View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF17683_high_1 (Length: 598)

Name: NF17683_high_1
Description: NF17683
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF17683_high_1
NF17683_high_1
[»] chr1 (4 HSPs)
chr1 (12-581)||(15196016-15196585)
chr1 (12-581)||(15216434-15217003)
chr1 (14-529)||(15195367-15195882)
chr1 (14-529)||(15215785-15216300)
[»] chr5 (6 HSPs)
chr5 (12-581)||(17563111-17563680)
chr5 (47-578)||(17570210-17570741)
chr5 (47-581)||(17690563-17691094)
chr5 (50-581)||(17683640-17684168)
chr5 (47-326)||(17621843-17622122)
chr5 (320-581)||(17701991-17702252)
[»] chr7 (6 HSPs)
chr7 (12-581)||(14764919-14765488)
chr7 (47-578)||(14757794-14758325)
chr7 (47-581)||(14661093-14661624)
chr7 (47-581)||(14652658-14653189)
chr7 (47-577)||(14749875-14750402)
chr7 (320-581)||(14627241-14627502)
[»] scaffold1961 (1 HSPs)
scaffold1961 (299-550)||(1-252)
[»] chr8 (2 HSPs)
chr8 (47-401)||(24395374-24395728)
chr8 (476-554)||(24395803-24395881)


Alignment Details
Target: chr1 (Bit Score: 526; Significance: 0; HSPs: 4)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 526; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 581
Target Start/End: Original strand, 15196016 - 15196585
Alignment:
Q  12 tcatcacttctcgtatttgtgatagaccaccgttgacacgacggaacaggttatacattctactcagatcttcatatttatcatcaccaatcatgtttac 111  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  15196016 tcatcacttctcgtatttgcgagagaccaccggtgacacgacggaacaagttatacattctaatcaaatctttatacttatcatcaccaatcatgtttac 15196115  T
Q  112 taacccagagttctccatatggattaatctaagcatgtgattttcgatcatctccttctccaccacaatagtaatcttcttttgagtgctagggtcccag 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  15196116 taacccagagttctccatatggattaatctaagcatgtgattttcgatcatctccttctccaccacaatagtaatcttcttttgagtgctagggtccaag 15196215  T
Q  212 aagtggctcactctatcaattacctcattcaggcgcatctcagccttctttagataatccccacaatcatagcactcaatcaatttctgtgattcagccc 311  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15196216 aagtggctcactttatcaattacctcattcaggcgcatctcagccttctttagataatccccacaatcatagcgctcaatcaatttctgtgattcagccc 15196315  T
Q  312 ggtagaactcagctgaaacttgcagcaaaggattctcaaattcttgcatataaacggaaggacctaaatccattagcatatttgttatatatctaatcag 411  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15196316 ggtagaactcagctgaaacttgcagcaaaggattctcaaattcttgcatataaacggaaggacctaaatccattagcatatttgttatatatctaatcag 15196415  T
Q  412 ttttctatcaacaacttctccagcatagtccttgcatactaataccaaaagcatattcgacaatcgagtccttatctggtttgaataaataacattttct 511  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15196416 ttttctatcaacaacttctccagcatagtccttgcatactaataccaaaagcatattcgacaatcgagtccttatctggtttgaataaataacattttct 15196515  T
Q  512 ctccacaggctcagaccaagttcataaacaggtgtcttgttggtctttgggatataagtcgtatccatgt 581  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15196516 ctccacaggctcagaccaagttcataaacaggtgtcttgttggtctttgggatataagtcgtatccatgt 15196585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 526; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 581
Target Start/End: Original strand, 15216434 - 15217003
Alignment:
Q  12 tcatcacttctcgtatttgtgatagaccaccgttgacacgacggaacaggttatacattctactcagatcttcatatttatcatcaccaatcatgtttac 111  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  15216434 tcatcacttctcgtatttgcgagagaccaccggtgacacgacggaacaagttatacattctaatcaaatctttatacttatcatcaccaatcatgtttac 15216533  T
Q  112 taacccagagttctccatatggattaatctaagcatgtgattttcgatcatctccttctccaccacaatagtaatcttcttttgagtgctagggtcccag 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  15216534 taacccagagttctccatatggattaatctaagcatgtgattttcgatcatctccttctccaccacaatagtaatcttcttttgagtgctagggtccaag 15216633  T
Q  212 aagtggctcactctatcaattacctcattcaggcgcatctcagccttctttagataatccccacaatcatagcactcaatcaatttctgtgattcagccc 311  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15216634 aagtggctcactttatcaattacctcattcaggcgcatctcagccttctttagataatccccacaatcatagcgctcaatcaatttctgtgattcagccc 15216733  T
Q  312 ggtagaactcagctgaaacttgcagcaaaggattctcaaattcttgcatataaacggaaggacctaaatccattagcatatttgttatatatctaatcag 411  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15216734 ggtagaactcagctgaaacttgcagcaaaggattctcaaattcttgcatataaacggaaggacctaaatccattagcatatttgttatatatctaatcag 15216833  T
