View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF17611_high_19 (Length: 341)

Name: NF17611_high_19
Description: NF17611
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF17611_high_19
NF17611_high_19
[»] chr6 (44 HSPs)
chr6 (1-341)||(27284233-27284575)
chr6 (11-341)||(16755815-16756148)
chr6 (1-341)||(29555543-29555885)
chr6 (13-341)||(26110282-26110611)
chr6 (13-341)||(13518065-13518395)
chr6 (13-341)||(27491130-27491460)
chr6 (13-341)||(26772500-26772829)
chr6 (6-341)||(27355982-27356319)
chr6 (12-341)||(28166490-28166822)
chr6 (11-341)||(27063477-27063808)
chr6 (1-337)||(27623582-27623922)
chr6 (12-339)||(4778876-4779206)
chr6 (13-341)||(16680136-16680467)
chr6 (6-341)||(4539629-4539967)
chr6 (1-341)||(22928752-22929096)
chr6 (19-341)||(29579018-29579341)
chr6 (6-339)||(4531278-4531612)
chr6 (1-341)||(8899570-8899912)
chr6 (6-329)||(27200176-27200502)
chr6 (6-329)||(27248731-27249057)
chr6 (6-341)||(30551871-30552208)
chr6 (19-329)||(13292834-13293140)
chr6 (6-341)||(28213444-28213782)
chr6 (12-341)||(29507412-29507745)
chr6 (11-341)||(26791811-26792143)
chr6 (12-341)||(4763759-4764090)
chr6 (11-317)||(26926763-26927070)
chr6 (6-329)||(34458391-34458714)
chr6 (34-341)||(16937896-16938204)
chr6 (6-329)||(33370314-33370639)
chr6 (11-341)||(27013728-27014053)
chr6 (11-341)||(14139271-14139597)
chr6 (97-341)||(26666529-26666774)
chr6 (12-339)||(27031019-27031345)
chr6 (11-339)||(24869705-24870029)
chr6 (12-339)||(27025141-27025466)
chr6 (11-317)||(27208899-27209204)
chr6 (11-317)||(27240024-27240329)
chr6 (12-339)||(24299633-24299957)
chr6 (12-341)||(15406404-15406731)
chr6 (12-341)||(15418191-15418518)
chr6 (56-338)||(20174589-20174883)
chr6 (56-338)||(22161108-22161402)
chr6 (1-92)||(23851450-23851541)
[»] chr5 (49 HSPs)
chr5 (19-341)||(11555367-11555690)
chr5 (7-341)||(3795539-3795876)
chr5 (1-341)||(22894411-22894752)
chr5 (13-341)||(33881133-33881463)
chr5 (1-341)||(9323472-9323813)
chr5 (13-341)||(18369356-18369686)
chr5 (6-339)||(6880303-6880639)
chr5 (13-341)||(24729977-24730307)
chr5 (12-329)||(30174471-30174791)
chr5 (11-339)||(37665312-37665642)
chr5 (12-341)||(40467377-40467708)
chr5 (1-341)||(12138171-12138512)
chr5 (12-341)||(13318652-13318982)
chr5 (19-341)||(23631982-23632308)
chr5 (11-341)||(28655247-28655580)
chr5 (20-336)||(30158048-30158366)
chr5 (6-329)||(2517065-2517391)
chr5 (11-341)||(13436498-13436836)
chr5 (11-341)||(9544531-9544864)
chr5 (11-341)||(15752682-15753008)
chr5 (6-341)||(31820234-31820569)
chr5 (11-341)||(37746152-37746484)
chr5 (6-341)||(33522382-33522720)
chr5 (11-341)||(30035431-30035762)
chr5 (11-341)||(5643805-5644135)
chr5 (1-341)||(26486391-26486722)
chr5 (11-339)||(18122242-18122572)
chr5 (1-339)||(33298528-33298872)
chr5 (18-341)||(18494592-18494916)
chr5 (12-341)||(34622524-34622856)
chr5 (12-339)||(41680710-41681040)
chr5 (13-341)||(37352468-37352798)
chr5 (6-341)||(32590100-32590436)
chr5 (1-339)||(28953606-28953946)
chr5 (11-341)||(37760987-37761320)
chr5 (18-329)||(43084270-43084583)
chr5 (12-341)||(13180617-13180944)
chr5 (13-341)||(8659296-8659625)
chr5 (13-341)||(11329644-11329976)
chr5 (33-341)||(25206304-25206621)
chr5 (33-341)||(25270460-25270777)
chr5 (11-341)||(31437469-31437794)
chr5 (11-339)||(22992950-22993272)
chr5 (11-339)||(15652586-15652914)
chr5 (18-341)||(23897886-23898205)
chr5 (11-339)||(33783492-33783817)
chr5 (18-339)||(24975861-24976178)
chr5 (11-339)||(24608250-24608576)
chr5 (12-341)||(30940642-30940967)
[»] chr2 (41 HSPs)
chr2 (19-341)||(12661543-12661866)
chr2 (11-341)||(37383673-37384005)
chr2 (34-341)||(39896088-39896396)
chr2 (1-341)||(12710515-12710857)
chr2 (13-341)||(34867681-34868010)
chr2 (12-341)||(9343901-9344232)
chr2 (12-329)||(37945791-37946111)
chr2 (12-341)||(39045736-39046067)
chr2 (6-341)||(21697087-21697427)
chr2 (12-329)||(254578-254897)
chr2 (11-329)||(27809697-27810019)
chr2 (12-341)||(27122522-27122851)
chr2 (12-341)||(13930458-13930791)
chr2 (34-341)||(22922057-22922368)
chr2 (11-341)||(34160840-34161174)
chr2 (12-336)||(31882284-31882609)
chr2 (6-341)||(16823251-16823588)
chr2 (6-341)||(16897892-16898229)
chr2 (12-329)||(16167475-16167794)
chr2 (11-341)||(32055798-32056129)
chr2 (11-329)||(12592806-12593130)
chr2 (34-341)||(19410398-19410709)
chr2 (12-341)||(37931369-37931707)
chr2 (1-339)||(11629101-11629440)
chr2 (1-339)||(40239495-40239834)
chr2 (11-329)||(3788490-3788809)
chr2 (1-341)||(37679805-37680149)
chr2 (1-341)||(37695070-37695414)
chr2 (1-341)||(21671084-21671429)
chr2 (6-341)||(27782223-27782560)
chr2 (11-341)||(34297152-34297477)
chr2 (63-336)||(31868705-31868979)
chr2 (9-341)||(27396317-27396661)
chr2 (1-322)||(19450351-19450683)
chr2 (11-341)||(34268840-34269167)
chr2 (12-339)||(23122494-23122818)
chr2 (11-339)||(28888275-28888600)
chr2 (11-341)||(27428367-27428692)
chr2 (12-336)||(20843909-20844235)
chr2 (211-341)||(23116993-23117124)
chr2 (12-68)||(31887682-31887738)
[»] chr8 (24 HSPs)
chr8 (12-336)||(33248365-33248690)
chr8 (11-341)||(18796704-18797037)
chr8 (12-341)||(44566979-44567313)
chr8 (11-341)||(9360620-9360951)
chr8 (7-341)||(29835317-29835652)
chr8 (11-341)||(33264729-33265060)
chr8 (6-341)||(12086609-12086947)
chr8 (1-341)||(19680436-19680777)
chr8 (6-329)||(28355848-28356176)
chr8 (34-341)||(31483756-31484067)
chr8 (12-341)||(15773573-15773904)
chr8 (12-329)||(31360527-31360846)
chr8 (11-341)||(18715478-18715812)
chr8 (1-341)||(19202261-19202592)
chr8 (19-341)||(21342056-21342381)
chr8 (19-341)||(19911048-19911374)
chr8 (9-341)||(22074815-22075150)
chr8 (6-270)||(16260216-16260480)
chr8 (11-341)||(19655233-19655562)
chr8 (11-341)||(22138904-22139230)
chr8 (1-339)||(27602802-27603135)
chr8 (12-339)||(2131156-2131479)
chr8 (12-339)||(19694094-19694419)
chr8 (51-339)||(14569194-14569482)
[»] scaffold0547 (1 HSPs)
scaffold0547 (11-341)||(9566-9897)
[»] chr3 (58 HSPs)
chr3 (1-329)||(32296580-32296911)
chr3 (11-339)||(22381550-22381879)
chr3 (12-341)||(4790600-4790932)
chr3 (12-329)||(5727940-5728260)
chr3 (12-329)||(47029415-47029735)
chr3 (12-329)||(5717030-5717350)
chr3 (12-329)||(5764108-5764428)
chr3 (11-341)||(10402110-10402441)
chr3 (1-341)||(16422134-16422476)
chr3 (6-341)||(17978917-17979255)
chr3 (11-341)||(22864815-22865145)
chr3 (11-341)||(22879874-22880204)
chr3 (12-341)||(48471889-48472224)
chr3 (1-341)||(16618456-16618802)
chr3 (6-341)||(29658935-29659272)
chr3 (6-341)||(28027247-28027582)
chr3 (34-341)||(31958422-31958733)
chr3 (6-329)||(5590340-5590665)
chr3 (12-341)||(4422880-4423211)
chr3 (34-341)||(5603280-5603591)
chr3 (34-341)||(24334157-24334468)
chr3 (12-341)||(5019675-5020005)
chr3 (11-341)||(17970833-17971163)
chr3 (6-341)||(4340643-4340980)
chr3 (1-339)||(29142723-29143066)
chr3 (12-329)||(10649033-10649352)
chr3 (19-339)||(18286324-18286645)
chr3 (19-339)||(18301625-18301946)
chr3 (11-341)||(20071994-20072328)
chr3 (1-341)||(28109918-28110265)
chr3 (1-339)||(4629736-4630075)
chr3 (6-341)||(18248694-18249031)
chr3 (1-339)||(21680652-21680991)
chr3 (34-341)||(28345155-28345463)
chr3 (11-341)||(6536710-6537042)
chr3 (11-341)||(7079183-7079520)
chr3 (11-341)||(8217593-8217927)
chr3 (12-341)||(11104328-11104660)
chr3 (12-339)||(31030214-31030536)
chr3 (12-341)||(51787984-51788315)
chr3 (12-341)||(18231155-18231486)
chr3 (11-341)||(5472949-5473280)
chr3 (13-339)||(18336591-18336913)
chr3 (18-341)||(19700454-19700791)
chr3 (6-341)||(20570813-20571150)
chr3 (12-341)||(18057222-18057556)
chr3 (18-339)||(32445122-32445436)
chr3 (19-339)||(4727602-4727918)
chr3 (19-339)||(6207869-6208187)
chr3 (12-339)||(15735069-15735393)
chr3 (11-341)||(5658095-5658424)
chr3 (19-339)||(35886733-35887051)
chr3 (12-341)||(4689613-4689938)
chr3 (12-336)||(8283430-8283767)
chr3 (11-121)||(15886894-15887006)
chr3 (12-97)||(8002522-8002607)
chr3 (150-341)||(15886708-15886895)
chr3 (78-161)||(27561018-27561101)
[»] scaffold0159 (2 HSPs)
scaffold0159 (1-341)||(3103-3447)
scaffold0159 (159-341)||(17952-18138)
[»] scaffold0418 (1 HSPs)
scaffold0418 (11-341)||(12034-12365)
[»] chr7 (33 HSPs)
chr7 (19-341)||(5164387-5164711)
chr7 (6-341)||(11446878-11447215)
chr7 (1-341)||(31084432-31084775)
chr7 (11-341)||(5154079-5154410)
chr7 (1-341)||(26313659-26314000)
chr7 (12-341)||(26518789-26519118)
chr7 (6-329)||(24586357-24586682)
chr7 (11-341)||(26509505-26509839)
chr7 (13-341)||(45393216-45393546)
chr7 (34-329)||(4139067-4139366)
chr7 (1-341)||(16047300-16047639)
chr7 (1-341)||(3451303-3451646)
chr7 (1-341)||(5141144-5141487)
chr7 (1-329)||(16745342-16745673)
chr7 (1-341)||(4205374-4205716)
chr7 (1-336)||(26441238-26441576)
chr7 (11-341)||(45737296-45737630)
chr7 (19-341)||(11418589-11418913)
chr7 (6-341)||(26268895-26269236)
chr7 (12-329)||(26663734-26664054)
chr7 (12-329)||(26678926-26679246)
chr7 (12-341)||(31558204-31558535)
chr7 (9-336)||(16443818-16444148)
chr7 (12-341)||(39206949-39207280)
chr7 (12-341)||(2160566-2160899)
chr7 (11-341)||(2779247-2779573)
chr7 (11-341)||(31129900-31130226)
chr7 (1-329)||(10847568-10847902)
chr7 (98-329)||(26595750-26595985)
chr7 (11-339)||(16512252-16512576)
chr7 (12-341)||(10910736-10911061)
chr7 (12-97)||(26531926-26532011)
chr7 (78-161)||(29027282-29027366)
[»] chr1 (11 HSPs)
chr1 (12-341)||(3647147-3647478)
chr1 (13-341)||(28591085-28591414)
chr1 (6-341)||(51644215-51644554)
chr1 (1-341)||(20334339-20334683)
chr1 (20-341)||(10951100-10951424)
chr1 (12-341)||(10968666-10968998)
chr1 (12-341)||(41787233-41787566)
chr1 (11-341)||(28155726-28156060)
chr1 (8-341)||(16201951-16202294)
chr1 (1-341)||(20466767-20467117)
chr1 (1-339)||(21891688-21892014)
[»] chr4 (27 HSPs)
chr4 (13-329)||(14104554-14104871)
chr4 (1-341)||(39856636-39856976)
chr4 (11-339)||(34182890-34183218)
chr4 (13-341)||(30759775-30760103)
chr4 (13-341)||(33667727-33668055)
chr4 (12-329)||(20332358-20332678)
chr4 (12-329)||(40099572-40099892)
chr4 (11-341)||(54839400-54839731)
chr4 (12-329)||(27157248-27157569)
chr4 (11-339)||(14753420-14753749)
chr4 (1-341)||(5011876-5012219)
chr4 (11-339)||(24118672-24119001)
chr4 (11-341)||(5700549-5700881)
chr4 (6-341)||(21975708-21976045)
chr4 (12-341)||(24586285-24586617)
chr4 (11-339)||(36338452-36338774)
chr4 (9-341)||(1906259-1906598)
chr4 (6-341)||(31120434-31120772)
chr4 (6-341)||(18794541-18794878)
chr4 (19-339)||(6575879-6576193)
chr4 (19-339)||(1673877-1674202)
chr4 (9-341)||(15380162-15380496)
chr4 (1-329)||(15276565-15276898)
chr4 (9-341)||(15233823-15234161)
chr4 (92-339)||(36324243-36324484)
chr4 (12-339)||(14671026-14671352)
chr4 (12-339)||(17019062-17019387)
[»] scaffold0792 (1 HSPs)
scaffold0792 (11-341)||(4527-4862)
[»] scaffold0322 (2 HSPs)
scaffold0322 (1-341)||(1645-1987)
scaffold0322 (1-341)||(12034-12387)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (12-341)||(18584-18917)
[»] scaffold0237 (1 HSPs)
scaffold0237 (11-341)||(8853-9184)
[»] scaffold0143 (2 HSPs)
scaffold0143 (11-341)||(9912-10243)
scaffold0143 (11-339)||(33295-33622)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (6-341)||(13942-14280)
[»] scaffold0109 (1 HSPs)
scaffold0109 (1-341)||(25103-25453)
[»] scaffold0336 (1 HSPs)
scaffold0336 (6-341)||(15562-15906)
[»] scaffold0240 (1 HSPs)
scaffold0240 (19-339)||(24832-25150)
[»] scaffold0089 (1 HSPs)
scaffold0089 (12-339)||(6065-6391)
[»] scaffold0288 (1 HSPs)
scaffold0288 (6-176)||(370-540)
[»] scaffold0093 (1 HSPs)
scaffold0093 (226-341)||(1-117)
[»] scaffold0241 (1 HSPs)
scaffold0241 (1-155)||(26245-26399)
[»] scaffold0099 (2 HSPs)
scaffold0099 (19-151)||(40759-40898)
scaffold0099 (290-339)||(40556-40606)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 307; Significance: 1e-173; HSPs: 44)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 307; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 1 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 27284575 - 27284233
Alignment:
Q  1 gaagtttctgtgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27284575 gaagcttctgtgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgt 27284476  T
Q  101 gaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctat-ttttcttctactttcaaagc 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27284475 gaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctattttttcttctactttcaaagc 27284376  T
Q  200 tatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttg-aaagcaaacctga 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27284375 tatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctga 27284276  T
Q  299 gcaacagggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagtgtat 341  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  27284275 gcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtat 27284233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 11 - 341
Target Start/End: Original strand, 16755815 - 16756148
Alignment:
Q  11 tgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 110  Q
    |||||| ||||||||| |||| ||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16755815 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 16755914  T
Q  111 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 210  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16755915 agtcacgccttcggctgaccaccgctcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 16756014  T
Q  211 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaac--attttgaaaattgaaaactttttgtctattttg-aaagcaaacctgagcaacaggg 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16756015 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatattttgacaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacaggg 16756114  T
Q  308 tacattcaaacgaaacatgcataagcgagtgtat 341  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  16756115 tacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtat 16756148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 1 - 341
Target Start/End: Original strand, 29555543 - 29555885
Alignment:
Q  1 gaagtttctgtgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29555543 gaagtttctgtgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgt 29555642  T
Q  101 gaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagct 200  Q
     ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  || |||||||||||||    
T  29555643 aaatccgtggagtcgcgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtctgaaactctgttttctttttactttcaaagct 29555742  T
Q  201 atatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttg-aaagcaaacctga 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  29555743 atatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttagaaaattaaaagctttttgtctattttgaaaagcaaacctga 29555842  T
Q  299 gcaacagggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagtgtat 341  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  29555843 acaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtat 29555885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 13 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 26110611 - 26110282
Alignment:
Q  13 cttgtgaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 112  Q
    |||||| ||||||| |||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26110611 cttgtggattcaaagtttctaagaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 26110512  T
Q  113 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaaca 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  || |||||||||||||||||||||||||    
T  26110511 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttcaaagctatatacaaaaca 26110412  T
Q  213 ttttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttg-aaagcaaacctgagcaacagggtaca 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  26110411 ttttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctgttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtaca 26110312  T
Q  312 ttcaaacgaaacatgcataagcgagtgtat 341  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  26110311 ttcaaatgaaacatgcatgagcgagagtat 26110282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 13 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 13518395 - 13518065
Alignment:
Q  13 cttgtgaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 112  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13518395 cttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 13518296  T
Q  113 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaac 211  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  13518295 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttttttccactttcaaagctatatacaaaac 13518196  T
Q  212 attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttg-aaagcaaacctgagcaacagggtac 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13518195 attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtac 13518096  T
Q  311 attcaaacgaaacatgcataagcgagtgtat 341  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  13518095 attcaaatgaaacatgcatgagcgagagtat 13518065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 13 - 341
Target Start/End: Original strand, 27491130 - 27491460
Alignment:
Q  13 cttgtgaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 112  Q
    |||||||||||||| |||| | ||| || |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27491130 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 27491229  T
Q  113 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaaca 212  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27491230 tcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctgtatacaaaaca 27491329  T
Q  213 ttttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttg-aaagcaaacctgagcaacagggtac 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27491330 ttttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaacctttggtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtac 27491429  T
Q  311 attcaaacgaaacatgcataagcgagtgtat 341  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  27491430 attcaaatgaaacatgcatgagcgagagtat 27491460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 13 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 26772829 - 26772500
Alignment:
Q  13 cttgtgaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 112  Q
    |||||| ||||||| |||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26772829 cttgtggattcaaagtttctaagaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 26772730  T
Q  113 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaaca 212  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26772729 tcacgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaattcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaaaca 26772631  T
Q  213 ttttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttg-aaagcaaacctgagcaacagggtac 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  26772630 ttttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaagattgaaaactttttgtctattttgaaaaacaaacctgagcaacagggtac 26772531  T
Q  311 attcaaacgaaacatgcataagcgagtgtat 341  Q
    | ||||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  26772530 aatcaaatgaaacatgcatgagcgagggtat 26772500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 6 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 27356319 - 27355982
Alignment:
Q  6 ttctgtgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 105  Q
    |||||| |||||||||||||| |||| | ||| || |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27356319 ttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 27356220  T
Q  106 cgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatata 205  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27356219 cgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaagttgagcctttgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatata 27356120  T
Q  206 caaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttg-aaagcaaacctgagcaac 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27356119 caaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaacctttggtctattttgaaaagcaaacctgagcaac 27356020  T
Q  304 agggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagtgtat 341  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  27356019 agggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtat 27355982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 12 - 341
Target Start/End: Original strand, 28166490 - 28166822
Alignment:
Q  12 gcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 111  Q
    ||||| |||| |||| ||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28166490 gcttgcgaatccaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 28166589  T
Q  112 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaac 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       
T  28166590 gtcacgccttcggctgaccaccactctcatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaattt 28166689  T
Q  212 attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca--ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttg-aaagcaaacctgagcaacagggt 308  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28166690 attttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 28166789  T
Q  309 acattcaaacgaaacatgcataagcgagtgtat 341  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  28166790 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtat 28166822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 11 - 341
Target Start/End: Original strand, 27063477 - 27063808
Alignment:
Q  11 tgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 110  Q
    |||||||||||||||| ||||  |||||||   |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27063477 tgcttgtgaattcaaagtttctgggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaactaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 27063576  T
Q  111 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  27063577 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttaaaactcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaat 27063675  T
Q  211 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttg-aaagcaaacctgagcaacagggt 308  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27063676 cattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 27063775  T
Q  309 acattcaaacgaaacatgcataagcgagtgtat 341  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  27063776 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtat 27063808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 27623922 - 27623582
Alignment:
Q  1 gaagtttctgtgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgt 100  Q
    |||| |||||| |||||||||||||| |||| | ||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27623922 gaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgt 27623823  T
Q  101 gaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactcta-tttttcttctactttcaaag 198  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27623822 gaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttttcttctactttcaaag 27623723  T
Q  199 ctatatacaaaaca-ttttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttg-aaagcaaacct 296  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27623722 ctatatacaaaacatttttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttaaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacct 27623623  T
Q  297 gagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagt 337  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  27623622 gagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagt 27623582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 12 - 339
Target Start/End: Original strand, 4778876 - 4779206
Alignment:
Q  12 gcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 110  Q
    ||||| ||||||||| ||| ||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4778876 gcttgcgaattcaaagttttcaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 4778975  T
Q  111 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttc-aaagctatatacaaa 209  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||    
T  4778976 agtcacgcctccggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaaagctgtatacgaa 4779075  T
Q  210 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttg-aaagcaaacctgagcaacaggg 307  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4779076 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacaggg 4779175  T
Q  308 tacattcaaacgaaacatgcataagcgagtgt 339  Q
    |||||||||| | ||||||||| |||||||||    
T  4779176 tacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgt 4779206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 13 - 341
Target Start/End: Original strand, 16680136 - 16680467
Alignment:
Q  13 cttgtgaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 112  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  16680136 cttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgaaaatccgtggag 16680235  T
Q  113 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactcta-tttttcttctactttcaaagctatatac-aaaa 210  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  16680236 tcacgccgtcggctgaccaccactcttatacgtcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctattttttcttctactttcaaagttatatacaaaaa 16680335  T
Q  211 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttg-aaagcaaacctgagcaacagggta 309  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  16680336 tattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcgacagggta 16680435  T
Q  310 cattcaaacgaaacatgcataagcgagtgtat 341  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  16680436 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtat 16680467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 6 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 4539967 - 4539629
Alignment:
Q  6 ttctgtgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaat 104  Q
    |||||| |||||||||||||| |||| | ||| || |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4539967 ttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtgaat 4539868  T
Q  105 ccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttc-ttctactttcaaagctata 203  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  4539867 ccgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcttgtgctgttgtttgaaactctatttttctttttactttcaaagctata 4539768  T
Q  204 tacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttg-aaagcaaacctgagcaa 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  4539767 tacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctgttttgaaaagcaaacctgagcaa 4539668  T
Q  303 cagggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagtgtat 341  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  4539667 cagggtacgttcaaatgaaacatgcatgagcgagagtat 4539629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 22929096 - 22928752
Alignment:
Q  1 gaagtttctgtgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgt 100  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22929096 gaagcttctgtgcttgcgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgt 22928997  T
Q  101 gaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagct 200  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||    
T  22928996 aaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctatgcttttgtttgaaactctactttctttctactttcaaagct 22928897  T
Q  201 atatac--aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattg-aaaactttttgtcta-ttttgaaagcaaacct 296  Q
    || |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  22928896 atgtacaaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtttttgtctatttttgaaagcaaacct 22928797  T
Q  297 gagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagtgtat 341  Q
    |||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  22928796 gagcaatagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagtgtat 22928752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 19 - 341
Target Start/End: Original strand, 29579018 - 29579341
Alignment:
Q  19 aattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgc 118  Q
    |||||||| ||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  29579018 aattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgc 29579117  T
Q  119 cttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttct 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||     
T  29579118 cttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactcta-ttttcttctattttcaaagctatatacaaatcattttcc 29579216  T
Q  219 ttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttg-aaaattgaaaactttttgtctattttg-aaagcaaacctgagcaacagggtacattcaa 316  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29579217 ttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacaatcaa 29579316  T
Q  317 acgaaacatgcataagcgagtgtat 341  Q
    | ||||||||||| |||||| ||||    
T  29579317 atgaaacatgcatgagcgagggtat 29579341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 6 - 339
Target Start/End: Original strand, 4531278 - 4531612
Alignment:
Q  6 ttctgtgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 105  Q
    |||||| ||||||||||| || ||||  |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4531278 ttctgtacttgtgaattcgaagtttctgggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 4531377  T
Q  106 cgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatata 205  Q
    |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4531378 cgtggagtcgtgccttcggctgatcaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctgtata 4531477  T
Q  206 caaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttg-aaagcaaacctgagcaac 303  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  4531478 caaaacattctctttccattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacccgagcaac 4531577  T
Q  304 agggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagtgt 339  Q
    |||||||||||||| | ||||||||| |||||||||    
T  4531578 agggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgt 4531612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 1 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 8899912 - 8899570
Alignment:
Q  1 gaagtttctgtgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgt 100  Q
    |||| |||||| |||||||||||||| |||| | ||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8899912 gaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgt 8899813  T
Q  101 gaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactctatttttcttctactttcaaagc 199  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||     
T  8899812 gaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactcta-ttttcttctactttcaaagt 8899714  T
Q  200 tatatac-aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttg-aaagcaaacctg 297  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8899713 tatatacaaaaatattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctg 8899614  T
Q  298 agcaacagggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagtgtat 341  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  8899613 agcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagggtat 8899570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 6 - 329
Target Start/End: Original strand, 27200176 - 27200502
Alignment:
Q  6 ttctgtgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaat 104  Q
    |||||| |||||| ||||||| |||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27200176 ttctgtacttgtggattcaaagtttctaagaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtgaat 27200275  T
Q  105 ccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatat 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  27200276 ccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatctatttgagcttgtgcttttgattaaaactcta-ttttcttctactttcaaagctatgt 27200374  T
Q  205 ac-aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt-ttgaaaattgaaaactttttgtctattttg-aaagcaaacctgagca 301  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27200375 acaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattcttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagca 27200474  T
Q  302 acagggtacattcaaacgaaacatgcat 329  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||    
T  27200475 acagggtacattcaaatgaaacatgcat 27200502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 6 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 27249057 - 27248731
Alignment:
Q  6 ttctgtgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaat 104  Q
    |||||| |||||| ||||||| |||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27249057 ttctgtacttgtggattcaaagtttctaagaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtgaat 27248958  T
Q  105 ccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatat 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  27248957 ccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatctatttgagcttgtgcttttgattaaaactcta-ttttcttctactttcaaagctatgt 27248859  T
Q  205 ac-aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt-ttgaaaattgaaaactttttgtctattttg-aaagcaaacctgagca 301  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27248858 acaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattcttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagca 27248759  T
Q  302 acagggtacattcaaacgaaacatgcat 329  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||    
T  27248758 acagggtacattcaaatgaaacatgcat 27248731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 6 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 30552208 - 30551871
Alignment:
Q  6 ttctgtgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 105  Q
    |||||| |||||| ||||||| || |||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30552208 ttctgtacttgtggattcaaagttcccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 30552109  T
Q  106 cgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatata 205  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||||||    
T  30552108 cgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagactgtgcttttgtttgaaactctgttttctttttactttcaaagctatata 30552009  T
Q  206 c-aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttg-aaagcaaacctgagcaac 303  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  30552008 caaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacccgagcaac 30551909  T
Q  304 agggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagtgtat 341  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  30551908 agggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagggtat 30551871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 19 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 13293140 - 13292834
Alignment:
Q  19 aattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgc 118  Q
    |||||||| |||| |||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13293140 aattcaaagtttctaggaaatgtaatgattaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgc 13293041  T
Q  119 cttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttct 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13293040 cttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttct 13292941  T
Q  219 ttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttg-aaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaa 317  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||||     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13292940 ttctattttgataatgataatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtttt-----ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaa 13292846  T
Q  318 cgaaacatgcat 329  Q
     |||||||||||    
T  13292845 tgaaacatgcat 13292834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 6 - 341
Target Start/End: Original strand, 28213444 - 28213782
Alignment:
Q  6 ttctgtgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaat 104  Q
    |||||| |||||||||||||| |||| | ||| || |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  28213444 ttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtgaat 28213543  T
Q  105 ccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatat 204  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  28213544 ccgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcttgtgctgttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctgtat 28213643  T
Q  205 acaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttg-aaagcaaacctgagcaa 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||| |||||||||    
T  28213644 acaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtgtgttttgaaaagcaagcctgagcaa 28213743  T
Q  303 cagggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagtgtat 341  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  28213744 cagggtacgttcaaatgaaacatgcatgagcgagagtat 28213782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 12 - 341
Target Start/End: Original strand, 29507412 - 29507745
Alignment:
Q  12 gcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 111  Q
    ||||| ||||||||| |||| |||| |||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29507412 gcttgcgaattcaaagtttctaggagatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgga 29507511  T
Q  112 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactct--atttttcttctactttcaaagctatatacaaa 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || || || ||||||||||||||||||||||    
T  29507512 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttttactttcaaagctatatacaaa 29507611  T
Q  210 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttg-aaagcaaacctgagcaacaggg 307  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  29507612 acattttctttctcttttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacaggg 29507711  T
Q  308 tacattcaaacgaaacatgcataagcgagtgtat 341  Q
    |||||||||| | ||||||||| |||||| ||||    
T  29507712 tacattcaaatggaacatgcatgagcgagagtat 29507745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 238; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 11 - 341
Target Start/End: Original strand, 26791811 - 26792143
Alignment:
Q  11 tgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 110  Q
    |||||| ||||||||| |||| ||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26791811 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 26791910  T
Q  111 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaa 209  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26791911 aatcacgcctttggctgaccaccactcttatacgtcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaaactcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaa 26792009  T
Q  210 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttg-aaagcaaacctgagcaacaggg 307  Q
     ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26792010 tcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacaggg 26792109  T
Q  308 tacattcaaacgaaacatgcataagcgagtgtat 341  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  26792110 tacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagggtat 26792143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 12 - 341
Target Start/End: Original strand, 4763759 - 4764090
Alignment:
Q  12 gcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 111  Q
    ||||| ||||||||| |||| |||| |||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4763759 gcttgcgaattcaaagtttctaggagatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgga 4763858  T
Q  112 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  4763859 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatctatttgagcctttgcttttgtttgaaaactcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaat 4763957  T
Q  211 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttg-aaagcaaacctgagcaacagggt 308  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4763958 cattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 4764057  T
Q  309 acattcaaacgaaacatgcataagcgagtgtat 341  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  4764058 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtat 4764090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 11 - 317
Target Start/End: Original strand, 26926763 - 26927070
Alignment:
Q  11 tgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 110  Q
    |||||| ||||||||| |||| ||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26926763 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 26926862  T
Q  111 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||      
T  26926863 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgtttaaaactcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaatt 26926961  T
Q  211 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttg-aaagcaaacctgagcaacagggt 308  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26926962 tattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 26927061  T
Q  309 acattcaaa 317  Q
    |||||||||    
T  26927062 acattcaaa 26927070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 6 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 34458714 - 34458391
Alignment:
Q  6 ttctgtgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 105  Q
    |||||| |||||||||||||| |||| | ||| || |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34458714 ttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 34458615  T
Q  106 cgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactctatttttcttctactttcaaagctatat 204  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| |||||||||    
T  34458614 cgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaagttgagcctttgcttttgtttgaaaactcta-ttttcttctattttctaagctatat 34458516  T
Q  205 acaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttg-aaagcaaacctgagcaac 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  34458515 acaaaacattttctttctattttgataatgacaatggttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac-ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaac 34458417  T
Q  304 agggtacattcaaacgaaacatgcat 329  Q
    |||||||||||||| |||||||||||    
T  34458416 agggtacattcaaatgaaacatgcat 34458391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 34 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 16938204 - 16937896
Alignment:
Q  34 ggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccacc 133  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16938204 ggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggccgaccacc 16938105  T
Q  134 actcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataat 233  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  16938104 actcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgtttaaaactcta-ttttcttctattttcaaagctatatacaaattattttccttctattttgataat 16938006  T
Q  234 gacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttg-aaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcataa 331  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  16938005 ggcaatgcttgaaacaaacatttttgaaaactgaaaactttttgtttattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatga 16937906  T
Q  332 gcgagtgtat 341  Q
    ||||| ||||    
T  16937905 gcgagagtat 16937896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 6 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 33370639 - 33370314
Alignment:
Q  6 ttctgtgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 105  Q
    |||||| |||||||||||||| |||| | ||| || |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33370639 ttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 33370540  T
