View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF17657_low_1 (Length: 991)

Name: NF17657_low_1
Description: NF17657
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF17657_low_1
NF17657_low_1
[»] chr4 (25 HSPs)
chr4 (617-975)||(42567528-42567885)
chr4 (617-899)||(35904946-35905228)
chr4 (617-855)||(6262105-6262343)
chr4 (617-906)||(24423154-24423443)
chr4 (617-854)||(36048790-36049027)
chr4 (617-854)||(2228757-2228994)
chr4 (617-973)||(33366655-33367011)
chr4 (617-974)||(54256144-54256505)
chr4 (617-887)||(18891074-18891344)
chr4 (617-867)||(13393666-13393916)
chr4 (617-867)||(13396805-13397055)
chr4 (617-822)||(33361539-33361744)
chr4 (617-851)||(44160724-44160958)
chr4 (883-974)||(42570763-42570854)
chr4 (616-732)||(43444804-43444920)
chr4 (502-572)||(53593834-53593904)
chr4 (871-970)||(33361761-33361857)
chr4 (619-673)||(123440-123494)
chr4 (617-665)||(2544838-2544886)
chr4 (927-966)||(36049103-36049142)
chr4 (471-510)||(53592898-53592937)
chr4 (651-741)||(18888167-18888257)
chr4 (622-670)||(30425735-30425783)
chr4 (623-670)||(36166221-36166268)
chr4 (617-670)||(38791956-38792009)
[»] chr7 (14 HSPs)
chr7 (617-975)||(267628-267982)
chr7 (619-973)||(48853502-48853854)
chr7 (617-973)||(32517018-32517371)
chr7 (617-975)||(278712-279049)
chr7 (630-904)||(26450872-26451141)
chr7 (617-848)||(40771648-40771877)
chr7 (688-856)||(29148715-29148882)
chr7 (632-775)||(40771155-40771296)
chr7 (687-849)||(5172840-5173002)
chr7 (625-676)||(29148922-29148973)
chr7 (616-696)||(21910422-21910502)
chr7 (801-854)||(40771296-40771349)
chr7 (623-666)||(25189443-25189485)
chr7 (931-973)||(5173090-5173132)
[»] scaffold0502 (2 HSPs)
scaffold0502 (617-906)||(8837-9128)
scaffold0502 (617-906)||(4122-4428)
[»] chr6 (17 HSPs)
chr6 (617-906)||(18338013-18338304)
chr6 (617-906)||(23848519-23848808)
chr6 (617-906)||(9972674-9972966)
chr6 (616-906)||(7553363-7553654)
chr6 (617-906)||(32932264-32932546)
chr6 (617-867)||(22958071-22958312)
chr6 (617-867)||(23830080-23830321)
chr6 (745-906)||(27101530-27101691)
chr6 (745-906)||(27143352-27143513)
chr6 (617-854)||(15121532-15121762)
chr6 (746-900)||(19543490-19543650)
chr6 (617-696)||(19543398-19543477)
chr6 (617-696)||(27101433-27101512)
chr6 (617-696)||(27143255-27143334)
chr6 (926-973)||(9972965-9973012)
chr6 (853-906)||(22958009-22958062)
chr6 (853-906)||(23830330-23830383)
[»] chr8 (14 HSPs)
chr8 (617-906)||(44626023-44626312)
chr8 (617-973)||(32037991-32038345)
chr8 (617-973)||(26005424-26005777)
chr8 (635-906)||(1262238-1262511)
chr8 (617-906)||(38143786-38144069)
chr8 (724-973)||(17497399-17497643)
chr8 (617-900)||(45266087-45266354)
chr8 (739-906)||(34548038-34548210)
chr8 (660-788)||(18324737-18324865)
chr8 (619-867)||(39517250-39517492)
chr8 (617-705)||(34548215-34548303)
chr8 (617-681)||(17497646-17497710)
chr8 (802-867)||(18324934-18324998)
chr8 (803-871)||(38151014-38151082)
[»] chr3 (22 HSPs)
chr3 (617-906)||(3469752-3470041)
chr3 (617-906)||(19240465-19240754)
chr3 (617-906)||(39032686-39032982)
chr3 (617-905)||(31112280-31112564)
chr3 (617-902)||(29960875-29961161)
chr3 (617-902)||(30010080-30010366)
chr3 (617-906)||(32280721-32281012)
chr3 (617-906)||(32285665-32285956)
chr3 (617-906)||(39039699-39039994)
chr3 (616-906)||(41272864-41273158)
chr3 (617-906)||(45677836-45678127)
chr3 (619-865)||(38445548-38445794)
chr3 (617-866)||(50158075-50158324)
chr3 (617-775)||(11172093-11172251)
chr3 (687-835)||(10626311-10626459)
chr3 (690-856)||(46611791-46611957)
chr3 (745-854)||(11458160-11458269)
chr3 (617-696)||(10657253-10657329)
chr3 (623-719)||(11457240-11457334)
chr3 (793-855)||(39350935-39350997)
chr3 (617-664)||(46611745-46611792)
chr3 (619-673)||(19242073-19242130)
[»] chr5 (9 HSPs)
chr5 (619-906)||(22729735-22730022)
chr5 (617-902)||(35941073-35941350)
chr5 (617-906)||(36950077-36950371)
chr5 (617-906)||(43097346-43097639)
chr5 (662-906)||(11339770-11340013)
chr5 (617-788)||(10491096-10491267)
chr5 (816-891)||(10491257-10491331)
chr5 (617-665)||(16057789-16057837)
chr5 (931-973)||(43097657-43097699)
[»] chr2 (22 HSPs)
chr2 (617-906)||(40113309-40113604)
chr2 (617-906)||(3949901-3950191)
chr2 (617-969)||(23888282-23888635)
chr2 (617-969)||(23892358-23892711)
chr2 (617-906)||(669913-670198)
chr2 (624-906)||(24138292-24138575)
chr2 (617-854)||(18341573-18341810)
chr2 (700-906)||(15144214-15144420)
chr2 (617-845)||(39190009-39190237)
chr2 (673-906)||(41826520-41826745)
chr2 (617-856)||(17527310-17527552)
chr2 (617-899)||(662699-662959)
chr2 (745-969)||(14661291-14661513)
chr2 (714-867)||(17530016-17530171)
chr2 (617-854)||(33425823-33426064)
chr2 (684-895)||(25336147-25336358)
chr2 (617-687)||(14661188-14661258)
chr2 (617-676)||(4840927-4840986)
chr2 (617-681)||(25335751-25335815)
chr2 (927-969)||(18341457-18341499)
chr2 (935-973)||(17527194-17527232)
chr2 (746-811)||(4840581-4840645)
[»] chr1 (17 HSPs)
chr1 (617-973)||(39574395-39574745)
chr1 (617-973)||(47858008-47858362)
chr1 (617-856)||(24515354-24515590)
chr1 (617-900)||(9764930-9765215)
chr1 (617-906)||(41140774-41141067)
chr1 (617-900)||(9758314-9758587)
chr1 (746-906)||(39581073-39581232)
chr1 (617-732)||(39580411-39580526)
chr1 (687-854)||(12017733-12017899)
chr1 (699-788)||(24523172-24523261)
chr1 (622-732)||(47854629-47854739)
chr1 (617-673)||(24526361-24526417)
chr1 (623-749)||(38279796-38279923)
chr1 (617-669)||(39183711-39183762)
chr1 (617-705)||(38278809-38278895)
chr1 (617-664)||(5996229-5996275)
chr1 (819-856)||(24523142-24523179)
[»] scaffold0040 (2 HSPs)
scaffold0040 (617-906)||(67675-67967)
scaffold0040 (630-906)||(60212-60491)
[»] scaffold1634 (1 HSPs)
scaffold1634 (617-865)||(19-267)
[»] scaffold0045 (1 HSPs)
scaffold0045 (637-854)||(30003-30220)
[»] scaffold0062 (1 HSPs)
scaffold0062 (616-854)||(40145-40383)
[»] scaffold0027 (1 HSPs)
scaffold0027 (618-868)||(134537-134786)
[»] scaffold1074 (1 HSPs)
scaffold1074 (868-973)||(19-120)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (629-672)||(143309-143352)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 275; Significance: 1e-153; HSPs: 25)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 617 - 975
Target Start/End: Complemental strand, 42567885 - 42567528
Alignment:
Q  617 tgttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataagttgatgtcataatataaattataatctattgcgttaagcact 716  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |    
T  42567885 tgttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataagttgatgtcataatataaattatggtctattgcgttaagcatt 42567786  T
Q  717 aattagttgatgaatacgtctgattgtgctattctttctaaatggaccgtgatgggttgaaccatttagctaaacccaatgaggggtccctgccctcagc 816  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  42567785 aattagttgatgaatatgtctgattgggctattctttttaaatggaccgtgatgagttggaccatttagctaagcccaatgagaggtccctgccctcagc 42567686  T
Q  817 cgtttaactatttaaacgttatcccatcagacggttaaaccattctgaacattctggtgctaaacggaatgagggtagtcatccctctcactctcatcct 916  Q
     |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42567685 tgtttaactatttaaacgtcatcccatcagacggttaaactattatgaacattctggtgctaaac-gaatgagggtagtcatccctctcactctcatcct 42567587  T
Q  917 tcagacaaccatccttcatgaacctaaacatacaaggtacacaatttcttattcctttg 975  Q
    || ||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  42567586 tctgacagttatccttcatgaacctaaacatacaaggtacacaatttcttattcttttg 42567528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 171; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 617 - 899
Target Start/End: Complemental strand, 35905228 - 35904946
Alignment:
Q  617 tgttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataagttgatgtcataatataaattataatctattgcgttaagcact 716  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || ||||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  35905228 tgtttgattaattatttaattaatcaattatggattcacaataatcaattattataagtaaatatcataatgtaaattatggtctattgtgttaagcact 35905129  T
Q  717 aattagttgatgaatacgtctgattgtgctattctttctaaatggaccgtgatgggttgaaccatttagctaaacccaatgaggggtccctgccctcagc 816  Q
    |||||||||||||||| |  ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||| |||    
T  35905128 aattagttgatgaatatgggtgattgaactattctttctaaatggaccgtgatgggttgaaccatttagctaagcccaatgagaggtctctgcccttagc 35905029  T
Q  817 cgtttaactatttaaacgttatcccatcagacggttaaaccattctgaacattctggtgctaaacggaatgagggtagtcatc 899  Q
    |||||| |||||||||||| ||| |||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||| || || |||||| |||||    
T  35905028 cgtttagctatttaaacgtcatctcatcagacagttaaactattctgaacattatggtgctaaatggtatcagggtaatcatc 35904946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 163; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 617 - 855
Target Start/End: Original strand, 6262105 - 6262343
Alignment:
Q  617 tgttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataagttgatgtcataatataaattataatctattgcgttaagcact 716  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  6262105 tgttggattaattatttagttaatcaattatggattgacaataatcaattattataagttaatgtcataatataaattatggtctattgtgttaagcact 6262204  T
Q  717 aattagttgatgaatacgtctgattgtgctattctttctaaatggaccgtgatgggttgaaccatttagctaaacccaatgaggggtccctgccctcagc 816  Q
    ||||| |||| ||||| || ||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||  ||||||| |||    
T  6262205 aattaattgacgaatatgtgtgattggactattctttctaaatggatcgtgatgggttggaccatttagctaagcccaatgagaggtgtctgcccttagc 6262304  T
Q  817 cgtttaactatttaaacgttatcccatcagacggttaaa 855  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6262305 cgtttagctatttaaacgttatcccatcagacggttaaa 6262343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 163; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 617 - 906
Target Start/End: Complemental strand, 24423443 - 24423154
Alignment:
Q  617 tgttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataagttgatgtcataatataaattataatctattgcgttaagcact 716  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||  | ||||| ||||||||||    
T  24423443 tgttggattaattatttaactaatcaattatggattgacaataatcaattattataagttaatgttattatataaattatggtatattgtgttaagcact 24423344  T
Q  717 aattagttgatgaatacgtctgattgtgctattctttctaaatggaccgtgatgggttgaaccatttagctaaacccaatgaggggtccctgccctcagc 816  Q
    |||||  ||||||||| || ||||||  |||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||| |||| ||||||||| ||||||| |||||||     
T  24423343 aatta-atgatgaatatgtgtgattggactattctttctaaatggatcgtaatgggttggaccatttaactaagcccaatgagaggtcccttccctcagt 24423245  T
Q  817 cgtttaactatttaaacgttatcccatcagacggtt-aaaccattctgaacattctggtgctaaacggaatgagggtagtcatccctctca 906  Q
    |||||| ||||||||| || ||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  24423244 cgtttagctatttaaatgtcatctcatcagacggttaaaactattctgaacattctggtgctaaacggaatgagggtagttattcctctca 24423154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 617 - 854
Target Start/End: Original strand, 36048790 - 36049027
Alignment:
Q  617 tgttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataagttgatgtcataatataaattataatctattgcgttaagcact 716  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||  ||| ||| ||||| ||||    
T  36048790 tgttggattaattatttaattaatcaattatggtttgacaataatcaattattataagttaatttcataatataaattatggtcttttgtgttaaacact 36048889  T
Q  717 aattagttgatgaatacgtctgattgtgctattctttctaaatggaccgtgatgggttgaaccatttagctaaacccaatgaggggtccctgccctcagc 816  Q
    |||||| ||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||    
T  36048890 aattagatgatgaatatgtgtgattgggctattctttctaaatggaccgtgatgggttggaccatttagctaagcccaatgagaggtctctgccctcagc 36048989  T
Q  817 cgtttaactatttaaacgttatcccatcagacggttaa 854  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||| ||| ||||    
T  36048990 cgtttagctatttaaacgtcatcccatcatacgattaa 36049027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 154; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 617 - 854
Target Start/End: Original strand, 2228757 - 2228994
Alignment:
Q  617 tgttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataagttgatgtcataatataaattataatctattgcgttaagcact 716  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||  ||||||| ||| ||||||    
T  2228757 tgttggattaattatttaattaattaattatggatcgacaataatcaattattataagttaatattataatataaattatggtctattgagttgagcact 2228856  T
Q  717 aattagttgatgaatacgtctgattgtgctattctttctaaatggaccgtgatgggttgaaccatttagctaaacccaatgaggggtccctgccctcagc 816  Q
    |||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| || |||| | ||||||| |    
T  2228857 aattagttgatgaatatgtgtgattgagctattctttctaaatggaccgtgatgggttgaaccatttaactaagcccaattagaggtctcagccctcaac 2228956  T
Q  817 cgtttaactatttaaacgttatcccatcagacggttaa 854  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  2228957 cgtttaactatttaaacgtcatctcatcagacggttaa 2228994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 145; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 617 - 973
Target Start/End: Original strand, 33366655 - 33367011
Alignment:
Q  617 tgttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataagttgatgtcataatataaattataatctattgcgttaagcact 716  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||| || | |||  |||||||  |||||||||    
T  33366655 tgttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataaattaatgttataatttatagtatggtctattgtattaagcact 33366754  T
Q  717 aatta---gttgatgaatacgtctgattgtgctattctttctaaatggaccgtgatgggttgaaccatttagctaaacccaatgaggggtccctgccctc 813  Q
     ||||   ||||||||||| || |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  33366755 cattattagttgatgaatatgtatgattgggttattctttctaaatggatcgtgatgggttggaccatttagctaagcccaatgagaggtccctgccctc 33366854  T
Q  814 agccgtttaactatttaaacgttatcccatcagacggttaa---accattctgaa-cattctggtgctaaacggaatgagggtagtcatccctctcactc 909  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||    |||||||   |  ||| ||||   ||||||||||| | ||||||| |||||||||||      |||    
T  33366855 agccgtttagctatttaaacgtcatcccat----cggttaaattattattgtgaattcttctggtgctacatggaatgaaggtagtcatcc------ctc 33366944  T
Q  910 tcatccttcagacaac---catccttcatgaacctaaacatacaaggtacacaatttcttattcctt 973  Q
    ||||||||| ||||||    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  33366945 tcatccttctgacaacagttatccttcatgaatctaaacatacaaggttcacaatttcttattcctt 33367011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 134; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 617 - 974
Target Start/End: Original strand, 54256144 - 54256505
Alignment:
Q  617 tgttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataagttgatgtcataatataaattataatctattgcgttaagcact 716  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  54256144 tgttagattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattatatgttaatgtcataatataaattatgatctattgtgttaagcact 54256243  T
Q  717 aattagttgatgaatacgtctgattgtgctattctttctaaatggaccgtgatgggttgaaccatttagctaa----------------acccaatgagg 800  Q
    ||||| ||||||||||  | ||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||                 |||||||||     
T  54256244 aattaattgatgaata--tgtgattgaactattctttctaaatggaccgtgatcggttgaaccatttagctaagctcaatgagaggtccgcccaatgaga 54256341  T
Q  801 ggtccctgccctcagccgtttaactatttaaacgttatcccatcagacggtt--aaaccattctgaacattctggtgctaaacggaatgagggtagtcat 898  Q
    ||||| |||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  |||| || ||||||||||||||        |||||||||||||       
T  54256342 ggtccatgccctcagcagtttagctatttaaacgtcatcccatcagacggttaaaaactatcctgaacattctggt--------gaatgagggtagt--- 54256430  T
Q  899 ccctctcactctcatccttcagacaaccatccttcatgaa-cctaaa-catacaaggtacacaatttcttattccttt 974  Q
      || || |||||||||||| |||||| ||||| |||||| |||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  54256431 --ctatccctctcatccttctgacaactatcctgcatgaatcctaaatcata-aaggtacacaatctcttattccttt 54256505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 128; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 617 - 887
Target Start/End: Complemental strand, 18891344 - 18891074
Alignment:
Q  617 tgttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataagttgatgtcataatataaattataatctattgcgttaagcact 716  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||| || | |||  | |||||  |||||||||    
T  18891344 tgttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataaattaatgttataatttataatatggtatattgtattaagcact 18891245  T
Q  717 aattagttgatgaatacgtctgattgtgctattctttctaaatggaccgtgatgggttgaaccatttagctaaacccaatgaggggtccctgccctcagc 816  Q
     ||||||||||||||| || ||||||  ||||||||| | ||||||| ||||||||||  ||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  18891244 cattagttgatgaatatgtatgattggactattctttttgaatggactgtgatgggttagaccatttagttaagcccaatgagaggtccctgccctcagc 18891145  T
