View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF17734_low_4 (Length: 605)

Name: NF17734_low_4
Description: NF17734
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF17734_low_4
NF17734_low_4
[»] chr3 (202 HSPs)
chr3 (15-586)||(33386318-33386890)
chr3 (15-582)||(27974599-27975173)
chr3 (15-586)||(8370132-8370711)
chr3 (19-586)||(16264216-16264792)
chr3 (15-539)||(27986147-27986668)
chr3 (15-588)||(32143186-32143767)
chr3 (12-586)||(30709439-30710018)
chr3 (12-586)||(40592424-40593010)
chr3 (15-586)||(27452822-27453400)
chr3 (12-586)||(36028965-36029537)
chr3 (12-582)||(48438074-48438655)
chr3 (12-548)||(35925342-35925885)
chr3 (37-516)||(21711108-21711594)
chr3 (19-561)||(1305818-1306378)
chr3 (82-539)||(26928290-26928757)
chr3 (97-586)||(1735946-1736447)
chr3 (12-586)||(24694808-24695390)
chr3 (12-493)||(6794451-6794939)
chr3 (230-586)||(39032198-39032551)
chr3 (19-586)||(40844519-40845097)
chr3 (137-586)||(47923546-47924006)
chr3 (15-468)||(3715760-3716226)
chr3 (14-484)||(26298844-26299329)
chr3 (14-236)||(39039995-39040216)
chr3 (12-469)||(1417251-1417716)
chr3 (339-586)||(37725871-37726118)
chr3 (34-479)||(3328107-3328561)
chr3 (81-468)||(25795709-25796108)
chr3 (12-490)||(37466151-37466642)
chr3 (362-586)||(27026925-27027149)
chr3 (81-394)||(18552720-18553041)
chr3 (251-586)||(8126739-8127074)
chr3 (47-469)||(8477258-8477697)
chr3 (362-586)||(27038270-27038485)
chr3 (152-469)||(40372560-40372891)
chr3 (117-469)||(2671350-2671716)
chr3 (173-509)||(3323410-3323756)
chr3 (342-539)||(25929086-25929282)
chr3 (117-469)||(9091065-9091431)
chr3 (250-468)||(47649677-47649898)
chr3 (380-586)||(40734255-40734461)
chr3 (380-586)||(37408216-37408422)
chr3 (117-469)||(8738827-8739193)
chr3 (15-170)||(1309719-1309872)
chr3 (46-469)||(7167137-7167578)
chr3 (12-132)||(27026805-27026925)
chr3 (380-586)||(29812820-29813026)
chr3 (380-586)||(23410534-23410741)
chr3 (12-132)||(27038150-27038270)
chr3 (380-586)||(23198142-23198348)
chr3 (380-586)||(5236661-5236868)
chr3 (360-469)||(4386736-4386846)
chr3 (380-543)||(23392114-23392277)
chr3 (417-586)||(7762021-7762193)
chr3 (380-586)||(29810625-29810831)
chr3 (380-586)||(23200341-23200547)
chr3 (12-236)||(4386930-4387158)
chr3 (328-469)||(21353746-21353894)
chr3 (417-574)||(51398583-51398741)
chr3 (380-586)||(5260528-5260734)
chr3 (380-586)||(45094921-45095128)
chr3 (15-114)||(1417129-1417227)
chr3 (15-111)||(47924000-47924093)
chr3 (88-220)||(34491315-34491449)
chr3 (152-236)||(18656436-18656518)
chr3 (152-236)||(22173197-22173279)
chr3 (50-236)||(25929446-25929633)
chr3 (474-586)||(7764209-7764321)
chr3 (380-586)||(9636331-9636539)
chr3 (138-220)||(9666449-9666531)
chr3 (380-586)||(5258349-5258555)
chr3 (135-220)||(29813166-29813251)
chr3 (135-220)||(51398917-51399002)
chr3 (454-586)||(7782420-7782551)
chr3 (152-236)||(28503878-28503960)
chr3 (156-220)||(38210565-38210629)
chr3 (145-220)||(40913396-40913472)
chr3 (156-220)||(50494194-50494258)
chr3 (138-220)||(29196369-29196451)
chr3 (463-585)||(44331735-44331857)
chr3 (135-220)||(40734601-40734686)
chr3 (135-220)||(40735486-40735571)
chr3 (152-220)||(44331648-44331717)
chr3 (156-220)||(458479-458543)
chr3 (152-236)||(2672933-2673015)
chr3 (152-236)||(2677089-2677171)
chr3 (156-220)||(6063444-6063508)
chr3 (152-236)||(8512218-8512300)
chr3 (152-236)||(8517098-8517180)
chr3 (156-220)||(10621528-10621592)
chr3 (138-220)||(23391892-23391974)
chr3 (138-220)||(32744419-32744501)
chr3 (12-132)||(8126561-8126682)
chr3 (152-221)||(32475486-32475554)
chr3 (152-221)||(32480344-32480412)
chr3 (514-586)||(40735186-40735259)
chr3 (156-220)||(456102-456166)
chr3 (156-220)||(746952-747016)
chr3 (156-220)||(1321674-1321738)
chr3 (156-220)||(5886393-5886457)
chr3 (156-220)||(5899866-5899930)
chr3 (156-220)||(7606586-7606650)
chr3 (156-220)||(25389100-25389164)
chr3 (156-220)||(28413030-28413094)
chr3 (137-220)||(29810971-29811054)
chr3 (145-220)||(30236228-30236304)
chr3 (426-541)||(44331360-44331473)
chr3 (156-216)||(53894055-53894115)
chr3 (138-220)||(760950-761032)
chr3 (135-194)||(5236437-5236495)
chr3 (156-226)||(10094075-10094146)
chr3 (156-226)||(10100092-10100163)
chr3 (156-226)||(10200955-10201026)
chr3 (138-220)||(16499132-16499214)
chr3 (138-220)||(29682462-29682544)
chr3 (138-220)||(31314548-31314630)
chr3 (156-203)||(53917662-53917709)
chr3 (156-225)||(10897117-10897187)
chr3 (151-220)||(39153356-39153426)
chr3 (156-225)||(54193338-54193408)
chr3 (380-472)||(40735254-40735346)
chr3 (156-220)||(3859722-3859786)
chr3 (156-220)||(4103894-4103958)
chr3 (156-220)||(5522625-5522689)
chr3 (156-220)||(6065794-6065858)
chr3 (138-220)||(7764567-7764650)
chr3 (156-220)||(10084387-10084451)
chr3 (156-220)||(10958321-10958385)
chr3 (380-479)||(32744631-32744730)
chr3 (156-220)||(35919113-35919177)
chr3 (156-220)||(43226280-43226344)
chr3 (156-220)||(43228486-43228550)
chr3 (145-220)||(46173460-46173536)
chr3 (145-220)||(47304354-47304430)
chr3 (156-203)||(1313621-1313668)
chr3 (156-203)||(6484572-6484619)
chr3 (156-226)||(10208001-10208072)
chr3 (138-216)||(23410312-23410390)
chr3 (156-226)||(27544383-27544454)
chr3 (156-203)||(27635656-27635703)
chr3 (156-203)||(41849271-41849318)
chr3 (156-203)||(42990516-42990563)
chr3 (156-203)||(42992482-42992529)
chr3 (156-203)||(43421413-43421460)
chr3 (15-66)||(47649604-47649655)
chr3 (156-225)||(10612778-10612848)
chr3 (156-225)||(22625984-22626054)
chr3 (156-225)||(29913955-29914025)
chr3 (156-210)||(48361669-48361723)
chr3 (380-449)||(32890998-32891066)
chr3 (380-449)||(39153566-39153634)
chr3 (145-220)||(49199457-49199534)
chr3 (156-220)||(4308279-4308343)
chr3 (156-220)||(9604605-9604669)
chr3 (156-220)||(10191308-10191372)
chr3 (156-220)||(10956025-10956089)
chr3 (156-220)||(11170599-11170663)
chr3 (156-220)||(25533637-25533701)
chr3 (159-203)||(25688161-25688205)
chr3 (156-220)||(30006036-30006100)
chr3 (162-225)||(36871304-36871368)
chr3 (156-220)||(38890235-38890299)
chr3 (156-203)||(3314897-3314944)
chr3 (386-470)||(5373096-5373180)
chr3 (156-203)||(5926762-5926809)
chr3 (156-203)||(6232012-6232059)
chr3 (179-226)||(6303420-6303467)
chr3 (156-203)||(15781091-15781138)
chr3 (543-586)||(21711602-21711645)
chr3 (160-203)||(26720759-26720802)
chr3 (156-203)||(27101179-27101226)
chr3 (138-220)||(44700462-44700543)
chr3 (156-203)||(47701669-47701716)
chr3 (156-203)||(51727005-51727052)
chr3 (156-203)||(51943582-51943629)
chr3 (417-479)||(53921744-53921807)
chr3 (12-50)||(3323752-3323790)
chr3 (164-225)||(5858656-5858718)
chr3 (156-225)||(10595034-10595104)
chr3 (158-220)||(18096900-18096962)
chr3 (194-236)||(21353604-21353646)
chr3 (156-225)||(48390302-48390372)
chr3 (156-225)||(54188621-54188690)
chr3 (526-586)||(4569490-4569551)
chr3 (417-473)||(7764338-7764395)
chr3 (152-201)||(10207935-10207983)
chr3 (164-220)||(32891207-32891264)
chr3 (145-220)||(43401789-43401866)
chr3 (153-220)||(43403740-43403809)
chr3 (526-586)||(43404301-43404362)
chr3 (156-209)||(43423461-43423514)
chr3 (156-220)||(45883134-45883199)
chr3 (138-220)||(801195-801279)
chr3 (138-220)||(9581385-9581468)
chr3 (156-220)||(18099168-18099232)
chr3 (138-220)||(19683871-19683954)
chr3 (141-220)||(22834989-22835067)
chr3 (417-449)||(22835243-22835275)
chr3 (152-236)||(24968108-24968190)
chr3 (417-449)||(26386722-26386754)
chr3 (155-223)||(29100162-29100230)
chr3 (417-449)||(29196642-29196674)
[»] scaffold0087 (2 HSPs)
scaffold0087 (12-586)||(36486-37069)
scaffold0087 (12-586)||(43615-44196)
[»] chr5 (161 HSPs)
chr5 (12-586)||(9352988-9353567)
chr5 (12-586)||(14520089-14520673)
chr5 (15-586)||(36932003-36932583)
chr5 (15-574)||(15464396-15464965)
chr5 (12-586)||(11916625-11917212)
chr5 (49-586)||(12083831-12084376)
chr5 (15-586)||(38219261-38219848)
chr5 (15-493)||(17003706-17004193)
chr5 (15-493)||(31300342-31300829)
chr5 (15-586)||(35387527-35388117)
chr5 (12-469)||(28832120-28832583)
chr5 (12-449)||(19588606-19589051)
chr5 (12-519)||(11181554-11182071)
chr5 (15-468)||(3880166-3880628)
chr5 (134-468)||(10281734-10282080)
chr5 (15-586)||(24135712-24136302)
chr5 (15-333)||(38192036-38192365)
chr5 (12-377)||(42127273-42127646)
chr5 (12-236)||(24553520-24553743)
chr5 (328-487)||(24553280-24553440)
chr5 (342-487)||(42127123-42127268)
chr5 (380-586)||(13487960-13488166)
chr5 (417-586)||(42426476-42426646)
chr5 (380-586)||(13239509-13239715)
chr5 (342-478)||(7160665-7160802)
chr5 (455-586)||(19806163-19806294)
chr5 (380-586)||(32636581-32636787)
chr5 (380-545)||(28750860-28751025)
chr5 (380-574)||(533538-533732)
chr5 (380-574)||(30683125-30683319)
chr5 (420-585)||(37438904-37439072)
chr5 (380-586)||(25412519-25412725)
chr5 (81-451)||(33030728-33031110)
chr5 (380-586)||(36074249-36074455)
chr5 (85-236)||(6741784-6741936)
chr5 (380-574)||(42428635-42428829)
chr5 (380-586)||(13342818-13343024)
chr5 (454-586)||(30182345-30182478)
chr5 (129-236)||(31180192-31180297)
chr5 (380-586)||(26177648-26177854)
chr5 (156-220)||(4410237-4410301)
chr5 (117-236)||(15044652-15044769)
chr5 (454-586)||(26170539-26170670)
chr5 (152-236)||(43592280-43592362)
chr5 (138-220)||(32636927-32637009)
chr5 (135-220)||(19806466-19806551)
chr5 (380-488)||(39468754-39468862)
chr5 (152-236)||(1457164-1457246)
chr5 (156-220)||(3373137-3373201)
chr5 (156-220)||(15552460-15552524)
chr5 (454-578)||(18441920-18442043)
chr5 (152-236)||(27449815-27449897)
chr5 (156-220)||(31179371-31179435)
chr5 (156-220)||(31542949-31543013)
chr5 (156-220)||(31545295-31545359)
chr5 (152-236)||(37556624-37556706)
chr5 (152-236)||(37561446-37561528)
chr5 (88-220)||(28278419-28278553)
chr5 (135-220)||(28750635-28750720)
chr5 (135-220)||(30682903-30682987)
chr5 (152-236)||(2785376-2785458)
chr5 (156-220)||(10749915-10749979)
chr5 (156-220)||(15354575-15354639)
chr5 (152-236)||(27444971-27445053)
chr5 (152-236)||(30631407-30631489)
chr5 (152-236)||(31396995-31397077)
chr5 (137-220)||(42428412-42428495)
chr5 (152-236)||(43598725-43598807)
chr5 (152-236)||(43604217-43604299)
chr5 (152-236)||(43609709-43609791)
chr5 (417-586)||(16649863-16650034)
chr5 (135-220)||(13488306-13488391)
chr5 (380-509)||(16409317-16409446)
chr5 (156-210)||(27910675-27910729)
chr5 (135-220)||(42426215-42426300)
chr5 (155-236)||(2630234-2630315)
chr5 (454-539)||(9789496-9789580)
chr5 (152-221)||(28807588-28807656)
chr5 (466-542)||(535685-535760)
chr5 (156-220)||(2175133-2175197)
chr5 (342-439)||(6742049-6742148)
chr5 (138-220)||(8565930-8566011)
chr5 (156-220)||(10757391-10757455)
chr5 (156-220)||(15356851-15356915)
chr5 (156-220)||(21684452-21684516)
chr5 (156-220)||(23665258-23665322)
chr5 (156-220)||(23741859-23741923)
chr5 (156-220)||(23793265-23793329)
chr5 (156-220)||(25921473-25921537)
chr5 (152-236)||(31401852-31401934)
chr5 (152-236)||(33768180-33768262)
chr5 (152-236)||(33791317-33791399)
chr5 (156-220)||(34477053-34477117)
chr5 (156-220)||(34479418-34479482)
chr5 (156-220)||(38960132-38960196)
chr5 (156-226)||(1170921-1170992)
chr5 (454-545)||(29722330-29722420)
chr5 (277-469)||(31180349-31180545)
chr5 (138-216)||(31183078-31183156)
chr5 (151-220)||(533872-533942)
chr5 (138-200)||(5887417-5887478)
chr5 (453-539)||(16407851-16407936)
chr5 (156-210)||(18466909-18466963)
chr5 (156-225)||(22672946-22673016)
chr5 (156-225)||(25445608-25445678)
chr5 (156-225)||(35385452-35385522)
chr5 (135-220)||(39468529-39468614)
chr5 (380-449)||(3075863-3075931)
chr5 (138-222)||(16452181-16452265)
chr5 (454-539)||(29720176-29720260)
chr5 (141-220)||(538128-538207)
chr5 (156-220)||(6745283-6745347)
chr5 (138-220)||(13239854-13239937)
chr5 (88-220)||(38747108-38747241)
chr5 (156-220)||(38882320-38882384)
chr5 (156-203)||(2724125-2724172)
chr5 (156-203)||(10529099-10529146)
chr5 (156-203)||(24127088-24127135)
chr5 (156-203)||(27912768-27912815)
chr5 (277-460)||(30631542-30631730)
chr5 (138-220)||(33831783-33831865)
chr5 (156-222)||(36263812-36263879)
chr5 (156-203)||(40221755-40221802)
chr5 (156-225)||(25452607-25452677)
chr5 (156-225)||(42238372-42238442)
chr5 (156-220)||(1189607-1189672)
chr5 (380-449)||(31182868-31182936)
chr5 (156-220)||(6747519-6747583)
chr5 (138-220)||(29722627-29722711)
chr5 (138-220)||(37439244-37439327)
chr5 (156-220)||(39798262-39798326)
chr5 (156-220)||(39854698-39854762)
chr5 (417-467)||(537901-537952)
chr5 (156-203)||(696110-696157)
chr5 (156-203)||(2818335-2818382)
chr5 (395-449)||(5007446-5007498)
chr5 (82-236)||(7160916-7161068)
chr5 (156-203)||(17073116-17073163)
chr5 (156-199)||(20505843-20505886)
chr5 (156-203)||(21288993-21289040)
chr5 (156-203)||(21948258-21948305)
chr5 (156-203)||(25904335-25904382)
chr5 (156-203)||(41585744-41585791)
chr5 (156-210)||(2954641-2954695)
chr5 (156-209)||(17841249-17841303)
chr5 (157-203)||(18596878-18596924)
chr5 (380-509)||(42926727-42926856)
chr5 (526-586)||(5057588-5057649)
chr5 (156-220)||(10587046-10587111)
chr5 (526-586)||(27015071-27015132)
chr5 (164-220)||(4236844-4236900)
chr5 (454-545)||(10593064-10593155)
chr5 (138-220)||(10593361-10593445)
chr5 (138-220)||(13343163-13343246)
chr5 (156-220)||(16776372-16776436)
chr5 (156-200)||(17818492-17818536)
chr5 (156-216)||(23667537-23667597)
chr5 (138-220)||(25412863-25412946)
chr5 (156-203)||(28786538-28786586)
chr5 (156-200)||(37705780-37705824)
chr5 (157-220)||(40147364-40147428)
[»] chr2 (140 HSPs)
chr2 (12-586)||(28258831-28259414)
chr2 (12-539)||(36757463-36757998)
chr2 (12-586)||(23078125-23078709)
chr2 (12-586)||(34388719-34389294)
chr2 (15-588)||(40738704-40739277)
chr2 (12-584)||(33528279-33528858)
chr2 (12-586)||(10706906-10707490)
chr2 (12-586)||(21629810-21630389)
chr2 (15-588)||(3491616-3492197)
chr2 (15-586)||(20522083-20522666)
chr2 (15-585)||(13569191-13569773)
chr2 (15-583)||(8389805-8390387)
chr2 (14-583)||(33117998-33118576)
chr2 (12-586)||(14698662-14699235)
chr2 (15-523)||(17865066-17865584)
chr2 (12-468)||(31055902-31056371)
chr2 (15-468)||(8039923-8040392)
chr2 (15-468)||(34682102-34682568)
chr2 (37-447)||(39482815-39483237)
chr2 (12-288)||(42039620-42039906)
chr2 (15-356)||(25398358-25398710)
chr2 (15-356)||(25403496-25403848)
chr2 (15-288)||(10445395-10445679)
chr2 (12-236)||(16940222-16940446)
chr2 (12-236)||(17010887-17011111)
chr2 (329-509)||(40015110-40015291)
chr2 (329-469)||(10445238-10445379)
chr2 (46-469)||(11098691-11099131)
chr2 (117-586)||(14291455-14291944)
chr2 (354-586)||(25409842-25410084)
chr2 (152-469)||(9296166-9296497)
chr2 (52-451)||(2869481-2869892)
chr2 (183-356)||(25407653-25407837)
chr2 (380-586)||(2334622-2334828)
chr2 (380-586)||(36988280-36988486)
chr2 (380-574)||(39284654-39284848)
chr2 (342-487)||(15903642-15903788)
chr2 (425-586)||(2837093-2837255)
chr2 (380-586)||(5723459-5723665)
chr2 (342-451)||(2837816-2837928)
chr2 (417-573)||(6595247-6595404)
chr2 (380-586)||(4484535-4484741)
chr2 (417-586)||(36318250-36318420)
chr2 (344-469)||(35397710-35397837)
chr2 (384-539)||(38312045-38312199)
chr2 (138-236)||(1345553-1345652)
chr2 (374-588)||(30833101-30833315)
chr2 (351-451)||(1344333-1344435)
chr2 (380-586)||(45099512-45099718)
chr2 (145-236)||(2838043-2838134)
chr2 (454-586)||(32289330-32289461)
chr2 (380-468)||(42269606-42269697)
chr2 (380-586)||(4503337-4503543)
chr2 (380-523)||(17057574-17057716)
chr2 (380-523)||(17085557-17085699)
chr2 (380-570)||(29867641-29867832)
chr2 (86-230)||(35397445-35397590)
chr2 (152-236)||(44312626-44312708)
chr2 (138-220)||(723727-723809)
chr2 (138-220)||(34139753-34139835)
chr2 (135-220)||(17057349-17057434)
chr2 (135-220)||(17085332-17085417)
chr2 (138-220)||(39284939-39285024)
chr2 (380-586)||(36205868-36206076)
chr2 (156-220)||(35215586-35215650)
chr2 (156-220)||(35217963-35218027)
chr2 (152-236)||(39811990-39812072)
chr2 (138-220)||(11151574-11151656)
chr2 (138-220)||(14633808-14633890)
chr2 (138-220)||(36773665-36773747)
chr2 (166-236)||(27149307-27149377)
chr2 (135-220)||(38312343-38312428)
chr2 (156-220)||(23452237-23452301)
chr2 (152-236)||(32246789-32246871)
chr2 (156-220)||(36558864-36558928)
chr2 (156-220)||(36561141-36561205)
chr2 (156-220)||(45332181-45332245)
chr2 (12-236)||(40014788-40015009)
chr2 (138-200)||(11067429-11067490)
chr2 (502-586)||(39483235-39483320)
chr2 (454-578)||(6266464-6266587)
chr2 (152-236)||(19344422-19344504)
chr2 (152-236)||(19349280-19349362)
chr2 (156-220)||(27104988-27105052)
chr2 (156-226)||(2736315-2736386)
chr2 (156-226)||(17462546-17462617)
chr2 (138-220)||(29867972-29868054)
chr2 (138-220)||(33162433-33162515)
chr2 (138-220)||(36317992-36318074)
chr2 (156-226)||(45679833-45679904)
chr2 (156-220)||(42064705-42064770)
chr2 (156-220)||(5375346-5375410)
chr2 (156-220)||(19502011-19502075)
chr2 (156-220)||(19504346-19504410)
chr2 (362-441)||(41586349-41586429)
chr2 (156-220)||(45279984-45280048)
chr2 (156-226)||(2741051-2741122)
chr2 (156-203)||(3022380-3022427)
chr2 (156-203)||(6264148-6264195)
chr2 (156-203)||(11739559-11739606)
chr2 (156-203)||(13910045-13910092)
chr2 (156-226)||(39680155-39680226)
chr2 (156-226)||(39687093-39687164)
chr2 (159-220)||(7462950-7463012)
chr2 (156-210)||(22163022-22163076)
chr2 (156-225)||(30479106-30479176)
chr2 (156-225)||(33670967-33671037)
chr2 (138-220)||(42362455-42362533)
chr2 (380-449)||(11151796-11151864)
chr2 (380-449)||(11690396-11690464)
chr2 (156-205)||(14837474-14837523)
chr2 (380-449)||(42362247-42362315)
chr2 (342-449)||(3278199-3278307)
chr2 (141-220)||(11690604-11690683)
chr2 (156-220)||(22287336-22287400)
chr2 (156-220)||(24162223-24162287)
chr2 (157-220)||(35446885-35446949)
chr2 (138-220)||(36988058-36988141)
chr2 (156-220)||(42452972-42453035)
chr2 (156-203)||(19007848-19007895)
chr2 (156-225)||(20050021-20050092)
chr2 (156-203)||(22407454-22407501)
chr2 (380-470)||(33162655-33162745)
chr2 (418-475)||(12632959-12633017)
chr2 (156-225)||(12781221-12781291)
chr2 (166-236)||(15903902-15903972)
chr2 (156-225)||(17943647-17943717)
chr2 (156-225)||(27517639-27517709)
chr2 (526-584)||(35447452-35447510)
chr2 (417-478)||(36773414-36773476)
chr2 (156-202)||(40032053-40032099)
chr2 (380-449)||(723949-724017)
chr2 (138-175)||(14202404-14202440)
chr2 (138-220)||(2334400-2334483)
chr2 (138-220)||(4503115-4503198)
chr2 (138-220)||(6594988-6595071)
chr2 (146-194)||(42288101-42288149)
chr2 (156-220)||(43623580-43623644)
chr2 (138-220)||(45099857-45099940)
chr2 (157-220)||(45727032-45727096)
[»] chr6 (112 HSPs)
chr6 (12-586)||(5757132-5757713)
chr6 (12-424)||(21355898-21356318)
chr6 (21-586)||(22708888-22709463)
chr6 (12-586)||(5017149-5017709)
chr6 (12-586)||(31086126-31086699)
chr6 (15-493)||(31936451-31936925)
chr6 (16-586)||(22963563-22964142)
chr6 (16-586)||(23824251-23824830)
chr6 (12-586)||(31979373-31979961)
chr6 (120-539)||(5571945-5572369)
chr6 (12-394)||(18232705-18233097)
chr6 (16-468)||(21801113-21801583)
chr6 (12-377)||(10077031-10077402)
chr6 (47-586)||(5674411-5674971)
chr6 (92-586)||(24435625-24436127)
chr6 (396-586)||(18234336-18234527)
chr6 (63-401)||(4629863-4630211)
chr6 (404-586)||(10076844-10077027)
chr6 (419-539)||(23896628-23896748)
chr6 (383-586)||(21272642-21272846)
chr6 (380-586)||(33160558-33160765)
chr6 (380-586)||(5406403-5406609)
chr6 (380-586)||(5410728-5410934)
chr6 (342-487)||(31076688-31076834)
chr6 (380-586)||(31404878-31405085)
chr6 (380-586)||(30834741-30834948)
chr6 (454-586)||(5411512-5411644)
chr6 (380-586)||(16452534-16452740)
chr6 (342-468)||(14521872-14522002)
chr6 (380-521)||(9183236-9183376)
chr6 (454-586)||(5407187-5407319)
chr6 (108-236)||(27165639-27165767)
chr6 (380-584)||(33211390-33211594)
chr6 (152-236)||(14742438-14742520)
chr6 (152-236)||(22010699-22010781)
chr6 (12-106)||(5572739-5572833)
chr6 (493-586)||(26253750-26253843)
chr6 (380-539)||(2171735-2171894)
chr6 (152-236)||(11856975-11857057)
chr6 (156-220)||(12195515-12195579)
chr6 (152-236)||(14737578-14737660)
chr6 (156-220)||(26932562-26932626)
chr6 (152-236)||(28155571-28155653)
chr6 (152-236)||(28184506-28184588)
chr6 (152-236)||(33335944-33336026)
chr6 (141-236)||(14521663-14521758)
chr6 (138-220)||(16569125-16569207)
chr6 (380-521)||(5413597-5413737)
chr6 (156-220)||(4816231-4816295)
chr6 (156-220)||(5273216-5273280)
chr6 (152-236)||(6005418-6005500)
chr6 (156-220)||(19704567-19704631)
chr6 (156-220)||(20915356-20915420)
chr6 (156-220)||(29754709-29754773)
chr6 (156-220)||(33309106-33309170)
chr6 (152-236)||(33330447-33330529)
chr6 (15-66)||(26258182-26258233)
chr6 (139-220)||(9183015-9183096)
chr6 (152-221)||(6438502-6438570)
chr6 (156-220)||(11983029-11983093)
chr6 (152-236)||(16838745-16838827)
chr6 (156-220)||(30967451-30967515)
chr6 (156-220)||(33311375-33311439)
chr6 (156-226)||(13878837-13878908)
chr6 (156-226)||(13883585-13883656)
chr6 (156-226)||(16786029-16786100)
chr6 (138-216)||(33211168-33211246)
chr6 (527-586)||(16452790-16452851)
chr6 (454-539)||(6097713-6097797)
chr6 (153-220)||(603085-603153)
chr6 (156-220)||(2628886-2628950)
chr6 (342-430)||(5385794-5385881)
chr6 (156-220)||(14458767-14458831)
chr6 (156-220)||(14507176-14507240)
chr6 (156-220)||(26066124-26066188)
chr6 (156-220)||(26068395-26068459)
chr6 (455-586)||(411868-411997)
chr6 (156-203)||(1230249-1230296)
chr6 (547-586)||(5413820-5413859)
chr6 (156-226)||(35201327-35201398)
chr6 (417-479)||(3039157-3039219)
chr6 (156-225)||(25941781-25941851)
chr6 (151-220)||(26954281-26954351)
chr6 (162-225)||(5165819-5165883)
chr6 (546-586)||(9183381-9183421)
chr6 (156-220)||(26065232-26065295)
chr6 (156-220)||(26085201-26085264)
chr6 (156-220)||(28241321-28241385)
chr6 (156-220)||(30034603-30034667)
chr6 (463-546)||(3073039-3073121)
chr6 (156-203)||(9020193-9020240)
chr6 (156-203)||(15346614-15346661)
chr6 (148-220)||(3808699-3808773)
chr6 (156-225)||(17038346-17038416)
chr6 (156-225)||(17694852-17694922)
chr6 (156-225)||(25465899-25465969)
chr6 (138-220)||(2171513-2171597)
chr6 (138-220)||(5406182-5406265)
chr6 (138-220)||(5410507-5410590)
chr6 (156-203)||(11262726-11262774)
chr6 (138-220)||(16452311-16452394)
chr6 (156-203)||(19696708-19696756)
chr6 (78-114)||(20504812-20504848)
chr6 (157-220)||(21589034-21589098)
chr6 (157-220)||(21593767-21593831)
chr6 (156-203)||(22857952-22858000)
chr6 (156-226)||(26887227-26887296)
chr6 (417-449)||(26954526-26954558)
chr6 (546-586)||(26954674-26954714)
chr6 (172-236)||(31076954-31077018)
chr6 (138-220)||(31404657-31404740)
chr6 (159-203)||(32280264-32280308)
[»] chr7 (182 HSPs)
chr7 (12-586)||(2479199-2479779)
chr7 (12-474)||(47263540-47263997)
chr7 (12-584)||(21988766-21989349)
chr7 (15-586)||(18413506-18414093)
chr7 (15-586)||(18408629-18409217)
chr7 (12-586)||(2647350-2647934)
chr7 (15-493)||(9184920-9185396)
chr7 (12-580)||(46515967-46516548)
chr7 (14-586)||(33332103-33332685)
chr7 (15-469)||(9189777-9190241)
chr7 (12-357)||(44848567-44848922)
chr7 (15-469)||(21639673-21640138)
chr7 (15-586)||(21645871-21646461)
chr7 (18-468)||(29159669-29160133)
chr7 (12-493)||(20283949-20284439)
chr7 (12-586)||(4796322-4796907)
chr7 (15-509)||(2580251-2580755)
chr7 (12-404)||(49091522-49091924)
chr7 (12-469)||(23402784-23403250)
chr7 (350-586)||(44847779-44848015)
chr7 (12-394)||(21983142-21983537)
chr7 (15-389)||(55802-56195)
chr7 (21-469)||(1533208-1533671)
chr7 (380-586)||(49091926-49092134)
chr7 (12-404)||(35960674-35961078)
chr7 (328-491)||(3047438-3047603)
chr7 (80-469)||(5817040-5817439)
chr7 (396-586)||(79641-79833)
chr7 (117-586)||(2057931-2058424)
chr7 (426-586)||(2761552-2761713)
chr7 (380-586)||(18126401-18126607)
chr7 (12-170)||(9235634-9235794)
chr7 (380-586)||(23554797-23555003)
chr7 (12-236)||(28617238-28617465)
chr7 (380-586)||(1113413-1113620)
chr7 (380-586)||(14070038-14070244)
chr7 (380-586)||(14380066-14380272)
chr7 (380-586)||(47676341-47676547)
chr7 (372-586)||(48491335-48491550)
chr7 (380-586)||(4585918-4586124)
chr7 (43-460)||(20357320-20357755)
chr7 (429-586)||(21983541-21983686)
chr7 (380-586)||(48489187-48489394)
chr7 (417-543)||(30024973-30025099)
chr7 (380-586)||(4178532-4178738)
chr7 (455-588)||(25767234-25767366)
chr7 (494-586)||(47263994-47264086)
chr7 (380-586)||(24514965-24515171)
chr7 (380-586)||(35853670-35853878)
chr7 (380-584)||(29990814-29991018)
chr7 (380-586)||(47674148-47674354)
chr7 (380-584)||(6570352-6570557)
chr7 (117-236)||(24024328-24024447)
chr7 (380-505)||(43864083-43864207)
chr7 (328-424)||(9235398-9235495)
chr7 (122-220)||(30814539-30814637)
chr7 (152-236)||(4866731-4866813)
chr7 (152-236)||(19992314-19992396)
chr7 (135-222)||(48489532-48489619)
chr7 (138-220)||(41317417-41317499)
chr7 (138-219)||(12097850-12097931)
chr7 (135-220)||(27347920-27348005)
chr7 (380-561)||(39731159-39731340)
chr7 (94-220)||(22270076-22270204)
chr7 (152-236)||(12396912-12396994)
chr7 (152-236)||(31109585-31109667)
chr7 (156-220)||(31155911-31155975)
chr7 (380-519)||(31733174-31733312)
chr7 (380-539)||(48408608-48408766)
chr7 (138-220)||(41648994-41649076)
chr7 (139-220)||(14069817-14069898)
chr7 (139-220)||(14379845-14379926)
chr7 (380-493)||(19502028-19502141)
chr7 (380-586)||(26417070-26417279)
chr7 (156-220)||(1049296-1049360)
chr7 (156-220)||(2935493-2935557)
chr7 (156-220)||(3035949-3036013)
chr7 (156-220)||(7351652-7351716)
chr7 (141-220)||(8153445-8153524)
chr7 (156-220)||(9027194-9027258)
chr7 (152-236)||(12406332-12406414)
chr7 (156-220)||(22108291-22108355)
chr7 (156-220)||(22137302-22137366)
chr7 (152-236)||(24261325-24261407)
chr7 (152-236)||(24266204-24266286)
chr7 (156-220)||(40550051-40550115)
chr7 (156-220)||(40552329-40552393)
chr7 (135-220)||(26417419-26417504)
chr7 (135-216)||(31732949-31733030)
chr7 (135-220)||(47676116-47676201)
chr7 (526-586)||(3050493-3050554)
chr7 (152-221)||(16880074-16880142)
chr7 (152-221)||(16884930-16884998)
chr7 (159-220)||(20297587-20297648)
chr7 (156-220)||(1046925-1046989)
chr7 (156-220)||(1606604-1606668)
chr7 (467-523)||(2759071-2759126)
chr7 (156-220)||(20299685-20299749)
chr7 (156-220)||(20626263-20626327)
chr7 (156-220)||(20630154-20630218)
chr7 (156-220)||(20642573-20642637)
chr7 (156-220)||(38394211-38394275)
chr7 (156-220)||(40836743-40836807)
chr7 (156-226)||(3320051-3320122)
chr7 (156-226)||(3324799-3324870)
chr7 (138-220)||(24525485-24525567)
chr7 (156-226)||(25405503-25405574)
chr7 (138-220)||(36146391-36146473)
chr7 (135-220)||(4586264-4586349)
chr7 (156-225)||(8378504-8378574)
chr7 (155-220)||(43864347-43864413)
chr7 (478-586)||(4538853-4538962)
chr7 (135-200)||(18126768-18126832)
chr7 (152-221)||(21812254-21812322)
chr7 (156-220)||(1850206-1850270)
chr7 (168-220)||(7349285-7349337)
chr7 (156-220)||(7470022-7470086)
chr7 (156-220)||(7471980-7472044)
chr7 (156-220)||(25542753-25542817)
chr7 (156-220)||(40946553-40946617)
chr7 (156-200)||(42330997-42331041)
chr7 (156-220)||(44724804-44724868)
chr7 (156-220)||(48457878-48457942)
chr7 (156-226)||(7069890-7069961)
chr7 (156-203)||(11759369-11759416)
chr7 (156-203)||(13099474-13099521)
chr7 (138-220)||(38671205-38671287)
chr7 (156-225)||(2121011-2121081)
chr7 (12-236)||(3047111-3047339)
chr7 (527-586)||(19495728-19495789)
chr7 (156-225)||(25351463-25351533)
chr7 (156-225)||(25357157-25357227)
chr7 (156-225)||(25410242-25410312)
chr7 (151-220)||(30024727-30024797)
chr7 (156-225)||(34546880-34546950)
chr7 (380-449)||(38671427-38671495)
chr7 (156-220)||(44789-44853)
chr7 (141-220)||(2759183-2759262)
chr7 (156-220)||(3878802-3878866)
chr7 (156-203)||(11081752-11081800)
chr7 (156-220)||(18345766-18345830)
chr7 (138-220)||(29991156-29991239)
chr7 (138-220)||(35854017-35854101)
chr7 (156-220)||(38396859-38396923)
chr7 (417-449)||(40808485-40808517)
chr7 (138-220)||(495966-496048)
chr7 (138-220)||(1113760-1113842)
chr7 (156-226)||(7074897-7074968)
chr7 (156-226)||(15540996-15541067)
chr7 (155-225)||(21369754-21369825)
chr7 (156-203)||(21592143-21592190)
chr7 (156-203)||(21990392-21990439)
chr7 (156-203)||(24748837-24748884)
chr7 (156-203)||(28487795-28487842)
chr7 (156-225)||(2075227-2075297)
chr7 (168-225)||(6046714-6046772)
chr7 (417-478)||(12098113-12098175)
chr7 (417-478)||(41317688-41317750)
chr7 (156-225)||(44010750-44010820)
chr7 (135-220)||(47673924-47674008)
chr7 (135-220)||(48491682-48491766)
chr7 (159-200)||(2360975-2361016)
chr7 (159-220)||(7094463-7094524)
chr7 (156-209)||(11355494-11355547)
chr7 (380-449)||(24526102-24526170)
chr7 (380-449)||(31105598-31105666)
chr7 (156-225)||(31435046-31435115)
chr7 (454-539)||(43504427-43504511)
chr7 (156-220)||(35854-35918)
chr7 (145-220)||(2390385-2390461)
chr7 (145-220)||(6359941-6360017)
chr7 (156-220)||(7092213-7092276)
chr7 (372-412)||(12098056-12098096)
chr7 (153-220)||(20344000-20344068)
chr7 (138-220)||(23555143-23555226)
chr7 (431-478)||(23565315-23565363)
chr7 (138-220)||(24789944-24790028)
chr7 (138-174)||(25766941-25766977)
chr7 (156-220)||(27306230-27306294)
chr7 (391-470)||(31109388-31109468)
chr7 (157-220)||(32358055-32358119)
chr7 (540-584)||(32358419-32358463)
[»] chr1 (156 HSPs)
chr1 (12-576)||(26644561-26645134)
chr1 (15-586)||(3281571-3282150)
chr1 (12-586)||(37069628-37070211)
chr1 (15-586)||(13604276-13604857)
chr1 (12-586)||(21536224-21536806)
chr1 (12-586)||(29651670-29652257)
chr1 (15-586)||(13598259-13598844)
chr1 (15-539)||(19361122-19361669)
chr1 (15-539)||(19358533-19359079)
chr1 (15-561)||(24202437-24203001)
chr1 (14-468)||(19072788-19073256)
chr1 (14-468)||(19120678-19121146)
chr1 (15-468)||(47703704-47704171)
chr1 (12-493)||(47098572-47099060)
chr1 (15-493)||(32889302-32889788)
chr1 (15-393)||(19379917-19380309)
chr1 (12-414)||(16124340-16124754)
chr1 (19-469)||(9476130-9476588)
chr1 (247-588)||(19365948-19366300)
chr1 (12-236)||(775532-775756)
chr1 (15-236)||(27104385-27104602)
chr1 (328-493)||(47102586-47102752)
chr1 (12-236)||(47102854-47103077)
chr1 (251-468)||(40816585-40816802)
chr1 (380-586)||(10924980-10925186)
chr1 (328-509)||(27104132-27104314)
chr1 (328-508)||(22819615-22819795)
chr1 (334-508)||(9022638-9022813)
chr1 (417-586)||(28220467-28220637)
chr1 (417-586)||(28223662-28223832)
chr1 (417-586)||(49918106-49918276)
chr1 (380-581)||(3206749-3206950)
chr1 (380-582)||(31658999-31659201)
chr1 (380-582)||(44454920-44455123)
chr1 (454-580)||(30476727-30476853)
chr1 (12-135)||(40816845-40816970)
chr1 (380-523)||(3156687-3156829)
chr1 (417-544)||(37503795-37503922)
chr1 (52-469)||(24787129-24787563)
chr1 (380-586)||(1833279-1833485)
chr1 (75-236)||(17345532-17345693)
chr1 (380-521)||(3189154-3189294)
chr1 (380-521)||(3197971-3198111)
chr1 (380-586)||(13316523-13316729)
chr1 (380-586)||(20762429-20762635)
chr1 (380-573)||(4552842-4553046)
chr1 (152-236)||(25445091-25445173)
chr1 (380-586)||(46064675-46064881)
chr1 (138-220)||(28265537-28265619)
chr1 (135-220)||(3156968-3157053)
chr1 (139-220)||(28220210-28220291)
chr1 (156-220)||(9459419-9459483)
chr1 (156-220)||(9463246-9463310)
chr1 (156-220)||(16226382-16226446)
chr1 (387-451)||(17345350-17345414)
chr1 (152-236)||(41390582-41390664)
chr1 (152-236)||(41398237-41398319)
chr1 (15-185)||(50521165-50521337)
chr1 (138-220)||(834150-834232)
chr1 (138-220)||(3847104-3847186)
chr1 (139-220)||(28223405-28223486)
chr1 (135-220)||(31659341-31659426)
chr1 (135-220)||(44455263-44455348)
chr1 (135-220)||(49918453-49918538)
chr1 (152-221)||(1055027-1055095)
chr1 (152-221)||(39445501-39445569)
chr1 (152-221)||(44023889-44023957)
chr1 (156-220)||(23786054-23786118)
chr1 (156-220)||(51752578-51752642)
chr1 (380-539)||(51765200-51765358)
chr1 (138-220)||(45644337-45644419)
chr1 (138-220)||(50167158-50167240)
chr1 (138-200)||(13137959-13138020)
chr1 (135-220)||(37503537-37503622)
chr1 (417-505)||(37560110-37560198)
chr1 (454-586)||(40282141-40282273)
chr1 (138-222)||(46065019-46065103)
chr1 (156-220)||(6823229-6823293)
chr1 (156-220)||(10399830-10399894)
chr1 (156-220)||(13358788-13358852)
chr1 (164-220)||(16231778-16231834)
chr1 (156-220)||(27336942-27337006)
chr1 (156-220)||(28840894-28840958)
chr1 (156-220)||(31735523-31735587)
chr1 (372-449)||(41360807-41360886)
chr1 (138-198)||(41361040-41361100)
chr1 (152-236)||(43988466-43988548)
chr1 (156-220)||(47179928-47179991)
chr1 (156-220)||(51750254-51750318)
chr1 (156-220)||(51757745-51757809)
chr1 (138-216)||(4552620-4552698)
chr1 (156-203)||(12302507-12302554)
chr1 (138-220)||(13659319-13659401)
chr1 (142-220)||(19754598-19754676)
chr1 (135-220)||(37559847-37559933)
chr1 (138-220)||(40122179-40122261)
chr1 (138-220)||(50169193-50169275)
chr1 (156-210)||(39462744-39462798)
chr1 (141-220)||(196893-196973)
chr1 (380-449)||(834372-834440)
chr1 (156-225)||(28207070-28207139)
chr1 (454-586)||(9986967-9987098)
chr1 (380-487)||(13138179-13138286)
chr1 (156-220)||(15294836-15294900)
chr1 (156-216)||(23816105-23816165)
chr1 (156-220)||(47177577-47177640)
chr1 (380-509)||(197113-197243)
chr1 (156-203)||(2510327-2510374)
chr1 (156-203)||(17324638-17324685)
chr1 (156-203)||(50307548-50307595)
chr1 (156-217)||(2232710-2232772)
chr1 (156-225)||(9526578-9526648)
chr1 (156-225)||(21353348-21353418)
chr1 (380-509)||(23555470-23555599)
chr1 (135-177)||(30476426-30476467)
chr1 (156-225)||(13215296-13215365)
chr1 (454-562)||(21053746-21053854)
chr1 (138-220)||(8550769-8550852)
chr1 (149-220)||(19752789-19752861)
chr1 (156-220)||(27339133-27339197)
chr1 (156-200)||(28998255-28998299)
chr1 (156-200)||(29003971-29004015)
chr1 (156-220)||(47906485-47906549)
chr1 (156-203)||(3579619-3579666)
chr1 (156-203)||(6115104-6115151)
chr1 (138-220)||(10925329-10925411)
chr1 (156-203)||(11457477-11457524)
chr1 (156-203)||(15823778-15823825)
chr1 (156-203)||(16429190-16429237)
chr1 (162-236)||(22819438-22819513)
chr1 (156-220)||(46431708-46431774)
chr1 (156-209)||(4144683-4144737)
chr1 (166-236)||(9023852-9023922)
chr1 (156-225)||(15916601-15916671)
chr1 (156-201)||(26613240-26613286)
chr1 (252-286)||(27104333-27104367)
chr1 (417-478)||(28265807-28265869)
chr1 (417-478)||(50167429-50167491)
chr1 (159-220)||(2617731-2617792)
chr1 (156-201)||(13762070-13762115)
chr1 (156-201)||(20302692-20302737)
chr1 (156-220)||(27916712-27916777)
chr1 (145-220)||(42297963-42298040)
chr1 (372-449)||(45644552-45644628)
chr1 (158-203)||(47451874-47451919)
chr1 (138-220)||(3189433-3189516)
chr1 (138-220)||(3198250-3198333)
chr1 (138-220)||(3207089-3207172)
chr1 (157-220)||(13547090-13547154)
chr1 (157-220)||(13549001-13549065)
chr1 (156-203)||(14183592-14183640)
chr1 (544-584)||(16455405-16455445)
chr1 (156-220)||(20291671-20291735)
chr1 (138-220)||(20622218-20622302)
chr1 (157-220)||(37168401-37168465)
chr1 (138-220)||(40282480-40282564)
[»] scaffold0140 (3 HSPs)
scaffold0140 (15-586)||(8071-8653)
scaffold0140 (156-220)||(22339-22403)
scaffold0140 (156-220)||(24614-24678)
[»] scaffold0006 (4 HSPs)
scaffold0006 (15-586)||(132933-133514)
scaffold0006 (15-586)||(5544-6129)
scaffold0006 (12-586)||(2352-2937)
scaffold0006 (138-220)||(149080-149162)
[»] chr8 (135 HSPs)
chr8 (12-574)||(7412197-7412771)
chr8 (12-534)||(4455888-4456419)
chr8 (12-550)||(19175441-19175994)
chr8 (12-586)||(5702133-5702720)
chr8 (15-546)||(26287766-26288295)
chr8 (15-546)||(26313017-26313546)
chr8 (37-542)||(4696306-4696808)
chr8 (12-586)||(23799229-23799815)
chr8 (15-546)||(26301011-26301552)
chr8 (15-430)||(31071035-31071462)
chr8 (15-468)||(26402997-26403464)
chr8 (15-486)||(19752148-19752627)
chr8 (15-561)||(1261621-1262185)
chr8 (15-451)||(6127082-6127533)
chr8 (12-220)||(9765848-9766057)
chr8 (329-586)||(3051305-3051565)
chr8 (46-469)||(33037572-33038011)
chr8 (21-469)||(4759838-4760306)
chr8 (46-469)||(36979270-36979709)
chr8 (380-584)||(43036182-43036386)
chr8 (328-487)||(28307746-28307907)
chr8 (380-586)||(30143099-30143305)
chr8 (380-586)||(15212543-15212749)
chr8 (46-460)||(30655533-30655970)
chr8 (152-470)||(10688903-10689239)
chr8 (380-586)||(12702843-12703050)
chr8 (117-469)||(18870325-18870692)
chr8 (417-586)||(34254569-34254739)
chr8 (380-586)||(33351907-33352113)
chr8 (78-230)||(6813608-6813761)
chr8 (380-586)||(17982410-17982616)
chr8 (117-469)||(18852931-18853298)
chr8 (342-487)||(5990315-5990459)
chr8 (380-586)||(4731415-4731621)
chr8 (380-521)||(42498017-42498157)
chr8 (342-466)||(9054193-9054318)
chr8 (417-586)||(19948562-19948732)
chr8 (417-582)||(34256745-34256911)
chr8 (328-437)||(7492976-7493086)
chr8 (380-586)||(31218014-31218220)
chr8 (454-586)||(1746497-1746629)
chr8 (135-220)||(4733809-4733894)
chr8 (417-542)||(27811080-27811205)
chr8 (152-236)||(6311298-6311380)
chr8 (152-236)||(7289928-7290010)
chr8 (152-236)||(25328280-25328362)
chr8 (135-220)||(4731761-4731846)
chr8 (135-216)||(15212893-15212974)
chr8 (135-220)||(33352253-33352338)
chr8 (380-586)||(44303611-44303817)
chr8 (78-236)||(9054850-9055008)
chr8 (380-539)||(4733610-4733772)
chr8 (380-468)||(9765622-9765712)
chr8 (156-220)||(43079873-43079937)
chr8 (156-220)||(43082244-43082308)
chr8 (138-220)||(40321183-40321265)
chr8 (135-220)||(43036526-43036611)
chr8 (136-220)||(27811381-27811465)
chr8 (152-221)||(39784838-39784906)
chr8 (152-236)||(10684266-10684348)
chr8 (145-220)||(10930188-10930264)
chr8 (156-220)||(18810978-18811042)
chr8 (380-539)||(19945565-19945722)
chr8 (152-236)||(35745392-35745474)
chr8 (156-220)||(44721114-44721178)
chr8 (138-220)||(4743197-4743279)
chr8 (138-220)||(5689374-5689456)
chr8 (138-236)||(3051107-3051204)
chr8 (483-561)||(31043113-31043191)
chr8 (151-220)||(40221848-40221918)
chr8 (152-229)||(28307561-28307638)
chr8 (156-220)||(3874281-3874345)
chr8 (141-220)||(6599075-6599154)
chr8 (141-220)||(6674528-6674607)
chr8 (342-469)||(13204562-13204681)
chr8 (156-220)||(18813152-18813216)
chr8 (138-198)||(19491681-19491741)
chr8 (372-449)||(19491895-19491974)
chr8 (156-220)||(22684653-22684717)
chr8 (156-220)||(27829567-27829631)
chr8 (454-509)||(2627577-2627631)
chr8 (138-216)||(12702617-12702695)
chr8 (156-226)||(16757268-16757339)
chr8 (156-226)||(25684753-25684824)
chr8 (156-225)||(28890877-28890947)
chr8 (135-220)||(30143443-30143528)
chr8 (156-220)||(609005-609069)
chr8 (156-220)||(4424289-4424353)
chr8 (156-220)||(24873181-24873245)
chr8 (156-220)||(27827256-27827320)
chr8 (156-220)||(28251567-28251631)
chr8 (156-220)||(32339580-32339644)
chr8 (138-220)||(3303653-3303735)
chr8 (156-226)||(4812488-4812559)
chr8 (156-203)||(14419190-14419237)
chr8 (156-226)||(28328018-28328089)
chr8 (156-203)||(30480503-30480550)
chr8 (138-200)||(1345354-1345415)
chr8 (335-460)||(6311493-6311622)
chr8 (417-478)||(11712244-11712306)
chr8 (380-449)||(3303875-3303943)
chr8 (387-487)||(3318761-3318862)
chr8 (156-201)||(14808051-14808096)
chr8 (156-220)||(15809489-15809553)
chr8 (156-220)||(28283221-28283284)
chr8 (156-222)||(33079685-33079753)
chr8 (372-470)||(41266840-41266940)
chr8 (141-220)||(41366601-41366679)
chr8 (138-220)||(42498297-42498380)
chr8 (156-220)||(43530386-43530450)
chr8 (156-203)||(15072999-15073046)
chr8 (163-225)||(17847785-17847848)
chr8 (156-203)||(37214264-37214311)
chr8 (156-203)||(41382950-41382997)
chr8 (156-203)||(41385032-41385079)
chr8 (546-585)||(42497973-42498012)
chr8 (481-586)||(4743498-4743604)
chr8 (546-584)||(19945710-19945748)
chr8 (156-225)||(23179561-23179631)
chr8 (179-225)||(29554809-29554855)
chr8 (374-470)||(38863743-38863841)
chr8 (545-586)||(10014916-10014957)
chr8 (156-201)||(15956248-15956293)
chr8 (156-225)||(25952787-25952856)
chr8 (417-480)||(1292704-1292768)
chr8 (426-489)||(1872173-1872237)
chr8 (380-444)||(4162400-4162463)
chr8 (156-200)||(15185714-15185758)
chr8 (138-220)||(17982756-17982839)
chr8 (157-220)||(18141923-18141987)
chr8 (387-470)||(29796535-29796618)
chr8 (138-220)||(30291710-30291793)
chr8 (159-203)||(33541413-33541457)
chr8 (138-220)||(34254313-34254396)
chr8 (138-220)||(34256489-34256572)
[»] chr4 (167 HSPs)
chr4 (12-539)||(5396372-5396911)
chr4 (15-586)||(8689150-8689712)
chr4 (15-586)||(31985288-31985866)
chr4 (12-586)||(5268853-5269431)
chr4 (15-586)||(3777413-3777992)
chr4 (12-586)||(5147537-5148121)
chr4 (12-574)||(10047239-10047808)
chr4 (12-586)||(5143119-5143704)
chr4 (12-586)||(25861686-25862259)
chr4 (15-539)||(28468224-28468760)
chr4 (94-586)||(36314883-36315384)
chr4 (94-586)||(36329092-36329593)
chr4 (107-586)||(16622947-16623435)
chr4 (12-586)||(38152091-38152677)
chr4 (12-586)||(6743068-6743657)
chr4 (12-586)||(54867042-54867623)
chr4 (273-586)||(16628526-16628838)
chr4 (12-493)||(42599322-42599814)
chr4 (15-468)||(24333674-24334139)
chr4 (12-236)||(16630693-16630917)
chr4 (19-236)||(39245860-39246078)
chr4 (15-288)||(3796470-3796755)
chr4 (332-481)||(5112425-5112576)
chr4 (46-469)||(24741833-24742273)
chr4 (117-469)||(29760608-29760974)
chr4 (165-505)||(39774039-39774389)
chr4 (380-574)||(26175841-26176035)
chr4 (380-586)||(37740383-37740589)
chr4 (380-586)||(13992490-13992697)
chr4 (328-505)||(18377543-18377715)
chr4 (328-468)||(3793849-3793993)
chr4 (380-574)||(12739755-12739949)
chr4 (380-574)||(12747961-12748155)
chr4 (372-582)||(34570611-34570821)
chr4 (380-586)||(52082862-52083068)
chr4 (380-586)||(5429437-5429642)
chr4 (12-115)||(16624143-16624246)
chr4 (380-586)||(29254251-29254457)
chr4 (380-574)||(56178841-56179035)
chr4 (417-586)||(52093905-52094075)
chr4 (12-469)||(1983070-1983536)
chr4 (380-586)||(9927662-9927872)
chr4 (380-586)||(54200111-54200317)
chr4 (380-574)||(48142810-48143005)
chr4 (380-586)||(52095567-52095771)
chr4 (380-582)||(30000010-30000212)
chr4 (380-468)||(6542386-6542475)
chr4 (380-468)||(51336938-51337027)
chr4 (417-539)||(12745677-12745799)
chr4 (374-574)||(5370285-5370486)
chr4 (135-220)||(12739530-12739615)
chr4 (135-220)||(26175616-26175701)
chr4 (48-236)||(34495836-34496024)
chr4 (152-236)||(3814025-3814107)
chr4 (152-236)||(5732666-5732748)
chr4 (152-236)||(9224409-9224491)
chr4 (152-236)||(51520458-51520540)
chr4 (138-220)||(48893621-48893703)
chr4 (135-220)||(9927438-9927523)
chr4 (135-220)||(12743905-12743990)
chr4 (135-220)||(12745294-12745379)
chr4 (152-236)||(9229196-9229278)
chr4 (156-220)||(16931789-16931853)
chr4 (156-220)||(16934143-16934207)
chr4 (156-220)||(22780373-22780437)
chr4 (156-220)||(44599838-44599902)
chr4 (152-236)||(45347819-45347901)
chr4 (152-236)||(45357298-45357380)
chr4 (138-220)||(52467337-52467419)
chr4 (380-481)||(4587820-4587921)
chr4 (162-236)||(5112247-5112321)
chr4 (135-220)||(5429782-5429867)
chr4 (135-220)||(29254597-29254682)
chr4 (135-220)||(34570394-34570479)
chr4 (152-221)||(18855728-18855796)
chr4 (454-574)||(35661978-35662098)
chr4 (156-220)||(6765113-6765177)
chr4 (156-220)||(7941592-7941656)
chr4 (156-220)||(18709164-18709228)
chr4 (156-220)||(22782738-22782802)
chr4 (454-546)||(31495589-31495680)
chr4 (151-218)||(36463384-36463452)
chr4 (152-236)||(56146713-56146795)
chr4 (138-220)||(46147374-46147456)
chr4 (138-220)||(47038394-47038476)
chr4 (151-220)||(27416960-27417030)
chr4 (135-220)||(37740728-37740813)
chr4 (380-451)||(48893847-48893920)
chr4 (140-220)||(5871923-5872003)
chr4 (417-493)||(36994375-36994451)
chr4 (135-200)||(54199887-54199950)
chr4 (156-220)||(5198689-5198753)
chr4 (156-220)||(5635476-5635540)
chr4 (156-220)||(8631419-8631483)
chr4 (156-220)||(9148521-9148585)
chr4 (156-220)||(11008568-11008632)
chr4 (156-220)||(17662245-17662309)
chr4 (342-449)||(37782062-37782170)
chr4 (156-226)||(11853659-11853730)
chr4 (138-220)||(45687165-45687247)
chr4 (387-449)||(6677362-6677424)
chr4 (156-225)||(18587078-18587148)
chr4 (156-220)||(2484873-2484937)
chr4 (156-220)||(9174146-9174210)
chr4 (156-220)||(9176474-9176538)
chr4 (156-220)||(11435223-11435287)
chr4 (156-220)||(11437631-11437695)
chr4 (156-220)||(18847422-18847485)
chr4 (156-220)||(22044391-22044455)
chr4 (156-220)||(22046686-22046750)
chr4 (156-220)||(22132392-22132456)
chr4 (156-220)||(22134618-22134681)
chr4 (156-220)||(24348487-24348551)
chr4 (156-220)||(24889065-24889129)
chr4 (145-220)||(26364339-26364415)
chr4 (156-220)||(31849599-31849663)
chr4 (138-220)||(36994627-36994708)
chr4 (156-220)||(37089372-37089436)
chr4 (12-236)||(37781722-37781946)
chr4 (156-220)||(38409473-38409537)
chr4 (156-203)||(4215592-4215639)
chr4 (156-203)||(16455528-16455575)
chr4 (156-203)||(22800862-22800909)
chr4 (156-203)||(24879276-24879323)
chr4 (156-203)||(24880738-24880785)
chr4 (156-203)||(38928177-38928224)
chr4 (156-203)||(40637360-40637407)
chr4 (156-225)||(4884986-4885056)
chr4 (156-225)||(8529379-8529449)
chr4 (151-220)||(13009439-13009509)
chr4 (156-210)||(19096162-19096216)
chr4 (145-220)||(2209817-2209894)
chr4 (156-201)||(14789428-14789473)
chr4 (25-236)||(18377244-18377443)
chr4 (526-586)||(27417519-27417580)
chr4 (156-225)||(36378557-36378626)
chr4 (162-225)||(10113134-10113198)
chr4 (156-220)||(11006237-11006301)
chr4 (156-220)||(51015514-51015578)
chr4 (145-220)||(54883123-54883199)
chr4 (138-220)||(56178619-56178702)
chr4 (138-220)||(6542162-6542244)
chr4 (156-203)||(12395845-12395892)
chr4 (156-203)||(12400807-12400854)
chr4 (156-203)||(14633604-14633651)
chr4 (156-203)||(36919584-36919631)
chr4 (400-470)||(37755149-37755220)
chr4 (156-203)||(40091415-40091462)
chr4 (156-203)||(48486605-48486652)
chr4 (138-220)||(52095345-52095427)
chr4 (387-477)||(52467567-52467657)
chr4 (164-225)||(15831253-15831315)
chr4 (164-225)||(19322958-19323020)
chr4 (15-74)||(36315386-36315446)
chr4 (15-74)||(36329595-36329655)
chr4 (164-225)||(36769591-36769653)
chr4 (417-478)||(46147596-46147658)
chr4 (156-220)||(4556060-4556125)
chr4 (156-201)||(14787429-14787474)
chr4 (94-197)||(21688376-21688478)
chr4 (156-220)||(26557854-26557919)
chr4 (156-203)||(16185834-16185882)
chr4 (546-586)||(24968867-24968907)
chr4 (156-220)||(26085977-26086041)
chr4 (156-203)||(38890224-38890272)
chr4 (417-449)||(45687437-45687469)
chr4 (138-220)||(48143146-48143229)
[»] scaffold0036 (1 HSPs)
scaffold0036 (12-545)||(85545-86085)
[»] scaffold0188 (2 HSPs)
scaffold0188 (15-539)||(17641-18185)
scaffold0188 (15-469)||(23812-24278)
[»] scaffold0098 (2 HSPs)
scaffold0098 (316-586)||(45371-45642)
scaffold0098 (12-268)||(45115-45368)
[»] scaffold0148 (1 HSPs)
scaffold0148 (19-468)||(10595-11059)
[»] scaffold0176 (1 HSPs)
scaffold0176 (12-542)||(17126-17650)
[»] scaffold0066 (2 HSPs)
scaffold0066 (417-586)||(20656-20826)
scaffold0066 (135-216)||(20395-20476)
[»] scaffold0491 (2 HSPs)
scaffold0491 (380-586)||(11366-11572)
scaffold0491 (382-539)||(8942-9099)
[»] scaffold1805 (1 HSPs)
scaffold1805 (12-89)||(1268-1344)
[»] scaffold0078 (4 HSPs)
scaffold0078 (342-487)||(23731-23877)
scaffold0078 (166-236)||(23542-23612)
scaffold0078 (162-236)||(43264-43338)
scaffold0078 (12-61)||(43117-43166)
[»] scaffold0002 (1 HSPs)
scaffold0002 (417-586)||(434290-434460)
[»] scaffold1519 (1 HSPs)
scaffold1519 (471-586)||(664-779)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (417-582)||(114347-114517)
[»] scaffold0355 (1 HSPs)
scaffold0355 (152-236)||(9644-9726)
[»] scaffold0267 (1 HSPs)
scaffold0267 (156-220)||(265-329)
[»] scaffold0135 (1 HSPs)
scaffold0135 (152-236)||(35064-35146)
[»] scaffold0464 (1 HSPs)
scaffold0464 (152-221)||(364-432)
[»] scaffold0286 (2 HSPs)
scaffold0286 (454-539)||(22149-22233)
scaffold0286 (138-220)||(11660-11744)
[»] scaffold0197 (2 HSPs)
scaffold0197 (152-236)||(14311-14393)
scaffold0197 (152-213)||(19189-19249)
[»] scaffold0154 (1 HSPs)
scaffold0154 (156-220)||(11473-11537)
[»] scaffold0025 (1 HSPs)
scaffold0025 (156-220)||(69292-69356)
[»] scaffold0477 (1 HSPs)
scaffold0477 (402-467)||(5728-5794)
[»] scaffold0060 (1 HSPs)
scaffold0060 (379-440)||(33368-33429)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (152-221)||(181980-182048)
[»] scaffold0472 (1 HSPs)
scaffold0472 (156-220)||(6423-6487)
[»] scaffold0370 (1 HSPs)
scaffold0370 (156-220)||(1453-1517)
[»] scaffold0259 (1 HSPs)
scaffold0259 (152-236)||(2253-2335)
[»] scaffold0068 (1 HSPs)
scaffold0068 (156-220)||(29394-29458)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (152-236)||(148958-149040)
[»] scaffold1050 (1 HSPs)
scaffold1050 (156-226)||(3070-3141)
[»] scaffold0209 (1 HSPs)
scaffold0209 (156-225)||(16986-17056)
[»] scaffold0250 (1 HSPs)
scaffold0250 (156-220)||(3103-3167)
[»] scaffold0131 (1 HSPs)
scaffold0131 (156-220)||(14382-14446)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (156-220)||(41483-41547)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (156-220)||(79409-79473)
[»] scaffold0891 (1 HSPs)
scaffold0891 (156-203)||(4679-4726)
[»] scaffold0005 (3 HSPs)
scaffold0005 (156-203)||(183641-183688)
scaffold0005 (156-201)||(50257-50302)
scaffold0005 (156-201)||(52256-52301)
[»] scaffold0256 (1 HSPs)
scaffold0256 (156-209)||(16453-16507)
[»] scaffold0184 (2 HSPs)
scaffold0184 (162-236)||(29506-29580)
scaffold0184 (12-61)||(29678-29727)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (526-586)||(80851-80912)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 446; Significance: 0; HSPs: 202)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 446; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 33386890 - 33386318
Alignment:
Q  15 aaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaactaaaaacagacctagacttagtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagca 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||| |||| ||    
T  33386890 aaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaaacagacctagtct-agtgtagagcaacaccacaagtataaccaaaaca 33386792  T
Q  115 c-aaagataagcaatgaaagaaggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaat 213  Q
      ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  33386791 ataaagataagcaatgaaagaagaaacaaacacaccaaaagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaat 33386692  T
Q  214 ccactatgatgaaagtgttacaagaaaaatagtttgcaagcttacacaagaacaagacttaatttctacccatttgtgtttctcactctctcaataatga 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  33386691 ccactatgatgaaagtgttacaagaaaaatagtttgcaagcttacacaagaacaagtcctaatttctacccatttgtgtttcccactctctcaataatga 33386592  T
Q  314 accctaaagg-gaagacacaaaaggaagcttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaaatgtttacaatgtttctcaacccaagagatcctc 412  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33386591 accctaaaagagaagacacaaaaggaagcttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttctcaacccaagagatcctc 33386492  T
Q  413 actacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatccaagtttctctctcttcaagctctccttcaaaatctgcacaagaacacttaaataaca 512  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  33386491 actacaaagacactcaaccctaaagttctctcctttgtaatccaagtttctctctcttcaagctctactccaaaatctgcacaagaacacttaaatacca 33386392  T
Q  513 gtcttcagctgataaaatcgtgccacgttttccaaatcatgccacgattgatgcgtacgacccaaggtacgacc 586  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| || |||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  33386391 gtcttcagctgataaaatcgtgccacaatttccaaatcgtgtcacgattgatacgtacgacccaagatacgacc 33386318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 440; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 582
Target Start/End: Complemental strand, 27975173 - 27974599
Alignment:
Q  15 aaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaactaaaaacagacctagacttagtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagca 114  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  27975173 aaaggaagtgataatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacagc--aaaacagacctaatct-agtgtagagcaacaccacaagcataaataaagaa 27975077  T
Q  115 caaagataagcaatgaaagaaggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatc 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27975076 caaagataagcaatgaaagaaggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatc 27974977  T
Q  215 cactatgatgaaagtgttacaa----------gaaaaatagtttgcaagcttacacaagaacaagacttaatttctacccatttgtgtttctcactctct 304  Q
    ||||||||||||||||||||||          ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  27974976 cactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaaaatagcttgcaagcttacacaagaacaagacctaatttctacccatttgtgtttcccattctct 27974877  T
Q  305 caataatgaaccctaaagggaagacacaaaaggaagcttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaaatgtttacaatgtttctcaacccaag 404  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| | |||||||    
T  27974876 caataatgaaccctaaagagaagacacaaaaggaagcttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttcccgacccaag 27974777  T
Q  405 agatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatccaagtttctctctcttcaagctctccttcaaaatctgcacaagaacactt 504  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27974776 agatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatccaagtttctctctcttcaagctctccttcaaaatctgcacaagaacactt 27974677  T
Q  505 aaataacagtcttcagctgataaaatcgtgccacgttttccaaatcatgccacgattgatgcgtacgacccaaggtac 582  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  27974676 atataacagtcttcagctgataaaatcgtgccacaatttccaaatcatgtcacgattgatacgtacgacccaaggtac 27974599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 382; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 8370711 - 8370132
Alignment:
Q  15 aaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaactaaaaacagacctaga-cttagtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagc 113  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8370711 aaaggaagaggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaac-aaaaacagacctagatctaagtgtagagcaacaccacaagcataatcaaagc 8370613  T
Q  114 acaaagataagcaatgaaagaa-ggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaa 212  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8370612 acaaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaa 8370513  T
Q  213 tccactatgatgaaagtgttacaa-ga--------aaaatagtttgcaagcttacacaagaacaagacttaatttctacccatttgtgtttctcactctc 303  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||        ||| ||| ||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  | |||||||    
T  8370512 tccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaattagcttaaaagcttacacaagaacaagacataatttctacccatttgtgtcacccactctc 8370413  T
Q  304 tcaataatgaaccctaaagggaagacacaaaaggaagcttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaaatgtttacaatgtttctcaacccaa 403  Q
     ||||| |||| ||||| | ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  8370412 acaata-tgaatcctaa-gagaaaacacaaaaggaaacttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaagatgtttacaatgtttcccaacccaa 8370315  T
