View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF17655_low_3 (Length: 555)

Name: NF17655_low_3
Description: NF17655
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF17655_low_3
NF17655_low_3
[»] chr3 (30 HSPs)
chr3 (11-540)||(5298652-5299181)
chr3 (11-531)||(5250090-5250610)
chr3 (11-522)||(5267977-5268488)
chr3 (11-531)||(4388525-4389051)
chr3 (20-531)||(8589656-8590170)
chr3 (11-531)||(8568536-8569056)
chr3 (23-432)||(5280614-5281023)
chr3 (11-531)||(6735908-6736431)
chr3 (11-307)||(6882450-6882746)
chr3 (36-387)||(6838633-6838984)
chr3 (11-531)||(6448370-6448898)
chr3 (11-327)||(6265637-6265953)
chr3 (75-531)||(6554026-6554485)
chr3 (255-516)||(6947434-6947695)
chr3 (11-531)||(8454572-8455095)
chr3 (11-297)||(6142232-6142518)
chr3 (11-282)||(6168837-6169108)
chr3 (11-154)||(6259145-6259288)
chr3 (11-282)||(6245233-6245504)
chr3 (28-387)||(8471499-8471858)
chr3 (20-437)||(6900043-6900460)
chr3 (11-293)||(13270357-13270639)
chr3 (11-536)||(6479565-6480093)
chr3 (11-422)||(6591028-6591439)
chr3 (11-531)||(6519750-6520273)
chr3 (11-336)||(6721852-6722177)
chr3 (11-139)||(7587793-7587921)
chr3 (11-281)||(6917047-6917317)
chr3 (11-154)||(7749945-7750088)
chr3 (11-149)||(6947187-6947325)
[»] scaffold0425 (1 HSPs)
scaffold0425 (20-531)||(7065-7579)
[»] chr4 (1 HSPs)
chr4 (23-209)||(25242067-25242256)
[»] chr7 (1 HSPs)
chr7 (23-379)||(6573038-6573394)
[»] chr1 (1 HSPs)
chr1 (20-154)||(35140303-35140443)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 486; Significance: 0; HSPs: 30)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 486; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 540
Target Start/End: Original strand, 5298652 - 5299181
Alignment:
Q  11 cacagatctgtctccaatatcttaacccattcacgttgagagaattttcttcgcaagagattccccaatgtttttagagctaaaggcaaccctccacact 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  5298652 cacagatctgtctccaatatcttaacccattcacgttgagagaattttcttcgcaagagattccccaatgcttttacagctagaggcaaccctccacact 5298751  T
Q  111 tttctacgattttcttgccaattgattcaagatttggatattcacttgcatttgtgccgtgaaaagcgtgtctcataaacatactccaacattcactctt 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5298752 tttctacgattttcttgccaattgattcaagatttggatattcacttgcatttgtgccgtgaaaagcgtgtctcacaaacatactccaacattcactctt 5298851  T
Q  211 ctccaattgcttcaaatgaagaagtttggtggacttcatgactgatgctacctccttgtcacgtgttgtcacaataatcttacttccggtagatccattg 310  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5298852 cttcaattgcttcaaatgaagaagtttggtggacttcataactgatgctacctccttgtcacgtgtggtcacaataatcttacttccggtagatccattg 5298951  T
Q  311 ttaaaaggaagtagtaagcgctcccaacattccgcactaccgttccagacatcatccaaaacaagcagatatttctttcctgttagtctctgctgcaatt 410  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5298952 ttaaaaggaagtagtaagcgctcccaacattccgcactaccgttccagacatcatccaaaacaagcagatatttctttcctgttagtctctgctgcaatt 5299051  T
Q  411 gatgttggagtagattcaagtcttcaccatcagccaaagagtgaaatgaccgcaaaattgctttggtaagtccaacaacattgaaagtttccgaaacata 510  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5299052 gatgttggagtagattcaagtcttcaccatctgccgaagagtgaaatgaccgtaaaattgctttggtaagtccaacaacattaaaagtttccgaaacata 5299151  T
Q  511 gacccaggcttttagttcaaactgtttctg 540  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5299152 gacccaggcttttagttcaaactgtttctg 5299181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 11 - 531
Target Start/End: Original strand, 5250090 - 5250610
Alignment:
Q  11 cacagatctgtctccaatatcttaacccattcacgttgagagaattttcttcgcaagagattccccaatgtttttagagctaaaggcaaccctccacact 110  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  5250090 cacatatctgtctccaatatcttaacccaatcacgttgagaaaactttcttcgcaagagatttcccaaagtttttacagctaatggcaaccctccacact 5250189  T
Q  111 tttctacgattttcttgccaattgattcaagatttggatattcacttgcatttgtgccgtgaaaagcgtgtctcataaacatactccaacattcactctt 210  Q
    |  |||  |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  5250190 tgcctataattttcttaccaatagattcaagatttggatattcacttgcattccttccgtaaaaagcatgtctcacaaacatactccaacattcactctc 5250289  T
Q  211 ctccaattgcttcaaatgaagaagtttggtggacttcatgactgatgctacctccttgtcacgtgttgtcacaataatcttacttccggtagatccattg 310  Q
    || ||||| ||  |||| |||    ||||||||||||||||  ||||| |||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||| |    
T  5250290 cttcaatttctctaaattaagctccttggtggacttcatgatagatgccacctccttgttacgtgttgtaacaataattttacttccagtagatccatgg 5250389  T
Q  311 ttaaaaggaagtagtaagcgctcccaacattccgcactaccgttccagacatcatccaaaacaagcagatatttctttcctgttagtctctgctgcaatt 410  Q
       || ||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||    
T  5250390 cataagggaagtagtaagcgctcccaacattccacactcccattccagacatcatccaaaacaagaagatatttcttacctgttagtctctgccgcagtt 5250489  T
Q  411 gatgttggagtagattcaagtcttcaccatcagccaaagagtgaaatgaccgcaaaattgctttggtaagtccaacaacattgaaagtttccgaaacata 510  Q
    ||| |||||||||||| || |||||| |||| |   ||||||||||||| | || |||||||||||| |||||||||||||  |||||||| ||||||||    
T  5250490 gatattggagtagattgaactcttcagcatctgttgaagagtgaaatgagctcataattgctttggtgagtccaacaacatcaaaagtttctgaaacata 5250589  T
Q  511 gacccaggcttttagttcaaa 531  Q
    |||||| ||||| ||||||||    
T  5250590 gacccaagctttaagttcaaa 5250610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 11 - 522
Target Start/End: Original strand, 5267977 - 5268488
Alignment:
Q  11 cacagatctgtctccaatatcttaacccattcacgttgagagaattttcttcgcaagagattccccaatgtttttagagctaaaggcaaccctccacact 110  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  5267977 cacatatctgtctccaatatcttaacccattcatgttgagagaattttcttcgcaagagatttcccaaagtttttacagctaaaggtaaccctccacact 5268076  T
Q  111 tttctacgattttcttgccaattgattcaagatttggatattcacttgcatttgtgccgtgaaaagcgtgtctcataaacatactccaacattcactctt 210  Q
    | ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||  | || |||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||     
T  5268077 tatctactattttctttccaattgattcaagatttgggtattcacttgcattgcttccatgaaaagcatgtcgcacaaacatactccaacattcactctc 5268176  T
Q  211 ctccaattgcttcaaatgaagaagtttggtggacttcatgactgatgctacctccttgtcacgtgttgtcacaataatcttacttccggtagatccattg 310  Q
    || || || ||  |||| |||   ||||||||| |||||||| | |||||||| | ||| |||||||||||||||||| |||||||| | |||||||| |    
T  5268177 cttcagtttctctaaattaaggtttttggtggagttcatgacagttgctaccttcatgttacgtgttgtcacaataattttacttccagcagatccatgg 5268276  T
Q  311 ttaaaaggaagtagtaagcgctcccaacattccgcactaccgttccagacatcatccaaaacaagcagatatttctttcctgttagtctctgctgcaatt 410  Q
