View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF17627_high_3 (Length: 426)

Name: NF17627_high_3
Description: NF17627
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF17627_high_3
NF17627_high_3
[»] scaffold0240 (1 HSPs)
scaffold0240 (24-399)||(5845-6221)
[»] scaffold0021 (3 HSPs)
scaffold0021 (24-400)||(138296-138673)
scaffold0021 (24-290)||(76589-76853)
scaffold0021 (128-270)||(10003-10148)
[»] chr7 (95 HSPs)
chr7 (24-400)||(26071753-26072131)
chr7 (24-400)||(26095540-26095918)
chr7 (24-400)||(3893381-3893772)
chr7 (24-400)||(12753172-12753558)
chr7 (24-289)||(15824105-15824371)
chr7 (24-290)||(44863443-44863711)
chr7 (24-290)||(141869-142136)
chr7 (24-290)||(47287976-47288244)
chr7 (24-400)||(112784-113168)
chr7 (126-400)||(45453745-45454016)
chr7 (124-400)||(1938257-1938532)
chr7 (24-216)||(7286328-7286522)
chr7 (24-216)||(12545607-12545802)
chr7 (24-215)||(18305642-18305831)
chr7 (24-215)||(13867887-13868080)
chr7 (24-217)||(7290908-7291102)
chr7 (247-400)||(15913921-15914075)
chr7 (24-216)||(2192606-2192799)
chr7 (24-216)||(369143-369336)
chr7 (24-216)||(14253071-14253263)
chr7 (24-216)||(16480836-16481029)
chr7 (24-216)||(15952859-15953050)
chr7 (216-381)||(9058141-9058311)
chr7 (24-290)||(49049452-49049723)
chr7 (251-400)||(13388493-13388643)
chr7 (196-380)||(15761867-15762051)
chr7 (194-380)||(32496053-32496242)
chr7 (251-376)||(13376200-13376324)
chr7 (24-270)||(15629004-15629255)
chr7 (246-360)||(20587140-20587254)
chr7 (194-290)||(13867688-13867784)
chr7 (24-289)||(13272976-13273246)
chr7 (256-360)||(8565108-8565212)
chr7 (39-212)||(15762262-15762429)
chr7 (197-376)||(18255324-18255505)
chr7 (251-380)||(3058585-3058713)
chr7 (251-360)||(9322594-9322703)
chr7 (194-290)||(11285619-11285715)
chr7 (246-360)||(28718977-28719091)
chr7 (194-290)||(11582535-11582631)
chr7 (160-299)||(15952673-15952813)
chr7 (123-290)||(16571751-16571921)
chr7 (123-290)||(16593741-16593911)
chr7 (267-380)||(125378-125492)
chr7 (24-93)||(16571983-16572053)
chr7 (24-93)||(16593609-16593679)
chr7 (256-380)||(2027097-2027222)
chr7 (194-291)||(13038808-13038905)
chr7 (119-216)||(2024757-2024858)
chr7 (124-290)||(10862515-10862683)
chr7 (155-290)||(12249771-12249908)
chr7 (194-290)||(12545404-12545501)
chr7 (142-216)||(12545553-12545627)
chr7 (202-274)||(36051075-36051147)
chr7 (194-299)||(369364-369471)
chr7 (196-374)||(10988092-10988271)
chr7 (202-273)||(122987-123059)
chr7 (194-274)||(16210183-16210263)
chr7 (197-374)||(26010695-26010874)
chr7 (187-241)||(18305492-18305546)
chr7 (24-88)||(2024692-2024757)
chr7 (197-273)||(2192376-2192453)
chr7 (197-299)||(15518435-15518539)
chr7 (24-208)||(16416509-16416684)
chr7 (142-214)||(16480710-16480782)
chr7 (24-99)||(45455505-45455581)
chr7 (197-376)||(2436110-2436285)
chr7 (160-254)||(2024904-2024998)
chr7 (314-360)||(4483318-4483364)
chr7 (216-274)||(7291277-7291335)
chr7 (197-290)||(7821406-7821500)
chr7 (197-290)||(7828717-7828811)
chr7 (197-290)||(16416949-16417043)
chr7 (197-274)||(16480605-16480683)
chr7 (197-290)||(27103134-27103228)
chr7 (197-290)||(27110482-27110576)
chr7 (197-290)||(27175098-27175192)
chr7 (197-290)||(38785226-38785320)
chr7 (142-214)||(2192480-2192552)
chr7 (246-298)||(4483268-4483320)
chr7 (24-216)||(11582659-11582840)
chr7 (197-360)||(13757060-13757225)
chr7 (194-241)||(3055193-3055241)
chr7 (197-299)||(25293856-25293960)
chr7 (112-216)||(122854-122951)
chr7 (197-290)||(11514604-11514698)
chr7 (24-153)||(13038989-13039114)
chr7 (197-290)||(15443146-15443240)
chr7 (197-274)||(30263727-30263805)
chr7 (222-299)||(42057741-42057819)
chr7 (295-340)||(3193586-3193630)
chr7 (24-95)||(16209975-16210045)
chr7 (304-373)||(19066193-19066262)
chr7 (295-339)||(13460914-13460958)
chr7 (201-299)||(13912691-13912791)
[»] chr6 (91 HSPs)
chr6 (24-400)||(31626739-31627117)
chr6 (24-396)||(18775506-18775886)
chr6 (24-396)||(22428473-22428850)
chr6 (24-400)||(16104850-16105237)
chr6 (24-290)||(25646518-25646786)
chr6 (24-396)||(25745792-25746160)
chr6 (24-216)||(35017451-35017645)
chr6 (24-215)||(35011124-35011316)
chr6 (24-216)||(18128340-18128532)
chr6 (24-216)||(18578834-18579027)
chr6 (24-210)||(13622937-13623121)
chr6 (275-400)||(16083970-16084095)
chr6 (24-215)||(19627498-19627690)
chr6 (39-216)||(14628368-14628545)
chr6 (24-216)||(18004857-18005050)
chr6 (217-400)||(18128776-18128964)
chr6 (24-216)||(23975708-23975902)
chr6 (24-216)||(18843708-18843900)
chr6 (24-290)||(13016436-13016702)
chr6 (194-380)||(19984699-19984887)
chr6 (47-207)||(33316422-33316582)
chr6 (251-400)||(18383173-18383323)
chr6 (196-380)||(1554324-1554508)
chr6 (169-290)||(18422182-18422303)
chr6 (251-400)||(33323342-33323492)
chr6 (306-400)||(23151845-23151939)
chr6 (196-376)||(16238848-16239028)
chr6 (256-381)||(17790652-17790776)
chr6 (24-156)||(23151706-23151839)
chr6 (24-241)||(32896282-32896492)
chr6 (257-400)||(16889236-16889379)
chr6 (90-216)||(18825647-18825774)
chr6 (246-360)||(34965470-34965584)
chr6 (275-400)||(35137439-35137565)
chr6 (123-290)||(25369014-25369184)
chr6 (216-359)||(22846615-22846767)
chr6 (197-376)||(11214623-11214803)
chr6 (24-290)||(18397163-18397434)
chr6 (39-212)||(1553946-1554113)
chr6 (256-360)||(16134814-16134918)
chr6 (195-376)||(4989379-4989561)
chr6 (206-290)||(35017303-35017387)
chr6 (246-360)||(19852795-19852909)
chr6 (24-153)||(16827873-16828003)
chr6 (202-274)||(18740863-18740935)
chr6 (197-376)||(1659212-1659387)
chr6 (196-274)||(13622800-13622878)
chr6 (246-360)||(23220222-23220336)
chr6 (197-374)||(14628111-14628289)
chr6 (197-374)||(23976053-23976231)
chr6 (197-374)||(26088319-26088497)
chr6 (197-298)||(33316158-33316260)
chr6 (24-104)||(17787746-17787827)
chr6 (142-209)||(23975956-23976023)
chr6 (194-290)||(16827462-16827559)
chr6 (194-290)||(18004635-18004732)
chr6 (217-359)||(1651466-1651605)
chr6 (142-214)||(14628316-14628388)
chr6 (24-95)||(25173518-25173590)
chr6 (221-374)||(16650745-16650899)
chr6 (195-290)||(18825420-18825515)
chr6 (39-216)||(4989004-4989171)
chr6 (125-290)||(15738590-15738757)
chr6 (156-210)||(16238711-16238765)
chr6 (24-216)||(18740645-18740828)
chr6 (197-290)||(25174040-25174134)
chr6 (197-290)||(27655670-27655764)
chr6 (222-359)||(15861243-15861375)
chr6 (186-290)||(28196439-28196546)
chr6 (221-374)||(16557515-16557669)
chr6 (195-290)||(18843481-18843576)
chr6 (142-216)||(4989201-4989275)
chr6 (197-290)||(10487364-10487458)
chr6 (197-290)||(16377869-16377963)
chr6 (197-290)||(16385193-16385287)
chr6 (24-93)||(18422115-18422185)
chr6 (146-207)||(33316292-33316353)
chr6 (197-374)||(29870975-29871153)
chr6 (146-216)||(16827663-16827733)
chr6 (197-274)||(17343864-17343942)
chr6 (295-340)||(16374954-16374999)
chr6 (197-299)||(16230065-16230169)
chr6 (197-299)||(23993645-23993749)
chr6 (142-200)||(18004770-18004827)
chr6 (24-216)||(19984915-19985096)
chr6 (197-274)||(22227278-22227356)
chr6 (142-216)||(25173731-25173805)
chr6 (24-95)||(18835474-18835544)
chr6 (246-290)||(21930417-21930462)
chr6 (295-340)||(31162441-31162486)
chr6 (218-262)||(32896494-32896538)
[»] chr8 (99 HSPs)
chr8 (24-400)||(37605283-37605668)
chr8 (24-366)||(41243948-41244277)
chr8 (24-290)||(25120745-25121012)
chr8 (24-290)||(19994802-19995078)
chr8 (24-290)||(20479893-20480166)
chr8 (24-290)||(16416537-16416810)
chr8 (24-215)||(18610428-18610620)
chr8 (24-216)||(41508927-41509122)
chr8 (108-380)||(16203832-16204098)
chr8 (24-211)||(24719328-24719513)
chr8 (24-216)||(13664550-13664743)
chr8 (24-216)||(13723825-13724018)
chr8 (24-205)||(22008366-22008548)
chr8 (24-216)||(22909342-22909535)
chr8 (24-278)||(20655677-20655943)
chr8 (272-400)||(41245210-41245338)
chr8 (24-216)||(24108465-24108657)
chr8 (251-400)||(21192234-21192384)
chr8 (251-400)||(21696086-21696236)
chr8 (251-400)||(21199661-21199811)
chr8 (256-400)||(31195772-31195917)
chr8 (251-400)||(23835746-23835895)
chr8 (24-216)||(23509068-23509261)
chr8 (216-400)||(37655134-37655324)
chr8 (194-380)||(29758768-29758956)
chr8 (39-216)||(22323225-22323398)
chr8 (24-215)||(269950-270138)
chr8 (24-215)||(645782-645970)
chr8 (24-215)||(831517-831705)
chr8 (251-400)||(39448310-39448460)
chr8 (24-215)||(16043054-16043245)
chr8 (203-380)||(270226-270401)
chr8 (203-380)||(645519-645694)
chr8 (203-380)||(831254-831429)
chr8 (24-177)||(17343480-17343632)
chr8 (24-215)||(16041378-16041569)
chr8 (314-400)||(37609956-37610042)
chr8 (125-290)||(17731117-17731286)
chr8 (202-290)||(24719077-24719165)
chr8 (245-360)||(22498832-22498947)
chr8 (204-376)||(24930614-24930789)
chr8 (202-380)||(24387203-24387383)
chr8 (251-360)||(23116349-23116458)
chr8 (24-290)||(38531882-38532152)
chr8 (246-360)||(22312190-22312304)
chr8 (246-360)||(45560747-45560861)
chr8 (216-306)||(25294490-25294582)
chr8 (216-306)||(25756479-25756571)
chr8 (246-351)||(33170785-33170890)
chr8 (256-381)||(33612569-33612694)
chr8 (123-290)||(28543270-28543440)
chr8 (24-142)||(6776303-6776422)
chr8 (246-400)||(23153297-23153452)
chr8 (24-216)||(43375310-43375493)
chr8 (24-290)||(18768422-18768691)
chr8 (194-290)||(22008139-22008236)
chr8 (167-290)||(24108245-24108368)
chr8 (24-216)||(3433535-3433718)
chr8 (194-290)||(22323102-22323197)
chr8 (202-274)||(43375202-43375274)
chr8 (221-374)||(22089943-22090097)
chr8 (246-360)||(24238065-24238177)
chr8 (24-86)||(28543151-28543213)
chr8 (197-290)||(23509397-23509491)
chr8 (194-290)||(13664296-13664393)
chr8 (194-290)||(13723571-13723668)
chr8 (197-374)||(3433076-3433254)
chr8 (142-214)||(13664424-13664496)
chr8 (142-214)||(13723699-13723771)
chr8 (197-374)||(21853396-21853574)
chr8 (194-290)||(22909146-22909242)
chr8 (217-359)||(24547724-24547863)
chr8 (221-374)||(15320559-15320713)
chr8 (221-374)||(15500928-15501082)
chr8 (142-205)||(23509315-23509378)
chr8 (24-153)||(23631046-23631173)
chr8 (299-360)||(11543088-11543149)
chr8 (197-299)||(21846065-21846169)
chr8 (341-400)||(25294581-25294641)
chr8 (341-400)||(25756570-25756630)
chr8 (24-208)||(28835980-28836155)
chr8 (142-209)||(3433285-3433352)
chr8 (197-290)||(272786-272880)
chr8 (197-290)||(642969-643063)
chr8 (197-290)||(828775-828869)
chr8 (197-290)||(5236674-5236768)
chr8 (24-96)||(39448573-39448646)
chr8 (197-374)||(16874439-16874617)
chr8 (24-79)||(17731331-17731387)
chr8 (314-400)||(23148481-23148568)
chr8 (112-216)||(29758643-29758740)
chr8 (221-299)||(224737-224816)
chr8 (221-299)||(738360-738439)
chr8 (221-299)||(862255-862334)
chr8 (221-299)||(16675900-16675979)
chr8 (24-65)||(21695899-21695941)
chr8 (197-290)||(24662830-24662924)
chr8 (142-207)||(3433390-3433455)
chr8 (320-360)||(18043091-18043131)
[»] scaffold0102 (1 HSPs)
scaffold0102 (24-363)||(37760-38101)
[»] chr3 (134 HSPs)
chr3 (24-400)||(50113612-50113991)
chr3 (24-399)||(319099-319486)
chr3 (24-380)||(51159973-51160335)
chr3 (24-290)||(17098913-17099181)
chr3 (24-398)||(12351332-12351709)
chr3 (24-400)||(47786356-47786735)
chr3 (24-290)||(6148457-6148723)
chr3 (24-290)||(30204696-30204961)
chr3 (142-400)||(7852223-7852482)
chr3 (24-216)||(11812801-11812994)
chr3 (24-290)||(16183665-16183945)
chr3 (194-400)||(8630315-8630521)
chr3 (24-290)||(19572430-19572693)
chr3 (24-290)||(22145882-22146145)
chr3 (24-216)||(38166213-38166407)
chr3 (24-216)||(18737974-18738167)
chr3 (148-400)||(14060726-14060980)
chr3 (24-216)||(19944805-19944998)
chr3 (24-216)||(7851683-7851877)
chr3 (24-216)||(30140984-30141177)
chr3 (29-207)||(12796728-12796908)
chr3 (24-216)||(17936455-17936649)
chr3 (215-400)||(38812481-38812671)
chr3 (247-378)||(18008645-18008776)
chr3 (202-400)||(19230535-19230734)
chr3 (251-381)||(15874690-15874820)
chr3 (24-216)||(16819043-16819234)
chr3 (251-381)||(48420197-48420327)
chr3 (251-400)||(55442252-55442404)
chr3 (251-374)||(12490249-12490372)
chr3 (24-290)||(14287323-14287596)
chr3 (194-380)||(2048535-2048723)
chr3 (251-400)||(11330493-11330643)
chr3 (24-290)||(11199144-11199415)
chr3 (246-360)||(5229607-5229721)
chr3 (194-380)||(33340317-33340506)
chr3 (194-380)||(23490980-23491169)
chr3 (24-290)||(35121921-35122189)
chr3 (188-380)||(19945098-19945289)
chr3 (81-212)||(8630101-8630232)
chr3 (194-380)||(10737033-10737219)
chr3 (24-290)||(14296730-14297000)
chr3 (24-290)||(14302357-14302627)
chr3 (197-376)||(14846160-14846339)
chr3 (123-290)||(11062691-11062861)
chr3 (246-358)||(47983418-47983531)
chr3 (246-358)||(47992705-47992818)
chr3 (246-358)||(48001992-48002105)
chr3 (246-358)||(48011278-48011391)
chr3 (24-132)||(54045594-54045703)
chr3 (194-290)||(11813307-11813403)
chr3 (246-400)||(9592239-9592394)
chr3 (119-216)||(13815973-13816070)
chr3 (24-290)||(14523006-14523278)
chr3 (24-157)||(17958169-17958303)
chr3 (160-374)||(49230655-49230869)
chr3 (203-380)||(5227201-5227378)
chr3 (197-376)||(15939959-15940140)
chr3 (194-374)||(17913751-17913933)
chr3 (246-360)||(41660135-41660249)
chr3 (51-212)||(54686551-54686707)
chr3 (24-99)||(11062944-11063020)
chr3 (194-290)||(17957996-17958093)
chr3 (196-374)||(44227903-44228083)
chr3 (51-212)||(9304664-9304819)
chr3 (197-374)||(16819386-16819565)
chr3 (160-359)||(16259487-16259683)
chr3 (24-157)||(25057035-25057166)
chr3 (126-290)||(15516035-15516197)
chr3 (194-289)||(19262602-19262698)
chr3 (24-110)||(13815856-13815943)
chr3 (24-216)||(19230318-19230499)
chr3 (142-216)||(11813179-11813253)
chr3 (148-290)||(12563136-12563281)
chr3 (194-290)||(25057247-25057344)
chr3 (251-340)||(33370914-33371002)
chr3 (24-99)||(17536847-17536923)
chr3 (24-208)||(18908679-18908854)
chr3 (24-208)||(22273034-22273209)
chr3 (197-374)||(27839184-27839362)
chr3 (194-266)||(45581310-45581382)
chr3 (149-216)||(7851968-7852035)
chr3 (196-274)||(15860824-15860902)
chr3 (197-274)||(18905356-18905434)
chr3 (142-216)||(18908892-18908966)
chr3 (39-216)||(49230262-49230429)
chr3 (217-376)||(15613564-15613720)
chr3 (142-214)||(11813048-11813120)
chr3 (148-290)||(17137827-17137969)
chr3 (217-359)||(23081682-23081821)
chr3 (24-156)||(23490768-23490898)
chr3 (146-209)||(16819292-16819355)
chr3 (195-290)||(30141361-30141456)
chr3 (197-290)||(2450910-2451004)
chr3 (294-340)||(11517010-11517056)
chr3 (197-290)||(18909169-18909263)
chr3 (197-290)||(22273524-22273618)
chr3 (142-292)||(40938085-40938236)
chr3 (197-359)||(12266007-12266167)
chr3 (217-290)||(15574545-15574618)
chr3 (197-374)||(16745670-16745848)
chr3 (24-99)||(53900388-53900463)
chr3 (197-290)||(1469236-1469330)
chr3 (142-216)||(7851857-7851931)
chr3 (125-290)||(17536606-17536774)
chr3 (24-146)||(33340038-33340155)
chr3 (197-289)||(15470048-15470141)
chr3 (24-209)||(19262733-19262907)
chr3 (197-374)||(30151813-30151991)
chr3 (24-86)||(12563334-12563397)
chr3 (216-290)||(12951476-12951555)
chr3 (24-96)||(39654163-39654237)
chr3 (197-299)||(8269976-8270080)
chr3 (197-299)||(8277087-8277191)
chr3 (197-299)||(8305896-8306000)
chr3 (24-94)||(14061039-14061110)
chr3 (197-299)||(53769137-53769241)
chr3 (221-299)||(13956378-13956457)
chr3 (221-299)||(13977211-13977290)
chr3 (329-376)||(18905296-18905343)
chr3 (221-299)||(41268743-41268822)
chr3 (221-299)||(45859521-45859600)
chr3 (143-290)||(53900177-53900326)
chr3 (221-299)||(55314883-55314962)
chr3 (142-216)||(2451155-2451229)
chr3 (142-216)||(22273247-22273321)
chr3 (142-216)||(49230509-49230583)
chr3 (160-209)||(2451035-2451084)
chr3 (108-157)||(10736904-10736953)
chr3 (245-290)||(11883923-11883968)
chr3 (245-290)||(14291910-14291955)
chr3 (246-290)||(38377415-38377460)
chr3 (108-157)||(45581181-45581230)
chr3 (251-290)||(15989508-15989548)
[»] chr5 (96 HSPs)
chr5 (24-400)||(4863551-4863943)
chr5 (24-400)||(27185318-27185699)
chr5 (24-340)||(21661268-21661593)
chr5 (24-290)||(21392432-21392698)
chr5 (24-216)||(34937571-34937764)
chr5 (24-216)||(10307-10500)
chr5 (24-216)||(10780112-10780305)
chr5 (247-400)||(32967661-32967815)
chr5 (24-216)||(43445708-43445901)
chr5 (251-381)||(23492532-23492662)
chr5 (24-216)||(28257781-28257970)
chr5 (24-216)||(22885041-22885234)
chr5 (216-381)||(24226976-24227146)
chr5 (24-210)||(25211796-25211982)
chr5 (24-210)||(25275948-25276134)
chr5 (245-381)||(21615535-21615671)
chr5 (24-213)||(17473704-17473892)
chr5 (256-400)||(7727112-7727257)
chr5 (39-207)||(19497952-19498120)
chr5 (245-400)||(19860756-19860912)
chr5 (247-400)||(28888441-28888598)
chr5 (142-290)||(11582266-11582414)
chr5 (24-216)||(11579922-11580113)
chr5 (144-290)||(1170321-1170467)
chr5 (251-400)||(13793659-13793809)
chr5 (251-381)||(37189637-37189767)
chr5 (24-290)||(23453184-23453454)
chr5 (24-290)||(23460428-23460698)
chr5 (24-290)||(23464689-23464959)
chr5 (142-374)||(1221351-1221584)
chr5 (24-215)||(23986165-23986359)
chr5 (24-166)||(1171320-1171464)
chr5 (24-216)||(9732592-9732782)
chr5 (24-216)||(1221638-1221826)
chr5 (246-360)||(11964472-11964586)
chr5 (24-290)||(24184869-24185137)
chr5 (24-290)||(24470555-24470804)
chr5 (194-290)||(21653052-21653148)
chr5 (194-374)||(11213222-11213404)
chr5 (194-374)||(110604-110785)
chr5 (246-360)||(20455627-20455741)
chr5 (160-290)||(22884887-22885017)
chr5 (194-274)||(17473568-17473648)
chr5 (108-274)||(23510313-23510473)
chr5 (24-216)||(29192671-29192857)
chr5 (31-212)||(17907853-17908030)
chr5 (160-360)||(35792767-35792964)
chr5 (160-290)||(16534750-16534881)
chr5 (24-216)||(35793162-35793345)
chr5 (142-216)||(10554-10628)
chr5 (160-274)||(18779790-18779904)
chr5 (194-290)||(22368188-22368285)
chr5 (197-374)||(19498280-19498458)
chr5 (194-290)||(28257998-28258093)
chr5 (142-209)||(9732495-9732562)
chr5 (194-374)||(10779799-10779980)
chr5 (24-228)||(11338584-11338802)
chr5 (24-216)||(25944566-25944750)
chr5 (24-216)||(11340599-11340782)
chr5 (197-374)||(11341116-11341294)
chr5 (24-216)||(18780052-18780235)
chr5 (197-299)||(25425102-25425206)
chr5 (142-209)||(11341018-11341085)
chr5 (197-290)||(10831-10925)
chr5 (39-216)||(110990-111157)
chr5 (216-290)||(5452432-5452511)
chr5 (142-208)||(19498182-19498248)
chr5 (197-360)||(43445390-43445555)
chr5 (197-374)||(4201586-4201764)
chr5 (197-299)||(9732360-9732464)
chr5 (24-216)||(16534391-16534574)
chr5 (167-263)||(25211623-25211719)
chr5 (167-263)||(25275775-25275871)
chr5 (39-95)||(25424680-25424736)
chr5 (142-206)||(25944472-25944536)
chr5 (142-214)||(43445582-43445654)
chr5 (197-290)||(21075192-21075286)
chr5 (197-290)||(21933863-21933957)
chr5 (197-290)||(21940033-21940127)
chr5 (142-216)||(22368337-22368411)
chr5 (197-290)||(29192321-29192415)
chr5 (197-290)||(35580735-35580829)
chr5 (197-290)||(37010867-37010961)
chr5 (216-290)||(3672421-3672497)
chr5 (142-214)||(10780011-10780082)
chr5 (24-95)||(22368602-22368674)
chr5 (197-374)||(24594981-24595159)
chr5 (221-360)||(23327458-23327598)
chr5 (197-299)||(27008492-27008596)
chr5 (146-216)||(110888-110957)
chr5 (24-96)||(7726919-7726993)
chr5 (197-298)||(25902021-25902123)
chr5 (142-200)||(29192583-29192641)
chr5 (197-290)||(37051465-37051559)
chr5 (119-156)||(21653228-21653265)
chr5 (348-380)||(21649463-21649495)
[»] scaffold0011 (9 HSPs)
scaffold0011 (24-290)||(256560-256827)
scaffold0011 (194-274)||(125009-125089)
scaffold0011 (196-274)||(72028-72106)
scaffold0011 (196-274)||(76409-76487)
scaffold0011 (202-274)||(192985-193057)
scaffold0011 (24-154)||(72191-72317)
scaffold0011 (24-154)||(76572-76698)
scaffold0011 (24-153)||(125173-125298)
scaffold0011 (24-157)||(192768-192897)
[»] chr4 (98 HSPs)
chr4 (24-400)||(21961053-21961440)
chr4 (24-312)||(12837900-12838192)
chr4 (24-388)||(12901269-12901631)
chr4 (24-290)||(44345057-44345333)
chr4 (24-291)||(33738477-33738732)
chr4 (24-216)||(18166874-18167067)
chr4 (216-400)||(8873978-8874162)
chr4 (24-216)||(34393385-34393580)
chr4 (24-216)||(53909555-53909750)
chr4 (24-290)||(16366361-16366624)
chr4 (196-381)||(14899948-14900136)
chr4 (24-215)||(19699414-19699606)
chr4 (24-215)||(19709999-19710191)
chr4 (247-400)||(34197658-34197812)
chr4 (24-216)||(7134310-7134503)
chr4 (24-216)||(8372607-8372800)
chr4 (247-400)||(37958550-37958704)
chr4 (24-216)||(15274470-15274663)
chr4 (256-400)||(27959563-27959708)
chr4 (194-380)||(109957-110143)
chr4 (251-400)||(12245745-12245895)
chr4 (24-216)||(26678179-26678370)
chr4 (24-290)||(44054168-44054427)
chr4 (24-290)||(45460611-45460894)
chr4 (251-381)||(15852829-15852959)
chr4 (259-381)||(41167447-41167569)
chr4 (142-380)||(15211762-15212004)
chr4 (24-290)||(13244606-13244861)
chr4 (24-218)||(53706635-53706828)
chr4 (24-290)||(13811287-13811558)
chr4 (24-290)||(30236147-30236411)
chr4 (24-216)||(22356424-22356616)
chr4 (24-197)||(20813715-20813890)
chr4 (24-205)||(47355509-47355688)
chr4 (202-290)||(53909431-53909519)
chr4 (216-400)||(41257842-41258031)
chr4 (246-360)||(5372228-5372342)
chr4 (246-360)||(10238967-10239081)
chr4 (24-169)||(18294600-18294746)
chr4 (251-360)||(47469867-47469976)
chr4 (224-376)||(16521294-16521447)
chr4 (194-374)||(5684404-5684586)
chr4 (246-356)||(50223696-50223806)
chr4 (198-290)||(43283043-43283138)
chr4 (24-216)||(15211515-15211698)
chr4 (24-104)||(8874265-8874346)
chr4 (194-290)||(10642586-10642683)
chr4 (197-374)||(19999005-19999183)
chr4 (142-198)||(34393610-34393666)
chr4 (221-290)||(52267125-52267196)
chr4 (184-260)||(53706515-53706591)
chr4 (106-208)||(55378542-55378646)
chr4 (142-209)||(8372854-8372921)
chr4 (142-209)||(18167097-18167164)
chr4 (24-290)||(18496065-18496334)
chr4 (204-274)||(54119906-54119976)
chr4 (142-263)||(7134088-7134208)
chr4 (24-157)||(9293712-9293843)
chr4 (194-290)||(9293924-9294021)
chr4 (24-157)||(10642374-10642505)
chr4 (195-374)||(22356065-22356244)
chr4 (197-299)||(15138134-15138238)
chr4 (24-216)||(19998517-19998700)
chr4 (197-299)||(26678522-26678626)
chr4 (197-299)||(47355803-47355907)
chr4 (146-209)||(26678428-26678491)
chr4 (197-274)||(8372951-8373029)
chr4 (197-290)||(14994678-14994772)
chr4 (197-274)||(18167195-18167273)
chr4 (197-290)||(18246668-18246762)
chr4 (142-208)||(19998907-19998973)
chr4 (334-380)||(25120617-25120663)
chr4 (194-274)||(15274361-15274442)
chr4 (142-207)||(19998780-19998845)
chr4 (141-209)||(13751910-13751978)
chr4 (24-95)||(18246178-18246250)
chr4 (142-206)||(47355705-47355769)
chr4 (144-270)||(7848776-7848902)
chr4 (24-216)||(16520801-16520985)
chr4 (24-157)||(54120066-54120195)
chr4 (31-97)||(55378691-55378757)
chr4 (363-400)||(34393690-34393727)
chr4 (197-299)||(14950498-14950602)
chr4 (108-209)||(109828-109922)
chr4 (230-290)||(15043381-15043443)
chr4 (230-290)||(15110981-15111043)
chr4 (142-207)||(16521015-16521080)
chr4 (234-290)||(53706465-53706521)
chr4 (160-254)||(16521168-16521263)
chr4 (197-290)||(10487149-10487243)
chr4 (197-290)||(16329508-16329602)
chr4 (317-359)||(17213378-17213420)
chr4 (142-216)||(18246391-18246465)
chr4 (314-360)||(24237479-24237525)
chr4 (124-168)||(43283140-43283185)
chr4 (29-88)||(5684742-5684802)
chr4 (197-299)||(13049739-13049843)
chr4 (246-290)||(17377040-17377084)
[»] scaffold0068 (1 HSPs)
scaffold0068 (24-400)||(59865-60250)
[»] chr1 (73 HSPs)
chr1 (24-400)||(35053141-35053515)
chr1 (24-290)||(22407894-22408162)
chr1 (24-290)||(2422733-2422997)
chr1 (142-400)||(5676091-5676355)
chr1 (24-216)||(41217544-41217739)
chr1 (24-208)||(5676350-5676535)
chr1 (219-400)||(41217945-41218126)
chr1 (194-400)||(20444214-20444420)
chr1 (24-215)||(20252342-20252534)
chr1 (194-400)||(37845956-37846162)
chr1 (194-400)||(20529978-20530185)
chr1 (152-290)||(49966013-49966151)
chr1 (251-381)||(38035130-38035260)
chr1 (256-400)||(13378250-13378395)
chr1 (24-216)||(9786123-9786315)
chr1 (24-290)||(35524082-35524350)
chr1 (256-379)||(19601713-19601836)
chr1 (251-400)||(36357826-36357976)
chr1 (251-381)||(37235470-37235600)
chr1 (202-376)||(20929955-20930131)
chr1 (251-400)||(21193694-21193844)
chr1 (197-376)||(22226459-22226638)
chr1 (124-290)||(22836911-22837078)
chr1 (87-216)||(22250776-22250905)
chr1 (265-359)||(8539490-8539584)
chr1 (265-359)||(8604729-8604823)
chr1 (194-376)||(22352601-22352785)
chr1 (202-380)||(44036401-44036582)
chr1 (24-290)||(51657986-51658255)
chr1 (251-360)||(5769744-5769853)
chr1 (194-290)||(20895390-20895486)
chr1 (142-290)||(20956627-20956776)
chr1 (160-376)||(15862938-15863149)
chr1 (246-360)||(20821476-20821590)
chr1 (24-196)||(18505646-18505817)
chr1 (246-400)||(5471872-5472028)
chr1 (194-290)||(9785899-9785995)
chr1 (24-290)||(21716430-21716707)
chr1 (334-400)||(20526725-20526791)
chr1 (246-360)||(41213197-41213311)
chr1 (50-216)||(20895514-20895660)
chr1 (246-359)||(22144923-22145036)
chr1 (142-216)||(41217793-41217867)
chr1 (24-216)||(15863325-15863508)
chr1 (24-216)||(21857753-21857934)
chr1 (160-290)||(22250622-22250752)
chr1 (24-216)||(17146820-17147003)
chr1 (194-290)||(27673257-27673355)
chr1 (194-290)||(22365155-22365252)
chr1 (197-299)||(17147258-17147362)
chr1 (142-214)||(22352498-22352570)
chr1 (142-216)||(15863221-15863295)
chr1 (24-216)||(22352285-22352468)
chr1 (205-274)||(21857966-21858035)
chr1 (217-290)||(35935166-35935239)
chr1 (197-360)||(7642105-7642270)
chr1 (197-290)||(17003302-17003396)
chr1 (24-157)||(22364943-22365074)
chr1 (197-374)||(22034325-22034503)
chr1 (217-359)||(45050185-45050324)
chr1 (56-169)||(20589963-20590078)
chr1 (24-73)||(22080190-22080240)
chr1 (197-290)||(41392929-41393023)
chr1 (197-290)||(51451090-51451184)
chr1 (197-299)||(20826805-20826909)
chr1 (221-299)||(5073884-5073963)
chr1 (251-290)||(18505816-18505855)
chr1 (221-299)||(18602627-18602706)
chr1 (108-146)||(20444085-20444123)
chr1 (108-146)||(20529825-20529863)
chr1 (246-290)||(77632-77677)
chr1 (108-153)||(37846241-37846286)
chr1 (126-169)||(27673216-27673260)
[»] scaffold0083 (1 HSPs)
scaffold0083 (24-400)||(12488-12874)
[»] chr2 (94 HSPs)
chr2 (106-400)||(6877821-6878117)
chr2 (24-290)||(36892360-36892628)
chr2 (24-290)||(25877618-25877882)
chr2 (24-399)||(8886450-8886814)
chr2 (161-396)||(22861923-22862158)
chr2 (196-400)||(25600431-25600635)
chr2 (142-381)||(24088880-24089120)
chr2 (216-400)||(19434958-19435144)
chr2 (24-215)||(42180210-42180402)
chr2 (163-380)||(43644471-43644688)
chr2 (246-400)||(19658470-19658625)
chr2 (24-216)||(21276342-21276535)
chr2 (194-400)||(15631864-15632071)
chr2 (24-210)||(24966425-24966609)
chr2 (251-381)||(4795-4925)
chr2 (251-400)||(25304094-25304244)
chr2 (39-207)||(12638003-12638171)
chr2 (273-400)||(27260130-27260257)
chr2 (24-209)||(21140139-21140325)
chr2 (251-381)||(23823027-23823157)
chr2 (251-381)||(23824971-23825101)
chr2 (251-381)||(23832106-23832236)
chr2 (245-400)||(43641346-43641502)
chr2 (24-290)||(7319718-7319989)
chr2 (251-400)||(19670629-19670778)
chr2 (202-380)||(22282601-22282782)
chr2 (251-400)||(24296071-24296221)
chr2 (24-290)||(28972272-28972543)
chr2 (24-290)||(31832-32102)
chr2 (202-378)||(22273368-22273547)
chr2 (142-299)||(12643600-12643758)
chr2 (24-216)||(12643812-12644000)
chr2 (24-292)||(269422-269693)
chr2 (124-216)||(25600309-25600401)
chr2 (24-289)||(24573051-24573320)
chr2 (106-216)||(15631702-15631812)
chr2 (197-376)||(22692768-22692949)
chr2 (197-376)||(22697415-22697596)
chr2 (24-290)||(22581588-22581858)
chr2 (24-110)||(4450084-4450171)
chr2 (246-360)||(18534350-18534464)
chr2 (246-356)||(24272579-24272689)
chr2 (246-374)||(22137341-22137469)
chr2 (194-274)||(461139-461219)
chr2 (24-216)||(3801123-3801306)
chr2 (24-216)||(38706810-38706993)
chr2 (202-274)||(9654507-9654579)
chr2 (197-374)||(12637665-12637843)
chr2 (194-274)||(20629034-20629114)
chr2 (197-374)||(21140355-21140533)
chr2 (24-216)||(34822315-34822498)
chr2 (196-274)||(24966692-24966770)
chr2 (141-290)||(22691607-22691758)
chr2 (141-290)||(22696254-22696405)
chr2 (197-374)||(21276027-21276205)
chr2 (142-209)||(12637873-12637940)
chr2 (24-110)||(22691823-22691910)
chr2 (24-110)||(22696470-22696557)
chr2 (24-110)||(25600173-25600260)
chr2 (221-381)||(24687161-24687322)
chr2 (197-374)||(3800613-3800791)
chr2 (24-95)||(8941712-8941784)
chr2 (24-95)||(19888848-19888920)
chr2 (39-216)||(25210909-25211076)
chr2 (197-374)||(34822676-34822854)
chr2 (142-209)||(34822578-34822645)
chr2 (24-93)||(6877721-6877791)
chr2 (197-290)||(19888362-19888456)
chr2 (108-216)||(20629142-20629243)
chr2 (108-216)||(43644713-43644814)
chr2 (197-374)||(12726531-12726709)
chr2 (144-216)||(25211108-25211180)
chr2 (142-209)||(3800822-3800889)
chr2 (197-290)||(5889880-5889974)
chr2 (24-216)||(9654615-9654792)
chr2 (197-290)||(11232835-11232929)
chr2 (197-290)||(14908022-14908116)
chr2 (197-290)||(22514682-22514776)
chr2 (197-290)||(28777283-28777377)
chr2 (24-96)||(22654339-22654412)
chr2 (217-274)||(24828161-24828218)
chr2 (217-274)||(24832613-24832670)
chr2 (194-274)||(720835-720918)
chr2 (197-299)||(8942124-8942228)
chr2 (197-374)||(23773015-23773193)
chr2 (221-299)||(17398170-17398249)
chr2 (142-216)||(3800969-3801043)
chr2 (197-290)||(20013601-20013695)
chr2 (24-93)||(22273164-22273233)
chr2 (197-290)||(23818658-23818752)
chr2 (142-216)||(24089074-24089146)
chr2 (217-267)||(25211379-25211429)
chr2 (162-215)||(461007-461060)
chr2 (108-153)||(23806359-23806404)
[»] scaffold0462 (1 HSPs)
scaffold0462 (24-400)||(4425-4805)
[»] scaffold0395 (1 HSPs)
scaffold0395 (24-400)||(13964-14354)
[»] scaffold0171 (1 HSPs)
scaffold0171 (24-290)||(31038-31304)
[»] scaffold0008 (3 HSPs)
scaffold0008 (24-290)||(20860-21128)
scaffold0008 (24-291)||(28450-28719)
scaffold0008 (202-376)||(129700-129877)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (108-400)||(249025-249313)
[»] scaffold0447 (6 HSPs)
scaffold0447 (194-400)||(3095-3301)
scaffold0447 (142-216)||(2737-2811)
scaffold0447 (142-216)||(2865-2939)
scaffold0447 (149-216)||(2616-2683)
scaffold0447 (142-216)||(2993-3067)
scaffold0447 (24-110)||(2475-2561)
[»] scaffold0383 (7 HSPs)
scaffold0383 (194-400)||(5703-5909)
scaffold0383 (160-290)||(813-943)
scaffold0383 (149-216)||(5480-5547)
scaffold0383 (142-216)||(5601-5675)
scaffold0383 (24-216)||(328-511)
scaffold0383 (24-110)||(5339-5425)
scaffold0383 (142-216)||(641-715)
[»] scaffold0622 (3 HSPs)
scaffold0622 (142-400)||(7842-8108)
scaffold0622 (40-216)||(7453-7631)
scaffold0622 (139-216)||(7682-7759)
[»] scaffold0480 (1 HSPs)
scaffold0480 (24-291)||(7012-7287)
[»] scaffold0396 (4 HSPs)
scaffold0396 (196-400)||(13680-13884)
scaffold0396 (197-376)||(15922-16103)
scaffold0396 (123-216)||(13914-14007)
scaffold0396 (24-99)||(14078-14154)
[»] scaffold2147 (1 HSPs)
scaffold2147 (24-290)||(535-802)
[»] scaffold0434 (2 HSPs)
scaffold0434 (194-400)||(3129-3335)
scaffold0434 (24-216)||(2907-3101)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (142-400)||(3784-4044)
[»] scaffold0692 (1 HSPs)
scaffold0692 (24-290)||(1046-1307)
[»] scaffold0195 (8 HSPs)
scaffold0195 (141-400)||(19799-20067)
scaffold0195 (195-400)||(17776-17983)
scaffold0195 (247-400)||(8140-8293)
scaffold0195 (247-400)||(13529-13682)
scaffold0195 (24-216)||(17526-17716)
scaffold0195 (24-216)||(19556-19746)
scaffold0195 (24-96)||(8466-8539)
scaffold0195 (24-96)||(13855-13928)
[»] scaffold0120 (2 HSPs)
scaffold0120 (217-400)||(27067-27250)
scaffold0120 (39-104)||(26889-26954)
[»] scaffold0009 (5 HSPs)
scaffold0009 (24-208)||(236412-236597)
scaffold0009 (195-400)||(236652-236857)
scaffold0009 (142-380)||(270545-270785)
scaffold0009 (24-216)||(270329-270515)
scaffold0009 (296-340)||(255963-256007)
[»] scaffold0116 (3 HSPs)
scaffold0116 (24-216)||(27950-28145)
scaffold0116 (142-290)||(28179-28327)
scaffold0116 (142-216)||(28125-28199)
[»] scaffold0051 (2 HSPs)
scaffold0051 (161-400)||(56369-56615)
scaffold0051 (24-196)||(56206-56370)
[»] scaffold0269 (4 HSPs)
scaffold0269 (24-215)||(3055-3248)
scaffold0269 (24-216)||(281-477)
scaffold0269 (216-376)||(577-739)
scaffold0269 (202-290)||(3430-3518)
[»] scaffold0049 (2 HSPs)
scaffold0049 (24-215)||(30650-30843)
scaffold0049 (202-290)||(31002-31090)
[»] scaffold0190 (2 HSPs)
scaffold0190 (141-400)||(8493-8754)
scaffold0190 (24-79)||(8387-8443)
[»] scaffold0359 (2 HSPs)
scaffold0359 (24-216)||(13548-13740)
scaffold0359 (166-290)||(13434-13557)
[»] scaffold0138 (3 HSPs)
scaffold0138 (24-290)||(15006-15271)
scaffold0138 (24-215)||(26451-26642)
scaffold0138 (307-400)||(23915-24009)
[»] scaffold0673 (2 HSPs)
scaffold0673 (106-290)||(3707-3893)
scaffold0673 (24-110)||(3927-4014)
[»] scaffold0483 (2 HSPs)
scaffold0483 (24-216)||(4638-4831)
scaffold0483 (194-376)||(4250-4435)
[»] scaffold0109 (2 HSPs)
scaffold0109 (24-216)||(49478-49671)
scaffold0109 (194-376)||(49090-49275)
[»] scaffold0037 (4 HSPs)
scaffold0037 (131-290)||(26416-26575)
scaffold0037 (280-400)||(70883-71003)
scaffold0037 (24-284)||(66322-66592)
scaffold0037 (24-93)||(26590-26660)
[»] scaffold0077 (1 HSPs)
scaffold0077 (24-216)||(21633-21827)
[»] scaffold0023 (5 HSPs)
scaffold0023 (24-216)||(156183-156376)
scaffold0023 (24-216)||(85966-86149)
scaffold0023 (196-372)||(34811-34989)
scaffold0023 (142-209)||(156062-156129)
scaffold0023 (197-290)||(155937-156031)
[»] scaffold0058 (2 HSPs)
scaffold0058 (247-400)||(71768-71922)
scaffold0058 (24-96)||(72093-72166)
[»] scaffold0342 (2 HSPs)
scaffold0342 (24-207)||(2474-2658)
scaffold0342 (24-290)||(4078-4346)
[»] scaffold0034 (3 HSPs)
scaffold0034 (26-216)||(77600-77793)
scaffold0034 (216-274)||(77919-77977)
scaffold0034 (122-169)||(35999-36047)
[»] scaffold0610 (2 HSPs)
scaffold0610 (250-400)||(2112-2262)
scaffold0610 (24-96)||(2438-2511)
[»] scaffold0253 (1 HSPs)
scaffold0253 (24-207)||(14849-15032)
[»] scaffold0022 (6 HSPs)
scaffold0022 (251-400)||(106409-106559)
scaffold0022 (24-270)||(113902-114150)
scaffold0022 (197-376)||(6649-6830)
scaffold0022 (246-359)||(130409-130522)
scaffold0022 (197-376)||(58936-59117)
scaffold0022 (194-290)||(108058-108156)
[»] scaffold0292 (2 HSPs)
scaffold0292 (24-215)||(17735-17928)
scaffold0292 (194-290)||(18055-18151)
[»] scaffold0191 (1 HSPs)
scaffold0191 (24-210)||(499-683)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (39-216)||(29653-29830)
[»] scaffold0031 (4 HSPs)
scaffold0031 (184-361)||(68785-68964)
scaffold0031 (27-200)||(68597-68773)
scaffold0031 (353-400)||(69394-69441)
scaffold0031 (24-241)||(30314-30531)
[»] scaffold0184 (3 HSPs)
scaffold0184 (24-216)||(33395-33580)
scaffold0184 (202-380)||(32688-32869)
scaffold0184 (167-290)||(33725-33848)
[»] scaffold0078 (3 HSPs)
scaffold0078 (24-216)||(39264-39449)
scaffold0078 (202-380)||(39975-40156)
scaffold0078 (167-290)||(38996-39119)
[»] scaffold0338 (2 HSPs)
scaffold0338 (27-216)||(6984-7175)
scaffold0338 (206-290)||(7214-7298)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (251-400)||(4842-4991)
[»] scaffold0158 (2 HSPs)
scaffold0158 (24-173)||(23040-23190)
scaffold0158 (24-92)||(16376-16445)
[»] scaffold0597 (2 HSPs)
scaffold0597 (142-380)||(2627-2869)
scaffold0597 (24-216)||(2899-3083)
[»] scaffold0234 (1 HSPs)
scaffold0234 (24-274)||(19248-19489)
[»] scaffold0044 (2 HSPs)
scaffold0044 (55-214)||(94335-94495)
scaffold0044 (194-241)||(94695-94742)
[»] scaffold0028 (5 HSPs)
scaffold0028 (142-290)||(90600-90748)
scaffold0028 (272-381)||(78228-78337)
scaffold0028 (24-216)||(90802-91018)
scaffold0028 (197-358)||(128867-129026)
scaffold0028 (142-216)||(128730-128804)
[»] scaffold0025 (4 HSPs)
scaffold0025 (202-380)||(145016-145195)
scaffold0025 (202-380)||(147275-147454)
scaffold0025 (162-216)||(144926-144980)
scaffold0025 (162-216)||(147185-147239)
[»] scaffold0095 (2 HSPs)
scaffold0095 (251-400)||(7153-7303)
scaffold0095 (24-96)||(7416-7489)
[»] scaffold0053 (1 HSPs)
scaffold0053 (251-381)||(78342-78472)
[»] scaffold0016 (2 HSPs)
scaffold0016 (251-400)||(118094-118244)
scaffold0016 (206-290)||(163817-163901)
[»] scaffold0032 (5 HSPs)
scaffold0032 (196-378)||(54118-54300)
scaffold0032 (160-376)||(109582-109799)
scaffold0032 (142-216)||(109897-109971)
scaffold0032 (108-216)||(54011-54112)
scaffold0032 (162-215)||(110002-110055)
[»] scaffold0004 (3 HSPs)
scaffold0004 (202-380)||(197600-197778)
scaffold0004 (246-360)||(84942-85056)
scaffold0004 (246-360)||(26080-26194)
[»] scaffold0092 (1 HSPs)
scaffold0092 (24-293)||(1652-1925)
[»] scaffold0315 (2 HSPs)
scaffold0315 (81-216)||(16826-16961)
scaffold0315 (216-274)||(17070-17128)
[»] scaffold0080 (1 HSPs)
scaffold0080 (230-400)||(25101-25274)
[»] scaffold0013 (1 HSPs)
scaffold0013 (259-381)||(34006-34128)
[»] scaffold0003 (3 HSPs)
scaffold0003 (202-380)||(217246-217426)
scaffold0003 (24-208)||(5221-5396)
scaffold0003 (197-290)||(5661-5755)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (216-360)||(3244-3393)
[»] scaffold0335 (1 HSPs)
scaffold0335 (24-216)||(9930-10122)
[»] scaffold0467 (2 HSPs)
scaffold0467 (194-380)||(11532-11716)
scaffold0467 (108-157)||(11796-11845)
[»] scaffold0302 (1 HSPs)
scaffold0302 (197-376)||(4320-4501)
[»] scaffold0589 (1 HSPs)
scaffold0589 (31-290)||(6123-6386)
[»] scaffold0266 (2 HSPs)
scaffold0266 (202-373)||(5102-5274)
scaffold0266 (202-290)||(12788-12876)
[»] scaffold0346 (3 HSPs)
scaffold0346 (252-400)||(14101-14250)
scaffold0346 (140-216)||(15935-16011)
scaffold0346 (194-268)||(15833-15907)
[»] scaffold0104 (1 HSPs)
scaffold0104 (197-376)||(51511-51690)
[»] scaffold0039 (3 HSPs)
scaffold0039 (81-216)||(21158-21288)
scaffold0039 (194-290)||(20906-21002)
scaffold0039 (142-216)||(21030-21104)
[»] scaffold0808 (1 HSPs)
scaffold0808 (24-290)||(3125-3395)
[»] scaffold0407 (3 HSPs)
scaffold0407 (24-216)||(6410-6583)
scaffold0407 (194-290)||(6310-6406)
scaffold0407 (24-120)||(22-119)
[»] scaffold0225 (2 HSPs)
scaffold0225 (197-376)||(14779-14958)
scaffold0225 (197-376)||(28300-28479)
[»] scaffold0786 (2 HSPs)
scaffold0786 (246-381)||(211-346)
scaffold0786 (246-381)||(5266-5401)
[»] scaffold0390 (1 HSPs)
scaffold0390 (246-381)||(3799-3934)
[»] scaffold0327 (1 HSPs)
scaffold0327 (262-381)||(4568-4686)
[»] scaffold0001 (2 HSPs)
scaffold0001 (24-208)||(75550-75727)
scaffold0001 (219-290)||(72106-72177)
[»] scaffold1753 (1 HSPs)
scaffold1753 (256-380)||(1-126)
[»] scaffold0134 (2 HSPs)
scaffold0134 (82-205)||(25594-25718)
scaffold0134 (142-206)||(25735-25799)
[»] scaffold0026 (2 HSPs)
scaffold0026 (197-376)||(106479-106660)
scaffold0026 (24-216)||(27169-27352)
[»] scaffold0103 (2 HSPs)
scaffold0103 (125-290)||(31925-32093)
scaffold0103 (24-99)||(31776-31850)
[»] scaffold1560 (1 HSPs)
scaffold1560 (195-376)||(1292-1469)
[»] scaffold1404 (1 HSPs)
scaffold1404 (197-376)||(35-215)
[»] scaffold0106 (2 HSPs)
scaffold0106 (202-290)||(40010-40098)
scaffold0106 (24-95)||(37627-37697)
[»] scaffold0073 (1 HSPs)
scaffold0073 (256-360)||(55922-56026)
[»] scaffold0066 (2 HSPs)
scaffold0066 (51-212)||(44288-44443)
scaffold0066 (51-197)||(52457-52597)
[»] scaffold0132 (1 HSPs)
scaffold0132 (202-380)||(41190-41371)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (197-376)||(9426-9607)
[»] scaffold0014 (2 HSPs)
scaffold0014 (142-270)||(145283-145413)
scaffold0014 (24-96)||(144987-145060)
[»] scaffold0498 (1 HSPs)
scaffold0498 (202-376)||(7465-7641)
[»] scaffold0130 (3 HSPs)
scaffold0130 (51-146)||(12989-13085)
scaffold0130 (24-95)||(31120-31192)
scaffold0130 (142-200)||(31333-31391)
[»] scaffold1140 (2 HSPs)
scaffold1140 (196-274)||(1509-1587)
scaffold1140 (24-157)||(1298-1427)
[»] scaffold0018 (2 HSPs)
scaffold0018 (314-380)||(52771-52837)
scaffold0018 (314-380)||(56723-56789)
[»] scaffold0529 (1 HSPs)
scaffold0529 (24-216)||(804-987)
[»] scaffold0384 (2 HSPs)
scaffold0384 (197-289)||(1-94)
scaffold0384 (24-216)||(264-448)
[»] scaffold0226 (1 HSPs)
scaffold0226 (24-95)||(15167-15239)
[»] scaffold0218 (2 HSPs)
scaffold0218 (202-274)||(6826-6898)
scaffold0218 (24-216)||(6934-7115)
[»] scaffold0450 (2 HSPs)
scaffold0450 (24-110)||(4639-4725)
scaffold0450 (141-209)||(4528-4596)
[»] scaffold0107 (1 HSPs)
scaffold0107 (221-374)||(29855-30009)
[»] scaffold0215 (1 HSPs)
scaffold0215 (197-381)||(17586-17771)
[»] scaffold0076 (1 HSPs)
scaffold0076 (197-290)||(37768-37862)
[»] scaffold0057 (1 HSPs)
scaffold0057 (314-360)||(4532-4578)
[»] scaffold0750 (1 HSPs)
scaffold0750 (141-290)||(2839-2989)
[»] scaffold0124 (2 HSPs)
scaffold0124 (141-290)||(26542-26692)
scaffold0124 (197-290)||(3160-3254)
[»] scaffold0112 (1 HSPs)
scaffold0112 (296-340)||(12285-12329)
[»] scaffold0141 (1 HSPs)
scaffold0141 (197-290)||(25382-25476)
[»] scaffold0121 (1 HSPs)
scaffold0121 (24-65)||(7299-7341)
[»] scaffold0521 (1 HSPs)
scaffold0521 (198-271)||(7049-7125)


Alignment Details
Target: scaffold0240 (Bit Score: 305; Significance: 1e-171; HSPs: 1)
Name: scaffold0240
Description:

Target: scaffold0240; HSP #1
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 24 - 399
Target Start/End: Original strand, 5845 - 6221
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 122  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||  |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||    
T  5845 acatcattataatccaaataacagttaacatgaatatttcaattcaaacatcatgtatttgatcaataataacattctcatacatatagttacattaaac 5944  T
Q  123 cccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaataaga 222  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  5945 cccaatatctcacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaataaaa 6044  T
Q  223 ctcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagat 322  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  6045 ctcatgtcatgatatgcacctatcgacacatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaaatatcgtatgtaagat 6144  T
Q  323 ttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaatctcaacacgactatgat 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6145 ttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaatctcaacacgactatgat 6221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 294; Significance: 1e-165; HSPs: 3)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 24 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 138673 - 138296
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 122  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  138673 acatcatcataatccaaataacagttaacattaatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattttcatacttatacttacatcaaac 138574  T
Q  123 cccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaataaga 222  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  138573 cccaatatctcacatcaataatcaccaatcacatgtttcatgaacaaatatcaattcaaaattatttatacacaatcaccaatcacatatatcaataaga 138474  T
Q  223 ctcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagat 322  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  138473 ctcatgtcatgatatgcacctatcgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaaacatcgtatgtaatat 138374  T
Q  323 ttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaatctcaacacgactatgatg 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  138373 ttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaatctcaacacgactatgatg 138296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 24 - 290
Target Start/End: Original strand, 76589 - 76853
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 122  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||  |||   |||||||||||||||    
T  76589 acatcatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatataaacatcatgcacttgat---taataatattcatatatcaatacttacatcaaac 76685  T
Q  123 cccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaataaga 222  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  76686 cccaatatctcacatcaataatcatcaatcacatgtgtcatgaacaaatctcaattcacaattattcatgcacaatcaccaatcacatatatcaataaga 76785  T
Q  223 ctcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 290  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  76786 ctcatgtcatgatatgcacctattgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 76853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 128 - 270
Target Start/End: Original strand, 10003 - 10148
Alignment:
Q  128 tatcttacatcaat-aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatat-atcaataagactc 225  Q
    ||||| |||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||  |||||  |||| |||||||||||||||||||| |||||| | | |||||||||||    
T  10003 tatctcacatcaattaatcatcaatcacatgtgccatgaacaatcatcaaatcacatttattcatacacaatcatcattcacatttcagcaataagactc 10102  T
Q  226 atgtcatgatatgcacata--tcgacgcatacatgcatgtggtacca 270  Q
    ||| |||||| || || ||   |||| ||||||||||||||||||||    
T  10103 atg-catgatgtgtacctagcccgacacatacatgcatgtggtacca 10148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 291; Significance: 1e-163; HSPs: 95)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 24 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 26072131 - 26071753
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaa-a 121  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  26072131 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaga 26072032  T
Q  122 ccccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaataag 221  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26072031 ccccaatatctcacatcaataatcaccaatcacatgtgtcttgaacaaatatcaattcacaattattcatacacaatcaccaatcacatatatcaataag 26071932  T
Q  222 actcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaaga 321  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26071931 actcatgtcatgatatgcacctatcgacacatatatgcatgtggtatcggatcacctcaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaaacatcgtatgtaaga 26071832  T
Q  322 tttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaatctcaacacgactatgatg 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26071831 tttcacacccgtcttacataatctctgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaatctcaacacgactatgatg 26071753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 24 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 26095918 - 26095540
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaa-a 121  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  26095918 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaga 26095819  T
Q  122 ccccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaataag 221  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26095818 ccccaatatctcacatcaataatcaccaatcacatgtgtcttgaacaaatatcaattcacaattattcatacacaatcaccaatcacatatatcaataag 26095719  T
Q  222 actcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaaga 321  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26095718 actcatgtcatgatatgcacctatcgacacatatatgcatgtggtatcggatcacctcaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaaacatcgtatgtaaga 26095619  T
Q  322 tttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaatctcaacacgactatgatg 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26095618 tttcacacccgtcttacataatctctgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaatctcaacacgactatgatg 26095540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 24 - 400
Target Start/End: Original strand, 3893381 - 3893772
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatata------cttaca 116  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| | |||||||||||| |||| |||||| |||||      ||||||    
T  3893381 acatcatcataatccaaataacagttaacatgaata-ttcaacataaacatcatgcatttgatcaataatgatatcctcataaatatatatatacttaca 3893479  T
Q  117 tcaaa-ccccaatatcttacatcaataa-tcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcac-----a 209  Q
    ||||| ||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||     |    
T  3893480 tcaaaaccccaatatctcacattaataaatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaacatcaatgcacaattattcatacacaatcaccaatcaccaatca 3893579  T
Q  210 tatatc--aataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaa 307  Q
     || ||  |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3893580 catttccaaataagactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaaa 3893679  T
Q  308 catcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaatctcaacacgactatgatg 400  Q
    ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3893680 catcgtatgtaagagttcacacctgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaatctcaacacgactatgatg 3893772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 24 - 400
Target Start/End: Original strand, 12753172 - 12753558
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 122  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | | ||||||| |||| |     
T  12753172 acatcatcataatccaaataacatttaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattcacaaata-atacttatatcacat 12753270  T
Q  123 cc-caatatcttacatcaat-aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcac-----atatatc 215  Q
     | |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||   || ||||||||||||| ||| |||||||     | || ||    
T  12753271 tctcaatatctcacatcaattaatcaccaatcacatgtgtcatgaaaaatcatcaatttgcagttattcatacacagtcaccaatcaccaatcacatttc 12753370  T
Q  216 aataa---gactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcg 312  Q
    || ||   ||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12753371 aaaaacaagactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaaacatcg 12753470  T
Q  313 catgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaatctcaacacgactatgatg 400  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12753471 tatttaagatttcacacccgtcttacataatttccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaatctcaacatgactatgatg 12753558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 24 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 15824371 - 15824105
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 122  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15824371 acatcatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 15824272  T
Q  123 cccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaataaga 222  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||| ||| |||||| ||||||||||    
T  15824271 cccaatatctcacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatttccaattattcatacataatcaccaaacacatacatcaataaga 15824172  T
Q  223 ctcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtca 289  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15824171 ctcatgtcatgatatgcacctatcgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtca 15824105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 24 - 290
Target Start/End: Original strand, 44863443 - 44863711
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaa- 121  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  44863443 acatcattataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatttaaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacttatacttacatcaaaa 44863542  T
Q  122 ccccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaataag 221  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  44863543 ccccaatatctcacatcaataatcaccaatcgcatgtgtcatgaacaaatatcaattcacaattattcatacacaatcaccaatcacatacatcaataag 44863642  T
Q  222 actcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 290  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44863643 actcatgtcatgatattcacctatcgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 44863711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 24 - 290
Target Start/End: Original strand, 141869 - 142136
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 122  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  141869 acatcatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatttaatcatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 141968  T
Q  123 cccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaataaga 222  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||    
T  141969 cccaatatctcacatcaataatcaacaatcgcatgtgtcatgaacgaatatcaattcacaattattcatacacaataaccaatcacatacatcaataaga 142068  T
Q  223 ctcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 290  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  142069 ctcatgtcatgatatgcacctatcaacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 142136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 24 - 290
Target Start/End: Original strand, 47287976 - 47288244
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 122  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  47287976 acatcatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcgtacatatacttacatcaaaa 47288075  T
Q  123 -cccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaataag 221  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||    
T  47288076 acccaatatctcacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacaattattcatacacaatcaccaattacatacatcaataag 47288175  T
Q  222 actcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 290  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||| | |||||| |||||    
T  47288176 actcatgtcatgatatgcacctatcgacacatatatgcatgtggtaccaaatcatcccaaggttgtcac 47288244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 24 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 113168 - 112784
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 122  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||||| || |   | ||||   ||||||||||||||     
T  113168 acatcatcataatccaaataacatttagcatgaatatttcaaaataaacattatgcacttgatcaatagtagt---cacatatcaatacttacatcaaaa 113072  T
Q  123 cccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca------ 216  Q
    | |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||| |||| |||||||||  ||  ||          
T  113071 ctcaatatctcacatcaataataaccaatcacatgtgtcatgaacaaacaacaattcacatttattcatacgcaattatcaatcaccaatcacattttca 112972  T
Q  217 -ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtc---actttcgatgcaacaaaaacatcg 312  Q
     ||||||||||||||||||||||||| |||  || |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||   || |||||||||||||||||||||    
T  112971 aataagactcatgtcatgatatgcacttattaacacataaatgcatgtggtaccgaatcacctcaaggtcgtcgtcaccttcgatgcaacaaaaacatcg 112872  T
Q  313 catgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaatctcaacacgactatgatg 400  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  112871 tatgtaagagttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaatccttttacaactacaatctcaacacgactatgatg 112784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 126 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 45454016 - 45453745
Alignment:
Q  126 aatatcttacatcaataa-tcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaataagact 224  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||  |||||||||||||||| |||||||| ||   |||||||||    
T  45454016 aatatctcacatcaataaatcaccaatcacatgtgtcatgaacaatcatcaattcacagctattcatacacaatcaccaatcaca-attcaaataagact 45453918  T
Q  225 catgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagattt 324  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||  |||||||||||||| |||| |||||||||||||||   ||| |||||||||||    
T  45453917 catgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcatcaccttcgatgcaacaaaa---tcgtatgtaagattt 45453821  T
Q  325 cacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaatctcaacacgactatgatg 400  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  45453820 cacatccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaatctcaacatgactatgatg 45453745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 124 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 1938532 - 1938257
Alignment:
Q  124 ccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaataagac 223  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||  ||||| ||||||| | | | ||||||||    
T  1938532 ccaatatctcacatcaataaccaccaatcacatgtgtcatggacaaatatcaatacacaattatgcatacgtaatcaccaatcacgtttctaaataagac 1938433  T
Q  224 tcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatt 323  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| || |||| |  ||| |||||| |||||||  |    
T  1938432 tcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcacctttgatg-ataaaacacatcgtatgtaagggt 1938334  T
Q  324 tcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaatctcaacacgactatgatg 400  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1938333 tcacacccaccttacataatctccgaagtaaaagagttcaactcttttacaactacaatctcaacaagactatgatg 1938257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 24 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 7286522 - 7286328
Alignment:
Q  24 acatcatcataatcca-ataacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaa- 121  Q
    |||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  7286522 acatcatcataatcaacataacagttaacatgaataattcaatataaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatatatatacttacatcaaaa 7286423  T
Q  122 ccccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 216  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  7286422 ccccaatatctcacattaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcatatacatca 7286328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 24 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 12545802 - 12545607
Alignment:
Q  24 acatcatcataatcca-ataacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaa- 121  Q
    ||||||||||| |||| || ||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  12545802 acatcatcatagtccacattacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcttatacatatacttacatcaaaa 12545703  T
Q  122 -ccccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 216  Q
     ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12545702 accccaatatctcacatcaacaatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacggttattcatacacaatcaccaatcacatatatca 12545607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 24 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 18305831 - 18305642
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 122  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   ||| ||||   ||||||||| |||||    
T  18305831 acatcatcataatccaaataacagttaacatgaataattcaatataaacatcatgcacttgatcaataata---ttcacatatcaatacttacaccaaac 18305735  T
Q  123 cccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatc 215  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18305734 cccaatatctcacatcaataatcatcaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacaattattcatacacaatcgtcaatcacatatatc 18305642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 24 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 13868080 - 13867887
Alignment:
Q  24 acatcatcataatcca-ataacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatca-aa 121  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||    
T  13868080 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatatatatacttatatcataa 13867981  T
Q  122 ccccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatc 215  Q
     | |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  13867980 tctcaatatctcacattaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttatttatacacaatcaccaatcacatatatc 13867887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 24 - 217
Target Start/End: Original strand, 7290908 - 7291102
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 122  Q
    |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||     
T  7290908 acattatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatatcaatacttacatcaaat 7291007  T
Q  123 cccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaa 217  Q
    |||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| ||| |||||    
T  7291008 cccaatatctcacattaataatcatcaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcatatacatcaa 7291102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 247 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 15914075 - 15913921
Alignment:
Q  247 gacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctc 346  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15914075 gacgcataaatgcatgtggtaccgaatcacctcaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaaacatcgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatctc 15913976  T
Q  347 cgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaa-tctcaacacgactatgatg 400  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  15913975 cgaagtaaaagagctcaacccttttacaactacaagactcaacatgactatgatg 15913921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 24 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 2192799 - 2192606
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 122  Q
    |||| |||||||||||| |||||  ||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |   |||||||||||||||    
T  2192799 acattatcataatccaaataacatataacatgaatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattcccacatcaatacttacatcaaac 2192700  T
Q  123 cccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 216  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  2192699 cccaatatctcacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcatatacatca 2192606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 24 - 216
Target Start/End: Original strand, 369143 - 369336
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 122  Q
    |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| || |   |||||||||||||||    
T  369143 acattatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatataaacatcatacatttgatcaataataatattcccacatcaatacttacatcaaac 369242  T
Q  123 cccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 216  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||| ||| ||||    
T  369243 cccaatatctcacatcaatcatcaccaatcacatgtgtcatgaacaattatcaattcacagttattcatacacaattatcaatcatatacatca 369336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 24 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 14253263 - 14253071
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 122  Q
    |||||| |||||||||| ||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |   |||||||||||||||    
T  14253263 acatcaacataatccaaataacagttaacatgattatttcaatataaacatcatgcacttgattaataataatattctcaaatcaatacttacatcaaac 14253164  T
Q  123 cccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 216  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  14253163 cccaatatctcacatcaataataaccaatcacatgtgtcatg-acaaatatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcatatacatca 14253071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 24 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 16481029 - 16480836
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 122  Q
    |||| |||||||||||| |||||  ||||||||||| |||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||| || |   |||||||||||||||    
T  16481029 acattatcataatccaaataacagataacatgaatatttcaatttaaacatcatgcacatgatcaataataatattcccacatcaatacttacatcaaac 16480930  T
Q  123 cccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 216  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  16480929 cccaatatctcacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcatagttattcatacacaatcaccaatcatatacatca 16480836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 24 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 15953050 - 15952859
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 122  Q
    |||| |||||||||||| ||| | |||||||||||| ||||||   ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||    
T  15953050 acattatcataatccaaataatagttaacatgaatatttcaatt--aacatcatgcatttgatcaataataatattctcatatcaatacttacatcaaac 15952953  T
Q  123 cccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 216  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  15952952 cccaatatctcacatcaatattcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcatatacatca 15952859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 216 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 9058311 - 9058141
Alignment:
Q  216 aataagactcatgtca---tgatatgcacata--tcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacat 310  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||| ||  ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  9058311 aataagactcatgtcaacatgatatgcacctagttcgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaaacat 9058212  T
Q  311 cgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaa 381  Q
    || |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| | ||||||    
T  9058211 cgtatgtaagatttcacactcgtcttacataatcaccgaagtaaaagagctcaacccttttaaagctacaa 9058141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 24 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 49049723 - 49049452
Alignment:
Q  24 acatcatcataatcca-ataacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaa-taataatattctcatacatatacttacatca-a 120  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||| ||||| ||||||||| | |||| |||| | |||  || |    
T  49049723 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaatatcatgtacttaatcaaataataatatccacatatatattcatac--cata 49049626  T
Q  121 accccaatatcttacatcaat-aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatat-atcaat 218  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||  |||| |||||||| |||| | |||| |||||| | ||||||    
T  49049625 atcccaatatcttacatcaattaatcaccaatcacatgtgtcatgaacaatcatcaaatcacatttattcatgcacactaatcattcacatttcatcaat 49049526  T
Q  219 aagactcatgtcatgatatgcacata--tcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 290  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||  ||||| |||| |||||||||||||||  |||| |||||||||||||    
T  49049525 aagactcatgtcatgatgtgcacctagttcgacacatatatgcatgtggtaccatttcacttcaaggtcgtcac 49049452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 251 - 400
Target Start/End: Original strand, 13388493 - 13388643
Alignment:
Q  251 catacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaa 350  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  13388493 cataaatgcatgtggtaccgaatcacctcaaggtcgtcaccttcgatgcaacagaaacatcgtatgtaagatttcacacccgtattacataatcaccgaa 13388592  T
Q  351 gtaaaagagttcaacccttttacaactacaa-tctcaacacgactatgatg 400  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||  ||||||| ||||||||||    
T  13388593 gtaaaagagctcaacccttttacaactataagactcaacatgactatgatg 13388643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 196 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 15762051 - 15761867
Alignment:
Q  196 aatcatcaatcacatatatcaa-taagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttc 294  Q
    ||||| ||| ||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| |||    
T  15762051 aatcaccaaccacatttatcaaataagactcatgttatgatatgcacttattgacgcataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcaccttc 15761952  T
Q  295 gatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactaca 380  Q
    ||||  | ||| |||||| |||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15761951 gatgata-aaacacatcgtatgtaagggttcacacccgccttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactaca 15761867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 194 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 32496242 - 32496053
Alignment:
Q  194 acaatcatcaatcacatatatcaa-taagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactt 292  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| |    
T  32496242 acaatcaccaatcacatatatcaaataagactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcacct 32496143  T
Q  293 tcgatgcaacaa--aaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactaca 380  Q
     ||||| |||||   ||||||| |||||||  ||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  32496142 ccgatggaacaactcaacatcgtatgtaagggttcacccccgcgttacataatctccgaagtaaaagagctcaacccttttacaactaca 32496053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 251 - 376
Target Start/End: Original strand, 13376200 - 13376324
Alignment:
Q  251 catacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaa 350  Q
    |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  13376200 cataaatgcatatggtaccgaatcacctcaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaaacatcatatgtaagatttcaca-ccgtcttacataatcaccgaa 13376298  T
Q  351 gtaaaagagttcaacccttttacaac 376  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||    
T  13376299 gtaaaagagctcaacccttttacaac 13376324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 24 - 270
Target Start/End: Original strand, 15629004 - 15629255
Alignment:
Q  24 acatcatcataatcca-ataacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaa-taataatattctcatacatatacttacatca-a 120  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||| ||||| | ||||||| |  ||| |||| | |||  || |    
T  15629004 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaatatcatgtacttaatcaaatcataatatccatatatatattcatac--cata 15629101  T
Q  121 accccaatatcttacatcaat-aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatat-atcaat 218  Q
    | ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||  |||||  |||| |||||||| ||||||||||| |||||| | | ||||    
T  15629102 atcccaatatcttacatcaattaatcaccaatcagatgtgttatgaacaatcatcaactcacatttattcatgcacaatcatcattcacatttcaccaat 15629201  T
Q  219 aagactcatgtcatgatatgcacata--tcgacgcatacatgcatgtggtacca 270  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||  ||||| |||| |||||||||||||||    
T  15629202 aagactcatgtcatgatgtgcacctagttcgacacatatatgcatgtggtacca 15629255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 246 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 20587254 - 20587140
Alignment:
Q  246 cgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatct 345  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  20587254 cgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactcatgatgcaacaaaaacatcatatgtaagatttcacacccgtcttacattatca 20587155  T
Q  346 ccgaagtaaaagagt 360  Q
    ||||| |||||||||    
T  20587154 ccgaaataaaagagt 20587140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 194 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 13867784 - 13867688
Alignment:
Q  194 acaatcatcaatcacatatatcaataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 290  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13867784 acaatcaccaaccacatatatcaataagactcatgtcatgatatgcacctatcgacacatatatgcatgtggtaccaaatctcctcaaggtcgtcac 13867688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 24 - 289
Target Start/End: Original strand, 13272976 - 13273246
Alignment:
Q  24 acatcatcataatcca-ataacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaa-taataatattctcatacatatacttacatca-a 120  Q
    ||||||||||||| || |||||| || ||| ||||||||||||  ||| ||||||||||| ||||| ||||||||| | |||| | || | |||  || |    
T  13272976 acatcatcataattcacataacagttgacaagaataattcaattcaaatatcatgtacttaatcaaataataatatccacatatacattcatac--cata 13273073  T
Q  121 accccaatatcttacatcaat-aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatat-atcaat 218  Q
    | ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||  |||||  |||| |||| ||| ||||||||||| |||||| | | ||||    
T  13273074 atcccgatatcttacatcaattaatcaccaatcacatgtgtctggaacaatcatcaaatcacatttatccatgcacaatcatcattcacatttcaccaat 13273173  T
Q  219 aagactcatgtcatgatatgcacata--tcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtca 289  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||  ||||| |||| |||||||||||||||  |||| ||||||||||||    
T  13273174 aagactcatgtcatgatgtgcacctagttcgacacatatatgcatgtggtaccatttcacttcaaggtcgtca 13273246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 256 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 8565212 - 8565108
Alignment:
Q  256 atgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaa 355  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  8565212 atgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcacccatgatgcaataaaaacatcatatgtaagatttcacacccgtcttacattatcaccgaagtaaa 8565113  T
Q  356 agagt 360  Q
    |||||    
T  8565112 agagt 8565108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 39 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 15762429 - 15762262
Alignment:
Q  39 aataacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatc-aaaccccaatatcttacat 137  Q
    ||||||| |||||||| ||| |||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  15762429 aataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcacatgcatatacttacatcaaaacctcaatatctcacat 15762330  T
Q  138 caataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatat 212  Q
    ||||||||| | ||||        |||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  15762329 caataatcatcgatca-------tatgaacaattatcaactcacaattattcatacacaatcaccgatcacatat 15762262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 197 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 18255505 - 18255324
Alignment:
Q  197 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcg 295  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| | ||    
T  18255505 atcaccaatcacatatatcacataagactcatgttatgatatgcacttattgactcataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcacctccg 18255406  T
Q  296 atgcaacaa--aaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaac 376  Q
    |||  ||||   ||||||| |||||||  ||||| |||| |||||||||||||||||||||||| | | | ||||||||||||    
T  18255405 atg-gacaagtcaacatcgtatgtaagggttcacccccgccttacataatctccgaagtaaaagcgcttagcccttttacaac 18255324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 251 - 380
Target Start/End: Original strand, 3058585 - 3058713
Alignment:
Q  251 catacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaa 350  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| |||||||  | ||| |||||| |||||||  |||||||||| |||| ||||||||||||    
T  3058585 cataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcaccttcgatgata-aaacacatcgtatgtaagggttcacacccgccttatataatctccgaa 3058683  T
Q  351 gtaaaagagttcaacccttttacaactaca 380  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3058684 gtaaaagagctcaacccttttacaactaca 3058713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 251 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 9322703 - 9322594
Alignment:
Q  251 catacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaa 350  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||    
T  9322703 catatatgcatgtggtaccaaatcacatcaaggtcgtcacccatgatgcaacaaaaacatcatatgtaagatttcacacccgtcttacattatcactgaa 9322604  T
Q  351 gtaaaagagt 360  Q
    ||||||||||    
T  9322603 gtaaaagagt 9322594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 194 - 290
Target Start/End: Original strand, 11285619 - 11285715
Alignment:
Q  194 acaatcatcaatcacatatatcaataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 290  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  11285619 acaatcattaatcacatttatcaataagactcatgtcatgatatgcacctattgacacatatatgcatgtggtaccaaattaactcaaggtcgtcac 11285715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 246 - 360
Target Start/End: Original strand, 28718977 - 28719091
Alignment:
Q  246 cgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatct 345  Q
    |||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||     
T  28718977 cgacacatatatgcatgtggtaccaagtcacctcaaggtcgtcacccatgatgcaacaaaaatatcacatgtaagatttcacacctgtcttacattatca 28719076  T
Q  346 ccgaagtaaaagagt 360  Q
    |||||||||| ||||    
T  28719077 ccgaagtaaacgagt 28719091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 194 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 11582631 - 11582535
Alignment:
Q  194 acaatcatcaatcacatatatcaataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 290  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||||  ||| |||||||||    
T  11582631 acaatcaccaatcacatatatcaataagactcatgccatgatatgcacctattgacacataaatgcatgtggtaccaaatcatttcagggtcgtcac 11582535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 160 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 15952813 - 15952673
Alignment:
Q  160 tcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgc 259  Q
    |||||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||||  ||||||||| |   |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||    
T  15952813 tcatgaacaattatcaattcacaaatattcattcacaatctccaatcacattttcaaataagactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgc 15952714  T
Q  260 atgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtca-ctttcgatgc 299  Q
    |||||||||||| || |  ||||||||||| ||||||||||    
T  15952713 atgtggtaccaagtctcaacaaggtcgtcacctttcgatgc 15952673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 123 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 16571921 - 16571751
Alignment:
Q  123 cccaatatcttacatcaat-aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaataag 221  Q
    ||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||  |||||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||| |   ||||||    
T  16571921 cccaatacctcacatcaattaatcaccaatcacatgtgtcgtgaacaatcatcaactcacagttattcatacacaatcaccaatcacatttcaaaataag 16571822  T
Q  222 actcatgtcatgatatgcacata--tcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 290  Q
    ||| |||||||| | ||||| ||  ||||| |||| |||||||||||||||  |||| |||||||| ||||    
T  16571821 acttatgtcatgttgtgcacctagttcgacacatatatgcatgtggtaccatttcacttcaaggtcatcac 16571751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 123 - 290
Target Start/End: Original strand, 16593741 - 16593911
Alignment:
Q  123 cccaatatcttacatcaat-aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaataag 221  Q
    ||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||  |||||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||| |   ||||||    
T  16593741 cccaatacctcacatcaattaatcaccaatcacatgtgtcgtgaacaatcatcaactcacagttattcatacacaatcaccaatcacatttcaaaataag 16593840  T
Q  222 actcatgtcatgatatgcacata--tcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 290  Q
    ||| |||||||| | ||||| ||  ||||| |||| |||||||||||||||  |||| |||||||| ||||    
T  16593841 acttatgtcatgttgtgcacctagttcgacacatatatgcatgtggtaccatttcacttcaaggtcatcac 16593911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 267 - 380
Target Start/End: Original strand, 125378 - 125492
Alignment:
Q  267 accaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaa-acatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaac 365  Q
    |||||||| ||  ||||||||||| ||||||| ||||||  |||||| |||||||  || ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  125378 accaaatctccaaaaggtcgtcaccttcgatggaacaaatcacatcgtatgtaagggtttacacccgccttacataatctccgaagtaaaagagctcaac 125477  T
Q  366 ccttttacaactaca 380  Q
    |||||||||||||||    
T  125478 ccttttacaactaca 125492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 24 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 16572053 - 16571983
Alignment:
Q  24 acatcatcataatcca-ataacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataata 93  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16572053 acatcatcataatccacataacaattaacatgaataattcaatttaaacatcatgtacttgatcaataata 16571983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 24 - 93
Target Start/End: Original strand, 16593609 - 16593679
Alignment:
Q  24 acatcatcataatcca-ataacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataata 93  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16593609 acatcatcataatccacataacaattaacatgaataattcaatttaaacatcatgtacttgatcaataata 16593679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 256 - 380
Target Start/End: Original strand, 2027097 - 2027222
Alignment:
Q  256 atgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaa-acatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaa 354  Q
    ||||||||||||||||||| |   ||||||||||| | ||||| |||||   |||||| |||||||  ||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  2027097 atgcatgtggtaccaaatctcgaaaaggtcgtcacctccgatggaacaactcacatcgtatgtaagggttcacccccgacttacataatctccgaagtaa 2027196  T
Q  355 aagagttcaacccttttacaactaca 380  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||    
T  2027197 aagagctcaacccttttacaactaca 2027222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 194 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 13038905 - 13038808
Alignment:
Q  194 acaatcatcaatcacatatatcaataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcact 291  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||    
T  13038905 acaatcaccaatcacatatatcaataaaactcatgccatgatatgcacctattgacacatatatgcatgtggtaccaaatcatttcagggtcgtcact 13038808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 119 - 216
Target Start/End: Original strand, 2024757 - 2024858
Alignment:
Q  119 aaaccccaatatcttacatcaataatcaccaatca----catgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatat 214  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    | |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  2024757 aaaccgcaatatctcacatcaataatcaccaatcaatcacgtgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaatcatcaatcatatacat 2024856  T
Q  215 ca 216  Q
    ||    
T  2024857 ca 2024858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 124 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 10862683 - 10862515
Alignment:
Q  124 ccaatatcttacatcaa-taatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatat-atcaataag 221  Q
    |||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||  |||||  |||| |||| |||  ||||||||||||||||| | | |||||||    
T  10862683 ccaatatcttacattaagtaaccaccaatcacatgtgtcatgaacaatcatcaac-cacatttat-catgaacaatcatcaatcacatttcaccaataag 10862586  T
Q  222 actcatgtcatgatatgcacata--tcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 290  Q
    ||| |||||||||||||||| ||  ||||| |||| |||||||  ||| |||||||| |||||||||||||    
T  10862585 acttatgtcatgatatgcacctagttcgacacatatatgcatgcagtagcaaatcacttcaaggtcgtcac 10862515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 155 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 12249908 - 12249771
Alignment:
Q  155 atgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaataagactcatgtcatgatatgcacata--tcgacgca 252  Q
    |||||||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||| |||  |||||||| |   |||||||||||||||||||| ||||| ||  ||||| ||    
T  12249908 atgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacattcactaatcacatttcgaaataagactcatgtcatgatgtgcacctagttcgacaca 12249809  T
Q  253 tacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 290  Q
    || ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||    
T  12249808 tatatgcatgtggtaccatatcacttcaaagtcgtcac 12249771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 194 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 12545501 - 12545404
Alignment:
Q  194 acaatcatcaatcacatatatcaataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtacc-aaatcacctcaaggtcgtcac 290  Q
    ||||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||  || ||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12545501 acaatcaccaaccacatttatcaataagacttatgtcatgatatgcaccaattgacacatatatgcatgtggtaccaaaatcacctcaaggtcgtcac 12545404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 142 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 12545627 - 12545553
Alignment:
Q  142 aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 216  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  12545627 aatcaccaatcacatatatcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcccatatatca 12545553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 202 - 274
Target Start/End: Original strand, 36051075 - 36051147
Alignment:
Q  202 caatcacatatatcaataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatc 274  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||| ||| |||| |||||||||||||||||||    
T  36051075 caatcacatatatcaataagactcatgttatgttatgcacctattgacacatatatgcatgtggtaccaaatc 36051147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 194 - 299
Target Start/End: Original strand, 369364 - 369471
Alignment:
Q  194 acaatcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtca-ct 291  Q
    ||||||| |||||||| || ||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||| ||    
T  369364 acaatcaccaatcacaaatttcacataagactcatgttatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacct 369463  T
Q  292 ttcgatgc 299  Q
    ||||||||    
T  369464 ttcgatgc 369471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 196 - 374
Target Start/End: Original strand, 10988092 - 10988271
Alignment:
Q  196 aatcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtca-cttt 293  Q
    ||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||| ||||    
T  10988092 aatcaccaatcacatatttcacataggactcatgctatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcaccttt 10988191  T
Q  294 cgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttac-ataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttaca 374  Q
    |||||| ||    |||||| |||||||   ||||||| | ||||| ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  10988192 cgatgccacttgcacatcgaatgtaagggctcacacctgccttacaataatct-cgaagtaaaagag-tcatcccttttaca 10988271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 202 - 273
Target Start/End: Original strand, 122987 - 123059
Alignment:
Q  202 caatcacatatatcaa-taagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaat 273  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||| ||||||    
T  122987 caatcacatatatcaaataagactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtgccaaat 123059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 194 - 274
Target Start/End: Original strand, 16210183 - 16210263
Alignment:
Q  194 acaatcatcaatcacatatatcaataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatc 274  Q
    |||||||  |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||| ||| |||| ||||| |||||||||||||    
T  16210183 acaatcacaaatcacatatatcaatgagactcatgccatgatatgcacctattgacacatatatgcacgtggtaccaaatc 16210263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 197 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 26010874 - 26010695
Alignment:
Q  197 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac-tttc 294  Q
    |||| ||||||||||  ||| ||| ||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||| ||| ||||||| |  |||||||||||| ||||    
T  26010874 atcaccaatcacataattcacataggactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgcggtgccaaatctcaacaaggtcgtcacctttc 26010775  T
Q  295 gatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttaca-taatctccgaagtaaaagagttcaacccttttaca 374  Q
    ||||| ||    |||||| |||||||   ||||||| | |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26010774 gatgccacttgcacatcgaatgtaagggctcacacctgccttacaataatctc-gaagtaaaagagttcaacccttttaca 26010695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 187 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 18305546 - 18305492
Alignment:
Q  187 ttcatacacaatcatcaatcacatatatcaataagactcatgtcatgatatgcac 241  Q
    |||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18305546 ttcataaacaatcaccaaccacatatatcaataagactcatgtcatgatatgcac 18305492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 24 - 88
Target Start/End: Original strand, 2024692 - 2024757
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaa 88  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  2024692 acatcatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaa 2024757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 197 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 2192453 - 2192376
Alignment:
Q  197 atcatcaatcacatatatcaat-aagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaat 273  Q
    |||| ||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||    
T  2192453 atcaccaatcacatttatcaaacaagactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaat 2192376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 197 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 15518539 - 15518435
Alignment:
Q  197 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtca-ctttc 294  Q
    |||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||| |||||    
T  15518539 atcaccaatcacatatttcacataggactcatgctatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttc 15518440  T
Q  295 gatgc 299  Q
    |||||    
T  15518439 gatgc 15518435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 24 - 208
Target Start/End: Original strand, 16416509 - 16416684
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 122  Q
    |||| |||||||||||| |||||  ||||||||||| |||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| | | |||    |||||||||||| ||    
T  16416509 acattatcataatccaaataacaggtaacatgaatatttcattttaaacatcatgcacttgatcaataataat-tacacat--taatacttacatcacac 16416605  T
Q  123 cccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcac 208  Q
    ||| |||||| ||||||||| ||  ||||||        |||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||| |||||||    
T  16416606 cccgatatctcacatcaatattcgtcaatca-------tatgaacaattatcaatttacaattattcattcacaatcaccaatcac 16416684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 142 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 16480782 - 16480710
Alignment:
Q  142 aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatat 214  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||||| | |||||||| |||||||| ||||    
T  16480782 aatcaccaatcacatgtatcaggaacaaatatcaattcacaaatattccttcacaatcaccaatcacaaatat 16480710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 24 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 45455581 - 45455505
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattc 99  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||  ||| ||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  45455581 acatcatcataatccaaataacagttaacatgaataatttaattcaaaaatcatatacttgatcaataatgatattc 45455505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 197 - 376
Target Start/End: Original strand, 2436110 - 2436285
Alignment:
Q  197 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcg 295  Q
    |||| ||||||||||  ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |   ||||||||||| || |    
T  2436110 atcaccaatcacataattcacataggactcatgttatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaaaaaggtcgtcacctttg 2436209  T
Q  296 atgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaac 376  Q
    ||| |  ||| ||||| ||||||||   |||| |    ||||||||||||||||||||||||||   ||| ||||||||||    
T  2436210 atg-ataaaacacatcacatgtaaggggtcactc----cttacataatctccgaagtaaaagagccgaactcttttacaac 2436285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 160 - 254
Target Start/End: Original strand, 2024904 - 2024998
Alignment:
Q  160 tcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcata 254  Q
    |||||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||||  ||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| ||||    
T  2024904 tcatgaacaattatcaattcacaaatattcattcacaatctccaatcacatttccaaataagactcatgtcataatatgcacttattgacacata 2024998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 314 - 360
Target Start/End: Original strand, 4483318 - 4483364
Alignment:
Q  314 atgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagt 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  4483318 atgtaagatttcacacccgtcttacattatcaccgaagtaaaagagt 4483364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 216 - 274
Target Start/End: Original strand, 7291277 - 7291335
Alignment:
Q  216 aataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatc 274  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| |||||||||||||||||||    
T  7291277 aatatgactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatc 7291335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 197 - 290
Target Start/End: Original strand, 7821406 - 7821500
Alignment:
Q  197 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 290  Q
    |||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  7821406 atcaccaatcacatatttcacataggactcatgctatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcac 7821500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 197 - 290
Target Start/End: Original strand, 7828717 - 7828811
Alignment:
Q  197 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 290  Q
    |||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  7828717 atcaccaatcacatatttcacataggactcatgctatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcac 7828811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 197 - 290
Target Start/End: Original strand, 16416949 - 16417043
Alignment:
Q  197 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 290  Q
    |||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  16416949 atcaccaatcgcatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcac 16417043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 197 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 16480683 - 16480605
Alignment:
Q  197 atcatcaatcacatatatcaat-aagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatc 274  Q
    |||| ||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| ||| ||  |||| |||||||||||||||||||    
T  16480683 atcaccaatcacatttatcaaacaagactcatgtcatgatatgcacttattgatacataaatgcatgtggtaccaaatc 16480605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 197 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 27103228 - 27103134
Alignment:
Q  197 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 290  Q
    |||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  27103228 atcaccaatcacatatttcacataggactcatgctatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcac 27103134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 197 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 27110576 - 27110482
Alignment:
Q  197 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 290  Q
    |||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  27110576 atcaccaatcacatatttcacataggactcatgctatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcac 27110482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 197 - 290
Target Start/End: Original strand, 27175098 - 27175192
Alignment:
Q  197 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 290  Q
    |||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  27175098 atcaccaatcacatatttcacataggactcatgctatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcac 27175192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 197 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 38785320 - 38785226
Alignment:
Q  197 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 290  Q
    |||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  38785320 atcaccaatcacatatttcacataggactcatgctatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcac 38785226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 142 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 2192552 - 2192480
Alignment:
Q  142 aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatat 214  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||||| | |||||||| |||| ||| ||||    
T  2192552 aatcaccaatcacatgtatcaggaacaaatatcaattcacaaatattccttcacaatcaccaataacaaatat 2192480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 246 - 298
Target Start/End: Original strand, 4483268 - 4483320
Alignment:
Q  246 cgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatg 298  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  4483268 cgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacgtcaaggtcgtcaccttcgatg 4483320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 24 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 11582840 - 11582659
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacat--atacttacatcaa 120  Q
    |||| |||||||||||| ||||| ||| |||||||| ||||||   ||||||||| | ||||| |||||||||     || ||||  ||||||||||||     
T  11582840 acattatcataatccaaataacagttatcatgaatagttcaatt--aacatcatgcatttgattaataataat-----cacacattaatacttacatcac 11582748  T
Q  121 accccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 216  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||| ||||||       |||| |||| ||||||| ||||| ||||||| |||||||| ||| ||||| |||||    
T  11582747 acctcaatatctcacatcaataatcatcaatca-------catggacaattatcaattcacaaatattcattcacaatcaccaaccacatttatca 11582659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 197 - 360
Target Start/End: Original strand, 13757060 - 13757225
Alignment:
Q  197 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtca-ctttc 294  Q
    |||| ||||||||||  ||| ||| ||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||| ||||||||||| |  ||||||||||| |||||    
T  13757060 atcaccaatcacataattcacataggactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgcggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttc 13757159  T
Q  295 gatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttac-ataatctccgaagtaaaagagt 360  Q
    ||||| ||    |||||| |||||||   ||||||| | ||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  13757160 gatgccacttgcacatcgaatgtaagggctcacacctgccttacaataatct-cgaagtaaaagagt 13757225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 194 - 241
Target Start/End: Original strand, 3055193 - 3055241
Alignment:
Q  194 acaatcatcaatcacatatatcaat-aagactcatgtcatgatatgcac 241  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  3055193 acaatcaccaatcacatatatcaaacaagactcatgtcatgatatgcac 3055241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 197 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 25293960 - 25293856
Alignment:
Q  197 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtca-ctttc 294  Q
    |||| ||||||||||  ||| ||| ||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||| ||||||||||| |  ||||||||||| |||||    
T  25293960 atcaccaatcacataattcacataggactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgcggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttc 25293861  T
Q  295 gatgc 299  Q
    |||||    
T  25293860 gatgc 25293856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 112 - 216
Target Start/End: Original strand, 122854 - 122951
Alignment:
Q  112 ttacatcaaaccccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacata 211  Q
    |||||||| ||| |||||||| ||||||||||||| ||||||       ||||||||| ||||||| ||||| |||| || |||||||| |||| ||||     
T  122854 ttacatcacacctcaatatctcacatcaataatcatcaatca-------catgaacaattatcaattcacaactattaattcacaatcaccaattacatt 122946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 197 - 290
Target Start/End: Original strand, 11514604 - 11514698
Alignment:
Q  197 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 290  Q
    |||| ||||||||||  ||| ||| ||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||| ||||||||||| |  ||||||||||||    
T  11514604 atcaccaatcacataattcacataggactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgcggtaccaaatctctacaaggtcgtcac 11514698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 24 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 13039114 - 13038989
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacat--atacttacatcaa 120  Q
    |||||| |||||||||| ||||| ||| |||||||| ||||||   ||||||||| | |||||| ||||||||     || ||||  ||||||||||||     
T  13039114 acatcaacataatccaaataacagttatcatgaatatttcaatt--aacatcatgcatttgatccataataat-----cacacattaatacttacatcac 13039022  T
Q  121 accccaatatcttacatcaataatcaccaatca 153  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  13039021 acctcaatatctcacatcaataatcatcaatca 13038989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 197 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 15443240 - 15443146
Alignment:
Q  197 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 290  Q
    |||| ||||||||||  ||| ||| ||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||| ||||||||||| |  ||||||||||||    
T  15443240 atcaccaatcacataattcacataggactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgcggtaccaaatctcaacaaggtcgtcac 15443146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 197 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 30263805 - 30263727
Alignment:
Q  197 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatc 274  Q
    |||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||| |||||||||||    
T  30263805 atcaccaatcacatatttcacataggactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgcggtaccaaatc 30263727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 222 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 42057819 - 42057741
Alignment:
Q  222 actcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtca-ctttcgatgc 299  Q
    |||||||  ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||| ||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||    
T  42057819 actcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgcggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgc 42057741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 295 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 3193630 - 3193586
Alignment:
Q  295 gatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacat 340  Q
    |||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||    
T  3193630 gatgcaacaaaaacatca-atgtaacatttcacacccgtcttacat 3193586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 24 - 95
Target Start/End: Original strand, 16209975 - 16210045
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataat 95  Q
    |||| |||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| ||||||||| | |||||||||||||||    
T  16209975 acattatcataatccaaataacagttatcatgaataattc--tattaacatcatgcatttgatcaataataat 16210045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 304 - 373
Target Start/End: Original strand, 19066193 - 19066262
Alignment:
Q  304 aaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttac 373  Q
    ||||||||  ||||||||||||||  |||||||||||  || ||||||||||||||  || |||||||||    
T  19066193 aaaacatcctatgtaagatttcacgtccgtcttacattttcgccgaagtaaaagagcacaccccttttac 19066262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 295 - 339
Target Start/End: Original strand, 13460914 - 13460958
Alignment:
Q  295 gatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttaca 339  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||    
T  13460914 gatgcaacaaaaacatcaaatgtaagatttcactcccgtattaca 13460958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 201 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 13912791 - 13912691
Alignment:
Q  201 tcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtca-ctttcgatg 298  Q
    |||||||||||  ||| ||| ||||||||  ||||||||||| ||  ||| |||| ||||||| ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||    
T  13912791 tcaatcacataattcacataggactcatgctatgatatgcacttacggacacataaatgcatgcggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatg 13912692  T
Q  299 c 299  Q
    |    
T  13912691 c 13912691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 279; Significance: 1e-156; HSPs: 91)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 24 - 400
Target Start/End: Original strand, 31626739 - 31627117
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaa-a 121  Q
    |||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||| |||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  31626739 acatcatcttaatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacattatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaga 31626838  T
Q  122 ccccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaataag 221  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  31626839 ccccaatatctcacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatattaattcacaattattcatacacaatcaccaatcacatatatcaataag 31626938  T
Q  222 actcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaaga 321  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  31626939 actcatgtcatgatatgcacctatagacacatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaaacatcatatgtaaga 31627038  T
Q  322 tttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaatctcaacacgactatgatg 400  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  31627039 tttcacacatgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacgactacattctcaacacgactatgatg 31627117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 24 - 396
Target Start/End: Original strand, 18775506 - 18775886
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 122  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||  | | | |||||||||||||||    
T  18775506 acatcattataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataaaattcaaaaaaaaatacttacatcaaac 18775605  T
Q  123 cccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcac-------atatatc 215  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||       || |       
T  18775606 cccaatatctcacatcaataatcaccaatcacatgtgtcataaacaaaaatcaattcacaattattcatacacaatcaccaatcaccattcacattttca 18775705  T
Q  216 aataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcat 315  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||  |||||||||| |||||||| |||||| ||||||| |||||| ||    
T  18775706 aataagacttatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaagtcgtcaccttcgatacaacaaagacatcgtat 18775805  T
Q  316 gtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaatctcaacacgactat 396  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18775806 gtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaatctcaacacaactat 18775886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 24 - 396
Target Start/End: Original strand, 22428473 - 22428850
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacat--atacttacatcaa 120  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||  ||| ||  ||||||||||||     
T  22428473 acatcatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatttaaacatcatgtacttgatcaacaataatactcaaatatatcaatacttacatcat 22428572  T
Q  121 a-ccccaatatcttacatcaa-taatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaat 218  Q
    | |||||| |||| ||||||| |||||||||| ||||| || |||||||||  |||||| || | ||||||||||||||||| ||||||||| |   ||     
T  22428573 atccccaacatctcacatcaaataatcaccaaacacatatgacatgaacaatcatcaattcatagttattcatacacaatcaccaatcacatttcaaaac 22428672  T
Q  219 aagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgta 318  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  22428673 aagactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaaacatcgtatgta 22428772  T
Q  319 agatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaatctcaacacgactat 396  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22428773 cgatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttgaacccttttacaactacaaactcaacacgactat 22428850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 24 - 400
Target Start/End: Original strand, 16104850 - 16105237
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 122  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||| ||    
T  16104850 acatcatcataatccaaataacagttaacatgaataattcgttataaacatcatgtatttgatcaataataatattcacataacaatacttacatcatac 16104949  T
Q  123 ccc-aatatcttacatcaat-aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcac-----atatatc 215  Q
    ||| ||||||| |||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||  || ||| || | ||||||||||||||||| |||||||     | || ||    
T  16104950 ccccaatatctcacatcaattaatcacctatcacatttgtcatgaacaatcattaattcatagttattcatacacaatcaccaatcactaatcacatttc 16105049  T
Q  216 ---aataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcg 312  Q
       || |||||||||||||||||||| || ||| ||| |||| ||||||||||||||  || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16105050 caaaacaagactcatgtcatgatatgtacttattgacacataaatgcatgtggtaccggataacctcaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaaacatcg 16105149  T
Q  313 catgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaatctcaacacgactatgatg 400  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16105150 tatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaatctcaacaagactatgatg 16105237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 24 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 25646786 - 25646518
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaa- 121  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  25646786 acatcatcataatccaaataacatttaacatgaatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattcacatacatatacttacatcaaaa 25646687  T
Q  122 ccccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaataag 221  Q
    ||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  25646686 ccccaatatttcacattaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacaactattcacacacaatcaccaatcaaatatatcaataag 25646587  T
Q  222 actcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 290  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25646586 actcatgtcatgatatgcacctattgacacatatatgcatgtggtaccaaatctcctcaaggtcgtcac 25646518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 24 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 25746160 - 25745792
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 122  Q
    |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||| |||| |||||           ||  ||||    
T  25746160 acatcatcataatcaaaataacagttaacatgaataattcaacataaacatcatgcatttgatcaataatgatatcctcat-----------ca--aaac 25746074  T
Q  123 cccaatatcttacatcaataa-tcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcac-----atatatc- 215  Q
    |||||||||| |||| ||||| || |||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||     | || ||     
T  25746073 cccaatatctcacattaataaatccccaatcacgtgtgtcatgaacaaacatcaatgcacaattattcatacacaatcaccaatcaccaatcacatttcc 25745974  T
Q  216 -aataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgca 314  Q
     |||||||||||||||||||||||||  ||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |    
T  25745973 aaataagactcatgtcatgatatgcagttattgacacataaattcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcaccctcgatgcaacaaaaacatcgta 25745874  T
Q  315 tgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaatctcaacacgactat 396  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25745873 tgtaagagttcacacctgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaatctcaacacgactat 25745792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 24 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 35017645 - 35017451
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaa- 121  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||  ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  35017645 acatcatcataatccaaataacagttaacatgaatatatcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatagatatacttacatcaaaa 35017546  T
Q  122 ccccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 216  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  35017545 ccccaatatctcacatcaataatcatcaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacaattattcatacacaatcaccaatcacatatatca 35017451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 24 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 35011316 - 35011124
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 122  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||    
T  35011316 acatcatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatataaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatatcaatacttacatcaaac 35011217  T
Q  123 cccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatc 215  Q
    |||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  35011216 cccaatatctcacattaataatcatcaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatc 35011124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 24 - 216
Target Start/End: Original strand, 18128340 - 18128532
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 122  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| | ||||||||||| |||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||    
T  18128340 acatcatcataatccaaataacagttaacatgaatatttca-tctaaacatcatgcacttgatcaataattacattcccatacatatacttacatcaaac 18128438  T
Q  123 cccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 216  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  18128439 cccaatatctcacatcaataatctccaatcatatgtgtcatgaacaaatatcaatttacagttattcatacacaattaccaatcacatatatca 18128532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 24 - 216
Target Start/End: Original strand, 18578834 - 18579027
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 122  Q
    |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||    
T  18578834 acatgatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatataaacatcatgcatatgatcaataataatattctcatatcaatacttacatcaaac 18578933  T
Q  123 cccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 216  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  18578934 cccaatatctcacattaataatcaccaatcacatgtgtcatggacaaatatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcatatacatca 18579027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 24 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 13623121 - 13622937
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 122  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||   ||| ||||   |||||||||||||||    
T  13623121 acatcatcataatccaaataacagttaacatgaataactcaatataaacatcatgcacttgatcaataata---ttcacatatcaatacttacatcaaac 13623025  T
Q  123 cccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacat 210  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| |||||||||    
T  13623024 cccaatatctcacattaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacataatcaccaatcacat 13622937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 275 - 400
Target Start/End: Original strand, 16083970 - 16084095
Alignment:
Q  275 acctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttaca 374  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16083970 acctcaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaaacatcgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttaca 16084069  T
Q  375 actacaatctcaacacgactatgatg 400  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||    
T  16084070 actacaatctcaacaagactatgatg 16084095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 24 - 215
Target Start/End: Original strand, 19627498 - 19627690
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 122  Q
    |||||| |||||||||| ||||| ||||||| | || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||    
T  19627498 acatcaacataatccaaataacagttaacattattatttcaatataaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatatcaatacttacatcaaac 19627597  T
Q  123 cccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatc 215  Q
    ||||||||||  ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  19627598 cccaatatctcccattaataatcatcaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagctattcatacacaatcaccaatcatatatatc 19627690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 39 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 14628545 - 14628368
Alignment:
Q  39 aataacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaaccccaatatcttacatc 138  Q
    |||||||  ||||||||||| |||||| ||||||||| |||| |||||| ||||||||||| || |   ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14628545 aataacatataacatgaatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcattaataatattcccacatcaatacttacatcaaaccccaatatctcacatc 14628446  T
Q  139 aataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  14628445 aataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatgtatca 14628368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 24 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 18005050 - 18004857
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 122  Q
    |||| |||||||||||| ||| | |||||||||| | |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| || |   |||||||||||||||    
T  18005050 acattatcataatccaaataatagttaacatgaacatttcaatataaacatcatgcatttgatcaataataatattcccacatcaatacttacatcaaac 18004951  T
Q  123 cccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 216  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  18004950 cccaatatctcacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagtcattcatacacaatcaccaatcatatacatca 18004857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 217 - 400
Target Start/End: Original strand, 18128776 - 18128964
Alignment:
Q  217 ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgat-----gcaacaaaaacatc 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||  ||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||     || ||   ||||||    
T  18128776 ataagactcatgtcatgatatgcacttattgacatataaatgcatgtggtaccaaatcacctccagttcgtcaccttcgattcgatgccacttgaacatc 18128875  T
Q  312 gcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaatctcaacacgactatgatg 400  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18128876 gtatgtaagatttcacacctgtcttacataatcttcgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaatctcaacacgactatgatg 18128964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 24 - 216
Target Start/End: Original strand, 23975708 - 23975902
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacat--atacttacatcaa 120  Q
    |||| |||||||||||| |||||  ||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||| ||  ||||  |||||||||||||    
T  23975708 acattatcataatccaaataacagataacatgaatatttcaatataaacatcatgcatttgatcaataataaaatt-tcccacatcaatacttacatcaa 23975806  T
Q  121 accccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 216  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  23975807 accccaatatctcacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcatatacatca 23975902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 24 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 18843900 - 18843708
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaa- 121  Q
    |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| || |||   ||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  18843900 acattatcataatccaaataacagttaacatgaatattttaatt--aacatcatgcatttgatcaataataatattctcatatatatacttacatcaaaa 18843803  T
Q  122 ccccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 216  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  18843802 ccccaatatctcacatcaataatcatcaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcatatacatca 18843708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 24 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 13016702 - 13016436
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaataacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaacc 123  Q
    |||||||||||||||||  ||| |||||||||||| |||||| ||| ||||| | | |||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||| ||    
T  13016702 acatcatcataatccaaatacagttaacatgaatatttcaatttaa-catcaagcatttgatcaataataatattctaaaaaatatacttacatcaa-cc 13016605  T
Q  124 ccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcaca-tatatcaataaga 222  Q
    ||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  ||||| |  ||| ||||||    
T  13016604 ccaatatctcacattaatattcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacaattattcatacacaatcacctgtcacattcaatcgataaga 13016505  T
Q  223 ctcatgtcatgatatgcacat--atcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 290  Q
    |||||| |||||| || | ||  | |||| || | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  13016504 ctcatg-catgatgtgtatatagaccgacacaaatatgcatgtggtaccatatcatctcaaggtcgtcac 13016436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 194 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 19984887 - 19984699
Alignment:
Q  194 acaatcatcaatcacatatatcaa-taagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactt 292  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||  ||  ||||||||||| |    
T  19984887 acaatcaccaatcacatatatcaaataagactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatatccaaaaggtcgtcacct 19984788  T
Q  293 tcgatgcaacaaaa-acatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactaca 380  Q
    |||||| ||||||  |||||| |||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19984787 tcgatggaacaaatcacatcgtatgtaagggttcacacccgccttacataatctccgaagtaaaagagctcaacccttttacaactaca 19984699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 47 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 33316582 - 33316422
Alignment:
Q  47 ttaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaaccccaatatcttacatcaataatca 146  Q
    |||||||| ||| |||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| || |   ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  33316582 ttaacatggatatttcaatttaaacattatgcacttgatcaataataatattcccacatcaatacttacatcaaaccccaatatctcacatcaataatca 33316483  T
Q  147 ccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatca 207  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  33316482 ccaatcacgtgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatca 33316422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 251 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 18383323 - 18383173
Alignment:
Q  251 catacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaa 350  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  18383323 cataaatgcatgtggtaccgaatcacctcaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaaacattgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatcactgaa 18383224  T
Q  351 gtaaaagagttcaacccttttacaactacaa-tctcaacacgactatgatg 400  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  18383223 gtaaaagagctaaacccttttacaactacaagactcaacatgactatgatg 18383173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 196 - 380
Target Start/End: Original strand, 1554324 - 1554508
Alignment:
Q  196 aatcatcaatcacatatatcaa-taagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttc 294  Q
    ||||| ||| ||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| |||    
T  1554324 aatcaccaaccacatttatcaaataagactcatgttatgatatgcacttattgacgcataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcaccttc 1554423  T
Q  295 gatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactaca 380  Q
    ||||  | ||| |||||| |||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1554424 gatgata-aaacacatcgtatgtaagggttcacacccgccttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactaca 1554508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 169 - 290
Target Start/End: Original strand, 18422182 - 18422303
Alignment:
Q  169 aatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtac 268  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||    
T  18422182 aatatcaattcacaattattcatacacaatcaccaatcacatacatcaataagactcatgtcatgatatgcacctatcgacacatatatgcatgtggtac 18422281  T
Q  269 caaatcacctcaaggtcgtcac 290  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  18422282 caaatcacctcaaggtcgtcac 18422303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 251 - 400
Target Start/End: Original strand, 33323342 - 33323492
Alignment:
Q  251 catacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaa 350  Q
    |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  33323342 cataaatgcatttggtaccgaatcacctcaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaaacatcgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatttccgta 33323441  T
Q  351 gtaaaagagttcaacccttttacaactac-aatctcaacacgactatgatg 400  Q
    |||||| || ||||||||||||||| | | || ||||||| ||||||||||    
T  33323442 gtaaaaaagctcaacccttttacaattgcaaaactcaacatgactatgatg 33323492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 306 - 400
Target Start/End: Original strand, 23151845 - 23151939
Alignment:
Q  306 aacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaatctcaacacgactatgatg 400  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23151845 aacatcgtatgtaagagttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaatctcaacacgactatgatg 23151939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 196 - 376
Target Start/End: Original strand, 16238848 - 16239028
Alignment:
Q  196 aatcatcaatcacatatatcaataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacc-tcaaggtcgtcactttc 294  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||| ||||| ||   ||||||||||| | |    
T  16238848 aatcaccaatcacatatatcaataagactcatgtcatgatatgcacttattgacacatatatgcatgtggtacaaaatctccaaaaaggtcgtcacctcc 16238947  T
Q  295 gatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaac 376  Q
    |||| |  ||| |||||| |||||||  ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16238948 gatg-ataaaacacatcgtatgtaagggttcacccccgccttacataatctccgaagtaaaagagctcaacccttttacaac 16239028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 256 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 17790776 - 17790652
Alignment:
Q  256 atgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaa 355  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||| ||| | ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17790776 atgcatgtggtaccgaatcacctctaggtcgtcaccttcgatgcatcaaca-catcgtatataagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaa 17790678  T
Q  356 agagttcaacccttttacaactacaa 381  Q
    |||| |||||||||||||||||||||    
T  17790677 agagctcaacccttttacaactacaa 17790652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 24 - 156
Target Start/End: Original strand, 23151706 - 23151839
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 122  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||| |||| ||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||    
T  23151706 acatcatcataatccaaataacagttagcatggatatttcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatatcaatacttacatcaaac 23151805  T
Q  123 cccaatatcttacatcaataatcaccaatcacat 156  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23151806 cccaatatctcacatcaataatcaccaatcacat 23151839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 24 - 241
Target Start/End: Original strand, 32896282 - 32896492
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatca-aa 121  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| |||  |||||| |||||||||||| |||  |||||          |||||||||||| ||    
T  32896282 acatcatcataatccaaataacagttaccatgaataatttaattcaaacattatgtacttgatcgatataaatat----------atacttacatcataa 32896371  T
Q  122 ccccaatatcttacatcaataa-tcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaataa 220  Q
    |||||||| || | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||| | | |||||    
T  32896372 ccccaataactcatatcaataaatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaacatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatttctaaataa 32896471  T
Q  221 gactcatgtcatgatatgcac 241  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  32896472 gactcatgtcatgatatgcac 32896492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 257 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 16889379 - 16889236
Alignment:
Q  257 tgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaa 356  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16889379 tgcatgtggtaccgaatcacctccaggtcgtcaccttcgatgcatcaaca-catcgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaa 16889281  T
Q  357 gagttcaacccttttacaactacaa-tctcaacacgactatgatg 400  Q
      | |||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  16889280 tcgctcaacccttttacaactacaagactcaacatgactatgatg 16889236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 90 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 18825774 - 18825647
Alignment:
Q  90 aataatattctcatacatatacttacatcaaa-ccccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattatt 188  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  18825774 aataatattctcatatatatacttacatcaaaaccccaatatctcacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttatt 18825675  T
Q  189 catacacaatcatcaatcacatatatca 216  Q
    |||  ||||||| |||||| ||| ||||    
T  18825674 catgaacaatcaccaatcatatacatca 18825647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 246 - 360
Target Start/End: Original strand, 34965470 - 34965584
Alignment:
Q  246 cgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatct 345  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||     
T  34965470 cgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaaatatcgtatgtaagatttcacatccgtcttacattatca 34965569  T
Q  346 ccgaagtaaaagagt 360  Q
    |||||||||||||||    
T  34965570 ccgaagtaaaagagt 34965584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 275 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 35137565 - 35137439
Alignment:
Q  275 acctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttaca 374  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||    
T  35137565 acctcaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaaacatcgtatgtaagatttcacacccatcttacataatcttcgtagtaaaagagctcaacccttttaca 35137466  T
Q  375 actac-aatctcaacacgactatgatg 400  Q
    ||| | || ||||||| ||||||||||    
T  35137465 actgcaaaactcaacatgactatgatg 35137439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 123 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 25369184 - 25369014
Alignment:
Q  123 cccaatatcttacatcaa-taatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatat-atcaataa 220  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||  |||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||| | | ||||||    
T  25369184 cccaatatcttacattaagtaatcaccaatcacaagtgtcatgaacaatcatcaat-cacatttattcatgcacaatcatcaatcacatttcaccaataa 25369086  T
Q  221 gactcatgtcatgatatgcacata--tcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 290  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||  |||||||||| |||||||||||||||  |||| |||||||||||||    
T  25369085 gactcatgtcatgatgtgcacctagttcgacgcatatatgcatgtggtaccatttcacttcaaggtcgtcac 25369014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 216 - 359
Target Start/End: Original strand, 22846615 - 22846767
Alignment:
Q  216 aataagactcatgtca---tgatatgcacata--tcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacat 310  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||| ||  ||||| |||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22846615 aataagactcatgtcaacatgatatgcacctagttcgacacatatatgcatgtagtaccaaatcaccgcaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaaacat 22846714  T
Q  311 cgc----atgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagag 359  Q
    ||     ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22846715 cgatcgtatgtaagatttcacatccgtcttacataatcaccgaagtaaaagag 22846767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 197 - 376
Target Start/End: Original strand, 11214623 - 11214803
Alignment:
Q  197 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacc-tcaaggtcgtcactttc 294  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||   ||||||||||| | |    
T  11214623 atcatcaatcacatatatcacataagactcatgttatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaaggtcgtcacctcc 11214722  T
Q  295 gatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaac 376  Q
    |||| |  ||| |||||| |||||||  ||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  11214723 gatg-ataaaacacatcgtatgtaagggttcacccccgctttacataatctccgaagtaaaagagctcaaccattttacaac 11214803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 24 - 290
Target Start/End: Original strand, 18397163 - 18397434
Alignment:
Q  24 acatcatcataatcca-ataacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatca-aa 121  Q
    |||||||||||||||| |||||  |||||||||||| |||||| ||||| || |||||||| ||||||||||||||| |||| |||||| || ||||  |    
T  18397163 acatcatcataatccacataacgtttaacatgaatatttcaatttaaacttcgtgtacttggtcaataataatattcacatatatatacatatatcacga 18397262  T
Q  122 ccccaatatcttacatcaa-taatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatat-atcaata 219  Q
     | ||| | || ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||| |  |||| |||||||| || |||||||||||||| || | |||||    
T  18397263 tctcaacaactcacatcaattaatcaccaatcgcatgtgtcatgaacaagtatccaatcacatttattcatgcaaaatcatcaatcacaaatcaccaata 18397362  T
Q  220 agactcatgtcatgatatgca--catatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 290  Q
    ||||||||| |||||| || |   | | || | | || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18397363 agactcatg-catgatgtgtatctagaccggcacttatatgcatgtggtaccatatcacctcaaggtcgtcac 18397434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 39 - 212
Target Start/End: Original strand, 1553946 - 1554113
Alignment:
Q  39 aataacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatc-aaaccccaatatcttacat 137  Q
    ||||||| |||||||| ||| |||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  1553946 aataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcacatgcatatacttacatcaaaacctcaatatctcacat 1554045  T
Q  138 caataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatat 212  Q
    ||||||||| | ||||        |||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  1554046 caataatcatcgatca-------tatgaacaattatcaactcacaattattcatacacaatcaccgatcacatat 1554113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 256 - 360
Target Start/End: Original strand, 16134814 - 16134918
Alignment:
Q  256 atgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaa 355  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  16134814 atgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcttcacccatgatgcaacaaaaacatcatatgtaagatttcacacccgtcttacattatcaccgaagtaaa 16134913  T
Q  356 agagt 360  Q
    |||||    
T  16134914 agagt 16134918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 195 - 376
Target Start/End: Original strand, 4989379 - 4989561
Alignment:
Q  195 caatcatcaatcacatatatcaat-aagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtca-ctt 292  Q
    ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||| |||    
T  4989379 caatcatcaatcacatacatcatttaagactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctt 4989478  T
Q  293 tcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttac-ataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaac 376  Q
    ||||||| ||    |||||| |||||||   ||||||| | ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4989479 tcgatgccacttgcacatcgtatgtaag-gctcacacctgccttacaataatct-cgaagtaaaagagctcaacccttttacaac 4989561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 206 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 35017387 - 35017303
Alignment:
Q  206 cacatatatcaataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 290  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  35017387 cacatttatcaataagactcatgtcatgatatgcacatattgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcagggtcgtcac 35017303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 246 - 360
Target Start/End: Original strand, 19852795 - 19852909
Alignment:
Q  246 cgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatct 345  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||| |||     
T  19852795 cgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcacccatgatgcaacaaaaacatcatatgtaagatttcacactcgtcttacattatca 19852894  T
Q  346 ccgaagtaaaagagt 360  Q
     |||| |||||||||    
T  19852895 tcgaaataaaagagt 19852909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 24 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 16828003 - 16827873
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 122  Q
    |||| |||||||||||| ||||| |||| ||| ||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||     |||||||||||||||    
T  16828003 acattatcataatccaaataacagttaatatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattcccacgtcaatacttacatcaaac 16827904  T
Q  123 cccaatatcttacatcaataatcaccaatca 153  Q
    |||| ||||| ||||||||||||| ||||||    
T  16827903 cccattatctcacatcaataatcatcaatca 16827873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 202 - 274
Target Start/End: Original strand, 18740863 - 18740935
Alignment:
Q  202 caatcacatatatcaataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatc 274  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| |||||||||||||||||||    
T  18740863 caatcacatatatcaataagactcatgtcatgatatgcacctatagacacatatatgcatgtggtaccaaatc 18740935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 197 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 1659387 - 1659212
Alignment:
Q  197 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcg 295  Q
    |||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| | ||    
T  1659387 atcaccaatcacatatttcatataagactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcacctccg 1659288  T
Q  296 atgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaac 376  Q
    ||| |  ||| |||||| |||||||   |||| |    ||||||||||||||||||||||||||   ||| ||||||||||    
T  1659287 atg-ataaaacacatcgtatgtaaggggtcactc----cttacataatctccgaagtaaaagagccgaactcttttacaac 1659212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 196 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 13622878 - 13622800
Alignment:
Q  196 aatcatcaatcacatatatcaataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatc 274  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||| |||| |||||||||||||||||||    
T  13622878 aatcaccaatcacatatatcaataagactcatgccatgatatgcacctattgacacatatatgcatgtggtaccaaatc 13622800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 246 - 360
Target Start/End: Original strand, 23220222 - 23220336
Alignment:
Q  246 cgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatct 345  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |     |||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||| || |||     
T  23220222 cgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgttatccatgatgcaacaaaaacatcatatgtaagatttcacatccgtcttatattatca 23220321  T
Q  346 ccgaagtaaaagagt 360  Q
    | |||||||||||||    
T  23220322 ctgaagtaaaagagt 23220336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 197 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 14628289 - 14628111
Alignment:
Q  197 atcatcaatcacatatatcaat-aagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtca-ctttc 294  Q
    |||| ||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||| |||||    
T  14628289 atcaccaatcacatttatcaaacaagactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttc 14628190  T
Q  295 gatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttac-ataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttaca 374  Q
    ||||| ||    |||||| |||||||   ||||||| | ||||| ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  14628189 gatgccacttgcacatcgaatgtaagggctcacacctgccttacaataatct-cgaagtaaaagag-tcatcccttttaca 14628111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 197 - 374
Target Start/End: Original strand, 23976053 - 23976231
Alignment:
Q  197 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtca-ctttc 294  Q
    |||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||| |||||    
T  23976053 atcaccaatcacatatttcacataagactcatgttatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttc 23976152  T
Q  295 gatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttac-ataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttaca 374  Q
    ||||| ||    |||||| |||||||   ||||||| | ||||| ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  23976153 gatgccacttgcacatcgaatgtaagggctcacacctgccttacaataatct-cgaagtaaaagag-tcatcccttttaca 23976231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 197 - 374
Target Start/End: Original strand, 26088319 - 26088497
Alignment:
Q  197 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtca-ctttc 294  Q
    |||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||| |||||    
T  26088319 atcaccaatcacatatttcacataggactcatgttatgatatgcacttatggacgcataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttc 26088418  T
Q  295 gatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttac-ataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttaca 374  Q
    ||||| ||    |||||| |||||||   ||||||| | ||||| ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  26088419 gatgccacttgcacatcgaatgtaagggctcacacctgccttacaataatct-cgaagtaaaagag-tcatcccttttaca 26088497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 197 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 33316260 - 33316158
Alignment:
Q  197 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcg 295  Q
    |||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |  |||||||||||| ||||    
T  33316260 atcaccaatcacatatttcacataagactcatgttatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcaccttcg 33316161  T
Q  296 atg 298  Q
    |||    
T  33316160 atg 33316158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 24 - 104
Target Start/End: Original strand, 17787746 - 17787827
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcata 104  Q
    |||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||| |||||    
T  17787746 acatcatcataatcaaaataataattaacatgaataattcaatataaacatcatgcatttgatcaataatgatattatcata 17787827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 142 - 209
Target Start/End: Original strand, 23975956 - 23976023
Alignment:
Q  142 aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcaca 209  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  23975956 aatcaccaatcacatgtatcaggaacaaatatcaattcacaaatattcattcacaatcatcaatcaca 23976023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 194 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 16827559 - 16827462
Alignment:
Q  194 acaatcatcaatcacatatatcaat-aagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 290  Q
    |||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  16827559 acaatcataaatcacatacatcatttaagactcatgtcaagatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcac 16827462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 194 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 18004732 - 18004635
Alignment:
Q  194 acaatcatcaatcacatatatcaat-aagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 290  Q
    ||||||| ||||||||| | ||||  ||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||    
T  18004732 acaatcaccaatcacatttctcaaacaagactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcac 18004635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 217 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 1651605 - 1651466
Alignment:
Q  217 ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaa--aaacatcgca 314  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| | |||||  ||||   |||||||||    
T  1651605 ataagactcatgttatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcacctccgatg-gacaagtcaacatcgca 1651507  T
Q  315 tgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagag 359  Q
    ||||||   |||| |    ||||||||||||||||||||||||||    
T  1651506 tgtaaggggtcactc----cttacataatctccgaagtaaaagag 1651466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 142 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 14628388 - 14628316
Alignment:
Q  142 aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatat 214  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  14628388 aatcaccaatcacatgtatcaggaacaaatatcaattcacaaatattcattcacaatcaccaatcacaaatat 14628316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 24 - 95
Target Start/End: Original strand, 25173518 - 25173590
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataat 95  Q
    |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25173518 acattatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataat 25173590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 221 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 16650899 - 16650745
Alignment:
Q  221 gactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtca-ctttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaa 319  Q
    ||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||| ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||| ||    |||||| ||||||    
T  16650899 gactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgcggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgaatgtaa 16650800  T
Q  320 gatttcacacccgtcttac-ataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttaca 374  Q
    |   ||||||| | ||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16650799 gggctcacacctgccttacaataatct-cgaagtaaaagagttcaactcttttaca 16650745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 195 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 18825515 - 18825420
Alignment:
Q  195 caatcatcaatcacatatatcaataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 290  Q
    |||||| ||||||||| |   |||| ||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||    
T  18825515 caatcaccaatcacattttcaaatatgactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcac 18825420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 39 - 216
Target Start/End: Original strand, 4989004 - 4989171
Alignment:
Q  39 aataacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacat--atacttacatcaaaccccaatatcttaca 136  Q
    |||||||| |||||| |||| |||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||     | ||||  |||||||||||| ||||| |||||| |||    
T  4989004 aataacaaataacataaatatttcaatttaaacatcatgcaattgatcaataataata-----acacattaatacttacatcacaccccgatatctcaca 4989098  T
Q  137 tcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 216  Q
    |||||| ||| ||||||        |||||||| |||||||  |||| ||||||| |||||||| ||||||||| |||||    
T  4989099 tcaatattcatcaatca-------tatgaacaattatcaatttacaaatattcattcacaatcaccaatcacatttatca 4989171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 125 - 290
Target Start/End: Original strand, 15738590 - 15738757
Alignment:
Q  125 caatatcttacatcaat-aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatat-atcaataaga 222  Q
    ||||||||||||| ||  |||||||  ||||| |||||||||||||  |||||| |||| |||| |||  |||||||| |||||||| | | |||  | |    
T  15738590 caatatcttacattaaacaatcaccgttcacacgtgtcatgaacaatcatcaat-cacatttat-catgaacaatcattaatcacatttcaccaaataaa 15738687  T
Q  223 ctcatgtcatgatatgcacata--tcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 290  Q
    |||||||||| |||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  15738688 ctcatgtcatcatatgcacctagttcgacacatacatgcatgtggtaccaaatcacttcaacgtcgtcac 15738757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 156 - 210
Target Start/End: Original strand, 16238711 - 16238765
Alignment:
Q  156 tgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacat 210  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  16238711 tgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacat 16238765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 24 - 216
Target Start/End: Original strand, 18740645 - 18740828
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacat--atacttacatcaa 120  Q
    |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| || ||||||||||||||| | ||||||||||||||     ||| ||||  ||||||||||||     
T  18740645 acattatcataatccaaataacagttaacatgaatatttgaatataaacatcatgcatttgatcaataataa-----tcacacattaatacttacatcac 18740739  T
Q  121 accccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 216  Q
    | ||  |||||| ||||||||||||| ||||||        |||||||| ||||||| || || ||||||| |||||| | ||||||||| |||||    
T  18740740 atccagatatctcacatcaataatcatcaatca-------tatgaacaattatcaattcaaaaatattcattcacaattaccaatcacatttatca 18740828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 197 - 290
Target Start/End: Original strand, 25174040 - 25174134
Alignment:
Q  197 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 290  Q
    |||| ||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  25174040 atcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcac 25174134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 197 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 27655764 - 27655670
Alignment:
Q  197 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 290  Q
    |||| ||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  27655764 atcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcac 27655670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 222 - 359
Target Start/End: Original strand, 15861243 - 15861375
Alignment:
Q  222 actcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaaga 321  Q
    |||||||| ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| | ||||| |  ||| |||||| |||||||     
T  15861243 actcatgttatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcacctccgatg-ataaaacacatcgtatgtaagg 15861341  T
Q  322 tttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagag 359  Q
      |||| |    ||||||||||||||||||||||||||    
T  15861342 ggtcactc----cttacataatctccgaagtaaaagag 15861375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 186 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 28196546 - 28196439
Alignment:
Q  186 attcatacacaatcatcaatcacatat-atcaataagactcatgtcatgatatgcacata--tcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaag 282  Q
    |||||| || ||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||| ||||| ||  ||||| | || |||||||||||||||  |||| |||||    
T  28196546 attcatgcataatcatcaatcacatttcaccaataagactcatgtcatgatgtgcacctagttcgacacttatatgcatgtggtaccatttcacttcaag 28196447  T
Q  283 gtcgtcac 290  Q
    ||||||||    
T  28196446 gtcgtcac 28196439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 221 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 16557669 - 16557515
Alignment:
Q  221 gactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtca-ctttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaa 319  Q
    ||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||| ||| ||| ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||| ||    |||||| ||||||    
T  16557669 gactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgtatgcggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgaatgtaa 16557570  T
Q  320 gatttcacacccgtcttac-ataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttaca 374  Q
    |   ||||||| | ||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16557569 gggctcacacctgccttacaataatct-cgaagtaaaagagttcaactcttttaca 16557515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 195 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 18843576 - 18843481
Alignment:
Q  195 caatcatcaatcacatatatcaataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 290  Q
    |||||| ||||||||| |   |||| ||| ||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||    
T  18843576 caatcaccaatcacattttcaaatatgacgcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcac 18843481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 142 - 216
Target Start/End: Original strand, 4989201 - 4989275
Alignment:
Q  142 aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 216  Q
    |||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  4989201 aatcaccaattacatgtatcatgaataaatatcaattaacagttattcatacacaatcaccaatcatatacatca 4989275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 197 - 290
Target Start/End: Original strand, 10487364 - 10487458
Alignment:
Q  197 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 290  Q
    |||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  10487364 atcaccaatcacatatttcacataggactcatgctatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcac 10487458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 197 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 16377963 - 16377869
Alignment:
Q  197 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 290  Q
    |||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  16377963 atcaccaatcacatatttcacataggactcatgctatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcac 16377869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 197 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 16385287 - 16385193
Alignment:
Q  197 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 290  Q
    |||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  16385287 atcaccaatcacatatttcacataggactcatgctatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcac 16385193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 24 - 93
Target Start/End: Original strand, 18422115 - 18422185
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataata 93  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||  |||||||||||||||    
T  18422115 acatcatcataattcaaataacagttaacatgaatatttcaatttaaacatcattcacttgatcaataata 18422185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 146 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 33316353 - 33316292
Alignment:
Q  146 accaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatca 207  Q
    ||||||||||||| |||  ||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  33316353 accaatcacatgtatcagaaacaaatatcaattcacaaatattcattcacaatcatcaatca 33316292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 197 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 29871153 - 29870975
Alignment:
Q  197 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtca-ctttc 294  Q
    |||| ||||||||||  ||| ||| ||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||| ||||||||||| |  ||||||||||| |||||    
T  29871153 atcaccaatcacataattcacataggactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgcggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttc 29871054  T
Q  295 gatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttac-ataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttaca 374  Q
    ||||| ||    |||||| |||||||   ||||||| | ||||| ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  29871053 gatgccacttgcacatcgaatgtaagggctcacacctgccttacaataatct-cgaagtaaaagag-tcatcccttttaca 29870975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 146 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 16827733 - 16827663
Alignment:
Q  146 accaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 216  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||  ||| ||||||||||| ||||| |||||| ||| ||||    
T  16827733 accaattacatgtatcatgaacaaatatcaattaacagttattcatacataatcaccaatcatataaatca 16827663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 197 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 17343942 - 17343864
Alignment:
Q  197 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatc 274  Q
    |||| ||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| | || |||||||||||||| ||||    
T  17343942 atcaccaatcacttatatcacataagactcatgttatgatatgcacttattgactcgtaaatgcatgtggtaccgaatc 17343864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 295 - 340
Target Start/End: Original strand, 16374954 - 16374999
Alignment:
Q  295 gatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacat 340  Q
    |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  16374954 gatgtaacaaaaacatcatatgtaagatttcacacccgtcttacat 16374999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 197 - 299
Target Start/End: Original strand, 16230065 - 16230169
Alignment:
Q  197 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtca-ctttc 294  Q
    |||| ||||||||||  ||| ||| ||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||| ||||||||||| |  ||||||||||| |||||    
T  16230065 atcaccaatcacataattcacataggactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgcggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttc 16230164  T
Q  295 gatgc 299  Q
    |||||    
T  16230165 gatgc 16230169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 197 - 299
Target Start/End: Original strand, 23993645 - 23993749
Alignment:
Q  197 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtca-ctttc 294  Q
    |||| ||||||||||  ||| ||| ||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||| ||||||||||| |  ||||||||||| |||||    
T  23993645 atcaccaatcacataattcacataggactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgcggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttc 23993744  T
Q  295 gatgc 299  Q
    |||||    
T  23993745 gatgc 23993749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #84
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 142 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 18004827 - 18004770
Alignment:
Q  142 aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatca 200  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  18004827 aatcaccaatcacatgtatcaggaac-aatatcaattcacaactattcattcacaatca 18004770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #85
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 24 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 19985096 - 19984915
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacat--atacttacatcaa 120  Q
    |||| |||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||   ||||||||| | ||||||||||||||     ||| ||||  ||||||| ||||     
T  19985096 acattatcataatccaaataacagttatcatgaataattcaatt--aacatcatgcatttgatcaataataa-----tcacacattaatacttatatcac 19985004  T
Q  121 accccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 216  Q
    ||| |||||||| ||||||||  ||| ||||  ||||     ||||||| |||| || ||||| ||||||| |||||||| ||||||||| |||||    
T  19985003 acctcaatatctcacatcaatcgtcatcaat--catg-----tgaacaattatcgattcacaaatattcattcacaatcaccaatcacatttatca 19984915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #86
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 197 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 22227356 - 22227278
Alignment:
Q  197 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatc 274  Q
    |||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||| |||||||||||||| ||||    
T  22227356 atcaccaatcacatatttcacataggactcatgctatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccgaatc 22227278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #87
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 142 - 216
Target Start/End: Original strand, 25173731 - 25173805
Alignment:
Q  142 aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 216  Q
    |||||||||| || ||| |||| || |||||||||| |||| |||||||||||| |||| |||||| ||| ||||    
T  25173731 aatcaccaattacttgtatcataaataaatatcaattcacagttattcatacacgatcaccaatcatatacatca 25173805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #88
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 24 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 18835544 - 18835474
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataat 95  Q
    |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||   ||||||||| | |||||||||||||||    
T  18835544 acattatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatt--aacatcatgcatttgatcaataataat 18835474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #89
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 246 - 290
Target Start/End: Original strand, 21930417 - 21930462
Alignment:
Q  246 cgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctc-aaggtcgtcac 290  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21930417 cgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaaggtcgtcac 21930462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #90
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 295 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 31162486 - 31162441
Alignment:
Q  295 gatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacat 340  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||| ||| |||||||||||    
T  31162486 gatgcaacaaaaacatcatatgtaagatttgacatccgtcttacat 31162441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #91
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 218 - 262
Target Start/End: Original strand, 32896494 - 32896538
Alignment:
Q  218 taagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatg 262  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| |||||||    
T  32896494 taagactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatg 32896538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 248; Significance: 1e-137; HSPs: 99)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 24 - 400
Target Start/End: Original strand, 37605283 - 37605668
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 122  Q
    |||||||||||||| || ||||| |||||||||||| ||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  37605283 acatcatcataatctaaataacagttaacatgaatatttcaattcaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatatatatacttacatcaaac 37605382  T
Q  123 cccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatca-------tcaatcacatatatc 215  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||| |       
T  37605383 cccaatatttcacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcaccaatcatcaatcacatttcca 37605482  T
Q  216 aataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtc-gtcactttcgatgcaacaaaaacatcgca 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||  |    
T  37605483 aataagactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtctgtcaccttcgatgcaacaaaaatatcata 37605582  T
Q  315 tgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaatctcaacacgactatgatg 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37605583 tgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaaataaaagagttcaacccttttacaactacaatctcaacacgactatgatg 37605668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 24 - 366
Target Start/End: Original strand, 41243948 - 41244277
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 122  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41243948 acatcatcataatccaaataacagttaacatgtatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 41244047  T
Q  123 cccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaataaga 222  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||              | ||||||||||||||||||||||    
T  41244048 cccaatatctcacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaat--------------cctcaatcacatatatcaataaga 41244133  T
Q  223 ctcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagat 322  Q
     |||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  41244134 ttcatgtcatgatatgcacctatcgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaaatatcgtatgtaagat 41244233  T
Q  323 ttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacc 366  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41244234 ttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacc 41244277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 24 - 290
Target Start/End: Original strand, 25120745 - 25121012
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 122  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25120745 acatcatcataatccaaataacagttaacatgtatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 25120844  T
Q  123 cccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaataaga 222  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  25120845 cccaatatctcacataaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatttccaattattcatacacaattatcaaacacatatatcaataaga 25120944  T
Q  223 ctcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 290  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25120945 ctcatgtcatgatatgcacctatcgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 25121012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 24 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 19995078 - 19994802
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatactta-------- 114  Q
    |||||||||||||| || ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||| |||||  ||            
T  19995078 acatcatcataatcaaaataatagttaacatgaataattcaatataaacatcatgcatttgatcaataatgatattctcatatatatatatatatatata 19994979  T
Q  115 catcaaa-ccccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatata 213  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||| ||||||||| ||| ||||||||    
T  19994978 catcaaaaccccaataactcacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatttccaattattcacacacaatcaccaaacacatata 19994879  T
Q  214 tcaataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19994878 tcaataagactcatgtcatgatatgcacctatcgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 19994802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 24 - 290
Target Start/End: Original strand, 20479893 - 20480166
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacata------tacttaca 116  Q
    |||||||||||||| || ||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||| | |||||||| ||| ||||||||||| |||      ||||||||    
T  20479893 acatcatcataatcaaaataacacttaacatggatagttcaatataaacatcatgcatttgatcaa-aatgatattctcatatatacatatatacttaca 20479991  T
Q  117 tcaaaccccaa-tatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatc 215  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||| ||| ||||| | | ||||||||||    
T  20479992 tcaaaacccaaatatctcacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatttccaattattcacacataatcaccgagcacatatatc 20480091  T
Q  216 aataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  20480092 aataagactcatgtcatgatatgcacctatcgacacatatatgcatgtggtaccgaatcacctcaatgtcgtcac 20480166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 24 - 290
Target Start/End: Original strand, 16416537 - 16416810
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacata------tacttaca 116  Q
    |||||||||||||| || ||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||  | |||||||||||| ||||||  ||| |||      |||| |||    
T  16416537 acatcatcataatcaaaataataattaacatggatagttcaatataaacatcataca-ttgatcaataatgatattcaaatatatacatatatactcaca 16416635  T
Q  117 tcaaa-ccccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatc 215  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||| ||||||||| | | |||||||||     
T  16416636 tcaaaaccccaatatctcacatcaataatcaataatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatttccaattattcacacacaatcaccgaacacatatatg 16416735  T
Q  216 aataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16416736 aataagactcatgtcatgatatgcacctatcgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcatcac 16416810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 24 - 215
Target Start/End: Original strand, 18610428 - 18610620
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 122  Q
    |||||| |||||||||| ||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||    
T  18610428 acatcaacataatccaaataacagttaacatgattatttcaatataaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatatcaatacttacatcaaac 18610527  T
Q  123 cccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatc 215  Q
    ||||||||||  ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18610528 cccaatatctcccattaataatcatcaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagctattcatacacaatcaccaatcacatatatc 18610620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 24 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 41509122 - 41508927
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaa- 121  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||| ||| ||| ||||||  |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  41509122 acatcatcataatccaaataacagttaatatggatatttcaattcaaacatcaggcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaaa 41509023  T
Q  122 -ccccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 216  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  41509022 accccaatatctcacatcaataatcaccactcacatgtgtcatgaacaattatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatca 41508927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 108 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 16204098 - 16203832
Alignment:
Q  108 atacttacatcaaaccccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatca 207  Q
    |||||| ||||| || ||||||||| |||||||||||||  |||||||||       ||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||||| ||||||    
T  16204098 atacttgcatcacactccaatatctcacatcaataatcattaatcacatg-------aacaattatcaattcacaaatattcattcacaatcaccaatca 16204006  T
Q  208 catatatcaataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaa-aa 306  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| ||||||| | |||       
T  16204005 catatatcaataagactcatgccatgatatgcacctattgacacatatatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcaccttcgatggatcaattc 16203906  T
Q  307 acatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactaca 380  Q
    |||||| |||||||  |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16203905 acatcgtatgtaagggttcacacccgccttacataatctctgaagtaaaagagctcaacccttttacaactaca 16203832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 24 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 24719513 - 24719328
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 122  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   ||| ||||   |||||| ||||||||    
T  24719513 acatcatcataatccaaataacagttaacatgaataattcaatataaacatcatgcacttgatcaataata---ttcacatatcaatacttgcatcaaac 24719417  T
Q  123 cccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacata 211  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24719416 cccaatatctcacattaataatcaccattcacatgtgtcatgaacaaatatcacttcacaattattcatacacaatcaccaatcacata 24719328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 24 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 13664743 - 13664550
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 122  Q
    |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||| || |   |||||||||||||||    
T  13664743 acattatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatttaaacatcatacacttgatcaataataatattcccacatcaatacttacatcaaac 13664644  T
Q  123 cccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 216  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  13664643 cccaatatctcacatcaataatcatcaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcatatacatca 13664550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 24 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 13724018 - 13723825
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 122  Q
    |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||| || |   |||||||||||||||    
T  13724018 acattatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatttaaacatcatacacttgatcaataataatattcccacatcaatacttacatcaaac 13723919  T
Q  123 cccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 216  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  13723918 cccaatatctcacatcaataatcatcaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcatatacatca 13723825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 24 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 22008548 - 22008366
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 122  Q
    |||| |||||||||||| ||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |   |||||||||||||||    
T  22008548 acattatcataatccaaataacagttaacataaatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattcccacatcaatacttacatcaaac 22008449  T
Q  123 cccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaat 205  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || | ||||||||||||||||||||||    
T  22008448 cccaatatctcacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcatttcatagttattcatacacaatcatcaat 22008366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 24 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 22909535 - 22909342
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 122  Q
    |||| |||||||||||| ||| | |||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||     
T  22909535 acattatcataatccaaataatagttaacatgaatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatatcaatacttacatcaaat 22909436  T
Q  123 cccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 216  Q
    |||||||||| | || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  22909435 cccaatatctcaaattaataatcatcaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcatatacatca 22909342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 24 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 20655943 - 20655677
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatca-aa 121  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||  |||||||| ||||  |    
T  20655943 acatcatcataatccaaataacagttagcatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatatccacatatgtatacttatatcatga 20655844  T
Q  122 ccccaatatcttacatcaat-aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatca-----catatatc 215  Q
     |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||     || || ||    
T  20655843 tcccaatatctcacatcaataaatcaccaatcacatgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcaccaatcacatttc 20655744  T
Q  216 --aataagactcatgtcatgatatgcacata--tcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacct 278  Q
      || ||||||||||||||||| ||||| ||  ||||| |||| ||||||||||||||| |||||||    
T  20655743 aaaacaagactcatgtcatgatgtgcacctagttcgacacatatatgcatgtggtaccatatcacct 20655677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 272 - 400
Target Start/End: Original strand, 41245210 - 41245338
Alignment:
Q  272 atcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaaccctttt 371  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  41245210 atcacctcaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaaatatcgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaaccatttt 41245309  T
Q  372 acaactacaatctcaacacgactatgatg 400  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  41245310 acaactacaatttcaacacgactatgatg 41245338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 24 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 24108657 - 24108465
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 122  Q
    |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||   ||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  24108657 acattatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatt--aacatcatgcatttgatcaataataatattctcatatatatacttacatcaaaa 24108560  T
Q  123 c-ccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 216  Q
    | ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  24108559 ctccaatatgtcacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcatatacatca 24108465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 251 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 21192384 - 21192234
Alignment:
Q  251 catacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaa 350  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21192384 cataaatgcatgtggtaccgaatcaccttaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaaacatcgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatcaccgaa 21192285  T
Q  351 gtaaaagagttcaacccttttacaactacaa-tctcaacacgactatgatg 400  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  21192284 gtaaaagagctcaacccttttacaactacaagactcaacatgactatgatg 21192234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 251 - 400
Target Start/End: Original strand, 21696086 - 21696236
Alignment:
Q  251 catacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaa 350  Q
    |||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21696086 cataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaaacattgtatgtaagatttcacacccgttttacataatctccgaa 21696185  T
Q  351 gtaaaagagttcaacccttttacaactac-aatctcaacacgactatgatg 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||    
T  21696186 gtaaaagagttcaacccttttacaactacaaaactcaacatgactatgatg 21696236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 251 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 21199811 - 21199661
Alignment:
Q  251 catacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaa 350  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  21199811 cataaatgcatgtggtaccgaatcacctcaagctcgtcaccttcgatgcaacaaaaacatcgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatcactgaa 21199712  T
Q  351 gtaaaagagttcaacccttttacaactacaa-tctcaacacgactatgatg 400  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  21199711 gtaaaagagctcaacccttttacaactacaagactcaacatgactatgatg 21199661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 256 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 31195917 - 31195772
Alignment:
Q  256 atgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaa 355  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  31195917 atgcatgtggtaccaaatcaccttaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaaatatcgtatgtaagatttcacgcccgtcttacataatctccgaagtaaa 31195818  T
Q  356 agagttcaacccttttacaactacaa-tctcaacacgactatgatg 400  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  31195817 agagctcaacctttttacaactacaagactcaacatgactatgatg 31195772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 251 - 400
Target Start/End: Original strand, 23835746 - 23835895
Alignment:
Q  251 catacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaa 350  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  23835746 cataaatgcatgtggtaccgaa-cacctcaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaaacatcgtatgtaagattttacacccgtcttacataatcaccgaa 23835844  T
Q  351 gtaaaagagttcaacccttttacaactacaa-tctcaacacgactatgatg 400  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  23835845 gtaaaagagctcaacccttttacaactacaagactcaacatgactatgatg 23835895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 24 - 216
Target Start/End: Original strand, 23509068 - 23509261
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 122  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |  | ||| ||||||||||||||| |  |   |||||||||||||||    
T  23509068 acattatcataatccaaataacaattaacatgaatatttcaatataaacatcctacatttggtcaataataatattcccgcatcaatacttacatcaaac 23509167  T
Q  123 cccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 216  Q
    |||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  23509168 cccaatatcgcacatcaatcatcaccaatcacatgtgtcttgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcatatacatca 23509261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 216 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 37655324 - 37655134
Alignment:
Q  216 aataagactcatgtca---tgatatgcacata--tcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacat 310  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||| ||  ||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  37655324 aataagactcatgtcaacatgatatgcacctagttcgacacatatatgcatgtggtgccaaatcacctcaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaaacat 37655225  T
Q  311 cgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaa-tctcaacacgactatgatg 400  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |  | |||||||| ||||||  ||||||| ||||||||||    
T  37655224 cgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatcaccgaagtaaaagagcacccctcttttacagctacaagactcaacatgactatgatg 37655134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 194 - 380
Target Start/End: Original strand, 29758768 - 29758956
Alignment:
Q  194 acaatcatcaatcacatatatcaa-taagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactt 292  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||  ||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| |    
T  29758768 acaatcaccaatcacatatatcaaataagactcatgtcatgatatgcacttattgacatataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcacct 29758867  T
Q  293 tcgatgcaacaaa-aacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactaca 380  Q
    |||||| ||||||  |||| | |||||||  |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  29758868 tcgatggaacaaatcacattgtatgtaagggttcacacccgccttacaaaatctccgaagtaaaagagctcaacccttttacaactaca 29758956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 39 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 22323398 - 22323225
Alignment:
Q  39 aataacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaaccccaatatcttacatc 138  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||   ||| ||||   || ||||||||| |||||||||||| |||||    
T  22323398 aataacagttaacatgaa-aattcaatataaacatcatgcacttgatcaataata---ttcacataacaatgcttacatcacaccccaatatctcacatc 22323303  T
Q  139 aataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 216  Q
    |||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  22323302 aatattcatcaatcacatgtatcatgaacaaatatcaattcacaattattcatacacaatcaccaatcacatacatca 22323225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 24 - 215
Target Start/End: Original strand, 269950 - 270138
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 122  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||   ||| || |   |||||||||||||||    
T  269950 acatcatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatataa-catcatgcacttgatcaataata---ttcacacatcaatacttacatcaaac 270045  T
Q  123 cccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatc 215  Q
    || ||||||| |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||    
T  270046 ccaaatatctcacatcaataatcattaatcacgtgtgtcatgaacaaatatcaattcacaattattcatacacagtcaccaattacatatatc 270138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 24 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 645970 - 645782
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 122  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||   ||| || |   |||||||||||||||    
T  645970 acatcatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatataa-catcatgcacttgatcaataata---ttcacacatcaatacttacatcaaac 645875  T
Q  123 cccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatc 215  Q
    || ||||||| |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||    
T  645874 ccaaatatctcacatcaataatcattaatcacgtgtgtcatgaacaaatatcaattcacaattattcatacacagtcaccaattacatatatc 645782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 24 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 831705 - 831517
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 122  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||   ||| || |   |||||||||||||||    
T  831705 acatcatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatataa-catcatgcacttgatcaataata---ttcacacatcaatacttacatcaaac 831610  T
Q  123 cccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatc 215  Q
    || ||||||| |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||    
T  831609 ccaaatatctcacatcaataatcattaatcacgtgtgtcatgaacaaatatcaattcacaattattcatacacagtcaccaattacatatatc 831517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 251 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 39448460 - 39448310
Alignment:
Q  251 catacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaa 350  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  39448460 cataaatgcatgtggtaccgaatcacctcaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaaacatcgtgtgtaagatttcacaccagtcttacataatctccgaa 39448361  T
Q  351 gtaaaagagttcaacccttttacaacta-caatctcaacacgactatgatg 400  Q
    ||||||||| |||||| |||||| |||| ||  ||||||| ||||||||||    
T  39448360 gtaaaagagctcaacctttttacgactaccagactcaacatgactatgatg 39448310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 24 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 16043245 - 16043054
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaa- 121  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||   ||||||||| | ||||||||||| ||||||| ||||   ||||||||||||||     
T  16043245 acatcatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatt--aacatcatgcatttgatcaataaaaatattcacataacaatacttacatcaaaa 16043148  T
Q  122 ccccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatc 215  Q
    ||||||||||| |||| |||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | | ||||||||||||    
T  16043147 ccccaatatctcacattaataatcatctatcacacgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaattacccatcacatatatc 16043054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 203 - 380
Target Start/End: Original strand, 270226 - 270401
Alignment:
Q  203 aatcacatatatcaataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaac 302  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| ||||||| |      
T  270226 aatcacatatatcaataaaactcatgtcatgatatgcacctattgacacatatatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcaccttcgatg-ata 270324  T
Q  303 aaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactaca 380  Q
    ||| |||||| || |||   |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  270325 aaacacatcgtat-taatggttcacatccgccttacataatctccgaagtaaaagagctcaacccttttacaactaca 270401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 203 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 645694 - 645519
Alignment:
Q  203 aatcacatatatcaataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaac 302  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| ||||||| |      
T  645694 aatcacatatatcaataaaactcatgtcatgatatgcacctattgacacatatatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcaccttcgatg-ata 645596  T
Q  303 aaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactaca 380  Q
    ||| |||||| || |||   |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  645595 aaacacatcgtat-taatggttcacatccgccttacataatctccgaagtaaaagagatcaacccttttacaactaca 645519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 203 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 831429 - 831254
Alignment:
Q  203 aatcacatatatcaataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaac 302  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| ||||||| |      
T  831429 aatcacatatatcaataaaactcatgtcatgatatgcacctattgacacatatatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcaccttcgatg-ata 831331  T
Q  303 aaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactaca 380  Q
    ||| |||||| || |||   |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  831330 aaacacatcgtat-taatggttcacatccgccttacataatctccgaagtaaaagagctcaacccttttacaactaca 831254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 24 - 177
Target Start/End: Original strand, 17343480 - 17343632
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 122  Q
    |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |   |||||  ||||||||    
T  17343480 acattatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattcccacatcaatact--catcaaac 17343577  T
Q  123 cccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaat 177  Q
    |||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17343578 cccaatatcccacatcaataatcgccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaat 17343632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 24 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 16041569 - 16041378
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaa- 121  Q
    |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||   ||||||||| | ||||||||||| ||||||| ||||   ||||||||||||||     
T  16041569 acattatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatt--aacatcatgcatttgatcaataaaaatattcacataacaatacttacatcaaaa 16041472  T
Q  122 ccccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatc 215  Q
    ||||||||||| |||| |||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | | ||||||||||||    
T  16041471 ccccaatatctcacattaataatcatctatcacacgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaattacccatcacatatatc 16041378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 314 - 400
Target Start/End: Original strand, 37609956 - 37610042
Alignment:
Q  314 atgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaatctcaacacgactatgatg 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37609956 atgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaaataaaagagttcaacccttttacaactacaatctcaacacgactatgatg 37610042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 125 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 17731286 - 17731117
Alignment:
Q  125 caatatcttacatcaat-aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatat-atcaataaga 222  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  |||||  |||| ||||| ||||||||||||||||||||| | | ||||||||    
T  17731286 caatatctcacatcaattaatcaccaatcacaagtgtcatgaacaatcatcaaatcacatttatttatacacaatcatcaatcacatttcaccaataaga 17731187  T
Q  223 ctcatgtcatgatatgcacata--tcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 290  Q
    ||||||||||||||||||| ||  ||||| |||| |||||||||||||||  |||| |||||||||||||    
T  17731186 ctcatgtcatgatatgcacctagttcgacacatatatgcatgtggtaccatttcacttcaaggtcgtcac 17731117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 202 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 24719165 - 24719077
Alignment:
Q  202 caatcacatatatcaataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 290  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24719165 caatcatatatatcaataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 24719077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 245 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 22498947 - 22498832
Alignment:
Q  245 tcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatc 344  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  22498947 tcgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcacccatgatgcaacaaaaacatcatatgtaagatttcacacccgtcttacattatc 22498848  T
Q  345 tccgaagtaaaagagt 360  Q
     |||||||||||||||    
T  22498847 accgaagtaaaagagt 22498832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 204 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 24930789 - 24930614
Alignment:
Q  204 atcacatatatcaa-taagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaac 302  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| | ||||| |||    
T  24930789 atcacgtatatcaaataagactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcacctccgatggaac 24930690  T
Q  303 aa--aaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaac 376  Q
    ||   ||||||| |||||||  ||||| ||||  |||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  24930689 aactcaacatcgtatgtaagggttcacccccgctttacataatctctgaagtaaaagagctcaactcttttacaac 24930614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 202 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 24387383 - 24387203
Alignment:
Q  202 caatcacatatatcaa-taagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgca 300  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| |||||||||||||||||||  |  ||||||||||| |  |||| |    
T  24387383 caatcatatatatcaaataagactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatc-tcaaaaggtcgtcacctctgatgga 24387285  T
Q  301 acaa--aaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactaca 380  Q
    ||||   ||||||| |||||||   |||| || | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24387284 acaactcaacatcgtatgtaagggctcacccctgccttacataatctccgaagtaaaagagctcaacccttttacaactaca 24387203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 251 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 23116458 - 23116349
Alignment:
Q  251 catacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaa 350  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  23116458 catatatgcatgtggtaccaaatcacatcaaggtcgtcacccatgatgcaacaaaaacatcatatgtaagatttcacacccgtcttacattatcaccgaa 23116359  T
Q  351 gtaaaagagt 360  Q
    ||||||||||    
T  23116358 gtaaaagagt 23116349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 24 - 290
Target Start/End: Original strand, 38531882 - 38532152
Alignment:
Q  24 acatcatcataatcca-ataacaattaa-catgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaa-taataatattctcatacatatacttacatca- 119  Q
    ||||||||||||| || |||||| |||| |||||||||||||||  ||| |||||| |||| ||||| ||| ||||| |  ||| ||||||| | | ||     
T  38531882 acatcatcataattcatataacagttaaacatgaataattcaattcaaatatcatgcacttaatcaaataagaatatcc--atatatatactcataccat 38531979  T
Q  120 aaccccaatatcttacatcaa-taatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatat-atcaa 217  Q
    || ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||| || |||||||||||||||||| | | | |    
T  38531980 aatcccaatatcttacattaagtaatcaccaatcacatgtgtcatgaacaatcatcaat-cacaattatt-atgcacaatcatcaatcacatttcaccca 38532077  T
Q  218 taagactcatgtcatgatatgcacata--tcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 290  Q
    |||||||||||||||| | | ||| ||  ||||| |||| ||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||    
T  38532078 taagactcatgtcatgctgtacacctagttcgacacatatatgcatggggtaccatatcacttcaaggtcgtcac 38532152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 246 - 360
Target Start/End: Original strand, 22312190 - 22312304
Alignment:
Q  246 cgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatct 345  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  22312190 cgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaagtcatcacccatgatgcaacaaaaacatcatatgtaagatttcacacccgtcttacattatca 22312289  T
Q  346 ccgaagtaaaagagt 360  Q
    |||||||||||||||    
T  22312290 ccgaagtaaaagagt 22312304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 246 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 45560861 - 45560747
Alignment:
Q  246 cgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatct 345  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| |||     
T  45560861 cgacacatacatgcatgtggtaacaaatcacctcaaggtcgtcacccatgatgcaacaaaaacatcatatgtaagattttacacccgtcttacattatca 45560762  T
Q  346 ccgaagtaaaagagt 360  Q
    ||||| |||||||||    
T  45560761 ccgaattaaaagagt 45560747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 216 - 306
Target Start/End: Original strand, 25294490 - 25294582
Alignment:
Q  216 aataagactcatgtcatgatatgcacata--tcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaa 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25294490 aataagactcatgtcatgatatgcatctagttcgacgcatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaa 25294582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 216 - 306
Target Start/End: Original strand, 25756479 - 25756571
Alignment:
Q  216 aataagactcatgtcatgatatgcacata--tcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaa 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25756479 aataagactcatgtcatgatatgcatctagttcgacgcatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaa 25756571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 246 - 351
Target Start/End: Original strand, 33170785 - 33170890
Alignment:
Q  246 cgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatct 345  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  33170785 cgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcacccatgatgcaacaaaaacatcatatgtaagatttcacacccgtcttacattatca 33170884  T
Q  346 ccgaag 351  Q
    ||||||    
T  33170885 ccgaag 33170890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 256 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 33612694 - 33612569
Alignment:
Q  256 atgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaa 355  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||| |||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  33612694 atgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcacccatgatgtaacaaacacatcatatgtaagatttcacacccgtcttacattatcaccgaagtaaa 33612595  T
Q  356 agagttcaacccttttacaactacaa 381  Q
    ||||  || |||||||| | ||||||    
T  33612594 agagcacatcccttttaaagctacaa 33612569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 123 - 290
Target Start/End: Original strand, 28543270 - 28543440
Alignment:
Q  123 cccaatatcttacatcaat-aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatat-atcaataa 220  Q
    ||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||||| |||||||| |||||| || | | ||||||    
T  28543270 cccaataactcacatcaattaatcaccaatcacatgtgtcatgaacaattatcaaatcacatttattcatgcacaatcaccaatcaaatttcaccaataa 28543369  T
Q  221 gactcatgtcatgatatgcac--atatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 290  Q
    |||||||| |||||| || ||  | | |||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  28543370 gactcatg-catgatgtgtacctagaccgacacatatatgcatgtggtaccatatcacctcaaggtcgtcac 28543440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 24 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 6776422 - 6776303
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 122  Q
    |||| |||||||||||| |||||  ||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |   |||||||||||||||    
T  6776422 acattatcataatccaaataacagataacatgaatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattcccacatcaatacttacatcaaac 6776323  T
Q  123 cccaatatcttacatcaata 142  Q
    |||||||||| |||||||||    
T  6776322 cccaatatctcacatcaata 6776303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 246 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 23153452 - 23153297
Alignment:
Q  246 cgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatct 345  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    | || |||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  23153452 cgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaagatcgtcacccatggtgtaacaaacacatcatatgtaagatttcacacccgtcttacattatca 23153353  T
Q  346 ccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaa-tctcaacacgactatgatg 400  Q
    |||||||||||||||  | |||||||||| | ||||  ||||||| ||||||||||    
T  23153352 ccgaagtaaaagagtatatcccttttacagccacaagactcaacatgactatgatg 23153297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 24 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 43375493 - 43375310
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacat--atacttacatcaa 120  Q
    |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||     ||| ||||  ||||||||||||     
T  43375493 acattatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatataaacatcatgcatttgatcaataataa-----tcacacattaatacttacatcac 43375399  T
Q  121 accccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 216  Q
    |||||||||||  ||||||||||||| ||||||        |||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||||| ||||||||| |||||    
T  43375398 accccaatatcccacatcaataatcatcaatca-------tatgaacaattatcaattcacaaatattcattcacaatcaccaatcacatttatca 43375310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 24 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 18768691 - 18768422
Alignment:
Q  24 acatcatcataatcca-ataacaattaa-catgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatca-a 120  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||| |||||  ||| |||||||||||  ||||||||||||| |  |||  |||||| | | || |    
T  18768691 acatcatcataatccacataacagttaagcatgaataaatcaattcaaatatcatgtacttactcaataataatatccaaata--tatactcataccata 18768594  T
Q  121 accccaatatcttacatcaat-aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatat-atcaat 218  Q
    |  |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||  |||||| || | ||| |||| || ||||||||||||||| | | ||||    
T  18768593 attccaatatcttacattaagcaatcaccaatcacatgtgtcatgaacaatcatcaat-catattta-tcatgcataatcatcaatcacatttcaccaat 18768496  T
Q  219 aagactcatgtcatgatatgcac--atatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 290  Q
    ||||||||||||||| |||||||  |  ||||| ||||||||||| ||||||||  |||| |||| ||||||||    
T  18768495 aagactcatgtcatgttatgcaccaagttcgacacatacatgcatatggtaccatttcacttcaaagtcgtcac 18768422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 194 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 22008236 - 22008139
Alignment:
Q  194 acaatcatcaatcacatatatcaa-taagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 290  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||    
T  22008236 acaatcaccaatcacatatatcaaataagactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcac 22008139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 167 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 24108368 - 24108245
Alignment:
Q  167 caaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggt 266  Q
    |||| |||||| |||||||||||| ||| ||||| ||||||||| |   |||| ||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| |||||||||||    
T  24108368 caaacatcaattcacaattattcacacataatcaccaatcacattttcaaatatgactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggt 24108269  T
Q  267 accaaatcacctcaaggtcgtcac 290  Q
    |||||||| ||  |||||||||||    
T  24108268 accaaatctccaaaaggtcgtcac 24108245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 24 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 3433718 - 3433535
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 122  Q
    |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| | | |||    |||||||||||| ||    
T  3433718 acattatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatttaaacatcatacacttgatcaataataat-tacacat--taatacttacatcacac 3433622  T
Q  123 cccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 216  Q
    ||| |||||| ||||||||| ||| ||||||        |||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||    
T  3433621 cccgatatctcacatcaatattcatcaatca-------tatgaacaattatcaatttacaattattcattcacaatcaccaatcacatttatca 3433535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 194 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 22323197 - 22323102
Alignment:
Q  194 acaatcatcaatcacatatatcaataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 290  Q
    ||||||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||| |||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  22323197 acaatcaccaaacacatttatcaataaaactcatgtcatgatatgcacctattgacacatatatgcatgtggtacc-aatctcctcaaggtcgtcac 22323102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 202 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 43375274 - 43375202
Alignment:
Q  202 caatcacatatatcaataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatc 274  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||| |||| |||||||||||||||||||    
T  43375274 caatcacatatatcaataagactcatgccatgatatgcacctattgacacatatatgcatgtggtaccaaatc 43375202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 221 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 22090097 - 22089943
Alignment:
Q  221 gactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtca-ctttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaa 319  Q
    ||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||| ||    |||||| ||||||    
T  22090097 gactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgaatgtaa 22089998  T
Q  320 gatttcacacccgtcttac-ataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttaca 374  Q
    |   ||||||| | ||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22089997 gggctcacacctgccttacaataatct-cgaagtaaaagagttcaactcttttaca 22089943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 246 - 360
Target Start/End: Original strand, 24238065 - 24238177
Alignment:
Q  246 cgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatct 345  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    |||||||||||||||||| ||||| ||||||    || |||||||| |||     
T  24238065 cgacacatatatgcatgtggtaccaaatcagctcaaggtcgtcacccatgatgcaacaaaaacatcgtatgtacgatttcgt--ccatcttacattatcg 24238162  T
Q  346 ccgaagtaaaagagt 360  Q
    |||||||||||||||    
T  24238163 ccgaagtaaaagagt 24238177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 24 - 86
Target Start/End: Original strand, 28543151 - 28543213
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatc 86  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28543151 acatcatcataatccaaataacaattaacatgaataattcaat-taaacatcatgtacttgatc 28543213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 197 - 290
Target Start/End: Original strand, 23509397 - 23509491
Alignment:
Q  197 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 290  Q
    |||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  23509397 atcaccaatcacatatttcacataagactcatgttatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcac 23509491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 194 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 13664393 - 13664296
Alignment:
Q  194 acaatcatcaatcacatatatcaat-aagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 290  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| |||||||||||||||||||  |  |||||||||||    
T  13664393 acaatcaccaatcacatttatcaaacaagactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatcttcaaaaggtcgtcac 13664296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 194 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 13723668 - 13723571
Alignment:
Q  194 acaatcatcaatcacatatatcaat-aagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 290  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| |||||||||||||||||||  |  |||||||||||    
T  13723668 acaatcaccaatcacatttatcaaacaagactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatcttcaaaaggtcgtcac 13723571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 197 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 3433254 - 3433076
Alignment:
Q  197 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtca-ctttc 294  Q
    |||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||| |||||    
T  3433254 atcaccaatcacatatttcacataggactcatgctatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttc 3433155  T
Q  295 gatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttac-ataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttaca 374  Q
    ||||| ||    |||||| |||||||   ||||||| | ||||| ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  3433154 gatgccacttgcacatcgaatgtaagggctcacacctgccttacaataatct-cgaagtaaaagag-tcatcccttttaca 3433076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 142 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 13664496 - 13664424
Alignment:
Q  142 aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatat 214  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  13664496 aatcaccaatcacatgtatcaggaacaaatatcaattcacaaatattcattcacaatcaccaatcacaaatat 13664424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 142 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 13723771 - 13723699
Alignment:
Q  142 aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatat 214  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  13723771 aatcaccaatcacatgtatcaggaacaaatatcaattcacaaatattcattcacaatcaccaatcacaaatat 13723699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 197 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 21853574 - 21853396
Alignment:
Q  197 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtca-ctttc 294  Q
    |||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||| |||||    
T  21853574 atcaccaatcacatatttcacataggactcatgctatgatatgcacttattgactcataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttc 21853475  T
Q  295 gatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttac-ataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttaca 374  Q
    ||||| ||    |||||| |||||||   ||||||| | ||||| ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  21853474 gatgccacttgcacatcgaatgtaagggctcacacctgccttacaataatct-cgaagtaaaagag-tcatcccttttaca 21853396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 194 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 22909242 - 22909146
Alignment:
Q  194 acaatcatcaatcacatatatcaataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 290  Q
    ||||||||||||||||| |   |||  ||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||    
T  22909242 acaatcatcaatcacattttcaaatctgactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcac 22909146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 217 - 359
Target Start/End: Original strand, 24547724 - 24547863
Alignment:
Q  217 ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaa--aaacatcgca 314  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| | |||||  ||||   |||||||||    
T  24547724 ataagactcatgttatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcacctccgatg-gacaagtcaacatcgca 24547822  T
Q  315 tgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagag 359  Q
    ||||||   |||| |    ||||||||||||||||||||||||||    
T  24547823 tgtaaggggtcactc----cttacataatctccgaagtaaaagag 24547863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 221 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 15320713 - 15320559
Alignment:
Q  221 gactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtca-ctttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaa 319  Q
    ||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||| ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||| ||    |||||| ||||||    
T  15320713 gactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgcggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgaatgtaa 15320614  T
Q  320 gatttcacacccgtcttac-ataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttaca 374  Q
    |   ||||||| | ||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15320613 gggctcacacctgccttacaataatct-cgaagtaaaagagttcaactcttttaca 15320559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 221 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 15501082 - 15500928
Alignment:
Q  221 gactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtca-ctttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaa 319  Q
    ||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||| ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||| ||    |||||| ||||||    
T  15501082 gactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgcggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgaatgtaa 15500983  T
Q  320 gatttcacacccgtcttac-ataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttaca 374  Q
    |   ||||||| | ||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15500982 gggctcacacctgccttacaataatct-cgaagtaaaagagttcaactcttttaca 15500928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 142 - 205
Target Start/End: Original strand, 23509315 - 23509378
Alignment:
Q  142 aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaat 205  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||    
T  23509315 aatcaccaatcacatgtatcaggaacaaatatcaattcacaaatattcattcacaatcatcaat 23509378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 24 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 23631173 - 23631046
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 122  Q
    |||| |||||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | | |||    |||||||||||| ||    
T  23631173 acattatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataat-tacacat--taatacttacatcacac 23631077  T
Q  123 cccaatatcttacatcaataatcaccaatca 153  Q
    ||| |||||| ||||||||| ||| ||||||    
T  23631076 cccgatatctcacatcaatattcatcaatca 23631046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 299 - 360
Target Start/End: Original strand, 11543088 - 11543149
Alignment:
Q  299 caacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagt 360  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||    
T  11543088 caacaaaaacatcatatgtaagatttcacacccgtcttacattatcaccgaaataaaagagt 11543149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 197 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 21846169 - 21846065
Alignment:
Q  197 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtca-ctttc 294  Q
    |||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||| |||||    
T  21846169 atcaccaatcacatatttcacataggactcatgctatgatatgcacttattgactcataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttc 21846070  T
Q  295 gatgc 299  Q
    |||||    
T  21846069 gatgc 21846065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 341 - 400
Target Start/End: Original strand, 25294581 - 25294641
Alignment:
Q  341 aatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaa-tctcaacacgactatgatg 400  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  25294581 aatctccgaagtaaaagagctcaacccttttacaactacaagactcaacatgactatgatg 25294641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 341 - 400
Target Start/End: Original strand, 25756570 - 25756630
Alignment:
Q  341 aatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaa-tctcaacacgactatgatg 400  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  25756570 aatctccgaagtaaaagagctcaacccttttacaactacaagactcaacatgactatgatg 25756630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 24 - 208
Target Start/End: Original strand, 28835980 - 28836155
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 122  Q
    |||| |||||||||||| ||||| ||||| |||||| |||||| ||||||||||| | ||||||||||||||| | | |||    |||||||||||| ||    
T  28835980 acattatcataatccaaataacagttaacctgaatatttcaatttaaacatcatgcaattgatcaataataat-tacacat--taatacttacatcacac 28836076  T
Q  123 cccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcac 208  Q
    ||| |||||| ||||||||| ||  ||||||        |||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||| |||||||    
T  28836077 cccgatatctcacatcaatattcgtcaatca-------tatgaacaattatcaatttacaattattcattcacaatcaccaatcac 28836155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 142 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 3433352 - 3433285
Alignment:
Q  142 aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcaca 209  Q
    |||||||| |||||||| ||| ||| |||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  3433352 aatcaccattcacatgtatcaggaataaatatcaattcacaaatattcattcacaatcatcaatcaca 3433285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 197 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 272880 - 272786
Alignment:
Q  197 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 290  Q
    |||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  272880 atcaccaatcacatatttcacataggactcatgctatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcac 272786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 197 - 290
Target Start/End: Original strand, 642969 - 643063
Alignment:
Q  197 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 290  Q
    |||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  642969 atcaccaatcacatatttcacataggactcatgctatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcac 643063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 197 - 290
Target Start/End: Original strand, 828775 - 828869
Alignment:
Q  197 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 290  Q
    |||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  828775 atcaccaatcacatatttcacataggactcatgctatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcac 828869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #86
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 197 - 290
Target Start/End: Original strand, 5236674 - 5236768
Alignment:
Q  197 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 290  Q
    |||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  5236674 atcaccaatcacatatttcacataggactcatgctatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcac 5236768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #87
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 24 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 39448646 - 39448573
Alignment:
Q  24 acatcatcataatcca-ataacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataata 96  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||| | |||| ||||||    
T  39448646 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaatatcatgtacttaaccaatgataata 39448573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #88
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 197 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 16874617 - 16874439
Alignment:
Q  197 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtca-ctttc 294  Q
    |||| ||||||||||  ||| ||| ||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||| ||||||||||| |  ||||||||||| |||||    
T  16874617 atcaccaatcacataattcacataggactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgcggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttc 16874518  T
Q  295 gatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttac-ataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttaca 374  Q
    ||||| ||    |||||| |||||||   ||||||| | ||||| ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  16874517 gatgccacttgcacatcgaatgtaagggctcacacctgccttacaataatct-cgaagtaaaagag-tcatcccttttaca 16874439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #89
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 24 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 17731387 - 17731331
Alignment:
Q  24 acatcatcataatcca-ataacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgta 79  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||    
T  17731387 acatcatcataatccacataacaattaacatgaatgattcaatttaaatatcatgta 17731331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #90
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 314 - 400
Target Start/End: Original strand, 23148481 - 23148568
Alignment:
Q  314 atgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaa-tctcaacacgactatgatg 400  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||  || |||||||||| | ||||  ||||||| ||||||||||    
T  23148481 atgtaagattttacacccgtcttacattatcaccgaagttaaagagcacatcccttttacagccacaagactcaacatgactatgatg 23148568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #91
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 112 - 216
Target Start/End: Original strand, 29758643 - 29758740
Alignment:
Q  112 ttacatcaaaccccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacata 211  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||       ||| ||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||||| |||| ||||     
T  29758643 ttacatcacaccccaatatctcacatcaataatcatcaatca-------cattaacaattatcaattcacaactattcattcacaatcaccaattacatt 29758735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #92
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 221 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 224816 - 224737
Alignment:
Q  221 gactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtca-ctttcgatgc 299  Q
    ||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||| ||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||    
T  224816 gactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgcggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgc 224737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #93
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 221 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 738439 - 738360
Alignment:
Q  221 gactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtca-ctttcgatgc 299  Q
    ||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||| ||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||    
T  738439 gactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgcggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgc 738360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #94
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 221 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 862334 - 862255
Alignment:
Q  221 gactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtca-ctttcgatgc 299  Q
    ||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||| ||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||    
T  862334 gactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgcggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgc 862255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #95
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 221 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 16675979 - 16675900
Alignment:
Q  221 gactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtca-ctttcgatgc 299  Q
    ||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||| ||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||    
T  16675979 gactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgcggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgc 16675900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #96
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 24 - 65
Target Start/End: Original strand, 21695899 - 21695941
Alignment:
Q  24 acatcatcataatcca-ataacaattaacatgaataattcaat 65  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  21695899 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaat 21695941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #97
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 197 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 24662924 - 24662830
Alignment:
Q  197 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 290  Q
    |||| ||||||||||  ||| ||| ||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||| ||||||||||| |  ||||||||||||    
T  24662924 atcaccaatcacataattcacatatgactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgcggtaccaaatctcaacaaggtcgtcac 24662830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #98
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 142 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 3433455 - 3433390
Alignment:
Q  142 aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatca 207  Q
    |||||||||| |||||| ||||||| ||  || ||| |||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  3433455 aatcaccaattacatgtatcatgaataataattaattcacagttattcatacacaatcaccaatca 3433390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #99
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 320 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 18043131 - 18043091
Alignment:
Q  320 gatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagt 360  Q
    ||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||    
T  18043131 gatttcacacccgtcttacattatcatcgaagtaaaagagt 18043091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 246; Significance: 1e-136; HSPs: 1)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 24 - 363
Target Start/End: Original strand, 37760 - 38101
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaa-a 121  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||| |||| ||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  37760 acatcatcataatccaaataacagttaccatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaga 37859  T
Q  122 ccccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaataag 221  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||    
T  37860 ccccaatatctcacatcaataatcaccaataacaagtgtcatgaacaaatatcaattcacaattattcatacacaatcaccaatcacatacatcactaag 37959  T
Q  222 actcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaaga 321  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  37960 actcatgtcatgatatgcacatatcgacacgtacatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaaacatcgtatgtaaga 38059  T
Q  322 tttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttca 363  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  38060 tttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaaaagttca 38101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 237; Significance: 1e-131; HSPs: 134)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 24 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 50113991 - 50113612
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatca-aa 121  Q
    ||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||| | ||    
T  50113991 acatcatcataatccaaataatagttaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattcacattca-atacttacattagaa 50113893  T
Q  122 ccccaatatcttacatcaat-aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaa-ta 219  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||| | ||||||| ||  |||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  50113892 ccccaatatctcacatcaattaatcatcaatcacatatatcatgaataatcatcaatccacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcaaata 50113793  T
Q  220 agactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaa 319  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||    
T  50113792 agactcatgtcattatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcaccttcgatgcaataaaaacatcgtatgtaa 50113693  T
Q  320 gatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaatctcaacacgactatgatg 400  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50113692 gatttcacacccgtcttgcataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaatctcaacacgactatgatg 50113612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 24 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 319486 - 319099
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatata--cttacatcaa 120  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||    
T  319486 acatcatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatataaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatatatatatacttacatcaa 319387  T
Q  121 a-ccccaatatcttacatcaataa-tcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcac--at---ata 213  Q
    | ||||||||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||  ||   ||     
T  319386 aaccccaatatctcatattaataaatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaacatcaatgcacaattattcatacacaatcaccaatcaccaatcgcatt 319287  T
Q  214 tc--aataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatc 311  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  319286 tccaaataagactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccagatcacctcaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaaacatc 319187  T
Q  312 gcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaatctcaacacgactatgat 399  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  319186 gtatgtaagagttcacacccgtcttacataatttccgaagtaaaagagttcaacccttttacgactacaatctcaacacgactatgat 319099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 24 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 51160335 - 51159973
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 122  Q
    |||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||  ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |   |||||||||||||||    
T  51160335 acattatcataatccaaataacagttaacatgaatatctcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcaaatcaatacttacatcaaac 51160236  T
Q  123 cccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaataaga 222  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  51160235 ctcaatatctcacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcaatgaga 51160136  T
Q  223 ctcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaa-aaacatcgcatgt---- 317  Q
    |||||| |||||||||||| |||  || |||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| ||||||| |||||   |||||| ||||        
T  51160135 ctcatgccatgatatgcacctattaacacatatatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcaccttcgatggaacaactcacatcgtatgtaagg 51160036  T
Q  318 aagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactaca 380  Q
    |||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  51160035 aagggttcacacccgccttacataatctccgaagtaaaagagctcaacccttttacaactaca 51159973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 24 - 290
Target Start/End: Original strand, 17098913 - 17099181
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaa- 121  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  17098913 acatcatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatttaaacatcatgcaattgatcaataataatattctcataaatatacttacatcaaaa 17099012  T
Q  122 ccccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaataag 221  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17099013 ccccaatatctcacattaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacaattattcacacacaatcaccaatcacatatatcaataag 17099112  T
Q  222 actcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 290  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  17099113 actcatgtcatgatatgcacctatcgacacatatatgcatgtggtaccaaatctcctcaaggttgtcac 17099181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 24 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 12351709 - 12351332
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaa- 121  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||| | |||||||| ||||||| || ||||   |||||||  ||| |     
T  12351709 acatcatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatttaaacatcatgcagttgatcaacaataatactcacatatcaatacttatgtcatat 12351610  T
Q  122 ccccaatatcttacatcaa-taatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaataa 220  Q
    |||||| |||| ||||||| |||||||||| ||||| || |||||||||  |||||| || ||||||||||||||||||| || |||||| |   || ||    
T  12351609 ccccaacatctcacatcaaataatcaccaaacacatatgacatgaacaatcatcaattcataattattcatacacaatcaccagtcacatttcaaaacaa 12351510  T
Q  221 gactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaag 320  Q
    |||||| |||||||||||||| ||| ||| |||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12351509 gactcacgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtactggatcacctcaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaaacatcgtatgtaag 12351410  T
Q  321 atttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaatctcaacacgactatga 398  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12351409 atttcacactcgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaatctcaacaccactatga 12351332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 24 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 47786735 - 47786356
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatca-aa 121  Q
    ||||||||||||||||| ||||  ||| ||||||||  |||||   ||||||||||||||||||||||||| | ||| |||| ||||||||| |||| ||    
T  47786735 acatcatcataatccaaataactgttatcatgaatatatcaatt--aacatcatgtacttgatcaataatagttttcacatatatatacttatatcacaa 47786638  T
Q  122 ccccaatatcttacatcaat-aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatat-atcaata 219  Q
     |||||||||| |||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||| | | |||||    
T  47786637 tcccaatatctcacatcaattaatcactaatctcatgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatttcaccaata 47786538  T
Q  220 agactcatgtcatgatatgcacata--tcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgt 317  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||  ||||| |||| ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  47786537 agactcatgtcatgatgtgcacctagttcgacacatatatgcatgtgttactatatcacctcaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaaacatcgtatgt 47786438  T
Q  318 aagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaatctcaacacgactatgatg 400  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  47786437 aagatttcacatccgtcttacataatctccaaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaa-ctcaacatgactatgatg 47786356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 24 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 6148723 - 6148457
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaa- 121  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  6148723 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacacatacttacatcaaaa 6148624  T
Q  122 ccccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaataag 221  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  6148623 ccccaatatctcacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacgaatatcaattcacaagtattcacacacaatcaccaatcac--atatcaataag 6148526  T
Q  222 actcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 290  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6148525 actcatgtcatgatatgcacctattgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 6148457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 24 - 290
Target Start/End: Original strand, 30204696 - 30204961
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 122  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |||| ||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  30204696 acatcatcataatccaaataaaagttaatatggatatttcaatataaacatcatgcacttgatcaataataatgttctcatacatatacttacatcaaac 30204795  T
Q  123 cccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaataaga 222  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |   |||||||    
T  30204796 cccaatatctcacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacaattattcatacacaatcaccaatcacatttccaaataaga 30204895  T
Q  223 ctcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 290  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||  || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30204896 ctcatgtcatgatatgcacctattga--cacaaatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 30204961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 168; E-Value: 7e-90
Query Start/End: Original strand, 142 - 400
Target Start/End: Original strand, 7852223 - 7852482
Alignment:
Q  142 aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaat-aagactcatgtcatgatatgca 240  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||  || ||| || | ||||||||||||||||| ||||||||| |   ||  ||||||||||||||||||||||    
T  7852223 aatcaccaatcacatttatcatgaacaatcattaattcatagttattcatacacaatcaccaatcacatttgcaaaacaagactcatgtcatgatatgca 7852322  T
Q  241 catatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacat 340  Q
    | ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  7852323 cctatcgacacatacatgcatgtgataccaaatcacctcaaggtcgtcaccttcgatccaacaaaaacatcgtatgtaagatttcacactcgtcttacat 7852422  T
Q  341 aatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaatctcaacacgactatgatg 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7852423 aatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaatctcaacacgactatgatg 7852482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 24 - 216
Target Start/End: Original strand, 11812801 - 11812994
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 122  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  11812801 acatcatcataatccaaataacaattaacatgaatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatatttatacttacatcaaac 11812900  T
Q  123 cccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 216  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  11812901 cccaatatctcacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacaattattcatacacaatcaccaatcatatacatca 11812994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 24 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 16183945 - 16183665
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatc---- 118  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||| |||||  || ||         
T  16183945 acatcatcataatcaaaataacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgcatttgatcaataatgatattctcatatatatatatatatatata 16183846  T
Q  119 ---------aaaccccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcaca 209  Q
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||| ||||| | ||||||| ||| ||||    
T  16183845 tatatatcaaaaccccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatttccaatcattcacagacaatcaccaaacaca 16183746  T
Q  210 tatatcaataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16183745 tatatcaataagactcatgtcatgatatgcacctatcgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaagtcgtcac 16183665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 194 - 400
Target Start/End: Original strand, 8630315 - 8630521
Alignment:
Q  194 acaatcatcaatcacatatatcaataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcacttt 293  Q
    |||||||| |||||||| | | |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  8630315 acaatcattaatcacatttctaaataagactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatcacctccaggtcgtcacctt 8630414  T
Q  294 cgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaatctcaacacgac 393  Q
    |||||| ||   ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8630415 cgatgccacttgaacatcgtatgtaagatttcacacccatcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaatctcaacacgac 8630514  T
Q  394 tatgatg 400  Q
    |||||||    
T  8630515 tatgatg 8630521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 24 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 19572693 - 19572430
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacat--atacttacatcaa 120  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||| |||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||     || ||||  ||||||||||||     
T  19572693 acatcatcataatccaaataacagttagcatgaatatttcaatttaa-catcatgtgtttgatcaataataat-----cacacattaatacttacatcac 19572600  T
Q  121 accccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaataa 220  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||||||||||||||    
T  19572599 accccaatatctcacatcaataatcatcaatcacatgtgtcatgaacaattatcaatacacaaatattcattcacaatcaccactcacatatatcaataa 19572500  T
Q  221 gactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 290  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19572499 gactcatgtcatgatatgcacctattgacacatatatgcatgtggtaccaaatctcctcaaggtcgtcac 19572430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 24 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 22146145 - 22145882
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 122  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||   ||| ||||   |||| |||||| | |    
T  22146145 acatcatcataatccaaataatagttaacatgaataattcgatataaacatcatgcacttgatcaataata---ttcacatatcaatacatacatcca-c 22146050  T
Q  123 cccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaataaga 222  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||    
T  22146049 cccaatatctaacatcaataatcaccaatcatatgtgtcatgaacaaatatcaattcacaattattcatatgcaatcaccaatcacatatatcaataaga 22145950  T
Q  223 ctcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 290  Q
    ||| |||||| | |||||| ||| ||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22145949 ctcgtgtcatcacatgcacctattgacacataaatgcatgtggtaccaaattacctcaaggtcgtcac 22145882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 24 - 216
Target Start/End: Original strand, 38166213 - 38166407
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 122  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  38166213 acatcatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatatatatacttacatcaaaa 38166312  T
Q  123 c-ccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 216  Q
    | ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  38166313 ctccaatatctcacatcaataatcatcaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcatatacatca 38166407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 24 - 216
Target Start/End: Original strand, 18737974 - 18738167
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 122  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18737974 acatcatcataatccaaataacagttaacatgaatattccaatataaacatcatgcacttgatcaatagtactattctcatacatatacttacatcaaac 18738073  T
Q  123 cccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 216  Q
    |||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| | |||| ||||||||||    
T  18738074 cccaatatctcacatcaataatcttcaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatttacagttattcatacacaattaccaattacatatatca 18738167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 148 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 14060980 - 14060726
Alignment:
Q  148 caatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatat-atcaataagactcatgtcatgatatgcacata-- 244  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||| |||| |||| ||| ||||||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||||| ||||| ||      
T  14060980 caatcacatgtgtcatgaacaatcatcaat-cacatttat-catgcacaatcatcaattacattttaccaataagactcatgtcatgatgtgcacctagt 14060883  T
Q  245 tcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatc 344  Q
    ||||| | || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||| ||||||||||||    
T  14060882 tcgacacgtatatgcatgtgataccaaatcacctcaaggtcgtcacctttgatgcaacaaaaatatcgaatgtaagagttcacccccatcttacataatc 14060783  T
Q  345 tccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaa-tctcaacacgactatgatg 400  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  14060782 tccgaagtaaaagagctcaacccttttacaactacaagactcaacatgactatgatg 14060726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 24 - 216
Target Start/End: Original strand, 19944805 - 19944998
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 122  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||| |||| ||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||    
T  19944805 acatcatcataatccaaataacagttagcatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatatcaatacttacatcaaac 19944904  T
Q  123 cccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 216  Q
    |||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  19944905 cccaatatctcacattaataatcatcaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacaattattcatacacaatcaccaatcatatacatca 19944998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 24 - 216
Target Start/End: Original strand, 7851683 - 7851877
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatca-aa 121  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||  ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| || | ||    
T  7851683 acatcatcataatccaaataacagttagtatgaatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattcacatatatatacttatatgacaa 7851782  T
Q  122 ccccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 216  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  7851783 ccccaatatctcacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatactcaatcatcaaccacatatatca 7851877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 24 - 216
Target Start/End: Original strand, 30140984 - 30141177
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 122  Q
    |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||     
T  30140984 acattatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatatcaatacttacatcaaat 30141083  T
Q  123 cccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 216  Q
    |||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  30141084 cccaatatctcacattaataatcatcaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacatttattcatacacaatcaccaatcatatacatca 30141177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 29 - 207
Target Start/End: Original strand, 12796728 - 12796908
Alignment:
Q  29 atcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacat--atacttacatcaaacccc 125  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||| ||  ||||  ||||||||||||||||||    
T  12796728 atcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatataaacatcatgcatttgatcaataataaaatt-tcccacatcaatacttacatcaaacccc 12796826  T
Q  126 aatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatca 207  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  12796827 aatatctcacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatca 12796908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 24 - 216
Target Start/End: Original strand, 17936455 - 17936649
Alignment:
Q  24 acatcatcataatcca-ataacaattaacatgaataattcaat-ataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaa 121  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||| | ||  || |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  17936455 acatcatcataatccacataacagttaacatgaacattttcatcataaacatcatgcacttgatcaattataatattcccatacatatacttatatcaaa 17936554  T
Q  122 ccccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 216  Q
    ||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  17936555 ccccaatatctcacatcaataatctcaaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatttacagttattcatacacaattaccaatcatatatatca 17936649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 215 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 38812671 - 38812481
Alignment:
Q  215 caataagactcatgtca---tgatatgcacata--tcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaaca 309  Q
    |||||||||||||||||   |||||||||| ||  ||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  38812671 caataagactcatgtcaccatgatatgcacctagttcgacacatatatgcatgtcgtaccaaatcacctcaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaaaca 38812572  T
Q  310 tcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactac-aatctcaacacgactatgatg 400  Q
    ||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  ||||||| ||||||||||    
T  38812571 tcgtatgtaatatttcac-cccgtcttacataatctccgaagtaaaagagctcaacccttttacaactactagactcaacatgactatgatg 38812481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 247 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 18008776 - 18008645
Alignment:
Q  247 gacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctc 346  Q
    |||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18008776 gacgcataaatgcatgtggtactgaatcacctcaaggtcgtcaccttcaatgcaacaaaaacatcgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatctc 18008677  T
Q  347 cgaagtaaaagagttcaacccttttacaacta 378  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18008676 cgaagtaaaagagctcaacccttttacaacta 18008645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 202 - 400
Target Start/End: Original strand, 19230535 - 19230734
Alignment:
Q  202 caatcacatatatcaataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac-tttcgatgca 300  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||| |||| |||||| |||||||||||| ||  || |||||||| |||||||| |    
T  19230535 caatcacatttatcaataagactcatgccatgatatgcacctattgacacatatatgcatatggtaccaaatctccaaaacgtcgtcacctttcgatgaa 19230634  T
Q  301 acaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaatctcaacacgactatgatg 400  Q
     |||| |||||| |||||||  |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||    
T  19230635 tcaaacacatcgtatgtaagggttcacacccaccttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaatttcaacataactatgatg 19230734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 251 - 381
Target Start/End: Original strand, 15874690 - 15874820
Alignment:
Q  251 catacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaa 350  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  15874690 cataaatgcatgtggtaccgaatcacctcaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaaacatcgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatcactgaa 15874789  T
Q  351 gtaaaagagttcaacccttttacaactacaa 381  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15874790 gtaaaagagctcaacccttttacaactacaa 15874820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 24 - 216
Target Start/End: Original strand, 16819043 - 16819234
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 122  Q
    |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||   ||||||||| | ||||||||||||||||||| || |   |||||||||||||||    
T  16819043 acattatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatt--aacatcatgcatttgatcaataataatattcccacatcaatacttacatcaaac 16819140  T
Q  123 cccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 216  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  16819141 cccaatatctcacatcaatattcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcatatacatca 16819234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 251 - 381
Target Start/End: Original strand, 48420197 - 48420327
Alignment:
Q  251 catacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaa 350  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  48420197 cataaatgcatgtggtaccgaatcacctcaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaaatatcgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatcaccgaa 48420296  T
Q  351 gtaaaagagttcaacccttttacaactacaa 381  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  48420297 gtaaaagagctcaacccttttacaactacaa 48420327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 251 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 55442404 - 55442252
Alignment:
Q  251 catacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtc---actttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctcc 347  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||   || ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  55442404 cataaatgcatgtggtaccagatcacctcaaggtcgtcgtcaccttcaatgcaacaaaaacatcgtatgtaagatttcacacccgccttacataatctcc 55442305  T
Q  348 gaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaatctcaacacgactatgatg 400  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  55442304 gaagtaaaagagttcaaccattttacaactacaaactcaacatgactatgatg 55442252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 251 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 12490372 - 12490249
Alignment:
Q  251 catacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaa 350  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12490372 cataaatgcatgtggtaccgaatcatctcaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaaacatcgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaa 12490273  T
Q  351 gtaaaagagttcaacccttttaca 374  Q
    ||||||||| ||||||||||||||    
T  12490272 gtaaaagagctcaacccttttaca 12490249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 24 - 290
Target Start/End: Original strand, 14287323 - 14287596
Alignment:
Q  24 acatcatcataatcca-ataacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatata--cttacatcaa 120  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| |||||  |||| | ||     
T  14287323 acatcatcataatccacataacaattaacatgaatagttcaatttaaacatcatgtacttgatcaataataacgttcacatatatatatacttataccat 14287422  T
Q  121 -accccaatatcttacatcaat-aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaat 218  Q
     |  |||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  |||||| |||| ||||||||||| ||||| ||||||||| |   |||    
T  14287423 gattccaatacctcacatcaattaatcaacaatcacatgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacaaaatcaccaatcacatttcaaaat 14287522  T
Q  219 aagactcatgtcatgatatgcacata--tcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 290  Q
    ||||||||||||||||| || || ||  ||||| |||| |||||||||||||||  |||| |||||||||||||    
T  14287523 aagactcatgtcatgatgtgtacctagttcgacacatatatgcatgtggtaccatttcacttcaaggtcgtcac 14287596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 194 - 380
Target Start/End: Original strand, 2048535 - 2048723
Alignment:
Q  194 acaatcatcaatcacatatatcaat-aagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactt 292  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| |||||||||||||||||||  |  ||||||||||| |    
T  2048535 acaatcaccaatcacatatatcaaacaagactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatcttcaaaaggtcgtcacct 2048634  T
Q  293 tcgatgcaacaaaa-acatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactaca 380  Q
    |||||| |||||   |||||| |||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2048635 tcgatggaacaactcacatcgtatgtaagggttcacacccgccttacataatctccgaagtaaaagagctcaacccttttacaactaca 2048723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 251 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 11330643 - 11330493
Alignment:
Q  251 catacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaa 350  Q
    |||| |||||||||||||| | |||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  11330643 cataaatgcatgtggtaccgagtcacctcaaggttgtcacctttgatgcaacaaaaacatcgtatgtaagatttcacacatgtcttacataatctccgaa 11330544  T
Q  351 gtaaaagagttcaacccttttacaactacaa-tctcaacacgactatgatg 400  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  11330543 gtaaaagagctcaacccttttacaactacaagactcaacatgactatgatg 11330493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 24 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 11199415 - 11199144
Alignment:
Q  24 acatcatcataatcca-ataacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatca-aa 121  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| || | ||  |    
T  11199415 acatcatcataatccacataacaattaacatgaacaattcaatttaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatatatacatataccatca 11199316  T
Q  122 ccccaatatcttacatcaa-taatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatat-atcaata 219  Q
      ||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||   |||||  |||| | |||||| |||||||| ||||||||| | | |||||    
T  11199315 ttccaatatttcacatcaattaatcaccaatcacatgtgtcatgaacagtcatcaaatcacattcattcatgcacaatcaccaatcacatttcaccaata 11199216  T
Q  220 agactcatgtcatgatatgcacata--tcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 290  Q
    ||||||||| |||||| ||||| ||   || | |||| |||||||||||||||  |||| |||||||||||||    
T  11199215 agactcatg-catgatgtgcacctagcccgccacatatatgcatgtggtaccatttcacttcaaggtcgtcac 11199144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 246 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 5229721 - 5229607
Alignment:
Q  246 cgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatct 345  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  5229721 cgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaaacatcgtatgtaagatttcacacccgtcttacattatca 5229622  T
Q  346 ccgaagtaaaagagt 360  Q
    |||||||||||||||    
T  5229621 ccgaagtaaaagagt 5229607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 194 - 380
Target Start/End: Original strand, 33340317 - 33340506
Alignment:
Q  194 acaatcatcaatcacatatatcaa-taagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactt 292  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| |    
T  33340317 acaatcaccaatcacatatatcaaataagactcatgtcataatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcacct 33340416  T
Q  293 tcgatgcaacaaa--aacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactaca 380  Q
     ||||| |||||   ||||||| |||||||  ||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  33340417 ccgatggaacaactcaacatcgtatgtaagggttcacccccgccttacataatctctgaagtaaaagagctcaacccttttacaactaca 33340506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 194 - 380
Target Start/End: Original strand, 23490980 - 23491169
Alignment:
Q  194 acaatcatcaatcacatatatcaat-aagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactt 292  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| |    
T  23490980 acaatcaccaatcacatttatcaaacaagactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcacct 23491079  T
Q  293 tcgatgcaacaaa--aacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactaca 380  Q
     ||||| |||||   ||||||| |||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||    
T  23491080 ccgatggaacaactcaacatcgtatgtaagggttcacacccgccttacataatctccgaagtaaaagagcacaacctttttacaactaca 23491169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 24 - 290
Target Start/End: Original strand, 35121921 - 35122189
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 122  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   ||  |||| | ||||||| ||||||     
T  35121921 acatcatcataatccaaataacagttaacatgaataattcaatataaacatcgtgtacttgatcaataata---tttacatataaatacttatatcaaaa 35122017  T
Q  123 -cccaatatcttacatcaat-aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaataa 220  Q
     |||||  ||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  | |||  |||| ||||||||||||||||| |||||||   |   || ||    
T  35122018 tcccaaattctcacatcaattaatcaccaatcacatgtgtcaggaacaatcaccaaatcacagttattcatacacaatcaccaatcacgattcaaaacaa 35122117  T
Q  221 gactcatgtcatgatatgcacata--tcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 290  Q
    |||||||||||| || ||||| ||   |||| |||| |||||||||||||||  |||| |||||||||||||    
T  35122118 gactcatgtcataatgtgcacctagtccgacacatatatgcatgtggtaccatttcacttcaaggtcgtcac 35122189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 188 - 380
Target Start/End: Original strand, 19945098 - 19945289
Alignment:
Q  188 tcatacacaatcatcaatcacatatatcaataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgt 287  Q
    ||||| ||||||| ||||||||| |   |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||||    
T  19945098 tcataaacaatcaccaatcacatttccaaataagactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgt 19945197  T
Q  288 cactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactaca 380  Q
    ||| | ||||| |  ||| |||||| |||||||  |||| | ||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19945198 cacctccgatg-ataaaacacatcgtatgtaagggttcaaaaccaccttacataatctccgaagtaaaagagctcaacccttttacaactaca 19945289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 81 - 212
Target Start/End: Original strand, 8630101 - 8630232
Alignment:
Q  81 ttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaaccccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaataca 180  Q
    ||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  8630101 ttgatcaataacaatatccacatacatatacttacatcaaaccccaatatctcacattcataatctccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattta 8630200  T
Q  181 caattattcatacacaatcatcaatcacatat 212  Q
    || |||||||| |||||| | |||||||||||    
T  8630201 cagttattcatgcacaattaccaatcacatat 8630232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 194 - 380
Target Start/End: Original strand, 10737033 - 10737219
Alignment:
Q  194 acaatcatcaatcacatatatcaa-taagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactt 292  Q
    ||||||| |||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||| ||| ||| |||| || |||||||||||||||| ||  ||||||| ||| |    
T  10737033 acaatcaccaatcacatatatcaaatcagactcatgttatgatatgcacttattgacacataaattcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgccacct 10737132  T
Q  293 tcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactaca 380  Q
    ||||||  | ||| |||||| |||||||  |||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  10737133 tcgatgata-aaacacatcgtatgtaagggttcacacccgccttacataatctctgaagtagaagagctcaacccttttacaactaca 10737219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 24 - 290
Target Start/End: Original strand, 14296730 - 14297000
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatca-aa 121  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| |||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | ||  |    
T  14296730 acatcatcataatccaaataatagttaacatgaatatttcaatttaa-catcatgcacttgatcaataataatattcacatatatatacttataccatga 14296828  T
Q  122 ccccaatatcttacatcaa-taatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcac-atatatcaata 219  Q
     ||||| | || ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||| | ||| || |||||||| ||||||| ||  | |||||    
T  14296829 tcccaaaaactcacatcaattaatcaccaatcacatgtatcatgaacaagtatcaaatcacattcatttatgcacaatcaccaatcacaatccaccaata 14296928  T
Q  220 agactcatgtcatgatatgcac--atatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 290  Q
    ||||||||| |||||| || ||  | | |||| | || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14296929 agactcatg-catgatgtgtacctagaccgacacgtatatgcatgtggtaccatatcacctcaaggtcgtcac 14297000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 24 - 290
Target Start/End: Original strand, 14302357 - 14302627
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatca-aa 121  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| |||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | ||  |    
T  14302357 acatcatcataatccaaataatagttaacatgaatatttcaatttaa-catcatgcacttgatcaataataatattcacatatatatacttataccatga 14302455  T
Q  122 ccccaatatcttacatcaa-taatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcac-atatatcaata 219  Q
     ||||| | || ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||| | ||| || |||||||| ||||||| ||  | |||||    
T  14302456 tcccaaaaactcacatcaattaatcaccaatcacatgtatcatgaacaagtatcaaatcacattcatttatgcacaatcaccaatcacaatccaccaata 14302555  T
Q  220 agactcatgtcatgatatgcac--atatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 290  Q
    ||||||||| |||||| || ||  | | |||| | || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14302556 agactcatg-catgatgtgtacctagaccgacacgtatatgcatgtggtaccatatcacctcaaggtcgtcac 14302627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 197 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 14846339 - 14846160
Alignment:
Q  197 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcg 295  Q
    |||| ||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| | ||    
T  14846339 atcaccaatcacatatattacataagactcatgttatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcacctccg 14846240  T
Q  296 atgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaac 376  Q
    |||  | ||| |||||| |||||||  ||||| |||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14846239 atgata-aaacacatcgtatgtaagggttcaccccccccttacataatctccgaagtaaaagagctcaacccttttacaac 14846160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 123 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 11062861 - 11062691
Alignment:
Q  123 cccaatatcttacatcaat-aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaataag 221  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||| |   ||||||    
T  11062861 cccaatatctcacatcaattaatcaccaatcacatgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatttcaaaataag 11062762  T
Q  222 actcatgtcatgatatgcacata--tcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 290  Q
    ||||||||| |||| ||||| ||  ||||| |||| ||||||||||||||   |||| |||||||||||||    
T  11062761 actcatgtcctgatgtgcacctagttcgacacatatatgcatgtggtaccgtttcacttcaaggtcgtcac 11062691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 246 - 358
Target Start/End: Original strand, 47983418 - 47983531
Alignment:
Q  246 cgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacaccc-gtcttacataatc 344  Q
    |||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  47983418 cgacacatatatgcatgtggtaccgaatcacctcaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaacagatcgtatgtaagatttcacacccggtcttacataata 47983517  T
Q  345 tccgaagtaaaaga 358  Q
    ||||||||||||||    
T  47983518 tccgaagtaaaaga 47983531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 246 - 358
Target Start/End: Original strand, 47992705 - 47992818
Alignment:
Q  246 cgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacaccc-gtcttacataatc 344  Q
    |||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  47992705 cgacacatatatgcatgtggtaccgaatcacctcaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaacagatcgtatgtaagatttcacacccggtcttacataata 47992804  T
Q  345 tccgaagtaaaaga 358  Q
    ||||||||||||||    
T  47992805 tccgaagtaaaaga 47992818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 246 - 358
Target Start/End: Original strand, 48001992 - 48002105
Alignment:
Q  246 cgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacaccc-gtcttacataatc 344  Q
    |||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  48001992 cgacacatatatgcatgtggtaccgaatcacctcaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaacagatcgtatgtaagatttcacacccggtcttacataata 48002091  T
Q  345 tccgaagtaaaaga 358  Q
    ||||||||||||||    
T  48002092 tccgaagtaaaaga 48002105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 246 - 358
Target Start/End: Original strand, 48011278 - 48011391
Alignment:
Q  246 cgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacaccc-gtcttacataatc 344  Q
    |||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  48011278 cgacacatatatgcatgtggtaccgaatcacctcaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaacagatcgtatgtaagatttcacacccggtcttacataata 48011377  T
Q  345 tccgaagtaaaaga 358  Q
    ||||||||||||||    
T  48011378 tccgaagtaaaaga 48011391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 24 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 54045703 - 54045594
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 122  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||    
T  54045703 acatcatcataatccaaataatagttaacatgaatatttcaatataaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatatcaatacttacatcaaac 54045604  T
Q  123 cccaatatct 132  Q
    ||||||||||    
T  54045603 cccaatatct 54045594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 194 - 290
Target Start/End: Original strand, 11813307 - 11813403
Alignment:
Q  194 acaatcatcaatcacatatatcaataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 290  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11813307 acaatcagcaatcacatttatcaataagactcatgtcatgatatgcacctattgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcagggtcgtcac 11813403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 246 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 9592394 - 9592239
Alignment:
Q  246 cgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatct 345  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||| |||||| |||||   |||||||||||||||||||||||||| |||     
T  9592394 cgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcacccatgatgtaacaaacacatcatgtgtaagatttcacacccgtcttacattatca 9592295  T
Q  346 ccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaa-tctcaacacgactatgatg 400  Q
    ||||||||||||||  || |||||||||| | ||||  ||||||| ||||||||||    
T  9592294 ccgaagtaaaagagcacatcccttttacagccacaagactcaacatgactatgatg 9592239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 119 - 216
Target Start/End: Original strand, 13815973 - 13816070
Alignment:
Q  119 aaaccccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 216  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||| ||||| |||||    
T  13815973 aaactccaatatctcacgtcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaatcaccaaccacatttatca 13816070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 24 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 14523278 - 14523006
Alignment:
Q  24 acatcatcataatcca-ataacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatactta---catca 119  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| | || | |||| ||   |||||    
T  14523278 acatcatcataatccacataacaattaacatgaatattccaatttaaccatcatgtacttgatcaataataatattcacgtataaatacatataccatca 14523179  T
Q  120 aaccccaatatcttacatcaa-taatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatat-atcaa 217  Q
      | | || || | |  |||| || ||||||||||||||||||||||||||  |||||  |||| |||| ||| ||||||||||||| |||| | | |||    
T  14523178 ttctcaaagat-tcagctcaattattcaccaatcacatgtgtcatgaacaatcatcaaatcacacttatgcatgcacaatcatcaattacatttcaccaa 14523080  T
Q  218 taagactcatgtcatgatatgcacata--tcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 290  Q
    ||||||| ||| |||||| ||  | ||   |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14523079 taagacttatg-catgatgtgttcctagcccgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 14523006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 24 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 17958303 - 17958169
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaataacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaa-- 121  Q
    |||||| ||||||| ||||||| |||||||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||   |||||||||||| |      
T  17958303 acatcaacataatc-aataacagttaacatggatatttcaaagtaaacatcatgtacttgatcaataataatactcccatattaatacttacatcatatc 17958205  T
Q  122 ccccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatg 157  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17958204 ccccaatatctcacatcaataatcaccaatcacatg 17958169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 160 - 374
Target Start/End: Original strand, 49230655 - 49230869
Alignment:
Q  160 tcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgc 259  Q
    |||||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||||  ||||||||| |   |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||    
T  49230655 tcatgaacaattatcaattcacaaatattcattcacaatctccaatcacatttccaaataagactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgc 49230754  T
Q  260 atgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtca-ctttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttac-ataatctccgaagtaaaag 357  Q
    ||||||||||||||| |  ||| ||||||| |||||||||| ||    |||||| |||||||   ||||||| | ||||| ||||||| |||||||||||    
T  49230755 atgtggtaccaaatctcaacaacgtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgaatgtaagggctcacacctgccttacaataatct-cgaagtaaaag 49230853  T
Q  358 agttcaacccttttaca 374  Q
    || ||| ||||||||||    
T  49230854 ag-tcatcccttttaca 49230869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 203 - 380
Target Start/End: Original strand, 5227201 - 5227378
Alignment:
Q  203 aatcacatatatcaat-aagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaa-ggtcgtcactttcgatgca 300  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||| ||| ||||||| ||| ||| |||| |||||||||||||| |||| ||  || ||||||||| |||||||      
T  5227201 aatcacatatatcaaacaagactcatgttatgttatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccgaatctccaaaaaggtcgtcacattcgatgat 5227300  T
Q  301 acaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactaca 380  Q
    | ||| |||| | |||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  5227301 a-aaacacattgtatgtaagggttcacacccgccttacataatctccgaagtaaaagag-ccaacccttttacaactaca 5227378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 197 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 15940140 - 15939959
Alignment:
Q  197 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcg 295  Q
    |||| |||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||| || ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| | ||    
T  15940140 atcaccaatcacataaatcacataagactcatgttatgatatgaacttattgactcataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcacctccg 15940041  T
Q  296 atgcaacaaa--aacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaac 376  Q
    ||  | |||   ||||||| |||||||  ||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  15940040 ataga-caagtcaacatcgtatgtaagggttcacccccgccttacataatctccgaagtaaaaaagttcagcccttttacaac 15939959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 194 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 17913933 - 17913751
Alignment:
Q  194 acaatcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtca-ct 291  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||| ||    
T  17913933 acaatcatcaatcacatacatcatataagactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacct 17913834  T
Q  292 ttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttac-ataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttaca 374  Q
    |||||||| ||    |||||| | |||||   ||||||| | ||||| ||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||    
T  17913833 ttcgatgccacttgcacatcgtacgtaagggctcacacctgccttacaataatct-cgaagtaaaagagcttaacccttttaca 17913751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 246 - 360
Target Start/End: Original strand, 41660135 - 41660249
Alignment:
Q  246 cgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatct 345  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||     
T  41660135 cgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaagatcgtcacccatgatgcaacaaaaacatcatatgtaagatttcacacctgtcttacattatca 41660234  T
Q  346 ccgaagtaaaagagt 360  Q
    ||||| |||||||||    
T  41660235 ccgaaataaaagagt 41660249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 51 - 212
Target Start/End: Original strand, 54686551 - 54686707
Alignment:
Q  51 catgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatc--aaaccccaatatcttacatcaataatcacc 148  Q
    |||||||| |||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  54686551 catgaatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcacatgcatatacttacatcaaaaaccccaatatctcacatcaataatcatc 54686650  T
Q  149 aatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatat 212  Q
     ||||        |||||||| ||||||  |||||||||||||||||||| | | |||||||||    
T  54686651 gatca-------tatgaacaattatcaactcacaattattcatacacaattaccgatcacatat 54686707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 24 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 11063020 - 11062944
Alignment:
Q  24 acatcatcataatcca-ataacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattc 99  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11063020 acatcatcataatccacataacaattaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattc 11062944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 194 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 17958093 - 17957996
Alignment:
Q  194 acaatcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 290  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||    
T  17958093 acaatcatcaatcacatatatcatataagactcatgtcatgagatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcac 17957996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 196 - 374
Target Start/End: Original strand, 44227903 - 44228083
Alignment:
Q  196 aatcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtca-cttt 293  Q
    ||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||| ||||    
T  44227903 aatcaccaatcacatatttcacataggactcatgctatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcaccttt 44228002  T
Q  294 cgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttac-ataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttaca 374  Q
    |||||| ||    |||||| |||||||   ||||||| | ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  44228003 cgatgccacttgcacatcgtatgtaagggctcacacctgccttacaataatct-cgaagtaaaagagttcaacccttttaca 44228083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 51 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 9304819 - 9304664
Alignment:
Q  51 catgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatc-aaaccccaatatcttacatcaataatcacca 149  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||  |||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||| |     
T  9304819 catggatatttcaatttaaacatctcgtacatgatcaataataatattcacatgcatatacttacatcaaaacctcaatatctcacatcaataatcatcg 9304720  T
Q  150 atcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatat 212  Q
    ||||        |||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  9304719 atca-------tatgaacaattatcaactcacaattattcatacacaatcaccgatcacatat 9304664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 197 - 374
Target Start/End: Original strand, 16819386 - 16819565
Alignment:
Q  197 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtca-ctttc 294  Q
    |||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||| |||||    
T  16819386 atcaccaatcacatatttcacataagactcatgttatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttc 16819485  T
Q  295 gatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttac-ataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttaca 374  Q
     |||| ||    |||||| |||||||   ||||||| | ||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16819486 aatgccacttgcacatcgaatgtaagggctcacacctgccttgcaataatct-cgaagtaaaagagttcaacccttttaca 16819565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 160 - 359
Target Start/End: Original strand, 16259487 - 16259683
Alignment:
Q  160 tcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgc 259  Q
    |||||||||| |||||||  |||| ||||||| |||||||   |||||||| |   |||||||| ||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||    
T  16259487 tcatgaacaattatcaattgacaaatattcattcacaatctctaatcacatttccaaataagacccatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgc 16259586  T
Q  260 atgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaa--aaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaag 357  Q
    ||||||||||||||| ||  ||||||||||| | |||||  ||||   |||||||||||||||   |||| |    ||||||||||||||||||||||||    
T  16259587 atgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcacctccgatg-gacaagtcaacatcgcatgtaaggggtcactc----cttacataatctccgaagtaaaag 16259681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 24 - 157
Target Start/End: Original strand, 25057035 - 25057166
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacat--atacttacatcaa 120  Q
    |||| |||||||||||| |||||  ||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||     ||| ||||  ||||||||||||     
T  25057035 acattatcataatccaaataacagataacatgaatatttcaatataaacatcatgcatttgatcaataataa-----tcacacattaatacttacatcac 25057129  T
Q  121 accccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatg 157  Q
    | |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  25057130 atcccaatatctcacatcaataatcatcaatcacatg 25057166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 126 - 290
Target Start/End: Original strand, 15516035 - 15516197
Alignment:
Q  126 aatatcttacatcaat-aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatat-atcaataagac 223  Q
    |||||||||||| ||  ||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||| |||| |||  ||||||||||||||||| | | |||||||||    
T  15516035 aatatcttacattaagcaatcaccaatcacatgtatcatgaacaatcatcaat-cacatttat-catgaacaatcatcaatcacatttcaccaataagac 15516132  T
Q  224 tcatgtcatgatatgcacata--tcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 290  Q
    |||||||||||||||||| ||  |||    ||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  15516133 tcatgtcatgatatgcacctagttcg----atatatgcatgtggtacgaaatcacttcaaggtcgtcac 15516197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 194 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 19262698 - 19262602
Alignment:
Q  194 acaatcatcaatcacatatatcaa-taagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtca 289  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||    
T  19262698 acaatcaccaatcacatatatcaaataagactcatgttatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtca 19262602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 24 - 110
Target Start/End: Original strand, 13815856 - 13815943
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatata 110  Q
    |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  13815856 acatcatcataatcaaaataacagttaacatgaataattcgatataaacatcatgcatttgatcaataatgatattctcatatatata 13815943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 24 - 216
Target Start/End: Original strand, 19230318 - 19230499
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacat--atacttacatcaa 120  Q
    |||| |||||||||||| ||||| ||| |||||||| ||||||   ||||||||| | ||||||||||||||      || ||||  ||||||||||||     
T  19230318 acattatcataatccaaataacagttatcatgaatatttcaatt--aacatcatgcatttgatcaataataac-----cacacattaatacttacatcac 19230410  T
Q  121 accccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 216  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||       ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  19230411 accccaatatctcacatcaataatcatcaatcatatg-------aacaattatcaattcacaattattcattcacaatcatcaatcacatttatca 19230499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 142 - 216
Target Start/End: Original strand, 11813179 - 11813253
Alignment:
Q  142 aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 216  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  11813179 aatcaccaatcacatgggtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcatatacatca 11813253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 148 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 12563281 - 12563136
Alignment:
Q  148 caatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatat-atcaataagactcatgtcatgatatgcacata-- 244  Q
    ||||||||||||||||||  ||  |||||  |||| ||| |||| |||||||||||||||||| | | |||||||||||||| |||||| ||||| ||      
T  12563281 caatcacatgtgtcatgagaaatcatcaaatcacatttaatcatgcacaatcatcaatcacatttcaccaataagactcatgccatgatgtgcacctagt 12563182  T
Q  245 tcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 290  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||  |||| |||||||||||||    
T  12563181 tcgacacatatatgcatgtggtaccatttcacttcaaggtcgtcac 12563136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 194 - 290
Target Start/End: Original strand, 25057247 - 25057344
Alignment:
Q  194 acaatcatcaatcacatatatcaat-aagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 290  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||    
T  25057247 acaatcaccaatcacatttatcaaacaagactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctccataaggtcgtcac 25057344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 251 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 33371002 - 33370914
Alignment:
Q  251 catacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacat 340  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    | ||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  33371002 catatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcacccatggtgcaacaaaaa-atcatatgtaagatttcacacccgtcttacat 33370914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 24 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 17536923 - 17536847
Alignment:
Q  24 acatcatcataatcca-ataacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattc 99  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  17536923 acatcatcataatccacataacatttaacatgaatatttcaatttaaacttcatgcacttgatcaataataatattc 17536847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 24 - 208
Target Start/End: Original strand, 18908679 - 18908854
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 122  Q
    |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | | |||    |||||||||||| ||    
T  18908679 acattatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataat-tacacat--taatacttacatcacac 18908775  T
Q  123 cccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcac 208  Q
    ||| |||||| ||||||||| ||  ||||||        |||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||| |||||||    
T  18908776 cccgatatctcacatcaatattcgtcaatca-------tatgaacaattatcaatttacaattattcattcacaatcaccaatcac 18908854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 24 - 208
Target Start/End: Original strand, 22273034 - 22273209
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 122  Q
    |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | | |||    |||||||||||| ||    
T  22273034 acattatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataat-tacacat--taatacttacatcacac 22273130  T
Q  123 cccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcac 208  Q
    ||| |||||| ||||||||| ||  ||||||        |||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||| |||||||    
T  22273131 cccgatatctcacatcaatattcgtcaatca-------tatgaacaattatcaatttacaattattcattcacaatcaccaatcac 22273209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 197 - 374
Target Start/End: Original strand, 27839184 - 27839362
Alignment:
Q  197 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtca-ctttc 294  Q
    |||||||||||||||| ||| ||| ||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||| |||||    
T  27839184 atcatcaatcacatatttcacataggactcatgctatgatatgcacttattgactcataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttc 27839283  T
Q  295 gatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttac-ataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttaca 374  Q
    ||||| ||    |||||| |||||||   ||||||| | ||||| ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  27839284 gatgccacttgcacatcgaatgtaagggctcacacctgccttacaataatct-cgaagtaaaagag-tcatcccttttaca 27839362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 194 - 266
Target Start/End: Original strand, 45581310 - 45581382
Alignment:
Q  194 acaatcatcaatcacatatatcaataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggt 266  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| |||| |||||||||||    
T  45581310 acaatcaccaatcacatatatcaataagactcatgtcataatatgcacttattgacacataaatgcatgtggt 45581382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 149 - 216
Target Start/End: Original strand, 7851968 - 7852035
Alignment:
Q  149 aatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  7851968 aatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcatatacatca 7852035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 196 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 15860902 - 15860824
Alignment:
Q  196 aatcatcaatcacatatatcaataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatc 274  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||| ||||  ||||||| ||||||||||    
T  15860902 aatcaccaatcacatatatcaataagactcatgccatgatatgcacctattgacacatatgtgcatgttgtaccaaatc 15860824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 197 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 18905434 - 18905356
Alignment:
Q  197 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatc 274  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| |||| |||||||||||||||||||    
T  18905434 atcaccaatcacatatatcacataagactcatgttatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatc 18905356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 142 - 216
Target Start/End: Original strand, 18908892 - 18908966
Alignment:
Q  142 aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 216  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  18908892 aatcaccaattacatgtatcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcatatacatca 18908966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 39 - 216
Target Start/End: Original strand, 49230262 - 49230429
Alignment:
Q  39 aataacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacata-tacttacatcaaaccccaatatcttacat 137  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||||||||||| | | |||   || ||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  49230262 aataacagttaacatgaatatttcaattaaaacatcatggacttgatcaataataat-tacacat---tagtacttacatcacaccccaatatctcacat 49230357  T
Q  138 caataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 216  Q
    ||||  ||| ||||||        |||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||    
T  49230358 caatcttcatcaatca-------tatgaacaattatcaatttacaattattcattcacaatcaccaatcacatttatca 49230429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 217 - 376
Target Start/End: Original strand, 15613564 - 15613720
Alignment:
Q  217 ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaa--aaacatcgca 314  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| | |||||  ||||   |||||||||    
T  15613564 ataagactcatgttatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcacctccgatg-gacaagtcaacatcgca 15613662  T
Q  315 tgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaac 376  Q
    ||||||   |||| |    ||||||||||||||||||||||||||   ||| ||||||||||    
T  15613663 tgtaaggggtcactc----cttacataatctccgaagtaaaagagccgaactcttttacaac 15613720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 142 - 214
Target Start/End: Original strand, 11813048 - 11813120
Alignment:
Q  142 aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatat 214  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  11813048 aatcaccaattacatgtttcatgaacaaatatcaattcacaaatattcattcacaatcaccaatcacaaatat 11813120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 148 - 290
Target Start/End: Original strand, 17137827 - 17137969
Alignment:
Q  148 caatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcaca-tatatcaataagactcatgtcatgatatgcacat-at 245  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| || |||||||||||| |||| || | |||||| |||||||||||||| ||||| | ||    
T  17137827 caatcacatgtgtcatgaacaaacatcaat-cacatttatt-atgcacaatcatcaaccacattacaccaataacactcatgtcatgatgtgcacctaat 17137924  T
Q  246 cgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 290  Q
      || |||| |||||||||||||||  |||| ||||||| |||||    
T  17137925 tcacacatatatgcatgtggtaccatttcacttcaaggttgtcac 17137969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 217 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 23081821 - 23081682
Alignment:
Q  217 ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaa--aaacatcgca 314  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| | |||||  ||||   |||||||||    
T  23081821 ataagactcatgttatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcacctccgatg-gacaagtcaacatcgca 23081723  T
Q  315 tgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagag 359  Q
    ||||||   |||| |    ||||||||||||||||||||||||||    
T  23081722 tgtaaggggtcactc----cttacataatctccgaagtaaaagag 23081682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 24 - 156
Target Start/End: Original strand, 23490768 - 23490898
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacat--atacttacatcaa 120  Q
    |||| |||||||||||| |||||  |||||||| || |||||||||||||||||| | |||||||||| |||     ||| ||||  ||||||||||||     
T  23490768 acattatcataatccaaataacagataacatgagtatttcaatataaacatcatgcatttgatcaatagtaa-----tcacacattaatacttacatcac 23490862  T
Q  121 accccaatatcttacatcaataatcaccaatcacat 156  Q
    | |||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  23490863 atcccaatatctcacatcaataatcatcaatcacat 23490898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 146 - 209
Target Start/End: Original strand, 16819292 - 16819355
Alignment:
Q  146 accaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcaca 209  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  16819292 accaatcacatgtatcaggaacaaatatcaattcacaaatattcattcacaatcatcaatcaca 16819355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 195 - 290
Target Start/End: Original strand, 30141361 - 30141456
Alignment:
Q  195 caatcatcaatcacatatatcaataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 290  Q
    |||||| ||||||||| |   |||| ||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||    
T  30141361 caatcaccaatcacattttcaaatatgactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcac 30141456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 197 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 2451004 - 2450910
Alignment:
Q  197 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 290  Q
    |||| ||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  2451004 atcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcac 2450910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 294 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 11517056 - 11517010
Alignment:
Q  294 cgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacat 340  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11517056 cgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgttttacat 11517010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 197 - 290
Target Start/End: Original strand, 18909169 - 18909263
Alignment:
Q  197 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 290  Q
    |||| ||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  18909169 atcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcac 18909263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 197 - 290
Target Start/End: Original strand, 22273524 - 22273618
Alignment:
Q  197 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 290  Q
    |||| ||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  22273524 atcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcac 22273618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 142 - 292
Target Start/End: Original strand, 40938085 - 40938236
Alignment:
Q  142 aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatat-atcaataagactcatgtcatgatatgca 240  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||    ||||| |||| ||||||| ||||||| |||| ||| || | | |||||||||||||| |||||| ||||    
T  40938085 aatcaccagtcacatgtgtcatgaacattcttcaat-cacatttattcacacacaattatcattcatatttcaccaataagactcatg-catgatgtgca 40938182  T
Q  241 cata--tcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactt 292  Q
    | ||  ||||| |||| |||||||||||||||  |||| |||||||||||||||    
T  40938183 cctagctcgacacatatatgcatgtggtaccatttcacttcaaggtcgtcactt 40938236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 197 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 12266167 - 12266007
Alignment:
Q  197 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcg 295  Q
    |||| |||||| |||| ||| ||||||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| | ||    
T  12266167 atcaccaatcaaatatttcacataagactcatgatatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcacctccg 12266068  T
Q  296 atgcaacaa--aaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagag 359  Q
    |||  ||||   |||||||||||||||   |||| |    ||||||||||||||||||||||||||    
T  12266067 atg-gacaagtcaacatcgcatgtaaggggtcactc----cttacataatctccgaagtaaaagag 12266007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 217 - 290
Target Start/End: Original strand, 15574545 - 15574618
Alignment:
Q  217 ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 290  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||    
T  15574545 ataagactcatgttatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcac 15574618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 197 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 16745848 - 16745670
Alignment:
Q  197 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtca-ctttc 294  Q
    |||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||| |||||    
T  16745848 atcaccaatcacatatttcacatatgactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttc 16745749  T
Q  295 gatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttac-ataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttaca 374  Q
     |||| ||    |||||| |||||||   ||||||| | ||||| ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  16745748 aatgccacttgcacatcgaatgtaagggctcacacctgccttacaataatct-cgaagtaaaagag-tcatcccttttaca 16745670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 24 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 53900463 - 53900388
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaat-aacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattc 99  Q
    |||||||||||||||||  |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  53900463 acatcatcataatccaaacaacagtta-cataaataattcaatataaacatcatgaacttgatcaataacaatattc 53900388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 197 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 1469330 - 1469236
Alignment:
Q  197 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 290  Q
    |||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  1469330 atcaccaatcacatatttcacataggactcatgctatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcac 1469236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 142 - 216
Target Start/End: Original strand, 7851857 - 7851931
Alignment:
Q  142 aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 216  Q
    ||||| ||| ||||| | |||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||| |||||| |||||||||||    
T  7851857 aatcatcaaccacatatatcatgaacaaatatcaattcacagttattcatactcaaccatcaaccacatatatca 7851931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 125 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 17536774 - 17536606
Alignment:
Q  125 caatatcttacatcaat-aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatat-atcaataaga 222  Q
    ||||| || |||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||  |||| |||||||  ||| |  | ||||||||  | | ||||||||    
T  17536774 caataactcacatcaattaatcaccgatcacatctgtcatgaacaagtatcaaatcacatttattcacgcaccaataccaatcacaattcaccaataaga 17536675  T
Q  223 ctcatgtcatgatatgcacatat--cgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 290  Q
    |||||| |||||| || || ||   |||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17536674 ctcatg-catgatgtgtacctagaccgacacatatatgcatgtggtaccatatcacctcaaggtcgtcac 17536606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 24 - 146
Target Start/End: Original strand, 33340038 - 33340155
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaataacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacat--atacttacatcaaa 121  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||   |||| |||| | ||||||| |||||||     || ||||  |||||||||||| |    
T  33340038 acattatcataatccaataacagttatcatgaataattcaatt--aacaacatgcatttgatcactaataat-----cacacattaatacttacatcaca 33340130  T
Q  122 ccccaatatcttacatcaataatca 146  Q
    ||||||||||| |||||||||||||    
T  33340131 ccccaatatctaacatcaataatca 33340155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 197 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 15470141 - 15470048
Alignment:
Q  197 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtca 289  Q
    |||| |||||||| || ||| |||||||| |||| ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||    
T  15470141 atcaccaatcacaaatttcacataagacttatgttatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtca 15470048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 24 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 19262907 - 19262733
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaataa-caattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacat--atacttacatcaa 120  Q
    |||| ||||||||||||| | || ||| |||||||||||||||   ||||||||| | ||||||||||||||      || ||||  ||||||||||||     
T  19262907 acattatcataatccaattagcagttatcatgaataattcaatt--aacatcatgcatttgatcaataataac-----cacacattaatacttacatcac 19262815  T
Q  121 accccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcaca 209  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||       ||||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||||  ||||||||    
T  19262814 acccccatatctcacatcaataatcatcaatca-------catgaacaattatcaattcacaaatattcattcacaatcgccaatcaca 19262733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 197 - 374
Target Start/End: Original strand, 30151813 - 30151991
Alignment:
Q  197 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtca-ctttc 294  Q
    |||| ||||||||||  ||| ||| ||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||| ||||||||||| |  ||||||||||| |||||    
T  30151813 atcaccaatcacataattcacataggactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgcggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttc 30151912  T
Q  295 gatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttac-ataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttaca 374  Q
    ||||| ||    |||||| |||||||   ||||||| | ||||| ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  30151913 gatgccacttgcacatcgaatgtaagggctcacacctgccttacaataatct-cgaagtaaaagag-tcatcccttttaca 30151991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 24 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 12563397 - 12563334
Alignment:
Q  24 acatcatcataatcca-ataacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatc 86  Q
    ||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||    
T  12563397 acatcatcataattcacataacacttaacatgaataattcaatttaaatatcatgtacttaatc 12563334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 216 - 290
Target Start/End: Original strand, 12951476 - 12951555
Alignment:
Q  216 aataagactcatgtca---tgatatgcacata--tcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 290  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||| ||  ||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  12951476 aataagactcatgtcaacatgatatgcacgtagttcgacacatatatgcatgtggtaccgaatcacttcaaggtcgtcac 12951555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 24 - 96
Target Start/End: Original strand, 39654163 - 39654237
Alignment:
Q  24 acatcatcataatcca-ataacaattaa-catgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataata 96  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||  ||| ||||||||||| |||||| ||||||    
T  39654163 acatcatcataatccacataacagttaagcatgaataattcaattcaaatatcatgtacttaatcaatgataata 39654237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 197 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 8270080 - 8269976
Alignment:
Q  197 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtca-ctttc 294  Q
    |||| ||||||||||  ||| ||| ||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||| ||||||||||| |  ||||||||||| |||||    
T  8270080 atcaccaatcacataattcacataggactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgcggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttc 8269981  T
Q  295 gatgc 299  Q
    |||||    
T  8269980 gatgc 8269976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 197 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 8277191 - 8277087
Alignment:
Q  197 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtca-ctttc 294  Q
    |||| ||||||||||  ||| ||| ||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||| ||||||||||| |  ||||||||||| |||||    
T  8277191 atcaccaatcacataattcacataggactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgcggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttc 8277092  T
Q  295 gatgc 299  Q
    |||||    
T  8277091 gatgc 8277087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 197 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 8306000 - 8305896
Alignment:
Q  197 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtca-ctttc 294  Q
    |||| ||||||||||  ||| ||| ||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||| ||||||||||| |  ||||||||||| |||||    
T  8306000 atcaccaatcacataattcacataggactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgcggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttc 8305901  T
Q  295 gatgc 299  Q
    |||||    
T  8305900 gatgc 8305896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 24 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 14061110 - 14061039
Alignment:
Q  24 acatcatcataatcca-ataacaattaa-catgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataa 94  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||| ||||    
T  14061110 acatcatcataatccacataacagttaagcatgaataattcaat-tcaacatcatgtacttaatcaatgataa 14061039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 197 - 299
Target Start/End: Original strand, 53769137 - 53769241
Alignment:
Q  197 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtca-ctttc 294  Q
    |||| ||||||||||  ||| ||| ||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||| ||||||||||| |  ||||||||||| |||||    
T  53769137 atcaccaatcacataattcacataggactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgcggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttc 53769236  T
Q  295 gatgc 299  Q
    |||||    
T  53769237 gatgc 53769241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 221 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 13956457 - 13956378
Alignment:
Q  221 gactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtca-ctttcgatgc 299  Q
    ||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||| ||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||    
T  13956457 gactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgcggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgc 13956378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 221 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 13977290 - 13977211
Alignment:
Q  221 gactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtca-ctttcgatgc 299  Q
    ||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||| ||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||    
T  13977290 gactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgcggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgc 13977211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 329 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 18905343 - 18905296
Alignment:
Q  329 cccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaac 376  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||    
T  18905343 cccgccttacataatctccaaagtaaaagagcccaacccttttacaac 18905296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #121
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 221 - 299
Target Start/End: Original strand, 41268743 - 41268822
Alignment:
Q  221 gactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtca-ctttcgatgc 299  Q
    ||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||| ||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||    
T  41268743 gactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgcggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgc 41268822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #122
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 221 - 299
Target Start/End: Original strand, 45859521 - 45859600
Alignment:
Q  221 gactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtca-ctttcgatgc 299  Q
    ||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||| ||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||    
T  45859521 gactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgcggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgc 45859600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #123
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 143 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 53900326 - 53900177
Alignment:
Q  143 atcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatat-atcaataagactcatgtcatgatatgcac 241  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||| ||||||  |||   ||||||| |||||| | ||||||||  | | |||||||||||||| |||||| |  ||    
T  53900326 atcatcaatcacatgtgtcataaacaagtatcaaatcacgtatattcatgcacaattaccaatcacaattcaccaataagactcatg-catgatgtatac 53900228  T
Q  242 atat--cgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 290  Q
     ||   ||||||||| |||||||||||||||  |||| |||||||||||||    
T  53900227 ctagaccgacgcatatatgcatgtggtaccatttcacttcaaggtcgtcac 53900177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #124
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 221 - 299
Target Start/End: Original strand, 55314883 - 55314962
Alignment:
Q  221 gactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtca-ctttcgatgc 299  Q
    ||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||| ||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||    
T  55314883 gactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgcggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgc 55314962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #125
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 142 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 2451229 - 2451155
Alignment:
Q  142 aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 216  Q
    |||||||||| || ||| |||| || |||||||||| |||| |||||||||||| |||| |||||| ||| ||||    
T  2451229 aatcaccaattacttgtatcataaataaatatcaattcacagttattcatacacgatcaccaatcatatacatca 2451155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #126
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 142 - 216
Target Start/End: Original strand, 22273247 - 22273321
Alignment:
Q  142 aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 216  Q
    |||||||||| || ||| |||| || |||||||||| |||| |||||||||||| |||| |||||| ||| ||||    
T  22273247 aatcaccaattacttgtatcataaataaatatcaattcacagttattcatacacgatcaccaatcatatacatca 22273321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #127
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 142 - 216
Target Start/End: Original strand, 49230509 - 49230583
Alignment:
Q  142 aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 216  Q
    |||||||||| |||||| ||||||| ||  || ||| |||| ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  49230509 aatcaccaattacatgtatcatgaataataattaattcacagttattcatacacaatcaccaatcatatacatca 49230583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #128
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 160 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 2451084 - 2451035
Alignment:
Q  160 tcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcaca 209  Q
    |||||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||| |||||||||||    
T  2451084 tcatgaacaattatcaattcacaaatattcattcacaaacatcaatcaca 2451035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #129
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 108 - 157
Target Start/End: Original strand, 10736904 - 10736953
Alignment:
Q  108 atacttacatcaaaccccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatg 157  Q
    |||||||| ||| || ||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  10736904 atacttacgtcacactccaatatctcacattaataatcaccaatcacatg 10736953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #130
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 245 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 11883968 - 11883923
Alignment:
Q  245 tcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 290  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  11883968 tcgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacttcaaagtcgtcac 11883923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #131
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 245 - 290
Target Start/End: Original strand, 14291910 - 14291955
Alignment:
Q  245 tcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 290  Q
    |||||||||| |||||||||||||||  |||| |||||||||||||    
T  14291910 tcgacgcatatatgcatgtggtaccatttcacttcaaggtcgtcac 14291955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #132
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 246 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 38377460 - 38377415
Alignment:
Q  246 cgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacc-tcaaggtcgtcac 290  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  38377460 cgacgcatatatgcatgtggtaccaaatcaccttaaaggtcgtcac 38377415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #133
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 108 - 157
Target Start/End: Original strand, 45581181 - 45581230
Alignment:
Q  108 atacttacatcaaaccccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatg 157  Q
    |||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||| ||||    
T  45581181 atacttacatcacacccccatatctcacatcaataatcatcaatctcatg 45581230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #134
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 251 - 290
Target Start/End: Original strand, 15989508 - 15989548
Alignment:
Q  251 catacatgcatgtggtaccaaatcacctc-aaggtcgtcac 290  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15989508 catatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaaggtcgtcac 15989548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 232; Significance: 1e-128; HSPs: 96)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 24 - 400
Target Start/End: Original strand, 4863551 - 4863943
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaat-aacaattaa-catgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacata------tacttac 115  Q
    |||||||||||||| ||  |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||| |||      |||||||    
T  4863551 acatcatcataatcaaaacaacagttaatcatgaataatttaatataaacatcatgcatttgatcaataatgatattctcatatatacatatatacttac 4863650  T
Q  116 atcaaa-ccccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcac------ 208  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||| |||||||          
T  4863651 atcaaaaccccaatatctcacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaacatcaaagcacaattattcatacacaatcaccaatcaccaatca 4863750  T
Q  209 -atatatcaataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaa 307  Q
     || |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4863751 catttatcaataagactcatgtcatgatatgcacttattgacgcataaatgaatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaaa 4863850  T
Q  308 catcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaatctcaacacgactatgatg 400  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4863851 catcgtatgtaagagttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaatctcaacacgattatgatg 4863943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 24 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 27185699 - 27185318
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaat-aacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 122  Q
    |||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||   ||| ||||   |||||||||||||||    
T  27185699 acatcaacataatccaattaacagttaacatggatatttcaatataaacattatgcacttgatcaataata---ttcacatatcaatacttacatcaaac 27185603  T
Q  123 cccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcac-----atatatc-- 215  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||| |||| ||||||| ||||||| |||||||||     | || ||      
T  27185602 cccaatatctcacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgtacaaacaacaattcacatttattcagacacaattatcaatcaccaatcacatttcca 27185503  T
Q  216 aataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcat 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  27185502 aataagactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaaacatcgtat 27185403  T
Q  316 gtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaatctcaacacgactatgatg 400  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27185402 gtaagatttcacacacgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaatctcaacatgactatgatg 27185318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 24 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 21661593 - 21661268
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaa-a 121  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  21661593 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcaattgatcaataataatattctcatacatatgcttacatcaaga 21661494  T
Q  122 ccccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatca-----catatatc- 215  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||     || || ||     
T  21661493 ccccaatatctcacaacaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacaattattcatacacaatcaccaatcaccattcacatttcc 21661394  T
Q  216 -aataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgca 314  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  21661393 aaataagactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaaacatcgta 21661294  T
Q  315 tgtaagatttcacacccgtcttacat 340  Q
    |||||||||||||||| |||||||||    
T  21661293 tgtaagatttcacaccagtcttacat 21661268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 180; E-Value: 5e-97
Query Start/End: Original strand, 24 - 290
Target Start/End: Original strand, 21392432 - 21392698
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 122  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  21392432 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataaaaatattctcatacatatacttacatcaa-c 21392530  T
Q  123 cccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaataaga 222  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |   |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  21392531 cccaatatctcacatcaataatcaccaatcacatgtgttatgaacaaatatcagtttccaattattcatacacaatcaccaaacacatatatcaataaga 21392630  T
Q  223 ctcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 290  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21392631 ctcatgtcatgatatgcacctatcgacacatatatgcatgtggtaccaaatcaactcaaggtcgtcac 21392698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 24 - 216
Target Start/End: Original strand, 34937571 - 34937764
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 122  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||    
T  34937571 acatcatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatataaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatatcaatacttacatcaaac 34937670  T
Q  123 cccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 216  Q
    |||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  34937671 cccaatatctaacattaataatcatcaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatca 34937764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 24 - 216
Target Start/End: Original strand, 10307 - 10500
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 122  Q
    |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |   |||||||||||||||    
T  10307 acattatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattcccacatcaatacttacatcaaac 10406  T
Q  123 cccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 216  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  10407 cccaatatctcacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcatatacatca 10500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 24 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 10780305 - 10780112
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 122  Q
    |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |   |||||||||||||||    
T  10780305 acattatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcacatcaatacttacatcaaac 10780206  T
Q  123 cccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 216  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  10780205 cccaatatctcacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagtcattcatacacaatcaccaatcatatacatca 10780112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 247 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 32967815 - 32967661
Alignment:
Q  247 gacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctc 346  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32967815 gacgcataaatgcatgtggtaccgaatcacctcaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaaacatcgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatctc 32967716  T
Q  347 cgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaa-tctcaacacgactatgatg 400  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  32967715 cgaagtaaaagagctcaacccttttacaactacaagactcaacatgactatgatg 32967661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 24 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 43445901 - 43445708
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 122  Q
    |||| |||||||||||| |||||  ||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |   |||||||||||||||    
T  43445901 acattatcataatccaaataacagataacatgaatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattcccacatcaatacttacatcaaac 43445802  T
Q  123 cccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 216  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  43445801 cccaatatctcacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcatatacatca 43445708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 251 - 381
Target Start/End: Original strand, 23492532 - 23492662
Alignment:
Q  251 catacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaa 350  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23492532 cataaatgcatgtggtaccgaatcacctcaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaaacatcgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaa 23492631  T
Q  351 gtaaaagagttcaacccttttacaactacaa 381  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23492632 gtaaaagagttcaacctttttacaactacaa 23492662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 24 - 216
Target Start/End: Original strand, 28257781 - 28257970
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 122  Q
    |||||||||||||| || ||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||   ||| ||||   |||||||||||| ||    
T  28257781 acatcatcataatcaaaataacagttaaaatgaa-aattcaatataaacatcatgcacttgatcaataata---ttcacatatcaatacttacatcacac 28257876  T
Q  123 cccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 216  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  28257877 cccaatatctcacatcaataatcatcaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacaattattcatacacaatcaccaatcacatacatca 28257970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 24 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 22885234 - 22885041
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 122  Q
    |||| |||||||||||| ||||| | | |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||    
T  22885234 acattatcataatccaaataacagtcatcatgaatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatatcaatacttacatcaaac 22885135  T
Q  123 cccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 216  Q
    |||||||||| |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| || |||||| ||| ||||    
T  22885134 cccaatatctcacatcaatgatcgccaattacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaaccaccaatcatatacatca 22885041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 216 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 24227146 - 24226976
Alignment:
Q  216 aataagactcatgtca---tgatatgcacata--tcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacat 310  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||| ||  ||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24227146 aataagactcatgtcaacatgatatgcacctagttcgacacatatatgcatgtcgtaccgaatcacctcaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaaacat 24227047  T
Q  311 cgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaa 381  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  24227046 cgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatcaccgaagtaaaagagctcaacccttttacagctacaa 24226976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 24 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 25211982 - 25211796
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 122  Q
    |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||   ||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  25211982 acattatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatt--aacatcatgcatttgatcaataataatattctcatatatatacttacatcaaaa 25211885  T
Q  123 c-ccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacat 210  Q
    | ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| |||||||||    
T  25211884 ctccaatatctcacattaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacatttattcatacagaatcaccaatcacat 25211796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 24 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 25276134 - 25275948
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 122  Q
    |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||   ||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  25276134 acattatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatt--aacatcatgcatttgatcaataataatattctcatatatatacttacatcaaaa 25276037  T
Q  123 c-ccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacat 210  Q
    | ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| |||||||||    
T  25276036 ctccaatatctcacattaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacatttattcatacagaatcaccaatcacat 25275948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 245 - 381
Target Start/End: Original strand, 21615535 - 21615671
Alignment:
Q  245 tcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatc 344  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21615535 tcgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaaacatcgtatgtaaaatttcacacccgtcttacataatc 21615634  T
Q  345 tccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaa 381  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  21615635 accgaagtaaaagagttcaactcttttacagctacaa 21615671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 24 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 17473892 - 17473704
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 122  Q
    |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||| | ||||||||||| |||| || ||| || |||||||||||||||    
T  17473892 acattatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatttaaacatcatgcatttgatcaataaaaatactcacat-ca-atacttacatcaaac 17473795  T
Q  123 cccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatata 213  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  17473794 cccaatagctcacatcaataatcaccaatcacatatgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcatatata 17473704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 256 - 400
Target Start/End: Original strand, 7727112 - 7727257
Alignment:
Q  256 atgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaa 355  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  7727112 atgcatgtggtaccgaatcacctcaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaaacatcgtatgtaagatttcacacccatcttacataatctccgaagtaaa 7727211  T
Q  356 agagttcaacccttttacaactacaa-tctcaacacgactatgatg 400  Q
    | || ||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  7727212 atagctcaacccctttacaactacaagactcaacatgactatgatg 7727257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 39 - 207
Target Start/End: Original strand, 19497952 - 19498120
Alignment:
Q  39 aataacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaaccccaatatcttacatc 138  Q
    |||||||  ||||||||||| |||||| ||||||| | |||| |||||| ||||||||||| || |   ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19497952 aataacagataacatgaatatttcaatttaaacattacgtacatgatcattaataatattcacacatcaatacttacatcaaaccccaatatctcacatc 19498051  T
Q  139 aataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatca 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  19498052 aataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatca 19498120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 245 - 400
Target Start/End: Original strand, 19860756 - 19860912
Alignment:
Q  245 tcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatc 344  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19860756 tcgacacatatatgcatgtggtaccaaatcaccccaaggtcgtcaccttcgatacaacaaaaacatcgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatc 19860855  T
Q  345 tccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaa-tctcaacacgactatgatg 400  Q
     |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| ||||||||||    
T  19860856 accgaagtaaaagagctcaactcttttacagctacaagactcaacatgactatgatg 19860912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 247 - 400
Target Start/End: Original strand, 28888441 - 28888598
Alignment:
Q  247 gacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcact---ttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataat 343  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||     ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28888441 gacgcataaatgcatgtggtaccgaatcacctcaaggtcatcatcatcttcgatgcaacaaaaacatcgtatgtaagatttcacacccgtcttacataat 28888540  T
Q  344 ctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaa-tctcaacacgactatgatg 400  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  28888541 ctccgaagtaaaagagttcaacctttttacaactacaagactcaacatgactatgatg 28888598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 142 - 290
Target Start/End: Original strand, 11582266 - 11582414
Alignment:
Q  142 aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaataagactcatgtcatgatatgcac 241  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  11582266 aatcaccaatcacatgtgtaatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaatctccaatcacatacatcaataagactcatgccatgatatgcac 11582365  T
Q  242 atatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 290  Q
     ||| ||| |||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  11582366 ctattgacacatatatgcatgtggtaccaaatcatctcagggtcgtcac 11582414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 24 - 216
Target Start/End: Original strand, 11579922 - 11580113
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 122  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||| |||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||     
T  11579922 acatcatcataattcaaataacagttaacatgaatatttcaatttaa-catcatgcacttgatcaataataatattctcata--tatacttacatcaaaa 11580018  T
Q  123 c-ccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 216  Q
    | ||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| || ||| |||||| ||| ||||    
T  11580019 ctccaatatctcacatcagtaatcatcaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacgcagtcaccaatcatatacatca 11580113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 144 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 1170467 - 1170321
Alignment:
Q  144 tcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaataagactcatgtcatgatatgcacat 243  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  1170467 tcacaaatcacatgtgtcatgaacaattatcaattcacaaatattcattcacaatcaccaatcacatatatcaataagactcatgtcatgatattcacct 1170368  T
Q  244 atcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 290  Q
    || ||  |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1170367 attgatacatatatgcatgtggtaccaaatctcctcaaggtcgtcac 1170321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 251 - 400
Target Start/End: Original strand, 13793659 - 13793809
Alignment:
Q  251 catacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaa 350  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  13793659 cataaatgcatgtggtaccgaatcacctcaaggtcgtcacctttgatgcaacaaaaacatcgtatataagatctcacacccgtcttacataatcaccgaa 13793758  T
Q  351 gtaaaagagttcaacccttttacaactacaa-tctcaacacgactatgatg 400  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||  ||||||| ||||||||||    
T  13793759 gtaaaagagctcaacccttttacaaccacaagactcaacatgactatgatg 13793809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 251 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 37189767 - 37189637
Alignment:
Q  251 catacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaa 350  Q
    |||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  37189767 cataaatgcaagtggtaccgaatcacctcaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaaacatcgtatgtaatatttcacacccgtcttacataatcaccgaa 37189668  T
Q  351 gtaaaagagttcaacccttttacaactacaa 381  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  37189667 gtaaaagagctcaacccttttacagctacaa 37189637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 24 - 290
Target Start/End: Original strand, 23453184 - 23453454
Alignment:
Q  24 acatcatcataatcca-ataacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatc-aataataatattctcatacatatacttaca-tcaa 120  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||| | || ||| |||||||||||   || | ||||| ||||| || |    
T  23453184 acatcatcataatccacataacaaataacatgaataattcaatttaaatatcatgcatttaatccaataataatat---cacaaatatatttacaatcta 23453280  T
Q  121 accccaatatcttacatcaat-aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatat-atcaat 218  Q
    | | |||||||| |||||||| |||||||||| | |||||||||||||||  |||||  |||||||||| || |||||||||||||||||| | | ||||    
T  23453281 atctcaatatctcacatcaattaatcaccaataatatgtgtcatgaacaatcatcaaatcacaattatttatgcacaatcatcaatcacatttcaccaat 23453380  T
Q  219 aagactcatgtcatgatatgcacata--tcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 290  Q
    ||||||||||||||||| || || ||  ||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23453381 aagactcatgtcatgatgtgaacctagttcgacacatatatgcatgtggtaccatatcacctcaaggtcgtcac 23453454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 24 - 290
Target Start/End: Original strand, 23460428 - 23460698
Alignment:
Q  24 acatcatcataatcca-ataacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatc-aataataatattctcatacatatacttaca-tcaa 120  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||| | || ||| |||||||||||   || | ||||| ||||| || |    
T  23460428 acatcatcataatccacataacaaataacatgaataattcaatttaaatatcatgcatttaatccaataataatat---cacaaatatatttacaatcta 23460524  T
Q  121 accccaatatcttacatcaat-aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatat-atcaat 218  Q
    | | |||||||| |||||||| |||||||||| | |||||||||||||||  |||||  |||||||||| || |||||||||||||||||| | | ||||    
T  23460525 atctcaatatctcacatcaattaatcaccaataatatgtgtcatgaacaatcatcaaatcacaattatttatgcacaatcatcaatcacatttcaccaat 23460624  T
Q  219 aagactcatgtcatgatatgcacata--tcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 290  Q
    ||||||||||||||||| || || ||  ||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23460625 aagactcatgtcatgatgtgaacctagttcgacacatatatgcatgtggtaccatatcacctcaaggtcgtcac 23460698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 24 - 290
Target Start/End: Original strand, 23464689 - 23464959
Alignment:
Q  24 acatcatcataatcca-ataacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatc-aataataatattctcatacatatacttaca-tcaa 120  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||| | || ||| |||||||||||   || | ||||| ||||| || |    
T  23464689 acatcatcataatccacataacaaataacatgaataattcaatttaaatatcatgcatttaatccaataataatat---cacaaatatatttacaatcta 23464785  T
Q  121 accccaatatcttacatcaat-aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatat-atcaat 218  Q
    | | |||||||| |||||||| |||||||||| | |||||||||||||||  |||||  |||||||||| || |||||||||||||||||| | | ||||    
T  23464786 atctcaatatctcacatcaattaatcaccaataatatgtgtcatgaacaatcatcaaatcacaattatttatgcacaatcatcaatcacatttcaccaat 23464885  T
Q  219 aagactcatgtcatgatatgcacata--tcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 290  Q
    ||||||||||||||||| || || ||  ||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23464886 aagactcatgtcatgatgtgaacctagttcgacacatatatgcatgtggtaccatatcacctcaaggtcgtcac 23464959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 142 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 1221584 - 1221351
Alignment:
Q  142 aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaataagactcatgtcatgatatgcac 241  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||| ||||||||| |   |||| |||||||||||||||||||||    
T  1221584 aatcaccaatcacatgtatcaggaacaaatatcaattcacaaatattcattcacaatcaccaatcacatttccaaatatgactcatgtcatgatatgcac 1221485  T
Q  242 atatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtca-ctttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttac-a 339  Q
     ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |  |||| |||||| |||||||||| ||    |||||| |||||||   ||||||| | ||||| |    
T  1221484 ttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaagttcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgaatgtaagggctcacacctgccttacaa 1221385  T
Q  340 taatctccgaagtaaaagagttcaacccttttaca 374  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1221384 taatct-cgaagtaaaagagttcaacccttttaca 1221351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 24 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 23986359 - 23986165
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 122  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||   |||||||||||| ||    
T  23986359 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttctatataaacatcatgcacttgataaataataatactctcatatcaatacttacatcatac 23986260  T
Q  123 ccc-aatatcttacatcaa-taatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatc 215  Q
    ||| ||| | | ||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23986259 ccccaatgtttcacatcaagtaatcaccaatcatatgtgtcaggaacaaatattaattcacagttattcatacacaatcatcattcacatatatc 23986165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 24 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 1171464 - 1171320
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaa- 121  Q
    ||||||||||||||||| |||||  ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  1171464 acatcatcataatccaaataacagataacatgaatatttcaatataaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatatatatacttacatcaaag 1171365  T
Q  122 ccccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaa 166  Q
    ||||||||||| |||| ||||| || ||||||||| | |||||||    
T  1171364 ccccaatatctcacattaataaacatcaatcacatttatcatgaa 1171320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 24 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 9732782 - 9732592
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacat--atacttacatcaa 120  Q
    |||| |||||||||||| |||||  ||||||||||| ||||| |||||||||||| | |||||||||||||||     || ||||  ||||||||||||     
T  9732782 acattatcataatccaaataacaggtaacatgaatatttcaagataaacatcatgcatttgatcaataataat-----cacacattaatacttacatcac 9732688  T
Q  121 accccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 216  Q
    | ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  9732687 atcccaatatctcgcatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaagatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcatatacatca 9732592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 24 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 1221826 - 1221638
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 122  Q
    |||| |||||||||||| ||||| ||| |||||| | ||||||   ||||||||| | ||||||||||| |||| || ||| || |||||||||||||||    
T  1221826 acattatcataatccaaataacagttatcatgaacatttcaatt--aacatcatgcatttgatcaataa-aatactcacat-ca-atacttacatcaaac 1221732  T
Q  123 cccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 216  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  1221731 cccaatagctcacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcatatacatca 1221638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 246 - 360
Target Start/End: Original strand, 11964472 - 11964586
Alignment:
Q  246 cgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatct 345  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||| |||     
T  11964472 cgacacatacatgcatgtggtaccaaaccacctcaaggtcgtcaccttcaatgcaacaaaaacatcgtatgtaagatttcaaacccgtattacattatca 11964571  T
Q  346 ccgaagtaaaagagt 360  Q
    |||||||||||||||    
T  11964572 ccgaagtaaaagagt 11964586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 24 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 24185137 - 24184869
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatca-aa 121  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   ||| |||| | ||||  | |||| ||    
T  24185137 acatcatcataatccaaataacagttaacatgaataattcaatataaacatcatgtaattgatcaataata---ttcacatataaatacaaatatcataa 24185041  T
Q  122 ccccaatatcttacatcaat-aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaataa 220  Q
     | |||| ||| |||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||  | |||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||  |   || ||    
T  24185040 tctcaatttctcacatcaattaatcaccaattccatgtgtcaggaacaatcaccaaatcacagttattcatacacaatcaccaatcacacttcaaaacaa 24184941  T
Q  221 gactcatgtcatgatatgcacata--tcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 290  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||   |||| |||| |||||||||||||||  |||| |||||||||||||    
T  24184940 gactcatgtcatgatgtgcacctagtccgacacatatatgcatgtggtaccatttcacttcaaggtcgtcac 24184869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 24 - 290
Target Start/End: Original strand, 24470555 - 24470804
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 122  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||| |||||| ||| ||||||| | |||||||||||||||   | || |   ||| |||||||| ||    
T  24470555 acatcatcataatccaaataacagttagcatgaatagttcaatttaa-catcatgcatttgatcaataataat---cacacaataatatttacatcacac 24470650  T
Q  123 cccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaataaga 222  Q
    |||||||||| ||| ||||||| | ||||||||| ||||| |||||| ||||||| ||||||              || ||||||||||||||| |||||    
T  24470651 cccaatatctcacaacaataataatcaatcacatatgtcacgaacaattatcaattcacaat--------------cagcaatcacatatatcagtaaga 24470736  T
Q  223 ctcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 290  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24470737 ctcatgtcatgatatgcacctattgacccatatatgcatgtggtaccaaatctcctcaaggtcgtcac 24470804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 194 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 21653148 - 21653052
Alignment:
Q  194 acaatcatcaatcacatatatcaataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 290  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  21653148 acaatcaccaatcacatttatcaataagactcgtgtcatgatatgcacttatcgacgcatatatgcatgtggtaccaaatgtcctcaaggtcgtcac 21653052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 194 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 11213404 - 11213222
Alignment:
Q  194 acaatcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtca-ct 291  Q
    ||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||| ||||||||||| |  ||||||||||| ||    
T  11213404 acaatcatcaatcacttatatcatatgagactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgcggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacct 11213305  T
Q  292 ttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttac-ataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttaca 374  Q
    |||||||| ||    |||||| |||||||   ||||||| | ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11213304 ttcgatgccacttgcacatcgtatgtaagggctcacacctgccttacaataatct-cgaagtaaaagagttcaacccttttaca 11213222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 194 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 110785 - 110604
Alignment:
Q  194 acaatcatcaatcacatatatcaat-aagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtca-ct 291  Q
    |||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||| ||    
T  110785 acaatcatcaatcacatacatcatttaagactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacct 110686  T
Q  292 ttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttac-ataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttaca 374  Q
    |||||||| ||    |||||| |||||||   ||||||| | ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  110685 ttcgatgccacttgcacatcgtatgtaag-gctcacacctgccttacaataatct-cgaagtaaaagagctcaacccttttaca 110604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 246 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 20455741 - 20455627
Alignment:
Q  246 cgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatct 345  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    |||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||| |||     
T  20455741 cgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaagatcgttacccatgatgcaacaaaaacatcatatgtaagatttcacatccgtcttacattatca 20455642  T
Q  346 ccgaagtaaaagagt 360  Q
    |||||||||||||||    
T  20455641 ccgaagtaaaagagt 20455627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 160 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 22885017 - 22884887
Alignment:
Q  160 tcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgc 259  Q
    |||||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||||  ||||||||| |   |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||    
T  22885017 tcatgaacaattatcaattcacaaatattcattcacaatctccaatcacatttccaaataagactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgc 22884918  T
Q  260 atgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 290  Q
    ||||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  22884917 atgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcac 22884887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 194 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 17473648 - 17473568
Alignment:
Q  194 acaatcatcaatcacatatatcaataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatc 274  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  17473648 acaatcaccaatcacatatatcaataagactcatgccatgatatgcacctatcgacacatatatgcatgtggtaccaaatc 17473568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 108 - 274
Target Start/End: Original strand, 23510313 - 23510473
Alignment:
Q  108 atacttacatcaaaccccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatca 207  Q
    |||||| ||||| |||||||||||| ||||||||| ||| ||||||    |||   |||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||||| ||||||    
T  23510313 atacttgcatcataccccaatatctcacatcaatagtcatcaatca----tgt---gaacaattatcaattcacaaatattcattcacaatcaccaatca 23510405  T
Q  208 catatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatc 274  Q
    ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| |||| |||||||| ||||||||||    
T  23510406 catttatcacataagactcatgttatgatatgcacttattgacacataaatgcatgttgtaccaaatc 23510473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 24 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 29192857 - 29192671
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 122  Q
    |||| |||||||||||| |||||  ||||||||||| |||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||| || |   |||||||||||||||    
T  29192857 acattatcataatccaaataacagataacatgaatatttcaatttaaacatcattcacttgatcaataataatattcccacatcaatacttacatcaaac 29192758  T
Q  123 cccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 216  Q
    ||| ||||||  |||||||| ||| ||||||        |||||||| |||||||  |||||||||||  |||||||| ||||||||| |||||    
T  29192757 cccgatatctcgcatcaatattcatcaatca-------tatgaacaattatcaatttacaattattcaatcacaatcaccaatcacatttatca 29192671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 31 - 212
Target Start/End: Original strand, 17907853 - 17908030
Alignment:
Q  31 cataatccaa-taacaattaa-catgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatc-aaaccccaa 127  Q
    |||||||||| ||||| |||| |||| ||| |||||| ||||||||  |||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||| | |||||||||    
T  17907853 cataatccaaataacagttaatcatggatatttcaatttaaacatctcgtacatgatcaataataatattcacatgcatatacttacaccaaaaccccaa 17907952  T
Q  128 tatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatat 212  Q
    ||||| ||||||||||||| | ||||        |||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  17907953 tatctcacatcaataatcatcgatca-------tatgaacaattatcaactcacaattattcatacacaatcaccgatcacatat 17908030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 160 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 35792964 - 35792767
Alignment:
Q  160 tcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgc 259  Q
    |||||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||| |||   |||||||| |   |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||    
T  35792964 tcatgaacaattatcaattcacaaatattcattcacgatctctaatcacatttccaaataagactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgc 35792865  T
Q  260 atgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaa--aaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaag 357  Q
    ||||||||||||||| ||  ||||||||||| | |||||  ||||   |||||||||||||||   |||| |    ||||||||||||||||||||||||    
T  35792864 atgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcacctccgatg-gacaagtcaacatcgcatgtaaggggtcactc----cttacataatctccgaagtaaaag 35792770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 160 - 290
Target Start/End: Original strand, 16534750 - 16534881
Alignment:
Q  160 tcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatg 258  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||  ||||||||||  ||| ||| ||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||| |||    
T  16534750 tcatgaacaattatcaattcacaattattcattcacaatctccaatcacatagttcacataggactcatgctatgatatgcacttattgacacataaatg 16534849  T
Q  259 catgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 290  Q
    |||||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  16534850 catgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcac 16534881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 24 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 35793345 - 35793162
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 122  Q
    |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | | |||    |||||||||||| ||    
T  35793345 acattatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatataaacatcatgcacttgatcaataataat-tacacat--taatacttacatcacac 35793249  T
Q  123 cccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 216  Q
    | | |||||| ||||||||  ||| ||||||        |||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||    
T  35793248 ctcgatatctcacatcaatcttcatcaatca-------tatgaacaattatcaatttacaattattcattcacaatcaccaatcacatttatca 35793162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 142 - 216
Target Start/End: Original strand, 10554 - 10628
Alignment:
Q  142 aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 216  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  10554 aatcaccaatcacatgtatcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcatatacatca 10628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 160 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 18779904 - 18779790
Alignment:
Q  160 tcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgc 259  Q
    |||||||||| ||||||| ||||| | ||||| |||||||   |||||||| |   |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||    
T  18779904 tcatgaacaattatcaattcacaaatgttcattcacaatctctaatcacatttccaaataagactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgc 18779805  T
Q  260 atgtggtaccaaatc 274  Q
    |||||||||||||||    
T  18779804 atgtggtaccaaatc 18779790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 194 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 22368285 - 22368188
Alignment:
Q  194 acaatcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 290  Q
    ||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  22368285 acaatcaccaatcacatatttcacataagactcatgttatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcac 22368188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 197 - 374
Target Start/End: Original strand, 19498280 - 19498458
Alignment:
Q  197 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtca-ctttc 294  Q
    |||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||| ||| |    
T  19498280 atcaccaatcacatatttcacataagactcatgttatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcaccttcc 19498379  T
Q  295 gatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttac-ataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttaca 374  Q
    ||||| ||    |||||| |||||||   ||||||| | ||||| ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  19498380 gatgccacttgcacatcgtatgtaagggctcacacctgccttacaataatct-cgaagtaaaagag-tcatcccttttaca 19498458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 194 - 290
Target Start/End: Original strand, 28257998 - 28258093
Alignment:
Q  194 acaatcatcaatcacatatatcaataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 290  Q
    ||||||| ||| ||||| |||| |||| |||||||||||||||||||| ||| ||| |||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  28257998 acaatcaccaaccacatttatcgataaaactcatgtcatgatatgcacctattgacacatatatgcatgtggtacc-aatctcctcaaggtcgtcac 28258093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 142 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 9732562 - 9732495
Alignment:
Q  142 aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcaca 209  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  9732562 aatcaccaatcacatgtatcaggaacaaatatcaattcacaaatattcattcacaatcatcaatcaca 9732495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 194 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 10779980 - 10779799
Alignment:
Q  194 acaatcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtca-ct 291  Q
    ||||||| |||||||| || ||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||| ||    
T  10779980 acaatcaccaatcacaaatttcacataagactcatgttatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacct 10779881  T
Q  292 ttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttac-ataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttaca 374  Q
    | |||||| ||    |||||| |||||||   ||||||| | ||||| ||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||    
T  10779880 tccgatgccacttgcacatcgtatgtaag-gctcacacctgccttacaataatct-caaagtaaaagagctcaacccttttaca 10779799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 24 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 11338802 - 11338584
Alignment:
Q  24 acatcatcataatcca-ataacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaa-- 120  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||  ||| |||||||||||||||||||| || ||||  ||| |||||  || ||  |      
T  11338802 acatcatcataatccacataacaattaacatgaatatttcaattaaaagatcatgtacttgatcaataacaacattcatatatatatatatatatatata 11338703  T
Q  121 -----------accccaatatcttacatcaat-aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcac 208  Q
               | ||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||| |||||||| |||||||    
T  11338702 tatatatcatgatcccaataactcacatcaattaatcatcaatcacatgtgtcatgaacaattatcaat-cacatttattcatgcacaatcaccaatcac 11338604  T
Q  209 atatatcaataagactcatg 228  Q
    || |   |||||||||||||    
T  11338603 atttcaaaataagactcatg 11338584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 24 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 25944750 - 25944566
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacat--atacttacatcaa 120  Q
    |||| |||||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||     ||| ||||  ||||||||||||     
T  25944750 acattatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataa-----tcacacattaatacttacatcac 25944656  T
Q  121 accccaatatcttacatcaataatc-accaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 216  Q
    |||| ||||||| |||| ||||||| | ||||||        |||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||| || ||||||||| |||||    
T  25944655 accctaatatctcacattaataatcaatcaatca-------tatgaacaattatcaattcacaattattcattcacaaacaccaatcacatttatca 25944566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 24 - 216
Target Start/End: Original strand, 11340599 - 11340782
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 122  Q
    |||| |||||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | | |||    |||||||||||| ||    
T  11340599 acattatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataat-tacacat--taatacttacatcacac 11340695  T
Q  123 cccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 216  Q
    ||| |||||| |||| |||| ||| ||||||        |||||| | |||||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||    
T  11340696 cccgatatctcacataaatattcatcaatca-------tatgaacgattatcaatttacaattattcattcacaatcaccaatcacatttatca 11340782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 197 - 374
Target Start/End: Original strand, 11341116 - 11341294
Alignment:
Q  197 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtca-ctttc 294  Q
    |||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||| |||||    
T  11341116 atcaccaatcacatatttcacataggactcatgctatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttc 11341215  T
Q  295 gatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttac-ataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttaca 374  Q
    ||||| ||    |||||| |||||||   ||||||| | ||||| ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  11341216 gatgccacttgcacatcgaatgtaagggctcacacctgccttacaataatct-cgaagtaaaagag-tcatcccttttaca 11341294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 24 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 18780235 - 18780052
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 122  Q
    |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| | | |||    |||||||||||| ||    
T  18780235 acattatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatttaaacatcatgcacttgattaataataat-tacacat--taatacttacatcacac 18780139  T
Q  123 cccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 216  Q
    | | |||||| ||||||||  ||| ||||||        |||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||    
T  18780138 ctcgatatctcacatcaatcttcatcaatca-------tatgaacaattatcaatttacaattattcattcacaatcaccaatcacatttatca 18780052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 197 - 299
Target Start/End: Original strand, 25425102 - 25425206
Alignment:
Q  197 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtca-ctttc 294  Q
    |||| ||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||| |||||    
T  25425102 atcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttc 25425201  T
Q  295 gatgc 299  Q
    |||||    
T  25425202 gatgc 25425206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 142 - 209
Target Start/End: Original strand, 11341018 - 11341085
Alignment:
Q  142 aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcaca 209  Q
    |||||||| |||||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  11341018 aatcaccattcacatgtatcaggaacaaatatcaattcacaaatattcattcacaatcatcaatcaca 11341085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 197 - 290
Target Start/End: Original strand, 10831 - 10925
Alignment:
Q  197 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 290  Q
    |||| ||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  10831 atcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcac 10925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 39 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 111157 - 110990
Alignment:
Q  39 aataacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacat--atacttacatcaaaccccaatatcttaca 136  Q
    ||||||| |||||||| ||| |||||| ||||||||||| | ||||||||||||||     ||| ||||  |||||||||||| ||||| |||||| |||    
T  111157 aataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcaattgatcaataataa-----tcacacattaatacttacatcacaccccgatatctcaca 111063  T
Q  137 tcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 216  Q
    |||||| ||| ||||||        |||||||| |||||||  |||| ||||||| |||||||| ||||||||| |||||    
T  111062 tcaatattcatcaatca-------tatgaacaattatcaatttacaaatattcattcacaatcaccaatcacatttatca 110990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 216 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 5452511 - 5452432
Alignment:
Q  216 aataagactcatgtca---tgatatgcacata--tcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 290  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||| ||  ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5452511 aataagactcatgtcaacatgatatgcacctagttcgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 5452432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 142 - 208
Target Start/End: Original strand, 19498182 - 19498248
Alignment:
Q  142 aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcac 208  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||| |||||||    
T  19498182 aatcaccaatcacatgtatcaggaacaaatatcaattcacaaatattcattcacaatcaccaatcac 19498248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 197 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 43445555 - 43445390
Alignment:
Q  197 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtca-ctttc 294  Q
    |||| |||||| |||| ||| |||||| |||||| ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||| |||||    
T  43445555 atcaccaatcatatatttcacataagattcatgttatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttc 43445456  T
Q  295 gatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttac-ataatctccgaagtaaaagagt 360  Q
    ||||| ||    |||||| |||||||   ||||||| | ||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  43445455 gatgccacttgcacatcgtatgtaagggctcacacctgccttacaataatct-cgaagtaaaagagt 43445390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 197 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 4201764 - 4201586
Alignment:
Q  197 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtca-ctttc 294  Q
    |||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||| |||||    
T  4201764 atcaccaatcacatatttcacataggactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttc 4201665  T
Q  295 gatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttac-ataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttaca 374  Q
    ||||  ||    |||||| |||||||   ||||||| | ||||| ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  4201664 gatgtcacttgcacatcgaatgtaagggctcacacctgccttacaataatct-cgaagtaaaagag-tcatcccttttaca 4201586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 197 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 9732464 - 9732360
Alignment:
Q  197 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtca-ctttc 294  Q
    |||| |||||| |||| ||| ||||||||||||| ||||||||||| |||  || |||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||| |||||    
T  9732464 atcaccaatcagatatttcacataagactcatgttatgatatgcacttattaacacatagatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttc 9732365  T
Q  295 gatgc 299  Q
    |||||    
T  9732364 gatgc 9732360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 24 - 216
Target Start/End: Original strand, 16534391 - 16534574
Alignment:
Q  24 acatcatcataatcca-ataacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 122  Q
    |||| ||||||||||| |||| |||||||||| ||| |||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| | | |||    |||||||||||| ||    
T  16534391 acattatcataatccagataataattaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaacaataat-tacacat--taatacttacatcacac 16534487  T
Q  123 cccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 216  Q
    ||| |  ||| ||||||||| ||| ||||||        |||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||    
T  16534488 cccgaagtctcacatcaatattcatcaatca-------tatgaacaattatcaatttacaattattcattcacaatcaccaatcacatttatca 16534574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 167 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 25211719 - 25211623
Alignment:
Q  167 caaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgt 263  Q
    |||| |||||| |||||||||||| ||| ||||| ||||||||| |   |||| ||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||    
T  25211719 caaacatcaattcacaattattcacacataatcaccaatcacattttcaaatatgactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgt 25211623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 167 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 25275871 - 25275775
Alignment:
Q  167 caaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgt 263  Q
    |||| |||||| |||||||||||| ||| ||||| ||||||||| |   |||| ||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||    
T  25275871 caaacatcaattcacaattattcacacataatcaccaatcacattttcaaatatgactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgt 25275775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 39 - 95
Target Start/End: Original strand, 25424680 - 25424736
Alignment:
Q  39 aataacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataat 95  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25424680 aataacagttaacatgaatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataat 25424736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 142 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 25944536 - 25944472
Alignment:
Q  142 aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatc 206  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||| |||||    
T  25944536 aatcaccaattacatgtatcatgaacaaatatcaattcacaaatattcattcacaatcaccaatc 25944472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 142 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 43445654 - 43445582
Alignment:
Q  142 aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatat 214  Q
    |||| |||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  43445654 aatcgccaatcacatgtatcaggaacaaatatcaattcacaaatattcattcacaatcaccaatcacaaatat 43445582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 197 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 21075286 - 21075192
Alignment:
Q  197 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 290  Q
    |||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  21075286 atcaccaatcacatatttcacataggactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcac 21075192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 197 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 21933957 - 21933863
Alignment:
Q  197 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 290  Q
    |||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  21933957 atcaccaatcacatatttcacataggactcatgctatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcac 21933863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 197 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 21940127 - 21940033
Alignment:
Q  197 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 290  Q
    |||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  21940127 atcaccaatcacatatttcacataggactcatgctatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcac 21940033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 142 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 22368411 - 22368337
Alignment:
Q  142 aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 216  Q
    |||||||||| |||||| || |||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  22368411 aatcaccaattacatgtatcctgaacaaatatcaattaacagttattcatacacaatcaccaatcatatacatca 22368337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 197 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 29192415 - 29192321
Alignment:
Q  197 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 290  Q
    |||| ||||||||||  ||| ||||||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  29192415 atcaccaatcacatacttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcac 29192321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 197 - 290
Target Start/End: Original strand, 35580735 - 35580829
Alignment:
Q  197 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 290  Q
    |||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  35580735 atcaccaatcacatatttcacataggactcatgctatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcac 35580829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 197 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 37010961 - 37010867
Alignment:
Q  197 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 290  Q
    |||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  37010961 atcaccaatcacatatttcacataggactcatgctatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcac 37010867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 216 - 290
Target Start/End: Original strand, 3672421 - 3672497
Alignment:
Q  216 aataagactcatgtcatgatatgcacata--tcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 290  Q
    ||||||||||||||| |||||||||  ||  ||||| |||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  3672421 aataagactcatgtcttgatatgcatctagttcgacacatatatgcatgtggtaccaactcacttcaaggtcgtcac 3672497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 142 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 10780082 - 10780011
Alignment:
Q  142 aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatat 214  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||| ||||| ||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  10780082 aatcaccaatcacatgtatcaggaac-aatatcaattcacaaatattcattcacaatcaccaatcacaaatat 10780011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 24 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 22368674 - 22368602
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataat 95  Q
    |||| |||||||||||| ||||| ||||||| |||| ||||||  |||||||||| |||||||||||||||||    
T  22368674 acattatcataatccaaataacagttaacattaatatttcaattaaaacatcatgcacttgatcaataataat 22368602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 197 - 374
Target Start/End: Original strand, 24594981 - 24595159
Alignment:
Q  197 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtca-ctttc 294  Q
    |||| ||||||||||  ||| ||| ||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||| ||||||||||| |  ||||||||||| |||||    
T  24594981 atcaccaatcacataattcacataggactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgcggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttc 24595080  T
Q  295 gatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttac-ataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttaca 374  Q
    ||||| ||    |||||| |||||||   ||||||| | ||||| ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  24595081 gatgccacttgcacatcgaatgtaagggctcacacctgccttacaataatct-cgaagtaaaagag-tcatcccttttaca 24595159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 221 - 360
Target Start/End: Original strand, 23327458 - 23327598
Alignment:
Q  221 gactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtca-ctttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaa 319  Q
    ||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||| ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||| ||    |||||| ||||||    
T  23327458 gactcatgctatgatatgcacttatggacccataaatgcatgcggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgaatgtaa 23327557  T
Q  320 gatttcacacccgtcttac-ataatctccgaagtaaaagagt 360  Q
    |   ||||||| | ||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  23327558 gggctcacacctgccttacaataatct-cgaagtaaaagagt 23327598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 197 - 299
Target Start/End: Original strand, 27008492 - 27008596
Alignment:
Q  197 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtca-ctttc 294  Q
    |||| ||||||||||  ||| ||| ||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||| ||||||||||| |  ||||||||||| |||||    
T  27008492 atcaccaatcacataattcacataggactcatgctatgatatgcacttattgacacataaatgcatgaggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttc 27008591  T
Q  295 gatgc 299  Q
    |||||    
T  27008592 gatgc 27008596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 146 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 110957 - 110888
Alignment:
Q  146 accaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 216  Q
    |||||| |||||| |||||||||| |||||||  ||| ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  110957 accaattacatgtatcatgaacaa-tatcaattaacagttattcatacacaatcaccaatcatatacatca 110888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 24 - 96
Target Start/End: Original strand, 7726919 - 7726993
Alignment:
Q  24 acatcatcataatcca-ataacaattaa-catgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataata 96  Q
    |||||||||||||||| ||||||  ||| |||||||||||||||  ||| ||||||||||| |||||| ||||||    
T  7726919 acatcatcataatccagataacagctaagcatgaataattcaattcaaatatcatgtacttaatcaatgataata 7726993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 197 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 25902123 - 25902021
Alignment:
Q  197 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcg 295  Q
    |||| ||||||||||  ||| ||| ||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||| ||||||||||| |   ||||||||||| ||||    
T  25902123 atcaccaatcacataattcacataggactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgcggtaccaaatctctataaggtcgtcaccttcg 25902024  T
Q  296 atg 298  Q
    |||    
T  25902023 atg 25902021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #93
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 142 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 29192641 - 29192583
Alignment:
Q  142 aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatca 200  Q
    |||||||||| || ||| |||| || |||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  29192641 aatcaccaattacttgtatcataaataaatatcaattcacagttattcatacacaatca 29192583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #94
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 197 - 290
Target Start/End: Original strand, 37051465 - 37051559
Alignment:
Q  197 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 290  Q
    |||| ||||||||||  ||| ||| ||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||| ||||||||||| |  ||||||||||||    
T  37051465 atcaccaatcacataattcacatatgactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgcggtaccaaatctcaacaaggtcgtcac 37051559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #95
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 119 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 21653265 - 21653228
Alignment:
Q  119 aaaccccaatatcttacatcaataatcaccaatcacat 156  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21653265 aaacctcaatatctcacatcaataatcaccaatcacat 21653228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #96
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 348 - 380
Target Start/End: Original strand, 21649463 - 21649495
Alignment:
Q  348 gaagtaaaagagttcaacccttttacaactaca 380  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21649463 gaagtaaaagagctcaacccttttacaactaca 21649495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 216; Significance: 1e-118; HSPs: 9)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 24 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 256827 - 256560
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 122  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  256827 acatcatcataatccaaataacagttaatatgaatatttcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 256728  T
Q  123 cccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaataaga 222  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  256727 cccaatatctcacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacatttattcatacacaatcaccaatcacatatatcaataaga 256628  T
Q  223 ctcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 290  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  256627 ctcatgtcatgatatgcacctattgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 256560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 194 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 125089 - 125009
Alignment:
Q  194 acaatcatcaatcacatatatcaataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatc 274  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||| |||| |||||||||||||||||||    
T  125089 acaatcaccaatcacatatatcaataagactcatgccatgatatgcacctattgacacatatatgcatgtggtaccaaatc 125009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 196 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 72106 - 72028
Alignment:
Q  196 aatcatcaatcacatatatcaataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatc 274  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||  ||| |||| |||||||||||||||||||    
T  72106 aatcaccaatcacatatatcaataagactcatgccatgatatgcacctaatgacacatatatgcatgtggtaccaaatc 72028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #4
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 196 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 76487 - 76409
Alignment:
Q  196 aatcatcaatcacatatatcaataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatc 274  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||  ||| |||| |||||||||||||||||||    
T  76487 aatcaccaatcacatatatcaataagactcatgccatgatatgcacctaatgacacatatatgcatgtggtaccaaatc 76409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #5
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 202 - 274
Target Start/End: Original strand, 192985 - 193057
Alignment:
Q  202 caatcacatatatcaataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatc 274  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||  ||| |||| |||||||||||||||||||    
T  192985 caatcacatatatcaataagactcatgccatgatatgcacctaatgacacatatatgcatgtggtaccaaatc 193057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #6
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 24 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 72317 - 72191
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacat--atacttacatcaa 120  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||| ||||||   ||||||||| | |||||||||||||||     || ||||  |||||||||| |     
T  72317 acatcatcataatccaaataacagttatcatgaatatttcaatt--aacatcatgcatttgatcaataataat-----cacacattaatacttacattac 72225  T
Q  121 accccaatatcttacatcaataatcaccaatcac 154  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  72224 accccaatatctcacatcaataatcatcaatcac 72191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #7
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 24 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 76698 - 76572
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacat--atacttacatcaa 120  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||| || ||||| ||||||   ||||||||| | |||||||||||||||     || ||||  |||||||||| |     
T  76698 acatcatcataatccaaataacagttatcaagaatatttcaatt--aacatcatgcatttgatcaataataat-----cacacattaatacttacattac 76606  T
Q  121 accccaatatcttacatcaataatcaccaatcac 154  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  76605 accccaatatctcacatcaataatcatcaatcac 76572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #8
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 24 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 125298 - 125173
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacat--atacttacatcaa 120  Q
    |||||||||||||| || ||||| ||| |||||||| ||||||   ||||||||| | |||||||||||||||     || ||||  ||||||||||||     
T  125298 acatcatcataatctaaataacagttatcatgaatatttcaatt--aacatcatgcatttgatcaataataat-----cacacattaatacttacatcac 125206  T
Q  121 accccaatatcttacatcaataatcaccaatca 153  Q
    | |||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  125205 atcccaatatctcacatcaataatcatcaatca 125173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #9
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 24 - 157
Target Start/End: Original strand, 192768 - 192897
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacat--atacttacatcaa 120  Q
    |||||| |||||||||| ||||| ||| |||||||| ||||||   ||||||||| | |||||||||||||||     || ||||  |||||||||| |     
T  192768 acatcaacataatccaaataacagttatcatgaatatttcaatt--aacatcatgcatttgatcaataataat-----cacacattaatacttacattac 192860  T
Q  121 accccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatg 157  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||    
T  192861 accccaatatctcacatcaataatcatcaattacatg 192897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 210; Significance: 1e-115; HSPs: 98)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 24 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 21961440 - 21961053
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 122  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||   ||||||| |||| ||    
T  21961440 acatcatcataatccaaataacagttaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattcatatatcaatacttaaatcatac 21961341  T
Q  123 -cccaatatcttacatcaat-aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcac-----atatatc 215  Q
     ||||||| || |||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||  || ||| || | ||||||||||||||||| |||||||     | || ||    
T  21961340 tcccaatagctcacatcaattaatcaccaatcacatatatcatgaacaatcattaattcatagttattcatacacaatcaccaatcactaaacacatttc 21961241  T
Q  216 ---aataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcg 312  Q
       || ||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21961240 caaaacaagactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaaacatcg 21961141  T
Q  313 catgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaatctcaacacgactatgatg 400  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21961140 tatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaatctcaacacgactatgatg 21961053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 24 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 12838192 - 12837900
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaa- 121  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  12838192 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttatatcaaaa 12838093  T
Q  122 ccccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaataag 221  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  12838092 ccccaatagctcacatcaataatcaccaatcacatgtgttatgaacaaatatcaattcacaattattcatacacaatcaccaatcacatatatcaaaaag 12837993  T
Q  222 actcatgtcatgatatgcac--atatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcg 312  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12837992 actcatgtcatgatatgcacctatatcgacacatacatgcatgtggtaccaaatcacatcaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaaacatcg 12837900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 24 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 12901631 - 12901269
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatca-aa 121  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||  |||||          |||||||||||| ||    
T  12901631 acatcatcataatccaaataacagttaacatgaataatt-aattcaaacatcatgtacttgatcaatataaatat----------atacttacatcataa 12901543  T
Q  122 ccccaatatcttacatcaataa-tcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcac-----atatatc 215  Q
    ||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||| |||||| |||||||||| |||||||     | || ||    
T  12901542 ccctaatatctcacatcaataaatcaccaatcacatgtgtcatgaacaataatcaattcacagttattcgtacacaatcaccaatcaccaatcacatttc 12901443  T
Q  216 aat-aagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgca 314  Q
    ||  ||||||||||||||||||| ||| ||| ||| |||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  12901442 aaagaagactcatgtcatgatatacacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaaacatcgta 12901343  T
Q  315 tgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaatctcaac 388  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  12901342 tgtaatatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaatttcaac 12901269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 24 - 290
Target Start/End: Original strand, 44345057 - 44345333
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaat-aacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatac--------tta 114  Q
    |||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||| ||||||        |||    
T  44345057 acatcatcataatcaaaacaacagttaacatgaataattcaatataaacatcatgcatttgatcaataatgatattctcatatatatacatatatactta 44345156  T
Q  115 catcaaa-ccccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatata 213  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||| ||||||||| ||| || ||| |    
T  44345157 catcaaaaccccaatatctcacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatttccaattattcacacacaatcaccaaacatataca 44345256  T
Q  214 tcaataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  44345257 tcaataagactcatgtcatgatatgcacctattgacacatatatgcatgtggtaacaaatcacctcaaggtcgtcac 44345333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 24 - 291
Target Start/End: Original strand, 33738477 - 33738732
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaa- 121  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||              |||||||||||||||||     
T  33738477 acatcatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaata--------------catatacttacatcaaaa 33738562  T
Q  122 ccccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaataag 221  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  33738563 ccccaatatctcacatcaataatcaacaatcgcatgtgccatgagcaaatatcaattcacaattattcatacacaatcaccaatcacatacatcaataag 33738662  T
Q  222 actcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcact 291  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  33738663 actcatgtcatgatatgcatgtatcgacacatatatgcatgtggtaccaaatcaccttaaggtcgtcact 33738732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 24 - 216
Target Start/End: Original strand, 18166874 - 18167067
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 122  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||    
T  18166874 acattatcataatccaaataacaattaacatgaatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatatcaatacttacatcaaac 18166973  T
Q  123 cccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 216  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  18166974 cccaatatctcacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacaattattcatacacaatcaccaatcatatacatca 18167067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 216 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 8874162 - 8873978
Alignment:
Q  216 aataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcat 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||  ||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||    
T  8874162 aataagactcatgtcatgatatgcacttattgacaaataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaaacatcttat 8874063  T
Q  316 gtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaatctcaacacgactatgatg 400  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8874062 gtaagagttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccatttacaactacaatctcaacacgactatgatg 8873978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 24 - 216
Target Start/End: Original strand, 34393385 - 34393580
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaa- 121  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  34393385 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaaa 34393484  T
Q  122 -ccccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 216  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  34393485 accccaatatctcacatcaataatcaccaatcacatctgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaatcgccaatcacatatatca 34393580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 24 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 53909750 - 53909555
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 122  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |||||||| ||| |||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53909750 acatcatcataatccaaataatagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcatttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 53909651  T
Q  123 --cccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 216  Q
      |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  53909650 accccaatatctcacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatttatca 53909555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 24 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 16366624 - 16366361
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacat--atacttacatcaa 120  Q
    ||||||||||||||||| ||| | ||| |||||||| |||||| ||| |||||||   |||||||||||||||     || ||||  ||||||||||||     
T  16366624 acatcatcataatccaaataatagttagcatgaatatttcaatttaa-catcatgcgtttgatcaataataat-----cacacattaatacttacatcac 16366531  T
Q  121 accccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaataa 220  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||    
T  16366530 accctaatatctcacatcaataatcatcaatcaaatgtgtcatgaacaattatcaattcacaaatattcattcacaatcactaatcacatatatcaataa 16366431  T
Q  221 gactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 290  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16366430 gactcatgtcatgatatgcacctattgacacatatatgcatgtggtaccaaatctcctcaaggtcgtcac 16366361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 196 - 381
Target Start/End: Original strand, 14899948 - 14900136
Alignment:
Q  196 aatcatcaatcacatat-atcaataagactcatgtcatgatatgcacata--tcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactt 292  Q
    ||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  14899948 aatcatcaatcacatttcaccaataagactcatgtcatgatatgcacgtagttcgacacatatatgcatgtgataccaaatcacctcaaggtcgtcacct 14900047  T
Q  293 tcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaa 381  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14900048 ccgatgcaacaaaaacatcgtatgtaagatttcacatccgtcttacaaaatcaccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaa 14900136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 24 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 19699606 - 19699414
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 122  Q
    |||||| |||||||||| ||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||    
T  19699606 acatcaacataatccaaataacagttaacatgattatttcaatataaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatatcaatacttacatcaaac 19699507  T
Q  123 cccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatc 215  Q
    ||||||||||  ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19699506 cccaatatctcccattaataatcatcaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagctattcatacacaatcaccaatcacatatatc 19699414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 24 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 19710191 - 19709999
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 122  Q
    |||||| |||||||||| ||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||    
T  19710191 acatcaacataatccaaataacagttaacatgattatttcaatataaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatatcaatacttacatcaaac 19710092  T
Q  123 cccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatc 215  Q
    ||||||||||  ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19710091 cccaatatctcccattaataatcatcaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagctattcatacacaatcaccaatcacatatatc 19709999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 247 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 34197812 - 34197658
Alignment:
Q  247 gacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctc 346  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34197812 gacgcataaatgcatgtggtaccgaatcacctcaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaaacatcgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatctc 34197713  T
Q  347 cgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaa-tctcaacacgactatgatg 400  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  34197712 cgaagtaaaagagctcaacccttttacaactacaagactcaacatgactatgatg 34197658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 24 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 7134503 - 7134310
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 122  Q
    |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |   ||| |||||||||||    
T  7134503 acattatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattcccacatcaataattacatcaaac 7134404  T
Q  123 cccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 216  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  7134403 cccaatatcccacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacaattattcatacacaatcaccaatcatatacatca 7134310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 24 - 216
Target Start/End: Original strand, 8372607 - 8372800
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 122  Q
    |||| |||||||||||| ||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| || |   |||||||||||||||    
T  8372607 acattatcataatccaaataacagttaacaagaatatttcaatataaacatcatgcatttgatcaataataatattcccacatcaatacttacatcaaac 8372706  T
Q  123 cccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 216  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  8372707 cccaatatctcacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcatatacatca 8372800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 247 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 37958704 - 37958550
Alignment:
Q  247 gacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctc 346  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37958704 gacgcataaatgcatgtggtaccgaatcacctcaaggtcatcaccttcgatgcaacaaaaacatcgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatctc 37958605  T
Q  347 cgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaa-tctcaacacgactatgatg 400  Q
     |||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  37958604 tgaagtaaaagagctcaacccttttacaactacaagactcaacatgactatgatg 37958550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 24 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 15274663 - 15274470
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 122  Q
    |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||| | |||||||||||||| |||| || |   |||||||||||||||    
T  15274663 acattatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatttaaacatcatgcatttgatcaataataaaattcccacatcaatacttacatcaaac 15274564  T
Q  123 cccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 216  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||| ||| ||||    
T  15274563 cccaatatctcacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaagtatcaattcacagttattcatacacaattatcaatcatatacatca 15274470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 256 - 400
Target Start/End: Original strand, 27959563 - 27959708
Alignment:
Q  256 atgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaa 355  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27959563 atgcatgtggtaccgaatcacctcaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaaacatcgtatgtaagattttacacccgtcttacataatctccgaagtaaa 27959662  T
Q  356 agagttcaacccttttacaactacaa-tctcaacacgactatgatg 400  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  27959663 agagttcaacctttttacaactacaagactcaacatgactatgatg 27959708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 194 - 380
Target Start/End: Original strand, 109957 - 110143
Alignment:
Q  194 acaatcatcaatcacatatatcaa-taagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactt 292  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| |    
T  109957 acaatcaccaatcacatatatcaaataagactcatgttatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcacct 110056  T
Q  293 tcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactaca 380  Q
    ||||||  | ||| |||||| |||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  110057 tcgatgata-aaacacatcgtatgtaagggttcacacccgccttacataatctccgaagtaaaagagctcaacccttttacaactaca 110143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 251 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 12245895 - 12245745
Alignment:
Q  251 catacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaa 350  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  12245895 cataaatgcatgtggtaccgaatcacctcaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaaacatcgtatgtaagatttcacactcgtcttacataatcaccgaa 12245796  T
Q  351 gtaaaagagttcaacccttttacaactacaa-tctcaacacgactatgatg 400  Q
    ||||||||| | ||||||||||||| |||||  ||||||| ||||||||||    
T  12245795 gtaaaagagctaaacccttttacaaatacaagactcaacatgactatgatg 12245745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 24 - 216
Target Start/End: Original strand, 26678179 - 26678370
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 122  Q
    |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||   ||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||    
T  26678179 acattatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatt--aacatcatgcatttgatcaataataatattcccatatcaatacttacatcaaac 26678276  T
Q  123 cccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 216  Q
    |||||||| | ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  26678277 cccaatatgtcacatcaatattcacctatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcatatacatca 26678370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 24 - 290
Target Start/End: Original strand, 44054168 - 44054427
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatca-aa 121  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||| | ||||| |||  ||||||||||||||||||| |||  |||||          |||||||||||| ||    
T  44054168 acatcatcataatccaaataacagttaacataattaatttaattcaaacatcatgtacttgatcgatataaatat----------atacttacatcataa 44054257  T
Q  122 ccccaatatcttacatcaataa-tcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaataa 220  Q
     |||||||||| | |||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||| |   |||||    
T  44054258 tcccaatatctcatatcaataaatcaccagtcacatgtgtcatgaacaaacatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatttccaaataa 44054357  T
Q  221 gactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 290  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||  |||||||||||| ||||||    
T  44054358 gactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggccgtcac 44054427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 24 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 45460894 - 45460611
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcata--catatacttacatca- 119  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||   ||||||||| ||||     
T  45460894 acatcataataatccaaataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaatgataatattcacatatgtatatacttatatcat 45460795  T
Q  120 aaccccaatatcttacatcaataa-tcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacac--------aatcatcaatcacat 210  Q
    ||||||||||| | |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||        ||||| ||||||||     
T  45460794 aaccccaatatttcacatcaataattcatcaatcacatgtgtcatgaacaaacatcaattcacagttattcatacacaatcaccaaatcaccaatcacag 45460695  T
Q  211 atatca--ataagactcatgtcatgatatgcacata--tcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 290  Q
     | |||  ||||||||||||||||||| ||||| ||  ||||| | || ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  45460694 ttctcaacataagactcatgtcatgatgtgcacctagttcgacacgtatatgcatgcggtaccatatcacctcaaggtcgtcac 45460611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 251 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 15852959 - 15852829
Alignment:
Q  251 catacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaa 350  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    |||||||||||||||||||    
T  15852959 cataaatgcatgtggtaccgaatcacctcaaggtcgtcaccttcgatgcaaaaaaaacatcgtatgtaagatttcaccaaagtcttacataatctccgaa 15852860  T
Q  351 gtaaaagagttcaacccttttacaactacaa 381  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15852859 gtaaaagagctcaacccttttacaactacaa 15852829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 259 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 41167569 - 41167447
Alignment:
Q  259 catgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaaga 358  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  41167569 catgtggtaccgaatcacctcaaggtcgtcaccttcgatgtaacaaaaacatcgtatgtgagatttcacacccgtcttacataatcaccgaagtaaaaga 41167470  T
Q  359 gttcaacccttttacaactacaa 381  Q
    | |||||||||||||||| ||||    
T  41167469 gctcaacccttttacaaccacaa 41167447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 142 - 380
Target Start/End: Original strand, 15211762 - 15212004
Alignment:
Q  142 aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatc-aataagactcatgtcatgatatgca 240  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||| || || || |||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  15211762 aatcaccaattacatgtatcatgaacaaatatcaattcaaaaatactcattcacaatcaccaatcacaaatatcaaataagactcatgttatgatatgca 15211861  T
Q  241 catatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacc-tcaaggtcgtcactttcgatgcaacaa--aaacatcgcatgtaagatttcacacccgtctta 337  Q
    | ||| ||  |||| ||||||||||||||||||  ||   |||| |||||| |  |||| |||||   ||||||| |||||||  ||||| |||| ||||    
T  15211862 cttattgagacataaatgcatgtggtaccaaatatccaaaaaggacgtcacctctgatggaacaactcaacatcgtatgtaagggttcacccccgcctta 15211961  T
Q  338 cataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactaca 380  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15211962 cataatctctgaagtaaaagagctcaacccttttacaactaca 15212004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 24 - 290
Target Start/End: Original strand, 13244606 - 13244861
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacat--atacttacatcaa 120  Q
    |||||| |||||||||| ||||| ||| |||||||| ||||||   ||||||||| | |||||||||||||||     || ||||  ||||||||||||     
T  13244606 acatcaacataatccaaataacagttatcatgaatatttcaatt--aacatcatgcatttgatcaataataat-----cacacattaatacttacatcac 13244698  T
Q  121 accccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaataa 220  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||       ||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  13244699 acctcaatatctcacatcaataatcatcaatcacatg-------aacaattatcaattcacaaatattcattcacaatcaccaatcacatatatcaataa 13244791  T
Q  221 gactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 290  Q
    |||||||| |||||||| ||| ||| ||| |||| |||||||||| |||||||||  ||| |||||||||    
T  13244792 gactcatgccatgatatccacctattgacacatatatgcatgtgggaccaaatcatttcagggtcgtcac 13244861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 24 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 53706828 - 53706635
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacata--tacttacatcaa 120  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||| | |||||||||| |||      |||| ||   |||||||||||     
T  53706828 acatcatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcagtataaacatcatgcatttgatcaatagtaaa-----cataaattagtacttacatcac 53706734  T
Q  121 accccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatc-aatcacatatatcaat 218  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||    
T  53706733 accccaatatctcacatcaataatcatcaatcacatgtatcatgaacaattatcaattcacaattattcattcacaatcaccaaatcacatatatcaat 53706635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 24 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 13811558 - 13811287
Alignment:
Q  24 acatcatcataatcca-ataacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaa-taataatattctcatacatatacttacatca-a 120  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||| ||||| ||||||||| |  ||| | || | |||  || |    
T  13811558 acatcatcataatccacataacaattaacatgaataattcaattcaaatatcatgtacttaatcaaataataatatccaaatataaattcatac--cata 13811461  T
Q  121 accccaatatcttacatcaat-aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatat-atcaat 218  Q
    | |||||||||||||||| || |||||||||||||| |||| ||||||||  |||||  |||| |||||||| |||||||| || || ||| | | ||||    
T  13811460 atcccaatatcttacatccattaatcaccaatcacacgtgtaatgaacaatcatcaaatcacatttattcatgcacaatcaacattcgcatttcaccaat 13811361  T
Q  219 aagactcatgtcatgatatgcacata--tcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 290  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||  ||||| |||| |||||||||||||||  |||| |||||||||||||    
T  13811360 aagactcatgtcatgatgtgcacctagttcgacacatatatgcatgtggtaccatttcacttcaaggtcgtcac 13811287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 24 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 30236411 - 30236147
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatca-aa 121  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||||||||||         || ||||||||| |||| ||    
T  30236411 acatcatcataatccaaataacagttaacatgaataattcaattcagacatcatgtacctgatcaataata---------tatatatacttatatcataa 30236321  T
Q  122 ccccaatatcttacatcaataa-tcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca--at 218  Q
    |  |||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  |  ||| |||| ||||||||||||| ||| ||||||||  | |||  ||    
T  30236320 ctgcaatatctcacatcaataaatcaccaattacatgtgtcatgaacaatcaataattcacagttattcatacacagtcaccaatcacaattctcaacat 30236221  T
Q  219 aagactcatgtcatgatatgcacata--tcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 290  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||  | ||| |||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  30236220 aagactcatgtcatgatgtgcacctaatttgacacatatatggatgtggtaccatatcacctcaaggtcgtcac 30236147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 24 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 22356616 - 22356424
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaa-a 121  Q
    |||| |||||||||||| ||||| ||||||  |||| ||||||   ||||||||| | ||||||||||| |||| || ||||   |||||| |||||| |    
T  22356616 acattatcataatccaaataacagttaacaataatatttcaatt--aacatcatgcatttgatcaataaaaatactcacataacaatacttgcatcaaga 22356519  T
Q  122 ccccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 216  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||| |||||| ||| ||||    
T  22356518 ccccaatatctcacatcaataatcaccaatcatatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacgatcaccaatcatatacatca 22356424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 24 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 20813890 - 20813715
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatca-aa 121  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||   | |||  ||||||||| |||| ||    
T  20813890 acatcatcataatccaaataatagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataat-attcacacatgtatatacttatatcataa 20813792  T
Q  122 ccccaatatcttacatcaataa-tcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaa 197  Q
     |||||||| | |||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||    
T  20813791 tcccaatatttcacatcaataattcattaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcatagttattcatacacaa 20813715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 24 - 205
Target Start/End: Original strand, 47355509 - 47355688
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaataacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatca-aac 122  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||| || ||| | ||||||    |||| ||| | ||||||||||| ||||||| ||||   |||||||||||| |||    
T  47355509 acattatcataatccaataacagttatcacgaacatttcaatt---acatgatgcatttgatcaataaaaatattcacataacaatacttacatcagaac 47355605  T
Q  123 cccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaat 205  Q
    |||||||||| |||| |||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  47355606 cccaatatctcacattaataatcatctatcacatgtgtcataaacaaatatcaattcacagttattcatacataatcatcaat 47355688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 202 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 53909519 - 53909431
Alignment:
Q  202 caatcacatatatcaataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  53909519 caatcacatatatcaataagactcatgtcatgatatgcacctattgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcagggtcgtcac 53909431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 216 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 41258031 - 41257842
Alignment:
Q  216 aataagactcatgtca---tgatatgcacatat--cgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacat 310  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||| ||   |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||| ||    
T  41258031 aataagactcatgtcaacatgatatgcacctagtccgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcacccatgatgcaacaaaaatat 41257932  T
Q  311 cgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacc-cttttacaactacaa-tctcaacacgactatgatg 400  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||| |||||  || || |||||||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  41257931 catatgtaagatttcacacccgtcttacattatcactgaagtagaagag--caccctcttttacaactacaagactcaacatgactatgatg 41257842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 246 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 5372342 - 5372228
Alignment:
Q  246 cgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatct 345  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||| |||     
T  5372342 cgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaagatcgtcacccatgatgcaacaaaaacatcatatgtaagacttcacacccgtcttacattatca 5372243  T
Q  346 ccgaagtaaaagagt 360  Q
    |||||||||||||||    
T  5372242 ccgaagtaaaagagt 5372228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 246 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 10239081 - 10238967
Alignment:
Q  246 cgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatct 345  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||| |||     
T  10239081 cgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcacacatgatgcaacaaaaacatcatatgtaaaatttcacacccgtcttacattatca 10238982  T
Q  346 ccgaagtaaaagagt 360  Q
    || ||||||||||||    
T  10238981 ccaaagtaaaagagt 10238967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 24 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 18294746 - 18294600
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 122  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||| |||| ||| ||||||  ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||   |||||||||| |||     
T  18294746 acatcatcataatccaaataacagttagcatggatatttcaattcaaatatcatctacttgatcaataataatattctcatatcaatacttacattaaat 18294647  T
Q  123 cccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaa 169  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||   ||||||||||    
T  18294646 cccaatatctcacatcaataatcaccgatcacataaatcatgaacaa 18294600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 251 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 47469976 - 47469867
Alignment:
Q  251 catacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaa 350  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  47469976 catatatgcatgtggtaccaaataaccccaaggtcgtcacccatgatgcaacaaaaacatcatatgtaagatttcacacccgtcttacattatcaccgaa 47469877  T
Q  351 gtaaaagagt 360  Q
    ||||||||||    
T  47469876 gtaaaagagt 47469867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 224 - 376
Target Start/End: Original strand, 16521294 - 16521447
Alignment:
Q  224 tcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaa--aacatcgcatgtaaga 321  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||| |||| |||||||||||||||||||  |  ||||||||||| | ||||| | |||   ||||||| |||||||     
T  16521294 tcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatcttcaaaaggtcgtcacctccgatgga-caagccaacatcgtatgtaagg 16521392  T
Q  322 tttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaac 376  Q
     ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16521393 gttcacccccgccttacataatctccgaagtaaaagagctcaacccttttacaac 16521447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 194 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 5684586 - 5684404
Alignment:
Q  194 acaatcatcaatcacatatatcaat-aagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtca-ct 291  Q
    |||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||| ||||||||| |  ||||||||||| ||    
T  5684586 acaatcatcaatcacatacatcatttaagactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtgataccaaatctcaacaaggtcgtcacct 5684487  T
Q  292 ttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttac-ataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttaca 374  Q
    |||||||| ||    |||||| |||||||   ||||||| | ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  5684486 ttcgatgccacttgcacatcgtatgtaaggactcacacctgccttacaataatct-cgaagtaaaagagctcaactcttttaca 5684404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 246 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 50223806 - 50223696
Alignment:
Q  246 cgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatct 345  Q
    |||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    |||||||||||||||||  |||| |||||||| ||||||||||||| |||     
T  50223806 cgacacatatatgcatgtgataccaaatcacctcaaggtcatcacccatgatgcaacaaaaacatcatatgttagatttcatacccgtcttacattatca 50223707  T
Q  346 ccgaagtaaaa 356  Q
    |||||||||||    
T  50223706 ccgaagtaaaa 50223696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 198 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 43283138 - 43283043
Alignment:
Q  198 tcatcaatcacatat-atcaataagactcatgtcatgatatgcacata--tcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 290  Q
    ||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  43283138 tcatcaatcacatttcaccaataagactcatgtcatgatatgcacctagttcgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacttcaaggtcgtcac 43283043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 24 - 216
Target Start/End: Original strand, 15211515 - 15211698
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacat--atacttacatcaa 120  Q
    |||| |||||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||     ||||||||  ||||||||||||     
T  15211515 acattatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataa-----tcatacattcatacttacatcac 15211609  T
Q  121 accccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 216  Q
    ||| |||||||| ||||||||| ||| ||||||        |||||||| ||||||| | ||| |||||||  ||||||| ||||||||| |||||    
T  15211610 acctcaatatctcacatcaatattcatcaatca-------tatgaacaattatcaattcgcaaatattcattaacaatcaccaatcacatttatca 15211698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 24 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 8874346 - 8874265
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcata 104  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||| |||| ||||||    
T  8874346 acatcatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatataaacatcatgcatttgatcaataatgatatcctcata 8874265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 194 - 290
Target Start/End: Original strand, 10642586 - 10642683
Alignment:
Q  194 acaatcatcaatcacatatatcaat-aagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 290  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||    
T  10642586 acaatcaccaatcacatttatcaaacaagactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcac 10642683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 197 - 374
Target Start/End: Original strand, 19999005 - 19999183
Alignment:
Q  197 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtca-ctttc 294  Q
    |||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||| ||| |    
T  19999005 atcaccaatcacatatttcacataagactcatgttatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcaccttcc 19999104  T
Q  295 gatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttac-ataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttaca 374  Q
    ||||| ||    |||||| |||||||   ||||||| | ||||| ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  19999105 gatgccacttgcacatcgtatgtaagggctcacacctgccttacaataatct-cgaagtaaaagag-tcatcccttttaca 19999183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 142 - 198
Target Start/End: Original strand, 34393610 - 34393666
Alignment:
Q  142 aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaat 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  34393610 aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaat 34393666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 221 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 52267196 - 52267125
Alignment:
Q  221 gactcatgtcatgatatgcacata--tcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 290  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  52267196 gactcatgtcatgatatgcacctagttcgacacatacatgcatgtggtaccaaatcacttcaaggtcgtcac 52267125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 184 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 53706591 - 53706515
Alignment:
Q  184 ttattcatacacaatcatcaatcacatatatcaataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgca 260  Q
    ||||||| ||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||    
T  53706591 ttattcacacacaatcaccaaacacaaatatcaataagactcatgtcatgatatgcacctatcgacacatatatgca 53706515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 106 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 55378646 - 55378542
Alignment:
Q  106 atatacttacatca-aaccccaatatcttacatcaat-aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatca 203  Q
    |||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||| |||||||||||  |||||||||||||||  |||||  ||||| |||||||||||||||||||    
T  55378646 atatacttacatcataattccaatatctcacatcaattaatcaccaatcttatgtgtcatgaacaatcatcaaatcacaaatattcatacacaatcatca 55378547  T
Q  204 atcac 208  Q
    |||||    
T  55378546 atcac 55378542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 142 - 209
Target Start/End: Original strand, 8372854 - 8372921
Alignment:
Q  142 aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcaca 209  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  8372854 aatcaccaatcacatgtatcaggaacaaatatcaattcacaaatattcattcacaatcatcaatcaca 8372921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 142 - 209
Target Start/End: Original strand, 18167097 - 18167164
Alignment:
Q  142 aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcaca 209  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||| ||||||||    
T  18167097 aatcaccaatcacatgtatcatgaacaaatatcaattcacaaatattcattcacaatcaccaatcaca 18167164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 24 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 18496334 - 18496065
Alignment:
Q  24 acatcatcataatcca-ataacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatca-ataataatattctcatacatatacttacatca-a 120  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||| |||| |||||| | || |||  ||||||||||   || | ||||| | | | || |    
T  18496334 acatcatcataatccatataacaaataacatgaatagttcaatttaaatatcatgcatttaatccgataataatat---cacaaatatattcataccata 18496238  T
Q  121 accccaatatcttacatcaat-aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatat-atcaat 218  Q
    | | |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||  |||| ||||| || |||| |||||| ||| || | | || |    
T  18496237 atctcaatatctcacatcaattaatcaccaatcacatgtttcatgaataatcatcaaatcacatttatttatgcacagtcatcactcatatttcaccatt 18496138  T
Q  219 aagactcatgtcatgatatgcacata-tcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 290  Q
    || |||||||||||||| ||||| || | ||| |||| |||||||||||||||  |||| |||||||||||||    
T  18496137 aaaactcatgtcatgatgtgcacctagttgacacatatatgcatgtggtaccatttcacttcaaggtcgtcac 18496065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 204 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 54119976 - 54119906
Alignment:
Q  204 atcacatatatcaataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatc 274  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||| |||| |||||| ||||||||||||    
T  54119976 atcacatatatcaataagactcatgccatgatatgcacctattgacacatatatgcatctggtaccaaatc 54119906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 142 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 7134208 - 7134088
Alignment:
Q  142 aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaataagactcatgtcatgatatgcac 241  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||| ||||| ||||||| | ||| || ||||||||| |   |||| |||||||||||||||||||||    
T  7134208 aatcaccaatcacatgtatcaggaataaatatcaattcacaaatattcattcgcaa-caccaatcacatttccaaatatgactcatgtcatgatatgcac 7134110  T
Q  242 atatcgacgcatacatgcatgt 263  Q
     ||| ||| |||| ||||||||    
T  7134109 ttattgacacataaatgcatgt 7134088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 24 - 157
Target Start/End: Original strand, 9293712 - 9293843
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacat--atacttacatcaa 120  Q
    |||| |||||||||||| |||||  ||||||| ||| ||||| |||||||||||| | |||||||||||||||     || ||||  ||||||||||||     
T  9293712 acattatcataatccaaataacagataacatggatatttcaacataaacatcatgcatttgatcaataataat-----cacacattaatacttacatcac 9293806  T
Q  121 accccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatg 157  Q
    | |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  9293807 atcccaatatctcacatcaataatcatcaatcacatg 9293843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 194 - 290
Target Start/End: Original strand, 9293924 - 9294021
Alignment:
Q  194 acaatcatcaatcacatatatcaat-aagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 290  Q
    ||||||| ||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||    
T  9293924 acaatcaccaatcacatttatgaaacaagactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcac 9294021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 24 - 157
Target Start/End: Original strand, 10642374 - 10642505
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacat--atacttacatcaa 120  Q
    |||| |||||||||||| |||||  ||||||||||| ||||| |||||| ||||| | |||||||||||||||     || ||||  ||||||||||||     
T  10642374 acattatcataatccaaataacagataacatgaatatttcaacataaacctcatgcatttgatcaataataat-----cacacattaatacttacatcac 10642468  T
Q  121 accccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatg 157  Q
    | |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  10642469 atcccaatatctcacatcaataatcatcaatcacatg 10642505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 195 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 22356244 - 22356065
Alignment:
Q  195 caatcatcaatcacatatatcaataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtca-cttt 293  Q
    |||||| ||||||||| |   |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||  ||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||| ||||    
T  22356244 caatcaccaatcacattttcaaatatgactcatgtcatgatatgcacttattgacaaataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcaccttt 22356145  T
Q  294 cgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttac-ataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttaca 374  Q
    |||||| ||    |||||| |||||||   ||||||| | ||||| ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  22356144 cgatgccacttgcacatcgaatgtaagggctcacacctgccttacaataatct-cgaagtaaaagag-tcatcccttttaca 22356065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 197 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 15138238 - 15138134
Alignment:
Q  197 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtca-ctttc 294  Q
    |||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |  ||||||| ||| |||||    
T  15138238 atcaccaatcacatatttcacataagactcatgttatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcatcacctttc 15138139  T
Q  295 gatgc 299  Q
    |||||    
T  15138138 gatgc 15138134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 24 - 216
Target Start/End: Original strand, 19998517 - 19998700
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 122  Q
    |||| |||||||||||| ||||| | |||||  ||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | | |||    ||||| |||||| ||    
T  19998517 acattatcataatccaaataacagtcaacatagatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataat-tacacat--taatactcacatcacac 19998613  T
Q  123 cccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 216  Q
    |||||||||| ||||||||| ||| ||||||        |||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||    
T  19998614 cccaatatctcacatcaatattcatcaatca-------tatgaacaattatcaatttacaattattcattcacaatcaccaatcacatttatca 19998700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 197 - 299
Target Start/End: Original strand, 26678522 - 26678626
Alignment:
Q  197 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtca-ctttc 294  Q
    |||| ||||||||||| ||| ||||||||| ||| ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||| |||||    
T  26678522 atcaccaatcacatatttcacataagactcgtgttatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcatctttc 26678621  T
Q  295 gatgc 299  Q
    |||||    
T  26678622 gatgc 26678626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 197 - 299
Target Start/End: Original strand, 47355803 - 47355907
Alignment:
Q  197 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtca-ctttc 294  Q
    |||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||| || ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||| |||||    
T  47355803 atcaccaatcacatatttcacataagactcatgttatgatatgaacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttc 47355902  T
Q  295 gatgc 299  Q
    |||||    
T  47355903 gatgc 47355907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 146 - 209
Target Start/End: Original strand, 26678428 - 26678491
Alignment:
Q  146 accaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcaca 209  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  26678428 accaatcacatgtatcaggaacaaatatcaattcacaaatattcattcacaatcatcaatcaca 26678491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 197 - 274
Target Start/End: Original strand, 8372951 - 8373029
Alignment:
Q  197 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatc 274  Q
    |||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| |||| |||||||||||||||||||    
T  8372951 atcaccaatcacatatttcacataagactcatgttatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatc 8373029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 197 - 290
Target Start/End: Original strand, 14994678 - 14994772
Alignment:
Q  197 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 290  Q
    |||| |||||||| || ||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||    
T  14994678 atcaccaatcacaaatttcacataagactcatgttatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcac 14994772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 197 - 274
Target Start/End: Original strand, 18167195 - 18167273
Alignment:
Q  197 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatc 274  Q
    |||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| ||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  18167195 atcaccaatcacatatgtcacataagactcatgttatgatttgcacttattgacgcataaatgcatgtggtaccaaatc 18167273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 197 - 290
Target Start/End: Original strand, 18246668 - 18246762
Alignment:
Q  197 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 290  Q
    |||| ||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  18246668 atcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcac 18246762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 142 - 208
Target Start/End: Original strand, 19998907 - 19998973
Alignment:
Q  142 aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcac 208  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||| |||||||    
T  19998907 aatcaccaatcacatgtatcaggaacaaatatcaattcacaaatattcattcacaatcaccaatcac 19998973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 334 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 25120663 - 25120617
Alignment:
Q  334 cttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactaca 380  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25120663 cttacataatctccgaagtaaaagagctcaacccttttacaactaca 25120617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 194 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 15274442 - 15274361
Alignment:
Q  194 acaatcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatc 274  Q
    ||||||| |||||||| || ||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| |||| |||||||||||||||||||    
T  15274442 acaatcaccaatcacaaatttcacataagactcatgttatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatc 15274361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 142 - 207
Target Start/End: Original strand, 19998780 - 19998845
Alignment:
Q  142 aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatca 207  Q
    |||||||||| |||||| ||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  19998780 aatcaccaattacatgtatcaggaacaaatatcaattcacaaatattcatacacaatcaccaatca 19998845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 141 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 13751978 - 13751910
Alignment:
Q  141 taatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcaca 209  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||| |||||||| |||||||| ||||||||    
T  13751978 taatcaccaatcacatatgtcatgaacaagtatcaaatcacatttattcatgcacaatcaccaatcaca 13751910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 24 - 95
Target Start/End: Original strand, 18246178 - 18246250
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataat 95  Q
    |||| |||||||||||| |||||  ||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18246178 acattatcataatccaaataacagataacatgaatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataat 18246250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 142 - 206
Target Start/End: Original strand, 47355705 - 47355769
Alignment:
Q  142 aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatc 206  Q
    |||||||||||| |||| ||| |||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  47355705 aatcaccaatcatatgtatcaggaacaaatatcaattcacaaatattcattcacaatcatcaatc 47355769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 144 - 270
Target Start/End: Original strand, 7848776 - 7848902
Alignment:
Q  144 tcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaa-taagactcatgtcatgatatgcaca 242  Q
    |||||||||||||| ||| | |||||||| |||  ||||| |||||  ||||||||| || ||||| || |||| | ||| ||||||||||||||||||     
T  7848776 tcaccaatcacatgggtcctaaacaaataccaaaccacaactattcgcacacaatcaccactcaca-atttcaaatgagattcatgtcatgatatgcacc 7848874  T
Q  243 tatcgacgcatacatgcatgtggtacca 270  Q
    ||| ||| |||| |||||||||||||||    
T  7848875 tattgacacatatatgcatgtggtacca 7848902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 24 - 216
Target Start/End: Original strand, 16520801 - 16520985
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaa-catcatgtacttgatcaataataatattctcatacat--atacttacatca 119  Q
    |||||||||||||| || ||| | |||||||| ||| |||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||     ||| ||||  ||||||||||||    
T  16520801 acatcatcataatctaaataatagttaacatggatatttcaatttaaaacatcatgcacttgatcaataataa-----tcacacattaatacttacatca 16520895  T
Q  120 aaccccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 216  Q
     ||||| |||||||||||| ||| ||| ||||||        |||||||| |||||||  |||| ||||||| |||||||| ||||||||| |||||    
T  16520896 caccccgatatcttacatctatattcatcaatca-------tatgaacaattatcaatttacaaatattcattcacaatcaccaatcacatttatca 16520985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 24 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 54120195 - 54120066
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaat-aacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacat--atacttacatcaa 120  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||   ||||||||| | | |||||||||||||     || ||||  ||||||||||||     
T  54120195 acatcaacataatccaattaacaattaacatggatatttcaatt--aacatcatgcattcgatcaataataat-----cacacattaatacttacatcac 54120103  T
Q  121 accccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatg 157  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  54120102 acctcaatatctcacatcaataatcatcaatcacatg 54120066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 31 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 55378757 - 55378691
Alignment:
Q  31 cataatccaataacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatat 97  Q
    ||||||||||||||  |||||||| ||| |||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  55378757 cataatccaataactgttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttaatcaataataatat 55378691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 363 - 400
Target Start/End: Original strand, 34393690 - 34393727
Alignment:
Q  363 aacccttttacaactacaatctcaacacgactatgatg 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34393690 aacccttttacaactacaatctcaacacgactatgatg 34393727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 197 - 299
Target Start/End: Original strand, 14950498 - 14950602
Alignment:
Q  197 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtca-ctttc 294  Q
    |||| ||||||| ||| ||| ||| ||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||| |||||    
T  14950498 atcaccaatcacgtatttcacataggactcatgatatgatatgcacttattgacccataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttc 14950597  T
Q  295 gatgc 299  Q
    |||||    
T  14950598 gatgc 14950602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 108 - 209
Target Start/End: Original strand, 109828 - 109922
Alignment:
Q  108 atacttacatcaaaccccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatca 207  Q
    |||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||       ||||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||||  ||||||    
T  109828 atacttacatcacacccccatatctcacatcaataatcatcaatca-------catgaacaattatcaattcacaaatattcattcacaatcgccaatca 109920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 230 - 290
Target Start/End: Original strand, 15043381 - 15043443
Alignment:
Q  230 catgatatgcacata--tcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 290  Q
    |||||||||||| ||  ||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15043381 catgatatgcacctagttcgacacatatatgcatgtggtaccaaatgacctcaaggtcgtcac 15043443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 230 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 15111043 - 15110981
Alignment:
Q  230 catgatatgcacata--tcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 290  Q
    |||||||||||| ||  ||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15111043 catgatatgcacctagttcgacacatatatgcatgtggtaccaaatgacctcaaggtcgtcac 15110981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 142 - 207
Target Start/End: Original strand, 16521015 - 16521080
Alignment:
Q  142 aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatca 207  Q
    |||||||||| |||||| ||||||| ||  ||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16521015 aatcaccaattacatgtatcatgaataatcatcaattaacaattattcatacacaatcaccaatca 16521080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 234 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 53706521 - 53706465
Alignment:
Q  234 atatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 290  Q
    |||||||| ||||||| |||| ||||||||||||| | ||||||||| |||||||||    
T  53706521 atatgcacctatcgacacatatatgcatgtggtactagatcacctcagggtcgtcac 53706465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 160 - 254
Target Start/End: Original strand, 16521168 - 16521263
Alignment:
Q  160 tcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaataagac-tcatgtcatgatatgcacatatcgacgcata 254  Q
    |||||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||||  ||||||||| |   |||||| | |||||||||||||||||| ||| ||| ||||    
T  16521168 tcatgaacaattatcaattcacaaatattcattcacaatctccaatcacatttcaaaataagccatcatgtcatgatatgcacttattgacacata 16521263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 197 - 290
Target Start/End: Original strand, 10487149 - 10487243
Alignment:
Q  197 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 290  Q
    |||| ||||||||||  ||| ||| ||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||| ||||||||||| |  ||||||||||||    
T  10487149 atcaccaatcacataattcacatatgactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgcggtaccaaatctcaacaaggtcgtcac 10487243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 197 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 16329602 - 16329508
Alignment:
Q  197 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 290  Q
    |||| ||||||||||  ||| ||| ||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||| ||||||||||| |  ||||||||||||    
T  16329602 atcaccaatcacataattcacatatgactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgcggtaccaaatctcaacaaggtcgtcac 16329508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 317 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 17213420 - 17213378
Alignment:
Q  317 taagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagag 359  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||    
T  17213420 taagatttcacacccgtcttacattttcgccgaagtaaaagag 17213378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 142 - 216
Target Start/End: Original strand, 18246391 - 18246465
Alignment:
Q  142 aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 216  Q
    |||||||||| || ||| |||| || |||||||||| |||| |||||||||||| |||| |||||| ||| ||||    
T  18246391 aatcaccaattacttgtatcataaataaatatcaatccacagttattcatacacgatcaccaatcatatacatca 18246465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 314 - 360
Target Start/End: Original strand, 24237479 - 24237525
Alignment:
Q  314 atgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagt 360  Q
    |||||||||||||| | |||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  24237479 atgtaagatttcacgcacgtcttacattatcgccgaagtaaaagagt 24237525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 124 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 43283185 - 43283140
Alignment:
Q  124 ccaatatcttacat-caataatcaccaatcacatgtgtcatgaaca 168  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  43283185 ccaatatcttacattcaacaatcaccaatcacatatgtcatgaaca 43283140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 29 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 5684802 - 5684742
Alignment:
Q  29 atcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaa 88  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||| | |||  ||||||||||| ||||||||||    
T  5684802 atcataatccaaataacagttaacatgaatattacaaattaaacatcatgcacttgatcaa 5684742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 197 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 13049843 - 13049739
Alignment:
Q  197 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtca-ctttc 294  Q
    |||| ||||||||||  ||| ||| ||||||||  ||||||||||| ||| |||  ||| ||||||| ||||||||||| |  ||||||||||| |||||    
T  13049843 atcaccaatcacataattcacataggactcatgctatgatatgcacttatggacatataaatgcatgcggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttc 13049744  T
Q  295 gatgc 299  Q
    |||||    
T  13049743 gatgc 13049739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 246 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 17377084 - 17377040
Alignment:
Q  246 cgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 290  Q
    |||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17377084 cgacacatatatgaatgtggtaccaaatcacctcaaggtcatcac 17377040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 208; Significance: 1e-114; HSPs: 1)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 24 - 400
Target Start/End: Original strand, 59865 - 60250
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 122  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| | || | | ||||||| |||| |     
T  59865 acatcatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatatccacaaata-atacttatatcatat 59963  T
Q  123 -cccaatatcttacatcaata-atcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcac-----atatatc 215  Q
     |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||| ||||||||||||||||| |||||||     | || ||    
T  59964 tcccaatatctcacatcaatacatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaacattaattcacagttattcatacacaatcaccaatcaccaatcacatttc 60063  T
Q  216 --aataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgc 313  Q
      |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  60064 caaataagactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaaacatcgt 60163  T
Q  314 atgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaatctcaacacgactatgatg 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  60164 atgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaatatcaacacgaatatgatg 60250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 208; Significance: 1e-114; HSPs: 73)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 24 - 400
Target Start/End: Original strand, 35053141 - 35053515
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 122  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||          |||||    
T  35053141 acatcatcataattcaaataacagttaacatgaatatttcaatttaaacaccatgtacttgatcaataataacattctcatacat----------caaac 35053230  T
Q  123 cccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaa-------tcacatatatc 215  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||       |||||| |       
T  35053231 cacaatatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaaacatcaattcacaattattcatacacaatcaccaaacaccattcacatttcca 35053330  T
Q  216 aataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcat 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  35053331 aataagactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaaacatcgtat 35053430  T
Q  316 gtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaatctcaacacgactatgatg 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35053431 gtaagatttcacacccgtcttacataatctcataagtaaaagagttcaacccttctacaactacaatctcaacacgactatgatg 35053515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 24 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 22408162 - 22407894
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaa- 121  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  22408162 acatcatcataatccaaataacaattaacatgaatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatatatatacttacatcaaaa 22408063  T
Q  122 ccccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaataag 221  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22408062 ccccaatatctcacattaataatcaccaatcacatgtgtcatgagcaaatatcaattcacaattattcacacacaatcaccaatcacatatatcaataag 22407963  T
Q  222 actcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 290  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22407962 acttatgtcatgatatgcacatatcgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 22407894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 24 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 2422997 - 2422733
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 122  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||    
T  2422997 acatcaacataatccaaataacaattaacatggatatttcaatataaacatcatacacttgatcaataata---ttctcatacatatacttacatcaaac 2422901  T
Q  123 cccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaataaga 222  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |   |||||||    
T  2422900 cccaatatctcacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacaattattcatacacaatcaccaatcacatttccaaataaga 2422801  T
Q  223 ctcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 290  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2422800 ctcatgtcatgatatgcacctattgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaagtcgtcac 2422733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 142 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 5676355 - 5676091
Alignment:
Q  142 aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaat-------cacatatatcaataagactcatgtcatga 234  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||       ||||| |   |||||||||||||||||||    
T  5676355 aatcaccaatcacatgtgtcatga-caaatatcaatacataattattcatacacaatcaccaattaccaatcacatttccaaataagactcatgtcatga 5676257  T
Q  235 tatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtc 334  Q
    ||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5676256 tatgcacttattgactcataaatgcatgtggtaccgtatcacctcaaggtcgtcaccttcaatgcaacaaaaacatcgtatgtaagatttcacacccgtc 5676157  T
Q  335 ttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaatctcaacacgactatgatg 400  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5676156 ttacataatctctgaagtaagagagttcaacccttttacaactacaatctcaacacgactatgatg 5676091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 24 - 216
Target Start/End: Original strand, 41217544 - 41217739
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaa- 121  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  41217544 acatcatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcataaatatacttacatcaaaa 41217643  T
Q  122 -ccccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 216  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  41217644 accccaatatctcacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatca 41217739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 24 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 5676535 - 5676350
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 122  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| |||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5676535 acatcatcataatccaaataatagttaacatgaatatttcattataaacatcatgcatttgatcaataataatattctcatgcatatacttacatcaaac 5676436  T
Q  123 cccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcac 208  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5676435 cccaatatctcacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaattatcaatacacaattattcatacacaatcaccaatcac 5676350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 219 - 400
Target Start/End: Original strand, 41217945 - 41218126
Alignment:
Q  219 aagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgta 318  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||   ||| || |||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  41217945 aagactcatgtcatgatatgcacctatcgatagatatatacatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaaacatcgtatgta 41218044  T
Q  319 agatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaatctcaacacgactatgatg 400  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41218045 agagttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaatagttcaacccttttacaactacaatctcaacacgactatgatg 41218126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 194 - 400
Target Start/End: Original strand, 20444214 - 20444420
Alignment:
Q  194 acaatcatcaatcacatatatcaataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcacttt 293  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| ||    
T  20444214 acaatcaccaatcacatatatcaataagactcatgccatgatatgcacctattgacacatatatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcacctt 20444313  T
Q  294 cgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaatctcaacacgac 393  Q
    ||||| | |||| |||||  |||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20444314 cgatgaatcaaacacatcttatgtaagggttcacacccgccttacataatctccgaagtaaaagagctcaacccttttacaactacaatctcaacacgac 20444413  T
Q  394 tatgatg 400  Q
    |||||||    
T  20444414 tatgatg 20444420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 24 - 215
Target Start/End: Original strand, 20252342 - 20252534
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 122  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||   |||||||||||||||    
T  20252342 acatcatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatataaacatcatgcacttgatcaataataatattatcatatcaatacttacatcaaac 20252441  T
Q  123 cccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatc 215  Q
    |||||||||| |||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20252442 cccaatatctcacattaataatcatcaatcacatgtatcatgaacgaatatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatc 20252534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 194 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 37846162 - 37845956
Alignment:
Q  194 acaatcatcaatcacatatatcaataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcacttt 293  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| ||    
T  37846162 acaatcaccaatcacatatatcaataagactcatgccatgatatgcacctattgacacatatatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcacctt 37846063  T
Q  294 cgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaatctcaacacgac 393  Q
    ||||| | |||| |||||| |||||||  |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||| |||    
T  37846062 cgatgaatcaaacacatcgtatgtaagggttcacacccgccttacataatctctgaagtaaaagagctcagcccttttacaactacaatttcaacatgac 37845963  T
Q  394 tatgatg 400  Q
    |||||||    
T  37845962 tatgatg 37845956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 194 - 400
Target Start/End: Original strand, 20529978 - 20530185
Alignment:
Q  194 acaatcatcaatcacatatatcaataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcact-t 292  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||  || |||||| |  |    
T  20529978 acaatcaccaatcacatatatcaataagactcatgccatgatatgcacctattgacacatatatgcatgtggtaccaaatctccaaaacgtcgtccccct 20530077  T
Q  293 tcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaatctcaacacga 392  Q
    |||||| | |||| |||||  |||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20530078 tcgatgaatcaaacacatcttatgtaagggttcacacccgccttacataatctccgaagtaaaagagctcaacccttttacaactacaatctcaacacga 20530177  T
Q  393 ctatgatg 400  Q
    ||||||||    
T  20530178 ctatgatg 20530185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 152 - 290
Target Start/End: Original strand, 49966013 - 49966151
Alignment:
Q  152 cacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgc 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  49966013 cacatgtgtcatgaacaaatatcaatttccaattattcatacacaatcaccaatcacatatatcaataagactcatgtcatgatatgcacctatcgacac 49966112  T
Q  252 atacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 290  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49966113 atatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 49966151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 251 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 38035260 - 38035130
Alignment:
Q  251 catacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaa 350  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  38035260 cataaatgcatgtggtaccgaatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaaaacatcgtatgtaagatttcacacccgttttacataatctccgaa 38035161  T
Q  351 gtaaaagagttcaacccttttacaactacaa 381  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  38035160 gtaaaagagctcaacccttttacaactacaa 38035130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 256 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 13378395 - 13378250
Alignment:
Q  256 atgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaa 355  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13378395 atgcatgtggtaccgaatcacctcaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaaacatcgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatcaccgaagtaaa 13378296  T
Q  356 agagttcaacccttttacaactacaa-tctcaacacgactatgatg 400  Q
    |||| | |||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  13378295 agagcttaacccttttacaactacaagactcaacatgactatgatg 13378250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 24 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 9786315 - 9786123
Alignment:
Q  24 acatcatcataatcca-ataacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 122  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||| | ||||  |||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |    
T  9786315 acatcatcataatccacataacagttaacatgaacatttcatcataaacatcatacacttgatcaataataatatcctcatacatgtacttacatcaa-c 9786217  T
Q  123 cccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 216  Q
    |||||| ||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| | | |||||||||||||    
T  9786216 cccaatgtctcacatcaataatctccaatcacatttgtcatgaacaaatatcaatttacagttattcatacacaattacccatcacatatatca 9786123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 24 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 35524350 - 35524082
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaat-aacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatca-aa 121  Q
    |||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| |||| | |||||||||||| ||    
T  35524350 acatcatcataatccaaagaacagttaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaat---aatattcacatataaatacttacatcataa 35524254  T
Q  122 ccccaatatcttacatcaa-taatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaataa 220  Q
     |||||| ||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  | |||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||  |   || ||    
T  35524253 tcccaatttctcacatcaattaatcaccaatcgcatgtgtcatgaacaatcaccaaatcacagttattcatacacaatcaccaatcacaattcaaaacaa 35524154  T
Q  221 gactcatgtcatgatatgcacata--tcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 290  Q
    |||||||||| |||| ||||| ||   |||| |||| |||||||||||||||  |||| |||||||||||||    
T  35524153 gactcatgtcgtgatgtgcacctagtccgacacatatatgcatgtggtaccatttcacttcaaggtcgtcac 35524082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 256 - 379
Target Start/End: Original strand, 19601713 - 19601836
Alignment:
Q  256 atgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaa 355  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||    
T  19601713 atgcatgtggtaccgaatcacctcaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaaacatcgtatgtaagatttcacatccgtcttacataatcaacgaagtaaa 19601812  T
Q  356 agagttcaacccttttacaactac 379  Q
    |||| |||||||||||||||||||    
T  19601813 agagctcaacccttttacaactac 19601836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 251 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 36357976 - 36357826
Alignment:
Q  251 catacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaa 350  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||| |||    
T  36357976 cataaatgcatgtggtaccgaatcacctcaaggtcgtcatcttcgatgcaacaaaaacatcgtatgtaagatttcactccagtcttacataatctctgaa 36357877  T
Q  351 gtaaaagagttcaacccttttacaactacaa-tctcaacacgactatgatg 400  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  36357876 gtaaaagagctcaactcttttacaactacaagactcaacatgactatgatg 36357826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 251 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 37235600 - 37235470
Alignment:
Q  251 catacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaa 350  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  37235600 catatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaaacatcgtatttaagatttcacatccgtcttacataatcaccgaa 37235501  T
Q  351 gtaaaagagttcaacccttttacaactacaa 381  Q
    ||||||||| |||||| ||||| | ||||||    
T  37235500 gtaaaagagctcaaccattttatagctacaa 37235470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 202 - 376
Target Start/End: Original strand, 20929955 - 20930131
Alignment:
Q  202 caatcacatatatcaataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaa 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| | ||||| ||    
T  20929955 caatcacatatatcaataagactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcacctccgatgtaa 20930054  T
Q  302 caa--aaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaac 376  Q
    |||   ||||||| |||||||  ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||    
T  20930055 caactcaacatcgtatgtaagggttcacccccgccttacataatctccaaagtaaaagagctcaaccattttacaac 20930131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 251 - 400
Target Start/End: Original strand, 21193694 - 21193844
Alignment:
Q  251 catacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaa 350  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  21193694 catatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggttgtcaccttcgatgcaacaaaaacatcgtatgtaagatttcacacccgtcttacattatcaccgaa 21193793  T
Q  351 gtaaaagagttcaacccttttacaactac-aatctcaacacgactatgatg 400  Q
    |||||||||  |  | |||||||| |||| || ||||||| ||||||||||    
T  21193794 gtaaaagagcacccctcttttacagctacaaaactcaacatgactatgatg 21193844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 197 - 376
Target Start/End: Original strand, 22226459 - 22226638
Alignment:
Q  197 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcg 295  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| | ||    
T  22226459 atcaccaatcacatatatcacataagactcatgttatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcacctccg 22226558  T
Q  296 atgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaac 376  Q
    |||  | ||| |||||| |||||||  ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22226559 atgata-aaacacatcgtatgtaagggttcacccccgccttacataatctccgaagtaaaagagctcaacccttttacaac 22226638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 124 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 22837078 - 22836911
Alignment:
Q  124 ccaatatcttacatcaat-aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaataaga 222  Q
    |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||   ||||| |||| |||| |||  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22837078 ccaatatcttacattaagcaatcaccaatcacatgtgtcatgaacaatcttcaat-cacatttat-catgaacaatcatcaatcacatttatcaataaga 22836981  T
Q  223 ctcatgtcatgatatgcacata--tcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 290  Q
    ||||||||||||||||||| ||  ||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22836980 ctcatgtcatgatatgcacctagttcgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacttcaaggtcgtcac 22836911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 87 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 22250905 - 22250776
Alignment:
Q  87 aataataatattctcatacatatacttacatcaaaccccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaatta 186  Q
    ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  22250905 aataataatattctcatatcaatacttacatcaaaccccaatatctcacatcaatgatcaccaattacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagtta 22250806  T
Q  187 ttcatacacaatcatcaatcacatatatca 216  Q
    ||||||||||| || |||||| ||| ||||    
T  22250805 ttcatacacaaccaccaatcatatacatca 22250776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 265 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 8539584 - 8539490
Alignment:
Q  265 gtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagag 359  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  8539584 gtaccaaatcacctcaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaaacatcgtatgtaagatttcacatccgtcttacataatcaccgaagtaaaagag 8539490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 265 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 8604823 - 8604729
Alignment:
Q  265 gtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagag 359  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  8604823 gtaccaaatcacctcaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaaacatcgtatgtaagatttcacatccgtcttacataatcaccgaagtaaaagag 8604729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 194 - 376
Target Start/End: Original strand, 22352601 - 22352785
Alignment:
Q  194 acaatcatcaatcacatatatcaa-taagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactt 292  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| |    
T  22352601 acaatcaccaatcacatatatcaaataagactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcacct 22352700  T
Q  293 tcgatgcaacaa--aaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaac 376  Q
     |||||  ||||   ||||||| |||||||  ||||| |||| ||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  22352701 ccgatg-gacaagtcaacatcgtatgtaagggttcacccccgccttacataatctctgaagtaagagagctcaacccttttacaac 22352785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 202 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 44036582 - 44036401
Alignment:
Q  202 caatcacatatatcaa-taagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgca 300  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||  ||| |||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| |  |||| |    
T  44036582 caatcacatatatcaaataagactcatgtcatgatatgcacttactgacacataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcacctctgatgga 44036483  T
Q  301 acaaa--aacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactaca 380  Q
    ||||   ||||||| |||||||  | ||| || | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  44036482 acaactcaacatcgtatgtaagggtccacccctgccttacataatctccgaagtaaaagagctcaacccttttacaactaca 44036401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 24 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 51658255 - 51657986
Alignment:
Q  24 acatcatcataatcca-ataacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacat--ca- 119  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||| ||||| ||||| ||||  ||||||||     ||||||||| | |||  ||     
T  51658255 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaatatcatatacttaatcac-aataatatc----tacatatacattcataccat 51658161  T
Q  120 aaccccaatatcttacatcaat-aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcaca-tatatcaa 217  Q
    ||  |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||  |||| |||||||||||||||||||| ||||| |  | |||    
T  51658160 aattccaatatcttacatcaattaatcaccaatcgcatgtggcatgaacaattatcaaatcacatttattcatacacaatcatcattcacattccaccaa 51658061  T
Q  218 taagactcatgtcatgatatgcacata--tcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 290  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||  ||||| |||| |||||||||||||||  ||||  ||||||||||||    
T  51658060 taagactcatgtcatgatgtgcacctagttcgacacatatatgcatgtggtaccatttcactccaaggtcgtcac 51657986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 251 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 5769853 - 5769744
Alignment:
Q  251 catacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaa 350  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  5769853 catatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcacccatgatgcaacaaaaacatcatatgtaagatttcacacccgtcttacattatcaccgaa 5769754  T
Q  351 gtaaaagagt 360  Q
    ||||||||||    
T  5769753 gtaaaagagt 5769744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 194 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 20895486 - 20895390
Alignment:
Q  194 acaatcatcaatcacatatatcaataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 290  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  20895486 acaatcaccaatcacatatatcaataagactcatgtcatgatatgcacctattgacacatatatgcatgtggtaccaaatcatctcagggtcgtcac 20895390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 142 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 20956776 - 20956627
Alignment:
Q  142 aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatat-atcaataagactcatgtcatgatatgca 240  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||| || |||  ||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||    
T  20956776 aatcaccaatcacatgtatcatgaacaatcatcaat-cacaataat-catgaacaatcatcaatcacatttcaccaataagactcatgtcatgatatgca 20956679  T
Q  241 cata--tcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 290  Q
    | ||  ||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20956678 cctagttcgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacttcaaggtcgtcac 20956627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 160 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 15863149 - 15862938
Alignment:
Q  160 tcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgc 259  Q
    |||||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||||  ||||||||| |   |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||    
T  15863149 tcatgaacaattatcaattcacaaatattcattcacaatctccaatcacatttccaaataagactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgc 15863050  T
Q  260 atgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagag 359  Q
    ||||||||||||||| ||  ||||||||||| | ||||| |  ||| |||||| |||||||   |||| |    ||||||||||||||||||||||||||    
T  15863049 atgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcacctccgatg-ataaaacacatcgtatgtaaggggtcactc----cttacataatctccgaagtaaaagag 15862955  T
Q  360 ttcaacccttttacaac 376  Q
       ||| ||||||||||    
T  15862954 ccgaactcttttacaac 15862938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 246 - 360
Target Start/End: Original strand, 20821476 - 20821590
Alignment:
Q  246 cgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatct 345  Q
    |||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||| |||     
T  20821476 cgacacatatatgcatgtggtatcaaatcacctcaaggtcgtcacccatgatgcaacaaaaacatcatatgtaagatttcacgcccgtcttacattatcg 20821575  T
Q  346 ccgaagtaaaagagt 360  Q
    |||||||||||||||    
T  20821576 ccgaagtaaaagagt 20821590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 24 - 196
Target Start/End: Original strand, 18505646 - 18505817
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 122  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||| |||||| ||| ||||||| | |||||||||||||||   | ||||   |||||||||||| ||    
T  18505646 acatcatcataatccaaataacagttagcatgaatatttcaatttaa-catcatgcatttgatcaataataatca-cacatattaatacttacatcacac 18505743  T
Q  123 cccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacaca 196  Q
    || ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||| ||||||| ||||    
T  18505744 ccaaatatctcacatcaataatcatcaatcacatgtgtcatgaacaatcatcaattcacaaatattcattcaca 18505817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 246 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 5472028 - 5471872
Alignment:
Q  246 cgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttc-gatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatc 344  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  5472028 cgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcaccccatgatgcaacaaaaacatcatatgtaagatttcacacccgtcttacattatc 5471929  T
Q  345 tccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaa-tctcaacacgactatgatg 400  Q
     ||||| ||||||||| |  | | ||||||||| |||  ||||||| ||||||||||    
T  5471928 accgaaataaaagagtacccctcatttacaacttcaagactcaacatgactatgatg 5471872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 194 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 9785995 - 9785899
Alignment:
Q  194 acaatcatcaatcacatatatcaataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 290  Q
    ||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  9785995 acaatcaccaaccacatttatcaataagactcatgtcatgatatgcacctattgacacatatatgcatgtggtaccaaatctcctcaaggtcgtcac 9785899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 24 - 290
Target Start/End: Original strand, 21716430 - 21716707
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttaca-tca-- 119  Q
    ||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||  |||  ||      
T  21716430 acatcatcataatccaaataatagttaacatgaataattcattataaacatcatgtacttgatcaataataatattcatatatatatacacacacacata 21716529  T
Q  120 ----aaccccaatatcttacatcaa-taatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcac-atata 213  Q
        || | ||||| || ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||| |||||||| |||||| | ||||||| ||  |    
T  21716530 ccataatctcaataactcacatcaattaatcaccaatcacatgtatcatgaacaagtatcaaatcacatttattcatgcacaattaccaatcacaattca 21716629  T
Q  214 tcaataagactcatgtcatgatatgcac--atatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 290  Q
     |||  ||||||||| |||||| || ||  | | |||| |||| ||||||||||||||| || | ||||||||||||||    
T  21716630 ccaaatagactcatg-catgatgtgtacctagaccgacacatatatgcatgtggtaccatattatctcaaggtcgtcac 21716707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 334 - 400
Target Start/End: Original strand, 20526725 - 20526791
Alignment:
Q  334 cttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaatctcaacacgactatgatg 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20526725 cttacataatctccgaagtaaaagagctcaaccattttacaactacaatctcaacacgactatgatg 20526791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 246 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 41213311 - 41213197
Alignment:
Q  246 cgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatct 345  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||| ||| ||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  41213311 cgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcacccatgatacaataaaaatatcatatgtaagatttcacacccgtcttacattatca 41213212  T
Q  346 ccgaagtaaaagagt 360  Q
     ||||||||||||||    
T  41213211 tcgaagtaaaagagt 41213197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 50 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 20895660 - 20895514
Alignment:
Q  50 acatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaaccccaatatcttacatcaataatcacca 149  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||                    |||||||||||||    
T  20895660 acatgaatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatatactcatacatatacttaca--------------------tcaataatcacca 20895581  T
Q  150 atcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 216  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| || | ||||||||||||||||| ||| ||||| |||||    
T  20895580 atcacatgtgtcataaacaaatatcaattcatagttattcatacacaatcaccaaccacatttatca 20895514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 246 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 22145036 - 22144923
Alignment:
Q  246 cgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatct 345  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||| |||||| |||||  |||||| ||||||||| |||||||||| |||     
T  22145036 cgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcacccatgatgtaacaaacacatcatatgtaaaatttcacactcgtcttacattatca 22144937  T
Q  346 ccgaagtaaaagag 359  Q
    ||||||||||||||    
T  22144936 ccgaagtaaaagag 22144923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 142 - 216
Target Start/End: Original strand, 41217793 - 41217867
Alignment:
Q  142 aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||| ||||| |||||    
T  41217793 aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacatttattcatacacaatcaccaaccacatttatca 41217867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 24 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 15863508 - 15863325
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacat--atacttacatcaa 120  Q
    |||| |||||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||     ||| ||||  ||||||||||||     
T  15863508 acattatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaccatcatgcacttgatcaataataa-----tcacacattaatacttacatcac 15863414  T
Q  121 accccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 216  Q
    ||||| |||||| ||||||||| ||| ||||||        |||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||    
T  15863413 accccgatatctcacatcaatattcatcaatca-------tatgaacaattatcaatttacaattattcattcacaatcaccaatcacatttatca 15863325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 24 - 216
Target Start/End: Original strand, 21857753 - 21857934
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacat--atacttacatcaa 120  Q
    |||| |||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||||     ||| ||||  ||||||||||||     
T  21857753 acattatcataatccaaataacagttatcatgaataattcaatt--aacatcatgtatttgatcaataataa-----tcacacattaatacttacatcac 21857845  T
Q  121 accccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 216  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||  ||||     ||||||| ||||||| ||||| ||||||| || ||||| ||||||||| |||||    
T  21857846 accccaatatctcacatcaataatcatcaat--catg-----tgaacaattatcaatgcacaaatattcattcataatcaccaatcacatttatca 21857934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 160 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 22250752 - 22250622
Alignment:
Q  160 tcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgc 259  Q
    |||||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||| ||  ||||||||| |   |||| ||| ||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||    
T  22250752 tcatgaacaattatcaattcacaaatattcattcacagtctccaatcacatttccaaatatgacacatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgc 22250653  T
Q  260 atgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 290  Q
    ||||||||||||||| ||  |||||||||||    
T  22250652 atgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcac 22250622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 24 - 216
Target Start/End: Original strand, 17146820 - 17147003
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 122  Q
    |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | | |||    |||||||||||| ||    
T  17146820 acattatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataat-tacacat--taatacttacatcacac 17146916  T
Q  123 cccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 216  Q
    ||| |||| | ||||||||| ||  ||||||        |||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||    
T  17146917 cccgatatttcacatcaatattcgtcaatca-------tatgaacaattatcaatttacaattattcattcacaatcaccaatcacgtatatca 17147003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 194 - 290
Target Start/End: Original strand, 27673257 - 27673355
Alignment:
Q  194 acaatcatcaatcacatatatcaataagactcatgtcatgatatgcacata--tcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 290  Q
    ||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| ||  | ||| |||| |||||||||||||||| |||| |||||| ||||||    
T  27673257 acaatcatcaatcacatttatcaaatagactcatgtcatgatatgcacctagtttgacacatatatgcatgtggtaccaactcacttcaagggcgtcac 27673355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 194 - 290
Target Start/End: Original strand, 22365155 - 22365252
Alignment:
Q  194 acaatcatcaatcacatatatcaat-aagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 290  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||  |||||||||||||| |||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||    
T  22365155 acaatcaccaatcacatttatcaaacaagactcatgtcattatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcac 22365252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 197 - 299
Target Start/End: Original strand, 17147258 - 17147362
Alignment:
Q  197 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtca-ctttc 294  Q
    |||| ||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||| |||||    
T  17147258 atcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttc 17147357  T
Q  295 gatgc 299  Q
    |||||    
T  17147358 gatgc 17147362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 142 - 214
Target Start/End: Original strand, 22352498 - 22352570
Alignment:
Q  142 aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatat 214  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  22352498 aatcaccaatcacatgtatcaggaacaaatatcaattcacaaatattcattcacaatcaccaatcacaaatat 22352570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 142 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 15863295 - 15863221
Alignment:
Q  142 aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 216  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  15863295 aatcaccaattacatgtatcatgaacaagtatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcatatacatca 15863221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 24 - 216
Target Start/End: Original strand, 22352285 - 22352468
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacat--atacttacatcaa 120  Q
    |||| |||||||||||| ||| | |||||||| ||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||     |||  |||  ||||||||||||     
T  22352285 acattatcataatccaaataatagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataa-----tcacgcattaatacttacatcac 22352379  T
Q  121 accccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 216  Q
    |||||||||||| | ||||||| ||| ||||||        |||||||| | ||||| ||||| ||||||| |||||||| ||||||||| |||||    
T  22352380 accccaatatctcatatcaatattcatcaatca-------tatgaacaattttcaattcacaaatattcattcacaatcaccaatcacatttatca 22352468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 205 - 274
Target Start/End: Original strand, 21857966 - 21858035
Alignment:
Q  205 tcacatatatcaataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatc 274  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||| |||| |||||| ||||||||||||    
T  21857966 tcacatatgtcaataagactcatgccatgatatgcacctattgacacatatatgcatatggtaccaaatc 21858035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 217 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 35935239 - 35935166
Alignment:
Q  217 ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 290  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||    
T  35935239 ataagactcatgttatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcac 35935166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 197 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 7642270 - 7642105
Alignment:
Q  197 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtca-ctttc 294  Q
    |||| ||||||||||  ||| ||||||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||| ||||||||||| |  ||||||||||| |||||    
T  7642270 atcaccaatcacataattcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgcggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttc 7642171  T
Q  295 gatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttac-ataatctccgaagtaaaagagt 360  Q
    ||||| ||    |||||| |||||||   ||||||| | ||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  7642170 gatgccacttgcacatcgaatgtaaggactcacacctgccttacaataatct-cgaagtaaaagagt 7642105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 197 - 290
Target Start/End: Original strand, 17003302 - 17003396
Alignment:
Q  197 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 290  Q
    |||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  17003302 atcaccaatcacatatttcacataggactcatgctatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcac 17003396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 24 - 157
Target Start/End: Original strand, 22364943 - 22365074
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacat--atacttacatcaa 120  Q
    |||| |||||||||||| |||||  ||||||||||| ||||| |||||| ||||| | ||||||||||||||     ||| ||||  ||||||||||||     
T  22364943 acattatcataatccaaataacagataacatgaatatttcaacataaacctcatgcatttgatcaataataa-----tcacacattaatacttacatcac 22365037  T
Q  121 accccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatg 157  Q
    | |||||||||| || |||||||||| | ||||||||    
T  22365038 atcccaatatctcacgtcaataatcatccatcacatg 22365074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 197 - 374
Target Start/End: Original strand, 22034325 - 22034503
Alignment:
Q  197 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtca-ctttc 294  Q
    |||| ||||||||||  ||| ||| ||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||| ||||||||||| |  ||||||||||| |||||    
T  22034325 atcaccaatcacataattcacataggactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgcggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttc 22034424  T
Q  295 gatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttac-ataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttaca 374  Q
    ||||| ||    |||||| |||||||   ||||||| | ||||| ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  22034425 gatgccacttgcacatcgaatgtaagggctcacacctgccttacaataatct-cgaagtaaaagag-tcatcccttttaca 22034503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 217 - 359
Target Start/End: Original strand, 45050185 - 45050324
Alignment:
Q  217 ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaa--aaacatcgca 314  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| | | ||| |||| ||||||||||||||||||| ||  |||||| |||| | |||||  ||||   |||||||||    
T  45050185 ataagactcatgttatgatatgcacttgttgacacataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcatcacctccgatg-gacaagtcaacatcgca 45050283  T
Q  315 tgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagag 359  Q
    ||||||   |||| |    ||||||||||||||||||||||||||    
T  45050284 tgtaaggggtcactc----cttacataatctccgaagtaaaagag 45050324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 56 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 20590078 - 20589963
Alignment:
Q  56 ataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatca-aaccccaatatcttacatcaataa-tcaccaatca 153  Q
    |||||||||| ||||  |||| || || |||||||||||||| | |||  ||||||||| |||| || | |||||||| |||||||||| |||||||||     
T  20590078 ataattcaatttaaatctcatatatttaatcaataataatatccacatgtatatacttatatcataatcacaatatctcacatcaataaatcaccaatcg 20589979  T
Q  154 catgtgtcatgaacaa 169  Q
    ||||| ||||||||||    
T  20589978 catgtatcatgaacaa 20589963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 24 - 73
Target Start/End: Original strand, 22080190 - 22080240
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacat 73  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  22080190 acatcatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatataaacat 22080240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 197 - 290
Target Start/End: Original strand, 41392929 - 41393023
Alignment:
Q  197 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 290  Q
    |||| ||||||||||| ||| ||| |||||||   ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  41392929 atcaccaatcacatatttcacataggactcatactatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcac 41393023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 197 - 290
Target Start/End: Original strand, 51451090 - 51451184
Alignment:
Q  197 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 290  Q
    |||| ||||||||||  ||| ||| ||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  51451090 atcaccaatcacataattcacatatgactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcac 51451184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 197 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 20826909 - 20826805
Alignment:
Q  197 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtca-ctttc 294  Q
    |||| ||||||||||  ||| ||| ||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||| ||||||||||| |  ||||||||||| |||||    
T  20826909 atcaccaatcacataattcacataggactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgcggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttc 20826810  T
Q  295 gatgc 299  Q
    |||||    
T  20826809 gatgc 20826805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 221 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 5073963 - 5073884
Alignment:
Q  221 gactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtca-ctttcgatgc 299  Q
    ||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||| ||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||    
T  5073963 gactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgcggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgc 5073884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 251 - 290
Target Start/End: Original strand, 18505816 - 18505855
Alignment:
Q  251 catacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 290  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18505816 catatatgcatgtggtaccaaatctcctcaaggtcgtcac 18505855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 221 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 18602706 - 18602627
Alignment:
Q  221 gactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtca-ctttcgatgc 299  Q
    ||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||| ||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||    
T  18602706 gactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgcggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgc 18602627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 108 - 146
Target Start/End: Original strand, 20444085 - 20444123
Alignment:
Q  108 atacttacatcaaaccccaatatcttacatcaataatca 146  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  20444085 atacttacatcacaccccaatatctcacatcaataatca 20444123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 108 - 146
Target Start/End: Original strand, 20529825 - 20529863
Alignment:
Q  108 atacttacatcaaaccccaatatcttacatcaataatca 146  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  20529825 atacttacatcacaccccaatatctcacatcaataatca 20529863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 246 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 77677 - 77632
Alignment:
Q  246 cgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctc-aaggtcgtcac 290  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  77677 cgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaaggtcgtcac 77632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 108 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 37846286 - 37846241
Alignment:
Q  108 atacttacatcaaaccccaatatcttacatcaataatcaccaatca 153  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  37846286 atacttacatcacaccccaatatctcacatcaatgatcatcaatca 37846241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 126 - 169
Target Start/End: Original strand, 27673216 - 27673260
Alignment:
Q  126 aatatcttacatcaat-aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaa 169  Q
    |||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27673216 aatatcttacattaagcaatcaccaatcacatgtgtcatgaacaa 27673260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083 (Bit Score: 207; Significance: 1e-113; HSPs: 1)
Name: scaffold0083
Description:

Target: scaffold0083; HSP #1
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 24 - 400
Target Start/End: Original strand, 12488 - 12874
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatata------cttaca 116  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||      ||||||    
T  12488 acatcatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatatagacatcatgcacttgatgaataataatattctcatatatatatatatacttaca 12587  T
Q  117 tcaaa---ccccaatatcttacatcaataa-tcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatat 212  Q
    |||||   ||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||  || ||| || ||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  12588 tcaaaaccccccaatatctcacattaataaatcaccaatcacatgtgtcatgaacaac-attaattcaaaattattcatacacaatcaccaatcacattt 12686  T
Q  213 atcaataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcg 312  Q
       |||| ||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12687 ccaaataggactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaaacatcg 12786  T
Q  313 catgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaatctcaacacgactatgatg 400  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  12787 tatgtaagatttcacacccgccttacataatctccgaagtaaaagagttcaagccttttatgactacaatctcaacacgactatgatg 12874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 94)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 106 - 400
Target Start/End: Original strand, 6877821 - 6878117
Alignment:
Q  106 atatacttacatcaaaccccaa-tatcttacatcaataa-tcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatca 203  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||| |||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  6877821 atatacttacatcaaaacccaaatatctgacattaataaatcaccattcacatgtgtcatgaacaaacatcaattcacaattattcatacacaatcacca 6877920  T
Q  204 atcacatatatcaataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaaca 303  Q
    ||||||| |   |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| |||||| |||||||  |||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  6877921 atcacatttccaaataagactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatttggtaccggatcacctcaaagtcgtcaccttcgatgcaaca 6878020  T
Q  304 aaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaatctcaacacgactatgatg 400  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6878021 aaaacatcgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaatctcaacacgactatgatg 6878117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 24 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 36892628 - 36892360
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaa- 121  Q
    |||||||||||||| || ||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  36892628 acatcatcataatcaaaataacagttaacatgaatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaaa 36892529  T
Q  122 ccccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaataag 221  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  36892528 ccccaatagcttacatcaataatcaccaatcacatgtgttatgaacaaatatcaattcacaattattcatacacaatcaccaatcacatatatcaataag 36892429  T
Q  222 actcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 290  Q
    |||||||||| ||||||||| ||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36892428 actcatgtcaagatatgcacctattgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 36892360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 24 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 25877882 - 25877618
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 122  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   ||| ||||   ||||||||||||| |    
T  25877882 acatcatcataatccaaataacagttaacatgaataattcaatataaacatcatgcacttgatcaataata---ttcacataacaatacttacatcaatc 25877786  T
Q  123 cccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaataaga 222  Q
    ||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25877785 cccaatatctcgcatcaataatcatcaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacaattattcatacacaatcaccaatcacatatatcaataaga 25877686  T
Q  223 ctcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 290  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25877685 ctcatatcatgatatgcacctattgacacatatatgcatgtggtaccaaatctcctcaaggtcgtcac 25877618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 24 - 399
Target Start/End: Original strand, 8886450 - 8886814
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacat--atacttacatcaa 120  Q
    |||| |||||||||||| ||||| ||| |||||||| ||||||   ||||||||| | |||||||||||||||     || ||||  |||| |||||||     
T  8886450 acattatcataatccaaataacagttatcatgaatatttcaatt--aacatcatgcatttgatcaataataat-----cacacatcaatacctacatcac 8886542  T
Q  121 accccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaataa 220  Q
    || |||||||||  ||||||||||||  |||||||||       ||||| ||||||| ||||| ||||||  |||||||| |||||||| ||||||||||    
T  8886543 actccaatatctcgcatcaataatcattaatcacatg-------aacaattatcaattcacaaatattcactcacaatcaccaatcacacatatcaataa 8886635  T
Q  221 gactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaag 320  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  8886636 gactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaaacatcgtatgtaag 8886735  T
Q  321 atttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaatctcaacacgactatgat 399  Q
    | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8886736 agttcacacccgtcttacataatctctgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaatctcaacacgactatgat 8886814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 161 - 396
Target Start/End: Original strand, 22861923 - 22862158
Alignment:
Q  161 catgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgca 260  Q
    ||||||| | ||||||| ||||| ||||||| |||||||| ||||||||  |   ||||||| |||||||||||||||||| ||| ||| |||| |||||    
T  22861923 catgaacgattatcaattcacaaatattcattcacaatcaccaatcacacttccaaataagaatcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgca 22862022  T
Q  261 tgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagt 360  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22862023 tgtggtacgagatcacctcaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaaacatcgtatgtaagagttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagt 22862122  T
Q  361 tcaacccttttacaactacaatctcaacacgactat 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22862123 tcaacccttttacaactacaatctcaacacaactat 22862158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 196 - 400
Target Start/End: Original strand, 25600431 - 25600635
Alignment:
Q  196 aatcatcaatcacatatatcaataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcg 295  Q
    ||||| ||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||    
T  25600431 aatcaccaaccacatttatcaataagattcatgtcatgatatgcacctattgacacatatatgcatgtggtaccatattacctcaaggtcgtcaccttcg 25600530  T
Q  296 atgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaatctcaacacgacta 395  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||    
T  25600531 atgcaacaaaaacatcgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaaactcaacgagacta 25600630  T
Q  396 tgatg 400  Q
    |||||    
T  25600631 tgatg 25600635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 142 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 24089120 - 24088880
Alignment:
Q  142 aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatat-atcaataagactcatgtcatgatatgca 240  Q
    ||||| ||||||||| | ||||||||||  |||||| |||| |||| ||| |||||||||||||||||| | | ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  24089120 aatcatcaatcacatttatcatgaacaatcatcaat-cacatttat-catgcacaatcatcaatcacatttcaccaataagactcgtgtcatgatgtgca 24089023  T
Q  241 cata--tcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttac 338  Q
    | ||  ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24089022 cctagttcgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcatcttcgatgcaacaaaaacatcgtatgtaagatttcacacccgtcttac 24088923  T
Q  339 ataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaa 381  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24088922 ataatctccgacgtaaaagagctcaacccttttacaactacaa 24088880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 216 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 19435144 - 19434958
Alignment:
Q  216 aataagactcatgtcatgatatgcacata--tcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgc 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  19435144 aataagactcatgtcatgatatgcacctagttcgacacatatatgcatgtggtatcaaatcacctcaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaaacatcgt 19435045  T
Q  314 atgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaa-tctcaacacgactatgatg 400  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  19435044 acgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagt-aaagagctcaaccctttttcaactacaagactcaacatgactatgatg 19434958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 24 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 42180402 - 42180210
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 122  Q
    |||||| |||||||||| ||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||   |||||||||||||||    
T  42180402 acatcaacataatccaaataacagttaacatgattatttcaatataaacatcatgcacttgattaataataatattctcatatcaatacttacatcaaac 42180303  T
Q  123 cccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatc 215  Q
    ||||||||||  ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  42180302 cccaatatctcccattaataatcatcaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagctattcatacacaatcaccaatcacatatatc 42180210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 163 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 43644688 - 43644471
Alignment:
Q  163 tgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatg 262  Q
    ||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||    
T  43644688 tgaacaattatcaattcacaaatattcattcacaatcaccaatcacatttatcaataagactcatgtcatgatatgcacctattgacgcatatatgcatg 43644589  T
Q  263 tggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttc 362  Q
    |||||||||||| ||  ||| ||||||| |||| || | |||  |||||| |||||||  |||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| ||    
T  43644588 tggtaccaaatctccaaaagatcgtcaccttcgttgaatcaagcacatcgtatgtaagggttcacacccgcctcacataatcttcgaagtaaaagagctc 43644489  T
Q  363 aacccttttacaactaca 380  Q
    ||||||||||||||||||    
T  43644488 aacccttttacaactaca 43644471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 246 - 400
Target Start/End: Original strand, 19658470 - 19658625
Alignment:
Q  246 cgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatct 345  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19658470 cgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaaacatcgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatct 19658569  T
Q  346 ccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaa-tctcaacacgactatgatg 400  Q
     ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  19658570 tcgaagtaaaagagctcaacctttttacaactacaagactcaacatgactatgatg 19658625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 24 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 21276535 - 21276342
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 122  Q
    |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||| | |||||||||||| |||||| || |   |||||||||||||||    
T  21276535 acattatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatataagcatcatgcatttgatcaataatcatattcccacatcaatacttacatcaaac 21276436  T
Q  123 cccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 216  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  21276435 cccaatatctcacatcgataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcatatacatca 21276342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 194 - 400
Target Start/End: Original strand, 15631864 - 15632071
Alignment:
Q  194 acaatcatcaatcacatatatcaa-taagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactt 292  Q
    ||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||| || | |||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |    
T  15631864 acaatcaccaatcacatttatcaaataagactcatgtcatgatatgcacttattgactcaaaaatgcatgtggtaccgaatcacctccaggtcgtcacct 15631963  T
Q  293 tcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaatctcaacacga 392  Q
    | |||||  |   ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||   ||||||||    
T  15631964 ttgatgcctcttgaacatcatatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagcttaacccttttacaactacaaatacaacacga 15632063  T
Q  393 ctatgatg 400  Q
    ||||||||    
T  15632064 ctatgatg 15632071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 24 - 210
Target Start/End: Original strand, 24966425 - 24966609
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 122  Q
    ||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||   ||| ||||   |||||||||||||||    
T  24966425 acatcatcataatccaaataaaagttaacatgaataactcaatataaacatcatgcacttgatcaataata---ttcacatatcaatacttacatcaaac 24966521  T
Q  123 cccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacat 210  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| |||||||||    
T  24966522 cccaatatctcacattaataatcaccaatcatatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacataatcaccaatcacat 24966609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 251 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 4925 - 4795
Alignment:
Q  251 catacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaa 350  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4925 cataaatgcatgtggtaccgaatcacctcaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaaacattgtatgtaagatttcacccccgtcttacataatctccgaa 4826  T
Q  351 gtaaaagagttcaacccttttacaactacaa 381  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4825 gtaaaagagctcaacccttttacaactacaa 4795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 251 - 400
Target Start/End: Original strand, 25304094 - 25304244
Alignment:
Q  251 catacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaa 350  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25304094 cataaatgcatgtggtaccgaatcacctcaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaaacatcgtatgtaagatttcacacccttcttacataatctccgaa 25304193  T
Q  351 gtaaaagagttcaacccttttacaactacaa-tctcaacacgactatgatg 400  Q
    |||||| || | |||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  25304194 gtaaaatagcttaacccttttacaactacaagactcaacatgactatgatg 25304244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 39 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 12638171 - 12638003
Alignment:
Q  39 aataacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaaccccaatatcttacatc 138  Q
    ||||||| |||||||| ||| |||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||| || |   ||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  12638171 aataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcaattgatcaataataatattcccacatcaatacttacatcaaaccccaatgtctcacatc 12638072  T
Q  139 aataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatca 207  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  12638071 aataatcactaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatca 12638003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 273 - 400
Target Start/End: Original strand, 27260130 - 27260257
Alignment:
Q  273 tcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaaccctttta 372  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27260130 tcacctcaaggtcgtcacctttgatgcaacaaaaacatcgtatgtaagatttcacactcgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaaccctttta 27260229  T
Q  373 caactacaatctcaacacgactatgatg 400  Q
    ||||||||| | ||||| ||||||||||    
T  27260230 caactacaaacacaacatgactatgatg 27260257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 24 - 209
Target Start/End: Original strand, 21140139 - 21140325
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 122  Q
    |||| |||||||||||| |||||  ||||||||||| |||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||| || |   |||||||||||||||    
T  21140139 acattatcataatccaaataacagataacatgaatatttcaatttaaacatcatgcatttgatcaataataatattcccacatcaatacttacatcaaac 21140238  T
Q  123 cccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcaca 209  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||    
T  21140239 cccaatatctcacatcaataatcaccaatcacatgtataaggaacaaatatcaattcacaagtattcatttacaatcatcaatcaca 21140325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 251 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 23823157 - 23823027
Alignment:
Q  251 catacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaa 350  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  | |||||||||||||||||||    
T  23823157 cataaatgcatgtggtaccgaatcacctcaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaaacatcgtatgtaagatttcacctcagtcttacataatctccgaa 23823058  T
Q  351 gtaaaagagttcaacccttttacaactacaa 381  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23823057 gtaaaagagctcaacccttttacaactacaa 23823027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 251 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 23825101 - 23824971
Alignment:
Q  251 catacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaa 350  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  | |||||||||||||||||||    
T  23825101 cataaatgcatgtggtaccgaatcacctcaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaaacatcgtatgtaagatttcacctcagtcttacataatctccgaa 23825002  T
Q  351 gtaaaagagttcaacccttttacaactacaa 381  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23825001 gtaaaagagctcaacccttttacaactacaa 23824971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 251 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 23832236 - 23832106
Alignment:
Q  251 catacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaa 350  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  | |||||||||||||||||||    
T  23832236 cataaatgcatgtggtaccgaatcacctcaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaaacatcgtatgtaagatttcacctcagtcttacataatctccgaa 23832137  T
Q  351 gtaaaagagttcaacccttttacaactacaa 381  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23832136 gtaaaagagctcaacccttttacaactacaa 23832106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 245 - 400
Target Start/End: Original strand, 43641346 - 43641502
Alignment:
Q  245 tcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatc 344  Q
    ||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  43641346 tcgacacatatatgcatgtggtaccgaatcacctcaaggtcgtcaccttcgatgcaataaaaacatcgtatgtaagatttcacatccgtcttacataatc 43641445  T
Q  345 tccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaa-tctcaacacgactatgatg 400  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  ||||||| ||||||||||    
T  43641446 accgaagtaaaagagctcaacccttttacggctacaagactcaacatgactatgatg 43641502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 24 - 290
Target Start/End: Original strand, 7319718 - 7319989
Alignment:
Q  24 acatcatcataatcca-ataacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaa-taataatattctcatacatatacttacatca-a 120  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||| ||||| ||||||||| | | || |||| | |||  || |    
T  7319718 acatcatcataatccacataacaattaacatgaataattcaattcaaatatcatgtacttaatcaaataataatatccacgtatatattcatac--cata 7319815  T
Q  121 accccaatatcttacatcaat-aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatat-atcaat 218  Q
    | |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||  |||| | |||||||||||||||||| |||||| | | ||||    
T  7319816 atcccaatatctcacatcaattaatcaccaatcacatgtgtcatgaacaatcatcaaatcacattcattcatacacaatcatcattcacatttcaccaat 7319915  T
Q  219 aagactcatgtcatgatatgcacata--tcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 290  Q
    ||||||||||||||||| || || ||  ||||| |||| |||||||||||||||  |||| |||||||||||||    
T  7319916 aagactcatgtcatgatgtgtacctagttcgacacatatatgcatgtggtaccatttcacttcaaggtcgtcac 7319989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 251 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 19670778 - 19670629
Alignment:
Q  251 catacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaa 350  Q
    |||| ||||||||||| || |||| ||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19670778 cataaatgcatgtggtgccgaatctcctcaaggtcgtcaccttcgatgcatcaaga-catcgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaa 19670680  T
Q  351 gtaaaagagttcaacccttttacaactacaa-tctcaacacgactatgatg 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  19670679 gtaaaagagttcaacccttttacaactacaagactcaacatgactatgatg 19670629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 202 - 380
Target Start/End: Original strand, 22282601 - 22282782
Alignment:
Q  202 caatcacatatatcaa-taagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgca 300  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| | ||||| |    
T  22282601 caatcacatatatcaaataagactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcacctccgatgga 22282700  T
Q  301 acaaa--aacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactaca 380  Q
    ||||   ||||||| |||||||  ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22282701 acaactcaacatcgtatgtaagggttcacccccgccttacataatctccgaagtaaaagagctcaacccttttacaactaca 22282782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 251 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 24296221 - 24296071
Alignment:
Q  251 catacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaa 350  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |  |||||||||||||||||||    
T  24296221 cataaatgcatgtggtaccgaatcacctcaaggtcgtcaccttcgatgcaactaaaacatcgtatgtaagatttcacccaagtcttacataatctccgaa 24296122  T
Q  351 gtaaaagagttcaacccttttacaactacaa-tctcaacacgactatgatg 400  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  24296121 gtaaaagagctcaactcttttacaactacaagactcaacatgactatgatg 24296071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 24 - 290
Target Start/End: Original strand, 28972272 - 28972543
Alignment:
Q  24 acatcatcataatcca-ataacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatc--aa 120  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||| || | |  ||    
T  28972272 acatcatcataatccacataacaattaacatgaatagttcaat-taaacatcatgtacttgatcaataataatattcacacatatatacatataccataa 28972370  T
Q  121 accccaatatcttacatcaa-taatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatat-atcaat 218  Q
      ||||| || | ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||  |||||  |||| |||||||| |||||||||||||||||| | | ||||    
T  28972371 ttcccaaaatttcacatcaattaatcaccaatcacatgtgtcctgaacaatcatcaaatcacatttattcatgcacaatcatcaatcacatttcaccaat 28972470  T
Q  219 aagactcatgtcatgatatgcacata--tcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 290  Q
    |||||||||| |||||| || || ||   |||| |||| |||||||||||||||  |||| |||||||||||||    
T  28972471 aagactcatg-catgatgtgtacctagcccgacacatatatgcatgtggtaccatttcacttcaaggtcgtcac 28972543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 24 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 32102 - 31832
Alignment:
Q  24 acatcatcataatcca-ataacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgat-caataataatattctcatacatatacttacatcaaa 121  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  ||| ||||||||||| || | |||||||||| | |||| |||| | ||| |  ||    
T  32102 acatcatcataatccacataacaaataacatgaataattcaattcaaatatcatgtacttaattcgataataatat-cacatatatattcatac-tataa 32005  T
Q  122 ccccaatatcttacatcaa-taatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatat-atcaata 219  Q
       |||||||| ||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||  |||||  |||| |||||||| |||||||||||||||||| | | |||||    
T  32004 tttcaatatctcacatcaaataatcaccagtcacatatgtcatgaacaatcatcaaatcacatttattcatgcacaatcatcaatcacatttcaccaata 31905  T
Q  220 agactcatgtcatgatatgcacata--tcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 290  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||  ||||| |||| |||||||||||||||  |||| |||||||||||||    
T  31904 agactcatgtcatgatgtgcacctagttcgacacatatatgcatgtggtaccatttcacttcaaggtcgtcac 31832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 202 - 378
Target Start/End: Original strand, 22273368 - 22273547
Alignment:
Q  202 caatcacatatatcaa-taagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgca 300  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| | ||||| |    
T  22273368 caatcacatatatcaaataagactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcacctccgatgga 22273467  T
Q  301 acaa--aaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaacta 378  Q
    ||||   ||||||| |||||||  ||||| |||| |||||||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  22273468 acaactcaacatcgtatgtaagggttcacccccgccttacataatctcttaagtaaaagagctcaactcttttacaacta 22273547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 142 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 12643758 - 12643600
Alignment:
Q  142 aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaataagactcatgtcatgatatgcac 241  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| || || |||||||||||||||| ||||||||| |   |||| |||||||||||||||||||||    
T  12643758 aatcaccaatcacatgtatcaggaacaaatatcaattcagaaatattcatacacaatcaccaatcacatttccaaatatgactcatgtcatgatatgcac 12643659  T
Q  242 atatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtca-ctttcgatgc 299  Q
     ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||    
T  12643658 ttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgc 12643600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 24 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 12644000 - 12643812
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 122  Q
    |||| |||||||||||| ||||| ||| |||||| | ||||||   ||||||||| | ||||||||||| |||| || ||| || |||||||||||||||    
T  12644000 acattatcataatccaaataacagttatcatgaacatttcaatt--aacatcatgcatttgatcaataa-aatactcacat-ca-atacttacatcaaac 12643906  T
Q  123 cccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 216  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||| |||||| ||| ||||    
T  12643905 cccaatgtctcacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcgtacacaatcaccaatcatatacatca 12643812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 24 - 292
Target Start/End: Original strand, 269422 - 269693
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatca-aa 121  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||| |||  |||||| || | ||  |    
T  269422 acatcatcataatccaaataacaattaacatgaataattaaatataaacatcatgaatttgatcaataacaatattcacat--atatacatataccatga 269519  T
Q  122 ccccaatatcttacatcaa-taatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcac-atatatcaata 219  Q
     | ||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||  |||| || |||||| | ||||||| ||  | |||||    
T  269520 tctcaataactcacatcaattaatcaccaatcacatgtgtcatgaacaagtatcaaatcacatatatttatgcacaattaccaatcacaattcaccaata 269619  T
Q  220 agactcatgtcatgatatgcac--atatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactt 292  Q
    ||||||||| |||||| || ||  | | |||| |||| |||||||||||||||  |||| |||||||||||||||    
T  269620 agactcatg-catgatgtgtacctagaccgacacatatatgcatgtggtaccatttcacttcaaggtcgtcactt 269693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 124 - 216
Target Start/End: Original strand, 25600309 - 25600401
Alignment:
Q  124 ccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 216  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25600309 ccaatatctcacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatca 25600401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 24 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 24573320 - 24573051
Alignment:
Q  24 acatcatcataatcca-ataacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatca-ataataatattctcatacatatacttacatca-a 120  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| || |||  ||||||| ||   || | ||||| | |||  | |    
T  24573320 acatcatcataatccacataacaaataacatgaataattcaatttaaatatcatgtatttaatccgataataaaat---cacaaatatattcacactata 24573224  T
Q  121 accccaatatcttacatcaat-aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatat-atcaat 218  Q
    | | |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||  |||| ||||| || ||||||| |||||||||| | | ||||    
T  24573223 atctcaatatctcacatcaattaatcaccaatcacatgtgtcatgaacaatcatcaaatcacatttatttatgcacaatcttcaatcacatttcaccaat 24573124  T
Q  219 aagactcatgtcatgatatgcacata--tcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtca 289  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||  ||||| |||| |||||||||||||||  |||| ||||||||||||    
T  24573123 aagactcatgtcatgatgtgcacctagttcgacccatatatgcatgtggtaccatttcacttcaaggtcgtca 24573051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 106 - 216
Target Start/End: Original strand, 15631702 - 15631812
Alignment:
Q  106 atatacttacatcaaaccccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaat 205  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||| || ||||||    
T  15631702 atatacttacatcaaactccaatatctcacatcaataatctccaatcacatgtgtcatgaacgaatatcaacttacaattattcatacaccattatcaat 15631801  T
Q  206 cacatatatca 216  Q
    || ||||||||    
T  15631802 catatatatca 15631812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 197 - 376
Target Start/End: Original strand, 22692768 - 22692949
Alignment:
Q  197 atcatcaatcacatatatcaa-taagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcg 295  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||| |||| || |||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| | ||    
T  22692768 atcaccaatcacatatatcaaataagactaatgttattatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctccataaggtcgtcacctccg 22692867  T
Q  296 atgcaacaa--aaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaac 376  Q
    |||  ||||   ||||||| |||||||  ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22692868 atg-gacaagtcaacatcgtatgtaagggttcacccccgccttacaaaatctccgaagtaaaagagctcaacccttttacaac 22692949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 197 - 376
Target Start/End: Original strand, 22697415 - 22697596
Alignment:
Q  197 atcatcaatcacatatatcaa-taagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcg 295  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||| |||| || |||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| | ||    
T  22697415 atcaccaatcacatatatcaaataagactaatgttattatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctccataaggtcgtcacctccg 22697514  T
Q  296 atgcaacaa--aaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaac 376  Q
    |||  ||||   ||||||| |||||||  ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22697515 atg-gacaagtcaacatcgtatgtaagggttcacccccgccttacaaaatctccgaagtaaaagagctcaacccttttacaac 22697596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 24 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 22581858 - 22581588
Alignment:
Q  24 acatcatcataatcca-ataacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatca-ataataatattctcatacatatacttacatca-a 120  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||| || || |||  ||||||||||   || | ||||| | |||  | |    
T  22581858 acatcatcataatccacataacaaataacatgaataattcaatttaaatatcatttatttaatccgataataatat---cacaaatatattcacactata 22581762  T
Q  121 accccaatatcttacatcaat-aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatat-atcaat 218  Q
    | | |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||  || | | ||| || |||||||||||||||||| | | ||||    
T  22581761 atctcaatatctcacgtcaattaatcaccaatcacatgtgtcatgaacaatcatcaaatcatattcatttatgcacaatcatcaatcacatttcaccaat 22581662  T
Q  219 aagactcatgtcatgatatgcacata--tcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 290  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||   |||| |||| |||||||||||||||  |||| |||||||||||||    
T  22581661 aagactcatgtcatgatgtgcacctagtccgacacataaatgcatgtggtaccatttcacttcaaggtcgtcac 22581588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 24 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 4450171 - 4450084
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatata 110  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  4450171 acatcatcataatccaaataacagttaacatgaataattcaatataaacatcatgaacttgatcaataacaatattctcatatatata 4450084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 246 - 360
Target Start/End: Original strand, 18534350 - 18534464
Alignment:
Q  246 cgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatct 345  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||||||||||  |||||||||| ||||| |||||||||| |||     
T  18534350 cgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaacgtcgtcacccatgatgcaacaaaaacatcatatgtaagattgcacactcgtcttacattatca 18534449  T
Q  346 ccgaagtaaaagagt 360  Q
    |||||||||||||||    
T  18534450 ccgaagtaaaagagt 18534464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 246 - 356
Target Start/End: Original strand, 24272579 - 24272689
Alignment:
Q  246 cgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatct 345  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||| |||     
T  24272579 cgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacttcaaggtcgtcacccatgatgcaacaaaaacatcatatgtaagatttcacactcgtcttacattatca 24272678  T
Q  346 ccgaagtaaaa 356  Q
    |||||||||||    
T  24272679 ccgaagtaaaa 24272689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 246 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 22137469 - 22137341
Alignment:
Q  246 cgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatct 345  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||| |||||| |||||  |||||||||||||||||| |||||||| |||     
T  22137469 cgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcacccatgatgtaacaaacacatcatatgtaagatttcacacccatcttacattatca 22137370  T
Q  346 ccgaagtaaaagagttcaacccttttaca 374  Q
    ||||| ||||||||  || ||||||||||    
T  22137369 ccgaaataaaagagcacatcccttttaca 22137341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 194 - 274
Target Start/End: Original strand, 461139 - 461219
Alignment:
Q  194 acaatcatcaatcacatatatcaataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatc 274  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||| |||| |||||||||||||||||||    
T  461139 acaatcaccaatcacatatatcaataagactcatgccatgatatgcacctattgacacatatatgcatgtggtaccaaatc 461219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 24 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 3801306 - 3801123
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 122  Q
    |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | | |||    |||||||||||| ||    
T  3801306 acattatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataat-tacacat--taatacttacatcacac 3801210  T
Q  123 cccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 216  Q
    ||| |||||| ||||||||| ||| ||||||        |||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||    
T  3801209 cccgatatctcacatcaatattcatcaatca-------tatgaacaattatcaatttacaattattcattcacaatcaccaatcacatttatca 3801123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 24 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 38706993 - 38706810
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacata-tacttacatcaaa 121  Q
    |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||||||||||| | | |||   || ||||||||||| |    
T  38706993 acattatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaattaaaacatcatgcacttgatcaataataat-tacacat---tagtacttacatcaca 38706898  T
Q  122 ccccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 216  Q
    | ||||||||| ||||||||| ||| ||||||        |||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  38706897 caccaatatctcacatcaatattcatcaatca-------tatgaacaattatcaatttacaattattcattcacaatcatcaatcacatttatca 38706810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 202 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 9654579 - 9654507
Alignment:
Q  202 caatcacatatatcaataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatc 274  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||| |||| |||||||||||||||||||    
T  9654579 caatcacatatatcaataagactcatggcatgatatgcacctatagacacatatatgcatgtggtaccaaatc 9654507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 197 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 12637843 - 12637665
Alignment:
Q  197 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtca-ctttc 294  Q
    |||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||| |||||    
T  12637843 atcaccaatcacatatttcacataagactcatgttatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttc 12637744  T
Q  295 gatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttac-ataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttaca 374  Q
    ||||| ||    |||||| |||||||   ||||||| | ||||| ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  12637743 gatgccacttgcacatcgaatgtaagggctcacacctgccttacaataatct-cgaagtaaaagag-tcatcccttttaca 12637665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 194 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 20629114 - 20629034
Alignment:
Q  194 acaatcatcaatcacatatatcaataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatc 274  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||| ||| |||| |||||||||||||||||||    
T  20629114 acaatcaccaatcacatatatcaataagactcttgccatgatatgcacctattgacacatatatgcatgtggtaccaaatc 20629034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 197 - 374
Target Start/End: Original strand, 21140355 - 21140533
Alignment:
Q  197 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtca-ctttc 294  Q
    |||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||| ||| |    
T  21140355 atcaccaatcacatatttcacataagactcatgttatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcaccttcc 21140454  T
Q  295 gatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttac-ataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttaca 374  Q
    ||||| ||    |||||| |||||||   ||||||| | ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21140455 gatgccacttgcacatcgtatgtaag-gctcacacctgccttacaataatct-cgaagtaaaagagctcaacccttttaca 21140533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 24 - 216
Target Start/End: Original strand, 34822315 - 34822498
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 122  Q
    |||| |||||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | | |||    |||||||||||| ||    
T  34822315 acattatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataat-tacacat--taatacttacatcacac 34822411  T
Q  123 cccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 216  Q
    ||| |||||| ||||||||| ||| ||||||        |||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||    
T  34822412 cccgatatctcacatcaatattcatcaatca-------tatgaacaattatcaatttacaattattcattcacaatcaccaatcacatttatca 34822498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 196 - 274
Target Start/End: Original strand, 24966692 - 24966770
Alignment:
Q  196 aatcatcaatcacatatatcaataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatc 274  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||| ||| |||| |||||||||||||||||||    
T  24966692 aatcaccaatcacatatatcaataagattcatgccatgatatgcacctattgacacatatatgcatgtggtaccaaatc 24966770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 141 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 22691758 - 22691607
Alignment:
Q  141 taatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcac-atatatcaataagactcatgtcatgatatgc 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||||| |||||||| ||||||| ||    ||||||||| |||| |||||| ||     
T  22691758 taatcaccaatcacatgtgtcatgaacaagtatcaaatcacatttattcatgcacaatcaccaatcacaattcgccaataagacacatg-catgatgtgt 22691660  T
Q  240 ac--atatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 290  Q
    ||  | | |||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  22691659 acctagaccgacacatatatgcatgtggtaccatatcacctcaaggtcttcac 22691607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 141 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 22696405 - 22696254
Alignment:
Q  141 taatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcac-atatatcaataagactcatgtcatgatatgc 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||||| |||||||| ||||||| ||    ||||||||| |||| |||||| ||     
T  22696405 taatcaccaatcacatgtgtcatgaacaagtatcaaatcacatttattcatgcacaatcaccaatcacaattcgccaataagacacatg-catgatgtgt 22696307  T
Q  240 ac--atatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 290  Q
    ||  | | |||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  22696306 acctagaccgacacatatatgcatgtggtaccatatcacctcaaggtcttcac 22696254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 197 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 21276205 - 21276027
Alignment:
Q  197 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtca-ctttc 294  Q
    |||| |||||| |||| ||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||| ||| |    
T  21276205 atcaccaatcaaatatttcacataagactcatgttatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcaccttcc 21276106  T
Q  295 gatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttac-ataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttaca 374  Q
    ||||| ||    |||||| |||||||   ||||||| | ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21276105 gatgccacttgcacatcgtatgtaag-gctcacacctgccttacaataatct-cgaagtaaaagagctcaacccttttaca 21276027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 142 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 12637940 - 12637873
Alignment:
Q  142 aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcaca 209  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  12637940 aatcaccaatcacatgtatcaggaacaaatatcaattcacaaatattcattcacaatcatcaatcaca 12637873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 24 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 22691910 - 22691823
Alignment:
Q  24 acatcatcataatcca-ataacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatata 110  Q
    ||||||||||| |||| |||||| |||||||||||| |||||| ||||| | ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22691910 acatcatcatagtccacataacatttaacatgaatatttcaatttaaacttaatgcacttgatcaataataatattcacatacatata 22691823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 24 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 22696557 - 22696470
Alignment:
Q  24 acatcatcataatcca-ataacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatata 110  Q
    ||||||||||| |||| |||||| |||||||||||| |||||| ||||| | ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22696557 acatcatcatagtccacataacatttaacatgaatatttcaatttaaacttaatgcacttgatcaataataatattcacatacatata 22696470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 24 - 110
Target Start/End: Original strand, 25600173 - 25600260
Alignment:
Q  24 acatcatcataatcca-ataacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatata 110  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||  ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| || |||||||    
T  25600173 acatcatcataatccacataacagttaacatgaatatttcaaactaaacatcatgcacttgatcaataatagtattcacacacatata 25600260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 221 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 24687322 - 24687161
Alignment:
Q  221 gactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtc-actttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaa 319  Q
    ||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||| ||||||||||| |  |||||||||| ||||||||||| ||    |||||| ||||||    
T  24687322 gactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgcggtaccaaatctcaacaaggtcgtcaactttcgatgccacttgcacatcgaatgtaa 24687223  T
Q  320 gatttcacacccgtcttac-ataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaa 381  Q
    |   ||||||| | ||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  24687222 gggctcacacctgccttacaataatct-cgaagtaaaagagttcaactcttttacaacaacaa 24687161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 197 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 3800791 - 3800613
Alignment:
Q  197 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtca-ctttc 294  Q
    |||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||| |||||    
T  3800791 atcaccaatcacatatttcacataggactcatgctatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttc 3800692  T
Q  295 gatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttac-ataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttaca 374  Q
    ||||| ||    |||||| |||||||   ||||||| | ||||| ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  3800691 gatgccacttgcacatcgaatgtaagggctcacacctgccttacaataatct-cgaagtaaaagag-tcatcccttttaca 3800613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 24 - 95
Target Start/End: Original strand, 8941712 - 8941784
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataat 95  Q
    |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8941712 acattatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataat 8941784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 24 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 19888920 - 19888848
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataat 95  Q
    |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19888920 acattatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataat 19888848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 39 - 216
Target Start/End: Original strand, 25210909 - 25211076
Alignment:
Q  39 aataacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaaccccaatatcttacatc 138  Q
    ||||||| |||||||| ||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | | |||    |||||||||||| ||||| |||||| |||||    
T  25210909 aataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataat-tacacat--taatacttacatcacaccccgatatctcacatc 25211005  T
Q  139 aataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 216  Q
    | || ||| ||||||        |||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||    
T  25211006 agtattcatcaatca-------tatgaacaattatcaatttacaattattcattcacaatcaccaatcacatttatca 25211076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 197 - 374
Target Start/End: Original strand, 34822676 - 34822854
Alignment:
Q  197 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtca-ctttc 294  Q
    |||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||| |||||    
T  34822676 atcaccaatcacatatttcacataggactcatgctatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttc 34822775  T
Q  295 gatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttac-ataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttaca 374  Q
    ||||| ||    |||||| |||||||   ||||||| | ||||| ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  34822776 gatgccacttgcacatcgaatgtaagggctcacacctgccttacaataatct-cgaagtaaaagag-tcatcccttttaca 34822854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 142 - 209
Target Start/End: Original strand, 34822578 - 34822645
Alignment:
Q  142 aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcaca 209  Q
    |||||||||| |||||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  34822578 aatcaccaattacatgtatcatgaataaatatcaattcacaaatattcattcacaatcatcaatcaca 34822645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 24 - 93
Target Start/End: Original strand, 6877721 - 6877791
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataata 93  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||| ||||||||    
T  6877721 acattatcataatccaaataacaattaacatgaatatttcaatataaacatcatacacttgaacaataata 6877791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 197 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 19888456 - 19888362
Alignment:
Q  197 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 290  Q
    |||| ||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  19888456 atcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcac 19888362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 108 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 20629243 - 20629142
Alignment:
Q  108 atacttacatcaaaccccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatca 207  Q
    |||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||| | ||||||||||       ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  20629243 atacttacatcacaccccattatctcacatcaataattatcaatcacatg-------aacaattatcaattcacaattattcattcacaatcaccaatca 20629151  T
Q  208 catatatca 216  Q
    ||| |||||    
T  20629150 catttatca 20629142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 108 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 43644814 - 43644713
Alignment:
Q  108 atacttacatcaaaccccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatca 207  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||        |||||||| ||||||| | ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  43644814 atacttacatcacaccccaatatctcacatcaataatcatcaatca-------tatgaacaattatcaattcgcaattattcattcacaatcaccaatca 43644722  T
Q  208 catatatca 216  Q
    ||| |||||    
T  43644721 catttatca 43644713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 197 - 374
Target Start/End: Original strand, 12726531 - 12726709
Alignment:
Q  197 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtca-ctttc 294  Q
    |||| ||||||||||  ||| ||| ||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||| |||||    
T  12726531 atcaccaatcacataattcacataggactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttc 12726630  T
Q  295 gatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttac-ataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttaca 374  Q
    ||||| ||    |||||| |||||||   ||||||| | ||||| ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  12726631 gatgccacttgcacatcgaatgtaagggctcacacctgccttacaataatct-cgaagtaaaagag-tcatcccttttaca 12726709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 144 - 216
Target Start/End: Original strand, 25211108 - 25211180
Alignment:
Q  144 tcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 216  Q
    |||||||| || ||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  25211108 tcaccaattacttgtatcatgaacaattatcaattcacaattattcatacacaatcaccaatcatatacatca 25211180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 142 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 3800889 - 3800822
Alignment:
Q  142 aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcaca 209  Q
    |||||||| |||||||| ||| ||| |||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  3800889 aatcaccattcacatgtatcaggaataaatatcaattcacaaatattcattcacaatcatcaatcaca 3800822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 197 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 5889974 - 5889880
Alignment:
Q  197 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 290  Q
    |||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  5889974 atcaccaatcacatatttcacataggactcatgctatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcac 5889880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 24 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 9654792 - 9654615
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 122  Q
    |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||      |||| | |||||||||||||||   | ||||   |||||||||||| |     
T  9654792 acattatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatat------catgcatttgatcaataataat---cacatattaatacttacatcacat 9654702  T
Q  123 cccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 216  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||        |||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||| | ||||||||| |||||    
T  9654701 cccaatatctcacatcaataatcatcaatca-------tatgaacaattatcaattcacaaatattcattcacaattaccaatcacatttatca 9654615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 197 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 11232929 - 11232835
Alignment:
Q  197 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 290  Q
    |||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  11232929 atcaccaatcacatatttcacataggactcatgctatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcac 11232835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 197 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 14908116 - 14908022
Alignment:
Q  197 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 290  Q
    |||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  14908116 atcaccaatcacatatttcacataggactcatgctatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcac 14908022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 197 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 22514776 - 22514682
Alignment:
Q  197 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 290  Q
    |||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  22514776 atcaccaatcacatatttcacataggactcatgctatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcac 22514682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 197 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 28777377 - 28777283
Alignment:
Q  197 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 290  Q
    |||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  28777377 atcaccaatcacatatttcacataggactcatgctatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcac 28777283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 24 - 96
Target Start/End: Original strand, 22654339 - 22654412
Alignment:
Q  24 acatcatcataatcca-ataacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataata 96  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  |||  |||| ||||| |||||||||||||    
T  22654339 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaatttcatatacttaatcaataataata 22654412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 217 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 24828218 - 24828161
Alignment:
Q  217 ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatc 274  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| |||| |||||||||||||||||||    
T  24828218 ataagactcatgttatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatc 24828161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 217 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 24832670 - 24832613
Alignment:
Q  217 ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatc 274  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| |||| |||||||||||||||||||    
T  24832670 ataagactcatgttatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatc 24832613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 194 - 274
Target Start/End: Original strand, 720835 - 720918
Alignment:
Q  194 acaatcatcaatcacatat-atcaataagactcatgtcatgatatgcacata--tcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatc 274  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||||||| || |||||||||||| ||  ||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  720835 acaatcatcaatcacatttcaccaataagactcgtgacatgatatgcacctagttcgacacatatatgcatgtggtaccaaatc 720918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 197 - 299
Target Start/End: Original strand, 8942124 - 8942228
Alignment:
Q  197 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtca-ctttc 294  Q
    |||| ||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||| |||||  |||||||||||| |  ||||||||||| |||||    
T  8942124 atcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcacttggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttc 8942223  T
Q  295 gatgc 299  Q
    |||||    
T  8942224 gatgc 8942228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 197 - 374
Target Start/End: Original strand, 23773015 - 23773193
Alignment:
Q  197 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtca-ctttc 294  Q
    |||| ||||||||||  ||| ||| ||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||| ||||||||||| |  ||||||||||| |||||    
T  23773015 atcaccaatcacataattcacataggactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgcggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttc 23773114  T
Q  295 gatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttac-ataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttaca 374  Q
    ||||| ||    |||||| |||||||   ||||||| | ||||| ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  23773115 gatgccacttgcacatcgaatgtaagggctcacacctgccttacaataatct-cgaagtaaaagag-tcatcccttttaca 23773193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #86
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 221 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 17398249 - 17398170
Alignment:
Q  221 gactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtca-ctttcgatgc 299  Q
    ||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||| ||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||    
T  17398249 gactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgcggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgc 17398170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #87
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 142 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 3801043 - 3800969
Alignment:
Q  142 aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 216  Q
    |||||||||| |||||| ||||||| ||  || ||| |||| ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  3801043 aatcaccaattacatgtatcatgaataataattaattcacagttattcatacacaatcaccaatcatatacatca 3800969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #88
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 197 - 290
Target Start/End: Original strand, 20013601 - 20013695
Alignment:
Q  197 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 290  Q
    |||| ||||||||||  ||| ||| ||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||| ||||||||||| |  ||||||||||||    
T  20013601 atcaccaatcacataattcacataggactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgcggtaccaaatctcaacaaggtcgtcac 20013695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #89
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 24 - 93
Target Start/End: Original strand, 22273164 - 22273233
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataata 93  Q
    |||| |||||||||||| || || |||||||||||| |||||| ||| ||||||||| |||||||||||||    
T  22273164 acattatcataatccaaatagcagttaacatgaatatttcaat-taatcatcatgtatttgatcaataata 22273233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #90
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 197 - 290
Target Start/End: Original strand, 23818658 - 23818752
Alignment:
Q  197 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 290  Q
    |||| ||||||||||  ||| ||| ||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||| ||||||||||| |  ||||||||||||    
T  23818658 atcaccaatcacataattcacataggactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgcggtaccaaatctcaacaaggtcgtcac 23818752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #91
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 142 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 24089146 - 24089074
Alignment:
Q  142 aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 216  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||  |||||| |||| ||| ||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  24089146 aatcatcaatcacatgtgtcatgaacaatcatcaat-cacattta-tcatgaacaatcatcaatcacatttatca 24089074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #92
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 217 - 267
Target Start/End: Original strand, 25211379 - 25211429
Alignment:
Q  217 ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggta 267  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||    
T  25211379 ataagactcatgttatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggta 25211429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #93
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 162 - 215
Target Start/End: Original strand, 461007 - 461060
Alignment:
Q  162 atgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatc 215  Q
    |||||||| ||||||  ||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||    
T  461007 atgaacaattatcaagtcacaattattcattcacaatcaccaatcacatttatc 461060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #94
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 108 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 23806404 - 23806359
Alignment:
Q  108 atacttacatcaaaccccaatatcttacatcaataatcaccaatca 153  Q
    |||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||| ||||||    
T  23806404 atacttacatcacaccccaatatcccacatcaataatcatcaatca 23806359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0462 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 1)
Name: scaffold0462
Description:

Target: scaffold0462; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 24 - 400
Target Start/End: Original strand, 4425 - 4805
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 122  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||| ||    
T  4425 acatcatcataatccaaataacaattaacatgaataagtcaatataaacatcatgtatttgatcaataataatattcacatatcaatacttacatcatac 4524  T
Q  123 -cccaatatcttacatcaat-aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcac-----atatatc 215  Q
     |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||       |||||  || ||| || | ||||||||||||| ||| |||||||     | |||||    
T  4525 tcccaatatctcacatcaattaatcaccaatcacatg-------aacaatcattaattcatagttattcatacacattcaccaatcaccaatcacatatc 4617  T
Q  216 ---aataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcg 312  Q
       || || |||||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  4618 caaaacaatactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaaacatca 4717  T
Q  313 catgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaatctcaacacgactatgatg 400  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4718 tatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaatctcaacacgactatgatg 4805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 1)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 24 - 400
Target Start/End: Original strand, 13964 - 14354
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatac--atatacttacatca- 119  Q
    |||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||   ||||||||| ||||     
T  13964 acatcaacataatccaaataacagttaacatgaataattcaattcagacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatatacttatatcat 14063  T
Q  120 aaccccaatatcttacatcaataa-tcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaat 218  Q
    ||||||||||||| |||| ||||| ||| |||||  |||||||||||||||  |||||  ||||   |||||||||||||| ||||||||  ||  ||||    
T  14064 aaccccaatatctcacattaataagtcatcaatcgtatgtgtcatgaacaatcatcaaatcacagacattcatacacaatcgtcaatcaccaatcacaat 14163  T
Q  219 ---------aagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaaca 309  Q
             ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  14164 tttcaacataagactcatgtcatgatatgcacttatcgacacataaatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcatcttcgatgcaacaaaaaca 14263  T
Q  310 tcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaatctcaacacgactatgatg 400  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14264 tcgtatgtaagatttgacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagaattcaacccttttacaactacaatctcaacaagactatgatg 14354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0171 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 1)
Name: scaffold0171
Description:

Target: scaffold0171; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 24 - 290
Target Start/End: Original strand, 31038 - 31304
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 122  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |    
T  31038 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcataaaaatacttacatcaa-c 31136  T
Q  123 cccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaataaga 222  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  31137 cccaatatctcacatcaataatcatcaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacaattattcatacacaatcaccaatcacatatatcaataaga 31236  T
Q  223 ctcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 290  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  31237 ctcatgtcatgatatgcacctattgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcagggtcgtcac 31304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 169; Significance: 2e-90; HSPs: 3)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 24 - 290
Target Start/End: Original strand, 20860 - 21128
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatca-aa 121  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| ||| ||||||| | ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  20860 acatcatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatttaagcatcatgcatttgattaacaataatattctcatacatatacttacatcataa 20959  T
Q  122 ccccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaataag 221  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| || |||||||||| |||||||||    
T  20960 tcccaatatctcacatcaataatcaccaatcataagtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaaacaccaatcacatacatcaataag 21059  T
Q  222 actcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 290  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21060 actcatgtcatgatatgcacctatcgacacatatatgcatgtggtaccaaatctcctcaaggtcgtcac 21128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 24 - 291
Target Start/End: Original strand, 28450 - 28719
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaa-a 121  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||  |||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||  |    
T  28450 acatcatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaattgaaacatcatgcatttgatcaacaataatattctcatacatagacttacatcatga 28549  T
Q  122 ccccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaataag 221  Q
     |  ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||| || |||||||||| |||||||||    
T  28550 tctgaatatctcacatcaataatcaccaatcacaagtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatactcaaacaccaatcacatacatcaataag 28649  T
Q  222 actcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcact 291  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  28650 actcatgtcatgatatgcacctatcgacacatatatgcatgtggtgccaaatctcctcaaggtcgtcact 28719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #3
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 202 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 129877 - 129700
Alignment:
Q  202 caatcacatatatcaa-taagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgca 300  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||  || ||| |||| | ||||| |    
T  129877 caatcacatatatcaaataagactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaacgtcttcacctccgatgga 129778  T
Q  301 acaa--aaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaac 376  Q
    ||||   ||||| | |||||||  ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  129777 acaactcaacattgtatgtaagggttcacccccgccttacataatctccaaagtaaaagagctcaactcttttacaac 129700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 164; Significance: 2e-87; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 108 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 249313 - 249025
Alignment:
Q  108 atacttacatcaaaccccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatca 207  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||  |||||||||       ||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||||| ||||||    
T  249313 atacttacatcacaccccaatatctcacatcaataatcattaatcacatg-------aacaattatcaattcacaaatattcattcacaatcaccaatca 249221  T
Q  208 catatatcaataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtc---actttcgatgcaacaa 304  Q
    ||| |   |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||   || |||||||||||||    
T  249220 catttccaaataagactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccagatcacctcaaggtcgtcgtcaccttcgatgcaacaa 249121  T
Q  305 aaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaatctcaacacgactatgatg 400  Q
    |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  249120 aaacatcttatgtaagagttcacacccgtcttacataatctcctaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaatctcaacacgactatgatg 249025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447 (Bit Score: 163; Significance: 6e-87; HSPs: 6)
Name: scaffold0447
Description:

Target: scaffold0447; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 194 - 400
Target Start/End: Original strand, 3095 - 3301
Alignment:
Q  194 acaatcatcaatcacatatatcaataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcacttt 293  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  3095 acaatcaccaatcacatttatcaataagactcatagcatgatatgcacctatcgacacgtacatgcatgtggtaccaaatcacctcaagctcgtcacctt 3194  T
Q  294 cgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaatctcaacacgac 393  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3195 cgatgcaacaaaaacatcgtatgtaaaatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaatctcaacacgac 3294  T
Q  394 tatgatg 400  Q
    |||||||    
T  3295 tatgatg 3301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 142 - 216
Target Start/End: Original strand, 2737 - 2811
Alignment:
Q  142 aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  2737 aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcatagttattcatacacaatcaccaatcacatatatca 2811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447; HSP #3
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 142 - 216
Target Start/End: Original strand, 2865 - 2939
Alignment:
Q  142 aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  2865 aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcatagttattcatacacaatcaccaatcacatatatca 2939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447; HSP #4
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 149 - 216
Target Start/End: Original strand, 2616 - 2683
Alignment:
Q  149 aatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2616 aatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatttacagttattcatacacaatcatcaatcacatatatca 2683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447; HSP #5
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 142 - 216
Target Start/End: Original strand, 2993 - 3067
Alignment:
Q  142 aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||| ||| ||||| |||||    
T  2993 aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcatagttattcatacacaatcaccaaccacatttatca 3067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447; HSP #6
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 24 - 110
Target Start/End: Original strand, 2475 - 2561
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatata 110  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| | |||||||||||| |||| |||||| |||||    
T  2475 acatcatcataatccaaataacagttaacatgaata-ttcaacataaacatcatgcatttgatcaataatgatatcctcatatatata 2561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383 (Bit Score: 163; Significance: 6e-87; HSPs: 7)
Name: scaffold0383
Description:

Target: scaffold0383; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 194 - 400
Target Start/End: Original strand, 5703 - 5909
Alignment:
Q  194 acaatcatcaatcacatatatcaataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcacttt 293  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  5703 acaatcaccaatcacatttatcaataagactcatagcatgatatgcacctatcgacacgtacatgcatgtggtaccaaatcacctcaagctcgtcacctt 5802  T
Q  294 cgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaatctcaacacgac 393  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5803 cgatgcaacaaaaacatcgtatgtaaaatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaatctcaacacgac 5902  T
Q  394 tatgatg 400  Q
    |||||||    
T  5903 tatgatg 5909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383; HSP #2
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 160 - 290
Target Start/End: Original strand, 813 - 943
Alignment:
Q  160 tcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgc 259  Q
    |||||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||| |||||||||| |   |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||    
T  813 tcatgaacaattatcaattcacaaatattcattcacaatcttcaatcacatttccaaataagactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgc 912  T
Q  260 atgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 290  Q
    ||||||||||||||| ||  |||||||||||    
T  913 atgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcac 943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383; HSP #3
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 149 - 216
Target Start/End: Original strand, 5480 - 5547
Alignment:
Q  149 aatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5480 aatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatttacagttattcatacacaatcatcaatcacatatatca 5547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383; HSP #4
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 142 - 216
Target Start/End: Original strand, 5601 - 5675
Alignment:
Q  142 aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||| ||| ||||| |||||    
T  5601 aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcatagttattcatacacaatcaccaaccacatttatca 5675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383; HSP #5
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 24 - 216
Target Start/End: Original strand, 328 - 511
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 122  Q
    |||| |||||||||||| ||||| ||| |||| ||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | | |||    |||||||||||| ||    
T  328 acattatcataatccaaataacagttaccatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataat-tacacat--taatacttacatcacac 424  T
Q  123 cccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 216  Q
    ||| |||||| ||||||||| ||| ||||||        |||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||    
T  425 cccgatatctcacatcaatattcatcaatca-------tatgaacaattatcaatttacaattattcattcacaatcaccaatcacatttatca 511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383; HSP #6
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 24 - 110
Target Start/End: Original strand, 5339 - 5425
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatata 110  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| | |||||||||||| |||| |||||| |||||    
T  5339 acatcatcataatccaaataacagttaacatgaata-ttcaacataaacatcatgcatttgatcaataatgatatcctcatatatata 5425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383; HSP #7
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 142 - 216
Target Start/End: Original strand, 641 - 715
Alignment:
Q  142 aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 216  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  641 aatcaccaattacatgtatcatgaacaattatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcatatacatca 715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0622 (Bit Score: 161; Significance: 1e-85; HSPs: 3)
Name: scaffold0622
Description:

Target: scaffold0622; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 142 - 400
Target Start/End: Original strand, 7842 - 8108
Alignment:
Q  142 aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcac-----atatatc---aataagactcatgtcatg 233  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||  || ||| || | ||||||||||||||||| |||||||     | || |    || |||||||||||||||    
T  7842 aatcaccaatcacatttgtcatgaacaatcattaattcatagttattcatacacaatcaccaatcaccactcacatttgcaaaacaagactcatgtcatg 7941  T
Q  234 atatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgt 333  Q
    |||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  7942 atatgcacctatcgacacataaatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaaacatcgtatgtaagatttcacaaccgt 8041  T
Q  334 cttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaatctcaacacgactatgatg 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8042 cttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaatctcaacacgactatgatg 8108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0622; HSP #2
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 40 - 216
Target Start/End: Original strand, 7453 - 7631
Alignment:
Q  40 ataacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaa--ccccaatatcttacat 137  Q
    |||||| |||||||| ||| |||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  |||    
T  7453 ataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaagaataatattctcatacatatacttacatcaaaaaccccaatatctcccat 7552  T
Q  138 caataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 216  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7553 caataatcaccaatcaaatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatca 7631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0622; HSP #3
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 139 - 216
Target Start/End: Original strand, 7682 - 7759
Alignment:
Q  139 aataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||| ||||| |||||    
T  7682 aataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaatcaccaaccacatttatca 7759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0480 (Bit Score: 161; Significance: 1e-85; HSPs: 1)
Name: scaffold0480
Description:

Target: scaffold0480; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 24 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 7287 - 7012
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacata------tacttaca 116  Q
    |||||||||||||| || ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||| ||||||||||| |||      ||||||||    
T  7287 acatcatcataatcaaaataaaagttaacatgaataattcaatataaacatcatacatttgatcaataatgatattctcatatatacatatatacttaca 7188  T
Q  117 tcaaa-ccccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatc 215  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||    
T  7187 tcaaaaccccaatatctcacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattttcaattattcacacacaatcaccaaacacatatatc 7088  T
Q  216 aataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcact 291  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  7087 aataagactcatgtcatgatatgcacctatcgacacatatatgcatgtggtaccaaataacctcaaggtcgtcact 7012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0396 (Bit Score: 161; Significance: 1e-85; HSPs: 4)
Name: scaffold0396
Description:

Target: scaffold0396; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 196 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 13884 - 13680
Alignment:
Q  196 aatcatcaatcacatatatcaataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcg 295  Q
    ||||| ||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13884 aatcaccaaccacatttatcaataagattcatgtcatgatatacacctattgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcaccttcg 13785  T
Q  296 atgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaatctcaacacgacta 395  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13784 atgcaacaaaaacatcgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaatctcaacacgacta 13685  T
Q  396 tgatg 400  Q
    |||||    
T  13684 tgatg 13680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0396; HSP #2
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 197 - 376
Target Start/End: Original strand, 15922 - 16103
Alignment:
Q  197 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcg 295  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| |||| |||||||||||| |||||| ||  ||||||||||| | ||    
T  15922 atcaccaatcacatatatcacataagactcatgttatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtatcaaatctccaaaaggtcgtcacctccg 16021  T
Q  296 atgcaacaa--aaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaac 376  Q
    |||  ||||   ||||||| |||||||  ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16022 atg-gacaagtcaacatcgtatgtaagggttcacccccgccttacataatctccgaagtaaaagagctcaacccttttacaac 16103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0396; HSP #3
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 123 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 14007 - 13914
Alignment:
Q  123 cccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 216  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14007 cccaacatctcacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatgtcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatca 13914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0396; HSP #4
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 24 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 14154 - 14078
Alignment:
Q  24 acatcatcataatcca-ataacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattc 99  Q
    |||||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||  ||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  14154 acatcatcataatccacataatagttaacatgaatatttcaaactaaacatcatgcacttgatcaataatagtattc 14078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2147 (Bit Score: 156; Significance: 1e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold2147
Description:

Target: scaffold2147; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 24 - 290
Target Start/End: Original strand, 535 - 802
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 122  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| ||| |||||||| |||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||    
T  535 acatcatcataatacaaataacagttagcatgaatatttcaatttaagcatcatgcacttgatcaataataatattctcatatcaatacttacatcaaac 634  T
Q  123 cccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaataaga 222  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||  ||| | |||||||||||||||||||||    
T  635 cccaatatctcacatcaataatcatcaatcacatgtgtcatgaacaattatcaattcacagttattcatacgtaattaccaatcacatatatcaataaga 734  T
Q  223 ctcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 290  Q
    ||||||||||| ||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  735 ctcatgtcatggtatgcacctattgacacatatatgcatgtggtaccaaatctcctaaaggtcgtcac 802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0434 (Bit Score: 155; Significance: 4e-82; HSPs: 2)
Name: scaffold0434
Description:

Target: scaffold0434; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 194 - 400
Target Start/End: Original strand, 3129 - 3335
Alignment:
Q  194 acaatcatcaatcacatatatcaataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcacttt 293  Q
    ||||||| ||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  3129 acaatcaccaaccacatttatcaataagactcgtggcatgatatgcacctattgacacatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcacctt 3228  T
Q  294 cgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaatctcaacacgac 393  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||    
T  3229 cgatgcaacaaaaacatcgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaaccctttttcaactacaaactcaacaagac 3328  T
Q  394 tatgatg 400  Q
    |||||||    
T  3329 tatgatg 3335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0434; HSP #2
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 24 - 216
Target Start/End: Original strand, 2907 - 3101
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatca-aa 121  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||| |||||||| ||||| |||| |||||| || |||  ||    
T  2907 acatcatcataatccaaataatagttaacatgaatatttcaatttaaacatcatgcacttgaacaataatagtattcacataaatatacctatatcccaa 3006  T
Q  122 ccccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 216  Q
      ||||||||| ||| ||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  3007 ttccaatatctcacagcaatagtcactaatcatatgtgtcatgaacaaatatcaattcacggttattcatacacaattaccaatcacatatatca 3101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 152; Significance: 2e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 142 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 4044 - 3784
Alignment:
Q  142 aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatat-atcaataagactcatgtcatgatatgca 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||| |||| ||| |||||||||||||||||| | | |||||| |||||||||||||| ||||    
T  4044 aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaatcatcaat-cacatttat-catgcacaatcatcaatcacatttcaccaataatactcatgtcatgatgtgca 3947  T
Q  241 cata--tcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttac 338  Q
    | ||  ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  3946 cctagttcgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaaacatcgtatgtaagatttcacacccgtcttat 3847  T
Q  339 ataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaa-tctcaacacgactatgatg 400  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  3846 ataatctccgaagtaaaagagctcaacccttttacaactacaagactcaacatgactatgatg 3784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0692 (Bit Score: 149; Significance: 1e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0692
Description:

Target: scaffold0692; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 24 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 1307 - 1046
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 122  Q
    |||||||||||||| || ||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||      ||| | ||   |||||||||||| ||    
T  1307 acatcatcataatcaaaataatagttatcatgaataattcaatataaacatcatgcacttgatcaata------ttcacgtatcaatacttacatcacac 1214  T
Q  123 cccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaataaga 222  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  1213 cccaatatctcacatcaatattcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacaattattcatacccaatcaccaatcacatatatcaataaga 1114  T
Q  223 ctcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 290  Q
    |||||||||| |||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1113 ctcatgtcataatatgcacctattgacacatatatgcatgtggtaccaaatctcctcaaggtcgtcac 1046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195 (Bit Score: 147; Significance: 2e-77; HSPs: 8)
Name: scaffold0195
Description:

Target: scaffold0195; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 141 - 400
Target Start/End: Original strand, 19799 - 20067
Alignment:
Q  141 taatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcac-----atatatc--aataagactcatgtcatg 233  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||| |||||||     | || ||  |||||||||||| |||||    
T  19799 taatcagcaatcacatgtatcaggaacaaatatcaattcacaaatattcattcacaatcaccaatcaccaatcacatttccaaataagactcatatcatg 19898  T
Q  234 atatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcact--ttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacaccc 331  Q
    |||||||| ||| ||| |||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  19899 atatgcacttattgacacattaatgcatttggtaccaaatcacctcaaggtcgtcacgccttcgatgcaacaaaaacatcgtatgtaagagttcacaccc 19998  T
Q  332 gtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaatctcaacacgactatgatg 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19999 gtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacacttttacaactacaatctcaacacgactatgatg 20067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195; HSP #2
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 195 - 400
Target Start/End: Original strand, 17776 - 17983
Alignment:
Q  195 caatcatcaatcacatatatcaataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcact--t 292  Q
    |||||| ||||||||| |   |||||||||||| ||||||||||||| ||| ||| |||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||   |    
T  17776 caatcaccaatcacatttccaaataagactcatatcatgatatgcacttattgacacattaatgcatttggtaccaaatcacctcaaggtcgtcacgcct 17875  T
Q  293 tcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaatctcaacacga 392  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  17876 tcgatgcaacaaaaacatcgtatgtaagagttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacacttttacaactacaatctcaacatga 17975  T
Q  393 ctatgatg 400  Q
    ||||||||    
T  17976 ctatgatg 17983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195; HSP #3
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 247 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 8293 - 8140
Alignment:
Q  247 gacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctc 346  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8293 gacgcataaatgcatgtggtaccgaatcacctcaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaaatatcgtatgtaagatttcacacccgtcttagataatctc 8194  T
Q  347 cgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaatctcaacacgactatgatg 400  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||| |||| ||| ||| ||||||||||    
T  8193 cgaagtaaaagagttcaacctatttacaacaacaaactctacatgactatgatg 8140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195; HSP #4
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 247 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 13682 - 13529
Alignment:
Q  247 gacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctc 346  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13682 gacgcataaatgcatgtggtaccgaatcacctcaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaaatatcgtatgtaagatttcacacccgtcttagataatctc 13583  T
Q  347 cgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaatctcaacacgactatgatg 400  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||| |||| ||| ||| ||||||||||    
T  13582 cgaagtaaaagagttcaacctatttacaacaacaaactctacatgactatgatg 13529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195; HSP #5
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 24 - 216
Target Start/End: Original strand, 17526 - 17716
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaat-aacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 122  Q
    |||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||| | |||||||||||| ||| |||| ||||||||||   ||| ||||   |||||||||||||||    
T  17526 acatcaacataatccaattaacagttaacatggatattccaatataaacattatgcacttcatcaataata---ttcacatatcaatacttacatcaaac 17622  T
Q  123 cccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 216  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  17623 cccaatatctcacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatggacaaatatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcatatacatca 17716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195; HSP #6
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 24 - 216
Target Start/End: Original strand, 19556 - 19746
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaat-aacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 122  Q
    |||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||| | |||||||||||| ||| |||| ||||||||||   ||| ||||   |||||||||||||||    
T  19556 acatcaacataatccaattaacagttaacatggatattccaatataaacattatgcacttcatcaataata---ttcacatatcaatacttacatcaaac 19652  T
Q  123 cccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 216  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  19653 cccaatatctcacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatggacaaatatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcatatacatca 19746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195; HSP #7
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 24 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 8539 - 8466
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataata 96  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||  |||  |||| ||||| |||||| ||||||    
T  8539 acatcatcataatcaaaataacaattaacatgaataattcaattcaaatttcatatacttaatcaatgataata 8466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195; HSP #8
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 24 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 13928 - 13855
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataata 96  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||  |||  |||| ||||| |||||| ||||||    
T  13928 acatcatcataatcaaaataacaattaacatgaataattcaattcaaatttcatatacttaatcaatgataata 13855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 144; Significance: 1e-75; HSPs: 2)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 217 - 400
Target Start/End: Original strand, 27067 - 27250
Alignment:
Q  217 ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatg 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||| |||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  27067 ataagactcatgtcatgatatgcacttatcgacacataaatgcatgtagtaccggatcacctcaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaaacatcgtatg 27166  T
Q  317 taagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaatctcaacacgactatgatg 400  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27167 taagatttcacacccatcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaatctcaacaagactatgatg 27250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 39 - 104
Target Start/End: Original strand, 26889 - 26954
Alignment:
Q  39 aataacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcata 104  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  26889 aataacagttaacatgaataattcaattcagacatcatgtacttgatcaaaaataatattcacata 26954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 142; Significance: 2e-74; HSPs: 5)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 24 - 208
Target Start/End: Original strand, 236412 - 236597
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 122  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  236412 acatcatcataattcaaataacaattaacatgaatatttcaattcaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcgaac 236511  T
Q  123 cccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcac 208  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  236512 cccaatatctgacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacaccattattcatacacaatcaccaatcac 236597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #2
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 195 - 400
Target Start/End: Original strand, 236652 - 236857
Alignment:
Q  195 caatcatcaatcacatatatcaataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttc 294  Q
    |||||| ||||||||| |   |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||  |||||||| |||||||||| |||    
T  236652 caatcaccaatcacatttccaaataagactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccttatcacctctaggtcgtcaccttc 236751  T
Q  295 gatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaatctcaacacgact 394  Q
    ||||| ||   ||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  236752 gatgctactttaacatcgtatgtaagatttcacacctttcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaatctcaacacgact 236851  T
Q  395 atgatg 400  Q
    ||||||    
T  236852 atgatg 236857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #3
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 142 - 380
Target Start/End: Original strand, 270545 - 270785
Alignment:
Q  142 aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaa-taagactcatgtcatgatatgca 240  Q
    |||||||||| |||||| ||||||| || ||||||| ||||| ||||||| |||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  270545 aatcaccaattacatgtatcatgaataa-tatcaattcacaaatattcattcacaatcaccaatcacaaatatcaaataagactcatgtcatgatatgca 270643  T
Q  241 catatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaa--aacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttac 338  Q
    | ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||  ||| ||||||| | ||||| |||||   ||||||| |||||||  ||||| |||| |||||    
T  270644 cttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaagatcgtcacctccgatggaacaactcaacatcgtatgtaagggttcacccccgccttac 270743  T
Q  339 ataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactaca 380  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  270744 ataatctccgaaataaaagagctcaacccttttacaactaca 270785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #4
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 24 - 216
Target Start/End: Original strand, 270329 - 270515
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 122  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||    
T  270329 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatatcaatacttacatcaaac 270428  T
Q  123 cccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 216  Q
    |||||||||| ||||||||| ||| ||||||        |||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||| | ||||||||| |||||    
T  270429 cccaatatctcacatcaatattcatcaatca-------tatgaacaattatcaattcacaaatattcattcacaataaccaatcacatttatca 270515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #5
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 296 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 256007 - 255963
Alignment:
Q  296 atgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacat 340  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||    
T  256007 atgcaacaaaaacatcaaatgtaagatttcatacccgtcttacat 255963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 141; Significance: 9e-74; HSPs: 3)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 24 - 216
Target Start/End: Original strand, 27950 - 28145
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 122  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27950 acatcatcataatccaaataacagttagcatgaatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 28049  T
Q  123 --cccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 216  Q
      |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  28050 accccaatatctcacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatca 28145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116; HSP #2
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 142 - 290
Target Start/End: Original strand, 28179 - 28327
Alignment:
Q  142 aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaataagactcatgtcatgatatgcac 241  Q
    ||||| ||| ||||| | |||| ||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28179 aatcatcaaccacatatatcattaacaaatatcaattcacagttattcatactcaatcatcaaacacaaatatcaataagactcatgtcatgatatgcac 28278  T
Q  242 atatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 290  Q
     ||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  28279 ctattgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcagggtcgtcac 28327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116; HSP #3
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 142 - 216
Target Start/End: Original strand, 28125 - 28199
Alignment:
Q  142 aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 216  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| |||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  28125 aatcaccaatcacatatatcatgaacaagtatcaattcacagttattcatactcaatcatcaaccacatatatca 28199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051 (Bit Score: 141; Significance: 9e-74; HSPs: 2)
Name: scaffold0051
Description:

Target: scaffold0051; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 161 - 400
Target Start/End: Original strand, 56369 - 56615
Alignment:
Q  161 catgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatca-------atcacatatatcaataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcat 253  Q
    |||||||||| |||||| |||| ||| ||||||||||||||||       ||||||| |   |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||    
T  56369 catgaacaaacatcaattcacagttactcatacacaatcatcattcaacaatcacatttccaaataagactcatgtcatgatatgcacttattgacacat 56468  T
Q  254 acatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagta 353  Q
    | ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  56469 aaatgcatgtggtaccaaatcaccaaaaggtcgtcacattcgatgcaacaaaaacatcgtatgtaagaattcaaacccgtcttacataatctctgaagta 56568  T
Q  354 aaagagttcaacccttttacaactacaatctcaacacgactatgatg 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  56569 aaagagttcaacccttttacaactacaatctcaacatgactatgatg 56615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 24 - 196
Target Start/End: Original strand, 56206 - 56370
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatca-aa 121  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||  |||||          |||||||||||| ||    
T  56206 acatcatcataatccaaataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaatataaatat----------atacttacatcataa 56295  T
Q  122 ccccaatatcttacatcaataa-tcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacaca 196  Q
    ||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||    
T  56296 ccctaatatctcacatcaataaatcaccaatcacatg-gtcatgaacaaacatcaattcacagttattcatacaca 56370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0269 (Bit Score: 138; Significance: 5e-72; HSPs: 4)
Name: scaffold0269
Description:

Target: scaffold0269; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 24 - 215
Target Start/End: Original strand, 3055 - 3248
Alignment:
Q  24 acatcatcataatcca-ataacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaa- 121  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  3055 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaatataaaaatcatgcacttgatcaataataatattctcatatatatacttacatcaaaa 3154  T
Q  122 ccccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatc 215  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3155 ccccaatatctcacattaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcacttcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatc 3248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0269; HSP #2
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 24 - 216
Target Start/End: Original strand, 281 - 477
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatata--cttacatcaa 120  Q
    |||| |||||||||||| ||||| ||| |||| ||| ||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||    
T  281 acattatcataatccaaataacagttagcatggatatttcaattcaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatatatatatacttacatcaa 380  T
Q  121 a-ccccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 216  Q
    | |||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  381 aaccccaatatcttacctcaacaatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaaatatcaattcacatttattcatacacaatcaccaatcatatacatca 477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0269; HSP #3
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 216 - 376
Target Start/End: Original strand, 577 - 739
Alignment:
Q  216 aataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaa--aaacatcgc 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| | ||||| |||||   |||||||     
T  577 aataagactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcacctccgatggaacaactcaacatcgt 676  T
Q  314 atgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaac 376  Q
    |||||||  ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  677 atgtaagggttcacccccgccttacataatctccgaagtaaaagagctcaacccttttacaac 739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0269; HSP #4
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 202 - 290
Target Start/End: Original strand, 3430 - 3518
Alignment:
Q  202 caatcacatatatcaataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  3430 caatcacatatatcaataagactcatgtcatgatatgcacctatcgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcagggtcgtcac 3518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 138; Significance: 5e-72; HSPs: 2)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 24 - 215
Target Start/End: Original strand, 30650 - 30843
Alignment:
Q  24 acatcatcataatcca-ataacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatc-aaa 121  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  30650 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaatataaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatatatatacttacatcaaaa 30749  T
Q  122 ccccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatc 215  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  30750 ccccaatatctcacattaataatcaccattcacatgtgtcatgaacaaatatcacttcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatc 30843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 202 - 290
Target Start/End: Original strand, 31002 - 31090
Alignment:
Q  202 caatcacatatatcaataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  31002 caatcacatatatcaataagactcatgtcatgatatgcacctatcgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcagggtcgtcac 31090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0190 (Bit Score: 135; Significance: 3e-70; HSPs: 2)
Name: scaffold0190
Description:

Target: scaffold0190; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 141 - 400
Target Start/End: Original strand, 8493 - 8754
Alignment:
Q  141 taatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaataagactcatgtcatgatatgca 240  Q
    ||||||||| ||||| || ||||||||||  | |||  |||| ||||||||||||||||| ||||| ||  |   || ||||||||||||||||| ||||    
T  8493 taatcaccactcacacgtatcatgaacaatcaccaaatcacagttattcatacacaatcaccaatctcaattcaaaacaagactcatgtcatgatgtgca 8592  T
Q  241 catat--cgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttac 338  Q
    | ||   |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8593 cctagtccgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggccgtcacctccgattcaacaaaaacatcgtatgtaagatttcacacccgtcttac 8692  T
Q  339 ataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaatctcaacacgactatgatg 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  8693 ataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaaactcaacaagactatgatg 8754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0190; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 24 - 79
Target Start/End: Original strand, 8387 - 8443
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgta 79  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  8387 acatcatcataatccaaataacaattaacatgaataattcactataaacgtcatgta 8443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359 (Bit Score: 134; Significance: 1e-69; HSPs: 2)
Name: scaffold0359
Description:

Target: scaffold0359; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 24 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 13740 - 13548
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 122  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13740 acatcatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 13641  T
Q  123 cccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 216  Q
    |||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  13640 cccaatatctcacatcaatattcactaatcacatgtgtcatgaac-aatatcaattcacaattatttatacacaatcaccaatcacaaatatca 13548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 166 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 13557 - 13434
Alignment:
Q  166 acaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtgg 265  Q
    |||||||||| |  ||||||| |||||||||||||  || |||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| |||| ||||||||||    
T  13557 acaaatatcatttaacaattactcatacacaatcactaaacacatatatcaa-aagactcatgtcatgatatgaacctatcgacacatatatgcatgtgg 13459  T
Q  266 taccaaatcacctcaaggtcgtcac 290  Q
    ||||||||||| |||||||||||||    
T  13458 taccaaatcacttcaaggtcgtcac 13434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 132; Significance: 2e-68; HSPs: 3)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 24 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 15271 - 15006
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacat--atacttacatcaa 120  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||     |||||||  ||||||||||||     
T  15271 acatcatcataatccaaataacagttaacatgaataattcaatttaaacatcatgcatttgatcaataataat-----catacattaatacttacatcac 15177  T
Q  121 accccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaa-tcatcaatcacatatatcaata 219  Q
    |||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||| ||| | ||||||| ||||| ||| || |||||| ||||||||    
T  15176 accccaatatctcacatcaataataatcaatcacatgtgtcatgaacaattatcaattcactaatattcattcacaaatcaccagtcacatgtatcaata 15077  T
Q  220 agactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 290  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||| |||||| |||| |||||||||    
T  15076 agactcatgtcatgatatgcacctattgacacatatatgcatgtggtacaaaatcatctcagggtcgtcac 15006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #2
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 24 - 215
Target Start/End: Original strand, 26451 - 26642
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 122  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| |    
T  26451 acatcatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatataaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatatcaatacttacatcaa-c 26549  T
Q  123 cccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatc 215  Q
    |||||||||| ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26550 cccaatatctcacattcataatcatcaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatc 26642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #3
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 307 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 24009 - 23915
Alignment:
Q  307 acatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaa-tctcaacacgactatgatg 400  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  24009 acatcgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatcttcgaagtaaaagagctcaacccttttacaactacaagactcaacatgactatgatg 23915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0673 (Bit Score: 127; Significance: 2e-65; HSPs: 2)
Name: scaffold0673
Description:

Target: scaffold0673; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 106 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 3893 - 3707
Alignment:
Q  106 atatacttacatcaaa-ccccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaa-tatcaatacacaattattcatacacaatcatca 203  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||| |||||||    
T  3893 atatacttacatcaaaaccccaatatctcacattaataatcactaatcacatgtgtcatgaacaaaatatcaattcacaattattcacacaccatcatca 3794  T
Q  204 atcacatatatcaataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 290  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3793 atcacatatatcaacaaaactcatgtcatgatatgcacctatcgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 3707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0673; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 24 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 4014 - 3927
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatata 110  Q
    ||||||| ||||||||| ||| | |||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  4014 acatcattataatccaaataatagttaacatgaatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatatatata 3927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0483 (Bit Score: 126; Significance: 8e-65; HSPs: 2)
Name: scaffold0483
Description:

Target: scaffold0483; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 24 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 4831 - 4638
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 122  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||    
T  4831 acatcatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatatcaatacttacatcaaac 4732  T
Q  123 cccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 216  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  4731 cccaatatctcacatcaataatcaccaattacatgtgtcatgaacaaatatcaatttacagttattcatacacaatcaccaatcatatacatca 4638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0483; HSP #2
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 194 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 4435 - 4250
Alignment:
Q  194 acaatcatcaatcacatatatcaa-taagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactt 292  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| |    
T  4435 acaatcaccaatcacatatatcaaataagagtaatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcacct 4336  T
Q  293 tcgatgcaacaaa--aacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaac 376  Q
     ||||| |||||   ||||||| |||||||  ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4335 ccgatggaacaactcaacatcgtatgtaagggttcacccccgccttacataatctccgaagtaaaagagctcaacccttttacaac 4250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 126; Significance: 8e-65; HSPs: 2)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 24 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 49671 - 49478
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 122  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||    
T  49671 acatcatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatatcaatacttacatcaaac 49572  T
Q  123 cccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 216  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  49571 cccaatatctcacatcaataatcaccaattacatgtgtcatgaacaaatatcaatttacagttattcatacacaatcaccaatcatatacatca 49478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #2
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 194 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 49275 - 49090
Alignment:
Q  194 acaatcatcaatcacatatatcaa-taagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactt 292  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| |    
T  49275 acaatcaccaatcacatatatcaaataagagtaatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcacct 49176  T
Q  293 tcgatgcaacaaa--aacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaac 376  Q
     ||||| |||||   ||||||| |||||||  ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  49175 ccgatggaacaactcaacatcgtatgtaagggttcacccccgccttacataatctccgaagtaaaagagctcaacccttttacaac 49090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 124; Significance: 1e-63; HSPs: 4)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 131 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 26575 - 26416
Alignment:
Q  131 cttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaataagactcatgtc 230  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26575 cttacatcaataatcatcaatcacatgtgtcatgaacaaatctcaattcacaattattcatacacaatcaccaatcacatatatcaataagactcatgtc 26476  T
Q  231 atgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 290  Q
    | ||||||||| ||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26475 aagatatgcacctattgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 26416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 280 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 71003 - 70883
Alignment:
Q  280 aaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactac 379  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  71003 aaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaaacatcgtatggaagatttcacacctatcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactac 70904  T
Q  380 aatctcaacacgactatgatg 400  Q
    |||||||||| ||||||||||    
T  70903 aatctcaacatgactatgatg 70883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #3
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 24 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 66592 - 66322
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatca-aa 121  Q
    ||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||   |||||||||||| ||    
T  66592 acatcatcataatccaaatgacatttaacatgaataattcaatataatcatcatgtacttgctcaataataatattcacatatcaatacttacatcataa 66493  T
Q  122 ccccaatatcttacatcaa-taatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcataca-------caatcatcaatcacatata 213  Q
     | |||||||| | ||||| |||||||||||||||||  ||||||||||  |||||| || | ||| |||||||       |||||| ||||||||  |     
T  66492 tctcaatatctcatatcaattaatcaccaatcacatgaatcatgaacaatcatcaatccatagttactcatacacaattcccaatcaccaatcacacttc 66393  T
Q  214 tcaataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggt 284  Q
      |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||  |||||||||||||    
T  66392 aaaataagactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggt 66322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #4
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 24 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 26660 - 26590
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaat-aacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataata 93  Q
    |||||||||||||||||  |||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  26660 acatcatcataatccaaagaacagttaacatgaatatttcaatataaacatcatgcacttgatcaataata 26590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 123; Significance: 5e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 24 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 21827 - 21633
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaa- 121  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||| ||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  21827 acatcatcataatccaaataacagttagcataaatatttcaatataaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatatatatacttacatcaaaa 21728  T
Q  122 ccccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 216  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  21727 ccccaatatctcacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaaaaaatgtcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcatatacatca 21633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 122; Significance: 2e-62; HSPs: 5)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 24 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 156376 - 156183
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 122  Q
    |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||    
T  156376 acattatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatatcaatacttacatcaaac 156277  T
Q  123 cccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 216  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  156276 tccaatatctcacatcaataatcaccaattacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcatatacatca 156183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 24 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 86149 - 85966
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacat--atacttacatcaa 120  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| | ||||||||||| ||     ||| ||||  ||||||||||||     
T  86149 acattatcataatccaaataacaattaacatgaatatttcactataaacatcatgcatttgatcaataacaa-----tcacacattaatacttacatcac 86055  T
Q  121 accccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 216  Q
    |||||||||||  ||||||||||||| ||||||        |||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||||| ||||||||| |||||    
T  86054 accccaatatcccacatcaataatcatcaatca-------tatgaacaattatcaattcacaaatattcattcacaatcaacaatcacatttatca 85966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 196 - 372
Target Start/End: Original strand, 34811 - 34989
Alignment:
Q  196 aatcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtca-cttt 293  Q
    ||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||| ||||    
T  34811 aatcaccaatcacatatttcacataggactcatgctatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcaccttt 34910  T
Q  294 cgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttac-ataatctccgaagtaaaagagttcaaccctttta 372  Q
    |||||| ||    |||||| |||||||   ||||||| | ||||| ||||| | |||||||||||||||||| |||||||    
T  34911 cgatgccacttgcacatcgtatgtaagggctcacacctgccttacaataatat-cgaagtaaaagagttcaatcctttta 34989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 142 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 156129 - 156062
Alignment:
Q  142 aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcaca 209  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||| ||||||||    
T  156129 aatcaccaatcacatgtatcaggaacaaatatcaattcacaaatattcattcacaatcaccaatcaca 156062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #5
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 197 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 156031 - 155937
Alignment:
Q  197 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 290  Q
    |||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| ||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||    
T  156031 atcaccaatcacatatgtcacataagactcatgttatgatctgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcac 155937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 119; Significance: 1e-60; HSPs: 2)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 247 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 71922 - 71768
Alignment:
Q  247 gacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctc 346  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  71922 gacgcataaatgcctgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaaaacatcgtatgtaagatttcacaaccgtcttacataatctc 71823  T
Q  347 cgaagtaaaagagttcaacccttttacaactac-aatctcaacacgactatgatg 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||    
T  71822 cgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaaaactcaacatgactatgatg 71768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 24 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 72166 - 72093
Alignment:
Q  24 acatcatcataatcca-ataacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataata 96  Q
    |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||| |  ||| ||||| ||||| |||||| ||||||    
T  72166 acatcatcataatccacataatagttaacatgaataattcatttcaaatatcatatacttaatcaatgataata 72093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 117; Significance: 2e-59; HSPs: 2)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 24 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 2658 - 2474
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 122  Q
    |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |   |||||||||||||||    
T  2658 acattatcataatccaaataacatttaacatgaatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcaaatcaatacttacatcaaac 2559  T
Q  123 cccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatca 207  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||||||    
T  2558 cccaatatctcacatcaatattcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaattaccaatca 2474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342; HSP #2
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 24 - 290
Target Start/End: Original strand, 4078 - 4346
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatca-aa 121  Q
    |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||| ||||| |||| | ||||||| |||| ||    
T  4078 acatcatcataatcaaaataacagttaacatgaataattcaatataaacatcatgtgcttgatc---aatagtattcacatatacatacttatatcataa 4174  T
Q  122 ccccaatatcttacatcaa-taatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaataa 220  Q
     |||||| ||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||   | |||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||  |   || ||    
T  4175 tcccaatttctcacatcaattaataaccaatcacatgtgtcatgaacactcaccaaatcacagttattcatacacaatcaccaatcacaattcaaaacaa 4274  T
Q  221 gactcatgtcatgatatgcacata--tcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 290  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||   |||| |||| || ||||||||||||  |||| |||||||||||||    
T  4275 gactcatgtcatgatgtgcacctagcccgacacatatatacatgtggtaccatttcacttcaaggtcgtcac 4346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 115; Significance: 3e-58; HSPs: 3)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 26 - 216
Target Start/End: Original strand, 77600 - 77793
Alignment:
Q  26 atcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaa--c 122  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  77600 atcatcataatccaaataacatttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcatttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaaaac 77699  T
Q  123 cccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 216  Q
    || ||||||| ||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  77700 cctaatatctcacatccataaccaccaatcaaatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatgcacaatcaccaatcacatatatca 77793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 216 - 274
Target Start/End: Original strand, 77919 - 77977
Alignment:
Q  216 aataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatc 274  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||| ||| ||| |||| |||||||||||||||||||    
T  77919 aataagactcatatcatgatatacacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatc 77977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 122 - 169
Target Start/End: Original strand, 35999 - 36047
Alignment:
Q  122 ccccaatatcttacatcaataa-tcaccaatcacatgtgtcatgaacaa 169  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  35999 ccccaatatctcacatcaataaatcaccaatcacatgtatcatgaacaa 36047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0610 (Bit Score: 111; Significance: 7e-56; HSPs: 2)
Name: scaffold0610
Description:

Target: scaffold0610; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 250 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 2262 - 2112
Alignment:
Q  250 gcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccga 349  Q
    ||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2262 gcataaatgcatgtggtaccggatcacctcaagatcgtcaccttcgattcaacaaaaacatcgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccga 2163  T
Q  350 agtaaaagagttcaacccttttacaactacaatctcaacacgactatgatg 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  2162 agtaaaagagttcaacccttttacaactacaaactctacatgactatgatg 2112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0610; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 24 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 2511 - 2438
Alignment:
Q  24 acatcatcataatcca-ataacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataata 96  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  |||  |||| ||||| |||||| ||||||    
T  2511 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaatccaaatttcatatacttaatcaatgataata 2438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0253 (Bit Score: 111; Significance: 7e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0253
Description:

Target: scaffold0253; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 24 - 207
Target Start/End: Original strand, 14849 - 15032
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaa- 121  Q
    |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||   ||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  14849 acattatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatt--aacatcatgcatttgatcaataataatattctcatatatatacttacatcaaaa 14946  T
Q  122 ccccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatca 207  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||| ||||||    
T  14947 ccccaatatctcacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcgtacacaatcaccaatca 15032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 111; Significance: 7e-56; HSPs: 6)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 251 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 106559 - 106409
Alignment:
Q  251 catacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaa 350  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  106559 cataaatgcatgtggtaccgaatcacctcaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaaatatcgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaa 106460  T
Q  351 gtaaaagagttcaacccttttacaactacaa-tctcaacacgactatgatg 400  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  106459 gtaaaagagctcaacccttttacaactacaagactcaacatgactatgatg 106409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 24 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 114150 - 113902
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatca-aa 121  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| |||| | ||||||| |||| ||    
T  114150 acatcatcataattcaaataacagttaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaat---aatattcacatataaatacttatatcataa 114054  T
Q  122 ccccaatatcttacatcaa-taatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaataa 220  Q
     |||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | |||  || | ||||| ||||||||||| ||||||||  |   || ||    
T  114053 tcccaatttctcacatcaattaatcaccaatcacatgtgtcatgaacaatcaccaaatcatagttatttatacacaatcaccaatcacaattcaaaacaa 113954  T
Q  221 gactcatgtcatgatatgcacata--tcgacgcatacatgcatgtggtacca 270  Q
    |||||||||| |||| ||||| ||   |||| |||| |||||||||||||||    
T  113953 gactcatgtcttgatgtgcacctagtccgacacatatatgcatgtggtacca 113902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 197 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 6830 - 6649
Alignment:
Q  197 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcg 295  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| | ||    
T  6830 atcaccaatcacatatatcacataagactcatgttatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcacctccg 6731  T
Q  296 atgcaacaa--aaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaac 376  Q
    |||  ||||   ||||||| |||||||  ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6730 atg-gacaagtcaacatcgtatgtaagggttcacccccgccttacataatctccgaagtaaaagagctcaacccttttacaac 6649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #4
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 246 - 359
Target Start/End: Original strand, 130409 - 130522
Alignment:
Q  246 cgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatct 345  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| | |||     
T  130409 cgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcacccatgatgcaacaaaaacatcatatgtaagatttcacaccggtcttacgttatca 130508  T
Q  346 ccgaagtaaaagag 359  Q
    ||||||||||||||    
T  130509 ccgaagtaaaagag 130522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #5
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 197 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 59117 - 58936
Alignment:
Q  197 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcg 295  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||      ||||||||||| | ||    
T  59117 atcaccaatcacatatatcacataagactcatgttatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaattttaaaaaggtcgtcacctccg 59018  T
Q  296 atgcaacaa--aaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaac 376  Q
    |||  ||||   ||||||  |||||||  ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  59017 atg-gacaagtcaacatcttatgtaagggttcacccccgccttacataatctccgaagtaaaagagctcaacccttttacaac 58936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #6
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 194 - 290
Target Start/End: Original strand, 108058 - 108156
Alignment:
Q  194 acaatcatcaatcacatatatcaataagactcatgtcatgatatgcac--atatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 290  Q
    |||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||||||| |||||  |  ||||| |||| |||||||||||||||  |||| |||||||||||||    
T  108058 acaaccatcaatcacatttcccaataagactcatgtcatgatgtgcaccaagttcgacacatatatgcatgtggtaccatttcacttcaaggtcgtcac 108156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292 (Bit Score: 110; Significance: 3e-55; HSPs: 2)
Name: scaffold0292
Description:

Target: scaffold0292; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 24 - 215
Target Start/End: Original strand, 17735 - 17928
Alignment:
Q  24 acatcatcataatcca-ataacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaa-a 121  Q
    ||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  |    
T  17735 acatcatcaaaatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacaccatgtacttgatcaataataatattctcatatatatacttatatcatta 17834  T
Q  122 ccccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatc 215  Q
     ||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  17835 tcccaatacctcacattaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattaacagttattaatacacaatcaccaatcacatatatc 17928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 194 - 290
Target Start/End: Original strand, 18055 - 18151
Alignment:
Q  194 acaatcatcaatcacatatatcaataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 290  Q
    ||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18055 acaatcaccaaccacatttatcaataagactcatgtcatgatatgcacctattgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 18151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0191 (Bit Score: 110; Significance: 3e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0191
Description:

Target: scaffold0191; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 24 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 683 - 499
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 122  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||   ||| ||||   |||||||||||||||    
T  683 acatcatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatataaacatcatgcacttgatcaataata---ttcacatatcaatacttacatcaaac 587  T
Q  123 cccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacat 210  Q
    |||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||| |||||||||    
T  586 cccaatatctcatattaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacaccatcaccaatcacat 499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 106; Significance: 7e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 39 - 216
Target Start/End: Original strand, 29653 - 29830
Alignment:
Q  39 aataacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaaccccaatatcttacatc 138  Q
    ||||||| |||||||| ||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |   ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  29653 aataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattcacaaatcaatacttacatcaaaccccaatatctcacatc 29752  T
Q  139 aataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 216  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  29753 aataatcaccaatcacatgtgtaatgaacaaatatcaattcaccgttattcatacacaatcaccaatcatatacatca 29830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 105; Significance: 3e-52; HSPs: 4)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 184 - 361
Target Start/End: Original strand, 68785 - 68964
Alignment:
Q  184 ttattcatacacaatcatcaatcacatatatcaataagactcatgtcatgatatgcacatat--cgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaa 281  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||  |   || ||||||||||||||||| ||||| ||   |||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  68785 ttattcatacacaatcaccaatcacaattcaaaacaagactcatgtcatgatgtgcacctagtccgacacatatatgcatgtggtaccatatcacctcaa 68884  T
Q  282 ggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagtt 361  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  68885 ggtcgtcaccttcgatgcaacaaaaacatcgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatctcccaagtaaaagagtt 68964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 27 - 200
Target Start/End: Original strand, 68597 - 68773
Alignment:
Q  27 tcatcataatcca-ataacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatca-aaccc 124  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||| |||| || ||    
T  68597 tcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattcgcatataaatacttatatcataatcc 68696  T
Q  125 caatatcttacatca-ataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatca 200  Q
    |||| ||| ||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||  | |||  |||| |||||||||||||||||    
T  68697 caatttctcacatcagttaatcaccaatcacatgtatcatgaacaatcaccaaatcacagttattcatacacaatca 68773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 353 - 400
Target Start/End: Original strand, 69394 - 69441
Alignment:
Q  353 aaaagagttcaacccttttacaactacaatctcaacacgactatgatg 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  69394 aaaagagttcaacccttttacaactacaaactcaacatgactatgatg 69441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #4
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 24 - 241
Target Start/End: Original strand, 30314 - 30531
Alignment:
Q  24 acatcatcataatcca-ataacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatca-ataataatattctcatacatatacttacatcaaa 121  Q
    |||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||  ||| |||||| | || |||  |||||||||| | |||| |||| | |||   ||     
T  30314 acatcatcataatctatataataattaacatgaataattcaattcaaatatcatgcatttaatccgataataatat-cacatatatattcatactataat 30412  T
Q  122 ccccaatatcttacatcaat-aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatat-atcaata 219  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    ||||| |||| ||||||| ||||||| |||||||| || | | |||||    
T  30413 cccca-tatctcacatcaatcaatcaccagtcacatgtgtcatgaacattcttcaat-cacatttattcacacacaattatcaatcatatttcaccaata 30510  T
Q  220 agactcatgtcatgatatgcac 241  Q
    ||||||||| |||||| |||||    
T  30511 agactcatg-catgatgtgcac 30531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 101; Significance: 6e-50; HSPs: 3)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 24 - 216
Target Start/End: Original strand, 33395 - 33580
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 122  Q
    |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||        ||||||||||||||     
T  33395 acattatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattc--------atacttacatcaaat 33486  T
Q  123 cccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 216  Q
    |||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  33487 cccaatatctcacattaataatcatcaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacatttattcatacacaatcaccaatcatatacatca 33580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184; HSP #2
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 202 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 32869 - 32688
Alignment:
Q  202 caatcacatatatcaa-taagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgca 300  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| | ||||| |    
T  32869 caatcacatatatcaaataagactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcacctccgatgga 32770  T
Q  301 acaaa--aacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactaca 380  Q
    ||||   ||||||| |||||||  ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  32769 acaactcaacatcgtatgtaagggttcacccccgccttacataatctccgaagtaaaagagctcaacccttttacaactaca 32688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184; HSP #3
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 167 - 290
Target Start/End: Original strand, 33725 - 33848
Alignment:
Q  167 caaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggt 266  Q
    |||| |||||| |||||||||||| ||| | ||| ||||||||| |   |||| ||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| |||||||||||    
T  33725 caaacatcaattcacaattattcacacatactcaccaatcacattttcaaatatgactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggt 33824  T
Q  267 accaaatcacctcaaggtcgtcac 290  Q
    |||||||| ||  |||||||||||    
T  33825 accaaatctccaaaaggtcgtcac 33848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 101; Significance: 6e-50; HSPs: 3)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 24 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 39449 - 39264
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 122  Q
    |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||        ||||||||||||||     
T  39449 acattatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattc--------atacttacatcaaat 39358  T
Q  123 cccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 216  Q
    |||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  39357 cccaatatctcacattaataatcatcaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacatttattcatacacaatcaccaatcatatacatca 39264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078; HSP #2
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 202 - 380
Target Start/End: Original strand, 39975 - 40156
Alignment:
Q  202 caatcacatatatcaa-taagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgca 300  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| | ||||| |    
T  39975 caatcacatatatcaaataagactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcacctccgatgga 40074  T
Q  301 acaaa--aacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactaca 380  Q
    ||||   ||||||| |||||||  ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  40075 acaactcaacatcgtatgtaagggttcacccccgccttacataatctccgaagtaaaagagctcaacccttttacaactaca 40156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078; HSP #3
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 167 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 39119 - 38996
Alignment:
Q  167 caaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggt 266  Q
    |||| |||||| |||||||||||| ||| | ||| ||||||||| |   |||| ||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| |||||||||||    
T  39119 caaacatcaattcacaattattcacacatactcaccaatcacattttcaaatatgactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggt 39020  T
Q  267 accaaatcacctcaaggtcgtcac 290  Q
    |||||||| ||  |||||||||||    
T  39019 accaaatctccaaaaggtcgtcac 38996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0338 (Bit Score: 100; Significance: 3e-49; HSPs: 2)
Name: scaffold0338
Description:

Target: scaffold0338; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 27 - 216
Target Start/End: Original strand, 6984 - 7175
Alignment:
Q  27 tcatcataatcca-ataacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatca-aaccc 124  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  | |  ||||||||  ||| || ||    
T  6984 tcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcatacatgtatacttatctcataatcc 7083  T
Q  125 caatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 216  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7084 cgatatctcacatcaataatcaccaatcacacgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatca 7175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0338; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 206 - 290
Target Start/End: Original strand, 7214 - 7298
Alignment:
Q  206 cacatatatcaataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 290  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  7214 cacatttatcaataagactcatgtcatgatatgcacctattgacacatatatgcatgtggtactaaatcacctcaaggtcgtcac 7298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 99; Significance: 1e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 251 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 4991 - 4842
Alignment:
Q  251 catacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaa 350  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4991 cataaatgcatgtggtaccgaatcacctcaaggtcgtcacctt-gatgcaacaaaaacatcgtatgtaagatttcacacccgtcatacataatctccgaa 4893  T
Q  351 gtaaaagagttcaacccttttacaactacaa-tctcaacacgactatgatg 400  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  4892 gtaaaagagctcaactcttttacaactacaagactcaacatgactatgatg 4842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0158 (Bit Score: 99; Significance: 1e-48; HSPs: 2)
Name: scaffold0158
Description:

Target: scaffold0158; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 24 - 173
Target Start/End: Original strand, 23040 - 23190
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 122  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||    
T  23040 acatcatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatataaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatatcaatacttacatcaaac 23139  T
Q  123 cccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatat 173  Q
    |||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||  |||||||||||    
T  23140 cccaatatctcacattaataatcatcaatcacatgtgttctgaacaaatat 23190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0158; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 24 - 92
Target Start/End: Original strand, 16376 - 16445
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataat 92  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16376 acatcatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatataaacatcatgcacttgatcaataat 16445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0597 (Bit Score: 98; Significance: 4e-48; HSPs: 2)
Name: scaffold0597
Description:

Target: scaffold0597; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 142 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 2869 - 2627
Alignment:
Q  142 aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaa-taagactcatgtcatgatatg-- 238  Q
    |||||||||| |||||| ||||||| ||  || ||| ||||| ||||||| |||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||      
T  2869 aatcaccaattacatgtatcatgaataatcattaat-cacaaatattcattcacaatcaccaatcacaaatatcaaataagactcatgtcatgatatgtg 2771  T
Q  239 cacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaa--aacatcgcatgtaagatttcacacccgtctt 336  Q
    ||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| |  |||| |||||   ||||||| |||||||  ||||| ||||||||    
T  2770 cacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcacctctgatggaacaactcaacatcgtatgtaagggttcacccccgtctt 2671  T
Q  337 acataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactaca 380  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2670 acataatctccgaagtaaaagagctcaacccttttacaactaca 2627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0597; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 24 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 3083 - 2899
Alignment:
Q  24 acatcatcataatcc-aataacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacat--atacttacatcaa 120  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||| |||||| ||||||| ||| ||||||||| ||||||     ||| ||||  ||||||||||||     
T  3083 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacataatgcacttgatcattaataa-----tcacacattaatacttacatcac 2989  T
Q  121 accccaatatcttacatcaataatc-accaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 216  Q
    ||||| |||||| |||||||||||| | ||||||        |||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||| || ||||||||| |||||    
T  2988 accccgatatctcacatcaataatcaatcaatca-------tatgaacaattatcaattcacaattattcattcacaaacaccaatcacatttatca 2899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234 (Bit Score: 97; Significance: 2e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0234
Description:

Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 24 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 19489 - 19248
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacat--atacttacatcaa 120  Q
    |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||     || ||||  ||||||||||||     
T  19489 acattatcataatccaaataacatttaacatgaatatttcaatataaacatcatgcatttgatcaataataat-----cacacattaatacttacatcac 19395  T
Q  121 accccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaataa 220  Q
    | |||||||||| ||||||||||||| |||||| |||       ||||| |||||||  |||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||    
T  19394 atcccaatatctcacatcaataatcatcaatcatatg-------aacaattatcaatttacaaatattcattcacaatcaccaatcacatatatcaaaaa 19302  T
Q  221 gactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatc 274  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| | |||| |||||||||||| ||||||    
T  19301 gactcatgtcatgatatgcacctatcgccacatatatgcatgtggtatcaaatc 19248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 97; Significance: 2e-47; HSPs: 2)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 55 - 214
Target Start/End: Original strand, 94335 - 94495
Alignment:
Q  55 aataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatca-aaccccaatatcttacatcaataatcaccaatca 153  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||| || |||||||||| | || |||||||||||||||    
T  94335 aataattcaattcaaacatcatgtactggatcaataataatattctcatatatataattatatcataatcccaatatctcatattaataatcaccaatca 94434  T
Q  154 catgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatat 214  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| || |||||||||||||    
T  94435 catgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaaccaccaatcacatatat 94495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 194 - 241
Target Start/End: Original strand, 94695 - 94742
Alignment:
Q  194 acaatcatcaatcacatatatcaataagactcatgtcatgatatgcac 241  Q
    ||||||| ||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||    
T  94695 acaatcaccaatcacatttatatataagactcatgtcatgatatgcac 94742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 97; Significance: 2e-47; HSPs: 5)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 142 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 90748 - 90600
Alignment:
Q  142 aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaataagactcatgtcatgatatgcac 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||  |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  90748 aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcttacacaatctccaatcacatacatcaataagactcatgccatgatatgcac 90649  T
Q  242 atatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 290  Q
     ||| ||| |||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  90648 ctattgacacatatatgcatttggtaccaaatcacctcagggtcgtcac 90600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 272 - 381
Target Start/End: Original strand, 78228 - 78337
Alignment:
Q  272 atcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaaccctttt 371  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  78228 atcacctcaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaaacatcgtatgtaagatttcacacccatcttacataatctccgaagtaaaagagctgaaccctttt 78327  T
Q  372 acaactacaa 381  Q
    ||||||||||    
T  78328 acaactacaa 78337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 24 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 91018 - 90802
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatata------------ 110  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||| |||||                
T  91018 acatcatcataatccaaataacagttaacatgaataattcaatataaacatcatgcacttgatcaataataatattcatatatatatatatatatatata 90919  T
Q  111 ----------cttacatc-aaaccccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatc 199  Q
              |||||||| |||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||    
T  90918 tatgtatatacttacatcaaaaccccaatatctcacattaatattcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagtcattcatacacaatc 90819  T
Q  200 atcaatcacatatatca 216  Q
    | |||||| ||| ||||    
T  90818 accaatcatatacatca 90802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 197 - 358
Target Start/End: Original strand, 128867 - 129026
Alignment:
Q  197 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcg 295  Q
    |||||||||||| |||| || ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| | ||    
T  128867 atcatcaatcacctataacacataagactcatgttatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcacctccg 128966  T
Q  296 atgcaacaa--aaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaaga 358  Q
    |||  ||||   |||||||||||||||   |||| |    |||||||||||||||||||||||||    
T  128967 atg-gacaagtcaacatcgcatgtaaggggtcactc----cttacataatctccgaagtaaaaga 129026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 142 - 216
Target Start/End: Original strand, 128730 - 128804
Alignment:
Q  142 aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 216  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  128730 aatcaccaattacatgtatcatgaacaaatatcaattaacagttattcatacacaatcaccaatcatatacatca 128804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 96; Significance: 6e-47; HSPs: 4)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 202 - 380
Target Start/End: Original strand, 145016 - 145195
Alignment:
Q  202 caatcacatatatcaataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaa 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| ||||||| ||    
T  145016 caatcacatatatcaataagactcatgctatgatatgcacctattgacacatatatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcaccttcgatggaa 145115  T
Q  302 caa-aaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactaca 380  Q
    |||   |||||| |||||||  ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  145116 caactcacatcgtatgtaagggttcacccccgccttacataatctccgaagtaaaagagctcaacccttttacaactaca 145195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 202 - 380
Target Start/End: Original strand, 147275 - 147454
Alignment:
Q  202 caatcacatatatcaataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaa 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||  |||||| |||| ||||||| ||    
T  147275 caatcacatatatcaataagactcatgctatgatatgcacctattgacacatatatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcatcaccttcgatggaa 147374  T
Q  302 caa-aaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactaca 380  Q
    |||   |||||| |||||||  ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  147375 caactcacatcgtatgtaagggttcacccccgccttacataatctccgaagtaaaagagctcaacccttttacaactaca 147454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 162 - 216
Target Start/End: Original strand, 144926 - 144980
Alignment:
Q  162 atgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 216  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||    
T  144926 atgaacaattatcaattcacaattattcattcacaatcaccaatcacatttatca 144980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #4
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 162 - 216
Target Start/End: Original strand, 147185 - 147239
Alignment:
Q  162 atgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 216  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||    
T  147185 atgaacaattatcaattcacaattattcattcacaatcaccaatcacatttatca 147239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0095 (Bit Score: 95; Significance: 2e-46; HSPs: 2)
Name: scaffold0095
Description:

Target: scaffold0095; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 251 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 7303 - 7153
Alignment:
Q  251 catacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaa 350  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  7303 cataaatgcatgtggtaccgaatcacctcaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaaacatcgtgtgtaagatttcacaccagtcttacataatctccgaa 7204  T
Q  351 gtaaaagagttcaacccttttacaacta-caatctcaacacgactatgatg 400  Q
    ||||||||| |||||| |||||| |||| ||  ||||||| ||||||||||    
T  7203 gtaaaagagctcaacctttttacgactaccagactcaacatgactatgatg 7153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0095; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 24 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 7489 - 7416
Alignment:
Q  24 acatcatcataatcca-ataacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataata 96  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||| | |||| ||||||    
T  7489 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaatatcatgtacttaaccaatgataata 7416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 95; Significance: 2e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 251 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 78472 - 78342
Alignment:
Q  251 catacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaa 350  Q
    |||| |||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  78472 cataaatgcatgtggtactgaatcacctcaaggttgtcaccttcgatgcaacaaaaacatcgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatcaccgaa 78373  T
Q  351 gtaaaagagttcaacccttttacaactacaa 381  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  78372 gtaaaagagctcaacccttttacacctacaa 78342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 95; Significance: 2e-46; HSPs: 2)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 251 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 118244 - 118094
Alignment:
Q  251 catacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaa 350  Q
    |||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||| |||||    
T  118244 catatatgcatgtggtactgaatcacctcaaggtcgtcaccttcgattcaacaaaaacatcgtatgtaagatttcacagccatcttacataatcaccgaa 118145  T
Q  351 gtaaaagagttcaacccttttacaactacaa-tctcaacacgactatgatg 400  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  118144 gtaaaagagctcaacccttttacaactacaagactcaacatgactatgatg 118094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 206 - 290
Target Start/End: Original strand, 163817 - 163901
Alignment:
Q  206 cacatatatcaataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  163817 cacatatatcaataagactcatgtcatgatatgcacctattgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 163901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 92; Significance: 1e-44; HSPs: 5)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 196 - 378
Target Start/End: Original strand, 54118 - 54300
Alignment:
Q  196 aatcatcaatcacatatatcaa-taagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttc 294  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||    
T  54118 aatcaccaatcacatatatcaaataagactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcactttc 54217  T
Q  295 gatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaacta 378  Q
    |||| |  ||| |||||| |||||||  |||||||||  ||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  54218 gatg-ataaaacacatcgtatgtaagggttcacacccagcttacataatctctgaagtaaaagagctcaacctttttacaacta 54300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #2
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 160 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 109799 - 109582
Alignment:
Q  160 tcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgc 259  Q
    |||||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||||   |||||||| |   |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||    
T  109799 tcatgaacaattatcaattcacaaatattcattcacaatctcaaatcacatttccaaataagactcatgtcatgatatgcacctattgacacataaatgc 109700  T
Q  260 atgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaa--aaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaag 357  Q
    ||||||||||||||| ||  ||||||||||| | |||||  ||||   ||||||| |||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  109699 atgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcacctccgatg-gacaagtcaacatcgtatgtaagggttcacccccgtcttacataatctccgaagtaaaag 109601  T
Q  358 agttcaacccttttacaac 376  Q
    || |||||| |||||||||    
T  109600 agatcaaccattttacaac 109582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #3
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 142 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 109971 - 109897
Alignment:
Q  142 aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  109971 aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcatatacatca 109897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #4
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 108 - 216
Target Start/End: Original strand, 54011 - 54112
Alignment:
Q  108 atacttacatcaaaccccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatca 207  Q
    |||||||| ||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||       ||||||||| ||||||| |||||||||| || ||| |||| ||||||    
T  54011 atacttacgtcacactccaatatctcacatcaataatcaccaatca-------catgaacaattatcaattcacaattattaattcactatcaccaatca 54103  T
Q  208 catatatca 216  Q
    ||| |||||    
T  54104 catttatca 54112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #5
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 162 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 110055 - 110002
Alignment:
Q  162 atgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatc 215  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||    
T  110055 atgaacaattatcaattcacaattattcattcacaatcactaatcacatatatc 110002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 92; Significance: 1e-44; HSPs: 3)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 202 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 197778 - 197600
Alignment:
Q  202 caatcacatatatcaa-taagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgca 300  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| || |||||||||||||||| ||  ||||||||||| |||||||      
T  197778 caatcacatatatcaaataagactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatacatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcaccttcgatgat 197679  T
Q  301 acaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactaca 380  Q
    | ||| |||||| |||||||  |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  197678 a-aaagacatcgtatgtaagggttcacacccgccttacataatctctgaagtaaaagagctcaacccttttacaactaca 197600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 246 - 360
Target Start/End: Original strand, 84942 - 85056
Alignment:
Q  246 cgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatct 345  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  84942 cgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcacccatgatgcaacaaaaacatcatatgtaagatttcacacccgtcttacattatca 85041  T
Q  346 ccgaagtaaaagagt 360  Q
    |||||||||||||||    
T  85042 ccgaagtaaaagagt 85056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #3
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 246 - 360
Target Start/End: Original strand, 26080 - 26194
Alignment:
Q  246 cgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatct 345  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||| |||     
T  26080 cgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctaaaggtcgtcacccatgatgcaacaaaaacatcatatgtaagatttcacacacgtcttacattatca 26179  T
Q  346 ccgaagtaaaagagt 360  Q
    |||||||||||||||    
T  26180 ccgaagtaaaagagt 26194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0092 (Bit Score: 89; Significance: 9e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0092
Description:

Target: scaffold0092; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 24 - 293
Target Start/End: Original strand, 1652 - 1925
Alignment:
Q  24 acatcatcataatcca-ataacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgat-caataataatattctcatacatatacttacatcaaa 121  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||| || | |||||||||| | |||| |||| | ||| |  ||    
T  1652 acatcatcataatccacataacaattaacatgagtaatttaatttaaacatcatgtacttaattcgataataatat-cacatatatattcatac-tataa 1749  T
Q  122 ccccaatatcttacatcaat-aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatat-atcaata 219  Q
     |||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||   ||||  |||| |||||||| |||||||||||||||||| | | |||||    
T  1750 tcccaatatctcacatcaattaatcatcaatcacatgtgtcatgaacaatcttcaaatcacatttattcatgcacaatcatcaatcacatttcaccaata 1849  T
Q  220 agactcatgtcatgatatgcacata--tcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcacttt 293  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||  | ||| |||| |||||||||||||||  |||| ||||||||||| ||||    
T  1850 agactcatgtcatgatgtgcacctagtttgacacatatatgcatgtggtaccatttcacttcaaggtcgtctcttt 1925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0315 (Bit Score: 88; Significance: 4e-42; HSPs: 2)
Name: scaffold0315
Description:

Target: scaffold0315; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 81 - 216
Target Start/End: Original strand, 16826 - 16961
Alignment:
Q  81 ttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaaccccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaataca 180  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16826 ttgatcaataataatattctcatatcaatacttacatcaaaccccaatatctcacatcaatgatcaccaattacatgtgtcatgaacaaatatcaattca 16925  T
Q  181 caattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 216  Q
    || ||||||| ||||||||| |||||| ||| ||||    
T  16926 cagttattcacacacaatcaccaatcatatacatca 16961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0315; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 216 - 274
Target Start/End: Original strand, 17070 - 17128
Alignment:
Q  216 aataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatc 274  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| |||||||||||||||||||    
T  17070 aatatgactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatc 17128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 87; Significance: 1e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 230 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 25274 - 25101
Alignment:
Q  230 catgatatgcacata--tcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcac 327  Q
    |||||||||||| ||  ||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  25274 catgatatgcacctagttcgacacatatatgcatgtggtacaaaatcacctcaaggtcgtcaccttaaatgcaacaaaaatatcgtatgtaagatttcac 25175  T
Q  328 acccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaa-tctcaacacgactatgatg 400  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||  || | |||||||| ||||||  ||||||| ||||||||||    
T  25174 acccgtcttacataatcaccgaagtaaaagagcacacctcttttacagctacaagactcaacatgactatgatg 25101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 87; Significance: 1e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 259 - 381
Target Start/End: Original strand, 34006 - 34128
Alignment:
Q  259 catgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaaga 358  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  34006 catgtggtaccgaatcacctcaaagtcgtcaccttcgatgcaacaaaaacatcgtatgtaacatttcacacctgtcttacataatcaccgaagtaaaaga 34105  T
Q  359 gttcaacccttttacaactacaa 381  Q
    | |||||||||||||| ||||||    
T  34106 gctcaacccttttacagctacaa 34128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 87; Significance: 1e-41; HSPs: 3)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 202 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 217426 - 217246
Alignment:
Q  202 caatcacatatatcaa-taagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgca 300  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| | ||||| |    
T  217426 caatcacatatatcaaataagactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcacctccgatgga 217327  T
Q  301 acaa--aaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactaca 380  Q
    ||||   ||||||| |||||||  ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  217326 acaactcaacatcgtatgtaagggttcac-cccgccttacataatctccgaagtaaaagagctcaacccttttacaattaca 217246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 24 - 208
Target Start/End: Original strand, 5221 - 5396
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 122  Q
    |||| |||||||||||| |||||  ||||||||||| |||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| | | |||    |||||||||||| ||    
T  5221 acattatcataatccaaataacaggtaacatgaatatttcattttaaacatcatgcacttgatcaataataat-tacacat--taatacttacatcacac 5317  T
Q  123 cccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcac 208  Q
    ||| |||||| ||||||||| ||  ||||||        |||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||| |||||||    
T  5318 cccgatatctcacatcaatattcgtcaatca-------tatgaacaattatcaatttacaattattcattcacaatcaccaatcac 5396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 197 - 290
Target Start/End: Original strand, 5661 - 5755
Alignment:
Q  197 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 290  Q
    |||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  5661 atcaccaatcgcatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcac 5755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 216 - 360
Target Start/End: Original strand, 3244 - 3393
Alignment:
Q  216 aataagactcatgt---catgatatgcacata--tcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacat 310  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||| ||  ||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3244 aataagactcatgtgaacatgatatgcacctagttcgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctctaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaaacat 3343  T
Q  311 cgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagt 360  Q
     | |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  3344 tgtatgtaagatttcacgcccgtcttacataatcaccgaagtataagagt 3393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0335 (Bit Score: 82; Significance: 1e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0335
Description:

Target: scaffold0335; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 24 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 10122 - 9930
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 122  Q
    |||| |||||||||||| | ||| |||||||| ||  |||||| ||| ||||||| |||| ||| |||||| |||||||| |   | |||||||||||||    
T  10122 acattatcataatccaaatgacagttaacatgtatttttcaatttaa-catcatgcactttatcgataatattattctcaaatcaacacttacatcaaac 10024  T
Q  123 cccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 216  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || | ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  10023 cccaatatctcacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaataaatatcaattcatagttattcatacacaatcaccaatcatatacatca 9930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0467 (Bit Score: 81; Significance: 5e-38; HSPs: 2)
Name: scaffold0467
Description:

Target: scaffold0467; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 194 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 11716 - 11532
Alignment:
Q  194 acaatcatcaatcacatatatcaa-taagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactt 292  Q
    ||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| |    
T  11716 acaatcaccaatcacatacatcaaataagactcatgtcatgttatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcacct 11617  T
Q  293 tcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactaca 380  Q
    |||||| |  ||| |||||| |||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||   | |||||||||||||||||    
T  11616 tcgatg-ataaaacacatcgtatgtaagggttcacacccgccttacataatctccgaagtaaaaga--accacccttttacaactaca 11532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0467; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 108 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 11845 - 11796
Alignment:
Q  108 atacttacatcaaaccccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatg 157  Q
    |||||||||||| |||||||||| |  |||||||||||| ||||||||||    
T  11845 atacttacatcacaccccaatatttctcatcaataatcatcaatcacatg 11796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0302 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0302
Description:

Target: scaffold0302; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 197 - 376
Target Start/End: Original strand, 4320 - 4501
Alignment:
Q  197 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcg 295  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| | ||    
T  4320 atcaccaatcacatatatcacataagactcatgttatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcacctccg 4419  T
Q  296 atgcaacaa--aaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaac 376  Q
    |||  ||||   ||||||| |||||||  ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4420 atg-gacaagtcaacatcgtatgtaagggttcacccccgccttacataatctccgaagtaaaagagctcaacccttttacaac 4501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0589 (Bit Score: 79; Significance: 9e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0589
Description:

Target: scaffold0589; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 31 - 290
Target Start/End: Original strand, 6123 - 6386
Alignment:
Q  31 cataatcca-ataacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatca-ataataatattctcatacatatacttacatcaaaccccaat 128  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| |||  |||||||||| | || | |||| | ||| |  || | ||||    
T  6123 cataatccacataaaaattaacatgagtaattcaatttaaatatcatgtacttaatccgataataatat-cacacatatattcatac-tataatctcaat 6220  T
Q  129 atcttacatcaat-aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatat-atcaataagactca 226  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  |||||  |||| |||||||| |||||||||||||||||| | | ||||||||||||    
T  6221 atctcacatcaattaatcaccaatcacatgtgttatgaacaatcatcaaatcacatttattcatgcacaatcatcaatcacatttcaccaataagactca 6320  T
Q  227 tgtcatgatatgcacata--tcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 290  Q
    ||||||||| ||||| ||  ||||| |||| |||||||||||||||  |||| |||||||||||||    
T  6321 tgtcatgatgtgcacctagttcgacacatatatgcatgtggtaccatttcacttcaaggtcgtcac 6386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 79; Significance: 9e-37; HSPs: 2)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 202 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 5274 - 5102
Alignment:
Q  202 caatcacatatatcaataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaa 301  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| | |||||  |    
T  5274 caatcacatatatcaataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcacctccgatg-ga 5176  T
Q  302 caa--aaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttac 373  Q
    |||  |||||||| |||||||  |||||  ||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  5175 caagtaaacatcgtatgtaagggttcactgccgccttacataatctccaaagtaaaagagctcaacccttttac 5102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 202 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 12876 - 12788
Alignment:
Q  202 caatcacatatatcaataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||    
T  12876 caatcacatatatcaataagactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcac 12788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0346 (Bit Score: 74; Significance: 8e-34; HSPs: 3)
Name: scaffold0346
Description:

Target: scaffold0346; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 252 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 14250 - 14101
Alignment:
Q  252 atacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaag 351  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  14250 atacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgttacccatgatgcaacaaaaacatcatatgtaaaatttcacacccgtcttacattatcaccgaag 14151  T
Q  352 taaaagagttcaacccttttacaactacaa-tctcaacacgactatgatg 400  Q
    ||||||||| |  | ||||||||||| |||  ||||||| ||||||||||    
T  14150 taaaagagtacccctcttttacaacttcaagactcaacatgactatgatg 14101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0346; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 140 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 16011 - 15935
Alignment:
Q  140 ataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||| || |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16011 ataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttgttcatacacaatcaccaatcacatatatca 15935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0346; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 194 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 15907 - 15833
Alignment:
Q  194 acaatcatcaatcacatatatcaataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtac 268  Q
    ||||||| ||| ||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| ||| |||| |||||||||||||    
T  15907 acaatcaccaaccacatttatgaataagactcacgtcatgatatgcacctattgacacatatatgcatgtggtac 15833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 197 - 376
Target Start/End: Original strand, 51511 - 51690
Alignment:
Q  197 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcg 295  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| |||| ||||| ||||||||||||| ||  |||||| |||| | ||    
T  51511 atcaccaatcacatatatcacataagactcatgttatgatatgcacttattgacacataaatgcacgtggtaccaaatctccaaaaggtcatcacctccg 51610  T
Q  296 atgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaac 376  Q
    |||  | ||| |||||| |||||||  ||||| |||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  51611 atgata-aaacacatcgtatgtaagggttcacccccgcctgacataatctccgaagtaaaagagctcaacccttttacaac 51690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 3)
Name: scaffold0039
Description:

Target: scaffold0039; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 81 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 21288 - 21158
Alignment:
Q  81 ttgatcaataataatattctcatacatatacttacatc--aaaccccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaata 178  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||        |||||||| |||||||     
T  21288 ttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaaaaccccaatatctcacatcaataatcatcaatca-------tatgaacaattatcaatt 21196  T
Q  179 cacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 216  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  21195 cacaattattcattcacaatcaccaatcacatatatca 21158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 194 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 21002 - 20906
Alignment:
Q  194 acaatcatcaatcacatatatcaataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 290  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21002 acaatcaccaatcacatatatcattaagactcatgccatgatatgcacctatcgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcagggtcgtcac 20906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039; HSP #3
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 142 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 21104 - 21030
Alignment:
Q  142 aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21104 aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatca 21030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0808 (Bit Score: 72; Significance: 1e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0808
Description:

Target: scaffold0808; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 24 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 3395 - 3125
Alignment:
Q  24 acatcatcataatcca-ataacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaa-taataatattctcatacatatacttacatca-a 120  Q
    |||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||| ||||| ||||||||| | |||| |||| | |||  || |    
T  3395 acatcatcataatccacataatagttaacatgaataattcaattcaaatatcatgtacttaatcaaataataatatccacatatatattcatac--cata 3298  T
Q  121 accccaatatcttacatcaat-aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatat-atcaat 218  Q
    | | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||  |||| |||||||| | ||||||| | |||||| | | ||||    
T  3297 atctcaatatcttacatcaattaatcaccaatcacatgtgtcatgaacaatcatcaaatcacatttattcatgcgcaatcataattcacatttcaccaat 3198  T
Q  219 aagactcatgtcatgatatgcacata--tcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 290  Q
    |||||||||| |||||| || || ||  ||||| |||| ||||||||| |||||  |||| |||||||||||||    
T  3197 aagactcatg-catgatgtgtacctagttcgacacatatatgcatgtgataccatttcacttcaaggtcgtcac 3125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0407 (Bit Score: 69; Significance: 8e-31; HSPs: 3)
Name: scaffold0407
Description:

Target: scaffold0407; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 24 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 6583 - 6410
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaat-aacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 122  Q
    |||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||           
T  6583 acatcaacataatccaattaacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatatactcatacatatacttac------- 6491  T
Q  123 cccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 216  Q
                 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||| ||||| |||||    
T  6490 -------------atcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttatttatacacaatcaccaaccacatttatca 6410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0407; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 194 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 6406 - 6310
Alignment:
Q  194 acaatcatcaatcacatatatcaataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 290  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  || |||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  6406 acaatcattaatcacatatatcaataagactcatgtcatgatatgcacctattaacacatatatgcatgtggtaccaaatcatctcagggtcgtcac 6310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0407; HSP #3
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 24 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 119 - 22
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaat-aacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaa 120  Q
    |||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  119 acatcaacataatccaattaacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatatactcatacatatacttacatcaa 22  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0225 (Bit Score: 69; Significance: 8e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0225
Description:

Target: scaffold0225; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 197 - 376
Target Start/End: Original strand, 14779 - 14958
Alignment:
Q  197 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcg 295  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||| |||||||||| |||||||| ||  ||||||||||| | ||    
T  14779 atcaccaatcacatatatcacataagactcatgatatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggaaccaaatctccaaaaggtcgtcacctccg 14878  T
Q  296 atgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaac 376  Q
    |||  | ||| |||||| |||||||  ||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  14879 atgata-aaacacatcgtatgtaagggttcacccccaccttacataatctccgaaataaaagagctcaacccttttacaac 14958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0225; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 197 - 376
Target Start/End: Original strand, 28300 - 28479
Alignment:
Q  197 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcg 295  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||  ||| ||| |||| |||||||||| |||||||| ||  ||||||||||| | ||    
T  28300 atcaccaatcacatatatcacataagactcatgatatgatattcatttattgacacataaatgcatgtggcaccaaatctccaaaaggtcgtcacctccg 28399  T
Q  296 atgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaac 376  Q
    |||  | ||| |||||| |||||||  ||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  28400 atgata-aaacacatcgtatgtaagggttcacccccgccttacataatctccgaattaaaagagctcaacccttttacaac 28479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0786 (Bit Score: 68; Significance: 3e-30; HSPs: 2)
Name: scaffold0786
Description:

Target: scaffold0786; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 246 - 381
Target Start/End: Original strand, 211 - 346
Alignment:
Q  246 cgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatct 345  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||| |||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  211 cgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcacccatgatgtaacaaacacatcatatgtaagatttcacacccgtcttacattatca 310  T
Q  346 ccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaa 381  Q
    ||||||||||||||  |  |||||||||||| ||||    
T  311 ccgaagtaaaagagcacgtcccttttacaaccacaa 346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0786; HSP #2
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 246 - 381
Target Start/End: Original strand, 5266 - 5401
Alignment:
Q  246 cgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatct 345  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||| |||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  5266 cgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcacccatgatgtaacaaacacatcatatgtaagatttcacacccgtcttacattatca 5365  T
Q  346 ccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaa 381  Q
    ||||||||||||||  |  |||||||||||| ||||    
T  5366 ccgaagtaaaagagcacgtcccttttacaaccacaa 5401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0390 (Bit Score: 68; Significance: 3e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0390
Description:

Target: scaffold0390; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 246 - 381
Target Start/End: Original strand, 3799 - 3934
Alignment:
Q  246 cgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatct 345  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||| |||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  3799 cgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcacccatgatgtaacaaacacatcatatgtaagatttcacacccgtcttacattatca 3898  T
Q  346 ccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaa 381  Q
    ||||| ||||||||  || |||||||||||| ||||    
T  3899 ccgaaataaaagagcacatcccttttacaaccacaa 3934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327 (Bit Score: 68; Significance: 3e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0327
Description:

Target: scaffold0327; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 262 - 381
Target Start/End: Original strand, 4568 - 4686
Alignment:
Q  262 gtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagtt 361  Q
    |||||||  ||||||||| |||||||||| ||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||      
T  4568 gtggtactgaatcacctccaggtcgtcaccttcgatgcatcaaca-catcgtatgtaagatttcacactcgtcttacataatctctgaagtaaaagagcc 4666  T
Q  362 caacccttttacaactacaa 381  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  4667 caacccttttacaactacaa 4686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 68; Significance: 3e-30; HSPs: 2)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 24 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 75727 - 75550
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatca-aa 121  Q
    ||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||  | ||||         | |||||||||||||| ||    
T  75727 acatcatcataatccaaataatagttaacatgaataatttaattcaaacatcatgtacttgatcg-tcataa---------atatatacttacatcataa 75638  T
Q  122 ccccaatatcttacatcaataa-tcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcac 208  Q
    ||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  75637 ccccaatatctcatatcaataaatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaacatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcac 75550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 219 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 72177 - 72106
Alignment:
Q  219 aagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 290  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  72177 aagactcatgtcatgatatgcacttattgacgcataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcac 72106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1753 (Bit Score: 66; Significance: 5e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold1753
Description:

Target: scaffold1753; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 256 - 380
Target Start/End: Original strand, 1 - 126
Alignment:
Q  256 atgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaa-acatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaa 354  Q
    ||||||||||||||||||| ||  ||| ||||||| ||||||| ||||||  |||||| |||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1 atgcatgtggtaccaaatctccaaaagctcgtcaccttcgatggaacaaatcacatcgtatgtaagggttcacacccgccttacataatctccgaagtaa 100  T
Q  355 aagagttcaacccttttacaactaca 380  Q
    || || ||||||||||||||||||||    
T  101 aaaagctcaacccttttacaactaca 126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 82 - 205
Target Start/End: Original strand, 25594 - 25718
Alignment:
Q  82 tgatcaataataatattctcatacatatacttacatca-aaccccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaataca 180  Q
    |||||||||| ||||||| ||||   |||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  25594 tgatcaataaaaatattcacataacaatacttacatcagaaccccaatatctcacattaataatcatctatcacatgtgtcataaacaaatatcaattca 25693  T
Q  181 caattattcatacacaatcatcaat 205  Q
    || ||||||||||| ||||||||||    
T  25694 cagttattcatacataatcatcaat 25718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 142 - 206
Target Start/End: Original strand, 25735 - 25799
Alignment:
Q  142 aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatc 206  Q
    |||||||||||| |||| ||| |||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  25735 aatcaccaatcatatgtatcaggaacaaatatcaattcacaaatattcattcacaatcatcaatc 25799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 64; Significance: 8e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 197 - 376
Target Start/End: Original strand, 106479 - 106660
Alignment:
Q  197 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcg 295  Q
    |||| ||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| | ||    
T  106479 atcaccaatcacataagtcacataagactcatgttatgatatgcacttattgactcataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcacctccg 106578  T
Q  296 atgcaacaa--aaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaac 376  Q
    |||  ||||   ||||||  |||||||   |||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  106579 atg-gacaagtcaacatcatatgtaagggatcacccccgccttacataatctccgaagtaaaagagctcaacccttttacaac 106660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 24 - 216
Target Start/End: Original strand, 27169 - 27352
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacat--atacttacatcaa 120  Q
    |||| |||||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||     ||| ||||  ||||||||||||     
T  27169 acattatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataa-----tcacacattaatacttacatcac 27263  T
Q  121 accccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 216  Q
    ||||| |||||| ||||||||| ||| | ||||        |||| ||| |||||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||    
T  27264 accccgatatctcacatcaatattcatcgatca-------tatgagcaattatcaatttacaattattcattcacaatcaccaatcacatttatca 27352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0103 (Bit Score: 63; Significance: 3e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0103
Description:

Target: scaffold0103; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 125 - 290
Target Start/End: Original strand, 31925 - 32093
Alignment:
Q  125 caatatcttacatcaat-aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcac-atatatcaataaga 222  Q
    ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| ||||||||||||||| ||||||||| ||  | ||||||||    
T  31925 caataactcacatcaattaatcaccaatcacatgtgtcatgaacaagtatcaaatcacatttattcatacacaattatcaatcacaattcaccaataaga 32024  T
Q  223 ctcatgtcatgatatgcac--atatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 290  Q
    |||||| |||||| || ||  | | |||| |||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  32025 ctcatg-catgatgtgtacctagaccgacacatatatgcatgtggtaccatttcacctcaaggtcgtcac 32093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0103; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 24 - 99
Target Start/End: Original strand, 31776 - 31850
Alignment:
Q  24 acatcatcataatcca-ataacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattc 99  Q
    |||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||| |||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||||||    
T  31776 acatcatcataacccacataacattta-catgaatatttcaatttaa-cttcatgcacttgatcaataataatattc 31850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1560 (Bit Score: 62; Significance: 1e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold1560
Description:

Target: scaffold1560; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 195 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 1469 - 1292
Alignment:
Q  195 caatcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcacttt 293  Q
    |||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| |     
T  1469 caatcaccaatcacatatttcacataagactcatgttatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcacctc 1370  T
Q  294 cgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaac 376  Q
    ||||| |  ||| |||||| |||||||  ||||| |    |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  1369 cgatg-ataaaacacatcgtatgtaagggttcactc----cttacataatctccaaagtaaaagagctcaactcttttacaac 1292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1404 (Bit Score: 62; Significance: 1e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold1404
Description:

Target: scaffold1404; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 197 - 376
Target Start/End: Original strand, 35 - 215
Alignment:
Q  197 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaa-ggtcgtcactttc 294  Q
    |||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| |||  ||| |||||||||||||||| || ||  || ||||||||| | |    
T  35 atcaccaaccacatatatcacataagactcatgttatgatatgcacttattgacatataaatgcatgtggtaccaattctccaaaaaggtcgtcacctcc 134  T
Q  295 gatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaac 376  Q
    ||||  | ||| |||||| |||||||  ||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  135 gatgata-aaacacatcgtatgtaagggttcacccccgccttacataatctccgaaataaaagagctcaacccttttacaac 215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 61; Significance: 5e-26; HSPs: 2)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 202 - 290
Target Start/End: Original strand, 40010 - 40098
Alignment:
Q  202 caatcacatatatcaataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 290  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  40010 caatcacatatatcaataagactcatgccatgatatgcacctattgacacataaatgcatgtggtaccaaatcacctcagggttgtcac 40098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 24 - 95
Target Start/End: Original strand, 37627 - 37697
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataat 95  Q
    |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  || ||||||||| | |||||||||||||||    
T  37627 acattatcataatccaaataacagttaacatgaataattca--attaacatcatgcatttgatcaataataat 37697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0073 (Bit Score: 61; Significance: 5e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0073
Description:

Target: scaffold0073; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 256 - 360
Target Start/End: Original strand, 55922 - 56026
Alignment:
Q  256 atgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaa 355  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  55922 atgcatgtggtacaaaatcccctcaaggtcgtcacccatgatgcaacaaaaatatcatatgtaagatttcacacccgtcttacattatcaccgaagtaaa 56021  T
Q  356 agagt 360  Q
    |||||    
T  56022 agagt 56026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 61; Significance: 5e-26; HSPs: 2)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 51 - 212
Target Start/End: Original strand, 44288 - 44443
Alignment:
Q  51 catgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatc-aaaccccaatatcttacatcaataatcacca 149  Q
    |||||||| |||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||| || |     
T  44288 catgaatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcacatgcatatacttacaccaaaaccccaatatctcacatcaataaacatcg 44387  T
Q  150 atcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatat 212  Q
    ||||        |||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  44388 atca-------tatgaacaattatcaactcacaattattcatacacaatcaccgatcacatat 44443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 51 - 197
Target Start/End: Original strand, 52457 - 52597
Alignment:
Q  51 catgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatc-aaaccccaatatcttacatcaataatcacca 149  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||| |||||||||||||| | ||||||| ||| ||    
T  52457 catggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcacatgcatatacttaaatcaaaaccccaatatctcagatcaatagtcatca 52556  T
Q  150 atcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaa 197  Q
    ||||        |||||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  52557 atca-------tatgaacaattatcaactcacaattattcatacacaa 52597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 59; Significance: 7e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 202 - 380
Target Start/End: Original strand, 41190 - 41371
Alignment:
Q  202 caatcacatatatcaataa-gactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgca 300  Q
    ||||||||||||| || || |||| |||||  ||||||||| ||| ||| |||| || |||||||||||||||| ||  ||||||||||| | ||||| |    
T  41190 caatcacatatataaaaaaagacttatgtctggatatgcacttattgacacataaattcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcacctccgatgga 41289  T
Q  301 acaaa--aacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactaca 380  Q
    |||    ||||||| |||||||  ||||| || | |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  41290 acagctcaacatcgtatgtaagggttcacccctgccttacataatctacgaagtaaaagagctcaacccttttacaactaca 41371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 58; Significance: 3e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 197 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 9607 - 9426
Alignment:
Q  197 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcg 295  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| | | ||| |||| ||||||||||||||||||| ||  |||||| |||| | ||    
T  9607 atcaccaatcacatatatcacataagactcatgttatgatatgcactttttgacacataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcatcacctccg 9508  T
Q  296 atgca-acaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaac 376  Q
    ||| | |    || |||  |||||||  ||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9507 atggacatgtcaatatcatatgtaagggttcaaccccgccttacataatctccgaagtaaaagagctcaacccttttacaac 9426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 56; Significance: 5e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 142 - 270
Target Start/End: Original strand, 145283 - 145413
Alignment:
Q  142 aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaataagactcatgtcatgatatgcac 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||  |||||| |||| |||||||||||||||||  | |||||| |   |||||||||||||||||||| |||||    
T  145283 aatcaccaatcacatgtgtcatgaaaaatcatcaattcacagttattcatacacaatcactactcacatttcaaaataagactcatgtcatgatgtgcac 145382  T
Q  242 ata--tcgacgcatacatgcatgtggtacca 270  Q
     ||  ||||| |||| |||||||||||||||    
T  145383 ctagttcgacacatatatgcatgtggtacca 145413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 24 - 96
Target Start/End: Original strand, 144987 - 145060
Alignment:
Q  24 acatcatcataatcca-ataacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataata 96  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  144987 acattatcataatccacataacaattaacatgattaattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataata 145060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0498 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0498
Description:

Target: scaffold0498; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 202 - 376
Target Start/End: Original strand, 7465 - 7641
Alignment:
Q  202 caatcacatatatcaa-taagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgca 300  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || | | ||| |||| |||||||| |||||||||| ||  |||||| |||| |  |||| |    
T  7465 caatcacatatatcaaataagactcatgtcatgatatgtacttgttgacacataaatgcatgtcgtaccaaatctccaaaaggtcatcacctctgatgga 7564  T
Q  301 acaaa--aacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaac 376  Q
     |||   ||||||| || ||||  ||||| || | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7565 -caagtcaacatcgtatataagggttcaccccagccttacataatctccaaagtaaaagagttcaacccttttacaac 7641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 53; Significance: 3e-21; HSPs: 3)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 51 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 13085 - 12989
Alignment:
Q  51 catgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatc-aaaccccaatatcttacatcaataatca 146  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||  |||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  13085 catggatatttcaatttaaacatctcgtacatgatcaataataatattcacatgcatatacttacatcaaaaccccaatatctcacatcaataatca 12989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 24 - 95
Target Start/End: Original strand, 31120 - 31192
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataat 95  Q
    |||| |||||||||||| |||||  ||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  31120 acattatcataatccaaataacagataacatgaatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataat 31192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 142 - 200
Target Start/End: Original strand, 31333 - 31391
Alignment:
Q  142 aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatca 200  Q
    |||||||||| || ||| |||| || |||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  31333 aatcaccaattacttgtatcataaataaatatcaattcacagttattcatacacaatca 31391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1140 (Bit Score: 51; Significance: 4e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold1140
Description:

Target: scaffold1140; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 196 - 274
Target Start/End: Original strand, 1509 - 1587
Alignment:
Q  196 aatcatcaatcacatatatcaataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatc 274  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||  ||| |||| |||||||||||||||||||    
T  1509 aatcaccaatcacatatatcaataagactcatgccatgatatgcacctaatgacacatatatgcatgtggtaccaaatc 1587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1140; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 24 - 157
Target Start/End: Original strand, 1298 - 1427
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacat--atacttacatcaa 120  Q
    |||||| |||||||||| ||||| ||| |||||||| ||||||   ||||||||| | |||||||||||||||     || ||||  |||||||||| |     
T  1298 acatcaacataatccaaataacagttatcatgaatatttcaatt--aacatcatgcatttgatcaataataat-----cacacattaatacttacattac 1390  T
Q  121 accccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatg 157  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  1391 accccaatatctcacatcaataatcatcaatcacatg 1427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 51; Significance: 4e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 314 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 52837 - 52771
Alignment:
Q  314 atgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactaca 380  Q
    |||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  52837 atgtaagggttcacacccgccttacataatctccgaagtaaaagagctcaacccttttacaactaca 52771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 314 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 56789 - 56723
Alignment:
Q  314 atgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactaca 380  Q
    |||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  56789 atgtaagggttcacacccgccttacataatctccgaagtaaaagagctcaacccttttacaactaca 56723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0529 (Bit Score: 49; Significance: 7e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0529
Description:

Target: scaffold0529; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 24 - 216
Target Start/End: Original strand, 804 - 987
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 122  Q
    |||| |||||||||||| ||||| |||||||  ||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | | |||    |||||||||||| ||    
T  804 acattatcataatccaaataacagttaacatagatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataat-tacacat--taatacttacatcacac 900  T
Q  123 cccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 216  Q
    ||| |||||| ||||||||| ||| ||||||        |||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||    
T  901 cccgatatctcacatcaatattcatcaatca-------tatgaacaattatcaatttacaattattcattcacaatcaccaatcacatttatca 987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0384 (Bit Score: 46; Significance: 4e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0384
Description:

Target: scaffold0384; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 197 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 94 - 1
Alignment:
Q  197 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtca 289  Q
    |||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||    
T  94 atcaccaatcacatatttcacataagactcatgttatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtca 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0384; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 24 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 448 - 264
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatca-aa 121  Q
    |||| |||||||||||| ||||| |||||||  ||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | | |||    |||||||||||| |     
T  448 acattatcataatccaaataacagttaacatagatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataat-tacacat--taatacttacatcacac 352  T
Q  122 ccccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 216  Q
    |||| |||||| ||||||||| ||| ||||||        |||| ||| |||||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||    
T  351 ccccgatatctcacatcaatattcatcaatca-------tatgaccaattatcaatttacaattattcattcacaatcaccaatcacatttatca 264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0226 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0226
Description:

Target: scaffold0226; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 24 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 15239 - 15167
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataat 95  Q
    |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15239 acattatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataat 15167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 202 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 6898 - 6826
Alignment:
Q  202 caatcacatatatcaataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatc 274  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||  || |||| |||||||||||||||||||    
T  6898 caatcatatatatcaataagactcatgccatgatatgcacctattaacacatatatgcatgtggtaccaaatc 6826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 24 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 7115 - 6934
Alignment:
Q  24 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacat--atacttacatcaa 120  Q
    |||| |||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||   ||||||||| | |||||||||| ||||     || ||||  |||||||| |||     
T  7115 acattatcataatccaaataacagttatcatgaataattcaatt--aacatcatgcatttgatcaatagtaat-----cacacattaatacttacttcac 7023  T
Q  121 accccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 216  Q
    | |||||||||| ||||||||| ||| |||||| |||       | ||| ||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  7022 atcccaatatctcacatcaatagtcatcaatcatatg-------accaattatcaattcacaaatattcattcacaatcatcaatcacatttatca 6934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0450 (Bit Score: 44; Significance: 7e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0450
Description:

Target: scaffold0450; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 24 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 4725 - 4639
Alignment:
Q  24 acatcatcataatcca-ataacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatata 110  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||| ||| | ||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  4725 acatcatcataatccacataacatttaacatgaatatttcaatttaa-cttcatgcacttgatcaataataatattcacatatatata 4639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0450; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 141 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 4596 - 4528
Alignment:
Q  141 taatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcaca 209  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| |||| |||||||| |||||||| ||||||||    
T  4596 taatcaccaatcacatatatcatgaacaagtatcaattcacatttattcatgcacaatcaccaatcaca 4528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 44; Significance: 7e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 221 - 374
Target Start/End: Original strand, 29855 - 30009
Alignment:
Q  221 gactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtca-ctttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaa 319  Q
    ||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||| ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||| ||    |||||| ||||||    
T  29855 gactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgcggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgaatgtaa 29954  T
Q  320 gatttcacacccgtcttac-ataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttaca 374  Q
    |   ||||||| | ||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  29955 gggctcacacctgccttacaataatct-cgaagtaaaagagttcaactcttttaca 30009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 197 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 17771 - 17586
Alignment:
Q  197 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtca-ctttc 294  Q
    |||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||| ||||||||||| |  ||||||||||| |||||    
T  17771 atcaccaatcacatatttcacataggactcatgctatgatatgcacttattgacacataaatgcatgcggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttc 17672  T
Q  295 gatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttac-ataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaa 381  Q
    ||||| ||    |||||| |||||||   ||||||| | ||||| ||||||| | ||||||||||| ||| |||||||||||| ||||    
T  17671 gatgccacttgcacatcgaatgtaagggctcacacctgccttacaataatct-caaagtaaaagag-tcatcccttttacaacaacaa 17586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 197 - 290
Target Start/End: Original strand, 37768 - 37862
Alignment:
Q  197 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 290  Q
    |||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  37768 atcaccaatcacatatttcacataggactcatgctatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcac 37862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0057
Description:

Target: scaffold0057; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 314 - 360
Target Start/End: Original strand, 4532 - 4578
Alignment:
Q  314 atgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagt 360  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4532 atgtaagatttcacgtccgtcttacattatctccgaagtaaaagagt 4578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0750 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0750
Description:

Target: scaffold0750; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 141 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 2989 - 2839
Alignment:
Q  141 taatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatat-atcaataagactcatgtcatgatatgc 239  Q
    ||||| ||| |||| ||| ||||||| ||  |||||  |||| |||||||||||||||||||| |||||| | | |||||||||||||| |||||| |      
T  2989 taatcgccagtcacgtgtatcatgaataatcatcaaatcacatttattcatacacaatcatcattcacatttcaccaataagactcatg-catgatgtat 2891  T
Q  240 acata--tcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 290  Q
    || ||   |||| |||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  2890 acctagcccgacacatatatgcatgtggtacc-attcacctcaaggtcgtcac 2839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000006; HSPs: 2)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 141 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 26692 - 26542
Alignment:
Q  141 taatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatat-atcaataagactcatgtcatgatatgc 239  Q
    ||||| ||| |||| ||| ||||||| ||  |||||  |||| |||||||||||||||||||| |||||| | | |||||||||||||| |||||| |      
T  26692 taatcgccagtcacgtgtatcatgaataatcatcaaatcacatttattcatacacaatcatcattcacatttcaccaataagactcatg-catgatgtat 26594  T
Q  240 acata--tcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 290  Q
    || ||   |||| |||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  26593 acctagcccgacacatatatgcatgtggtacc-attcacctcaaggtcgtcac 26542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 197 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 3254 - 3160
Alignment:
Q  197 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 290  Q
    |||| ||||||||||  ||| ||| ||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||| ||||||||||| |  ||||||||||||    
T  3254 atcaccaatcacataattcacatatgactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgcggtaccaaatctcaacaaggtcgtcac 3160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0112 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0112
Description:

Target: scaffold0112; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 296 - 340
Target Start/End: Original strand, 12285 - 12329
Alignment:
Q  296 atgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacat 340  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||    
T  12285 atgcaacaaaaacatcatatgtaagatttcacacccatcttacat 12329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 197 - 290
Target Start/End: Original strand, 25382 - 25476
Alignment:
Q  197 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 290  Q
    |||| ||||||||||  ||| ||| ||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||| ||||||||||| |  ||||||||||||    
T  25382 atcaccaatcacataattcacatatgactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgcggtaccaaatctcaacaaggtcgtcac 25476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0121 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0121
Description:

Target: scaffold0121; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 24 - 65
Target Start/End: Original strand, 7299 - 7341
Alignment:
Q  24 acatcatcataatcca-ataacaattaacatgaataattcaat 65  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  7299 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaat 7341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0521 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0521
Description:

Target: scaffold0521; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 198 - 271
Target Start/End: Original strand, 7049 - 7125
Alignment:
Q  198 tcatcaatcacat-atatcaataagactcatgtcatgatatgcacata--tcgacgcatacatgcatgtggtaccaa 271  Q
    ||||||||||||| | |||||  |||||||||| ||||||||||| ||  ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  7049 tcatcaatcacattacatcaaatagactcatgttatgatatgcacctagttcgacacatatatgcatgtggtaccaa 7125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University