Q  412 ttttctatcaacaacttctccagcatagtccttgcatactaataccaaaagcatattcgacaatcgagtccttatctggtttgaataaataacattttct 511  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15216834 ttttctatcaacaacttctccagcatagtccttgcatactaataccaaaagcatattcgacaatcgagtccttatctggtttgaataaataacattttct 15216933  T
Q  512 ctccacaggctcagaccaagttcataaacaggtgtcttgttggtctttgggatataagtcgtatccatgt 581  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15216934 ctccacaggctcagaccaagttcataaacaggtgtcttgttggtctttgggatataagtcgtatccatgt 15217003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 400; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 529
Target Start/End: Original strand, 15195367 - 15195882
Alignment:
Q  14 atcacttctcgtatttgtgatagaccaccgttgacacgacggaacaggttatacattctactcagatcttcatatttatcatcaccaatcatgtttacta 113  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15195367 atcacttctcgtatttgcgagagaccaccggtgacacgacggaacaagttatacattctactcaaatcttcatacttatcatcaccaatcatgtttacta 15195466  T
Q  114 acccagagttctccatatggattaatctaagcatgtgattttcgatcatctccttctccaccacaatagtaatcttcttttgagtgctagggtcccagaa 213  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15195467 acccagagttctccataaggattaatctaatcatgtgattttcgatcatctccttctccaccacaatagtaatcttcttttgagtgctagggtcccagaa 15195566  T
Q  214 gtggctcactctatcaattacctcattcaggcgcatctcagccttctttagataatccccacaatcatagcactcaatcaatttctgtgattcagcccgg 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15195567 gtggctcactctatcaattacctcattcaggcgcatctcagccttcttgagataatccccacaatcacagcactcaataaatttctgtgattcagcccgg 15195666  T
Q  314 tagaactcagctgaaacttgcagcaaaggattctcaaattcttgcatataaacggaaggacctaaatccattagcatatttgttatatatctaatcagtt 413  Q
    |||||||| |||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  15195667 tagaactcggctggaagctgcagaaaaggattctcaaattcttgcacataaacggaaggtcctaaatccattagcatatttgttatatttctaatcactt 15195766  T
Q  414 ttctatcaacaacttctccagcatagtccttgcatactaataccaaaagcatattcgacaatcgagtccttatctggtttgaataaataacattttctct 513  Q
    || | | |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  15195767 ttatgttaacaacttctccagcatagtacttgcatactaattcccaaagcgtattcgacaatcgagtccttatctggtttgaataaataacattttcgct 15195866  T
Q  514 ccacaggctcagacca 529  Q
    ||||||| ||||||||    
T  15195867 ccacaggttcagacca 15195882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 400; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 529
Target Start/End: Original strand, 15215785 - 15216300
Alignment:
Q  14 atcacttctcgtatttgtgatagaccaccgttgacacgacggaacaggttatacattctactcagatcttcatatttatcatcaccaatcatgtttacta 113  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15215785 atcacttctcgtatttgcgagagaccaccggtgacacgacggaacaagttatacattctactcaaatcttcatacttatcatcaccaatcatgtttacta 15215884  T
Q  114 acccagagttctccatatggattaatctaagcatgtgattttcgatcatctccttctccaccacaatagtaatcttcttttgagtgctagggtcccagaa 213  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15215885 acccagagttctccataaggattaatctaatcatgtgattttcgatcatctccttctccaccacaatagtaatcttcttttgagtgctagggtcccagaa 15215984  T
Q  214 gtggctcactctatcaattacctcattcaggcgcatctcagccttctttagataatccccacaatcatagcactcaatcaatttctgtgattcagcccgg 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15215985 gtggctcactctatcaattacctcattcaggcgcatctcagccttcttgagataatccccacaatcacagcactcaataaatttctgtgattcagcccgg 15216084  T
Q  314 tagaactcagctgaaacttgcagcaaaggattctcaaattcttgcatataaacggaaggacctaaatccattagcatatttgttatatatctaatcagtt 413  Q
    |||||||| |||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  15216085 tagaactcggctggaagctgcagaaaaggattctcaaattcttgcacataaacggaaggtcctaaatccattagcatatttgttatatttctaatcactt 15216184  T
Q  414 ttctatcaacaacttctccagcatagtccttgcatactaataccaaaagcatattcgacaatcgagtccttatctggtttgaataaataacattttctct 513  Q
    || | | |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  15216185 ttatgttaacaacttctccagcatagtacttgcatactaattcccaaagcgtattcgacaatcgagtccttatctggtttgaataaataacattttcgct 15216284  T
Q  514 ccacaggctcagacca 529  Q
    ||||||| ||||||||    
T  15216285 ccacaggttcagacca 15216300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 278; Significance: 1e-155; HSPs: 6)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 12 - 581