       || ||||||| ||||||||||||||||||  |||| || ||||||||||||||||||| |||||  |||||||| |||||||||| ||||||||| |    
T  5268277 aataagggaagtaataagcgctcccaacattcttcactcccattccagacatcatccaaaaaaagcaagtatttcttgcctgttagtccctgctgcaact 5268376  T
Q  411 gatgttggagtagattcaagtcttcaccatcagccaaagagtgaaatgaccgcaaaattgctttggtaagtccaacaacattgaaagtttccgaaacata 510  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| ||  || ||| |||||||| || ||||||||| |||||||| | | |||  ||| |||||||||||||    
T  5268377 gatgttggagtaaattcaagtcttcaccatctgctgaaaagtcaaatgacctcagaattgctttagtaagtccgagaccatcaaaaatttccgaaacata 5268476  T
Q  511 gacccaggcttt 522  Q
    ||||||||||||    
T  5268477 gacccaggcttt 5268488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 11 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 4389051 - 4388525
Alignment:
Q  11 cacagatctgtctccaatatcttaacccattcacgttgagagaattttcttcgcaagagattccccaatgtttttagagctaaaggcaaccctccacact 110  Q
    |||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||| || |||||| ||||||    
T  4389051 cacatatcggtctccaatatcctaacccattcacgttgagagaattttcttcgcaagagatttcccaacgtttttacagctaatggaaaccctacacact 4388952  T
Q  111 tttctacgattttcttgccaattgattcaagatttggatattcacttgcatttgtgccgtgaaaagcgtgtctcataaacatactccaacattcactctt 210  Q
    | ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||  | ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||| |     
T  4388951 tatctacaattttcttgccaattgatacaagatttggatactcacttgcattccttccgtgaaaagcatgtctcacaaacattctccaacattcactttc 4388852  T
Q  211 ctccaattgcttcaaatgaagaagtttggtggacttcatgactgatgctacctccttgtcacgtgttgtcacaataatctt------acttccggtagat 304  Q
     | || || ||  |||| |||    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||      |||||| ||||||    
T  4388851 attcagtttctctaaattaagctccttggtggacttcatgatagatgctacctccttgtcacgagttgtcacaataattttacttccacttccagtagat 4388752  T
Q  305 ccattgttaaaaggaagtagtaagcgctcccaacattccgcactaccgttccagacatcatccaaaacaagcagatatttctttcctgttagtctctgct 404  Q
    |||| |   |  |||||||||||||||||||||| |||| || | || |||||||||||||| |||||||||| ||||||||| || |||||| | ||||    
T  4388751 ccatggcataggggaagtagtaagcgctcccaaccttcctcattcccattccagacatcatctaaaacaagcaaatatttcttaccagttagtttgtgct 4388652  T
Q  405 gcaattgatgttggagtagattcaagtcttcaccatcagccaaagagtgaaatgaccgcaaaattgctttggtaagtccaacaacattgaaagtttccga 504  Q
    |||||||||||||||| ||||| || |||||| |||  |   ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||    
T  4388651 gcaattgatgttggagcagattaaactcttcagcatgtgttgaagagtgaaatgacctcagaattgctttggtaagtccaacaacatcaaaagtttctga 4388552  T
Q  505 aacatagacccaggcttttagttcaaa 531  Q
    ||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  4388551 aacgtagacccaagctttaagttcaaa 4388525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 20 - 531
Target Start/End: Original strand, 8589656 - 8590170
Alignment:
Q  20 gtctccaatatcttaacccattcacgttgagagaattttcttcgcaagagattccccaatgtttttagagctaaaggcaaccctccacacttttctacga 119  Q
    |||||||||||||||| ||| ||| ||||||| || |||||||||||||| |  |||| || ||||| |||||||||||||||||||||||| || |  |    
T  8589656 gtctccaatatcttaatccactcatgttgagaaaaatttcttcgcaagagttggcccattgattttacagctaaaggcaaccctccacacttatccagta 8589755  T
Q  120 ttttcttgccaattgattcaagatttggatattcacttgcatttgtgccgtgaaaagcgtgtctcataaacatactccaacattcactcttctccaattg 219  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   ||||  | || |||||||| ||| ||| ||| | ||||||||| || || || ||||||||    
T  8589756 ttttcttgccagttgattcaagatttggatattcacacacattctttccttgaaaagcatgtgtcacaaataaactccaacaatcgcttttgtccaattg 8589855  T
Q  220 cttcaaatgaagaagtttggtggacttcatgac-tgat--gctacctccttgtcacgtgttgtcacaataatcttacttccggtagatccattgttaaaa 316  Q
     |  |||| ||  |  |||||||| || |  || ||||  ||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||| | | |||||| ||||||     
T  8589856 ttgtaaatcaaataacttggtggatttaagaacatgatatgctacctccttttcacgtgttgtcacgacaatcttacttccagaaaatccatggttaaag 8589955  T
Q  317 ggaagtagtaagcgctcccaacattccgcactaccgttccagacatcatccaaaacaagcagatatttctttcctgttagtctctgctgcaattgatgtt 416  Q
    |||||||||||  ||||||||||||| ||| | |||||||||| ||| || ||||||||||  |||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||    
T  8589956 ggaagtagtaactgctcccaacattctgcattcccgttccagatatcgtctaaaacaagcaagtatttcttgcctgttagtatgtgctgcaattgatgtt 8590055  T
Q  417 ggagtagattcaagtcttcaccatcagccaaagagtgaaatgaccgcaaaattgctttggtaagtccaacaacattgaaagtttccgaaacatagaccca 516  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||  |||| | ||||||    | |||||||||||| |||||||||||||  |||| ||| ||||||||||||||    
T  8590056 ggagtagattcaagtcttcaccatctgctgaagaattaaatgaattgataattgctttggtgagtccaacaacatcaaaagattcagaaacatagaccca 8590155  T
Q  517 ggcttttagttcaaa 531  Q
     ||||| || |||||    
T  8590156 tgctttaagctcaaa 8590170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 11 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 8569056 - 8568536
Alignment:
Q  11 cacagatctgtctccaatatcttaacccattcacgttgagagaattttcttcgcaagagattccccaatgtttttagagctaaaggcaaccctccacact 110  Q
    |||| ||| ||||||||||| |||  |||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  8569056 cacatatcagtctccaatatgttagaccattcaccttgagaaaattttctttgcaagagattccccaatgttttcacagctaaaggcaaccctccacact 8568957  T
Q  111 tttctacgattttcttgccaattgattcaagatttggatattcacttgcatttgtgccgtgaaaagcgtgtctcataaacatactccaacattcactctt 210  Q
    ||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||    ||||  | || |||||||| ||| ||| ||| | ||||||||| ||  |||     
T  8568956 tttctacaatcttctttccaatcgattcaagatttggatattcaaacacattctttccttgaaaagcatgtttcacaaataaactccaacaatctttctc 8568857  T
Q  211 ctccaattgcttcaaatgaagaagtttggtggacttcatgactgatgctacctccttgtcacgtgttgtcacaataatcttacttccggtagatccattg 310  Q
    |||||||||||| ||||||||  | |     || ||||||||| |||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||      
T  8568856 ctccaattgctttaaatgaagttgctgctcagatttcatgactaatgcaacatgcttgtcacgtgttgtcacaataatcttacttcctgaagatccatga 8568757  T
Q  311 ttaaaaggaagtagtaagcgctcccaacattccgcactaccgttccagacatcatccaaaacaagcagatatttctttcctgttagtctctgctgcaatt 410  Q
    ||||| |||||||||||  |||||||| ||||| || | || ||||||| |||||| | |||||||| | | || || ||||||| | |||| || | ||    
T  8568756 ttaaatggaagtagtaactgctcccaaaattcctcattcccattccagatatcatctagaacaagcaaaaactttttgcctgttaatatctgttgtagtt 8568657  T
Q  411 gatgttggagtagattcaagtcttcaccatcagccaaagagtgaaatgaccgcaaaattgctttggtaagtccaacaacattgaaagtttccgaaacata 510  Q
    ||  || |||| ||| |||||||||||| ||||   | || ||||||||||  | ||||| |||||| |||||||||||||  |||| ||| |||||||     
