View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF17705_low_3 (Length: 572)

Name: NF17705_low_3
Description: NF17705
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF17705_low_3
NF17705_low_3
[»] chr1 (20 HSPs)
chr1 (10-554)||(13101045-13101589)
chr1 (10-554)||(13007245-13007789)
chr1 (10-552)||(13069779-13070321)
chr1 (116-552)||(13204506-13204942)
chr1 (29-436)||(19727316-19727723)
chr1 (105-550)||(13161570-13162015)
chr1 (105-550)||(13129877-13130322)
chr1 (105-550)||(13094448-13094893)
chr1 (11-552)||(30367697-30368253)
chr1 (22-314)||(13214104-13214396)
chr1 (123-550)||(13064929-13065356)
chr1 (104-550)||(13244212-13244664)
chr1 (105-550)||(19278863-19279311)
chr1 (120-550)||(13080575-13081008)
chr1 (147-550)||(13271635-13272041)
chr1 (335-550)||(12963803-12964018)
chr1 (152-550)||(13086156-13086557)
chr1 (104-288)||(12963605-12963789)
chr1 (10-57)||(13010795-13010842)
chr1 (10-65)||(13205005-13205060)
[»] chr6 (1 HSPs)
chr6 (152-293)||(31396420-31396562)
[»] chr7 (2 HSPs)
chr7 (356-410)||(12164462-12164516)
chr7 (356-410)||(12175987-12176041)
[»] chr8 (1 HSPs)
chr8 (356-410)||(36668314-36668368)


Alignment Details
Target: chr1 (Bit Score: 505; Significance: 0; HSPs: 20)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 505; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 13101589 - 13101045
Alignment:
Q  10 cgaagaaaatcttgacaggttcttgtatgaaagtattacgttttccaagcaagagcgatgcaagtgcagcagcagtgaagagatggatgacttcctaaaa 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13101589 cgaagaaaatcttgacaggttcttgtatgaaagtattacgttttccaagcaagagcaatgcaagtgcagcagcagtgaagagatggatgacttcctaaaa 13101490  T
Q  110 gcactaacgaaggaaggatcgggaaagggggaaatggatgagaagtatcttagagacaatgcaatcactctctttttagcaggaaatggcccagttagtt 209  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13101489 gcactaacgaaggaaggatctggaaagggggaaatggatgagaagtatcttagagacaatgtaatcactctctttttagcaggaaatggcccagttagtt 13101390  T
Q  210 cagctctcagttggtttttctggcttgtttccactcatcctattgtggaagccaaaataattcaagaaatcaaagataactgtcctacacaagaggagaa 309  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13101389 cagctctcagttggtttttctggcttgtttccactcatcctattgtggaagccaaaataattcaagaaatcaaagataactgtcctacacaagaggagaa 13101290  T
Q  310 tcagattccttcgagagatgtggatcttgataagctagtgtacctccatggagctatatgtgaaaccttgaggctttatcctcctgtaccttttgagcat 409  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13101289 tcagattccttcgagagatgagtatcttgataagctagtgtacctccatggagctatatgtgaaaccttgaggctttatcctcctgtaccttttgagcat 13101190  T
Q  410 atctgtgcaatcaaatccgatatactacctagtggagagcgtgttagtccaaatacaaggttattgtactctttgtatgctatgggaaggatggaacaaa 509  Q
    || ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13101189 atatgttcaatcaaatccgatatacttcctagtggagagcgttttagtccaaatacaaggttattgtactctttgtacgctatgggaaggatggaacaaa 13101090  T
Q  510 tatggggagaagactgcatggaatttaagcctgagagatgggtgt 554  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13101089 tatggggagaagactgcatggaatttaagcctgagagatgggtgt 13101045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 401; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 13007789 - 13007245
Alignment:
Q  10 cgaagaaaatcttgacaggttcttgtatgaaagtattacgttttccaagcaagagcgatgcaagtgcagcagcagtgaagagatggatgacttcctaaaa 109  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||| ||  |||||    
T  13007789 cgaaaaaaatcttgacagtttcttgtatgaaagaataacattttccaaacaagagcaaagcaagtgcagcagcagtgaagaaatggatgattttgtaaaa 13007690  T
Q  110 gcactaacgaaggaaggatcgggaaagggggaaatggatgagaagtatcttagagacaatgcaatcactctctttttagcaggaaatggcccagttagtt 209  Q
    ||||| | |||||||||| | ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  13007689 gcacttatgaaggaaggagctggaaacgggggaatggacgagaagtatcttagagacaatgtcctcactctctttttagcaggaaatggcacaattagtt 13007590  T
Q  210 cagctctcagttggtttttctggcttgtttccactcatcctattgtggaagccaaaataattcaagaaatcaaagataactgtcctacacaagaggagaa 309  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  13007589 caggtctcagttggtttttctggcttgtttcaactcatcctattgtggaagccaaaattattcaagaaatcaaagataactggcccacacaagaggagaa 13007490  T