Target Start/End: Complemental strand, 17563680 - 17563111
Alignment:
Q  12 tcatcacttctcgtatttgtgatagaccaccgttgacacgacggaacaggttatacattctactcagatcttcatatttatcatcaccaatcatgtttac 111  Q
    |||||||||| |||||||   | |||||| || ||||||||| ||||| ||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17563680 tcatcacttcacgtattttcaagagaccatcggtgacacgactgaacaagttatacatcctacccaaatcttcatatttatcatcaccaagcatgtttac 17563581  T
Q  112 taacccagagttctccatatggattaatctaagcatgtgattttcgatcatctccttctccaccacaatagtaatcttcttttgagtgctagggtcccag 211  Q
    |||||||||  ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||    
T  17563580 taacccagaagtctccttatagattaatctaagcatgtgattttcgagcatctccttctccaccagagtagtaatcttcgtttcagtgctagggtccaag 17563481  T
Q  212 aagtggctcactctatcaattacctcattcaggcgcatctcagccttctttagataatccccacaatcatagcactcaatcaatttctgtgattcagccc 311  Q
     |||||||||||||||||| | ||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| || || |||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  17563480 tagtggctcactctatcaagttcctcattcagatgcatctcagccttcttgagataatccccagaaccacagcactcaataaatatctgtgattcagccc 17563381  T
Q  312 ggtagaactcagctgaaacttgcagcaaaggattctcaaattcttgcatataaacggaaggacctaaatccattagcatatttgttatatatctaatcag 411  Q
    | |||||||||| |||| || |||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||  ||| |||||||| |||||||||  |||||||||    
T  17563380 gatagaactcagttgaagctagcagaaaaggattctcaaattcttccccataaacggaaggacctgtatcaattagcatctttgttatacttctaatcag 17563281  T
Q  412 ttttctatcaacaacttctccagcatagtccttgcatactaataccaaaagcatattcgacaatcgagtccttatctggtttgaataaataacattttct 511  Q
    |  ||||| ||||||||| || |||   ||  ||| ||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  17563280 tcctctattaacaacttcgccggcacgctcactgcgtactaattccaaaagcatattcaacagtcgagtccttatctggtttgaatgaagaacattttct 17563181  T
Q  512 ctccacaggctcagaccaagttcataaacaggtgtcttgttggtctttgggatataagtcgtatccatgt 581  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||| |  || ||||||||||| | |||||||    
T  17563180 ctccacaggttcagaccaagttcataaacagttgtcttcttgatggtttggatataagtcctgtccatgt 17563111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 47 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 17570741 - 17570210
Alignment:
Q  47 acacgacggaacaggttatacattctactcagatcttcatatttatcatcaccaatcatgtttactaacccagagttctccatatggattaatctaagca 146  Q
    |||||||| |||| |||||||||||| | || |||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17570741 acacgacgaaacaagttatacattcttcccaaatcttcatatttatcaccacaaagcatgtttactaaccccgagttctccatatggattaatctaagca 17570642  T
Q  147 tgtgattttcgatcatctccttctccaccacaatagtaatcttcttttgagtgctagggtcccagaagtggctcactctatcaattacctcattcaggcg 246  Q
    |||||||||| |||||||||||||| | |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||| || ||||||  || ||||||||||||     
T  17570641 tgtgattttcaatcatctccttctcgatcacactagtaatcttcttttcagtgctagggtccaagtagtggcacattctatctgtttcctcattcaggca 17570542  T
Q  247 catctcagccttctttagataatccccacaatcatagcactcaatcaatttctgtgattcagcccggtagaactcagctgaaacttgcagcaaaggattc 346  Q
    | ||||| | ||||| |||||||| || |||||| ||||||| || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| || || | | ||    
T  17570541 cctctcaactttcttgagataatcaccgcaatcacagcactcgataaatttctgagattcagccctgtagaactcagctgaaacttgtagaaacgaagtc 17570442  T
Q  347 tcaaattcttgcatataaacggaaggacctaaatccattagcatatttgttatatatctaatcagttttctatcaacaacttctccagcatagtccttgc 446  Q
    || |||||||||  |||||| |||| |||||||||||||||||| ||||| |||| | ||||||||| | ||| |||| |||| ||||||   |||||||    
T  17570441 tcgaattcttgctcataaacagaagaacctaaatccattagcatctttgtaatatttttaatcagttctatattaacatcttccccagcacgttccttgc 17570342  T
Q  447 atactaataccaaaagcatattcgacaatcgagtccttatctggtttgaataaataacattttctctccacaggctcagaccaagttcataaacaggtgt 546  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||| |||||||| |||  ||||||||||||| | ||||    
T  17570341 atactaattccaaaagcatattcgacagtcgagtcctgatctgttttgagtaaataacattctctgtccacaggttcaagccaagttcataaatatgtgt 17570242  T
