View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF17610_high_1 (Length: 437)

Name: NF17610_high_1
Description: NF17610
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF17610_high_1
NF17610_high_1
[»] chr1 (33 HSPs)
chr1 (13-422)||(19798632-19799041)
chr1 (13-420)||(40166049-40166452)
chr1 (13-422)||(38620759-38621170)
chr1 (11-422)||(16035675-16036088)
chr1 (13-422)||(26927350-26927750)
chr1 (20-422)||(25843823-25844212)
chr1 (13-408)||(39587998-39588381)
chr1 (13-422)||(47450857-47451253)
chr1 (13-234)||(39200393-39200606)
chr1 (223-422)||(33301009-33301208)
chr1 (20-422)||(10140156-10140554)
chr1 (238-411)||(8138017-8138190)
chr1 (238-422)||(51041307-51041491)
chr1 (219-413)||(28434399-28434593)
chr1 (224-422)||(23192648-23192845)
chr1 (291-422)||(16649510-16649641)
chr1 (13-230)||(11806596-11806814)
chr1 (13-265)||(16649265-16649508)
chr1 (168-386)||(3094191-3094403)
chr1 (224-407)||(16833566-16833749)
chr1 (257-422)||(11806426-11806591)
chr1 (168-373)||(18784336-18784536)
chr1 (308-422)||(10135523-10135637)
chr1 (205-372)||(8267647-8267810)
chr1 (13-128)||(33300877-33300992)
chr1 (205-328)||(41097769-41097887)
chr1 (20-112)||(10135694-10135786)
chr1 (29-112)||(51041156-51041239)
chr1 (168-337)||(33055189-33055354)
chr1 (224-422)||(12260063-12260254)
chr1 (160-198)||(10135617-10135655)
chr1 (238-346)||(25779158-25779270)
chr1 (377-422)||(47455369-47455414)
[»] chr4 (60 HSPs)
chr4 (13-422)||(16421096-16421504)
chr4 (13-422)||(12823521-12823923)
chr4 (20-422)||(37264200-37264592)
chr4 (13-422)||(19102044-19102444)
chr4 (20-422)||(13059477-13059867)
chr4 (155-422)||(37259638-37259905)
chr4 (13-286)||(32081757-32082024)
chr4 (13-422)||(8693778-8694179)
chr4 (155-422)||(47244315-47244582)
chr4 (20-422)||(31273588-31273974)
chr4 (13-422)||(51697984-51698384)
chr4 (20-422)||(31269101-31269485)
chr4 (13-373)||(19106724-19107075)
chr4 (13-422)||(5927847-5928247)
chr4 (20-415)||(31729026-31729408)
chr4 (20-422)||(5271058-5271447)
chr4 (223-422)||(55251786-55251985)
chr4 (13-270)||(6942987-6943246)
chr4 (44-354)||(13065464-13065776)
chr4 (13-185)||(55251956-55252128)
chr4 (183-422)||(19540950-19541189)
chr4 (33-404)||(40408284-40408660)
chr4 (135-358)||(15134283-15134507)
chr4 (224-414)||(33463186-33463376)
chr4 (224-422)||(48276479-48276677)
chr4 (160-297)||(31766002-31766139)
chr4 (224-422)||(8030306-8030504)
chr4 (168-422)||(13521767-13522020)
chr4 (238-414)||(19906326-19906501)
chr4 (306-422)||(4551064-4551180)
chr4 (292-407)||(8649528-8649643)
chr4 (292-407)||(8661335-8661450)
chr4 (168-337)||(31298168-31298332)
chr4 (205-328)||(7902923-7903041)
chr4 (13-112)||(31766238-31766337)
chr4 (320-422)||(32082017-32082119)
chr4 (220-415)||(12878313-12878507)
chr4 (205-327)||(39319735-39319852)
chr4 (13-118)||(19540811-19540916)
chr4 (205-326)||(34560588-34560704)
chr4 (309-413)||(2819920-2820024)
chr4 (224-421)||(33468803-33469000)
chr4 (322-422)||(42758683-42758783)
chr4 (136-219)||(4551242-4551325)
chr4 (305-415)||(12874613-12874722)
chr4 (329-415)||(47574699-47574785)
chr4 (168-328)||(47574817-47574973)
chr4 (168-337)||(41816935-41817098)
chr4 (205-328)||(3997874-3997992)
chr4 (20-106)||(37259500-37259586)
chr4 (44-383)||(23093214-23093550)
chr4 (257-350)||(55810142-55810234)
chr4 (160-208)||(31766153-31766201)
chr4 (168-255)||(39217184-39217272)
chr4 (20-72)||(16948369-16948422)
chr4 (170-244)||(2820030-2820107)
chr4 (220-270)||(42316539-42316589)
chr4 (309-338)||(2575172-2575201)
chr4 (321-422)||(16948068-16948169)
chr4 (377-422)||(31765953-31765998)
[»] chr8 (43 HSPs)
chr8 (13-422)||(1910587-1910997)
chr8 (13-422)||(38181875-38182265)
chr8 (13-422)||(19166701-19167110)
chr8 (19-422)||(2965697-2966107)
chr8 (13-357)||(17020470-17020814)
chr8 (13-357)||(17550907-17551251)
chr8 (37-372)||(28564461-28564797)
chr8 (160-422)||(33416614-33416875)
chr8 (24-422)||(23548258-23548660)
chr8 (15-422)||(36683646-36684044)
chr8 (63-372)||(28572110-28572420)
chr8 (13-422)||(44925552-44925951)
chr8 (13-422)||(15951183-15951583)
chr8 (63-422)||(28559333-28559682)
chr8 (13-422)||(18876020-18876395)
chr8 (224-422)||(40125716-40125913)
chr8 (20-321)||(26779268-26779574)
chr8 (223-411)||(24090705-24090888)
chr8 (168-422)||(31449645-31449894)
chr8 (291-422)||(1807539-1807671)
chr8 (13-348)||(24672955-24673287)
chr8 (268-422)||(34118533-34118687)
chr8 (224-411)||(17026013-17026200)
chr8 (224-411)||(17556505-17556692)
chr8 (168-386)||(4238121-4238333)
chr8 (168-386)||(4242860-4243072)
chr8 (171-415)||(43302470-43302712)
chr8 (23-312)||(22714633-22714926)
chr8 (205-337)||(25367797-25367924)
chr8 (205-337)||(37771862-37771989)
chr8 (205-337)||(34818516-34818643)
chr8 (322-422)||(17953800-17953901)
chr8 (205-337)||(8331174-8331301)
chr8 (322-422)||(15875596-15875696)
chr8 (20-112)||(1807814-1807906)
chr8 (328-422)||(10933499-10933592)
chr8 (29-130)||(33416894-33416998)
chr8 (37-89)||(28559282-28559334)
chr8 (160-231)||(1807705-1807775)
chr8 (168-252)||(14035669-14035753)
chr8 (29-101)||(17793852-17793925)
chr8 (160-255)||(17793697-17793793)
chr8 (216-252)||(29220583-29220619)
[»] chr3 (45 HSPs)
chr3 (20-422)||(20520119-20520518)
chr3 (19-422)||(3419060-3419463)
chr3 (13-422)||(3656858-3657268)
chr3 (13-422)||(757997-758396)
chr3 (29-415)||(7570863-7571239)
chr3 (20-422)||(23661100-23661492)
chr3 (13-415)||(18467297-18467690)
chr3 (20-422)||(23665759-23666151)
chr3 (20-422)||(24038007-24038399)
chr3 (13-415)||(55325848-55326241)
chr3 (13-422)||(55431380-55431780)
chr3 (23-422)||(14438337-14438723)
chr3 (13-422)||(18472072-18472472)
chr3 (13-422)||(39775357-39775756)
chr3 (20-422)||(27709001-27709390)
chr3 (155-413)||(29350314-29350572)
chr3 (13-402)||(2207377-2207757)
chr3 (13-409)||(46964093-46964474)
chr3 (13-385)||(25726406-25726779)
chr3 (110-327)||(10708390-10708613)
chr3 (238-422)||(32474523-32474708)
chr3 (239-415)||(12971478-12971654)
chr3 (168-422)||(8069744-8069992)
chr3 (168-422)||(3672651-3672900)
chr3 (168-422)||(3692683-3692932)
chr3 (168-422)||(8883235-8883484)
chr3 (168-422)||(6596136-6596385)
chr3 (168-422)||(8887995-8888244)
chr3 (289-415)||(49971319-49971445)
chr3 (168-422)||(3033709-3033957)
chr3 (224-422)||(12965703-12965901)
chr3 (20-234)||(12112303-12112522)
chr3 (205-337)||(10586000-10586127)
chr3 (20-229)||(32473555-32473754)
chr3 (289-422)||(12112536-12112669)
chr3 (44-130)||(11399711-11399796)
chr3 (13-128)||(17025734-17025851)
chr3 (205-288)||(45904355-45904438)
chr3 (205-288)||(45904811-45904894)
chr3 (192-404)||(17025904-17026115)
chr3 (357-422)||(29715709-29715774)
chr3 (209-337)||(31002847-31002970)
chr3 (160-410)||(19276686-19276936)
chr3 (13-77)||(29350641-29350705)
chr3 (13-63)||(10708333-10708383)
[»] chr6 (42 HSPs)
chr6 (13-422)||(2699726-2700134)
chr6 (13-410)||(4156986-4157385)
chr6 (19-415)||(12405976-12406374)
chr6 (13-422)||(17964188-17964587)
chr6 (20-422)||(6407497-6407888)
chr6 (13-415)||(11559849-11560242)
chr6 (13-342)||(5856155-5856481)
chr6 (20-403)||(19995034-19995412)
chr6 (13-415)||(11534339-11534732)
chr6 (51-373)||(11428125-11428436)
chr6 (155-422)||(11570510-11570777)
chr6 (171-422)||(12689038-12689289)
chr6 (164-422)||(29892031-29892289)
chr6 (20-422)||(16835794-16836184)
chr6 (13-330)||(25314085-25314393)
chr6 (13-330)||(26201579-26201887)
chr6 (44-331)||(11613415-11613704)
chr6 (224-422)||(33687433-33687631)
chr6 (22-232)||(22694949-22695161)
chr6 (228-422)||(14509051-14509245)
chr6 (168-422)||(8747849-8748098)
chr6 (247-422)||(24589022-24589192)
chr6 (283-422)||(20748173-20748312)
chr6 (205-318)||(17913768-17913881)
chr6 (217-415)||(22609642-22609841)
chr6 (337-422)||(11614035-11614120)
chr6 (262-422)||(21309098-21309241)
chr6 (332-410)||(13736616-13736694)
chr6 (13-91)||(33687279-33687357)
chr6 (13-109)||(11570377-11570472)
chr6 (322-413)||(15991668-15991759)
chr6 (322-413)||(15999330-15999421)
chr6 (324-414)||(25316494-25316583)
chr6 (324-414)||(26203988-26204077)
chr6 (160-252)||(2863232-2863324)
chr6 (309-388)||(9751724-9751802)
chr6 (349-412)||(22695226-22695289)
chr6 (13-77)||(12689374-12689438)
chr6 (205-251)||(20748117-20748163)
chr6 (192-328)||(6112759-6112889)
chr6 (216-252)||(2882592-2882628)
chr6 (34-130)||(17599716-17599812)
[»] chr7 (37 HSPs)
chr7 (13-415)||(30258174-30258565)
chr7 (22-423)||(10387994-10388396)
chr7 (44-415)||(27238316-27238690)
chr7 (20-422)||(44422770-44423165)
chr7 (20-364)||(3045680-3046026)
chr7 (20-411)||(13313870-13314253)
chr7 (155-422)||(4930300-4930567)
chr7 (13-413)||(42626219-42626610)
chr7 (13-422)||(8268360-8268758)
chr7 (20-407)||(21671277-21671655)
chr7 (13-422)||(26341266-26341673)
chr7 (155-422)||(12799477-12799752)
chr7 (176-421)||(13142683-13142928)
chr7 (168-422)||(44510451-44510705)
chr7 (239-422)||(3357476-3357660)
chr7 (224-422)||(3880065-3880260)
chr7 (224-422)||(26286976-26287173)
chr7 (168-422)||(23866135-23866384)
chr7 (273-411)||(25543241-25543379)
chr7 (245-415)||(12254153-12254322)
chr7 (168-422)||(9650742-9650995)
chr7 (81-255)||(3356781-3356957)
chr7 (168-337)||(19640449-19640613)
chr7 (239-399)||(3284818-3284978)
chr7 (216-382)||(23318092-23318257)
chr7 (322-422)||(4579575-4579675)
chr7 (171-422)||(8076117-8076358)
chr7 (305-410)||(9008242-9008346)
chr7 (205-337)||(27256393-27256520)
chr7 (31-112)||(4930589-4930670)
chr7 (224-337)||(40865189-40865297)
chr7 (172-297)||(15642369-15642495)
chr7 (224-411)||(16372472-16372662)
chr7 (322-422)||(23246861-23246961)
chr7 (322-422)||(6590911-6591011)
chr7 (167-219)||(15642506-15642558)
chr7 (316-399)||(45748562-45748647)
[»] chr5 (45 HSPs)
chr5 (19-422)||(35679510-35679903)
chr5 (13-422)||(29167602-29168001)
chr5 (94-415)||(20180760-20181084)
chr5 (13-422)||(36423704-36424104)
chr5 (13-422)||(26667339-26667739)
chr5 (13-422)||(26938936-26939336)
chr5 (13-422)||(12103092-12103492)
chr5 (13-422)||(36428776-36429176)
chr5 (155-422)||(10759582-10759848)
chr5 (13-422)||(37248433-37248823)
chr5 (20-422)||(7451825-7452214)
chr5 (13-422)||(40147962-40148362)
chr5 (168-422)||(6155192-6155447)
chr5 (13-234)||(6513546-6513766)
chr5 (21-422)||(16115871-16116277)
chr5 (224-422)||(39523116-39523313)
chr5 (238-422)||(12501743-12501927)
chr5 (168-422)||(556762-557010)
chr5 (168-422)||(561534-561782)
chr5 (224-422)||(39518477-39518674)
chr5 (238-422)||(6514444-6514629)
chr5 (149-370)||(34707293-34707513)
chr5 (224-422)||(11981110-11981308)
chr5 (168-422)||(36937291-36937539)
chr5 (168-422)||(36942045-36942293)
chr5 (168-422)||(41996732-41996975)
chr5 (224-422)||(4871989-4872187)
chr5 (192-422)||(32461351-32461577)
chr5 (168-415)||(12044918-12045160)
chr5 (283-422)||(41587051-41587188)
chr5 (168-422)||(42001501-42001744)
chr5 (20-422)||(15414505-15414909)
chr5 (238-385)||(9726532-9726678)
chr5 (204-406)||(12102639-12102843)
chr5 (292-422)||(3665999-3666129)
chr5 (13-255)||(37549781-37550014)
chr5 (13-255)||(37652579-37652812)
chr5 (13-130)||(9726384-9726502)
chr5 (238-422)||(12041776-12041960)
chr5 (205-337)||(13301299-13301426)
chr5 (205-337)||(31731694-31731821)
chr5 (204-402)||(9911239-9911430)
chr5 (227-337)||(21323805-21323910)
chr5 (168-263)||(3666131-3666226)
chr5 (224-337)||(1429831-1429938)
[»] scaffold0054 (3 HSPs)
scaffold0054 (13-295)||(25637-25919)
scaffold0054 (13-422)||(29222-29638)
scaffold0054 (283-422)||(25466-25605)
[»] chr2 (35 HSPs)
chr2 (13-422)||(25496954-25497353)
chr2 (61-422)||(17544963-17545326)
chr2 (13-422)||(25477926-25478325)
chr2 (20-422)||(1934629-1935021)
chr2 (29-422)||(40847237-40847623)
chr2 (20-422)||(9180363-9180752)
chr2 (13-422)||(12796992-12797391)
chr2 (155-422)||(19892229-19892494)
chr2 (159-422)||(9189572-9189831)
chr2 (24-409)||(28603382-28603756)
chr2 (13-415)||(18344505-18344889)
chr2 (13-422)||(31326806-31327216)
chr2 (224-422)||(29677834-29678032)
chr2 (224-422)||(30650996-30651193)
chr2 (168-422)||(10160504-10160752)
chr2 (168-422)||(35601989-35602238)
chr2 (225-422)||(7737682-7737879)
chr2 (292-422)||(30658330-30658460)
chr2 (165-410)||(19578186-19578430)
chr2 (316-422)||(29677448-29677554)
chr2 (283-422)||(21523614-21523748)
chr2 (305-422)||(30631646-30631766)
chr2 (20-112)||(9185054-9185146)
chr2 (238-379)||(17453431-17453564)
chr2 (322-422)||(19094422-19094523)
chr2 (205-337)||(6297703-6297830)
chr2 (349-422)||(42926714-42926787)
chr2 (13-112)||(17968592-17968691)
chr2 (168-337)||(28855156-28855319)
chr2 (354-422)||(35638957-35639025)
chr2 (168-328)||(19538545-19538700)
chr2 (13-130)||(19892102-19892215)
chr2 (217-295)||(41558864-41558942)
chr2 (219-264)||(30643408-30643453)
chr2 (239-276)||(42926361-42926398)
[»] scaffold0352 (1 HSPs)
scaffold0352 (13-422)||(7171-7571)
[»] scaffold0002 (2 HSPs)
scaffold0002 (13-422)||(443574-443972)
scaffold0002 (224-422)||(4141-4338)
[»] scaffold0690 (1 HSPs)
scaffold0690 (20-369)||(5410-5755)
[»] scaffold0182 (1 HSPs)
scaffold0182 (168-422)||(9661-9915)
[»] scaffold0009 (2 HSPs)
scaffold0009 (21-304)||(148030-148316)
scaffold0009 (299-422)||(164928-165057)
[»] scaffold0240 (2 HSPs)
scaffold0240 (204-370)||(4092-4259)
scaffold0240 (383-423)||(4057-4097)
[»] scaffold0045 (1 HSPs)
scaffold0045 (192-422)||(83133-83355)
[»] scaffold2020 (1 HSPs)
scaffold2020 (299-422)||(438-567)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (305-422)||(165998-166114)
[»] scaffold0057 (1 HSPs)
scaffold0057 (337-422)||(35701-35786)
[»] scaffold0061 (1 HSPs)
scaffold0061 (205-337)||(45935-46062)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (205-337)||(152725-152852)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (323-422)||(255884-255983)
[»] scaffold0060 (2 HSPs)
scaffold0060 (205-337)||(52717-52844)
scaffold0060 (224-337)||(47693-47801)
[»] scaffold0128 (2 HSPs)
scaffold0128 (299-410)||(13351-13460)
scaffold0128 (44-104)||(13601-13661)
[»] scaffold1050 (1 HSPs)
scaffold1050 (319-415)||(1214-1309)
[»] scaffold0011 (1 HSPs)
scaffold0011 (168-364)||(146204-146404)
[»] scaffold0020 (1 HSPs)
scaffold0020 (250-337)||(1088-1170)
[»] scaffold0037 (1 HSPs)
scaffold0037 (178-256)||(42183-42262)


Alignment Details
Target: chr1 (Bit Score: 314; Significance: 1e-177; HSPs: 33)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 314; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 13 - 422
Target Start/End: Original strand, 19798632 - 19799041
Alignment:
Q  13 aatataagtcccttcggaataaagagtaccattaagatcatagtccctttttggaataataatgtcctgtcggaattaaagatgatcttaacggtatata 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  19798632 aatataagtcccttcggaataaagagtactatgaagatcatagtccctttttggaataataatgtcccgtcggaattaagaatgatcttaacggtatata 19798731  T
Q  113 aatattctttcaatatttaaattgaggagaaattaaaaagttgaaaaggtgatatcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatactttggagaa 212  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19798732 aatattctttcaatactttaattgaggagaaattaaaaagtggaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatactttggagaa 19798831  T
Q  213 attaaagttaaaatggtggtaaaatcatatttgagtggtctcagcaccataacagagtgataacaatactatattgaagtggttttagtattaaagagtg 312  Q
    |||||||||| ||||| ||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19798832 attaaagttagaatgggggtaacaccatatttgagttgtctcagcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtggttttagtattaaagagtg 19798931  T
Q  313 gtcttagtaccatatttgaaggtgtaaatctcgaacggttttctacagtgcaatagttaactgcacagttgtagttgtgcttgttttatcctggaggcgg 412  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  19798932 gtcttagtgccatatttgaaggtgtaaatctcgaacggttttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgtagctgggcttgttttatcctggaggcgg 19799031  T
Q  413 cgtcgttgat 422  Q
    ||| ||||||    
T  19799032 cgtggttgat 19799041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 13 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 40166452 - 40166049
Alignment:
Q  13 aatataagtcccttcggaataaagagtaccattaagatcatagtccctttttggaataataatgtcctgtcggaattaaagatgatcttaacggtatata 112  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| | ||| |||||||  ||||||||||| |||||||    
T  40166452 aatataagtcccttcggaataaa-agtactattaagatcatagtccctttt-gaaataataatgttccgtctgaattaagaatgatcttaacagtatata 40166355  T
Q  113 aatattctttcaatatttaaattgaggagaaattaaaaagttgaaaaggtgatatcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatactttggagaa 212  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40166354 aatattctttcaatattttaattgaggagaaattaaaaagtggaaa--gtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatactttggagaa 40166257  T
Q  213 attaaagttaaaatggtggtaaaatcatatttgagtggtctcagcaccataacagagtgataacaatactatattgaagtggttttagtattaaagagtg 312  Q
    |||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||||  ||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  40166256 attaaagttagaatggtggtaacaccatatttgagtggtctcaataccataagagagtggtaacaatatcatattaaagtggtttcagtattaaagagtg 40166157  T
Q  313 gtcttagtaccatatttgaaggtgtaaatctcgaacggttttctacagtgcaatagttaactgcacagttgtagttgtgcttgttttatcctggaggcgg 412  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||  | | |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  40166156 gtcttagtaccatattcgaatgtgtaaatttcgaacggttttctacagtgcagtagttaatcgtatagttgtagttgtgcttgttttatcctagaggcgg 40166057  T
Q  413 cgtcgttg 420  Q
    ||| ||||    
T  40166056 cgttgttg 40166049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 13 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 38621170 - 38620759
Alignment:
Q  13 aatataagtcccttcggaataaagagtaccattaagatcatagtccctttttggaataataatgtcctgtcggaattaaagatgatcttaacggtatata 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  38621170 aatataagtcccttcggaataaagattactattaagatcatagtccctttt-gaaataataatgtcccgtcggaattaagaatgatcttaacggtatata 38621072  T
Q  113 aatattctttcaatattta----aattgaggagaaattaaaaagttgaaaaggtgatatcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatactttgg 208  Q
    ||| ||||||||||||||     | ||||||| |||||||||||| |||| | || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  38621071 aat-ttctttcaatattttttctatttgaggataaattaaaaagtcgaaatgttgttattaccatatttgagtgatcgtagtgccatattgatattttgg 38620973  T
Q  209 agaaattaaagttaaaatggtggtaaaatcatatttgagtggtctcagcaccataacagagtgataacaatactatattgaagtggttttagtattaaag 308  Q
    |||||||||||||| |||||||  || | |||||||||||||||| | || |||||||||||| | || |||| ||||| ||||| ||| ||||||||||    
T  38620972 agaaattaaagttagaatggtgaaaacaccatatttgagtggtcttaacatcataacagagtggtgacgataccatattaaagtgatttcagtattaaag 38620873  T
Q  309 agtggtcttagtaccatatttgaaggtgtaaatctcgaacggttttctacagtgcaatagttaactgcacagttgtagttgtgcttgttttatcctggag 408  Q
    |||||||||| |||||||||| | |||||||||||| ||| |||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||  ||||||||||| |||||    
T  38620872 agtggtcttaataccatattttagggtgtaaatctcaaacagttttctacaatgcagtagttaaccgcacagttgtagttggacttgttttatcttggag 38620773  T
Q  409 gcggcgtcgttgat 422  Q
    ||||||| ||||||    
T  38620772 gcggcgtagttgat 38620759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 11 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 16036088 - 16035675
Alignment:
Q  11 agaatataagtcccttcggaataaagagtaccattaagatcatagtccctttttggaataataatgtcctgtcggaattaaagatgatcttaacggtata 110  Q
    ||||| || ||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||  || |||||||  ||||||||||  |||||    
T  16036088 agaatgtatgtcccttcgaaataaagagtacttttaagatcatagtctcttttcggaacaataatgtcccttccgaattaagaatgatcttaatagtata 16035989  T
Q  111 taaatattctttcaatattta---aattgaggagaaattaaaaagttgaaaaggtgatatcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatactttg 207  Q
    ||||||||||||||||||||    | |||||||||||| ||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  16035988 taaatattctttcaatatttttctatttgaggagaaataaaaaatttgaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttg 16035889  T
Q  208 gagaaattaaagttaaaatggtggtaaaatcatatttgagtggtctcagcaccataacagagtgataacaatactatattgaagtggttttagtattaa- 306  Q
    ||||| ||||||||| ||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||| ||||  ||||| ||||||     
T  16035888 gagaacttaaagttagaatggtgataacaccatatttgagtggtctcagcaccataatagagtggtaacaataccatattaaagtcattttaatattaac 16035789  T
Q  307 agagtggtcttagtaccatatttgaaggtgtaaatctcgaacggttttctacagtgcaatagttaactgcacagttgtagttgtgcttgttttatcctgg 406  Q
    | | ||||||| |||||||| ||| |||||| ||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||  |||| |||||| || ||||||||||||||||    
T  16035788 ataatggtcttggtaccata-ttggaggtgt-aatctcgaatggttttctaaagtgcagtagttaaccacacatttgtagatgagcttgttttatcctgg 16035691  T
Q  407 aggcggcgtcgttgat 422  Q
    ||||||||| ||||||    
T  16035690 aggcggcgtggttgat 16035675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 13 - 422
Target Start/End: Original strand, 26927350 - 26927750
Alignment:
Q  13 aatataagtcccttcggaataaagagtaccattaagatcatagtccctttttggaataataatgtcctgtcggaattaaagatgatcttaacggtatata 112  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||| ||||| | |||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  26927350 aatatatgtcccttcagaataaagagtatttttaagatcatagtccctatttggaataacaatgttccgtcggaattaagaatgatcttaacggtatata 26927449  T
Q  113 --aatattctttcaatattta---aattgaggagaaattaaaaagttgaaaaggtgatatcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatactttg 207  Q
      || | | |||||||||||    | ||||||||||||              |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  26927450 taaaaagtatttcaatatttttctatttgaggagaaat--------------ggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttg 26927535  T
Q  208 gagaaattaaagttaaaatggtggtaaaatcatatttgagtggtctcagcaccataacagagtgataacaatactatattgaagtggttttagtattaaa 307  Q
    ||||| ||||||||| ||||||  ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||    
T  26927536 gagaacttaaagttagaatggtattaacaccatatttgagtggtctcagcgccataacagagtggtaacaataccatattaaagtggtttcagtattaaa 26927635  T
Q  308 gagtggtcttagtaccatatttgaaggtgtaaatctcgaacggttttctacagtgcaatagttaactgcacagttgtagttgtgcttgttttatcctgga 407  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||| || |||||||||| || |||||||||||  | ||    
T  26927636 gagtggtcttagtaccatatttggaggtgtaattctcgaacgattttctacagtgcagtagttaagtgtacagttgtagctgggcttgttttattttaga 26927735  T
Q  408 ggcggcgtcgttgat 422  Q
    |||||||| ||||||    
T  26927736 ggcggcgtggttgat 26927750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 173; E-Value: 7e-93
Query Start/End: Original strand, 20 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 25844212 - 25843823
Alignment:
Q  20 gtcccttcggaataaagagtaccattaagatcatagtccctttttggaataataatgtcctgtcggaattaaagatgatcttaacggtatata--aatat 117  Q
    |||||||| | |||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||  ||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||  || |     
T  25844212 gtcccttcaggataaagagtacttttaagatcatagtccctatttggaatagcaatgtcccgtcggaattaagaatgatcttaacggtatatataaaaag 25844113  T
Q  118 tctttcaa-tatttaaattgaggagaaattaaaaagttgaaaaggtgatatcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatactttggagaaatta 216  Q
    | |||||| |||||   ||||||||||||              |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  25844112 tatttcaaatatttt--ttgaggagaaat--------------ggtggtatcaccatatttgaatggtcgtagtgccatattgatgttttggagaaatta 25844029  T
Q  217 aagttaaaatggtggtaaaatcatatttgagtggtctcagcaccataacagagtgataacaatactatattgaagtggttttagtattaaagagtggtct 316  Q
    |||||| |||||||  |  |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||| ||||| | ||||||| ||||||||||||||||||    
T  25844028 aagttagaatggtgacagcatcatatttgagtggtctcaacaccataagagagtggtaacaataccatattaaggtggtttcagtattaaagagtggtct 25843929  T
Q  317 tagtaccatatttgaaggtgtaaatctcgaacggttttctacagtgcaatagttaactgcacagttgtagttgtgcttgttttatcctggaggcggcgtc 416  Q
    ||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||     
T  25843928 tagtaccatatatgagggtgtaattctcgaacggttttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgtagctgggcttgttttatactggaggcggcgtg 25843829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 13 - 408
Target Start/End: Original strand, 39587998 - 39588381
Alignment:
Q  13 aatataagtcccttcggaataaagagtaccattaagatcatagtccctttttggaataataatgtcctgtcggaattaaagatgatcttaacggtatata 112  Q
    |||||| ||||| |||||||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||| | ||||||| |||| ||||||  ||| |||||||||||||||    
T  39587998 aatatatgtcccatcggaataaagaatacttttaagatcatagtccctatttggaatgacaatgtcccgtcgaaattaagaatggtcttaacggtatata 39588097  T
Q  113 aatattctttca-atattta-aattgaggagaaattaaaaagttgaaaaggtgatatcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatactttggag 210  Q
    |||||| ||| | || |||  ||||||||||||||              |||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  39588098 aatattattttatatttttctaattgaggagaaat--------------ggtggtgtcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggag 39588183  T
Q  211 aaattaaagttaaaatggtggtaaaatcatatttgagtggtctcagcaccataacagagtgataacaatactatattgaagtggttttagtattaaagag 310  Q
    || ||||||||| ||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||     
T  39588184 aacttaaagttagaatggtgttaacaccatatttgagtggtctcagcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtggttttagtattaaagat 39588283  T
Q  311 tggtcttagtaccatatttgaaggtgtaaatctcgaacggttttctacagtgcaatagttaactgcacagttgtagttgtgcttgttttatcctggag 408  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||  | ||| |||||| || ||||| ||||||||||||    
T  39588284 tggtctcagtaccatatttggaggtgtaattctcgaacggttttctacactgcagtagttaatcgaacaattgtagatgagcttgctttatcctggag 39588381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 13 - 422
Target Start/End: Original strand, 47450857 - 47451253
Alignment:
Q  13 aatataagtcccttcggaataaagagtaccattaagatcatagtccctttttggaataataatgtcctgtcggaattaaagatgatcttaacggtatata 112  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||  |||||||||| ||||||||    
T  47450857 aatatatgtcccttcggaataaagagtacttttaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcccgtcggaattaagaatgatcttaatggtatata 47450956  T
Q  113 aatattctttcaatattta--aattgaggagaaattaaaaagttgaaaaggtgatatcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatactttggag 210  Q
    |||||| ||| |   |||   |||||||||||||| |              || |||| ||||||||||||||| ||| |  |||||||||| |||||||    
T  47450957 aatattattttatagttttctaattgaggagaaatga--------------tggtatcgccatatttgagtggttgtaatatcatattgatagtttggag 47451042  T
Q  211 aaattaaagttaaaatggtggtaaaatcatatttgagtggtctcagcaccataacagagtgataacaatactatattgaagtggttttagtattaaagag 310  Q
    || ||||||||| ||||| | ||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||| |     
T  47451043 aacttaaagttagaatggagttaatatcatatttgagtggtctcagcgtcataacagagtggtaacaataccatattaaagtggtttcagtattaaa-aa 47451141  T
Q  311 tggtcttagtaccatatttgaaggtgtaaatctcgaacggttttctacagtgcaatagttaactgcacagttgtagttgtgcttgttttatcctggaggc 410  Q
      |  ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||| || |||||||  | ||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  47451142 aagaattagtaccatatttggaggtgtaattctcgaacggttttctgcagtacagtagttaatcgaacagttgtagttgagcttgttttatcttggaggc 47451241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 136; E-Value: 9e-71
Query Start/End: Original strand, 13 - 234
Target Start/End: Original strand, 39200393 - 39200606
Alignment:
Q  13 aatataagtcccttcggaataaagagtaccattaagatcatagtccctttttggaataataatgtcctgtcggaattaaagatgatcttaacggtatata 112  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||       |||||||| ||||||||    
T  39200393 aatataagtcccttcgaaataaagagtactattaagatcattgtccctttt-ggaataataatgtcccgtcggaat-------gatcttaaaggtatata 39200484  T
Q  113 aatattctttcaatatttaaattgaggagaaattaaaaagttgaaaaggtgatatcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatactttggagaa 212  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  39200485 aatattctttcaatactttaattgaggagaaattaaaaagtggaaacggtggtatcaccatatttgagtgatcgtaatgccatattgatactttggagaa 39200584  T
Q  213 attaaagttaaaatggtggtaa 234  Q
    |||||||||| |||||||||||    
T  39200585 attaaagttagaatggtggtaa 39200606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 223 - 422
Target Start/End: Original strand, 33301009 - 33301208
Alignment:
Q  223 aaatggtggtaaaatcatatttgagtggtctcagcaccataacagagtgataacaatactatattgaagtggttttagtattaaagagtggtcttagtac 322  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||  ||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  33301009 aaatggtggtaacaccatatttgagtggtctcaacaccataacagagtggtaacaatatcatattaaagtggtttaagtattaacgagtggtcttagtac 33301108  T
Q  323 catatttgaaggtgtaaatctcgaacggttttctacagtgcaatagttaactgcacagttgtagttgtgcttgttttatcctggaggcggcgtcgttgat 422  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  33301109 catatttgaaggtgtaattctcgaacagttttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgtagatgaaattgttttatcctggaggcggcgtggttgat 33301208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 20 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 10140554 - 10140156
Alignment:
Q  20 gtcccttcggaataaagagtaccattaagatcatagtccctttttggaataataatgtcctgtcggaattaaagatgatcttaacggtatataaatat-- 117  Q
    ||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||  ||||||||||| ||||||| |||       
T  10140554 gtcccttcataataaagagtacttttaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcccgtcggaattaagaatgatcttaacagtatatatataaaa 10140455  T
Q  118 --tctttcaatatttaaat---tgaggagaaattaaaaagttgaaaaggtgatatcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatactttggagaa 212  Q
      | |||||||||||   |   |||||||||||              |||| |||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||   |||||||||    
T  10140454 agtatttcaatatttttctatgtgaggagaaat--------------ggtggtatcacaatatttgaatggtcgtagtggcatattgaagttttggagaa 10140369  T
Q  213 attaaagttaaaatggtggtaaaatcatatttgagtggtctcagcaccataacagagtgataacaatactatattgaagtggttttagtattaaagagtg 312  Q
    |||||||||| |||||||| || | |||||||||||||||||| |||||||||| |||| | ||||||| ||    | ||||||| | ||||||||| ||    
T  10140368 attaaagttagaatggtggcaacaccatatttgagtggtctcaacaccataacaaagtggttacaataccat----aggtggtttcaatattaaagaatg 10140273  T
Q  313 gtcttagtaccatatttgaaggtgtaaatctcgaa-------cggttttctacagtgcaatagttaactgcacagttgtagttgtgcttgttttatcctg 405  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||       ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| || || ||||||||||||||     
T  10140272 gtcttagtaccatatttgagggtgtaattctcgaacggttttcggttttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgcagctgggcttgttttatccta 10140173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 238 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 8138190 - 8138017
Alignment:
Q  238 catatttgagtggtctcagcaccataacagagtgataacaatactatattgaagtggttttagtattaaagagtggtcttagtaccatatttgaaggtgt 337  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||| | ||  ||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  8138190 catatttgagtggtctcaacaccataatagagtggtaagagtatcatattaaagtggtttcagtattaaagggtggtcttagtaccatatttgagggtgt 8138091  T
Q  338 aaatctcgaacggttttctacagtgcaatagttaactgcacagttgtagttgtgcttgttttatcctggaggcg 411  Q
    || ||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  8138090 aattctcgaacggttttctacattgcagtagttaaccgcacagttgtagctgagcttgttttatcctggaggcg 8138017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 238 - 422
Target Start/End: Original strand, 51041307 - 51041491
Alignment:
Q  238 catatttgagtggtctcagcaccataacagagtgataacaatactatattgaagtggttttagtattaaagagtggtcttagtaccatatttgaaggtgt 337  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | ||||| ||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |    
T  51041307 catatttgagtggtctcaacaccataacagagtggtaacaattccatattaaagtggtttcaatattaaagagtgatcttagtaccatatttggaggtat 51041406  T
Q  338 aaatctcgaacggttttctacagtgcaatagttaactgcacagttgtagttgtgcttgttttatcctggaggcggcgtcgttgat 422  Q
    |  ||||||||| |||||||||||||| || ||||  | |||||||||| || |||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  51041407 agttctcgaacgattttctacagtgcagtaattaatcgaacagttgtagctgggcttgttttatcttggaggcggcgtggttgat 51041491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 219 - 413
Target Start/End: Original strand, 28434399 - 28434593
Alignment:
Q  219 gttaaaatggtggtaaaatcatatttgagtggtctcagcaccataacagagtgataacaatactatattgaagtggttttagtattaaa-gagtggtctt 317  Q
    |||| ||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||| || || ||||    
T  28434399 gttagaatggtggtaacaccatatttgagtggtctcaacaccataatagagtggtaacagtaccatattaaagtggtttcagtattaaaagaatgatctt 28434498  T
Q  318 agtaccatatttgaaggtgtaaatctcgaacggttttctacagtgcaatagttaactgcacagttgtagttgtgcttgttttatcctggaggcggc 413  Q
     |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||  | |||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||| ||||    
T  28434499 tgtaccatattgga-ggtgtaaatctcgaacggttttctatagtaaagtagttaactgcacaattgtagttgaacttgttttatcctggagacggc 28434593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 224 - 422
Target Start/End: Original strand, 23192648 - 23192845
Alignment:
Q  224 aatggtggtaaaatcatatttgagtggtctcagcaccataacagagtgataacaatactatattgaagtggttttagtatt-aaagagtggtcttagtac 322  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| |||||| ||||| ||  ||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||| ||||    
T  23192648 aatggtggtaacattatattcgagtggtctcaacaccataatagagtggtaacagtatcatattaaagtggtttcagtattaaaagaatggtcttggtac 23192747  T
Q  323 catatttgaaggtgtaaatctcgaacggttttctacagtgcaatagttaactgcacagttgtagttgtgcttgttttatcctggaggcggcgtcgttgat 422  Q
    |||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||  | ||| |||||| || ||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  23192748 cata-ttggaggtgtaattctcgaacggttttctacagtgcagtagttaatcgaacaattgtagctg-gcttgttttatcctggaggaggcgtggttgat 23192845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 291 - 422
Target Start/End: Original strand, 16649510 - 16649641
Alignment:
Q  291 gtggttttagtattaaagagtggtcttagtaccatatttgaaggtgtaaatctcgaacggttttctacagtgcaatagttaactgcacagttgtagttgt 390  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||| ||     
T  16649510 gtggtttcagtattaaagagtggtattagtaccatatttgagggtgtaattctcgaacagttttctacagtgcagtagttaaccacacagttgtagctgg 16649609  T
Q  391 gcttgttttatcctggaggcggcgtcgttgat 422  Q
     |||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  16649610 acttgttttatcccggaggcggcgtggttgat 16649641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 13 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 11806814 - 11806596
Alignment:
Q  13 aatataagtcccttcggaataaagagtaccattaagatcatagtccctttttggaataataatgtcctgtcggaattaaagatgatcttaacggtatata 112  Q
    |||||| | |||||||||||||||| |||  |||| ||||||  ||||||| |||| |||||||||| ||| ||| |||  || || ||| | |||||||    
T  11806814 aatatacgccccttcggaataaagaatact-ttaaaatcataaaccctttt-ggaacaataatgtcccgtcagaaataagaattattttagcagtatata 11806717  T
Q  113 aatattctttcaatattta---aattgaggagaaattaaaaagttgaaaaggtgatatcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatactttgga 209  Q
    ||||||||||||||||||    | |||| || |||||||||||| |||  |||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11806716 aatattctttcaatatttttctacttgaagaaaaattaaaaagtcgaattggtggtatcactgtatttgagtggtcgtagtgccatattgatattttgga 11806617  T
Q  210 gaaattaaagttaaaatggtg 230  Q
    ||| ||||||||| |||||||    
T  11806616 gaacttaaagttataatggtg 11806596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 13 - 265
Target Start/End: Original strand, 16649265 - 16649508
Alignment:
Q  13 aatataagtcccttcggaataaagagtaccattaagatcatagtccctttttggaataataatgtcctgtcggaattaaagatgatcttaacggtatata 112  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||   ||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| |||| ||||||  ||||| |||||||||||||    
T  16649265 aatatatgtcccttcagaataaagagtatttttaagatcatagtccttatttggaataacaatgtcccgtcgaaattaagaatgattttaacggtatata 16649364  T
Q  113 --aatattctttcaatattta---aattgaggagaaattaaaaagttgaaaaggtgatatcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatactttg 207  Q
      || | | |||||||||||    | ||||||||||||              |||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||    
T  16649365 taaaaagtatttcaatatttttccatttgaggagaaat--------------ggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtctcatattgatgttttg 16649450  T
Q  208 gagaaattaaagttaaaatggtggtaaaatcatatttgagtggtctcagcaccataac 265  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||| | |||||||||||||| ||| |||||||||    
T  16649451 gagaaattaaagttagaatcgtggtaacaccatatttgagtggtttcaacaccataac 16649508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 168 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 3094403 - 3094191
Alignment:
Q  168 caccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatactttggagaaattaaag-ttaaaatggtggtaaaatcatatttgagtggtctcagcaccataaca 266  Q
    ||||||||||||||||| | | |||| |||||||| ||||||||| |||||  ||| ||||||||||| | |||||||||||||||||| || |||||      
T  3094403 caccatatttgagtggttgaaatgcc-tattgata-tttggagaagttaaaaattagaatggtggtaacaccatatttgagtggtctcaacatcataatt 3094306  T
Q  267 gagtgataacaatactatattgaagtggttttagtattaaa-gagtggtcttagtaccatatttgaaggtgtaaatctcgaacggttttctacagtgcaa 365  Q
    ||||| | ||||||| ||||||     |||| ||||||||| || |||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  3094305 gagtggttacaataccatattg-----gtttcagtattaaaagattggtcttaataccatatt-gaaggtgtaattctcgaacggttttctacagtgcag 3094212  T
Q  366 tagttaactgcacagttgtag 386  Q
    |||||||  | ||||||||||    
T  3094211 tagttaatcgaacagttgtag 3094191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 224 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 16833749 - 16833566
Alignment:
Q  224 aatggtggtaaaatcatatttgagtggtctcagcaccataacagagtgataacaatactatattgaagtggttttagtatt-aaagagtggtcttagtac 322  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||| ||| ||||| || ||| || ||||||||| ||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||| ||||    
T  16833749 aatggtggtaacaccatatttgagtggtttcaacaccaaaatagaatggtaacaataccatattaaagtggtttcagtattaaaagaatggtcttggtac 16833650  T
Q  323 catatttgaaggtgtaaatctcgaacggttttctacagtgcaatagttaactgcacagttgtagttgtgcttgttttatcctgga 407  Q
    |||| ||| |||||||| | ||||||||||||||||| |||| |||||||  | |||||||||| || |  ||||||||||||||    
T  16833649 cata-ttggaggtgtaattttcgaacggttttctacaatgcagtagttaatcgaacagttgtagctgaggctgttttatcctgga 16833566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 257 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 11806591 - 11806426
Alignment:
Q  257 caccataacagagtgataacaatactatattgaagtggttttagtattaaagagtggtcttagtaccatatttgaaggtgtaaatctcgaacggttttct 356  Q
    |||||||| |||||| ||| ||||| ||||| |||| | || |||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  11806591 caccataaaagagtggtaataataccatattaaagttgcttaagtattaaagagtgatcttagtgccatatttgaaagtgtaaatctcaaacgattttct 11806492  T
Q  357 acagtgcaatagttaactgcacagttgtagttgtgcttgttttatcctggaggcggcgtcgttgat 422  Q
     || |||| || ||||| ||||| |||||||||  ||| |||||| ||| ||||||||| ||||||    
T  11806491 gcactgcagtatttaaccgcacaattgtagttgaacttcttttattctgaaggcggcgtggttgat 11806426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 168 - 373
Target Start/End: Original strand, 18784336 - 18784536
Alignment:
Q  168 caccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatactttggagaaattaaag-ttaaaatggtggtaaaatcatatttgagtggtctcagcaccataaca 266  Q
    ||||||||||||||||| | | | ||||||||||| |||| |||| |||||  ||| ||||||||||| | || |||||||||||||||  ||||||| |    
T  18784336 caccatatttgagtggttgaaataccatattgata-tttgaagaagttaaaaattagaatggtggtaacaccagatttgagtggtctcaataccataata 18784434  T
Q  267 gagtgataacaatactatattgaagtggttttagtattaaa-gagtggtcttagtaccatatttgaaggtgtaaatctcgaacggttttctacagtgcaa 365  Q
    |||||   ||| ||| |||||      |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  18784435 gagtggctacagtaccatattt-----gtttcagtattaaaagagtggtcttagtaccatatt-gaaggtgtaattctcgaacggttttctacagtgcag 18784528  T
Q  366 tagttaac 373  Q
    ||||||||    
T  18784529 tagttaac 18784536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 308 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 10135637 - 10135523
Alignment:
Q  308 gagtggtcttagtaccatatttgaaggtgtaaatctcgaacggttttctacagtgcaatagttaactgcacagttgtagttgtgcttgttttatcctgga 407  Q
    |||||||| |||| |||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |  || |||||||||||||| ||    
T  10135637 gagtggtcgtagtgccatatttgagggtgtaattcttgaacggttttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgcaactgggcttgttttatcctaga 10135538  T
Q  408 ggcggcgtcgttgat 422  Q
    |||||||| ||||||    
T  10135537 ggcggcgtggttgat 10135523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 205 - 372
Target Start/End: Original strand, 8267647 - 8267810
Alignment:
Q  205 ttggagaaattaaagttaaaatggtggtaaaatcatatttgagtggtctcagcaccataacagagtgataacaatactatattgaagtggttttagtatt 304  Q
    |||||||| ||||| ||| ||||||| ||| | |||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||| ||||     |||||| ||||||    
T  8267647 ttggagaagttaaaattagaatggtgataacaacatatttgagtggtctcaacaccataatagagtgatcacaataccatat-----tggtttcagtatt 8267741  T
Q  305 aaagagtggtcttagtaccatatttgaaggtg-taaatctcgaacggttttctacagtgcaatagttaa 372  Q
     ||||||||||||||||||||||| || |||| ||  ||||||||| || | |||||||||||| ||||    
T  8267742 taagagtggtcttagtaccatattagagggtgttatttctcgaacgattatttacagtgcaatacttaa 8267810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 13 - 128
Target Start/End: Original strand, 33300877 - 33300992
Alignment:
Q  13 aatataagtcccttcggaataaagagtaccattaagatcatagtccctttttggaataataatgtcctgtcggaattaaagatgatcttaacggtatata 112  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||| |||| ||||||| || ||||||| | ||||||    
T  33300877 aatatatgtcccttcggaataaagagtacttttaagatcatagtccctatttgaaataacaatgtcccgtcgaaattaaaaataatcttaaggttatata 33300976  T
Q  113 aatattctttcaatat 128  Q
    || ||| |||||||||    
T  33300977 aaaattatttcaatat 33300992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 205 - 328
Target Start/End: Original strand, 41097769 - 41097887
Alignment:
Q  205 ttggagaaattaaagttaaaatggtggtaaaatcatatttgagtggtctcagcaccataacagagtgataacaatactatattgaagtggttttagtatt 304  Q
    |||||||| ||||| ||| ||||||||||| | |||||||| ||||||||| |||||||| ||| || ||||||||| ||||     |||||| ||||||    
T  41097769 ttggagaagttaaaattagaatggtggtaataccatatttgcgtggtctcaacaccataatagaatggtaacaataccatat-----tggtttcagtatt 41097863  T
Q  305 aaagagtggtcttagtaccatatt 328  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  41097864 aaagagtggtcttagtaccatatt 41097887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 20 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 10135786 - 10135694
Alignment:
Q  20 gtcccttcggaataaagagtaccattaagatcatagtccctttttggaataataatgtcctgtcggaattaaagatgatcttaacggtatata 112  Q
    ||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||  ||||||||||| |||||||    
T  10135786 gtcccttcataataaagagtacttttaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcccgtcggaattaagaatgatcttaacagtatata 10135694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 29 - 112
Target Start/End: Original strand, 51041156 - 51041239
Alignment:
Q  29 gaataaagagtaccattaagatcatagtccctttttggaataataatgtcctgtcggaattaaagatgatcttaacggtatata 112  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||  ||||||||||  |||||||||||| ||||||    
T  51041156 gaataaagagtacttttaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcccatcggaattaagaatgatcttaacgatatata 51041239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 168 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 33055354 - 33055189
Alignment:
Q  168 caccatatttgagtggtcgta-gtgccatattgatactttggagaaattaaag-ttaaaatggtggtaaaatcatatttgagtggtctcagcaccataac 265  Q
    ||||||||||||||||| | | || | ||||||||| ||||||||| |||||  ||| ||||||| ||| | |||||||||||||||||| |||||||      
T  33055354 caccatatttgagtggttgaaagtacgatattgata-tttggagaagttaaaaattagaatggtgataacaccatatttgagtggtctcaacaccatagt 33055256  T
Q  266 agagtgataacaatactatattgaagtggttttagtattaaagagtggtcttagtaccatatttgaaggtgt 337  Q
    |||||| | ||||||| ||||     | ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||    
T  33055255 agagtggtcacaataccatat-----tagttttagtattaaagagtggcattagtaccatattagagggtgt 33055189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 224 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 12260254 - 12260063
Alignment:
Q  224 aatggtggtaaaatcatatttgagtggtctcagcaccataacagagtgataacaatactatattgaagtggttttagtattaaagagtggtcttagtacc 323  Q
    |||| |||||| | |||||||||||||||||||||| |||| |||||| | ||||||| |||||  | | |||| |||||| ||||||||||||||||      
T  12260254 aatgatggtaacaccatatttgagtggtctcagcacaataatagagtggtcacaataccatattataatagtttcagtatt-aagagtggtcttagta-- 12260158  T
Q  324 atatttgaaggtgtaaatctcgaacggttttctacagtgcaatagttaactgcacagttgtagttgtgcttgttttatcctggaggcggcgtcgttgat 422  Q
        ||| |||||||| | || ||  ||||||||   |||| |||||||| ||| |||||||  |||| ||||||||||||  || |||||| ||||||    
T  12260157 ----ttggaggtgtaattttcaaattgttttctattatgcagtagttaaccgcatagttgtacatgtgtttgttttatcctaaagacggcgtggttgat 12260063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 160 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 10135655 - 10135617
Alignment:
Q  160 ggtgatatcaccatatttgagtggtcgtagtgccatatt 198  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10135655 ggtggtatcgccatatttgagtggtcgtagtgccatatt 10135617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 238 - 346
Target Start/End: Original strand, 25779158 - 25779270
Alignment:
Q  238 catatttgagtggtctcagcaccataacagagtgataacaatactatattgaagtggttttagtattaaa---gagtggtcttagta-ccatatttgaag 333  Q
    |||||||||||| ||| |  ||||||| |||||| | | |||||||||||  |||||||| |||||||||   |||||||||||  | |||||||||| |    
T  25779158 catatttgagtgatcttaataccataatagagtggtcataatactatattatagtggtttcagtattaaatttgagtggtcttaaaagccatatttgagg 25779257  T
Q  334 gtgtaaatctcga 346  Q
    |||||| ||||||    
T  25779258 gtgtaattctcga 25779270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 377 - 422
Target Start/End: Original strand, 47455369 - 47455414
Alignment:
Q  377 acagttgtagttgtgcttgttttatcctggaggcggcgtcgttgat 422  Q
    |||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  47455369 acagttgtagctaggcttgttttatcctggaggcggcgtggttgat 47455414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 298; Significance: 1e-167; HSPs: 60)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 13 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 16421504 - 16421096
Alignment:
Q  13 aatataagtcccttcggaataaagagtaccattaagatcatagtccctttttggaataataatgtcctgtcggaattaaagatgatcttaacggtatata 112  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  16421504 aatataagtccctttggaataaagagtactattaagatcatagtccctttttggaataataatgtcccgtcggaattaagaatgatcttaacggtatata 16421405  T
Q  113 aatattctttcaatatttaaattgaggagaaattaaaaagttgaaaaggtgatatcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatactttggagaa 212  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| || |||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16421404 aatattctttcgatattttaattgaggagaaattaaaa-gtggaaatggtcgtatcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatactttggagaa 16421306  T
Q  213 attaaagttaaaatggtggtaaaatcatatttgagtggtctcagcaccataacagagtgataacaatactatattgaagtggttttagtattaaagagtg 312  Q
    |||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||||||||    
T  16421305 attaaagttagaatggtggtaacaccatatttgagtggtctcagcaccataacagagtgataacaatacaatattaaagtggtttcaatattaaagagtg 16421206  T
Q  313 gtcttagtaccatatttgaaggtgtaaatctcgaacggttttctacagtgcaatagttaactgcacagttgtagttgtgcttgttttatcctggaggcgg 412  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||    
T  16421205 gtcttagtaccatattcgaaggtgtaaatctcggacggttttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgtagctgggcttgttttatcctgtaggcgg 16421106  T
Q  413 cgtcgttgat 422  Q
    ||| ||||||    
T  16421105 cgtggttgat 16421096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 13 - 422
Target Start/End: Original strand, 12823521 - 12823923
Alignment:
Q  13 aatataagtcccttcggaataaagagtaccattaagatcatagtccctttttggaataataatgtcctgtcggaattaaagatgatcttaacggtatata 112  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| | |||||||||||  ||||||||||| |||||||    
T  12823521 aatataagtcctttcggaataaagagtattattaagatcatagaccctttt-ggaataataatgttccgtcggaattaagaatgatcttaacagtatata 12823619  T
Q  113 aatattctttcaatatttaaattgaggagaaattaaaaagttgaaaaggtgatatcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatactttggagaa 212  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  12823620 aatattctttcaatattttaattgatgagaaatttaaaagttgaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtgtcatattgatattttggagaa 12823719  T
Q  213 attaaagttaaaatggtggtaaaatcatatttgagtggtctcagcaccataacagagtgataacaatactatattgaagtggttttagtattaaagagtg 312  Q
    |||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||||||| ||||||||||||||    
T  12823720 attaaagttagaatggtggtaacaccatatttgagtggtctcagcaccataacagagtggtaacaataccattttaaagtggtttcagtattaaagagtg 12823819  T
Q  313 gtcttagtaccatatttgaaggtgtaaatctcgaacggttttctacagtgcaatagttaactgcacagttgtagttgtgcttgttttatcctggaggcgg 412  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||      ||| ||  |||||||||||||||||||||    
T  12823820 gtcttagtaccatattcgaaggtgtaaatctcgaacggttttctacagtgcagtagttagccgca------tagatggacttgttttatcctggaggcgg 12823913  T
Q  413 cgtcgttgat 422  Q
    ||| ||||||    
T  12823914 cgtggttgat 12823923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 20 - 422
Target Start/End: Original strand, 37264200 - 37264592
Alignment:
Q  20 gtcccttcggaataaagagtaccattaagatcatagtccctttttggaataataatgtcctgtcggaattaaagatgatcttaacggtatata--aatat 117  Q
    |||||||| ||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||| || ||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||  || |     
T  37264200 gtcccttcagaataaagaatacttttaagatcatagtccctatttggaagaacaatgtcccgtcggaattaagaatgatcttaacggtatatataaaaag 37264299  T
Q  118 tctttcaatattta--aattgaggagaaattaaaaagttgaaaaggtgatatcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatactttggagaaatt 215  Q
    | |||||||||||   | ||||||||||||              |||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| ||    
T  37264300 tatttcaatattttttatttgaggagaaat--------------ggtggtatcaccatatttgagtggttgtagtaccatattgatagtttggagaactt 37264385  T
Q  216 aaagttaaaatggtggtaaaatcatatttgagtggtctcagcaccataacagagtgataacaatactatattgaagtggttttagtattaaagagtggtc 315  Q
    ||||||| ||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  37264386 aaagttagaatggtgttaacaccatatttgagtggtctcagcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtggtttcagtattaaagagtggtc 37264485  T
Q  316 ttagtaccatatttgaaggtgtaaatctcgaacggttttctacagtgcaatagttaactgcacagttgtagttgtgcttgttttatcctggaggcggcgt 415  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  37264486 ttagtaccatatttgagggtgtaattctcgaacggttttctacagtgcagtagttaaccgcacaattgtagctgggcttgttttatcctggaggcggcgt 37264585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 13 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 19102444 - 19102044
Alignment:
Q  13 aatataagtcccttcggaataaagagtaccattaagatcatagtccctttttggaataataatgtcctgtcggaattaaagatgatcttaacggtatata 112  Q
    |||||| |||| |||| ||||||||||||  |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  19102444 aatatatgtccattcgaaataaagagtacttttaagatcattgtccctatttggaataacaatgtcctgtcgaaattaagaatgatcttaacggtatata 19102345  T
Q  113 --aatattctttcaatattta---aattgaggagaaattaaaaagttgaaaaggtgatatcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatactttg 207  Q
      || | | |||||||||||    | |||||||||||               |||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  ||||    
T  19102344 taaaaagtatttcaatatttttctatttgaggagaaac--------------ggtggtatcaccatatttgagtggtcgtatggccatattgatgttttg 19102259  T
Q  208 gagaaattaaagttaaaatggtggtaaaatcatatttgagtggtctcagcaccataacagagtgataacaatactatattgaagtggttttagtattaaa 307  Q
    ||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  19102258 gagaaattaaagttagaatggtggcaacatcatatttgagtggtctcaacaccataacagagtggtaacaataccatattaaaatggttttagtattaaa 19102159  T
Q  308 gagtggtcttagtaccatatttgaaggtgtaaatctcgaacggttttctacagtgcaatagttaactgcacagttgtagttgtgcttgttttatcctgga 407  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  19102158 gagtggtcttagtaccatatttgagggtgtaattctcgaacggttttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgtagttggacttgttttatcctgga 19102059  T
Q  408 ggcggcgtcgttgat 422  Q
    |||| ||| ||||||    
T  19102058 ggcgacgtggttgat 19102044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 20 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 13059867 - 13059477
Alignment:
Q  20 gtcccttcggaataaagagtaccattaagatcatagtccctttttggaataataatgtcctgtcggaattaaagatgatcttaacggtatataaatattc 119  Q
    ||||||| | ||||||||||||  ||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||     
T  13059867 gtccctttgaaataaagagtacttttaagatcatagtccctatttagaataacaatgtcccgtcggaattaagaatgatcttaacggtatataaaaatta 13059768  T
Q  120 tttcaatattta---aattgaggagaaattaaaaagttgaaaaggtgatatcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatactttggagaaatta 216  Q
    |||||||||||    | ||||||||||||              |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13059767 tttcaatatttttctatttgaggagaaat--------------ggtggtatcatcatatttgagtggtcgtagtgccatattgatactttggagaaatta 13059682  T
Q  217 aagttaaaatggtggtaaaatcatatttgagtggtctcagcaccataacagagtgataacaatactatattgaagtggttttagtattaaagagtggtct 316  Q
    |||||| |||||||  || | ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||||||||||||    
T  13059681 aagttagaatggtgacaacaccatatttgagtggtctcagcaccataatagagtggtaacaataccatattaaagtggtttcaatattaaagagtggtct 13059582  T
Q  317 tagtaccatatttgaaggtgtaaatctcgaacggttttctacagtgcaatagttaactgcacagttgtagttgtgcttgttttatcctggaggcggcgtc 416  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||||||||||| || ||||||||||| || ||||||| ||     
T  13059581 tagaaccatatttgaaggtgt-aatctcgaacggttttctacaatgcagtagttaaccacacagttgtagctgagcttgttttattctagaggcggagtg 13059483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 155 - 422
Target Start/End: Original strand, 37259638 - 37259905
Alignment:
Q  155 gaaaaggtgatatcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatactttggagaaattaaagttaaaatggtggtaaaatcatatttgagtggtctc 254  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  37259638 gaaatggtggtatcaccatatttgagtggttgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaagttagaatggtgttaacaccatatttgagtggtctc 37259737  T
Q  255 agcaccataacagagtgataacaatactatattgaagtggttttagtattaaagagtggtcttagtaccatatttgaaggtgtaaatctcgaacggtttt 354  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  37259738 agcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtggtttcagtattaaagagtggtcttagtaccatatttgagggtgtaattctcgaacggtttt 37259837  T
Q  355 ctacagtgcaatagttaactgcacagttgtagttgtgcttgttttatcctggaggcggcgtcgttgat 422  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  37259838 ctacagtgcagtagttaaccgcacagttgtagctgggcttgttttatcctggaggcggcgtggttgat 37259905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 13 - 286
Target Start/End: Original strand, 32081757 - 32082024
Alignment:
Q  13 aatataagtcccttcggaataaagagtaccattaagatcatagtccctttttggaataataatgtcctgtcggaattaaagatgatcttaacggtatata 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||     ||||||| |||||||    
T  32081757 aatataagtcccttcggaataaagagtactattaagatcatagtccctttt-ggaataataatgtcccgtcggaattaaa-----tcttaacagtatata 32081850  T
Q  113 aatattctttcaatatttaaattgaggagaaattaaaaagttgaaaaggtgatatcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatactttggagaa 212  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| | |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32081851 aatattcttccaatattttaattgaggagaaattaaaaaatggaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatactttggagaa 32081950  T
Q  213 attaaagttaaaatggtggtaaaatcatatttgagtggtctcagcaccataacagagtgataacaatactatat 286  Q
    |||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||| ||||    
T  32081951 attaaagttagaatggtggtaacaccatatttgagtggtctcagcaccataatagagcggtaacaataccatat 32082024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 13 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 8694179 - 8693778
Alignment:
Q  13 aatataagtcccttcggaataaagagtaccattaagatcatagtccctttttggaataataatgtcctgtcggaattaaagatgatcttaacggtatata 112  Q
    |||||| |||||||  |||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||  ||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  8694179 aatatatgtccctttagaataaagagtacttttaagatcatagtccctatttggaatagcaatgtcccgtcggaattaagaatgatcttaacggtatata 8694080  T
Q  113 --aatattctttcaatattta--aattgaggagaaattaaaaagttgaaaaggtgatatcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatactttgg 208  Q
      || | | |||||||||||   | ||||||||||||      ||       ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  8694079 taaaaagtatttcaatattttttatttgaggagaaatg-----gt-------gtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttgg 8693992  T
Q  209 agaaattaaagttaaaatggtggtaaaatcatatttgagtggtctcagcaccataacagagtgataacaatactatattgaagtggttttagtattaaag 308  Q
    |||| ||||||||| ||||||  ||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  8693991 agaacttaaagttagaatggtattaacaccatatttgagtggtctcagaaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtggtttcagtattaaag 8693892  T
Q  309 agtggtcttagtaccatatttgaaggtgtaaatctcgaacggttttctacagtgcaatagttaactgcacagttgtagttgtgcttgttttatcctggag 408  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||  | |||||||||| || |||||||||||||| |||    
T  8693891 agtggtcttagtaccatatttggaggtgtaattctcgaacgattttctacagtgcagtagttaatcgaacagttgtagctgagcttgttttatccttgag 8693792  T
Q  409 gcggcgtcgttgat 422  Q
    ||||||| ||||||    
T  8693791 gcggcgtggttgat 8693778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 155 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 47244582 - 47244315
Alignment:
Q  155 gaaaaggtgatatcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatactttggagaaattaaagttaaaatggtggtaaaatcatatttgagtggtctc 254  Q
    |||| |||| ||||||||||||| |||||||||| || |||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||| || | |||||||||||||||||    
T  47244582 gaaatggtggtatcaccatatttaagtggtcgtaatgtcatattgatgttttggagaaattaaagttagaatggtggcaacaccatatttgagtggtctc 47244483  T
Q  255 agcaccataacagagtgataacaatactatattgaagtggttttagtattaaagagtggtcttagtaccatatttgaaggtgtaaatctcgaacggtttt 354  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||    
T  47244482 aacaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtggtttcagtattaaagagtggtcttagtaccatatttgggggtttaattctcgaacggtttt 47244383  T
Q  355 ctacagtgcaatagttaactgcacagttgtagttgtgcttgttttatcctggaggcggcgtcgttgat 422  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  47244382 ctacagtgcagtagttaaccgcacagttgtagttgtgcttgttttatcctggaggcggcgtggttgat 47244315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 20 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 31273974 - 31273588
Alignment:
Q  20 gtcccttcggaataaagagtaccattaagatcatagtccctttttggaataataatgtcctgtcggaattaaagatgatcttaacggtatata--aatat 117  Q
    |||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| || ||||||| |||||||||||  |||||||||||| ||||||  || |     
T  31273974 gtcccttcagaataaagagtacttttaagatcatagtccctatttggaagaacaatgtcccgtcggaattaagaatgatcttaacgatatatataaaaag 31273875  T
Q  118 tctttcaatattta--aattgaggagaaattaaaaagttgaaaaggtgatatcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatactttggagaaatt 215  Q
    | |||||||||||   | ||||||||||||      ||       ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||    
T  31273874 tatttcaatattttttatttgaggagaaatg-----gt-------gtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaactt 31273787  T
Q  216 aaagttaaaatggtggtaaaatcatatttgagtggtctcagcaccataacagagtgataacaatactatattgaagtggttttagtattaaagagtggtc 315  Q
    ||||||| |||         | |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  31273786 aaagttagaatc--------accatatttgagtggtctcagcaccataacagagtggttacaataccatattaaagtggtttcagtattaaagagtggtc 31273695  T
Q  316 ttagtaccatatttgaaggtgtaaatctcgaacggttttctacagtgcaatagttaactgcacagttgtagttgtgcttgttttatcctggaggcggcgt 415  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  31273694 ttagtaccatatttgagggtgtaattctcgaacggttttctacagtgcagtagttaaccacacagttgtagctgggcttgttttatcctggaggcggcgt 31273595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 13 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 51698384 - 51697984
Alignment:
Q  13 aatataagtccc-ttcggaataaagagtaccattaagatcatagtccctttttggaataataatgtcctgtcggaattaaagatgatcttaacggtatat 111  Q
    |||||| ||||| ||| |||||| ||||||  |||||||| |||||||| |||||||||| ||||||| | |||||||||  ||||||||||||||||||    
T  51698384 aatatatgtcccattcagaataatgagtacttttaagatcgtagtccctatttggaataacaatgtcccgccggaattaagaatgatcttaacggtatat 51698285  T
Q  112 a--aatattctttcaatattta---aattgaggagaaattaaaaagttgaaaaggtgatatcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatacttt 206  Q
    |  || | | |||||||||||    | ||||||||||||              |||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  |||    
T  51698284 ataaaaagtatttcaatatttttctatttgaggagaaat--------------ggtggtatcaccatatttgagtgatcgtagtgtcatattgatgtttt 51698199  T
Q  207 ggagaaattaaagttaaaatggtggtaaaatcatatttgagtggtctcagcaccataacagagtgataacaatactatattgaagtggttttagtattaa 306  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||| | ||||||| ||||| |||| |||| | ||||||    
T  51698198 ggagaaattaaagttaggatggtggtaaaaccatatttgagtggtctcaacaccctaacagagtggtgacaataccatattaaagtagtttcaatattaa 51698099  T
Q  307 agagtggtcttagtaccatatttgaaggtgtaaatctcgaacggttttctacagtgcaatagttaactgcacagttgtagttgtgcttgttttatcctgg 406  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  51698098 agagtgatcttagtaccatatttgagggtgtaattctcgaacggttttctacagtgc-atagttaaccgcacaattgtagttgagcttgttttatcctgg 51698000  T
Q  407 aggcggcgtcgttgat 422  Q
    ||||||||| ||||||    
T  51697999 aggcggcgtggttgat 51697984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 20 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 31269485 - 31269101
Alignment:
Q  20 gtcccttcggaataaagagtaccattaagatcatagtccctttttggaataataatgtcctgtcggaattaaagatgatcttaacggtatata--aatat 117  Q
    |||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| || ||||||| |||||||||||  |||||||||||| ||||||  || |     
T  31269485 gtcccttcagaataaagagtacttttaagatcatagtccctatttggaagaacaatgtcccgtcggaattaagaatgatcttaacgatatatataaaaag 31269386  T
Q  118 tctttcaatattta--aattgaggagaaattaaaaagttgaaaaggtgatatcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatactttggagaaatt 215  Q
    | |||||||||||   | ||||||||||||              |||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||| ||    
T  31269385 tatttcaatattttttatttgaggagaaat--------------ggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtatcatattgatagtttggagaactt 31269300  T
Q  216 aaagttaaaatggtggtaaaatcatatttgagtggtctcagcaccataacagagtgataacaatactatattgaagtggttttagtattaaagagtggtc 315  Q
    ||||||| |||         | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  31269299 aaagttagaatc--------accatatttgagtggtctcagcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtggtttcagtattaaagagtggtc 31269208  T
Q  316 ttagtaccatatttgaaggtgtaaatctcgaacggttttctacagtgcaatagttaactgcacagttgtagttgtgcttgttttatcctggaggcggcgt 415  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||    
T  31269207 ttagtaccatatttgagggtgtaattctcgaacggttttctacagtgcagtagttaaccacacggttgtagctggacttgttttatcctggaggcggcgt 31269108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 13 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 19107075 - 19106724
Alignment:
Q  13 aatataagtcccttcggaataaagagtaccattaagatcatagtccctttttggaataataatgtcctgtcggaattaaagatgatcttaacggtatata 112  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| |||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19107075 aatatatgtctcttcggaataaagagtacttttaagatcatagcccctatttggaataacaatgtcccgtcggaattaaaaatgatcttaacggtatata 19106976  T
Q  113 --aatattctttcaatattta---aattgaggagaaattaaaaagttgaaaaggtgatatcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatactttg 207  Q
      || | | |||||||||||    | ||||||||||||              |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  19106975 taaaaaatatttcaatatttttctatttgaggagaaat--------------ggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatgttttg 19106890  T
Q  208 gagaaattaaagttaaaatggtggtaaaatcatatttgagtggtctcagcaccataacagagtgataacaatactatattgaagtggttttagtattaaa 307  Q
    ||||||||||||||| |||||||| || | |||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||| || ||||||  ||||||||    
T  19106889 gagaaattaaagttagaatggtggcaacaccatatttgagtgttctcaacaccataacagagtggtaacaataccatattaaaatggtttctgtattaaa 19106790  T
Q  308 gagtggtcttagtaccatatttgaaggtgtaaatctcgaacggttttctacagtgcaatagttaac 373  Q
    ||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19106789 gagtgatcttaataccatatttgagggtgtaattctcgaacggttttctacagtgcagtagttaac 19106724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 13 - 422
Target Start/End: Original strand, 5927847 - 5928247
Alignment:
Q  13 aatataagtcccttcggaataaagagtaccattaagatcatagtccctttttggaataataatgtcctgtcggaattaaagatgatcttaacggtatata 112  Q
    |||||| ||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  5927847 aatatatgtcccttcaaaataaagagtacttttaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcccgtcgaaattaagaatgatcttaacggtatata 5927946  T
Q  113 --aatattctttcaatattta---aattgaggagaaattaaaaagttgaaaaggtgatatcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatactttg 207  Q
      || | | |||||||||||    | ||||||||||||              |||| ||||||||||||||||||||||| || |||| |||||| ||||    
T  5927947 taaaaagtatttcaatatttttctatttgaggagaaat--------------ggtggtatcaccatatttgagtggtcgtggtaccattttgatagtttg 5928032  T
Q  208 gagaaattaaagttaaaatggtggtaaaatcatatttgagtggtctcagcaccataacagagtgataacaatactatattgaagtggttttagtattaaa 307  Q
     | || ||||| ||| || |||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||    
T  5928033 aaaaacttaaaattagaacggtgttaacaccatatttgagtggtctcagcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtggtttaagtattaaa 5928132  T
Q  308 gagtggtcttagtaccatatttgaaggtgtaaatctcgaacggttttctacagtgcaatagttaactgcacagttgtagttgtgcttgttttatcctgga 407  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| |||||||||||||| |||||||  | ||||||| || || |||||||||||||||||    
T  5928133 gagtggtcttagtaccatatttggaggtgtaattcttgaacgattttctacagtgcagtagttaatcgaacagttgcagctgggcttgttttatcctgga 5928232  T
Q  408 ggcggcgtcgttgat 422  Q
    ||||| || ||||||    
T  5928233 ggcggtgtggttgat 5928247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 20 - 415
Target Start/End: Original strand, 31729026 - 31729408
Alignment:
Q  20 gtcccttcggaataaagagtaccattaagatcatagtccctttttggaataataatgtcctgtcggaattaaagatgatcttaacggtatata--aatat 117  Q
    |||||||| ||||||| |||||  ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||  ||||||||| | |||||||  || |     
T  31729026 gtcccttcagaataaaaagtacttttaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcccgtcggaattaagaatgatcttatcagtatatataaaaag 31729125  T
Q  118 tctttcaatattta---aattgaggagaaattaaaaagttgaaaaggtgatatcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatactttggagaaat 214  Q
    | | |||||||||    | ||||||||||||              |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||    
T  31729126 tatatcaatatttttctatttgaggagaaat--------------ggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattgaagttttggagaaat 31729211  T
Q  215 taaagttaaaatggtggtaaaatcatatttgagtggtctcagcaccataacagagtgataacaatactatattgaagtggttttagtattaaagagtggt 314  Q
    |||||||| |||||| | || | |||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||| |||     ||||||| ||||||||||||||||    
T  31729212 taaagttagaatggttgcaacaccatatttgagtggtctcaacaccataacagagtggttacaataccatag----gtggtttcagtattaaagagtggt 31729307  T
Q  315 cttagtaccatatttgaaggtgtaaatctcgaacggttttctacagtgcaatagttaactgcacagttgtagttgtgcttgttttatcctggaggcggcg 414  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| || ||  |||||||||||||||||||||||    
T  31729308 cttagtaccatatttgagggtgtaattctcgaacggttttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgcagctggacttgttttatcctggaggcggcg 31729407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 20 - 422
Target Start/End: Original strand, 5271058 - 5271447
Alignment:
Q  20 gtcccttcggaataaagagtaccattaagatcatagtccctttttggaataataatgtcctgtcggaattaaagatgatcttaacggtatata--aatat 117  Q
    |||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||  ||||||||||| |||||||  || |     
T  5271058 gtcccttcagaataaagagtacttttaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcccgtcggaattaagaatgatcttaacagtatatataaaaag 5271157  T
Q  118 tctttcaatattta---aattgaggagaaattaaaaagttgaaaaggtgatatcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatactttggagaaat 214  Q
    | |||||||||||    | ||| ||||||||              |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||    
T  5271158 tatttcaatatttttctatttgtggagaaat--------------ggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattgaagttttggagaaat 5271243  T
Q  215 taaagttaaaatggtggtaaaatcatatttgagtggtctcagcaccataacagagtgataacaatactatattgaagtggttttagtattaaagagtggt 314  Q
    |||||||| |||||||| || | |||||||||||||||| | ||||||||||||||| | ||||||| |||     ||||||| ||||||||||||||||    
T  5271244 taaagttagaatggtggcaacaccatatttgagtggtctgaacaccataacagagtggttacaataccatag----gtggtttcagtattaaagagtggt 5271339  T
Q  315 cttagtaccatatttgaaggtgtaaatctcgaacggttttctacagtgcaatagttaactgcacagttgtagttgtgcttgttttatcctggaggcggcg 414  Q
    ||||| |||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  5271340 cttagcaccatatttggaggtgtaattctcgaacgattttctacagtgcaatagtgaatcaaacagttgtagttggacttgttttatcctggaggcggcg 5271439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 223 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 55251985 - 55251786
Alignment:
Q  223 aaatggtggtaaaatcatatttgagtggtctcagcaccataacagagtgataacaatactatattgaagtggttttagtattaaagagtggtcttagtac 322  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  55251985 aaatggtggtaacaccatatttgagtggtctcagcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtggtttcagtattaaagagtggtcttagtac 55251886  T
Q  323 catatttgaaggtgtaaatctcgaacggttttctacagtgcaatagttaactgcacagttgtagttgtgcttgttttatcctggaggcggcgtcgttgat 422  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  55251885 catattcaaaggtgtaaatctcgaacggttttctacagtgcagtagttaaccgtacagttgtagttgggcttgttttatcctggaggtggcgtggttgat 55251786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 13 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 6943246 - 6942987
Alignment:
Q  13 aatataagtcccttcggaataaagagtaccattaagatcatagtccctttttggaataataatgtcctgtcggaattaaagatgatcttaacggtatata 112  Q
    |||||| |||| ||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||| ||||||||    
T  6943246 aatatatgtccattcggaataaatagtatttttaagatcatagtccctttt-ggaataataatgtcgcgtcggaattaagaatgatcttaatggtatata 6943148  T
Q  113 aatattctttcaatattta---aattgaggagaaattaaaaagttgaaaaggtgatatcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatactttgga 209  Q
    ||||||||||||||||||    |||| || ||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||    
T  6943147 aatattctttcaatatttttctaattaagaagaaattaaaaagtcaaaatggtgatatcaccatatttgagtggttgtagtaccatattgatagttttga 6943048  T
Q  210 gaaattaaagttaaaatggtggtaaaatcatatttgagtggtctcagcaccataacagagt 270  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6943047 gaaattaaagttagaatggtggtaacaccatatttgagtagtctcagcaccataacagagt 6942987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 44 - 354
Target Start/End: Original strand, 13065464 - 13065776
Alignment:
Q  44 ttaagatcatagtccctttttggaataataatgtcctgtcggaattaaagatgatcttaacggtatataaatattctttcaatattta---aattgagga 140  Q
    ||||||||||||| |||||| |||| ||||| |||| |||| ||| ||  ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    | ||||| |    
T  13065464 ttaagatcatagtgcctttt-ggaacaataacgtcccgtcgaaatcaagaatgattttaacagtatataaatattctttcaatatttttctacttgagaa 13065562  T
Q  141 gaaattaaaaa-gttgaaaaggtgatatcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatactttggagaaattaaagttaaaatggtggtaaaatca 239  Q
    ||||||||||| || ||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||| | ||    
T  13065563 gaaattaaaaaagtcgaaattgtgttatcaccatatttgagtggtcgtagtgttatattgatattttg-agaacttaaagttagaatggtggtaacacca 13065661  T
Q  240 tatttgagtggtctcagcaccataacagagtgataacaatactatattgaagtggttttagtattaaagagtggtcttagtaccatatttgaaggtgtaa 339  Q
    ||||||||| || ||||||| |||||||| |||||||||||  ||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  13065662 tatttgagtagtatcagcactataacagactgataacaataacatattaaagtggtttcggtattaaagagtggttttagtaccatatttgagggtgtaa 13065761  T
Q  340 atctcgaacggtttt 354  Q
    |||||||| ||||||    
T  13065762 atctcgaatggtttt 13065776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 13 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 55252128 - 55251956
Alignment:
Q  13 aatataagtcccttcggaataaagagtaccattaagatcatagtccctttttggaataataatgtcctgtcggaattaaagatgatcttaacggtatata 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||| |||||||||||||    
T  55252128 aatataagtcccttcggaataaagaatactattaagatcatagtccctttttggaataataatgtcccgtcagaattaagaatgattttaacggtatata 55252029  T
Q  113 aatattctttcaatatttaaattgaggagaaattaaaaagttgaaaaggtgatatcaccatatttgagtggtc 185  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||| || ||||||||||||||||||    
T  55252028 aatattctttcgatattttaattgaggagaaattaaaaagtggaaatggtggtaacaccatatttgagtggtc 55251956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 183 - 422
Target Start/End: Original strand, 19540950 - 19541189
Alignment:
Q  183 gtcgtagtgccatattgatactttggagaaattaaagttaaaatggtggtaaaatcatatttgagtggtctcagcaccataacagagtgataacaatact 282  Q
    |||||| | ||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||| ||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||      
T  19540950 gtcgtaataccatattgatagtttggagaacttaaagttagaatagtgttaacaccatatttgagtggtctcaacaccatagcagagtggtaacaatatc 19541049  T
Q  283 atattgaagtggttttagtattaaagagtggtcttagtaccatatttgaaggtgtaaatctcgaacggttttctacagtgcaatagttaactgcacagtt 382  Q
    ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||  | || |||    
T  19541050 atattaaagtggtttcaatattaaagagtggtcttagtaccatatttggaggtgtaattctcgaacggttttctacaatgcagtagttaatcgaactgtt 19541149  T
Q  383 gtagttgtgcttgttttatcctggaggcggcgtcgttgat 422  Q
    |||| ||  |||||||||||||  ||||||||| ||||||    
T  19541150 gtagctggacttgttttatcctataggcggcgtggttgat 19541189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 33 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 40408660 - 40408284
Alignment:
Q  33 aaagagtaccattaagatcatagtccctttttggaataataatgtcctgtcggaattaaagatgatcttaacggtatataaatattctttcaatattta- 131  Q
    |||||||||  ||||||||||||| |||||  | || |||||||||   ||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||      
T  40408660 aaagagtacttttaagatcatagttcctttgag-aacaataatgtctcatcggaattaagaatgattttaacagtatataaatattctttcaatgttttt 40408562  T
Q  132 --aattgaggagaaattaaaaagttgaaaaggtgatatcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatactttggagaaattaaagttaaaatggt 229  Q
      | ||||| ||||||||||||||  ||| |||| ||||| | ||||||| |  || ||| | |||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||    
T  40408561 ctatttgagaagaaattaaaaagtcaaaatggtggtatcatcgtatttgaattatcatagggtcatattgatattttggagaacttaaagttagaatggt 40408462  T
Q  230 ggtaaaatcatatttgagtggtctcagcaccat-aacagagtgataacaatactatattgaagtggttttagtattaaagagtggtcttagtaccatatt 328  Q
    |||   | ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||| ||||| ||| | ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  40408461 ggtggcaccatatttgagtggtcccagcaccataaacagagtgctaacaataccatattaaagtgatttcaatattaaaaagtggtcttagtaccatatt 40408362  T
Q  329 tgaaggtgtaaatct--cgaacggttttctacagtgcaatagttaactgcacagttgtagttgtgcttgttttatcct 404  Q
    | |   |||||||||   ||||||||||||||||| || || |||||  |||| |||||||||  |||||||||||||    
T  40408361 taagaatgtaaatcttgagaacggttttctacagtacagtaattaaccacacaattgtagttgaacttgttttatcct 40408284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 135 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 15134507 - 15134283
Alignment:
Q  135 tgaggagaaattaaaaagttgaaaaggtgatatcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatactttggagaaattaaa-gttaaaatggtggta 233  Q
    |||| |||||||| |||| | ||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||| ||||| |||| ||||||||||    
T  15134507 tgagaagaaattataaagataaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcctagtggcatattgatattttggagaacttaaatgttagaatggtggta 15134408  T
Q  234 aaatcatatttgagtggtctcagcaccataacagagtgataacaatactatattgaagtggttttagtattaaagagtggtcttagtaccatatttgaag 333  Q
    | | |||||||||||||||| | |||||||| |||||  | ||||||| |||||  |||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||| | |    
T  15134407 acaccatatttgagtggtcttaacaccataatagagtagtcacaatacgatattagagtggttttagtattaaagaatagccttagtaccatatttaagg 15134308  T
Q  334 gtgtaaatctcgaacggttttctac 358  Q
    || |||||||||||| |||||||||    
T  15134307 gtataaatctcgaacagttttctac 15134283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 224 - 414
Target Start/End: Original strand, 33463186 - 33463376
Alignment:
Q  224 aatggtggtaaaatcatatttgagtggtctcagcaccataacagagtgataacaatactatattgaagtggttttagtattaaa-gagtggtcttagtac 322  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||| |||||  ||| | ||| ||||| ||||||||| ||||||||| || |||| || ||||    
T  33463186 aatggtggtaacaccatatttgagtggtctcaacaccataatagagttgtaatagtacaatattaaagtggtttcagtattaaaagaatggttttggtac 33463285  T
Q  323 catatttgaaggtgtaaatctcgaacggttttctacagtgcaatagttaactgcacagttgtagttgtgcttgttttatcctggaggcggcg 414  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33463286 catatt-gaaggtgtaattctcgaacggttttctacaatgcagtagttaatcgaacagttgtagttgtgcttgttttatcctggaggcggcg 33463376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 224 - 422
Target Start/End: Original strand, 48276479 - 48276677
Alignment:
Q  224 aatggtggtaaaatcatatttgagtggtctcagcaccataacagagtgataacaatactatattgaagtggttttagtattaaa-gagtggtcttagtac 322  Q
    ||||||||||| | |||||| ||||||||||| |||||||| |||||| ||||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||| || ||||||| ||||    
T  48276479 aatggtggtaacaccatattcgagtggtctcaacaccataatagagtggtaacagtaccatattaaagtggtttcagtattaaaagaatggtcttggtac 48276578  T
Q  323 catatttgaaggtgtaaatctcgaacggttttctacagtgcaatagttaactgcacagttgtagttgtgcttgttttatcctggaggcggcgtcgttgat 422  Q
    |||||| || ||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||  | |||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  48276579 catattgga-ggtgtaattctcgaatggttttctacagtgcagtagttaatcgaacagttgtagctgaacttgttttatcctggaggcggcgtggttgat 48276677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 160 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 31766139 - 31766002
Alignment:
Q  160 ggtgatatcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatactttggagaaattaaagttaaaatggtggtaaaatcatatttgagtggtctcagcac 259  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||  ||| | ||||||||||||||||||||||    
T  31766139 ggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaagttagaatggtattaacaccatatttgagtggtctcagcac 31766040  T
Q  260 cataacagagtgataacaatactatattgaagtggttt 297  Q
    ||||| |||||| ||||||||| ||||| |||||||||    
T  31766039 cataatagagtggtaacaataccatattaaagtggttt 31766002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 224 - 422
Target Start/End: Original strand, 8030306 - 8030504
Alignment:
Q  224 aatggtggtaaaatcatatttgagtggtctcagcaccataacagagtgataacaatactatattgaagtggttttagtatt-aaagagtggtcttagtac 322  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||| ||| ||||| || ||||||||||||| ||||| || |||| |||     
T  8030306 aatggtggtaacaccatatttgagtggtctcaacaccataatagagtggtaacagtaccatattaaaatggttttagtattaaaagaatgatcttggtat 8030405  T
Q  323 catatttgaaggtgtaaatctcgaacggttttctacagtgcaatagttaactgcacagttgtagttgtgcttgttttatcctggaggcggcgtcgttgat 422  Q
    |||| ||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||  | ||| |||||| || |||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  8030406 cata-ttggaggtgtaattttcgaacggttttctacagtgcagtagttaatcgaacatttgtagctgggcttgttttatcctggaggcagcgttgttgat 8030504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 168 - 422
Target Start/End: Original strand, 13521767 - 13522020
Alignment:
Q  168 caccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatactttggagaaattaaag--ttaaaatggtggtaaaatcatatttgagtggtctcagcaccataac 265  Q
    ||||||||||||||||| | | | ||||||||||| ||||||||| |||||   ||| ||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||     
T  13521767 caccatatttgagtggttgaaataccatattgata-tttggagaagttaaaaaattagaatggtggtaacaacatatttgagtggtctcaacaccataat 13521865  T
Q  266 agagtgataacaatactatattgaagtggttttagtattaaa-gagtggtcttagtaccatatttgaaggtgtaaatctcgaacggttttctacagtgca 364  Q
    |||||| | | | ||| ||||||     |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||  ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13521866 agagtggtcatagtaccatattg-----gtttcagtattaaaagagtggtcttagtaccatattaaaag-tgtaattctcgaacggttttctacagtgca 13521959  T
Q  365 atagttaactgcacagtt---gtagttgtgcttgttttatcctggaggcggcgtcgttgat 422  Q
     |||| ||| | ||||||   | || ||  |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13521960 gtagtcaaccgtacagttgcagcagctggacttgttttatcctggaggcggcgtggttgat 13522020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 238 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 19906501 - 19906326
Alignment:
Q  238 catatttgagtggtctcagcaccataacagagtgataacaatactatattgaagtggttttagtatt-aaagagtggtcttagtaccatatttgaaggtg 336  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||| |||||| ||||||||| |||||  |||||||| |||||| ||||| ||||||| |||||||| ||| |||||    
T  19906501 catatttgagtgatctcggcaccataatagagtggtaacaataccatattagagtggtttaagtattaaaagaatggtcttggtaccata-ttggaggtg 19906403  T
Q  337 taaatctcgaacggttttctacagtgcaatagttaactgcacagttgtagttgtgcttgttttatcctggaggcggcg 414  Q
    ||| | ||||||||||||||| || ||| |||||| |   ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19906402 taattttcgaacggttttctaaagcgcagtagttatc-aaacagttgtagttgagcttgttttatcctggaggcggcg 19906326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 306 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 4551180 - 4551064
Alignment:
Q  306 aagagtggtcttagtaccatatttgaaggtgtaaatctcgaacggttttctacagtgcaatagttaactgcacagttgtagttgtgcttgttttatcctg 405  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||  ||| ||||||| ||| | |||||||||||||    
T  4551180 aagaatggtcttagtaccatatttgatggtgtaaatcttaaacggttttctacagtgcagtagttaatcgcagagttgtaattgagtttgttttatcctg 4551081  T
Q  406 gaggcggcgtcgttgat 422  Q
    |||||||||| ||||||    
T  4551080 gaggcggcgtagttgat 4551064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 292 - 407
Target Start/End: Original strand, 8649528 - 8649643
Alignment:
Q  292 tggttttagtattaaa-gagtggtcttagtaccatatttgaaggtgtaaatctcgaacggttttctacagtgcaatagttaactgcacagttgtagttgt 390  Q
    |||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||      
T  8649528 tggtttcagtattaaaagagtggtgttagtaccatatt-gaaggtgtaattctcgaacagttttctacagtgtagtagttaaccgcacagttgtagttag 8649626  T
Q  391 gcttgttttatcctgga 407  Q
    |||||||||||||||||    
T  8649627 gcttgttttatcctgga 8649643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 292 - 407
Target Start/End: Original strand, 8661335 - 8661450
Alignment:
Q  292 tggttttagtattaaa-gagtggtcttagtaccatatttgaaggtgtaaatctcgaacggttttctacagtgcaatagttaactgcacagttgtagttgt 390  Q
    |||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||      
T  8661335 tggtttcagtattaaaagagtggtgttagtaccatatt-gaaggtgtaattctcgaacagttttctacagtgtagtagttaaccgcacagttgtagttag 8661433  T
Q  391 gcttgttttatcctgga 407  Q
    |||||||||||||||||    
T  8661434 gcttgttttatcctgga 8661450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 168 - 337
Target Start/End: Original strand, 31298168 - 31298332
Alignment:
Q  168 caccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatactttggagaaattaaag-ttaaaatggtggtaaaatcatatttgagtggtctcagcaccataaca 266  Q
    ||||||||||||||||| | ||| ||||||||||| ||||||||| |||||  ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||  |    
T  31298168 caccatatttgagtggttgaagtaccatattgata-tttggagaagttaaaaattagaatggtggtaaaaccatatttgagtggtctcaacaccatagta 31298266  T
Q  267 gagtgataacaatactatattgaagtggttttagtattaaagagtggtcttagtaccatatttgaaggtgt 337  Q
    ||||| | ||||||| ||||||     |||| | ||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||    
T  31298267 gagtggtcacaataccatattg-----gtttcaatattaaagagtggttatagtaccatatttgatggtgt 31298332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 205 - 328
Target Start/End: Original strand, 7902923 - 7903041
Alignment:
Q  205 ttggagaaattaaagttaaaatggtggtaaaatcatatttgagtggtctcagcaccataacagagtgataacaatactatattgaagtggttttagtatt 304  Q
    |||||||| ||||| ||| ||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||| ||| || ||||||||| ||||     |||||| ||||||    
T  7902923 ttggagaagttaaaattagaatggtggtaacaccatatttgagtggtctcaacaccataatagaatggtaacaataccatat-----tggtttcagtatt 7903017  T
Q  305 aaagagtggtcttagtaccatatt 328  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  7903018 aaagagtggtcttagtaccatatt 7903041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 13 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 31766337 - 31766238
Alignment:
Q  13 aatataagtcccttcggaataaagagtaccattaagatcatagtccctttttggaataataatgtcctgtcggaattaaagatgatcttaacggtatata 112  Q
    |||||| |||||||| ||||||| |||||  ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  31766337 aatatatgtcccttcagaataaaaagtacttttaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcccgtcggaattaagaatgatcttaacggtatata 31766238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 320 - 422
Target Start/End: Original strand, 32082017 - 32082119
Alignment:
Q  320 taccatatttgaaggtgtaaatctcgaacggttttctacagtgcaatagttaactgcacagttgtagttgtgcttgttttatcctggaggcggcgtcgtt 419  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| |||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  32082017 taccatatccgaaggtgtaaatctcgaatggttttctacactgcagtagttaaccgcacaattgtaactgagcttgttttatcctggaggcggcgtggtt 32082116  T
Q  420 gat 422  Q
    |||    
T  32082117 gat 32082119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 220 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 12878507 - 12878313
Alignment:
Q  220 ttaaaatggtggtaaaatcatatttgagtggtctcagcaccataacagagtgataacaatactatattgaagtggttttagtattaaa-gagtggtctta 318  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| | ||  ||| ||| |  ||| |||| |  |||||| |||||||||||    
T  12878507 ttaaaatggtggtaacaccatatttgagtgttctcaacaccataactgagtggtcaccgtaccatactagagtcgtttcaacattaaaagagtggtctta 12878408  T
Q  319 gtaccatatttgaaggtgtaaatctcgaacggttttctacagtgcaatagttaactgcacagttgtagttgtgcttgttttatcctggaggcggcgt 415  Q
    ||| |||||| || ||||||| |||||||||||||||||| ||||| || |||||  ||||||||||| ||  |||||||||| ||||||| |||||    
T  12878407 gtatcatattgga-ggtgtaattctcgaacggttttctac-gtgcagtaattaacaacacagttgtagctgaacttgttttattctggaggtggcgt 12878313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 205 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 39319852 - 39319735
Alignment:
Q  205 ttggagaaattaaagttaaaatggtggtaaaatcatatttgagtggtctcagcaccataacagagtgataacaatactatattgaagtggttttagtatt 304  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| ||| || | ||||||||||||     |||||| ||||||    
T  39319852 ttggagaagttaaaattaaaatggtggtaacaccatatttgagtgttctcagcaccataatagaatggtcacaatactatat-----tggtttcagtatt 39319758  T
Q  305 aaagagtggtcttagtaccatat 327  Q
     ||||||| ||||||||||||||    
T  39319757 gaagagtgatcttagtaccatat 39319735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 13 - 118
Target Start/End: Original strand, 19540811 - 19540916
Alignment:
Q  13 aatataagtcccttcggaataaagagtaccattaagatcatagtccctttttggaataataatgtcctgtcggaattaaagatgatcttaacggtatata 112  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||| ||||  | || ||| ||||  ||| |||||||||||||||    
T  19540811 aatatatgtcccttcggaataaagagtacttttaagatcatagtccctatttggaataacaatgctccgttggatttaagaatggtcttaacggtatata 19540910  T
Q  113 aatatt 118  Q
    ||||||    
T  19540911 aatatt 19540916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 205 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 34560704 - 34560588
Alignment:
Q  205 ttggagaaattaaagttaaaatggtggtaaaatcatatttgagtggtctcagcaccataacagagtgataacaatactatattgaagtggttttagtatt 304  Q
    |||||||| ||||| ||| ||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||| ||| || ||||||||| ||||||     |||| | ||||    
T  34560704 ttggagaagttaaaattagaatggtggtaacaccatatttgagtggtctcaacaccataatagaatggtaacaataccatattg-----gtttcaatatt 34560610  T
Q  305 aaagagtggtcttagtaccata 326  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  34560609 aaagagtggtcttagtaccata 34560588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 309 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 2820024 - 2819920
Alignment:
Q  309 agtggtcttagtaccatatttgaaggtgtaaatctcgaacggttttctacagtgcaatagttaactgcacagttgtagttgtgcttgttttatcctggag 408  Q
    ||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||| |||| |||||||| |   ||||||||||||||||     
T  2820024 agtggtcttagtgtcatatttgagggtgtaaatctcgaacgattttctatagtgcaacagttaattgcatagttgtagctaaacttgttttatcctggac 2819925  T
Q  409 gcggc 413  Q
    |||||    
T  2819924 gcggc 2819920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 224 - 421
Target Start/End: Original strand, 33468803 - 33469000
Alignment:
Q  224 aatggtggtaaaatcatatttgagtggtctcagcaccataacagagtgataacaatactatattgaagtggttttagtatt-aaagagtggtcttagtac 322  Q
    |||| |||||| | || ||||||||||||||| || ||||| |||||  ||| | ||| ||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||| ||||    
T  33468803 aatgatggtaacaccaaatttgagtggtctcaacatcataatagagttgtaatagtaccatattaaagtggtttcagtattaaaagaatggtcttggtac 33468902  T
Q  323 catatttgaaggtgtaaatctcgaacggttttctacagtgcaatagttaactgcacagttgtagttgtgcttgttttatcctggaggcggcgtcgttga 421  Q
    |||| ||| |||||||| |||| |||  | ||| |||||||| |||||||  | ||| |||||| || |||||||||||| |||||| ||||| |||||    
T  33468903 cata-ttggaggtgtaattctcaaaccttattcaacagtgcagtagttaatcgaacaattgtagctgagcttgttttatcatggaggtggcgtggttga 33469000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 322 - 422
Target Start/End: Original strand, 42758683 - 42758783
Alignment:
Q  322 ccatatttgaaggtgtaaatctcgaacggttttctacagtgcaatagttaactgcacagttgtagttgtgcttgttttatcctggaggcggcgtcgttga 421  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||  |||  || ||||||| ||||||||| ||| |||||    
T  42758683 ccatatttgagggtgtaattctcgaacggttttctacagtgcagtagttaatcgcacagttgtttttggactagttttattctggaggcgacgtggttga 42758782  T
Q  422 t 422  Q
    |    
T  42758783 t 42758783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 136 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 4551325 - 4551242
Alignment:
Q  136 gaggagaaattaaaaagttgaaaaggtgatatcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatactttggagaaattaaag 219  Q
    ||||||||||||||||||  ||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| || ||||||    
T  4551325 gaggagaaattaaaaagtcaaaatggtggtatcatcatatttgagtggtcgtagtgccacattgatattttggacaacttaaag 4551242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 305 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 12874722 - 12874613
Alignment:
Q  305 aaagagtggtcttagtaccatatttgaaggtgtaaatctcgaacggttttctacagtgcaatagttaactgcacagttgtagttgtgcttgttttatcct 404  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| |||| ||||| ||   ||||||||||||||||| | |||||||| ||||| || ||| || ||||||||||||||    
T  12874722 aaagggtggtcttactaccatattggaag-tgtaattcattaacggttttctacagtgtagtagttaaccgcacaattttagctgagcttgttttatcct 12874624  T
Q  405 ggaggcggcgt 415  Q
    |||||||||||    
T  12874623 ggaggcggcgt 12874613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 329 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 47574785 - 47574699
Alignment:
Q  329 tgaaggtgtaaatctcgaacggttttctacagtgcaatagttaactgcacagttgtagttgtgcttgttttatcctggaggcggcgt 415  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||  ||| |||||||| |||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||||    
T  47574785 tgaaggtgtaattctcgaacagttttctacatggcagtagttaaccgcacagttgtagctggacttgttttatcctggatgcggcgt 47574699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 168 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 47574973 - 47574817
Alignment:
Q  168 caccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatactttggagaaattaaag-ttaaaatggtggtaaaatcatatttgagtggtctcagcaccataaca 266  Q
    ||||||||||||||||| | | | ||||||||||| ||||||||| |||||  ||| ||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||| |    
T  47574973 caccatatttgagtggttgaaataccatattgata-tttggagaagttaaaaattagaatggtggtaacaccatatttgagtggtctcaacaccataata 47574875  T
Q  267 gagtgataacaatactatattgaagtggttttagtatt-aaagagtggtcttagtaccatatt 328  Q