Q  817 cgtttaactatttaaacgttatcccatcagacggttaaaccattctgaac-attctggtgctaaacggaatg 887  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||| || ||||||| ||| |||||  ||||||||||| || |||||    
T  18891144 cgtttagctatttaaacgtcatcccatca-acagttaaactattatgaactcttctggtgctacactgaatg 18891074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 120; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 617 - 867
Target Start/End: Complemental strand, 13393916 - 13393666
Alignment:
Q  617 tgttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataagttga-tgtcataatataaattataatctattgcgttaagcac 715  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    | | | ||||||||||||||  ||||||| ||||| |||    
T  13393916 tgttgaattaattatttgattaatcaattatggattgacaataatcaattattataaaagcaatattataatataaattatggtctattgagttaaacac 13393817  T
Q  716 taattagttgatgaatacgtctgattgtgctattctttctaaatggaccgtgatgggttgaaccatttagctaaacccaatgaggggtccctgccctcag 815  Q
    ||||||||||||||||| |  |||||  |||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||| ||||| | |||||||    
T  13393816 taattagttgatgaatatgcgtgattaagctattctttttaaatggaccgtgatgagttggaccatttagctaagcccaatgagaggtcctttccctcag 13393717  T
Q  816 ccgtttaactatttaaacgttatcccatcagacggttaaaccattctgaaca 867  Q
    || |||| |||||||||| | ||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  13393716 ccatttagctatttaaacttcatctcatcagacggttaaa-cattctgaaca 13393666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 120; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 617 - 867
Target Start/End: Complemental strand, 13397055 - 13396805
Alignment:
Q  617 tgttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataagttga-tgtcataatataaattataatctattgcgttaagcac 715  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    | | | ||||||||||||||  ||||||| ||||| |||    
T  13397055 tgttgaattaattatttgattaatcaattatggattgacaataatcaattattataaaagcaatattataatataaattatggtctattgagttaaacac 13396956  T
Q  716 taattagttgatgaatacgtctgattgtgctattctttctaaatggaccgtgatgggttgaaccatttagctaaacccaatgaggggtccctgccctcag 815  Q
    ||||||||||||||||| |  |||||  |||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||| ||||| | |||||||    
T  13396955 taattagttgatgaatatgcgtgattaagctattctttttaaatggaccgtgatgagttggaccatttagctaagcccaatgagaggtcctttccctcag 13396856  T
Q  816 ccgtttaactatttaaacgttatcccatcagacggttaaaccattctgaaca 867  Q
    || |||| |||||||||| | ||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  13396855 ccatttagctatttaaacttcatctcatcagacggttaaa-cattctgaaca 13396805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 114; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 617 - 822
Target Start/End: Original strand, 33361539 - 33361744
Alignment:
Q  617 tgttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataagttgatgtcataatataaattataatctattgcgttaagcact 716  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||| || | ||| | ||||||  |||||||||    
T  33361539 tgttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataaattaatgttataatttatagtatgacctattgtattaagcact 33361638  T
Q  717 aattagttgatgaatacgtctgattgtgctattctttctaaatggaccgtgatgggttgaaccatttagctaaacccaatgaggggtccctgccctcagc 816  Q
     |||||||||| |||| || |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  | |||||| |||||||  |||||||    
T  33361639 cattagttgataaatatgtatgattgggttattctttctaaatggaccgtgatgggttggaccatttagctaagtctaatgagaggtccctaacctcagc 33361738  T
Q  817 cgttta 822  Q
    ||||||    
T  33361739 cgttta 33361744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 92; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 617 - 851
Target Start/End: Complemental strand, 44160958 - 44160724
Alignment:
Q  617 tgttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataagttga---tgtcataatataaattataatctattgcgttaagc 713  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| | ||  ||||||||| |||| |||||||||||| |   | | ||| ||||||||||  ||||||| ||||||     
T  44160958 tgttagattaattatttaattaatca-tcata-attgacaattatcagttattataagttaatattattatattataaattatggtctattgtgttaagt 44160861  T
Q  714 actaattagttgatgaatacgtctgattgtgctattctttctaaatggaccgtgatgggttgaaccatttagctaaacccaatgaggggtccctgccctc 813  Q
    || |||||||||||||||| || |||||| |||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||| | ||| |||||||    
T  44160860 acaaattagttgatgaatatgtgtgattgagctattctttttaaatgga-cgtggtgggttgaaccatttagctaagcccaacgagagatccttgccctc 44160762  T
Q  814 agccgtttaactatttaaacgttatcccatcagacggt 851  Q
     |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  44160761 ggccgtttagctatttaaacgtcatcccatcagacggt 44160724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 883 - 974
Target Start/End: Original strand, 42570763 - 42570854
Alignment:
Q  883 gaatgagggtagtcatccctctcactctcatccttcagacaaccatccttcatgaacctaaacatacaaggtacacaatttcttattccttt 974  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42570763 gaatgagggtattcatccctctcactctcatccttctgacagttatccttcatgaacctaaacatacaaggtacacaatttcttattccttt 42570854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 616 - 732
Target Start/End: Original strand, 43444804 - 43444920
Alignment:
Q  616 gtgttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataagttgatgtcataatataaattataatctattgcgttaagcac 715  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| || | ||| ||||||||||  ||||||| ||||| |||    
T  43444804 gtgttagattaattatttaattaatcaattatggattgacaatagtcaattattataggttaatattatattataaattatggtctattgtgttaaacac 43444903  T
Q  716 taattagttgatgaata 732  Q
    | |||||||||||||||    
T  43444904 tcattagttgatgaata 43444920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 502 - 572
Target Start/End: Original strand, 53593834 - 53593904
Alignment:
Q  502 gagcataacatgttaacgttgaaatcgtaatttcggctgaaagaatgataactattcataattattgtttt 572  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  53593834 gagcataacatgttaacgttgaaatcgtaatttcggccgaaagaatgataactattcataattcttgtttt 53593904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 871 - 970
Target Start/End: Original strand, 33361761 - 33361857
Alignment:
Q  871 tggtgctaaacggaatgagggtagtcatccctctcactctcatccttcagacaacc---atccttcatgaacctaaacatacaaggtacacaatttctta 967  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||      |||||| ||||||    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  33361761 tggtgctacacggaatgagggtagtcatccctctca------tccttctgacaacagttatccttcatgaacctaaacatacaaagtacacaatttctta 33361854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 619 - 673
Target Start/End: Original strand, 123440 - 123494
Alignment:
Q  619 ttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataa 673  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  123440 ttggattaagtatttaattaatcaattatggattgataataatcaattattataa 123494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 617 - 665
Target Start/End: Original strand, 2544838 - 2544886
Alignment:
Q  617 tgttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaat 665  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2544838 tgttggattaattatttaattaatcaattacggattgacaataatcaat 2544886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 927 - 966
Target Start/End: Original strand, 36049103 - 36049142
Alignment:
Q  927 atccttcatgaacctaaacatacaaggtacacaatttctt 966  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36049103 atccttcatgaacctaaacatacaaggtacacaatttctt 36049142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 471 - 510
Target Start/End: Original strand, 53592898 - 53592937
Alignment:
Q  471 ttcgcccaaaatccaatgaattttaccatatgagcataac 510  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53592898 ttcgcccaaaatccaatgaattttaccatatgagcataac 53592937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 651 - 741
Target Start/End: Complemental strand, 18888257 - 18888167
Alignment:
Q  651 ttgacaataatcaattattataagttgatgtcataatataaattataatctattgcgttaagcactaattagttgatgaatacgtctgatt 741  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||| ||||| || | |||  |||||||  ||||||||| ||||||||||||||| || |||||    
T  18888257 ttgacaataatcaattattataaattaatgttataatttataatatggtctattgtattaagcactcattagttgatgaatatgtatgatt 18888167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 622 - 670
Target Start/End: Original strand, 30425735 - 30425783
Alignment:
Q  622 gattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattatta 670  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  30425735 gattaattatttaatcaataaattatgaattgacaataatcaattatta 30425783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 623 - 670
Target Start/End: Original strand, 36166221 - 36166268
Alignment:
Q  623 attaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattatta 670  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  36166221 attacttatttaattaatcaaatatggatttacaataatcaattatta 36166268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 617 - 670
Target Start/End: Complemental strand, 38792009 - 38791956
Alignment:
Q  617 tgttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattatta 670  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||| |||||||||    
T  38792009 tgttagattaattatttaactaatcaataatggatcgacaataagcaattatta 38791956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 266; Significance: 1e-148; HSPs: 14)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 617 - 975
Target Start/End: Complemental strand, 267982 - 267628
Alignment:
Q  617 tgttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataagttgatgtcataatataaattataatctattgcgttaagcact 716  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  267982 tgttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataagttgatgtcataatataaattatggtctattgcgttaagcact 267883  T
Q  717 aattagttgatgaatacgtctgattgtgctattctttctaaatggaccgtgatgggttgaaccatttagctaaacccaatgaggggtccctgccctcagc 816  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  267882 aattagttgatgaatatgtctgattgggctattctttctaaatggaccgtgatgggtttgaccatttagctaagcccaatgagaggtccctgccctcagc 267783  T
Q  817 cgtttaactatttaaacgttatcccatcagacggttaaaccattctgaacattctggtgctaaacggaatgagggtagtcatccctctcactctcatcct 916  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||        
T  267782 cgtttagctatttaaacgtcatcccatcaaacggttaaactattctgaacattctggtgctaaacggaatgagggtagtcattcctcccactctca---- 267687  T
Q  917 tcagacaaccatccttcatgaacctaaacatacaaggtacacaatttcttattcctttg 975  Q
    || ||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  267686 tctgacagttatccttcatgaacctaaacatacaaggtacacaatttcttattcatttg 267628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 619 - 973
Target Start/End: Original strand, 48853502 - 48853854
Alignment:
Q  619 ttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataagttgatgtcataatataaattataatctattgcgttaagcactaa 718  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||| || | |||  |||||||  ||||||||| |    
T  48853502 ttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataaattaatgttataatttataatatggtctattgtattaagcactca 48853601  T
Q  719 ttagttgatgaatacgtctgattgtgctattctttctaaatggaccgtgatgggttgaaccatttagctaaacccaatgaggggtccctgccctcagccg 818  Q
    |||||||||||||| || ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  48853602 ttagttgatgaatatgtatgattggactattctttctaaatggaccgtgatgggttggaccatttagctaagcccaatgagaggtccctgccctcagccg 48853701  T
Q  819 tttaactatttaaacgttatcccatcagacggttaaaccattctgaa-cattctggtgctaaacggaatgagggtagtcatccctctcactctcatcctt 917  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||   ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||   || | ||     
T  48853702 tttaactatttaaacgtcatcccatcagacggttaaactattgtgaattcttctggtgctacacggaatgagggtagtcatccctctca---tccttctg 48853798  T
Q  918 cagacaaccatccttcatgaacctaaacatacaaggtacacaatttcttattcctt 973  Q
       ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  48853799 acaacaactatcattcatgaacctaaacatacaaggtagacaatttcttattcctt 48853854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 195; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 617 - 973
Target Start/End: Original strand, 32517018 - 32517371
Alignment:
Q  617 tgttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataagttgatgtcataatataaattataatctattgcgttaagcact 716  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||| || | |||  |||||||  |||||||||    
T  32517018 tgttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataaattaatgttataatttataatatggtctattgtattaagcact 32517117  T
Q  717 aattagttgatgaatacgtctgattgtgctattctttctaaatggaccgtgatgggttgaaccatttagctaaacccaatgaggggtccctgccctcagc 816  Q
     ||||||||||||||| || |||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||    
T  32517118 tattagttgatgaatatgtatgattgggctattcttactaaattgaccgtgatgggttggaccatttagctaagcccaatgagaggtccatgccctcagc 32517217  T
Q  817 cgtttaactatttaaacgttatcccatcagacggttaaacca---ttctgaacattctggtgctaaacggaatgagggtagtcatccctctcactctcat 913  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||  |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||    
T  32517218 cgtttagctatttaaacgtcatcccattagacggttaaagtattcttctgaacattctggtgctaaacggaatgagggtagtcatcc------ctctcat 32517311  T
Q  914 ccttcagacaaccatccttcatgaacctaaacatacaaggtacacaatttcttattcctt 973  Q
    ||||| |||||| ||||||||| |||||||||||| ||| || | |||||||||||||||    
T  32517312 ccttctgacaactatccttcataaacctaaacatagaagatatataatttcttattcctt 32517371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 617 - 975
Target Start/End: Complemental strand, 279049 - 278712
Alignment:
Q  617 tgttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataagttgatgtcataatataaattataatctattgcgttaagcact 716  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  279049 tgttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataaattgatgtcataatataaattatggtctattgcgttaagcact 278950  T
Q  717 aattagttgatgaatacgtctgattgtgctattctttctaaatggaccgtgatgggttgaaccatttagctaaacccaatgaggggtccctgccctcagc 816  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||         || |||||||| |||||||    
T  278949 aattagttgatgaatatgtctgattgggctattctttctaaatggaccgtgatgggttggaccatttagcta---------agaggtccctg-cctcagc 278860  T
Q  817 cgtttaactatttaaacgttatcccatcagacggttaaaccattctgaacattctggtgctaaacggaatgagggtagtcatccctctcactctcatcct 916  Q
    |||||| |||||||||||| ||||        |||||||| |||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||        
T  278859 cgtttagctatttaaacgtcatcc-------aggttaaactattctgaacattctagtactaaacagaatgagggtagtcattcctcccactctca---- 278771  T
Q  917 tcagacaaccatccttcatgaacctaaacatacaaggtacacaatttcttattcctttg 975  Q
    || ||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  278770 tctgacagttatccttcatgaacctaaacatacaaggtacacaatttcttattcatttg 278712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 170; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 630 - 904
Target Start/End: Complemental strand, 26451141 - 26450872
Alignment:
Q  630 atttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataagttgatgtcataatataaattataatctattgcgttaagcactaattagttgatga 729  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  26451141 atttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataagttaatgtcataatataaattatggtctattgtgttaagcactaattagatgatga 26451042  T
Q  730 atacgtctgattgtgctattctttctaaatggaccgtgatgggttgaaccatttagctaaacccaatgaggggtccctgccctcagccgtttaactattt 829  Q
    |||  | |||||| ||||    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  26451041 atatttgtgattgggcta----ttctaaatggactgtgatgggttggaccatttagctaagcccaatgagaggtcccttccctcagccgtttagctattt 26450946  T
Q  830 aaacgttatcccatcagacggttaaaccattctgaacattctggtgctaaacggaatgagggtagtcatccctct 904  Q
    |||||| |||||||||||||||| || ||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26450945 aaacgtcatcccatcagacggtt-aagcattctgaacactctactgctaaacggaatgagggtagtcatccctct 26450872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 101; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 617 - 848
Target Start/End: Complemental strand, 40771877 - 40771648
Alignment:
Q  617 tgttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataagttgatgtcataatataaattataatctattgcgttaagcact 716  Q
    ||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||| || |  |||||||||||||  ||||||| ||| ||||||    
T  40771877 tgttggattaattgttgaattaatgaattatggattgacgacaatcaattattataagttaatct--taatataaattatggtctattgtgttgagcact 40771780  T
Q  717 aattagttgatgaatacgtctgattgtgctattctttctaaatggaccgtgatgggttgaaccatttagctaaacccaatgaggggtccctgccctcagc 816  Q
    |||||| |  |||||| || |||||| |||||| ||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||| | ||||||| ||||| ||||||||||    