T  8568656 gacatttgagtggatccaagtcttcaccgtcagatgaggaatgaaatgacctgagaattgttttggtgagtccaacaacatcaaaagattctgaaacatg 8568557  T
Q  511 gacccaggcttttagttcaaa 531  Q
    |||||| ||||| ||||||||    
T  8568556 gacccaagctttaagttcaaa 8568536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 23 - 432
Target Start/End: Original strand, 5280614 - 5281023
Alignment:
Q  23 tccaatatcttaacccattcacgttgagagaattttcttcgcaagagattccccaatgtttttagagctaaaggcaaccctccacacttttctacgattt 122  Q
    |||||||||||   ||||||||   |||| |||||  |||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||  |||||||||||| | ||| ||||    
T  5280614 tccaatatcttggtccattcaccaggagaaaatttcattcgcaagagattccctaatgatttcagagctaaaggcggccctccacacttgtttacaattt 5280713  T
Q  123 tcttgccaattgattcaagatttggatattcacttgcatttgtgccgtgaaaagcgtgtctcataaacatactccaacattcactcttctccaattgctt 222  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||| ||| | | ||||||  || || | ||||||||||||    
T  5280714 tcttcccaattgattcaagatttggatattcacttgcattttttccgtgaaaagcatgtctcacaaataaattccaaccatcgctttcctccaattgctt 5280813  T
Q  223 caaatgaagaagtttggtggacttcatgactgatgctacctccttgtcacgtgttgtcacaataatcttacttccggtagatccattgttaaaaggaagt 322  Q
    ||||||||  | || || ||| ||||| |||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||   ||||||||  ||||| ||||||    
T  5280814 caaatgaactatttgggaggatttcattactgctgctacctctttgtcacgtgtggtcacaataatcttacttccaaaagatccatgattaaagggaagt 5280913  T
Q  323 agtaagcgctcccaacattccgcactaccgttccagacatcatccaaaacaagcagatatttctttcctgttagtctctgctgcaattgatgttggagta 422  Q
    |||||  | |||||||||||| |||| || |||   || || || | |||||||| |||| || | ||||||| ||| || ||||  || ||||||||||    
T  5280914 agtaactgttcccaacattccccactgccattctgaacgtcctctataacaagcaaatatctcgtgcctgttattctttgatgcagctgttgttggagta 5281013  T
Q  423 gattcaagtc 432  Q
    ||||||||||    
T  5281014 gattcaagtc 5281023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 11 - 531
Target Start/End: Original strand, 6735908 - 6736431
Alignment:
Q  11 cacagatctgtctccaatatcttaacccattcacgttgagagaattttcttcgcaagagattccccaatgtttttagagctaaaggcaaccctccacact 110  Q
    |||| ||| |||||||||||||||| ||||||| ||| ||| | |||| | ||||| || |  ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  6735908 cacatatcagtctccaatatcttaatccattcatgttcagaaagttttttacgcaaaagttggcccaatgattttatagctagaggcaaccctccacact 6736007  T
Q  111 tttctacgattttcttgccaattgattcaagatttggatattcacttgcatttgtgccgtgaaaagcgtgtctcataaacatactccaacattcactctt 210  Q
    | || || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||   || || | || ||||| || ||| ||| ||| |  |||||||| |  || ||    
T  6736008 tctccactattttcttcccaattgattcaagatttggatattcacaaacactttttccttgaaacgcatgtgtcacaaataatctccaacaattgctttt 6736107  T
Q  211 ctccaattgcttcaaatgaagaagtttggtggactt-----catgactgatgctacctccttgtcacgtgttgtcacaataatcttacttccggtagatc 305  Q
     |||||||| |  |||| ||  | || ||| || ||     ||||||  ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| | |||||    
T  6736108 ttccaattgttgtaaatcaaataattcggttgattttagaacatgac--atgctacctccttttcacgtgttgtcacgataattttacttccagaagatc 6736205  T
Q  306 cattgttaaaaggaagtagtaagcgctcccaacattccgcactaccgttccagacatcatccaaaacaagcagatatttctttcctgttagtctctgctg 405  Q
    ||| |||||| ||||||||||   |||||||| ||||  |||| || ||||||| |||||| ||||||||||  |||||||||||  |||   | || ||    
T  6736206 catggttaaacggaagtagtagctgctcccaatattctacactcccattccagatatcatctaaaacaagcaagtatttctttcccattaacatgtgttg 6736305  T
Q  406 caattgatgttggagtagattcaagtcttcaccatcagccaaagagtgaaatgaccgcaaaattgctttggtaagtccaacaacattgaaagtttccgaa 505  Q
     | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  |||  | |||||||   | |||||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||| |||    
T  6736306 gagttgatgttggagttgattcaagtcttcaccatctgctgaaggattaaatgacttgagaattgctttggtgagtccaaaaacatcgaaagattctgaa 6736405  T
Q  506 acatagacccaggcttttagttcaaa 531  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  6736406 acatagacccatgctttaagttcaaa 6736431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 11 - 307
Target Start/End: Original strand, 6882450 - 6882746
Alignment:
Q  11 cacagatctgtctccaatatcttaacccattcacgttgagagaattttcttcgcaagagattccccaatgtttttagagctaaaggcaaccctccacact 110  Q
    |||| ||| |||||||||| ||||| |||||||  || |||||||||| || |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||    
T  6882450 cacaaatcagtctccaataccttaatccattcagattcagagaatttttttagcaagagattccccaatgttttcagtgctaaaggcaaccccccacact 6882549  T
Q  111 tttctacgattttcttgccaattgattcaagatttggatattcacttgcatttgtgccgtgaaaagcgtgtctcataaacatactccaacattcactctt 210  Q
    ||||||| ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||  | ||||  | || |||||||| | ||||| ||| | ||||||| | |||||||     
T  6882550 tttctactattttcttgcctatcaattcaagatttggatattcaaatacattcctaccttgaaaagcatatctcacaaataaactccaagaatcactctc 6882649  T
Q  211 ctccaattgcttcaaatgaagaagtttggtggacttcatgactgatgctacctccttgtcacgtgttgtcacaataatcttacttccggtagatcca 307  Q
    |||||||||||| || || |  ||   ||||||  |||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| | |||||||    
T  6882650 ctccaattgctttaagtgtattagccgggtggatctcatgattgatgctacttccttgtcatgtgttgtcacaatcatcttacttcctgaagatcca 6882746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 36 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 6838984 - 6838633
Alignment:
Q  36 cccattcacgttgagagaattttcttcgcaagagattccccaatgtttttagagctaaaggcaaccctccacacttttctacgattttcttgccaattga 135  Q
    |||||||| ||| |||||||||| | |||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| || || |||||||||||    
T  6838984 cccattcatgtttagagaattttttccgcaagaggttccccaatgttttcacagctaaaggcaaccctccacacttatctacaatctttttgccaattga 6838885  T
Q  136 ttcaagatttggatattcacttgcatttgtgccgtgaaaagcgtgtctcataaacatactccaacattcactcttctccaattgcttcaaatgaagaagt 235  Q
    |||||| ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||  || |   ||| | ||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| ||  |      
T  6838884 ttcaagttttgggtattcgcttgcatttttgccgtgaaaagcaagtgtggaaaataaactccaactgtcactcttctccaattgtttcaaatcaaataac 6838785  T
Q  236 ttggtggacttcatgactgatgctacctccttgtcacgtgttgtcacaataatcttacttccggtagatccattgttaaaaggaagtagtaagcgctccc 335  Q
    || || || ||||  | ||||||||| |  || || |||||||||||||||||||||||    | |||||| | ||||||||||||||||||   |||||    
T  6838784 tttgtagatttcacaattgatgctacatttttatcgcgtgttgtcacaataatcttactcgtagaagatccttggttaaaaggaagtagtaacgtctccc 6838685  T
Q  336 aacattccgcactaccgttccagacatcatccaaaacaagcagatatttctt 387  Q