Q  106 cgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactctatttttcttctactttcaaagctatat 204  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33370539 cgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaagttgagcctttgcttttgtttgaaaactcta-ttttcttctactttcaaagctatat 33370441  T
Q  205 acaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttg-aaagcaaacctgagcaa 302  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  33370440 acaaagcattttctttctcttttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaatttttttgtctattttgaaaagcgaacctgagcaa 33370341  T
Q  303 cagggtacattcaaacgaaacatgcat 329  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||    
T  33370340 cagggtacattcaaatgaaacatgcat 33370314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 11 - 341
Target Start/End: Original strand, 27013728 - 27014053
Alignment:
Q  11 tgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 110  Q
    |||||| ||||||||| |||| |||| |||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27013728 tgcttgcgaattcaaagtttctaggagatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 27013827  T
Q  111 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||  || |||||||||||||||||||||||    
T  27013828 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatctatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttcaaagctatatacaaaa 27013927  T
Q  211 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaagcaaacctgagcaacagggtac 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||     |||  |||||||||||||||||||||||||    
T  27013928 cattttctttctattttgataatgataatgctcgaaacaaacattttgaaaattgaaaaagtttt-----tttgaaaagcaaacctgagcaacagggtac 27014022  T
Q  311 attcaaacgaaacatgcataagcgagtgtat 341  Q
    ||||||| || |||||||| |||||| ||||    
T  27014023 attcaaatgagacatgcatgagcgagagtat 27014053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 11 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 14139597 - 14139271
Alignment:
Q  11 tgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 110  Q
    |||||| ||||||||| |||| |||| |||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14139597 tgcttgcgaattcaaagtttctaggagatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 14139498  T
Q  111 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||  || |||||||||||||||||||||||    
T  14139497 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatctatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttcaaagctatatacaaaa 14139398  T
Q  211 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttg-aaagcaaacctgagcaacagggta 309  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||     ||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  14139397 cattttctttctattttgataatgataatgctcgaaacaaacattttgaaaattgaaaaagtttt-----ttttgaaaagcaaacctgagcaacatggta 14139303  T
Q  310 cattcaaacgaaacatgcataagcgagtgtat 341  Q
    |||||||| || |||||||| |||||| ||||    
T  14139302 cattcaaatgagacatgcatgagcgagagtat 14139271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 97 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 26666774 - 26666529
Alignment:
Q  97 ttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaa 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  26666774 ttgtgaatccgtggagtcacgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaattctatttt-cttctactttcaa 26666676  T
Q  197 agctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttg-aaagcaaac 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  26666675 agctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaagattgaaaactttttgtctattttgaaaaacaaac 26666576  T
Q  295 ctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagtgtat 341  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  26666575 ctgagcaacagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagggtat 26666529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 12 - 339
Target Start/End: Original strand, 27031019 - 27031345
Alignment:
Q  12 gcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 111  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||| | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27031019 gcttgtgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtattcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgga 27031118  T
Q  112 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac--aaa 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||| ||| |||  |||    
T  27031119 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctgttttctttttactttcaaagttatgtacaaaaa 27031218  T
Q  210 acattttctttctattttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaagcaaacctgagcaacagggt 308  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||||   | |||  |||||||||||||||||||||||    
T  27031219 acattttccttctattttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtttt---tttttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 27031315  T
Q  309 acattcaaacgaaacatgcataagcgagtgt 339  Q
    ||||||||| | ||||||||| |||||||||    
T  27031316 acattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgt 27031345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 181; E-Value: 9e-98
Query Start/End: Original strand, 11 - 339
Target Start/End: Original strand, 24869705 - 24870029
Alignment:
Q  11 tgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 110  Q
    |||||| ||||||||| |||| ||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24869705 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 24869804  T
Q  111 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac-aaa 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  || ||||||||||| ||| ||| |||    
T  24869805 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctactttctttttactttcaaagttatgtacaaaa 24869904  T
Q  210 acattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaagcaaacctgagcaacaggg 307  Q
    |||||||| ||||| |||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||  |||      |||  ||||||||||||||||||||||    
T  24869905 acattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttt------tttgaaaagcaaacctgagcaacaggg 24869998  T
Q  308 tacattcaaacgaaacatgcataagcgagtgt 339  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  24869999 tacattcaaacg-aacatgcatgagcgagtgt 24870029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 12 - 339
Target Start/End: Original strand, 27025141 - 27025466
Alignment:
Q  12 gcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 111  Q
    ||||| ||||||||| | || |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27025141 gcttgcgaattcaaagtctctaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgga 27025240  T
Q  112 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac--aaa 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||  || ||||||||||| ||| |||  |||    
T  27025241 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttcaaagttatgtacaaaaa 27025340  T
Q  210 acattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaagcaaacctgagcaacaggg 307  Q
    |||||||| ||||| |||| |||||||| |||||| ||||||| ||| ||||||||||||||  |||      |||  ||||||||||||||||||||||    
T  27025341 acattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaagcatcttgaaaattgaaaaagttt------tttgaaaagcaaacctgagcaacaggg 27025434  T
Q  308 tacattcaaacgaaacatgcataagcgagtgt 339  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| |||||    
T  27025435 tacattcaaacgagacatgcatgagctagtgt 27025466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 11 - 317
Target Start/End: Original strand, 27208899 - 27209204
Alignment:
Q  11 tgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 110  Q
    |||||| ||||||||| |||| |||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27208899 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacccataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 27208998  T
Q  111 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac-aaa 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||| ||| |||    
T  27208999 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcgtgtgcttttgtttgaaactctattttctttttactttcaaagttatgtacaaaa 27209098  T
Q  210 acattttctttcta---ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaagcaaacctgagcaacag 305  Q
    |||||||| |||||   |||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||  |||      |||  ||||||||| ||||||||||    
T  27209099 acattttccttctatttttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttt------tttgaaaagcaaacttgagcaacag 27209192  T
Q  306 ggtacattcaaa 317  Q
    ||||||||||||    
T  27209193 ggtacattcaaa 27209204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 11 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 27240329 - 27240024
Alignment:
Q  11 tgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 110  Q
    |||||| ||||||||| |||| |||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27240329 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacccataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 27240230  T
Q  111 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac-aaa 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||| ||| |||    
T  27240229 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcgtgtgcttttgtttgaaactctattttctttttactttcaaagttatgtacaaaa 27240130  T
Q  210 acattttctttcta---ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaagcaaacctgagcaacag 305  Q
    |||||||| |||||   |||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||  |||      |||  ||||||||| ||||||||||    
T  27240129 acattttccttctatttttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttt------tttgaaaagcaaacttgagcaacag 27240036  T
Q  306 ggtacattcaaa 317  Q
    ||||||||||||    
T  27240035 ggtacattcaaa 27240024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 12 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 24299957 - 24299633
Alignment:
Q  12 gcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 111  Q
    ||||| ||||||||| |||| |||||||| | |||||  ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24299957 gcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgttgtgttcaatgtatcaccaacccataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgga 24299858  T
Q  112 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac-aaaa 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||  || |||| |||||| ||| ||| ||||    
T  24299857 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactctcaaagttatgtacaaaaa 24299758  T
Q  211 cattttctttctattttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttg-aaagcaaacctgagcaacagggt 308  Q
    | ||| | |||| |||| |||||||| |||||| | ||||||||| ||||||||||||||  ||||     ||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  24299757 cgtttcccttcttttttaataatgacaaatgctcggaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtttt-----ttttgaaaagcaaacctgagtaacagggt 24299663  T
Q  309 acattcaaacgaaacatgcataagcgagtgt 339  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  24299662 acattcaaatg-aacatgcataagcgagtgt 24299633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 12 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 15406731 - 15406404
Alignment:
Q  12 gcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 110  Q
    ||||| ||||||||| || | ||||||||   ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15406731 gcttgcgaattcaaagttcctaggaaatgtcatgattgctgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 15406632  T
Q  111 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac-aaa 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||  || ||||||||||| ||| ||| |||    
T  15406631 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttcaaagatatgtacaaaa 15406532  T
Q  210 acattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaagcaaacctgagcaacaggg 307  Q
    |||||||| ||||| |||| |||||||| |||||| ||||||||||| | |||||||| |||   |||     |||  ||||||||||||||||||||||    
T  15406531 acattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatctggaaaattggaaaaagttt-----tttgaaaagcaaacctgagcaacaggg 15406437  T
Q  308 tacattcaaacgaaacatgcataagcgagtgtat 341  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  15406436 tacattcaaacg-aacatgcatgagcgagtgtat 15406404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 12 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 15418518 - 15418191
Alignment:
Q  12 gcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 110  Q
    ||||| ||||||||| || | ||||||||   ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15418518 gcttgcgaattcaaagttcctaggaaatgtcatgattgctgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 15418419  T
Q  111 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac-aaa 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||  || ||||||||||| ||| ||| |||    
T  15418418 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttcaaagatatgtacaaaa 15418319  T
Q  210 acattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaagcaaacctgagcaacaggg 307  Q
    |||||||| ||||| |||| |||||||| |||||| ||||||||||| | |||||||| |||   |||     |||  ||||||||||||||||||||||    
T  15418318 acattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatctggaaaattggaaaaagttt-----tttgaaaagcaaacctgagcaacaggg 15418224  T
Q  308 tacattcaaacgaaacatgcataagcgagtgtat 341  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  15418223 tacattcaaacg-aacatgcatgagcgagtgtat 15418191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 56 - 338
Target Start/End: Original strand, 20174589 - 20174883
Alignment:
Q  56 tcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  20174589 tcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccatggagtcccgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagt 20174688  T
Q  156 ttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttc--tactttcaaagctatatac-aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttg-aaacaaa 251  Q
     |||||||||||||||||||||||||||  ||  ||||| ||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  20174689 ctgtgcttttgtttgaaactctattttttctctttacttccaaagttatgtacaaaaacattttctttctattttgatgatgacaatgcttgaaaacaaa 20174788  T
Q  252 cattttgaaa------attgaaaactttt-tgtctattttg-aaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagtg 338  Q
    |||| | |||      ||  | || |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||| |||||  ||||||||||| ||||||||    
T  20174789 cattctaaaaaaaaatatcaagaagttttctgtctattttgaaaagcaaaccttagcaacaaggtactttcaagtgaaacatgcatgagcgagtg 20174883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 56 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 22161402 - 22161108
Alignment:
Q  56 tcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  22161402 tcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccatggagtcccgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagt 22161303  T
Q  156 ttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttc--tactttcaaagctatatac-aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttg-aaacaaa 251  Q
     |||||||||||||||||||||||||||  ||  ||||| ||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  22161302 ctgtgcttttgtttgaaactctattttttctctttacttccaaagttatgtacaaaaacattttctttctattttgatgatgacaatgcttgaaaacaaa 22161203  T
Q  252 cattttgaaa------attgaaaactttt-tgtctattttg-aaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagtg 338  Q
    |||| | |||      ||  | || |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||| |||||  ||||||||||| ||||||||    
T  22161202 cattctaaaaaaaaatatcaagaagttttctgtctattttgaaaagcaaaccttagcaacaaggtactttcaagtgaaacatgcatgagcgagtg 22161108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 23851541 - 23851450
Alignment:
Q  1 gaagtttctgtgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttcca 92  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23851541 gaagcttctgtgcttgcgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttcca 23851450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 284; Significance: 1e-159; HSPs: 49)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 19 - 341
Target Start/End: Original strand, 11555367 - 11555690
Alignment:
Q  19 aattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgc 118  Q
    |||||||| |||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11555367 aattcaaagtttctaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgc 11555466  T
Q  119 cttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttct 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11555467 cttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttct 11555566  T
Q  219 ttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttg-aaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaa 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11555567 ttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaacttcttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaa 11555666  T
Q  318 cgaaacatgcataagcgagtgtat 341  Q
     ||||||||||| |||||| ||||    
T  11555667 tgaaacatgcatgagcgagagtat 11555690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 7 - 341
Target Start/End: Original strand, 3795539 - 3795876
Alignment:
Q  7 tctgtgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3795539 tctgtgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 3795638  T
Q  107 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactcta-tttttcttctactttcaaagctatat 204  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  3795639 gtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaattctattttttcttctactttcaaagctatat 3795738  T
Q  205 acaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttg-aaagcaaacctgagcaac 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3795739 acaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaac 3795838  T
Q  304 agggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagtgtat 341  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  3795839 agggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtat 3795876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 1 - 341
Target Start/End: Original strand, 22894411 - 22894752
Alignment:
Q  1 gaagtttctgtgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgt 100  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||| |||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22894411 gaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgt 22894510  T
Q  101 gaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagct 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||    
T  22894511 aaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaactctactttctttctactttcaaagct 22894610  T
Q  201 atatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa-ctttttgtctattttgaaagcaaacctgag 299  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22894611 atgtacaaaatattttctttctattttgataatgaccatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaggtttttgtctattttgaaagcaaacctgag 22894710  T
Q  300 caacagggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagtgtat 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22894711 caacagggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagtgtat 22894752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 13 - 341
Target Start/End: Original strand, 33881133 - 33881463
Alignment:
Q  13 cttgtgaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 112  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33881133 cttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 33881232  T
Q  113 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaac 211  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  33881233 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttttttccactttcaaagctatatacaaaac 33881332  T
Q  212 attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttg-aaagcaaacctgagcaacagggtac 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33881333 attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtac 33881432  T
Q  311 attcaaacgaaacatgcataagcgagtgtat 341  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  33881433 attcaaatgaaacatgcatgagcgagagtat 33881463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 1 - 341
Target Start/End: Original strand, 9323472 - 9323813
Alignment:
Q  1 gaagtttctgtgcttgtgaattcaaa-atttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttg 99  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||  |||   ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9323472 gaagtttctgtacttgtgaattcaaagttttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttg 9323571  T
Q  100 tgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagc 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||    
T  9323572 tgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgtttaaaactcta-ttttcttctattttcaaagc 9323670  T
Q  200 tatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttg-aaagcaaacctga 298  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  9323671 tatatacaaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctga 9323770  T
Q  299 gcaacagggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagtgtat 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9323771 gcaacagggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagagtat 9323813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 13 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 18369686 - 18369356
Alignment:
Q  13 cttgtgaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 112  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18369686 cttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 18369587  T
Q  113 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaac 211  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18369586 tcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgaaccttcgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaac 18369487  T
Q  212 attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttg-aaagcaaacctgagcaacagggtac 310  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18369486 attttctttctattttggtaatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtac 18369387  T
Q  311 attcaaacgaaacatgcataagcgagtgtat 341  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  18369386 attcaaatgaaacatgcatgagcgagagtat 18369356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 6 - 339
Target Start/End: Original strand, 6880303 - 6880639
Alignment:
Q  6 ttctgtgcttgtgaattcaaa-atttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaat 104  Q
    |||||| ||||||||||||||  |||   ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6880303 ttctgtacttgtgaattcaaagttttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaat 6880402  T
Q  105 ccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatat 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6880403 ccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgtttaagactctatttttcttctactttcaaagctatat 6880502  T
Q  205 acaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttg-aaagcaaacctgagcaa 302  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6880503 acaaaacattttcttcctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaa 6880602  T
Q  303 cagggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagtgt 339  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  6880603 cagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtgt 6880639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 13 - 341
Target Start/End: Original strand, 24729977 - 24730307
Alignment:
Q  13 cttgtgaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 112  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24729977 cttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 24730076  T
Q  113 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaaca 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  24730077 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgtttgaaattcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaaata 24730175  T
Q  213 ttttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca--ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttg-aaagcaaacctgagcaacagggta 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24730176 ttttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggta 24730275  T
Q  310 cattcaaacgaaacatgcataagcgagtgtat 341  Q
    || ||||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  24730276 caatcaaatgaaacatgcatgagcgagggtat 24730307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 12 - 329
Target Start/End: Original strand, 30174471 - 30174791
Alignment:
Q  12 gcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 111  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30174471 gcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 30174570  T
Q  112 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactcta-tttttcttctactttcaaagctatatacaaa 209  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30174571 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttttcttctactttcaaagctatatacaaa 30174670  T
Q  210 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttg-aaagcaaacctgagcaacagggt 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  30174671 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 30174770  T
Q  309 acattcaaacgaaacatgcat 329  Q
    ||||||||| |||||||||||    
T  30174771 acattcaaatgaaacatgcat 30174791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 11 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 37665642 - 37665312
Alignment:
Q  11 tgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 110  Q
    |||||| ||||||||||||||  |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  37665642 tgcttgcgaattcaaaatttctgggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 37665543  T
Q  111 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  37665542 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctgtatacaaaa 37665443  T
Q  211 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctatttt--gaaagcaaacctgagcaacaggg 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  37665442 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaaccttttgtctatttttaaaaagcaaacctgagcaacaggg 37665343  T
Q  308 tacattcaaacgaaacatgcataagcgagtgt 339  Q
    |||||||||| | ||||||||| |||||||||    
T  37665342 tacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgt 37665312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 12 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 40467708 - 40467377
Alignment:
Q  12 gcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 111  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  40467708 gcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttataaatccgtgga 40467609  T
Q  112 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaac 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  40467608 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctattttctttctactttcaaagctatatacaaaac 40467509  T
Q  212 attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttg-aaagcaaacctgagcaacagggta 309  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  40467508 attttctttccattttaataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggta 40467409  T
Q  310 cattcaaacgaaacatgcataagcgagtgtat 341  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  40467408 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtat 40467377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 1 - 341
Target Start/End: Original strand, 12138171 - 12138512
Alignment:
Q  1 gaagtttctgtgcttgtgaattcaaa-atttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttg 99  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||  |||   ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12138171 gaagtttctgtacttatgaattcaaagttttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttg 12138270  T
Q  100 tgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagc 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||    
T  12138271 tgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgtttaaaactcta-ttttcttctattttcaaagc 12138369  T
Q  200 tatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttg-aaagcaaacctga 298  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  12138370 tatatacaaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctga 12138469  T
Q  299 gcaacagggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagtgtat 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12138470 gcaacagggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagagtat 12138512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 12 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 13318982 - 13318652
Alignment:
Q  12 gcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 111  Q
    ||||| ||||||||| ||||  |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13318982 gcttgcgaattcaaagtttctgggaaatgttatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgga 13318883  T
Q  112 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaac 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  || ||||||||||||||||||||||||    
T  13318882 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttcaaagctatatacaaaac 13318783  T
Q  212 attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttg-aaagcaaacctgagcaacagggtac 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13318782 attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctgttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtac 13318683  T
Q  311 attcaaacgaaacatgcataagcgagtgtat 341  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  13318682 attcaaatgaaacatgcatgagcgagagtat 13318652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 19 - 341
Target Start/End: Original strand, 23631982 - 23632308
Alignment:
Q  19 aattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgc 118  Q
    |||||||| |||| |||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23631982 aattcaaagtttctaggaaatgtaatgattaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagcttcgtgaatccgtggagtcacgc 23632081  T
Q  119 cttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttct 218  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23632082 cttcggctgaccaccactcttatgcatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttct 23632181  T
Q  219 ttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa--ctttttgtctatttt--gaaagcaaacctgagcaacagggtacattc 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23632182 ttctattttgataatgacaatgcttgaaataaacatcttgaaaattgaaaaagctttttgtctatttttgaaaagcaaacttgagcaacagggtacattc 23632281  T
Q  315 aaacgaaacatgcataagcgagtgtat 341  Q
    ||| ||||||||||| |||||||||||    
T  23632282 aaatgaaacatgcatgagcgagtgtat 23632308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 11 - 341
Target Start/End: Original strand, 28655247 - 28655580
Alignment:
Q  11 tgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 110  Q
    |||||| ||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28655247 tgcttgcgaattcaaagttttcaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 28655346  T
Q  111 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 210  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28655347 agtcacgccttcggctgactaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttaaaactcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 28655445  T
Q  211 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca--ttttgaaaattgaaaac-tttttgtctattttg-aaagcaaacctgagcaacagg 306  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28655446 cattttctttctattttaataatgacaatgctcgaaacaaacattttttgaaaattgaaaacttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 28655545  T
Q  307 gtacattcaaacgaaacatgcataagcgagtgtat 341  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  28655546 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtat 28655580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 20 - 336
Target Start/End: Original strand, 30158048 - 30158366
Alignment:
Q  20 attcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgcc 119  Q
    ||||||| |||| | |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30158048 attcaaagtttctaagaaatgtagtgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgcc 30158147  T
Q  120 ttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctt 219  Q
    || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  30158148 tttggctgaccaccactcttacacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctacctttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttcct 30158247  T
Q  220 tctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttg-aaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaa 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  30158248 tctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacggggtacattcaaa 30158347  T
Q  318 cgaaacatgcataagcgag 336  Q
     ||||||||||| ||||||    
T  30158348 tgaaacatgcatgagcgag 30158366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 6 - 329
Target Start/End: Original strand, 2517065 - 2517391
Alignment:
Q  6 ttctgtgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 105  Q
    |||||| |||||||||||||| |||| | ||| ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2517065 ttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 2517164  T
Q  106 cgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatata 205  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2517165 cgtggagtcatgccctcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgagattcta-ttttcttctactttcaaagctatata 2517263  T
Q  206 caaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca---ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttg-aaagcaaacctgagca 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2517264 caaaacattttctttctattttgataatgataatgcttgaaacaaacatttttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagca 2517363  T
Q  302 acagggtacattcaaacgaaacatgcat 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2517364 acagggtacattcaaacgaaacatgcat 2517391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 11 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 13436836 - 13436498
Alignment:
Q  11 tgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtg 109  Q
    |||||| ||||||||| ||| ||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13436836 tgcttgcgaattcaaagttttcaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtg 13436737  T
Q  110 gagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctat-ttttcttctactttcaaagctatatacaa 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13436736 gagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctattttttcttctactttcaaagctatatacaa 13436637  T
Q  209 aaca-ttttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca----ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttg-aaagcaaacctgagcaa 302  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13436636 aacatttttctttctattttgataatggcaacgcttgaaacaaacattttttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaa 13436537  T
Q  303 cagggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagtgtat 341  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  13436536 cagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtat 13436498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 243; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 11 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 9544864 - 9544531
Alignment:
Q  11 tgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 110  Q
    |||||| ||||||||| |||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  9544864 tgcttgcgaattcaaagtttc-aggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 9544766  T
Q  111 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9544765 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgtttaaaactcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 9544667  T
Q  211 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca----ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttg-aaagcaaacctgagcaacag 305  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  9544666 cattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagtaaacctgagcaacag 9544567  T
Q  306 ggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagtgtat 341  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  9544566 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtat 9544531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 243; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 11 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 15753008 - 15752682
Alignment:
Q  11 tgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 110  Q
    |||||| ||||||||| |||| ||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15753008 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 15752909  T
Q  111 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 210  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15752908 agtcacgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaattcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 15752810  T
Q  211 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttg-aaagcaaacctgagcaacagggta 309  Q
    |||||||||||    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15752809 cattttctttc----ttgataatgacaatacttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggta 15752714  T
Q  310 cattcaaacgaaacatgcataagcgagtgtat 341  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  15752713 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtat 15752682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 6 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 31820569 - 31820234
Alignment:
Q  6 ttctgtgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 105  Q
    |||||| |||||||||||||| |||| | ||| || |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31820569 ttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 31820470  T
Q  106 cgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatata 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  31820469 cgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgtttaaaactcta-ttttcttctattttcaaagctatata 31820371  T
Q  206 caaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttg-aaagcaaacctgagcaaca 304  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  31820370 caaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaaca 31820271  T
Q  305 gggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagtgtat 341  Q
     |||||| ||||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  31820270 aggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagggtat 31820234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 11 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 37746484 - 37746152
Alignment:
Q  11 tgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 110  Q
    |||||| ||||||||| ||||  |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  37746484 tgcttgcgaattcaaagtttctgggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 37746385  T
Q  111 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaa 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||    
T  37746384 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttctttttactttcaaagctatatacaaa 37746285  T
Q  210 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttg-aaagcaaacctgagcaacagggt 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  37746284 acattttctttctattttgataatgacaatgctcgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctgttttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 37746185  T
Q  309 acattcaaacgaaacatgcataagcgagtgtat 341  Q
    ||||||||| ||| ||||||| |||||| ||||    
T  37746184 acattcaaatgaagcatgcatgagcgagagtat 37746152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 6 - 341
Target Start/End: Original strand, 33522382 - 33522720
Alignment:
Q  6 ttctgtgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 105  Q
    |||||| |||||| ||||||| || |||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33522382 ttctgtacttgtggattcaaagttcccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 33522481  T
Q  106 cgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttt-tcttctactttcaaagctatat 204  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||| | || |||||||||||||||||    
T  33522482 cgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagactgtgcttttgtttgaaactctgttttcttttttactttcaaagctatat 33522581  T
Q  205 ac-aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttg-aaagcaaacctgagcaa 302  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  33522582 acaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacccgagcaa 33522681  T
Q  303 cagggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagtgtat 341  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  33522682 cagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagggtat 33522720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 11 - 341
Target Start/End: Original strand, 30035431 - 30035762
Alignment:
Q  11 tgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 110  Q
    |||||| ||||||||| |||| ||||||||   |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  30035431 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 30035530  T
Q  111 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30035531 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgtttaaaattcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 30035629  T
Q  211 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttg-aaagcaaacctgagcaacagggt 308  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  30035630 cattttctttctattttgataatggcaatgcttgaaacaaacatttttgaaaactgaaaactttttgtttattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 30035729  T
Q  309 acattcaaacgaaacatgcataagcgagtgtat 341  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  30035730 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtat 30035762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 11 - 341
Target Start/End: Original strand, 5643805 - 5644135
Alignment:
Q  11 tgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 110  Q
    |||||| ||||||||| || | ||||||||   |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5643805 tgcttgcgaattcaaagttcctaggaaatgtcatgatcactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagttttgtgaatccgtgg 5643904  T
Q  111 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5643905 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactcta-ttttcttttactttcaaagctatatacaaaa 5644003  T
Q  211 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttg-aaagcaaacctgagcaacagggt 308  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5644004 cattttccttctattttgataatgacaatgcctgaaacaaacatttttgaaaatcgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 5644103  T
Q  309 acattcaaacgaaacatgcataagcgagtgtat 341  Q
    ||||||||| | ||||||||| |||||| ||||    
T  5644104 acattcaaatg-aacatgcatgagcgagagtat 5644135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 341
Target Start/End: Original strand, 26486391 - 26486722
Alignment:
Q  1 gaagtttctgtgcttgtgaattcaaa-atttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttg 99  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||  |||   ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26486391 gaagtttctgtacttgtgaattcaaagttttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttg 26486490  T