Q  310 tcagattccttcgagagatgtggatcttgataagctagtgtacctccatggagctatatgtgaaaccttgaggctttatcctcctgtaccttttgagcat 409  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13007489 tcagactcctttgagagatgtggatcttgataagctagtgtacctccatggagctctatgtgaagccatgaggctttatcctcctgtaccttttgagcat 13007390  T
Q  410 atctgtgcaatcaaatccgatatactacctagtggagagcgtgttagtccaaatacaaggttattgtactctttgtatgctatgggaaggatggaacaaa 509  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13007389 atctgtgcaatcaattccgatatactacctagtggagagcgtgttagtccaaatacaaggttattgtactctttgtacgctatgggaaggatggaacaaa 13007290  T
Q  510 tatggggagaagactgcatggaatttaagcctgagagatgggtgt 554  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13007289 tatggggagaagactgcatggaatttaagcctgagagatgggtgt 13007245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 387; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 552
Target Start/End: Original strand, 13069779 - 13070321
Alignment:
Q  10 cgaagaaaatcttgacaggttcttgtatgaaagtattacgttttccaagcaagagcgatgcaagtgcagcagcagtgaagagatggatgacttcctaaaa 109  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||| |||| || |||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||| | || ||||||||  |||||    
T  13069779 cgaagaaaatcttgaccgtttcttgtatgaaggtataacattttccaaacaagagcaaagcaagtgcagcagcagtgaataaattgatgactttgtaaaa 13069878  T
Q  110 gcactaacgaaggaaggatcgggaaagggggaaatggatgagaagtatcttagagacaatgcaatcactctctttttagcaggaaatggcccagttagtt 209  Q
    ||||| | |||||||| ||  ||||   ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  13069879 gcactgatgaaggaagaatatggaacaaggggaatggatgagaagtatcttagagacaatgcactctctctctttttagcaggaaatggcacagttactt 13069978  T
Q  210 cagctctcagttggtttttctggcttgtttccactcatcctattgtggaagccaaaataattcaagaaatcaaagataactgtcctacacaagaggagaa 309  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||    
T  13069979 caggtctcagttggtttttctggcttgtttcaactcatcctattgtggaagccaaaattattcaagaaataaaagataactggcccacacaagaggagaa 13070078  T
Q  310 tcagattccttcgagagatgtggatcttgataagctagtgtacctccatggagctatatgtgaaaccttgaggctttatcctcctgtaccttttgagcat 409  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  13070079 tcagactccttggagagatgtggatcttgataatctagtgtaccttcatggagctatatgtgaaaccttgagactttatcctcctgtaccttttgagcat 13070178  T
Q  410 atctgtgcaatcaaatccgatatactacctagtggagagcgtgttagtccaaatacaaggttattgtactctttgtatgctatgggaaggatggaacaaa 509  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13070179 atatgtgcaatcaaatccgatatactacctagtggagagcgtgttagtccaaatacaaggttattgtactctttgtacgctatgggaaggatggaacaaa 13070278  T
Q  510 tatggggagaagactgcatggaatttaagcctgagagatgggt 552  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13070279 tatggggagaagactgcatggaatttaagcctgagagatgggt 13070321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 333; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 116 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 13204942 - 13204506
Alignment:
Q  116 acgaaggaaggatcgggaaagggggaaatggatgagaagtatcttagagacaatgcaatcactctctttttagcaggaaatggcccagttagttcagctc 215  Q
    |||||||||||||  |||||||  ||||||  || ||||| |||||||||| || || || ||||||| |||||||||| ||| |||| |||||||| ||    
T  13204942 acgaaggaaggatatggaaaggaagaaatgagtgggaagtttcttagagacgatacactctctctcttcttagcaggaagtggtccagctagttcaggtc 13204843  T
Q  216 tcagttggtttttctggcttgtttccactcatcctattgtggaagccaaaataattcaagaaatcaaagataactgtcctacacaagaggagaatcagat 315  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13204842 taagttggtttttttggcttgtttccactcatcctattgtggaagccaaaataattcaagaaatcaaagataactgtcctacacaagaggagaatcagat 13204743  T
Q  316 tccttcgagagatgtggatcttgataagctagtgtacctccatggagctatatgtgaaaccttgaggctttatcctcctgtaccttttgagcatatctgt 415  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  13204742 tccttcgagagatgagtatcttgataagctagtgtaccttcatggagctatatgtgaagccttgagactttatcctcctgtaccttttgagcatatatgt 13204643  T
Q  416 gcaatcaaatccgatatactacctagtggagagcgtgttagtccaaatacaaggttattgtactctttgtatgctatgggaaggatggaacaaatatggg 515  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13204642 gcaatcaaatccgatatactacctagtggagagcgtgttagtccaaatacaaggttattgtactctttgtacgctatgggaaggatggaacaaatatggg 13204543  T