T  40771779 aattagctagtgaatatgtgtgattgagctattgtttctaaatggaccgtgatgaattgactcatttagctaagctcaatgagaggtccttgccctcagc 40771680  T
Q  817 cgtttaactatttaaacgttatcccatcagac 848  Q
    |||||| |||||||||| | || |||||||||    
T  40771679 cgtttagctatttaaacatcattccatcagac 40771648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 73; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 688 - 856
Target Start/End: Complemental strand, 29148882 - 29148715
Alignment:
Q  688 ataaattataatctattgcgttaagcactaattagttgatgaatacgtctgattgtgctattctttctaaatggaccgtgatgggttgaaccatttagct 787  Q
    |||||||||| ||||| |  |||| |||||||||||||||||||| || || ||    |||||||||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||    
T  29148882 ataaattatagtctatggtattaaacactaattagttgatgaatatgtatgtttcgattattctttctaaatggacggtgattggttggaacatttagct 29148783  T
Q  788 aaacccaatgaggggtccctgccctcagccgtttaactatttaaacgttatcccatcagacggttaaac 856  Q
    ||  |||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  29148782 aagtccaatgagaggtcc-tgccctcagccgtttagctatttaaacgtcatcccatcagacgtttaaac 29148715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 73; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 632 - 775
Target Start/End: Original strand, 40771155 - 40771296
Alignment:
Q  632 ttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataagttgatgtcataatataaattataatctattgcgttaagcactaattagttgatgaat 731  Q
    ||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||  |||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  40771155 ttaattattgaattatggattgacgataatcaattattataagttaatctca--atataaattatggtctattgtgttaaacactaattagttgatgaat 40771252  T
Q  732 acgtctgattgtgctattctttctaaatggaccgtgatgggttg 775  Q
    | || |||||| |||||| |||||||||||| |||||| |||||    
T  40771253 atgtgtgattgggctattgtttctaaatggaacgtgataggttg 40771296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 687 - 849
Target Start/End: Original strand, 5172840 - 5173002
Alignment:
Q  687 tataaattataatctattgcgttaagcactaattagttgatgaatacgtctgattgtgctattctttctaaatggaccgtgatgggttgaaccatttagc 786  Q
    |||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||  | ||||||   |||| ||||||||| |||| ||||||||||||| ||||| |    
T  5172840 tataaattatgatctattgtattaagcactaattagttgatgaatatatgtgattggattattgtttctaaattgaccatgatgggttgaactatttacc 5172939  T
Q  787 taaacccaatgaggggtccctgccctcagccgtttaactatttaaacgttatcccatcagacg 849  Q
    ||| | ||||||| ||| | |||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||| |||||    
T  5172940 taagcacaatgagaggttcttgccctcaaccgtttagctatttaaacgtcatcccattagacg 5173002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 625 - 676
Target Start/End: Complemental strand, 29148973 - 29148922
Alignment:
Q  625 taattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataagtt 676  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  29148973 taattatttaattaatcaattatgaattgacaataattaattattataagtt 29148922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 616 - 696
Target Start/End: Original strand, 21910422 - 21910502
Alignment:
Q  616 gtgttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattat--aagttgatgtcataatataaattat 696  Q
    |||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || | ||||||||||||||    
T  21910422 gtgttggattaattgtttaattat--aattatggattgacaataatcaattattataaaagttaatattataatataaattat 21910502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 801 - 854
Target Start/End: Original strand, 40771296 - 40771349
Alignment:
Q  801 ggtccctgccctcagccgtttaactatttaaacgttatcccatcagacggttaa 854  Q
    |||||| ||||| ||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  40771296 ggtccccgcccttagcggtttagctatttaaacgtcatcccatcagacggttaa 40771349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 623 - 666
Target Start/End: Complemental strand, 25189485 - 25189443
Alignment:
Q  623 attaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaatt 666  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  25189485 attaattatttaattaatcaattatgaattga-aataatcaatt 25189443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 931 - 973
Target Start/End: Original strand, 5173090 - 5173132
Alignment:
Q  931 ttcatgaacctaaacatacaaggtacacaatttcttattcctt 973  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5173090 ttcataaacctaaccatacaaggtacataatttcttattcctt 5173132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0502 (Bit Score: 217; Significance: 1e-119; HSPs: 2)
Name: scaffold0502
Description:

Target: scaffold0502; HSP #1
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 617 - 906
Target Start/End: Original strand, 8837 - 9128
Alignment:
Q  617 tgttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataagttgatgtcataatataaattataatctattgcgttaagcact 716  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  8837 tgttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataagttaaagtcataatataaattatggtctattgtgttaagcact 8936  T
Q  717 aattagttgatgaatacgtctgattgtgctattctttctaaatggaccgtgatgggttgaaccatttagctaaacccaatgaggggtccctgccctcagc 816  Q
    |||||||| ||||||| || ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  8937 aattagtttatgaatatgtgtgattgatctattctttctaaatggaccgtgatgggttgaaccatttagctaagcccaatgagaggtccctgccctcagc 9036  T
Q  817 cgtttaactatttaaacgttatcccatcagacggttaaaccattctgaa--cattctggtgctaaacggaatgagggtagtcatccctctca 906  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9037 cgtttagctatttaaacgtcatcccatcagacggttaaaccattctgaaattcttctggtgctaaacggaatgagggtagtcatccctctca 9128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0502; HSP #2
Raw Score: 157; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 617 - 906
Target Start/End: Original strand, 4122 - 4428
Alignment:
Q  617 tgttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaatta--------------tta-taagttgatgtcataatataaattataatct 701  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |              ||| ||| || | |||||||||||||||||  |||    
T  4122 tgttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaatgaatttttttattcttttactaatttaaagtcataatataaattatggtct 4221  T
Q  702 attgcgttaagcactaattagttgatgaatacgtctgattgtgctattctttctaaatggaccgtgatgggttgaaccatttagctaaacccaatgaggg 801  Q
    |||| ||||| |||||||||||| ||||||| || ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  4222 attgtgttaaacactaattagtttatgaatatgtgtgattggactattctttctaaatggaccgtgatgggttgaaccatttagctaagcccaatgagag 4321  T
Q  802 gtccctgccctcagccgtttaactatttaaacgttatcccatcagacggttaaaccattctgaa--cattctggtgctaaacggaatgagggtagtcatc 899  Q
    ||||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4322 gtccctgccctcaaccgttcagctatttaaacgtcatcccatcagacggttaaaccattctgaaattcttctggtgctaaacggaatgagggtagtcatc 4421  T
Q  900 cctctca 906  Q
    |||||||    
T  4422 cctctca 4428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 217; Significance: 1e-119; HSPs: 17)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 617 - 906
Target Start/End: Original strand, 18338013 - 18338304
Alignment:
Q  617 tgttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataagttgatgtcataatataaattataatctattgcgttaagcact 716  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  18338013 tgttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataagttaaagtcataatataaattatggtctattgtgttaagcact 18338112  T
Q  717 aattagttgatgaatacgtctgattgtgctattctttctaaatggaccgtgatgggttgaaccatttagctaaacccaatgaggggtccctgccctcagc 816  Q
    |||||||| ||||||| || ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  18338113 aattagtttatgaatatgtgtgattgatctattctttctaaatggaccgtgatgggttgaaccatttagctaagcccaatgagaggtccctgccctcagc 18338212  T
Q  817 cgtttaactatttaaacgttatcccatcagacggttaaaccattctgaa--cattctggtgctaaacggaatgagggtagtcatccctctca 906  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18338213 cgtttagctatttaaacgtcatcccatcagacggttaaaccattctgaaattcttctggtgctaaacggaatgagggtagtcatccctctca 18338304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 617 - 906
Target Start/End: Complemental strand, 23848808 - 23848519
Alignment:
Q  617 tgttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataagttgatgtcataatataaattataatctattgcgttaagcact 716  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||| || |||||||    
T  23848808 tgttggattaattatttagttaatcatttatggattgacaataatcaattattataagttaatgtcataatataaattatggtctattgtgtaaagcact 23848709  T
Q  717 aattagttgatgaatacgtctgattgtgctattctttctaaatggaccgtgatgggttgaaccatttagctaaacccaatgaggggtccctgccctcagc 816  Q
    ||||| |||||||||| || ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||    
T  23848708 aattaattgatgaatatgtgtgattggactattctttctaaatggaccgtgatgggttgaaccatttagctaagcccaatgagaggtccctgcccttagc 23848609  T
Q  817 cgtttaactatttaaacgttatcccatcagacggttaaaccattctgaacattctggtgctaaacggaatgagggtagtcatccctctca 906  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||    
T  23848608 cgtttagctatttaaacgtcatcccatcagatggttaaactattctgaacattctggtgctaaagggaatgagcgcagtcatccctctca 23848519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 617 - 906
Target Start/End: Original strand, 9972674 - 9972966
Alignment:
Q  617 tgttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataagttgatgtcataatataaattataatctattgcgttaagcact 716  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||| || | |||  |||||||  |||| || |    
T  9972674 tgttggattaattatttaattaatcaattatagattgacaataatcaattattataaattaatgttataatttataatatggtctattgtattaaacatt 9972773  T
Q  717 aattagttgatgaatacgtctgattgtgctattctttctaaatggaccgtgatgggttgaaccatttagctaaacccaatgaggggtccctgccctcagc 816  Q
     ||||||||||||||| || |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  9972774 cattagttgatgaatatgtatgattgggctattctaactaaatggaccgtgatgggttgaaccatttagctaagcccaatgagaggtccctgccctcagc 9972873  T
Q  817 cgtttaactatttaaacgttatcccatcagacggttaaacca---ttctgaacattctggtgctaaacggaatgagggtagtcatccctctca 906  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9972874 cgtttagctatttaaacgttatcccatcagacggttaaactattcttctgaacattctggtgctaaacggaatgagggtagtcatccctctca 9972966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 164; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 616 - 906
Target Start/End: Complemental strand, 7553654 - 7553363
Alignment:
Q  616 gtgttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataagttgatgtcataatataaattataatctattgcgttaagcac 715  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||| | ||||||||     
T  7553654 gtgttggattaattatttaattaatcaaatatgg-ttgacaataatcaattattataagttaatgtcataatataaattatggtctatggtgttaagcat 7553556  T
Q  716 taattagttgatgaatacgtctgattgtgctattctttctaaatggaccgtgatgggttgaaccatttagctaaacccaatgaggggtccctgccctcag 815  Q
    |||||| | |||||||| ||  ||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||||||||| |    
T  7553555 taattaat-gatgaatatgtgcgattgggctattctttttaaatggatcgtgatgggttggaccatttagctaaacccagtgagaagtccctgccctcgg 7553457  T
Q  816 ccgtttaactatttaaacgttatcccatcagacggttaaaccattctgaaca---ttctggtgctaaacggaatgagggtagtcatccctctca 906  Q
    |||||||  ||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7553456 ccgtttagttatttaaacatcatcccatcagacggttaaactattctgaacatttttcaggtgctaaacggaatgagggtagtcatccctctca 7553363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 160; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 617 - 906
Target Start/End: Complemental strand, 32932546 - 32932264
Alignment:
Q  617 tgttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataagttgatgtcataatataaattataatctattgcgttaagcact 716  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||| |||||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||    
T  32932546 tgttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataat-------tataagttaatgtcataatataaattatggtctattgtgttaaacact 32932454  T
Q  717 aattagttgatgaatacgtctgattgtgctattctttctaaatggaccgtgatgggttgaaccatttagctaaacccaatgaggggtccctgccctcagc 816  Q
    ||||| |||||||||| || |||||| |||||||||||||||||| | |||||| |||| ||||||||| | | ||||||||| | || ||||||||||     
T  32932453 aattaattgatgaatatgtgtgattgagctattctttctaaatgggctgtgatgtgttggaccatttagttgagcccaatgagagatctctgccctcagt 32932354  T
Q  817 cgtttaactatttaaacgttatcccatcagacggttaaaccattctgaacattctggtgctaaacggaatgagggtagtcatccctctca 906  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | | |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  32932353 cgtttaactatttaaacgtcatcccatcagacggttaaactactatgaacattttggtgctaaatggaatgagggtagtcatccctctca 32932264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 125; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 617 - 867
Target Start/End: Complemental strand, 22958312 - 22958071
Alignment:
Q  617 tgttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataagttgatgtcataatataaattataatctattgcgttaagcact 716  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||          | ||||||||    
T  22958312 tgttggattaattatttagttaatcaattatggattgacaataatcaattattataagttaatgtcataatataaactat----------ggtaagcact 22958223  T
Q  717 aattagttgatgaatacgtctgattgtgctattctttctaaatggaccgtgatgggttgaaccatttagctaaacccaatgaggggtccctgccctcagc 816  Q
    ||||| |||||||| | || |||||  | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  |||||||||||||||    
T  22958222 aattaattgatgaaaatgtgtgattaggttattctttttaaatggaccgtgatgggttgaaccatttagttaagcccaatgagaagtccctgccctcagc 22958123  T
Q  817 cgtttaactatttaaacgttatcccatcagacggtt-aaaccattctgaaca 867  Q
    || ||| |||||||||||| ||||||||||| |||| |||| ||||||||||    
T  22958122 cgattagctatttaaacgtcatcccatcagatggttaaaactattctgaaca 22958071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 125; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 617 - 867
Target Start/End: Original strand, 23830080 - 23830321
Alignment:
Q  617 tgttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataagttgatgtcataatataaattataatctattgcgttaagcact 716  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||          | ||||||||    
T  23830080 tgttggattaattatttagttaatcaattatggattgacaataatcaattattataagttaatgtcataatataaactat----------ggtaagcact 23830169  T
Q  717 aattagttgatgaatacgtctgattgtgctattctttctaaatggaccgtgatgggttgaaccatttagctaaacccaatgaggggtccctgccctcagc 816  Q
    ||||| |||||||| | || |||||  | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  |||||||||||||||    
T  23830170 aattaattgatgaaaatgtgtgattaggttattctttttaaatggaccgtgatgggttgaaccatttagttaagcccaatgagaagtccctgccctcagc 23830269  T
Q  817 cgtttaactatttaaacgttatcccatcagacggtt-aaaccattctgaaca 867  Q
    || ||| |||||||||||| ||||||||||| |||| |||| ||||||||||    
T  23830270 cgattagctatttaaacgtcatcccatcagatggttaaaactattctgaaca 23830321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 745 - 906
Target Start/End: Original strand, 27101530 - 27101691
Alignment:
Q  745 ctattctttctaaatggaccgtgatgggttgaaccatttagctaaacccaatgaggggtccctgccctcagccgtttaactatttaaacgttatcccatc 844  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  |||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||    
T  27101530 ctattctttctaaatggaccgtgatgggttgaaccatttagttaagcccaatgagatgtccctgccctcagtcgtttagctatttaaactttatcccatc 27101629  T
Q  845 agacggttaaaccattctgaacattctggtgctaaacggaatgagggtagtcatccctctca 906  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27101630 agacggttaaactactctgaacattctggtgttaaacggaatgagggtagtcatccctctca 27101691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 745 - 906
Target Start/End: Original strand, 27143352 - 27143513
Alignment:
Q  745 ctattctttctaaatggaccgtgatgggttgaaccatttagctaaacccaatgaggggtccctgccctcagccgtttaactatttaaacgttatcccatc 844  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  |||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||    
T  27143352 ctattctttctaaatggaccgtgatgggttgaaccatttagttaagcccaatgagatgtccctgccctcagtcgtttagctatttaaactttatcccatc 27143451  T
Q  845 agacggttaaaccattctgaacattctggtgctaaacggaatgagggtagtcatccctctca 906  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27143452 agacggttaaactactctgaacattctggtgttaaacggaatgagggtagtcatccctctca 27143513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 617 - 854
Target Start/End: Complemental strand, 15121762 - 15121532
Alignment:
Q  617 tgttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataagttgatgtcataatataaattataatctattgcgttaagcact 716  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| || |   ||||||||||||  | ||||| |||||  |||    
T  15121762 tgttggattaattatttaattaatcaattgtagattgacaataatcaattattataagttcatctttcaatataaattatggtatattgtgttaataact 15121663  T
Q  717 aattagttgatgaatacgtctgattgtgctattctttctaaatggaccgtgatgggttgaaccatttagctaaacccaatgaggggtccctgccctcagc 816  Q