Q  100 tgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagc 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||           |||||||||    
T  26486491 tgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgtttaaaactctat-----------tttcaaagc 26486579  T
Q  200 tatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttg-aaagcaaacctga 298  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  26486580 tatatacaaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctga 26486679  T
Q  299 gcaacagggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagtgtat 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26486680 gcaacagggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagagtat 26486722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 11 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 18122572 - 18122242
Alignment:
Q  11 tgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 110  Q
    |||||| ||||||||| |||| |||| |||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18122572 tgcttgcgaattcaaagtttctaggagatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 18122473  T
Q  111 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctat-ttttcttctactttcaaagctatatacaaa 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||     
T  18122472 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctatttttttttctactttcaaagctatatacaat 18122373  T
Q  210 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttg-aaagcaaacctgagcaacaggg 307  Q
      |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18122372 ttattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgagaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacaggg 18122273  T
Q  308 tacattcaaacgaaacatgcataagcgagtgt 339  Q
    |||||||||| | ||||||||| |||||||||    
T  18122272 tacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgt 18122242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 339
Target Start/End: Original strand, 33298528 - 33298872
Alignment:
Q  1 gaagtttctgtgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgt 100  Q
    |||| |||||| |||||||||||||| |||| | ||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33298528 gaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgt 33298627  T
Q  101 gaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactcta-tttttcttctactttcaaag 198  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||||    
T  33298628 gaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactccatttttttttctactttcaaag 33298727  T
Q  199 ctatatac-aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctatttt---gaaagcaaac 294  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||| |||||    
T  33298728 ctatatacaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctatttttgaaaaaacaaac 33298827  T
Q  295 ctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagtgt 339  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  33298828 ctgagcaacatggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtgt 33298872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 18 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 18494916 - 18494592
Alignment:
Q  18 gaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacg 117  Q
    |||||| || ||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18494916 gaattcgaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacg 18494817  T
Q  118 ccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacatttt 216  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||   | |||    
T  18494816 ccttcggccgaccaccactctcatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactcca-ttttcttctactttcaaagctatatacaatttacttt 18494718  T
Q  217 ctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttg-aaagcaaacctgagcaacagggtacattca 315  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18494717 cttcctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattca 18494618  T
Q  316 aacgaaacatgcataagcgagtgtat 341  Q
    || ||||||||||| |||||| ||||    
T  18494617 aatgaaacatgcatgagcgagagtat 18494592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 12 - 341
Target Start/End: Original strand, 34622524 - 34622856
Alignment:
Q  12 gcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 110  Q
    ||||| ||||||||| ||| ||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  34622524 gcttgcgaattcaaagttttcaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagttttgtgaatccgtgg 34622623  T
Q  111 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 210  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  || |||||||||||||||||||||||    
T  34622624 agtcacgcctccggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttcaaagctatatacaaaa 34622723  T
Q  211 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttg-aaagcaaacctgagcaacagggt 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  34622724 cattttctttctattttgataatgataatgctcgaaacaaacatttttgaaaattaaaaactttttgtctgttttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 34622823  T
Q  309 acattcaaacgaaacatgcataagcgagtgtat 341  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  34622824 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtat 34622856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 12 - 339
Target Start/End: Original strand, 41680710 - 41681040
Alignment:
Q  12 gcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 111  Q
    ||||| ||||||||| |||| |||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41680710 gcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 41680809  T
Q  112 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactctatttttcttctactttcaaagctatatac-aaa 209  Q
    |||  ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  41680810 gtcgtgcccttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactccatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 41680909  T
Q  210 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctatttt--gaaagcaaacctgagcaacaggg 307  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  41680910 atattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctatttttgaaaagcaaacctgagcaacaggg 41681009  T
Q  308 tacattcaaacgaaacatgcataagcgagtgt 339  Q
    |||||||||| | ||||||||| |||||||||    
T  41681010 tacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgt 41681040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 13 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 37352798 - 37352468
Alignment:
Q  13 cttgtgaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 112  Q
    |||||| ||||||| ||||  |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37352798 cttgtggattcaaagtttctgggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 37352699  T
Q  113 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaac 211  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37352698 tcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaagttgagcctttgcttttgtttgaaaactcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaaac 37352600  T
Q  212 attttctttcta-ttttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttg-aaagcaaacctgagcaacagggta 309  Q
    |||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  37352599 attttccttccatttttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtttattttgaaaagcaaacctgagcaacagggta 37352500  T
Q  310 cattcaaacgaaacatgcataagcgagtgtat 341  Q
    | |||||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  37352499 cgttcaaatgaaacatgcatgagcgagagtat 37352468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 6 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 32590436 - 32590100
Alignment:
Q  6 ttctgtgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 105  Q
    |||||| |||||| ||||||| |||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  32590436 ttctgtacttgtggattcaaagtttctaagaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatt 32590337  T
Q  106 cgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatata 205  Q
    ||||| |||| ||||| ||| ||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  32590336 cgtggggtcatgcctttggccgactaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgtttaaaactcta-ctttcttctactttcaaagctatata 32590238  T
Q  206 caaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttg-aaagcaaacctgagcaac 303  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  32590237 caaatcattttctttctattttgataatgacaatgcctgaaacgaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaac 32590138  T
Q  304 agggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagtgtat 341  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  32590137 agggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtat 32590100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 28953946 - 28953606
Alignment:
Q  1 gaagtttctgtgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgt 100  Q
    |||| |||||| |||||||||||||| |||| | ||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28953946 gaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagagctgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgt 28953847  T
Q  101 gaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactctatttttcttctactttcaaagc 199  Q
     |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28953846 aaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactcta-ttttcttctactttcaaagc 28953748  T
Q  200 tatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctatttt--gaaagcaaacct 296  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||    
T  28953747 tatatacaaaacattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgggaattgaaaactttttgtctatttttgaaaagcaaacct 28953648  T
Q  297 gagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagtgt 339  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||    
T  28953647 gagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgt 28953606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 11 - 341
Target Start/End: Original strand, 37760987 - 37761320
Alignment:
Q  11 tgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 110  Q
    |||||| ||||||||| |||| |||| |||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  37760987 tgcttgcgaattcaaagtttctaggagatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgcgg 37761086  T
Q  111 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaa 209  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37761087 agtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaa 37761185  T
Q  210 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctatttt--gaaagcaaacctgagcaacagg 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||    
T  37761186 acattttctttctattttgataatgataatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctatttttgaaaagcaaacctgagcaacagg 37761285  T
Q  307 gtacattcaaacgaaacatgcataagcgagtgtat 341  Q
    | ||||||||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  37761286 gcacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtat 37761320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 18 - 329
Target Start/End: Original strand, 43084270 - 43084583
Alignment:
Q  18 gaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacg 117  Q
    ||||||||| ||| | ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  43084270 gaattcaaagttttcgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatg 43084369  T
Q  118 ccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactctatttttcttctactttcaaagctatatac-aaaacattt 215  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| ||||||| |||| ||||    
T  43084370 cctttggctgaccaccactcttatgcatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactcta-ttttcttctattttcaaagttatatacaaaaatattt 43084468  T
Q  216 tctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttg-aaagcaaacctgagcaacagggtacattc 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  43084469 tctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaagttgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattc 43084568  T
Q  315 aaacgaaacatgcat 329  Q
    ||| |||||||||||    
T  43084569 aaatgaaacatgcat 43084583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 12 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 13180944 - 13180617
Alignment:
Q  12 gcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 110  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13180944 gcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 13180845  T
Q  111 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaa 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13180844 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactccatttttcttctactttcaaagctatatacaaa 13180745  T
Q  210 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttg-aaagcaaacctgagcaacagggt 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||||     ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13180744 acattttctttctattttgataatgataatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtttt-----ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 13180650  T
Q  309 acattcaaacgaaacatgcataagcgagtgtat 341  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  13180649 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtat 13180617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 13 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 8659625 - 8659296
Alignment:
Q  13 cttgtgaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 112  Q
    |||||||||||||| ||||  ||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  8659625 cttgtgaattcaaagtttcg-ggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattcgccaagctttgtgaatccgtggag 8659527  T
Q  113 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaac 211  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8659526 tcacgcctttggctgaccaccactcttatacatcaagttgagcctttgtttttgtttgaaaactcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaaac 8659428  T
Q  212 attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttg-aaagcaaacctgagcaacagggta 309  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8659427 attttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtttattttgaaaagcaaacctgagcaacagggta 8659328  T
Q  310 cattcaaacgaaacatgcataagcgagtgtat 341  Q
    || ||||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  8659327 caatcaaatgaaacatgcatgagcgagagtat 8659296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 13 - 341
Target Start/End: Original strand, 11329644 - 11329976
Alignment:
Q  13 cttgtgaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 112  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11329644 cttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 11329743  T
Q  113 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttg-tttgaaactctatttttcttctactttcaaagct--atatacaaa 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||     
T  11329744 tcacgccttcggctgaccaccactctcatacatcaatttgagcctttgcttttgttttaaaactcta-ttttcttctactttcaaagctaaatatacaat 11329842  T
Q  210 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttg-aaagcaaacctgagcaacaggg 307  Q
      |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  11329843 ttattttccttctattttgataatgataatgcttgaaacaaacatttttaaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacaggg 11329942  T
Q  308 tacattcaaacgaaacatgcataagcgagtgtat 341  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  11329943 tacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtat 11329976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 33 - 341
Target Start/End: Original strand, 25206304 - 25206621
Alignment:
Q  33 aggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgacca 131  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25206304 aggaaatgtagtgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgacca 25206403  T
Q  132 ccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac--aaaacattttctttctattttga 229  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||    
T  25206404 ccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctattttctttttactttcaaagctatgtacaaaaaacattttctttctattttga 25206503  T
Q  230 taatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa-----ctttttgtctattttgaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaac 323  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||      |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25206504 taatgacaaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtttttttttgtctattttgaaagcaaacctgaacaacagggtacattcaaacgaaac 25206603  T
Q  324 atgcataagcgagtgtat 341  Q
    |||||| |||||| ||||    
T  25206604 atgcatgagcgagcgtat 25206621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 33 - 341
Target Start/End: Original strand, 25270460 - 25270777
Alignment:
Q  33 aggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgacca 131  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25270460 aggaaatgtagtgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgacca 25270559  T
Q  132 ccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac--aaaacattttctttctattttga 229  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||    
T  25270560 ccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctattttctttttactttcaaagctatgtacaaaaaacattttctttctattttga 25270659  T
Q  230 taatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa-----ctttttgtctattttgaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaac 323  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||      |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25270660 taatgacaaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtttttttttgtctattttgaaagcaaacctgaacaacagggtacattcaaacgaaac 25270759  T
Q  324 atgcataagcgagtgtat 341  Q
    |||||| |||||| ||||    
T  25270760 atgcatgagcgagcgtat 25270777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 11 - 341
Target Start/End: Original strand, 31437469 - 31437794
Alignment:
Q  11 tgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 110  Q
    |||||| ||||||||| |||| |||| |||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  31437469 tgcttgcgaattcaaagtttctaggagatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 31437568  T
Q  111 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||  || |||||||||||||||||||||||    
T  31437569 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatctatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttcaaagctatatacaaaa 31437668  T
Q  211 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaagcaaacctgagcaacagggtac 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||     |||  |||||||||||||||||||||||||    
T  31437669 cattttctttctattttgataatgataatgctcgaaacaaacattttgaaaattgaaaaagtttt-----tttgaaaagcaaacctgagcaacagggtac 31437763  T
Q  311 attcaaacgaaacatgcataagcgagtgtat 341  Q
    ||||||| || |||||||| |||||| ||||    
T  31437764 attcaaatgagacatgcatgagcgagagtat 31437794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 11 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 22993272 - 22992950
Alignment:
Q  11 tgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 110  Q
    |||||| ||||||||| ||| ||||||||| |  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22993272 tgcttgcgaattcaaagttttcaggaaatgtatcgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 22993173  T
Q  111 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  || |||||||||||||||||||||||    
T  22993172 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttcaaagctatatacaaaa 22993073  T
Q  211 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaagcaaacctgagcaacagggtac 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||  ||||     |||  |||||||||||||||||||||||||    
T  22993072 cattttctttctattttgataatgatgatgctcgaaacaagcattttgaaaattgaaaaagtttt-----tttgaaaagcaaacctgagcaacagggtac 22992978  T
Q  311 attcaaacgaaacatgcataagcgagtgt 339  Q
    ||||||| | ||||||||| |||||||||    
T  22992977 attcaaatg-aacatgcatgagcgagtgt 22992950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 11 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 15652914 - 15652586
Alignment:
Q  11 tgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 110  Q
    |||||| ||||||||| |||| ||||||||   ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15652914 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattgctgtgttcaatgtaccaccaactaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 15652815  T
Q  111 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  || |||||||||||||||||||||||    
T  15652814 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttcaaagctatatacaaaa 15652715  T
Q  211 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattg-aaaactttttgtctattttgaaagcaaacctgagcaacagggta 309  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||| | |      ||||||||||||||||||||||||    
T  15652714 cattttctttctattttgataatgataatgctcgaaacaaacattttgaaaattgaaaaagttttttttttaaaaaaaagcaaacctgagcaacagggta 15652615  T
Q  310 cattcaaacgaaacatgcataagcgagtgt 339  Q
    |||||||| | ||||||||| |||||||||    
T  15652614 cattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgt 15652586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 18 - 341
Target Start/End: Original strand, 23897886 - 23898205
Alignment:
Q  18 gaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacg 117  Q
    ||||||||| |||| |||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||    
T  23897886 gaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaattcatggagtcacg 23897985  T
Q  118 ccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac----aaaacat 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  || ||||||||||||||| |||    |||||||    
T  23897986 ccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctattttctttttactttcaaagctatgtacaaaaaaaacat 23898085  T
Q  214 tttctttctattttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaagcaaacctgagcaacagggtacat 312  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||           ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23898086 tttctttctattttaataatgacaaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaa---------agttttgaaagcaaacctgagcaacagggtacat 23898176  T
Q  313 tcaaacgaaacatgcataagcgagtgtat 341  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23898177 tcaaacgaaacatgcatgagcgagtgtat 23898205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 11 - 339
Target Start/End: Original strand, 33783492 - 33783817
Alignment:
Q  11 tgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 110  Q
    |||||| ||||||||| |||| |||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  33783492 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacccataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 33783591  T
Q  111 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac-aaa 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||| ||| |||    
T  33783592 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctattttctttttactttcaaagttatgtacaaaa 33783691  T
Q  210 acattttctttcta--ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaagcaaacctgagcaacagg 306  Q
    |||||||| |||||  |||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||  |||      |||  |||||||||| ||||||||||    
T  33783692 acattttccttctattttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttt------tttgaaaagcaaaccggagcaacagg 33783785  T
Q  307 gtacattcaaacgaaacatgcataagcgagtgt 339  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  33783786 gtacattcaaacg-aacatgcatgagcgagtgt 33783817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 18 - 339
Target Start/End: Original strand, 24975861 - 24976178
Alignment:
Q  18 gaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacg 117  Q
    ||||||||| |||| |||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24975861 gaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgttgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacg 24975960  T
Q  118 ccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac-aaaacatttt 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  |||  || ||||||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  24975961 ccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagtctgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttcaaagttatgtacaaaaacatttt 24976060  T
Q  217 ctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaatt-gaaaactttttgtctattttgaaagcaaacctgagcaacagggtacatt 313  Q
    | ||||| |||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||         ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24976061 ccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattggaaaagtttttg--------aaaagcaaacctgagcaacagggtacatt 24976152  T
Q  314 caaacgaaacatgcataagcgagtgt 339  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||    
T  24976153 caaacgaaatatgcatgagcgagtgt 24976178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 11 - 339
Target Start/End: Original strand, 24608250 - 24608576
Alignment:
Q  11 tgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtg 109  Q
    |||||| ||||||||| |||| |||||||| | |||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24608250 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgttgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtg 24608349  T
Q  110 gagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac-aa 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||  || ||||||||||| ||| ||| ||    
T  24608350 gagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcatgtgcttttgtttgaaactccgctttctttttactttcaaagttatgtacaaa 24608449  T
Q  209 aacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaagcaaacctgagcaacagg 306  Q
    ||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||  |||      |||  |||||||||||||||||||||    
T  24608450 aacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttt------tttgaaaagcaaacctgagcaacagg 24608543  T
Q  307 gtacattcaaacgaaacatgcataagcgagtgt 339  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||| |||||    
T  24608544 gtacattcaaacaaaacatgcatgagcaagtgt 24608576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 12 - 341
Target Start/End: Original strand, 30940642 - 30940967
Alignment:
Q  12 gcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 110  Q
    ||||| ||||||||| |||| |||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||    
T  30940642 gcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagcttcgtaaatccgtgg 30940741  T
Q  111 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac-aaa 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||  |||  || ||||||||||| ||| ||| |||    
T  30940742 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatctatttgagcctgtgcttttgtttgaaattctgctttctttttactttcaaagttatgtacaaaa 30940841  T
Q  210 acattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaagcaaacctgagcaacaggg 307  Q
    |||||||| ||||| |||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||       |||  ||||||||||||||||||||||    
T  30940842 acattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtt-------tttgaaaagcaaacctgagcaacaggg 30940934  T
Q  308 tacattcaaacgaaacatgcataagcgagtgtat 341  Q
    |||||||||| | ||||||||| |||||||||||    
T  30940935 tacattcaaaag-aacatgcatgagcgagtgtat 30940967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 284; Significance: 1e-159; HSPs: 41)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 19 - 341
Target Start/End: Original strand, 12661543 - 12661866
Alignment:
Q  19 aattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgc 118  Q
    |||||||| |||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12661543 aattcaaagtttctaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgc 12661642  T
Q  119 cttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttct 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12661643 cttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttct 12661742  T
Q  219 ttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttg-aaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaa 317  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12661743 ttctattttgataatgataatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaa 12661842  T
Q  318 cgaaacatgcataagcgagtgtat 341  Q
     ||||||||||| |||||| ||||    
T  12661843 tgaaacatgcatgagcgagagtat 12661866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 11 - 341
Target Start/End: Original strand, 37383673 - 37384005
Alignment:
Q  11 tgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtg 109  Q
    |||||| ||||||||| ||| ||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37383673 tgcttgcgaattcaaagttttcaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtg 37383772  T
Q  110 gagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaa 209  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37383773 gagtcacgcctccggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaa 37383872  T
Q  210 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttg-aaagcaaacctgagcaacagggt 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  37383873 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 37383972  T
Q  309 acattcaaacgaaacatgcataagcgagtgtat 341  Q
    |||| |||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  37383973 acatccaaatgaaacatgcatgagcgagagtat 37384005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 34 - 341
Target Start/End: Original strand, 39896088 - 39896396
Alignment:
Q  34 ggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccacc 133  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  39896088 ggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccgagctttgtgaatccgtggagtcacgcctccggctgaccacc 39896187  T
Q  134 actcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataat 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39896188 actcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataat 39896287  T
Q  234 gacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttg-aaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcataag 332  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  39896288 gacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgag 39896387  T
Q  333 cgagtgtat 341  Q
    |||| ||||    
T  39896388 cgagagtat 39896396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 12710857 - 12710515
Alignment:
Q  1 gaagtttctgtgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgt 100  Q
    |||| |||||| |||||||||||||| |||| | ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12710857 gaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgt 12710758  T
Q  101 gaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagct 200  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  12710757 gaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaattcta-ttttcttctactttcaaagct 12710659  T
Q  201 atatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca--ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttg-aaagcaaacctg 297  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12710658 atatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctg 12710559  T
Q  298 agcaacagggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagtgtat 341  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  12710558 agcaacagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagggtat 12710515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 13 - 341
Target Start/End: Original strand, 34867681 - 34868010
Alignment:
Q  13 cttgtgaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 112  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  34867681 cttgcgaattcaaagtttccaggaaatgaaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtagag 34867780  T
Q  113 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaaca 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  34867781 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgtttaaaactcta-ttttcttctattttcaaagctatatacaaaaca 34867879  T
Q  213 ttttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttg-aaagcaaacctgagcaacagggtac 310  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  34867880 ttttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtac 34867979  T
Q  311 attcaaacgaaacatgcataagcgagtgtat 341  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  34867980 attcaaatgaaacatgcatgagcgagagtat 34868010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 12 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 9344232 - 9343901
Alignment:
Q  12 gcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 111  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9344232 gcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgga 9344133  T
Q  112 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaac 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  9344132 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctattttctttctactttcaaagctatatacaaaac 9344033  T
Q  212 attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttg-aaagcaaacctgagcaacagggta 309  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9344032 attttctttccattttaataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtccattttgaaaagcaaacctgagcaacagggta 9343933  T
Q  310 cattcaaacgaaacatgcataagcgagtgtat 341  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  9343932 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtat 9343901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 12 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 37946111 - 37945791
Alignment:
Q  12 gcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 111  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37946111 gcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatataccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 37946012  T
Q  112 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactcta-tttttcttctactttcaaagctatatacaaa 209  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37946011 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttttcttctactttcaaagctatatacaaa 37945912  T
Q  210 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttg-aaagcaaacctgagcaacagggt 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  37945911 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 37945812  T
Q  309 acattcaaacgaaacatgcat 329  Q
    ||||||||| |||||||||||    
T  37945811 acattcaaatgaaacatgcat 37945791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 12 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 39046067 - 39045736
Alignment:
Q  12 gcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 111  Q
    ||||| ||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  39046067 gcttgcgaattcaaagtttccagaaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccactaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgga 39045968  T
Q  112 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaac 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  39045967 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctattttctttctactttcaaagctatatacaaaac 39045868  T
Q  212 attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttg-aaagcaaacctgagcaacagggta 309  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  39045867 attttctttccattttaataatgacaatacttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggta 39045768  T
Q  310 cattcaaacgaaacatgcataagcgagtgtat 341  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  39045767 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtat 39045736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 6 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 21697427 - 21697087
Alignment:
Q  6 ttctgtgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 105  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21697427 ttctgtgcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatc 21697328  T
Q  106 cgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatata 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |  | |||||||||||||||| ||    
T  21697327 cgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctactatcttcctactttcaaagctatgta 21697228  T
Q  206 c--aaaacattttctttctattttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa--ctttttgtctattttgaaagcaaacctgagc 300  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21697227 caaaaaacattttctttctattttgataatgacaaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctattttgaaagcaaacctgagc 21697128  T
Q  301 aacagggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagtgtat 341  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21697127 aacaaggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagtgtat 21697087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 12 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 254897 - 254578
Alignment:
Q  12 gcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 111  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  254897 gcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 254798  T
Q  112 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactcta-tttttcttctactttcaaagctatatacaaa 209  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  254797 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttttcttctactttcaaagctatatacaaa 254698  T
Q  210 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttg-aaagcaaacctgagcaacagggt 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  254697 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac-ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 254599  T
Q  309 acattcaaacgaaacatgcat 329  Q
    ||||||||| |||||||||||    
T  254598 acattcaaatgaaacatgcat 254578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 11 - 329
Target Start/End: Original strand, 27809697 - 27810019
Alignment:
Q  11 tgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 110  Q
    |||||| ||||||||| |||| ||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27809697 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 27809796  T
Q  111 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactcta--tttttcttctactttcaaagctatataca 207  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27809797 agtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttttcttctactttcaaagctatataca 27809896  T
Q  208 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttg-aaagcaaacctgagcaacagg 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27809897 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 27809996  T
Q  307 gtacattcaaacgaaacatgcat 329  Q
     |||||||||| |||||||||||    
T  27809997 ttacattcaaatgaaacatgcat 27810019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 12 - 341
Target Start/End: Original strand, 27122522 - 27122851
Alignment:
Q  12 gcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 111  Q
    ||||| ||||||||| |||| |||| |||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27122522 gcttgcgaattcaaagtttctaggagatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgga 27122621  T
Q  112 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaac 211  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27122622 gtcacgccttcggctgaccacccctcttatacatcaaattgagcctttgcttttgtttaaaactcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaaac 27122720  T
Q  212 attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttga-aagcaaacctgagcaacagggtac 310  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27122721 attttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgagaagcaaacctgagcaacagggtac 27122820  T
Q  311 attcaaacgaaacatgcataagcgagtgtat 341  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  27122821 attcaaatgaaacatgcatgagcgagagtat 27122851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 12 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 13930791 - 13930458
Alignment:
Q  12 gcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 111  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13930791 gcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 13930692  T
Q  112 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactctatttttcttctactttcaaagctatatac-aaa 209  Q
    |||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  13930691 gtcgtgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactccatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 13930592  T
Q  210 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttg-aaagcaaacctgagcaacaggg 307  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13930591 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacaggg 13930492  T
Q  308 tacattcaaacgaaacatgcataagcgagtgtat 341  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  13930491 tacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtat 13930458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 34 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 22922368 - 22922057
Alignment:
Q  34 ggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccacc 133  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22922368 ggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccacc 22922269  T
Q  134 actcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactctattt--ttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgat 230  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22922268 actcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaattctattttgttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgat 22922169  T
Q  231 aatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttg-aaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcat 329  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  22922168 aatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtaccttcaaatgaaacatgcat 22922069  T
Q  330 aagcgagtgtat 341  Q
     |||||| ||||    
T  22922068 gagcgagagtat 22922057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 11 - 341
Target Start/End: Original strand, 34160840 - 34161174
Alignment:
Q  11 tgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 110  Q
    |||||| ||||||||| ||||  |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  34160840 tgcttgcgaattcaaagtttctgggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 34160939  T
Q  111 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  || |||||||||||||||||||||||    
T  34160940 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttcaaagctatatacaaaa 34161039  T
Q  211 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca---ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttg-aaagcaaacctgagcaacagg 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  34161040 cattttctttctattttgataatgataatgcttgaaacaaacatttttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 34161139  T
Q  307 gtacattcaaacgaaacatgcataagcgagtgtat 341  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  34161140 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtat 34161174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 243; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 12 - 336
Target Start/End: Original strand, 31882284 - 31882609
Alignment:
Q  12 gcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 111  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||| | ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31882284 gcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgga 31882383  T
Q  112 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaac 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31882384 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaattcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaaac 31882482  T