Q  404 gagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatccaagtttctctctcttcaagctctccttcaaaatctgcacaagaacact 503  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  8370314 gagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatccaagtttctctctcttcaagctcttcttcaaaatctgcacaagaacgct 8370215  T
Q  504 taaataacagtcttcagctgataaaatcgtgccacgttttccaaatcatgccacgattgatgcgtacgacccaaggtacgacc 586  Q
    || ||| |||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||| || |||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  8370214 tatatagcagtcttcagttgtcaaaatcgtgtcacgttttccaaatcgtgacacgattggtgcgtacaacccaaggtacgacc 8370132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 370; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 586
Target Start/End: Original strand, 16264216 - 16264792
Alignment:
Q  19 gaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaactaaaaacagacctaga-cttagtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagcacaa 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||  |||||| || |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  16264216 gaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagaaacaacaac-aaaaacaatcctagatctaagtgtagagcaacaccacaaacataatcaaagcacaa 16264314  T
Q  118 agataagcaatgaaagaa-ggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatcca 216  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16264315 agataaacaatgaaagaaaggaacaaacacacaaaaagattgttgacctagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 16264414  T
Q  217 ctatgatgaaagtgttacaa-ga--------aaaatagtttgcaagcttacacaagaacaagacttaatttctacccatttgtgtttctcactctctcaa 307  Q
    |||||||||||||||||||| ||        ||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||| | |||||||||||    
T  16264415 ctatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaaatagcttgcaagcttccacaagaacaagacctaatttctacacatttgtgttacccactctctcaa 16264514  T
Q  308 taatgaaccctaaagggaagacacaaaaggaagcttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaaatgtttacaatgtttctcaacccaagaga 407  Q
    | ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16264515 tgatgaaccctaa-gagaagacacaaaaggaagcttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga 16264613  T
Q  408 tcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatccaagtttctctctcttcaagctctccttcaaaatctgcacaagaacacttaaa 507  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  16264614 tcctcattacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatccaagtttctcttacttcaagctctccttcaaaaactgcacaagaacacttata 16264713  T
Q  508 taacagtcttcagctgataaaatcgtgccacgttttccaaatcatgccacgattgatgcgtacgacccaaggtacgacc 586  Q
    || |||||||||||||  ||||||||| |||| |||||||||| || |||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  16264714 tagcagtcttcagctgtcaaaatcgtgtcacgctttccaaatcgtggcacgattggtgcgtaccacccaaggtacgacc 16264792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 363; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 27986668 - 27986147
Alignment:
Q  15 aaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaactaaaaacagacctagacttagtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagca 114  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27986668 aaaggaagtggtaatctatgtgtaaagtgtcttcaagcaacaacaac-aaaaatagacctagtct-agtgtagagcaacaccacaagcatatacaaagca 27986571  T
Q  115 c-aaagataagcaatgaaagaaggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaat 213  Q
      |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27986570 ataaagataagcaa-gaaagaatgaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaat 27986472  T
Q  214 ccactatgatgaaagtgttacaagaaaaatagtttgcaagcttacacaagaacaagacttaatttctacccatttgtgtttctcactctctcaataatga 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |    
T  27986471 ccactatgatgaaagtgttacaagaaaaaaagcttgcaagcttacacaagaacaagacctaatttctacccatttgtgtttcccactctctcaat-atca 27986373  T
Q  314 accct-aaagggaagacacaaaaggaagcttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaaatgtttacaatgtttctcaacccaagagatcctc 412  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27986372 accctaaaagagaagacacaaaaggaagcttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagatcctc 27986273  T
Q  413 actacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatccaagtttctctctcttcaagctctccttcaaaatctgcacaagaacacttaaataaca 512  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |     
T  27986272 actacaaagacactcaaccctaaagttccctcctttgtaatccaagtttctctctcttccaactct-cttccaaatctgcacaagaacacttaaatacct 27986174  T
Q  513 gtcttcagctgataaaatcgtgccacg 539  Q
    |||||| || || ||||||||| ||||    
T  27986173 gtcttctgcggacaaaatcgtgtcacg 27986147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 348; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 588
Target Start/End: Original strand, 32143186 - 32143767
Alignment:
Q  15 aaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaactaaaaacagacctagacttagtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagca 114  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  32143186 aaaggaagtggtaatctatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaac-aaaaacagacctagtct-agtgtagagcaacaccacaagcaaatacaaagca 32143283  T
Q  115 c-aaagataagcaatgaaagaaggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaat 213  Q
      |||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  32143284 ataaagataagcaa-gaaaggaagaacaaacacaccaaaagattgttgacctagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaat 32143382  T
Q  214 ccactatgatgaaagtgttacaa----------gaaaaatagtttgcaagcttacacaagaacaagacttaatttctacccatttgtgtttctc-actct 302  Q
    |||||||||||||||||||||||          ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| | |||||    
T  32143383 ccactatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaaaatagcttgcaagcttacacaagaacaagacctagattctacccatttgtgtttccccactct 32143482  T
Q  303 ctcaataatgaaccctaaagg-gaagacacaaaaggaagcttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaaatgtttacaatgtttctcaaccc 401  Q
    ||||||| ||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||  ||||||    
T  32143483 ctcaata-tgaaccctaaaagagaagacacaagaggaagcttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgttttccaaccc 32143581  T
Q  402 aagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatccaagtttctctctcttcaagctctccttcaaaatctgcacaagaaca 501  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  32143582 aagagatcatcactacaaagacactcaaccctagagttccctcctttgtaatccaaatttctctctcttcaa-ctctcctccaaaatctgcacaagaaca 32143680  T
Q  502 cttaaataacagtcttcagctgataaaatcgtgccacgttttccaaatcatgccacgattgatgcgtacgacccaaggtacgacctg 588  Q
    ||||||||  |||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||| || |||||||||| |||||| | ||||||||||||||    
T  32143681 cttaaatacaagtcttcaactgataaaatcgtgtcacgatttccaaatcgtgtcacgattgatacgtacgtcacaaggtacgacctg 32143767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 12 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 30710018 - 30709439
Alignment:
Q  12 agcaaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaactaaaaacagacctaga-cttagtgtagagcaacaccacaagcataaacaa 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||||||||| |||||||| |||    
T  30710018 agcaaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaac-aaaaacagacctagatctaagtttagagcaacaccataagcataatcaa 30709920  T
Q  111 agcacaaagataagcaatgaaagaa-ggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctc 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  30709919 agcacaaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctc 30709820  T
Q  210 caatccactatgatgaaagtgttacaaga----------aaaatagtttgcaagcttacacaagaacaagacttaatttctacccat-ttgtgtttctca 298  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |          ||| ||| ||  |||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||  | ||    
T  30709819 caatccactatgatgaaattgttacaaaagagttacaagaaattagcttataagcttacacaagagcaagacctaatttctacccatcttgtgtcaccca 30709720  T
Q  299 ctctctcaataatgaaccctaaagggaagacacaaaaggaagct-tttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaaatgtttacaatgtttctca 397  Q
    | |||||||||||||| ||| ||| ||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||| |||||  ||||||||||||||| ||    
T  30709719 cactctcaataatgaatcct-aagagaaaacacaaaaggaagctatttgatcattccaatgatgaaatctcactccccaaggtgtttacaatgtttccca 30709621  T
Q  398 acccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatccaagtttctctctcttcaagctctccttcaaaatctgcacaag 497  Q
    |||||| ||||| ||        |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30709620 acccaaaagatcatc--------gacactcaactctaaagttacctcctttgtaatccaagtttctgtctcttcaagctctccttcaaaatctgcacaag 30709529  T
Q  498 aacacttaaataacagtcttcagctgataaaatcgtgccacg-ttttccaaatcatgccacgattgatgcgtacgacccaaggtacgacc 586  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  30709528 aacacttatatagcagtcttcagctgtcaaaatcgtgtcacgtttttccaaatcgtgacacgattggtgcgtacgacccaaggtaagacc 30709439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 307; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 12 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 40593010 - 40592424
Alignment:
Q  12 agcaaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaactaaaaacagacctaga-cttagtgtagagcaacaccacaagcataaacaa 110  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  40593010 agcaaaggaagtggtaatcaatggataaaatgtctccaagcaacaacaac-aaaaacagacctaaatctaagtgtagagcaacaccacaagcataatcaa 40592912  T
Q  111 agcacaa-agataagcaatgaaagaa--ggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctc 207  Q
    ||||  | ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||    
T  40592911 agcaatatagataagcaatgaaagaaaaggaacaaacacaccaa--gattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgtgggagagagaagctc 40592814  T
Q  208 tccaatccactatgatgaaagtgttacaaga----------aaaatagtttgcaagcttacacaagaacaagacttaatttctacccattt-gtgtttct 296  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |          ||| ||| || ||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||| ||||  |     
T  40592813 tccaatcgactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaagcttacacaagaacaaaatctaatttctacccattttgtgtcacc 40592714  T
Q  297 cactctctcaataatgaaccctaaagggaagacacaaaaggaagctttt-gatccttccaatggtgaaatctcactacccaaaatgtttacaatgtttct 395  Q
    ||||||| ||||| |||| ||||| | ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||     
T  40592713 cactctcacaata-tgaatcctaa-gagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttcc 40592616  T
Q  396 caacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatccaagtttctctctcttcaagctctccttcaaaatctgcaca 495  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  40592615 caacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatccaagtttctctctcttcaagctctcattcaaaatctgcaca 40592516  T
Q  496 agaacacttaaataacagtcttcagctgataaaatcgtgccacgttt-tccaaatcatgccacgattgatgcgtacgacccaaggtacgacc 586  Q
    |||||||||| ||| | |||||||||||  ||||||||| ||||||| |||||||| || |||||||| || |||||| |||||||||||||    
T  40592515 agaacacttatatagcggtcttcagctgtcaaaatcgtgtcacgtttgtccaaatcgtgacacgattggtgtgtacgatccaaggtacgacc 40592424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 15 - 586
Target Start/End: Original strand, 27452822 - 27453400
Alignment:
Q  15 aaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaacta---------aaaacagacctagacttagtgtagagcaacaccacaagcata 105  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |         ||||||||||||| || |||||||||||         |||||    
T  27452822 aaaggaagtggtaatctatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaacaacaacaacaaaaaacagacctagtct-agtgtagagca---------gcata 27452911  T
Q  106 aacaaagcac-aaagataagcaatgaaagaaggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcat 204  Q
     ||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  27452912 tacaaagcaataaagataagcaa-gaaagaaggaacaaacacaccaaaagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatccgggggagagagcag 27453010  T
Q  205 ctctccaatccactatgatgaaagtgttacaa----------gaaaaatagtttgcaagcttacacaagaacaagacttaatttctacccatttgtgttt 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||          ||||||||| ||||||||||||||||||||||  | || |||||||||||||||||||    
T  27453011 ctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaaaatagcttgcaagcttacacaagaacaattcctattttctacccatttgtgttt 27453110  T
Q  295 ctc-actctctcaataatgaaccctaaagg-gaagacacaaaaggaagcttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaaatgtttacaatgtt 392  Q
    | | |||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  27453111 ccccactctctcaata-tgaaccctaaaagagaagacacaaaaggaagcttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtt 27453209  T
Q  393 tctcaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatccaagtttctctctcttcaagctctccttcaaaatctgc 492  Q
    |  ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  27453210 tgccaacccaagagatcctcactac--agacactcaaccctaaagttccctcctttgtaatccaagtttctctctcttcaagctct-cttcaaaaactgc 27453306  T
Q  493 acaagaacacttaaataacagtcttcagctgataaaatcgtgccacgttttccaaatcatgccacgattgatgcgtacgacccaaggtacgacc 586  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  27453307 acaagaacacttaaaaactagtcttcaactgataaaatcgtgccacgatttccaaatcgtgtcacgattgatacgtacgtcacaaggtacgacc 27453400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 12 - 586
Target Start/End: Original strand, 36028965 - 36029537
Alignment:
Q  12 agcaaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaactaaaaacagacctaga-cttagtgtagagcaacaccacaagcataaacaa 110  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||       
T  36028965 agcaaatgaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaac-aaaaacagacctagatctaagtatagagcaacaccacaagcataaa--- 36029060  T
Q  111 agcacaaagataagcaatgaaagaa-ggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctc 209  Q
            ||||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  36029061 --------gataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccga--gattgttgacccagttctgtccaatatgacctaatctgggggagaaagcagctctc 36029150  T
Q  210 caatccactatgatgaaagtgttacaaga----------aaaatagtttgcaagcttacacaagaacaagacttaatttctacccattt-gtgtttctca 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |          ||| ||| || ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||  ||||    
T  36029151 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaaacttacacaagaacaagacctaatttctacccattttgtgtcactca 36029250  T
Q  299 ctctctcaataatgaaccctaaagggaagacacaaaaggaagcttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaaatgtttacaatgtttctcaa 398  Q
    |||||  |||| |||| ||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||    
T  36029251 ctctcaaaata-tgaatcctaa-gagaaaacacaaaaggaagcttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttcccaa 36029348  T
Q  399 cccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatccaagtttctctctcttcaagctctccttcaaaatctgcacaaga 498  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36029349 cccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaatttacctcctttgtaatccaagtttctcttacttcaagctctccttcaaaatctgcacaaga 36029448  T
Q  499 acacttaaataacagtcttcagctgataaaatcgtgccacg-ttttccaaatcatgccacgattgatgcgtacgacccaaggtacgacc 586  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||  ||||| ||| |||| ||||| ||| | || |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  36029449 acacttatatagcagtcttcagctgtcaaaattgtgtcacgtttttctaaaccgtgacacgattggtgcgtacgacccaaggtacgacc 36029537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 12 - 582
Target Start/End: Original strand, 48438074 - 48438655
Alignment:
Q  12 agcaaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaactaaaaacagacctaga-cttagtgtagagcaacaccacaagcataaacaa 110  Q
    |||||||||| |||||||||||   |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  48438074 agcaaaggaaatggtaatcaatagataaagtatctccaagcaacaacaac-aaaaacagacctagatctaagtgtagagcaacaccacaagcataatcaa 48438172  T
Q  111 agcac-aaagataagcaatgaaagaa-ggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctct 208  Q
    | ||  |||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||  |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  48438173 aacaataaagataaacaatgacagaaaggaacaaacacaccaa--gattattgacctagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccct 48438270  T
Q  209 ccaatccactatgatgaaagtgttacaaga----------aaaatagtttgcaagcttacacaagaacaagacttaatttctacccattt-gtgtttctc 297  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |          ||| |||  |  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||  | |    
T  48438271 ccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcatataagcttacacaagaacaagacctaatttctacccattttgtgtcaccc 48438370  T
Q  298 actctctcaataatgaaccctaaagggaagacacaaaaggaagctttt-gatccttccaatggtgaaatctcactacccaaaatgtttacaatgtttctc 396  Q
    || |||||||||||||| ||||| | ||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |    
T  48438371 acactctcaataatgaatcctaa-gagaaaacacaaaaggaagctttttgatcattccaatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttccc 48438469  T
Q  397 aacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatccaagtttctctctcttcaagctctccttcaaaatctgcacaa 496  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  48438470 aacc-aagagatccttactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatccaagtttctctctattcaagctctccttcaaaatttgcacaa 48438568  T
Q  497 gaacacttaaataacagtcttcagctgataaaatcgtgccacgttt-tccaaatcatgccacgattgatgcgtacgacccaaggtac 582  Q
    ||||||||| ||| |||||||| |||| |||||||||| ||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||| |||||||||    
T  48438569 gaacacttatatagcagtcttcggctgttaaaatcgtgtcacgtttgtccaaatcgtgacacgattggtgcgtacgatccaaggtac 48438655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 12 - 548
Target Start/End: Original strand, 35925342 - 35925885
Alignment:
Q  12 agcaaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaactaaaaacagacctaga-cttagtgtagagcaacaccacaagcataaacaa 110  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  35925342 agcaaagcaggtggtaatcaatgtgtaaaatgtctccaagtaacaacaac-aaaaacagacctagatctaagtgtagagcaacaccacaagcataatcaa 35925440  T
Q  111 agcacaaagataagcaatgaaagaag-gaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctc 209  Q
    | ||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| | |   |||  ||||    
T  35925441 aacacaaagatgagcaatgaaagaaaagaacaaacacaccaaaagattgttgacctagttcggtccaatatgacctaatttgggaggg---gcagttctc 35925537  T
Q  210 caatccactatgatgaaagtgttacaa-ga--------aaaatagtttgcaagcttacacaagaacaagacttaatttctacccatttgtgtttctcact 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||        ||| ||||||  |||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||  | ||||    
T  35925538 caatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaattagtttataagcttacactagaacaaaacctaatttctacccatttgtgtcacccact 35925637  T
Q  301 ctctcaataatgaaccctaaagggaagacacaaaaggaagcttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaaatgtttacaatgtttctcaacc 400  Q
    ||| ||||| |||| ||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||    
T  35925638 ctcacaata-tgaatcctaa-gagaaaacacaaaaggaagcttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttcccaacc 35925735  T
Q  401 caagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttac--ctcctttgtaatccaagtttctctctcttcaagctctccttcaaaatctgcacaaga 498  Q
    ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||| ||||||||||    
T  35925736 caaaagatcctcactacaaagacattcaaccctaaagttacatctcctttgtaatccaagtttctctcactttaagctcaccttcaaaaactgcacaaga 35925835  T
Q  499 acacttaaataacagtcttcagctgataaaatcgtgccacgttttccaaa 548  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||    
T  35925836 acacttatatagcagtcttcagctgtcaaaatcgtgtcacgttttccaaa 35925885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 37 - 516
Target Start/End: Original strand, 21711108 - 21711594
Alignment:
Q  37 taaagtgtctccaagcaacaacaactaaaaacagacctaga-cttagtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagcacaa-agataagcaatgaaaga 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |    ||||||||||||||| | |||||| |||||||  | |||||||||||||||||    
T  21711108 taaagtgtctccaagcaacaacaac-aaaaacagacctaaatcaccatgtagagcaacaccataggcataatcaaagcaatagagataagcaatgaaaga 21711206  T
Q  135 a-ggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactatgatgaaagtgtta 233  Q
    | ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21711207 aaggaacaaacacaccaa--gattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctcaaatccactatgatgaaagtgtta 21711304  T
Q  234 caa-ga--------aaaatagtttgcaagcttacacaagaacaagacttaatttctacccatttgtgtttctcactctctcaataatgaaccctaaaggg 324  Q
    ||| ||        ||| ||| ||  |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||| ||||| | |    
T  21711305 caaagagttacaagaaattagcttaaaagcttacacaagagcaagacctaatttctacccatttgtgttacccacactctcaataatgaatcctaa-gag 21711403  T
Q  325 aagacacaaaaggaagcttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaaatgtttacaatgtttctcaacccaagagatcctcactacaaagaca 424  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21711404 aaaacacaaaaggaagcttttgatccttccaatggtgaaatctcactactcaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagatcctcactacaaagaca 21711503  T
Q  425 ctcaaccctaaagttacctcctttgtaatccaagtttctctctcttcaagctctccttcaaaatctgcacaagaacacttaaataacagtct 516  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  21711504 ctcaaccctaaagttacctcctttgtaatccaagtttctctctcttcaagctct-cttcaaaatctgcacaagaacacttacatagcagtct 21711594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 19 - 561
Target Start/End: Original strand, 1305818 - 1306378
Alignment:
Q  19 gaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaactaaaaacagacctagacttagtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagca-caa 117  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| | |||||||| | |    
T  1305818 gaagtggtaatctatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaac-aaaaacagccctagtct-agtgtagagcaacaccacaagcaaatacaaagcaacca 1305915  T
Q  118 agataagcaatgaaagaaggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccac 217  Q
    |||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||||| |||| |||||||||||||    
T  1305916 agataagcaa-gaaaggaagaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctaggggagatagcagctctccaatccac 1306013  T
Q  218 tatgatgaaagtgttacaa----------gaaaaatagtttgcaagcttacacaagaacaagacttaatttctacccatttgtgtttctc-actctctca 306  Q
    || ||||||||||||||||          ||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  1306014 tacgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaaaatagtttgcaagcttacacaagaacaagtcatagtttctacccatttgtgtttccccactctctca 1306113  T
Q  307 ataatgaaccctaaagg-gaagacacaaaaggaagcttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaaatgtttacaatgtttctc--aacccaa 403  Q
    ||| ||||||||||| | |||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||  |||||||    
T  1306114 ata-tgaaccctaaaagagaagacacaagaggaagcttaagatccttccaatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttttcccaacccaa 1306212  T
Q  404 gagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatccaagtttctctctc--------ttcaagctctccttcaaaatctgcaca 495  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||        | ||||||||||| ||||| |||||||    
T  1306213 gagatcctcactacaaagacactcaactctagagttccctcctttataatccaagtttctctctctaagctcttccaagctctcctccaaaaactgcaca 1306312  T
Q  496 agaacacttaaataacagtcttcagctgataaaatcgtgccacgttttccaaatcatgccacgatt 561  Q
    ||||||||||||||  |||||||  |||||||||||||| |||| ||||||| || || |||||||    
T  1306313 agaacacttaaatactagtcttccactgataaaatcgtgtcacgatttccaagtcgtgtcacgatt 1306378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 82 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 26928757 - 26928290
Alignment:
Q  82 gtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagcac-aaagataagcaatgaaagaaggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatat 180  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||  |||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  26928757 gtgtagagcaacaccacaagcaaatacaaagcaataaagataagcta-gaaagaaagaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcag-ccaatat 26928660  T
Q  181 gacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactatgatgaaagtgttacaag-----------aaaaatagtttgcaagcttacacaagaacaag 269  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||            |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26928659 gacctaatctgggggagagagcaactctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaaaaatagcttgcaagcttacacaagaacaag 26928560  T
Q  270 acttaatttctacccatttgtgtttctc-actctctcaataatgaaccctaaagg-gaagacacaaaaggaagcttttgatccttccaatggtgaaatct 367  Q
    || ||  ||||||||||||||||||| | |||||| ||||| ||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26928559 acctagattctacccatttgtgtttccccactctcacaata-tgaaccctaaaagagaagacacaagaggaagcttttgatccttccaatggtgaaatct 26928461  T
Q  368 cactacccaaaatgtttacaatgtttctcaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatccaagtttctctct 467  Q
    || |||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||| |||||    
T  26928460 cattacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctagagttccctcgtttgtaatccaagtttttctct 26928361  T
Q  468 cttcaagctctccttcaaaatctgcacaagaacacttaaataacagtcttcagctgataaaatcgtgccacg 539  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  26928360 cttcaa-ctctcctccaaaatctgcacaagaacacttaaatacaagtcttcaactgataaaatcgtgtcacg 26928290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 97 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 1736447 - 1735946
Alignment:
Q  97 acaagcataaacaaagcac-aaagataagcaatgaaagaa-ggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggg 194  Q
    |||||||||| |||||||  ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1736447 acaagcataatcaaagcaataaacataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaata--ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggg 1736350  T
Q  195 gagagagcatctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaga----------aaaatagtttgcaagcttacacaagaacaagacttaatttctaccc 284  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |          ||| ||  ||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1736349 gagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattaacttataagcttacacaagaacaagacctaatttctaccc 1736250  T
Q  285 attt-gtgtttctcactctctcaataatgaaccctaaagggaagacacaaaaggaagctttt-gatccttccaatggtgaaatctcactacccaaaatgt 382  Q
    |||| ||||  |  || |||||||||||||| ||||| | ||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  1736249 attttgtgtcaccaacactctcaataatgaatcctaa-gagaaaacacaaaaagaagctttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaggtgt 1736151  T
Q  383 ttacaatgtttctcaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatccaagtttctctctcttcaagctctcctt 482  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  1736150 ttacaatgtttcccaacccaatagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatccaagtttctctctctccaaactctcctt 1736051  T
Q  483 caaaatctgcacaagaacacttaaataacagtcttcagctgataaaatcgtgccacgttt-tccaaatcatgccacgattgatgcgtacgacccaaggta 581  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||| |||||||| || |||||||| ||||||| ||||||||||    
T  1736050 caaaatctgcataagaacacttatatagcagtcttcagctgtcaaaatcgtgtcacgtttgtccaaatcgtgacacgattggtgcgtacaacccaaggta 1735951  T
Q  582 cgacc 586  Q
    |||||    
T  1735950 cgacc 1735946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 12 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 24695390 - 24694808
Alignment:
Q  12 agcaaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaactaaaaacagacctaga-cttagtgtagagcaacaccacaagcataaacaa 110  Q
    ||||||||||||||||||||||   |||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| ||| | || ||| ||||||||||| |||||||||| |||    
T  24695390 agcaaaggaagtggtaatcaatagataaaatgtcttcaagcaacaacaac-aaaaacagagctaaatctaagtatagagcaacac-acaagcataatcaa 24695293  T
Q  111 agcac-aaagataagcaatgaaagaag-gaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctct 208  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||  |||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| | ||    
T  24695292 agcaataaagataaacaatgaaagaaatgaacaaacacaccaa--gattgttgacctagttcggtccaatatgacctaatctacgggagagagcaaccct 24695195  T
Q  209 ccaatccactatgatgaaagtgttacaaga----------aaaatagtttgcaagcttacacaagaacaagacttaatttctacccattt-gtgtttctc 297  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||| |          ||| ||| ||  || |||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||  | |    
T  24695194 ctaatccgctatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttataaacttacaaaagaacaagacctaatttctacccattttgtgtcaccc 24695095  T
Q  298 actctctcaataatgaaccctaaagggaagacacaaaaggaagctttt-gatccttccaatggtgaaatctcactacccaaaatgtttacaatgtttctc 396  Q
    || ||||||||   ||| |||||| | || |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| |    
T  24695094 acactctcaat---gaatcctaaaagaaa-acacaaaaggaagctttttgatcattccaatggtgaaatctcaccacccaaggtgtttacaatgtttccc 24694999  T
Q  397 aacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatccaagtttctctctcttcaagctctccttcaaaatctgcacaa 496  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24694998 aacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatccaaatttctctctcttcaagctcttcttcaaaatctgcacaa 24694899  T
Q  497 gaacacttaaataacagtcttcagctgataaaatcgtgccacgttt-tccaaatcatgccacgattgatgcgtacgacccaaggtacgacc 586  Q
    ||||||||| ||| |||||||||| ||  |||||||||  |||||| |||||||| || |||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  24694898 gaacacttatatagcagtcttcagttgtcaaaatcgtgttacgtttgtccaaatcgtgacacgattggtgcgtacaacccaaggtacgacc 24694808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 12 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 6794939 - 6794451
Alignment:
Q  12 agcaaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaactaaaaacagacctaga-cttagtgtagagcaacaccacaagcataaacaa 110  Q
    ||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| | || ||||||||| | || ||||||||||| |||    
T  6794939 agcaaaggaagtggtaatcaatagaaaaagtgtctccaagcaacaacaac--aaaacagacctaaatctaagtgtagagtagcatcacaagcataatcaa 6794842  T
Q  111 agcacaa-agataagcaatgaaagaa-ggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctct 208  Q
    ||||  | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  6794841 agcaatagagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaa--gattgttgacccggttaggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctct 6794744  T
Q  209 ccaatccactatgatgaaagtgttacaa----------gaaaaatagtttgcaagcttacacaagaacaagacttaatttctacccatttgtgtttctca 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||          ||||| ||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||  | ||    
T  6794743 ccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaaattagcttgcaagcttacacaagaacaagtcctaatttctacccatttgtgtcaccca 6794644  T
Q  299 ctctctcaataatgaaccctaaagggaagacacaaaaggaagcttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaaatgtttacaatgtttctcaa 398  Q
    ||||| ||||| |||||||||| | ||| | ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||    
T  6794643 ctctcacaata-tgaaccctaa-gagaaaatacaaaaggaagcttttgttcattccaatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttcccaa 6794546  T
Q  399 cccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatccaagtttctctctcttcaagctctccttcaaaatctgca 493  Q
    | ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||    
T  6794545 ctcaagagaacctcactacaatgacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatccaagtttctctctctaaaacctctccttcaaaatctgca 6794451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 230 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 39032551 - 39032198
Alignment:
Q  230 gttacaagaaaaatagtttgcaagcttacacaagaacaagacttaatttctacccatttgtgtttctcactctctcaataatgaaccctaaagggaagac 329  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| |||||  ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||    
T  39032551 gttacaagaaaa-tagcttgcaagcttacgcaagagcaagatctaatttctatccatttatgtttctcactctctcaatgatgaaccctaa-gagaagac 39032454  T
Q  330 acaaaaggaagcttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaaatgtttacaatgtttctcaacccaagagatcctcactacaaagacactcaa 429  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  39032453 acaaaaggaagcttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttaccaacccaagagatc-tcactacaaagacactcaa 39032355  T
Q  430 ccctaaagttacctcctttgtaatccaagtttctctctcttcaagctctccttcaaaatctgcacaagaacacttaaataacagtcttcagctgataaaa 529  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||| || ||||||||||  ||||    
T  39032354 ccctaaagttacctcctttgtaatccaagtttctctctcttcaagctctacttcaaaaactgcacaagaacacttatatagcaatcttcagctgtcaaaa 39032255  T
Q  530 tcgtgccacgttttccaaatcatgccacgattgatgcgtacgacccaaggtacgacc 586  Q
    ||||| |||| ||| |||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  39032254 tcgtgtcacgattttcaaatcgtggcacgattggtgcgtacgacccaaggtacgacc 39032198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 19 - 586
Target Start/End: Original strand, 40844519 - 40845097
Alignment:
Q  19 gaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaactaaaaacagacctaga-cttagtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagcac-a 116  Q
    |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | || ||||||||||||||| |||||||||| |||||||  |    
T  40844519 gaagtggtaatcaatagataaagtgtctccaagcaacaacaac-aaaaacaaacctaaatctaagtgtagagcaacactacaagcataatcaaagcaata 40844617  T
Q  117 aagataagcaatgaaagaag-gaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatcc 215  Q
    |||||||||||||||||||  |||| ||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| |||||    
T  40844618 aagataagcaatgaaagaaatgaacgaacacaccaa--gattgttgattcagttcggtccaatatgacctaatctgggg-agagagcagccctcaaatcc 40844714  T
Q  216 actatgatgaaagtgttacaaga----------aaaatagtttgcaagcttacacaagaacaagacttaatttctacccattt-gtgtttctcactctct 304  Q
    ||||||||||||||||||||| |          ||| ||| ||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||  | ||| ||||    
T  40844715 actatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttataagcttacacaagaacaagacctaatttctacccattttgtgtcacccacactct 40844814  T
Q  305 caataatgaaccctaaagggaagacacaaaaggaagctttt-gatccttccaatggtga-----aatctcactacccaaaatgtttacaatgtttctcaa 398  Q
    ||||   ||| ||||| | ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |     ||||||| ||| |||  |||||||||||||||||||    
T  40844815 caat---gaatcctaa-gagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtcaggtcaaatctcattactcaaggtgtttacaatgtttctcaa 40844910  T
Q  399 cccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatccaagtttctctctcttcaagctctccttcaaaatctgcacaaga 498  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| || |||||||||||||| |||||||||    
T  40844911 cccaatagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatctaagtttctctatcttaaaactctccttcaaaatttgcacaaga 40845010  T
Q  499 acacttaaataacagtcttcagctgataaaatcgtgccacgttt-tccaaatcatgccacgattgatgcgtacgacccaaggtacgacc 586  Q
    ||||||  ||| ||||||||||||    |||| ||| ||||||| |||||||| || |||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  40845011 acactt--atagcagtcttcagctatctaaattgtgtcacgtttgtccaaatcgtgacacgattggtgcgtacaacccaaggtacgacc 40845097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 137 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 47924006 - 47923546
Alignment:
Q  137 gaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactatgatgaaagtgttacaa 236  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| | || ||||| ||||||||||||||| |||||    
T  47924006 gaacaaacacaccaa--gattgttgacccagttcgatccaatatgacctaatctaggggagagagcagcccttcaatctactatgatgaaagtgctacaa 47923909  T
Q  237 ga----------aaaatagtttgcaagcttacacaa-gaacaagacttaatttctacccattt-gtgtttctcactctctcaataatgaaccctaaaggg 324  Q
     |          ||| ||| ||  ||| |||||||| || ||| || |||||| ||||||||| ||||    ||| |||||||||||||| ||||  | |    
T  47923908 aagagttacaagaaattagcttaaaagtttacacaaagagcaaaacctaatttatacccattttgtgtcatccacactctcaataatgaatcctac-gag 47923810  T
Q  325 aagacacaaaaggaagctttt-gatccttccaatggtgaaatctcactacccaaaatgtttacaatgtttctcaacccaagagatcctcactacaaagac 423  Q
    || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  47923809 aaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagattctcactacaaagac 47923710  T
Q  424 actcaaccctaaagttacctcctttgtaatccaagtttctctctcttcaagctctccttcaaaatctgcacaagaacacttaaataacagtcttcagctg 523  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||| ||    
T  47923709 actcaatcctaaagttacctcctttgtaatccaagtttctctctcttcaagctctccttcaaaatctgcacaagaacacttatatagcactcttcagttg 47923610  T
Q  524 ataaaatcgtgccacgttt-tccaaatcatgccacgattgatgcgtacgacccaaggtacgacc 586  Q
      ||||||||| ||||||| |||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  47923609 tcaaaatcgtgtcacgtttgtccaaatcgtgacacgattgatgcgtacaacccaaggtacgacc 47923546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 15 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 3716226 - 3715760
Alignment:
Q  15 aaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaactaaaaacagacctaga-cttagtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagc 113  Q
    |||||||||||||||||||   |||||||||| |||||||||||||| |||||||||| || | || |||||||||||||||||||||||||| || | |    
T  3716226 aaaggaagtggtaatcaatagataaagtgtctacaagcaacaacaac-aaaaacagacataaatctaagtgtagagcaacaccacaagcataatcacaac 3716128  T
Q  114 ac-aaagataagcaatgaaaga-aggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctcca 211  Q
    |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||    
T  3716127 aataaagataagcaatgaaagagaggaacaaacacaccaa--gattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctaggagagagagcagctctcca 3716030  T
Q  212 atccactatgatgaaagtgttacaaga----------aaaatagtttgcaagcttacacaagaacaagacttaatttctaccca-tttgtgtttctcact 300  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| |          ||| ||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  | ||||    
T  3716029 atctactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaaacttacacaagaacaagacttaatttctacccattttgtgtcacccact 3715930  T
Q  301 ctctcaataatgaaccctaaagggaagacacaaaaggaagc-ttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaaatgtttacaatgtttctcaac 399  Q
     || |||| ||||| ||| ||| ||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||    
T  3715929 ttcacaat-atgaatcct-aagagaaaacacaaaagaaagctttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttcccaac 3715832  T
Q  400 c--caagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatc-caagtttctctctc 468  Q
    |  ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  3715831 cctcaagagaacctcactacaaagacattcaaccctaaagttacctcctttgtattctcaagtttctctctc 3715760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 14 - 484
Target Start/End: Original strand, 26298844 - 26299329
Alignment:
Q  14 caaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaacta-----aaaacagacctaga-cttagtgtagagcaacaccacaagcataaa 107  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||| |     |||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||     
T  26298844 caaaggaagtggtaatcaatggataaagtgtctccaaacaacaacaacaacaacaaaaacagacctaaatctaagtgtagagcaacaccacaagcataat 26298943  T
Q  108 caaagcac-aaagataagcaatgaaaga-aggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatc 205  Q
    |||||||  |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  26298944 caaagcaataaagataagcaacgaaagagaggaacaaacacaccaa--gattgttgacccagttcggttcaatatgacataatctgggggagagagcagc 26299041  T
Q  206 tctccaatccactatgatgaaagtgttacaaga----------aaaatagtttgcaagcttacacaagaacaagacttaatttctacccattt-gtgttt 294  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||| |          ||| ||| ||  || |||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||      
T  26299042 cctccaatctactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttataaacttagacaagaacaagacctaatttctacccattttgtgtca 26299141  T
Q  295 ctcactctctcaataatgaaccctaaagggaagacacaaaa-ggaagctttt-gatccttccaatggtgaaatctcactacccaaaatgtttacaatgtt 392  Q
    | |||  ||||||| |   | ||||| | ||| |||||||| |||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  26299142 cccacaatctcaatta---atcctaa-gagaaaacacaaaaaggaagctttttgataattccaatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtt 26299237  T
Q  393 tctcaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatccaagtttctctctcttcaagctctccttca 484  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  26299238 tcccaacccaagagatcctcactacaaagacattcaaccctaaagttacctcctttataatccaagtttctctctctaaaagctctccttca 26299329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 14 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 39040216 - 39039995
Alignment:
Q  14 caaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaactaaaaacagacctagacttagtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagc 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39040216 caaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaac--aaaacagacctagacttagtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagc 39040119  T
Q  114 acaaagataagcaatgaaagaa-ggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaa 212  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||    
T  39040118 acaaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaaagattgttgacctagttcggtccaatatgacctaatctggggaagagaacaactctccaa 39040019  T
Q  213 tccactatgatgaaagtgttacaa 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  39040018 tccactatgatgaaagtgttacaa 39039995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 177; E-Value: 4e-95
Query Start/End: Original strand, 12 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 1417716 - 1417251
Alignment:
Q  12 agcaaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaactaaaaacagacctaga-cttagtgtagagcaacaccacaagcataaacaa 110  Q
    ||||||||||||||||||||||   |||||||||| ||||||||||||||  |||||| || || | || ||||||||| |||| ||||||||||| |||    
T  1417716 agcaaaggaagtggtaatcaatagataaagtgtcttcaagcaacaacaac--aaaacatacataaatctaagtgtagagtaacatcacaagcataatcaa 1417619  T
Q  111 agcac-aaagataagcaatgaaaga-aggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctct 208  Q
    ||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  1417618 agcaataaagataagcaatgaaagagaggaacaaacacaccaa--gattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatccct 1417521  T
Q  209 ccaatccactatgatgaaagtgttacaa-ga--------aaaatagtttgcaagcttacacaagaacaagacttaatttctacccatttgt-gtttctca 298  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||| ||        ||| ||| ||  || |||||| ||||||||| | |||||||||||||||| |  | || |     
T  1417520 ccaatccactaagaagaaagtgttacaatgagttataagaaattagcttataaacttacaaaagaacaagtcctaatttctacccatttttcatatcacc 1417421  T
Q  299 ctctctcaataatgaaccctaaagggaagacacaaaaggaagc-ttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaaatgtttacaatgtttctca 397  Q
    | | |||   |||||| ||| ||| ||| ||||||||| || | ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||    
T  1417420 cacactc-ccaatgaatcct-aagagaaaacacaaaagaaaactttttgatcctttcaatggtgaaatctcactacctaaagtgtttacaatgtttccca 1417323  T
Q  398 acccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatccaagtttctctctct 469  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  1417322 acccaagataacctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaattcaagtttttctctct 1417251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 339 - 586
Target Start/End: Original strand, 37725871 - 37726118
Alignment:
Q  339 agcttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaaatgtttacaatgtttctcaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagt 438  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||  |||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37725871 agcttttgatcctttcaatggtgaaatctcactatccaaggtgtttataatgtttccccacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagt 37725970  T
Q  439 tacctcctttgtaatccaagtttctctctcttcaagctctccttcaaaatctgcacaagaacacttaaataacagtcttcagctgataaaatcgtgccac 538  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||| ||| |||| | |||||||||||||||||||||    
T  37725971 ttcctcctttgtaatccaagtttctctctcttcaagctcacttccaaaatctgcacaagaacacttatatagcagtttgcagctgataaaatcgtgccac 37726070  T
Q  539 gttttccaaatcatgccacgattgatgcgtacgacccaaggtacgacc 586  Q
    |||||||||||| || |||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  37726071 gttttccaaatcgtgtcacgattgatacgtacgacccaatgtacgacc 37726118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 162; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 34 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 3328561 - 3328107
Alignment:
Q  34 gtgtaaagtgtctccaagcaacaacaactaaaaacagacctaga-cttagtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagcac-aaagataagcaatgaa 131  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||    
T  3328561 gtgtaaagtgtctccaagaaacaacaac-aaaaacagacctaaatctaagtgtagagcaacaccacaagcataatcaaaacaataaagataagcaatgaa 3328463  T
Q  132 aga-aggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactatgatgaaagtg 230  Q
    ||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||  |||||||||||||||||| | |||||||||| | || |||||||||| ||||||||||    
T  3328462 agagaggaacaaacacaccaa--gattgttgacccagttcattccaatatgacctaatctagaggagagagcagcccttcaatccactaagatgaaagtg 3328365  T
Q  231 ttacaa-ga--------aaaatagtttgcaagcttacacaagaacaagacttaatttctacccattt---gtgtttctcactctctcaataatgaaccct 318  Q
    |||||| ||        ||| ||| ||  ||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||    | |  | ||| |||||   |||| | |||    
T  3328364 ttacaatgagttacaagaaattagcttataagcttacaaaagaacaagtcctaatttctacccatttttcatatcacccacactctc---aatgtatcct 3328268  T
Q  319 aaagggaagacacaaaaggaag-cttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaaatgtttacaatgtttctcaacccaagagatcctcactac 417  Q
     ||| ||| |||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||    
T  3328267 -aagagaaaacacaaaaggaagttttttgatccttccaatgctgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgttttccaacccaagagaagctcactac 3328169  T
Q  418 aaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatccaagtttctctctcttcaagctctc 479  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  3328168 aaagacattcaaccctaaagttatctcctttctaatccaagtttctctctctaaaagctctc 3328107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 160; E-Value: 6e-85
Query Start/End: Original strand, 81 - 468
Target Start/End: Original strand, 25795709 - 25796108
Alignment:
Q  81 agtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagcac-aaagataagcaatgaaagaag-gaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaat 178  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||  ||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  25795709 agtgtagagcaacaccacaagcataataaaaacaataaaaataagcaatgaaagaaatgaacaaacacaccaaa-gattgttgacctagttcggtccaat 25795807  T
Q  179 atgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactatgatgaaagtgttac--aaga--------aaaatagtttgcaagcttacacaagaacaa 268  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||  ||||        ||| ||| ||  ||||||||| ||||||||    
T  25795808 atgacctaatctgggggagagagcagctctccaatctactaagatgaaagtgttacgaaagagttacaagaaattagcttataagcttacaaaagaacaa 25795907  T
Q  269 gacttaatttctacccattt-gtgtttctcactctctcaataatgaaccctaaagggaagacacaaaaggaagctttt-gatccttccaatggtgaaatc 366  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||  | ||| ||||||||   ||| ||||| | ||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25795908 gacctaatttctacccattttgtgtcacccacactctcaat---gaatcctaa-gagaaaacataaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatc 25796003  T
Q  367 tcactacccaaaatgtttacaatgtttctcaacc--caagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaat-ccaagtttct 463  Q
    |||||||||||  |||||||| |||||| |||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  25796004 tcactacccaaggtgtttacattgtttcccaaccctcaagagagcctcactacaaagacactcaaccctcaagttacctcctttgtattcccaagtttct 25796103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 158; E-Value: 9e-84
Query Start/End: Original strand, 12 - 490
Target Start/End: Original strand, 37466151 - 37466642
Alignment:
Q  12 agcaaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaactaaaaacagacctaga-cttagtgtagagcaacaccacaagcataaacaa 110  Q
    |||||||||| ||||||||||||  | ||||||||||||  || || ||  |||||||||| |  | || ||||||||||||||  |||||||||| |||    
T  37466151 agcaaaggaaatggtaatcaatggattaagtgtctccaaaaaaaaaaaaa-aaaaacagacattaatctaagtgtagagcaacattacaagcataatcaa 37466249  T
Q  111 agcac-aaagataagcaatgaaagaag-gaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctct 208  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||    
T  37466250 agcaataaagataagcaatgaaagaaatgaacaaacacaccaa--gattgttgacacagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagtagccct 37466347  T
Q  209 ccaatccactatgatgaaagtgttacaa-ga--------aaaatagtttgcaagcttacacaagaacaagacttaatttctacccatttgtgttt---ct 296  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||        ||| || |||  ||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||| |  |    ||    
T  37466348 ccaatccactaagatgaaagtgttacaatgagttacaagaaattaatttataagcttacaaaagaacaagtcctaatttctacccatttttcatatcact 37466447  T
Q  297 cactctctcaat-aatgaaccctaaagggaagacacaaaaggaagctttt-gatccttccaatggtgaaatctcactacccaaaatgtttacaatgtttc 394  Q
    ||| | | |  | |||||| ||||||   || |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  37466448 cacccgcactctcaatgaatcctaaaataaa-acacaaaaggaagcttttcgatctttccaatggtgaaatctcacaacccaaagtgtttacaatgtttc 37466546  T
Q  395 tcaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatccaagtttctctctcttcaagctctccttcaaaatct 490  Q
     ||||| |||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||| |||||||||||    
T  37466547 ccaacctaagagaacctcactacaaagacactcagctctaaagttacctcctttgtaatccaagtttctctctctaaaacctcttcttcaaaatct 37466642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 362 - 586
Target Start/End: Original strand, 27026925 - 27027149
Alignment:
Q  362 aaatctcactacccaaaatgtttacaatgtttctcaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatccaagttt 461  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||| | | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27026925 aaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttccctatccaagagatcctcagtacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatccaagttt 27027024  T
Q  462 ctctctcttcaagctctccttcaaaatctgcacaagaacacttaaataacagtcttcagctgataaaatcgtgccacgttttccaaatcatgccacgatt 561  Q
     |||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||| | || |||||||    
T  27027025 ttctctcttcaagctcttcttcaaaatctgcacaagattacttatatagcagtcttcagctgtcaaaatcgtgtcacgttttccaaaacgtggcacgatt 27027124  T
Q  562 gatgcgtacgacccaaggtacgacc 586  Q
    | |||||||||||||||||||||||    
T  27027125 ggtgcgtacgacccaaggtacgacc 27027149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 81 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 18553041 - 18552720
Alignment:
Q  81 agtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagcac-aaagataagcaatgaaagaa-ggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaat 178  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||  |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  18553041 agtgtagagcaacaccacaaacataatcaaagcaataaagataatcaatgaaagaaaggaacaaatacaccaa--gattgttgacccagttcggtccaat 18552944  T
Q  179 atgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaga----------aaaatagtttgcaagcttacacaagaacaa 268  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |          ||| ||| ||  ||||||||||||||||||    
T  18552943 atgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttataagcttacacaagaacaa 18552844  T
Q  269 gacttaatttctaccca-tttgtgtttctcactctctcaataatgaaccctaaagggaagacacaaaaggaag-cttttgatccttccaatggtgaaatc 366  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||  | ||| |||||   |||||| ||| ||| ||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  18552843 gacctaatttctacccattttgtgtcacccacactctc---aatgaatcct-aagagaaaacacaaaaggaagttttttgatccttccaatggtgaaatc 18552748  T
Q  367 tcactacccaaaatgtttacaatgtttc 394  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||    
T  18552747 tcactacccaaggtgtttacaatgtttc 18552720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 135; E-Value: 5e-70
Query Start/End: Original strand, 251 - 586
Target Start/End: Original strand, 8126739 - 8127074
Alignment:
Q  251 aagcttacacaagaacaagacttaatttctacccatttgtgtttctc--actctctcaataatgaaccctaaagggaagacacaaaaggaagctttt-ga 347  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||| || |  || ||||||||   ||| | ||| | ||| |||||||| ||||||||| ||    
T  8126739 aagcttacaaaagaacaatacttaatttctacccatttttgtgtcacccacactctcaat---gaatcttaa-gagaaaacacaaaaagaagctttttga 8126834  T
Q  348 tccttccaatggtgaaatctcactacccaaaatgtttacaatgtttctcaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctt 447  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||  ||||||||| | |||    
T  8126835 tccttccaatgatgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaaaacctcactacaaagacactcaactgtaaagttactttctt 8126934  T
Q  448 tgtaatccaagtttctctctcttcaagctctccttcaaaatctgcacaagaacacttaaataacagtcttcagctgataaaatcgtgccacgttt-tcca 546  Q
    ||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||| |  |||||||| ||| ||||||||| |||  ||||||||| ||||||| ||||    
T  8126935 tgtaatccaagtttctctctctaaaaactctccttcaaaatctgcaaataaacacttatatagcagtcttcaactgtcaaaatcgtgtcacgtttgtcca 8127034  T
Q  547 aatcatgccacgattgatgcgtacgacccaaggtacgacc 586  Q
    |||| || |||| ||| || |||||||||||| |||||||    
T  8127035 aatcgtgacacggttggtgtgtacgacccaagatacgacc 8127074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 128; E-Value: 7e-66
Query Start/End: Original strand, 47 - 469
Target Start/End: Original strand, 8477258 - 8477697
Alignment:
Q  47 ccaagcaacaacaactaaaaacagacctagacttagtgtagagcaacaccacaagcataa-acaaagcaca-aagataagcaatgaaagaaggaacaaac 144  Q
    ||||||||||||||| |||| ||| |||||||| |||||||| |||||||||||  |||| |||||||| | ||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  8477258 ccaagcaacaacaac-aaaaccagccctagact-agtgtagaacaacaccacaaagataatacaaagcaaacaagataagcaa-gaaagaaagaacaaac 8477354  T
Q  145 acaccaa-aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactatgatgaaagt----------gtta 233  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||          ||||    
T  8477355 acaccaagaagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggtta 8477453  T