    ||||| | | | ||| ||||     |||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  47574874 gagtggtcatagtaccatat-----tggtttcagtattaaaagagtggtcatagtaccatatt 47574817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 168 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 41817098 - 41816935
Alignment:
Q  168 caccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatactttggagaaattaaagttaaaatggtggtaaaatcatatttgagtggtctcagcaccataacag 267  Q
    ||||||||||||||||| | ||| |||||||||||| |||||||| |||||  |  |||| |||||| ||||||||| | |||||||| |||||||| ||    
T  41817098 caccatatttgagtggttgaagtaccatattgatac-ttggagaagttaaaaattgaatgatggtaacatcatattttaatggtctcaacaccataatag 41817000  T
Q  268 agtgataacaatactatattgaagtggttttagtattaaagagtggtcttagtaccatatttgaaggtgt 337  Q
    |||| ||| || || | ||     |||||| |  ||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  41816999 agtggtaataacaccacat-----tggtttcaacattaaagagtggtcttagtaccatattagagggtgt 41816935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 205 - 328
Target Start/End: Original strand, 3997874 - 3997992
Alignment:
Q  205 ttggagaaattaaagttaaaatggtggtaaaatcatatttgagtggtctcagcaccataacagagtgataacaatactatattgaagtggttttagtatt 304  Q
    |||||||| ||||| ||| ||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||| | | || || |||||| ||||     |||||| ||||||    
T  3997874 ttggagaagttaaaattagaatggtggtaacaccatatttgagtggtctcaacaccataataaaatggtagcaataccatat-----tggtttcagtatt 3997968  T
Q  305 aaagagtggtcttagtaccatatt 328  Q
    ||||| |||| |||||||||||||    
T  3997969 aaagaatggttttagtaccatatt 3997992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 20 - 106
Target Start/End: Original strand, 37259500 - 37259586
Alignment:
Q  20 gtcccttcggaataaagagtaccattaagatcatagtccctttttggaataataatgtcctgtcggaattaaagatgatcttaacgg 106  Q
    |||||||| ||||||||| ||   ||||||||||||||||| ||||||| || ||||||| |||||||||||  |||||||||||||    
T  37259500 gtcccttcagaataaagaatatttttaagatcatagtccctatttggaagaacaatgtcccgtcggaattaagaatgatcttaacgg 37259586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 44 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 23093550 - 23093214
Alignment:
Q  44 ttaagatcatagtccctttttggaataataatgtcctgtcggaattaaagatgatcttaacggtatataaatattctttcaatattt---aaattgagga 140  Q
    ||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||  || | ||||||  ||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||    | ||    |    
T  23093550 ttaagattatagttcctttttggagtaataatgtctcgttgaaattaagaatgattttaccagtatataaatattctttcaatatttttctacttttaaa 23093451  T
Q  141 gaaattaaaaagttgaaaaggtgatatcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatactttggagaaattaaa-gttaaaatggtggtaaaatca 239  Q
    ||| ||| |||||   || |||| ||||||||| ||| || ||||| |||| |||||||||| ||| ||||| ||||| |||| |||| || ||| |  |    
T  23093450 gaagttataaagtcagaatggtggtatcaccattttttagcggtcgcagtgtcatattgatattttagagaacttaaaggttagaatgatgataacacta 23093351  T
Q  240 tatttgagtggtctcagcaccataacagagtgataacaatactatattgaagtggttttagtattaaagagtggtcttagtaccatatttgaaggtgtaa 339  Q
    ||||   ||||||| |||||||||| |||||| | ||||||| ||||| |||| ||       ||||||||||||||||||| |||| | | | ||||||    
T  23093350 tattctggtggtcttagcaccataatagagtggttacaataccatattaaagtagt-------ttaaagagtggtcttagtatcata-tcggatgtgtaa 23093259  T
Q  340 atctcgaacggtttt-ctacagtgcaatagttaactgcacagttg 383  Q
    |||| ||| |||||| ||||  ||||||| |||||  ||||||||    
T  23093258 atcttgaatggttttcctactatgcaatatttaaccacacagttg 23093214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 257 - 350
Target Start/End: Original strand, 55810142 - 55810234
Alignment:
Q  257 caccataacagagtgataacaatactatattgaagtggttttagtattaaa-gagtggtcttagtaccatatttgaaggtgtaaatctcgaacgg 350  Q
    |||||||| || ||| |||||||||||| || || |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||    
T  55810142 caccataagagtgtggtaacaatactatcttaaa-tggtttcagtattaaaagagtggtcttagtaccata-ttgaacgtgtaattctcgaacgg 55810234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 160 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 31766201 - 31766153
Alignment:
Q  160 ggtgatatcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatactttgg 208  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  31766201 ggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttgg 31766153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 168 - 255
Target Start/End: Original strand, 39217184 - 39217272
Alignment:
Q  168 caccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatactttggagaaattaaagtt-aaaatggtggtaaaatcatatttgagtggtctca 255  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| || | |||| | | || | ||||||||||||||||||    
T  39217184 caccatatttgaatggtcgtagtaccatattgatattttggagaagttaaaattcagaatgatcgaaacaccatatttgagtggtctca 39217272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 20 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 16948422 - 16948369
Alignment:
Q  20 gtcccttcggaataaagagtaccattaagatcatagtcccttttt-ggaataat 72  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  16948422 gtcccttcggaataaagagtacatttaagatcatagtccttttttaggaataat 16948369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 170 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 2820107 - 2820030
Alignment:
Q  170 ccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatacttt--ggagaaattaaa-gttaaaatggtggtaaaatcatattt 244  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||| |||| |||  |||||| ||||| |||| ||||||||||| |||||||||    
T  2820107 ccatatttgagtggttgtagtaccatatagatattttgcggagaacttaaatgttagaatggtggtaagatcatattt 2820030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 220 - 270
Target Start/End: Original strand, 42316539 - 42316589
Alignment:
Q  220 ttaaaatggtggtaaaatcatatttgagtggtctcagcaccataacagagt 270  Q
    ||||||||||| ||| | |||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  42316539 ttaaaatggtgataataccatatttgagtggtatcagcaccataatagagt 42316589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 309 - 338
Target Start/End: Original strand, 2575172 - 2575201
Alignment:
Q  309 agtggtcttagtaccatatttgaaggtgta 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2575172 agtggtcttagtaccatatttgaaggtgta 2575201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 321 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 16948169 - 16948068
Alignment:
Q  321 accatatttgaaggtgtaaatctcgaacggttttctacagtgcaatagttaactgcacagttgtagttgtgcttgttttatcctggaggcggcgtcgttg 420  Q
    |||||||| || ||||||| ||| ||| | ||  |||||||| | |||||||  ||||||||||   ||  |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16948169 accatattcgagggtgtaattctagaatgattagctacagtgtagtagttaatcgcacagttgtcaatgaacttgttttatcctggaggcggcgtagttg 16948070  T
Q  421 at 422  Q
    ||    
T  16948069 at 16948068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 377 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 31765998 - 31765953
Alignment:
Q  377 acagttgtagttgtgcttgttttatcctggaggcggcgtcgttgat 422  Q
    |||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31765998 acagttgtagctggacttgttttatcctggaggcggcgtggttgat 31765953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 275; Significance: 1e-153; HSPs: 43)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 13 - 422
Target Start/End: Original strand, 1910587 - 1910997
Alignment:
Q  13 aatataagtcccttcggaataaagagtaccattaagatcatagtccctttttggaataataatgtcctgtcggaattaaagatgatcttaacggtatata 112  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||| ||||||||||||||    
T  1910587 aatataagtcccttcgaaataaagagtactattaagatcatagtcccttttttgaataataatgtcccgtcggaattaagaatgaccttaacggtatata 1910686  T
Q  113 aatattctttcaatatttaaattgaggagaaattaaaaagttgaaaaggtgata-tcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatactttggaga 211  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||| |||| |||| || | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1910687 aatattctttcaatattttaatcgaggagaaatttaaaagtggaaatggtggtaataaccatatttgagtggtcgtagtgtcatattgatactttggaga 1910786  T
Q  212 aattaaagttaaaatggtggtaaaatcatatttgagtggtctcagcaccataacagagtgataacaatactatattgaagtggttttagtattaaagagt 311  Q
    ||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  1910787 aattaaagtcagaatggtggtaacatcatatttgagtggtctcagcaccataacagagtggtaacagtaccatattaaagtggtttcagtattaaagagt 1910886  T
Q  312 ggtcttagtaccatatttgaaggtgtaaatctcgaacggttttctacagtgcaatagttaactgcacagttgtagttgtgcttgttttatcctggaggcg 411  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||     
T  1910887 ggtcttaataccatatttgaatgtgtaaatctcgaatggttttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgtagttgagcttgttttatactggaggca 1910986  T
Q  412 gcgtcgttgat 422  Q
    |||| ||||||    
T  1910987 gcgtggttgat 1910997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 13 - 422
Target Start/End: Original strand, 38181875 - 38182265
Alignment:
Q  13 aatataagtcccttcggaataaagagtaccattaagatcatagtccctttttggaataataatgtcctgtcggaattaaagatgatcttaacggtatata 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  38181875 aatataagtcccttcggaataaagagtaccattaagatcatagtccttttttggaataataatgtcccgtcggaattaaaaatgatcttaacggtatata 38181974  T
Q  113 aatattctttcaatatttaaattgaggagaaattaaaaagttgaaaaggtgatatcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatactttggagaa 212  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38181975 aatattctttcattatttaaattgaggagaaattaaaaagttgaaatggtgagatcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatactttggagaa 38182074  T
Q  213 attaaagttaaaatggtggtaaaatcatatttgagtggtctcagcaccataacagagtgataacaatactatattgaagtggttttagtattaaagagtg 312  Q
    |||||||||  ||| ||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||  ||||| ||||||||                    
T  38182075 attaaagtttgaatagtggtaacaccatatttgagtggtctcaacaccataacagagtggtaacaatatcatattaaagtggtt---------------- 38182158  T
Q  313 gtcttagtaccatatttgaaggtgtaaatctcgaacggttttctacagtgcaatagttaactgcacagttgtagttgtgcttgttttatcctggaggcgg 412  Q
       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  38182159 ---ttagtaccatatttgaaggtgtaaatctcgaacggttttttatagtgcagtagttaacagcacagttgtagctgtgcttgttttatcctggaggcgg 38182255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 13 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 19167110 - 19166701
Alignment:
Q  13 aatataagtcccttcggaataaagagtaccattaagatcatagtccctttttggaataataatgtcctgtcggaattaaagatgatcttaacggtatata 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||| |||  |||||||||||||||||||    
T  19167110 aatataagtcccttcggaataaagagtactattaagatcatagtccctttttgaaataataatgttctgccggaaataagaatgatcttaacggtatata 19167011  T
Q  113 aatattctttcaatatttaaattgaggagaaattaaaaagttgaaaaggtgatatcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatactttggagaa 212  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||  |||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    |||||||||    
T  19167010 aatattctttcaatactttaattgaggagaaattaaaaagaagaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtaatgccatattgtagttttggagaa 19166911  T
Q  213 attaaagttaaaatggtggtaaaatcatatttgagtggtctcagcaccataacagagtgataacaatactatattgaagtggttttagtattaaagagtg 312  Q
    |||||||||| ||||||||||| | ||||| |||||||||||| |||||||| |||||| |||| | || ||||| ||||| ||| ||| ||||||| ||    
T  19166910 attaaagttagaatggtggtaacaccatatatgagtggtctcaacaccataatagagtggtaaccacaccatattaaagtgatttaagttttaaagaatg 19166811  T
Q  313 gtcttagtaccatatttgaaggtgtaaatctcgaacggttttctacagtgcaatagttaactgcacagttgtagttgtgcttgttttatcctggaggcgg 412  Q
     |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19166810 atcttagtaccatatttgagggtgtaattctcgaacggttttctatagtgcagtagttaacagcacagttgtagttgagcttgttttatcctggaggcgg 19166711  T
Q  413 cgtcgttgat 422  Q
    ||| ||||||    
T  19166710 cgtggttgat 19166701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 19 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 2966107 - 2965697
Alignment:
Q  19 agtcccttcggaataaagagtaccattaagatcatagtccctttttggaataataatgtcctgtcggaattaaagatgatcttaacggtatataaatatt 118  Q
    ||||||||| ||||||| ||||   ||||||||||||||| |||||| || |||||||||| |||| ||||||  ||||| ||||| |||||||||||||    
T  2966107 agtcccttcagaataaaaagtatttttaagatcatagtccttttttgaaacaataatgtcccgtcgaaattaagaatgattttaacagtatataaatatt 2966008  T
Q  119 ctttcaatattta-------aattgaggagaaattaaaaagttgaaaaggtgatatcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatactttggaga 211  Q
    |||||||||||||       | |||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||  || ||||    
T  2966007 ctttcaatatttatttttctacttgaggagaaattaaaaagtcgaaatggtggtatcaccatatttgagtgggcgtagtaccatatcgatagattagaga 2965908  T
Q  212 aattaaagttaaaatggtggtaaaatcatatttgagtggtctcagcaccataacagagtgataacaatactatattgaagtggttttagtattaaagagt 311  Q
    | |||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  2965907 acttaacgttaaaatggtggtaacatcatatttgagtagtctcaacaccataacagagtggtaacaatactatattaaagtagttttagtattaaagagt 2965808  T
Q  312 ggtcttagtaccatatttgaaggtgtaaatctcgaacggttttctacagtgcaatagttaactgcacagttgtagttgtgcttgttttatcctggaggcg 411  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||  ||||||||||||| ||||||    
T  2965807 ggtcttagtaccatatttgagggtgtaaatctcaaatggttttctacagtgcagtagttaactgcatagttgtagctggacttgttttatcctagaggcg 2965708  T
Q  412 gcgtcgttgat 422  Q
    | || ||||||    
T  2965707 gtgtggttgat 2965697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 13 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 17020814 - 17020470
Alignment:
Q  13 aatataagtcccttcggaataaagagtaccattaagatcatagtccctttttggaataataatgtcctgtcggaattaaagatgatcttaacggtatata 112  Q
    |||||||| ||||||  |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | | | |||||||  |||||||||||||||||||    
T  17020814 aatataagccccttcaaaataaagagtactattaagatcattgtccctttttggaataataatgttccgccagaattaagaatgatcttaacggtatata 17020715  T
Q  113 aatattctttcaatatttaaattgaggagaaattaaaaagttgaaaaggtgatatcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatactttggagaa 212  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  17020714 aatattctttcgatattttaattgaggagaaattaaaaagtggaaatggtggtatcaccatatttaagtggtcatagtgccatattgatactttgaagaa 17020615  T
Q  213 attaaagttaaaatggtggtaaaatcatatttgagtggtctcagcaccataacagagtgataacaatactatattgaagtggttttagtattaaagagtg 312  Q
    |||||||||| ||||||||||| | ||| |||||||||||||||| |||||| ||| |  ||||||||  ||||  ||||||||| | ||||||||||||    
T  17020614 attaaagttagaatggtggtaacaccatgtttgagtggtctcagcgccataagagaattgtaacaatatcatatgaaagtggtttcaatattaaagagtg 17020515  T
Q  313 gtcttagtaccatatttgaaggtgtaaatctcgaacggttttcta 357  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  17020514 gtcttagtaccatattcgaatgtgtaaatctcaaacggttttcta 17020470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 13 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 17551251 - 17550907
Alignment:
Q  13 aatataagtcccttcggaataaagagtaccattaagatcatagtccctttttggaataataatgtcctgtcggaattaaagatgatcttaacggtatata 112  Q
    |||||||| ||||||  |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | | | |||||||  |||||||||||||||||||    
T  17551251 aatataagccccttcaaaataaagagtactattaagatcattgtccctttttggaataataatgttccgccagaattaagaatgatcttaacggtatata 17551152  T
Q  113 aatattctttcaatatttaaattgaggagaaattaaaaagttgaaaaggtgatatcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatactttggagaa 212  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  17551151 aatattctttcgatattttaattgaggagaaattaaaaagtggaaatggtggtatcaccatatttaagtggtcatagtgccatattgatactttgaagaa 17551052  T
Q  213 attaaagttaaaatggtggtaaaatcatatttgagtggtctcagcaccataacagagtgataacaatactatattgaagtggttttagtattaaagagtg 312  Q
    |||||||||| ||||||||||| | ||| |||||||||||||||| |||||| ||| |  ||||||||  ||||  ||||||||| | ||||||||||||    
T  17551051 attaaagttagaatggtggtaacaccatgtttgagtggtctcagcgccataagagaattgtaacaatatcatatgaaagtggtttcaatattaaagagtg 17550952  T
Q  313 gtcttagtaccatatttgaaggtgtaaatctcgaacggttttcta 357  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  17550951 gtcttagtaccatattcgaatgtgtaaatctcaaacggttttcta 17550907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 37 - 372
Target Start/End: Original strand, 28564461 - 28564797
Alignment:
Q  37 agtaccattaagatcatagtccctttttggaataataatgtcctgtcggaattaaagatgatcttaacggtatataaatattctttcaata---tttaaa 133  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||  ||||||||||  ||||||||| |||||||||| |   ||  ||    
T  28564461 agtactattaagatcatagttcctttttggaataataatgtcccgtcgaaattaagaatgatcttaaatgtatataaacattctttcaaaaaatttctaa 28564560  T
Q  134 ttgaggagaaattaaaaagttgaaaaggtgatatcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatactttggagaaattaaagttaaaatggtggta 233  Q
    |||||||||||||||||||| ||||  ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28564561 ttgaggagaaattaaaaagtggaaatagtggtatcagcatatttgagtggtcgtagtgccatattgatattttggagaa-ttaaagttaaaatggtggta 28564659  T
Q  234 aaatcatatttgagtggtctcagcaccataacagagtgataacaatactatattgaagtggttttagtattaaagagtggtcttagtaccatatttgaag 333  Q
    | | ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||| ||||||||| |  ||||||||||||||||| || |||| ||||||    
T  28564660 acaccatatttgagtggtctcagcaccataagagagtggtaacaataccatattaaagtggtttcaacattaaagagtggtcttactatcata-ttgaag 28564758  T
Q  334 gtgtaaatctcgaacggttttctacagtgcaatagttaa 372  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28564759 gtgtaattctcgaacggttttctacactgcaatagttaa 28564797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 160 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 33416875 - 33416614
Alignment:
Q  160 ggtgatatcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatactttggagaaattaaagttaaaatggtggtaaaatcatatttgagtggtctcagcac 259  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  33416875 ggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatgttttggagaaattaaagttagaatggtggtaacatcatatttgagtggtctcaacac 33416776  T
Q  260 cataacagagtgataacaatactatattgaagtggttttagtattaaagagtggtcttagtaccatatttgaaggtgtaaatctcgaacggttttctaca 359  Q
    ||||||||| |||||||||||  ||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  33416775 cataacagaatgataacaatatcatattaaagtggtttcagtattaaagagcggtcttagtaccgtatttgagggtgtaattctcgaacggttttctaca 33416676  T
Q  360 gtgcaatagttaactgcacagttgtagttgtgcttgttttatcctggaggcggcgtcgttgat 422  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  33416675 gtgc-atagttaaccgcacagttgtagctgggcttgttttatcttggaggcggcgtggttgat 33416614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 24 - 422
Target Start/End: Original strand, 23548258 - 23548660
Alignment:
Q  24 cttcggaataaagagtaccattaagatcatagtccctttttggaataataatgtcctgtcggaattaaagatgatcttaacggtatataaatattctttc 123  Q
    ||||| |||||||| |||  ||||||| |||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||  ||||||||||| || |||||||||||||||    
T  23548258 cttcgtaataaagaatacttttaagattatagtccctttt-ggaacaataatgtcttgtcggaattaagaatgatcttaacagtttataaatattctttc 23548356  T
Q  124 aatattta---aattgaggagaaattaaaaagttgaaaaggtgatatcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatactttggagaaattaaagt 220  Q
    |||| ||    | |||||||||||||||||||| |||| |||| ||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||| | ||||||| |||||||    
T  23548357 aatagttttctatttgaggagaaattaaaaagtcgaaatggtggtatcatcatatttgagtggtcatagtgcgatattgatattatggagaacttaaagt 23548456  T
Q  221 taaaatggtggtaaaatcatatttgagtggtctcagcaccataacagagtgataacaatactatattgaagtggttttagtat--taaagagtggtctta 318  Q
    |  ||||||||||| | |||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| ||| |||||  |||| ||||||||||    
T  23548457 tcgaatggtggtaacaccatatttgagtgatctcaacaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtgatttcagtattataaatagtggtctta 23548556  T
Q  319 gtaccatatttgaaggtgtaaatctcgaacggttttctacagtgcaatagttaactgcacagttgtagttgtgcttgttttatcctggaggcggcgtcgt 418  Q
    ||| ||||||| | |||| |||||| ||||||||||||||| |||| |||||||| || ||||||||| ||  ||||||||||||| |||||| ||| ||    
T  23548557 gtatcatatttaagggtgaaaatcttgaacggttttctacaatgcagtagttaaccgcgcagttgtagctgaacttgttttatcctagaggcgacgtggt 23548656  T
Q  419 tgat 422  Q
    ||||    
T  23548657 tgat 23548660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 15 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 36684044 - 36683646
Alignment:
Q  15 tataagtcccttcggaataaagagtaccattaagatcatagtccctttttggaataataatgtcctgtcggaattaaagatgatcttaacggtatata-- 112  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||  ||||||  |||||||||||||||||||      
T  36684044 tatatgtcccttcagaataaagagtacttttaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcccgtcataattaagaatgatcttaacggtatatata 36683945  T
Q  113 aatattctttcaatattta---aattgaggagaaattaaaaagttgaaaaggtgatatcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatactttgga 209  Q
    || | | |||||||||||    | ||||||||||||              |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  36683944 aaaagtatttcaatatttttctatttgaggagaaat--------------ggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatcttttgga 36683859  T
Q  210 gaaattaaagttaaaatggtggtaaaatcatatttgagtggtctcagcaccataacagagtgataacaatactatattgaagtggttttagtattaaaga 309  Q
    ||||||||||||| |||||||| || | |||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||||| ||||| ||| |||||||||||    
T  36683858 gaaattaaagttagaatggtggcaagaccatatttgagtggtctcaacaccataacatagtggtaacaataccatattaaagtgatttcagtattaaaga 36683759  T
Q  310 gtggtcttagtaccatatttgaaggtgtaaatctcgaacggttttctacagtgcaatagttaactgcacagttgtagttgtgcttgttttatcctggagg 409  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| |||||||||||||| |||||||  |||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||    
T  36683758 gtggtcttagtaccatatttgagggtgtaattctcaaacgattttctacagtgcagtagttaatcgcacagatgtagctgaccttgttttatcctggagg 36683659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 63 - 372
Target Start/End: Original strand, 28572110 - 28572420
Alignment:
Q  63 ttggaataataatgtcctgtcggaattaaagatgatcttaacggtatataaatattctttcaata---tttaaattgaggagaaattaaaaagttgaaaa 159  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||  ||||||||||  ||||||||| |||||||||| |   ||  |||||||||||||||||||||| ||||     
T  28572110 ttggaataataatgtcccgtcgaaattaagaatgatcttaaatgtatataaacattctttcaaaaaatttctaattgaggagaaattaaaaagtggaaat 28572209  T
Q  160 ggtgatatcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatactttggagaaattaaagttaaaatggtggtaaaatcatatttgagtggtctcagcac 259  Q
     ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  28572210 agtggtatcagcatatttgagtggtcgtagtgccatattgatattttggagaa-ttaaagttaaaatggtggtaacaccatatttgagtggtctcagcac 28572308  T
Q  260 cataacagagtgataacaatactatattgaagtggttttagtattaaagagtggtcttagtaccatatttgaaggtgtaaatctcgaacggttttctaca 359  Q
    ||||| |||||| ||||||||| ||||| ||||||||| |  ||||||||||||||||| || |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  28572309 cataagagagtggtaacaataccatattaaagtggtttcaacattaaagagtggtcttactatcata-ttgaaggtgtaattctcgaacggttttctaca 28572407  T
Q  360 gtgcaatagttaa 372  Q
     ||||||||||||    
T  28572408 ctgcaatagttaa 28572420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 13 - 422
Target Start/End: Original strand, 44925552 - 44925951
Alignment:
Q  13 aatataagtcccttcggaataaagagtaccattaagatcatagtccctttttggaataataatgtcctgtcggaattaaagatgatcttaacggtatata 112  Q
    |||||| |||||||| ||||||| |||||  ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||| ||||||| |||  ||||| ||||| |||||||    
T  44925552 aatatatgtcccttcagaataaatagtacttttaagatcatagtccctatttggattaacaatgtcccgtcggaaataagaatgattttaacagtatata 44925651  T
Q  113 --aatattctttcaatattta---aattgaggagaaattaaaaagttgaaaaggtgatatcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatactttg 207  Q
      || | | |||||||||||    | ||||||||||||              |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||    
T  44925652 taaaaagtatttcaatatttttctatttgaggagaaat--------------ggtggtatcaccatatttgaatggtcgtagtgccatattgatgttttg 44925737  T
Q  208 gagaaattaaagttaaaatggtggtaaaatcatatttgagtggtctcagcaccataacagagtgataacaatactatattgaagtggttttagtattaaa 307  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||| ||  ||||| ||||||||| |||||||||    
T  44925738 gagaaattaaagttagaatggtggtaaaaccatatttgagtggtctcgacaccataacagagtggtaacagtatcatattaaagtggtttcagtattaaa 44925837  T
Q  308 gagtggtcttagtaccatatttgaaggtgtaaatctcgaacggttttctacagtgcaatagttaactgcacagttgtagttgtgcttgttttatcctgga 407  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  44925838 gagtggttttagtaccatatttgagggtgtaattctcgaacggttttctacagtgc-atagttaaccgcatagttgtagatgaccttgttttatcctgga 44925936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 13 - 422
Target Start/End: Original strand, 15951183 - 15951583
Alignment:
Q  13 aatataagtcccttcggaataaagagtaccattaagatcatagtccctttttggaataataatgtcctgtcggaattaaagatgatcttaacggtatata 112  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||| ||||| | |||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  15951183 aatatatgtcccttcagaataaagagtacttttaagatcatagtccctatttggaataacaatgttccgtcggaattaagaatgatcttaacggtatata 15951282  T
Q  113 --aatattctttcaatatttaaattgaggagaaattaaaaagttgaaaaggtgatatcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatactttggag 210  Q
      || | | |||||||||||   |         ||| ||  |  ||||  ||| |||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||    
T  15951283 taaaaagtatttcaatatttttct---------atttaa--ggagaaacagtggtatcactatatttgagtggtcgtagtaccaaattgatagtttggag 15951371  T
Q  211 aaattaaagttaaaatggtggtaaaatcatatttgagtggtctcagcaccataacagagtgataacaatactatattgaagtggttttagtattaaagag 310  Q
    || ||||||||| ||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||    
T  15951372 aacttaaagttagaatggtgttaacaccatatttgagtggtctcagcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtgatttcagtattaaagag 15951471  T
Q  311 tggtcttagtaccatatttgaaggtgtaaatctcgaacggttttctac--agtgcaatagttaactgcacagttgtagttgtgcttgttttatcctggag 408  Q
    |||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||    
T  15951472 tggtcttagtaccata-tcgaacgtgtaaatctcgaacggttttctacagagtgcagtagttaactgcacagttgtagctgggcttgttttat-ctggag 15951569  T
Q  409 gcggcgtcgttgat 422  Q
    ||||||| ||||||    
T  15951570 gcggcgtggttgat 15951583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 63 - 422
Target Start/End: Original strand, 28559333 - 28559682
Alignment:
Q  63 ttggaataataatgtcctgtcggaattaaagatgatcttaacggtatataaatattctttcaatattta---aattgaggagaaattaaaaagttgaaaa 159  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||  ||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||    ||||||||||||||||||| || ||||     
T  28559333 ttggaataataatgtcccgtcgaaattaagaatgatcttaaatgtatataaacattctttcaatatttttctaattgaggagaaattaaaa-gtggaaat 28559431  T
Q  160 ggtgatatcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatactttggagaaattaaagttaaaatggtggtaaaatcatatttgagtggtctcagcac 259  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  28559432 ggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtgtcatattgatattttggagaa-ttaaagttagaatggtggtaacaccatatttgagtggtctcagcac 28559530  T
Q  260 cataacagagtgataacaatactatattgaagtggttttagtattaaagagtggtcttagtaccatatttgaaggtgtaaatctcgaacggttttctaca 359  Q
    ||||| |||||| ||||||||| ||||| |||||||||           |||||||||| |||| || |||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  28559531 cataagagagtggtaacaataccatattaaagtggttt----------cagtggtcttactaccgta-ttgaaggtgtaattctcgaacggttttttaca 28559619  T
Q  360 gtgcaatagttaactgcacagttgtagttgtgcttgttttatcctggaggcggcgtcgttgat 422  Q
    |||||||||||||  | |||||| ||  || |||| |||||||||| || |||||| ||||||    
T  28559620 gtgcaatagttaatcgaacagttctaactgggcttattttatcctgcagacggcgtggttgat 28559682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 13 - 422
Target Start/End: Original strand, 18876020 - 18876395
Alignment:
Q  13 aatataagtcccttcggaataaagagtaccattaagatcatagtccctttttggaataataatgtcctgtcggaattaaagatgatcttaacggtatata 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||| ||||||    
T  18876020 aatataagtcccttcggaataaagagtaatattaagatcatagtccctttt-ggaataataatgtcccgtcggaattaagaatgatcttaacgctatata 18876118  T
Q  113 aatattctttcaatattta---aattgaggagaaattaaaaagttgaaaaggtgatatcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatactttgga 209  Q
    |||||||||||||| |||    | ||||| |||||||              ||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||    
T  18876119 aatattctttcaatttttttctatttgagcagaaatt--------------gtggtatcgccatatttgagtggttgtagtgccatattgatgttttgga 18876204  T
Q  210 gaaattaaagttaaaatggtggtaaaatcatatttgagtggtctcagcaccataacagagtgataacaatactatattgaagtggttttagtattaaaga 309  Q
    ||||||||||||| |||||||| || | |||||||||||||||||| |||||                      |||| | ||||||| | |||||||||    
T  18876205 gaaattaaagttagaatggtggcaacaacatatttgagtggtctcaacacca----------------------tattaaggtggtttcaatattaaaga 18876282  T
Q  310 gtggtcttagtaccatatttgaaggtgtaaatctcgaacggttttctacagtgcaatagttaactgcacagttgtagttgtgcttgttttatcctggagg 409  Q
    ||||| |||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| || | |||||||||||||||||    
T  18876283 gtggtattagtatcatatttgagggtgtaattctcgaacggttttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgtagatgagtttgttttatcctggagg 18876382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 224 - 422
Target Start/End: Original strand, 40125716 - 40125913
Alignment:
Q  224 aatggtggtaaaatcatatttgagtggtctcagcaccataacagagtgataacaatactatattgaagtggttttagtattaaagagtggtcttagtacc 323  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||| | | ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  40125716 aatggtggtaacaccatatttgagtggtctcagcaccatat-agagtggtaacagtgccatattaaagtggtttcagtattaaagagtggtcttagtacc 40125814  T
Q  324 atatttgaaggtgtaaatctcgaacggttttctacagtgcaatagttaactgcacagttgtagttgtgcttgttttatcctggaggcggcgtcgttgat 422  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||| |||||||| ||||| |||||||  | |||||||||| || |||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  40125815 atatttggaggtgtaattctcgaacgattttctacggtgcagtagttaatcgaacagttgtagctgggcttgttttatcttggaggcggcgtggttgat 40125913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 20 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 26779574 - 26779268
Alignment:
Q  20 gtcccttcggaataaagagtaccattaagatcatagtccctttttggaataataatgtcctgtcggaattaaagatgatcttaacggtatataaatattc 119  Q
    ||||||||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||| |||| |||||||||  |||||||||||  ||||||||||  || |||||||||||    
T  26779574 gtcccttcgaaataaaaagtacttttaagatcatagtccctttt-ggaaaaataatgtctcgtcggaattaagaatgatcttaaaagtttataaatattc 26779476  T
Q  120 tttcaatattta---aattgaggagaaattaaaaagttgaaaaggtga--tatcaccatatttgagtggtc--gtagtgccatattgatactttgg-aga 211  Q
    |||||||||||    | ||||||| |||||||||| |  ||| ||||   |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| ||| | |||    
T  26779475 tttcaatatttttctatttgaggaaaaattaaaaaatcaaaatggtgtggtatcaccatatttgagtggtcccgtagtgccatattaatatttttgcaga 26779376  T
Q  212 aattaaagttaaaatggtggtaaaatcatatttgagtggtctcagcaccataacagagtgataacaatactatattgaagtggttttagtattaaagagt 311  Q
    | ||||||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||  ||||| || |||||| |||||||||| ||    
T  26779375 agttaaagttaaaatggtg-tagcaccatatttgagtggtctcagcaacataacagagtgatatcaatatcatatt-aaatggtttcagtattaaagggt 26779278  T
Q  312 ggtcttagta 321  Q
    | ||||||||    
T  26779277 gatcttagta 26779268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 223 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 24090888 - 24090705
Alignment:
Q  223 aaatggtggtaaaatcatatttgagtggtctcagcaccataacagagtgataacaatactatattgaagtggttttagtattaaagagtggtcttagtac 322  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  24090888 aaatggtggtatcaccatatttgagtggtctcagcaccataacagagtggtaacaatatcatattaaagtggtttcaatattaaagagtggtcttagtac 24090789  T
Q  323 catatttgaaggtgtaaatctcgaacggttttctacagtgcaatagttaactgcacagttgtagttgtgcttgttttatcctggaggcg 411  Q
     |||||||| | |||||||||||||||||||||||     ||||||||||| |||||||||||| |  |||||||||||| ||||||||    
T  24090788 aatatttgaggatgtaaatctcgaacggttttcta-----caatagttaaccgcacagttgtagataagcttgttttatcttggaggcg 24090705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 168 - 422
Target Start/End: Original strand, 31449645 - 31449894
Alignment:
Q  168 caccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatactttggagaaattaaag--ttaaaatggtggtaaaatcatatttgagtggtctcagcaccataac 265  Q
    ||||||||||||||||| | | |||| |||||||| ||||||||| |||||   ||| ||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||     
T  31449645 caccatatttgagtggttgaaatgcc-tattgata-tttggagaagttaaaaaattagaatggtggtaacaccatatttgagtggtctcaacaccataat 31449742  T
Q  266 agagtgataacaatactatattgaagtggttttagtattaaa-gagtggtcttagtaccatatttgaaggtgtaaatctcgaacggttttctacagtgca 364  Q
     ||||| | ||||||| ||||||     |||| ||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31449743 tgagtggttacaataccatattg-----gtttcagtattaaaagattggtcttagtaccatatt-gaaggtgtaattctcgaacggttttctacagtgca 31449836  T
Q  365 atagttaactgcacagttgtagttgtgcttgttttatcctggaggcggcgtcgttgat 422  Q
     |||||||| ||||||||| || ||  |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31449837 gtagttaaccgcacagttgcagctggacttgttttatcctggaggcggcgtggttgat 31449894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 291 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 1807671 - 1807539
Alignment:
Q  291 gtggttttagtattaaagagtggtcttagtaccatatttgaaggtgtaaatctcgaacggttttctacagtgcaatagttaactgcacagttgtagttgt 390  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||     
T  1807671 gtggtttcagtattaaagagtgatcttagtaccatatttgaaggtgtaaatctcgaacggttttctacagtgcactagttaaccgcacagttgtagctgg 1807572  T
Q  391 gcttg-ttttatcctggaggcggcgtcgttgat 422  Q
     |||| ||||||||| |||||||||| ||||||    
T  1807571 acttgtttttatcctagaggcggcgtggttgat 1807539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 13 - 348
Target Start/End: Original strand, 24672955 - 24673287
Alignment:
Q  13 aatataagtcccttcggaataaagagtaccattaagatcatagtccctttttggaataataatgtcctgtcggaattaaagatgatcttaacggtatata 112  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||   |||||| ||  |||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||  ||||| ||||   ||||||    
T  24672955 aatatatgtcccttcagaataaagagtatttttaagacca--gtcc-tttttggaatagtaatgtccagtcggaattaagaatgatgttaaatttatata 24673051  T
Q  113 aatattctttcaatatttaaa-ttgaggagaaattaaaaagttgaaaaggtgatatcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatactttggaga 211  Q
    ||||||||||||||||||  | ||  |||||| |||||||||   || |||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||| || |||| |||    
T  24673052 aatattctttcaatatttctacttttggagaagttaaaaagtcacaatggtggtatcaccatatttaagtggtcgtagtaccatattgttattttgaaga 24673151  T
Q  212 aattaaa-gttaaaatggtggtaaaatcatatttgagtggtctcagcaccataacagagtgataacaatactatattgaagtggttttagtattaaagag 310  Q
    | ||||| |||  ||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||  | |||||| | | | ||| |||||  |||||||| |  |||||| ||    
T  24673152 acttaaaggttggaatggtgataacatcatatttgagtggtcttagcaccactatagagtg-tcatagtaccatattagagtggtttcaacattaaaaag 24673250  T
Q  311 tggtcttagtaccatatttgaaggtgtaaatctcgaac 348  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||    
T  24673251 tggtcttagtaccata-ttggaggtgtaaatcttgaac 24673287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 268 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 34118687 - 34118533
Alignment:
Q  268 agtgataacaatactatattgaagtggttttagtattaaagagtggtcttagtaccatatttgaaggtgtaaatctcgaacggttttctacagtgcaata 367  Q
    |||| ||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||    
T  34118687 agtggtaacaataccatattaaagtggtttcattattaaagagtggccttagtaccatattcgaaggtgtaaatctcgaacagttttctacggtgcagta 34118588  T
Q  368 gttaactgcacagttgtagttgtgcttgttttatcctggaggcggcgtcgttgat 422  Q
    |||||| |||||||||||| || ||||||||||||||  ||||| ||| ||||||    
T  34118587 gttaacagcacagttgtagctgggcttgttttatcctaaaggcgacgtggttgat 34118533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 224 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 17026200 - 17026013
Alignment:
Q  224 aatggtggtaaaatcatatttgagtggtctcagcaccataacagagtgataacaatactatattgaagtggttttagtattaaa-gagtggtcttagtac 322  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | ||| ||||| ||||||||| | ||||||| || ||||||| ||||    
T  17026200 aatggtggtaacaccatatttgagtggtctcagcaccataatagagtggtaatagtaccatattaaagtggtttcaatattaaaagaatggtcttggtac 17026101  T
Q  323 catatttgaaggtgtaaatctcgaacggttttctacagtgcaatagttaactgcacagttgtagttgtgcttgttttatcctggaggcg 411  Q
    |||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||  | |||||||||| |   ||||||||||||||||||||    
T  17026100 catattgga-ggtgtaattctcgaacggttttctacagtgcagtagttaatcgaacagttgtagctagacttgttttatcctggaggcg 17026013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 224 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 17556692 - 17556505
Alignment:
Q  224 aatggtggtaaaatcatatttgagtggtctcagcaccataacagagtgataacaatactatattgaagtggttttagtattaaa-gagtggtcttagtac 322  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | ||| ||||| ||||||||| | ||||||| || ||||||| ||||    
T  17556692 aatggtggtaacaccatatttgagtggtctcagcaccataatagagtggtaatagtaccatattaaagtggtttcaatattaaaagaatggtcttggtac 17556593  T
Q  323 catatttgaaggtgtaaatctcgaacggttttctacagtgcaatagttaactgcacagttgtagttgtgcttgttttatcctggaggcg 411  Q
    |||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||  | |||||||||| |   ||||||||||||||||||||    
T  17556592 catattgga-ggtgtaattctcgaacggttttctacagtgcagtagttaatcgaacagttgtagctagacttgttttatcctggaggcg 17556505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 168 - 386
Target Start/End: Original strand, 4238121 - 4238333
Alignment:
Q  168 caccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatactttggagaaattaaag-ttaaaatggtggtaaaatcatatttgagtggtctcagcaccataaca 266  Q
    ||||||||||||||||| | | |||| |||||||| ||||||||| |||||  ||| ||||||||||| | |||||||||||||||||| || |||||      
T  4238121 caccatatttgagtggttgaaatgcc-tattgata-tttggagaagttaaaaattagaatggtggtaacaccatatttgagtggtctcaacatcataatt 4238218  T
Q  267 gagtgataacaatactatattgaagtggttttagtattaaa-gagtggtcttagtaccatatttgaaggtgtaaatctcgaacggttttctacagtgcaa 365  Q
    ||||| | ||||||| ||||||     |||| ||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  4238219 gagtggttacaataccatattg-----gtttcagtattaaaagattggtcttagtaccatatt-gaaggtgtaattctcgaacggttttctacagtgcag 4238312  T
Q  366 tagttaactgcacagttgtag 386  Q
    |||||||  | ||||||||||    
T  4238313 tagttaatcgaacagttgtag 4238333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 168 - 386
Target Start/End: Original strand, 4242860 - 4243072
Alignment:
Q  168 caccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatactttggagaaattaaag-ttaaaatggtggtaaaatcatatttgagtggtctcagcaccataaca 266  Q
    ||||||||||||||||| | | |||| |||||||| ||||||||| |||||  ||| ||||||||||| | |||||||||||||||||| || |||||      
T  4242860 caccatatttgagtggttgaaatgcc-tattgata-tttggagaagttaaaaattagaatggtggtaacaccatatttgagtggtctcaacatcataatt 4242957  T
Q  267 gagtgataacaatactatattgaagtggttttagtattaaa-gagtggtcttagtaccatatttgaaggtgtaaatctcgaacggttttctacagtgcaa 365  Q
    ||||| | ||||||| ||||||     |||| ||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  4242958 gagtggttacaataccatattg-----gtttcagtattaaaagattggtcttagtaccatatt-gaaggtgtaattctcgaacggttttctacagtgcag 4243051  T
Q  366 tagttaactgcacagttgtag 386  Q
    |||||||  | ||||||||||    
T  4243052 tagttaatcgaacagttgtag 4243072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 171 - 415
Target Start/End: Original strand, 43302470 - 43302712
Alignment:
Q  171 catatttgagtggtcgtagtgccatattgatactttggagaaattaaag-ttaaaatggtggtaaaatcatatttgagtggt---ctcagcaccataaca 266  Q
    |||||||||||||| | | | ||||||||||| ||||||||| |||||  ||| ||||||||||| | ||||||||||||||   |||| |||||||| |    
T  43302470 catatttgagtggttgaaataccatattgata-tttggagaagttaaaaattagaatggtggtaacaccatatttgagtggtggtctcaacaccataata 43302568  T
Q  267 gagtgataacaatactatattgaagtggttttagtattaaa-gagtggtcttagtaccatatttgaaggtgtaaatctcgaacggttttctacagtgcaa 365  Q
    ||||| | | | ||| ||||||     |||| | ||||||| |||| |||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||     
T  43302569 gagtggtcatagtaccatattg-----gtttcaatattaaaagagtagtcttagtaccacatt-gaaggtgtaattctcgaacgattttctacagtgcag 43302662  T
Q  366 tagttaactgcacagttgtagttgtgcttgttttatcctggaggcggcgt 415  Q
    |||||||| |||||| || || || |||||||||||||||||||||||||    
T  43302663 tagttaaccgcacaggtgcagctgggcttgttttatcctggaggcggcgt 43302712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 23 - 312
Target Start/End: Original strand, 22714633 - 22714926
Alignment:
Q  23 ccttcggaataaagagtaccattaagatcatagtccctttttggaataataatgtcctgtcggaattaaagatgatcttaacggtatataaatattcttt 122  Q
    ||||||| |||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||  ||| ||||||  |||||||||     |||||||||||||||    
T  22714633 ccttcgggataaagagtacttttaagatcatactccctttttggaataataatatcccatcgaaattaagaatgatcttattaacatataaatattcttt 22714732  T
Q  123 caatattt---aaattgaggagaaattaaaaagttgaaaaggtgatatcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatactttggagaaattaaa- 218  Q
    | ||||||    | ||  |||||| |||||||||   || | |  ||||| |||||||||||| ||||| | |||||||||||  ||| |||| |||||     
T  22714733 cgatatttttctacttttggagaagttaaaaagtcataatgatagtatcatcatatttgagtgatcgtaataccatattgatatattgaagaagttaaat 22714832  T
Q  219 gttaaaatggtggtaaaatcatatttgagtggtctcagcaccataacagagtgataacaatactatattgaagtggttttagtattaaagagtg 312  Q
    |||| ||||||  ||| ||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||| | | ||  |||||  |||| ||| ||||||||||||||    
T  22714833 gttagaatggtcataacatcatatttgaatgatcttagcaccataaaagagtgatcaaagtatcatattagagtgatttcagtattaaagagtg 22714926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 205 - 337
Target Start/End: Original strand, 25367797 - 25367924
Alignment:
Q  205 ttggagaaattaaagttaaaatggtggtaaaatcatatttgagtggtctcagcaccataacagagtgataacaatactatattgaagtggttttagtatt 304  Q
    |||||||| ||||| ||| ||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||| ||| || ||||||||| |||||||     ||| ||||||    
T  25367797 ttggagaagttaaaattagaatggtggtaacaccatatttgagtggtctcaacaccataatagaatggtaacaataccatattga-----tttcagtatt 25367891  T
Q  305 aaagagtggtcttagtaccatatttgaaggtgt 337  Q
    ||||||||| |||||||||||||| || |||||    
T  25367892 aaagagtggacttagtaccatattagagggtgt 25367924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 205 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 37771989 - 37771862
Alignment:
Q  205 ttggagaaattaaagttaaaatggtggtaaaatcatatttgagtggtctcagcaccataacagagtgataacaatactatattgaagtggttttagtatt 304  Q
    |||||||| ||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||| || ||||||||| ||||     |||||| ||||||    
T  37771989 ttggagaagttaaaattagaatggtggtaatatcatatttgagtggtctcaacaccataatagaatggtaacaataccatat-----tggtttcagtatt 37771895  T
Q  305 aaagagtggtcttagtaccatatttgaaggtgt 337  Q
    ||||||| ||||| |||||||||| || |||||    
T  37771894 aaagagtagtcttggtaccatattagagggtgt 37771862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 205 - 337
Target Start/End: Original strand, 34818516 - 34818643
Alignment:
Q  205 ttggagaaattaaagttaaaatggtggtaaaatcatatttgagtggtctcagcaccataacagagtgataacaatactatattgaagtggttttagtatt 304  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||| || |||||||| ||| || ||||| ||| ||||     |||||| ||||||    
T  34818516 ttggagaagttaaagttagaatggtggtagcaccatatttgagtggtcacaacaccataatagaatggtaacagtaccatat-----tggtttcagtatt 34818610  T
Q  305 aaagagtggtcttagtaccatatttgaaggtgt 337  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  34818611 aaagagtggtcttagtaccatattagagggtgt 34818643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 322 - 422
Target Start/End: Original strand, 17953800 - 17953901
Alignment:
Q  322 ccatatttgaaggtgtaaatctcgaacggttttctacagtgcaatagttaactgcacag-ttgtagttgtgcttgttttatcctggaggcggcgtcgttg 420  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||   ||||| |||||| || |||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  17953800 ccatatttgagggtgtaattctcgaacgattttctacagtgcagtagttaatcacacagtttgtaggtgagcttgttttatcttggaggcggcgtggttg 17953899  T
Q  421 at 422  Q
    ||    
T  17953900 at 17953901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 205 - 337
Target Start/End: Original strand, 8331174 - 8331301
Alignment:
Q  205 ttggagaaattaaagttaaaatggtggtaaaatcatatttgagtggtctcagcaccataacagagtgataacaatactatattgaagtggttttagtatt 304  Q
    |||||||| ||||| ||| ||||||||||| | |||||||||||||||| | |||||||| ||| || ||||||||  ||||     | |||| ||||||    
T  8331174 ttggagaagttaaaattagaatggtggtaacaccatatttgagtggtcttaccaccataatagaatggtaacaataacatat-----ttgtttcagtatt 8331268  T
Q  305 aaagagtggtcttagtaccatatttgaaggtgt 337  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  8331269 aaagagtggtcttagtaccatattagagggtgt 8331301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 322 - 422
Target Start/End: Original strand, 15875596 - 15875696
Alignment:
Q  322 ccatatttgaaggtgtaaatctcgaacggttttctacagtgcaatagttaactgcacagttgtagttgtgcttgttttatcctggaggcggcgtcgttga 421  Q
    ||||||||||  |||||| ||| ||||||||||||| |||||| |||||||  | ||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15875596 ccatatttgagagtgtaattcttgaacggttttctatagtgcagtagttaatcgtacaattgtagctgagcttgttttatcctggaggcggcgtggttga 15875695  T
Q  422 t 422  Q
    |    
T  15875696 t 15875696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 20 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 1807906 - 1807814
Alignment:
Q  20 gtcccttcggaataaagagtaccattaagatcatagtccctttttggaataataatgtcctgtcggaattaaagatgatcttaacggtatata 112  Q
    |||||||| ||||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||   ||||||  |||||||||||||||||||    
T  1807906 gtcccttcagaataaagattacttttaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcccgtaaaaattaagaatgatcttaacggtatata 1807814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 328 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 10933592 - 10933499
Alignment:
Q  328 ttgaaggtgtaaatctcgaacggttttctacagtgcaatagttaactgcacagttgtagttgtgcttgttttatcctggaggcggcgtcgttgat 422  Q
    |||||||||||| ||||||||  || ||||||||||| |||||||   |||||||||||||| | |||||||||| |||||||| ||| ||||||    
T  10933592 ttgaaggtgtaattctcgaacaattctctacagtgcagtagttaatcacacagttgtagttg-gtttgttttatcatggaggcgacgtggttgat 10933499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 29 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 33416998 - 33416894
Alignment:
Q  29 gaataaagagtaccattaagatcatagtccctttttggaataa-taatgtcctgtcggaattaaagatgatcttaacgg--tatataaatattctttcaa 125  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||| ||||||  ||||| |||||||  |||||||| | | ||||||    
