View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF17641_low_14 (Length: 222)

Name: NF17641_low_14
Description: NF17641
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF17641_low_14
NF17641_low_14
[»] chr6 (73 HSPs)
chr6 (1-218)||(34963364-34963581)
chr6 (1-218)||(30676664-30676881)
chr6 (1-205)||(12742321-12742525)
chr6 (1-205)||(19005050-19005254)
chr6 (1-205)||(22782231-22782435)
chr6 (1-205)||(24422551-24422755)
chr6 (1-205)||(33861798-33862002)
chr6 (1-205)||(33864282-33864486)
chr6 (1-205)||(8055033-8055237)
chr6 (1-205)||(18334546-18334750)
chr6 (1-205)||(19858873-19859077)
chr6 (1-205)||(2291134-2291338)
chr6 (3-205)||(26924596-26924798)
chr6 (1-205)||(1540865-1541069)
chr6 (1-205)||(25656633-25656837)
chr6 (17-205)||(25754813-25755001)
chr6 (5-204)||(25688507-25688706)
chr6 (1-205)||(1595553-1595757)
chr6 (17-205)||(20556864-20557050)
chr6 (30-193)||(18456735-18456898)
chr6 (35-205)||(16448514-16448685)
chr6 (31-205)||(3852001-3852175)
chr6 (60-193)||(18461895-18462028)
chr6 (47-211)||(25629310-25629475)
chr6 (47-214)||(18409782-18409950)
chr6 (30-218)||(19847932-19848122)
chr6 (50-211)||(29060541-29060703)
chr6 (47-211)||(20593774-20593939)
chr6 (64-211)||(17287768-17287916)
chr6 (47-211)||(20360915-20361080)
chr6 (47-211)||(16496245-16496410)
chr6 (47-211)||(19303496-19303660)
chr6 (47-197)||(25644335-25644487)
chr6 (47-211)||(20076701-20076862)
chr6 (32-211)||(22780166-22780347)
chr6 (47-193)||(18821801-18821946)
chr6 (62-211)||(20638253-20638403)
chr6 (32-197)||(20109153-20109322)
chr6 (30-211)||(8227448-8227631)
chr6 (100-218)||(23992421-23992540)
chr6 (151-211)||(25714418-25714478)
chr6 (1-47)||(12942363-12942409)
chr6 (151-211)||(27333277-27333338)
chr6 (151-211)||(27394017-27394078)
chr6 (51-193)||(23019425-23019567)
chr6 (51-197)||(9098473-9098620)
chr6 (47-211)||(35245587-35245749)
chr6 (64-185)||(15041522-15041644)
chr6 (114-218)||(25603406-25603512)
chr6 (114-218)||(25611744-25611850)
chr6 (1-46)||(15875469-15875514)
chr6 (1-46)||(28289289-28289334)
chr6 (98-197)||(19668386-19668488)
chr6 (98-195)||(28496477-28496575)
chr6 (98-195)||(29808888-29808986)
chr6 (165-211)||(22080799-22080845)
chr6 (1-42)||(18913994-18914035)
chr6 (1-42)||(18937252-18937293)
chr6 (91-198)||(19652209-19652316)
chr6 (159-211)||(1561304-1561356)
chr6 (154-185)||(19790842-19790873)
chr6 (154-205)||(19862981-19863032)
chr6 (154-205)||(19873123-19873174)
chr6 (159-193)||(11185524-11185558)
chr6 (160-218)||(16929658-16929716)
chr6 (160-218)||(16965378-16965436)
chr6 (151-185)||(21766718-21766752)
chr6 (124-205)||(22432252-22432334)
chr6 (124-205)||(22438802-22438884)
chr6 (62-211)||(16920602-16920750)
chr6 (151-191)||(22831524-22831565)
chr6 (30-82)||(23076862-23076915)
chr6 (151-191)||(33443068-33443108)
[»] chr2 (68 HSPs)
chr2 (1-218)||(32214875-32215092)
chr2 (1-205)||(18808947-18809151)
chr2 (1-205)||(23709486-23709690)
chr2 (1-205)||(23711967-23712171)
chr2 (1-205)||(39682317-39682521)
chr2 (1-205)||(571401-571605)
chr2 (1-205)||(6725999-6726203)
chr2 (1-205)||(21155014-21155218)
chr2 (1-205)||(23130866-23131070)
chr2 (1-205)||(23133333-23133537)
chr2 (1-205)||(26505383-26505587)
chr2 (1-205)||(26507861-26508065)
chr2 (1-205)||(34402476-34402680)
chr2 (1-205)||(23135594-23135798)
chr2 (1-201)||(24367782-24367982)
chr2 (1-205)||(32039452-32039656)
chr2 (1-205)||(24898149-24898354)
chr2 (1-205)||(24900632-24900837)
chr2 (1-205)||(24903109-24903314)
chr2 (1-205)||(24905586-24905791)
chr2 (1-205)||(24908061-24908266)
chr2 (1-205)||(28577103-28577307)
chr2 (1-205)||(22105416-22105621)
chr2 (1-205)||(45029808-45030012)
chr2 (31-205)||(43137303-43137477)
chr2 (1-205)||(38967378-38967582)
chr2 (30-205)||(24529511-24529687)
chr2 (47-211)||(22337116-22337281)
chr2 (17-124)||(24642826-24642933)
chr2 (47-211)||(23060514-23060679)
chr2 (47-211)||(23076443-23076608)
chr2 (32-211)||(19671831-19672010)
chr2 (47-211)||(22731189-22731354)
chr2 (47-211)||(22738135-22738299)
chr2 (47-211)||(23660024-23660188)
chr2 (47-205)||(298769-298929)
chr2 (47-211)||(23285866-23286027)
chr2 (131-205)||(24643034-24643108)
chr2 (47-211)||(23654341-23654506)
chr2 (32-197)||(23708558-23708725)
chr2 (113-211)||(38136-38234)
chr2 (17-86)||(22173799-22173868)
chr2 (64-211)||(23103369-23103515)
chr2 (91-198)||(28405990-28406099)
chr2 (47-193)||(7688-7835)
chr2 (84-218)||(25616179-25616314)
chr2 (151-211)||(23040249-23040309)
chr2 (1-47)||(20261381-20261427)
chr2 (62-211)||(20309109-20309257)
chr2 (136-211)||(8946658-8946734)
chr2 (41-117)||(22459511-22459587)
chr2 (30-131)||(23791357-23791458)
chr2 (1-46)||(10684719-10684764)
chr2 (30-193)||(20520130-20520295)
chr2 (30-193)||(23207296-23207461)
chr2 (51-205)||(7679592-7679745)
chr2 (30-70)||(29601478-29601518)
chr2 (60-193)||(32451896-32452031)
chr2 (51-198)||(25175864-25176010)
chr2 (151-214)||(22134266-22134329)
chr2 (159-197)||(18786971-18787009)
chr2 (30-131)||(24697543-24697644)
chr2 (154-185)||(24869903-24869934)
chr2 (154-185)||(25961597-25961628)
chr2 (161-211)||(23072019-23072069)
chr2 (151-185)||(24655398-24655432)
chr2 (151-191)||(23287384-23287424)
chr2 (151-191)||(26392403-26392443)
[»] chr8 (69 HSPs)
chr8 (1-207)||(16413270-16413476)
chr8 (1-205)||(14409398-14409602)
chr8 (1-205)||(1484406-1484610)
chr8 (1-205)||(5853246-5853450)
chr8 (1-205)||(20403231-20403435)
chr8 (1-205)||(22001757-22001961)
chr8 (1-205)||(15203185-15203389)
chr8 (1-205)||(20046149-20046353)
chr8 (1-205)||(4483285-4483488)
chr8 (1-205)||(4542327-4542531)
chr8 (11-205)||(19896269-19896466)
chr8 (30-205)||(41598192-41598367)
chr8 (1-205)||(14823778-14823981)
chr8 (1-209)||(45290648-45290857)
chr8 (30-214)||(26223914-26224098)
chr8 (4-196)||(15070571-15070765)
chr8 (17-205)||(19936975-19937164)
chr8 (17-205)||(25484245-25484426)
chr8 (32-193)||(19801367-19801527)
chr8 (47-211)||(16092297-16092462)
chr8 (47-211)||(6759259-6759421)
chr8 (32-211)||(18818348-18818529)
chr8 (47-214)||(28648999-28649167)
chr8 (59-211)||(7372779-7372932)
chr8 (47-211)||(20536209-20536374)
chr8 (67-205)||(26219721-26219858)
chr8 (47-211)||(22875066-22875230)
chr8 (46-211)||(23406380-23406548)
chr8 (64-211)||(21923900-21924048)
chr8 (62-211)||(21918969-21919120)
chr8 (67-205)||(26225268-26225405)
chr8 (47-211)||(22626737-22626901)
chr8 (1-96)||(24485998-24486093)
chr8 (30-209)||(13508022-13508203)
chr8 (30-209)||(13597554-13597735)
chr8 (1-86)||(32810054-32810139)
chr8 (30-193)||(20498581-20498746)
chr8 (47-211)||(18879191-18879351)
chr8 (47-218)||(23648547-23648719)
chr8 (41-211)||(17612059-17612230)
chr8 (84-218)||(18678094-18678229)
chr8 (62-211)||(31971258-31971407)
chr8 (84-218)||(32121726-32121861)
chr8 (51-211)||(38855212-38855371)
chr8 (113-211)||(45131019-45131116)
chr8 (98-211)||(6520369-6520483)
chr8 (91-203)||(21285606-21285719)
chr8 (30-193)||(37116366-37116532)
chr8 (113-211)||(16199666-16199764)
chr8 (98-211)||(5866280-5866394)
chr8 (110-211)||(17140917-17141019)
chr8 (98-211)||(21490996-21491110)
chr8 (98-197)||(983410-983512)
chr8 (30-131)||(17266930-17267031)
chr8 (98-211)||(21389458-21389570)
chr8 (98-211)||(21395988-21396100)
chr8 (98-211)||(21778784-21778896)
chr8 (98-211)||(21790481-21790593)
chr8 (47-131)||(17439461-17439544)
chr8 (151-197)||(23760903-23760950)
chr8 (162-211)||(21249385-21249434)
chr8 (162-211)||(21255223-21255272)
chr8 (91-198)||(21673718-21673826)
chr8 (1-46)||(35026850-35026895)
chr8 (159-198)||(26355766-26355805)
chr8 (154-208)||(39094987-39095041)
chr8 (1-46)||(1326997-1327042)
chr8 (1-46)||(2418861-2418906)
chr8 (159-208)||(20856492-20856541)
[»] chr4 (71 HSPs)
chr4 (1-218)||(19618126-19618343)
chr4 (1-218)||(14970661-14970878)
chr4 (1-205)||(3515011-3515215)
chr4 (1-205)||(18215228-18215432)
chr4 (1-205)||(15118306-15118510)
chr4 (1-205)||(52312514-52312718)
chr4 (1-205)||(12261-12465)
chr4 (1-209)||(15355278-15355487)
chr4 (1-205)||(19242703-19242908)
chr4 (1-205)||(44615292-44615496)
chr4 (1-205)||(44773041-44773245)
chr4 (1-205)||(1837463-1837667)
chr4 (1-205)||(18239373-18239577)
chr4 (1-205)||(50222293-50222497)
chr4 (17-205)||(51463838-51464026)
chr4 (17-205)||(23803235-23803423)
chr4 (30-205)||(44102218-44102393)
chr4 (17-205)||(12610954-12611135)
chr4 (1-205)||(7641146-7641340)
chr4 (41-205)||(44928873-44929038)
chr4 (30-211)||(15367691-15367873)
chr4 (30-211)||(15402704-15402886)
chr4 (30-193)||(21815568-21815731)
chr4 (30-211)||(15371203-15371385)
chr4 (30-211)||(15373484-15373666)
chr4 (35-205)||(20149833-20150004)
chr4 (30-211)||(15370019-15370200)
chr4 (33-211)||(16223533-16223712)
chr4 (67-205)||(54798729-54798868)
chr4 (91-205)||(14280320-14280434)
chr4 (32-211)||(7798775-7798956)
chr4 (47-205)||(14038655-14038814)
chr4 (47-204)||(16377478-16377634)
chr4 (47-211)||(7088878-7089043)
chr4 (47-211)||(12902758-12902923)
chr4 (47-210)||(22636437-22636601)
chr4 (36-193)||(22353852-22354010)
chr4 (47-211)||(7893704-7893869)
chr4 (100-211)||(52873375-52873487)
chr4 (47-211)||(16270191-16270355)
chr4 (49-211)||(16239927-16240089)
chr4 (67-205)||(8574844-8574981)
chr4 (47-211)||(6899892-6900056)
chr4 (47-211)||(44052830-44052995)
chr4 (30-193)||(13788-13953)
chr4 (47-207)||(23374314-23374475)
chr4 (30-197)||(52243131-52243302)
chr4 (32-197)||(43198492-43198661)
chr4 (127-211)||(3096294-3096379)
chr4 (49-138)||(15464888-15464977)
chr4 (1-47)||(15534343-15534389)
chr4 (103-211)||(39706299-39706408)
chr4 (1-46)||(14048740-14048785)
chr4 (1-46)||(36038033-36038078)
chr4 (87-198)||(12774021-12774132)
chr4 (113-211)||(14053323-14053421)
chr4 (98-197)||(12288214-12288316)
chr4 (30-193)||(46640393-46640558)
chr4 (4-46)||(49547731-49547773)
chr4 (1-46)||(15497025-15497070)
chr4 (151-211)||(15551818-15551879)
chr4 (1-46)||(19857607-19857652)
chr4 (30-193)||(53082089-53082254)
chr4 (60-193)||(6190481-6190616)
chr4 (1-45)||(52873132-52873176)
chr4 (151-211)||(17046488-17046549)
chr4 (151-185)||(11250621-11250655)
chr4 (151-185)||(15353367-15353401)
chr4 (154-212)||(20157522-20157580)
chr4 (32-120)||(8846465-8846553)
chr4 (151-198)||(8846370-8846418)
[»] scaffold0494 (1 HSPs)
scaffold0494 (1-218)||(12203-12420)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (1-210)||(10772-10981)
[»] chr3 (91 HSPs)
chr3 (1-218)||(13544016-13544233)
chr3 (1-218)||(12567551-12567768)
chr3 (1-205)||(9707561-9707765)
chr3 (1-205)||(16454235-16454439)
chr3 (1-205)||(17463182-17463386)
chr3 (1-205)||(45606861-45607065)
chr3 (1-205)||(7781301-7781505)
chr3 (1-205)||(8899098-8899302)
chr3 (1-205)||(34159330-34159534)
chr3 (1-205)||(55476495-55476699)
chr3 (1-205)||(6469088-6469292)
chr3 (1-205)||(10247677-10247881)
chr3 (1-205)||(16282765-16282969)
chr3 (1-205)||(28848565-28848769)
chr3 (1-201)||(38961845-38962045)
chr3 (1-205)||(13151744-13151949)
chr3 (1-205)||(13154209-13154414)
chr3 (1-205)||(41123894-41124095)
chr3 (6-205)||(17446614-17446812)
chr3 (17-201)||(50242830-50243014)
chr3 (30-205)||(29172565-29172741)
chr3 (30-205)||(17672630-17672805)
chr3 (1-205)||(8499522-8499728)
chr3 (1-205)||(15412433-15412639)
chr3 (30-205)||(12119707-12119883)
chr3 (30-193)||(53070636-53070799)
chr3 (17-193)||(43550448-43550625)
chr3 (78-205)||(15977519-15977646)
chr3 (1-205)||(27165254-27165460)
chr3 (47-211)||(14972855-14973020)
chr3 (1-205)||(53301458-53301665)
chr3 (47-205)||(40213676-40213834)
chr3 (98-205)||(55500946-55501053)
chr3 (67-205)||(36166602-36166739)
chr3 (47-211)||(17487857-17488022)
chr3 (47-211)||(17499339-17499504)
chr3 (47-211)||(25476340-25476505)
chr3 (31-194)||(42386428-42386593)
chr3 (32-204)||(43840940-43841114)
chr3 (32-211)||(26686888-26687069)
chr3 (47-198)||(14576788-14576939)
chr3 (67-199)||(21618459-21618590)
chr3 (47-211)||(13442275-13442440)
chr3 (47-211)||(18438535-18438700)
chr3 (47-211)||(23083316-23083481)
chr3 (62-211)||(12399210-12399360)
chr3 (62-211)||(20698405-20698555)
chr3 (30-211)||(24340660-24340843)
chr3 (106-205)||(10556989-10557088)
chr3 (47-205)||(24153164-24153322)
chr3 (110-205)||(44494813-44494908)
chr3 (47-211)||(11424718-11424879)
chr3 (111-205)||(17737240-17737337)
chr3 (30-194)||(23274705-23274871)
chr3 (66-198)||(14572603-14572735)
chr3 (32-193)||(52523666-52523831)
chr3 (30-211)||(37642202-37642385)
chr3 (84-218)||(46822259-46822394)
chr3 (32-131)||(2051138-2051238)
chr3 (30-93)||(17248224-17248287)
chr3 (84-218)||(30029834-30029968)
chr3 (98-218)||(12511051-12511172)
chr3 (41-138)||(22147474-22147571)
chr3 (51-197)||(15470939-15471085)
chr3 (87-208)||(32307681-32307802)
chr3 (32-198)||(16097342-16097509)
chr3 (32-198)||(16103794-16103960)
chr3 (156-205)||(45577947-45577996)
chr3 (1-46)||(54520985-54521030)
chr3 (98-211)||(13210333-13210447)
chr3 (98-211)||(14234488-14234602)
chr3 (151-205)||(28194697-28194752)
chr3 (1-44)||(29544796-29544839)
chr3 (30-193)||(37251105-37251270)
chr3 (98-198)||(12174265-12174366)
chr3 (1-39)||(12305315-12305353)
chr3 (151-212)||(14665397-14665458)
chr3 (49-193)||(43925977-43926123)
chr3 (151-205)||(856143-856197)
chr3 (154-208)||(3389999-3390053)
chr3 (154-212)||(14668553-14668611)
chr3 (151-205)||(23077537-23077591)
chr3 (1-46)||(15977696-15977741)
chr3 (107-198)||(49668091-49668183)
chr3 (154-205)||(15878114-15878165)
chr3 (154-208)||(3403019-3403073)
chr3 (107-198)||(9512934-9513026)
chr3 (107-198)||(9520909-9521001)
chr3 (160-205)||(26196500-26196545)
chr3 (151-191)||(13919350-13919390)
chr3 (1-37)||(15977663-15977699)
[»] chr1 (51 HSPs)
chr1 (1-210)||(21840766-21840975)
chr1 (1-205)||(23593688-23593893)
chr1 (1-218)||(16361908-16362126)
chr1 (1-205)||(13988870-13989074)
chr1 (1-205)||(21923245-21923449)
chr1 (1-205)||(21475041-21475245)
chr1 (1-205)||(29776692-29776896)
chr1 (1-205)||(29298141-29298344)
chr1 (1-205)||(31612317-31612521)
chr1 (1-205)||(22123021-22123226)
chr1 (1-205)||(16275317-16275522)
chr1 (1-205)||(15859962-15860167)
chr1 (30-211)||(13212844-13213026)
chr1 (30-205)||(21346965-21347141)
chr1 (17-193)||(45574812-45574989)
chr1 (30-205)||(21342100-21342276)
chr1 (30-205)||(21707171-21707346)
chr1 (30-205)||(21711713-21711888)
chr1 (35-205)||(40389158-40389329)
chr1 (30-205)||(433016-433190)
chr1 (47-214)||(50210168-50210336)
chr1 (47-205)||(34509787-34509946)
chr1 (47-211)||(22532270-22532435)
chr1 (47-211)||(27250684-27250849)
chr1 (47-218)||(22468651-22468823)
chr1 (30-193)||(21896193-21896358)
chr1 (49-218)||(20135181-20135351)
chr1 (33-193)||(21861510-21861672)
chr1 (47-196)||(21026696-21026846)
chr1 (41-197)||(16758664-16758822)
chr1 (30-193)||(35261018-35261180)
chr1 (151-218)||(20454613-20454680)
chr1 (111-211)||(20847173-20847274)
chr1 (32-197)||(33681022-33681188)
chr1 (87-208)||(21754049-21754170)
chr1 (30-193)||(41049973-41050138)
chr1 (30-192)||(14295493-14295652)
chr1 (51-197)||(22237642-22237788)
chr1 (98-198)||(20248293-20248394)
chr1 (32-196)||(20918620-20918782)
chr1 (47-136)||(22354527-22354616)
chr1 (91-198)||(22921868-22921976)
chr1 (1-46)||(43543214-43543259)
chr1 (154-205)||(21714549-21714600)
chr1 (154-212)||(24783155-24783213)
chr1 (34-131)||(50686695-50686792)
chr1 (159-197)||(52928038-52928076)
chr1 (41-125)||(12271642-12271725)
chr1 (137-198)||(21161730-21161792)
chr1 (151-205)||(42865273-42865327)
chr1 (30-81)||(16368224-16368276)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (6-218)||(11279-11491)
[»] scaffold0023 (7 HSPs)
scaffold0023 (1-207)||(17394-17600)
scaffold0023 (1-205)||(94415-94619)
scaffold0023 (50-205)||(44458-44614)
scaffold0023 (51-198)||(100388-100534)
scaffold0023 (151-211)||(119876-119937)
scaffold0023 (51-198)||(40135-40281)
scaffold0023 (154-205)||(38542-38593)
[»] scaffold0001 (3 HSPs)
scaffold0001 (1-218)||(501075-501292)
scaffold0001 (30-205)||(85562-85738)
scaffold0001 (32-198)||(160698-160864)
[»] scaffold0716 (1 HSPs)
scaffold0716 (1-205)||(4698-4902)
[»] scaffold0363 (1 HSPs)
scaffold0363 (1-210)||(9241-9450)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (1-205)||(20751-20955)
[»] scaffold0134 (1 HSPs)
scaffold0134 (1-205)||(37825-38029)
[»] chr7 (86 HSPs)
chr7 (1-205)||(456325-456529)
chr7 (1-205)||(11393241-11393445)
chr7 (1-205)||(15376667-15376871)
chr7 (1-205)||(16232524-16232728)
chr7 (1-205)||(20385077-20385281)
chr7 (1-205)||(21189549-21189753)
chr7 (1-205)||(32125495-32125699)
chr7 (1-205)||(41522921-41523125)
chr7 (1-205)||(41525383-41525587)
chr7 (1-205)||(11972500-11972704)
chr7 (1-205)||(14949076-14949280)
chr7 (1-205)||(18640276-18640480)
chr7 (1-205)||(24702242-24702446)
chr7 (1-205)||(27216864-27217068)
chr7 (1-205)||(16213688-16213892)
chr7 (1-205)||(16410063-16410267)
chr7 (1-211)||(18430710-18430920)
chr7 (1-205)||(24704692-24704893)
chr7 (30-205)||(44116513-44116688)
chr7 (31-205)||(3386337-3386511)
chr7 (60-218)||(24275162-24275320)
chr7 (17-193)||(13647344-13647521)
chr7 (1-205)||(13869350-13869556)
chr7 (30-205)||(17061898-17062073)
chr7 (1-205)||(26355937-26356152)
chr7 (1-205)||(26358389-26358604)
chr7 (32-205)||(20110560-20110723)
chr7 (30-205)||(38898359-38898535)
chr7 (30-193)||(12756654-12756817)
chr7 (90-205)||(48273396-48273512)
chr7 (47-205)||(3564319-3564478)
chr7 (83-205)||(13831377-13831499)
chr7 (47-205)||(18456368-18456526)
chr7 (47-211)||(12698832-12698998)
chr7 (47-211)||(38227482-38227646)
chr7 (47-211)||(9509190-9509355)
chr7 (41-196)||(26212012-26212168)
chr7 (30-197)||(2280056-2280225)
chr7 (17-116)||(15081919-15082019)
chr7 (47-197)||(15143993-15144143)
chr7 (98-196)||(10589055-10589154)
chr7 (30-211)||(19486681-19486864)
chr7 (90-211)||(67746-67868)
chr7 (91-211)||(22072914-22073036)
chr7 (1-64)||(13841157-13841220)
chr7 (30-211)||(10063760-10063938)
chr7 (1-47)||(11303409-11303455)
chr7 (32-190)||(12255730-12255892)
chr7 (51-197)||(16056343-16056488)
chr7 (30-211)||(16495403-16495581)
chr7 (1-58)||(18627717-18627774)
chr7 (41-125)||(15113031-15113114)
chr7 (113-211)||(16386268-16386368)
chr7 (159-211)||(47831808-47831860)
chr7 (107-205)||(14932749-14932848)
chr7 (107-205)||(15356184-15356283)
chr7 (107-205)||(15360298-15360397)
chr7 (98-211)||(34200787-34200901)
chr7 (62-210)||(40443393-40443541)
chr7 (51-198)||(18005660-18005806)
chr7 (30-197)||(1867932-1868101)
chr7 (1-46)||(16108643-16108688)
chr7 (1-46)||(23664907-23664952)
chr7 (1-46)||(29796771-29796816)
chr7 (1-46)||(29800590-29800635)
chr7 (41-125)||(15116568-15116651)
chr7 (114-218)||(15211450-15211557)
chr7 (115-211)||(28505321-28505418)
chr7 (103-198)||(811142-811238)
chr7 (1-46)||(14270016-14270061)
chr7 (51-197)||(16219677-16219823)
chr7 (30-131)||(20220127-20220225)
chr7 (100-198)||(44014192-44014291)
chr7 (154-212)||(2832504-2832562)
chr7 (30-131)||(15008436-15008536)
chr7 (151-205)||(18154901-18154955)
chr7 (1-46)||(8468803-8468848)
chr7 (159-211)||(11996095-11996147)
chr7 (159-211)||(15754955-15755007)
chr7 (187-218)||(16213622-16213653)
chr7 (154-205)||(19649552-19649603)
chr7 (151-185)||(9446218-9446252)
chr7 (151-205)||(12187022-12187076)
chr7 (151-205)||(17138120-17138174)
chr7 (151-185)||(20569656-20569690)
chr7 (98-211)||(27847838-27847950)
[»] chr5 (68 HSPs)
chr5 (1-205)||(264722-264926)
chr5 (1-205)||(42245319-42245523)
chr5 (1-205)||(39363388-39363592)
chr5 (1-205)||(10732894-10733098)
chr5 (1-205)||(20909016-20909220)
chr5 (1-205)||(29345984-29346188)
chr5 (1-205)||(32027397-32027601)
chr5 (1-205)||(29348457-29348661)
chr5 (1-205)||(29350930-29351134)
chr5 (1-205)||(39245140-39245344)
chr5 (1-205)||(29329938-29330139)
chr5 (1-205)||(20917906-20918106)
chr5 (30-205)||(36154766-36154938)
chr5 (32-205)||(11581184-11581357)
chr5 (30-205)||(20901991-20902168)
chr5 (30-205)||(2154596-2154772)
chr5 (35-205)||(18319021-18319192)
chr5 (30-205)||(31061072-31061248)
chr5 (1-205)||(38619438-38619644)
chr5 (1-205)||(23064515-23064721)
chr5 (30-205)||(10775659-10775834)
chr5 (35-205)||(24067111-24067282)
chr5 (47-211)||(1096468-1096633)
chr5 (47-211)||(9077953-9078118)
chr5 (47-211)||(23390451-23390616)
chr5 (47-211)||(25421533-25421698)
chr5 (47-205)||(24529227-24529386)
chr5 (47-192)||(25431414-25431560)
chr5 (47-211)||(21729019-21729184)
chr5 (47-211)||(21808344-21808509)
chr5 (47-211)||(24493570-24493734)
chr5 (105-211)||(21997547-21997654)
chr5 (47-211)||(8286797-8286963)
chr5 (67-205)||(22412191-22412329)
chr5 (47-211)||(13025312-13025476)
chr5 (47-211)||(13095496-13095660)
chr5 (47-196)||(22075035-22075185)
chr5 (47-193)||(22144068-22144215)
chr5 (84-218)||(17517193-17517328)
chr5 (30-211)||(40725854-40726037)
chr5 (67-154)||(20766095-20766181)
chr5 (32-198)||(21565556-21565723)
chr5 (64-209)||(37723906-37724050)
chr5 (114-202)||(18418590-18418678)
chr5 (151-211)||(21329556-21329617)
chr5 (34-193)||(22178161-22178323)
chr5 (98-193)||(20026945-20027043)
chr5 (113-211)||(21292992-21293089)
chr5 (103-211)||(21502167-21502276)
chr5 (1-46)||(9776521-9776566)
chr5 (150-205)||(20806845-20806900)
chr5 (98-198)||(22959538-22959639)
chr5 (151-211)||(19660894-19660955)
chr5 (51-197)||(26011995-26012141)
chr5 (113-185)||(21873277-21873350)
chr5 (151-211)||(36314578-36314639)
chr5 (1-46)||(37804857-37804902)
chr5 (154-185)||(26680605-26680636)
chr5 (154-205)||(26704078-26704129)
chr5 (154-185)||(26952212-26952243)
chr5 (154-205)||(26973811-26973862)
chr5 (151-205)||(22032326-22032380)
chr5 (151-193)||(26740705-26740747)
chr5 (148-205)||(23501412-23501469)
chr5 (151-196)||(26732892-26732937)
chr5 (41-137)||(18356389-18356485)
chr5 (159-211)||(19668899-19668951)
chr5 (154-198)||(23535642-23535686)
[»] scaffold0230 (1 HSPs)
scaffold0230 (1-205)||(13951-14155)
[»] scaffold0444 (1 HSPs)
scaffold0444 (1-205)||(13396-13600)
[»] scaffold0028 (7 HSPs)
scaffold0028 (1-205)||(136684-136888)
scaffold0028 (1-205)||(139153-139357)
scaffold0028 (1-205)||(144091-144295)
scaffold0028 (1-205)||(134215-134419)
scaffold0028 (1-205)||(141622-141826)
scaffold0028 (87-198)||(132672-132784)
scaffold0028 (108-194)||(62216-62303)
[»] scaffold0044 (1 HSPs)
scaffold0044 (1-205)||(40404-40608)
[»] scaffold0037 (2 HSPs)
scaffold0037 (17-205)||(82076-82264)
scaffold0037 (32-197)||(22610-22776)
[»] scaffold0003 (2 HSPs)
scaffold0003 (30-205)||(158433-158608)
scaffold0003 (47-197)||(339905-340053)
[»] scaffold1439 (1 HSPs)
scaffold1439 (17-205)||(110-298)
[»] scaffold0142 (1 HSPs)
scaffold0142 (30-205)||(16788-16963)
[»] scaffold0761 (1 HSPs)
scaffold0761 (30-205)||(4301-4476)
[»] scaffold0394 (1 HSPs)
scaffold0394 (17-205)||(12068-12250)
[»] scaffold0145 (3 HSPs)
scaffold0145 (30-205)||(9753-9929)
scaffold0145 (47-211)||(32943-33107)
scaffold0145 (47-211)||(38762-38926)
[»] scaffold0819 (1 HSPs)
scaffold0819 (30-205)||(4218-4393)
[»] scaffold0149 (1 HSPs)
scaffold0149 (30-195)||(29946-30111)
[»] scaffold0101 (1 HSPs)
scaffold0101 (17-205)||(1250-1439)
[»] scaffold0056 (2 HSPs)
scaffold0056 (30-193)||(79267-79430)
scaffold0056 (47-214)||(17170-17340)
[»] scaffold0031 (2 HSPs)
scaffold0031 (30-193)||(20363-20524)
scaffold0031 (47-211)||(128752-128916)
[»] scaffold0247 (2 HSPs)
scaffold0247 (30-201)||(2111-2283)
scaffold0247 (30-211)||(17964-18147)
[»] scaffold0007 (2 HSPs)
scaffold0007 (30-205)||(161072-161248)
scaffold0007 (30-130)||(164573-164674)
[»] scaffold0231 (1 HSPs)
scaffold0231 (47-205)||(22890-23048)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (1-205)||(38610-38816)
[»] scaffold0122 (2 HSPs)
scaffold0122 (67-205)||(44682-44821)
scaffold0122 (47-205)||(26020-26179)
[»] scaffold0540 (1 HSPs)
scaffold0540 (47-211)||(3106-3270)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (41-211)||(51914-52085)
scaffold0011 (62-211)||(167948-168098)
[»] scaffold0217 (1 HSPs)
scaffold0217 (47-211)||(16555-16720)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (47-211)||(13212-13377)
[»] scaffold0908 (1 HSPs)
scaffold0908 (47-214)||(3141-3309)
[»] scaffold0228 (3 HSPs)
scaffold0228 (47-198)||(4522-4673)
scaffold0228 (47-198)||(12104-12255)
scaffold0228 (47-198)||(22056-22207)
[»] scaffold0022 (4 HSPs)
scaffold0022 (67-205)||(116434-116571)
scaffold0022 (30-193)||(128907-129072)
scaffold0022 (1-46)||(53826-53873)
scaffold0022 (30-81)||(78453-78505)
[»] scaffold0141 (1 HSPs)
scaffold0141 (47-203)||(39486-39642)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (47-203)||(75170-75326)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (47-211)||(1852-2017)
[»] scaffold1842 (1 HSPs)
scaffold1842 (62-211)||(1018-1168)
[»] scaffold0403 (1 HSPs)
scaffold0403 (47-211)||(4850-5015)
[»] scaffold0292 (2 HSPs)
scaffold0292 (47-211)||(3471-3636)
scaffold0292 (47-211)||(344-508)
[»] scaffold0120 (4 HSPs)
scaffold0120 (47-211)||(32913-33076)
scaffold0120 (47-211)||(45929-46092)
scaffold0120 (48-211)||(16114-16278)
scaffold0120 (150-211)||(17388-17449)
[»] scaffold0121 (1 HSPs)
scaffold0121 (32-211)||(8472-8649)
[»] scaffold0026 (2 HSPs)
scaffold0026 (47-204)||(25904-26061)
scaffold0026 (47-211)||(39859-40023)
[»] scaffold0621 (2 HSPs)
scaffold0621 (32-197)||(8481-8650)
scaffold0621 (51-211)||(6536-6695)
[»] scaffold0647 (1 HSPs)
scaffold0647 (47-211)||(6076-6244)
[»] scaffold0046 (4 HSPs)
scaffold0046 (98-211)||(28415-28529)
scaffold0046 (98-211)||(11293-11407)
scaffold0046 (159-211)||(1998-2050)
scaffold0046 (159-211)||(4553-4605)
[»] scaffold0327 (2 HSPs)
scaffold0327 (47-148)||(3485-3586)
scaffold0327 (154-205)||(292-343)
[»] scaffold0042 (1 HSPs)
scaffold0042 (47-194)||(24257-24406)
[»] scaffold0639 (1 HSPs)
scaffold0639 (64-211)||(8480-8628)
[»] scaffold0165 (1 HSPs)
scaffold0165 (30-197)||(27686-27855)
[»] scaffold0183 (1 HSPs)
scaffold0183 (52-125)||(13092-13165)
[»] scaffold0461 (1 HSPs)
scaffold0461 (30-211)||(11465-11648)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (30-211)||(38193-38376)
[»] scaffold0490 (1 HSPs)
scaffold0490 (62-211)||(1953-2103)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (30-193)||(53486-53651)
[»] scaffold0695 (1 HSPs)
scaffold0695 (1-86)||(6070-6155)
[»] scaffold0080 (2 HSPs)
scaffold0080 (47-211)||(39914-40078)
scaffold0080 (92-193)||(19883-19987)
[»] scaffold0357 (2 HSPs)
scaffold0357 (30-193)||(13147-13313)
scaffold0357 (30-197)||(16037-16206)
[»] scaffold0175 (3 HSPs)
scaffold0175 (32-160)||(13144-13274)
scaffold0175 (156-204)||(281-329)
scaffold0175 (98-211)||(34124-34238)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (30-138)||(225482-225590)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (30-193)||(12587-12751)
[»] scaffold0358 (1 HSPs)
scaffold0358 (122-211)||(4713-4803)
[»] scaffold0021 (3 HSPs)
scaffold0021 (64-193)||(174785-174913)
scaffold0021 (151-211)||(121767-121827)
scaffold0021 (47-123)||(124675-124751)
[»] scaffold0456 (1 HSPs)
scaffold0456 (47-211)||(10381-10543)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (62-211)||(32068-32216)
[»] scaffold0420 (1 HSPs)
scaffold0420 (30-209)||(6220-6400)
[»] scaffold0503 (2 HSPs)
scaffold0503 (30-103)||(12039-12112)
scaffold0503 (133-193)||(11982-12042)
[»] scaffold0235 (1 HSPs)
scaffold0235 (113-205)||(11464-11557)
[»] scaffold0130 (1 HSPs)
scaffold0130 (47-132)||(27911-27996)
[»] scaffold0114 (3 HSPs)
scaffold0114 (47-211)||(15420-15583)
scaffold0114 (1-40)||(27958-27997)
scaffold0114 (151-205)||(7298-7352)
[»] scaffold0010 (2 HSPs)
scaffold0010 (51-198)||(129919-130066)
scaffold0010 (30-193)||(60652-60818)
[»] scaffold0555 (1 HSPs)
scaffold0555 (32-197)||(10481-10647)
[»] scaffold0427 (1 HSPs)
scaffold0427 (113-196)||(13513-13596)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (30-131)||(7996-8098)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (47-211)||(20911-21077)
[»] scaffold0070 (1 HSPs)
scaffold0070 (62-191)||(4545-4675)
[»] scaffold0261 (1 HSPs)
scaffold0261 (98-205)||(15668-15776)
[»] scaffold0395 (2 HSPs)
scaffold0395 (151-211)||(4893-4953)
scaffold0395 (47-136)||(918-1006)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (103-211)||(6134-6243)
[»] scaffold0102 (1 HSPs)
scaffold0102 (51-198)||(19278-19424)
[»] scaffold0184 (2 HSPs)
scaffold0184 (30-211)||(1011-1189)
scaffold0184 (151-185)||(4286-4320)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (32-198)||(45732-45899)
[»] scaffold0530 (1 HSPs)
scaffold0530 (159-211)||(1102-1154)
[»] scaffold0333 (2 HSPs)
scaffold0333 (159-211)||(6612-6664)
scaffold0333 (159-211)||(13992-14044)
[»] scaffold0123 (2 HSPs)
scaffold0123 (30-197)||(25121-25289)
scaffold0123 (30-131)||(620-720)
[»] scaffold0020 (2 HSPs)
scaffold0020 (159-211)||(15845-15897)
scaffold0020 (154-205)||(178901-178952)
[»] scaffold0422 (1 HSPs)
scaffold0422 (3-46)||(3186-3229)
[»] scaffold0278 (1 HSPs)
scaffold0278 (51-198)||(5657-5803)
[»] scaffold0106 (3 HSPs)
scaffold0106 (151-205)||(15298-15352)
scaffold0106 (98-211)||(1290-1402)
scaffold0106 (98-211)||(7267-7379)
[»] scaffold0006 (2 HSPs)
scaffold0006 (30-131)||(97089-97190)
scaffold0006 (30-131)||(106367-106468)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (30-193)||(267679-267844)
[»] scaffold1984 (1 HSPs)
scaffold1984 (51-198)||(143-290)
[»] scaffold1427 (1 HSPs)
scaffold1427 (1-46)||(1591-1636)
[»] scaffold0628 (1 HSPs)
scaffold0628 (91-198)||(2805-2913)
[»] scaffold0351 (1 HSPs)
scaffold0351 (98-211)||(16283-16395)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (91-198)||(14696-14804)
[»] scaffold2014 (1 HSPs)
scaffold2014 (111-193)||(1051-1134)
[»] scaffold1765 (1 HSPs)
scaffold1765 (159-203)||(1091-1135)
[»] scaffold0034 (2 HSPs)
scaffold0034 (91-197)||(32551-32657)
scaffold0034 (47-193)||(51839-51985)
[»] scaffold0556 (2 HSPs)
scaffold0556 (51-138)||(8090-8176)
scaffold0556 (98-198)||(6826-6927)
[»] scaffold0205 (1 HSPs)
scaffold0205 (107-205)||(29561-29660)
[»] scaffold0309 (1 HSPs)
scaffold0309 (62-148)||(6675-6761)
[»] scaffold0138 (2 HSPs)
scaffold0138 (31-120)||(18176-18265)
scaffold0138 (98-197)||(12954-13054)
[»] scaffold0017 (3 HSPs)
scaffold0017 (114-211)||(192997-193097)
scaffold0017 (154-208)||(15273-15327)
scaffold0017 (154-208)||(19795-19849)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (159-198)||(2713-2752)
[»] scaffold0198 (1 HSPs)
scaffold0198 (154-205)||(23846-23897)
[»] scaffold0139 (1 HSPs)
scaffold0139 (47-189)||(38339-38483)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (98-193)||(51601-51695)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (30-197)||(8011-8180)
[»] scaffold0131 (1 HSPs)
scaffold0131 (159-205)||(36457-36503)
[»] scaffold0150 (1 HSPs)
scaffold0150 (87-198)||(32112-32224)
[»] scaffold0100 (2 HSPs)
scaffold0100 (107-197)||(23898-23989)
scaffold0100 (1-46)||(36020-36065)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (91-197)||(10542-10649)
[»] scaffold0737 (1 HSPs)
scaffold0737 (30-131)||(1735-1835)
[»] scaffold0476 (1 HSPs)
scaffold0476 (159-198)||(12780-12819)
[»] scaffold0425 (1 HSPs)
scaffold0425 (154-205)||(162-213)
[»] scaffold0210 (2 HSPs)
scaffold0210 (154-205)||(21866-21917)
scaffold0210 (154-205)||(29758-29809)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (154-205)||(69797-69848)
[»] scaffold1351 (1 HSPs)
scaffold1351 (30-131)||(88-189)
[»] scaffold1124 (1 HSPs)
scaffold1124 (151-205)||(1884-1938)
[»] scaffold0718 (1 HSPs)
scaffold0718 (159-193)||(5196-5230)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (151-185)||(7330-7364)
[»] scaffold0297 (1 HSPs)
scaffold0297 (151-205)||(10582-10636)
[»] scaffold0220 (1 HSPs)
scaffold0220 (151-185)||(5003-5037)
[»] scaffold0211 (1 HSPs)
scaffold0211 (160-198)||(28839-28877)
[»] scaffold0064 (1 HSPs)
scaffold0064 (113-211)||(46996-47093)
[»] scaffold0598 (1 HSPs)
scaffold0598 (62-211)||(1021-1169)
[»] scaffold0513 (1 HSPs)
scaffold0513 (1-46)||(10841-10886)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 214; Significance: 1e-117; HSPs: 73)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 34963581 - 34963364
Alignment:
Q  1 atatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34963581 atatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 34963482  T
Q  101 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatta 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34963481 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatta 34963382  T
Q  201 agatgttgatgatgatgt 218  Q
    ||||||||||||||||||    
T  34963381 agatgttgatgatgatgt 34963364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 30676664 - 30676881
Alignment:
Q  1 atatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30676664 atatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 30676763  T
Q  101 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatta 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  30676764 gttgacttgcatttgatattattatatcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 30676863  T
Q  201 agatgttgatgatgatgt 218  Q
    ||||||||||||||||||    
T  30676864 agatgttgatgatgatgt 30676881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 12742525 - 12742321
Alignment:
Q  1 atatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12742525 atatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 12742426  T
Q  101 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatta 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12742425 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 12742326  T
Q  201 agatg 205  Q
    |||||    
T  12742325 agatg 12742321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 19005254 - 19005050
Alignment:
Q  1 atatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19005254 atatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 19005155  T
Q  101 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatta 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19005154 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 19005055  T
Q  201 agatg 205  Q
    |||||    
T  19005054 agatg 19005050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 22782435 - 22782231
Alignment:
Q  1 atatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22782435 atatatgatgttttaagatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatgtgtgaataattgagacgtt 22782336  T
Q  101 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatta 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22782335 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 22782236  T
Q  201 agatg 205  Q
    |||||    
T  22782235 agatg 22782231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 24422755 - 24422551
Alignment:
Q  1 atatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24422755 atatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 24422656  T
Q  101 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatta 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24422655 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 24422556  T
Q  201 agatg 205  Q
    |||||    
T  24422555 agatg 24422551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 33862002 - 33861798
Alignment:
Q  1 atatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33862002 atatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 33861903  T
Q  101 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatta 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33861902 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 33861803  T
Q  201 agatg 205  Q
    |||||    
T  33861802 agatg 33861798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 33864486 - 33864282
Alignment:
Q  1 atatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33864486 atatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 33864387  T
Q  101 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatta 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33864386 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 33864287  T
Q  201 agatg 205  Q
    |||||    
T  33864286 agatg 33864282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 8055237 - 8055033
Alignment:
Q  1 atatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8055237 atatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 8055138  T
Q  101 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatta 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8055137 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatacttttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 8055038  T
Q  201 agatg 205  Q
    |||||    
T  8055037 agatg 8055033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 18334546 - 18334750
Alignment:
Q  1 atatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18334546 atatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 18334645  T
Q  101 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatta 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18334646 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 18334745  T
Q  201 agatg 205  Q
    |||||    
T  18334746 agatg 18334750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 19858873 - 19859077
Alignment:
Q  1 atatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19858873 atatatgatgttttaagatgttgattgttatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 19858972  T
Q  101 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatta 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19858973 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 19859072  T
Q  201 agatg 205  Q
    |||||    
T  19859073 agatg 19859077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 177; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 2291134 - 2291338
Alignment:
Q  1 atatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2291134 atatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 2291233  T
Q  101 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatta 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  2291234 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 2291333  T
Q  201 agatg 205  Q
    |||||    
T  2291334 agatg 2291338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 3 - 205
Target Start/End: Original strand, 26924596 - 26924798
Alignment:
Q  3 atatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgt 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26924596 atatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgt 26924695  T
Q  103 tgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaag 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26924696 tgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactattgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 26924795  T
Q  203 atg 205  Q
    |||    
T  26924796 atg 26924798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 173; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 1540865 - 1541069
Alignment:
Q  1 atatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1540865 atatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatgtaattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 1540964  T
Q  101 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatta 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  1540965 gttgacttgcatttgatattattatgtcatactgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcgatctaagttgatta 1541064  T
Q  201 agatg 205  Q
    |||||    
T  1541065 agatg 1541069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 173; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 25656837 - 25656633
Alignment:
Q  1 atatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  25656837 atataagatgttttaagatgttgattaccatttgatgtttttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatgtgaataattgagacgtt 25656738  T
Q  101 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatta 200  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25656737 attaacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 25656638  T
Q  201 agatg 205  Q
    |||||    
T  25656637 agatg 25656633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 169; E-Value: 8e-91
Query Start/End: Original strand, 17 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 25755001 - 25754813
Alignment:
Q  17 gatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttga 116  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25755001 gatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttga 25754902  T
Q  117 tattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25754901 tattattatgtcatgctgtttttgtatactactgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 25754813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 168; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 5 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 25688706 - 25688507
Alignment:
Q  5 atgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttg 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25688706 atgatgttttaagatgttgattaccatttggtgttgttatattgtgatatgattatatatgtattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttg 25688607  T
Q  105 acttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 204  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25688606 acttgcagttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcgatctaagttgattaagat 25688507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 1595757 - 1595553
Alignment:
Q  1 atatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1595757 atatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatccattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 1595658  T
Q  101 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatta 200  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  1595657 gttgaattgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatta 1595558  T
Q  201 agatg 205  Q
    |||||    
T  1595557 agatg 1595553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 17 - 205
Target Start/End: Original strand, 20556864 - 20557050
Alignment:
Q  17 gatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttga 116  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  20556864 gatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaa--attgagacgttgttgacttgcatttga 20556961  T
Q  117 tattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 205  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20556962 tattattatgccatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgattaagatg 20557050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 30 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 18456898 - 18456735
Alignment:
Q  30 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18456898 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 18456799  T
Q  130 tgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 193  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18456798 tgctgtttttgtatactattgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 18456735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 144; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 35 - 205
Target Start/End: Original strand, 16448514 - 16448685
Alignment:
Q  35 atgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgct 133  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16448514 atgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgct 16448613  T
Q  134 gtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 205  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16448614 gtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgattaagatg 16448685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 31 - 205
Target Start/End: Original strand, 3852001 - 3852175
Alignment:
Q  31 tttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 130  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  3852001 tttgatgatgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcattttatattatcatgtcat 3852100  T
Q  131 gctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 205  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3852101 gctgtttttgtatactattgtgttgctgttgttattaaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 3852175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 122; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 60 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 18462028 - 18461895
Alignment:
Q  60 tatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgt 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  18462028 tatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactattgtgttgctgt 18461929  T
Q  160 tgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 193  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18461928 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 18461895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 47 - 211
Target Start/End: Original strand, 25629310 - 25629475
Alignment:
Q  47 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 146  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  25629310 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattgttatgtcatgctgttttcgtatact 25629409  T
Q  147 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 211  Q
    || |||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  25629410 gcatgtgttcctgttgtaatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 25629475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 47 - 214
Target Start/End: Original strand, 18409782 - 18409950
Alignment:
Q  47 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 146  Q
    |||||||||||  |||||| |||| |||||||||   || || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  18409782 tgtgatataatgttatatgtattatttgaattatgaatggatgattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttttcgtatact 18409881  T