Q  516 gagaagactgcatggaatttaagcctgagagatgggt 552  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13204542 gagaagactgcatggaatttaagcctgagagatgggt 13204506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 29 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 19727723 - 19727316
Alignment:
Q  29 ttcttgtatgaaagtattacgttttccaagcaagagcgatgcaagtgcagcagcagtgaagagatggatgacttcctaaaagcactaacgaaggaaggat 128  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19727723 ttcttgtatgaaagtattacattttccaagcaagagcaaagcaagtgcagcagcagtgaagagatggatgacttcctaaaagcactaatgaaggaaggat 19727624  T
Q  129 cgggaaagggggaaatggatgagaagtatcttagagacaatgcaatcactctctttttagcaggaaatggcccagttagttcagctctcagttggttttt 228  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  19727623 ctggaaagggggaaatgaatgagaagtatcttagagacaatttactcactctctttttagcaggaaatggcccagttagtacaggtctcagttggttttt 19727524  T
Q  229 ctggcttgtttccactcatcctattgtggaagccaaaataattcaagaaatcaaagataactgtcctacacaagaggagaatcagattccttcgagagat 328  Q
     ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||| ||||| |||||||    
T  19727523 ttggcttgtttcgactcatcctattgtcgaagccaaaattattcaagaaatcaaagataactggcccacacaagaggagaaccagactcctttgagagat 19727424  T
Q  329 gtggatcttgataagctagtgtacctccatggagctatatgtgaaaccttgaggctttatcctcctgtaccttttgagcatatctgtgcaatcaaatccg 428  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||      
T  19727423 gtggatcttgataagctagtgtacctccacggagatctatgttaagccttgagactttatcctcctgtaccttttgagcatatatgtgcaatcaaatctc 19727324  T
Q  429 atatacta 436  Q
    ||||||||    
T  19727323 atatacta 19727316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 105 - 550
Target Start/End: Complemental strand, 13162015 - 13161570
Alignment:
Q  105 taaaagcactaacgaaggaaggatcgggaaagggggaaatggatgagaagtatcttagagacaatgcaatcactctctttttagcaggaaatggcccagt 204  Q
    ||||||| |||| ||| |||||||  ||||||||||||||   |||||||||||||||||| | |||| ||||| |  | || || ||||||||  || |    
T  13162015 taaaagccctaaagaaagaaggatatggaaagggggaaatcagtgagaagtatcttagagatactgcactcactatggtgtttgccggaaatggttcaat 13161916  T
Q  205 tagttcagctctcagttggtttttctggcttgtttccactcatcctattgtggaagccaaaataattcaagaaatcaaagataactgtcctacacaagag 304  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||  ||||| |||||||| ||||||||||| || |  |||||||||    
T  13161915 tagttcagctctcagttggtttttctggctcctttcaacttatcctattgtggaagaaaaaatcattcaagagatcaaagataattggctaacacaagag 13161816  T
Q  305 gagaatcagattccttcgagagatgtggatcttgataagctagtgtacctccatggagctatatgtgaaaccttgaggctttatcctcctgtaccttttg 404  Q
    || |||| ||||  || ||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  13161815 gataatcggattattttgagggatgtggttcttgataagctagtatacctccatggagctatatgtgaaaccttaaggctttatccacctataccttttg 13161716  T
Q  405 agcatatctgtgcaatcaaatccgatatactacctagtggagagcgtgttagtccaaatacaaggttattgtactctttgtatgctatgggaaggatgga 504  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  13161715 agcatatctgtgcaatcaaatccgatatactacctagtggagaacgtattagtccaaatacaagtttaatgtactctatgtattctatgggcaggatgga 13161616  T
Q  505 acaaatatggggagaagactgcatggaatttaagcctgagagatgg 550  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13161615 acaactatggggggaagactgcatggaatttaagcctgagagatgg 13161570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 105 - 550
Target Start/End: Complemental strand, 13130322 - 13129877
Alignment:
Q  105 taaaagcactaacgaaggaaggatcgggaaagggggaaatggatgagaagtatcttagagacaatgcaatcactctctttttagcaggaaatggcccagt 204  Q
    ||||||| |||| ||| |||||||  |||||||| |||||   |||||||||||||||||| | |||| | ||| | ||||| || ||||||||  || |    
T  13130322 taaaagccctaaagaatgaaggatatggaaagggtgaaatcagtgagaagtatcttagagatactgcatttactatgttttttgccggaaatggttcaat 13130223  T
Q  205 tagttcagctctcagttggtttttctggcttgtttccactcatcctattgtggaagccaaaataattcaagaaatcaaagataactgtcctacacaagag 304  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||  ||||| |||||||| ||||||||||| ||    |||||||||    
T  13130222 tagttcagctctcagttggtttttctggcttctttcaacttatcctattgtggaagaaaaaatcattcaagagatcaaagataattggttaacacaagag 13130123  T