Q  212 attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttg-aaagcaaacctgagcaacagggta 309  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||| |||||    
T  31882483 attttctttctattttgataatggcaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattaaaaactttttttctattttgaaaagcaaacttgagcaacggggta 31882582  T
Q  310 cattcaaacgaaacatgcataagcgag 336  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||    
T  31882583 cattcaaatgaaacatgcatgagcgag 31882609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 6 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 16823588 - 16823251
Alignment:
Q  6 ttctgtgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 105  Q
    |||||| |||||| ||||||| || |||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16823588 ttctgtacttgtggattcaaagttcccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 16823489  T
Q  106 cgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatata 205  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||||||    
T  16823488 cgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagactgtgcttttgtttgaaactctgttttctttttactttcaaagctatata 16823389  T
Q  206 c-aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttg-aaagcaaacctgagcaac 303  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  16823388 caaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacccgagcaac 16823289  T
Q  304 agggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagtgtat 341  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  16823288 agggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagggtat 16823251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 6 - 341
Target Start/End: Original strand, 16897892 - 16898229
Alignment:
Q  6 ttctgtgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 105  Q
    |||||| |||||| ||||||| || |||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16897892 ttctgtacttgtggattcaaagttcccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 16897991  T
Q  106 cgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatata 205  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||||||    
T  16897992 cgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagactgtgcttttgtttgaaactctgttttctttttactttcaaagctatata 16898091  T
Q  206 c-aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttg-aaagcaaacctgagcaac 303  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  16898092 caaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacccgagcaac 16898191  T
Q  304 agggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagtgtat 341  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  16898192 agggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagggtat 16898229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 12 - 329
Target Start/End: Original strand, 16167475 - 16167794
Alignment:
Q  12 gcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 111  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16167475 gcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 16167574  T
Q  112 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactctatttttcttctactttcaaagctatatac-aaa 209  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  16167575 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactcta-ttttcttctactttcaaagttatatacaaaa 16167673  T
Q  210 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttg-aaagcaaacctgagcaacagggt 308  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16167674 atattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 16167773  T
Q  309 acattcaaacgaaacatgcat 329  Q
    ||||||||| |||||||||||    
T  16167774 acattcaaatgaaacatgcat 16167794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 11 - 341
Target Start/End: Original strand, 32055798 - 32056129
Alignment:
Q  11 tgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 110  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  32055798 tgcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 32055897  T
Q  111 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 210  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32055898 agtcacgccttcggctgactaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgtttaaaattcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 32055996  T
Q  211 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttg-aaagcaaacctgagcaacagggt 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  32055997 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaactgaaaactttttgtttattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 32056096  T
Q  309 acattcaaacgaaacatgcataagcgagtgtat 341  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  32056097 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtat 32056129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 11 - 329
Target Start/End: Original strand, 12592806 - 12593130
Alignment:
Q  11 tgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 110  Q
    |||||| ||||||||| |||| ||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12592806 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 12592905  T
Q  111 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaa 209  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12592906 agtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactccatttttcttctactttcaaagctatatacaaa 12593005  T
Q  210 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca----ttttgaaaattgaaaactttttgtctatttt-gaaagcaaacctgagcaaca 304  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12593006 acattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttttttgaaaattgaaaactttttgtctattttggaaagcaaacctgagcaaca 12593105  T
Q  305 gggtacattcaaacgaaacatgcat 329  Q
    ||||||||||||| |||||||||||    
T  12593106 gggtacattcaaatgaaacatgcat 12593130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 34 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 19410709 - 19410398
Alignment:
Q  34 ggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccacc 133  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19410709 ggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccacc 19410610  T
Q  134 actcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactctattt--ttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgat 230  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19410609 actcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaattctattttgttcttctactttcaaagctatacacaaaacattttctttctattttgat 19410510  T
Q  231 aatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttg-aaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcat 329  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||    
T  19410509 aatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacaggataccttcaaatgaaacatgcat 19410410  T
Q  330 aagcgagtgtat 341  Q
     |||||| ||||    
T  19410409 gagcgagagtat 19410398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 12 - 341
Target Start/End: Original strand, 37931369 - 37931707
Alignment:
Q  12 gcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 111  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37931369 gcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 37931468  T
Q  112 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactcta------tttttcttctactttcaaagctatat 204  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||      ||||||||||||||||||||||||||    
T  37931469 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttttttttcttctactttcaaagctatat 37931568  T
Q  205 acaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttg-aaagcaaacctgagcaa 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  37931569 acaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtttattttgaaaagcaaacctgagcaa 37931668  T
Q  303 cagggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagtgtat 341  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  37931669 cagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagagtat 37931707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 11629440 - 11629101
Alignment:
Q  1 gaagtttctgtgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgt 100  Q
    |||| |||||| |||||||||||||| |||   ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11629440 gaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgt 11629341  T
Q  101 gaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagct 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||| || ||||||||||    
T  11629340 gaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttaaaactcta-ttttcttttattttcaaagct 11629242  T
Q  201 atatac-aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttg-aaagcaaacctg 297  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||    
T  11629241 atatacaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaataaacatttttgaaaattgaaaactctttgtctattttgaaaaacaaacctg 11629142  T
Q  298 agcaacagggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagtgt 339  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||    
T  11629141 agcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgt 11629101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 339
Target Start/End: Original strand, 40239495 - 40239834
Alignment:
Q  1 gaagtttctgtgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgt 100  Q
    |||| |||||| |||||||||||||| |||| | ||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40239495 gaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgt 40239594  T
Q  101 gaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactctatttttcttctactttcaaagc 199  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||     
T  40239595 gaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactcta-ttttcttctactttcaaagt 40239693  T
Q  200 tatatac-aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttg-aaagcaaacctg 297  Q
    ||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  40239694 tatatacaaaaatattttctttccattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctg 40239793  T
Q  298 agcaacagggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagtgt 339  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||    
T  40239794 agcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgt 40239834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 11 - 329
Target Start/End: Original strand, 3788490 - 3788809
Alignment:
Q  11 tgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 110  Q
    |||||| ||||||||| |||| |||| |||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||    
T  3788490 tgcttgcgaattcaaagtttctaggagatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttataaatccgcgg 3788589  T
Q  111 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaa 209  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3788590 agtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaa 3788688  T
Q  210 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttg-aaagcaaacctgagcaacagggt 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3788689 acattttctttctattttgataatgataatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 3788788  T
Q  309 acattcaaacgaaacatgcat 329  Q
    ||||||||| |||||||||||    
T  3788789 acattcaaatgaaacatgcat 3788809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 37680149 - 37679805
Alignment:
Q  1 gaagtttctgtgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttg 99  Q
    |||| |||||| |||||||||||||| ||| | ||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  37680149 gaagcttctgtacttgtgaattcaaagttttcgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttg 37680050  T
Q  100 tgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagc 199  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  37680049 tgaatccgtggagtcacgcctttggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgtttaaaactcta-ttttcttctactttcaaagc 37679951  T
Q  200 tatatac-aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca--ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttg-aaagcaaacc 295  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||    
T  37679950 tatatacaaaaacattttctttctattttgataaagacaatgcttgaaacaaacattttttgaaaattgaaatttttttgtctattttgaaaagcaaacc 37679851  T
Q  296 tgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagtgtat 341  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  37679850 tgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtat 37679805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 37695414 - 37695070
Alignment:
Q  1 gaagtttctgtgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttg 99  Q
    |||| |||||| |||||||||||||| ||| | ||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  37695414 gaagcttctgtacttgtgaattcaaagttttcgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttg 37695315  T
Q  100 tgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagc 199  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  37695314 tgaatccgtggagtcacgcctttggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgtttaaaactcta-ttttcttctactttcaaagc 37695216  T
Q  200 tatatac-aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca--ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttg-aaagcaaacc 295  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||    
T  37695215 tatatacaaaaacattttctttctattttgataaagacaatgcttgaaacaaacattttttgaaaattgaaatttttttgtctattttgaaaagcaaacc 37695116  T
Q  296 tgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagtgtat 341  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  37695115 tgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtat 37695070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 21671429 - 21671084
Alignment:
Q  1 gaagtttctgtgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttg 99  Q
    |||| |||||| |||||||||||||| ||| | ||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21671429 gaagcttctgtacttgtgaattcaaagttttcgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttg 21671330  T
Q  100 tgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagc 199  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21671329 tgaatccgtggagtcacgcctttggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgtttaaaactcta-ttttcttctactttcaaagc 21671231  T
Q  200 tatatac-aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca--ttttgaaaattgaaa-actttttgtctattttg-aaagcaaac 294  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||    
T  21671230 tatatacaaaaacattttctttctattttgataaagacaatgcttgaaacaaacattttttgaaaattgaaattttttttgtctattttgaaaagcaaac 21671131  T
Q  295 ctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagtgtat 341  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  21671130 ctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtat 21671084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 6 - 341
Target Start/End: Original strand, 27782223 - 27782560
Alignment:
Q  6 ttctgtgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 105  Q
    |||||| |||||||||||||| |||| | ||| || |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27782223 ttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 27782322  T
Q  106 cgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactctatttttcttctactttcaaagctatat 204  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||   |||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  27782323 cgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaagttgagccgttgcttttgtttgaaaactcta-ttttcttctattttcaaagctatat 27782421  T
Q  205 acaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttg-aaagcaaacctgagcaa 302  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  27782422 acaaaacattttccttccattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtttattttgaaaagcaaacctgagcaa 27782521  T
Q  303 cagggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagtgtat 341  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  27782522 cagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagtgtat 27782560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 11 - 341
Target Start/End: Original strand, 34297152 - 34297477
Alignment:
Q  11 tgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 110  Q
    |||||| ||||||||| |||| |||| |||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  34297152 tgcttgcgaattcaaagtttctaggagatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtgg 34297251  T
Q  111 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  || |||||||||||||||||||||||    
T  34297252 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttcaaagctatatacaaaa 34297351  T
Q  211 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaagcaaacctgagcaacagggtac 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||  ||||     |||  |||||||||||||||||||||||||    
T  34297352 cattttctttctattttgataatgataatgctcgaaacaaacatttcgaaaattgaaaaagtttt-----tttgaaaagcaaacctgagcaacagggtac 34297446  T
Q  311 attcaaacgaaacatgcataagcgagtgtat 341  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  34297447 attcaaatgaaacatgcatgagcgagagtat 34297477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 63 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 31868979 - 31868705
Alignment:
Q  63 accaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgct 162  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  31868979 accaccaaccaataaaattaccatttttcaagcattgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgct 31868880  T
Q  163 tttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaa 261  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  31868879 tttgtttaaaactcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaa 31868781  T
Q  262 attgaaaactttttgtctattttg-aaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcataagcgag 336  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  31868780 attgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 31868705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 9 - 341
Target Start/End: Original strand, 27396317 - 27396661
Alignment:
Q  9 tgtgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgt 108  Q
    |||||||| ||||||||| |||| |||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  27396317 tgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattgccattttccaagctttgtaaatccgt 27396416  T
Q  109 ggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac-- 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||      
T  27396417 ggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctactttctttctactttcaaagctatgtacaa 27396516  T
Q  207 aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa----------ctttttgtctattttgaaagcaaacct 296  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||           ||||||||  ||||||||||||||||    
T  27396517 aaaacattttctttctatctttataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaaaaaaaaaagttttttgtcctttttgaaagcaaacct 27396616  T
Q  297 gagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagtgtat 341  Q
     ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  27396617 aagcaacaaggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagcgtat 27396661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 19450683 - 19450351
Alignment:
Q  1 gaagtttctgtgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgt 100  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||| |||| |||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19450683 gaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattgccattttccaagctttgt 19450584  T
Q  101 gaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagct 200  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| |    
T  19450583 aaatccgtggaatcacgccttcggctgaccaccacttttatacatcaattcgagcatgtgcttttgtttgaaactctattttctctctactttcaaaggt 19450484  T
Q  201 atatac-----aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattg------aaaactttttgtctattttgaaag 289  Q
    || |||     |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||      |||| ||||||||| |||||||||    
T  19450483 atgtacaaaaaaaaacattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaaaaaaagtttttgtctgttttgaaag 19450384  T
Q  290 caaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaa 322  Q
     |||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  19450383 taaacctgagcaacaaggtacgttcaaacgaaa 19450351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 11 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 34269167 - 34268840
Alignment:
Q  11 tgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 110  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||   |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  34269167 tgcttgtgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattgttgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattctccaagctttgtaaatccgtgg 34269068  T
Q  111 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac-aaa 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||  || ||||||||||| ||| ||| |||    
T  34269067 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcatgtgcttttgtttaaaactctattttctttttactttcaaagttatgtacaaaa 34268968  T
Q  210 acattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaagcaaacctgagcaacaggg 307  Q
    |||||||| ||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||  |||      |||  ||||||||||||||||||||||    
T  34268967 acattttccttctatttttaataatgacaaatgcttgaaacaaacatcttaaaaattgaaaaagttt------tttgaaaagcaaacctgagcaacaggg 34268874  T
Q  308 tacattcaaacgaaacatgcataagcgagtgtat 341  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  34268873 tacattcaaacgaaacatgcatgagcgagtgtat 34268840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 12 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 23122818 - 23122494
Alignment:
Q  12 gcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 110  Q
    ||||| ||||||||| |||| |||||||| | ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  23122818 gcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgcaaatccgtgg 23122719  T
Q  111 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac-aaa 209  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||| ||| ||| |||    
T  23122718 agtcacaccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctgttttctttttactttcaaagttatgtacaaaa 23122619  T
Q  210 acattttctttctattttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaagcaaacctgagcaacagggt 308  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||||     |||  |||||||||||||||||||||||    
T  23122618 acattttccttctattttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtttt-----tttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 23122524  T
Q  309 acattcaaacgaaacatgcataagcgagtgt 339  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  23122523 acattcaaacg-aacatgcatgagcgagtgt 23122494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 11 - 339
Target Start/End: Original strand, 28888275 - 28888600
Alignment:
Q  11 tgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 110  Q
    |||||| ||||||||| |||| ||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  28888275 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 28888374  T
Q  111 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac-aaa 209  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||  || ||||||||||| ||| ||| |||    
T  28888375 agtcgcgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttcaaagttatgtacaaaa 28888474  T
Q  210 acattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaagcaaacctgagcaacaggg 307  Q
    |||||||| ||||| |||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||||     |||  ||||||||||||||||||||||    
T  28888475 acattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtttt-----tttgaaaagcaaacctgagcaacaggg 28888569  T
Q  308 tacattcaaacgaaacatgcataagcgagtgt 339  Q
    |||||||||| | ||||||||| |||||||||    
T  28888570 tacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgt 28888600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 11 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 27428692 - 27428367
Alignment:
Q  11 tgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 110  Q
    ||||||||| |||||| |||| |||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27428692 tgcttgtgagttcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 27428593  T
Q  111 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac-aaa 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  || ||||||||||| ||| | | |||    
T  27428592 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttaaaactctattttctttttactttcaaagttatgtgcaaaa 27428493  T
Q  210 acattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattg-aaaactttttgtctattttgaaagcaaacctgagcaacagg 306  Q
    |||||||| ||||| |||| |||||||| |||| | ||||||||||| |||||||||| |||| ||||||         |||||||||||||||||||||    
T  27428492 acattttccttctatttttaataatgacaaatgttcgaaacaaacatcttgaaaattgcaaaagtttttg--------aaaagcaaacctgagcaacagg 27428401  T
Q  307 gtacattcaaacgaaacatgcataagcgagtgtat 341  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||    
T  27428400 gtacattcaaacg-aacgtgcatgagcgagtgtat 27428367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 12 - 336
Target Start/End: Original strand, 20843909 - 20844235
Alignment:
Q  12 gcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 110  Q
    ||||| ||||||||| || | |||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20843909 gcttgcgaattcaaagttcctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 20844008  T
Q  111 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttc-aaagctatat--aca 207  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  || ||| ||| |||| ||| |  | |    
T  20844009 agtcacgccttcggctggacaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctactttctttttaccttcaaaagttatgttcaaa 20844108  T
Q  208 aaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttg-aaagcaaacctgagcaaca 304  Q
    |||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||| ||||||| ||| ||||||||||||||  ||||     ||||| |||||||||||||||||||    
T  20844109 aaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaagcatcttgaaaattgaaaaagtttt-----ttttgaaaagcaaacctgagcaaca 20844203  T
Q  305 gggtacattcaaacgaaacatgcataagcgag 336  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  20844204 gggtacattcaaacaaaacatgcatgagcgag 20844235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 211 - 341
Target Start/End: Original strand, 23116993 - 23117124
Alignment:
Q  211 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaa-gcaaacctgagcaacagggta 309  Q
    ||||||| | |||| || || |||||||||||||||  ||   ||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  23116993 cattttcctcctatcttcatcatgacaatgcttgaactaacgtttttgaccattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgggcaacagggta 23117092  T
Q  310 cattcaaacgaaacatgcataagcgagtgtat 341  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  23117093 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtat 23117124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 31887738 - 31887682
Alignment:
Q  12 gcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccacc 68  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||||||||   |||||||||||||||||||||||||    
T  31887738 gcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccacc 31887682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 282; Significance: 1e-158; HSPs: 24)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 12 - 336
Target Start/End: Original strand, 33248365 - 33248690
Alignment:
Q  12 gcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 111  Q
    ||||| ||||||||| |||| |||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33248365 gcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 33248464  T
Q  112 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaac 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33248465 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaac 33248564  T
Q  212 attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttg-aaagcaaacctgagcaacagggtac 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33248565 attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtac 33248664  T
Q  311 attcaaacgaaacatgcataagcgag 336  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||    
T  33248665 attcaaatgaaacatgcatgagcgag 33248690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 11 - 341
Target Start/End: Original strand, 18796704 - 18797037
Alignment:
Q  11 tgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtg 109  Q
    |||||| ||||||||| ||| ||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  18796704 tgcttgcgaattcaaagttttcaggaaatgtaatgattaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttataaatccgtg 18796803  T
Q  110 gagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac-aa 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  18796804 gagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaa 18796903  T
Q  209 aacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttg-aaagcaaacctgagcaacaggg 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18796904 aacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacaggg 18797003  T
Q  308 tacattcaaacgaaacatgcataagcgagtgtat 341  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  18797004 tacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtat 18797037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 12 - 341
Target Start/End: Original strand, 44566979 - 44567313
Alignment:
Q  12 gcttgtgaattcaaaatttcc-aggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 110  Q
    ||||| ||||||||| ||||| |||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  44566979 gcttgcgaattcaaagtttcccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 44567078  T
Q  111 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44567079 agtcacgccttcggctgaccaccactctcatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttaaaactcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 44567177  T
Q  211 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca----ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttg-aaagcaaacctgagcaacag 305  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  44567178 cattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 44567277  T
Q  306 ggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagtgtat 341  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  44567278 ggtacattcaaatgaaacatgcataagcgagagtat 44567313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 11 - 341
Target Start/End: Original strand, 9360620 - 9360951
Alignment:
Q  11 tgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 110  Q
    |||||| ||||||||| |||| |||| |||   |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9360620 tgcttgcgaattcaaagtttctaggagatgtcatgattactgtgtccaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 9360719  T
Q  111 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaa 209  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9360720 agtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaagttgagcctttgcttttgtttgaaaactcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaa 9360818  T
Q  210 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttg-aaagcaaacctgagcaacagggt 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9360819 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 9360918  T
Q  309 acattcaaacgaaacatgcataagcgagtgtat 341  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  9360919 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtat 9360951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 7 - 341
Target Start/End: Original strand, 29835317 - 29835652
Alignment:
Q  7 tctgtgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 106  Q
    ||||| |||||||||||||| ||| | ||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  29835317 tctgtacttgtgaattcaaagttttcgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatcc 29835416  T
Q  107 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactctatttttcttctactttcaaagctatata 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  29835417 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgtttgaaaactcca-ttttcttctactttcaaagctatata 29835515  T
Q  206 caaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttg-aaagcaaacctgagcaaca 304  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  29835516 caaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaaca 29835615  T
Q  305 gggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagtgtat 341  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  29835616 gggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtat 29835652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 11 - 341
Target Start/End: Original strand, 33264729 - 33265060
Alignment:
Q  11 tgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 110  Q
    |||||| ||||||||| || | ||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  33264729 tgcttgcgaattcaaagttcctaggaaatgccatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 33264828  T
Q  111 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 210  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  33264829 agtcacgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaattcta-ttttcttctactttcaaagctatatacgaaa 33264927  T
Q  211 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttg-aaagcaaacctgagcaacagggt 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  33264928 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacgaacatttttgaaaattaaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 33265027  T
Q  309 acattcaaacgaaacatgcataagcgagtgtat 341  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  33265028 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtat 33265060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 243; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 6 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 12086947 - 12086609
Alignment:
Q  6 ttctgtgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaat 104  Q
    |||||| |||||||||||||| |||| | ||| || |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12086947 ttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtgaat 12086848  T
Q  105 ccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatat 204  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  12086847 ccgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcttgtgctgttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctgtat 12086748  T
Q  205 acaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttg-aaagcaaacctgagcaa 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||    
T  12086747 acaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctgttttgaaaagcaagcctgagcaa 12086648  T
Q  303 cagggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagtgtat 341  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  12086647 cagggtacgttcaaatgaaacatgcatgagcgagagtat 12086609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 243; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 1 - 341
Target Start/End: Original strand, 19680436 - 19680777
Alignment:
Q  1 gaagtttctgtgcttgtgaattcaaa-atttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttg 99  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||  |||   ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19680436 gaagcttctgtacttgtgaattcaaagttttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttg 19680535  T
Q  100 tgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagc 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||    
T  19680536 tgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgtttaaaactcta-ttttcttctattttcaaagc 19680634  T
Q  200 tatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttg-aaagcaaacctga 298  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  19680635 tatatacaaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctga 19680734  T
Q  299 gcaacagggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagtgtat 341  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| ||||    
T  19680735 gcaacagggtacattcaaatgaaacatgcacgagcgagagtat 19680777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 243; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 6 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 28356176 - 28355848
Alignment:
Q  6 ttctgtgcttgtgaattcaaa-atttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaat 104  Q
    |||||| ||||||||||||||  |||   ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28356176 ttctgtacttgtgaattcaaagttttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaat 28356077  T
Q  105 ccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa---ctctatttttcttctactttcaaagcta 201  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||   || | |||||||||||||||||||||||    
T  28356076 ccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaattctatttttttcttctactttcaaagcta 28355977  T
Q  202 tatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttg-aaagcaaacctgagc 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  28355976 tatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagc 28355877  T
Q  301 aacagggtacattcaaacgaaacatgcat 329  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28355876 aacagggtacattcaaatgaaacatgcat 28355848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 34 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 31484067 - 31483756
Alignment:
Q  34 ggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccacc 133  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31484067 ggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccacc 31483968  T
Q  134 actcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactctattt--ttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgat 230  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31483967 actcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaattctattttgttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgat 31483868  T
Q  231 aatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttg-aaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcat 329  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||    
T  31483867 aatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacaaggtaccttcaaatgaaacatgcat 31483768  T
Q  330 aagcgagtgtat 341  Q
     |||||| ||||    
T  31483767 gagcgagagtat 31483756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 12 - 341
Target Start/End: Original strand, 15773573 - 15773904
Alignment:
Q  12 gcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 111  Q
    ||||| ||||||||| |||| |||| |||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15773573 gcttgcgaattcaaagtttctaggagatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgga 15773672  T
Q  112 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaac 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  || |||||||| |||||||||||||||    
T  15773673 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacgtcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttcagagctatatacaaaac 15773772  T
Q  212 attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttg-aaagcaaacctgagcaacagggta 309  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15773773 attttctttctcttttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggta 15773872  T
Q  310 cattcaaacgaaacatgcataagcgagtgtat 341  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  15773873 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtat 15773904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 12 - 329
Target Start/End: Original strand, 31360527 - 31360846
Alignment:
Q  12 gcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 111  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||| || | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31360527 gcttgcgaattcaaagtttccaggaagtgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 31360626  T
Q  112 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactctatttttcttctactttcaaagctatatac-aaa 209  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  31360627 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactcta-ttttcttctactttcaaagttatatacaaaa 31360725  T
Q  210 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttg-aaagcaaacctgagcaacagggt 308  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31360726 atattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 31360825  T
Q  309 acattcaaacgaaacatgcat 329  Q
    ||||||||| |||||||||||    
T  31360826 acattcaaatgaaacatgcat 31360846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 11 - 341
Target Start/End: Original strand, 18715478 - 18715812
Alignment:
Q  11 tgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 110  Q
    |||||| ||||||||| |||| ||||||||   |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18715478 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgatcactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 18715577  T
Q  111 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 210  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18715578 agtcacgccttcggctgaccacccctcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgtttaaaactcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 18715676  T
Q  211 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt----gaaaattgaaaactttttgtctattttg-aaagcaaacctgagcaacag 305  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18715677 cattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttttgaaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 18715776  T
Q  306 ggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagtgtat 341  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  18715777 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtat 18715812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 19202592 - 19202261
Alignment:
Q  1 gaagtttctgtgcttgtgaattcaaaat-ttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttg 99  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| | ||   ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19202592 gaagtttctgtacttgtgaattcaaagtcttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttg 19202493  T
Q  100 tgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagc 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||           ||||||    
T  19202492 tgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgtttaaaactctatttt-----------caaagc 19202404  T
Q  200 tatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttg-aaagcaaacctga 298  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  19202403 tatatacaaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctga 19202304  T
Q  299 gcaacagggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagtgtat 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19202303 gcaacagggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagagtat 19202261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 19 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 21342381 - 21342056
Alignment:
Q  19 aattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacg 117  Q
    |||||||| |||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21342381 aattcaaagtttctaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacg 21342282  T