Q  234 caagaaa-aatagtttgcaagcttacacaa-gaacaagacttaatttctacccatttgtgttt--ctcactctctcaataatgaaccct-aaagggaaga 328  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||  |||||||| ||  |||||||| || ||||||  | ||||||| |||| ||||||||| |||| |||||    
T  8477454 caagaaacaatagcttgcaagcttacacaataaacaagacctagattctaccctttggtgtttcccccactctcacaat-atgaaccctaaaagagaaga 8477552  T
Q  329 cacaaaaggaagcttttgatccttccaa-tggtgaaat-ctcactacccaaaatgtttacaatg--tttctcaacccaagagatcctcactacaaagaca 424  Q
    ||| | |||||||||| ||||||||||| |  |||| | ||||||||||||  || ||||||||  |||| ||||||||||||  ||| |||||||||||    
T  8477553 cactagaggaagctttagatccttccaactaatgaactcctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctctacaaagaca 8477652  T
Q  425 ctcaaccctaaagttacctcctttgtaatccaagtttctctctct 469  Q
    |||||||||   ||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8477653 ctcaaccctttggttccctcctctgtaatccaagtttctctctct 8477697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 362 - 586
Target Start/End: Original strand, 27038270 - 27038485
Alignment:
Q  362 aaatctcactacccaaaatgtttacaatgtttctcaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatccaagttt 461  Q
    ||||||||| ||||||  ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27038270 aaatctcaccacccaaggtgtttacaatgtttccctacccaagagatcctcactacaaaggcactcaaccctaaagttatctcctttgtaatccaagttt 27038369  T
Q  462 ctctctcttcaagctctccttcaaaatctgcacaagaacacttaaataacagtcttcagctgataaaatcgtgccacgttttccaaatcatgccacgatt 561  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||          || |||||||    
T  27038370 ttctctcttcaagctcttcttcaaaatctacacaagaacacttatatagcagtcttcagctgtcaaaatcgtgtcacgtt---------gtggcacgatt 27038460  T
Q  562 gatgcgtacgacccaaggtacgacc 586  Q
    | |||||||||||||||||||||||    
T  27038461 ggtgcgtacgacccaaggtacgacc 27038485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 152 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 40372891 - 40372560
Alignment:
Q  152 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactatgatgaaagtgtt----------acaagaaaa 241  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||          |||||||||    
T  40372891 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaaa 40372793  T
Q  242 atagtttgcaagcttacacaagaacaagacttaatttctacccatttgtgttt-ctcactctctcaataatgaaccct-aaagggaagacacaaaaggaa 339  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| | ||  |||||||||| ||||||| | |||||||  ||| ||||||||| |||| |||||||| | |||||    
T  40372792 atagcttgcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcataat-atgaaccctaaaagagaagacactagaggaa 40372694  T
Q  340 gcttttgatccttccaa-tggtgaaat-ctcactacccaaaatgtttacaatg--tttctcaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaa 435  Q
    ||||| ||||||||||| |  |||| | ||||||||||||  || ||||||||  |||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||      
T  40372693 gctttagatccttccaactaatgaactcctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctctacaaagacactcaacccttt 40372594  T
Q  436 agttacctcctttgtaatccaagtttctctctct 469  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  40372593 ggttccctcctttgtaatccaagtttctctctct 40372560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 117 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 2671716 - 2671350
Alignment:
Q  117 aagataagcaatgaaagaaggaacaaacacaccaa-aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatcc 215  Q
    ||||||||||| ||||| | ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  2671716 aagataagcaa-gaaaggaagaacaaa-acaccaagaagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcc 2671620  T
Q  216 actatgatgaaagtgtt----------acaagaaa-aatagtttgcaagcttacacaagaacaagacttaatttctacccatttgtgttt-ctcactctc 303  Q
    | |||||||||||||||          |||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| | ||  |||||||||| ||||||| | |||||||    
T  2671619 aatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagattgcaagcttacacaagaccaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctc 2671520  T
Q  304 tcaataatgaaccct-aaagggaagacacaaaaggaagcttttgatccttccaa-tggtgaaat-ctcactacccaaaatgtttacaatg--tttctcaa 398  Q
     |||| ||||||||| |||| |||||||| | |||||||||| ||||||||||| |  |||| | ||||||||||||  || ||||||||  |||| |||    
T  2671519 acaat-atgaaccctaaaagagaagacactagaggaagctttagatccttccaactaatgaactcctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaa 2671421  T
Q  399 cccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatccaagtttctctctct 469  Q
    |||||||||  ||| ||||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2671420 cccaagagacactctctacaaagacactcaaccctttggttccctcctttgtaatccaagtttctctctct 2671350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 173 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 3323756 - 3323410
Alignment:
Q  173 tccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactatgatgaaagtgttacaa-ga--------aaaatagtttgcaagcttacacaag 263  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| || | ||||||||||||| |||||||||||||||| ||        ||| ||| ||  ||||||||| |||    
T  3323756 tccaatatgacctaatctgggagagagaacagccctccaatccactaagatgaaagtgttacaatgagttacaagaaattagcttataagcttacaaaag 3323657  T
Q  264 aacaagacttaatttctacccatttgtgtttctcactctctcaat-aatgaaccctaaagggaagacacaaaaggaagctttt-gatccttccaatggtg 361  Q
    |||||| | ||||||||||||||| ||   | |||| | | |  | ||||||  |||| | ||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  3323656 aacaagtcataatttctacccatt-gttcatatcacccacactctcaatgaattctaa-gagaaaacacaaaaggaagctttttgatcattccaatggtg 3323559  T
Q  362 aaatctcactacccaaaatgtttacaatgtttctcaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatccaagttt 461  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3323558 aaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaacctcactataaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatcgaagttt 3323459  T
Q  462 ctctctcttcaagctctc-cttcaaaatctgcacaagaacacttaaata 509  Q
     |||||||  || ||||| ||  |||||||||| |  ||||||||||||    
T  3323458 gtctctctaaaatctctctctcaaaaatctgcaaagaaacacttaaata 3323410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 342 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 25929282 - 25929086
Alignment:
Q  342 ttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaaatgtttacaatgtttctcaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttac 441  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25929282 ttttgatccttccgatggtgaaatctcactacccaag-tgtttacaatgttttccaactcaagagaacctcactacaaagacactcaaccctaaagttac 25929184  T
Q  442 ctcctttgtaatccaagtttctctctcttcaagctctccttcaaaatctgcacaagaacacttaaataacagtcttcagctgataaaatcgtgccacg 539  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||||||||| || |  |||||||| |||  | ||||||||||  ||||||||| ||||    
T  25929183 ctcctttgtaatctaagtttctctcacttcaaactctacttcaaaatctacaaagaaacacttatatagaaatcttcagctgtcaaaatcgtgtcacg 25929086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 117 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 9091431 - 9091065
Alignment:
Q  117 aagataagcaatgaaagaaggaacaaacacaccaa-aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatcc 215  Q
    ||||||||||| ||||| | ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9091431 aagataagcaa-gaaaggaagaacaaa-acaccaagaagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcc 9091335  T
Q  216 actatgatgaaagtgtt----------acaagaaa-aatagtttgcaagcttacacaagaacaagacttaatttctacccatttgtgttt-ctcactctc 303  Q
    | |||||||||||||||          |||||||| |||||  | |||||||||||||||||||  | ||  |||||||||| ||| ||| | |||||||    
T  9091334 aatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagccttcaagcttacacaagaacaatccctagattctacccatatgtatttccccactctc 9091235  T
Q  304 tcaataatgaacccta-aagggaagacacaaaaggaagcttttgatccttccaa-tggtgaaat-ctcactacccaaaatgtttacaatg--tttctcaa 398  Q
     |||| |||||||||| ||| |||||||| | |||||||||| ||||||| ||| |  |||| | ||||||||||||  || ||||||||  |||| |||    
T  9091234 acaat-atgaaccctagaagagaagacactagaggaagctttagatcctttcaactaatgaactcctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaa 9091136  T
Q  399 cccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatccaagtttctctctct 469  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  9091135 cccaagagatactctctacaaagacactcaaccctttggttccctcctttgtaatccaagtttctctctct 9091065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 250 - 468
Target Start/End: Original strand, 47649677 - 47649898
Alignment:
Q  250 caagcttacacaagaacaagacttaatttctacccattt-gtgtttctcactctctcaataatgaaccctaaagggaagacacaaaaggaagctttt-ga 347  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||  | ||||||| ||||| |||| ||||| | ||| |||||||||||||||||| ||    
T  47649677 caagcttccacaagaacaagacctaatttctacccattttgtgtcacccactctcgcaata-tgaatcctaa-gagaaaacacaaaaggaagctttttga 47649774  T
Q  348 tccttccaatggtgaaatctcactacccaaaatgtttacaatgtttctcaaccc--aagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcc 445  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  47649775 tccttcaaatggtgaaatctaactacccaaggtgtttacaatgtttcccaaccctcaagagaacctcactacaaagacactcaaccctaaagttatctcc 47649874  T
Q  446 tttgtaat-ccaagtttctctctc 468  Q
    |||||| | |||||||||| ||||    
T  47649875 tttgtattcccaagtttctatctc 47649898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 380 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 40734461 - 40734255
Alignment:
Q  380 tgtttacaatgtttctcaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttg-taatccaagtttctctctcttcaagctct 478  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |   | | ||||||| |||||||||||||||| |||||||| |  ||||||||||| ||||||||||||||    
T  40734461 tgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaat-caaagaccctcaaccctaaagttatctcctttgattttccaagtttctgtctcttcaagctct 40734363  T
Q  479 ccttcaaaatctgcacaagaacacttaaataacagtcttcagctgataaaatcgtgccacgttt-tccaaatcatgccacgattgatgcgtacgacccaa 577  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||| ||| ||||||| |||||||| || |||||||||||||||||| ||||    
T  40734362 ccttcaaaatctgca-aagaacacttatatagcagtcttcagctgtcaaaattgtgtcacgtttgtccaaatcgtgacacgattgatgcgtacgatccaa 40734264  T
Q  578 ggtacgacc 586  Q
    |||||||||    
T  40734263 ggtacgacc 40734255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 96; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 380 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 37408422 - 37408216
Alignment:
Q  380 tgtttacaatgtttctcaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatcc-aagtttctctctcttcaagctct 478  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |   | | |||||||  | |||||||||||| |||||||||   ||| ||||||||||||||||||||||     
T  37408422 tgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaat-caaagaccataaaccctaaagttgcctcctttgatttcccaagtttctctctcttcaagctca 37408324  T
Q  479 ccttcaaaatctgcacaagaacacttaaataacagtcttcagctgataaaatcgtgccacgttttccaaatcatgccacgattgatgcgtacgacccaag 578  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||| ||  ||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  37408323 ccttcaaaatcttcacaagaacacttatataccagtcttcagcagataaaatcttgttacgatttccaaatcgtgccacgattgatacgtacgacccaag 37408224  T
Q  579 gtacgacc 586  Q
    ||||||||    
T  37408223 gtacgacc 37408216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 117 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 8739193 - 8738827
Alignment:
Q  117 aagataagcaatgaaagaaggaacaaacacaccaa-aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatcc 215  Q
    ||||||||||| ||||| | ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8739193 aagataagcaa-gaaaggaagaacaaa-acaccaagaagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcc 8739097  T
Q  216 actatgatgaaagtgtt----------acaagaaa-aatagtttgcaagcttacacaagaacaagacttaatttctacccatttgtgttt-ctcactctc 303  Q
    | |||||||||||||||          |||||||| |||||  | |||||||||||||||||||  | ||  |||||||||| ||| ||| | |||||||    
T  8739096 aatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagccttcaagcttacacaagaacaatccctagattctacccatatgtatttccccactctc 8738997  T
Q  304 tcaataatgaacccta-aagggaagacacaaaaggaagcttttgatccttccaa-tggtgaaat-ctcactacccaaaatgtttacaatg--tttctcaa 398  Q
     |||| |||||||||| ||| |||||||| | |||||||||| ||||||| ||| |  |||| | ||||||||||||  || ||||||||  |||| |||    
T  8738996 acaat-atgaaccctagaagagaagacactagaggaagctttagatcctttcaactaatgaactcctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaa 8738898  T
Q  399 cccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatccaagtttctctctct 469  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||    ||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8738897 cccaagagatactctctacaaagacactcaacccattggttccctcctttgcaatccaagtttctctctct 8738827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 15 - 170
Target Start/End: Original strand, 1309719 - 1309872
Alignment:
Q  15 aaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaactaaaaacagacctagacttagtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagc- 113  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||| | |||||||     
T  1309719 aaaggaagtggtaatctatgtgtaaagtgtcttcaagcaacaacaac-aaaaacagccctagtc-tagtgtagagcaacaccacaagcaaatacaaagca 1309816  T
Q  114 acaaagataagcaatgaaagaaggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttc 170  Q
    || ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1309817 accaagataagcaa-gaaaggaagaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttc 1309872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 46 - 469
Target Start/End: Original strand, 7167137 - 7167578
Alignment:
Q  46 tccaagcaacaacaactaaaaacagacctagacttagtgtagagcaacaccacaagcata---aacaaagcacaaa---gataagcaatgaaagaaggaa 139  Q
    ||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||   | |   ||||||||| |||   ||||||||| ||||| | |||    
T  7167137 tccaagcaacaacaac--aaaacagccctagact-agtgtagagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaacaagataagcaa-gaaaggaagaa 7167232  T
Q  140 caaacacaccaa-aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactatgatgaaagt--------- 229  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||             
T  7167233 caaa-acaccaagaagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaag 7167330  T
Q  230 -gttacaagaaa-aatagtttgcaagcttacacaagaacaagacttaatttctacccatttgtgttt-ctcactctctcaataatgaaccct-aaaggga 325  Q
     ||||||||||| |||||  | |||||||||||||||||||  | ||  |||||||| || || ||| | ||||||| |||| ||||||||| |||| ||    
T  7167331 ggttacaagaaacaatagccttcaagcttacacaagaacaaaccctagattctaccctttggtatttccccactctcacaat-atgaaccctaaaagaga 7167429  T
Q  326 agacacaaaaggaagcttttgatccttccaa-tggtgaaat-ctcactacccaaaatgtttacaatg---tttctcaacccaagagatcctcactacaaa 420  Q
    |||||| | |||||||||| ||||||||||| |  |||| | ||||||||||||  || ||||||||   |||| ||||||||||||  ||| | |||||    
T  7167430 agacactagaggaagctttagatccttccaactaatgaactcctcactacccaaggtgattacaatgttttttcccaacccaagagacactctcaacaaa 7167529  T
Q  421 gacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatccaagtttctctctct 469  Q
    |||||||||||||   ||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  7167530 gacactcaaccctttggttccctcctttgttatccaagtttctctctct 7167578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 12 - 132
Target Start/End: Original strand, 27026805 - 27026925
Alignment:
Q  12 agcaaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaactaaaaacagacctaga-cttagtgtagagcaacaccacaagcataaacaa 110  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  27026805 agcaaatgaaatggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaag-aaaaacagacctagatctaagtgtagagcaacaccacaagcataatcaa 27026903  T
Q  111 agcacaaagataagcaatgaaa 132  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  27026904 agcacaaagataagcaatgaaa 27026925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 380 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 29813026 - 29812820
Alignment:
Q  380 tgtttacaatgtttctcaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatcc-aagtttctctctcttcaagctct 478  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||| | | | | ||||||| |||||||||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||| ||||    
T  29813026 tgtttacaatgcttcccaacccaagagaactttaat-caaagaccctcaaccctaaagttacctcctttgatttcccaagtttctctctcttcaacctct 29812928  T
Q  479 ccttcaaaatctgcacaagaacacttaaataacagtcttcagctgataaaatcgtgccacgtttt-ccaaatcatgccacgattgatgcgtacgacccaa 577  Q
     ||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||||| |  ||||||||| |||||||| ||||||| || |||| ||| ||||||||||||||    
T  29812927 tcttcaaaatctaca-aagaacacttatatagcagtcttcagcggtcaaaatcgtgtcacgtttttccaaatcgtgacacgtttggtgcgtacgacccaa 29812829  T
Q  578 ggtacgacc 586  Q
    |||||||||    
T  29812828 ggtacgacc 29812820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 380 - 586
Target Start/End: Original strand, 23410534 - 23410741
Alignment:
Q  380 tgtttacaatgtttctcaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaat-ccaagtttctctctcttcaagctct 478  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  23410534 tgtttacaatgttttccaacccaagagaacctcactacaaagacactcaaccctaaagttctctcctttgcaatcccaagtttctctctcttc-agctct 23410632  T
Q  479 ccttc-aaaatctgcacaagaacacttaaataacagtcttcagctgataaaatcgtgccacgtttt-ccaaatcatgccacgattgatgcgtacgaccca 576  Q
    ||||| |||| ||||| |  |||||||| ||| ||||||||||||| | |||| ||| |||||||| ||||||| || |||| ||| || | || |||||    
T  23410633 ccttcaaaaaactgcaaagaaacacttatatagcagtcttcagctg-tcaaattgtgtcacgttttgccaaatcgtgacacggttggtgtgaacaaccca 23410731  T
Q  577 aggtacgacc 586  Q
    ||||||||||    
T  23410732 aggtacgacc 23410741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 12 - 132
Target Start/End: Original strand, 27038150 - 27038270
Alignment:
Q  12 agcaaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaactaaaaacagacctaga-cttagtgtagagcaacaccacaagcataaacaa 110  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  27038150 agcaaatgaaatggtaatcaatgtgtaaagtgtcttcaagcaacaacaac-aaaaacagatctagatctaagtgtagagcaacaccacaagcataatcaa 27038248  T
Q  111 agcacaaagataagcaatgaaa 132  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  27038249 agcacaaagataagcaatgaaa 27038270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 380 - 586
Target Start/End: Original strand, 23198142 - 23198348
Alignment:
Q  380 tgtttacaatgtttctcaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttg-taatccaagtttctctctcttcaagctct 478  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||  |||    ||||||| || ||||||| |||| |  |||||| |  ||||||||||||||||||| | ||||    
T  23198142 tgtttacaatgtttcccaacccaagagaaactctaatcaaagaccctaaaccctagagttgctccctttgattttccaagtttctctctcttccaactct 23198241  T
Q  479 ccttcaaaatctgcacaagaacacttaaataacagtcttcagctgataaaatcgtgccacgttttccaaatcatgccacgattgatgcgtacgacccaag 578  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||  |||||||||||||| |||| |||||||||| || |||||||| | |||||| | ||||    
T  23198242 c-ttcaaaatctgcacaagaacacttaaatactagtcttccactgataaaatcgtgtcacgatttccaaatcgtgtcacgattggtacgtacgtcacaag 23198340  T
Q  579 gtacgacc 586  Q
    ||||||||    
T  23198341 gtacgacc 23198348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 380 - 586
Target Start/End: Original strand, 5236661 - 5236868
Alignment:
Q  380 tgtttacaatgtttctcaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttg-taatccaagtttctctctcttcaagctct 478  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |   | | ||||||| ||||||||||||||||||||||| | |   |||||||||||||||||||||| |     
T  5236661 tgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaat-caaagaccctcaaccctaaagttacctccttcgatttcccaagtttctctctcttcaagcccc 5236759  T
Q  479 ccttcaaaatctgcacaagaacacttaaataacagtcttcagctgataaaatcgtgccacgtttt-ccaaatcatgccacgattgatgcgtacgacccaa 577  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||  |  || ||  ||  ||||||||| |||||||| ||||||| || |||| ||| ||||||||||||||    
T  5236760 acttcaaaatctgcacaagaacacttaaatagtaccctgcaagtgtcaaaatcgtgtcacgttttgccaaatcgtgacacgtttggtgcgtacgacccaa 5236859  T
Q  578 ggtacgacc 586  Q
    |||||||||    
T  5236860 ggtacgacc 5236868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 360 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 4386846 - 4386736
Alignment:
Q  360 tgaaatctcactacccaaaatgtttacaatgtttctcaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgta-atccaag 458  Q
    |||||||||||||| |||  || |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||    
T  4386846 tgaaatctcactactcaaggtgattacaatgtttcccaacccaagagaacctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtattttcaag 4386747  T
Q  459 tttctctctct 469  Q
    |||||||||||    
T  4386746 tttctctctct 4386736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 380 - 543
Target Start/End: Original strand, 23392114 - 23392277
Alignment:
Q  380 tgtttacaatgtttctcaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaat-ccaagtttctctctcttcaagctct 478  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||| | | |||||||||||||||||| ||||||    
T  23392114 tgtttacaatgtttcccaacccaagagaacctcactacaaagacactcaaccctaaatttctctcctttgcagtcccaagtttctctctcttc-agctct 23392212  T
Q  479 ccttc-aaaatctgcacaagaacacttaaataacagtcttcagctgataaaatcgtgccacgtttt 543  Q
    ||||| |||| ||||| |  |||||||| |||||||| ||||| || |||||| ||| ||||||||    
T  23392213 ccttcaaaaaactgcaaagaaacacttatataacagt-ttcagatgttaaaattgtgtcacgtttt 23392277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 417 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 7762193 - 7762021
Alignment:
Q  417 caaagacactcaaccctaaagttacctcctttg-taatccaagtt--tctctctcttcaagctctccttcaaaatctgcacaagaacacttaaataacag 513  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |   |||||||  |||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| ||| |||    
T  7762193 caaagaccctcaaccctaaagttacctcctttgatttcccaagtttctctctctcttcaagctttccttcaaaatttgca-aagaacacttatatagcag 7762095  T
Q  514 tcttcagctgataaaatcgtgccacgtttt--ccaaatcatgccacgattgatgcgtacgacccaaggtacgacc 586  Q
    |||||||| |   |||||||| ||||||||  || |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7762094 tcttcagc-gtctaaatcgtgtcacgtttttccccaatcgtgtcacgattgatgcgtacgacccaaggtacgacc 7762021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 380 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 29810831 - 29810625
Alignment:
Q  380 tgtttacaatgtttctcaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatcc-aagtttctctctcttcaagctct 478  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||| |   | | ||||||| |||||||||||| ||||||||||||   ||| |||||| ||| ||||||| || |    
T  29810831 tgtttacaatgtttcccaacccaaaagaactctaat-caaagaccctcaaccctaaaattacctcctttgatttcccaagtttttctttcttcaaccttt 29810733  T
Q  479 ccttcaaaatctgcacaagaacacttaaataacagtcttcagctgataaaatcgtgccacgtttt-ccaaatcatgccacgattgatgcgtacgacccaa 577  Q
     ||||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||| || |||| ||| ||||||||||||||    
T  29810732 tcttcaaaatatgca-aagaacacttatatagcagtcttcagctgtcaaaatcgtgtcacgttttcccaaatcgtgacacgtttggtgcgtacgacccaa 29810634  T
Q  578 ggtacgacc 586  Q
    |||||||||    
T  29810633 ggtacgacc 29810625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 380 - 586
Target Start/End: Original strand, 23200341 - 23200547
Alignment:
Q  380 tgtttacaatgtttctcaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatcc-aagtttctctctcttcaagctct 478  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||  |||    ||||||| || ||||||| |||| |  ||||||   ||| |||||||||||||||| | ||||    
T  23200341 tgtttacaatgtttcccaacccaagagaaactctaatcaaagaccctaaaccctagagttgctccctttgatttcccaagtttctctctcttccaactct 23200440  T
Q  479 ccttcaaaatctgcacaagaacacttaaataacagtcttcagctgataaaatcgtgccacgttttccaaatcatgccacgattgatgcgtacgacccaag 578  Q
    | |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||| |||| |||||||||| || |||||||| | |||| | | ||||    
T  23200441 c-ttcaaaatctgcacaaaaacacttaaataccagtcttccactgataaaatcgtgtcacgatttccaaatcgtgtcacgattggtacgtaagtcacaag 23200539  T
Q  579 gtacgacc 586  Q
    ||||||||    
T  23200540 gtacgacc 23200547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 12 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 4387158 - 4386930
Alignment:
Q  12 agcaaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaactaaaaaca--gaccta-gacttagtgtagagcaacaccacaagcataaac 108  Q
    ||||||| |||| |||||||||| |||||||  |   ||||||||||||| ||||| |  |||||| | |||| |||||| |||| ||||| |||||| |    
T  4387158 agcaaagaaagtagtaatcaatgagtaaagtagccataagcaacaacaacaaaaaaaaaagacctaagtcttaatgtagaacaacgccacatgcataatc 4387059  T
Q  109 aaagcac-aaagataagcaatgaaagaa-ggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatct 206  Q
    ||| ||  |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||| ||||||||  || || ||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  4387058 aaaacaataaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacatcaaa-gattgtttacccagtttagttcagtatgacctactctgggggagagagcagct 4386960  T
Q  207 ctccaatccactatgatgaaagtgttacaa 236  Q
    |||||||||| || ||| |||||| |||||    
T  4386959 ctccaatccaataagataaaagtgatacaa 4386930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 328 - 469
Target Start/End: Original strand, 21353746 - 21353894
Alignment:
Q  328 acacaaaaggaagcttttg-atccttccaatggtgaaat-ctcactacccaaaatgtttacaatgtttctcaacc--caagagatcctcactacaaagac 423  Q
    |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||  ||||||| |||||||||||||||    
T  21353746 acactaaaggaaacttttggatccttccaatggtgacattctcactacccaaagtgtttacgatgtttcccaaccctcaagagaacctcactacaaagac 21353845  T
Q  424 actc--aaccctaaagttacctcctttgtaatcc-aagtttctctctct 469  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||    
T  21353846 actcaaaaccctaaagttacctcctttgtattcctaggtttctctctct 21353894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 417 - 574
Target Start/End: Complemental strand, 51398741 - 51398583
Alignment:
Q  417 caaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatcc-aagtttctctctcttcaagctctccttcaaaatctgcacaagaacacttaaataacagtc 515  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||   ||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||| ||| || ||    
T  51398741 caaagactctcaaccctaaagttacctcctttgatttcccaagtttctatctcttcaacctctccttcaaaatctaca-aagaacacttatatagcaatc 51398643  T
Q  516 ttcagctgataaaatcgtgccacgtttt-ccaaatcatgccacgattgatgcgtacgacc 574  Q
    ||||||||  ||||||||| ||| |||| ||||||| || |||| ||| |||||||||||    
T  51398642 ttcagctgtcaaaatcgtgtcacattttcccaaatcgtgacacgtttggtgcgtacgacc 51398583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 380 - 586
Target Start/End: Original strand, 5260528 - 5260734
Alignment:
Q  380 tgtttacaatgtttctcaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatcc-aagtttctctctcttcaagctct 478  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |   | | ||||||| || |||||||||||| |||||||||   ||| ||||||||||||||||||||||     
T  5260528 tgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaat-caaagaccctaaaccctaaagttgcctcctttgatttcccaagtttctctctcttcaagctca 5260626  T
Q  479 ccttcaaaatctgcacaagaacacttaaataacagtcttcagctgataaaatcgtgccacgtttt--ccaaatcatgccacgattgatgcgtacgaccca 576  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||| | |||||| || |  ||||||||| || |||||  || |||| |||||| |||||||||||||| |||    
T  5260627 ccttcaaaatctgca-aagaacacttatatagctgtcttctgc-gtcaaaatcgtgtcatgtttttccccaatcgtgccacaattgatgcgtacgatcca 5260724  T
Q  577 aggtacgacc 586  Q
    | ||||||||    
T  5260725 aagtacgacc 5260734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 380 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 45095128 - 45094921
Alignment:
Q  380 tgtttacaatgtttctcaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatcc-aagtttctctctcttcaagctct 478  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |   | | ||||||| || |||||||||||| |||| ||||   ||| ||||||||||||||||||||||     
T  45095128 tgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaat-caaagaccctaaaccctaaagttgcctcttttgatttcccaagtttctctctcttcaagctca 45095030  T
Q  479 ccttcaaaatctgcacaagaacacttaaataacagtcttcagctgataaaatcgtgccacgtttt--ccaaatcatgccacgattgatgcgtacgaccca 576  Q
     |||||||||||||| ||||||||||| ||| || ||||||||     |||||||| ||||||||  || |||| || |||||||||||||||||  |||    
T  45095029 tcttcaaaatctgca-aagaacacttatatagcaatcttcagcgttcgaaatcgtgtcacgtttttccccaatcgtgtcacgattgatgcgtacgttcca 45094931  T
Q  577 aggtacgacc 586  Q
    ||||||||||    
T  45094930 aggtacgacc 45094921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 15 - 114
Target Start/End: Original strand, 1417129 - 1417227
Alignment:
Q  15 aaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaactaaaaacagacctaga-cttagtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagc 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| | || ||||||||| | || ||||||||||| ||||||    
T  1417129 aaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaac--aaaacagacctaaatctaagtgtagagtagcatcacaagcataatcaaagc 1417226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 15 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 47924093 - 47924000
Alignment:
Q  15 aaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaactaaaaacagacctaga-cttagtgtagagcaacaccacaagcataaacaaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  47924093 aaaggaagtggtaatcaatggataaagtgtctccaagcaacaac----aaaaacagacctagatctaagtgtagagcaacaccacaagcatgaacaaa 47924000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 88 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 34491449 - 34491315
Alignment:
Q  88 agcaacaccacaagcataaacaaagcac-aaagataagcaatgaaagaag-gaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacct 185  Q
    ||||| ||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  ||||||    
T  34491449 agcaaaaccacaatcataatcaaagcaataaagataagcaatgaaagaaatgaacaaacacaccaaa-gattgttcacccagttcggtccaacttgacct 34491351  T
Q  186 aatctgggggagaga-gcatctctccaatccactat 220  Q
    | ||||| |||||||   ||||||||||||||||||    
T  34491350 actctggaggagagattgatctctccaatccactat 34491315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 152 - 236
Target Start/End: Original strand, 18656436 - 18656518
Alignment:
Q  152 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactatgatgaaagtgttacaa 236  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  18656436 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaa 18656518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 152 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 22173279 - 22173197
Alignment:
Q  152 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactatgatgaaagtgttacaa 236  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  22173279 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaa 22173197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 50 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 25929633 - 25929446
Alignment:
Q  50 agcaacaacaacta-aaaacagacctaga-cttagtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagca-caaagataagcaat---gaaagaaggaacaaa 143  Q
    |||||||||||| | |||||| ||||| | || |||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| ||    |||||||  ||||||    
T  25929633 agcaacaacaacaacaaaacaaacctaaatctaagtgtagagcaacaccacaaacataatcaaagcaacaaagataagaaagcaagaaagaaa-aacaaa 25929535  T
Q  144 cacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactatgatgaaagtgttacaa 236  Q
    |||||||| |   || | |||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||| | ||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  25929534 cacaccaaga---tggtaacccagttcggtccaatacgacctactctggggg-gagagcagccctccaatccactaagatgaaagtgatacaa 25929446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 474 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 7764321 - 7764209
Alignment:
Q  474 gctctccttcaaaatctgcacaagaacacttaaataacagtcttcagctgataaaatcgtgccacgtttt--ccaaatcatgccacgattgatgcgtacg 571  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||||   |||| ||||| ||||||||  || ||||||| |||||||||||||||||    
T  7764321 gctctccttcaaaatttgca-aagaacacttatatagcagtcttcagcatctaaa-tcgtgtcacgtttttccccaatcatgtcacgattgatgcgtacg 7764224  T
Q  572 acccaaggtacgacc 586  Q
    |||||||||||||||    
T  7764223 acccaaggtacgacc 7764209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 380 - 586
Target Start/End: Original strand, 9636331 - 9636539
Alignment:
Q  380 tgtttacaatgtttctcaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatcc-aagtttctctctcttcaagctct 478  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||  |||    ||||||| || |||||||||||| | |||||||   ||| |||||||||||||||| | |||     
T  9636331 tgtttacaatatttcccaacccaagagagactctaatcaaagaccctaaaccctaaagtttcttcctttgatttcccaagtttctctctcttccaactca 9636430  T
Q  479 c-cttcaaaatctgcacaagaacacttaaataacagtcttcagctgataaaatcgtgccacgtttt--ccaaatcatgccacgattgatgcgtacgaccc 575  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||| ||| | | |||| || |  ||||||||| ||||||||  || |||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  9636431 ctcttcaaaatctgca-aagaacacttatatagctgccttctgc-gtcaaaatcgtgtcacgtttttccccaatcgtgccacgattgatgcgtacgatcc 9636528  T
Q  576 aaggtacgacc 586  Q
    |||||||||||    
T  9636529 aaggtacgacc 9636539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 138 - 220
Target Start/End: Original strand, 9666449 - 9666531
Alignment:
Q  138 aacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagc-atctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  9666449 aacaaacacaccaaa-gattgttgacccagttcggtccaactttacctaatctgggggagagatcaatctctccaatccactat 9666531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 380 - 586
Target Start/End: Original strand, 5258349 - 5258555
Alignment:
Q  380 tgtttacaatgtttctcaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatc-caagtttctctctcttcaagctct 478  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |   | | ||||||| || |||||||||||| |  ||||||   || ||||||||||||||||| ||||||    
T  5258349 tgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaat-caaagaccctaaaccctaaagtttctccctttgatttctcaagtttctctctcttctagctct 5258447  T
Q  479 ccttcaaaatctgcacaagaacacttaaataacagtcttcagctgataaaatcgtgccacgtttt--ccaaatcatgccacgattgatgcgtacgaccca 576  Q
    ||||||||||||||| |||||||| || ||| | |||||| || |  ||||||||| ||||||||  || |||| |||||| || |||||||||||  ||    
T  5258448 ccttcaaaatctgca-aagaacacgtatatagctgtcttctgc-gtcaaaatcgtgtcacgtttttccccaatcgtgccacaatcgatgcgtacgattca 5258545  T
Q  577 aggtacgacc 586  Q
    ||||||||||    
T  5258546 aggtacgacc 5258555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 135 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 29813251 - 29813166
Alignment:
Q  135 aggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga-gcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  29813251 aggaacaaacacatcaaa-gattgttgacccagttcggtccaacatgaccaaatctgggggagagattgatctctccaatccactat 29813166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 135 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 51399002 - 51398917
Alignment:
Q  135 aggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga-gcatctctccaatccactat 220  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  51399002 aggaacaaacacaccaaa-gattgttgaccaagttcggtccaacttgacctaatctgggggagagataaatctctccaatccactat 51398917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 454 - 586
Target Start/End: Original strand, 7782420 - 7782551
Alignment:
Q  454 ccaagtttctctctcttcaagctctccttcaaaatctgcacaagaacacttaaataacagtcttcagctgataaaatcgtgccacgttttccaaatcatg 553  Q
    |||||||||||||||||| | || ||||||||| ||||||||||||||||||||||  || | ||  |||||||||||||| |||| |||||| ||| ||    
T  7782420 ccaagtttctctctcttccaactgtccttcaaa-tctgcacaagaacacttaaatactagccctccactgataaaatcgtgtcacgatttccagatcgtg 7782518  T
Q  554 ccacgattgatgcgtacgacccaaggtacgacc 586  Q
     |||||||| | ||| || ||||||| ||||||    
T  7782519 tcacgattggtacgttcgtcccaaggcacgacc 7782551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 152 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 28503960 - 28503878
Alignment:
Q  152 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactatgatgaaagtgttacaa 236  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  28503960 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggggaagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaa 28503878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 156 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 38210629 - 38210565
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  38210629 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtatgggggagagagcagctctccaatccactat 38210565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 145 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 40913472 - 40913396
Alignment:
Q  145 acaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga-gcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  40913472 acaccaagagattgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactat 40913396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 156 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 50494258 - 50494194
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  50494258 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactat 50494194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 138 - 220
Target Start/End: Original strand, 29196369 - 29196451
Alignment:
Q  138 aacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga-gcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  29196369 aacaaacacaccaaa-gattgttgacccagttcggtccaacttgacctaatttgggggagagattgatctctccaatccactat 29196451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 463 - 585
Target Start/End: Original strand, 44331735 - 44331857
Alignment:
Q  463 tctctcttcaagctctccttcaaaatctgcacaagaacacttaaataacagtcttcagctgataaaatcgtgccacgttt-tccaaatcatgccacgatt 561  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||| || ||| |||||||||||||  |||||| ||||||||||  ||||||| || |||  ||    
T  44331735 tctctctttaagctctccttcaaaatctgca-aataacacatatatagcagtcttcagctgtcaaaatcatgccacgtttccccaaatcgtgacacattt 44331833  T
Q  562 gatgcgtacgacccaaggtacgac 585  Q
    | || |||||||||||||||||||    
T  44331834 ggtgtgtacgacccaaggtacgac 44331857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 135 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 40734686 - 40734601
Alignment:
Q  135 aggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga-gcatctctccaatccactat 220  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  40734686 aggaacaaacactccaaa-gattgttgacccagttcggtccaacttgacctaatttgggggagagattgatctctccaatccactat 40734601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 135 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 40735571 - 40735486
Alignment:
Q  135 aggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga-gcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  40735571 aggaacaaatacaccaaa-gattgctgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactat 40735486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 152 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 44331717 - 44331648
Alignment:
Q  152 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga-gcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  44331717 aagattgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactat 44331648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 156 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 458543 - 458479
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  458543 ttgttgacccagttcggtccaacctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactat 458479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 152 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 2673015 - 2672933
Alignment:
Q  152 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactatgatgaaagtgttacaa 236  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  2673015 aagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaa 2672933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 152 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 2677171 - 2677089
Alignment:
Q  152 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactatgatgaaagtgttacaa 236  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  2677171 aagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaa 2677089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 156 - 220
Target Start/End: Original strand, 6063444 - 6063508
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactat 220  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  6063444 ttgtggacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactat 6063508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 152 - 236
Target Start/End: Original strand, 8512218 - 8512300
Alignment:
Q  152 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactatgatgaaagtgttacaa 236  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  8512218 aagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaa 8512300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 152 - 236
Target Start/End: Original strand, 8517098 - 8517180
Alignment:
Q  152 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactatgatgaaagtgttacaa 236  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  8517098 aagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaa 8517180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 156 - 220
Target Start/End: Original strand, 10621528 - 10621592
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  10621528 ttgttgacccagttcggtccaatctgagctagtctgggggagagagcagccctccaatccactat 10621592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 138 - 220
Target Start/End: Original strand, 23391892 - 23391974
Alignment:
Q  138 aacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga-gcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||   |||||| |||||||||||    
T  23391892 aacaaacacaccaaa-gattgttgacccagttcggtccaacttgacctaatttgggggagagatttatctctacaatccactat 23391974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 138 - 220
Target Start/End: Original strand, 32744419 - 32744501
Alignment:
Q  138 aacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga-gcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||   |||||| |||||||||||    
T  32744419 aacaaacacaccaaa-gattgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggatagatttatctcttcaatccactat 32744501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 12 - 132
Target Start/End: Original strand, 8126561 - 8126682
Alignment:
Q  12 agcaaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaactaaaaacagacctaga-cttagtgtagagcaacaccacaagcataaacaa 110  Q
    |||||||||||||||| |||||   || | ||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| | || |||||||||||||||||||  ||||| |||    
T  8126561 agcaaaggaagtggtattcaatagatacaatgtctccaaccaacaacaac-aaaaacatacctaaatctaagtgtagagcaacaccacactcataatcaa 8126659  T
Q  111 agc-acaaagataagcaatgaaa 132  Q
    ||| | |||||||||||||||||    
T  8126660 agcaataaagataagcaatgaaa 8126682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 152 - 221
Target Start/End: Original strand, 32475486 - 32475554
Alignment:
Q  152 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactatg 221  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  32475486 aagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg 32475554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 152 - 221
Target Start/End: Original strand, 32480344 - 32480412
Alignment:
Q  152 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactatg 221  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  32480344 aagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg 32480412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 514 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 40735259 - 40735186
Alignment:
Q  514 tcttcagctgataaaatcgtgccacgttt-tccaaatcatgccacgattgatgcgtacgacccaaggtacgacc 586  Q
    ||||||||||  ||||||||| ||||||| ||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  40735259 tcttcagctgtcaaaatcgtgtcacgtttgtccaaatcataacacgattggtgcgtacgacccaaggtacgacc 40735186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 156 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 456166 - 456102
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||||||||||||   |||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  456166 ttgttgacccagttcggtccaacccgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactat 456102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 156 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 747016 - 746952
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||   |||| |||||||||    
T  747016 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagtcctccgatccactat 746952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 156 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 1321738 - 1321674
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| | |||| |||||||||    
T  1321738 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactat 1321674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 156 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 5886457 - 5886393
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| | |||| |||||||||    
T  5886457 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactat 5886393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 156 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 5899930 - 5899866
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| | |||| |||||||||    
T  5899930 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactat 5899866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 156 - 220
Target Start/End: Original strand, 7606586 - 7606650
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| | |||| |||||||||    
T  7606586 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactat 7606650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 156 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 25389164 - 25389100
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| | |||| |||||||||    
T  25389164 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactat 25389100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 156 - 220
Target Start/End: Original strand, 28413030 - 28413094
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||| | ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  28413030 ttgttgacctaattcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactat 28413094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 137 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 29811054 - 29810971
Alignment:
Q  137 gaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga-gcatctctccaatccactat 220  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  ||  |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  29811054 gaacaaacacaccaaa-gattgttgacccaattcggtttaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactat 29810971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 145 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 30236304 - 30236228
Alignment:
Q  145 acaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga-gcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||| | |||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  30236304 acaccaagaaattgttgacctagttcggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactat 30236228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 426 - 541
Target Start/End: Complemental strand, 44331473 - 44331360
Alignment:
Q  426 tcaaccctaaagttacctcctttg-taatccaagtttctctctcttcaagctctccttcaaaatctgcacaagaacacttaaataacagtcttcagctga 524  Q
    |||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| || ||||||| ||| ||| |||||||||||||     
T  44331473 tcaaccctaaagttacctcctttgatttcccaagtttctctctc-tcaagctctccttc-aaatctaca-aagaacatttatatagcagtcttcagctgt 44331377  T
Q  525 taaaatcgtgccacgtt 541  Q
     |||||| || ||||||    
T  44331376 caaaatcatgtcacgtt 44331360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 156 - 216
Target Start/End: Original strand, 53894055 - 53894115
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatcca 216  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||    
T  53894055 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 53894115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 138 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 761032 - 760950
Alignment:
Q  138 aacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga-gcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| ||||||  |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  761032 aacaaacacaccaaa-gattgttaacccatttcagtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactat 760950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 135 - 194
Target Start/End: Original strand, 5236437 - 5236495
Alignment:
Q  135 aggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggg 194  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||    
T  5236437 aggaacaaacacaccaaa-gattgttgacccagtttggtccaaattgacctaatctgggg 5236495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 156 - 226
Target Start/End: Original strand, 10094075 - 10094146
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaat-atgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactatgatgaa 226  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||    
T  10094075 ttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactataatgaa 10094146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 156 - 226
Target Start/End: Original strand, 10100092 - 10100163
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaat-atgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactatgatgaa 226  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||    
T  10100092 ttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactataatgaa 10100163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 156 - 226
Target Start/End: Original strand, 10200955 - 10201026
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaat-atgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactatgatgaa 226  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||    
T  10200955 ttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactataatgaa 10201026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 138 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 16499214 - 16499132
Alignment:
Q  138 aacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga-gcatctctccaatccactat 220  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||  | ||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  16499214 aacaaatacaccaaa-gattgttgacccagttcggtccaacttaacctactctgggggagagattgatctctccaatccactat 16499132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 138 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 29682544 - 29682462
Alignment:
Q  138 aacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga-gcatctctccaatccactat 220  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||| |||||||||   ||||||||||||||||||    
T  29682544 aacatacacaccaaa-gattgttgacccagttcggtccaacttgatctaatctaggggagagattgatctctccaatccactat 29682462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 138 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 31314630 - 31314548
Alignment:
Q  138 aacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga-gcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||| |   ||||||||||||||||||    
T  31314630 aacaaacacaccaaa-gattgttgactcagttcggtccaacttgacctaatatgggggagatattgatctctccaatccactat 31314548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 156 - 203
Target Start/End: Original strand, 53917662 - 53917709
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagca 203  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  53917662 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagca 53917709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 156 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 10897187 - 10897117
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaat-atgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactatgatga 225  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||    
T  10897187 ttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactataatga 10897117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 151 - 220
Target Start/End: Original strand, 39153356 - 39153426
Alignment:
Q  151 aaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga-gcatctctccaatccactat 220  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||    
T  39153356 aaagattgttgacccagttcagtccaacttgacctaatctgggggagagattgttctctccaatccactat 39153426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 156 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 54193408 - 54193338
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaat-atgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactatgatga 225  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||    
T  54193408 ttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactataatga 54193338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #121
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 380 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 40735346 - 40735254
Alignment:
Q  380 tgtttacaatgtttctcaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttg-taatccaagtttctctctcttca 472  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||| | | | | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |   |||||||||||||||||||    
T  40735346 tgtttacaatgtttcctaacccaagagaactttaat-caaagaccctcaaccctaaagttacctcctttgatttcccaagtttctctctcttca 40735254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #122
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 156 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 3859786 - 3859722
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| | || | |||||||||    
T  3859786 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctacgatccactat 3859722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #123
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 156 - 220
Target Start/End: Original strand, 4103894 - 4103958
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| |||| | |||| |||||||||    
T  4103894 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagatagcagccctccgatccactat 4103958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #124
