View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF17634_low_2 (Length: 350)

Name: NF17634_low_2
Description: NF17634
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF17634_low_2
NF17634_low_2
[»] chr2 (31 HSPs)
chr2 (1-341)||(45367972-45368312)
chr2 (6-341)||(11992454-11992788)
chr2 (1-341)||(41763389-41763736)
chr2 (1-340)||(2610123-2610461)
chr2 (1-335)||(451976-452303)
chr2 (1-341)||(4807187-4807526)
chr2 (1-341)||(3865667-3866006)
chr2 (6-322)||(30743223-30743538)
chr2 (6-341)||(8180380-8180714)
chr2 (1-341)||(24583954-24584293)
chr2 (43-322)||(3244018-3244293)
chr2 (1-251)||(38453058-38453306)
chr2 (128-341)||(41197576-41197792)
chr2 (48-200)||(13148953-13149106)
chr2 (108-311)||(6238132-6238334)
chr2 (192-341)||(23997402-23997551)
chr2 (45-176)||(37281746-37281878)
chr2 (48-201)||(17581112-17581262)
chr2 (223-341)||(38429700-38429818)
chr2 (61-201)||(14769943-14770090)
chr2 (55-201)||(33594757-33594904)
chr2 (213-341)||(36183257-36183385)
chr2 (1-80)||(12475031-12475108)
chr2 (64-201)||(12904624-12904762)
chr2 (54-108)||(876778-876833)
chr2 (54-154)||(7135220-7135321)
chr2 (45-183)||(28317383-28317517)
chr2 (5-110)||(13592930-13593031)
chr2 (57-201)||(6465370-6465515)
chr2 (93-201)||(7292673-7292782)
chr2 (228-320)||(32443436-32443527)
[»] chr4 (49 HSPs)
chr4 (1-341)||(27450521-27450860)
chr4 (1-341)||(23906649-23906988)
chr4 (1-341)||(435824-436163)
chr4 (6-341)||(31960162-31960496)
chr4 (6-341)||(33226809-33227143)
chr4 (1-325)||(48174457-48174780)
chr4 (1-325)||(1777379-1777702)
chr4 (1-311)||(56374885-56375194)
chr4 (1-262)||(48622954-48623214)
chr4 (1-341)||(53707389-53707728)
chr4 (1-322)||(39708052-39708373)
chr4 (9-322)||(16002532-16002842)
chr4 (62-335)||(50286625-50286899)
chr4 (6-311)||(47265580-47265886)
chr4 (63-341)||(1211738-1212017)
chr4 (132-341)||(43433643-43433852)
chr4 (117-341)||(46583172-46583396)
chr4 (120-341)||(41009698-41009922)
chr4 (45-201)||(17666526-17666680)
chr4 (57-193)||(54787741-54787878)
chr4 (54-133)||(10775975-10776055)
chr4 (61-184)||(1629084-1629208)
chr4 (96-260)||(54914618-54914781)
chr4 (95-311)||(55578722-55578935)
chr4 (54-278)||(39754782-39755007)
chr4 (47-201)||(17667817-17667969)
chr4 (54-140)||(30807244-30807331)
chr4 (144-341)||(35690042-35690238)
chr4 (55-182)||(7092719-7092847)
chr4 (80-192)||(52280695-52280807)
chr4 (57-150)||(42037510-42037604)
chr4 (128-193)||(45185477-45185542)
chr4 (56-187)||(20917630-20917762)
chr4 (83-214)||(3273098-3273229)
chr4 (239-321)||(11389552-11389634)
chr4 (267-335)||(26037836-26037904)
chr4 (257-341)||(45205196-45205280)
chr4 (45-103)||(55768963-55769022)
chr4 (45-103)||(55833219-55833278)
chr4 (263-341)||(1793316-1793394)
chr4 (45-122)||(30853053-30853131)
chr4 (57-142)||(41427488-41427574)
chr4 (217-322)||(52569882-52569987)
chr4 (254-322)||(31458875-31458943)
chr4 (83-201)||(8917815-8917938)
chr4 (275-341)||(12494618-12494684)
chr4 (275-341)||(39100881-39100947)
chr4 (233-322)||(4440682-4440770)
chr4 (290-335)||(27983083-27983128)
[»] chr3 (29 HSPs)
chr3 (1-341)||(25190974-25191313)
chr3 (1-341)||(38849689-38850028)
chr3 (1-341)||(51448057-51448396)
chr3 (9-311)||(47542089-47542390)
chr3 (64-322)||(28245093-28245352)
chr3 (7-321)||(27917173-27917486)
chr3 (178-341)||(5168599-5168762)
chr3 (6-273)||(29817105-29817370)
chr3 (160-341)||(52138553-52138734)
chr3 (84-226)||(54425369-54425511)
chr3 (6-159)||(19757668-19757820)
chr3 (1-126)||(52138423-52138547)
chr3 (174-341)||(53519353-53519520)
chr3 (55-341)||(26489964-26490251)
chr3 (52-341)||(30345175-30345457)
chr3 (45-187)||(48221421-48221564)
chr3 (6-159)||(19736766-19736914)
chr3 (1-117)||(9258478-9258589)
chr3 (138-320)||(3186500-3186682)
chr3 (55-178)||(30724311-30724435)
chr3 (228-341)||(43695113-43695226)
chr3 (54-123)||(46145799-46145869)
chr3 (58-180)||(44395080-44395200)
chr3 (242-306)||(54278855-54278919)
chr3 (58-164)||(32490249-32490356)
chr3 (54-103)||(1470683-1470733)
chr3 (58-187)||(15750888-15751018)
chr3 (267-341)||(33272376-33272450)
chr3 (168-310)||(40674492-40674634)
[»] chr7 (35 HSPs)
chr7 (1-341)||(38606601-38606939)
chr7 (1-341)||(32630202-32630529)
chr7 (1-311)||(46356229-46356538)
chr7 (1-341)||(36651589-36651928)
chr7 (6-341)||(33350154-33350488)
chr7 (6-341)||(31004824-31005157)
chr7 (1-341)||(11593554-11593894)
chr7 (1-281)||(37616511-37616790)
chr7 (1-335)||(39906729-39907066)
chr7 (6-341)||(36869637-36869971)
chr7 (120-341)||(43281389-43281610)
chr7 (1-341)||(49028862-49029210)
chr7 (1-250)||(48918983-48919231)
chr7 (94-341)||(35906549-35906796)
chr7 (157-322)||(34869170-34869335)
chr7 (119-341)||(33072666-33072888)
chr7 (147-341)||(7272780-7272973)
chr7 (6-170)||(24177714-24177877)
chr7 (170-322)||(23404181-23404333)
chr7 (191-341)||(12841623-12841773)
chr7 (54-200)||(24550178-24550320)
chr7 (144-341)||(7189581-7189777)
chr7 (55-188)||(21517826-21517959)
chr7 (54-137)||(43793592-43793676)
chr7 (219-323)||(13859372-13859476)
chr7 (153-321)||(25579439-25579612)
chr7 (61-201)||(18637233-18637371)
chr7 (61-201)||(18650668-18650806)
chr7 (97-188)||(23087603-23087694)
chr7 (61-183)||(18608199-18608319)
chr7 (69-140)||(5843105-5843177)
chr7 (266-322)||(15681216-15681272)
chr7 (61-140)||(18626559-18626639)
chr7 (142-213)||(33139006-33139077)
chr7 (289-341)||(21517674-21517726)
[»] chr6 (20 HSPs)
chr6 (6-341)||(5631417-5631752)
chr6 (6-341)||(9706376-9706710)
chr6 (6-331)||(5258508-5258832)
chr6 (1-341)||(10100205-10100544)
chr6 (1-341)||(20427984-20428323)
chr6 (153-341)||(607905-608093)
chr6 (65-341)||(2689313-2689590)
chr6 (6-341)||(33495807-33496118)
chr6 (159-341)||(14030558-14030740)
chr6 (130-309)||(6056150-6056329)
chr6 (151-322)||(30679218-30679389)
chr6 (4-201)||(27790754-27790950)
chr6 (73-341)||(26291444-26291712)
chr6 (242-335)||(30031091-30031184)
chr6 (45-115)||(3632653-3632724)
chr6 (144-340)||(2065105-2065302)
chr6 (275-341)||(35043789-35043855)
chr6 (228-341)||(28085197-28085310)
chr6 (1-76)||(30670483-30670556)
chr6 (86-183)||(6641916-6642013)
[»] chr8 (40 HSPs)
chr8 (1-341)||(42854352-42854700)
chr8 (6-340)||(36565590-36565923)
chr8 (1-341)||(15215619-15215957)
chr8 (1-311)||(12492220-12492529)
chr8 (1-266)||(4032917-4033181)
chr8 (6-341)||(36544752-36545081)
chr8 (55-335)||(18124825-18125103)
chr8 (1-273)||(8879850-8880121)
chr8 (132-341)||(37077490-37077699)
chr8 (153-341)||(39946603-39946791)
chr8 (120-311)||(25299950-25300141)
chr8 (120-311)||(25288613-25288806)
chr8 (45-215)||(13984672-13984842)
chr8 (218-335)||(18752227-18752344)
chr8 (120-262)||(25439249-25439391)
chr8 (48-201)||(28300596-28300747)
chr8 (57-193)||(19293776-19293913)
chr8 (60-214)||(30113671-30113827)
chr8 (45-183)||(41444809-41444949)
chr8 (45-189)||(29735454-29735592)
chr8 (199-322)||(36395320-36395443)
chr8 (95-209)||(35601686-35601799)
chr8 (45-201)||(33830721-33830875)
chr8 (54-201)||(38667205-38667351)
chr8 (6-192)||(18849624-18849797)
chr8 (45-201)||(25985179-25985334)
chr8 (52-214)||(13589084-13589247)
chr8 (178-322)||(2796326-2796470)
chr8 (47-264)||(6510841-6511059)
chr8 (60-137)||(45332039-45332117)
chr8 (168-231)||(10824546-10824609)
chr8 (110-188)||(6986525-6986603)
chr8 (266-341)||(9905234-9905309)
chr8 (95-192)||(35601501-35601598)
chr8 (55-103)||(43732230-43732279)
chr8 (158-199)||(43732355-43732396)
chr8 (135-188)||(13172147-13172200)
chr8 (280-321)||(17491994-17492035)
chr8 (54-82)||(3285135-3285163)
chr8 (119-222)||(44681543-44681644)
[»] chr1 (39 HSPs)
chr1 (1-341)||(32083093-32083432)
chr1 (1-322)||(8671515-8671835)
chr1 (1-341)||(1210340-1210679)
chr1 (1-322)||(51601653-51601973)
chr1 (1-341)||(43240729-43241068)
chr1 (1-341)||(51441113-51441451)
chr1 (1-322)||(49347760-49348081)
chr1 (88-341)||(30202478-30202731)
chr1 (62-335)||(19936175-19936450)
chr1 (6-309)||(34827482-34827784)
chr1 (162-341)||(8391525-8391706)
chr1 (47-252)||(27445537-27445743)
chr1 (6-307)||(37463249-37463544)
chr1 (139-340)||(22089826-22090027)
chr1 (136-341)||(9592463-9592668)
chr1 (201-341)||(15085728-15085868)
chr1 (207-341)||(696069-696203)
chr1 (45-199)||(32066761-32066913)
chr1 (60-214)||(51234267-51234421)
chr1 (55-196)||(7921574-7921716)
chr1 (54-201)||(28528227-28528375)
chr1 (45-188)||(35828894-35829038)
chr1 (54-179)||(6640772-6640898)
chr1 (58-191)||(52739965-52740098)
chr1 (117-341)||(46226630-46226853)
chr1 (45-188)||(12807587-12807732)
chr1 (45-189)||(52421067-52421210)
chr1 (94-231)||(21275588-21275725)
chr1 (55-107)||(40419328-40419381)
chr1 (46-114)||(46226887-46226956)
chr1 (54-179)||(3877495-3877621)
chr1 (52-139)||(16142399-16142487)
chr1 (82-185)||(11331568-11331666)
chr1 (82-185)||(11489589-11489687)
chr1 (48-110)||(52641033-52641093)
chr1 (117-194)||(52640920-52640997)
chr1 (179-291)||(52831830-52831942)
chr1 (48-106)||(16273415-16273471)
chr1 (269-311)||(34792726-34792768)
[»] chr5 (29 HSPs)
chr5 (1-315)||(3301444-3301757)
chr5 (6-287)||(3394311-3394593)
chr5 (1-341)||(1274860-1275199)
chr5 (1-341)||(12492735-12493074)
chr5 (1-341)||(10638892-10639231)
chr5 (1-335)||(28977211-28977544)
chr5 (45-341)||(2075822-2076119)
chr5 (1-341)||(20318586-20318921)
chr5 (1-341)||(1287937-1288276)
chr5 (1-264)||(24178119-24178381)
chr5 (6-213)||(16347879-16348084)
chr5 (153-341)||(34272768-34272956)
chr5 (6-188)||(27302451-27302629)
chr5 (52-305)||(36200426-36200680)
chr5 (135-341)||(27622-27828)
chr5 (190-341)||(16347726-16347877)
chr5 (54-185)||(43558318-43558450)
chr5 (45-142)||(17341748-17341846)
chr5 (106-184)||(43423578-43423656)
chr5 (94-201)||(20077305-20077413)
chr5 (61-201)||(38578992-38579130)
chr5 (54-273)||(3096828-3097041)
chr5 (6-80)||(27530-27602)
chr5 (54-136)||(6368478-6368561)
chr5 (54-140)||(21915532-21915619)
chr5 (45-115)||(37124207-37124278)
chr5 (131-193)||(28676253-28676314)
chr5 (5-108)||(23979831-23979930)
chr5 (55-115)||(25937719-25937780)
[»] scaffold0570 (1 HSPs)
scaffold0570 (7-341)||(2618-2951)
[»] scaffold0024 (1 HSPs)
scaffold0024 (43-341)||(82356-82655)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (6-322)||(31068-31383)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (7-259)||(12028-12279)
[»] scaffold0171 (1 HSPs)
scaffold0171 (50-126)||(5834-5911)
[»] scaffold1493 (1 HSPs)
scaffold1493 (120-233)||(41-156)
[»] scaffold0045 (2 HSPs)
scaffold0045 (94-341)||(86955-87204)
scaffold0045 (6-98)||(88514-88605)
[»] scaffold0606 (1 HSPs)
scaffold0606 (54-184)||(9303-9434)


Alignment Details
Target: chr2 (Bit Score: 313; Significance: 1e-176; HSPs: 31)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 313; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 1 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 45368312 - 45367972
Alignment:
Q  1 acggggtatatggaatgtaacttcaacaaaaggagaagtgtgggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcatacccaagttacacggtttaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  45368312 acggggtatatggaatgtaacttcaacaaaaggagaagtgtgggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcatacccaaattacacggtttaaa 45368213  T
Q  101 tatcttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgttt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45368212 tatcttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgttt 45368113  T
Q  201 tgtgcgataagaaaaaaccacttaagctgaaagaaaggttttatcggacagcagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaagag 300  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  45368112 tgtgcgataagaaagtaccacttaagctgaaaggaaagttttatcggacaacagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcgattaagag 45368013  T
Q  301 ccaacacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgt 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45368012 ccaacacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgt 45367972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 6 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 11992788 - 11992454
Alignment:
Q  6 gtatatggaatgtaacttcaacaaaaggagaagtgtgggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcataccc-aagttacacggtttaaatatc 104  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11992788 gtatatggaatgtaacttcagtaaaaagagaagtg--ggtctaccttagaggtgaaagttggagatcatatcataccccaagttacacggtttaaatatc 11992691  T
Q  105 ttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgttttgtg 204  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11992690 ttgggtctatagtacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaatcatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagcctcaggtgttttgtg 11992591  T
Q  205 cgataagaaaaaaccacttaagctgaaagaaaggttttatcggacagcagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaagagccaa 304  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  11992590 cgataagaaagtaccacttaagctgaaaggaaagttctatcggacagcagtctgaccggcaatgttgtatggtacggagtgatgggcggttaagagtcaa 11992491  T
Q  305 cacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgt 341  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||| |||||    
T  11992490 cacgagagtaaagtaagtgtagcggagatgaggatgt 11992454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 41763736 - 41763389
Alignment:
Q  1 acggggtatatggaatgtaacttcaacaaaaggagaagtgtgggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcataccc-aagttacacggtttaa 99  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||| |||||    
T  41763736 acggagtatatggaatgtaacttcagcaaaaggagaagtg--ggtctaccttggaggtgaaagttggagattatatcataccccaagttgcacgatttaa 41763639  T
Q  100 atatcttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtattcaagctgggtggtt--------gaaatggagaagagtct 191  Q
    |||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||        |||||||||||||| ||    
T  41763638 atatcttgggtccatagtacaaaatgtcggagaaatagaagcagatgtaaatcatcgtattcaagctgggtggttgaaaacttgaaatggagaagagcct 41763539  T
Q  192 caggtgttttgtgcgataagaaaaaaccacttaagctgaaagaaaggttttatcggacagcagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggc 291  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| || ||| ||||| | | || |||||||| |||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  41763538 caggtgttttgtgcgataagaaagtaccacttaagctaaaaggaaagttctatcgaagaacaatcagaccggcaatgttgtatggtacagagtgttgggc 41763439  T
Q  292 ggttaagagccaacacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgt 341  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||    
T  41763438 ggttaagaaccaacacgagagtaaagtaagtgtagcggagatgaggatgt 41763389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Original strand, 2610123 - 2610461
Alignment:
Q  1 acggggtatatggaatgtaacttcaacaaaaggagaagtgtgggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcataccc-aagttacacggtttaa 99  Q
    |||| ||||||| |||||||||||| || ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2610123 acggagtatatgaaatgtaacttcagcagaaggagaagta--ggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcataccccaagttacacggtttaa 2610220  T
Q  100 atatcttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgtt 199  Q
    ||||||||||||| |  ||||||||||  ||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2610221 atatcttgggtccttcgtacaaaatgacagagaaatagaagcagatgtaaaccatcatattcaagctgggtggttgaaatggagaagagcctcaggtgtt 2610320  T
Q  200 ttgtgcgataagaaaaaaccacttaagctgaaagaaaggttttatcggacagcagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaaga 299  Q
    || ||||||||||||  |||||||||| |||||| || ||| ||||||||| ||||||||| | |  ||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  2610321 ttatgcgataagaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttctatcggacaacagtcagactggcgttgttgtatggtacggagtgttgggcggttaaga 2610420  T
Q  300 gccaacacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatg 340  Q
    | ||||| |||| | |||||||| || | ||||||| ||||    
T  2610421 gtcaacatgagaatcaagtaagtgtagcagagatgaggatg 2610461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 452303 - 451976
Alignment:
Q  1 acggggtatatggaatgtaacttcaacaaaaggagaagtgtgggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcataccc-aagttacacggtttaa 99  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |  ||||||||||   ||||||||||||||||      ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  452303 acggagtatatggaatgtaacttcagcggaaggagaagta--ggtctaccttggaggt------tggagatcatatcataccccaagttacacggtttaa 452212  T
Q  100 atatcttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgtt 199  Q
    ||||||||||||| |  |||||||||| ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  452211 atatcttgggtccttcgtacaaaatgacggagaaatagaagcagatgtaagccatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagcctcaggtgtt 452112  T
Q  200 ttgtgcgataagaaaaaaccacttaagctgaaagaaaggttttatcggacagcagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaaga 299  Q
    |||||||||||||||  |||||||||| |||||| || ||| ||||||||||||||| |||||||  ||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  452111 ttgtgcgataagaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttctatcggacagcagtccgaccgacgttgttgtatggtacggagtgttgggcggttaaga 452012  T
Q  300 gccaacacgagagtaaagtaagtataacggagatga 335  Q
    | ||||| |||| | |||||||| || | |||||||    
T  452011 gtcaacatgagaatcaagtaagtgtagcagagatga 451976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 341
Target Start/End: Original strand, 4807187 - 4807526
Alignment:
Q  1 acggggtatatggaatgtaacttcaacaaaaggagaagtgtgggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcataccc-aagttacacggtttaa 99  Q
    |||| ||||||||||||||||||||    ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  4807187 acggagtatatggaatgtaacttcagtggaaggagaagta--ggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcataccccaagttacacagtttaa 4807284  T
Q  100 atatcttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgtt 199  Q
    ||||||||||||  |  |||||||||| ||||||||||||||||||||||   |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4807285 atatcttgggtctttcgtacaaaatgacggagaaatagaagcagatgtaagccatcgtattcaagatgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgtt 4807384  T
Q  200 ttgtgcgataagaaaaaaccacttaagctgaaagaaaggttttatcggacagcagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaaga 299  Q
    |||||||||||||||  |||| ||||| |||||| || ||| ||||||||||||||| |||||||  ||||||| |  || ||||| || ||||||||||    
T  4807385 ttgtgcgataagaaagtaccatttaagttgaaaggaaagttctatcggacagcagtccgaccgacgttgttgtatgacacagagtgttgagcggttaaga 4807484  T
Q  300 gccaacacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgt 341  Q
    | ||||| |||| | |||||||| || | ||||||| |||||    
T  4807485 gtcaacatgagaattaagtaagtgtagcagagatgaggatgt 4807526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 341
Target Start/End: Original strand, 3865667 - 3866006
Alignment:
Q  1 acggggtatatggaatgtaacttcaacaaaaggagaagtgtgggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcata-cccaagttacacggtttaa 99  Q
    |||| ||||||| |||||||||||| |  ||||||||||  |  ||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||| |    
T  3865667 acggagtatatgaaatgtaacttcagcggaaggagaagtacg--tctaccttggaggtgaaagttggagatcatattgtatcccaagttacacggtttca 3865764  T
Q  100 atatcttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgtt 199  Q
    ||| ||||||||| |  |||||||||| ||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  3865765 ataacttgggtccttcgtacaaaatgacggagaaatagaagcaaatgtaagctatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagcctcagatgtt 3865864  T
Q  200 ttgtgcgataagaaaaaaccacttaagctgaaagaaaggttttatcggacagcagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaaga 299  Q
    ||||| |||||||||  || ||||||| |||||| || ||| ||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  3865865 ttgtgtgataagaaagtactacttaagttgaaaggaaagttctatcggacaacagtcagaccgacgttgttgtatggtacggagtgttggacggttaaga 3865964  T
Q  300 gccaacacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgt 341  Q
    | ||||| |||| | |||||||| || | |||||||||||||    
T  3865965 gtcaacatgagaatcaagtaagtgtagcagagatgatgatgt 3866006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 6 - 322
Target Start/End: Original strand, 30743223 - 30743538
Alignment:
Q  6 gtatatggaatgtaacttcaacaaaaggagaagtgtgggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcata-cccaagttacacggtttaaatatc 104  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  30743223 gtatatggaatgtaacttcagcaaaaggagaaatt--ggtctaccttggaggtgaaagttggagatcataccatatcccaagttacacggtttaaatatc 30743320  T
Q  105 ttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgttttgtg 204  Q
    || |||| ||| |||||||||| ||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||| ||||||||||    
T  30743321 ttaggtcaatagtacaaaatgacggataaatagaagtagatataaatcatcgtattcaagctgagtgattgaaattgagaagagcctcatgtgttttgtg 30743420  T
Q  205 cgataagaaaaaaccacttaagctgaaagaaaggttttatcggacagcagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaagagccaa 304  Q
     |||||||||  |||||||||| |||||| || |||||| |||| ||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| | | |||| |||| ||||||    
T  30743421 tgataagaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttttaccggatagcggtcagaccgacgatgttgtatggtacggagagttaggcgattaaaagccaa 30743520  T
Q  305 cacgagagtaaagtaagt 322  Q
    ||||||| | ||||||||    
T  30743521 cacgagaatcaagtaagt 30743538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 6 - 341
Target Start/End: Original strand, 8180380 - 8180714
Alignment:
Q  6 gtatatggaatgtaacttcaacaaaaggagaagtgtgggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcatac-ccaagttacacggtttaaatatc 104  Q
    ||||||||||||||| ||||    ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  8180380 gtatatggaatgtaatttcagtggaaggagaagta--ggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcatactccaagttacacggtttaaatatt 8180477  T
Q  105 ttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgttttgtg 204  Q
    |||||||| |  || ||||||| ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||    
T  8180478 ttgggtccttcttataaaatgacggagaaatagaagcagatgtaagccatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagcctcaagagttttgtg 8180577  T
Q  205 cgataagaaaaaaccacttaagctgaaagaaaggttttatcggacagcagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaagagccaa 304  Q
    ||||||||||  |||||||||| |||||| || ||| ||||||||| ||||||||||  |  ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||| |||    
T  8180578 cgataagaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttctatcggacatcagtcagaccagcgttgttgtatggtacggagtgttggacggttaagagtcaa 8180677  T
Q  305 cacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgt 341  Q
    || |||| | |||||||| || | ||||||| |||||    
T  8180678 catgagaatcaagtaagtgtagcagagatgaggatgt 8180714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 24584293 - 24583954
Alignment:
Q  1 acggggtatatggaatgtaacttcaacaaaaggagaagtgtgggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcatacc-caagttacacggtttaa 99  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  24584293 acggagtatatggaatgtaacttcagcaaaaggagaattatg--tctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcagaccgcaagttacacggtttaa 24584196  T
Q  100 atatcttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgtt 199  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||| |||   ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || |||  |||||    
T  24584195 atatcttgggtccatagtacaaaatgatggagaaatataggcagatttaagccatcatattcaagctgggtggtggaaatggagaatagcctcgtgtgtt 24584096  T
Q  200 ttgtgcgataagaaaaaaccacttaagctgaaagaaaggttttatcggacagcagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaaga 299  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||| ||| | |  || || |  ||||||||| |||||||| |||||  | || |||||||||||||    
T  24584095 ttgtgcgaaaagaaaataccacttaagttgaaagaaaagttctgttagatagtatccagaccgacgatgttgtatggtacaaaatgttgggcggttaaga 24583996  T
Q  300 gccaacacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgt 341  Q
    | |||||||||| | |||||||| || | ||||||| |||||    
T  24583995 gtcaacacgagaatcaagtaagtgtagcagagatgaagatgt 24583954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 43 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 3244293 - 3244018
Alignment:
Q  43 ggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcatacccaagttacacggtttaaatatcttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagca 142  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||| |||||||||||||||    
T  3244293 ggtctaccttggaggtgaaagttgaagatcatatc----ccaagttacacggtttaaatatcttgggtccttcgtacaaaatgacggagaaatagaagca 3244198  T
Q  143 gatgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgttttgtgcgataagaaaaaaccacttaagctgaaagaaaggtttt 242  Q
    |||||||   ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||| | |||||| || ||| |    
T  3244197 gatgtaagccatcgtattcaagctgggtggtagaaatggagatgagcctcaggtgttttgtgcgataagaaagtaccacttatgttgaaaggaaagttct 3244098  T
Q  243 atcggacagcagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaagagccaacacgagagtaaagtaagt 322  Q
    |||||||||||||| ||||| |  ||||| | ||||||||||| ||| | |||||||| ||||| |||| | ||||||||    
T  3244097 atcggacagcagtccgaccggcgttgttgaatggtacggagtgttggacagttaagagtcaacatgagaatcaagtaagt 3244018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 38453306 - 38453058
Alignment:
Q  1 acggggtatatggaatgtaacttcaacaaaaggagaagtgtgggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcataccc-aagttacacggtttaa 99  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |  ||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  38453306 acggagtatatggaatgtaacatcagcggaaggagaagta---gtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcataccccaagttacacgatttaa 38453210  T
Q  100 atatcttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgtt 199  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||   ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  38453209 atatcttgggtccttcatacaaaatgacggagaaatagaagcatatgtaagccatcatattcaagctgggtggttgaaatggagaagagcctcatgtgtt 38453110  T
Q  200 ttgtgcgataagaaaaaaccacttaagctgaaagaaaggttttatcggacag 251  Q
    |||||||||||||||  |||||||||| |||||| || ||| ||||||||||    
T  38453109 ttgtgcgataagaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttctatcggacag 38453058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 128 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 41197792 - 41197576
Alignment:
Q  128 ggagaaatagaagcagatgtaaattatc---gtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgttttgtgcgataagaaaaaaccactta 224  Q
    ||||||||||||||| |||| ||| |||   ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||    
T  41197792 ggagaaatagaagcatatgtgaatcatcatcgtattcaagttgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgttttgtgcgataaaaaagtaccactta 41197693  T
Q  225 agctgaaagaaaggttttatcggacagcagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaagagccaacacgagagtaaagtaagtat 324  Q
    ||||||||| || ||| ||||| ||| ||||||||||  |||||||||| |||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  41197692 agctgaaaggaaagttctatcgaacaacagtcagaccagcaatgttgtatggtacaaagtgttgggcggttaagagccaacacgagagtaaagtaagtgt 41197593  T
Q  325 aacggagatgatgatgt 341  Q
    | ||||||||| |||||    
T  41197592 agcggagatgaggatgt 41197576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 48 - 200
Target Start/End: Original strand, 13148953 - 13149106
Alignment:
Q  48 accttggaggtgaaagttggagatcatatcataccc-aagttacacggtttaaatatcttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatg 146  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||     
T  13148953 accttggaggtgaaagttggagatcatatcataccccaagttacacggtttaaatatctcaggtccatagtacaaaatgacggagaaatagaagtagata 13149052  T
Q  147 taaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgttt 200  Q
     |||| |||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||    
T  13149053 caaatcatcgtattcaagttggatggttgaaatgaagaagagcttcaggtgttt 13149106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 108 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 6238334 - 6238132
Alignment:
Q  108 ggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgttttgtgcga 207  Q
    |||||||| |||||||||  ||||||||| || || |||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||    
T  6238334 ggtccatagtacaaaatgtcggagaaataaaaacatatgtaaatcatcgtattcaagttggatggttgaaatggagaagagcctcatgtgttttgtgtga 6238235  T
Q  208 taagaaaaaaccacttaagctgaaagaaaggttttatcggacagcagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaagagccaacac 307  Q
    ||| |||| |||||||||| |||||  ||  || ||||||||| |||| |||| ||| |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||    
T  6238234 taa-aaaataccacttaagttgaaaagaaaattctatcggacaacagttagactgacgatgttgtatggtacggagtgttgggtggttaagagtcaacac 6238136  T
Q  308 gaga 311  Q
    ||||    
T  6238135 gaga 6238132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 192 - 341
Target Start/End: Original strand, 23997402 - 23997551
Alignment:
Q  192 caggtgttttgtgcgataagaaaaaaccacttaagctgaaagaaaggttttatcggacagcagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggc 291  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| || ||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| |||| |||||    
T  23997402 caggtgttttgtgcgatgagaaaataccacttaagctgaaaggaaagttctatcggacaacagtaagaccgacaatgttgtatggtacgaagtgttgggc 23997501  T
Q  292 ggttaagagccaacacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgt 341  Q
     |||||||| |||||||||||  |||||||| |||||||||||| |||||    
T  23997502 agttaagagtcaacacgagagccaagtaagtgtaacggagatgaagatgt 23997551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 45 - 176
Target Start/End: Original strand, 37281746 - 37281878
Alignment:
Q  45 tctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcataccc-aagttacacggtttaaatatcttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcag 143  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||  |||||||||||| | |||||| || ||||||| ||||||||||||| ||    
T  37281746 tctaccttggaggtgaaagtttgagatcatgtcataccccaagttacacattttaaatatcttagctccatagtataaaatgaaggagaaatagaagtag 37281845  T
Q  144 atgtaaattatcgtattcaagctgggtggttga 176  Q
    |||||||| ||| |||||||| |||||||||||    
T  37281846 atgtaaatcatcctattcaagttgggtggttga 37281878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 48 - 201
Target Start/End: Original strand, 17581112 - 17581262
Alignment:
Q  48 accttggaggtgaaagttggagatcatatcatacccaagttacacggtttaaatatcttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgt 147  Q
    ||||| || ||||||||| |||||||||||||||  ||||||||| |||||||| |||||||| |||  ||||||||||   ||||||| ||||||||||    
T  17581112 accttagaagtgaaagttagagatcatatcatac--aagttacacagtttaaat-tcttgggttcattgtacaaaatgacaaagaaataaaagcagatgt 17581208  T
Q  148 aaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgtttt 201  Q
    ||||  || |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17581209 aaatcctcatattcaagttggatggttcaaatggagaagagtctcaggtgtttt 17581262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 223 - 341
Target Start/End: Original strand, 38429700 - 38429818
Alignment:
Q  223 taagctgaaagaaaggttttatcggacagcagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaagagccaacacgagagtaaagtaagt 322  Q