Q  118 ccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttc 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||  |||  || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21342281 ccttcggctgaccaccactcttatacatcgatttgagcctgtgcttctgtttgaaactctgctttctttttactttcaaagctatatacaaaacattttc 21342182  T
Q  218 tttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttg-aaagcaaacctgagcaacagggtacattca 315  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21342181 cttctattttgataatgacaatgcttgaaacaagcatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattca 21342082  T
Q  316 aacgaaacatgcataagcgagtgtat 341  Q
    || ||||||||||| |||||| ||||    
T  21342081 aatgaaacatgcatgagcgagagtat 21342056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 19 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 19911374 - 19911048
Alignment:
Q  19 aattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgc 118  Q
    |||||||| |||| |||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19911374 aattcaaagtttctaggagatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattacctttttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgc 19911275  T
Q  119 cttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac--aaaacatttt 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||   || ||||||||||||||| |||  ||||||||||    
T  19911274 cttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgtttaaaactctatttcctttttactttcaaagctatgtacaaaaaacatttt 19911175  T
Q  217 ctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattg-aaaactttttgtcta-ttttgaaagcaaacctgagcaacagggtacattc 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19911174 ctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtttttgtctatttttgaaagcaaacctgagcaacagggtacattc 19911075  T
Q  315 aaacgaaacatgcataagcgagtgtat 341  Q
    ||| ||||||||||| |||||||||||    
T  19911074 aaatgaaacatgcatgagcgagtgtat 19911048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 9 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 22075150 - 22074815
Alignment:
Q  9 tgtgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgt 108  Q
    |||| ||| ||||||||| |||| |||||||| |||| || | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  22075150 tgtgtttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttgccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattgccattttccaagctttgtaaatccgt 22075051  T
Q  109 ggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac-- 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |  ||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||      
T  22075050 ggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaattcgagcctaggcttttgtttgaaactctactttctttctactttcaaagctatgtacaa 22074951  T
Q  207 -aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaagcaaacctgagcaacag 305  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||  |||| ||||||||| |||||||||||| | |||||||||     
T  22074950 aaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacttcttgaaaataaaaaagtttttgtctgttttgaaagcaagcatgagcaacaa 22074851  T
Q  306 ggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagtgtat 341  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||    
T  22074850 ggtacattcaaacgaaacgtgcatgagcgagcgtat 22074815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 6 - 270
Target Start/End: Original strand, 16260216 - 16260480
Alignment:
Q  6 ttctgtgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 105  Q
    |||||| |||||| ||||||| |||| | |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16260216 ttctgtacttgtggattcaaagtttctaagaaatgtagtgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatc 16260315  T
Q  106 cgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactctatttttcttctactttcaaagctatat 204  Q
    || ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16260316 cgcggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactcta-ttttcttctactttcaaagctatat 16260414  T
Q  205 acaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac 270  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16260415 acaaaacattttctttctattttgataatgataatgcttgaaacaaacattttgaaaatcgaaaac 16260480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 11 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 19655562 - 19655233
Alignment:
Q  11 tgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa--ttaccattttccaagctttgtgaatccgt 108  Q
    |||||| ||||||||| |||| |||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19655562 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgt 19655463  T
Q  109 ggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac-a 207  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  || ||||||||||| ||| ||| |    
T  19655462 ggagtctcgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctactttctttttactttcaaagttatgtacaa 19655363  T
Q  208 aaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaagcaaacctgagcaacag 305  Q
    |||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||      |||||||||||||||||||||||||    
T  19655362 aaacattttccttctatttttaataatgacaaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaagtttt------ttttgaaagcaaacctgagcaacag 19655269  T
Q  306 ggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagtgtat 341  Q
    ||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||    
T  19655268 ggtacattcaaacaaaacgtgcatgagcgagtgtat 19655233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 11 - 341
Target Start/End: Original strand, 22138904 - 22139230
Alignment:
Q  11 tgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtg 109  Q
    |||||| ||||||||| |||| |||||||| | |||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22138904 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgttgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtg 22139003  T
Q  110 gagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac-aa 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||| ||| ||    
T  22139004 gagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctattttctttttactttcaaagttatgtacaaa 22139103  T
Q  209 aacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaagcaaacctgagcaacagg 306  Q
    ||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||  |        |||||||||||||| |||||||||||    
T  22139104 aacattttccttctatttttaataatgacaaatgcttgaaacaaacgtcttgaaaattgaaaaagt--------ttttgaaagcaaacttgagcaacagg 22139195  T
Q  307 gtacattcaaacgaaacatgcataagcgagtgtat 341  Q
    ||||||| ||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  22139196 gtacattgaaatgaaacgtgcatgagcgagtgtat 22139230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 176; E-Value: 9e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 27603135 - 27602802
Alignment:
Q  1 gaagtttctgtgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgt 100  Q
    |||| |||||| |||||||||||||| |||| | ||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27603135 gaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgt 27603036  T
Q  101 gaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagct 200  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||  || |||||||||||||    
T  27603035 gaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttagacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttcaaagct 27602936  T
Q  201 atatac-aaaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaagcaaacctg 297  Q
    || ||| ||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||       |||  ||||||||||||    
T  27602935 atgtacaaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaagttt-------tttgaaaagcaaacctg 27602843  T
Q  298 agcaacagggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagtgt 339  Q
     ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  27602842 tgcaacagggtacattcaaacg-aacatgcatgagcgagtgt 27602802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 12 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 2131479 - 2131156
Alignment:
Q  12 gcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 111  Q
    ||||| ||||||||| |||| |||||||| | |||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2131479 gcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgatgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgga 2131380  T
Q  112 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac-aaaa 210  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  || ||||||||||| ||| ||| ||||    
T  2131379 gtcgcgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctactttctttttactttcaaagttatgtacaaaaa 2131280  T
Q  211 cattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaagcaaacctgagcaacagggt 308  Q
    ||||||| ||||| |||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||  |      | |||  |||||||||||||||||||||||    
T  2131279 cattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagt------tctttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 2131186  T
Q  309 acattcaaacgaaacatgcataagcgagtgt 339  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  2131185 acattcaaacg-aacatgcatgagcgagtgt 2131156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 12 - 339
Target Start/End: Original strand, 19694094 - 19694419
Alignment:
Q  12 gcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 110  Q
    ||||| ||||||||| |||| |||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19694094 gcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 19694193  T
Q  111 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac-aaa 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||   |||  || ||||||||||| ||| ||| |||    
T  19694194 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttaaaactccgctttctttttactttcaaagttatgtacaaaa 19694293  T
Q  210 acattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaagcaaacctgagcaacaggg 307  Q
    |||||||| ||||| |||| |||||||| |||||| ||||||| ||| ||||||||||||||  ||||     |||  ||||||||||||||||||||||    
T  19694294 acattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaagcatcttgaaaattgaaaaagtttt-----tttgaaaagcaaacctgagcaacaggg 19694388  T
Q  308 tacattcaaacgaaacatgcataagcgagtgt 339  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  19694389 tacattcaaacg-aacatgcatgagcgagtgt 19694419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 51 - 339
Target Start/End: Original strand, 14569194 - 14569482
Alignment:
Q  51 tgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatt 150  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14569194 tgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatt 14569293  T
Q  151 tgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctat-----atacaaaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgctt 243  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||  |||  || ||||||||||| |||     | | ||||||||||| ||||| |||| |||||||| ||||||     
T  14569294 tgagcctgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttcaaagttatgttcaaaaaaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctc 14569393  T
Q  244 gaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaag-caaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagtgt 339  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||  ||       ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  14569394 gaaacaagcatcttgaaaattgaaaaagtt-------ttttgaaagacaaacctgagcaacagggtacattcaaacg-aacatgcatgagcgagtgt 14569482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0547 (Bit Score: 280; Significance: 1e-157; HSPs: 1)
Name: scaffold0547
Description:

Target: scaffold0547; HSP #1
Raw Score: 280; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 11 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 9897 - 9566
Alignment:
Q  11 tgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 110  Q
    |||||| ||||||||| |||| |||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  9897 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 9798  T
Q  111 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 210  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9797 agtcacgctttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 9698  T
Q  211 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttg-aaagcaaacctgagcaacagggta 309  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9697 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggta 9598  T
Q  310 cattcaaacgaaacatgcataagcgagtgtat 341  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  9597 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtat 9566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 276; Significance: 1e-154; HSPs: 58)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 1 - 329
Target Start/End: Original strand, 32296580 - 32296911
Alignment:
Q  1 gaagtttctgtgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgt 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32296580 gaagtttctgcgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgt 32296679  T
Q  101 gaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactcta-tttttcttctactttcaaag 198  Q
    ||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  32296680 gaatccgtggagtcgtgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaattctattttttcttctactttcaaag 32296779  T
Q  199 ctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttg-aaagcaaacctg 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  32296780 ctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctg 32296879  T
Q  298 agcaacagggtacattcaaacgaaacatgcat 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32296880 agcaacagggtacattcaaacgaaacatgcat 32296911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 11 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 22381879 - 22381550
Alignment:
Q  11 tgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 110  Q
    |||||| ||||||||| |||| ||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22381879 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 22381780  T
Q  111 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22381779 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 22381680  T
Q  211 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttg-aaagcaaacctgagcaacagggt 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||    
T  22381679 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcgacagtgt 22381580  T
Q  309 acattcaaacgaaacatgcataagcgagtgt 339  Q
    ||||||||| | ||||||||| |||||||||    
T  22381579 acattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgt 22381550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 12 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 4790932 - 4790600
Alignment:
Q  12 gcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 110  Q
    ||||| ||||||||| ||| ||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4790932 gcttgcgaattcaaagttttcaggaaatgtaatgattaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 4790833  T
Q  111 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac-aaa 209  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  4790832 attcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 4790733  T
Q  210 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttg-aaagcaaacctgagcaacagggt 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4790732 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 4790633  T
Q  309 acattcaaacgaaacatgcataagcgagtgtat 341  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  4790632 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtat 4790600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 12 - 329
Target Start/End: Original strand, 5727940 - 5728260
Alignment:
Q  12 gcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 111  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5727940 gcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 5728039  T
Q  112 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactcta-tttttcttctactttcaaagctatatacaaa 209  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5728040 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttttcttctactttcaaagctatatacaaa 5728139  T
Q  210 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttg-aaagcaaacctgagcaacagggt 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5728140 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 5728239  T
Q  309 acattcaaacgaaacatgcat 329  Q
    ||||||||| |||||||||||    
T  5728240 acattcaaatgaaacatgcat 5728260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 12 - 329
Target Start/End: Original strand, 47029415 - 47029735
Alignment:
Q  12 gcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 111  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47029415 gcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 47029514  T
Q  112 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactcta-tttttcttctactttcaaagctatatacaaa 209  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47029515 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttttcttctactttcaaagctatatacaaa 47029614  T
Q  210 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttg-aaagcaaacctgagcaacagggt 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  47029615 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 47029714  T
Q  309 acattcaaacgaaacatgcat 329  Q
    ||||||||| |||||||||||    
T  47029715 acattcaaatgaaacatgcat 47029735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 12 - 329
Target Start/End: Original strand, 5717030 - 5717350
Alignment:
Q  12 gcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 111  Q
    ||||| ||||||||| ||| ||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5717030 gcttgcgaattcaaagttttcaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 5717129  T
Q  112 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactcta-tttttcttctactttcaaagctatatacaaa 209  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5717130 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttttcttctactttcaaagctatatacaaa 5717229  T
Q  210 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttg-aaagcaaacctgagcaacagggt 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5717230 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 5717329  T
Q  309 acattcaaacgaaacatgcat 329  Q
    ||||||||| |||||||||||    
T  5717330 acattcaaatgaaacatgcat 5717350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 12 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 5764428 - 5764108
Alignment:
Q  12 gcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 111  Q
    ||||| ||||||||| ||| ||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5764428 gcttgcgaattcaaagttttcaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 5764329  T
Q  112 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactcta-tttttcttctactttcaaagctatatacaaa 209  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5764328 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttttcttctactttcaaagctatatacaaa 5764229  T
Q  210 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttg-aaagcaaacctgagcaacagggt 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5764228 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 5764129  T
Q  309 acattcaaacgaaacatgcat 329  Q
    ||||||||| |||||||||||    
T  5764128 acattcaaatgaaacatgcat 5764108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 11 - 341
Target Start/End: Original strand, 10402110 - 10402441
Alignment:
Q  11 tgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 110  Q
    |||||| ||||||||| ||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10402110 tgcttgcgaattcaaagttttcaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 10402209  T
Q  111 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 210  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10402210 agtcacaccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgattaaaattctattttt-ttctactttcaaagctatatacaaaa 10402308  T
Q  211 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttg-aaagcaaacctgagcaacagggt 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10402309 cattttctttctattttgataatgacaatgctcgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 10402408  T
Q  309 acattcaaacgaaacatgcataagcgagtgtat 341  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  10402409 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtat 10402441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 1 - 341
Target Start/End: Original strand, 16422134 - 16422476
Alignment:
Q  1 gaagtttctgtgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgt 100  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16422134 gaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttcc-ggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgt 16422232  T
Q  101 gaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagct 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||    
T  16422233 aaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaactctactttctttctactttcaaagct 16422332  T
Q  201 atatac--aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattg-aaaactttttgtctattttgaaagcaaacctg 297  Q
    || |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  16422333 atgtacaaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtttttgtgtattttgaaagcaaacctg 16422432  T
Q  298 agcaacagggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagtgtat 341  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  16422433 agcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtgtat 16422476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 6 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 17979255 - 17978917
Alignment:
Q  6 ttctgtgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 105  Q
    |||||| |||||| ||||||| || |||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17979255 ttctgtacttgtggattcaaagttcccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 17979156  T
Q  106 cgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatata 205  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||||||    
T  17979155 cgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagactgtgcttttgtttgaaactctgttttctttttactttcaaagctatata 17979056  T
Q  206 c-aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttg--aaagcaaacctgagcaa 302  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  17979055 caaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaaagcaaacctgagcaa 17978956  T
Q  303 cagggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagtgtat 341  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| |||||| ||||    
T  17978955 cagggtacattcaaaggaaatatgcatgagcgagggtat 17978917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 11 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 22865145 - 22864815
Alignment:
Q  11 tgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 110  Q
    |||||| ||||||||| ||||  |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22865145 tgcttgcgaattcaaagtttctgggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 22865046  T
Q  111 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 210  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22865045 agtcacgccttcggctgatcaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactat-gctttcttctactttcaaagctgtatacaaaa 22864947  T
Q  211 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttg-aaagcaaacctgagcaacagggta 309  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22864946 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctgttttgaaaagcaaacctgagcaacagggta 22864847  T
Q  310 cattcaaacgaaacatgcataagcgagtgtat 341  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  22864846 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtat 22864815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 11 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 22880204 - 22879874
Alignment:
Q  11 tgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 110  Q
    |||||| ||||||||| ||||  |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22880204 tgcttgcgaattcaaagtttctgggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 22880105  T
Q  111 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 210  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22880104 agtcacgccttcggctgatcaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactat-gctttcttctactttcaaagctgtatacaaaa 22880006  T
Q  211 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttg-aaagcaaacctgagcaacagggta 309  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22880005 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctgttttgaaaagcaaacctgagcaacagggta 22879906  T
Q  310 cattcaaacgaaacatgcataagcgagtgtat 341  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  22879905 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtat 22879874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 12 - 341
Target Start/End: Original strand, 48471889 - 48472224
Alignment:
Q  12 gcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 111  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  48471889 gcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgatgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccatgga 48471988  T
Q  112 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaac 211  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48471989 gtcacgccctcggctgaccaccactctcatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaac 48472088  T
Q  212 attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttg-----aaaattgaaaactttttgtctattttgaaa-gcaaacctgagcaacag 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  48472089 attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttttttaaaaattgaaaactttctgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 48472188  T
Q  306 ggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagtgtat 341  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  48472189 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtat 48472224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 1 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 16618802 - 16618456
Alignment:
Q  1 gaagtttctgtgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgt 100  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||| |||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16618802 gaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgt 16618703  T
Q  101 gaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagct 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||    
T  16618702 aaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctactttctttctactttcaaagct 16618603  T
Q  201 atatac---aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattg---aaaactttttgtctattttgaaagcaaac 294  Q
    || |||   |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   |||| |||||||| |||||||||||||||    
T  16618602 atgtacaaaaaaacattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaaaagtttttgtccattttgaaagcaaac 16618503  T
Q  295 ctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagtgtat 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  16618502 ctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagcgtat 16618456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 6 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 29659272 - 29658935
Alignment:
Q  6 ttctgtgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 105  Q
    |||||| |||||||||||||| |||| | ||| || |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29659272 ttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 29659173  T
Q  106 cgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatata 205  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  29659172 cgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaagttgagcctttgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagttatata 29659073  T
Q  206 caaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttg-aaagcaaacctgagcaac 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29659072 caaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaacctttggtctattttgaaaagcaaacctgagcaac 29658973  T
Q  304 agggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagtgtat 341  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  29658972 agggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtat 29658935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 6 - 341
Target Start/End: Original strand, 28027247 - 28027582
Alignment:
Q  6 ttctgtgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 105  Q
    |||||| |||||| ||||||| |||| | ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28027247 ttctgtacttgtggattcaaagtttctaagaactgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 28027346  T
Q  106 cgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatata 205  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  28027347 cgtggagtcaggcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaattcta-ttttcttctactttcaaagctatata 28027445  T
Q  206 caaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttg-aaagcaaacctgagcaaca 304  Q
    |||   |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  28027446 caatttattttccttctattttgataatgataatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaaca 28027545  T
Q  305 gggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagtgtat 341  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  28027546 gggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtat 28027582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 34 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 31958733 - 31958422
Alignment:
Q  34 ggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccacc 133  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31958733 ggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccacc 31958634  T
Q  134 actcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactctattt--ttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgat 230  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31958633 actcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaattctattttgttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgat 31958534  T
Q  231 aatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttg-aaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcat 329  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  31958533 aatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtaccttcaaatgaaacatgcat 31958434  T
Q  330 aagcgagtgtat 341  Q
     |||||| ||||    
T  31958433 gagcgagagtat 31958422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 6 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 5590665 - 5590340
Alignment:
Q  6 ttctgtgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 105  Q
    |||||| |||||||||||||| |||| | ||  ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5590665 ttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagagctgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatc 5590566  T
Q  106 cgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatata 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||| ||    
T  5590565 cgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctgttttctttttactttcaaagctatgta 5590466  T
Q  206 c-aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttg-aaagcaaacctgagcaac 303  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5590465 caaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaac 5590366  T
Q  304 agggtacattcaaacgaaacatgcat 329  Q
    |||||||||||||| |||||||||||    
T  5590365 agggtacattcaaatgaaacatgcat 5590340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 12 - 341
Target Start/End: Original strand, 4422880 - 4423211
Alignment:
Q  12 gcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 111  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4422880 gcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgga 4422979  T
Q  112 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| | |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  4422980 gtcacgccttcggctgaccaccacttttatacatcaagttgagcctttgcttttgtttgaaaactcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaat 4423078  T
Q  211 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttg-aaagcaaacctgagcaacagggt 308  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4423079 cattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaataaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 4423178  T
Q  309 acattcaaacgaaacatgcataagcgagtgtat 341  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  4423179 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtat 4423211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 34 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 5603591 - 5603280
Alignment:
Q  34 ggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccacc 133  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5603591 ggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccacc 5603492  T
Q  134 actcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactctattt--ttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgat 230  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5603491 actcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaattctattttgttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgat 5603392  T
Q  231 aatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttg-aaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcat 329  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||    
T  5603391 aatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtaccttcaaataaaacatgcat 5603292  T
Q  330 aagcgagtgtat 341  Q
     |||||| ||||    
T  5603291 gagcgagagtat 5603280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 34 - 341
Target Start/End: Original strand, 24334157 - 24334468
Alignment:
Q  34 ggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccacc 133  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24334157 ggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccacc 24334256  T
Q  134 actcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactctattt--ttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgat 230  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24334257 actcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaattctattttgttcttctactttcaaagctatacacaaaacattttctttctattttgat 24334356  T
Q  231 aatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttg-aaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcat 329  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  24334357 aatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtaccttcaaatgaaacatgcat 24334456  T
Q  330 aagcgagtgtat 341  Q
     |||||| ||||    
T  24334457 gagcgagagtat 24334468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 12 - 341
Target Start/End: Original strand, 5019675 - 5020005
Alignment:
Q  12 gcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 111  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5019675 gcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgga 5019774  T
Q  112 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaac 211  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  5019775 gtcacgcctttggctgaccaccactcttacacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactcta-ctttcttctactttcaaagctatatacaaatc 5019873  T
Q  212 attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttg-aaagcaaacctgagcaacagggta 309  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5019874 attttccttctattttgataatgacaatgcctgaaacgaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggta 5019973  T
Q  310 cattcaaacgaaacatgcataagcgagtgtat 341  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  5019974 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtat 5020005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 11 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 17971163 - 17970833
Alignment:
Q  11 tgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 110  Q
    |||||| ||||||||| |||| ||||||||   ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17971163 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattgctgtgttcaacgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 17971064  T
Q  111 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||      
T  17971063 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgtttaaaactcta-ttttcttctattttcaaagctatatacaatt 17970965  T
Q  211 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttg-aaagcaaacctgagcaacagggta 309  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17970964 tattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggta 17970865  T
Q  310 cattcaaacgaaacatgcataagcgagtgtat 341  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  17970864 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtat 17970833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 6 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 4340980 - 4340643
Alignment:
Q  6 ttctgtgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 105  Q
    |||||| |||||| ||||||| |||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4340980 ttctgtacttgtggattcaaagtttctaagaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 4340881  T
Q  106 cgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactctatttttcttctactttcaaagctatat 204  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4340880 cgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaagttgagcctttgcttttgtttgaaaactcta-ttttcttctactttcaaagctatat 4340782  T
Q  205 acaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttg-aaagcaaacctgagcaa 302  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  4340781 acaaaacattttccttccattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtttattttgaaaagcaaacctgagcaa 4340682  T
Q  303 cagggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagtgtat 341  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  4340681 cagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagagtat 4340643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 238; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 1 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 29143066 - 29142723
Alignment:
Q  1 gaagtttctgtgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgt 100  Q
    |||| |||||| |||||||||||||| |||| | ||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29143066 gaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgt 29142967  T
Q  101 gaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactctatttttcttctactttcaaagc 199  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||    
T  29142966 gaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactccattttttttctactttcaaagc 29142867  T
Q  200 tatatac-aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctatttt---gaaagcaaacc 295  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||| ||||||    
T  29142866 tatatacaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctatttttgaaaaaacaaacc 29142767  T
Q  296 tgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagtgt 339  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  29142766 tgagcaacatggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtgt 29142723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 12 - 329
Target Start/End: Original strand, 10649033 - 10649352
Alignment:
Q  12 gcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 111  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||| || | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10649033 gcttgcgaattcaaagtttccaggaagtgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 10649132  T
Q  112 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactctatttttcttctactttcaaagctatatac-aaa 209  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  10649133 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactcta-ttttcttctactttcaaagttatatacaaaa 10649231  T
Q  210 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttg-aaagcaaacctgagcaacagggt 308  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10649232 atattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 10649331  T
Q  309 acattcaaacgaaacatgcat 329  Q
    ||||||||| |||||||||||    
T  10649332 acattcaaatgaaacatgcat 10649352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 18286645 - 18286324
Alignment:
Q  19 aattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgc 118  Q
    |||||||| ||||  |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18286645 aattcaaagtttctgggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgc 18286546  T
Q  119 cttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttct 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18286545 cttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgattaaaactcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttct 18286447  T
Q  219 ttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca--ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttg-aaagcaaacctgagcaacagggtacattca 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18286446 ttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaatctgagcaacagggtacattca 18286347  T
Q  316 aacgaaacatgcataagcgagtgt 339  Q
    || | ||||||||| |||||||||    
T  18286346 aatg-aacatgcatgagcgagtgt 18286324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 18301946 - 18301625
Alignment:
Q  19 aattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgc 118  Q
    |||||||| ||||  |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18301946 aattcaaagtttctgggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgc 18301847  T
Q  119 cttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttct 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18301846 cttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgattaaaactcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttct 18301748  T
Q  219 ttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca--ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttg-aaagcaaacctgagcaacagggtacattca 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18301747 ttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaatctgagcaacagggtacattca 18301648  T
Q  316 aacgaaacatgcataagcgagtgt 339  Q
    || | ||||||||| |||||||||    
T  18301647 aatg-aacatgcatgagcgagtgt 18301625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 11 - 341
Target Start/End: Original strand, 20071994 - 20072328
Alignment:
Q  11 tgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 110  Q
    |||||| ||||||||| |||| ||||||||   |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20071994 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgatcactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 20072093  T
Q  111 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 210  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20072094 agtcacaccttcggctgaccacccctcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgtttaaaactcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 20072192  T
Q  211 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca----ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttg-aaagcaaacctgagcaacag 305  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20072193 cattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 20072292  T
