View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF17682_low_5 (Length: 462)

Name: NF17682_low_5
Description: NF17682
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF17682_low_5
NF17682_low_5
[»] scaffold0390 (2 HSPs)
scaffold0390 (19-450)||(2625-3056)
scaffold0390 (19-450)||(15609-16040)
[»] chr2 (29 HSPs)
chr2 (19-450)||(22138208-22138639)
chr2 (153-362)||(32296025-32296227)
chr2 (133-362)||(24428859-24429077)
chr2 (193-357)||(32240500-32240661)
chr2 (273-362)||(32303738-32303827)
chr2 (363-450)||(19666576-19666663)
chr2 (364-447)||(19669222-19669305)
chr2 (363-450)||(68040-68127)
chr2 (375-450)||(9636793-9636868)
chr2 (376-450)||(23821730-23821804)
chr2 (376-450)||(23830809-23830883)
chr2 (363-447)||(43645944-43646028)
chr2 (365-447)||(25265520-25265601)
chr2 (363-447)||(24571404-24571488)
chr2 (375-450)||(6094764-6094839)
chr2 (375-450)||(24277809-24277884)
chr2 (375-442)||(24884742-24884809)
chr2 (375-450)||(19433456-19433531)
chr2 (363-447)||(25305496-25305581)
chr2 (395-447)||(24294667-24294719)
chr2 (375-443)||(25595075-25595143)
chr2 (375-437)||(16292925-16292987)
chr2 (392-450)||(33128093-33128151)
chr2 (363-447)||(31146293-31146376)
chr2 (414-447)||(3404-3437)
chr2 (377-438)||(22775331-22775392)
chr2 (377-438)||(22780709-22780770)
chr2 (191-220)||(32303694-32303723)
chr2 (363-447)||(36890798-36890881)
[»] scaffold0786 (1 HSPs)
scaffold0786 (19-450)||(4092-4523)
[»] scaffold1678 (1 HSPs)
scaffold1678 (185-362)||(103-280)
[»] chr5 (26 HSPs)
chr5 (363-450)||(23981628-23981715)
chr5 (363-450)||(19862257-19862344)
chr5 (370-447)||(23493970-23494047)
chr5 (363-447)||(7728471-7728555)
chr5 (375-450)||(29918013-29918088)
chr5 (363-449)||(6456673-6456759)
chr5 (375-443)||(24084132-24084200)
chr5 (375-450)||(21617064-21617139)
chr5 (375-450)||(26559939-26560014)
chr5 (375-450)||(37983412-37983487)
chr5 (376-450)||(22885690-22885764)
chr5 (375-450)||(21109798-21109873)
chr5 (363-443)||(3673917-3673997)
chr5 (363-447)||(5450955-5451039)
chr5 (363-450)||(432511-432598)
chr5 (379-450)||(21222736-21222807)
chr5 (376-450)||(23234610-23234684)
chr5 (363-444)||(1168317-1168397)
chr5 (378-443)||(16835426-16835491)
chr5 (375-438)||(11763629-11763692)
chr5 (363-438)||(24183245-24183319)
chr5 (379-437)||(28902252-28902310)
chr5 (379-437)||(28938647-28938705)
chr5 (363-444)||(11337299-11337379)
chr5 (409-450)||(19873892-19873933)
chr5 (377-438)||(23417301-23417362)
[»] scaffold0700 (1 HSPs)
scaffold0700 (375-450)||(2573-2648)
[»] scaffold0080 (2 HSPs)
scaffold0080 (379-450)||(43926-43997)
scaffold0080 (375-443)||(23796-23864)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (363-450)||(79587-79674)
[»] chr8 (33 HSPs)
chr8 (363-450)||(29306465-29306552)
chr8 (363-450)||(23226188-23226275)
chr8 (376-450)||(33611178-33611252)
chr8 (363-447)||(23158211-23158295)
chr8 (363-447)||(39446878-39446962)
chr8 (375-450)||(15933346-15933421)
chr8 (375-450)||(18261595-18261670)
chr8 (375-438)||(22742824-22742887)
chr8 (375-450)||(26011542-26011617)
chr8 (375-450)||(33528473-33528548)
chr8 (375-450)||(38635772-38635847)
chr8 (375-450)||(45559061-45559136)
chr8 (369-450)||(23151951-23152032)
chr8 (363-447)||(21198264-21198348)
chr8 (363-447)||(23837249-23837333)
chr8 (363-447)||(38533700-38533784)
chr8 (375-450)||(5854662-5854737)
chr8 (375-450)||(27233191-27233266)
chr8 (363-437)||(19331426-19331500)
chr8 (363-447)||(23149832-23149913)
chr8 (375-437)||(33172289-33172351)
chr8 (375-450)||(45465250-45465325)
chr8 (375-443)||(18041656-18041724)
chr8 (375-443)||(22497333-22497401)
chr8 (375-449)||(24552694-24552768)
chr8 (363-435)||(25296222-25296293)
chr8 (363-435)||(25758242-25758313)
chr8 (376-435)||(20709755-20709814)
chr8 (392-443)||(37653757-37653808)
chr8 (363-434)||(21681066-21681137)
chr8 (377-447)||(22735964-22736034)
chr8 (363-444)||(37611722-37611802)
chr8 (363-403)||(22981368-22981408)
[»] chr7 (41 HSPs)
chr7 (363-450)||(20583666-20583753)
chr7 (363-447)||(13274838-13274922)
chr7 (375-450)||(9611355-9611430)
chr7 (375-450)||(9838927-9839002)
chr7 (363-450)||(13863042-13863129)
chr7 (363-447)||(12248233-12248317)
chr7 (363-443)||(14940810-14940890)
chr7 (363-447)||(49047786-49047870)
chr7 (363-450)||(4484775-4484862)
chr7 (375-450)||(16915052-16915127)
chr7 (363-450)||(16919607-16919694)
chr7 (375-446)||(34241312-34241383)
chr7 (375-450)||(48356692-48356767)
chr7 (364-438)||(31501233-31501307)
chr7 (363-447)||(16570118-16570202)
chr7 (363-447)||(16595460-16595544)
chr7 (375-450)||(13448951-13449026)
chr7 (375-450)||(17947716-17947791)
chr7 (363-450)||(38424267-38424354)
chr7 (375-450)||(9723931-9724006)
chr7 (375-450)||(28390360-28390435)
chr7 (375-450)||(33559695-33559770)
chr7 (375-450)||(46474049-46474124)
chr7 (363-437)||(14935421-14935495)
chr7 (363-437)||(15363014-15363088)
chr7 (377-443)||(15368403-15368469)
chr7 (379-444)||(13377583-13377648)
chr7 (377-450)||(45149650-45149723)
chr7 (375-443)||(4446268-4446335)
chr7 (375-443)||(15358852-15358920)
chr7 (375-447)||(17224062-17224134)
chr7 (363-447)||(12369953-12370036)
chr7 (363-438)||(28722169-28722245)
chr7 (375-438)||(8267852-8267915)
chr7 (363-444)||(11287471-11287551)
chr7 (363-444)||(12759041-12759121)
chr7 (363-447)||(3049634-3049717)
chr7 (363-447)||(3895076-3895159)
chr7 (410-450)||(14272045-14272085)
chr7 (363-447)||(26070377-26070460)
chr7 (363-447)||(26094164-26094247)
[»] chr4 (29 HSPs)
chr4 (375-450)||(7964835-7964910)
chr4 (375-450)||(18238281-18238356)
chr4 (363-450)||(52265620-52265707)
chr4 (365-443)||(38764764-38764842)
chr4 (377-450)||(7185970-7186043)
chr4 (363-447)||(13809622-13809706)
chr4 (363-447)||(15044879-15044963)
chr4 (363-447)||(41166058-41166142)
chr4 (363-450)||(15013394-15013481)
chr4 (375-450)||(40905058-40905132)
chr4 (363-450)||(41256481-41256568)
chr4 (375-450)||(41916850-41916925)
chr4 (375-450)||(13590198-13590273)
chr4 (375-450)||(18276482-18276557)
chr4 (375-438)||(47468472-47468535)
chr4 (363-438)||(47535177-47535252)
chr4 (375-450)||(54398431-54398506)
chr4 (379-444)||(15109477-15109542)
chr4 (375-438)||(13442800-13442863)
chr4 (375-450)||(50220064-50220139)
chr4 (394-447)||(19821919-19821972)
chr4 (363-447)||(27961022-27961106)
chr4 (363-444)||(16732223-16732303)
chr4 (363-447)||(12837313-12837396)
chr4 (375-447)||(14901283-14901355)
chr4 (363-447)||(30232609-30232692)
chr4 (363-438)||(21959576-21959650)
chr4 (365-447)||(18494442-18494524)
chr4 (395-447)||(37957169-37957221)
[»] chr1 (21 HSPs)
chr1 (363-450)||(22143473-22143560)
chr1 (375-450)||(37233984-37234059)
chr1 (375-440)||(52400689-52400754)
chr1 (363-447)||(51627776-51627860)
chr1 (375-450)||(17608976-17609051)
chr1 (363-450)||(21195062-21195149)
chr1 (387-443)||(8538046-8538102)
chr1 (387-443)||(8603285-8603341)
chr1 (375-450)||(33397400-33397475)
chr1 (375-447)||(13376964-13377036)
chr1 (363-447)||(20177226-20177310)
chr1 (376-440)||(49997406-49997470)
chr1 (375-450)||(5768293-5768368)
chr1 (375-450)||(40436393-40436468)
chr1 (375-437)||(25093920-25093982)
chr1 (361-438)||(35522430-35522506)
chr1 (410-447)||(41229098-41229135)
chr1 (379-435)||(16645975-16646031)
chr1 (363-447)||(27329868-27329951)
chr1 (379-437)||(16656699-16656757)
chr1 (395-447)||(36356437-36356489)
[»] scaffold0123 (1 HSPs)
scaffold0123 (363-447)||(8061-8145)
[»] chr6 (25 HSPs)
chr6 (363-447)||(18398989-18399073)
chr6 (375-450)||(25651285-25651360)
chr6 (363-447)||(15079820-15079904)
chr6 (363-447)||(33324744-33324828)
chr6 (374-450)||(33538492-33538568)
chr6 (363-447)||(35136124-35136208)
chr6 (363-450)||(22361877-22361964)
chr6 (375-450)||(34966915-34966990)
chr6 (377-450)||(19854203-19854276)
chr6 (363-447)||(21623219-21623303)
chr6 (375-443)||(29605505-29605573)
chr6 (365-447)||(35009569-35009650)
chr6 (363-436)||(16887904-16887977)
chr6 (375-447)||(18381807-18381879)
chr6 (363-447)||(25367349-25367433)
chr6 (375-438)||(17083321-17083384)
chr6 (375-438)||(18629732-18629795)
chr6 (375-450)||(29160427-29160502)
chr6 (375-438)||(32352107-32352170)
chr6 (365-435)||(22848078-22848148)
chr6 (387-441)||(25919670-25919724)
chr6 (375-442)||(17557141-17557207)
chr6 (375-450)||(22462221-22462295)
chr6 (365-447)||(28195207-28195290)
chr6 (375-438)||(23222811-23222874)
[»] scaffold0253 (2 HSPs)
scaffold0253 (375-450)||(7450-7525)
scaffold0253 (375-450)||(16875-16950)
[»] scaffold0077 (1 HSPs)
scaffold0077 (375-450)||(6592-6667)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (363-450)||(104735-104821)
[»] chr3 (40 HSPs)
chr3 (363-450)||(9590866-9590953)
chr3 (363-450)||(11061118-11061205)
chr3 (363-447)||(14295489-14295573)
chr3 (363-447)||(14301116-14301200)
chr3 (363-447)||(14528124-14528208)
chr3 (363-447)||(17139559-17139643)
chr3 (365-450)||(14814879-14814964)
chr3 (363-447)||(11329073-11329157)
chr3 (375-450)||(12953012-12953087)
chr3 (377-443)||(33369034-33369100)
chr3 (376-450)||(34559947-34560021)
chr3 (363-444)||(14080563-14080644)
chr3 (375-443)||(4162329-4162397)
chr3 (375-443)||(6228749-6228817)
chr3 (363-447)||(16880174-16880258)
chr3 (363-450)||(3576550-3576637)
chr3 (375-450)||(17204748-17204823)
chr3 (363-450)||(39656574-39656661)
chr3 (375-438)||(41661625-41661688)
chr3 (363-444)||(17191595-17191676)
chr3 (363-447)||(12488838-12488922)
chr3 (363-447)||(12560348-12560432)
chr3 (363-447)||(14059325-14059409)
chr3 (375-450)||(31412457-31412532)
chr3 (375-438)||(43427640-43427703)
chr3 (387-450)||(50313235-50313298)
chr3 (375-437)||(11638418-11638480)
chr3 (377-450)||(1990851-1990924)
chr3 (395-447)||(38811152-38811204)
chr3 (363-447)||(55440961-55441045)
chr3 (363-446)||(54424064-54424146)
chr3 (377-438)||(38375804-38375865)
chr3 (363-447)||(17100704-17100787)
chr3 (363-447)||(17101389-17101472)
chr3 (375-447)||(47784871-47784943)
chr3 (375-438)||(10912945-10913008)
chr3 (363-438)||(12349652-12349726)
chr3 (392-447)||(15876119-15876174)
chr3 (363-444)||(17523002-17523082)
chr3 (363-447)||(38167965-38168048)
[»] scaffold0095 (1 HSPs)
scaffold0095 (363-447)||(33840-33924)
[»] scaffold0447 (2 HSPs)
scaffold0447 (363-450)||(4611-4698)
scaffold0447 (363-450)||(9225-9312)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (363-450)||(5988-6075)
[»] scaffold0053 (1 HSPs)
scaffold0053 (375-450)||(76971-77046)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (375-450)||(69505-69580)
[»] scaffold0521 (1 HSPs)
scaffold0521 (363-447)||(11145-11229)
[»] scaffold0480 (1 HSPs)
scaffold0480 (363-447)||(8994-9078)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (363-447)||(2428-2512)
[»] scaffold0058 (1 HSPs)
scaffold0058 (363-447)||(70418-70502)
[»] scaffold0014 (2 HSPs)
scaffold0014 (363-447)||(159350-159434)
scaffold0014 (363-444)||(85386-85466)
[»] scaffold0670 (1 HSPs)
scaffold0670 (375-450)||(7799-7874)
[»] scaffold0165 (2 HSPs)
scaffold0165 (375-450)||(30012-30087)
scaffold0165 (375-450)||(22047-22122)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (375-450)||(197377-197452)
[»] scaffold0970 (1 HSPs)
scaffold0970 (381-447)||(2506-2572)
[»] scaffold0021 (1 HSPs)
scaffold0021 (364-446)||(11739-11821)
[»] scaffold0025 (3 HSPs)
scaffold0025 (377-450)||(85581-85654)
scaffold0025 (379-446)||(53398-53465)
scaffold0025 (363-447)||(146652-146735)
[»] scaffold0010 (1 HSPs)
scaffold0010 (375-448)||(31070-31143)
[»] scaffold0389 (1 HSPs)
scaffold0389 (363-447)||(10713-10797)
[»] scaffold0383 (1 HSPs)
scaffold0383 (363-450)||(7219-7307)
[»] scaffold0598 (1 HSPs)
scaffold0598 (375-450)||(3300-3374)
[»] scaffold0151 (1 HSPs)
scaffold0151 (363-450)||(22534-22621)
[»] scaffold0148 (1 HSPs)
scaffold0148 (375-450)||(37606-37681)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (368-447)||(41700-41778)
[»] scaffold0031 (2 HSPs)
scaffold0031 (375-450)||(97322-97397)
scaffold0031 (363-435)||(70676-70748)
[»] scaffold0004 (2 HSPs)
scaffold0004 (375-450)||(27545-27620)
scaffold0004 (375-450)||(86405-86480)
[»] scaffold1272 (1 HSPs)
scaffold1272 (365-447)||(360-442)
[»] scaffold0132 (1 HSPs)
scaffold0132 (377-447)||(13558-13628)
[»] scaffold0554 (1 HSPs)
scaffold0554 (363-444)||(1970-2050)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (375-443)||(4660-4728)
[»] scaffold0150 (1 HSPs)
scaffold0150 (363-447)||(28587-28671)
[»] scaffold0092 (1 HSPs)
scaffold0092 (363-447)||(3370-3454)
[»] scaffold0022 (4 HSPs)
scaffold0022 (363-447)||(103034-103118)
scaffold0022 (363-447)||(109641-109725)
scaffold0022 (375-438)||(68082-68145)
scaffold0022 (395-443)||(131891-131939)
[»] scaffold0456 (2 HSPs)
scaffold0456 (363-438)||(1658-1733)
scaffold0456 (363-438)||(8803-8878)
[»] scaffold0406 (1 HSPs)
scaffold0406 (375-438)||(14096-14159)
[»] scaffold0162 (2 HSPs)
scaffold0162 (363-450)||(7137-7224)
scaffold0162 (391-447)||(8332-8388)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (365-436)||(51312-51382)
[»] scaffold0367 (1 HSPs)
scaffold0367 (392-450)||(17462-17520)
[»] scaffold0138 (1 HSPs)
scaffold0138 (363-421)||(22541-22599)
[»] scaffold0023 (1 HSPs)
scaffold0023 (392-450)||(61375-61433)
[»] scaffold0120 (1 HSPs)
scaffold0120 (363-444)||(21566-21646)
[»] scaffold0103 (1 HSPs)
scaffold0103 (377-450)||(33710-33783)
[»] scaffold0601 (1 HSPs)
scaffold0601 (375-438)||(998-1061)
[»] scaffold0034 (2 HSPs)
scaffold0034 (363-450)||(46213-46299)
scaffold0034 (363-450)||(40706-40792)
[»] scaffold0610 (1 HSPs)
scaffold0610 (363-444)||(689-769)
[»] scaffold0153 (1 HSPs)
scaffold0153 (398-450)||(1882-1934)
[»] scaffold0037 (1 HSPs)
scaffold0037 (363-447)||(24841-24924)
[»] scaffold0020 (1 HSPs)
scaffold0020 (375-443)||(108065-108132)
[»] scaffold0013 (1 HSPs)
scaffold0013 (375-447)||(35529-35601)
[»] scaffold1867 (1 HSPs)
scaffold1867 (363-438)||(204-278)
[»] scaffold0387 (1 HSPs)
scaffold0387 (412-443)||(1107-1138)
[»] scaffold0190 (1 HSPs)
scaffold0190 (363-438)||(9997-10071)
[»] scaffold0026 (1 HSPs)
scaffold0026 (363-438)||(89975-90050)
[»] scaffold0483 (1 HSPs)
scaffold0483 (365-447)||(6712-6794)
[»] scaffold0396 (1 HSPs)
scaffold0396 (363-444)||(11821-11901)
[»] scaffold0195 (1 HSPs)
scaffold0195 (363-444)||(631-711)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (363-444)||(4995-5075)
[»] scaffold0035 (1 HSPs)
scaffold0035 (363-444)||(118076-118156)


