View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF17710_high_15 (Length: 341)

Name: NF17710_high_15
Description: NF17710
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF17710_high_15
NF17710_high_15
[»] scaffold0234 (2 HSPs)
scaffold0234 (23-341)||(2043-2362)
scaffold0234 (23-341)||(10934-11253)
[»] chr8 (41 HSPs)
chr8 (23-341)||(21940831-21941150)
chr8 (23-341)||(22171653-22171972)
chr8 (23-341)||(6094289-6094608)
chr8 (23-341)||(24642815-24643133)
chr8 (81-341)||(15326422-15326683)
chr8 (81-341)||(15506791-15507052)
chr8 (202-341)||(28548393-28548532)
chr8 (34-341)||(14983651-14983950)
chr8 (29-341)||(8371255-8371563)
chr8 (37-341)||(21969333-21969633)
chr8 (37-341)||(12562123-12562423)
chr8 (29-327)||(38232115-38232412)
chr8 (32-228)||(24797224-24797419)
chr8 (37-341)||(27007519-27007819)
chr8 (37-341)||(27014662-27014962)
chr8 (37-341)||(27880489-27880789)
chr8 (37-341)||(28020670-28020970)
chr8 (37-341)||(22130611-22130911)
chr8 (37-341)||(25611195-25611495)
chr8 (38-341)||(22659496-22659795)
chr8 (37-341)||(21916676-21916976)
chr8 (37-341)||(45534275-45534575)
chr8 (29-246)||(18835342-18835556)
chr8 (37-341)||(26240484-26240784)
chr8 (25-302)||(32872609-32872880)
chr8 (105-341)||(6430953-6431186)
chr8 (113-258)||(8781959-8782102)
chr8 (60-234)||(2375214-2375386)
chr8 (236-333)||(24796731-24796826)
chr8 (175-327)||(20535226-20535377)
chr8 (40-134)||(29645537-29645631)
chr8 (105-341)||(2962934-2963171)
chr8 (194-316)||(29645675-29645797)
chr8 (37-144)||(36970265-36970371)
chr8 (84-136)||(10920427-10920479)
chr8 (56-111)||(24535514-24535569)
chr8 (23-58)||(28555049-28555084)
chr8 (230-341)||(36970439-36970549)
chr8 (281-341)||(8968017-8968077)
chr8 (283-331)||(41368106-41368154)
chr8 (283-331)||(41375077-41375125)
[»] chr6 (43 HSPs)
chr6 (23-341)||(17684191-17684510)
chr6 (23-341)||(27380974-27381293)
chr6 (23-341)||(27471357-27471676)
chr6 (23-341)||(11651889-11652208)
chr6 (23-341)||(17691162-17691481)
chr6 (23-341)||(29309056-29309375)
chr6 (23-341)||(29316016-29316334)
chr6 (23-341)||(188699-189018)
chr6 (105-341)||(27296877-27297114)
chr6 (71-341)||(16394167-16394438)
chr6 (103-339)||(25536915-25537152)
chr6 (122-341)||(16559194-16559414)
chr6 (19-326)||(13359010-13359314)
chr6 (40-333)||(2669476-2669768)
chr6 (23-127)||(16566257-16566361)
chr6 (37-341)||(16789071-16789371)
chr6 (37-341)||(22859890-22860190)
chr6 (37-341)||(1586110-1586410)
chr6 (37-341)||(27508349-27508649)
chr6 (37-329)||(27527947-27528235)
chr6 (37-202)||(18019981-18020143)
chr6 (37-341)||(14074480-14074780)
chr6 (29-321)||(10359073-10359359)
chr6 (37-341)||(8612915-8613219)
chr6 (38-240)||(17850321-17850521)
chr6 (107-258)||(20736413-20736562)
chr6 (38-166)||(27925935-27926062)
chr6 (55-160)||(28172754-28172859)
chr6 (29-161)||(20553492-20553622)
chr6 (90-334)||(8510155-8510399)
chr6 (105-246)||(21994655-21994794)
chr6 (105-341)||(17120507-17120740)
chr6 (35-246)||(19218427-19218630)
chr6 (36-215)||(22560311-22560487)
chr6 (23-75)||(25537148-25537200)
chr6 (112-258)||(5758565-5758709)
chr6 (37-132)||(13995151-13995245)
chr6 (51-172)||(19347092-19347212)
chr6 (202-265)||(28172899-28172963)
chr6 (230-341)||(33317055-33317165)
chr6 (35-246)||(4073574-4073781)
chr6 (187-326)||(28756145-28756283)
chr6 (37-73)||(20736594-20736630)
[»] chr4 (56 HSPs)
chr4 (23-341)||(18262378-18262697)
chr4 (23-341)||(18269239-18269558)
chr4 (23-341)||(55612849-55613168)
chr4 (23-341)||(26963806-26964125)
chr4 (23-341)||(26970629-26970948)
chr4 (23-341)||(868763-869082)
chr4 (23-341)||(19926482-19926801)
chr4 (23-341)||(5707486-5707805)
chr4 (23-341)||(5714114-5714433)
chr4 (23-341)||(8858333-8858652)
chr4 (23-341)||(10621055-10621374)
chr4 (29-341)||(10628134-10628447)
chr4 (23-341)||(28392856-28393175)
chr4 (23-341)||(8845369-8845688)
chr4 (23-341)||(4426338-4426645)
chr4 (29-341)||(35223732-35224045)
chr4 (33-341)||(5667851-5668156)
chr4 (23-341)||(20311458-20311775)
chr4 (112-338)||(10677308-10677534)
chr4 (112-338)||(10890948-10891174)
chr4 (37-341)||(15461497-15461797)
chr4 (37-341)||(34975551-34975851)
chr4 (37-341)||(2677013-2677313)
chr4 (37-341)||(15815021-15815321)
chr4 (37-341)||(18111045-18111345)
chr4 (37-341)||(3369025-3369325)
chr4 (37-325)||(17299977-17300261)
chr4 (37-341)||(18163162-18163462)
chr4 (37-341)||(20243937-20244237)
chr4 (37-341)||(26531613-26531913)
chr4 (37-341)||(4675985-4676285)
chr4 (33-169)||(56516232-56516368)
chr4 (38-341)||(5870419-5870718)
chr4 (37-327)||(19365519-19365806)
chr4 (37-341)||(1941724-1942024)
chr4 (93-242)||(21453961-21454110)
chr4 (58-330)||(32646536-32646807)
chr4 (105-326)||(19362477-19362695)
chr4 (37-241)||(32636484-32636685)
chr4 (112-341)||(9487625-9487851)
chr4 (29-327)||(5616387-5616681)
chr4 (105-327)||(5528495-5528714)
chr4 (37-258)||(4546080-4546298)
chr4 (41-119)||(24700213-24700291)
chr4 (112-327)||(9538033-9538244)
chr4 (124-341)||(30040491-30040705)
chr4 (127-341)||(11421096-11421307)
chr4 (215-265)||(24701361-24701411)
chr4 (234-315)||(9937745-9937826)
chr4 (29-81)||(10677538-10677590)
chr4 (29-81)||(10891178-10891230)
chr4 (25-95)||(9937933-9938003)
chr4 (84-166)||(34777893-34777975)
chr4 (93-246)||(33888594-33888743)
chr4 (37-73)||(11421016-11421052)
chr4 (29-73)||(30040740-30040784)
[»] chr3 (46 HSPs)
chr3 (23-341)||(6110230-6110549)
chr3 (23-341)||(16482205-16482524)
chr3 (23-341)||(10579077-10579396)
chr3 (23-341)||(15600606-15600925)
chr3 (23-341)||(15607151-15607470)
chr3 (23-341)||(10572314-10572633)
chr3 (23-341)||(15341941-15342260)
chr3 (23-341)||(18520141-18520460)
chr3 (30-339)||(18522836-18523146)
chr3 (38-341)||(8490676-8490980)
chr3 (23-341)||(15357308-15357627)
chr3 (23-341)||(17780840-17781159)
chr3 (23-341)||(13211468-13211787)
chr3 (29-341)||(13248779-13249092)
chr3 (23-341)||(32056621-32056941)
chr3 (23-341)||(17199906-17200225)
chr3 (23-341)||(13516977-13517292)
chr3 (29-341)||(1647243-1647556)
chr3 (23-341)||(17136525-17136838)
chr3 (23-341)||(29925137-29925456)
chr3 (23-341)||(29974290-29974609)
chr3 (54-341)||(16200627-16200915)
chr3 (37-341)||(21034238-21034538)
chr3 (37-341)||(15846538-15846838)
chr3 (29-325)||(24253130-24253423)
chr3 (37-341)||(20147556-20147856)
chr3 (37-341)||(21398792-21399092)
chr3 (37-341)||(14890391-14890691)
chr3 (37-341)||(55427021-55427321)
chr3 (37-341)||(12299911-12300210)
chr3 (105-341)||(25978730-25978963)
chr3 (29-245)||(14147013-14147226)
chr3 (112-309)||(15526827-15527021)
chr3 (40-341)||(15317178-15317472)
chr3 (159-341)||(28088227-28088406)
chr3 (105-341)||(11787654-11787887)
chr3 (23-75)||(19089734-19089786)
chr3 (76-204)||(28953965-28954093)
chr3 (29-122)||(9504455-9504548)
chr3 (78-269)||(32280313-32280507)
chr3 (33-148)||(8251933-8252048)
chr3 (23-96)||(16200291-16200363)
chr3 (190-258)||(30464147-30464215)
chr3 (116-209)||(4189223-4189314)
chr3 (182-246)||(36138033-36138097)
chr3 (182-246)||(36142816-36142880)
[»] chr1 (38 HSPs)
chr1 (23-341)||(18252196-18252515)
chr1 (23-341)||(18532236-18532555)
chr1 (23-341)||(27131132-27131450)
chr1 (23-341)||(27310299-27310618)
chr1 (23-341)||(16358757-16359076)
chr1 (29-341)||(3855641-3855954)
chr1 (29-334)||(36816363-36816668)
chr1 (63-341)||(22641596-22641871)
chr1 (29-341)||(27277280-27277592)
chr1 (23-215)||(21171081-21171274)
chr1 (37-341)||(19706441-19706741)
chr1 (37-341)||(43802367-43802667)
chr1 (151-341)||(9916499-9916689)
chr1 (37-341)||(28134725-28135025)
chr1 (23-177)||(22657108-22657262)
chr1 (37-341)||(9456116-9456416)
chr1 (37-341)||(20391241-20391541)
chr1 (37-341)||(20779647-20779947)
chr1 (37-341)||(22670259-22670559)
chr1 (37-341)||(42816991-42817291)
chr1 (29-265)||(12014084-12014319)
chr1 (53-341)||(23507096-23507383)
chr1 (37-341)||(22612492-22612792)
chr1 (28-323)||(633925-634216)
chr1 (30-146)||(9917837-9917952)
chr1 (37-341)||(8727667-8727967)
chr1 (37-341)||(47667487-47667776)
chr1 (105-256)||(29096789-29096938)
chr1 (37-169)||(35930582-35930713)
chr1 (53-142)||(12006461-12006550)
chr1 (112-243)||(21881475-21881604)
chr1 (112-246)||(51997353-51997485)
chr1 (230-341)||(28145725-28145835)
chr1 (45-171)||(26923553-26923678)
chr1 (92-256)||(24301691-24301855)
chr1 (126-204)||(31236402-31236478)
chr1 (196-276)||(12006332-12006413)
chr1 (182-241)||(10852402-10852461)
[»] chr7 (49 HSPs)
chr7 (23-339)||(15152609-15152926)
chr7 (23-341)||(29327950-29328269)
chr7 (23-341)||(11535784-11536103)
chr7 (23-341)||(11542702-11543021)
chr7 (18-341)||(12750987-12751311)
chr7 (23-341)||(12738702-12739021)
chr7 (23-341)||(18561173-18561483)
chr7 (33-341)||(13392326-13392635)
chr7 (32-331)||(18257577-18257874)
chr7 (37-341)||(2204552-2204852)
chr7 (37-341)||(8464999-8465299)
chr7 (37-341)||(18400104-18400404)
chr7 (37-341)||(18407088-18407388)
chr7 (37-341)||(48808498-48808798)
chr7 (37-331)||(30254138-30254428)
chr7 (37-341)||(15729751-15730051)
chr7 (37-341)||(18139340-18139640)
chr7 (37-341)||(19230888-19231188)
chr7 (104-325)||(2365169-2365389)
chr7 (105-341)||(41680970-41681203)
chr7 (37-331)||(47166871-47167161)
chr7 (37-341)||(10668903-10669204)
chr7 (29-258)||(19388544-19388774)
chr7 (112-341)||(34128647-34128873)
chr7 (38-321)||(24443349-24443628)
chr7 (37-341)||(28130561-28130861)
chr7 (56-341)||(10235361-10235644)
chr7 (37-305)||(19393462-19393726)
chr7 (35-321)||(25845498-25845780)
chr7 (35-321)||(25845917-25846199)
chr7 (105-341)||(18259126-18259359)
chr7 (195-332)||(39112138-39112275)
chr7 (38-146)||(47833875-47833983)
chr7 (23-78)||(15148308-15148363)
chr7 (28-137)||(19859113-19859221)
chr7 (112-246)||(14591924-14592056)
chr7 (112-246)||(16011515-16011647)
chr7 (119-257)||(31190524-31190660)
chr7 (32-170)||(3132849-3132986)
chr7 (42-160)||(7662569-7662686)
chr7 (112-243)||(22969024-22969153)
chr7 (29-115)||(7396361-7396450)
chr7 (194-269)||(22948499-22948574)
chr7 (102-160)||(7396469-7396527)
chr7 (156-341)||(15169292-15169474)
chr7 (71-126)||(29983179-29983234)
chr7 (34-137)||(39111989-39112092)
chr7 (33-75)||(2365070-2365112)
chr7 (189-253)||(29984308-29984372)
[»] chr5 (35 HSPs)
chr5 (29-341)||(24695188-24695501)
chr5 (23-341)||(19714220-19714539)
chr5 (23-341)||(19706941-19707259)
chr5 (23-341)||(18569583-18569904)
chr5 (53-337)||(17298627-17298912)
chr5 (23-221)||(39538754-39538953)
chr5 (53-337)||(17285476-17285759)
chr5 (29-256)||(18806843-18807069)
chr5 (170-341)||(27347258-27347428)
chr5 (37-341)||(20941027-20941327)
chr5 (236-341)||(24701952-24702057)
chr5 (37-341)||(25805387-25805687)
chr5 (37-341)||(31899-32199)
chr5 (37-341)||(12789665-12789965)
chr5 (34-210)||(22546872-22547046)
chr5 (37-341)||(22941250-22941550)
chr5 (37-341)||(23545922-23546222)
chr5 (37-341)||(24933308-24933608)
chr5 (39-331)||(20100255-20100543)
chr5 (37-341)||(31096816-31097116)
chr5 (37-330)||(5097651-5097940)
chr5 (37-341)||(7865432-7865736)
chr5 (37-341)||(12764992-12765296)
chr5 (119-256)||(18806483-18806619)
chr5 (119-256)||(18806663-18806799)
chr5 (95-341)||(18829283-18829530)
chr5 (37-341)||(9811735-9812039)
chr5 (37-341)||(12703876-12704180)
chr5 (29-117)||(27347425-27347513)
chr5 (37-341)||(26245102-26245402)
chr5 (258-341)||(28719477-28719558)
chr5 (105-246)||(26129789-26129928)
chr5 (262-341)||(39538954-39539033)
chr5 (40-169)||(33477193-33477321)
chr5 (38-82)||(39535465-39535509)
[»] scaffold0433 (1 HSPs)
scaffold0433 (23-341)||(7273-7592)
[»] scaffold0390 (2 HSPs)
scaffold0390 (23-341)||(6656-6975)
scaffold0390 (23-341)||(13672-13991)
[»] scaffold0220 (1 HSPs)
scaffold0220 (23-341)||(18454-18772)
[»] scaffold0186 (1 HSPs)
scaffold0186 (23-341)||(25712-26031)
[»] chr2 (28 HSPs)
chr2 (23-341)||(21329970-21330289)
chr2 (23-341)||(18796672-18796991)
chr2 (29-334)||(18619976-18620281)
chr2 (29-341)||(36270338-36270648)
chr2 (32-329)||(6991847-6992146)
chr2 (29-329)||(22183220-22183518)
chr2 (73-334)||(20978091-20978351)
chr2 (37-341)||(30174377-30174677)
chr2 (23-331)||(18822249-18822556)
chr2 (37-341)||(24250034-24250334)
chr2 (37-341)||(24229217-24229517)
chr2 (29-169)||(19279460-19279600)
chr2 (38-146)||(18851977-18852085)
chr2 (105-331)||(15342014-15342237)
chr2 (38-327)||(29800468-29800757)
chr2 (180-314)||(17241034-17241167)
chr2 (43-146)||(36801899-36802003)
chr2 (37-258)||(19616435-19616653)
chr2 (196-299)||(36799722-36799826)
chr2 (112-246)||(21626824-21626955)
chr2 (108-201)||(28718915-28719006)
chr2 (112-245)||(40301034-40301164)
chr2 (114-318)||(41316305-41316506)
chr2 (39-146)||(28741220-28741326)
chr2 (182-258)||(28740910-28740986)
chr2 (276-338)||(41661694-41661756)
chr2 (29-146)||(24763751-24763867)
chr2 (33-73)||(12098609-12098649)
[»] scaffold0657 (1 HSPs)
scaffold0657 (23-324)||(1159-1461)
[»] scaffold0063 (1 HSPs)
scaffold0063 (23-341)||(5695-6007)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (88-341)||(230113-230367)
[»] scaffold0112 (1 HSPs)
scaffold0112 (37-341)||(183-483)
[»] scaffold0264 (1 HSPs)
scaffold0264 (37-341)||(3677-3977)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (37-341)||(119730-120030)
[»] scaffold0466 (1 HSPs)
scaffold0466 (37-331)||(12961-13251)
[»] scaffold0001 (1 HSPs)
scaffold0001 (37-305)||(130262-130526)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (37-341)||(67376-67676)
[»] scaffold0378 (1 HSPs)
scaffold0378 (37-246)||(8305-8511)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (37-341)||(39990-40290)
[»] scaffold0111 (1 HSPs)
scaffold0111 (105-341)||(26609-26842)
[»] scaffold0039 (1 HSPs)
scaffold0039 (29-146)||(90033-90151)
[»] scaffold0297 (1 HSPs)
scaffold0297 (154-341)||(102-286)
[»] scaffold0136 (1 HSPs)
scaffold0136 (29-315)||(8723-9005)
[»] scaffold0034 (1 HSPs)
scaffold0034 (112-246)||(83111-83243)
[»] scaffold0376 (1 HSPs)
scaffold0376 (112-341)||(11528-11758)
[»] scaffold0086 (1 HSPs)
scaffold0086 (38-341)||(53766-54064)
[»] scaffold0099 (1 HSPs)
scaffold0099 (37-202)||(9110-9277)
[»] scaffold0118 (1 HSPs)
scaffold0118 (76-167)||(45956-46051)
[»] scaffold0496 (1 HSPs)
scaffold0496 (124-219)||(11328-11421)
[»] scaffold0393 (1 HSPs)
scaffold0393 (29-73)||(15089-15133)


Alignment Details
Target: scaffold0234 (Bit Score: 300; Significance: 1e-169; HSPs: 2)
Name: scaffold0234
Description:

Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 300; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 23 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 2362 - 2043
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 122  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2362 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 2263  T
Q  123 ggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttat-aaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2262 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 2163  T
Q  222 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccgttcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2162 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 2063  T
Q  322 gatgggtactccatgaatca 341  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  2062 gatgggtactccatgaatca 2043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234; HSP #2
Raw Score: 300; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 23 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 11253 - 10934
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 122  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11253 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 11154  T
Q  123 ggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttat-aaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11153 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 11054  T
Q  222 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccgttcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11053 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 10954  T
Q  322 gatgggtactccatgaatca 341  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  10953 gatgggtactccatgaatca 10934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 300; Significance: 1e-169; HSPs: 41)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 300; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 23 - 341
Target Start/End: Original strand, 21940831 - 21941150
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 122  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21940831 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 21940930  T
Q  123 ggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttat-aaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21940931 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 21941030  T
Q  222 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccgttcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21941031 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 21941130  T
Q  322 gatgggtactccatgaatca 341  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  21941131 gatgggtactccatgaatca 21941150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 23 - 341
Target Start/End: Original strand, 22171653 - 22171972
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 122  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22171653 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcatagatcatggataaagagttatcaagtcttcacataaatataaatatta 22171752  T
Q  123 ggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttat-aaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 221  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22171753 tgagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 22171852  T
Q  222 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccgttcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22171853 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 22171952  T
Q  322 gatgggtactccatgaatca 341  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  22171953 gatgggtactccatgaatca 22171972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 23 - 341
Target Start/End: Original strand, 6094289 - 6094608
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 122  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6094289 atcattaaagcatagagactattatatgggtagagtgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 6094388  T
Q  123 ggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttat-aaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6094389 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactatatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 6094488  T
Q  222 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccgttcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 321  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  6094489 cacccttcgaccagaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgttcgtaacaagatgactataaagttggtt 6094588  T
Q  322 gatgggtactccatgaatca 341  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  6094589 gatgggtactccatgaatca 6094608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 23 - 341
Target Start/End: Original strand, 24642815 - 24643133
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 122  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24642815 atcattaaagtatagagactattatgtgggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 24642914  T
Q  123 ggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttat-aaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24642915 ggagtaatatttatattggattgatcctccatgagaatactacatagtaaaa-ttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgataatggtgtattc 24643013  T
Q  222 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccgttcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 321  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24643014 cacccttcgaactgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcaagtgttttgtcaccattcaaacgtggtctgtaacaggatgactataaagttggtt 24643113  T
Q  322 gatgggtactccatgaatca 341  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  24643114 gatgggtactccatgaatca 24643133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 238; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 81 - 341
Target Start/End: Original strand, 15326422 - 15326683
Alignment:
Q  81 tggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttat- 179  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  15326422 tggagaaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatg 15326521  T
Q  180 aaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcac 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15326522 aaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcac 15326621  T
Q  280 cgttcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatca 341  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15326622 cattcaaatgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatca 15326683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 238; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 81 - 341
Target Start/End: Original strand, 15506791 - 15507052
Alignment:
Q  81 tggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttat- 179  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  15506791 tggagaaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatg 15506890  T
Q  180 aaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcac 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15506891 aaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcac 15506990  T
Q  280 cgttcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatca 341  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15506991 cattcaaatgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatca 15507052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 202 - 341
Target Start/End: Original strand, 28548393 - 28548532
Alignment:
Q  202 atagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccgttcaaacgttgtccgtaaca 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28548393 atagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaaca 28548492  T
Q  302 ggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatca 341  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28548493 gggtgactataaagttggttgatgggtactccatgaatca 28548532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 34 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 14983950 - 14983651
Alignment:
Q  34 atagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatt 133  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |    
T  14983950 atagggactattatgtgggtagactaatgatcatatctcacggatcatggaaaaagtgttatcaagtcttcacatagatgtagatattaggagtaata-t 14983852  T
Q  134 tatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaagtgtcataagatattctcatagtgat-agtggtgtattccacccttcgac 232  Q
    |||||| || ||| ||| ||||||||||||||||||  ||||||||  || ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||    
T  14983851 tatattagaatgacccgccatgagaatactacatag--aaagttatgtaaatgtcataagttattctcatagtgataagtggtgtattccgtccttcgac 14983754  T
Q  233 ctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccgttcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactc 332  Q
    |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||   ||| |||| ||      ||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||    
T  14983753 ctgaaatcactatgtaccctagatgtaagagtcgagtactttgttttcgtacaaaagt------taacaagatgactataaagtcagttgatgggtaatc 14983660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 29 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 8371563 - 8371255
Alignment:
Q  29 aaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagta 128  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||| ||||||||||| |||||    
T  8371563 aaagcatcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacataggtataaatattaagagta 8371465  T
Q  129 atatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 228  Q
    |||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | |||    
T  8371464 atatttatattggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatgaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctctt 8371367  T
Q  229 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccgttcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggt 328  Q
     |||||||||||||||||  ||||||||| |||| || ||||||||||  || ||| ||||||||| |||| |||||||  |||| ||||||||||||||    
T  8371366 agacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggatgatcataacgttggttgatgggt 8371268  T
Q  329 actccatgaatca 341  Q
    |||  ||||||||    
T  8371267 acttgatgaatca 8371255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 37 - 341
Target Start/End: Original strand, 21969333 - 21969633
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 136  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  |||||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21969333 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatggatcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 21969431  T
Q  137 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctga 236  Q
    |||||||||| ||  | |||||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| |||||||    
T  21969432 attggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatgaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctga 21969529  T
Q  237 aaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccgttcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatg 336  Q
    ||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  || ||| ||||||||| |||| ||||| |  |||| |||||||||||||||||  |||    
T  21969530 aaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgggtacttgatg 21969628  T
Q  337 aatca 341  Q
    |||||    
T  21969629 aatca 21969633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 37 - 341
Target Start/End: Original strand, 12562123 - 12562423
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 136  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12562123 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 12562221  T
Q  137 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctga 236  Q
    |||||||||| ||  | |||||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| |||||||    
T  12562222 attggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatgaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctga 12562319  T
Q  237 aaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccgttcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatg 336  Q
    ||||||||||  ||||||||| |||| || ||||||||||   | ||| ||||||||| |||| ||||| |  |||| |||||||||||||||||  |||    
T  12562320 aaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgtcattctaacgttgtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgggtacttgatg 12562418  T
Q  337 aatca 341  Q
    |||||    
T  12562419 aatca 12562423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 29 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 38232412 - 38232115
Alignment:
Q  29 aaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagta 128  Q
    |||||||| | |||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||| | |||||| | |||    
T  38232412 aaagcataaaaactattttgtgggtagactgataatcacatctcacggatcatggataaagagtgatccagtcttgacatagatacacatattatgggta 38232313  T
Q  129 atatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaagtgtcataagatattctcatagtgat-agtggtgtattccaccct 227  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||  ||||||||  || ||||| | | ||||| |||| |||| |||||||||||||| |||    
T  38232312 atatttatattggattgatccgccgtgagaatgctacatag--aaagttatgtaaatgtcacaggttattcgcataatgataagtggtgtattccatcct 38232215  T
Q  228 tcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccgttcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatggg 327  Q
      ||| |||||    | |||||||| ||||| | |||||||| ||||||   ||| |||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||    
T  38232214 cagacttgaaattgatgtgtacccttgatgtagaagtcgagtactttgttgtcgtacaaacgttgtccgtgacatgatggttataaagttggttgatggg 38232115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 32 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 24797419 - 24797224
Alignment:
Q  32 gcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaata 131  Q
    ||||||||||||||||||  ||| | ||||||  ||||||||  | ||||||||| || | ||||| |||||||| ||| ||||||||||| |||||| |    
T  24797419 gcatagagactattatgtgagtatattgatgactacatctcatgggtcatggatatag-gatatcatgtcttcacgtaggtataaatattatgagtaaaa 24797321  T
Q  132 tttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttat-aaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 228  Q
    |||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24797320 tttatactggattgacccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgat-gtggtgtattccaccctt 24797224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 37 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 27007819 - 27007519
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 136  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27007819 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 27007721  T
Q  137 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctga 236  Q
    |||||||||| ||    |||||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| |||||||    
T  27007720 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatgaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctga 27007623  T
Q  237 aaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccgttcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatg 336  Q
    ||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  || ||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  |||    
T  27007622 aaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgatg 27007524  T
Q  337 aatca 341  Q
    |||||    
T  27007523 aatca 27007519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 37 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 27014962 - 27014662
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 136  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27014962 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 27014864  T
Q  137 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctga 236  Q
    |||||||||| ||    |||||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| |||||||    
T  27014863 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatgaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctga 27014766  T
Q  237 aaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccgttcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatg 336  Q
    ||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  || ||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  |||    
T  27014765 aaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgatg 27014667  T
Q  337 aatca 341  Q
    |||||    
T  27014666 aatca 27014662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 37 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 27880789 - 27880489
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 136  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27880789 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 27880691  T
Q  137 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctga 236  Q
    |||||||||| ||    |||||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| |||||||    
T  27880690 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatgaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctga 27880593  T
Q  237 aaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccgttcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatg 336  Q
    ||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  || ||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  |||    
T  27880592 aaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgatg 27880494  T
Q  337 aatca 341  Q
    |||||    
T  27880493 aatca 27880489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 37 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 28020970 - 28020670
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 136  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28020970 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 28020872  T
Q  137 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctga 236  Q
    |||||||||| ||    |||||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| |||||||    
T  28020871 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatgaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctga 28020774  T
Q  237 aaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccgttcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatg 336  Q
    ||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  || ||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  |||    
T  28020773 aaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgatg 28020675  T
Q  337 aatca 341  Q
    |||||    
T  28020674 aatca 28020670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 37 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 22130911 - 22130611
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 136  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22130911 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 22130813  T
Q  137 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctga 236  Q
    |||||||||| ||    |||||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| |||||||    
T  22130812 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatgaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttggacctga 22130715  T
Q  237 aaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccgttcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatg 336  Q
    ||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  || ||| |||||||||  ||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  |||    
T  22130714 aaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctataaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgatg 22130616  T
Q  337 aatca 341  Q
    |||||    
T  22130615 aatca 22130611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 37 - 341
Target Start/End: Original strand, 25611195 - 25611495
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 136  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||   |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25611195 gagactattatgtatgtagactgatgactgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 25611293  T
Q  137 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctga 236  Q
    |||||||||| ||  | |||||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  ||| ||| |||||||    
T  25611294 attggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatgaaactgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcactcttagacctga 25611391  T
Q  237 aaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccgttcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatg 336  Q
    ||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  || ||| ||||||||| |||| ||||| |  |||  ||||||||||||| |||  |||    
T  25611392 aaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataatcatagtgttggttgatgggcacttgatg 25611490  T
Q  337 aatca 341  Q
    |||||    
T  25611491 aatca 25611495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 38 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 22659795 - 22659496
Alignment:
Q  38 agactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttata 137  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||   |||||||  | |||| ||||  ||| ||| ||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  22659795 agactattatgtatgtagactgatgactgcatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtctatacataggtataaatattaggagtaatatgtata 22659697  T
Q  138 ttggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaa 237  Q
     |||||||| ||  | |||||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| | ||||||  | | ||| ||||||||    
T  22659696 ctggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatgaaattgtcataagatattctcacaatgataatagtgtatatcgctcttagacctgaa 22659599  T
Q  238 accactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccgttcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatga 337  Q
    |||||||||  ||||||||| |||| || ||||||||||  || ||| ||| ||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||  ||||    
T  22659598 accactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacattgtctgtaaaaggataaccataacgttggttgatgggtacttgatga 22659500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 37 - 341
Target Start/End: Original strand, 21916676 - 21916976
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 136  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21916676 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatgcatagatataaatattaggagtaatatttat 21916774  T
Q  137 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctga 236  Q
    |||||||||| ||    |||||||||||||| ||  ||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| |||||||    
T  21916775 attggattgacccactgtgagaatactacattgt--aagttatgaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctga 21916872  T
Q  237 aaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccgttcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatg 336  Q
    ||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  || ||| ||||||||| |||| ||||| || ||||  |||||||||||| |||  |||    
T  21916873 aaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataactttggttgatgggcacttgatg 21916971  T
Q  337 aatca 341  Q
    |||||    
T  21916972 aatca 21916976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 37 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 45534575 - 45534275
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 136  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||| ||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  45534575 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtctatacatagatataaatattagaagtaatatttat 45534477  T
Q  137 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctga 236  Q
    |||||||||| ||    |||||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||    | ||| |||||||    
T  45534476 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatgaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatattgctcttagacctga 45534379  T
Q  237 aaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccgttcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatg 336  Q
    ||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  || ||| |||||||||  ||| ||||| || |||| |||||||||||||||||  |||    
T  45534378 aaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctataaaaggataacaataacgttggttgatgggtacttgatg 45534280  T
Q  337 aatca 341  Q
    |||||    
T  45534279 aatca 45534275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 29 - 246
Target Start/End: Original strand, 18835342 - 18835556
Alignment:
Q  29 aaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagta 128  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||| | |||||||||  | |||| ||||  ||| ||| ||||||  |||||  |||||||||||||||||    
T  18835342 aaagcatcgagactattatgtatgtagactgattaccacatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtctatacataagtataaatattaggagta 18835440  T
Q  129 atatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 228  Q
    ||||||||| |||||||| ||  | |||||||||||||||||  | ||| ||||| ||||||||||||||| || ||||||| ||||||||  ||| |||    
T  18835441 atatttatactggattgacccaccgtgagaatactacatagt--atgttttaaaaatgtcataagatattcacacagtgataatggtgtatatcactctt 18835538  T
Q  229 cgacctgaaaccactatg 246  Q
     |||||||||||| ||||    
T  18835539 agacctgaaaccattatg 18835556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 37 - 341
Target Start/End: Original strand, 26240484 - 26240784
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 136  Q
    |||||||||||||| | |||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||| |||| |  |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26240484 gagactattatgtatgaagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtatatacataggtataaatattaggagtaatatttat 26240582  T
Q  137 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctga 236  Q
    |||||||||| ||  | |||||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||  |  |||||  | | ||| ||||| |    
T  26240583 attggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatgaaattgtcataagatattctcacaatgattataatgtatatcgctcttagacctaa 26240680  T
Q  237 aaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccgttcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatg 336  Q
    ||||||||||  ||||||||| |||| || ||||||||||   | ||| ||||||||  |||| ||||| |  |||| |||||||||||||||||  |||    
T  26240681 aaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgtcattctaacgttgtttgtaaaaggataatcataacgttggttgatgggtacttgatg 26240779  T
Q  337 aatca 341  Q
    |||||    
T  26240780 aatca 26240784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 25 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 32872880 - 32872609
Alignment:
Q  25 catcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattagg 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||  | | |||| | ||||  ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| |  |||| ||||||     
T  32872880 catcaaagcatagagactattatgcggctggactcacgatcttatctcacagatcatgaataaagaggtatcaagtctttacatcggcataagtattagt 32872781  T
Q  125 agtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccac 224  Q
    | |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||  ||| ||    |||   |||| ||||||  |||| ||||||||||| ||||||||  |||    
T  32872780 aataatatttatattgaattgatctgtcatgagaatact--ataata----ttacgtaagtatcataaattattatcatagtgatattggtgtatgtcac 32872687  T
Q  225 ccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccgttcaaacgttgtccgtaacag 302  Q
    ||||| |  |||||||||||| || ||| ||||| | |||| ||| ||||||    ||||||||||||||| ||||||    
T  32872686 ccttcaatttgaaaccactatctatccttgatgtagaagtcaagtactttgttgttgttcaaacgttgtccataacag 32872609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 105 - 341
Target Start/End: Original strand, 6430953 - 6431186
Alignment:
Q  105 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaagtgtcataagatattctcata 204  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||| || ||  | |||||||||||||||||  ||||||| | | |||||||||||||||||| |    
T  6430953 acataggtataaatattaggagtaatatttatactagatagacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatgagattgtcataagatattctcaca 6431050  T
Q  205 gtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccgttcaaacgttgtccgtaacagga 304  Q
     ||||| | ||||||  | | ||  ||||||||| |||||||  ||||||||| |||| || ||| ||||||   | ||| ||||||||| |||| ||||    
T  6431051 atgataatagtgtatatcgctctaagacctgaaatcactatgatccctagatg-tggactcaagtactttgttgtcattctaacgttgtctgtaaaagga 6431149  T
Q  305 tgactataaagttggttgatgggtactccatgaatca 341  Q
    | || |||| |||||||||||||||||  ||||||||    
T  6431150 taaccataacgttggttgatgggtacttgatgaatca 6431186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 113 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 8782102 - 8781959
Alignment:
Q  113 ataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaagtgtcataagatattctcatagtgatagt 212  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||  | |||||||||||||||||    ||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |    
T  8782102 ataaatattaggactaatatttatacttgattgatccaccgtgagaatactacatagtct--gttatgaaaatgtcataagatattctcacaatgataat 8782005  T
Q  213 ggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgt 258  Q
    ||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||  ||||||||||    
T  8782004 ggtgtataccactcttagacttgaaaccactatgatccctagatgt 8781959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 60 - 234
Target Start/End: Original strand, 2375214 - 2375386
Alignment:
Q  60 atgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaa 159  Q
    ||||||||||| |||  ||||||||||| |||||||||| | |||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||  ||| | ||    
T  2375214 atgatcacatcacacgtatcatggataatgagttatcaaattttcacataaatataaatattatgagtaatatgtatattggattgaccctccattataa 2375313  T
Q  160 tactacatagtaaaagttataaaagtgtcataagatattctcatagtgat-agtggtgtattccacccttcgacct 234  Q
    | |||||||  |||||||||  ||   |||| || ||||||||||||||| |||||||||||| ||| || |||||    
T  2375314 ttctacata--aaaagttatgtaaaactcat-agttattctcatagtgataagtggtgtattcaaccatttgacct 2375386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 236 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 24796826 - 24796731
Alignment:
Q  236 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccgttcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactcc 333  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||  || |||| |  ||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  24796826 aaaccactatataccctagatgttggagtcgagtgctttatcaccattcaatcgt--tctgtaatataatggctataaaattggttgatgggtactcc 24796731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 175 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 20535377 - 20535226
Alignment:
Q  175 gttataaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgcttt 274  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||| |||| ||| |||||| ||||||||||  || || ||  |||| || ||||||||    
T  20535377 gttatgaaagtgtcataagatattctcacaatgataatggtgtataccactcttagacctggaaccactatgatccttaaat-atggactcaagtgcttt 20535279  T
Q  275 gtcaccgttcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatggg 327  Q
     |  || |||||||||||||  ||||||||| || |||| ||||||| |||||    
T  20535278 attgccattcaaacgttgtctataacaggataaccataatgttggttaatggg 20535226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 40 - 134
Target Start/End: Original strand, 29645537 - 29645631
Alignment:
Q  40 actattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatattt 134  Q
    ||||||| || |||| |||||||| |||||||||  | ||||| ||||||| ||||||| |||||||||| ||||||| |||| |||||||||||    
T  29645537 actattacgtgggtaaactgatgaccacatctcatggttcatgcataaagatttatcaactcttcacatatatataaacattaagagtaatattt 29645631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 105 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 2963171 - 2962934
Alignment:
Q  105 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataa----aagtgtcataagatattct 200  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |   |  ||||||||||||||||| |  |||| |    || ||||||||||||||||    
T  2963171 acataggtataaatattaggagtaatatttatactggatagacctaccgcgagaatactacatagtaca--ttatgagattaattgtcataagatattct 2963074  T
Q  201 catagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccgttcaaacgttgtccgtaac 300  Q
    || | ||||| | | ||||  | | ||| |||||||||||||||||  ||||||| || ||| || ||| ||||||  || ||| ||||||||| | ||     
T  2963073 cacaatgataatagcgtatatccctcttagacctgaaaccactatgatccctagacgt-ggactcaagtactttgtttccattctaacgttgtctgcaaa 2962975  T
Q  301 aggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatca 341  Q
    ||||| || |||| |||||||||||| ||||  ||||||||    
T  2962974 aggataaccataacgttggttgatggttacttgatgaatca 2962934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 194 - 316
Target Start/End: Original strand, 29645675 - 29645797
Alignment:
Q  194 atattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccgttcaaacgttgt 293  Q
    |||||||||||||||||||| |||| | |||| |||||||||||||  ||| ||| ||||||| | ||| || | | ||||||   |||||||| |||||    
T  29645675 atattctcatagtgatagtgatgtacttcaccattcgacctgaaacttctacgtatcctagatataggattcaatttctttgtagacgttcaaatgttgt 29645774  T
Q  294 ccgtaacaggatgactataaagt 316  Q
      |||| ||||||||||||||||    
T  29645775 ttgtaaaaggatgactataaagt 29645797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 37 - 144
Target Start/End: Original strand, 36970265 - 36970371
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 136  Q
    |||||||| ||||| ||||| |||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  36970265 gagactatcatgtatgtagattgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtctatacataggtataaatattaggagtaatatttat 36970363  T
Q  137 attggatt 144  Q
    | ||||||    
T  36970364 actggatt 36970371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 84 - 136
Target Start/End: Original strand, 10920427 - 10920479
Alignment:
Q  84 ataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 136  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||  ||||||||||| |||||||||||||    
T  10920427 ataaagagttatcaaatattcacatatgtataaatattatgagtaatatttat 10920479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 56 - 111
Target Start/End: Original strand, 24535514 - 24535569
Alignment:
Q  56 actgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacataga 111  Q
    ||||||||||| |||| || ||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||    
T  24535514 actgatgatcatatcttacggatcatgaataatgagttatcaagttttcacataga 24535569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 23 - 58
Target Start/End: Original strand, 28555049 - 28555084
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagact 58  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28555049 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagact 28555084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 230 - 341
Target Start/End: Original strand, 36970439 - 36970549
Alignment:
Q  230 gacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccgttcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggta 329  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| |||| || ||||||||||  || ||| |||||| |  |||| ||| | || |||| |||||||||||||||    
T  36970439 gacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttatatgtaaaagggtaacaataacgttggttgatgggta 36970537  T
Q  330 ctccatgaatca 341  Q
    ||  ||||||||    
T  36970538 cttgatgaatca 36970549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 281 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 8968077 - 8968017
Alignment:
Q  281 gttcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatca 341  Q
    ||||||||||||||| ||| | ||||| |||||||| |  ||||||||||||||| |||||    
T  8968077 gttcaaacgttgtccataaaaagatgattataaagtcgactgatgggtactccataaatca 8968017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 283 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 41368154 - 41368106
Alignment:
Q  283 tcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtact 331  Q
    |||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| || ||||||    
T  41368154 tcaaacgttgtctgtaacatgataactataaagttggttaataggtact 41368106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 283 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 41375125 - 41375077
Alignment:
Q  283 tcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtact 331  Q
    |||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| || ||||||    
T  41375125 tcaaacgttgtctgtaacatgataactataaagttggttaataggtact 41375077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 300; Significance: 1e-169; HSPs: 43)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 300; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 23 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 17684510 - 17684191
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 122  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17684510 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 17684411  T
Q  123 ggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttat-aaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17684410 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 17684311  T
Q  222 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccgttcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17684310 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 17684211  T
Q  322 gatgggtactccatgaatca 341  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  17684210 gatgggtactccatgaatca 17684191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 300; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 23 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 27381293 - 27380974
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 122  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27381293 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 27381194  T
Q  123 ggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttat-aaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27381193 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 27381094  T
Q  222 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccgttcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27381093 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 27380994  T
Q  322 gatgggtactccatgaatca 341  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  27380993 gatgggtactccatgaatca 27380974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 300; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 23 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 27471676 - 27471357
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 122  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27471676 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 27471577  T
Q  123 ggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttat-aaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27471576 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 27471477  T
Q  222 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccgttcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27471476 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 27471377  T
Q  322 gatgggtactccatgaatca 341  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  27471376 gatgggtactccatgaatca 27471357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 23 - 341
Target Start/End: Original strand, 11651889 - 11652208
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 122  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11651889 atcattaaagcatagagactattatgtgggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 11651988  T
Q  123 ggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttat-aaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11651989 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcataatgatagtggtgtattc 11652088  T
Q  222 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccgttcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11652089 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 11652188  T
Q  322 gatgggtactccatgaatca 341  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  11652189 gatgggtactccatgaatca 11652208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 23 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 17691481 - 17691162
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 122  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17691481 atcattaaagcataaagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacatatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 17691382  T
Q  123 ggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttat-aaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17691381 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 17691282  T
Q  222 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccgttcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17691281 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 17691182  T
Q  322 gatgggtactccatgaatca 341  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  17691181 gatgggtactccatgaatca 17691162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 23 - 341
Target Start/End: Original strand, 29309056 - 29309375
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 122  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29309056 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacatatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 29309155  T
Q  123 ggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttat-aaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29309156 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 29309255  T
Q  222 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccgttcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29309256 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcaggtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 29309355  T
Q  322 gatgggtactccatgaatca 341  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  29309356 gatgggtactccatgaatca 29309375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 23 - 341
Target Start/End: Original strand, 29316016 - 29316334
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 122  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29316016 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacatatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 29316115  T
Q  123 ggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttat-aaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29316116 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 29316215  T
Q  222 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccgttcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 321  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29316216 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtc-agtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 29316314  T
Q  322 gatgggtactccatgaatca 341  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  29316315 gatgggtactccatgaatca 29316334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 23 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 189018 - 188699
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 122  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  189018 atcattaaagcatagagactattatgtgggtagactgatgatcacatctcacatatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 188919  T
Q  123 ggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttat-aaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  188918 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 188819  T
Q  222 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccgttcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||    
T  188818 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgttatcattcaaatattgtctgtaacagaatgactataaagttgatt 188719  T
Q  322 gatgggtactccatgaatca 341  Q
    ||||| |||||||| |||||    
T  188718 gatggatactccataaatca 188699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 105 - 341
Target Start/End: Original strand, 27296877 - 27297114
Alignment:
Q  105 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttat-aaaagtgtcataagatattctcat 203  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27296877 acattgatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 27296976  T
Q  204 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccgttcaaacgttgtccgtaacagg 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27296977 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 27297076  T
Q  304 atgactataaagttggttgatgggtactccatgaatca 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27297077 atgactataaagttggttgatgggtactccatgaatca 27297114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 71 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 16394438 - 16394167
Alignment:
Q  71 tcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagt 170  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||| ||||    
T  16394438 tcacatatcatggataaacagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccaccatgagaatactacgtagt 16394339  T
Q  171 aaaagttat-aaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagt 269  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16394338 aaaagttatgaaaagtgtcataagatattcttatagtgatagtggtgtattccaccctttgacttgaaaccactatgtaccctagatgttggaatcgagt 16394239  T
Q  270 gctttgtcaccgttcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatca 341  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16394238 gctttgtcaccattcaaacgttgtctgtaacaagatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatca 16394167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 103 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 25537152 - 25536915
Alignment:
Q  103 tcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttat-aaaagtgtcataagatattctc 201  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25537152 tcacatagatataaatattaggtgtcatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctc 25537053  T
Q  202 atagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccgttcaaacgttgtccgtaaca 301  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25537052 atagtgacagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatttaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaaca 25536953  T
Q  302 ggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaat 339  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25536952 ggatgattataaagttggttgatgggtactccatgaat 25536915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 122 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 16559414 - 16559194
Alignment:
Q  122 aggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttat-aaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtatt 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16559414 aggagtaatatttatattggattgatccaccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtatt 16559315  T
Q  221 ccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccgttcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggt 320  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16559314 ccacccttcgacctgaaaccgctatgtaccgtagatgttggagtcgagtgttttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggt 16559215  T
Q  321 tgatgggtactccatgaatca 341  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  16559214 tgatgggtactccatgaatca 16559194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 19 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 13359314 - 13359010
Alignment:
Q  19 ggacatcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaat 118  Q
    ||||| ||| ||||| ||||||||||||| | | |||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||| |    
T  13359314 ggacaacattaaagcgtagagactattatatggatagactgatgatcacatctcgcaaatcatggataaaaagttatcaaatcttcacttagatataagt 13359215  T
Q  119 attaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaagtgtcataagatattctcatagtgata-gtggtgt 217  Q
    ||||| |||| ||||||||||| ||||   |  |||||  ||||||||| | |||  ||||  || ||||||||  |||||||||||||||| |||||||    
T  13359214 attagaagtagtatttatattgaattgtctcaccatga--atactacattgaaaa--ttatgtaaatgtcataaattattctcatagtgataagtggtgt 13359119  T
Q  218 attccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccgttcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagtt 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  |||||  |||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||     
T  13359118 attccacccttcgacctgaaaccactatgtaccttagatgtaggagtcgagtattttgttgccgtacaaacatcgtccgtaacaggatgactataaagtc 13359019  T
Q  318 ggttgatgg 326  Q
    |||||||||    
T  13359018 ggttgatgg 13359010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 40 - 333
Target Start/End: Original strand, 2669476 - 2669768
Alignment:
Q  40 actattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatatt 139  Q
    |||||||| | |||||| ||||||||||||||||   ||||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2669476 actattatatgggtagattgatgatcacatctcatgaatcattgattaagagttatcatgtattcacatagatataaatattaggagtaatatttatatt 2669575  T
Q  140 ggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaagtgtcataagatattctcatagtga-tagtggtgtattccacccttcgacctgaaa 238  Q
     ||||||  | |||||| ||||||||||||  || ||| |  |||| ||||||| ||||||||||||||  ||| |||||||||||  || |||||||||    
T  2669576 tgattgacacatcatgaaaatactacatag--aatgttgtttaagtatcataagttattctcatagtgacaagttgtgtattccactatttgacctgaaa 2669673  T
Q  239 ccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccgttcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactcc 333  Q
     || ||||||| |||||||| ||||||  || ||||||   |||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||    
T  2669674 tcattatgtactctagatgtaggagtccggtactttgttgtcgttcaaatgttatctataacaggatgactataaagtcagttgattggtactcc 2669768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 23 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 16566361 - 16566257
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 122  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16566361 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 16566262  T
Q  123 ggagt 127  Q
    |||||    
T  16566261 ggagt 16566257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 37 - 341
Target Start/End: Original strand, 16789071 - 16789371
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 136  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16789071 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 16789169  T
Q  137 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctga 236  Q
    |||||||||| ||    |||||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| |||||||    
T  16789170 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatgaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctga 16789267  T
Q  237 aaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccgttcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatg 336  Q
    ||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||   | ||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  |||    
T  16789268 aaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgtcattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgatg 16789366  T
Q  337 aatca 341  Q
    |||||    
T  16789367 aatca 16789371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 37 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 22860190 - 22859890
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 136  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22860190 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 22860092  T
Q  137 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctga 236  Q
    |||||||||| ||    |||||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| |||||||    
T  22860091 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatgaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctga 22859994  T
Q  237 aaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccgttcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatg 336  Q
    ||||||||||  | ||||||| |||| || |||| |||||  || ||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  |||    
T  22859993 aaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgttttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgatg 22859895  T
Q  337 aatca 341  Q
    |||||    
T  22859894 aatca 22859890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 37 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 1586410 - 1586110
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 136  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||| ||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1586410 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtctatacatagatataaatattagaagtaatatttat 1586312  T
Q  137 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctga 236  Q
    |||||||||| ||    |||||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||    | ||| |||||||    
T  1586311 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatgaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatattgctcttagacctga 1586214  T
Q  237 aaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccgttcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatg 336  Q
    ||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  || ||| ||||||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||  |||    
T  1586213 aaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggtacttgatg 1586115  T
Q  337 aatca 341  Q
    |||||    
T  1586114 aatca 1586110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 37 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 27508649 - 27508349
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 136  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  27508649 gagactgttatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttgt 27508551  T
Q  137 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctga 236  Q
    |||||||||| ||    |||||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| |||||||    
T  27508550 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatgaaaatgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctga 27508453  T
Q  237 aaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccgttcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatg 336  Q
    ||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  || ||| ||||||||| |||| ||||| |  |||| |||||||||||||||||  |||    
T  27508452 aaccactatgatctctagatg-tggattcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataaaaataacgttggttgatgggtacttgatg 27508354  T
Q  337 aatca 341  Q
    |||||    
T  27508353 aatca 27508349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 37 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 27528235 - 27527947
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 136  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  27528235 gagactgttatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttgt 27528137  T
Q  137 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctga 236  Q
    |||||||||| ||    |||||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| |||||||    
T  27528136 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatgaaaatgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctga 27528039  T
Q  237 aaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccgttcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggta 329  Q
    ||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  || ||| ||||||||| |||| ||||| |  |||| |||||||||||||||    
T  27528038 aaccactatgatctctagatg-tggattcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataaaaataacgttggttgatgggta 27527947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 37 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 18020143 - 18019981
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 136  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18020143 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 18020045  T
Q  137 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaagtgtcataagatattctca 202  Q
    |||||||||| ||  | |||||||||||||||||  ||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  18020044 attggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatgaaattgtcataagatattctca 18019981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 37 - 341
Target Start/End: Original strand, 14074480 - 14074780
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 136  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||| ||||||  |||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  14074480 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtctatacataggtataaatattgggagtaatatttat 14074578  T
Q  137 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctga 236  Q
    | |||||||| ||  | |||||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||| ||| | |||||   ||||||    | ||| |||||||    
T  14074579 aatggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatgaaattgtcataagatattttcacaatgataaaagtgtatattgctcttagacctga 14074676  T
Q  237 aaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccgttcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatg 336  Q
    ||||||||||  ||||||||| | || || ||||||||||  || ||| ||| ||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||  |||    
T  14074677 aaccactatgatccctagatg-tagactcaagtgctttgttgcctttctaacattgtctgtaaaaggataaccataacgttggttgatgggtacttgatg 14074775  T
Q  337 aatca 341  Q
    |||||    
T  14074776 aatca 14074780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 29 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 10359359 - 10359073
Alignment:
Q  29 aaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagta 128  Q
    ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||| |||||||||  | ||||| ||   ||| ||| ||||||  ||||||||||||||||||   |||    
T  10359359 aaagcgtagagactattatatatgtagagtgatgaccacatctcatgg-tcatgaatgt-gagatattaagtctatacatagatataaatattataggta 10359262  T
Q  129 atatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 228  Q
    ||||||||| ||||| || ||  | ||| |||||||||||||  | |||||  ||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||| |||| |||    
T  10359261 atatttatactggatcgacccaccgtgaaaatactacatagt--atgttat-gaagtgtcataagatattctcacaatgataatggtgtataccactctt 10359165  T
Q  229 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccgttcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 321  Q
     ||| |||||||||||||  ||||||||| |||| ||| ||||||| |   | ||||||| |||||||||||||||| || || |||||||||    
T  10359164 agacttgaaaccactatgatccctagatg-tggactcgtgtgctttattgtcattcaaacattgtccgtaacaggataaccattaagttggtt 10359073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 37 - 341
Target Start/End: Original strand, 8612915 - 8613219
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 136  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | | || ||||  ||| ||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8612915 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggttatagatat-gagatattaagtctatacataggtataaatattaggagtaatatttat 8613013  T
Q  137 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataa----aagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgac 232  Q
    | ||||| || ||  | ||||||||||||||||||   ||||| |    || |||||||||||||||||| | ||||| | ||||||  | | ||| |||    
T  8613014 actggatagacccaccgtgagaatactacatagtac--gttatgagattaattgtcataagatattctcacaatgataatagtgtatatcgctcttagac 8613111  T
Q  233 ctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccgttcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactc 332  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| |||| || |||  |||||  || ||| ||||||||| |||| ||||| || ||||  ||||||||||||||||     
T  8613112 ctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtattttgtttcccttctaacgttgtctgtaaaaggataaccataacattggttgatgggtactt 8613210  T
Q  333 catgaatca 341  Q
     ||||||||    
T  8613211 gatgaatca 8613219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 38 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 17850521 - 17850321
Alignment:
Q  38 agactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttata 137  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||| |||| | ||||||| || || ||||||||  || ||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  17850521 agactattatatgggtagactgatgatcatatcttatagatcattgacaacgagttatcgtgtattcacataggtataaatattatgagtaatatatata 17850422  T
Q  138 ttggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaa 237  Q
    ||||||||| ||  | | ||||||||||||  |     ||||  |||| ||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  17850421 ttggattgaccctccttaagaatactacat--tgggttttatgtaagtatcataagttattcttatagtgatagtgatgtataccaccctttgacctgaa 17850324  T
Q  238 acc 240  Q
    |||    
T  17850323 acc 17850321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 107 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 20736562 - 20736413
Alignment:
Q  107 atagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaagtgtcataagatattctcatagt 206  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||| |  | | ||| ||| |||||||||||||||||| |||    
T  20736562 ataggtataaatattaggagtaatatttatactggattgatccatcgtgagaatactacatatt--atgctatgaaaatgtcataagatattctcacagt 20736465  T
Q  207 gatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgt 258  Q
    |||| | ||||||  ||| ||| ||||| |||| ||||||  ||||||||||    
T  20736464 gataatagtgtatatcactcttagacctaaaactactatgatccctagatgt 20736413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 38 - 166
Target Start/End: Original strand, 27925935 - 27926062
Alignment:
Q  38 agactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttata 137  Q
    |||||||||||| | || |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||| || ||||||| |||||||||||    
T  27925935 agactattatgtggataaactgatgatctcatctcacggatcatggataaagatttatgaagttttcacatagatattaa-attaggaataatatttata 27926033  T
Q  138 ttggattgatccgtcatgagaatactaca 166  Q
    ||| |||||  || ||||| |||||||||    
T  27926034 ttgaattgactcgccatgataatactaca 27926062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 55 - 160
Target Start/End: Original strand, 28172754 - 28172859
Alignment:
Q  55 gactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcat 154  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| | |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||| | ||||||||||||||| ||  |||    
T  28172754 gactgatgatcacatcttacagatcattgttaaaaagttatcaagtctttacatagatataaatattaagggtagtgtttatattggattgaccctccat 28172853  T
Q  155 gagaat 160  Q
    ||||||    
T  28172854 gagaat 28172859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 29 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 20553622 - 20553492
Alignment:
Q  29 aaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagta 128  Q
    |||||||| ||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||   ||||||||||||| ||||||| || ||    
T  20553622 aaagcataaagatttttatgttggtagactgatgatcacatctcacatatcatcgataaagaaatatcaaacattcacatagatat-aatattaagaata 20553524  T
Q  129 atatttatattggattgatccgtcatgagaata 161  Q
    ||||||||||| |||||| || |||||||||||    
T  20553523 atatttatatt-gattgacccatcatgagaata 20553492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 90 - 334
Target Start/End: Original strand, 8510155 - 8510399
Alignment:
Q  90 agttatcaagtcttcacatagatataaa-tattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaagtgtc 188  Q
    ||||||||  |||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||| |||||| |    |||| ||||||||||||  || |||||  |||||||    
T  8510155 agttatcatttcttcatatagataaaaaatattagaagtaatatttatatttgattgacctacaatgataatactacatag--aatgttatgtaagtgtc 8510252  T
Q  189 ataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccgttcaaac 288  Q
    || || || |||||||||||| |||||| ||| ||  ||||| |||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||| |    | ||| ||    
T  8510253 attagttactctcatagtgatggtggtgcattacatgcttcggcctggaaccactatgtaccttagatgtaggagtcgagtactttatttttgctcatac 8510352  T
Q  289 -gttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactcca 334  Q
      |||| || |||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||    
T  8510353 atttgtgcgaaacaggataactataaagtcggttgataggtactcca 8510399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 105 - 246
Target Start/End: Original strand, 21994655 - 21994794
Alignment:
Q  105 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaagtgtcataagatattctcata 204  Q
    |||||| |||||| |||| |||||||||||||| |||| ||| ||  ||||||||||||| |||||  | ||||| ||| |||||||||||||| ||| |    
T  21994655 acatagctataaacattacgagtaatatttatactggaatgacccaccatgagaatactaaatagt--atgttatgaaaatgtcataagatattttcaca 21994752  T
Q  205 gtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatg 246  Q
     ||||| ||||||||  ||| ||| |||||||||| ||||||    
T  21994753 atgataatggtgtatatcactcttagacctgaaacgactatg 21994794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 105 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 17120740 - 17120507
Alignment:
Q  105 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaagtgtcataagatattctcata 204  Q
    |||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||    ||||||| ||| ||||||   ||||| ||| |||||||||||||||||| |    
T  17120740 acataggtataaatactaggagtagtatttatactggattgacccactgtgagaatgctaaatagtat--gttatgaaattgtcataagatattctcaca 17120643  T
Q  205 gtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccgttcaaacgttgtccgtaacagga 304  Q
     ||||| |  |||||  | | ||| |||||||||||||||||  ||||| |||| ||| || ||||||||||   | ||| ||||||||| || | ||||    
T  17120642 atgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctatatgt-ggactcaagtgctttgttgtcattctaacgttgtctgtcaaagga 17120544  T
Q  305 tgactataaagttggttgatgggtactccatgaatca 341  Q
    | || |||| |||||||||||||| ||  ||||||||    
T  17120543 taaccataacgttggttgatgggtgcttgatgaatca 17120507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 35 - 246
Target Start/End: Original strand, 19218427 - 19218630
Alignment:
Q  35 tagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatattt 134  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||  | ||||| || | ||| ||| ||||||  |||||  |||||||||||||||||| ||||    
T  19218427 tagagactattatgtatgtagactgatgaccacacctcatgggtcatgaat-atgagatattaagtctatacatatgtataaatattaggagtaaaattt 19218525  T
Q  135 atattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacct 234  Q
    ||     ||||| ||  | |||||||||||||||||  | ||||| ||| | |||||||||||||||| | ||||| || | ||| | || ||| |||||    
T  19218526 at-----attgacccaccgtgagaatactacatagt--atgttatgaaaatttcataagatattctcagaatgataatgatatatactactcttagacct 19218618  T
Q  235 gaaaccactatg 246  Q
    ||||||||||||    
T  19218619 gaaaccactatg 19218630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 36 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 22560487 - 22560311
Alignment:
Q  36 agagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatattta 135  Q
    ||||||||||||| | |||||| ||||| |||||||||  | |||||||||  ||| ||| |||| |  |||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  22560487 agagactattatgcatgtagaccgatgaccacatctcatgggtcatggatat-gagatattaagtttatacataggtttaaatattaggagtaatattta 22560389  T
Q  136 tattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggt 215  Q
    || || ||||| |    ||||||| ||||||||||  | ||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| ||||    
T  22560388 tactgtattgacctactatgagaacactacatagt--atgttatgaaaatgtcataagatattctcacaatgataatggt 22560311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 23 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 25537200 - 25537148
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcaca 75  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25537200 atcattaaagcataaagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcaca 25537148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 112 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 5758709 - 5758565
Alignment:
Q  112 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaagtgtcataagatattctcatagtgatag 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    |||||||||||||||||  | ||||| | | || ||||||||||||||| | | |||     
T  5758709 tataaatattaggagtaatatttatactggatagatccactgtgagaatactacatagt--acgttatgagattgccataagatattctcacaattataa 5758612  T
Q  212 tggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgt 258  Q
    | ||||||  | | ||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  5758611 tagtgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctagatgt 5758565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 37 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 13995245 - 13995151
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatat 132  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13995245 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatat 13995151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 51 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 19347212 - 19347092
Alignment:
Q  51 ggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccg 150  Q
    |||||| |||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| ||| || ||||||||  |||||| |||| || |||||||| || |||||||| | |    
T  19347212 ggtagattgatgaccatatctcacatatcattgataaagagttgtcatgttttcacataagtataaacatta-gaataatatttgtaatggattgaactg 19347114  T
Q  151 tcatgagaatactacatagtaa 172  Q
     ||| |||||||||||||||||    
T  19347113 ccattagaatactacatagtaa 19347092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 202 - 265
Target Start/End: Original strand, 28172899 - 28172963
Alignment:
Q  202 atagtgata-gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtc 265  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| | ||||||    
T  28172899 atagtgataagtggtgtattccacccttcgaccggaaaccagtatgtaccctagatataggagtc 28172963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 230 - 341
Target Start/End: Original strand, 33317055 - 33317165
Alignment:
Q  230 gacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccgttcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggta 329  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||| ||| || ||| ||||||  || ||| ||||||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||    
T  33317055 gacctgaaaccactatgatccctagatgt-ggactcaagtactttgtttccattctaacgttgtctgtaaaaggataaccataacgttggttgatgggta 33317153  T
Q  330 ctccatgaatca 341  Q
    ||  ||||||||    
T  33317154 cttgatgaatca 33317165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 35 - 246
Target Start/End: Original strand, 4073574 - 4073781
Alignment:
Q  35 tagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatattt 134  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||| ||||||||| || || ||||| |||  ||| ||| ||||||  |||||  | ||||||||||  |||||||||    
T  4073574 tagagactattatgtttgtagattgaggatcacatcccataggtcatgaatat-gagatattaagtctatacataagtgtaaatattagaggtaatattt 4073672  T
Q  135 atattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacct 234  Q
    ||||| |||||| |   | |||||||||||||||  | | ||||| ||| | |||||||||||||||||| |||||  | ||||| |||  ||| |||||    
T  4073673 atatttgattgacctaccgtgagaatactacata--atatgttatgaaaat-tcataagatattctcataatgataacgatgtataccaatcttagacct 4073769  T
Q  235 gaaaccactatg 246  Q
     |||||||||||    
T  4073770 aaaaccactatg 4073781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 187 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 28756283 - 28756145
Alignment:
Q  187 tcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccgttcaa 286  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || | |||  || |||  |||||||||||||| |||||| || |||| ||||||  || |||| |||||  ||||    
T  28756283 tcataaaatattctcatagtgataatgatttatctcatcctatgacctgaaaccactgtgtaccatatatgtaggagtcatgtactttatcacc-atcaa 28756185  T
Q  287 acgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 326  Q
    | |||||  |||||| |||| ||||||||| |||||||||    
T  28756184 atgttgtatgtaacaagatgcctataaagtcggttgatgg 28756145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 37 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 20736630 - 20736594
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctca 73  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  20736630 gagactattatgtatgtagactgatgaccacatctca 20736594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 300; Significance: 1e-169; HSPs: 56)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 300; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 23 - 341
Target Start/End: Original strand, 18262378 - 18262697
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 122  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18262378 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 18262477  T
Q  123 ggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttat-aaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18262478 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 18262577  T
Q  222 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccgttcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18262578 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 18262677  T
Q  322 gatgggtactccatgaatca 341  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  18262678 gatgggtactccatgaatca 18262697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 300; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 23 - 341
Target Start/End: Original strand, 18269239 - 18269558
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 122  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18269239 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 18269338  T
Q  123 ggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttat-aaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18269339 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 18269438  T
Q  222 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccgttcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18269439 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 18269538  T
Q  322 gatgggtactccatgaatca 341  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  18269539 gatgggtactccatgaatca 18269558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 300; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 23 - 341
Target Start/End: Original strand, 55612849 - 55613168
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 122  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55612849 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 55612948  T
Q  123 ggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttat-aaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55612949 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 55613048  T
Q  222 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccgttcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55613049 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 55613148  T
Q  322 gatgggtactccatgaatca 341  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  55613149 gatgggtactccatgaatca 55613168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 23 - 341
Target Start/End: Original strand, 26963806 - 26964125
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 122  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26963806 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 26963905  T
Q  123 ggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttat-aaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 221  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26963906 gcagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 26964005  T
Q  222 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccgttcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26964006 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 26964105  T
Q  322 gatgggtactccatgaatca 341  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  26964106 gatgggtactccatgaatca 26964125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 23 - 341
Target Start/End: Original strand, 26970629 - 26970948
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 122  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26970629 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 26970728  T
Q  123 ggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttat-aaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 221  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26970729 gcagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 26970828  T
Q  222 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccgttcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26970829 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 26970928  T
Q  322 gatgggtactccatgaatca 341  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  26970929 gatgggtactccatgaatca 26970948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 23 - 341
Target Start/End: Original strand, 868763 - 869082
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 122  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  868763 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaaaagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 868862  T
Q  123 ggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttat-aaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  868863 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgataatggtgtattc 868962  T
Q  222 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccgttcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  868963 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 869062  T
Q  322 gatgggtactccatgaatca 341  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  869063 gatgggtactccatgaatca 869082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 23 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 19926801 - 19926482
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 122  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19926801 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcaaatagatataaatatta 19926702  T
Q  123 ggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttat-aaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19926701 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaaatgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 19926602  T
Q  222 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccgttcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19926601 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 19926502  T
Q  322 gatgggtactccatgaatca 341  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  19926501 gatgggtactccatgaatca 19926482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 23 - 341
Target Start/End: Original strand, 5707486 - 5707805
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 122  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5707486 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 5707585  T
Q  123 ggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttat-aaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 221  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5707586 tgagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 5707685  T
Q  222 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccgttcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 321  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5707686 catccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaactttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 5707785  T
Q  322 gatgggtactccatgaatca 341  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  5707786 gatgggtactccatgaatca 5707805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 23 - 341
Target Start/End: Original strand, 5714114 - 5714433
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 122  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5714114 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 5714213  T
Q  123 ggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttat-aaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 221  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5714214 tgagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 5714313  T
Q  222 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccgttcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 321  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5714314 catccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaactttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 5714413  T
Q  322 gatgggtactccatgaatca 341  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  5714414 gatgggtactccatgaatca 5714433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 23 - 341
Target Start/End: Original strand, 8858333 - 8858652
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 122  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8858333 atcattaaagcatagagactattatgtgggtaggctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcatatagatataaatatta 8858432  T
Q  123 ggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttat-aaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8858433 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 8858532  T
Q  222 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccgttcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8858533 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 8858632  T
Q  322 gatgggtactccatgaatca 341  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  8858633 gatgggtactccatgaatca 8858652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 23 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 10621374 - 10621055
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 122  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  10621374 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatttta 10621275  T
Q  123 ggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttat-aaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  10621274 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgttttc 10621175  T
Q  222 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccgttcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10621174 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaactttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 10621075  T
Q  322 gatgggtactccatgaatca 341  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  10621074 gatgggtactccatgaatca 10621055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 29 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 10628447 - 10628134
Alignment:
Q  29 aaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagta 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10628447 aaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagta 10628348  T
Q  129 atatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttat-aaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccct 227  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  10628347 atatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgataatggtgttttccaccct 10628248  T
Q  228 tcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccgttcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatggg 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10628247 tcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaactttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatggg 10628148  T
Q  328 tactccatgaatca 341  Q
    ||||||||||||||    
T  10628147 tactccatgaatca 10628134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 280; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 23 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 28393175 - 28392856
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 122  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28393175 atcattaaagcatagagactattatgtgggtagactgatgatcacatctcacatatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 28393076  T
Q  123 ggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttat-aaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 221  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28393075 gaagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 28392976  T
Q  222 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccgttcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 321  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28392975 cacccttcaacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 28392876  T
Q  322 gatgggtactccatgaatca 341  Q
    |||| |||||||||||||||    
T  28392875 gatgagtactccatgaatca 28392856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 23 - 341
Target Start/End: Original strand, 8845369 - 8845688
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 122  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||    
T  8845369 atcattaaagcatagagactattatgtgggtaggctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaattctttatatagatataaatatta 8845468  T
Q  123 ggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttat-aaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8845469 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataatatattctcatagtgatagtggtgtattc 8845568  T
Q  222 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccgttcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 321  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8845569 catccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaatttggtt 8845668  T
Q  322 gatgggtactccatgaatca 341  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  8845669 gatgggtactccatgaatca 8845688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 23 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 4426645 - 4426338
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 122  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4426645 atcattaaagcatagagactattatgtgggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 4426546  T
Q  123 ggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattcc 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||| ||        |||   ||||||||||||||||||||||||||    
T  4426545 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaatctatgaa--------aag---ttctcatagtgatagtggtgtattcc 4426457  T
Q  223 acccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccgttcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttg 322  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4426456 acccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgttaccattcaaacattgtccgtaataggatgactataaagttggttg 4426357  T
Q  323 atgggtactccatgaatca 341  Q
    |||||||||||||||||||    
T  4426356 atgggtactccatgaatca 4426338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 29 - 341
Target Start/End: Original strand, 35223732 - 35224045
Alignment:
Q  29 aaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagta 128  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||| |||||  |||||||||||||||||    
T  35223732 aaagcatatagactattatgtgggtagacggatgatcacatctcacggatcatagataaagagttatcatgtctttacatatgtataaatattaggagta 35223831  T
Q  129 atatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttat-aaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccct 227  Q
    ||||||||| |||||||| ||  ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  35223832 atatttatactggattgaaccaccatgagaatactatatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtgttgtattccaccct 35223931  T
Q  228 tcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccgttcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatggg 327  Q
    | ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  35223932 ttgacctgaaaccacgatgtaccttagatgttggagtcgagtgctttatcaacattcaaacgttgtctgtaacaagatgactataaagttggttgatgtg 35224031  T
Q  328 tactccatgaatca 341  Q
    ||||||| ||||||    
T  35224032 tactccacgaatca 35224045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 33 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 5668156 - 5667851
Alignment:
Q  33 catagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatat 132  Q
    ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||  |||||| |||||| |||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  5668156 catagagactattatgtggatagaccgatgatca--tctcacggatcatagataaagagttatcatatcttcacgtaggtataaatattaggagtaatat 5668059  T
Q  133 ttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttat-aaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcga 231  Q
    ||||| ||||||||  |  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  5668058 ttatactggattgactcaccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttaga 5667959  T
Q  232 cctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccgttcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtact 331  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5667958 cctgaaaccactatgtaccctagatgttg--gtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtctgtaacaagatgactataaagttggttgatgggtact 5667861  T
Q  332 ccatgaatca 341  Q
    ||| ||||||    
T  5667860 ccacgaatca 5667851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 23 - 341
Target Start/End: Original strand, 20311458 - 20311775
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 122  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20311458 atcattaaagcatagagactattttgtgggtagattgatgatcacatatcatggatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatgtaaatatta 20311557  T
Q  123 ggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaagtgtcataagatattctcatagtgat-agtggtgtattc 221  Q
    |||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||  | ||||||  || | |||||   ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20311558 ggagtaatttttatattggattgacctgtcatgagaatactacatag--acagttatgtaactatcatacattattctcatagtgataagtggtgtattc 20311655  T
Q  222 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccgttcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 321  Q
    |||||||| || |||||||||||| |||||||||||| ||| |||||| ||||||  |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  20311656 cacccttctacttgaaaccactatttaccctagatgtaggattcgagtactttgttcccgtacaaacgttgtccgtagcaggatgactataaagtcggtt 20311755  T
Q  322 gatgggtactccatgaatca 341  Q
     || ||||||||| ||||||    
T  20311756 aatcggtactccacgaatca 20311775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 112 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 10677534 - 10677308
Alignment:
Q  112 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttat-aaaagtgtcataagatattctcatagtgata 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||   ||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10677534 tataaatattaggagtaatatttatactggattgacccactatgagaatactacatagtaaatgttatgaaaaatgtcataagatattctcatagtgata 10677435  T