Q  306 ggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagtgtat 341  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  20072293 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtat 20072328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 28110265 - 28109918
Alignment:
Q  1 gaagtttctgtgcttgtgaattcaaa-atttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttg 99  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||  |||   ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  28110265 gaagcttctgtacttgtgaattcaaagttttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagcttta 28110166  T
Q  100 tgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactctatttttcttctactttcaaag 198  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  28110165 tgaatccgtggagtcatgccttgggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactccatttttcttctactttcaaag 28110066  T
Q  199 ctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaac----attttgaaaattgaaaactttttgtctattttg-aaagcaaa 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28110065 ctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacgttttttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaa 28109966  T
Q  294 cctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagtgtat 341  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  28109965 cctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtat 28109918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 339
Target Start/End: Original strand, 4629736 - 4630075
Alignment:
Q  1 gaagtttctgtgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgt 100  Q
    |||| |||||| |||||||||||||| |||| | ||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4629736 gaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgt 4629835  T
Q  101 gaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactctatttttcttctactttcaaagc 199  Q
     |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||     
T  4629836 taatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactcta-ttttcttctactttcaaagt 4629934  T
Q  200 tatatac-aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttg-aaagcaaacctg 297  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4629935 tatatacaaaaatattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctg 4630034  T
Q  298 agcaacagggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagtgt 339  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||    
T  4630035 agcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgt 4630075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 6 - 341
Target Start/End: Original strand, 18248694 - 18249031
Alignment:
Q  6 ttctgtgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 105  Q
    |||||| |||||||||||||| |||| | ||| || |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18248694 ttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccgagctttgtgaatc 18248793  T
Q  106 cgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatata 205  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18248794 cgtggagtcatgcctttggctgaccatcactcttatacatcaagttgagcctttgcttttgtttggaactctatttttcttctactttcaaagctacata 18248893  T
Q  206 caaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttg-aaagcaaacctgagcaac 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18248894 caaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaacctttggtctattttgaaaagcaaacctgagcaac 18248993  T
Q  304 agggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagtgtat 341  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  18248994 agggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtat 18249031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 339
Target Start/End: Original strand, 21680652 - 21680991
Alignment:
Q  1 gaagtttctgtgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgt 100  Q
    |||| |||||| |||||||||||||| |||| | ||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21680652 gaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgt 21680751  T
Q  101 gaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactctatttttcttctactttcaaagc 199  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||     
T  21680752 gaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactcta-ttttcttctactttcaaagt 21680850  T
Q  200 tatatac-aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttg-aaagcaaacctg 297  Q
    ||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21680851 tatatacaaaaatattttctttccattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctg 21680950  T
Q  298 agcaacagggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagtgt 339  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||    
T  21680951 agcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgt 21680991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 34 - 341
Target Start/End: Original strand, 28345155 - 28345463
Alignment:
Q  34 ggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccacc 133  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28345155 ggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccacc 28345254  T
Q  134 actcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataat 233  Q
    ||||||||||||||| |||||| | ||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  28345255 actcttatacatcaaattgagcctatgcttttgtttaaaactcta-ttttcttctattttcaaagctatatacaaatcattttccttctattttgataat 28345353  T
Q  234 gacaatgcttgaaacaaacattttg-aaaattgaaaactttttgtctattttg-aaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcataa 331  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  28345354 gacaatgcttgaaacaaacattttgaaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatga 28345453  T
Q  332 gcgagtgtat 341  Q
    ||||| ||||    
T  28345454 gcgagggtat 28345463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 11 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 6537042 - 6536710
Alignment:
Q  11 tgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 110  Q
    |||||| ||||||||| ||||  |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  6537042 tgcttgcgaattcaaagtttctgggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 6536943  T
Q  111 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  || |||||||||||||||||||||||    
T  6536942 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttcaaagctatatacaaaa 6536843  T
Q  211 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttg-aaagcaaacctgagcaacagggt 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6536842 cattttctttctattttgataatgataatgctcgaaacaaacatttttgaaaattaaaaactttttgtctgttttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 6536743  T
Q  309 acattcaaacgaaacatgcataagcgagtgtat 341  Q
    ||||||||| ||| ||||||| |||||| ||||    
T  6536742 acattcaaatgaagcatgcatgagcgagagtat 6536710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 11 - 341
Target Start/End: Original strand, 7079183 - 7079520
Alignment:
Q  11 tgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 110  Q
    |||||| ||||||||| |||| ||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  7079183 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 7079282  T
Q  111 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagc----tatatac 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  || ||||||||||||    |||||||    
T  7079283 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtctgaaactctgttttctttttactttcaaagctatatatatac 7079382  T
Q  207 aaaacattttctttctatt-ttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaatt-gaaaactttttgtctattttg-aaagcaaacctgagcaac 303  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  7079383 aaaacattttctttctattcttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattaaaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaac 7079482  T
Q  304 agggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagtgtat 341  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  7079483 agggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtat 7079520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 11 - 341
Target Start/End: Original strand, 8217593 - 8217927
Alignment:
Q  11 tgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 110  Q
    |||||| ||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8217593 tgcttgcgaattcaaagttttcaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtggatccgtgg 8217692  T
Q  111 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactctatttttcttctactttcaaagctatatac-aa 208  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  8217693 agtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactcta-ttttcttctactttcaaagttatatacaaa 8217791  T
Q  209 aacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca--ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttg-aaagcaaacctgagcaacag 305  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  8217792 aatattttctttctattttgataatgacaatgctcgaaacaaacattttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 8217891  T
Q  306 ggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagtgtat 341  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  8217892 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtat 8217927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 12 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 11104660 - 11104328
Alignment:
Q  12 gcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 111  Q
    ||||| || |||||| |||||||||| || | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11104660 gcttgcgagttcaaagtttccaggaagtgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 11104561  T
Q  112 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagct--atatacaaa 209  Q
    | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||  ||||||||     
T  11104560 gccacgccttcggctgactaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctattttctttttactttcaaagctaaatatacaat 11104461  T
Q  210 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttg-aaagcaaacctgagcaacagggt 308  Q
      |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11104460 ttattttccttctattttgataatgataatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 11104361  T
Q  309 acattcaaacgaaacatgcataagcgagtgtat 341  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  11104360 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtat 11104328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 12 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 31030536 - 31030214
Alignment:
Q  12 gcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 111  Q
    ||||| ||||||||| |||| |||| |||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31030536 gcttgcgaattcaaagtttctaggagatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgga 31030437  T
Q  112 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaac 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31030436 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacgtcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaac 31030337  T
Q  212 attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttg-aaagcaaacctgagcaacagggtac 310  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||     ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  31030336 attttctttctattttgataatgataatgctcgaaacaaacattttgaaaattgaaaaagtttt-----ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtac 31030242  T
Q  311 attcaaacgaaacatgcataagcgagtgt 339  Q
    ||||||| | ||||||||| |||||||||    
T  31030241 attcaaatg-aacatgcatgagcgagtgt 31030214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 12 - 341
Target Start/End: Original strand, 51787984 - 51788315
Alignment:
Q  12 gcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 111  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||| || | ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51787984 gcttgcgaattcaaagtttccaggaagtgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccgataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 51788083  T
Q  112 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 210  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51788084 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaagttgagcctttgcttttgtttgaaaactcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 51788182  T
Q  211 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttg-aaagcaaacctgagcaacagggt 308  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  51788183 tattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtttattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 51788282  T
Q  309 acattcaaacgaaacatgcataagcgagtgtat 341  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  51788283 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtat 51788315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 12 - 341
Target Start/End: Original strand, 18231155 - 18231486
Alignment:
Q  12 gcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 111  Q
    ||||| ||||||||| ||| ||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  18231155 gcttgcgaattcaaagttttcaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagatttgcgaatccgtgga 18231254  T
Q  112 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaac 211  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  18231255 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttaaaactctgttttctttctactttcaaagctatatacaaaac 18231354  T
Q  212 attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttg-aaagcaaacctgagcaacagggta 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  18231355 attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacccgagcaacagggta 18231454  T
Q  310 cattcaaacgaaacatgcataagcgagtgtat 341  Q
    || ||||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  18231455 cagtcaaatgaaacatgcatgagcgagggtat 18231486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 11 - 341
Target Start/End: Original strand, 5472949 - 5473280
Alignment:
Q  11 tgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 110  Q
    |||||| ||||||||| |||| |||| |||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5472949 tgcttgcgaattcaaagtttctaggagatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 5473048  T
Q  111 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaa 209  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5473049 agtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaagttgagcctttgcttttgtttgaaaactcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaa 5473147  T
Q  210 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttg-aaagcaaacctgagcaacaggg 307  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5473148 acattttccttccattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaac-ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacaggg 5473246  T
Q  308 tacattcaaacgaaacatgcataagcgagtgtat 341  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  5473247 tacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtat 5473280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 13 - 339
Target Start/End: Original strand, 18336591 - 18336913
Alignment:
Q  13 cttgtgaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 111  Q
    |||| ||||||||| |||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18336591 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgga 18336690  T
Q  112 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaac 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18336691 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcgatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaac 18336790  T
Q  212 attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttg-aaagcaaacctgagcaacagggtac 310  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||||     ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18336791 attttctttctattatgataatgataatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtttt-----ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtac 18336885  T
Q  311 attcaaacgaaacatgcataagcgagtgt 339  Q
    ||||||| | ||||||||| |||||||||    
T  18336886 attcaaatg-aacatgcatgagcgagtgt 18336913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 18 - 341
Target Start/End: Original strand, 19700454 - 19700791
Alignment:
Q  18 gaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacg 117  Q
    ||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19700454 gaattcaaagtttctaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacg 19700553  T
Q  118 ccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac----------- 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||| |||               
T  19700554 ccttcggctgaccaccactcttatacatcaagttaagcctgtgcttttgtttgaaactctattttctttttactttcaaagctatgtacaaaaaaaaaaa 19700653  T
Q  207 aaaacattttctttctattttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa--ctttttgtctattttgaaagcaaacctgagcaac 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19700654 aaaacattttctttctattttgataatgacaaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctattttgaaagcaaacctgagcaac 19700753  T
Q  304 agggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagtgtat 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19700754 agggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagtgtat 19700791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 6 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 20571150 - 20570813
Alignment:
Q  6 ttctgtgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 105  Q
    |||||| |||||||||||||| |||| | ||| || |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20571150 ttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 20571051  T
Q  106 cgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactctatttttcttctactttcaaagctatat 204  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||   |||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  20571050 cgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaagttgagccgttgcttttgtttgaaaactcta-ttttcttctattttcaaagctatat 20570952  T
Q  205 acaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttg-aaagcaaacctgagcaa 302  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  20570951 acaaaacattttccttccattttgataatgacaatgcttgaaataaacatttttgaaaattgaaaactttttgtttattttgaaaagcaaacctgagcaa 20570852  T
Q  303 cagggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagtgtat 341  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||| ||| |||||||    
T  20570851 cagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcaagtgtat 20570813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 12 - 341
Target Start/End: Original strand, 18057222 - 18057556
Alignment:
Q  12 gcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 110  Q
    ||||| ||||||||| |||| |||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18057222 gcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 18057321  T
Q  111 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac-aaa 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||  || ||||||||||| ||| ||| |||    
T  18057322 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcccgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttcaaagttatgtacaaaa 18057421  T
Q  210 acattttctttcta-ttttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattg-aaaactttttgtcta-ttttgaaagcaaacctgagcaacagg 306  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18057422 acattttccttctatttttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtttttgtctatttttgaaagcaaacctgagcaacagg 18057521  T
Q  307 gtacattcaaacgaaacatgcataagcgagtgtat 341  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  18057522 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtgtat 18057556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 18 - 339
Target Start/End: Original strand, 32445122 - 32445436
Alignment:
Q  18 gaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacg 117  Q
    ||||||||| ||||  |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  32445122 gaattcaaagtttctgggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacg 32445221  T
Q  118 ccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttc 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  || ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  32445222 ccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttcaaagttatatacaaaacattttc 32445321  T
Q  218 tttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaa 317  Q
    ||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||      |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32445322 tttctgttttgataatgataatgctcgaaacaaacattttgaaaattgaaaaagttt------tttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaa 32445415  T
Q  318 cgaaacatgcataagcgagtgt 339  Q
     | ||||||||| |||||||||    
T  32445416 tg-aacatgcatgagcgagtgt 32445436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Original strand, 4727602 - 4727918
Alignment:
Q  19 aattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgc 118  Q
    |||||||| |||| ||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4727602 aattcaaagtttctaggaaatgtgatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgc 4727701  T
Q  119 cttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttct 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4727702 cttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttcaaagctatatacaaaacattttct 4727801  T
Q  219 ttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaa 316  Q
    ||||| |||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||||     |||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4727802 ttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtttt-----tttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaa 4727896  T
Q  317 acgaaacatgcataagcgagtgt 339  Q
    | | ||||||||| |||||||||    
T  4727897 atg-aacatgcatgagcgagtgt 4727918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Original strand, 6207869 - 6208187
Alignment:
Q  19 aattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacg 117  Q
    |||||||| |||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6207869 aattcaaagtttctaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacg 6207968  T
Q  118 ccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacatttt 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6207969 ccttcggctgaccaccactcttatacgtcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacatttt 6208068  T
Q  217 ctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaagcaaacctgagcaacagggtacattc 314  Q
    | ||||| |||| |||||||| || ||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||||     |||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6208069 ccttctatttttaataatgacaaaggctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtttt-----tttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattc 6208163  T
Q  315 aaacgaaacatgcataagcgagtgt 339  Q
    ||| | ||||||||| |||||||||    
T  6208164 aaatg-aacatgcatgagcgagtgt 6208187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 176; E-Value: 9e-95
Query Start/End: Original strand, 12 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 15735393 - 15735069
Alignment:
Q  12 gcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 111  Q
    ||||| ||||||||| |||| |||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15735393 gcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 15735294  T
Q  112 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac-aaaa 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   |||||| ||||||||||| ||| ||| ||||    
T  15735293 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactct-gctttcttttactttcaaagttatgtacaaaaa 15735195  T
Q  211 cattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttg-aaagcaaacctgagcaacaggg 307  Q
    ||||| | ||||| |||| |||||||| |||||| ||||||| ||| ||||||||||||||  ||||     ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15735194 catttcccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaagcatcttgaaaattgaaaaagtttt-----ttttgaaaagcaaacctgagcaacaggg 15735100  T
Q  308 tacattcaaacgaaacatgcataagcgagtgt 339  Q
    |||||||||| | ||||||||| |||||||||    
T  15735099 tacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgt 15735069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 11 - 341
Target Start/End: Original strand, 5658095 - 5658424
Alignment:
Q  11 tgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 110  Q
    |||||| ||||||||| |||| ||||||||   ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5658095 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattgctgtgttcaacgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 5658194  T
Q  111 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatac--atcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac-a 207  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| | ||| ||| |    
T  5658195 agtcaggccttcggctgaccaccactcttatacatatcattttgagcctgtgcttttgtttgaaactctattttccttttactttcaacgttatgtacaa 5658294  T
Q  208 aaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaagcaaacctgagcaacag 305  Q
    |||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||  ||||     |||  ||||||||||| ||||||||    
T  5658295 aaacattttccttctatttttaataatgacaaatgcttgaaacaaacatcttaaaaattgaaaaagtttt-----tttgaaaagcaaacctaagcaacag 5658389  T
Q  306 ggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagtgtat 341  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  5658390 ggtacattcaaacg-aacatgcatgagcgagtgtat 5658424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Original strand, 35886733 - 35887051
Alignment:
Q  19 aattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacg 117  Q
    |||||||| |||| |||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  35886733 aattcaaagtttctaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacg 35886832  T
Q  118 ccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac-aaaacatttt 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||  || ||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  35886833 ccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttcaaagctatgtacaaaaacatttt 35886932  T
Q  217 ctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaagcaaacctgagcaacagggtacattc 314  Q
    | ||||| |||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||||     |||  |||||||||||| | ||||||||||||||    
T  35886933 ccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtttt-----tttgaaaagcaaacctgtgtaacagggtacattc 35887027  T
Q  315 aaacgaaacatgcataagcgagtgt 339  Q
    ||||| ||||| ||| |||||||||    
T  35887028 aaacg-aacatacatgagcgagtgt 35887051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 12 - 341
Target Start/End: Original strand, 4689613 - 4689938
Alignment:
Q  12 gcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 110  Q
    ||||| ||||||||| |||| |||||||| | ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||    
T  4689613 gcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgcgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagcttcgtaaatccgtgg 4689712  T
Q  111 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac-aaa 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   |||||| ||||||| ||| ||| ||| |||    
T  4689713 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactct-gctttcttttactttctaagttatgtacaaaa 4689811  T
Q  210 acattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaagcaaacctgagcaacaggg 307  Q
    |||||||| ||||| |||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||  |||      |||  ||||||||||||||||||||||    
T  4689812 acattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttt------tttgaaaagcaaacctgagcaacaggg 4689905  T
Q  308 tacattcaaacgaaacatgcataagcgagtgtat 341  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  4689906 tacattcaaacg-aacatgcatgagcgagtgtat 4689938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 12 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 8283767 - 8283430
Alignment:
Q  12 gcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 111  Q
    ||||| ||||||||| |||| |||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8283767 gcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgatgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 8283668  T
Q  112 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac-aaaa 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||   |||  || ||||||||||| ||| ||| ||||    
T  8283667 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcatgtgtttttgtttgaaactccgctttctttttactttcaaagttatgtacaaaaa 8283568  T
Q  211 cattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa----------ctttttgtctattttgaaagcaaacctga 298  Q
    ||||||| ||||| |||| |||||||| |||||| ||||||| ||| ||||||||||||||           ||||| | | ||| ||||||||||||||    
T  8283567 cattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaagcatcttgaaaattgaaaaagttttttttttttttttttttttggaaagcaaacctga 8283468  T
Q  299 gcaacagggtacattcaaacgaaacatgcataagcgag 336  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  8283467 gcaacagggtacattcaaacaaaacatgcatgagcgag 8283430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 11 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 15887006 - 15886894
Alignment:
Q  11 tgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaat-aaaattaccattttccaagctttgt-gaatccgt 108  Q
    |||||| ||||||||| |||| |||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  15887006 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaaatccgt 15886907  T
Q  109 ggagtcacgcctt 121  Q
    |||||||||||||    
T  15886906 ggagtcacgcctt 15886894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 12 - 97
Target Start/End: Original strand, 8002522 - 8002607
Alignment:
Q  12 gcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctt 97  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||| || | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8002522 gcttgcgaattcaaagtttccaggaagtgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctt 8002607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 150 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 15886895 - 15886708
Alignment:
Q  150 ttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaac-attttctttctattttga-taatgacaa-tgcttgaa 246  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||| ||||  || ||||||||||| ||| |||||||  | |||| ||||||||| | ||||||||| |||| |||    
T  15886895 ttgagcctgtgtttttgtttgaaactctgttttctttttactttcaaagttatgtacaaaaatactttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaa 15886796  T
Q  247 acaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagtgtat 341  Q
     ||||||| ||||||||||||||  ||||      ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  15886795 gcaaacatcttgaaaattgaaaaagtttt------ttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacg-aacatgcatgagcgagtgtat 15886708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 78 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 27561101 - 27561018
Alignment:
Q  78 aattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccacca-ctcttatacatcaatttgagcttgtgc 161  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||| |||| | || ||||||||||| | |||| ||||| || |||||||||||| |||||    
T  27561101 aattaccattttccaaactttgtg-atctgtggtgccaagccttcggctggctaccatctcttttaaatcaatttgagcctgtgc 27561018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159 (Bit Score: 274; Significance: 1e-153; HSPs: 2)
Name: scaffold0159
Description:

Target: scaffold0159; HSP #1
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 1 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 3447 - 3103
Alignment:
Q  1 gaagtttctgtgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3447 gaagtttctgtgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgt 3348  T
Q  101 gaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactctattt--ttcttctactttcaaa 197  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||    
T  3347 aaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaattctattttgttcttctactttcaaa 3248  T
Q  198 gctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttg-aaagcaaacct 296  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  3247 gctatatacaaaacattctctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacct 3148  T
Q  297 gagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagtgtat 341  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  3147 gagcaacagggtaccttcaaatgaaacatgcatgagcgagagtat 3103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159; HSP #2
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 159 - 341
Target Start/End: Original strand, 17952 - 18138
Alignment:
Q  159 tgcttttgtttgaaact-ctatttt--tcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 255  Q
    ||||||||||||||| | |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17952 tgcttttgtttgaaaattctattttgttcttctactttcaaagctatatacaaaacattctctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 18051  T
Q  256 ttgaaaattgaaaactttttgtctattttg-aaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagtgtat 341  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  18052 ttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtaccttcaaatgaaacatgcatgagcgagagtat 18138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0418 (Bit Score: 269; Significance: 1e-150; HSPs: 1)
Name: scaffold0418
Description:

Target: scaffold0418; HSP #1
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 11 - 341
Target Start/End: Original strand, 12034 - 12365
Alignment:
Q  11 tgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 110  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12034 tgcttgcgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 12133  T
Q  111 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaa 209  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  12134 agtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactcta-ttttcttctactttcaaagctatatataaa 12232  T
Q  210 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttg-aaagcaaacctgagcaacagggt 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12233 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 12332  T
Q  309 acattcaaacgaaacatgcataagcgagtgtat 341  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  12333 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtat 12365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 265; Significance: 1e-148; HSPs: 33)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 19 - 341
Target Start/End: Original strand, 5164387 - 5164711
Alignment:
Q  19 aattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgc 118  Q
    |||||||| |||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5164387 aattcaaagtttctaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgc 5164486  T
Q  119 cttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaag-ctatatacaaaacattttc 217  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5164487 tttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagcctatatacaaaacattttc 5164586  T
Q  218 tttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttg-aaagcaaacctgagcaacagggtacattcaa 316  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  5164587 tttctattttgataataacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacatccaa 5164686  T
Q  317 acgaaacatgcataagcgagtgtat 341  Q
    | ||||||||||| |||||| ||||    
T  5164687 atgaaacatgcatgagcgagagtat 5164711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 6 - 341
Target Start/End: Original strand, 11446878 - 11447215
Alignment:
Q  6 ttctgtgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 105  Q
    |||||| |||||||||||||| |||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11446878 ttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 11446977  T
Q  106 cgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatata 205  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  11446978 cgtggagtcacgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaattcta-ttttcttctactttcaaagctatata 11447076  T
Q  206 caaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt--gaaaattgaaaactttttgtctattttg-aaagcaaacctgagcaa 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11447077 caaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaa 11447176  T
Q  303 cagggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagtgtat 341  Q
    ||||||||| ||||  ||||||||||| |||||| ||||    
T  11447177 cagggtacaatcaagtgaaacatgcatgagcgagggtat 11447215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 31084775 - 31084432
Alignment:
Q  1 gaagtttctgtgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttg 99  Q
    |||| |||||| |||||||||||||| |||   ||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  31084775 gaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttg 31084676  T
Q  100 tgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagc 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  31084675 tgaatccgtggagtcacgccttcggttgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaattctatttttcttctactttcaaagc 31084576  T
Q  200 tatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttg-aaagcaaacctg 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  31084575 tatatacaaaacattttctttctattttgataatggcaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaatttttttgtctattttgaaaagcaaacctg 31084476  T
Q  298 agcaacagggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagtgtat 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31084475 agcaacagggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagagtat 31084432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 11 - 341
Target Start/End: Original strand, 5154079 - 5154410
Alignment:
Q  11 tgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 110  Q
    |||||| ||||||||| |||| ||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5154079 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 5154178  T
Q  111 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  || |||||||||||||||||||||||    
T  5154179 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttcaaagctatatacaaaa 5154278  T
Q  211 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttg-aaagcaaacctgagcaacagggta 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5154279 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggta 5154378  T
Q  310 cattcaaacgaaacatgcataagcgagtgtat 341  Q
    ||| |||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  5154379 catccaaatgaaacatgcatgagcgagagtat 5154410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 1 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 26314000 - 26313659
Alignment:
Q  1 gaagtttctgtgcttgtgaattcaaa-atttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttg 99  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||  |||   ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26314000 gaagtttctgtacttatgaattcaaagttttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttg 26313901  T
Q  100 tgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagc 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||    
T  26313900 tgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgtttaaaactcta-ttttcttctattttcaaagc 26313802  T
Q  200 tatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttg-aaagcaaacctga 298  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  26313801 tatatacaaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctga 26313702  T
Q  299 gcaacagggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagtgtat 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26313701 gcaacagggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagagtat 26313659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 12 - 341
Target Start/End: Original strand, 26518789 - 26519118
Alignment:
Q  12 gcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 111  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26518789 gcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 26518888  T
Q  112 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaac 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  26518889 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgtttaaaactcta-ttttcttctattttcaaagctatatacaaatc 26518987  T
Q  212 attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttg-aaagcaaacctgagcaacagggtac 310  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26518988 attttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtac 26519087  T
Q  311 attcaaacgaaacatgcataagcgagtgtat 341  Q
    ||||||| ||||||||||  |||||| ||||    
T  26519088 attcaaatgaaacatgcacgagcgagagtat 26519118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 6 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 24586682 - 24586357
Alignment:
Q  6 ttctgtgcttgtgaattcaaa-atttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaat 104  Q
    |||||| ||||||||||||||  |||   ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24586682 ttctgtacttgtgaattcaaagttttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaat 24586583  T
Q  105 ccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatat 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24586582 ccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgctttcgtttaagactctatttttcttctactttcaaagctatat 24586483  T
Q  205 acaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttg-aaagcaaacctgagcaac 303  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24586482 acaaaacattttcttcctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaac 24586383  T
Q  304 agggtacattcaaacgaaacatgcat 329  Q
    |||||||||||||| |||||||||||    
T  24586382 agggtacattcaaatgaaacatgcat 24586357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 11 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 26509839 - 26509505
Alignment:
Q  11 tgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtg 109  Q
    |||||| ||||||||| |||| ||||||||   ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26509839 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtg 26509740  T
Q  110 gagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa-ctctatttttcttctactttcaaagctatatacaa 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26509739 gagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaaactccatttttcttctactttcaaagctatatacaa 26509640  T
Q  209 aacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa-ctttttgtctattttg-aaagcaaacctgagcaacagg 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26509639 aacattttctttctattttgataatgacaatgctcgaaacaaacattttgaaaattgaaaacctttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 26509540  T
Q  307 gtacattcaaacgaaacatgcataagcgagtgtat 341  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  26509539 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtgtat 26509505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 13 - 341
Target Start/End: Original strand, 45393216 - 45393546
Alignment:
Q  13 cttgtgaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 112  Q
    |||||| ||||||| |||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45393216 cttgtggattcaaagtttctaagaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 45393315  T
Q  113 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaaca 212  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  45393316 tcacgcctttggctgaccaccactcttacacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctacttttcttctactttcaaagctatacacaaatca 45393415  T