    ||| |||| || |    |||||||||||||||| |||||| ||||| |||||    
T  6838684 aactttcctcattcagtttccagacatcatccacaacaagtagatagttctt 6838633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 11 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 6448898 - 6448370
Alignment:
Q  11 cacagatctgtctccaatatcttaacccattcacgttgagagaattttcttcgcaagagattccccaatgtttttagagctaaaggcaaccctccacact 110  Q
    |||| ||| |||||||||||||| | |||||||  |||||| || ||| | |||||  | |  |||| || ||||| ||||||||||||||||||||||     
T  6448898 cacatatcagtctccaatatcttcatccattcatcttgagaaaactttttccgcaaatgttggcccagtgattttatagctaaaggcaaccctccacaca 6448799  T
Q  111 tttctacgattttcttgccaattgattcaagatttggatattcacttgcatttgtgccgtgaaaagcgtgtctcataaacatactccaacattcactctt 210  Q
    | |  |  |||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||   || |  | || |||||||| ||| ||| ||||| ||||||||| |  || ||    
T  6448798 tgttcaatattttcctaccaattgattcaagaattggatattcacacacactctttccatgaaaagcatgtgtcaaaaacaaactccaacaattgctttt 6448699  T
Q  211 ctccaattgcttcaaatgaagaagtttggtggacttcat-----gac-tgat--gctacctccttgtcacgtgttgtcacaataatcttacttccggtag 302  Q
     |||||||| |  |||| ||  |  |||||||| |||||     ||| ||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  6448698 gtccaattggtgtaaatcaaataacttggtggatttcatttcaggacatgatatgctacctccttttcacgtgttgtcacaataatcttacttccagaag 6448599  T
Q  303 atccattgttaaaaggaagtagtaagcgctcccaacattccgcactaccgttccagacatcatccaaaacaagcagatatttctttcctgttagtctctg 402  Q
    |||||| |||||| ||||| ||||   ||||||||| ||| ||| | ||||||||||  || || |||||||| |  |||||||||| ||||||| | ||    
T  6448598 atccatggttaaacggaagcagtacctgctcccaacgttctgcattcccgttccagatgtcgtctaaaacaagaaagtatttctttcttgttagtatgtg 6448499  T
Q  403 ctgcaattgatgttggagtagattcaagtcttcaccatcagccaaagagtgaaatgaccgcaaaattgctttggtaagtccaacaacattgaaagtttcc 502  Q
     |||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||| | |||||||   |  ||||||||||| |||||||||||||  |||  |||     
T  6448498 ttgcagttcatgttggagtagattcaagtcttcaccatctgctgaagaattaaatgactttaggattgctttggtgagtccaacaacatcaaaatattct 6448399  T
Q  503 gaaacatagacccaggcttttagttcaaa 531  Q
    |||||||||||||| | ||| ||||||||    
T  6448398 gaaacatagacccaagatttaagttcaaa 6448370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 11 - 327
Target Start/End: Original strand, 6265637 - 6265953
Alignment:
Q  11 cacagatctgtctccaatatcttaacccattcacgttgagagaattttcttcgcaagagattccccaatgtttttagagctaaaggcaaccctccacact 110  Q
    |||| ||| ||||||||||||| ||||||||||  |  ||||||||||||| | |||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||| |    
T  6265637 cacaaatcagtctccaatatctcaacccattcagttacagagaattttctttggaagagaatccccaatgttttcagagttaaaggcaaccccccacatt 6265736  T
Q  111 tttctacgattttcttgccaattgattcaagatttggatattcacttgcatttgtgccgtgaaaagcgtgtctcataaacatactccaacattcactctt 210  Q
    || |||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    ||||  |||| |||||||| | ||||| ||| | ||||||| | |||||||     
T  6265737 ttgctactattttcttgccaatcaattcaagatttggatattcaaacacattcttgccttgaaaagcatatctcacaaataaactccaagagtcactctc 6265836  T
Q  211 ctccaattgcttcaaatgaagaagtttggtggacttcatgactgatgctacctccttgtcacgtgttgtcacaataatcttacttccggtagatccattg 310  Q
    |||||||||||| |||||||| |||   |||||  |||| ||| | ||||||||  ||||| |||||||||| || ||||||| ||  | |||||||  |    
T  6265837 ctccaattgctttaaatgaagtagtcgtgtggatctcataactaacgctacctcactgtcatgtgttgtcacgatcatcttacctcgagaagatccacgg 6265936  T
Q  311 ttaaaaggaagtagtaa 327  Q
    |||| ||||||||||||    
T  6265937 ttaagaggaagtagtaa 6265953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 75 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 6554485 - 6554026
Alignment:
Q  75 ccaatgtttttagagctaaaggcaaccctccacacttttctacgattttcttgccaattgattcaagatttggatattcacttgcatttgtgccgtgaaa 174  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| || || |||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||   || || | || |||||    
T  6554485 ccaatgattttatagctaaaggcaaccctccacacttgtccactattttcctcccaattgtttcaagatttggatattcacacacactttttccttgaaa 6554386  T
Q  175 agcgtgtctcataaacatactccaacattcactcttctccaattgcttcaaatgaagaagtttggtggactt-----catgactgatgctacctccttgt 269  Q
    ||| ||| ||| ||| |  |||||||| |  || || |||||||| |  |||| ||  | |||||| || ||     ||||||  ||||||||||||| |    
T  6554385 agcatgtgtcacaaataatctccaacaattgcttttttccaattgttgtaaatcaaataatttggttgattttagaacatgac--atgctacctcctttt 6554288  T
Q  270 cacgtgttgtcacaataatcttacttccggtagatccattgttaaaaggaagtagtaagcgctcccaacattccgcactaccgttccagacatcatccaa 369  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||| | |||||||| |||||| ||||||||||   |||||||| ||||  |||| || ||||| | |||||| ||    
T  6554287 cacgtgttgtcacgataatcatacttccagaagatccatggttaaacggaagtagtagctgctcccaatattctacactcccattccatatatcatctaa 6554188  T
Q  370 aacaagcagatatttctttcctgttagtctctgctgcaattgatgttggagtagattcaagtcttcaccatcagccaaagagtgaaatgaccgcaaaatt 469  Q
    ||||||||  |||||||||||  ||||  | |  || | ||||||||||||| ||| ||||| ||||||||| ||  |||  | |||||||   | ||||    
T  6554187 aacaagcaagtatttctttcccattagcatgtcttggagttgatgttggagttgatccaagtattcaccatctgctgaaggattaaatgacttgagaatt 6554088  T
Q  470 gctttggtaagtccaacaacattgaaagtttccgaaacatagacccaggcttttagttcaaa 531  Q
    |||||||| ||||||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  6554087 gctttggtgagtccaaaaacatcgaaagattctgaaacatagacccatgctttaagttcaaa 6554026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 255 - 516
Target Start/End: Original strand, 6947434 - 6947695
Alignment:
Q  255 atgctacctccttgtcacgtgttgtcacaataatcttacttccggtagatccattgttaaaaggaagtagtaagcgctcccaacattccgcactaccgtt 354  Q
    ||||| ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| | |||||||| |||||| ||||| |||||  ||||||||||||| |||   |||||    
T  6947434 atgctgcctccttttcacgagttgtcacgataatcttacttccagaagatccatggttaaagggaagaagtaacagctcccaacattctgcatccccgtt 6947533  T
Q  355 ccagacatcatccaaaacaagcagatatttctttcctgttagtctctgctgcaattgatgttggagtagattcaagtcttcaccatcagccaaagagtga 454  Q
    ||||| |||||| ||||||||||  |||||||||||  |||   | || || | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||| | |    
T  6947534 ccagatatcatctaaaacaagcaagtatttctttcccattaacatgtgttggagttgatgttggagtagattcaagtcttcaccatctgctgaagaatta 6947633  T
Q  455 aatgaccgcaaaattgctttggtaagtccaacaacattgaaagtttccgaaacatagaccca 516  Q
    ||||||   | |||||||||||| |||||||||||||  |||| ||| ||||| ||||||||    
T  6947634 aatgacttgagaattgctttggtgagtccaacaacatcaaaagattctgaaacgtagaccca 6947695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 11 - 531