Q  305 gagaatcagattccttcgagagatgtggatcttgataagctagtgtacctccatggagctatatgtgaaaccttgaggctttatcctcctgtaccttttg 404  Q
    |  |||| |||| ||| |||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  13130122 ggtaatcggattactttgaggcatgtggatcttgataagctagtatacctccatggagctatatgtgaaaccttaaggctttatcctcctataccttttg 13130023  T
Q  405 agcatatctgtgcaatcaaatccgatatactacctagtggagagcgtgttagtccaaatacaaggttattgtactctttgtatgctatgggaaggatgga 504  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||  ||  | |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13130022 agcatatctgttcaatcaaatctgatatactacctagtggataccatgttagtccaaatacaactttgatttactctttgtattctatgggaaggatgga 13129923  T
Q  505 acaaatatggggagaagactgcatggaatttaagcctgagagatgg 550  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13129922 acaaatatggggagaagactgcatggaatttaagcctgagagatgg 13129877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 105 - 550
Target Start/End: Complemental strand, 13094893 - 13094448
Alignment:
Q  105 taaaagcactaacgaaggaaggatcgggaaagggggaaatggatgagaagtatcttagagacaatgcaatcactctctttttagcaggaaatggcccagt 204  Q
    ||||||| |||| ||| ||||||   |||||||| |||||   |||||||||||||||||||| |||| | ||| |  | || || ||||||||  || |    
T  13094893 taaaagccctaaagaatgaaggacatggaaagggagaaatcagtgagaagtatcttagagacactgcatttactatgatatttgccggaaatggtacaat 13094794  T
Q  205 tagttcagctctcagttggtttttctggcttgtttccactcatcctattgtggaagccaaaataattcaagaaatcaaagataactgtcctacacaagag 304  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||  ||||| |||||||| |||| |||||| ||    |||| ||||    
T  13094793 tagttcagctctcagttggtttttctggcttctttcaacttatcctattgtggaagaaaaaatcattcaagagatcagagataattggttaacacgagag 13094694  T
Q  305 gagaatcagattccttcgagagatgtggatcttgataagctagtgtacctccatggagctatatgtgaaaccttgaggctttatcctcctgtaccttttg 404  Q
    ||  ||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13094693 gattatcggattactttgagggatgtggatcttgataagctagtatacctccatggagctatatgtgaaaccttaaggctttatcctcctgtaccttttg 13094594  T
Q  405 agcatatctgtgcaatcaaatccgatatactacctagtggagagcgtgttagtccaaatacaaggttattgtactctttgtatgctatgggaaggatgga 504  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | | ||||| |||||||||||  ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13094593 agcatatctgtgcaatcaaatctgatatactacctagtggataccatgttactccaaatacaactttaatttactctttgtattctatgggaaggatgga 13094494  T
Q  505 acaaatatggggagaagactgcatggaatttaagcctgagagatgg 550  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13094493 acaaatatggggagaagactgcatggaatttaagcctgagagatgg 13094448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 11 - 552
Target Start/End: Original strand, 30367697 - 30368253
Alignment:
Q  11 gaagaaaatcttgacaggttcttgtatgaaagtattacgttttccaagc---aagagcgatgcaagtgcagcagcagtgaagagatggatga-------- 99  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||| | || ||| |||| |   |||||  | |||||||||||||||||||||| ||||||||            
T  30367697 gaagaaaatcttgaccgattcttgtatgaaagtgtaacatttgccaaacgcgaagagaaaagcaagtgcagcagcagtgaagaaatggatgaatcttatt 30367796  T
Q  100 ----cttcctaaaagcactaacgaaggaaggatcgggaaagggggaaatggatgagaagtatcttagagacaatgcaatcactctctttttagcaggaaa 195  Q
        |||  |||||||||| | ||||||||| || ||||| | || | ||  ||||||||||||||||||||||||| || |||| || |||||||| ||    
T  30367797 tcaactttgtaaaagcactgatgaaggaaggttctggaaatgagggagtgagtgagaagtatcttagagacaatgcactctctcttttgttagcaggtaa 30367896  T
Q  196 tggcccagttagttcagctctcagttggtttttctggcttgtttccactcatcctattgtggaagccaaaataattcaagaaatcaaagataactgtcct 295  Q
    |||| || ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||       
T  30367897 tggcacacttagttcaagtctcagttggtttttctggcttgtttcaactcatcctattgtggaagccaaaattattcaagagatcaaagataattgtgta 30367996  T
Q  296 acacaagaggagaatcagattccttcgagagatgtggatcttgataagctagtgtacctccatggagctatatgtgaaaccttgaggctttatcctcctg 395  Q
     || || | ||||||  |||  |||| |  |  |     |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||| | |||||| |||    
T  30367997 tcaaaacatgagaattggataacttcaatggtggaaagccttgataagctagtctacctccatggagctatatgtgaatccatgaggttgtatcctactg 30368096  T