Q  547 cttgttggtctttgggatataagtcgtatcca 578  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  17570241 cttcttggtctgtgggatataagtcttatcca 17570210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 47 - 581
Target Start/End: Original strand, 17690563 - 17691094
Alignment:
Q  47 acacgacggaacaggttatacattctactcagatcttcatatttatcatcaccaatcatgtttactaacccagagttctccatatggattaatctaagca 146  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||   || |||||||||||||  | ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  17690563 acacgtcggaacaagttatacattctttccaaatcttcatatttagtaccacaaatcatgtttacaaacccagagttctccatattgattaatctaggca 17690662  T
Q  147 tgtgattttcgatcatctccttctccaccacaatagtaatcttcttttgagtgctagggtcccagaagtggctcactctatcaattacctcattcaggcg 246  Q
    || ||||||| |||||||||||||| | | || || |||| ||||||| |||  |||||||| || | ||    ||||||||  || ||||||||| ||     
T  17690663 tgggattttcaatcatctccttctcgatcgcattaataattttcttttcagtcttagggtccaagtaatga---actctatccgtttcctcattcaagca 17690759  T
Q  247 catctcagccttctttagataatccccacaatcatagcactcaatcaatttctgtgattcagcccggtagaactcagctgaaacttgcagcaaaggattc 346  Q
    | ||||| | ||||| |||||||||||||| ||| | |||| |||  ||||||| |||||||||  |||  | |||||| |||||||||| |||||| ||    
T  17690760 cctctcaactttcttgagataatccccacagtcaaaacacttaatatatttctgggattcagccttgtaagattcagctaaaacttgcagaaaaggagtc 17690859  T
Q  347 tcaaattcttgcatataaacggaaggacctaaatccattagcatatttgttatatatctaatcagttttctatcaacaacttctccagcatagtccttgc 446  Q
    |||||| |||||  |||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| | || ||||||||||| ||| | |||| |||| || |||   ||||||     
T  17690860 tcaaatacttgctcataaacagaaggacctaaatcaattagcatctttgtaacatttctaatcagttctctgttaacatcttccccggcacgctccttga 17690959  T
Q  447 atactaataccaaaagcatattcgacaatcgagtccttatctggtttgaataaataacattttctctccacaggctcagaccaagttcataaacaggtgt 546  Q
    |||| ||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  17690960 atacaaactccaaaagcatattcgacaatcgattccttatctggtttgaataaataacattttctctccacaggttcaaaccaagttcataaacaggtgt 17691059  T
Q  547 cttgttggtctttgggatataagtcgtatccatgt 581  Q
    ||| |||||  | |||||||||||| | |||||||    
T  17691060 ctttttggtgctggggatataagtcctttccatgt 17691094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 50 - 581
Target Start/End: Original strand, 17683640 - 17684168
Alignment:
Q  50 cgacggaacaggttatacattctactcagatcttcatatttatcatcaccaatcatgtttactaacccagagttctccatatggattaatctaagcatgt 149  Q
    |||||||||| ||||||||||||   || |||||||||||||| | ||| || ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||     
T  17683640 cgacggaacaagttatacattctttccaaatcttcatatttattaccacaaagcatgtttacaaacccagagttctccatattgattaatctcagcatgg 17683739  T
Q  150 gattttcgatcatctccttctccaccacaatagtaatcttcttttgagtgctagggtcccagaagtggctcactctatcaattacctcattcaggcgcat 249  Q
    ||||||| |||||||||||||| | | || || |||| ||||||| |||  |||||||| || | ||  |   ||||||  || |||||||||||| | |    
T  17683740 gattttcaatcatctccttctcgatcgcattaataattttcttttcagtcttagggtccaagtaatgaat---tctatccgtttcctcattcaggcacct 17683836  T
Q  250 ctcagccttctttagataatccccacaatcatagcactcaatcaatttctgtgattcagcccggtagaactcagctgaaacttgcagcaaaggattctca 349  Q
    |||| | ||||| ||||||||||| || ||| | ||||| ||  ||||||  |||||||||  |||  | |||||| |||||||||| |||||| |||||    
T  17683837 ctcaactttcttgagataatccccgcagtcacaacactcgatatatttctcggattcagccttgtaagattcagctaaaacttgcagaaaaggagtctca 17683936  T
Q  350 aattcttgcatataaacggaaggacctaaatccattagcatatttgttatatatctaatcagttttctatcaacaacttctccagcatagtccttgcata 449  Q
    |||||||||  |||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| | || ||||||||||| ||| | |||| |||| || ||| | |||||  |||    
T  17683937 aattcttgctcataaacagaaggacctaaatcaattagcatctttgtaacatttctaatcagttctctgttaacatcttccccggcacactccttaaata 17684036  T
Q  450 ctaataccaaaagcatattcgacaatcgagtccttatctggtttgaataaataacattttctctccacaggctcagaccaagttcataaacaggtgtctt 549  Q
    | ||  |||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  17684037 caaactccaaaagcgtattcgacagttgagtccttatctggtttgaataaataacaatttctctccacaggttcagaccaagttcataaacaggagtctt 17684136  T
Q  550 gttggtctttgggatataagtcgtatccatgt 581  Q
     || ||  |||||||||||||| | |||||||    
T  17684137 ttttgtgcttgggatataagtcctttccatgt 17684168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 47 - 326
