View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF1762_low_33 (Length: 226)

Name: NF1762_low_33
Description: NF1762
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF1762_low_33
NF1762_low_33
[»] chr8 (34 HSPs)
chr8 (14-217)||(8354748-8354951)
chr8 (14-217)||(22124513-22124715)
chr8 (14-217)||(22115705-22115907)
chr8 (42-217)||(22083751-22083925)
chr8 (14-217)||(22047865-22048066)
chr8 (14-217)||(20013848-20014048)
chr8 (14-217)||(20019925-20020125)
chr8 (43-217)||(17669583-17669755)
chr8 (43-217)||(17676235-17676407)
chr8 (14-217)||(19111146-19111347)
chr8 (14-217)||(19117437-19117638)
chr8 (49-217)||(22123403-22123571)
chr8 (48-217)||(16883188-16883357)
chr8 (48-217)||(18854855-18855024)
chr8 (48-217)||(18865250-18865419)
chr8 (14-217)||(19496309-19496510)
chr8 (14-217)||(19498357-19498558)
chr8 (43-210)||(21915583-21915747)
chr8 (43-217)||(5534452-5534624)
chr8 (48-217)||(29123007-29123176)
chr8 (45-217)||(20023941-20024129)
chr8 (45-217)||(23845775-23845963)
chr8 (14-205)||(3216181-3216383)
chr8 (135-205)||(26935296-26935366)
chr8 (135-205)||(19905414-19905484)
chr8 (135-205)||(20527369-20527438)
chr8 (135-181)||(22111642-22111688)
chr8 (135-181)||(43251522-43251568)
chr8 (135-181)||(19278636-19278682)
chr8 (135-181)||(21972930-21972976)
chr8 (135-181)||(21977021-21977067)
chr8 (171-217)||(28454670-28454716)
chr8 (52-122)||(19905511-19905583)
chr8 (139-176)||(20856545-20856582)
[»] chr7 (58 HSPs)
chr7 (14-217)||(18176025-18176225)
chr7 (14-217)||(18182697-18182897)
chr7 (26-217)||(11366117-11366309)
chr7 (42-217)||(60688-60862)
chr7 (14-217)||(14655401-14655602)
chr7 (43-217)||(18164686-18164858)
chr7 (14-217)||(44786459-44786660)
chr7 (14-217)||(44793100-44793301)
chr7 (14-217)||(14330707-14330907)
chr7 (14-217)||(14337291-14337491)
chr7 (49-217)||(15162838-15163006)
chr7 (51-217)||(15156189-15156355)
chr7 (43-217)||(9511025-9511196)
chr7 (43-217)||(40523374-40523546)
chr7 (43-217)||(49051292-49051463)
chr7 (49-217)||(13691013-13691181)
chr7 (49-217)||(16407312-16407480)
chr7 (43-217)||(12703422-12703593)
chr7 (48-217)||(20703006-20703175)
chr7 (48-217)||(32767596-32767765)
chr7 (49-217)||(13684382-13684550)
chr7 (45-217)||(13569797-13569985)
chr7 (135-217)||(9409851-9409934)
chr7 (135-205)||(20213-20283)
chr7 (135-205)||(6017291-6017361)
chr7 (135-181)||(32820-32866)
chr7 (135-181)||(71116-71162)
chr7 (135-181)||(75225-75271)
chr7 (135-205)||(11262248-11262317)
chr7 (135-181)||(12705008-12705054)
chr7 (135-181)||(12714575-12714621)
chr7 (135-181)||(12718379-12718425)
chr7 (135-205)||(14953117-14953186)
chr7 (135-205)||(14959083-14959152)
chr7 (135-181)||(16907584-16907630)
chr7 (135-181)||(26292108-26292154)
chr7 (135-205)||(26419919-26419988)
chr7 (135-205)||(44408454-44408523)
chr7 (135-205)||(7536101-7536171)
chr7 (136-217)||(11232402-11232483)
chr7 (136-217)||(11239089-11239170)
chr7 (135-181)||(12723290-12723336)
chr7 (135-181)||(16113952-16113998)
chr7 (135-181)||(16117105-16117151)
chr7 (135-181)||(18425395-18425441)
chr7 (135-205)||(18531163-18531233)
chr7 (138-181)||(12692438-12692481)
chr7 (136-217)||(1347414-1347495)
chr7 (52-122)||(4318565-4318634)
chr7 (135-205)||(4318661-4318731)
chr7 (135-181)||(18279114-18279160)
chr7 (135-181)||(18283077-18283123)
chr7 (135-188)||(11548383-11548436)
chr7 (135-188)||(11554979-11555032)
chr7 (171-217)||(15022028-15022074)
chr7 (52-122)||(14148583-14148655)
chr7 (139-176)||(42203954-42203991)
chr7 (135-167)||(14148524-14148556)
[»] scaffold0052 (1 HSPs)
scaffold0052 (14-217)||(1038-1239)
[»] chr6 (70 HSPs)
chr6 (14-217)||(27328041-27328242)
chr6 (14-217)||(27388781-27388982)
chr6 (14-217)||(2870120-2870321)
chr6 (14-217)||(2876735-2876936)
chr6 (14-217)||(4233483-4233684)
chr6 (14-217)||(26130388-26130589)
chr6 (14-217)||(30694283-30694484)
chr6 (14-217)||(20801678-20801878)
chr6 (42-217)||(20060570-20060744)
chr6 (14-217)||(27430268-27430469)
chr6 (14-176)||(14059601-14059761)
chr6 (43-217)||(8797112-8797284)
chr6 (43-217)||(6980581-6980752)
chr6 (43-217)||(12762623-12762795)
chr6 (14-205)||(28258438-28258628)
chr6 (14-205)||(28265062-28265252)
chr6 (14-205)||(28287288-28287478)
chr6 (14-205)||(28337187-28337377)
chr6 (14-205)||(28343811-28344001)
chr6 (53-217)||(20649814-20649976)
chr6 (14-183)||(30597173-30597339)
chr6 (14-216)||(25110747-25110962)
chr6 (14-216)||(25117350-25117565)
chr6 (45-217)||(3708496-3708682)
chr6 (135-217)||(24291164-24291246)
chr6 (135-217)||(31317204-31317286)
chr6 (135-217)||(24315192-24315274)
chr6 (135-217)||(4167829-4167912)
chr6 (48-217)||(17037350-17037532)
chr6 (48-205)||(25595369-25595540)
chr6 (135-217)||(4208509-4208592)
chr6 (135-205)||(34832574-34832644)
chr6 (48-217)||(1545060-1545242)
chr6 (48-122)||(1538961-1539034)
chr6 (135-181)||(8243544-8243590)
chr6 (135-181)||(11566573-11566619)
chr6 (135-181)||(12619191-12619237)
chr6 (135-181)||(18917783-18917829)
chr6 (135-205)||(19808444-19808514)
chr6 (135-181)||(19870301-19870347)
chr6 (124-217)||(20176847-20176941)
chr6 (135-205)||(22758768-22758838)
chr6 (135-181)||(22862657-22862703)
chr6 (135-181)||(23394779-23394825)
chr6 (135-181)||(23989631-23989677)
chr6 (135-205)||(25928213-25928283)
chr6 (135-205)||(34298740-34298809)
chr6 (135-217)||(14098534-14098616)
chr6 (135-181)||(1644245-1644291)
chr6 (135-181)||(16624089-16624135)
chr6 (135-205)||(34370092-34370162)
chr6 (45-120)||(24291064-24291132)
chr6 (45-120)||(24315092-24315160)
chr6 (45-120)||(31317104-31317172)
chr6 (135-217)||(1539061-1539143)
chr6 (124-217)||(5834591-5834685)
chr6 (124-217)||(22159050-22159144)
chr6 (135-181)||(31478333-31478379)
chr6 (48-122)||(4167942-4168015)
chr6 (48-122)||(4208622-4208695)
chr6 (171-217)||(8228787-8228833)
chr6 (48-122)||(14098643-14098716)
chr6 (171-217)||(18930976-18931022)
chr6 (171-217)||(29587840-29587886)
chr6 (171-217)||(29593981-29594027)
chr6 (52-122)||(16371872-16371944)
chr6 (141-217)||(16759934-16760011)
chr6 (139-176)||(23657531-23657568)
chr6 (52-122)||(25928310-25928382)
chr6 (139-176)||(27553692-27553729)
[»] chr2 (54 HSPs)
chr2 (14-217)||(29233450-29233650)
chr2 (14-217)||(29346749-29346949)
chr2 (14-217)||(27599184-27599385)
chr2 (26-217)||(1843003-1843192)
chr2 (14-217)||(24913949-24914151)
chr2 (14-217)||(23170958-23171159)
chr2 (14-217)||(23582215-23582416)
chr2 (14-217)||(10866291-10866492)
chr2 (14-217)||(10873458-10873659)
chr2 (43-217)||(22320999-22321171)
chr2 (43-217)||(22327152-22327324)
chr2 (14-217)||(16928276-16928477)
chr2 (14-217)||(16996970-16997171)
chr2 (14-217)||(17003603-17003804)
chr2 (48-217)||(12828992-12829161)
chr2 (43-217)||(27617218-27617389)
chr2 (43-217)||(26877581-26877752)
chr2 (45-217)||(13970382-13970570)
chr2 (45-217)||(24714617-24714805)
chr2 (45-217)||(45057438-45057626)
chr2 (45-217)||(41610642-41610830)
chr2 (135-217)||(41604851-41604933)
chr2 (45-217)||(37318181-37318367)
chr2 (135-205)||(24872527-24872597)
chr2 (135-205)||(24880412-24880482)
chr2 (135-205)||(30971099-30971169)
chr2 (45-120)||(41604745-41604819)
chr2 (135-181)||(10102002-10102048)
chr2 (135-181)||(12901865-12901911)
chr2 (135-205)||(21147410-21147480)
chr2 (135-181)||(24628828-24628874)
chr2 (135-181)||(24649066-24649112)
chr2 (135-181)||(27379781-27379827)
chr2 (135-181)||(27383827-27383873)
chr2 (135-181)||(27601503-27601549)
chr2 (148-217)||(10866093-10866162)
chr2 (14-120)||(19645951-19646055)
chr2 (135-205)||(24503030-24503099)
chr2 (135-205)||(11677365-11677435)
chr2 (171-217)||(13306750-13306796)
chr2 (171-217)||(16985843-16985889)
chr2 (135-205)||(24641081-24641151)
chr2 (171-217)||(9340182-9340228)
chr2 (171-217)||(9488816-9488862)
chr2 (171-217)||(9608077-9608123)
chr2 (171-217)||(16922431-16922477)
chr2 (171-217)||(19490085-19490131)
chr2 (136-178)||(27196829-27196871)
chr2 (171-217)||(27215965-27216011)
chr2 (171-217)||(28432073-28432119)
chr2 (139-176)||(24174759-24174796)
chr2 (139-176)||(24655459-24655496)
chr2 (139-176)||(24869839-24869876)
chr2 (139-176)||(40428422-40428459)
[»] chr5 (66 HSPs)
chr5 (14-217)||(22328147-22328348)
chr5 (14-217)||(37286765-37286966)
chr5 (14-217)||(37293468-37293669)
chr5 (14-217)||(19991803-19992004)
chr5 (14-217)||(22341586-22341787)
chr5 (14-217)||(41294419-41294619)
chr5 (26-217)||(15001675-15001865)
chr5 (14-217)||(23249859-23250059)
chr5 (42-217)||(23584059-23584233)
chr5 (26-217)||(14995032-14995222)
chr5 (14-217)||(22062866-22063067)
chr5 (53-217)||(23609823-23609986)
chr5 (53-217)||(23841219-23841382)
chr5 (14-217)||(40707042-40707243)
chr5 (14-217)||(40713684-40713885)
chr5 (14-217)||(27608660-27608860)
chr5 (14-217)||(27615266-27615466)
chr5 (43-217)||(24472260-24472432)
chr5 (43-217)||(27663802-27663974)
chr5 (49-217)||(18038685-18038853)
chr5 (14-217)||(27516672-27516873)
chr5 (14-217)||(27523309-27523510)
chr5 (53-217)||(41098244-41098407)
chr5 (43-217)||(34294565-34294737)
chr5 (43-217)||(41769163-41769335)
chr5 (43-217)||(41775737-41775909)
chr5 (42-210)||(33725785-33725953)
chr5 (14-217)||(37543960-37544161)
chr5 (43-217)||(17706943-17707114)
chr5 (43-217)||(22264865-22265038)
chr5 (48-217)||(22132918-22133087)
chr5 (48-217)||(25406345-25406514)
chr5 (49-217)||(1692454-1692622)
chr5 (53-217)||(27670451-27670613)
chr5 (48-217)||(17283988-17284157)
chr5 (48-217)||(22139610-22139779)
chr5 (48-217)||(22588016-22588185)
chr5 (49-217)||(27687346-27687514)
chr5 (53-217)||(29471379-29471544)
chr5 (53-217)||(29477974-29478139)
chr5 (45-217)||(24020189-24020374)
chr5 (45-217)||(19768253-19768441)
chr5 (45-217)||(19774849-19775037)
chr5 (135-217)||(22352803-22352885)
chr5 (135-217)||(22343403-22343485)
chr5 (135-205)||(22326046-22326116)
chr5 (135-181)||(15237184-15237230)
chr5 (135-181)||(19473067-19473113)
chr5 (135-181)||(20295558-20295604)
chr5 (135-205)||(21295380-21295449)
chr5 (135-205)||(24554454-24554523)
chr5 (135-181)||(10752901-10752947)
chr5 (135-205)||(14359937-14360007)
chr5 (135-205)||(25534908-25534977)
chr5 (135-177)||(15442074-15442116)
chr5 (135-205)||(23337408-23337478)
chr5 (171-217)||(16354744-16354790)
chr5 (171-217)||(16361403-16361449)
chr5 (171-217)||(34564737-34564783)
chr5 (171-217)||(34571392-34571438)
chr5 (139-176)||(123423-123460)
chr5 (139-176)||(12028685-12028722)
chr5 (52-122)||(15441975-15442047)
chr5 (139-176)||(17919263-17919300)
chr5 (139-176)||(22757085-22757122)
chr5 (139-176)||(24221836-24221873)
[»] chr4 (65 HSPs)
chr4 (26-217)||(14298825-14299014)
chr4 (26-217)||(14305449-14305638)
chr4 (14-217)||(15148377-15148577)
chr4 (14-217)||(14268443-14268640)
chr4 (14-217)||(4772017-4772217)
chr4 (42-217)||(15362052-15362226)
chr4 (42-217)||(16231854-16232028)
chr4 (42-217)||(22194539-22194713)
chr4 (42-217)||(36884747-36884921)
chr4 (14-217)||(18071088-18071289)
chr4 (14-217)||(8048481-8048681)
chr4 (43-217)||(23954068-23954240)
chr4 (43-217)||(23960730-23960902)
chr4 (14-217)||(18024413-18024614)
chr4 (14-217)||(18295545-18295746)
chr4 (14-217)||(8055094-8055294)
chr4 (42-217)||(15383505-15383678)
chr4 (20-217)||(12474939-12475134)
chr4 (20-217)||(12481569-12481764)
chr4 (53-217)||(20115062-20115226)
chr4 (48-217)||(386347-386516)
chr4 (48-217)||(6873394-6873563)
chr4 (43-217)||(19780303-19780474)
chr4 (48-217)||(40478069-40478238)
chr4 (48-217)||(26284923-26285094)
chr4 (48-217)||(51493835-51494002)
chr4 (48-164)||(40471449-40471565)
chr4 (45-217)||(19942167-19942355)
chr4 (45-217)||(23081493-23081681)
chr4 (45-217)||(16956664-16956852)
chr4 (45-217)||(27709650-27709838)
chr4 (135-217)||(9272275-9272357)
chr4 (135-217)||(4561683-4561765)
chr4 (135-217)||(5757288-5757370)
chr4 (135-205)||(53433293-53433363)
chr4 (135-205)||(20682069-20682139)
chr4 (48-122)||(15322111-15322184)
chr4 (135-217)||(7901289-7901371)
chr4 (135-217)||(35170532-35170615)
chr4 (135-181)||(9556241-9556287)
chr4 (135-181)||(14757771-14757817)
chr4 (135-181)||(17809985-17810031)
chr4 (135-181)||(33742091-33742137)
chr4 (140-202)||(35613859-35613921)
chr4 (135-205)||(41385862-41385931)
chr4 (135-183)||(14678903-14678951)
chr4 (14-122)||(30235162-30235268)
chr4 (135-205)||(12522000-12522070)
chr4 (135-181)||(15224752-15224798)
chr4 (135-205)||(23838353-23838422)
chr4 (48-120)||(7901186-7901260)
chr4 (135-183)||(14685111-14685159)
chr4 (135-217)||(15322211-15322293)
chr4 (158-217)||(40453840-40453899)
chr4 (48-120)||(9272120-9272191)
chr4 (171-217)||(8384733-8384779)
chr4 (171-217)||(8391388-8391434)
chr4 (171-217)||(14073729-14073775)
chr4 (171-217)||(15256507-15256553)
chr4 (171-217)||(17090139-17090185)
chr4 (171-217)||(29041060-29041106)
chr4 (139-176)||(11250681-11250718)
chr4 (139-176)||(15353428-15353465)
chr4 (139-176)||(16351972-16352009)
chr4 (52-122)||(35613952-35614024)
[»] chr3 (101 HSPs)
chr3 (43-217)||(53380362-53380535)
chr3 (43-217)||(53387014-53387187)
chr3 (14-217)||(10846267-10846468)
chr3 (14-217)||(20057388-20057589)
chr3 (14-217)||(20064026-20064227)
chr3 (43-217)||(5106896-5107068)
chr3 (14-217)||(3690540-3690741)
chr3 (42-217)||(5221326-5221499)
chr3 (14-217)||(13250640-13250841)
chr3 (14-217)||(13257286-13257487)
chr3 (53-217)||(6598640-6598803)
chr3 (53-217)||(6605320-6605483)
chr3 (14-217)||(14673184-14673385)
chr3 (53-217)||(31422574-31422737)
chr3 (53-217)||(37615314-37615477)
chr3 (42-217)||(26889377-26889550)
chr3 (20-217)||(417921-418116)
chr3 (43-217)||(16747851-16748023)
chr3 (43-217)||(16758583-16758755)
chr3 (42-210)||(10003564-10003732)
chr3 (42-210)||(10010211-10010379)
chr3 (42-210)||(10904154-10904322)
chr3 (42-210)||(10910826-10910994)
chr3 (53-216)||(16489691-16489853)
chr3 (43-217)||(16624067-16624239)
chr3 (43-217)||(26794407-26794579)
chr3 (53-217)||(10153756-10153919)
chr3 (43-210)||(26788817-26788982)
chr3 (48-217)||(23704782-23704951)
chr3 (48-217)||(23723238-23723407)
chr3 (48-217)||(23741694-23741863)
chr3 (48-217)||(41201812-41201981)
chr3 (48-217)||(15692292-15692461)
chr3 (53-217)||(15726951-15727115)
chr3 (45-217)||(22643330-22643515)
chr3 (45-217)||(10236408-10236592)
chr3 (45-217)||(15825571-15825755)
chr3 (45-217)||(15992117-15992301)
chr3 (48-217)||(19808933-19809116)
chr3 (45-217)||(1145564-1145752)
chr3 (45-217)||(8721168-8721356)
chr3 (45-217)||(9073055-9073243)
chr3 (45-217)||(15343617-15343805)
chr3 (45-217)||(410763-410951)
chr3 (45-217)||(15350261-15350449)
chr3 (135-217)||(13316302-13316384)
chr3 (45-217)||(15360596-15360784)
chr3 (45-217)||(15397916-15398104)
chr3 (45-217)||(15404507-15404695)
chr3 (135-217)||(4710206-4710288)
chr3 (136-217)||(15337338-15337419)
chr3 (135-217)||(15367048-15367130)
chr3 (135-205)||(12891322-12891392)
chr3 (135-205)||(13320892-13320962)
chr3 (135-205)||(17253176-17253246)
chr3 (136-210)||(17710710-17710784)
chr3 (135-217)||(30777343-30777426)
chr3 (45-120)||(15337452-15337526)
chr3 (135-181)||(7109410-7109456)
chr3 (135-181)||(7113345-7113391)
chr3 (135-181)||(11069782-11069828)
chr3 (135-181)||(11165878-11165924)
chr3 (135-205)||(20722921-20722990)
chr3 (135-181)||(22321378-22321424)
chr3 (135-181)||(22336433-22336479)
chr3 (135-205)||(24187697-24187766)
chr3 (135-181)||(27409993-27410039)
chr3 (135-181)||(28949436-28949482)
chr3 (135-181)||(30065662-30065708)
chr3 (135-181)||(55022579-55022625)
chr3 (135-205)||(55148898-55148967)
chr3 (45-120)||(4710320-4710391)
chr3 (136-181)||(15617088-15617133)
chr3 (45-120)||(30777237-30777311)
chr3 (135-217)||(41092462-41092544)
chr3 (135-205)||(839166-839236)
chr3 (135-181)||(4107748-4107794)
chr3 (135-181)||(4111600-4111646)
chr3 (48-122)||(5149984-5150057)
chr3 (135-205)||(7985623-7985693)
chr3 (135-181)||(14499039-14499085)
chr3 (52-205)||(16333089-16333258)
chr3 (135-181)||(16750691-16750737)
chr3 (135-181)||(19775305-19775351)
chr3 (135-205)||(28351283-28351353)
chr3 (45-121)||(17710605-17710680)
chr3 (135-217)||(5150084-5150166)
chr3 (45-120)||(15366942-15367016)
chr3 (135-180)||(4589296-4589341)
chr3 (135-180)||(10325793-10325838)
chr3 (15-120)||(13316172-13316275)
chr3 (48-120)||(41092362-41092433)
chr3 (56-122)||(13320988-13321053)
chr3 (171-217)||(16633751-16633797)
chr3 (171-217)||(16640361-16640407)
chr3 (171-217)||(43161026-43161072)
chr3 (171-217)||(43167263-43167309)
chr3 (52-122)||(7985720-7985792)
chr3 (139-176)||(11557505-11557542)
chr3 (139-176)||(11595259-11595296)
chr3 (139-176)||(42325901-42325938)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (14-217)||(56894-57095)
[»] chr1 (37 HSPs)
chr1 (14-217)||(51328663-51328864)
chr1 (14-217)||(51335297-51335498)
chr1 (14-217)||(16345759-16345960)
chr1 (14-217)||(16352407-16352608)
chr1 (26-210)||(47659141-47659324)
chr1 (42-217)||(44844895-44845069)
chr1 (49-217)||(18600123-18600291)
chr1 (49-217)||(41478595-41478763)
chr1 (14-217)||(41348836-41349037)
chr1 (43-217)||(20215941-20216112)
chr1 (48-217)||(21844147-21844315)
chr1 (14-217)||(41356273-41356474)
chr1 (48-217)||(21828634-21828802)
chr1 (45-217)||(33386236-33386424)
chr1 (45-217)||(33392881-33393069)
chr1 (49-217)||(21807217-21807401)
chr1 (49-217)||(21835271-21835455)
chr1 (135-205)||(50887872-50887942)
chr1 (135-181)||(1010434-1010480)
chr1 (135-205)||(8305060-8305130)
chr1 (135-181)||(16375806-16375852)
chr1 (135-205)||(19104669-19104739)
chr1 (135-205)||(19111326-19111396)
chr1 (135-181)||(21407066-21407112)
chr1 (135-205)||(23763131-23763200)
chr1 (135-181)||(52639252-52639298)
chr1 (135-181)||(21437737-21437783)
chr1 (135-181)||(39244244-39244290)
chr1 (135-181)||(39247799-39247845)
chr1 (135-181)||(41388344-41388390)
chr1 (136-181)||(20229333-20229378)
chr1 (133-176)||(20525332-20525375)
chr1 (171-217)||(43078339-43078385)
chr1 (171-217)||(46157481-46157527)
chr1 (139-176)||(18394085-18394122)
chr1 (52-122)||(19104766-19104838)
chr1 (52-122)||(20525235-20525307)
[»] scaffold0155 (1 HSPs)
scaffold0155 (43-217)||(9829-10001)
[»] scaffold0044 (3 HSPs)
scaffold0044 (43-217)||(72911-73083)
scaffold0044 (43-217)||(30447-30620)
scaffold0044 (48-217)||(7981-8150)
[»] scaffold0141 (1 HSPs)
scaffold0141 (14-217)||(37962-38162)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (14-217)||(76650-76850)
[»] scaffold0061 (2 HSPs)
scaffold0061 (42-217)||(59472-59646)
scaffold0061 (135-181)||(67650-67696)
[»] scaffold0017 (3 HSPs)
scaffold0017 (42-217)||(138987-139161)
scaffold0017 (139-176)||(15331-15368)
scaffold0017 (139-176)||(19853-19890)
[»] scaffold0029 (5 HSPs)
scaffold0029 (14-217)||(105863-106071)
scaffold0029 (14-217)||(126098-126306)
scaffold0029 (135-181)||(61959-62005)
scaffold0029 (135-181)||(65875-65921)
scaffold0029 (135-181)||(80252-80298)
[»] scaffold0028 (9 HSPs)
scaffold0028 (43-217)||(67430-67601)
scaffold0028 (45-217)||(6911-7095)
scaffold0028 (45-217)||(13436-13620)
scaffold0028 (45-217)||(22964-23148)
scaffold0028 (48-122)||(57060-57133)
scaffold0028 (135-181)||(59068-59114)
scaffold0028 (48-122)||(41553-41626)
scaffold0028 (135-217)||(56951-57033)
scaffold0028 (135-217)||(41444-41526)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (48-217)||(307018-307187)
[»] scaffold0004 (2 HSPs)
scaffold0004 (14-217)||(78121-78335)
scaffold0004 (135-205)||(60884-60953)
[»] scaffold0109 (2 HSPs)
scaffold0109 (14-217)||(26547-26763)
scaffold0109 (14-205)||(43234-43435)
[»] scaffold0431 (1 HSPs)
scaffold0431 (45-217)||(12351-12535)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (45-217)||(73901-74089)
[»] scaffold0744 (1 HSPs)
scaffold0744 (135-217)||(3790-3872)
[»] scaffold0572 (1 HSPs)
scaffold0572 (45-217)||(9759-9943)
[»] scaffold0089 (1 HSPs)
scaffold0089 (14-217)||(19561-19777)
[»] scaffold0780 (2 HSPs)
scaffold0780 (135-205)||(34-104)
scaffold0780 (50-121)||(131-201)
[»] scaffold0525 (1 HSPs)
scaffold0525 (135-217)||(4222-4305)
[»] scaffold0096 (1 HSPs)
scaffold0096 (48-205)||(15010-15179)
[»] scaffold0676 (1 HSPs)
scaffold0676 (135-181)||(161-207)
[»] scaffold0372 (1 HSPs)
scaffold0372 (135-181)||(5448-5494)
[»] scaffold0349 (1 HSPs)
scaffold0349 (135-181)||(12133-12179)
[»] scaffold0242 (2 HSPs)
scaffold0242 (135-205)||(19495-19564)
scaffold0242 (135-205)||(25669-25738)
[»] scaffold0010 (1 HSPs)
scaffold0010 (135-205)||(241977-242046)
[»] scaffold0697 (1 HSPs)
scaffold0697 (135-217)||(6522-6604)
[»] scaffold0560 (1 HSPs)
scaffold0560 (135-205)||(5915-5985)
[»] scaffold0233 (1 HSPs)
scaffold0233 (135-205)||(14657-14727)
[»] scaffold0216 (1 HSPs)
scaffold0216 (135-205)||(8971-9041)
[»] scaffold0259 (1 HSPs)
scaffold0259 (135-205)||(10093-10163)
[»] scaffold0256 (1 HSPs)
scaffold0256 (135-205)||(25093-25162)
[»] scaffold0156 (1 HSPs)
scaffold0156 (135-205)||(2729-2798)
[»] scaffold0037 (1 HSPs)
scaffold0037 (135-180)||(80878-80923)
[»] scaffold0140 (1 HSPs)
scaffold0140 (171-217)||(38603-38649)
[»] scaffold0013 (2 HSPs)
scaffold0013 (135-205)||(9257-9326)
scaffold0013 (52-122)||(9353-9425)
[»] scaffold0637 (1 HSPs)
scaffold0637 (139-176)||(8520-8557)
[»] scaffold0439 (2 HSPs)
scaffold0439 (139-176)||(2557-2594)
scaffold0439 (139-176)||(10417-10454)
[»] scaffold0184 (1 HSPs)
scaffold0184 (139-176)||(4346-4383)
[»] scaffold0181 (1 HSPs)
scaffold0181 (139-176)||(27243-27280)
[»] scaffold0036 (1 HSPs)
scaffold0036 (139-176)||(68837-68874)
[»] scaffold0015 (1 HSPs)
scaffold0015 (139-176)||(192438-192475)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 204; Significance: 1e-111; HSPs: 34)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 14 - 217
Target Start/End: Original strand, 8354748 - 8354951
Alignment:
Q  14 agatatgaaggtttgataaagatgcaattttatgtgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaacta 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8354748 agatatgaaggtttgataaagatgcaattttatgtgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaacta 8354847  T
Q  114 agtgcataagtatatgataaagtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatctc 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8354848 agtgcataagtatatgataaagtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatctc 8354947  T
Q  214 attg 217  Q
    ||||    
T  8354948 attg 8354951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 14 - 217
Target Start/End: Original strand, 22124513 - 22124715
Alignment:
Q  14 agatatgaaggtttgataaagatgcaattttatgtgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaacta 113  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22124513 agatatgaaggtttgataatgatgcaattt-ataagctattgatataatgatatcattttg-ttatgtgacttgtttatgctgcttccgttatttaacta 22124610  T
Q  114 agtgcataagtatatgataaagtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatg-ttctgttcataagtgtccatgcatagcatct 212  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||| |||||||||||||||||    
T  22124611 agtgcataagtatatgatgaagtttagctccaaattactggatgcatgttgatatgttgattacgatgtttttgtccataagagtccatgcatagcatct 22124710  T
Q  213 cattg 217  Q
    |||||    
T  22124711 cattg 22124715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 14 - 217
Target Start/End: Original strand, 22115705 - 22115907
Alignment:
Q  14 agatatgaaggtttgataaagatgcaattttatgtgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaacta 113  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  22115705 agatatgaaggtttgataatgatgcaattt-ataagctattgatataatgatatcattttg-ttatgtgacttgtttatgctgcttcccttatttaacta 22115802  T
Q  114 agtgcataagtatatgataaagtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatg-ttctgttcataagtgtccatgcatagcatct 212  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||| |||||||||||||||||    
T  22115803 agtgcataagtatatgattaagtttagctccaaattactggatgcatgttgatatgttgattacgatgtttttgtccataagagtccatgcatagcatct 22115902  T
Q  213 cattg 217  Q
    |||||    
T  22115903 cattg 22115907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 42 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 22083925 - 22083751
Alignment:
Q  42 tttatgtgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaactaagtgcataagtatatgataaagtttagc 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22083925 tttatgtgctattgatataatgatatcatcttgat-atgtgacttgtttatgctgcttccgttgtttaactaagtgcataagtatatgatgaagtttagc 22083827  T
Q  142 tccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatctcattg 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  22083826 tccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgttgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattg 22083751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 14 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 22048066 - 22047865
Alignment:
Q  14 agatatgaaggtttgataaagatgcaattttatgtgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaacta 113  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  22048066 agatatgaaggtttgataataatgcaattt-atgtgctattgatataatgatatcatcttgctg-tgtgacttgtttatgctgcttctgttatttaacta 22047969  T
Q  114 agtgcataagtatatgataaagtttagctccaaattattggatgcatgttga-tatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatct 212  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22047968 agtgcatatgtatatgataatgtttagctccaaattattggatgcatgttgattacgatgattacg-tgttctgttcataagtgtccatgcatagcatat 22047870  T
Q  213 cattg 217  Q
    |||||    
T  22047869 cattg 22047865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 14 - 217
Target Start/End: Original strand, 20013848 - 20014048
Alignment:
Q  14 agatatgaaggtttgataaagatgcaattttatgtgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaacta 113  Q
    ||||||||||  ||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  20013848 agatatgaagagttgataatgatacaattt-atgtgctattgatataatgatatcatcttg-ttatgtgacctgtttatgctgcttccgttatttaacta 20013945  T
Q  114 agtgcataagtatatgataaagtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatctc 213  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  20013946 agtgcataattatatgatgaagtttagctccaagttattggatgcatgttgataag-tgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatc 20014044  T
Q  214 attg 217  Q
    ||||    
T  20014045 attg 20014048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 14 - 217
Target Start/End: Original strand, 20019925 - 20020125
Alignment:
Q  14 agatatgaaggtttgataaagatgcaattttatgtgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaacta 113  Q
    ||||||||||  ||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  20019925 agatatgaagagttgataatgatacaattt-atgtgctattgatataatgatatcatcttg-ttatgtgacctgtttatgctgcttccgttatttaacta 20020022  T
Q  114 agtgcataagtatatgataaagtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatctc 213  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  20020023 agtgcataattatatgatgaagtttagctccaagttattggatgcatgttgataag-tgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatc 20020121  T
Q  214 attg 217  Q
    ||||    
T  20020122 attg 20020125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 43 - 217
Target Start/End: Original strand, 17669583 - 17669755
Alignment:
Q  43 ttatgtgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaactaagtgcataagtatatgataaagtttagct 142  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  17669583 ttatgtgct-ttgatataatgatatcatcttg-ttatgtgacctgtttatgctgcttccgttatttaactaagtgcataattatatgatgaagtttagct 17669680  T
Q  143 ccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatctcattg 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  17669681 ccaaattattggatgcatgttgataagttgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattg 17669755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 43 - 217
Target Start/End: Original strand, 17676235 - 17676407
Alignment:
Q  43 ttatgtgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaactaagtgcataagtatatgataaagtttagct 142  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  17676235 ttatgtgct-ttgatataatgatatcatcttg-ttatgtgacctgtttatgctgcttccgttatttaactaagtgcataattatatgatgaagtttagct 17676332  T
Q  143 ccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatctcattg 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  17676333 ccaaattattggatgcatgttgataagttgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattg 17676407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 14 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 19111347 - 19111146
Alignment:
Q  14 agatatgaaggtttgataaagatgcaattttatgtgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaacta 113  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  19111347 agatatgaaggtttgataataatgcaattt-acgtgctattgatataataatatcatcttgat-atgtgacttgtttatgctgcttccgttgtttaacta 19111250  T
Q  114 agtgcataagtatatgataaagtttagctccaaattattggatgcatgttga-tatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatct 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||| ||||  |||| ||||||||||||||| |    
T  19111249 agtgcataagtatatgataaagtttagctccaaattattggatgcatgttgattacgttgattacg-tgttttgttgttaagagtccatgcatagcatat 19111151  T
Q  213 cattg 217  Q
    |||||    
T  19111150 cattg 19111146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 14 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 19117638 - 19117437
Alignment:
Q  14 agatatgaaggtttgataaagatgcaattttatgtgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaacta 113  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  19117638 agatatgaaggtttgataataatgcaattt-acgtgctattgatataataatatcatcttgat-atgtgacttgtttatgctgcttccgttgtttaacta 19117541  T
Q  114 agtgcataagtatatgataaagtttagctccaaattattggatgcatgttga-tatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatct 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||| ||||  |||| ||||||||||||||| |    
T  19117540 agtgcataagtatatgataaagtttagctccaaattattggatgcatgttgattacgttgattacg-tgttttgttgttaagagtccatgcatagcatat 19117442  T
Q  213 cattg 217  Q
    |||||    
T  19117441 cattg 19117437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 49 - 217
Target Start/End: Original strand, 22123403 - 22123571
Alignment:
Q  49 gctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaactaagtgcataagtatatgataaagtttagctccaaat 148  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||    
T  22123403 gctattgatataatgatatcattttgtttatgtgacctgtttatgctgctcccgttatttaactaagtgcataagtttatgatgaag-ttagctccaaat 22123501  T
Q  149 tattggatgcatgttgatatgttgattacgatg-ttctgttcataagtgtccatgcatagcatctcattg 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22123502 tattggatgcatgttgatatgttgattacgatgtttttgttcataagtgtccatgcatagcatctcattg 22123571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 48 - 217
Target Start/End: Original strand, 16883188 - 16883357
Alignment:
Q  48 tgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaactaagtgcataag-tatatgataaagtttagctccaa 146  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||    
T  16883188 tgctattgatataatgatatcatcttg-ttatgtgacttgtttatgctgcttccgttatttaactaagtgcatatggtatatgatgaagtttagctccaa 16883286  T
Q  147 attattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatctcattg 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||  |||| ||||||||||||||| ||||||    
T  16883287 attattggatgcatgttgatatgttgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattg 16883357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 48 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 18855024 - 18854855
Alignment:
Q  48 tgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaactaagtgcataag-tatatgataaagtttagctccaa 146  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||    
T  18855024 tgctattgatataatgatatcatcttg-ttatgtgacttgtttatgctgcttccgttatttaactaagtgcatatggtatatgatgaagtttagctccaa 18854926  T
Q  147 attattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatctcattg 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||  |||| ||||||||||||||| ||||||    
T  18854925 attattggatgcatgttgatatgttgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattg 18854855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 48 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 18865419 - 18865250
Alignment:
Q  48 tgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaactaagtgcataag-tatatgataaagtttagctccaa 146  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||    
T  18865419 tgctattgatataatgatatcatcttg-ttatgtgacttgtttatgctgcttccgttatttaactaagtgcatatggtatatgatcaagtttagctccaa 18865321  T
Q  147 attattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatctcattg 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||  |||| ||||||||||||||| ||||||    
T  18865320 attattggatgcatgttgatatgttgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattg 18865250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 14 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 19496510 - 19496309
Alignment:
Q  14 agatatgaaggtttgataaagatgcaattttatgtgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaacta 113  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  19496510 agatatgaaggtttgataataatgcaattt-atgtgctaatgatataatgatatcatcttgctg-tgtgacttgtttatgctgcttctgttatttaacta 19496413  T
Q  114 agtgcataagtatatgataaagtttagctccaaattattggatgcatgttga-tatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatct 212  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| || | |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  19496412 agtgcatatgtatatgataaggtttagcttcaaattattggatgcatgttgattacgatgattacg-tgttttgttcataagtgtccatgcatagcatat 19496314  T
Q  213 cattg 217  Q
    |||||    
T  19496313 cattg 19496309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 14 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 19498558 - 19498357
Alignment:
Q  14 agatatgaaggtttgataaagatgcaattttatgtgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaacta 113  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  19498558 agatatgaaggtttgataataatgcaattt-atgtgctaatgatataatgatatcatcttgctg-tgtgacttgtttatgctgcttctgttatttaacta 19498461  T
Q  114 agtgcataagtatatgataaagtttagctccaaattattggatgcatgttga-tatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatct 212  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| || | |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  19498460 agtgcatatgtatatgataaggtttagcttcaaattattggatgcatgttgattacgatgattacg-tgttttgttcataagtgtccatgcatagcatat 19498362  T
Q  213 cattg 217  Q
    |||||    
T  19498361 cattg 19498357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 43 - 210
Target Start/End: Original strand, 21915583 - 21915747
Alignment:
Q  43 ttatgtgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaactaagtgcataagtatatgataaagtttagct 142  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  21915583 ttatgtgct-ttgatataatgatatcatcttg-ttatgtgacctgtttatgctgcttccgttatttaactaagtgcataattatatgatgaagtttagct 21915680  T
Q  143 ccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcat 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  21915681 ccaaattattggatgcatgttgataag-tgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcat 21915747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 43 - 217
Target Start/End: Original strand, 5534452 - 5534624
Alignment:
Q  43 ttatgtgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaactaagtgcataagtatatgataaagtttagct 142  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  5534452 ttatgtgct-ttgatataatgatatcatcttg-ttatgtgacctatttatgctgcttccgttattaaactaagtgcataattatatgatgaagtttagct 5534549  T
Q  143 ccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatctcattg 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  5534550 ccaaattattggatgcatgttgataagttgattacgatattttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattg 5534624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 48 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 29123176 - 29123007
Alignment:
Q  48 tgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaactaagtgcataag-tatatgataaagtttagctccaa 146  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  29123176 tgctgttgatataatgatatcatcttg-ttatgtgacttgtttatgctgcttccgttatttaactaagtgcatatggtatatgataaagtttagctccaa 29123078  T
Q  147 attattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatctcattg 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||  |||| ||||||||||||||| ||||||    
T  29123077 attattggatgcatgttgatatgttgattacagtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattg 29123007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 45 - 217
Target Start/End: Original strand, 20023941 - 20024129
Alignment:
Q  45 atgtgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaactaagtgcat---aagtat--------------a 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||   | ||||              |    
T  20023941 atgtgctattgatataatgatatcatcctg-ttatgtgacttgattatgctgctgctgttatttaactaagtgcattgtatgtatttatatatgatgaaa 20024039  T
Q  128 tgataaagtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatctcattg 217  Q
    |||| | |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20024040 tgatgacgtttagctccaagttgttggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagagtccatgcatagcatctcattg 20024129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 45 - 217
Target Start/End: Original strand, 23845775 - 23845963
Alignment:
Q  45 atgtgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaactaagtgcataag---------tatatgataaa- 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||            |||||||| ||     
T  23845775 atgtgctattgatataatgatatcatcctg-ttatgtgacttgattatgctgctgctgttatttaactaagtgcattgtatatatttatatatgatgaaa 23845873  T
Q  135 -------gtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatctcattg 217  Q
           ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23845874 tgatgacgtttagctccaaattgttggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagagtccatgcatagcatctcattg 23845963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 14 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 3216383 - 3216181
Alignment:
Q  14 agatatgaaggtttgataaagatgcaattttatgtgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaacta 113  Q
    ||||||||| |||| || | |||||||||  || |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  |||||||||   ||||||||||||    
T  3216383 agatatgaaagtttaattatgatgcaattg-atttgctattgatataatgatatcatcctg-ttatgtgacttgactatgctgctgctgttatttaacta 3216286  T
Q  114 agtgcataag-----tatatgataaa--------gtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtcca 200  Q
    |||||||||      |||||||| ||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || | |||||||||| |||||    
T  3216285 agtgcataatgtctatatatgatgaaatgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacagtgatttgttcataagagtcca 3216186  T
Q  201 tgcat 205  Q
    |||||    
T  3216185 tgcat 3216181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 135 - 205
Target Start/End: Original strand, 26935296 - 26935366
Alignment:
Q  135 gtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcat 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||| ||||||||||    
T  26935296 gtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacggtgatttgttcataagagtccatgcat 26935366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 135 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 19905484 - 19905414
Alignment:
Q  135 gtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcat 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || | |||| ||||| ||||||||||    
T  19905484 gtttagctccaaattattggatgcatattgatatgatgattacggtgatttgttgataagagtccatgcat 19905414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 135 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 20527438 - 20527369
Alignment:
Q  135 gtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcat 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||| || || ||||||||||    
T  20527438 gtttagctccaaattattggatgcatattgatatgatgattacgatgttttgttgat-agagtccatgcat 20527369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 135 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 22111688 - 22111642
Alignment:
Q  135 gtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatg 181  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22111688 gtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatg 22111642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 135 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 43251568 - 43251522
Alignment:
Q  135 gtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatg 181  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  43251568 gtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatg 43251522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 135 - 181
Target Start/End: Original strand, 19278636 - 19278682
Alignment:
Q  135 gtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatg 181  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  19278636 gtttagctccaaattattgaatgcatgatgatatgttgattacgatg 19278682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 135 - 181
Target Start/End: Original strand, 21972930 - 21972976
Alignment:
Q  135 gtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatg 181  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  21972930 gtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattgcgatg 21972976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 135 - 181
Target Start/End: Original strand, 21977021 - 21977067
Alignment:
Q  135 gtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatg 181  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  21977021 gtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattgcgatg 21977067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 171 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 28454716 - 28454670
Alignment:
Q  171 tgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatctcattg 217  Q
    |||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  28454716 tgattatgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattg 28454670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 52 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 19905583 - 19905511
Alignment:
Q  52 attgatataatgatatcatcttgat--tatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaactaagtgcataa 122  Q
    |||||||||||||||||||| || |  | |||||||||  |||||||||   |||||||||||||||||||||    
T  19905583 attgatataatgatatcatcctgttgttgtgtgacttgactatgctgctgctgttatttaactaagtgcataa 19905511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 139 - 176
Target Start/End: Original strand, 20856545 - 20856582
Alignment:
Q  139 agctccaaattattggatgcatgttgatatgttgatta 176  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  20856545 agctccaaattattggatgcatattgagatgttgatta 20856582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 165; Significance: 2e-88; HSPs: 58)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 14 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 18176225 - 18176025
Alignment:
Q  14 agatatgaaggtttgataaagatgcaattttatgtgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaacta 113  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18176225 agatatgaaggtttgataatgatgcaatt--atgtgcaattgatataatgatatcatcttg-ttatgtgacttgtttatgctgcttccgttatttaacta 18176129  T
Q  114 agtgcataagtatatgataaagtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatctc 213  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18176128 agtgcataagtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccatgcatagcatctc 18176029  T
Q  214 attg 217  Q
    ||||    
T  18176028 attg 18176025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 14 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 18182897 - 18182697
Alignment:
Q  14 agatatgaaggtttgataaagatgcaattttatgtgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaacta 113  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18182897 agatatgaaggtttgataatgatgcaatt--atgtgctattgatataatgatatcatcttg-ttatgtgacttgtttatgctgcttccgttatttaacta 18182801  T
Q  114 agtgcataagtatatgataaagtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatctc 213  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  18182800 agtgcataagtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttattcataagtgtccatgcatagcatctc 18182701  T
Q  214 attg 217  Q
    ||||    
T  18182700 attg 18182697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 26 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 11366309 - 11366117
Alignment:
Q  26 ttgataaagatgcaattttatgtgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaactaagtgcataagta 125  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11366309 ttgataatgatgcaattt-atgtgctattgatataatgatatcatctcgtttatgtgacctgtttatgctgcttccgttatttaactaagtgcataagta 11366211  T
Q  126 tatgataaagtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatg---ttctgttcataagtgtccatgcatagcatctcattg 217  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11366210 tatgatgaag-ttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgtttttgtgttcataagtgtccatgcatagcatctcattg 11366117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 42 - 217
Target Start/End: Original strand, 60688 - 60862
Alignment:
Q  42 tttatgtgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaactaagtgcataagtatatgataaagtttagc 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  60688 tttatgtgctattgatataatgatatcatcttgat-atgtgacttgtttatgctgcttccgttgtttaactaagtgcataagtatatgatgaagtttagc 60786  T
Q  142 tccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatctcattg 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  60787 tccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgttgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattg 60862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 14 - 217
Target Start/End: Original strand, 14655401 - 14655602
Alignment:
Q  14 agatatgaaggtttgataaagatgcaattttatgtgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaacta 113  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14655401 agatatgaaggtttgataataatgcaattt-atgtgctattgatataatgatatcatcttgat-atgtgacttgtttatgctgcttccgttatttaacta 14655498  T
Q  114 agtgcataagtatatgataaagtttagctccaaattattggatgcatgttga-tatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatct 212  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| |||| ||||  |||| ||||||||||||||| |    
T  14655499 agtgcataagtatatgataaggtttagctccaaattattggatgcatgttgattacgatgattacg-tgttttgttgttaagagtccatgcatagcatat 14655597  T
Q  213 cattg 217  Q
    |||||    
T  14655598 cattg 14655602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 43 - 217
Target Start/End: Original strand, 18164686 - 18164858
Alignment:
Q  43 ttatgtgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaactaagtgcataagtatatgataaagtttagct 142  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  18164686 ttatgtgct-ttgatataatgatatcatcttg-ttatgtgacctgtttatgctgcttccgttatttaactaagtgcataattatatgatgaagtttagct 18164783  T
Q  143 ccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatctcattg 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  18164784 ccaaattattggatgcatgttgataagttgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattg 18164858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 14 - 217
Target Start/End: Original strand, 44786459 - 44786660
Alignment:
Q  14 agatatgaaggtttgataaagatgcaattttatgtgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaacta 113  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  44786459 agatatgaaggtttgataataatgcaattt-acgtgctattgatataataatatcatcttgat-atgtgacttgtttatgctgcttccgttgtttaacta 44786556  T
Q  114 agtgcataagtatatgataaagtttagctccaaattattggatgcatgttga-tatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatct 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||| ||||  |||| ||||||||||||||| |    
T  44786557 agtgcataagtatatgataaagtttagctccaaattattggatgcatgttgattacgttgattacg-tgttttgttgttaagagtccatgcatagcatat 44786655  T
Q  213 cattg 217  Q
    |||||    
T  44786656 cattg 44786660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 14 - 217
Target Start/End: Original strand, 44793100 - 44793301
Alignment:
Q  14 agatatgaaggtttgataaagatgcaattttatgtgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaacta 113  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  44793100 agatatgaaggtttgataataatgcaattt-acgtgctattgatataataatatcatcttgat-atgtgacttgtttatgctgcttccgttgtttaacta 44793197  T
Q  114 agtgcataagtatatgataaagtttagctccaaattattggatgcatgttga-tatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatct 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||| ||||  |||| ||||||||||||||| |    
T  44793198 agtgcataagtatatgataaagtttagctccaaattattggatgcatgttgattacgttgattacg-tgttttgttgttaagagtccatgcatagcatat 44793296  T
Q  213 cattg 217  Q
    |||||    
T  44793297 cattg 44793301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 14 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 14330907 - 14330707
Alignment:
Q  14 agatatgaaggtttgataaagatgcaattttatgtgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaacta 113  Q
    ||||||||||  ||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  14330907 agatatgaagagttgataatgatacaattt-atgtgctattgatataatgatatcatcttg-ttatgtgacctgtttatgctgcttccgttatttaacta 14330810  T
Q  114 agtgcataagtatatgataaagtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatctc 213  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||| | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  14330809 agtgcataattatatgatgaagtttagctccaagttattggatgcatattgataag-tgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatc 14330711  T
Q  214 attg 217  Q
    ||||    
T  14330710 attg 14330707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 14 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 14337491 - 14337291
Alignment:
Q  14 agatatgaaggtttgataaagatgcaattttatgtgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaacta 113  Q
    ||||||||||  ||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  14337491 agatatgaagagttgataatgatacaattt-atgtgctattgatataatgatatcatcttg-ttatgtgacctgtttatgctgcttccgttatttaacta 14337394  T
Q  114 agtgcataagtatatgataaagtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatctc 213  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||| | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  14337393 agtgcataattatatgatgaagtttagctccaagttattggatgcatattgataag-tgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatc 14337295  T
Q  214 attg 217  Q
    ||||    
T  14337294 attg 14337291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 49 - 217
Target Start/End: Original strand, 15162838 - 15163006
Alignment:
Q  49 gctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaactaagtgcataagtatatgataaagtttagctccaaat 148  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||| ||| ||||||||||||    
T  15162838 gctattgatataatgatatcattttgtttatgtgacctgtttatgctgcttccgttatttaactaagtgcataagtttgtgatgaag-ttagctccaaat 15162936  T
Q  149 tattggatgcatgttgatatgttgattacgatg-ttctgttcataagtgtccatgcatagcatctcattg 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15162937 tattggatgcatgttgatatgttgattacgatgtttttgttcataagtgtccatgcatagcatctcattg 15163006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 51 - 217
Target Start/End: Original strand, 15156189 - 15156355
Alignment:
Q  51 tattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaactaagtgcataagtatatgataaagtttagctccaaatta 150  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||| ||| ||||||||||||||    
T  15156189 tattgatataatgatatcattttgtttatgtgacctgtttatgctgcttccgttatttaactaagtgcataagtttgtgatgaag-ttagctccaaatta 15156287  T
Q  151 ttggatgcatgttgatatgttgattacgatg-ttctgttcataagtgtccatgcatagcatctcattg 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15156288 ttggatgcatgttgatatgttgattacgatgtttttgttcataagtgtccatgcatagcatctcattg 15156355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 43 - 217
Target Start/End: Original strand, 9511025 - 9511196
Alignment:
Q  43 ttatgtgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaactaagtgcataagtatatgataaagtttagct 142  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  9511025 ttatgtgct-ttgatataatgatatcatcttg-ttatgtgacctgtttatgctgcttccgttatttaactaagtgcataattatatgatgaagtttagct 9511122  T
Q  143 ccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatctcattg 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  9511123 ccaaattattggatgcatgttgataag-tgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattg 9511196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 43 - 217
Target Start/End: Original strand, 40523374 - 40523546
Alignment:
Q  43 ttatgtgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaactaagtgcataagtatatgataaagtttagct 142  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  40523374 ttatgtgct-ttgatataatgatatcatcttg-ttatgtgacctgtttatgctgcttccgttacttaactaagtgcataattatatgatgaagtttagct 40523471  T
Q  143 ccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatctcattg 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||    
T  40523472 ccaaattattggatgcatgttgataagttgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcagagcatatcattg 40523546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 43 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 49051463 - 49051292
Alignment:
Q  43 ttatgtgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaactaagtgcataagtatatgataaagtttagct 142  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  49051463 ttatgtgct-ttgatataatgatatcatcttg-ttatgtgacctgtttatgctgcttccgttatttaactaagtgcataattatatgatgaagtttagct 49051366  T
Q  143 ccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatctcattg 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  49051365 ccaaattattggatgcatgttgataag-tgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattg 49051292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 49 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 13691181 - 13691013
Alignment:
Q  49 gctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaactaagtgcataagtatatgataaagtttagctccaaat 148  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||| |    
T  13691181 gctattgatataatgatatcattttgtttatgtgacctgtttatgctgcttccgttatttaactaagtgcataagtttatgatgaag-ttagctccaatt 13691083  T
Q  149 tattggatgcatgttgatatgttgattacgatg-ttctgttcataagtgtccatgcatagcatctcattg 217  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13691082 taatggatgcatgttgatatgttgattacgatgtttttgttcataagtgtccatgcatagcatctcattg 13691013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 49 - 217
Target Start/End: Original strand, 16407312 - 16407480
Alignment:
Q  49 gctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaactaagtgcataagtatatgataaagtttagctccaaat 148  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||    
T  16407312 gctaatgacataatgatatcatcttgtttatgtgacctgtttatgctgcttccgttatttaactaagtgcataagtttatgatgaag-ttagctccaaat 16407410  T
Q  149 tattggatgcatgttgatatgttgattacgatg-ttctgttcataagtgtccatgcatagcatctcattg 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16407411 tattggatgcatgttgatatgttgattacgatgtttttattcataagtgtccatgcatagcatctcattg 16407480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 43 - 217
Target Start/End: Original strand, 12703422 - 12703593
Alignment:
Q  43 ttatgtgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaactaagtgcataagtatatgataaagtttagct 142  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  12703422 ttatgtgct-ttgatataatgatatcatcctg-ttatgtgacctgtttatgctgcttccgttatttaactaagtgcataattatatgatgaagtttagct 12703519  T
Q  143 ccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatctcattg 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  12703520 ccaaattattggatgcatgttgataag-tgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattg 12703593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 48 - 217
Target Start/End: Original strand, 20703006 - 20703175
Alignment:
Q  48 tgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaactaagtgcataag-tatatgataaagtttagctccaa 146  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||    
T  20703006 tgctgttgatataatgatatcatcttg-ttatgtgacttgtttatgctgcttccgttatttaactaagtgcatatggtatatgatgaagtttagctccaa 20703104  T
Q  147 attattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatctcattg 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||  |||| ||||||||||||||| ||||||    
T  20703105 attattggatgcatgttgatatgttgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattg 20703175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 48 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 32767765 - 32767596
Alignment:
Q  48 tgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaactaagtgcataag-tatatgataaagtttagctccaa 146  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||    
T  32767765 tgctgttgatataatgatatcatcttg-ttatgtgacttgtttatgctgcttccgttatttaactaagtgcatatggtatatgatgaagtttagctccaa 32767667  T
Q  147 attattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatctcattg 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||  |||| ||||||||||||||| ||||||    
T  32767666 attattggatgcatgttgatatgttgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattg 32767596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 49 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 13684550 - 13684382
Alignment:
Q  49 gctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaactaagtgcataagtatatgataaagtttagctccaaat 148  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||| |    
T  13684550 gctattgatataatgatatcattttgtttatgtgacctgtttatgttgcttccgttatttaactaagtgcataagtttatgatgaag-ttagctccaatt 13684452  T
Q  149 tattggatgcatgttgatatgttgattacgatg-ttctgttcataagtgtccatgcatagcatctcattg 217  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13684451 taatggatgcatgttgatatgttgattacgatgtttttgttcacaagtgtccatgcatagcatctcattg 13684382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 45 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 13569985 - 13569797
Alignment:
Q  45 atgtgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaactaagtgcataag---------tatatgataaa- 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||            |||||||| ||     
T  13569985 atgtgctattgatataatgatatcatcctg-ttatgtgacttgattatgctgctgctgttatttaactaagtgcattgtatatatttatatatgatgaaa 13569887  T
Q  135 -------gtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatctcattg 217  Q
           ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  13569886 tgatgacgtttagctccaaatttttggatgcatgtcgatatgttgattacgatgttttgttcataagagtccatgtatagcatctcattg 13569797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 135 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 9409934 - 9409851
Alignment:
Q  135 gtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgca-tagcatctcattg 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||| ||||||    
T  9409934 gtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagagtccatgcattagcatttcattg 9409851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 135 - 205
Target Start/End: Original strand, 20213 - 20283
Alignment:
Q  135 gtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcat 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||| ||||||||||    
T  20213 gtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacggtgatttgttcataagagtccatgcat 20283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 135 - 205
Target Start/End: Original strand, 6017291 - 6017361
Alignment:
Q  135 gtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcat 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||| ||||||||||    
T  6017291 gtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacggtgatttgttcataagagtccatgcat 6017361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 135 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 32866 - 32820
Alignment:
Q  135 gtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatg 181  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  32866 gtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatg 32820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 135 - 181
Target Start/End: Original strand, 71116 - 71162
Alignment:
Q  135 gtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatg 181  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  71116 gtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatg 71162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 135 - 181
Target Start/End: Original strand, 75225 - 75271
Alignment:
Q  135 gtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatg 181  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  75225 gtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatg 75271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 135 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 11262317 - 11262248
Alignment:
Q  135 gtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcat 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||| || || ||||||||||    
T  11262317 gtttagctccaaattattggatgcatattgatatgatgattacgatgttttgttgat-agagtccatgcat 11262248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 135 - 181
Target Start/End: Original strand, 12705008 - 12705054
Alignment:
Q  135 gtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatg 181  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12705008 gtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatg 12705054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 135 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 12714621 - 12714575
Alignment:
Q  135 gtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatg 181  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12714621 gtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatg 12714575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 135 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 12718425 - 12718379
Alignment:
Q  135 gtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatg 181  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12718425 gtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatg 12718379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 135 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 14953186 - 14953117
Alignment:
Q  135 gtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcat 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||| || || ||||||||||    
T  14953186 gtttagctccaaattattggatgcatattgatatgatgattacgatgttttgttgat-agagtccatgcat 14953117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 135 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 14959152 - 14959083
Alignment:
Q  135 gtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcat 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||| || || ||||||||||    
T  14959152 gtttagctccaaattattggatgcatattgatatgatgattacgatgttttgttgat-agagtccatgcat 14959083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 135 - 181
Target Start/End: Original strand, 16907584 - 16907630
Alignment:
Q  135 gtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatg 181  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16907584 gtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatg 16907630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 135 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 26292154 - 26292108
Alignment:
Q  135 gtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatg 181  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26292154 gtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatg 26292108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 135 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 26419988 - 26419919
Alignment:
Q  135 gtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcat 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||| || || ||||||||||    
T  26419988 gtttagctccaaattattggatgcatattgatatgatgattacgatgttttgttgat-agcgtccatgcat 26419919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 135 - 205
Target Start/End: Original strand, 44408454 - 44408523
Alignment:
Q  135 gtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcat 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||| || || ||||||||||    
T  44408454 gtttagctccaaattattggatgcatattgatatgatgattacgatgttttgttgat-agagtccatgcat 44408523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 135 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 7536171 - 7536101
Alignment:
Q  135 gtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcat 205  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || | |||| ||||| || |||||||    
T  7536171 gtttagctccaaattattggatgcttattgatatgttgattacggtgatttgttgataagagttcatgcat 7536101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 136 - 217
Target Start/End: Original strand, 11232402 - 11232483
Alignment:
Q  136 tttagctccaaattattggatgcatgttga-tatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatctcattg 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| |||| ||||  |||| ||||||||||||||| ||||||    
T  11232402 tttagctccaaattattggatgcatgttgattacgatgattacg-tgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattg 11232483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 136 - 217
Target Start/End: Original strand, 11239089 - 11239170
Alignment:
Q  136 tttagctccaaattattggatgcatgttga-tatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatctcattg 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| |||| ||||  |||| ||||||||||||||| ||||||    
T  11239089 tttagctccaaattattggatgcatgttgattacgatgattacg-tgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattg 11239170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 135 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 12723336 - 12723290
Alignment:
Q  135 gtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatg 181  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  12723336 gtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgctgattacgatg 12723290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 135 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 16113998 - 16113952
Alignment:
Q  135 gtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatg 181  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16113998 gtttagctccaagttattggatgcatgatgatatgttgattacgatg 16113952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 135 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 16117151 - 16117105
Alignment:
Q  135 gtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatg 181  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16117151 gtttagctccaagttattggatgcatgatgatatgttgattacgatg 16117105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 135 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 18425441 - 18425395
Alignment:
Q  135 gtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatg 181  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  18425441 gtttagctccaaattattggatgcatgataatatgttgattacgatg 18425395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 135 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 18531233 - 18531163
Alignment:
Q  135 gtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcat 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| || | |||| ||||| ||||||||||    
T  18531233 gtttagctccaaattattggatgctcattgatatgttgattacggtgatttgttgataagagtccatgcat 18531163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 138 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 12692481 - 12692438
Alignment:
Q  138 tagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatg 181  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  12692481 tagctccaaattattggatgcatattgatatgatgattacgatg 12692438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 136 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 1347495 - 1347414
Alignment:
Q  136 tttagctccaaattattggatgcatgttga-tatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatctcattg 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| |||| ||||  |||| || |||||||||||| ||||||    
T  1347495 tttagctccaaattattggatgcatgttgattacgatgattacg-tgttttgttgttaagagttcatgcatagcatatcattg 1347414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 52 - 122
Target Start/End: Original strand, 4318565 - 4318634
Alignment:
Q  52 attgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaactaagtgcataa 122  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||  |||| ||||   |||||||||||||||||||||    
T  4318565 attgatataatgatatcatcctg-ttatgtgacttgactatgatgctactgttatttaactaagtgcataa 4318634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 135 - 205
Target Start/End: Original strand, 4318661 - 4318731
Alignment:
Q  135 gtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcat 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| | || | ||||  |||| ||||||||||    
T  4318661 gtttagctccaaattattggatgcatattgatatgatgattatggtgatttgttgttaagagtccatgcat 4318731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 135 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 18279160 - 18279114
Alignment:
Q  135 gtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatg 181  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  18279160 gtttaactccaaattattgaatgcatgatgatatgttgattacgatg 18279114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 135 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 18283123 - 18283077
Alignment:
Q  135 gtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatg 181  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  18283123 gtttaactccaaattattgaatgcatgatgatatgttgattacgatg 18283077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 135 - 188
Target Start/End: Original strand, 11548383 - 11548436
Alignment:
Q  135 gtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgtt 188  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||  |||||||||||| ||||    
T  11548383 gtttagctccaaattgttggatgcatattgatatgaagattacgatgttttgtt 11548436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 135 - 188
Target Start/End: Original strand, 11554979 - 11555032
Alignment:
Q  135 gtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgtt 188  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||  |||||||||||| ||||    
T  11554979 gtttagctccaaattgttggatgcatattgatatgaagattacgatgttttgtt 11555032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 171 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 15022074 - 15022028
Alignment:
Q  171 tgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatctcattg 217  Q
    |||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  15022074 tgattatgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattg 15022028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 52 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 14148655 - 14148583
Alignment:
Q  52 attgatataatgatatcatcttgat--tatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaactaagtgcataa 122  Q
    |||||||||||||||||||| || |  | |||||||||  |||||||||   |||||||||||||||||||||    
T  14148655 attgatataatgatatcatcctgttgttgtgtgacttgactatgctgctgctgttatttaactaagtgcataa 14148583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 139 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 42203991 - 42203954
Alignment:
Q  139 agctccaaattattggatgcatgttgatatgttgatta 176  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  42203991 agctccaaattattggatgcatattgagatgttgatta 42203954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 135 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 14148556 - 14148524
Alignment:
Q  135 gtttagctccaaattattggatgcatgttgata 167  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14148556 gtttagctccaaattattggatgcatattgata 14148524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0052 (Bit Score: 164; Significance: 8e-88; HSPs: 1)
Name: scaffold0052
Description:

Target: scaffold0052; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 14 - 217
Target Start/End: Original strand, 1038 - 1239
Alignment:
Q  14 agatatgaaggtttgataaagatgcaattttatgtgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaacta 113  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1038 agatatgaaggtttgattatgatgcaattt-atgtgctattgatataatgacatcatcttg-ttatgtgacttgtttatgctgcttccgttatttaacta 1135  T
Q  114 agtgcataagtatatgataaagtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatctc 213  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1136 agtgcataagtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccatgcatagcatctc 1235  T
Q  214 attg 217  Q
    ||||    
T  1236 attg 1239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 164; Significance: 8e-88; HSPs: 70)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 14 - 217
Target Start/End: Original strand, 27328041 - 27328242
Alignment:
Q  14 agatatgaaggtttgataaagatgcaattttatgtgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaacta 113  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27328041 agatatgaaggtttgataatgatgcaatttg-tgtgctattgatataatgatatcatcttg-ttatgtgacttgtttatgctgcttccgttatttaacta 27328138  T
Q  114 agtgcataagtatatgataaagtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatctc 213  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27328139 agtgcataagtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgctgattacgatgttttgttcataagtgtccatgcatagcatctc 27328238  T
Q  214 attg 217  Q
    ||||    
T  27328239 attg 27328242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 164; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 14 - 217
Target Start/End: Original strand, 27388781 - 27388982
Alignment:
Q  14 agatatgaaggtttgataaagatgcaattttatgtgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaacta 113  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27388781 agatatgaaggtttgataatgatgcaatttg-tgtgctattgatataatgatatcatcttg-ttatgtgacttgtttatgctgcttccgttatttaacta 27388878  T
Q  114 agtgcataagtatatgataaagtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatctc 213  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27388879 agtgcataagtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgctgattacgatgttttgttcataagtgtccatgcatagcatctc 27388978  T
Q  214 attg 217  Q
    ||||    
T  27388979 attg 27388982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 14 - 217
Target Start/End: Original strand, 2870120 - 2870321
Alignment:
Q  14 agatatgaaggtttgataaagatgcaattttatgtgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaacta 113  Q
    |||||||||| |||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  2870120 agatatgaagatttgataatgatacaattt-atgtgctattgatataatgatatcatcttg-ttatgtgacctgtttatgctgcttccgttatttaacta 2870217  T
Q  114 agtgcataagtatatgataaagtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatctc 213  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2870218 agtgcataagtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatattgataagttgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctc 2870317  T
Q  214 attg 217  Q
    ||||    
T  2870318 attg 2870321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 14 - 217
Target Start/End: Original strand, 2876735 - 2876936
Alignment:
Q  14 agatatgaaggtttgataaagatgcaattttatgtgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaacta 113  Q
    |||||||||| |||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  2876735 agatatgaagatttgataatgatacaattt-atgtgctattgatataatgatatcatcttg-ttatgtgacctgtttatgctgcttccgttatttaacta 2876832  T
Q  114 agtgcataagtatatgataaagtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatctc 213  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2876833 agtgcataagtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatattgataagttgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctc 2876932  T
Q  214 attg 217  Q
    ||||    
T  2876933 attg 2876936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 144; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 14 - 217
Target Start/End: Original strand, 4233483 - 4233684
Alignment:
Q  14 agatatgaaggtttgataaagatgcaattttatgtgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaacta 113  Q
    |||||||||| |||||||| ||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||    
T  4233483 agatatgaagatttgataatgatacaattt-atgtgctagtgatataatgatatcatcttg-ttatgtgacctgtttatgctgcttccgttgtttaacta 4233580  T
Q  114 agtgcataagtatatgataaagtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatctc 213  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4233581 agtgcataagtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagttgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctc 4233680  T
Q  214 attg 217  Q
    ||||    
T  4233681 attg 4233684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 144; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 14 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 26130589 - 26130388
Alignment:
Q  14 agatatgaaggtttgataaagatgcaattttatgtgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaacta 113  Q
    ||||||||| | ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  26130589 agatatgaaagcttgataatgatgcaattt-atgtgctattgatataataatatcatctcgtttatgtgacctgtttatgctgcttccgttatttaacta 26130491  T
Q  114 agtgcataagtatatgataaagtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatctc 213  Q
    |||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26130490 agtgtataagtatatgatgaagtt-agctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccatgcatagcatctc 26130392  T
Q  214 attg 217  Q
    ||||    
T  26130391 attg 26130388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 144; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 14 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 30694484 - 30694283
Alignment:
Q  14 agatatgaaggtttgataaagatgcaattttatgtgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaacta 113  Q
    ||||||||| | ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  30694484 agatatgaaagcttgataatgatgcaattt-atgtgctattgatataatgatatcatctcgtttatgtgacctgtttatgctgcttccgttatttaacta 30694386  T
Q  114 agtgcataagtatatgataaagtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatctc 213  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  30694385 agtgcataagtatatgatgaag-ttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgactacgatgttttgttcataagtgtccatgcatagaatctc 30694287  T
Q  214 attg 217  Q
    ||||    
T  30694286 attg 30694283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 14 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 20801878 - 20801678
Alignment:
Q  14 agatatgaaggtttgataaagatgcaattttatgtgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaacta 113  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20801878 agatatgaaggtttgataataatgcaattt-atgtgccattgatataatgatatcatcttg-ttatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaacta 20801781  T
Q  114 agtgcataagtatatgataaagtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatctc 213  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||| ||    
T  20801780 agtgcataagtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataag-tgattacgaagttttgtccatatgtgtccatgcatagcatatc 20801682  T
Q  214 attg 217  Q
    ||||    
T  20801681 attg 20801678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 42 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 20060744 - 20060570
Alignment:
Q  42 tttatgtgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaactaagtgcataagtatatgataaagtttagc 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20060744 tttatgtgctattgatataatgatatcatcttgat-atgtgacttgtttatgctgcttccgttgtttaactaagtgcataagtatatgatgaagtttagc 20060646  T
Q  142 tccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatctcattg 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  20060645 tccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgttgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattg 20060570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 14 - 217
Target Start/End: Original strand, 27430268 - 27430469
Alignment:
Q  14 agatatgaaggtttgataaagatgcaattttatgtgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaacta 113  Q
    |||||||||| ||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27430268 agatatgaagatttgataataatgcaattt-atgtgctattgatataatgatatcatcttgat-atgtgacttgtttatgctgcttccgttatttaacta 27430365  T
Q  114 agtgcataagtatatgataaagtttagctccaaattattggatgcatgttga-tatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatct 212  Q
    |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  27430366 agtgcatatgtttatgataaggtttagctccaaattattggatgcatgttgattacgatgattacg-tgttttgttcataagtgtccatgcatagcatat 27430464  T
Q  213 cattg 217  Q
    |||||    
T  27430465 cattg 27430469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 14 - 176
Target Start/End: Original strand, 14059601 - 14059761
Alignment:
Q  14 agatatgaaggtttgataaagatgcaattttatgtgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaacta 113  Q
    |||||||||| |||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14059601 agatatgaagatttgataatgatacaattt-atgtgctattgatataatgatatcatcttg-ttatgtgacttgcttatgctgctttcgttatttaacta 14059698  T
Q  114 agtgcataagtatatgataaagtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgatta 176  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14059699 agtgcataagtatatggtaaagtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgatta 14059761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 43 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 8797284 - 8797112
Alignment:
Q  43 ttatgtgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaactaagtgcataagtatatgataaagtttagct 142  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8797284 ttatgtgct-ttgatataatgatatcatcttg-ttatatgatttgtttatgctgctttcgttatttaactaagtgcataagtatatgatgaagtttagct 8797187  T
Q  143 ccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatctcattg 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  8797186 ccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgttgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattg 8797112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 43 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 6980752 - 6980581
Alignment:
Q  43 ttatgtgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaactaagtgcataagtatatgataaagtttagct 142  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  6980752 ttatgtgct-ttgatataatgatatcatcttg-ttatgtgacctatttatgctgcttccgttatttaactaagtgcataattatatgatgaagtttagct 6980655  T
Q  143 ccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatctcattg 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  6980654 ccaaattattggatgcatgttgataag-tgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattg 6980581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 43 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 12762795 - 12762623
Alignment:
Q  43 ttatgtgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaactaagtgcataagtatatgataaagtttagct 142  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  12762795 ttatgtgct-ttgatataatgatatcatcttg-ttatgtgacctgtttatgctgcttctgttatttaactaagtgcataagtatatgatgaagtctagct 12762698  T
Q  143 ccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatctcattg 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  12762697 ccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgttgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattg 12762623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 14 - 205
Target Start/End: Original strand, 28258438 - 28258628
Alignment:
Q  14 agatatgaaggtttgataaagatgcaattttatgtgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaacta 113  Q
    ||||||||||| || ||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28258438 agatatgaagggttaataataatgcaattt-atgtgctattgatataatgatatcatcttgat-atgtgacttgtttatgctgcttccgttatttaacta 28258535  T
Q  114 agtgcataagtatatgataaagtttagctccaaattattggatgca-tgttga-tatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcat 205  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||| || | |||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  28258536 agtgcatatgtatatgataaggtttagctccaaattattggacgcattgttgattacgatgattacg-tgttttgttcataagtgtccatgcat 28258628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 14 - 205
Target Start/End: Original strand, 28265062 - 28265252
Alignment:
Q  14 agatatgaaggtttgataaagatgcaattttatgtgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaacta 113  Q
    ||||||||||| || ||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28265062 agatatgaagggttaataataatgcaattt-atgtgctattgatataatgatatcatcttgat-atgtgacttgtttatgctgcttccgttatttaacta 28265159  T
Q  114 agtgcataagtatatgataaagtttagctccaaattattggatgca-tgttga-tatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcat 205  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||| || | |||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  28265160 agtgcatatgtatatgataaggtttagctccaaattattggacgcattgttgattacgatgattacg-tgttttgttcataagtgtccatgcat 28265252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 14 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 28287478 - 28287288
Alignment:
Q  14 agatatgaaggtttgataaagatgcaattttatgtgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaacta 113  Q
    ||||||||||| || ||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28287478 agatatgaagggttaataataatgcaattt-atgtgctattgatataatgatatcatcttgat-atgtgacttgtttatgctgcttccgttatttaacta 28287381  T
Q  114 agtgcataagtatatgataaagtttagctccaaattattggatgca-tgttga-tatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcat 205  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||| || | |||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  28287380 agtgcatatgtatatgataaggtttagctccaaattattggacgcattgttgattacgatgattacg-tgttttgttcataagtgtccatgcat 28287288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 14 - 205
Target Start/End: Original strand, 28337187 - 28337377
Alignment:
Q  14 agatatgaaggtttgataaagatgcaattttatgtgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaacta 113  Q
    ||||||||||| || ||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28337187 agatatgaagggttaataataatgcaattt-atgtgctattgatataatgatatcatcttgat-atgtgacttgtttatgctgcttccgttatttaacta 28337284  T
Q  114 agtgcataagtatatgataaagtttagctccaaattattggatgca-tgttga-tatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcat 205  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||| || | |||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  28337285 agtgcatatgtatatgataaggtttagctccaaattattggacgcattgttgattacgatgattacg-tgttttgttcataagtgtccatgcat 28337377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 14 - 205
Target Start/End: Original strand, 28343811 - 28344001
Alignment:
Q  14 agatatgaaggtttgataaagatgcaattttatgtgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaacta 113  Q
    ||||||||||| || ||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28343811 agatatgaagggttaataataatgcaattt-atgtgctattgatataatgatatcatcttgat-atgtgacttgtttatgctgcttccgttatttaacta 28343908  T
Q  114 agtgcataagtatatgataaagtttagctccaaattattggatgca-tgttga-tatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcat 205  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||| || | |||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  28343909 agtgcatatgtatatgataaggtttagctccaaattattggacgcattgttgattacgatgattacg-tgttttgttcataagtgtccatgcat 28344001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 109; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 53 - 217
Target Start/End: Original strand, 20649814 - 20649976
Alignment:
Q  53 ttgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaactaagtgcataagtatatgataaagtttagctccaaattatt 152  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20649814 ttgatataacgatatcatcttg-ttatgtgacctgtttatgctgcttccattatttaactaagtgcataattatatgatgaagtttagctccaaattatt 20649912  T
Q  153 ggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatctcattg 217  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  20649913 ggatgcatgttgataag-tgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattg 20649976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 14 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 30597339 - 30597173
Alignment:
Q  14 agatatgaaggtttgataaagatgcaattttatgtgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaacta 113  Q
    ||||| |||| | |||||||||| ||| || ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  30597339 agataagaagatgtgataaagatacaaatt-atgtgct-ttgatataatgatatcatcttg-ttatgtgacctgtttatgctgcttccgttatttaacta 30597243  T
Q  114 agtgcataagtatatgataaagtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgtt 183  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  30597242 agtgcataagtatatgatgaagttaagctccaaattattggatgcatgtcgataagttgattacgatgtt 30597173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 14 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 25110962 - 25110747
Alignment:
Q  14 agatatgaaggtttgataaagatgcaattttatgtgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaacta 113  Q
    ||||||||| |||| || | ||||||||| | ||||||| ||||||||||| |||||| || ||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||    
T  25110962 agatatgaaagtttaattatgatgcaattgt-tgtgctaatgatataatgacatcatcctg-ttatgtgacttatttatgctgctgccgttatttaacta 25110865  T
Q  114 agtgcata---------agtat------atgataaagtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtc 198  Q
    ||||||||         |||||      ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||    
T  25110864 agtgcatattgtatatgagtatgatgaaatgatgaagtttagctccaaattattagatgcatgttgatatgatgattacgatgttttgttcataagagtc 25110765  T
Q  199 catgcatagcatctcatt 216  Q
    |||||||||||| |||||    
T  25110764 catgcatagcatttcatt 25110747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 14 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 25117565 - 25117350
Alignment:
Q  14 agatatgaaggtttgataaagatgcaattttatgtgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaacta 113  Q
    ||||||||| |||| || | ||||||||| | ||||||| ||||||||||| |||||| || ||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||    
T  25117565 agatatgaaagtttaattatgatgcaattgt-tgtgctaatgatataatgacatcatcctg-ttatgtgacttatttatgctgctgccgttatttaacta 25117468  T
Q  114 agtgcata---------agtat------atgataaagtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtc 198  Q
    ||||||||         |||||      ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||    
T  25117467 agtgcatattgtatatgagtatgatgaaatgatgaagtttagctccaaattattagatgcatgttgatatgatgattacgatgttttgttcataagagtc 25117368  T
Q  199 catgcatagcatctcatt 216  Q
    |||||||||||| |||||    
T  25117367 catgcatagcatttcatt 25117350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 45 - 217
Target Start/End: Original strand, 3708496 - 3708682
Alignment:
Q  45 atgtgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaactaagtgcataa---------gtat------atg 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||||         ||||      |||    
T  3708496 atgtgctattgatataatgatatcatcctg-ttatgtgacttgattatgctgctgctgttatttaactaagtgcataatgtatatgtgtatgatgaaatg 3708594  T
Q  130 ataaagtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatctcattg 217  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || | |||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  3708595 atgatgtttagctccaaattattggatgcatattgatatgttgattacggtgatttgttcataagagtccatgcatagcatttcattg 3708682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 135 - 217
Target Start/End: Original strand, 24291164 - 24291246
Alignment:
Q  135 gtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatctcattg 217  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24291164 gtttagctccaaattgttggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagagtccatgcatagcatctcattg 24291246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 135 - 217
Target Start/End: Original strand, 31317204 - 31317286
Alignment:
Q  135 gtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatctcattg 217  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31317204 gtttagctccaaattgttggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagagtccatgcatagcatctcattg 31317286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 135 - 217
Target Start/End: Original strand, 24315192 - 24315274
Alignment:
Q  135 gtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatctcattg 217  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  24315192 gtttagctccaaattgttggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagagtccatgcataacatctcattg 24315274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 135 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 4167912 - 4167829
Alignment:
Q  135 gtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgca-tagcatctcattg 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||| ||||||    
T  4167912 gtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagagtccatgcattagcatttcattg 4167829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 48 - 217
Target Start/End: Original strand, 17037350 - 17037532
Alignment:
Q  48 tgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaactaagtgcataa-------gtat-atgataaag---- 135  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||||       |||| |||| ||||        
T  17037350 tgctattgatataatgatatcatcctg-ttatgtgacttgattatgctgctgctgttatttaactaagtgcataatgtctatgtatgatgaaaaagatga 17037448  T
Q  136 --tttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatctcattg 217  Q
      ||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||| |||| |||| ||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  17037449 cgtttagctccaaattattggatgcacattgatatgatgattacggtgttttgttgataagagtccatgcatagcatatcattg 17037532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 48 - 205
Target Start/End: Original strand, 25595369 - 25595540
Alignment:
Q  48 tgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaactaagtgcataag-------tatatgataaa------ 134  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  |||||||||   |||||||||||||||||||||        |||||||| ||          
T  25595369 tgctattgatataatgatatcatcctg-ttatgtgacttgactatgctgctgctgttatttaactaagtgcataatgcctatatatatgatgaaatgatg 25595467  T
Q  135 --gtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcat 205  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||| ||||||||||    
T  25595468 acgtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacggtgatttgttcataagagtccatgcat 25595540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 135 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 4208592 - 4208509
Alignment:
Q  135 gtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgca-tagcatctcattg 217  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||| ||||||    
T  4208592 gtttagctccaaattattagatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagagtccatgcattagcatttcattg 4208509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 135 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 34832644 - 34832574
Alignment:
Q  135 gtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcat 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||| ||||||||||    
T  34832644 gtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacggtgatttgttcataagagtccatgcat 34832574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 48 - 217
Target Start/End: Original strand, 1545060 - 1545242
Alignment:
Q  48 tgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaactaagtgcataa--------------gtatatgataa 133  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||||              | ||| ||| |    
T  1545060 tgctattgatataatgatatcatcctg-ttatgtgacttgattatgctgctgctgttatttaactaagtgcataatgattatgtgtaatgaataagatga 1545158  T
Q  134 agtttagctccaaattattggatgcatgttga-tatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatctcattg 217  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| |||| ||||  |||| ||||||||||||||| ||||||    
T  1545159 cgtttagctccaaattattggatgcatgttgattacgatgattacg-tgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattg 1545242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 48 - 122
Target Start/End: Original strand, 1538961 - 1539034
Alignment:
Q  48 tgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaactaagtgcataa 122  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||||    
T  1538961 tgctattgatataatgatatcatcctg-ttatgtgacttgattatgctgctgctgttatttaactaagtgcataa 1539034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 135 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 8243590 - 8243544
Alignment:
Q  135 gtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatg 181  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8243590 gtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatg 8243544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 135 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 11566619 - 11566573
Alignment:
Q  135 gtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatg 181  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11566619 gtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatg 11566573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 135 - 181
Target Start/End: Original strand, 12619191 - 12619237
Alignment:
Q  135 gtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatg 181  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12619191 gtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatg 12619237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 135 - 181
Target Start/End: Original strand, 18917783 - 18917829
Alignment:
Q  135 gtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatg 181  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18917783 gtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatg 18917829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 135 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 19808514 - 19808444
Alignment:
Q  135 gtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcat 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || | |||| ||||| ||||||||||    
T  19808514 gtttagctccaaattattggatgcatattgatatgatgattacggtgatttgttgataagagtccatgcat 19808444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 135 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 19870347 - 19870301
Alignment:
Q  135 gtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatg 181  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19870347 gtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatg 19870301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 124 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 20176941 - 20176847
Alignment:
Q  124 tatatgataaagtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatg-ttctgttcataagtgtccatgcatagcatctcattg 217  Q
    |||||||| | | ||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| || || ||||  |||| ||||||||||||||||||||||    
T  20176941 tatatgatgacggttatctccaaattattggatgcacgttgatgtgttgattacggtgtttttgttgttaagagtccatgcatagcatctcattg 20176847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 135 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 22758838 - 22758768
Alignment:
Q  135 gtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcat 205  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || | |||| ||||| ||||||||||    
T  22758838 gtttagctccaaattattggatgcttattgatatgttgattacggtgatttgttgataagagtccatgcat 22758768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 135 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 22862703 - 22862657
Alignment:
Q  135 gtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatg 181  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22862703 gtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatg 22862657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 135 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 23394825 - 23394779
Alignment:
Q  135 gtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatg 181  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23394825 gtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatg 23394779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 135 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 23989677 - 23989631
Alignment:
Q  135 gtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatg 181  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23989677 gtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatg 23989631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 135 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 25928283 - 25928213
Alignment:
Q  135 gtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcat 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || | |||| ||||| ||||||||||    
T  25928283 gtttagctccaaattattggatgcatattgatatgatgattacggtgatttgttgataagagtccatgcat 25928213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 135 - 205
Target Start/End: Original strand, 34298740 - 34298809
Alignment:
Q  135 gtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcat 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||| || || ||||||||||    
T  34298740 gtttagctccaaattattggatgcatattgatatgatgattacgatgttttgttgat-agagtccatgcat 34298809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 135 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 14098616 - 14098534
Alignment:
Q  135 gtttagctccaaattattggatgcatgttga-tatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatctcattg 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| |||| ||||  |||| ||||||||||||||| ||||||    
T  14098616 gtttagctccaaattattggatgcatgttgattacggtgattacg-tgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattg 14098534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 135 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 1644291 - 1644245
Alignment:
Q  135 gtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatg 181  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  1644291 gtttagctccaaattattggatgcatgataatatgttgattacgatg 1644245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 135 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 16624135 - 16624089
Alignment:
Q  135 gtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatg 181  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  16624135 gtttagctccaaattattggatgcatgataatatgttgattacgatg 16624089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 135 - 205
Target Start/End: Original strand, 34370092 - 34370162
Alignment:
Q  135 gtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcat 205  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || | |||| ||||| ||||||||||    
T  34370092 gtttagcttcaaattattggatgcatattgatatgatgattacggtgatttgttgataagagtccatgcat 34370162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 45 - 120
Target Start/End: Original strand, 24291064 - 24291132
Alignment:
Q  45 atgtgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaactaagtgcat 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||      |||||||||||||||||||    
T  24291064 atgtgctattgatataatgatatcatcctg-ttatgtgacttgattatgct------gttatttaactaagtgcat 24291132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 45 - 120
Target Start/End: Original strand, 24315092 - 24315160
Alignment:
Q  45 atgtgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaactaagtgcat 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||      |||||||||||||||||||    
T  24315092 atgtgctattgatataatgatatcatcctg-ttatgtgacttgattatgct------gttatttaactaagtgcat 24315160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 45 - 120
Target Start/End: Original strand, 31317104 - 31317172
Alignment:
Q  45 atgtgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaactaagtgcat 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||      |||||||||||||||||||    
T  31317104 atgtgctattgatataatgatatcatcctg-ttatgtgacttgattatgct------gttatttaactaagtgcat 31317172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 135 - 217
Target Start/End: Original strand, 1539061 - 1539143
Alignment:
Q  135 gtttagctccaaattattggatgcatgttga-tatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatctcattg 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| |||| ||||  |||| ||||| ||||||||| ||||||    
T  1539061 gtttagctccaaattattggatgcatgttgattacgatgattacg-tgttttgttgttaagagtccaggcatagcatatcattg 1539143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 124 - 217
Target Start/End: Original strand, 5834591 - 5834685
Alignment:
Q  124 tatatgataaagtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatg-ttctgttcataagtgtccatgcatagcatctcattg 217  Q
    |||||||| | | ||| |||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| || || ||||  |||| |||||||||||| |||||||||    
T  5834591 tatatgatgacggttatctccaaattattggatgcactttgatgtgttgattacggtgtttttgttgttaagagtccatgcatagtatctcattg 5834685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 124 - 217
Target Start/End: Original strand, 22159050 - 22159144
Alignment:
Q  124 tatatgataaagtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatg-ttctgttcataagtgtccatgcatagcatctcattg 217  Q
    |||||||| | | ||| |||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| || || ||||  |||| |||||||||||| |||||||||    
T  22159050 tatatgatgacggttaactccaaattattggatgcacattgatgtgttgattacggtgtttttgttgttaagagtccatgcatagaatctcattg 22159144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 135 - 181
Target Start/End: Original strand, 31478333 - 31478379
Alignment:
Q  135 gtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatg 181  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  31478333 gtttagcttcaaattattggatgcatgataatatgttgattacgatg 31478379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 48 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 4168015 - 4167942
Alignment:
Q  48 tgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaactaagtgcataa 122  Q
    |||||||| ||||||||||||||  || ||||||||||||  | |||||||   |||||||||||||||||||||    
T  4168015 tgctattggtataatgatatcatactg-ttatgtgacttgactgtgctgctgctgttatttaactaagtgcataa 4167942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 48 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 4208695 - 4208622
Alignment:
Q  48 tgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaactaagtgcataa 122  Q
    |||||||| ||||||||||||||  || ||||||||||||  | |||||||   |||||||||||||||||||||    
T  4208695 tgctattggtataatgatatcatactg-ttatgtgacttgactgtgctgctgctgttatttaactaagtgcataa 4208622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 171 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 8228833 - 8228787
Alignment:
Q  171 tgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatctcattg 217  Q
    |||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  8228833 tgattatgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattg 8228787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 48 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 14098716 - 14098643
Alignment:
Q  48 tgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaactaagtgcataa 122  Q
    |||||||| ||||||||||||||  || ||||||||||||  | |||||||   |||||||||||||||||||||    
T  14098716 tgctattggtataatgatatcatactg-ttatgtgacttgactgtgctgctgctgttatttaactaagtgcataa 14098643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 171 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 18931022 - 18930976
Alignment:
Q  171 tgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatctcattg 217  Q
    |||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  18931022 tgattatgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattg 18930976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 171 - 217
Target Start/End: Original strand, 29587840 - 29587886
Alignment:
Q  171 tgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatctcattg 217  Q
    |||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  29587840 tgattatgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattg 29587886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 171 - 217
Target Start/End: Original strand, 29593981 - 29594027
Alignment:
Q  171 tgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatctcattg 217  Q
    |||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  29593981 tgattatgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattg 29594027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 52 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 16371944 - 16371872
Alignment:
Q  52 attgatataatgatatcatcttgat--tatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaactaagtgcataa 122  Q
    |||||||||||||||||||| || |  | |||||||||  |||||||||   |||||||||||||||||||||    
T  16371944 attgatataatgatatcatcctgttgttgtgtgacttgactatgctgctgctgttatttaactaagtgcataa 16371872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 141 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 16760011 - 16759934
Alignment:
Q  141 ctccaaattattggatgcatgt-tgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatctcattg 217  Q
    ||||||||||||||||| ||   ||||| |||||||||| |||| ||||  |||| ||||||||||||||| ||||||    
T  16760011 ctccaaattattggatgtataagtgataagttgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattg 16759934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 139 - 176
Target Start/End: Original strand, 23657531 - 23657568
Alignment:
Q  139 agctccaaattattggatgcatgttgatatgttgatta 176  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  23657531 agctccaaattattggatgcatattgagatgttgatta 23657568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 52 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 25928382 - 25928310
Alignment:
Q  52 attgatataatgatatcatcttgat--tatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaactaagtgcataa 122  Q
    |||||||||||||||||||| || |  | |||||||||  |||||||||   |||||||||||||||||||||    
T  25928382 attgatataatgatatcatcctgttgttgtgtgacttgactatgctgctgctgttatttaactaagtgcataa 25928310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 139 - 176
Target Start/End: Original strand, 27553692 - 27553729
Alignment:
Q  139 agctccaaattattggatgcatgttgatatgttgatta 176  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  27553692 agctccaaattattggatgcatattgagatgttgatta 27553729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 160; Significance: 2e-85; HSPs: 54)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 14 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 29233650 - 29233450
Alignment:
Q  14 agatatgaaggtttgataaagatgcaattttatgtgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaacta 113  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  29233650 agatatgaaggtttgataataatgcaattt-atgtgctattgatataatgatatcatcttg-ttatgtgacttgtttatgctgcttccgttatttaacta 29233553  T
Q  114 agtgcataagtatatgataaagtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatctc 213  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  29233552 agtgcataagtatatgatgaagtt-agctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccatgcatagcatctc 29233454  T
Q  214 attg 217  Q
    ||||    
T  29233453 attg 29233450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 14 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 29346949 - 29346749
Alignment:
Q  14 agatatgaaggtttgataaagatgcaattttatgtgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaacta 113  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  29346949 agatatgaaggtttgataataatgcaattt-atgtgctattgatataatgatatcatcttg-ttatgtgacttgtttatgctgcttccgttatttaacta 29346852  T
Q  114 agtgcataagtatatgataaagtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatctc 213  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  29346851 agtgcataagtatatgatgaagtt-agctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccatgcatagcatctc 29346753  T
Q  214 attg 217  Q
    ||||    
T  29346752 attg 29346749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 14 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 27599385 - 27599184
Alignment:
Q  14 agatatgaaggtttgataaagatgcaattttatgtgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaacta 113  Q
    ||||||||| | ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  27599385 agatatgaaagcttgataatgatgcaattt-atgtgctattgatataatgatatcaactcgtttatgtgacctgtttatgctgcttccgttatttaacta 27599287  T
Q  114 agtgcataagtatatgataaagtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatctc 213  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27599286 agtgcataagtatatgatgaagtt-agctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccatgcatagcatctc 27599188  T
Q  214 attg 217  Q
    ||||    
T  27599187 attg 27599184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 144; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 26 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 1843192 - 1843003
Alignment:
Q  26 ttgataaagatgcaattttatgtgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaactaagtgcataagta 125  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  1843192 ttgataatgatgcaattt-atgtgctattgatataatgatatcatctcgtttatgtgacctgtttatgctgcttccgttatttaactaagtgcataaata 1843094  T
Q  126 tatgataaagtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatctcattg 217  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1843093 tatgatgaagtt-agctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccatgcatagcatctcattg 1843003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 14 - 217
Target Start/End: Original strand, 24913949 - 24914151
Alignment:
Q  14 agatatgaaggtttgataaagatgcaattttatgtgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaacta 113  Q
    ||||||||| ||||||| | |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24913949 agatatgaaagtttgattatgatgcaattg-atgtgctattgatataatgatatcatcttg-ttatgtgacttgtttatgctgcttccgttatttaacta 24914046  T
Q  114 agtgcataag-tatatgataaagtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatct 212  Q
    |||||||| | |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  24914047 agtgcatatggtatacgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagagtccatgcatagcatct 24914146  T
Q  213 cattg 217  Q
    |||||    
T  24914147 cattg 24914151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 14 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 23171159 - 23170958
Alignment:
Q  14 agatatgaaggtttgataaagatgcaattttatgtgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaacta 113  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||    
T  23171159 agatatgaaggtttgataatgatgcaattt-ataagctattgatataatgatatcattttg-ttatgtgagttgtttatgctgcttctgttatttaacta 23171062  T
Q  114 agtgcataagtatatgataaagtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatctc 213  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  23171061 agtgcataagtatatgatgaagtttagctccaaattactggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgtccataagagtccatgcatagcatctc 23170962  T
Q  214 attg 217  Q
    ||||    
T  23170961 attg 23170958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 14 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 23582416 - 23582215
Alignment:
Q  14 agatatgaaggtttgataaagatgcaattttatgtgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaacta 113  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||    
T  23582416 agatatgaaggtttgataatgatgcaattt-ataagctattgatataatgatatcattttg-ttatgtgagttgtttatgctgcttctgttatttaacta 23582319  T
Q  114 agtgcataagtatatgataaagtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatctc 213  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  23582318 agtgcataagtatatgatgaagtttagctccaaattactggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgtccataagagtccatgcatagcatctc 23582219  T
Q  214 attg 217  Q
    ||||    
T  23582218 attg 23582215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 14 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 10866492 - 10866291
Alignment:
Q  14 agatatgaaggtttgataaagatgcaattttatgtgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaacta 113  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  10866492 agatatgaaggtttgataataatgcaattt-atgtgctattgatataatgatatcatcttgctg-tgtgacttgtttatgctgcttctgttatttaacta 10866395  T
Q  114 agtgcataagtatatgataaagtttagctccaaattattggatgcatgttga-tatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatct 212  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  10866394 agtgcatatgtatatgataatgtttagctccaaattattggatgcatgttgattacgatgattacg-tgttctgttcataagtgtccatgcatagcatat 10866296  T
Q  213 cattg 217  Q
    |||||    
T  10866295 cattg 10866291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 14 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 10873659 - 10873458
Alignment:
Q  14 agatatgaaggtttgataaagatgcaattttatgtgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaacta 113  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  10873659 agatatgaaggtttgataataatgcaattt-atgtgctattgatataatgatatcatcttgctg-tgtgacttgtttatgctgcttctgttatttaacta 10873562  T
Q  114 agtgcataagtatatgataaagtttagctccaaattattggatgcatgttga-tatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatct 212  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  10873561 agtgcatatgtatatgataatgtttagctccaaattattggatgcatgttgattacgatgattacg-tgttctgttcataagtgtccatgcatagcatat 10873463  T
Q  213 cattg 217  Q
    |||||    
T  10873462 cattg 10873458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 43 - 217
Target Start/End: Original strand, 22320999 - 22321171
Alignment:
Q  43 ttatgtgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaactaagtgcataagtatatgataaagtttagct 142  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  22320999 ttatgtgct-ttgatataatgatatcatcttg-ttatgtgacctgtttatgctgcttccgttatttaactaagtgcataattatatgatgaagtttagct 22321096  T
Q  143 ccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatctcattg 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  22321097 ccaaattattggatgcatgttgataagttgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattg 22321171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 43 - 217
Target Start/End: Original strand, 22327152 - 22327324
Alignment:
Q  43 ttatgtgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaactaagtgcataagtatatgataaagtttagct 142  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  22327152 ttatgtgct-ttgatataatgatatcatcttg-ttatgtgacctgtttatgctgcttccgttatttaactaagtgcataattatatgatgaagtttagct 22327249  T
Q  143 ccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatctcattg 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  22327250 ccaaattattggatgcatgttgataagttgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattg 22327324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 14 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 16928477 - 16928276
Alignment:
Q  14 agatatgaaggtttgataaagatgcaattttatgtgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaacta 113  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  16928477 agatatgaaggtttgataataatgcaattt-acgtgctattgatataataatatcatcttgat-atgtgacttgtttatgctgcttccgttgtttaacta 16928380  T
Q  114 agtgcataagtatatgataaagtttagctccaaattattggatgcatgttga-tatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatct 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||| ||||  |||| ||||||||||||||| |    
T  16928379 agtgcataagtatatgataaagtttagctccaaattattggatgcatgttgattacgttgattacg-tgttttgttgttaagagtccatgcatagcatat 16928281  T
Q  213 cattg 217  Q
    |||||    
T  16928280 cattg 16928276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 14 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 16997171 - 16996970
Alignment:
Q  14 agatatgaaggtttgataaagatgcaattttatgtgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaacta 113  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  16997171 agatatgaaggtttgataataatgcaattt-acgtgctattgatataataatatcatcttgat-atgtgacttgtttatgctgcttccgttgtttaacta 16997074  T
Q  114 agtgcataagtatatgataaagtttagctccaaattattggatgcatgttga-tatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatct 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||| ||||  |||| ||||||||||||||| |    
T  16997073 agtgcataagtatatgataaagtttagctccaaattattggatgcatgttgattacgttgattacg-tgttttgttgttaagagtccatgcatagcatat 16996975  T
Q  213 cattg 217  Q
    |||||    
T  16996974 cattg 16996970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 14 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 17003804 - 17003603
Alignment:
Q  14 agatatgaaggtttgataaagatgcaattttatgtgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaacta 113  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  17003804 agatatgaaggtttgataataatgcaattt-acgtgctattgatataataatatcatcttgat-atgtgacttgtttatgctgcttccgttgtttaacta 17003707  T
Q  114 agtgcataagtatatgataaagtttagctccaaattattggatgcatgttga-tatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatct 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||| ||||  |||| ||||||||||||||| |    
T  17003706 agtgcataagtatatgataaagtttagctccaaattattggatgcatgttgattacgttgattacg-tgttttgttgttaagagtccatgcatagcatat 17003608  T
Q  213 cattg 217  Q
    |||||    
T  17003607 cattg 17003603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 48 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 12829161 - 12828992
Alignment:
Q  48 tgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaactaagtgcataag-tatatgataaagtttagctccaa 146  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||    
T  12829161 tgctatttatataatgatatcatcttg-ttatgtgacttgtttatgctgcttccgttatttaactaagtgcatatggtatatgatgaagtttagctccaa 12829063  T
Q  147 attattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatctcattg 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||  |||| ||||||||||||||| ||||||    
T  12829062 attattggatgcatgttgatatgttgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattg 12828992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 43 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 27617389 - 27617218
Alignment:
Q  43 ttatgtgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaactaagtgcataagtatatgataaagtttagct 142  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  27617389 ttatgtgct-ttgatataatgatatcatcttg-ttatgtgacctgtttatgttgcttccgttatttaactaagtgcataattatatgatgaagtttagct 27617292  T
Q  143 ccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatctcattg 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  27617291 ccaaattattggatgcatgttgataag-tgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattg 27617218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 43 - 217
Target Start/End: Original strand, 26877581 - 26877752
Alignment:
Q  43 ttatgtgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaactaagtgcataagtatatgataaagtttagct 142  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  26877581 ttatgtgct-ttgatataatgacatcatcttg-ttatgtgacctgtttatgctgcttccgttatttaactaagtgcataattatatgatgaagtttagct 26877678  T
Q  143 ccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatctcattg 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  26877679 ccaaattattggatgcatgttgataag-tgattacgttgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattg 26877752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 45 - 217
Target Start/End: Original strand, 13970382 - 13970570
Alignment:
Q  45 atgtgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaactaagtgcat---aagtat--------------a 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||   | ||||              |    
T  13970382 atgtgctattgatataatgatatcatcctg-ttatgtgacttgattatgctgctgctgttatttaactaagtgcattgtatgtatttatatatgatgaaa 13970480  T
Q  128 tgataaagtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatctcattg 217  Q
    |||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13970481 tgatgacgtttagctccaaattgttggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagagtccatgcatagcatctcattg 13970570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 45 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 24714805 - 24714617
Alignment:
Q  45 atgtgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaactaagtgcat---aagtat--------------a 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||   | ||||              |    
T  24714805 atgtgctattgatataatgatatcatcctg-ttatgtgacttgattatgctgctgctgttatttaactaagtgcattgtatgtatttatatatgatgaaa 24714707  T
Q  128 tgataaagtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatctcattg 217  Q
    |||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24714706 tgatgacgtttagctccaaattgttggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagagtccatgcatagcatctcattg 24714617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 45 - 217
Target Start/End: Original strand, 45057438 - 45057626
Alignment:
Q  45 atgtgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaactaagtgcat---aagtat--------------a 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||   | ||||              |    
T  45057438 atgtgctattgatataatgatatcatcctg-ttatgtgacttgattatgctgctgctgttatttaactaagtgcattgtatgtatttatatatgatgaaa 45057536  T
Q  128 tgataaagtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatctcattg 217  Q
    |||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  45057537 tgatgacgtttagctccaaattgttggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagattccatgcatagcatctcattg 45057626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 45 - 217
Target Start/End: Original strand, 41610642 - 41610830
Alignment:
Q  45 atgtgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaactaagtgcataag---------tatatgataaa- 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||            |||||||| ||     
T  41610642 atgtgctattgatataatgatatcatcctg-ttatgtgacttgattatgctgctgctgttatttaactaagtgcattgtatatatttatatatgatgaaa 41610740  T
Q  135 -------gtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatctcattg 217  Q
           ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  41610741 tgatgacgtttagctccaaattgttggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagagtccatgcataacatctcattg 41610830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 135 - 217
Target Start/End: Original strand, 41604851 - 41604933
Alignment:
Q  135 gtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatctcattg 217  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  41604851 gtttagctccaaattgttggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagagtccatgcataacatctcattg 41604933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 45 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 37318367 - 37318181
Alignment:
Q  45 atgtgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaactaagtgcataa-gtatat--------------g 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||   ||||||||||||||||||||  ||||||              |    
T  37318367 atgtgctattgatataatgatatcatcctg-ttatgtgacttgattatgctgctgctgttatttaactaagtgcatagtgtatatatacatgatgaaacg 37318269  T
Q  130 ataaagtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatctcattg 217  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||| |||| | ||||||||||||||| ||||||    
T  37318268 atgacgtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacggtgatttgtgcatatgagtccatgcatagcatttcattg 37318181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 135 - 205
Target Start/End: Original strand, 24872527 - 24872597
Alignment:
Q  135 gtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcat 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||| ||||||||||    
T  24872527 gtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacaatgatttgttcataagagtccatgcat 24872597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 135 - 205
Target Start/End: Original strand, 24880412 - 24880482
Alignment:
Q  135 gtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcat 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||| ||||||||||    
T  24880412 gtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacaatgatttgttcataagagtccatgcat 24880482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 135 - 205
Target Start/End: Original strand, 30971099 - 30971169
Alignment:
Q  135 gtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcat 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||| ||||||||||    
T  30971099 gtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacggtgatttgttcataagagtccatgcat 30971169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 45 - 120
Target Start/End: Original strand, 41604745 - 41604819
Alignment:
Q  45 atgtgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaactaagtgcat 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||   ||||||||||||| |||||    
T  41604745 atgtgctattgatataatgatatcatcctg-ttatgtgacttgattatgctgctgctgttatttaactaactgcat 41604819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 135 - 181
Target Start/End: Original strand, 10102002 - 10102048
Alignment:
Q  135 gtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatg 181  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10102002 gtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatg 10102048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 135 - 181
Target Start/End: Original strand, 12901865 - 12901911
Alignment:
Q  135 gtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatg 181  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12901865 gtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatg 12901911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 135 - 205
Target Start/End: Original strand, 21147410 - 21147480
Alignment:
Q  135 gtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcat 205  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || | |||| ||||| ||||||||||    
T  21147410 gtttagctccaaattattggatgcttattgatatgttgattacggtgatttgttgataagagtccatgcat 21147480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 135 - 181
Target Start/End: Original strand, 24628828 - 24628874
Alignment:
Q  135 gtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatg 181  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24628828 gtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatg 24628874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 135 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 24649112 - 24649066
Alignment:
Q  135 gtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatg 181  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24649112 gtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatg 24649066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 135 - 181
Target Start/End: Original strand, 27379781 - 27379827
Alignment:
Q  135 gtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatg 181  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27379781 gtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatg 27379827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 135 - 181
Target Start/End: Original strand, 27383827 - 27383873
Alignment:
Q  135 gtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatg 181  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27383827 gtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatg 27383873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 135 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 27601549 - 27601503
Alignment:
Q  135 gtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatg 181  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27601549 gtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatg 27601503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 148 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 10866162 - 10866093
Alignment:
Q  148 ttattggatgcatgttgat-atgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatctcattg 217  Q
    ||||||||||||||||||| | | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  10866162 ttattggatgcatgttgattacgatgattacg-tgttctgttcataagtgtccatgcataacatatcattg 10866093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 14 - 120
Target Start/End: Original strand, 19645951 - 19646055
Alignment:
Q  14 agatatgaaggtttgataaagatgcaattttatgtgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaacta 113  Q
    |||||||||||||| || | |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  | | || ||   ||||||||||||    
T  19645951 agatatgaaggtttaattatgatgcaattg-atgtgctattgatataatgatatcatcctg-ttatgtgacttgactgtactactgctgttatttaacta 19646048  T
Q  114 agtgcat 120  Q
    |||||||    
T  19646049 agtgcat 19646055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 135 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 24503099 - 24503030
Alignment:
Q  135 gtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcat 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| |||| || || ||||||||||    
T  24503099 gtttagctccaaattattggatgcatattgatataatgattacgatgttttgttgat-agagtccatgcat 24503030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 135 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 11677435 - 11677365
Alignment:
Q  135 gtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcat 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||| || |||| ||| | |||| ||||| ||||||||||    
T  11677435 gtttagctccaaattattggatgcacattgatatgatggttacaatgatttgttgataagagtccatgcat 11677365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 171 - 217
Target Start/End: Original strand, 13306750 - 13306796
Alignment:
Q  171 tgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatctcattg 217  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  13306750 tgattatgatgttctgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattg 13306796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 171 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 16985889 - 16985843
Alignment:
Q  171 tgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatctcattg 217  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  16985889 tgattatgatgttctgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattg 16985843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 135 - 205
Target Start/End: Original strand, 24641081 - 24641151
Alignment:
Q  135 gtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcat 205  Q
    |||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||| || | |||| ||||| || |||||||    
T  24641081 gtttagctccaaattattggatgtttattgatatgttgattacggtgatttgttgataagagtgcatgcat 24641151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 171 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 9340228 - 9340182
Alignment:
Q  171 tgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatctcattg 217  Q
    |||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  9340228 tgattatgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattg 9340182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 171 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 9488862 - 9488816
Alignment:
Q  171 tgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatctcattg 217  Q
    |||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  9488862 tgattatgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattg 9488816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 171 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 9608123 - 9608077
Alignment:
Q  171 tgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatctcattg 217  Q
    |||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  9608123 tgattatgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattg 9608077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 171 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 16922477 - 16922431
Alignment:
Q  171 tgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatctcattg 217  Q
    |||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  16922477 tgattatgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattg 16922431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 171 - 217
Target Start/End: Original strand, 19490085 - 19490131
Alignment:
Q  171 tgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatctcattg 217  Q
    |||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  19490085 tgattatgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattg 19490131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 136 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 27196871 - 27196829
Alignment:
Q  136 tttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacg 178  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||    
T  27196871 tttagctccaaattattggatgcatattgatatgatgaatacg 27196829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 171 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 27216011 - 27215965
Alignment:
Q  171 tgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatctcattg 217  Q
    |||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  27216011 tgattatgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattg 27215965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 171 - 217
Target Start/End: Original strand, 28432073 - 28432119
Alignment:
Q  171 tgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatctcattg 217  Q
    |||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  28432073 tgattatgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattg 28432119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 139 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 24174796 - 24174759
Alignment:
Q  139 agctccaaattattggatgcatgttgatatgttgatta 176  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  24174796 agctccaaattattggatgcatattgagatgttgatta 24174759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 139 - 176
Target Start/End: Original strand, 24655459 - 24655496
Alignment:
Q  139 agctccaaattattggatgcatgttgatatgttgatta 176  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  24655459 agctccaaattattggatgcatattgagatgttgatta 24655496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 139 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 24869876 - 24869839
Alignment:
Q  139 agctccaaattattggatgcatgttgatatgttgatta 176  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  24869876 agctccaaattattggatgcatattgagatgttgatta 24869839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 139 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 40428459 - 40428422
Alignment:
Q  139 agctccaaattattggatgcatgttgatatgttgatta 176  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  40428459 agctccaaattattggatgcatattgagatgttgatta 40428422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 152; Significance: 1e-80; HSPs: 66)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 14 - 217
Target Start/End: Original strand, 22328147 - 22328348
Alignment:
Q  14 agatatgaaggtttgataaagatgcaattttatgtgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaacta 113  Q
    ||||||||| | ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  22328147 agatatgaaagcttgataatgatgcaattt-atgtgctattgatataatgatatcatctcgtttatgtgacctgtttatgctgcttccgttatttaacta 22328245  T
Q  114 agtgcataagtatatgataaagtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatctc 213  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22328246 agtgcataagtatatgatgaagtt-agctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccatgcatagcatctc 22328344  T
Q  214 attg 217  Q
    ||||    
T  22328345 attg 22328348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 14 - 217
Target Start/End: Original strand, 37286765 - 37286966
Alignment:
Q  14 agatatgaaggtttgataaagatgcaattttatgtgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaacta 113  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  37286765 agatatgaaagtttgataatgatgcaattt-atgtgctattgatataataatatcatctcgtttatgtgacctgtttatgctgcttccgttatttaacta 37286863  T
Q  114 agtgcataagtatatgataaagtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatctc 213  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  37286864 agtgcataagtatatgatgaagtt-agctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccatgcatagcatctc 37286962  T
Q  214 attg 217  Q
    ||||    
T  37286963 attg 37286966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 14 - 217
Target Start/End: Original strand, 37293468 - 37293669
Alignment:
Q  14 agatatgaaggtttgataaagatgcaattttatgtgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaacta 113  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  37293468 agatatgaaagtttgataatgatgcaattt-atgtgctattgatataataatatcatctcgtttatgtgacctgtttatgctgcttccgttatttaacta 37293566  T
Q  114 agtgcataagtatatgataaagtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatctc 213  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  37293567 agtgcataagtatatgatgaagtt-agctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccatgcatagcatctc 37293665  T
Q  214 attg 217  Q
    ||||    
T  37293666 attg 37293669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 14 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 19992004 - 19991803
Alignment:
Q  14 agatatgaaggtttgataaagatgcaattttatgtgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaacta 113  Q
    ||||||||| | ||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  19992004 agatatgaaagcttgataatgatgcaattt-atatgctattgatataatgatatcatctcgtttatgtgacctgtttatgctgcttccgttatttaacta 19991906  T
Q  114 agtgcataagtatatgataaagtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatctc 213  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19991905 agtgcataagtatatgatgaagtt-agctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccatgcatagcatctc 19991807  T
Q  214 attg 217  Q
    ||||    
T  19991806 attg 19991803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 144; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 14 - 217
Target Start/End: Original strand, 22341586 - 22341787
Alignment:
Q  14 agatatgaaggtttgataaagatgcaattttatgtgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaacta 113  Q
    ||||||||| | ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  22341586 agatatgaaagcttgataatgatgcaattt-atgtgctattgatataatgatatcatctcgtttatgtgacctgtttatgctgcttccgttatttaacta 22341684  T
Q  114 agtgcataagtatatgataaagtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatctc 213  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22341685 agtgcataagtatatgatgaag-ttagctccaaattatttgatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgcccatgcatagcatctc 22341783  T
Q  214 attg 217  Q
    ||||    
T  22341784 attg 22341787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 14 - 217
Target Start/End: Original strand, 41294419 - 41294619
Alignment:
Q  14 agatatgaaggtttgataaagatgcaattttatgtgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaacta 113  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  41294419 agatatgaaggtttgataatgatgcaattt-ataagctattgatataatgatatcattttg-ttatgtgacttgtttatgctgcttccgttatttaacta 41294516  T
Q  114 agtgcataagtatatgataaagtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatctc 213  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||| ||||||||||||||||||    
T  41294517 agtgcataagtatatgatgaagtttagctccaaattactggatgcatgttgatatgttgattacgatgtt-tttccataagagtccatgcatagcatctc 41294615  T
Q  214 attg 217  Q
    ||||    
T  41294616 attg 41294619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 26 - 217
Target Start/End: Original strand, 15001675 - 15001865
Alignment:
Q  26 ttgataaagatgcaattttatgtgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaactaagtgcataagta 125  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  15001675 ttgataatgatgcaattt-atgtgctattgatataatgatatcattttgtttatgtgacctgtttatgctgcttccgttatttaactaagtgcataagtt 15001773  T
Q  126 tatgataaagtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatg-ttctgttcataagtgtccatgcatagcatctcattg 217  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15001774 tatgatgaag-ttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgtttttgttcataagtgtccatgcatagcatctcattg 15001865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 14 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 23250059 - 23249859
