccctcgaagcaacccgtgatattgtgacgtacaactgtccatgtgaaaaa 274  Q
    |||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25649 atatttttaaaccacccctcgaagtaacccgtgatattgcgacgtacaactgtccatgtgaaaaa 25713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0121 (Bit Score: 175; Significance: 6e-94; HSPs: 1)
Name: scaffold0121
Description:

Target: scaffold0121; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 6e-94
Query Start/End: Original strand, 10 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 45797 - 45548
Alignment:
Q  10 ataattctagtacgtagttcatgttagtttaacataacatataattttaaaagggaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaa 109  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45797 ataattctagtacgtagttcctgttactttaaaataacatataattttgaaagggaaattgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaa 45698  T
Q  110 aatgaatagtacataaaaaagtcttacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgatgcaacatcggtaccatcgccgtccttgtcattaatca 209  Q
    | |||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| | |||||||||||    
T  45697 a-tgaacagtacacaaaaaagtcctacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgatgcaacatcgatatcatcgccgtcgtcgtcattaatca 45599  T
Q  210 atatctttaaatcacccctcgaagcaacccgtgatattgtgacgtacaact 260  Q
    |||| |||||| |||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  45598 atatttttaaaccacctctcgaagtaacccgtgatattgcgacgtacaact 45548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0374 (Bit Score: 154; Significance: 2e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0374
Description:

Target: scaffold0374; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 26 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 2175 - 1971
Alignment:
Q  26 gttcatgttagtttaacataacatataattttaaaagggaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaaaatgaatagtacataa 125  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| | ||    
T  2175 gttcctgttactttaacataacatataattctaaaagggaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaacaagtaagaaaa-tgaatagtatacaa 2077  T
Q  126 aaaagtcttacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgatgcaacatcggtaccatcgccgtccttgtcattaatcaatatctttaaatcacc 225  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  2076 aaaagtgctacacattacggaaaacttctctgtagaccacatttgatgcaacatcggtatcatcgccgtcctcgtcattaatcaatatctttaaaccacc 1977  T
Q  226 cctcga 231  Q
    ||||||    
T  1976 cctcga 1971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0119 (Bit Score: 100; Significance: 3e-49; HSPs: 2)
Name: scaffold0119
Description:

Target: scaffold0119; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 10 - 141
Target Start/End: Original strand, 27936 - 28066
Alignment:
Q  10 ataattctagtacgtagttcatgttagtttaacataacatataattttaaaagggaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaa 109  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  27936 ataattctagtacgtagttcctgttactttaacataacatataattttaaaagggaaactgaagtttgttgacatgcatatagtttcaataagtaag-aa 28034  T
Q  110 aatgaatagtacataaaaaagtcttacacatt 141  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  28035 aatgaatagtacacaaaaaagtcctacacatt 28066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0119; HSP #2
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 10 - 141
Target Start/End: Original strand, 34337 - 34467
Alignment:
Q  10 ataattctagtacgtagttcatgttagtttaacataacatataattttaaaagggaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaagaaa 109  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  34337 ataattctagtacgtagttcctgttactttaacataacatttaattttaaaagggaaactgaagttcgttgacatgcaaatagtttcaataagtaag-aa 34435  T
Q  110 aatgaatagtacataaaaaagtcttacacatt 141  Q
    ||||||||||||| |||||| || ||||||||    
T  34436 aatgaatagtacacaaaaaactcctacacatt 34467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University