Q  213 ttttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttg-aaagcaaacctgagcaacagggtac 310  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  45393416 ttttccttctattttgataatgacaatgcctgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtac 45393515  T
Q  311 attcaaacgaaacatgcataagcgagtgtat 341  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  45393516 attcaaatgaaacatgcatgagcgagagtat 45393546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 34 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 4139366 - 4139067
Alignment:
Q  34 ggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccacc 133  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4139366 ggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccacc 4139267  T
Q  134 actcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactctattt--ttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgat 230  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4139266 actcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaattctattttgttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgat 4139167  T
Q  231 aatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttg-aaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcat 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4139166 aatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcat 4139067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 1 - 341
Target Start/End: Original strand, 16047300 - 16047639
Alignment:
Q  1 gaagtttctgtgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgt 100  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16047300 gaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtagtgattactatgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgt 16047399  T
Q  101 gaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagct 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||  ||||||| ||||||||    
T  16047400 aaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaactctactttctttctactgtcaaagct 16047499  T
Q  201 atatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaagcaaacctgagc 300  Q
    || ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16047500 atgtacaaaa-attttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcctgaaaattgaaaagtttttgtctattttgaaagcaagcctgagc 16047598  T
Q  301 aacagggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagtgtat 341  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  16047599 aacaggatacattcaaacgaaacatgcatgagcgagcgtat 16047639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 243; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 1 - 341
Target Start/End: Original strand, 3451303 - 3451646
Alignment:
Q  1 gaagtttctgtgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgt 100  Q
    |||| |||||| |||||||||||||| |||| | ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3451303 gaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtgatcactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagttttgt 3451402  T
Q  101 gaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagct 200  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  3451403 gaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagctggtgcttttgtttgaaattcta-ttttcttctactttcaaagct 3451501  T
Q  201 atatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca---ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttg-aaagcaaacct 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3451502 atatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacct 3451601  T
Q  297 gagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagtgtat 341  Q
    ||||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||||| ||||    
T  3451602 gagcaacagggtacaatcaaatggaacatgcatgagcgagggtat 3451646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 1 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 5141487 - 5141144
Alignment:
Q  1 gaagtttctgtgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgt 100  Q
    |||| |||||| |||||||||||||| |||| | ||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5141487 gaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgt 5141388  T
Q  101 gaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactctatttttcttctactttcaaagc 199  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||     
T  5141387 gaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactcta-ttttcttctactttcaaagt 5141289  T
Q  200 tatatac-aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttg--aaagcaaacct 296  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  5141288 tatatacaaaaatattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaaagcaaacct 5141189  T
Q  297 gagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagtgtat 341  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  5141188 gagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagggtat 5141144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 1 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 16745673 - 16745342
Alignment:
Q  1 gaagtttctgtgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgt 100  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||| |||   ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16745673 gaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgt 16745574  T
Q  101 gaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactctatttttcttctactttcaaagc 199  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16745573 gaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaagttgagcctttgcttttgtttgaaaactcta-ttttcttctactttcaaagc 16745475  T
Q  200 tatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca--ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttg-aaagcaaacct 296  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16745474 tatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacct 16745375  T
Q  297 gagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcat 329  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16745374 gagcaacagggtatattcaaacgaaacatgcat 16745342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 341
Target Start/End: Original strand, 4205374 - 4205716
Alignment:
Q  1 gaagtttctgtgcttgtgaattcaaa-atttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttg 99  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||  |||   ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4205374 gaagcttctgtacttgtgaattcaaagttttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttg 4205473  T
Q  100 tgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagc 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||    
T  4205474 tgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgtttaaaactcta-ttttcttctattttcaaagc 4205572  T
Q  200 tatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttg-aaaattgaaaactttttgtctattttg-aaagcaaacctg 297  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  4205573 tatatacaaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctg 4205672  T
Q  298 agcaacagggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagtgtat 341  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  4205673 agcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtat 4205716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 1 - 336
Target Start/End: Original strand, 26441238 - 26441576
Alignment:
Q  1 gaagtttctgtgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgt 100  Q
    |||| |||||| |||||||||||||| |||| | ||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26441238 gaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctatgaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgt 26441337  T
Q  101 gaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgttt-gaaactcta-tttttcttctactttcaaag 198  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||  |||||| | |||||||| |||||||||||    
T  26441338 gaatccgtggagtcatgcctttggctgaccgccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttaaaaactccattttttcttttactttcaaag 26441437  T
Q  199 ctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttg-aaagcaaacctg 297  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26441438 ctatatacaaaacattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctg 26441537  T
Q  298 agcaacagggtacattcaaacgaaacatgcataagcgag 336  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  26441538 agcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 26441576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 11 - 341
Target Start/End: Original strand, 45737296 - 45737630
Alignment:
Q  11 tgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 110  Q
    |||||| ||||||||| |||| ||||||||   |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  45737296 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgatcactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 45737395  T
Q  111 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 210  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45737396 agtcacgccttcggctgaccacccctcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgtttaaaactcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 45737494  T
Q  211 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca----ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttg-aaagcaaacctgagcaacag 305  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  45737495 cattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 45737594  T
Q  306 ggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagtgtat 341  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  45737595 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtat 45737630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 19 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 11418913 - 11418589
Alignment:
Q  19 aattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgc 118  Q
    |||||||| |||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11418913 aattcaaagtttctaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgc 11418814  T
Q  119 cttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttct 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  11418813 cttcggctgaccaccactcttatacatcgatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctactttctttttactttcaaagctatatacaaaacattttcc 11418714  T
Q  219 ttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttg-aaagcaaacctgagcaacagggtacattcaa 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11418713 ttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttctgtctgttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaa 11418614  T
Q  317 acgaaacatgcataagcgagtgtat 341  Q
    | ||||||||||  |||||| ||||    
T  11418613 atgaaacatgcacgagcgagagtat 11418589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 6 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 26269236 - 26268895
Alignment:
Q  6 ttctgtgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 105  Q
    |||||| |||||||||||||| |||| | ||| ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26269236 ttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatc 26269137  T
Q  106 cgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatata 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||| ||    
T  26269136 cgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctgttttctttttactttcaaagctatgta 26269037  T
Q  206 c-aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca----ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttg-aaagcaaacctgag 299  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26269036 caaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgag 26268937  T
Q  300 caacagggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagtgtat 341  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  26268936 caacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtat 26268895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 12 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 26664054 - 26663734
Alignment:
Q  12 gcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 111  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26664054 gcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 26663955  T
Q  112 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactcta-tttttcttctactttcaaagctatatacaaa 209  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26663954 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttacttttgtttgaaaactctattttttcttctactttcaaagctatatacaaa 26663855  T
Q  210 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttg-aaagcaaacctgagcaacagggt 308  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  26663854 acattttctttatattttgataacgacaatgctcgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacggggt 26663755  T
Q  309 acattcaaacgaaacatgcat 329  Q
    ||||||||| |||||||||||    
T  26663754 acattcaaatgaaacatgcat 26663734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 12 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 26679246 - 26678926
Alignment:
Q  12 gcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 111  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26679246 gcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 26679147  T
Q  112 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactcta-tttttcttctactttcaaagctatatacaaa 209  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26679146 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttacttttgtttgaaaactctattttttcttctactttcaaagctatatacaaa 26679047  T
Q  210 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttg-aaagcaaacctgagcaacagggt 308  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  26679046 acattttctttatattttgataacgacaatgctcgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacggggt 26678947  T
Q  309 acattcaaacgaaacatgcat 329  Q
    ||||||||| |||||||||||    
T  26678946 acattcaaatgaaacatgcat 26678926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 12 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 31558535 - 31558204
Alignment:
Q  12 gcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 111  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31558535 gcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgatcactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgga 31558436  T
Q  112 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| | |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  31558435 gtcacgccttcggctgaccaccacttttatacatcaagttgagcctttgcttttgtttgaaaactcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaat 31558337  T
Q  211 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttg-aaagcaaacctgagcaacagggt 308  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31558336 cattttccttctattttgataatgacaatacttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 31558237  T
Q  309 acattcaaacgaaacatgcataagcgagtgtat 341  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  31558236 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtat 31558204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 9 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 16444148 - 16443818
Alignment:
Q  9 tgtgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgt 108  Q
    |||||||| ||||||||| |||| | |||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16444148 tgtgcttgcgaattcaaagtttctaagaaatgtagtcgttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgt 16444049  T
Q  109 ggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac-- 206  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||| |||  |||||||||||||||||| |||      
T  16444048 ggagtcacgccttcgcctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttaaaactctactttctttctactttcaaagctatgtacaa 16443949  T
Q  207 aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattg-aaaactttttgtctattttgaaagcaaacctgagcaacag 305  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16443948 aaaacattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtttttgtctattttgaaagcaaacctgagcaacag 16443849  T
Q  306 ggtacattcaaacgaaacatgcataagcgag 336  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16443848 ggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgag 16443818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 12 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 39207280 - 39206949
Alignment:
Q  12 gcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 111  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||| || | ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39207280 gcttgcgaattcaaagtttccaggaagtgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccgataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 39207181  T
Q  112 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 210  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39207180 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaagttgagcctttgcttttgtttgaaaactcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 39207082  T
Q  211 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttg-aaagcaaacctgagcaacagggt 308  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  39207081 tattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtttattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 39206982  T
Q  309 acattcaaacgaaacatgcataagcgagtgtat 341  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  39206981 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtat 39206949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 12 - 341
Target Start/End: Original strand, 2160566 - 2160899
Alignment:
Q  12 gcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 111  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||| | ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2160566 gcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgga 2160665  T
Q  112 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac--aaa 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||   || ||||||||||||||| |||  |||    
T  2160666 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgtttaaaactctatttcctttttactttcaaagctatgtacaaaaa 2160765  T
Q  210 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattg-aaaactttttgtcta-ttttgaaagcaaacctgagcaacaggg 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  2160766 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtttttgtctatttttgaaagcaaatctgagcaacaggg 2160865  T
Q  308 tacattcaaacgaaacatgcataagcgagtgtat 341  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  2160866 tacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtgtat 2160899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 11 - 341
Target Start/End: Original strand, 2779247 - 2779573
Alignment:
Q  11 tgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 110  Q
    |||||| ||||||||| |||| |||| |||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  2779247 tgcttgcgaattcaaagtttctaggagatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 2779346  T
Q  111 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||  || |||||||||||||||||||||||    
T  2779347 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatctatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttcaaagctatatacaaaa 2779446  T
Q  211 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttg-aaagcaaacctgagcaacagggta 309  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||     ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2779447 cattttctttctattttgataatgataatgctcgaaacaaacattttgaaaattgaaaaagtttt-----ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggta 2779541  T
Q  310 cattcaaacgaaacatgcataagcgagtgtat 341  Q
    |||||||| || |||||||| |||||| ||||    
T  2779542 cattcaaatgagacatgcatgagcgagagtat 2779573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 11 - 341
Target Start/End: Original strand, 31129900 - 31130226
Alignment:
Q  11 tgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 110  Q
    |||||| ||||||||| |||| |||| |||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  31129900 tgcttgcgaattcaaagtttctaggagatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 31129999  T
Q  111 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||  || |||||||||||||||||||||||    
T  31130000 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatctatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttcaaagctatatacaaaa 31130099  T
Q  211 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttg-aaagcaaacctgagcaacagggta 309  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||     ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31130100 cattttctttctattttgataatgataatgctcgaaacaaacattttgaaaattgaaaaagtttt-----ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggta 31130194  T
Q  310 cattcaaacgaaacatgcataagcgagtgtat 341  Q
    |||||||| || |||||||| |||||| ||||    
T  31130195 cattcaaatgagacatgcatgagcgagagtat 31130226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 329
Target Start/End: Original strand, 10847568 - 10847902
Alignment:
Q  1 gaagtttctgtgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgt 100  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||| |||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10847568 gaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattgccattttccaagctttgt 10847667  T
Q  101 gaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagct 200  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||    
T  10847668 aaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaattcgagcctgtgcttttgtctgaaactctattttctctctactttcaaagct 10847767  T
Q  201 atatac---aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa---ctttttgtctattttgaaagcaaac 294  Q
    || |||   |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    ||||||||| ||||||||| ||||    
T  10847768 atgtacaaaaaaacattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaaagttttttgtctgttttgaaagtaaac 10847867  T
Q  295 ctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcat 329  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||| |||||    
T  10847868 ctgagcaacaaggtacgttcaaacgaaacgtgcat 10847902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 176; E-Value: 9e-95
Query Start/End: Original strand, 98 - 329
Target Start/End: Original strand, 26595750 - 26595985
Alignment:
Q  98 tgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa-ctctatttt-tcttctactttca 195  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  26595750 tgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttttcttctactttca 26595849  T
Q  196 aagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttg-aaagcaaa 293  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26595850 aagctatatacaacacattttctttttattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaa 26595949  T
Q  294 cctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcat 329  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26595950 cctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcat 26595985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 11 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 16512576 - 16512252
Alignment:
Q  11 tgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 110  Q
    |||||| ||||||||| |||| |||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16512576 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 16512477  T
Q  111 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac-aaa 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||  |||  || ||||||||||| ||| ||| |||    
T  16512476 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttaagcctgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttcaaagttatgtacaaaa 16512377  T
Q  210 acattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaatt-gaaaactttttgtctattttgaaagcaaacctgagcaacagg 306  Q
    |||||||| ||||| |||| |||||||| |||||| ||||||||||| |||| |||| ||||| ||||||         |||||||||||||||||||||    
T  16512376 acattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgataattggaaaagtttttg--------aaaagcaaacctgagcaacagg 16512285  T
Q  307 gtacattcaaacgaaacatgcataagcgagtgt 339  Q
    ||||||||||| |||| |||||| |||||||||    
T  16512284 gtacattcaaatgaaatatgcatgagcgagtgt 16512252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 12 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 10911061 - 10910736
Alignment:
Q  12 gcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 111  Q
    ||||| |||| |||| |||| |||||||| | ||||| |||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10911061 gcttgcgaatacaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtatcactaacccataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgga 10910962  T
Q  112 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac-aaaa 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||| ||| ||||    
T  10910961 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctattttctttttactttcaaagttatgtacaaaaa 10910862  T
Q  211 cattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaagcaaacctgagcaacagggt 308  Q
    ||||||| ||||| |||| |||||||| |||||| ||||||| ||| ||||||||||||||  |||      |||  ||||||||||||||||||| |||    
T  10910861 cattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaagcatcttgaaaattgaaaaagttt------tttgaaaagcaaacctgagcaacatggt 10910768  T
Q  309 acattcaaacgaaacatgcataagcgagtgtat 341  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  10910767 acattcaaacg-aacatgcatgagcgagtgtat 10910736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 12 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 26532011 - 26531926
Alignment:
Q  12 gcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctt 97  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26532011 gcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctt 26531926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 78 - 161
Target Start/End: Original strand, 29027282 - 29027366
Alignment:
Q  78 aattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccact-cttatacatcaatttgagcttgtgc 161  Q
    |||||||||||||||| ||||   ||||||||||  |||||||| ||| |||||||||| | | ||||| || ||||||||||||    
T  29027282 aattaccattttccaaacttttaaaatccgtggaaccacgcctttggcagaccaccactccatttacattaacttgagcttgtgc 29027366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 264; Significance: 1e-147; HSPs: 11)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 12 - 341
Target Start/End: Original strand, 3647147 - 3647478
Alignment:
Q  12 gcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 111  Q
    ||||| ||||||||| |||| |||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3647147 gcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgga 3647246  T
Q  112 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3647247 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactccatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 3647346  T
Q  211 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttg-aaagcaaacctgagcaacagggta 309  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3647347 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggta 3647446  T
Q  310 cattcaaacgaaacatgcataagcgagtgtat 341  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  3647447 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtat 3647478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 13 - 341
Target Start/End: Original strand, 28591085 - 28591414
Alignment:
Q  13 cttgtgaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 112  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28591085 cttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 28591184  T
Q  113 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaaca 212  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  || |||||||||||||||||||||||||    
T  28591185 tcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttcaaagctatatacaaaaca 28591284  T
Q  213 ttttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttg-aaagcaaacctgagcaacagggtaca 311  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  28591285 ttctctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtaca 28591384  T
Q  312 ttcaaacgaaacatgcataagcgagtgtat 341  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  28591385 ttcaaatgaaacatgcatgagcgagagtat 28591414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 6 - 341
Target Start/End: Original strand, 51644215 - 51644554
Alignment:
Q  6 ttctgtgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 105  Q
    |||||| |||||||||||||| |||| | ||| ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  51644215 ttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatc 51644314  T
Q  106 cgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactcta-tttttcttctactttcaaagctata 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  51644315 cgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttacacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttttcttctactttcaaagctata 51644414  T
Q  204 tacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac-tttttgtctattttg-aaagcaaacctgagca 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  51644415 tacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaacttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagca 51644514  T
Q  302 acagggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagtgtat 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  51644515 acagggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagagtat 51644554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 1 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 20334683 - 20334339
Alignment:
Q  1 gaagtttctgtgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgt 100  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20334683 gaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagccttgt 20334584  T
Q  101 gaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagct 200  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||    
T  20334583 aaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgaaattgtgcttttgtttgaaactctactttctttctactttcaaagct 20334484  T
Q  201 atatac---aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattg-aaaactttttgtctattttgaaagcaaacct 296  Q
    || |||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20334483 atgtacaaaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtttttgtctattttgaaagcaaacct 20334384  T
Q  297 gagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagtgtat 341  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  20334383 gagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtgtat 20334339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 20 - 341
Target Start/End: Original strand, 10951100 - 10951424
Alignment:
Q  20 attcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgcc 119  Q
    ||||||| ||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  10951100 attcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcatgcc 10951199  T
Q  120 ttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactcta-tttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttc 217  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10951200 tttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttc 10951299  T
Q  218 tttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttg-aaagcaaacctgagcaacagggtacattcaa 316  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10951300 tttttattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagtaaacctgagcaacagggtacattcaa 10951399  T
Q  317 acgaaacatgcataagcgagtgtat 341  Q
    |||||||||||||||||||| ||||    
T  10951400 acgaaacatgcataagcgagagtat 10951424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 12 - 341
Target Start/End: Original strand, 10968666 - 10968998
Alignment:
Q  12 gcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 111  Q
    ||||| ||||||||| |||| |||| |||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10968666 gcttgcgaattcaaagtttctaggagatgtcctgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 10968765  T
Q  112 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactcta-tttttcttctactttcaaagctatatacaaa 209  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10968766 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttttcttctactttcaaagctatatacaaa 10968865  T
Q  210 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttg-aaagcaaacctgagcaacagggt 308  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10968866 atattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 10968965  T
Q  309 acattcaaacgaaacatgcataagcgagtgtat 341  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  10968966 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtat 10968998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 12 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 41787566 - 41787233
Alignment:
Q  12 gcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 110  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41787566 gcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 41787467  T
Q  111 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 210  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41787466 ggtcacgcctccggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 41787368  T
Q  211 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca---ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttg-aaagcaaacctgagcaacagg 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  41787367 cattttctttctattttgataatgacaatgctcgaaacaaacatttttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 41787268  T
Q  307 gtacattcaaacgaaacatgcataagcgagtgtat 341  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  41787267 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtat 41787233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 11 - 341
Target Start/End: Original strand, 28155726 - 28156060
Alignment:
Q  11 tgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 110  Q
    |||||| ||||||||| |||| ||||||||   |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  28155726 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgatcactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 28155825  T
Q  111 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 210  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28155826 agtcacgccttcggctgaccacccctcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgtttaaaactcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 28155924  T
Q  211 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca----ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttg-aaagcaaacctgagcaacag 305  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28155925 cattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 28156024  T
Q  306 ggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagtgtat 341  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  28156025 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtat 28156060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 8 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 16202294 - 16201951
Alignment:
Q  8 ctgtgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccg 107  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16202294 ctgtgcttgcgaattcaaagtttccaggacatgtagtaattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccg 16202195  T
Q  108 tggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac- 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||| || |||     
T  16202194 tggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctattttctttttactttcaaagccatgtaca 16202095  T
Q  207 ----aaaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa---ctttttgtctattttgaaagcaaacctg 297  Q
        ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    |||| ||||||||||||||||||||||    
T  16202094 aaaaaaaacattttctttctatttttgataatgacaaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttcgtctattttgaaagcaaacctg 16201995  T
Q  298 agcaacagggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagtgtat 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  16201994 agcaacagggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagcgtat 16201951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 341
Target Start/End: Original strand, 20466767 - 20467117
Alignment:
Q  1 gaagtttctgtgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgt 100  Q
    |||| |||| ||||||  |||||||| |||| |||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20466767 gaagcttctatgcttgcaaattcaaagtttctaggaaatgtagtcgttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgt 20466866  T
Q  101 gaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagct 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  ||| ||||||||||||    
T  20466867 aaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctactttctttccactttcaaagct 20466966  T
Q  201 atatacaaaa--cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaatt--------gaaaactttttgtctattttgaaagc 290  Q
    || |||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||         |||| ||  ||||||||||||||||    
T  20466967 atgtacaaaaaccattttctttctattttgataatgataatgcttgaaacaaacatcttcaaaattagaaaaaaaaaaagttcctgtctattttgaaagc 20467066  T
Q  291 aaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagtgtat 341  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  20467067 aaacctgagcagcaaggtacattcaaacgaaacatgcgtgagcgagtgtat 20467117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 21892014 - 21891688
Alignment:
Q  1 gaagtttctgtgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21892014 gaagcttctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgtagtgattactatgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgt 21891915  T
Q  101 gaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactcta-tttttcttctactttcaaagc 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| | || ||  ||||        
T  21891914 gaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctactttcttttttatgttca---- 21891819  T
Q  200 tatatacaaaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaagcaaacctg 297  Q
           ||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||| ||||||| ||| ||||||||||||||   |||   | |||  ||||||||||||    
T  21891818 -------aaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaagcatcttgaaaattgaaaaaagttt---tttttgaaaagcaaacctg 21891729  T
Q  298 agcaacagggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagtgt 339  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  21891728 agcaacagggtacattcaaacg-aacatgcatgagcgagtgt 21891688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 262; Significance: 1e-146; HSPs: 27)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 13 - 329
Target Start/End: Original strand, 14104554 - 14104871
Alignment:
Q  13 cttgtgaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 112  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14104554 cttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 14104653  T
Q  113 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaaca 212  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14104654 tcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctgttttctttctactttcaaagctatatacaaaaca 14104753  T
Q  213 ttttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttg-aaagcaaacctgagcaacagggtaca 311  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  14104754 ttttctttctattttggtaatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtaca 14104853  T
Q  312 ttcaaacgaaacatgcat 329  Q
    |||||| |||||||||||    
T  14104854 ttcaaatgaaacatgcat 14104871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 1 - 341
Target Start/End: Original strand, 39856636 - 39856976
Alignment:
Q  1 gaagtttctgtgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgt 100  Q
    |||| |||||| |||||||||||||| |||| | ||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39856636 gaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgt 39856735  T
Q  101 gaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagct 200  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  39856736 gaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttaaaactct-tttttcttctactttcaaagct 39856834  T
Q  201 atatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttg-aaagcaaacctgag 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  39856835 atatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgag 39856934  T
Q  300 caacagggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagtgtat 341  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  39856935 caacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtat 39856976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 11 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 34183218 - 34182890
Alignment:
Q  11 tgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 110  Q
    |||||| ||||||||| ||||  |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  34183218 tgcttgcgaattcaaagtttctgggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 34183119  T
Q  111 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 210  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34183118 agtcacgccttcggctgaccaccgctcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 34183019  T
Q  211 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttg-aaagcaaacctgagcaacagggt 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  34183018 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaac-ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 34182920  T
Q  309 acattcaaacgaaacatgcataagcgagtgt 339  Q
    ||||||||| | ||||||||| |||||||||    
T  34182919 acattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgt 34182890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 13 - 341
Target Start/End: Original strand, 30759775 - 30760103
Alignment:
Q  13 cttgtgaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 112  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30759775 cttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 30759874  T
Q  113 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaaca 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  30759875 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgtttaaaactcta-ttttcttctattttcaaagctatatacaaatca 30759973  T
Q  213 ttttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttg-aaagcaaacctgagcaacagggtaca 311  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  30759974 ttttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtact 30760073  T
Q  312 ttcaaacgaaacatgcataagcgagtgtat 341  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  30760074 ttcaaatgaaacatgcatgagcgagagtat 30760103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 13 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 33668055 - 33667727
Alignment:
Q  13 cttgtgaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 112  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33668055 cttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 33667956  T
Q  113 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaaca 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  33667955 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgtttaaaactcta-ttttcttctattttcaaagctatatacaaatca 33667857  T
Q  213 ttttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttg-aaagcaaacctgagcaacagggtaca 311  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  33667856 ttttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtact 33667757  T