Target Start/End: Original strand, 8454572 - 8455095
Alignment:
Q  11 cacagatctgtctccaatatcttaacccattcacgttgagagaattttcttcgcaagagattccccaatgtttttagagctaaaggcaaccctccacact 110  Q
    |||| ||| ||||||||||| |||| ||||||| ||| ||| ||| || | ||||  || |  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8454572 cacatatcagtctccaatatattaatccattcatgttcagaaaatgttttccgcagaagttggcccaatgattttatagctaaaggcaaccctccacact 8454671  T
Q  111 tttctacgattttcttgccaattgattcaagatttggatattcacttgcatttgtgccgtgaaaagcgtgtctcataaacatactccaacattcactctt 210  Q
    |||| || |||||  | |||| ||||||||||||||||||||||    || |  | || |||||||| ||| ||| ||| | ||||||||| |  || ||    
T  8454672 tttccactatttttctaccaactgattcaagatttggatattcagacacactctttccttgaaaagcatgtgtcacaaataaactccaacaattgctttt 8454771  T
Q  211 ctccaattgcttcaaatgaagaagtttggtggacttcatgac-tga--tgctacctccttgtcacgtgttgtcacaataatcttacttccggtagatcca 307  Q
     |||||||| |  |||| ||  |  |  || || |||| ||| | |  ||| |||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||   |||||||    
T  8454772 gtccaattgttgtaaatcaaataactctgtcgatttcaggacattatctgccacctccttctcacgtgttgtcacgacaatcttacttccaaaagatcca 8454871  T
Q  308 ttgttaaaaggaagtagtaagcgctcccaacattccgcactaccgttccagacatcatccaaaacaagcagatatttctttcctgttagtctctgctgca 407  Q
    | |||||| |||||||||||   |||||||| |||||||   |||||||||| ||| || |||||||||| ||||||||| ||  ||||  | |  || |    
T  8454872 tggttaaagggaagtagtaacaactcccaacgttccgcatccccgttccagatatcgtctaaaacaagcaaatatttcttgcccattagcatgtattgga 8454971  T
Q  408 attgatgttggagtagattcaagtcttcaccatcagccaaagagtgaaatgaccgcaaaattgctttggtaagtccaacaacattgaaagtttccgaaac 507  Q
     |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||  |||| | ||| |||   | |||||||||||| |||||||||||||  |||| ||| |||||    
T  8454972 gttgatgttggagtagatttaagtcttcaccatctgctgaagaattaaacgacttgagaattgctttggtgagtccaacaacatcaaaagattctgaaac 8455071  T
Q  508 atagacccaggcttttagttcaaa 531  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||    
T  8455072 atagacccatgctttaagttcaaa 8455095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 11 - 297
Target Start/End: Original strand, 6142232 - 6142518
Alignment:
Q  11 cacagatctgtctccaatatcttaacccattcacgttgagagaattttcttcgcaagagattccccaatgtttttagagctaaaggcaaccctccacact 110  Q
    |||| ||| |||||||||||| |||||||||||  || ||||||||||||   ||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||    
T  6142232 cacaaatcagtctccaatatcctaacccattcaatttcagagaattttctattcaagagaatccccaatgttttcagagctaatggcaaccccccacact 6142331  T
Q  111 tttctacgattttcttgccaattgattcaagatttggatattcacttgcatttgtgccgtgaaaagcgtgtctcataaacatactccaacattcactctt 210  Q
    ||||||| ||||||||||| ||  ||||||||||||||||| ||    ||||  | ||  ||||||| | ||||| ||| | ||||||| | | |||||     
T  6142332 tttctactattttcttgcctatcaattcaagatttggatatccaaacacattcctacctggaaaagcatatctcacaaataaactccaagagttactctc 6142431  T
Q  211 ctccaattgcttcaaatgaagaagtttggtggacttcatgactgatgctacctccttgtcacgtgttgtcacaataatcttacttcc 297  Q
    ||||||||||||||||||||| |     | |||  |||||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  6142432 ctccaattgcttcaaatgaagtatccgagcggaactcatgcttgatgctacttccttgtcatgtgttgtcacaatcatcttacttcc 6142518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 11 - 282
Target Start/End: Original strand, 6168837 - 6169108
Alignment:
Q  11 cacagatctgtctccaatatcttaacccattcacgttgagagaattttcttcgcaagagattccccaatgtttttagagctaaaggcaaccctccacact 110  Q
    |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||  || ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| |    
T  6168837 cacaaatcagtctctaatatcttaacccattcattttcagagaatcttctttgcaagagaatccccaatgtttttagagcaaaaggcgaccccccacatt 6168936  T
Q  111 tttctacgattttcttgccaattgattcaagatttggatattcacttgcatttgtgccgtgaaaagcgtgtctcataaacatactccaacattcactctt 210  Q
    ||||||| |||||| | ||||| |||||||||||||||||||||     |||  |||| | |||||| ||||| | ||| | ||||||| | |||||||     
T  6168937 tttctactattttcataccaatcgattcaagatttggatattcaaacatattcctgccttcaaaagcatgtcttacaaataaactccaagagtcactctc 6169036  T
Q  211 ctccaattgcttcaaatgaagaagtttggtggacttcatgactgatgctacctccttgtcacgtgttgtcac 282  Q
    |||||||||| | |||||||| |  | ||||||  ||||||||||||| || || || ||| ||||||||||    
T  6169037 ctccaattgccttaaatgaagtatctgggtggatctcatgactgatgcaacttctttatcatgtgttgtcac 6169108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 11 - 154
Target Start/End: Original strand, 6259145 - 6259288
Alignment:
Q  11 cacagatctgtctccaatatcttaacccattcacgttgagagaattttcttcgcaagagattccccaatgtttttagagctaaaggcaaccctccacact 110  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||  || |||||| |||||| |||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||| |    
T  6259145 cacaaatcagtctccaatatcttaacccattcattttcagagaactttctttgcaagagaatccccaatgttttcagagctgaaggcaaccccccacatt 6259244  T
Q  111 tttctacgattttcttgccaattgattcaagatttggatattca 154  Q
    ||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  6259245 tttctactattttcttgccgatcgattcaagatttggatattca 6259288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 11 - 282
Target Start/End: Original strand, 6245233 - 6245504
Alignment:
Q  11 cacagatctgtctccaatatcttaacccattcacgttgagagaattttcttcgcaagagattccccaatgtttttagagctaaaggcaaccctccacact 110  Q
    |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||  || ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||| |    
T  6245233 cacaaatcagtctctaatatcttaacccattcattttcagagaatcttctttgcaagagaatccccaatgttttcagagctaaaggcgaccccccacatt 6245332  T
Q  111 tttctacgattttcttgccaattgattcaagatttggatattcacttgcatttgtgccgtgaaaagcgtgtctcataaacatactccaacattcactctt 210  Q
    ||||||| |||||| | ||||| |||||||||||||||||||||     |||  |||| | |||||| ||||| | ||| | ||||||| | |||||||     
T  6245333 tttctactattttcataccaatcgattcaagatttggatattcaaacatattcctgccttcaaaagcatgtcttacaaataaactccaagagtcactctc 6245432  T
Q  211 ctccaattgcttcaaatgaagaagtttggtggacttcatgactgatgctacctccttgtcacgtgttgtcac 282  Q
    |||||||||| | |||||||| |  | |||| |  ||||||||||||| || || || ||| ||||||||||    
T  6245433 ctccaattgccttaaatgaagtatctgggtgtatctcatgactgatgcaacttctttatcatgtgttgtcac 6245504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 28 - 387
Target Start/End: Original strand, 8471499 - 8471858
Alignment:
Q  28 tatcttaacccattcacgttgagagaattttcttcgcaagagattccccaatgtttttagagctaaaggcaaccctccacacttttctacgattttcttg 127  Q
    ||||||| |||||||  |||||||  ||||| | ||||| || || ||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||| ||||| || || |||    