    |||||| |||| || ||| |||| ||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  38429700 taagctaaaaggaaagttctatcagacagcagtcaaaccggcaatgttgtatggtacggagtgttgggcggttaagaaccaacacgagagtagagtaagt 38429799  T
Q  323 ataacggagatgatgatgt 341  Q
     || ||||||||| |||||    
T  38429800 gtagcggagatgaggatgt 38429818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 61 - 201
Target Start/End: Original strand, 14769943 - 14770090
Alignment:
Q  61 aagttggagatcatatcataccc-aagttacacggtttaaatatcttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaat-----tat 154  Q
    |||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||  |  |||||||  ||||| ||||||||     |||    
T  14769943 aagttggagatcatatcatagcataagttacacggtttaaatatcttagggccatagtacaaaacaacagagaaattcaagcatatgtaaatcattatat 14770042  T
Q  155 cgtattcaagct-gggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgtttt 201  Q
    | |||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  14770043 catattcaagctggggtggttgaaatggagaagagtgtaaggtgtttt 14770090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 55 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 33594904 - 33594757
Alignment:
Q  55 aggtgaaagttggagatcatatcataccca-agttacacggtttaaatatcttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaatta 153  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||   | |||||| ||||||||||||| |||  ||| ||||||| |  ||||||||||||| |||||||||  |    
T  33594904 aggtgaaagttggagttcatatcataccagcatttacacagtttaaatatcttaggtatatagtacaaaacgtcggagaaatagaaggagatgtaaaaca 33594805  T
Q  154 tcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgtttt 201  Q
    ||  |||||| |||||||||||| |||||| || |||| |||||||||    
T  33594804 tcaaattcaaactgggtggttgagatggaggagtgtcttaggtgtttt 33594757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 213 - 341
Target Start/End: Original strand, 36183257 - 36183385
Alignment:
Q  213 aaaaaccacttaagctgaaagaaaggttttatcggacagcagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaagagccaacacgagag 312  Q
    |||||| ||||||| |||||| || ||| ||||||||| ||||| ||||| |  ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||     
T  36183257 aaaaactacttaagttgaaaggaaagttctatcggacaacagtccgaccggcgttgttgtatggtacggagtgttgggcggttaagagtcaacatgagaa 36183356  T
Q  313 taaagtaagtataacggagatgatgatgt 341  Q
    | |||||||| || | ||||||| |||||    
T  36183357 tcaagtaagtgtagcagagatgaggatgt 36183385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 12475108 - 12475031
Alignment:
Q  1 acggggtatatggaatgtaacttcaacaaaaggagaagtgtgggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcata 80  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |  ||||||||||   |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  12475108 acggagtatatggaatgtaacttcagcggaaggagaagta--ggtctaccttagaggtgaaagttggagatcatatcata 12475031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 64 - 201
Target Start/End: Original strand, 12904624 - 12904762
Alignment:
Q  64 ttggagatcatatcatacc-caagttacacggtttaaatatcttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtattca 162  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| | | ||| ||| |||||||| |||||||| | | || |||||||||  || | |||||    
T  12904624 ttggagatcatatcatatcacaagttacacggtttaaatatatggtgtctatagtacaaaataatggagaagttggaggagatgtaaaccatagaattca 12904723  T
Q  163 agctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgtttt 201  Q
    || | ||||||||||||  |  || ||||||||||||||    
T  12904724 agttaggtggttgaaataaacgagtgtctcaggtgtttt 12904762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 54 - 108
Target Start/End: Original strand, 876778 - 876833
Alignment:
Q  54 gaggtgaaagttggagatcatatcatacc-caagttacacggtttaaatatcttgg 108  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||| ||||    
T  876778 gaggtgaaagttggagatcatatcctaccacaagttacacagtttaaatatgttgg 876833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 54 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 7135321 - 7135220
Alignment:
Q  54 gaggtgaaagttggagatcatatcatacc-caagttacacggtttaaatatcttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaatt 152  Q
    ||||||||| || || ||||||||||||| |||||||||| ||| |||  ||||||||||| | |||||||  ||  ||||||||||| ||| |||||||    
T  7135321 gaggtgaaatttagatatcatatcataccacaagttacacagttaaaaagtcttgggtccacagtacaaaacaataaagaaatagaagtagaagtaaatt 7135222  T
Q  153 at 154  Q
    ||    
T  7135221 at 7135220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 45 - 183
Target Start/End: Original strand, 28317383 - 28317517
Alignment:
Q  45 tctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcatacccaagttacacggtttaaatatcttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcaga 144  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||    |||| |||||  |||| |||| |||| ||  || |||||||||||||| ||| ||||| |||    
T  28317383 tctagcttagaggtgaaagttggagatcatatca----caaggtacacaatttatatattttggatctgtagtacaaaatgatggataaaaagaagtaga 28317478  T
Q  145 tgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggag 183  Q
    |||| |  || | || ||||||| |||||||||| ||||    
T  28317479 tgtataccattgaatccaagctgagtggttgaaacggag 28317517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 5 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 13593031 - 13592930
Alignment:
Q  5 ggtatatggaatgtaacttcaacaaaaggagaagtgtgggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcatacccaagttacacggtttaaatatc 104  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||  |||||   | || | ||| ||||||||||||| |||||||||||||   ||||||||| ||||| |||||    
T  13593031 ggtatgtgtaatgtaacttcaacaaaagacgaagta--gttcaaacttagaggtgaaagttgaagatcatatcata--gaagttacacagtttagatatc 13592936  T
Q  105 ttgggt 110  Q
    ||||||    
T  13592935 ttgggt 13592930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 57 - 201
Target Start/End: Original strand, 6465370 - 6465515
Alignment:
Q  57 gtgaaagttggagatcatatcatacc-caagttacacggtttaaatatcttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatc 155  Q
    |||||||||||||||||||| | | | ||||||||||  ||| ||||| ||||    ||| ||||||||||  ||||||| |||||| ||| |||| |||    
T  6465370 gtgaaagttggagatcatattaaaacacaagttacacaattttaatattttggcattatactacaaaatgactgagaaattgaagcatatgcaaatcatc 6465469  T
Q  156 gtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgtttt 201  Q
      |||||||   ||||| ||| |||||||||||||| || ||||||    
T  6465470 aaattcaagtcaggtggctgagatggagaagagtcttagctgtttt 6465515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 93 - 201
Target Start/End: Original strand, 7292673 - 7292782
Alignment:
Q  93 ggtttaaatatcttggg-tccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtct 191  Q
    ||||||||||||| ||| || ||| |||||| ||| || | |||||||| |||||||||  |||  || |||| ||||||||||||||| || || | ||    
T  7292673 ggtttaaatatctcggggtctatagtacaaactgacgggggaatagaaggagatgtaaaccatcaaatccaagttgggtggttgaaatgaaggagtgact 7292772  T
Q  192 caggtgtttt 201  Q
    ||||||||||    
T  7292773 caggtgtttt 7292782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 228 - 320
Target Start/End: Original strand, 32443436 - 32443527
Alignment:
Q  228 tgaaagaaaggttttatcggacagcagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaagagccaacacgagagtaaagtaa 320  Q
    |||||||||  || ||||| | |||||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||| |||| ||||||||  |||||||||| | ||||||    
T  32443436 tgaaagaaaaattctatcgtatagcagtcaaacc-acaatgttgtatggtacagagtgttgggtggttaagaatcaacacgagaatcaagtaa 32443527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 223; Significance: 1e-123; HSPs: 49)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 27450860 - 27450521
Alignment:
Q  1 acggggtatatggaatgtaacttcaacaaaaggagaagtgtgggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcataccc-aagttacacggtttaa 99  Q
    |||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||     
T  27450860 acggagtatttggaatgtaacttcagcaaaaggagaagtg--ggtataccttggaggtgaaagttggagatcatatcataccccaagttacacagtttac 27450763  T
Q  100 atatcttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgtt 199  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  27450762 atatcttgggtccatagtgcaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaatcatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagcctcaagtgtt 27450663  T
Q  200 ttgtgcgataagaaaaaaccacttaagctgaaagaaaggttttatcggacagcagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaaga 299  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||  || |||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||    
T  27450662 ttgtgcgataagaaagtaccacttaagctgaaaggaaaattctatcagacaacagtcagaccgacaatgttgtatggtacggagtgttgggcagttaaga 27450563  T
Q  300 gccaacacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgt 341  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||    
T  27450562 gccaacacgagagtaaagtaagtgtagcggagatgaggatgt 27450521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 23906988 - 23906649
Alignment:
Q  1 acggggtatatggaatgtaacttcaacaaaaggagaagtgtgggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcataccc-aagttacacggtttaa 99  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23906988 acggagtatatggaatgtaacttcaacggaaggagaagta--ggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcataccccaagttacacggtttaa 23906891  T
Q  100 atatcttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgtt 199  Q
    ||||||||||||| |  |||||||||| ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23906890 atatcttgggtccttcgtacaaaatgacggagaaatagaagcagatgtaagccatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagcctcaggtgtt 23906791  T
Q  200 ttgtgcgataagaaaaaaccacttaagctgaaagaaaggttttatcggacagcagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaaga 299  Q
    |||||||||||||||  |||||||||| |||||| || ||| ||||||||||||||| ||||| |  ||||||| |||||| |||| |||||||||||||    
T  23906790 ttgtgcgataagaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttctatcggacagcagtccgaccggcgttgttgtatggtacgaagtgttgggcggttaaga 23906691  T
Q  300 gccaacacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgt 341  Q
    | ||||| |||| | |||||||| || | ||||||| |||||    
T  23906690 gtcaacatgagaatcaagtaagtgtagcagagatgaggatgt 23906649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 341
Target Start/End: Original strand, 435824 - 436163
Alignment:
Q  1 acggggtatatggaatgtaacttcaacaaaaggagaagtgtgggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcataccc-aagttacacggtttaa 99  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |  ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  435824 acggagtatatggaatgtaacttcagcggaaggagaagta--ggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcataccccaagttacacggtttaa 435921  T
Q  100 atatcttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgtt 199  Q
    ||||||||||||| |  || ||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  435922 atatcttgggtccttcgtataaaatgacggagaaatagaagcagatgtaagtcatcgtattcaagctgagtggttgaaatggagaagagcctcaggtgtt 436021  T
Q  200 ttgtgcgataagaaaaaaccacttaagctgaaagaaaggttttatcggacagcagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaaga 299  Q
    |||||||||||||||  |||||||||| |||||| || ||| ||||||||||||||| ||||| |  ||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  436022 ttgtgcgataagaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttctatcggacagcagtccgaccggcgttgttgtatggtacggagtgttgggcggttaaga 436121  T
Q  300 gccaacacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgt 341  Q
    | ||||| |||| | |||||||| || | ||||||| |||||    
T  436122 gtcaacatgagaatcaagtaagtgtagcagagatgaggatgt 436163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 6 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 31960496 - 31960162
Alignment:
Q  6 gtatatggaatgtaacttcaacaaaaggagaagtgtgggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcataccc-aagttacacggtttaaatatc 104  Q
    |||||||||||||||||||| |  ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  31960496 gtatatggaatgtaacttcagcggaaggagaagta--ggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcataccccaatttacacggtttaaatatc 31960399  T
Q  105 ttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgttttgtg 204  Q
    |||||||| |  |||||||||| ||||||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||    
T  31960398 ttgggtccttcgtacaaaatgacggagaaatagaagcagatgtaagccatcatattcaagctgggtggttgaaatggagaagagcctcatatgttttgtg 31960299  T
Q  205 cgataagaaaaaaccacttaagctgaaagaaaggttttatcggacagcagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaagagccaa 304  Q
    ||||||||||  |||||||||| |||||| || ||| ||||||||||||||||||||| |  ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  31960298 cgataagaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttctatcggacagcagtcagaccggcgttgttgtatggtacggagtgttgggcggttaagagtcaa 31960199  T
Q  305 cacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgt 341  Q
    || |||| | |||||||| || | ||||||| |||||    
T  31960198 catgagaatcaagtaagtgtagcagagatgaggatgt 31960162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 6 - 341
Target Start/End: Original strand, 33226809 - 33227143
Alignment:
Q  6 gtatatggaatgtaacttcaacaaaaggagaagtgtgggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcataccc-aagttacacggtttaaatatc 104  Q
    |||||||||||||||||||| |  ||||| ||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  33226809 gtatatggaatgtaacttcagcggaaggacaagta--ggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcataccccaagttacacggtttaaatatc 33226906  T
Q  105 ttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgttttgtg 204  Q
    |||||||| |  |||||||||| ||||||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  33226907 ttgggtccttcgtacaaaatgacggagaaatagaagcagatgtaagccatcatattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgttttgta 33227006  T
Q  205 cgataagaaaaaaccacttaagctgaaagaaaggttttatcggacagcagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaagagccaa 304  Q
    ||||||||||  |||||||||| |||||| || ||| ||||||||||||||| ||||| |  ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  33227007 cgataagaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttctatcggacagcagtccgaccggcgttgttgtatggtacggagtgttgggcggttaagagtcaa 33227106  T
Q  305 cacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgt 341  Q
    || |||| | | |||||| || | ||||||| |||||    
T  33227107 catgagaatcatgtaagtgtagcagagatgaggatgt 33227143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 48174780 - 48174457
Alignment:
Q  1 acggggtatatggaatgtaacttcaacaaaaggagaagtgtgggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcataccc-aagttacacggtttaa 99  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |  ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  48174780 acggagtatatggaatgtaacttcagcggaaggagaagta--ggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcataccccaagttacacggtttaa 48174683  T
Q  100 atatcttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgtt 199  Q
    ||||||||||||| |  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  48174682 atatcttgggtccttcgtacaaagtgacggagaaatagaagcagatgtaagccatcgtattcaagctaggtggttgaaatggagaagagcctcaggtgtt 48174583  T
Q  200 ttgtgcgataagaaaaaaccacttaagctgaaagaaaggttttatcggacagcagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaaga 299  Q
    |||||| ||||||||  |||||||||| |||||| || ||| ||||||||||||||||||||| |  ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  48174582 ttgtgcaataagaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttctatcggacagcagtcagaccggcgttgttgtatggtacggagtgttggacggttaaga 48174483  T
Q  300 gccaacacgagagtaaagtaagtata 325  Q
    | ||||| || | | |||||||||||    
T  48174482 gtcaacatgaaaatcaagtaagtata 48174457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 1777702 - 1777379
Alignment:
Q  1 acggggtatatggaatgtaacttcaacaaaaggagaagtgtgggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcataccc-aagttacacggtttaa 99  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |  ||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  1777702 acggagtatatggaatgtaacttcagcggaaggagaagta--ggtctaccttggaggtgaaagttggaaatcatatcataccccaagttacacgttttaa 1777605  T
Q  100 atatcttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgtt 199  Q
    ||||||||||||| |  ||||||||||  |||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1777604 atatcttgggtccttcgtacaaaatgacagagaaatagaagcaaatgtaagtcatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagcctcaggtgtt 1777505  T
Q  200 ttgtgcgataagaaaaaaccacttaagctgaaagaaaggttttatcggacagcagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaaga 299  Q
    |||||||||||||||  |||||||||| |||||| || ||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| | ||||||||| ||   ||||||||    
T  1777504 ttgtgcgataagaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttctatcggacagcagtcagaccgacgttgttgtatgatacggagtgttgaaaggttaaga 1777405  T
Q  300 gccaacacgagagtaaagtaagtata 325  Q
    | ||||| || | | |||||||||||    
T  1777404 gtcaacatgaaaatcaagtaagtata 1777379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 311
Target Start/End: Original strand, 56374885 - 56375194
Alignment:
Q  1 acggggtatatggaatgtaacttcaacaaaaggagaagtgtgggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcataccc-aagttacacggtttaa 99  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |  ||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  56374885 acggagtatatggaatgtaacttcagcggaaggagaagta--ggtctaccttggaggtgaaagttggagagcatatcataccccaagttacacggtttaa 56374982  T
Q  100 atatcttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgtt 199  Q
    ||||||||||||| |  |||||||||| |||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  56374983 atatcttgggtccttcgtacaaaatgacggagaaatagaagcagatataagccatcgtattcaagctgggtggttgaaattgagaagagcctcaggtgtt 56375082  T
Q  200 ttgtgcgataagaaaaaaccacttaagctgaaagaaaggttttatcggacagcagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaaga 299  Q
    |||||||||||||||  |||||||||  |||||| || | | ||||||||||||||||||||  |  | ||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  56375083 ttgtgcgataagaaagtaccacttaatttgaaaggaaagatctatcggacagcagtcagaccagcgttattgtatggtacggagtgttgggcggttaaga 56375182  T
Q  300 gccaacacgaga 311  Q
    | ||||| ||||    
T  56375183 gtcaacatgaga 56375194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 48623214 - 48622954
Alignment:
Q  1 acggggtatatggaatgtaacttcaacaaaaggagaagtgtgggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcataccc-aagttacacggtttaa 99  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |  ||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||| |||||    
T  48623214 acggagtatatggaatgtaacttcagcggaaggagaagta--ggtctaccttggaggtgaaagttggagagcatatcataccccaaattacacgatttaa 48623117  T
Q  100 atatcttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgtt 199  Q
    ||||||||||||| |  |||||||||| ||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  48623116 atatcttgggtccttcgtacaaaatgacggagaaatagaagcagatgtaagccatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaaaagcctcaggtgtt 48623017  T
Q  200 ttgtgcgataagaaaaaaccacttaagctgaaagaaaggttttatcggacagcagtcagaccg 262  Q
    |||||||||||||||  |||||||||| |||||| || ||| |||||||||||||||||||||    
T  48623016 ttgtgcgataagaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttctatcggacagcagtcagaccg 48622954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 341
Target Start/End: Original strand, 53707389 - 53707728
Alignment:
Q  1 acggggtatatggaatgtaacttcaacaaaaggagaagtgtgggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcataccc-aagttacacggtttaa 99  Q
    |||| |||||| |||||||||||||    ||||||||||   |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  53707389 acggagtatatcgaatgtaacttcagtggaaggagaagta--ggtctaccttggaggtgaaagttgaagatcatatcataccccaagttacacggtctaa 53707486  T
Q  100 atatcttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgtt 199  Q
    ||||||||||||| |  |||||||||| ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  53707487 atatcttgggtccttcgtacaaaatgacggagaaatagaagcagatgtaagccatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagactcagatgtt 53707586  T
Q  200 ttgtgcgataagaaaaaaccacttaagctgaaagaaaggttttatcggacagcagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaaga 299  Q
    |||||||||||||||  |||||||||| |||||| || ||| |||||| ||||| || ||||| |  || |||| ||||  ||||| |||||||||||||    
T  53707587 ttgtgcgataagaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttctatcggccagcattccgaccggcgttgatgtatggtagagagtgttgggcggttaaga 53707686  T
Q  300 gccaacacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgt 341  Q
    | ||||| |||| | |||||||| || | ||||||| |||||    
T  53707687 gtcaacatgagaatcaagtaagtgtagcagagatgaggatgt 53707728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 322
Target Start/End: Original strand, 39708052 - 39708373
Alignment:
Q  1 acggggtatatggaatgtaacttcaacaaaaggagaagtgtgggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcatacc-caagttacacggtttaa 99  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |   |||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||  ||||||||    
T  39708052 acggagtatatggaatataacttcagcaaaaggagaatta--ggtctatcttggaggtgaaatttggagatcatattatacctcaagttatgcggtttaa 39708149  T
Q  100 atatcttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggt-gt 198  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| || |||| ||    
T  39708150 atatcttgggtcgatagtacaaaatgacggagaaatagaagcaggtgtaaatcctcgtattcaagctggatggttgaaatggataagagccttaggtggt 39708249  T
Q  199 tttgtgcgataagaaaaaaccacttaagctgaaagaaaggttttatcggacagcagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaag 298  Q
    ||| || |||||||||  |||||||||| |||||| || ||| |||||| || ||||| || ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  39708250 tttttgtgataagaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttctatcgggcaacagtccgatcgacaatgttgtatggtacggagtgttgggcggttaag 39708349  T
Q  299 agccaacacgagagtaaagtaagt 322  Q
    || |||||||||| | ||||||||    
T  39708350 aggcaacacgagaatcaagtaagt 39708373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 9 - 322
Target Start/End: Original strand, 16002532 - 16002842
Alignment:
Q  9 tatggaatgtaacttcaacaaaaggagaagtgtgggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcataccc-aagttacacggtttaaatatcttg 107  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||||||  |  |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||    
T  16002532 tatggaatataactttagcaaaaggagaagttag--tctaccttggaggtaaaagttggaaatcatatcataccccaaattacacggtttaaa-atcttg 16002628  T
Q  108 ggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgttttgtgcga 207  Q
    | |||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||    
T  16002629 gttccatagtacaaaatgacggagacatagaagcagatgtaaatcatcgtatttaagctgagtggttgaaattgagaagagcctcaggtgttttgtgtga 16002728  T
Q  208 taagaaaaaaccacttaagctgaaagaaaggttttatcggacagcagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaagagccaacac 307  Q
    |||||||  |||||||||| | ||||||| |||||||| |||| |||| |||||  | ||||||| | | ||| |||| |||| ||||||||| ||||||    
T  16002729 taagaaagtaccacttaagttcaaagaaaagttttatcagacatcagttagaccagcgatgttgt-atgaacgaagtgttgggaggttaagagtcaacac 16002827  T
Q  308 gagagtaaagtaagt 322  Q
    |||| | ||||||||    
T  16002828 gagaatcaagtaagt 16002842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 62 - 335
Target Start/End: Original strand, 50286625 - 50286899
Alignment:
Q  62 agttggagatcatatcataccc-aagttacacggtttaaatatcttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtatt 160  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||| |  |||||||||| ||||||||||||||||||||||   ||||||||    
T  50286625 agttggagatcatatcataccccaagttacacggtttaaatatattgtgtccttcgtacaaaatgacggagaaatagaagcagatgtaagccatcgtatt 50286724  T
Q  161 caagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgttttgtgcgataagaaaaaaccacttaagctgaaagaaaggttttatcggacagcagtcagac 260  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||  |||| ||||| |||||| || ||| ||||||||| | ||||||     
T  50286725 caagctgggtggttgaaatgaagaagagtcacatgtgttttgtgcgataagaaagtaccatttaagttgaaaggaaagttctatcggacaaccgtcagat 50286824  T
Q  261 cgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaagagccaacacgagagtaaagtaagtataacggagatga 335  Q
    ||||  ||||||| | ||||||||| |||||||||||||| ||||| |||| | |||||||| || | |||||||    
T  50286825 cgacgttgttgtatgatacggagtgttgggcggttaagagtcaacatgagaatcaagtaagtgtagcagagatga 50286899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 6 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 47265886 - 47265580
Alignment:
Q  6 gtatatggaatgtaacttcaacaaaaggagaagtgtgggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcataccc-aagttacacggtttaaatatc 104  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||  |||||||||||    
T  47265886 gtatatgaaatgtaacttcagcaaaaggagaagta--ggtctaccttggaggtgaaagttggaggtcatatcataccccaagttacatagtttaaatatc 47265789  T
Q  105 ttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgttttgtg 204  Q
    |||| |||||| || ||||||| ||||||||||||||| ||||||   ||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||| || ||||||||||||    
T  47265788 ttggatccatagtataaaatgacggagaaatagaagcaaatgtaagccatcgt-ttcaagctgggtgattgaaatgaagaagagccttaggtgttttgtg 47265690  T
Q  205 cgataagaa---aaaaccacttaagctgaaagaaaggttttatcggacagcagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaagagc 301  Q
    |||||||||   |  |||||||||| |||||  || ||| |||| |||| ||||||||||  | |||||||| |||||  |||  ||| ||||||||||     
T  47265689 cgataagaaagtagtaccacttaagttgaaatgaaagttctatctgacaacagtcagaccagcgatgttgtatggtacaaagtattggacggttaagagt 47265590  T
Q  302 caacacgaga 311  Q
    ||||||||||    
T  47265589 caacacgaga 47265580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 63 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 1212017 - 1211738
Alignment:
Q  63 gttggagatcatatcatacccaa-gttacacggtttaaatatcttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtattc 161  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||||||  |||||||||||||| ||||||| |||||||| |  ||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  1212017 gttggagatcatatcataccttacgttacatagtttaaatatcttgtgtccatagtacaaaataacagagaaatagaagcaggtgtaaatcatcgtattc 1211918  T
Q  162 aagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgttttgtgcgataagaaaaaaccacttaagctgaaagaaaggttttatcggacagcagtcagacc 261  Q
    ||| | ||| ||||||||||||||||| ||||  ||||||||  |||||||||| |||||||||| |||||| || ||| ||||||||| ||||||||||    
T  1211917 aagttaggtagttgaaatggagaagagcctcaaatgttttgtatgataagaaaataccacttaagttgaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacc 1211818  T
Q  262 gacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaagagccaacacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgt 341  Q
    |   |||||||  ||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| || |||| |||| |||||    
T  1211817 ggtgatgttgtgtggtacagagtgttggacggttaagagccaacacgagaatcaagtaagtgtagcggatatgaggatgt 1211738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 132 - 341
Target Start/End: Original strand, 43433643 - 43433852
Alignment:
Q  132 aaatagaagcagatgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgttttgtgcgataagaaaaaaccacttaagctgaa 231  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    |||||||| ||||    
T  43433643 aaatagaagcagatgtaaaccatcgtattcaagctgggtgattgaaatggagaagagcctcaggtgttttgtgcgataagaaagtgtcacttaagttgaa 43433742  T
Q  232 agaaaggttttatcggacagcagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaagagccaacacgagagtaaagtaagtataacggag 331  Q
    || || ||| |||||||||||| |||||||| |  ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||| | |||||||| || | |||    
T  43433743 aggaaagttctatcggacagcaatcagaccggcgttgttgtatggtacggagtgttgggcggttaagagtcaacatgagaatcaagtaagtgtagcagag 43433842  T
Q  332 atgatgatgt 341  Q
    |||| |||||    
T  43433843 atgaggatgt 43433852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 117 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 46583396 - 46583172
Alignment:
Q  117 tacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgttttgtgcgataagaaaaa 216  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||      
T  46583396 tacaaaatgacggagaaatagaagcagatgtaagccatcatattcaagctgggtggttgaaatggagaagagcctcaggtattttgtgcgataagaaagt 46583297  T
Q  217 accacttaagctgaaagaaaggttttatcggacagcagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaagagccaacacgagagtaaa 316  Q
    | |||||||  |||||| || ||| ||| |||||||||||||| || |  ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||| | ||    
T  46583296 atcacttaatttgaaaggaaagttctattggacagcagtcagatcggcgctgttgtatggtacggagtgttgggcggttaagagtcaacatgagaatcaa 46583197  T
Q  317 gtaagtataacggagatgatgatgt 341  Q
    |||||| || | ||||||| |||||    
T  46583196 gtaagtgtagcagagatgaggatgt 46583172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 120 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 41009922 - 41009698
Alignment:
Q  120 aaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaag---agtctcaggtgttttgtgcgataagaaaaa 216  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||| | |||||||||||||||||||   | ||| ||||| |||||  ||||||||||     
T  41009922 aaaatgacggagaaatagaagcaaatgtaaatcttcgtattcaagttaggtggttgaaatggagaagattaatctgaggtgatttgtatgataagaaaat 41009823  T
Q  217 accacttaagctgaaagaaaggttttatcggacagcagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaagagccaacacgagagtaaa 316  Q
    |||||||||| ||  | ||| ||| ||| ||||| || |||||||  | ||||||||  |||||||||| |||||| ||||||||||||| |||| | ||    
T  41009822 accacttaagttgggaaaaaagttctattggacaacaatcagaccagcgatgttgtatagtacggagtgttgggcgattaagagccaacatgagaatcaa 41009723  T
Q  317 gtaagtataacggagatgatgatgt 341  Q
    |||||| || |||| |||| |||||    
T  41009722 gtaagtgtagcggaaatgaggatgt 41009698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 45 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 17666680 - 17666526
Alignment:
Q  45 tctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcatacccaagttacacggtttaaatatcttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcaga 144  Q
    |||| ||| |||||||| ||| |||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||| || | |||||||||  | ||||||| ||||| |    
T  17666680 tctatcttagaggtgaacgttagagatcatatcatac--aagttacacagtttaaatatcttgggttcaaagtacaaaatgtcgaagaaataaaagcaaa 17666583  T
Q  145 tgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgtttt 201  Q
    ||||||| |||||||||||| ||| | |||||||||||||||||  ||| |||||||    
T  17666582 tgtaaatcatcgtattcaagttggattgttgaaatggagaagagcatcatgtgtttt 17666526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 57 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 54787878 - 54787741
Alignment:
Q  57 gtgaaagttggagatcatatcatacccaag-ttacacggtttaaatatcttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatc 155  Q
    |||||||||| ||| | ||||| |||| || |||||||||||||||||||| |||||| | |||||||| |  |||||| | |||||||||||||| |||    
T  54787878 gtgaaagttgaagaacgtatcaaaccccagattacacggtttaaatatctttggtccagagtacaaaatcacagagaaaaaaaagcagatgtaaataatc 54787779  T