Q  312 ttcaaacgaaacatgcataagcgagtgtat 341  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  33667756 ttcaaatgaaacatgcatgagcgagagtat 33667727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 12 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 20332678 - 20332358
Alignment:
Q  12 gcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 111  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20332678 gcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 20332579  T
Q  112 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactcta-tttttcttctactttcaaagctatatacaaa 209  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20332578 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttttcttctactttcaaagctatatacaaa 20332479  T
Q  210 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttg-aaagcaaacctgagcaacagggt 308  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20332478 atattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 20332379  T
Q  309 acattcaaacgaaacatgcat 329  Q
    ||||||||| |||||||||||    
T  20332378 acattcaaatgaaacatgcat 20332358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 12 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 40099892 - 40099572
Alignment:
Q  12 gcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 111  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40099892 gcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 40099793  T
Q  112 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactcta-tttttcttctactttcaaagctatatacaaa 209  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40099792 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttacttttgtttgaaaactctattttttcttctactttcaaagctatatacaaa 40099693  T
Q  210 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttg-aaagcaaacctgagcaacagggt 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  40099692 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 40099593  T
Q  309 acattcaaacgaaacatgcat 329  Q
    ||||||||| |||||||||||    
T  40099592 acattcaaatgaaacatgcat 40099572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 11 - 341
Target Start/End: Original strand, 54839400 - 54839731
Alignment:
Q  11 tgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 110  Q
    |||||| ||||||||| |||| ||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  54839400 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 54839499  T
Q  111 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  54839500 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgcttgaaactcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaat 54839598  T
Q  211 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttg-aaagcaaacctgagcaacagggt 308  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  54839599 cattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacttgagcaacagggt 54839698  T
Q  309 acattcaaacgaaacatgcataagcgagtgtat 341  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  54839699 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtat 54839731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 12 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 27157569 - 27157248
Alignment:
Q  12 gcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 111  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27157569 gcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 27157470  T
Q  112 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactcta-tttttcttctactttcaaagctatatac-aa 208  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  27157469 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttttcttctactttcaaagctatatacaaa 27157370  T
Q  209 aacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttg-aaagcaaacctgagcaacaggg 307  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27157369 aatattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacaggg 27157270  T
Q  308 tacattcaaacgaaacatgcat 329  Q
    |||||||||| |||||||||||    
T  27157269 tacattcaaatgaaacatgcat 27157248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 11 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 14753749 - 14753420
Alignment:
Q  11 tgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 110  Q
    |||||| ||||||||| ||||  |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14753749 tgcttgcgaattcaaagtttctgggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 14753650  T
Q  111 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14753649 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgattaaaactcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 14753551  T
Q  211 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca--ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttg-aaagcaaacctgagcaacaggg 307  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  14753550 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaatctgagcaacaggg 14753451  T
Q  308 tacattcaaacgaaacatgcataagcgagtgt 339  Q
    |||||||||| | ||||||||| |||||||||    
T  14753450 tacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgt 14753420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 341
Target Start/End: Original strand, 5011876 - 5012219
Alignment:
Q  1 gaagtttctgtgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttg 99  Q
    |||| |||||| |||||||||||||| |||   ||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5011876 gaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttg 5011975  T
Q  100 tgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagc 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5011976 tgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgtttaaaactctacttttcttctactttcaaagc 5012075  T
Q  200 tatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttg-aaagcaaacctg 297  Q
    |||||||||| ||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5012076 tatatacaaatcattttctttctacttggataatggcaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattaaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctg 5012175  T
Q  298 agcaacagggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagtgtat 341  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5012176 agcaacagggcacattcaaacgaaacatgcataagcgagagtat 5012219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 11 - 339
Target Start/End: Original strand, 24118672 - 24119001
Alignment:
Q  11 tgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 110  Q
    |||||| ||||||||| ||||  |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24118672 tgcttgcgaattcaaagtttctgggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 24118771  T
Q  111 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  || |||||||||||||||||||||||    
T  24118772 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtctgaaactctgttttctttttactttcaaagctatatacaaaa 24118871  T
Q  211 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttg-aaagcaaacctgagcaacagggt 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  24118872 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattaaaaactttttgtctattttgaaaagcaaaccggagcaacagggt 24118971  T
Q  309 acattcaaacgaaacatgcataagcgagtgt 339  Q
    ||||||||| | ||||||||| |||||||||    
T  24118972 acattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgt 24119001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 238; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 11 - 341
Target Start/End: Original strand, 5700549 - 5700881
Alignment:
Q  11 tgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtg 109  Q
    |||||| ||||||||| |||   |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5700549 tgcttgcgaattcaaagtttttgggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtg 5700648  T
Q  110 gagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaa 209  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5700649 gagtcacgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaattcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaa 5700747  T
Q  210 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttg-aaagcaaacctgagcaacaggg 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  5700748 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacgaacatttttgaaaattaaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacttgagcaacaggg 5700847  T
Q  308 tacattcaaacgaaacatgcataagcgagtgtat 341  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  5700848 tacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtat 5700881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 238; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 6 - 341
Target Start/End: Original strand, 21975708 - 21976045
Alignment:
Q  6 ttctgtgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 105  Q
    |||||| |||||| ||||||| || |||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21975708 ttctgtacttgtggattcaaagttcccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 21975807  T
Q  106 cgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatata 205  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||||||    
T  21975808 cgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagactgcgcttttgtttgaaactctgttttctttttactttcaaagctatata 21975907  T
Q  206 c-aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttg-aaagcaaacctgagcaac 303  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  21975908 caaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacccgagcaac 21976007  T
Q  304 agggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagtgtat 341  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  21976008 agggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagggtat 21976045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 12 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 24586617 - 24586285
Alignment:
Q  12 gcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 110  Q
    ||||| ||||||||| |||| |||||||| | |||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24586617 gcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgatgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 24586518  T
Q  111 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa-ctctatttttcttctactttcaaagctatatacaaa 209  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24586517 agtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactccatttttcttctactttcaaagctatatacaaa 24586418  T
Q  210 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttg-aaagcaaacctgagcaacagggt 308  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  24586417 acattttctttctattttgataaggacaatgctcgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaatagggt 24586318  T
Q  309 acattcaaacgaaacatgcataagcgagtgtat 341  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  24586317 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtat 24586285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 11 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 36338774 - 36338452
Alignment:
Q  11 tgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 110  Q
    |||||| ||||||||| |||| |||| |||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36338774 tgcttgcgaattcaaagtttctaggagatgtcatgattactgtgttcaatgtaccgccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 36338675  T
Q  111 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36338674 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 36338575  T
Q  211 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaagcaaacctgagcaacagggtac 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||     |||  |||||||||||||||||||||||||    
T  36338574 cattttctttctattttgataatgataatgctcgaaacaaacattttgaaaattgaaaaagtttt-----tttgaaaagcaaacctgagcaacagggtac 36338480  T
Q  311 attcaaacgaaacatgcataagcgagtgt 339  Q
    ||||||| | ||||||||| |||||||||    
T  36338479 attcaaatg-aacatgcatgagcgagtgt 36338452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 9 - 341
Target Start/End: Original strand, 1906259 - 1906598
Alignment:
Q  9 tgtgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgt 108  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||    
T  1906259 tgtgcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtatatctgt 1906358  T
Q  109 ggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatataca- 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| | |  ||||||||||||||| || ||||     
T  1906359 ggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagtctgtgcttttgtttgaaactctactatctttctactttcaaagccatgtacaa 1906458  T
Q  208 ---aaacattttctttctattttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa--ctttttgtctattttgaaagcaaacctgagca 301  Q
       ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1906459 aagaaacattttctttctattttgataatgacaaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctattttgaaagcaaacctgagca 1906558  T
Q  302 acagggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagtgtat 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  1906559 acagggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagtgtat 1906598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 6 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 31120772 - 31120434
Alignment:
Q  6 ttctgtgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 105  Q
    |||||| |||||| |||| || || |||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  31120772 ttctgtacttgtggattcgaagttcccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatc 31120673  T
Q  106 cgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatata 205  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||||||    
T  31120672 cgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagactgtgcttttgtttgaaactctgttttctttttactttcaaagctatata 31120573  T
Q  206 c-aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctatttt--gaaagcaaacctgagcaa 302  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   |||||||||| ||||||    
T  31120572 caaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctatttttgaaaagcaaacccgagcaa 31120473  T
Q  303 cagggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagtgtat 341  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  31120472 cagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagggtat 31120434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 6 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 18794878 - 18794541
Alignment:
Q  6 ttctgtgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 105  Q
    |||||| |||||||||||||| |||| |  || || |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18794878 ttctgtacttgtgaattcaaagtttctaaaaactgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 18794779  T
Q  106 cgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactctatttttcttctactttcaaagctatat 204  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18794778 cgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctttgcttttgtttgaaaactcta-ttttcttctactttcaaagctatat 18794680  T
Q  205 acaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt-ttgaaaattgaaaactttttgtctattttg-aaagcaaacctgagcaa 302  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  18794679 acaaaacattttccttccattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattcttgaaaattgaaaactttttgtttattttgaaaagcaaacctgagcaa 18794580  T
Q  303 cagggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagtgtat 341  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  18794579 cagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagagtat 18794541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Original strand, 6575879 - 6576193
Alignment:
Q  19 aattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgc 118  Q
    |||||||| |||| ||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6575879 aattcaaagtttctaggaaatgtgatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgc 6575978  T
Q  119 cttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttct 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6575979 cttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttcaaagctatatacaaaacattttct 6576078  T
Q  219 ttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaac 318  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||      || | |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  6576079 ttctattttgataatgataatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa-----agtttctttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaat 6576173  T
Q  319 gaaacatgcataagcgagtgt 339  Q
    | ||||||||| |||||||||    
T  6576174 g-aacatgcatgagcgagtgt 6576193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Original strand, 1673877 - 1674202
Alignment:
Q  19 aattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgc 118  Q
    |||||||| |||| |||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |    
T  1673877 aattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatataccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggtgtcactc 1673976  T
Q  119 cttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac--aaaacatttt 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |  ||||||||||||||| || |||  |||| |||||    
T  1673977 cttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctactatctttctactttcaaagccatgtacaaaaaatatttt 1674076  T
Q  217 ctttctattttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa--ctttttgtctattttgaaagcaaacctgagcaacagggtacatt 313  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1674077 ctttctattttgataatgacaaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctattttgaaagcaaacttgagcaacagggtacatt 1674176  T
Q  314 caaacgaaacatgcataagcgagtgt 339  Q
    |||||||||||||||| |||||||||    
T  1674177 caaacgaaacatgcatgagcgagtgt 1674202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 9 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 15380496 - 15380162
Alignment:
Q  9 tgtgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgt 108  Q
    |||||||| ||||||||| |||| |||||||| |||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  15380496 tgtgcttgcgaattcaaagtttcaaggaaatgtagtggttatcgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattgccattttccaagctttgtaaatccgt 15380397  T
Q  109 ggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac-- 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||      
T  15380396 ggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaattcgagcctgtgcttttgtttgaaactctactttctttctactttcaaagctatgtacaa 15380297  T
Q  207 aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaagcaaacctgagcaacagg 306  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |  |||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |    
T  15380296 aaaacattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaattaaaaaagtttttgtctgttttgaaagcaagcctgagcaacaag 15380197  T
Q  307 gtacattcaaacgaaacatgcataagcgagtgtat 341  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||    
T  15380196 gtacattcaaacgaaacgtgcatgagcgagcgtat 15380162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 15276898 - 15276565
Alignment:
Q  1 gaagtttctgtgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgt 100  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||| |||| |||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15276898 gaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattgccattttccaagctttgt 15276799  T
Q  101 gaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagct 200  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||    
T  15276798 aaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaattcgagcctgtgcttttgtttgaaactctattttctctctactttcaaagct 15276699  T
Q  201 atatac--aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattg---aaaactttttgtctattttgaaagcaaacc 295  Q
    || |||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   |||| ||||||||| ||||||||| ||||     
T  15276698 atgtacaaaaaacattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaaaagtttttgtctgttttgaaagtaaact 15276599  T
Q  296 tgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcat 329  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||| |||||    
T  15276598 tgagcaacaaggtacgttcaaacgaaacgtgcat 15276565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 9 - 341
Target Start/End: Original strand, 15233823 - 15234161
Alignment:
Q  9 tgtgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgt 108  Q
    |||||||| ||||||||| |||  |||||||| |||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15233823 tgtgcttgcgaattcaaagtttataggaaatgtagtggttactatgtccaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgt 15233922  T
Q  109 ggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaa 208  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||    
T  15233923 agagtcacgccttcggctaaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaactctactttctttctactttcaaagctatgtacaa 15234022  T
Q  209 aacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa------ctttttgtctattttgaaagcaaacctgagcaa 302  Q
    || | ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||       ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15234023 aaaaatttctttttatcttgataatgacaatgcttgaagcaaacatcttgaaacttgaaaaagttttttttttgtctattttgaaagcaaacctgggcaa 15234122  T
Q  303 cagggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagtgtat 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15234123 cagggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagtgtat 15234161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 92 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 36324484 - 36324243
Alignment:
Q  92 aagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctact 191  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36324484 aagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctact 36324385  T
Q  192 ttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaagca 291  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||     |||  ||||||    
T  36324384 ttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgataatgctcgaaacaaacattttgaaaattgaaaaagtttt-----tttgaaaagca 36324290  T
Q  292 aacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagtgt 339  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||    
T  36324289 aacctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgt 36324243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 12 - 339
Target Start/End: Original strand, 14671026 - 14671352
Alignment:
Q  12 gcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 110  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14671026 gcttgtgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 14671125  T
Q  111 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaa-a 209  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||  || ||||||||||| ||| ||||| |    
T  14671126 agttacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcccgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttcaaagttatgtacaaga 14671225  T
Q  210 acattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaagcaaacctgagcaacaggg 307  Q
    |||||||| ||||| |||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||||     |||  ||||||||||||||||||||||    
T  14671226 acattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtttt-----tttgaaaagcaaacctgagcaacaggg 14671320  T
Q  308 tacattcaaacgaaacatgcataagcgagtgt 339  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14671321 tacattcaaacgaaacatgcatgagcgagtgt 14671352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 12 - 339
Target Start/End: Original strand, 17019062 - 17019387
Alignment:
Q  12 gcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 110  Q
    ||||| ||||||||| |||| |||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17019062 gcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 17019161  T
Q  111 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttc-aaagctatatac-aa 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||  |||  || ||||||| |||||||| ||| ||    
T  17019162 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctatgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttcaaaagctatgtacaaa 17019261  T
Q  209 aacattttctttctattttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaagcaaacctgagcaacaggg 307  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||| |||| |||||||||  ||||     |||  ||||||||||||||||||||||    
T  17019262 aacattttccttctattttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgagaattgaaaaagtttt-----tttgaaaagcaaacctgagcaacaggg 17019356  T
Q  308 tacattcaaacgaaacatgcataagcgagtgt 339  Q
    |||||||||| | ||||||||| |||||||||    
T  17019357 tacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgt 17019387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0792 (Bit Score: 260; Significance: 1e-145; HSPs: 1)
Name: scaffold0792
Description:

Target: scaffold0792; HSP #1
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 11 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 4862 - 4527
Alignment:
Q  11 tgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaa-ccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgt 108  Q
    |||||| ||||||||| ||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4862 tgcttgcgaattcaaagttttcaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtgaatccgt 4763  T
Q  109 ggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac-a 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  4762 ggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaa 4663  T
Q  208 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattg-aaaactttttgtcta-ttttgaaagcaaacctgagcaacag 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4662 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtttttgtctatttttgaaagcaaacctgagcaacag 4563  T
Q  306 ggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagtgtat 341  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  4562 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtgtat 4527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322 (Bit Score: 260; Significance: 1e-145; HSPs: 2)
Name: scaffold0322
Description:

Target: scaffold0322; HSP #1
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 341
Target Start/End: Original strand, 1645 - 1987
Alignment:
Q  1 gaagtttctgtgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttg 99  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1645 gaagtttctgtgcttatgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttg 1744  T
Q  100 tgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagc 199  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1745 taaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactcta-ttttcttctactttcaaagc 1843  T
Q  200 tatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttg-aaagcaaacctg 297  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||    
T  1844 tatatacaaaacattttccttccattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtttactttgaaaagcaaacctg 1943  T
Q  298 agcaacagggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagtgtat 341  Q
    |||||||||||||  ||||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  1944 agcaacagggtacgatcaaatgaaacatgcatgagcgagagtat 1987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322; HSP #2
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 341
Target Start/End: Original strand, 12034 - 12387
Alignment:
Q  1 gaagtttctgtgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgt 100  Q
    |||| |||||| |||| ||| ||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12034 gaagcttctgtacttgcgaactcaaagtttccaggaaatgtagtgattactatgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgt 12133  T
Q  101 gaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaa-tttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagc 199  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| | |  |||||||||||||||    
T  12134 aaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaattttgagcctgtgcttttgtttgaaactctactatctttctactttcaaagc 12233  T
Q  200 tat-----------atacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattg-aaaactttttgtctattttgaa 287  Q
    |||           | | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  12234 tatgtaaaaaaaaaaaaaaaaacatttgctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtttttgtctattttgaa 12333  T
Q  288 agcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagtgtat 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  12334 agcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagggtat 12387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 249; Significance: 1e-138; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 12 - 341
Target Start/End: Original strand, 18584 - 18917
Alignment:
Q  12 gcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 110  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18584 gcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 18683  T
Q  111 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 210  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18684 ggtcacgcctccggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 18782  T
Q  211 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca---ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttg-aaagcaaacctgagcaacagg 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18783 cattttctttctattttgataatgacaatgctcgaaacaaacatttttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 18882  T
Q  307 gtacattcaaacgaaacatgcataagcgagtgtat 341  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  18883 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtat 18917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0237 (Bit Score: 245; Significance: 1e-136; HSPs: 1)
Name: scaffold0237
Description:

Target: scaffold0237; HSP #1
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 11 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 9184 - 8853
Alignment:
Q  11 tgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 110  Q
    |||||| ||||||||| |||   |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9184 tgcttgcgaattcaaagtttttgggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 9085  T
Q  111 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 210  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9084 agtcacgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaattcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 8986  T
Q  211 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttg-aaagcaaacctgagcaacagggt 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  8985 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacgaacatttttgaaaattaaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacttgagcaacagggt 8886  T
Q  309 acattcaaacgaaacatgcataagcgagtgtat 341  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  8885 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtat 8853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143 (Bit Score: 245; Significance: 1e-136; HSPs: 2)
Name: scaffold0143
Description:

Target: scaffold0143; HSP #1
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 11 - 341
Target Start/End: Original strand, 9912 - 10243
Alignment:
Q  11 tgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 110  Q
    |||||| ||||||||| |||| |||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  9912 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccatga 10011  T
Q  111 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10012 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgtttaaaactcta-ttttcttctattttcaaagctatatacaaaa 10110  T
Q  211 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttg-aaagcaaacctgagcaacagggt 308  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10111 cattttccttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 10210  T
Q  309 acattcaaacgaaacatgcataagcgagtgtat 341  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  10211 acattcaaatgaaacatgcataagcgagagtat 10243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143; HSP #2
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 11 - 339
Target Start/End: Original strand, 33295 - 33622
Alignment:
Q  11 tgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtg 109  Q
    |||||| ||||||||| |||| |||||||| | |||||  ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  33295 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgttgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtg 33394  T
Q  110 gagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac-aa 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||| ||| ||| ||    
T  33395 gagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctgttttctttttactttcaaagttatgtacaaa 33494  T
Q  209 aacattttctttctattttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaagcaaacctgagcaacaggg 307  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||||   | || | ||||||||||||||||||||||    
T  33495 aacattttccttctattttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtttt---ttttgtaaaagcaaacctgagcaacaggg 33591  T
Q  308 tacattcaaacgaaacatgcataagcgagtgt 339  Q
    |||||||||| | ||||||||| |||||||||    
T  33592 tacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgt 33622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 239; Significance: 1e-132; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 6 - 341
Target Start/End: Original strand, 13942 - 14280
Alignment:
Q  6 ttctgtgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaat 104  Q
    |||||| |||||||||||||| |||| | ||| || |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13942 ttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtgaat 14041  T
Q  105 ccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatat 204  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  14042 ccgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcttgtgctgttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctgtat 14141  T
Q  205 acaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttg-aaagcaaacctgagcaa 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||| |||||||||    
T  14142 acaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtgtgttttgaaaagcaagcctgagcaa 14241  T
Q  303 cagggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagtgtat 341  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  14242 cagggtacgttcaaatgaaacatgcatgagcgagagtat 14280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 211; Significance: 1e-115; HSPs: 1)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 341
Target Start/End: Original strand, 25103 - 25453
Alignment:
Q  1 gaagtttctgtgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgt 100  Q
    |||| |||||||||||  |||||||| |||| |||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25103 gaagcttctgtgcttgcaaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattgccattttccaagctttgt 25202  T
Q  101 gaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagct 200  Q
     ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||    
T  25203 aaatccgtggagtcacaccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgcgcttttgtttgaaactctactttctttctactttcaaagct 25302  T
Q  201 atatac---aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa-------ctttttgtctattttgaaagc 290  Q
    || |||   |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||        ||||||||| ||||||||||    
T  25303 atgtacgaaaaaacattatctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaaaaaaagttttttgtctgttttgaaagc 25402  T
Q  291 aaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagtgtat 341  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  25403 aaacctgagcaacaaggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagcgtat 25453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0336 (Bit Score: 204; Significance: 1e-111; HSPs: 1)
Name: scaffold0336
Description:

Target: scaffold0336; HSP #1
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 6 - 341
Target Start/End: Original strand, 15562 - 15906
Alignment:
Q  6 ttctgtgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 105  Q
    |||||| |||||||||||||| |||| | ||| || |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15562 ttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 15661  T
Q  106 cgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactctatttttcttctactttcaaagctatat 204  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15662 cgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaagttgagcctttgcttttgtttgaaaactcta-ttttcttctactttcaaagctatat 15760  T
Q  205 acaaaacattttctttctatttt-gataatgacaatgcttgaaacaaaca------ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttg--aaagcaaacc 295  Q
    ||||||||||||| |||||||||  |  ||||||||||| ||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  15761 acaaaacattttccttctattttaaacgatgacaatgctcgaaacaaacattttttttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaaagcaaacc 15860  T
Q  296 tgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagtgtat 341  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  15861 tgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtat 15906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0240 (Bit Score: 169; Significance: 1e-90; HSPs: 1)
Name: scaffold0240
Description:

Target: scaffold0240; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 25150 - 24832
Alignment:
Q  19 aattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacg 117  Q
    |||||||| |||| |||||||| | ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25150 aattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgggttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacg 25051  T
Q  118 ccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac-aaaacatttt 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||  || ||||||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  25050 ccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttcaaagttatgtacaaaaacatttt 24951  T
Q  217 ctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaagcaaacctgagcaacagggtacattc 314  Q
    | ||||| |||| |||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||     |||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24950 ccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaatttttt-----tttgaaaagaaaacctgagcaacagggtacattc 24856  T
Q  315 aaacgaaacatgcataagcgagtgt 339  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||    
T  24855 aaacg-aacatgcatgagcgagtgt 24832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 167; Significance: 2e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 12 - 339
Target Start/End: Original strand, 6065 - 6391
Alignment:
Q  12 gcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 110  Q
    ||||| ||||||||| |||| |||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  6065 gcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccagtaaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 6164  T
Q  111 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatat--acaa 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||| |||  || ||||||||||| ||| |  | ||    
T  6165 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcatattgagcctgtgcttttgtttgaaactctactttctttttactttcaaagttatgttcaaaa 6264  T
Q  209 aacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaagcaaacctgagcaacagg 306  Q
    ||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||      |||  |||||||||||||||||||||    
T  6265 aacattttccttctatttttaataatgacaaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttt------tttgaaaagcaaacctgagcaacagg 6358  T
Q  307 gtacattcaaacgaaacatgcataagcgagtgt 339  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  6359 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtgt 6391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0288 (Bit Score: 135; Significance: 3e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0288
Description:

Target: scaffold0288; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 6 - 176
Target Start/End: Original strand, 370 - 540
Alignment:
Q  6 ttctgtgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 105  Q
    |||||| |||||||||||||| |||| | ||| || |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  370 ttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 469  T
Q  106 cgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactc 176  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  470 cgtggagtcacgccttcggctgaccaccactctcatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactc 540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0093 (Bit Score: 93; Significance: 3e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0093
Description:

Target: scaffold0093; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 226 - 341
Target Start/End: Original strand, 1 - 117
Alignment:
Q  226 ttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac-tttttgtctattttgaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaaca 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1 ttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtttttgtctattttgaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaaca 100  T
Q  325 tgcataagcgagtgtat 341  Q
    ||||| ||| |||||||    
T  101 tgcatgagcaagtgtat 117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0241 (Bit Score: 91; Significance: 5e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0241
Description:

Target: scaffold0241; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 26399 - 26245
Alignment:
Q  1 gaagtttctgtgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgt 100  Q
    |||| |||||||||||  |||||||| |||| |||||||| |||| |||| ||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  26399 gaagcttctgtgcttgctaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttaccgtgctcaatgtaccaccaacaaataaaatttccatttttcaagctttgt 26300  T
Q  101 gaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 155  Q
     |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26299 aaatctgtgaagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaattcgagc 26245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099 (Bit Score: 56; Significance: 4e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0099
Description:

Target: scaffold0099; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 19 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 40898 - 40759
Alignment:
Q  19 aattcaaaatttccaggaaatgaagtgattactgtgtt-caat-gtaccaccaaccaataaaa-ttaccatttt-ccaagcttt-gtgaatccgt-ggag 112  Q
    |||||||| |||| |||||||| | |||||  |||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| || ||||||| ||||    
T  40898 aattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgttgtgtttcaattgtaccaccaaccaataaaaattaccatttttccaagcttttgtaaatccgttggag 40799  T
Q  113 tcacgccttcggct-gaccaccactcttatacatcaattt 151  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  40798 tcacgccttcggcttgaccaccactcttatacatcaattt 40759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 290 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 40606 - 40556
Alignment:
Q  290 caaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaa-catgcataagcgagtgt 339  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||    
T  40606 caaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaataatgcatgagcgagtgt 40556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University