Alignment:
Q  14 agatatgaaggtttgataaagatgcaattttatgtgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaacta 113  Q
    ||||||||||  ||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  23250059 agatatgaagagttgataatgatacaattt-atgtgctattgatataatgatatcatcttg-ttatgtgacctgtttatgctgcttccgttatttaacta 23249962  T
Q  114 agtgcataagtatatgataaagtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatctc 213  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  23249961 agtgcataattatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataag-tgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatc 23249863  T
Q  214 attg 217  Q
    ||||    
T  23249862 attg 23249859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 42 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 23584233 - 23584059
Alignment:
Q  42 tttatgtgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaactaagtgcataagtatatgataaagtttagc 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23584233 tttatgtgctattgatataatgatatcatcttg-ttatgtgacctgtttatgctgcttccgttatttaactaagtgcataagtatatgatgaagtttagc 23584135  T
Q  142 tccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatctcattg 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  23584134 tccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgttgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattg 23584059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 26 - 217
Target Start/End: Original strand, 14995032 - 14995222
Alignment:
Q  26 ttgataaagatgcaattttatgtgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaactaagtgcataagta 125  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  14995032 ttgataatgatgcaattt-atgtgctattgatattatgatatcattttgtttatgtgacctgtttatgctgcttccgttatttaactaagtgcataagtt 14995130  T
Q  126 tatgataaagtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatg-ttctgttcataagtgtccatgcatagcatctcattg 217  Q
    |||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14995131 tatgatgatg-ttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgtttttgttcataagtgtccatgcatagcatctcattg 14995222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 14 - 217
Target Start/End: Original strand, 22062866 - 22063067
Alignment:
Q  14 agatatgaaggtttgataaagatgcaattttatgtgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaacta 113  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  22062866 agatatgaaggtttgataataatgcaattt-atgtgctattgatataataatatcatcttgat-atgtgacttgtttatgctgcttccgttgtttaacta 22062963  T
Q  114 agtgcataagtatatgataaagtttagctccaaattattggatgcatgttga-tatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatct 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||| ||||  |||| ||||||||||||||| |    
T  22062964 agtgcataagtatatgataaagtttagctccaaattattggatgcatgttgattacgttgattacg-tgttttgttgttaagagtccatgcatagcatat 22063062  T
Q  213 cattg 217  Q
    |||||    
T  22063063 cattg 22063067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 53 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 23609986 - 23609823
Alignment:
Q  53 ttgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaactaagtgcataagtatatgataaagtttagctccaaattatt 152  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23609986 ttgatataatgatatcatcttg-ttatgtgacctgtttatgctgcttccgttatttaactaagtgcataagtatatgatgaagtttagctccaaattatt 23609888  T
Q  153 ggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatctcattg 217  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  23609887 ggatgcatgttgataagttgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattg 23609823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 53 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 23841382 - 23841219
Alignment:
Q  53 ttgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaactaagtgcataagtatatgataaagtttagctccaaattatt 152  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23841382 ttgatataatgatatcatcttg-ttatgtgacctgtttatgctgcttccgttatttaactaagtgcataagtatatgatgaagtttagctccaaattatt 23841284  T
Q  153 ggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatctcattg 217  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  23841283 ggatgcatgttgataagttgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattg 23841219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 14 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 40707243 - 40707042
Alignment:
Q  14 agatatgaaggtttgataaagatgcaattttatgtgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaacta 113  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  40707243 agatatgaaggtttgataataatgcaattt-atgtgctattgatataataatatcatcttgat-atgtgacttgtttatgctgcttccgttgtttaacta 40707146  T
Q  114 agtgcataagtatatgataaagtttagctccaaattattggatgcatgttga-tatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatct 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||| ||||  |||| ||||||||||||||| |    
T  40707145 agtgcataagtatatgataaagtttagctccaaattattggatgcatgttgattacgttgattacg-tgttttgttgttaagagtccatgcatagcatat 40707047  T
Q  213 cattg 217  Q
    |||||    
T  40707046 cattg 40707042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 14 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 40713885 - 40713684
Alignment:
Q  14 agatatgaaggtttgataaagatgcaattttatgtgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaacta 113  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  40713885 agatatgaaggtttgataataatgcaattt-atgtgctattgatataataatatcatcttgat-atgtgacttgtttatgctgcttccgttgtttaacta 40713788  T
Q  114 agtgcataagtatatgataaagtttagctccaaattattggatgcatgttga-tatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatct 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||| ||||  |||| ||||||||||||||| |    
T  40713787 agtgcataagtatatgataaagtttagctccaaattattggatgcatgttgattacgttgattacg-tgttttgttgttaagagtccatgcatagcatat 40713689  T
Q  213 cattg 217  Q
    |||||    
T  40713688 cattg 40713684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 14 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 27608860 - 27608660
Alignment:
Q  14 agatatgaaggtttgataaagatgcaattttatgtgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaacta 113  Q
    ||||||||||  ||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  27608860 agatatgaagagttgataatgatacaattt-atgtgctattgatataatgatatcatcttg-ttatgtgacctgtttatgctgcttccgttatttaacta 27608763  T
Q  114 agtgcataagtatatgataaagtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatctc 213  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  27608762 agtgcataattatatgatgaagtttagctccaagttattggatgcatgttgataag-tgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatc 27608664  T
Q  214 attg 217  Q
    ||||    
T  27608663 attg 27608660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 14 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 27615466 - 27615266
Alignment:
Q  14 agatatgaaggtttgataaagatgcaattttatgtgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaacta 113  Q
    ||||||||||  ||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  27615466 agatatgaagagttgataatgatacaattt-atgtgctattgatataatgatatcatcttg-ttatgtgacctgtttatgctgcttccgttatttaacta 27615369  T
Q  114 agtgcataagtatatgataaagtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatctc 213  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  27615368 agtgcataattatatgatgaagtttagctccaagttattggatgcatgttgataag-tgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatc 27615270  T
Q  214 attg 217  Q
    ||||    
T  27615269 attg 27615266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 43 - 217
Target Start/End: Original strand, 24472260 - 24472432
Alignment:
Q  43 ttatgtgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaactaagtgcataagtatatgataaagtttagct 142  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  24472260 ttatgtgct-ttgatataatgatatcatcttg-ttatgtgacctgtttatgctgcttccgttatttaactaagtgcataattatatgatgaagtttagct 24472357  T
Q  143 ccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatctcattg 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  24472358 ccaaattattggatgcatgttgataagttgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattg 24472432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 43 - 217
Target Start/End: Original strand, 27663802 - 27663974
Alignment:
Q  43 ttatgtgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaactaagtgcataagtatatgataaagtttagct 142  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  27663802 ttatgtgct-ttgatataatgatatcatcttg-ttatgtgacctgtttatgctgcttccgttatttaactaagtgcataattatatgatgaagtttagct 27663899  T
Q  143 ccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatctcattg 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  27663900 ccaaattattggatgcatgttgataagttgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattg 27663974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 49 - 217
Target Start/End: Original strand, 18038685 - 18038853
Alignment:
Q  49 gctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaactaagtgcataagtatatgataaagtttagctccaaat 148  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||    
T  18038685 gctattgatataatgatatcattttgtttatgtgacctgtttatgctgcttccgttatttaactaagtgcataagtttatgatgaag-ttagctccaaat 18038783  T
Q  149 tattggatgcatgttgatatgttgattacgatg-ttctgttcataagtgtccatgcatagcatctcattg 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18038784 tattggatgcatgttgatatgttgattacgatgtttttgttcataagtgtccatgcatagcatctcattg 18038853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 14 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 27516873 - 27516672
Alignment:
Q  14 agatatgaaggtttgataaagatgcaattttatgtgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaacta 113  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  27516873 agatatgaaggtttgataataatgcaattt-atgtgctattgatataataatatcatcttgat-atgtgacttgtttatgctgcttccgttgtttaacta 27516776  T
Q  114 agtgcataagtatatgataaagtttagctccaaattattggatgcatgttga-tatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatct 212  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||| ||||  |||| ||||||||||||||| |    
T  27516775 agtgcataagtatatgatagagtttagctccaaattattggatgcatgttgattacgttgattacg-tgttttgttgttaagagtccatgcatagcatat 27516677  T
Q  213 cattg 217  Q
    |||||    
T  27516676 cattg 27516672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 14 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 27523510 - 27523309
Alignment:
Q  14 agatatgaaggtttgataaagatgcaattttatgtgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaacta 113  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  27523510 agatatgaaggtttgataataatgcaattt-atgtgctattgatataataatatcatcttgat-atgtgacttgtttatgctgcttccgttgtttaacta 27523413  T
Q  114 agtgcataagtatatgataaagtttagctccaaattattggatgcatgttga-tatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatct 212  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||| ||||  |||| ||||||||||||||| |    
T  27523412 agtgcataagtatatgatagagtttagctccaaattattggatgcatgttgattacgttgattacg-tgttttgttgttaagagtccatgcatagcatat 27523314  T
Q  213 cattg 217  Q
    |||||    
T  27523313 cattg 27523309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 53 - 217
Target Start/End: Original strand, 41098244 - 41098407
Alignment:
Q  53 ttgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaactaagtgcataagtatatgataaagtttagctccaaattatt 152  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  41098244 ttgatataatgatatcatcttg-ttatgtgacctgtttatgctgcttccgttatttaactaagtgcataattatatgatgaagtttagctccaaattatt 41098342  T
Q  153 ggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatctcattg 217  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  41098343 ggatgcatgttgataagttgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattg 41098407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 43 - 217
Target Start/End: Original strand, 34294565 - 34294737
Alignment:
Q  43 ttatgtgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaactaagtgcataagtatatgataaagtttagct 142  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  34294565 ttatgtgct-ttgatataatgatatcatcttg-ttatgtgacctgtttatgctgcttccgttatttaactaagtgcataattatatgatgaagtttagct 34294662  T
Q  143 ccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatctcattg 217  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  34294663 ccaaattattggatacatgttgataagttgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattg 34294737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 43 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 41769335 - 41769163
Alignment:
Q  43 ttatgtgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaactaagtgcataagtatatgataaagtttagct 142  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  41769335 ttatgtgct-ttgatataatgatatcaccttg-ttatgtgacctgtttatgctgcttccgttatttaactaagtgcataattatatgatgaagtttagct 41769238  T
Q  143 ccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatctcattg 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  41769237 ccaaattattggatgcatgttgataagttgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattg 41769163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 43 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 41775909 - 41775737
Alignment:
Q  43 ttatgtgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaactaagtgcataagtatatgataaagtttagct 142  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  41775909 ttatgtgct-ttgatataatgatatcaccttg-ttatgtgacctgtttatgctgcttccgttatttaactaagtgcataattatatgatgaagtttagct 41775812  T
Q  143 ccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatctcattg 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  41775811 ccaaattattggatgcatgttgataagttgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattg 41775737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 42 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 33725953 - 33725785
Alignment:
Q  42 tttatgtgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaactaagtgcataagtatatgataaagtttagc 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  33725953 tttatgtgctattgatataatgatatcattttgtttatgtgatctgtttatgctgcttccgttgtttaactaagtgcataagtatatgatgaagtttagc 33725854  T
Q  142 tccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcat 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  33725853 tccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgttgttttgttcatatgtgtccatgcatagcat 33725785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 14 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 37544161 - 37543960
Alignment:
Q  14 agatatgaaggtttgataaagatgcaattttatgtgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaacta 113  Q
    ||||| |||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  37544161 agatacgaaggtttgataataatgcaattt-atgtgctattgatataatgatatcatcttgctg-tgtgacttgtttatgctgcttctgttatttaacta 37544064  T
Q  114 agtgcataagtatatgataaagtttagctccaaattattggatgcatgttga-tatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatct 212  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  37544063 agtgcatatgtatatgataaggtttagctccaaattattggatgcatgttgattacgatgattacg-tgttttgttcataagtgtccatgcatagcatat 37543965  T
Q  213 cattg 217  Q
    |||||    
T  37543964 cattg 37543960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 43 - 217
Target Start/End: Original strand, 17706943 - 17707114
Alignment:
Q  43 ttatgtgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaactaagtgcataagtatatgataaagtttagct 142  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  17706943 ttatgtgct-ttgatataatgatatcatcttg-ttatgtgacctgtttatgctgcttccgttatttaactaagtgcataattatatgatgaagtttagct 17707040  T
Q  143 ccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatctcattg 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  17707041 ccaaattattggatgcatgttgataag-tgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattg 17707114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 43 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 22265038 - 22264865
Alignment:
Q  43 ttatgtgctattgatataatga-tatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaactaagtgcataagtatatgataaagtttagc 141  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  22265038 ttatgtgct-ttgatataatgaatatcatcttg-ttatgtgacctgtttatgctgcttccgttatttaactaagtgcataattatatgatgaagtttagc 22264941  T
Q  142 tccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatctcattg 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  22264940 tccaaattattggatgcatgttgataagttgactacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattg 22264865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 48 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 22133087 - 22132918
Alignment:
Q  48 tgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaactaagtgcataag-tatatgataaagtttagctccaa 146  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||    
T  22133087 tgctattgatataatgatatcatcttg-ttatgtgacttgtttatgctgcttccgttatttaactaagtgcatatggtatatgatgaagtttagctccaa 22132989  T
Q  147 attattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatctcattg 217  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||  |||| ||||||||||||||| ||||||    
T  22132988 attattggatgcatgttgatatattgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattg 22132918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 48 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 25406514 - 25406345
Alignment:
Q  48 tgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaactaagtgcataag-tatatgataaagtttagctccaa 146  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  | |||||||| ||||||||||||||    
T  25406514 tgctattgatataatgatatcatcttg-ttatgtgacttgtttatgctgcttccgttatttaactaagtgcatgtggtatatgatgaagtttagctccaa 25406416  T
Q  147 attattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatctcattg 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||  |||| ||||||||||||||| ||||||    
T  25406415 attattggatgcatgttgatatgttgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattg 25406345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 49 - 217
Target Start/End: Original strand, 1692454 - 1692622
Alignment:
Q  49 gctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaactaagtgcataagtatatgataaagtttagctccaaat 148  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||| |    
T  1692454 gctattgatataatgatatcattttgtttatgtgacctgtttatgctgcttccgttatttaactaagtgcataagtttatgatgaag-ttagctccaatt 1692552  T
Q  149 tattggatgcatgttgatatgttgattacgatg-ttctgttcataagtgtccatgcatagcatctcattg 217  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1692553 taatggatgcatgttgatatgttgattacgatgtttttgttcataagtgtccatgcatagcatcttattg 1692622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 53 - 217
Target Start/End: Original strand, 27670451 - 27670613
Alignment:
Q  53 ttgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaactaagtgcataagtatatgataaagtttagctccaaattatt 152  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||    
T  27670451 ttgatataatgatatcatcttg-ttatgtgacctgtttatgctgcttccgttatttaactaagtgcataattatatgatgaagtttagctccaagttatt 27670549  T
Q  153 ggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatctcattg 217  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  27670550 ggatgcatgttgataag-tgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattg 27670613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 48 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 17284157 - 17283988
Alignment:
Q  48 tgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaactaagtgcataag-tatatgataaagtttagctccaa 146  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||    
T  17284157 tgctgttgatataatgatatcatcttg-ttatgtgacttgtttatgctgcttccgttatttaactaagtgcatatggtatatgatgaagtttagctccaa 17284059  T
Q  147 attattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatctcattg 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||  |||| ||||||| ||||||| ||||||    
T  17284058 attattggatgcatgttgatatgttgattacggtgttttgttgttaagagtccatgtatagcatatcattg 17283988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 48 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 22139779 - 22139610
Alignment:
Q  48 tgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaactaagtgcataag-tatatgataaagtttagctccaa 146  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||    
T  22139779 tgctattgatataatgatatcatcttg-ttatgtgacttgtttatgctgattccgttatttaactaagtgcatatggtatatgatgaagtttagctccaa 22139681  T
Q  147 attattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatctcattg 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||  |||| ||| ||||||||||| ||||||    
T  22139680 attattggatgcatgttgatatgttgattacggtgttttgttgttaagagtctatgcatagcatatcattg 22139610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 48 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 22588185 - 22588016
Alignment:
Q  48 tgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaactaagtgcataag-tatatgataaagtttagctccaa 146  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||| ||||||    
T  22588185 tgctattggtataatgatatcatcttg-ttatgtgacttgtttatgctgcttccgttatttaactaagtgcatatggtatatgatgaagtttatctccaa 22588087  T
Q  147 attattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatctcattg 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||  |||| ||||||||||||||| ||||||    
T  22588086 attattggatgcatgttgatatgttgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattg 22588016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 49 - 217
Target Start/End: Original strand, 27687346 - 27687514
Alignment:
Q  49 gctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaactaagtgcataagtatatgataaagtttagctccaaat 148  Q
    ||||||||||||||||||| || ||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||| |    
T  27687346 gctattgatataatgatattattttgtttatgtgacctgtttatgctgcttccgttatttaactaagtgcataagtttatgatgaag-ttagctccaatt 27687444  T
Q  149 tattggatgcatgttgatatgttgattacgatg-ttctgttcataagtgtccatgcatagcatctcattg 217  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27687445 taatggatgcgtgttgatatgttgattacgatgtttttgttcataagtgtccatgcatagcatctcattg 27687514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 53 - 217
Target Start/End: Original strand, 29471379 - 29471544
Alignment:
Q  53 ttgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaactaagtgcataag-tatatgataaagtttagctccaaattat 151  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||    
T  29471379 ttgatataatgatatcatcttg-ttatgtgacttgtttatgctgcttccgttatttaactaagtgcatatggtatatgatgaagtttagctccaaattat 29471477  T
Q  152 tggatgcatgttgatatgttg-attacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatctcattg 217  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||  |||| ||||||||||||||| ||||||    
T  29471478 tggatgcatgttgatatgttgaattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattg 29471544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 53 - 217
Target Start/End: Original strand, 29477974 - 29478139
Alignment:
Q  53 ttgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaactaagtgcataag-tatatgataaagtttagctccaaattat 151  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||    
T  29477974 ttgatataatgatatcatcttg-ttatgtgacttgtttatgctgcttccgttatttaactaagtgcatatggtatatgatgaagtttagctccaaattat 29478072  T
Q  152 tggatgcatgttgatatgttg-attacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatctcattg 217  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||  |||| ||||||||||| ||| ||||||    
T  29478073 tggatgcatgttgatatgttgaattacggtgttttgttgttaagagtccatgcataacatatcattg 29478139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 45 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 24020374 - 24020189
Alignment:
Q  45 atgtgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaactaagtgcataag------tatatgataaa---- 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||        |||||||| ||        
T  24020374 atgtgctattgatataatgatatcatcctg-ttatgtgacttgtttatgctgctgctgttatttaactaagtgcatagtgtactttatatgatgaaatga 24020276  T
Q  135 ----gtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatctcattg 217  Q
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||  |||||||||| ||| ||||||    
T  24020275 tgacgtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgatttgttcataagaatccatgcataacatttcattg 24020189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 45 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 19768441 - 19768253
Alignment:
Q  45 atgtgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaactaagtgcat---aagtat--------------a 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||   | ||||              |    
T  19768441 atgtgctattgatataatgatatcatcctg-ttatgtgacttgattatgctgctgctgttatttaactaagtgcattgtatgtatttatatatgatgaaa 19768343  T
Q  128 tgataaagtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatctcattg 217  Q
    |||| | ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19768342 tgatgacgtttagctccaaattgttggatgcatgatgatatgttgattacgatgttttgttcataagagtccatgcatagcatctcattg 19768253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 45 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 19775037 - 19774849
Alignment:
Q  45 atgtgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaactaagtgcat---aagtat--------------a 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||   | ||||              |    
T  19775037 atgtgctattgatataatgatatcatcctg-ttatgtgacttgattatgctgctgctgttatttaactaagtgcattgtatgtatttatatatgatgaaa 19774939  T
Q  128 tgataaagtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatctcattg 217  Q
    |||| | ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19774938 tgatgacgtttagctccaaattgttggatgcatgatgatatgttgattacgatgttttgttcataagagtccatgcatagcatctcattg 19774849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 135 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 22352885 - 22352803
Alignment:
Q  135 gtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatctcattg 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  22352885 gtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacggtgatttgttcataagagtccatgcatagcatttcattg 22352803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 135 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 22343485 - 22343403
Alignment:
Q  135 gtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatctcattg 217  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  22343485 gtttagctccaaattattagatgcatgttgatatgttgattacggtgatttgttcataagagtccatgcatagcatttcattg 22343403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 135 - 205
Target Start/End: Original strand, 22326046 - 22326116
Alignment:
Q  135 gtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcat 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || | |||||||||| ||||||||||    
T  22326046 gtttagctccaaattattggatgcatattgatatgttgattacggtgatttgttcataagagtccatgcat 22326116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 135 - 181
Target Start/End: Original strand, 15237184 - 15237230
Alignment:
Q  135 gtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatg 181  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15237184 gtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatg 15237230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 135 - 181
Target Start/End: Original strand, 19473067 - 19473113
Alignment:
Q  135 gtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatg 181  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19473067 gtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatg 19473113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 135 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 20295604 - 20295558
Alignment:
Q  135 gtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatg 181  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20295604 gtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatg 20295558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 135 - 205
Target Start/End: Original strand, 21295380 - 21295449
Alignment:
Q  135 gtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcat 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||| || || ||||||||||    
T  21295380 gtttagctccaaattattggatgcatattgatatgatgattacgatgttttgttgat-agagtccatgcat 21295449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 135 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 24554523 - 24554454
Alignment:
Q  135 gtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcat 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||| || || ||||||||||    
T  24554523 gtttagctccaaattattggatgcatattgatatgatgattacgatgttttgttgat-agagtccatgcat 24554454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 135 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 10752947 - 10752901
Alignment:
Q  135 gtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatg 181  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  10752947 gtttagctccaaattattggatgcatgataatatgttgattacgatg 10752901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 135 - 205
Target Start/End: Original strand, 14359937 - 14360007
Alignment:
Q  135 gtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcat 205  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||| || | |||| ||||| ||||||||||    
T  14359937 gtttagctccaaactattggatgcatattgatatgatgattacggtggtttgttgataagagtccatgcat 14360007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 135 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 25534977 - 25534908
Alignment:
Q  135 gtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcat 205  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||| || || ||||||||||    
T  25534977 gtttaactccaaattattggatgcatattgatatgatgattacgatgttttgttgat-agagtccatgcat 25534908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 135 - 177
Target Start/End: Original strand, 15442074 - 15442116
Alignment:
Q  135 gtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattac 177  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  15442074 gtttagctccaaattattggatgcatattgatatgatgattac 15442116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 135 - 205
Target Start/End: Original strand, 23337408 - 23337478
Alignment:
Q  135 gtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcat 205  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||  || | |||| ||||| ||||||||||    
T  23337408 gtttggctccaaattattggatgcatattgatatgatgattacagtgatttgttgataagagtccatgcat 23337478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 171 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 16354790 - 16354744
Alignment:
Q  171 tgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatctcattg 217  Q
    |||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  16354790 tgattatgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattg 16354744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 171 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 16361449 - 16361403
Alignment:
Q  171 tgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatctcattg 217  Q
    |||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  16361449 tgattatgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattg 16361403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 171 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 34564783 - 34564737
Alignment:
Q  171 tgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatctcattg 217  Q
    |||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  34564783 tgattatgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattg 34564737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 171 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 34571438 - 34571392
Alignment:
Q  171 tgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatctcattg 217  Q
    |||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  34571438 tgattatgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattg 34571392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 139 - 176
Target Start/End: Original strand, 123423 - 123460
Alignment:
Q  139 agctccaaattattggatgcatgttgatatgttgatta 176  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  123423 agctccaaattattggatgcatattgagatgttgatta 123460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 139 - 176
Target Start/End: Original strand, 12028685 - 12028722
Alignment:
Q  139 agctccaaattattggatgcatgttgatatgttgatta 176  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  12028685 agctccaaattattggatgcatattgagatgttgatta 12028722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 52 - 122
Target Start/End: Original strand, 15441975 - 15442047
Alignment:
Q  52 attgatataatgatatcatcttgat--tatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaactaagtgcataa 122  Q
    |||||||||||||||||||| || |  | |||||||||  |||||||||   |||||||||||||||||||||    
T  15441975 attgatataatgatatcatcctgttgttgtgtgacttgactatgctgctgctgttatttaactaagtgcataa 15442047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 139 - 176
Target Start/End: Original strand, 17919263 - 17919300
Alignment:
Q  139 agctccaaattattggatgcatgttgatatgttgatta 176  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  17919263 agctccaaattattggatgcatattgagatgttgatta 17919300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 139 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 22757122 - 22757085
Alignment:
Q  139 agctccaaattattggatgcatgttgatatgttgatta 176  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  22757122 agctccaaattattggatgcatattgagatgttgatta 22757085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 139 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 24221873 - 24221836
Alignment:
Q  139 agctccaaattattggatgcatgttgatatgttgatta 176  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  24221873 agctccaaattattggatgcatattgagatgttgatta 24221836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 148; Significance: 3e-78; HSPs: 65)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 26 - 217
Target Start/End: Original strand, 14298825 - 14299014
Alignment:
Q  26 ttgataaagatgcaattttatgtgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaactaagtgcataagta 125  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14298825 ttgataatgatgcaattt-atgtgctattgatataatgatatcatctcgtttatgtgacctgtttatgctgcttccgttatttaactaagtgcataagta 14298923  T
Q  126 tatgataaagtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatctcattg 217  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14298924 tatgatgaagtt-agctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccatgcatagcatctcattg 14299014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 26 - 217
Target Start/End: Original strand, 14305449 - 14305638
Alignment:
Q  26 ttgataaagatgcaattttatgtgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaactaagtgcataagta 125  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14305449 ttgataatgatgcaattt-atgtgctattgatataatgatatcatctcgtttatgtgacctgtttatgctgcttccgttatttaactaagtgcataagta 14305547  T
Q  126 tatgataaagtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatctcattg 217  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14305548 tatgatgaagtt-agctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccatgcatagcatctcattg 14305638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 14 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 15148577 - 15148377
Alignment:
Q  14 agatatgaaggtttgataaagatgcaattttatgtgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaacta 113  Q
    ||||||||||||| |||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  15148577 agatatgaaggtt-gataataatgcaattt-atgtgctattgatataatgatatcatcttgat-atgtgacttgtttatgctgcttccgttgtttaacta 15148481  T
Q  114 agtgcataagtatatgataaagtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatctc 213  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  15148480 agtgcataagtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgttgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatc 15148381  T
Q  214 attg 217  Q
    ||||    
T  15148380 attg 15148377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 14 - 217
Target Start/End: Original strand, 14268443 - 14268640
Alignment:
Q  14 agatatgaaggtttgataaagatgcaattttatgtgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaacta 113  Q
    |||||||||| |||||||| |||| ||||  | ||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14268443 agatatgaag-tttgataatgatgtaatt--aagtgctattggtataatgatatcat-ttg-ttatgtgacttgtttatgctgcttccgttatttaacta 14268537  T
Q  114 agtgcataagtatatgataaagtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatctc 213  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14268538 agtgcataagtatatgatgaagtt-agctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccatgcatagcatctc 14268636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 14 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 4772217 - 4772017
Alignment:
Q  14 agatatgaaggtttgataaagatgcaattttatgtgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaacta 113  Q
    ||||||||||  ||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  4772217 agatatgaagagttgataatgatacaattt-atgtgctattgatataatgatatcatcttg-ttatgtgacctgtttatgctgcttccgttatttaacta 4772120  T
Q  114 agtgcataagtatatgataaagtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatctc 213  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  4772119 agtgcataattatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataag-tgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatc 4772021  T
Q  214 attg 217  Q
    ||||    
T  4772020 attg 4772017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 42 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 15362226 - 15362052
Alignment:
Q  42 tttatgtgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaactaagtgcataagtatatgataaagtttagc 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15362226 tttatgtgctattgatataatgatatcatcttgat-atgtgacttgtttatgctgcttccgttgtttaactaagtgcataagtatatgatgaagtttagc 15362128  T
Q  142 tccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatctcattg 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  15362127 tccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgttgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattg 15362052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 42 - 217
Target Start/End: Original strand, 16231854 - 16232028
Alignment:
Q  42 tttatgtgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaactaagtgcataagtatatgataaagtttagc 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16231854 tttatgtgctattgatataatgatatcatcttgat-atgtgacttgtttatgctgcttccgttgtttaactaagtgcataagtatatgatgaagtttagc 16231952  T
Q  142 tccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatctcattg 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  16231953 tccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgttgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattg 16232028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 42 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 22194713 - 22194539
Alignment:
Q  42 tttatgtgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaactaagtgcataagtatatgataaagtttagc 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22194713 tttatgtgctattgatataatgatatcatcttgat-atgtgacttgtttatgctgcttccgttgtttaactaagtgcataagtatatgatgaagtttagc 22194615  T
Q  142 tccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatctcattg 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  22194614 tccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgttgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattg 22194539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 42 - 217
Target Start/End: Original strand, 36884747 - 36884921
Alignment:
Q  42 tttatgtgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaactaagtgcataagtatatgataaagtttagc 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  36884747 tttatgtgctattgatataatgatatcatcttgat-atgtgacttgtttatgctgcttccgttgtttaactaagtgcataagtatatgatgaagtttagc 36884845  T
Q  142 tccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatctcattg 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  36884846 tccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgttgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattg 36884921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 14 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 18071289 - 18071088
Alignment:
Q  14 agatatgaaggtttgataaagatgcaattttatgtgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaacta 113  Q
    |||||||||| ||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18071289 agatatgaagatttgataataatgcaattt-atgtgctattgatataatgatatcatcttgat-atgtgacttgtttatgctgcttccgttatttaacta 18071192  T
Q  114 agtgcataagtatatgataaagtttagctccaaattattggatgcatgttga-tatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatct 212  Q
    |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  18071191 agtgcatatgtttatgataaggtttagctccaaattattggatgcatgttgattacgatgattacg-tgttttgttcataagtgtccatgcatagcatat 18071093  T
Q  213 cattg 217  Q
    |||||    
T  18071092 cattg 18071088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 14 - 217
Target Start/End: Original strand, 8048481 - 8048681
Alignment:
Q  14 agatatgaaggtttgataaagatgcaattttatgtgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaacta 113  Q
    ||||||||||  ||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  8048481 agatatgaagagttgataatgatacaattt-atgtgctattgatataatgatatcatcttg-ttatgtgacctgtttatgctgcttccgttatttaacta 8048578  T
Q  114 agtgcataagtatatgataaagtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatctc 213  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  8048579 agtgcataattatatgatgaagtttagctccaagttattggatgcatgttgataag-tgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatc 8048677  T
Q  214 attg 217  Q
    ||||    
T  8048678 attg 8048681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 43 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 23954240 - 23954068
Alignment:
Q  43 ttatgtgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaactaagtgcataagtatatgataaagtttagct 142  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  23954240 ttatgtgct-ttgatataatgatatcatcttg-ttatgtgacctgtttatgctgcttccgttatttaactaagtgcataattatatgatgaagtttagct 23954143  T
Q  143 ccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatctcattg 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  23954142 ccaaattattggatgcatgttgataagttgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattg 23954068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 43 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 23960902 - 23960730
Alignment:
Q  43 ttatgtgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaactaagtgcataagtatatgataaagtttagct 142  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  23960902 ttatgtgct-ttgatataatgatatcatcttg-ttatgtgacctgtttatgctgcttccgttatttaactaagtgcataattatatgatgaagtttagct 23960805  T
Q  143 ccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatctcattg 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  23960804 ccaaattattggatgcatgttgataagttgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattg 23960730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 14 - 217
Target Start/End: Original strand, 18024413 - 18024614
Alignment:
Q  14 agatatgaaggtttgataaagatgcaattttatgtgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaacta 113  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  18024413 agatatgaaggtttgataataatgcaattt-atgtgctattgatataataatatcatcttgat-atgtgacttgtttatgctgcttccgttgtttaacta 18024510  T
Q  114 agtgcataagtatatgataaagtttagctccaaattattggatgcatgttga-tatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatct 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||| ||||  |||| |||||| |||||||| |    
T  18024511 agtgcataagtatatgataaagtttagctccaaattattggatgcatgttgattacgttgattacg-tgttttgttgttaagagtccatacatagcatat 18024609  T
Q  213 cattg 217  Q
    |||||    
T  18024610 cattg 18024614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 14 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 18295746 - 18295545
Alignment:
Q  14 agatatgaaggtttgataaagatgcaattttatgtgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaacta 113  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  18295746 agatatgaaggtttgataataatgcaattt-atgtgctattgatataataataccatcttgat-atgtgacttgtttatgctgcttccgttgtttaacta 18295649  T
Q  114 agtgcataagtatatgataaagtttagctccaaattattggatgcatgttga-tatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatct 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||| ||||  |||| ||||||||||||||| |    
T  18295648 agtgcataagtatatgataaagtttagctccaaattattggatgcatgttgattacgttgattacg-tgttttgttgttaagagtccatgcatagcatat 18295550  T
Q  213 cattg 217  Q
    |||||    
T  18295549 cattg 18295545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 14 - 217
Target Start/End: Original strand, 8055094 - 8055294
Alignment:
Q  14 agatatgaaggtttgataaagatgcaattttatgtgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaacta 113  Q
    ||||||||||  ||||||| ||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  8055094 agatatgaagagttgataatgatacaattt-atgtgttattgatataatgatatcatcttg-ttatgtgacctgtttatgctgcttccgttatttaacta 8055191  T
Q  114 agtgcataagtatatgataaagtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatctc 213  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  8055192 agtgcataattatatgatgaagtttagctccaagttattggatgcatgttgataag-tgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatc 8055290  T
Q  214 attg 217  Q
    ||||    
T  8055291 attg 8055294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 42 - 217
Target Start/End: Original strand, 15383505 - 15383678
Alignment:
Q  42 tttatgtgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaactaagtgcataagtatatgataaagtttagc 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15383505 tttatgtgctattgatataatgatatcatcttgat-atgtgacttgtttatgctgcttccgttgtttaactaagtgcataagtatatgatgaagtttagc 15383603  T
Q  142 tccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatctcattg 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||  || ||||||||||||||||| ||||||    
T  15383604 tccaaattattggatgcatgttgatacgttgattacg-tgttttgttgttatgtgtccatgcatagcatatcattg 15383678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 20 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 12475134 - 12474939
Alignment:
Q  20 gaaggtttgataaagatgcaattttatgtgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaactaagtgca 119  Q
    |||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  12475134 gaaggtttgataataatgcaattt-atgtgctattgatataataatatcatcttgat-atgtgacttgtttatgctgcttccgttgtttaactaagtgca 12475037  T
Q  120 taagtatatgataaagtttagctccaaattattggatgcatgttga-tatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatctcattg 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||| ||||  |||| ||||||||||||||| ||||||    
T  12475036 taagtatatgataaagtttagctccaaattattggatgcatgttgattacgttgattacg-tgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattg 12474939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 20 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 12481764 - 12481569
Alignment:
Q  20 gaaggtttgataaagatgcaattttatgtgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaactaagtgca 119  Q
    |||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  12481764 gaaggtttgataataatgcaattt-atgtgctattgatataataatatcatcttgat-atgtgacttgtttatgctgcttccgttgtttaactaagtgca 12481667  T
Q  120 taagtatatgataaagtttagctccaaattattggatgcatgttga-tatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatctcattg 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||| ||||  |||| ||||||||||||||| ||||||    
T  12481666 taagtatatgataaagtttagctccaaattattggatgcatgttgattacgttgattacg-tgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattg 12481569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 53 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 20115226 - 20115062
Alignment:
Q  53 ttgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaactaagtgcataagtatatgataaagtttagctccaaattatt 152  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||    
T  20115226 ttgatataatgatatcattttgtttatgtgacctgtttatgctgcttccgttatttaactaagtgcataagtttatgatgaag-ttagctccaaattatt 20115128  T
Q  153 ggatgcatgttgatatgttgattacgatg-ttctgttcataagtgtccatgcatagcatctcattg 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20115127 ggatgcatgttgatatgttgattacgatgtttttgttcataagtgtccatgcatagcatctcattg 20115062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 48 - 217
Target Start/End: Original strand, 386347 - 386516
Alignment:
Q  48 tgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaactaagtgcataag-tatatgataaagtttagctccaa 146  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||    
T  386347 tgctattgatataatgatatcatcttg-ttatgtgacttgtttatgctgcttccgttatttaactaagtgcatatggtatatgatgaagtttagctccaa 386445  T
Q  147 attattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatctcattg 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||  |||| ||||||||||||||| ||||||    
T  386446 attattggatgcatgttgatatgttgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattg 386516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 48 - 217
Target Start/End: Original strand, 6873394 - 6873563
Alignment:
Q  48 tgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaactaagtgcataag-tatatgataaagtttagctccaa 146  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||    
T  6873394 tgctattgatataatgatatcatcttg-ttatgtgacttgtttatgctgcttccgttatttaactaagtgcatatggtatatgatgaagtttagctccaa 6873492  T
Q  147 attattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatctcattg 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||  |||| ||||||||||||||| ||||||    
T  6873493 attattggatgcatgttgatatgttgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattg 6873563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 43 - 217
Target Start/End: Original strand, 19780303 - 19780474
Alignment:
Q  43 ttatgtgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaactaagtgcataagtatatgataaagtttagct 142  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  19780303 ttatgtgct-ttgatataatgatatcatcttg-ttatgtgacctgtttatgctgcttccgttattta-ctaagtgcataattatatgatgaagtttagct 19780399  T
Q  143 ccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatctcattg 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  19780400 ccaaattattggatgcatgttgataagttgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattg 19780474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 48 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 40478238 - 40478069
Alignment:
Q  48 tgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaactaagtgcataag-tatatgataaagtttagctccaa 146  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||    
T  40478238 tgctgttgatataatgatatcatcttg-ttatgtgacttgtttatgttgcttccgttatttaactaagtgcatatggtatatgatgaagtttagctccaa 40478140  T
Q  147 attattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatctcattg 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||  |||| ||||||||||||||| ||||||    
T  40478139 attattggatgcatgttgatatgttgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattg 40478069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 48 - 217
Target Start/End: Original strand, 26284923 - 26285094
Alignment:
Q  48 tgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaactaagtgcata-agtatatgataaagtttagctccaa 146  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||| |||| |||||||||    
T  26284923 tgctgttgatataatgatatcatcttgttattgtgacttgtttatgctgcttccgttatttaactaagtgcatatggtatatgatgaagtctagctccaa 26285022  T
Q  147 attattggatgcatgttgatatgttg-attacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatctcattg 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||  |||| ||||||||||||||| ||||||    
T  26285023 attattggatgcatgttgatatgttgaattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattg 26285094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 48 - 217
Target Start/End: Original strand, 51493835 - 51494002
Alignment:
Q  48 tgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaactaagtgcata-agtatatgataaagtttagctccaa 146  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||    
T  51493835 tgctattaatataatgatatcatcttg-ttatgtgacttgtttatgctgcttccgttatttaactaagtgcatatggtatatgatgaagtttagctccaa 51493933  T
Q  147 attattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatctcattg 217  Q
    |||||||||||||  |||||||||| |||||| |||| ||||  |||| ||||||||||||||| ||||||    
T  51493934 attattggatgca--ttgatatgtttattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattg 51494002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 48 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 40471565 - 40471449
Alignment:
Q  48 tgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaactaagtgcataag-tatatgataaagtttagctccaa 146  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||    
T  40471565 tgctgttgatataatgatatcatcttg-ttatgtgacttgtttatgttgcttccgttatttaactaagtgcatatggtatatgatgaagtttagctccaa 40471467  T
Q  147 attattggatgcatgttg 164  Q
    ||||||||||||||||||    
T  40471466 attattggatgcatgttg 40471449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 45 - 217
Target Start/End: Original strand, 19942167 - 19942355
Alignment:
Q  45 atgtgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaactaagtgcat---aagtat--------------a 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||   | ||||              |    
T  19942167 atgtgctattgatataatgatatcatcctg-ttatgtgacttgattatgctgctgctgttatttaactaagtgcattgtatgtatttatatatgatgaaa 19942265  T
Q  128 tgataaagtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatctcattg 217  Q
    |||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19942266 tgatgacgtttagctccaaattgttggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagagtccatgcatagcatctcattg 19942355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 45 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 23081681 - 23081493
Alignment:
Q  45 atgtgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaactaagtgcat---aagtat--------------a 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||   | ||||              |    
T  23081681 atgtgctattgatataatgatatcatcctg-ttatgtgacttgattatgctgctgctgttatttaactaagtgcattgtatgtatttatatatgatgaaa 23081583  T
Q  128 tgataaagtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatctcattg 217  Q
    |||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23081582 tgatgacgtttagctccaaattgttggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagagtccatgcatagcatctcattg 23081493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 45 - 217
Target Start/End: Original strand, 16956664 - 16956852
Alignment:
Q  45 atgtgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaactaagtgcataag---------tatatgataaa- 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||            |||||||| ||     
T  16956664 atgtgctattgatataatgatatcatcctg-ttatgtgacttgattatgctgctgctgttatttaactaagtgcattgtatatatttatatatgatgaaa 16956762  T
Q  135 -------gtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatctcattg 217  Q
           ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16956763 tgatgacgtttagctccaaattgttggatgcatgttgatatgttgattacgatgttatgttcataagagtccatgcatagcatctcattg 16956852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 45 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 27709838 - 27709650
Alignment:
Q  45 atgtgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaactaagtgcat---aagtat--------------a 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||| |   |||||||||||||||||||   | ||||              |    
T  27709838 atgtgctattgatataatgatatcatcctg-ttatgtgacttgattatgctgttgctgttatttaactaagtgcattgtatgtatttatatatgatgaaa 27709740  T
Q  128 tgataaagtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatctcattg 217  Q
    |||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27709739 tgatgacgtttagctccaaattgttggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagagtccatgcatagcatctcattg 27709650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 135 - 217
Target Start/End: Original strand, 9272275 - 9272357
Alignment:
Q  135 gtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatctcattg 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || | |||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  9272275 gtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgaatacggtgatttgttcataagagtccatgcatagcatttcattg 9272357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 135 - 217
Target Start/End: Original strand, 4561683 - 4561765
Alignment:
Q  135 gtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatctcattg 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||  |||| ||||||||||||||| ||||||    
T  4561683 gtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattg 4561765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 135 - 217
Target Start/End: Original strand, 5757288 - 5757370
Alignment:
Q  135 gtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatctcattg 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||  |||| ||||||||||||||| ||||||    
T  5757288 gtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattg 5757370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 135 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 53433363 - 53433293
Alignment:
Q  135 gtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcat 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||| ||||||||||    
T  53433363 gtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacggtgatttgttcataagagtccatgcat 53433293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 135 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 20682139 - 20682069
Alignment:
Q  135 gtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcat 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || | |||||||||| ||||||||||    
T  20682139 gtttagctccaaattattggatgcatattgatatgttgattacggtgatttgttcataagagtccatgcat 20682069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 48 - 122
Target Start/End: Original strand, 15322111 - 15322184
Alignment:
Q  48 tgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaactaagtgcataa 122  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||||    
T  15322111 tgctattgatataatgatatcatcctg-ttatgtgacttgattatgctgctgctgttatttaactaagtgcataa 15322184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 135 - 217
Target Start/End: Original strand, 7901289 - 7901371
Alignment:
Q  135 gtttagctccaaattattggatgcatgttga-tatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatctcattg 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||| ||||  |||| ||||||||||||||| ||||||    
T  7901289 gtttagctccaaattattggatgcatgttgattatgatgattacg-tgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattg 7901371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 135 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 35170615 - 35170532
Alignment:
Q  135 gtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgca-tagcatctcattg 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || | |||| ||||| ||||||||| |||||| ||||||    
T  35170615 gtttagctccaaattattggatgcatattgatatgatgattacggtgatttgttgataagagtccatgcattagcatttcattg 35170532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 135 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 9556287 - 9556241
Alignment:
Q  135 gtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatg 181  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  9556287 gtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatg 9556241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 135 - 181
Target Start/End: Original strand, 14757771 - 14757817
Alignment:
Q  135 gtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatg 181  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14757771 gtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatg 14757817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 135 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 17810031 - 17809985
Alignment:
Q  135 gtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatg 181  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17810031 gtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatg 17809985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 135 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 33742137 - 33742091
Alignment:
Q  135 gtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatg 181  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  33742137 gtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatg 33742091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 140 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 35613921 - 35613859
Alignment:
Q  140 gctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatg 202  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||| ||||| |||||||    
T  35613921 gctccaaattattggatgcatattgatatgatgattacgatgttttgttgataagagtccatg 35613859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 135 - 205
Target Start/End: Original strand, 41385862 - 41385931
Alignment:
Q  135 gtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcat 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||| || || ||||||||||    
T  41385862 gtttagctccaaattattggatgcatattgatatgatgattacgatgttttgttgat-agagtccatgcat 41385931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 135 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 14678951 - 14678903
Alignment:
Q  135 gtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgtt 183  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  14678951 gtttagctccaaattattggatgcatattgatatgatgattacgatgtt 14678903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 14 - 122
Target Start/End: Original strand, 30235162 - 30235268
Alignment:
Q  14 agatatgaaggtttgataaagatgcaattttatgtgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaacta 113  Q
    ||||||||| |||| || | |||||||||  || |||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||  |||||||||   ||||||||||||    
T  30235162 agatatgaaagtttaattatgatgcaattg-atttgctattgatataatgatatcattatg-ttatgtgacttgactatgctgctgctgttatttaacta 30235259  T
Q  114 agtgcataa 122  Q
    |||||||||    
T  30235260 agtgcataa 30235268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 135 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 12522070 - 12522000
Alignment:
Q  135 gtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcat 205  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || | |||| ||||| ||||||||||    
T  12522070 gtttggctccaaattattggatgcatattgatatgatgattacggtgatttgttgataagagtccatgcat 12522000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 135 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 15224798 - 15224752
Alignment:
Q  135 gtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatg 181  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  15224798 gtttagctccaaattattggatgcatgataatatgttgattacgatg 15224752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 135 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 23838422 - 23838353
Alignment:
Q  135 gtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcat 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||| |||| || || ||||||||||    
T  23838422 gtttagctccaaattattggatgcatattgatatgatgattacgacgttttgttgat-agagtccatgcat 23838353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 48 - 120
Target Start/End: Original strand, 7901186 - 7901260
Alignment:
Q  48 tgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgct--ttc-gttatttaactaagtgcat 120  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||  | | |||||||||||||||||||    
T  7901186 tgctattgatataatgatatcatcatg-ttatgtgacttgattatgctgctgctgctgttatttaactaagtgcat 7901260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 135 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 14685159 - 14685111
Alignment:
Q  135 gtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgtt 183  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  14685159 gtttagctccaaattattggatgcatattaatatgatgattacgatgtt 14685111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 135 - 217
Target Start/End: Original strand, 15322211 - 15322293
Alignment:
Q  135 gtttagctccaaattattggatgcatgttga-tatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatctcattg 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| |||| | ||  |||| ||||||||||||||| ||||||    
T  15322211 gtttagctccaaattattggatgcatgttgattacgatgattacg-tgttttattgttaagagtccatgcatagcatatcattg 15322293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 158 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 40453899 - 40453840
Alignment:
Q  158 catgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatctcattg 217  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||  |||| ||||||||||||||| ||||||    
T  40453899 catgttgatatgttgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattg 40453840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 48 - 120
Target Start/End: Original strand, 9272120 - 9272191
Alignment:
Q  48 tgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaactaagtgcat 120  Q
    ||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||  |||||||||   ||| |||||||||||||||    
T  9272120 tgctattgatataatgaaatcatcctg-ttatgtgacttgactatgctgctgctgttgtttaactaagtgcat 9272191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 171 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 8384779 - 8384733
Alignment:
Q  171 tgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatctcattg 217  Q
    |||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  8384779 tgattatgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattg 8384733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 171 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 8391434 - 8391388
Alignment:
Q  171 tgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatctcattg 217  Q
    |||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  8391434 tgattatgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattg 8391388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 171 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 14073775 - 14073729
Alignment:
Q  171 tgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatctcattg 217  Q
    |||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  14073775 tgattatgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattg 14073729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 171 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 15256553 - 15256507
Alignment:
Q  171 tgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatctcattg 217  Q
    |||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  15256553 tgattatgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattg 15256507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 171 - 217
Target Start/End: Original strand, 17090139 - 17090185
Alignment:
Q  171 tgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatctcattg 217  Q
    |||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  17090139 tgattatgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattg 17090185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 171 - 217
Target Start/End: Original strand, 29041060 - 29041106
Alignment:
Q  171 tgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatctcattg 217  Q
    |||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  29041060 tgattatgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattg 29041106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 139 - 176
Target Start/End: Original strand, 11250681 - 11250718
Alignment:
Q  139 agctccaaattattggatgcatgttgatatgttgatta 176  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  11250681 agctccaaattattggatgcatattgagatgttgatta 11250718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 139 - 176
Target Start/End: Original strand, 15353428 - 15353465
Alignment:
Q  139 agctccaaattattggatgcatgttgatatgttgatta 176  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  15353428 agctccaaattattggatgcatattgagatgttgatta 15353465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 139 - 176
Target Start/End: Original strand, 16351972 - 16352009
Alignment:
Q  139 agctccaaattattggatgcatgttgatatgttgatta 176  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  16351972 agctccaaattattggatgcatattgagatgttgatta 16352009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 52 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 35614024 - 35613952
Alignment:
Q  52 attgatataatgatatcatcttgat--tatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaactaagtgcataa 122  Q
    |||||||||||||||||||| || |  | |||||||||  |||||||||   |||||||||||||||||||||    
T  35614024 attgatataatgatatcatcctgttgttgtgtgacttgactatgctgctgatgttatttaactaagtgcataa 35613952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 143; Significance: 3e-75; HSPs: 101)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 43 - 217
Target Start/End: Original strand, 53380362 - 53380535
Alignment:
Q  43 ttatgtgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaactaagtgcataagtatatgataaagtttagct 142  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53380362 ttatgtgcttttgatataatgatatcatcttg-ttatgtgacctgtttatgctgcttccgttatttaactaagtgcataagtatatgataaagtttagct 53380460  T
Q  143 ccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatctcattg 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  53380461 ccaaattattggatgcatgttgataagttgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattg 53380535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 43 - 217
Target Start/End: Original strand, 53387014 - 53387187
Alignment:
Q  43 ttatgtgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaactaagtgcataagtatatgataaagtttagct 142  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53387014 ttatgtgcttttgatataatgatatcatcttg-ttatgtgacctgtttatgctgcttccgttatttaactaagtgcataagtatatgataaagtttagct 53387112  T
Q  143 ccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatctcattg 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  53387113 ccaaattattggatgcatgttgataagttgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattg 53387187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 14 - 217
Target Start/End: Original strand, 10846267 - 10846468
Alignment:
Q  14 agatatgaaggtttgataaagatgcaattttatgtgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaacta 113  Q
    ||||||||||  ||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10846267 agatatgaagaattgataatgatacaattt-atgtgctattgatataatgatatcatcttg-ttatgtgacctgtttatgctgctttcgttatttaacta 10846364  T
Q  114 agtgcataagtatatgataaagtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatctc 213  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10846365 agtgcataagtatatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatattgataagtttattacaatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctc 10846464  T
Q  214 attg 217  Q
    ||||    
T  10846465 attg 10846468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 14 - 217
Target Start/End: Original strand, 20057388 - 20057589
Alignment:
Q  14 agatatgaaggtttgataaagatgcaattttatgtgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaacta 113  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20057388 agatatgaaggtttgataataatgcaattt-atgtgctattgatataatgatatcatcttgat-atgtgacttgtttatgctgcttccgttatttaacta 20057485  T
Q  114 agtgcataagtatatgataaagtttagctccaaattattggatgcatgttga-tatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatct 212  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  20057486 agtgcatatgtatatgataaggtttagctccaaattattggatgcatgttgattacgatgattacg-tgttttgttcataagtgtccatgcatagcatat 20057584  T
Q  213 cattg 217  Q
    |||||    