Q  211 gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccgttcaaacgttgtccgtaacaggatgacta 310  Q
    |||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||  |||| || |||||||||  |||| | |||||| |    
T  10677434 gtggtgtatttcaccctttgacttgaaaccactatgtatcctagatgtaggagtcgagtgctttaccaccatttaaacgttgtttgtaataagatgac-a 10677336  T
Q  311 taaagttggttgatgggtactccatgaa 338  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||    
T  10677335 taaagttggtagatgggtactccatgaa 10677308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 112 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 10891174 - 10890948
Alignment:
Q  112 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttat-aaaagtgtcataagatattctcatagtgata 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||   ||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10891174 tataaatattaggagtaatatttatactggattgacccactatgagaatactacatagtaaatgttatgaaaaatgtcataagatattctcatagtgata 10891075  T
Q  211 gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccgttcaaacgttgtccgtaacaggatgacta 310  Q
    |||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||  |||| || |||||||||  |||| | |||||| |    
T  10891074 gtggtgtatttcaccctttgacttgaaaccactatgtatcctagatgtaggagtcgagtgctttaccaccatttaaacgttgtttgtaataagatgac-a 10890976  T
Q  311 taaagttggttgatgggtactccatgaa 338  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||    
T  10890975 taaagttggtagatgggtactccatgaa 10890948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 37 - 341
Target Start/End: Original strand, 15461497 - 15461797
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 136  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15461497 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 15461595  T
Q  137 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctga 236  Q
    |||||||||| ||  | |||||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| |||||||    
T  15461596 attggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatgaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctga 15461693  T
Q  237 aaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccgttcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatg 336  Q
    ||||||||||  ||||||||| |||| || ||||||||||  || ||| ||||||||| |||| ||||| |  |||| |||||||||||||||||  |||    
T  15461694 aaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgggtacttgatg 15461792  T
Q  337 aatca 341  Q
    |||||    
T  15461793 aatca 15461797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 37 - 341
Target Start/End: Original strand, 34975551 - 34975851
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 136  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34975551 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 34975649  T
Q  137 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctga 236  Q
    |||||||||| ||    |||||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| |||||||    
T  34975650 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatgaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctga 34975747  T
Q  237 aaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccgttcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatg 336  Q
    ||||||||||  ||||||||| |||| || ||||||||||  || ||| ||||||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||  |||    
T  34975748 aaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgtttccattctaacgttgtctgtaaaaggataaccataacgttggttgatgggtacttgatg 34975846  T
Q  337 aatca 341  Q
    |||||    
T  34975847 aatca 34975851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 37 - 341
Target Start/End: Original strand, 2677013 - 2677313
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 136  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2677013 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 2677111  T
Q  137 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctga 236  Q
    |||||||||| ||    |||||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| |||||||    
T  2677112 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatgaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctga 2677209  T
Q  237 aaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccgttcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatg 336  Q
    ||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  || ||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  |||    
T  2677210 aaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgatg 2677308  T
Q  337 aatca 341  Q
    |||||    
T  2677309 aatca 2677313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 37 - 341
Target Start/End: Original strand, 15815021 - 15815321
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 136  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15815021 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 15815119  T
Q  137 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctga 236  Q
    |||||||||| ||    |||||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| |||||||    
T  15815120 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatgaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctga 15815217  T
Q  237 aaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccgttcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatg 336  Q
    ||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  || ||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  |||    
T  15815218 aaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgatg 15815316  T
Q  337 aatca 341  Q
    |||||    
T  15815317 aatca 15815321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 37 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 18111345 - 18111045
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 136  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18111345 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 18111247  T
Q  137 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctga 236  Q
    |||||||||| ||    |||||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| |||||||    
T  18111246 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatgaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctga 18111149  T
Q  237 aaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccgttcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatg 336  Q
    ||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  || ||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  |||    
T  18111148 aaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgatg 18111050  T
Q  337 aatca 341  Q
    |||||    
T  18111049 aatca 18111045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 37 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 3369325 - 3369025
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 136  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  3369325 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttgt 3369227  T
Q  137 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctga 236  Q
    |||||||||| ||    |||||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| |||||||    
T  3369226 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatgaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctga 3369129  T
Q  237 aaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccgttcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatg 336  Q
    ||||||||||  | || |||| |||| || ||||||||||  || ||| ||||||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||  |||    
T  3369128 aaccactatgatctcttgatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggtacttgatg 3369030  T
Q  337 aatca 341  Q
    |||||    
T  3369029 aatca 3369025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 37 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 17300261 - 17299977
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 136  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17300261 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 17300163  T
Q  137 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctga 236  Q
    |||||||||| ||    |||||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| |||||||    
T  17300162 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatgaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctga 17300065  T
Q  237 aaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccgttcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatg 325  Q
    ||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  || ||| ||||||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||    
T  17300064 aaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatg 17299977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 37 - 341
Target Start/End: Original strand, 18163162 - 18163462
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 136  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||  | |||| ||||  ||| ||| ||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18163162 gagactattatgtatgtagactgatgatcgcatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtctatacatagatataaatattagaagtaatatttat 18163260  T
Q  137 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctga 236  Q
    |||||||| | ||    |||||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||    | ||| |||||||    
T  18163261 attggattcacccactgtgagaatactacatagt--aagttatgaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatattgctcttagacctga 18163358  T
Q  237 aaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccgttcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatg 336  Q
    ||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  || ||| ||||||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||  |||    
T  18163359 aaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggtacttgatg 18163457  T
Q  337 aatca 341  Q
    |||||    
T  18163458 aatca 18163462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 37 - 341
Target Start/End: Original strand, 20243937 - 20244237
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 136  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||| ||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20243937 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtctatacatagatataaatattagaagtaatatttat 20244035  T
Q  137 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctga 236  Q
    |||||||||| ||    |||||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||    | ||| |||||||    
T  20244036 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatgaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatattgctcttagacctga 20244133  T
Q  237 aaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccgttcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatg 336  Q
    ||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  || ||| ||||||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||  |||    
T  20244134 aaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggtacttgatg 20244232  T
Q  337 aatca 341  Q
    |||||    
T  20244233 aatca 20244237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 37 - 341
Target Start/End: Original strand, 26531613 - 26531913
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 136  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  26531613 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaaggctatacataaatataaatattaggagtaatatttat 26531711  T
Q  137 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctga 236  Q
    |||||||||| ||    |||||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| |||||||    
T  26531712 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatgaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctga 26531809  T
Q  237 aaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccgttcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatg 336  Q
    ||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  || ||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  |||    
T  26531810 aaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgatg 26531908  T
Q  337 aatca 341  Q
    |||||    
T  26531909 aatca 26531913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 37 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 4676285 - 4675985
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 136  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||| ||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4676285 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtctatacatagatataaatattagaagtaatatttat 4676187  T
Q  137 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctga 236  Q
    |||||||||| ||    |||||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||    | ||| |||||||    
T  4676186 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatgaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatattgctcttagacctga 4676089  T
Q  237 aaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccgttcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatg 336  Q
    ||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  || ||  ||||||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||  |||    
T  4676088 aaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattataacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggtacttgatg 4675990  T
Q  337 aatca 341  Q
    |||||    
T  4675989 aatca 4675985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 33 - 169
Target Start/End: Original strand, 56516232 - 56516368
Alignment:
Q  33 catagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatat 132  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| | |||||||||    
T  56516232 catagagactattatgtaggtagattaatgatcaaatctcacagataatggataaagagttatcaagtcttcacatacgtataaatatcatgagtaatat 56516331  T
Q  133 ttatattggattgatccgtcatgagaatactacatag 169  Q
    ||||||||||||||  ||  ||||||| |||||||||    
T  56516332 ttatattggattgactcgctatgagaacactacatag 56516368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 38 - 341
Target Start/End: Original strand, 5870419 - 5870718
Alignment:
Q  38 agactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttata 137  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5870419 agactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttata 5870517  T
Q  138 ttggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaa 237  Q
    ||||||||| ||    |||||||||||||||||  ||||||| ||| ||||||| |||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||||    
T  5870518 ttggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatgaaattgtcatatgatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaa 5870615  T
Q  238 accactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccgttcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatga 337  Q
    |||||||||  | ||||||| |||| || |||| |||||   | ||| |||||||||  ||| ||||| || |||| ||||||||||| |||||  ||||    
T  5870616 accactatgatctctagatg-tggactcaagtgttttgttgtcattctaacgttgtctataataggataacaataacgttggttgatgagtacttgatga 5870714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 37 - 327
Target Start/End: Original strand, 19365519 - 19365806
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 136  Q
    ||||||||||| || |||||||||||| |||||||||  | |||||  ||  ||| ||| || |||  |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19365519 gagactattatatacgtagactgatgaccacatctcatgggtcatgagtat-gagatattaaatctatacataggtataaatattaggagtaatatttat 19365617  T
Q  137 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaagtgtcataagatattctca-tagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 235  Q
    | |||||||| ||  | ||||| |||||||||||  | ||||| ||||||||||||||||||||||  | ||||| |||||||| |||| ||| ||||||    
T  19365618 actggattgacccaccgtgagagtactacatagt--atgttatgaaagtgtcataagatattctcaccaatgataatggtgtataccactcttagacctg 19365715  T
Q  236 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccgttcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatggg 327  Q
    |||||| ||||  ||||||||| |||| || |||||||| |   | ||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||| ||| |||||    
T  19365716 aaaccattatgatccctagatg-tggactcaagtgctttattgtcattcaaacgttgtctgtaacaggatgaccataacgttagttaatggg 19365806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 37 - 341
Target Start/End: Original strand, 1941724 - 1942024
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 136  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||  | | || ||||  ||| ||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1941724 gagactattatgtatatagactgatgaccgcatctcatgggttatagatat-gagatattaagtctatacataggtataaatattaggagtaatatttat 1941822  T
Q  137 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctga 236  Q
    |||||||| | ||  | |||||||||||||||||  ||||||| | | |||||| ||||||||||| | ||||| | ||||||  | | ||| |||||||    
T  1941823 attggattaacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatgagattgtcatgagatattctcacaatgataatagtgtatatcgctcttagacctga 1941920  T
Q  237 aaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccgttcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatg 336  Q
    ||||||||||  ||||||||| |||| || ||| ||||||  || ||| || |||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||  |||    
T  1941921 aaccactatgatccctagatg-tggactcaagtactttgttgccattctaatgttgtctgtaaaaggataaccataacgttggttgatgggtacttgatg 1942019  T
Q  337 aatca 341  Q
    |||||    
T  1942020 aatca 1942024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 93 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 21454110 - 21453961
Alignment:
Q  93 tatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttat-aaaagtgtcata 191  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||||||| ||  ||||||  ||| | |||||    
T  21454110 tatcaagttttcacatacatataaatattaggagtaatatttatattgaattgacccaccatgagaatactacata-tatgagttatgtaaaatatcata 21454012  T
Q  192 agatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccac 242  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  21454011 agatattttcattgtgatagtggtgtatgtcacccttcgacctgaaaccac 21453961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 58 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 32646807 - 32646536
Alignment:
Q  58 tgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgag 157  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||   |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |   ||| ||    
T  32646807 tgatgatcacatctcacggatcattgataaaggaatatcgagtcttcacatagatataaatattaggaataatatttacattggattgacctaccataag 32646708  T
Q  158 aatactacatagtaaaagttataaaagtgtcataagatattctcatagtgat-agtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagat 256  Q
    ||| |||||||  ||| |||||  |   |||| | || |||| | ||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||| ||| |||| ||| |||    
T  32646707 aatgctacata--aaaggttatgtataagtcacatgacattcccgtagtgataagtggtgtattttacccttcgacctgaaacaactctgtatcctggat 32646610  T
Q  257 gttggagtcgagtgctttgtcaccgttcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtac 330  Q
    ||  |||||| || ||||||   ||| |||||||  ||| ||||||||||| ||| |||| |||||||||||||    
T  32646609 gtatgagtcgggtactttgttgtcgtacaaacgtcatccataacaggatgattatgaagtcggttgatgggtac 32646536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 105 - 326
Target Start/End: Original strand, 19362477 - 19362695
Alignment:
Q  105 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaagtgtcataagatattctcata 204  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||||||||||   ||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  19362477 acataggtattaatattaggagtaatatttatactggattgacccatcgtgagagtactacatagtat--gttatcaaagtgtcataagatattctcaca 19362574  T
Q  205 gtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccgttcaaacgttgtccgtaacagga 304  Q
     ||||| |||||||| |||| |||  ||||||||||||||||  || |||||| |||| |  | |||||| |   | ||||||||||||| |||||||||    
T  19362575 atgataatggtgtataccactcttaaacctgaaaccactatgatccttagatg-tggacttaaatgctttattgtcattcaaacgttgtctgtaacagga 19362673  T
Q  305 tgactataaagttggttgatgg 326  Q
    |||| |||| | ||||| ||||    
T  19362674 tgaccataacggtggttaatgg 19362695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 37 - 241
Target Start/End: Original strand, 32636484 - 32636685
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 136  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | ||||| |||  ||| ||| |||||    ||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  32636484 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatgaatac-gagatattaagtccatgcataggtataaatattatgagtaatatttat 32636582  T
Q  137 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctga 236  Q
    |||||||||| ||    |||||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |||||||| |||| || |||| |||    
T  32636583 attggattgacccaatgtgagaatactacatagt--aagttatgaaattgtcataagatattctcacaatgataatggtgtataccactctccgacgtga 32636680  T
Q  237 aacca 241  Q
    |||||    
T  32636681 aacca 32636685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 112 - 341
Target Start/End: Original strand, 9487625 - 9487851
Alignment:
Q  112 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaagtgtcataagatattctcatagtgatag 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| || || || |||||||||||||||||  ||||||| | | |||||||||||||||||| | |||||     
T  9487625 tataaatattaggagtaatatttatactggatagacccatcgtgagaatactacatagt--aagttatgagattgtcataagatattctcacaatgataa 9487722  T
Q  212 tggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccgttcaaacgttgtccgtaacaggatgactat 311  Q
    | ||||||  | | ||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||| || |||  |||||   | ||  ||||||||| |||| ||||| || ||    
T  9487723 tagtgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtattttgttgtcattataacgttgtctgtaataggataaccat 9487821  T
Q  312 aaagttggttgatgggtactccatgaatca 341  Q
    ||  ||||||||||||||||  ||||||||    
T  9487822 aacattggttgatgggtacttgatgaatca 9487851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 29 - 327
Target Start/End: Original strand, 5616387 - 5616681
Alignment:
Q  29 aaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagta 128  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||  | ||||  |||  ||| | | |||| |  || ||| |||||||||||| ||||    
T  5616387 aaagcattgagactattatgtatgtagattgatgaccacatctcatgggtcataaatat-gagatgttaagtatatacgtaggtataaatattagaagta 5616485  T
Q  129 atatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 228  Q
    ||||||||| |||||||| |   | ||||||||||||| |||  |  |||| |||||||||||||||||||| | | ||||| |||||||| |||  |||    
T  5616486 atatttatactggattgaccaaccgtgagaatactacagagttta--ttatgaaagtgtcataagatattcttacaatgataatggtgtataccaatctt 5616583  T
Q  229 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccgttcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatggg 327  Q
     || ||||||||||||||  ||||||||| |||| || |||||||| |  || ||||||||||||  |||||| ||| ||| ||| ||||||| |||||    
T  5616584 agatctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttattgccattcaaacgttgtttgtaacaagataactgtaacgttggttaatggg 5616681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 105 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 5528714 - 5528495
Alignment:
Q  105 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaagtgtcataagatattctcata 204  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||| | ||  | ||||||||| || ||||| |  |||| ||| || |||||||||||||||||    
T  5528714 acataggtataaatattaggagtgatatttatattgtattaacccaacgtgagaataccacgtagtata--ttatgaaaatgccataagatattctcata 5528617  T
Q  205 gtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccgttcaaacgttgtccgtaacagga 304  Q
     ||||| ||||||||  ||| |||  |||||||||  |||||  ||||||||| |||| || |||||||| |  || |||||||||| || |||||||||    
T  5528616 atgataatggtgtataacactcttatacctgaaactgctatgatccctagatg-tggactcaagtgctttatttccattcaaacgttatctgtaacagga 5528518  T
Q  305 tgactataaagttggttgatggg 327  Q
    | || |||| ||||||| |||||    
T  5528517 taaccataatgttggttaatggg 5528495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 37 - 258
Target Start/End: Original strand, 4546080 - 4546298
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 136  Q
    |||||||||||||| || ||||||| ||| |||||||  | | || ||||  ||| ||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4546080 gagactattatgtatgttgactgataatcgcatctcatgggttatagatat-gagatattaagtctatacataggtataaatattaggagtaatatttat 4546178  T
Q  137 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctga 236  Q
    | ||||  || ||  | |||||||||||||||||  ||||||| | | |||||||||||||||||| | ||||| | ||||||  | | ||| ||||| |    
T  4546179 actggacagacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatgagattgtcataagatattctcacaatgataatagtgtatatcgctctttgacctaa 4546276  T
Q  237 aaccactatgtaccctagatgt 258  Q
    ||||||||||  ||||||||||    
T  4546277 aaccactatgatccctagatgt 4546298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 41 - 119
Target Start/End: Original strand, 24700213 - 24700291
Alignment:
Q  41 ctattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaata 119  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  24700213 ctattatgtgggtagactgataatcacatcttacagatcttggataaagagatattaagtcttcacatagatataaata 24700291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 112 - 327
Target Start/End: Original strand, 9538033 - 9538244
Alignment:
Q  112 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaagtgtcataagatattctcatagtgatag 211  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||  | ||||||||||||||||   | ||||| |||||||||||||||||||||| | |||||     
T  9538033 tataaatgttaggagtaatatttatactggattgacccagcgtgagaatactacatag--catgttatgaaagtgtcataagatattctcacaatgataa 9538130  T
Q  212 tggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccgttcaaacgttgtccgtaacaggatgactat 311  Q
    ||| ||  ||||  ||| ||||| ||||||| |||  || | |||| |||| || |||||||| |  || ||||||| |||||||||||||||| || ||    
T  9538131 tggcgt-gtccagtcttagacctcaaaccaccatgatccttggatg-tggactcaagtgctttattgccattcaaacattgtccgtaacaggataaccat 9538228  T
Q  312 aaagttggttgatggg 327  Q
    || ||||||| |||||    
T  9538229 aacgttggttaatggg 9538244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 124 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 30040705 - 30040491
Alignment:
Q  124 gagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattcca 223  Q
    |||||||||||||| | |||||| ||  ||||||| ||||||||||||   ||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| | ||||||  ||    
T  30040705 gagtaatatttatactagattgacccaccatgagagtactacatagtat--gttatgaaaatgtcataagatattctcacaatgataatagtgtatatca 30040608  T
Q  224 cccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccgttcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttga 323  Q
    | ||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||| || ||||||||||   | ||| || |||||  |||| ||||| || |||| ||||||| |    
T  30040607 ctcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgtcattctaatgttgtttgtaaaaggataaccataacgttggttaa 30040509  T
Q  324 tgggtactccatgaatca 341  Q
    || |||||  ||||||||    
T  30040508 tgagtacttgatgaatca 30040491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 127 - 341
Target Start/End: Original strand, 11421096 - 11421307
Alignment:
Q  127 taatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 226  Q
    |||||||||||||||||||| ||  | | |||||||||||||||  | ||||| ||| |||||||||||||| ||| || |||| |  |||||  ||| |    
T  11421096 taatatttatattggattgacccaccgttagaatactacatagt--atgttatgaaaatgtcataagatattatcacagggataataatgtatatcactc 11421193  T
Q  227 ttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccgttcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 326  Q
     | |||||||||||||||||  || |||||| || | || |||||||| |   | ||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||| | ||||    
T  11421194 atagacctgaaaccactatgatccgtagatg-tgtactcaagtgctttattgtcattctaacgttgtctgtaaaaggataaccataatgttggctaatgg 11421292  T
Q  327 gtactccatgaatca 341  Q
    |||||| ||||||||    
T  11421293 gtactcgatgaatca 11421307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 215 - 265
Target Start/End: Original strand, 24701361 - 24701411
Alignment:
Q  215 tgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtc 265  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  24701361 tgtattccacccttcgacctaaaaccactgtgtaccctagatgtaggagtc 24701411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 234 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 9937826 - 9937745
Alignment:
Q  234 tgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccgttcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaag 315  Q
    ||||| |||||||||||||||||||  ||||||| | |||| ||  ||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||    
T  9937826 tgaaatcactatgtaccctagatgtaagagtcgaatactttatcgtcgttcaaacattgttcgtaaaaggatgactataaag 9937745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 29 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 10677590 - 10677538
Alignment:
Q  29 aaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcat 81  Q
    |||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10677590 aaagtatatagactattatgtgggtagactgatgatcacatctcacggatcat 10677538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 29 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 10891230 - 10891178
Alignment:
Q  29 aaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcat 81  Q
    |||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10891230 aaagtatatagactattatgtgggtagactgatgatcacatctcacggatcat 10891178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 25 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 9938003 - 9937933
Alignment:
Q  25 catcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttat 95  Q
    |||| ||||||| |||||||| ||| |||||| | |||||||||||||| | |||||| ||||||||||||    
T  9938003 catcgaagcatatagactattgtgtgggtagagtcatgatcacatctcataaatcatgaataaagagttat 9937933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 84 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 34777975 - 34777893
Alignment:
Q  84 ataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactaca 166  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||  ||||||||| | ||||||| ||| |||| |||||| ||  |||||||||||||||    
T  34777975 ataaaaagttatcaagtcttcaaatatgtataaatataatgagtaatttttgtattagattgaccctccatgagaatactaca 34777893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 93 - 246
Target Start/End: Original strand, 33888594 - 33888743
Alignment:
Q  93 tatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttat-aaaagtgtcata 191  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||   || ||||| ||  ||||| ||||| |||||  |  | ||||  ||||||| |||    
T  33888594 tatcaagttttcacatagatataaatattatgtgtaatattta---tgaattgacccaccatgataataccacata--atgatttatgtaaagtgtgata 33888688  T
Q  192 agatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatg 246  Q
    ||||| | ||||| ||| |||||||||| ||||  |||||||||||| |||||||    
T  33888689 agataatatcatattgacagtggtgtatgccacatttcgacctgaaatcactatg 33888743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 37 - 73
Target Start/End: Original strand, 11421016 - 11421052
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctca 73  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  11421016 gagactattatgtatgtagactgatgaccacatctca 11421052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 29 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 30040784 - 30040740
Alignment:
Q  29 aaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctca 73  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||    
T  30040784 aaagcatcgagactattatgtatatagactgatgaccacatctca 30040740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 300; Significance: 1e-169; HSPs: 46)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 300; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 23 - 341
Target Start/End: Original strand, 6110230 - 6110549
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 122  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6110230 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 6110329  T
Q  123 ggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttat-aaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6110330 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 6110429  T
Q  222 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccgttcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6110430 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 6110529  T
Q  322 gatgggtactccatgaatca 341  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  6110530 gatgggtactccatgaatca 6110549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 300; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 23 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 16482524 - 16482205
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 122  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16482524 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 16482425  T
Q  123 ggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttat-aaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16482424 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 16482325  T
Q  222 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccgttcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16482324 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 16482225  T
Q  322 gatgggtactccatgaatca 341  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  16482224 gatgggtactccatgaatca 16482205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 23 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 10579396 - 10579077
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 122  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10579396 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 10579297  T
Q  123 ggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttat-aaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10579296 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacataataaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 10579197  T
Q  222 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccgttcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10579196 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 10579097  T
Q  322 gatgggtactccatgaatca 341  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  10579096 gatgggtactccatgaatca 10579077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 23 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 15600925 - 15600606
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 122  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15600925 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 15600826  T
Q  123 ggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttat-aaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15600825 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 15600726  T
Q  222 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccgttcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15600725 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 15600626  T
Q  322 gatgggtactccatgaatca 341  Q
    ||||||||| ||||||||||    
T  15600625 gatgggtaccccatgaatca 15600606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 23 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 15607470 - 15607151
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 122  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15607470 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 15607371  T
Q  123 ggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttat-aaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15607370 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 15607271  T
Q  222 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccgttcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15607270 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 15607171  T
Q  322 gatgggtactccatgaatca 341  Q
    ||||||||| ||||||||||    
T  15607170 gatgggtaccccatgaatca 15607151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 23 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 10572633 - 10572314
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 122  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10572633 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 10572534  T
Q  123 ggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttat-aaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10572533 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaactgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 10572434  T
Q  222 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccgttcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10572433 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccgtagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 10572334  T
Q  322 gatgggtactccatgaatca 341  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  10572333 gatgggtactccatgaatca 10572314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 23 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 15342260 - 15341941
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 122  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  15342260 atcattaaaacatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaaaatta 15342161  T
Q  123 ggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttat-aaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15342160 ggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaaattatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 15342061  T
Q  222 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccgttcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15342060 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 15341961  T
Q  322 gatgggtactccatgaatca 341  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  15341960 gatgggtactccatgaatca 15341941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 23 - 341
Target Start/End: Original strand, 18520141 - 18520460
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 122  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18520141 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 18520240  T
Q  123 ggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttat-aaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 221  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18520241 ggagtaatatttatatttgattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 18520340  T
Q  222 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccgttcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 321  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18520341 cacccttcgaactgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccataacaggatgactataaagttggtt 18520440  T
Q  322 gatgggtactccatgaatca 341  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  18520441 gatgggtactccatgaatca 18520460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 30 - 339
Target Start/End: Original strand, 18522836 - 18523146
Alignment:
Q  30 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18522836 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 18522935  T
Q  130 tatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttat-aaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 228  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18522936 tatttatattggattgatccgccatgaaaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtatttcaccctt 18523035  T
Q  229 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccgttcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggt 328  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18523036 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggt 18523135  T
Q  329 actccatgaat 339  Q
    |||||||||||    
T  18523136 actccatgaat 18523146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 285; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 38 - 341
Target Start/End: Original strand, 8490676 - 8490980
Alignment:
Q  38 agactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttata 137  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8490676 agacgattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttata 8490775  T
Q  138 ttggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttat-aaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctga 236  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8490776 ttggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctga 8490875  T
Q  237 aaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccgttcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatg 336  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8490876 aaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatg 8490975  T
Q  337 aatca 341  Q
    |||||    
T  8490976 aatca 8490980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 23 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 15357627 - 15357308
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 122  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  15357627 atcattaaaacatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaaaatta 15357528  T
Q  123 ggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttat-aaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 221  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15357527 ggagtaatatttatattgggttgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 15357428  T
Q  222 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccgttcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15357427 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 15357328  T
Q  322 gatgggtactccatgaatca 341  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  15357327 gatgggtactccatgaatca 15357308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 23 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 17781159 - 17780840
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 122  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17781159 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacaaatcatagataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 17781060  T
Q  123 ggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttat-aaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17781059 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaaattatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 17780960  T
Q  222 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccgttcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17780959 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaataggatgactataaagttggtt 17780860  T
Q  322 gatgggtactccatgaatca 341  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  17780859 gatgggtactccatgaatca 17780840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 280; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 23 - 341
Target Start/End: Original strand, 13211468 - 13211787
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 122  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13211468 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacaactcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 13211567  T
Q  123 ggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttat-aaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13211568 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatattacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataatatattctcatagtgatagtggtgtattc 13211667  T
Q  222 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccgttcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 321  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13211668 cacccttcgacctgaaaccattatgtaacctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 13211767  T
Q  322 gatgggtactccatgaatca 341  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  13211768 gatgggtactccatgaatca 13211787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 29 - 341
Target Start/End: Original strand, 13248779 - 13249092
Alignment:
Q  29 aaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagta 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13248779 aaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacaactcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagta 13248878  T
Q  129 atatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttat-aaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccct 227  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13248879 atatttatattggattgattcgccatgagaatattacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataatatattctcatagtgatagtggtgtattccaccct 13248978  T
Q  228 tcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccgttcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatggg 327  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13248979 tcgacctgaaaccactatgtaacctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatggg 13249078  T
Q  328 tactccatgaatca 341  Q
    ||||||||||||||    
T  13249079 tactccatgaatca 13249092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 23 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 32056941 - 32056621
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaa-tatt 121  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  32056941 atcattaaagcatagagactattatgtgggtagactaatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaaatatt 32056842  T
Q  122 aggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttat-aaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtatt 220  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32056841 atgagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtatt 32056742  T
Q  221 ccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccgttcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggt 320  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32056741 ccacccttcaacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggt 32056642  T
Q  321 tgatgggtactccatgaatca 341  Q
    |||||| ||||||||||||||    
T  32056641 tgatggatactccatgaatca 32056621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 23 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 17200225 - 17199906
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 122  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17200225 atcattaaagcatagagactattatgtgggtagactgatgatcacatctcacagatcgtggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 17200126  T
Q  123 ggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttat-aaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 221  Q
    |||||| ||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17200125 ggagtagtatttgtattggattgacccgctatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 17200026  T
Q  222 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccgttcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  17200025 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccttagatgttggagtcgagtgttttgtcaccattcaaatgttgttcgtatcaggatgactataaagttggtt 17199926  T
Q  322 gatgggtactccatgaatca 341  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  17199925 gatgggtactccatgaatca 17199906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 23 - 341
Target Start/End: Original strand, 13516977 - 13517292
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 122  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13516977 atcattaaagcacagagactattatgtgggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 13517076  T
Q  123 ggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttat-aaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||      |    
T  13517077 ggagtaatatttatattggattgatcctccatgagaatactaaatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtgg----ccc 13517172  T
Q  222 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccgttcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  13517173 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttatcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggta 13517272  T
Q  322 gatgggtactccatgaatca 341  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  13517273 gatgggtactccatgaatca 13517292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 29 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 1647556 - 1647243
Alignment:
Q  29 aaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagta 128  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1647556 aaagcatagagactattatgtggatagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtctacacatagatataaatattaggagta 1647457  T
Q  129 atatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttat-aaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccct 227  Q
    || |||||||| ||||||  || ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1647456 atgtttatatttgattgactcgccatgagaatactacataataaaagttatgaaaagtgtcatacgatattcccatagtgatagtggtgtattccaccct 1647357  T
Q  228 tcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccgttcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatggg 327  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  1647356 tcgacctaaaaccactatataccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaatttggttgatgag 1647257  T
Q  328 tactccatgaatca 341  Q
    ||||||||||||||    
T  1647256 tactccatgaatca 1647243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 23 - 341
Target Start/End: Original strand, 17136525 - 17136838
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 122  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||    
T  17136525 atcattaaaacatagagactattatgtgggtagactgatgatcacatttcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatat------ta 17136618  T
Q  123 ggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttata-aaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 221  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17136619 ggagtaatatttatattggattgacccaccatgagaatactacatagtaaaagttattgaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 17136718  T
Q  222 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccgttcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 321  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17136719 cacccttcgacttgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgcttagtaaacattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 17136818  T
Q  322 gatgggtactccatgaatca 341  Q
    ||||| ||||||||||||||    
T  17136819 gatggatactccatgaatca 17136838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 23 - 341
Target Start/End: Original strand, 29925137 - 29925456
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 122  Q
    ||||| ||||||| ||| ||||||||| | ||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  29925137 atcattaaagcatggaggctattatgtggatagatcgatgatcacatctcatagatcatggataaagagtcattaagtcttcacatagatataaatatta 29925236  T
Q  123 ggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttat-aaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 221  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||  |  ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29925237 ggagtaatatttatattggattgacccacctagagaatactgcatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 29925336  T
Q  222 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccgttcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 321  Q
    |||| || |||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||  |||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||    
T  29925337 caccatttgacctgaaaccattatgtaccctagacgttggagttgagtgctttgtcaccaatcaaacgttgtctgtaacaagatgattataaagttggtt 29925436  T
Q  322 gatgggtactccatgaatca 341  Q
    ||||| ||||||| ||||||    
T  29925437 gatggatactccacgaatca 29925456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 23 - 341
Target Start/End: Original strand, 29974290 - 29974609
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 122  Q
    ||||| ||||||| ||| ||||||||| | ||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  29974290 atcattaaagcatggaggctattatgtggatagatcgatgatcacatctcatagatcatggataaagagtcattaagtcttcacatagatataaatatta 29974389  T
Q  123 ggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttat-aaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 221  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||  |  ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29974390 ggagtaatatttatattggattgacccacctagagaatactgcatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 29974489  T
Q  222 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccgttcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 321  Q
    |||| || |||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||  |||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||    
T  29974490 caccatttgacctgaaaccattatgtaccctagacgttggagttgagtgctttgtcaccaatcaaacgttgtctgtaacaagatgattataaagttggtt 29974589  T
Q  322 gatgggtactccatgaatca 341  Q
    ||||| ||||||| ||||||    
T  29974590 gatggatactccacgaatca 29974609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 54 - 341
Target Start/End: Original strand, 16200627 - 16200915
Alignment:
Q  54 agactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtca 153  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||| ||  ||    
T  16200627 agactgatgatcatatcttacagatcatggataaagaattatcaagtattcatatagatacaaatattaggtgtaatattcatattggattgacccacca 16200726  T
Q  154 tgagaatactacatagtaaaagttata-aaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccct 252  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16200727 tgagaatactacatagtcaaaattatgtaaagtatcataagatattctcatagtgatagtggtgtattcaaccctttgacctgaaaccactatgtaccct 16200826  T
Q  253 agatgttggagtcgagtgctttgtcaccgttcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatca 341  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  16200827 agatgttgaagtcgagtgctttgtcaccattcaaatgttgtctgtaacaagatgactataaagttggttgatggatactccacgaatca 16200915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 37 - 341
Target Start/End: Original strand, 21034238 - 21034538
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 136  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21034238 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 21034336  T
Q  137 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctga 236  Q
    |||||||||| ||  | |||||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| |||||||    
T  21034337 attggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatgaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctga 21034434  T
Q  237 aaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccgttcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatg 336  Q
    ||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  || ||| ||||||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||  |||    
T  21034435 aaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggtacttgatg 21034533  T
Q  337 aatca 341  Q
    |||||    
T  21034534 aatca 21034538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 37 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 15846838 - 15846538
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 136  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15846838 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 15846740  T
Q  137 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctga 236  Q
    |||||||||| ||  | |||||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| |||||||    
T  15846739 attggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatgaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctga 15846642  T
Q  237 aaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccgttcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatg 336  Q
    ||||||||||  ||||||||| |||| || |||| |||||  || ||| ||||||||| |||| ||||| |  |||| |||||||||||||||||  |||    
T  15846641 aaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgttttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgggtacttgatg 15846543  T
Q  337 aatca 341  Q
    |||||    
T  15846542 aatca 15846538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 29 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 24253423 - 24253130
Alignment:
Q  29 aaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagta 128  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||  || ||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||| |||| ||||     
T  24253423 aaagcatagagactattatgtcggtagactaatgatcatatctcacgaattatggataaagagttatcaagttttcacatacttataaacattaagagtt 24253324  T
Q  129 atatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 228  Q
    ||||||||||||| |||| ||  |||||||||| | |||||  || |||||  |||  ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||| | ||    
T  24253323 atatttatattggtttgaccctccatgagaataatgcatag--aatgttatttaaggatcataagttattctcatagtgataacggtgtattcca-catt 24253227  T
Q  229 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccgttcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatg 325  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||  || |||||| ||||||   ||||||||| |||||  | ||||  |||| |||||||| |||||||    
T  24253226 cgacctaaaaccactatgtaccttagatgtatgactcgagtactttgttgtcgttcaaacattgtcaattacagagtgaccataaagttagttgatg 24253130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 37 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 20147856 - 20147556
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 136  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20147856 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 20147758  T
Q  137 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctga 236  Q
    |||||||||| ||    |||||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| |||||||    
T  20147757 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatgaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctga 20147660  T
Q  237 aaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccgttcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatg 336  Q
    ||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  || ||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  |||    
T  20147659 aaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgatg 20147561  T
Q  337 aatca 341  Q
    |||||    
T  20147560 aatca 20147556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 37 - 341
Target Start/End: Original strand, 21398792 - 21399092
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 136  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21398792 gagactattatgtatgtagacttatgacctcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacataggtataaatattaggagtaatatttat 21398890  T
Q  137 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctga 236  Q
    |||||||||| ||  | |||||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||| | | ||||| |  |||||  | | ||| |||||||    
T  21398891 attggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatgaaattgtcataagatattcttacaatgataataatgtatatcgctcttagacctga 21398988  T
Q  237 aaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccgttcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatg 336  Q
    ||||||||||  ||||||||| |||| || ||||||||||  || ||| ||||||||| |||| ||||| |  |||| |||||||||||||||||  |||    
T  21398989 aaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgggtacttgatg 21399087  T
Q  337 aatca 341  Q
    |||||    
T  21399088 aatca 21399092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 37 - 341
Target Start/End: Original strand, 14890391 - 14890691
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 136  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14890391 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 14890489  T
Q  137 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctga 236  Q
    |||||||||| ||  | |||||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||    | ||| |||||||    
T  14890490 attggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatgaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatattgctcttagacctga 14890587  T
Q  237 aaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccgttcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatg 336  Q
    || |||| ||  | ||||||| |||| || ||||||||||   | ||| ||||||||| |||| ||||| | ||||| |||||||||||||||||  |||    
T  14890588 aagcactgtgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgtcattctaacgttgtctgtaaaaggataattataacgttggttgatgggtacttgatg 14890686  T
Q  337 aatca 341  Q
    |||||    
T  14890687 aatca 14890691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 37 - 341
Target Start/End: Original strand, 55427021 - 55427321
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 136  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||| ||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  55427021 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtctatacatagatataaatattagaagtaatatttat 55427119  T
Q  137 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctga 236  Q
    |||||||||| ||    |||||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||    | ||| |||||||    
T  55427120 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatgaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatattgctcttagacctga 55427217  T
Q  237 aaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccgttcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatg 336  Q
    ||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  || ||| ||||||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||  |||    
T  55427218 aaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggtacttgatg 55427316  T
Q  337 aatca 341  Q
    |||||    
T  55427317 aatca 55427321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 37 - 341
Target Start/End: Original strand, 12299911 - 12300210
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 136  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||   ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12299911 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctat-catagatataaatgttaggagtaatatttat 12300008  T
Q  137 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctga 236  Q
    |||||||||| ||    |||||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| |||||||    
T  12300009 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatgaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctga 12300106  T
Q  237 aaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccgttcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatg 336  Q
    ||||||||||  | ||||||| |||| || |||| |||||  || ||| ||||||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||  |||    
T  12300107 aaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgatttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggtacttgatg 12300205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 105 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 25978963 - 25978730
Alignment:
Q  105 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaagtgtcataagatattctcata 204  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||  | |||||||||||||||||  ||||||| | | |||||||||||||||||| |    
T  25978963 acataggtataattattaggagtaatatttatactggatagacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatgagattgtcataagatattctcaca 25978866  T
Q  205 gtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccgttcaaacgttgtccgtaacagga 304  Q
     ||||| | ||||||  | | ||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||| || ||| ||||||  || ||| ||||||||| |||| ||||    
T  25978865 atgataatagtgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtactttgttgccattctaacgttgtctgtaaaagga 25978767  T
Q  305 tgactataaagttggttgatgggtactccatgaatca 341  Q
    | || |||| |||||||||||||||||  ||||||||    
T  25978766 taaccataacgttggttgatgggtacttgatgaatca 25978730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 29 - 245
Target Start/End: Original strand, 14147013 - 14147226
Alignment:
Q  29 aaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagta 128  Q
    |||||| |||||||||||| || |||||||||||| |||||||||  | |||||||||  ||| ||| ||||||  |||||  ||||||||||||||| |    
T  14147013 aaagcacagagactattatatatgtagactgatgaccacatctcatgggtcatggatat-gagatattaagtctatacatatgtataaatattaggagga 14147111  T
Q  129 atatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 228  Q
    ||||||||| |||||||| | | | ||||||| |||||||||  | ||||| ||| |||| ||||||||||||| | |||||  |||||||  ||| |||    
T  14147112 atatttatactggattgacctgccgtgagaatgctacatagt--atgttatgaaaatgtcgtaagatattctcacattgataaaggtgtatatcactctt 14147209  T
Q  229 cgacctgaaaccactat 245  Q
     ||||||||||||||||    
T  14147210 agacctgaaaccactat 14147226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 112 - 309
Target Start/End: Original strand, 15526827 - 15527021
Alignment:
Q  112 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaagtgtcataagatattctcatagtgatag 211  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| |||||  | | ||| ||| |||||||||||||||| | | || ||     
T  15526827 tataaatcttaggagtaatatttatactggattgacccatcgtgagagtactaaatagt--atgctatgaaaatgtcataagatattcttacaatgttaa 15526924  T
Q  212 tggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccgttcaaacgttgtccgtaacaggatgact 309  Q
    |||||||| |||| ||| |||||||||||||||||  || || ||| |||| || |||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  15526925 tggtgtataccactcttagacctgaaaccactatgatccatacatg-tggactcaagtgctttataaccattcaaacgttgtctgtaacagcatgact 15527021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 40 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 15317472 - 15317178
Alignment:
Q  40 actattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatatt 139  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| | |||||||  | | || ||||  ||| ||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  15317472 actattatgtatgtagattgatgaccgcatctcatgggttatagatat-gagatattaagtctatacataggtataaatattaggagtaatatttatact 15317374  T
Q  140 ggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaac 239  Q
     ||| || ||  | |||||||||||||||||  | ||||| | | |||||||||||||||||| | ||||| | |||||   | | ||| ||||||||||    
T  15317373 agatagacccaccgtgagaatactacatagt--acgttatgagattgtcataagatattctcacaatgataatagtgtaaatcgctcttagacctgaaac 15317276  T
Q  240 cactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccgttcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaat 339  Q
    |||||||  ||||||||| |||| || ||| ||||||||   ||| ||||||||| ||||  |||| |  |||| ||||||||| |||||||  ||||||    
T  15317275 cactatgatccctagatg-tggactcaagtactttgtca---ttctaacgttgtctgtaaacggataatcataacgttggttgacgggtacttgatgaat 15317180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 159 - 341
Target Start/End: Original strand, 28088227 - 28088406
Alignment:
Q  159 atactacatagtaaaagttataaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgt 258  Q
    ||||||||||||||  ||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| | ||||||  | | ||| |||||||||||||||||  |||||||||     
T  28088227 atactacatagtaa--gttatgaaattgtcataagatattctcacaatgataatagtgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctagatg- 28088323  T
Q  259 tggagtcgagtgctttgtcaccgttcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatca 341  Q
    |||| || || |||||||  || ||| ||||||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||| ||||  ||||||||    
T  28088324 tggactcaagggctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataaccataacgttggttgatggatacttgatgaatca 28088406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 105 - 341
Target Start/End: Original strand, 11787654 - 11787887
Alignment:
Q  105 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaagtgtcataagatattctcata 204  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||  | |||||||||||||||||  ||||||| | | | |||||||||||||||| |    
T  11787654 acataggtataaatattaggagtaatatttatactggatagacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatgatattttcataagatattctcaca 11787751  T
Q  205 gtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccgttcaaacgttgtccgtaacagga 304  Q
     ||||| |  |||||  | | ||| |||||||||||| ||||  ||||||||  |  | || ||| ||||||  || ||| ||||||||| ||||  |||    
T  11787752 atgataatattgtatatcgctcttagacctgaaaccattatgatccctagat-ctataatcaagtactttgttgccattctaacgttgtctgtaaatgga 11787850  T
Q  305 tgactataaagttggttgatgggtactccatgaatca 341  Q
    | || |||| |||||||||||||||||  ||||||||    
T  11787851 taaccataacgttggttgatgggtacttaatgaatca 11787887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 23 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 19089786 - 19089734
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcaca 75  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19089786 atcattaaatcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcaca 19089734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 76 - 204
Target Start/End: Original strand, 28953965 - 28954093
Alignment:
Q  76 gatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatattt-atattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaa 174  Q
    |||||| ||||||||||||  |||||||||||||  |||| | ||||||||||||||||  | ||||||| | || ||||||||||||||||||  | ||    
T  28953965 gatcattgataaagagttacaaagtcttcacatatgtatacacattaggagtaatatttgttgttggattaacccatcatgagaatactacata--ataa 28954062  T
Q  175 gtta-taaaagtgtcataagatattctcata 204  Q
    |||| | ||||||||||| ||||||||||||    
T  28954063 gttatttaaagtgtcatatgatattctcata 28954093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 29 - 122
Target Start/End: Original strand, 9504455 - 9504548
Alignment:
Q  29 aaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 122  Q
    |||| ||||| |||||||||| ||||||||||| |||  ||||||| | |||||||||| |||||||||||| || ||||| ||| ||||||||    
T  9504455 aaaggatagaaactattatgtgggtagactgataatcttatctcacgggtcatggataaggagttatcaagtattaacatacataaaaatatta 9504548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 78 - 269
Target Start/End: Original strand, 32280313 - 32280507
Alignment:
Q  78 tcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagtt 177  Q
    ||||||||||||||||||  | ||||||||||| |||||  |||| || ||||||||| | | | |||| ||   ||||||||| |||||||| |  ||     
T  32280313 tcatggataaagagttatttaatcttcacataggtataatcattacgaataatatttacactcggttgacccacaatgagaataatacatagtga--gtc 32280410  T
Q  178 ata-aaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccac----tatgtaccctagatgttggagtcgagt 269  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||  ||| ||  || |||||||||    |||||||||||||||| ||||||||||    
T  32280411 atgtaaagtgtcataagatattctcatagtgataatgatttattttaccttttcacttgaaaccactatatatgtaccctagatgtaggagtcgagt 32280507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 33 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 8252048 - 8251933
Alignment:
Q  33 catagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatat 132  Q
    |||| ||||||| |||| | | |||||| |||||||||| || ||||||| |||||  |||||||| |||| ||||| || || |||||  |||||||||    
T  8252048 catatagactatcatgtggatggactgaagatcacatcttacggatcatgaataaaatgttatcaaatctttacataaatttacatatttcgagtaatat 8251949  T
Q  133 ttatattggattgatc 148  Q
    ||||||| ||||||||    
T  8251948 ttatatttgattgatc 8251933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 23 - 96
Target Start/End: Original strand, 16200291 - 16200363
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatc 96  Q
    ||||| ||||||| ||||||||| ||| |  ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16200291 atcattaaagcatggagactatt-tgtggagagactgatgatcatatcttacagatcatggataaagagttatc 16200363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 190 - 258
Target Start/End: Original strand, 30464147 - 30464215
Alignment:
Q  190 taagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgt 258  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||| ||| |||| ||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  30464147 taagatattctcataatgataatggtctataccactcttagacctgaaaccactatgatccctagatgt 30464215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 116 - 209
Target Start/End: Original strand, 4189223 - 4189314
Alignment:
Q  116 aatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaagtgtcataagatattctcatagtgat 209  Q
    ||||||| |||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||| ||||||  |||  |||| || ||||||||| ||||||||||| ||||    
T  4189223 aatattatgagtaatatttatactatattgatctgtcatgagaatattacata--aaatattatgaaggtgtcataaaatattctcatattgat 4189314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 182 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 36138097 - 36138033
Alignment:
Q  182 aagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatg 246  Q
    ||||| |||||||||||  || ||||||| |||||||| ||||||||| |||||||| |||||||    
T  36138097 aagtgccataagatatttccaaagtgataatggtgtataccacccttcaacctgaaatcactatg 36138033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 182 - 246
Target Start/End: Original strand, 36142816 - 36142880
Alignment:
Q  182 aagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatg 246  Q
    ||||| |||||||||||  || ||||||| || |||||  |||||||| ||||||||||||||||    
T  36142816 aagtgccataagatatttccaaagtgataatgatgtatgtcacccttcaacctgaaaccactatg 36142880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 300; Significance: 1e-169; HSPs: 38)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 300; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 23 - 341
Target Start/End: Original strand, 18252196 - 18252515
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 122  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18252196 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 18252295  T
Q  123 ggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttat-aaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18252296 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 18252395  T
Q  222 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccgttcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18252396 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 18252495  T
Q  322 gatgggtactccatgaatca 341  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  18252496 gatgggtactccatgaatca 18252515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 23 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 18532555 - 18532236
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 122  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18532555 atcattaaagcatagagactattatgtagatagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 18532456  T
Q  123 ggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttat-aaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18532455 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 18532356  T
Q  222 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccgttcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18532355 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 18532256  T
Q  322 gatgggtactccatgaatca 341  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  18532255 gatgggtactccatgaatca 18532236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 23 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 27131450 - 27131132
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 122  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27131450 atcattaaagcataaagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 27131351  T
Q  123 ggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttat-aaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27131350 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 27131251  T
Q  222 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccgttcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27131250 cacccttcgacctgaaaccactatgta-cctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 27131152  T
Q  322 gatgggtactccatgaatca 341  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  27131151 gatgggtactccatgaatca 27131132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 280; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 23 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 27310618 - 27310299
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 122  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27310618 atcattaaagcatagagactattatgtgggtagactgatgatcacatctcacagattatggataaagagttatcaagtcttcacataaatataaatatta 27310519  T
Q  123 ggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttat-aaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27310518 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattcttatagtgatagtggtgtattc 27310419  T
Q  222 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccgttcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27310418 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtctgtaacaggatgactataaagttggtt 27310319  T
Q  322 gatgggtactccatgaatca 341  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  27310318 gatgggtactccatgaatca 27310299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 23 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 16359076 - 16358757
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 122  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16359076 atcattaaagcatagagactattatgtgggtagactgatgatcacatctcacagataatggataaagagttatcaagccttcacatagatataaatatta 16358977  T
Q  123 ggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataa-aagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 221  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16358976 tgagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgagaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 16358877  T
Q  222 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccgttcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 321  Q
    ||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16358876 cacccttcgtcttgaaaccaccatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactttaaagttggtt 16358777  T
Q  322 gatgggtactccatgaatca 341  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  16358776 gatgggtactccatgaatca 16358757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 29 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 3855954 - 3855641
Alignment:
Q  29 aaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagta 128  Q
    ||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3855954 aaagcatggagactattacgtgggtagactgatgatcacatctcacaaatcatggataaagagttataaagtcttcacataggtataaatattaggagta 3855855  T
Q  129 atatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttat-aaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccct 227  Q
    |||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  3855854 atatttatattggattgacccgcaatgagaatactacatagtaaaggttatgaaaagtgtcataagatattctcacagtgatagtggtgtattccaccat 3855755  T
Q  228 tcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccgttcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatggg 327  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  3855754 tcgacccgaaaccactatgtaccctagatgttggagttgagcgctttgtcaccattcaagcgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgaccgg 3855655  T
Q  328 tactccatgaatca 341  Q
    ||||||||||||||    
T  3855654 tactccatgaatca 3855641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 29 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 36816668 - 36816363
Alignment:
Q  29 aaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagta 128  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  36816668 aaagcatagagactattatgtggatagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtctacacatagatataaatattaggagta 36816569  T
Q  129 atatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttat-aaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccct 227  Q
    |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  36816568 atatttatattggattgacccaccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataa-aaattatcatagtgatggtggtgtattccaccct 36816470  T
Q  228 tcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccgttcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatggg 327  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||| ||    
T  36816469 ttgaactgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagcgttttgtcaccattcaaacgttgtctgtaacaagataactataaagttggttgatagg 36816370  T
Q  328 tactcca 334  Q
    |||||||    
T  36816369 tactcca 36816363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 63 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 22641871 - 22641596
Alignment:
Q  63 atcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatac 162  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||   |||||| ||||||||||| | |||||| ||  |||||||| ||    
T  22641871 atcacatctcatagatcatggataaagagttattaagtgttcacatagatataa---ttaggaataatatttatactagattgacccaccatgagaa-ac 22641776  T
Q  163 tacatagtaaaagttataaaa-gtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttgg 261  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22641775 tacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcacagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccgtagatgttgg 22641676  T
Q  262 agtcgagtgctttgtcaccgttcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatca 341  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  22641675 agtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtctgtaacaagatgactataaagttggtcgatgggtactccacgaatca 22641596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 29 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 27277592 - 27277280
Alignment:
Q  29 aaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagta 128  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||    
T  27277592 aaagcatagagactattatgtgggtagaccgatgatcacatctcacggatcatagataaagagttatcatgttttcacataggtataaatattaggagta 27277493  T
Q  129 atatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 228  Q
    ||||||||| | |||||| ||  ||| |||||| | |||||||||||| || |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27277492 atatttatactagattgacccaccataagaatattgcatagtaaaagtcatgaaagtgccataagatattcttatagtgatagtggtgtattccaccctt 27277393  T
Q  229 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccgttcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggt 328  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||   ||||||| ||||  |||||| |||||| |||||||||||||| ||||    
T  27277392 tgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttatcataattcaaacattgtttgtaacaagatgaccataaagttggttgaagggt 27277293  T
Q  329 actccatgaatca 341  Q
    ||||||| |||||    
T  27277292 actccataaatca 27277280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 23 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 21171274 - 21171081
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 122  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21171274 atcattaaagcataaagactattatgtgggtagactgatgataacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 21171175  T
Q  123 ggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttat-aaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggt 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21171174 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggt 21171081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 37 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 19706741 - 19706441
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 136  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19706741 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 19706643  T
Q  137 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctga 236  Q
    |||||||||| ||  | |||||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| |||||||    
T  19706642 attggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatgaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctga 19706545  T
Q  237 aaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccgttcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatg 336  Q
    ||||||||||  ||||||||| |||| || ||||||||||  || ||| ||||||||| |||| ||||| |  |||| |||||||||||||||||  |||    
T  19706544 aaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgggtacttgatg 19706446  T
Q  337 aatca 341  Q
    |||||    
T  19706445 aatca 19706441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 37 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 43802667 - 43802367
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 136  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43802667 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 43802569  T
Q  137 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctga 236  Q
    |||||||||| ||  | |||||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| |||||||    
T  43802568 attggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatgaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctga 43802471  T
Q  237 aaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccgttcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatg 336  Q
    ||||||||||  ||||||||| |||| || ||||||||||  || ||| ||||||||| |||| ||||| |  |||| |||||||||||||||||  |||    
T  43802470 aaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgggtacttgatg 43802372  T
Q  337 aatca 341  Q
    |||||    
T  43802371 aatca 43802367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 151 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 9916689 - 9916499
Alignment:
Q  151 tcatgagaatactacatagtaaaagttataaaagtgtcataagatattctcatagtgata-gtggtgtattccacccttcgacctgaaa-ccactatgta 248  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||  || ||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9916689 tcatgagaatactacatag--aaagttatgtaaatgtcataaattattctcatagtgataagtggtgtattccacccttcgacctgaaaaccactatgta 9916592  T
Q  249 ccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccgttcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatca 341  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| ||| || ||||| ||||||    
T  9916591 ccctagatgtaggagtcgagtactttgttaccgtccaaacgttgtccgtaacaaggtgactataaagttagtttatgagttctccacgaatca 9916499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 37 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 28135025 - 28134725
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 136  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28135025 gagacaattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 28134927  T
Q  137 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctga 236  Q
    |||||||||||||  | |||||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| |||||||    
T  28134926 attggattgatccaccgtgagaatactacatagt--aagttatgaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctga 28134829  T
Q  237 aaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccgttcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatg 336  Q
    ||||||||||  ||||| ||| |||| || ||||||||||  || ||| ||||||||| |||| ||||| |  |||| |||||||||||||||||  |||    
T  28134828 aaccactatgatccctaaatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgggtacttgatg 28134730  T
Q  337 aatca 341  Q
    |||||    
T  28134729 aatca 28134725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 23 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 22657262 - 22657108
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 122  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22657262 atcattaaagcatagagactatcatgtggatagactgatgatcacatctcatagctcatagataaagagttattaagtcttcacatagatataaatatta 22657163  T
Q  123 ggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagtt 177  Q
     |||||||||||||||| |||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||    
T  22657162 tgagtaatatttatattagattgacccaccatgtgaatactacatagtaaaagtt 22657108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 37 - 341
Target Start/End: Original strand, 9456116 - 9456416
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 136  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9456116 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 9456214  T
Q  137 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctga 236  Q
    |||||||||| ||    |||||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| |||||||    
T  9456215 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatgaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctga 9456312  T
Q  237 aaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccgttcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatg 336  Q
    ||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  || ||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  |||    
T  9456313 aaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgatg 9456411  T
Q  337 aatca 341  Q
    |||||    
T  9456412 aatca 9456416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 37 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 20391541 - 20391241
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 136  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20391541 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatgttaggagtaatatttat 20391443  T
Q  137 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctga 236  Q
    |||||||||| ||    |||||||||||||||||  ||||||| ||| | |||||||||||||||| | ||||| |  ||||| || | ||| |||||||    
T  20391442 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatgaaattttcataagatattctcacaatgataataatgtataccgctcttagacctga 20391345  T
Q  237 aaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccgttcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatg 336  Q
    ||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  || ||| ||||||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||  |||    
T  20391344 aaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggtacttgatg 20391246  T
Q  337 aatca 341  Q
    |||||    
T  20391245 aatca 20391241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 37 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 20779947 - 20779647
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 136  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20779947 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 20779849  T
Q  137 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctga 236  Q
    |||||||||| ||    |||||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| |||||||    
T  20779848 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatgaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctga 20779751  T
Q  237 aaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccgttcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatg 336  Q
    ||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  || ||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  |||    