Target Start/End: Original strand, 17621843 - 17622122
Alignment:
Q  47 acacgacggaacaggttatacattctactcagatcttcatatttatcatcaccaatcatgtttactaacccagagttctccatatggattaatctaagca 146  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  17621843 acacgacggaacaagttatacattctacccaagtcttcatatttatcaccacaaatcatgtttactaacccagaattttccatatggattaatctaagca 17621942  T
Q  147 tgtgattttcgatcatctccttctccaccacaatagtaatcttcttttgagtgctagggtcccagaagtggctcactctatcaattacctcattcaggcg 246  Q
    ||| |||||| || ||||||||| |||||| | ||| |||  ||| ||  || ||||| ||| |  | ||| |||||||||| | | |||||||||| ||    
T  17621943 tgtcattttcaataatctccttcaccaccatattagcaatagtctctttggtcctaggatccaaataatggttcactctatccaattcctcattcagccg 17622042  T
Q  247 catctcagccttctttagataatccccacaatcatagcactcaatcaatttctgtgattcagcccggtagaactcagctg 326  Q
    | ||||||| ||||| |||||||||||||||||| | ||  |||| |||||||| | ||| |||| ||||||||||||||    
T  17622043 cctctcagctttcttgagataatccccacaatcacaacatccaataaatttctgagtttctgccctgtagaactcagctg 17622122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 106; E-Value: 9e-53
Query Start/End: Original strand, 320 - 581
Target Start/End: Original strand, 17701991 - 17702252
Alignment:
Q  320 tcagctgaaacttgcagcaaaggattctcaaattcttgcatataaacggaaggacctaaatccattagcatatttgttatatatctaatcagttttctat 419  Q
    |||||| |||||||||| |||||| |||||||| |||||  |||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| | || ||||||||||| ||| |    
T  17701991 tcagctaaaacttgcagaaaaggagtctcaaatacttgctcataaacagaaggacctaaatcaattagcatctttgtaacatttctaatcagttctctgt 17702090  T
Q  420 caacaacttctccagcatagtccttgcatactaataccaaaagcatattcgacaatcgagtccttatctggtttgaataaataacattttctctccacag 519  Q
     |||| |||| || |||   || ||   ||| ||  |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17702091 taacatcttccccggcacgctctttaagtacaaactccaaaagcgtattcgacagtcgagtccttatctggtttgaataaataacattttctctccacag 17702190  T
Q  520 gctcagaccaagttcataaacaggtgtcttgttggtctttgggatataagtcgtatccatgt 581  Q
    | ||| ||||||||||||||||||| | || |||||  |||||||||||||| | |||||||    
T  17702191 gttcaaaccaagttcataaacaggtttgtttttggtgcttgggatataagtcctgtccatgt 17702252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 270; Significance: 1e-150; HSPs: 6)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 12 - 581
Target Start/End: Original strand, 14764919 - 14765488
Alignment:
Q  12 tcatcacttctcgtatttgtgatagaccaccgttgacacgacggaacaggttatacattctactcagatcttcatatttatcatcaccaatcatgtttac 111  Q
    |||||||||| |||||||   | |||||| || ||||||||| ||||| ||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14764919 tcatcacttcacgtattttcaagagaccatcggtgacacgactgaacaagttatacatcctacccaaatcttcatatttatcatcaccaagcatgtttac 14765018  T
Q  112 taacccagagttctccatatggattaatctaagcatgtgattttcgatcatctccttctccaccacaatagtaatcttcttttgagtgctagggtcccag 211  Q
    |||||||||  ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||| ||||||||||||| ||    
T  14765019 taacccagaagtctccttatagattaatctaagcatgtgattttcgagcatctccttctccaccagagtagtaattttcgtttcagtgctagggtccaag 14765118  T
Q  212 aagtggctcactctatcaattacctcattcaggcgcatctcagccttctttagataatccccacaatcatagcactcaatcaatttctgtgattcagccc 311  Q
     |||||||||||||||||| | ||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| || || |||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  14765119 tagtggctcactctatcaagttcctcattcagatgcatctcagccttcttgagataatccccagaaccacagcactcaataaatatctgtgattcagccc 14765218  T
Q  312 ggtagaactcagctgaaacttgcagcaaaggattctcaaattcttgcatataaacggaaggacctaaatccattagcatatttgttatatatctaatcag 411  Q
    | |||||||||| |||| || |||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||  ||| |||||||| |||||||||  |||||||||    
T  14765219 gatagaactcagttgaagctagcagaaaaggattctcaaattcttcctcataaacggaaggacctgtatcaattagcatctttgttatacttctaatcag 14765318  T
Q  412 ttttctatcaacaacttctccagcatagtccttgcatactaataccaaaagcatattcgacaatcgagtccttatctggtttgaataaataacattttct 511  Q
    |  ||||| ||||||||| || |||   ||  ||  ||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  14765319 tcctctattaacaacttcgccggcacgctcactgtgtactaattccaaaagcatattcaacagtcgagtccttatctggtttgaatgaagaacattttct 14765418  T