Q  156 gtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctca 193  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  54787778 gtatttaagttgggtggttgaaatggagaatagtctca 54787741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 54 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 10776055 - 10775975
Alignment:
Q  54 gaggtgaaagttggagatcatatcatacc-caagttacacggtttaaatatcttgggtccataatacaaaatgatggagaa 133  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10776055 gaggggaaagttggagatcatatcataccacaagttacatggtttaaatatcttgggtctataatacaaaatgatggagaa 10775975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 61 - 184
Target Start/End: Original strand, 1629084 - 1629208
Alignment:
Q  61 aagttggagatcatatcatacc-caagttacacggtttaaatatcttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtat 159  Q
    ||||| ||||||||||| | || |||||||||  ||||||||||||||  | |||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1629084 aagtttgagatcatatcgtgccacaagttacatagtttaaatatcttgaattcatagtataaaacgatggagaaatagaagcagatgtaaatcatcgtat 1629183  T
Q  160 tcaagctgggtggttgaaatggaga 184  Q
    ||||  || ||||||||||||||||    
T  1629184 tcaacttgagtggttgaaatggaga 1629208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 96 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 54914781 - 54914618
Alignment:
Q  96 ttaaatatcttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcagg 195  Q
    |||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||| |||||||||||  | ||||||||     ||||||||||||||||| || ||  ||    
T  54914781 ttaaatatcttgggtccatggtataaaatgatggagaaatagaaacagatgtaaatccttgtattcaaatcatgtggttgaaatggagaaaag-ctttgg 54914683  T
Q  196 tgttttgtgcgataagaaaaaaccacttaagctgaaagaaaggttttatcggacagcagtcagac 260  Q
    |||||| || |||||||||| |||||||||| |||||| ||  || |||||| ||| ||||||||    
T  54914682 tgttttatgtgataagaaaataccacttaagttgaaaggaaaattctatcggtcaggagtcagac 54914618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 95 - 311
Target Start/End: Original strand, 55578722 - 55578935
Alignment:
Q  95 tttaaatatcttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcag 194  Q
    |||||||||||||| || ||| || |||||||  |||||||||||||| |  ||||| |||||||| ||| | ||||||| ||||||||||||   ||||    
T  55578722 tttaaatatcttggatctatagtataaaatgactgagaaatagaagcatacataaatcatcgtatttaagttaggtggttaaaatggagaagatcttcag 55578821  T
Q  195 gtgttttgtgcgataagaaaaaaccacttaagctgaaagaaaggttttatcggacagcagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggt 294  Q
     |||||| || ||||| |      | |||||| || ||| ||  || ||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||| | |||| ||||||||    
T  55578822 atgttttatgtgataacatgt---cgcttaagttggaaggaaaattctatcggacaacagtcagaccaacaatgttgtatggtatgaagtgttgggcggt 55578918  T
Q  295 taagagccaacacgaga 311  Q
    ||||| |||||||||||    
T  55578919 taagaaccaacacgaga 55578935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 54 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 39755007 - 39754782
Alignment:
Q  54 gaggtgaaagttggagatcatatcatacc-caagttacacggtttaaatatcttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaatt 152  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||  |||||||||| |||||| ||| ||||||| ||   ||||||||||| ||||||||||     
T  39755007 gaggtgaaagttgaagatcatatcataccacaagtcacacactttaaatatcatgggtctatagtacaaaacgacaaagaaatagaaggagatgtaaatc 39754908  T
Q  153 atcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgttttgtgcgataagaaaaaaccacttaagctgaaagaaaggttttatcggacagc 252  Q
    || | || |||| |  |||||||||||| |  || | |||| ||||||| || |||  ||||| |||||||||| |||| |||   ||||||| |||| |    
T  39754907 attgaatccaagtttagtggttgaaatgaaccagtgcctcaagtgttttatgtgatgcgaaaataccacttaagttgaaggaattattttatcagacaac 39754808  T
Q  253 agtcagaccgacaatgttgtaaggta 278  Q
     ||  ||||||| |||||||| ||||    
T  39754807 ggtatgaccgacgatgttgtacggta 39754782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 47 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 17667969 - 17667817
Alignment:
Q  47 taccttggaggtgaaagttggagatcatatcatacccaagttacacggtttaaatatcttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatg 146  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| |  |||||||||| |||||| |||| ||||||||||   ||||||| | ||| |||    
T  17667969 taccttagaggtgaaagttggatatcatatcatac--aagttatatagtttaaatatattgggttcatagtacaaaatgacttagaaataaacgcaaatg 17667872  T
Q  147 taaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgtttt 201  Q
    ||||| |||||||||||| ||| ||||  |||| ||||| |   |||||||||||    
T  17667871 taaatcatcgtattcaagttggatggtataaatagagaaaaacttcaggtgtttt 17667817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 54 - 140
Target Start/End: Original strand, 30807244 - 30807331
Alignment:
Q  54 gaggtgaaagttggagatcatatcatacc-caagttacacggtttaaatatcttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaag 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | | | ||| ||| ||||||||||  ||||||||||||    
T  30807244 gaggtgaaagttggagatcatatcataccacaagttacacggtttaaatgtttggagtctatagtacaaaatgactgagaaatagaag 30807331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 144 - 341
Target Start/End: Original strand, 35690042 - 35690238
Alignment:
Q  144 atgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgttttgtgcgataagaaaaaaccacttaagctgaaagaaaggtttta 243  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  | |||||||| || |||||||||   ||  ||||| ||| || ||  || ||    
T  35690042 atgtaaatcatcgtattcaagttgggtggttgaaatggagaagagt-gcgggtgttttatgtgataagaaagtgccgtttaagttgagaggaaaattcta 35690140  T
Q  244 tcggacagcagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaagagccaacacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgt 341  Q
    || |||| |||| |||||||| |||||||| | || ||| || || | |||||||| |||||| |||| | |||||||| || | ||||||| |||||    
T  35690141 tcagacaacagttagaccgacgatgttgtatgatatggaatgttgtgtggttaagaaccaacatgagaatcaagtaagtgtagccgagatgaggatgt 35690238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 55 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 7092847 - 7092719
Alignment:
Q  55 aggtgaaagttggagatcatatcataccc-aagttacacggtttaaatatcttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaatta 153  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |  || |||||||||||||||||  |||||| ||| || ||||| | | | ||||||| ||||||||| || |    
T  7092847 aggtgaaagttgaagatcatatcatatcttaaattacacggtttaaatattgtgggtctatagtataaaataacgaataaatagatgcagatgtacatca 7092748  T
Q  154 tcgtattcaagctgggtggttgaaatgga 182  Q
    |  |||||||| |||||||||||||||||    
T  7092747 tattattcaagttgggtggttgaaatgga 7092719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 80 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 52280807 - 52280695
Alignment:
Q  80 acccaagttacacggtttaaatatcttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaat 179  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| ||||||| | | |||||||| | |||||||  ||||||  ||||||| |||||||||| | || |||||||||||    
T  52280807 acccaggttacacgatttaaatattttgggtctaaagtacaaaataaaggagaaactgaagcaagtgtaaataatcgtattcacgttgtgtggttgaaat 52280708  T
Q  180 ggagaagagtctc 192  Q
    ||||||| |||||    
T  52280707 ggagaagggtctc 52280695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 57 - 150
Target Start/End: Original strand, 42037510 - 42037604
Alignment:
Q  57 gtgaaagttggagatcatatcatacc-caagttacacggtttaaatatcttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaa 150  Q
    |||||| ||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||  || ||| ||||||||||  |||||||| ||| |||||||||    
T  42037510 gtgaaatttgaagatcatatcatcccacaagttacacggtttaaatatcttgaatctatagtacaaaatgactgagaaatataaggagatgtaaa 42037604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 128 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 45185542 - 45185477
Alignment:
Q  128 ggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctca 193  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||  |||||||||| ||||||||| ||||    
T  45185542 ggagaaatagaagcagatgtaaatcattgtattcaagcttagtggttgaaagggagaagagcctca 45185477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 56 - 187
Target Start/End: Original strand, 20917630 - 20917762
Alignment:
Q  56 ggtgaaagttggagatcatatcataccc-aagttacacggtttaaatatcttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattat 154  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||   | |||||| || ||||  | |||||||||||| || |||||| | ||    
T  20917630 ggtgaaagttgaagatcatatcataccataagttacacagtttaaatatccgagctccatagtataaaacaacggagaaatagaaacatatgtaagtcat 20917729  T
Q  155 cgtattcaagctgggtggttgaaatggagaaga 187  Q
    || |||||| || | ||||| ||||||||||||    
T  20917730 cgaattcaatctagatggttaaaatggagaaga 20917762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 214
Target Start/End: Original strand, 3273098 - 3273229
Alignment:
Q  83 caagttacacggtttaaatatcttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatgga 182  Q
    ||||||||||  |||||| ||||| |||||||| ||||||| ||   ||||||||||||| || ||||  |||| ||||||| ||| |||||||||||||    
T  3273098 caagttacacaatttaaacatcttaggtccatagtacaaaacgacaaagaaatagaagcaaatataaaccatcgaattcaagttggatggttgaaatgga 3273197  T
Q  183 gaagagtctcaggtgttttgtgcgataagaaa 214  Q
    || ||| ||||  |||||| || |||| ||||    
T  3273198 gatgagcctcatttgttttatgtgatacgaaa 3273229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 239 - 321
Target Start/End: Original strand, 11389552 - 11389634
Alignment:
Q  239 ttttatcggacagcagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaagagccaacacgagagtaaagtaag 321  Q
    |||||||||||||  || ||||||||||||||||| || | | |||| ||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  11389552 ttttatcggacagttgtaagaccgacaatgttgtatggaaagtagtgttgggcggttaagaaccaactcgagaataaagtaag 11389634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 267 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 26037904 - 26037836
Alignment:
Q  267 tgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaagagccaacacgagagtaaagtaagtataacggagatga 335  Q
    ||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||  | |||||||||    
T  26037904 tgttgtatgatacggagtgttgggcggttaagagccaacacgagaatcaagtaagtggagcggagatga 26037836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 257 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 45205280 - 45205196
Alignment:
Q  257 agaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaagagccaacacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgt 341  Q
    |||||| | |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| | |||||||  || ||||||||| |||||    
T  45205280 agaccggcgatgttgtatggtacggagtgttgggcagttaagaaccaacacgagaatcaagtaagcgtagcggagatgaggatgt 45205196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 45 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 55769022 - 55768963
Alignment:
Q  45 tctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcatacc-caagttacacggtttaaatat 103  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  55769022 tctaccttagaggtgaaagttgaagatcatgtcataccacaagtaacacggtttaaatat 55768963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 45 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 55833278 - 55833219
Alignment:
Q  45 tctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcatacc-caagttacacggtttaaatat 103  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  55833278 tctaccttagaggtgaaagttgaagatcatgtcataccacaagtaacacggtttaaatat 55833219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 263 - 341
Target Start/End: Original strand, 1793316 - 1793394
Alignment:
Q  263 acaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaagagccaacacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgt 341  Q
    ||||||||||| | ||| ||||| | ||||||||||||||||||| ||| | |||||||| || ||||||||| |||||    
T  1793316 acaatgttgtatgatacagagtgtttggcggttaagagccaacactagaatcaagtaagtgtagcggagatgaggatgt 1793394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 45 - 122
Target Start/End: Original strand, 30853053 - 30853131
Alignment:
Q  45 tctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcatacc-caagttacacggtttaaatatcttgggtccataatacaaa 122  Q
    |||| ||| ||| ||||| ||||||| ||| ||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  30853053 tctagcttagagttgaaatttggagaacatgtcataccacaagctacacagtttaaatatcttgggtccatagtacaaa 30853131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 57 - 142
Target Start/End: Original strand, 41427488 - 41427574
Alignment:
Q  57 gtgaaagttggagatcatatcataccc-aagttacacggtttaaatatcttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagca 142  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| |  |||| |||| ||||| ||||||||| |||||    
T  41427488 gtgaaaattgaagatcatatcataccccaagttacacgacttaaatatcttgtgctcatagtacagaatgacggagaaatataagca 41427574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 217 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 52569987 - 52569882
Alignment:
Q  217 accacttaagctgaaagaaaggttttatcggacagcagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaagagccaacacgagagtaaa 316  Q
    |||||||||| |||||| || ||| ||| ||||| |||||||||||    ||||||| ||||||||||| ||  |||||||||| ||||| |||| | ||    
T  52569987 accacttaagttgaaaggaaagttctattggacaacagtcagaccggtgttgttgtatggtacggagtgttgttcggttaagagtcaacatgagaatcaa 52569888  T
Q  317 gtaagt 322  Q
    ||||||    
T  52569887 gtaagt 52569882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 254 - 322
Target Start/End: Original strand, 31458875 - 31458943
Alignment:
Q  254 gtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaagagccaacacgagagtaaagtaagt 322  Q
    ||||||||| | ||||| || ||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| | ||||||||||    
T  31458875 gtcagaccggcgatgttttatggtacggagtgttgggcagttaagaaccaacacgaaaataaagtaagt 31458943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 83 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 8917938 - 8917815
Alignment:
Q  83 caagttacacggtttaaatatcttgggtccata-----atacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaa 177  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||| |||      |||||||||||  |||||||| |||||||  ||||| ||||| |||||| ||| |  |||||    
T  8917938 caagttacacagtttaaatatattgggttcatttaattatacaaaatgacagagaaataaaagcagacataaatcatcgttttcaagttggataattgaa 8917839  T
Q  178 atggagaagagtctcaggtgtttt 201  Q
    || |||||||| |||| |||||||    
T  8917838 attgagaagagcctcaagtgtttt 8917815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 275 - 341
Target Start/End: Original strand, 12494618 - 12494684
Alignment:
Q  275 ggtacggagtgctgggcggttaagagccaacacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgt 341  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||| | |||||||| || | ||||||| |||||    
T  12494618 ggtacggagtgttgggcggttaagagtcaacatgagaatcaagtaagtgtagcagagatgaggatgt 12494684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 275 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 39100947 - 39100881
Alignment:
Q  275 ggtacggagtgctgggcggttaagagccaacacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgt 341  Q
    ||||| ||||| ||| | ||||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||||| |||||    
T  39100947 ggtacagagtgttggacagttaagagccaacacgagagtcatgtaagtgtagcggagatgaggatgt 39100881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 233 - 322
Target Start/End: Original strand, 4440682 - 4440770
Alignment:
Q  233 gaaaggttttatcggacagcagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaagagccaacacgagagtaaagtaagt 322  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||| | ||||| ||| | |||||||||||| ||||| |||| | ||||||||    
T  4440682 gaaaagttctatcggacagcagtcagaccaacgttgttgtatgatacggggtg-ttggcggttaagagtcaacatgagaatcaagtaagt 4440770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 290 - 335
Target Start/End: Original strand, 27983083 - 27983128
Alignment:
Q  290 gcggttaagagccaacacgagagtaaagtaagtataacggagatga 335  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| || |||||||||    
T  27983083 gcggttaagagtcaacatgagagtaaagtaagtgtagcggagatga 27983128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 223; Significance: 1e-123; HSPs: 29)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 341
Target Start/End: Original strand, 25190974 - 25191313
Alignment:
Q  1 acggggtatatggaatgtaacttcaacaaaaggagaagtgtgggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcata-cccaagttacacggtttaa 99  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25190974 acggagtatatggaatgtaacttcagcaaaaggagaagtg--ggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcatagcccaagttacacggtttaa 25191071  T
Q  100 atatcttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgtt 199  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25191072 atatcttgggtctatagtacaaaatgatggagaaatagaagcaaatgtaaatcatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgtt 25191171  T
Q  200 ttgtgcgataagaaaaaaccacttaagctgaaagaaaggttttatcggacagcagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaaga 299  Q
    |||||||||||||||  |||||||||| |||||| |||||| ||||| |||  ||||||||||  ||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||    
T  25191172 ttgtgcgataagaaagtaccacttaagttgaaaggaaggttctatcgaacaatagtcagaccggaaatgttgtatggtacagagtgttgggctgttaaga 25191271  T
Q  300 gccaacacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgt 341  Q
    | ||||||||||||||||||||| || | ||||||| |||||    
T  25191272 gtcaacacgagagtaaagtaagtgtagcagagatgaggatgt 25191313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 341
Target Start/End: Original strand, 38849689 - 38850028
Alignment:
Q  1 acggggtatatggaatgtaacttcaacaaaaggagaagtgtgggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcatacc-caagttacacggtttaa 99  Q
    |||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  38849689 acggagtatatggaatgtaactacatcaaaaggagaagta--ggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcatacctcaatttacacggtttaa 38849786  T
Q  100 atatcttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgtt 199  Q
    |||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||   || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  38849787 atatcttgggtccacagtacaaaatgacggagaaatagaagcagatgtaagccattgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagcctcaggtgtt 38849886  T
Q  200 ttgtgcgataagaaaaaaccacttaagctgaaagaaaggttttatcggacagcagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaaga 299  Q
    ||||||||||| |||  |||||||||| |||||||||  |||||||||||| |||||| |||||| |||||||| |||||  |||| |||||||||||||    
T  38849887 ttgtgcgataacaaagtaccacttaagttgaaagaaattttttatcggacaacagtcacaccgacgatgttgtatggtacaaagtgttgggcggttaaga 38849986  T
Q  300 gccaacacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgt 341  Q
    | |||||||||| | |||||||| || | ||||||| |||||    
T  38849987 gtcaacacgagaatcaagtaagtgtagcagagatgaggatgt 38850028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 51448396 - 51448057
Alignment:
Q  1 acggggtatatggaatgtaacttcaacaaaaggagaagtgtgggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcataccc-aagttacacggtttaa 99  Q
    |||| ||||||| |||||||||||| |  ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  51448396 acggagtatatgaaatgtaacttcagcggaaggagaagta--ggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcataccccaagttacacggtttaa 51448299  T
Q  100 atatcttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgtt 199  Q
    ||||||||||||| |  |||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  51448298 atatcttgggtccttcgtacaaaatgacggagaaatagaagcagatgtaagctatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagcctcgggtgtt 51448199  T
Q  200 ttgtgcgataagaaaaaaccacttaagctgaaagaaaggttttatcggacagcagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaaga 299  Q
    |||||||||||||||  |||||||||| |||||| || ||| ||||||||||||||| |||||||  ||||||| ||||||||||| | |||||||||||    
T  51448198 ttgtgcgataagaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttatatcggacagcagtccgaccgacgttgttgtatggtacggagtgttaggcggttaaga 51448099  T
Q  300 gccaacacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgt 341  Q
    | ||||| |||| | || ||||| || | ||||||| |||||    
T  51448098 gtcaacatgagaatcaactaagtgtagcagagatgaggatgt 51448057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 9 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 47542390 - 47542089
Alignment:
Q  9 tatggaatgtaacttcaacaaaaggagaagtgtgggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcataccc-aagttacacggtttaaatatcttg 107  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  47542390 tatggaatgtaacttcagcagaaggagaagta--ggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatttcataccccaagttacacggtttaaatatcttg 47542293  T
Q  108 ggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgttttgtgcga 207  Q
    ||||| |  |||||||||| ||||||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  47542292 ggtccttcgtacaaaatgacggagaaatagaagcagatgtaagccatcatattcaagctgggtggttgaaatggagaagagcctcaggtgttttgtgcga 47542193  T
Q  208 taagaaaaaaccacttaagctgaaagaaaggttttatcggacagcagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaagagccaacac 307  Q
    |||||||  |||||||||| |||||| || ||| ||||||||||| ||| ||||| |  ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||     
T  47542192 taagaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttctatcggacagcggtctgaccggcgttgttgtatggtacggagtgttgggcagttaagagtcaacat 47542093  T
Q  308 gaga 311  Q
    ||||    
T  47542092 gaga 47542089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 64 - 322
Target Start/End: Original strand, 28245093 - 28245352
Alignment:
Q  64 ttggagatcatatcataccc-aagttacacggtttaaatatcttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtattca 162  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||    
T  28245093 ttggagatcatataataccccaagttacacggcttaaatatcttggatccttcgtacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaagccatcgtattca 28245192  T
Q  163 agctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgttttgtgcgataagaaaaaaccacttaagctgaaagaaaggttttatcggacagcagtcagaccg 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| || ||| |||||||||||||||||||||    
T  28245193 agctgggtggttgaaatggagaagagtctcagttgttttgtgcgataagaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttctatcggacagcagtcagaccg 28245292  T
Q  263 acaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaagagccaacacgagagtaaagtaagt 322  Q
     |  ||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||| | ||||||||    
T  28245293 gcgttgttgtacggtacggagtgttgggcggttaaaagtcaacatgagaattaagtaagt 28245352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 7 - 321
Target Start/End: Original strand, 27917173 - 27917486
Alignment:
Q  7 tatatggaatgtaacttcaacaaaaggagaagtgtgggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcata-cccaagttacacggtttaaatatct 105  Q
    |||||||| ||||||||||  |||||||||| |   | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27917173 tatatggattgtaacttcagtaaaaggagaacta--gttctaccttgaaggtgaaagttggagatcatatcatatcccaagttacacggtttaaatatct 27917270  T
Q  106 tgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgttttgtgc 205  Q
    || ||||||| |||||||||| ||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||| ||||| | |||||| |||||||| |||| ||||||| ||     
T  27917271 tgagtccatagtacaaaatgacggagaaatataagcatatataaatcatcgtattcaagttgggtagctgaaatagagaagagcctcatgtgttttatgt 27917370  T
Q  206 gataagaaaaaaccacttaagctgaaagaaaggttttatcggacagcagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaagagccaac 305  Q
    ||||| |||  |||||||||| |||| ||||  || ||||| ||| |||||| |||| | |||||||| |||||  |||| || || ||||||| ||||     
T  27917371 gataaaaaagtaccacttaagttgaatgaaaaattctatcgaacatcagtcacaccggcgatgttgtatggtacaaagtgatgtgcagttaagaaccaaa 27917470  T
Q  306 acgagagtaaagtaag 321  Q
    |||||| | |||||||    
T  27917471 acgagaatcaagtaag 27917486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 178 - 341
Target Start/End: Original strand, 5168599 - 5168762
Alignment:
Q  178 atggagaagagtctcaggtgttttgtgcgataagaaaaaaccacttaagctgaaagaaaggttttatcggacagcagtcagaccgacaatgttgtaaggt 277  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||  || ||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||    
T  5168599 atggagaagagcctcaggtgttttgtgcgataagaaagtaccacttaagctgaaaggaaaattctatcggacaacagtcagaccggcaatgttgtatggt 5168698  T
Q  278 acggagtgctgggcggttaagagccaacacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgt 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||||    
T  5168699 acggagtgctgggcggttaagagccaacatgagagtaaagtaagtgtagcggagatgaggatgt 5168762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 6 - 273
Target Start/End: Original strand, 29817105 - 29817370
Alignment:
Q  6 gtatatggaatgtaacttcaacaaaaggagaagtgtgggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcataccc-aagttacacggtttaaatatc 104  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||   | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||    
T  29817105 gtatatggaatgtaacttcatcaaaaggtgaagtt--gttctatcttggaggtgaaagttggagatcatatcataccataagttacacggttcaaatatc 29817202  T
Q  105 ttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgttttgtg 204  Q
    || |  ||||| |||||||||| ||| |||||   |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||    |||||| ||    
T  29817203 tttga-ccatagtacaaaatgacggataaataacggcagatgtaaatcatcgtattcaagttgggtggttgaaatagagaatagtctgttatgttttatg 29817301  T
Q  205 cgataagaaaaaaccacttaagctgaaagaaaggttttatcggacagcagtcagaccgacaatgttgta 273  Q
     |||||||||  | | |||||| |||||||||  || || |||||| |||| ||||||| |||||||||    
T  29817302 tgataagaaagtaacgcttaagttgaaagaaaatttctaccggacaacagttagaccgataatgttgta 29817370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 160 - 341
Target Start/End: Original strand, 52138553 - 52138734
Alignment:
Q  160 tcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgttttgtgcgataagaaaaaaccacttaagctgaaagaaaggttttatcggacagcagtcaga 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||| || ||| ||||||||||||||| ||    
T  52138553 tcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgtcttgtgcgataagaaaataccacttaagttgaaaggaaagttctatcggacagcagtccga 52138652  T
Q  260 ccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaagagccaacacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgt 341  Q
    ||| |  ||||||| |||||| |||| |||||||||||||| ||| | |||| | |||||||| || | ||||||| |||||    
T  52138653 ccggcgttgttgtatggtacgaagtgttgggcggttaagagtcaagatgagaatcaagtaagtgtagcagagatgaggatgt 52138734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 84 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 54425511 - 54425369
Alignment:
Q  84 aagttacacggtttaaatatcttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggag 183  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || |||||||||| |     
T  54425511 aagttacacggtttaaatatcttggatccatagtaaaaaatgacggagaaatagaagcatatgtaaatcatcgtatttaagctaggcggttgaaatgaaa 54425412  T
Q  184 aagagtctcaggtgttttgtgcgataagaaaaaaccacttaag 226  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||  ||||||||||    
T  54425411 aagagtctcatgtgttttgtgtgataagaaagtaccacttaag 54425369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 6 - 159
Target Start/End: Original strand, 19757668 - 19757820
Alignment:
Q  6 gtatatggaatgtaacttcaacaaaaggagaagtgtgggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcataccc-aagttacacggtttaaatatc 104  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||  ||||   |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  19757668 gtatatggaatgtaactttagcaaaaggcaaagta--gtcctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcataccccaagttacatggtttaaatatc 19757765  T
Q  105 ttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtat 159  Q
    ||||||||||| |||||||| |  ||||||||  ||||||||||||| |||||||    
T  19757766 ttgggtccatagtacaaaataacagagaaataagagcagatgtaaatcatcgtat 19757820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 126
Target Start/End: Original strand, 52138423 - 52138547
Alignment:
Q  1 acggggtatatggaatgtaacttcaacaaaaggagaagtgtgggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcata-cccaagttacacggtttaa 99  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |  ||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  52138423 acggagtatatggaatgtaacttcagcggaaggagaagta--ggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcataccccaagttacacggtttaa 52138520  T
Q  100 atatcttgggtccataatacaaaatga 126  Q
    ||||||||||||| |  ||||||||||    
T  52138521 atatcttgggtccttcgtacaaaatga 52138547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 174 - 341
Target Start/End: Original strand, 53519353 - 53519520
Alignment:
Q  174 tgaaatggagaagagtctcaggtgttttgtgcgataagaaaaaaccacttaagctgaaagaaaggttttatcggacagcagtcagaccgacaatgttgta 273  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  | |||||||||| |||| ||   | |||||||||||||||||| || |||||||||     
T  53519353 tgaaatggagaagagcctcaggtgttttgtgcgataagaaagtatcacttaagcttaaaggaaaaatctatcggacagcagtcagatcggcaatgttgtg 53519452  T
Q  274 aggtacggagtgctgggcggttaagagccaacacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgt 341  Q
      |||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||| |||| |||||    
T  53519453 ttgtacggagtgttaagcggttaagagccaacacgagagtaaagttagtgtagcggaaatgaggatgt 53519520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 55 - 341
Target Start/End: Original strand, 26489964 - 26490251
Alignment:
Q  55 aggtgaaagttggagatcatatcatac-ccaagttacacggtttaaatatcttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaatta 153  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||| ||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  26489964 aggtgaaagtgggagatcatatcatactccaagttacatgatttaaatatcttggttccatgatataaaatgacggagaaatagaagcagatgtaaatca 26490063  T
Q  154 tcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgttttgtgcgataagaaaaaaccacttaagctgaaagaaaggttttatcggacagca 253  Q
    || |||| ||| || |||||||| ||| |||| || || | | ||||| ||  || |||||| ||| |||||  | |||| ||  || ||||||||| ||    
T  26490064 tcatattgaagttgagtggttgagatgaagaatagcctta-gagttttatgtaatgagaaaataccgcttaaatttaaaggaaaattatatcggacaaca 26490162  T
Q  254 gtcagaccgacaatgt--tgtaaggtacggagtgctgggcggttaagagccaacacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgt 341  Q
    ||||||||| | ||||  |||| |||| | | || ||||||||||||| |||||| |||| | |||||||| || ||||||||| |||||    
T  26490163 gtcagaccggcgatgttgtgtatggtaagta-tgttgggcggttaagaaccaacaagagaatcaagtaagtgtagcggagatgaggatgt 26490251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 52 - 341
Target Start/End: Original strand, 30345175 - 30345457
Alignment:
Q  52 tggaggtgaaagttggagatcatatcataccc-aagttacacggtttaaatatcttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaa 150  Q
    ||||||||||||| | || ||||||||||||| ||| |||| |||||||||||    ||| |||| ||||||| ||  |||||||| || || || ||||    
T  30345175 tggaggtgaaagtggaagctcatatcataccccaagctacaaggtttaaatat----ggttcatagtacaaaaagaaagagaaataaaaacatatataaa 30345270  T