T  20779750 aaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgatg 20779652  T
Q  337 aatca 341  Q
    |||||    
T  20779651 aatca 20779647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 37 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 22670559 - 22670259
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 136  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22670559 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 22670461  T
Q  137 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctga 236  Q
    |||||||||| ||    |||||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| |||||||    
T  22670460 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatgaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctga 22670363  T
Q  237 aaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccgttcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatg 336  Q
    ||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  || ||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  |||    
T  22670362 aaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgatg 22670264  T
Q  337 aatca 341  Q
    |||||    
T  22670263 aatca 22670259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 37 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 42817291 - 42816991
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 136  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42817291 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 42817193  T
Q  137 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctga 236  Q
    |||||||||| ||    |||||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| |||||||    
T  42817192 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatgaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctga 42817095  T
Q  237 aaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccgttcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatg 336  Q
    ||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  || ||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  |||    
T  42817094 aaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgatg 42816996  T
Q  337 aatca 341  Q
    |||||    
T  42816995 aatca 42816991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 29 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 12014319 - 12014084
Alignment:
Q  29 aaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagta 128  Q
    ||||| || |||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  12014319 aaagcgtaaagaccattatgtgggtagaatgatgatcacatctcacggatcattgataaggagttatcaagtcttcacataaatataaatattaagagta 12014220  T
Q  129 atatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaagtgtcataagatattctcatagtgat-agtggtgtattccaccct 227  Q
    ||||| |||||||||||| ||| |||||||||  ||||||| | ||  | |||||   ||| |||  |||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  12014219 atattaatattggattgacccggcatgagaatgttacatagaacaatatgtaaaa--atcacaagtcattctcatagtgataagtggtgtatttcaccct 12014122  T
Q  228 tcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtc 265  Q
    || |||| ||| |||| ||||| |||||||| ||||||    
T  12014121 tcaacctaaaatcactgtgtactctagatgtaggagtc 12014084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 53 - 341
Target Start/End: Original strand, 23507096 - 23507383
Alignment:
Q  53 tagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtc 152  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||  |    
T  23507096 tagactgatgatcacatctcacggatcatggataaggagttatcaagttttcacatagatataaataataggagtaatatttatattggattaacccacc 23507195  T
Q  153 atgagaatactacatagtaaaagttataaaagtgtcataagatattctcatagtgat-agtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccc 251  Q
    || ||||| ||||| ||  || ||| |  ||    |||||| ||||||||||||||| ||||| ||||  || ||||||||||||||||||| |||||||    
T  23507196 attagaatgctacagag--aacgttgtgtaaaaagcataagttattctcatagtgataagtggagtatgtcatccttcgacctgaaaccactgtgtaccc 23507293  T
Q  252 tagatgttggagtcgagtgctttgtcaccgttcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatca 341  Q
    |||||||  || | |||| |||||| | | | ||||    ||| |||| |||||||||||||| | | || ||||||||||||| |||||    
T  23507294 tagatgtaagatttgagtactttgttatcatacaaataccgtctgtaataggatgactataaattcgatttatgggtactccataaatca 23507383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 37 - 341
Target Start/End: Original strand, 22612492 - 22612792
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 136  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||  ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  22612492 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gatatatcaagtctatacatagatataaatattgggagtaatattttt 22612590  T
Q  137 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctga 236  Q
    |||||||||| ||  | |||||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| |||||||    
T  22612591 attggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatgaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctga 22612688  T
Q  237 aaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccgttcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatg 336  Q
    ||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  || ||| |||||||||  ||| ||||| |  |||| |||||||||||| ||||  |||    
T  22612689 aaccactatgatcactagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctataaaaggataatcataacgttggttgatggctacttgatg 22612787  T
Q  337 aatca 341  Q
    |||||    
T  22612788 aatca 22612792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 28 - 323
Target Start/End: Original strand, 633925 - 634216
Alignment:
Q  28 caaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 127  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| | ||  ||| ||| ||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  633925 caaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagctat-gagatattaagtctatacataggtataaatattaggagt 634023  T
Q  128 aatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccct 227  Q
    |||||||||| |||||| | ||  | |||||||||||||||||  ||||||| | | |||||||||||||||||| | ||||| | ||||||  | | ||    
T  634024 aatatttatactggattaacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatgagattgtcataagatattctcacaatgataatagtgtatatcgctct 634121  T
Q  228 tcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccgttcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttga 323  Q
    | |||||||||||||||||  ||||||||| |||| || ||||||||||  || ||| ||||||||| |||| ||||| || |||| |||||||||    
T  634122 tagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataaccataacgttggttga 634216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 30 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 9917952 - 9917837
Alignment:
Q  30 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 129  Q
    ||||||||||| || ||||| |||||  |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  9917952 aagcatagagaatactatgtcggtaggttgatgatcacatctcgtggatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatt-tgagtaa 9917854  T
Q  130 tatttatattggattga 146  Q
    |||||||||||||||||    
T  9917853 tatttatattggattga 9917837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 37 - 341
Target Start/End: Original strand, 8727667 - 8727967
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 136  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||  ||||||||  | ||||  |||  ||| ||| ||||||  |||||  |||||||||||| ||||||||||||    
T  8727667 gagactattatctatgtagactgatgactacatctcatgggtcatatatat-gagatattaagtctatacataagtataaatattagaagtaatatttat 8727765  T
Q  137 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctga 236  Q
    | |||||||||||  | |||||||||||||||||  | ||||| ||| |  |||||||||||||| ||||||||   ||||||  ||| ||| ||||||     
T  8727766 actggattgatccaccgtgagaatactacatagt--atgttatgaaaataccataagatattctcttagtgataagagtgtatatcactcttagacctgg 8727863  T
Q  237 aaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccgttcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatg 336  Q
    ||||||||||  |||||||||  ||| || ||||||||||  || ||| ||||||||| |||| ||||| || ||||  |||| | |||||||||  |||    
T  8727864 aaccactatgatccctagatg-cggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataaccataacattggctaatgggtacttgatg 8727962  T
Q  337 aatca 341  Q
    |||||    
T  8727963 aatca 8727967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 37 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 47667776 - 47667487
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 136  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  47667776 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattatgagtaatatttat 47667678  T
Q  137 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctga 236  Q
    |||||||||| ||  | |||           |||  ||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| |||||||    
T  47667677 attggattgacccaccgtga-----------agt--aagttatgaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctga 47667591  T
Q  237 aaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccgttcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatg 336  Q
    ||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  || ||| ||||||||| |||| ||||| |  |||| |||||||||||||||||  |||    
T  47667590 aaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgggtacttgatg 47667492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 105 - 256
Target Start/End: Original strand, 29096789 - 29096938
Alignment:
Q  105 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaagtgtcataagatattctcata 204  Q
    |||||| |||| ||||||||| ||||||||||| | |||||||||  | || ||||||||||||| |   ||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  29096789 acataggtatacatattaggaataatatttatactagattgatccaccgtgtgaatactacatagcat--gttatgaaaatgtcataagatattctcata 29096886  T
Q  205 gtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagat 256  Q
     ||||| |||||| |  ||| ||| ||| |||||||||||||  ||||||||    
T  29096887 atgataatggtgtttcacactcttagacatgaaaccactatgatccctagat 29096938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 37 - 169
Target Start/End: Original strand, 35930582 - 35930713
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 136  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  35930582 gagactattatgtatatagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtctatacataggtataaatattaggagtaatatttat 35930680  T
Q  137 attggattgatccgtcatgagaatactacatag 169  Q
    |||||||||| |   | ||||||||||||||||    
T  35930681 attggattgacctaccgtgagaatactacatag 35930713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 53 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 12006550 - 12006461
Alignment:
Q  53 tagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattgga 142  Q
    |||||||||||||||| || ||  ||||| ||||| |||||||||||| ||| || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  12006550 tagactgatgatcacaacttacgaatcattgataaggagttatcaagtgttcgcacagatataaatattaagagtaatatttatactgga 12006461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 112 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 21881604 - 21881475
Alignment:
Q  112 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaagtgtcataagatattctcatagtgatag 211  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||   |||||| ||  | ||||||||||||||||||   ||||| ||| |||||||||||||||||| | |||||     
T  21881604 tataaatattaggagtaatgtttatacaagattgacccaccgtgagaatactacatagtat--gttatgaaaatgtcataagatattctcacaatgataa 21881507  T
Q  212 tggtgtattccacccttcgacctgaaaccact 243  Q
     ||||||| |||| ||| |||||||| |||||    
T  21881506 cggtgtataccactcttagacctgaagccact 21881475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 112 - 246
Target Start/End: Original strand, 51997353 - 51997485
Alignment:
Q  112 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaagtgtcataagatattctcatagtgatag 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||  |||||||||||||| ||  |||  |||| || || ||||||| |||||||||| |||||     
T  51997353 tataaatattaggagtaatatttatattagattgacccaccatgagaatactacgta--aaatattatgaatgtatcataagttattctcatattgataa 51997450  T
Q  212 tggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatg 246  Q
    || | ||| |||| ||| |||| ||||| ||||||    
T  51997451 tgatatataccacgcttagaccagaaactactatg 51997485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 230 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 28145835 - 28145725
Alignment:
Q  230 gacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccgttcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggta 329  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||| ||| || ||||||||||  || ||| ||||||||| |||| ||||| |  |||| |||||||||||||||    
T  28145835 gacctgaaaccactatgatccctagatgt-ggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgggta 28145737  T
Q  330 ctccatgaatca 341  Q
    ||  ||||||||    
T  28145736 cttgatgaatca 28145725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 45 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 26923678 - 26923553
Alignment:
Q  45 tatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggatt 144  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||  | |||| ||||  ||| ||| ||||||  |||| | ||| |||||||||||||||||||||| || |||    
T  26923678 tatgtatgtagactgatgaccacatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtctatacattggtatgaatattaggagtaatatttatactgaatt 26923580  T
Q  145 gatccgtcatgagaatactacatagta 171  Q
    || ||  | ||||||||||||||||||    
T  26923579 gacccaccgtgagaatactacatagta 26923553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 92 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 24301855 - 24301691
Alignment:
Q  92 ttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatattta-tattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataa-aagtgtca 189  Q
    ||||||||  ||||||||| |||| ||||||||||||||||||  |||| ||   | || ||| |||||||| ||||||| |  |||||   |||| |||    
T  24301855 ttatcaagatttcacataggtatacatattaggagtaatatttgctattagaaatacccatcacgagaataccacatagtga--gttatgttaagtatca 24301758  T
Q  190 taagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagat 256  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| ||| || ||||  ||||||||    
T  24301757 taagacattctcatagtgatagtggtgtatacaaccctttgacctaaaatcattatgatccctagat 24301691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 126 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 31236478 - 31236402
Alignment:
Q  126 gtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaagtgtcataagatattctcata 204  Q
    |||||| ||||| || |||||||  ||||||||||||||||||||| |  |||| |||||||| |||||||||||||||    
T  31236478 gtaatacttatactgaattgatctatcatgagaatactacatagtata--ttatgaaagtgtcgtaagatattctcata 31236402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 196 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 12006413 - 12006332
Alignment:
Q  196 attctcatagtgata-gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgt 276  Q
    ||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| || | ||||| |||||||| | |||| ||| ||||||    
T  12006413 attctcatactgataagtggtgttttccacccttcgacctgaaatcattgtgtactctagatgtagaagtcaagtactttgt 12006332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 182 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 10852461 - 10852402
Alignment:
Q  182 aagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaacca 241  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||  |||||||| |||||||||||    
T  10852461 aagtgtcataagatatttttaaagtgataatggtgtatgtcacccttcaacctgaaacca 10852402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 298; Significance: 1e-167; HSPs: 49)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 23 - 339
Target Start/End: Original strand, 15152609 - 15152926
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 122  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15152609 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 15152708  T
Q  123 ggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttat-aaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15152709 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 15152808  T
Q  222 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccgttcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15152809 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 15152908  T
Q  322 gatgggtactccatgaat 339  Q
    ||||||||||||||||||    
T  15152909 gatgggtactccatgaat 15152926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 23 - 341
Target Start/End: Original strand, 29327950 - 29328269
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 122  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29327950 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 29328049  T
Q  123 ggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttat-aaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29328050 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 29328149  T
Q  222 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccgttcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  29328150 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttgctt 29328249  T
Q  322 gatgggtactccatgaatca 341  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  29328250 gatgggtactccatgaatca 29328269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 280; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 23 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 11536103 - 11535784
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 122  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  11536103 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatccagtcttcacaaagatataaatatta 11536004  T
Q  123 ggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttat-aaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11536003 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtgatgtattc 11535904  T
Q  222 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccgttcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 321  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11535903 caacattcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 11535804  T
Q  322 gatgggtactccatgaatca 341  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  11535803 gatgggtactccatgaatca 11535784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 23 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 11543021 - 11542702
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 122  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11543021 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatatta 11542922  T
Q  123 ggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttat-aaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11542921 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaatgttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtgatgtattc 11542822  T
Q  222 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccgttcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 321  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  11542821 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgctggagtcgagtgatttgtcaccattcaaacgttgtctgtaacaggatgactataaagttggtt 11542722  T
Q  322 gatgggtactccatgaatca 341  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  11542721 gatgggtactccatgaatca 11542702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 18 - 341
Target Start/End: Original strand, 12750987 - 12751311
Alignment:
Q  18 tggacatcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaa 117  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  12750987 tggatatcattaaagcatagagactattatgtggatagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaattcttctcatagatataaa 12751086  T
Q  118 tattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttat-aaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtg 216  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12751087 tattatgagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtg 12751186  T
Q  217 tattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccgttcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagt 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12751187 tattccacccttcgacctgaaaccactaggtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagt 12751286  T
Q  317 tggttgatgggtactccatgaatca 341  Q
    |||||||||| ||||||||||||||    
T  12751287 tggttgatggatactccatgaatca 12751311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 23 - 341
Target Start/End: Original strand, 12738702 - 12739021
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 122  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12738702 atcattaaagcatagagactattatgtgggtagactgaagatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 12738801  T
Q  123 ggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttat-aaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 221  Q
        |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12738802 ctcataatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 12738901  T
Q  222 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccgttcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 321  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  12738902 caccgttcgacctgaaactactatgtaccctagatgttgtagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtttgtaacaggatgactataaagttggtt 12739001  T
Q  322 gatgggtactccatgaatca 341  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  12739002 gatgggtactccatgaatca 12739021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 23 - 341
Target Start/End: Original strand, 18561173 - 18561483
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 122  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18561173 atcattaaagcatagagactattatgtgggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 18561272  T
Q  123 ggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttat-aaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 221  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||         ||||||||||||||||||||    
T  18561273 ggagtaatatttatattggattgaccctctatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataa---------atagtgatagtggtgtattc 18561363  T
Q  222 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccgttcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 321  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  18561364 cacccttcgacttgaaaccactatgtaccctagatgttggagttgagtgatttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttgatt 18561463  T
Q  322 gatgggtactccatgaatca 341  Q
    ||| |||||| || ||||||    
T  18561464 gataggtactgcacgaatca 18561483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 33 - 341
Target Start/End: Original strand, 13392326 - 13392635
Alignment:
Q  33 catagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatat 132  Q
    ||||||||||||| | | ||||||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||| |||||    
T  13392326 catagagactattgtattggtagatcgatgatcacatctcacggatcatagataaagagttatcctgtcttcacataggaataaatattaggagaaatat 13392425  T
Q  133 ttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttat-aaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcga 231  Q
    ||||| |||||||| ||  |||| ||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  13392426 ttatactggattgacccaccatgcgaatattacatagtaaaatttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctttga 13392525  T
Q  232 cctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccgttcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtact 331  Q
    ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| | ||||||||||  |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13392526 cctaaaatcactatgtaccatagatgttggagtcaggtgctttgtcaccatacaaacgttgtttgtaacaagatgactataaaattggttgatgggtact 13392625  T
Q  332 ccatgaatca 341  Q
    ||||||||||    
T  13392626 ccatgaatca 13392635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 32 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 18257874 - 18257577
Alignment:
Q  32 gcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaata 131  Q
    ||||| |||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18257874 gcataaagactattatgtggatagattgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaata 18257775  T
Q  132 tttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttat-aaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcg 230  Q
    ||||||||||||| | ||  | | |||||| ||||||||  | || || |||| |||||||||||||||||| | ||||| ||||||||  ||| ||| |    
T  18257774 tttatattggattaacccaccgtcagaatattacatagt--atgtcatgaaaaatgtcataagatattctcacaatgataatggtgtatatcactcttag 18257677  T
Q  231 acctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccgttcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtac 330  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||| |||| || ||||||||||  || ||||||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18257676 acctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattcaaacgttgtgtgtaacaagataactataaagttggttgatgggtac 18257578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 37 - 341
Target Start/End: Original strand, 2204552 - 2204852
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 136  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2204552 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 2204650  T
Q  137 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctga 236  Q
    |||||||||| ||    |||||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| |||||||    
T  2204651 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatgaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctga 2204748  T
Q  237 aaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccgttcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatg 336  Q
    ||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  || ||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  |||    
T  2204749 aaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgatg 2204847  T
Q  337 aatca 341  Q
    |||||    
T  2204848 aatca 2204852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 37 - 341
Target Start/End: Original strand, 8464999 - 8465299
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 136  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8464999 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 8465097  T
Q  137 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctga 236  Q
    |||||||||| ||  | |||||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| |||||||    
T  8465098 attggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatgaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctga 8465195  T
Q  237 aaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccgttcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatg 336  Q
    ||||||||||  || |||||| |||| || ||||||||||  || ||| ||| ||||| |||| ||||| |  |||| |||||||||||||||||  |||    
T  8465196 aaccactatgatccttagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacattgtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgggtacttgatg 8465294  T
Q  337 aatca 341  Q
    |||||    
T  8465295 aatca 8465299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 37 - 341
Target Start/End: Original strand, 18400104 - 18400404
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 136  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18400104 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 18400202  T
Q  137 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctga 236  Q
    |||||||||| ||    |||||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| |||||||    
T  18400203 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatgaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttggacctga 18400300  T
Q  237 aaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccgttcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatg 336  Q
    ||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  || ||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  |||    
T  18400301 aaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgatg 18400399  T
Q  337 aatca 341  Q
    |||||    
T  18400400 aatca 18400404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 37 - 341
Target Start/End: Original strand, 18407088 - 18407388
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 136  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18407088 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 18407186  T
Q  137 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctga 236  Q
    |||||||||| ||    |||||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| |||||||    
T  18407187 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatgaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttggacctga 18407284  T
Q  237 aaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccgttcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatg 336  Q
    ||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  || ||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  |||    
T  18407285 aaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgatg 18407383  T
Q  337 aatca 341  Q
    |||||    
T  18407384 aatca 18407388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 37 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 48808798 - 48808498
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 136  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48808798 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 48808700  T
Q  137 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctga 236  Q
    |||||||||| ||    |||||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| |||||||    
T  48808699 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatgaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctga 48808602  T
Q  237 aaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccgttcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatg 336  Q
    ||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  || ||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  |||    
T  48808601 aaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgatg 48808503  T
Q  337 aatca 341  Q
    |||||    
T  48808502 aatca 48808498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 37 - 331
Target Start/End: Original strand, 30254138 - 30254428
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 136  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  30254138 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttgt 30254236  T
Q  137 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctga 236  Q
    |||||||||| ||  | |||||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||   || ||| ||| |||    
T  30254237 attggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatgaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatattactcttagacttga 30254334  T
Q  237 aaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccgttcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtact 331  Q
    ||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  || ||| ||||||||| |||| ||||| |  |||| |||||||||||||||||    
T  30254335 aaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgggtact 30254428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 37 - 341
Target Start/End: Original strand, 15729751 - 15730051
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 136  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||| ||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15729751 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtctatacatagatataaatattagaagtaatatttat 15729849  T
Q  137 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctga 236  Q
    |||||||||| ||    |||||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||    | ||| |||||||    
T  15729850 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatgaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatattgctcttagacctga 15729947  T
Q  237 aaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccgttcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatg 336  Q
    ||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  || ||| ||||||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||  |||    
T  15729948 aaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggtacttgatg 15730046  T
Q  337 aatca 341  Q
    |||||    
T  15730047 aatca 15730051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 37 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 18139640 - 18139340
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 136  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18139640 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaggtctatacatagatataaatattaggagtaatatttgt 18139542  T
Q  137 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctga 236  Q
    |||||||||| ||    |||||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| |||||||    
T  18139541 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatgaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctga 18139444  T
Q  237 aaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccgttcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatg 336  Q
    ||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  || ||| ||||||||| |||| ||||| |  |||| |||||||||||||||||  |||    
T  18139443 aaccactatgatctctagatg-tggattcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataataataacgttggttgatgggtacttgatg 18139345  T
Q  337 aatca 341  Q
    |||||    
T  18139344 aatca 18139340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 37 - 341
Target Start/End: Original strand, 19230888 - 19231188
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 136  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19230888 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 19230986  T
Q  137 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctga 236  Q
    | |||||||| ||  | |||||||||||||||  | ||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| |||||||    
T  19230987 actggattgacccaccgtgagaatactacata--ataagttatgaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctga 19231084  T
Q  237 aaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccgttcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatg 336  Q
    ||||||||||  ||||| ||| |||| || |||| |||||  || ||| ||||||||  |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||  |||    
T  19231085 aaccactatgatccctaaatg-tggactcaagtgttttgttgccattctaacgttgtttgtaaaaggataaccataacgttggttgatgggtacttgatg 19231183  T
Q  337 aatca 341  Q
    |||||    
T  19231184 aatca 19231188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 104 - 325
Target Start/End: Original strand, 2365169 - 2365389
Alignment:
Q  104 cacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaagtgtcataagatattctcat 203  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||  ||||| ||| |||||||| ||  |||||  || ||||||||| |||||||||    
T  2365169 cacatagatatcaatattaggagtaatatttacattggattgacccaccatgaaaatgctacataggaa--gttatgtaaatgtcataagttattctcat 2365266  T
Q  204 agtgata-gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccgttcaaacgttgtccgtaacag 302  Q
     |||||| |||||||||| |||| |||||||| || |||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||   ||| ||||||| |||||||||||    
T  2365267 tgtgataagtggtgtatttcaccattcgacctaaagccactatgtaccctagaccttggagtcaagtactttgttgtcgtacaaacgtcgtccgtaacag 2365366  T
Q  303 gatgactataaagttggttgatg 325  Q
      |||||||||||| ||||||||    
T  2365367 attgactataaagtcggttgatg 2365389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 105 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 41681203 - 41680970
Alignment:
Q  105 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaagtgtcataagatattctcata 204  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||  | |||||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||||| |    
T  41681203 acataggtataaatattatgagtaatatttatactggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatgaaattgtcataagatattctcaca 41681106  T
Q  205 gtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccgttcaaacgttgtccgtaacagga 304  Q
     ||||| | ||||||  | | ||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||| || ||||||||||  || ||| ||| ||||| |||| ||||    
T  41681105 atgataatagtgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacattgtctgtaaaagga 41681007  T
Q  305 tgactataaagttggttgatgggtactccatgaatca 341  Q
    | || |||| |||||||||| ||||||  ||||||||    
T  41681006 taaccataacgttggttgattggtacttgatgaatca 41680970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 37 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 47167161 - 47166871
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 136  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | | || ||||  ||| ||| ||||||  |||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  47167161 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggttatagatat-gagatattaagtctatacataggtataaatattatgagtaatatttat 47167063  T
Q  137 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctga 236  Q
    | | ||| || ||  | |||||||||||||||||||  ||||| | | |||||||||||||||||| | ||||| | ||||||  | | ||| |||||||    
T  47167062 actagatagacccaccgtgagaatactacatagtaa--gttatgagattgtcataagatattctcacaatgataatagtgtatatcgctcttagacctga 47166965  T
Q  237 aaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccgttcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtact 331  Q
    ||||||||||  ||||||||| |||| || ||| ||||||   | ||| ||||||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||    
T  47166964 aaccactatgatccctagatg-tggactcaagtactttgttgtcattctaacgttgtctgtaaaaggataaccataacgttggttgatgggtact 47166871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 37 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 10669204 - 10668903
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 136  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10669204 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtctatacataggtataaatattaggagtaatatttat 10669106  T
Q  137 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaagtgtcataagatattctc-atagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 235  Q
    | | |||||| ||  | |||||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||||   | ||||| | ||||||  | | ||| ||||||    
T  10669105 actagattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatgaaattgtcataagatattctcgcaattgataatagtgtatatcgctcttagacctg 10669008  T
Q  236 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccgttcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 335  Q
    |||||||||||  || || ||| |||| || | ||||||||  || ||| ||||||||| |||| ||||| |  |||| |||||||||||||||||  ||    
T  10669007 aaaccactatgatccgtaaatg-tggactcaaatgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataaaaataacgttggttgatgggtacttgat 10668909  T
Q  336 gaatca 341  Q
    ||||||    
T  10668908 gaatca 10668903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 29 - 258
Target Start/End: Original strand, 19388544 - 19388774
Alignment:
Q  29 aaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagta 128  Q
    |||||||||||| |||||||||  |||| |||||| || ||||||| | ||||| |||  ||| ||| |||| |  ||| || |||||||||||||||||    
T  19388544 aaagcatagagattattatgtatatagattgatgaccatatctcacgggtcatgaatat-gagatattaagtttgtacaaaggtataaatattaggagta 19388642  T
Q  129 atatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaa--aagttataaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 226  Q
    ||||||||| |||||||  |  ||||||||||||||||||   |  | ||||| ||||||||||||||||||||||||||| || | |||||| |||| |    
T  19388643 atatttatactggattgcccaatcatgagaatactacatatatagtatgttatgaaagtgtcataagatattctcatagtggtaatagtgtataccactc 19388742  T
Q  227 ttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgt 258  Q
    || |||||||||||| ||||  ||||||||||    
T  19388743 ttagacctgaaaccattatgagccctagatgt 19388774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 112 - 341
Target Start/End: Original strand, 34128647 - 34128873
Alignment:
Q  112 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaagtgtcataagatattctcatagtgatag 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |  |||||||||||||||||  | ||||| | | |||||||||||||||||| | | |||     
T  34128647 tataaatattaggagtaatatttatactggatagatccattgtgagaatactacatagt--acgttatgagattgtcataagatattctcacaattataa 34128744  T
Q  212 tggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccgttcaaacgttgtccgtaacaggatgactat 311  Q
    | ||||||  | | ||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||| || ||| ||||||   | ||| ||||||||| |||| ||||| || ||    
T  34128745 tagtgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtactttgttgtcattctaacgttgtctgtaaaaggataaccat 34128843  T
Q  312 aaagttggttgatgggtactccatgaatca 341  Q
    || |||||||||||||||||  ||||||||    
T  34128844 aacgttggttgatgggtacttgatgaatca 34128873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 38 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 24443628 - 24443349
Alignment:
Q  38 agactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttata 137  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||  | ||||| ||| | || ||| |||| |  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  24443628 agactattatgtatgtagactgatgaccacatctcatgggtcatgaatata-agatattaagtttatacataggtatgaatattaggagtaatatttata 24443530  T
Q  138 ttggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaa 237  Q
     | |||| | ||  | ||||| |||||||||||  | ||||| ||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||  ||| ||| ||| ||||    
T  24443529 ctagattaacccaccgtgagagtactacatagt--atgttatgaaaatgtcataagttattctcacagtgataatggtgtataacactcttagacttgaa 24443432  T
Q  238 accactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccgttcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 321  Q
    |||| ||||  ||||||||| |||| || |||||||| |     ||||||||||||  ||||||||||||| |||| |||||||    
T  24443431 accattatgatccctagatg-tggactcaagtgctttattgttattcaaacgttgtgtgtaacaggatgaccataacgttggtt 24443349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 37 - 341
Target Start/End: Original strand, 28130561 - 28130861
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 136  Q
    |||||||||||| | |||||||||||| | |||||||  | ||||  |||  ||| ||| ||||||  |||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  28130561 gagactattatgcatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcataaatat-gagatattaagtctatacataggtataaatatcaggagtaatatttat 28130659  T
Q  137 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctga 236  Q
    | |||||||| ||    |||||||| ||||||||  | ||||| ||| |||||||||||||||||| | | ||| | ||||||  ||  ||| |||||||    
T  28130660 actggattgacccactgtgagaatattacatagt--atgttatgaaattgtcataagatattctcacaataataatagtgtatatcattcttagacctga 28130757  T
Q  237 aaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccgttcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatg 336  Q
    || |||||||  || |||||| |||| || ||||||||||   | ||| ||||||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||  |||    
T  28130758 aatcactatgatccgtagatg-tggactcaagtgctttgttgtcattctaacgttgtctgtaaaaggataaccataacgttggttgatgggtacttaatg 28130856  T
Q  337 aatca 341  Q
    |||||    
T  28130857 aatca 28130861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 56 - 341
Target Start/End: Original strand, 10235361 - 10235644
Alignment:
Q  56 actgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatg 155  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||  |||||||||||||| |||||||||||| |||||||  |  ||||    
T  10235361 actgatgatcacatctcacagatcattgataaagagttatcaggtgttcccatatgtataaatattaggaataatatttatatcggattgactcaccatg 10235460  T
Q  156 agaatactacatagtaaaagttataaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttc-gacctgaaaccactatgtaccctag 254  Q
    |||||  |||||||  |  |||||  ||| |||||||| |||| |  || ||||| || || ||  || ||||| ||| ||||||||||||  |||||||    
T  10235461 agaattatacatag--agtgttatgtaagagtcataagttattattgtaatgataatgatgcatatcatccttctgacatgaaaccactatcgaccctag 10235558  T
Q  255 atgttggagtcgagtgctttgtcaccgttcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatca 341  Q
    |||| || ||||||  || |||  || || ||   |||| |||| ||||||||| ||||| | |||||||||||||||||| |||||    
T  10235559 atgtagg-gtcgagaactgtgttgccatttaattattgttcgtagcaggatgaccataaactcggttgatgggtactccataaatca 10235644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 37 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 19393726 - 19393462
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 136  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||| ||||| |||  | ||||  |||  ||| ||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19393726 gagactattatgtatgtagactaatgaccacatttcatgggtcataaatat-gagatattaagtctatacataggtataaatattaggagtaatatttat 19393628  T
Q  137 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctga 236  Q
    | | |||||| |   | |||||||||||||||||  | ||||| ||| | |||||||||||||||| | ||||| | ||||||  ||| ||| |||||||    
T  19393627 actagattgaccgaccgtgagaatactacatagt--atgttatgaaaatctcataagatattctcacaatgataatagtgtatatcactcttagacctga 19393530  T
Q  237 aaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccgttcaaacgttgtccgtaacaggat 305  Q
    | ||| ||||  ||||||||||| || || |||||||||| ||| ||| || |||||| |||| |||||    
T  19393529 atccagtatgatccctagatgtt-gactcaagtgctttgttacctttctaatgttgtctgtaaaaggat 19393462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 35 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 25845780 - 25845498
Alignment:
Q  35 tagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatattt 134  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||  | ||||| |||  ||| ||| ||||||  || ||  | | |||||||||||||||||||    
T  25845780 tagagactattatgcatgtagactgatgaccacatctcattgctcatgaatat-gagatattaagtctatacgtatgtgtcaatattaggagtaatattt 25845682  T
Q  135 atattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacct 234  Q
    ||| ||||||||  |  | ||||||||||||||||||   ||||| ||| | |||||||||||||||| | | ||| || ||||| |||| ||| |||||    
T  25845681 atactggattgacacaccgtgagaatactacatagtat--gttatgaaaatatcataagatattctcaaaataataatgatgtataccactcttagacct 25845584  T
Q  235 gaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccgttcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 321  Q
    ||||||| ||||  ||||||||| |||| || |||||||| |  || ||||||| || || |||| | ||| ||||||| |||||||    
T  25845583 gaaaccattatgatccctagatg-tggactcaagtgctttatttccattcaaaccttatctgtaaaaagataactataacgttggtt 25845498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 35 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 25846199 - 25845917
Alignment:
Q  35 tagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatattt 134  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||  | ||||| |||  ||| ||| ||||||  || ||  | | |||||||||||||||||||    
T  25846199 tagagactattatgcatgtagactgatgaccacatctcattgctcatgaatat-gagatattaagtctatacgtatgtgtcaatattaggagtaatattt 25846101  T
Q  135 atattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacct 234  Q
    ||| ||||||||  |  | ||||||||||||||||||   ||||| ||| | |||||||||||||||| | | ||| || ||||| |||| ||| |||||    
T  25846100 atactggattgacacaccgtgagaatactacatagtat--gttatgaaaatatcataagatattctcaaaataataatgatgtataccactcttagacct 25846003  T
Q  235 gaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccgttcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 321  Q
    ||||||| ||||  ||||||||| |||| || |||||||| |  || ||||||| || || |||| | ||| ||||||| |||||||    
T  25846002 gaaaccattatgatccctagatg-tggactcaagtgctttatttccattcaaaccttatctgtaaaaagataactataacgttggtt 25845917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 105 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 18259359 - 18259126
Alignment:
Q  105 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaagtgtcataagatattctcata 204  Q
    |||||| ||||||||||   ||||||||||||| ||||| || ||  | |||||||||| ||||||||  ||||| | | |||||||||||||||||| |    
T  18259359 acataggtataaatattgaaagtaatatttatactggatagacccaccgtgagaatactgcatagtaa--gttatgagattgtcataagatattctcaca 18259262  T
Q  205 gtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccgttcaaacgttgtccgtaacagga 304  Q
     ||||| | ||||||  | | ||| |||||||||||  ||||  |||||||||| ||| || ||| ||||||  || ||| ||||||||| |||| ||||    
T  18259261 atgataatagtgtatatcgctcttagacctgaaacccttatgatccctagatgt-ggactcaagtactttgttgccattctaacgttgtctgtaaaagga 18259163  T
Q  305 tgactataaagttggttgatgggtactccatgaatca 341  Q
    | || |||| |||||||||||||||||  ||||||||    
T  18259162 taaccataacgttggttgatgggtacttgatgaatca 18259126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 195 - 332
Target Start/End: Original strand, 39112138 - 39112275
Alignment:
Q  195 tattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccgttcaaacgttgtc 294  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||   ||| || ||||| |||||||||| |||||||| ||| || |||  |||||   |||||||||||||||    
T  39112138 tattctcttagtgatagtggtgtattccattattcaacatgaaatcactatgtactctagatgtaggaatcaagtattttgttgtcgttcaaacgttgtc 39112237  T
Q  295 cgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactc 332  Q
     |||| | | |||||||||||||||||||| |||||||    
T  39112238 tgtaataaggtgactataaagttggttgataggtactc 39112275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 38 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 47833983 - 47833875
Alignment:
Q  38 agactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttata 137  Q
    ||||||||| |||||||| ||| |||||| ||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||    |||||||||||    
T  47833983 agactattacgtaggtaggctggtgatcagatctcaccgatcatgaataaagagttaccaagttttcacataggtataaatattactcataatatttata 47833884  T
Q  138 ttggattga 146  Q
    || ||||||    
T  47833883 tttgattga 47833875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 23 - 78
Target Start/End: Original strand, 15148308 - 15148363
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagat 78  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15148308 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagat 15148363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 28 - 137
Target Start/End: Original strand, 19859113 - 19859221
Alignment:
Q  28 caaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 127  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  19859113 caaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagt 19859211  T
Q  128 aatatttata 137  Q
    ||||||||||    
T  19859212 aatatttata 19859221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 112 - 246
Target Start/End: Original strand, 14591924 - 14592056
Alignment:
Q  112 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaagtgtcataagatattctcatagtgatag 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  | ||||||||||||| |||    ||||| ||| |||||||||||||||||| | |||||     
T  14591924 tataaatattaggagtaatatttatactggattgacccaccgtgagaatactacacagt--ttgttatgaaaatgtcataagatattctcagattgataa 14592021  T
Q  212 tggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatg 246  Q
    | ||||||  ||| ||| ||| |||||||||||||    
T  14592022 tagtgtatatcactcttagacttgaaaccactatg 14592056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 112 - 246
Target Start/End: Original strand, 16011515 - 16011647
Alignment:
Q  112 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaagtgtcataagatattctcatagtgatag 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  ||||||||||||| | |||    ||||| ||| |||||||||||||||||| | |||||     
T  16011515 tataaatattaggagtaatatttatactggattgacccaccatgagaatactatacagt--ttgttatgaaaatgtcataagatattctcacattgataa 16011612  T
Q  212 tggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatg 246  Q
    |  |||||  ||| ||| |||||||||||||||||    
T  16011613 taatgtatatcactcttagacctgaaaccactatg 16011647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 119 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 31190660 - 31190524
Alignment:
Q  119 attaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 218  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||| |||   ||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  31190660 attaggagcaatatttatactggattgacccaccatgagaatactacattgtat--gttatgaatatgtcttaagatattctcatagtgataatggtgta 31190563  T
Q  219 ttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatg 257  Q
    |  |||  || ||||||||||||||| |  |||||||||    
T  31190562 tatcactgttagacctgaaaccactaagatccctagatg 31190524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 32 - 170
Target Start/End: Original strand, 3132849 - 3132986
Alignment:
Q  32 gcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaata 131  Q
    ||||||||||||  ||||   ||||||||||||||||||||| |||| |  ||  | ||| |||||||||||||||||  ||||| ||||| |  |||||    
T  3132849 gcatagagactacaatgtgattagactgatgatcacatctcatagataaatgaatatgagatatcaagtcttcacatatgtataattattatgt-taata 3132947  T
Q  132 tttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagt 170  Q
    ||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||    
T  3132948 tttatattggattgacctgtcataagaatactacatagt 3132986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 42 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 7662686 - 7662569
Alignment:
Q  42 tattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 141  Q
    |||||||| | || ||||||||||| |||| ||  |||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||| |||| |    
T  7662686 tattatgtggatacactgatgatcatatcttacgaatcatgtataaaaacttatcaagtcttcacatagatataaa-attataagtaatatttttattag 7662588  T
Q  142 attgatccgtcatgagaat 160  Q
    ||||| ||| |||||||||    
T  7662587 attgacccgccatgagaat 7662569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 112 - 243
Target Start/End: Original strand, 22969024 - 22969153
Alignment:
Q  112 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaagtgtcataagatattctcatagtgatag 211  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||   |||||| ||  | ||||||||||||||||||   ||||| ||| |||||||||||||||||| | |||||     
T  22969024 tataaatattaggagtaatgtttatacaagattgacccaccgtgagaatactacatagtat--gttatgaaaatgtcataagatattctcacaatgataa 22969121  T
Q  212 tggtgtattccacccttcgacctgaaaccact 243  Q
     ||||||| |||| ||| |||||||| |||||    
T  22969122 cggtgtataccactcttagacctgaagccact 22969153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 29 - 115
Target Start/End: Original strand, 7396361 - 7396450
Alignment:
Q  29 aaagcatagagactattatgta---ggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatata 115  Q
    |||||||||||||||||||||    |||  |||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||| |||||||| |||||    
T  7396361 aaagcatagagactattatgtgcagggtgaactgatgatcacatctcacatatcatgaataaagaattatcaagtattcacataaatata 7396450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 194 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 22948574 - 22948499
Alignment:
Q  194 atattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagt 269  Q
    |||||||| |||| ||||| |||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||    
T  22948574 atattctcgtagtaatagtcgtgtatgccacccttcgacatgaaaccgctatgtaccttagatgtaggagttgagt 22948499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 102 - 160
Target Start/End: Original strand, 7396469 - 7396527
Alignment:
Q  102 ttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaat 160  Q
    |||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||| | ||||||| |||||    
T  7396469 ttcacataaatataaatattatgggtaatatttatattggattaacccgtcataagaat 7396527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 156 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 15169474 - 15169292
Alignment:
Q  156 agaatactacatagtaaaagttataaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaga 255  Q
    ||||||||||||||||   ||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |||||||| | || ||| | ||| |||||||||||  ||| |||    
T  15169474 agaatactacatagtat--gttatgaaaatgtcataagatattctcacaatgataatggtgtatgctactcttagtcctaaaaccactatgatcccaaga 15169377  T
Q  256 tgttggagtcgagtgctttgtcaccgttcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatca 341  Q
    || |||| |  | |||||| |  || |||||||||| ||  ||||||||| || |||| |||||||||| || |||  ||||||||    
T  15169376 tg-tggacttaaatgctttattgccattcaaacgttatctataacaggataaccataacgttggttgataggcacttgatgaatca 15169292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 71 - 126
Target Start/End: Original strand, 29983179 - 29983234
Alignment:
Q  71 tcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggag 126  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||| | ||||||||  |||||||||||||||    
T  29983179 tcacggatcatggataaagagttaacaaattttcacatatgtataaatattaggag 29983234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 34 - 137
Target Start/End: Original strand, 39111989 - 39112092
Alignment:
Q  34 atagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatt 133  Q
    ||||||||||||||   |||||||| ||| | | ||| || || |||||||||||||||||  |  |||||| ||| | |||||||||||||||| ||||    
T  39111989 atagagactattataagggtagactaatggtaatatcacataggtcatggataaagagttacaatttcttcatatatacataaatattaggagtattatt 39112088  T
Q  134 tata 137  Q
    ||||    
T  39112089 tata 39112092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 33 - 75
Target Start/End: Original strand, 2365070 - 2365112
Alignment:
Q  33 catagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcaca 75  Q
    |||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  2365070 catagagactatcatgtgggtcgactgatgatcacatctcaca 2365112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 189 - 253
Target Start/End: Original strand, 29984308 - 29984372
Alignment:
Q  189 ataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtacccta 253  Q
    |||||||||||||||||||  |||| || ||  |||||||| || ||||||||| ||||||||||    
T  29984308 ataagatattctcatagtggaagtgatgcatatcacccttcaacttgaaaccaccatgtacccta 29984372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 298; Significance: 1e-167; HSPs: 35)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 29 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 24695501 - 24695188
Alignment:
Q  29 aaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagta 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24695501 aaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagta 24695402  T
Q  129 atatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttat-aaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccct 227  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24695401 atatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccct 24695302  T
Q  228 tcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccgttcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatggg 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24695301 tcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatggg 24695202  T
Q  328 tactccatgaatca 341  Q
    ||||||||||||||    
T  24695201 tactccatgaatca 24695188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 23 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 19714539 - 19714220
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 122  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19714539 atcattaaagcatagagactattatgtgggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 19714440  T
Q  123 ggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttat-aaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19714439 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagttgtgtattc 19714340  T
Q  222 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccgttcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19714339 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaactttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 19714240  T
Q  322 gatgggtactccatgaatca 341  Q
    |||||||||| |||||||||    
T  19714239 gatgggtactacatgaatca 19714220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 23 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 19707259 - 19706941
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 122  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  19707259 atcattaaagcatagagactattatgtgggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaaatcttcacatagatataaatacta 19707160  T
Q  123 ggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttat-aaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||    
T  19707159 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagattttctcatagtgataattgtgtattc 19707060  T
Q  222 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccgttcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 321  Q
    |||||||||||||| ||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19707059 cacccttcgacctg-aataactatgtaccctagatattggagtcgagtgctctgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaagatgactataaagttggtt 19706961  T
Q  322 gatgggtactccatgaatca 341  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  19706960 gatgggtactccatgaatca 19706941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 23 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 18569904 - 18569583
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggata--aagagttatcaagtcttcacatagatataaatat 120  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18569904 atcattaaagcataaagactattatgttggtagactgatgatcacatctcacatatcatggatataaagagatatcaagtcttcacatagatataaatat 18569805  T
Q  121 taggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttat-aaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtat 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18569804 taggagtaatatttatattggattgacccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattatcatagtgatagtggtgtat 18569705  T
Q  220 tccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccgttcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttgg 319  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18569704 tccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctacatgttggagtcgagtgctttatcaccattcaaatgttgtccgtaacaggatgactataaaattgg 18569605  T
Q  320 ttgatgggtactccatgaatca 341  Q
    |||||||||||| |||||||||    
T  18569604 ttgatgggtacttcatgaatca 18569583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 53 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 17298912 - 17298627
Alignment:
Q  53 tagactgatgatcaca--tctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccg 150  Q
    ||||||||||||||||  | |||| | |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||     
T  17298912 tagactgatgatcacacatatcacgggtcatggataaagagttattaaatcttcacatagatataaatattaagagtaatatttatattggattgaccca 17298813  T
Q  151 tcatgagaatactacatagtaaaagttataaaagtgtcataagatattctcatagtgata-gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtac 249  Q
     |||||||||||||| |||  ||||||||  || ||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  17298812 ccatgagaatactacgtag--aaagttatgtaaatgtcataagttattctcatagtgataagtggcgtattccacccttcaacctgaaaccaatatgtac 17298715  T
Q  250 cctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccgttcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatga 337  Q
    ||||| | | |||||||||| ||||||  |||| |||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||    
T  17298714 cctaggtttaggagtcgagtactttgtttccgtacaaacgttgtccgtaataggatgactataaaatcggttgatgggtgctccatga 17298627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 23 - 221
Target Start/End: Original strand, 39538754 - 39538953
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 122  Q
    ||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39538754 atcattaaagcatgaagactattatgtgggtagactgatggtcatatttcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 39538853  T
Q  123 ggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttat-aaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 221  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  39538854 ggagtaatatttatattggattgacccaccatgaaaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataaaatattctcatagtgatagtggtatattc 39538953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 53 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 17285759 - 17285476
Alignment:
Q  53 tagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtc 152  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||       
T  17285759 tagactgatgatcacatatcacaggtcatggataaagagttatcaagtctttacatagatataaatattaagagtaatatttatattggattgacccaca 17285660  T
Q  153 atgagaatactacatagtaaaagttataaaagtgtcataagatattctcatagtgat-agtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccc 251  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||  |  | ||||||| |||| |||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||| || |||||||||    
T  17285659 atgagaatactacatag--aaagttatgtatatatcataagttattatcatagtgataagtggtatattccactcttcgacctgaaatcaatatgtaccc 17285562  T
Q  252 tagatgttggagtcgagtgctttgtcaccgttcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatga 337  Q
    ||| | | ||| |||||| ||||||  |||| ||||| |||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||    
T  17285561 taggtttaggattcgagtactttgtttccgtacaaactttgtccgtaataggatgactataaaatcggttgatgggtgctccatga 17285476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 29 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 18807069 - 18806843
Alignment:
Q  29 aaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagta 128  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18807069 aaagcatagagactattatgcgggtagactgatgatcacatttcatatatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattagaagta 18806970  T
Q  129 atatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaagtgtcataagatattctcatagtgat-agtggtgtattccaccct 227  Q
    || ||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||  |||||| |  || ||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  18806969 atgtttatattggattgatccaccatgagaatgatacatag--aaagttttgtaactgtcataagttattctcatagtgataagtgatgtattccaccct 18806872  T
Q  228 tcgacctgaaaccactatgtaccctagat 256  Q
    || ||||||||||||||||||| ||||||    
T  18806871 tcaacctgaaaccactatgtacactagat 18806843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 170 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 27347428 - 27347258
Alignment:
Q  170 taaaagttataaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagt 269  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27347428 taaaagttatgaaagtgtcataagatattctcatagtgatagttgtgtattccaccctttgacacgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagt 27347329  T
Q  270 gctttgtcaccgttcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatca 341  Q
    | ||||||||| |||||| ||| ||  ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27347328 gttttgtcaccattcaaatgttatctttaacaagatgac-ataaagttggttgatgggtactccacgaatca 27347258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 37 - 341
Target Start/End: Original strand, 20941027 - 20941327
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 136  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20941027 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 20941125  T
Q  137 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctga 236  Q
    |||||||||| ||  | |||||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| |||||||    
T  20941126 attggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatgaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctga 20941223  T
Q  237 aaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccgttcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatg 336  Q
    ||||||||||  ||||||||| |||| || ||||||||||   | ||| ||||||||| |||| ||||| |  |||| |||||||||||||||||  |||    
T  20941224 aaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgtcattctaacgttgtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgggtacttgatg 20941322  T
Q  337 aatca 341  Q
    |||||    
T  20941323 aatca 20941327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 236 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 24702057 - 24701952
Alignment:
Q  236 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccgttcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24702057 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 24701958  T
Q  336 gaatca 341  Q
    ||||||    
T  24701957 gaatca 24701952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 37 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 25805687 - 25805387
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 136  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25805687 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 25805589  T
Q  137 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctga 236  Q
    |||||||||| ||  | |||||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | |||  ||||||    
T  25805588 attggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatgaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttacacctga 25805491  T
Q  237 aaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccgttcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatg 336  Q
    ||||||||||  ||||||||| |||| || ||||||||||  || ||| ||||||||| |||| ||||| |  |||| |||||||||||||||||  |||    
T  25805490 aaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgggtacttgatg 25805392  T
Q  337 aatca 341  Q
    |||||    
T  25805391 aatca 25805387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 37 - 341
Target Start/End: Original strand, 31899 - 32199
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 136  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31899 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 31997  T
Q  137 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctga 236  Q
    |||||||||| ||    |||||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| |||||||    
T  31998 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatgaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctga 32095  T
Q  237 aaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccgttcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatg 336  Q
    ||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  || ||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  |||    
T  32096 aaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgatg 32194  T
Q  337 aatca 341  Q
    |||||    
T  32195 aatca 32199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 37 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 12789965 - 12789665
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 136  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12789965 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattagaagtaatatttat 12789867  T
Q  137 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctga 236  Q
    |||||||||| ||    |||||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  ||||| |  | ||| |||||||    
T  12789866 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatgaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatactgctcttagacctga 12789769  T
Q  237 aaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccgttcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatg 336  Q
    ||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  || ||| ||||||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||  |||    
T  12789768 aaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggtacttgatg 12789670  T
Q  337 aatca 341  Q
    |||||    
T  12789669 aatca 12789665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 34 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 22547046 - 22546872
Alignment:
Q  34 atagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatt 133  Q
    |||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  22547046 atagagactattatgtggatagaccgatgatcacatctcacaaatcatggataaagagttatcaagttttcatatagatataaatattatgagtaatatt 22546947  T
Q  134 tatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaagtgtcataagatattctcatagtgata 210  Q
    ||||||||||||| | | |||||||||||||||||  |||||||||  || | ||||||| |||| ||||| |||||    
T  22546946 tatattggattgaccagccatgagaatactacata--aaaagttatgtaaatatcataagttattttcataatgata 22546872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 37 - 341
Target Start/End: Original strand, 22941250 - 22941550
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 136  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||  | |||| ||||  ||| |||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22941250 gagactattatgtatgtagactgatgaccgtatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtttatacatagatataaatattaggagtaatatttat 22941348  T
Q  137 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctga 236  Q
    |||||||||| ||  | |||||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| |||||||    
T  22941349 attggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatgaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctga 22941446  T
Q  237 aaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccgttcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatg 336  Q
    ||||||||||  ||||||||| |||| || ||||||||||  || ||| ||||||||| |||| ||||| |  |||| |||||||||||||||||  |||    
T  22941447 aaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgggtacttgatg 22941545  T
Q  337 aatca 341  Q
    |||||    
T  22941546 aatca 22941550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 37 - 341
Target Start/End: Original strand, 23545922 - 23546222
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 136  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23545922 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 23546020  T
Q  137 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctga 236  Q
    |||||||||| ||    |||||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| |||||||    
T  23546021 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatgaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctga 23546118  T
Q  237 aaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccgttcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatg 336  Q
    ||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  || ||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  |||    
T  23546119 aaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgatg 23546217  T
Q  337 aatca 341  Q
    |||||    
T  23546218 aatca 23546222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 37 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 24933608 - 24933308
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 136  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||| ||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24933608 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtctatacatagatataaatattagaagtaatatttat 24933510  T
Q  137 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctga 236  Q
    |||||||||| ||    |||||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||    | ||| |||||||    
T  24933509 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatgaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatattgctcttagacctga 24933412  T
Q  237 aaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccgttcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatg 336  Q
    ||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  || ||| ||||||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||  |||    
T  24933411 aaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggtacttgatg 24933313  T
Q  337 aatca 341  Q
    |||||    
T  24933312 aatca 24933308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 39 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 20100543 - 20100255
Alignment:
Q  39 gactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatat 138  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||  | ||||| |||  ||| ||| ||||||  | |||| ||| |||||||||||||||| |||||     
T  20100543 gactattatgtatgtagactgatgatcacatctcatgggtcatgaatat-gagatattaagtctatagataggtatcaatattaggagtaatacttatac 20100445  T
Q  139 tggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaa 238  Q
    ||| |||| ||  | |||||| |||||||||||   ||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |||||||| |||| ||| ||| |||||    
T  20100444 tggcttgacccaacgtgagaaaactacatagtat--gttatgaaaatgtcataagatattctcacaatgataatggtgtataccactcttagacatgaaa 20100347  T
Q  239 ccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccgttcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtact 331  Q
    ||||||||  ||| ||||| |||| || |||||||| |  || ||||||||||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||    
T  20100346 ccactatgatcccaagatg-tggactcaagtgctttattgccattcaaacgttgtctgtaaaaggataaccataatgttggttgatgggtact 20100255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 37 - 341
Target Start/End: Original strand, 31096816 - 31097116
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 136  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||| ||||||  |||||| |||||||  ||||||||||||||||    
T  31096816 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtctatacataggtataaattataggagtaatatttat 31096914  T
Q  137 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctga 236  Q
    |||||||||| ||  | |||||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| |||||||    
T  31096915 attggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatgaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctga 31097012  T
Q  237 aaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccgttcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatg 336  Q
    ||||| ||||  ||||||||| |||| || ||||||||||  || ||| ||||||||| |||| ||||| |  |||| |||||||||||||||||  |||    
T  31097013 aaccattatgatccctagatg-tggaatcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgggtacttgatg 31097111  T
Q  337 aatca 341  Q
    |||||    
T  31097112 aatca 31097116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 37 - 330
Target Start/End: Original strand, 5097651 - 5097940
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 136  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||  | |||| ||||  ||| ||| ||||||  |||||  ||||||||||| |||||||||||||    
T  5097651 gagactattatgtatgtagactgatgactacatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtctatacataagtataaatattatgagtaatatttat 5097749  T
Q  137 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctga 236  Q
    |||||||| | ||  | |||||||||||||||||  | ||||| ||| ||||||||| |||||||| | ||||| | ||||||  | | ||| |||||||    
T  5097750 attggattaacccaccgtgagaatactacatagt--atgttatgaaattgtcataagttattctcacaatgataatagtgtatatcgctcttagacctga 5097847  T
Q  237 aaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccgttcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtac 330  Q
    ||||||||||  ||| ||||| |||| || ||||||||||  || ||| ||||||||  |||| ||||| || |||| ||| ||||||||||||    
T  5097848 aaccactatgatcccgagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtatgtaaaaggataaccataacgtttgttgatgggtac 5097940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 37 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 7865736 - 7865432
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 136  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | | || ||||  ||| ||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7865736 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggttatagatat-gagatattaagtctatacataggtataaatattaggagtaatatttat 7865638  T
Q  137 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataa----aagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgac 232  Q
    | ||||| || ||  | ||||||||||||||||||   ||||| |    || |||||||||||||||||| | ||||| | ||||||  | | ||| |||    
T  7865637 actggatagacccaccgtgagaatactacatagtac--gttatgagattaattgtcataagatattctcacaatgataatagtgtatatcgctcttagac 7865540  T
Q  233 ctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccgttcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactc 332  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| |||| || |||  |||||  || ||| ||||||||| |||| ||||| || ||||  ||||||||||||||||     
T  7865539 ctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtattttgtttcccttctaacgttgtctgtaaaaggataaccataacattggttgatgggtactt 7865441  T
Q  333 catgaatca 341  Q
     ||||||||    
T  7865440 gatgaatca 7865432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 37 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 12765296 - 12764992
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 136  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||  | | || ||||  ||| ||| ||||||  |||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  12765296 gagactattatgtatgtagactgatgaccacatctcatgggttatagatat-gagatattaagtctatacatatgtataaatattaggagtaatatttat 12765198  T
Q  137 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataa----aagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgac 232  Q
    ||||||| || ||  | |||||||||||||||||  ||||||| |    || |||||||||| ||||||| | ||||| | ||||||  | | ||| |||    
T  12765197 attggatagacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatgagattaattgtcataagacattctcacaatgataatagtgtatatcgctcttagac 12765100  T
Q  233 ctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccgttcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactc 332  Q
    ||||||||||||||  | || |||| |||| || ||| ||||||  || ||| ||||||||| |||| || || || |||| |||||||||||||||||     
T  12765099 ctgaaaccactatgatctcttgatg-tggactcaagtactttgtttccattctaacgttgtctgtaaaagaataaccataacgttggttgatgggtactt 12765001  T
Q  333 catgaatca 341  Q
     ||||||||    
T  12765000 gatgaatca 12764992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 119 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 18806619 - 18806483
Alignment:
Q  119 attaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaagtgtcataagatattctcatagtgata-gtggtgt 217  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||  |||||| |  || ||||||||| |||||||||||||||| ||| |||    
T  18806619 attagaagtaatgtttatattggattgatccaccatgagaatgatacatag--aaagttttgtaactgtcataagttattctcatagtgataagtgatgt 18806522  T
Q  218 attccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagat 256  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  18806521 attccacccttcaacctgaaaccactatgtacactagat 18806483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 119 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 18806799 - 18806663
Alignment:
Q  119 attaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaagtgtcataagatattctcatagtgata-gtggtgt 217  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||  |||||| |  || ||||||||| |||||||||||||||| ||| |||    
T  18806799 attagaagtaatgtttatattggattgatccaccatgagaatgatacatag--aaagttttgtaactgtcataagttattctcatagtgataagtgatgt 18806702  T
Q  218 attccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagat 256  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  18806701 attccacccttcaacctgaaaccactatgtacactagat 18806663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 95 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 18829530 - 18829283
Alignment:
Q  95 tcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaagtgtcataaga 194  Q
    |||||| ||| |||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||  |||||||||  |||||||  ||||||||  ||||  ||||||     
T  18829530 tcaagtgttctcatatatataaatattaggaccaatatttatattggattgacccaccatgagaatgatacatag--aaagttatgtaagttccataagt 18829433  T
Q  195 tattctcatagtgat-agtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccgttcaaacgttgt 293  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||| | || ||||| |||||||||||||| || |||||  |||||| || ||||||   ||| |||| ||  |    
T  18829432 tattctcataatgataagtggtgtattccatcatttgacctaaaaccactatgtacact-gatgtgagagtcgtgtactttgttgtcgtacaaatgtcat 18829334  T
Q  294 ccgtaacaggatgactataaagttgg---ttgatgggtactccatgaatca 341  Q
    |  ||| | |||||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||    
T  18829333 ctataaaatgatgactataaagttggttattgatgggtactccatggatca 18829283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 37 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 9812039 - 9811735
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 136  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||  | | || ||||  ||| ||| ||||||  |||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  9812039 gagactactatgtatgtagactgatgaccacatctcatgggttatagatat-gagatattaagtctatacatatgtataaatattaggagtaatatttat 9811941  T
Q  137 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataa----aagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgac 232  Q
    ||||||| || ||  | |||||||||||||||||  | ||||| |    || ||||||||||| |||||| | ||||| | ||||||  | | ||| |||    
T  9811940 attggatagacccaccgtgagaatactacatagt--acgttatgagattaattgtcataagattttctcacaatgataatagtgtatatcgctcttagac 9811843  T
Q  233 ctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccgttcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactc 332  Q
    ||||||||||||||  | || |||| |||| || ||| ||||||  || ||| ||||||||| |||| || || || |||| |||||||||||||||||     
T  9811842 ctgaaaccactatgatctcttgatg-tggactcaagtactttgtttccattctaacgttgtctgtaaaagaataaccataacgttggttgatgggtactt 9811744  T
Q  333 catgaatca 341  Q
     ||||||||    
T  9811743 gatgaatca 9811735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 37 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 12704180 - 12703876
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 136  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||  | | || ||||  ||| ||| ||||||  |||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  12704180 gagactactatgtatgtagactgatgaccacatctcatgggttatagatat-gagatattaagtctatacatatgtataaatattaggagtaatatttat 12704082  T
Q  137 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataa----aagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgac 232  Q
    ||||||| || ||  | |||||||||||||||||  | ||||| |    || ||||||||||| |||||| | ||||| | ||||||  | | ||| |||    
T  12704081 attggatagacccaccgtgagaatactacatagt--acgttatgagattaattgtcataagattttctcacaatgataatagtgtatatcgctcttagac 12703984  T
Q  233 ctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccgttcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactc 332  Q
    ||||||||||||||  | || |||| |||| || ||| ||||||  || ||| ||||||||| |||| || || || |||| |||||||||||||||||     
T  12703983 ctgaaaccactatgatctcttgatg-tggactcaagtactttgtttccattctaacgttgtctgtaaaagaataaccataacgttggttgatgggtactt 12703885  T
Q  333 catgaatca 341  Q
     ||||||||    
T  12703884 gatgaatca 12703876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 29 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 27347513 - 27347425
Alignment:
Q  29 aaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaa 117  Q
    ||||||||||||||||| ||| | ||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  27347513 aaagcatagagactattttgtggataggccgatgatcacatctcacagatcatagataaagagttatcatgtcttcacataggtataaa 27347425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 37 - 341
Target Start/End: Original strand, 26245102 - 26245402
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 136  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||  |||||||  | |||| ||||  ||| ||| |||| |  |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26245102 gagactattatgtatgtagactgatgattgcatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtttatacataggtataaatattaggagtaatatttat 26245200  T
Q  137 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctga 236  Q
    | | |||||||||    | |||||||| ||||||  | ||||| ||| |||||||||||||||||| | || || | ||||||  | | ||| |||||||    
T  26245201 acttgattgatccactgtcagaatactgcatagt--atgttatgaaattgtcataagatattctcacaatgttaatagtgtatatcgctcttagacctga 26245298  T
Q  237 aaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccgttcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatg 336  Q
    ||||| ||||  | ||||||  |||| |  ||||||||||   | ||| ||||||||| |||| ||||| || |||  |||||||||||||||||  |||    
T  26245299 aaccattatgatctctagat-atggacttaagtgctttgttgtcattctaacgttgtctgtaaaaggataaccatagcgttggttgatgggtacttgatg 26245397  T
Q  337 aatca 341  Q
    |||||    
T  26245398 aatca 26245402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 258 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 28719558 - 28719477
Alignment:
Q  258 ttggagtcgagtgctttgtcaccgttcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatca 341  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  28719558 ttggagtcgagtgctttatcaccgt-caaacgttgtctgtaacaagatgac-ataaagttggttgatgggtactccacgaatca 28719477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 105 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 26129928 - 26129789
Alignment:
Q  105 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaagtgtcataagatattctcata 204  Q
    ||||| ||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||  | ||| ||||| ||||||||   ||||| ||| ||| |||||||||||||| |    
T  26129928 acatatatacaaatattatgagtaatatttatactggattgacccaccgtgaaaataccacatagtat--gttatgaaaatgtaataagatattctcaca 26129831  T
Q  205 gtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatg 246  Q
     ||||| ||||||||  ||| ||| ||| |||||||||||||    
T  26129830 ttgataatggtgtatatcactcttagacatgaaaccactatg 26129789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 262 - 341
Target Start/End: Original strand, 39538954 - 39539033
Alignment:
Q  262 agtcgagtgctttgtcaccgttcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatca 341  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||| |||||  | || ||||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||||||    
T  39538954 agtcgagtgctttatcaccattcaaatgttgtttggaataggatgattataaagttggttggtaggtactccacgaatca 39539033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 40 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 33477321 - 33477193
Alignment:
Q  40 actattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatatt 139  Q
    ||||||||||  ||| |||||| ||||||| ||| || |||||||||  ||  |||||| ||| || ||| |||| ||||||| ||||||||||||||      
T  33477321 actattatgtgagtaaactgataatcacatatcaaaggtcatggatat-gaaatatcaaatctacaaataaatattaatattaagagtaatatttataca 33477223  T
Q  140 ggattgatccgtcatgagaatactacatag 169  Q
      ||||||| | ||| ||||||||||||||    
T  33477222 taattgatctgccataagaatactacatag 33477193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 38 - 82
Target Start/End: Original strand, 39535465 - 39535509
Alignment:
Q  38 agactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatg 82  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| || |||||    
T  39535465 agactattatgtatgtagactgatgaccacatctcataggtcatg 39535509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0433 (Bit Score: 296; Significance: 1e-166; HSPs: 1)
Name: scaffold0433
Description:

Target: scaffold0433; HSP #1
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 23 - 341
Target Start/End: Original strand, 7273 - 7592
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 122  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7273 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 7372  T
Q  123 ggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttat-aaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7373 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 7472  T
Q  222 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccgttcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 321  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7473 cacccttcgacctgaaacaactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 7572  T
Q  322 gatgggtactccatgaatca 341  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  7573 gatgggtactccatgaatca 7592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0390 (Bit Score: 296; Significance: 1e-166; HSPs: 2)
Name: scaffold0390
Description:

Target: scaffold0390; HSP #1
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 23 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 6975 - 6656
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 122  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6975 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 6876  T
Q  123 ggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttat-aaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6875 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 6776  T
Q  222 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccgttcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  6775 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccataacaggatgactataaagttggtt 6676  T
Q  322 gatgggtactccatgaatca 341  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  6675 gatgggtactccatgaatca 6656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0390; HSP #2
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 23 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 13991 - 13672
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 122  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13991 atcattaaagcataaagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacaaagatataaatatta 13892  T
Q  123 ggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttat-aaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13891 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacataataaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 13792  T
Q  222 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccgttcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13791 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 13692  T
Q  322 gatgggtactccatgaatca 341  Q
    ||||| ||||||||||||||    
T  13691 gatggttactccatgaatca 13672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 292; Significance: 1e-164; HSPs: 1)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 23 - 341
Target Start/End: Original strand, 18454 - 18772
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 122  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18454 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 18553  T
Q  123 ggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttat-aaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18554 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 18653  T
Q  222 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccgttcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18654 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 18753  T
Q  322 gatgggtactccatgaatca 341  Q
    ||| ||||||||||||||||    
T  18754 gat-ggtactccatgaatca 18772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0186 (Bit Score: 288; Significance: 1e-161; HSPs: 1)
Name: scaffold0186
Description:

Target: scaffold0186; HSP #1
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 23 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 26031 - 25712
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 122  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26031 atcattaaagcatagcgactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagacttcacatagatataaatatta 25932  T
Q  123 ggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttat-aaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25931 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 25832  T
Q  222 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccgttcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25831 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 25732  T
Q  322 gatgggtactccatgaatca 341  Q
    |||||||||||||| |||||    
T  25731 gatgggtactccataaatca 25712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 284; Significance: 1e-159; HSPs: 28)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 23 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 21330289 - 21329970
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 122  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21330289 atcattaaagcatagagactattatgtaggtggactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 21330190  T
Q  123 ggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttat-aaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 221  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21330189 tgagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 21330090  T
Q  222 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccgttcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21330089 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagtaggtt 21329990  T
Q  322 gatgggtactccatgaatca 341  Q
    |||||| |||||||||||||    
T  21329989 gatggggactccatgaatca 21329970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 23 - 341
Target Start/End: Original strand, 18796672 - 18796991
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 122  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18796672 atcattaaagcattgagactattatgtgggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 18796771  T
Q  123 ggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttat-aaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18796772 ggagtaatatttatattggattgatcctctatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatggtggtgtattc 18796871  T
Q  222 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccgttcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 321  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  18796872 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaaatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtacgtaacaggatgactataaagtttgtt 18796971  T
Q  322 gatgggtactccatgaatca 341  Q
    ||||||||| ||||||||||    
T  18796972 gatgggtacaccatgaatca 18796991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 29 - 334
Target Start/End: Original strand, 18619976 - 18620281
Alignment:
Q  29 aaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagta 128  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||| | |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18619976 aaagcatatagactattatgtgggtaggccgatgatcacatctcacggatcatagataaagagttatcatgtcttcacataggtataaatattaggagta 18620075  T
Q  129 atatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 228  Q
    ||||||||| | |||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||    
T  18620076 atatttatactagattgacccaccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaagtgtcataagatattctcatggtgatattggtgtatcccaccctt 18620175  T
Q  229 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccgttcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggt 328  Q
     |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||| |   |||  |||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  18620176 tgacctgaaaccactatgtaccctaaatgttggagtcgagtgctttatcaccattcacattatgtatgtaacaagatgaccataaagttggttgatgggt 18620275  T
Q  329 actcca 334  Q
    ||||||    
T  18620276 actcca 18620281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 29 - 341
Target Start/End: Original strand, 36270338 - 36270648
Alignment:
Q  29 aaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagta 128  Q
    |||| ||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||   |||| || ||||||||||||||| ||||| | ||| |||||||||||||||    
T  36270338 aaagtataaagactattgtgtgggtagactgatgatcacatctcacgagtcatagagaaagagttatcaagttttcacttcgatttaaatattaggagta 36270437  T
Q  129 atatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaagtgtcataagatattctcatagtgat-agtggtgtattccaccct 227  Q
    ||||||||||||||||||  || |||||||||  |||||||  ||| ||||  ||  |||| |||  |||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  36270438 atatttatattggattgactcgccatgagaatgttacatag--aaaattatgtaaaggtcacaagtcattctcatagtgataagtggtgtatt-caccct 36270534  T
Q  228 tcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccgttcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatggg 327  Q
    ||||||| ||||||| ||| |||||||||||  ||||||| | ||||||  |||| |||| || || |||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  36270535 tcgacctaaaaccaccatgcaccctagatgtatgagtcgaatactttgttgccgtacaaaagtcgttcgtaacaggatgactataaagtcggttgttggg 36270634  T
Q  328 tactccatgaatca 341  Q
    ||||| ||||||||    
T  36270635 tactcaatgaatca 36270648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 32 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 6992146 - 6991847
Alignment:
Q  32 gcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagt--cttcacatagatataaatattaggagtaa 129  Q
    ||||| ||| |||||| | |||||||| ||||||| ||||||||||| ||  ||||||| |||||||||  |||||||||| ||||||| | ||||||||    
T  6992146 gcataaagattattatatgggtagactaatgatcatatctcacagattataaataaagatttatcaagtatcttcacataggtataaatctcaggagtaa 6992047  T
Q  130 tatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaagtgtcataagatattctcatagtgata-gtggtgtattccaccctt 228  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| ||||  |||||||| |||  ||||  ||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6992046 tatttatattggattgatcctccataagaacgctacatagaaaa--ttatgtaagtgacataaactattctcatagtgataagtggtgtattccaccctt 6991949  T
Q  229 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgc-tttgtcaccgttcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatggg 327  Q
    || ||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||| | |||||  | ||| ||||||||||  | ||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  6991948 cggcctgaaatcactatgttccctagatgtaggagtcgagtacttttgtttctgtttaaacgttgtctatgacacgatgactataaagtcggttgatggg 6991849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 29 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 22183518 - 22183220
Alignment:
Q  29 aaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagta 128  Q
    |||| ||||||||||||| || |||||| ||||||||| |||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22183518 aaagtatagagactattacgtgggtagattgatgatcaaatctcacagatctttgataaggagttatcaagtcttcacatagatataaatattaagagta 22183419  T
Q  129 atatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaagtgtcataagatattctcatagtgat-agtggtgtattccaccct 227  Q
    ||| |||||||||||||| ||| ||||| |||  ||||||   || |||||  ||  |||| | |  |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22183418 ata-ttatattggattgacccgccatgacaatgttacata--taatgttatgtaaaagtcacaggtcattctcatagtgataagtggtgtattccaccct 22183322  T
Q  228 tcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccgttcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatggg 327  Q
    | ||||||||||||   ||||| || ||||| |||||||||| ||||||    || ||||||||||  ||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  22183321 ttgacctgaaaccaacgtgtactcttgatgtaggagtcgagtactttgttgttgtacaaacgttgtttgtaacaggatgactataaagtcgattgatggg 22183222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 73 - 334
Target Start/End: Original strand, 20978091 - 20978351
Alignment:
Q  73 acagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaa 172  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  || || |  |    
T  20978091 acagatcatggataaagagttatcaagtcttcaccgagatataattattatgagtaatatttatattggattgacccgccatgagaattttatatgg--a 20978188  T
Q  173 aagttataaaagtgtcataagatattctcatagtgat-agtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgc 271  Q
    || |||| ||| ||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| ||| ||| || |||||||||||||||||| ||| |||||| |    
T  20978189 aaattatgaaaatgtcataagttattctcgtagtgataagtggtgtattccactctttgacatgacactactatgtaccctagatgtaggattcgagtac 20978288  T
Q  272 tttgtcaccgttcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactcca 334  Q
    ||||    | |  |||||| |||||||||| ||| |||||||||| | ||||||| |||||||    
T  20978289 tttgatgtcatataaacgtagtccgtaacatgataactataaagtcgattgatggatactcca 20978351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 37 - 341
Target Start/End: Original strand, 30174377 - 30174677
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 136  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30174377 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 30174475  T
Q  137 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctga 236  Q
    |||||||||| ||    |||||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| |||||||    
T  30174476 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatgaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctga 30174573  T
Q  237 aaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccgttcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatg 336  Q
    ||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  || ||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  |||    
T  30174574 aaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgatg 30174672  T
Q  337 aatca 341  Q
    |||||    
T  30174673 aatca 30174677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 23 - 331
Target Start/End: Original strand, 18822249 - 18822556
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 122  Q
    ||||| |||||| | ||| ||||||||   ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  18822249 atcattaaagcagatagattattatgtcaatagactgatgatcacatatcacggatcattgataaggagttatcaacttttcacatagatataaatatta 18822348  T
Q  123 ggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaagtgtcataagatattctcatagtgat-agtggtgtattc 221  Q
       ||||||||||||||||||||||| | ||||||| |  ||||||  ||| |||||  ||   ||  |||  |||||||||  ||| ||||||||||||    
T  18822349 atggtaatatttatattggattgatctgccatgagattgttacata--aaacgttatgtaaagatctcaagtcattctcatatagataagtggtgtattc 18822446  T
Q  222 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccgttcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 321  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||| |||| |   | |  ||||||  |||||||||  ||||||||||||||||||    
T  18822447 cacccttcgacctgaaaccactgtgtaccctagatgtaggagtcaagtacttttttgtcatataaacgtcatccgtaacacaatgactataaagttggtt 18822546  T
Q  322 gatgggtact 331  Q
     |||||||||    
T  18822547 aatgggtact 18822556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 37 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 24250334 - 24250034
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 136  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24250334 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 24250236  T
Q  137 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctga 236  Q
    |||||||||| ||    |||||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| |||||||    
T  24250235 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatgaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctga 24250138  T
Q  237 aaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccgttcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatg 336  Q
    ||||||||||  | ||||||| |||| || |||| |||||  || ||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  |||    
T  24250137 aaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgttttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgatg 24250039  T
Q  337 aatca 341  Q
    |||||    
T  24250038 aatca 24250034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 37 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 24229517 - 24229217
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 136  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24229517 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatggttcatagatat-gagatattaagtctatacataggtataaatattaggagtaatatttat 24229419  T
Q  137 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctga 236  Q
    | |||||||| ||  | |||||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| | ||||||  | | ||| | | |||    
T  24229418 actggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatgaaattgtcataagatattctcacaatgataatagtgtatatcgctcttagccttga 24229321  T
Q  237 aaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccgttcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatg 336  Q
    ||||||||||  ||||||||| | || || ||||||||||   | ||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||| |||||||  |||    
T  24229320 aaccactatgatccctagatg-tagactcaagtgctttgttgtcattctaacgttgtctgtaaaaggataaccataacgttggttgaagggtacttgatg 24229222  T
Q  337 aatca 341  Q
    |||||    
T  24229221 aatca 24229217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 29 - 169
Target Start/End: Original strand, 19279460 - 19279600
Alignment:
Q  29 aaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagta 128  Q
    |||||||| |||||||||||   || |||| |||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||||| ||||||    
T  19279460 aaagcataaagactattatgcgagttgactaatgatcacatctcacgtatcatggataaaaagttatcaagttttcagatagatatagatatttggagta 19279559  T
Q  129 atatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatag 169  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||    
T  19279560 atatttatattggattgacacgtcatgagaataccacatag 19279600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 38 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 18852085 - 18851977
Alignment:
Q  38 agactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttata 137  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||| ||||||||||||||    
T  18852085 agactattatgtcggtagactaatgatcccatctcacggatcatgaataaagagttatcaagtcttcaaatatgtataaatattaagagtaatatttata 18851986  T
Q  138 ttggattga 146  Q
    |||||||||    
T  18851985 ttggattga 18851977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 105 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 15342237 - 15342014
Alignment:
Q  105 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaagtgtcataagatattctcata 204  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||  | ||| ||||||||||||||   ||||| |||||||||||||||| ||||| |    
T  15342237 acataggtataaatattaggagtaatatttatactggattaacccaccgtgaaaatactacatagtat--gttatgaaagtgtcataagatagtctcaca 15342140  T
Q  205 gtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccgttcaaacgttgtccgtaacagga 304  Q
     |||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||  ||||||||| || | || | |||||| |  |  ||||||  ||||  |||||||||    
T  15342139 atgatagtggtgtatgccactcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tgaactcaaatgctttattgcaattcaaaaattgtttgtaacagga 15342041  T
Q  305 tgactataaagttggttgatgggtact 331  Q
    |||| |||| ||||||| |||||||||    
T  15342040 tgaccataacgttggttaatgggtact 15342014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 38 - 327
Target Start/End: Original strand, 29800468 - 29800757
Alignment:
Q  38 agactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggat---aaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatattt 134  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  | ||||||||   | | | | || |||| |  |||| | |||||||||||||||||||||||    
T  29800468 agactattatgtatgtagactgatgatcacatcccatgggtcatggatgtgagatattaattaagtatatacatgggtataaatattaggagtaatattt 29800567  T
Q  135 atattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacct 234  Q
    ||| |||||||| ||  | |||||||||||||||||  | ||||||||||||| | | |||||||||| |  |||| |||||||| |||| ||| ||| |    
T  29800568 atactggattgacccaccgtgagaatactacatagt--atgttataaaagtgtaacatgatattctcacaaggataatggtgtataccactcttagactt 29800665  T
Q  235 gaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccgttcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatggg 327  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||| || |||||||| |   | ||||||| ||||| |||||||||| |  |||| ||||||| |||||    
T  29800666 gaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttattgtcattcaaacattgtctgtaacaggataatcataatgttggttaatggg 29800757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 180 - 314
Target Start/End: Original strand, 17241034 - 17241167
Alignment:
Q  180 aaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcac 279  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||  ||||||| |||||| ||| |||| ||||    
T  17241034 aaaagtgtaataagatattctcatagtgataatggtgtatttcacc-ttcgacctaaaaccactatgtactgtagatgtaggagtcaagtactttatcac 17241132  T
Q  280 cgttcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaa 314  Q
    || |||||||||||  |||||| || | |||||||    
T  17241133 cgctcaaacgttgtgtgtaacatgaagcctataaa 17241167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 43 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 36802003 - 36801899
Alignment:
Q  43 attatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacat-agatataaatattaggagtaatatttatattgg 141  Q
    |||||||  ||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| ||| | |||||||||||| | |||||||||||||||     
T  36802003 attatgtgagtagactgatgatcacacctcacaaatcattgataatgagttatcaagtcttcgcataaaatataaatattaagggtaatatttatattga 36801904  T
Q  142 attga 146  Q
    |||||    
T  36801903 attga 36801899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 37 - 258
Target Start/End: Original strand, 19616435 - 19616653
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 136  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    ||||  |||   || ||| ||||||  |||||  |||||||||||||||||| ||||||    
T  19616435 gagactattatgtatgtagactgatgaccacatctcatgagtcataaatatt-agatattaagtctatacatatgtataaatattaggagtaacatttat 19616533  T
Q  137 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctga 236  Q
      || ||||| ||  | ||||||||||||||||||    |||| ||| ||||||| |||||||||| ||||||| | ||||||  ||| ||| |||||||    
T  19616534 tctgaattgacccaccgtgagaatactacatagtatt--ttatgaaaatgtcatatgatattctcacagtgataatagtgtatatcactcttagacctga 19616631  T
Q  237 aaccactatgtaccctagatgt 258  Q
    ||||||||||  ||||||||||    
T  19616632 aaccactatgatccctagatgt 19616653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 196 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 36799826 - 36799722
Alignment:
Q  196 attctcatagtgata-gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccgttcaaacgttgtc 294  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||||||||||||  |||||||||| |||||| ||| ||||||  |||| ||||||  |||    
T  36799826 attctcatagtgataagtggtgtattctaccgtttgacctgaaaccactatgcgccctagatgtaggagtcaagtactttgttgccgtacaaacgccgtc 36799727  T
Q  295 cgtaa 299  Q
    |||||    
T  36799726 cgtaa 36799722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 112 - 246
Target Start/End: Original strand, 21626824 - 21626955
Alignment:
Q  112 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaagtgtcataagatattctcatagtgatag 211  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||  |||||||||||||||   ||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  21626824 tataaataatatgagtaatatttatattgaattga-ccaccatgagaatactacacgctat--gttatgaaagtgtcataagatattctcatagtgataa 21626920  T
Q  212 tggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatg 246  Q
    | |||| | ||||  || ||||||||| |||||||    
T  21626921 tagtgtctaccactgttagacctgaaatcactatg 21626955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 28719006 - 28718915
Alignment:
Q  108 tagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaagtgtcataagatattctc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||  | || ||||||||||||| |||  | ||||||||||| |||||| ||||||||    
T  28719006 tagatataaatattaggagtaatatttatacttgattgactcatcgtgagaatactacacagt--atgttataaaagtttcataaaatattctc 28718915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 112 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 40301164 - 40301034
Alignment:
Q  112 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaagtgtcataagatattctcatagtgatag 211  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||   |||||| ||  |||||||||||||||||  | | ||||| || ||||||||||||| |||||||||||||     
T  40301164 tatacatattagaagtaatatttataccagattgacccaccatgagaatactacata--acatgttatgaa-gtgtcataagatagtctcatagtgataa 40301068  T
Q  212 tggtgtattccacccttcgacctgaaaccactat 245  Q
    || ||||| |||| ||| ||| ||||||||||||    
T  40301067 tgatgtataccactcttagacatgaaaccactat 40301034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 114 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 41316506 - 41316305
Alignment:
Q  114 taaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtg 213  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |  || || ||  |||||||||| || ||||||   ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||  |    
T  41316506 taaatattatgagtaatatttatacttaatcgacccaccatgagaatattatatagtat--gttatgaaagtgtcataagatattctcatactgataacg 41316409  T
Q  214 gtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccgttcaaacgttgtccgtaacaggatgactataa 313  Q
    | | || |||  ||| |||||||| ||||||||  ||||||||| |||| |  || ||||| |   | |||||||||| || |||||||||| |||||||    
T  41316408 gagaataccattcttagacctgaatccactatgatccctagatg-tggacttaagggctttattgtcattcaaacgttatctgtaacaggataactataa 41316310  T
Q  314 agttg 318  Q
    |||||    
T  41316309 agttg 41316305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 39 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 28741326 - 28741220
Alignment:
Q  39 gactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatat 138  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    ||||| || | ||| ||| |||| |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  28741326 gactattatgtatgtagactgatgatcacatctcatgcgtcatgaat-atgagatattaagtatgtacataggtataaatattaggagtaatatttatac 28741228  T
Q  139 tggattga 146  Q
     |||||||    
T  28741227 cggattga 28741220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 182 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 28740986 - 28740910
Alignment:
Q  182 aagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgt 258  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| |||  ||| || ||||||||||||||  ||||||||||    
T  28740986 aagtgtcataagacattctcataatgataatggtgtataccattcttagatctgaaaccactatgatccctagatgt 28740910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 276 - 338
Target Start/End: Original strand, 41661694 - 41661756
Alignment:
Q  276 tcaccgttcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaa 338  Q
    ||||| |||||||||||||  ||| | |||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  41661694 tcaccattcaaacgttgtctataataagatgatcataaagttggttgatgggtactccatgaa 41661756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 29 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 24763867 - 24763751
Alignment:
Q  29 aaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagta 128  Q
    ||||||| ||||||||||| || |||||||||||| ||| |||||  | |||| || |  ||| ||| | ||||  |||||| ||||||||||| |||||    
T  24763867 aaagcatcgagactattatttatgtagactgatgaccacgtctcatgggtcatagacat-gagatattacgtctatacataggtataaatattatgagta 24763769  T
Q  129 atatttatattggattga 146  Q
    ||||||||| ||||||||    
T  24763768 atatttatactggattga 24763751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 33 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 12098649 - 12098609
Alignment:
Q  33 catagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctca 73  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  12098649 catagagactattatgtatgtagactgatgatcagatctca 12098609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0657 (Bit Score: 251; Significance: 1e-139; HSPs: 1)
Name: scaffold0657
Description:

Target: scaffold0657; HSP #1
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 23 - 324
Target Start/End: Original strand, 1159 - 1461
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 122  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  1159 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaaaagttatcaagtcttgccatagatataaatatta 1258  T
Q  123 ggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttat-aaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 221  Q
     ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1259 agagtaatatttatattggattgatctgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtatcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 1358  T
Q  222 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccgttcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  1359 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggataaatataaagttggtt 1458  T
Q  322 gat 324  Q
    |||    
T  1459 gat 1461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0063 (Bit Score: 223; Significance: 1e-123; HSPs: 1)
Name: scaffold0063
Description:

Target: scaffold0063; HSP #1
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 23 - 341
Target Start/End: Original strand, 5695 - 6007
Alignment:
Q  23 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 122  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5695 atcattaaagcataaagactattatgtgggtagactgatgatcacatctcacaggtcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 5794  T
Q  123 ggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttat--aaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtatt 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||         ||| |||    
T  5795 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgtgaatactacatagtaaaagttatgaaaaagtgtcataagatattctcata---------gtgcatt 5885  T
Q  221 cca-cccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccgttcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttgg 319  Q
    ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5886 ccatcctttcgacatgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcaagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttgg 5985  T
Q  320 ttgatgggtactccatgaatca 341  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  5986 ttgatgggtactccatcaatca 6007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 88 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 230367 - 230113
Alignment:
Q  88 agagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttat-aaaagtg 186  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  230367 agagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatctgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtg 230268  T
Q  187 tcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccgttcaa 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  230267 tcataagatattctcatagtgatagtggtgtattctacccttcgacctgaaaccattatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcactattcaa 230168  T
Q  287 acgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatca 341  Q
    |||||||| |||||| |||||| ||||||||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  230167 acgttgtctgtaacaagatgacaataaagttggttggtggatacaccatgaatca 230113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0112 (Bit Score: 102; Significance: 1e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0112
Description:

Target: scaffold0112; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 37 - 341
Target Start/End: Original strand, 183 - 483
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 136  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| |||||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  183 gagactattatgtatgtcgactgatgaccacatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 281  T
Q  137 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctga 236  Q
    |||||||||| ||  | |||||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| |||||||    
T  282 attggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatgaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctga 379  T
Q  237 aaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccgttcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatg 336  Q
    ||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  || ||| ||||||||| |||| ||||| |  |||| |||||||||||||||||  |||    
T  380 aaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgggtacttgatg 478  T
Q  337 aatca 341  Q
    |||||    
T  479 aatca 483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0264 (Bit Score: 98; Significance: 3e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0264
Description:

Target: scaffold0264; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 37 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 3977 - 3677
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 136  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3977 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 3879  T
Q  137 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctga 236  Q
    |||||||||| ||    |||||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| |||||||    
T  3878 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatgaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctga 3781  T
Q  237 aaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccgttcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatg 336  Q
    ||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  || ||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  |||    
T  3780 aaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgatg 3682  T
Q  337 aatca 341  Q
    |||||    
T  3681 aatca 3677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 98; Significance: 3e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 37 - 341
Target Start/End: Original strand, 119730 - 120030
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 136  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  119730 gagactattatgtacgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 119828  T
Q  137 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctga 236  Q
    |||||||||| ||    |||||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| |||||||    
T  119829 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatgaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctga 119926  T
Q  237 aaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccgttcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatg 336  Q
    ||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  || ||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  |||    
T  119927 aaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgatg 120025  T
Q  337 aatca 341  Q
    |||||    
T  120026 aatca 120030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0466 (Bit Score: 92; Significance: 1e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0466
Description:

Target: scaffold0466; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 37 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 13251 - 12961
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 136  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||  | ||||  |||  ||| ||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13251 gagactattatgtatgtagaccgatgaccacatctcatgggtcatatatat-gagatattaagtctatacataggtataaatattaggagtaatatttat 13153  T
Q  137 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctga 236  Q
    |  ||||||| ||  | ||||||||||||||||||   ||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||  ||| ||| |||||||    
T  13152 accggattgacccaccgtgagaatactacatagtat--gttatgaaattgtcataagatattctcataatgataatagtgtatatcactcttagacctga 13055  T
Q  237 aaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccgttcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtact 331  Q
    ||||||||||  ||||||||| |||| || | ||||||||  || ||| ||||||||  |||| ||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  13054 aaccactatgatccctagatg-tggactcaattgctttgttgccattctaacgttgtttgtaaaaggataaccataaagttggttgatgggtact 12961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 37 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 130526 - 130262
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 136  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  130526 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 130428  T
Q  137 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctga 236  Q
    |||||||||| ||    |||||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| |||||||    
T  130427 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatgaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctga 130330  T
Q  237 aaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccgttcaaacgttgtccgtaacaggat 305  Q
    ||||||||||  ||||||||| |||| || ||||||||||  || ||| ||||||||| |||| |||||    
T  130329 aaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggat 130262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 86; Significance: 5e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 37 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 67676 - 67376
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 136  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||  | | || ||||  ||| ||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  67676 gagactattatgtatatagactgatgaccgcatctcatgggttatagatat-gagatattaagtctatacataggtataaatattaggagtaatatttat 67578  T
Q  137 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctga 236  Q
    |||||||||| ||  | |||||||||||||||||  ||||||| | | |||||| ||||||||||| | ||||| | ||||||  | | ||| |||||||    
T  67577 attggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatgagattgtcatgagatattctcacaatgataatagtgtatatcgctcttagacctga 67480  T
Q  237 aaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccgttcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatg 336  Q
    ||||||||||  ||||||||| |||| || ||| ||||||  || ||| ||||||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||  |||    
T  67479 aaccactatgatccctagatg-tggactcaagtactttgtttccattctaacgttgtctgtaaaaggataaccataacgttggttgatgggtacttgatg 67381  T
Q  337 aatca 341  Q
    |||||    
T  67380 aatca 67376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0378 (Bit Score: 83; Significance: 3e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0378
Description:

Target: scaffold0378; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 37 - 246
Target Start/End: Original strand, 8305 - 8511
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 136  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8305 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 8403  T
Q  137 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctga 236  Q
    |||||||||| ||  | |||||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| |||||||    
T  8404 attggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatgaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctga 8501  T
Q  237 aaccactatg 246  Q
    ||||||||||    
T  8502 aaccactatg 8511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 74; Significance: 7e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 37 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 40290 - 39990
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 136  Q
    |||||||||||||| |||||||||||  |||||||||  | |||||||||  ||| ||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  40290 gagactattatgtatgtagactgatggccacatctcatgggtcatggatat-gagatattaagtctatacataggtataaatattaggagtaatatttat 40192  T
Q  137 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctga 236  Q
    |  ||||||| ||    ||||||||||||||||||   ||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||   || ||| ||| |||    
T  40191 accggattgacccactgtgagaatactacatagtat--gttatgaaaatgtcataagatattctcacagtgataatggtgtatataactcttagacttga 40094  T
Q  237 aaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccgttcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatg 336  Q
    ||||||||||  ||||| ||  |||| || |||||||| |  || ||| ||||||||  |||| ||||| || |||||||||| | |||| ||||  |||    
T  40093 aaccactatgatccctaaat-atggactcaagtgctttatttccattctaacgttgtttgtaaaaggataaccataaagttggctaatggttacttgatg 39995  T
Q  337 aatca 341  Q
    |||||    
T  39994 aatca 39990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0111
Description:

Target: scaffold0111; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 105 - 341
Target Start/End: Original strand, 26609 - 26842
Alignment:
Q  105 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaagtgtcataagatattctcata 204  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  | ||||||||||| |||||  | ||||| ||| |||||||||||||||||| |    
T  26609 acataggtataaatattaggagtaatatttatactggattgacccaccttgagaatactatatagt--atgttatgaaaatgtcataagatattctcaca 26706  T
Q  205 gtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccgttcaaacgttgtccgtaacagga 304  Q
    |||||| | ||||||  ||| ||| |||||||||||||||||  ||||| ||| |||| ||||||||||| |   | ||  || |||||| |||| ||||    
T  26707 gtgataatagtgtatatcactcttagacctgaaaccactatgatccctatatg-tggactcgagtgctttattgtcattttaatgttgtctgtaaaagga 26805  T
Q  305 tgactataaagttggttgatgggtactccatgaatca 341  Q
    | || |||| ||||| | |||||||||| ||||||||    
T  26806 taaccataacgttggataatgggtactcgatgaatca 26842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0039
Description:

Target: scaffold0039; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 29 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 90151 - 90033
Alignment:
Q  29 aaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaa-gagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 127  Q
    |||||||| |||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||| |  |    
T  90151 aaagcataaagactactatgtagatagactgataatcacatctcacggatcatgggtaaaagagttatcaacacttcacatagatataaatattacgtat 90052  T
Q  128 aatatttatattggattga 146  Q
    || ||||||||||||||||    
T  90051 aacatttatattggattga 90033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297 (Bit Score: 57; Significance: 9e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0297
Description:

Target: scaffold0297; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 154 - 341
Target Start/End: Original strand, 102 - 286
Alignment:
Q  154 tgagaatactacatagtaaaagttataaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtacccta 253  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| | ||||||  ||| ||| |||||||||||||| ||  |||||    
T  102 tgagaatactacatagtaa--gttatgaaattgtcataagatattctcacaatgataatagtgtatatcactcttagacctgaaaccactctgatcccta 199  T
Q  254 gatgttggagtcgagtgctttgtcaccgttcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatca 341  Q
    |||| |||| || ||| ||||||  || ||| ||||||||  |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||  ||||||||    
T  200 gatg-tggactcaagtactttgttgccattctaacgttgtatgtaaaaggataaccataacgttggttgatgggtacttgatgaatca 286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0136 (Bit Score: 56; Significance: 4e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0136
Description:

Target: scaffold0136; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 29 - 315
Target Start/End: Original strand, 8723 - 9005
Alignment:
Q  29 aaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagta 128  Q
    ||||| ||||||||| |||||| ||||| |||||||||| |||||||  |||| ||||  ||| ||| |||  |   ||||  | |||||||||||||||    
T  8723 aaagcgtagagactaatatgtatgtagattgatgatcacgtctcacatgtcatagatat-gagatattaaggatatgcatatgtgtaaatattaggagta 8821  T
Q  129 atatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 228  Q
    ||||||||| | |||||| ||   ||||||||||||| |||||   ||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| | |    
T  8822 atatttatactagattgacccccaatgagaatactacttagtat--gttatgaagatgtcataagatattctcatagtgataatggtgtataccactcct 8919  T
Q  229 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccgttcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaag 315  Q
     ||||||||||||| |||  || || ||| ||||||| |||| ||| |   | |||||||||| || |||||| ||| |||||||||    
T  8920 agacctgaaaccacaatgatccttaaatg-tggagtcaagtgttttattgtcattcaaacgttctctgtaacatgataactataaag 9005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 52; Significance: 9e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 112 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 83243 - 83111
Alignment:
Q  112 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaagtgtcataagatattctcatagtgatag 211  Q
    ||||||||| || ||||||||||||| |||||||| ||   |||||||||||||||||||   ||||  || ||||||||||||||| ||||||| |||     
T  83243 tataaatatcagaagtaatatttatactggattgacccacaatgagaatactacatagtat--gttacgaaggtgtcataagatattatcatagtcatat 83146  T
Q  212 tggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatg 246  Q
    ||||||| ||||| ||| |||||||||||| ||||    
T  83145 tggtgtactccactcttagacctgaaaccagtatg 83111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0376 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0376
Description:

Target: scaffold0376; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 112 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 11758 - 11528
Alignment:
Q  112 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaa---aagttataaaagtgtcataagatattctcatagtga 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||    ||||||||||||||||||    | || || ||  |||||||||||||||||| | |||    
T  11758 tataaatattaggagtaatatttatactggatagacccactgtgagaatactacatagtacgttatgtgattaat-tgtcataagatattctcacaatga 11660  T
Q  209 tagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccgttcaaacgttgtccgtaacaggatgac 308  Q
    ||   |||||   | | ||| |||||||||||||| ||  |||||||||| ||| || ||| ||||||  || ||| ||||||||| |||| ||||| ||    
T  11659 taacagtgtacatcgctcttagacctgaaaccactttgatccctagatgt-ggactcaagtactttgtttccattctaacgttgtctgtaaaaggataac 11561  T
Q  309 tataaagttggttgatgggtactccatgaatca 341  Q
     |||| |||||||||||||||||  ||||||||    
T  11560 cataacgttggttgatgggtacttgatgaatca 11528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0086 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0086
Description:

Target: scaffold0086; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 38 - 341
Target Start/End: Original strand, 53766 - 54064
Alignment:
Q  38 agactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttata 137  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||| || |||  |||||| ||||||||||| |||||||||| | |    
T  53766 agactattatgtatgtagattgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gaggtattaattctatacataggtataaatattaagagtaatattcaca 53864  T
Q  138 ttggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaa 237  Q
     ||| |||| ||  | |||||||||||||||||  | ||||| ||| ||||||||||||||||||   || || | || |||    | ||| ||||||||    
T  53865 ctgggttgacccaccgtgagaatactacatagt--atgttatgaaattgtcataagatattctcaacatgttaatagtttatattgctcttagacctgaa 53962  T
Q  238 accactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccgttcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatga 337  Q
    |||||||||  |||||| || |||| || |||||||| |  || ||| ||||||||  |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||  ||||    
T  53963 accactatgatccctaggtg-tggactcaagtgctttat-gccattctaacgttgtatgtaaaaggataaccataacgttggttgatgggtacttgatga 54060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0099
Description:

Target: scaffold0099; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 37 - 202
Target Start/End: Original strand, 9110 - 9277
Alignment:
Q  37 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagat-catggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatattt- 134  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | | ||| ||||  ||| ||| ||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  9110 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtacatagatat-gagatattaagtctatacatagatataaatattagaagtaatatttt 9208  T
Q  135 atatt-ggatt-gatccgtca-tgagaatactacatagtaaaagttataaaagtgtcataagatattctca 202  Q
    ||||| ||||| || ||  |  |||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  9209 atatttggatttgaccccactgtgagaatactacatagtaa--gttatgaaattgtcataagatattctca 9277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0118 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0118
Description:

Target: scaffold0118; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 76 - 167
Target Start/End: Original strand, 45956 - 46051
Alignment:
Q  76 gatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataa----atattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacat 167  Q
    ||||||||||||| |||| |||| | |||| ||||||||||    |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||  ||| ||||| ||||||    
T  45956 gatcatggataaaaagttgtcaaatattcatatagatataaatatatattatgagtaatatttatattgaattgacccaccattagaatgctacat 46051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0496 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0496
Description:

Target: scaffold0496; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 124 - 219
Target Start/End: Original strand, 11328 - 11421
Alignment:
Q  124 gagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtat 219  Q
    |||||||||||||  |||||| | ||  |||||||||||||||||||  | ||||| ||  ||| ||||| |||||| ||||||||| ||||||||    
T  11328 gagtaatatttatgatggatttacccaccatgagaatactacatagt--atgttatgaagatgttataagttattctaatagtgataatggtgtat 11421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0393 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0393
Description:

Target: scaffold0393; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 29 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 15133 - 15089
Alignment:
Q  29 aaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctca 73  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||    
T  15133 aaagcatcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctca 15089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University