Q  512 ctccacaggctcagaccaagttcataaacaggtgtcttgttggtctttgggatataagtcgtatccatgt 581  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||| |  || ||||||||||| | |||||||    
T  14765419 ctccacaggttcagaccaagttcataaacagttgtcttcttgatggtttggatataagtcctgtccatgt 14765488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 240; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 47 - 578
Target Start/End: Original strand, 14757794 - 14758325
Alignment:
Q  47 acacgacggaacaggttatacattctactcagatcttcatatttatcatcaccaatcatgtttactaacccagagttctccatatggattaatctaagca 146  Q
    |||||||| |||| |||||||||||| | || |||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14757794 acacgacgaaacaagttatacattcttcccaaatcttcatatttatcaccacaaagcatgtttactaaccccgagttctccatatggattaatctaagca 14757893  T
Q  147 tgtgattttcgatcatctccttctccaccacaatagtaatcttcttttgagtgctagggtcccagaagtggctcactctatcaattacctcattcaggcg 246  Q
    |||||||||| |||||||||||||| | |||| ||||||||||||||| ||||||||||||  || |||||| || ||||||  || ||||||||||||     
T  14757894 tgtgattttcaatcatctccttctcgatcacactagtaatcttcttttcagtgctagggtctaagtagtggcacattctatctgtttcctcattcaggca 14757993  T
Q  247 catctcagccttctttagataatccccacaatcatagcactcaatcaatttctgtgattcagcccggtagaactcagctgaaacttgcagcaaaggattc 346  Q
    | ||||| | ||||| |||||||| || |||||| ||||||| || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| || || | | ||    
T  14757994 cctctcaactttcttgagataatcaccgcaatcacagcactcgataaatttctgagattcagccctgtagaactcagctgaaacttgtagaaacgaagtc 14758093  T
Q  347 tcaaattcttgcatataaacggaaggacctaaatccattagcatatttgttatatatctaatcagttttctatcaacaacttctccagcatagtccttgc 446  Q
    || |||||||||   ||||| |||| |||||||||||||||||| ||||| |||| | ||||||||| | ||| |||| |||| ||||||   |||||||    
T  14758094 tcgaattcttgctcttaaacagaagaacctaaatccattagcatctttgtaatatttttaatcagttctatattaacatcttccccagcacgttccttgc 14758193  T
Q  447 atactaataccaaaagcatattcgacaatcgagtccttatctggtttgaataaataacattttctctccacaggctcagaccaagttcataaacaggtgt 546  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||| |||||||| |||  ||||||||||||| | ||||    
T  14758194 atactaattccaaaagcatattcgacagtcgagtcctgatctgttttgagtaaataacattctctgtccacaggttcaagccaagttcataaatatgtgt 14758293  T
Q  547 cttgttggtctttgggatataagtcgtatcca 578  Q
    ||| ||||||| |||||||||| || ||||||    
T  14758294 cttcttggtctgtgggatataattcttatcca 14758325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 47 - 581
Target Start/End: Complemental strand, 14661624 - 14661093
Alignment:
Q  47 acacgacggaacaggttatacattctactcagatcttcatatttatcatcaccaatcatgtttactaacccagagttctccatatggattaatctaagca 146  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||   || |||||||||||||| | ||| || ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  14661624 acacgacggaacaagttatacattctttccaaatcttcatatttattaccacaaagcatgtttacaaacccagagttctccatattgattaatctcagca 14661525  T
Q  147 tgtgattttcgatcatctccttctccaccacaatagtaatcttcttttgagtgctagggtcccagaagtggctcactctatcaattacctcattcaggcg 246  Q
    || ||||||| |||||||||||||| | | || || |||| ||||||| |||  |||||||| || | ||  |   ||||||  || ||||| ||||||     
T  14661524 tgggattttcaatcatctccttctcgatcgcattaataattttcttttcagtcttagggtccaagtaatgaat---tctatccgtttcctcagtcaggca 14661428  T
Q  247 catctcagccttctttagataatccccacaatcatagcactcaatcaatttctgtgattcagcccggtagaactcagctgaaacttgcagcaaaggattc 346  Q
    | ||||| | ||||| ||||||||| | || ||| ||||||||||  ||||||  |||||||||  |||  | |||||| |||||||||| |||||| ||    
T  14661427 cctctcaactttcttgagataatcctcgcagtcacagcactcaatatatttctcagattcagccttgtaagattcagctaaaacttgcagaaaaggagtc 14661328  T
Q  347 tcaaattcttgcatataaacggaaggacctaaatccattagcatatttgttatatatctaatcagttttctatcaacaacttctccagcatagtccttgc 446  Q
    ||||||||||||  |||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| | || ||||||||||| ||| | |||| |||| || |||   ||||||     
T  14661327 tcaaattcttgctcataaacagaaggacctaaatcaattagcatctttgtaacatttctaatcagttctctgttaacatcttccccggcacgctccttga 14661228  T
Q  447 atactaataccaaaagcatattcgacaatcgagtccttatctggtttgaataaataacattttctctccacaggctcagaccaagttcataaacaggtgt 546  Q
    |||| ||  |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  14661227 atacaaactccaaaagcgtattcgacagtcgagtccttatctggtttgaataaataacattttctctccacaggttcagaccaagttcataaacaggagt 14661128  T
Q  547 cttgttggtctttgggatataagtcgtatccatgt 581  Q