T  33416998 gaataaagagtacttttaagatcatagtccctatttggaataacaaatgtcccgtcgaaattaagaatgattttaacggtatatataaaaagtatttcaa 33416899  T
Q  126 tattt 130  Q
    |||||    
T  33416898 tattt 33416894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 37 - 89
Target Start/End: Original strand, 28559282 - 28559334
Alignment:
Q  37 agtaccattaagatcatagtccctttttggaataataatgtcctgtcggaatt 89  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  28559282 agtactattaagatcatagttcctttttggaataataatgtcccgtcgaaatt 28559334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 160 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 1807775 - 1807705
Alignment:
Q  160 ggtgatatcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatactttggagaaattaaagttaaaatggtgg 231  Q
    |||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||  |||||| |||||||||||| ||||||||    
T  1807775 ggtggtatcaccatatttgagtcgttgt-gtgccatattgatgttttggataaattaaagttagaatggtgg 1807705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 168 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 14035753 - 14035669
Alignment:
Q  168 caccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatactttggagaaattaaa-gttaaaatggtggtaaaatcatatttgagtggtc 252  Q
    ||||||||||||| ||| | | | ||||||||||| ||||||||  ||||| |||| ||||||||| | |||||||||||||||||    
T  14035753 caccatatttgagcggttgaaataccatattgata-tttggagatgttaaatgttagaatggtggtgacatcatatttgagtggtc 14035669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 29 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 17793925 - 17793852
Alignment:
Q  29 gaataaagagtaccattaagatcatagtcccttttt-ggaataataatgtcctgtcggaattaaagatgatctt 101  Q
    ||||||| |||||  ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| || ||| |||  ||||||||    
T  17793925 gaataaaaagtacttttaagatcatagtccatttttaggaataataatgtcctttcagaactaagaatgatctt 17793852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 160 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 17793793 - 17793697
Alignment:
Q  160 ggtgatatcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatactttggagaaattaaa-gttaaaatggtggtaaaatcatatttgagtggtctca 255  Q
    |||| ||| ||||||||||| |||| | ||| |||||| |||| || |||||| ||||| |||| |||| || ||| |||||||||||| |||||||    
T  17793793 ggtggtataaccatatttgaatggttgcagtaccatatcgatatttaggagaagttaaaggttagaatgatgataacatcatatttgagaggtctca 17793697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 216 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 29220619 - 29220583
Alignment:
Q  216 aaagttaaaatggtggtaaaatcatatttgagtggtc 252  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  29220619 aaagttagaatggtggtaacatcatatttgagtggtc 29220583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 245; Significance: 1e-136; HSPs: 45)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 20 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 20520518 - 20520119
Alignment:
Q  20 gtcccttcggaataaagagtaccattaagatcatagtccctttttggaataataatgtcctgtcggaattaaagatgatcttaacggtatataaatattc 119  Q
    ||||||||||||| ||||||    |||||| ||||||||||||| ||  ||||   ||||  ||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||    
T  20520518 gtcccttcggaattaagagtgttcttaagaccatagtcccttttcggtttaat---gtcccttcggaattaagaatgatcttaacggaatataaatattc 20520422  T
Q  120 tttcaatatttaaattgaggagaaattaaaaagttgaaaaggtgatatcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatactttggagaaattaaag 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20520421 tttcaatatttaaattgaggagaaattaaaaagttgaaatggcgatatcaccatatttgagtggtcgtagtgcaatattgatactttggagaaattaaag 20520322  T
Q  220 ttaaaatggtggtaaaatcatatttgagtggtctcagcaccataacagagtgataacaatactatattgaagtggttttagtattaaagagtggtcttag 319  Q
    ||| ||||||||||| | ||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20520321 ttagaatggtggtaacaccatattttagtggtttcagcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtggtttcagtattaaagagtggtcttag 20520222  T
Q  320 taccatatttgaaggtgtaaatctcgaacggttttctacagtgcaatagttaactgcacagttgtagttgtgcttgttttatcctggaggcggcgtcgtt 419  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||| |||||||||||| ||  ||||||||||| |||||||||||| |||    
T  20520221 tactatatttgaaggtgtaaatctcgaacagttttctacagtacagtagttaaccgcacagttgtagctggacttgttttatcttggaggcggcgtggtt 20520122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 19 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 3419463 - 3419060
Alignment:
Q  19 agtcccttcggaataaagagtaccattaagatcatagtccctttttggaataataatgtcctgtcggaattaaagatgatcttaacggtatataaatatt 118  Q
    ||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||    
T  3419463 agtcctttcggaataaagagtattattaagatcatagtccctttttagaataataatgtcccgtcggaattaagaatgatcttaacagtatataaatatt 3419364  T
Q  119 ctttcaatatttaaattgaggagaaattaaaaagttgaaaaggtgatatcaccatatttgagtggtcgta--gtgccatattgatactttggagaaatta 216  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||    
T  3419363 ctttcaatattttaattgaggagaaattaaaaagtgaaaatggtggtatcaccatatttaagtggtcgtagtgtgccatattgatattttggagaaatta 3419264  T
Q  217 aagttaaaatggtggtaaaatcatatttgagtggtctcagcaccataacagagtgataacaatactatattgaagtggttttagtattaaagagtggtct 316  Q
    |||||| |||||||| || | |||| |||||||||| |||| ||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||||||| |||||| |||||||||||    
T  3419263 aagttagaatggtggcaacaccata-ttgagtggtcacagcgccataacagagcggtaacaatacaatattaaagtggtttcagtatt-aagagtggtct 3419166  T
Q  317 tagtaccatatttgaaggtgtaaatctcgaacggttttctacagtgcaatagttaactgcacagttgtagttgtgcttgttttatcctggaggcggcgtc 416  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||| |||||     
T  3419165 tagtaccatatttgagggtgtaaatctcaaacggttttctacgatgcaatagttaaccgcacagttgcagttgagcttgttttatcctgaaggtggcgtg 3419066  T
Q  417 gttgat 422  Q
    ||||||    
T  3419065 gttgat 3419060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 13 - 422
Target Start/End: Original strand, 3656858 - 3657268
Alignment:
Q  13 aatataagtcccttcggaataaagagtaccattaagatcatagtccctttttggaataataatgtcctgtcggaattaaagatgatcttaacggtatata 112  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||  | |||||||| ||||||||    
T  3656858 aatataagtcccttcgtaataaagagtactgttaagatcataatccctttttggaataataatgtcccgtcggaattaagaacgatcttaaaggtatata 3656957  T
Q  113 aatattctttcaatattta---aattgaggagaaattaaaaagttgaaaaggtgatatcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatactttgga 209  Q
    |||||| ||| |||||||    |||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3656958 aatattatttgaatatttttctaattgaggagaaattaaaaagtggaaatggtggtatc--catatttgagtggtcgtagtgccatattgatattttgga 3657055  T
Q  210 gaaattaaagttaaaatggtggtaaaatcatatttgagtggtctcagcaccataacagagtgataacaatactatattgaagtggttttagtattaaaga 309  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||  ||||| ||||||||| || ||||||||    
T  3657056 gaaattaaagttagaatggtggtaacatcatatttgattggtctcagcaccgtaacagagtggtaacaatatcatattaaagtggtttcagcattaaaga 3657155  T
Q  310 gtggtcttagtaccatatttgaaggtgtaaatctcgaacggttttctacagtgcaatagttaactgcacagttgtagttgtgcttgttttatcctggagg 409  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||    |||||||||| ||  ||||||||||| ||||||    
T  3657156 gtggtcttagtaccatatttaagggtgtaattctcgaacgattttctacagtgcagtagttaatctaacagttgtagctggacttgttttatcttggagg 3657255  T
Q  410 cggcgtcgttgat 422  Q
     ||| | ||||||    
T  3657256 tggcatggttgat 3657268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 13 - 422
Target Start/End: Original strand, 757997 - 758396
Alignment:
Q  13 aatataagtcccttcggaataaagagtaccattaagatcatagtccctttttggaataataatgtcctgtcggaattaaagatgatcttaacggtatata 112  Q
    |||||| |||||||| || ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| || ||||||| |||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  757997 aatatatgtcccttcagattaaagagtacttttaagatcatagtccctatttggaagaacaatgtcccgtcgaaattaagaatgatcttaacggtatata 758096  T
Q  113 --aatattctttcaatattta--aattgaggagaaattaaaaagttgaaaaggtgatatcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatactttgg 208  Q
      || | | |||||||||||   | ||||||||||||              |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  758097 taaaaagtatttcaatattttttatttgaggagaaat--------------ggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttgg 758182  T
Q  209 agaaattaaagttaaaatggtggtaaaatcatatttgagtggtctcagcaccataacagagtgataacaatactatattgaagtggttttagtattaaag 308  Q
    |||| ||||||||| ||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  758183 agaacttaaagttagaatggtgttaacaccatatttgagtggtctcagcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtggtttcagtattaaag 758282  T
Q  309 agtggtcttagtaccatatttgaaggtgtaaatctcgaacggttttctacagtgcaatagttaactgcacagttgtagttgtgcttgttttatcctggag 408  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| || || ||||||||||||||||||    
T  758283 agtggtcttagtaccatatttgagggtgtaattctcgaacggttttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgcagctgggcttgttttatcctggag 758382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 29 - 415
Target Start/End: Original strand, 7570863 - 7571239
Alignment:
Q  29 gaataaagagtaccattaagatcatagtccctttttggaataataatgtcctgtcggaattaaagatgatcttaacggtatata--aatattctttcaat 126  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||| | ||||||| || ||||||| |||||||||||  ||||||||||| |||||||  || | | |||||||    
T  7570863 gaataaagagtacttttaagatcatagtccatatttggaagaacaatgtcccgtcggaattaagaatgatcttaacagtatatataaaaagtatttcaat 7570962  T
Q  127 attta--aattgaggagaaattaaaaagttgaaaaggtgatatcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatactttggagaaattaaagttaaa 224  Q
    ||||   | ||||||||||||              |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||| |    
T  7570963 attttttatttgaggagaaat--------------ggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaagttata 7571048  T
Q  225 atggtggtaaaatcatatttgagtggtctcagcaccataacagagtgataacaatactatattgaagtggttttagtattaaagagtggtcttagtacca 324  Q
    |||||  ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  7571049 atggtattaacaccatatttgagtggtctcagcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtggtttcagtattaaagcgtggtcttagtacca 7571148  T
Q  325 tatttgaaggtgtaaatctcgaacggttttctacagtgcaatagttaactgcacagttgtagttgtgcttgttttatcctggaggcggcgt 415  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  7571149 tatttggaggtgtaattctcgaacggttttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgtagctgagcttgttttatcctggaggcggcgt 7571239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 20 - 422
Target Start/End: Original strand, 23661100 - 23661492
Alignment:
Q  20 gtcccttcggaataaagagtaccattaagatcatagtccctttttggaataataatgtcctgtcggaattaaagatgatcttaacggtatata--aatat 117  Q
    |||||||| ||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||| || ||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||  || |     
T  23661100 gtcccttcagaataaagaatacttttaagatcatagtccctatttggaagaacaatgtcccgtcggaattaagaatgatcttaacggtatatataaaaag 23661199  T
Q  118 tctttcaatattta--aattgaggagaaattaaaaagttgaaaaggtgatatcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatactttggagaaatt 215  Q
    | |||||||||||   | ||||||||||||              |||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| ||    
T  23661200 tatttcaatattttttatttgaggagaaat--------------ggtggtatcaccatatttgagtgatcgtagtaccatattgatagtttggagaactt 23661285  T
Q  216 aaagttaaaatggtggtaaaatcatatttgagtggtctcagcaccataacagagtgataacaatactatattgaagtggttttagtattaaagagtggtc 315  Q
    ||||||| ||||||   || | ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  23661286 aaagttagaatggtatgaacaccatatttgagtggtctcagcaccttaacagagtggtaacaataccatattaaagtggtttcagtattaaagagtggtc 23661385  T
Q  316 ttagtaccatatttgaaggtgtaaatctcgaacggttttctacagtgcaatagttaactgcacagttgtagttgtgcttgttttatcctggaggcggcgt 415  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||    
T  23661386 ttagtaccatatttgagggtgtaattctcgaacggttttctacagtgcattagttaaccgcacagttgcagctgggcttgttttatcctggaggcggcgt 23661485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 180; E-Value: 5e-97
Query Start/End: Original strand, 13 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 18467690 - 18467297
Alignment:
Q  13 aatataagtcccttcggaataaagagtaccattaagatcatagtccctttttggaataataatgtcctgtcggaattaaagatgatcttaacggtatata 112  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  18467690 aatatatgtcccttcagaataaagagtacttttaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcccgtcggaattaagaatgatcttaacggtatata 18467591  T
Q  113 --aatattctttcaatattta---aattgaggagaaattaaaaagttgaaaaggtgatatcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatactttg 207  Q
      || | | |||||||||||    | ||||||||||||              |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  18467590 taaaaagtatttcaatatttttctatttgaggagaaat--------------ggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttg 18467505  T
Q  208 gagaaattaaagttaaaatggtggtaaaatcatatttgagtggtctcagcaccataacagagtgataacaatactatattgaagtggttttagtattaaa 307  Q
    ||||| ||||||||| ||||||  ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| || |||||| |||||||||    
T  18467504 gagaacttaaagttagaatggtattaacaccatatttgagtggtctcagcaccataacagagtggtaacaataccatattaaaatggtttcagtattaaa 18467405  T
Q  308 gagtggtcttagtaccatatttgaaggtgtaaatctcgaacggttttctacagtgcaatagttaactgcacagttgtagttgtgcttgttttatcctgga 407  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||  | ||| |||||||||  ||||||||||||||||    
T  18467404 gagtggtcttagtaccatatttggaagtgtaattctcgaacgattttctacagtgcagtagttaatcgaacaattgtagttggacttgttttatcctgga 18467305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 20 - 422
Target Start/End: Original strand, 23665759 - 23666151
Alignment:
Q  20 gtcccttcggaataaagagtaccattaagatcatagtccctttttggaataataatgtcctgtcggaattaaagatgatcttaacggtatata--aatat 117  Q
    |||||||| ||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||| || ||||||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||  || |     
T  23665759 gtcccttcagaataaagaatacttttaagatcatagtccctatttggaagaacaatgtcccgtcggaattaagaatgatctaaacggtatatataaaaag 23665858  T
Q  118 tctttcaatattta--aattgaggagaaattaaaaagttgaaaaggtgatatcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatactttggagaaatt 215  Q
    | |||||||||||   | ||||||||||||              |||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| ||    
T  23665859 tatttcaatattttttatttgaggagaaat--------------ggtggtatcaccatatttgagtgatcgtagtaccatattgatagtttggagaactt 23665944  T
Q  216 aaagttaaaatggtggtaaaatcatatttgagtggtctcagcaccataacagagtgataacaatactatattgaagtggttttagtattaaagagtggtc 315  Q
    ||||||| ||||||   || | ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  23665945 aaagttagaatggtatgaacaccatatttgagtggtctcagcaccttaacagagtggtaacaataccatattaaagtggtttcagtattaaagagtggtc 23666044  T
Q  316 ttagtaccatatttgaaggtgtaaatctcgaacggttttctacagtgcaatagttaactgcacagttgtagttgtgcttgttttatcctggaggcggcgt 415  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||    
T  23666045 ttagtaccatatttgagggtgtaattctcgaacggttttctacagtgcattagttaaccgcacagttgcagctgggcttgttttatcctggaggcggcgt 23666144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 20 - 422
Target Start/End: Original strand, 24038007 - 24038399
Alignment:
Q  20 gtcccttcggaataaagagtaccattaagatcatagtccctttttggaataataatgtcctgtcggaattaaagatgatcttaacggtatata--aatat 117  Q
    |||||||| ||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||| || ||||||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||  || |     
T  24038007 gtcccttcagaataaagaatacttttaagatcatagtccctatttggaagaacaatgtcccgtcggaattaagaatgatctaaacggtatatataaaaag 24038106  T
Q  118 tctttcaatattta--aattgaggagaaattaaaaagttgaaaaggtgatatcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatactttggagaaatt 215  Q
    | |||||||||||   | ||||||||||||              |||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| ||    
T  24038107 tatttcaatattttttatttgaggagaaat--------------ggtggtatcaccatatttgagtgatcgtagtaccatattgatagtttggagaactt 24038192  T
Q  216 aaagttaaaatggtggtaaaatcatatttgagtggtctcagcaccataacagagtgataacaatactatattgaagtggttttagtattaaagagtggtc 315  Q
    ||||||| ||||||   || | ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  24038193 aaagttagaatggtatgaacaccatatttgagtggtctcagcaccttaacagagtggtaacaataccatattaaagtggtttcagtattaaagagtggtc 24038292  T
Q  316 ttagtaccatatttgaaggtgtaaatctcgaacggttttctacagtgcaatagttaactgcacagttgtagttgtgcttgttttatcctggaggcggcgt 415  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||    
T  24038293 ttagtaccatatttgagggtgtaattctcgaacggttttctacagtgcattagttaaccgcacagttgcagctgggcttgttttatcctggaggcggcgt 24038392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 173; E-Value: 7e-93
Query Start/End: Original strand, 13 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 55326241 - 55325848
Alignment:
Q  13 aatataagtcccttcggaataaagagtaccattaagatcatagtccctttttggaataataatgtcctgtcggaattaaagatgatcttaacggtatata 112  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||  ||||||||||| |||||||    
T  55326241 aatatatgtcccttcagaataaagagtacttttaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcccgtcggaattaagaatgatcttaacagtatata 55326142  T
Q  113 --aatattctttcaatattta---aattgaggagaaattaaaaagttgaaaaggtgatatcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatactttg 207  Q
      || | | |||||||||||    | ||||||||||||              |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  55326141 taaaaagtatttcaatatttttctatttgaggagaaat--------------ggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatgttttg 55326056  T
Q  208 gagaaattaaagttaaaatggtggtaaaatcatatttgagtggtctcagcaccataacagagtgataacaatactatattgaagtggttttagtattaaa 307  Q
    || |||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||  ||||| ||||||||| |||||||||    
T  55326055 gaaaaattaaagttagaatggtggtaacaccatatttgagtggtctcaacaccataacagaatgataacaatatcatattaaagtggtttcagtattaaa 55325956  T
Q  308 gagtggtcttagtaccatatttgaaggtgtaaatctcgaac-ggttttctacagtgcaatagttaactgcacagttgtagttgtgcttgttttatcctgg 406  Q
    |||||||||||||||| ||||| | ||||||| |||||| | ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||  || ||||||||||||||||    
T  55325955 gagtggtcttagtaccgtatttaagggtgtaattctcgatcgggttttctacagtgc-atagttaaccgcacagttgtaactgggcttgttttatcctgg 55325857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 13 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 55431780 - 55431380
Alignment:
Q  13 aatataagtcccttcggaataaagagtaccattaagatcatagtccctttttggaataataatgtcctgtcggaattaaagatgatcttaacggtatata 112  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||  ||||||||||| ||| | |||||||||| ||||||| |||||||||||  ||||||||||| |||||||    
T  55431780 aatatatgtcccttcagaataaagagtacttttaagatcataatccatatttggaataacaatgtcccgtcggaattaagaatgatcttaacagtatata 55431681  T
Q  113 --aatattctttcaatattta---aattgaggagaaattaaaaagttgaaaaggtgatatcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatactttg 207  Q
      || | | |||||||||||    | |||||||||||||              ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||    
T  55431680 taaaaagtatttcaatatttttctatttgaggagaaatt--------------gtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtgtcatattgatgttttg 55431595  T
Q  208 gagaaattaaagttaaaatggtggtaaaatcatatttgagtggtctcagcaccataacagagtgataacaatactatattgaagtggttttagtattaaa 307  Q
    ||||||||||||||| |||||||  || | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||| | ||||||| ||||| |||    
T  55431594 gagaaattaaagttagaatggtgacaacaccatatttgagtggtctcaacaccataacagagtgataacaatgccatattaaggtggtttaagtatcaaa 55431495  T
Q  308 gagtggtcttagtaccatatttgaaggtgtaaatctcgaacggttttctacagtgcaatagttaactgcacagttgtagttgtgcttgttttatcctgga 407  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  55431494 gagtggtcttagtaccatatttgagggtgcaattctcgaacagttttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgtagctggacttgttttatcctgga 55431395  T
Q  408 ggcggcgtcgttgat 422  Q
    |||||||| ||||||    
T  55431394 ggcggcgtggttgat 55431380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 168; E-Value: 7e-90
Query Start/End: Original strand, 23 - 422
Target Start/End: Original strand, 14438337 - 14438723
Alignment:
Q  23 ccttcggaataaagagtaccattaagatcatagtccctttttggaataataatgtcctgtcggaattaaagatgatcttaacggtatata--aatattct 120  Q
    ||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||  ||||||||||| |||||||  || | | |    
T  14438337 ccttcagaataaagagtacttttaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcccgtcggaattaagaatgatcttaacagtatatataaaaagtat 14438436  T
Q  121 ttcaatattta---aattgaggagaaattaaaaagttgaaaaggtgatatcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatactttggagaaattaa 217  Q
    ||||||||||    | ||||||||||||              |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||    
T  14438437 ttcaatatttttctatttgaggagaaat--------------ggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattgaagttttggagaaattaa 14438522  T
Q  218 agttaaaatggtggtaaaatcatatttgagtggtctcagcaccataacagagtgataacaatactatattgaagtggttttagtattaaagagtggtctt 317  Q
    ||||| |||||| | |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||| |||     ||||||| | |||||||||||||||||    
T  14438523 agttagaatggtagcaaaaccatatttgagtggtctcaacaccataacagagtggttacaataccatag----gtggtttcaatattaaagagtggtctt 14438618  T
Q  318 agtaccatatttgaaggtgtaaatctcgaacggttttctacagtgcaatagttaactgcacagttgtagttgtgcttgttttatcctggaggcggcgtcg 417  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||| |    
T  14438619 agtaccatatttgagggtgtaattctcgaacggttttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgcagctgggcttgttttatcctggaggcggcgtgg 14438718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 13 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 18472472 - 18472072
Alignment:
Q  13 aatataagtcccttcggaataaagagtaccattaagatcatagtccctttttggaataataatgtcctgtcggaattaaagatgatcttaacggtatata 112  Q
    |||||| |||||||  |||||||||||||  ||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| |||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  18472472 aatatatgtccctttagaataaagagtacttttaagatgatagtccctatttggaataacaatgtcccgtcgaaattaagaatgatcttaacggtatata 18472373  T
Q  113 --aatattctttcaatattta---aattgaggagaaattaaaaagttgaaaaggtgatatcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatactttg 207  Q
      || | | ||| |||||||    | ||||||||||||              |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  18472372 taaaaagtattttaatatttttctatttgaggagaaat--------------ggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttg 18472287  T
Q  208 gagaaattaaagttaaaatggtggtaaaatcatatttgagtggtctcagcaccataacagagtgataacaatactatattgaagtggttttagtattaaa 307  Q
    ||||| ||||||||| |||| |  ||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||    
T  18472286 gagaacttaaagttagaatgatattaacaccatatttgagtggtctcagcaccataacaaagtggtaacaataccatattaaagtggtttcagtattaaa 18472187  T
Q  308 gagtggtcttagtaccatatttgaaggtgtaaatctcgaacggttttctacagtgcaatagttaactgcacagttgtagttgtgcttgttttatcctgga 407  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| |||| |||||||  | |||||||||| || |||||||||||||||||    
T  18472186 gagtggtcttagtaccatatttggaggtgtaattctcgaacgattttctacaatgcagtagttaatcgaacagttgtagctgggcttgttttatcctgga 18472087  T
Q  408 ggcggcgtcgttgat 422  Q
    |||||||| ||||||    
T  18472086 ggcggcgtggttgat 18472072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 13 - 422
Target Start/End: Original strand, 39775357 - 39775756
Alignment:
Q  13 aatataagtcccttcggaataaagagtaccattaagatcatagtccctttttggaataataatgtcctgtcggaattaaagatgatcttaacggtatata 112  Q
    |||||| |||||||| ||||||| |||||  |||||||||||||| || |||||||||| ||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  39775357 aatatatgtcccttcagaataaatagtacttttaagatcatagtctctatttggaataacaatgtcccgtcggaattaagaatgatcttaacggtatata 39775456  T
Q  113 --aatattctttcaatattta--aattgaggagaaattaaaaagttgaaaaggtgatatcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatactttgg 208  Q
      || | |  ||||||||||   | ||||||||||||              |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  39775457 taaaaagtagttcaatattttttatttgaggagaaat--------------ggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttgg 39775542  T
Q  209 agaaattaaagttaaaatggtggtaaaatcatatttgagtggtctcagcaccataacagagtgataacaatactatattgaagtggttttagtattaaag 308  Q
    |||| ||||||||| ||||||  ||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||    
T  39775543 agaacttaaagttagaatggtattaacaccatatttgagtggtctcagcatcataacagagtagtaacaataccatattaaagtggtttcagtagtaaag 39775642  T
Q  309 agtggtcttagtaccatatttgaaggtgtaaatctcgaacggttttctacagtgcaatagttaactgcacagttgtagttgtgcttgttttatcctggag 408  Q
    ||| |||||||||||||||||| |||||||| | ||||||| |||||||||||||| |||||||  | |||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  39775643 agttgtcttagtaccatatttggaggtgtaattttcgaacgattttctacagtgcagtagttaatcgaacagttgtagctgagcttgttttatcctggag 39775742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 20 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 27709390 - 27709001
Alignment:
Q  20 gtcccttcggaataaagagtaccattaagatcatagtccctttttggaataataatgtcctgtcggaattaaagatgatcttaacggtatata--aatat 117  Q
    |||||||| ||||||||||||   |||||||||||||| || |||||||||| ||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||  || |     
T  27709390 gtcccttcagaataaagagtatttttaagatcatagtctctatttggaataacaatgtcccgtcggaattaagaatgatcttaacggtatatataaaaag 27709291  T
Q  118 tctttcaatattta---aattgaggagaaattaaaaagttgaaaaggtgatatcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatactttggagaaat 214  Q
    | ||| |||||||    | ||||||||||||              |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  27709290 tattttaatatttttctatttgaggagaaat--------------ggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatgttttggagaaat 27709205  T
Q  215 taaagttaaaatggtggtaaaatcatatttgagtggtctcagcaccataacagagtgataacaatactatattgaagtggttttagtattaaagagtggt 314  Q
    |||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||| || |||||||| |||||| | |||||||||||     ||||||| |||||| ||||||| |    
T  27709204 taaagttagaatggtggtaacaccatatttgagtggtcgcaacaccataatagagtggttacaatactatag----gtggtttcagtattgaagagtgat 27709109  T
Q  315 cttagtaccatatttgaaggtgtaaatctcgaacggttttctacagtgcaatagttaactgcacagttgtagttgtgcttgttttatcctggaggcggcg 414  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||    
T  27709108 cttagtaccatatttgagggtgtaattctcgaacggttttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgaagctgggcttgttttatcctggaggcggcg 27709009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 155 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 29350572 - 29350314
Alignment:
Q  155 gaaaaggtgatatcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatactttggagaaattaaagttaaaatggtggtaaaatcatatttgagtggtctc 254  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||| |||||||| || | |||||||||||| ||||    
T  29350572 gaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatgttttggagaaattaaaattagaatggtggcaacaccatatttgagtgctctc 29350473  T
Q  255 agcaccataacagagtgataacaatactatattgaagtggttttagtattaaagagtggtcttagtaccatatttgaaggtgtaaatctcgaacggtttt 354  Q
    | ||| ||||||||||| ||||||||  ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  29350472 aacactataacagagtggtaacaatatcatattaaagtgattttagtattaaagagtggtcttagtaccatatttgagggtgtaattctcgaacggtttt 29350373  T
Q  355 ctacagtgcaatagttaactgcacagttgtagttgtgcttgttttatcctggaggcggc 413  Q
    |||||||||| || |||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  29350372 ctacagtgcagtaattaaccacacagttgtagttgagcttgttttatcctggaggcggc 29350314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 13 - 402
Target Start/End: Original strand, 2207377 - 2207757
Alignment:
Q  13 aatataagtcccttcggaataaagagtaccattaagatcatagtccctttttggaataataatgtcctgtcggaattaaagatgatcttaacggtatata 112  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||| |||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  2207377 aatatatgtctcttcggaataaagagtacttttaagatcatggtccctgtttggaataacaatgtcccgtcgaaattaagaatgatcttaacggtatata 2207476  T
Q  113 --aatattctttcaatattta---aattgaggagaaattaaaaagttgaaaaggtgatatcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatactttg 207  Q
      || | | |||||| ||||    | ||||||||||||              |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  2207477 taaaaagtatttcaacatttttctatttgaggagaaat--------------ggtggtatcatcatatttgagtggtcgtagtgccatattgatgttttg 2207562  T
Q  208 gagaaattaaagttaaaatggtggtaaaatcatatttgagtggtctcagcaccataacagagtgataacaatactatattgaagtggttttagtattaaa 307  Q
     |||||||||||||| || ||||| || | |||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||    
T  2207563 aagaaattaaagttagaacggtggcaacaccatatttgagtggtctcaacaccataatagagtggtaacaataccatataaaagtggtttcagtattaaa 2207662  T
Q  308 gagtggtcttagtaccatatttgaaggtgtaaatctcgaacggttttctacagtgcaatagttaactgcacagttgtagttgtgcttgttttatc 402  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||| || ||||||||||||    
T  2207663 gagtggtcttagtaccatatttgagggtgtaattctcgaagggttttctacagtacagtagttaaccgcacaattgtagatgggcttgttttatc 2207757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 13 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 46964474 - 46964093
Alignment:
Q  13 aatataagtcccttcggaataaagagtaccattaagatcatagtccctttttggaataataatgtcctgtcggaattaaagatgatcttaacggtatata 112  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||  ||||||||||| |   | |||||||||  ||||||| |||||||||||  ||||||||||| |||||||    
T  46964474 aatatatgtcccttcagaataaagagtacttttaagatcataatttatatttggaatagcaatgtcccgtcggaattaagaatgatcttaacagtatata 46964375  T
Q  113 aatattctttcaatattta---aattgaggagaaattaaaaagttgaaaaggtgatatcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatactttgga 209  Q
    || ||| |||||||||||    | |||| ||||||||              ||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||   |    ||||    
T  46964374 aaaattatttcaatatttttctatttgaagagaaatt--------------gtggtatcaccatacttgagttgtcgtagtgccatatgtct----tgga 46964293  T
Q  210 gaaattaaagttaaaatggtggtaaaatcatatttgagtggtctcagcaccataacagagtgataacaatactatattgaagtggttttagtattaaaga 309  Q
     |||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||||    
T  46964292 taaattaaagttagaatggtggtaacaccatatttgagtggtctcagcaccataacagagtggtaacaataccatatcaaagtggtttcagtattaaaga 46964193  T
Q  310 gtggtcttagtaccatatttgaaggtgtaaatctcgaacggttttctacagtgcaatagttaactgcacagttgtagttgtgcttgttttatcctggagg 409  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  || |||||||  || | |||||||||||| ||||    
T  46964192 gtggtcttaataccatatttgagggtgtaaatctcgaacggttttctatagtgcaatagttaaccacatagttgtatctgagtttgttttatcctagagg 46964093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 13 - 385
Target Start/End: Original strand, 25726406 - 25726779
Alignment:
Q  13 aatataagtcccttcggaataaagagtaccattaagatcatagtccctttttggaataataatgtcctgtcggaattaaagatgatcttaacggtatata 112  Q
    |||||| ||||||| | ||||||||||||   | ||||||||||||  ||||| |||||||| || | |||||||||||  ||||||||||   ||||||    
T  25726406 aatatatgtccctttgaaataaagagtacttatcagatcatagtccaattttgaaataataacgttccgtcggaattaagaatgatcttaatattatata 25726505  T
Q  113 aatattctttcaatattta---aattgaggagaaattaaaaagttgaaaaggtgatatcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatactttgga 209  Q
    ||||||||||||||||||    | |   ||| || ||||||||||  || |||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  25726506 aatattctttcaatatttttctactcttggaaaagttaaaaagttagaatggtggtatcaccatatttgaatggtcgtagtaccatattgatattttgga 25726605  T
Q  210 gaaattaaag-ttaaaatggtggtaaaatcatatttgagtggtctcagcaccataacagagtgataacaatactatattgaagtggttttagtattaaag 308  Q
    ||| |||||| ||| |||| || ||| | |||||||||||||||| | |||||||| ||  || | ||||||| |||||  | || ||| |||||| |||    
T  25726606 gaacttaaaggttagaatgatgataacaccatatttgagtggtcttaacaccataatag--tggtcacaataccatattagaatgatttcagtatttaag 25726703  T
Q  309 agtggtcttagtaccatatttgaaggtgtaaatctcgaacggttttctacagtgcaatagttaactgcacagttgta 385  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  25726704 agtggtcttagtaccatattgga-ggtgtaaatctcgaacggttttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgta 25726779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 110 - 327
Target Start/End: Original strand, 10708390 - 10708613
Alignment:
Q  110 ataaatattctttcaatattta---aattgaggagaaattaaaaagttgaaaaggtgatatcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatacttt 206  Q
    |||||||||||||||||||||    | ||||||||||||||| |||| |||| |||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||     
T  10708390 ataaatattctttcaatatttttctatttgaggagaaattaataagtcgaaatggtggtatcaccatatttgagtgctcgtagtaccatattgatagttc 10708489  T
Q  207 ggagaaattaaagttaaaatggtggtaaaatcatatttgagtggtctcagcaccataacagagtgataacaata--ctatattgaagtggttttagtatt 304  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    ||||| ||||||||| ||||||    
T  10708490 ggagaacttaaagttagaatggtggtaacaccatatttgagtggtctcagcaccataacagagtgttaacaatatcacatattaaagtggtttcagtatt 10708589  T
Q  305 -aaagagtggtcttagtaccatat 327  Q
     ||||| |||||||||| ||||||    
T  10708590 aaaagaatggtcttagtcccatat 10708613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 238 - 422
Target Start/End: Original strand, 32474523 - 32474708
Alignment:
Q  238 catatttgagtggtctcagcaccataacagagtgataacaatactatattgaagtggttttagtattaaagagtggtc-ttagtaccatatttgaaggtg 336  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||  ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||     
T  32474523 catatttgagtggtctcagcaccataatagagtggtaacaatatcatattaaagtggtttcagtattaaagagtggtctttagtaccatatttagaggta 32474622  T
Q  337 taaatctcgaacggttttctacagtgcaatagttaactgcacagttgtagttgtgcttgttttatcctggaggcggcgtcgttgat 422  Q
    ||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||  | |||||||||| || |||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  32474623 taattctcgaacgattttctacagtgcagtagttaatcgaacagttgtagctgggcttgttttatcctggagacggcgtggttgat 32474708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 239 - 415
Target Start/End: Original strand, 12971478 - 12971654
Alignment:
Q  239 atatttgagtggtctcagcaccataacagagtgataacaatactatattgaagtggttttagtattaaa-gagtggtcttagtaccatatttgaaggtgt 337  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| || | ||||| |||||||||| || |||||    
T  12971478 atatttgagtggtctcagcaccataatagagtggtaacagtaccatattaaagtggttttagtattaaaagattagtcttggtaccatattgga-ggtgt 12971576  T
Q  338 aaatctcgaacggttttctacagtgcaatagttaactgcacagttgtagttgtgcttgttttatcctggaggcggcgt 415  Q
    || ||||||||||||||||||| |||| ||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  12971577 aattctcgaacggttttctacaatgcagtagttaattgaacagttgtagttgggcttgttttatcctagaggcggcgt 12971654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 168 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 8069992 - 8069744
Alignment:
Q  168 caccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatactttggagaaattaaag-ttaaaatggtggtaaaatcatatttgagtggtctcagcaccataaca 266  Q
    ||||||||||||||||| | | |||| |||||||| ||||||||| |||||  ||| ||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||      
T  8069992 caccatatttgagtggttgaaatgcc-tattgata-tttggagaagttaaaaattagaatggtggtaacaccatatttgagtggtctcaacaccataatt 8069895  T
Q  267 gagtgataacaatactatattgaagtggttttagtattaaa-gagtggtcttagtaccatatttgaaggtgtaaatctcgaacggttttctacagtgcaa 365  Q
    ||||| | ||||||| ||||||     |||| ||| ||||| || |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||     
T  8069894 gagtggttacaataccatattg-----gtttcagtgttaaaagattggtcttagtaccatatt-gaaggtgtaattctcgaacggttatctacagtgcag 8069801  T
Q  366 tagttaactgcacagttgtagttgtgcttgttttatcctggaggcggcgtcgttgat 422  Q
    |||||||| ||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8069800 tagttaaccgcacagttgcagctgggcttgttttatcctggaggcggcgtggttgat 8069744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 168 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 3672900 - 3672651
Alignment:
Q  168 caccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatactttggagaaattaaag--ttaaaatggtggtaaaatcatatttgagtggtctcagcaccataac 265  Q
    ||||||||||||||||| | | |||| |||||||| ||||||||| |||||   ||| ||||||||||| | |||||||||||||||||| || |||||     
T  3672900 caccatatttgagtggttgaaatgcc-tattgata-tttggagaagttaaaaaattagaatggtggtaacaccatatttgagtggtctcaacatcataat 3672803  T
Q  266 agagtgataacaatactatattgaagtggttttagtattaaa-gagtggtcttagtaccatatttgaaggtgtaaatctcgaacggttttctacagtgca 364  Q
     ||||| | ||||||| ||||||     |||| ||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3672802 tgagtggttacaataccatattg-----gtttcagtattaaaagattggtcttagtaccatatt-gaaggtgtaattctcgaacggttttctacagtgca 3672709  T
Q  365 atagttaactgcacagttgtagttgtgcttgttttatcctggaggcggcgtcgttgat 422  Q
     |||||||  | |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3672708 gtagttaatcgaacagttgtagctgggcttgttttatcctggaggcggcgtggttgat 3672651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 168 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 3692932 - 3692683
Alignment:
Q  168 caccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatactttggagaaattaaag--ttaaaatggtggtaaaatcatatttgagtggtctcagcaccataac 265  Q
    ||||||||||||||||| | | |||| |||||||| ||||||||| |||||   ||| ||||||||||| | |||||||||||||||||| || |||||     
T  3692932 caccatatttgagtggttgaaatgcc-tattgata-tttggagaagttaaaaaattagaatggtggtaacaccatatttgagtggtctcaacatcataat 3692835  T
Q  266 agagtgataacaatactatattgaagtggttttagtattaaa-gagtggtcttagtaccatatttgaaggtgtaaatctcgaacggttttctacagtgca 364  Q
     ||||| | ||||||| ||||||     |||| ||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3692834 tgagtggttacaataccatattg-----gtttcagtattaaaagattggtcttagtaccatatt-gaaggtgtaattctcgaacggttttctacagtgca 3692741  T
Q  365 atagttaactgcacagttgtagttgtgcttgttttatcctggaggcggcgtcgttgat 422  Q
     |||||||  | |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3692740 gtagttaatcgaacagttgtagctgggcttgttttatcctggaggcggcgtggttgat 3692683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 168 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 8883484 - 8883235
Alignment:
Q  168 caccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatactttggagaaattaaag--ttaaaatggtggtaaaatcatatttgagtggtctcagcaccataac 265  Q
    ||||||||||||||||| | | |||| |||||||| ||||||||| |||||   ||| ||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||     
T  8883484 caccatatttgagtggttgaaatgcc-tattgata-tttggagaagttaaaaaattagaatggtggtaacaccatatttgagtggtctcaacaccataat 8883387  T
Q  266 agagtgataacaatactatattgaagtggttttagtattaaag-agtggtcttagtaccatatttgaaggtgtaaatctcgaacggttttctacagtgca 364  Q
     ||||| | ||||||| ||||||     |||| |||||||||  | ||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8883386 tgagtggttacaataccatattg-----gtttcagtattaaaatattggtctttgtaccatatt-gaaggtgtaattctcgaacggttttctacagtgca 8883293  T
Q  365 atagttaactgcacagttgtagttgtgcttgttttatcctggaggcggcgtcgttgat 422  Q
     |||||||| ||||||||| || || |||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  8883292 gtagttaaccgcacagttgcagctgggcttgttttatcctggaggcagcgtggttgat 8883235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 168 - 422
Target Start/End: Original strand, 6596136 - 6596385
Alignment:
Q  168 caccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatactttggagaaattaaa-gttaaaatggtggtaaaatcatatttgagtggtctcagcaccataaca 266  Q
    ||||||||||||||||| | | | | ||||||| | ||||||||| ||| | |||| ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| |    
T  6596136 caccatatttgagtggttgaaatactatattgaca-tttggagaagttagatgttagaatggtggtaacacaatatttgagtggtctcagcaccataata 6596234  T
Q  267 gagtgataacaatactatattgaagtggttttagtattaaa-gagtggtcttagtaccatatttgaaggtgtaaatctcgaacggttttctacagtgcaa 365  Q
    ||||| | |||  || ||||||     |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||     
T  6596235 gagtggtcacagcaccatattg-----gtttcagtattaaaagagtggtcttagtaccatatt-gaaggtgtaattctcgaacggttttctacaatgcag 6596328  T
Q  366 tagttaactgcacagttgtagttgtgcttgttttatcctggaggcggcgtcgttgat 422  Q
    ||||||||  || | |||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6596329 tagttaaccacataattgtagctgagcttgttttatcctggaggcggcgtggttgat 6596385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 168 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 8888244 - 8887995
Alignment:
Q  168 caccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatactttggagaaattaaag--ttaaaatggtggtaaaatcatatttgagtggtctcagcaccataac 265  Q
    |||||||||||||| || | | |||| |||||||| ||||||||| |||||   ||| ||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||     
T  8888244 caccatatttgagttgttgaaatgcc-tattgata-tttggagaagttaaaaaattagaatggtggtaacaccatatttgagtggtctcaacaccataat 8888147  T
Q  266 agagtgataacaatactatattgaagtggttttagtattaaa-gagtggtcttagtaccatatttgaaggtgtaaatctcgaacggttttctacagtgca 364  Q
     ||||| | ||||||| ||||||     |||| ||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  8888146 tgagtggttacaataccatattg-----gtttcagtattaaaagattggtcttagtaccatatt-gaaggtgtaattctcgaacggttttctacagtgta 8888053  T
Q  365 atagttaactgcacagttgtagttgtgcttgttttatcctggaggcggcgtcgttgat 422  Q
     |||||||| ||||||||| || ||   ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8888052 gtagttaaccgcacagttgcagctggatttgttttatcctggaggcggcgtggttgat 8887995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 289 - 415
Target Start/End: Original strand, 49971319 - 49971445
Alignment:
Q  289 aagtggttttagtattaaagagtggtcttagtaccatatttgaaggtgtaaatctcgaacggttttctacagtgcaatagttaactgcacagttgtagtt 388  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || |    
T  49971319 aagtggtttcagtattaaagagtggtctcagtaccatatttgagggtgtaattctcgaacggttttctacagtgaagtagttaactgcacagttgcagct 49971418  T
Q  389 gtgcttgttttatcctggaggcggcgt 415  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||    
T  49971419 ggacttgttttatcctggaggcggcgt 49971445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 168 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 3033957 - 3033709
Alignment:
Q  168 caccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatactttggagaaattaaag-ttaaaatggtggtaaaatcatatttgagtggtctcagcaccataaca 266  Q
    ||||||||||||||||| | | |||| |||||||| ||||||||| |||||  ||| ||||||||||| | |||||||||||||||||| || |||||      
T  3033957 caccatatttgagtggttgaaatgcc-tattgata-tttggagaagttaaaaattagaatggtggtaacaccatatttgagtggtctcaacatcataatt 3033860  T
Q  267 gagtgataacaatactatattgaagtggttttagtattaaa-gagtggtcttagtaccatatttgaaggtgtaaatctcgaacggttttctacagtgcaa 365  Q
    ||||| | ||||||| ||||||     |||| ||||||||| || || ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  3033859 gagtggttacaataccatattg-----gtttcagtattaaaagattgatcttagtaccatatt-gaaggtgtaattctcgaacggttttctacagtgcag 3033766  T
Q  366 tagttaactgcacagttgtagttgtgcttgttttatcctggaggcggcgtcgttgat 422  Q
    |||||||  | |||||||||| || |||||||||||||| ||||||| || ||||||    
T  3033765 tagttaatcgaacagttgtagctgagcttgttttatccttgaggcggtgtggttgat 3033709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 224 - 422
Target Start/End: Original strand, 12965703 - 12965901
Alignment:
Q  224 aatggtggtaaaatcatatttgagtggtctcagcaccataacagagtgataacaatactatattgaagtggttttagtattaaa-gagtggtcttagtac 322  Q
    ||||||||||| | ||||||||||| |||||||  |||||| |||||| ||| | ||| ||||| ||||||||| ||||||||| || ||||||| ||||    
T  12965703 aatggtggtaacaccatatttgagttgtctcagttccataatagagtggtaatattaccatattaaagtggtttcagtattaaaagaatggtcttggtac 12965802  T
Q  323 catatttgaaggtgtaaatctcgaacggttttctacagtgcaatagttaactgcacagttgtagttgtgcttgttttatcctggaggcggcgtcgttgat 422  Q
    |||||| || ||||||| ||| |||| ||||||||||||||| |||||||  | ||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12965803 catattgga-ggtgtaattcttgaacagttttctacagtgcattagttaatcgaacaattgtagttggacttgttttatcctggaggcggcgtggttgat 12965901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 20 - 234
Target Start/End: Original strand, 12112303 - 12112522
Alignment:
Q  20 gtcccttcggaataaagagtaccattaagatcatagtccctttttggaataataatgtcctgtcggaattaaagatgatcttaacggtatataaatattc 119  Q
    ||||||||| |||||| | |||  ||||||||||| ||||| |||| |||||||||||| ||| | ||||||  |||||||||||||||||||||||||     
T  12112303 gtcccttcgaaataaataatacttttaagatcatactccctatttgaaataataatgtcatgtggaaattaagaatgatcttaacggtatataaatatta 12112402  T
Q  120 tttcaatattt---aaattgag-gagaaattaaaaagttgaaaaggtgatatcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatactttggagaaatt 215  Q
    ||| |||||||    | ||||| |  ||| |||||| | |||| |||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||| ||    
T  12112403 ttttaatatttttctacttgagaggaaaaataaaaaatcgaaatggtagaatcaccatatttgaggggtcgtagtgccatattgatatattggagaactt 12112502  T
Q  216 aaa-gttaaaatggtggtaa 234  Q
    ||| |||| |||||||||||    
T  12112503 aaaggttagaatggtggtaa 12112522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 205 - 337
Target Start/End: Original strand, 10586000 - 10586127
Alignment:
Q  205 ttggagaaattaaagttaaaatggtggtaaaatcatatttgagtggtctcagcaccataacagagtgataacaatactatattgaagtggttttagtatt 304  Q
    |||||||| ||||| ||| ||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| || ||| || ||||||||| ||||     |||||| ||||||    
T  10586000 ttggagaagttaaaattagaatggtggtaacaccatatttgagtggtctcaacaccaaaatagaatggtaacaataccatat-----tggtttcagtatt 10586094  T
Q  305 aaagagtggtcttagtaccatatttgaaggtgt 337  Q
    ||||| |||||||||||||||||| || |||||    
T  10586095 aaagaatggtcttagtaccatattagagggtgt 10586127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 20 - 229
Target Start/End: Original strand, 32473555 - 32473754
Alignment:
Q  20 gtcccttcggaataaagagtaccattaagatcatagtccctttttggaataataatgtcctgtcggaattaaagatgatcttaacggtatata--aatat 117  Q
    ||||||||||||| ||||||    |||||| ||| |||||| ||||||| || ||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||  || |     
T  32473555 gtcccttcggaattaagagtgttcttaagaccatggtccctgtttggaaaaacaatgtcccgtcggaattaagaatgatcttaacggtatatataaaaag 32473654  T
Q  118 tctttcaatatttaaa--ttgaggagaaattaaaaagttgaaaaggtgatatcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatactttggagaaatt 215  Q
    | ||||||||||| |   ||||||||||||              |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||    
T  32473655 tatttcaatattttatatttgaggagaaat--------------ggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaactt 32473740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 289 - 422
Target Start/End: Original strand, 12112536 - 12112669
Alignment:
Q  289 aagtggttttagtattaaa-gagtggtcttagtaccatatttgaaggtgtaaatctcgaacggttttctacagtgcaatagttaactgcacagttgtagt 387  Q
    ||||||||| ||||||||| || | ||||| | |||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||| |  |||||||  | || |||||||    