Q  147 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatg 214  Q
    | |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  18409882 gcctgtgttgctgttgttatttaactgagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgatg 18409950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 30 - 218
Target Start/End: Original strand, 19847932 - 19848122
Alignment:
Q  30 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaa-taattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| || || |||  ||||||| ||||| |||||||| ||||||     
T  19847932 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattatttgaattatatgtgaaatatttaagatattgttgaattgcaattgatatttttatgtg 19848031  T
Q  129 atgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgt 218  Q
     |||||||  ||||  |||| | || |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19848032 ttgctgttgatgtaatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgataatgatgt 19848122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 50 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 29060703 - 29060541
Alignment:
Q  50 gatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-c 148  Q
    ||||||||  ||| |||||||||||||||||   || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  29060703 gatataatgttatgtgcattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcc 29060604  T
Q  149 tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 211  Q
    | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||| |||||    
T  29060603 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagctgatgaagatgatgatg 29060541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 47 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 20593939 - 20593774
Alignment:
Q  47 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 146  Q
    ||||||||| |  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20593939 tgtgatatattgttatacgcattacttgatttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttcgtatact 20593840  T
Q  147 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 211  Q
    || |||||||||||| |||||||||| || ||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||    
T  20593839 gcatgtgttgctgtttttatttaactgagctgcatgattcggtctaagttgatgaagatgatgatg 20593774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 64 - 211
Target Start/End: Original strand, 17287768 - 17287916
Alignment:
Q  64 tgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgt 162  Q
    ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| | | ||||||||||||    
T  17287768 tgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtgtttgtatactacctatgttgctgttgt 17287867  T
Q  163 tatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 211  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17287868 tatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatg 17287916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 47 - 211
Target Start/End: Original strand, 20360915 - 20361080
Alignment:
Q  47 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 146  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  20360915 tgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatgct 20361014  T
Q  147 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 211  Q
    | || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||    
T  20361015 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcgatctaagttgatgaaaatgatgatg 20361080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 47 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 16496410 - 16496245
Alignment:
Q  47 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 146  Q
    |||||||||||  | ||||||||||||||    ||| |||||| || ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16496410 tgtgatataatattttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatact 16496311  T
Q  147 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 211  Q
    || | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||| |||||    
T  16496310 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatg 16496245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 47 - 211
Target Start/End: Original strand, 19303496 - 19303660
Alignment:
Q  47 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac- 145  Q
    |||||||||||  ||| | ||||||||||| |||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||     
T  19303496 tgtgatataatgttatgtacattacttgaaatatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttg-ttttgtatact 19303594  T
Q  146 tgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 211  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||| |||||    
T  19303595 tcctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgaagatgatgatg 19303660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 47 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 25644487 - 25644335
Alignment:
Q  47 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 146  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||  |||||| |||| |||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||    
T  25644487 tgtgatataattgtatacgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttacatttgatattgttatatcacgctgtttttgcatact 25644388  T
Q  147 g-ctgtgttgctgt-tgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttga 197  Q
    | || ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25644387 gcctatgttgctgtctgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 25644335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 47 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 20076862 - 20076701
Alignment:
Q  47 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 146  Q
    |||||||||||  |||| |||||||||||| ||||  |||||  || |||   |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  20076862 tgtgatataatgttatacgcattacttgaagtataattgaatttttaaga---tgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtttact 20076767  T
Q  147 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 211  Q
    || | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  20076766 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 20076701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 32 - 211
Target Start/End: Original strand, 22780166 - 22780347
Alignment:
Q  32 ttgatgttg-ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 130  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||  |   ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| | |||||||||||| |||||||||||||||||     
T  22780166 ttgatgttgattatgttgtgatataatgttgcgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcaa 22780265  T
Q  131 gctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 211  Q
    |||||||||||||| || || ||||  |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||| |||||    
T  22780266 gctgtttttgtatattgcctatgtttttgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatg 22780347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 47 - 193
Target Start/End: Original strand, 18821801 - 18821946
Alignment:
Q  47 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacg-ttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 145  Q
    |||||||||||  |||| |||||||||||| | ||  ||||||||||||| | |||||| ||||| || |||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  18821801 tgtgatataatg-tatacgcattacttgaagtttaaatgaataattgagatgattgttggcttgcgtt-gatattgttatggcatgctgtttttgtatac 18821898  T
Q  146 tgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 193  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18821899 tgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 18821946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 62 - 211
Target Start/End: Original strand, 20638253 - 20638403
Alignment:
Q  62 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt 160  Q
    |||||||||||||||  || | |||||| |  ||| |||| | | ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||| ||||    
T  20638253 tatgcattacttgaagaatgtttgaatattaaagatgttgataaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgtt 20638352  T
Q  161 gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 211  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||    
T  20638353 gttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatg 20638403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 32 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 20109322 - 20109153
Alignment:
Q  32 ttgatgttgtt-atattgtgatataat--tatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 128  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||  | ||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| |||| |     
T  20109322 ttgatgttgtttataatgtgatataatattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatt 20109223  T
Q  129 atgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttga 197  Q
    ||| || ||||| |||||| || |||||||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20109222 atgttg-ttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 20109153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 30 - 211
Target Start/End: Original strand, 8227448 - 8227631
Alignment:
Q  30 atttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 128  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||| |||| | |  ||||||||||| ||    
T  8227448 atttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatc 8227547  T
Q  129 atgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 211  Q
    ||| || ||||| |||||| ||  ||||||| |  |||  |||||||| |||||||||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  8227548 atgatg-ttttgcatactgcctacgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtccaagttgttgaagatgttgatg 8227631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 100 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 23992540 - 23992421
Alignment:
Q  100 tgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 198  Q
    |||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||  ||||  |||| | || |||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23992540 tgttgaattgcaattgatatttttatgtcttgctgttgatgtaatctgcctatgctgctattgttatttagctaagttgcatgagtcagtctaagttgat 23992441  T
Q  199 taagatgttgatgatgatgt 218  Q
    |||||||||||| |||||||    
T  23992440 taagatgttgataatgatgt 23992421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 151 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 25714478 - 25714418
Alignment:
Q  151 tgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 211  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  25714478 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatg 25714418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 47
Target Start/End: Complemental strand, 12942409 - 12942363
Alignment:
Q  1 atatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatatt 47  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12942409 atatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatatt 12942363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 151 - 211
Target Start/End: Original strand, 27333277 - 27333338
Alignment:
Q  151 tgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 211  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27333277 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatg 27333338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 151 - 211
Target Start/End: Original strand, 27394017 - 27394078
Alignment:
Q  151 tgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 211  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27394017 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatg 27394078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 51 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 23019567 - 23019425
Alignment:
Q  51 atataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-t 149  Q
    |||||||| ||||| |||||| |||||||| | ||| |  |||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||| || ||||| ||||||| |    
T  23019567 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tgtttgagatgttgttgacttgcatttgatattgttatatcatgttg-ttttgcatactgctt 23019470  T
Q  150 gtgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 193  Q
     |||||||| |||||  ||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  23019469 atgttgctgtttgtttattaactaagctgcataagtcggtctaag 23019425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 51 - 197
Target Start/End: Original strand, 9098473 - 9098620
Alignment:
Q  51 atataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgt-ttttgtatactgc- 148  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||| | |||    ||| || ||||||||  ||||||||||||| |||| |||||   | ||||| |||||||     
T  9098473 atataattatatatacattacatgaattatgtttgatg--ttgtgaagttgttgaaatgcatttgatattgttatatcatgaattgttttgcatactgcc 9098570  T
Q  149 tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttga 197  Q
    | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9098571 tttgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 9098620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 35245749 - 35245587
Alignment:
Q  47 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 146  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   |||||||    
T  35245749 tgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatact 35245654  T
Q  147 gc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 211  Q
    || | ||||| |||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||| || | |||||| |||||    
T  35245653 gcctatgttggtgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 35245587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 64 - 185
Target Start/End: Original strand, 15041522 - 15041644
Alignment:
Q  64 tgcattacttga-attatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttg 161  Q
    |||||||||||| ||| ||| |||||| || ||| ||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||   ||| || || | || |||    
T  15041522 tgcattacttgagattttat-tgaatacttaagatgttattgaattgcatttgatattataatgtcatgctgttgttgtgatctgcctatgctactattg 15041620  T
Q  162 ttatttaactaagttgcatgagtc 185  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  15041621 ttatttaactaagttgcatgagtc 15041644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 114 - 218
Target Start/End: Original strand, 25603406 - 25603512
Alignment:
Q  114 tgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttg-attaagatgttgatg 211  Q
    ||||||| |||||||||| |||| |||||  |||| | || ||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||| | |||| |||||||||||||||    
T  25603406 tgatattgttatgtcatgatgttgttgtaatctgcctatgctgctgttgttaattaactaagtcgcatgagtcagtccatgttgaattaagatgttgatg 25603505  T
Q  212 atgatgt 218  Q
     ||||||    
T  25603506 ttgatgt 25603512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 114 - 218
Target Start/End: Original strand, 25611744 - 25611850
Alignment:
Q  114 tgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttg-attaagatgttgatg 211  Q
    ||||||| |||||||||| |||| |||||  |||| | || ||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||| | |||| |||||||||||||||    
T  25611744 tgatattgttatgtcatgatgttgttgtaatctgcctatgctgctgttgttaattaactaagtcgcatgagtcagtccatgttgaattaagatgttgatg 25611843  T
Q  212 atgatgt 218  Q
     ||||||    
T  25611844 ttgatgt 25611850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 46
Target Start/End: Complemental strand, 15875514 - 15875469
Alignment:
Q  1 atatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 46  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  15875514 atatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatat 15875469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 46
Target Start/End: Original strand, 28289289 - 28289334
Alignment:
Q  1 atatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 46  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  28289289 atatatgatgttttaagatgttaattaccatttgatgtcgttatat 28289334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 98 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 19668488 - 19668386
Alignment:
Q  98 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 193  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||| |||||  ||||||| | |||||  || |||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19668488 gttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgtttt-gcatactatctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 19668390  T
Q  194 ttga 197  Q
    ||||    
T  19668389 ttga 19668386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 98 - 195
Target Start/End: Original strand, 28496477 - 28496575
Alignment:
Q  98 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagtt 195  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||| ||||| || ||| | ||||||| | |||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28496477 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgctaattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 28496575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 98 - 195
Target Start/End: Original strand, 29808888 - 29808986
Alignment:
Q  98 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagtt 195  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||| ||||| || ||| | ||||||| | |||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  29808888 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgctaattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 29808986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 165 - 211
Target Start/End: Original strand, 22080799 - 22080845
Alignment:
Q  165 tttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 211  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  22080799 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgattaagatgatgatg 22080845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 42
Target Start/End: Complemental strand, 18914035 - 18913994
Alignment:
Q  1 atatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgtt 42  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  18914035 atatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgtt 18913994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 42
Target Start/End: Complemental strand, 18937293 - 18937252
Alignment:
Q  1 atatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgtt 42  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  18937293 atatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgtt 18937252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 91 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 19652316 - 19652209
Alignment:
Q  91 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggt 188  Q
    |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | ||||| |||| ||| |||||||||| |||||||||||||    
T  19652316 ttgagatgttgttga-ttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggt 19652219  T
Q  189 ctaagttgat 198  Q
    ||||||||||    
T  19652218 ctaagttgat 19652209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 1561356 - 1561304
Alignment:
Q  159 ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 211  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| | |||||| |||||    
T  1561356 ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgttgaagatgatgatg 1561304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 154 - 185
Target Start/End: Original strand, 19790842 - 19790873
Alignment:
Q  154 tgctgttgttatttaactaagttgcatgagtc 185  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19790842 tgctgttgttatttaactaagttgcatgagtc 19790873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 154 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 19863032 - 19862981
Alignment:
Q  154 tgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 205  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||| ||||||    
T  19863032 tgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatg 19862981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 154 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 19873174 - 19873123
Alignment:
Q  154 tgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 205  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||| ||||||    
T  19873174 tgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatg 19873123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 159 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 11185558 - 11185524
Alignment:
Q  159 ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 193  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11185558 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 11185524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 160 - 218
Target Start/End: Original strand, 16929658 - 16929716
Alignment:
Q  160 tgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgt 218  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| || |||| ||||||||| |||| |||||||||    
T  16929658 tgttaattaaccaagttgcatgagtcagtttaagatgattaagacgttgttgatgatgt 16929716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 160 - 218
Target Start/End: Original strand, 16965378 - 16965436
Alignment:
Q  160 tgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgt 218  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| || |||| ||||||||| |||| |||||||||    
T  16965378 tgttaattaaccaagttgcatgagtcagtttaagatgattaagacgttgttgatgatgt 16965436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 151 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 21766752 - 21766718
Alignment:
Q  151 tgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtc 185  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21766752 tgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 21766718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 124 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 22432334 - 22432252
Alignment:
Q  124 atgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 205  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||| | || |||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| |||| ||||||    
T  22432334 atgtcatactgttgttgtaaactgcctatgctgctattgttaattaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatg 22432252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 124 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 22438884 - 22438802
Alignment:
Q  124 atgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 205  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||| | || |||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| |||| ||||||    
T  22438884 atgtcatactgttgttgtaaactgcctatgctgctattgttaattaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatg 22438802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 62 - 211
Target Start/End: Original strand, 16920602 - 16920750
Alignment:
Q  62 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt 160  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| | | |||||||||  |||||||||| ||||   ||||||||| | || |||||||    
T  16920602 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaatggaatttgatatacttatgtcatgatgtt---gtatactgcctatgctgctgtt 16920698  T
Q  161 -gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 211  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||| ||| || | |||||| |||||    
T  16920699 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtcaaagatgttgaagatgatgatg 16920750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 151 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 22831565 - 22831524
Alignment:
Q  151 tgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtcta 191  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22831565 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 22831524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 30 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 23076915 - 23076862
Alignment:
Q  30 atttgatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaattatat 82  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| || |||||||||||| ||||||||||    
T  23076915 atttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatat 23076862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 33443108 - 33443068
Alignment:
Q  151 tgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtcta 191  Q
    |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||    
T  33443108 tgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcggtcta 33443068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 210; Significance: 1e-115; HSPs: 68)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 32214875 - 32215092
Alignment:
Q  1 atatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32214875 atatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 32214974  T
Q  101 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatta 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  32214975 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 32215074  T
Q  201 agatgttgatgatgatgt 218  Q
    ||||||||||||||||||    
T  32215075 agatgttgatgatgatgt 32215092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 18809151 - 18808947
Alignment:
Q  1 atatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18809151 atatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 18809052  T
Q  101 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatta 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18809051 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 18808952  T
Q  201 agatg 205  Q
    |||||    
T  18808951 agatg 18808947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 23709486 - 23709690
Alignment:
Q  1 atatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23709486 atatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 23709585  T
Q  101 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatta 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23709586 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 23709685  T
Q  201 agatg 205  Q
    |||||    
T  23709686 agatg 23709690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 23711967 - 23712171
Alignment:
Q  1 atatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23711967 atatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 23712066  T
Q  101 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatta 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23712067 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 23712166  T
Q  201 agatg 205  Q
    |||||    
T  23712167 agatg 23712171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 39682521 - 39682317
Alignment:
Q  1 atatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39682521 atatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 39682422  T
Q  101 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatta 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  39682421 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 39682322  T
Q  201 agatg 205  Q
    |||||    
T  39682321 agatg 39682317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 571605 - 571401
Alignment:
Q  1 atatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  571605 atatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaacaattgagacgtt 571506  T
Q  101 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatta 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  571505 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 571406  T
Q  201 agatg 205  Q
    |||||    
T  571405 agatg 571401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 6726203 - 6725999
Alignment:
Q  1 atatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6726203 atatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 6726104  T
Q  101 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatta 200  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  6726103 gttgacttacatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 6726004  T
Q  201 agatg 205  Q
    |||||    
T  6726003 agatg 6725999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 21155014 - 21155218
Alignment:
Q  1 atatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21155014 atatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 21155113  T
Q  101 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatta 200  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21155114 gttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 21155213  T
Q  201 agatg 205  Q
    |||||    
T  21155214 agatg 21155218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 23131070 - 23130866
Alignment:
Q  1 atatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23131070 atatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 23130971  T
Q  101 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatta 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23130970 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 23130871  T
Q  201 agatg 205  Q
    |||||    
T  23130870 agatg 23130866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 23133537 - 23133333
Alignment:
Q  1 atatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23133537 atatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 23133438  T
Q  101 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatta 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23133437 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 23133338  T
Q  201 agatg 205  Q
    |||||    
T  23133337 agatg 23133333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 26505587 - 26505383
Alignment:
Q  1 atatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26505587 atatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 26505488  T
Q  101 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatta 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26505487 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 26505388  T
Q  201 agatg 205  Q
    |||||    
T  26505387 agatg 26505383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 26508065 - 26507861
Alignment:
Q  1 atatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26508065 atatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 26507966  T
Q  101 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatta 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26507965 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 26507866  T
Q  201 agatg 205  Q
    |||||    
T  26507865 agatg 26507861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 34402476 - 34402680
Alignment:
Q  1 atatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34402476 atatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 34402575  T
Q  101 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatta 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  34402576 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 34402675  T
Q  201 agatg 205  Q
    |||||    
T  34402676 agatg 34402680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 177; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 23135798 - 23135594
Alignment:
Q  1 atatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23135798 atatatgatgttttaagatgctgattatcatttgatgttgttatactgtgatgtaattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 23135699  T
Q  101 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatta 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23135698 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 23135599  T
Q  201 agatg 205  Q
    |||||    
T  23135598 agatg 23135594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 177; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 24367982 - 24367782
Alignment:
Q  1 atatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24367982 atatatgatgttttaagatgttggttattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 24367883  T
Q  101 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatta 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24367882 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 24367783  T
Q  201 a 201  Q
    |    
T  24367782 a 24367782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 177; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 32039452 - 32039656
Alignment:
Q  1 atatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32039452 atatatgatgttttaagatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 32039551  T
Q  101 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatta 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  32039552 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttactgttgttatttaactaagctgcatgagccggtctaagttgatta 32039651  T
Q  201 agatg 205  Q
    |||||    
T  32039652 agatg 32039656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 174; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 24898149 - 24898354
Alignment:
Q  1 atatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24898149 atatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 24898248  T
Q  101 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaact-aagttgcatgagtcggtctaagttgatt 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24898249 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgatt 24898348  T
Q  200 aagatg 205  Q
    ||||||    
T  24898349 aagatg 24898354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 174; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 24900632 - 24900837
Alignment:
Q  1 atatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24900632 atatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 24900731  T
Q  101 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaact-aagttgcatgagtcggtctaagttgatt 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24900732 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgatt 24900831  T
Q  200 aagatg 205  Q
    ||||||    
T  24900832 aagatg 24900837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 174; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 24903109 - 24903314
Alignment:
Q  1 atatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24903109 atatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 24903208  T
Q  101 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaact-aagttgcatgagtcggtctaagttgatt 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24903209 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgatt 24903308  T
Q  200 aagatg 205  Q
    ||||||    
T  24903309 aagatg 24903314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 174; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 24905586 - 24905791
Alignment:
Q  1 atatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24905586 atatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 24905685  T
Q  101 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaact-aagttgcatgagtcggtctaagttgatt 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24905686 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgatt 24905785  T
Q  200 aagatg 205  Q
    ||||||    
T  24905786 aagatg 24905791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 174; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 24908061 - 24908266
Alignment:
Q  1 atatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24908061 atatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 24908160  T
Q  101 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaact-aagttgcatgagtcggtctaagttgatt 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24908161 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgatt 24908260  T
Q  200 aagatg 205  Q
    ||||||    
T  24908261 aagatg 24908266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 173; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 28577307 - 28577103
Alignment:
Q  1 atatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28577307 atatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 28577208  T
Q  101 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatta 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  28577207 gttggcttgcatttgatattattatatcatgctgtttttgtatactgttgcgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 28577108  T
Q  201 agatg 205  Q
    |||||    
T  28577107 agatg 28577103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 22105621 - 22105416
Alignment:
Q  1 atatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  22105621 atatatgatgttttaagatgttgattataatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagaagtt 22105522  T
Q  101 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22105521 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatt 22105422  T
Q  200 aagatg 205  Q
    ||||||    
T  22105421 aagatg 22105416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 45029808 - 45030012
Alignment:
Q  1 atatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45029808 atatatgatgttttaagatgatgattattatttcatgttgttatattgtgatataaatgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 45029907  T
Q  101 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatta 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  45029908 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatattgttgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 45030007  T
Q  201 agatg 205  Q
    |||||    
T  45030008 agatg 45030012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 31 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 43137477 - 43137303
Alignment:
Q  31 tttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 130  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43137477 tttgatgatgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaacaattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 43137378  T
Q  131 gctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 205  Q
    | |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43137377 gttgtttttgtatattactgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 43137303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 38967582 - 38967378
Alignment:
Q  1 atatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  38967582 atatatgatgtcttaagatgttgattattatttgatgttgt-atattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagatgtt 38967484  T
Q  101 g-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatt 199  Q
    | |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| || ||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  38967483 gattgacttgcatttgatattattatttcatgctatttttgtatattgttgtgtcgatgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatt 38967384  T
Q  200 aagatg 205  Q
    ||||||    
T  38967383 aagatg 38967378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 30 - 205
Target Start/End: Original strand, 24529511 - 24529687
Alignment:
Q  30 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaa-taattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  24529511 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattatttgaattatatatgaaataattgagacgttgttaacttgcacttgatattattatgtc 24529610  T
Q  129 atgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 205  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24529611 atgctgtttttgtatactgatgtgttgttgttgttatttaactatgctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 24529687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 47 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 22337281 - 22337116
Alignment:
Q  47 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 146  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || ||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  22337281 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgtcttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatataca 22337182  T
Q  147 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 211  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  22337181 gcctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 22337116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 17 - 124
Target Start/End: Original strand, 24642826 - 24642933
Alignment:
Q  17 gatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttga 116  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24642826 gatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttga 24642925  T
Q  117 tattatta 124  Q
    ||||||||    
T  24642926 tattatta 24642933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 47 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 23060679 - 23060514
Alignment:
Q  47 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 146  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  | |||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23060679 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 23060580  T
Q  147 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 211  Q
    | || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  23060579 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 23060514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 47 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 23076608 - 23076443
Alignment:
Q  47 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 146  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || |||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23076608 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatattgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 23076509  T
Q  147 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 211  Q
    | || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||    
T  23076508 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtggatgaagatgatgatg 23076443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 32 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 19672010 - 19671831
Alignment:
Q  32 ttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg 131  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||| || ||||||||||| |||||    
T  19672010 ttgatgttgttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaat-attgagatgttgtttacttgcgttcgatattattatatcatg 19671912  T
Q  132 ctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 211  Q
     || ||||| |||||| || |||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||| | | ||||||||||||    
T  19671911 atg-ttttgcatactgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatg 19671831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 47 - 211
Target Start/End: Original strand, 22731189 - 22731354
Alignment:
Q  47 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 146  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  |||| |||||| || | | |||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  22731189 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaatatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtaaact 22731288  T
Q  147 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 211  Q
    | || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||    
T  22731289 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaacttgatgaagatgatgatg 22731354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 47 - 211
Target Start/End: Original strand, 22738135 - 22738299
Alignment:
Q  47 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 146  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  22738135 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtaaact 22738234  T
Q  147 gctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 211  Q
    ||    ||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  22738235 gcctatttaatgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatcaagatgatgatg 22738299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 47 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 23660188 - 23660024
Alignment:
Q  47 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 146  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   |||||| || ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||    
T  23660188 tgtgatataatgttatacgcattacttgagttatgattgaatatttaagatgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatcctg-tttcgtatact 23660090  T
Q  147 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 211  Q
    | || ||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  23660089 gcctatgttgctgttgttgtttaactaagatacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 23660024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 47 - 205
Target Start/End: Original strand, 298769 - 298929
Alignment:
Q  47 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 146  Q
    |||||||||||  | ||||||||||||||    ||| |||||| || ||| |||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||| |||||||||||    
T  298769 tgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatatttatgtcatgctgattttgtatact 298868  T
Q  147 gc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 205  Q
    || | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  298869 gcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 298929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 47 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 23286027 - 23285866
Alignment:
Q  47 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 146  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||||  | || |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||    ||||||||||||||    
T  23286027 tgtgatataatgttttatgcattacttgaagaacatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtc----tgtttttgtatact 23285932  T