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 156 - 220
Target Start/End: Original strand, 5522625 - 5522689
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| |||| ||||||||||| | |||| |||||||||    
T  5522625 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgcgggagagagcagccctccgatccactat 5522689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #125
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 156 - 220
Target Start/End: Original strand, 6065794 - 6065858
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||||| |  |||||||||||||    
T  6065794 ttgttgacccagttctgtccaatctgacctagtctaggggagagagcagccatccaatccactat 6065858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #126
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 138 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 7764650 - 7764567
Alignment:
Q  138 aacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtc-caatatgacctaatctgggggagaga-gcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||  ||| ||||||| ||||| |||||||  |||||||||||||||||||    
T  7764650 aacaaacacaccaaa-gattgttcacccagttcggtctaaatttgacctactctggaggagagattcatctctccaatccactat 7764567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #127
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 156 - 220
Target Start/End: Original strand, 10084387 - 10084451
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||| | |||| |||||||||    
T  10084387 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtcttggggagagagcagccctccgatccactat 10084451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #128
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 156 - 220
Target Start/End: Original strand, 10958321 - 10958385
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| | ||||  ||||||||    
T  10958321 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactat 10958385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #129
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 380 - 479
Target Start/End: Original strand, 32744631 - 32744730
Alignment:
Q  380 tgtttacaatgtttctcaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttg-taatccaagtttctctctcttcaagctct 478  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |   | | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |   |||||||| |||||||| |||||||    
T  32744631 tgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaat-caaagaccctcaaccctaaagttacctcctttgatttcccaagtttttctctcttgaagctct 32744729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #130
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 156 - 220
Target Start/End: Original strand, 35919113 - 35919177
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| | ||||  ||||||||    
T  35919113 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactat 35919177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #131
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 156 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 43226344 - 43226280
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||| | |||| |||||||||    
T  43226344 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccgatccactat 43226280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #132
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 156 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 43228550 - 43228486
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| | |||| |||||||||    
T  43228550 ttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactat 43228486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #133
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 145 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 46173536 - 46173460
Alignment:
Q  145 acaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga-gcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||| | |||||||| | ||||||||||||  |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  46173536 acaccaagaaattgttgatctagttcggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactat 46173460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #134
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 145 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 47304430 - 47304354
Alignment:
Q  145 acaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga-gcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| |||||||||   ||||||||||||||||||    
T  47304430 acaccaataaattgttgacccagttcggtcaaacttgacctaatcttggggagagattgatctctccaatccactat 47304354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #135
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 156 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 1313668 - 1313621
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagca 203  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  1313668 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagca 1313621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #136
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 156 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 6484619 - 6484572
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagca 203  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  6484619 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagca 6484572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #137
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 156 - 226
Target Start/End: Original strand, 10208001 - 10208072
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaat-atgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactatgatgaa 226  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| |||||||| |||| ||||||||||| |||||| ||||||||| |||||    
T  10208001 ttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctgcgggagagagcagctctccgatccactataatgaa 10208072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #138
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 138 - 216
Target Start/End: Original strand, 23410312 - 23410390
Alignment:
Q  138 aacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga-gcatctctccaatcca 216  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||  ||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||    
T  23410312 aacaaacacaccaaa-gattgttgacccaattcgttccaacttgacctaatttgggggagagatttatctctccaatcca 23410390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #139
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 156 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 27544454 - 27544383
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaat-atgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactatgatgaa 226  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| |||||||| |||| ||||||||||| |||||| ||||||||| |||||    
T  27544454 ttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctgagggagagagcagctctccgatccactataatgaa 27544383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #140
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 156 - 203
Target Start/End: Original strand, 27635656 - 27635703
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagca 203  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  27635656 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagca 27635703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #141
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 156 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 41849318 - 41849271
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagca 203  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  41849318 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagca 41849271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #142
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 156 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 42990563 - 42990516
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagca 203  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  42990563 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagca 42990516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #143
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 156 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 42992529 - 42992482
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagca 203  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  42992529 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagca 42992482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #144
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 156 - 203
Target Start/End: Original strand, 43421413 - 43421460
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagca 203  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  43421413 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagca 43421460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #145
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 15 - 66
Target Start/End: Original strand, 47649604 - 47649655
Alignment:
Q  15 aaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaactaaaa 66  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  47649604 aaaggaagtggtaatcaatagataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaa 47649655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #146
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 156 - 225
Target Start/End: Original strand, 10612778 - 10612848
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaat-atgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactatgatga 225  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||  |||||||| ||||    
T  10612778 ttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctccgttccactataatga 10612848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #147
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 156 - 225
Target Start/End: Original strand, 22625984 - 22626054
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaat-atgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactatgatga 225  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||||| ||||    
T  22625984 ttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagttctccgatccactataatga 22626054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #148
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 156 - 225
Target Start/End: Original strand, 29913955 - 29914025
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaat-atgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactatgatga 225  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| |||| | ||||||||| ||||    
T  29913955 ttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctcttcgatccactataatga 29914025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #149
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 156 - 210
Target Start/End: Original strand, 48361669 - 48361723
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctcc 210  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  48361669 ttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtctgggggagagagcagctctcc 48361723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #150
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 380 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 32891066 - 32890998
Alignment:
Q  380 tgtttacaatgtttctcaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttg 449  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||| ||  | | ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  32891066 tgtttacaatgtttcccaccccaagagaaccctaat-caaagaccctcaaccctaaagttacctcctttg 32890998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #151
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 380 - 449
Target Start/End: Original strand, 39153566 - 39153634
Alignment:
Q  380 tgtttacaatgtttctcaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttg 449  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |   | | ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  39153566 tgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaat-caaagaccctcaaccctaaagttacctcctttg 39153634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #152
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 145 - 220
Target Start/End: Original strand, 49199457 - 49199534
Alignment:
Q  145 acaccaaaagattgttgacccagttcggtccaa-tatgacctaatctgggggagaga-gcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||  |||||||| ||||| |||||||   ||||||||||||||||||    
T  49199457 acaccaagagattgttcacccagttcggtccaaccatgacctagtctggaggagagattaatctctccaatccactat 49199534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #153
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 156 - 220
Target Start/End: Original strand, 4308279 - 4308343
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||| | ||||  ||||||||    
T  4308279 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccgttccactat 4308343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #154
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 156 - 220
Target Start/End: Original strand, 9604605 - 9604669
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||| ||||||||| ||  ||||||| |||||||||||||||| | |||| |||||||||    
T  9604605 ttgttgacctagttcggtctaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactat 9604669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #155
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 156 - 220
Target Start/End: Original strand, 10191308 - 10191372
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| |||  ||||||||||| | |||| |||||||||    
T  10191308 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtcttagggagagagcagccctccgatccactat 10191372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #156
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 156 - 220
Target Start/End: Original strand, 10956025 - 10956089
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||| | ||||  ||||||||    
T  10956025 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggtggagagagcagccctccgttccactat 10956089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #157
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 156 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 11170663 - 11170599
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||||||| ||||  ||||||| |||||||||||||||| | ||||  ||||||||    
T  11170663 ttgttgacccagttcggcccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactat 11170599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #158
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 156 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 25533701 - 25533637
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||| |||||||||||| | |||| |||||||||    
T  25533701 ttgttgacccagttcagtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccgatccactat 25533637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #159
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 159 - 203
Target Start/End: Original strand, 25688161 - 25688205
Alignment:
Q  159 ttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagca 203  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  25688161 ttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagca 25688205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #160
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 156 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 30006100 - 30006036
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||| ||||||| |||||||||||| | ||||  ||||||||    
T  30006100 ttgttgacccagttcggtccaaattgatctaatctaggggagagagcagccctccgttccactat 30006036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #161
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 162 - 225
Target Start/End: Original strand, 36871304 - 36871368
Alignment:
Q  162 acccagttcggtccaata-tgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactatgatga 225  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| | ||||  |||||||| ||||    
T  36871304 acccagttcggtccaatactgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactataatga 36871368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #162
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 156 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 38890299 - 38890235
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| | | |||||||||||| | |||| |||||||||    
T  38890299 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtataggggagagagcagccctccgatccactat 38890235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #163
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 156 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 3314944 - 3314897
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagca 203  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| | ||||||||||||||    
T  3314944 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtttgggggagagagca 3314897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #164
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 386 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 5373180 - 5373096
Alignment:
Q  386 caatgtttctcaacccaagagatcct-cactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttg-taatccaagtttctctctctt 470  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||| |||  ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |  | ||||||||||||||||    
T  5373180 caatgtttcccaacccaagagaaccttcac--caaagactctcaaccttaaagttacctcctttgatttttcaagtttctctctctt 5373096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #165
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 156 - 203
Target Start/End: Original strand, 5926762 - 5926809
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagca 203  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| |||| |||||||||||    
T  5926762 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgcgggagagagca 5926809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #166
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 156 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 6232059 - 6232012
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagca 203  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||| ||||    
T  6232059 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctaatcggggggagacagca 6232012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #167
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 179 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 6303467 - 6303420
Alignment:
Q  179 atgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactatgatgaa 226  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||    
T  6303467 atgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactataatgaa 6303420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #168
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 156 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 15781138 - 15781091
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagca 203  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| | ||||||||||||||    
T  15781138 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtgtgggggagagagca 15781091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #169
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 543 - 586
Target Start/End: Original strand, 21711602 - 21711645
Alignment:
Q  543 tccaaatcatgccacgattgatgcgtacgacccaaggtacgacc 586  Q
    |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21711602 tccaaatcgtgacacgattggtgcgtacgacccaaggtacgacc 21711645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #170
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 160 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 26720802 - 26720759
Alignment:
Q  160 tgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagca 203  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||    
T  26720802 tgacccagttcggtccaaattgacctaatctaggggagagagca 26720759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #171
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 156 - 203
Target Start/End: Original strand, 27101179 - 27101226
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagca 203  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  27101179 ttgttgatccagttcggtccaaattgacctattctgggggagagagca 27101226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #172
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 138 - 220
Target Start/End: Original strand, 44700462 - 44700543
Alignment:
Q  138 aacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga-gcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||| | |||||||||   ||||||||||||||||||    
T  44700462 aacaaacacacgaaa-gattgttgacctagttcggtccaacttgacctaatgt-ggggagagattgatctctccaatccactat 44700543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #173
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 156 - 203
Target Start/End: Original strand, 47701669 - 47701716
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagca 203  Q
    ||||||| |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  47701669 ttgttgatccagttcgatccaaattgacctaatctgggggagagagca 47701716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #174
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 156 - 203
Target Start/End: Original strand, 51727005 - 51727052
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagca 203  Q
    ||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  51727005 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagca 51727052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #175
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 156 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 51943629 - 51943582
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagca 203  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| | ||||||||||||||    
T  51943629 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagca 51943582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #176
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 417 - 479
Target Start/End: Original strand, 53921744 - 53921807
Alignment:
Q  417 caaagacactcaaccctaaagttacctcctttg-taatccaagtttctctctcttcaagctctc 479  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||| |   |||||||| |||||||||||||||||    
T  53921744 caaagactctcaaccctaaagttacctcatttgatttcccaagtttttctctcttcaagctctc 53921807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #177
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 12 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 3323790 - 3323752
Alignment:
Q  12 agcaaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaa 50  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  3323790 agcaaaggaagtggtaatcaatgcataaagtgtctccaa 3323752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #178
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 164 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 5858718 - 5858656
Alignment:
Q  164 ccagttcggtccaat-atgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactatgatga 225  Q
    ||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| |||||  ||||||||| ||||    
T  5858718 ccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctctgatccactataatga 5858656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #179
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 156 - 225
Target Start/End: Original strand, 10595034 - 10595104
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaat-atgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactatgatga 225  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| |||||||| | |||||||||||||| ||||||  |||||||| ||||    
T  10595034 ttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtatgggggagagagcagctctccgttccactataatga 10595104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #180
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 158 - 220
Target Start/End: Original strand, 18096900 - 18096962
Alignment:
Q  158 gttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||| ||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  18096900 gttgaccaagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagctctccgttccactat 18096962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #181
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 194 - 236
Target Start/End: Original strand, 21353604 - 21353646
Alignment:
Q  194 ggagagagcatctctccaatccactatgatgaaagtgttacaa 236  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  21353604 ggagagagcacctctccaatccactaagatgaaagtgatacaa 21353646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #182
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 156 - 225
Target Start/End: Original strand, 48390302 - 48390372
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaat-atgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactatgatga 225  Q
    ||||| ||||||||||||  ||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||  |||||||| ||||    
T  48390302 ttgtttacccagttcggtttaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctccgttccactataatga 48390372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #183
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 156 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 54188690 - 54188621
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaat-atgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactatgatga 225  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| |||||||| ||||||| |||||||| |||||| ||||||||| ||||    
T  54188690 ttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctgggg-agagagcagctctccgatccactataatga 54188621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #184
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 526 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 4569551 - 4569490
Alignment:
Q  526 aaaatcgtgccacgttttcca-aatcatgccacgattgatgcgtacgacccaaggtacgacc 586  Q
    ||||||||| ||||||||||| || | || |||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  4569551 aaaatcgtgtcacgttttccacaaccgtgacacggttggtgcgtacgacccaaggtacgacc 4569490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #185
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 417 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 7764395 - 7764338
Alignment:
Q  417 caaagacactcaaccctaaagttacctcctttg-taatccaagtttctctctcttcaa 473  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||||    
T  7764395 caaagaccctcaactctaaagttacctcctttgatttcccaagtttctctctcttcaa 7764338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #186
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 152 - 201
Target Start/End: Original strand, 10207935 - 10207983
Alignment:
Q  152 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagag 201  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| || |||||||||||||||||||    
T  10207935 aagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagag 10207983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #187
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 164 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 32891264 - 32891207
Alignment:
Q  164 ccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga-gcatctctccaatccactat 220  Q
    |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  32891264 ccagttcggtccaacatgacctactccgggggagagatttatctctccaatccactat 32891207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #188
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 145 - 220
Target Start/End: Original strand, 43401789 - 43401866
Alignment:
Q  145 acaccaaaagattgttgacccagttcggtccaa-tatgacctaatctgggggagaga-gcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||  |||||||| ||||| |||||||   || |||||||||||||||    
T  43401789 acaccaagagattgttcacccagttcggtccaaccatgacctactctggaggagagattaatttctccaatccactat 43401866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #189
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 153 - 220
Target Start/End: Original strand, 43403740 - 43403809
Alignment:
Q  153 agattgttgacccagttcggtccaa-tatgacctaatctgggggagaga-gcatctctccaatccactat 220  Q
    |||||||| ||||||||||||||||  |||||||| ||||| |||||||   ||||||||||||||||||    
T  43403740 agattgttcacccagttcggtccaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactat 43403809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #190
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 526 - 586
Target Start/End: Original strand, 43404301 - 43404362
Alignment:
Q  526 aaaatcgtgccacgttttcc-aaatcatgccacgattgatgcgtacgacccaaggtacgacc 586  Q
    ||||||||| |||| ||||| ||||| || |||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  43404301 aaaatcgtgtcacgatttcccaaatcgtgacacgtttggtgcgtacgacccaaggtacgacc 43404362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #191
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 156 - 209
Target Start/End: Original strand, 43423461 - 43423514
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctc 209  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| |||  ||||||||||| |||||    
T  43423461 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctcagggagagagcagctctc 43423514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #192
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 156 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 45883199 - 45883134
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatct-gggggagagagcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| ||||||||||||| | ||||  ||||||||    
T  45883199 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctagggggagagagcagccctccgttccactat 45883134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #193
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 138 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 801279 - 801195
Alignment:
Q  138 aacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtcc-aatatgacctaatctgggggagagagcat-ctctccaatccactat 220  Q
    |||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| ||  ||||||| ||||| |||||||   | ||||||||||||||||    
T  801279 aacaaagacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactat 801195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #194
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 138 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 9581468 - 9581385
Alignment:
Q  138 aacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtcc-aatatgacctaatctgggggagaga-gcatctctccaatccactat 220  Q
    |||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||| ||  ||||||| ||||| |||||||   ||||||||||||||||||    
T  9581468 aacaaacacatcaaa-gattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactat 9581385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #195
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 156 - 220
Target Start/End: Original strand, 18099168 - 18099232
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactat 220  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||||| ||| |||||||||||| | ||||  ||||||||    
T  18099168 ttgttgacccagttcggtccatattgacctagtctaggggagagagcagccctccgttccactat 18099232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #196
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 138 - 220
Target Start/End: Original strand, 19683871 - 19683954
Alignment:
Q  138 aacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatat-gacctaatctgggggagagagc-atctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  | |||||| | ||| |||||||   ||||||||||||||||||    
T  19683871 aacaaacacaccaaa-gattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactatggaggagagattgatctctccaatccactat 19683954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #197
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 141 - 220
Target Start/End: Original strand, 22834989 - 22835067
Alignment:
Q  141 aaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga-gcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||  ||||||||| ||| |||||||   ||||||||||||||||||    
T  22834989 aaacacaccaaat-attgttgacc-agttcggtccaacttgacctaatatggcggagagattgatctctccaatccactat 22835067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #198
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 417 - 449
Target Start/End: Original strand, 22835243 - 22835275
Alignment:
Q  417 caaagacactcaaccctaaagttacctcctttg 449  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22835243 caaagaccctcaaccctaaagttacctcctttg 22835275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #199
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 152 - 236
Target Start/End: Original strand, 24968108 - 24968190
Alignment:
Q  152 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactatgatgaaagtgttacaa 236  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| || | |||| | |||||||||| | |||||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  24968108 aagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcttaattttggggagagagtagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaa 24968190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #200
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 417 - 449
Target Start/End: Original strand, 26386722 - 26386754
Alignment:
Q  417 caaagacactcaaccctaaagttacctcctttg 449  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26386722 caaagactctcaaccctaaagttacctcctttg 26386754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #201
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 155 - 223
Target Start/End: Original strand, 29100162 - 29100230
Alignment:
Q  155 attgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactatgat 223  Q
    |||||| |||||||||||||||| || ||| | | | ||| |||||||| ||||||| |||||||||||    
T  29100162 attgtttacccagttcggtccaaaattacccactatagggaagagagcagctctccattccactatgat 29100230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #202
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 417 - 449
Target Start/End: Original strand, 29196642 - 29196674
Alignment:
Q  417 caaagacactcaaccctaaagttacctcctttg 449  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  29196642 caaagaccctcaaccctaaagttacctcctttg 29196674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0087 (Bit Score: 436; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0087
Description:

Target: scaffold0087; HSP #1
Raw Score: 436; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 37069 - 36486
Alignment:
Q  12 agcaaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaactaaaaacagacctagacttagtgtagagcaacaccacaagcataaacaaa 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  37069 agcaaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaac-aaaaacagacctagacttggtgtagaccaacaccacaagtataaacaaa 36971  T
Q  112 gcacaaagataagcaatgaaagaa-ggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctcc 210  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||| ||    
T  36970 gcacaaagataagcaataaaagaaaggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctagggaagagagcagctcgcc 36871  T
Q  211 aatccactatgatgaaagtgttacaa-ga--------aaaatagtttgcaagcttacacaagaacaagacttaatttctacccatttgtgtttctcactc 301  Q
    || ||||||||||||||||||||||| ||        ||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||    
T  36870 aacccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaaatagcttgcaagcttacacaagaacaagacatgatttctacccatttgtgtttcccactc 36771  T
Q  302 tctcaataatgaaccctaaagggaagacacaaaaggaagcttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaaatgtttacaatgtttctcaaccc 401  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||  ||||||    
T  36770 tctcaataatgaaccctaaagagaagacacaaaaggaagcttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgttttccaaccc 36671  T
Q  402 aagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatccaagtttctctctcttcaagctctccttcaaaatctgcacaagaaca 501  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36670 aagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatccaagtttctctctcttcaagctctccttcaaaatctgcacaagaaca 36571  T
Q  502 cttaaataacagtcttcagctgataaaatcgtgccacgttttccaaatcatgccacgattgatgcgtacgacccaaggtacgacc 586  Q
    |||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  36570 cttttatagcagtcttcagctgataaaatcgtgccacgttttccaaatcgtgccatgattggtgcgtacgacccaaggtacgacc 36486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0087; HSP #2
Raw Score: 427; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 44196 - 43615
Alignment:
Q  12 agcaaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaactaaaaacagacctagacttagtgtagagcaacaccacaagcataaacaaa 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44196 agcaaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaac-aaaaacagacctaatct-agtgtagagcaacaccacaagcataaacaaa 44099  T
Q  112 gcacaaagataagcaatgaaagaaggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctcca 211  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||    
T  44098 gaacaaagataagcaatgaaagaaggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgatctattctgggggagagagcagctctcca 43999  T
Q  212 atccactatgatgaaagtgttacaa-ga--------aaaatagtttgcaagcttacacaagaacaagacttaatttctacccatttgtgtttctcactct 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||        ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | | ||||    
T  43998 atccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaaatagcttgcaagcttatacaagaacaagacctaatttctacccatttgtgttccactctct 43899  T
Q  303 ctcaataatgaaccctaaagggaagacacaaaaggaagcttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaaatgtttacaatgtttctcaaccca 402  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||    
T  43898 ctcaataatgaaccctaaagagaagacacaaaaggaagcttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttcccaaccca 43799  T
Q  403 agagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatccaagtttctctctcttcaagctctccttcaaaatctgcacaagaacac 502  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  43798 aaagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatccaagtttctctctcttccagctctcctccaaaatctgcacaaaaacac 43699  T
Q  503 ttaaataacagtcttcagctgataaaatcgtgccacgttttccaaatcatgccacgattgatgcgtacgacccaaggtacgacc 586  Q
    ||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  43698 ttatatagcagtattcagctgataaaatcgtgccacgttttccaaatcgtgccacgattgatacatacgacccaaggtacgacc 43615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 432; Significance: 0; HSPs: 161)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 432; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 9353567 - 9352988
Alignment:
Q  12 agcaaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaactaaaaacagacctagacttagtgtagagcaacaccacaagcataaacaaa 111  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  9353567 agcaaaggaagtggtaaacaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaac-aaaaacagacctagtct-agtgtagagcaacaccacaagcatatacaaa 9353470  T
Q  112 gcacaaagataagcaatgaaagaaggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctcca 211  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9353469 gaacaaagataagcaatgaaagaaggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctcca 9353370  T
Q  212 atccactatgatgaaagtgttacaa-ga--------aaaatagtttgcaagcttacacaagaacaagacttaatttctacccatttgtgtttctcactct 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||        |||| || ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  9353369 atccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaaaaagcttgcaagcttacacaagaacaagatctaatttctacccatttgtgtttcccactct 9353270  T
Q  303 ctcaataatgaaccctaaagggaagacacaaaaggaagcttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaaatgtttacaatgtttctcaaccca 402  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||    
T  9353269 ctcaataatgaaccttaaagagaagacacaaaaggaagcttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttcccaaccca 9353170  T
Q  403 agagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatccaagtttctctctcttcaagctctccttcaaaatctgcacaagaacac 502  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  ||||||||||||||||||||    
T  9353169 agagatcctcactacaaagacacttaaccctaaagttacctcctttgtaatccaagtttctctctcttcatcctctcc--caaaatctgcacaagaacac 9353072  T
Q  503 ttaaataacagtcttcagctgataaaatcgtgccacgttttccaaatcatgccacgattgatgcgtacgacccaaggtacgacc 586  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  9353071 ttaaataccagtcttcagctgataaaatcgtgccacgttttccaaatcgtgccacgattgatatgtacgacccaaggtacgacc 9352988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 417; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 586
Target Start/End: Original strand, 14520089 - 14520673
Alignment:
Q  12 agcaaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaactaaaaacagacctaga-cttagtgtagagcaacaccacaagcataaacaa 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14520089 agcaaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaac-aaaaacagacctagatctaagtgtagagcaacaccacaagcataaacaa 14520187  T
Q  111 agcacaaagataagcaatgaaagaa-ggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctc 209  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||     
T  14520188 agcacaaagataagcactgaaagaaaggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctaggggggagagcagctctt 14520287  T
Q  210 caatccactatgatgaaagtgttacaa-ga--------aaaatagtttgcaagcttacacaagaacaagacttaatttctacccatttgtgtttctcact 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||        ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||    
T  14520288 caatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaaatagcttgcaagcttacacaagaacaagacctaatttctacccatttgtgttacccact 14520387  T
Q  301 ctctcaataatgaaccctaaagggaagacacaaaaggaagcttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaaatgtttacaatgtttctcaacc 400  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| |||||    
T  14520388 ctctcaattatgaaccctaaagagaagacacaaaaggaagcttttgatccttccaatggtgaaatctcactatccaaggtgtttacaatgtttcccaacc 14520487  T
Q  401 caagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatccaagtttctctctcttcaagctctccttcaaaatctgcacaagaac 500  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14520488 caagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatctaagtttctctctcttcaagctctccttcaaaatctgcacaagaac 14520587  T
Q  501 acttaaataacagtcttcagctgataaaatcgtgccacgttttccaaatcatgccacgattgatgcgtacgacccaaggtacgacc 586  Q
    ||||| |||  ||||| ||||||  ||||||||| ||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14520588 acttatataggagtctccagctgtcaaaatcgtgtcacgttttccaaatcgtgacacgattaatgcgtacgacccaaggtacgacc 14520673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 408; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 36932583 - 36932003
Alignment:
Q  15 aaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaactaaaaacagacctagacttagtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagca 114  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  36932583 aaaggaagaggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaaacagacctagtct-agtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagaa 36932485  T
Q  115 caaagataagcaatgaaagaaggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatc 214  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  36932484 caaagataagcaatgaaaaaaggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatc 36932385  T
Q  215 cactatgatgaaagtgttacaa----------gaaaaatagtttgcaagcttacacaagaacaagacttaatttctacccatttgtgtttctcactctct 304  Q
    ||||||||||||||||||||||          ||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  36932384 cactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaaaatagcttgcaagtttacataagaacaagacttaatttctacccatttgtgtttcccactctct 36932285  T
Q  305 caataatgaaccctaaagg-gaagacacaaaaggaagcttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaaatgtttacaatgtttctcaacccaa 403  Q
    |||||||||||||||||   |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||    
T  36932284 caataatgaaccctaaaacagaagacacaagaggaagcttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaa 36932185  T
Q  404 gagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatccaagtttctctctcttcaagctctccttcaaaatctgcacaagaacact 503  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  36932184 gagatcatcactataaagacactcaaccctaaagttccctcctttgcaatccaagtttctctctcttc-agctctcctccaaaaactgcacaagaacact 36932086  T
Q  504 taaataacagtcttcagctgataaaatcgtgccacgttttccaaatcatgccacgattgatgcgtacgacccaaggtacgacc 586  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||  || |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  36932085 taaataccagtcttcagctgataaaatcgtgccacgattttcaaattgtgtcacgattgatacgtacgacccaaggtacgacc 36932003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 393; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 574
Target Start/End: Original strand, 15464396 - 15464965
Alignment:
Q  15 aaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaactaaaaacagacctagacttagtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagca 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||| |||| ||    
T  15464396 aaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaac-aaaaacagacctagtct-agtgtagagcaacaccacaagtataaccaaaaca 15464493  T
Q  115 c-aaagataagcaatgaaagaaggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaat 213  Q
      ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15464494 ataaagataagcaatgaaagaagaaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgatctaatctgggggagagagcagctctccaat 15464593  T
Q  214 ccactatgatgaaagtgttacaa----------gaaaaatagtttgcaagcttacacaagaacaagacttaatttctacccatttgtgtttctcactctc 303  Q
    |||||||||||||||||||||||          ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15464594 ccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaaaatagcttgcaagcttacacaagaacaagacctaatttctacccatttgtgtttcccactctc 15464693  T
Q  304 tcaataatgaaccctaaagg-gaagacacaaaaggaagcttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaaatgtttacaatgtttctcaaccca 402  Q
     ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||    
T  15464694 acaataatgaaccctaaaagagaagacacaaaaggaagcttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacgatgtttcccaaccca 15464793  T
Q  403 agagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatccaagtttctctctcttcaagctctccttcaaaatctgcacaagaacac 502  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15464794 agagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagtttccttctttgtaatccaagtttctctctcttcaagctctcctccaaaatctgcacaagaacac 15464893  T
Q  503 ttaaataacagtcttcagctgataaaatcgtgccacgttttccaaatcatgccacgattgatgcgtacgacc 574  Q
    |||||||  |||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||| |||||||||    
T  15464894 ttaaatactagtcttctactgataaaatcgtgccacgatttccaaatcgtgtcacgattgatacgtacgacc 15464965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 315; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 12 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 11917212 - 11916625
Alignment:
Q  12 agcaaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaactaaaaaca--gacctaga-cttagtgtagagcaacaccacaagcataaac 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||  ||||| |  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11917212 agcaaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtcttcaagcaaaaaaaaaaaaaaaaaaagacctagatcttagtgtagagcaacaccacaagcataaac 11917113  T
Q  109 aaagcac-aaagataagcaatgaaagaa-ggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatct 206  Q
    |  |||  ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  11917112 agtgcaataaagataagcaatgagagaaaggaacaaacacaccga--gattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagct 11917015  T
Q  207 ctccaatccactatgatgaaagtgttacaaga----------aaaatagtttgcaagcttacacaagaacaagacttaatttctacccatttgtgtttct 296  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |          ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||     
T  11917014 ctccaatccactataatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaaatagtttgcaagcttacacaagaacaagacctaatttctacccattt-tgtgtca 11916916  T
Q  297 cactctctcaata-atgaaccctaaagggaagacacaaaaggaagcttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaaatgtttacaatgtttct 395  Q
    | | |||||||   ||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||     
T  11916915 cccactctcaaacgatgaaccctaa-gagaaaacacaaaaggaagtttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttcc 11916817  T
Q  396 caacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatccaagtttctctctcttcaagctctccttcaaaatctgcaca 495  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11916816 caacccaagagatcctcactacaaagaaactcaaccctaaagttacctcctttgtaatccaagtttctctcacttcaagctctccttcaaaatctgcaca 11916717  T
Q  496 agaacacttaaataacagtcttcagctgataaaatcgtgccacgttttc-caaatcatgccacgattgatgcgtacgacccaaggtacgacc 586  Q
    |||||||||| ||| |||| |||| |||  ||||||||| ||||||||| |||||| ||  ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11916716 agaacacttatatagcagttttcaactgtcaaaatcgtgtcacgttttctcaaatcgtgatacgattggtgcgtacgacccaaggtacgacc 11916625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 49 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 12084376 - 12083831
Alignment:
Q  49 aagcaacaacaactaaaaacagacctaga-cttagtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagcacaaagataagcaatgaaagaa-ggaacaaacac 146  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12084376 aagcaacaaaaac-aaaaacagacctagatctaagtgtagagcaacaccacaagcataatcaaagcacaaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacac 12084278  T
Q  147 accaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactatgatgaaagtgttacaa-ga------- 238  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||           
T  12084277 accaaaatattgttgacccagttcggtccactatgacctaatatggggcagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaa 12084178  T
Q  239 -aaaatagtttgcaagcttacacaagaacaagacttaatttctacccatttgtgtttctcactctctcaataatgaaccctaaagggaagacacaaaagg 337  Q
     ||| ||  ||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  | ||||||| ||||| |||| ||||| |  || ||||||||||    
T  12084177 gaaattaacttaaaagcttacacaagaacaagacctaatttctacccatttgtgtcacccactctcacaata-tgaatcctaa-gaaaaaacacaaaagg 12084080  T
Q  338 aagcttttgatccttccaa-tggtgaaatctcactacccaaaatgtttacaatgtttctcaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaa 436  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||  |||||| |||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12084079 aagctttt-atccttccaaatggtgaattctcactacccaaggtgtttaaaatgtttaccaacccaagagatcctcactataaagacactcaaccctaaa 12083981  T
Q  437 gttacctcctttgtaatccaagtttctctctcttcaagctctccttcaaaatctgcacaagaacacttaaataacagtcttcagctgataaaatcgtgcc 536  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||  ||||| ||| |    
T  12083980 gttacctcctttgtaatccaagtttctctcacttctagctctccttcaaaatctgcacaagaacacttatatagcagtcttcaactgtcaaaattgtgtc 12083881  T
Q  537 acgttttccaaatcatgccacgattgatgcgtacgacccaaggtacgacc 586  Q
    |||||||||||||| || |||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  12083880 acgttttccaaatcgtgacacgattggtgcatacgacccaaggtacgacc 12083831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 15 - 586
Target Start/End: Original strand, 38219261 - 38219848
Alignment:
Q  15 aaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaactaaaaacagacctagacttagtgtagagcaacaccaca--agcataaacaaag 112  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||  ||   | ||||||    
T  38219261 aaaggaagtggtaatctatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaac-aaaaacagccctagact-agtgtagagcaacaccacacaagagaatacaaag 38219358  T
Q  113 caca-aagataagcaatgaaagaaggaacaaacacaccaaaa-gattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctcc 210  Q
    || | ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  38219359 caaacaagataagcaa-gaaaggaagaacaaacacaccaaaaagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcc 38219456  T
Q  211 aatccactatgatgaaagtgttacaa----------gaaaaatagtttgcaagcttacacaagaacaagacttaatttctacccatttgtgtttctc-ac 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||          ||||||||| ||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||| | ||    
T  38219457 aatccactatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaaaatagcttgcaagcttacacaagaacaagtcctagtttctacccatttgtgtttccccac 38219556  T
Q  300 tctctcaataatgaaccctaaagg-gaagacacaaaaggaagcttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaaatgtttacaatgtttctc-- 396  Q
    |||| ||||| ||||||||||| | |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||      
T  38219557 tctcacaata-tgaaccctaaaagagaagacacaagaggaagctttagatccttccaatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttttccc 38219655  T
Q  397 aacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatccaagtttctctctct----tc----aagctctccttcaaaat 488  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    ||    ||||||| |||||||||    
T  38219656 aacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctagagttccctcctttgtaatccaagtttctctctctaagctcttcaaagctcttcttcaaaat 38219755  T
Q  489 ctgcacaagaacacttaaataacagtcttcagctgataaaatcgtgccacgttttccaaatcatgccacgattgatgcgtacgacccaaggtacgacc 586  Q
    ||||||||||||||     ||  || ||||  |||||||||| ||| |||| |||||||||| || ||||||||   |||||| | ||||||||||||    
T  38219756 ctgcacaagaacac-----tactagccttcctctgataaaattgtgtcacgatttccaaatcgtgtcacgattggaacgtacgtcacaaggtacgacc 38219848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 15 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 17004193 - 17003706
Alignment:
Q  15 aaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaactaaaaacagacctaga-cttagtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagc 113  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | || |||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  17004193 aaaggaagtggtaatcaatagataaagtgtctccaagcaacaacaac-aaaaacagacctaaatctaagtgta-agcaacaccacaagcataatcaaagc 17004096  T
Q  114 acaaa-gataagcaatgaaagaa-ggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctcca 211  Q
    | ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  17004095 aaaaaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaa--gattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctcttca 17003998  T
Q  212 atccactatgatgaaagt-----------gttacaagaaaaatagtttgcaagcttacacaagaacaagacttaatttctacccattt-gtgtttctcac 299  Q
    ||||||||||||||||||           ||||||| |||| ||  || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  | |  |||||    