Q  396 taccttttgagcatatctgtgcaatcaaatccgatatactacctagtggagagcgtgttagtccaaatacaaggttattgtactctttgtatgctatggg 495  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| | |||| | ||||||||||||||||||||    
T  30368097 taccttttgagcttatcagtgcaatcaaatctgatatactacctagtggagagaatgttagtccaaataccaagttaatttactctttgtatgctatggg 30368196  T
Q  496 aaggatggaacaaatatggggagaagactgcatggaatttaagcctgagagatgggt 552  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  30368197 aaggatggaaaaaatatggggagaagattgcatggaatttaagcctgagagatgggt 30368253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 22 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 13214396 - 13214104
Alignment:
Q  22 tgacaggttcttgtatgaaagtattacgttttccaagcaagagcgatgcaagtgcagcagcagtgaagagatggatgacttcctaaaagcactaacgaag 121  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  13214396 tgacagtttcttgtatgaaagtattacattttcgaagcaagagcaaagcaagtgcagcagcagtgaagagatggatgacttcgtaaaagcactaatgaag 13214297  T
Q  122 gaaggatcgggaaagggggaaatggatgagaagtatcttagagacaatgcaatcactctctttttagcaggaaatggcccagttagttcagctctcagtt 221  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||    
T  13214296 gaaggatttggaaagggggaaatggatgagaagtatcttagagacaatgcgatcactctctttttagcaggaaatggcccagttcgttcaggtctcattt 13214197  T
Q  222 ggtttttctggcttgtttccactcatcctattgtggaagccaaaataattcaagaaatcaaagataactgtcctacacaagaggagaatcaga 314  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| |||  || ||| |||||||||||||||    
T  13214196 ggtttttctggcttgtttcaactcatcttattgtggaagctaaaattattcaagaaataaaagattacttgcccacagaagaggagaatcaga 13214104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 123 - 550
Target Start/End: Original strand, 13064929 - 13065356
Alignment:
Q  123 aaggatcgggaaagggggaaatggatgagaagtatcttagagacaatgcaatcactctctttttagcaggaaatggcccagttagttcagctctcagttg 222  Q
    ||||| ||||||| ||| ||| |  |||||||||||||||||||| |||| ||| ||| || ||||| ||||| ||| |||||||||||| |||||||||    
T  13064929 aaggaacgggaaaagggaaaacgagtgagaagtatcttagagacactgcagtcaatctattgttagcgggaaacggcacagttagttcaggtctcagttg 13065028  T
Q  223 gtttttctggcttgtttccactcatcctattgtggaagccaaaataattcaagaaatcaaagataactgtcctacacaagaggagaatcagattccttcg 322  Q
    ||| || |||||||||||   ||||||| ||||||||||||| || |||||||| || |||||||| ||||   |  | || || ||   |||| ||||     
T  13065029 gttcttttggcttgtttcatgtcatcctgttgtggaagccaagattattcaagagatgaaagataattgtctatctgatgatgaaaacttgattacttca 13065128  T
Q  323 agagatgtggatcttgataagctagtgtacctccatggagctatatgtgaaaccttgaggctttatcctcctgtaccttttgagcatatctgtgcaatca 422  Q
    |  |  |   | |||||||| ||| | |||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| | ||||| |  | ||||||||    
T  13065129 attgtggaaaagcttgataaactaatttacctccacggagctatatgtgaagccttaaggctttatcctcctgtacctatcgagcaaaagtttgcaatca 13065228  T
Q  423 aatccgatatactacctagtggagagcgtgttagtccaaatacaaggttattgtactctttgtatgctatgggaaggatggaacaaatatggggagaaga 522  Q
    || | |||||||| ||||||||||  | ||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||| | ||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  13065229 aagctgatatacttcctagtggagtccatgtaagtccaaatacaaggatattatactatttgtattcaatgggaaggatggagaaaatatggggagaaga 13065328  T
Q  523 ctgcatggaatttaagcctgagagatgg 550  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13065329 ctgcatggaatttaagcctgagagatgg 13065356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 104 - 550
Target Start/End: Original strand, 13244212 - 13244664
Alignment:
Q  104 ctaaaagcactaacgaaggaaggatcgggaaagggggaaatg---gatgagaagtatcttagagacaatgcaatcactctctttttagcaggaaatggcc 200  Q
    ||||||| ||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||   |||||||||||| | ||||||| |||  | | ||||||    |||||||||||      
T  13244212 ctaaaagaactaatgaaggaaagattgggaaagggggaaatgatcgatgagaagtatatcagagacactgcggtaaatctcttcggtgcaggaaatggaa 13244311  T
Q  201 cagttagttcagctctcagttggtttttctggcttgtttccactcatcctattgtggaagccaaaataattcaagaaatcaaagataactgtcctacaca 300  Q
    || ||||||||| ||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||  |||||    
T  13244312 caattagttcaggtctaagttggttcttttggcttgtttcaactcatcctattggggaagcgaaaattattcaagagatcaaagataattgtctaacaca 13244411  T