    |||||||||||||||| || |||||| | |||| ||| ||||||||| ||||| ||||| || ||||| ||||       |   |||| |||||||||||    
T  15121662 aattagttgatgaatatgtgtgattgagttattgtttataaatggactgtgatcggttggacgatttaactaa-------gtcaggtctctgccctcagc 15121570  T
Q  817 cgtttaactatttaaacgttatcccatcagacggttaa 854  Q
     ||||||||||||||| || ||| ||||| ||||||||    
T  15121569 agtttaactatttaaatgtcatctcatcatacggttaa 15121532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 746 - 900
Target Start/End: Original strand, 19543490 - 19543650
Alignment:
Q  746 tattctttctaaatggaccgtgatgggttgaaccatttagctaaacccaatgaggggtccctgccctcagccgtttaactatttaaacgttatcccatca 845  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||| |||| || |||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||| ||||    
T  19543490 tattctttttaaatgggccgtgatgggttggaccatttaactaagccgaatgagaggtccctgcccttagccgtttagctatttaaacgtcatcctatca 19543589  T
Q  846 gacggtt-aaaccattctg-----aacattctggtgctaaacggaatgagggtagtcatcc 900  Q
    ||||||| |||| || |||     ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19543590 gacggttaaaactatgctgaacttaacattctggtgctaaagggaatgagggtagtcatcc 19543650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 617 - 696
Target Start/End: Original strand, 19543398 - 19543477
Alignment:
Q  617 tgttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataagttgatgtcataatataaattat 696  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19543398 tgttggattaattatttagttaatcaattatggattgacaataatcaattattataagttaatgtcataatataaattat 19543477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 617 - 696
Target Start/End: Original strand, 27101433 - 27101512
Alignment:
Q  617 tgttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataagttgatgtcataatataaattat 696  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  27101433 tgttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataagttaatgttataatataaattat 27101512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 617 - 696
Target Start/End: Original strand, 27143255 - 27143334
Alignment:
Q  617 tgttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataagttgatgtcataatataaattat 696  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  27143255 tgttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataagttaatgttataatataaattat 27143334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 926 - 973
Target Start/End: Original strand, 9972965 - 9973012
Alignment:
Q  926 catccttcatgaacctaaacatacaaggtacacaatttcttattcctt 973  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  9972965 catccttcatgaacctaaacatacaaggtacataatttcttattcctt 9973012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 853 - 906
Target Start/End: Complemental strand, 22958062 - 22958009
Alignment:
Q  853 aaaccattctgaacattctggtgctaaacggaatgagggtagtcatccctctca 906  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  22958062 aaactattctgaacattctggtgctaaagggaatgagggtaatcatccctctca 22958009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 853 - 906
Target Start/End: Original strand, 23830330 - 23830383
Alignment:
Q  853 aaaccattctgaacattctggtgctaaacggaatgagggtagtcatccctctca 906  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  23830330 aaactattctgaacattctggtgctaaagggaatgagggtaatcatccctctca 23830383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 214; Significance: 1e-117; HSPs: 14)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 617 - 906
Target Start/End: Original strand, 44626023 - 44626312
Alignment:
Q  617 tgttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataagttgatgtcataatataaattataatctattgcgttaagcact 716  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||||||||    
T  44626023 tgttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataagttgatgtcataatataaattatggtttattgtgttaagcact 44626122  T
Q  717 aattagttgatgaatacgtctgattgtgctattctttctaaatggaccgtgatgggttgaaccatttagctaaacccaatgaggggtccctgccctcagc 816  Q
    |||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| ||||| |||||    
T  44626123 aattagttgatgaatatgtctaattgagctattctttctaaatggaccgtgatgggttggaccatttagctaagcccaatgagaggtctctgccttcagc 44626222  T
Q  817 cgtttaactatttaaacgttatcccatcagacggttaaaccattctgaacattctggtgctaaacggaatgagggtagtcatccctctca 906  Q
    |||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44626223 cgtttagctatttaaacgtcatctcatcagacggttaaactattctgaatattccagtgctaaacggaatgagggtagtcatccctctca 44626312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 617 - 973
Target Start/End: Complemental strand, 32038345 - 32037991
Alignment:
Q  617 tgttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataagttgatgtcataatataaattataatctattgcgttaagcact 716  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||| || | |||  |||||||  |||||||||    
T  32038345 tgttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataaattaatgttataatttataatatggtctattgtattaagcact 32038246  T
Q  717 aattagttgatgaatacgtctgattgtgctattctttctaaatggaccgtgatgggttgaaccatttagctaaacccaatgaggggtccctgccctcagc 816  Q
     ||||||||||||||| || ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  32038245 cattagttgatgaatatgtatgattggactattctttctaaatggaccgtgatgggttggaccatttagctaagcccaatgagaggtccctgccctcagc 32038146  T
Q  817 cgtttaactatttaaacgttatcccatcagacggttaaaccattctgaac-attctggtgctaaacggaatgagggtagtcatccctctcactctcatcc 915  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||| || |||||||||||||||||||||      |||||||||    
T  32038145 cgtttagctatttaaacgtcatcccatcagacggttaaactattctgaactcttctggtgttacacggaatgagggtagtcatcc------ctctcatcc 32038052  T
Q  916 ttcagacaa---ccatccttcatgaacctaaacatacaaggtacacaatttcttattcctt 973  Q
    ||| |||||   |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32038051 ttctgacaacagctgtccttcatgaacctaaacatacaaggtacacaatttcttattcctt 32037991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 171; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 617 - 973
Target Start/End: Complemental strand, 26005777 - 26005424
Alignment:
Q  617 tgttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataagttgatgtcataatataaattataatctattgcgttaagcact 716  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || | ||||| || | |||  | ||||   |||||||||    
T  26005777 tgttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataaattaatattataatttataatatggtttattatattaagcact 26005678  T
Q  717 aattagttgatgaatacgtctgattgtgctattctttctaaatggaccgtgatgggttgaaccatttagctaaacccaatgaggggtccctgccctcagc 816  Q
     |||| |||||||||| || |||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  26005677 cattaattgatgaatatgtatgattgggctattcttactaaatggactgtgatgggttggaccatttagctaagcccaatgagaggtccctaccctcagc 26005578  T
Q  817 cgtttaactatttaaacgttatcccatcagacggttaaaccattc---tgaacattctggtgctaaacggaatgagggtagtcatccctctcactctcat 913  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||      || |||||||    
T  26005577 cgtttagctatttaaacgtcatcccatcatacggttaaactattcttatgaacattctggtgctaaacggaatgagggtagtca------tctctctcat 26005484  T
Q  914 ccttcagacaaccatccttcatgaacctaaacatacaaggtacacaatttcttattcctt 973  Q
    || |  |||| | ||| || ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  26005483 ccctgtgacagctatcatttatgaacctaaacatataaggtacataatttcttattcctt 26005424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 635 - 906
Target Start/End: Original strand, 1262238 - 1262511
Alignment:
Q  635 attaatcaattatggattgacaataatcaattattataagttgatgtcataatataaattataatctattgcgttaagcactaattagttgatgaatacg 734  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  1262238 attaaccaattatggattgagaataatcaattattataagttaatgttctaatataaattatgatctattgtgttaagcactaattagttgatgaatatg 1262337  T
Q  735 tctgattgtgctattctttctaaatggaccgtgatgggttgaaccatttagctaaacccaatgaggggtccctgccctcagccgtttaactatttaaacg 834  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| || |||||| | ||| |||||||||||||||| | |||||||||    
T  1262338 tgtgattgggctattctttctaaatggaccgtgatgagtttgaccatttagctaagcctaatgagagatccatgccctcagccgtttagccatttaaacg 1262437  T
Q  835 ttatcccatcagacggttaaaccattctgaacattctggtg-----ctaaacggaatgagggtagtcatccctctca 906  Q
    | ||||  ||  |||||||||  ||||||| || | |||||     |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1262438 tcatcc--tcccacggttaaagtattctgaccagtatggtgcaaacctaaac-gaatgagggtagtcatccctctca 1262511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 124; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 617 - 906
Target Start/End: Original strand, 38143786 - 38144069
Alignment:
Q  617 tgttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataagttgatgtcataatataaattataatctattgcgttaagcact 716  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||| || | |||  |||||||  |||||||||    
T  38143786 tgttggattaattatttaattaatcaactatagattgacaataatcaattattataaattaatgttataatttataatatggtctattgtattaagcact 38143885  T
Q  717 aattagttgatgaatacgtctgattgtgctattctttctaaatggaccgtgatgggttgaaccatttagctaaacccaatgaggggtccctgccc--tca 814  Q
     ||||||||||         |||||| | |||||||| |||||| ||| |||||||||| |||||||| | || ||||||||| |||||||||||  |||    
T  38143886 cattagttgata--------tgattgggatattctttttaaatgaaccatgatgggttggaccatttatccaagcccaatgagaggtccctgccccctca 38143977  T
Q  815 gccgtttaactatttaaacgttatcccatcagacggttaaaccattctgaacattctggtgctaaacggaatgagggtagtcatccctctca 906  Q
    |||||||| |||||||||| | ||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  38143978 gccgtttagctatttaaacctcatcccatcatacggttaaactattctgaacattccggtgctagacggaatgacggtagtcatccctctca 38144069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 123; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 724 - 973
Target Start/End: Complemental strand, 17497643 - 17497399
Alignment:
Q  724 tgatgaatacgtctgattgtgctattctttctaaatggaccgtgatgggttgaaccatttagctaaacccaatgaggggtccctgccctcagccgtttaa 823  Q
    ||||||||| || |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||     
T  17497643 tgatgaatatgtgtgattgggttattctttctaaatggaccgtgatgggttggaccatttagccaaacccaatgagaggtccctgccctcagtcgtttag 17497544  T
Q  824 ctatttaaacgttatcccatcagacggttaaaccattctgaacattctggtgctaaacggaatgagggtagtcatccctctcactctcatccttcagaca 923  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||  | ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||   |||   ||||||||||| ||||    
T  17497543 ctatttaaacgtcatcccatcagacggttattctattttgaacattatggtgctaaacggaatgagggtagtcat---tct---tctcatccttctgaca 17497450  T
Q  924 accatccttcatgaa-cctaaacatacaaggtacacaatttcttattcctt 973  Q
     | |||||||||||| ||||||  |  |||||||||||| |||||||||||    
T  17497449 gctatccttcatgaatcctaaatcttaaaggtacacaatctcttattcctt 17497399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 110; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 617 - 900
Target Start/End: Complemental strand, 45266354 - 45266087
Alignment:
Q  617 tgttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataagttgatgtcataatataaattataatctattgcgttaagcact 716  Q
    ||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||  |||||||||    
T  45266354 tgttggattaattatttaat----caattatggattgacaataataaattattataagttaatgtcataatataaattatagtatattgtattaagcact 45266259  T
Q  717 aattagttgatgaatacgtctgattgtgctattctttctaaatggaccgtgatgggttgaaccatttagctaaacccaatgaggggtccctgccctcagc 816  Q
    ||||||||||| |||| |  |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||             ||| ||||||||| | || ||||||||||     
T  45266258 aattagttgataaatatgggtgattgggctattctttctaaatggatcgtgatgggt-------------taagcccaatgagagatcactgccctcagt 45266172  T
Q  817 cgtttaactatttaaacgttatcccatcagacggttaaaccattctgaacattct--ggtgctaaacggaatgagggtagtcatcc 900  Q
    |||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||| ||||||||||   | |||||||||||||| |||||||||||    
T  45266171 cgtttagctatttaaacgtcattccatcagacggttaaactattttgaacattcttctgcgctaaacggaatga-ggtagtcatcc 45266087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 739 - 906
Target Start/End: Complemental strand, 34548210 - 34548038
Alignment:
Q  739 attgtgctattctttctaaatggaccgtgatgggttgaaccatttagctaaacccaatgaggggtccctgccctcagccgtttaactatttaaacgt--t 836  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| | ||||||| ||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||  |    
T  34548210 attgagctattctttctaaatggaccgtgatggattagaccatttagctaagctcaatgagaggtccttgccctcagccgtttagcta-ttaaacgtcat 34548112  T
Q  837 atcccatcagacggttaaaccattctgaa----cattctggtgctaaacggaatgagggtagtcatccctctca 906  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||||||    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  34548111 atcgcatcagacggttaaacaattctgaacattcattctggtgctaaacggaatgaaggtagacatccctctca 34548038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 660 - 788
Target Start/End: Original strand, 18324737 - 18324865
Alignment:
Q  660 atcaattattataagttgatgtcataatataaattataatctattgcgttaagcactaattagttgatgaatacgtctgattgtgctattctttctaaat 759  Q
    ||||||||||||||||| || | ||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||  |||||  |||||||||||||||    
T  18324737 atcaattattataagttaatattatattataaattatggtctattgtgttaagcactaattagttgatgaataagtgcgattgaactattctttctaaat 18324836  T
Q  760 ggaccgtgatgggttgaaccatttagcta 788  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18324837 ggaccgtgatgggttgaatcatttagcta 18324865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 619 - 867
Target Start/End: Original strand, 39517250 - 39517492
Alignment:
Q  619 ttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataagttgatgtcataatataaattataatctattgcgttaagcactaa 718  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| | || ||      |||||| || ||||| ||||||||||||    
T  39517250 ttggattaattattcaattaatcaattatggatcgacaataatcgattattataagttaacgttat------aattatgatatattgtgttaagcactaa 39517343  T
Q  719 ttagttgatgaatacgtctgattgtgctattctttctaaatggaccgtgatgggttgaaccatttagctaaacccaatgaggggtccctgccctcagccg 818  Q
    ||||| |||||||| || ||||||  ||||| ||  ||||||||| || |||||||  || |||||||| |   ||||||| |||| ||||  |||| ||    
T  39517344 ttagtcgatgaatatgtgtgattgaactattgttattaaatggactgtaatgggtttgacaatttagctgagttcaatgagaggtctctgctttcagtcg 39517443  T
Q  819 tttaactatttaaacgtta-tcccatcagacggttaaaccattctgaaca 867  Q
    |||| |||||||||| | | ||||||||||||||| || |||||||||||    
T  39517444 tttagctatttaaacatcattcccatcagacggtt-aagcattctgaaca 39517492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 617 - 705
Target Start/End: Complemental strand, 34548303 - 34548215
Alignment:
Q  617 tgttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataagttgatgtcataatataaattataatctattg 705  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  ||||||||||||||  |||||||    
T  34548303 tgttagattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataaattaatgatataatataaattatggtctattg 34548215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 617 - 681
Target Start/End: Complemental strand, 17497710 - 17497646
Alignment:
Q  617 tgttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataagttgatgt 681  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  17497710 tgttggattaattatttaattaatcaattatggattgataataatcaattattataagttaatgt 17497646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 802 - 867
Target Start/End: Original strand, 18324934 - 18324998
Alignment:
Q  802 gtccctgccctcagccgtttaactatttaaacgttatcccatcagacggttaaaccattctgaaca 867  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18324934 gtccctgccctcagtcgtttaactatttaaacgtcatcccatcagacggttaaa-cattctgaaca 18324998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 803 - 871
Target Start/End: Original strand, 38151014 - 38151082
Alignment:
Q  803 tccctgccctcagccgtttaactatttaaacgttatcccatcagacggttaaaccattctgaacattct 871  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  38151014 tccctgccctcagtcgtttagctatttaaacgtcaccccatcagacggttaaactattatgaacattct 38151082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 214; Significance: 1e-117; HSPs: 22)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 617 - 906
Target Start/End: Original strand, 3469752 - 3470041
Alignment:
Q  617 tgttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataagttgatgtcataatataaattataatctattgcgttaagcact 716  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  3469752 tgttggattaattatttaattaatcaattatgaattgacaataatcaattatcataagttaatgtcataatataaattatggtctattgtgttaagcact 3469851  T
Q  717 aattagttgatgaatacgtctgattgtgctattctttctaaatggaccgtgatgggttgaaccatttagctaaacccaatgaggggtccctgccctcagc 816  Q
    ||||| |||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||    
T  3469852 aattaattgatgaatatgtgtgattgggctattctttctaaatggaccgtgatggtttggaccatttagcgaagcccaatgagaggtccctgccctcagc 3469951  T