T  8471499 tatcttatcccattcgtgttgagaatattttttccgcaaaaggtttcccaatgttttcacagctaaaggcagccctccacacttatctacaatatttttg 8471598  T
Q  128 ccaattgattcaagatttggatattcacttgcatttgtgccgtgaaaagcgtgtctcataaacatactccaacattcactcttctccaattgcttcaaat 227  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||    ||| ||||  |||||||  | ||   ||| | ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  8471599 ccaattgattcaagatttgggtattcgctcaattttttgccaggaaaagcaagactggaaaataaactccaacagtcactcttctccaattgtttcaaat 8471698  T
Q  228 gaagaagtttggtggacttcatgactgatgctacctccttgtcacgtgttgtcacaataatcttacttccggtagatccattgttaaaaggaagtagtaa 327  Q
     ||  |  || || || ||||  | | |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    | |||||||| |||||| |||||||||||    
T  8471699 caaataactttgtagatttcacaattaatgctacctctttgtcgcgtgttgtcacaataatcttactcgtagaagatccatggttaaagggaagtagtaa 8471798  T
Q  328 gcgctcccaacattccgcactaccgttccagacatcatccaaaacaagcagatatttctt 387  Q
       |||||||| |||| || |    |||||||||||||||| |||||| ||||| |||||    
T  8471799 cttctcccaactttcctcattcagtttccagacatcatccacaacaagtagatagttctt 8471858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 20 - 437
Target Start/End: Original strand, 6900043 - 6900460
Alignment:
Q  20 gtctccaatatcttaacccattcacgttgagagaattttcttcgcaagagattccccaatgtttttagagctaaaggcaaccctccacacttttctacga 119  Q
    |||||||| ||||||||||| ||| ||| |||||| ||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||| |    
T  6900043 gtctccaacatcttaacccaatcaggttcagagaactttctttccaagagattccccaatgttttcagagctaaaggcaacccttcacacttttgtacta 6900142  T
Q  120 ttttcttgccaattgattcaagatttggatattcacttgcatttgtgccgtgaaaagcgtgtctcataaacatactccaacattcactcttctccaattg 219  Q
    |||  ||||| ||  |||| |||||||||||||||  | | ||| | ||  |||| || ||| ||| ||| | ||||||||| ||||||| || ||||||    
T  6900143 tttgtttgcctatcaattccagatttggatattcaaatacttttcttcctagaaaggcatgtttcacaaataaactccaacaatcactctccttcaattg 6900242  T
Q  220 cttcaaatgaagaagtttggtggacttcatgactgatgctacctccttgtcacgtgttgtcacaataatcttacttccggtagatccattgttaaaagga 319  Q
     || |||||||| ||||  || ||  | |||| ||||||||| ||| | ||| ||||||||||||| ||||||| | | | |||| ||  | ||||||||    
T  6900243 ttttaaatgaagtagttgcgtagatcttatgattgatgctacttccatatcatgtgttgtcacaatcatcttacctactgaagattcacggctaaaagga 6900342  T
Q  320 agtagtaagcgctccca-acattccgcactaccgttccagacatcatccaaaacaagcagatatttctttcctgttagtctctgctgcaattgatgttgg 418  Q
    ||||| ||  ||||||| | |||||  | |   ||||| ||||||||| ||||| |||| ||||| ||| ||  |||  ||||| ||||| |||||||||    
T  6900343 agtaggaaatgctcccacatattcc-tatttttgttcctgacatcatctaaaacgagcaaatattgcttgcccattaacctctgttgcaactgatgttgg 6900441  T
Q  419 agtagattcaagtcttcac 437  Q
    ||||  | |||||||||||    
T  6900442 agtatttccaagtcttcac 6900460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 11 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 13270639 - 13270357
Alignment:
Q  11 cacagatctgtctccaatatcttaacccattcacgttgagagaattttcttcgcaagagattccccaatgtttttagagctaaaggcaaccctccacact 110  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||| |  || ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| |    
T  13270639 cacaaatcagtctccaatatcttaacccatttaatttcagagaattttctttgcaagagaatccccaatgttttcagagctaaaggcaaacccccacatt 13270540  T
Q  111 tttctacgattttcttgccaattgattcaagatttggatattcacttgcatttgtgccgtgaaaagcgtgtctcataaacatactccaacattcactctt 210  Q
    ||||||| ||| || | || || |||||||||||||||||||||     |||  |||| | |||||| ||||||| ||| | ||||||| | |||||||     
T  13270539 tttctactattctcataccgatggattcaagatttggatattcaaacatattcctgccttcaaaagcatgtctcacaaataaactccaagagtcactctc 13270440  T
Q  211 ctccaattgcttcaaatgaagaagtttggtggacttcatgactgatgctacctccttgtcacgtgttgtcacaataatcttac 293  Q
    |||||||||| | |||||||  |    | ||||  |||||||||||||||| || || ||| |||| ||||| ||||||||||    
T  13270439 ctccaattgccttaaatgaattatccggttggatctcatgactgatgctacttcattatcatgtgtcgtcacgataatcttac 13270357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 11 - 536
Target Start/End: Complemental strand, 6480093 - 6479565
Alignment:
Q  11 cacagatctgtctccaatatcttaacccattcacgttgagagaattttcttcgcaagagattccccaatgtttttagagctaaaggcaaccctccacact 110  Q
    |||| ||| |||||||||||||| | |||||||  |||||| || ||| | ||||| || |  ||||||| | ||| |||||||||||||||| ||||||    
T  6480093 cacatatcagtctccaatatcttcatccattcatcttgagaaaactttttccgcaaaagttggcccaatgatattatagctaaaggcaacccttcacact 6479994  T
Q  111 tttctacgattttcttgccaattgattcaagatttggatattcacttgcatttgtgccgtgaaaagcgtgtctcataaacatactccaacattcactctt 210  Q
    | || |  |||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||   || |  |||| |||||||| ||  ||| ||| |  |||||||| ||||| ||    
T  6479993 tgtccattattttcctgccaattgattcaagttttggatagtcacacacactcttgccttgaaaagcatgagtcacaaataatctccaacaatcactttt 6479894  T
Q  211 ctccaattgcttcaaatgaagaagtttggtggacttcatgac-tg--atgctacctccttgtcacgtgttgtcacaataatcttacttccggtagatcca 307  Q
      |||||||    | || |   |   ||||||| |||| ||| ||  |||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||   |||||||    
T  6479893 gaccaattgacgtagatcacataacatggtggatttcacgacatgatatgccacctccttttcacgtgttgtcacgataatcttacttccaaaagatcca 6479794  T
Q  308 ttgttaaaaggaagtagtaagcgctcccaacattccgcactaccgttccagacatcatccaaaacaagcagatatttctttcctgttagtctctgctgca 407  Q
    | |||||| |||||||||||  |||||||| | ||  || | || ||||||| |||||| ||||||||||  |||||||||||  |||   | || || |    
T  6479793 tggttaaatggaagtagtaactgctcccaatactctacattcccattccagatatcatctaaaacaagcaagtatttctttcccattaacatgtgttgga 6479694  T
Q  408 attgatgttggagtagattcaagtcttcaccatcagccaaagagtgaaatgaccgcaaaattgctttggtaagtccaacaacattgaaagtttccgaaac 507  Q
     ||||||||||||| ||| ||||| ||||||||| ||  |||  | |||||||   | |||||||||||| |||||||||||||   ||| ||| |||||    
T  6479693 gttgatgttggagttgatccaagtattcaccatctgctgaaggattaaatgacttgagaattgctttggtgagtccaacaacatcataagattctgaaac 6479594  T
Q  508 atagacccaggcttttagttcaaactgtt 536  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  6479593 atagacccatgctttaagttcaaaatgtt 6479565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 11 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 6591439 - 6591028
Alignment:
Q  11 cacagatctgtctccaatatcttaacccattcacgttgagagaattttcttcgcaagagattccccaatgtttttagagctaaaggcaaccctccacact 110  Q
    |||| ||| |||||||||||||| | ||||||   |  |||||||||| || |||| || | ||||| |||||||||||||||||| | ||| |||||||    
T  6591439 cacatatcagtctccaatatcttcatccattcggttacagagaattttttttgcaaaagttgccccattgtttttagagctaaaggaatccccccacact 6591340  T