T  17003997 atccactatgatgaaagtatttcaaaagagttacaa-aaaattaacttacaagcttacacaagaacaagacctaatttctacccatttaatttcactcac 17003899  T
Q  300 tctctcaataatgaaccctaaagggaagacacaaaaggaagc-ttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaaatgtttacaatgtttctcaa 398  Q
    |||| |||| ||||| ||| ||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||  ||    
T  17003898 tctcacaat-atgaatcct-aagagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttccaaa 17003801  T
Q  399 cccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatccaagtttctctctcttcaagctctccttcaaaatctgca 493  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  17003800 cccaagagaacctcactacaaagacattcaaccctaaagttatctcctttgtaatccaagtttctctctctcaaagctctccttcaaaatctgca 17003706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 15 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 31300829 - 31300342
Alignment:
Q  15 aaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaactaaaaacagacctaga-cttagtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagc 113  Q
    ||||||| |||||||||||   |||||||| | ||||||| ||||||  |||||||||||| | || |||||||||||||||||||||  ||| |||| |    
T  31300829 aaaggaactggtaatcaatagataaagtgttttcaagcaaaaacaac--aaaacagacctaaatctaagtgtagagcaacaccacaagtgtaatcaaaac 31300732  T
Q  114 ac-aaagataagcaatgaaaga-aggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctcca 211  Q
    |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | |||||||    
T  31300731 aataaagataagcaatgaaagagaggaacaaacacaccaa--gattgttgacccagttcggtccaatatgacctagtctgagggagagagaaactctcca 31300634  T
Q  212 atccactatgatgaaagtgtta----------caagaaaaatagtttgcaagcttacacaagaacaagacttaatttctacccatttgtgttt---ctca 298  Q
    |||||||| |||||||||||||          |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |  |    | ||    
T  31300633 atccactaagatgaaagtgttataatgagttgcaagaaaaatagtttgcaagcttacacaagaacaagtcctaatttctacccatttctcatatcaccca 31300534  T
Q  299 ctctctcaataatgaaccctaaagggaagacacaaaaggaagc-ttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaaatgtttacaatgtttctca 397  Q
    | ||||||||   ||| ||||| | ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  31300533 cactctcaat---gaatcctaa-gagaaaacacaaaaggaagccttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttctca 31300438  T
Q  398 acccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatccaagtttctctctcttcaagctctccttcaaaatctgca 493  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  || |||| ||||||||||||||    
T  31300437 acccaagagaacctcactacaaagacactcaaccttaaagttacctcctttgcaatccaagtttctctctctaaaacctcttcttcaaaatctgca 31300342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 15 - 586
Target Start/End: Original strand, 35387527 - 35388117
Alignment:
Q  15 aaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaactaaaaacagacctagacttagtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagca 114  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| || ||||||||||||| |||||||   | ||||||||    
T  35387527 aaaggaagtgataatctatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaac-aaaaacaaccctagtct-agtgtagagcaactccacaagagaatacaaagca 35387624  T
Q  115 caa-agataagcaatgaaagaaggaacaaacacaccaaaa-gattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaa 212  Q
     |  |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  35387625 aacgagataagcaa-gaaaggaagaacaaacacaccaaaaagattgttgacccaattcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaa 35387722  T
Q  213 tccactatgatgaaagtgttacaa----------gaaaaatagtttgcaagcttacacaagaacaagacttaatttctacccatttgtgtttctc-actc 301  Q
    || |||||||||||||||||||||          ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| | || |||||||||||||||||||| | ||||    
T  35387723 tctactatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaaaatagcttgcaagcttacacaagaataagtcctagtttctacccatttgtgtttccccactc 35387822  T
Q  302 tctcaataatgaaccctaaagg-gaagacacaaaaggaagcttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaaatgtttacaatgtttct--caa 398  Q
    || ||||| ||||||||||| | |||||||| | |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| |  |||    
T  35387823 tcacaata-tgaaccctaaaagagaagacactagaggaagttttagatccttccaatggtgaaatctcactacccaaggtgattacaatgttttttccaa 35387921  T
Q  399 cccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatccaagtttctctctc--------ttcaagctctccttcaaaatct 490  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||        | ||||||||| | ||||||||    
T  35387922 cccaagagaccctctctacaaagacactcaaccctagagttccctcctttgtaatccaagtttttctctctaagctcttccaagctctcttccaaaatct 35388021  T
Q  491 gcacaagaacacttaaataacagtcttcagctgataaaatcgtgccacgttttccaaatcatgccacgattgatgcgtacgacccaaggtacgacc 586  Q
    |||||||||||||||||||  || ||||  |||||||||||||| |||| |||||| ||| || |||||||    |||||| ||||||||| ||||    
T  35388022 gcacaagaacacttaaatactagccttcctctgataaaatcgtgtcacgatttccagatcgtgtcacgatttgaacgtacgtcccaaggtatgacc 35388117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 12 - 469
Target Start/End: Original strand, 28832120 - 28832583
Alignment:
Q  12 agcaaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaactaaaaacagacctagacttagtgtagagcaacaccacaagcataaacaaa 111  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28832120 agcaaaggaagtggtaatcaatggataaagtgtcttcaagcaacaacaac-aaaaacagacctaatctaagtgtagagcaacaccacaagcataatcaaa 28832218  T
Q  112 gcac-aaagataagcaatgaaagaaggaa-caaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctc 209  Q
     ||  ||||||||||||||||||||  || ||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  28832219 tcaataaagataagcaatgaaagaaacaaacaaacacaccaa--gattgttgacccggttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctc 28832316  T
Q  210 caatccactatgatgaaagtgttacaa-ga--------aaaatagtttgcaagcttacacaagaacaagacttaatttctacccattt---gtgtttctc 297  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||        ||| ||| ||  |||  |||| |||||||||   ||||||||||||||||    | |  | |    
T  28832317 caatccactaagatgaaagtgttacaatgagttacaagaaattagcttataag--tacaaaagaacaagttctaatttctacccatttttcatatcaccc 28832414  T
Q  298 actctctcaataatgaaccctaaagggaagacacaaaaggaagc-ttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaaatgtttacaatgtttctc 396  Q
    || |||||   |||||| ||| ||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |    
T  28832415 acactctc---aatgaatcct-aagagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttccc 28832510  T
Q  397 aacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatccaagtttctctctct 469  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28832511 aacccaagagaacctcactacaaagacactcaactctaaagttacctcctttgtaatccaagtttctctctct 28832583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 12 - 449
Target Start/End: Original strand, 19588606 - 19589051
Alignment:
Q  12 agcaaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaactaaaaacagacctaga-cttagtgtagagcaacaccacaagcataaacaa 110  Q
    ||||||||||||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| | || |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  19588606 agcaaaggaagtggtaatcaatagataaagcgtctccaagcaacaacaacaaaaaa-agacctaaatctaagtgtagagcaacaccacaagcataatcaa 19588704  T
Q  111 agcac-aaagataagcaatgaaagaa-ggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctct 208  Q
    ||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| | ||    
T  19588705 agcaataaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacactc--aaagattgttgacccagttcggtccaatatgaactaatcttagggagagagcagccct 19588802  T
Q  209 ccaatccactatgatgaaagtgttacaaga----------aaaatagtttgcaagcttacacaagaacaagacttaatttctaccc-atttgtgtttctc 297  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |          ||| ||  ||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||  | |    
T  19588803 ccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattaccttataagcttacacaagaacaagacctaatttctaccctttttgtgtcaccc 19588902  T
Q  298 actctctcaataatgaaccctaaagggaagacacaaaaggaag-cttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaaatgtttacaatgtttctc 396  Q
    ||  ||||   |||||| ||| ||| ||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |    
T  19588903 acaatctc---aatgaatcct-aagagaaaacacaaaaggaagatttttgatccttccaatggtgaaatctcactgcccaagatgtttacaatgtttccc 19588998  T
Q  397 aacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttg 449  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19588999 aacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaaattacctcctttg 19589051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 182; E-Value: 4e-98
Query Start/End: Original strand, 12 - 519
Target Start/End: Complemental strand, 11182071 - 11181554
Alignment:
Q  12 agcaaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaactaaaaa-cagacctaga-cttagtgtagagcaacaccacaagcataaaca 109  Q
    ||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || | || |||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  11182071 agcaaagtaagtggtaatcaatagataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaaaacagacttaaatctaagtgtagagcaataccacaagcataatca 11181972  T
Q  110 aagcac-aaagataagcaatgaaagaag-gaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatct-gggggagagagcatct 206  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |   || | ||| ||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| |     
T  11181971 aagcaataaagataagcaatgaaagaaatgaacaaacacaccaaga---tggtaacctagttcggtctaatatgacctactctagggggagagagcaacc 11181875  T
Q  207 ctccaatccactatgatgaaagtgttacaa--ga--------aaaatagtttgcaagcttacacaagaacaagacttaatttctacccatttgtgtttct 296  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||  ||        ||| |||  |  |||||  || | ||||||||| ||||||||||||||||   | ||     
T  11181874 ctccaatccactaagatgaaagtgatacaaatgagttacaagaaattagcctaaaagctctcaaatgaacaagacctaatttctacccattttcatgtca 11181775  T
Q  297 cactctctcaataatgaaccctaaagggaagacacaaaaggaagctttt-gatccttccaatggtgaaatctcactacccaaaatgtttacaatgtttct 395  Q
    | | | ||||  |||||| ||||| | ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||     
T  11181774 cccacactcac-aatgaatcctaa-gagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatttcactacccaaggtgtttacaatgtttcc 11181677  T
Q  396 caacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatccaagtttctctctcttcaagctctccttcaaaatctgcaca 495  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |    
T  11181676 caacccaagagaacctcactacaaagacactcaaccataaagttacctcctttgtaaaccaagtttctctctcttcaagctctacttcaaaaactgca-a 11181578  T
Q  496 agaacacttaaataacagtcttca 519  Q
    |||||||||| |||||||||||||    
T  11181577 agaacacttatataacagtcttca 11181554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 174; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 15 - 468
Target Start/End: Original strand, 3880166 - 3880628
Alignment:
Q  15 aaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaactaaaaacagacctaga-cttagtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagc 113  Q
    |||||||||||||||||||   |||||||||| ||| |||||||||    ||||||||||| | || |||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  3880166 aaaggaagtggtaatcaatagataaagtgtcttcaatcaacaacaa----aaacagacctaaatctaagtgtaaagcaacaccacaagcataatcaaagc 3880261  T
Q  114 ac-aaagataagcaatgaaagaa-ggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctcca 211  Q
    |  |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  |||||||||  |||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||    
T  3880262 aataaagataagcaatgaaagaaaggaacaa-cacaccaa--gattgttgattcagttctgtccaatatgacctaatctgaggcagagagcagctctcca 3880358  T
Q  212 atccactatgatgaaagtgttacaaga----------aaaatagtttgcaagcttacacaagaacaagacttaatttctacccattt-gtgtttctcact 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |          ||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||  | ||||    
T  3880359 atccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagtttacaagcttacacaagaacaagacctaatttctacccattttgtgtcacccact 3880458  T
Q  301 ctctcaataatgaaccctaaagggaagacacaaaaggaagctttt-gatccttccaatggtgaaatctcactacccaaaatgtttacaatgtttctcaac 399  Q
    ||| ||||| |||| ||||  | ||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||    
T  3880459 ctcacaata-tgaatcctag-gagaaaaaacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatctcacaacccaatgtgtttacaatgtttctcaac 3880556  T
Q  400 c--caagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatcc-aagtttctctctc 468  Q
    |  ||||||| ||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||    
T  3880557 cctcaagagaacctcactacaaggacactcaactctcaagttacctcctttgtattcctaggtttctctctc 3880628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 134 - 468
Target Start/End: Original strand, 10281734 - 10282080
Alignment:
Q  134 aaggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactatgatgaaagtgtta 233  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10281734 aaggaacaaacacaccaaa-gattgttgacccagttcggtccaatatgacctgatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgtta 10281832  T
Q  234 caaga----------aaaatagtttgcaagcttacacaagaacaagacttaatttctacccattt-gtgtttctcactctctcaataatgaaccctaaag 322  Q
    ||| |          ||| ||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||  | ||| ||| ||||| |||| ||||| |    
T  10281833 caaaagagttacaagaaattagcttacaagcttacacaagaacaagacctaatttctacccattttgtgtcacccacactcacaata-tgaatcctaa-g 10281930  T
Q  323 ggaagacacaaaaggaagctttt-gatccttccaatggtgaaatctcactacccaaaatgtttacaatgtttctcaacc--caagagatcctcactacaa 419  Q
     ||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||  ||||||| |||||||||||    
T  10281931 agaaaacacaaaagaaagctttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttcacaaccctcaagagaacctcactacaa 10282030  T
Q  420 agacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatc-caagtttctctctc 468  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  10282031 agacactcaaccctaaagttacctcctttgtattctcaagtttctctctc 10282080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 15 - 586
Target Start/End: Original strand, 24135712 - 24136302
Alignment:
Q  15 aaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaa-caacaactaaaaacagacctagacttagtgtagagcaacaccacaagcataa-acaaag 112  Q
    ||||| |||||||||| ||| |||||| |||||||||||| |||||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  24135712 aaagggagtggtaatctatgagtaaagagtctccaagcaaacaacaac--aaaacagccctagact-agtgtagagcaacaccacaag-ataatacaaag 24135807  T
Q  113 caca-aagataagcaatgaaagaaggaacaaacacaccaa-aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctcc 210  Q
    || | ||||||||| |  |||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||| || |||    
T  24135808 caaacaagataagctagaaaaggaagaacaaacacaccaagaagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctatcc 24135906  T
Q  211 aatccactatgatgaaagtgttacaa----------gaaaaatagtttgcaagcttacacaagaacaagacttaatttctacccatttgtgtttctc-ac 299  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||          ||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||  |||||||| || ||||||| | ||    
T  24135907 aatgcactaagatgaaagtgttacaaagggttacaagaaaaatagcttgcaagcttacacaagaacaagtcctagattctaccctttggtgtttccccac 24136006  T
Q  300 tctctcaataatgaaccctaaagg-gaagacacaaaaggaagcttttgatccttccaatggtgaaatc-tcactacccaaaatgtttacaatgtttctc- 396  Q
    |||| ||||  ||||||||||| | |||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||  || ||||||||||| ||     
T  24136007 tctcacaatg-tgaaccctaaaagagaagacactagaggaagctttagatccttccaatggtgaactcctcactacccaaggtgattacaatgtttttcc 24136105  T
Q  397 -aacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatccaagtttctctctctt--------caagctctccttcaaaa 487  Q
     |||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||| || |||||    
T  24136106 caacccaagagacactttctacaaagacactcaaccctttggttccctcctttgtaatccaagtttctctctcttagctcttccaagctctactccaaaa 24136205  T
Q  488 tctgcacaagaacac-ttaaataacagtcttcagctgataaaatcgtgccacgttttccaaatcatgccacgattgatgcgtacgacccaaggtacgacc 586  Q
      ||||||||||||| ||| |||  ||  |||  |||||| |||||||||||| |||||| ||| || |||||||  |||||||| ||||||||| ||||    
T  24136206 -atgcacaagaacactttatatactagctttcctctgatacaatcgtgccacgatttccagatcgtgtcacgatt--tgcgtacgtcccaaggtatgacc 24136302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 15 - 333
Target Start/End: Original strand, 38192036 - 38192365
Alignment:
Q  15 aaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaactaaaaacagacctagacttagtgtagagcaacaccaca--agcataaacaaag 112  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||  ||   | ||||||    
T  38192036 aaaggaagtggtaatctatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaac-aaaaacagccctagact-agtgtagagcaacaccacacaagagaatacaaag 38192133  T
Q  113 caca-aagataagcaatgaaagaaggaacaaacacaccaaaa-gattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctcc 210  Q
    || | ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  38192134 caaacaagataagcaa-gaaaggaagaacaaacacaccaaaaagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcc 38192231  T
Q  211 aatccactatgatgaaagt----------gttacaagaaaaatagtttgcaagcttacacaagaacaagacttaatttctacccatttgtgttt-ctcac 299  Q
    |||||||||||||||||||          |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||| | |||    
T  38192232 aatccactatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaaaatagcttgcaagcttacacaagaacaagtcctagtttctacccatttgtgtttccccac 38192331  T
Q  300 tctctcaataatgaaccct-aaagggaagacacaa 333  Q
    |||| |||| ||||||||| |||| ||||||||||    
T  38192332 tctcacaat-atgaaccctaaaagagaagacacaa 38192365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 12 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 42127646 - 42127273
Alignment:
Q  12 agcaaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaactaaaaacagacctaga-cttagtgtagagcaacaccacaagcataaacaa 110  Q
    ||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||| || | || | |||||||||||||||||||||||| |||    
T  42127646 agcaaagaaagtggtaatcaatggataaagtgtctccaagcaacaacaac--aaaacagacttaaatctaattgtagagcaacaccacaagcataatcaa 42127549  T
Q  111 agcac-aaagataagcaatgaaagaa-ggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctct 208  Q
    | ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| | |     
T  42127548 aacaataaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaa--gattgttgacccagttcgatctaatatgacctaatctgggggagagagcagcccc 42127451  T
Q  209 ccaatccactatgatgaaagtgttacaa-ga--------aaaatagtttgcaagcttacacaagaacaagacttaatttctacccattt---gtgtttct 296  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||        ||| ||| ||  ||||||||| ||||||||| | || |||||||||||||    | |  |     
T  42127450 ccaatccactaagatgaaagtgttacaatgagttacaagaaattagcttataagcttacaaaagaacaagtcctactttctacccatttttcatatcacc 42127351  T
Q  297 cactctctcaataatgaaccctaaagggaagacacaaaaggaagc-ttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaa 377  Q
    ||| |||||   |||||| ||| ||| ||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42127350 cacactctc---aatgaatcct-aagagaaaacacaaaagaaagctttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaa 42127273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 12 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 24553743 - 24553520
Alignment:
Q  12 agcaaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaactaaaaacagacctaga-cttagtgtagagcaacaccacaagcataaacaa 110  Q
    ||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| | || ||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  24553743 agcaaaggaagtgataatcaatggataaagtgtctccaagcaacatcaac-aaaaacagacctaaatctaagtgtagagaaacaccacaagcataatcaa 24553645  T
Q  111 agcac-aaagataagcaatgaaagaa-ggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctct 208  Q
    ||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| | ||    
T  24553644 agcaataaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaa--gattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatctatgggagagagcagc-ct 24553548  T
Q  209 ccaatccactatgatgaaagtgttacaa 236  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  24553547 ccactccactaagatgaaagtgttacaa 24553520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 328 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 24553440 - 24553280
Alignment:
Q  328 acacaaaaggaagctttt-gatccttccaatggtgaaatctcactacccaaaatgtttacaatgtttctcaacccaagagatcctcactacaaagacact 426  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24553440 acacaaaaggaagctttttgatccttctaatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaacctcactacaaagacact 24553341  T
Q  427 caaccctaaagttacctcctttgtaatccaagtttctctctcttcaagctctccttcaaaa 487  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||||||    
T  24553340 caacccttaagttacctcctttgtaatccaagtttctttctctaaaagttctccttcaaaa 24553280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 342 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 42127268 - 42127123
Alignment:
Q  342 ttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaaatgtttacaatgtttctcaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttac 441  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  42127268 ttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaggtgtatacaatgtttctcaacccaagagaacctcactacaaagatactcaaccttaaagttac 42127169  T
Q  442 ctcctttgtaatccaagtttctctctcttcaagctctccttcaaaa 487  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||||||||    
T  42127168 ctcctttgtaatccaagtttctcactctaaaacctctccttcaaaa 42127123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 380 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 13488166 - 13487960
Alignment:
Q  380 tgtttacaatgtttctcaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatcc-aagtttctctctcttcaagctct 478  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| |   | | ||||||| |||||||||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||| ||||||    
T  13488166 tgtttacaatgttttccaacccaagagaactctaat-caaagaccctcaaccctaaagttacctcctttgatttcccaagtttctctctcttctagctct 13488068  T
Q  479 ccttcaaaatctgcacaagaacacttaaataacagtcttcagctgataaaatcgtgccacgtttt-ccaaatcatgccacgattgatgcgtacgacccaa 577  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||  ||||| ||| |||||||| ||||||| || |||| ||| ||||||||||||||    
T  13488067 ccttcaaaatctgca-aaaaacacttatataacagtcttcagctgtcaaaattgtgtcacgttttcccaaatcgtgacacgtttggtgcgtacgacccaa 13487969  T
Q  578 ggtacgacc 586  Q
    |||||||||    
T  13487968 ggtacgacc 13487960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 417 - 586
Target Start/End: Original strand, 42426476 - 42426646
Alignment:
Q  417 caaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatcc-aagtttctctctcttcaagctctccttcaaaatctgcacaagaacacttaaataacagtc 515  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||   ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||    
T  42426476 caaagaccctcaaccctaaagttacctcctttgatttcccaagtttctctcttttcaagctctccttcaaaatctgca-aagaacacttatatagcagtc 42426574  T
Q  516 ttcagctgataaaatcgtgccacgtttt-ccaaatcatgccacgattgatgcgtacgacccaaggtacgacc 586  Q
    ||||||||  ||||| ||| |||||||| ||||||| || || | ||| |||||||||||||||||||||||    
T  42426575 ttcagctgtcaaaattgtgtcacgttttcccaaatcgtgacatgtttggtgcgtacgacccaaggtacgacc 42426646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 380 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 13239715 - 13239509
Alignment:
Q  380 tgtttacaatgtttctcaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttg-taatccaagtttctctctcttcaagctct 478  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |   | | ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||| ||||    
T  13239715 tgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaat-caaagaccctcaaccataaagttacctcctttgattttctaagtttctctctcttcaaactct 13239617  T
Q  479 ccttcaaaatctgcacaagaacacttaaataacagtcttcagctgataaaatcgtgccacgttttcca--aatcatgccacgattgatgcgtacgaccca 576  Q
     |||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| |  ||||| ||| |||||||||||  |||| || ||||||||||||||||||||||    
T  13239616 acttcaaaatctgca-aagaacacttatatagcagtcttcagc-gtcaaaattgtgtcacgttttccatcaatcgtgtcacgattgatgcgtacgaccca 13239519  T
Q  577 aggtacgacc 586  Q
    ||||||||||    
T  13239518 aggtacgacc 13239509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 342 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 7160802 - 7160665
Alignment:
Q  342 ttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaaatgtttacaatgtttctcaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttac 441  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||  || |||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7160802 ttttgatccttccaatgatgaaatctcactgtccaaggtgattacaatgtttcccaatccaagagaacctcactacaaagacactcaaccctaaagttac 7160703  T
Q  442 ctcctttgtaat-ccaagtttctctctcttcaagctct 478  Q
    ||| |||||||| |||| ||||||  ||||||||||||    
T  7160702 ctcatttgtaatcccaaatttctcattcttcaagctct 7160665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 455 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 19806294 - 19806163
Alignment:
Q  455 caagtttctctctcttcaagctctccttcaaaatctgcacaagaacacttaaataacagtcttcagctgataaaatcgtgccacgtttt-ccaaatcatg 553  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| |||||||| |||| || ||    
T  19806294 caagtttctctctcttcaagctctccttcaaaatctgca-aagaacacttatatagcagtcttcagctgtcaaaatcgtgtcacgttttcccaagtcgtg 19806196  T
Q  554 ccacgattgatgcgtacgacccaaggtacgacc 586  Q
     |||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  19806195 acacgtttggtgcgtacgacccaaggtacgacc 19806163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 380 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 32636787 - 32636581
Alignment:
Q  380 tgtttacaatgtttctcaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatc-caagtttctctctcttcaagctct 478  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||| |   | | ||||||| || ||||||||||||||||||||||   || ||||||||||||||| ||||||||    
T  32636787 tgtttacaatgtttcactacccaagagaactctaat-caaagacccttaaccctaaagttacctcctttgatttctcaagtttctctctctccaagctct 32636689  T
Q  479 ccttcaaaatctgcacaagaacacttaaataacagtcttcagctgataaaatcgtgccacgtttt-ccaaatcatgccacgattgatgcgtacgacccaa 577  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| ||||||||  |||||| || |||||||| ||||||| || |||| ||| |||||| |||||||    
T  32636688 ccttcaaaatctgca-aagaacacttatatagcagttttcagctgtcaaaatcatgtcacgttttcccaaatcgtgacacgtttggtgcgtaagacccaa 32636590  T
Q  578 ggtacgacc 586  Q
    |||||||||    
T  32636589 ggtacgacc 32636581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 380 - 545
Target Start/End: Original strand, 28750860 - 28751025
Alignment:
Q  380 tgtttacaatgtttctcaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatcc-aagtttctctctcttcaagctct 478  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||| |   | | ||||||| |||||||||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||    
T  28750860 tgttttcaatgtttcccaacccaagagaactctaat-caaagaccctcaaccctaaagttacctcctttgatttcccaagtttctctctcttcaagctct 28750958  T
Q  479 ccttcaaaatctgcacaagaacacttaaataacagtcttcagctgataaaatcgtgccacgttttcc 545  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| |||||||||  ||||||||| ||||||||||    
T  28750959 ctttcaaaatctgcataagaacacttatatagcagacttcagctgtcaaaatcgtgtcacgttttcc 28751025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 380 - 574
Target Start/End: Complemental strand, 533732 - 533538
Alignment:
Q  380 tgtttacaatgtttctcaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatcc-aagtttctctctcttcaagctct 478  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |   | | ||||||| | |||||||||||||||||||||||   ||| || ||||||||||||||| ||||    
T  533732 tgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaat-caaagacccccaaccctaaagttacctcctttgatttcccaaatttctctctcttcaacctct 533634  T
Q  479 ccttcaaaatctgcacaagaacacttaaataacagtcttcagctgataaaatcgtgccacgtttt-ccaaatcatgccacgattgatgcgtacgacc 574  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||| || |||| ||| |||||||||||    
T  533633 ccttcaaaatctgca-aaaaacacttatatagcagtcttcagctgtcaaaatcgtgtcacgttttcccaaatcgtgacacgtttggtgcgtacgacc 533538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 380 - 574
Target Start/End: Original strand, 30683125 - 30683319
Alignment:
Q  380 tgtttacaatgtttctcaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttg-taatccaagtttctctctcttcaagctct 478  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |   | | ||||||| |||||||||||| ||||||||| || |   |||||||||||||||||||||||||    
T  30683125 tgtttacaatgtttcgcaacccaagagaactctaat-caaagaccctcaaccctaaaattacctcctctgatttcccaagtttctctctcttcaagctct 30683223  T
Q  479 ccttcaaaatctgcacaagaacacttaaataacagtcttcagctgataaaatcgtgccacgttttcc--aaatcatgccacgattgatgcgtacgacc 574  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| |||||| |  ||||||||| ||||||||||  ||||  || ||||||||||||||||||||    
T  30683224 ccttcaaaatctgca-aagaacacttatatagcagttttcagc-gtcaaaatcgtgtcacgttttcccaaaattgtgtcacgattgatgcgtacgacc 30683319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 420 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 37439072 - 37438904
Alignment:
Q  420 agacactcaaccctaaagttacctcctttg-taatccaagtttctctctcttcaagctctccttcaaaatctgcacaagaacacttaaataacagtcttc 518  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||    
T  37439072 agaccctcaaccctaaagttacctcatttgattttccaagtttctctctcttcaagctctccttcaaaatctgca-aagaacacttatatagcagtcttc 37438974  T
Q  519 agctgat-aaaatcgtgccacg----ttttccaaatcatgccacgattgatgcgtacgacccaaggtacgac 585  Q
    | |  || ||||| ||| ||||    |||| | |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37438973 aac--atcaaaattgtgtcacgtttttttttccaatcgtgtcacgattgatgcgtacgacccaaggtacgac 37438904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 380 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 25412725 - 25412519
Alignment:
Q  380 tgtttacaatgtttctcaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatcc-aagtttctctctcttcaagctct 478  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |   | | ||||||| || |||||||| ||| |||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||    
T  25412725 tgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaat-caaagaccctaaaccctaatgttgcctcctttgatttcccaagtttctctctcttcaagctct 25412627  T
Q  479 ccttcaaaatctgcacaagaacacttaaataacagtcttcagctgataaaatcgtgccacgtttt--ccaaatcatgccacgattgatgcgtacgaccca 576  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||   |||||| || |   |||||||| ||||||||  || |||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  25412626 ccttcaaaatctgca-aagaacacttatatagatgtcttctgc-gtcgaaatcgtgtcacgtttttccccaatcgtgccacgattgatgcgtacgatcca 25412529  T
Q  577 aggtacgacc 586  Q
    ||||||||||    
T  25412528 aggtacgacc 25412519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 81 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 33031110 - 33030728
Alignment:
Q  81 agtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagcac-aaagataagcaatgaaag--aaggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaa 177  Q
    |||||||||||| ||||| || |||| |||||||  |||||||| ||||||||   |||||||||||||| |||| ||||||| |  |||||||||| ||    
T  33031110 agtgtagagcaataccacgagaataatcaaagcaataaagataaccaatgaaaataaaggaacaaacacatcaaa-gattgttaattcagttcggtcaaa 33031012  T
Q  178 tatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactatgatgaaagtg-----------ttacaagaaaaatagtttgcaagcttacacaagaac 266  Q
    |||||| || |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||           ||||||||||  ||| ||  ||||| ||| ||||||    
T  33031011 tatgacatactctgggggagagagcagctctccaattcactaagatgaaagtgatgcaatggggttacaagaaat-tagcttaaaagctcaca-aagaac 33030914  T
Q  267 aagacttaatttctacccatttgt---gtttctcactctctcaataatgaaccctaaagggaag----acacaaaaggaagcttttgatccttccaatgg 359  Q
    || || |||||||||||||||| |   ||  ||||| ||||||||   ||| |||||  | ||     |||| |||||||||||||  | ||  ||||||    
T  33030913 aaaacataatttctacccatttttcaagtcactcacactctcaat---gaatcctaagagaaattaaaacactaaaggaagctttttgttct--caatgg 33030819  T
Q  360 tgaaatctcactacccaaaatgtttacaatgtttctcaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgta 451  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||  |||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  33030818 tgaaatctcactacccaagatgattacaatatttctcaacccaagagaacctcgttacaaa-atactcaaccctaaagttacctcttttgta 33030728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 380 - 586
Target Start/End: Original strand, 36074249 - 36074455
Alignment:
Q  380 tgtttacaatgtttctcaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatcc-aagtttctctctcttcaagctct 478  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |   | | ||||||| || |||||||||||| | |||||||   ||| |||||||||||||||||||||||    
T  36074249 tgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaat-caaagaccctaaaccctaaagttgcttcctttgatttcccaagtttctctctcttcaagctct 36074347  T
Q  479 ccttcaaaatctgcacaagaacacttaaataacagtcttcagctgataaaatcgtgccacg--ttttccaaatcatgccacgattgatgcgtacgaccca 576  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||| | |||||| || |  |||||| || ||||  |||||| |||| ||||| ||||||||||||||| |||    
T  36074348 ccttcaaaatctgca-aagaacacttatatagctgtcttctgc-gtcaaaatcatgtcacgttttttcccaatcgtgccatgattgatgcgtacgatcca 36074445  T
Q  577 aggtacgacc 586  Q
    ||||||||||    
T  36074446 aggtacgacc 36074455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 85 - 236
Target Start/End: Original strand, 6741784 - 6741936
Alignment:
Q  85 tagagcaacaccacaagcataaacaaagcac-aaagataagcaatgaaagaag-gaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatga 182  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| || || ||||||||| ||||||||    
T  6741784 tagaacaacaccacaagcataatcaaagcaataaagataagcaatgaaagaaatgaacaaacacaccaaa-gattattaacacagttcggttcaatatga 6741882  T
Q  183 cctaatctgggggagagagcatctctccaatccactatgatgaaagtgttacaa 236  Q
    | || ||||||||| |||||| |||||||||||| || |||| ||||| |||||    
T  6741883 catactctgggggatagagcagctctccaatccattaagatggaagtgatacaa 6741936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 380 - 574
Target Start/End: Original strand, 42428635 - 42428829
Alignment:
Q  380 tgtttacaatgtttctcaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatcc-aagtttctctctcttcaagctct 478  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||| |   | | |||||||  ||||||||||||||| ||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||    
T  42428635 tgtttacaatatttcccaacccaagagaactctaat-caaagaccttcaaccctaaagttatctcctttgatttcccaagtttctctctcttcaagctct 42428733  T
Q  479 ccttcaaaatctgcacaagaacacttaaataacagtcttcagctgataaaatcgtgccacgttttcc-aaatcatgccacgattgatgcgtacgacc 574  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||| ||| |||||||||| ||  ||||||||| || ||||||| ||||| || |||| ||| |||||||||||    
T  42428734 ccttcaaaatctgca-aagaacatttatatagcagtcttcagttgtcaaaatcgtgtcaggttttcctaaatcgtgacacgtttggtgcgtacgacc 42428829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 380 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 13343024 - 13342818
Alignment:
Q  380 tgtttacaatgtttctcaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatcc-aagtttctctctcttcaagctct 478  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |   | | || |||| || |||||||||||| | |||||||   ||| |||||||||||||||||||||||    
T  13343024 tgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaat-cagagaccctaaaccctaaagttgcttcctttgatttcccaagtttctctctcttcaagctct 13342926  T
Q  479 ccttcaaaatctgcacaagaacacttaaataacagtcttcagctgataaaatcgtgccacgtttt--ccaaatcatgccacgattgatgcgtacgaccca 576  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||| | |||||| ||    ||||||||| ||||||||  || |||| ||||||||||||||||||||| | |    
T  13342925 ccttcaaaatctgca-aagaacacttatatagctgtcttctgc-ctcaaaatcgtgtcacgtttttccccaatcgtgccacgattgatgcgtacgatcta 13342828  T
Q  577 aggtacgacc 586  Q
    ||||||||||    
T  13342827 aggtacgacc 13342818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 454 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 30182478 - 30182345
Alignment:
Q  454 ccaagtttctctctcttcaagctctccttcaaaatctgcacaagaacacttaaataacagtcttcagctgataaaatcgtgccacgtttt---ccaaatc 550  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  ||| | |||||| || |  ||||||||| ||||||||   || ||||    
T  30182478 ccaagtttctctctcttcaagctctcattcaaaatctgca-aagaacacttttatagctgtcttctgc-gtcaaaatcgtgtcacgtttttcccccaatc 30182381  T
Q  551 atgccacgattgatgcgtacgacccaaggtacgacc 586  Q
     ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  30182380 gtgccacgattgatgcgtacgatccaaggtacgacc 30182345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 129 - 236
Target Start/End: Original strand, 31180192 - 31180297
Alignment:
Q  129 gaaagaaggaacaaacacaccaa-aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactatgatgaaa 227  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||    
T  31180192 gaaagaaagaacaaa-acaccaagaagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaa 31180288  T
Q  228 gtgttacaa 236  Q
    |||||||||    
T  31180289 gtgttacaa 31180297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 380 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 26177854 - 26177648
Alignment:
Q  380 tgtttacaatgtttctcaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttg-taatccaagtttctctctcttcaagctct 478  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||  |||    ||||||| || ||||||| ||||||  |||||| |   |||||||||||||||||| | ||||    
T  26177854 tgtttaccatgtttcccaacccaagagaagctctaatcaaagactctaaaccctagagttactccctttgatttcccaagtttctctctcttccaactct 26177755  T
Q  479 ccttcaaaatctgcacaagaacacttaaataacagtcttcagctgataaaatcgtgccacgttttccaaatcatgccacgattgatgcgtacgacccaag 578  Q
     ||||||||||||| ||||||||||||||||  || | ||  |||||||||||||| |||| ||||||  || || |||||||| ||||| || ||||||    
T  26177754 -cttcaaaatctgcgcaagaacacttaaatactagccctccactgataaaatcgtgtcacgatttccaggtcgtgtcacgattggtgcgtccgtcccaag 26177656  T
Q  579 gtacgacc 586  Q
    ||||||||    
T  26177655 gtacgacc 26177648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 156 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 4410301 - 4410237
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4410301 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagctctccaatccactat 4410237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 117 - 236
Target Start/End: Original strand, 15044652 - 15044769
Alignment:
Q  117 aagataagcaatgaaagaaggaacaaacacaccaa-aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatcc 215  Q
    |||||||||||  |||| | ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  15044652 aagataagcaagaaaaggaagaacaaa-acaccaagaagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatcc 15044749  T
Q  216 actatgatgaaagtgttacaa 236  Q
    | ||||| |||||||||||||    
T  15044750 aatatga-gaaagtgttacaa 15044769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 454 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 26170670 - 26170539
Alignment:
Q  454 ccaagtttctctctcttcaagctctccttcaaaatctgcacaagaacacttaaataacagtcttcagctgataaaatcgtgccacgttttccaaatcatg 553  Q
    |||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  || | ||  |||||||||||||| |||| | ||||  || ||    
T  26170670 ccaagtttctctctcttccaactctc-ttcaaaatctgcacaagaacacttaaatactagccctccactgataaaatcgtgtcacgatatccaggtcgtg 26170572  T
Q  554 ccacgattgatgcgtacgacccaaggtacgacc 586  Q
     |||||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  26170571 tcacgattggtgcgtccgtcccaaggtacgacc 26170539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 152 - 236
Target Start/End: Original strand, 43592280 - 43592362
Alignment:
Q  152 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactatgatgaaagtgttacaa 236  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  43592280 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaa 43592362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 138 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 32637009 - 32636927
Alignment:
Q  138 aacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga-gcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  32637009 aacaaacacaccaaa-gattgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactat 32636927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 135 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 19806551 - 19806466
Alignment:
Q  135 aggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga-gcatctctccaatccactat 220  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  19806551 aggaacaaacaccccaaa-gattgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactat 19806466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 380 - 488
Target Start/End: Original strand, 39468754 - 39468862
Alignment:
Q  380 tgtttacaatgtttctcaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatcc-aagtttctctctcttcaagctct 478  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |   | |  |||||| |||||||||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||    
T  39468754 tgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatg-aaagaccctcaaccctaaagttacctcctttgatttcccaagtttctctctcttcaagctct 39468852  T
Q  479 ccttcaaaat 488  Q
    ||||||||||    
T  39468853 ccttcaaaat 39468862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 152 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 1457246 - 1457164
Alignment:
Q  152 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactatgatgaaagtgttacaa 236  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  1457246 aagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaa 1457164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 156 - 220
Target Start/End: Original strand, 3373137 - 3373201
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  3373137 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcaaccctccaatccactat 3373201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 156 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 15552524 - 15552460
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  15552524 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactat 15552460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 454 - 578
Target Start/End: Original strand, 18441920 - 18442043
Alignment:
Q  454 ccaagtttctctctcttcaagctctccttcaaaatctgcacaagaacacttaaataacagtcttcagctgataaaatcgtgccacgttttccaaatcatg 553  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||  || | ||  |||||||||||||| |||| ||||||  || ||    
T  18441920 ccaagtttctctctcttccaactctccttc-aaatctgcacaagaacacttaaatactagccctccactgataaaatcgtgtcacgatttccaggtcgtg 18442018  T
Q  554 ccacgattgatgcgtacgacccaag 578  Q
     |||||||| ||||| || ||||||    
T  18442019 tcacgattggtgcgttcgtcccaag 18442043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 152 - 236
Target Start/End: Original strand, 27449815 - 27449897
Alignment:
Q  152 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactatgatgaaagtgttacaa 236  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  27449815 aagattgttgacccagttcag-ccaatatagcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaa 27449897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 156 - 220
Target Start/End: Original strand, 31179371 - 31179435
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  31179371 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactat 31179435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 156 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 31543013 - 31542949
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  31543013 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactat 31542949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 156 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 31545359 - 31545295
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  31545359 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactat 31545295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 152 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 37556706 - 37556624
Alignment:
Q  152 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactatgatgaaagtgttacaa 236  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  37556706 aagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaaagtgttacaa 37556624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 152 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 37561528 - 37561446
Alignment:
Q  152 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactatgatgaaagtgttacaa 236  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  37561528 aagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaaagtgttacaa 37561446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 88 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 28278553 - 28278419
Alignment:
Q  88 agcaacaccacaagcataaacaaagcac-aaagataagcaatgaaagaaggaac-aaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacct 185  Q
    ||||| ||||||| ||||| |||||||  |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||  ||||||    
T  28278553 agcaaaaccacaatcataatcaaagcaataaagataagcaatgaaagaaagaaagaaacacaccaaga-attgttcacccagttcggtccaacttgacct 28278455  T
Q  186 aatctgggggagaga-gcatctctccaatccactat 220  Q
    | ||||| |||||||   ||||||||||||||||||    
T  28278454 actctggaggagagattgatctctccaatccactat 28278419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 135 - 220
Target Start/End: Original strand, 28750635 - 28750720
Alignment:
Q  135 aggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga-gcatctctccaatccactat 220  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  28750635 aggaacaaacacaccaaa-gattattgacccaattcggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactat 28750720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 135 - 220
Target Start/End: Original strand, 30682903 - 30682987
Alignment:
Q  135 aggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga-gcatctctccaatccactat 220  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  30682903 aggaacaaacacaccaaa-gattgttgacc-agttcggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactat 30682987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 152 - 236
Target Start/End: Original strand, 2785376 - 2785458
Alignment:
Q  152 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactatgatgaaagtgttacaa 236  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  2785376 aagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaa 2785458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 156 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 10749979 - 10749915
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| | |||| |||||||||    
T  10749979 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactat 10749915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 156 - 220
Target Start/End: Original strand, 15354575 - 15354639
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| | |||| |||||||||    
T  15354575 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactat 15354639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 152 - 236
Target Start/End: Original strand, 27444971 - 27445053
Alignment:
Q  152 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactatgatgaaagtgttacaa 236  Q
    ||||||||||||||||||| | | |||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  27444971 aagattgttgacccagttcaggc-aatatagcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaa 27445053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 152 - 236
Target Start/End: Original strand, 30631407 - 30631489
Alignment:
Q  152 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactatgatgaaagtgttacaa 236  Q
    |||||||||||| |||||| | ||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  30631407 aagattgttgactcagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaa 30631489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 152 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 31397077 - 31396995
Alignment:
Q  152 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactatgatgaaagtgttacaa 236  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  31397077 aagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaa 31396995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 137 - 220
Target Start/End: Original strand, 42428412 - 42428495
Alignment:
Q  137 gaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga-gcatctctccaatccactat 220  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  42428412 gaacaaacacactaaa-gattgttgacccagttcggtccaacttgacctaatatgggggagagattgatctctccaatccactat 42428495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 152 - 236
Target Start/End: Original strand, 43598725 - 43598807
Alignment:
Q  152 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactatgatgaaagtgttacaa 236  Q
    ||||||||||  ||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  43598725 aagattgttggtccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaa 43598807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 152 - 236
Target Start/End: Original strand, 43604217 - 43604299
Alignment:
Q  152 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactatgatgaaagtgttacaa 236  Q
    ||||||||||  ||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  43604217 aagattgttggtccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaa 43604299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 152 - 236
Target Start/End: Original strand, 43609709 - 43609791
Alignment:
Q  152 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactatgatgaaagtgttacaa 236  Q
    ||||||||||  ||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  43609709 aagattgttggtccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaa 43609791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 417 - 586
Target Start/End: Original strand, 16649863 - 16650034
Alignment:
Q  417 caaagacactcaaccctaaagttacctcctttg-taatccaagtttctctctcttcaagctctccttcaaaatctgcacaagaacacttaaataacagtc 515  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||| |   ||||||||  ||||||| || || || ||||||||||||| |  |||||||| |||  ||||    
T  16649863 caaagaccatcaaccctaaagttacctcctttgatttcccaagttttcctctcttgaacctatcattcaaaatctgcaaagaaacacttatatagtagtc 16649962  T
Q  516 ttcagctgataaaatcgtgccacgtttt-ccaaatcatgccacgattgatgcgtacgacccaaggtacgacc 586  Q
    || |||||  |||||| || ||| |||| ||||||| || |||| ||| ||||||||| |||||||||||||    
T  16649963 tttagctgtcaaaatcatgtcacattttgccaaatcgtgacacggttggtgcgtacgatccaaggtacgacc 16650034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 135 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 13488391 - 13488306
Alignment:
Q  135 aggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga-gcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||   ||||||||||||||||||    
T  13488391 aggaacaaagacac-aaaagattattgacccagttcggtccaacttgacctaatctcggggagagattgatctctccaatccactat 13488306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 380 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 16409446 - 16409317
Alignment:
Q  380 tgtttacaatgtttctcaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttg-taatccaagtttctctctcttcaagctct 478  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||  |||    ||||||| || ||||||| ||||||  |||||| |   |||||||||||||||||| | ||||    
T  16409446 tgtttaccatgtttcccaacccaagagaagctctaatcaaagactctaaaccctagagttactccctttgatttcccaagtttctctctcttccaactct 16409347  T
Q  479 ccttcaaaatctgcacaagaacacttaaata 509  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16409346 -cttcaaaatctgcacaagaacacttaaata 16409317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 156 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 27910729 - 27910675
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctcc 210  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27910729 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctaatctgggggagagagcagctctcc 27910675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 135 - 220
Target Start/End: Original strand, 42426215 - 42426300
Alignment:
Q  135 aggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga-gcatctctccaatccactat 220  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||  |||||||||| ||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  42426215 aggaacaaacacac-aaaagattgttgacctagttcagtccaacttgacctaatcagggggagagattgatctctccaatccactat 42426300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 155 - 236
Target Start/End: Original strand, 2630234 - 2630315
Alignment:
Q  155 attgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactatgatgaaagtgttacaa 236  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||  | || |||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  2630234 attgttaacctagttcggtccaatatgacctgctttgagggagatagcagctcttcaatccactatgatgaaagtgatacaa 2630315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 454 - 539
Target Start/End: Original strand, 9789496 - 9789580
Alignment:
Q  454 ccaagtttctctctcttcaagctctccttcaaaatctgcacaagaacacttaaataacagtcttcagctgataaaatcgtgccacg 539  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||  || | ||  |||||||||||||| ||||    
T  9789496 ccaagtttctctctcttccaactctccttc-aaatctgcacaagaacacttaaatactagccctccactgataaaatcgtgtcacg 9789580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 152 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 28807656 - 28807588
Alignment:
Q  152 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactatg 221  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  28807656 aagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg 28807588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 466 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 535760 - 535685
Alignment:
Q  466 ctcttcaagctctccttcaaaatctgcacaagaacacttaaataacagtcttcagctgataaaatcgtgccacgttt 542  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||| |||||||||||||  ||||||||| |||||||    
T  535760 ctcttcaacctctccttcaaaatctgca-aagaacaattatatatcagtcttcagctgtcaaaatcgtgacacgttt 535685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 156 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 2175197 - 2175133
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| | |||| |||||||||    
T  2175197 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactat 2175133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 342 - 439
Target Start/End: Original strand, 6742049 - 6742148
Alignment:
Q  342 ttttgatccttccaatggtgaaatctcactac--ccaaaatgtttacaatgtttctcaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagtt 439  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||| ||   ||||||||  || ||||||||||||| ||||||| | ||| || ||||||||||||||||||||||    