Q  817 cgtttaactatttaaacgttatcccatcagacggttaaaccattctgaacattctggtgctaaacggaatgagggtagtcatccctctca 906  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3469952 cgtttaactatttaaacgtcatcccatcagacggttaaactactctgaacattctggtgctaaacggaatgagggtaatcatccctctca 3470041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 617 - 906
Target Start/End: Complemental strand, 19240754 - 19240465
Alignment:
Q  617 tgttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataagttgatgtcataatataaattataatctattgcgttaagcact 716  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||  | ||||| ||||||||||    
T  19240754 tgttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataagttaatgttataatataaattatggtatattgtgttaagcact 19240655  T
Q  717 aattagttgatgaatacgtctgattgtgctattctttctaaatggaccgtgatgggttgaaccatttagctaaacccaatgaggggtccctgccctcagc 816  Q
    |||||||||||||||| || |||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| || |||||| |||||||||||||| |    
T  19240654 aattagttgatgaatatgtgtgattgagatattctttctaaatggaccgtgatggattggaccatttagctaagcctaatgagaggtccctgccctcatc 19240555  T
Q  817 cgtttaactatttaaacgttatcccatcagacggttaaaccattctgaacattctggtgctaaacggaatgagggtagtcatccctctca 906  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  19240554 cgtttaactatttaaacgttatcccatcagacggttaaactattatgaatattctggtgctaaatggaatgagggtagtcatctctctca 19240465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 617 - 906
Target Start/End: Complemental strand, 39032982 - 39032686
Alignment:
Q  617 tgttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataagttgatgtcataatataaattataatctattgcgttaagcact 716  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||  ||||||  ||||||||||    
T  39032982 tgttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataagttaatgtcataatataa-ttatggtctattctgttaagcact 39032884  T
Q  717 aattagttgatgaatacgtctgattgtgctattctttctaaatggaccgtgatgggttgaaccatttagctaaacccaatgaggggtccctgccctcagc 816  Q
    |||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  39032883 aattagttgatgaatatgtgtgattgggctattctttctaaatggaccgtgatgggttggaccatttagctaagcccaatgagaggtccctgccctcagc 39032784  T
Q  817 cgtttaactatttaaacgttatcccatcagacggttaaacc--------attctgaacattctggtgctaaacggaatgagggtagtcatccctctca 906  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |        ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  39032783 cgtttagctatttaaacgtcatcccatcagacggttaaaactattctgaattctgaacattctggtgctaaagggaatgagggtagtcatccctctca 39032686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 617 - 905
Target Start/End: Original strand, 31112280 - 31112564
Alignment:
Q  617 tgttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataagttgatgtcataatataaattataatctattgcgttaagcact 716  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||  ||||||| |||||| |||    
T  31112280 tgttggaataattatttaattaataaattatggatctacaataatcaattattataagttaatatcataatataaattatggtctattgtgttaagtact 31112379  T
Q  717 aattagttgatgaatacgtctgattgtgctattctttctaaatggaccgtgatgggttgaaccatttagctaaacccaatgaggggtccctgccctcagc 816  Q
    |||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||| |||    
T  31112380 aattagttgatgaataagtgtgattgggctattctttctaaatggaccgtgatgggttggaccatttagctaagcccaatgagaggtccatgcccttagc 31112479  T
Q  817 cgtttaactatttaaacgttatcccatcagacggttaaaccattctgaacattctggtgctaaacggaatgagggtagtcatccctctc 905  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31112480 cgtttaactatttaaacgtcatcccatcagacggttaaactattctgaa----ctggtgctaaacggaatgagggtagtcatccctctc 31112564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 617 - 902
Target Start/End: Complemental strand, 29961161 - 29960875
Alignment:
Q  617 tgttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataagttgatgtcataatataaattataatctattgcgttaagcact 716  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||||| |||||||| |    
T  29961161 tgttggattaattattaaattaattaattctggattgacaataatcaattattataagttaatgtcataataaaaattatggtctattgtgttaagcatt 29961062  T
Q  717 aattagttgatgaatacgtctgattgtgctattctttctaaatggaccgtgatgggttgaaccatttagctaaacccaatgaggggtccctgccctcagc 816  Q
    |||||||||||||||| || ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  29961061 aattagttgatgaatatgtgtgattggactattctttctaaatggaccgtgatgggttggaccatttagctaaacccaatgagaggtctctgccctcagc 29960962  T
Q  817 cgtttaactatttaaacgttatcccatcagacggtt-aaaccattctgaacattctggtgctaaacggaatgagggtagtcatccct 902  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||    
T  29960961 cgtttagctatttaaacgtcatcccatcagatggttaaaaccattctgaacattctgatactagacggaatgagggtagtcatccct 29960875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 617 - 902
Target Start/End: Complemental strand, 30010366 - 30010080
Alignment:
Q  617 tgttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataagttgatgtcataatataaattataatctattgcgttaagcact 716  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||||| |||||||| |    
T  30010366 tgttggattaattattaaattaattaattctggattgacaataatcaattattataagttaatgtcataataaaaattatggtctattgtgttaagcatt 30010267  T
Q  717 aattagttgatgaatacgtctgattgtgctattctttctaaatggaccgtgatgggttgaaccatttagctaaacccaatgaggggtccctgccctcagc 816  Q
    |||||||||||||||| || ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  30010266 aattagttgatgaatatgtgtgattggactattctttctaaatggaccgtgatgggttggaccatttagctaaacccaatgagaggtctctgccctcagc 30010167  T
Q  817 cgtttaactatttaaacgttatcccatcagacggtt-aaaccattctgaacattctggtgctaaacggaatgagggtagtcatccct 902  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||    
T  30010166 cgtttagctatttaaacgtcatcccatcagatggttaaaaccattctgaacattctgatactagacggaatgagggtagtcatccct 30010080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 617 - 906
Target Start/End: Complemental strand, 32281012 - 32280721
Alignment:
Q  617 tgttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataagttgatgtcataatataaattataatctattgcgttaagcact 716  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||   |||||||||    
T  32281012 tgttggattaattatttaagtaatcaattatggattgacaataatcaattattataagttaatgtcataatataaattatggtctattctattaagcact 32280913  T
Q  717 aattagttgatgaatacgtctgattgtgctattctttctaaatggaccgtgatgggttgaaccatttagctaaacccaatgaggggtccctgccctcagc 816  Q
    |||||||||||||| | || |||||   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  32280912 aattagttgatgaacatgtgtgatttgactattctttctaaatggaccgtgatgggttggaccatttagctaagcccaatgagaggtccctaccctcagc 32280813  T
Q  817 cgtttaactatttaaacgttatcccatcagacggttaaaccattctgaacattctg--gtgctaaacggaatgagggtagtcatccctctca 906  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  32280812 cgtttagctatttaaacgtcatcccatcatacggttaaactattctgaacattctggtgtgctaaacagaacgagggtagtcatccctctca 32280721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 181; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 617 - 906
Target Start/End: Complemental strand, 32285956 - 32285665
Alignment:
Q  617 tgttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataagttgatgtcataatataaattataatctattgcgttaagcact 716  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  | ||||  ||||| ||||    
T  32285956 tgttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataagttaatgtcataatataaattatggtttattctgttaaacact 32285857  T
Q  717 aattagttgatgaatacgtctgattgtgctattctttctaaatggaccgtgatgggttgaaccatttagctaaacccaatgaggggtccctgccctcagc 816  Q
    |||||||||||||||| || ||||||   |||| ||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||| |||| |||||||||||    
T  32285856 aattagttgatgaatatgtgtgattgaattatttttcttaaatggaccgtgatgggttggaccatttagctaagcctaatgagaggtctctgccctcagc 32285757  T
Q  817 cgtttaactatttaaacgttatcccatcagacggttaaaccattctgaacattctg--gtgctaaacggaatgagggtagtcatccctctca 906  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  32285756 cgtttaacaatttaaacgtcatcccatcagacggttaaactattctgaacattccggtgtgctaaacggaatgagggtagtcatctctctca 32285665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 165; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 617 - 906
Target Start/End: Complemental strand, 39039994 - 39039699
Alignment:
Q  617 tgttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataagttgatgtcataatataaattataatctattgcgttaagcact 716  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||  ||||||  ||||| ||||    
T  39039994 tgttgaattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcagttattataagttaatgtcataatataa-ttatggtctattctgttaaacact 39039896  T
Q  717 aattagttgatgaatacgtctgattgtgctattctttctaaatggaccgtgatgggttgaaccatttagctaaacccaatgaggggtccctgccctcagc 816  Q
    |||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||     
T  39039895 aattagttgatgaatatgtgtgattgggctattctttctaaatggaccgtgatgggttggaccatttagctaagcccaatgagaggt-cctgccctcagt 39039797  T
Q  817 cgtttaactatttaaacgttatcccatcagacggttaaacc--------attctgaacattctggtgctaaacggaatgagggtagtcatccctctca 906  Q
    |||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||| |        ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  39039796 cgtttagctatttaaacgtcatcgcatcagacggttaaaactattctgaattctgaacattcaggtgctaaagggaatgagggtagttatccctctca 39039699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 160; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 616 - 906
Target Start/End: Original strand, 41272864 - 41273158
Alignment:
Q  616 gtgttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataagttgatgtcataatataaattataatctattgcgttaagcac 715  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    |||| ||||||||||||||  ||||||| |||||||||    
T  41272864 gtgttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattattataaaatgttataatataaattatggtctattgtgttaagcac 41272963  T
Q  716 taattagttgatgaatacgtctgattgtgctattctttctaaatggaccgtgatgggttgaaccatttagctaaacccaatgaggggtccctgccctcag 815  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    |||||| |||||||||||||||    
T  41272964 taattagttgatgaatatgtatgattgtgctattctttctaaatggaccatgataggttgaaccatttagctaagtttaatgagaggtccctgccctcag 41273063  T
Q  816 ccgtttaactatttaaacgttatcccatcagacggttaaaccattctgaacattctggtg-----ctaaacggaatgagggtagtcatccctctca 906  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| ||   |||||     ||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  41273064 ccgtttatctatttaaacgtcatcccattagacggttaaa-cattctgaccagcatggtgcaaacctagacggaatgagggtagtcattcctctca 41273158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 152; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 617 - 906
Target Start/End: Complemental strand, 45678127 - 45677836
Alignment:
Q  617 tgttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataagttgatgtcataatataaattataatctattgcgttaagcact 716  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||| ||||| || | |||  |||||||  ||| ||  |    
T  45678127 tgttggattaattatttaattaatcaattatggattggcaataatcaattattataaattaatgttataatttataatatggtctattgtattatgcgtt 45678028  T
Q  717 aattagttgatgaatacgtctgattgtgctattctttctaaatggaccgtgatgggttgaaccatttagctaaacccaatgaggggtccctgccctcagc 816  Q
     ||||||||||||| | || ||||||  ||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  45678027 tattagttgatgaaaatgtatgattgaactattctttttaaatagaccgtgatgggttggaccatttacctaagcccaatgagaggtccctgccctcagc 45677928  T
Q  817 cgtttaactatttaaacgt-tatcccatcagacggttaaaccattctgaac-attctggtgctaaacggaatgagggtagtcatccctctca 906  Q
    |||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  45677927 cgtttagctatttaaacgtcaatcccatcagacggttaaactattctgaactcttctggtgctacacggaatgagggtagtcatccctctca 45677836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 139; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 619 - 865
Target Start/End: Original strand, 38445548 - 38445794
Alignment:
Q  619 ttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataagttgatgtcataatataaattataatctattgcgttaagcactaa 718  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||| || ||||||||||||||||  ||||||  |||||||| |||    
T  38445548 ttggattaattatttaattaattaattatggattgacaatgttcaattattataagttaatatcataatataaattatggtctattcagttaagcattaa 38445647  T
Q  719 ttagttgatgaatacgtctgattgtgctattctttctaaatggaccgtgatgggttgaaccatttagctaaacccaatgaggggtccctgccctcagccg 818  Q
    |||||||||||||| || ||||||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || |||| |||||||| | ||    
T  38445648 ttagttgatgaatatgtgtgattgaactattttttctaaatgaaccgtgatgggttgaaccatttagctaagtccaattagaggtctctgccctcggtcg 38445747  T
Q  819 tttaactatttaaacgttatcccatcagacggttaaaccattctgaa 865  Q
    |||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  38445748 tttagctatttaaacgtcatctcatcagacggttaaactattctgaa 38445794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 617 - 866
Target Start/End: Original strand, 50158075 - 50158324
Alignment:
Q  617 tgttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataagttgatgtcataatataaattataatctattgcgttaagcact 716  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || | ||||| || | |||  |||| ||  |||||||||    
T  50158075 tgttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataaattaatattataatttataatatggtctactgtattaagcact 50158174  T
Q  717 aattagttgatgaatacgtctgattgtgctattctttctaaatggaccgtgatgggttgaaccatttagctaaacccaatgaggggtccctgccctcagc 816  Q
     ||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||   ||||||  ||| | ||||||||||    
T  50158175 cattagttgatgaatatgtatgattgtgctattatttctaaatggaccgtgatgggttggaccatttaactaagttcaatgaaaggttcatgccctcagc 50158274  T
Q  817 cgtttaactatttaaacgttatcccatcagacggttaaaccattctgaac 866  Q
    |||||  ||||||||| || ||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  50158275 cgtttggctatttaaatgtgatcacatcagacggttaaactattctgaac 50158324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 115; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 617 - 775
Target Start/End: Complemental strand, 11172251 - 11172093
Alignment:
Q  617 tgttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataagttgatgtcataatataaattataatctattgcgttaagcact 716  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||  | ||||||||    
T  11172251 tgttggattaattatttgattaatcaattatggattgacaataatcaattattataagttaatgtcataatataaattatggtctattctgataagcact 11172152  T
Q  717 aattagttgatgaatacgtctgattgtgctattctttctaaatggaccgtgatgggttg 775  Q
    |||||||||||||||| || ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11172151 aattagttgatgaatatgtgtgattgaactattctttctaaatggaccgtgatgggttg 11172093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 101; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 687 - 835
Target Start/End: Complemental strand, 10626459 - 10626311
Alignment:
Q  687 tataaattataatctattgcgttaagcactaattagttgatgaatacgtctgattgtgctattctttctaaatggaccgtgatgggttgaaccatttagc 786  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| |||| ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10626459 tataaattatggtctattgtgttaagcactaattagtagatggatatgtgtgattgggctattctttctaaatggaccgtgatgggttggaccatttagc 10626360  T
Q  787 taaacccaatgaggggtccctgccctcagccgtttaactatttaaacgt 835  Q
    ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  10626359 taagcccaatgagtggtccctgccctcagccgtttagctatttaaacgt 10626311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 690 - 856
Target Start/End: Original strand, 46611791 - 46611957
Alignment:
Q  690 aaattataatctattgcgttaagcactaattagttgatgaatacgtctgattgtgctattctttctaaatggaccgtgatgggttgaaccatttagctaa 789  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||| |||| || ||||||  |||||||||||| ||||| ||||||| |||| |||||||||||||    
T  46611791 aaattatagtctattgtgttaagcactaattagatgataaatatgtgtgattgaactattctttctagatggatcgtgatgagttggaccatttagctaa 46611890  T
Q  790 acccaatgaggggtccctgccctcagccgtttaactatttaaacgttatcccatcagacggttaaac 856  Q
     |||||| || |||| |||||||||||||||||  ||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  46611891 gcccaataagaggtcactgccctcagccgtttagttatttaaacgtcatgccatcagacggttaaac 46611957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 745 - 854
Target Start/End: Original strand, 11458160 - 11458269
Alignment:
Q  745 ctattctttctaaatggaccgtgatgggttgaaccatttagctaaacccaatgaggggtccctgccctcagccgtttaactatttaaacgttatcccatc 844  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||||| |||| ||||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||||||||| || |||||    
T  11458160 ctattgtttctaaatggaccgtgatggatttgaccatttaactaagcccaatgagaggtccatgcccttagccgtttagctatttaaacgtcataccatc 11458259  T
Q  845 agacggttaa 854  Q
    ||||||||||    
T  11458260 agacggttaa 11458269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 617 - 696
Target Start/End: Complemental strand, 10657329 - 10657253
Alignment:
Q  617 tgttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataagttgatgtcataatataaattat 696  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    |||| ||||||||||||||    