Alignment Details
Target: scaffold0390 (Bit Score: 404; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0390
Description:

Target: scaffold0390; HSP #1
Raw Score: 404; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 450
Target Start/End: Original strand, 2625 - 3056
Alignment:
Q  19 acatgtacaacgtttatggagaacaacatgattgtccccaccaagatggagggtgtcgttcgcgtggttcgtgttgttaaaccccttgcattcaggacca 118  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2625 acatgtacaacatttatggagaacaacatcattgtccccaccaagatggagggtgtcgttcgcgtggttcgtgttgttaaaccccttgcattcaggacca 2724  T
Q  119 agacaattgatgaggaatgttacaagcttgcgaatgagttgggtttggacaagattgatgataattgattgtttaaacaatcattcaacttattcattaa 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2725 agacaattgatgaggaatgttacaagcttgccaatgagttgggtttggacaagattgatgataattgattgtttaaacaatcattcaacttattcattaa 2824  T
Q  219 tcgtaaatgaaaaataaaataaaagccacttaatgttgtgaaaattctattggcacaattgacatgtatatgtttaaattattatttctctgcaaaaatg 318  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2825 tcgtaaacgaaaaataaaataaaagccacttaatgttgtgaaaattctattggcacaattgacctgtatatgtttaaattattatttctctgcaaaaatg 2924  T
Q  319 tgttgttggttattatgtgtaactatacaaactcatgttcattgtatgctcaattggttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatg 418  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  2925 tgttgttggttattatgtgtaactatacaaactcatgttcattgtatgctcaattggttgaattatgctatgatgtttttgaattatgaagagaaccatg 3024  T
Q  419 tttaattgatgttgttgttgctaagtgatatt 450  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3025 tttaattgatgttgttgttgctaagtgatatt 3056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0390; HSP #2
Raw Score: 400; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 450
Target Start/End: Original strand, 15609 - 16040
Alignment:
Q  19 acatgtacaacgtttatggagaacaacatgattgtccccaccaagatggagggtgtcgttcgcgtggttcgtgttgttaaaccccttgcattcaggacca 118  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15609 acatgtacaacatttatggagaacaacatcattgtcccgaccaagatggagggtgtcgttcgcgtggttcgtgttgttaaaccccttgcattcaggacca 15708  T
Q  119 agacaattgatgaggaatgttacaagcttgcgaatgagttgggtttggacaagattgatgataattgattgtttaaacaatcattcaacttattcattaa 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15709 agacaattgatgaggaatgttacaagcttgccaatgagttgggtttggacaagattgatgataattgattgtttaaacaatcattcaacttattcattaa 15808  T
Q  219 tcgtaaatgaaaaataaaataaaagccacttaatgttgtgaaaattctattggcacaattgacatgtatatgtttaaattattatttctctgcaaaaatg 318  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15809 tcgtaaacgaaaaataaaataaaagccacttaatgttgtgaaaattctattggcacaattgacctgtatatgtttaaattattatttctctgcaaaaatg 15908  T
Q  319 tgttgttggttattatgtgtaactatacaaactcatgttcattgtatgctcaattggttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatg 418  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  15909 tgttgttggttattatgtgtaactatacaaactcatgttcattgtatgctcaattggttgaattatgctatgatgtttttgaattatgaagagaaccatg 16008  T
Q  419 tttaattgatgttgttgttgctaagtgatatt 450  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16009 tttaattgatgttgttgttgctaagtgatatt 16040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 400; Significance: 0; HSPs: 29)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 400; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 22138639 - 22138208
Alignment:
Q  19 acatgtacaacgtttatggagaacaacatgattgtccccaccaagatggagggtgtcgttcgcgtggttcgtgttgttaaaccccttgcattcaggacca 118  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22138639 acatgtacaacatttatggagaacaacatcattgtcccgaccaagatggagggtgtcgttcgcgtggttcgtgttgttaaaccccttgcattcaggacca 22138540  T
Q  119 agacaattgatgaggaatgttacaagcttgcgaatgagttgggtttggacaagattgatgataattgattgtttaaacaatcattcaacttattcattaa 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22138539 agacaattgatgaggaatgttacaagcttgccaatgagttgggtttggacaagattgatgataattgattgtttaaacaatcattcaacttattcattaa 22138440  T
Q  219 tcgtaaatgaaaaataaaataaaagccacttaatgttgtgaaaattctattggcacaattgacatgtatatgtttaaattattatttctctgcaaaaatg 318  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22138439 tcgtaaacgaaaaataaaataaaagccacttaatgttgtgaaaattctattggcacaattgacctgtatatgtttaaattattatttctctgcaaaaatg 22138340  T
Q  319 tgttgttggttattatgtgtaactatacaaactcatgttcattgtatgctcaattggttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatg 418  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  22138339 tgttgttggttattatgtgtaactatacaaactcatgttcattgtatgctcaattggttgaattatgctatgatgtttttgaattatgaagagaaccatg 22138240  T
Q  419 tttaattgatgttgttgttgctaagtgatatt 450  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22138239 tttaattgatgttgttgttgctaagtgatatt 22138208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 153 - 362
Target Start/End: Original strand, 32296025 - 32296227
Alignment:
Q  153 tgagttgggtttggacaagattgatgataattgattgtttaaacaatcattcaacttattcattaatcgtaaatgaaaaataaaataaaagccacttaat 252  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||       || |||||||||||||||||||||||||||| | |||   |||||||||||||||||||||||||    
T  32296025 tgagttgggtttggacaagcttgatgat-------tgattaaacaatcattcaacttattcattaaacctaatcaaaaaataaaataaaagccacttaat 32296117  T
Q  253 gttgtgaaaattctattggcacaattgacatgtatatgtttaaattattatttctctgcaaaaatgtgttgttggttattatgtgtaactatacaaactc 352  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  32296118 gttgtgaaatttatattggcacaattgacctgtatctgtttaaattattatttctctgcaaaaatgtgttgttggttattatgtgtaactatacaaaatc 32296217  T
Q  353 atgttcattg 362  Q
    ||||| ||||    
T  32296218 atgtttattg 32296227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 133 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 24429077 - 24428859
Alignment:
Q  133 gaatgttacaagcttgcgaatgagttgggtttggacaagattgatgataattgattgtttaaacaatcattcaacttattcattaatcgtaaatgaaaaa 232  Q
    |||||| | |||||||  || |||||||||||||||||| ||||||||       || ||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  24429077 gaatgtgaaaagcttgtaaaagagttgggtttggacaagcttgatgat-------tgattaaataatcattcaacttattcattaatcctaaacgaaaaa 24428985  T
Q  233 taaaataaaagccacttaatgttgtgaaaattctattggcacaattgacatgtatatgtttaaattattatttctctgcaaaaatgtgttgttggttatt 332  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24428984 taaaataaaagtcacttaatgttgtgaaaattctattggcaca----acctgtatctgtttaaattattatttctctgcaaaaatgttttgttggttatt 24428889  T
Q  333 atgtgtaactatacaaactcatgttcattg 362  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||    
T  24428888 atgcctaactatacaaactcatgttcattg 24428859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 193 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 32240661 - 32240500
Alignment:
Q  193 aaacaatcattcaacttattcattaatcgtaaatgaaaaataaaataaaagccacttaatgttgtgaaaattctattggcacaattgacatgtatatgtt 292  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    || ||||| ||||    
T  32240661 aaacaatcattcaacttattcgttaatcctaaacgaaaaataaaataaaggccacttaatgttgtgaaaattctattggtaca----acctgtatctgtt 32240566  T
Q  293 taaatta-ttatttctctgcaaaaatgtgttgttggttattatgtgtaactatacaaactcatgtt 357  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  32240565 taaattatttatttctctgcaaaaatgtgttattggttattatgtgtaactatacaaactcttgtt 32240500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 273 - 362
Target Start/End: Original strand, 32303738 - 32303827
Alignment:
Q  273 acaattgacatgtatatgtttaaattattatttctctgcaaaaatgtgttgttggttattatgtgtaactatacaaactcatgttcattg 362  Q
    ||||||||||||||  ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  32303738 acaattgacatgtaactgtttaaaccattatttctctgcaaaaatgtgttgttggttattatatgtaactataaaaactcatgttcattg 32303827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 363 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 19666663 - 19666576
Alignment:
Q  363 tatgctcaattggttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaagtgatatt 450  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19666663 tatgctcaaatggttgaattatgctatgttgttattgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatatt 19666576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 364 - 447
Target Start/End: Original strand, 19669222 - 19669305
Alignment:
Q  364 atgctcaattggttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaagtgat 447  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19669222 atgcttaattggttgaattatgatatgttgttgttgaattatgatgtgaaccatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgat 19669305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 363 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 68127 - 68040
Alignment:
Q  363 tatgctcaattggttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaagtgatatt 450  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||| ||   ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  68127 tatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatatt 68040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 375 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 9636868 - 9636793
Alignment:
Q  375 gttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaagtgatatt 450  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  9636868 gttgaattgtgctatgttgttgttgaattgtgatgagaatcatgtttaattgatgttgttgttgttaagagatatt 9636793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 376 - 450
Target Start/End: Original strand, 23821730 - 23821804
Alignment:
Q  376 ttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaagtgatatt 450  Q
    ||||||| ||||||| | |||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23821730 ttgaattgtgctatgttattgttgaattatgatgagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatatt 23821804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 376 - 450
Target Start/End: Original strand, 23830809 - 23830883
Alignment:
Q  376 ttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaagtgatatt 450  Q
    ||||||| ||||||| | |||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23830809 ttgaattgtgctatgttattgttgaattatgatgagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatatt 23830883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 363 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 43646028 - 43645944
Alignment:
Q  363 tatgctcaattggttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaagtgat 447  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||| | ||   ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  43646028 tatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaactgtggtaagaatcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgat 43645944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 365 - 447
Target Start/End: Original strand, 25265520 - 25265601
Alignment:
Q  365 tgctcaattggttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaagtgat 447  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||    
T  25265520 tgctcaattggt-gaattttgctatgttgttgttgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgttgttgttaattgat 25265601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 363 - 447
Target Start/End: Original strand, 24571404 - 24571488
Alignment:
Q  363 tatgctcaattggttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaagtgat 447  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||   ||| ||||| | ||||||||||||||||| ||||||||    
T  24571404 tatgctcaattggttgaattatgctatgtttttgttgaattgtgttaagattcatgatcaattgatgttgttgttgttaagtgat 24571488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 375 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 6094839 - 6094764
Alignment:
Q  375 gttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaagtgatatt 450  Q
    |||||||| || |||| ||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  6094839 gttgaattgtgttatgttgttgttgatttgtgatgagaatcatgtttaattgatgttgttgttgttaagagatatt 6094764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 375 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 24277884 - 24277809
Alignment:
Q  375 gttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaagtgatatt 450  Q
    |||||||| || |||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||    
T  24277884 gttgaattgtgttatgttgttgttgaattgtgatgagaatcatgtttaaatgatgttgttgttgttaagagatatt 24277809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 375 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 24884809 - 24884742
Alignment:
Q  375 gttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaa 442  Q
    |||||||| ||||||| | |||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24884809 gttgaattgtgctatgttattgttgaattgtgatgagattcatgtttaattgatgttgttgttgctaa 24884742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 375 - 450
Target Start/End: Original strand, 19433456 - 19433531
Alignment:
Q  375 gttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaagtgatatt 450  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||| |    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19433456 gttgaattatgctatgttgttattgaattgttgtaagaatcatgttcaattgatgttgttgttgctaagagatatt 19433531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 363 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 25305581 - 25305496
Alignment:
Q  363 tatgctcaattggttgaattatgctatgatg-ttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaagtgat 447  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||| || |||||||||| ||   ||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  25305581 tatgctcaaattgttgaattatgctatgttgattgttgaattgtggtaagagtcatgttcaattgatgttgttgtggctaagtgat 25305496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 395 - 447
Target Start/End: Original strand, 24294667 - 24294719
Alignment:
Q  395 tgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaagtgat 447  Q
    ||||||||||||  |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24294667 tgttgaattatgctgagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgat 24294719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 375 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 25595143 - 25595075
Alignment:
Q  375 gttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaag 443  Q
    |||||||| ||||||| |||| |||| || ||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  25595143 gttgaattgtgctatgttgtttttgatttgtgatgagattcatgtttaattgatgttgttgttgttaag 25595075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 375 - 437
Target Start/End: Original strand, 16292925 - 16292987
Alignment:
Q  375 gttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgtt 437  Q
    |||||||| | ||||| ||||||||| || ||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16292925 gttgaattgtactatgttgttgttgatttgtgatgagattcatgtttaattgatgttgttgtt 16292987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 392 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 33128151 - 33128093
Alignment:
Q  392 tgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaagtgatatt 450  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||| | |||| ||||||    
T  33128151 tgttgttgaattgtgatgagaatcatgtttaattgatattgttgtggttaagagatatt 33128093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 363 - 447
Target Start/End: Original strand, 31146293 - 31146376
Alignment:
Q  363 tatgctcaattggttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaagtgat 447  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||| | |  ||| || |||| ||||||||||  ||||||||||||||    
T  31146293 tatgctcaaattgttgaattatgctatg-tgttgttgaattgtaataagattcctgttcaattgatgttactgttgctaagtgat 31146376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 414 - 447
Target Start/End: Original strand, 3404 - 3437
Alignment:
Q  414 tcatgtttaattgatgttgttgttgctaagtgat 447  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  3404 tcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgat 3437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 377 - 438
Target Start/End: Original strand, 22775331 - 22775392
Alignment:
Q  377 tgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttg 438  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||| |||  ||| ||||||| |||||| ||||||||||    
T  22775331 tgaattatgctatgttgtagttgaattgtgataagattcatgttcaattgaagttgttgttg 22775392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 377 - 438
Target Start/End: Original strand, 22780709 - 22780770
Alignment:
Q  377 tgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttg 438  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||| |||  ||| ||||||| |||||| ||||||||||    
T  22780709 tgaattatgctatgttgtagttgaattgtgataagattcatgttcaattgaagttgttgttg 22780770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 191 - 220
Target Start/End: Original strand, 32303694 - 32303723
Alignment:
Q  191 ttaaacaatcattcaacttattcattaatc 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32303694 ttaaacaatcattcaacttattcattaatc 32303723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 363 - 447
Target Start/End: Original strand, 36890798 - 36890881
Alignment:
Q  363 tatgctcaattggttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaagtgat 447  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||| ||||| | |||| |||  ||  ||||| | ||||| ||||||||||||||||||||    
T  36890798 tatgcttaattggt-gaattatgctatgttgttgataaattgtgataagtttcatgatcaattgttgttgttgttgctaagtgat 36890881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0786 (Bit Score: 392; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0786
Description:

Target: scaffold0786; HSP #1
Raw Score: 392; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 450
Target Start/End: Original strand, 4092 - 4523
Alignment:
Q  19 acatgtacaacgtttatggagaacaacatgattgtccccaccaagatggagggtgtcgttcgcgtggttcgtgttgttaaaccccttgcattcaggacca 118  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4092 acatgtacaacatttatggagaacaacatcattgtccccaccaagatggagggtgtcgttcgcgtggttcgtgttgttaaaccccttgcattcgggacca 4191  T
Q  119 agacaattgatgaggaatgttacaagcttgcgaatgagttgggtttggacaagattgatgataattgattgtttaaacaatcattcaacttattcattaa 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4192 agacaattgatgaggaatgttacaagcttgccaatgagttgggtttggacaagattgatgataattgattgtttaaacaatcattcaacttattcattaa 4291  T
Q  219 tcgtaaatgaaaaataaaataaaagccacttaatgttgtgaaaattctattggcacaattgacatgtatatgtttaaattattatttctctgcaaaaatg 318  Q
    |||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4292 tcgtaaacaaaaaataaaataaaagctacttaatgttgtgaaaattctattggcacaattgacctgtatatgtttaaattattatttctctgcaaaaatg 4391  T
Q  319 tgttgttggttattatgtgtaactatacaaactcatgttcattgtatgctcaattggttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatg 418  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  4392 tgttgttggttattatgtgtaactatacaaactcatgttcattgtatgctcaattggttgaattatgctatgatgtttttgaattatgaagagaaccatg 4491  T
Q  419 tttaattgatgttgttgttgctaagtgatatt 450  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4492 tttaattgatgttgttgttgctaagtgatatt 4523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1678 (Bit Score: 134; Significance: 1e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold1678
Description:

Target: scaffold1678; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 185 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 280 - 103
Alignment:
Q  185 gattgtttaaacaatcattcaacttattcattaatcgtaaatgaaaaataaaataaaagccacttaatgttgtgaaaattctattggcacaattgacatg 284  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||  |||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  280 gattgattaaacaatcattcaacttatttattaatcctaaaccaaaaataaaataaaagtcatttaatgttgcgaaaattctattggcacaattgacctg 181  T
Q  285 tatatgtttaaattattatttctctgcaaaaatgtgttgttggttattatgtgtaactatacaaactcatgttcattg 362  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  180 gatctgtttaaattattatttctctgcaaaaatgtgttgttggttattatgtgtaactatacaaactcatgttcattg 103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 64; Significance: 8e-28; HSPs: 26)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 363 - 450
Target Start/End: Original strand, 23981628 - 23981715
Alignment:
Q  363 tatgctcaattggttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaagtgatatt 450  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23981628 tatgctcaaatggttgaattatgatatgttgttgttgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatatt 23981715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 363 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 19862344 - 19862257
Alignment:
Q  363 tatgctcaattggttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaagtgatatt 450  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||| |||  ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19862344 tatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagaatcatgtgcaattgatgttgttgttgctaagtgatatt 19862257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 370 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 23494047 - 23493970
Alignment:
Q  370 aattggttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaagtgat 447  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||  ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  23494047 aattggttgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgat 23493970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 363 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 7728555 - 7728471
Alignment:
Q  363 tatgctcaattggttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaagtgat 447  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||| |||  ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  7728555 tatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgat 7728471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 375 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 29918088 - 29918013
Alignment:
Q  375 gttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaagtgatatt 450  Q
    |||||||| || |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  29918088 gttgaattgtgttatgttgttgttgaattatgatgagaatcatgtttaactgatgttgttgttgctaagagatatt 29918013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 363 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 6456759 - 6456673
Alignment:
Q  363 tatgctcaattggttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaagtgatat 449  Q
    ||||||||| | |||||||| || |||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  6456759 tatgctcaaattgttgaattgtgttatgttgttgttgaattgtgatgagaatcatgtttaattgatgttgttgttgttaagagatat 6456673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 375 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 24084200 - 24084132
Alignment:
Q  375 gttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaag 443  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24084200 gttgaattgtgctatgttgttgttgaattgtgatgtgaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaag 24084132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 375 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 21617139 - 21617064
Alignment:
Q  375 gttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaagtgatatt 450  Q
    |||||||| | ||||| |||||||||||| ||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21617139 gttgaattgttctatgttgttgttgaattgtgatgagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatatt 21617064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 375 - 450
Target Start/End: Original strand, 26559939 - 26560014
Alignment:
Q  375 gttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaagtgatatt 450  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||| || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26559939 gttgaattgtgctatgttgttgttgatttgtgatgagaattatgtttaattgatgttgttgttgctaagagatatt 26560014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 375 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 37983487 - 37983412
Alignment:
Q  375 gttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaagtgatatt 450  Q
    |||||||| ||||||| | |||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  37983487 gttgaattgtgctatgttattgttgaattgtaatgagaatcatgtttaattgatgttgttgttgttaagtgatatt 37983412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 376 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 22885764 - 22885690
Alignment:
Q  376 ttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaagtgatatt 450  Q
    ||||||| || |||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  22885764 ttgaattgtgttatgttgttgttgaattatgttgagaatcatgtttaattgatgttgttgttgttaagagatatt 22885690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 375 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 21109873 - 21109798
Alignment:
Q  375 gttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaagtgatatt 450  Q
    |||||||| || |||| ||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  21109873 gttgaattgtgttatgttgttgttgatttgtgatgagaatcatgtttaattgatgttgttgttgttaagagatatt 21109798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 363 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 3673997 - 3673917
Alignment:
Q  363 tatgctcaattggttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaag 443  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||| |||  ||  ||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  3673997 tatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaag 3673917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 363 - 447
Target Start/End: Original strand, 5450955 - 5451039
Alignment:
Q  363 tatgctcaattggttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaagtgat 447  Q
    ||||||||| | | |||||||||||||| |||||||||||| |||  | | ||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  5450955 tatgctcaaattgatgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataaaattcatgttcaactgatgttgttgttgctaagtgat 5451039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 363 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 432598 - 432511
Alignment:
Q  363 tatgctcaattggttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaagtgatatt 450  Q
    ||||||||| | | |||||||| ||||| |||||||| ||| ||   ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  432598 tatgctcaaattgatgaattatactatgttgttgttggattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatatt 432511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 379 - 450
Target Start/End: Original strand, 21222736 - 21222807
Alignment:
Q  379 aattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaagtgatatt 450  Q
    |||| ||||||| |||||||||||| |||  ||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21222736 aattgtgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattaatgttgttgttgctaagtgatatt 21222807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 376 - 450
Target Start/End: Original strand, 23234610 - 23234684
Alignment:
Q  376 ttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaagtgatatt 450  Q
    ||||||| ||||||  ||||||||| |  ||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||    
T  23234610 ttgaattgtgctattttgttgttgattagtgatgagaatcatgtttaattgatgttgttattgttaagagatatt 23234684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 363 - 444
Target Start/End: Original strand, 1168317 - 1168397
Alignment:
Q  363 tatgctcaattggttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaagt 444  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| |||||| |||  ||  ||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  1168317 tatgctcaattggt-gaattatgcaatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagt 1168397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 378 - 443
Target Start/End: Original strand, 16835426 - 16835491
Alignment:
Q  378 gaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaag 443  Q
    ||||| ||||||| ||||||||| || ||| |||| |||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  16835426 gaattgtgctatgttgttgttgatttgtgatgagattcatgtttaattaatgttgttgttgttaag 16835491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 375 - 438
Target Start/End: Original strand, 11763629 - 11763692
Alignment:
Q  375 gttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttg 438  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||| || ||| | || ||||||||||||| |||||||||||    
T  11763629 gttgaattgtgctatgttgttgttgatttgtgatgggattcatgtttaattgttgttgttgttg 11763692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 363 - 438
Target Start/End: Original strand, 24183245 - 24183319
Alignment:
Q  363 tatgctcaattggttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttg 438  Q
    |||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||| ||| |||  ||||| | |||||||| ||||||||    
T  24183245 tatgctcaattggt-gaattatgctttgttgttgttgaattgtgatgagtttcatgatcaattgatggtgttgttg 24183319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 379 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 28902310 - 28902252
Alignment:
Q  379 aattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgtt 437  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||  ||| ||||||| |||||| |||||||||    
T  28902310 aattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattgaagttgttgtt 28902252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 379 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 28938705 - 28938647
Alignment:
Q  379 aattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgtt 437  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||  ||| ||||||| |||||| |||||||||    
T  28938705 aattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattgaagttgttgtt 28938647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 363 - 444
Target Start/End: Original strand, 11337299 - 11337379
Alignment:
Q  363 tatgctcaattggttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaagt 444  Q
    |||||||| ||||| |||||||| |||| ||||| |||||| |||  ||  ||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  11337299 tatgctcatttggt-gaattatgttatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagt 11337379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 409 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 19873933 - 19873892
Alignment:
Q  409 gagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaagtgatatt 450  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  19873933 gagattcatgtttaattgatgttgttgttgttaagagatatt 19873892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 377 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 23417362 - 23417301
Alignment:
Q  377 tgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttg 438  Q
    |||||| ||||||| ||||||||| || ||  || | |||||||||||||||||||||||||    
T  23417362 tgaattgtgctatgttgttgttgatttgtggtgacattcatgtttaattgatgttgttgttg 23417301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0700 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0700
Description:

Target: scaffold0700; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 375 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 2648 - 2573
Alignment:
Q  375 gttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaagtgatatt 450  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2648 gttgaattatgctatgttgttgttgaattatgatgagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatatt 2573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 379 - 450
Target Start/End: Original strand, 43926 - 43997
Alignment:
Q  379 aattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaagtgatatt 450  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43926 aattgtgctatgttgttgttgaattatgatgagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaagtgatatt 43997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 375 - 443
Target Start/End: Original strand, 23796 - 23864
Alignment:
Q  375 gttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaag 443  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  23796 gttgaattgtgctatgttgttgttgaattgtgatgagaatcatgtttaattgacgttgttgttgttaag 23864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 363 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 79674 - 79587
Alignment:
Q  363 tatgctcaattggttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaagtgatatt 450  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| | ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  79674 tatgcttaattggttgaattatgatatgttgttgttgaattatgatgtgaaccatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatatt 79587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 33)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 363 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 29306552 - 29306465
Alignment:
Q  363 tatgctcaattggttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaagtgatatt 450  Q
    ||||||||| | |||||||| ||||||| |||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29306552 tatgctcaaattgttgaattgtgctatgttgttgttgaattgtgatgagattcatgtttaattgatgttgttgttgctaagtgatatt 29306465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 363 - 450
Target Start/End: Original strand, 23226188 - 23226275
Alignment:
Q  363 tatgctcaattggttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaagtgatatt 450  Q
    ||||||||| || |||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23226188 tatgctcaaatgattgaattatgttatgttgttgttgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgttgttgttaagtgatatt 23226275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 376 - 450
Target Start/End: Original strand, 33611178 - 33611252
Alignment:
Q  376 ttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaagtgatatt 450  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33611178 ttgaattatgctatgttgttgttgaattgtgttgagaaccatgtttaattgatgttgttgttgctaagtgatatt 33611252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 363 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 23158295 - 23158211
Alignment:
Q  363 tatgctcaattggttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaagtgat 447  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||| |||||| ||| | |||||||||| |||||||||    
T  23158295 tatgctcaattggttgaattatgttatgttgttgttgaattatgatgagaaccatgttcaatagttgttgttgttcctaagtgat 23158211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 363 - 447
Target Start/End: Original strand, 39446878 - 39446962
Alignment:
Q  363 tatgctcaattggttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaagtgat 447  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||  ||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  39446878 tatgctaaattggttgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgat 39446962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 375 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 15933421 - 15933346
Alignment:
Q  375 gttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaagtgatatt 450  Q
    |||||||| || |||| |||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15933421 gttgaattgtgttatgttgttgttgaattatgatgagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatatt 15933346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 375 - 450
Target Start/End: Original strand, 18261595 - 18261670
Alignment:
Q  375 gttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaagtgatatt 450  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  18261595 gttgaattgtgctatgttgttgttgaattgtgatgagaatcatgtttaattgatgttgttgttgttaagagatatt 18261670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 375 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 22742887 - 22742824
Alignment:
Q  375 gttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttg 438  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22742887 gttgaattgtgctatgttgttgttgaattatgatgagaatcatgtttaattgatgttgttgttg 22742824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 375 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 26011617 - 26011542
Alignment:
Q  375 gttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaagtgatatt 450  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||| ||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26011617 gttgaattgtgctatgttgttgttgaattgtgatgagattcatgttgaattgatgttgttgttgctaagtgatatt 26011542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 375 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 33528548 - 33528473
Alignment:
Q  375 gttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaagtgatatt 450  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  33528548 gttgaattgtgctatgttgttgttgaattgtgatgagattcatgtttaattgatgttgttgttgctaagagatatt 33528473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 375 - 450
Target Start/End: Original strand, 38635772 - 38635847
Alignment:
Q  375 gttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaagtgatatt 450  Q
    |||||||| || |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  38635772 gttgaattgtgttatgttgttgttgaattatgatgagaatcatgtttaattgatgttgttgttgttaagagatatt 38635847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 375 - 450
Target Start/End: Original strand, 45559061 - 45559136
Alignment:
Q  375 gttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaagtgatatt 450  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  45559061 gttgaattgtgctatgttgttgttgaattgtgatgagaatcatgtttaattgatgttgttgttgttaagggatatt 45559136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 369 - 450
Target Start/End: Original strand, 23151951 - 23152032
Alignment:
Q  369 caattggttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaagtgatatt 450  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||| | |||| |||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  23151951 caattggttgaattatgatatgttgttgttgaattatgatgagaaccgtgttcaattgatgctgttgttgctatgtgatatt 23152032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 363 - 447
Target Start/End: Original strand, 21198264 - 21198348
Alignment:
Q  363 tatgctcaattggttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaagtgat 447  Q
    ||||||||| | ||||||||||| |||| |||||||||||| ||   ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21198264 tatgctcaaattgttgaattatgttatgttgttgttgaattgtggtaagaatcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgat 21198348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 363 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 23837333 - 23837249
Alignment:
Q  363 tatgctcaattggttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaagtgat 447  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||| ||   ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  23837333 tatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagagtcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgat 23837249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 363 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 38533784 - 38533700
Alignment:
Q  363 tatgctcaattggttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaagtgat 447  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  38533784 tatgctcaaattattgaattatgctatgttgttgttgaattgtgatgagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaggtgat 38533700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 375 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 5854737 - 5854662
Alignment:
Q  375 gttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaagtgatatt 450  Q
    ||||| || ||||||| |||||||||||| ||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5854737 gttgagttgtgctatgttgttgttgaattgtgatgagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatatt 5854662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 375 - 450
Target Start/End: Original strand, 27233191 - 27233266
Alignment:
Q  375 gttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaagtgatatt 450  Q
    |||||||| || |||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  27233191 gttgaattgtgttatgttgttgttgaattgtgatgagaatcatgtttaattgatgttgttgttgttaagagatatt 27233266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 363 - 437
Target Start/End: Original strand, 19331426 - 19331500
Alignment:
Q  363 tatgctcaattggttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgtt 437  Q
    ||||||||| | ||||| || ||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19331426 tatgctcaaattgttgagttgtgctatgttgttgttgaattgtgatgagaatcatgtttaattgatgttgttgtt 19331500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 363 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 23149913 - 23149832
Alignment:
Q  363 tatgctcaattggttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaagtgat 447  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |   |||||||||||||| |||||||||||| ||| | |||| |||||||||||||||    
T  23149913 tatgctcaattggttgaattatgctaag---ttgttgaattatgatgagaatcatgttcaatagttgtttttgttgctaagtgat 23149832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 375 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 33172351 - 33172289
Alignment:
Q  375 gttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgtt 437  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  33172351 gttgaattgtgctatgttgttgttgaattgtgatgagaatcatgtttaattgatgttgttgtt 33172289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 375 - 450
Target Start/End: Original strand, 45465250 - 45465325
Alignment:
Q  375 gttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaagtgatatt 450  Q
    ||||||||  |||||| | |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  45465250 gttgaattgagctatgttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaattgatgttgttgttgttaagagatatt 45465325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 375 - 443
Target Start/End: Original strand, 18041656 - 18041724
Alignment:
Q  375 gttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaag 443  Q
    |||||||| || |||| ||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18041656 gttgaattgtgttatgttgttgttgatttgtgatgagaatcatgtttaattgatgttgttgttgttaag 18041724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 375 - 443
Target Start/End: Original strand, 22497333 - 22497401
Alignment:
Q  375 gttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaag 443  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||| || ||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22497333 gttgaattgtgctatgttgttgttgatttgtgatgagattcatgtttaattgatgttgttgttgataag 22497401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 375 - 449
Target Start/End: Original strand, 24552694 - 24552768
Alignment:
Q  375 gttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaagtgatat 449  Q
    |||||||| || |||| ||||||| | || ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  24552694 gttgaattgtgttatgttgttgttaatttgtgatgagaatcatgtttaattgatgttgttgttgttaagagatat 24552768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 363 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 25296293 - 25296222
Alignment:
Q  363 tatgctcaattggttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttg 435  Q
    ||||||||| | |||||||| | ||||| ||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  25296293 tatgctcaaattgttgaattgttctatg-tgttgttcaattatgatgagaattatgtttaattgatgttgttg 25296222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 363 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 25758313 - 25758242
Alignment:
Q  363 tatgctcaattggttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttg 435  Q
    ||||||||| | |||||||| | ||||| ||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  25758313 tatgctcaaattgttgaattgttctatg-tgttgttcaattatgatgagaattatgtttaattgatgttgttg 25758242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 376 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 20709814 - 20709755
Alignment:
Q  376 ttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttg 435  Q
    ||||||| ||||||  ||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20709814 ttgaattgtgctattttgttgttgagttttgatgagaatcatgtttaattgatgttgttg 20709755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 392 - 443
Target Start/End: Original strand, 37653757 - 37653808
Alignment:
Q  392 tgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaag 443  Q
    |||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  37653757 tgttgttgaattctgttgagaatcatgtttaattgatgttgttgttgttaag 37653808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 363 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 21681137 - 21681066
Alignment:
Q  363 tatgctcaattggttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgtt 434  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||| |||  ||  ||||| | |||||||||||||    
T  21681137 tatgctcaattggttaaattatgctttgttgttgttgaattgtgattagtttcatgatcaattgatgttgtt 21681066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 377 - 447
Target Start/End: Original strand, 22735964 - 22736034
Alignment:
Q  377 tgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaagtgat 447  Q
    |||||||| ||||| |||||||| ||| |||  ||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||    
T  22735964 tgaattatactatgttgttgttggattgtgataagattcatgttcaattgatgttgttcttgctaactgat 22736034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 363 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 37611802 - 37611722
Alignment:
Q  363 tatgctcaattggttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaagt 444  Q
    |||||||||||||| |||||||||| || ||||| |||||| |||| ||  ||||| | ||||| ||||||||||| |||||    
T  37611802 tatgctcaattggt-gaattatgctttgttgttgatgaattgtgaaaagtttcatgatcaattgttgttgttgttgttaagt 37611722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 363 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 22981408 - 22981368
Alignment:
Q  363 tatgctcaattggttgaattatgctatgatgttgttgaatt 403  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22981408 tatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaatt 22981368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 41)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 363 - 450
Target Start/End: Original strand, 20583666 - 20583753
Alignment:
Q  363 tatgctcaattggttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaagtgatatt 450  Q
    ||||||||| | |||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  20583666 tatgctcaaattgttgaattgtgctatgttgttgttgaattatgatgagaatcatgtttaattgatgttgttgttgttaagggatatt 20583753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 363 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 13274922 - 13274838
Alignment:
Q  363 tatgctcaattggttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaagtgat 447  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||  ||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  13274922 tatgctcaattggttgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgat 13274838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 375 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 9611430 - 9611355
Alignment:
Q  375 gttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaagtgatatt 450  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  9611430 gttgaattgtgctatgttgttgttgaattatgatgagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatatt 9611355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 375 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 9839002 - 9838927
Alignment:
Q  375 gttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaagtgatatt 450  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  9839002 gttgaattgtgctatgttgttgttgaattatgatgagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatatt 9838927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 363 - 450
Target Start/End: Original strand, 13863042 - 13863129
Alignment:
Q  363 tatgctcaattggttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaagtgatatt 450  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||  | | ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13863042 tatgctcaattggttgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataatattcatgttcaattgttgttgttgttgctaagtgatatt 13863129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 363 - 447
Target Start/End: Original strand, 12248233 - 12248317
Alignment:
Q  363 tatgctcaattggttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaagtgat 447  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||  ||| ||||| | ||| ||||||||||||||||||||||    
T  12248233 tatgctcaattggttgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaatggatgttgttgttgctaagtgat 12248317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 363 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 14940890 - 14940810
Alignment:
Q  363 tatgctcaattggttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaag 443  Q
    ||||||||| | |||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  14940890 tatgctcaaattgttgaattgtgctatgttgttgttgaattatgatgagaatcatgtttaaatgatgttgttgttgttaag 14940810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 363 - 447
Target Start/End: Original strand, 49047786 - 49047870
Alignment:
Q  363 tatgctcaattggttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaagtgat 447  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||  ||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  49047786 tatgctcaattggttgaattatgttatgttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgat 49047870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 363 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 4484862 - 4484775
Alignment:
Q  363 tatgctcaattggttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaagtgatatt 450  Q
    ||||||||| | |||||||| ||||||  |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  4484862 tatgctcaaattgttgaattgtgctatattgttgttgaattgtgatgagaatcatgtttaattgatgttgttgttgttaagagatatt 4484775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 375 - 450
Target Start/End: Original strand, 16915052 - 16915127
Alignment:
Q  375 gttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaagtgatatt 450  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16915052 gttgaattgtgctatgttgttgttgaattatgatgagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtcatatt 16915127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 363 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 16919694 - 16919607
Alignment:
Q  363 tatgctcaattggttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaagtgatatt 450  Q
    ||||||||| | | |||||||||||||| |||||||||||| |||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16919694 tatgctcaaattgatgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagaatcgtgtttaattgatgttgttgttgctaagtaatatt 16919607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 375 - 446
Target Start/End: Original strand, 34241312 - 34241383
Alignment:
Q  375 gttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaagtga 446  Q
    |||||||| || |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  34241312 gttgaattgtgttatgttgttgttgaattatgatgagaatcatgtttaattgatgttgttgttgataagtga 34241383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 375 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 48356767 - 48356692
Alignment:
Q  375 gttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaagtgatatt 450  Q
    |||||||| || |||| |||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  48356767 gttgaattgtgttatgttgttgttgaattatgatgagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatatt 48356692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 364 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 31501307 - 31501233
Alignment:
Q  364 atgctcaattggttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttg 438  Q
    |||||||| | |||||||| ||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31501307 atgctcaaattgttgaattgtgctatgttgttgttgaattgtgatgagaatcatgtttaattgatgttgttgttg 31501233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 363 - 447
Target Start/End: Original strand, 16570118 - 16570202
Alignment:
Q  363 tatgctcaattggttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaagtgat 447  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||  ||  ||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  16570118 tatgctcaattggttgaattatgctatgttgttgttgaattgagataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgat 16570202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 363 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 16595544 - 16595460
Alignment:
Q  363 tatgctcaattggttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaagtgat 447  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||  ||  ||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  16595544 tatgctcaattggttgaattatgctatgttgttgttgaattgagataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgat 16595460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 375 - 450
Target Start/End: Original strand, 13448951 - 13449026
Alignment:
Q  375 gttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaagtgatatt 450  Q
    |||||||| ||||||| | |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  13448951 gttgaattgtgctatgttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaattgatgttgttgttgttaagagatatt 13449026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 375 - 450
Target Start/End: Original strand, 17947716 - 17947791
Alignment:
Q  375 gttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaagtgatatt 450  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  17947716 gttgaattgtgctatgttgttgttgatttgtgatgagaatcatgtttaattgatgttgttgttgttaagagatatt 17947791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 363 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 38424354 - 38424267
Alignment:
Q  363 tatgctcaattggttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaagtgatatt 450  Q
    ||||||||| | |||||||| | ||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||    
T  38424354 tatgctcaaattgttgaattgttctatgttgttgttgaattatgatgagaattatgtttaagtgatgttgttgttgttaagagatatt 38424267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 375 - 450
Target Start/End: Original strand, 9723931 - 9724006
Alignment:
Q  375 gttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaagtgatatt 450  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||| || ||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  9723931 gttgaattgtgctatgttgttgttgatttgtgatgagattcatgtttaattgatgttgttgttgttaagagatatt 9724006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 375 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 28390435 - 28390360
Alignment:
Q  375 gttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaagtgatatt 450  Q
    |||||||| ||||||| | |||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  28390435 gttgaattgtgctatgttattgttgaattgtgatgataatcatgtttaattgatgttgttgttgttaagagatatt 28390360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 375 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 33559770 - 33559695
Alignment:
Q  375 gttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaagtgatatt 450  Q
    |||||||| || |||| ||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  33559770 gttgaattgtgttatgttgttgttgatttgtgatgagaatcatgtttaattgatgttgttgttgttaagagatatt 33559695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 375 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 46474124 - 46474049
Alignment:
Q  375 gttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaagtgatatt 450  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||| || ||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  46474124 gttgaattgtgctatgttgttgttgatttgtgatgagattcatgtttaattgatgttgttgttgttaagagatatt 46474049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 363 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 14935495 - 14935421
Alignment:
Q  363 tatgctcaattggttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgtt 437  Q
    ||||||||| | |||||||| || |||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  14935495 tatgctcaaattgttgaattgtgatatgttgttgttgaattatgatgagaatcatttttaaatgatgttgttgtt 14935421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 363 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 15363088 - 15363014
Alignment:
Q  363 tatgctcaattggttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgtt 437  Q
    ||||||||| | |||||||| || |||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  15363088 tatgctcaaattgttgaattgtgatatgttgttgttgaattatgatgagaatcatttttaaatgatgttgttgtt 15363014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 377 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 15368469 - 15368403
Alignment:
Q  377 tgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaag 443  Q
    |||||| || |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  15368469 tgaattgtgatatgttgttgttgaattatgatgagaatcatgtttaaatgatgttgttgttgttaag 15368403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 379 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 13377648 - 13377583
Alignment:
Q  379 aattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaagt 444  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||  ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13377648 aattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagt 13377583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 377 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 45149723 - 45149650
Alignment:
Q  377 tgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaagtgatatt 450  Q
    |||||| ||||||||||||||||  || ||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  45149723 tgaattgtgctatgatgttgttggtttgtgatgagattcatgtttaattgatgttgttgttgttaagagatatt 45149650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 375 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 4446335 - 4446268
Alignment:
Q  375 gttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaag 443  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  4446335 gttgaattgtgctatgttgttgttgaattgtgatgagaatcatg-ttaattgatgttgttgttgataag 4446268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 375 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 15358920 - 15358852
Alignment:
Q  375 gttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaag 443  Q
    |||||||| || |||| |||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15358920 gttgaattgtgttatgttgttgttgaattgtgatgggaatcatgtttaattgatgttgttgttgttaag 15358852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 375 - 447
Target Start/End: Original strand, 17224062 - 17224134
Alignment:
Q  375 gttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaagtgat 447  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |    ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17224062 gttgaattatgctatgttgttgttgaattgttgtaagagtcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgat 17224134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 363 - 447
Target Start/End: Original strand, 12369953 - 12370036
Alignment:
Q  363 tatgctcaattggttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaagtgat 447  Q
    |||||||||||||| |||||||||  || |||||||||||| |||  |   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12369953 tatgctcaattggt-gaattatgccttgttgttgttgaattgtgataactttcatgattaattgatgttgttgttgctaagtgat 12370036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 363 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 28722245 - 28722169
Alignment:
Q  363 tatgctcaattggttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaa-tcatgtttaattgatgttgttgttg 438  Q
    ||||||||| | |||||||| ||||||| |||||||||||| ||| ||||| |||||||||| ||| ||||||||||    
T  28722245 tatgctcaaattgttgaattgtgctatgttgttgttgaattgtgatgagaattcatgtttaaatgaagttgttgttg 28722169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 375 - 438
Target Start/End: Original strand, 8267852 - 8267915
Alignment:
Q  375 gttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttg 438  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||| || ||| |||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  8267852 gttgaattgtgctatgttgttgttgatttgtgatgagaattatgtttaattgatgatgttgttg 8267915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 363 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 11287551 - 11287471
Alignment:
Q  363 tatgctcaattggttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaagt 444  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||| |||  ||  ||||| | | |||||||||||||||||||||    
T  11287551 tatgctcaattggt-gaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcagttgatgttgttgttgctaagt 11287471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 363 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 12759121 - 12759041
Alignment:
Q  363 tatgctcaattggttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaagt 444  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||  ||  ||||| | ||||| ||||||||||| |||||    
T  12759121 tatgctcaattggt-gaattatgctatgttgttggtgaattatgataagtttcatgatcaattgttgttgttgttgttaagt 12759041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 363 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 3049717 - 3049634
Alignment:
Q  363 tatgctcaattggttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaagtgat 447  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||| |||  ||  ||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  3049717 tatgctcaattggt-gaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgat 3049634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 363 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 3895159 - 3895076
Alignment:
Q  363 tatgctcaattggttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaagtgat 447  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||| |||  ||  ||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  3895159 tatgctcaattggt-gaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgat 3895076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 410 - 450
Target Start/End: Original strand, 14272045 - 14272085
Alignment:
Q  410 agaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaagtgatatt 450  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14272045 agaatcatgttcaattgatgttgttgttgctaaatgatatt 14272085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 363 - 447
Target Start/End: Original strand, 26070377 - 26070460
Alignment:
Q  363 tatgctcaattggttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaagtgat 447  Q
    |||||| ||||||| |||||||| |||| ||||| |||||| |||  ||  ||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  26070377 tatgcttaattggt-gaattatgttatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgat 26070460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 363 - 447