T  12112536 aagtggtttaagtattaaaagaatagtctttgcaccatattgga-ggtgtaaatctcgaatggttttctacagtgtagcagttaaccacccatttgtagt 12112634  T
Q  388 tgtgcttgttttatcctggaggcggcgtcgttgat 422  Q
    || |||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  12112635 tgagcttgttttatcctggaggcggtgtggttgat 12112669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 44 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 11399796 - 11399711
Alignment:
Q  44 ttaagatcatagtccctttttggaataataatgtcctgtcggaattaaagatgatcttaacggtatataaatattctttcaatattt 130  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||   ||| ||||||  ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  11399796 ttaagatcatagtccctttt-ggaacaataatgtctgatcgaaattaagaatgatcttaacagtatataaatattgtttcaatattt 11399711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 128
Target Start/End: Original strand, 17025734 - 17025851
Alignment:
Q  13 aatataagtcccttcggaataaagagtaccattaagatcatagtccctttttggaataataatgtcctgtcggaattaaagatgatcttaacggtatat- 111  Q
    |||||| |||||||| ||||||| ||||   |||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||| |||||  |||||||| || ||||||     
T  17025734 aatatatgtcccttcagaataaaaagtatttttaagaccatagtccctttttgtaatgataatgtcccgtcgggattaagaatgatctttacagtatata 17025833  T
Q  112 -aaatattctttcaatat 128  Q
     |||||||||||| ||||    
T  17025834 aaaatattctttcgatat 17025851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 205 - 288
Target Start/End: Original strand, 45904355 - 45904438
Alignment:
Q  205 ttggagaaattaaagttaaaatggtggtaaaatcatatttgagtggtctcagcaccataacagagtgataacaatactatattg 288  Q
    |||||||| ||||| ||| ||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||| ||| |  ||||||||| ||||||    
T  45904355 ttggagaagttaaaattagaatggtggtaacaccatatttgagtggtctcaacaccataatagaatagtaacaataccatattg 45904438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 205 - 288
Target Start/End: Original strand, 45904811 - 45904894
Alignment:
Q  205 ttggagaaattaaagttaaaatggtggtaaaatcatatttgagtggtctcagcaccataacagagtgataacaatactatattg 288  Q
    |||||||| ||||| ||| ||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||| ||  || ||||||||| ||||||    
T  45904811 ttggagaagttaaaattagaatggtggtaacaccatatttgagtggtctcaacaccataataggatggtaacaataccatattg 45904894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 192 - 404
Target Start/End: Original strand, 17025904 - 17026115
Alignment:
Q  192 ccatattgatactttggagaaattaaagt-taaaatggtggtaaaatcatatttgagtggtctcagcaccataacagagtgataacaatactatattgaa 290  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||  |  ||||||| ||| | ||||||| |||||||| |||||||||  |||||| | |||  || |||||  |    
T  17025904 ccatattgatactttagagaacttaaaggctggaatggtgataacaccatatttaagtggtcttagcaccatactagagtggtcacagcaccatattaga 17026003  T
Q  291 gtggttttagtattaaagagtggtcttagtaccatatttgaaggtgtaaatctcgaacggttttctacagtgcaatagttaactgcacagttgtagttgt 390  Q
    ||| ||| | |||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||  | || ||  ||||||||| ||||| ||||| || ||||| |||||| ||     
T  17026004 gtgatttcaatattaaagagtggtattaggaccata-ttaaaggtgtatgtgtcaaattgttttctaccgtgcagtagtt-accgcacaattgtagctga 17026101  T
Q  391 gcttgttttatcct 404  Q
     |||||||||||||    
T  17026102 acttgttttatcct 17026115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 357 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 29715774 - 29715709
Alignment:
Q  357 acagtgcaatagttaactgcacagttgtagttgtgcttgttttatcctggaggcggcgtcgttgat 422  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||| ||  ||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  29715774 acagtgcaatagttaaccgcacagctgtagctggacttgttttatcctagaggcggcgtggttgat 29715709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 209 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 31002970 - 31002847
Alignment:
Q  209 agaaattaaagttaaaatggtggtaaaatcatatttgagtggtctcagcaccataacagagtgataacaatactatattgaagtggttttagtattaaag 308  Q
    |||| ||||| ||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||  ||||||| ||| || ||||||||  ||||     ||||||  || ||||||    
T  31002970 agaagttaaaattagaatggtggtaacaccatatttgagtggtctcaataccataatagaatggtaacaatatcatat-----tggtttcggtgttaaag 31002876  T
Q  309 agtggtcttagtaccatatttgaaggtgt 337  Q
    ||||||||||||| |||||| || |||||    
T  31002875 agtggtcttagtaacatattagagggtgt 31002847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 160 - 410
Target Start/End: Original strand, 19276686 - 19276936
Alignment:
Q  160 ggtgatatcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatactttgga-gaaattaaag-ttaaaatggtggtaaaatcatatttgagtggtctcagc 257  Q
    |||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||| || | | |||||| ||| || | || ||| | || ||||||||||| | |||    
T  19276686 ggtggtatcaccatatttgagtggttgtggtaccatattgatatttttgaaggatttaaaggttagaacgatgataacaccaaatttgagtggttt-agc 19276784  T
Q  258 accataacagagtgataacaatactatattgaagtggttttagtattaaagagtggtcttagtaccatatttgaaggtgtaaatctcgaacggttttcta 357  Q
    ||||||| |||||  | | | ||  |||||  | |||| ||||||| ||||||  ||||| ||| |||||| || ||||||||||||||||  ||||| |    
T  19276785 accataatagagtagtcatagtatcatattagactggtgttagtataaaagagatgtcttcgtatcatattaga-ggtgtaaatctcgaacaattttcaa 19276883  T
Q  358 cagtgcaatagttaactgcacagttgtagttgtgcttgttttatcctggaggc 410  Q
    || |||| ||| |||| ||| |||| || ||| ||||||||||| || |||||    
T  19276884 cattgcagtagctaaccgcatagttttaattgagcttgttttattctagaggc 19276936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 29350705 - 29350641
Alignment:
Q  13 aatataagtcccttcggaataaagagtaccattaagatcatagtccctttttggaataataatgt 77  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| ||   ||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  29350705 aatatatgtcccttcagaataaagaatatttttaagatcatagtccctatttggaataacaatgt 29350641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 13 - 63
Target Start/End: Original strand, 10708333 - 10708383
Alignment:
Q  13 aatataagtcccttcggaataaagagtaccattaagatcatagtccctttt 63  Q
    |||||| |||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||    
T  10708333 aatatatgtccattcggaataaaaagtattattaagatcatagtccctttt 10708383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 242; Significance: 1e-134; HSPs: 42)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 13 - 422
Target Start/End: Original strand, 2699726 - 2700134
Alignment:
Q  13 aatataagtcccttcggaataaagagtaccattaagatcatagtccctttttggaataataatgtcctgtcggaattaaagatgatcttaacggtatata 112  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||| ||||||    
T  2699726 aatataagttccttcggaataaagagtactattaagatcatagtcccttttcgaaataataatgtcccgtcagaattaagaatgatcttaacgatatata 2699825  T
Q  113 aatattctttcaatatttaaattgaggagaaattaaaaagttgaaaaggtgatatcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatactttggagaa 212  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||| || ||    
T  2699826 aatattctttcaatattttaattgaggagatattaaaaagtggaaatggcgatatcaccatatttgaatggtcgtagtgtcatattgatattttagaaaa 2699925  T
Q  213 attaaagttaaaatggtggtaaaatcatatttgagtggtctcagcaccataacagagtgataacaatactatattgaagtggttttagtattaaagagtg 312  Q
    |||||||||| |||||||| || | | ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  2699926 attaaagttagaatggtggcaacaccgtatttgagtggtctcagcaccataacatagtggtaacaataccatattaaagtggtttcagtattaaagagtg 2700025  T
Q  313 gtcttagtaccatatttgaaggtgtaaatctcgaacggttttctacagtgcaatagttaactgcacagttgtagttgtgcttgttttatcctggaggcgg 412  Q
     ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||| |||||||||||||| |||||||  | ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  2700026 atcttagtaccatatttggaggtgtaattctcg-acgattttctacagtgcagtagttaatcgaacagttgtagttgggcttgttttatcctggaagcgg 2700124  T
Q  413 cgtcgttgat 422  Q
    ||| ||||||    
T  2700125 cgtggttgat 2700134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 13 - 410
Target Start/End: Original strand, 4156986 - 4157385
Alignment:
Q  13 aatataagtcccttcggaataaagagtaccattaagatcatagtccctttttggaataataatgtcctgtcggaattaaagatgatcttaacgg--tata 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| ||  ||||    
T  4156986 aatataagtcccttcggaataaagagtattattaagatcataatccctttttagaataataatgtcccgtcggaattaagaatgatcttaatgggatata 4157085  T
Q  111 taaatattctttcaatatttaaattgaggagaaattaaaaagttgaaaaggtgatatcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatactttggag 210  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||  |||||||    
T  4157086 taaatattctttcaatattttaattgaagagaaattaaaaagtggaaatggtgatatcaccatatttgagtggtggtagtatcatattgatgttttggag 4157185  T
Q  211 aaattaaagttaaaatggtggtaaaatcatatttgagtggtctcagcaccataacagagtgataacaatactatattgaagtggttttagtattaaagag 310  Q
    |||||||||||  ||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||  ||||| ||||| ||| ||||||||||||    
T  4157186 aaattaaagtttgaatggtggtgacaccatatttgagtggtctcagcaccataacagagcggtaacaataacatattaaagtgatttcagtattaaagag 4157285  T
Q  311 tggtcttagtaccatatttgaaggtgtaaatctcgaacggttttctacagtgcaatagttaactgcacagttgtagttgtgcttgttttatcctggaggc 410  Q
    || | |||| ||||||||| | ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| || | |||||||||||| |||||    
T  4157286 tgatattagcaccatatttaagggtgtaaatttcgaacgattttctacagtgcagtagttaaccgcaccgttgtagctgagtttgttttatcctagaggc 4157385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 19 - 415
Target Start/End: Original strand, 12405976 - 12406374
Alignment:
Q  19 agtcccttcggaataaagagtaccattaagatcatagtccctttttggaataataatgtcctgtcggaattaaagatgatcttaacggtatataaatatt 118  Q
    ||||| |||| |||||||||||   |||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| ||||||  |||| |||||| |||||||||||||    
T  12405976 agtcctttcgaaataaagagtatttttaagatcatagtccctttt-ggaacaataatgtcccgtcgaaattaagaatgagcttaacagtatataaatatt 12406074  T
Q  119 ctttcaatattta---aattgaggagaaattaaaaagttgaaaaggtgatatcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatactttggagaaatt 215  Q
    ||||||||||||    ||||||||||||||||||| ||  ||| |||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  12406075 ctttcaatatttttctaattgaggagaaattaaaatgtcaaaatggtagtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaaatt 12406174  T
Q  216 aaagttaaaatggtggtaaaatcatatttgagtggtctcagcaccataacagagtgataacaatactatattgaagtggttttagtattaaagagtggtc 315  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||| |||| |     
T  12406175 aaagttaaaatagtggtaacatcatatttgagtggtatcagcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtggtttcagtattaaaaagtgatt 12406274  T
Q  316 ttagtaccatatttgaaggtgtaaatctcgaacggttttctacagtgcaatagttaactgcacagttgtagttgtgcttgttttatcctggaggcggcgt 415  Q
    |||||| ||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||| ||||| ||||||||  |||||||||||||| || ||||||||| || |||||||||    
T  12406275 ttagtatcatatttgagggtataaatctctcacggttttctacggtgcagtagttaaccacacagttgtagttgagcatgttttatcatgaaggcggcgt 12406374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 13 - 422
Target Start/End: Original strand, 17964188 - 17964587
Alignment:
Q  13 aatataagtcccttcggaataaagagtaccattaagatcatagtccctttttggaataataatgtcctgtcggaattaaagatgatcttaacggtatata 112  Q
    |||||| |||| |||  ||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| || ||||||  |||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  17964188 aatatatgtccattcaaaataaagagtacttttaagatcatagtccctatttggaagaacaatgtcgcgtcggaattaagaatgatcttaacggtatata 17964287  T
Q  113 --aatattctttcaatattta--aattgaggagaaattaaaaagttgaaaaggtgatatcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatactttgg 208  Q
      || | | |||||||||||   | ||||||||||||              |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  17964288 taaaaagtatttcaatattttttatttgaggagaaat--------------ggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttgg 17964373  T
Q  209 agaaattaaagttaaaatggtggtaaaatcatatttgagtggtctcagcaccataacagagtgataacaatactatattgaagtggttttagtattaaag 308  Q
    |||| ||||||||| ||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  17964374 agaacttaaagttagaatggtgttaacaccatatttgagtggtctcagcaccataacagagtggtaacaatttcatattaaagtggtttcagtattaaag 17964473  T
Q  309 agtggtcttagtaccatatttgaaggtgtaaatctcgaacggttttctacagtgcaatagttaactgcacagttgtagttgtgcttgttttatcctggag 408  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| || || ||||||||||||||||||    
T  17964474 agtggtcttagtaccatatttgaaggtgtaattctcgaacggttttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgcagctgggcttgttttatcctggag 17964573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 20 - 422
Target Start/End: Original strand, 6407497 - 6407888
Alignment:
Q  20 gtcccttcggaataaagagtaccattaagatcatagtccctttttggaataataatgtcctgtcggaattaaagatgatcttaacggtatata--aatat 117  Q
    |||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| || ||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||  || |     
T  6407497 gtcccttcagaataaagagtacttttaagatcatagtccctatttggaagaacaatgtcccgtcggaattaagaatgatcttaacggtatatataaaaag 6407596  T
Q  118 tctttcaatattta--aattgaggagaaattaaaaagttgaaaaggtgatatcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatactttggagaaatt 215  Q
    | |||||||||||   | |||||||||||| |              || |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||| || ||    
T  6407597 tatttcaatattttttatttgaggagaaatga--------------tggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccgtattgatagtttggaaaactt 6407682  T
Q  216 aaagttaaaatggtggtaaaatcatatttgagtggtctcagcaccataacagagtgataacaatactatattgaagtggttttagtattaaagagtggtc 315  Q
    ||||||| ||||||  ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  6407683 aaagttagaatggtattaacaccatatttgagtggtctcagcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtggtttcagtattaaagagtggtc 6407782  T
Q  316 ttagtaccatatttgaaggtgtaaatctcgaacggttttctacagtgcaatagttaactgcacagttgtagttgtgcttgttttatcctggaggcggcgt 415  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  6407783 ttagtaccatatttggaggtgtaattcttgaacggttttctacagtg-agtagttaaccgcacagttgtagctgagcttgttttatcctggaggcggcgt 6407881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 13 - 415
Target Start/End: Original strand, 11559849 - 11560242
Alignment:
Q  13 aatataagtcccttcggaataaagagtaccattaagatcatagtccctttttggaataataatgtcctgtcggaattaaagatgatcttaacggtat--a 110  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||  ||||||||||  ||||||||||| ||||  |    
T  11559849 aatatatgtcccttcggaataaagagtacttttaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcccatcggaattaagaatgatcttaacagtattta 11559948  T
Q  111 taaatattctttcaatattta---aattgaggagaaattaaaaagttgaaaaggtgatatcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatactttg 207  Q
    |||| | | |||||||||||    | ||||||||||||              |||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  ||||    
T  11559949 taaaaagtatttcaatatttttctatttgaggagaaat--------------ggtggtatcaccatatctaagtggtcgtagtgccatattgatgttttg 11560034  T
Q  208 gagaaattaaagttaaaatggtggtaaaatcatatttgagtggtctcagcaccataacagagtgataacaatactatattgaagtggttttagtattaaa 307  Q
    |||||| |||||||| |||||||  || | |||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||| ||||| ||||||||| | |||||||    
T  11560035 gagaaactaaagttagaatggtgacaacaccatatttgagtggtctcaacaccataacagagtggttacaataccatattaaagtggtttcaatattaaa 11560134  T
Q  308 gagtggtcttagtaccatatttgaaggtgtaaatctcgaacggttttctacagtgcaatagttaactgcacagttgtagttgtgcttgttttatcctgga 407  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| |||| ||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11560135 gagtggtcttagtaccatatttgagggtgtaattctggaacggttttctacaatgcagtagttcaccgcacagttgtagttgagcttgttttatcctgga 11560234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 13 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 5856481 - 5856155
Alignment:
Q  13 aatataagtcccttcggaataaagagtaccattaagatcatagtcccttttt-ggaataataatgtcctgtcggaattaaagatgatcttaacggtatat 111  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||  |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||   ||| ||||||| || ||||||| |||||||    
T  5856481 aatataagtcccttcgaaataaagaatat-attaagttcatagtcccttttttggaataataatgtctcatcgaaattaaa-ataatcttaatggtatat 5856384  T
Q  112 aaatattctttcaatatttaaattgaggagaaattaaaaagttgaaaaggtgatatcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatactttggaga 211  Q
    ||||||||||  |||| |||| |||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  5856383 aaatattcttaaaatacttaa-ttgaggagaaattaaaaagtggaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtaatgccatattgatactttggaaa 5856285  T
Q  212 aattaaagttaaaatggtggtaaaatcatatttgagtggtctcagcaccataacagagtgataacaatactatattgaagtggttttagtattaaagagt 311  Q
    ||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||| | |||||||| |||||| ||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||    
T  5856284 aattaaagttagaatggtggtaacaccatatttgagtggtcttaacaccataatagagtggtaacaataccatatt-aagtggtttcagtattatagagt 5856186  T
Q  312 ggtcttagtaccatatttgaaggtgtaaatc 342  Q
    | | ||| |||||||||||||||||||||||    
T  5856185 gattttactaccatatttgaaggtgtaaatc 5856155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 20 - 403
Target Start/End: Original strand, 19995034 - 19995412
Alignment:
Q  20 gtcccttcggaataaagagtaccattaagatcatagtccctttttggaataataatgtcctgtcggaattaaagatgatcttaacggtatataaatattc 119  Q
    |||||||| |||||||||||||  ||| |||||||||||||||| |||| ||||||||  |||  |||||||  ||||||||||  ||||| ||||||||    
T  19995034 gtcccttcagaataaagagtact-ttaggatcatagtccctttt-ggaacaataatgttttgtacgaattaagaatgatcttaaatgtatacaaatattc 19995131  T
Q  120 tttcaatatttaaattgaggagaaattaaaaagttgaaaaggtgatatcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatactttggagaaattaaag 219  Q
    || ||||||||   |||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  19995132 ttccaatattt---ttgaggagaaattaaaaagtcgaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatattttggagaacttaaag 19995228  T
Q  220 ttaaaatggtggtaaaatcatatttgagtggtctcagcaccataacagagtgataacaatactatattgaagtggttttagtattaaagagtggtcttag 319  Q
    ||| |||| |||||| | | || ||||| |||||||  ||||||||| |||| ||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||| |||| | ||||    
T  19995229 ttagaatgatggtaacaccgtagttgaggggtctcataaccataacaaagtggtaacaataccatattaaagtggtttcagtattaaatagtgtttttag 19995328  T
Q  320 taccatatttgaaggtgtaaatctcgaacggttttctacagtgcaatagttaactgcacagttgtagttgtgcttgttttatcc 403  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||| | |||||||| ||| |||||||| || |||||||||||||    
T  19995329 tacgatatttgagggtgtaaatctcgaaaggttttctacggtgtagtagttaaccgcatagttgtagctgggcttgttttatcc 19995412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 13 - 415
Target Start/End: Original strand, 11534339 - 11534732
Alignment:
Q  13 aatataagtcccttcggaataaagagtaccattaagatcatagtccctttttggaataataatgtcctgtcggaattaaagatgatcttaacggtat--a 110  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||  ||| ||||||  ||||||||||| ||||  |    
T  11534339 aatatatgtcccttaggaataaagaatacttttaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcccatcgaaattaagaatgatcttaacagtattta 11534438  T
Q  111 taaatattctttcaatattta---aattgaggagaaattaaaaagttgaaaaggtgatatcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatactttg 207  Q
    |||| | | |||||||||||    | ||||||||||||              |||| ||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||  ||||    
T  11534439 taaaaagtatttcaatatttttctatttgaggagaaat--------------ggtggtatcaccatatataagtggtcatagtgccatattgatgttttg 11534524  T
Q  208 gagaaattaaagttaaaatggtggtaaaatcatatttgagtggtctcagcaccataacagagtgataacaatactatattgaagtggttttagtattaaa 307  Q
    |||||| |||||||| |||||||| || | |||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||| ||||| ||||||||| | |||||||    
T  11534525 gagaaactaaagttagaatggtggcaacaccatatttgagtggtctcaacaccataacagagtggttacaataccatattaaagtggtttcaatattaaa 11534624  T
Q  308 gagtggtcttagtaccatatttgaaggtgtaaatctcgaacggttttctacagtgcaatagttaactgcacagttgtagttgtgcttgttttatcctgga 407  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| |||| ||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11534625 gagtggtcttagtaccatatttgagggtgtaattctggaacggttttctacaatgcagtagttcaccgcacagttgtagttgagcttgttttatcctgga 11534724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 51 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 11428436 - 11428125
Alignment:
Q  51 catagtccctttttggaataataatgtcctgtcggaattaaagatgatcttaacggtatataaatattctttcaatattta---aattgaggagaaatta 147  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||| | ||| |||||||  ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    | ||||||||||||      
T  11428436 catagtccctatttggaataacaatgttccgtcagaattaagaatgatcttaacggtatataaaaattatttcaatatttttctatttgaggagaaat-- 11428339  T
Q  148 aaaagttgaaaaggtgatatcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatactttggagaaattaaagttaaaatggtggtaaaatcatatttgag 247  Q
                |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||||||||||| | ||||||||||    
T  11428338 ------------ggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatgttttggagaaatgaaagttagaatggtggtaacaccatatttgag 11428251  T
Q  248 tggtctcagcaccataacagagtgataacaatactatattgaagtggttttagtattaaagagtggtcttagtaccatatttgaaggtgtaaatctcgaa 347  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11428250 tggtctcaacaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtggtttcagtattaaagagtagtcttagtaccatatttgatggtgtaaatctcgaa 11428151  T
Q  348 cggttttctacagtgcaatagttaac 373  Q
    ||||||||||||||||| || |||||    
T  11428150 cggttttctacagtgcagtacttaac 11428125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 155 - 422
Target Start/End: Original strand, 11570510 - 11570777
Alignment:
Q  155 gaaaaggtgatatcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatactttggagaaattaaagttaaaatggtggtaaaatcatatttgagtggtctc 254  Q
    |||| |||| ||||||||||||| |||||||||| || |||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||| || | ||||||||||||||||     
T  11570510 gaaatggtggtatcaccatatttaagtggtcgtaatgacatattgatgttttggagaaattaaagttagaatggtggcaacaccatatttgagtggtctt 11570609  T
Q  255 agcaccataacagagtgataacaatactatattgaagtggttttagtattaaagagtggtcttagtaccatatttgaaggtgtaaatctcgaacggtttt 354  Q
    | ||||||||||||||| | ||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||| ||||||||||    
T  11570610 aacaccataacagagtggttacaataccatattaaagtggtttcagtattaaagagtggtcttagtaccatatttgagggtataattctggaacggtttt 11570709  T
Q  355 ctacagtgcaatagttaactgcacagttgtagttgtgcttgttttatcctggaggcggcgtcgttgat 422  Q
    |||||| | | ||||| || |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11570710 ctacagcggagtagttcaccgcacagttgtagctgagcttgttttatcctggaggcggcgtggttgat 11570777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 171 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 12689289 - 12689038
Alignment:
Q  171 catatttgagtggtcgtagtgccatattgatactttggagaaattaaagttaaaatggtggtaaaatcatatttgagtggtctcagcaccataacagagt 270  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||| || | |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12689289 catatttgagtggtcatagtgtcatattgatgttttggagaaattaaagttagaatggtggcaacaccatatttgagtggtctcaacaccataacagagt 12689190  T
Q  271 gataacaatactatattgaagtggttttagtattaaagagtggtcttagtaccatatttgaaggtgtaaatctcgaacggttttctacagtgcaatagtt 370  Q
    | ||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||||||| |||||| ||||||| |||| ||||||| | |||||||||||||||||||| | |||||    
T  12689189 ggtaacaatacgatattaaagtggtttcaatattaaagagtcgtcttaataccataattgagggtgtaattgtcgaacggttttctacagtgtagtagtt 12689090  T
Q  371 aactgcacagttgtagttgtgcttgttttatcctggaggcggcgtcgttgat 422  Q
    ||| |||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  12689089 aaccgcacagttgtagctgagcttgttttatcctggagacggcgtggttgat 12689038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 164 - 422
Target Start/End: Original strand, 29892031 - 29892289
Alignment:
Q  164 atatcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatactttggagaaattaaagttaaaatggtggtaaaatcatatttgagtggtctcagcaccata 263  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||| | |||||||||||| ||| || ||||||    
T  29892031 atatcactatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaaattaaatttagaatggtggtaacaccatatttgagtgctcttagtaccata 29892130  T
Q  264 acagagtgataacaatactatattgaagtggttttagtattaaagagtggtcttagtaccatatttgaaggtgtaaatctcgaacggttttctacagtgc 363  Q
    |||||||| ||||||||| ||||| ||| | ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| |||    
T  29892131 acagagtggtaacaataccatattaaagcgatttcagtattaaagagtgatcttagtaccatatttgagggtgtaaatatcgaaaggttttctacaatgc 29892230  T
Q  364 aatagttaactgcacagttgtagttgtgcttgttttatcctggaggcggcgtcgttgat 422  Q
    ||||||||||  ||||||||||| ||  |||||||||||||||||| || || ||||||    
T  29892231 aatagttaaccacacagttgtagctggacttgttttatcctggaggaggtgtggttgat 29892289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 20 - 422
Target Start/End: Original strand, 16835794 - 16836184
Alignment:
Q  20 gtcccttcggaataaagag--taccattaagatcatagtccctttttggaataataatgtcctgtcggaattaaagatgatcttaacggtatata-aata 116  Q
    |||||||| ||||||||||  |||  ||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||  ||||||||||| ||||||| || |    
T  16835794 gtcccttcagaataaagagagtacttttaaggtcatagtccctatttggaataacaatgtcccgtcggaattaagaatgatcttaacagtatatataaaa 16835893  T
Q  117 ttctttcaatattta---aattgaggagaaattaaaaagttgaaaaggtgatatcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatactttggagaaa 213  Q
     | |||||||||||    | || ||||||||||              ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||     
T  16835894 atatttcaatatttttctatttaaggagaaatt--------------gtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattaatgttttggagaag 16835979  T
Q  214 ttaaagttaaaatggtggtaaaatcatatttgagtggtctcagcaccataacagagtgataacaatactatattgaagtggttttagtattaaagagtgg 313  Q
    ||||||||| |||||||| || | |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| | ||||||| |||     ||||||| |||||||||||||||    
T  16835980 ttaaagttagaatggtggcaacaccatatttgagtggtctcaacaccataacagtgtggttacaataccatag----gtggtttcagtattaaagagtgg 16836075  T
Q  314 tcttagtaccatatttgaaggtgtaaatctcgaacggttttctacagtgcaatagttaactgcacagttgtagttgtgcttgttttatcctggaggcggc 413  Q
    ||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  16836076 tcttagtaccaaatatgagggtgtaattctcgaacggttttctacagtgcagtaactaaccgcacagttgtagctgggcttgttttatcctggaggcggc 16836175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 13 - 330
Target Start/End: Original strand, 25314085 - 25314393
Alignment:
Q  13 aatataagtcccttcggaataaagagtaccattaagatcatagtccc--tttttggaataataatgtcctgtcggaattaaagatgatcttaacggtata 110  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||  | |||||||||| ||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||    
T  25314085 aatatatgtcccttcagaataaagagtacttttaagatcatagtccccctatttggaataacaatgtcccgtcggaattaagaatgatcttaacggtata 25314184  T
Q  111 taaatattctttcaatattta---aattgaggagaaattaaaaagttgaaaaggtgatatcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatactttg 207  Q
    |||| | | |||||| ||||    | ||||||||||||               ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  25314185 taaaaagtatttcaacatttttctatttgaggagaaata--------------gtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatgttttg 25314270  T
Q  208 gagaaattaaagttaaaatggtggtaaaatcatatttgagtggtctcagcaccataacagagtgataacaatactatattgaagtggttttagtattaaa 307  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| ||| |||||||||    
T  25314271 gagaaattaaagttagaatggtggtaacaccatatttgagtggtctcaacaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtgatttcagtattaaa 25314370  T
Q  308 gagtggtcttagtaccatatttg 330  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  25314371 gagtggtcttagtaccatatttg 25314393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 13 - 330
Target Start/End: Original strand, 26201579 - 26201887
Alignment:
Q  13 aatataagtcccttcggaataaagagtaccattaagatcatagtccc--tttttggaataataatgtcctgtcggaattaaagatgatcttaacggtata 110  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||  | |||||||||| ||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||    
T  26201579 aatatatgtcccttcagaataaagagtacttttaagatcatagtccccctatttggaataacaatgtcccgtcggaattaagaatgatcttaacggtata 26201678  T
Q  111 taaatattctttcaatattta---aattgaggagaaattaaaaagttgaaaaggtgatatcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatactttg 207  Q
    |||| | | |||||| ||||    | ||||||||||||               ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  26201679 taaaaagtatttcaacatttttctatttgaggagaaata--------------gtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatgttttg 26201764  T
Q  208 gagaaattaaagttaaaatggtggtaaaatcatatttgagtggtctcagcaccataacagagtgataacaatactatattgaagtggttttagtattaaa 307  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| ||| |||||||||    
T  26201765 gagaaattaaagttagaatggtggtaacaccatatttgagtggtctcaacaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtgatttcagtattaaa 26201864  T
Q  308 gagtggtcttagtaccatatttg 330  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  26201865 gagtggtcttagtaccatatttg 26201887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 44 - 331
Target Start/End: Original strand, 11613415 - 11613704
Alignment:
Q  44 ttaagatcatagtccctttttggaataataatgtcctgtcggaattaaagatgatcttaacggtatataaatattctttcaatattta--aattgaggag 141  Q
    |||||||||||||| ||||| |||| |||||||| | ||| |||||||  |||||||||||  |||||||||||||||| |||||||   | ||| ||||    
T  11613415 ttaagatcatagtcactttt-ggaacaataatgttccgtcagaattaagaatgatcttaacaatatataaatattcttttaatattttctacttgcggag 11613513  T
Q  142 aaattaaaaagttgaaaaggtgatatcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatactttggagaaattaaagttaaaatggtggtaaaatcata 241  Q
    |||||||||||| |||| |||| |||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||| | ||||||| ||||||||||| | ||||    
T  11613514 aaattaaaaagtcgaaatggtggtatcaccataattgagtggtcgtag-gctatattgatattttggagaactcaaagttagaatggtggtaacaccata 11613612  T
Q  242 tttgagtggtctcagcaccataacagagtgataacaatac--tatattgaagtggttttagtattaaagagtggtcttagtaccatatttga 331  Q
    |||||| ||||| |||||||||| |||||| ||| |||||  |||||| ||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  11613613 tttgagaggtcttagcaccataatagagtggtaataataccatatattaaagtggtttcagtattaaatagtgatcttagtaccatatttga 11613704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 224 - 422
Target Start/End: Original strand, 33687433 - 33687631
Alignment:
Q  224 aatggtggtaaaatcatatttgagtggtctcagcaccataacagagtgataacaatactatattgaagtggttttagtattaaagagtggtcttagtacc 323  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||  ||||| ||||||||| | |||||||||||||| ||||||||    
T  33687433 aatggtggtaacatcatatttgagtggtctcggcaccataacagagtggtgacaatatcatattaaagtggtttcaatattaaagagtggttttagtacc 33687532  T
Q  324 atatttgaaggtgtaaatctcgaacggttttctacagtgcaatagttaactgcacagttgtagttgtgcttgttttatcctggaggcggcgtcgttgat 422  Q
    |||||||| ||||||||||||||| | ||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||| | ||||||    
T  33687533 atatttgagggtgtaaatctcgaaggattttctacaatgcagtagttaaccgcacagttgtagttgagtttgttttatcctggagacggcatggttgat 33687631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 22 - 232
Target Start/End: Original strand, 22694949 - 22695161
Alignment:
Q  22 cccttcggaataaagagtaccattaagatcatagtccctttttggaataataatgtcctgtcggaattaaagatgatcttaacggtatataaatattctt 121  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| | || |||||||||| |||| ||||||  ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  22694949 cccttcggaataaagagtacttttaagatcatagtccctttt-gaaacaataatgtcccgtcgaaattaagaatgatcttaacagtatagaaatattctt 22695047  T
Q  122 tcaatattta---aattgaggagaaattaaaaagttgaaaaggtgatatcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatactttggagaaattaaa 218  Q
    |||||||||    |||| ||||||||||||||||| |||  |||| |||||||||||||||||||| |||||  ||| |||||| ||||||||| |||||    
T  22695048 tcaatatttttctaattaaggagaaattaaaaagtcgaattggtggtatcaccatatttgagtggttgtagtatcatgttgatagtttggagaacttaaa 22695147  T
Q  219 gttaaaatggtggt 232  Q
    |||| |||||||||    
T  22695148 gttagaatggtggt 22695161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 228 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 14509245 - 14509051
Alignment:
Q  228 gtggtaaaatcatatttgagtggtctcagcaccataacagagtgataacaatactatattgaagtggttttagtatt-aaagagtggtcttagtaccata 326  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||| ||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  14509245 gtggtaacaccatatttgagtggtctcaacaccataatagagtgataacagtaccatattaaagtggtttcagtattaaaagaatggtcttggtaccata 14509146  T
Q  327 tttgaaggtgtaaatctcgaacggttttctacagtgcaatagttaactgcacagttgtagttgtgcttgttttatcctggaggcggcgtcgttgat 422  Q
     ||| |||||||| ||||||||| ||||||||| |||| |||||||  | |||||||||| || |||||||||||| |||| ||||||| ||||||    
T  14509145 -ttggaggtgtaattctcgaacgattttctacaatgcagtagttaatcgaacagttgtagatgagcttgttttatcttggaagcggcgtggttgat 14509051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 168 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 8748098 - 8747849
Alignment:
Q  168 caccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatactttggagaaattaaag-ttaaaatggtggtaaaatcatatttgagtggtctcagcaccataaca 266  Q
    ||||||||||||||||| | | | ||||||||||| ||||||||   ||||  ||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||| ||||||||      
T  8748098 caccatatttgagtggttgaaataccatattgata-tttggagatgctaaaaattagaatggtggtaacaccatatttgaatggtctcaacaccataatt 8748000  T
Q  267 gagtgataacaatactatattgaagtggttttagtattaaa-gagtggtcttagtaccatatttgaaggtgtaaatctcgaacggttttctacagtgcaa 365  Q
    ||||| | ||||||| ||||||     |||| |||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||     
T  8747999 gagtggttacaataccatattg-----gtttcagtaataaaagagtggtcttagtaccatatt-gaaggtgtaattttcgaacggttttctacagtgcag 8747906  T
Q  366 tagttaactgcacagttgtagttgtgcttgttttatcctggaggcggcgtcgttgat 422  Q
    ||||||||  || ||||| || || ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8747905 tagttaaccacatagttgcagctgagcttgttttatcctggaggcggcgttgttgat 8747849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 247 - 422
Target Start/End: Original strand, 24589022 - 24589192
Alignment:
Q  247 gtggtctcagcaccataacagagtgataacaatactatattgaagtggttttagtattaaa-gagtggtcttagtaccatatttgaaggtgtaaatctcg 345  Q
    ||||||||| |||||||| |||||| | ||| ||| ||||||     |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  24589022 gtggtctcaacaccataatagagtggttacattaccatattg-----gtttcagtattaaaagagtggtcttagtaccatatt-gaaggtgtaattctcg 24589115  T
Q  346 aacggttttctacagtgcaatagttaactgcacagttgtagttgtgcttgttttatcctggaggcggcgtcgttgat 422  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  24589116 aacggttttctacaatgcagtagttaaccgcacagttgtagttggacttgttttatcctggagacggcgtggttgat 24589192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 283 - 422
Target Start/End: Original strand, 20748173 - 20748312
Alignment:
Q  283 atattgaagtggttttagtattaaa-gagtggtcttagtaccatatttgaaggtgtaaatctcgaacggttttctacagtgcaatagttaactgcacagt 381  Q
    |||||| ||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  20748173 atattggagtagttttagtattaaaagagtggttttagtaccatattt-aaggtgtaattctcgaaccgttttctacggtgcagtagttaaccgcacagt 20748271  T
Q  382 tgtagttgtgcttgttttatcctggaggcggcgtcgttgat 422  Q
    ||||| ||  |||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  20748272 tgtagatggacttgttttattctggaggcggcgtggttgat 20748312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 205 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 17913881 - 17913768
Alignment:
Q  205 ttggagaaattaaagttaaaatggtggtaaaatcatatttgagtggtctcagcaccataacagagtgataacaatactatattgaagtggttttagtatt 304  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||  ||| |  |||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||| |||| |||| ||||||    
T  17913881 ttggagaacttaaagttagaatggtaataacactatatttaagtggtctcaacaccataacagagtggtaacaatactgtattaaagtagtttcagtatt 17913782  T
Q  305 aaagagtggtctta 318  Q
    ||||||||||||||    
T  17913781 aaagagtggtctta 17913768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 217 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 22609841 - 22609642
Alignment:
Q  217 aagttaaaatggtggtaaaatcatatttgagtggtctcagcaccataacagagtgataacaatactatattgaagtggttttagtattaa--agagtggt 314  Q
    |||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |  ||    |||| || ||||  ||||||||| |  |||||  ||||||||    
T  22609841 aagttagaatggtggtaacaccatatttgagtggtctcagcaccataataatgttggcacaacaccatatcaaagtggtttaaaaattaataagagtggt 22609742  T
Q  315 cttagtaccatatttgaaggtgtaaatctcgaacggttttctacagtgcaatagttaactgcacagttgtagttgtgcttgttttatcctggaggcggcg 414  Q
    | || ||||||||| || ||||||| |||||||  ||||||||| ||||| | |||||   | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22609741 catattaccatattgga-ggtgtaattctcgaatagttttctaccgtgcagttgttaatcacgcagttgtagttgagcttgttttatcctggaggcggcg 22609643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 337 - 422
Target Start/End: Original strand, 11614035 - 11614120
Alignment:
Q  337 taaatctcgaacggttttctacagtgcaatagttaactgcacagttgtagttgtgcttgttttatcctggaggcggcgtcgttgat 422  Q
    |||||||| ||| |||||||| |||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11614035 taaatctcaaacagttttctaaagtgcattagttaaccgcacaattgtaattgtgcttgttttatcctggaggcggcgtggttgat 11614120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 262 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 21309241 - 21309098
Alignment:
Q  262 taacagagtgataacaatactatattgaagtggttttagtattaaagagtggtcttagtaccatatttgaaggtgtaaatctcgaacggttttctacagt 361  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||| | ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||                 ||    
T  21309241 taacagagtggtaacaataccatattaatgtgatttcagtattaaagagtggtcttagtaccgtatttgaaggtataaatc-----------------gt 21309159  T
Q  362 gcaatagttaactgcacagttgtagttgtgcttgttttatcctggaggcggcgtcgttgat 422  Q
    ||| |||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21309158 gcagtagttaaccgcacagttgtagctgagcttgttttatcctggaggcggcgtggttgat 21309098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 332 - 410
Target Start/End: Original strand, 13736616 - 13736694
Alignment:
Q  332 aggtgtaaatctcgaacggttttctacagtgcaatagttaactgcacagttgtagttgtgcttgttttatcctggaggc 410  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||   ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13736616 aggtgtaaatctcgaacagttttctacagtgcagtagttattcgcacatttgtagatgtgcttgttttatcctggaggc 13736694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 13 - 91
Target Start/End: Original strand, 33687279 - 33687357
Alignment:
Q  13 aatataagtcccttcggaataaagagtaccattaagatcatagtccctttttggaataataatgtcctgtcggaattaa 91  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  33687279 aatatatgttccttcggaataaagagtacttttaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcccgtcggaattaa 33687357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 13 - 109
Target Start/End: Original strand, 11570377 - 11570472
Alignment:
Q  13 aatataagtcccttcggaataaagagtaccattaagatcatagtccctttttggaataataatgtcctgtcggaattaaagatgatcttaacggtat 109  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||  || |||||||  ||||||||||| ||||    
T  11570377 aatatatgtcccttcggattaaagagtacttttaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcc-ctcagaattaagaatgatcttaacagtat 11570472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 322 - 413
Target Start/End: Original strand, 15991668 - 15991759
Alignment:
Q  322 ccatatttgaaggtgtaaatctcgaacggttttctacagtgcaatagttaactgcacagttgtagttgtgcttgttttatcctggaggcggc 413  Q
    ||||||||||  |||||| |||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||| || ||  ||||||||||||| ||||||||    
T  15991668 ccatatttgattgtgtaattctcaaacggttttcgacagtgcagtagttaactgcacaattgcagctgaacttgttttatcctagaggcggc 15991759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 322 - 413
Target Start/End: Original strand, 15999330 - 15999421
Alignment:
Q  322 ccatatttgaaggtgtaaatctcgaacggttttctacagtgcaatagttaactgcacagttgtagttgtgcttgttttatcctggaggcggc 413  Q
    ||||||||||  |||||| |||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||| || ||  ||||||||||||| ||||||||    
T  15999330 ccatatttgattgtgtaattctcaaacggttttcgacagtgcagtagttaactgcacaattgcagctgaacttgttttatcctagaggcggc 15999421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 324 - 414
Target Start/End: Original strand, 25316494 - 25316583
Alignment:
Q  324 atatttgaaggtgtaaatctcgaacggttttctacagtgcaatagttaactgcacagttgtagttgtgcttgttttatcctggaggcggcg 414  Q
    |||||||| |||| || |||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| ||  ||||||||||||||||| |||||    
T  25316494 atatttgagggtgcaattctcgaacagttttctacagtgca-tagttaaccgcacggttgtagatgaacttgttttatcctggagacggcg 25316583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 324 - 414
Target Start/End: Original strand, 26203988 - 26204077
Alignment:
Q  324 atatttgaaggtgtaaatctcgaacggttttctacagtgcaatagttaactgcacagttgtagttgtgcttgttttatcctggaggcggcg 414  Q
    |||||||| |||| || |||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| ||  ||||||||||||||||| |||||    
T  26203988 atatttgagggtgcaattctcgaacagttttctacagtgca-tagttaaccgcacggttgtagatgaacttgttttatcctggagacggcg 26204077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 160 - 252
Target Start/End: Original strand, 2863232 - 2863324
Alignment:
Q  160 ggtgatatcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatactttggagaaattaaa-gttaaaatggtggtaaaatcatatttgagtggtc 252  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| | | |  |||||||||| ||||||||  ||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2863232 ggtgataacaccatatttgagtggttgaaatttcatattgata-tttggagatgttaaaagttagaatggtggtaacatcatatttgagtggtc 2863324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 309 - 388
Target Start/End: Original strand, 9751724 - 9751802
Alignment:
Q  309 agtggtcttagtaccatatttgaaggtgtaaatctcgaacggttttctacagtgcaatagttaactgcacagttgtagtt 388  Q
    |||||||||||| ||||||| || ||||||| ||||||| ||| |||||||||||| |||||||  ||||| ||||||||    
T  9751724 agtggtcttagtgccatattgga-ggtgtaattctcgaatggtgttctacagtgcagtagttaatcgcacaattgtagtt 9751802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 349 - 412
Target Start/End: Original strand, 22695226 - 22695289
Alignment:
Q  349 ggttttctacagtgcaatagttaactgcacagttgtagttgtgcttgttttatcctggaggcgg 412  Q
    ||||||||||| |||| | |||||| |||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||    
T  22695226 ggttttctacaatgcagtggttaaccgcacagttgtagctgtacttgttttatcgtggaggcgg 22695289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 12689438 - 12689374
Alignment:
Q  13 aatataagtcccttcggaataaagagtaccattaagatcatagtccctttttggaataataatgt 77  Q
    |||||| ||| |||| ||||||| |||||  ||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  12689438 aatatatgtctcttcagaataaatagtacttttaagatcatagtccctatttggaataacaatgt 12689374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 205 - 251
Target Start/End: Original strand, 20748117 - 20748163
Alignment:
Q  205 ttggagaaattaaagttaaaatggtggtaaaatcatatttgagtggt 251  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  20748117 ttggagaagttaaaattaaaatggtggtaacatcttatttgagtggt 20748163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 192 - 328
Target Start/End: Original strand, 6112759 - 6112889
Alignment:
Q  192 ccatattgatactttggagaaattaaag-ttaaaatggtggtaaaatcatatttgagtggtctcagcaccataacagagtgataacaatactatattgaa 290  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||  ||| ||||||| ||| | |||||||||||||||| | ||| |||| |||||| |||||||| |||||||      
T  6112759 ccatattgata-tttggagaagttaaaaattagaatggtgataacaccatatttgagtggtcttaacac-ataatagagtggtaacaatattatattg-- 6112854  T
Q  291 gtggttttagtattaaagagtggtcttagtaccatatt 328  Q
       |||| | ||||||| | | ||||||||||||||||    
T  6112855 ---gtttcaatattaaaaattagtcttagtaccatatt 6112889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 216 - 252
Target Start/End: Original strand, 2882592 - 2882628
Alignment:
Q  216 aaagttaaaatggtggtaaaatcatatttgagtggtc 252  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2882592 aaagttagaatggtggtaacatcatatttgagtggtc 2882628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 34 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 17599812 - 17599716
Alignment:
Q  34 aagagtaccattaagatcatagtccctttttggaataataatgtcctgtcggaattaaagatgatcttaacggtatataaatattctttcaatattt 130  Q
    ||||||||  ||||||| ||| |||||||||  || |||||||||   ||  ||||||  |||||||||||  | ||||||||||||||||||||||    
T  17599812 aagagtacttttaagattataatccctttttaaaacaataatgtcacttcataattaagaatgatcttaacaatgtataaatattctttcaatattt 17599716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 217; Significance: 1e-119; HSPs: 37)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 13 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 30258565 - 30258174
Alignment:
Q  13 aatataagtcccttcggaataaagagtaccattaagatcatagtccctttttggaataataatgtcctgtcggaattaaagatgatcttaacggtatata 112  Q
    |||||||||||||||  ||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||  ||||||||||| |||||||    
T  30258565 aatataagtcccttcaaaatcaagggtactattaagatcatagtccctttttgaaataataatgtcccgtcgaaattaataatgatcttaactgtatata 30258466  T
Q  113 aatattctttcaatatttaaattgaggagaaattaaaaagttgaaaaggtgatatcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatactttggagaa 212  Q
    |||||| |           |||||||||||||||||||| | |||| |||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  30258465 aatatttt-----------aattgaggagaaattaaaaattggaaatggtggtattatcatatttgagtggtcgtagtgccatattgatactttaaagaa 30258377  T
Q  213 attaaagttaaaatggtggtaaaatcatatttgagtggtctcagcaccataacagagtgataacaatactatattgaagtggttttagtattaaagagtg 312  Q
    |||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  30258376 attaaagttagaatggtggtaacaccatatttgagtggtctcagcaccataacatagtggtaacaataccatattaaagtggtttcagtattaaagagtg 30258277  T
Q  313 gtcttagtaccatatttgaaggtgtaaatctcgaacggttttctacagtgcaatagttaactgcacagttgtagttgtgcttgttttatcctggaggcgg 412  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| ||  |||||||||||||||||||||    
T  30258276 gtcttagtaccatatttgaaggtgtaaatttcgaacaattttctacagtgcagtagttaaccgcactgttgtagctggacttgttttatcctggaggcgg 30258177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 22 - 423
Target Start/End: Original strand, 10387994 - 10388396
Alignment:
Q  22 cccttcggaataaagagtaccattaagatcatagtccctttttggaataataatgtcctgtcggaattaaagatgatcttaacggtatataaatattctt 121  Q
    |||||| ||||||| |||||  ||||||  |||||||||||| |||| |||||||||   |||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10387994 cccttcagaataaaaagtacttttaagaatatagtccctttt-ggaacaataatgtctcatcggaattgagaatgatcttaacggtatataaatattctt 10388092  T