    ||| || ||  |||||||||||||| | |||||||    
T  14661127 cttttttgtgcttgggatataagtcctttccatgt 14661093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 47 - 581
Target Start/End: Complemental strand, 14653189 - 14652658
Alignment:
Q  47 acacgacggaacaggttatacattctactcagatcttcatatttatcatcaccaatcatgtttactaacccagagttctccatatggattaatctaagca 146  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||   || |||||||||||||  | ||| || ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  14653189 acacgtcggaacaagttatacattctttccaaatcttcatatttagtaccacaaagcatgtttacaaacccagagttctccatattgattaatctcagca 14653090  T
Q  147 tgtgattttcgatcatctccttctccaccacaatagtaatcttcttttgagtgctagggtcccagaagtggctcactctatcaattacctcattcaggcg 246  Q
    || ||||||| |||||||||||||| | | || || |||| ||||||| |||  |||||||| || | ||    ||||||||  || ||||||||||||     
T  14653089 tgggattttcaatcatctccttctcgatcgcattaataattttcttttcagtcttagggtccaagtaatga---actctatccgtttcctcattcaggca 14652993  T
Q  247 catctcagccttctttagataatccccacaatcatagcactcaatcaatttctgtgattcagcccggtagaactcagctgaaacttgcagcaaaggattc 346  Q
      ||||| | ||||| |||||||||||||| ||| | |||| |||  ||||||| |||||||||  |||  | |||||| |||||||||| |||||| ||    
T  14652992 tctctcaactttcttgagataatccccacagtcaaaacacttaatatatttctgggattcagccttgtaagattcagctaaaacttgcagaaaaggagtc 14652893  T
Q  347 tcaaattcttgcatataaacggaaggacctaaatccattagcatatttgttatatatctaatcagttttctatcaacaacttctccagcatagtccttgc 446  Q
    |||||| |||||  |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| | || ||||||||||| ||| | |||| |||| || |||   |||||      
T  14652892 tcaaatacttgctcataaacagaaggacctaaatccatcagcatctttgtaacatttctaatcagttctctgttaacatcttccccggcacgctccttaa 14652793  T
Q  447 atactaataccaaaagcatattcgacaatcgagtccttatctggtttgaataaataacattttctctccacaggctcagaccaagttcataaacaggtgt 546  Q
    |||| ||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  14652792 atacaaactccaaaagcgtattcgacaatcgagtccttatctggtttgaataaataacattttctctccacaggttcaaaccaagttcataaacaggtgt 14652693  T
Q  547 cttgttggtctttgggatataagtcgtatccatgt 581  Q
    ||| |||||  | |||||||||||| | |||||||    
T  14652692 ctttttggtgctggggatataagtcctttccatgt 14652658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 47 - 577
Target Start/End: Original strand, 14749875 - 14750402
Alignment:
Q  47 acacgacggaacaggttatacattctactcagatcttcatatttatcatcaccaatcatgtttactaacccagagttctccatatggattaatctaagca 146  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||| || ||| | |||||||||| ||| || |||||||||||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||    
T  14749875 acacgatggaacaagttatacattctacccaaatcgttatatttatcaccacaaagcatgtttactaacccagaattctgcaattggattaatctaagca 14749974  T
Q  147 tgtgattttcgatcatctccttctccaccacaatagtaatcttcttttgagtgctagggtcccagaagtggctcactctatcaattacctcattcaggcg 246  Q
    |||||||||| ||  ||||||||   | || | |||||||||||| ||  || | ||  ||| | || ||||||| ||||||  || |||||||||| ||    
T  14749975 tgtgattttcaatagtctccttc---agcatattagtaatcttctcttttgtcccagtatccaataaatggctcagtctatctgtttcctcattcagccg 14750071  T
Q  247 catctcagccttctttagataatccccacaatcatagcactcaatcaatttctgtgattcagcccggtagaactcagctgaaacttgcagcaaaggattc 346  Q
    | |  || | ||||| | |||||| || |||||| |  | ||||  |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| |  |||||| ||    
T  14750072 ctttgcaactttcttgaaataatcaccgcaatcagaaaaatcaacaaatttctgggattcagccctatagaactcagctgaaacttgtaaaaaaggagtc 14750171  T
Q  347 tcaaattcttgcatataaacggaaggacctaaatccattagcatatttgttatatatctaatcagttttctatcaacaacttctccagcatagtccttgc 446  Q
    |||||||||| |  ||||||  | |||||||||||||||||||| |||| || || ||||||| ||| ||||| |||| ||||  ||||||  ||||||     
T  14750172 tcaaattcttcctcataaacaaagggacctaaatccattagcatctttgatagatttctaatcggttctctattaacatcttccgcagcatgctccttga 14750271  T
Q  447 atactaataccaaaagcatattcgacaatcgagtccttatctggtttgaataaataacattttctctccacaggctcagaccaagttcataaacaggtgt 546  Q
    |||| ||  |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||    
T  14750272 atacaaactccaaaagcgtattcgacagtcgagtccttatctggtttgaataaataacattctctctccacaggttcagaccaagtttataaacatgtgt 14750371  T
Q  547 cttgttggtctttgggatataagtcgtatcc 577  Q
    ||| ||| ||| ||||| ||||||| |||||    