Q  151 ttatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgttttgtgcgataagaaaaaaccacttaagctgaaagaaaggttttatcggaca 250  Q
    | || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||| |||||  |||||| ||  || || | |||     
T  30345271 tcatagtattcaagttgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgttttatgcgataagaaagtaccgcttaaattgaaaggaaaattctaccagacg 30345370  T
Q  251 gcagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaagagccaacacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgt 341  Q
      | |||||  ||| ||||| ||  |||||||||| ||||||||||||| |||||| ||    ||| |||||||| ||||||||| |||||    
T  30345371 aaaatcagattgacgatgttatattgtacggagtgatgggcggttaagaaccaacatga----aaattaagtatagcggagatgaggatgt 30345457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 45 - 187
Target Start/End: Original strand, 48221421 - 48221564
Alignment:
Q  45 tctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcatacc-caagttacacggtttaaatatcttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcag 143  Q
    |||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||| | |||| ||||||||||  ||||| ||||||||     
T  48221421 tctatcttagaggtgaaagttgaagatcatatcataccacaagttacacattttaaatatcttggattcatagtacaaaatgacagagaagtagaagcat 48221520  T
Q  144 atgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaaga 187  Q
    |||||||| |||| |||||| |||| ||||||||||| ||||||    
T  48221521 atgtaaatcatcgaattcaaactggatggttgaaatgaagaaga 48221564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 6 - 159
Target Start/End: Original strand, 19736766 - 19736914
Alignment:
Q  6 gtatatggaatgtaacttcaacaaaaggagaagtgtgggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcata-cccaagttacacggtttaaatatc 104  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||   || || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  19736766 gtatatggaatgtaacttcagcaaaaggc--agagtagtcctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcataccccaagttacatggtttaaatatc 19736863  T
Q  105 ttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtat 159  Q
    |    |||||| |||||||| |  ||||||||  ||||||||||||| |||||||    
T  19736864 t----tccatagtacaaaataacagagaaataagagcagatgtaaatcatcgtat 19736914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 117
Target Start/End: Original strand, 9258478 - 9258589
Alignment:
Q  1 acggggtatatggaatgtaacttcaacaaaaggagaagtgtgggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcata-cccaagttacacggtttaa 99  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||    | ||||||||  || || ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  9258478 acggagtatatggaatgtaacttcaacaaaaggagaagta--ggtct----tagaggtgaacattagatatcatatcatatcccaagttacacggtttaa 9258571  T
Q  100 atatcttgggtccataat 117  Q
    ||||||||||||||||||    
T  9258572 atatcttgggtccataat 9258589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 138 - 320
Target Start/End: Original strand, 3186500 - 3186682
Alignment:
Q  138 aagcagatgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgttttgtgcgataagaaaaaaccacttaagctgaaagaaag 237  Q
    |||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||| |||| | | ||| |||||||  | |||||||||  | |||||||| |||||| ||     
T  3186500 aagcagatgtaaaacatcgtattcaagttgggtggttgaaatgaagaatattttcatgtgttttaggtgataagaaagtatcacttaagttgaaaggaaa 3186599  T
Q  238 gttttatcggacagcagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaagagccaacacgagagtaaagtaa 320  Q
    ||| ||||||||| |||||  ||| || |||||||| | ||   |||| |||||| ||||||| |||||||||| | ||||||    
T  3186600 gttatatcggacaacagtcccaccaacgatgttgtatgatatatagtgttgggcgattaagagtcaacacgagaatcaagtaa 3186682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 55 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 30724435 - 30724311
Alignment:
Q  55 aggtgaaagttggagatcatatcataccc-aagttacacggtttaaatatcttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaatta 153  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||   ||||||||| ||||| ||||||||| | |||| |||||||| |  |||||||||||  | ||||||||||    
T  30724435 aggtgaacgttggagatcatatcatactataagttacacagtttagatatcttggatacatattacaaaataagtgagaaatagaatgatatgtaaatta 30724336  T
Q  154 tcgtattcaagctgggtggttgaaa 178  Q
    ||| ||||||| |||||||| ||||    
T  30724335 tcgaattcaagttgggtggtagaaa 30724311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 228 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 43695226 - 43695113
Alignment:
Q  228 tgaaagaaaggttttatcggacagcagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaagagccaacacgagagtaaagtaagtataac 327  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| | |||||||| ||||||||||| |||| |||| |||   ||||||||| | |||||||| ||||    
T  43695226 tgaaagaaaagttctatcggacagcagttagaccggcgatgttgtatggtacggagtgttgggtggttgagaattaacacgagaatcaagtaagtgtaac 43695127  T
Q  328 ggagatgatgatgt 341  Q
     ||||||| |||||    
T  43695126 agagatgaggatgt 43695113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 54 - 123
Target Start/End: Original strand, 46145799 - 46145869
Alignment:
Q  54 gaggtgaaagttggagatcatatcatacc-caagttacacggtttaaatatcttgggtccataatacaaaa 123  Q
    ||||| |||||||||||| || ||||||| ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||| |||||||    
T  46145799 gaggttaaagttggagattatgtcataccacaagttatacggtttaaatattttgagtccatagtacaaaa 46145869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 58 - 180
Target Start/End: Original strand, 44395080 - 44395200
Alignment:
Q  58 tgaaagttggagatcatatcatacc-caagttacacggtttaaatatcttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcg 156  Q
    |||||||||||||||||| || | | ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||| |||  |  ||||||||||   |||||||||  ||||    
T  44395080 tgaaagttggagatcataccacaacgcaagttacacgatttaaatatctcgggtccatagtactaaacaacagagaaataga---agatgtaaaccatcg 44395176  T
Q  157 tattcaagctgggtggttgaaatg 180  Q
     ||||||| |  ||||||||||||    
T  44395177 aattcaagttaagtggttgaaatg 44395200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 242 - 306
Target Start/End: Original strand, 54278855 - 54278919
Alignment:
Q  242 tatcggacagcagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaagagccaaca 306  Q
    ||||||||||||||||||||  |  ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  54278855 tatcggacagcagtcagaccagcgttgttgtatggtacggagtgttgggcagttaagagtcaaca 54278919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 58 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 32490356 - 32490249
Alignment:
Q  58 tgaaagttggagatcatatcatacc-caagttacacggtttaaatatcttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcg 156  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| ||||||||| ||| || || | || | | ||||||||  |||| |||| |||||    
T  32490356 tgaaagttgaagatcatatcataccacaagttacacaatttaaatttcttgggtctatattataagacgacgaaaaaatagaactagatataaactatcg 32490257  T
Q  157 tattcaag 164  Q
     |||||||    
T  32490256 aattcaag 32490249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 54 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 1470733 - 1470683
Alignment:
Q  54 gaggtgaaagttggagatcatatcatacc-caagttacacggtttaaatat 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || |||||||||||    
T  1470733 gaggtgaaagttggagatcatatcataccaaaagttgcatggtttaaatat 1470683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 58 - 187
Target Start/End: Original strand, 15750888 - 15751018
Alignment:
Q  58 tgaaagttggagatcatatcatacc-caagttacacggtttaaatatcttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcg 156  Q
    ||||||||||||||||||| | | | ||| ||||| | |||||| || |||||| |||||| ||||| || ||||| || |||||| |||||||  |||     
T  15750888 tgaaagttggagatcatatgacatctcaaattacatgatttaaacattttgggttcataatgcaaaacgaaggagacatcgaagcatatgtaaaacatca 15750987  T
Q  157 tattcaagctgggtggttgaaatggagaaga 187  Q
    || ||| | | ||||||||||||| ||||||    
T  15750988 tactcatgttaggtggttgaaatgaagaaga 15751018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 267 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 33272450 - 33272376
Alignment:
Q  267 tgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaagagccaacacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgt 341  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||| | |||||||| || | ||||||| |||||    
T  33272450 tgttgtatggtacggagtgttgggcagttaagagtcaacatgagaatcaagtaagtgtagcagagatgaggatgt 33272376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 168 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 40674634 - 40674492
Alignment:
Q  168 ggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgttttgtgcgataagaaaaaaccacttaagctgaaagaaaggttttatcggacagcagtcagaccgacaat 267  Q
    |||||||||| ||| ||||||||| || |||||| || |||||||||  | |||||||| |||||| ||  || ||||| | | ||| |||| | |||||    
T  40674634 ggtggttgaagtggggaagagtctgagatgttttatgtgataagaaagtatcacttaagttgaaaggaaaattctatcgaatatcaggcagatcaacaat 40674535  T
Q  268 gttgtaaggtacggagtgctgggcggttaagagccaacacgag 310  Q
    ||||||  |||||||||| ||| | | |||||  |||||||||    
T  40674534 gttgtatagtacggagtgttggactgataagaatcaacacgag 40674492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 219; Significance: 1e-120; HSPs: 35)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 341
Target Start/End: Original strand, 38606601 - 38606939
Alignment:
Q  1 acggggtatatggaatgtaacttcaacaaaaggagaagtgtgggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcata-cccaagttacacggtttaa 99  Q
    |||| ||||||||||||||| ||   ||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  38606601 acggagtatatggaatgtaatttttgcaaaaggagaagtg--ggtctaccttg-aggtgaaagttggagatcatatcatatcccaagttacacggtttaa 38606697  T
Q  100 atatcttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgtt 199  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  38606698 atatcttgggtccatagtacaaaatgacgaagaaatagaagcagatgtaaaccatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagccttaggtgtt 38606797  T
Q  200 ttgtgcgataagaaaaaaccacttaagctgaaagaaaggttttatcggacagcagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaaga 299  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||| || ||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  38606798 ttgtgcgataagaaagtaccacttaagctgaaaggaaagttctatcggacaacagtcagaccggcaatgttgtatggtacggagtgttgggcggttaaga 38606897  T
Q  300 gccaacacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgt 341  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||    
T  38606898 gccaacacgagagtaaagtaagtgtagcggagatgataatgt 38606939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 341
Target Start/End: Original strand, 32630202 - 32630529
Alignment:
Q  1 acggggtatatggaatgtaacttcaacaaaaggagaagtgtgggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcataccc-aagttacacggtttaa 99  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  32630202 acggagtatatggaatgtaacttcagcaaaaggagaagtg--ggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcataccccaagttacacggtttaa 32630299  T
Q  100 atatcttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgtt 199  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |            | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||  |||||    
T  32630300 atatcttgggtccatattacaaaatgatggagaattaca------------tcatcgtattcaagctgggtagttgaaatggagaagagcctcgagtgtt 32630387  T
Q  200 ttgtgcgataagaaaaaaccacttaagctgaaagaaaggttttatcggacagcagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaaga 299  Q
    |||||||||||||||  | ||||||||||||||| || ||| ||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  32630388 ttgtgcgataagaaagtatcacttaagctgaaaggaaagttctatcggacatcaatcagaccgacaatgttgtatggtacggagtgctgggcggttaaga 32630487  T
Q  300 gccaacacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgt 341  Q
     |||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||    
T  32630488 accaacacgagagtaaagtaagtgtagcggagatgaggatgt 32630529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 181; E-Value: 9e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 46356538 - 46356229
Alignment:
Q  1 acggggtatatggaatgtaacttcaacaaaaggagaagtgtgggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcataccc-aagttacacggtttaa 99  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |  ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  46356538 acggagtatatggaatgtaacttcagcggaaggagaagta--ggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcataccccaagttacacggtttaa 46356441  T
Q  100 atatcttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgtt 199  Q
    ||||||||||||| |  |||||||||| ||||||||||||||||||||||   |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  46356440 atatcttgggtcctttgtacaaaatgacggagaaatagaagcagatgtaagccatcgtattcaagttgggtggttgaaatggagaagagcctcaggtgtt 46356341  T
Q  200 ttgtgcgataagaaaaaaccacttaagctgaaagaaaggttttatcggacagcagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaaga 299  Q
    |||||||||||||||  || ||||||| |||||| || ||| |||||||||| |||||||||| || ||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  46356340 ttgtgcgataagaaagtactacttaagttgaaaggaaagttctatcggacagtagtcagaccggcattgttgtatggtacggagtgttgggcggttaaga 46356241  T
Q  300 gccaacacgaga 311  Q
    | ||||| ||||    
T  46356240 gtcaacatgaga 46356229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 341
Target Start/End: Original strand, 36651589 - 36651928
Alignment:
Q  1 acggggtatatggaatgtaacttcaacaaaaggagaagtgtgggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcataccc-aagttacacggtttaa 99  Q
    |||| |||||||||||| ||||||| |  ||| ||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  36651589 acggagtatatggaatggaacttcagcggaagaagaagta--ggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcataccccaagttacgcggtttaa 36651686  T
Q  100 atatcttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgtt 199  Q
    ||||||||||||| |  |||||||||| ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  36651687 atatcttgggtccttcgtacaaaatgacggagaaatagaagcagatgtaagccatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagcctcaggtgtt 36651786  T
Q  200 ttgtgcgataagaaaaaaccacttaagctgaaagaaaggttttatcggacagcagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaaga 299  Q
    |||||||||||||||  |||||||||| |||||| || ||| |||||||||||| || ||||| |  ||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  36651787 ttgtgcgataagaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttctatcggacagcaatccgaccggcgttgttgtatggtacggagtgttgggcggttaaga 36651886  T
Q  300 gccaacacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgt 341  Q
    | ||||| |||| | |||||||| |||| ||||||| |||||    
T  36651887 gtcaacatgagaatcaagtaagtgtaacagagatgaggatgt 36651928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 6 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 33350488 - 33350154
Alignment:
Q  6 gtatatggaatgtaacttcaacaaaaggagaagtgtgggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcataccc-aagttacacggtttaaatatc 104  Q
    |||||||||||||||||||| |  ||| ||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  33350488 gtatatggaatgtaacttcagcggaagaagaagta--ggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcataccccaagttacacggtttaaatatc 33350391  T
Q  105 ttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgttttgtg 204  Q
    | |||||  |  |||||||||| ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  33350390 tagggtctttcgtacaaaatgacggagaaatagaagcagatgtaagccatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagcctcaagtgttttgtg 33350291  T
Q  205 cgataagaaaaaaccacttaagctgaaagaaaggttttatcggacagcagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaagagccaa 304  Q
    ||||||||||  |||||||||| ||| || || ||| ||||||||||||||| ||||| |  ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  33350290 cgataagaaagtaccacttaagttgacaggaaagttctatcggacagcagtccgaccggcgttgttgtatggtacggagtgttgggcggttaagagtcaa 33350191  T
Q  305 cacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgt 341  Q
    || |||| | |||||||| || | ||||||| |||||    
T  33350190 catgagaatcaagtaagtgtagcagagatgaggatgt 33350154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 6 - 341
Target Start/End: Original strand, 31004824 - 31005157
Alignment:
Q  6 gtatatggaatgtaacttcaacaaaaggagaagtgtgggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcataccc-aagttacacggtttaaatatc 104  Q
    ||||||||||||| |||||| |  ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  31004824 gtatatggaatgttacttcagcggaaggagaagta--ggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcataccccaagttacacg-tttaaatatc 31004920  T
Q  105 ttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgttttgtg 204  Q
    |||| ||| |  |||||||||| ||||||||||||||||||||||   |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  31004921 ttggctccttcgtacaaaatgacggagaaatagaagcagatgtaagccatcgtattcaagttgggtggttgaaatggagaagagcctcaggtgttttgtg 31005020  T
Q  205 cgataagaaaaaaccacttaagctgaaagaaaggttttatcggacagcagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaagagccaa 304  Q
    ||||||||||  |||||||||| |||||| || ||| ||||||||||||||| ||||| |  ||||||| ||||||||||| | |||||||||||| |||    
T  31005021 cgataagaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttctatcggacagcagtccgaccggcgttgttgtatggtacggagtgttaggcggttaagagtcaa 31005120  T
Q  305 cacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgt 341  Q
    || |||| | |||||||| || | ||||||| |||||    
T  31005121 catgagaatcaagtaagtgtagcagagatgaggatgt 31005157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 341
Target Start/End: Original strand, 11593554 - 11593894
Alignment:
Q  1 acggggtatatggaatgtaacttcaaca-aaaggagaagtgtgggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcataccc-aagttacacggttta 98  Q
    |||| ||||||| |||||||||||| |  |||||||||||   |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  11593554 acggagtatatgaaatgtaacttcagcggaaaggagaagta--ggtctaccttggaggtgaaagttgaagatcatatcataccccaagttagacggttta 11593651  T
Q  99 aatatcttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgt 198  Q
    |||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11593652 aatatcttgggtccttcgtacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaagccatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagcctcaggtgt 11593751  T
Q  199 tttgtgcgataagaaaaaaccacttaagctgaaagaaaggttttatcggacagcagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaag 298  Q
    |||||||||||| |||  |||||||||| |||||| || ||| ||||||||| ||||  ||||| |  ||||||| ||||||||||| ||| ||||||||    
T  11593752 tttgtgcgataaaaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttctatcggacaacagttcgaccggcgttgttgtatggtacggagtgttggacggttaag 11593851  T
Q  299 agccaacacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgt 341  Q
    || ||||| |||| | |||||||| || | ||||||| |||||    
T  11593852 agtcaacatgagaatcaagtaagtgtagcagagatgaggatgt 11593894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 281
Target Start/End: Original strand, 37616511 - 37616790
Alignment:
Q  1 acggggtatatggaatgtaacttcaacaaaaggagaagtgtgggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcataccc-aagttacacggtttaa 99  Q
    |||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||   ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  37616511 acggagtatatggaatgtaacttcagcagaaggagaagta--ggtctaccttggaggtgaaaggtggagatcatatcataccccaagttacacgatttaa 37616608  T
Q  100 atatcttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgtt 199  Q
    ||||||||||||| |  |||||||||| ||||||||||||||||||||||   || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  37616609 atatcttgggtcctttgtacaaaatgacggagaaatagaagcagatgtaagccattgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagcctcaagtgtt 37616708  T
Q  200 ttgtgcgataagaaaaaaccacttaagctgaaagaaaggttttatcggacagcagtcagaccgacaatgttgtaaggtacgg 281  Q
    |||||||||||||||  |||||||||| |||||| || ||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  37616709 ttgtgcgataagaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttatatcggccagcagtcagaccgacattgttgtatggtacgg 37616790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 39907066 - 39906729
Alignment:
Q  1 acggggtatatggaatgtaacttcaacaaaaggagaagtgtgggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcata-cccaagttacacggtttaa 99  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |  ||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  39907066 acggagtatatggaatgtaacttcagcggaaggagaagta--ggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcatatcccatgttacacggtttaa 39906969  T
Q  100 atatcttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtattcaagctgggtggttg----aaatggagaagagtctcagg 195  Q
    ||||||||||||  |  |||||||||| ||||||||||||| ||||| ||   |||||||||||||||||||||||    ||||||||||||| |||||     
T  39906968 atatcttgggtcattcgtacaaaatgacggagaaatagaagtagatgcaagccatcgtattcaagctgggtggttggttgaaatggagaagagcctcaga 39906869  T
Q  196 tgttttgtgcgataagaaaaaaccacttaagctgaaagaaaggttttatcggacagcagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggtt 295  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| || ||| ||||||||||||||||||||| |  ||||||| ||||||||||| | |||| ||    
T  39906868 tgttttgtgcgataagaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttctatcggacagcagtcagaccggcgttgttgtatggtacggagtgttaggcgatt 39906769  T
Q  296 aagagccaacacgagagtaaagtaagtataacggagatga 335  Q
    ||||| ||||| |||| | |||||||| || | |||||||    
T  39906768 aagagtcaacatgagaatcaagtaagtgtagcagagatga 39906729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 6 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 36869971 - 36869637
Alignment:
Q  6 gtatatggaatgtaacttcaacaaaaggagaagtgtgggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcataccc-aagttacacggtttaaatatc 104  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||  |||| ||  |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||| |||||||||||||    
T  36869971 gtatatggaatgtaacttcaggaaaagggaaagtatg--tctaccctggaggtgaaagttggagagcatatcataccccaaattacgcggtttaaatatc 36869874  T
Q  105 ttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgttttgtg 204  Q
    |||| |||||| |||||||||| | ||||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  36869873 ttggatccatagtacaaaatgacgaagaaataaaagcagatgtaagccatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagcctcaggggttttgtg 36869774  T
Q  205 cgataagaaaaaaccacttaagctgaaagaaaggttttatcggacagcagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaagagccaa 304  Q
    ||||||||||  |||||||||| |||||| || ||| ||||||||| ||||||| ||| | |||||||| |||||||| || || |||  |||||| |||    
T  36869773 cgataagaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttctatcggacaacagtcaggccggcgatgttgtatggtacggaatgttgagcgactaagagtcaa 36869674  T
Q  305 cacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgt 341  Q
    |||| || | |||||||| || | ||||||| |||||    
T  36869673 cacgtgaatcaagtaagtgtagcagagatgaggatgt 36869637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 120 - 341
Target Start/End: Original strand, 43281389 - 43281610
Alignment:
Q  120 aaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgttttgtgcgataagaaaaaacc 219  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||  |||    
T  43281389 aaaatgacggagaaatagaagcagatgtaaatcatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagcctcaggcgttttgtgcgataagaaagtacc 43281488  T
Q  220 acttaagctgaaagaaaggttttatcggacagcagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaagagccaacacgagagtaaagta 319  Q
    |||||||||||||| || ||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  43281489 acttaagctgaaaggaaagttctatcggacagcagtcaaaccggcaatgttgtatggtacagagtgttgggcggttaagagccaacgcaagagtaaagta 43281588  T
Q  320 agtataacggagatgatgatgt 341  Q
    ||| || ||| ||||| |||||    
T  43281589 agtgtagcggggatgaggatgt 43281610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 341
Target Start/End: Original strand, 49028862 - 49029210
Alignment:
Q  1 acggggtatatggaatgtaacttcaacaaaaggagaagtgtgggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcataccc-aagttacacggtttaa 99  Q
    |||| ||||||||||||||||||||    ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  49028862 acggagtatatggaatgtaacttcaggggaaggagaagta--ggtctaccttggaggtgaaagttggagatcagatcataccccaagttacacggtttaa 49028959  T
Q  100 atatcttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtattcaagctggg--------------tggttgaaatggagaa 185  Q
    ||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||              ||||||||||||||||    
T  49028960 atatcttgggtcctttgtacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtatgccatcgtattcaagctgggtggttggttgtggttggttgaaatggagaa 49029059  T
Q  186 gagtctcaggtgttttgtgcgataagaaaaaaccacttaagctgaaagaaaggttttatcggacagcagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtg 285  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||     |||||| || ||| |||||||||||||||  ||||    ||||||| |||||||||||    
T  49029060 gagcctcaggtgttttgtgcgataagaaaataccact-----tgaaaggaaagttctatcggacagcagtccaaccggtgttgttgtatggtacggagtg 49029154  T
Q  286 ctgggcggttaagagccaacacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgt 341  Q
     |||||||||||||| ||||| |||| | |||||||| || | ||||||| |||||    
T  49029155 ttgggcggttaagagtcaacatgagaatcaagtaagtgtagcagagatgaggatgt 49029210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Original strand, 48918983 - 48919231
Alignment:
Q  1 acggggtatatggaatgtaacttcaacaaaaggagaagtgtgggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcataccc-aagttacacggtttaa 99  Q
    |||| ||||||||||||| |||||| |||| ||||||||   ||||||| ||| |||| ||||| ||||||||||| | |||| ||||||||||||||||    
T  48918983 acggagtatatggaatgtgacttcagcaaatggagaagta--ggtctacattgaaggtaaaagtaggagatcatattacaccccaagttacacggtttaa 48919080  T
Q  100 atatcttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgtt 199  Q
    |||| |||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  48919081 atattttggatccatagtacaaaatgacggagaaatagaagcatatgtgaatcatcgtattcaagctgggtagttgaaatggagaagagcctcaggtgtt 48919180  T
Q  200 ttgtgcgataagaaaaaaccacttaagctgaaagaaaggttttatcggaca 250  Q
    |||||||||||||||  ||| |||||| |||||| |||||| |||||||||    
T  48919181 ttgtgcgataagaaagtaccccttaagttgaaaggaaggttatatcggaca 48919231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 94 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 35906796 - 35906549
Alignment:
Q  94 gtttaaatatcttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctca 193  Q
    ||||||||||||||||||| |  |||||||||| ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||    
T  35906796 gtttaaatatcttgggtccttcgtacaaaatgacggagaaatagaagcagatgtaagccatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagatcttca 35906697  T
Q  194 ggtgttttgtgcgataagaaaaaaccacttaagctgaaagaaaggttttatcggacagcagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcgg 293  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| || ||| ||||||||||||||| ||||| |  ||||||| | ||||||||| |||| ||    
T  35906696 ggtgttttgtgcgataagaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttctatcggacagcagtccgaccggcgttgttgtatgatacggagtgttgggtgg 35906597  T
Q  294 ttaagagccaacacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgt 341  Q
    ||||||| ||||| |||| | |||||||| || | ||||||| |||||    
T  35906596 ttaagagtcaacatgagaatcaagtaagtgtagcagagatgaggatgt 35906549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 157 - 322
Target Start/End: Original strand, 34869170 - 34869335
Alignment:
Q  157 tattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgttttgtgcgataagaaaaaaccacttaagctgaaagaaaggttttatcggacagcagtc 256  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| || ||| |||||||||||||||    
T  34869170 tattcaagctgggtggttgaattggagaagagcctcaggcgttttgtgcgataagaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttctatcggacagcagtc 34869269  T
Q  257 agaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaagagccaacacgagagtaaagtaagt 322  Q
    |||||| |  ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||| | ||||||||    
T  34869270 agaccggcgttgttgtatggtacggagtgttgggcggttaagagtcaacatgagaatcaagtaagt 34869335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 119 - 341
Target Start/End: Original strand, 33072666 - 33072888
Alignment:
Q  119 caaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgttttgtgcgataagaaaaaac 218  Q
    |||||||| ||| || |||||||||||||||   |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||  ||    
T  33072666 caaaatgacggataattagaagcagatgtaagccatcgtattcaagttggatggttgaaatggagaagagcctcaagtgttttgtgcgataagaaagtac 33072765  T
Q  219 cacttaagctgaaagaaaggttttatcggacagcagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaagagccaacacgagagtaaagt 318  Q
    |||||||| | |||| || ||| ||||||||| |||| |||||| |  ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||| | || |    
T  33072766 cacttaagttaaaaggaaagttctatcggacaacagttagaccggcgttgttgtatggtacagagtgttgggcggttaagagtcaacatgagaatcaaat 33072865  T
Q  319 aagtataacggagatgatgatgt 341  Q
    |||| || | |||||||||||||    
T  33072866 aagtgtagcagagatgatgatgt 33072888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 147 - 341
Target Start/End: Original strand, 7272780 - 7272973
Alignment:
Q  147 taaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgttttgtgcgataagaaaaaaccacttaagctgaaagaaaggttttatcg 246  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||||| ||||||| |||||||||  |||||||||| ||| || || ||| |||||    
T  7272780 taaatcatcgtattcaagctgggtggttgagattgagaa-agcctcaggtattttgtgtgataagaaagtaccacttaagttgagaggaaagttgtatcg 7272878  T
Q  247 gacagcagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaagagccaacacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgt 341  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||| | ||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| || ||||||||| |||||    
T  7272879 gtcagcagtcaaaccgacaatgttgtatgatacagagtgttgggcggttgagagccaacacgagaatcaagtaagtgtaccggagatgaggatgt 7272973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 6 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 24177877 - 24177714
Alignment:
Q  6 gtatatggaatgtaacttcaacaaaaggagaagtgtgggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcataccc-aagttacacggtttaaatatc 104  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||   |||||| |||| || |||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  24177877 gtatatggaatgtaacttcagcaaaagaagaagta--ggtctagcttgtagatgaaggttggagatcatatcataccccaatttacacggtttaaatatc 24177780  T
Q  105 ttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtattcaagctgggt 170  Q
      ||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||    
T  24177779 acgggtcaatagtacaaaatgacggagaaatagaagcagatgtaaatcatcatattcaagttgggt 24177714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 170 - 322
Target Start/End: Original strand, 23404181 - 23404333
Alignment:
Q  170 tggttgaaatggagaagagtctcaggtgttttgtgcgataagaaaaaaccacttaagctgaaagaaaggttttatcggacagcagtcagaccgacaatgt 269  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||  |||||||||| |||||| ||  || ||||||||| ||||||||||||| || |    