T  6742049 ttttgattctttcaatggtgaaatctcattatatccaaaatgaatataatgtttctcaactcaagagaacttcagtataaagacactcaaccctaaagtt 6742148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 138 - 220
Target Start/End: Original strand, 8565930 - 8566011
Alignment:
Q  138 aacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga-gcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||| ||||||   ||||||||||||||||||    
T  8565930 aacaaacacaccaa--gattgttgacctagttcggtccaacttgacctaatctgggtgagagattgatctctccaatccactat 8566011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 156 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 10757455 - 10757391
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||| | |||| |||||||||    
T  10757455 ttgttgacccagttcggtctaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactat 10757391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 156 - 220
Target Start/End: Original strand, 15356851 - 15356915
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||| | |||| |||||||||    
T  15356851 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtccgggggagagagcagccctccgatccactat 15356915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 156 - 220
Target Start/End: Original strand, 21684452 - 21684516
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| | |||| |||||||||    
T  21684452 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactat 21684516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 156 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 23665322 - 23665258
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||| | |||| |||||||||    
T  23665322 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactat 23665258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 156 - 220
Target Start/End: Original strand, 23741859 - 23741923
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||| | |||| |||||||||    
T  23741859 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactat 23741923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 156 - 220
Target Start/End: Original strand, 23793265 - 23793329
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||| | |||| |||||||||    
T  23793265 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactat 23793329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 156 - 220
Target Start/End: Original strand, 25921473 - 25921537
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  25921473 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagctctccgttccactat 25921537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 152 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 31401934 - 31401852
Alignment:
Q  152 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactatgatgaaagtgttacaa 236  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| || |||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  31401934 aagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaa 31401852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 152 - 236
Target Start/End: Original strand, 33768180 - 33768262
Alignment:
Q  152 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactatgatgaaagtgttacaa 236  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| || ||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  33768180 aagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggggagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaa 33768262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 152 - 236
Target Start/End: Original strand, 33791317 - 33791399
Alignment:
Q  152 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactatgatgaaagtgttacaa 236  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| || |||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  33791317 aagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggaaagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaa 33791399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #93
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 156 - 220
Target Start/End: Original strand, 34477053 - 34477117
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| | |||| |||||||||    
T  34477053 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactat 34477117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #94
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 156 - 220
Target Start/End: Original strand, 34479418 - 34479482
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| | |||| |||||||||    
T  34479418 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactat 34479482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #95
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 156 - 220
Target Start/End: Original strand, 38960132 - 38960196
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||| | |||| |||||||||    
T  38960132 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtttgggggagagagcagccctccgatccactat 38960196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #96
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 156 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 1170992 - 1170921
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaat-atgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactatgatgaa 226  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||    
T  1170992 ttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactataatgaa 1170921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #97
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 454 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 29722420 - 29722330
Alignment:
Q  454 ccaagtttctctctcttcaagctctccttcaaaatctgcacaagaacacttaaataacagtcttcagctgataaaatcgtgccacgttttcc 545  Q
    |||||||||||||| ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||   | ||||  |||||||||||||| |||| |||||    
T  29722420 ccaagtttctctcttttccaactctccttcaaa-tctgcacaagaacacttaaatacatgccttccactgataaaatcgtgtcacgatttcc 29722330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #98
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 277 - 469
Target Start/End: Original strand, 31180349 - 31180545
Alignment:
Q  277 ttctacccatttgtgtttctc-actctctcaataatgaaccctaaagg-gaagacacaaaaggaagcttttgatccttccaa-tggtgaaatc-tcacta 372  Q
    |||||||| || ||||||| | |||||| ||||| |||||| |||| | |||||||| | |||||||||| ||||||||||| |  |||| || ||||||    
T  31180349 ttctaccctttggtgtttccccactctcacaata-tgaaccataaaagagaagacactagaggaagctttagatccttccaactaatgaactcctcacta 31180447  T
Q  373 cccaaaatgtttacaatgtttctc--aacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatccaagtttctctctct 469  Q
    |||||  || ||||||||||| ||  |||||||||||  ||| | ||||||||||||||||||   ||| |||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  31180448 cccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccctttggttccctcctttgttatccaag-ttctctctct 31180545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #99
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 138 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 31183156 - 31183078
Alignment:
Q  138 aacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga-gcatctctccaatcca 216  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||    
T  31183156 aacaaacacaccaaa-gaatgttgacccagttcggtccaacttgacctaatatgggggagagatagatctctccaatcca 31183078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #100
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 151 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 533942 - 533872
Alignment:
Q  151 aaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga-gcatctctccaatccactat 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||   |||| |||||||||||||    
T  533942 aaagattgttgacccagttcggtccaacttgacctaatatgggggagagattgatctttccaatccactat 533872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #101
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 138 - 200
Target Start/End: Original strand, 5887417 - 5887478
Alignment:
Q  138 aacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  5887417 aacaaacacaccaaa-gattgttgatccaattcggtccaacttgacctaatctgggggagaga 5887478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #102
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 453 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 16407936 - 16407851
Alignment:
Q  453 tccaagtttctctctcttcaagctctccttcaaaatctgcacaagaacacttaaataacagtcttcagctgataaaatcgtgccacg 539  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||  || | ||  |||||||||||||| ||||    
T  16407936 tccaagtttctctctcttccaactctc-ttcaaaatctgcacaagaatacttaaatactagccctccactgataaaatcgtgtcacg 16407851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #103
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 156 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 18466963 - 18466909
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctcc 210  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  18466963 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagctctcc 18466909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #104
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 156 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 22673016 - 22672946
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaat-atgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactatgatga 225  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||    
T  22673016 ttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactataatga 22672946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #105
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 156 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 25445678 - 25445608
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaat-atgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactatgatga 225  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||    
T  25445678 ttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactataatga 25445608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #106
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 156 - 225
Target Start/End: Original strand, 35385452 - 35385522
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaat-atgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactatgatga 225  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||    
T  35385452 ttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactataatga 35385522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #107
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 135 - 220
Target Start/End: Original strand, 39468529 - 39468614
Alignment:
Q  135 aggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga-gcatctctccaatccactat 220  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||| | ||||||| |||||||||||   ||||||| ||||||||||    
T  39468529 aggaacaaacacactaaa-gattgttgacccagttcagtccaatttaacctaatatgggggagagattgatctctctaatccactat 39468614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #108
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 380 - 449
Target Start/End: Original strand, 3075863 - 3075931
Alignment:
Q  380 tgtttacaatgtttctcaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttg 449  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| | | | | ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  3075863 tgtttacaatgtttcccaacccaagagaactttaat-caaagaccctcaaccctaaagttacctcctttg 3075931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #109
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 138 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 16452265 - 16452181
Alignment:
Q  138 aacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga-gcatctctccaatccactatga 222  Q
    |||||||||||||| | || ||| ||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  16452265 aacaaacacaccaagaaat-gtttacccagttcggtccaacttgacctactctgggggagagatttatctctccaatccactatga 16452181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #110
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 454 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 29720260 - 29720176
Alignment:
Q  454 ccaagtttctctctcttcaagctctccttcaaaatctgcacaagaacacttaaataacagtcttcagctgataaaatcgtgccacg 539  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||   | ||||  |||||||||||||| ||||    
T  29720260 ccaagtttctctctcttccaactctccttc-aaatttgcacaagaacacttaaatacatgccttccactgataaaatcgtgtcacg 29720176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #111
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 141 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 538207 - 538128
Alignment:
Q  141 aaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga-gcatctctccaatccactat 220  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||   |||||||||||| |||||    
T  538207 aaacacaccaaa-gattgttgatccagttcggtccaacttgacctaatatgggggagagattgatctctccaatctactat 538128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #112
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 156 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 6745347 - 6745283
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||  |||||||||||||||| | |||| |||||||||    
T  6745347 ttgttgacccagttcggtccaaattgaccttgtctgggggagagagcagccctccgatccactat 6745283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #113
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 138 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 13239937 - 13239854
Alignment:
Q  138 aacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtcc-aatatgacctaatctgggggagaga-gcatctctccaatccactat 220  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||||| ||||| |||||||   ||||||||||||||||||    
T  13239937 aacaaacacaccaaaa-attgttcacccagttcggtccaaatttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactat 13239854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #114
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 88 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 38747241 - 38747108
Alignment:
Q  88 agcaacaccacaagcataaacaaagcac-aaagataagcaatgaaagaa-ggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacct 185  Q
    ||||| ||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||| |||||| ||||||||  ||||||  |||| ||||||||||| |||||||  ||||||    
T  38747241 agcaaaaccacaatcataatcaaagcaataaagataagcaattaaagaaaggaacaaatccaccaa--gattattgacccagtttggtccaacttgacct 38747144  T
Q  186 aatctgggggagaga-gcatctctccaatccactat 220  Q
     ||||| ||||||||   ||||||||||||| ||||    
T  38747143 gatctgagggagagattgatctctccaatcctctat 38747108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #115
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 156 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 38882384 - 38882320
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||| | |||| |||||||||    
T  38882384 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggaggagagagcagccctccgatccactat 38882320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #116
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 156 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 2724172 - 2724125
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagca 203  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  2724172 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagca 2724125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #117
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 156 - 203
Target Start/End: Original strand, 10529099 - 10529146
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagca 203  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  10529099 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagca 10529146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #118
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 156 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 24127135 - 24127088
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagca 203  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  24127135 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagca 24127088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #119
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 156 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 27912815 - 27912768
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagca 203  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  27912815 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagca 27912768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #120
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 277 - 460
Target Start/End: Original strand, 30631542 - 30631730
Alignment:
Q  277 ttctacccatttgtgtttctc-actctctcaataatgaaccctaaagggaagacacaaaaggaagcttttgatccttccaa-tggtgaaatc--tcacta 372  Q
    |||||||| || ||||||| | |||||| ||||| |||||||||||| |||| ||| | |||||||||| ||||||||||| |  |||| ||   |||||    
T  30631542 ttctaccctttggtgtttccccactctcacaata-tgaaccctaaagagaagtcactagaggaagctttagatccttccaactaatgaactcctccacta 30631640  T
Q  373 cccaaaatgtttacaatg--tttctcaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatccaagtt 460  Q
    |||||  || ||||||||  |||| ||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||    ||| |||||||||| |||||||||    
T  30631641 cccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcctttgttatccaagtt 30631730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #121
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 138 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 33831865 - 33831783
Alignment:
Q  138 aacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga-gcatctctccaatccactat 220  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| |||||||||||   |||||| |||||||||||    
T  33831865 aacaaaaacaccaaa-gattgttgacccagttcagtccaacttgacctaatatgggggagagattgatctcttcaatccactat 33831783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #122
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 156 - 222
Target Start/End: Original strand, 36263812 - 36263879
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaa-tctgggggagagagcatctctccaatccactatga 222  Q
    ||||| ||||||| ||| |||||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  36263812 ttgtttacccagtccggcccaatatgacctatgtctaggggagagagcagctctccaatccactatga 36263879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #123
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 156 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 40221802 - 40221755
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagca 203  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  40221802 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagca 40221755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #124
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 156 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 25452677 - 25452607
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaat-atgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactatgatga 225  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| |||||  ||||||||| ||||    
T  25452677 ttgtttacccagttcggtctaatgatgacctattctgggggagagagcagctctctgatccactataatga 25452607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #125
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 156 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 42238442 - 42238372
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaat-atgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactatgatga 225  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||  |||||||| ||||    
T  42238442 ttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctccgttccactataatga 42238372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #126
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 156 - 220
Target Start/End: Original strand, 1189607 - 1189672
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctggg-ggagagagcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| |||||||||||| ||||  ||||||||    
T  1189607 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggaggagagagcatccctccgttccactat 1189672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #127
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 380 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 31182936 - 31182868
Alignment:
Q  380 tgtttacaatgtttctcaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttg 449  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |   | | ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  31182936 tgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaat-caaagaccctcaaccctaaagttacctcctttg 31182868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #128
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 156 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 6747583 - 6747519
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| |||| | ||||||||| | |||| |||||||||    
T  6747583 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgagagagagagcagccctccgatccactat 6747519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #129
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 138 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 29722711 - 29722627
Alignment:
Q  138 aacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtcc-aatatgacctaatctgggggagagagcat-ctctccaatccactat 220  Q
    |||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| ||||| |||||||   | ||||||||||||||||    
T  29722711 aacaaagacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaatttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactat 29722627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #130
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 138 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 37439327 - 37439244
Alignment:
Q  138 aacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtcc-aatatgacctaatctgggggagaga-gcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||  ||||||| ||||| |||||||   ||||||||||||||||||    
T  37439327 aacaaacacaccaaa-gattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactat 37439244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #131
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 156 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 39798326 - 39798262
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactat 220  Q
    |||||||||||||||| |||||  |||| || |||||||||||||||| | |||| |||||||||    
T  39798326 ttgttgacccagttcgatccaaattgacttagtctgggggagagagcagccctccgatccactat 39798262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #132
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 156 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 39854762 - 39854698
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||| ||||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||| | |||| |||||||||    
T  39854762 ttgttgacctagttcggtccaaattgatctagtctgggggagagagcagccctccgatccactat 39854698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #133
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 417 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 537952 - 537901
Alignment:
Q  417 caaagacactcaaccctaaagttacctcctttg-taatccaagtttctctct 467  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  537952 caaagaccctcaaccctaaagttacctcctttgattttccaagtttctctct 537901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #134
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 156 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 696157 - 696110
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagca 203  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||  ||||||||||||||||    
T  696157 ttgttgacccagttcggtccaaattgaccttgtctgggggagagagca 696110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #135
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 156 - 203
Target Start/End: Original strand, 2818335 - 2818382
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagca 203  Q
    ||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  2818335 ttgttgaccaagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagca 2818382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #136
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 395 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 5007498 - 5007446
Alignment:
Q  395 tcaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttg 449  Q
    ||||| ||||||| ||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5007498 tcaactcaagagaacctcac--caaagatactcaaccctaaagttacctcctttg 5007446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #137
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 7161068 - 7160916
Alignment:
Q  82 gtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagcacaaagataagcaatgaaagaaggaa--caaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaata 179  Q
    ||||| |||||||||||| |||||| |||||||  || ||||| || | ||||| |||  ||||||||||||||   || | | |||||| | | |||||    
T  7161068 gtgtaaagcaacaccacaggcataatcaaagcaacaaaataagaaa-gcaagaaagaaaacaaacacaccaaaa---tggtaatccagtttgattcaata 7160973  T
Q  180 tgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactatgatgaaagtgttacaa 236  Q
    ||||||| | | ||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||| |||||    
T  7160972 tgacctactataggggagagatcagctctccaatccactcagatgaaagtgatacaa 7160916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #138
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 156 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 17073163 - 17073116
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagca 203  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||| | ||||||||||||||||    
T  17073163 ttgttgacccagttcggtccaaattgaccgagtctgggggagagagca 17073116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #139
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 156 - 199
Target Start/End: Original strand, 20505843 - 20505886
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagag 199  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||    
T  20505843 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagag 20505886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #140
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 156 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 21289040 - 21288993
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagca 203  Q
    ||||||||||||||||||| ||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  21289040 ttgttgacccagttcggtctaaattgacctagtctgggggagagagca 21288993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #141
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 156 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 21948305 - 21948258
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagca 203  Q
    ||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  21948305 ttgttgacccagttcagtccaaattgacctagtctgggggagagagca 21948258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #142
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 156 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 25904382 - 25904335
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagca 203  Q
    ||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  25904382 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagca 25904335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #143
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 156 - 203
Target Start/End: Original strand, 41585744 - 41585791
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagca 203  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| | ||||||||||||||    
T  41585744 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtttgggggagagagca 41585791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #144
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 156 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 2954695 - 2954641
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctcc 210  Q
    ||||||||||||||||||| ||  ||||||| | |||||||||||||||| ||||    
T  2954695 ttgttgacccagttcggtcaaaattgacctagtttgggggagagagcatccctcc 2954641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #145
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 156 - 209
Target Start/End: Original strand, 17841249 - 17841303
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaat-atgacctaatctgggggagagagcatctctc 209  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  17841249 ttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctc 17841303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #146
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 157 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 18596924 - 18596878
Alignment:
Q  157 tgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagca 203  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||    
T  18596924 tgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggaggagagagca 18596878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #147
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 380 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 42926856 - 42926727
Alignment:
Q  380 tgtttacaatgtttctcaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatcc-aagtttctctctcttcaagctct 478  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||| |   | | |||||||  |||| |||||||||||||| ||||   ||| |||||| |||||||| |||||||    
T  42926856 tgtttacaatgtttcccaatccaagagaactctaat-caaagaccatcaatcctaaagttacctcatttgatttcccaagtttttctctcttgaagctct 42926758  T
Q  479 ccttcaaaatctgcacaagaacacttaaata 509  Q
    | | ||||||||| |||  ||||||||||||    
T  42926757 catccaaaatctgaacagaaacacttaaata 42926727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #148
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 526 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 5057649 - 5057588
Alignment:
Q  526 aaaatcgtgccacgttttcc-aaatcatgccacgattgatgcgtacgacccaaggtacgacc 586  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||  || |||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  5057649 aaaatcgtgtcacgttttcccaaattgtgacacggttgatgcgtacgaccaaaggtacgacc 5057588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #149
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 156 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 10587111 - 10587046
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatct-gggggagagagcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||| ||||||||||||| | |||| |||||||||    
T  10587111 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggggagagagcagccctccgatccactat 10587046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #150
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 526 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 27015132 - 27015071
Alignment:
Q  526 aaaatcgtgccacgttttcc-aaatcatgccacgattgatgcgtacgacccaaggtacgacc 586  Q
    ||||||||| |||| ||||| ||||| || |||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  27015132 aaaatcgtgtcacgatttcccaaatcgtgacacgtttggtgcgtacgacccaaggtacgacc 27015071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #151
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 164 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 4236900 - 4236844
Alignment:
Q  164 ccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||||| | |||| |||||||||    
T  4236900 ccagttcggtccaaattgacctagtttgggggagagagcagccctccgatccactat 4236844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #152
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 454 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 10593155 - 10593064
Alignment:
Q  454 ccaagtttctctctcttcaagctctc-cttcaaaatctgcacaagaacacttaaataacagtcttcagctgataaaatcgtgccacgttttcc 545  Q
    |||||| ||||||||||| | ||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||  |||||||  ||| | |||||||| |||| |||||    
T  10593155 ccaagtctctctctcttccaactctctcttcaaa-tctgcacaagaacacttacatactagtcttcctctgttgaaatcgtgtcacgatttcc 10593064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #153
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 138 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 10593445 - 10593361
Alignment:
Q  138 aacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtcc-aatatgacctaatctgggggagagagcat-ctctccaatccactat 220  Q
    |||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| ||  ||||||| ||||| |||||||   | ||||||||||||||||    
T  10593445 aacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactat 10593361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #154
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 138 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 13343246 - 13343163
Alignment:
Q  138 aacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtcc-aatatgacctaatctgggggagaga-gcatctctccaatccactat 220  Q
    |||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||   | ||||||||||||||||    
T  13343246 aacaaacacatcaaa-gattgttcacccagttcggtccaaacatgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactat 13343163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #155
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 156 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 16776436 - 16776372
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||||||||||||  || | || ||||||||||| |||| | |||| |||||||||    
T  16776436 ttgttgacccagttcggtccaaattggcatagtctgggggagatagcagccctccgatccactat 16776372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #156
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 156 - 200
Target Start/End: Original strand, 17818492 - 17818536
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga 200  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||    
T  17818492 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtttgggggagaga 17818536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #157
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 156 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 23667597 - 23667537
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatcca 216  Q
    |||||| |||||||||||||||| || |||| ||||||| |||||||| | |||| |||||    
T  23667597 ttgttggcccagttcggtccaatctgtcctagtctggggaagagagcagccctccgatcca 23667537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #158
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 138 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 25412946 - 25412863
Alignment:
Q  138 aacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatat-gacctaatctgggggagagagc-atctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||  | |||||| ||||| |||||||   ||||||||||||||||||    
T  25412946 aacaaacacaccaaa-gattgttcacccagttcagtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactat 25412863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #159
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 156 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 28786586 - 28786538
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaat-atgacctaatctgggggagagagca 203  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  28786586 ttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagca 28786538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #160
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 156 - 200
Target Start/End: Original strand, 37705780 - 37705824
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  37705780 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 37705824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #161
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 157 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 40147428 - 40147364
Alignment:
Q  157 tgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga-gcatctctccaatccactat 220  Q
    |||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||   ||||||||||||||||||    
T  40147428 tgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactat 40147364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 432; Significance: 0; HSPs: 140)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 432; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 28259414 - 28258831
Alignment:
Q  12 agcaaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaactaaaaa-cagacctagacttagtgtagagcaacaccacaagcataaacaa 110  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28259414 agcaaaggaagtaataatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaataacaaaaaaacagacctagtct-agtgtagagcaacaccacaagcatatacaa 28259316  T
Q  111 agcacaaagataagcaatgaaagaaggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctcc 210  Q
    || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  28259315 agaacaaagataagcaatgaaagaagaaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatttgggggagagagcagctctcc 28259216  T
Q  211 aatccactatgatgaaagtgttacaa-ga--------aaaatagtttgcaagcttacacaagaacaagacttaatttctacccatttgtgtttctcactc 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||        ||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  28259215 aatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaaatagcttgcaagcttacacaagaacaagatctaatttctacccatttgtgtttcccactc 28259116  T
Q  302 tctcaataatgaaccctaaagggaagacacaaaaggaagcttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaaatgtttacaatgtttctcaaccc 401  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  28259115 tctcaataatgacccctaaagagaagacacaaaaggaagcttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaagatgtttacaatgtttcccaaccc 28259016  T
Q  402 aagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatccaagtttctctctcttcaagctctccttcaaaatctgcacaagaaca 501  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  28259015 aagagatcctcactataaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatccaagtttctctctcttcaagctcttcttcaaaatctacacaagaaca 28258916  T
Q  502 cttaaataacagtcttcagctgataaaatcgtgccacgttttccaaatcatgccacgattgatgcgtacgacccaaggtacgacc 586  Q
    |||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28258915 cttatatagcagtcttcagttgataaaatcgtgccacgttttccaaatcgtgccacgattgatgcgtacgacccaaggtacgacc 28258831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 382; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 36757998 - 36757463
Alignment:
Q  12 agcaaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaactaaaaacagacctagacttagtgtagagcaacaccacaagcataaacaaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36757998 agcaaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaac--aaaacagacctagacttagtgtagagcaacaccacaagcataaacaaa 36757901  T
Q  112 gcacaaagataagcaatgaaagaa-ggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctcc 210  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || | || ||||||    
T  36757900 gcacaaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaaagattgttgacccaattcggtccaatatgacctaatctgggggggataacagctctcc 36757801  T
Q  211 aatccactatgatgaaagtgttacaa-ga--------aaaatagtttgcaagcttacacaagaacaagacttaatttctacccatttgtgtttctcactc 301  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||| ||        |||| || || ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| | |||||    
T  36757800 aatccagtatgatgaaagtgtttcaaagagttataagaaaaaagctttcaagcttacacaagaacaaaacctaatttctacccatttgtgttacccactc 36757701  T
Q  302 tctcaataatgaaccctaaagggaagacacaaaaggaagcttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaaatgtttacaatgtttctcaaccc 401  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||    
T  36757700 tctcaatgatgaaccctaaagagaagacacaaaaggaagcttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttcccaaccc 36757601  T
Q  402 aagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatccaagtttctctctcttcaagctctccttcaaaatctgcacaagaaca 501  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36757600 aagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaattcaagtttctctcacttcaagctctccttcaaaatctgcacaagaaca 36757501  T
Q  502 cttaaataacagtcttcagctgataaaatcgtgccacg 539  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||||||||| ||||    
T  36757500 cttatataacagtcttcagctgtcaaaatcgtgtcacg 36757463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 381; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 23078709 - 23078125
Alignment:
Q  12 agcaaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaactaaaaacagacctaga-cttagtgtagagcaacaccacaagcataaacaa 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  23078709 agcaaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaaacatacctagatctaagtgtagagcaacaccacaagcataatcaa 23078610  T
Q  111 agcacaaagataagcaatgaaagaa-ggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctc 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| || |||||    
T  23078609 agcacaaagataagcaatgaaagaatggaacaaacacaccaaaagaatgttgacccagttcgatccaatatgacctaatatgggggagagaacaactctc 23078510  T
Q  210 caatccactatgatgaaagtgttacaa-ga--------aaaatagtttgcaagcttacacaagaacaagacttaatttctacccatttgtgtttctcact 300  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||        ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||     
T  23078509 caatccactatgatgaaagtgttagaaagagttacaagaaaatagcttgcaagcttacacaagaacaagacttaatttctacccatttgtgttacccaca 23078410  T
Q  301 ctctcaataatgaaccctaaagggaagacacaaaaggaagcttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaaatgtttacaatgtttctcaacc 400  Q
    |||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||    
T  23078409 ctctcaatgatgaaccctaa-gagaagacacaaaaggaagcttttgatccttccaatgatgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttcccaacc 23078311  T
Q  401 caagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatccaagtttctctctcttcaagctctccttcaaaatctgcacaagaac 500  Q
    |||||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23078310 caagagattctcatcacaaagacactcaacccaaaagttacctcctttgtaatccaagtttctctcacttcaagctctccttcaaaatctgcacaagaac 23078211  T
Q  501 acttaaataacagtcttcagctgataaaatcgtgccacgttttccaaatcatgccacgattgatgcgtacgacccaaggtacgacc 586  Q
    ||||| ||| ||||||||| |||  ||||| ||| ||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  23078210 acttatatagcagtcttcaactgtcaaaattgtgtcacgttttccaaatcgtggcacgattggtgcgtacgacccaagatacgacc 23078125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 331; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 586
Target Start/End: Original strand, 34388719 - 34389294
Alignment:
Q  12 agcaaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaactaaaaacagacctaga-cttagtgtagagcaacaccacaagcataaacaa 110  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || |||    
T  34388719 agcaaaggaagtggtaatcaatatgtaaagtgtcttcaagcaacaacaac-aaaaacagacctagatctaagtgtagagcaacaccacaagcaaaatcaa 34388817  T
Q  111 agcacaaagataagcaatgaaagaa-ggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctc 209  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  34388818 agcacaaagataaacaaagaaagaaaggaacaaacacaccga--gattgttgacccaattcggtccaatatgacctaatctgggggagagagtagctctc 34388915  T
Q  210 caatccactatgatgaaagtgttacaagaaaaatagtttgca--agcttacacaagaacaagacttaatttctacccattt-gtgtttctcactctctca 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |  ||      |  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||  | ||||||| ||    
T  34388916 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacacaagaacaagacctaatttctacccattttgtgtcacccactctcaca 34389015  T
Q  307 ataatgaaccctaaagggaagacacaaaaggaagctttt-gatccttccaatggtgaaatctcactacccaaaatgtttacaatgtttctcaacccaaga 405  Q
    ||| |||| ||||| | ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||    
T  34389016 ata-tgaatcctaa-gagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaaga 34389113  T
Q  406 gatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatccaagtttctctctcttcaagctctccttcaaaatctgcacaagaacactta 505  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34389114 gatcctcactacaaagacacacaaccctaaagttacctcctttgtaatccaagtttctctcacatcaagctctccttcaaaatctgcacaagaacactta 34389213  T
Q  506 aataacagtcttcagctgataaaatcgtgccacgttttccaaatcatgccacgattgatgcgtacgacccaaggtacgacc 586  Q
     ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  34389214 tatagcagtcttcagctgtcaaaatcgtgtcacgttttccaaatcgtgacacgattggtgcgtacgacccaaggtacgacc 34389294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 15 - 588
Target Start/End: Original strand, 40738704 - 40739277
Alignment:
Q  15 aaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaactaaaaa----cagacctagacttagtgtagagcaacaccacaagcataaacaa 110  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| | |||    |||| |||| || ||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  40738704 aaaggaagtggtaatctatatgtaaagtgtctccaagcaacaacaacaacaaaaaaccagatctagtct-agtgtagagcaacaccacaagcaaatacaa 40738802  T
Q  111 agcac-aaagataagcaatgaaagaaggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctc 209  Q
    ||||  |||||||||| | ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  40738803 agcaataaagataagcta-gaaaggaagaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcag-ccaatatgacctaatctggggg-gagagcagctctc 40738899  T
Q  210 caatccactatgatgaaagtgttacaagaaaaatagtttgcaagcttacacaagaacaagacttaatttctacccatttgtgtttctc-actctctcaat 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| | |||||| ||||    
T  40738900 caatccactatgatgaaagtgttacaagaaaaatagcttgcaagcttacacaagaacaagtcttagtttctacccatttgtgtttccccactctcacaat 40738999  T
Q  309 aatgaaccctaaagg-gaagacacaaaaggaagcttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaaatgtttacaatgtttctcaacccaagaga 407  Q
    | ||||||||||| | |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  40739000 a-tgaaccctaaaagagaagacacaatagtaagcttttgatccttccaatggtgaaatctcattacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga 40739098  T
Q  408 tcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatccaagtttctctctcttcaagctctccttcaaaat-ctgcacaagaacacttaa 506  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| || |||||  ||||||||||||||||||    
T  40739099 tcctcactacaaagacactcaaccctagagttccctcctttgtaatccaagtttctctct--tcaa-ctctactccaaaaaactgcacaagaacacttaa 40739195  T
Q  507 ataacagtcttcagctgataaaatcgtgccacgttttccaaatcatgccacgattgatgcgtacgacccaaggtacgacctg 588  Q
    |||  |||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||| || |||||||||| |||||| | ||||||||||||||    
T  40739196 atacaagtcttcaactgataaaatcgtgtcacgatttccaaatcgtgtcacgattgatacgtacgtcacaaggtacgacctg 40739277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 307; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 12 - 584
Target Start/End: Complemental strand, 33528858 - 33528279
Alignment:
Q  12 agcaaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaactaaaaacagacctaga-cttagtgtagagcaacaccacaagcataaacaa 110  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||| |||    
T  33528858 agcaaaggaagtggtaatcaatggataaagtgtccccaagcaacaacaac-aaaaacagacctagatctaaatgtagagcaacaccacaagcataatcaa 33528760  T
Q  111 agcac-aaagataagcaatgaaagaa-ggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctct 208  Q
    ||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| | ||    
T  33528759 agcaataaagataaacaatgaaagaaaggaacaaacacaccaa--gattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatatgggaaagagagcaaccct 33528662  T
Q  209 ccaatccactatgatgaaagtgttacaaga----------aaaatagtttgcaagcttacacaagaacaagacttaatttctacccattt-gtgtttctc 297  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |          ||| ||| ||  |||||     ||||||||||| |||||||||||||||| ||||  | |    
T  33528661 ccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttataagct-----aagaacaagacctaatttctacccattttgtgtcaccc 33528567  T
Q  298 actctctcaataatgaaccctaaagggaagacacaaaaggaagctttt-gatccttccaatggtgaaatctcactacccaaaatgtttacaatgtttctc 396  Q
    |  |||||||||||||| ||||| | ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |    
T  33528566 aaactctcaataatgaatcctaa-gagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaatgtgtttacaatgtttccc 33528468  T
Q  397 aacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatccaagtttctctctcttcaagctctccttcaaaatctgcacaa 496  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33528467 aacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatccaagtttctctctcttcaagctctccttcaaaatctgcacaa 33528368  T
Q  497 gaacacttaaataacagtcttcagctgataaaatcgtgccacgttt-tccaaatcatgccacgattgatgcgtacgacccaaggtacga 584  Q
    ||||||||| ||| |||||||||| || |||||||||| ||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  33528367 gaacacttatatagcagtcttcagttgttaaaatcgtgtcacgtttgtccaaatcgtgacacgattggtgcgtacgacccaaggtacga 33528279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 12 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 10707490 - 10706906
Alignment:
Q  12 agcaaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaacta-aaaacagacctaga-cttagtgtagagcaacaccacaagcataaaca 109  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| | ||||||| || |||||||||||||||  ||||||||| ||    
T  10707490 agcaaaagaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaacaagaaaatatacctagatctaagtgtagagcaacactgcaagcataatca 10707391  T
Q  110 aagcacaaagataagcaatgaaagaag-gaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctct 208  Q
    |||||||||||||||||| |||||||  ||| ||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||    
T  10707390 aagcacaaagataagcaaagaaagaaatgaataaacacaccga--gattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagaacaactct 10707293  T
Q  209 ccaatccactatgatgaaagtgttacaaga----------aaaatagtttgcaagcttacacaagaacaagacttaatttctacccatttgtgtttctca 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |          ||| ||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||  | ||    
T  10707292 ccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaagcttacacaagaacaagacctaatttctacccatctgtgtcaccca 10707193  T
Q  299 ctctctcaataatgaaccctaaagggaagacacaaaaggaagctttt-gatccttccaatggtgaaatctcactacccaaaatgtttacaatgtttctca 397  Q
    ||||| ||||| |||| ||||| | ||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||    
T  10707192 ctctcacaata-tgaatcctaa-gagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttctaatggtgaaatctaactacccaaggtgtttacaatgtttctca 10707095  T
Q  398 acccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatccaagtttctctctcttcaagctctccttcaaaatctgcacaag 497  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  10707094 acccaagagatcctcactacaaagataataaaccctaaagttacctcctttgtaatctaagtttctctctcttccagctcttcttcaaaatctgcacaag 10706995  T
Q  498 aacacttaaataacagtcttcagctgataaaatcgtgccacgttttccaaatcatgccacgattgatgcgtacgacccaaggtacgacc 586  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||| | || |||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  10706994 aacacttatatagcagtcttcagctgtcaaaatcgtgtcacgttttccaaaccgtggcacgattggtgtgtacgacccaaggtacgacc 10706906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 12 - 586
Target Start/End: Original strand, 21629810 - 21630389
Alignment:
Q  12 agcaaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaactaaaaacagacctaga-cttagtgtagagcaacaccacaagcataaacaa 110  Q
    ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||       |||    
T  21629810 agcaaaggaagtggtaatcaatagataaagtgtctccaagcaacaacaac--aaaacagacctagatctaagtgtagagcagcaccacaatt-----caa 21629902  T
Q  111 agcac-aaagataagcaatgaaagaa-ggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctct 208  Q
    ||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  21629903 agcaataaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaa--gattgttgacccagttcagtccaatatgacctaatctgggg-agagagcagctct 21629999  T
Q  209 ccaatccactatgatgaaagtgttacaaga----------aaaatagtttgcaagcttacacaagaacaagacttaatttctacccattt-gtgtttctc 297  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |          ||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  | |    
T  21630000 ccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagtttataagcttacacaagaacaagacttaatttctacccattttgtgtcaccc 21630099  T
Q  298 actctctcaataatgaaccctaaagggaagacacaaaaggaagctttt-gatccttccaatggtgaaatctcactacccaaaatgtttacaatgtttctc 396  Q
    || |||||||||||||| ||||| | ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |    
T  21630100 acactctcaataatgaatcctaa-gagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttccc 21630198  T
Q  397 aacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatccaagtttctctctcttcaagctctccttcaaaatctgcacaa 496  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21630199 aacccaagagatcctcactacaaagacactcaacactaaagttacctcctttgtaatccaagtttctctcccttcaagctctccttcaaaatctacacaa 21630298  T
Q  497 gaacacttaaataacagtcttcagctgataaaatcgtgccacgttt-tccaaatcatgccacgattgatgcgtacgacccaaggtacgacc 586  Q
    ||||||||| ||| ||||||| |||||  ||||||||| ||||||| |||||||| || |||||||| || ||||||||||| ||||||||    
T  21630299 gaacacttatatagcagtctttagctgtcaaaatcgtgtcacgtttgtccaaatcgtgacacgattggtgtgtacgacccaaagtacgacc 21630389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 15 - 588
Target Start/End: Original strand, 3491616 - 3492197
Alignment:
Q  15 aaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaactaaaaacagacctagacttagtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagca 114  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| | | ||||||    
T  3491616 aaaggaagtggtaatctatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaac-aaaaacagccctagtct-agtgtagagcaacaccacaagcaaatagaaagca 3491713  T
Q  115 -caaagataagcaatgaaagaaggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaat 213  Q
     | ||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  3491714 accaagataagcaa-gaaaggaagaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 3491811  T
Q  214 ccactatgatgaaagtgttacaa----------gaaaaatagtttgcaagcttacacaagaacaagacttaatttctacccatttgtgtttctc-actct 302  Q
    |||||||||||||||||||||||          ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| | |||||    
T  3491812 ccactatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaaaatagcttgcaagcttacacaagaacaagacctagattctacccatttgtgtttccccactct 3491911  T
Q  303 ctcaataatgaaccctaaagg-gaagacacaaaaggaagcttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaaatgtttacaatgtttct--caac 399  Q
    | ||||| ||||||||||| | |||||||||| |||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| |  ||||    
T  3491912 cacaata-tgaaccctaaaagagaagacacaagaggaagcttaagatccttccaatggtggaatctcactacccaaggtgtttacaatgttttttccaac 3492010  T