Q  147 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 211  Q
    || | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  23285931 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 23285866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 131 - 205
Target Start/End: Original strand, 24643034 - 24643108
Alignment:
Q  131 gctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 205  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24643034 gctgtttttgtatactgatgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 24643108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 47 - 211
Target Start/End: Original strand, 23654341 - 23654506
Alignment:
Q  47 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 146  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| | |||  |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||    
T  23654341 tgtgatataatgttttatgcattacttgagtaatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgatgtatttgtatgct 23654440  T
Q  147 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 211  Q
    || | || || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||| |||||    
T  23654441 gcctatgctgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatg 23654506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 32 - 197
Target Start/End: Original strand, 23708558 - 23708725
Alignment:
Q  32 ttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 130  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  |||||| || | ||| ||||| |||||||| |||| ||||    
T  23708558 ttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatttgaatgtttgagatgtcgatgatttgcaattgatattgttatatcat 23708657  T
Q  131 gctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgt-tgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttga 197  Q
    | || ||||| |||||| || ||||||| | ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  23708658 gttg-ttttgcatactgcctatgttgctatctgttatttaactaagctgcttgagtcggtctaagttga 23708725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 113 - 211
Target Start/End: Original strand, 38136 - 38234
Alignment:
Q  113 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||| |||||    
T  38136 ttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatg 38234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 17 - 86
Target Start/End: Original strand, 22173799 - 22173868
Alignment:
Q  17 gatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtga 86  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22173799 gatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtga 22173868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 64 - 211
Target Start/End: Original strand, 23103369 - 23103515
Alignment:
Q  64 tgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgt 162  Q
    ||||| |||||||||||   ||||| ||||||| |||| ||| ||| ||||||||| || ||||||||||||||  ||||||||| | |||||||||| |    
T  23103369 tgcatgacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgatgaattgaatttgatataatcatgtcatgctgttt--gtatactgcctatgttgctgtttt 23103466  T
Q  163 tatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 211  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| || | |||||| |||||    
T  23103467 tatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 23103515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 91 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 28406099 - 28405990
Alignment:
Q  91 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggt 188  Q
    |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||||| ||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28406099 ttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagttgcatgagtcggt 28406000  T
Q  189 ctaagttgat 198  Q
    ||||||||||    
T  28405999 ctaagttgat 28405990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 47 - 193
Target Start/End: Original strand, 7688 - 7835
Alignment:
Q  47 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 146  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||  |||||| |||| |||||||||||||||||| |||| ||||| || ||||| |||||    
T  7688 tgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgttg-ttttgcatact 7786  T
Q  147 g-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 193  Q
    | || |||||||| |||||  ||||||||| ||||||| || |||||||    
T  7787 gcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgattcagtctaag 7835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 84 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 25616314 - 25616179
Alignment:
Q  84 tgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatga 182  Q
    |||||| || ||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||  ||||  |||| | || |||| |||| |||||||||||||||||||    
T  25616314 tgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatttttatgtcttgctgttgatgtaatctgcctatgctgctattgtaatttaactaagttgcatga 25616215  T
Q  183 gtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgt 218  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  25616214 gtcagtctaagttgattaagatgttaataatgatgt 25616179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 151 - 211
Target Start/End: Original strand, 23040249 - 23040309
Alignment:
Q  151 tgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 211  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  23040249 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 23040309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 47
Target Start/End: Complemental strand, 20261427 - 20261381
Alignment:
Q  1 atatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatatt 47  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20261427 atatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatatt 20261381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 62 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 20309257 - 20309109
Alignment:
Q  62 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt 160  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||| | ||||||| ||    
T  20309257 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctatt 20309161  T
Q  161 -gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 211  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||||||| || | |||||| |||||    
T  20309160 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 20309109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 136 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 8946734 - 8946658
Alignment:
Q  136 ttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 211  Q
    ||||||||||||| | ||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  8946734 ttttgtatactgcctatgttgctattgttatctaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 8946658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 41 - 117
Target Start/End: Original strand, 22459511 - 22459587
Alignment:
Q  41 ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgat 117  Q
    ||||| |||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| |||||| ||||||||    
T  22459511 ttataatgtgatataattgtatatacattacttgagttatatgtgaatatttgagatgttgatgactttcatttgat 22459587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 23791458 - 23791357
Alignment:
Q  30 atttgatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 128  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| | |||||||||||| |||||||||| | |||  |||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||    
T  23791458 atttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatat-aatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatatttttatatc 23791360  T
Q  129 atg 131  Q
    |||    
T  23791359 atg 23791357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 46
Target Start/End: Original strand, 10684719 - 10684764
Alignment:
Q  1 atatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 46  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10684719 atatatgatgttttaagatgttaattaccatttgatgttgttatat 10684764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 30 - 193
Target Start/End: Original strand, 20520130 - 20520295
Alignment:
Q  30 atttgatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 128  Q
    ||||||||| |||| || ||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || ||  |||||| |||||||| ||||| |||||||| |||| ||    
T  20520130 atttgatgtcgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacttgaattatatatg-atgtttgagatgttgttgatttgca-ttgatattgttatatc 20520227  T
Q  129 atg--ctgtttttgtatactgc-tgtgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 193  Q
    |||  ||| |||| | |||||| | |||||||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20520228 atgaactg-ttttatgtactgcatatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 20520295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 30 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 23207461 - 23207296
Alignment:
Q  30 atttgatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 128  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| | |||||||||||| |||||||| | | |||  |||||| || ||||| |||||||||||||| |||| ||    
T  23207461 atttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatttat-aatg-ttgagatgtcgttgatttgcatttgatattgttatatc 23207364  T
Q  129 atg--ctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 193  Q
    |||  |||||||  |||||||| | |||||||||| |||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23207363 atgaactgtttta-tatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 23207296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 51 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 7679745 - 7679592
Alignment:
Q  51 atataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-t 149  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||| | ||| |  ||  || |||| |||||| |||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  7679745 atataattatatatacattacatgaattatgtttga-tgtttatgatgttgatgacttacatt-gatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 7679649  T
Q  150 gtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 205  Q
     |||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  7679648 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 7679592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 29601518 - 29601478
Alignment:
Q  30 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcatta 70  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29601518 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcatta 29601478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 60 - 193
Target Start/End: Original strand, 32451896 - 32452031
Alignment:
Q  60 tatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacg-ttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgct 157  Q
    |||| |||||||||||| | ||  ||||||||||||| | |||||| |||||||| |||||| |||||||||||| |||||| || |||| | |||||||    
T  32451896 tatacgcattacttgaagtttaaatgaataattgagatgattgttggcttgcatt-gatattgttatgtcatgctatttttgaatgctgcctatgttgct 32451994  T
Q  158 gtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 193  Q
    ||| | | |||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  32451995 gtttgatgtttaaccaagctgcatgagtcggtctaag 32452031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 51 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 25176010 - 25175864
Alignment:
Q  51 atataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-t 149  Q
    |||||||||||||| | |||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  25176010 atataattatatatacgttatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 25175914  T
Q  150 gtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 198  Q
     |||||||||| |||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||    
T  25175913 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgaatctgtctaagttgat 25175864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 151 - 214
Target Start/End: Original strand, 22134266 - 22134329
Alignment:
Q  151 tgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatg 214  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| | |||| | |||| ||||||||    
T  22134266 tgttgctgttgatatttaactaagctgcatgagtcggtctatgatgatgatgatgatgatgatg 22134329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 159 - 197
Target Start/End: Original strand, 18786971 - 18787009
Alignment:
Q  159 ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttga 197  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18786971 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 18787009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 30 - 131
Target Start/End: Original strand, 24697543 - 24697644
Alignment:
Q  30 atttgatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 128  Q
    |||| ||||||||| || |||||||||| | |||||||||||| |||||| ||| ||||   |||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||    
T  24697543 attttatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattgtatatgaagt-ttgagatgttgttgaattgcatttgatattgttatatc 24697641  T
Q  129 atg 131  Q
    |||    
T  24697642 atg 24697644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 154 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 24869934 - 24869903
Alignment:
Q  154 tgctgttgttatttaactaagttgcatgagtc 185  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24869934 tgctgttgttatttaactaagttgcatgagtc 24869903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 154 - 185
Target Start/End: Original strand, 25961597 - 25961628
Alignment:
Q  154 tgctgttgttatttaactaagttgcatgagtc 185  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25961597 tgctgttgttatttaactaagttgcatgagtc 25961628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 161 - 211
Target Start/End: Original strand, 23072019 - 23072069
Alignment:
Q  161 gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 211  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||||| | |||||| |||||    
T  23072019 gttatttaactaagctgcatgagtcggactaagttgttgaagatgatgatg 23072069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 151 - 185
Target Start/End: Original strand, 24655398 - 24655432
Alignment:
Q  151 tgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtc 185  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24655398 tgttgctgctgttatttaactaagttgcatgagtc 24655432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 23287424 - 23287384
Alignment:
Q  151 tgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtcta 191  Q
    |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||    
T  23287424 tgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcggtcta 23287384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 26392443 - 26392403
Alignment:
Q  151 tgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtcta 191  Q
    |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||    
T  26392443 tgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcggtcta 26392403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 203; Significance: 1e-111; HSPs: 69)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Original strand, 16413270 - 16413476
Alignment:
Q  1 atatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16413270 atatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 16413369  T
Q  101 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatta 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16413370 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 16413469  T
Q  201 agatgtt 207  Q
    |||||||    
T  16413470 agatgtt 16413476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 14409398 - 14409602
Alignment:
Q  1 atatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14409398 atatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 14409497  T
Q  101 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatta 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14409498 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 14409597  T
Q  201 agatg 205  Q
    |||||    
T  14409598 agatg 14409602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 1484610 - 1484406
Alignment:
Q  1 atatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1484610 atatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 1484511  T
Q  101 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatta 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1484510 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 1484411  T
Q  201 agatg 205  Q
    |||||    
T  1484410 agatg 1484406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 5853246 - 5853450
Alignment:
Q  1 atatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5853246 atatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 5853345  T
Q  101 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatta 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5853346 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 5853445  T
Q  201 agatg 205  Q
    |||||    
T  5853446 agatg 5853450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 20403435 - 20403231
Alignment:
Q  1 atatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20403435 atatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 20403336  T
Q  101 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatta 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20403335 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 20403236  T
Q  201 agatg 205  Q
    |||||    
T  20403235 agatg 20403231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 22001961 - 22001757
Alignment:
Q  1 atatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22001961 atatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 22001862  T
Q  101 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatta 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22001861 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 22001762  T
Q  201 agatg 205  Q
    |||||    
T  22001761 agatg 22001757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 177; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 15203185 - 15203389
Alignment:
Q  1 atatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15203185 atatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 15203284  T
Q  101 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatta 200  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  15203285 gttgacttacatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcgctctaagttgatta 15203384  T
Q  201 agatg 205  Q
    |||||    
T  15203385 agatg 15203389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 177; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 20046149 - 20046353
Alignment:
Q  1 atatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20046149 atatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtaaataattgagacgtt 20046248  T
Q  101 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatta 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20046249 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 20046348  T
Q  201 agatg 205  Q
    |||||    
T  20046349 agatg 20046353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 173; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 4483488 - 4483285
Alignment:
Q  1 atatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4483488 atatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 4483389  T
Q  101 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatta 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4483388 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 4483290  T
Q  201 agatg 205  Q
    |||||    
T  4483289 agatg 4483285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 169; E-Value: 8e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 4542327 - 4542531
Alignment:
Q  1 atatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4542327 atatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaactatatgtgaataattgagacgtt 4542426  T
Q  101 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatta 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4542427 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatcttgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 4542526  T
Q  201 agatg 205  Q
    |||||    
T  4542527 agatg 4542531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 11 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 19896466 - 19896269
Alignment:
Q  11 ttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgc 110  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19896466 ttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgc 19896367  T
Q  111 atttgatatta---ttatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 205  Q
    |||||||||||   |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19896366 atttgatattattattatgtcatgctgtttttgtataccgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 19896269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 30 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 41598367 - 41598192
Alignment:
Q  30 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41598367 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 41598268  T
Q  130 tgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 205  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41598267 tgctgtttttgtatactactgtgttgctgttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 41598192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 14823981 - 14823778
Alignment:
Q  1 atatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14823981 atatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 14823882  T
Q  101 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatta 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||  | ||||||||| ||||||| |||||||    
T  14823881 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgttgttgttatttaactttgctgcatgagt-ggtctaaattgatta 14823783  T
Q  201 agatg 205  Q
    |||||    
T  14823782 agatg 14823778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 45290648 - 45290857
Alignment:
Q  1 atatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| |||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  45290648 atatatgatgttttaagatgttgattattatttgacgttgttatactgtgatataattgtatctgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgtt 45290747  T
Q  101 g-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatt 199  Q
    | ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  45290748 gattggcttacatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatt 45290847  T
Q  200 aagatgttga 209  Q
    ||||||||||    
T  45290848 aagatgttga 45290857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 30 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 26224098 - 26223914
Alignment:
Q  30 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26224098 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattaaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 26223999  T
Q  130 tgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatg 214  Q
    |||| |||||||||| |||| | ||||||||||||||||| |||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26223998 tgctatttttgtatattgctttattgctgttgttatttaattaagctgcatgggtcgatctaagttgattaagatgttgatgatg 26223914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 4 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 15070765 - 15070571
Alignment:
Q  4 tatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg- 101  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||| | ||  ||||| ||||||||||||||||||||     
T  15070765 tatgatgttttaagatgttgattatcatttgatgttgtttatattcagatataattgtatatgcatcaattagattatctgtgaataattgagacgttga 15070666  T
Q  102 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttg 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15070665 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactactgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 15070571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 17 - 205
Target Start/End: Original strand, 19936975 - 19937164
Alignment:
Q  17 gatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttg 115  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||  ||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19936975 gatgttgattatcatttgatgttgttatattgtgatataactgtatgtgcattgattgaattatttgtgagtaattgagacgttgattgacttgcatttg 19937074  T
Q  116 atattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 205  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19937075 atcttattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatg 19937164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 17 - 205
Target Start/End: Original strand, 25484245 - 25484426
Alignment:
Q  17 gatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttga 116  Q
    |||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25484245 gatgttgattatgatttgatgttattatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttga 25484344  T
Q  117 tattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||       | |||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  25484345 tattattatgtcatgctgtttttgtatac-------tagctgttgttatttaactaagctgcacgagttggtctaagttgattaagatg 25484426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 32 - 193
Target Start/End: Original strand, 19801367 - 19801527
Alignment:
Q  32 ttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg 131  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19801367 ttgatgttgttatattgtgttataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcgtttgatattattatgtcatg 19801466  T
Q  132 ctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 193  Q
    ||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  19801467 ctg-ttttgtatactgttgtgttgctattgttatttaactaagctgcatgagccggtctaag 19801527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 47 - 211
Target Start/End: Original strand, 16092297 - 16092462
Alignment:
Q  47 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 146  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||| ||||||   || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16092297 tgtgatataatgttatacgcattacttaaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 16092396  T
Q  147 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 211  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  16092397 gcctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 16092462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 47 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 6759421 - 6759259
Alignment:
Q  47 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 146  Q
    |||||||||||  |||| |||||| |||||||||  ||| ||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6759421 tgtgatataatgttatacgcattaattgaattatgagtgtataattgaga---tgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 6759325  T
Q  147 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 211  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  6759324 gcctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 6759259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 32 - 211
Target Start/End: Original strand, 18818348 - 18818529
Alignment:
Q  32 ttgatgttg-ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 130  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| | ||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  18818348 ttgatgttgattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttacaattgatattattatgtcat 18818447  T
Q  131 gctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 211  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  18818448 gctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 18818529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 47 - 214
Target Start/End: Original strand, 28648999 - 28649167
Alignment:
Q  47 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 146  Q
    |||||||||||  ||||  |||||||||||||||   || |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28648999 tgtgatataatgttatacacattacttgaattatgaatgtataattaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttcgtatact 28649098  T
Q  147 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatg 214  Q
    | || ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  28649099 gcctatgttgcttttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgatg 28649167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 59 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 7372932 - 7372779
Alignment:
Q  59 atatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgct 157  Q
    ||||| |||||||||||| ||||  |||||| || ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  7372932 atataagcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgct 7372833  T
Q  158 gttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 211  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  7372832 gttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 7372779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 47 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 20536374 - 20536209
Alignment:
Q  47 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 146  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20536374 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 20536275  T
Q  147 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 211  Q
    | || |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  20536274 gcctatgtttctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 20536209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 67 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 26219858 - 26219721
Alignment:
Q  67 attacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatt 166  Q
    ||||||||||||||   || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  26219858 attacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatactatttt-gtatactgctgtgtcgctgttgttatt 26219760  T
Q  167 taactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 205  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26219759 taactaagctgcatgagtcggtctaagttgattatgatg 26219721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 47 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 22875230 - 22875066
Alignment:
Q  47 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 146  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  22875230 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttg-ttttgtatact 22875132  T
Q  147 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 211  Q
    | ||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||    
T  22875131 gcctgtgttgctgctgctatttaactaagctgcatgagtcggtctaaattgatgaagatgatgatg 22875066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 46 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 23406548 - 23406380
Alignment:
Q  46 ttgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt--gttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtat 143  Q
    ||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| | |  ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23406548 ttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtat 23406449  T
Q  144 actgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 211  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  23406448 actgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 23406380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 64 - 211
Target Start/End: Original strand, 21923900 - 21924048
Alignment:
Q  64 tgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgt 162  Q
    ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| | ||||||||||||    
T  21923900 tgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattatcatgtcatgttgtttttgtagactgcctatgttgctgttgt 21923999  T
Q  163 tatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 211  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  21924000 tatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 21924048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 62 - 211
Target Start/End: Original strand, 21918969 - 21919120
Alignment:
Q  62 tatgcattacttgaattat-atgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgt 159  Q
    |||||||||||||||  || || |||||| || ||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  21918969 tatgcattacttgaagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgt 21919068  T
Q  160 tgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 211  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||| |||||    
T  21919069 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatg 21919120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 67 - 205
Target Start/End: Original strand, 26225268 - 26225405
Alignment:
Q  67 attacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatt 166  Q
    ||||||||||||||   || ||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||    
T  26225268 attacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgtatttgatattattatgtcatactgtttt-gtatattgttgtgtcgctgttgttatt 26225366  T
Q  167 taactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 205  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26225367 taactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 26225405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 47 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 22626901 - 22626737
Alignment:
Q  47 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 146  Q
    |||||||||||  ||||  ||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  22626901 tgtgatataatgttatacacattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgatttgtatttgatattattatgtcatgttgtttt-gtatact 22626803  T
Q  147 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 211  Q
    || | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  22626802 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 22626737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 96
Target Start/End: Original strand, 24485998 - 24486093
Alignment:
Q  1 atatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaga 96  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24485998 atatatgatgttctaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaga 24486093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 30 - 209
Target Start/End: Original strand, 13508022 - 13508203
Alignment:
Q  30 atttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 128  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||| || ||||||||||| ||    
T  13508022 atttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatatttgagatgttgtttacttgcgttcgatattattatatc 13508121  T
Q  129 atgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttga 209  Q
    ||| || || || ||| || || |||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||| | | ||||||||||    
T  13508122 atgatg-ttgtgcatattgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttga 13508203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 30 - 209
Target Start/End: Original strand, 13597554 - 13597735
Alignment:
Q  30 atttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 128  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||| |||||| || ||||||||||| ||    
T  13597554 atttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatatttgggatgttgtttacttgcgttcgatattattatatc 13597653  T
Q  129 atgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttga 209  Q
    ||| || ||||| || |||| | |||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||| | | ||||||||||    
T  13597654 atgatg-ttttgcattctgcttatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttga 13597735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 32810139 - 32810054
Alignment:
Q  1 atatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtga 86  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  32810139 atatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtga 32810054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 30 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 20498746 - 20498581
Alignment:
Q  30 atttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 128  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||  |||||| |||| |||||||||||||||||| |||| ||    
T  20498746 atttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatc 20498647  T
Q  129 atgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 193  Q
    |||||  ||||  |||||| || |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20498646 atgct-attttacatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaag 20498581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 47 - 211
Target Start/End: Original strand, 18879191 - 18879351
Alignment:
Q  47 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 146  Q
    |||||||||||  |||  ||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||||||||||||||     ||||||||||||||    
T  18879191 tgtgatataatgttatgagcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgt-----tgtttttgtatact 18879285  T
Q  147 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 211  Q
    || | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  18879286 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 18879351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 47 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 23648719 - 23648547
Alignment:
Q  47 tgtgatataattatatatgcattacttgaa-ttatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 145  Q
    |||||||||||  | | ||||||||||||| || ||| |||||| || ||| |||||||  |||||  |||||||||||||||||| |||| |||||  |    
T  23648719 tgtgatataatgttgtgtgcattacttgaagttttat-tgaatatttaagatgttgttgtattgcaaatgatattattatgtcatgttgttgttgtaatc 23648621  T
Q  146 tgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgt 218  Q
    ||| | ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23648620 tgcctatgttgctattgttaattaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatgatgatgt 23648547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 41 - 211
Target Start/End: Original strand, 17612059 - 17612230
Alignment:
Q  41 ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 140  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||| |||| | |  ||||||||||| ||||| || |||||    
T  17612059 ttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgatg-ttttg 17612157  T
Q  141 tatactg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 211  Q
     |||||| || ||||| || |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||| | | ||||||||||||    
T  17612158 catactgcctatgttgttgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatg 17612230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 84 - 218
Target Start/End: Original strand, 18678094 - 18678229
Alignment:
Q  84 tgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatga 182  Q
    |||||| || ||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||  ||||  |||| | || |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18678094 tgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatttttatgtcttgctgttgatgtaatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 18678193  T
Q  183 gtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgt 218  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18678194 gtcagtctaagttgattaagatgttgataatgatgt 18678229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 62 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 31971407 - 31971258
Alignment:
Q  62 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt 160  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| | ||||||||||    
T  31971407 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattggaattgatattattatgtcatgttgtttt-gtatactgcctatgttgctgtt 31971309  T
Q  161 gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 211  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||| |||||    
T  31971308 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatg 31971258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 84 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 32121861 - 32121726
Alignment:
Q  84 tgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatga 182  Q
    |||||| || ||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||  ||||  |||| | || |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  32121861 tgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatttttatgtcttgctgttgatgtaatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 32121762  T
Q  183 gtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgt 218  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  32121761 gtcattctaagttgattaagatgttgataatgatgt 32121726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 51 - 211
Target Start/End: Original strand, 38855212 - 38855371
Alignment:
Q  51 atataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-t 149  Q
    |||||||| ||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  38855212 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 38855308  T
Q  150 gtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 211  Q
     |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  38855309 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatg 38855371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 113 - 211
Target Start/End: Original strand, 45131019 - 45131116
Alignment:
Q  113 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||  || |||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || | |||||| |||||    
T  45131019 ttgatattattatgtcatgctgttt--gtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 45131116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 98 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 6520483 - 6520369
Alignment:
Q  98 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagtt 195  Q
    |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6520483 gttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 6520385  T
Q  196 gattaagatgttgatg 211  Q
    |||||||||| |||||    
T  6520384 gattaagatgatgatg 6520369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 91 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 21285719 - 21285606
Alignment:
Q  91 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggt 188  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||| |||||| | ||||||| | ||||| |||| |||||||||| ||| |||||||||||||    
T  21285719 ttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgttgtttt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaacaaagctgcatgagtcggt 21285621  T
Q  189 ctaagttgattaaga 203  Q
    |||||||||||||||    
T  21285620 ctaagttgattaaga 21285606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 30 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 37116532 - 37116366
Alignment:
Q  30 atttgatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 128  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| || |||||||||||| |||||||||| ||| |  |||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||    
T  37116532 atttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatga-tgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatc 37116434  T
Q  129 atg--ctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 193  Q
    |||  ||| |||| | ||||| || |||||||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  37116433 atgaactg-ttttatgtactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 37116366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 113 - 211
Target Start/End: Original strand, 16199666 - 16199764
Alignment:
Q  113 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgat 210  Q
    ||||||||||||||||||| |||||  | |||||| || |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| || | |||||| ||||    
T  16199666 ttgatattattatgtcatgttgttt--gaatactgtctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 16199763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 98 - 211
Target Start/End: Original strand, 5866280 - 5866394
Alignment:
Q  98 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagtt 195  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||| ||||| || ||| | ||||||| | |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  5866280 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 5866378  T
Q  196 gattaagatgttgatg 211  Q
    | | |||||| |||||    
T  5866379 gttgaagatgatgatg 5866394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 110 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 17141019 - 17140917
Alignment:
Q  110 catttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgtt 207  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||  || | ||||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||| |    
T  17141019 cattcgatattattatgtcatgatggatt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 17140921  T
Q  208 gatg 211  Q
    ||||    
T  17140920 gatg 17140917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 98 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 21491110 - 21490996
Alignment:
Q  98 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagtt 195  Q
    |||||||| || ||||  |||||||||| ||||| || ||| | ||||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21491110 gttgttgatttacattcaatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 21491012  T
Q  196 gattaagatgttgatg 211  Q
    | | |||||| |||||    
T  21491011 gttgaagatgatgatg 21490996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 98 - 197
Target Start/End: Original strand, 983410 - 983512
Alignment:
Q  98 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtt-tttgtatactgc-tgtgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagt 194  Q
    |||||||| |||||||||| ||| |||| |||||   || |||| ||||||| | |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  983410 gttgttgaattgcatttgagattgttatatcatgaacttgtttgcatactgcctatgttgctgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 983509  T
Q  195 tga 197  Q
    |||    
T  983510 tga 983512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 131
Target Start/End: Original strand, 17266930 - 17267031
Alignment:
Q  30 atttgatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 128  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| | ||||||||||||  ||||||||| ||| |  |||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||    
T  17266930 atttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacaagaattatatatga-tgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatc 17267028  T
Q  129 atg 131  Q
    |||    
T  17267029 atg 17267031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 98 - 211
Target Start/End: Original strand, 21389458 - 21389570
Alignment:
Q  98 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagtt 195  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||| | | ||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  21389458 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 21389554  T
Q  196 gattaagatgttgatg 211  Q
    | | |||||| |||||    
T  21389555 gttgaagatgatgatg 21389570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 98 - 211
Target Start/End: Original strand, 21395988 - 21396100
Alignment:
Q  98 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagtt 195  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||| ||||||||||   ||||||||| | ||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  21395988 gttgatgaattgaatttgatataattatctcatgctgtt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 21396084  T
Q  196 gattaagatgttgatg 211  Q
    | | |||||| |||||    
T  21396085 gttgaagatgatgatg 21396100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 98 - 211
Target Start/End: Original strand, 21778784 - 21778896
Alignment:
Q  98 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagtt 195  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||| | | ||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  21778784 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 21778880  T
Q  196 gattaagatgttgatg 211  Q
    | | |||||| |||||    
T  21778881 gttgaagatgatgatg 21778896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 98 - 211
Target Start/End: Original strand, 21790481 - 21790593
Alignment:
Q  98 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagtt 195  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||| ||||||||||   ||||||||| | ||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  21790481 gttgatgaattgaatttgatataattatctcatgctgtt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 21790577  T
Q  196 gattaagatgttgatg 211  Q
    | | |||||| |||||    
T  21790578 gttgaagatgatgatg 21790593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 47 - 131
Target Start/End: Original strand, 17439461 - 17439544
Alignment:
Q  47 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg 131  Q
    ||||||||| || |||||||||||| |||||||||| ||| |  |||||| |||||||| |||||||||||||| |||| |||||    
T  17439461 tgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatga-tgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatg 17439544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 151 - 197
Target Start/End: Original strand, 23760903 - 23760950
Alignment:
Q  151 tgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttga 197  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23760903 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 23760950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 162 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 21249434 - 21249385
Alignment:
Q  162 ttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 211  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||| |||||    
T  21249434 ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatg 21249385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 162 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 21255272 - 21255223
Alignment:
Q  162 ttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 211  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||| |||||    
T  21255272 ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatg 21255223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 91 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 21673826 - 21673718
Alignment:
Q  91 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggt 188  Q
    |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||| ||| | ||||| |||| |||||||||||| | |||||||||||||    
T  21673826 ttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcataatgcctatgttgttgtttgttatttaactatgatgcatgagtcggt 21673728  T
Q  189 ctaagttgat 198  Q
    ||||||||||    
T  21673727 ctaagttgat 21673718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 46
Target Start/End: Original strand, 35026850 - 35026895
Alignment:
Q  1 atatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 46  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||    
T  35026850 atatatgatgttttaagatgttgattatcgtttgatattgttatat 35026895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 159 - 198
Target Start/End: Original strand, 26355766 - 26355805
Alignment:
Q  159 ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 198  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26355766 ttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 26355805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 154 - 208
Target Start/End: Original strand, 39094987 - 39095041
Alignment:
Q  154 tgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttg 208  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||  | |||| ||| ||||||||||    
T  39094987 tgcttttgttatttaactaagttgcatgagtcattataagatgaataagatgttg 39095041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 46
Target Start/End: Original strand, 1326997 - 1327042
Alignment:
Q  1 atatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 46  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  1326997 atatacgatgttttgagatgttgattattatttgatgttgttatat 1327042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 46
Target Start/End: Original strand, 2418861 - 2418906
Alignment:
Q  1 atatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 46  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| | |||||| |||||||||    
T  2418861 atatatgatgtttcaagatgttgattatcgtttgatattgttatat 2418906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 159 - 208
Target Start/End: Original strand, 20856492 - 20856541
Alignment:
Q  159 ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttg 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  | |||| ||| ||||||||||    
T  20856492 ttgttatttaactaagttgcatgagtcattataagatgaataagatgttg 20856541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 202; Significance: 1e-110; HSPs: 71)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 19618126 - 19618343
Alignment:
Q  1 atatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19618126 atatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattataggtgaataattgagacgtt 19618225  T
Q  101 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatta 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19618226 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 19618325  T
Q  201 agatgttgatgatgatgt 218  Q
    ||||||||||||| ||||    
T  19618326 agatgttgatgataatgt 19618343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 14970661 - 14970878
Alignment:
Q  1 atatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14970661 atatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgtattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 14970760  T
Q  101 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatta 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  14970761 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatattgctgttttgctgttgttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatta 14970860  T
Q  201 agatgttgatgatgatgt 218  Q
    | ||||||||||||||||    
T  14970861 aaatgttgatgatgatgt 14970878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 3515215 - 3515011
Alignment:
Q  1 atatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3515215 atatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 3515116  T
Q  101 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatta 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  3515115 gttgacttgcatttgatattattatgtcttgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttttttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 3515016  T
Q  201 agatg 205  Q
    |||||    
T  3515015 agatg 3515011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 18215228 - 18215432
Alignment:
Q  1 atatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18215228 atatatgatgttttaagatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 18215327  T
Q  101 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatta 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18215328 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 18215427  T
Q  201 agatg 205  Q
    |||||    
T  18215428 agatg 18215432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 15118306 - 15118510
Alignment:
Q  1 atatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15118306 atatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 15118405  T
Q  101 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatta 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15118406 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 15118505  T
Q  201 agatg 205  Q
    |||||    
T  15118506 agatg 15118510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 52312718 - 52312514
Alignment:
Q  1 atatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52312718 atatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 52312619  T
Q  101 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatta 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  52312618 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 52312519  T
Q  201 agatg 205  Q
    |||||    
T  52312518 agatg 52312514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 12261 - 12465
Alignment:
Q  1 atatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12261 atatatgatgttttaagatgttgattattattggatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 12360  T
Q  101 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatta 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12361 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 12460  T
Q  201 agatg 205  Q
    |||||    
T  12461 agatg 12465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 15355278 - 15355487
Alignment:
Q  1 atatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15355278 atatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgtt 15355377  T
Q  101 g-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatt 199  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15355378 gattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatt 15355477  T
Q  200 aagatgttga 209  Q
    ||||||||||    
T  15355478 aagatgttga 15355487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 19242908 - 19242703
Alignment:
Q  1 atatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19242908 atatatgatgttttaagatgttgattaccatttggagttgtttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgt 19242809  T
Q  100 tgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19242808 tgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatt 19242709  T
Q  200 aagatg 205  Q
    ||||||    
T  19242708 aagatg 19242703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 177; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 44615496 - 44615292
Alignment:
Q  1 atatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44615496 atatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 44615397  T
Q  101 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatta 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  44615396 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 44615297  T
Q  201 agatg 205  Q
    |||||    
T  44615296 agatg 44615292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 177; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 44773041 - 44773245
Alignment:
Q  1 atatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  44773041 atatatgatattttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatttgtgaataattgagacgtt 44773140  T
Q  101 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatta 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  44773141 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 44773240  T
Q  201 agatg 205  Q
    |||||    
T  44773241 agatg 44773245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 173; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 1837463 - 1837667
Alignment:
Q  1 atatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1837463 atatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttataatgtgatataatcgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 1837562  T
Q  101 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatta 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1837563 gttgacttgcatttggtattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 1837662  T
Q  201 agatg 205  Q
    |||||    
T  1837663 agatg 1837667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 173; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 18239373 - 18239577
Alignment:
Q  1 atatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18239373 atatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatgtaattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 18239472  T
Q  101 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatta 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18239473 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgctgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 18239572  T
Q  201 agatg 205  Q
    |||||    
T  18239573 agatg 18239577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 173; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 50222293 - 50222497
Alignment:
Q  1 atatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50222293 atatatgatgttttaagatgttgattattatttgatattgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 50222392  T
Q  101 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatta 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  50222393 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtataatgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 50222492  T
Q  201 agatg 205  Q
    |||||    
T  50222493 agatg 50222497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 17 - 205
Target Start/End: Original strand, 51463838 - 51464026
Alignment:
Q  17 gatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttga 116  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  51463838 gatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattatttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttga 51463937  T
Q  117 tattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51463938 tattattatgtcatgctgtttttgtatactactgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 51464026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 17 - 205
Target Start/End: Original strand, 23803235 - 23803423
Alignment:
Q  17 gatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttga 116  Q
    |||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  23803235 gatgttgattatgattttatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataatttagacgttgttgatttgcatttga 23803334  T
Q  117 tattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23803335 tattattatgtcatgctgtttttgtatactactgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 23803423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 30 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 44102393 - 44102218
Alignment:
Q  30 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 129  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  44102393 atttgatgatgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtttacttgcatttgatattattatgtca 44102294  T
Q  130 tgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 205  Q
    ||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44102293 tgctgtttttgtatactactgtgttattgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 44102218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 17 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 12611135 - 12610954
Alignment:
Q  17 gatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttga 116  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12611135 gatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttga 12611036  T
Q  117 tattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12611035 tattattatgtcatgctgtttttgt-------tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 12610954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 7641146 - 7641340
Alignment:
Q  1 atatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7641146 atatatgatattttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtaaataattgagacgtt 7641245  T
Q  101 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatta 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||          |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7641246 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttt----------tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 7641335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 41 - 205
Target Start/End: Original strand, 44928873 - 44929038
Alignment:
Q  41 ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 140  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  44928873 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagatgttattgacttgcatttgacattattatgtcatgctgtttttg 44928972  T
Q  141 tatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 205  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44928973 tatactgcttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 44929038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 30 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 15367873 - 15367691
Alignment:
Q  30 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15367873 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcgttagttgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 15367774  T
Q  129 atgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 211  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| | | ||||||||||||    
T  15367773 atgctgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatg 15367691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 30 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 15402886 - 15402704
Alignment:
Q  30 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15402886 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcgttagttgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 15402787  T
Q  129 atgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 211  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| | | ||||||||||||    
T  15402786 atgctgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatg 15402704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 30 - 193
Target Start/End: Original strand, 21815568 - 21815731
Alignment:
Q  30 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 129  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21815568 atttgatgttgttatattatgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcattttatattattatgtca 21815667  T
Q  130 tgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 193  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  21815668 tgctgtttttgtatacagttgtgttgctgtcgttatttaactaagctgcacgagtcggtctaag 21815731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 30 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 15371385 - 15371203
Alignment:
Q  30 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15371385 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcgttagttgaattatatgtgaataattgagacattgattgacttgcatttgatattattatgtc 15371286  T
Q  129 atgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 211  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| | | ||||||||||||    
T  15371285 atgctgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatg 15371203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 30 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 15373666 - 15373484
Alignment:
Q  30 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15373666 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcgttagttgaattatatgtgaataattgagacattgattgacttgcatttgatattattatgtc 15373567  T
Q  129 atgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 211  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| | | ||||||||||||    
T  15373566 atgctgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatg 15373484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 128; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 35 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 20150004 - 20149833
Alignment:
Q  35 atgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgct 133  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20150004 atgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgatgattgacttgcatttgatattattatgtcatgct 20149905  T
Q  134 gtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 205  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |  |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20149904 gtttttgtatactgatgtgtcgctgttgttattttatcaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 20149833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 30 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 15370200 - 15370019
Alignment:
Q  30 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15370200 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcgt-agttgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 15370102  T
Q  129 atgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 211  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| | | ||||||||||||    
T  15370101 atgctgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatg 15370019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 33 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 16223712 - 16223533
Alignment:
Q  33 tgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatg 131  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16223712 tgatgttgttatattgtgatataattgtatatgggttagttgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcattagatattattatgtcatg 16223613  T
Q  132 ctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 211  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| | | ||||||||||||    
T  16223612 ctgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatg 16223533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 67 - 205
Target Start/End: Original strand, 54798729 - 54798868
Alignment:
Q  67 attacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttat 165  Q
    ||||||||||||||   || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  54798729 attacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcttgtgttgctgttgttat 54798828  T
Q  166 ttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 205  Q
    | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54798829 tcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 54798868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 91 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 14280434 - 14280320
Alignment:
Q  91 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtct 190  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14280434 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgccgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 14280335  T
Q  191 aagttgattaagatg 205  Q
    |||||||||||||||    
T  14280334 aagttgattaagatg 14280320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 32 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 7798956 - 7798775
Alignment:
Q  32 ttgatgttg-ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 130  Q
    ||||||||| |||| |||||||| |||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  7798956 ttgatgttgattatgttgtgatacaatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgatgacttgcaattgatattattatgtcat 7798857  T
Q  131 gctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 211  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  7798856 gctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 7798775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 47 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 14038814 - 14038655
Alignment:
Q  47 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 146  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| |||   || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  14038814 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaaatatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgttgtttttgtatact 14038715  T
Q  147 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 205  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  14038714 gcatgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatg 14038655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 47 - 204
Target Start/End: Original strand, 16377478 - 16377634
Alignment:
Q  47 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 146  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  16377478 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg--tttgtatact 16377575  T
Q  147 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 204  Q
    | || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16377576 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagat 16377634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 47 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 7089043 - 7088878
Alignment:
Q  47 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 146  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||||| |||| ||||||  | ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7089043 tgtgatataatgttttatgcattacttgaataatatttgaatatgtaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 7088944  T
Q  147 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 211  Q
    | || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  7088943 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 7088878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 47 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 12902923 - 12902758
Alignment:
Q  47 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 146  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||||| |||| |||||| || ||| |||| ||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12902923 tgtgatataatgttttatgcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 12902824  T
Q  147 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 211  Q
    | || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||| |||||    
T  12902823 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatg 12902758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 47 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 22636601 - 22636437
Alignment:
Q  47 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 146  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  22636601 tgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtaaact 22636502  T
Q  147 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgat 210  Q
    | || ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  22636501 gtctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgat 22636437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 36 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 22354010 - 22353852
Alignment:
Q  36 tgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgt 135  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||| |||||||||| |||    
T  22354010 tgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgaattgtaattgatattgttatgtcatgttgt 22353911  T
Q  136 ttttgtatactg-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 193  Q
    |  |  |  ||| || || ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  22353910 tgctacaatctgcctatgctgctgttgttatttacctaagctgcatgagtcggtctaag 22353852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 47 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 7893869 - 7893704
Alignment:
Q  47 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 146  Q
    ||||| |||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7893869 tgtgaaataatggtatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 7893770  T
Q  147 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 211  Q
    | || ||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||    
T  7893769 gcctatgttgctattgttatttaactaagctgcatgaatcggtctaagttgatgaagatgatgatg 7893704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 100 - 211
Target Start/End: Original strand, 52873375 - 52873487
Alignment:
Q  100 tgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 198  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  52873375 tgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 52873474  T
Q  199 taagatgttgatg 211  Q
     |||||| |||||    
T  52873475 gaagatgatgatg 52873487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 47 - 211
Target Start/End: Original strand, 16270191 - 16270355
Alignment:
Q  47 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 146  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16270191 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttaacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatact 16270289  T
Q  147 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 211  Q
    | || ||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||    
T  16270290 gcctatgttgctattgttatttaattaagctgcatgagtcggtctaacttgatgaagatgatgatg 16270355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 49 - 211
Target Start/End: Original strand, 16239927 - 16240089
Alignment:
Q  49 tgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg- 147  Q
    |||||||||  ||| |||||||||| || ||||  |||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  16239927 tgatataatgttatttgcattacttaaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgc 16240025  T
Q  148 ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 211  Q
    || | ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||    
T  16240026 ctattttgctattgttatttaattaagttgcatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatg 16240089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 67 - 205
Target Start/End: Original strand, 8574844 - 8574981
Alignment:
Q  67 attacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatt 166  Q
    ||||||||||||||   || ||| |||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| ||||||||||||    
T  8574844 attacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgaattacatttgatattattatgtcatgttgtttt-gtatactgttgtgtcgctgttgttatt 8574942  T
Q  167 taactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 205  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8574943 taactaagctgcatgagtcggtctaagttaattaagatg 8574981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 47 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 6900056 - 6899892
Alignment:
Q  47 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 146  Q
    |||||||||||  ||| | ||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||| |||||||    
T  6900056 tgtgatataatgttatgtacattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgctatgttgtttt-gtatact 6899958  T
Q  147 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 211  Q
    || | ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  6899957 gcctatgttgctattgttatttaactaagatgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 6899892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 47 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 44052995 - 44052830
Alignment:
Q  47 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 146  Q
    |||||||||||  |||  ||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44052995 tgtgatataatgttatgagcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 44052896  T
Q  147 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 211  Q
    | || ||||| ||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||| |||||| |||||    
T  44052895 gcctatgttgatgttgttatttaactgagctgcatgagtcggcctaagttgatgaagatgatgatg 44052830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 30 - 193
Target Start/End: Original strand, 13788 - 13953
Alignment:
Q  30 atttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 128  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| |||| ||    
T  13788 atttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatc 13887  T
Q  129 atgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 193  Q
    ||| || ||||| |||||| || |||||||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13888 atgttg-ttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 13953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 47 - 207
Target Start/End: Original strand, 23374314 - 23374475
Alignment:
Q  47 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 146  Q
    |||||||||||  | ||||||||||||||    ||| |||||| || ||| |||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||| |||||||||||    
T  23374314 tgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatatttatgtcatgctgattttgtatact 23374413  T
Q  147 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgtt 207  Q
    || | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| | ||||||||    
T  23374414 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcgttctaagttgttgaagatgtt 23374475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 30 - 197
Target Start/End: Original strand, 52243131 - 52243302
Alignment:
Q  30 atttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 128  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||  |||||| |||||||| || ||||||||||| |||| ||    
T  52243131 atttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttggattatatatgaatgtttgagatgttgttgaatttcatttgatattgttatatc 52243230  T
Q  129 atg--ctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttga 197  Q
    |||  |||  |||| |||||| || |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  52243231 atgaactg-atttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 52243302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 32 - 197
Target Start/End: Original strand, 43198492 - 43198661
Alignment:
Q  32 ttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 130  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||| |||||||||||||||||  |||| ||||    
T  43198492 ttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatattgatgacttgcatttgatatggttatatcat 43198591  T
Q  131 g-ctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttga 197  Q
    |  |  ||||| ||| || || |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  43198592 gaattgttttgcatattgtctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 43198661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 127 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 3096379 - 3096294
Alignment:
Q  127 tcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 211  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||| |||||    
T  3096379 tcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatg 3096294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 49 - 138
Target Start/End: Original strand, 15464888 - 15464977
Alignment:
Q  49 tgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt 138  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||  |||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||| ||||    
T  15464888 tgatataattgtatatgcaatacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgctatttt 15464977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 47
Target Start/End: Complemental strand, 15534389 - 15534343
Alignment:
Q  1 atatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatatt 47  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15534389 atatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatatt 15534343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 103 - 211
Target Start/End: Original strand, 39706299 - 39706408
Alignment:
Q  103 tgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatta 200  Q
    ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | ||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  39706299 tgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 39706397  T
Q  201 agatgttgatg 211  Q
    ||||| |||||    
T  39706398 agatgatgatg 39706408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 46
Target Start/End: Complemental strand, 14048785 - 14048740
Alignment:
Q  1 atatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 46  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14048785 atatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 14048740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 46
Target Start/End: Complemental strand, 36038078 - 36038033
Alignment:
Q  1 atatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 46  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36038078 atatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 36038033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 87 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 12774132 - 12774021
Alignment:
Q  87 ataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagt 184  Q
    |||||||||| |||||||| ||| ||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | |||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  12774132 ataattgagatgttgttga-ttgtattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 12774035  T
Q  185 cggtctaagttgat 198  Q
    ||||||||||||||    
T  12774034 cggtctaagttgat 12774021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 113 - 211
Target Start/End: Original strand, 14053323 - 14053421
Alignment:
Q  113 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgat 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||| || || || |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| || | |||||| ||||    
T  14053323 ttgatattattatgtcatgctgttt--gtatactgtctatgctgttgtttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagatgttgaagatgatgat 14053420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 98 - 197
Target Start/End: Original strand, 12288214 - 12288316
Alignment:
Q  98 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 193  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||| |||||  ||| ||| | ||||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12288214 gttgttgaattgcatttgatattgttatatcatgaactggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 12288312  T
Q  194 ttga 197  Q
    ||||    
T  12288313 ttga 12288316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 193
Target Start/End: Original strand, 46640393 - 46640558
Alignment:
Q  30 atttgatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 128  Q
    |||||||||||||| |  |||||||||| | |||||||||||| |||||||||| |||    |||||| ||| |||| || ||||||||||| |||| ||    
T  46640393 atttgatgttgttaatgatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatga--tgttgagatgttattgattttcatttgatattgttatatc 46640490  T
Q  129 atg--ctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 193  Q
    |||  ||| |||| ||||||| || |||||||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  46640491 atgaactg-ttttatatactgtctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 46640558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 4 - 46
Target Start/End: Original strand, 49547731 - 49547773
Alignment:
Q  4 tatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 46  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  49547731 tatgatgttttaagatgttgattatcatttgatgttgttatat 49547773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 46
Target Start/End: Original strand, 15497025 - 15497070
Alignment:
Q  1 atatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 46  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  15497025 atatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatat 15497070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 151 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 15551879 - 15551818
Alignment:
Q  151 tgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 211  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||| |||||    
T  15551879 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatg 15551818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 46
Target Start/End: Complemental strand, 19857652 - 19857607
Alignment:
Q  1 atatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 46  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  19857652 atatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatat 19857607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 193
Target Start/End: Original strand, 53082089 - 53082254
Alignment:
Q  30 atttgatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 128  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| | |||||||||||| |||||||||| || ||  |||||| ||| |||| |||| ||||||||| |||| ||    
T  53082089 atttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatc 53082186  T
Q  129 atg--ctgtttttgtatactgc-tgtgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 193  Q
    |||  ||| |||| | |||||| | |||||||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  53082187 atgaactg-ttttatgtactgcttatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 53082254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 60 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 6190616 - 6190481
Alignment:
Q  60 tatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacg-ttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgct 157  Q
    |||| |||||||||||| | ||  ||||||||||||| | |||||  ||| |||| |||||| |||||||||||| |||||| || |||| | |||||||    
T  6190616 tatacgcattacttgaagtttaaatgaataattgagatgattgttcgcttacatt-gatattgttatgtcatgctatttttgaatgctgcctatgttgct 6190518  T
Q  158 gtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 193  Q
    ||| | | |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6190517 gtttgatgtttaactaagctgcatgagtcggtctaag 6190481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 45
Target Start/End: Original strand, 52873132 - 52873176
Alignment:
Q  1 atatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttata 45  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  52873132 atatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttata 52873176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 17046549 - 17046488
Alignment:
Q  151 tgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 211  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| || | |||||| |||||    
T  17046549 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 17046488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 151 - 185
Target Start/End: Original strand, 11250621 - 11250655
Alignment:
Q  151 tgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtc 185  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  11250621 tgttgctgctgttatttaactaagttgcatgagtc 11250655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 151 - 185
Target Start/End: Original strand, 15353367 - 15353401
Alignment:
Q  151 tgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtc 185  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15353367 tgttgctgctgttatttaactaagttgcatgagtc 15353401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 154 - 212
Target Start/End: Original strand, 20157522 - 20157580
Alignment:
Q  154 tgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatga 212  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||  | |||||||||||||| | ||||||    
T  20157522 tgctattgttatttaactaatttgcatgagtctatataagttgattaagacgatgatga 20157580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 32 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 8846553 - 8846465
Alignment:
Q  32 ttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatatt 120  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||| |||||| |||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| ||||||    
T  8846553 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatatt 8846465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 8846418 - 8846370
Alignment:
Q  151 tgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 198  Q
    |||||||||| |||||||||||||| || || |||||||||||||||||    
T  8846418 tgttgctgtttgttatttaactaagctgaataagtcggtctaagttgat 8846370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0494 (Bit Score: 198; Significance: 1e-108; HSPs: 1)
Name: scaffold0494
Description:

Target: scaffold0494; HSP #1
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 12203 - 12420
Alignment:
Q  1 atatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12203 atatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattaaatgtgaataattgagacgtt 12302  T
Q  101 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatta 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  12303 gttgacttgcatttgatattattttgtcatgctgtttttgtattctgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcataagtcggtctaagttgatta 12402  T
Q  201 agatgttgatgatgatgt 218  Q
    ||||||||||||||||||    
T  12403 agatgttgatgatgatgt 12420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 198; Significance: 1e-108; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 10981 - 10772
Alignment:
Q  1 atatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10981 atatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttaaattatatgtgaataattgagacgtt 10882  T
Q  101 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatta 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10881 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 10782  T
Q  201 agatgttgat 210  Q
    ||||||||||    
T  10781 agatgttgat 10772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 198; Significance: 1e-108; HSPs: 91)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 13544233 - 13544016
Alignment:
Q  1 atatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13544233 atatatgatgttttaagatgttgattatcatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 13544134  T
Q  101 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatta 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13544133 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatattgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 13544034  T
Q  201 agatgttgatgatgatgt 218  Q
    |||||||||| |||||||    
T  13544033 agatgttgataatgatgt 13544016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 12567768 - 12567551
Alignment:
Q  1 atatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12567768 atatatgatgttttaagatgttgattatcatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 12567669  T
Q  101 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatta 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12567668 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatattgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 12567569  T
Q  201 agatgttgatgatgatgt 218  Q
    |||||||| | |||||||    
T  12567568 agatgttgtttatgatgt 12567551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 9707561 - 9707765
Alignment:
Q  1 atatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9707561 atatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 9707660  T
Q  101 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatta 200  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9707661 gttgacttgtatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 9707760  T
Q  201 agatg 205  Q
    |||||    
T  9707761 agatg 9707765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 16454235 - 16454439
Alignment:
Q  1 atatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16454235 atatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 16454334  T
Q  101 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatta 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16454335 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatta 16454434  T
Q  201 agatg 205  Q
    |||||    
T  16454435 agatg 16454439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 17463386 - 17463182
Alignment:
Q  1 atatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17463386 atatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 17463287  T
Q  101 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatta 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17463286 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 17463187  T
Q  201 agatg 205  Q
    |||||    
T  17463186 agatg 17463182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 45606861 - 45607065
Alignment:
Q  1 atatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45606861 atatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 45606960  T
Q  101 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatta 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  45606961 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 45607060  T
Q  201 agatg 205  Q
    |||||    
T  45607061 agatg 45607065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 7781301 - 7781505
Alignment:
Q  1 atatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7781301 atatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 7781400  T
Q  101 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatta 200  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7781401 gttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 7781500  T
Q  201 agatg 205  Q
    |||||    
T  7781501 agatg 7781505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 8899302 - 8899098
Alignment:
Q  1 atatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8899302 atatatgatgttttaagatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 8899203  T
Q  101 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatta 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  8899202 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaattgatta 8899103  T
Q  201 agatg 205  Q
    |||||    
T  8899102 agatg 8899098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 34159534 - 34159330
Alignment:
Q  1 atatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34159534 atatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 34159435  T
Q  101 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatta 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  34159434 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 34159335  T
Q  201 agatg 205  Q
    |||||    
T  34159334 agatg 34159330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 55476699 - 55476495
Alignment:
Q  1 atatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55476699 atatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 55476600  T
Q  101 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatta 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  55476599 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 55476500  T
Q  201 agatg 205  Q
    |||||    
T  55476499 agatg 55476495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 177; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 6469088 - 6469292
Alignment:
Q  1 atatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  6469088 atatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttcaattatatgtgactaattgagacgtt 6469187  T
Q  101 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatta 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  6469188 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 6469287  T
Q  201 agatg 205  Q
    |||||    
T  6469288 agatg 6469292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 177; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 10247677 - 10247881
Alignment:
Q  1 atatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10247677 atatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 10247776  T
Q  101 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatta 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  10247777 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgctgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgatta 10247876  T
Q  201 agatg 205  Q
    |||||    
T  10247877 agatg 10247881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 177; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 16282765 - 16282969
Alignment:
Q  1 atatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16282765 atatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 16282864  T
Q  101 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatta 200  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16282865 gttgacttgcattcaatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 16282964  T
Q  201 agatg 205  Q
    |||||    
T  16282965 agatg 16282969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 177; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 28848565 - 28848769
Alignment:
Q  1 atatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28848565 atatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatgtaattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 28848664  T
Q  101 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatta 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  28848665 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 28848764  T
Q  201 agatg 205  Q
    |||||    
T  28848765 agatg 28848769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 177; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 38961845 - 38962045
Alignment:
Q  1 atatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38961845 atatatgatgttttaagatgttggttattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 38961944  T
Q  101 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatta 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  38961945 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 38962044  T
Q  201 a 201  Q
    |    
T  38962045 a 38962045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 174; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 13151744 - 13151949
Alignment:
Q  1 atatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13151744 atatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 13151843  T
Q  101 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaact-aagttgcatgagtcggtctaagttgatt 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13151844 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgatt 13151943  T
Q  200 aagatg 205  Q
    ||||||    
T  13151944 aagatg 13151949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 174; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 13154209 - 13154414
Alignment:
Q  1 atatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13154209 atatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 13154308  T
Q  101 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaact-aagttgcatgagtcggtctaagttgatt 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13154309 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgatt 13154408  T
Q  200 aagatg 205  Q
    ||||||    
T  13154409 aagatg 13154414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 171; E-Value: 5e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 41124095 - 41123894
Alignment:
Q  1 atatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41124095 atatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 41123996  T
Q  101 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatta 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  41123995 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgt---tgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 41123899  T
Q  201 agatg 205  Q
    |||||    
T  41123898 agatg 41123894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 168; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 6 - 205
Target Start/End: Original strand, 17446614 - 17446812
Alignment:
Q  6 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 105  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17446614 tgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaatgatatgtgaataattgagacgttgttga 17446713  T
Q  106 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17446714 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc-gtctaagttgattaagatg 17446812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 17 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 50243014 - 50242830
Alignment:
Q  17 gatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttga 116  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  50243014 gatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttga 50242915  T
Q  117 tattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaa 201  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  50242914 tattattatgtcatgttgtttttgtatactactgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa 50242830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 30 - 205
Target Start/End: Original strand, 29172565 - 29172741
Alignment:
Q  30 atttgatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 128  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29172565 atttgatgttgatagtattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 29172664  T
Q  129 atgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29172665 atgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 29172741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 30 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 17672805 - 17672630
Alignment:
Q  30 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 129  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17672805 atttgatgatgttatattgtgatataattatatatgcattatttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtca 17672706  T
Q  130 tgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 205  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17672705 tgctgtttttgtatactgctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 17672630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 8499728 - 8499522
Alignment:
Q  1 atatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||| |    
T  8499728 atatatgatgttttaagatgttgattatcatttgatgttgtttatattgtgatataattgtatatgcattaattagattatctgtgaataattgagacat 8499629  T
Q  100 tg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 198  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8499628 tgattgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactactgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 8499529  T
Q  199 taagatg 205  Q
    |||||||    
T  8499528 taagatg 8499522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 15412639 - 15412433
Alignment:
Q  1 atatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgt 99  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||| | ||  ||||| ||||||||||||||||||    
T  15412639 atatatgaagttttaagatgttgattatcatttgatgttgtttatattgggatataattgtatatgcatcaattagattatctgtgaataattgagacgt 15412540  T
Q  100 tg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 198  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15412539 tgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactactgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 15412440  T
Q  199 taagatg 205  Q
    |||||||    
T  15412439 taagatg 15412433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 30 - 205
Target Start/End: Original strand, 12119707 - 12119883
Alignment:
Q  30 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  12119707 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattagattatctgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 12119806  T
Q  129 atgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12119807 atgctgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaacaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 12119883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 30 - 193
Target Start/End: Original strand, 53070636 - 53070799
Alignment:
Q  30 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 129  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  53070636 atttgatgttgttagattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtct 53070735  T
Q  130 tgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 193  Q
    || ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  53070736 tgttgtttttgtatactgttatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 53070799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 17 - 193
Target Start/End: Original strand, 43550448 - 43550625
Alignment:
Q  17 gatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttga 116  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43550448 gatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatacattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttga 43550547  T
Q  117 tattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 193  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||| | |||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  43550548 tattattatgtcatgttgtttttgcatactgcatatgttgctgtcattatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 43550625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 78 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 15977646 - 15977519
Alignment:
Q  78 tatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttg 177  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  15977646 tatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactattgtgttgctgttgttatttaactaagctg 15977547  T
Q  178 catgagtcggtctaagttgattaagatg 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15977546 catgagtcggtctaagttgattaagatg 15977519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 27165460 - 27165254
Alignment:
Q  1 atatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||| ||||| |||||||| |||||| ||||||  |    
T  27165460 atatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgtttatattgtgatataattgtatacgcaatacttaaattatatatgaatatttgagatat 27165361  T
Q  100 tgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttga 197  Q
    || ||||||||||||||||||  ||| ||||| || ||||| |||||| || | |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27165360 tgatgacttgcatttgatattggtatatcatgttg-ttttgcatactgtctatattgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 27165262  T
Q  198 ttaagatg 205  Q
    ||||||||    
T  27165261 ttaagatg 27165254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 47 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 14973020 - 14972855
Alignment:
Q  47 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 146  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||   || |||  ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14973020 tgtgatataatgttatatgcattacttgaattatgaatgtatatatgagatgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 14972921  T
Q  147 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 211  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  14972920 gcctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 14972855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 53301458 - 53301665
Alignment:
Q  1 atatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||| | | |||||||||||||| |||||| ||||||  |    
T  53301458 atatatgatgttttaagatgttgattaccattttatgttgtttatattgtgatataattgtatacgtaatacttgaattatatatgaatatttgagatat 53301557  T
Q  100 tgt-tgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttg 196  Q
    ||  |||||||||||||||||| |||| ||||| |||||| | |||||| || |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  53301558 tgaatgacttgcatttgatattgttatatcatgttgtttt-gcatactgtctatgttgctgtttgttatttaactaagttgtatgagtcggtctaagttg 53301656  T
Q  197 attaagatg 205  Q
    |||||||||    
T  53301657 attaagatg 53301665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 47 - 205
Target Start/End: Original strand, 40213676 - 40213834
Alignment:
Q  47 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 146  Q
    |||||||||||  |||| |||||||||| |||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  40213676 tgtgatataatgttatacgcattacttggattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttatgtatact 40213775  T
Q  147 gctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 205  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  40213776 gctgtgttgatgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgattaagatg 40213834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 98 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 55501053 - 55500946
Alignment:
Q  98 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttga 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  55501053 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 55500954  T
Q  198 ttaagatg 205  Q
    ||||||||    
T  55500953 ttaagatg 55500946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 67 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 36166739 - 36166602
Alignment:
Q  67 attacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatt 166  Q
    ||||||||||||||   || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  36166739 attacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgctgtgtcgctgttgttatt 36166641  T
Q  167 taactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 205  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36166640 taactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 36166602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 47 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 17488022 - 17487857
Alignment:
Q  47 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 146  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17488022 tgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 17487923  T
Q  147 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 211  Q
    | || | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  17487922 gtctattttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 17487857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 47 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 17499504 - 17499339
Alignment:
Q  47 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 146  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17499504 tgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 17499405  T
Q  147 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 211  Q
    | || | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  17499404 gtctattttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 17499339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 47 - 211
Target Start/End: Original strand, 25476340 - 25476505
Alignment:
Q  47 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 146  Q
    |||||||||||  |||  ||||||||||||||||   || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25476340 tgtgatataatgttatgcgcattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 25476439  T
Q  147 -gctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 211  Q
      |||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  25476440 acctgtgttgctgttgttttttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 25476505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 31 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 42386593 - 42386428
Alignment:
Q  31 tttgatgttg-ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 129  Q
    |||||||||| ||||  |||||||||||  |||||||||| ||||||||||   |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  42386593 tttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattgcttgaattatgaatgaatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattgttatgtca 42386494  T
Q  130 tgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagt 194  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  42386493 tgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaaactgcatgagtcggtctaagt 42386428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 32 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 43841114 - 43840940
Alignment:
Q  32 ttgatgttg-ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 130  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  43841114 ttgatgttgattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcat 43841015  T
Q  131 gctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 204  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  43841014 gctgtttttgtatactgtctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgatgaagat 43840940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 32 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 26687069 - 26686888
Alignment:
Q  32 ttgatgttg-ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 130  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||   ||||| || ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26687069 ttgatgttgattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatggaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcat 26686970  T
Q  131 gctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 211  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||| |||||    
T  26686969 gctgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgaagaagatgatgatg 26686888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 47 - 198
Target Start/End: Original strand, 14576788 - 14576939
Alignment:
Q  47 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 146  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  14576788 tgtgatataatgttatatgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgttgtt-tatact 14576886  T
Q  147 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 198  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14576887 gtctatgttgctgttgttatttaactaagttgaatgagtcggtctaagttgat 14576939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 67 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 21618590 - 21618459
Alignment:
Q  67 attacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatt 166  Q
    ||||||||||||||   || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||    
T  21618590 attacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgttgtgtcgctgttgttatt 21618492  T
Q  167 taactaagttgcatgagtcggtctaagttgatt 199  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21618491 taactaagctgcatgagtcggtctaagttgatt 21618459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 47 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 13442440 - 13442275
Alignment:
Q  47 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 146  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13442440 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 13442341  T
Q  147 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 211  Q
    | || |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  13442340 gcctatgttgccgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 13442275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 47 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 18438700 - 18438535
Alignment:
Q  47 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 146  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||  |||   || ||||   ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18438700 tgtgatataatgttatatgcattacttgagatatgaatgtataaaaaagatgttgttgacttgcatttgatattattatatcatgctgtttttgtatact 18438601  T
Q  147 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 211  Q
    | || |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  18438600 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 18438535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 47 - 211
Target Start/End: Original strand, 23083316 - 23083481
Alignment:
Q  47 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 146  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||| ||| || |  |||||| || ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23083316 tgtgatataatgttatgtgcattactagaagtaaaattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcattctgtttttgtatact 23083415  T
Q  147 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 211  Q
    | || ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  23083416 gcctatgttgctattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 23083481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 62 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 12399360 - 12399210
Alignment:
Q  62 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt 160  Q
    ||||||||||||||    ||| |||||| || ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||    
T  12399360 tatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcatttgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgtt 12399261  T
Q  161 gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 211  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||| |||||    
T  12399260 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatg 12399210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 62 - 211
Target Start/End: Original strand, 20698405 - 20698555
Alignment:
Q  62 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt 160  Q
    |||||||||||||||  |||| ||||||  | ||| |||| ||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  20698405 tatgcattacttgaagaatatttgaatatataagatgttgatgaattgcaattgatattattacgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt 20698504  T
Q  161 gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 211  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  20698505 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 20698555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 30 - 211
Target Start/End: Original strand, 24340660 - 24340843
Alignment:
Q  30 atttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 128  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||| || ||||||||||| ||    
T  24340660 atttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatatttgagatgttgtttacttgcgttcgatattattatatc 24340759  T
Q  129 atgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 211  Q
    ||| || || || ||||||| | |||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||| | | ||||||||||||    
T  24340760 atgatg-ttgtgcatactgcatatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatg 24340843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 106 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 10557088 - 10556989
Alignment:
Q  106 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10557088 cttgcatttgatattattatgtcatgccgtttttgtatgctgatgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 10556989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 47 - 205
Target Start/End: Original strand, 24153164 - 24153322
Alignment:
Q  47 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 146  Q
    |||||||| ||  ||| ||||||| ||||| ||||  |||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24153164 tgtgatattatgttatgtgcattatttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatact 24153262  T
Q  147 -gctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 205  Q
      || ||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24153263 acctatgttgctatcgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 24153322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 110 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 44494908 - 44494813
Alignment:
Q  110 catttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 205  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  44494908 catttgatattattatgttatgctgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcgatctaagttgattaagatg 44494813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 47 - 211
Target Start/End: Original strand, 11424718 - 11424879
Alignment:
Q  47 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 146  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || ||||||||||   |||||| ||||  |||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  11424718 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgcataattgaga---tgttgatttgctattgatattgttatgtcatgctgtttt-gtatact 11424813  T
Q  147 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 211  Q
    || | |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||| |||||    
T  11424814 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatg 11424879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 111 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 17737337 - 17737240
Alignment:
Q  111 atttgatattattatgtcatgctgtttttgta---tactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||   || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17737337 atttgatattattatgtcatgctgttgttgtagtatattgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 17737240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 30 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 23274871 - 23274705
Alignment:
Q  30 atttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 128  Q
    ||||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||| || ||||||||||| ||    
T  23274871 atttgatgttgtttataatgtgatgtaattgtatattctttacttgaattatatgtgaatatttgagatgttgtttacttgcgttcgatattattatatc 23274772  T
Q  129 atgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagt 194  Q
    ||| || ||||| |||||| || |||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23274771 atgatg-ttttgcatactgcctatgttgctgattgttaattaactaagttgcatgagtcagtctaagt 23274705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 66 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 14572735 - 14572603
Alignment:
Q  66 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttgtta 164  Q
    ||||| ||||| ||||  |||||| || ||| ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||    
T  14572735 cattatttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgactctcaattgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgtctatgttgctgttgtta 14572637  T
Q  165 tttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 198  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14572636 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 14572603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 32 - 193
Target Start/End: Original strand, 52523666 - 52523831
Alignment:
Q  32 ttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 130  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||    
T  52523666 ttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcat 52523765  T
Q  131 g--ctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 193  Q
    |  ||| ||||| |||||| || ||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  52523766 gaactg-ttttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 52523831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 30 - 211
Target Start/End: Original strand, 37642202 - 37642385
Alignment:
Q  30 atttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 128  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||| |||| | |  ||||||||||| ||    
T  37642202 atttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatc 37642301  T
Q  129 atgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttg-ttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 211  Q
    ||| |||||| | ||||||| | |||||||| |  |||  |||||||| |||||||||||||| |||| | | ||||||||||||    
T  37642302 atgatgtttt-gcatactgcctatgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtccaagtcgttgaagatgttgatg 37642385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 84 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 46822394 - 46822259
Alignment:
Q  84 tgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatga 182  Q
    |||||| || ||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||| || ||||  ||||  |||| | || |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  46822394 tgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatttttatgtcttgttgttgatgtaatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 46822295  T
Q  183 gtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgt 218  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  46822294 gtcagtctaagttgattaagatgttgataatgatgt 46822259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 32 - 131
Target Start/End: Original strand, 2051138 - 2051238
Alignment:
Q  32 ttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 130  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  |||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||    
T  2051138 ttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcat 2051237  T
Q  131 g 131  Q
    |    
T  2051238 g 2051238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 30 - 93
Target Start/End: Original strand, 17248224 - 17248287
Alignment:
Q  30 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattg 93  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17248224 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattatttgaattatatgtgaataattg 17248287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 84 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 30029968 - 30029834
Alignment:
Q  84 tgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatga 182  Q
    |||||| || ||||||||| || |||||  ||||||| ||||||||||||||| |||||  ||| || || |||| |||||||| |||||||||||||||    
T  30029968 tgaatatttaagacgttgt-gaattgcaaatgatattcttatgtcatgctgttgttgtaatctgtctatgctgctattgttattaaactaagttgcatga 30029870  T
Q  183 gtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgt 218  Q
    ||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  30029869 gtcagtctaagttgaatgagatgttgatgatgatgt 30029834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 98 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 12511172 - 12511051
Alignment:
Q  98 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttg 196  Q
    |||||||| ||||| |||||||| ||||||| || ||||  ||||  |||| | || |||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  12511172 gttgttgaattgcaattgatatttttatgtcttgttgttgatgtaatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtcattctaagttg 12511073  T
Q  197 attaagatgttgatgatgatgt 218  Q
    |||||||||||||| |||||||    
T  12511072 attaagatgttgataatgatgt 12511051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 41 - 138
Target Start/End: Original strand, 22147474 - 22147571
Alignment:
Q  41 ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt 138  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||| |||| | |  ||||||||||| ||||| ||||||    
T  22147474 ttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgatgtttt 22147571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 51 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 15471085 - 15470939
Alignment:
Q  51 atataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-t 149  Q
    |||||||| ||||| |||||| |||||||| | ||| |  |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  15471085 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tgtttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 15470988  T
Q  150 gtgttgctgt-tgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttga 197  Q
     ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15470987 atgttgctgtctgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 15470939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 87 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 32307802 - 32307681
Alignment:
Q  87 ataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagt 184  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | |||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  32307802 ataattgagatgttgttga-ttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 32307705  T
Q  185 cggtctaagttgattaagatgttg 208  Q
    |||||||||||||| | |||||||    
T  32307704 cggtctaagttgatgatgatgttg 32307681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 32 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 16097509 - 16097342
Alignment:
Q  32 ttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 130  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||| |||||| |||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| | ||    
T  16097509 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatgat 16097411  T
Q  131 gctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 198  Q
    | || ||| | ||| ||| | ||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16097410 gatgattt-gcatattgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 16097342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 32 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 16103960 - 16103794
Alignment:
Q  32 ttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 130  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||| |||||  |||||||| | ||| || |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||    
T  16103960 ttgatgttgtttataatgttatataattttatatacattaaatgaattatgtttga-tatttgagatgttgttga-ttgcattcgatattgttatatcat 16103863  T
Q  131 gctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 198  Q
    | || ||| | ||||||| | |||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16103862 gatgattt-gcatactgcctatgttgctgttcgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 16103794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 156 - 205
Target Start/End: Original strand, 45577947 - 45577996
Alignment:
Q  156 ctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 205  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45577947 ctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 45577996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 46
Target Start/End: Complemental strand, 54521030 - 54520985
Alignment:
Q  1 atatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 46  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54521030 atatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 54520985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 98 - 211
Target Start/End: Original strand, 13210333 - 13210447
Alignment:
Q  98 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagtt 195  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| || ||| | ||||||| | ||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13210333 gttgttgatttgcattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgctatttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 13210431  T
Q  196 gattaagatgttgatg 211  Q
    | | |||||| |||||    
T  13210432 gttgaagatgatgatg 13210447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 98 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 14234602 - 14234488
Alignment:
Q  98 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagtt 195  Q
    |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | |||||||| |||||||||||||||| ||||||| || |||||||||    
T  14234602 gttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgcttgttatttaactaagctgcatgaatcagtctaagtt 14234504  T
Q  196 gattaagatgttgatg 211  Q
    |||||||||| |||||    
T  14234503 gattaagatgatgatg 14234488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 151 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 28194752 - 28194697
Alignment:
Q  151 tgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 205  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28194752 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 28194697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 44
Target Start/End: Original strand, 29544796 - 29544839
Alignment:
Q  1 atatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttat 44  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29544796 atatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttat 29544839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 193
Target Start/End: Original strand, 37251105 - 37251270
Alignment:
Q  30 atttgatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 128  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| | |||||||||||| |||||||| | |||    |||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||    
T  37251105 atttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatttatgatg--ttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatc 37251202  T
Q  129 atg--ctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 193  Q
    |||  ||| |||| ||||||| || |||||||| |||||  ||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  37251203 atgaactg-ttttatatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgactcggtctaag 37251270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 98 - 198
Target Start/End: Original strand, 12174265 - 12174366
Alignment:
Q  98 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagtt 195  Q
    |||||||  ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12174265 gttgttgttttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 12174363  T
Q  196 gat 198  Q
    |||    
T  12174364 gat 12174366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 39
Target Start/End: Complemental strand, 12305353 - 12305315
Alignment:
Q  1 atatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgtt 39  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12305353 atatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgtt 12305315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 151 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 14665458 - 14665397
Alignment:
Q  151 tgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatga 212  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||  | |||| ||||||||||| ||||||    
T  14665458 tgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtctatataagatgattaagatgatgatga 14665397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 49 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 43926123 - 43925977
Alignment:
Q  49 tgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat--gctgtttttgtatact 146  Q
    |||||||| | |||||||||||| |||||| ||| ||| |  |||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||  |||| |||| | ||||    
T  43926123 tgatataaatgtatatgcattacatgaattgtatatga-tgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgagctg-ttttatgtact 43926026  T
Q  147 g-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 193  Q
    | || |||||||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  43926025 gcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 43925977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 151 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 856197 - 856143
Alignment:
Q  151 tgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 205  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||    
T  856197 tgttgctattgttattcaactaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatg 856143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 154 - 208
Target Start/End: Original strand, 3389999 - 3390053
Alignment:
Q  154 tgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttg 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||| ||| ||||||||||    
T  3389999 tgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcattataagatgaataagatgttg 3390053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 154 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 14668611 - 14668553
Alignment:
Q  154 tgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatga 212  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||  | |||| ||||||||||| ||||||    
T  14668611 tgctattgttatttaactaagttgcatgagtctatataagatgattaagatgatgatga 14668553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 151 - 205
Target Start/End: Original strand, 23077537 - 23077591
Alignment:
Q  151 tgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 205  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||  | |||| |||||||||||    
T  23077537 tgttgctgttgttatttaaccaagttgcatgagtctatataagatgattaagatg 23077591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 46
Target Start/End: Complemental strand, 15977741 - 15977696
Alignment:
Q  1 atatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 46  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||    
T  15977741 atatatgatgttttaagatgttggttattatttgatgttgttatat 15977696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 107 - 198
Target Start/End: Original strand, 49668091 - 49668183
Alignment:
Q  107 ttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 198  Q
    ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  49668091 ttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgat 49668183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 154 - 205
Target Start/End: Original strand, 15878114 - 15878165
Alignment:
Q  154 tgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 205  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||| ||||||    
T  15878114 tgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatg 15878165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 154 - 208
Target Start/End: Original strand, 3403019 - 3403073
Alignment:
Q  154 tgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttg 208  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||  | |||| ||| ||||||||||    
T  3403019 tgctattgttatttaactaagttgcatgagtcattataagatgaataagatgttg 3403073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 107 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 9513026 - 9512934
Alignment:
Q  107 ttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 198  Q
    ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | |||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  9513026 ttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgat 9512934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 107 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 9521001 - 9520909
Alignment:
Q  107 ttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 198  Q
    ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | |||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  9521001 ttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgat 9520909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 160 - 205
Target Start/End: Original strand, 26196500 - 26196545
Alignment:
Q  160 tgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||||||    
T  26196500 tgttatttaactaagttgcatgagtctatataagatgattaagatg 26196545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 13919390 - 13919350
Alignment:
Q  151 tgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtcta 191  Q
    |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||    
T  13919390 tgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcggtcta 13919350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 37
Target Start/End: Complemental strand, 15977699 - 15977663
Alignment:
Q  1 atatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatg 37  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  15977699 atatatgatgttttaagatgttgattattatttgatg 15977663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 198; Significance: 1e-108; HSPs: 51)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 21840975 - 21840766
Alignment:
Q  1 atatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21840975 atatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttaaattatatgtgaataattgagacgtt 21840876  T
Q  101 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatta 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21840875 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 21840776  T
Q  201 agatgttgat 210  Q
    ||||||||||    
T  21840775 agatgttgat 21840766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 23593688 - 23593893
Alignment:
Q  1 atatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23593688 atatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgtttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgt 23593787  T
Q  100 tgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23593788 tgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatt 23593887  T
Q  200 aagatg 205  Q
    ||||||    
T  23593888 aagatg 23593893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 16362126 - 16361908
Alignment:
Q  1 atatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16362126 atatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgtttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatttgtgaataattgagacgt 16362027  T
Q  100 tgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16362026 tgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttatatactgttgtgttgctgtcgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatt 16361927  T
Q  200 aagatgttgatgatgatgt 218  Q
    |||||||||||||||||||    
T  16361926 aagatgttgatgatgatgt 16361908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 13989074 - 13988870
Alignment:
Q  1 atatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13989074 atatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 13988975  T
Q  101 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatta 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13988974 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 13988875  T
Q  201 agatg 205  Q
    |||||    
T  13988874 agatg 13988870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 21923245 - 21923449
Alignment:
Q  1 atatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21923245 atatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 21923344  T
Q  101 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatta 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21923345 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 21923444  T
Q  201 agatg 205  Q
    |||||    
T  21923445 agatg 21923449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 21475041 - 21475245
Alignment:
Q  1 atatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21475041 atatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 21475140  T
Q  101 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatta 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  21475141 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatta 21475240  T
Q  201 agatg 205  Q
    |||||    
T  21475241 agatg 21475245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 177; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 29776896 - 29776692
Alignment:
Q  1 atatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29776896 atatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 29776797  T
Q  101 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatta 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  29776796 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgttatttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 29776697  T
Q  201 agatg 205  Q
    |||||    
T  29776696 agatg 29776692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 173; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 29298344 - 29298141
Alignment:
Q  1 atatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29298344 atatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttattatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 29298245  T
Q  101 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatta 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  29298244 gttgacttgcatttgatattattat-tcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 29298146  T
Q  201 agatg 205  Q
    |||||    
T  29298145 agatg 29298141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 169; E-Value: 8e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 31612521 - 31612317
Alignment:
Q  1 atatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  31612521 atatatgatgttttaagatattgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataactgagatgtt 31612422  T
Q  101 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatta 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  31612421 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactattgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 31612322  T
Q  201 agatg 205  Q
    |||||    
T  31612321 agatg 31612317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 22123021 - 22123226
Alignment:
Q  1 atatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  22123021 atatatgatgttttaagatattgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattaaatgtgaataattgagacatt 22123120  T
Q  101 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatt 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  22123121 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgtgttgctgtttgctatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtagatt 22123220  T
Q  200 aagatg 205  Q
    ||||||    
T  22123221 aagatg 22123226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 146; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 16275317 - 16275522
Alignment:
Q  1 atatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 100  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16275317 atatatgatgtttcaagatattgattattatttgatgttgttatattgtgatataatggtatatgcattaattgaattttatgtgaataattgagacgtt 16275416  T
Q  101 g-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatt 199  Q
    | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16275417 gattgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctatgtcgttgttgttatttaactaagttgtatgagtcggtctaagttgatt 16275516  T
Q  200 aagatg 205  Q
    ||||||    
T  16275517 aagatg 16275522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 15859962 - 15860167
Alignment:
Q  1 atatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  ||||||||| ||||| ||||| |||||||    
T  15859962 atatatgatgtcttaagatgttgattaccatctgatgttgttatattgtgatataattgtatgtgcattgattgaattatttgtgagtaattaagacgtt 15860061  T
Q  101 g-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatt 199  Q
    | ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  15860062 gattgacttgcatttaatattattatgtcatgttgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgatt 15860161  T
Q  200 aagatg 205  Q
    ||||||    
T  15860162 aagatg 15860167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 30 - 211
Target Start/End: Original strand, 13212844 - 13213026
Alignment:
Q  30 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  13212844 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 13212943  T
Q  129 atgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 211  Q
    ||| ||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13212944 atgttgtttttgtatactgttgcgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatg 13213026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 30 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 21347141 - 21346965
Alignment:
Q  30 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21347141 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 21347042  T
Q  129 atgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 205  Q
    ||| |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21347041 atgttgtttttgtatactgctgtgtctttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 21346965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 134; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 17 - 193
Target Start/End: Original strand, 45574812 - 45574989
Alignment:
Q  17 gatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttga 116  Q
    |||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  45574812 gatgttgattatgatttgatgttcttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgttaataattgagacgttgttgacttgcatttgg 45574911  T
Q  117 tattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 193  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  45574912 tattattatgtcatgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 45574989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 30 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 21342276 - 21342100
Alignment:
Q  30 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 128  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21342276 atttgatgttgttatattgtgatgtaattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 21342177  T
Q  129 atgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 205  Q
    ||| |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21342176 atgttgtttttgtatactgctgtgtctttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 21342100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 30 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 21707346 - 21707171
Alignment:
Q  30 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 129  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21707346 atttgatgatgttatattgtgatataattgtataggcattacatgatttatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattctgtca 21707247  T
Q  130 tgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 205  Q
    |||| ||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21707246 tgctttttttgtatactattgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 21707171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 30 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 21711888 - 21711713
Alignment:
Q  30 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 129  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21711888 atttgatgatgttatattgtgatataattgtataggcattacatgatttatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattctgtca 21711789  T
Q  130 tgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 205  Q
    |||| ||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21711788 tgctttttttgtatactattgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 21711713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 35 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 40389329 - 40389158
Alignment:
Q  35 atgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgct 133  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40389329 atgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgatgattgacttgcatttgatattattatgtcatgct 40389230  T
Q  134 gtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 205  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  40389229 gtttttgtatactgatgtgtcgctgttgttatttaaccaagttgcatgagtcagtctaggttgattaagatg 40389158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 30 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 433190 - 433016
Alignment:
Q  30 atttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 128  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  433190 atttgatgttgtttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 433091  T
Q  129 atgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 205  Q
     || ||||||||||||||| |||||||||    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  433090 ttgatgtttttgtatactgcctgtgttgc---cgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 433016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 47 - 214
Target Start/End: Original strand, 50210168 - 50210336
Alignment:
Q  47 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 146  Q
    |||||||||||  || | ||||||||||||||||   || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  50210168 tgtgatataatgttaaacgcattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 50210267  T
Q  147 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatg 214  Q
    | || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  50210268 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgatg 50210336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 47 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 34509946 - 34509787
Alignment:
Q  47 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 146  Q
    |||||||||||  |||| |||||||||||  |||   || |||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  34509946 tgtgatataatgttataagcattacttgagatatgaatgtataattaagatgttgttgacttgcatttgatatcattatgtcatgctgtttttgtatact 34509847  T
Q  147 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 205  Q
    | || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  34509846 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 34509787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 47 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 22532435 - 22532270
Alignment:
Q  47 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 146  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||||||   |||||| || ||| |||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22532435 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaattatgaatgaatatttaagatgttgttgaattgcaatggatattattatgtcatgctgtttttgtatact 22532336  T
Q  147 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 211  Q
    | || ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||    
T  22532335 gcctatgttgctgttgttatttaactaaattgcatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatg 22532270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 47 - 211
Target Start/End: Original strand, 27250684 - 27250849
Alignment:
Q  47 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 146  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||||| |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27250684 tgtgatataatgttttatgcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 27250783  T
Q  147 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 211  Q
    | || ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||| |||||    
T  27250784 gcctatgttgctattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatg 27250849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 47 - 218
Target Start/End: Original strand, 22468651 - 22468823
Alignment:
Q  47 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 146  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||  |||   ||||||||| ||| |||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||  ||    
T  22468651 tgtgatataatgttatgtgcattacttgagatattattgaataattaagatgttgttgaattgcaattgatattatgatgtcatgctgttgttgtaatct 22468750  T
Q  147 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgt 218  Q
    || | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22468751 gcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatgaagatgt 22468823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 30 - 193
Target Start/End: Original strand, 21896193 - 21896358
Alignment:
Q  30 atttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 128  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| |||||| |||||||||| |||||  |||||| |||| |||||||||||||||||| |||| ||    
T  21896193 atttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacatgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatc 21896292  T
Q  129 atgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 193  Q
    |||||| |||||||||||| || |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21896293 atgctg-ttttgtatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaag 21896358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 49 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 20135351 - 20135181
Alignment:
Q  49 tgatataattatatatgcattacttgaa-ttatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 147  Q
    |||||||||  | ||||||||||||||| || ||| |||||| || ||| |||||||| |||||  |||||||||||||||||| |||| |||||  |||    
T  20135351 tgatataatgttgtatgcattacttgaagttttat-tgaatacttaagatgttgttgaattgcacatgatattattatgtcatgatgttgttgtaatctg 20135253  T
Q  148 c-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgt 218  Q
    | | || |||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20135252 cctatgctgctattgttgtttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatgatgatgt 20135181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 33 - 193
Target Start/End: Original strand, 21861510 - 21861672
Alignment:
Q  33 tgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg 131  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||  |||||| |||| |||||||||||||||||| |||| |||||    
T  21861510 tgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatg 21861609  T
Q  132 ctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 193  Q
    ||| ||||| |||||| || |||||||| |||||  ||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  21861610 ctg-ttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattagctaagctgcatgagtcggtctaag 21861672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 47 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 21026846 - 21026696
Alignment:
Q  47 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 146  Q
    |||||||||||  | ||||||||||||||    ||| |||||| || ||| |||||||| ||||| |||||||  ||| ||||||||| |||||||||||    
T  21026846 tgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatatttacgtcatgctgattttgtatact 21026747  T
Q  147 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttg 196  Q
    || | | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21026746 gcctatattgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 21026696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 41 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 16758822 - 16758664
Alignment:
Q  41 ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg--ctgtttt 138  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || |||||||  ||| |||||||||| |||| |||||  ||| |||    
T  16758822 ttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatg-ttgtgatgttgttgtattgtatttgatattgttatatcatgaactggttt 16758724  T
Q  139 tgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttga 197  Q
     | ||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16758723 -gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttga 16758664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 30 - 193
Target Start/End: Original strand, 35261018 - 35261180
Alignment:
Q  30 atttgatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 128  Q
    |||||||||||||| || |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | |||||  ||||||   |||||| |||||||||||||| |||| ||    
T  35261018 atttgatgttgttaataatgtgatgtaattgtatatgcattacttgaattatgtatgaatgtttgaga---tgttgatttgcatttgatattgttatatc 35261114  T
Q  129 atgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 193  Q
    |||||| ||||| |||||| || |||||||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  35261115 atgctg-ttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 35261180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 151 - 218
Target Start/End: Original strand, 20454613 - 20454680
Alignment:
Q  151 tgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgt 218  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20454613 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgataatgt 20454680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 111 - 211
Target Start/End: Original strand, 20847173 - 20847274
Alignment:
Q  111 atttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttga 209  Q
    |||||||||  ||||||||||||| |||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||| |||    
T  20847173 atttgatatatttatgtcatgctgattttgtgtactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 20847272  T
Q  210 tg 211  Q
    ||    
T  20847273 tg 20847274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 32 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 33681188 - 33681022
Alignment:
Q  32 ttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 130  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||| |||||| |||||||| | ||| || |||||| ||||  |||||||||| |||||| |||| ||||    
T  33681188 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgacgacttgcattcgatattgttatatcat 33681090  T
Q  131 gctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttga 197  Q
    | || ||| | ||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33681089 gatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttga 33681022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 87 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 21754170 - 21754049
Alignment:
Q  87 ataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagt 184  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | ||||| |||| |||||||||||||| |||||||||    
T  21754170 ataattgagatgttgttga-ttgcatttgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagt 21754073  T
Q  185 cggtctaagttgattaagatgttg 208  Q
    |||||||||||||| | |||||||    
T  21754072 cggtctaagttgatgatgatgttg 21754049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 30 - 193
Target Start/End: Original strand, 41049973 - 41050138
Alignment:
Q  30 atttgatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 128  Q
    |||||| ||||||| || ||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||    |||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||    
T  41049973 atttgacgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacttgaattatatatga--tgttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatc 41050070  T
Q  129 atgctgt-ttttgtatactg-ctgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 193  Q
    |||   | |||| ||||||| || |||||||||| |||   |||||||| ||||||||||||||||||    
T  41050071 atgaactattttatatactgcctatgttgctgttcgtttagtaactaagctgcatgagtcggtctaag 41050138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 192
Target Start/End: Original strand, 14295493 - 14295652
Alignment:
Q  30 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 129  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| ||||||||||| |||    
T  14295493 atttgatgttgttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctga-taattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatca 14295588  T
Q  130 tgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaa 192  Q
    || || ||| | ||||| | | |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14295589 tgatggttt-gcatactacctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 14295652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 51 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 22237788 - 22237642
Alignment:
Q  51 atataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-t 149  Q
    |||||||| ||||| |||||| |||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||| ||| |    
T  22237788 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcataatgcct 22237691  T
Q  150 gtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttga 197  Q
     ||| |||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  22237690 atgtcgctgtttgttatttaactaagcttcatgagtcggtctaagttga 22237642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 98 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 20248394 - 20248293
Alignment:
Q  98 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagtt 195  Q
    |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20248394 gttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttttttaactaagttgcatgagtcggtctaagtt 20248296  T
Q  196 gat 198  Q
    |||    
T  20248295 gat 20248293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 32 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 20918782 - 20918620
Alignment:
Q  32 ttgatgttg-ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 130  Q
    ||||||||| ||||| ||| |||||||| ||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| ||||||||||| ||||    
T  20918782 ttgatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcat 20918687  T
Q  131 gctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttg 196  Q
    | || ||| | ||||||| | |||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20918686 gatggttt-gcatactgcctatgttgcagtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 20918620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 47 - 136
Target Start/End: Original strand, 22354527 - 22354616
Alignment:
Q  47 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtt 136  Q
    |||||||||||  ||||| |||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  22354527 tgtgatataatgttatatacattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatatttttatgtcatgctgtt 22354616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 91 - 198
Target Start/End: Original strand, 22921868 - 22921976
Alignment:
Q  91 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggt 188  Q
    |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | ||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  22921868 ttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 22921966  T
Q  189 ctaagttgat 198  Q
    ||||| ||||    
T  22921967 ctaagatgat 22921976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 46
Target Start/End: Complemental strand, 43543259 - 43543214
Alignment:
Q  1 atatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 46  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  43543259 atatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatat 43543214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 154 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 21714600 - 21714549
Alignment:
Q  154 tgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 205  Q
    |||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21714600 tgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatcaagatg 21714549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 154 - 212
Target Start/End: Original strand, 24783155 - 24783213
Alignment:
Q  154 tgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatga 212  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||| ||||||||||| ||||||    
T  24783155 tgctattgttatttaactaagttgcatgagtctgaataagatgattaagatgatgatga 24783213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 34 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 50686792 - 50686695
Alignment:
Q  34 gatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg 131  Q
    |||||||||| || |||||||||| | |||||||||||| |||||||||| || ||  |||||| |||||||| |||||||||| ||| |||| |||||    
T  50686792 gatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttgttgatttgcatttgacattgttatatcatg 50686695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 159 - 197
Target Start/End: Original strand, 52928038 - 52928076
Alignment:
Q  159 ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttga 197  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  52928038 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 52928076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 41 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 12271725 - 12271642
Alignment:
Q  41 ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattat 125  Q
    ||||| |||||||||||| |||||  ||||||| | ||||| || |||| |||||| |||| |||||||||||||||||| ||||    
T  12271725 ttataatgtgatataattgtatatatattactttagttatacgtaaata-ttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttat 12271642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 137 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 21161792 - 21161730
Alignment:
Q  137 tttgtatactgctgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 198  Q
    |||| |||||| | |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  21161792 tttgcatactgttttgttgctgtttgttgtttaactaagttgcatgagtcgatccaagttgat 21161730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 151 - 205
Target Start/End: Original strand, 42865273 - 42865327
Alignment:
Q  151 tgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 205  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| | |||| |||| ||||||    
T  42865273 tgttgctattgttatttaactatgttgcatgagtcgatataagatgatcaagatg 42865327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 81
Target Start/End: Original strand, 16368224 - 16368276
Alignment:
Q  30 atttgatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaattata 81  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| | |||||||||||| |||||||||    
T  16368224 atttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattata 16368276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 6 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 11491 - 11279
Alignment:
Q  6 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  11491 tgatgttttaagatgttgattaccatttgattttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttga 11392  T
Q  106 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  11391 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaatttgattaagatg 11292  T
Q  206 ttgatgatgatgt 218  Q
    |||||||| ||||    
T  11291 ttgatgataatgt 11279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 7)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Original strand, 17394 - 17600
Alignment:
Q  1 atatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17394 atatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatactgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 17493  T
Q  101 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatta 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17494 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 17593  T
Q  201 agatgtt 207  Q
    |||||||    
T  17594 agatgtt 17600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 94619 - 94415
Alignment:
Q  1 atatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  94619 atatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 94520  T
Q  101 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatta 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  94519 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 94420  T
Q  201 agatg 205  Q
    |||||    
T  94419 agatg 94415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 50 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 44614 - 44458
Alignment:
Q  50 gatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgt-ttttgtatactgc 148  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  44614 gatataattctatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttttgtatactgt 44515  T
Q  149 tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44514 tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 44458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 51 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 100534 - 100388
Alignment:
Q  51 atataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-t 149  Q
    |||||||| ||||| |||||  ||||||||  || |||| |||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  100534 atataattgtatatacattatatgaattat--gttaatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattattatatcatgatgattt-gcatactgcct 100438  T
Q  150 gtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 198  Q
     |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  100437 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 100388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #5
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 151 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 119937 - 119876
Alignment:
Q  151 tgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 211  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||| |||||    
T  119937 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatg 119876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #6
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 51 - 198
Target Start/End: Original strand, 40135 - 40281
Alignment:
Q  51 atataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-t 149  Q
    |||||||| ||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| |  |||||| |    
T  40135 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcctactgcct 40231  T
Q  150 gtgttgctgttg-ttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 198  Q
     ||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  40232 atgttgctgtttattatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgat 40281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #7
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 154 - 205
Target Start/End: Original strand, 38542 - 38593
Alignment:
Q  154 tgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 205  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||||||    
T  38542 tgctattgttatttaactaagttgcatgagtcaatataagatgattaagatg 38593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 3)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 501292 - 501075
Alignment:
Q  1 atatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  501292 atatataatgttttaagatgttgattactatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 501193  T
Q  101 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatta 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  501192 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatattgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 501093  T
Q  201 agatgttgatgatgatgt 218  Q
    |||||||| |||| ||||    
T  501092 agatgttgttgattatgt 501075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 30 - 205
Target Start/End: Original strand, 85562 - 85738
Alignment:
Q  30 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  85562 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattcagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 85661  T
Q  129 atgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 205  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  85662 atgctgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgattaagatg 85738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 32 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 160864 - 160698
Alignment:
Q  32 ttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 130  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||| |||||  ||||| ||| |||| | ||| || |||| | |||||||| |||||||||||||| |||| ||||    
T  160864 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatatattacatgacttatgtttga-tatttgacatgttgttga-ttgcatttgatattgttatatcat 160767  T
Q  131 gctgtttttgtatactgc-tgtgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 198  Q
    | || ||| | ||||||| | |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  160766 gatgattt-gcatactgcctatgttgctgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 160698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0716 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 1)
Name: scaffold0716
Description:

Target: scaffold0716; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 4902 - 4698
Alignment:
Q  1 atatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4902 atatatgttgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 4803  T
Q  101 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatta 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4802 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 4703  T
Q  201 agatg 205  Q
     ||||    
T  4702 ggatg 4698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0363 (Bit Score: 186; Significance: 1e-101; HSPs: 1)
Name: scaffold0363
Description:

Target: scaffold0363; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 9450 - 9241
Alignment:
Q  1 atatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9450 atatttgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttaaattatatgtgaataattgagacgtt 9351  T
Q  101 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatta 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9350 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttatatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 9251  T
Q  201 agatgttgat 210  Q
    ||||||||||    
T  9250 agatgttgat 9241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 20955 - 20751
Alignment:
Q  1 atatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20955 atatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 20856  T
Q  101 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatta 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20855 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 20756  T
Q  201 agatg 205  Q
    |||||    
T  20755 agatg 20751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 1)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 38029 - 37825
Alignment:
Q  1 atatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38029 atatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 37930  T
Q  101 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatta 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  37929 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 37830  T
Q  201 agatg 205  Q
    |||||    
T  37829 agatg 37825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 86)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 456529 - 456325
Alignment:
Q  1 atatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  456529 atatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 456430  T
Q  101 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatta 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  456429 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 456330  T
Q  201 agatg 205  Q
    |||||    
T  456329 agatg 456325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 11393241 - 11393445
Alignment:
Q  1 atatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11393241 atatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 11393340  T
Q  101 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatta 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11393341 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 11393440  T
Q  201 agatg 205  Q
    |||||    
T  11393441 agatg 11393445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 15376667 - 15376871
Alignment:
Q  1 atatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15376667 atatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 15376766  T
Q  101 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatta 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15376767 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 15376866  T
Q  201 agatg 205  Q
    |||||    
T  15376867 agatg 15376871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 16232728 - 16232524
Alignment:
Q  1 atatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16232728 atatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 16232629  T
Q  101 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatta 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16232628 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 16232529  T
Q  201 agatg 205  Q
    |||||    
T  16232528 agatg 16232524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 20385077 - 20385281
Alignment:
Q  1 atatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20385077 atatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 20385176  T
Q  101 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatta 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20385177 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 20385276  T
Q  201 agatg 205  Q
    |||||    
T  20385277 agatg 20385281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 21189549 - 21189753
Alignment:
Q  1 atatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21189549 atatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 21189648  T
Q  101 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatta 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21189649 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 21189748  T
Q  201 agatg 205  Q
    |||||    
T  21189749 agatg 21189753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 32125699 - 32125495
Alignment:
Q  1 atatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32125699 atatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 32125600  T
Q  101 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatta 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  32125599 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 32125500  T
Q  201 agatg 205  Q
    |||||    
T  32125499 agatg 32125495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 41523125 - 41522921
Alignment:
Q  1 atatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41523125 atatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 41523026  T
Q  101 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatta 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  41523025 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 41522926  T
Q  201 agatg 205  Q
    |||||    
T  41522925 agatg 41522921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 41525587 - 41525383
Alignment:
Q  1 atatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41525587 atatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 41525488  T
Q  101 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatta 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  41525487 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 41525388  T
Q  201 agatg 205  Q
    |||||    
T  41525387 agatg 41525383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 11972704 - 11972500
Alignment:
Q  1 atatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11972704 atatatgatgttttaagatattgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 11972605  T
Q  101 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatta 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11972604 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 11972505  T
Q  201 agatg 205  Q
    |||||    
T  11972504 agatg 11972500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 14949076 - 14949280
Alignment:
Q  1 atatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14949076 atatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 14949175  T
Q  101 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatta 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14949176 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 14949275  T
Q  201 agatg 205  Q
    |||||    
T  14949276 agatg 14949280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 18640480 - 18640276
Alignment:
Q  1 atatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18640480 atatatgatgttttaagatgttgattattattttatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 18640381  T
Q  101 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatta 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18640380 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 18640281  T
Q  201 agatg 205  Q
    |||||    
T  18640280 agatg 18640276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 24702446 - 24702242
Alignment:
Q  1 atatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24702446 atatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 24702347  T
Q  101 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatta 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24702346 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 24702247  T
Q  201 agatg 205  Q
    |||||    
T  24702246 agatg 24702242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 27217068 - 27216864
Alignment:
Q  1 atatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27217068 atatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 27216969  T
Q  101 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatta 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  27216968 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatta 27216869  T
Q  201 agatg 205  Q
    |||||    
T  27216868 agatg 27216864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 177; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 16213892 - 16213688
Alignment:
Q  1 atatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 100  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16213892 atatatgatgttttcatatgttgattaccatttgatgttgttatgttgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattaagacgtt 16213793  T
Q  101 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatta 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16213792 gttgacttggatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 16213693  T
Q  201 agatg 205  Q
    |||||    
T  16213692 agatg 16213688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 173; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 16410267 - 16410063
Alignment:
Q  1 atatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| | |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16410267 atatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactatgatataattgtatatgtattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 16410168  T
Q  101 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatta 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16410167 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 16410068  T
Q  201 agatg 205  Q
    |||||    
T  16410067 agatg 16410063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 171; E-Value: 5e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 18430920 - 18430710
Alignment:
Q  1 atatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18430920 atatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagatgtt 18430821  T
Q  101 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatta 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18430820 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttatatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 18430721  T
Q  201 agatgttgatg 211  Q
    ||||| |||||    
T  18430720 agatgatgatg 18430710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 24704893 - 24704692
Alignment:
Q  1 atatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24704893 atatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 24704794  T
Q  101 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatta 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24704793 gttgacttgcatttgatattattatgtc---ttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 24704697  T
Q  201 agatg 205  Q
    |||||    
T  24704696 agatg 24704692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 30 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 44116688 - 44116513
Alignment:
Q  30 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44116688 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattgcttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 44116589  T
Q  130 tgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 205  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44116588 tgttgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 44116513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 31 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 3386511 - 3386337
Alignment:
Q  31 tttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 130  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3386511 tttgatgatgttatattgtgatataattgtatatgtattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattatcatgtcat 3386412  T
Q  131 gctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 205  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3386411 gctgtttttgtatactattgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 3386337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 60 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 24275320 - 24275162
Alignment:
Q  60 tatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgt 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24275320 tatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgt 24275221  T
Q  160 tgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgt 218  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  24275220 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgttgattatgt 24275162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 146; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 17 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 13647521 - 13647344
Alignment:
Q  17 gatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttga 116  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13647521 gatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttga 13647422  T
Q  117 tattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 193  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13647421 tattattatgtcatgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 13647344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 13869556 - 13869350
Alignment:
Q  1 atatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||| | ||  ||||| | ||||||||||||||||    
T  13869556 atatatgatgttttaagatgttgattatcatttgatgttgtttatattgggatataattgtatatgcatcaattagattatctttgaataattgagacgt 13869457  T
Q  100 tg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 198  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13869456 tgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactactgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 13869357  T
Q  199 taagatg 205  Q
    |||||||    
T  13869356 taagatg 13869350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 30 - 205
Target Start/End: Original strand, 17061898 - 17062073
Alignment:
Q  30 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17061898 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgttaataattgagacgttgctgacttgcatttgatattattatgtca 17061997  T
Q  130 tgctgtttttgtatactgctgtgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 205  Q
    ||||  ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17061998 tgct-attttgtatactgctgagttgctgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 17062073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 26355937 - 26356152
Alignment:
Q  1 atatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26355937 atatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 26356036  T
Q  101 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgtt-----------gctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtc 189  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||           | |||||||||||||||  | |||||||||| |||    
T  26356037 gttgacttgcatttgatattattatgttatgctgtttttgtatactgttgtgtttatgttgtgttgttgttgttatttaactttgctgcatgagtcagtc 26356136  T
Q  190 taagttgattaagatg 205  Q
    ||| ||||||||||||    
T  26356137 taaattgattaagatg 26356152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 26358389 - 26358604
Alignment:
Q  1 atatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26358389 atatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 26358488  T
Q  101 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgtt-----------gctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtc 189  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||           | |||||||||||||||  | |||||||||| |||    
T  26358489 gttgacttgcatttgatattattatgttatgctgtttttgtatactgttgtgtttatgttgtgttgttgttgttatttaactttgctgcatgagtcagtc 26358588  T
Q  190 taagttgattaagatg 205  Q
    ||| ||||||||||||    
T  26358589 taaattgattaagatg 26358604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 32 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 20110723 - 20110560
Alignment:
Q  32 ttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20110723 ttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttattgacttgcatttgatattattatgtcatg 20110624  T
Q  132 ctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 205  Q
    |||||||||||||          |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20110623 ctgtttttgtata----------gctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 20110560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 30 - 205
Target Start/End: Original strand, 38898359 - 38898535
Alignment:
Q  30 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 128  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  38898359 atttgacgttgttatactgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagatgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 38898458  T
Q  129 atgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 205  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  38898459 atgctgtttttatatactgctgtgtcgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgattaagatg 38898535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 30 - 193
Target Start/End: Original strand, 12756654 - 12756817
Alignment:
Q  30 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12756654 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattttatgtgaataattgagacgttgtttacttgcatttgatattattatgtca 12756753  T
Q  130 tgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 193  Q
    || |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||  |||  |||||||||||||    
T  12756754 tgttgtttttgtatattgttgtgttgctgttgttatttaactaaactgctcgagtcggtctaag 12756817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 90 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 48273512 - 48273396
Alignment:
Q  90 attgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggt 188  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  48273512 attgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcataagtcggt 48273413  T
Q  189 ctaagttgattaagatg 205  Q
    |||||||||||||||||    
T  48273412 ctaagttgattaagatg 48273396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 47 - 205
Target Start/End: Original strand, 3564319 - 3564478
Alignment:
Q  47 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 146  Q
    |||||| ||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3564319 tgtgatctaatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 3564418  T
Q  147 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 205  Q
    | || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3564419 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 3564478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 83 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 13831499 - 13831377
Alignment:
Q  83 gtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatga 182  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  13831499 gtgaataattgagacgttgttgacttgcattttatattattatgtcatgttgtttttgtatactaccgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatga 13831400  T
Q  183 gtcggtctaagttgattaagatg 205  Q
    |||||||||| ||||||||||||    
T  13831399 gtcggtctaaattgattaagatg 13831377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 47 - 205
Target Start/End: Original strand, 18456368 - 18456526
Alignment:
Q  47 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 146  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  18456368 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttg-ttttgtatact 18456466  T
Q  147 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 205  Q
    | || ||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18456467 gcctatgttgctatcgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 18456526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 47 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 12698998 - 12698832
Alignment:
Q  47 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgt-ttttgtatac 145  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12698998 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtgttttgtatac 12698899  T
Q  146 tgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 211  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  12698898 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 12698832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 47 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 38227646 - 38227482
Alignment:
Q  47 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 146  Q
    ||||||||||| |||| | ||||| ||||| ||||  |||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  38227646 tgtgatataatgatatgtacattaattgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatact 38227548  T
Q  147 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 211  Q
    | || ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||    
T  38227547 gcctatgttgctattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtagatgaagatgatgatg 38227482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 47 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 9509355 - 9509190
Alignment:
Q  47 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 146  Q
    ||||||||| |  ||| |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  9509355 tgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgttattgtatact 9509256  T
Q  147 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 211  Q
    | || |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  9509255 gcctatgttactgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 9509190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 41 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 26212168 - 26212012
Alignment:
Q  41 ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 140  Q
    ||||| |||||||||||  | ||||||||||||||    ||| |||||| || ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  26212168 ttataatgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttg 26212069  T
Q  141 tatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttg 196  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26212068 tatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgtatgagtcggtctaagttg 26212012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 30 - 197
Target Start/End: Original strand, 2280056 - 2280225
Alignment:
Q  30 atttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 128  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  2280056 atttgatgttgtttataatgtgatataattttatatgtattatttgaattatatatgaatatttgagatgttgttgatttgcatttgatattattatatc 2280155  T
Q  129 atgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttga 197  Q
    |||||| ||||| |||||| || ||||| || |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  2280156 atgctg-ttttgcatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 2280225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 17 - 116
Target Start/End: Original strand, 15081919 - 15082019
Alignment:
Q  17 gatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttg 115  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  15081919 gatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacattgattgacttgcatttg 15082018  T
Q  116 a 116  Q
    |    
T  15082019 a 15082019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 47 - 197
Target Start/End: Original strand, 15143993 - 15144143
Alignment:
Q  47 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 146  Q
    |||||||| ||  |||| ||||||||| ||||||   || ||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||| || || ||||||| ||| |||||    
T  15143993 tgtgatatgatgttatacgcattacttaaattatgaatgtatacttgagatgttgttggcttgcatttgatattatgatatcttgctgttattgcatact 15144092  T
Q  147 gctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttga 197  Q
    |   |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15144093 gagatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 15144143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 98 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 10589154 - 10589055
Alignment:
Q  98 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttg 196  Q
    |||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  10589154 gttgttgaattgcaattgatatgattatgtcatgttgtttttgtatactgcatatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcgatctaagttg 10589055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 30 - 211
Target Start/End: Original strand, 19486681 - 19486864
Alignment:
Q  30 atttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 128  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| || |||||| |||||| |||| | |  ||||||||||| ||    
T  19486681 atttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcataacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatc 19486780  T
Q  129 atgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttg-ttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 211  Q
    ||| |||||| | ||||||| | |||||||| |  |||  |||||||| |||||||||||||| |||| | | ||||||||||||    
T  19486781 atgatgtttt-gcatactgcctatgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtccaagtcgttgaagatgttgatg 19486864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 90 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 67868 - 67746
Alignment:
Q  90 attgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcgg 187  Q
    ||||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  67868 attgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 67770  T
Q  188 tctaagttgattaagatgttgatg 211  Q
    |||||||||||||||||| |||||    
T  67769 tctaagttgattaagatgatgatg 67746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 91 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 22073036 - 22072914
Alignment:
Q  91 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggt 188  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||| ||| | ||||| |||| |||||||||||||| |||||| ||| ||    
T  22073036 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatagtgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgggtcagt 22072937  T
Q  189 ctaagttgattaagatgttgatg 211  Q
    ||||||||||||||||| |||||    
T  22072936 ctaagttgattaagatgatgatg 22072914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 13841220 - 13841157
Alignment:
Q  1 atatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatat 64  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13841220 atatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatat 13841157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 30 - 211
Target Start/End: Original strand, 10063760 - 10063938
Alignment:
Q  30 atttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 128  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||      |||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||  || ||||||||||| ||    
T  10063760 atttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgt-----ttgaattatatgtgaatatttgagatgttgtttacttgtgttcgatattattatatc 10063854  T
Q  129 atgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 211  Q
    ||| || || || |||| | || |||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | | ||| ||||||||    
T  10063855 atgatg-ttgtgcataccgcctatgttgctgattgttaattaactaagttgcatgagtcagtctaagtcgttgaaggtgttgatg 10063938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 47
Target Start/End: Complemental strand, 11303455 - 11303409
Alignment:
Q  1 atatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatatt 47  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11303455 atatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatatt 11303409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 32 - 190
Target Start/End: Original strand, 12255730 - 12255892
Alignment:
Q  32 ttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 130  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||  |||||| ||||| || || ||||||||||| |||| ||||    
T  12255730 ttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgtattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgtagaatttcatttgatattgttatatcat 12255829  T
Q  131 g-ctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtct 190  Q
    |  |   |||| |||||| || ||||| || |||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  12255830 gaattgatttgcatactgactatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtctgtct 12255892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 51 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 16056488 - 16056343
Alignment:
Q  51 atataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ct 149  Q
    |||||||| ||||| |||||| |||||||| | ||| |  |||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||| |||||  | ||| || ||    
T  16056488 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgttgttt--gcataatgtct 16056392  T
Q  150 gtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttga 197  Q
     |||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  16056391 atgttgctgtttgttatttaactaaggtgcatcagtcggtctaagttga 16056343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 30 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 16495581 - 16495403
Alignment:
Q  30 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 129  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| |||||| ||| |||  | || ||||||||   |||||||| || |||| ||||||||||| |||    
T  16495581 atttgatgttgttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctg-ataattga---gttgttgatttacattcgatattattatatca 16495486  T
Q  130 tgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 211  Q
    || ||  |||| |||||| || ||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||| || | |||||| |||||    
T  16495485 tgatg-gtttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 16495403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 18627774 - 18627717
Alignment:
Q  1 atatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataatt 58  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18627774 atatatgatgttttaagatgttgattagtatttgatcttgttatattgtgatataatt 18627717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 41 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 15113114 - 15113031
Alignment:
Q  41 ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattat 125  Q
    ||||| |||||||||||| |||||  ||||||||| |||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||    
T  15113114 ttataatgtgatataattgtatatatattacttgagttatatgtgaat-attgagatgttgatgacttgcatttgatattgttat 15113031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 113 - 211
Target Start/End: Original strand, 16386268 - 16386368
Alignment:
Q  113 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgat 210  Q
    |||||||  ||||||||||||| ||||||||||||| | ||| | |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||| ||||    
T  16386268 ttgatatatttatgtcatgctgattttgtatactgcctatgtcgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgat 16386367  T
Q  211 g 211  Q
    |    
T  16386368 g 16386368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 159 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 47831860 - 47831808
Alignment:
Q  159 ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 211  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  47831860 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatg 47831808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 107 - 205
Target Start/End: Original strand, 14932749 - 14932848
Alignment:
Q  107 ttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 205  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| || |||||  || | | || | || ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14932749 ttgcaattgatattattatgtcatgctattgttgtaatctacctatgctactattgttatttaactaagtcgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 14932848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 107 - 205
Target Start/End: Original strand, 15356184 - 15356283
Alignment:
Q  107 ttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 205  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| || |||||  || | | || | || ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15356184 ttgcaattgatattattatgtcatgctattgttgtaatctacctatgctactattgttatttaactaagtcgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 15356283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 107 - 205
Target Start/End: Original strand, 15360298 - 15360397
Alignment:
Q  107 ttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 205  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| || |||||  || | | || | || ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15360298 ttgcaattgatattattatgtcatgctattgttgtaatctacctatgctactattgttatttaactaagtcgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 15360397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 98 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 34200901 - 34200787
Alignment:
Q  98 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagtt 195  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||| ||||| || ||| | ||||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  34200901 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 34200803  T
Q  196 gattaagatgttgatg 211  Q
    | | |||||| |||||    
T  34200802 gttgaagatgatgatg 34200787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 62 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 40443541 - 40443393
Alignment:
Q  62 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt 160  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | |||||||||||||||||||||||||  || |||||| | ||||||||||    
T  40443541 tatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgctgttt--gtttactgcgtatgttgctgtt 40443444  T
Q  161 -gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgat 210  Q
     |||||||||||||| |||| ||||||||||||| || | |||||| ||||    
T  40443443 tgttatttaactaagctgcacgagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 40443393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 51 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 18005806 - 18005660
Alignment:
Q  51 atataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctg 150  Q
    |||||||| ||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || |||   ||||||||     
T  18005806 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttcc-atactgctt 18005710  T
Q  151 -tgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 198  Q
     |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18005709 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 18005660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 30 - 197
Target Start/End: Original strand, 1867932 - 1868101
Alignment:
Q  30 atttgatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 128  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| || |||||||||||| |||||||||| || ||  |||||| |||||| | ||||| |||||||| |||| ||    
T  1867932 atttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttgttcatttgca-ttgatattgttatatc 1868029  T
Q  129 at--gctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttga 197  Q
    ||  |||| |||| ||||||| || ||||| |||| |||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1868030 atgagctg-ttttatatactgcctatgttgttgttagtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 1868101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 46
Target Start/End: Original strand, 16108643 - 16108688
Alignment:
Q  1 atatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 46  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16108643 atatatgatgttttaagatgttgattaccgtttgatgttgttatat 16108688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 46
Target Start/End: Original strand, 23664907 - 23664952
Alignment:
Q  1 atatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 46  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23664907 atatatgatgttttaagatgttaattaccatttgatgttgttatat 23664952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 46
Target Start/End: Complemental strand, 29796816 - 29796771
Alignment:
Q  1 atatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 46  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  29796816 atatatgatgttttaagatgttaattaccatttgatgttgttatat 29796771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 46
Target Start/End: Complemental strand, 29800635 - 29800590
Alignment:
Q  1 atatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 46  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  29800635 atatatgatgttttaagatgttaattaccatttgatgttgttatat 29800590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 41 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 15116651 - 15116568
Alignment:
Q  41 ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattat 125  Q
    ||||| |||||||||||| |||||  ||||||||| |||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| |||||||| ||||    
T  15116651 ttataatgtgatataattgtatatatattacttgagttatatgtgaat-attgagatgttgatgacttgcaattgatattgttat 15116568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 114 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 15211557 - 15211450
Alignment:
Q  114 tgatattattatgtcatgctgtttttgt-atactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttg-attaagatgttgat 210  Q
    ||||||| |||||||||| |||| |||| || |||| | || ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| | |||| ||||||||||||||    
T  15211557 tgatattgttatgtcatgatgttgttgtgattctgcctatgctgctgttgttaattaactaagttgcatgagtcagtccatgttgaattaagatgttgat 15211458  T
Q  211 gatgatgt 218  Q
    | ||||||    
T  15211457 gttgatgt 15211450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 115 - 211
Target Start/End: Original strand, 28505321 - 28505418
Alignment:
Q  115 gatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 211  Q
    ||||||||||| ||||| || ||| | ||||||| | |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||| |||||    
T  28505321 gatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgaagatgatgatg 28505418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 103 - 198
Target Start/End: Original strand, 811142 - 811238
Alignment:
Q  103 tgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 198  Q
    ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | ||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  811142 tgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctatttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 811238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 46
Target Start/End: Original strand, 14270016 - 14270061
Alignment:
Q  1 atatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 46  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  14270016 atatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatat 14270061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 51 - 197
Target Start/End: Original strand, 16219677 - 16219823
Alignment:
Q  51 atataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-t 149  Q
    |||||||| ||||| |||||| |||||||| | ||| |  || ||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  16219677 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tgtttaagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 16219774  T
Q  150 gtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttga 197  Q
     ||||| |||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  16219775 atgttgttgtttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttga 16219823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 30 - 131
Target Start/End: Original strand, 20220127 - 20220225
Alignment:
Q  30 atttgatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 128  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| || ||  ||||||   |||||| |||||||||||||| |||| ||    
T  20220127 atttgatgttgttaataatgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgaga---tgttgatttgcatttgatattgttatatc 20220222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 100 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 44014291 - 44014192
Alignment:
Q  100 tgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttga 197  Q
    |||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  44014291 tgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 44014193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 154 - 212
Target Start/End: Original strand, 2832504 - 2832562
Alignment:
Q  154 tgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatga 212  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||  | |||| ||||||||||| ||||||    
T  2832504 tgctattgttatttaactaagttgcatgagtctatataagatgattaagatgatgatga 2832562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 30 - 131
Target Start/End: Original strand, 15008436 - 15008536
Alignment:
Q  30 atttgatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 128  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || ||  |||||  |||||||| ||||| |||||||| |||| ||    
T  15008436 atttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacttgaattatatatg-atgtttgaggtgttgttgatttgca-ttgatattgttatatc 15008533  T
Q  129 atg 131  Q
    |||    
T  15008534 atg 15008536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 151 - 205
Target Start/End: Original strand, 18154901 - 18154955
Alignment:
Q  151 tgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 205  Q
    ||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  18154901 tgttgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagtcgatcaagatg 18154955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 46
Target Start/End: Complemental strand, 8468848 - 8468803
Alignment:
Q  1 atatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 46  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||    
T  8468848 atatatgatgttttatgatgttgattattatttgatgttgttatat 8468803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 211
Target Start/End: Original strand, 11996095 - 11996147
Alignment:
Q  159 ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 211  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||| |||||    
T  11996095 ttgttaattaactaagatgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatg 11996147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 211
Target Start/End: Original strand, 15754955 - 15755007
Alignment:
Q  159 ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 211  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| | |||||| |||||    
T  15754955 ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgttgaagatgatgatg 15755007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 187 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 16213653 - 16213622
Alignment:
Q  187 gtctaagttgattaagatgttgatgatgatgt 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16213653 gtctaagttgattaagatgttgatgatgatgt 16213622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 154 - 205
Target Start/End: Original strand, 19649552 - 19649603
Alignment:
Q  154 tgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 205  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||| ||||||    
T  19649552 tgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatg 19649603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 151 - 185
Target Start/End: Original strand, 9446218 - 9446252
Alignment:
Q  151 tgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtc 185  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9446218 tgttgctgctgttatttaactaagttgcatgagtc 9446252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 151 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 12187076 - 12187022
Alignment:
Q  151 tgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 205  Q
    ||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||| | |||| |||||||||||    
T  12187076 tgttgctattgttattcaaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatg 12187022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 151 - 205
Target Start/End: Original strand, 17138120 - 17138174
Alignment:
Q  151 tgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 205  Q
    ||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||| | |||| |||||||||||    
T  17138120 tgttgctattgttattcaaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatg 17138174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 151 - 185
Target Start/End: Original strand, 20569656 - 20569690
Alignment:
Q  151 tgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtc 185  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20569656 tgttgctgctgttatttaactaagttgcatgagtc 20569690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 98 - 211
Target Start/End: Original strand, 27847838 - 27847950
Alignment:
Q  98 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttg-ttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagtt 195  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| |||||||||| |||||   ||| ||||| | ||||||||||  ||||||||||||| ||||||| |||||||||| |    
T  27847838 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatactgtt---gtacactgcctatgttgctgtttattatttaactaagctgcatgaatcggtctaagat 27847934  T
Q  196 gattaagatgttgatg 211  Q
    | | |||||| |||||    
T  27847935 gttgaagatgatgatg 27847950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 68)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 264722 - 264926
Alignment:
Q  1 atatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  264722 atatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 264821  T
Q  101 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatta 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  264822 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 264921  T
Q  201 agatg 205  Q
    |||||    
T  264922 agatg 264926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 42245319 - 42245523
Alignment:
Q  1 atatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42245319 atatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 42245418  T
Q  101 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatta 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42245419 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatta 42245518  T
Q  201 agatg 205  Q
    |||||    
T  42245519 agatg 42245523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 39363592 - 39363388
Alignment:
Q  1 atatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39363592 atatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 39363493  T
Q  101 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatta 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  39363492 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 39363393  T
Q  201 agatg 205  Q
    |||||    
T  39363392 agatg 39363388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 177; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 10732894 - 10733098
Alignment:
Q  1 atatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10732894 atatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatacggtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 10732993  T
Q  101 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatta 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10732994 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 10733093  T
Q  201 agatg 205  Q
    |||||    
T  10733094 agatg 10733098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 177; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 20909220 - 20909016
Alignment:
Q  1 atatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20909220 atatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 20909121  T
Q  101 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatta 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20909120 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgcttttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 20909021  T
Q  201 agatg 205  Q
    |||||    
T  20909020 agatg 20909016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 177; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 29346188 - 29345984
Alignment:
Q  1 atatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29346188 atatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 29346089  T
Q  101 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatta 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  29346088 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgatgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgatta 29345989  T
Q  201 agatg 205  Q
    |||||    
T  29345988 agatg 29345984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 177; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 32027601 - 32027397
Alignment:
Q  1 atatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32027601 atatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 32027502  T
Q  101 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatta 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  32027501 gttgacttggatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgttgttgttatttaactaagttgtatgagtcggtctaagttgatta 32027402  T
Q  201 agatg 205  Q
    |||||    
T  32027401 agatg 32027397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 173; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 29348661 - 29348457
Alignment:
Q  1 atatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29348661 atatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 29348562  T
Q  101 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatta 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  29348561 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgatgctgttcttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgatta 29348462  T
Q  201 agatg 205  Q
    |||||    
T  29348461 agatg 29348457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 173; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 29351134 - 29350930
Alignment:
Q  1 atatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29351134 atatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 29351035  T
Q  101 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatta 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  29351034 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgatgctgttcttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgatta 29350935  T
Q  201 agatg 205  Q
    |||||    
T  29350934 agatg 29350930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 173; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 39245344 - 39245140
Alignment:
Q  1 atatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  39245344 atatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatgtaattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgggacgtt 39245245  T
Q  101 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatta 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  39245244 attgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 39245145  T
Q  201 agatg 205  Q
    |||||    
T  39245144 agatg 39245140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 29330139 - 29329938
Alignment:
Q  1 atatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 100  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||   |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29330139 atatatgatgttttaagatgattatta---tttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 29330043  T
Q  101 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatta 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  29330042 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 29329943  T
Q  201 agatg 205  Q
    |||||    
T  29329942 agatg 29329938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 20917906 - 20918106
Alignment:
Q  1 atatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20917906 atatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgctttacttgaattagatgtgaataattgagacgtt 20918005  T
Q  101 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatta 200  Q
    |||||||    ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20918006 gttgact----ttttatattattttgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 20918101  T
Q  201 agatg 205  Q
    |||||    
T  20918102 agatg 20918106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 30 - 205
Target Start/End: Original strand, 36154766 - 36154938
Alignment:
Q  30 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 129  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36154766 atttgatgatgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 36154865  T
Q  130 tgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36154866 tgctgtttttgtatactgctgtgt---tgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 36154938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 146; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 32 - 205
Target Start/End: Original strand, 11581184 - 11581357
Alignment:
Q  32 ttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11581184 ttgatgttgttatattgtgatataattgtatatacattacttgaattatacgtgaataattgagacgttattgacttgcatttgatattattatgtcatg 11581283  T
Q  132 ctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 205  Q
     ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11581284 ttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 11581357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 146; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 30 - 205
Target Start/End: Original strand, 20901991 - 20902168
Alignment:
Q  30 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaa-taattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20901991 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattatttgaattatatgtgaaataattgagacgttgttgacttgcacttgatattattatgtc 20902090  T
Q  129 atgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttg-attaagatg 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20902091 atgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgaattaagatg 20902168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 30 - 205
Target Start/End: Original strand, 2154596 - 2154772
Alignment:
Q  30 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaa-taattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2154596 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattatttgaattatatgtgaaataattgagacgttgttgacttgcagttgatattattatgtc 2154695  T
Q  129 atgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 205  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2154696 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 2154772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 144; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 35 - 205
Target Start/End: Original strand, 18319021 - 18319192
Alignment:
Q  35 atgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgct 133  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18319021 atgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgct 18319120  T
Q  134 gtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 205  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18319121 gtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgattaagatg 18319192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 30 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 31061248 - 31061072
Alignment:
Q  30 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  31061248 atttgatgttgttatattgtgatataattttatatgcattaattaaattatttgtgaataattgatacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 31061149  T
Q  129 atgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 205  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31061148 atgctgtttttgtatactactgttttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 31061072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 38619644 - 38619438
Alignment:
Q  1 atatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||  |||||||| ||||||||| | ||  ||||| ||||||||||||||||||    
T  38619644 atatatgatgttttaagatgttgattatcatttgatgttgtttatattggaatataattgtatatgcatcaattagattatctgtgaataattgagacgt 38619545  T
Q  100 tg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 198  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  38619544 tgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactactgtgtcgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 38619445  T
Q  199 taagatg 205  Q
    |||||||    
T  38619444 taagatg 38619438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 23064721 - 23064515
Alignment:
Q  1 atatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgt 99  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||| | ||  ||||| ||||||||||||||||||    
T  23064721 atatattatgttttaagatgttgattatcatttgatgttgtttatattgggatataattgtatatgcatcaattagattatctgtgaataattgagacgt 23064622  T
Q  100 tg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 198  Q
    || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23064621 tgattgacttgcatttgatattattaggtcatgctgtttttgtatactactgtgtcgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 23064522  T
Q  199 taagatg 205  Q
    |||||||    
T  23064521 taagatg 23064515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 30 - 205
Target Start/End: Original strand, 10775659 - 10775834
Alignment:
Q  30 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 128  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10775659 atttgatgttgt-atattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 10775757  T
Q  129 atgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 205  Q
    |||||| |||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10775758 atgctggttttatatactgctgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 10775834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 35 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 24067282 - 24067111
Alignment:
Q  35 atgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgct 133  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  24067282 atgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgatgattgacttgcatttgatattattatgtcatgtt 24067183  T
Q  134 gtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 205  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||    
T  24067182 gtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaaccaagctgcattggtcggtctaagttgattaagatg 24067111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 47 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 1096633 - 1096468
Alignment:
Q  47 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 146  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||   || |||  ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||    
T  1096633 tgtgatataatgttatatgcattacttgaattatgaatgtatatgtgagatgttgttgatttgcatttgatattattatgttatgttgtttttgcatact 1096534  T
Q  147 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 211  Q
     | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1096533 acctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgttgatg 1096468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 47 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 9078118 - 9077953
Alignment:
Q  47 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 146  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9078118 tgtgatataatgttatacgcattacttgagttatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcacttgatattattatgtcatgctgttttcgtatact 9078019  T
Q  147 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 211  Q
    | || |||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| |||||| |||||    
T  9078018 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgggtcagtctaagttgatgaagatgatgatg 9077953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 47 - 211
Target Start/End: Original strand, 23390451 - 23390616
Alignment:
Q  47 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 146  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23390451 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 23390550  T
Q  147 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 211  Q
    | || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  23390551 gtctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 23390616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 47 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 25421698 - 25421533
Alignment:
Q  47 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 146  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25421698 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgctgttgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 25421599  T
Q  147 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 211  Q
    | || ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  25421598 gcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 25421533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 47 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 24529386 - 24529227
Alignment:
Q  47 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 146  Q
    |||||||||||  |||| |||||||||||  |||   || |||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  24529386 tgtgatataatgttataagcattacttgagatatgaatgtataattaagatgttgttgacttgcatttgatatcattatgtcatgttgtttttgtatact 24529287  T
Q  147 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 205  Q
    | || ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24529286 gcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 24529227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 47 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 25431560 - 25431414
Alignment:
Q  47 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 146  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||| | || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25431560 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaacatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 25431461  T
Q  147 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaa 192  Q
    | || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25431460 gcctatgttgctgttgttatttaactaagatgcatgagtcggtctaa 25431414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 47 - 211
Target Start/End: Original strand, 21729019 - 21729184
Alignment:
Q  47 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 146  Q
    |||||||||||  | ||||||||||||||    ||| |||||| || ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21729019 tgtgatataatattttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatact 21729118  T
Q  147 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 211  Q
    || | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||| |||||    
T  21729119 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatg 21729184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 47 - 211
Target Start/End: Original strand, 21808344 - 21808509
Alignment:
Q  47 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 146  Q
    |||||||||||  | ||||||||||||||    ||| |||||| || ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21808344 tgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatact 21808443  T
Q  147 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 211  Q
    || | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||| |||||    
T  21808444 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatg 21808509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 47 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 24493734 - 24493570
Alignment:
Q  47 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 146  Q
    |||||||||||  ||| ||||| ||||||| ||||  |||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24493734 tgtgatataatgttatgtgcatcacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatact 24493636  T
Q  147 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 211  Q
    | || ||||||| |||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  24493635 gcctatgttgctattgttacttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 24493570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 105 - 211
Target Start/End: Original strand, 21997547 - 21997654
Alignment:
Q  105 acttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaaga 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21997547 acttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 21997646  T
Q  204 tgttgatg 211  Q
    || |||||    
T  21997647 tgatgatg 21997654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 47 - 211
Target Start/End: Original strand, 8286797 - 8286963
Alignment:
Q  47 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttt-gtatac 145  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  || | ||| || || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8286797 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatgtttgattatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgttttttgtatac 8286896  T
Q  146 tgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 211  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  8286897 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 8286963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 67 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 22412329 - 22412191
Alignment:
Q  67 attacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttgttat 165  Q
    ||||||||||||||   || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| | | |||||    
T  22412329 attacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgttatcgttat 22412231  T
Q  166 ttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 205  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22412230 ttaactaagctacatgagtcggtctaagttgattaagatg 22412191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 47 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 13025476 - 13025312
Alignment:
Q  47 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 146  Q
    |||||||||||  ||| | ||||| ||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||    
T  13025476 tgtgatataatgttatgtacattatttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatatcaatatgtcatgctgtttt-gtatact 13025378  T
Q  147 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 211  Q
    || | ||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  13025377 gcctatgttgctattgttatttaactatgctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 13025312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 47 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 13095660 - 13095496
Alignment:
Q  47 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 146  Q
    |||||||||||  ||| | ||||| ||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||    
T  13095660 tgtgatataatgttatgtacattatttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatatcaatatgtcatgctgtttt-gtatact 13095562  T
Q  147 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 211  Q
    || | ||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  13095561 gcctatgttgctattgttatttaactatgctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 13095496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 47 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 22075185 - 22075035
Alignment:
Q  47 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 146  Q
    |||||||||||  | ||||||||||||||    ||| |||||| || ||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  22075185 tgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgttgattttgtatact 22075086  T
Q  147 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttg 196  Q
     | | |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  22075085 tcctatgttgctgttgttatttaactaagctgaatgagtcggtctaagttg 22075035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 47 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 22144215 - 22144068
Alignment:
Q  47 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 146  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  |||||| |||||||| ||||| |||||||| |||| ||||| |||||| | |||||    
T  22144215 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgcaattgatattgttatatcatgttgtttt-gcatact 22144117  T
Q  147 gc-tgtgttgctgt-tgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 193  Q
     | | ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22144116 acctatgttgatgtctgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 22144068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 84 - 218
Target Start/End: Original strand, 17517193 - 17517328
Alignment:
Q  84 tgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatga 182  Q
    |||||| || ||| |||||||| ||||  |||||||| ||||||| |||||||  ||||  |||| | || |||| |||||||| |||||||||||||||    
T  17517193 tgaatatttaagatgttgttgaattgcgattgatatttttatgtcttgctgttgatgtaatctgcctatgctgctattgttattaaactaagttgcatga 17517292  T
Q  183 gtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgt 218  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17517293 gtcagtctaagttgattaagatgttgataatgatgt 17517328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 30 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 40726037 - 40725854
Alignment:
Q  30 atttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 128  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||| |||| | |  ||||||||||| ||    
T  40726037 atttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatc 40725938  T
Q  129 atgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 211  Q
    ||| ||  |||| |||||| ||  ||||||| |  |||  |||||||| |||||||||||||| |||| | | ||||||||||||    
T  40725937 atgatg-ctttgcatactgcctacgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtccaagtcgttgaagatgttgatg 40725854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 67 - 154
Target Start/End: Original strand, 20766095 - 20766181
Alignment:
Q  67 attacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgtt 154  Q
    ||||||||||||||   || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  20766095 attacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgttgtgtt 20766181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 32 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 21565723 - 21565556
Alignment:
Q  32 ttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 130  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||| |||||| |||||||| | ||| || |||| | |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  21565723 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgaaatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 21565625  T
Q  131 gctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 198  Q
    | || ||| | ||||||| | ||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21565624 gatgatttgg-atactgcctatgttgctatttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 21565556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 64 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 37724050 - 37723906
Alignment:
Q  64 tgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgt-tg 161  Q
    |||||||||||||||||   ||||| ||||||| |||| ||| ||  ||||||||| || |||||||||||||   ||||||||| | ||||||||| ||    
T  37724050 tgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgatgaatttaatttgatataatcatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtctg 37723954  T
Q  162 ttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttga 209  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||| || | ||||||||||    
T  37723953 ttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagatgttgaagatgttga 37723906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 114 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 18418678 - 18418590
Alignment:
Q  114 tgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttattt-aactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaag 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| | ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  18418678 tgatattattatgtcatgctgttt--gtatactgcctatgttgatgttgttattttaactaagttgcacgagtcagtctaagttgattaag 18418590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 151 - 211
Target Start/End: Original strand, 21329556 - 21329617
Alignment:
Q  151 tgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 211  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21329556 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatg 21329617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 34 - 193
Target Start/End: Original strand, 22178161 - 22178323
Alignment:
Q  34 gatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat-- 130  Q
    |||||||||| || |||||||||| | |||||||||||| |||||||||| || ||  |||||| |||||||| |||||||||||||| | || ||||      
T  22178161 gatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgtcatatcatga 22178259  T
Q  131 gctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 193  Q
    |||| |||| ||||||| || ||||| || |||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22178260 gctg-ttttatatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaag 22178323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 98 - 193
Target Start/End: Original strand, 20026945 - 20027043
Alignment:
Q  98 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 193  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||||  ||||||| | ||||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20026945 gttgttgaattgcatttgatattattatatcatgaactgttttgg-atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 20027043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 113 - 211
Target Start/End: Original strand, 21292992 - 21293089
Alignment:
Q  113 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 211  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  || |||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| || | |||||| |||||    
T  21292992 ttgatattattatgtcatactgttt--gtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgaatcggtctaagatgttgaagatgatgatg 21293089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 103 - 211
Target Start/End: Original strand, 21502167 - 21502276
Alignment:
Q  103 tgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatta 200  Q
    ||||||||||| |||||| |||| |||||||| |||   ||||||| | |||||||||| |||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21502167 tgacttgcattcgatattgttatatcatgctgatttac-atactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 21502265  T
Q  201 agatgttgatg 211  Q
    ||||| |||||    
T  21502266 agatgatgatg 21502276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 46
Target Start/End: Complemental strand, 9776566 - 9776521
Alignment:
Q  1 atatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 46  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9776566 atatatgatgttttaagatgttaattaccatttgatgttgttatat 9776521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 150 - 205
Target Start/End: Original strand, 20806845 - 20806900
Alignment:
Q  150 gtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 205  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20806845 gtgtcgctgttgttatttaattaagctgcatgagtcggtctatgttgattaagatg 20806900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 98 - 198
Target Start/End: Original strand, 22959538 - 22959639
Alignment:
Q  98 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagtt 195  Q
    |||||||| |||||||  ||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22959538 gttgttgatttgcattcaatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 22959636  T
Q  196 gat 198  Q
    |||    
T  22959637 gat 22959639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 151 - 211
Target Start/End: Original strand, 19660894 - 19660955
Alignment:
Q  151 tgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 211  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||| |||||    
T  19660894 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatg 19660955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 51 - 197
Target Start/End: Original strand, 26011995 - 26012141
Alignment:
Q  51 atataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-t 149  Q
    |||||||| ||||| |||||| |||||||| | ||| |  |||||| |||||||| |  ||||||||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  26011995 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tgtttgagatgttgttgattcacatttgatattgttatatcatgttgcttt-gcatactgcct 26012092  T
Q  150 gtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttga 197  Q
     |||||||||| |||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26012093 atgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 26012141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 113 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 21873350 - 21873277
Alignment:
Q  113 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtc 185  Q
    |||||||||| | ||||||||| | |||||| |||| | || |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21873350 ttgatattatgaagtcatgctgatgttgtatcctgcctatgctgcttttgttatttaactaagttgcatgagtc 21873277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 36314639 - 36314578
Alignment:
Q  151 tgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 211  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| || | |||||| |||||    
T  36314639 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 36314578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 46
Target Start/End: Original strand, 37804857 - 37804902
Alignment:
Q  1 atatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 46  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||    
T  37804857 atatatgatgttttaagatgttaattagaatttgatgttgttatat 37804902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 154 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 26680636 - 26680605
Alignment:
Q  154 tgctgttgttatttaactaagttgcatgagtc 185  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26680636 tgctgttgttatttaactaagttgcatgagtc 26680605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 154 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 26704129 - 26704078
Alignment:
Q  154 tgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 205  Q
    |||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  26704129 tgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagtcgatcaagatg 26704078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 154 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 26952243 - 26952212
Alignment:
Q  154 tgctgttgttatttaactaagttgcatgagtc 185  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26952243 tgctgttgttatttaactaagttgcatgagtc 26952212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 154 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 26973862 - 26973811
Alignment:
Q  154 tgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 205  Q
    |||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  26973862 tgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagtcgatcaagatg 26973811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 151 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 22032380 - 22032326
Alignment:
Q  151 tgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 205  Q
    ||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||| | |||| |||||||||||    
T  22032380 tgttgctattgttattcaaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatg 22032326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 151 - 193
Target Start/End: Original strand, 26740705 - 26740747
Alignment:
Q  151 tgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 193  Q
    |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26740705 tgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 26740747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 148 - 205
Target Start/End: Original strand, 23501412 - 23501469
Alignment:
Q  148 ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 205  Q
    ||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||| | |||| |||| ||||||    
T  23501412 ctgtgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcgatataagatgatcaagatg 23501469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 151 - 196
Target Start/End: Original strand, 26732892 - 26732937
Alignment:
Q  151 tgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttg 196  Q
    |||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  26732892 tgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctatgttg 26732937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 41 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 18356485 - 18356389
Alignment:
Q  41 ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttt 137  Q
    ||||| |||||||||||  | |||||||||||| |   |||| |||||| |  ||| |||||||| ||| | ||||||||||||| |||||||||||    
T  18356485 ttataatgtgatataatgttttatgcattacttaagaaatatttgaatattcaagatgttgttgaattgaaattgatattattatatcatgctgttt 18356389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 159 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 19668951 - 19668899
Alignment:
Q  159 ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 211  Q
    ||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||| | |||| |||||    
T  19668951 ttgttatttaactgagctgcaagagtcggtctaagttgatgatgatgatgatg 19668899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 154 - 198
Target Start/End: Original strand, 23535642 - 23535686
Alignment:
Q  154 tgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 198  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||    
T  23535642 tgctattgttatttaactaagttgcatgagtctgaataagttgat 23535686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230 (Bit Score: 181; Significance: 6e-98; HSPs: 1)
Name: scaffold0230
Description:

Target: scaffold0230; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 14155 - 13951
Alignment:
Q  1 atatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14155 atatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 14056  T
Q  101 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatta 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14055 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttatctaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 13956  T
Q  201 agatg 205  Q
    |||||    
T  13955 agatg 13951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0444 (Bit Score: 177; Significance: 1e-95; HSPs: 1)
Name: scaffold0444
Description:

Target: scaffold0444; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 13600 - 13396
Alignment:
Q  1 atatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13600 atatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatgtaattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 13501  T
Q  101 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatta 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13500 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 13401  T
Q  201 agatg 205  Q
    |||||    
T  13400 agatg 13396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 177; Significance: 1e-95; HSPs: 7)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 136888 - 136684
Alignment:
Q  1 atatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  136888 atatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 136789  T
Q  101 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatta 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  136788 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 136689  T
Q  201 agatg 205  Q
    |||||    
T  136688 agatg 136684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 177; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 139357 - 139153
Alignment:
Q  1 atatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  139357 atatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 139258  T
Q  101 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatta 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  139257 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 139158  T
Q  201 agatg 205  Q
    |||||    
T  139157 agatg 139153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 177; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 144295 - 144091
Alignment:
Q  1 atatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  144295 atatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 144196  T
Q  101 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatta 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  144195 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 144096  T
Q  201 agatg 205  Q
    |||||    
T  144095 agatg 144091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 173; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 134419 - 134215
Alignment:
Q  1 atatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  134419 atatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 134320  T
Q  101 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatta 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  134319 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctatgttgatta 134220  T
Q  201 agatg 205  Q
    |||||    
T  134219 agatg 134215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 173; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 141826 - 141622
Alignment:
Q  1 atatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  141826 atatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 141727  T
Q  101 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatta 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  141726 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatta 141627  T
Q  201 agatg 205  Q
    |||||    
T  141626 agatg 141622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #6
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 87 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 132784 - 132672
Alignment:
Q  87 ataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctg-tgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagt 184  Q
    ||||||||||||||| ||| || |||| |||||| || | ||||| || ||||| ||||| ||  |||||||||| |||||||| ||||| |||||||||    
T  132784 ataattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttgtatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctaagctgcatgagt 132686  T
Q  185 cggtctaagttgat 198  Q
    ||||||||| ||||    
T  132685 cggtctaagatgat 132672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #7
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 108 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 62303 - 62216
Alignment:
Q  108 tgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagt 194  Q
    |||||| |||||||||||  |||| |||||||  ||||||| | |||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  62303 tgcattcgatattattataccatgatgtttttc-atactgcctatgttgctgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtttaagt 62216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 165; Significance: 2e-88; HSPs: 1)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 40608 - 40404
Alignment:
Q  1 atatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  40608 atatatgaagttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattttatgtgaataattgagacgtt 40509  T
Q  101 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatta 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  40508 gttgacttgcatttgatattattatgtcatcctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcacgagtcggtctaagttgatta 40409  T
Q  201 agatg 205  Q
    |||||    
T  40408 agatg 40404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 165; Significance: 2e-88; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 17 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 82264 - 82076
Alignment:
Q  17 gatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttga 116  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  82264 gatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttga 82165  T
Q  117 tattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  82164 tattattatgtcatgctgtttttgtatactactgtgttgctgttgttatttaactaagcttcatgagtcggtctaagttgattaagatg 82076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 32 - 197
Target Start/End: Original strand, 22610 - 22776
Alignment:
Q  32 ttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 130  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||| |||||| |||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  22610 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 22708  T
Q  131 gctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttga 197  Q
    | || ||| | |||||| || ||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22709 gatgattt-gcatactgtctatgtcgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 22776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 164; Significance: 8e-88; HSPs: 2)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 30 - 205
Target Start/End: Original strand, 158433 - 158608
Alignment:
Q  30 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  158433 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 158532  T
Q  130 tgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 205  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  158533 tgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 158608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 47 - 197
Target Start/End: Original strand, 339905 - 340053
Alignment:
Q  47 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 146  Q
    |||||||||||  ||||  |||||||||||||||   || ||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  339905 tgtgatataatgttatacacattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgacttg-atttgatattattatgtcatgttgtttt-gtatact 340002  T
Q  147 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttga 197  Q
    || | ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  340003 gcctatgttgttgt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 340053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1439 (Bit Score: 157; Significance: 1e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold1439
Description:

Target: scaffold1439; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 17 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 298 - 110
Alignment:
Q  17 gatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttga 116  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  298 gatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttga 199  T
Q  117 tattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 205  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  198 tattattatgtcatgttgtttttgtatactattgtgttgctgttgttatttaactaagctgcataagtcggtctaagttgattaagatg 110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142 (Bit Score: 152; Significance: 1e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0142
Description:

Target: scaffold0142; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 30 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 16963 - 16788
Alignment:
Q  30 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 129  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16963 atttgatgatgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtaaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 16864  T
Q  130 tgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 205  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16863 tgttgtttttgtatactactgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 16788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 148; Significance: 3e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 30 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 4476 - 4301
Alignment:
Q  30 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 129  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  4476 atttgatgatgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgattaattgagacgttgttgatttgcaattgatattattatgtca 4377  T
Q  130 tgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 205  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4376 tgttgtttttgtatactactgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 4301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0394 (Bit Score: 146; Significance: 4e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0394
Description:

Target: scaffold0394; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 17 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 12250 - 12068
Alignment:
Q  17 gatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttga 116  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12250 gatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttga 12151  T
Q  117 tattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 205  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||      |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12150 tattattatgtcatgctgttttagtatactgctgtgttgctg------tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 12068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145 (Bit Score: 145; Significance: 2e-76; HSPs: 3)
Name: scaffold0145
Description:

Target: scaffold0145; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 30 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 9929 - 9753
Alignment:
Q  30 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaa-taattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9929 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattatttgaattatatgtgaaataattgagacgttgttgacttgcacttgatattattatgtc 9830  T
Q  129 atgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 205  Q
    || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9829 attctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 9753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #2
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 47 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 33107 - 32943
Alignment:
Q  47 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 146  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  33107 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttaacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatact 33009  T
Q  147 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 211  Q
    | || ||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||    
T  33008 gcctatgttgctattgttatttaattaagctgcatgagtcggtctaacttgatgaagatgatgatg 32943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #3
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 47 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 38926 - 38762
Alignment:
Q  47 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 146  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  38926 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgtttatttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatact 38828  T
Q  147 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 211  Q
    | || ||||||| ||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||    
T  38827 gcctatgttgctattgttatttaattaagctgcatgactcggtctaagttgatgaagatgatgatg 38762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0819 (Bit Score: 141; Significance: 4e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0819
Description:

Target: scaffold0819; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 30 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 4393 - 4218
Alignment:
Q  30 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 128  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  4393 atttgatgttgt-atattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 4295  T
Q  129 atgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 205  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4294 atgctggttttgtatactgctgtgtcgctgtcgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 4218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 138; Significance: 3e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 30 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 30111 - 29946
Alignment:
Q  30 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  30111 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgaattatttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacacttgatattattatgtca 30012  T
Q  130 tgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagtt 195  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  30011 tgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 29946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 138; Significance: 3e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 17 - 205
Target Start/End: Original strand, 1250 - 1439
Alignment:
Q  17 gatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttg 115  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  1250 gatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgatgattgacttgcatttg 1349  T
Q  116 atattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1350 atattattatgtcatgctgtttttgtatactcatgtgttattgttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 1439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 136; Significance: 4e-71; HSPs: 2)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 30 - 193
Target Start/End: Original strand, 79267 - 79430
Alignment:
Q  30 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  79267 atttgatgttgttatattgtgatatacttgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgaaattattatgtca 79366  T
Q  130 tgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 193  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  79367 tgctgtttttatatactgtcgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 79430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #2
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 47 - 214
Target Start/End: Original strand, 17170 - 17340
Alignment:
Q  47 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg--tttttgtata 144  Q
    |||||||||||  || | ||||||||||||||||   || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  17170 tgtgatataatgttaaacgcattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttttgtata 17269  T
Q  145 ctg-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatg 214  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  17270 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgatg 17340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 132; Significance: 1e-68; HSPs: 2)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 30 - 193
Target Start/End: Original strand, 20363 - 20524
Alignment:
Q  30 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 129  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20363 atttgatgtt-ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 20461  T
Q  130 tgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 193  Q
    || || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20462 tgttg-ttttgtatactgatgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 20524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 47 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 128916 - 128752
Alignment:
Q  47 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 146  Q
    |||||||||||  ||| | ||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  |    
T  128916 tgtgatataatgttatgtacattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttttttttt 128817  T
Q  147 gctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 211  Q
      | ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||    
T  128816 tttttgttgcttttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaatttgattaagatgatgatg 128752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247 (Bit Score: 129; Significance: 6e-67; HSPs: 2)
Name: scaffold0247
Description:

Target: scaffold0247; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 30 - 201
Target Start/End: Original strand, 2111 - 2283
Alignment:
Q  30 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  2111 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttaattgacttgcatttgatattattatgtc 2210  T
Q  129 atgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaa 201  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  2211 atgttgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcaagagtcggtctaagttgattaa 2283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247; HSP #2
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 30 - 211
Target Start/End: Original strand, 17964 - 18147
Alignment:
Q  30 atttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 128  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||| || ||||||||||| ||    
T  17964 atttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatatttgagatgttgtttacttgcgttcgatattattatatc 18063  T
Q  129 atgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 211  Q
    ||| || || || ||| ||| | |||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||| | | ||||||||||||    
T  18064 atgatg-ttgtgcataatgcatatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatg 18147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 125; Significance: 2e-64; HSPs: 2)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 30 - 205
Target Start/End: Original strand, 161072 - 161248
Alignment:
Q  30 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 128  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  161072 atttgatattgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagatgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 161171  T
Q  129 atgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 205  Q
    ||  ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  161172 attatgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgatatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttggttaagatg 161248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #2
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 30 - 130
Target Start/End: Original strand, 164573 - 164674
Alignment:
Q  30 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  164573 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagatgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 164672  T
Q  129 at 130  Q
    ||    
T  164673 at 164674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0231 (Bit Score: 115; Significance: 1e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0231
Description:

Target: scaffold0231; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 47 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 23048 - 22890
Alignment:
Q  47 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 146  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23048 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 22949  T
Q  147 gctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 205  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22948 ggtgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 22890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 112; Significance: 9e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 38610 - 38816
Alignment:
Q  1 atatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||| | |||| ||||||  |    
T  38610 atatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgtttatattgtgatataattgtatacgcaatacttgaattatatataaatatttgagatat 38709  T
Q  100 tgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttga 197  Q
    || |||||||||||||||||| |||| ||||| || ||||| |||||| || |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  38710 tgatgacttgcatttgatattgttatatcatgttg-ttttgcatactgtctatgttgctgtttgttatttaactaaggtgcatgagtaggtctaagttga 38808  T
Q  198 ttaagatg 205  Q
    ||||||||    
T  38809 ttaagatg 38816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 100; Significance: 1e-49; HSPs: 2)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 67 - 205
Target Start/End: Original strand, 44682 - 44821
Alignment:
Q  67 attacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttgttat 165  Q
    ||||||||||||||   || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  44682 attacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgttgttat 44781  T
Q  166 ttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 205  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  44782 ttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 44821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #2
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 47 - 205
Target Start/End: Original strand, 26020 - 26179
Alignment:
Q  47 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 146  Q
    |||||||||||  || | ||||||||||||||||   || ||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26020 tgtgatataatgttaaacgcattacttgaattatgaatgtatacttgagacgttgttgaattacatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 26119  T
Q  147 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 205  Q
    | || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26120 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 26179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540 (Bit Score: 98; Significance: 2e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0540
Description:

Target: scaffold0540; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 47 - 211
Target Start/End: Original strand, 3106 - 3270
Alignment:
Q  47 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 146  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||   || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  3106 tgtgatataatgttatatgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttg-ttttgtatact 3204  T
Q  147 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 211  Q
    | || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  3205 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 3270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 96; Significance: 3e-47; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 41 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 52085 - 51914
Alignment:
Q  41 ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 140  Q
    |||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  52085 ttatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttg 51986  T
Q  141 tatactg-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 211  Q
    |||| || || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  51985 tatattgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 51914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 62 - 211
Target Start/End: Original strand, 167948 - 168098
Alignment:
Q  62 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgtt 160  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||| ||||    
T  167948 tatgcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctatttttgtatactgcctatgttgttgtt 168047  T
Q  161 gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 211  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||| |||||    
T  168048 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatg 168098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217 (Bit Score: 94; Significance: 5e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0217
Description:

Target: scaffold0217; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 47 - 211
Target Start/End: Original strand, 16555 - 16720
Alignment:
Q  47 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 146  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || ||| |||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16555 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatacttgagatgctgttgacttccatttgatattattatgtcatgctgttttcgtatact 16654  T
Q  147 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 211  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||    
T  16655 gcttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaattgatgaagatgatgatg 16720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 94; Significance: 5e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 47 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 13377 - 13212
Alignment:
Q  47 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 146  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13377 tgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 13278  T
Q  147 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 211  Q
    | || |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||| |||||    
T  13277 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatg 13212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0908 (Bit Score: 93; Significance: 2e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0908
Description:

Target: scaffold0908; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 47 - 214
Target Start/End: Original strand, 3141 - 3309
Alignment:
Q  47 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 146  Q
    |||||||||||  || | ||||||||||||||||   || ||| |||||| |||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3141 tgtgatataatgttaaacgcattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgaattacatttgatattattatatcatgctgtttttgtatact 3240  T
Q  147 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatg 214  Q
    || | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  3241 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgatg 3309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228 (Bit Score: 93; Significance: 2e-45; HSPs: 3)
Name: scaffold0228
Description:

Target: scaffold0228; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 47 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 4673 - 4522
Alignment:
Q  47 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 146  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4673 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatact 4574  T
Q  147 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 198  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  4573 gcttgtgttgctgttgttatttaactaag-cgcatgagtcggtctaagttgat 4522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #2
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 47 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 12255 - 12104
Alignment:
Q  47 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 146  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12255 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatact 12156  T
Q  147 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 198  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  12155 gcttgtgttgctgttgttatttaactaag-cgcatgagtcggtctaagttgat 12104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #3
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 47 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 22207 - 22056
Alignment:
Q  47 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 146  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22207 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatact 22108  T
Q  147 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 198  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  22107 gcttgtgttgctgttgttatttaactaag-cgcatgagtcggtctaagttgat 22056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 91; Significance: 3e-44; HSPs: 4)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 67 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 116571 - 116434
Alignment:
Q  67 attacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatt 166  Q
    ||||||||||||||   || ||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||    
T  116571 attacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatatgattatgtcatgctgtttt-gtatactgttgtgtcgctgttgttatt 116473  T
Q  167 taactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 205  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  116472 taactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 116434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 30 - 193
Target Start/End: Original strand, 128907 - 129072
Alignment:
Q  30 atttgatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 128  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| || ||||| |||||| |||||||||| ||| |  |||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||    
T  128907 atttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatccattacatgaattatatatga-tgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatc 129005  T
Q  129 atg-ctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 193  Q
    |||  |  |||| | ||||| || |||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  129006 atgaattgttttatgtactgcctatgttgctgtttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaag 129072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 46
Target Start/End: Original strand, 53826 - 53873
Alignment:
Q  1 atatatgatgtttta--agatgttgattaccatttgatgttgttatat 46  Q
    ||||||||||||| |  |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  53826 atatatgatgtttaagtagatgttgattatcatttgatgttgttatat 53873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 78505 - 78453
Alignment:
Q  30 atttgatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaattata 81  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| | |||||||||||| |||||||||    
T  78505 atttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattata 78453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 90; Significance: 1e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 47 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 39642 - 39486
Alignment:
Q  47 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 146  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||||||   || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  39642 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatact 39544  T
Q  147 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaaga 203  Q
    | || ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  39543 gcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 39486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 90; Significance: 1e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 47 - 203
Target Start/End: Original strand, 75170 - 75326
Alignment:
Q  47 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 146  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||||||   || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  75170 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatact 75268  T
Q  147 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaaga 203  Q
    | || ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  75269 gcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 75326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 90; Significance: 1e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 47 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 2017 - 1852
Alignment:
Q  47 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 146  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2017 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 1918  T
Q  147 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 211  Q
    | || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  1917 gtctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 1852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1842 (Bit Score: 83; Significance: 2e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold1842
Description:

Target: scaffold1842; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 62 - 211
Target Start/End: Original strand, 1018 - 1168
Alignment:
Q  62 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgtt 160  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||| ||||    
T  1018 tatgcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctatttttgtatactgcctatgttgttgtt 1117  T
Q  161 gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 211  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||| |||||    
T  1118 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatg 1168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 82; Significance: 7e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 47 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 5015 - 4850
Alignment:
Q  47 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 146  Q
    |||||||||||  | ||||||||||||||    ||| |||||| || ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5015 tgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatacttaagatgttgttgaattgcatttgatattattatgtcatgctgattttgtatact 4916  T
Q  147 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 211  Q
    | || |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| | |||||| |||||    
T  4915 gcctatgttgctgttgttatttaactaatctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatg 4850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292 (Bit Score: 82; Significance: 7e-39; HSPs: 2)
Name: scaffold0292
Description:

Target: scaffold0292; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 47 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 3636 - 3471
Alignment:
Q  47 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 146  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3636 tgtgatataatgttatttgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 3537  T
Q  147 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 211  Q
    | || ||||||| | |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  3536 gcctatgttgctttagttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 3471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292; HSP #2
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 47 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 508 - 344
Alignment:
Q  47 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 146  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||   ||||| || ||| ||||||||||| || |||||||||||| |||||||| |||| |||||||    
T  508 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatcgaatatttaagatgttgttgacttccaattgatattattacgtcatgctatttt-gtatact 410  T
Q  147 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 211  Q
    || | ||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||    
T  409 gcctatgttattgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgataaagatgatgatg 344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 82; Significance: 7e-39; HSPs: 4)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 47 - 211
Target Start/End: Original strand, 32913 - 33076
Alignment:
Q  47 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 146  Q
    |||| ||||||  ||||||||||||| ||| ||||  |||||| || ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  32913 tgtgttataatgttatatgcattactcgaagtataa-tgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttt-gtatact 33010  T
Q  147 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 211  Q
    || |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  33011 gcctgtgttgctgttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 33076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 47 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 46092 - 45929
Alignment:
Q  47 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 146  Q
    |||| ||||||  ||||||||||||| ||| ||||  |||||| || ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  46092 tgtgttataatgttatatgcattactcgaagtataa-tgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttt-gtatact 45995  T
Q  147 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 211  Q
    || |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  45994 gcctgtgttgctgttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 45929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 48 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 16278 - 16114
Alignment:
Q  48 gtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 147  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||| ||||   || ||| |||||| | ||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||    
T  16278 gtgatataatgttatatgcattacttgagttatgaatgtatacttgagatgatgttggcttgcatttgatattatgatatcttgctgtttttgtatactg 16179  T
Q  148 c-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 211  Q
    | | ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  16178 cctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 16114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #4
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 150 - 211
Target Start/End: Original strand, 17388 - 17449
Alignment:
Q  150 gtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  17388 gtgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 17449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0121 (Bit Score: 80; Significance: 1e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0121
Description:

Target: scaffold0121; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 32 - 211
Target Start/End: Original strand, 8472 - 8649
Alignment:
Q  32 ttgatgttg-ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 130  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8472 ttgatgttgattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcat 8571  T
Q  131 gctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 211  Q
    |||||||||| |||||| || ||||||   ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  8572 gctgtttttg-atactgcctatgttgc---tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 8649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 79; Significance: 4e-37; HSPs: 2)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 47 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 26061 - 25904
Alignment:
Q  47 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 146  Q
    |||||||||||  || |||||||||||||| ||||  |||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||    
T  26061 tgtgatataatgttaaatgcattacttgaagtataattgaatatttgagatgttgtttacttgcatttgatattattatgtcatgat-attttgtatact 25963  T
Q  147 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 204  Q
    | || ||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||    
T  25962 gcctatgttgctattgttatttaactaagcttcatgagtcggtctaagttgatgaagat 25904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 47 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 40023 - 39859
Alignment:
Q  47 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 146  Q
    |||||||||||  || |||||||||||||| ||||  |||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||    
T  40023 tgtgatataatgttaaatgcattacttgaagtataattgaatatttgagatgttgtttacttgcatttgatattattatgtcatgat-attttgtatact 39925  T
Q  147 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 211  Q
    | || ||||||| |||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| |||||| |||||    
T  39924 gcctatgttgctattgttatttaactaagcttcatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatg 39859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621 (Bit Score: 76; Significance: 3e-35; HSPs: 2)
Name: scaffold0621
Description:

Target: scaffold0621; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 32 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 8650 - 8481
Alignment:
Q  32 ttgatgttgtt-atattgtgatataat--tatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 128  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||  | ||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| |||| ||    
T  8650 ttgatgttgtttataatgtgatataatattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatc 8551  T
Q  129 atgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttga 197  Q
    |||||| ||||| |||||| || ||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8550 atgctg-ttttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 8481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 51 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 6695 - 6536
Alignment:
Q  51 atataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-t 149  Q
    |||||||| ||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  6695 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 6599  T
Q  150 gtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 211  Q
     |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||| |||||    
T  6598 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatgatg 6536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0647
Description:

Target: scaffold0647; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 47 - 211
Target Start/End: Original strand, 6076 - 6244
Alignment:
Q  47 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 146  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6076 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattatcatgtcatgctgtttttgtatact 6175  T
Q  147 gc---tg-tgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 211  Q
     |   || ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  6176 acctatgttgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 6244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 4)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 98 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 28529 - 28415
Alignment:
Q  98 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttg 196  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28529 gttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 28430  T
Q  197 attaagatgttgatg 211  Q
    || |||||| |||||    
T  28429 atgaagatgatgatg 28415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 98 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 11407 - 11293
Alignment:
Q  98 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagtt 195  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||| ||||| || ||| | ||||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11407 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 11309  T
Q  196 gattaagatgttgatg 211  Q
    | | |||||| |||||    
T  11308 gttgaagatgatgatg 11293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 159 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 2050 - 1998
Alignment:
Q  159 ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 211  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||| |||||    
T  2050 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatg 1998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #4
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 159 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 4605 - 4553
Alignment:
Q  159 ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 211  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||| |||||    
T  4605 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatg 4553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327 (Bit Score: 74; Significance: 4e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0327
Description:

Target: scaffold0327; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 47 - 148
Target Start/End: Original strand, 3485 - 3586
Alignment:
Q  47 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 146  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||  ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3485 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgagtgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 3584  T
Q  147 gc 148  Q
    ||    
T  3585 gc 3586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 154 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 343 - 292
Alignment:
Q  154 tgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 205  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||||||    
T  343 tgcttttgttatttaactaagttgcatgagtctatataagatgattaagatg 292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 74; Significance: 4e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 47 - 194
Target Start/End: Original strand, 24257 - 24406
Alignment:
Q  47 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgt-ttttgtatac 145  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  24257 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatatttttatgtcatgctgtgttttgtatac 24356  T
Q  146 tgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagt 194  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24357 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 24406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0639 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0639
Description:

Target: scaffold0639; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 64 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 8628 - 8480
Alignment:
Q  64 tgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact-gctgtgttgctgttgt 162  Q
    ||||||||||||| || |  |||||  || ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||| ||||    
T  8628 tgcattacttgaagtacacttgaatgtttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatactgtttttgtatactacctatgttgctattgt 8529  T
Q  163 tatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 211  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  8528 tatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 8480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 71; Significance: 3e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 30 - 197
Target Start/End: Original strand, 27686 - 27855
Alignment:
Q  30 atttgatgttg-ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 128  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||  |||||| |||||||| || ||||||||||| |||| ||    
T  27686 atttgatgttggttataatgtgatataattgtatatgcattactagaattatatgtgaatgtttgagatgttgttgatttacatttgatattgttatatc 27785  T
Q  129 atgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttga 197  Q
    |||||||||| | ||||| | | ||||| |||| |||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27786 atgctgtttt-gcatactacctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 27855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0183 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0183
Description:

Target: scaffold0183; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 52 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 13165 - 13092
Alignment:
Q  52 tataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattat 125  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13165 tataattatatatgcattacttcaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattat 13092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0461 (Bit Score: 69; Significance: 4e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0461
Description:

Target: scaffold0461; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 30 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 11648 - 11465
Alignment:
Q  30 atttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 128  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||| |||| | |  ||||||||||| ||    
T  11648 atttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatc 11549  T
Q  129 atgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 211  Q
    ||| || ||||| |||||| || |||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||  ||||||| | | ||||||||||||    
T  11548 atgatg-ttttgcatactgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcaatctaagtcgttgaagatgttgatg 11465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 69; Significance: 4e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 30 - 211
Target Start/End: Original strand, 38193 - 38376
Alignment:
Q  30 atttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 128  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||| |||| | |  ||||||||||| ||    
T  38193 atttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatc 38292  T
Q  129 atgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 211  Q
    ||| || ||||| |||||| || |||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||  ||||||| | | ||||||||||||    
T  38293 atgatg-ttttgcatactgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcaatctaagtcgttgaagatgttgatg 38376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0490 (Bit Score: 67; Significance: 6e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0490
Description:

Target: scaffold0490; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 62 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 2103 - 1953
Alignment:
Q  62 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgtt 160  Q
    |||||||||||||||| || | |||||| || ||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| || |||||||||||| || ||| ||||||    
T  2103 tatgcattacttgaataatgtttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatcattatgtcatgttgattttgtatactgcctatgtcgctgtt 2004  T
Q  161 gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 211  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||| || | |||||| |||||    
T  2003 gttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 1953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 67; Significance: 6e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 30 - 193
Target Start/End: Original strand, 53486 - 53651
Alignment:
Q  30 atttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 128  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| |||| ||    
T  53486 atttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatc 53585  T
Q  129 atgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 193  Q
    ||| || ||||| |||||| || |||||||| |||||  ||||||||| ||||||| || |||||||    
T  53586 atgttg-ttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaatcagtctaag 53651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0695 (Bit Score: 66; Significance: 2e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0695
Description:

Target: scaffold0695; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 6155 - 6070
Alignment:
Q  1 atatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtga 86  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  6155 atatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatttaattgcatatgcattacttgaattatatgtga 6070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 66; Significance: 2e-29; HSPs: 2)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 47 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 40078 - 39914
Alignment:
Q  47 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 146  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||    |||| || ||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  40078 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatcaaatatttaagatgttattgacatgcatttgatattattatgtcatgttgtttt-gtatact 39980  T
Q  147 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 211  Q
    || | ||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||    
T  39979 gcctatgttgctattgttatttaattaagctgcatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatg 39914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 92 - 193
Target Start/End: Original strand, 19883 - 19987
Alignment:
Q  92 tgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcgg 187  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||| |||| |||||  ||| |||| ||||||| || |||||||| |||||  |||| |||| ||||||||||||    
T  19883 tgagatgttgttgaattgcatttgatattgttatatcatgaactg-ttttatatactgcctatgttgctgtttgtttattaattaagctgcatgagtcgg 19981  T
Q  188 tctaag 193  Q
    ||||||    
T  19982 tctaag 19987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357 (Bit Score: 64; Significance: 4e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0357
Description:

Target: scaffold0357; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 30 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 13313 - 13147
Alignment:
Q  30 atttgatgttg-ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaat-aattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgt 127  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||   || ||| |||||||| |||||||||||||| |||| |    
T  13313 atttgatgttggttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatggtttcagatgttgttgatttgcatttgatattgttatat 13214  T
Q  128 catgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 193  Q
    ||||||| ||||| |||||| || ||||| || |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13213 catgctg-ttttgcatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 13147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #2
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 30 - 197
Target Start/End: Original strand, 16037 - 16206
Alignment:
Q  30 atttgatgttg-ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 128  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||  |||||| |||||||| || ||||||||||| |||| ||    
T  16037 atttgatgttggttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatataagaatgtttgagatgttgttgatttacatttgatattgttatatc 16136  T
Q  129 atgctgtttttgtatact-gctgtgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttga 197  Q
    ||| || ||||| |||||  || ||||| || |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16137 atgttg-ttttgcatactacctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 16206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 3)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 32 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 13274 - 13144
Alignment:
Q  32 ttgatgttg-ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 130  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13274 ttgatgttgattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcat 13175  T
Q  131 gctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgtt 160  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  13174 gctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt 13144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 156 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 329 - 281
Alignment:
Q  156 ctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 204  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  329 ctgttgttatttaactaagctgcatgaatcggtctaagttgatgaagat 281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 98 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 34238 - 34124
Alignment:
Q  98 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagtt 195  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  || ||||||||| | ||||| |||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  34238 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggtt-gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagtt 34140  T
Q  196 gattaagatgttgatg 211  Q
    | | |||||| |||||    
T  34139 gttgaagatgatgatg 34124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 62; Significance: 6e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 30 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 225590 - 225482
Alignment:
Q  30 atttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 128  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  |||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  225590 atttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttga-ttgcatttgatattattatatc 225492  T
Q  129 atgctgtttt 138  Q
    | ||||||||    
T  225491 acgctgtttt 225482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 59; Significance: 4e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 30 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 12751 - 12587
Alignment:
Q  30 atttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 128  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| | | || |||||| |||| |||||||||||||||||| |||| ||    
T  12751 atttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattact-gaattatatataagtatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatc 12653  T
Q  129 atgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 193  Q
    |||||| ||||| |||||| || |||||||| |||||  ||||||||| | ||||||||||||||||    
T  12652 atgctg-ttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctacatgagtcggtctaag 12587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 59; Significance: 4e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 122 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 4803 - 4713
Alignment:
Q  122 ttatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||| |||||    
T  4803 ttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatg 4713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 58; Significance: 1e-24; HSPs: 3)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 64 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 174913 - 174785
Alignment:
Q  64 tgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg-ttg 161  Q
    |||||||||||||||||   ||||| ||||||| |||||||| ||| ||||||||| || |||||||||||   |||||||||| || |||||||| |||    
T  174913 tgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgttgaattgaatttgatataatcatgtcatgctg---ttgtatactgcctatgttgctgtttg 174817  T
Q  162 ttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 193  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  174816 ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 174785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 151 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 121827 - 121767
Alignment:
Q  151 tgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 211  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  121827 tgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 121767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 47 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 124751 - 124675
Alignment:
Q  47 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattatt 123  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||  |||| |||||| || | |||||| ||| ||||| |||||||||||    
T  124751 tgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaaaacgttgatgaattgcaattgatattatt 124675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456 (Bit Score: 57; Significance: 6e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0456
Description:

Target: scaffold0456; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 47 - 211
Target Start/End: Original strand, 10381 - 10543
Alignment:
Q  47 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 146  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || ||| || ||| |||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||   |||||||||    
T  10381 tgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacttaagatgttgttgaattgaaattgatattattatgtcatgctg---ttgtatact 10476  T
Q  147 g-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 211  Q
    | || |||||||| |||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| | |||||| |||||    
T  10477 gcctatgttgctgtttgttaattaactatgctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatg 10543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 56; Significance: 2e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 62 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 32216 - 32068
Alignment:
Q  62 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt 160  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| |||||  || |||||| | ||||||||||    
T  32216 tatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttt--gtttactgcctatgttgctgtt 32119  T
Q  161 gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 211  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||| |||||    
T  32118 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatg 32068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 55; Significance: 9e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 30 - 209
Target Start/End: Original strand, 6220 - 6400
Alignment:
Q  30 atttgatgttgttat-attgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 128  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||| | |||||||||||| |||||||||| ||| |  |||||| |||||||| |||||||||||||| | || ||    
T  6220 atttgatgttgttattaatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatga-tgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgtcatatc 6318  T
Q  129 atg--ctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttga 209  Q
    |||  |||||||  |||||||| | |||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||    
T  6319 atgagctgtttta-tatactgcctatgttgctgtttgttcattaactaagttgcatgagtcggtctaagatga--aagatgttga 6400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0503 (Bit Score: 54; Significance: 4e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0503
Description:

Target: scaffold0503; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 30 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 12112 - 12039
Alignment:
Q  30 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 103  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12112 atttgatactgttatattgtgatataattgtatatgcattgcttgaattatatgtgaataattgaggcgttgtt 12039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0503; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 133 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 12042 - 11982
Alignment:
Q  133 tgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 193  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12042 tgttttggtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 11982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 54; Significance: 4e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 113 - 205
Target Start/End: Original strand, 11464 - 11557
Alignment:
Q  113 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 205  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| | | ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| | ||||||    
T  11464 ttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactacctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgttgaagatg 11557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 54; Significance: 4e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 47 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 27996 - 27911
Alignment:
Q  47 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgc 132  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||   || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27996 tgtgatataatgttatatgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgc 27911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 54; Significance: 4e-22; HSPs: 3)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 47 - 211
Target Start/End: Original strand, 15420 - 15583
Alignment:
Q  47 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 146  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |  |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  15420 tgtgatataat-atttatgcattacttgaagaatatttttatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtttt-gtatact 15517  T
Q  147 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 211  Q
    || | ||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| | |||||| |||||    
T  15518 gcctatgttgctcttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgttgaagatgatgatg 15583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 40
Target Start/End: Complemental strand, 27997 - 27958
Alignment:
Q  1 atatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttg 40  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  27997 atatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttg 27958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 151 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 7352 - 7298
Alignment:
Q  151 tgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 205  Q
    ||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||| | |||| |||||||||||    
T  7352 tgttgctattgttattcaaccaagttgcatgagtcgatttaagatgattaagatg 7298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 54; Significance: 4e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 51 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 130066 - 129919
Alignment:
Q  51 atataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-t 149  Q
    |||||||| ||||| |||||| |||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  130066 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 129969  T
Q  150 gtgttgctgt-tgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 198  Q
     ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  129968 atgttgctgtgtgttatttaactaagatgcatgagtcggtctaagttgat 129919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 30 - 193
Target Start/End: Original strand, 60652 - 60818
Alignment:
Q  30 atttgatgttgttatat-tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 128  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||  |||||| |||||||| ||||| ||||||||  ||| ||    
T  60652 atttgatgttgttaattatgtgatatatttgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgca-ttgatattggtatatc 60750  T
Q  129 at--gctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 193  Q
    ||  |||| |||||||||||| || |||||||| |||||  ||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  60751 atgagctg-ttttgtatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtttaag 60818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0555 (Bit Score: 53; Significance: 1e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0555
Description:

Target: scaffold0555; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 32 - 197
Target Start/End: Original strand, 10481 - 10647
Alignment:
Q  32 ttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 130  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||| |||||| |||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  10481 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 10579  T
Q  131 gctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttga 197  Q
    | || ||| | ||||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  10580 gatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcataagtcggtctaagttga 10647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0427 (Bit Score: 53; Significance: 1e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0427
Description:

Target: scaffold0427; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 113 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 13596 - 13513
Alignment:
Q  113 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttg 196  Q
    |||||||||| |||||||| |||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13596 ttgatattatcatgtcatgttgtttt-gtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 13513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 51; Significance: 2e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 30 - 131
Target Start/End: Original strand, 7996 - 8098
Alignment:
Q  30 atttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 128  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||  || ||| |||||||| || |||||||||||||||| ||    
T  7996 atttgatgttgtttataatgtgatataattttatatacattacttgaattatatatgaatgtttaagatgttgttgaatttcatttgatattattatatc 8095  T
Q  129 atg 131  Q
    |||    
T  8096 atg 8098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 51; Significance: 2e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 47 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 21077 - 20911
Alignment:
Q  47 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 146  Q
    |||||||||||  | ||||||||||||| |  | || ||||||  | ||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| |    
T  21077 tgtgatataatgttttatgcattacttgtagaacatttgaatatataagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgcatatt 20978  T
Q  147 g-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 211  Q
    | || |||||||| |||||| ||||||||| |  |||||||||||||||| | | ||||||||||||    
T  20977 gcctatgttgctgattgttaattaactaagctttatgagtcggtctaagtcgttgaagatgttgatg 20911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0070 (Bit Score: 51; Significance: 2e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0070
Description:

Target: scaffold0070; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 62 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 4675 - 4545
Alignment:
Q  62 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt 160  Q
    ||||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||| ||  |||||||||||| || || ||||| | ||| ||||||| | || || ||||    
T  4675 tatgcattacttgaagtataaatgaatatttaagatgttgttgaattatatttgatattatgatatcttgctgctgttgcatactgcctatgctgttgtt 4576  T
Q  161 gttatttaactaagttgcatgagtcggtcta 191  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4575 gttatttaactaagttgcatgagtcggtcta 4545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 50; Significance: 9e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 98 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 15776 - 15668
Alignment:
Q  98 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagtt 195  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||| ||||| || ||| ||||||||| | |||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  15776 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcacgagtcggtctaagtt 15678  T
Q  196 gattaagatg 205  Q
    ||||||||||    
T  15677 gattaagatg 15668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 49; Significance: 3e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 151 - 211
Target Start/End: Original strand, 4893 - 4953
Alignment:
Q  151 tgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||    
T  4893 tgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatg 4953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 47 - 136
Target Start/End: Original strand, 918 - 1006
Alignment:
Q  47 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtt 136  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||||||   |||||| ||||||  ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  918 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaattatgattgaatatttgagattttgttgacttgca-ttgatattattatgccatgctgtt 1006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 47; Significance: 5e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 103 - 211
Target Start/End: Original strand, 6134 - 6243
Alignment:
Q  103 tgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatta 200  Q
    ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | |||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  6134 tgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttactgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 6232  T
Q  201 agatgttgatg 211  Q
    ||||| |||||    
T  6233 agatgatgatg 6243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 47; Significance: 5e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 51 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 19424 - 19278
Alignment:
Q  51 atataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-t 149  Q
    |||||||| ||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  19424 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 19328  T
Q  150 gtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 198  Q
     |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19327 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 19278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 46; Significance: 2e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 30 - 211
Target Start/End: Original strand, 1011 - 1189
Alignment:
Q  30 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 129  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| |||||| ||| |||  | || ||||||||   |||||||| || |||| ||||||||||| |||    
T  1011 atttgatgttgttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctg-ataattga---gttgttgatttacattcgatattattatatca 1106  T
Q  130 tgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 211  Q
    || ||  |||| |||||| || ||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||| || | |||||| |||||    
T  1107 tgatg-gtttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 1189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 151 - 185
Target Start/End: Original strand, 4286 - 4320
Alignment:
Q  151 tgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtc 185  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  4286 tgttgctgctgttatttaactaagttgcatgagtc 4320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 46; Significance: 2e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 32 - 198
Target Start/End: Original strand, 45732 - 45899
Alignment:
Q  32 ttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 130  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||| ||| || |||||||| | ||| ||||||||| |||| |||||| |||| |||||| |||| ||||    
T  45732 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacatcacatgaattatgtttga-taattgagatgttgatgacttacattcgatattgttatatcat 45830  T
Q  131 gctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 198  Q
    | || ||| | ||||||| | | || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  45831 gatgattt-gcatactgcctatttttctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 45899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0530 (Bit Score: 45; Significance: 8e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0530
Description:

Target: scaffold0530; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 159 - 211
Target Start/End: Original strand, 1102 - 1154
Alignment:
Q  159 ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 211  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1102 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatg 1154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 45; Significance: 8e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 159 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 6664 - 6612
Alignment:
Q  159 ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 211  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6664 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatg 6612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 159 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 14044 - 13992
Alignment:
Q  159 ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 211  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14044 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatg 13992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 45; Significance: 8e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 30 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 25289 - 25121
Alignment:
Q  30 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 129  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||| || ||||| |||||| |||||||||| || ||  |||||| |||||||| ||||| |||||||  |||| |||    
T  25289 atttgatgttgtaataatgtgatatatttgtatatacattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttgttgatttgca-ttgatatcgttatatca 25192  T
Q  130 t--gctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttga 197  Q
    |  |||| |||| ||||||| || |||||||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25191 tgagctg-ttttatatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 25121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 720 - 620
Alignment:
Q  30 atttgatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 128  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| | |||||||||||| |||||||||| || ||  |||||| ||| |||| |||| ||||||||| |||| ||    
T  720 atttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatc 623  T
Q  129 atg 131  Q
    |||    
T  622 atg 620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 45; Significance: 8e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 159 - 211
Target Start/End: Original strand, 15845 - 15897
Alignment:
Q  159 ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 211  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15845 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatg 15897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 154 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 178952 - 178901
Alignment:
Q  154 tgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 205  Q
    |||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  178952 tgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagtcgatcaagatg 178901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0422 (Bit Score: 44; Significance: 3e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0422
Description:

Target: scaffold0422; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 3 - 46
Target Start/End: Complemental strand, 3229 - 3186
Alignment:
Q  3 atatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 46  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3229 atatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 3186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 51 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 5803 - 5657
Alignment:
Q  51 atataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-t 149  Q
    |||||||| ||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||||  ||||||| |    
T  5803 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattttc-atactgcct 5707  T
Q  150 gtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 198  Q
     |||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5706 atgttgctgtttgttattttactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 5657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 3)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 151 - 205
Target Start/End: Original strand, 15298 - 15352
Alignment:
Q  151 tgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 205  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15298 tgttgctattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctacgttgattaagatg 15352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 98 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 1402 - 1290
Alignment:
Q  98 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagtt 195  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   ||| ||||| | |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  1402 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgatgtt---gtacactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 1306  T
Q  196 gattaagatgttgatg 211  Q
    | | |||||| |||||    
T  1305 gttgaagatgatgatg 1290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 98 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 7379 - 7267
Alignment:
Q  98 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagtt 195  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||| ||||| ||||   ||||||||| | ||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  7379 gttgatgaattgaatttgatataattatttcatgttgtt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 7283  T
Q  196 gattaagatgttgatg 211  Q
    | | |||||| |||||    
T  7282 gttgaagatgatgatg 7267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 97190 - 97089
Alignment:
Q  30 atttgatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 128  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| || |||||||||||| |||||||||| ||| |  |||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||    
T  97190 atttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatga-tgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatc 97092  T
Q  129 atg 131  Q
    |||    
T  97091 atg 97089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 106468 - 106367
Alignment:
Q  30 atttgatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 128  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| || |||||||||||| |||||||||| ||| |  |||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||    
T  106468 atttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatga-tgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatc 106370  T
Q  129 atg 131  Q
    |||    
T  106369 atg 106367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 267844 - 267679
Alignment:
Q  30 atttgatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 128  Q
    |||||||| ||||| || |||||||||| | |||||||||||| |||||||||| |||    ||||||  ||||||| |||||||||||||| |||| ||    
T  267844 atttgatggtgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatga--tgttgagatattgttgatttgcatttgatattgttatatc 267747  T
Q  129 atg--ctgtttttgtatactgc-tgtgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 193  Q
    |||  ||| |||| |||||||| | ||||| || |||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  267746 atgaactg-ttttatatactgcatatgttgatgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaag 267679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1984 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold1984
Description:

Target: scaffold1984; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 51 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 290 - 143
Alignment:
Q  51 atataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-t 149  Q
    |||||||| ||||| |||||| |||||||| | ||| || |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  290 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 193  T
Q  150 gtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 198  Q
     ||||| |||| ||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  192 atgttgttgtttgttgtttaactaagctgcatgaatcggtctaagttgat 143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1427 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold1427
Description:

Target: scaffold1427; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 46
Target Start/End: Complemental strand, 1636 - 1591
Alignment:
Q  1 atatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 46  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1636 atatatgattttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 1591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0628 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0628
Description:

Target: scaffold0628; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 91 - 198
Target Start/End: Original strand, 2805 - 2913
Alignment:
Q  91 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggt 188  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | ||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  2805 ttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgtagctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 2903  T
Q  189 ctaagttgat 198  Q
    ||||| ||||    
T  2904 ctaagatgat 2913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0351 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0351
Description:

Target: scaffold0351; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 98 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 16395 - 16283
Alignment:
Q  98 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttg-ttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagtt 195  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||| | ||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  16395 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttcttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 16299  T
Q  196 gattaagatgttgatg 211  Q
    | | |||||| |||||    
T  16298 gttgaagatgatgatg 16283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 91 - 198
Target Start/End: Original strand, 14696 - 14804
Alignment:
Q  91 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggt 188  Q
    |||||| |||||||| ||||||| ||||||| ||| ||||| || |||| | |||||| | |||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||    
T  14696 ttgagatgttgttgatttgcattcgatattactatatcatgatgattttct-tactgcctatgttgctgtttgttagttaactaagctgcatgagtcggt 14794  T
Q  189 ctaagttgat 198  Q
    ||||||||||    
T  14795 ctaagttgat 14804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2014 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold2014
Description:

Target: scaffold2014; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 111 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 1134 - 1051
Alignment:
Q  111 atttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 193  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||| | ||||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1134 atttgatattgttatatcatgctgtttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 1051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1765 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1765
Description:

Target: scaffold1765; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 159 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 1135 - 1091
Alignment:
Q  159 ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaaga 203  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1135 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 1091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 91 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 32657 - 32551
Alignment:
Q  91 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggt 188  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||| |||||| | ||||||| | |||||||||| |||  ||||||||| |||||||||||||    
T  32657 ttgagatgttgttga-ttgcatttgatattgttatatcatgttgtttt-gcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggt 32560  T
Q  189 ctaagttga 197  Q
    |||||||||    
T  32559 ctaagttga 32551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 47 - 193
Target Start/End: Original strand, 51839 - 51985
Alignment:
Q  47 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacg-ttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 145  Q
    |||||||||||  |||| |||||||||||| | ||  ||||||||||||| | |||||| |||||||| |||||||||||||| |||| |||||| || |    
T  51839 tgtgatataatg-tatacgcattacttgaagtttaaatgaataattgagatgattgttggcttgcatt-gatattattatgtcttgctatttttgaatgc 51936  T
Q  146 tg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 193  Q
    || || || ||||| ||| | |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  51937 tgcctatg-tgctgtttgatgtttaactaagctgcatgagtcggtctaag 51985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000008; HSPs: 2)
Name: scaffold0556
Description:

Target: scaffold0556; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 51 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 8176 - 8090
Alignment:
Q  51 atataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt 138  Q
    |||||||| ||||| |||||| |||||||| | ||| |  |||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  8176 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tgtttgagatgttgttgacttgcatttgatattgttatatcatgctgtttt 8090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 98 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 6927 - 6826
Alignment:
Q  98 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagtt 195  Q
    |||||||| |||||||  ||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | |||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||| |    
T  6927 gttgttgatttgcattcaatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagctgcatgagtcggtctaagat 6829  T
Q  196 gat 198  Q
    |||    
T  6828 gat 6826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0205 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0205
Description:

Target: scaffold0205; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 107 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 29660 - 29561
Alignment:
Q  107 ttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 205  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| || |||||  || | | || | || |||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||    
T  29660 ttgcaattgatattattatgtcatgctattattgtaatctacctatgctactattgttatttaactaagtcacatgagtcagtctaagttgattaagatg 29561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0309
Description:

Target: scaffold0309; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 62 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 6761 - 6675
Alignment:
Q  62 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc 148  Q
    |||||||||||||||| || | |||||| || ||| |||||||| ||||  ||||||| ||||||||||| || |||||||||||||    
T  6761 tatgcattacttgaataatgtttgaatatttaagatgttgttgaattgctattgatatcattatgtcatgttgattttgtatactgc 6675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 31 - 120
Target Start/End: Original strand, 18176 - 18265
Alignment:
Q  31 tttgatgttgttat-attgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatatt 120  Q
    |||||||||||||| | |||||||||| | |||||||||||| |||||||||| || ||  |||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  18176 tttgatgttgttattaatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttgttgatttgcatttgatatt 18265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 98 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 13054 - 12954
Alignment:
Q  98 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagtt 195  Q
    |||| ||||||||||| |||||| |||| |||||||| ||| | ||||||| | ||||| |||| ||||||||||| ||  |||||||||||||||||||    
T  13054 gttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgctgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagtt 12956  T
Q  196 ga 197  Q
    ||    
T  12955 ga 12954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000005; HSPs: 3)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 114 - 211
Target Start/End: Original strand, 192997 - 193097
Alignment:
Q  114 tgatattattatgtcatgctgtttttgt-atactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttg-attaagatgttgat 210  Q
    ||||||| |||||||||| |||| |||| || |||| | || ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| | |||| ||||||||||||||    
T  192997 tgatattgttatgtcatgatgttgttgtgattctgcctatgctgctgttgttaattaactaagttgcatgagtcagtccatgttgaattaagatgttgat 193096  T
Q  211 g 211  Q
    |    
T  193097 g 193097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 154 - 208
Target Start/End: Original strand, 15273 - 15327
Alignment:
Q  154 tgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttg 208  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||  | |||| ||| ||||||||||    
T  15273 tgcttttgttatttaactaagttgcatgagtcattataagatgaataagatgttg 15327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 154 - 208
Target Start/End: Original strand, 19795 - 19849
Alignment:
Q  154 tgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttg 208  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||  | |||| ||| ||||||||||    
T  19795 tgcttttgttatttaactaagttgcatgagtcattataagatgaataagatgttg 19849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 159 - 198
Target Start/End: Original strand, 2713 - 2752
Alignment:
Q  159 ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 198  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  2713 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 2752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0198
Description:

Target: scaffold0198; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 154 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 23897 - 23846
Alignment:
Q  154 tgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 205  Q
    |||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23897 tgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatcaagatg 23846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 38483 - 38339
Alignment:
Q  47 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat--gctgtttttgtata 144  Q
    |||||||||  | |||||||||||| |||||||||| ||| |  |||||| |||||||| |||||||||||||| | || ||||  |||| |||| ||||    
T  38483 tgtgatatatatgtatatgcattacatgaattatatatga-tgtttgagatgttgttgaattgcatttgatattgtcatatcatgagctg-ttttatata 38386  T
Q  145 ctg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtc 189  Q
    ||| || |||||||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||    
T  38385 ctgcctatgttgctgtttgttcattaactaagctgcatgagtcggtc 38339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 98 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 51695 - 51601
Alignment:
Q  98 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 193  Q
    |||| ||| ||| ||||| ||| ||||||||||| ||||   ||||||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  51695 gttgatgaattgaatttgttataattatgtcatgatgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 51601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 30 - 197
Target Start/End: Original strand, 8011 - 8180
Alignment:
Q  30 atttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 128  Q
    |||| |||||||| ||| ||| ||||| || ||||| |||||| |||||||||| |||    ||| || |||||||| ||| |||||||||| |||| ||    
T  8011 atttaatgttgttgataatgttatatagttgtatatacattacatgaattatatatgatg--ttgtgatgttgttgatttgtatttgatattgttatatc 8108  T
Q  129 atg--ctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttga 197  Q
    |||  ||| ||| ||||||||| | |||||||||| |||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8109 atgaactggttt-gtatactgcctatgttgctgtttgtttgttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 8180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0131
Description:

Target: scaffold0131; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 159 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 36503 - 36457
Alignment:
Q  159 ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 205  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  36503 ttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatcaagatg 36457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0150
Description:

Target: scaffold0150; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 87 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 32224 - 32112
Alignment:
Q  87 ataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctg-tgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagt 184  Q
    ||||||||||||||| ||| || |||| |||||| |||| ||||| || ||||| ||||| ||  ||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||    
T  32224 ataattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgttgtttgttatttatctaagctgcatgagt 32126  T
Q  185 cggtctaagttgat 198  Q
    ||||||||| ||||    
T  32125 cggtctaagatgat 32112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 107 - 197
Target Start/End: Original strand, 23898 - 23989
Alignment:
Q  107 ttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttga 197  Q
    ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | |||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  23898 ttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttga 23989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 46
Target Start/End: Original strand, 36020 - 36065
Alignment:
Q  1 atatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 46  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||    
T  36020 atatatgatgttttaagatgttgattattttttgatgttcttatat 36065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 91 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 10649 - 10542
Alignment:
Q  91 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggt 188  Q
    |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | ||||| |||| |||||||||  ||| |||||||||||||    
T  10649 ttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaaaaaagctgcatgagtcggt 10551  T
Q  189 ctaagttga 197  Q
    |||||||||    
T  10550 ctaagttga 10542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0737 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0737
Description:

Target: scaffold0737; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 30 - 131
Target Start/End: Original strand, 1735 - 1835
Alignment:
Q  30 atttgatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 128  Q
    |||||| ||||||| || |||||||||| | |||||||||||| | |||||||| |||    |||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||    
T  1735 atttgacgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacataaattatatatgatg--ttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatc 1832  T
Q  129 atg 131  Q
    |||    
T  1833 atg 1835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 159 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 12819 - 12780
Alignment:
Q  159 ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 198  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12819 ttgttatttagctaagctgcatgagtcggtctaagttgat 12780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0425 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0425
Description:

Target: scaffold0425; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 154 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 213 - 162
Alignment:
Q  154 tgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 205  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||||||    
T  213 tgctattgttatttaactaagttgcatgagtctatataagatgattaagatg 162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 2)
Name: scaffold0210
Description:

Target: scaffold0210; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 154 - 205
Target Start/End: Original strand, 21866 - 21917
Alignment:
Q  154 tgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 205  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||| | |||| |||||||||||    
T  21866 tgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatg 21917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 154 - 205
Target Start/End: Original strand, 29758 - 29809
Alignment:
Q  154 tgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 205  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||| | |||| |||||||||||    
T  29758 tgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatg 29809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 154 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 69848 - 69797
Alignment:
Q  154 tgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 205  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||| ||||||    
T  69848 tgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatg 69797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1351 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1351
Description:

Target: scaffold1351; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 189 - 88
Alignment:
Q  30 atttgatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 128  Q
    |||||||||||||| || ||| |||||| | |||||||||||| |||||||||| || ||  |||||| ||| |||| |||||| ||||||| |||| ||    
T  189 atttgatgttgttaataatgttatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttattgatttgcatctgatattgttatatc 91  T
Q  129 atg 131  Q
    |||    
T  90 atg 88  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1124 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1124
Description:

Target: scaffold1124; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 151 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 1938 - 1884
Alignment:
Q  151 tgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 205  Q
    ||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||| | |||| |||||||||||    
T  1938 tgttgctattgttattcaaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatg 1884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0718 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0718
Description:

Target: scaffold0718; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 159 - 193
Target Start/End: Original strand, 5196 - 5230
Alignment:
Q  159 ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 193  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5196 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 5230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 151 - 185
Target Start/End: Original strand, 7330 - 7364
Alignment:
Q  151 tgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtc 185  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  7330 tgttgctgctgttatttaactaagttgcatgagtc 7364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0297
Description:

Target: scaffold0297; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 151 - 205
Target Start/End: Original strand, 10582 - 10636
Alignment:
Q  151 tgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 205  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| | |||| |||| ||||||    
T  10582 tgttgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcgatataagatgatcaagatg 10636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 151 - 185
Target Start/End: Original strand, 5003 - 5037
Alignment:
Q  151 tgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtc 185  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5003 tgttgctgttgttatttaaccaagttgcatgagtc 5037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0211
Description:

Target: scaffold0211; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 160 - 198
Target Start/End: Original strand, 28839 - 28877
Alignment:
Q  160 tgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 198  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28839 tgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 28877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 113 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 47093 - 46996
Alignment:
Q  113 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgat 210  Q
    |||||||||||||||||||||| |   ||| ||||| | ||||| |||| |||||||||||||| | |||||||||||||||| || | |||||| ||||    
T  47093 ttgatattattatgtcatgctgct---gtaaactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 46997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0598 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0598
Description:

Target: scaffold0598; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 62 - 211
Target Start/End: Original strand, 1021 - 1169
Alignment:
Q  62 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt 160  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||| | ||||| ||||    
T  1021 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatataattatgtcatgatgtt---gtatactgcctatgttgatgtt 1117  T
Q  161 g-ttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 211  Q
      ||| ||||||||| |||||||||||||||||| || | |||||| |||||    
T  1118 tattaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 1169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0513 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0513
Description:

Target: scaffold0513; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 46
Target Start/End: Original strand, 10841 - 10886
Alignment:
Q  1 atatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 46  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  10841 atatatgatgttttaaaatgttgagtattatttgatgttgttatat 10886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University