Target Start/End: Original strand, 26094164 - 26094247
Alignment:
Q  363 tatgctcaattggttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaagtgat 447  Q
    |||||| ||||||| |||||||| |||| ||||| |||||| |||  ||  ||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  26094164 tatgcttaattggt-gaattatgttatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgat 26094247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 29)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 375 - 450
Target Start/End: Original strand, 7964835 - 7964910
Alignment:
Q  375 gttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaagtgatatt 450  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  7964835 gttgaattgtgctatgttgttgttgaattatgatgagaatcatgtttaattgattttgttgttgctaagtgatatt 7964910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 375 - 450
Target Start/End: Original strand, 18238281 - 18238356
Alignment:
Q  375 gttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaagtgatatt 450  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  18238281 gttgaattgtgctatgttgttgttgaattgtgatgagaatcatgtttaattgatgttgttgttgttaagagatatt 18238356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 363 - 450
Target Start/End: Original strand, 52265620 - 52265707
Alignment:
Q  363 tatgctcaattggttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaagtgatatt 450  Q
    ||||||||| | |||||||||||| ||| |||||||||||| |||  ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  52265620 tatgctcaaattgttgaattatgcaatgttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatatt 52265707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 365 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 38764842 - 38764764
Alignment:
Q  365 tgctcaattggttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaag 443  Q
    ||||||| | |||||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  38764842 tgctcaaattgttgaattatgcgatgttgttgttcaattatgatgagaatcatgtttaattgatgttgttgttgttaag 38764764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 377 - 450
Target Start/End: Original strand, 7185970 - 7186043
Alignment:
Q  377 tgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaagtgatatt 450  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  7185970 tgaattgtgctatgttgttgttgaattgtgatgagattcatgtttaattgatgttgttgttgctaagagatatt 7186043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 363 - 447
Target Start/End: Original strand, 13809622 - 13809706
Alignment:
Q  363 tatgctcaattggttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaagtgat 447  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||  ||| ||||| | ||||||||||||||||||||| ||||    
T  13809622 tatgctcaattagttgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgttgttgctaattgat 13809706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 363 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 15044963 - 15044879
Alignment:
Q  363 tatgctcaattggttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaagtgat 447  Q
    ||||||||| | | |||||||||||||| |||||||||||| |||  ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15044963 tatgctcaaattgatgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgat 15044879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 363 - 447
Target Start/End: Original strand, 41166058 - 41166142
Alignment:
Q  363 tatgctcaattggttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaagtgat 447  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||| ||   ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  41166058 tatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggcaagagtcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgat 41166142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 363 - 450
Target Start/End: Original strand, 15013394 - 15013481
Alignment:
Q  363 tatgctcaattggttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaagtgatatt 450  Q
    ||||||||| | |||||||| ||||| | |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||    
T  15013394 tatgctcaaattgttgaattgtgctaggttgttgttgaattgtgatgagaatcatgtttaattgatattgttgttgttaagagatatt 15013481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 375 - 450
Target Start/End: Original strand, 40905058 - 40905132
Alignment:
Q  375 gttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaagtgatatt 450  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  40905058 gttgaattgtgctatgttgttgttgaattgtgatgagaatcatg-ttaattgatgttgttgttgctaagagatatt 40905132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 363 - 450
Target Start/End: Original strand, 41256481 - 41256568
Alignment:
Q  363 tatgctcaattggttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaagtgatatt 450  Q
    ||||||||| | |||||||| ||||| | |||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  41256481 tatgctcaaattgttgaattgtgctaggttgttgttgaattgtgatgagaaccatgtttaattgatgttgttgttgttaagagatatt 41256568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 375 - 450
Target Start/End: Original strand, 41916850 - 41916925
Alignment:
Q  375 gttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaagtgatatt 450  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||    
T  41916850 gttgaattgtgctatgttgttgttgaattgtgatgagaatcatgtttaactgatgttgttgttgttaagagatatt 41916925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 375 - 450
Target Start/End: Original strand, 13590198 - 13590273
Alignment:
Q  375 gttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaagtgatatt 450  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||| || ||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  13590198 gttgaattgtgctatgttgttgttgatttgtgatgagattcatgtttaattgatgttgttgttgttaagagatatt 13590273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 375 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 18276557 - 18276482
Alignment:
Q  375 gttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaagtgatatt 450  Q
    |||||||| ||||||  |||||||||||| ||| |||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18276557 gttgaattgtgctatattgttgttgaattgtgatgagattcatgttcaattgatgttgttgttgcaaagtgatatt 18276482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 375 - 438
Target Start/End: Original strand, 47468472 - 47468535
Alignment:
Q  375 gttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttg 438  Q
    |||||||| || |||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47468472 gttgaattgtgttatgttgttgttgaattgtgatgagaatcatgtttaattgatgttgttgttg 47468535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 363 - 438
Target Start/End: Original strand, 47535177 - 47535252
Alignment:
Q  363 tatgctcaattggttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttg 438  Q
    ||||||||| | | |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  47535177 tatgctcaaattgatgaattatgctatgttgttgttgaattatgataagaatcatgttcaattgacgttgttgttg 47535252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 375 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 54398506 - 54398431
Alignment:
Q  375 gttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaagtgatatt 450  Q
    |||||||| || |||| ||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  54398506 gttgaattgtgttatgttgttgttgatttgtgatgagaatcatgtttaattgatgttgttgttgttaagagatatt 54398431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 379 - 444
Target Start/End: Original strand, 15109477 - 15109542
Alignment:
Q  379 aattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaagt 444  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||  ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15109477 aattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagt 15109542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 375 - 438
Target Start/End: Original strand, 13442800 - 13442863
Alignment:
Q  375 gttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttg 438  Q
    |||||||| || |||| | |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13442800 gttgaattgtgttatgttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaattgatgttgttgttg 13442863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 375 - 450
Target Start/End: Original strand, 50220064 - 50220139
Alignment:
Q  375 gttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaagtgatatt 450  Q
    |||||||| || | || ||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  50220064 gttgaattgtgttgtgttgttgttgatttgtgatgagaatcatgtttaattgatgttgttgttgttaagagatatt 50220139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 394 - 447
Target Start/End: Original strand, 19821919 - 19821972
Alignment:
Q  394 ttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaagtgat 447  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  19821919 ttgttgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgttgttgctatgtgat 19821972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 363 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 27961106 - 27961022
Alignment:
Q  363 tatgctcaattggttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaagtgat 447  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||  |||||||||||| | |  ||| ||||| | ||||||||||||||||| ||||||||    
T  27961106 tatgctaaattggttgaattatgttatattgttgttgaattgttataagattcatgatcaattgatgttgttgttgttaagtgat 27961022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 363 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 16732303 - 16732223
Alignment:
Q  363 tatgctcaattggttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaagt 444  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||| |||  ||  ||||| | ||||||||| |||||||||||||    
T  16732303 tatgctcaattggt-gaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgtcgttgttgctaagt 16732223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 363 - 447
Target Start/End: Original strand, 12837313 - 12837396
Alignment:
Q  363 tatgctcaattggttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaagtgat 447  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||| |||  ||  ||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  12837313 tatgctcaattggt-gaattatgctatgttgttgttaaattgtgataagtttcatggtcaatggatgttgttgttgttaagtgat 12837396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 375 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 14901355 - 14901283
Alignment:
Q  375 gttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaagtgat 447  Q
    ||||||||||| |||| | || ||||||| ||   |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  14901355 gttgaattatgatatgttattattgaattgtggtaagaatcatattcaattgatgttgttgttgctaagtgat 14901283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 363 - 447
Target Start/End: Original strand, 30232609 - 30232692
Alignment:
Q  363 tatgctcaattggttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaagtgat 447  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||| |||  ||  ||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  30232609 tatgctcaattggt-gaattatgctatgttgttgttaaattgtgataagtttcatgatcaatggatgttgttgttgttaagtgat 30232692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 363 - 438
Target Start/End: Original strand, 21959576 - 21959650
Alignment:
Q  363 tatgctcaattggttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttg 438  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||| |||  ||  ||||| | |||||||||||||||||    
T  21959576 tatgctcaattggt-gaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttg 21959650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 365 - 447
Target Start/End: Original strand, 18494442 - 18494524
Alignment:
Q  365 tgctcaattggttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaagtgat 447  Q
    |||||||||||||| || |||||||| |||||||||||| ||   ||| ||||| | ||||| || |||||||| ||||||||    
T  18494442 tgctcaattggttggatgatgctatgttgttgttgaattgtgttaagattcatgatcaattgttgctgttgttgttaagtgat 18494524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 395 - 447
Target Start/End: Original strand, 37957169 - 37957221
Alignment:
Q  395 tgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaagtgat 447  Q
    ||||||||||||  |||| ||||||| ||||||||| |||| |||||||||||    
T  37957169 tgttgaattatgctgagattcatgttcaattgatgtggttgctgctaagtgat 37957221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 21)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 363 - 450
Target Start/End: Original strand, 22143473 - 22143560
Alignment:
Q  363 tatgctcaattggttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaagtgatatt 450  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||| | |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22143473 tatgctcaaatggttgaattatgctatgttgttgttgaattatgatgagaaccatgctcaattgatgttgttgctgctaagtgatatt 22143560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 375 - 450
Target Start/End: Original strand, 37233984 - 37234059
Alignment:
Q  375 gttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaagtgatatt 450  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||| ||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  37233984 gttgaattatgctatgttgtggttgaattgtgatgagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatatt 37234059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 375 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 52400754 - 52400689
Alignment:
Q  375 gttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgct 440  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  52400754 gttgaattgtgctatgttgttgttgaattatgatgagaatcatgtttaattgacgttgttgttgct 52400689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 363 - 447
Target Start/End: Original strand, 51627776 - 51627860
Alignment:
Q  363 tatgctcaattggttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaagtgat 447  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||  ||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  51627776 tatgttcaattggttgaattatgatatggtgttgttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgat 51627860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 375 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 17609051 - 17608976
Alignment:
Q  375 gttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaagtgatatt 450  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  17609051 gttgaattgtgctatgttgttgttgaattatgatgagattcatgttcaattgttgttgttgttgttaagtgatatt 17608976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 363 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 21195149 - 21195062
Alignment:
Q  363 tatgctcaattggttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaagtgatatt 450  Q
    ||||||||| | |||||||| ||||| | |||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||    
T  21195149 tatgctcaaattgttgaattgtgctaggttgttgttgaattgtgatgagaatcatgtttaattaatgttgttgttgttaagagatatt 21195062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 387 - 443
Target Start/End: Original strand, 8538046 - 8538102
Alignment:
Q  387 tatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaag 443  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8538046 tatgttgttgttgaattatgatgagaatcatgtttaattgatgttgttgttgttaag 8538102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 387 - 443
Target Start/End: Original strand, 8603285 - 8603341
Alignment:
Q  387 tatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaag 443  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8603285 tatgttgttgttgaattatgatgagaatcatgtttaattgatgttgttgttgttaag 8603341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 375 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 33397475 - 33397400
Alignment:
Q  375 gttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaagtgatatt 450  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||    
T  33397475 gttgaattgtgctatgttgttgttgatttgtgatgagaatcatgtttaattgatcttgttgttgttaagagatatt 33397400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 375 - 447
Target Start/End: Original strand, 13376964 - 13377036
Alignment:
Q  375 gttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaagtgat 447  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||  || | ||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  13376964 gttgaattatgttatgttgttgttgaattatggtgaaagtcatgctcaattgatgttgttgttgctaagtgat 13377036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 363 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 20177310 - 20177226
Alignment:
Q  363 tatgctcaattggttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaagtgat 447  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||| ||   | | ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20177310 tatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaaaagtcaagttcaattgatgttgttgttgctaagtgat 20177226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 376 - 440
Target Start/End: Original strand, 49997406 - 49997470
Alignment:
Q  376 ttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgct 440  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  49997406 ttgaattgtgctatgttgttgttgaattaaggtgagaatcatgtttaactgatgttgttgttgct 49997470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 375 - 450
Target Start/End: Original strand, 5768293 - 5768368
Alignment:
Q  375 gttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaagtgatatt 450  Q
    |||||||| || |||| ||||||| | || ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  5768293 gttgaattgtgttatgttgttgttaatttgtgatgagaatcatgtttaattgatgttgttgttgttaagagatatt 5768368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 375 - 450
Target Start/End: Original strand, 40436393 - 40436468
Alignment:
Q  375 gttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaagtgatatt 450  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||| || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||  |||| ||||||    
T  40436393 gttgaattgtgctatgttgttgttgatttgtgatgagaattatgtttaattgatgttgttgtttttaagagatatt 40436468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 375 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 25093982 - 25093920
Alignment:
Q  375 gttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgtt 437  Q
    |||||||| || |||| ||||||||| || ||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25093982 gttgaattgtgttatgttgttgttgatttgtgatgagattcatgtttaattgatgttgttgtt 25093920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 361 - 438
Target Start/End: Original strand, 35522430 - 35522506
Alignment:
Q  361 tgtatgctcaattggttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttg 438  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||| |||  ||  ||||| | |||||||||||||||||    
T  35522430 tgtatgctcaattggt-gaattatgctttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttg 35522506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 410 - 447
Target Start/End: Original strand, 41229098 - 41229135
Alignment:
Q  410 agaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaagtgat 447  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  41229098 agaatcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgat 41229135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 379 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 16646031 - 16645975
Alignment:
Q  379 aattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttg 435  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||  ||| ||||||| ||||||||||||||    
T  16646031 aattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattgatgttgttg 16645975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 363 - 447
Target Start/End: Original strand, 27329868 - 27329951
Alignment:
Q  363 tatgctcaattggttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaagtgat 447  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||| |||  ||  ||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  27329868 tatgctcaattggt-gaattatgctatgttgttgttaaattgtgataagtttcatgatcaatggatgttgttgttgttaagtgat 27329951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 379 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 16656757 - 16656699
Alignment:
Q  379 aattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgtt 437  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||  ||| ||||||| |||||| |||||||||    
T  16656757 aattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattgaagttgttgtt 16656699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 395 - 447
Target Start/End: Original strand, 36356437 - 36356489
Alignment:
Q  395 tgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaagtgat 447  Q
    |||||| |||||  |||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  36356437 tgttgatttatgctgagattcatgttcaattgatgttgttgtttctaagtgat 36356489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 363 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 8145 - 8061
Alignment:
Q  363 tatgctcaattggttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaagtgat 447  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  8145 tatgctcaattgggtgaattatgctatgttgttgtggaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgttgttgctatgtgat 8061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 25)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 363 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 18399073 - 18398989
Alignment:
Q  363 tatgctcaattggttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaagtgat 447  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18399073 tatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtgatgagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgat 18398989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 375 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 25651360 - 25651285
Alignment:
Q  375 gttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaagtgatatt 450  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  25651360 gttgaattgtgctatgttgttgttgaattatgatgagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatatt 25651285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 363 - 447
Target Start/End: Original strand, 15079820 - 15079904
Alignment:
Q  363 tatgctcaattggttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaagtgat 447  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| ||||| ||||||||||||    
T  15079820 tatgctcaattgggtgaattatgctatattgttgttgaattatgatgagaaccatgttcaattgatattgttattgctaagtgat 15079904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 363 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 33324828 - 33324744
Alignment:
Q  363 tatgctcaattggttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaagtgat 447  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||  ||| |||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  33324828 tatgctcaattggatgaattatgctatattgtggttgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgttattgctaagtgat 33324744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 374 - 450
Target Start/End: Original strand, 33538492 - 33538568
Alignment:
Q  374 ggttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaagtgatatt 450  Q
    ||||||||| ||||||| | |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  33538492 ggttgaattgtgctatgttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaattgatgttgttattgctaagtgatatt 33538568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 363 - 447
Target Start/End: Original strand, 35136124 - 35136208
Alignment:
Q  363 tatgctcaattggttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaagtgat 447  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||  ||| |||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  35136124 tatgctcaattggatgaattatgctatattgtggttgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgttattgctaagtgat 35136208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 363 - 450
Target Start/End: Original strand, 22361877 - 22361964
Alignment:
Q  363 tatgctcaattggttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaagtgatatt 450  Q
    ||||||||| | | |||||||||||||| |||||||||||| ||| || | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22361877 tatgctcaaattgatgaattatgctatgttgttgttgaattgtgatgaaattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatatt 22361964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 375 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 34966990 - 34966915
Alignment:
Q  375 gttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaagtgatatt 450  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  34966990 gttgaattatgctatgttgttgttgatttgtgatgagaatcatgtttaattgatgttgttgttgttaagagatatt 34966915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 377 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 19854276 - 19854203
Alignment:
Q  377 tgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaagtgatatt 450  Q
    |||||| ||||||| | |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19854276 tgaattgtgctatgttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaagagatatt 19854203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 363 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 21623303 - 21623219
Alignment:
Q  363 tatgctcaattggttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaagtgat 447  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||| ||   |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  21623303 tatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagaatcatgttctattgatgttgttgttgctaagtgat 21623219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 375 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 29605573 - 29605505
Alignment:
Q  375 gttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaag 443  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29605573 gttgaattgtgctatgttgttgttgaattatgatgtgaatcatgcttaattgatgttgttgttgctaag 29605505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 365 - 447
Target Start/End: Original strand, 35009569 - 35009650
Alignment:
Q  365 tgctcaattggttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaagtgat 447  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||    
T  35009569 tgctcaattggt-gaattttgctatgttgttgttgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgttgttgttaattgat 35009650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 363 - 436
Target Start/End: Original strand, 16887904 - 16887977
Alignment:
Q  363 tatgctcaattggttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgt 436  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||    
T  16887904 tatgctcaattgggtgaattatgttatgttgttgttgaattatgatgagaaccatgttcaattgattttgttgt 16887977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 375 - 447
Target Start/End: Original strand, 18381807 - 18381879
Alignment:
Q  375 gttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaagtgat 447  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||| |||  ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18381807 gttgaattatgctttgttgttgttgaattgtgataagagtcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgat 18381879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 363 - 447
Target Start/End: Original strand, 25367349 - 25367433
Alignment:
Q  363 tatgctcaattggttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaagtgat 447  Q
    ||||||||| | |||||||| || |||| |||||||||||| |||  ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  25367349 tatgctcaaattgttgaattgtgttatgttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgat 25367433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 375 - 438
Target Start/End: Original strand, 17083321 - 17083384
Alignment:
Q  375 gttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttg 438  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17083321 gttgaattgtgctatgttgttgttgaattgtgatgagattcatgtttaattgatgttgttgttg 17083384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 375 - 438
Target Start/End: Original strand, 18629732 - 18629795
Alignment:
Q  375 gttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttg 438  Q
    |||||||| ||||||| | |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18629732 gttgaattgtgctatgttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaattgatgttgttgttg 18629795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 375 - 450
Target Start/End: Original strand, 29160427 - 29160502
Alignment:
Q  375 gttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaagtgatatt 450  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||| ||  || |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  29160427 gttgaattgtgctatgttgttgttgatttgcgatgagaatcatgtttaattgatgttgttgttgttaagagatatt 29160502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 375 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 32352170 - 32352107
Alignment:
Q  375 gttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttg 438  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32352170 gttgaattatgttatgttgttgttgatttgtgatgagaatcatgtttaattgatgttgttgttg 32352107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 365 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 22848148 - 22848078
Alignment:
Q  365 tgctcaattggttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttg 435  Q
    ||||||| | |||||||| ||||||| |||||||||||||||| | |||| ||| ||||||||||||||||    
T  22848148 tgctcaaattgttgaattgtgctatgttgttgttgaattatgatgggaataatgcttaattgatgttgttg 22848078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 387 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 25919724 - 25919670
Alignment:
Q  387 tatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgcta 441  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  25919724 tatgttgttgttgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgttgttgcta 25919670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 375 - 442
Target Start/End: Original strand, 17557141 - 17557207
Alignment:
Q  375 gttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaa 442  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||| |||  | |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17557141 gttgaatt-tgctatgttgttgttgaattgtgattataatcatatttaattgatgttgttgttgctaa 17557207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 375 - 450
Target Start/End: Original strand, 22462221 - 22462295
Alignment:
Q  375 gttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaagtgatatt 450  Q
    |||||||| ||||||||||||||||  || ||| |||| |||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||    
T  22462221 gttgaattgtgctatgatgttgttgg-ttgtgatgagattcatgtttaaatgatgttgttgttgttaagagatatt 22462295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 365 - 447
Target Start/End: Original strand, 28195207 - 28195290
Alignment:
Q  365 tgctcaattggttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagaga-atcatgtttaattgatgttgttgttgctaagtgat 447  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||  | ||| | ||||| ||| ||||||||||||||||    
T  28195207 tgctcaattagttgaattatgccatgatgttgttgaattgtgatgagattttatgatcaattgttgtggttgttgctaagtgat 28195290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 375 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 23222874 - 23222811
Alignment:
Q  375 gttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttg 438  Q
    |||||||| | ||||| ||||||| | || ||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23222874 gttgaattgtactatgttgttgtttatttgtgatgagattcatgtttaattgatgttgttgttg 23222811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0253 (Bit Score: 56; Significance: 5e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0253
Description:

Target: scaffold0253; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 375 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 7525 - 7450
Alignment:
Q  375 gttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaagtgatatt 450  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  7525 gttgaattgtgctatgctgttgttgaattatgatgagaatcatgtttaattgatgttggtgttgctaagagatatt 7450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0253; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 375 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 16950 - 16875
Alignment:
Q  375 gttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaagtgatatt 450  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  16950 gttgaattgtgctatgctgttgttgaattatgatgagaatcatgtttaattgatgttggtgttgctaagagatatt 16875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 56; Significance: 5e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 375 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 6667 - 6592
Alignment:
Q  375 gttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaagtgatatt 450  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  6667 gttgaattgtgctatgttgttgttgaattatgatgagaatcatgtttaattgatgatgttgttgctaagagatatt 6592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 56; Significance: 5e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 363 - 450
Target Start/End: Original strand, 104735 - 104821
Alignment:
Q  363 tatgctcaattggttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaagtgatatt 450  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  104735 tatgctcaaatggttgaattatgttatgttgttgttgaattatgatgataaccatg-ttaattgatgttgttgttgctaagtgatatt 104821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 56; Significance: 5e-23; HSPs: 40)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 363 - 450
Target Start/End: Original strand, 9590866 - 9590953
Alignment:
Q  363 tatgctcaattggttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaagtgatatt 450  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| || ||| ||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9590866 tatgctcaatttgttgaattatgctatgttgttgttgagttctgatgagaaccatgttcaattgatgttgttgttgttaagtgatatt 9590953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 363 - 450
Target Start/End: Original strand, 11061118 - 11061205
Alignment:
Q  363 tatgctcaattggttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaagtgatatt 450  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||  | | ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11061118 tatgctcaattggttgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataatagtcatgttcaattgatgttgttggtgctaagtgatatt 11061205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 363 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 14295573 - 14295489
Alignment:
Q  363 tatgctcaattggttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaagtgat 447  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||  ||| ||||| | |||||||||||||||| |||||||||    
T  14295573 tatgctcaattggttgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgttgtttctaagtgat 14295489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 363 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 14301200 - 14301116
Alignment:
Q  363 tatgctcaattggttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaagtgat 447  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||  ||| ||||| | |||||||||||||||| |||||||||    
T  14301200 tatgctcaattggttgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgttgtttctaagtgat 14301116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 363 - 447
Target Start/End: Original strand, 14528124 - 14528208
Alignment:
Q  363 tatgctcaattggttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaagtgat 447  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||  ||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  14528124 tatgctcaattggttgaatcatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgat 14528208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 363 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 17139643 - 17139559
Alignment:
Q  363 tatgctcaattggttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaagtgat 447  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||  ||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  17139643 tatgctcaattggttgaatcatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgat 17139559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 365 - 450
Target Start/End: Original strand, 14814879 - 14814964
Alignment:
Q  365 tgctcaattggttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaagtgatatt 450  Q
    ||||||| | |||||||| ||||||| |||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  14814879 tgctcaaattgttgaattgtgctatgttgttgttgaattgtgataagaatcatgtttaattgatgttgttgttgttaagagatatt 14814964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 363 - 447
Target Start/End: Original strand, 11329073 - 11329157
Alignment:
Q  363 tatgctcaattggttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaagtgat 447  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||| |||  ||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  11329073 tatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgat 11329157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 375 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 12953087 - 12953012
Alignment:
Q  375 gttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaagtgatatt 450  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||| ||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12953087 gttgaattgtgctatgttgttgttgaattgtgatgagatttatgtttaattgatgttgttgttgctaagagatatt 12953012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 377 - 443
Target Start/End: Original strand, 33369034 - 33369100
Alignment:
Q  377 tgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaag 443  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  33369034 tgaattgtgctatgttgttgttgaattatgatgagaatcatgtttaattgatgtttttgttgttaag 33369100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 376 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 34560021 - 34559947
Alignment:
Q  376 ttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaagtgatatt 450  Q
    |||||||||| ||||  ||||||||||||||| |||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  34560021 ttgaattatgttatgtagttgttgaattatgatgagattcatgttcgattgatgttgttgttgctaagtgatatt 34559947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 363 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 14080644 - 14080563
Alignment:
Q  363 tatgctcaattggttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaagt 444  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||  |||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| |||| ||||    
T  14080644 tatgctcaattgggtgaattgtgctatattgttgttgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgttattgcgaagt 14080563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 375 - 443
Target Start/End: Original strand, 4162329 - 4162397
Alignment:
Q  375 gttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaag 443  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4162329 gttgaattgtgttatgttgttgttgaatgatgacgtgaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaag 4162397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 375 - 443
Target Start/End: Original strand, 6228749 - 6228817
Alignment:
Q  375 gttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaag 443  Q
    |||||||| ||||||| |||||| ||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6228749 gttgaattgtgctatgttgttgtcgaattatgatgtggatcatgtttaattgatgttgttgttgctaag 6228817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 363 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 16880258 - 16880174
Alignment:
Q  363 tatgctcaattggttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaagtgat 447  Q
    ||||||||||| ||  |||||||||||| |||||||||||| |||  ||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  16880258 tatgctcaatttgtgaaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattgatgttattgttgctaagtgat 16880174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 363 - 450
Target Start/End: Original strand, 3576550 - 3576637
Alignment:
Q  363 tatgctcaattggttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaagtgatatt 450  Q
    ||||||||| | | || ||||||||||| |||||||||||| |||  ||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  3576550 tatgctcaaattgatggattatgctatgttgttgttgaattgtgataagagtcatgtttgattgatgttgttgttgctaagtaatatt 3576637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 375 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 17204823 - 17204748
Alignment:
Q  375 gttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaagtgatatt 450  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||| |||   |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  17204823 gttgaattatgctatattgttgttgaattgtgataggaatcatgtttaatggatgttgttgttgctaagtaatatt 17204748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 363 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 39656661 - 39656574
Alignment:
Q  363 tatgctcaattggttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaagtgatatt 450  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||| |    ||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  39656661 tatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgttgtaagattcatgttcaattgatgtggttgttgctaagtgatatt 39656574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 375 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 41661688 - 41661625
Alignment:
Q  375 gttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttg 438  Q
    |||||||| ||||||| | |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41661688 gttgaattgtgctatgttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaattgatgttgttgttg 41661625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 363 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 17191676 - 17191595
Alignment:
Q  363 tatgctcaattggttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaagt 444  Q
    ||||||||| | | ||||||||| |||| ||||| |||||| |||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17191676 tatgctcaaattgatgaattatgttatgttgttgctgaattgtgataagaatcatgtttaattgatgttgctgttgctaagt 17191595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 363 - 447
Target Start/End: Original strand, 12488838 - 12488922
Alignment:
Q  363 tatgctcaattggttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaagtgat 447  Q
    ||||||||| | | ||||||||| |||| |||||||||||| |||  ||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  12488838 tatgctcaaattgatgaattatgttatgttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgat 12488922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 363 - 447
Target Start/End: Original strand, 12560348 - 12560432
Alignment:
Q  363 tatgctcaattggttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaagtgat 447  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||   || ||||| | ||| ||||||||||||||||||||||    
T  12560348 tatgcccaactggttgaattatgctatgttgttgttgaattgtgatatgattcatgatcaatggatgttgttgttgctaagtgat 12560432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 363 - 447
Target Start/End: Original strand, 14059325 - 14059409
Alignment:
Q  363 tatgctcaattggttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaagtgat 447  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||| |||  | | ||||||| |||||||||| ||||||||| |||||    
T  14059325 tatgctcaatttgatgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataatattcatgttcaattgatgttattgttgctatgtgat 14059409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 375 - 450
Target Start/End: Original strand, 31412457 - 31412532
Alignment:
Q  375 gttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaagtgatatt 450  Q
    |||||||| || |||| |||||||||||| ||| |||||| | ||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  31412457 gttgaattgtgatatgttgttgttgaattgtgatgagaattaggtttaattgatgttgttgttgttaagagatatt 31412532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 375 - 438
Target Start/End: Original strand, 43427640 - 43427703
Alignment:
Q  375 gttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttg 438  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||| || ||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  43427640 gttgaattgtgctatgttgttgttgagttgtgatgagaatcatgattaattgatgttgttgttg 43427703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 387 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 50313298 - 50313235
Alignment:
Q  387 tatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaagtgatatt 450  Q
    |||| |||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  50313298 tatgttgttgttgaattgtgatgggaatcatgtttaattgatgttgttgttgttaagagatatt 50313235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 375 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 11638480 - 11638418
Alignment:
Q  375 gttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgtt 437  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||| || ||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11638480 gttgaattgtgctatgttgttgttgatttgtgatgagattcatgtttaattgatgttgttgtt 11638418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 377 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 1990924 - 1990851
Alignment:
Q  377 tgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaagtgatatt 450  Q
    |||||| || |||| |||||||||| | ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||    
T  1990924 tgaattgtgttatgttgttgttgaactgtgatgagaatcatgtttaaatgatgttgttgttgttaagagatatt 1990851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 395 - 447
Target Start/End: Original strand, 38811152 - 38811204
Alignment:
Q  395 tgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaagtgat 447  Q
    ||||||||||||  |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  38811152 tgttgaattatgctgagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgat 38811204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 363 - 447
Target Start/End: Original strand, 55440961 - 55441045
Alignment:
Q  363 tatgctcaattggttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaagtgat 447  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||| ||| |||||||| |||  ||  ||||| | |||||||||||||| |||||||||||    
T  55440961 tatgctcaactggttgaattatactatgttgtggttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgatgctaagtgat 55441045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 363 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 54424146 - 54424064
Alignment:
Q  363 tatgctcaattggttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaagtga 446  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||| |||  ||  ||||| | ||||||||||||| |||||||||||    
T  54424146 tatgctcaattggt-gaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttattgctaagtga 54424064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 377 - 438
Target Start/End: Original strand, 38375804 - 38375865
Alignment:
Q  377 tgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttg 438  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| | ||  |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  38375804 tgaattgtgctatgttgttgttgaaatgtggtgagattcatgtttaattgatgttgttgttg 38375865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 363 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 17100787 - 17100704
Alignment:
Q  363 tatgctcaattggttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaagtgat 447  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||| |||  ||  ||||| | |||||||||| |||||| ||||||||    
T  17100787 tatgctcaattggt-gaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttattgttgttaagtgat 17100704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 363 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 17101472 - 17101389
Alignment:
Q  363 tatgctcaattggttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaagtgat 447  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||| |||  ||  ||||| | |||||||||| |||||| ||||||||    
T  17101472 tatgctcaattggt-gaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttattgttgttaagtgat 17101389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 375 - 447
Target Start/End: Original strand, 47784871 - 47784943
Alignment:
Q  375 gttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaagtgat 447  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |    |||| |||||| | ||||||||||||||| ||||||||    
T  47784871 gttgaattatgctatgttgttgttgaattgtagtaagaaacatgttcagttgatgttgttgttgttaagtgat 47784943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 375 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 10913008 - 10912945
Alignment:
Q  375 gttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttg 438  Q
    |||||||| ||||||| ||| |||||| | ||  |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10913008 gttgaattgtgctatgttgtggttgaaatgtggtgagattcatgtttaattgatgttgttgttg 10912945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 363 - 438
Target Start/End: Original strand, 12349652 - 12349726
Alignment:
Q  363 tatgctcaattggttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttg 438  Q
    |||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||| |||  ||  ||||| | |||||||||||||||||    
T  12349652 tatgctcaattggt-gaattatgctttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttg 12349726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 392 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 15876174 - 15876119
Alignment:
Q  392 tgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaagtgat 447  Q
    |||||||||||| |||  ||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  15876174 tgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattgatgttgttgttggtaagtgat 15876119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 363 - 444
Target Start/End: Original strand, 17523002 - 17523082
Alignment:
Q  363 tatgctcaattggttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaagt 444  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| | ||| |||||| |||  ||  |||||   |||||||||||||||||||||||    
T  17523002 tatgctcaattggt-gaattatgctatgttattgatgaattgtgataagtttcatgaccaattgatgttgttgttgctaagt 17523082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 363 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 38168048 - 38167965
Alignment:
Q  363 tatgctcaattggttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaagtgat 447  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||| | |  ||  ||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  38168048 tatgctcaattggt-gaattatgctatgttgttgatgaattgtaataagtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgat 38167965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0095 (Bit Score: 53; Significance: 3e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0095
Description:

Target: scaffold0095; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 363 - 447
Target Start/End: Original strand, 33840 - 33924
Alignment:
Q  363 tatgctcaattggttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaagtgat 447  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||  ||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  33840 tatgctaaattggttgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgat 33924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447 (Bit Score: 52; Significance: 1e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0447
Description:

Target: scaffold0447; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 363 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 4698 - 4611
Alignment:
Q  363 tatgctcaattggttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaagtgatatt 450  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||  | | |||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4698 tatgctcaattggttgaattatgctatgttgttgtttaattgtgataatattcattttcaattgatgttgttgttgctaagtgatatt 4611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 363 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 9312 - 9225
Alignment:
Q  363 tatgctcaattggttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaagtgatatt 450  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||  | | |||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  9312 tatgctcaattggttgaattatgctatgttgttgtttaattgtgataatattcattttcaattgatgttgttgttgctaagtgatatt 9225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 52; Significance: 1e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 363 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 6075 - 5988
Alignment:
Q  363 tatgctcaattggttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaagtgatatt 450  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||| |||  | | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6075 tatgctcaattggttaaattatgctatgtggttgttgaattgtgataatattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatatt 5988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 52; Significance: 1e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 375 - 450
Target Start/End: Original strand, 76971 - 77046
Alignment:
Q  375 gttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaagtgatatt 450  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||  |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  76971 gttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtgagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatatt 77046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 52; Significance: 1e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 375 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 69580 - 69505
Alignment:
Q  375 gttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaagtgatatt 450  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||| ||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  69580 gttgaattgtgctatgttgttgttgaattgtgatgagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatatt 69505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0521 (Bit Score: 49; Significance: 7e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0521
Description:

Target: scaffold0521; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 363 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 11229 - 11145
Alignment:
Q  363 tatgctcaattggttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaagtgat 447  Q
    ||||||||| | |||||| ||||||||  |||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  11229 tatgctcaaatagttgaaatatgctatcttgttgttgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgttgttgctatgtgat 11145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0480 (Bit Score: 49; Significance: 7e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0480
Description:

Target: scaffold0480; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 363 - 447
Target Start/End: Original strand, 8994 - 9078
Alignment:
Q  363 tatgctcaattggttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaagtgat 447  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||  ||  ||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  8994 tatgctcaattggttgaattatgctatgttgttgttaaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgat 9078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 49; Significance: 7e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 363 - 447
Target Start/End: Original strand, 2428 - 2512
Alignment:
Q  363 tatgctcaattggttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaagtgat 447  Q
    ||||||||| | | |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  2428 tatgctcaaattgatgaattatgctatgttgttgttgaattatgataagactcatgttcaattgatgttgttgttcctaagtgat 2512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 49; Significance: 7e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 363 - 447
Target Start/End: Original strand, 70418 - 70502
Alignment:
Q  363 tatgctcaattggttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaagtgat 447  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||  |||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  70418 tatgctcaattgggtgaattatgttatattgttgttgaattatgatgaggaccatgttcaattgatgttgttattgctaagtgat 70502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 49; Significance: 7e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 363 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 159434 - 159350
Alignment:
Q  363 tatgctcaattggttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaagtgat 447  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||  ||  ||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  159434 tatgctcaattggttgaattatgctatgttgatgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgat 159350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 363 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 85466 - 85386
Alignment:
Q  363 tatgctcaattggttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaagt 444  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||| | ||||| |||||| |||  ||  ||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  85466 tatgcttaattggt-gaattatgctaggttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagt 85386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0670 (Bit Score: 48; Significance: 3e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0670
Description:

Target: scaffold0670; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 375 - 450
Target Start/End: Original strand, 7799 - 7874
Alignment:
Q  375 gttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaagtgatatt 450  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  7799 gttgaattgtgctatgttgttgttgatttgtgatgagaatcatgtttaattgatgttgttgttgttaagagatatt 7874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 48; Significance: 3e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 375 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 30087 - 30012
Alignment:
Q  375 gttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaagtgatatt 450  Q
    |||||||| ||||||| | |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  30087 gttgaattgtgctatgtttttgttgaattgtgatgagaatcatgtttaattgatgttgttgttgttaagcgatatt 30012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 375 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 22122 - 22047
Alignment:
Q  375 gttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaagtgatatt 450  Q
    ||||||||  |||||| |||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  22122 gttgaattgggctatgttgttgttgaattgtgatgagattcatgtttaattgatgttgttgttgttaagagatatt 22047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 48; Significance: 3e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 375 - 450
Target Start/End: Original strand, 197377 - 197452
Alignment:
Q  375 gttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaagtgatatt 450  Q
    |||||||| | ||||| |||||||||||| ||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  197377 gttgaattgtcctatgttgttgttgaattgtgatgagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatatt 197452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0970 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0970
Description:

Target: scaffold0970; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 381 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 2572 - 2506
Alignment:
Q  381 ttatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaagtgat 447  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2572 ttatgatatgttgttgttgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgat 2506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 364 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 11821 - 11739
Alignment:
Q  364 atgctcaattggttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaagtga 446  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||  ||  ||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  11821 atgctcaattggttgaattatgctatgttgttgtagaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtga 11739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 46; Significance: 5e-17; HSPs: 3)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 377 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 85654 - 85581
Alignment:
Q  377 tgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaagtgatatt 450  Q
    |||||| || |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||    
T  85654 tgaattgtgttatgttgttgttgaattatgatgagaatcatgtttaagtgatattgttgttgctaagagatatt 85581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 379 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 53465 - 53398
Alignment:
Q  379 aattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaagtga 446  Q
    |||||||||||  ||||| |||||| ||| |||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  53465 aattatgctattttgttgatgaattgtgatgagattcatgttcaatggatgttgttgttgctaagtga 53398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 363 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 146735 - 146652
Alignment:
Q  363 tatgctcaattggttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaagtgat 447  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| | ||||| |||||| |||  ||  ||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  146735 tatgctcaattggt-gaattatgctaggttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgat 146652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 46; Significance: 5e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 375 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 31143 - 31070
Alignment:
Q  375 gttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaagtgata 448  Q
    |||||||| ||||||| | |||||||||| ||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  31143 gttgaattgtgctatgttcttgttgaattgtgatgagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgata 31070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0389 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0389
Description:

Target: scaffold0389; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 363 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 10797 - 10713
Alignment:
Q  363 tatgctcaattggttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaagtgat 447  Q
    |||||| ||||||||| |||||| || | |||||| ||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  10797 tatgcttaattggttggattatgatacgttgttgtcgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgtttttgctaagtgat 10713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0383
Description:

Target: scaffold0383; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 363 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 7307 - 7219
Alignment:
Q  363 tatgctcaattggttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaatt-gatgttgttgttgctaagtgatatt 450  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||  | | |||| || |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7307 tatgctcaattggttgaattatgctatgttgttgtttaattgtgataatattcattttcaattggatgttgttgttgctaagtgatatt 7219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0598 (Bit Score: 44; Significance: 7e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0598
Description:

Target: scaffold0598; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 375 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 3374 - 3300
Alignment:
Q  375 gttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaagtgatatt 450  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  3374 gttgaattgtgctatgttgttgttgaattgtgatga-aatcatgtttaattgatgttgttgttgttaagagatatt 3300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0151 (Bit Score: 44; Significance: 7e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0151
Description:

Target: scaffold0151; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 363 - 450
Target Start/End: Original strand, 22534 - 22621
Alignment:
Q  363 tatgctcaattggttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaagtgatatt 450  Q
    ||||||||| |  ||||||| ||||||| ||||||||||||  || | |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  22534 tatgctcaaattattgaattgtgctatgttgttgttgaattgagatgtgaatcatgtttaattgatgttgttgttgttaattgatatt 22621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0148 (Bit Score: 44; Significance: 7e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0148
Description:

Target: scaffold0148; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 375 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 37681 - 37606
Alignment:
Q  375 gttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaagtgatatt 450  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  37681 gttgaattgtgctatgttattgttgaattgagacgagaatcatgtttaattgatgttgttgttgttaagagatatt 37606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 44; Significance: 7e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 368 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 41778 - 41700
Alignment:
Q  368 tcaattggttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaagtgat 447  Q
    ||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||    
T  41778 tcaattggt-gaattttgctatgttgttgttgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgttgttgttaaatgat 41700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 44; Significance: 7e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 375 - 450
Target Start/End: Original strand, 97322 - 97397
Alignment:
Q  375 gttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaagtgatatt 450  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| ||||||| ||||||| |||||||| |||| |||||||    
T  97322 gttgaattatgctatgttggtgttgaattatgatgagattcatgttcaattgatattgttgttactaattgatatt 97397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 363 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 70748 - 70676
Alignment:
Q  363 tatgctcaattggttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttg 435  Q
    |||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||| |||  ||  ||||| | ||||||||||||||    
T  70748 tatgcttaattggttgaattatgctttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttg 70676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 44; Significance: 7e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 375 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 27620 - 27545
Alignment:
Q  375 gttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaagtgatatt 450  Q
    |||||||| ||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  27620 gttgaattgtgctatattgttgttgaattgtgatgagaatcatgtttaattgatgatgttgttgttaagagatatt 27545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 375 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 86480 - 86405
Alignment:
Q  375 gttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaagtgatatt 450  Q
    |||||||| ||||||| | | ||| |||| ||| || |||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||    
T  86480 gttgaattgtgctatgttatagttcaattgtgatgataatcatgtttaattgatgtttttgttgttaagagatatt 86405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1272 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold1272
Description:

Target: scaffold1272; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 365 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 442 - 360
Alignment:
Q  365 tgctcaattggttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaagtgat 447  Q
    ||||||| | |||||||||||||||| | |||||||||| ||   ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  442 tgctcaaattgttgaattatgctatgttattgttgaattgtggtaagagtcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgat 360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 377 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 13628 - 13558
Alignment:
Q  377 tgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaagtgat 447  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||    
T  13628 tgaattttgctatgttgttgttgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgttgttgttaattgat 13558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0554 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0554
Description:

Target: scaffold0554; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 363 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 2050 - 1970
Alignment:
Q  363 tatgctcaattggttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaagt 444  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || | |  ||| ||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  2050 tatgctcaattggttgaattatgctatg-tgttgttgatttgttataagattcatgatcaattgatgttgttgttgctaagt 1970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 375 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 4728 - 4660
Alignment:
Q  375 gttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaag 443  Q
    |||||||| || |||| |||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4728 gttgaattgtgttatgttgttgttgaattgtgatgggaatcatgtttaattgatgttgttgttgttaag 4660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0150
Description:

Target: scaffold0150; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 363 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 28671 - 28587
Alignment:
Q  363 tatgctcaattggttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaagtgat 447  Q
    ||||||||| | ||||||||||| |||| |||||||||||| |    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  28671 tatgctcaaattgttgaattatggtatgttgttgttgaattgtagtaagaattatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgat 28587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0092 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0092
Description:

Target: scaffold0092; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 363 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 3454 - 3370
Alignment:
Q  363 tatgctcaattggttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaagtgat 447  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| ||| |||||||| |||  ||| ||||| | ||||||||||| ||||||||||||||    
T  3454 tatgctcaattggtccaattatgctatgttgtagttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgatgttgctaagtgat 3370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000004; HSPs: 4)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 363 - 447
Target Start/End: Original strand, 103034 - 103118
Alignment:
Q  363 tatgctcaattggttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaagtgat 447  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||  | | ||||||| |||||||||| ||||| |||||||||    
T  103034 tatgctaaatttgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataacattcatgttcaattgatgttattgtttctaagtgat 103118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 363 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 109725 - 109641
Alignment:
Q  363 tatgctcaattggttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaagtgat 447  Q
    ||||||||| | |||||||| ||||||| |||||||||||| |||  ||| ||||| | | ||||||||||||||||||||||||    
T  109725 tatgctcaaattgttgaattttgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgatcagttgatgttgttgttgctaagtgat 109641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 375 - 438
Target Start/End: Original strand, 68082 - 68145
Alignment:
Q  375 gttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttg 438  Q
    |||||||| || |||| |||||||||| | ||  |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  68082 gttgaattgtgttatgttgttgttgaaatgtggtgagattcatgtttaattgatgttgttgttg 68145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 395 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 131939 - 131891
Alignment:
Q  395 tgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaag 443  Q
    ||||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||    
T  131939 tgttgaattgtgatgagaatcatgcttaattgttgttgttgttgttaag 131891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0456
Description:

Target: scaffold0456; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 363 - 438
Target Start/End: Original strand, 1658 - 1733
Alignment:
Q  363 tatgctcaattggttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttg 438  Q
    |||| |||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||| | |||||| ||||||||||    
T  1658 tatgttcaaatgggtgaattatgctatgttgttgttgaattatgatgagaaccatgctcaattgaagttgttgttg 1733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 363 - 438
Target Start/End: Original strand, 8803 - 8878
Alignment:
Q  363 tatgctcaattggttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttg 438  Q
    |||| |||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||| | |||||| ||||||||||    
T  8803 tatgttcaaatgggtgaattatgctatgttgttgttgaattatgatgagaaccatgctcaattgaagttgttgttg 8878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0406 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0406
Description:

Target: scaffold0406; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 375 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 14159 - 14096
Alignment:
Q  375 gttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttg 438  Q
    |||||||||| ||| | | |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14159 gttgaattatactacgttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaattgatgttgttgttg 14096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 363 - 450
Target Start/End: Original strand, 7137 - 7224
Alignment:
Q  363 tatgctcaattggttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaagtgatatt 450  Q
    ||||||||| | ||| ||||||| |||| |||| ||| ||| |||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7137 tatgctcaaattgtttaattatgttatgttgttattggattgtgataagaatcatgttcaattgatgttgttgctgctaagtgatatt 7224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 391 - 447
Target Start/End: Original strand, 8332 - 8388
Alignment:
Q  391 atgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaagtgat 447  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||    
T  8332 atgttgttgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgttgttgttaattgat 8388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 365 - 436
Target Start/End: Original strand, 51312 - 51382
Alignment:
Q  365 tgctcaattggttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgt 436  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||  |||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  51312 tgctcaattggt-gaattatgttatgtggttgatgaattgtgatgagaatcatgtttaattgatgttgttgt 51382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0367 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0367
Description:

Target: scaffold0367; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 392 - 450
Target Start/End: Original strand, 17462 - 17520
Alignment:
Q  392 tgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaagtgatatt 450  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||    
T  17462 tgttgttgaattgtgatgagaatcatgtttaattgatgttgttgtggttaagagatatt 17520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 363 - 421
Target Start/End: Original strand, 22541 - 22599
Alignment:
Q  363 tatgctcaattggttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgttt 421  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  22541 tatgctcaattgggtgaattatgctaagttgttgttgaattatgatgagaaccatgttt 22599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 392 - 450
Target Start/End: Original strand, 61375 - 61433
Alignment:
Q  392 tgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaagtgatatt 450  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||    
T  61375 tgttgttgaattgtgatgagaatcatgtttaattgatgttgttgtggttaagagatatt 61433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 363 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 21646 - 21566
Alignment:
Q  363 tatgctcaattggttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaagt 444  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||| |||  ||  ||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  21646 tatgctcaattggt-gaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgattatttgatgttgttgttgctaagt 21566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0103 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0103
Description:

Target: scaffold0103; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 377 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 33783 - 33710
Alignment:
Q  377 tgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaagtgatatt 450  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||| |||  ||  ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  33783 tgaattatgctatgttgttgatgaattttgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatatt 33710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0601 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0601
Description:

Target: scaffold0601; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 375 - 438
Target Start/End: Original strand, 998 - 1061
Alignment:
Q  375 gttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttg 438  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||| | ||  |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  998 gttgaattgtgctatgttgttgttgaaatgtggggagattcatgtttaattgatgttgttgttg 1061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 363 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 46299 - 46213
Alignment:
Q  363 tatgctcaattggttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaagtgatatt 450  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||| |||  ||  ||||| | ||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  46299 tatgctcaattggt-gaattatgctatgttgttgttaaattgtgataagtttcatgatcaatggatgttgttgtttctaagtgatatt 46213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 363 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 40792 - 40706
Alignment:
Q  363 tatgctcaattggttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaagtgatatt 450  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||  |||||||  ||| |||  ||  ||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  40792 tatgctcaattggt-gaattatgctatattgttgttacattgtgataagtttcatgatcaatggatgttgttgttgctaagtgatatt 40706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0610 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0610
Description:

Target: scaffold0610; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 363 - 444
Target Start/End: Original strand, 689 - 769
Alignment:
Q  363 tatgctcaattggttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaagt 444  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||| ||||| |||||| |||  ||  ||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  689 tatgctcatttggt-gaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagt 769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0153 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0153
Description:

Target: scaffold0153; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 398 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 1934 - 1882
Alignment:
Q  398 tgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaagtgatatt 450  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||    
T  1934 tgaattgtgatgagaatcatgtttaattgatgttgatgttgttaagagatatt 1882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 363 - 447
Target Start/End: Original strand, 24841 - 24924
Alignment:
Q  363 tatgctcaattggttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaagtgat 447  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||| |||  ||  ||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  24841 tatgctcaattggt-gaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgat 24924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 375 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 108132 - 108065
Alignment:
Q  375 gttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaag 443  Q
    ||||||||||||| || | |||||||||| ||| ||  |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  108132 gttgaattatgct-tgttattgttgaattgtgatgaagatcatgtttaattgatgttgttgttgttaag 108065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 375 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 35601 - 35529
Alignment:
Q  375 gttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaagtgat 447  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||| | ||   ||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  35601 gttgatttatgctatgttgttgttgaaatgtggtaagagtcatgttcaattgatgtttttgttgctaagtgat 35529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1867 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1867
Description:

Target: scaffold1867; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 363 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 278 - 204
Alignment:
Q  363 tatgctcaattggttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttg 438  Q
    |||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||| |||  ||  ||||| | |||||||||||||||||    
T  278 tatgctcaattggt-gaattatgctttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttg 204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0387 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0387
Description:

Target: scaffold0387; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 412 - 443
Target Start/End: Original strand, 1107 - 1138
Alignment:
Q  412 aatcatgtttaattgatgttgttgttgctaag 443  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1107 aatcatgtttaattgatgttgttgttgctaag 1138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0190 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0190
Description:

Target: scaffold0190; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 363 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 10071 - 9997
Alignment:
Q  363 tatgctcaattggttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttg 438  Q
    |||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||| |||  ||  ||||| | |||||||||||||||||    
T  10071 tatgctcaattggt-gaattatgctttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttg 9997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 363 - 438
Target Start/End: Original strand, 89975 - 90050
Alignment:
Q  363 tatgctcaattggttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttg 438  Q
    ||||||||||||  || ||||||||||  | |||||||||||||| ||  | |||||| |||||||||||||||||    
T  89975 tatgctcaattgagtggattatgctatattattgttgaattatgatgaagaccatgttcaattgatgttgttgttg 90050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0483 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0483
Description:

Target: scaffold0483; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 365 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 6794 - 6712
Alignment:
Q  365 tgctcaattggttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaagtgat 447  Q
    ||||||| | |||||||||||||||| | |||||||||| ||   ||| ||||||| |||||||||||||  | |||||||||    
T  6794 tgctcaaattgttgaattatgctatgctattgttgaattgtggtaagagtcatgttcaattgatgttgttactcctaagtgat 6712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0396 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0396
Description:

Target: scaffold0396; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 363 - 444
Target Start/End: Original strand, 11821 - 11901
Alignment:
Q  363 tatgctcaattggttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaagt 444  Q
    |||||||||||||| |||||||||  || ||||| |||||| |||  ||  ||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  11821 tatgctcaattggt-gaattatgcattgttgttgatgaattttgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagt 11901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0195
Description:

Target: scaffold0195; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 363 - 444
Target Start/End: Original strand, 631 - 711
Alignment:
Q  363 tatgctcaattggttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaagt 444  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||| ||||| |||||| |||  ||  ||||| | |||||||||||||||| ||||||    
T  631 tatgctcatttggt-gaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttactaagt 711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 363 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 5075 - 4995
Alignment:
Q  363 tatgctcaattggttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaagt 444  Q
    |||||| ||||||| |||||||| | || |||||||||||| |||  ||  ||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  5075 tatgcttaattggt-gaattatgatttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagt 4995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 363 - 444
Target Start/End: Original strand, 118076 - 118156
Alignment:
Q  363 tatgctcaattggttgaattatgctatgatgttgttgaattatgaagagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaagt 444  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||| |||  ||  ||||| | | |||||||||||||||||||||    
T  118076 tatgttcaattggt-gaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcagttgatgttgttgttgctaagt 118156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University