T  23404181 tggttaaaatggagaagagcctcaggtgttttctgagataagaaaggaccacttaagttgaaaggaaaattctatcggacaacagtcagaccgacgatat 23404280  T
Q  270 tgtaaggtacggagtgctgggcggttaagagccaacacgagagtaaagtaagt 322  Q
    |||| |||||| |||  ||||||||||| ||||| ||||||| | ||||||||    
T  23404281 tgtatggtacgaagttttgggcggttaaaagccagcacgagaatcaagtaagt 23404333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 191 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 12841773 - 12841623
Alignment:
Q  191 tcaggtgttttgtgcgataagaaaaaaccacttaagctgaaagaaaggttttatcggacagcagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctggg 290  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| || ||| ||||| ||||||||| ||||| |  ||||||| ||||||||||| ||||    
T  12841773 tcaggtgttttgtgcgataagaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttctatcgtacagcagtctgaccggcgttgttgtatggtacggagtgttggg 12841674  T
Q  291 cggttaagagccaacacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgt 341  Q
     ||||||||| ||||| |||| | |||||||| || | ||||||| |||||    
T  12841673 tggttaagagtcaacatgagaatcaagtaagtgtagcagagatgaggatgt 12841623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 54 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 24550320 - 24550178
Alignment:
Q  54 gaggtgaaagttggagatcatatcatacccaagttacacggtttaaatatcttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaatta 153  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||    ||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||| || |||  |||||||| |||||||||||     
T  24550320 gaggtgaaagttgaagatcatatcata----agttacacgatttaaatatctttagtccatattacaaaacgacggattaatagaaggagatgtaaattg 24550225  T
Q  154 tcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgttt 200  Q
    | | ||||||| |||||||||||||||||| || |||||| ||||||    
T  24550224 ttgaattcaagttgggtggttgaaatggaggagggtctcacgtgttt 24550178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 144 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 7189777 - 7189581
Alignment:
Q  144 atgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgttttgtgcgataagaaaaaaccacttaagctgaaagaaaggtttta 243  Q
    |||||||| || ||||| | | || ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |  |||||||||  |  ||||||  ||||||| |  |||||    
T  7189777 atgtaaatcattgtatttatgttgagtggttgaaatggagaaaagtctcaggtgttttatttgataagaaagtattacttaaattgaaagagaaatttta 7189678  T
Q  244 tcggacagcagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaagagccaacacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgt 341  Q
    |  ||||| |||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||| |||||||| ||||||| | | | ||||||| |||  |||||||| |||||    
T  7189677 t-agacagtagtcagaccgacgatgttgtatggtacagagtgttgggtggttaagaaccaacacaaaaatcaagtaagcatagtggagatgaggatgt 7189581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 55 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 21517959 - 21517826
Alignment:
Q  55 aggtgaaagttggagatcatatcatacc-caagttacacggtttaaatatcttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaatta 153  Q
    |||||||||||||||| || || ||||| ||| |||||| ||||||||||||||| | |||| |||||| ||| | |||||||  | || |||||||| |    
T  21517959 aggtgaaagttggagaccacatgatacctcaatttacacagtttaaatatcttggattcatagtacaaa-tgacgaagaaataataacatatgtaaatca 21517861  T
Q  154 tcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagag 188  Q
    || |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  21517860 tcatattcaagttgggtggttgaaatcgagaagag 21517826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 54 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 43793676 - 43793592
Alignment:
Q  54 gaggtgaaagttggagatcatatcatacc-caagttacacggtttaaatatcttgggtccataatacaaaatgatggagaaatag 137  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||  ||||||||||||||||| ||| |||||||||| | ||||||||    
T  43793676 gaggtgaaagttagagatcatatcataccactagttacacattttaaatatcttgggtctatagtacaaaatgacgaagaaatag 43793592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 219 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 13859476 - 13859372
Alignment:
Q  219 cacttaagctgaaagaaaggttttatcggacagcagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaagagccaacacgagagtaaagt 318  Q
    |||||||| |||||| || ||| ||| | |||||||| |||||| || ||||||  |||||||| || ||||||||||||||  ||||||||| | ||||    
T  13859476 cacttaagttgaaaggaaagttctattgaacagcagttagaccggcagtgttgtttggtacggaatgttgggcggttaagagttaacacgagaatcaagt 13859377  T
Q  319 aagta 323  Q
    |||||    
T  13859376 aagta 13859372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 153 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 25579612 - 25579439
Alignment:
Q  153 atcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagt--ctcaggtgttttgtgcgataagaaaaaac---cacttaagctgaaagaaaggttttatcgg 247  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||   ||| ||| |||| || |||| |||||||    | || ||| |||| | ||  || ||||||    
T  25579612 atcgtattcaagttgggtggttaaaatggagaagagagcctcgggtattttatgtgatacgaaaaaaagtacgctcaagttgaagggaaaattctatcgg 25579513  T
Q  248 acagcagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaagagccaacacgagagtaaagtaag 321  Q
    ||||| || |||||| | |||||||| || ||||| || ||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||    
T  25579512 acagctgtaagaccggcgatgttgtatggaacggaatgttgggcggttaagaaccaacacgagaataaaataag 25579439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 61 - 201
Target Start/End: Original strand, 18637233 - 18637371
Alignment:
Q  61 aagttggagatcatatcatacc-caagttacacggtttaaatatcttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtat 159  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||  ||||||||||||  ||  ||| |||||||||| || ||||||||   |||||||||  |||| ||    
T  18637233 aagttggagatcatatcatatcacaagttacacattttaaatatcttaagttgatagtacaaaatgacggggaaataga---agatgtaaaccatcgaat 18637329  T
Q  160 tcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgtttt 201  Q
     ||||||| |  |||||||||||| || | |||| |||||||    
T  18637330 ccaagctgagcagttgaaatggaggagtgcctcatgtgtttt 18637371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 61 - 201
Target Start/End: Original strand, 18650668 - 18650806
Alignment:
Q  61 aagttggagatcatatcatacc-caagttacacggtttaaatatcttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtat 159  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||  ||||||||||||  ||  ||| |||||||||| || ||||||||   |||||||||  |||| ||    
T  18650668 aagttggagatcatatcatatcacaagttacacattttaaatatcttaagttgatagtacaaaatgacggggaaataga---agatgtaaaccatcgaat 18650764  T
Q  160 tcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgtttt 201  Q
     ||||||| |  |||||||||||| || | |||| |||||||    
T  18650765 ccaagctgagcagttgaaatggaggagtgcctcatgtgtttt 18650806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 97 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 23087694 - 23087603
Alignment:
Q  97 taaatatcttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagag 188  Q
    ||||| |||||||| |||| |||||||||| ||||||||| |||   |||||||| || ||||||||| | | ||||||||||||| |||||    
T  23087694 taaatctcttgggttcatagtacaaaatgaaggagaaataaaagtgtatgtaaatcattgtattcaagttagatggttgaaatggaaaagag 23087603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 61 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 18608319 - 18608199
Alignment:
Q  61 aagttggagatcatatcatacc-caagttacacggtttaaatatcttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtat 159  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||  ||||||||||||  ||  ||| |||||||||| || ||||||||   |||||||||  |||| ||    
T  18608319 aagttggagatcatatcatatcacaagttacacattttaaatatcttaagttgatagtacaaaatgacggggaaataga---agatgtaaaccatcgaat 18608223  T
Q  160 tcaagctgggtggttgaaatggag 183  Q
     ||||||| |  ||||||||||||    
T  18608222 ccaagctgagcagttgaaatggag 18608199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 69 - 140
Target Start/End: Original strand, 5843105 - 5843177
Alignment:
Q  69 gatcatatcatacc-caagttacacggtttaaatatcttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaag 140  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| || |||  ||||||||||| |||| |||||| ||||    
T  5843105 gatcatatcataccacaagttacacgatttaaatattttaggtttataatacaaaacgatgaagaaatcgaag 5843177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 266 - 322
Target Start/End: Original strand, 15681216 - 15681272
Alignment:
Q  266 atgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaagagccaacacgagagtaaagtaagt 322  Q
    |||||||| ||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  15681216 atgttgtatggtatagagtgttgggcggttaagagccaacacgagactcaagtaagt 15681272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 61 - 140
Target Start/End: Original strand, 18626559 - 18626639
Alignment:
Q  61 aagttggagatcatatcatacc-caagttacacggtttaaatatcttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaag 140  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||  ||||||||||||  ||  ||| |||||||||| || ||||||||||    
T  18626559 aagttggagatcatatcatatcacaagttacacattttaaatatcttaagttgatagtacaaaatgacggggaaatagaag 18626639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 142 - 213
Target Start/End: Original strand, 33139006 - 33139077
Alignment:
Q  142 agatgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgttttgtgcgataagaa 213  Q
    |||||||||| |||||||||| | |||||| ||||||||||||||||  | | |||| ||||||| ||||||    
T  33139006 agatgtaaatcatcgtattcatgttgggtgattgaaatggagaagagcttaatgtgtattgtgcgctaagaa 33139077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 289 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 21517726 - 21517674
Alignment:
Q  289 ggcggttaagagccaacacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgt 341  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||| |||| |||| ||| ||||||||||    
T  21517726 ggcggttaagaaccaacacgagaataaaataagcataatggatatgatgatgt 21517674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 219; Significance: 1e-120; HSPs: 20)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 6 - 341
Target Start/End: Original strand, 5631417 - 5631752
Alignment:
Q  6 gtatatggaatgtaacttcaacaaaaggagaagtgtgggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcataccc-aagttacacggtttaaatatc 104  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  5631417 gtatatggaatgtaacttcagcaaaaggagaagtg--ggtctaccttgcaggtgaaagttagagatcatatcataccccaagttacacggtttaaatatt 5631514  T
Q  105 tt-gggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgttttgt 203  Q
    || ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5631515 tttgggtccatagtacaaaatgacggagaaatagaagcagatgtaaatcatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcgggtgttttgt 5631614  T
Q  204 gcgataagaaaaaaccacttaagctgaaagaaaggttttatcggacagcagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaagagcca 303  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| ||  || ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||    
T  5631615 gcgataagaaagtaccacttaagctgaaaggaaaattctatcggacaacagtcagaccgacaatgttgtatggtatggagtgttgggcggttaagagcca 5631714  T
Q  304 acacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgt 341  Q
    || |||||||||||||||| || || |||||| |||||    
T  5631715 acgcgagagtaaagtaagtgtagcgaagatgaggatgt 5631752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 6 - 341
Target Start/End: Original strand, 9706376 - 9706710
Alignment:
Q  6 gtatatggaatgtaacttcaacaaaaggagaagtgtgggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcataccc-aagttacacggtttaaatatc 104  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  9706376 gtatatggaatgtaacttcagcaaaaggagaagtg--ggtataccttggagatgaaagttggagatcatatcataccccaagttacacggtttaaatatc 9706473  T
Q  105 ttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgttttgtg 204  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  9706474 ttgggtccatggtacaaaatgatggagaaatagaagcaggtgtaaatcatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagcatcaggtgttttgtg 9706573  T
Q  205 cgataagaaaaaaccacttaagctgaaagaaaggttttatcggacagcagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaagagccaa 304  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||| | || ||||||||| |||    
T  9706574 cgataagaaagtaccacttaagctgaaaggaaagttctatcgaacagcagtcagaccggcaatgttgtatggtacgaagtgttaggtggttaagagtcaa 9706673  T
Q  305 cacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgt 341  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||| |||||    
T  9706674 cacgagagtaaagtaagtgtagcggagatgaggatgt 9706710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 6 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 5258832 - 5258508
Alignment:
Q  6 gtatatggaatgtaacttcaacaaaaggagaagtgtgggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcataccc-aagttacacggtttaaatatc 104  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  5258832 gtatatggaatgtaacttcagcaaaaggagaagtg--ggtctaccttggaagtgaaagttggagatcatatcataccccaagttacacagtttaaatatc 5258735  T
Q  105 ttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgttttgtg 204  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||    
T  5258734 ttgggtccatagtacaaaatgacggagaaatagaagctgatgtacatcatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagcctcatgtgttttttg 5258635  T
Q  205 cgataagaaaaaaccacttaagctgaaagaaaggttttatcggacagcagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaagagccaa 304  Q
    |||| |||||  ||||||||||||||||| || ||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||  |||||||||    
T  5258634 cgatgagaaagtaccacttaagctgaaaggaaagttctatcggacaacagtcagaccggcaatgttgtatggtacggagtgttgggcggcgaagagccaa 5258535  T
Q  305 cacgagagtaaagtaagtataacggag 331  Q
    |||||||| ||||||||| || |||||    
T  5258534 cacgagagcaaagtaagtgtagcggag 5258508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 10100544 - 10100205
Alignment:
Q  1 acggggtatatggaatgtaacttcaacaaaaggagaagtgtgggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcataccc-aagttacacggtttaa 99  Q
    |||| |||||||||||||||||| | ||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10100544 acggagtatatggaatgtaactttagcaaaatgagaagta--ggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcataccccaagttacacggtttaa 10100447  T
Q  100 atatcttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgtt 199  Q
    |||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||    
T  10100446 atatcttgggtccatagtacaaaatgtcggagaaatagaagctgatataaatcatcgtattcaagctgggtggttggaatggagaagagcctcatgtgtt 10100347  T
Q  200 ttgtgcgataagaaaaaaccacttaagctgaaagaaaggttttatcggacagcagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaaga 299  Q
    ||||| |||||||||  |||||||||| |||||| || ||| |||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||    
T  10100346 ttgtgagataagaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttctatcggacagtagtcagaccgacgatgttgtatggtacggagtgttgggaggttaaga 10100247  T
Q  300 gccaacacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgt 341  Q
    ||||| |||||||| |||||||| || ||||||||| |||||    
T  10100246 gccaagacgagagtcaagtaagtgtagcggagatgaggatgt 10100205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 20428323 - 20427984
Alignment:
Q  1 acggggtatatggaatgtaacttcaacaaaaggagaagtgtgggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcatacc-caagttacacggtttaa 99  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |   ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  20428323 acggagtatatggaatgtaacttcagcaaaaggagaatta--ggtctacctaggaggtgaaagttggagatcatatcataccacaagttacgcggtttaa 20428226  T
Q  100 atatcttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgtt 199  Q
    |||| ||||||||| | ||||||| || ||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  20428225 atatattgggtccacagtacaaaacgacggaaaaatagaagcagatgtaaatcatcgtatccaagctgggtggttgaaatggagaagagcctcgggtgtt 20428126  T
Q  200 ttgtgcgataagaaaaaaccacttaagctgaaagaaaggttttatcggacagcagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaaga 299  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||| || ||| ||| |||||||||||| ||  | |||||||||  |||| ||||| |||| ||||||||    
T  20428125 ttgtgcgataagaaagtaccacttaagctgaaaggaaagttctattggacagcagtcaaactaaaaatgttgtatagtacagagtgttgggtggttaaga 20428026  T
Q  300 gccaacacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgt 341  Q
    |||||||||||||| || ||||| || ||||||||| |||||    
T  20428025 gccaacacgagagtcaaataagtgtagcggagatgaggatgt 20427984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 153 - 341
Target Start/End: Original strand, 607905 - 608093
Alignment:
Q  153 atcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgttttgtgcgataagaaaaaaccacttaagctgaaagaaaggttttatcggacagc 252  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||    
T  607905 atcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagcctcaggtgttttgtgcgataagacatgaccacttaaactgaaagaaaagttctatcggacagc 608004  T
Q  253 agtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaagagccaacacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgt 341  Q
    |||||||||| ||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||| |||||    
T  608005 agtcagaccggcaatgttgtattgtacggagtgttgggcggttaagagccaacacgagaataaagtaagtgtagcggagatgaggatgt 608093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 65 - 341
Target Start/End: Original strand, 2689313 - 2689590
Alignment:
Q  65 tggagatcatatcataccc-aagttacacggtttaaatatcttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtattcaa 163  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||| || |||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  2689313 tggagatcatatcataccctaagttacacggtttaaatattttgggtctatagtacaaaacgacggagaaatagaatcagatgtaaatcatcgtagtcaa 2689412  T
Q  164 gctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgttttgtgcgataagaaaaaaccacttaagctgaaagaaaggttttatcggacagcagtcagaccga 263  Q
    ||||| || |||||||||||||| | |||| || ||||||| |||||||||  || ||||||| |||||| || |||  ||||||||||||||||||||     
T  2689413 gctggatgattgaaatggagaagtgcctcatgtattttgtgtgataagaaagcactacttaagttgaaaggaaagttcaatcggacagcagtcagaccgt 2689512  T
Q  264 caatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaagagccaacacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgt 341  Q
    | |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||| | |||||| | ||  |||||||| |||||    
T  2689513 cgatgttgtatggtacggagtgttgggcggttaacagccaacgcgagaattaagtaaatgtagtggagatgaggatgt 2689590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 6 - 341
Target Start/End: Original strand, 33495807 - 33496118
Alignment:
Q  6 gtatatggaatgtaacttcaacaaaaggagaagtgtgggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcatacccaagttacacggtttaaatatct 105  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||         ||||    
T  33495807 gtatatggaatgtaacttcatcaaaaggagaagta--ggtctaccttggaggtgaaagttgaagatcatatcataccctagttacac---------atct 33495895  T
Q  106 tgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgttttgtgc 205  Q
    |||||||||| |||||||| | ||||||||||||||| |||||| | ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  33495896 tgggtccatagtacaaaataacggagaaatagaagcatatgtaactcatcatattcaagctggatggttgaaatggagaagagtctcagatgttttgtgt 33495995  T
Q  206 gataagaaaaaaccacttaagctgaaagaaaggttttatcggacagcagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaagagccaac 305  Q
    |||||||||  ||||||||||             ||||  ||||| ||||||||||  |||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||| | |||||    
T  33495996 gataagaaagtaccacttaag-------------tttaaaggacaacagtcagacctgcaatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaac 33496082  T
Q  306 acgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgt 341  Q
    | |||| | |||||||| ||||||||||||||||||    
T  33496083 atgagaatcaagtaagtgtaacggagatgatgatgt 33496118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 159 - 341
Target Start/End: Original strand, 14030558 - 14030740
Alignment:
Q  159 ttcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgttttgtgcgataagaaaaaaccacttaagctgaaagaaaggttttatcggacagcagtcag 258  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  || ||| ||||||||| ||||||     
T  14030558 ttcaaactgggtggttgaaatggagaatagtctcaggtgttttgtgcgataagaaagtaccacttaagctgaaatgaaagttctatcggacaacagtcaa 14030657  T
Q  259 accgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaagagccaacacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgt 341  Q
    ||   |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||| || | ||||||| |||||    
T  14030658 actagcaatgttgtatggtacggagtgttgggcggttaaaagtcaacacgagagtaaagtaagtgtagcagagatgaggatgt 14030740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 130 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 6056329 - 6056150
Alignment:
Q  130 agaaatagaagcagatgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgttttgtgcgataagaaaaaaccacttaagctg 229  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||  ||| ||||||| ||||||||||||| | || ||||| ||    
T  6056329 agaaatagaagcatatgtaaaatatcgtaggcaagttgggtggttgaaatgtagaagagcttcaagtgttttatgcgataagaaaatatcatttaagttg 6056230  T
Q  230 aaagaaaggttttatcggacagcagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaagagccaacacga 309  Q
    |||| |   || ||||||||| | ||||||||||||||||| || | ||||||||| |||| |||||||| |||||||||    
T  6056229 aaaggataattctatcggacaacggtcagaccgacaatgttatatgatacggagtgttgggtggttaagaaccaacacga 6056150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 151 - 322
Target Start/End: Original strand, 30679218 - 30679389
Alignment:
Q  151 ttatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgttttgtgcgataagaaaaaaccacttaagctgaaagaaaggttttatcggaca 250  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||  ||||| |||| |||||| || ||| |||| ||||    
T  30679218 ttatcgtattcaagttgggtggttgaaatagagaagaggctcaggtgttttgagcgataagaaagtaccacataagttgaaaggaaagttctatcagaca 30679317  T
Q  251 gcagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaagagccaacacgagagtaaagtaagt 322  Q
     ||||||||||||| |||||||| ||| |  | || ||| | |||||||  |||||||||| | ||||||||    
T  30679318 acagtcagaccgacgatgttgtatggtgcataatgttggacagttaagaatcaacacgagaatcaagtaagt 30679389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 4 - 201
Target Start/End: Original strand, 27790754 - 27790950
Alignment:
Q  4 gggtatatggaatgtaacttcaacaaaaggagaagtgtgggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcatac-ccaagttacacggtttaaata 102  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||   | |||||| |||||||||| || |||| |||||  |||| |||| ||||| ||||||||||    
T  27790754 gggtatatggagtgtaacttcaacaaaaggataagta--gttctaccatggaggtgaaggtgggaggtcataaaatactccaaattacatggtttaaata 27790851  T
Q  103 tcttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgtttt 201  Q
    |||||| |||||| |||||||||| | | |||||||||||  | ||||| ||| || | ||| || ||||||||||| |||||||| |||| |||||||    
T  27790852 tcttggatccatagtacaaaatgacgcataaatagaagcaagtctaaatcatcataataaagttgagtggttgaaatagagaagagcctcaagtgtttt 27790950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 73 - 341
Target Start/End: Original strand, 26291444 - 26291712
Alignment:
Q  73 atatcataccc-aagttacacggtttaaatatcttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtattcaagctgggtg 171  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||| | | |||| | |||||||||| ||| ||    
T  26291444 atatcataccctaagttacaccgtttaaatatcttgagtccatagtagaaaatgatggagaaatagaagcatacgcaaatcaacgtattcaagttggatg 26291543  T
Q  172 gttgaaatggagaagagtctcaggtgttttgtgcgataagaaaaaaccacttaagctgaaagaaaggttttatcggacagcagtcagaccgacaatgttg 271  Q
    ||||||||| |||| |  |||| || |||| || |||||||||  ||   ||||| || ||| ||  || ||||| ||| |  ||| ||  |||||||||    
T  26291544 gttgaaatgtagaataacctcatgtattttatgtgataagaaagcacatgttaagttggaagtaaaattatatcgaacaactatcatactaacaatgttg 26291643  T
Q  272 taaggtacggagtgctgggcggttaagagccaacacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgt 341  Q
    || ||||||||||| | ||| ||| | | |||||| |||| |||||||||| |||  |||||||||||||    
T  26291644 tatggtacggagtgttaggc-gttgaaaaccaacatgagaataaagtaagtgtaattgagatgatgatgt 26291712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 242 - 335
Target Start/End: Original strand, 30031091 - 30031184
Alignment:
Q  242 tatcggacagcagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaagagccaacacgagagtaaagtaagtataacggagatga 335  Q
    |||||||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| | |||| ||| || |||||||||    
T  30031091 tatcggacagcagtcagaccaatgatgttgtatggtacggagtgttgggcggttaagagccaacatgagaatcaagttagtgtagcggagatga 30031184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 45 - 115
Target Start/End: Original strand, 3632653 - 3632724
Alignment:
Q  45 tctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcataccc-aagttacacggtttaaatatcttgggtccata 115  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  3632653 tctacctttgaggtgaaagttggagatcatatcataccctaaattacacgatttaaatatcttggatccata 3632724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 144 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 2065302 - 2065105
Alignment:
Q  144 atgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcagg-tgttttgtgcgataagaaaaaaccacttaagctgaaagaaaggtttt 242  Q
    |||||||| |||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||  || |||||| |  |||||||||  ||  |||||| |||||| ||  || |    
T  2065302 atgtaaatcatcgtattcaagatgtgttgttgaaatggaaaagagactttgggtgttttatttgataagaaagtacatcttaagttgaaaggaaacttct 2065203  T
Q  243 atcggacagcagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaagagccaacacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatg 340  Q
    |||||||| | || | || | | |||||||| |||||||| || ||| ||||||||||||||||||||| | ||||| || || ||||||||| ||||    
T  2065202 atcggacaaccgtaaaactggcgatgttgtatggtacggaatgttggacggttaagagccaacacgagaatcaagtacgtgtagcggagatgaggatg 2065105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 275 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 35043855 - 35043789
Alignment:
Q  275 ggtacggagtgctgggcggttaagagccaacacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgt 341  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||| |||||||| || ||||||||| |||||    
T  35043855 ggtacggagtgttggacggttaagagccaacatgagagtcaagtaagtgtagcggagatgaagatgt 35043789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 228 - 341
Target Start/End: Original strand, 28085197 - 28085310
Alignment:
Q  228 tgaaagaaaggttttatcggacagcagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaagagccaacacgagagtaaagtaagtataac 327  Q
    |||||| || ||| |||||||||||||||||||||    || |||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||| |||| | |||||||| || |    
T  28085197 tgaaaggaaagttctatcggacagcagtcagaccggtgttgctgtatggtacggagtgttgggcggctaagagtcaacatgagaatcaagtaagtgtagc 28085296  T
Q  328 ggagatgatgatgt 341  Q
     ||||||| |||||    
T  28085297 agagatgaggatgt 28085310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 76
Target Start/End: Original strand, 30670483 - 30670556
Alignment:
Q  1 acggggtatatggaatgtaacttcaacaaaaggagaagtgtgggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatat 76  Q
    |||| |||||| ||||||| ||| | |||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30670483 acggagtatatagaatgtatctttagcaaaaggagaagta--ggtataccttggaggtgaaagttggagatcatat 30670556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 86 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 6642013 - 6641916
Alignment:
Q  86 gttacacggtttaaatatcttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggag 183  Q
    ||||||| ||||||  ||||| || | ||| ||||||||||  |||||||||||| |||||||||  || | ||| ||| ||||||||||||||||||    
T  6642013 gttacacagtttaagcatcttagggctatagtacaaaatgagagagaaatagaaggagatgtaaaccattgaattaaagttgggtggttgaaatggag 6641916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 218; Significance: 1e-120; HSPs: 40)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 42854700 - 42854352
Alignment:
Q  1 acggggtatatggaatgtaacttcaacaaaaggag---aagt----gtgggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcataccc-aagttacac 92  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||   |||     |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  42854700 acggagtatatggaatgtaacttcagcaaaaggagcaaaaggagaagtgggtctaccttggaggtgaaaggtggagatcatatcataccccaagttacac 42854601  T
Q  93 ggtttaaatatcttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctc 192  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  42854600 ggtttaaatatcttgggtccatcgtacaaaatgtttgagaaatagaagcagatgtaaatcatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagcctc 42854501  T
Q  193 aggtgttttgtgcgataagaaaaaaccacttaagctgaaagaaaggttttatcggacagcagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcg 292  Q
    | ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||  || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  42854500 atgtgttttgtgcgataagaaagtaccacttaagctgaaaggaaaattctatcggacagcagtcagaccgacaatgttgtatggtacggagtgttgggcg 42854401  T
Q  293 gttaagagccaacacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgt 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||| |||||    
T  42854400 gttaagagccaacacgagagtaaagttagtgtagcggagatgacgatgt 42854352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 6 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 36565923 - 36565590
Alignment:
Q  6 gtatatggaatgtaacttcaacaaaaggagaagtgtgggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcataccc-aagttacacggtttaaatatc 104  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  36565923 gtatatgaaatgtaacttcaacggaaggagaagta--ggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcataccccaagttacacggtttaaatatc 36565826  T
Q  105 ttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgttttgtg 204  Q
    |||||||| |  |||||||||| ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  36565825 ttgggtcctttgtacaaaatgacggagaaatagaagcagatgtaagccatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagcctcaggtgttttgtg 36565726  T
Q  205 cgataagaaaaaaccacttaagctgaaagaaaggttttatcggacagcagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaagagccaa 304  Q
    ||||||||||  |||||||||| |||||| || ||| ||||||||||||||||||||| |  ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  36565725 cgataagaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttctatcggacagcagtcagaccggcgttgttgtatggtacggagtgttgggcggttaagagtcaa 36565626  T
Q  305 cacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatg 340  Q
     | |||| | |||||||| || | ||||||| ||||    
T  36565625 tatgagaatcaagtaagtgtagcagagatgaggatg 36565590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 181; E-Value: 9e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 15215957 - 15215619
Alignment:
Q  1 acggggtatatggaatgtaacttcaacaaaaggagaagtgtgggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcatacccaa-gttacacggtttaa 99  Q
    |||| ||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15215957 acggagtacatgaaatgtaacttcagcaaaaggagaagtg--ggtctaccatggaggtgaaagttggagatcatatcatacccaaagttacacggtttaa 15215860  T