T  10657329 tgttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattatgataa---aatgttataatataaattat 10657253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 623 - 719
Target Start/End: Original strand, 11457240 - 11457334
Alignment:
Q  623 attaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataagttgatgtcataatataaattataatctattgcgttaagcactaat 719  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||  |||| |  |||||||||||||    
T  11457240 attaattatttaattaatcaattatggattgaaaataatcaattattataagttaatat--taatataaattatggtctactatgttaagcactaat 11457334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 793 - 855
Target Start/End: Original strand, 39350935 - 39350997
Alignment:
Q  793 caatgaggggtccctgccctcagccgtttaactatttaaacgttatcccatcagacggttaaa 855  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  39350935 caatgagaggtccctgccctcaaccgtttagctatttaaacgtcatcccatcagacggttaaa 39350997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 617 - 664
Target Start/End: Original strand, 46611745 - 46611792
Alignment:
Q  617 tgttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaa 664  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46611745 tgttgaattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaa 46611792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 619 - 673
Target Start/End: Complemental strand, 19242130 - 19242073
Alignment:
Q  619 ttggattaattatttaattaatcaattatgg---attgacaataatcaattattataa 673  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |   || |||||||||||||||||||||    
T  19242130 ttggattaattatttaattaatcaattatagatcatcgacaataatcaattattataa 19242073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 212; Significance: 1e-116; HSPs: 9)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 619 - 906
Target Start/End: Original strand, 22729735 - 22730022
Alignment:
Q  619 ttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataagttgatgtcataatataaattataatctattgcgttaagcactaa 718  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  22729735 ttggattaattatttaattaatcaatcatggattgacaataatcaattattataagttaatgtcataatataaattatgatctattgtgttaagcactaa 22729834  T
Q  719 ttagttgatgaatacgtctgattgtgctattctttctaaatggaccgtgatgggttgaaccatttagctaaacccaatgaggggtccctgccctcagccg 818  Q
    |||||||||||||| || |||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||    
T  22729835 ttagttgatgaatatgtgtgatcgggctattctttctaaatggactgtgatgggttggaccatttagctaagtccaatgagaggtccctgccctcagccg 22729934  T
Q  819 tttaactatttaaacgttatcccatcagacggttaaaccattctgaacattctggtgctaaacggaatgagggtagtcatccctctca 906  Q
    |||| |||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22729935 tttagctatttaaacgtcatcccatcggaaggttaaactattctgaacattctggtgctaaacggaatgagggtaatcatccctctca 22730022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 180; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 617 - 902
Target Start/End: Complemental strand, 35941350 - 35941073
Alignment:
Q  617 tgttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataagttgatgtcataatataaattataatctattgcgttaagcact 716  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||       || ||||||||||    
T  35941350 tgttggattaattatttaattaatcaattatagattgataataatcaattattataagttaatgtcataatataaattat-------tgtgttaagcact 35941258  T
Q  717 aattagttgatgaatacgtctgattgtgctattctttctaaatggaccgtgatgggttgaaccatttagctaaacccaatgaggggtccctgccctcagc 816  Q
    |||||||||||||||| || ||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  35941257 aattagttgatgaatatgtgtgattggactattctttctaaatggactgtgatgggttggaccatttcgctaagcccaatgagaggtccctgccctcagc 35941158  T
Q  817 cgtttaactatttaaacgttatcccatcagacggttaaaccattctgaacattctggtgctaaacggaatgagggtagtcatccct 902  Q
    |||||| |||||||||||| ||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  35941157 cgtttagctatttaaacgtcat-tcatcagacggttaaactattctgaacattctgatgctaaacggaatgagggtagtcatccct 35941073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 170; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 617 - 906
Target Start/End: Complemental strand, 36950371 - 36950077
Alignment:
Q  617 tgttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataagttgatgtcataatataaattataatctattgcgttaagcact 716  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  | ||||| ||||||||||    
T  36950371 tgttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataagttaatgtcataatataaattatggtttattgtgttaagcact 36950272  T
Q  717 aattagttgatgaatacgtctgattgtgctattctttctaaatggaccgtgatgggttgaaccatttagctaaacccaatgaggggtccctgccctcagc 816  Q
    |||||||||||||||| || |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  36950271 aattagttgatgaatatgtgtgattgagctattctttataaatggaccgtgatgggttggaccatttagctaagcccaatgagaggtccctgccctcagc 36950172  T
Q  817 cgtttaactatttaaacgttatccc-atcagacggtt----aaaccattctgaacattctggtgctaaacggaatgagggtagtcatccctctca 906  Q
    |||||| |||||||||||| |||||  | | |   ||    | |  ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  36950171 cgtttagctatttaaacgtcatccctgttaaattattctgaacattattctgaacattctggtgctagacgaaatgagggtagtcatccctctca 36950077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 159; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 617 - 906
Target Start/End: Original strand, 43097346 - 43097639
Alignment:
Q  617 tgttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataagttgatgtcataatataaattataatctattgcgttaagcact 716  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  43097346 tgttagattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataagttaatattataatataaattatggtctattgagttaagcact 43097445  T
Q  717 aattagttgatgaatacgtctgattgtgctattctttctaaatggaccgtgatgggttgaaccatttagctaaacccaatgaggggtccctgccctcagc 816  Q
    | |||||||||||||| || ||||||  ||||||||| |||||| ||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||    
T  43097446 agttagttgatgaatatgtgtgattggactattctttttaaatgaaccgtgatgagttggaccatttagctaagcccaatgaaaggtccctgccctcagc 43097545  T
Q  817 cgtttaactatttaaacgttatcccatcagacggttaaaccattctgaacattctggtg-----ctaaacggaatgagggtagtcatccctctca 906  Q
    |||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||| || | ||| |     ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  43097546 cgtttagctatttaaatgtcatcccatcagacggttaaa-cattctgatcagtatggggcaaacctaaacggaatgaggttagtcatccctctca 43097639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 129; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 662 - 906
Target Start/End: Original strand, 11339770 - 11340013
Alignment:
Q  662 caattattataagttgatgtcataatataaattataatctattgcgttaagcactaattagttgatgaatacgtctgattgtgctattctttctaaatgg 761  Q
    |||||||||||| || |||| ||||||||||||||  |||||||  ||||||||| ||||||| |||||||  | ||||||  |||||||||||||||||    
T  11339770 caattattataaattaatgttataatataaattatggtctattgtattaagcactgattagttaatgaatatatgtgattggactattctttctaaatgg 11339869  T
Q  762 accgtgatgggttgaaccatttagctaaacccaatgaggggtccctgccctcagccgtttaactatttaaacgttatcccatcagacggttaaaccattc 861  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||| ||||||| |||||||| |||     
T  11339870 accgtgatgggttggaccatttagctaaacccaatgagaggtccctgccctcagccgtttagctatttaaacatcatcgcatcagaaggttaaactattg 11339969  T
Q  862 tgaacattctggtgctaaacggaatgagggtagtcatccctctca 906  Q
      |||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11339970 caaacactctgctgctaaacggaatga-ggtagtcatccctctca 11340013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 617 - 788
Target Start/End: Original strand, 10491096 - 10491267
Alignment:
Q  617 tgttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataagttgatgtcataatataaattataatctattgcgttaagcact 716  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | |||||| |||||||  ||||||| |||| |||||    
T  10491096 tgttggattaattatttaattaatcaattatggatcgacaataatcaattattataagtttatattataatacaaattatggtctattgtgttaggcact 10491195  T
Q  717 aattagttgatgaatacgtctgattgtgctattctttctaaatggaccgtgatgggttgaaccatttagcta 788  Q
    |||||||| ||||||| |  |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  10491196 aattagttaatgaatatgagtgattgggctattcttactaaatggaccgtgatgggttggaccgtttagcta 10491267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 816 - 891
Target Start/End: Original strand, 10491257 - 10491331
Alignment:
Q  816 ccgtttaactatttaaacgttatcccatcagacggttaaaccattctgaacattctggtgctaaacggaatgaggg 891  Q
    ||||||| |||||||||| | |||||||||||||||| || ||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  10491257 ccgtttagctatttaaacatcatcccatcagacggtt-aatcattctgaacattttgctgctaaacggaatgaggg 10491331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 617 - 665
Target Start/End: Original strand, 16057789 - 16057837
Alignment:
Q  617 tgttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaat 665  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16057789 tgttagattagttatttaattaatcaattatgaattgacaataatcaat 16057837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 931 - 973
Target Start/End: Original strand, 43097657 - 43097699
Alignment:
Q  931 ttcatgaacctaaacatacaaggtacacaatttcttattcctt 973  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  43097657 ttcatgaatctaaacatacaaggtacacaaattcttcttcctt 43097699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 200; Significance: 1e-108; HSPs: 22)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 617 - 906
Target Start/End: Original strand, 40113309 - 40113604
Alignment:
Q  617 tgttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataagttgatgtcataatataaattataatctattgcgttaagcact 716  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  40113309 tgttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataattaattattataagttaatgtcataatataaattatggtctattgtgttaagcact 40113408  T
Q  717 a--attagttgatgaatacgtctgattgtgctattctttctaaatggaccgtgatgggttgaaccatttagctaaacccaatgaggggtccctgccctca 814  Q
    |  ||||||||||||||| || |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  40113409 ataattagttgatgaatatgtgtgattgagctattctttttaaatggaccgtgatgggttggaccatttagctaagcccaatgagaggtccctgccctca 40113508  T
Q  815 gccgtttaactatttaaacgttatcc----catcagacggttaaaccattctgaacattctggtgctaaacggaatgagggtagtcatccctctca 906  Q
    || ||||| |||||||||||| ||||    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40113509 gctgtttagctatttaaacgtcatcccatgcatcaaacggttaaactattctgaacattctggtgctaaacggaatgagggtagtcatccctctca 40113604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 617 - 906
Target Start/End: Original strand, 3949901 - 3950191
Alignment:
Q  617 tgttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataagttgatgtcataatataaattataatctattgcgttaagcact 716  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||    
T  3949901 tgttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataagttaatgtcataatataaattatagtctattgtgtcaagcact 3950000  T
Q  717 aattagttgatgaatacgtctgattgtgctattctttctaaatggaccgtgatgggttgaaccatttagctaaacccaatgaggggtccctgccctcagc 816  Q
    ||||| ||||| |||| || ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||    
T  3950001 aattaattgataaatatgtgtgattgaactattctttctaaatggaccgtgatgggttagaccatttagctaagcccaatgagaggtccttgccctcagc 3950100  T
Q  817 cgtttaactatttaaacgttatcccatcagacggttaaaccattctgaaca-ttctggtgctaaacggaatgagggtagtcatccctctca 906  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||| | | | |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3950101 cgtttaactatttaaacgtcatcccatgagacggataaactactataaacatttatggtgctaaacggaatgagggtagtcatccctctca 3950191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 178; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 617 - 969
Target Start/End: Complemental strand, 23888635 - 23888282
Alignment:
Q  617 tgttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataagttgatgtcataatataaattataatctattgcgttaagcact 716  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||| || | |||  |||||||  |||||||||    
T  23888635 tgttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataaattaatgttataatttataatatggtctattgtattaagcact 23888536  T
Q  717 aattagttgatgaatacgtctgattgtgctattctttctaaatggaccgtgatgggttgaaccatttagctaaacccaatgaggggtccctgccctcagc 816  Q
     ||||||||||||||| || |||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  23888535 cattagttgatgaatatgtatgatcggactattctttctaaatggaccgtgatgggttggaccatttagctaatcccaatgagaggtccctgccctcagc 23888436  T
Q  817 cgtttaactatttaaacgttatcccatcagacggttaaaccattctgaa-cattctggtgctaaacggaatgagggtagtcatccctctcactctcatcc 915  Q
    |||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||| ||||   |||| |||||| ||||||||||||||||||      || |||||||||    
T  23888435 cgtttagctatttaaacgtcatcccaccagacggttaaactattgtgaattcttctagtgctacacggaatgagggtagtca------tctctctcatcc 23888342  T
Q  916 ttcagacaac------catccttcatgaacctaaacatacaaggtacacaatttcttatt 969  Q
    |||  |||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23888341 ttcttacaacaatagttatccttcatgaacctaaacatacaaggtacacaatttcttatt 23888282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 178; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 617 - 969
Target Start/End: Complemental strand, 23892711 - 23892358
Alignment:
Q  617 tgttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataagttgatgtcataatataaattataatctattgcgttaagcact 716  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||| || | |||  |||||||  |||||||||    
T  23892711 tgttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataaattaatgttataatttataatatggtctattgtattaagcact 23892612  T
Q  717 aattagttgatgaatacgtctgattgtgctattctttctaaatggaccgtgatgggttgaaccatttagctaaacccaatgaggggtccctgccctcagc 816  Q
     ||||||||||||||| || |||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  23892611 cattagttgatgaatatgtatgatcggactattctttctaaatggaccgtgatgggttggaccatttagctaatcccaatgagaggtccctgccctcagc 23892512  T
Q  817 cgtttaactatttaaacgttatcccatcagacggttaaaccattctgaa-cattctggtgctaaacggaatgagggtagtcatccctctcactctcatcc 915  Q
    |||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||| ||||   |||| |||||| ||||||||||||||||||      || |||||||||    
T  23892511 cgtttagctatttaaacgtcatcccaccagacggttaaactattgtgaattcttctagtgctacacggaatgagggtagtca------tctctctcatcc 23892418  T
Q  916 ttcagacaac------catccttcatgaacctaaacatacaaggtacacaatttcttatt 969  Q
    |||  |||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23892417 ttcttacaacaatagttatccttcatgaacctaaacatacaaggtacacaatttcttatt 23892358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 165; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 617 - 906
Target Start/End: Original strand, 669913 - 670198
Alignment:
Q  617 tgttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataagttgatgtcataatataaattataatctattgcgttaagcact 716  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || | ||  |||||||| |  ||||||| ||||||||||    
T  669913 tgttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataaattaatattattttataaattgtggtctattgtgttaagcact 670012  T
Q  717 aattagttgatgaatacgtctgattgtgctattctttctaaatggaccgtgatgggttgaaccatttagctaaacccaatgaggggtccctgccctcagc 816  Q
    ||||| |||||||||| || ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||    
T  670013 aattacttgatgaatatgtgtgattgatctattctttctaaatggaccgtgatgggttagaccatttagctaagcccaatgagaggttcatgccctcagc 670112  T
Q  817 cgtttaactatttaaacgttatcccatcagacggttaaaccattctgaacattctggtgctaaacggaatgagggtagtcatccctctca 906  Q
    |||| | |||||||||||| |||||||||    ||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  670113 cgttcagctatttaaacgtcatcccatca----gttaaattattctgaatattctggtgctaaacggaatgagggtagtcatccctctca 670198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 164; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 624 - 906
Target Start/End: Original strand, 24138292 - 24138575
Alignment:
Q  624 ttaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataagttgatgtcataatataaattataatctattgcgttaagcactaattagt 723  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||| || | |||  |||||||  ||||||||| ||||||    
T  24138292 ttaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataaattaatgttataatttataatatggtctattgtattaagcactcattagt 24138391  T
Q  724 tgatgaatacgtctgattgtgctattctttctaaatggaccgtgatgggttgaaccatttagctaaacccaatgaggggtccctgccctcagccgtttaa 823  Q
    ||||||||| || |||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||  |||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  24138392 tgatgaatatgtatgattgagttattctttttaaatggaccgtgatgggttggaccatttagttaagtccaatgagaggtccctgccctcagccgtttag 24138491  T