Q  122 tcaatattta---aattgaggagaaattaaaaagttgaaaaggtgatatcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatactttggagaaattaaa 218  Q
    |||||||||    |||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  10388093 tcaatatttttctaattgaggagaaattaaaaagtcgaaatggtggtatcaccatatttgagtgatcgtagtgccatattgatattttggagaaattaaa 10388192  T
Q  219 gttaaaatggtggtaaaatcatatttgagtggtctcagcaccataacagagtgataacaatactatattgaagtggttttagtattaaagagtggtctta 318  Q
    |||||| | ||||||| | || |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  10388193 gttaaagttgtggtaacacca-atttgagtggtctcagcaccataatagagtggtaacaataccatattaaagtggtttcagtattaaagagtggtatta 10388291  T
Q  319 gtaccatatttgaaggtgtaaatctcgaacggttttctacagtgcaatagttaactgcacagttgtagttgtgcttgttttatcctggaggcggcgtcgt 418  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||  |||| || |||||| |||||||  ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||    
T  10388292 gtaccttatttgagggtgtaaatctcgaacaattttttagagtgcagtagttaatcgcacagttgtagttgagtttgttttatcctggaggcggcgttgt 10388391  T
Q  419 tgatg 423  Q
    |||||    
T  10388392 tgatg 10388396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 44 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 27238690 - 27238316
Alignment:
Q  44 ttaagatcatagtccctttttggaataataatgtcctgtcggaattaaagatgatcttaacggtatataaatattctttcaatattta---aattgagga 140  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||| |   ||||||| |||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    |||||||||    
T  27238690 ttaagaccatagtccctttttgaaataataatatttcgtcggaagtaagaatgatcttaaaggtatataaatattctttcaatatttttctaattgagga 27238591  T
Q  141 gaaattaaaaagttgaaaaggtgatatcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatactttggagaaattaaagttaaaatggtggtaaaatcat 240  Q
    |||||||||| || |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||| ||||||||||| | |||    
T  27238590 gaaattaaaaggtggaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatattttggagaaattacaattagaatggtggtaacaccat 27238491  T
Q  241 atttgagtggtctcagcaccataacagagtgataacaatactatattgaagtggttttagtattaaagagtggtcttagtaccatatttgaaggtgtaaa 340  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||  ||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  27238490 atttgagtggtctcagcaccataacaaagtggtaacattatcatattaaagtggtttcagaattaaagagtggtcttagtatcatatttgagggtgtaaa 27238391  T
Q  341 tctcgaacggttttctacagtgcaatagttaactgcacagttgtagttgtgcttgttttatcctggaggcggcgt 415  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||   | ||||||||| ||  ||||||||||| || |||||||||    
T  27238390 tctcgaacgattttctacagtgcagtagttaagcacgcagttgtagctggacttgttttatcttgcaggcggcgt 27238316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 20 - 422
Target Start/End: Original strand, 44422770 - 44423165
Alignment:
Q  20 gtcccttcggaataaagagtaccattaagatcatagtccctttttggaataataatgtcctgtcggaattaaagatgatcttaacggtatata----aat 115  Q
    |||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    ||     
T  44422770 gtcccttcagaataaagagtacttttaagatcatagtccctatttggactaacaatgtcctgtcggaattaagaatgatcttaacggtatatataaaaaa 44422869  T
Q  116 attctttcaatattta---aattgaggagaaattaaaaagttgaaaaggtgatatcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatactttggagaa 212  Q
    | | |||||||||||    | ||||||||||||              |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||    
T  44422870 agtatttcaatatttttctatttgaggagaaat--------------ggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtgccacattgatgttttggagaa 44422955  T
Q  213 attaaagttaaaatggtggtaaaatcatatttgagtggtctcagcaccataacagagtgataacaatactatattgaagtggttttagtattaaagagtg 312  Q
    |||||||||| ||| |||  || | ||||||||| |||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||| | || |||| ||||||||||||||    
T  44422956 attaaagttagaattgtgacaacaccatatttgattggtttcaacaccataacagagtggtaacaataccatattaaggtagtttcagtattaaagagtg 44423055  T
Q  313 gtcttagtaccatatttgaaggtgtaaatctcgaacggttttctacagtgcaatagttaactgcacagttgtagttgtgcttgttttatcctggaggcgg 412  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||    
T  44423056 gtcttagtaccatatttgagggtgtaattctcgaacggttttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgtagatggacttgttttatcctggaggcgg 44423155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 20 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 3046026 - 3045680
Alignment:
Q  20 gtcccttcggaataaagagtaccattaagatcatagtccctttttggaataataatgtcctgtcggaattaaagatgatcttaacggtatataaatattc 119  Q
    |||||||||||||||| || ||  | ||||| | |||||||||| |||| |||||| ||||| |||||||||  ||||||||||  |||||||||||||     
T  3046026 gtcccttcggaataaaaagaacattcaagattacagtccctttt-ggaacaataatatcctgacggaattaataatgatcttaatagtatataaatattt 3045928  T
Q  120 tttcaatattta---aattgaggagaaattaaaaagttgaaaaggtgatatcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatactttggagaaatta 216  Q
    |||||||||||    | |||| |||||||||||||||| ||| |||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| || || |||    
T  3045927 tttcaatatttttttacttgatgagaaattaaaaagttaaaatggtagtatcaccatatttgagtggtcgtagtgtcatattgatattttagaaaactta 3045828  T
Q  217 aagttaaaatggtggtaaaatcatatttgagtggtctcagcaccataacagagtgataacaatactatattgaagtggttttagtattaaagagtggtct 316  Q
    |||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| || |||||| | |||||||||| |||||    
T  3045827 aagttagaatggtggtaacaccatatttgagtggtctcagcaccataacagagtggtaacaataccatattaaaatggtttcaatattaaagagcggtct 3045728  T
Q  317 tagtaccatatttgaaggtgtaaatctcgaacggttttctacagtgca 364  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3045727 tagtaccatatttgagggtgtaaatctcgaacgattttctacagtgca 3045680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 20 - 411
Target Start/End: Original strand, 13313870 - 13314253
Alignment:
Q  20 gtcccttcggaataaagagtaccattaagatcatagtccctttttggaataataatgtcctgtcggaattaaagatgatcttaacggtatataaata--t 117  Q
    ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||| |||| |||||||||| ||||||| |||| ||||||  ||||||||||||||||||||| |  |    
T  13313870 gtccctttggaataaagagtacttttaagatcatagaccctatttggaataacaatgtcccgtcgaaattaagaatgatcttaacggtatataaaaaaat 13313969  T
Q  118 tctttcaatattta---aattgaggagaaattaaaaagttgaaaaggtgatatcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatactttggagaaat 214  Q
    | ||| |||||||    | ||||||||||||      ||       ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  13313970 tattttaatatttttctatttgaggagaaatg-----gt-------gtggtgtcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatgttttggagaaat 13314057  T
Q  215 taaagttaaaatggtggtaaaatcatatttgagtggtctcagcaccataacagagtgataacaatactatattgaagtggttttagtattaaagagtggt 314  Q
    |||||||| ||| ||||||| |  ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||| |||||| |||||||||    
T  13314058 taaagttagaatagtggtaacacaatatttgagtggtctcaacaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtggtttcagtatt-aagagtggt 13314156  T
Q  315 cttagtaccatatttgaaggtgtaaatctcgaacggttttctacagtgcaatagttaactgcacagttgtagttgtgcttgttttatcctggaggcg 411  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  13314157 cttagtaccatatttggaggtgtaattctcgaacggttttctacagtgcagtagttaattgaacagttgtagctgagcttgttttatcctggaggcg 13314253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 168; E-Value: 7e-90
Query Start/End: Original strand, 155 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 4930567 - 4930300
Alignment:
Q  155 gaaaaggtgatatcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatactttggagaaattaaagttaaaatggtggtaaaatcatatttgagtggtctc 254  Q
    |||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| |||||||  |  | |||||||||||||||||    
T  4930567 gaaatggtggtatcaccatatttgaatggtcgtagtgccatattaatgttttggagaaattaaagttagaatggtgacagcaccatatttgagtggtctc 4930468  T
Q  255 agcaccataacagagtgataacaatactatattgaagtggttttagtattaaagagtggtcttagtaccatatttgaaggtgtaaatctcgaacggtttt 354  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||| ||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||    
T  4930467 aacaccataacagagtggtaacaataccatattaaggtggtttcagtattaaagagtggtcttagtaccatatatgagggtgtaattctcgaacggtttt 4930368  T
Q  355 ctacagtgcaatagttaactgcacagttgtagttgtgcttgttttatcctggaggcggcgtcgttgat 422  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4930367 ctacagtgcagtagttaaccgcacagttgtagttgggcttgttttatcctggaggcggcgtggttgat 4930300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 13 - 413
Target Start/End: Original strand, 42626219 - 42626610
Alignment:
Q  13 aatataagtcccttcggaataaagagtaccattaagatcatagtccctttttggaataataatgtcctgtcggaattaaagatgatcttaacggtatata 112  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||  ||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  42626219 aatatatgtcccttcagaataaagagtacttttaagatcatattccctatttggaataacaatgtcccgtcggaattaagaatgatcttaacggtatata 42626318  T
Q  113 --aatattctttcaatattta---aattgaggagaaattaaaaagttgaaaaggtgatatcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatactttg 207  Q
      || | | |||||||||||    | ||||||||||||              |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||    
T  42626319 taaaaagtatttcaatatttttctatttgaggagaaat--------------ggtggtatcaccatatttgagtggttgtagtgccatattaatgttttg 42626404  T
Q  208 gagaaattaaagttaaaatggtggtaaaatcatatttgagtggtctcagcaccataacagagtgataacaatactatattgaagtggttttagtattaaa 307  Q
    ||||||||||||||| |||||||| || | |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||| | ||||||||| |||||||    
T  42626405 gagaaattaaagttagaatggtggcaacaccatatttgagtggtctcaacaccataacagagtggtaacaataccatattaaggtggttttaatattaaa 42626504  T
Q  308 gagtggtcttagtaccatatttgaaggtgtaaatctcgaacggttttctacagtgcaatagttaactgcacagttgtagttgtgcttgttttatcctgga 407  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||| ||  ||| |||||||||||     
T  42626505 gagtgatcttagtaccatatttgagggtgtaattctcgaacgattttctacagtgcagtaattaaccgcacagttgtagctggacttattttatcctggc 42626604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 13 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 8268758 - 8268360
Alignment:
Q  13 aatataagtcccttcggaataaagagtaccattaagatcatagtccctttttggaataataatgtcctgtcggaattaaagatgatcttaacggtatata 112  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  8268758 aatatatgtcccttcggaataaagagtacttttaagatcatagtccctatttggaataacaatgtctcgtcggaattaagaatgatcttaacggtatata 8268659  T
Q  113 aatattctttcaatattta---aattgaggagaaattaaaaagttgaaaaggtgatatcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatactttgga 209  Q
    |||||| || | ||||||    ||||||||||| ||              |||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||| ||||||    
T  8268658 aatattatt-ctatatttttctaattgaggagatat--------------ggtggtatcaccatatttgaatggtcgtagtaccatatagatagtttgga 8268574  T
Q  210 gaaattaaagttaaaatggtggtaaaatcatatttgagtggtctcagcaccataacagagtgataacaatactatattgaagtggttttagtattaaaga 309  Q
    ||| ||||||||| ||||||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||| |||| ||||||    
T  8268573 gaacttaaagttagaatggtgttaacaacatatttgagtggtctcaacaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtggtttcagtactaaaga 8268474  T
Q  310 gtggtcttagtaccatatttgaaggtgtaaatctcgaacgg-ttttctacagtgcaatagttaactgcacagttgtagttgtgcttgttttatcctggag 408  Q
    ||| ||||||||||||||||| |||||||| | |||||||| |||||||| ||||| |||||||  | |||||||||| ||  ||||||||||| |||||    
T  8268473 gtgatcttagtaccatatttggaggtgtaattatcgaacggtttttctacggtgcagtagttaatcgaacagttgtagctggacttgttttatcatggag 8268374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 20 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 21671655 - 21671277
Alignment:
Q  20 gtcccttcggaataaagagtaccattaagatcatagtccctttttggaataataatgtcctgtcggaattaaagatgatcttaacggtatataaatattc 119  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||| | ||||||||||| | |||||||||||  ||||||||||   ||||||||||||     
T  21671655 gtcccttcggaataaagagtacttttaagatcatggtccctttt-gaaataataatgttccgtcggaattaagaatgatcttaatactatataaatatt- 21671558  T
Q  120 tttcaatatttaaattgaggagaaattaaaaagttgaaaaggtgatatcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatactttggagaaattaaag 219  Q
    |||| ||       ||||| ||||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||    
T  21671557 tttctat-------ttgagtagaaattaaaaagtcaaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtgtcatattgatattttggaaaaattaaag 21671465  T
Q  220 ttaaaatggtggtaaaatcatatttgagtggtctcagcaccataacagagtgataacaatactatattgaagtggttttagtatt-aaagagtggtctta 318  Q
    ||| ||||||||||| | |||||||||||  ||||| |||||||  | |||| ||| ||||| ||||| ||||||||| | |||| ||||| |||||||     
T  21671464 ttataatggtggtaacaccatatttgagttatctcaacaccatattaaagtggtaataataccatattaaagtggtttcattattaaaagaatggtcttt 21671365  T
Q  319 gtaccatatttgaaggtgtaaatctcgaacggttttctacagtgcaatagttaactgcacagttgtagttgtgcttgttttatcctgga 407  Q
    || ||||| ||| |||| ||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||| |||||||||||| || ||||||||||| |||||    
T  21671364 gtcccata-ttggaggtttaaatctcgaacgattttctacactgcagtagttaaccgcacagttgtaggtgagcttgttttattctgga 21671277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 13 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 26341673 - 26341266
Alignment:
Q  13 aatataagtcccttcggaataaagagtaccattaagatcatagtccctttttggaataataatgtcctgtcggaattaaagatgatcttaacggtatata 112  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  26341673 aatatatgtcccttcagaataaagaatacttttaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcccgtcggaattaagaatgatcttaacggtatata 26341574  T
Q  113 --aatattctttcaatattta----aattgaggagaaattaaaaagttgaaaaggtgatatcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatacttt 206  Q
      || | | |||||||||||     | ||||||||||||              |||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||    
T  26341573 taaaaagtatttcaatattttttttatttgaggagaaat--------------ggtggtatcaccatatttgagtggtcggagtaccatattgatagttt 26341488  T
Q  207 ggagaaattaaagttaaaatggtggtaaaatcatatt------tgagtggtctcagcaccataacagagtgataacaatactatattgaagtggttttag 300  Q
    |||||| ||||||||| |||| |  ||| | ||||||      ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||  ||||| ||||||||| ||    
T  26341487 ggagaacttaaagttagaatgatattaacaccatattgatatttgagtggtctcagcatcataacagagtggtaacaatatcatattaaagtggtttcag 26341388  T
Q  301 tattaaagagtggtcttagtaccatatttgaaggtgtaaatctcgaacggttttctacagtgcaatagttaactgcacagttgtagttgtgcttgtttta 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| | |||||||||||| | |||||||  | |||||||||| ||  |||||||||    
T  26341387 tattaaagagtggtcttagtaccatatttggaggtgtaattcttgaatgattttctacagtgtagtagttaatcgaacagttgtagctggacttgtttta 26341288  T
Q  401 tcctggaggcggcgtcgttgat 422  Q
    ||||||||||||||| ||||||    
T  26341287 tcctggaggcggcgtggttgat 26341266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 155 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 12799752 - 12799477
Alignment:
Q  155 gaaaaggtgatatcaccatatttgagtggtcgtagtgccata--------ttgatactttggagaaattaaagttaaaatggtggtaaaatcatatttga 246  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||| ||||||||||||||||||| |||||||| || | |||||||||    
T  12799752 gaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtgccatagtgctatattgatattttggagaaattaaagttagaatggtggcaacaccatatttga 12799653  T
Q  247 gtggtctcagcaccataacagagtgataacaatactatattgaagtggttttagtattaaagagtggtcttagtaccatatttgaaggtgtaaatctcga 346  Q
    ||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  12799652 gtggtctcaacaccataacaaagtggtaacaataccatattaaagtgatttcagtattaaagagtggtcttagtaccatatttgagggtgtaattctcga 12799553  T
Q  347 acggttttctacagtgcaatagttaactgcacagttgtagttgtgcttgttttatcctggaggcggcgtcgttgat 422  Q
    |||||||||| || |||| |||||||| |||||||||||| ||  ||| |||||||||||| | ||||| ||||||    
T  12799552 acggttttctgcaatgcagtagttaaccgcacagttgtagctggacttattttatcctggatgtggcgtggttgat 12799477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 176 - 421
Target Start/End: Original strand, 13142683 - 13142928
Alignment:
Q  176 ttgagtggtcgtagtgccatattgatactttggagaaattaaagttaaaatggtggtaaaatcatatttgagtggtctcagcaccataacagagtgataa 275  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||| || |||  | ||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  13142683 ttgagtgatcgtagttccatattgatattttgtagaacttgaagaaagaatggtggtaacaccatatttaagtggtctcagcaccataacaaagtggtaa 13142782  T
Q  276 caatactatattgaagtggttttagtattaaagagtggtcttagtaccatatttgaaggtgtaaatctcgaacggttttctacagtgcaatagttaactg 375  Q
    |||||| ||||| ||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |      
T  13142783 caataccatattaaagtggtttcaatattaaagagtgatcttagtaccatatttaacggtgtaaatctcgaacagttttctatagtgcaatagttagcct 13142882  T
Q  376 cacagttgtagttgtgcttgttttatcctggaggcggcgtcgttga 421  Q
     |||||||||| ||  ||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  13142883 tacagttgtagctgaacttgttttatcctggtggcggcgttgttga 13142928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 168 - 422
Target Start/End: Original strand, 44510451 - 44510705
Alignment:
Q  168 caccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatactttggagaaattaaag-ttaaaatggtggtaaaatcatatttgagtggtctcagcaccataaca 266  Q
    ||||||||||||||||| | | | ||||||||||| ||||||||| |||||  ||| ||||||||||| | |||||||||||||||||| || |||||||    
T  44510451 caccatatttgagtggttgaaataccatattgata-tttggagaagttaaaaattagaatggtggtaacaccatatttgagtggtctcaacaacataaca 44510549  T
Q  267 gagtgataacaatactatattgaagtggttttagtattaaa-gagtggtcttagtaccatatttgaaggtgtaaatctcgaacggttttctacagtgcaa 365  Q
    || || |||||||   ||||| ||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  44510550 gaatggtaacaatgtcatattaaagtggtttcagtattaaaagtgtggtcttagtaccatatt-gaaggtgtaattctcgaacggttttctacagtgcag 44510648  T
Q  366 tagttaactgcacagttgtagttgtgcttgttttatcctggaggcggcgtcgttgat 422  Q
     ||||||| ||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  44510649 aagttaaccgcacagttgcagctgagcttgttttatcctggaggcggcgtggttgat 44510705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 239 - 422
Target Start/End: Original strand, 3357476 - 3357660
Alignment:
Q  239 atatttgagtggtctcagcaccataacagagtgataacaatactatattgaagtggttttagtattaaagagtggtcttagtaccatatttgaaggtgta 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||| |||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  3357476 atatttgagtggtctcagcaccataacagagtggtaacagtaccatattaaagtggtttcggtattaaagagtgatcttagtaccatattttagggtgta 3357575  T
Q  339 aatctcgaacggttttctacagtgcaatagttaactgcacagttgtagttgtgcttg-ttttatcctggaggcggcgtcgttgat 422  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||  |||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||| |||||| ||||||    
T  3357576 aatcttgaacgattttctacagtgcaatggttaaccacacaattgtagttgtgtttgtttttatcatggagacggcgtggttgat 3357660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 224 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 3880260 - 3880065
Alignment:
Q  224 aatggtggtaaaatcatatttgagtggtctcagcaccataacagagtgataacaatactatattgaagtggttttagtattaaagagtggtcttagtacc 323  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||  ||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||| |    
T  3880260 aatggtgataacaccatatttgagtggtctcagcaccataatagagtggtaacagtatcatattaaagtggtttcaatattaaagagtggtcttagtatc 3880161  T
Q  324 atatttgaaggtgtaaatctcgaacggttttctacagtgcaatagttaactgcacagttgtagttgtgcttgttttatcctggaggcggcgtcgttgat 422  Q
    ||||||||  |||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||  || ||||||||| | ||   |||||||||||||||||||| ||||||    
T  3880160 atatttgagagtgtaattctcgaacgattttctacagtgcagtagttaaccacatagttgtagtggggc---ttttatcctggaggcggcgtggttgat 3880065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 224 - 422
Target Start/End: Original strand, 26286976 - 26287173
Alignment:
Q  224 aatggtggtaaaatcatatttgagtggtctcagcaccataacagagtgataacaatactatattgaagtggttttagtattaaa-gagtggtcttagtac 322  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||| ||| |||| |||||| ||||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||| || ||||||| ||||    
T  26286976 aatggtggtaacaccatatttgagtggtctca-cacgataatagagtggtaacagtaccatattaaagtggtttcagtattaaaagaatggtcttggtac 26287074  T
Q  323 catatttgaaggtgtaaatctcgaacggttttctacagtgcaatagttaactgcacagttgtagttgtgcttgttttatcctggaggcggcgtcgttgat 422  Q
    |||||| || |||||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26287075 catattgga-ggtgtaaagctcgaacgattttctatagtgcagtagttaactgcacagttgtagctggatttgttttatcctggaggcggcgtggttgat 26287173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 168 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 23866384 - 23866135
Alignment:
Q  168 caccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatactttggagaaattaaag--ttaaaatggtggtaaaatcatatttgagtggtctcagcaccataac 265  Q
    ||||||||||||||||| | | | ||||||||||| ||||||||| |||||   ||| ||||||||||| | ||||||| |||||||||| ||| ||||     
T  23866384 caccatatttgagtggttgaaataccatattgata-tttggagaagttaaaaaattagaatggtggtaacaccatattt-agtggtctcaacacaataat 23866287  T
Q  266 agagtgataacaatactatattgaagtggttttagtattaaa-gagtggtcttagtaccatatttgaaggtgtaaatctcgaacggttttctacagtgca 364  Q
    |||||| | | | ||| ||||||     |||| || |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23866286 agagtggtcatagtaccatattg-----gtttcagcattaaaagagtggtcttagtaccatatt-gaaggtgtaattctcgaacggttttctacagtgca 23866193  T
Q  365 atagttaactgcacagttgtagttgtgcttgttttatcctggaggcggcgtcgttgat 422  Q
     |||||||| ||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23866192 gtagttaaccgcacagttgcagctgagcttgttttatcctggaggcggcgtggttgat 23866135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 273 - 411
Target Start/End: Original strand, 25543241 - 25543379
Alignment:
Q  273 taacaatactatattgaagtggttttagtattaaa-gagtggtcttagtaccatatttgaaggtgtaaatctcgaacggttttctacagtgcaatagtta 371  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25543241 taacaataccatattaaagtggtttcagtattaaaagagtggtcttagtaccatatt-gaaggtgtaattctcgaacggttttctacagtgcagtagtta 25543339  T
Q  372 actgcacagttgtagttgtgcttgttttatcctggaggcg 411  Q
    || |||||||||||| |   ||||||||||||||||||||    
T  25543340 accgcacagttgtagctagacttgttttatcctggaggcg 25543379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 245 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 12254322 - 12254153
Alignment:
Q  245 gagtggtctcagcaccataacagagtgataacaatactatattgaagtggttttagtattaaagagtggtcttagtaccatatttgaaggtgtaaatctc 344  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| || |||||  ||||| ||||||||| ||||  ||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12254322 gagtggtctcaacaccataacagagtggtagcaatatcatattaaagtggtttcagtaggaaagactggacttagtaccatatttga-ggtgtaaatctc 12254224  T
Q  345 gaacggttttctacagtgcaatagttaactgcacagttgtagttgtgcttgttttatcctggaggcggcgt 415  Q
     ||||||||||||||  ||| |||||||| |||||||||||| ||  |||||||||||||| |||||||||    
T  12254223 aaacggttttctacacagcattagttaaccgcacagttgtagctgaacttgttttatcctgtaggcggcgt 12254153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 168 - 422
Target Start/End: Original strand, 9650742 - 9650995
Alignment:
Q  168 caccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatactttggagaaattaaag--ttaaaatggtggtaaaatcatatttgagtggtctcagcaccataac 265  Q
    ||||||||||||||||| | | | ||||||||||| ||||||||| |||||   ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||     
T  9650742 caccatatttgagtggttgaaataccatattgata-tttggagaagttaaaaaattagaatggtggtaacatcatatttgagtggtctcaacaccataat 9650840  T
Q  266 agagtgataacaatactatattgaagtggttttagtatt-aaagagtggtcttagtaccatatttgaaggtgtaaatctcgaacggttttctacagtgca 364  Q
    |||||| | | | ||| ||||     |||||| |||||| |||||||||||||||||||||| || || |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9650841 agagtggtcatagtaccatat-----tggtttcagtattaaaagagtggtcttagtaccata-ttaaaagtgtaattctcgaacggttttctacagtgca 9650934  T
Q  365 atagttaactgcacagtt---gtagttgtgcttgttttatcctggaggcggcgtcgttgat 422  Q
     |||| ||| | ||||||   | || ||  |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  9650935 gtagtcaaccgtacagttgcagcagctggacttgttttatcctggaggcggcgtggttgat 9650995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 81 - 255
Target Start/End: Original strand, 3356781 - 3356957
Alignment:
Q  81 gtcggaattaaagatgatcttaacggtatataaatattctttcaa--tatttaaattgaggagaaattaaaaagttgaaaaggtgatatcaccatatttg 178  Q
    |||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||| ||| |   | ||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  3356781 gtcggaattaagaatgatcttaaccgtatataaatatttttttatatttttttaattgaggataaattaaaaagttgaaatggtggtatcaccatatttg 3356880  T
Q  179 agtggtcgtagtgccatattgatactttggagaaattaaagttaaaatggtggtaaaatcatatttgagtggtctca 255  Q
    | |||||||||| || |||||||| ||||||||| ||| ||||| ||| ||| ||| | ||||||||||||||||||    
T  3356881 attggtcgtagtaccgtattgatagtttggagaacttacagttagaattgtgataacaccatatttgagtggtctca 3356957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 168 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 19640613 - 19640449
Alignment:
Q  168 caccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatactttggagaaattaaag-ttaaaatggtggtaaaatcatatttgagtggtctcagcaccataaca 266  Q
    ||||||||||||||||| | |||  |||||||||| ||||||||| |||||  ||| ||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  19640613 caccatatttgagtggttgaagtatcatattgata-tttggagaagttaaaaattagaatggtggtaacaccatattttagtggtctcagcaccataata 19640515  T
Q  267 gagtgataacaatactatattgaagtggttttagtattaaagagtggtcttagtaccatatttgaaggtgt 337  Q
    ||||| | ||||||| ||||||     ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  19640514 gagtgttcacaataccatattg-----gttttagtattaaagagtggtgttagtaccatatttgagggtgt 19640449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 239 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 3284978 - 3284818
Alignment:
Q  239 atatttgagtggtctcagcaccataacagagtgataacaatactatattgaagtggttttagtattaaagagtggtcttagtaccatatttgaaggtgta 338  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||  ||| |||||  |||| |||||||||    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  3284978 atatttgattggtctcagcaccataacagagtagtaaaaataccttattaaagtggtttcgacattaaagagtggtctcagtaccatatttgagggtgta 3284879  T
Q  339 aatctcgaacggttttctacagtgcaatagttaactgcacagttgtagttgtgcttgtttt 399  Q
    | |||||||||||||||||  ||||  |||||||| |||| ||||||| || | |||||||    
T  3284878 attctcgaacggttttctattgtgcggtagttaaccgcacggttgtagctgagtttgtttt 3284818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 216 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 23318257 - 23318092
Alignment:
Q  216 aaagttaaaatggtggtaaaatcatatttgagtggtctcagcaccataacagagtgataacaatactatattgaagtggttttagtattaaagagtggtc 315  Q
    ||||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||| |||| ||| |||| |||||||| ||||| | |||||  |||||||| |||||||||||||||||    
T  23318257 aaagttagaatggtgataacatcatatttgaatggcctcatcactataatagagtgatcacaatgccatattagagtggtttcagtattaaagagtggtc 23318158  T
Q  316 ttagtaccatatttgaaggtgtaaatctcgaacggttttctacagtgcaatagttaactgcacagtt 382  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||| |  |||| |||   |||||||||||| ||||||||    
T  23318157 ttagtaccata-ttggaggtgtaaatctcgaccatttttgtacgaagcaatagttaaccgcacagtt 23318092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 322 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 4579675 - 4579575
Alignment:
Q  322 ccatatttgaaggtgtaaatctcgaacggttttctacagtgcaatagttaactgcacagttgtagttgtgcttgttttatcctggaggcggcgtcgttga 421  Q
    |||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  4579675 ccatatttgagggtgtaattcttgaacggttttctacagtgcagtagttaatcgcacagttgtagctggacttgttttatcctggaggcggcgtggttga 4579576  T
Q  422 t 422  Q
    |    
T  4579575 t 4579575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 171 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 8076358 - 8076117
Alignment:
Q  171 catatttgagtggtcgtagtgccatattgatactttggagaaattaaag--ttaaaatggtggtaaaatcatatttgagtggtctcagcaccataacaga 268  Q
    |||||||||||||| | | | ||||||||||| ||||||||| |||||   ||| || |||||||| | |||||||||||||||||| |||| ||| |||    
T  8076358 catatttgagtggttgaaataccatattgata-tttggagaagttaaaaaattagaacggtggtaacaccatatttgagtggtctcaacaccgtaataga 8076260  T
Q  269 gtgataacaatactatattgaagtggttttagtattaaa-gagtggtcttagtaccatatttgaaggtgtaaatctcgaacggttttctacagtgcaata 367  Q
    ||| | | | ||| ||||||     |||| |  |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||     |    
T  8076259 gtggtcatagtaccatattg-----gtttcaacattaaaagagtggtcttagtaccatatt-gaaggtgtaa-tctcgaacagttttctacagt-----a 8076172  T
Q  368 gttaactgcacagttgtagttgtgcttgttttatcctggaggcggcgtcgttgat 422  Q
    |||||  ||||||||| || || |||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  8076171 gttaatcgcacagttgcagctgagcttgttttatcctggaggcagcgtggttgat 8076117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 305 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 9008346 - 9008242
Alignment:
Q  305 aaagagtggtcttagtaccatatttgaaggtgtaaatctcgaacggttttctacagtgcaatagttaactgcacagttgtagttgtgcttgttttatcct 404  Q
    |||||||| | |||||| |||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||  |||||||||||||    
T  9008346 aaagagtgattttagtatcatatt-gaaggtgtaattctcgaacgattttctacagtgcagtagttaatcacacagttgtagttggacttgttttatcct 9008248  T
Q  405 ggaggc 410  Q
    ||||||    
T  9008247 ggaggc 9008242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 205 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 27256520 - 27256393
Alignment:
Q  205 ttggagaaattaaagttaaaatggtggtaaaatcatatttgagtggtctcagcaccataacagagtgataacaatactatattgaagtggttttagtatt 304  Q
    |||||||| ||||| ||| ||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||| ||| || ||| ||||| ||||     |||||| ||||||    
T  27256520 ttggagaagttaaaattagaatggtggtaacaccatatttgagtggtctcaacaccataatagaatggtaataataccatat-----tggtttcagtatt 27256426  T
Q  305 aaagagtggtcttagtaccatatttgaaggtgt 337  Q
    ||| |||||||||||||||||||| || |||||    
T  27256425 aaatagtggtcttagtaccatattagagggtgt 27256393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 31 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 4930670 - 4930589
Alignment:
Q  31 ataaagagtaccattaagatcatagtccctttttggaataataatgtcctgtcggaattaaagatgatcttaacggtatata 112  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||| |||||||  |||||||||||||||||||    
T  4930670 ataaagagtacttttaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcccgtcagaattaagaatgatcttaacggtatata 4930589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 224 - 337
Target Start/End: Original strand, 40865189 - 40865297
Alignment:
Q  224 aatggtggtaaaatcatatttgagtggtctcagcaccataacagagtgataacaatactatattgaagtggttttagtattaaagagtggtcttagtacc 323  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||| | |||||||| ||| || ||||||||| ||||||     |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  40865189 aatggtggtaacaccatatttgagtggtcttaacaccataatagaatggtaacaataccatattg-----gtttcagtattaaagagtggtcttagtacc 40865283  T
Q  324 atatttgaaggtgt 337  Q
    ||||| || |||||    
T  40865284 atattagagggtgt 40865297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 172 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 15642495 - 15642369
Alignment:
Q  172 atatttgagtggtcgtagtgccatattgatactttggagaaattaaa-gttaaaatggtggtaaaatcatatttgagtggtctcagcaccataacagagt 270  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||| ||||| |||| ||||||| ||| | ||||| ||| |||||| |||||||||| |||||    
T  15642495 atatttgagtggtcgtagtaccatcttgatattttggagaacttaaaggttagaatggtgataataccatatctgaatggtcttagcaccataagagagt 15642396  T
Q  271 gataacaatactatattgaagtggttt 297  Q
    | | ||| ||| |||||  ||||||||    
T  15642395 ggtcacagtaccatatttgagtggttt 15642369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 224 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 16372662 - 16372472
Alignment:
Q  224 aatggtggtaaaatcatatttgagtggtctcagcaccataacagagtgataacaatactatattgaagtggttttagtattaaa---gagtggtcttagt 320  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||  ||| |||  ||| ||| ||||   |||||||| |||||||||   |||||| |||| |    
T  16372662 aatggtggtaaaagcatatttgagtggtctcagtaccatagtagaatgaccacagtaccatataatagtggtttcagtattaaattcgagtggccttaat 16372563  T
Q  321 a-ccatatttgaaggtgtaaatctcgaacggttttctacagtgcaatagttaactgcacagttgtagttgtgcttgttttatcctggaggcg 411  Q
    | |||||||||| ||| ||| |||| |||| |||||||||||| | |||||||  ||| || |||||| |  ||||||||||| ||||||||    
T  16372562 agccatatttgatggtttaattctcaaacgattttctacagtgaagtagttaatcgcatag-tgtagtcgcacttgttttatcttggaggcg 16372472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 322 - 422
Target Start/End: Original strand, 23246861 - 23246961
Alignment:
Q  322 ccatatttgaaggtgtaaatctcgaacggttttctacagtgcaatagttaactgcacagttgtagttgtgcttgttttatcctggaggcggcgtcgttga 421  Q
    |||||||||| ||||||| | | ||||||||||||| |   || |||||||  |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23246861 ccatatttgagggtgtaattttggaacggttttctataaaacagtagttaatcgcacagttgtaggtgagcttgttttatcctggaggcggcgtggttga 23246960  T
Q  422 t 422  Q
    |    
T  23246961 t 23246961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 322 - 422
Target Start/End: Original strand, 6590911 - 6591011
Alignment:
Q  322 ccatatttgaaggtgtaaatctcgaacggttttctacagtgcaatagttaactgcacagttgtagttgtgcttgttttatcctggaggcggcgtcgttga 421  Q
    |||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||| || | |||||||   ||||||| ||  ||  |||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  6590911 ccatatttgagggtgtaattctcaaacgattttctacaatgtagtagttaatcacacagttataactgaacttgttttatcctgaaggcggcgtggttga 6591010  T
Q  422 t 422  Q
    |    
T  6591011 t 6591011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 167 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 15642558 - 15642506
Alignment:
Q  167 tcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatactttggagaaattaaag 219  Q
    |||||||||||||||||| ||||| | ||||| ||| ||||||||| ||||||    
T  15642558 tcaccatatttgagtggttgtagtactatattaatattttggagaacttaaag 15642506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 316 - 399
Target Start/End: Original strand, 45748562 - 45748647
Alignment:
Q  316 ttagtaccatatttgaaggtgtaaatctcgaacgg---ttttctacagtgcaatagttaactgcacagttgtagttgtgcttgtttt 399  Q
    |||||||||||||||||| | ||| |||||||||    |||||||||||||| |||||||  ||| |||||||||||  ||||||||    
T  45748562 ttagtaccatatttgaag-tataattctcgaacgacgattttctacagtgcagtagttaatcgcatagttgtagttgaacttgtttt 45748647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 201; Significance: 1e-109; HSPs: 45)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 19 - 422
Target Start/End: Original strand, 35679510 - 35679903
Alignment:
Q  19 agtcccttcggaataaagagtaccattaagatcatagtccctttttggaataataatgtcctgtcggaattaaagatgatcttaacggtatata--aata 116  Q
    |||||||||| |||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||||||||  || |    
T  35679510 agtcccttcgaaataaatagtactattaaaatcatagtccctttttggaataataatgtcgcgtcggaattaagaatgatcttaacggtatatataaaaa 35679609  T
Q  117 ttctttcaatattta---aattgaggagaaattaaaaagttgaaaaggtgatatcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatactttggagaaa 213  Q
     | |||||||||||    | ||||||||||||              |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  35679610 gtatttcaatatttttctatttgaggagaaat--------------ggtggtatcaccatatttgagtgatcgtagtgccatattgatgttttggagaaa 35679695  T
Q  214 ttaaagttaaaatggtggtaaaatcatatttgagtggtctcagcaccataacagagtgataacaatactatattgaagtggttttagtattaaagagtgg 313  Q
    ||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  35679696 ttaaagttagaatggtggtaacaccatatttgagtggtctgaacaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtggtttcagtattaaagagtgg 35679795  T
Q  314 tcttagtaccatatttgaaggtgtaaatctcgaacggttttctacagtgcaatagttaactgcacagttgtagttgtgcttgttttatcctggaggcggc 413  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  35679796 tcttagtaccatatttgagggtgtaattctcgaacgattttctacaatgc-atagttaactgcacagttgtagttgagcttgttttatcctggaggcggc 35679894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 13 - 422
Target Start/End: Original strand, 29167602 - 29168001
Alignment:
Q  13 aatataagtcccttcggaataaagagtaccattaagatcatagtccctttttggaataataatgtcctgtcggaattaaagatgatcttaacggtatata 112  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| || ||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  29167602 aatatatgtcccttcagaataaagagtacttttaagatcatagtccctatttggaagaacaatgtcccgtcggaattaagaatgatcttaacggtatata 29167701  T
Q  113 --aatattctttcaatattta--aattgaggagaaattaaaaagttgaaaaggtgatatcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatactttgg 208  Q
      || | | |||||||||||   | ||||||||||||               ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  29167702 tcaaaagtatttcaatattttttatttgaggagaaata--------------gtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttgg 29167787  T
Q  209 agaaattaaagttaaaatggtggtaaaatcatatttgagtggtctcagcaccataacagagtgataacaatactatattgaagtggttttagtattaaag 308  Q
    |||| ||||||||| ||||||| ||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  29167788 agaacttaaagttagaatggtgttaacaccatatttgagcggtctcagcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtggtttcagtattaaag 29167887  T
Q  309 agtggtcttagtaccatatttgaaggtgtaaatctcgaacggttttctacagtgcaatagttaactgcacagttgtagttgtgcttgttttatcctggag 408  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||  | ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29167888 agtggtcttagtaccatatttggaggtgtaattctcgaacgattttctacagtgcagtagttaatcgaacagttgtagttgggcttgttttatcctggag 29167987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 94 - 415
Target Start/End: Original strand, 20180760 - 20181084
Alignment:
Q  94 atgatcttaacggtatataaatattctttcaatattta---aattgaggagaaattaaaaagttgaaaaggtgatatcaccatatttgagtggtcgtagt 190  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    ||||||||||||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20180760 atgatcttaacggtatataaatattcattcaatatttttctaattgaggagaaattaaaaagtgaaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagt 20180859  T
Q  191 gccatattgatactttggagaaattaaagttaaaatggtggtaaaatcatatttgagtggtctcagcaccataacagagtgataacaatactatattgaa 290  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||  |||| ||    
T  20180860 accatattgatattttggagaaattaaagttagaatggtggcaacaccatatttgagtggtctcagcaccataacagaatggtagcaataccgtattaaa 20180959  T
Q  291 gtggttttagtattaaagagtggtcttagtaccatatttgaaggtgtaaatctcgaacggttttctacagtgcaatagttaactgcacagttgtagttgt 390  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||     
T  20180960 gtggtttcaatattaaagagtggtcttggtatcatatttgagggtgtaaatctcgaacagttttctacagtgcagtagttaaccgcacaattgtagttga 20181059  T
Q  391 gcttgttttatcctggaggcggcgt 415  Q
    |||||||||||| |||||| |||||    
T  20181060 gcttgttttatcatggaggtggcgt 20181084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 13 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 36424104 - 36423704
Alignment:
Q  13 aatataagtcccttcggaataaagagtaccattaagatcatagtccctttttggaataataatgtcctgtcggaattaaagatgatcttaacggtatata 112  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||| ||||| | |||||||||||  |||||||||| ||||||||    
T  36424104 aatatatgtcccttcagaataaagagtacttttaagatcatagtccctatttggaataacaatgttccgtcggaattaataatgatcttaagggtatata 36424005  T
Q  113 --aatattctttcaatattta---aattgaggagaaattaaaaagttgaaaaggtgatatcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatactttg 207  Q
      || | | |||||||||||    | ||||||||||||              |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  36424004 taaaaagtatttcaatatttttctatttgaggagaaat--------------ggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttg 36423919  T
Q  208 gagaaattaaagttaaaatggtggtaaaatcatatttgagtggtctcagcaccataacagagtgataacaatactatattgaagtggttttagtattaaa 307  Q
    ||||| ||||||||| ||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||    
T  36423918 gagaacttaaagttagaatggtgttaataccatatttgagtggtctcagcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtggtttcagtattaaa 36423819  T
Q  308 gagtggtcttagtaccatatttgaaggtgtaaatctcgaacggttttctacagtgcaatagttaactgcacagttgtagttgtgcttgttttatcctgga 407  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||    ||||| |||| || ||||||||||| |||||    
T  36423818 gagtggtcttagcaccatatttggaggtgtaattctcgaacgattttctacagtgcattagttaatcaaacagtagtagctgggcttgttttattctgga 36423719  T
Q  408 ggcggcgtcgttgat 422  Q
    |||||||| ||||||    
T  36423718 ggcggcgtggttgat 36423704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 13 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 26667739 - 26667339
Alignment:
Q  13 aatataagtcccttcggaataaagagtaccattaagatcatagtccctttttggaataataatgtcctgtcggaattaaagatgatcttaacggtatata 112  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  26667739 aatatatgtcccttcagaataaagagtacttttaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcccgtcggaattaagaatgatcttaacggtatata 26667640  T
Q  113 --aatattctttcaatattta---aattgaggagaaattaaaaagttgaaaaggtgatatcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatactttg 207  Q
      || | | |||||||||||    | ||||||||||||              |||| |||||||||||||||||||| || || |||| ||| || ||||    
T  26667639 taaaaagtatttcaatatttttctatttgaggagaaat--------------ggtggtatcaccatatttgagtggttgtggtaccattttggtagtttg 26667554  T
Q  208 gagaaattaaagttaaaatggtggtaaaatcatatttgagtggtctcagcaccataacagagtgataacaatactatattgaagtggttttagtattaaa 307  Q
     |||| ||||||||| ||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||    
T  26667553 tagaacttaaagttagaatggtgttaacaccatatttgagtggtctcagcaccataacagagtgataacaataccatattaaagtggtttcagtattaaa 26667454  T
Q  308 gagtggtcttagtaccatatttgaaggtgtaaatctcgaacggttttctacagtgcaatagttaactgcacagttgtagttgtgcttgttttatcctgga 407  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||| |||||| |||||||  | ||||||| || ||  ||||||||||||||||    
T  26667453 gagtggtcttagtaccatatttggaggtgtaattctcgaacgattttctagagtgcagtagttaatcgaacagttgcagctggacttgttttatcctgga 26667354  T
Q  408 ggcggcgtcgttgat 422  Q
    |||||||| ||||||    
T  26667353 ggcggcgtggttgat 26667339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 13 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 26939336 - 26938936
Alignment:
Q  13 aatataagtcccttcggaataaagagtaccattaagatcatagtccctttttggaataataatgtcctgtcggaattaaagatgatcttaacggtatata 112  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  26939336 aatatatgtcccttcagaataaagagtacttttaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcccgtcggaattaagaatgatcttaacggtatata 26939237  T
Q  113 --aatattctttcaatattta---aattgaggagaaattaaaaagttgaaaaggtgatatcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatactttg 207  Q
      || | | |||||||||||    | ||||||||||||              |||| |||||||||||||||||||| || || |||| ||| || ||||    
T  26939236 taaaaagtatttcaatatttttctatttgaggagaaat--------------ggtggtatcaccatatttgagtggttgtggtaccattttggtagtttg 26939151  T
Q  208 gagaaattaaagttaaaatggtggtaaaatcatatttgagtggtctcagcaccataacagagtgataacaatactatattgaagtggttttagtattaaa 307  Q
     |||| ||||||||| ||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||    
T  26939150 tagaacttaaagttagaatggtgttaacaccatatttgagtggtctcagcaccataacagagtgataacaataccatattaaagtggtttcagtattaaa 26939051  T
Q  308 gagtggtcttagtaccatatttgaaggtgtaaatctcgaacggttttctacagtgcaatagttaactgcacagttgtagttgtgcttgttttatcctgga 407  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||| |||||| |||||||  | ||||||| || ||  ||||||||||||||||    
T  26939050 gagtggtcttagtaccatatttggaggtgtaattctcgaacgattttctagagtgcagtagttaatcgaacagttgcagctggacttgttttatcctgga 26938951  T
Q  408 ggcggcgtcgttgat 422  Q
    |||||||| ||||||    
T  26938950 ggcggcgtggttgat 26938936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 13 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 12103492 - 12103092
Alignment:
Q  13 aatataagtcccttcggaataaagagtaccattaagatcatagtccctttttggaataataatgtcctgtcggaattaaagatgatcttaacggtatata 112  Q
    |||||| || ||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  12103492 aatatacgtgccttcagaatatagagtacttttaagatcatagtccctatttggaataacaatatcctgtcggaattaagaatgatcttaacggtatata 12103393  T
Q  113 --aatattctttcaatattta---aattgaggagaaattaaaaagttgaaaaggtgatatcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatactttg 207  Q
      || | | |||||||||||    | ||||||||||||              |||| ||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||  ||||    
T  12103392 taaaaagtatttcaatatttttctatttgaggagaaat--------------ggtggtatcaccatatttaagtagtcgcagtgccatattgatgttttg 12103307  T
Q  208 gagaaattaaagttaaaatggtggtaaaatcatatttgagtggtctcagcaccataacagagtgataacaatactatattgaagtggttttagtattaaa 307  Q
    ||||||||||||||| |||||||| || | ||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||| || || ||||||||| |||||||||    
T  12103306 gagaaattaaagttagaatggtggcaacaccatatttgagtggtctcaataccataacagagtggtaacaataccattttaaagtggtttcagtattaaa 12103207  T
Q  308 gagtggtcttagtaccatatttgaaggtgtaaatctcgaacggttttctacagtgcaatagttaactgcacagttgtagttgtgcttgttttatcctgga 407  Q
    ||||| |||||||||||||||| | ||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  12103206 gagtgatcttagtaccatatttaagggtgtaattctcgaacgattttctacagtgcagtagttaatcgcacatttgtagttgggcttgttttatcctgga 12103107  T
Q  408 ggcggcgtcgttgat 422  Q
    |||||||| ||||||    
T  12103106 ggcggcgtggttgat 12103092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 13 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 36429176 - 36428776
Alignment:
Q  13 aatataagtcccttcggaataaagagtaccattaagatcatagtccctttttggaataataatgtcctgtcggaattaaagatgatcttaacggtatata 112  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||   ||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  36429176 aatatatgtcccttcagaataaagagtatttttaagatcatagtacctatttggaataacaatgtcccgtcggaattaagaatgatcttaacggtatata 36429077  T
Q  113 --aatattctttcaatattta---aattgaggagaaattaaaaagttgaaaaggtgatatcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatactttg 207  Q
      || | | ||| |||||||    | ||||||||||||              |||| ||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||| ||||    
T  36429076 taaaaagtattttaatatttttctatttgaggagaaat--------------ggtggtatcaccatatttgagttgtcgtattaccatattgatagtttg 36428991  T
Q  208 gagaaattaaagttaaaatggtggtaaaatcatatttgagtggtctcagcaccataacagagtgataacaatactatattgaagtggttttagtattaaa 307  Q
    ||||| ||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||    
T  36428990 gagaacttaaagttagaatggtgttaacatcatatttgagtggtctcaacactataacagagtggtaacaataccatattaaagtggtttcagtattaaa 36428891  T
Q  308 gagtggtcttagtaccatatttgaaggtgtaaatctcgaacggttttctacagtgcaatagttaactgcacagttgtagttgtgcttgttttatcctgga 407  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||| || |||||||||||||| |||||||  | |||||||||| || |||||||||||||||||    