Q  100 atatcttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaa-gcagatgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgt 198  Q
    |||| ||||||||||| |||||| |||   |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||  ||||    
T  15215859 atatattgggtccatagtacaaagtgac--agaaatagaaagcagatgtaaatcatcgtattcaagctaggtggttgaaatggagaagagcctccagtgt 15215762  T
Q  199 tttgtgcgataagaaaaaaccacttaagctgaaagaaaggttttatcggacagcagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaag 298  Q
     ||||||| |||||||  | ||||||||||||||| || ||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  15215761 cttgtgcggtaagaaagtatcacttaagctgaaaggaaagttctatcgaacagtagtcagaccgaaaatgttgtatggtacggagtgttgggcggttaag 15215662  T
Q  299 agccaacacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgt 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||  | ||||||||| |||||    
T  15215661 agccaacacgagagtaaagtaagtgaagcggagatgaggatgt 15215619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 12492529 - 12492220
Alignment:
Q  1 acggggtatatggaatgtaacttcaacaaaaggagaagtgtgggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcataccc-aagttacacggtttaa 99  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |  ||||| ||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12492529 acggagtatatggaatgtaacttcagcggaaggataagta--ggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcataccccaagttacacggtttaa 12492432  T
Q  100 atatcttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgtt 199  Q
    ||||||||||||| |  |||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  12492431 atatcttgggtccttcgtacaaaatgacggagaaatagaagcagatgtaagctatcgtattcaggttgggtggttgaaatggagaagagcctcatgtgtt 12492332  T
Q  200 ttgtgcgataagaaaaaaccacttaagctgaaagaaaggttttatcggacagcagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaaga 299  Q
    |||||||||||||||  |||||||||| |||||| || ||| ||||||||||| ||| ||||| |  ||||| | ||||||||||| |||||||||||||    
T  12492331 ttgtgcgataagaaagtaccacttaagatgaaaggaaagttctatcggacagccgtccgaccggcgttgttgcatggtacggagtgttgggcggttaaga 12492232  T
Q  300 gccaacacgaga 311  Q
    | ||||| ||||    
T  12492231 gtcaacatgaga 12492220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 4033181 - 4032917
Alignment:
Q  1 acggggtatatggaatgtaacttcaacaaaaggagaagtgtgggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcataccc-aagttacacggtttaa 99  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4033181 acggagtatatggaatgtaacttcagcaaaaggagtagaa--ggtctaccttggagatgaaagttggagatcatatcataccccaagttacacggtttaa 4033084  T
Q  100 atatcttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgtt 199  Q
     |||||||||| |||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4033083 gtatcttgggttcatagtacacaatgatggagaaataaaagcatatgtaaatcatcatattcaagttgggtggttgaaatggagaagagcctcaggtgtt 4032984  T
Q  200 ttgtgcgataagaaaaaaccacttaagctgaaagaaaggttttatcggacagcagtcagaccgacaa 266  Q
    |||||||||||||||  |||||||||| |||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4032983 ttgtgcgataagaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttttatcggacaacagtcagaccgacaa 4032917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 6 - 341
Target Start/End: Original strand, 36544752 - 36545081
Alignment:
Q  6 gtatatggaatgtaacttcaacaaaaggagaagtgtgggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcataccc-aagttacacggtttaaatatc 104  Q
    |||||||||||||||||| | |  ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  36544752 gtatatggaatgtaactttagcggaaggagaagta--ggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcataccccaagttacaaggtttaaatatc 36544849  T
Q  105 ttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgttttgtg 204  Q
     |||| |  |  |||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  36544850 atggggctttcgtacaaaatgacggagaaatagaagcagatgtaagtcatcgtattcaagttgggtggttgaaatggataagagcctcaggtgttttgtg 36544949  T
Q  205 cgataagaaaaaaccacttaagctgaaagaaaggttttatcggacagcagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaagagccaa 304  Q
    ||||||||||  |||||||||| |||||  || ||| ||||||| ||||     |||  |  ||||||| ||||| ||||| |||| ||||||||| |||    
T  36544950 cgataagaaagtaccacttaagttgaaaagaaagttctatcggatagca-----accagcgttgttgtatggtaccgagtgttgggtggttaagagtcaa 36545044  T
Q  305 cacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgt 341  Q
    || |||| | |||||||| || | ||||||| |||||    
T  36545045 catgagaatcaagtaagtgtagcagagatgaggatgt 36545081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 55 - 335
Target Start/End: Original strand, 18124825 - 18125103
Alignment:
Q  55 aggtgaaagttggagatcatatcataccc-aagttacacggtttaaatatcttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaatta 153  Q
    |||| |||||| ||||||||| |||| || |||||| | ||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  18124825 aggtaaaagtttgagatcataccatatcctaagttatatggtttaaatattttg--tccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaactca 18124922  T
Q  154 tcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgttttgtgcgataagaaaaaaccacttaagctgaaagaaaggttttatcggacagca 253  Q
    ||| ||||||||||  |||||||||||||||| |  |||||||||||| || |||||||||  ||||||| || |||||| || ||| ||||||||| ||    
T  18124923 tcgaattcaagctgaatggttgaaatggagaaaaacctcaggtgttttatgtgataagaaagtaccactt-agttgaaaggaaagttctatcggacaaca 18125021  T
Q  254 gtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaagagccaacacgagagtaaagtaagtataacggagatga 335  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| | |||||||| || |||||||||    
T  18125022 gtcagaccaacaatgttgtatggtacggagtgttgggcggttaagagccaacatgagaatcaagtaagtgtagcggagatga 18125103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 8880121 - 8879850
Alignment:
Q  1 acggggtatatggaatgtaacttcaacaaaaggagaagtgtgggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcata-cccaagttacacggtttaa 99  Q
    |||| ||| ||| |||||||||||| |||||||||||||   |||| ||| || |||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8880121 acggagtacatgaaatgtaacttcagcaaaaggagaagta--ggtcgaccgtgaaggtgaaagttgaaaatcatatcatatcccaagttacacggtttaa 8880024  T
Q  100 atatcttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgtt 199  Q
    ||||||||||  |||| |||||||||| |||||||||||| |||||| | |  |||||||||| | ||| |||||||||| |||||||  || |||||||    
T  8880023 atatcttgggctcatagtacaaaatgaaggagaaatagaaccagatgaatagcatcgtattcatgttggatggttgaaatagagaagaaccttaggtgtt 8879924  T
Q  200 ttgtgcgataagaaaaaaccacttaagctgaaagaaaggttttatcggacagcagtcagaccgacaatgttgta 273  Q
    |||||||||||||||  |||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  8879923 ttgtgcgataagaaagtaccacttaagttgaaagaaaagttctatcggacagcagtcagacctactatgttgta 8879850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 132 - 341
Target Start/End: Original strand, 37077490 - 37077699
Alignment:
Q  132 aaatagaagcagatgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgttttgtgcgataagaaaaaaccacttaagctgaa 231  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||  |||||||||| ||||    
T  37077490 aaatagaagccgatgtaaatcatcgtattcaagctaagtggttgaaatggagaagagtctcaggtgttttgtgtgataagtaagtaccacttaagttgaa 37077589  T
Q  232 agaaaggttttatcggacagcagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaagagccaacacgagagtaaagtaagtataacggag 331  Q
    ||  | ||| | || |||| ||||||||||| | ||| |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| | |||||||| |  |||||    
T  37077590 agggaagttatgtcagacaacagtcagaccgtcgatgctgtatggtacggagtgttgggcagttaagagccaacacgagaatcaagtaagtgtggcggag 37077689  T
Q  332 atgatgatgt 341  Q
    |||| |||||    
T  37077690 atgaggatgt 37077699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 153 - 341
Target Start/End: Original strand, 39946603 - 39946791
Alignment:
Q  153 atcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgttttgtgcgataagaaaaaaccacttaagctgaaagaaaggttttatcggacagc 252  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||  |||||||||  |||||| || ||| |||||||||||    
T  39946603 atcgtattcaagctggatggttgaaatggagaagagccttaggtgttttgtgcgataagaaagtaccacttaaattgaaaggaaagttctatcggacagc 39946702  T
Q  253 agtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaagagccaacacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgt 341  Q
    |||||| ||| | |||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||||| | |||||||| || | ||||||| |||||    
T  39946703 agtcaggccggcgatgttgtatggtacggaatgttgggcggttaagagtcaacacgagaatcaagtaagtgtagcagagatgaggatgt 39946791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 120 - 311
Target Start/End: Original strand, 25299950 - 25300141
Alignment:
Q  120 aaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgttttgtgcgataagaaaaaacc 219  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| ||||| ||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||    
T  25299950 aaaatgatggggaaatagaagcatatgtaaatcatcgtatgcaagcagggggtttgaaatggagaagagcctcaggtgttttgtgcgataagaaagtacc 25300049  T
Q  220 acttaagctgaaagaaaggttttatcggacagcagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaagagccaacacgaga 311  Q
    | ||||| |||||| || ||| ||||  ||| ||||  ||||| | |||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25300050 aattaagttgaaaggaaagttctatcacacaacagttcgaccggcgatgttgtatgctacggagtgttgggcggttaagagccaacacgaga 25300141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 120 - 311
Target Start/End: Original strand, 25288613 - 25288806
Alignment:
Q  120 aaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtattcaagctggg--tggttgaaatggagaagagtctcaggtgttttgtgcgataagaaaaaa 217  Q
    ||||||| || |||||||||||| |||||||| ||||||| ||||| |||  || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |    
T  25288613 aaaatgacggggaaatagaagcatatgtaaatcatcgtatgcaagcagggggtgtttgaaatggagaagagcctcaggtgttttgtgcgataagaaagta 25288712  T
Q  218 ccacttaagctgaaagaaaggttttatcggacagcagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaagagccaacacgaga 311  Q
    ||| ||||| |||||| || ||| ||||  ||| ||||  ||||| | |||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25288713 ccaattaagttgaaaggaaagttctatcacacaacagttcgaccggcgatgttgtatgctacggagtgttgggcggttaagagccaacacgaga 25288806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 45 - 215
Target Start/End: Original strand, 13984672 - 13984842
Alignment:
Q  45 tctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcataccc-aagttacacggtttaaatatcttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcag 143  Q
    ||||||||| |||||||||  | |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||   ||||||| ||||||    
T  13984672 tctaccttgaaggtgaaagaagaagatcatatcataccccaagatacacggtttaaatatcttgggtccatagta-aaaatgacaaagaaataaaagcag 13984770  T
Q  144 atgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgttttgtgcgataagaaaa 215  Q
    |||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||||| || ||||||||||    
T  13984771 atgtaaatcatcgtatttaagttggatggttgaaatgaagaagagcctcaagtgttttatgtgataagaaaa 13984842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 218 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 18752344 - 18752227
Alignment:
Q  218 ccacttaagctgaaagaaaggttttatcggacagcagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaagagccaacacgagagtaaag 317  Q
    ||||||||||| |||| || ||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18752344 ccacttaagctcaaaggaaagttctatcggacaacagtcagaccggcaatgttgtatggtacggagtgctggacggttaagagccaacacgagagtaaag 18752245  T
Q  318 taagtataacggagatga 335  Q
    ||||| || |||||||||    
T  18752244 taagtgtagcggagatga 18752227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 120 - 262
Target Start/End: Original strand, 25439249 - 25439391
Alignment:
Q  120 aaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgttttgtgcgataagaaaaaacc 219  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||  |||    
T  25439249 aaaatgacggagaaatagaagcatatgtaaatcatcgtatgcaagcaggatggttgaaatggagaagagtctcgggtgttttgtgtgataagaaagtacc 25439348  T
Q  220 acttaagctgaaagaaaggttttatcggacagcagtcagaccg 262  Q
    ||||||| |||||| || ||| ||||  ||| |||||||||||    
T  25439349 acttaagttgaaaggaaagttctatcacacaacagtcagaccg 25439391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 48 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 28300747 - 28300596
Alignment:
Q  48 accttggaggtgaaagttggagatcatatcatacccaagttacacggtttaaatatcttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgt 147  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||| |||  ||||||||||  |||| ||| ||||||||||    
T  28300747 accttagaggtgaaagctggagatcatatcatac--aagttacacagtttaaatatcttgggttcatggtacaaaatgactgagatataaaagcagatgt 28300650  T
Q  148 aaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgtttt 201  Q
    | || |||||||||||| ||| ||||| || |||||||||| ||| | ||||||    
T  28300649 acatcatcgtattcaagttggatggttaaattggagaagagactcggatgtttt 28300596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 57 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 19293913 - 19293776
Alignment:
Q  57 gtgaaagttggagatcatatcatacccaag-ttacacggtttaaatatcttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatc 155  Q
    |||||||||| ||| | ||||| |||| || |||||||||||||||||||| |||||| | |||||||| |  |||||| | |||||||||||||| |||    
T  19293913 gtgaaagttgaagaacgtatcaaaccccagattacacggtttaaatatctttggtccagagtacaaaatcacagagaaaaaaaagcagatgtaaataatc 19293814  T
Q  156 gtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctca 193  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  19293813 gtatttaagttgggtggttgaaatggagaatagtctca 19293776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 60 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 30113827 - 30113671
Alignment:
Q  60 aaagttggagatcatatcatac-ccaagttacacggtttaaatatcttgggtccataatacaaaatgatggagaaata-gaagcagatgtaaattatcgt 157  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||| |  ||| ||||||||||  ||  ||||| ||||||| ||||||| | ||||||||||||||| || ||    
T  30113827 aaagttggagatcatatcatactccaaattatatagttcaaatatcttgaatctgtaatataaaatgacggagaaaaaagaagcagatgtaaatcattgt 30113728  T
Q  158 attcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgttttgtgcgataagaaa 214  Q
    |||||||||   ||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||    
T  30113727 attcaagctaaatggttgaaatggagaagagtcgcaggtgttttatgtgataagaaa 30113671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 45 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 41444949 - 41444809
Alignment:
Q  45 tctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcatacc-caagttacacggtttaaatatcttgggtcca-taatacaaaatgatggagaaatagaagca 142  Q
    |||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||| || | ||||||||||||| |||||||||||||    
T  41444949 tctaacttagaggtgaaaggtggagatcatatcataccacaagttacttggtttaaatatcttgggttcaatgatacaaaatgatgtagaaatagaagca 41444850  T
Q  143 gatgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggag 183  Q
      ||||||| || | || |||||  ||||||||||||||||    
T  41444849 agtgtaaatcattgaatacaagcaaggtggttgaaatggag 41444809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 45 - 189
Target Start/End: Original strand, 29735454 - 29735592
Alignment:
Q  45 tctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcataccc-aagttacacggtttaaatatcttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcag 143  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||        ||||||| | |||||||| |||||||||||||||     
T  29735454 tctaccatggaggtgaaagtgggagatcatatcataccccaagttatacgatttaaac-------gtccatagttcaaaatgacggagaaatagaagcat 29735546  T
Q  144 atgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagt 189  Q
    |||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  29735547 atgtaaatcatcttattcaagttgggtggttgaaatggagatgagt 29735592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 199 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 36395443 - 36395320
Alignment:
Q  199 tttgtgcgataagaaaaaaccacttaagctgaaagaaaggttttatcggacagcagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaag 298  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| |||||| || ||| ||||||||||||||| ||||| |  ||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  36395443 tttgtgcgataagaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttctatcggacagcagtccgaccggcgttgttgtatggtacggagtgttgggcggttaag 36395344  T
Q  299 agccaacacgagagtaaagtaagt 322  Q
    || ||||| |||| | ||||||||    
T  36395343 agtcaacatgagaatcaagtaagt 36395320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 95 - 209
Target Start/End: Original strand, 35601686 - 35601799
Alignment:
Q  95 tttaaatatcttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcag 194  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||| ||||||  |||||| | ||||||||||||| |||||     
T  35601686 tttaaatatcttggatccataatacaaaatgacagagaaatagacgtagatgtaaattatcgaattcaa-ttgggtgatagaaatggagaagactctcaa 35601784  T
Q  195 gtgttttgtgcgata 209  Q
    |||||||||| ||||    
T  35601785 gtgttttgtgtgata 35601799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 45 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 33830875 - 33830721
Alignment:
Q  45 tctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcatacccaagttacacggtttaaatatcttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcaga 144  Q
    |||||||| ||  ||||||||||| ||| |||||||   ||||||||| |||||||||| ||||||||||  |||||||||| | ||||||| ||||| |    
T  33830875 tctaccttagacatgaaagttggatatcttatcatat--aagttacacagtttaaatattttgggtccattgtacaaaatgacgaagaaataaaagcata 33830778  T
Q  145 tgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgtttt 201  Q
    ||||||| ||||| |||||| ||| ||||| |||||  ||||||||||| |||||||    
T  33830777 tgtaaatcatcgtgttcaagttggatggttaaaatgttgaagagtctcaagtgtttt 33830721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 54 - 201
Target Start/End: Original strand, 38667205 - 38667351
Alignment:
Q  54 gaggtgaaagttggagatcatatcatacccaagttacacggttt-aaatatcttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaatt 152  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||  |||| ||||||||||||| |||| ||||||| ||| |||||||| ||| ||||||||||     
T  38667205 gaggtgaaacttggagatcatatcatac--aagttacaaagttttaaatatcttgggttcatagtacaaaacgatagagaaataaaagaagatgtaaatc 38667302  T
Q  153 atcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgtttt 201  Q
    |||||||| ||| ||| |||||||||| ||| |||| || | |||||||    
T  38667303 atcgtattaaagttggatggttgaaatagagtagagcctaatgtgtttt 38667351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 6 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 18849797 - 18849624
Alignment:
Q  6 gtatatggaatgtaacttcaacaaaaggagaagtgtgggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcataccc-aagttacacggtttaaatatc 104  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||| |||||   | | | |||| ||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18849797 gtatatggaatataacgtcaacaaaaggtgaagta--gttatgccttagaggtaaaaattggagatcatatcataccccaagttacacggtttaaatatc 18849700  T
Q  105 ttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctc 192  Q
    ||       || || ||| ||| ||||||||||||||| |||||||| |||     |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18849699 tt-------tagtataaagtgacggagaaatagaagcaaatgtaaatcatc-----caagctgggtggttgaaatggataagagtctc 18849624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 45 - 201
Target Start/End: Original strand, 25985179 - 25985334
Alignment:
Q  45 tctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcatacc-caagttacacggtttaaatatcttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcag 143  Q
    |||| ||| |||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || ||| |||||||  ||||||||||||||| ||    
T  25985179 tctagcttagaggtgaaagttgga--tcatatcataccacaagttacacggtttaaatatattggatctatagtacaaaaatatggagaaatagaaggag 25985276  T
Q  144 atgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgtttt 201  Q
    |||||||  || | || |||  ||||| |||||||||||| || | |||| |||||||    
T  25985277 atgtaaaccattgaatccaaaatgggtagttgaaatggaggagtgcctcaagtgtttt 25985334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 52 - 214
Target Start/End: Original strand, 13589084 - 13589247
Alignment:
Q  52 tggaggtgaaagttggagatcatatcata-cccaagttacacggtttaaatatcttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaa 150  Q
    |||||||||||||  |||||||||||| | ||||||||||| | |  ||| || |||||||  || || ||||||||| ||||||||||||| ||| |||    
T  13589084 tggaggtgaaagtgagagatcatatcaaatcccaagttacatgatacaaaaatattgggtcgttagtataaaatgatgaagaaatagaagcatatgaaaa 13589183  T
Q  151 ttatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgttttgtgcgataagaaa 214  Q
    | | | |||||||| ||| ||||||||||||||||||| || | ||||||| ||| ||||||||    
T  13589184 tcaccatattcaaggtggatggttgaaatggagaagagcctgatgtgttttatgctataagaaa 13589247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 178 - 322
Target Start/End: Original strand, 2796326 - 2796470
Alignment:
Q  178 atggagaagagtctcaggtgttttgtgcgataagaaaaaaccacttaagctgaaagaaaggttttatcggacagcagtcagaccgacaatgttgtaaggt 277  Q
    ||||||||||| ||  |||||| ||||||||||||||  |||||||||| |||||| || ||| ||| ||||| |||| ||||||||  |||| || |||    
T  2796326 atggagaagagccttcggtgttctgtgcgataagaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttatattggacaacagttagaccgacgttgttatatggt 2796425  T
Q  278 acggagtgctgggcggttaagagccaacacgagagtaaagtaagt 322  Q
    || ||||  |||| ||||||||| |||||||||| | ||||||||    
T  2796426 accgagtcttgggtggttaagagtcaacacgagaatcaagtaagt 2796470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 47 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 6511059 - 6510841
Alignment:
Q  47 taccttggaggtgaaagttggagatcatatcatacccaagttacacggtttaaatatcttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatg 146  Q
    |||||||||||| || |||| |||||| || |  ||||||||||| ||| |||||||||||| ||| || || ||| ||| |||||||| ||||||| |     
T  6511059 taccttggaggtaaaggttgaagatcacataac-cccaagttacatggtataaatatcttggatccgtagtataaagtgaaggagaaatggaagcaggtc 6510961  T
Q  147 -taaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgttttg-tgcgataagaaaaaaccacttaagctgaaagaaaggttttat 244  Q
     ||||| || | ||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||| |||| || |||||||||  ||  |||||| |||||| || ||| ||     
T  6510960 ataaatcattgcattcaagttgagtggttgaaatggagaagagtctcatgtggtttgatgtgataagaaagtactgcttaagttgaaaggaaagttctaa 6510861  T
Q  245 cggacagcagtcagaccgac 264  Q
    | ||||  ||||||||||||    
T  6510860 cagacattagtcagaccgac 6510841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 60 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 45332117 - 45332039
Alignment:
Q  60 aaagttggagatcatatcatacc-caagttacacggtttaaatatcttgggtccataatacaaaatgatggagaaatag 137  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||| | |||| ||||||| | |||||||||||    
T  45332117 aaagttggagatcatgtcataccacaagttacacggtttaaatatcctggcttcatagtacaaaacggtggagaaatag 45332039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 168 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 10824609 - 10824546
Alignment:
Q  168 ggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgttttgtgcgataagaaaaaaccacttaagctgaa 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||| |||| ||||| ||||    
T  10824609 ggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgttttatgtgatacgaaaataccagttaagttgaa 10824546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 110 - 188
Target Start/End: Original strand, 6986525 - 6986603
Alignment:
Q  110 tccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagag 188  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||| |||||| ||| |||   |||||| |||||||    
T  6986525 tccataatacaaaatgatagagaaatcgaagcatatgtaaattatcgaattcaatctgagtgaccgaaatgaagaagag 6986603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 266 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 9905309 - 9905234
Alignment:
Q  266 atgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaagagccaacacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgt 341  Q
    |||||||| |||||  |||| ||| ||||||| | ||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||    
T  9905309 atgttgtatggtacatagtgttggacggttaataaccaacacgagaataaagttagtataacggagatgaggatgt 9905234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 95 - 192
Target Start/End: Original strand, 35601501 - 35601598
Alignment:
Q  95 tttaaatatcttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctc 192  Q
    |||||||||||||| || | | |||| || || | ||||| ||| | ||||||||||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||| ||||||    
T  35601501 tttaaatatcttggatctaaagtacacaacgacgaagaaagagacgtagatgtaaattatcgaattcaatccgggtgattgaaatggagaatagtctc 35601598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 55 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 43732279 - 43732230
Alignment:
Q  55 aggtgaaagttggagatcatatcata-cccaagttacacggtttaaatat 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||    
T  43732279 aggtgaaagttggagatcatatcatagcacaagtaacacggtttaaatat 43732230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 158 - 199
Target Start/End: Original strand, 43732355 - 43732396
Alignment:
Q  158 attcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgtt 199  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  43732355 attcaagttgggtggttgaaatggagaagagtctcaagtgtt 43732396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 135 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 13172200 - 13172147
Alignment:
Q  135 tagaagcagatgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagag 188  Q
    |||||||| |||| ||| || |||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  13172200 tagaagcaaatgtgaatcattgtattcaagcagggtggttgaaatagagaagag 13172147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 280 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 17492035 - 17491994
Alignment:
Q  280 ggagtgctgggcggttaagagccaacacgagagtaaagtaag 321  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  17492035 ggagtgttgggcggttaagaaccaacacgagaataaagtaag 17491994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 54 - 82
Target Start/End: Original strand, 3285135 - 3285163
Alignment:
Q  54 gaggtgaaagttggagatcatatcatacc 82  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3285135 gaggtgaaagttggagatcatatcatacc 3285163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 119 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 44681644 - 44681543
Alignment:
Q  119 caaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgttttgtgcgataagaaaaaac 218  Q
    ||||| |||||||||| ||||| |  ||||||| | |||||||||| || ||| ||||||||||||||||  ||| ||||| | || |||| ||||| ||    
T  44681644 caaaacgatggagaaaaagaagta--tgtaaatcagcgtattcaagttgagtgtttgaaatggagaagagcatcaagtgttctatgtgatacgaaaatac 44681547  T
Q  219 cact 222  Q
    ||||    
T  44681546 cact 44681543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 211; Significance: 1e-115; HSPs: 39)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 32083432 - 32083093
Alignment:
Q  1 acggggtatatggaatgtaacttcaacaaaaggagaagtgtgggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcataccc-aagttacacggtttaa 99  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||  |||||    
T  32083432 acggagtatatggaatgtaacttcagcaaaaggagaagtg--ggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcataccccaagttgcacaatttaa 32083335  T
Q  100 atatcttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgtt 199  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  32083334 atatcttgggtccatagtacaaaatgacggagaaatagaggcaaatgtaaatcatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagcctcaggtgtt 32083235  T
Q  200 ttgtgcgataagaaaaaaccacttaagctgaaagaaaggttttatcggacagcagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaaga 299  Q
     | ||||||||||||  ||||||||||||||||| || ||| |||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||    
T  32083234 ctatgcgataagaaagtaccacttaagctgaaaggaaagttctatcagacaacagtcagaccgacaatgttgtatggtacagagtgttgggcggttaaga 32083135  T
Q  300 gccaacacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgt 341  Q
    | |||||||||||||||||| || || ||||||||| |||||    
T  32083134 gtcaacacgagagtaaagtatgtgtagcggagatgaggatgt 32083093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 322
Target Start/End: Original strand, 8671515 - 8671835
Alignment:
Q  1 acggggtatatggaatgtaacttcaacaaaaggagaagtgtgggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcataccc-aagttacacggtttaa 99  Q
    |||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8671515 acggagtatatggaatgtaacttcagcagaaggagaagta--ggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcataccctaagttacacggtttaa 8671612  T
Q  100 atatcttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgtt 199  Q
    ||||||||||||| |  |||||||||| | |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  8671613 atatcttgggtccttcgtacaaaatgacgaagaaatagaagcagatgtaagtcatcgtattcaagctgggtggttaaaatggagaagagactcaggtgtt 8671712  T
Q  200 ttgtgcgataagaaaaaaccacttaagctgaaagaaaggttttatcggacagcagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaaga 299  Q
    |||||||||||||||  |||||||||| |||||| || ||| |||| |||| ||||||||||| |  ||||||| |||||| | || ||| |||||||||    
T  8671713 ttgtgcgataagaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttctatcagacaacagtcagaccggcgttgttgtatggtacgaaatgttggacggttaaga 8671812  T
Q  300 gccaacacgagagtaaagtaagt 322  Q
    | ||||| |||| | ||||||||    
T  8671813 gtcaacatgagaatcaagtaagt 8671835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 341
Target Start/End: Original strand, 1210340 - 1210679
Alignment:
Q  1 acggggtatatggaatgtaacttcaacaaaaggagaagtgtgggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcataccc-aagttacacggtttaa 99  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |  ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  1210340 acggagtatatggaatgtaacttcagcggaaggagaagta--ggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcataccccaagttacacagtttaa 1210437  T
Q  100 atatcttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgtt 199  Q
    ||||||||||||  |  |||||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||    
T  1210438 atatcttgggtctttcgtacaaaatgatggagaaataaaagcagatgtaagccatcgtattcaagctgggtggttgaaatgaagaagagcctgaggtgtt 1210537  T
Q  200 ttgtgcgataagaaaaaaccacttaagctgaaagaaaggttttatcggacagcagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaaga 299  Q
    |||||||||||||||  |||||||||| |||||| || ||| ||||||||||||||  ||||| |  ||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  1210538 ttgtgcgataagaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttctatcggacagcagttcgaccggcgttgttgtatggtacggagtgttgggcggttaaga 1210637  T
Q  300 gccaacacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgt 341  Q
    | ||||| |||| | |||||||| || | ||||||| |||||    
T  1210638 gtcaacatgagaatcaagtaagtgtagcagagatgaggatgt 1210679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 322
Target Start/End: Original strand, 51601653 - 51601973
Alignment:
Q  1 acggggtatatggaatgtaacttcaacaaaaggagaagtgtgggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcataccc-aagttacacggtttaa 99  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |  ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  51601653 acggagtatatggaatgtaacttcagcggaaggagaagta--ggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcataccccaagttacacggtttaa 51601750  T
Q  100 atatcttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgtt 199  Q
    ||||||||||||| |  |||||||||| ||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  51601751 atatcttgggtccttcgtacaaaatgacggagaaatagaagcagatgtaagccatcgtattcaagctgggtggtggaaatagagaagagtctcaggtgtt 51601850  T
Q  200 ttgtgcgataagaaaaaaccacttaagctgaaagaaaggttttatcggacagcagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaaga 299  Q
    |||| ||||||||||  ||| |||||| |||||  || ||| |||||||||| |||| ||||| |  ||||||| ||||||||||| |||| ||||||||    
T  51601851 ttgttcgataagaaagtaccccttaagttgaaatgaaagttctatcggacagtagtccgaccggcgttgttgtatggtacggagtgttgggtggttaaga 51601950  T
Q  300 gccaacacgagagtaaagtaagt 322  Q
    | ||||| |||| | ||||||||    
T  51601951 gtcaacatgagaatcaagtaagt 51601973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 43241068 - 43240729
Alignment:
Q  1 acggggtatatggaatgtaacttcaacaaaaggagaagtgtgggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcataccc-aagttacacggtttaa 99  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |  ||||||||||   | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  43241068 acggagtatatggaatgtaacttcagcggaaggagaagta--gatctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcataccccaagttacacggtttaa 43240971  T
Q  100 atatcttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgtt 199  Q
    ||||||||| ||| |  |||||||||| |||||||| |||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  43240970 atatcttggatccttcgtacaaaatgacggagaaatggaagcagatgtaagccatcatattcaagctgggtggttgaaatggagaagagcctcaggtgtt 43240871  T
Q  200 ttgtgcgataagaaaaaaccacttaagctgaaagaaaggttttatcggacagcagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaaga 299  Q
    |||||| ||||||||  |||||||||| |||||| || ||| ||||||||||||||| ||||| |  ||||||| | ||||||||| |||| ||||||||    
T  43240870 ttgtgcaataagaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttctatcggacagcagtccgaccggcgttgttgtatgatacggagtgttgggaggttaaga 43240771  T
Q  300 gccaacacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgt 341  Q
    | ||||| |||| | |||||||| || | ||||||| |||||    
T  43240770 gtcaacatgagaatcaagtaagtgtagcagagatgaggatgt 43240729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 51441451 - 51441113
Alignment:
Q  1 acggggtatatggaatgtaacttcaacaaaaggagaagtgtgggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcataccc-aagttacacggtttaa 99  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |  ||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  51441451 acggagtatatggaatgtaacttcagcggaaggagaagta--ggtctaccttgaaggtgaaagttggagatcatatcataccccaagttacacagtttaa 51441354  T
Q  100 atatcttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgtt 199  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||| |||||||||||||||||| |||   ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  51441353 atatcttgggtctttcatacaaaatgacggagaaatagaagcagatctaagccatcatattcaagctgggtggttgaaatggagaagagcctcaagtgtt 51441254  T
Q  200 ttgtgcgataagaaaaaaccacttaagctgaaagaaaggttttatcggacagcagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaaga 299  Q
    || ||||||||||||  |||||||||| |||||| || ||| ||||||||||||||| |||||||  ||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  51441253 tt-tgcgataagaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttctatcggacagcagtccgaccgacgttgttgtatggtacggagtgttgggcggttaaga 51441155  T
Q  300 gccaacacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgt 341  Q
    | ||||| |||| | |||| ||| || | ||||||| |||||    
T  51441154 gtcaacatgagaatcaagtgagtgtagcagagatgaggatgt 51441113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 49348081 - 49347760
Alignment:
Q  1 acggggtatatggaatgtaacttcaacaaaaggagaagtgtgggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcataccc-aagttacac-ggttta 98  Q
    |||| |||||| ||||||||||||| |  ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  49348081 acggagtatatcgaatgtaacttcagcggaaggagaagta--ggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcataccccaagttacactggttta 49347984  T
Q  99 aatatcttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgt 198  Q
    |||||||||||||| |  |||||||||| |||||||||||||||| |||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  49347983 aatatcttgggtccttcgtacaaaatgacggagaaatagaagcaggtgtaagccatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagcctcaggtgt 49347884  T
Q  199 tttgtgcgataagaaaaaaccacttaagctgaaagaaaggttttatcggacagcagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaag 298  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| |||||| ||   | ||||||||||||||| |||| ||  ||||||| |||||| |||| ||||||||||||    
T  49347883 tttgtgcgataagaaagtaccacttaagttgaaaggaaaaatctatcggacagcagtccgaccaaccttgttgtatggtacgaagtgttgggcggttaag 49347784  T
Q  299 agccaacacgagagtaaagtaagt 322  Q
    || ||||| |||| | ||||||||    
T  49347783 agtcaacatgagaatcaagtaagt 49347760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 88 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 30202731 - 30202478
Alignment:
Q  88 tacacggtttaaatatcttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaaga 187  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||| ||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  30202731 tacacggtttaaatatcttgggtccttcgtacaaaatgacggagaaatagaagcagatgtaagccatcgtattcaagccgggtggttgaaatggagaaga 30202632  T
Q  188 gtctcaggtgttttgtgcgataagaaaaaaccacttaagctgaaagaaaggttttatcggacagcagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgct 287  Q
    | |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| || ||| ||||||||| ||||| ||||| |  ||||||  ||||| ||||| |    
T  30202631 gcctcaggtgttttgtgcgataagaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttctatcggacaacagtccgaccggcgttgttgtgtggtacagagtgtt 30202532  T
Q  288 gggcggttaagagccaacacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgt 341  Q
    ||||||||||||| ||||| |||| | |||||||| || | ||||||| |||||    
T  30202531 gggcggttaagagtcaacatgagaatcaagtaagtgtagcagagatgaggatgt 30202478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 62 - 335
Target Start/End: Original strand, 19936175 - 19936450
Alignment:
Q  62 agttggagatcatatcataccc-aagttacacggtttaaatatcttgggtccataatacaaaa-tgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtat 159  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  19936175 agttggagatcatatcataccccaagttacatggtttaaatatcttgggtccataatacaaaaatgaaggagaaatagaagcatatgtaaatcatcgtat 19936274  T
Q  160 tcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgttttgtgcgataagaaaaaaccacttaagctgaaagaaaggttttatcggacagcagtcaga 259  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||  |||| ||||||| || |||||||||  ||| |||||  |||||| ||  || |||||||||||||| |||    
T  19936275 tcaagctgggtggttgaaatggataagaacctcaagtgttttatgtgataagaaagtaccgcttaaaatgaaaggaaaattatatcggacagcagttaga 19936374  T
Q  260 ccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaagagccaacacgagagtaaagtaagtataacggagatga 335  Q
    ||  ||||||| || ||||  ||||| ||||||||||||| |||||| |||| | || |||| ||| |||||||||    
T  19936375 ccagcaatgttatagggtatagagtgttgggcggttaagaaccaacatgagaatcaaataagcatagcggagatga 19936450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 6 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 34827784 - 34827482
Alignment:
Q  6 gtatatggaatgtaacttcaacaaaaggagaagtgtgggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcataccc-aagttacacggtttaaatatc 104  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||  |  | |   ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  34827784 gtatatggaatgtaacttcatcaaaagaagaagtg--gtcccatgatggaggtgaaagtgggagatcatatcataccctaagttacaaggtttaaatatc 34827687  T
Q  105 ttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgttttgtg 204  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||| || ||||||||| ||  ||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||    
T  34827686 ttgggtccatagtacaaaatgacggagaaatagaagcatatgtaaatcattgtattcaagttgaatggttgaaatggagaagagcctcatgtgttttatg 34827587  T
Q  205 cgataagaaaaaaccacttaagctgaaagaaaggttttatcggacagcagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaagagccaa 304  Q
     |||||||||  ||  |||||  |||||| ||  || ||| ||||| |||||||| | || |||||||| ||||| ||||| ||  ||||||||| ||||    
T  34827586 tgataagaaagtactgcttaaattgaaaggaaaattatattggacaacagtcagatcaacgatgttgtatggtacagagtgttgttcggttaagaaccaa 34827487  T
Q  305 cacga 309  Q
    |||||    
T  34827486 cacga 34827482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 162 - 341
Target Start/End: Original strand, 8391525 - 8391706
Alignment:
Q  162 aagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgttttgtgcgataagaaaaaaccacttaagctgaaagaaaggttttatcggacagcagtcagacc 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  8391525 aagctgggtggttgaaatggagaagagcctcaggtgttttgtgcgataagaaagtaccacttaagcttaaaggaatgttttatcggacagcagtcagacc 8391624  T
Q  262 gacaatgt--tgtaaggtacggagtgctgggcggttaagagccaacacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgt 341  Q
    | ||||||  | || ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||    
T  8391625 ggcaatgtcgtatatggtacagagtgttgggcggttaagagtcaacacgagagtaaagtaagtgtagcggagatgaagatgt 8391706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 47 - 252
Target Start/End: Original strand, 27445537 - 27445743
Alignment:
Q  47 taccttggaggtgaaagttggagatcatatcataccc-aagttacacggtttaaatatcttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagat 145  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27445537 taccttgcaggtgaaagttggagatcttatcataccccaagttacacggtttaattatgttgggtccatagtacaaaatgatggagaaatagaagcagat 27445636  T
Q  146 gtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgttttgtgcgataagaaaaaaccacttaagctgaaagaaaggttttatc 245  Q
    |||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||  |  ||||||| || |||||||||  |||||||||  |||||| || ||| ||||    
T  27445637 gtaaatcatcgtattcaagttggttggttgaaatggagaagagttccgagtgttttatgtgataagaaagtaccacttaaattgaaaggaaagttctatc 27445736  T
Q  246 ggacagc 252  Q
    || ||||    
T  27445737 gggcagc 27445743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 6 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 37463544 - 37463249
Alignment:
Q  6 gtatatggaatgtaacttcaacaaaaggagaagtgtgggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcatac-ccaagttacacggtttaaatatc 104  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||  | |||     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||    
T  37463544 gtatatggaatgtaacttcagcaaaagccggagt-----tctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcatactccgagttacacagtttaaatatc 37463450  T
Q  105 ttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgttttgtg 204  Q
    ||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||  ||     
T  37463449 ttgagtccatagtacaaaatgacggagaaatagaagcagatgtatatcattgtatttaagctaggtggttgatatggagaagagccttaggtgttaggt- 37463351  T
Q  205 cgataagaaaaaaccacttaagctgaaagaaaggttttatcggacagcagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaagagccaa 304  Q
     |||||||||  ||   ||||| |||||| ||  || |||| |||| |||||||||   |||||||||| ||||| ||||| |||| |||||||| ||||    
T  37463350 -gataagaaagcactgattaagttgaaaggaaaattctatcagacaacagtcagactagcaatgttgtatggtacagagtgttgggtggttaagaaccaa 37463252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 139 - 340
Target Start/End: Original strand, 22089826 - 22090027
Alignment:
Q  139 agcagatgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgttttgtgcgataagaaaaaaccacttaagctgaaagaaagg 238  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||| || |    
T  22089826 agcagatgtaagtcatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcagatgttttgtgcaataagaaaataccacttaagttgaaaggaaag 22089925  T
Q  239 ttttatcggacagcagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaagagccaacacgagagtaaagtaagtataacggagatgatga 338  Q
    || ||||||||||||||| ||||| |  ||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||| | |||||||| || | ||||||| ||    
T  22089926 ttctatcggacagcagtccgaccggcgttgttgtgtggtacggagtgttgggcggttaagagtcaacatgagaatcaagtaagtgtagcagagatgagga 22090025  T
Q  339 tg 340  Q
    ||    
T  22090026 tg 22090027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 136 - 341
Target Start/End: Original strand, 9592463 - 9592668
Alignment:
Q  136 agaagcagatgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgttttgtgcgataagaaaaaaccacttaagctgaaagaa 235  Q
    ||||||||| ||||   |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| |    
T  9592463 agaagcagaggtaagccatcgtattcaagttgggtggttgaaatggagaagagtctcgggtgttttgtgcgataagaaagtaccacttaagttgaaagga 9592562  T
Q  236 aggttttatcggacagcagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaagagccaacacgagagtaaagtaagtataacggagatga 335  Q
    | ||| |||||||||  |||||||| |||  ||||||| ||||||||||| |||||||||||||  ||||| |||| | |||||||| || | |||||||    
T  9592563 aagttctatcggacaatagtcagactgacgttgttgtatggtacggagtgttgggcggttaagaatcaacatgagaatcaagtaagtgtagcagagatga 9592662  T
Q  336 tgatgt 341  Q
     |||||    
T  9592663 ggatgt 9592668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 201 - 341
Target Start/End: Original strand, 15085728 - 15085868
Alignment:
Q  201 tgtgcgataagaaaaaaccacttaagctgaaagaaaggttttatcggacagcagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaagag 300  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||| || ||| |||| ||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  15085728 tgtgcgataagaaagcaccacttaagctgaaaggaaagttctatcagacagcagtcaaaccggcaatgttgtatggtacggagtgttgggcggttaagag 15085827  T
Q  301 ccaacacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgt 341  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||    
T  15085828 ccaacacgagagtaaagtaagtgtagcggagatgaggatgt 15085868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 207 - 341
Target Start/End: Original strand, 696069 - 696203
Alignment:
Q  207 ataagaaaaaaccacttaagctgaaagaaaggttttatcggacagcagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaagagccaaca 306  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  696069 ataagaaagtaccacttaagctgaaaggaaagttctatcggacagcagtcagaccggcaatgttgtatggtacggagtgttgggtggttaagagccaaca 696168  T
Q  307 cgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgt 341  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||| |||||    
T  696169 cgagagtaaagtaagtgtagcggagatgaggatgt 696203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 45 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 32066913 - 32066761
Alignment:
Q  45 tctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcatacccaagttacacggtttaaatatcttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcaga 144  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||| |||||| |||| ||||||||||  |||||||| ||||| |    
T  32066913 tctaccttagaggtgaaaattggagatcatatcatac--aagttacacagtttaaatattttgggttcatagtacaaaatgacagagaaataaaagcaaa 32066816  T
Q  145 tgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgtt 199  Q
    ||||||| |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  32066815 tgtaaatcatcgtattcaagttggatggttaaaatggagaagagcctcaggtgtt 32066761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 60 - 214
Target Start/End: Original strand, 51234267 - 51234421
Alignment:
Q  60 aaagttggagatcatatcatacccaagttacacggtttaaatatcttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtat 159  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||| ||  |||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||  ||    
T  51234267 aaagttggagatcatatcataaacaagtttcatagtttaaatatcttgagtccatagtgcaaaatgatggagaaattgaagcagatgtaaatcatcaaat 51234366  T
Q  160 tcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgttttgtgcgataagaaa 214  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| |||| || |||| ||||    
T  51234367 tcaagttgggtggttgaaatggagaatagcctcaggtcttttatgtgatacgaaa 51234421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 55 - 196
Target Start/End: Original strand, 7921574 - 7921716
Alignment:
Q  55 aggtgaaagttggagatcatatcatacc-caagttacacggtttaaatatcttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaatta 153  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||| ||||||||| |||||| ||||||| ||| |||||||||||| |||||||||  |    
T  7921574 aggtgaaagttggagatcatatcttaccacaagttacacgatttatatatcttggatccatagtacaaaacgattgagaaatagaaggagatgtaaacca 7921673  T
Q  154 tcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggt 196  Q
    ||| ||||||| ||||| |||||||||||  || |||||||||    
T  7921674 tcgaattcaagttgggttgttgaaatggatgagggtctcaggt 7921716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 54 - 201
Target Start/End: Original strand, 28528227 - 28528375
Alignment:
Q  54 gaggtgaaagttggagatcatatcatacc-caagttacacggtttaaatatcttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaatt 152  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||  |||||||  ||||||||||||||| || ||||||      
T  28528227 gaggtgaaagttggagatcatagcataccacaagttacacagtttaaatatcttgggtctatgttacaaaacaatggagaaatagaaggaggtgtaaacc 28528326  T
Q  153 atcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgtttt 201  Q
    |||| || | ||||||||||||||||| ||| || | ||||||||||||    
T  28528327 atcgaatccgagctgggtggttgaaattgaggagtgcctcaggtgtttt 28528375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 45 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 35829038 - 35828894
Alignment:
Q  45 tctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcatacc-caagttacacggtttaaatatcttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcag 143  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||| | | ||||| |||||||||||||| ||||||  || |||||||||||||||     
T  35829038 tctaccttggaggtgaaagctagagatcatatcataccacaagttacgctgcttaaacatcttgggtccatagtacaaagcgacggagaaatagaagcat 35828939  T
Q  144 atgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagag 188  Q
    |||||||| |||| |||| | ||| |||||||||||||| |||||    
T  35828938 atgtaaatcatcgaattcgatctgtgtggttgaaatggaaaagag 35828894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 54 - 179
Target Start/End: Original strand, 6640772 - 6640898
Alignment:
Q  54 gaggtgaaagttggagatcatatcatacc-caagttacacggtttaaatatcttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaatt 152  Q
    |||||||||||| |||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||||||||||||| || ||||||      
T  6640772 gaggtgaaagttagagatcatattacaccacaagttacacggtttaaatatcttgagtctatagtacaaaattatggagaaatagaaggaggtgtaaacc 6640871  T
Q  153 atcgtattcaagctgggtggttgaaat 179  Q
    || | || |||| ||||||||||||||    
T  6640872 attggatccaagttgggtggttgaaat 6640898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 58 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 52740098 - 52739965
Alignment:
Q  58 tgaaagttggagatcatatcatacccaagttacacggtttaaatatcttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgt 157  Q
    |||||||||||||||||||||| |  ||||| |||||||| ||||| ||||  | ||| |||||| ||| ||||||||||||| |||||||| | ||| |    
T  52740098 tgaaagttggagatcatatcatgcttaagttgcacggtttgaatattttggacctatagtacaaagtgacggagaaatagaagtagatgtaagtcatctt 52739999  T
Q  158 attcaagctgggtggttgaaatggagaagagtct 191  Q
    | ||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  52739998 actcaagttggatggttgaaatggagaagagtct 52739965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 117 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 46226853 - 46226630
Alignment:
Q  117 tacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgttttgtgcgataagaaaaa 216  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||| || ||||||||| ||| |||||||||||||||||||  ||| ||||||| || | |||||||      
T  46226853 tacaaaatgatggagaaacaaaagcagatgtaaat-attgtattcaagttggatggttgaaatggagaagagcatcaagtgttttatgtgctaagaaagt 46226755  T
Q  217 accacttaagctgaaagaaaggttttatcggacagcagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaagagccaacacgagagtaaa 316  Q
    |   |||||| |||||||||  || |||| |||| | |||| |  ||| |||||||| |||||| | || || ||  |||| | ||||||||||| | ||    
T  46226754 agtgcttaagttgaaagaaaaattctatcagacaactgtcatagtgacgatgttgtatggtacgaaatgttgagcaattaacaaccaacacgagaatcaa 46226655  T
Q  317 gtaagtataacggagatgatgatgt 341  Q
    |||||| || |||||||||||||||    
T  46226654 gtaagtttagcggagatgatgatgt 46226630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 45 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 12807732 - 12807587
Alignment:
Q  45 tctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcatacc-caagttacacggtttaaatatcttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcag 143  Q
    |||||||| |||||||||||||  |||| ||||||||  ||||||||||  |||||||||||||| |||||| || |||| || | |||||||||||| |    
T  12807732 tctaccttagaggtgaaagttgaggatcgtatcatactacaagttacacaatttaaatatcttggatccatagtataaaacgacgaagaaatagaagctg 12807633  T
Q  144 atgtaaattatcgtattcaagctgggtgg-ttgaaatggagaagag 188  Q
    |||||||| |||| ||| |  || ||||| ||||||||||||||||    
T  12807632 atgtaaatcatcgaatttattctaggtggtttgaaatggagaagag 12807587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 45 - 189
Target Start/End: Original strand, 52421067 - 52421210
Alignment:
Q  45 tctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcatacc-caagttacacggtttaaatatcttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcag 143  Q
    ||||||||  ||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||| | |||||||| ||||||||  || ||||||| ||   ||||||| |||||     
T  52421067 tctaccttataggtgaaagttagagatcatatcatgccacaagttacaag-tttaaatagcttgggtctttagtacaaaa-gacatagaaataaaagcat 52421164  T
Q  144 atgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagt 189  Q
    |||| ||| |||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  52421165 atgttaatcatcgaattcaagttgggtggttgaaatagagaagagt 52421210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 94 - 231
Target Start/End: Original strand, 21275588 - 21275725
Alignment:
Q  94 gtttaaatatcttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctca 193  Q
    |||||||||||||||||| ||| | ||||| ||  |||| ||| |||  ||||||||| || | || ||||||| |||||||||||  ||||||||||||    
T  21275588 gtttaaatatcttgggtcgatagtgcaaaacgacagagatataaaagttgatgtaaatcattgaatccaagctgagtggttgaaataaagaagagtctca 21275687  T
Q  194 ggtgttttgtgcgataagaaaaaaccacttaagctgaa 231  Q
     ||| ||| |  |||||||||  |||||||||||||||    
T  21275688 tgtgctttatttgataagaaagtaccacttaagctgaa 21275725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 55 - 107
Target Start/End: Original strand, 40419328 - 40419381
Alignment:
Q  55 aggtgaaagttggagatcatatcatacc-caagttacacggtttaaatatcttg 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  40419328 aggtgaaagttggagatcatatcataccacaagttacacagtttaaatatcttg 40419381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 46 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 46226956 - 46226887
Alignment:
Q  46 ctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcataccca-agttacacggtttaaatatcttgggtccat 114  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46226956 ctactttggaggtgcaagttggagatcataccataccttgagttacacggtttaaatatcttgggtccat 46226887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 54 - 179
Target Start/End: Original strand, 3877495 - 3877621
Alignment:
Q  54 gaggtgaaagttggagatcatatcatacc-caagttacacggtttaaatatcttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaatt 152  Q
    ||||| ||| |||||||| |||||||  | ||| ||||||  |||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| || ||| |     
T  3877495 gaggtaaaaattggagattatatcatttcacaaattacacaatttaaatatcatgggtccataatataaaacgatggagaaatagaagcaaatataattc 3877594  T
Q  153 atcgtattcaagctgggtggttgaaat 179  Q
    |||  ||||||  |||||| |||||||    
T  3877595 atcaaattcaatatgggtgcttgaaat 3877621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 52 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 16142487 - 16142399
Alignment:
Q  52 tggaggtgaaagttggagatcatatcata-cccaagttacacggtttaaatatcttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaa 139  Q
    |||||||||| || ||||  ||||||||| ||||||| ||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||| ||||    
T  16142487 tggaggtgaaggtgggagggcatatcatatcccaagtgacacattttaaatatcttgggttcataatacaaaatgacgaagaaaaagaa 16142399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 82 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 11331666 - 11331568
Alignment:
Q  82 ccaagttacacggtttaaatatcttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatgg 181  Q
    |||||||||||| ||||||||| || |||||||||     |||||  ||||||||||||||||||||||||| ||  || ||| ||| ||||| ||||||    
T  11331666 ccaagttacacgatttaaatatatttggtccataa-----aatgacagagaaatagaagcagatgtaaattaccgcttttaagttggatggtttaaatgg 11331572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 82 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 11489687 - 11489589
Alignment:
Q  82 ccaagttacacggtttaaatatcttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatgg 181  Q
    |||||||||||| ||||||||| || |||||||||     |||||  ||||||||||||||||||||||||| ||  || ||| ||| ||||| ||||||    
T  11489687 ccaagttacacgatttaaatatatttggtccataa-----aatgacagagaaatagaagcagatgtaaattaccgcttttaagttggatggtttaaatgg 11489593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 48 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 52641093 - 52641033
Alignment:
Q  48 accttggaggtgaaagttggagatcatatcatacccaagttacacggtttaaatatcttgggt 110  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||| ||||||    
T  52641093 accttagaggtgaaagttggagatcatatcata--caagttacacaatttaaatatattgggt 52641033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 117 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 52640997 - 52640920
Alignment:
Q  117 tacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcag 194  Q
    ||||||||||  |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||  | ||||||||| ||||||| |||||    
T  52640997 tacaaaatgacagagagataaaagcatatgtaaattatcgtattcaagttgaattgttgaaatgaagaagagcctcag 52640920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 179 - 291
Target Start/End: Original strand, 52831830 - 52831942
Alignment:
Q  179 tggagaagagtctcaggtgttttgtgcgataagaaaaaaccacttaagctgaaagaaaggttttatcggacagcagtcagaccgacaatgttgtaaggta 278  Q
    |||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||    || ||||  |||||||||  || ||||||||  |||| ||||||||||||||||| | ||    
T  52831830 tggagaagagcctcatgtgttttatgcgataagaaagtgtcatttaaattgaaagaaaaattgtatcggacgacagttagaccgacaatgttgtatgata 52831929  T
Q  279 cggagtgctgggc 291  Q
    || |||| |||||    
T  52831930 cgaagtgttgggc 52831942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 48 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 16273471 - 16273415
Alignment:
Q  48 accttggaggtgaaagttggagatcatatcatacccaagttacacggtttaaatatctt 106  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||    
T  16273471 accttagagatgaaagttggagatcatatcata--caagttacacaatttaaatatctt 16273415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 269 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 34792768 - 34792726
Alignment:
Q  269 ttgtaaggtacggagtgctgggcggttaagagccaacacgaga 311  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  34792768 ttgtatggtacggagtgttgggcggttaagagtcaacacgaga 34792726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 205; Significance: 1e-112; HSPs: 29)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 315
Target Start/End: Original strand, 3301444 - 3301757
Alignment:
Q  1 acggggtatatggaatgtaacttcaacaaaaggagaagtgtgggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcataccc-aagttacacggtttaa 99  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3301444 acggagtatatggaatgtaacttcagcaaaaggagaagtg--ggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcataccccaagttacacggtttaa 3301541  T
Q  100 atatcttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgtt 199  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||    
T  3301542 atatcttgggtccatagtaccaaatgaaggagaaatagaagcagatgcaaatcatcgtattcaagctgggtggttgaaatagagatgagcctcaggtgtt 3301641  T
Q  200 ttgtgcgataagaaaaaaccacttaagctgaaagaaaggttttatcggacagcagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaaga 299  Q
    |||||||||||||||  |||||||||  |||||| || ||| |||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||    
T  3301642 ttgtgcgataagaaagtaccacttaaattgaaaggaaagttctatcggacagtagtcagactgacaatgttgtatggtacgaagtgttgggcggttaaga 3301741  T
Q  300 gccaacacgagagtaa 315  Q
    |||||||||| |||||    
T  3301742 gccaacacgaaagtaa 3301757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 6 - 287
Target Start/End: Original strand, 3394311 - 3394593
Alignment:
Q  6 gtatatggaatgtaacttcaacaaaaggagaagtgtgggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcataccc-aagttacacggtttaaatatc 104  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3394311 gtatatggaatgtaa-ttcagcaaaaggagaagtg--ggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcataccccaagttacacggtttaaatatc 3394407  T
Q  105 ttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgttttgtg 204  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  3394408 ttgggtccatagtacaaaatgacggagaaatagaagcagatgtaaatcatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagatgagcctcaggtgttttgtg 3394507  T
Q  205 cgataagaaaaaaccacttaagctgaa---agaaaggttttatcggacagcagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgct 287  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||   || || ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||    
T  3394508 cgataagaaagtaccacttaagctgaaaggaggaaagttctatcggacagcagtcagaccggcaatgttgtatagtacggagtgct 3394593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 341
Target Start/End: Original strand, 1274860 - 1275199
Alignment:
Q  1 acggggtatatggaatgtaacttcaacaaaaggagaagtgtgggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcataccc-aagttacacggtttaa 99  Q
    |||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||   |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1274860 acggagtatatggaatgtaacttcagcgaaaggagaagta--ggtctaccttggagatgaaagttggagatcatatcataccccaagttacacggtttaa 1274957  T
Q  100 atatcttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgtt 199  Q
    ||||||||||||| |  |||||||||| ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||    
T  1274958 atatcttgggtccttcgtacaaaatgacggagaaatagaagcagatgtaagccatcgtattcaagctgggtggttgaaatgaagaagagcctaaggtgtt 1275057  T
Q  200 ttgtgcgataagaaaaaaccacttaagctgaaagaaaggttttatcggacagcagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaaga 299  Q
    |||||||||||||||  |||||||||| |||||| || ||| ||||||||||||||||||||| |  ||||||| ||||||||||| |||||||||| ||    