Q  824 ctatttaaacgttatcccatcagacggttaaaccattctgaac-attctggtgctaaacggaatgagggtagtcatccctctca 906  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  24138492 ctatttaaacgtcatcccatcagacggttaaaatattctgaactcttctggtgctacacggaatgagggtagtcatctctctca 24138575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 162; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 617 - 854
Target Start/End: Complemental strand, 18341810 - 18341573
Alignment:
Q  617 tgttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataagttgatgtcataatataaattataatctattgcgttaagcact 716  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  18341810 tgttggattaattatttaattaatcaattatggattcacaataattaattattataagttaatgtcataatataaattatgatctattgtgttaagcact 18341711  T
Q  717 aattagttgatgaatacgtctgattgtgctattctttctaaatggaccgtgatgggttgaaccatttagctaaacccaatgaggggtccctgccctcagc 816  Q
    |||||| ||||||||| || |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||| |||||||||| ||| |    
T  18341710 aattagatgatgaatatgtgtgattgagctattctttctatatggaccgtgatgggttggaccatttagctaagctcaatgagaggtccctgccttcaac 18341611  T
Q  817 cgtttaactatttaaacgttatcccatcagacggttaa 854  Q
     ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18341610 tgtttagctatttaaacgtcatcccatcagacggttaa 18341573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 700 - 906
Target Start/End: Complemental strand, 15144420 - 15144214
Alignment:
Q  700 ctattgcgttaagcactaattagttgatgaatacgtctgattgtgctattctttctaaatggaccgtgatgggttgaaccatttagctaaacccaatgag 799  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||| |||||||||    
T  15144420 ctattgtgttaagcactaattagttgatgaatatgtgtgattgtgctattctttctaaatggaccgtgatgagttggaccatttaactaagcccaatgag 15144321  T
Q  800 gggtccctgccctcagccgtttaactatttaaacgttatcccatcagacggttaaaccattctgaacattctggtgctaaacggaatgagggtagtcatc 899  Q
     | |||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15144320 agatccctgccctcagccgtttagctatttaaatgtcatcccatcagatggttaaactattctaaacattctggtgctaaacggaatgagggtagtcatc 15144221  T
Q  900 cctctca 906  Q
    | |||||    
T  15144220 cgtctca 15144214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 137; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 617 - 845
Target Start/End: Original strand, 39190009 - 39190237
Alignment:
Q  617 tgttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataagttgatgtcataatataaattataatctattgcgttaagcact 716  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || | ||||||||||||||  ||||||| ||||| || |    
T  39190009 tgttagattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattatgagttaatcttataatataaattatggtctattgtgttaaacatt 39190108  T
Q  717 aattagttgatgaatacgtctgattgtgctattctttctaaatggaccgtgatgggttgaaccatttagctaaacccaatgaggggtccctgccctcagc 816  Q
    |||||||||||||||| |  |||||| |||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||    
T  39190109 aattagttgatgaatatgagtgattgggctattgttactaaatggaccgtgatgggttggaccatttagctaagtccaatgagaggtccctgccctcagc 39190208  T
Q  817 cgtttaactatttaaacgttatcccatca 845  Q
    |||||| |||| ||||||| |||||||||    
T  39190209 cgtttagctatgtaaacgtcatcccatca 39190237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 132; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 673 - 906
Target Start/End: Original strand, 41826520 - 41826745
Alignment:
Q  673 agttgatgtcataatataaattataatctattgcgttaagcactaattagttgatgaatacgtctgattgtgctattctttctaaatggaccgtgatggg 772  Q
    |||| |||| ||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  41826520 agttaatgttatagtataaattatggtctattgtgttaagcactaattagttgatgaatatgtttgattgagctattctttttaaatggaccgtgatggg 41826619  T
Q  773 ttgaaccatttagctaaacccaatgaggggtccctgccctcagccgtttaactatttaaacgttatcccatcagacggttaaaccattctgaacattctg 872  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||      ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||      
T  41826620 ttggaccatttagctaagcccaatgagaggtccctgc------ccgtttagctatttaaacgtcatcccatcagacggttaaactactctgaacattc-- 41826711  T
Q  873 gtgctaaacggaatgagggtagtcatccctctca 906  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41826712 gtgctaaacggaatgagggtagtcatccctctca 41826745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 114; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 617 - 856
Target Start/End: Complemental strand, 17527552 - 17527310
Alignment:
Q  617 tgttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataagttgatgtcataatataaattataa-tctattgcgttaagcac 715  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||| ||||  ||||   | ||||| |||||||||    
T  17527552 tgttagattaattatttaattaatcaaatatggattgacaataatcaattattataagttaatattatattatat-ttatgggtttattgtgttaagcac 17527454  T
Q  716 ta---attagttgatgaatacgtctgattgtgctattctttctaaatggaccgtgatgggttgaaccatttagctaaacccaatgaggggtccctgccct 812  Q
    ||   ||||||||||||||| || |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||| ||||||||| ||    
T  17527453 tactaattagttgatgaatatgtgtgattgggccattctttctaaatggaccgtgatgggttggactatttagctaagcccaatgagaggtccctgctct 17527354  T
Q  813 cagccgtttaactatttaaacgttatcccatcagacggttaaac 856  Q
    || | ||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  17527353 caacagtttagctatttaaacgttatcgcgtcagacggttaaac 17527310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 107; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 617 - 899
Target Start/End: Original strand, 662699 - 662959
Alignment:
Q  617 tgttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataagttgatgtcataatataaattataatctattgcgttaagcact 716  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||  ||                   ||||| ||||| ||||    
T  662699 tgttggattaattatttaattaatcaattatggatttacaataataaattattataaattgtggtt------------------tattgtgttaaacact 662780  T
Q  717 aattagttgatgaatacgtctgattgtgctattctttctaaatggaccgtgatgggttgaaccatttagctaaacccaatgaggggtccctgccctcagc 816  Q
    ||||| |||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||| |||| ||||||||||     
T  662781 aattacttgatgaatatgtgtgattgagctattctttctaaatggaccgtgatgggttggaccatttagctaagtccaatgagaggtcactgccctcagt 662880  T
Q  817 cgtttaactatttaaacgttatcccatcagacggttaaaccattctgaacattctggtgctaaacggaatgagggtagtcatc 899  Q
    |||| | |||||||||||| ||||||    |||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  662881 cgttcagctatttaaacgtcatccca----acggttaaactattctgaatagtctggtgctaaacggaatgagggtaatcatc 662959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 745 - 969
Target Start/End: Original strand, 14661291 - 14661513
Alignment:
Q  745 ctattctttctaaatggaccgtgatgggttgaaccatttagctaaacccaatgaggggtccctgccctcagccgtttaactatttaaacgttatcccatc 844  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||| | ||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  14661291 ctattctttttaaatggaccgtgatgggttggaccatttagctaagctcaatgggaggtccctgctctcagccgtttagctatttaaacgtcatcccatc 14661390  T
Q  845 agacggttaaaccattctgaa-cattctggtgctaaacggaatgagggtagtcatccctctcactctcatccttcagacaa---ccatccttcatgaacc 940  Q
    |||||||||||  ||| ||||   |||| || ||| |||||||||||||||| ||||      |||||||||||| |||||   | |||||||||||| |    
T  14661391 agacggttaaattattgtgaattcttctagtactacacggaatgagggtagttatcc------ctctcatccttctgacaacagctatccttcatgaatc 14661484  T
Q  941 taaacatacaaggtacacaatttcttatt 969  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14661485 taaacatacaaggtacataatttcttatt 14661513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 83; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 714 - 867
Target Start/End: Complemental strand, 17530171 - 17530016
Alignment:
Q  714 actaattagttgatgaatacgtctgattgtgctattctttctaaatggacc---gtgatgggttgaaccatttagctaaacccaatgaggggtccctgcc 810  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||  ||||||| ||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||     
T  17530171 actaattagttgatgaatatgtgtgattgtgtcattctttttaaatggaccaccgtgatgggttggaccatttagctaaacccaatgagaggtcactgcg 17530072  T
Q  811 ctcagccgtttaactatttaaacgttatcccatcagacggttaaaccattctgaaca 867  Q
    |||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||| || |||||||||||    
T  17530071 ctcagccgtttagctatttcaacgtcatcccatcagacggtt-aagcattctgaaca 17530016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 617 - 854
Target Start/End: Original strand, 33425823 - 33426064
Alignment:
Q  617 tgttggattaattatttaattaatcaatt-atggattgacaataatcaattattataagttgatgtcataatataaattataatctattgcgttaagcac 715  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| || |  ||||||||||||| || ||||| ||||| |||    
T  33425823 tgttggattaatgatttaattgatcaatttatggattgacaataatcaattattata-gttaatcttttaatataaattatgatgtattgtgttaaacac 33425921  T
Q  716 taattagttgatgaatacgtctgattgtgctattctttctaaatggaccgtgatgggttgaaccatttagctaaacccaatgaggggtccctgccctca- 814  Q
     |||||| ||||||||| || | |||||| |||  |||||||||||| | |||| ||||  || |||||||||| | ||||||| ||||||| ||||||     
T  33425922 gaattagatgatgaatatgtgtaattgtgttatagtttctaaatggatcatgataggtttgactatttagctaagctcaatgagaggtccctaccctcag 33426021  T
Q  815 ---gccgtttaactatttaaacgttatcccatcagacggttaa 854  Q
       |||||||| || | ||||||||||||| ||||||||||||    
T  33426022 tcggccgtttagctttctaaacgttatcccgtcagacggttaa 33426064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 684 - 895
Target Start/End: Original strand, 25336147 - 25336358
Alignment:
Q  684 taatataaattataatctattgcgttaagcactaattagttgatgaatacgtctgattgtgctattctttctaaatggaccgtgatgggttgaaccattt 783  Q
    ||||||||| |||  ||| ||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25336147 taatataaactatggtctgttgtgttaagcactaattagttgatgaatatgtgtgattgaactattctttctaaatggaccgtgatgggttgaaccattt 25336246  T
Q  784 agctaaacccaatgaggggtccctgccctcagccgtttaactatttaaacgttatcccatcag-acggttaaaccattctgaacattctggtgctaaacg 882  Q
    || |||  | |||||| |||  ||||| |||||  |||| |||||||||||| ||  |||||| |||||||  | ||| ||||||| |||||||||||||    
T  25336247 agttaagtctaatgagaggt-tctgccatcagctatttagctatttaaacgtcatttcatcagaacggttattctattatgaacatactggtgctaaacg 25336345  T
Q  883 gaatgagggtagt 895  Q
      |||||||||||    
T  25336346 atatgagggtagt 25336358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 617 - 687
Target Start/End: Original strand, 14661188 - 14661258
Alignment:
Q  617 tgttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataagttgatgtcataat 687  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||    
T  14661188 tgttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataaattaatgttataat 14661258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 617 - 676
Target Start/End: Complemental strand, 4840986 - 4840927
Alignment:
Q  617 tgttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataagtt 676  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4840986 tgttggattaatgatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataagtt 4840927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 53; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 617 - 681
Target Start/End: Original strand, 25335751 - 25335815
Alignment:
Q  617 tgttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataagttgatgt 681  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  25335751 tgttggattaattatctaattaatcacttatggattgacaataatcaattattataagttaatgt 25335815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 927 - 969
Target Start/End: Complemental strand, 18341499 - 18341457
Alignment:
Q  927 atccttcatgaacctaaacatacaaggtacacaatttcttatt 969  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18341499 atccttcatgaacctaaacatataaggtacacaatttcttatt 18341457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 935 - 973
Target Start/End: Complemental strand, 17527232 - 17527194
Alignment:
Q  935 tgaacctaaacatacaaggtacacaatttcttattcctt 973  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17527232 tgaaccaaaacatacaaggtacacaatttcttaatcctt 17527194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 746 - 811
Target Start/End: Complemental strand, 4840645 - 4840581
Alignment:
Q  746 tattctttctaaatggaccgtgatgggttgaaccatttagctaaacccaatgaggggtccctgccc 811  Q
    ||||||||||||||| || |||||| |||| ||||||||||||| | ||| ||| |||||||||||    
T  4840645 tattctttctaaatgaac-gtgatgagttggaccatttagctaagctcaaagagaggtccctgccc 4840581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 191; Significance: 1e-103; HSPs: 17)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 617 - 973
Target Start/End: Original strand, 39574395 - 39574745
Alignment:
Q  617 tgttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataagttgatgtcataatataaattataatctattgcgttaagcact 716  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  39574395 tgttggattaattatttaattaatcctttatgaattgacagtaatcaattattataagttaatgtcataatataaattatggtctattgtgttaagcact 39574494  T
Q  717 aattagttgatgaatacgtctgattgtgctattctttctaaatggaccgtgatgggttgaaccatttagctaaacccaatgaggggtccctgccctcagc 816  Q
    |||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||    
T  39574495 aattagttgatgaatatgtgtgattgggctattctttctaaatggaccgtgatgggttggaccatttagctaagcccaatgagaggtccctgcccttagc 39574594  T
Q  817 cgtttaactatttaaacgttatcccatcagacggttaaaccattctgaacattctggtgctaaacggaatgagggtagtcatccctctcactctcatcct 916  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| | || ||||| | |||||||||||||||||||| || ||||||      ||||||||||    
T  39574595 cgtttagctatttaaacgtcatcccatcagacggttaaactactc-gaacaatatggtgctaaacggaatgaggataatcatcc------ctctcatcct 39574687  T
Q  917 tcagacaaccatccttcatgaa-cctaaacatacaaggtacacaatttcttattcctt 973  Q
    || ||||   |||||||||||| |||| |  |  ||||||||||||||||||||||||    
T  39574688 tctgacagttatccttcatgaatcctacatcttaaaggtacacaatttcttattcctt 39574745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 171; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 617 - 973
Target Start/End: Original strand, 47858008 - 47858362
Alignment:
Q  617 tgttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataagttgatgtcataatataaattataatctattgcgttaagcact 716  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||| || |||| ||||| || | |||  |||||||  |||| ||||    
T  47858008 tgttggattaattatttaattaatcaattatagattgacaataatcaattaaaataaattaatgttataatttataatatggtctattgtattaaacact 47858107  T
Q  717 aattagttgatgaatacgtctgattgtgctattctttctaaatggaccgtgatgggttgaaccatttagctaaacccaatgaggggtccctgccctcagc 816  Q
     ||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||| || ||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  47858108 cattagttgatgaatatgtatgattgagctattctttctaaattgatcgtaatgggttggaccatttagctaagcccaatgagaggtccctgccctcagc 47858207  T
Q  817 cgtttaactatttaaacgttatcccatcagacggttaaaccattctgaa-cattctggtgctaaacggaatgagggtagtcatccctctcactctcatcc 915  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||   |||| |||||| || |||||||||| |||||||||||||  ||  |||    
T  47858208 cgtttagctatttaaacgtcatcccatcagatggttaaactattgtgaattcttctagtgctataccgaatgagggtggtcatccctctcatcct--tcc 47858305  T
Q  916 ttcagacaaccatccttcatgaacctaaacatacaaggtacacaatttcttattcctt 973  Q
      || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47858306 aaca-acaactatccttcatgaacctaaacatacaaggtacacaatttcttattcctt 47858362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 617 - 856
Target Start/End: Complemental strand, 24515590 - 24515354
Alignment:
Q  617 tgttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataagttgatgtcataatataaattataatctattgcgttaagcact 716  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||| ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  24515590 tgttgaattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataaa---atgttataatataaattatggtctattgtgttaagcact 24515494  T
Q  717 aattagttgatgaatacgtctgattgtgctattctttctaaatggaccgtgatgggttgaaccatttagctaaacccaatgaggggtccctgccctcagc 816  Q
    |||||||||||||||| || |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||||    
T  24515493 aattagttgatgaatatgtgtgatcgggctattctttctaaatggaccgtgatgggttggaccatttagctaagtccaatgagaggtctctgccctcagc 24515394  T
Q  817 cgtttaactatttaaacgttatcccatcagacggttaaac 856  Q
    | |||| |||||||||||| ||||||| | ||||||||||    
T  24515393 catttagctatttaaacgtcatcccataatacggttaaac 24515354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 144; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 617 - 900
Target Start/End: Complemental strand, 9765215 - 9764930
Alignment:
Q  617 tgttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataagttgatgtcataatataaattataatctattgcgttaagcact 716  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| || |||| ||||| || | |||  |||| ||  |||||||||    
T  9765215 tgttggattaattatttaattaatcaattatggattttcaataatcaattattataaattaatgttataatttataatatggtctactgtattaagcact 9765116  T
Q  717 aattagttgatgaatacgtctgattgtgctattctttctaaatggaccgtgatgggttgaaccatttagctaaacccaatgaggggtccctgccctcagc 816  Q