Q  400 ccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatccaagtttctctctcttcaagctctccttcaaaatctgcacaagaa 499  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | || |||||||||||||||||    
T  3492011 ccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctagatttccctcctttgtaatccaagtttctctctct--aagctttactccaaaatctgcacaagaa 3492108  T
Q  500 cacttaaataacagtcttcagctgataaaatcgtgccacgttttccaaatcatgccacgattgatgcgtacgacccaaggtacgacctg 588  Q
    ||||||||||  |||||||  |||||||||| ||| |||| ||||||| || || |||||||| | |||||| | ||||||||||||||    
T  3492109 cacttaaatactagtcttccactgataaaattgtgtcacgatttccaagtcgtgtcacgattggtacgtacgtcacaaggtacgacctg 3492197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 15 - 586
Target Start/End: Original strand, 20522083 - 20522666
Alignment:
Q  15 aaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaactaaaaacagacctaga-cttagtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagc 113  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||| ||||| |||| |||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20522083 aaaggaagtggtaatcaatggataaagtgtctccaagcaaaaacaacaaaaaa-agacatagatctaagtgtagagcaacaccacaagcataatcaaagc 20522181  T
Q  114 ac-aaagataagcaatgaaagaa-ggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctcca 211  Q
    |  ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  20522182 aataaagataagaaatgaaagaaaggaacaaacacaccaa--gattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcaaccctcca 20522279  T
Q  212 atccactatgatgaaagtgttacaaga----------aaaatagtttgcaagcttacacaagaacaagacttaatttctacccattt-gtgtttctcact 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |          ||| ||| ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||  | |||     
T  20522280 atccactatgatgaaagtgttacaaaagggttacaagaaattagattataagcttacaaaagaacaagacttaatttctacccattttgtgtcacccaca 20522379  T
Q  301 ctctcaataatgaaccctaaagggaagacacaaaaggaagctttt-gatccttccaatggtgaaatctcactacccaaaatgtttacaatgtttctcaac 399  Q
    |||||||||||||  ||||| |  || |||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||| ||||    
T  20522380 ctctcaataatgagtcctaa-gaaaaaacacaaaaggaagctttttgatcattcaaatggtgaaatctcactacccaagttgtttacaatgcttcccaac 20522478  T
Q  400 ccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatccaagtttctctctcttcaagctctccttcaaaatctgcacaagaa 499  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  20522479 ccaagagatactcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatctaagtttctctctctccaagctcaccttcaaaatctgcagaagaa 20522578  T
Q  500 cacttaaataacagtcttcagctgataaaatcgtgccacgttt-tccaaatcatgccacgattgatgcgtacgacccaaggtacgacc 586  Q
    |||||  ||| |||| || |||||  ||||||||| ||||||| |||||||  || |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20522579 cacttttatagcagtttttagctgtcaaaatcgtgtcacgtttgtccaaattgtgacacgattggtgcgtacgacccaaggtacgacc 20522666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 15 - 585
Target Start/End: Original strand, 13569191 - 13569773
Alignment:
Q  15 aaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaactaaaaacagacctaga-cttagtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagc 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| | |||| || ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  13569191 aaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaaacaacaacaacaaaaaacaggcttagatctaagtatagagaaacaccacaagcataatcaaagc 13569290  T
Q  114 acaaagataagcaatgaaagaa-ggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaa 212  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13569291 acaaagataatcaatgaaagaaaggaataaacacaccaaaa--ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaa 13569388  T
Q  213 tccactatgatgaaagtgttacaaga----------aaaatagtttgcaagcttacacaagaacaagacttaatttctacccatt-tgtgtttctcactc 301  Q
    |||||||||||||||||||||||| |          ||| ||| ||  ||| ||||||||||||||||| |||||||||||| || | |||  | |||||    
T  13569389 tccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttataagtttacacaagaacaagacctaatttctaccctttgtttgtcacccactc 13569488  T
Q  302 tctcaataatgaaccctaaagggaagacacaaaaggaagc-ttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaaatgtttacaatgtttctcaacc 400  Q
    || |||| ||||| ||| ||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| |||||||| |||||    
T  13569489 tcacaat-atgaatcct-aagagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatctcactatccaaggtgtttataatgtttcccaacc 13569586  T
Q  401 caagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatccaagtttctctctct-tcaagctctccttcaaaatctgcacaagaa 499  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13569587 caagagatcctcactacaaagacacttaaccctaaagttatctcatttgtaatccaagtttctctctctcccaagctctcctttaaaatctgcacaagaa 13569686  T
Q  500 cacttaaataacagtcttcagctgataaaatcgtg-ccacgttttccaaatcatgccacgattgatgcgtacgacccaaggtacgac 585  Q
    |||||| |||  ||||||||||||  ||||||||| | |  ||||||||||| || |||||||| ||| ||||| ||||||||||||    
T  13569687 cacttatatagtagtcttcagctgtcaaaatcgtgtcaaatttttccaaatcgtgacacgattggtgcttacgatccaaggtacgac 13569773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 15 - 583
Target Start/End: Complemental strand, 8390387 - 8389805
Alignment:
Q  15 aaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaactaaaaa---cagacctaga-cttagtgtagagcaacaccacaagcataaacaa 110  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||| ||||| |||||||||| | |||   |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  8390387 aaaggaagtggtaatcaatggataaagtgtatccaaacaacaacaacaacaaaaaccagacctagatctaagtgtagagcaacaccacaagcataatcaa 8390288  T
Q  111 agcacaaagataagcaatgaaagaag-gaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctc 209  Q
    ||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  8390287 agcacaaagataagcgatgaaagaaatgaacaaacacaccaaaa--ttgttgacccagttcggtccaaaatgacctaatttgggggagagagcagctctc 8390190  T
Q  210 caatccactatgatgaaagtgttacaaga----------aaaatagtttgcaagcttacacaagaacaagacttaatttctacccattt-gtgtttctca 298  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |          ||| ||| || ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||  | ||    
T  8390189 caatccactatgatgaaagtgttaaaaaagagttacaagaaattagcttacaagcttgcacaagaacaagacctaatttctacccattttgtgtcaccca 8390090  T
Q  299 ctctctcaataatgaaccctaaagggaagacacaaaaggaagctttt-gatccttccaatggtgaaatctcactacccaaaatgtttacaatgtttctca 397  Q
    ||||| ||||| |||| ||||| | ||| |||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||  |    
T  8390089 ctctcacaata-tgaatcctaa-gagaaaacacaagaggaagctttttgattcttccaatggtaaaatctcactatccaaggtgtttacaatgtttccta 8389992  T
Q  398 acccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatccaagtttctctctcttcaagctctccttcaaaatctgcacaag 497  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |    
T  8389991 acccaagagatcatcactacaaagaccctcaaccctaaagttatctcctttgtaatccaagtttctctctcttccagctctacttcaaaatctgcacagg 8389892  T
Q  498 aacacttaaataacagtcttcagctgataaaatcgtgccacg-ttttccaaatcatgccacgattgatgcgtacgacccaaggtacg 583  Q
    |||||||||||||||||||||||||   ||||||||| || | |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||    
T  8389891 aacacttaaataacagtcttcagctatcaaaatcgtgtcatgtttttccaaatcatgacatgattggtgcgtacgacccaaggtacg 8389805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 14 - 583
Target Start/End: Original strand, 33117998 - 33118576
Alignment:
Q  14 caaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaactaaaaacagacctaga-cttagtgtagagcaacaccacaagcataaacaaag 112  Q
    ||||||||||||||||||||   |||||||||| ||| || ||||||| ||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  33117998 caaaggaagtggtaatcaatagataaagtgtcttcaaacatcaacaac-aaaaacagacctaaatctaagtgtagagcaacaccacaagcataatcaaag 33118096  T
Q  113 cac-aaagataagcaatgaaagaa-ggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctcc 210  Q
     |  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||    
T  33118097 taataaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaa--gattgttggctcagttcggtccaatatgacctaatttgggggagagagcagccctcc 33118194  T
Q  211 aatccactatgatgaaagtgttacaaga----------aaaatagtttgcaagcttacacaagaacaagacttaatttctacccatttgtgtttctcact 300  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |          ||| ||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || | ||    
T  33118195 aatccactatgatgaaagagttacaaaatagttacaagaaattagcttataagcttacacaagaacaagacttaatttctacccattt-tgtgtcaccct 33118293  T
Q  301 ctctcaataatgaaccctaaagggaagacacaaaaggaagctttt-gatccttccaatggtgaaatctcactacccaaaatgtttacaatgtttctcaac 399  Q
    | |||   |||||| | ||| | ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||||    
T  33118294 cactctc-aatgaatcttaa-gagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggcgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgttccccaac 33118391  T
Q  400 ccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatccaagtttctctctcttcaagctctccttcaaaatctgcacaagaa 499  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  33118392 ccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatccaagtttctctctctaaaagctcttcttcaaaatctgcacaagaa 33118491  T
Q  500 cacttaaataacagtcttcagctgataaaatcgtgccacgttt-tccaaatcatgccacgattgatgcgtacgacccaaggtacg 583  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||  ||||||||| || |||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  33118492 cacttatatagcagtcttcagttgtcaaaatcgtgtcatgtttgtccaaatcgtgacacgattggtgcgtacgacccaaggtacg 33118576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 12 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 14699235 - 14698662
Alignment:
Q  12 agcaaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaactaaaaa---cagacctaga-cttagtgtagagcaacaccacaagcataaa 107  Q
    ||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| | |||   |||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||     
T  14699235 agcaaaggaagtggtaatcaatagataaagtgtctccaagcaacaacaacaacaaaaagcagacctaaatctaagtgtagagcaacaccacaagcataat 14699136  T
Q  108 caaagcacaaagataagcaatgaaagaa-ggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatct 206  Q
    |||||||            ||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  14699135 caaagca------------atgaaagaaaggaacaaacacaccaa--gattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagcc 14699050  T
Q  207 ctccaatccactatgatgaaagt----------gttacaagaaaaatagtttgcaagcttacacaagaacaagacttaatttctacccattt-gtgtttc 295  Q
    ||||||||||||||||||||||           |||||||||||  ||| ||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||  |    
T  14699049 ctccaatccactatgatgaaaggttacaaaagagttacaagaaat-tagcttataagcttacacaagaacaagacctaatttctacccattttgtgtcac 14698951  T
Q  296 tcactctctcaataatgaaccctaaagggaagacacaaaaggaagctttt-gatccttccaatggtgaaatctcactacccaaaatgtttacaatgtttc 394  Q
     ||| ||||||||   ||| ||||| | ||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  14698950 ccacactctcaat---gaatcctaa-gagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatagtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttc 14698855  T
Q  395 tcaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatccaagtttctctctcttcaagctctccttcaaaatctgcac 494  Q
     |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||    
T  14698854 ccaacccgagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatccaagtttctctctctaaaagctctccttcaaaatctacac 14698755  T
Q  495 aagaacacttaaataacagtcttcagctgataaaatcgtgccacgttt-tccaaatcatgccacgattgatgcgtacgacccaaggtacgacc 586  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||| ||   ||||||||| ||||||| |||||||| ||  | | ||| |||||||||||||||||||||||    
T  14698754 aagaacacttatatagcagtcttcaactatcaaaatcgtgtcacgtttgtccaaatcgtgaaatggttggtgcgtacgacccaaggtacgacc 14698662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 15 - 523
Target Start/End: Original strand, 17865066 - 17865584
Alignment:
Q  15 aaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaactaaaaacagacctaga-cttagtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagc 113  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17865066 aaaggaagtggtaatcaatggataaaatgtctccaaccaacaacaac-aaaaacatacctagatctaagtgtagagcaacaccacaagcataatcaaagc 17865164  T
Q  114 ac-aaagataagcaatgaaagaa-ggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctcca 211  Q
    |  |||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  17865165 aataaagataatcaatgaaagaaaggaacaatcacaccaa--gattgttgacccagttcagtcgaatatgacctaatctgggggagagagcaaccctcca 17865262  T
Q  212 atccactatgatgaaagtgttacaaga----------aaaatagtttgcaagcttacacaagaacaagacttaatttctacccatttg-tgtttctcact 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |          ||| ||| ||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||    |||     
T  17865263 atccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttataagcttacacaagaacaagacataatttctacctattttatgtcatccaca 17865362  T
Q  301 ctctcaataatgaaccctaaagggaagacacaaaaggaagctttt-gatccttccaatggtgaaatctcactacccaaaatgtttacaatgtttctcaac 399  Q
    |||||||||||||| ||||| | ||| |||||||||||||||||| |||||||| | | |||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||    
T  17865363 ctctcaataatgaatcctaa-gagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttctatttgtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttcccaac 17865461  T
Q  400 ccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatccaagtttctctctcttcaagctctccttcaaaatctgcacaagaa 499  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  17865462 ccaagagatcttcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatccaag-ttctgtctcttcaagctcttcttcaaaatttgcacaagaa 17865560  T
Q  500 cacttaaataacagtcttcagctg 523  Q
    |||||| ||| ||||||| |||||    
T  17865561 cacttatatagcagtctttagctg 17865584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 12 - 468
Target Start/End: Original strand, 31055902 - 31056371
Alignment:
Q  12 agcaaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaactaaaaacagacctaga-cttagtgtagagcaacaccacaagcataaacaa 110  Q
    ||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  31055902 agcaaaggaagtggtaatcaatagataaagtgtctccaagcaacaacaac-aaaaacagacctaaatctaagtgtagagcaacaccacaagcataatcaa 31056000  T
Q  111 agcac-aaagataagcaatgaaagaa--ggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctc 207  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  31056001 agcaataaagataagcaatgaaagaaaaggaacaaacacaccaaa-gattgttgacctagttcggttcaatatgacctaatctaggggagagagcagctc 31056099  T
Q  208 tccaatccactatgatgaaagtgttacaaga----------aaaatagtttgcaagcttacacaagaacaagacttaatttctaccca-tttgtgtttct 296  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |          ||| ||| ||  ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||  |     
T  31056100 tccaatccactaagatgaaagtgttacaaaagagttacaataaattagcttataagcttacaaaagaacaagacctaatttctacccattttgtgtcacc 31056199  T
Q  297 cactctctcaataatgaaccctaaagggaagacacaaaaggaagc-ttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaaatgtttacaatgtttct 395  Q
    ||| |||||   |||||| ||| ||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||     
T  31056200 cacactctc---aatgaatcct-aagagaaaacacaaaaggaagctttttgatcctttcaatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttcc 31056295  T
Q  396 caacc--caagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaat-ccaagtttctctctc 468  Q
    |||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  31056296 caaccctcaagagaacctcactacaaagacactcaaccctcaagttacctcctttgtattcccaagtttctctctc 31056371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 15 - 468
Target Start/End: Original strand, 8039923 - 8040392
Alignment:
Q  15 aaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaactaaaaacagacctaga-cttagtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagc 113  Q
    |||||||||||||||||||   |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8039923 aaaggaagtggtaatcaatagataaagtgtcttcaagcaacaacaac-aaaaacagacctaaatctaagtgtagagcaacaccacaagcataatcaaagc 8040021  T
Q  114 ac-aaagataagcaatgaaaga-aggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctcca 211  Q
    |  |||||||||||||||| || ||||| ||| ||| |||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  8040022 aataaagataagcaatgaaggagaggaaaaaatacatcaa--gattgttgacccagttcagtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctcca 8040119  T
Q  212 atccactatgatgaaagtgttacaaga------------aaaatagtttgcaagcttacacaagaacaagacttaatttctaccca-tttgtgtttctca 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |            ||| ||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||  | ||    
T  8040120 atccactatgatgaaagtgttacaaaagagagttacaagaaattagcttacaagcttacacaagaacaagacctaatttctacccattttgtgtcaccca 8040219  T
Q  299 ctctctcaataatgaaccctaaagggaagacacaaaaggaagc-ttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaaatgtttacaatgtttctca 397  Q
    ||||| |||| ||||| |||||  | || ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||    
T  8040220 ctctcacaat-atgaatcctaagagaaaaacataaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttccca 8040318  T
Q  398 acc--caagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaat-ccaagtttctctctc 468  Q
    |||  ||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  8040319 accctcaagagaacttcactacaaagacactcaaccataaagttacctcctttgtattaccaagtttctctctc 8040392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 15 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 34682568 - 34682102
Alignment:
Q  15 aaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaactaaaaacagacctaga-cttagtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagc 113  Q
    |||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||| ||||      
T  34682568 aaagaaagtggtaatcaatagataaagtgtctccaagcaacaacaac-aaaaacagacctaaatctaagtgtagagcaacaccacaagcataatcaaaca 34682470  T
Q  114 ac-aaagataagcaatgaaaga-aggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctcca 211  Q
    |  ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  34682469 aataaatataagcaatgaaagagaggaacaaacacaccaa--gattgttgacccagttcggtccaatatgacataatctgggggagagagcagctctcca 34682372  T
Q  212 atccactatgatgaaagtgttacaaga----------aaaatagtttgcaagcttacacaagaacaagacttaatttctaccca-tttgtgtttctcact 300  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |          ||| ||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  | ||||    
T  34682371 atccactataatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaggcttacacaagaacaagacttaatttctacccattttgtgtcacccact 34682272  T
Q  301 ctctcaataatgaaccctaaagggaagacacaaaaggaagc-ttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaaatgtttacaatgtttctcaa- 398  Q
    ||| |||   |||| ||| ||| ||| |||||||||||| | |||||||||||| | |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||     
T  34682271 ctcacaa-ggtgaatcct-aagagaaaacacaaaaggaaacattttgatccttcaagtggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgttttccaac 34682174  T
Q  399 -cccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaat-ccaagtttctctctc 468  Q
     | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  34682173 tctcaagagaacctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtattcccaagtttctctctc 34682102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 37 - 447
Target Start/End: Original strand, 39482815 - 39483237
Alignment:
Q  37 taaagtgtctccaagcaacaacaactaaaaacagacctaga-cttagtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagcac-aaagataagcaatgaaaga 134  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| | || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||  |||||||| ||||||||||    
T  39482815 taaagtgtctccaaacaacaacaacaaaaaacagacctaaatctaagtgtagaacaacaccacaagcataaccaaagcaataaagataaacaatgaaaga 39482914  T
Q  135 -aggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactatgatgaaagtgtta 233  Q
     |||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| |||||    
T  39482915 gaggaacaaacacaccaa--gattgttgacctagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcaggcctccaatccactatgatgaaaatgtta 39483012  T
Q  234 caaga----------aaaatagtttgcaagcttacacaagaacaagacttaatttctaccca-tttgtgtttctcactctctcaataatgaaccctaaag 322  Q
    ||| |          ||| ||| ||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||  | ||| |||||||||||||| ||| |||    
T  39483013 caaaagagttacaagaaattagcttataagcttacacaagaacaagacctaatttctacccattttatgtcacccacactctcaataatgaatcct-aag 39483111  T
Q  323 ggaagacacaaaaggaag-cttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaaatgtttacaatgtttctcaacccaagagatcctcactacaaag 421  Q
     ||| |||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  39483112 agaaaacacaaaaggaagttttttgatcattccaatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatatttcccaacccaagagatcctcacaacaaag 39483211  T
Q  422 acactcaaccctaaagttacctcctt 447  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||    
T  39483212 acactcaaccctaaagttatctcctt 39483237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 12 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 42039906 - 42039620
Alignment:
Q  12 agcaaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaactaaaaacagacctagacttagtgtagagcaacaccacaagcataaacaaa 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42039906 agcaaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaac-aaaaacatacctagattaagtgtagagcaacaccacaagcataaacaaa 42039808  T
Q  112 gcacaaagataagcaatgaaagaa-ggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctcc 210  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||     
T  42039807 gcacaaagataagcaatgaaagaaaggagcaagcacaccaaaagattgttgatctagttcggtccaatatgacctaatctgtgggagagagcagctctct 42039708  T
Q  211 aatccactatgatgaaagtg----------ttacaagaaaaatagtttgcaagcttacacaagaacaagacttaatttctacccattt 288  Q
    ||||||||||||||||||||          ||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  42039707 aatccactatgatgaaagtgttacgaagagttacaagaaaattagcttgcaagcttacacaaaaacaagacctaatttctacccattt 42039620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 15 - 356
Target Start/End: Original strand, 25398358 - 25398710
Alignment:
Q  15 aaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaactaaaaacagacctagacttagtgtagagcaacaccaca--agcataaacaaag 112  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||  ||   | ||||||    
T  25398358 aaaggaagtggtaatctatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaac-aaaaacagccctagact-agtgtagagcaacaccacacaagagaatacaaag 25398455  T
Q  113 caca-aagataagcaatgaaagaaggaacaaacacaccaaaa-gattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctcc 210  Q
    || | ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25398456 caaacaagataagcaa-gaaaggaagaacaaacacaccaaaaagattgttgacccagttcag-ccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctcc 25398553  T
Q  211 aatccactatgatgaaagt----------gttacaagaaaaatagtttgcaagcttacacaagaacaagacttaatttctacccatttgtgtttct-cac 299  Q
    |||||||||||||||||||          |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||| |||    
T  25398554 aatccactatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaaaatagcttgcaagcttacacaagaacaagtcctagtttctacccatttgtgtttctccac 25398653  T
Q  300 tctctcaataatgaaccct-aaagggaagacacaaaaggaagcttttgatccttccaa 356  Q
    |||| |||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  25398654 tctcacaat-atgaaccctaaaagagaagacacaagaggaagctttagatccttccaa 25398710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 160; E-Value: 6e-85
Query Start/End: Original strand, 15 - 356
Target Start/End: Original strand, 25403496 - 25403848
Alignment:
Q  15 aaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaactaaaaacagacctagacttagtgtagagcaacaccaca--agcataaacaaag 112  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||  ||   | ||||||    
T  25403496 aaaggaagtggtaatctatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaac-aaaaacagccctagact-agtgtagagcaacaccacacaagagaatacaaag 25403593  T
Q  113 caca-aagataagcaatgaaagaaggaacaaacacaccaaaa-gattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctcc 210  Q
    || | ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25403594 caaacaagataagcaa-gaaaggaagaacaaacacaccaaaaagattgttgactcagttcag-ccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctcc 25403691  T
Q  211 aatccactatgatgaaagt----------gttacaagaaaaatagtttgcaagcttacacaagaacaagacttaatttctacccatttgtgtttct-cac 299  Q
    |||||||||||||||||||          |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||| |||    
T  25403692 aatccactatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaaaatagcttgcaagcttacacaagaacaagtcctagtttctacccatttgtgtttctccac 25403791  T
Q  300 tctctcaataatgaaccct-aaagggaagacacaaaaggaagcttttgatccttccaa 356  Q
    |||| |||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  25403792 tctcacaat-atgaaccctaaaagagaagacacaagaggaagctttagatccttccaa 25403848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 15 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 10445679 - 10445395
Alignment:
Q  15 aaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaactaaaaacagacctaga-cttagtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagc 113  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | || |||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  10445679 aaaggaagtggtaatcaatggataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaaacagacctaaatctaagtgtagagcaaaaccacaagcataatcaaagc 10445580  T
Q  114 ac-aaagataagcaatgaaaga-aggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctcca 211  Q
    |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10445579 aataaagataagcaatgaaagagaggaacaaacacaccaa--gattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctcca 10445482  T
Q  212 atccactatgatgaaagtgttacaaga----------aaaatagtttgcaagcttacacaagaacaagacttaatttctacccattt 288  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |          ||| ||| || ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10445481 atccactattatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaatcttacacaagaacaagacctaatttctacccattt 10445395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 12 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 16940446 - 16940222
Alignment:
Q  12 agcaaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaactaaaaacagacctaga-cttagtgtagagcaacaccacaagcataaacaa 110  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||| || |||| ||||| |||||| |||||||| |||    
T  16940446 agcaaaggaagtggtaatcaatgaataaagtgtctctatgcaacaacaac-aaaaacagacctagatctaagtgcagagcgacaccaaaagcataatcaa 16940348  T
Q  111 agcac-aaagataagcaatgaaagaa-ggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctct 208  Q
    ||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||| || | ||    
T  16940347 agcaataaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaa--gattgttgacccaattcggtccaatatgacataatctgggggaaagatcagccct 16940250  T
Q  209 ccaatccactatgatgaaagtgttacaa 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16940249 ccaatccactatgatgaaagtgttacaa 16940222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 12 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 17011111 - 17010887
Alignment:
Q  12 agcaaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaactaaaaacagacctaga-cttagtgtagagcaacaccacaagcataaacaa 110  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||| || |||| ||||| |||||| |||||||| |||    
T  17011111 agcaaaggaagtggtaatcaatgaataaagtgtctctatgcaacaacaac-aaaaacagacctagatctaagtgcagagcgacaccaaaagcataatcaa 17011013  T
Q  111 agcac-aaagataagcaatgaaagaa-ggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctct 208  Q
    ||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||| || | ||    
T  17011012 agcaataaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaa--gattgttgacccaattcggtccaatatgacataatctgggggaaagatcagccct 17010915  T
Q  209 ccaatccactatgatgaaagtgttacaa 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17010914 ccaatccactatgatgaaagtgttacaa 17010887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 329 - 509
Target Start/End: Original strand, 40015110 - 40015291
Alignment:
Q  329 cacaaaaggaagctttt-gatccttccaatggtgaaatctcactacccaaaatgtttacaatgtttctcaacccaagagatcctcactacaaagacactc 427  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||| ||||||    
T  40015110 cacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatctcactatccaatgtgtttacaatgtttcccaacccaagagaacctcaatacaaa-acactc 40015208  T
Q  428 aaccctaaagttacctcctttgtaatcc-aagtttctctctcttcaagctctccttcaaaatctgcacaagaacacttaaata 509  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||  ||||||||||||    
T  40015209 aaccctaaagttacctcctttgtaaacctaaatttctctctcttcaagctctacttcaaaatctgaacagaaacacttaaata 40015291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 329 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 10445379 - 10445238
Alignment:
Q  329 cacaaaaggaagctttt-gatccttccaatggtgaaatctcactacccaaaatgtttacaatgtttctcaacccaagagatcctcactacaaagacactc 427  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||| ||    
T  10445379 cacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccgagagaacctcactacaaagacattc 10445280  T
Q  428 aaccctaaagttacctcctttgtaatccaagtttctctctct 469  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10445279 aaccctaaagttacctcctttgtaatctaagtttctctctct 10445238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 46 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 11099131 - 11098691
Alignment:
Q  46 tccaagcaacaacaactaaaaacagacctagacttagtgtagagcaacaccacaagcataaa---caaagcacaa--agataagcaatgaaagaaggaac 140  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||   | | |   ||||||| ||  ||||||| || ||||| | ||||    
T  11099131 tccaagcaacaacaac-aaaaacagccctagact-agtgtagagcaaaaccacacaaagagataccaaagcaaaacaagataaggaa-gaaaggaagaac 11099035  T
Q  141 aaacacaccaa-aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactatgatgaaagtgtt------- 232  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||           
T  11099034 aaa-acaccaagaagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagg 11098937  T
Q  233 ---acaagaaa-aatagtttgcaagcttacacaagaacaagacttaatttctacccatttgtgttt-ctcactctctcaataatgaaccct-aaagggaa 326  Q
       |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  | ||  |||||||| || |||||| | ||||||| |||| ||||||||| |||| |||    
T  11098936 gttacaagaaacaatagcttgcaagcttacacaagaacaaaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaat-atgaaccctaaaagagaa 11098838  T
Q  327 gacacaaaaggaagcttttgatccttccaa-tggtgaaat-ctcactacccaaaatgtttacaatg--tttctcaacccaagagatcctcactacaaaga 422  Q
    ||||| | |||||||||| ||||||||||| |  || | | ||||||||||||  || ||||||||  |||| ||||||||||||  ||| |||||||||    
T  11098837 gacactagaggaagctttagatccttccaactaatgtactcctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctctacaaaga 11098738  T
Q  423 cactcaaccctaaagttacctcctttgtaatccaagtttctctctct 469  Q
    |||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11098737 cactcaaccctttggttccctcctttgtaatccaagtttctctctct 11098691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 117 - 586
Target Start/End: Original strand, 14291455 - 14291944
Alignment:
Q  117 aagataagcaatgaaagaaggaacaaacacaccaa-aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatcc 215  Q
    ||||||||||| ||||| | ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14291455 aagataagcaa-gaaaggaagaacaaa-acaccaagaagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcc 14291551  T
Q  216 actatgatgaaagt----------gttacaagaaa-aatagtttgcaagcttacacaagaacaagacttaatttctacccatttgtgttt-ctcactctc 303  Q
    | ||||||||||||          ||||||||||| |||||  | |||||||||||||||||||| | ||  |||||||||| ||||||| | |||||||    
T  14291552 aatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctc 14291651  T
Q  304 tcaataatgaaccct-aaagggaagacacaaaaggaagcttttgatccttccaa-tggtgaaat-ctcactacccaaaatgtttacaatg--tttctcaa 398  Q
     |||| ||||||||| |||| |||||||| | |||||||||| ||||||||||| |  |||| | ||||||||||||  || ||||||||  |||| |||    
T  14291652 acaat-atgaaccctaaaagagaagacactagaggaagctttagatccttccaactaatgaactcctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaa 14291750  T
Q  399 cccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatccaagtttctctctc--------ttcaagctctccttcaaaatct 490  Q
    |||||||||  ||  |||||||||| |||||||||   ||| ||||||||||||||||||||||||||||        | |||||||| ||  |||||||    
T  14291751 cccaagagacactatctacaaagacgctcaaccctttggttccctcctttgtaatccaagtttctctctctaagctcttccaagctct-ctctaaaatct 14291849  T
Q  491 gcacaagaacac-ttaaataacagtcttcagctgataaaatcgtgccacgttttccaaatcatgccacgattgatgcgtacgacccaaggtacgacc 586  Q
    ||||||||||||  || |||  |||||||  ||||  ||||||||||||| |||||| ||| || |||||||  ||||||| |||||||||| ||||    
T  14291850 gcacaagaacacaatatatactagtcttcctctgaagaaatcgtgccacgatttccagatcgtgtcacgatt--tgcgtacaacccaaggtatgacc 14291944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 354 - 586
Target Start/End: Original strand, 25409842 - 25410084
Alignment:
Q  354 caatggtgaaatctcactacccaaaatgtttacaatgtttctc--aacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgta 451  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||| |||||| ||||    
T  25409842 caatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttttcccaacccaagagatcctctctacaaagacactcaaccctagtgttccctcctctgta 25409941  T
Q  452 atccaagtttctctctc--------ttcaagctctccttcaaaatctgcacaagaacacttaaataacagtcttcagctgataaaatcgtgccacgtttt 543  Q
    |||||||||||||||||        | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||  |||||||||| ||| |||| |||    
T  25409942 atccaagtttctctctctaagctcttccaagctctacttcaaaatctgcacaagaacacttaaatatcatccttcctctgataaaattgtgtcacgattt 25410041  T
Q  544 ccaaatcatgccacgattgatgcgtacgacccaaggtacgacc 586  Q
    |||| || || |||||||| | |||||| | ||||||||||||    
T  25410042 ccaagtcgtgtcacgattggtacgtacgtcacaaggtacgacc 25410084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 152 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 9296497 - 9296166
Alignment:
Q  152 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactatgatgaaagtgttacaa----------gaaa- 240  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||          ||||     
T  9296497 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatttgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaac 9296399  T
Q  241 aatagtttgcaagcttacacaagaacaagacttaatttctacccatttgtgtttctc-actctctcaataatgaaccctaaagg-gaagacacaaaagga 338  Q
    |||||  | |||||||| ||||||||||| | ||  |||||||||| |||||||| | |||||| ||||| ||||||||||| | |||||||| | ||||    
T  9296398 aatagccttcaagcttatacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaata-tgaaccctaaaagagaagacactagagga 9296300  T
Q  339 agcttttgatccttccaatggtgaaatc-tcactacccaaaatgtttacaatgtttctc--aacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaa 435  Q
    |||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||  || ||||||||||| ||  ||||||| |||  ||  ||||||||||||||||||||      
T  9296299 agctttagatccttccaatggtgaactcctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaatagacactttctacaaagacactcaacccttt 9296200  T
Q  436 agttacctcctttgtaatccaagtttctctctct 469  Q
     ||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9296199 ggttccctcctttgtaatccaagtttttctctct 9296166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 96; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 52 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 2869892 - 2869481
Alignment:
Q  52 caacaacaactaaaaacagacctaga-cttagtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagca-caaagataagcaatgaaag-aag-gaacaaacaca 147  Q
    |||||||||| | ||| ||||||| | || ||||||||||||||||| |||||||  ||||||| |||||||||||||  |||| ||| |||||||||||    
T  2869892 caacaacaacaacaaatagacctaaatctaagtgtagagcaacaccataagcatattcaaagcaacaaagataagcaaataaaggaagagaacaaacaca 2869793  T
Q  148 ccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactatgatgaaagtgttacaa--ga------- 238  Q
    |||| |  ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||| |||||  ||           
T  2869792 ccaata--ttgtttacccagttcggtccaatatgacctactctaggggagagagtagctctccaatccactaagatgaaagtgatacaaaggagttacaa 2869695  T
Q  239 -aaaatagtttgcaagcttacacaagaac-aagacttaatttctacccatttgt---gtttctcactctctcaataatgaaccctaaagggaagacacaa 333  Q
     ||| ||| ||  ||||| ||| |||||| || || |||||||||||||||| |   ||  | ||| |||||   |||||| ||| ||| ||| |||| |    
T  2869694 gaaattagcttaaaagctcaca-aagaacaaaaacctaatttctacccatttttcaagtcacccacactctc---aatgaatcct-aagagaaaacacta 2869600  T
Q  334 aaggaagc-ttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaaatgtttacaatgtttctcaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccc 432  Q
    | |||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  2869599 acggaagctttttgattcttccaatggcgaaatctcactacccaatgtgtttacaatgttttccaactcaagagaacctcactacaaagacactcaaccg 2869500  T
Q  433 taaagttacctcctttgta 451  Q
    |||||||| ||||||||||    
T  2869499 taaagttatctcctttgta 2869481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 91; E-Value: 9e-44
Query Start/End: Original strand, 183 - 356
Target Start/End: Original strand, 25407653 - 25407837
Alignment:
Q  183 cctaatctgggggagagagcatctctccaatccactatgatgaaagtgtta----------caagaaaaatagtttgcaagcttacacaagaacaagact 272  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||          |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |     
T  25407653 cctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaaaatagcttgcaagcttacacaagaacaagtcc 25407752  T
Q  273 taatttctacccatttgtgtttct-cactctctcaataatgaaccct-aaagggaagacacaaaaggaagcttttgatccttccaa 356  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  25407753 tagtttctacccatttgtgtttctccactctcacaat-atgaaccctaaaagagaagacacaagaggaagctttagatccttccaa 25407837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 380 - 586
Target Start/End: Original strand, 2334622 - 2334828
Alignment:
Q  380 tgtttacaatgtttctcaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatcc-aagtttctctctcttcaagctct 478  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |   | | |||| || |||||||||||||||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||||     
T  2334622 tgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaat-caaataccctcaaccctaaagttacctcctttgatttcccaagtttctctctcttcaagctca 2334720  T
Q  479 ccttcaaaatctgcacaagaacacttaaataacagtcttcagctgataaaatcgtgccacgtttt--ccaaatcatgccacgattgatgcgtacgaccca 576  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| |   |||||||| ||||||||  ||||||| || ||||||||||| ||||||||||    
T  2334721 ccttcaaaatctgca-aagaacacttatatagcagtcttcagc-gtcgaaatcgtgtcacgtttttcccaaatcgtgtcacgattgatgtgtacgaccca 2334818  T
Q  577 aggtacgacc 586  Q
    ||||||||||    
T  2334819 aggtacgacc 2334828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 380 - 586
Target Start/End: Original strand, 36988280 - 36988486
Alignment:
Q  380 tgtttacaatgtttctcaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatcc-aagtttctctctcttcaagctct 478  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||| |   | | ||||||| |||||||||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||    
T  36988280 tgtttactatgtttcccaacccaagagaactctaat-caaagaccctcaaccctaaagttacctcctttgatttcccaagtttctctctcttcaagctct 36988378  T
Q  479 ccttcaaaatctgcacaagaacacttaaataacagtcttcagctgataaaatcgtgccacgttttcca--aatcatgccacgattgatgcgtacgaccca 576  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| ||| ||||||||||| |  ||||||||| ||| |||||||  |||| || ||| ||||||||||||||||||    
T  36988379 ccttcaaaatatgca-aagaacacttatatagcagtcttcagc-gtcaaaatcgtgtcacattttccatcaatcgtgtcacaattgatgcgtacgaccca 36988476  T
Q  577 aggtacgacc 586  Q
    ||||||||||    
T  36988477 aggtacgacc 36988486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 380 - 574
Target Start/End: Complemental strand, 39284848 - 39284654
Alignment:
Q  380 tgtttacaatgtttctcaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatcc-aagtttctctctcttcaagctct 478  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |   | | ||||||| |||||||||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||| ||||    
T  39284848 tgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaat-caaagaccctcaaccctaaagttacctcctttgatttcccaagtttctctctcttcaacctct 39284750  T
Q  479 ccttcaaaatctgcacaagaacacttaaataacagtcttcagctgataaaatcgtgccacgtttt-ccaaatcatgccacgattgatgcgtacgacc 574  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||  |||||| || |||||||| ||||||| || |||  ||| |||||||||||    
T  39284749 ccttcaaaatctgca-aagaacacttatatagcagtcttcagctgtcaaaatcatgtcacgttttcccaaatcgtgacacatttggtgcgtacgacc 39284654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 342 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 15903788 - 15903642
Alignment:
Q  342 ttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaaatgtttacaatgtttctcaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttac 441  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||| || ||||  |||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| || |||||    
T  15903788 tttttatcattccaatggtgaaatctcattatccaatgtgtttacaatgtttcctaacccaagagaacctcactacaaagacattcaacccaaaggttac 15903689  T
Q  442 ctcctttgt-aatccaagtttctctctcttcaagctctccttcaaaa 487  Q
    ||| ||||| || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15903688 ctcatttgtaaacccaaatttctctctcttcaagctctacttcaaaa 15903642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 425 - 586
Target Start/End: Original strand, 2837093 - 2837255
Alignment:
Q  425 ctcaaccctaaagttacctcctttgtaatcc-aagtttctctctcttcaagctctccttcaaaatctgcacaagaacacttaaataacagtcttcagctg 523  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||   ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| | || ||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  2837093 ctcaaccttaaaattacctcctttgatttcccaagtttctctctcttcaaactctccttcaaaatttaca-aagaacacttatatagcagtcttcagctg 2837191  T
Q  524 ataaaatcgtgccacgtttt-ccaaatcatgccacgattgatgcgtacgacccaaggtacgacc 586  Q
      |||||||||  ||||||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  2837192 tcaaaatcgtgttacgttttcccaaatcatgacacgtttggtgcgtacgacccaaggtacgacc 2837255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 380 - 586
Target Start/End: Original strand, 5723459 - 5723665
Alignment:
Q  380 tgtttacaatgtttctcaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatcc-aagtttctctctcttcaagctct 478  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |   | | ||||||| |  |||||||||||| |||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||    
T  5723459 tgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaat-caaagaccccaaaccctaaagttgcctcctttgatttcccaagtttctctctcttcaagctct 5723557  T
Q  479 ccttcaaaatctgcacaagaacacttaaataacagtcttcagctgataaaatcgtgccacgtttt--ccaaatcatgccacgattgatgcgtacgaccca 576  Q
     |||||||||||||| ||||||| ||| ||| || |||||||| |   |||||||| ||||||||  || |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5723558 tcttcaaaatctgca-aagaacatttatatagcaatcttcagc-gtcgaaatcgtgtcacgtttttccccaatcgtgccacgattgatgcgtacgaccca 5723655  T
Q  577 aggtacgacc 586  Q
    ||||||||||    
T  5723656 aggtacgacc 5723665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 342 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 2837928 - 2837816
Alignment:
Q  342 ttttgatccttccaatggtgaaat-ctcactacccaaaatgtttacaatgtttctcaaccc--aagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagt 438  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2837928 tttttatccttccaatggtgaaattctcactatccaaggtgtttacaatgtttcccaaccctcaagagaacctcactacaaagacactcaaccctaaagt 2837829  T
Q  439 tacctcctttgta 451  Q
    |||||||||||||    
T  2837828 tacctcctttgta 2837816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 417 - 573
Target Start/End: Original strand, 6595247 - 6595404
Alignment:
Q  417 caaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatcc-aagtttctctctcttcaagctctccttcaaaatctgcacaagaacacttaaataacagtc 515  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||   ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||    
T  6595247 caaagaccctcaaccctaaagttacctcatttgatttcctaagtttctctctcttcaagctctccttcaaaatctgca-aagaacacttatatagcagtc 6595345  T
Q  516 ttcagctgataaaatcgtgccacgttttcca--aatcatgccacgattgatgcgtacgac 573  Q
    |||| | |  ||||||||| |||||||||||  |||| || || ||||||||||||||||    
T  6595346 ttcaac-gtcaaaatcgtgtcacgttttccatcaatcgtgtcaagattgatgcgtacgac 6595404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 380 - 586
Target Start/End: Original strand, 4484535 - 4484741
Alignment:
Q  380 tgtttacaatgtttctcaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttg-taatccaagtttctctctcttcaagctct 478  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||  |||    ||||||| || ||||||| ||||||  |||||| |   |||||||||||||||||| | ||||    
T  4484535 tgtttacaatgtttcccaacccaagagaagctctaatcaaagaccctaaaccctagagttactccctttgatttcccaagtttctctctcttccaactct 4484634  T
Q  479 ccttcaaaatctgcacaagaacacttaaataacagtcttcagctgataaaatcgtgccacgttttccaaatcatgccacgattgatgcgtacgacccaag 578  Q
    | ||| |||||||||||||||||||||||||  || ||||  |||||||||||||| |||| |||||| ||| || |||||||| | |||||| ||||||    
T  4484635 ctttc-aaatctgcacaagaacacttaaatactagccttccactgataaaatcgtgtcacgatttccagatcgtgtcacgattggtacgtacgtcccaag 4484733  T
Q  579 gtacgacc 586  Q
    ||||||||    
T  4484734 gtacgacc 4484741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 417 - 586
Target Start/End: Original strand, 36318250 - 36318420
Alignment:
Q  417 caaagacactcaaccctaaagttacctcctttg-taatccaagtttctctctcttcaagctctccttcaaaatctgcacaagaacacttaaataacagtc 515  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |   |||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||    
T  36318250 caaagacattcaaccctaaagttacctcctttgatttcccaagtttctctctcttttacctctccttcaaaatctgca-aagaacacttatatagcagtc 36318348  T
Q  516 ttcagctgataaaatcgtgccacgtttt-ccaaatcatgccacgattgatgcgtacgacccaaggtacgacc 586  Q
    ||||||||  ||||||||| ||||||||  |||||  || |||| ||| |||||||||  ||||||||||||    
T  36318349 ttcagctgtcaaaatcgtgtcacgttttgtcaaattgtgacacggttggtgcgtacgattcaaggtacgacc 36318420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 344 - 469
Target Start/End: Original strand, 35397710 - 35397837
Alignment:
Q  344 ttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaaatgtttacaatgtttctcaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacct 443  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  |||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  35397710 ttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaggtaattacaatgttttccaacccagaagaacctcactacaaagacaatcaaccctaaagtgacct 35397809  T
Q  444 cctttgta--atccaagtttctctctct 469  Q
    ||||||||   | |||||||||||||||    
T  35397810 cctttgtatttttcaagtttctctctct 35397837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 384 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 38312199 - 38312045
Alignment:
Q  384 tacaatgtttctcaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatcc-aagtttctctctcttcaagctctcctt 482  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |   | | ||||||  |||||||||||||||||||||||||   ||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  38312199 tacaatgtttcccaacccaagagaactctaat-caaagaacctcaaccctaaagttacctcctttgatttcccaaatttctctctcttcaagctctcctt 38312101  T
Q  483 caaaatctgcacaagaacacttaaataacagtcttcagctgataaaatcgtgccacg 539  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||    
T  38312100 caaaatctgca-aagaacacttatatagcagtcttcagctgtcaaaatcgtgtcacg 38312045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 138 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 1345652 - 1345553
Alignment:
Q  138 aacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccac-tatgatgaaagtgttacaa 236  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| || |||||||||| |||||    
T  1345652 aacaaacacaccaagaaattgttgacccagttcggtccaatatgacctactctgggggagagagcacctctccgatccacttaagatgaaagtgatacaa 1345553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 374 - 588
Target Start/End: Complemental strand, 30833315 - 30833101
Alignment:
Q  374 ccaaaatgtttacaatgtttctcaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatcc-aagtttctctctcttca 472  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||| |  |||    |||| || || ||||||| ||||||  ||||||   ||| |||||||| |||||||     
T  30833315 ccaaagtgtttacaatgtttcccaacccaagataagctctaatcaaaaaccctaaaccctagagttactccctttgatttcccaagtttctttctcttcc 30833216  T
Q  473 agctctccttcaaaatctgcacaagaacacttaaataacagtcttcagctgataaaatcgtgccacgttttccaaatcatgccacgattgatgcgtacga 572  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||  |||||||||||||| |||| ||||||| || || |||||||| | ||||||     
T  30833215 agctcaccttcaaa-tctgcacaagaacacttaaatactagtcttccactgataaaatcgtgtcacgatttccaagtcgtgtcacgattggtacgtacgt 30833117  T
Q  573 cccaaggtacgacctg 588  Q
    | ||||||||||||||    
T  30833116 cacaaggtacgacctg 30833101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 351 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 1344435 - 1344333
Alignment:
Q  351 ttccaatggtgaaat-ctcactacccaaaatgtttacaatgtttctcaacc-caagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctccttt 448  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  1344435 ttccaatggtgaaattctcactaccgaagatgtttacaatgtttcccaacctcaagagaacctcactacaaagacactcaaccctaaaattacctcattt 1344336  T
Q  449 gta 451  Q
    |||    
T  1344335 gta 1344333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 380 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 45099718 - 45099512
Alignment:
Q  380 tgtttacaatgtttctcaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatcc-aagtttctctctcttcaagctct 478  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |   | | ||||||| || |||||||||||| | |||||||   ||| ||||||||||||||||||||||     
T  45099718 tgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaat-caaagaccctaaaccctaaagttgcttcctttgatttcccaagtttctctctcttcaagctca 45099620  T
Q  479 ccttcaaaatctgcacaagaacacttaaataacagtcttcagctgataaaatcgtgccacgtttt--ccaaatcatgccacgattgatgcgtacgaccca 576  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| ||| | |||||| || |  ||||||||| ||||||||  || |||| |||||||||||||||||||||  ||    
T  45099619 ccttcaaaatctaca-aagaacacttatatagctgtcttctgc-gtcaaaatcgtgtcacgtttttccccaatcgtgccacgattgatgcgtacgattca 45099522  T
Q  577 aggtacgacc 586  Q
    ||||||||||    
T  45099521 aggtacgacc 45099512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 145 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 2838134 - 2838043
Alignment:
Q  145 acaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactatgatgaaagtgttacaa 236  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||  ||||||||| |||||    
T  2838134 acaccaagaaattgttgacccagttcggtccaatatgacctactctgggggagagagcacatctccaatccactaaaatgaaagtgatacaa 2838043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 454 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 32289461 - 32289330
Alignment:
Q  454 ccaagtttctctctcttcaagctctccttcaaaatctgcacaagaacacttaaataacagtcttcagctgataaaatcgtgccacgttttccaaatcatg 553  Q
    |||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||  || | ||  |||||||||||||| |||| ||||||  || ||    
T  32289461 ccaagtttctctctcttccatctc-ccttcaaaatctgcacaagaacacttaaatactagccctccactgataaaatcgtgtcacgatttccaggtcgtg 32289363  T
Q  554 ccacgattgatgcgtacgacccaaggtacgacc 586  Q
     ||||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  32289362 tcacgattggagcgtacgtcccaaggtacgacc 32289330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 380 - 468
Target Start/End: Original strand, 42269606 - 42269697
Alignment:
Q  380 tgtttacaatgtttctcaaccc--aagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaat-ccaagtttctctctc 468  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  42269606 tgtttacaatgtttcccaaccctcaagagaacctcactacaaagacactcaaccttaaagttacctcctttgtattcccaagtttctctctc 42269697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 380 - 586
Target Start/End: Original strand, 4503337 - 4503543
Alignment:
Q  380 tgtttacaatgtttctcaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatcc-aagtttctctctcttcaagctct 478  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |   | | ||||||  || |||||||||||| | |||||||   ||| |||||||||||||||| ||||||    
T  4503337 tgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaat-caaagaacctaaaccctaaagttgcttcctttgatttcccaagtttctctctcttctagctct 4503435  T
Q  479 ccttcaaaatctgcacaagaacacttaaataacagtcttcagctgataaaatcgtgccacgtttt--ccaaatcatgccacgattgatgcgtacgaccca 576  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||   ||||||  | |  ||||||||| ||||||||  || |||| |||||| |||||||||||||| |||    
T  4503436 ccttcaaaatctgca-aagaacacttatatagttgtcttctac-gtcaaaatcgtgtcacgtttttccccaatcgtgccacaattgatgcgtacgatcca 4503533  T
Q  577 aggtacgacc 586  Q
    ||||||||||    
T  4503534 aggtacgacc 4503543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 380 - 523
Target Start/End: Original strand, 17057574 - 17057716
Alignment:
Q  380 tgtttacaatgtttctcaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatccaagttt-ctctctcttcaagctct 478  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||| |   | | |||||||  |||||||||||||||||||| |||   ||||| ||| |||||||||||| ||||    
T  17057574 tgtttacaatatttcccaacccaagagaactctaat-caaagaccttcaaccctaaagttacctccgttgatttccaaattttctctctcttcaaactct 17057672  T
Q  479 ccttcaaaatctgcacaagaacacttaaataacagtcttcagctg 523  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  17057673 ccttcaaaatctgca-aagaacacttatatagcagtcttcagctg 17057716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 380 - 523
Target Start/End: Original strand, 17085557 - 17085699
Alignment:
Q  380 tgtttacaatgtttctcaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatccaagttt-ctctctcttcaagctct 478  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||| |   | | |||||||  |||||||||||||||||||| |||   ||||| ||| |||||||||||| ||||    
T  17085557 tgtttacaatatttcccaacccaagagaactctaat-caaagaccttcaaccctaaagttacctccgttgatttccaaattttctctctcttcaaactct 17085655  T
Q  479 ccttcaaaatctgcacaagaacacttaaataacagtcttcagctg 523  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  17085656 ccttcaaaatctgca-aagaacacttatatagcagtcttcagctg 17085699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 380 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 29867832 - 29867641
Alignment:
Q  380 tgtttacaatgtttctcaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatcc--aagtttctctctcttcaagctc 477  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |   | | ||||||| |||||||| | |||||||| ||||| | |||  ||||||||||||||| ||||||    