Q  111 tttctacgattttcttgccaattgattcaagatttggatattcacttgcatttgtgccgtgaaaagcgtgtctcataaacatactccaacattcactctt 210  Q
    ||||||| ||||||||||| ||  || ||||| |||||||||||    |||   | ||  ||||||| | ||||| ||| | ||||||| | |||||||     
T  6591339 tttctactattttcttgcctatcaatacaagagttggatattcaaacacatccctacctcgaaaagcatatctcacaaataaactccaagagtcactctc 6591240  T
Q  211 ctccaattgcttcaaatgaagaagtttggtggacttcatgactgatgctacctccttgtcacgtgttgtcacaataatcttacttccggtagatccattg 310  Q
    ||||||||| || |||| ||  || | ||||||   ||||| ||||||||| ||||||||| | |||||||| || ||||||||||| | |||||||| |    
T  6591239 ctccaattgatttaaatcaactagctgggtggatcccatgattgatgctacttccttgtcatgcgttgtcaccatcatcttacttccagaagatccatgg 6591140  T
Q  311 ttaaaaggaagtagtaagcgctcccaacattccgcactaccgttccagacatcatccaaaacaagcagatatttctttcctgttagtctctgctgcaatt 410  Q
     |||| ||||||||||    |||||||||||||||  | ||| | |||| ||  || ||||||||||  |||||||| || |||| | |||| || ||||    
T  6591139 ctaaacggaagtagtagcatctcccaacattccgcttttccgctacagatattgtctaaaacaagcaagtatttcttgccagttactatctgttgtaatt 6591040  T
Q  411 gatgttggagta 422  Q
    || |||||||||    
T  6591039 gacgttggagta 6591028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 11 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 6520273 - 6519750
Alignment:
Q  11 cacagatctgtctccaatatcttaacccattcacgttgagagaattttcttcgcaagagattccccaatgtttttagagctaaaggcaaccctccacact 110  Q
    |||| ||| |||||||||||||  | |||||||  |||||| || ||| ||||||| || |  ||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  6520273 cacatatcagtctccaatatctccatccattcatcttgagaaaacttttttcgcaaaagttggcccaatgattttatagctaaaggcaacccaccacact 6520174  T
Q  111 tttctacgattttcttgccaattgattcaagatttggatattcacttgcatttgtgccgtgaaaagcgtgtctcataaacatactccaacattcactctt 210  Q
    | || || |||||| ||||||| | |||||| |||||||| ||||   ||    |||| |||||||| ||| ||  ||| | ||||||||| |  || ||    
T  6520173 tgtccactattttcatgccaatcgtttcaagttttggatagtcacacacacgcatgccttgaaaagcatgtgtctcaaataaactccaacaattgctttt 6520074  T
Q  211 ctccaattgcttcaaatgaagaagtttggtggacttcatgac-tga--tgctacctccttgtcacgtgttgtcacaataatcttacttccggtagatcca 307  Q
     |||||||| |  |||||||  |  | |||||| |||| ||| |||  |||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  6520073 gtccaattgatgtaaatgaattaactcggtggagttcaggacatgatctgctaccttcttttcacgtgttgtcacgataatcttacttccagaagatcca 6519974  T
Q  308 ttgttaaaaggaagtagtaagcgctcccaacattccgcactaccgttccagacatcatccaaaacaagcagatatttctttcctgttagtctctgctgca 407  Q
    | |||||  |||||||||||    |||||  ||||  |  | || ||||||| |||||| ||||||||||  ||||||||| |  ||||    || || |    
T  6519973 tggttaagcggaagtagtaacttatcccagtattctaccttcccattccagatatcatctaaaacaagcaagtatttctttgccattagcaggtgttgga 6519874  T
Q  408 attgatgttggagtagattcaagtcttcaccatcagccaaagagtgaaatgaccgcaaaattgctttggtaagtccaacaacattgaaagtttccgaaac 507  Q
     ||||||||||||| ||| ||||| ||||||||| ||  |||  | |||||||   | |||||||||||| ||||||||| |||  |||| ||| |||||    
T  6519873 gttgatgttggagttgatccaagtattcaccatctgctgaaggattaaatgacttgagaattgctttggtgagtccaacatcatcaaaagattctgaaac 6519774  T
Q  508 atagacccaggcttttagttcaaa 531  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||    
T  6519773 atagacccatgctttaagttcaaa 6519750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 11 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 6722177 - 6721852
Alignment:
Q  11 cacagatctgtctccaatatcttaacccattcacgttgagagaattttcttcgcaagagattccccaatgtttttagagctaaaggcaaccctccacact 110  Q
    |||| ||| ||||||||||||| | |||||||| ||| ||| |||  | ||| ||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  6722177 cacaaatcagtctccaatatctgatcccattcaagtttagaaaatcgtattctcaaaagattacccaatgttttcagagctaaaggcaaccctccacact 6722078  T
Q  111 tttctacgattttcttgccaattgattcaagatttggatattcacttgcatttgtgccgtgaaaagcgtgtctcataaacatactccaacattcactctt 210  Q
    ||||| | | |||||||  ||  || |||||||||||| | |||     |||  ||||  ||||||| ||  ||| ||| || |||||| | ||||| |     
T  6722077 tttctgccactttcttgataaccgactcaagatttggaaaatcaaacaaattcctgcctcgaaaagcatgattcacaaatatcctccaagagtcactttc 6721978  T
Q  211 ctccaattgcttcaaatgaagaagtttggtggacttcatgactgatgctacctccttgtcacgtgttgtcacaataatcttacttccggtagatccattg 310  Q
    ||||||||| |  |||||||| ||   ||||||  |||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| | |||||||       
T  6721977 ctccaattgatataaatgaagtagccgggtggatctcatgattgatgctacttccttgtcccgtgttgtcacgatcatcttacttcctgaagatccacat 6721878  T
Q  311 ttaaaaggaagtagtaagcgctccca 336  Q
    |||||| ||||||||||  |||||||    
T  6721877 ttaaaaagaagtagtaactgctccca 6721852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 11 - 139
Target Start/End: Original strand, 7587793 - 7587921
Alignment:
Q  11 cacagatctgtctccaatatcttaacccattcacgttgagagaattttcttcgcaagagattccccaatgtttttagagctaaaggcaaccctccacact 110  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||  |||||| ||||||||| ||| ||| |||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| |    
T  7587793 cacatatctgtctccaatatcttaaaccattcagcttgagaaaattttctttgcaggagtttccccaatgttttcacagctagaggcaaccctccacatt 7587892  T
Q  111 tttctacgattttcttgccaattgattca 139  Q
    | ||||| || ||||||||||| ||||||    
T  7587893 tctctacaatcttcttgccaatcgattca 7587921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 11 - 281
Target Start/End: Original strand, 6917047 - 6917317
Alignment:
Q  11 cacagatctgtctccaatatcttaacccattcacgttgagagaattttcttcgcaagagattccccaatgtttttagagctaaaggcaaccctccacact 110  Q
    |||| ||| ||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||| |||| ||||||||||| |||| |  | | | || |||||||||||||||||| |    
T  6917047 cacaaatcagtctccattatcttaacccactcacgtttagagaatcttctacgcaagagattacccatttctgtcacagttaaaggcaaccctccacatt 6917146  T
Q  111 tttctacgattttcttgccaattgattcaagatttggatattcacttgcatttgtgccgtgaaaagcgtgtctcataaacatactccaacattcactctt 210  Q
    | ||||| ||||||||||||||   |||||||||||||| || ||| |||||  |  | |||||||| || |||| ||| | ||||| |||  ||||||     
T  6917147 tgtctactattttcttgccaataatttcaagatttggatgttgactcgcattcctatcatgaaaagcatgactcacaaataaactcctacaaccactctc 6917246  T
Q  211 ctccaattgcttcaaatgaagaagtttggtggacttcatgactgatgctacctccttgtcacgtgttgtca 281  Q
     || |||||||| |||| ||| ||   ||||||  |||||| ||||||||| |||||||||  ||||||||    
T  6917247 ttctaattgctttaaatcaagtagccgggtggatctcatgattgatgctacttccttgtcatatgttgtca 6917317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 11 - 154
Target Start/End: Original strand, 7749945 - 7750088
Alignment:
Q  11 cacagatctgtctccaatatcttaacccattcacgttgagagaattttcttcgcaagagattccccaatgtttttagagctaaaggcaaccctccacact 110  Q