T  36428890 gagtggtcttagaaccatatttggaggtgtaattctcgagcgattttctacagtgcagtagttaatcgaacagttgtagctgggcttgttttatcctgga 36428791  T
Q  408 ggcggcgtcgttgat 422  Q
    |||||||| ||||||    
T  36428790 ggcggcgtggttgat 36428776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 155 - 422
Target Start/End: Original strand, 10759582 - 10759848
Alignment:
Q  155 gaaaaggtgatatcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatactttggagaaattaaagttaaaatggtggtaaaatcatatttgagtggtctc 254  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10759582 gaaaaggtggtatcaccgtatttgagtgctcgtagtgccatattgatgttttggagaaattaaagttagaatggtggtaacatcatatttgagtggtctc 10759681  T
Q  255 agcaccataacagagtgataacaatactatattgaagtggttttagtattaaagagtggtcttagtaccatatttgaaggtgtaaatctcgaacggtttt 354  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||    
T  10759682 aacaccataacagagtggtaacaataccacattaaagtggtttcagtatgacagagtggtcttagtaccatatttgagggtataattctcgaacggtttt 10759781  T
Q  355 ctacagtgcaatagttaactgcacagttgtagttgtgcttgttttatcctggaggcggcgtcgttgat 422  Q
    |||| |||| ||||||||| |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10759782 ctaccgtgc-atagttaaccgcacagttgtaaatgggcttgttttatcctggaggcggcgtggttgat 10759848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 13 - 422
Target Start/End: Original strand, 37248433 - 37248823
Alignment:
Q  13 aatataagtcccttcggaataaagagtaccattaagatcatagtccctttttggaataataatgtcctgtcggaattaaagatgatcttaacggtatata 112  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| || ||||||| |||||||||||  ||||||||||| |||||||    
T  37248433 aatatatgtcccttcagaataaagagtacttttaagatcatagtccctatttggaagaacaatgtcccgtcggaattaagaatgatcttaacagtatata 37248532  T
Q  113 --aatattctttcaatattta--aattgaggagaaattaaaaagttgaaaaggtgatatcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatactttgg 208  Q
      || | | |||||||||||   | ||||| ||||||              |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  37248533 taaaaagtatttcaatattttttatttgagaagaaat--------------ggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttgg 37248618  T
Q  209 agaaattaaagttaaaatggtggtaaaatcatatttgagtggtctcagcaccataacagagtgataacaatactatattgaagtggttttagtattaaag 308  Q
    |||| ||||||||| ||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||        |||| ||||||||| ||||||||||    
T  37248619 agaacttaaagttagaatggtgttaacaccatatttgagtggtctcagcaccataacagagtggtaa--------tattaaagtggtttcagtattaaag 37248710  T
Q  309 agtggtcttagtaccatatttgaaggtgtaaatctcgaacggttttctacagtgcaatagttaactgcacagttgtagttgtgcttgttttatcctggag 408  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||| || || ||||| ||||||||| || || ||||||||||||||||||    
T  37248711 agtggtcttagtaccatatttgagggtgtaattctcgaacggttttctatagtacagta-ttaaccgcacagttgcagctgggcttgttttatcctggag 37248809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 20 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 7452214 - 7451825
Alignment:
Q  20 gtcccttcggaataaagagtaccattaagatcatagtccctttttggaataataatgtcctgtcggaattaaagatgatcttaacggtatata--aatat 117  Q
    |||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||  ||||||  ||||||||||| |||||||  || |     
T  7452214 gtcccttcagaataaagagtacttttaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcccgtcaaaattaagaatgatcttaacagtatatataaaaag 7452115  T
Q  118 tctttcaatattta---aattgaggagaaattaaaaagttgaaaaggtgatatcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatactttggagaaat 214  Q
    | |||||||||||    | ||||||||||||              |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||    
T  7452114 tatttcaatatttttctatttgaggagaaat--------------ggtggtatcaccgtatttgagtggtcgtagtgccatattgaagttttggagaaat 7452029  T
Q  215 taaagttaaaatggtggtaaaatcatatttgagtggtctcagcaccataacagagtgataacaatactatattgaagtggttttagtattaaagagtggt 314  Q
    |||||||| |||||||| || | |||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||| |||     ||||||| ||||||||||||||||    
T  7452028 taaagttagaatggtggcaacaccatatttgagtggtctcaacaccataacagagtggttacaataccatag----gtggtttcagtattaaagagtggt 7451933  T
Q  315 cttagtaccatatttgaaggtgtaaatctcgaacggttttctacagtgcaatagttaactgcacagttgtagttgtgcttgttttatcctggaggcggcg 414  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||| || || |||||||||||||||||||| |||    
T  7451932 cttagtaccatatttggaggtgtaattctcgaacggttttctacagtgtagtagttaaccgcacagttgcagctgagcttgttttatcctggaggcagcg 7451833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 13 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 40148362 - 40147962
Alignment:
Q  13 aatataagtcccttcggaataaagagtaccattaagatcatagtccctttttggaataataatgtcctgtcggaattaaagatgatcttaacggtatat- 111  Q
    |||||| |||||||| ||||||| |||||  |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||  ||||||||| |  ||||| ||||||||||||     
T  40148362 aatatatgtcccttcagaataaaaagtacttttaagatcattgtccctatttggaataacaatgtctcgtcggaattgagaatgatgttaacggtatatg 40148263  T
Q  112 -aaatattctttcaatattta---aattgaggagaaattaaaaagttgaaaaggtgatatcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatactttg 207  Q
     ||| | | |||||||||||    | ||||||||||||              |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||    
T  40148262 taaaaaatatttcaatatttttctatttgaggagaaat--------------ggtggtatcaccatatttgagtggttgtagtgccatattgatgttttg 40148177  T
Q  208 gagaaattaaagttaaaatggtggtaaaatcatatttgagtggtctcagcaccataacagagtgataacaatactatattgaagtggttttagtattaaa 307  Q
    ||||||||||||||| ||||| || || | ||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||    
T  40148176 gagaaattaaagttagaatgggggcaacaccatatttaagtggtctcaacaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtggtttcagtattaaa 40148077  T
Q  308 gagtggtcttagtaccatatttgaaggtgtaaatctcgaacggttttctacagtgcaatagttaactgcacagttgtagttgtgcttgttttatcctgga 407  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||| || ||| ||| || || |||| ||||||||||||    
T  40148076 gagtggtcgtagtaccatatttggaggtgtaattctcgaacggttttctacagtgtagtagttaattgaacaattgaagctgagcttattttatcctgga 40147977  T
Q  408 ggcggcgtcgttgat 422  Q
    |||||||| ||||||    
T  40147976 ggcggcgtggttgat 40147962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 168 - 422
Target Start/End: Original strand, 6155192 - 6155447
Alignment:
Q  168 caccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatactttggagaaatta--aagttaaaatggtggtaaaatcatatttgagtggtctcagcaccataac 265  Q
    ||||||||||||||||| | | | ||||||||||| ||||||||| |||  || |||||||| |||||| | |||||||||||||||||| |||||||||    
T  6155192 caccatatttgagtggttgaaataccatattgata-tttggagaagttagaaaattaaaatgttggtaacaccatatttgagtggtctcaacaccataac 6155290  T
Q  266 agagtgataacaatactatattgaagtggttttagtattaaagagtggtcttagtaccatatttgaaggtgtaaatctcgaacggttttctacagtgcaa 365  Q
    |||||| ||||||||| | ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  6155291 agagtggtaacaataccaaattaaagtggtttcagtattaaagagtggtcttagtaccatatttggaggtgtaattctcgaacggttttctacagtgcag 6155390  T
Q  366 tagttaactgcacagttgtagttgtgcttgttttatcctggaggcggcgtcgttgat 422  Q
    |||||||  | |||||||||| || |||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  6155391 tagttaatcgaacagttgtagctgggcttgttttatcctggaggcggtgtggttgat 6155447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 13 - 234
Target Start/End: Original strand, 6513546 - 6513766
Alignment:
Q  13 aatataagtcccttcggaataaagagtaccattaagatcatagtccctttttggaataataatgtcctgtcggaattaaagatgatcttaacggtatata 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||  ||||||  |||||||||| ||||||||    
T  6513546 aatataagtcccttcggaataaagagtgctattaagatcatagtccctttt-ggaata-taatgtcccgtcataattaagaatgatcttaaaggtatata 6513643  T
Q  113 aatattctttcaatattta---aattgaggagaaattaaaaagttgaaaaggtgatatcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatactttgga 209  Q
    ||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6513644 aatattctttcaatatttttctaattgaggagaaattaaaaagtggaaatggtggtatc--catatttgagtggtcgtagtgccatattgatactttgga 6513741  T
Q  210 gaaattaaagttaaaatggtggtaa 234  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||    
T  6513742 gaaatgaaagttagaatggtggtaa 6513766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 21 - 422
Target Start/End: Original strand, 16115871 - 16116277
Alignment:
Q  21 tcccttcggaataaagagtaccattaagatcatagtccctttttggaa-taataatgtcctgtcggaattaaagatgatcttaacggtatataaatattc 119  Q
    ||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||| |||||||    
T  16115871 tcccttcagaataaagagtacttttaagatcatagtccattttttgaaataataatgtcctgtcagaattaagaatgatcttaacagtatattaatattc 16115970  T
Q  120 tttcaatattta---aattgaggagaaattaaaaagttgaaaaggtgatatcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatactttggagaaatta 216  Q
    |||  ||||||    | ||    |||| ||||||||||  || |||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| |||| |||    
T  16115971 ttttgatatttttctatttttttagaagttaaaaagttagaatggtggtatcatcatatttgagtggttgtagtaccatattgatagtttgaagaactta 16116070  T
Q  217 aagttaaaatggtggtaaaatcatatttgagtggtctcagcaccataacagagtg--ataacaatactatatt--gaagtggttttagtattaaagagtg 312  Q
    ||| || ||||||| ||| |||||||||||||||||| | |||||||| ||||||   | ||||||| |||||   ||| ||||| ||||||||||||||    
T  16116071 aaggtagaatggtgataacatcatatttgagtggtcttaacaccataatagagtggtgtcacaataccatattagaaagcggtttcagtattaaagagtg 16116170  T
Q  313 gtcttagtaccatatttgaaggtgtaaatctcgaacggttttctacagtgcaatagttaactgcacagttgtagttgtgcttgttttatcctggaggcgg 412  Q
       |||||| |||| ||| | |||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||| | || ||||||||||  |||||||||||  ||||| ||    
T  16116171 --attagtatcata-ttggatgtgtaattctcgaacggttttctatagtgcagtagttaacagtactgttgtagttgaacttgttttatctaggaggtgg 16116267  T
Q  413 cgtcgttgat 422  Q
    ||| ||||||    
T  16116268 cgtggttgat 16116277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 224 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 39523313 - 39523116
Alignment:
Q  224 aatggtggtaaaatcatatttgagtggtctcagcaccataacagagtgataacaatactatattgaagtggttttagtattaaagagtggtcttagtacc 323  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||| | | ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  39523313 aatggtggtaacaccatatttgagtggtctcagcaccatat-agagtggtaacagtgccatattaaagtggtttcagtattaaagagtggtcttagtacc 39523215  T
Q  324 atatttgaaggtgtaaatctcgaacggttttctacagtgcaatagttaactgcacagttgtagttgtgcttgttttatcctggaggcggcgtcgttgat 422  Q
    ||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| || ||  |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  39523214 atatttggaggtgtaattcttgaacggttttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgcagctggacttgttttatcctggaggcggcgtggttgat 39523116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 238 - 422
Target Start/End: Original strand, 12501743 - 12501927
Alignment:
Q  238 catatttgagtggtctcagcaccataacagagtgataacaatactatattgaagtggttttagtattaaagagtggtcttagtaccatatttgaaggtgt 337  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||| ||||| |||||||||  |||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  12501743 catatttgagtggtctcaacaccataacagagtggtaacagtaccatattaaagtggtttcggtattaaatagtggtcttagtatcatatttggaggtgt 12501842  T
Q  338 aaatctcgaacggttttctacagtgcaatagttaactgcacagttgtagttgtgcttgttttatcctggaggcggcgtcgttgat 422  Q
    || ||||||||| |||||||||||||| |||||||| | |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12501843 aattctcgaacgattttctacagtgcagtagttaaccgaacagttgtagctgggcttgttttatcctggaggcggcgtggttgat 12501927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 168 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 557010 - 556762
Alignment:
Q  168 caccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatactttggagaaattaaag-ttaaaatggtggtaaaatcatatttgagtggtctcagcaccataaca 266  Q
    ||||||||||||||||| | | |||| |||||||| ||||||||| |||||  ||| ||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||      
T  557010 caccatatttgagtggttgaaatgcc-tattgata-tttggagaagttaaaaattagaatggtggtaacaccatatttgagtggtctcaacaccataatt 556913  T
Q  267 gagtgataacaatactatattgaagtggttttagtattaaagagtggtcttagtaccatatttgaaggtgtaaatctcgaacggttttctacagtgcaat 366  Q
    ||||| | ||||||| ||||||     |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  556912 gagtggttacaataccatattg-----gtttcagtattatagagtggtcttagtaccatatttggaggtgtaattctcgaacggttttctacagtgcagt 556818  T
Q  367 agttaactgcacagttgtagttgtgcttgttttatcctggaggcggcgtcgttgat 422  Q
    ||||||  | |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  556817 agttaatcgaacagttgtagctgagcttgttttatcctggaggcggcgtggttgat 556762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 168 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 561782 - 561534
Alignment:
Q  168 caccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatactttggagaaattaaag-ttaaaatggtggtaaaatcatatttgagtggtctcagcaccataaca 266  Q
    ||||||||||||||||| | | |||| |||||||| ||||||||| |||||  ||| ||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||      
T  561782 caccatatttgagtggttgaaatgcc-tattgata-tttggagaagttaaaaattagaatggtggtaacaccatatttgagtggtctcaacaccataatt 561685  T
Q  267 gagtgataacaatactatattgaagtggttttagtattaaagagtggtcttagtaccatatttgaaggtgtaaatctcgaacggttttctacagtgcaat 366  Q
    ||||| | ||||||| ||||||     |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  561684 gagtggttacaataccatattg-----gtttcagtattatagagtggtcttagtaccatatttggaggtgtaattctcgaacggttttctacagtgcagt 561590  T
Q  367 agttaactgcacagttgtagttgtgcttgttttatcctggaggcggcgtcgttgat 422  Q
    ||||||  | |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  561589 agttaatcgaacagttgtagctgagcttgttttatcctggaggcggcgtggttgat 561534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 224 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 39518674 - 39518477
Alignment:
Q  224 aatggtggtaaaatcatatttgagtggtctcagcaccataacagagtgataacaatactatattgaagtggttttagtattaaagagtggtcttagtacc 323  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||| | | ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  39518674 aatggtggtaacaccatatttgagtggtctcagcaccatat-agagtggtaacagtgccatattaaagtggtttcagtattaaagagtggtcttagtacc 39518576  T
Q  324 atatttgaaggtgtaaatctcgaacggttttctacagtgcaatagttaactgcacagttgtagttgtgcttgttttatcctggaggcggcgtcgttgat 422  Q
    ||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||| || ||  |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  39518575 atatttggaggtgtaattcttgaacggttttctacactgcagtagttaaccgcacagttgcagctggacttgttttatcctggaggcggcgtggttgat 39518477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 238 - 422
Target Start/End: Original strand, 6514444 - 6514629
Alignment:
Q  238 catatttgagtggtctcagcaccataacagagtgataacaatactatattgaagtggttttagtattaaa-gagtggtcttagtaccatatttgaaggtg 336  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||||||||| | ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6514444 catatttgagtggtctcagcaccataacagagtggtaacaatacaatatcaaagtggtttcaatattaaaagagtggttttagtaccatatttgaaggtg 6514543  T
Q  337 taaatctcgaacggttttctacagtgcaatagttaactgcacagttgtagttgtgcttgttttatcctggaggcggcgtcgttgat 422  Q
    ||||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||  ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6514544 taaatctcgaatgattttctacaatgcagtagttaaccacacagttgtagctaagcttgttttatcctggaggcggcgtggttgat 6514629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 149 - 370
Target Start/End: Original strand, 34707293 - 34707513
Alignment:
Q  149 aaagttgaaaaggtgatatcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatactttggagaaattaaagttaaaatggtggtaaaatcatatttgagt 248  Q
    ||||| |||| |||| |||||||||||||||||||   ||||  |||||||||| ||| ||||| ||||||||| ||| ||| ||| | |||||||||||    
T  34707293 aaagtcgaaatggtggtatcaccatatttgagtggatttagtatcatattgatagttttgagaacttaaagttagaatagtgataacaccatatttgagt 34707392  T
Q  249 ggtctcagcaccataacagagtgataacaatactatattgaagtggttttagtattaaagagtggtcttagtaccatatttgaaggtgtaaatctcgaac 348  Q
    | | | |||||||||||||| |||||||||||  ||||| || || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  34707393 gattttagcaccataacagaatgataacaataacatattaaaatgatttcagtattaaagagtggtcttagtaccatattt-aaggtgtaaatctcgaac 34707491  T
Q  349 ggttttctacagtgcaatagtt 370  Q
    |||||||||  |||||||||||    
T  34707492 ggttttctatggtgcaatagtt 34707513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 224 - 422
Target Start/End: Original strand, 11981110 - 11981308
Alignment:
Q  224 aatggtggtaaaatcatatttgagtggtctcagcaccataacagagtgataacaatactatattgaagtggttttagtattaaa-gagtggtcttagtac 322  Q
    |||| |||||| | |||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||||| ||||| |||||||||  |||||||| || ||||||| ||||    
T  11981110 aatgatggtaacaccatatttgagtggtctcatcaccacaatagagtggtaacaataccatattaaagtggtttcggtattaaaagaatggtcttggtac 11981209  T
Q  323 catatttgaaggtgtaaatctcgaacggttttctacagtgcaatagttaactgcacagttgtagttgtgcttgttttatcctggaggcggcgtcgttgat 422  Q
    |||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  11981210 catattaga-ggtgtaattctcgaacggttttctacagtgcaatagttaatcgaacagttgtagatgtgcttgttttattctggaggcggcgtggttgat 11981308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 168 - 422
Target Start/End: Original strand, 36937291 - 36937539
Alignment:
Q  168 caccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatactttggagaaattaaag-ttaaaatggtggtaaaatcatatttgagtggtctcagcaccataaca 266  Q
    ||||||||||||||||| | | |||| |||||||| ||||||||| |||||  ||| ||||||||||| | |||||||||||||||||| || |||||      
T  36937291 caccatatttgagtggttgaaatgcc-tattgata-tttggagaagttaaaaattagaatggtggtaacaccatatttgagtggtctcaacatcataatt 36937388  T
Q  267 gagtgataacaatactatattgaagtggttttagtattaaa-gagtggtcttagtaccatatttgaaggtgtaaatctcgaacggttttctacagtgcaa 365  Q
    ||||| | ||||||| ||||||     |||| ||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  36937389 gagtggttacaataccatattg-----gtttcagtattaaaagattggtcttagtaccatatt-gaaggtgtaattctcgaacggttttctacagtgcag 36937482  T
Q  366 tagttaactgcacagttgtagttgtgcttgttttatcctggaggcggcgtcgttgat 422  Q
    |||||||  | |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  36937483 tagttaatcgaacagttgtagctgggcttgttttatcctggaggcggcgtggttgat 36937539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 168 - 422
Target Start/End: Original strand, 36942045 - 36942293
Alignment:
Q  168 caccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatactttggagaaattaaag-ttaaaatggtggtaaaatcatatttgagtggtctcagcaccataaca 266  Q
    ||||||||||||||||| | | |||| |||||||| ||||||||| |||||  ||| ||||||||||| | |||||||||||||||||| || |||||      
T  36942045 caccatatttgagtggttgaaatgcc-tattgata-tttggagaagttaaaaattagaatggtggtaacaccatatttgagtggtctcaacatcataatt 36942142  T
Q  267 gagtgataacaatactatattgaagtggttttagtattaaa-gagtggtcttagtaccatatttgaaggtgtaaatctcgaacggttttctacagtgcaa 365  Q
    ||||| | ||||||| ||||||     |||| ||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  36942143 gagtggttacaataccatattg-----gtttcagtattaaaagattggtcttagtaccatatt-gaaggtgtaattctcgaacggttttctacagtgcag 36942236  T
Q  366 tagttaactgcacagttgtagttgtgcttgttttatcctggaggcggcgtcgttgat 422  Q
    |||||||  | |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  36942237 tagttaatcgaacagttgtagctgggcttgttttatcctggaggcggcgtggttgat 36942293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 168 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 41996975 - 41996732
Alignment:
Q  168 caccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatactttggagaaattaaag-ttaaaatggtggtaaaatcatatttgagtggtctcagcaccataaca 266  Q
    ||||||||||||||||| | | |||| |||||||| ||||||||| |||||  ||| ||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||      
T  41996975 caccatatttgagtggttgaaatgcc-tattgata-tttggagaagttaaaaattagaatggtggtaacaccatatttgagtggtctcaacaccataatt 41996878  T
Q  267 gagtgataacaatactatattgaagtggttttagtattaaa-gagtggtcttagtaccatatttgaaggtgtaaatctcgaacggttttctacagtgcaa 365  Q
    ||||| | ||||||| ||||||     |||| ||| ||||| || |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||        
T  41996877 gagtggttacaataccatattg-----gtttcagtgttaaaagattggtcttagtaccatatt-gaaggtgtaattctcgaacggttttctacagt---- 41996788  T
Q  366 tagttaactgcacagttgtagttgtgcttgttttatcctggaggcggcgtcgttgat 422  Q
     ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  41996787 -agttaaccgcacagttgtagttgggcttgttttatcctggaggcggcgtggttgat 41996732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 224 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 4872187 - 4871989
Alignment:
Q  224 aatggtggtaaaatcatatttgagtggtctcagcaccataacagagtgataacaatactatattgaagtggttttagtattaaa-gagtggtcttagtac 322  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| ||| ||||| ||||||||| | ||||||| || ||||||| ||||    
T  4872187 aatggtggtaacaccatatttgagtggtcttagcaccataatagagtggtaacagtaccatattaaagtggtttcattattaaaagaatggtctttgtac 4872088  T
Q  323 catatttgaaggtgtaaatctcgaacggttttctacagtgcaatagttaactgcacagttgtagttgtgcttgttttatcctggaggcggcgtcgttgat 422  Q
    |||||| |||||| ||| |||| |||||||||||||||| || |||||||  | ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  4872087 catatt-gaaggtataattctcaaacggttttctacagtacagtagttaatcgaacagttgtagttgagcttgttttatcatggaggcggcgtggttgat 4871989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 192 - 422
Target Start/End: Original strand, 32461351 - 32461577
Alignment:
Q  192 ccatattgatactttggagaaattaaag--ttaaaatggtggtaaaatcatatttgagtggtctcagcaccataacagagtgataacaatactatattga 289  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||   ||| ||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||| |||||| | | | ||| ||||||     
T  32461351 ccatattgata-tttggagaagttaaaaaattagaatggtggtaacaccatatttgagtggtctcaacaccataatagagtggtcatagtaccatattg- 32461448  T
Q  290 agtggttttagtattaaa-gagtggtcttagtaccatatttgaaggtgtaaatctcgaacggttttctacagtgcaatagttaactgcacagttgtagtt 388  Q
        |||| || |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| || |    
T  32461449 ----gtttcagcattaaaagagtggtcttagtaccatatt-gaaggtgtaattctcgaacggttttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgcagct 32461543  T
Q  389 gtgcttgttttatcctggaggcggcgtcgttgat 422  Q
    |  |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  32461544 gaacttgttttatcctggaggcggcgtggttgat 32461577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 168 - 415
Target Start/End: Original strand, 12044918 - 12045160
Alignment:
Q  168 caccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatactttggagaaattaaag-ttaaaatggtggtaaaatcatatttgagtggtctcagcaccataaca 266  Q
    ||||||||||||||||| | | | ||||||||||| ||||||||| |||||  ||| || |||||||| | ||||||||| |||||||| |||||||| |    
T  12044918 caccatatttgagtggttgaaataccatattgata-tttggagaagttaaaaattagaaaggtggtaacaccatatttgattggtctcaacaccataata 12045016  T
Q  267 gagtgataacaatactatattgaagtggttttagtattaaa-gagtggtcttagtaccatatttgaaggtgtaaatctcgaacggttttctacagtgcaa 365  Q
    |||||   | | ||| ||||||     |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||  |||||||||||     
T  12045017 gagtggccatagtaccatattg-----gtttcagtattaaaagagtggtcttagtaccatatt-gaaggtgtaattctcgaacggtagtctacagtgcag 12045110  T
Q  366 tagttaactgcacagttgtagttgtgcttgttttatcctggaggcggcgt 415  Q
    |||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  12045111 tagttaaccgcacagttgtagctatgcttgttttatcctggaggcggcgt 12045160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 283 - 422
Target Start/End: Original strand, 41587051 - 41587188
Alignment:
Q  283 atattgaagtggttttagtattaaagagtggtcttagtaccatatttgaaggtgtaaatctcgaacggttttctacagtgcaatagttaactgcacagtt 382  Q
    ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  41587051 atattaaagtggtttcagtgttaaagagtggtcttagtaccatatttgagggtgtaattc--gaacggttttctacagtgcagtagttaaccgcacagtt 41587148  T
Q  383 gtagttgtgcttgttttatcctggaggcggcgtcgttgat 422  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  41587149 gtagctgagcttgttttatcctggaggcggcgtggttgat 41587188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 168 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 42001744 - 42001501
Alignment:
Q  168 caccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatactttggagaaattaaag-ttaaaatggtggtaaaatcatatttgagtggtctcagcaccataaca 266  Q
    ||||||||||||||||| | | |||| |||||||| ||||||||| |||||  ||| ||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||      
T  42001744 caccatatttgagtggttgaaatgcc-tattgata-tttggagaagttaaaaattagaatggtggtaacaccatatttgagtggtctcaacaccataatt 42001647  T
Q  267 gagtgataacaatactatattgaagtggttttagtattaaa-gagtggtcttagtaccatatttgaaggtgtaaatctcgaacggttttctacagtgcaa 365  Q
    ||||| | ||||||| ||||||     |||| ||| ||||| || |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||        
T  42001646 gagtggttacaataccatattg-----gtttcagtgttaaaagattggtcttagtaccatatt-gaaggtgtaattctcgaacggttttctacagt---- 42001557  T
Q  366 tagttaactgcacagttgtagttgtgcttgttttatcctggaggcggcgtcgttgat 422  Q
     ||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  42001556 -agttaaccgcacagttgtagctgggcttgttttatcctggaggcggcgtggttgat 42001501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 20 - 422
Target Start/End: Original strand, 15414505 - 15414909
Alignment:
Q  20 gtcccttcggaataaagagtaccattaagatcatagtccctttttggaataataatgtcctgtcggaattaaagatgatcttaacggtatataaatattc 119  Q
    ||||||||  ||||||||||||   |||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||| ||  ||||||||||| |||||||||| |||    
T  15414505 gtcccttcaaaataaagagtacttgtaagatcatagttcctttttggaataataatgtctcgtcggaatcaagaatgatcttaacagtatataaatgttc 15414604  T
Q  120 tttcaatatttaaat---tgaggagaa-attaaaaagttgaaaaggtgatatcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatactttggagaaatt 215  Q
     ||  ||||||   |   |  |||||| ||||||  ||   |  |||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||| ||    
T  15414605 atttgatatttttctacctttggagaagattaaa--gtcagatgggtggtgtcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatattttgaagaactt 15414702  T
Q  216 aaa-gttaaaatggtggtaaaatcatatttgagtggtctcagcaccataacagagtgataacaatactatattgaagtggttttagtattaaagagtggt 314  Q
    ||| |||| ||||||| ||| | ||||||| |||||||  | ||||||||||||||| | |   ||| |||||  |||| || |||||||||||| ||||    
T  15414703 aaatgttagaatggtgataacaccatattttagtggtcataacaccataacagagtggtcaaggtaccatattagagtgattctagtattaaagattggt 15414802  T
Q  315 cttagtaccatatttgaaggtgtaaatctcgaacggttttctacagtgcaatagttaactgcacagttgtagttgtgcttgttttatcctggaggcggcg 414  Q
    ||||||| |||| ||| |||||||||| ||||| ||||||||| |||||| |||||||| ||||| ||  |  ||  ||||  |||||||||||||||||    
T  15414803 cttagtagcata-ttggaggtgtaaatttcgaaaggttttctatagtgcagtagttaaccgcacatttacatgtggacttgcattatcctggaggcggcg 15414901  T
Q  415 tcgttgat 422  Q
    | ||||||    
T  15414902 tggttgat 15414909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 238 - 385
Target Start/End: Original strand, 9726532 - 9726678
Alignment:
Q  238 catatttgagtggtctcagcaccataacagagtgataacaatactatattgaagtggttttagtattaaagagtggtcttagtaccatatttgaaggtgt 337  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||  || |||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||| || ||||    
T  9726532 catatttgagtggtctcagcaccataatagagtggtaacaataccatatgaaaatggtttcagtattaaagaatggtcttaataccatattt-aaagtgt 9726630  T
Q  338 aaatctcgaacggttttctacagtgcaatagttaactgcacagttgta 385  Q
    ||| || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  9726631 aaaccttgaacggttttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgta 9726678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 204 - 406
Target Start/End: Original strand, 12102639 - 12102843
Alignment:
Q  204 tttggagaaattaaagttaaaatggtggtaaaatcatatttgagtggtctcagca-ccataacagagtgataacaatactatattgaagtggttttagta 302  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||| | ||||||| ||||||||||  | ||||||||||||| |||||||   ||||| ||||||||| ||||    
T  12102639 tttggagaacttaaagttagaatggtggtaacaccatatttaagtggtctcaaaaaccataacagagtggtaacaatgtcatattaaagtggtttcagta 12102738  T
Q  303 ttaaagagtggtcttag----taccatatttgaaggtgtaaatctcgaacggttttctacagtgcaatagttaactgcacagttgtagttgtgcttgttt 398  Q
    |||||||||||||||||    |||||||||||| |||| ||||| | |||||||||||||   | | |||||||| |||||||||||||||  |||||||    
T  12102739 ttaaagagtggtcttagtacataccatatttgagggtgaaaatcccaaacggttttctac---gtagtagttaaccgcacagttgtagttggtcttgttt 12102835  T
Q  399 tatcctgg 406  Q
    ||||||||    
T  12102836 tatcctgg 12102843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 292 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 3666129 - 3665999
Alignment:
Q  292 tggttttagtattaaa-gagtggtcttagtaccatatttgaaggtgtaaatctcgaacggttttctacagtgcaatagttaactgcacagttgtagttgt 390  Q
    |||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||     
T  3666129 tggtttcagtattaaaagagtggtattagtaccatatt-gaaggtgtaattcccgaacggttttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgtagttgg 3666031  T
Q  391 gcttgttttatcctggaggcggcgtcgttgat 422  Q
     ||||||||||||| |||| ||||| ||||||    
T  3666030 acttgttttatcctagaggtggcgtggttgat 3665999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 13 - 255
Target Start/End: Original strand, 37549781 - 37550014
Alignment:
Q  13 aatataagtcccttcggaataaagagtaccattaagatcatagtccctttttggaataataatgtcctgtcggaattaaagatgatcttaacgg--tata 110  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||  |||||||||||||  ||||    
T  37549781 aatatatgtcccttcagaataaagagtacttttaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcccgtcggaattaagaatgatcttaacggtatata 37549880  T
Q  111 taaatattctttcaatattt---aaattgaggagaaattaaaaagttgaaaaggtgatatcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatactttg 207  Q
    |||| | | |||||||||||    | ||||||||||||              |||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||     
T  37549881 taaaaagtatttcaatatttttctatttgaggagaaat--------------ggtggtatcaccatatttaagtggtcgtagtaccatattgatagttta 37549966  T
Q  208 gagaaattaaagttaaaatggtggtaaaatcatatttgagtggtctca 255  Q
    ||||| ||||||||| |||| |  ||| | ||||||||||||||||||    
T  37549967 gagaacttaaagttagaatgatattaacaccatatttgagtggtctca 37550014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 13 - 255
Target Start/End: Original strand, 37652579 - 37652812
Alignment:
Q  13 aatataagtcccttcggaataaagagtaccattaagatcatagtccctttttggaataataatgtcctgtcggaattaaagatgatcttaacgg--tata 110  Q
    |||||| |||||||| |||||||||| ||  ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||  |||||||||||||  ||||    
T  37652579 aatatatgtcccttcagaataaagagcacttttaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcccgtcggaattaataatgatcttaacggtatata 37652678  T
Q  111 taaatattctttcaatattt---aaattgaggagaaattaaaaagttgaaaaggtgatatcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatactttg 207  Q
    |||| | | |||||||||||    | ||||||||||||              |||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||     
T  37652679 taaaaagtatttcaatatttttctatttgaggagaaat--------------ggtggtatcaccatatttaagtggtcgtagtaccatattgatagttta 37652764  T
Q  208 gagaaattaaagttaaaatggtggtaaaatcatatttgagtggtctca 255  Q
    ||||| ||||||||| |||| |  ||| | ||||||||||||||||||    
T  37652765 gagaacttaaagttagaatgatattaacaccatatttgagtggtctca 37652812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 13 - 130
Target Start/End: Original strand, 9726384 - 9726502
Alignment:
Q  13 aatataagtcccttcggaataaagagtaccattaagatcatagtccctttttggaataataatgtcctgtcggaattaaagatgatcttaacggtatat- 111  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||  |||||||||| |||||||     
T  9726384 aatatatgtcccttcggaataaagagtacttttaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcccgtcggaattaagaatgatcttaaaggtatata 9726483  T
Q  112 aaatattctttcaatattt 130  Q
    ||| ||| |||||||||||    
T  9726484 aaaaattatttcaatattt 9726502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 238 - 422
Target Start/End: Original strand, 12041776 - 12041960
Alignment:
Q  238 catatttgagtggtctcagcaccataacagagtgataacaatactatattgaagtggttttagtattaaa-gagtggtcttagtaccatatttgaaggtg 336  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||| |||||| ||||| ||| ||||| | ||||||| ||||||||| || ||  ||| |||||||||| || ||||    
T  12041776 catatttgagtagtcttagcaccataatagagtggtaacagtaccatattaatgtggtttcagtattaaaagaatgtacttggtaccatattgga-ggtg 12041874  T
Q  337 taaatctcgaacggttttctacagtgcaatagttaactgcacagttgtagttgtgcttgttttatcctggaggcggcgtcgttgat 422  Q
    ||| |||||||| ||||| || |||||| |||||||  | |||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12041875 taattctcgaacagttttttatagtgcagtagttaatcgaacagttgtagctggacttgttttatcctggaggcggcgtggttgat 12041960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 205 - 337
Target Start/End: Original strand, 13301299 - 13301426
Alignment:
Q  205 ttggagaaattaaagttaaaatggtggtaaaatcatatttgagtggtctcagcaccataacagagtgataacaatactatattgaagtggttttagtatt 304  Q
    |||||||| ||||| ||| ||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||| ||| || || |||||| ||||     |||||| ||||||    
T  13301299 ttggagaagttaaaattagaatggtggtaacaccatatttgagtggtctcaacaccataatagaatggtaccaataccatat-----tggtttcagtatt 13301393  T
Q  305 aaagagtggtcttagtaccatatttgaaggtgt 337  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  13301394 aaagagtggtcttagtaccatattagagggtgt 13301426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 205 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 31731821 - 31731694
Alignment:
Q  205 ttggagaaattaaagttaaaatggtggtaaaatcatatttgagtggtctcagcaccataacagagtgataacaatactatattgaagtggttttagtatt 304  Q
    |||||||| ||||| ||| ||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||| ||| || ||||||||| ||||     |||||| ||||||    
T  31731821 ttggagaagttaaaattagaatggtggtaataccatatttgagtggtctcaacaccataatagaatggtaacaataccatat-----tggtttaagtatt 31731727  T
Q  305 aaagagtggtcttagtaccatatttgaaggtgt 337  Q
    ||||||| ||||| |||||||||| || |||||    
T  31731726 aaagagtagtcttggtaccatattagagggtgt 31731694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 204 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 9911430 - 9911239
Alignment:
Q  204 tttggagaaattaaag-ttaaaatggtggtaaaatcatatttgagtggtctcagcaccataacagagtgataacaatactatattgaagtggttttagta 302  Q
    ||||||||| |||||  ||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||  | |||  | ||||||| |||||||     ||| ||||    
T  9911430 tttggagaagttaaaaattagaatggtggtaacatcatatttgagtggtcttagcaccatataa-agttgtcacaataccatattga-----tttcagta 9911337  T
Q  303 ttaaa-gagtggtcttagtaccatatttgaaggtgtaaatctcgaacggttttctacagtgcaatagttaactgcacagttgtagttgtgcttgttttat 401  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| || ||||   | | |||||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||  ||||||||||    
T  9911336 ttaaaagagtggtcttagtaccatattt-aatgtgtc--ttttgaacggttttctacagtgcagtaattaaccgcacaattgtagttgaacttgttttat 9911240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 227 - 337
Target Start/End: Original strand, 21323805 - 21323910
Alignment:
Q  227 ggtggtaaaatcatatttgagtggtctcagcaccataacagagtgataacaatactatattgaagtggttttagtattaaagagtggtcttagtaccata 326  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||| |||||||| ||| || ||||||||| ||||     |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21323805 ggtggtaacaccatatttgagtggtctcaacaccataatagaatggtaacaataccatat-----tggtttcagtattaaagactggtcttagtaccata 21323899  T
Q  327 tttgaaggtgt 337  Q
    || || |||||    
T  21323900 ttagagggtgt 21323910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 168 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 3666226 - 3666131
Alignment:
Q  168 caccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatactttggagaaattaaa-gttaaaatggtggtaaaatcatatttgagtggtctcagcaccata 263  Q
    ||||||||||||||||| | | | ||||||||||| ||||||||| ||| | |||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||    
T  3666226 caccatatttgagtggttgaaataccatattgata-tttggagaagttagatgttagaatggtggtaacaccatatttgagtggtctcagcatcata 3666131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 224 - 337
Target Start/End: Original strand, 1429831 - 1429938
Alignment:
Q  224 aatggtggtaaaatcatatttgagtggtctcagcaccataacagagtgataacaatactatattgaagtggttttagtattaaagagtggtcttagtacc 323  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| | | || | ||||||| | ||     |||||| | ||||||||| |||||||||||||    
T  1429831 aatggtggtaacaccatatttgagtggtctcagcaccataa-ataatggtcacaataccacat-----tggtttcaatattaaagaatggtcttagtacc 1429924  T
Q  324 atatttgaaggtgt 337  Q
    |||||||| |||||    
T  1429925 atatttgagggtgt 1429938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0054 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 3)
Name: scaffold0054
Description:

Target: scaffold0054; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 13 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 25919 - 25637
Alignment:
Q  13 aatataagtcccttcggaataaagagtaccattaagatcatagtccctttttggaataataatgtcctgtcggaattaaagatgatcttaacggtatata 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  25919 aatataagtcccttcggaataaagagtgctattaagatcatagtccctttttggaataataatgtctcgtcggaattaagaatgatcttaacggtatata 25820  T
Q  113 aatattctttcaatatttaaattgaggagaaattaaaaagttgaaaaggtgatatcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatactttggagaa 212  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25819 aatattctttcaatattttaattgaggagaaattaaaaagtggaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtgtcatattgatactttggagaa 25720  T
Q  213 attaaagttaaaatggtggtaaaatcatatttgagtggtctcagcaccataacagagtgataacaatactatattgaagtggt 295  Q
    |||||| ||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||  ||||| |||||||    
T  25719 attaaaattagaatggtggtaacaccatatttgagtggtctcagaaccataacagagtggtaataatatcatattaaagtggt 25637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0054; HSP #2
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 13 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 29638 - 29222
Alignment:
Q  13 aatataagtcccttcggaataaagagtaccattaagatcatagtccctttttggaataataatgtcctgtcggaattaaagatgatcttaacggtatata 112  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||  ||||||||||| |||||||    
T  29638 aatataagtcccttcggaatgaagagt-ctattaagatcatagtccctttttggaataataatgtctcgtcgaaattaagaatgatcttaacagtatata 29540  T
Q  113 aatattctttcaatatttaaattgaggagaaattaaaaagttgaaaaggtgatatcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatactttg----g 208  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| |||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    |    
T  29539 aatattctttcaatattttaattgaagagaaattaaaaagtggaaatggtggtgtcaccatatttgagtggtcgtagtgcaatattgatattttggttag 29440  T
Q  209 agaaattaaagttaaaatggtggtaaaatcatatttgagtggtctcagcaccataacagagtgataacaatactatattgaagtggttttagtatt-aaa 307  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| | || |||||| |||||| |||    
T  29439 agaaattaaagttagaatggtggtaacaccatatttgagtggtctcagaaccataacagagtggtaacaatactatactaaaatggtttcagtattaaaa 29340  T
Q  308 gagtggtc----ttagtaccatatttgaaggtgtaaatctcgaacggttttctacagtgcaatagttaactgcacagttgtagttgtgcttgttttatcc 403  Q
    ||  | ||    |||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||| |||||   ||| ||||||||    
T  29339 gaacgatcttaattagtatcata-ttgaaggtgtaattctcgaacggttttctacaatgcagtagttaaccgcacagttatagttagacttattttatcc 29241  T
Q  404 tggaggcggcgtcgttgat 422  Q
    || || |||||| ||||||    
T  29240 tgaagacggcgtggttgat 29222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0054; HSP #3
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 283 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 25605 - 25466
Alignment:
Q  283 atattgaagtggttttagtattaaagagtggtcttagtaccatatttgaaggtgtaaatctcgaacggttttctacagtgcaatagttaactgcacagtt 382  Q
    ||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||    
T  25605 atattaaagtggtttcaatattaaagagtggtcttagtaccatatttgaagatgtaagtctcgaacggttttctacagtgtagtagttaaccgcacagtt 25506  T
Q  383 gtagttgtgcttgttttatcctggaggcggcgtcgttgat 422  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  25505 gtagttgggcttgttttatcctggacgcggcgtggttgat 25466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 179; Significance: 2e-96; HSPs: 35)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 13 - 422
Target Start/End: Original strand, 25496954 - 25497353
Alignment:
Q  13 aatataagtcccttcggaataaagagtaccattaagatcatagtccctttttggaataataatgtcctgtcggaattaaagatgatcttaacggtatata 112  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||  ||||||||||||| | | |||||||||| ||||||  |||||||||||  ||||| |||||||||||||    
T  25496954 aatatatgtcccttcagaataaagagtacttttaagatcatagtacttatttggaataacaatgtcacgtcggaattaagaatgattttaacggtatata 25497053  T
Q  113 --aatattctttcaatattta---aattgaggagaaattaaaaagttgaaaaggtgatatcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatactttg 207  Q
      || | | |||||||||||    | ||||||||||||              |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||    
T  25497054 taaaaagtatttcaatatttttctatttgaggagaaat--------------ggtggtatcaccatatttgaggggtcgtagtgccatattgatgttttg 25497139  T
Q  208 gagaaattaaagttaaaatggtggtaaaatcatatttgagtggtctcagcaccataacagagtgataacaatactatattgaagtggttttagtattaaa 307  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||||||| | |||||||    
T  25497140 gagaaattaaagttagaatggtggtaacaccatatttgagtggtctcaacaccataacagagtggtaataataccatattaaagtggtttcaatattaaa 25497239  T
Q  308 gagtggtcttagtaccatatttgaaggtgtaaatctcgaacggttttctacagtgcaatagttaactgcacagttgtagttgtgcttgttttatcctgga 407  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  25497240 gagtggtcttagtatcatatttgagggtgtaattctcgaacggttttctacagtgc-atagttaaccgcacagttgtagctgggcttgttttatcctgga 25497338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 61 - 422
Target Start/End: Original strand, 17544963 - 17545326
Alignment:
Q  61 ttttggaataataatgtcctgtcggaattaaagatgatcttaacggtatataaatattctttcaatattta---aattgaggagaaattaaaaagttgaa 157  Q
    ||||| || |||||||||  |||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    | |||||||||||||||||||| |||    
T  17544963 ttttgaaacaataatgtctcgtcggaattaagaatgatcttaacagtatataaatattctttcaatatttttctatttgaggagaaattaaaaagtcgaa 17545062  T
Q  158 aaggtgatatcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatactttggagaaattaaagttaaaatggtggtaaaatcatatttgagtggtctcagc 257  Q
    |||||  ||||| |||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||||| | ||||||| ||||||||||||    
T  17545063 aaggtagtatcatcatatttgagtgttcgtaataccatattgatagtttagagaacttaaagttagaatggtggtaacaccatattttagtggtctcagc 17545162  T
Q  258 accataacagagtgataacaatactatattgaagtggttttagtattaaagagtggtcttagtaccatatttgaaggtgtaaatctcgaacggttttcta 357  Q
    ||||||||| |||| |||||||| || ||| |||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| | |||||||    
T  17545163 accataacaaagtggtaacaata-tagattaaagtggtttccgtattaaagagtggtcttagtatcatatttgagggtgtaaatctcgaatgattttcta 17545261  T
Q  358 cagtgcaatagttaactgcacagttgtagttgtgcttgttttatcctggaggcggcgtcgttgat 422  Q
    || |||  |||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||    
T  17545262 caatgcgttagttaaccgcactgttgtagatgtgcttgttttatcctcgaggtggcgtggttgat 17545326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 13 - 422
Target Start/End: Original strand, 25477926 - 25478325
Alignment:
Q  13 aatataagtcccttcggaataaagagtaccattaagatcatagtccctttttggaataataatgtcctgtcggaattaaagatgatcttaacggtatata 112  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||  ||||||||||||| | | |||| ||||| ||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  25477926 aatatatgtcccttcagaataaagagtacttttaagatcatagtacttatttgaaataacaatgtcccgtcggaattaagaatgatcttaacggtatata 25478025  T
Q  113 --aatattctttcaatattta---aattgaggagaaattaaaaagttgaaaaggtgatatcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatactttg 207  Q
      || | | |||||||||||    | ||||||||||||              |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  25478026 taaaaagtatttcaatatttttctatttgaggagaaat--------------ggtggtgtcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatgttttg 25478111  T
Q  208 gagaaattaaagttaaaatggtggtaaaatcatatttgagtggtctcagcaccataacagagtgataacaatactatattgaagtggttttagtattaaa 307  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||    
T  25478112 gagaaattaaagttagaatggtggtaacatcatatttgagtagtctcaacaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtggtttcagtattaaa 25478211  T
Q  308 gagtggtcttagtaccatatttgaaggtgtaaatctcgaacggttttctacagtgcaatagttaactgcacagttgtagttgtgcttgttttatcctgga 407  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||| || ||||||||||| |||||    
T  25478212 gagtggtcttagtactatatttgagggtgtaattcttgaacggttttctacagtgc-atagttattcgcacagttgtagctgggcttgttttattctgga 25478310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 20 - 422
Target Start/End: Original strand, 1934629 - 1935021
Alignment:
Q  20 gtcccttcggaataaagagtaccattaagatcatagtccctttttggaataataatgtcctgtcggaattaaagatgatcttaacggtatata--aatat 117  Q
    |||||||| ||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||| || ||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||  || |     
T  1934629 gtcccttcagaataaagaatacttttaagatcatagtccctatttggaagaacaatgtcccgtcggaattaagaatgatcttaacggtatatataaaaag 1934728  T
Q  118 tctttcaatattta--aattgaggagaaattaaaaagttgaaaaggtgatatcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatactttggagaaatt 215  Q
    | |||||||||||   | ||||||||||||              |||| ||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| ||    
T  1934729 tatttcaatattttttatttgaggagaaat--------------ggtggtatcaccatatatgagtgatcgtagtaccatattgatagtttggagaactt 1934814  T
Q  216 aaagttaaaatggtggtaaaatcatatttgagtggtctcagcaccataacagagtgataacaatactatattgaagtggttttagtattaaagagtggtc 315  Q
    ||||||| ||||||   || | ||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  1934815 aaagttagaatggtatgaacaccatatttgagtggtctcagaaccttaacagagtggtaacaataccatattaaagtggtttcagtattaaagagtggtc 1934914  T
Q  316 ttagtaccatatttgaaggtgtaaatctcgaacggttttctacagtgcaatagttaactgcacagttgtagttgtgcttgttttatcctggaggcggcgt 415  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||    
T  1934915 ttagtaccatatttgagggtgtaattctcgaacggttttctacagtgcattagttaaccgcacagttgcagctgggcttgttttatcctggaggcggcgt 1935014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 29 - 422
Target Start/End: Original strand, 40847237 - 40847623
Alignment:
Q  29 gaataaagagtaccattaagatcatagtccctttttggaataataatgtcctgtcggaattaaagatgatcttaacggtatataaatattctttcaatat 128  Q
    ||||||||||| |  |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| ||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||||     
T  40847237 gaataaagagtgcttttaatatcatagtccctttt-ggaacaataatgtcccgtcgtaattaagaatgatcttaaaagtatataaatattctttcaataa 40847335  T
Q  129 ttaaattgaggagaaattaaaaagttgaaaaggtgatatcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatactttggagaaattaaagttaaaatgg 228  Q
    ||   |||||| ||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||| ||||||||| ||||||||| |||||    