Q  301 agaggagaatcagattccttcgagagatgtggatc---ttgataagctagtgtacctccatggagctatatgtgaaaccttgaggctttatcctcctgta 397  Q
    ||||||||||   ||   |     | | |||||     |||||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |     
T  13244412 agaggagaatttaatcaataatttaaacgtggaaaagattgataagcttgtttaccttcatggagccatatgtgaaaccttgaggctatatcctcctctg 13244511  T
Q  398 ccttttgagcatatctgtgcaatcaaatccgatatactacctagtggagagcgtgttagtccaaatacaaggttattgtactctttgtatgctatgggaa 497  Q
     | ||| |||| |  || || |||||||| |||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||| |||  | || ||||||||||| |||||||    
T  13244512 gcatttcagcacaagtgcgctatcaaatctgatatactacctagtggagaacatgttggtccaaatacaaagttgatatattctttgtatgcaatgggaa 13244611  T
Q  498 ggatggaacaaatatggggagaagactgcatggaatttaagcctgagagatgg 550  Q
    ||||| |||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||| ||||||    
T  13244612 ggatgcaacaaatatggggagatgattgcttggaatttaagcctgaaagatgg 13244664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 105 - 550
Target Start/End: Original strand, 19278863 - 19279311
Alignment:
Q  105 taaaagcactaacgaaggaaggatcgggaaagggggaaatggatgagaagtatcttagagacaatgcaatcactctctttttagcaggaaatggcccagt 204  Q
    |||||| ||||| ||||||| ||| ||||||||| |||| | |||||| |||| ||||||||| |||  ||| ||||||    ||||| |||||  || |    
T  19278863 taaaagaactaatgaaggaaagattgggaaagggcgaaacgaatgagatgtatattagagacactgctctcaatctcttggctgcaggtaatggaacaat 19278962  T
Q  205 tagttcagctctcagttggtttttctggcttgtttccactcatcctattgtggaagccaaaataattcaagaaatcaaagataactgtcctacacaagag 304  Q
    |||||| | ||||| |||||| || ||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| | |||||||   ||| |||||    
T  19278963 tagttcgggtctcaattggttcttttggctcgtatcaactcatcctattgtcgaagcaaaaattattcaagagatcaaggttaactgtttaacaaaagag 19279062  T
Q  305 gagaatcagattcc---ttcgagagatgtggatcttgataagctagtgtacctccatggagctatatgtgaaaccttgaggctttatcctcctgtacctt 401  Q
    || |||  |||  |   ||  || |     || |||||||||||||| || || |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| |    
T  19279063 gataatttgatcacaaattttagtgtgaaagagcttgataagctagtttatcttcatggagctatatgtgaagccttaaggctttatccacctgtaccat 19279162  T
Q  402 ttgagcatatctgtgcaatcaaatccgatatactacctagtggagagcgtgttagtccaaatacaaggttattgtactctttgtatgctatgggaaggat 501  Q
    |||| || |  |||||| | || ||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||| |||| | |||||||||||||| |||||||||||    
T  19279163 ttgaacacaagtgtgcagttaattccgatatactacctagtggagaccatgttagtctaaatacaaagttaatatactctttgtatgcaatgggaaggat 19279262  T
Q  502 ggaacaaatatggggagaagactgcatggaatttaagcctgagagatgg 550  Q
    ||||||||||||||| || || ||| | ||||||  |||||||||||||    
T  19279263 ggaacaaatatggggtgatgattgcctagaatttcggcctgagagatgg 19279311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 120 - 550
Target Start/End: Original strand, 13080575 - 13081008
Alignment:
Q  120 aggaaggatcgggaaagggggaaatggatgagaagtatcttagagacaatgcaatcactctctttttagcaggaaatggcccagttagttcagctctcag 219  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||| ||||||| | | |||||| ||||||  | |||||||||||  || ||||| ||| |||||     
T  13080575 aggaaggattggaaaagggggaaatggttgagaggtatattagagatactacaatcaatctcttggttgcaggaaatggaacaattagtacaggtctcac 13080674  T
Q  220 ttggtttttctggcttgtttccactcatcctattgtggaagccaaaataattcaagaaatcaaagataactgtcctacacaagaggagaatcagattcct 319  Q
    ||||||||| ||||| ||||| || |||||||  || || |  ||||| |||||||| ||||||||||| |||   | ||| || ||||||   ||  ||    
T  13080675 ttggtttttttggctggtttcaacgcatcctagggtagatggtaaaattattcaagagatcaaagataattgtttaaaacacgatgagaattttatcgct 13080774  T
Q  320 tcgagagatgtggat---cttgataagctagtgtacctccatggagctatatgtgaaaccttgaggctttatcctcctgtaccttttgagcatatctgtg 416  Q
         || ||||||    |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||| ||||| |||||| ||||| | ||| |||| |  ||||    
T  13080775 aatttaggtgtggaagagcttgataagctagtttaccttcatggagccatatgtgaagccttaaggctatatccttctgtagcatttcagcacaagtgtg 13080874  T
Q  417 caatcaaatccgatatactacctagtggagagcgtgttagtccaaatacaaggttattgtactctttgtatgctatgggaaggatggaacaaatatgggg 516  Q