T  1275058 ttgtgcgataagaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttctatcggacagcagtcagaccggcgttgttgtatggtacggagtgttgggcggttacga 1275157  T
Q  300 gccaacacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgt 341  Q
    | ||||| |||| | ||||||| ||| | ||||||| |||||    
T  1275158 gtcaacatgagaatcaagtaagcatagcagagatgaggatgt 1275199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 12493074 - 12492735
Alignment:
Q  1 acggggtatatggaatgtaacttcaacaaaaggagaagtgtgggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcataccc-aagttacacggtttaa 99  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |  ||||||||||   | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12493074 acggagtatatggaatgtaacttcagcggaaggagaagta--gctctaccttggaggtaaaagttggagatcatatcataccccaagttacacggtttaa 12492977  T
Q  100 atatcttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgtt 199  Q
    ||||||||||||| |  |||||||||| ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12492976 atatcttgggtccttcgtacaaaatgacggagaaatagaagcagatgtaagccatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagcctcaggtgtt 12492877  T
Q  200 ttgtgcgataagaaaaaaccacttaagctgaaagaaaggttttatcggacagcagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaaga 299  Q
    |||||| ||||||||  |||||||||| |||||| || ||| ||||||||||||||| ||||| |  ||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  12492876 ttgtgcaataagaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttctatcggacagcagtccgaccggctttgttgtatggtacggagtgttgggcggttaaga 12492777  T
Q  300 gccaacacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgt 341  Q
    | ||||| |||| | |||||||| || | ||||||| |||||    
T  12492776 gtcaacatgagaatcaagtaagtgtagcagagatgaggatgt 12492735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 341
Target Start/End: Original strand, 10638892 - 10639231
Alignment:
Q  1 acggggtatatggaatgtaacttcaacaaaaggagaagtgtgggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcataccc-aagttacacggtttaa 99  Q
    |||| ||||||||||||||||||||    ||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10638892 acggagtatatggaatgtaacttcagtggaaggagaagta--ggtctaccttggaggtgaaagttggaaatcatatcataccccaagttacacggtttaa 10638989  T
Q  100 atatcttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgtt 199  Q
    ||||||||||||| |  |||||||||| ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  10638990 atatcttgggtccttcgtacaaaatgacggagaaatagaagcagatgtaagccatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagccttaggtgtt 10639089  T
Q  200 ttgtgcgataagaaaaaaccacttaagctgaaagaaaggttttatcggacagcagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaaga 299  Q
    |||||||||||||||  |||||||||| |||||| || ||| ||||| ||||||||| |||||||  ||||||| ||||||||||| |||||||| ||||    
T  10639090 ttgtgcgataagaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttctatcgaacagcagtccgaccgacgttgttgtatggtacggagtgttgggcggtgaaga 10639189  T
Q  300 gccaacacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgt 341  Q
    | ||||| |||| | |||||||| || | ||||||| |||||    
T  10639190 gtcaacatgagaatcaagtaagtgtagcagagatgaggatgt 10639231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 28977544 - 28977211
Alignment:
Q  1 acggggtatatggaatgtaacttcaacaaaaggagaagtgtgggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcataccc-aagttacacggtttaa 99  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||   |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  28977544 acggagtatatggaatgtaacttcaacggaaggagaagta--ggtctaccttagaggtgaaagttggagatcatatcataccccaagtcacacggtttaa 28977447  T
Q  100 atatcttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgtt 199  Q
    ||||||||||||| |  |||||||||| |||| |||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  28977446 atatcttgggtccttcgtacaaaatgacggagtaatagaagtagatgtaagccatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagcctcgggtgtt 28977347  T
Q  200 ttgtgcgataagaaaaaaccacttaagctgaaagaaaggttttatcggacagcagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaaga 299  Q
    |||||||||||||||  |||||||||| |||||| || ||| ||||||||| ||||| || ||||  ||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  28977346 ttgtgcgataagaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttctatcggacatcagtccgaacgacgttgttgtatggtacggagtgttgggcggttaaga 28977247  T
Q  300 gccaacacgagagtaaagtaagtataacggagatga 335  Q
    | ||||| |||| | |||||||| || | |||||||    
T  28977246 gtcaacatgagaatcaagtaagtgtagcagagatga 28977211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 45 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 2076119 - 2075822
Alignment:
Q  45 tctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcataccc-aagttacacggtttaaatatcttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcag 143  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||  |||||||||||||||    
T  2076119 tctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcataccccaagttacacggtttaaatatcttgggtccttcgtacaaaatgacagagaaatagaagcag 2076020  T
Q  144 atgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgttttgtgcgataagaaaaaaccacttaagctgaaagaaaggtttta 243  Q
    ||||||   |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||  |||||||||| |||||| || ||| ||    
T  2076019 atgtaagccatcgtattcaagttgggtggttgaaatgaagaagagcctcaggtgttttgtgcaataagaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttcta 2075920  T
Q  244 tcggacagcagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaagagccaacacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgt 341  Q
    ||||||||||||| ||||| |  ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||| | |||||||| || | ||||||| |||||    
T  2075919 tcggacagcagtccgaccggcgttgttgtatggtacggagtgttgggcggttaagagtcaacatgagaattaagtaagtgtagcagagatgaggatgt 2075822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 341
Target Start/End: Original strand, 20318586 - 20318921
Alignment:
Q  1 acggggtatatggaatgtaacttcaacaaaaggagaagtgtgggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcataccc-aagttacacggtttaa 99  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |  ||||||||||   | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20318586 acggagtatatggaatgtaacttcagcggaaggagaagta--gttctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcataccccaagttacacggtttaa 20318683  T
Q  100 atatcttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgtt 199  Q
    ||||||||||||| |  |||||||||| ||||||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20318684 atatcttgggtccttcgtacaaaatgacggagaaatagaagcagatgtaagccatcatattcaagctgggtggttgaaatggagaagagcctcaggtgtt 20318783  T
Q  200 ttgtgcgataagaaaaaaccacttaagctgaaagaaaggttttatcggacagcagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaaga 299  Q
    ||||||||||||     |||||||||| |||||| || ||| ||||||| ||||||| ||||| |  ||||||| ||||||||||| || ||||||||||    
T  20318784 ttgtgcgataag----taccacttaagttgaaaggaaagttatatcggatagcagtccgaccggcgttgttgtatggtacggagtgttgcgcggttaaga 20318879  T
Q  300 gccaacacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgt 341  Q
    | ||||| |||| | |||||||| || | ||||||| |||||    
T  20318880 gtcaacatgagaatcaagtaagtgtagcagagatgaggatgt 20318921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 1288276 - 1287937
Alignment:
Q  1 acggggtatatggaatgtaacttcaacaaaaggagaagtgtgggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcataccc-aagttacacggtttaa 99  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |  ||||||||||  |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1288276 acggagtatatggaatgtaacttcagcggaaggagaagtaag--tctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcataccccaagttacacggtttaa 1288179  T
Q  100 atatcttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgtt 199  Q
    |||||||| |||| |  |||||||||| ||||||||||||||||||||||   |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  1288178 atatcttgagtccttcgtacaaaatgacggagaaatagaagcagatgtaagccatcgtattcaagttggatggttgaaatggagaagagcctcatgtgtt 1288079  T
Q  200 ttgtgcgataagaaaaaaccacttaagctgaaagaaaggttttatcggacagcagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaaga 299  Q
    |||||||||||||||  |||| ||||| |||||| || ||| ||||| ||||||||| || || |  ||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  1288078 ttgtgcgataagaaagtaccatttaagttgaaaggaaagttctatcgaacagcagtccgatcggcgttgttgtatggtacggagtgttgggcggttaaga 1287979  T
Q  300 gccaacacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgt 341  Q
    | ||||| |||| | |||||||| || | ||||||| |||||    
T  1287978 gtcaacatgagaatcaagtaagtgtagcagagatgaggatgt 1287937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 264
Target Start/End: Original strand, 24178119 - 24178381
Alignment:
Q  1 acggggtatatggaatgtaacttcaacaaaaggagaagtgtgggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcataccc-aagttacacggtttaa 99  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |  ||||||||||   ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24178119 acggagtatatggaatgtaacttcagcggaaggagaagta--ggtctaccttggaagtgaaagttggagatcatatcataccctaagttacacggtttaa 24178216  T
Q  100 atatcttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgtt 199  Q
    | ||||||||||| |  |||||||||| ||||||||||||||||||||||   ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  24178217 agatcttgggtccttcgtacaaaatgacggagaaatagaagcagatgtaagccatcatattcaagttgggtggttgaaatggagaagagcctcaagtgtt 24178316  T
Q  200 ttgtgcgataagaaaaaaccacttaagctgaaagaaaggttttatcggacagcagtcagaccgac 264  Q
    |||||||||||||||  |||||||||| |||||| || ||| |||||| ||||||||||||||||    
T  24178317 ttgtgcgataagaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttctatcgggcagcagtcagaccgac 24178381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 6 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 16348084 - 16347879
Alignment:
Q  6 gtatatggaatgtaacttcaacaaaaggagaagtgtgggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcataccc-aagttacacggtttaaatatc 104  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16348084 gtatatgaaatgtaacttcagcaaaaggagaagta--ggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcataccccaagttacacggtttaaatatc 16347987  T
Q  105 ttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgttttgtg 204  Q
    ||| ||||||| |||||||||| ||||||||| ||||  |||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16347986 ttgtgtccatagtacaaaatgacggagaaataaaagcgtatgtaaatcatcgtattcaag-taggtggttgaaatggagaagagcctcaggtgttttgtg 16347888  T
Q  205 cgataagaa 213  Q
    | |||||||    
T  16347887 caataagaa 16347879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 153 - 341
Target Start/End: Original strand, 34272768 - 34272956
Alignment:
Q  153 atcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgttttgtgcgataagaaaaaaccacttaagctgaaagaaaggttttatcggacagc 252  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| || |||  ||||||||||    
T  34272768 atcgtattcaagttgggtggttaaaatggagaagagcctcaggtgttttgtgcgataagaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttcaatcggacagc 34272867  T
Q  253 agtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaagagccaacacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgt 341  Q
    |||| | |||||  ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||| | |||||||| || | ||||||| |||||    
T  34272868 agtccggccgacgttgttgtatggtacggagtgttgggcggttaagagtcaatatgagaatcaagtaagtgtagcagagatgaggatgt 34272956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 6 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 27302629 - 27302451
Alignment:
Q  6 gtatatggaatgtaacttcaacaaaaggagaagtgtgggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcatacc-caagttacacggtttaaatatc 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||   | ||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||    
T  27302629 gtatatggaatgtaacttcaacaaaaggtaaagta--gttctaccttgaaggtgagtgttggagatcatatcatacctcaaactacacggtttaaatatc 27302532  T
Q  105 ttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagag 188  Q
    ||| ||||||||||||||| |  |||||||||||   |||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||| |||||    
T  27302531 ttgtgtccataatacaaaacggcggagaaataga---agatgtaaatcatcgtattcaagttgagtggttgaaatggaaaagag 27302451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 52 - 305
Target Start/End: Original strand, 36200426 - 36200680
Alignment:
Q  52 tggaggtgaaagttggagatcatatcatacc-caagttacacggtttaaatatcttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaa 150  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||| |||| ||||||||||   |||||||| |||| |||||||    
T  36200426 tggaggtgaaagtgggaggtcatatcatacctcaagttacaccgtttaaatattttgggttcatagtacaaaatgacatagaaatagtagcatatgtaaa 36200525  T
Q  151 ttatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgttttgtgcgataagaaaaaaccacttaagctgaaagaaaggttttatcggaca 250  Q
    | ||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| || ||||||||||  |   ||||| |||||| ||  || || ||||||    
T  36200526 tcatcatatttaagttgggtggttgaaatggagaagagactcatgtgttttatgtgataagaaaatgctgtttaagttgaaaggaaaattctaccggaca 36200625  T
Q  251 gcagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaagagccaac 305  Q
     |||||| || | |||||||||| | |||  |||| | ||||||||||| |||||    
T  36200626 acagtcaaactggcaatgttgtatgatacaaagtggtaggcggttaagaaccaac 36200680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 135 - 341
Target Start/End: Original strand, 27622 - 27828
Alignment:
Q  135 tagaagcagatgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgttttgtgcgataagaaaaaaccacttaagctgaaaga 234  Q
    ||||| || |||||||| ||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||  |||||||  | |||||||||  |||||||||| ||||||     
T  27622 tagaatcaaatgtaaatcatcatattcaagttgggtggtggaaatagagaagagtctcgagtgttttacgtgataagaaagtaccacttaagttgaaagg 27721  T
Q  235 aaggttttatcggacagcagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaagagccaacacgagagtaaagtaagtataacggagatg 334  Q
    ||  || |||| ||||  |||| ||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| | ||||||| ||||||||||||    
T  27722 aaaattctatctgacaatagtcggacagacgatgttgtatggtacggagtgttgggcggttaagaaccaacatgagaattaagtaagcataacggagatg 27821  T
Q  335 atgatgt 341  Q
    | |||||    
T  27822 aggatgt 27828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 190 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 16347877 - 16347726
Alignment:
Q  190 ctcaggtgttttgtgcgataagaaaaaaccacttaagctgaaagaaaggttttatcggacagcagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgg 289  Q
    |||| ||| ||||||| ||||||||  |||||||||| |||||| || ||| ||||||||| || |||||||||| || ||||| ||||||||||| ||     
T  16347877 ctcatgtgatttgtgcaataagaaattaccacttaagttgaaaggaaagttctatcggacaacactcagaccgacgatattgtatggtacggagtgttga 16347778  T
Q  290 gcggttaagagccaacacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgt 341  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||| |||||    
T  16347777 gcggttaagagccaacacgagagttaagtaagtgtagcggagatgaggatgt 16347726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 54 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 43558450 - 43558318
Alignment:
Q  54 gaggtgaaagttggagatcatatcatacc-caagttacacggtttaaatatcttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaatt 152  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||  |||||||  |  |||||||||||||||||||||||     
T  43558450 gaggtgaaagttggagatcatagcataccacaagttacacgatttaaatatcttaggtccattgtacaaaaccacagagaaatagaagcagatgtaaatc 43558351  T
Q  153 atcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaa 185  Q
    |||| |||||||| |||| || |||||||||||    
T  43558350 atcgaattcaagcagggtagtggaaatggagaa 43558318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 45 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 17341846 - 17341748
Alignment:
Q  45 tctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcataccc-aagttacacggtttaaatatcttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagca 142  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || ||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||    
T  17341846 tctaccttggaggtggaagttggagatcatatcatacctgaaattacatggtttaaatatattgggtccatagtagaaaatgatagagaaatagaagca 17341748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 106 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 43423656 - 43423578
Alignment:
Q  106 tgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggaga 184  Q
    ||||||| || |||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  43423656 tgggtccgtagtacaaaatgacggagaaacagaagcagatgtaaatcatcatattcaagttgggtggttgaaatggaga 43423578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 94 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 20077413 - 20077305
Alignment:
Q  94 gtttaaatatcttgggtccata-atacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctc 192  Q
    |||||||||| |||||| |||  ||||||||||| ||||||||  ||||||||| |||| ||| | |||| | ||| ||||||||||||||||||| |||    
T  20077413 gtttaaatattttgggttcatttatacaaaatgacggagaaattaaagcagatgcaaatcatcattttcaggttggatggttgaaatggagaagagcctc 20077314  T
Q  193 aggtgtttt 201  Q
    |||||||||    
T  20077313 aggtgtttt 20077305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 61 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 38579130 - 38578992
Alignment:
Q  61 aagttggagatcatatcatacc-caagttacacggtttaaatatcttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtat 159  Q
    |||||||||||||||| ||| | |||||||||| |||||||||||||| ||  ||| |||||||||| ||  ||| |||||   |||||||  |||| ||    
T  38579130 aagttggagatcatattatagcacaagttacacagtttaaatatcttgagttgatagtacaaaatgacgggaaaacagaag---atgtaaacgatcgaat 38579034  T
Q  160 tcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgtttt 201  Q
     ||||||| ||||||||||||||| || | |||| |||||||    
T  38579033 ccaagctgagtggttgaaatggaggagtgcctcatgtgtttt 38578992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 273
Target Start/End: Original strand, 3096828 - 3097041
Alignment:
Q  54 gaggtgaaagttggagatcatatcatacc-caagttacacggtttaaatatcttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaatt 152  Q
    |||||||||||| |||||||||||  | | ||||||||| ||||||||||||||||||  ||| ||||||||      || ||| |||  ||| ||||      
T  3096828 gaggtgaaagttagagatcatatctcagcacaagttacatggtttaaatatcttgggtttatagtacaaaat------gacatataaggggatataaacc 3096921  T
Q  153 atcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgttttgtgcgataagaaaaaaccacttaagctgaaagaaaggttttatcggacagc 252  Q
    |||  ||||||| |||||||||||||||||  |||| || ||||||||| || |||  ||||| ||| |||||| |||| ||||  |||||||| ||| |    
T  3096922 atcaaattcaagttgggtggttgaaatggatgagagccttaggtgttttatgtgatgtgaaaataccgcttaagttgaaggaaa-tttttatcgaacaac 3097020  T
Q  253 agtcagaccgacaatgttgta 273  Q
     || |||||||| ||||||||    
T  3097021 ggtaagaccgacgatgttgta 3097041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 6 - 80
Target Start/End: Original strand, 27530 - 27602
Alignment:
Q  6 gtatatggaatgtaacttcaacaaaaggagaagtgtgggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcata 80  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||| |||||   | | | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27530 gtatagggaatgtaacttcaacaataggcgaagta--gttatgccttggaggtgaaagttggagatcatatcata 27602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 54 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 6368561 - 6368478
Alignment:
Q  54 gaggtgaaagttggagatcatatcatacc-caagttacacggtttaaatatcttgggtccataatacaaaatgatggagaaata 136  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||  |||||||||||||  || ||| ||||||| || |||||||||    
T  6368561 gaggtgaaagatggagatcataacataccacaagttacacaatttaaatatcttgtatctatagtacaaaacgacggagaaata 6368478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 54 - 140
Target Start/End: Original strand, 21915532 - 21915619
Alignment:
Q  54 gaggtgaaagttggagatcatatcatacc-caagttacacggtttaaatatcttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaag 140  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||| |||| || ||| |||||||| | | |||||||||||    
T  21915532 gaggtgaaagttcgagattatatcataatacaagttacacggtttaaatatattggttcaatagtacaaaataacgaagaaatagaag 21915619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 45 - 115
Target Start/End: Original strand, 37124207 - 37124278
Alignment:
Q  45 tctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcatac-ccaagttacacggtttaaatatcttgggtccata 115  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||  ||||||||| |||| |||||||    
T  37124207 tctaccttagaggtgaaagttggagatcaaatcatacaacaagttacattgtttaaatagcttgagtccata 37124278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 131 - 193
Target Start/End: Original strand, 28676253 - 28676314
Alignment:
Q  131 gaaatagaagcagatgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctca 193  Q
    |||||||||||| ||| |||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||    
T  28676253 gaaatagaagcatatgcaaatcatcgtattcaag-tgtgtggttgaaatggagaagaatctca 28676314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 5 - 108
Target Start/End: Original strand, 23979831 - 23979930
Alignment:
Q  5 ggtatatggaatgtaacttcaacaaaaggagaagtgtgggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcatacccaagttacacggtttaaatatc 104  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||   ||||   | || ||||| |||||||||||||||||||||||||||   |||||||||  |||| |||||    
T  23979831 ggtatatgtaatgtaacttcaacaaaagacaaagta--gttcaaccttagaggtgaaagttggagatcatatcata--gaagttacacaatttagatatc 23979926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 55 - 115
Target Start/End: Original strand, 25937719 - 25937780
Alignment:
Q  55 aggtgaaagttggagatcatatca-tacccaagttacacggtttaaatatcttgggtccata 115  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||   ||||||||||||||||||||    
T  25937719 aggtgaaagttggagatcatatcattccccaaattacacaaattaaatatcttgggtccata 25937780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0570 (Bit Score: 177; Significance: 2e-95; HSPs: 1)
Name: scaffold0570
Description:

Target: scaffold0570; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 7 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 2951 - 2618
Alignment:
Q  7 tatatggaatgtaacttcaacaaaaggagaagtgtgggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcataccc-aagttacacggtttaaatatct 105  Q
    ||||||||||||||||||| |  ||||||||||  |  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  2951 tatatggaatgtaacttcagcggaaggagaagtcag--tctacattggaggtgaaagttggagatcatatcataccccaagttacacggtttaaatatct 2854  T
Q  106 tgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgttttgtgc 205  Q
    ||||||| |  |||||||||| | |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2853 tgggtccttcgtacaaaatgacgaagaaatagaagcagatgtaagtcatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagcctcaggtgttttgtgc 2754  T
Q  206 gataagaaaaaaccacttaagctgaaagaaaggttttatcggacagcagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaagagccaac 305  Q
    |||||||||  |||||||||| |||||| || ||| ||||||||||||||||||| |||  ||||||| |||| |||||| |||||||||||||| ||||    
T  2753 gataagaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttctatcggacagcagtcagactgacgttgttgtatggtatggagtgttgggcggttaagagtcaac 2654  T
Q  306 acgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgt 341  Q
    | || | | |||||||| || | ||||||| |||||    
T  2653 atgataatcaagtaagtgtagcagagatgaggatgt 2618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0024 (Bit Score: 164; Significance: 1e-87; HSPs: 1)
Name: scaffold0024
Description:

Target: scaffold0024; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 43 - 341
Target Start/End: Original strand, 82356 - 82655
Alignment:
Q  43 ggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcatacc-caagttacacggtttaaatatcttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagc 141  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||    
T  82356 ggtctgccttggaggcgaaagttggagattatatcataccacaagttacacggtttaaatatcttgggtccatagtaaaaaatgacggagaaatagaagc 82455  T
Q  142 agatgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgttttgtgcgataagaaaaaaccacttaagctgaaagaaaggttt 241  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||| |||| ||||||||||||||||||||  ||  |||||| |||||| || |||     
T  82456 agatgtaaatcatcgtattcaagctgggtggttgcaatgggaaagagcctcatgtgttttgtgcgataagaaagtactccttaagttgaaaggaaagttc 82555  T
Q  242 tatcggacagcagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaagagccaacacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgt 341  Q
    ||||||||| ||||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| | ||||||||  | ||||||||| |||||    
T  82556 tatcggacaacagtcagaccgacgatcttgtatggtacggagtgttgggcggttaagagccaacatgagaatcaagtaagtgcagcggagatgaggatgt 82655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 159; Significance: 1e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 6 - 322
Target Start/End: Original strand, 31068 - 31383
Alignment:
Q  6 gtatatggaatgtaacttcaacaaaaggagaagtgtgggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcataccc-aagttacacggtttaaatatc 104  Q
    |||||||||||||||||||| |  ||||||||||   ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  31068 gtatatggaatgtaacttcagcggaaggagaagta--ggtctaccttggaagtgaaagttggagatcatatcataccccaagttacacggtttaaacatc 31165  T
Q  105 ttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgttttgtg 204  Q
    |||||||| |  |||||||||| ||||||||| ||| |||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  31166 ttgggtccttcgtacaaaatgacggagaaataaaagtagatgtaggccatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagcctcaagtgttttgtg 31265  T
Q  205 cgataagaaaaaaccacttaagctgaaagaaaggttttatcggacagcagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaagagccaa 304  Q
    ||||||||||  |||||||||| |||||| || ||| ||||| ||||||||||||||| |  ||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| |||    
T  31266 cgataagaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttctatcgaacagcagtcagaccggcggtgttgtacggtacggagtgttgggtggttaagagtcaa 31365  T
Q  305 cacgagagtaaagtaagt 322  Q
    || |||| | ||||||||    
T  31366 catgagaatcaagtaagt 31383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 131; Significance: 6e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 7 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 12279 - 12028
Alignment:
Q  7 tatatggaatgtaacttcaacaaaaggagaagtgtgggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcataccc-aagttacacggtttaaatatct 105  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||   |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  12279 tatatagaatgtaacttcagcaaaaggagaagta--ggtctaccttcgcggtgaaagttggagatcatatcataccccaagttacatggtttaaatatct 12182  T
Q  106 tgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgttttgtgc 205  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||   |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||  |||| |||||||||||    
T  12181 tgggtccatagtacaaaatgacggagaaatagaagcatatgtaagccatcgtatttaagctgggtcgttgaaatggagaagaacctcaagtgttttgtgc 12082  T
Q  206 gataagaaaaaaccacttaagctgaaagaaaggttttatcggacagcagtcaga 259  Q
    |||||||||  ||| |||||| | |||| || |||||||||| ||||| |||||    
T  12081 gataagaaagtacctcttaagttaaaaggaaagttttatcggtcagcaatcaga 12028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0171 (Bit Score: 66; Significance: 4e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0171
Description:

Target: scaffold0171; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 50 - 126
Target Start/End: Original strand, 5834 - 5911
Alignment:
Q  50 cttggaggtgaaagttggagatcatatcataccc-aagttacacggtttaaatatcttgggtccataatacaaaatga 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5834 cttggaggtgaaagttggagatcatatcataccccaagttacacggtttaaatatcttgggtccacaatacaaaatga 5911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1493 (Bit Score: 57; Significance: 9e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold1493
Description:

Target: scaffold1493; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 120 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 156 - 41
Alignment:
Q  120 aaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtattcaagctggg--tggttgaaatggagaagagtctcaggtgttttgtgcgataagaaaaaa 217  Q
    ||||||| || |||||||||||| |||||||| ||||||| ||||| |||  || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |    
T  156 aaaatgacggggaaatagaagcatatgtaaatcatcgtatgcaagcagggggtgtttgaaatggagaagagcctcaggtgttttgtgcgataagaaagta 57  T
Q  218 ccacttaagctgaaag 233  Q
    ||| ||||| ||||||    
T  56 ccaattaagttgaaag 41  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045 (Bit Score: 54; Significance: 6e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0045
Description:

Target: scaffold0045; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 94 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 87204 - 86955
Alignment:
Q  94 gtttaaatatcttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctca 193  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||  |||||||||||| ||||||||| | ||| |||||| | | | |||||||||||||||| || |||     
T  87204 gtttaaatatcttgggtccatagtataaaatgtcggagaaatagaatcagatgtaactcatcatattcatgtttgatggttgaaatggagaaaagcctcg 87105  T
Q  194 ggtgttttgtgcgataagaaaaaaccacttaagct-----gaaagaaaggttttatcggacagcagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctg 288  Q
    || ||||| ||| ||||||||  | |||||||| |     |||| ||| | | ||| |||||||||||||||| || || ||||| |||||  |||| |     
T  87104 ggggttttatgcaataagaaagtatcacttaagttgaaaagaaaaaaaagctctattggacagcagtcagaccaacgattttgtatggtac--agtg-tt 87008  T
Q  289 ggcggttaagagccaacacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgt 341  Q
    |||||||||||||| ||| |||| | |||||||| ||  |||||||| |||||    
T  87007 ggcggttaagagccgacatgagactcaagtaagtgtagaggagatgaggatgt 86955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 6 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 88605 - 88514
Alignment:
Q  6 gtatatggaatgtaacttcaacaaaaggagaagtgtgggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcatac-ccaagttacacggttta 98  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||  || ||| |||||||||| |||||| |||| |||||| |||||  ||||||||| ||||||    
T  88605 gtatatggaatgtaacttcagcaaaaggagaa--gtaggtttaccttggagatgaaagatggaaatcataccatacttcaagttacatggttta 88514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0606 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0606
Description:

Target: scaffold0606; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 54 - 184
Target Start/End: Original strand, 9303 - 9434
Alignment:
Q  54 gaggtgaaagttggagatcatatcataccca-agttacacggtttaaatatcttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaatt 152  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||     ||||||||| |||||||||||| |||  ||| || |||| |||| |||||| |||| |||||||||      
T  9303 gaggtaaaagttggagatcatatcatattattagttacacgatttaaatatcttaggtttatattataaaacgatgaagaaatggaaggagatgtaaaac 9402  T
Q  153 atcgtattcaagctgggtggttgaaatggaga 184  Q
    || | |||||| |||||| ||||||| |||||    
T  9403 ataggattcaaactgggtagttgaaagggaga 9434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University