T  40847336 ttt--ttgaggtgaaattaaaaagtcgaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtatcatcttgatagtttggagaacttaaagttagaatgg 40847433  T
Q  229 tggtaaaatcatatttgagtggtctcagcaccataacagagtgataacaatactatattgaagtggttttagtattaaagagtggtcttagt-accatat 327  Q
      |||| |||||||||||||||||||| |||||| ||| |||| ||||||||  ||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| || |||||||    
T  40847434 acgtaacatcatatttgagtggtctcaacaccattacaaagtggtaacaatatcatattaaagtggtttcaatattaaagagtggtcttggtaaccatat 40847533  T
Q  328 ttgaaggtgtaaatctcgaacggttttctacagtgcaatagttaactgcacagttgtagttgtgcttgttttatcctggaggcggcgtcgttgat 422  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||| ||     ||||||||  ||||||||||||||  |||||||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  40847534 ttgagagtgtaaatctcgaacggttttctatag-----tagttaaccacacagttgtagttggacttgttttatccaggaggtggcgtggttgat 40847623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 20 - 422
Target Start/End: Original strand, 9180363 - 9180752
Alignment:
Q  20 gtcccttcggaataaagagtaccattaagatcatagtccctttttggaataataatgtcctgtcggaattaaagatgatcttaacggtatata--aatat 117  Q
    |||||||| | |||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||  || |     
T  9180363 gtcccttcaggataaagagtacttttaagatcatagttcctatttggaataacaatgtcccgtcggaattaagaatgatcttaacggtatatataaaaag 9180462  T
Q  118 tctttcaatattta---aattgaggagaaattaaaaagttgaaaaggtgatatcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatactttggagaaat 214  Q
    | |||||||||||    | ||||||||||||              |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||    
T  9180463 tatttcaatatttttctatttgaggagaaat--------------ggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtgctatattgatgttttggagaaat 9180548  T
Q  215 taaagttaaaatggtggtaaaatcatatttgagtggtctcagcaccataacagagtgataacaatactatattgaagtggttttagtattaaagagtggt 314  Q
    |||||||| |||||||| || | |||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||| |||     ||||||| ||||||||||||||||    
T  9180549 taaagttagaatggtggcaacaccatatttgagtggtctcaacaccataacagagtggttacaataccatag----gtggtttcagtattaaagagtggt 9180644  T
Q  315 cttagtaccatatttgaaggtgtaaatctcgaacggttttctacagtgcaatagttaactgcacagttgtagttgtgcttgttttatcctggaggcggcg 414  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  9180645 cttagtaccatatttgagggtgtaattctcgaacgattttctacagtgcagtagttaatcaaacagttgtagctgggcttgttttatcctggaggcggcg 9180744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 13 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 12797391 - 12796992
Alignment:
Q  13 aatataagtcccttcggaataaagagtaccattaagatcatagtccctttttggaataataatgtcctgtcggaattaaagatgatcttaacggtatat- 111  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||  ||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||| ||| |||||||| |||||||||||| |||||     
T  12797391 aatatatgtcccttcagaataaagagtacttttaagatcataatccctgtttggaataacaatgtcccgtcagaattaaaaatgatcttaacgatatata 12797292  T
Q  112 -aaatattctttcaatattta---aattgaggagaaattaaaaagttgaaaaggtgatatcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatactttg 207  Q
     ||| | | |||||||||||    | | |||||||||| |              || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  12797291 taaaaagtgtttcaatatttttctattcgaggagaaatga--------------tg-tatcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatgttttg 12797207  T
Q  208 gagaaattaaagttaaaatggtggtaaaatcatatttgagtggtctcagcaccataacagagtgataacaatactatattgaagtggttttagtattaaa 307  Q
    ||||||||||  ||| |||||||| || | |||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||| ||||| | ||||||| |||||||||    
T  12797206 gagaaattaatattagaatggtggcaataccatatttgagtggtctcaacaccataacagagtggttacaataccatattaaggtggtttcagtattaaa 12797107  T
Q  308 gagtggtcttagtaccatatttgaaggtgtaaatctcgaacggttttctacagtgcaatagttaactgcacagttgtagttgtgcttgttttatcctgga 407  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||  |  ||||||||||||||||    
T  12797106 gagtggtcttagtaccatatttgagggtgtaattctcgaacggttttctacggtgcagtagttaaccgcacagttgtagccggacttgttttatcctgga 12797007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 155 - 422
Target Start/End: Original strand, 19892229 - 19892494
Alignment:
Q  155 gaaaaggtgatatcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatactttggagaaattaaagttaaaatggtggtaaaatcatatttgagtggtctc 254  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||||||||| ||||||||| ||||||  ||| | ||||||||||||||||     
T  19892229 gaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccat--tgatagtttggagaatttaaagttagaatggtattaacaccatatttgagtggtctt 19892326  T
Q  255 agcaccataacagagtgataacaatactatattgaagtggttttagtattaaagagtggtcttagtaccatatttgaaggtgtaaatctcgaacggtttt 354  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||    
T  19892327 agcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtggtttcagtattaaagagtggtcttagtaccatatttggaggtgtaattctcgaacgatttt 19892426  T
Q  355 ctacagtgcaatagttaactgcacagttgtagttgtgcttgttttatcctggaggcggcgtcgttgat 422  Q
    |||||||||| |||||||  | |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19892427 ctacagtgcagtagttaatcgaacagttgtagctgagcttgttttatcctggaggcggcgtggttgat 19892494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 159 - 422
Target Start/End: Original strand, 9189572 - 9189831
Alignment:
Q  159 aggtgatatcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatactttggagaaattaaagttaaaatggtggtaaaatcatatttgagtggtctcagca 258  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||| || | |||||||||||||||||| ||    
T  9189572 aggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatgttttggagaaattaaagttagaatggtggcaacaccatatttgagtggtctcaaca 9189671  T
Q  259 ccataacagagtgataacaatactatattgaagtggttttagtattaaagagtggtcttagtaccatatttgaaggtgtaaatctcgaacggttttctac 358  Q
    ||||||||||||| | ||||||| |||     ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||    
T  9189672 ccataacagagtggttacaataccatag----gtggtttcagtattaaagagtggtcttagtaccatatttgagggtgtaattctcgaacgattttctac 9189767  T
Q  359 agtgcaatagttaactgcacagttgtagttgtgcttgttttatcctggaggcggcgtcgttgat 422  Q
    |||||| |||||||    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  9189768 agtgcagtagttaatcaaacagttgtagctgggcttgttttatcctggaggcggcgtggttgat 9189831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 24 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 28603756 - 28603382
Alignment:
Q  24 cttcggaataaagagtaccattaagatcatagtccctttttggaataataatgtcctgtcggaattaaagatgatcttaacggtatataaatattctttc 123  Q
    |||| |||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28603756 cttcagaataaagagtacttttaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcccgtcgaaattaagaatgatcttaacggtatataaatattatttc 28603657  T
Q  124 --aatatttaaattgaggagaaattaaaaagttgaaaaggtgatatcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatactttggagaaattaaagtt 221  Q
      | | ||  ||||||||||||||              |||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||| ||||||||    
T  28603656 ttatttttctaattgaggagaaat--------------ggtggtatcatcatatttgagtggtcgtagtaccatattaatagtttggagaacttaaagtt 28603571  T
Q  222 aaaatggtggtaaaatcatatttgagtggtctcagcaccataacagagtgataacaatactatattgaagtggttttagtattaaagagtggtcttagta 321  Q
    | ||||||| ||| | ||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||| |||||||||||||    
T  28603570 agaatggtgttaacaccatatttaagtggtctcatcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtggtttcaatattaaaaagtggtcttagta 28603471  T
Q  322 ccatatttgaaggtgtaaatctcgaacggttttctacagtgcaatagttaactgcacagttgtagttgtgcttg-ttttatcctggagg 409  Q
    ||||||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||||||| |||||||  | |||||||||| ||  |||| ||||||||||||||    
T  28603470 ccatatttggaggtgtaattcttgaacggttttttacagtgcagtagttaatcgaacagttgtagctgaacttgtttttatcctggagg 28603382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 13 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 18344889 - 18344505
Alignment:
Q  13 aatataagtcccttcggaataaagagtaccattaagatcatagtccctttttggaataataatgtcctgtcggaattaaagatgatcttaacggtatata 112  Q
    |||||| |||||||| ||||||| |||||  ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  18344889 aatatatgtcccttcagaataaatagtacttttaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcccgtcggaattaagaatgatcttaacggtatata 18344790  T
Q  113 --aatattctttcaatattta---aattgaggagaaattaaaaagttgaaaaggtgatatcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatactttg 207  Q
      || | | |||||||||||    | ||||||||||||              |||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| ||||    
T  18344789 taaaaagtatttcaatatttttctatttgaggagaaat--------------ggtggtatcaccatatctgagaggtcgtagtaccatattgatagtttg 18344704  T
Q  208 gagaaattaaagttaaaatggtggtaaaatcatatttgagtggtctcagcaccataacagagtgataacaatactatattgaagtggttttagtattaaa 307  Q
    ||||| ||||||||| ||||||  ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||          ||||||| |||||||||    
T  18344703 gagaacttaaagttagaatggtattaacaccatatttgagtggtctcagcgccataacagagtggtaacaatat---------gtggtttcagtattaaa 18344613  T
Q  308 gagtggtcttagtaccatatttgaaggtgtaaatctcgaacggttttctacagtgcaatagttaactgcacagttgtagttgtgcttgttttatcctgga 407  Q
     |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||  | |||||||||| || |||||||||||||||||    
T  18344612 tagtggtcttagtaccatatttggaggtgtaattctcgaacgattttctacagtgcagtagttaatcgaacagttgtagctgggcttgttttatcctgga 18344513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 136; E-Value: 9e-71
Query Start/End: Original strand, 13 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 31327216 - 31326806
Alignment:
Q  13 aatataagtcccttcggaataaagagtaccattaagatcatagtccctttttggaataataatgtcctgtcggaattaaagatgatcttaacggtatata 112  Q
    |||||| ||||||||| |||||| |||||  ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||| |||||||  |||||||||| ||||||||    
T  31327216 aatatatgtcccttcgaaataaaaagtacttttaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcccgtcagaattaagaatgatcttaatggtatata 31327117  T
Q  113 --aatattctttcaatattta---aattgaggagaaattaaaaagttgaaaaggtgatatcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatactttg 207  Q
      || | | ||||||||| |    | ||||||||||||              |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  31327116 taaaaagtatttcaatatgtttctatttgaggagaaat--------------ggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatgttttg 31327031  T
Q  208 gagaaattaaagttaaaatggtggtaaaatcatatttgagtggtctcag-----------caccataacagagtgataacaatactatattgaagtggtt 296  Q
    ||||||||||||||| |||||||  || | ||||||||||||||   ||           |||||||| |||||| ||||||||| ||||| ||||||||    
T  31327030 gagaaattaaagttagaatggtgacaacaccatatttgagtggttgtagaacggtggcaacaccataatagagtggtaacaataccatattaaagtggtt 31326931  T
Q  297 ttagtattaaagagtggtcttagtaccatatttgaaggtgtaaatctcgaacggttttctacagtgcaatagttaactgcacagttgtagttgtgcttgt 396  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||  ||||||||||||||| ||||||    
T  31326930 tcagtattaaatagtggtcttagtaccatatttgagggtgtaattctcgaacggttttcta-agtgcagtagttaatcgcacagttgtagttgggcttgt 31326832  T
Q  397 tttatcctggaggcggcgtcgttgat 422  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||    
T  31326831 tttatcctggaggtggcgtggttgat 31326806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 224 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 29678032 - 29677834
Alignment:
Q  224 aatggtggtaaaatcatatttgagtggtctcagcaccataacagagtgataacaatactatattgaagtggttttagtattaaagagtggtcttagtacc 323  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||| ||||| ||||||| | | |||||||||||||||||||||||    
T  29678032 aatggtggtaacaccatatttgagtggtctcagcaccataatagagtggtaacagtaccatattaaagtggtatcaatattaaagagtggtcttagtacc 29677933  T
Q  324 atatttgaaggtgtaaatctcgaacggttttctacagtgcaatagttaactgcacagttgtagttgtgcttgttttatcctggaggcggcgtcgttgat 422  Q
    |||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| || |||| |||||||||| ||||||| | ||||||    
T  29677932 atatttgtgggtgtaattctcgaacggttttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgtagctgggctttttttatcctgtaggcggcttggttgat 29677834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 224 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 30651193 - 30650996
Alignment:
Q  224 aatggtggtaaaatcatatttgagtggtctcagcaccataacagagtgataacaatactatattgaagtggttttagtattaaagagtggtcttagtacc 323  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||| | | ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  30651193 aatggtggtaacaccatatttgagtggtctcagcaccatat-agagtggtaacagtgccatattaaagtggtttcagtattaaagagtggtcttagtacc 30651095  T
Q  324 atatttgaaggtgtaaatctcgaacggttttctacagtgcaatagttaactgcacagttgtagttgtgcttgttttatcctggaggcggcgtcgttgat 422  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||| |||||||| ||||| |||||||  | |||||||||| || |||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  30651094 atatttggaggtgtaattctcgaacgattttctacggtgcagtagttaatcgaacagttgtagctgggcttgttttatcttggaggcggcgtggttgat 30650996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 168 - 422
Target Start/End: Original strand, 10160504 - 10160752
Alignment:
Q  168 caccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatactttggagaaattaaag-ttaaaatggtggtaaaatcatatttgagtggtctcagcaccataaca 266  Q
    |||||||||||||| || | | | ||||||||||| ||||||||| |||||  ||| ||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| || |    
T  10160504 caccatatttgagtagttgaaataccatattgata-tttggagaagttaaaaattagaatggtggtaataccatatttgagtggtctcaacaccaaaata 10160602  T
Q  267 gagtgataacaatactatattgaagtggttttagtattaaa-gagtggtcttagtaccatatttgaaggtgtaaatctcgaacggttttctacagtgcaa 365  Q
    ||||| | | | ||| |||||||     ||| ||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  10160603 gagtggtcatagtaccatattga-----tttcagtattaaaagaatggtcttagtaccatatt-gaaggtgtaattctcgaacggttttctacagtgca- 10160695  T
Q  366 tagttaactgcacagttgtagttgtgcttgttttatcctggaggcggcgtcgttgat 422  Q
    |||||||| ||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10160696 tagttaaccgcacagttgcagctgagcttgttttatcctggaggcggcgtggttgat 10160752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 168 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 35602238 - 35601989
Alignment:
Q  168 caccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatactttggagaaattaaag-ttaaaatggtggtaaaatcatatttgagtggtctcagcaccataaca 266  Q
    ||||||||||||||||| | | | |||||||| || ||||||||| |||||  ||| |||  |||||| | |||||||||||||||||| |||||||| |    
T  35602238 caccatatttgagtggttgaaataccatattggta-tttggagaagttaaaaattagaattttggtaacaccatatttgagtggtctcaacaccataata 35602140  T
Q  267 gagtgataacaatactatattgaagtggttttagtattaaagagtggtcttagtaccatatttgaaggtgtaaatctcgaacggttttctacagtgcaat 366  Q
    ||||| | | | ||| ||||||     |||| | |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  35602139 gagtggtcatagtaccatattg-----gtttcaatattaaagagtggtcttagtaccatatttggatgtgtaattctcgaacggttttctacagtgcagt 35602045  T
Q  367 agttaactgcacagttgtagttgtgcttgttttatcctggaggcggcgtcgttgat 422  Q
    ||||||  | ||| |||||| || | ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  35602044 agttaatcgaacaattgtagctgggtttgttttatcctggaggcggcgtggttgat 35601989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 225 - 422
Target Start/End: Original strand, 7737682 - 7737879
Alignment:
Q  225 atggtggtaaaatcatatttgagtggtctcagcaccataacagagtgataacaatactatattgaagtggttttagtattaaa-gagtggtcttagtacc 323  Q
    |||||||||| | ||| |||||||||||||| |||||||| |||||| | ||||||  ||||| ||||| ||| ||||||||| || |||| || ||| |    
T  7737682 atggtggtaacaccatgtttgagtggtctcaacaccataatagagtggtgacaatatcatattaaagtgatttcagtattaaaagaatggttttggtatc 7737781  T
Q  324 atatttgaaggtgtaaatctcgaacggttttctacagtgcaatagttaactgcacagttgtagttgtgcttgttttatcctggaggcggcgtcgttgat 422  Q
    ||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  7737782 atattgga-ggtgtaattctcgaacggttttctacagtgcaatagttaatcgaacaattgtagttgggcttgttttatcctggaggcggcgtggttgat 7737879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 292 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 30658460 - 30658330
Alignment:
Q  292 tggttttagtattaaaga-gtggtcttagtaccatatttgaaggtgtaaatctcgaacggttttctacagtgcaatagttaactgcacagttgtagttgt 390  Q
    |||||| ||||||||| | || |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| || ||     
T  30658460 tggtttcagtattaaaaaagttgtcttagtaccatatt-gaaggtgtaattctcgaacggttttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgcagctgg 30658362  T
Q  391 gcttgttttatcctggaggcggcgtcgttgat 422  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  30658361 gcttgttttatcctggaggcggcgtggttgat 30658330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 165 - 410
Target Start/End: Original strand, 19578186 - 19578430
Alignment:
Q  165 tatcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatactttggagaaattaaa-gttaaaatggtggtaaaatcatatttgagtggtctcagcaccata 263  Q
    ||||||||||||||| |||||||||  || |||||||| ||| ||||| ||||| |||| ||||||| ||| |   ||||| | |||| | | || ||||    
T  19578186 tatcaccatatttgaatggtcgtagcaccgtattgataatttagagaacttaaatgttagaatggtgataacaatttatttaaatggtataaacagcata 19578285  T
Q  264 acagagtgataacaatactatattgaagtggttttagtattaaagagtggtcttagtaccatatttgaaggtgtaaatctcgaacggttttctacagtgc 363  Q
    | |||||| | | | ||| |||||  |||| |||||||||||||||||| | ||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19578286 atagagtggtta-agtaccatattagagtgattttagtattaaagagtgattttaataccatatt-gaaggtgtaaatctcgaacgattttctacagtgc 19578383  T
Q  364 aatagttaactgcacagttgtagttgtgcttgttttatcctggaggc 410  Q
    |||||||||| || || |||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  19578384 aatagttaaccgcccaattgtagttggacttgttttaccctggaggc 19578430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 316 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 29677554 - 29677448
Alignment:
Q  316 ttagtaccatatttgaaggtgtaaatctcgaacggttttctacagtgcaatagttaactgcacagttgtagttgtgcttgttttatcctggaggcggcgt 415  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||    
T  29677554 ttagtaccatatttgagggtgtaattctcgaacggttttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgtagctggacttattttatcctggaggcggcgt 29677455  T
Q  416 cgttgat 422  Q
     ||||||    
T  29677454 ggttgat 29677448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 283 - 422
Target Start/End: Original strand, 21523614 - 21523748
Alignment:
Q  283 atattgaagtggttttagtattaaagagtggtcttagtaccatatttgaaggtgtaaatctcgaacggttttctacagtgcaatagttaactgcacagtt 382  Q
    ||||| |||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||     |||||||| ||||||||    
T  21523614 atattaaagtagtttaagttttaaagagtggtcttagtaccatatttgagggtgtaaatctcgaacgattttctacag-----tagttaaccgcacagtt 21523708  T
Q  383 gtagttgtgcttgttttatcctggaggcggcgtcgttgat 422  Q
    |||| ||  ||||||||| ||| || ||||||| ||||||    
T  21523709 gtagctgaacttgttttaacctagaagcggcgtggttgat 21523748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 305 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 30631766 - 30631646
Alignment:
Q  305 aaagagtggtcttagtaccatatttgaaggtgtaaat-ctcgaacggttttctacagtgcaatagttaactgcaca---gttgtagttgtgcttgtttta 400  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||   |||| ||||| ||||||||||    
T  30631766 aaagagttgtcttagtaccatatt-gaaggtgtaaattctcgaacggttttctacagtgcagtagataaccgcacaacagttgcagttgggcttgtttta 30631668  T
Q  401 tcctggaggcggcgtcgttgat 422  Q
    ||||||||| ||||| ||||||    
T  30631667 tcctggaggtggcgtggttgat 30631646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 20 - 112
Target Start/End: Original strand, 9185054 - 9185146
Alignment:
Q  20 gtcccttcggaataaagagtaccattaagatcatagtccctttttggaataataatgtcctgtcggaattaaagatgatcttaacggtatata 112  Q
    |||||||| | |||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  9185054 gtcccttcaggataaagagtacttttaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcccgtcggaattaagaatgatcttaacggtatata 9185146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 238 - 379
Target Start/End: Original strand, 17453431 - 17453564
Alignment:
Q  238 catatttgagtggtctcagcaccataacagagtgataacaatactatattgaagtggttttagtattaaagagtggtcttagtaccatatttgaaggtgt 337  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||| | ||||||| |||||      |||| |  |||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  17453431 catatttgagtggtctcaacaccataatagagtggttacaataccatatta-----gtttca--attatagaatggtcttagtaccatatt-gaaggtgt 17453522  T
Q  338 aaatctcgaacggttttctacagtgcaatagttaactgcaca 379  Q
    || |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  17453523 aattctcgaacggttttctacagtgcagtagttaaccgcaca 17453564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 322 - 422
Target Start/End: Original strand, 19094422 - 19094523
Alignment:
Q  322 ccatatttgaaggtgtaaatctcgaacggttttctacagtgcaatagttaactgcacagttgtagttgtgcttg-ttttatcctggaggcggcgtcgttg 420  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| || ||||    
T  19094422 ccatatttgagggtgtaattctcgaacggttttctacagtgcagtaattaatcgcacagttgtagctgagcttgtttttatcctggaggcggtgtggttg 19094521  T
Q  421 at 422  Q
    ||    
T  19094522 at 19094523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 205 - 337
Target Start/End: Original strand, 6297703 - 6297830
Alignment:
Q  205 ttggagaaattaaagttaaaatggtggtaaaatcatatttgagtggtctcagcaccataacagagtgataacaatactatattgaagtggttttagtatt 304  Q
    |||||||| ||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| ||| || ||||||||| ||||     |||||| ||||||    
T  6297703 ttggagaagttaaaattagaatggtggtaacatcatatttgagtggtctcaacaacataatagaatggtaacaataccatat-----tggtttcagtatt 6297797  T
Q  305 aaagagtggtcttagtaccatatttgaaggtgt 337  Q
    ||||| ||||||||||| |||||| || |||||    
T  6297798 aaagaatggtcttagtaacatattagagggtgt 6297830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 349 - 422
Target Start/End: Original strand, 42926714 - 42926787
Alignment:
Q  349 ggttttctacagtgcaatagttaactgcacagttgtagttgtgcttgttttatcctggaggcggcgtcgttgat 422  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  42926714 ggttttctacggtgcagtagttaaccgcacagttgtagttgagcttgtattatcctggaggcggcgtggttgat 42926787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 13 - 112
Target Start/End: Original strand, 17968592 - 17968691
Alignment:
Q  13 aatataagtcccttcggaataaagagtaccattaagatcatagtccctttttggaataataatgtcctgtcggaattaaagatgatcttaacggtatata 112  Q
    |||||| ||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| || ||||||| || ||||||||  |||||||| ||||||||||    
T  17968592 aatatatgtcccttcaaaataaagagtacttttaagatcatagtccctatttggaagaacaatgtcccgttggaattaagaatgatcttcacggtatata 17968691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 168 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 28855319 - 28855156
Alignment:
Q  168 caccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatactttggagaaatt-aaagttaaaatggtggtaaaatcatatttgagtggtctcagcaccataaca 266  Q
    ||||||||||||||||| | ||| ||||||||||| |||| |||| || ||| ||| ||||||||||| | ||||||||||||||  ||||||||||  |    
T  28855319 caccatatttgagtggttgaagtaccatattgatattttg-agaagttcaaaattagaatggtggtaacaccatatttgagtggttgcagcaccatagta 28855221  T
Q  267 gagtgataacaatactatattgaagtggttttagtattaaagagtggtcttagtaccatatttgaaggtgt 337  Q
    || || | ||||||| ||||     |||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| ||| |||||    
T  28855220 gaatggtcacaataccatat-----tggtttcagtatt-aagagtgatcttagtaccatatctgagggtgt 28855156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 354 - 422
Target Start/End: Original strand, 35638957 - 35639025
Alignment:
Q  354 tctacagtgcaatagttaactgcacagttgtagttgtgcttgttttatcctggaggcggcgtcgttgat 422  Q
    ||||||||||| |||||||  | |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  35638957 tctacagtgcagtagttaatcgaacagttgtagctgagcttgttttatcctggaggcggcgtggttgat 35639025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 168 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 19538700 - 19538545
Alignment:
Q  168 caccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatactttggagaaat-taaagttaaaatggtggtaaaatcatatttgagtggtctcagcaccataaca 266  Q
    ||||||||||||||||| | | | ||||||||||| ||||||||| |  ||| ||| |||||| |||| | |||| | ||||||||| |||||||||| |    
T  19538700 caccatatttgagtggttgaaataccatattgata-tttggagaagtaaaaaattagaatggtagtaacaccataatagagtggtcttagcaccataata 19538602  T
Q  267 gagtgataacaatactatattgaagtggttttagtattaaagagtggtcttagtaccatatt 328  Q
    ||||| | ||| ||| ||||     |||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  19538601 gagtggtcacattaccatat-----tggtttcagtattaaagagtgatcttaataccatatt 19538545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 130
Target Start/End: Original strand, 19892102 - 19892215
Alignment:
Q  13 aatataagtcccttcggaataaagagtaccattaagatcatagtccctttttggaataataatgtcctgtcggaattaaagatgatcttaacgg--tata 110  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||      ||||||  |||||||||||  |||||||||||||  ||||    
T  19892102 aatatatgtcccttcagaataaagagtacttttaagatcatagtccctatttgg------aatgtctagtcggaattaagaatgatcttaacggtatata 19892195  T
Q  111 taaatattctttcaatattt 130  Q
    |||| | | |||||||||||    
T  19892196 taaaaagtatttcaatattt 19892215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 217 - 295
Target Start/End: Original strand, 41558864 - 41558942
Alignment:
Q  217 aagttaaaatggtggtaaaatcatatttgagtggtctcagcaccataacagagtgataacaatactatattgaagtggt 295  Q
    |||||| |||||||  || | ||||||  ||||||||||| ||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  41558864 aagttagaatggtgaaaacaccatattgaagtggtctcagtaccataatagagtgatatcgatactatattgaagtggt 41558942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 219 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 30643453 - 30643408
Alignment:
Q  219 gttaaaatggtggtaaaatcatatttgagtggtctcagcaccataa 264  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  30643453 gttagaatggtggtaacatcatatttgagtggtctcaacaccataa 30643408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 239 - 276
Target Start/End: Original strand, 42926361 - 42926398
Alignment:
Q  239 atatttgagtggtctcagcaccataacagagtgataac 276  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  42926361 atatttgagtggtctcagcaccataatagagtggtaac 42926398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0352 (Bit Score: 171; Significance: 1e-91; HSPs: 1)
Name: scaffold0352
Description:

Target: scaffold0352; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 13 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 7571 - 7171
Alignment:
Q  13 aatataagtcccttcggaataaagagtaccattaagatcatagtccctttttggaataataatgtcctgtcggaattaaagatgatcttaacggtatata 112  Q
    |||||| ||| |||| |||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||| |||||||  |||||||||||||||||||    
T  7571 aatatatgtctcttcagaataaagagtacttttaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcccgtcagaattaagaatgatcttaacggtatata 7472  T
Q  113 --aatattctttcaatattta---aattgaggagaaattaaaaagttgaaaaggtgatatcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatactttg 207  Q
      || | | |||||||||||    | ||||||||||||              |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||    
T  7471 taaaaagtatttcaatatttttctatttgaggagaaat--------------ggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtgtcatattgatgttttg 7386  T
Q  208 gagaaattaaagttaaaatggtggtaaaatcatatttgagtggtctcagcaccataacagagtgataacaatactatattgaagtggttttagtattaaa 307  Q
    ||||||||||||||| |||||||| || |  |||||| |||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||| | ||||||| |||||||||    
T  7385 gagaaattaaagttagaatggtggcaacacaatatttaagtggtatcaacaccataacagagtggtaacaataccatattaaggtggtttcagtattaaa 7286  T
Q  308 gagtggtcttagtaccatatttgaaggtgtaaatctcgaacggttttctacagtgcaatagttaactgcacagttgtagttgtgcttgttttatcctgga 407  Q
    ||||||||||| ||| |||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  7285 gagtggtcttaatacaatatttgagggcgtaattctcgaacggttttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgtagctgagcttgttttatcctgga 7186  T
Q  408 ggcggcgtcgttgat 422  Q
    |||||||| ||||||    
T  7185 ggcggcgtggttgat 7171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 155; Significance: 4e-82; HSPs: 2)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 13 - 422
Target Start/End: Original strand, 443574 - 443972
Alignment:
Q  13 aatataagtcccttcggaataaagagtaccattaagatcatagtccctttttggaataataatgtcctgtcggaattaaagatgatcttaacggta--ta 110  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||  |||| |||||||||||| |||||||||| ||||||| || ||||||||  |||||||||||||||  ||    
T  443574 aatatatgtcccttcagaataaagagtacttttaaaatcatagtccctatttggaataacaatgtcccgttggaattaagaatgatcttaacggtacata 443673  T
Q  111 taaatattctttcaatattta---aattgaggagaaattaaaaagttgaaaaggtgatatcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatactttg 207  Q
    |||| | | |||||||||||    | ||||||||||||              |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||    
T  443674 taaaaagtatttcaatatttttctatttgaggagaaat--------------ggtggtatcaccatatttaagtggtcgtagtgccatattgatgttttg 443759  T
Q  208 gagaaattaaagttaaaatggtggtaaaatcatatttgagtggtctcagcaccataacagagtgataacaatactatattgaagtggttttagtattaaa 307  Q
    ||||||||||||||| |||||||| || | ||||||| |||||||||| |||||||| |||||| | ||||||  ||||| | ||| ||| |||||||||    
T  443760 gagaaattaaagttagaatggtggaaacaccatattttagtggtctcaacaccataatagagtggttacaatatcatattaaggtgatttcagtattaaa 443859  T
Q  308 gagtggtcttagtaccatatttgaaggtgtaaatctcgaacggttttctacagtgcaatagttaactgcacagttgtagttgtgcttgttttatcctgga 407  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||| ||    
T  443860 gagtggtcttagtaccatatttgagggtgtaattctcgaacggttttctatagtgc-atagttaaccgcacagttgtagctgggcttgttttatcct-ga 443957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #2
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 224 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 4338 - 4141
Alignment:
Q  224 aatggtggtaaaatcatatttgagtggtctcagcaccataacagagtgataacaatactatattgaagtggttttagtattaaagagtggtcttagtacc 323  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||| | | ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4338 aatggtggtaacaccatatttgagtggtctcagcaccatat-agagtggtaacagtgccatattaaagtggtttcagtattaaagagtggtcttagtacc 4240  T
Q  324 atatttgaaggtgtaaatctcgaacggttttctacagtgcaatagttaactgcacagttgtagttgtgcttgttttatcctggaggcggcgtcgttgat 422  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||  | |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4239 atatttggaggtgtaattctcgaacgattttctacagtgcagtagttaatcgaacagttgtagctgggcttgttttatcctggaggcggcgtggttgat 4141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0690 (Bit Score: 140; Significance: 3e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0690
Description:

Target: scaffold0690; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 20 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 5755 - 5410
Alignment:
Q  20 gtcccttcggaataaagagtaccattaagatcatagtccctttttggaataataatgtcctgtcggaattaaagatgatcttaacggtatataaatattc 119  Q
    |||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||   | ||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||    
T  5755 gtcccttcagaataaagagtacttttaagatcatagtccatttt-ggaataaaaatgtctcattggaattaagaatgatcttaacagtatataaatattc 5657  T
Q  120 tttcaatattta--aattgaggagaaattaaaaagttgaaaaggtgatatcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatactttggagaaattaa 217  Q
    |||||||||||   | |||||||||||||||||| | |||  |||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||  |||| ||||||||| ||||    
T  5656 tttcaatattttcgatttgaggagaaattaaaaaatcgaagtggtgttatcaccatatttgagtggtcatagtaccataaagataatttggagaacttaa 5557  T
Q  218 agttaaaatggtggtaaaatcatatttgagtggtctcagcaccataacagagtgataacaatactatattgaagtggttttagtattaaagagtggtctt 317  Q
    ||| | ||| ||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||| | |  ||||||||| ||||| ||||||||| |    | ||||||||||||    
T  5556 agtaagaatagtggtaacaccatatttgagtggtatcagcaccataacataattgtaacaatac-atattaaagtggtttca----ttaagagtggtctt 5462  T
Q  318 agtaccatatttgaaggtgtaaatctcgaacggttttctacagtgcaatagt 369  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||    
T  5461 agtaccatatttgagggtgtaaatctcaaacagttttctacggtgcaatagt 5410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0182 (Bit Score: 138; Significance: 5e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0182
Description:

Target: scaffold0182; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 168 - 422
Target Start/End: Original strand, 9661 - 9915
Alignment:
Q  168 caccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatactttggagaaattaaag--ttaaaatggtggtaaaatcatatttgagtggtctcagcaccataac 265  Q
    ||||||||||||||||| | | |||| |||||||| ||||||||| |||||   ||| ||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||    
T  9661 caccatatttgagtggttgaaatgcc-tattgata-tttggagaagttaaaaaattagaatggtggtaacaccatatttgagtggtctcaacaccataac 9758  T
Q  266 agagtgataacaatactatattgaagtggttttagtattaaagagtggtcttagtaccatatttgaaggtgtaaatctcgaacggttttctacagtgcaa 365  Q
    |||||| ||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  9759 agagtggtaacaataccatattaaagtggtttcagtattatagagtggtcttagtaccatatttggaggtgtaattctcgaacggttttctacagtgcag 9858  T
Q  366 tagttaactgcacagttgtagttgtgcttgttttatcctggaggcggcgtcgttgat 422  Q
    |||||||  | |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  9859 tagttaatcgaacagttgtagctgggcttgttttatcctggaggcggcgtggttgat 9915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 114; Significance: 1e-57; HSPs: 2)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 21 - 304
Target Start/End: Original strand, 148030 - 148316
Alignment:
Q  21 tcccttcggaataaagagtaccattaagatcatagtccctttttggaataataatgtcctgtcggaattaaagatgatcttaacggtatataaatattct 120  Q
    ||||||| ||||||||| |||  |||||||||||||||||||||| || ||||||||||  ||  ||||||  |||||||||   |||||||||||||||    
T  148030 tcccttcagaataaagaatacttttaagatcatagtccctttttgaaa-aataatgtcccatcaaaattaagaatgatcttagtagtatataaatattct 148128  T
Q  121 ttcaatattta---aattgaggagaaattaaaaagttgaaaaggtgatatcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatactttggagaaatt-a 216  Q
    || |||||||    | |||||||||| ||||||||| ||||||||| | |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| || |    
T  148129 ttaaatatttttctatttgaggagaatttaaaaagtcgaaaaggtggtttcaccatattagagtggttgtagtaccatattgatagtttggagaacttaa 148228  T
Q  217 aagttaaaatggtggtaaaatcatatttgagtggtctcagcaccataacagagtgataacaatactatattgaagtggttttagtatt 304  Q
    |||||| ||||||||||| |  ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||    
T  148229 aagttagaatggtggtaacactatatttgagtggtctcaacatcataatagagtgataacaataccatattaatgtggttttagtatt 148316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #2
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 299 - 422
Target Start/End: Original strand, 164928 - 165057
Alignment:
Q  299 agtattaaagagtggtcttagtaccatatttgaaggtgtaaatctcgaacggttttctacagtgcaatagttaac------tgcacagttgtagttgtgc 392  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||       |||||||||||| || ||    
T  164928 agtatgaaagagtggtcttagtaccgtatttgagggtgtaaatctcaaacggttttctacagtgcagtagttaaccgcgcgcgcacagttgtagctgagc 165027  T
Q  393 ttgttttatcctggaggcggcgtcgttgat 422  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  165028 ttgttttatcctggaggcgacgtggttgat 165057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0240 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 2)
Name: scaffold0240
Description:

Target: scaffold0240; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 204 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 4259 - 4092
Alignment:
Q  204 tttggagaaattaaag-ttaaaatggtggtaaaatcatatttgagtggtctcagcaccataacagagtgataacaatactatattgaagtggttttagta 302  Q
    |||||||||||||||  ||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||| ||| |||   ||||| ||| ||||    
T  4259 tttggagaaattaaaaattagaatggtggtaacaccatatttgagtggtctcagtaccataatagagtggtaacattaccataaaaaagtgatttaagta 4160  T
Q  303 ttaaagagtggtcttagtaccatatttgaaggtgtaaatctcgaacggttttctacagtgcaatagtt 370  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||    
T  4159 ttaaagagtggtcttagtaccatatttaagggtataaatctcgaatggttttctacaatgcagtagtt 4092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0240; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 383 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 4097 - 4057
Alignment:
Q  383 gtagttgtgcttgttttatcctggaggcggcgtcgttgatg 423  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4097 gtagttgggcttgttttatcctggaggcggcgtggttgatg 4057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0045
Description:

Target: scaffold0045; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 192 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 83355 - 83133
Alignment:
Q  192 ccatattgatactttggagaaattaaag-ttaaaatggtggtaaaatcatatttgagtggtctcagcaccataacagagtgataacaatactatattgaa 290  Q
    ||||||||||| ||||||||  |||||  ||| |||||| |||| | |||||||||||||||||| |||||||| |||||| | | | || |||||||      
T  83355 ccatattgata-tttggagatgttaaaaattagaatggtagtaacaccatatttgagtggtctcaacaccataatagagtggttatagtattatattg-- 83259  T
Q  291 gtggttttagtattaaagagtggtcttagtaccatatttgaaggtgtaaatctcgaacggttttctacagtgcaatagttaactgcacagttgtagttgt 390  Q
       |||| |||||  ||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||| || ||     
T  83258 ---gtttcagtat--aagagtgatcttagtaccatatt-gaaggtgtaattctcgaaaggttttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgcagctga 83165  T
Q  391 gcttgttttatcctggaggcggcgtcgttgat 422  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  83164 gcttgttttatcctggaggcggcatggttgat 83133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2020 (Bit Score: 67; Significance: 1e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold2020
Description:

Target: scaffold2020; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 299 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 567 - 438
Alignment:
Q  299 agtattaaagagtggtcttagtaccatatttgaaggtgtaaatctcgaacggttttctacagtgcaatagttaac------tgcacagttgtagttgtgc 392  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||       |||||||||||| || ||    
T  567 agtatgaaagagtggtcttagtaccgtatttgagggtgtaaatctcaaacggttttctacagtgcagtagttaaccgcgcgcgcacagttgtagctgagc 468  T
Q  393 ttgttttatcctggaggcggcgtcgttgat 422  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  467 ttgttttatcctggaggcgacgtggttgat 438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 62; Significance: 1e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 305 - 422
Target Start/End: Original strand, 165998 - 166114
Alignment:
Q  305 aaagagtggtcttagtaccatatttgaaggtgtaaatctcgaacggttttctacagtgcaatagttaactgcacagttgtagttgtgcttgttttatcct 404  Q
    ||||| |||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| || ||||| ||||||||| || || ||||||||||||||    
T  165998 aaagattggtcttagtaccatagta-aaggtgtaattctcgaacggttttttacagtgcagtaattaaccgcacagttgcagctgggcttgttttatcct 166096  T
Q  405 ggaggcggcgtcgttgat 422  Q
    ||||||||||| ||||||    
T  166097 ggaggcggcgtggttgat 166114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057 (Bit Score: 58; Significance: 3e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0057
Description:

Target: scaffold0057; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 337 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 35786 - 35701
Alignment:
Q  337 taaatctcgaacggttttctacagtgcaatagttaactgcacagttgtagttgtgcttgttttatcctggaggcggcgtcgttgat 422  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  35786 taaatctcgaacgattttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgtagctggacttgttttatcctggaggcggcgtggttgat 35701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0061 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0061
Description:

Target: scaffold0061; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 205 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 46062 - 45935
Alignment:
Q  205 ttggagaaattaaagttaaaatggtggtaaaatcatatttgagtggtctcagcaccataacagagtgataacaatactatattgaagtggttttagtatt 304  Q
    |||||||| ||||| ||| ||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||| ||| || ||||| |||  |||||     |||| ||||||    
T  46062 ttggagaagttaaaattagaatggtggtaacaccatatttgagtggtctcaacaccataatagaatggtaacagtaccgtattg-----gtttcagtatt 45968  T
Q  305 aaagagtggtcttagtaccatatttgaaggtgt 337  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  45967 aaagagtggtcttagtaccatatttgagggtgt 45935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 205 - 337
Target Start/End: Original strand, 152725 - 152852
Alignment:
Q  205 ttggagaaattaaagttaaaatggtggtaaaatcatatttgagtggtctcagcaccataacagagtgataacaatactatattgaagtggttttagtatt 304  Q
    |||||||| ||||| ||| ||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||| ||| || ||||| |||  |||||     |||| ||||||    
T  152725 ttggagaagttaaaattagaatggtggtaacaccatatttgagtggtctcaacaccataatagaatggtaacagtaccgtattg-----gtttcagtatt 152819  T
Q  305 aaagagtggtcttagtaccatatttgaaggtgt 337  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  152820 aaagagtggtcttagtaccatatttgagggtgt 152852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 56; Significance: 5e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 323 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 255983 - 255884
Alignment:
Q  323 catatttgaaggtgtaaatctcgaacggttttctacagtgcaatagttaactgcacagttgtagttgtgcttgttttatcctggaggcggcgtcgttgat 422  Q
    ||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  255983 catatttgagggtgtaatcctcgaacggttttctacagtgcagtagttaaccacacagttgtagctggacttgttttatcctggaggcggcatagttgat 255884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0060 (Bit Score: 53; Significance: 3e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0060
Description:

Target: scaffold0060; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 205 - 337
Target Start/End: Original strand, 52717 - 52844
Alignment:
Q  205 ttggagaaattaaagttaaaatggtggtaaaatcatatttgagtggtctcagcaccataacagagtgataacaatactatattgaagtggttttagtatt 304  Q
    ||||||||  |||| ||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||| ||| |||||| ||||  ||||     |||||| ||||||    
T  52717 ttggagaagataaaattagaatggtggtaaaaccatatttgagcggtctcaacaccataatagaatgataaaaatatcatat-----tggtttcagtatt 52811  T
Q  305 aaagagtggtcttagtaccatatttgaaggtgt 337  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  52812 aaagagtggtcttagtaccatattagagggtgt 52844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0060; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 224 - 337
Target Start/End: Original strand, 47693 - 47801
Alignment:
Q  224 aatggtggtaaaatcatatttgagtggtctcagcaccataacagagtgataacaatactatattgaagtggttttagtattaaagagtggtcttagtacc 323  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||| |||   |||||||||| ||||||     |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  47693 aatggtggtaacaccatatttgagtggtctcaacaccataatagaaaaataacaataccatattg-----gtttcagtattaaagagtggtcttagtacc 47787  T
Q  324 atatttgaaggtgt 337  Q
    ||||| || |||||    
T  47788 atattagagggtgt 47801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0128 (Bit Score: 48; Significance: 3e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0128
Description:

Target: scaffold0128; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 299 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 13460 - 13351
Alignment:
Q  299 agtattaaagagtggtcttagtaccatatttgaaggtgtaaatctcgaacggttttctacagtgcaatagttaactgcacagttgtagttgtgcttgttt 398  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||  |||||  |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||  ||||||     
T  13460 agtattaaa-agtggtcttagtaccatattaga-ggtgtaaattgcgaaccattttctacagtgaagtagttaaccgcacagttgtagttgaacttgttg 13363  T
Q  399 tatcctggaggc 410  Q
    |||| |||||||    
T  13362 tatcttggaggc 13351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0128; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 44 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 13661 - 13601
Alignment:
Q  44 ttaagatcatagtccctttttggaataataatgtcctgtcggaattaaagatgatcttaac 104  Q
    ||||||||||||||||||||||  | |||||||||| ||| |||||||  |||||||||||    
T  13661 ttaagatcatagtccctttttgataaaataatgtcccgtcagaattaagaatgatcttaac 13601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1050 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold1050
Description:

Target: scaffold1050; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 319 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 1309 - 1214
Alignment:
Q  319 gtaccatatttgaaggtgtaaatctcgaacggttttctacagtgcaatagttaactgcacagttgtagttgtgcttgttttatcctggaggcggcgt 415  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| ||||||| |||| ||  ||||||||  ||||||||| ||||    
T  1309 gtaccatatt-gaaggtgtaaatctcgaacgattttctatagtgcagtagttaaccgcacagtcgtagctgaacttgtttttgcctggaggcagcgt 1214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 168 - 364
Target Start/End: Original strand, 146204 - 146404
Alignment:
Q  168 caccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatactttggagaaattaaag-ttaaaatggtggtaaaatcatatttgagtggtctcagcaccataaca 266  Q
    ||||||||||||||||| ||| | || |||||| | ||||||||  |||||  ||| ||||||||||| | ||||||||| ||||||||| ||||||| |    
T  146204 caccatatttgagtggttgtactaccttattgaca-tttggagatgttaaaaattagaatggtggtaacaccatatttgaatggtctcagtaccataata 146302  T
Q  267 gagtgataacaatactatattgaagtggttttagtattaaa---gagtggtcttagta-ccatatttgaaggtgtaaatctcgaacggttttctacagtg 362  Q
    || || | ||||||| ||||   |||||||| | |||||||   |||||  |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||  ||||||||||||    
T  146303 gaatggtcacaataccatataatagtggtttcattattaaattcgagtgtccttactagccatatttgagagtgtaattctcgaacaattttctacagtg 146402  T
Q  363 ca 364  Q
    ||    
T  146403 ca 146404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 250 - 337
Target Start/End: Original strand, 1088 - 1170
Alignment:
Q  250 gtctcagcaccataacagagtgataacaatactatattgaagtggttttagtattaaagagtggtcttagtaccatatttgaaggtgt 337  Q
    |||||| |||||||| ||| || ||||||||| ||||||     |||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  1088 gtctcaacaccataatagaatggtaacaataccatattg-----gtttcagtattaaagagtggtcttagtaccatattagagggtgt 1170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 178 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 42262 - 42183
Alignment:
Q  178 gagtggtcgtagtgccatattgatactttggagaaattaaa-gttaaaatggtggtaaaatcatatttgagtggtctcag 256  Q
    ||||||||||||| | ||||||||| ||||||||| ||||| |||| |||||||  || | |||| ||||||||||||||    
T  42262 gagtggtcgtagtacaatattgatattttggagaagttaaaggttagaatggtgagaacaccatacttgagtggtctcag 42183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University