    | |||||||| |||| ||| ||||||||||| | ||||||||||||||||| |||| | || ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  13080875 ctatcaaatcggataaacttcctagtggagaccatgttagtccaaatacaaagttaatatattctttgtatgcaatgggaaggatggagcaaatatgggg 13080974  T
Q  517 agaagactgcatggaatttaagcctgagagatgg 550  Q
    ||| || ||| |||| ||||||||||||||||||    
T  13080975 agaggattgcttggagtttaagcctgagagatgg 13081008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 147 - 550
Target Start/End: Complemental strand, 13272041 - 13271635
Alignment:
Q  147 atgagaagtatcttagagacaatgcaatcactctctttttagcaggaaatggcccagttagttcagctctcagttggtttttctggcttgtttccactca 246  Q
    |||| |||||| ||||||||| |||| ||||||||||    |||||||||||  |||||||||||| ||| |||||||| || ||||||||||| |||||    
T  13272041 atgaaaagtatattagagacactgcattcactctcttggctgcaggaaatggaacagttagttcaggtctaagttggttcttttggcttgtttcaactca 13271942  T
Q  247 tcctattgtggaagccaaaataattcaagaaatcaaagataactgtcctacacaagaggagaatcagattccttcgagagatgtggatc---ttgataag 343  Q
    ||||| ||||||||| ||| | |||||||| ||||||||| | ||||  |||||||||||||||  |||   |     | |||| ||     ||||||||    
T  13271941 tcctaatgtggaagcaaaacttattcaagagatcaaagatcattgtctaacacaagaggagaatttgatcaataatttaaatgttgaaaacattgataag 13271842  T
Q  344 ctagtgtacctccatggagctatatgtgaaaccttgaggctttatcctcctgtaccttttgagcatatctgtgcaatcaaatccgatatactacctagtg 443  Q
    ||  | ||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||| || |  |||||| | || || ||||||||||||||||    
T  13271841 ctgatttaccttcatgcagctatatgtgaaaccttgagactttatcctcctataccatttgatcacaagtgtgcagttaattctgatatactacctagtg 13271742  T
Q  444 gagagcgtgttagtccaaatacaaggttattgtactctttgtatgctatgggaaggatggaacaaatatggggagaagactgcatggaatttaagcctga 543  Q
    || | | |||| ||||||| |||| |||| | |||||||||||||| |||||||| ||||||||  ||||||| |  || ||| |||| |||||||||||    
T  13271741 gacaccatgttggtccaaacacaaagttaatatactctttgtatgcaatgggaagaatggaacatgtatggggtggtgattgcttggagtttaagcctga 13271642  T
Q  544 gagatgg 550  Q
    |||||||    
T  13271641 gagatgg 13271635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 335 - 550
Target Start/End: Original strand, 12963803 - 12964018
Alignment:
Q  335 cttgataagctagtgtacctccatggagctatatgtgaaaccttgaggctttatcctcctgtaccttttgagcatatctgtgcaatcaaatccgatatac 434  Q
    ||||||||||| || || || ||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||| |||| ||||| || |  |||||||| ||||| ||||||     
T  12963803 cttgataagcttgtttatcttcatggagctatttgtgaagctttaaggctttatcctcctataccatttgaacacaagtgtgcaattaaatcagatatat 12963902  T
Q  435 tacctagtggagagcgtgttagtccaaatacaaggttattgtactctttgtatgctatgggaaggatggaacaaatatggggagaagactgcatggaatt 534  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||  | || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  12963903 tacctagtggagaccatgttagtccaaatacaaagttgatatattctttgtatgcaatgggaaggatggaacaaatatggggagaagattgcttggaatt 12964002  T
Q  535 taagcctgagagatgg 550  Q
    ||||||||| ||||||    
T  12964003 taagcctgaaagatgg 12964018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 152 - 550
Target Start/End: Complemental strand, 13086557 - 13086156
Alignment:
Q  152 aagtatcttagagacaatgcaatcactctctttttagcaggaaatggcccagttagttcagctctcagttggtttttctggcttgtttccactcatccta 251  Q
    |||||| ||||||||| |||| ||| ||||||    ||||||| |||  |||||||||||| ||| |||||||| |  ||||||||||| ||||||   |    
T  13086557 aagtatattagagacactgcattcaatctcttagctgcaggaagtggaacagttagttcaggtctaagttggttctcttggcttgtttcaactcatttca 13086458  T
Q  252 ttgtggaagccaaaataattcaagaaatcaaagataactgtcctacacaagaggagaatcagattcct---tcgagagatgtggatcttgataagctagt 348  Q
    | |||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||   |||| ||||| |||  | |  ||   |  |||| ||   | ||| |||| |||||    
T  13086457 tagtggaagctaaaataattcaagagataaaagataattgtctatcacatgaggataatttggtcactaatttaagagttgaaaagcttaataaactagt 13086358  T
Q  349 gtacctccatggagctatatgtgaaaccttgaggctttatcctcctgtaccttttgagcatatctgtgcaatcaaatccgatatactacctagtggagag 448  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||| |||| |  |||||||||||| | ||||||||||||||||||||     