T  14750372 cttcttgatctgtgggaaataagtcatatcc 14750402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 320 - 581
Target Start/End: Complemental strand, 14627502 - 14627241
Alignment:
Q  320 tcagctgaaacttgcagcaaaggattctcaaattcttgcatataaacggaaggacctaaatccattagcatatttgttatatatctaatcagttttctat 419  Q
    |||||| |||||||||| |||||| |||||||| |||||  |||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| | || ||||||||||| ||| |    
T  14627502 tcagctaaaacttgcagaaaaggagtctcaaatacttgctcataaacagaaggacctaaatcaattagcatctttgtaacatttctaatcagttctctgt 14627403  T
Q  420 caacaacttctccagcatagtccttgcatactaataccaaaagcatattcgacaatcgagtccttatctggtttgaataaataacattttctctccacag 519  Q
     |||| |||| || |||   || ||  |||| ||  |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14627402 taacatcttccccggcacgctctttaaatacaaactccaaaagcgtattcgacaatcgattccttatctggtttgaataaataacattttctctccacag 14627303  T
Q  520 gctcagaccaagttcataaacaggtgtcttgttggtctttgggatataagtcgtatccatgt 581  Q
    | ||| ||||||||||||||||||| | || |||||  |||||||||||||| | |||||||    
T  14627302 gttcaaaccaagttcataaacaggtttgtttttggtgcttgggatataagtcctgtccatgt 14627241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1961 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 1)
Name: scaffold1961
Description:

Target: scaffold1961; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 299 - 550
Target Start/End: Original strand, 1 - 252
Alignment:
Q  299 tgtgattcagcccggtagaactcagctgaaacttgcagcaaaggattctcaaattcttgcatataaacggaaggacctaaatccattagcatatttgtta 398  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1 tgtgattcagcccggtagaactcagctgaaacttgcagcaaaggattctcaaattcttgcatataaacggaaggacctaaatccattagcatattcgtta 100  T
Q  399 tatatctaatcagttttctatcaacaacttctccagcatagtccttgcatactaataccaaaagcatattcgacaatcgagtccttatctggtttgaata 498  Q
    | | ||||||||||||| ||| ||| |||||  |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  101 tttttctaatcagttttttattaacgacttcctcagcatagtccttgcatattaatcccaaaagcatattcaaaaatcgagtccttatctggtttgaata 200  T
Q  499 aataacattttctctccacaggctcagaccaagttcataaacaggtgtcttg 550  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  201 aataacattttctctccacaggttcagaccaagttcataaacaggtgtcttg 252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 108; Significance: 6e-54; HSPs: 2)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 47 - 401
Target Start/End: Original strand, 24395374 - 24395728
Alignment:
Q  47 acacgacggaacaggttatacattctactcagatcttcatatttatcatcaccaatcatgtttactaacccagagttctccatatggattaatctaagca 146  Q
    ||||| ||||||| ||||||||| |||| || |||||||||||||||||||| || |||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||    
T  24395374 acacggcggaacaagttatacatcctacccaaatcttcatatttatcatcacaaagcatgttgactaaaccagaattctccatatggattaacctgagca 24395473  T
Q  147 tgtgattttcgatcatctccttctccaccacaatagtaatcttcttttgagtgctaggg-tcccagaagtggctcactctatcaattacctcattcaggc 245  Q
    |||||||||| ||||||| | ||||||||||  || |||||||||||| ||| || ||| |||  | | ||||  |||||||| ||| |||||||||| |    
T  24395474 tgtgattttcaatcatctgcgtctccaccactttattaatcttcttttcagt-ctcgggatccatgtaatggccaactctatccatttcctcattcagac 24395572  T
Q  246 gcatctcagccttctttagataatccccacaatcatagcactcaatcaatttctgtgattcagcccggtagaactcagctgaaacttgcagcaaaggatt 345  Q
    || | ||||| ||||| |||||||| ||||||||| | |||||||| ||| | || |||||  || | || ||||||||||||||||| || ||| ||      
T  24395573 gcctttcagctttcttaagataatcaccacaatcacaacactcaatgaatctttgggattctacctgataaaactcagctgaaacttgaagaaaatgagc 24395672  T
Q  346 ctcaaattcttgcatataaacggaaggacctaaatccattagcatatttgttatat 401  Q
    |||||| |||||   |||||| |  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24395673 ctcaaaatcttgaccataaacagctggacctaaatccattagcatttttgttatat 24395728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 476 - 554
Target Start/End: Original strand, 24395803 - 24395881
Alignment:
Q  476 cgagtccttatctggtttgaataaataacattttctctccacaggctcagaccaagttcataaacaggtgtcttgttgg 554  Q
    |||||||| |||||||| |||||||| ||| |||||||||||||  |||| || ||||||| |||||| ||||| ||||    
T  24395803 cgagtcctgatctggttggaataaatgacactttctctccacagattcagcccgagttcatgaacaggagtctttttgg 24395881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University