    |||| ||| ||||||||||| |||| |||||||  || | |||||||  || |||| |  | ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  7749945 cacatatcagtctccaatattttaatccattcagtttcacagaatttgttttgcaataattgccccaatgtttctagagctaaaggcaaccccccacact 7750044  T
Q  111 tttctacgattttcttgccaattgattcaagatttggatattca 154  Q
    ||||||| ||||||||||| || || || |||||||||||||||    
T  7750045 tttctactattttcttgccgatcgactcgagatttggatattca 7750088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 11 - 149
Target Start/End: Original strand, 6947187 - 6947325
Alignment:
Q  11 cacagatctgtctccaatatcttaacccattcacgttgagagaattttcttcgcaagagattccccaatgtttttagagctaaaggcaaccctccacact 110  Q
    |||| ||| |||||||||||||  | |||||||  |||||| || ||| ||||||| || |  |||| || ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6947187 cacatatcagtctccaatatctgcatccattcatcttgagaaaacttttttcgcaaaagttggcccagtgattttatagctaaaggcaaccctccacact 6947286  T
Q  111 tttctacgattttcttgccaattgattcaagatttggat 149  Q
    | || || |||||| | |||||||||||||| |||||||    
T  6947287 tgtccactattttcctcccaattgattcaagttttggat 6947325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0425 (Bit Score: 118; Significance: 6e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0425
Description:

Target: scaffold0425; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 20 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 7579 - 7065
Alignment:
Q  20 gtctccaatatcttaacccattcacgttgagagaattttcttcgcaagagattccccaatgtttttagagctaaaggcaaccctccacacttttctacga 119  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||| ||| |||||||| ||||  || |   |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| || || |    
T  7579 gtctccaatatcttaatccattcatgttcagaaaattttctacgcagaagttgtgccaatgattttatagctaaaggcaaccctccacacttgtccacta 7480  T
Q  120 ttttcttgccaattgattcaagatttggatattcacttgcatttgtgccgtgaaaagcgtgtctcataaacatactccaacattcactcttctccaattg 219  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||   || || | || |||||||| ||| ||| ||| |  |||||||| |  || || ||||||||    
T  7479 ttttcttcccaattgtttcaagatttggatattcacacacactttttccttgaaaagcatgtgtcacaaataatctccaacaattgcttttttccaattg 7380  T
Q  220 cttcaaatgaagaagtttggtggactt-----catgactgatgctacctccttgtcacgtgttgtcacaataatcttacttccggtagatccattgttaa 314  Q
     |  |||| ||  | |||||| || ||     ||||||  ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| | |||||||| |||||    
T  7379 ttgtaaatcaaataatttggttgattttagaacatgac--atgctacctccttttcacgtgttgtcacgataattttacttccagaagatccatggttaa 7282  T
Q  315 aaggaagtagtaagcgctcccaacattccgcactaccgttccagacatcatccaaaacaagcagatatttctttcctgttagtctctgctgcaattgatg 414  Q
    | ||||||||||   |||||||| ||||  |||| || ||||| | |||||| ||||||||||  |||||||||||  |||   | || || | ||||||    
T  7281 acggaagtagtagctgctcccaatattctacactcccattccatatatcatctaaaacaagcaagtatttctttcccattaacatgtgttggagttgatg 7182  T
Q  415 ttggagtagattcaagtcttcaccatcagccaaagagtgaaatgaccgcaaaattgctttggtaagtccaacaacattgaaagtttccgaaacatagacc 514  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||  |||  | |||||||   | |||||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||    
T  7181 ttggagttgattcaagtcttcaccatctgctgaaggattaaatgacttgagaattgctttggtgagtccaaaaacatcgaaagattctgaaacatagacc 7082  T
Q  515 caggcttttagttcaaa 531  Q
    || ||||| ||||||||    
T  7081 catgctttaagttcaaa 7065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 112; Significance: 2e-56; HSPs: 1)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 23 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 25242256 - 25242067
Alignment:
Q  23 tccaatatcttaacccattcacgttgagagaattttcttcgcaagagattccccaatgtttttagagctaaaggcaaccctccacacttttctac---ga 119  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    |    
T  25242256 tccaatatcttaacccattcatgttgagagaattttcttcgcaagagattccccgttgtttttacagctaaaggcaacgctccacacttttctactatta 25242157  T
Q  120 ttttcttgccaattgattcaagatttggatattcacttgcatttgtgccgtgaaaagcgtgtctcataaacatactccaacattcactct 209  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||| || |||  ||||| ||||||||| |||||||    
T  25242156 ttttcttgccaattgatgcaagatttggatattcacttgcattccttccgtgaaaagcatgcctctcaaacacactccaacaatcactct 25242067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 81; Significance: 7e-38; HSPs: 1)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 23 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 6573394 - 6573038
Alignment:
Q  23 tccaatatcttaacccattcacgttgagagaattttcttcgcaagagattccccaatgtttttagagctaaaggcaaccctccacacttttctacgattt 122  Q
    ||||||||||||| ||||||||  ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| || ||||| || |    
T  6573394 tccaatatcttaaaccattcaccctgagaaaattttctttgcaagagattccccaatgttttcacggctaaaggcaaccctccacatttgtctacaatct 6573295  T
Q  123 tcttgccaattgattcaagatttggatattcacttgcatttgtgccgtgaaaagcgtgtctcataaacatactccaacattcactcttctccaattgctt 222  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||| |||    ||||| | ||  ||||||| ||| ||| ||| | ||||||||| ||  ||| |||||| | |||    
T  6573294 ccttgccaatcgattcaagatttggatagtcaaacacattttttcctcgaaaagcatgtttcacaaataaactccaacaatctttctcctccaaattctt 6573195  T
Q  223 caaatgaagaagtttggtggacttcatgactgatgctacctccttgtcacgtgttgtcacaataatcttacttccggtagatccattgttaaaaggaagt 322  Q
     ||| ||||  | | |   || ||||||||  |||| || |  |||||||||||||||||||||||||| |||||   | |||||| ||| |||| ||||    
T  6573194 taaaagaagttgatggtcagatttcatgaccaatgcaacgtttttgtcacgtgttgtcacaataatcttgcttcctaaaaatccatggttgaaagaaagt 6573095  T
Q  323 agtaagcgctcccaacattccgcactaccgttccagacatcatccaaaacaagcaga 379  Q
    |||||  ||||| |||| ||| || | || ||||| |||||||| | ||||||||||    
T  6573094 agtaattgctccaaacactcctcattccctttccacacatcatctagaacaagcaga 6573038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 46; Significance: 6e-17; HSPs: 1)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 20 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 35140443 - 35140303
Alignment:
Q  20 gtctccaatatcttaacccattcacgttgagagaattttcttcgcaagagattccccaatgtttttagagctaaaggcaacc------ctccacactttt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||  |||||||||||| |||||||| |||||| |||||| ||||||||||  ||||      | ||||| ||||    
T  35140443 gtctccaatatcttaacccattcattttcggagaattttctttgcaagagaatccccagtgttttcagagctaaagataacccccccaccccacattttt 35140344  T
Q  114 ctacgattttcttgccaattgattcaagatttggatattca 154  Q
    |||| | |||| | ||||| | |||||||||||||||||||    
T  35140343 ctactagtttcataccaatcgtttcaagatttggatattca 35140303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University