T  13086357 gtaccttcatggagctatatgtgaagcattgaggctttatcctcctgtaccatttcagcacaagtgtgcaatcaaagctgatatactacctagtggagat 13086258  T
Q  449 cgtgttagtccaaatacaaggttattgtactctttgtatgctatgggaaggatggaacaaatatggggagaagactgcatggaatttaagcctgagagat 548  Q
      |||||  |||||||| | |||| | |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||  | ||  || | ||||||||||| |||||||    
T  13086257 tatgttaaaccaaatactaagttaatatactctttgtatgcaatgggaaggatgaaacaaatatggggtaaggatcgcttcgaatttaagcccgagagat 13086158  T
Q  549 gg 550  Q
    ||    
T  13086157 gg 13086156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 104 - 288
Target Start/End: Original strand, 12963605 - 12963789
Alignment:
Q  104 ctaaaagcactaacgaaggaaggatcgggaaagggggaaatggatgagaagtatcttagagacaatgcaatcactctctttttagcaggaaatggcccag 203  Q
    |||||||  |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||| ||| | |||   || ||| ||||||    ||||||| |||  |||    
T  12963605 ctaaaagatctaatgaaggaaggattgggaaagggggaaatggctgagaaatatattataaacacaacactcaatctcttagctgcaggaagtggaacag 12963704  T
Q  204 ttagttcagctctcagttggtttttctggcttgtttccactcatcctattgtggaagccaaaataattcaagaaatcaaagataa 288  Q
    ||||||||| ||| |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| |||||||| || ||||||||    
T  12963705 ttagttcaggtctaagttggttcttttggcttgtttcaactcatcctattgtggaaactaaaattattcaagagattaaagataa 12963789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 10 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 13010842 - 13010795
Alignment:
Q  10 cgaagaaaatcttgacaggttcttgtatgaaagtattacgttttccaa 57  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || ||||||||    
T  13010842 cgaagaaaatcttgaccgattcttgtatgaaagtataacattttccaa 13010795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 10 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 13205060 - 13205005
Alignment:
Q  10 cgaagaaaatcttgacaggttcttgtatgaaagtattacgttttccaagcaagagc 65  Q
    |||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||    
T  13205060 cgaagaaaatcttgaccgattcttatatgaaagtataacattttccaaacaagagc 13205005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 67; Significance: 2e-29; HSPs: 1)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 152 - 293
Target Start/End: Original strand, 31396420 - 31396562
Alignment:
Q  152 aagtatcttagagacaatgcaatcactctctttttagcaggaaatggcccagttagttcagctctcagttggtttttctggcttg-tttccactcatcct 250  Q
    |||||||||||||||||||   || |||| || ||||||||||||||| || ||||||||  |||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  31396420 aagtatcttagagacaatgtgctctctcttttgttagcaggaaatggcacaattagttcaagtctcggttggtttttctggcttgttttcaactcatcct 31396519  T
Q  251 attgtggaagccaaaataattcaagaaatcaaagataactgtc 293  Q
    | ||||||||||||||| |||||||| ||  ||||||||||||    
T  31396520 aatgtggaagccaaaattattcaagagattcaagataactgtc 31396562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 2)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 356 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 12164516 - 12164462
Alignment:
Q  356 catggagctatatgtgaaaccttgaggctttatcctcctgtaccttttgagcata 410  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||  |||||||||||||||    
T  12164516 catggagctttatgtgaagccttgaggctttatccgccgataccttttgagcata 12164462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 356 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 12176041 - 12175987
Alignment:
Q  356 catggagctatatgtgaaaccttgaggctttatcctcctgtaccttttgagcata 410  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| || ||||| |||||||    
T  12176041 catggagctttatgtgaagccttgaggctttatcctccggttcctttagagcata 12175987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000005; HSPs: 1)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 356 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 36668368 - 36668314
Alignment:
Q  356 catggagctatatgtgaaaccttgaggctttatcctcctgtaccttttgagcata 410  Q
    ||||||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||  |||||||||||||||    
T  36668368 catggagctttatgtgaagccttaaggctttatccaccaataccttttgagcata 36668314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University