     ||||||||||||||| || |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  9765115 cattagttgatgaatatgtatgattgggctattctttataaatggaccgtgatgggttggaccatttagctaagcccaatgagaggtccctgccctcagc 9765016  T
Q  817 cgtttaactatttaaacgttatcccatcagacggtt--aaaccattctgaac-attctggtgctaaacggaatgagggtagtcatcc 900  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||| |||||||  |||  ||| |||||  |||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  9765015 cgtttagctatttaaacgtcatcccatc-gacggttaaaaattattatgaactcttctggtgttacacggaatgagggtagtcatcc 9764930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 617 - 906
Target Start/End: Original strand, 41140774 - 41141067
Alignment:
Q  617 tgttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataagttgatgtcataatataaattataatctattgcgttaagcact 716  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    |||| ||||||||||||||  ||||||  |||||||| |    
T  41140774 tgttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattattataaaatgttataatataaattatggtctattatgttaagcatt 41140873  T
Q  717 aattagttgatgaatacgtctgattgtgctattctttctaaatggaccgtgatgggttgaaccatttagctaaacccaatgaggggtccctgccctcagc 816  Q
    |||||||||||||||| || ||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||    
T  41140874 aattagttgatgaatatgtatgattggtctattctttttaaatggaccgtgatgggttggaccatttagctaagcctgatgagaggtccctgccctcagc 41140973  T
Q  817 cgtttaactatttaaacgttatcccatcagacggttaaaccattctgaacattctggtg-----ctaaacggaatgagggtagtcatccctctca 906  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||| | |||||||| ||   |||||     ||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  41140974 cgtttagctatttaaacgtcatcccattagacggttaga-cattctgaccagcatggtgcaaacctagacggaatgagggtagtcattcctctca 41141067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 115; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 617 - 900
Target Start/End: Complemental strand, 9758587 - 9758314
Alignment:
Q  617 tgttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataagttgatgtcataatataaattataatctattgcgttaagcact 716  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||           ||||  |||  |||| ||  |||||||||    
T  9758587 tgttggattaattatttaattaatcaattatggattttcaataatcaattattataattt-----------ataa--tatggtctactgtattaagcact 9758501  T
Q  717 aattagttgatgaatacgtctgattgtgctattctttctaaatggaccgtgatgggttgaaccatttagctaaacccaatgaggggtccctgccctcagc 816  Q
     ||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||| |||| ||||| |||||    
T  9758500 cattagttgatgaatatgtatgattgggctattctttctaaatggaccgtgatgggttggaacatttagctaagcccaatgagaggtcactgccttcagc 9758401  T
Q  817 cgtttaactatttaaacgttatcccatcagacggtt--aaaccattctgaac-attctggtgctaaacggaatgagggtagtcatcc 900  Q
    | |||| |||||||||||| ||||||||||||||||  |||  ||| |||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  9758400 catttagctatttaaacgtcatcccatcagacggttaaaaattattatgaactcttctggtgctacacggaatgagggtagtcatcc 9758314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 97; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 746 - 906
Target Start/End: Original strand, 39581073 - 39581232
Alignment:
Q  746 tattctttctaaatggaccgtgatgggttgaaccatttagctaaacccaatgaggggtccctgccctcagccgtttaactatttaaacgttatcccatca 845  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||| ||||    
T  39581073 tattctttctaaatggaccgtgatgagttgaacaatttagctaagcccaatgagaggtccctgccctcagtcgtttagctatttaaacgtcatccaatca 39581172  T
Q  846 gacggttaaaccattctgaacattctggtgctaaacggaatgagggtagtcatccctctca 906  Q
     |||||||||| | || ||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  39581173 aacggttaaactactc-gaacattatggtgctaaacagaatgagggaagtcatccctctca 39581232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 617 - 732
Target Start/End: Original strand, 39580411 - 39580526
Alignment:
Q  617 tgttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataagttgatgtcataatataaattataatctattgcgttaagcact 716  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||| |||||| |||    
T  39580411 tgttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataagttaatgtcataatataaattatggtctattgtgttaagtact 39580510  T
Q  717 aattagttgatgaata 732  Q
    ||||||||||||||||    
T  39580511 aattagttgatgaata 39580526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 687 - 854
Target Start/End: Complemental strand, 12017899 - 12017733
Alignment:
Q  687 tataaattataatctattgcgttaagcactaattagttgatgaatacgtctgattgtgctattcttt-ctaaatggaccgtgatgggttgaaccatttag 785  Q
    |||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||   |||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  12017899 tataaattatgatctattgtgttaaacactaattagttgatgaatatgtctgattgaattattcttttctaaatggaccgtgatgagttggaccatttag 12017800  T
Q  786 ctaaacccaatgaggggtccctgccctcagccgtttaactatttaaacgttatcccatcagacggttaa 854  Q
    ||||  ||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  12017799 ctaagtccaataagg--tccctgccctcagccgtttaactatttaaacgtcatcccatcagacagttaa 12017733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 699 - 788
Target Start/End: Complemental strand, 24523261 - 24523172
Alignment:
Q  699 tctattgcgttaagcactaattagttgatgaatacgtctgattgtgctattctttctaaatggaccgtgatgggttgaaccatttagcta 788  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||| || ||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24523261 tctattgtgttaagcactaattaattgatgaatatgtgtgattggtctattctttttaaatggaccgtgatgggttggaccatttagcta 24523172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 622 - 732
Target Start/End: Original strand, 47854629 - 47854739
Alignment:
Q  622 gattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataagttgatgtcataatataaattataatctattgcgttaagcactaatta 721  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| || |||| ||||| || | |||  |||||||  |||| |||| ||||    
T  47854629 gattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattaaaataaattaatgttataatttataatatggtctattgtattaaacactcatta 47854728  T
Q  722 gttgatgaata 732  Q
    |||||||||||    
T  47854729 gttgatgaata 47854739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 53; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 617 - 673
Target Start/End: Complemental strand, 24526417 - 24526361
Alignment:
Q  617 tgttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataa 673  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24526417 tgttgaattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataa 24526361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 623 - 749
Target Start/End: Original strand, 38279796 - 38279923
Alignment:
Q  623 attaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataagttgatgtcataatataaattataatcta--ttgcgtt-aagcactaat 719  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||  ||||||| |||||||||||| || || |  ||||||||||||| || ||  ||| ||| ||||||||||    
T  38279796 attaattatttaattaatcaaccatggatcaacaataaacaattattataaattaattt--taatataaattatgatttattttgtgttaaagcactaat 38279893  T
Q  720 tagttgatgaatacgtctgattgtgctatt 749  Q
    ||||| ||||||| || ||||||| |||||    
T  38279894 tagttcatgaatatgtgtgattgttctatt 38279923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 617 - 669
Target Start/End: Original strand, 39183711 - 39183762
Alignment:
Q  617 tgttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattatt 669  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  39183711 tgttggatgaattatttaattaatcaattatgaattgacaataa-caattatt 39183762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 617 - 705
Target Start/End: Original strand, 38278809 - 38278895
Alignment:
Q  617 tgttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataagttgatgtcataatataaattataatctattg 705  Q
    ||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||||| ||||| ||||||||| || |  || ||||||||||||| || |||||    
T  38278809 tgttgaattaattatttaattaattaactatagattgacaaaaatcagttattataaattaa--tcttaatataaattatgatttattg 38278895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 617 - 664
Target Start/End: Original strand, 5996229 - 5996275
Alignment:
Q  617 tgttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaa 664  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  5996229 tgttagattaattatttaattaatcaattatgaattga-aataatcaa 5996275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 819 - 856
Target Start/End: Complemental strand, 24523179 - 24523142
Alignment:
Q  819 tttaactatttaaacgttatcccatcagacggttaaac 856  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24523179 tttagctatttaaacgtcatcccatcagacggttaaac 24523142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 174; Significance: 4e-93; HSPs: 2)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 617 - 906
Target Start/End: Original strand, 67675 - 67967
Alignment:
Q  617 tgttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataagttgatgtcataatataaattataatctattgcgttaagcact 716  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||| || | |||  |||||||  || | ||||    
T  67675 tgttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataaattaatgttataatttataatatggtctattgtattgaacact 67774  T
Q  717 aattagttgatgaatacgtctgattgtgctattctttctaaatggaccgtgatgggttgaaccatttagctaaacccaatgaggggtccctgccctcagc 816  Q
     ||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  67775 cattagttgatgaatatgtatgattgggctattctttctaaatggaccgtgatgggttggaccatttagctaagcccaatgagaggtccctgccctcagc 67874  T
Q  817 cgtttaactatttaaacgttatcccatcagacggttaaaccattctgaac-attctggtgct--aaacggaatgagggtagtcatccctctca 906  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||  | |||||||||||||| ||||||||||||    
T  67875 cgtttagctatttaaacgtcatcccatcagacggttaaactattctgaactcttctggtgctacacacggaatgagggtactcatccctctca 67967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #2
Raw Score: 157; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 630 - 906
Target Start/End: Original strand, 60212 - 60491
Alignment:
Q  630 atttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataagttgatgtcataatataaattataatctattgcgttaagcactaattagttgatga 729  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||| || | |||  |||||||  || | |||| ||||||||||||    
T  60212 atttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataaattaatgttataatttataatatggtctattgtattgaacactcattagttgatga 60311  T
Q  730 atacgtctgattgtgctattctttctaaatggaccgtgatgggttgaaccatttagctaaacccaatgaggggtccctgccctcagccgtttaactattt 829  Q
    ||| || |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  60312 atatgtatgattgggctattcttactaaatggaccgtgatgggttggaccatttagctaagcccaatgagaggtccctgccctcagccgtttagctattt 60411  T
Q  830 aaacgttatcccatcagacggttaaaccattctgaac-attctggtgct--aaacggaatgagggtagtcatccctctca 906  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||  | |||||||||||||| ||||||||||||    
T  60412 aaacgtcatcccatcagacggttaaactattctgaactcttctggtgctacacacggaatgagggtactcatccctctca 60491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1634 (Bit Score: 149; Significance: 3e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold1634
Description:

Target: scaffold1634; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 617 - 865
Target Start/End: Complemental strand, 267 - 19
Alignment:
Q  617 tgttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataagttgatgtcataatataaattataatctattgcgttaagcact 716  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||| || | |||  |||||||  |||||||||    
T  267 tgttggattaattatttaattaattaattatggattgacaataatcaattattataaattaatgttataatttataatatggtctattgtattaagcact 168  T
Q  717 aattagttgatgaatacgtctgattgtgctattctttctaaatggaccgtgatgggttgaaccatttagctaaacccaatgaggggtccctgccctcagc 816  Q
     ||||||||||||||| || ||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||    
T  167 cattagttgatgaatatgtatgattggactattctttctaaatggatcgtgatgggttggaccatttagctaagccaaatgagaggtccctgccctcagc 68  T
Q  817 cgtttaactatttaaacgttatcccatcagacggttaaaccattctgaa 865  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  67 cgtttaactatttaaacgtcatcccatcagacgattaaactattgtgaa 19  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045 (Bit Score: 138; Significance: 1e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0045
Description:

Target: scaffold0045; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 637 - 854
Target Start/End: Original strand, 30003 - 30220
Alignment:
Q  637 taatcaattatggattgacaataatcaattattataagttgatgtcataatataaattataatctattgcgttaagcactaattagttgatgaatacgtc 736  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||| |||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||     
T  30003 taatcaattatggattgacaataatcaattattataagttaatattatattataaattatgatctattgtgttaaacactaattagttgatgaatatgtg 30102  T
Q  737 tgattgtgctattctttctaaatggaccgtgatgggttgaaccatttagctaaacccaatgaggggtccctgccctcagccgtttaactatttaaacgtt 836  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||| |||| || || ||||||||||| ||||||||||||     
T  30103 tgattgagctattctttctaaatggaccgtgatggattgaaccatttagctaagtccaatgagaggtctctaccttcagccgtttagctatttaaacgtc 30202  T
Q  837 atcccatcagacggttaa 854  Q
    || |||||||||||||||    
T  30203 attccatcagacggttaa 30220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0062 (Bit Score: 127; Significance: 5e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0062
Description:

Target: scaffold0062; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 616 - 854
Target Start/End: Complemental strand, 40383 - 40145
Alignment:
Q  616 gtgttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataagttgatgtcataatataaattataatctattgcgttaagcac 715  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||| ||||||||||  |||| || | |||||||    
T  40383 gtgttggattaattattcaattaattaattatggattgacaataatcaattattataagttaatattatattataaattatggtctactgtgctaagcac 40284  T
Q  716 taattagttgatgaatacgtctgattgtgctattctttctaaatggaccgtgatgggttgaaccatttagctaaacccaatgaggggtccctgccctcag 815  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| | |||||||| ||||||||||||| || |||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||  |||||||||    
T  40283 taattagttgatgaatatgtgtgattgagttattctttttaaatggaccgtgctgagttggaccatttagctaagcccgatgagaggtcattgccctcag 40184  T
Q  816 ccgtttaactatttaaacgttatcccatcagacggttaa 854  Q
    ||||| | |||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  40183 ccgttaagctatttaaccgtcatcccatcagacggttaa 40145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0027 (Bit Score: 127; Significance: 5e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0027
Description:

Target: scaffold0027; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 618 - 868
Target Start/End: Complemental strand, 134786 - 134537
Alignment:
Q  618 gttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataagttgatgtcataatataaattataatctattgcgttaagcacta 717  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||| || | ||||||||||||||  | ||||  ||||| ||||     
T  134786 gttggattaattatttaattaatcaattatggattgataataataatttattataagttaatcttataatataaattatggtatattctgttaaacactg 134687  T
Q  718 attagttgatgaatacgtctgattgtgctattctttctaaatggaccgtgatgggttgaaccatttagctaaacccaatgaggggtccctgccctcagcc 817  Q
    |||||||||||||||||  ||||||  ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||  |||||| |    
T  134686 attagttgatgaatacgagtgattggactattgttactaaatggaccgtgatgggttgaaccatttagataagcccaatgagaggtccctagcctcagtc 134587  T
Q  818 gtttaactatttaaacgttatcccatcagacggttaaaccattctgaacat 868  Q
    ||||| |||||||||||| || ||||||||||||| || ||||||||||||    
T  134586 gtttagctatttaaacgtcattccatcagacggtt-aatcattctgaacat 134537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1074 (Bit Score: 45; Significance: 4e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold1074
Description:

Target: scaffold1074; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 868 - 973
Target Start/End: Original strand, 19 - 120
Alignment:
Q  868 ttctggtgctaaacggaatgagggtagtcatccctctcactctcatccttcagacaacc---atccttcatgaacctaaacatacaaggtacacaatttc 964  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||       ||||||||||| ||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  19 ttctggtgctacacggaatgaggttagtcatcc-------tctcatccttccgacaacagttatccttcatgaacctaaacatacaaggtacacaaattc 111  T
Q  965 ttattcctt 973  Q
    || ||||||    
T  112 ttcttcctt 120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 629 - 672
Target Start/End: Complemental strand, 143352 - 143309
Alignment:
Q  629 tatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattata 672  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  143352 tatttaactaatcaattatagattgacaataatcagttattata 143309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University