T  20057585 cattg 20057589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 14 - 217
Target Start/End: Original strand, 20064026 - 20064227
Alignment:
Q  14 agatatgaaggtttgataaagatgcaattttatgtgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaacta 113  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20064026 agatatgaaggtttgataataatgcaattt-atgtgctattgatataatgatatcatcttgat-atgtgacttgtttatgctgcttccgttatttaacta 20064123  T
Q  114 agtgcataagtatatgataaagtttagctccaaattattggatgcatgttga-tatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatct 212  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  20064124 agtgcatatgtatatgataaggtttagctccaaattattggatgcatgttgattacgatgattacg-tgttttgttcataagtgtccatgcatagcatat 20064222  T
Q  213 cattg 217  Q
    |||||    
T  20064223 cattg 20064227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 43 - 217
Target Start/End: Original strand, 5106896 - 5107068
Alignment:
Q  43 ttatgtgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaactaagtgcataagtatatgataaagtttagct 142  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  5106896 ttatgtgct-ttgatataatgatatcatcttg-ttatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaactaagtgcatatgtatatgatgaagtttagct 5106993  T
Q  143 ccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatctcattg 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  5106994 ccaaattattggatgcatgttgataagttgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattg 5107068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 14 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 3690741 - 3690540
Alignment:
Q  14 agatatgaaggtttgataaagatgcaattttatgtgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaacta 113  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3690741 agatatgaaggtttgataaaaatgcaattt-atgtgctattgatataatgatatcatcttgat-atgagatttgtttatgctgcttccgttatttaacta 3690644  T
Q  114 agtgcataagtatatgataaagtttagctccaaattattggatgcatgttga-tatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatct 212  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  3690643 agtgcatatgtatatgataaggtttagctccaaattattggatgcatgttgattacgatgattacg-tgttttgttcataagtgtccatgcatagcatat 3690545  T
Q  213 cattg 217  Q
    |||||    
T  3690544 cattg 3690540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 42 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 5221499 - 5221326
Alignment:
Q  42 tttatgtgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaactaagtgcataagtatatgataaagtttagc 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |    
T  5221499 tttatgtgctattgatataatgatatcatcttg-ttatgtgacttgtttatgctgcttccgttatttaactaagtgcataagtatatgatgaagttaa-c 5221402  T
Q  142 tccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatctcattg 217  Q
    ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5221401 tccaaattattggacacatgttgttatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccatgcatagcatctcattg 5221326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 14 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 13250841 - 13250640
Alignment:
Q  14 agatatgaaggtttgataaagatgcaattttatgtgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaacta 113  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  13250841 agatatgaaggtttgataataatgcaattt-atgtgctattgatataataatatcatcttgat-atgtgacttgtttatgctgcttccgttgtttaacta 13250744  T
Q  114 agtgcataagtatatgataaagtttagctccaaattattggatgcatgttga-tatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatct 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||| ||||  |||| ||||||||||||||| |    
T  13250743 agtgcataagtatatgataaagtttagctccaaattattggatgcatgttgattacgttgattacg-tgttttgttgttaagagtccatgcatagcatat 13250645  T
Q  213 cattg 217  Q
    |||||    
T  13250644 cattg 13250640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 14 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 13257487 - 13257286
Alignment:
Q  14 agatatgaaggtttgataaagatgcaattttatgtgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaacta 113  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  13257487 agatatgaaggtttgataataatgcaattt-atgtgctattgatataataatatcatcttgat-atgtgacttgtttatgctgcttccgttgtttaacta 13257390  T
Q  114 agtgcataagtatatgataaagtttagctccaaattattggatgcatgttga-tatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatct 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||| ||||  |||| ||||||||||||||| |    
T  13257389 agtgcataagtatatgataaagtttagctccaaattattggatgcatgttgattacgttgattacg-tgttttgttgttaagagtccatgcatagcatat 13257291  T
Q  213 cattg 217  Q
    |||||    
T  13257290 cattg 13257286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 53 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 6598803 - 6598640
Alignment:
Q  53 ttgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaactaagtgcataagtatatgataaagtttagctccaaattatt 152  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6598803 ttgatataatgatatcatcttg-ttatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaactaagtgcataagtatatgataaagtttagctccaaattatt 6598705  T
Q  153 ggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatctcattg 217  Q
    ||||||||||||||| || ||||||| ||||  ||||||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  6598704 ggatgcatgttgataagtcgattacgttgtttcgttcatgtgtgtccatgcatagcatatcattg 6598640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 53 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 6605483 - 6605320
Alignment:
Q  53 ttgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaactaagtgcataagtatatgataaagtttagctccaaattatt 152  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6605483 ttgatataatgatatcatcttg-ttatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaactaagtgcataagtatatgataaagtttagctccaaattatt 6605385  T
Q  153 ggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatctcattg 217  Q
    ||||||||||||||| || ||||||| ||||  ||||||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  6605384 ggatgcatgttgataagtcgattacgttgtttcgttcatgtgtgtccatgcatagcatatcattg 6605320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 14 - 217
Target Start/End: Original strand, 14673184 - 14673385
Alignment:
Q  14 agatatgaaggtttgataaagatgcaattttatgtgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaacta 113  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  14673184 agatatgaaggtttgataataatgcaattt-atgtgctattgatataataatatcatcttgat-atgtgacttgtttatgctgcttccgttgtttaacta 14673281  T
Q  114 agtgcataagtatatgataaagtttagctccaaattattggatgcatgttga-tatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatct 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||| ||||  |||| |||||| |||||||| |    
T  14673282 agtgcataagtatatgataaagtttagctccaaattattggatgcatgttgattacgttgattacg-tgttttgttgttaagagtccatacatagcatat 14673380  T
Q  213 cattg 217  Q
    |||||    
T  14673381 cattg 14673385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 53 - 217
Target Start/End: Original strand, 31422574 - 31422737
Alignment:
Q  53 ttgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaactaagtgcataagtatatgataaagtttagctccaaattatt 152  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  31422574 ttgatataatgatatcatcttg-ttatgtgacctgtttatgctgcttccgttatttaactaagtgcataattatatgatgaagtttagctccaaattatt 31422672  T
Q  153 ggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatctcattg 217  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  31422673 ggatgcatgttgataagttgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattg 31422737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 53 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 37615477 - 37615314
Alignment:
Q  53 ttgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaactaagtgcataagtatatgataaagtttagctccaaattatt 152  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  37615477 ttgatataatgatatcatcttg-ttatgtgacctgtttatgctgcttccgttatttaactaagtgcataattatatgatgaagtttagctccaaattatt 37615379  T
Q  153 ggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatctcattg 217  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  37615378 ggatgcatgttgataagttgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattg 37615314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 42 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 26889550 - 26889377
Alignment:
Q  42 tttatgtgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaactaagtgcataagtatatgataaagtttagc 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  26889550 tttatgtgctattgatataatgatatcatcttg-ttatgtgacctgcttatgctgcttccgttatttaactaagtgcataattatatgatgaagtttagc 26889452  T
Q  142 tccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatctcattg 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  26889451 tccaaattattggatgcatgttgataag-tgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattg 26889377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 20 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 418116 - 417921
Alignment:
Q  20 gaaggtttgataaagatgcaattttatgtgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaactaagtgca 119  Q
    |||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  418116 gaaggtttgataataatgcaattt-atgtgctattgatataataatatcatcttgat-atgtgacttgtttatgctgcttccgttgtttaactaagtgca 418019  T
Q  120 taagtatatgataaagtttagctccaaattattggatgcatgttga-tatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatctcattg 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||| ||||  |||| ||||||||||||||| ||||||    
T  418018 taagtatatgataaagtttagctccaaattattggatgcatgttgattacgttgattacg-tgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattg 417921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 43 - 217
Target Start/End: Original strand, 16747851 - 16748023
Alignment:
Q  43 ttatgtgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaactaagtgcataagtatatgataaagtttagct 142  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16747851 ttatgtgct-ttgatataatgatatcatcttg-ttatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaactaagtgcataagtatatgatgaagtttagct 16747948  T
Q  143 ccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatctcattg 217  Q
    | ||||||||||||||||||||||| || ||||| | |||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  16747949 ctaaattattggatgcatgttgataagtcgattaggctgttttgttcatacgtgtccatgcatagcatatcattg 16748023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 43 - 217
Target Start/End: Original strand, 16758583 - 16758755
Alignment:
Q  43 ttatgtgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaactaagtgcataagtatatgataaagtttagct 142  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16758583 ttatgtgct-ttgatataatgatatcatcttg-ttatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaactaagtgcataagtatatgatgaagtttagct 16758680  T
Q  143 ccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatctcattg 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||| | |||| |||||||| |||| |||||||||||| ||||||    
T  16758681 ccaaattattggatgcatgttgataagtcgattaggttgttttgttcatacgtgttcatgcatagcatatcattg 16758755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 42 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 10003732 - 10003564
Alignment:
Q  42 tttatgtgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaactaagtgcataagtatatgataaagtttagc 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10003732 tttatgtgctattgatataatgatatcattttgtttatgtgatctgtttatgctgcttccgttgtttaactaagtgcataagtatatgatgaagtttagc 10003633  T
Q  142 tccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcat 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  10003632 tccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgttgttttgttcatatgtgtccatgcatagcat 10003564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 42 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 10010379 - 10010211
Alignment:
Q  42 tttatgtgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaactaagtgcataagtatatgataaagtttagc 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10010379 tttatgtgctattgatataatgatatcattttgtttatgtgatctgtttatgctgcttccgttgtttaactaagtgcataagtatatgatgaagtttagc 10010280  T
Q  142 tccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcat 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  10010279 tccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgttgttttgttcatatgtgtccatgcatagcat 10010211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 42 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 10904322 - 10904154
Alignment:
Q  42 tttatgtgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaactaagtgcataagtatatgataaagtttagc 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10904322 tttatgtgctattgatataatgatatcattttgtttatgtgatctgtttatgctgcttccgttgtttaactaagtgcataagtatatgatgaagtttagc 10904223  T
Q  142 tccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcat 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  10904222 tccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgttgttttgttcatatgtgtccatgcatagcat 10904154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 42 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 10910994 - 10910826
Alignment:
Q  42 tttatgtgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaactaagtgcataagtatatgataaagtttagc 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10910994 tttatgtgctattgatataatgatatcattttgtttatgtgatctgtttatgctgcttccgttgtttaactaagtgcataagtatatgatgaagtttagc 10910895  T
Q  142 tccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcat 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  10910894 tccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgttgttttgttcatatgtgtccatgcatagcat 10910826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 53 - 216
Target Start/End: Original strand, 16489691 - 16489853
Alignment:
Q  53 ttgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaactaagtgcataagtatatgataaagtttagctccaaattatt 152  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||    
T  16489691 ttgatataatgatatcattttgtttatgtgacctgtttatgctgcttccgttatttaactaagtgcataagtttatgatgaagtt-agctccaaattatt 16489789  T
Q  153 ggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatctcatt 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16489790 ggatgcatgttgatatgttgattacgatgtttttgtcataagtgtccatgcatagcatctcatt 16489853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 43 - 217
Target Start/End: Original strand, 16624067 - 16624239
Alignment:
Q  43 ttatgtgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaactaagtgcataagtatatgataaagtttagct 142  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16624067 ttatgtgct-ttgatataatgatatcatcttg-ttatgtgacctgtttatgctgcttccgttatttaactaagtgcataagtatatgatgaagtttagct 16624164  T
Q  143 ccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatctcattg 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||| |||||||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  16624165 ccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgttgttttgttcatgtgtgtccatgcatagcatatcattg 16624239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 43 - 217
Target Start/End: Original strand, 26794407 - 26794579
Alignment:
Q  43 ttatgtgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaactaagtgcataagtatatgataaagtttagct 142  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  26794407 ttatgtgct-ttgatataatgatatcatcttg-ttatgtgaccggtttatgctgcttccgttatttaactaagtgcataattatatgatgaagtttagct 26794504  T
Q  143 ccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatctcattg 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  26794505 ccaaattattggatgcatgttgataagttgattacgatgttttgttcatttgtgtccatgcatagcatatcattg 26794579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 53 - 217
Target Start/End: Original strand, 10153756 - 10153919
Alignment:
Q  53 ttgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaactaagtgcataagtatatgataaagtttagctccaaattatt 152  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  10153756 ttgatataatgatatcatcttg-ttatgtgacttgtttacgctgcttttgttatttaactaagtgcataagtataagatgaagtttagctccaaattatt 10153854  T
Q  153 ggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatctcattg 217  Q
    ||||||||||||||| || ||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  10153855 ggatgcatgttgataagtcgattacgttgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattg 10153919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 43 - 210
Target Start/End: Original strand, 26788817 - 26788982
Alignment:
Q  43 ttatgtgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaactaagtgcataagtatatgataaagtttagct 142  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  26788817 ttatgtgct-ttgatataatgatatcatcttg-ttatgtgaccggtttatgctgcttctgttatttaactaagtgcataattatatgatgaagtttagct 26788914  T
Q  143 ccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcat 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  26788915 ccaaattattggatgcatgttgataagttgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcat 26788982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 48 - 217
Target Start/End: Original strand, 23704782 - 23704951
Alignment:
Q  48 tgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaactaagtgcataag-tatatgataaagtttagctccaa 146  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||    
T  23704782 tgctgttgatataatgatatcatcttg-ttatgtgacttgtttatgctgcttccgttatttaactaagtgcatatggtatatgatgaagtttagctccaa 23704880  T
Q  147 attattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatctcattg 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||  |||| ||||||||||||||| ||||||    
T  23704881 attattggatgcatgttgatatgttgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattg 23704951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 48 - 217
Target Start/End: Original strand, 23723238 - 23723407
Alignment:
Q  48 tgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaactaagtgcataag-tatatgataaagtttagctccaa 146  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||    
T  23723238 tgctgttgatataatgatatcatcttg-ttatgtgacttgtttatgctgcttccgttatttaactaagtgcatatggtatatgatgaagtttagctccaa 23723336  T
Q  147 attattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatctcattg 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||  |||| ||||||||||||||| ||||||    
T  23723337 attattggatgcatgttgatatgttgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattg 23723407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 48 - 217
Target Start/End: Original strand, 23741694 - 23741863
Alignment:
Q  48 tgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaactaagtgcataag-tatatgataaagtttagctccaa 146  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||    
T  23741694 tgctgttgatataatgatatcatcttg-ttatgtgacttgtttatgctgcttccgttatttaactaagtgcatatggtatatgatgaagtttagctccaa 23741792  T
Q  147 attattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatctcattg 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||  |||| ||||||||||||||| ||||||    
T  23741793 attattggatgcatgttgatatgttgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattg 23741863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 48 - 217
Target Start/End: Original strand, 41201812 - 41201981
Alignment:
Q  48 tgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaactaagtgcataag-tatatgataaagtttagctccaa 146  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||    
T  41201812 tgctgttgatataatgatatcatcttg-ttatgtgacttgtttatgctgcttccgttatttaactaagtgcatatggtatatgatgaagtttagctccaa 41201910  T
Q  147 attattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatctcattg 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||  |||| ||||||||||||||| ||||||    
T  41201911 attattggatgcatgttgatatgttgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattg 41201981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 48 - 217
Target Start/End: Original strand, 15692292 - 15692461
Alignment:
Q  48 tgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaactaagtgcataag-tatatgataaagtttagctccaa 146  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||    
T  15692292 tgctgttgatataatgatatcatcttg-ttatgtgacttgtttatgctgcttccgttatttaactaagtgcatatggtatatgatgaagtttagctccaa 15692390  T
Q  147 attattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatctcattg 217  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||| ||||  |||| ||||||||||||||| ||||||    
T  15692391 attattgtatgcatgttgacatgttgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattg 15692461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 53 - 217
Target Start/End: Original strand, 15726951 - 15727115
Alignment:
Q  53 ttgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaactaagtgcataag-tatatgataaagtttagctccaaattat 151  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||    
T  15726951 ttgatataatgatatcatcttg-ttatgtgacttgtttatgctgcttccgttatttaactaagtgcatatggtatatgatgaagtttagctccaaattat 15727049  T
Q  152 tggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatctcattg 217  Q
    || ||||||||||| |||||||||||| |||| ||||  |||| ||||||||||||||| ||||||    
T  15727050 tgtatgcatgttgacatgttgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattg 15727115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 45 - 217
Target Start/End: Original strand, 22643330 - 22643515
Alignment:
Q  45 atgtgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaactaagtgcata---------agtat------atg 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||         |||||      |||    
T  22643330 atgtgctattgatataatgatatcatcctg-ttatgtgatttgtttatgctgcttctgttatttaactaagtgcatattgtatatgagtatgatgaaatg 22643428  T
Q  130 ataaagtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatctcattg 217  Q
    || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  22643429 atgaagtt-agctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcatacgagtccatgcatagcatctcattg 22643515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 45 - 217
Target Start/End: Original strand, 10236408 - 10236592
Alignment:
Q  45 atgtgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaactaagtgcat-----aagtatatgataaa----- 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||     |  |||||||| ||         
T  10236408 atgtgctattgatataatgatatcatcctg-ttatgtgacttgtttatgctgctgctgttatttaactaagtgcatggtgtatttatatgatgaactgat 10236506  T
Q  135 ---gtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatctcattg 217  Q
       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  10236507 gacgtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacggtgatttgttcataagagtccatgcatagcatttcattg 10236592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 45 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 15825755 - 15825571
Alignment:
Q  45 atgtgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaactaagtgcataag-----tatatgataaa----- 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||       |||||||| ||         
T  15825755 atgtgctattgatataatgatatcatcctg-ttatgtgacttgtttatgctgctgctgttatttaactaagtgcatagtgtatttatatgatgaaatgat 15825657  T
Q  135 ---gtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatctcattg 217  Q
       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  15825656 gacgtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacggtgatttgttcataagagtccatgcatagcatttcattg 15825571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 45 - 217
Target Start/End: Original strand, 15992117 - 15992301
Alignment:
Q  45 atgtgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaactaagtgcataag-----tatatgataaa----- 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||       |||||||| ||         
T  15992117 atgtgctattgatataatgatatcatcctg-ttatgtgacttgtttatgctgctgctgttatttaactaagtgcatagtgtatttatatgatgaactgat 15992215  T
Q  135 ---gtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatctcattg 217  Q
       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  15992216 gacgtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacggtgatttgttcataagagtccatgcatagcatttcattg 15992301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 48 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 19809116 - 19808933
Alignment:
Q  48 tgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaactaagtgcata---------agtat------atgata 132  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||   |||||| |||||||||||||         |||||      ||||||    
T  19809116 tgctattgatataatgatatcatcatg-ttatgtgacttgattatgctgctgctgttattgaactaagtgcatattgtatatgagtatgatgaaatgata 19809018  T
Q  133 aagtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatctcattg 217  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  19809017 aagtttagctccaaattattgaatgcatgttgatatgtcgattacgatgttttgttcataagagtccatgcatagcatttcattg 19808933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 45 - 217
Target Start/End: Original strand, 1145564 - 1145752
Alignment:
Q  45 atgtgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaactaagtgcat---aagtat--------------a 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||   | ||||              |    
T  1145564 atgtgctattgatataatgatatcatcctg-ttatgtgacttgattatgctgctgctgttatttaactaagtgcattgtatgtatttatatatgatgaaa 1145662  T
Q  128 tgataaagtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatctcattg 217  Q
    |||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1145663 tgatgacgtttagctccaaattgttggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagagtccatgcatagcatctcattg 1145752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 45 - 217
Target Start/End: Original strand, 8721168 - 8721356
Alignment:
Q  45 atgtgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaactaagtgcat---aagtat--------------a 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||   | ||||              |    
T  8721168 atgtgctattgatataatgatatcatcctg-ttatgtgacttgattatgctgctgctgttatttaactaagtgcattgtatgtatttatatatgatgaaa 8721266  T
Q  128 tgataaagtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatctcattg 217  Q
    |||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8721267 tgatgacgtttagctccaaattgttggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagagtccatgcatagcatctcattg 8721356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 45 - 217
Target Start/End: Original strand, 9073055 - 9073243
Alignment:
Q  45 atgtgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaactaagtgcat---aagtat--------------a 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||   | ||||              |    
T  9073055 atgtgctattgatataatgatatcatcctg-ttatgtgacttgattatgctgctgctgttatttaactaagtgcattgtatgtatttatatatgatgaaa 9073153  T
Q  128 tgataaagtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatctcattg 217  Q
    |||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9073154 tgatgacgtttagctccaaattgttggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagagtccatgcatagcatctcattg 9073243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 45 - 217
Target Start/End: Original strand, 15343617 - 15343805
Alignment:
Q  45 atgtgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaactaagtgcat---aagtat--------------a 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||   | ||||              |    
T  15343617 atgtgctattgatataatgatatcatcctg-ttatgtgacttgattatgctgctgctgttatttaactaagtgcattgtatgtatttatatatgatgaaa 15343715  T
Q  128 tgataaagtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatctcattg 217  Q
    |||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15343716 tgatgacgtttagctccaaattgttggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagagtccatgcatagcatctcattg 15343805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 45 - 217
Target Start/End: Original strand, 410763 - 410951
Alignment:
Q  45 atgtgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaactaagtgcat---aagtat--------------a 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||   | ||||              |    
T  410763 atgtgctattgatataatgatatcatcctg-ttatgtgacttgattatgctgctgctgttatttaactaagtgcattgtatgtatttatatatgatgaaa 410861  T
Q  128 tgataaagtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatctcattg 217  Q
    |||| | |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  410862 tgatgacgtttagctccaagttgttggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagagtccatgcatagcatctcattg 410951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 45 - 217
Target Start/End: Original strand, 15350261 - 15350449
Alignment:
Q  45 atgtgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaactaagtgcat---aagtat--------------a 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||   | ||||              |    
T  15350261 atgtgctattgatataatgatatcatcctg-ttatgtgacttgattatgctgctgctgttatttaactaagtgcattgtatgtatttatatatgatgaaa 15350359  T
Q  128 tgataaagtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatctcattg 217  Q
    |||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15350360 tgatgacgtttagctccaaattgttggatgcatgttgatatgttgattacgatgtttttttcataagagtccatgcatagcatctcattg 15350449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 135 - 217
Target Start/End: Original strand, 13316302 - 13316384
Alignment:
Q  135 gtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatctcattg 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  13316302 gtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagagtccatgcatagcatttcattg 13316384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 45 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 15360784 - 15360596
Alignment:
Q  45 atgtgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaactaagtgcataag---------tatatgataaa- 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||            |||||||| ||     
T  15360784 atgtgctattgatataatgatatcatcctg-ttatgtgacttgattatgctgctgctgttatttaactaagtgcattgtatatatttatatatgatgaaa 15360686  T
Q  135 -------gtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatctcattg 217  Q
           ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15360685 tgatgacgtttagctccaaattgttggatgcatgtcgatatgttgattacgatgttttgttcataagagtccatgcatagcatctcattg 15360596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 45 - 217
Target Start/End: Original strand, 15397916 - 15398104
Alignment:
Q  45 atgtgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaactaagtgcataag---------tatatgataaa- 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||            |||||||| ||     
T  15397916 atgtgctattgatataatgatatcatcctg-ttatgtgacttgattatgctgctgctgttatttaactaagtgcattgtatatatttatatatgatgaaa 15398014  T
Q  135 -------gtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatctcattg 217  Q
           ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15398015 tgatgacgtttagctccaaattgttggatgcatgtcgatatgttgattacgatgttttgttcataagagtccatgcatagcatctcattg 15398104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 45 - 217
Target Start/End: Original strand, 15404507 - 15404695
Alignment:
Q  45 atgtgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaactaagtgcataag---------tatatgataaa- 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||            |||||||| ||     
T  15404507 atgtgctattgatataatgatatcatcctg-ttatgtgacttgattatgctgctgctgttatttaactaagtgcattgtatatatttatatatgatgaaa 15404605  T
Q  135 -------gtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatctcattg 217  Q
           ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15404606 tgatgacgtttagctccaaatttttggatgcatgtcgatatgttgattacgatgttttgttcataagagtccatgcatagcatctcattg 15404695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 135 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 4710288 - 4710206
Alignment:
Q  135 gtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatctcattg 217  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  4710288 gtttagctccaaattgttggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagagtccatgcatagcatttcattg 4710206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 136 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 15337419 - 15337338
Alignment:
Q  136 tttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatctcattg 217  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15337419 tttagctccaaattgttggatgcatgtcgatatgttgattacgatgttttgttcataagagtccatgcatagcatctcattg 15337338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 135 - 217
Target Start/End: Original strand, 15367048 - 15367130
Alignment:
Q  135 gtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatctcattg 217  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15367048 gtttagctccaaattgtaggatgcatgttgatatgttgattacgattttttgttcataagagtccatgcatagcatctcattg 15367130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 135 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 12891392 - 12891322
Alignment:
Q  135 gtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcat 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||| ||||||||||    
T  12891392 gtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacggtgatttgttcataagagtccatgcat 12891322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 135 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 13320962 - 13320892
Alignment:
Q  135 gtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcat 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||| ||||||||||    
T  13320962 gtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacggtgatttgttcataagagtccatgcat 13320892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 135 - 205
Target Start/End: Original strand, 17253176 - 17253246
Alignment:
Q  135 gtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcat 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||| ||||||||||    
T  17253176 gtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacggtgatttgttcataagagtccatgcat 17253246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 136 - 210
Target Start/End: Original strand, 17710710 - 17710784
Alignment:
Q  136 tttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcat 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| | |||||||||||||||    
T  17710710 tttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacggtgatttgttcatatgagtccatgcatagcat 17710784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 135 - 217
Target Start/End: Original strand, 30777343 - 30777426
Alignment:
Q  135 gtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttg-attacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatctcattg 217  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||| ||||||    
T  30777343 gtttagctccaagttgttggatgcatgttgatatgttgaattacgatgttttgttcatgagagtccatgcatagcatttcattg 30777426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 45 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 15337526 - 15337452
Alignment:
Q  45 atgtgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaactaagtgcat 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||| ||   |||||||||||||||||||    
T  15337526 atgtgctattgatataatgatatcatcctg-ttatgtgacttgattatgctactgctgttatttaactaagtgcat 15337452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 135 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 7109456 - 7109410
Alignment:
Q  135 gtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatg 181  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  7109456 gtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatg 7109410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 135 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 7113391 - 7113345
Alignment:
Q  135 gtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatg 181  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  7113391 gtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatg 7113345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 135 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 11069828 - 11069782
Alignment:
Q  135 gtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatg 181  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11069828 gtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatg 11069782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 135 - 181
Target Start/End: Original strand, 11165878 - 11165924
Alignment:
Q  135 gtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatg 181  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11165878 gtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatg 11165924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 135 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 20722990 - 20722921
Alignment:
Q  135 gtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcat 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||| || || ||||||||||    
T  20722990 gtttagctccaaattattggatgcatattgatatgatgattacgatgttttgttgat-agagtccatgcat 20722921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 135 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 22321424 - 22321378
Alignment:
Q  135 gtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatg 181  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22321424 gtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatg 22321378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 135 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 22336479 - 22336433
Alignment:
Q  135 gtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatg 181  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22336479 gtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatg 22336433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 135 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 24187766 - 24187697
Alignment:
Q  135 gtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcat 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||| || || ||||||||||    
T  24187766 gtttagctccaaattattggatgcatattgatatgatgattacgatgttttgttgat-agagtccatgcat 24187697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 135 - 181
Target Start/End: Original strand, 27409993 - 27410039
Alignment:
Q  135 gtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatg 181  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27409993 gtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatg 27410039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 135 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 28949482 - 28949436
Alignment:
Q  135 gtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatg 181  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  28949482 gtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatg 28949436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 135 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 30065708 - 30065662
Alignment:
Q  135 gtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatg 181  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  30065708 gtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatg 30065662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 135 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 55022625 - 55022579
Alignment:
Q  135 gtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatg 181  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  55022625 gtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatg 55022579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 135 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 55148967 - 55148898
Alignment:
Q  135 gtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcat 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||| || || ||||||||||    
T  55148967 gtttagctccaaattattggatgcatattgatatgatgattacgatgttttgttgat-agagtccatgcat 55148898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 45 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 4710391 - 4710320
Alignment:
Q  45 atgtgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaactaagtgcat 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||| ||   |||||||||||||||||||    
T  4710391 atgtgctattgatataatgatatcatcctg-ttatgtgacttgattatgctact---gttatttaactaagtgcat 4710320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 136 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 15617133 - 15617088
Alignment:
Q  136 tttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatg 181  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15617133 tttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatg 15617088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 45 - 120
Target Start/End: Original strand, 30777237 - 30777311
Alignment:
Q  45 atgtgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaactaagtgcat 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||| ||   |||||||||| ||||||||    
T  30777237 atgtgctattgatataatgatatcatcctg-ttatgtgacttgattatgcttctgctgttatttaaccaagtgcat 30777311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 135 - 217
Target Start/End: Original strand, 41092462 - 41092544
Alignment:
Q  135 gtttagctccaaattattggatgcatgttga-tatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatctcattg 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| |||| ||||  |||| ||||||||||||||| ||||||    
T  41092462 gtttagctccaaattattggatgcatgttgattacgatgattacg-tgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattg 41092544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 135 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 839236 - 839166
Alignment:
Q  135 gtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcat 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||| || | |||| ||||| ||||||||||    
T  839236 gtttagctccaaattattggatgcacattgatatgatgattacggtgatttgttgataagagtccatgcat 839166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 135 - 181
Target Start/End: Original strand, 4107748 - 4107794
Alignment:
Q  135 gtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatg 181  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  4107748 gtttagctccaaattattggatgcatgatgatatattgattacgatg 4107794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 135 - 181
Target Start/End: Original strand, 4111600 - 4111646
Alignment:
Q  135 gtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatg 181  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  4111600 gtttagctccaaattattggatgcatgatgatatattgattacgatg 4111646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 48 - 122
Target Start/End: Original strand, 5149984 - 5150057
Alignment:
Q  48 tgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaactaagtgcataa 122  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||  ||||||||||   |||||||||||||||||||||    
T  5149984 tgctattgatataatgatatcatcct-attgtgtgacttaattatgctgctgctgttatttaactaagtgcataa 5150057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 135 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 7985693 - 7985623
Alignment:
Q  135 gtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcat 205  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||   |||| ||||| ||||||||||    
T  7985693 gtttagctccaaattattgggtgcatgttgatatgatgattacggtgaattgttgataagagtccatgcat 7985623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 135 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 14499085 - 14499039
Alignment:
Q  135 gtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatg 181  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  14499085 gtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattatgatg 14499039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 52 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 16333258 - 16333089
Alignment:
Q  52 attgatataatgatatcatcttgat--tatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaactaagtgcataa-----gtatatgataaa---------g 135  Q
    |||||||||||||||||||| || |  | |||||||||  |||||||||   |||||||||||||||||||||      |||||||||||         |    
T  16333258 attgatataatgatatcatcctgttgttgtgtgacttgactatgctgctgctgttatttaactaagtgcataatgtctatatatgataaataagatgacg 16333159  T
Q  136 tttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcat 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||   |||| ||||| ||||||||||    
T  16333158 tttagctccaaattattggatgcatattgatatgatgattacggtgaattgttgataagagtccatgcat 16333089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 135 - 181
Target Start/End: Original strand, 16750691 - 16750737
Alignment:
Q  135 gtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatg 181  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  16750691 gtttagctccaaattattggatgcatgataatatgttgattacgatg 16750737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 135 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 19775351 - 19775305
Alignment:
Q  135 gtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatg 181  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  19775351 gtttagctccaaattattggatgcatgataatatgttgattacgatg 19775305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 135 - 205
Target Start/End: Original strand, 28351283 - 28351353
Alignment:
Q  135 gtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcat 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||   |||| ||||| ||||||||||    
T  28351283 gtttagctccaaattattggatgcatattgatatgatgattacggtgaattgttgataagagtccatgcat 28351353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 45 - 121
Target Start/End: Original strand, 17710605 - 17710680
Alignment:
Q  45 atgtgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaactaagtgcata 121  Q
    |||||||| | |||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  17710605 atgtgctaataatataatgatatcatcctg-ttatgtgacctgattatgctgctgctgttatttaactaagtgcata 17710680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 135 - 217
Target Start/End: Original strand, 5150084 - 5150166
Alignment:
Q  135 gtttagctccaaattattggatgcatgttga-tatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatctcattg 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |  ||||||| |||| ||||  |||| ||||||||||||||| ||||||    
T  5150084 gtttagctccaaattattggatgcatgttgattacgacgattacg-tgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattg 5150166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 45 - 120
Target Start/End: Original strand, 15366942 - 15367016
Alignment:
Q  45 atgtgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaactaagtgcat 120  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||| ||||| || |   |||||||||||||||||||    
T  15366942 atgtgctattgatttaatgatatcatcctg-ttatgtgacttgattatgatgttgctgttatttaactaagtgcat 15367016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 135 - 180
Target Start/End: Original strand, 4589296 - 4589341
Alignment:
Q  135 gtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgat 180  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||    
T  4589296 gtttagctccaaattattggatgcatattgatatgatgaatacgat 4589341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 135 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 10325838 - 10325793
Alignment:
Q  135 gtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgat 180  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||    
T  10325838 gtttagctccaaattattggatgcttattgatatgatgattacgat 10325793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 15 - 120
Target Start/End: Original strand, 13316172 - 13316275
Alignment:
Q  15 gatatgaaggtttgataaagatgcaattttatgtgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaactaa 114  Q
    |||||||||||||| | | ||||||| |  || |||||||||||||||||||| ||| || |||| ||||||| ||||||||||   ||||||| |||||    
T  13316172 gatatgaaggtttggttatgatgcaaatgaat-tgctattgatataatgatattatcctg-ttatatgacttgattatgctgctgctgttatttgactaa 13316269  T
Q  115 gtgcat 120  Q
    ||||||    
T  13316270 gtgcat 13316275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 48 - 120
Target Start/End: Original strand, 41092362 - 41092433
Alignment:
Q  48 tgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaactaagtgcat 120  Q
    ||||||||||||||||||| |||  || |||||| ||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  41092362 tgctattgatataatgatagcattctg-ttatgtaacttgattatgctgctgctgttatttaactaagtgcat 41092433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 56 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 13321053 - 13320988
Alignment:
Q  56 atataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaactaagtgcataa 122  Q
    ||||| |||||||||| || ||||||||||||  |||||||||   |||||||||||||||||||||    
T  13321053 atatattgatatcatcctg-ttatgtgacttgactatgctgctgctgttatttaactaagtgcataa 13320988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 171 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 16633797 - 16633751
Alignment:
Q  171 tgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatctcattg 217  Q
    |||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  16633797 tgattatgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattg 16633751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 171 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 16640407 - 16640361
Alignment:
Q  171 tgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatctcattg 217  Q
    |||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  16640407 tgattatgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattg 16640361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 171 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 43161072 - 43161026
Alignment:
Q  171 tgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatctcattg 217  Q
    |||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  43161072 tgattatgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattg 43161026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 171 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 43167309 - 43167263
Alignment:
Q  171 tgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatctcattg 217  Q
    |||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  43167309 tgattatgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattg 43167263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 52 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 7985792 - 7985720
Alignment:
Q  52 attgatataatgatatcatcttgat--tatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaactaagtgcataa 122  Q
    |||||||||||||||||||| || |  | |||||||||  |||||||||   |||||||||||||||||||||    
T  7985792 attgatataatgatatcatcctgttgttgtgtgacttgactatgctgctgctgttatttaactaagtgcataa 7985720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 139 - 176
Target Start/End: Original strand, 11557505 - 11557542
Alignment:
Q  139 agctccaaattattggatgcatgttgatatgttgatta 176  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  11557505 agctccaaattattggatgcatattgagatgttgatta 11557542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 139 - 176
Target Start/End: Original strand, 11595259 - 11595296
Alignment:
Q  139 agctccaaattattggatgcatgttgatatgttgatta 176  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  11595259 agctccaaattattggatgcatattgagatgttgatta 11595296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 139 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 42325938 - 42325901
Alignment:
Q  139 agctccaaattattggatgcatgttgatatgttgatta 176  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  42325938 agctccaaattattggatgcatattgagatgttgatta 42325901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 129; Significance: 6e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 14 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 57095 - 56894
Alignment:
Q  14 agatatgaaggtttgataaagatgcaattttatgtgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaacta 113  Q
    |||||||||| ||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  57095 agatatgaagatttgataataatgcaattt-atgtgctattgatataatgatatcatcttgat-atgtgacttgtttatgctgcttccgttatttaacta 56998  T
Q  114 agtgcataagtatatgataaagtttagctccaaattattggatgcatgttga-tatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatct 212  Q
    |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  56997 agtgcatatgtttatgataaggtttagctccaaattattggatgcatgttgattacgatgattacg-tgttttgttcataagtgtccatgcatagcatat 56899  T
Q  213 cattg 217  Q
    |||||    
T  56898 cattg 56894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 129; Significance: 6e-67; HSPs: 37)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 14 - 217
Target Start/End: Original strand, 51328663 - 51328864
Alignment:
Q  14 agatatgaaggtttgataaagatgcaattttatgtgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaacta 113  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  51328663 agatatgaaggtttgataataatgcaattt-atgtgctattgatataataatatcatcttgat-atgtgacttgtttatgctgcttccgttgtttaacta 51328760  T
Q  114 agtgcataagtatatgataaagtttagctccaaattattggatgcatgttga-tatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatct 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||| ||||  |||| ||||||||||||||| |    
T  51328761 agtgcataagtatatgataaagtttagctccaaattattggatgcatgttgattacgttgattacg-tgttttgttgttaagagtccatgcatagcatat 51328859  T
Q  213 cattg 217  Q
    |||||    
T  51328860 cattg 51328864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 14 - 217
Target Start/End: Original strand, 51335297 - 51335498
Alignment:
Q  14 agatatgaaggtttgataaagatgcaattttatgtgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaacta 113  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  51335297 agatatgaaggtttgataataatgcaattt-atgtgctattgatataataatatcatcttgat-atgtgacttgtttatgctgcttccgttgtttaacta 51335394  T
Q  114 agtgcataagtatatgataaagtttagctccaaattattggatgcatgttga-tatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatct 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||| ||||  |||| ||||||||||||||| |    
T  51335395 agtgcataagtatatgataaagtttagctccaaattattggatgcatgttgattacgttgattacg-tgttttgttgttaagagtccatgcatagcatat 51335493  T
Q  213 cattg 217  Q
    |||||    
T  51335494 cattg 51335498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 14 - 217
Target Start/End: Original strand, 16345759 - 16345960
Alignment:
Q  14 agatatgaaggtttgataaagatgcaattttatgtgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaacta 113  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| || ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16345759 agatatgaaggtttgataataatgcaattt-atgtgctattgatataaagatatcatcttgat-atgagatttgtttatgctgcttccgttatttaacta 16345856  T
Q  114 agtgcataagtatatgataaagtttagctccaaattattggatgcatgttga-tatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatct 212  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  16345857 agtgcatatgtatatgataaggtttagctccaaattattggatgcatgttgattacgatgattacg-tgttttgttcataagtgtccatgcatagcatat 16345955  T
Q  213 cattg 217  Q
    |||||    
T  16345956 cattg 16345960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 14 - 217
Target Start/End: Original strand, 16352407 - 16352608
Alignment:
Q  14 agatatgaaggtttgataaagatgcaattttatgtgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaacta 113  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| || ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16352407 agatatgaaggtttgataataatgcaattt-atgtgctattgatataaagatatcatcttgat-atgagatttgtttatgctgcttccgttatttaacta 16352504  T
Q  114 agtgcataagtatatgataaagtttagctccaaattattggatgcatgttga-tatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatct 212  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  16352505 agtgcatatgtatatgataaggtttagctccaaattattggatgcatgttgattacgatgattacg-tgttttgttcataagtgtccatgcatagcatat 16352603  T
Q  213 cattg 217  Q
    |||||    
T  16352604 cattg 16352608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 26 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 47659324 - 47659141
Alignment:
Q  26 ttgataaagatgcaattttatgtgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaactaagtgcataagta 125  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  47659324 ttgataatgatgcaattt-atgtgctattgatataatgatatcattttgtttatgtgatctgtttatgctgcttccgttgtttaactaagtgcataagta 47659226  T
Q  126 tatgataaagtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcat 210  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  47659225 tatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgttgttttgttcatatgtgtccatgcatagcat 47659141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 42 - 217
Target Start/End: Original strand, 44844895 - 44845069
Alignment:
Q  42 tttatgtgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaactaagtgcataagtatatgataaagtttagc 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  44844895 tttatgtgctattgatataatgatatcatcttgat-atgtgacttgtttatgctgcttccgttgtttaactaagtgcataagtctatgatgaagtttagc 44844993  T
Q  142 tccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatctcattg 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||| |||||||| |||||| |||||||||| ||||||    
T  44844994 tccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgttgttttgttcatatgtgtccgtgcatagcatatcattg 44845069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 49 - 217
Target Start/End: Original strand, 18600123 - 18600291
Alignment:
Q  49 gctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaactaagtgcataagtatatgataaagtttagctccaaat 148  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||    
T  18600123 gctattgatataatgatatcattttgtttatgtgatctgtttatgctgcttccgttatttaactaagtgcataagtttatgatgaag-ttagctccaaat 18600221  T
Q  149 tattggatgcatgttgatatgttgattacgatg-ttctgttcataagtgtccatgcatagcatctcattg 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18600222 tattggatgcatgttgatatgttgattacgatgtttttgttcataagtgtccatgcatagcatctcattg 18600291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 49 - 217
Target Start/End: Original strand, 41478595 - 41478763
Alignment:
Q  49 gctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaactaagtgcataagtatatgataaagtttagctccaaat 148  Q
    |||||||||| |||||||||| |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||    
T  41478595 gctattgataaaatgatatcaccttgtttatgtgatctgtttatgctgctttcgttatttaactaagtgcataagtttatgatgaag-ttagctccaaat 41478693  T
Q  149 tattggatgcatgttgatatgttgattacgatg-ttctgttcataagtgtccatgcatagcatctcattg 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41478694 tattggatgcatgttgatatgttgattacgatgtttttgttcataagtgtccatgcatagcatctcattg 41478763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 14 - 217
Target Start/End: Original strand, 41348836 - 41349037
Alignment:
Q  14 agatatgaaggtttgataaagatgcaattttatgtgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaacta 113  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  41348836 agatatgaaggtttgataataatgcaattt-atgtgctaatgatataatgatatcatcttgctg-tgtgacttgtttatgctgcttctgttatttaacta 41348933  T
Q  114 agtgcataagtatatgataaagtttagctccaaattattggatgcatgttga-tatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatct 212  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  41348934 agtgcatatgtatatgataaggtttagctccaaattattggatgcatgttgattacgatgattacg-tgttttgttcataagtgtccatgcatagcatat 41349032  T
Q  213 cattg 217  Q
    |||||    
T  41349033 cattg 41349037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 43 - 217
Target Start/End: Original strand, 20215941 - 20216112
Alignment:
Q  43 ttatgtgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaactaagtgcataagtatatgataaagtttagct 142  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  20215941 ttatgtgct-ttgatataatgatatcatcttg-ttatgtgacctgtttatgctgcttccgttatttaactaagtgcataattatatgatgaagtttagct 20216038  T
Q  143 ccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatctcattg 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  20216039 ccaaattattggatgcatgttgataag-tgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattg 20216112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 48 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 21844315 - 21844147
Alignment:
Q  48 tgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaactaagtgcataagtatatgataaagtttagctccaaa 147  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  21844315 tgctattggtataatgatatcatcttg-ttatgtgacttgtttatgctgcttccgttatttaactaagtgcatatgtatatgatgaagtttagctccaaa 21844217  T
Q  148 ttattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatctcattg 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||  |||| ||||||||||||||| ||||||    
T  21844216 ttattggatgcatgttgatatgttgattacggcgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattg 21844147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 14 - 217
Target Start/End: Original strand, 41356273 - 41356474
Alignment:
Q  14 agatatgaaggtttgataaagatgcaattttatgtgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaacta 113  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  41356273 agatatgaaggtttgataataatgcaattt-atgtgctaatgatataatgatatcatcttgctg-tgtgacttgtttatgctgcttctgttatttaacta 41356370  T
Q  114 agtgcataagtatatgataaagtttagctccaaattattggatgcatgttga-tatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatct 212  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| || | |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  41356371 agtgcatatgtatatgataaggtttagcttcaaattattggatgcatgttgattacgatgattacg-tgttttgttcataagtgtccatgcatagcatat 41356469  T
Q  213 cattg 217  Q
    |||||    
T  41356470 cattg 41356474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 48 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 21828802 - 21828634
Alignment:
Q  48 tgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaactaagtgcataagtatatgataaagtttagctccaaa 147  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||    
T  21828802 tgctattggtataatgatatcatcttg-ttatgtgacttgtttatgctgcttccgttatttaactaagtgcatatgtatatgatgaattttagctccaaa 21828704  T
Q  148 ttattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatctcattg 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||  |||| ||||||||||| ||| ||||||    
T  21828703 ttattggatgcatgttgatatgttgattacggcgttttgttgttaagagtccatgcataacatatcattg 21828634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 45 - 217
Target Start/End: Original strand, 33386236 - 33386424
Alignment:
Q  45 atgtgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaactaagtgcat---aagtat--------------a 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||   | ||||              |    
T  33386236 atgtgctattgatataatgatatcatcctg-ttatgtgacttgattatgctgctgctgttatttaactaagtgcattgtatgtatttatatatgatgaaa 33386334  T
Q  128 tgataaagtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatctcattg 217  Q
    |||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  33386335 tgatgacgtttagctccaaattgttggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagagtccatgcatagcatctcattg 33386424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 45 - 217
Target Start/End: Original strand, 33392881 - 33393069
Alignment:
Q  45 atgtgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaactaagtgcat---aagtat--------------a 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||   | ||||              |    
T  33392881 atgtgctattgatataatgatatcatcctg-ttatgtgacttgattatgctgctgctgttatttaactaagtgcattgtatgtatttatatatgatgaaa 33392979  T
Q  128 tgataaagtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatctcattg 217  Q
    |||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  33392980 tgatgacgtttagctccaaattgttggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagagtccatgcatagcatctcattg 33393069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 49 - 217
Target Start/End: Original strand, 21807217 - 21807401
Alignment:
Q  49 gctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaactaagtgcat---aagtat--------------atgat 131  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||   | ||||              |||||    
T  21807217 gctattgatataatgatatcatcctg-ttatgtgacttgattatgctgctgctgttatttaactaagtgcattgtatgtatttatatatgatgaaatgat 21807315  T
Q  132 aaagtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatctcattg 217  Q
     | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21807316 gatgtttagctccaaattgttggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagagtccatgcatagcatctcattg 21807401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 49 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 21835455 - 21835271
Alignment:
Q  49 gctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaactaagtgcat---aagtat--------------atgat 131  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||   | ||||              |||||    
T  21835455 gctattgatataatgatatcatcctg-ttatgtgacttgattatgctgctgctgttatttaactaagtgcattgtatgtatttatatatgatgaaatgat 21835357  T
Q  132 aaagtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatctcattg 217  Q
     | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21835356 gatgtttagctccaaattgttggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagagtccatgcatagcatctcattg 21835271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 135 - 205
Target Start/End: Original strand, 50887872 - 50887942
Alignment:
Q  135 gtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcat 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||| ||||||||||    
T  50887872 gtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacggtgatttgttcataagagtccatgcat 50887942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 135 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 1010480 - 1010434
Alignment:
Q  135 gtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatg 181  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1010480 gtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatg 1010434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 135 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 8305130 - 8305060
Alignment:
Q  135 gtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcat 205  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || | |||| ||||| ||||||||||    
T  8305130 gtttaggtccaaattattggatgcatattgatatgttgattacggtgatttgttgataagagtccatgcat 8305060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 135 - 181
Target Start/End: Original strand, 16375806 - 16375852
Alignment:
Q  135 gtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatg 181  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16375806 gtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatg 16375852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 135 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 19104739 - 19104669
Alignment:
Q  135 gtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcat 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || | |||| ||||| ||||||||||    
T  19104739 gtttagctccaaattattggatgcatattgatatgatgattacggtgatttgttgataagagtccatgcat 19104669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 135 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 19111396 - 19111326
Alignment:
Q  135 gtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcat 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || | |||| ||||| ||||||||||    
T  19111396 gtttagctccaaattattggatgcatattgatatgatgattacggtgatttgttgataagagtccatgcat 19111326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 135 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 21407112 - 21407066
Alignment:
Q  135 gtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatg 181  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21407112 gtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatg 21407066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 135 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 23763200 - 23763131
Alignment:
Q  135 gtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcat 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||| || || ||||||||||    
T  23763200 gtttagctccaaattattggatgcatattgatatgatgattacgatgttttgttgat-agagtccatgcat 23763131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 135 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 52639298 - 52639252
Alignment:
Q  135 gtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatg 181  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  52639298 gtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatg 52639252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 135 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 21437783 - 21437737
Alignment:
Q  135 gtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatg 181  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  21437783 gtttagctccaaattattggatgcatattgatatgatgattacgatg 21437737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 135 - 181
Target Start/End: Original strand, 39244244 - 39244290
Alignment:
Q  135 gtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatg 181  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  39244244 gtttagctccaaattattggatgcatgataatatgttgattacgatg 39244290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 135 - 181
Target Start/End: Original strand, 39247799 - 39247845
Alignment:
Q  135 gtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatg 181  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  39247799 gtttagctccaaattattggatgcatgataatatgttgattacgatg 39247845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 135 - 181
Target Start/End: Original strand, 41388344 - 41388390
Alignment:
Q  135 gtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatg 181  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  41388344 gtttagctccaaattattggatgcatgataatatgttgattacgatg 41388390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 136 - 181
Target Start/End: Original strand, 20229333 - 20229378
Alignment:
Q  136 tttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatg 181  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  20229333 tttagctccaaattattggatgcatgataatatgttgattacgatg 20229378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 133 - 176
Target Start/End: Original strand, 20525332 - 20525375
Alignment:
Q  133 aagtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgatta 176  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  20525332 aagtttagctccaaattattggatgcatattgatatgatgatta 20525375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 171 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 43078385 - 43078339
Alignment:
Q  171 tgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatctcattg 217  Q
    |||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  43078385 tgattatgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattg 43078339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 171 - 217
Target Start/End: Original strand, 46157481 - 46157527
Alignment:
Q  171 tgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatctcattg 217  Q
    |||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  46157481 tgattatgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattg 46157527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 139 - 176
Target Start/End: Original strand, 18394085 - 18394122
Alignment:
Q  139 agctccaaattattggatgcatgttgatatgttgatta 176  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  18394085 agctccaaattattggatgcatattgagatgttgatta 18394122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 52 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 19104838 - 19104766
Alignment:
Q  52 attgatataatgatatcatcttgat--tatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaactaagtgcataa 122  Q
    |||||||||||||||||||| || |  | |||||||||  |||||||||   |||||||||||||||||||||    
T  19104838 attgatataatgatatcatcatgttgttgtgtgacttgactatgctgctgctgttatttaactaagtgcataa 19104766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 52 - 122
Target Start/End: Original strand, 20525235 - 20525307
Alignment:
Q  52 attgatataatgatatcatcttgat--tatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaactaagtgcataa 122  Q
    |||||||||||||||||||| || |  | |||||||||  |||| |||| | |||||||||||||||||||||    
T  20525235 attgatataatgatatcatcctgttgttgtgtgacttgactatgttgctgttgttatttaactaagtgcataa 20525307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0155 (Bit Score: 127; Significance: 1e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0155
Description:

Target: scaffold0155; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 43 - 217
Target Start/End: Original strand, 9829 - 10001
Alignment:
Q  43 ttatgtgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaactaagtgcataagtatatgataaagtttagct 142  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  9829 ttatgtgct-ttgatataatgatatcatcttg-ttatgtgacctgtttatgctgcttccgttatttaactaagtgcataattatatgatgaagtttagct 9926  T
Q  143 ccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatctcattg 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  9927 ccaaattattggatgcatgttgataagttgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattg 10001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 127; Significance: 1e-65; HSPs: 3)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 43 - 217
Target Start/End: Original strand, 72911 - 73083
Alignment:
Q  43 ttatgtgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaactaagtgcataagtatatgataaagtttagct 142  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  72911 ttatgtgct-ttgatataatgatatcatcttg-ttatgtgacctgtttatgctgcttccgttatttaactaagtgcataatcatatgatgaagtttagct 73008  T
Q  143 ccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatctcattg 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  73009 ccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattg 73083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 43 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 30620 - 30447
Alignment:
Q  43 ttatgtgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaactaagtgcataagtatatgataaagtttagct 142  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  30620 ttatgtgct-ttgatataatgatatcatcttg-ttatgtgacctgtttatgctgcttccgttatttaactaagtgcataattatatgatgaagtttagct 30523  T
Q  143 cc-aaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatctcattg 217  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  30522 ccaaaattattggatgcatgttgataagttgatcacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattg 30447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #3
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 48 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 8150 - 7981
Alignment:
Q  48 tgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaactaagtgcataag-tatatgataaagtttagctccaa 146  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||    
T  8150 tgctgttgatataattatatcatcttg-ttatgtgacttgtttatgctgcttccgttatttaactaagtgcatatggtatatgatgaagtttagctccaa 8052  T
Q  147 attattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatctcattg 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||  |||| ||||||||||||||| ||||||    
T  8051 attattggatgcatgttgatatgttgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattg 7981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 121; Significance: 4e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 14 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 38162 - 37962
Alignment:
Q  14 agatatgaaggtttgataaagatgcaattttatgtgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaacta 113  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||    
T  38162 agatatgaaggtttgataataatgcaattt-atgtgctattgatataatgatatcatcttgctg-tgtgacttgtt-atgctgcttctgttatttaacta 38066  T
Q  114 agtgcataagtatatgataaagtttagctccaaattattggatgcatgttga-tatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatct 212  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  38065 agtgcatatgtatatgataatgtttagctccaaattattggatgcatgttgattacgatgattacg-tgttctgttcataagtgtccatgcatagcatat 37967  T
Q  213 cattg 217  Q
    |||||    
T  37966 cattg 37962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 121; Significance: 4e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 14 - 217
Target Start/End: Original strand, 76650 - 76850
Alignment:
Q  14 agatatgaaggtttgataaagatgcaattttatgtgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaacta 113  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||    
T  76650 agatatgaaggtttgataataatgcaattt-atgtgctattgatataatgatatcatcttgctg-tgtgacttgtt-atgctgcttctgttatttaacta 76746  T
Q  114 agtgcataagtatatgataaagtttagctccaaattattggatgcatgttga-tatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatct 212  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  76747 agtgcatatgtatatgataatgtttagctccaaattattggatgcatgttgattacgatgattacg-tgttctgttcataagtgtccatgcatagcatat 76845  T
Q  213 cattg 217  Q
    |||||    
T  76846 cattg 76850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0061 (Bit Score: 120; Significance: 1e-61; HSPs: 2)
Name: scaffold0061
Description:

Target: scaffold0061; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 42 - 217
Target Start/End: Original strand, 59472 - 59646
Alignment:
Q  42 tttatgtgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaactaagtgcataagtatatgataaagtttagc 141  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  59472 tttatgtgctattgatataaagatatcatcttgat-atgtgacttgtttatgctgcttccgttgtttaactaagtgcataagtatatgatgaagtttaac 59570  T
Q  142 tccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatctcattg 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||    
T  59571 tccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgttgttttgttcctatgtgtccatgcatagcatatcattg 59646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0061; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 135 - 181
Target Start/End: Original strand, 67650 - 67696
Alignment:
Q  135 gtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatg 181  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  67650 gtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatg 67696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 120; Significance: 1e-61; HSPs: 3)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 42 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 139161 - 138987
Alignment:
Q  42 tttatgtgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaactaagtgcataagtatatgataaagtttagc 141  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  139161 tttatgtgctattgatataaagatatcatcttgat-atgtgacttgtttatgctgcttccgttgtttaactaagtgcataagtatatgatgaagtttaac 139063  T
Q  142 tccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatctcattg 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||    
T  139062 tccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgttgttttgttcctatgtgtccatgcatagcatatcattg 138987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 139 - 176
Target Start/End: Original strand, 15331 - 15368
Alignment:
Q  139 agctccaaattattggatgcatgttgatatgttgatta 176  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  15331 agctccaaattattggatgcatattgagatgttgatta 15368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 139 - 176
Target Start/End: Original strand, 19853 - 19890
Alignment:
Q  139 agctccaaattattggatgcatgttgatatgttgatta 176  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  19853 agctccaaattattggatgcatattgagatgttgatta 19890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 116; Significance: 4e-59; HSPs: 5)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 14 - 217
Target Start/End: Original strand, 105863 - 106071
Alignment:
Q  14 agatatgaaggtttgataaagatgcaattttatgtgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaacta 113  Q
    ||||||||| ||||||| | ||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  105863 agatatgaaagtttgattatgatccaattg-atgtgctattgatataatgatatcatcctgttt-tgtgacttgtttatgctgcttccgttatttaacta 105960  T
Q  114 agtgcataa-gtatatga------taaagtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcata 206  Q
    ||||||||  ||||||||      | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  105961 agtgcatattgtatatgagtatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagagtccatgcata 106060  T
Q  207 gcatctcattg 217  Q
    |||||||||||    
T  106061 gcatctcattg 106071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 14 - 217
Target Start/End: Original strand, 126098 - 126306
Alignment:
Q  14 agatatgaaggtttgataaagatgcaattttatgtgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaacta 113  Q
    ||||||||| ||||||| | ||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  126098 agatatgaaagtttgattatgatccaattg-atgtgctattgatataatgatatcatcctgttt-tgtgacttgtttatgctgcttccgttatttaacta 126195  T
Q  114 agtgcataa-gtatatga------taaagtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcata 206  Q
    ||||||||  ||||||||      | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||    
T  126196 agtgcatattgtatatgagtatgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagagaccatgcata 126295  T
Q  207 gcatctcattg 217  Q
    |||||||||||    
T  126296 gcatctcattg 126306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #3
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 135 - 181
Target Start/End: Original strand, 61959 - 62005
Alignment:
Q  135 gtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatg 181  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  61959 gtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatg 62005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #4
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 135 - 181
Target Start/End: Original strand, 65875 - 65921
Alignment:
Q  135 gtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatg 181  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  65875 gtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatg 65921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #5
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 135 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 80298 - 80252
Alignment:
Q  135 gtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatg 181  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  80298 gtttagctccaaattattggatgcatgataatatgttgattacgatg 80252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 115; Significance: 1e-58; HSPs: 9)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 43 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 67601 - 67430
Alignment:
Q  43 ttatgtgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaactaagtgcataagtatatgataaagtttagct 142  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||    
T  67601 ttatgtgct-ttgatataatgatatcatcttg-ttatgtgacctgtttatgctgcttccgttatttaactaagtgcataattatatgacgaagtttagct 67504  T
Q  143 ccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatctcattg 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  67503 ccaaattattggatgcatgttgataagttgattacgatgttttg-tcatatgtgtccatgcatagcatatcattg 67430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 45 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 7095 - 6911
Alignment:
Q  45 atgtgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaactaagtgcataag-----tatatgataaa----- 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||       |||||||| ||         
T  7095 atgtgctattgatataatgatatcatcttg-ttatgtgacttgtttatgctgctgctgttatttaactaagtgcatagtgtatttatatgatgaaatgat 6997  T
Q  135 ---gtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatctcattg 217  Q
       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||    
T  6996 gacgtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacggtgatttgttcataagagtccatgcataacatttcattg 6911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 45 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 13620 - 13436
Alignment:
Q  45 atgtgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaactaagtgcataag-----tatatgataaa----- 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||       |||||||| ||         
T  13620 atgtgctattgatataatgatatcatcctg-ttatgtgacttgtttatgctgctgctgttatttaactaagtgcatagtgtatttatatgatgaaatgat 13522  T
Q  135 ---gtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatctcattg 217  Q
       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  13521 gacgtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacggtgatttgttcataagagtccatgcatagcatttcattg 13436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 45 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 23148 - 22964
Alignment:
Q  45 atgtgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaactaagtgcataag-----tatatgataaa----- 134  Q
    ||||| ||||||||||||| |||| || || |||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||       |||||||| ||         
T  23148 atgtgttattgatataatgttatcctcctg-ttatgtgacttgtttatgctgctgctgttatttaactaagtgcatagtgtatttatatgatgaaatgat 23050  T
Q  135 ---gtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatctcattg 217  Q
       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||| |||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  23049 gacgtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacggtgatttgtccataagagtccatgcatagcatttcattg 22964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 48 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 57133 - 57060
Alignment:
Q  48 tgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaactaagtgcataa 122  Q
    ||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||||    
T  57133 tgctattgatacaatgatatcatcctg-ttatgtgacttgattatgctgctgctgttatttaactaagtgcataa 57060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #6
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 135 - 181
Target Start/End: Original strand, 59068 - 59114
Alignment:
Q  135 gtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatg 181  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  59068 gtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatg 59114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #7
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 48 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 41626 - 41553
Alignment:
Q  48 tgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaactaagtgcataa 122  Q
    ||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||| ||||| ||||   |||||||||||||||||||||    
T  41626 tgctattgatacaatgatatcatcctg-ttatgtgacttgattatgttgctgctgttatttaactaagtgcataa 41553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #8
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 135 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 57033 - 56951
Alignment:
Q  135 gtttagctccaaattattggatgcatgttga-tatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatctcattg 217  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| |||| ||||  |||| ||||||||||||||| ||||||    
T  57033 gtttaactccaaattattggatgcatgttgattacgatgattacg-tgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattg 56951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #9
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 135 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 41526 - 41444
Alignment:
Q  135 gtttagctccaaattattggatgcatgttga-tatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatctcattg 217  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| |||| ||||  | || ||||||||||||||| ||||||    
T  41526 gtttaactccaaattattggatgcatgttgattaggatgattacg-tgttttgttgtttagagtccatgcatagcatatcattg 41444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 115; Significance: 1e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 48 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 307187 - 307018
Alignment:
Q  48 tgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaactaagtgcataag-tatatgataaagtttagctccaa 146  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||    
T  307187 tgctgttgatataatgatatcatcttg-ttatgtgacttgtttatgctgcttccgttatttaactaagtgcatatggtatatgatgaagtttagctccaa 307089  T
Q  147 attattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatctcattg 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||  |||| ||||||||||||||| ||||||    
T  307088 attattggatgcatgttgatatgttgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattg 307018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 2)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 14 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 78335 - 78121
Alignment:
Q  14 agatatgaaggtttgataaagatgcaattttatgtgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaacta 113  Q
    |||||||||||||| || | |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||    
T  78335 agatatgaaggtttaattatgatgcaattg-atgtgctattgatataatgatatcatcctg-ttatgtgacttgattatgctgctgttgttatttaacta 78238  T
Q  114 agtgcataa-gtat------------atgataaagtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtcca 200  Q
    ||||||||  ||||            ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||| |||||    
T  78237 agtgcatattgtattcatacgatgaaatgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacggtgatttgttcataagagtcca 78138  T
Q  201 tgcatagcatctcattg 217  Q
    |||||||||| ||||||    
T  78137 tgcatagcatttcattg 78121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 135 - 205
Target Start/End: Original strand, 60884 - 60953
Alignment:
Q  135 gtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcat 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||| || || ||||||||||    
T  60884 gtttagctccaaattattggatgcatattgatatgatgattacgatgttttgttgat-agagtccatgcat 60953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 87; Significance: 7e-42; HSPs: 2)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 14 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 26763 - 26547
Alignment:
Q  14 agatatgaaggtttgataaagatgcaattttatgtgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaacta 113  Q
    ||||||||  ||||||| | |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  26763 agatatgacagtttgattatgatgcaattg-atgtgctattgatataatgatatcatcctg-ttatgtgacttgtttatgctgcttccgttatttaacta 26666  T
Q  114 agtgcataa-----gtatatgataaa---------gtttagctccaaattattggatgcatgttg-atatgttgattacgatgttctgttcataagtgtc 198  Q
    |||||||||      |||||||| ||         |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| ||||||||||  ||    
T  26665 agtgcataatgtctatatatgatgaataagatgacgtttagctccaaattattggatgcatgttgaatatgatgactacgatgttttgttcataagattc 26566  T
Q  199 catgcatagcatctcattg 217  Q
    |||||||||||||||||||    
T  26565 catgcatagcatctcattg 26547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 14 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 43435 - 43234
Alignment:
Q  14 agatatgaaggtttgataaagatgcaattttatgtgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaacta 113  Q
    ||||||||| |||| || | |||||||||  || |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  |||||||||   ||||||||||||    
T  43435 agatatgaaagtttaattatgatgcaattg-atttgctattgatataatgatatcatcctg-ttatgtgacttgactatgctgctactgttatttaacta 43338  T
Q  114 agtgca-taagtatat------------gataaagtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtcca 200  Q
    |||||| || || |||            ||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| || | |||||||||| |||||    
T  43337 agtgcaatatgtctatacatgatgaaatgatgacgtttagctccaaattattggaagcatgttgatatgttgatcacggtgat-tgttcataagagtcca 43239  T
Q  201 tgcat 205  Q
    |||||    
T  43238 tgcat 43234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0431 (Bit Score: 81; Significance: 3e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0431
Description:

Target: scaffold0431; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 45 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 12535 - 12351
Alignment:
Q  45 atgtgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaactaagtgcataag-----tatatgataaa----- 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||       |||||||| ||         
T  12535 atgtgctattgatataatgatatcatcctg-ttatgtgacttgtttatgctgctgctgttatttaactaagtgcatagtgtatttatatgatgaaatgat 12437  T
Q  135 ---gtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatctcattg 217  Q
       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  12436 gacgtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacggtgatttgttcataagagtccatgcatagcatttcattg 12351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 77; Significance: 7e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 45 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 74089 - 73901
Alignment:
Q  45 atgtgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaactaagtgcat---aagtat--------------a 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||   | ||||              |    
T  74089 atgtgctattgatataatgatatcatcctg-ttatgtgacttgattatgctgctgctgttatttaactaagtgcattgtatgtatttatatatgatgaaa 73991  T
Q  128 tgataaagtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatctcattg 217  Q
    |||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  73990 tgatgacgtttagctccaaattgttggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagagtccatgcatagcatctcattg 73901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0744 (Bit Score: 67; Significance: 6e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0744
Description:

Target: scaffold0744; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 135 - 217
Target Start/End: Original strand, 3790 - 3872
Alignment:
Q  135 gtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatctcattg 217  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  3790 gtttagctccaaattgttggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagagtccatgcatagcatttcattg 3872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0572 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0572
Description:

Target: scaffold0572; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 45 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 9943 - 9759
Alignment:
Q  45 atgtgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaactaagtgcataag-----tatatgataaa----- 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || | | |||||||||||||||||||   ||||||||||| ||||||||       |||||||| ||         
T  9943 atgtgctattgatataatgatatcatcctgct-acgtgacttgtttatgctgctgctgttatttaacttagtgcatagtgtatttatatgatgaaatgat 9845  T
Q  135 ---gtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatctcattg 217  Q
       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||    
T  9844 gacgtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacggtgatttgttcataagagtccatgcataacatttcattg 9759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 59; Significance: 4e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 14 - 217
Target Start/End: Original strand, 19561 - 19777
Alignment:
Q  14 agatatgaaggtttgataaagatgcaattttatgtgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaacta 113  Q
    ||||||||| |||| || | |||||||||  || |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||   ||||||||||||    
T  19561 agatatgaaagtttaattatgatgcaattg-atttgctattgatataatgatatcatcctg-ttatgtgacttgattatgctgctgctgttatttaacta 19658  T
Q  114 agtgcataa-----gtatatgataaa---------gtttagctccaaattattggatgcatgttg-atatgttgattacgatgttctgttcataagtgtc 198  Q
    |||||||||      |||||||| ||         |||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||| |||| |||| ||| | |||    
T  19659 agtgcataatgtctatatatgatgaataagatgacgtttagctccaaattattggatgcatgttgaatacgatgattacggtgttgtgttgatatgagtc 19758  T
Q  199 catgcatagcatctcattg 217  Q
    |||||||||||| ||||||    
T  19759 catgcatagcatttcattg 19777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0780 (Bit Score: 55; Significance: 9e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0780
Description:

Target: scaffold0780; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 135 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 104 - 34
Alignment:
Q  135 gtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcat 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||| ||||||||||    
T  104 gtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacggtgatttgttcataagagtccatgcat 34  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0780; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 50 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 201 - 131
Alignment:
Q  50 ctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaactaagtgcata 121  Q
    |||||||||||||||||||||  || ||||||||||||  |||| ||||   ||||||||||||||||||||    
T  201 ctattgatataatgatatcattctg-ttatgtgacttgactatgttgctgctgttatttaactaagtgcata 131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0525 (Bit Score: 48; Significance: 1e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0525
Description:

Target: scaffold0525; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 135 - 217
Target Start/End: Original strand, 4222 - 4305
Alignment:
Q  135 gtttagctccaaattattggatgcatgttg-atatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatctcattg 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||| |||| |||| ||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  4222 gtttagctccaaattattggatgcatgttgaatacgatgattacggtgttttgttgataagagtccatgcatagcatatcattg 4305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0096 (Bit Score: 46; Significance: 2e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0096
Description:

Target: scaffold0096; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 48 - 205
Target Start/End: Original strand, 15010 - 15179
Alignment:
Q  48 tgctattgatataatgatatcatcttgattatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaactaagtgcataag-----tatatgataaa-------- 134  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  |||| ||||   |||||||||||| ||||||||      |||||||| ||            
T  15010 tgctattgatataatgatatcatcctg-ttatgtgacttgactatgttgctgctgttatttaactatgtgcataatgtctatatatgatgaaatgatgat 15108  T
Q  135 gtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcat 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | || | |||||||||| || |||||||    
T  15109 gtttagctccaaattattggatgcatattgatatgttgattatggtgatttgttcataagagttcatgcat 15179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0676 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0676
Description:

Target: scaffold0676; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 135 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 207 - 161
Alignment:
Q  135 gtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatg 181  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  207 gtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatg 161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0372 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0372
Description:

Target: scaffold0372; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 135 - 181
Target Start/End: Original strand, 5448 - 5494
Alignment:
Q  135 gtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatg 181  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5448 gtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatg 5494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0349 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0349
Description:

Target: scaffold0349; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 135 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 12179 - 12133
Alignment:
Q  135 gtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatg 181  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12179 gtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatg 12133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0242 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0242
Description:

Target: scaffold0242; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 135 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 19564 - 19495
Alignment:
Q  135 gtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcat 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||| || || ||||||||||    
T  19564 gtttagctccaaattattggatgcatattgatatgatgattacgatgttttgttgat-agagtccatgcat 19495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0242; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 135 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 25738 - 25669
Alignment:
Q  135 gtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcat 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||| || || ||||||||||    
T  25738 gtttagctccaaattattggatgcattttgatatgatgattacgatgttttgttgat-agagtccatgcat 25669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 135 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 242046 - 241977
Alignment:
Q  135 gtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcat 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||| || || ||||||||||    
T  242046 gtttagctccaaattattggatgcatattgatatgatgattacgatgttttgttgat-agagtccatgcat 241977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0697 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0697
Description:

Target: scaffold0697; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 135 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 6604 - 6522
Alignment:
Q  135 gtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgca-tagcatctcattg 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||| |||| || || ||||||||| |||||| ||||||    
T  6604 gtttagctccaaattattggatgcatattgatatgatgattacgacgttttgttgat-agagtccatgcattagcatttcattg 6522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0560 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0560
Description:

Target: scaffold0560; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 135 - 205
Target Start/End: Original strand, 5915 - 5985
Alignment:
Q  135 gtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcat 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| || | |||| ||||| ||||||||||    
T  5915 gtttagctccaaattattggatgctcattgatatgttgattacggtgatttgttgataagagtccatgcat 5985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0233 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0233
Description:

Target: scaffold0233; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 135 - 205
Target Start/End: Original strand, 14657 - 14727
Alignment:
Q  135 gtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcat 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||| || | |||| ||||| ||||||||||    
T  14657 gtttagctccaaattattggatgcacattgatatgatgattacggtgatttgttgataagagtccatgcat 14727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0216 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0216
Description:

Target: scaffold0216; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 135 - 205
Target Start/End: Original strand, 8971 - 9041
Alignment:
Q  135 gtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcat 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| || | |||| ||||| ||||||||||    
T  8971 gtttagctccaaattattggatgctcattgatatgttgattacggtgatttgttgataagagtccatgcat 9041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0259 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0259
Description:

Target: scaffold0259; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 135 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 10163 - 10093
Alignment:
Q  135 gtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcat 205  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||   |||| ||||| ||||||||||    
T  10163 gtttatctccaaattattggatgcatattgatatgatgattacggtgaattgttgataagagtccatgcat 10093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0256 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0256
Description:

Target: scaffold0256; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 135 - 205
Target Start/End: Original strand, 25093 - 25162
Alignment:
Q  135 gtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcat 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||| ||||| |||| || || ||||||||||    
T  25093 gtttagctccaaattattggatgcacattgatatgatgattacaatgttttgttgat-agagtccatgcat 25162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0156 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0156
Description:

Target: scaffold0156; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 135 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 2798 - 2729
Alignment:
Q  135 gtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcat 205  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||| |||| || || ||||||||||    
T  2798 gtttggctccaaattattggatgcatatcgatatgatgattacgatgttttgttgat-agagtccatgcat 2729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 135 - 180
Target Start/End: Original strand, 80878 - 80923
Alignment:
Q  135 gtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgat 180  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||    
T  80878 gtttagctccaaattattggatgcatattgatatgatgaatacgat 80923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0140
Description:

Target: scaffold0140; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 171 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 38649 - 38603
Alignment:
Q  171 tgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcatagcatctcattg 217  Q
    |||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  38649 tgattatgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattg 38603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 135 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 9326 - 9257
Alignment:
Q  135 gtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcat 205  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| | |||||||| ||||||||||||| |||| || || ||||||||||    
T  9326 gtttagatccaaattattagatgcttattgatatgatgattacgatgttttgttgat-agagtccatgcat 9257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 52 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 9425 - 9353
Alignment:
Q  52 attgatataatgatatcatcttgat--tatgtgacttgtttatgctgctttcgttatttaactaagtgcataa 122  Q
    |||||||||||||||||||| || |  | |||||||||  |||||||||   |||||||||||||||||||||    
T  9425 attgatataatgatatcatcctgttgttgtgtgacttgactatgctgctgctgttatttaactaagtgcataa 9353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0637 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0637
Description:

Target: scaffold0637; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 139 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 8557 - 8520
Alignment:
Q  139 agctccaaattattggatgcatgttgatatgttgatta 176  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  8557 agctccaaattattggatgcatattgagatgttgatta 8520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0439 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 2)
Name: scaffold0439
Description:

Target: scaffold0439; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 139 - 176
Target Start/End: Original strand, 2557 - 2594
Alignment:
Q  139 agctccaaattattggatgcatgttgatatgttgatta 176  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  2557 agctccaaattattggatgcatattgagatgttgatta 2594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0439; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 139 - 176
Target Start/End: Original strand, 10417 - 10454
Alignment:
Q  139 agctccaaattattggatgcatgttgatatgttgatta 176  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  10417 agctccaaattattggatgcatattgagatgttgatta 10454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 139 - 176
Target Start/End: Original strand, 4346 - 4383
Alignment:
Q  139 agctccaaattattggatgcatgttgatatgttgatta 176  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  4346 agctccaaattattggatgcatattgagatgttgatta 4383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0181 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0181
Description:

Target: scaffold0181; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 139 - 176
Target Start/End: Original strand, 27243 - 27280
Alignment:
Q  139 agctccaaattattggatgcatgttgatatgttgatta 176  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  27243 agctccaaattattggatgcatattgagatgttgatta 27280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0036
Description:

Target: scaffold0036; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 139 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 68874 - 68837
Alignment:
Q  139 agctccaaattattggatgcatgttgatatgttgatta 176  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  68874 agctccaaattattggatgcatattgagatgttgatta 68837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0015 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0015
Description:

Target: scaffold0015; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 139 - 176
Target Start/End: Original strand, 192438 - 192475
Alignment:
Q  139 agctccaaattattggatgcatgttgatatgttgatta 176  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  192438 agctccaaattattggatgcatattgagatgttgatta 192475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University