T  29867832 tgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaat-caaagaccctcaacccaatagttaccttctttg-attcccaaagtttctctctctttaagctc 29867735  T
Q  478 tccttcaaaatctgcacaagaacacttaaataacagtcttcagctgataaaatcgtgccacgtttt--ccaaatcatgccacgattgatgcgtac 570  Q
    || ||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||||| |||  ||||||||| ||||||||  ||||||| || |||| ||| |||||||    
T  29867734 tctttcaaaaactgca-aagaacacttatatagcagtcttcatctgtcaaaatcgtgtcacgtttttcccaaatcgtgacacgtttggtgcgtac 29867641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 86 - 230
Target Start/End: Original strand, 35397445 - 35397590
Alignment:
Q  86 agagcaacaccacaagcataaacaaagc-acaaagataagcaatgaaagaagg-aacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgac 183  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||| |  || |||||||||||||||||| ||||||||||||  || |||||| |||||||||||| |||| | ||    
T  35397445 agagcaaaaccacaagcataatcaaagcaatcaatataagcaatgaaagaaggaaacaaacacacc--aatattgtttacccagttcggttcaatctaac 35397542  T
Q  184 cta-atctgggggagagagcatctctccaatccactatgatgaaagtg 230  Q
    ||| |||||| ||||| |||| |||| |||||||||| ||||||||||    
T  35397543 ctacatctggaggagatagcagctcttcaatccactaagatgaaagtg 35397590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 152 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 44312708 - 44312626
Alignment:
Q  152 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactatgatgaaagtgttacaa 236  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  44312708 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaa 44312626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 138 - 220
Target Start/End: Original strand, 723727 - 723809
Alignment:
Q  138 aacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga-gcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  723727 aacaaacacaccaaa-gattgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactat 723809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 138 - 220
Target Start/End: Original strand, 34139753 - 34139835
Alignment:
Q  138 aacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga-gcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  34139753 aacaaacacaccaaa-gattgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactat 34139835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 135 - 220
Target Start/End: Original strand, 17057349 - 17057434
Alignment:
Q  135 aggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga-gcatctctccaatccactat 220  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  17057349 aggaacaaacacaccaaa-gattgttgacccagttcggtccaacttgacctagtctgggggagagattgatctctccaatccactat 17057434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 135 - 220
Target Start/End: Original strand, 17085332 - 17085417
Alignment:
Q  135 aggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga-gcatctctccaatccactat 220  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  17085332 aggaacaaacacaccaaa-gattgttgacccagttcggtccaacttgacctagtctgggggagagattgatctctccaatccactat 17085417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 138 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 39285024 - 39284939
Alignment:
Q  138 aacaaacacacca--aaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga-gcatctctccaatccactat 220  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  39285024 aacaaacacaccattaaagattgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactat 39284939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 380 - 586
Target Start/End: Original strand, 36205868 - 36206076
Alignment:
Q  380 tgtttacaatgtttctcaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatcc-aagtttctctctcttcaagctct 478  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||| |   | | ||||||| || |||||||||||| | |||||||   ||| ||||||||||||||||||||||     
T  36205868 tgtttaccatgtttcccaacccaagagaactctaat-caaagaccctaaaccctaaagttgcttcctttgatttcccaagtttctctctcttcaagctca 36205966  T
Q  479 ccttcaaaatctgcacaagaacact--taaataacagtcttcagctgataaaatcgtgccacgtttt--ccaaatcatgccacgattgatgcgtacgacc 574  Q
    ||||||||||||||| |||||||||  || ||| | |||||| || |  ||||||||| ||||||||  || |||| |||||| |||||||||||| | |    
T  36205967 ccttcaaaatctgca-aagaacacttatatatagctgtcttctgc-gtcaaaatcgtgtcacgtttttccccaatcgtgccacaattgatgcgtacaatc 36206064  T
Q  575 caaggtacgacc 586  Q
    ||||||||||||    
T  36206065 caaggtacgacc 36206076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 156 - 220
Target Start/End: Original strand, 35215586 - 35215650
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  35215586 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactat 35215650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 156 - 220
Target Start/End: Original strand, 35217963 - 35218027
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  35217963 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactat 35218027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 152 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 39812072 - 39811990
Alignment:
Q  152 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactatgatgaaagtgttacaa 236  Q
    ||||||||||| ||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  39812072 aagattgttgaaccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaa 39811990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 138 - 220
Target Start/End: Original strand, 11151574 - 11151656
Alignment:
Q  138 aacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagc-atctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||    
T  11151574 aacaaacacaccaaa-gattgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagaggttgatctctccaatccactat 11151656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 138 - 220
Target Start/End: Original strand, 14633808 - 14633890
Alignment:
Q  138 aacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga-gcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  14633808 aacaaacacaccaaa-gattgttgactcagttcggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactat 14633890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 138 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 36773747 - 36773665
Alignment:
Q  138 aacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga-gcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  36773747 aacaaacacaccaaa-gattgttgacccagttcggtccaacttgacataatctgggggagagattgatctctccaatccactat 36773665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 166 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 27149377 - 27149307
Alignment:
Q  166 agttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactatgatgaaagtgttacaa 236  Q
    |||| |||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  27149377 agtttggtccaatatgacctactatgggggagagagcagctctccaatccactataatgaaagtgatacaa 27149307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 135 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 38312428 - 38312343
Alignment:
Q  135 aggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga-gcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  38312428 aggaacaaacacatcaaa-gattgttgacccagttcggtccaacttgacataatctgggggagagattgatctctccaatccactat 38312343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 156 - 220
Target Start/End: Original strand, 23452237 - 23452301
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  23452237 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactat 23452301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 152 - 236
Target Start/End: Original strand, 32246789 - 32246871
Alignment:
Q  152 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactatgatgaaagtgttacaa 236  Q
    |||||||||||||  |||| | |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  32246789 aagattgttgaccttgttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaa 32246871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 156 - 220
Target Start/End: Original strand, 36558864 - 36558928
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| | |||| |||||||||    
T  36558864 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactat 36558928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 156 - 220
Target Start/End: Original strand, 36561141 - 36561205
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| | |||| |||||||||    
T  36561141 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactat 36561205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 156 - 220
Target Start/End: Original strand, 45332181 - 45332245
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| | ||||||| ||||||    
T  45332181 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaattcactat 45332245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 12 - 236
Target Start/End: Original strand, 40014788 - 40015009
Alignment:
Q  12 agcaaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaactaaaaacagacctaga-cttagtgtagagcaacaccacaagcataaacaa 110  Q
    |||||||||||| ||||||||||   ||||||||  |||||||||||||| | |||||| |||| | || |||||| | || |||||||||||||| |||    
T  40014788 agcaaaggaagtagtaatcaatgg--aaagtgtcctcaagcaacaacaacaacaaacagtcctaaaactaagtgtaaaacatcaccacaagcataatcaa 40014885  T
Q  111 agcacaaagataagcaatgaaagaaggaa--caaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctct 208  Q
    ||||  |||||||| ||  ||  ||||||  |||| | ||   ||||| ||  |||||||| | ||||||||||| || |||| |||||||| |||| ||    
T  40014886 agcaacaagataagaaaccaagaaaggaaaacaaatatac---aagatggta-acccagttagatccaatatgacatactctgagggagagaacatccct 40014981  T
Q  209 ccaatccactatgatgaaagtgttacaa 236  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||    
T  40014982 ccaatccactaagatgaaagtgatacaa 40015009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 138 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 11067490 - 11067429
Alignment:
Q  138 aacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  11067490 aacaaacacaccaaa-gattgttgaccgagttcggtccaacttgacctaatctgggggagaga 11067429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 502 - 586
Target Start/End: Original strand, 39483235 - 39483320
Alignment:
Q  502 cttaaataacagtcttcagctgataaaatcgtgccacgttt-tccaaatcatgccacgattgatgcgtacgacccaaggtacgacc 586  Q
    |||| ||| |||||||||||||  ||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  39483235 cttatatagcagtcttcagctgtcaaaattgtgccacgtttgtccaaatcgtgacacgattggtgcgtaagacccaaggtacgacc 39483320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 454 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 6266587 - 6266464
Alignment:
Q  454 ccaagtttctctctcttcaagctctccttcaaaatctgcacaagaacacttaaataacagtcttcagctgataaaatcgtgccacgttttccaaatcatg 553  Q
    |||||| |||||||||||   |||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || | ||  |||||||||||||| |||| ||||||  || ||    
T  6266587 ccaagtctctctctcttcccactctccttcaaa-tctgcacaagaacacttaaatactagccctccactgataaaatcgtgtcacgatttccaggtcgtg 6266489  T
Q  554 ccacgattgatgcgtacgacccaag 578  Q
     |||||||| ||||| || ||||||    
T  6266488 tcacgattggtgcgttcgtcccaag 6266464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 152 - 236
Target Start/End: Original strand, 19344422 - 19344504
Alignment:
Q  152 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactatgatgaaagtgttacaa 236  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| || |||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  19344422 aagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctaggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaa 19344504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 152 - 236
Target Start/End: Original strand, 19349280 - 19349362
Alignment:
Q  152 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactatgatgaaagtgttacaa 236  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| || |||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  19349280 aagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctaggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaa 19349362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 156 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 27105052 - 27104988
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| | |||| |||||||||    
T  27105052 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactat 27104988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 156 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 2736386 - 2736315
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaat-atgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactatgatgaa 226  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||    
T  2736386 ttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactataatgaa 2736315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #86
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 156 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 17462617 - 17462546
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaat-atgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactatgatgaa 226  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||    
T  17462617 ttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactataatgaa 17462546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #87
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 138 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 29868054 - 29867972
Alignment:
Q  138 aacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga-gcatctctccaatccactat 220  Q
    |||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  29868054 aacaaacacatcaaa-gattattgacccagttcggtccaacttgacctaatttgggggagagattgatctctccaatccactat 29867972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #88
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 138 - 220
Target Start/End: Original strand, 33162433 - 33162515
Alignment:
Q  138 aacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga-gcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||| |||||||||   ||||||| ||||||||||    
T  33162433 aacaaacacaccaaa-gattgttgacctagttcggtccaacttgacctaatctaggggagagattgatctctctaatccactat 33162515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #89
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 138 - 220
Target Start/End: Original strand, 36317992 - 36318074
Alignment:
Q  138 aacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga-gcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||  ||||||||   ||||||||||||||||||    
T  36317992 aacaaacacaccaaa-gattgttgacccagttcggtccaacttgacctactctaagggagagattgatctctccaatccactat 36318074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #90
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 156 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 45679904 - 45679833
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaat-atgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactatgatgaa 226  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||    
T  45679904 ttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactataatgaa 45679833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #91
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 156 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 42064770 - 42064705
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaa-tatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactat 220  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||| | |||| |||||||||    
T  42064770 ttgttgacccagttcggtccaaatttgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactat 42064705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #92
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 156 - 220
Target Start/End: Original strand, 5375346 - 5375410
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| | ||||  ||||||||    
T  5375346 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactat 5375410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #93
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 156 - 220
Target Start/End: Original strand, 19502011 - 19502075
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| | || | |||||||||    
T  19502011 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagcccttcgatccactat 19502075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #94
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 156 - 220
Target Start/End: Original strand, 19504346 - 19504410
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| |||| | |||| |||||||||    
T  19504346 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagatagcagccctccgatccactat 19504410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #95
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 362 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 41586429 - 41586349
Alignment:
Q  362 aaatctcactacccaaaatgtttacaa-tgtttctcaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttac 441  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||| |||||  ||||||||||||  ||| |  |||||||||||||||||||||||||    
T  41586429 aaatctcactacccaaggtgtttacaactgttttccaacccaagagaagctctcaccaaagacactcaaccctaaagttac 41586349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #96
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 156 - 220
Target Start/End: Original strand, 45279984 - 45280048
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactat 220  Q
    |||||||||||||| |||||||  ||||||| |||||||||||||||| | |||| |||||||||    
T  45279984 ttgttgacccagtttggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactat 45280048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #97
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 156 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 2741122 - 2741051
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaat-atgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactatgatgaa 226  Q
    ||||| ||| ||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||    
T  2741122 ttgtttacctagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactataatgaa 2741051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #98
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 156 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 3022427 - 3022380
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagca 203  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  3022427 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagca 3022380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #99
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 156 - 203
Target Start/End: Original strand, 6264148 - 6264195
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagca 203  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  6264148 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagca 6264195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #100
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 156 - 203
Target Start/End: Original strand, 11739559 - 11739606
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagca 203  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  11739559 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagca 11739606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #101
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 156 - 203
Target Start/End: Original strand, 13910045 - 13910092
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagca 203  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  13910045 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagca 13910092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #102
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 156 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 39680226 - 39680155
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaat-atgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactatgatgaa 226  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||  |||||||| |||||    
T  39680226 ttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctccgttccactataatgaa 39680155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #103
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 156 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 39687164 - 39687093
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaat-atgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactatgatgaa 226  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||  |||||||| |||||    
T  39687164 ttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctccgttccactataatgaa 39687093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #104
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 159 - 220
Target Start/End: Original strand, 7462950 - 7463012
Alignment:
Q  159 ttgacccagttcggtccaatat-gacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||| | |||| |||||||||    
T  7462950 ttgacccagttcggtccaaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactat 7463012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #105
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 156 - 210
Target Start/End: Original strand, 22163022 - 22163076
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctcc 210  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  22163022 ttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtctgggggagagagcagctctcc 22163076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #106
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 156 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 30479176 - 30479106
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaat-atgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactatgatga 225  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| |||||| ||| ||||| ||||    
T  30479176 ttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctccgatctactataatga 30479106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #107
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 156 - 225
Target Start/End: Original strand, 33670967 - 33671037
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaat-atgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactatgatga 225  Q
    ||||| || |||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||    
T  33670967 ttgtttacgcagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactataatga 33671037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #108
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 138 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 42362533 - 42362455
Alignment:
Q  138 aacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga-gcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||    ||||||  |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  42362533 aacaaacacaccaaa-gattgttgacccag----gtccaacttgacctaatctgggggagagatagatctctccaatccactat 42362455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #109
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 380 - 449
Target Start/End: Original strand, 11151796 - 11151864
Alignment:
Q  380 tgtttacaatgtttctcaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttg 449  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |   | | ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11151796 tgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaat-caaagaccctcaaccctaaagttacctcctttg 11151864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #110
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 380 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 11690464 - 11690396
Alignment:
Q  380 tgtttacaatgtttctcaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttg 449  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |   | | ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11690464 tgtttacaatgtttcccaacccaagagaactataat-caaagaccctcaaccctaaagttacctcctttg 11690396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #111
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 156 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 14837523 - 14837474
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatc 205  Q
    |||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||    
T  14837523 ttgttgactcagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcatc 14837474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #112
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 380 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 42362315 - 42362247
Alignment:
Q  380 tgtttacaatgtttctcaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttg 449  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |   | | ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  42362315 tgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaat-caaagaccctcaaccctaaagttacctcctttg 42362247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #113
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 342 - 449
Target Start/End: Original strand, 3278199 - 3278307
Alignment:
Q  342 ttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaaatgtttacaa-tgtttctcaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagtta 440  Q
    ||||||||| ||| ||  ||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||  ||||||||||||  ||| |  ||| || |||||||||||||||||    
T  3278199 ttttgatccgtcctataatgaaatctcactatccaaggtgtttacaaatgttttccaacccaagagaatctctcatcaacgatactcaaccctaaagtta 3278298  T
Q  441 cctcctttg 449  Q
    |||| ||||    
T  3278299 cctcatttg 3278307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #114
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 141 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 11690683 - 11690604
Alignment:
Q  141 aaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagc-atctctccaatccactat 220  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  |||| |||| ||||||||||    ||||||||||||||||||    
T  11690683 aaacacaccaaa-gattgttgatccagttcggtccaacttgacgtaatatgggggagaggttgatctctccaatccactat 11690604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #115
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 156 - 220
Target Start/End: Original strand, 22287336 - 22287400
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||| | ||||| | ||||||    
T  22287336 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccatttcactat 22287400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #116
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 156 - 220
Target Start/End: Original strand, 24162223 - 24162287
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||| || ||||||||||||| |  |||||||||||||    
T  24162223 ttgttgacccaattcggtccaaattgacctagtccgggggagagagcagccatccaatccactat 24162287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #117
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 157 - 220
Target Start/End: Original strand, 35446885 - 35446949
Alignment:
Q  157 tgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagag-catctctccaatccactat 220  Q
    |||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||  ||||||||||||||||||    
T  35446885 tgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagagtgatctctccaatccactat 35446949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #118
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 138 - 220
Target Start/End: Original strand, 36988058 - 36988141
Alignment:
Q  138 aacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtcc-aatatgacctaatctgggggagaga-gcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||  ||||||| ||||| |||||||   ||||||||||||||||||    
T  36988058 aacaaacacaccaaa-gattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactat 36988141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #119
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 156 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 42453035 - 42452972
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||| | |||| |||||||||    
T  42453035 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccctccgatccactat 42452972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #120
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 156 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 19007895 - 19007848
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagca 203  Q
    ||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  19007895 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagca 19007848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #121
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 156 - 225
Target Start/End: Original strand, 20050021 - 20050092
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaat-atgacctaatctgggg-gagagagcatctctccaatccactatgatga 225  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||||| |||||| ||||||||| ||||    
T  20050021 ttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctggggggagagagcagctctccgatccactataatga 20050092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #122
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 156 - 203
Target Start/End: Original strand, 22407454 - 22407501
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagca 203  Q
    ||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  22407454 ttgttgaccaagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagca 22407501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #123
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 380 - 470
Target Start/End: Original strand, 33162655 - 33162745
Alignment:
Q  380 tgtttacaatgtttctcaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttg-taatccaagtttctctctctt 470  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||| ||  | | ||||||| |||||||||||| |||||||||||| |   |||||||||||||||||    
T  33162655 tgtttacaatgtttcccaactcaagagaaccctaat-caaagaccctcaaccctaaaattacctcctttgatttcccaagtttctctctctt 33162745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #124
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 418 - 475
Target Start/End: Original strand, 12632959 - 12633017
Alignment:
Q  418 aaagacactcaaccctaaagttacctccttt-gtaatccaagtttctctctcttcaagc 475  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||   ||||||||||||||||| ||||    
T  12632959 aaagacactcaaccctaaagttatctcctttggtttcccaagtttctctctcttgaagc 12633017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #125
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 156 - 225
Target Start/End: Original strand, 12781221 - 12781291
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaat-atgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactatgatga 225  Q
    ||||| ||| ||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||  |||||||| ||||    
T  12781221 ttgtttacctagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctccgttccactataatga 12781291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #126
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 166 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 15903972 - 15903902
Alignment:
Q  166 agttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactatgatgaaagtgttacaa 236  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||  |||||||| |  |||||||||||||| ||| |||||| |||||    
T  15903972 agttcgatccaatatgacctactctgacggagagagaaaatctccaatccactaagataaaagtgatacaa 15903902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #127
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 156 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 17943717 - 17943647
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaat-atgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactatgatga 225  Q
    ||||| ||| ||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| |||||  ||||||||| ||||    
T  17943717 ttgtttacctagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctctgatccactataatga 17943647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #128
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 156 - 225
Target Start/End: Original strand, 27517639 - 27517709
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaat-atgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactatgatga 225  Q
    ||||| ||| ||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||  |||||||| ||||    
T  27517639 ttgtttaccaagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctccgttccactataatga 27517709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #129
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 526 - 584
Target Start/End: Original strand, 35447452 - 35447510
Alignment:
Q  526 aaaatcgtgccacgttttccaaatcatgccacgattgatgcgtacgacccaaggtacga 584  Q
    ||||||||| |||| ||||| |||| || |||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  35447452 aaaatcgtgtcacgatttcccaatcgtgacacgtttggtgcgtacgacccaaggtacga 35447510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #130
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 417 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 36773476 - 36773414
Alignment:
Q  417 caaagacactcaaccctaaagttacctcctttg-taatccaagtttctctctcttcaagctct 478  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |   || |||||||||||||| |||||||    
T  36773476 caaagaccctcaaccctaaagttacctcctttgatttccctagtttctctctcttgaagctct 36773414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #131
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 156 - 202
Target Start/End: Original strand, 40032053 - 40032099
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagc 202  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| |||| ||||||||||    
T  40032053 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgagggagagagc 40032099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #132
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 380 - 449
Target Start/End: Original strand, 723949 - 724017
Alignment:
Q  380 tgtttacaatgtttctcaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttg 449  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||| |   | | ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  723949 tgtttacaatgtttcccaacccaaaagaactctaat-caaagaccctcaaccctaaagttacctcctttg 724017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #133
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 138 - 175
Target Start/End: Original strand, 14202404 - 14202440
Alignment:
Q  138 aacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtcc 175  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14202404 aacaaacacaccaaa-gattgttgacccagttcggtcc 14202440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #134
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 138 - 220
Target Start/End: Original strand, 2334400 - 2334483
Alignment:
Q  138 aacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtcc-aatatgacctaatctgggggagaga-gcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| ||  ||||||| ||||| |||||||   ||||||||||||||||||    
T  2334400 aacaaacacaccaaa-gattgttcccccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactat 2334483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #135
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 138 - 220
Target Start/End: Original strand, 4503115 - 4503198
Alignment:
Q  138 aacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtcc-aatatgacctaatctgggggagaga-gcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||  ||||||| ||||| |||||||   | ||||||||||||||||    
T  4503115 aacaaacacaccaaa-gattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactat 4503198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #136
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 138 - 220
Target Start/End: Original strand, 6594988 - 6595071
Alignment:
Q  138 aacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtcc-aatatgacctaatctgggggagaga-gcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||| ||  ||||||| ||||| |||||||   ||||||||||||||||||    
T  6594988 aacaaacacaccaaa-gattgttcactcagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactat 6595071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #137
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 146 - 194
Target Start/End: Original strand, 42288101 - 42288149
Alignment:
Q  146 caccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggg 194  Q
    |||||| | ||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  42288101 caccaagaaattattgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggg 42288149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #138
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 156 - 220
Target Start/End: Original strand, 43623580 - 43623644
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||| ||||||||||||  ||||||| | |||||||||||||| | ||||  ||||||||    
T  43623580 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtttgggggagagagcagccctccgttccactat 43623644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #139
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 138 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 45099940 - 45099857
Alignment:
Q  138 aacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtcc-aatatgacctaatctgggggagaga-gcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||  ||||||| ||||| |||||||   | ||||||||||||||||    
T  45099940 aacaaacacaccaaa-gattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactat 45099857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #140
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 157 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 45727096 - 45727032
Alignment:
Q  157 tgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga-gcatctctccaatccactat 220  Q
    |||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||   ||||||||||||||||||    
T  45727096 tgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactat 45727032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 419; Significance: 0; HSPs: 112)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 419; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 5757713 - 5757132
Alignment:
Q  12 agcaaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaactaaaaacagacctagacttagtgtagagcaacaccacaagcataaacaaa 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5757713 agcaaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaac-aaaaacagacctaatct-agtgtagagcaacaccacaagcataaacaaa 5757616  T
Q  112 gcacaaagataagcaatgaaagaaggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctcca 211  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5757615 gaacaaagataagcaatgaaagaaggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctcca 5757516  T
Q  212 atccactatgatgaaagtgttacaa-ga--------aaaatagtttgcaagcttacacaagaacaagacttaatttctacccatttgtgtttctcactct 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||        ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | | ||||    
T  5757515 atccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaaatagcttgcaagcttatacaagaacaagacctaatttctacccatttgtgttccactctct 5757416  T
Q  303 ctcaataatgaaccctaaagggaagacacaaaaggaagcttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaaatgtttacaatgtttctcaaccca 402  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||    
T  5757415 ctcaataatgaaccctaaagagaagacacggaaggaagcttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttcccaaccca 5757316  T
Q  403 agagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatccaagtttctctctcttcaagctctccttcaaaatctgcacaagaacac 502  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  5757315 agagatcctaaatacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatccaagtttctctctcttccagctctcctccaaaatctgcacaaaaacac 5757216  T
Q  503 ttaaataacagtcttcagctgataaaatcgtgccacgttttccaaatcatgccacgattgatgcgtacgacccaaggtacgacc 586  Q
    |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||| |||||||||||    
T  5757215 ttatttagcagtcttcagctgataaaatcgtgccacgttttccaaatcgtgccacgattgatacatacgaccaaaggtacgacc 5757132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 12 - 424
Target Start/End: Original strand, 21355898 - 21356318
Alignment:
Q  12 agcaaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaactaaaaacagacctagacttagtgtagagcaacaccacaagcataaacaaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21355898 agcaaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtcttcaagcaacaacaac-aaaaacagacctagtct-agtgtagagcaacaccacaagcatatacaaa 21355995  T
Q  112 gcacaaagataagcaatgaaagaaggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctcca 211  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  21355996 gaacaaagataagcaatgaaagaagaaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctggaggagagagcagctctcca 21356095  T
Q  212 atccactatgatgaaagt----------gttacaagaaaaatagtttgcaagcttacacaagaacaagacttaatttctacccatttgtgtttctcactc 301  Q
    ||||||||||||||||||          |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21356096 atccactatgatgaaagtgttactaagagttacaagaaaaataacttgcaagcttacacaagaacaagacctaatttctacccatttgtgtttctcactc 21356195  T
Q  302 tctcaataatgaaccctaaagggaagacacaaaaggaagcttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaaatgtttacaatgtttctcaaccc 401  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||  |||||    
T  21356196 tctcaataatgaaccctaaagaaaagacacaaaaggaagcttttgattcttccaatgatgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttcctaaccc 21356295  T
Q  402 aagagatcctcactacaaagaca 424  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  21356296 aagagatcctcactacaaagaca 21356318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 292; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 21 - 586
Target Start/End: Original strand, 22708888 - 22709463
Alignment:
Q  21 agtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaactaaaaacagacctagacttagtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagcac-aaag 119  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  || |||||||||||||||||||  ||  |||||||  ||||    
T  22708888 agtggtaatctatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaac-aaaaacagacctagatctaatgtagagcaacaccacaagtgtatccaaagcaataaag 22708986  T
Q  120 ataagcaatgaaagaaggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccacta 219  Q
    |||||||| ||||| | ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22708987 ataagcaa-gaaaggaagaacaaacacaccaaaaaattgttgacctagttcggttcaatatgatctaatctgggggagagagcagctctccaatccacta 22709085  T
Q  220 tgatgaaagtgttacaagaaaaatagtttgcaagcttacacaagaacaagacttaatttctacccatttgtgttt-ctcactctctcaataatgaaccct 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||| | ||||||| |||| |||||||||    
T  22709086 tgatgaaagtgttacaagaaaaatagcttgcaagcttacacaagaacaagtcctagtttctacccatttgtgtttccccactctcacaat-atgaaccct 22709184  T
Q  319 -aaagggaagacacaaaaggaagcttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaaatgtttacaatgtttctcaacccaagagatcctcactac 417  Q
     |||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22709185 aaaagagaagacacaagaggaagtttttgatccttccaatggtgaaatctcactatccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagatcctcactac 22709284  T
Q  418 aaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatccaagtttctctctctt----------caagctctccttcaaaatctgcacaagaacacttaaa 507  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||          ||| |||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  22709285 aaagacactcaaccctagagttccctcctttgtaatccaagtttttctctcttcaaactcttccaaactctactccaaaatctgcacaagaacacttaaa 22709384  T
Q  508 taacagtcttcagctgataaaatcgtgccacgttttccaaatcatgccacgattgatgcgtacgacccaaggtacgacc 586  Q
    ||  |||||||  || ||||||||||| |||| ||||||| || || |||||||  |  ||||| | ||||||||||||    
T  22709385 tactagtcttccactaataaaatcgtgtcacgatttccaagtcgtgtcacgatttgtatgtacgtcacaaggtacgacc 22709463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 12 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 5017709 - 5017149
Alignment:
Q  12 agcaaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaactaaaaa---cagacctaga-cttagtgtagagcaacaccacaagcataaa 107  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||  |||||   |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||     
T  5017709 agcaaaggaagtggtaatcaatggataaagtgtctccaagcaacaacaaaaaaaaaaaacagacctagatctaagtgtagagcaacaccacaagcataat 5017610  T
Q  108 caaagcacaaagataagcaatgaaagaa-ggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatct 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |     
T  5017609 caaagcacaaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaa--gattgttgacccagttcggtcaaatatgacctaatctaggggagagagcaacc 5017512  T
Q  207 ctccaatccactatgatgaaagtgttacaagaaaaatagtttgcaagcttacacaagaacaagacttaatttctaccca-tttgtgtttctcactctctc 305  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||| ||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||  | ||| |||||    
T  5017511 ctccaatctactatgatgaaagtgttacaag-aaattagcttataagcttacacaagaacaagacctaatttctacccattttgtgtcacccacactctc 5017413  T
Q  306 aataatgaaccctaaagggaagacacaaaaggaagctttt-gatccttccaatggtgaaatctcactacccaaaatgtttacaatgtttctcaacccaag 404  Q
    |||||||                   |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||| |||||||||    
T  5017412 aataatg-------------------aaaaggaagcttttcgatccttccaatggtgaaatctcattacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaag 5017332  T
Q  405 agatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatccaagtttctctctcttcaagctctccttcaaaatctgcacaagaacactt 504  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5017331 agatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttatctcgtttgtaatccaagtttctctttctttttcctctccttcaaaatctgcacaagaacactt 5017232  T
Q  505 aaataacagtcttcagctgataaaatcgtgccac-gttttccaaatcatgccacgattgatgcgtacgacccaaggtacgacc 586  Q
    | ||| | |||||||||||  ||||||||| |||  |||| |||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5017231 atatagcggtcttcagctgtcaaaatcgtgtcacattttttcaaatcgtgacacgattggtgcgtacgacccaaggtacgacc 5017149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 12 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 31086699 - 31086126
Alignment:
Q  12 agcaaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaactaaaaacagacctaga-cttagtgtagagcaacaccacaagcataaacaa 110  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||| |||||||||| || | || |||||||||||||| |||||              
T  31086699 agcaaaggaagtggtaatcaatggataaagtgtctccaagcaaaaacaac-aaaaacagacataaatctaagtgtagagcaacatcacaa---------- 31086611  T
Q  111 agcacaaagataagcaatgaaagaa-ggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctc 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||    
T  31086610 agcacaaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaa--gattgttgacccagttcagtccaatatgatctaatctaggggagagagcaactctc 31086513  T
Q  210 caatccactatgatgaaagtgttacaa--ga--------aaaatagtttgcaagcttacacaagaacaagacttaatttctacccatttgtgtttctcac 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||        ||| ||| ||  |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||| || | |    
T  31086512 caatccactatgatgaaagtgttacaaaggagttacaagaaattagcttataagcttacacaagagcaagacctaatttctacccattt-tgtgtcaccc 31086414  T
Q  300 tctctcaataatgaaccctaaagggaagacacaaaaggaagcttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaaatgtttacaatgtttctcaac 399  Q
     | |||||||||||| ||||| | ||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||    
T  31086413 acactcaataatgaatcctaa-gagaaaacataaaaagaagcttttgatccttccaatggtgaaatctcacaacccaaggtgtttacaatgtttctcaac 31086315  T
Q  400 ccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatccaagtttctctctcttcaagctctccttcaaaatctgcacaagaa 499  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  31086314 ctaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttaccccctttgtaatccaagtttctctctcttccagctcaccttcaaaatctgcacaagaa 31086215  T
Q  500 cacttaaataacagtcttcagctgataaaatcgtgccacgtttt--ccaaatcatgccacgattgatgcgtacgacccaaggtacgacc 586  Q
    |||||| ||| ||||||||||||   ||||||||| ||||||||  ||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31086214 cacttatatagcagtcttcagctatcaaaatcgtgtcacgtttttgccaaatcgtgacacgattggtgcgtacgacccaaggtacgacc 31086126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 245; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 15 - 493
Target Start/End: Original strand, 31936451 - 31936925
Alignment:
Q  15 aaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaactaaaaacagacctaga-cttagtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagc 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  | |  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31936451 aaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaac--aaaacagaccttaatcaaagtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagc 31936548  T
Q  114 ac-aaagataagcaatgaaaga-aggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctcca 211  Q
    |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||    
T  31936549 aataaagataagcaatgaaagataggaacaaacacaccaa--gattgttgacctagttcggtccaatatgacctagtctgggagagagagcagctctcca 31936646  T
Q  212 atccactatgatgaaagtgttacaagaaaaatagtttgcaagcttacacaagaacaagacttaatttctacccattt---gtgtttctcactctctcaat 308  Q
    ||||||||  |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||    | |  | ||| |||||       
T  31936647 atccactaatatgaaagtgttacaag-aaaatagcttgcaagcttacacaagaacaaatcctaatttctacccatttttcatatcacccacactctc--- 31936742  T
Q  309 aatgaaccctaaagggaagacacaaaaggaagc-ttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaaatgtttacaatgtttctcaacccaagaga 407  Q
    |||||| ||| ||| ||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||| |||    
T  31936743 aatgaatcct-aagagaaaacacaaa--gaagctttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaataga 31936839  T
Q  408 tcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatccaagtttctctctcttcaagctctccttcaaaatctgca 493  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  || |||| ||||||||||||||    
T  31936840 tcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgcaatccaagtttctctctctaaaacctctacttcaaaatctgca 31936925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 16 - 586
Target Start/End: Original strand, 22963563 - 22964142
Alignment:
Q  16 aaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaactaaaaacagacctaga-cttagtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagca 114  Q
    ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22963563 aaggaagtggtaatcaattaataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaaacagacctagatctaagtgtagagcaacaccacaagcataatcaaagca 22963662  T
Q  115 caa-agataagcaatgaaagaa-ggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaa 212  Q
      | |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||| | ||||||    
T  22963663 atagagataagctatgaaagaaaggaacaaacacaccaa--gattgttgacccagttcggtgcaatatgaccaaatctgggg-agagagcagccctccaa 22963759  T
Q  213 tccactatgatgaaagtgttacaaga----------aaaatagtttgcaagcttacacaagaacaagacttaatttctacccatttgt-gtttctcactc 301  Q
    |||||||||||||||||||||||| |          ||| ||| ||  || ||||||||| |||||| | |||||||||||||||| | ||  ||||| |    
T  22963760 tccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttataaccttacacaa-aacaagccgtaatttctacccattttttgtcactcacac 22963858  T
Q  302 tctcaataatgaaccctaaagggaagacacaaaaggaagcttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaaatgtttacaatgtttctcaaccc 401  Q
    ||||||||||||| |||||| | || ||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||| ||    
T  22963859 tctcaataatgaatcctaaaagaaa-acacaaagggaaatttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttcccaatcc 22963957  T
Q  402 aagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatccaagtttctctctcttcaagctctccttcaaaatctgcacaagaaca 501  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| |||||||    
T  22963958 aagagatcttcactacaaagacactcaaccctaaagttagctcttttgtaatcaaagtttctctcttttcaagctctagttcaaaatctgca-aagaaca 22964056  T
Q  502 cttaaataacagtcttcagctgataaaatcgtgccacgtttt-ccaaatcatgccacgattgatgcgtacgacccaaggtacgacc 586  Q
    |||| ||| ||||||||||| |  ||||||||| |||||||| ||||||  || |||| |||  ||||||||  ||||||||||||    
T  22964057 cttatatagcagtcttcagccgtcaaaatcgtgtcacgttttcccaaattgtgacacgtttggcgcgtacgatacaaggtacgacc 22964142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 16 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 23824830 - 23824251
Alignment:
Q  16 aaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaactaaaaacagacctaga-cttagtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagca 114  Q
    ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23824830 aaggaagtggtaatcaattaataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaaacagacctagatctaagtgtagagcaacaccacaagcataatcaaagca 23824731  T
Q  115 caa-agataagcaatgaaagaa-ggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaa 212  Q
      | |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||| | ||||||    
T  23824730 atagagataagctatgaaagaaaggaacaaacacaccaa--gattgttgacccagttcggtgcaatatgaccaaatctgggg-agagagcagccctccaa 23824634  T
Q  213 tccactatgatgaaagtgttacaaga----------aaaatagtttgcaagcttacacaagaacaagacttaatttctacccatttgt-gtttctcactc 301  Q
    |||||||||||||||||||||||| |          ||| ||| ||  || ||||||||| |||||| | |||||||||||||||| | ||  ||||| |    
T  23824633 tccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttataaccttacacaa-aacaagccgtaatttctacccattttttgtcactcacac 23824535  T
Q  302 tctcaataatgaaccctaaagggaagacacaaaaggaagcttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaaatgtttacaatgtttctcaaccc 401  Q
    ||||||||||||| |||||| | || ||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||| ||    
T  23824534 tctcaataatgaatcctaaaagaaa-acacaaagggaaatttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttcccaatcc 23824436  T
Q  402 aagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatccaagtttctctctcttcaagctctccttcaaaatctgcacaagaaca 501  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| |||||||    
T  23824435 aagagatcttcactacaaagacactcaaccctaaagttagctcttttgtaatcaaagtttctctcttttcaagctctagttcaaaatctgca-aagaaca 23824337  T
Q  502 cttaaataacagtcttcagctgataaaatcgtgccacgtttt-ccaaatcatgccacgattgatgcgtacgacccaaggtacgacc 586  Q
    |||| ||| ||||||||||| |  ||||||||| |||||||| ||||||  || |||| |||  ||||||||  ||||||||||||    
T  23824336 cttatatagcagtcttcagccgtcaaaatcgtgtcacgttttcccaaattgtgacacgtttggcgcgtacgatacaaggtacgacc 23824251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 12 - 586
Target Start/End: Original strand, 31979373 - 31979961
Alignment:
Q  12 agcaaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaactaaaaacagacctaga-cttagtgtagagcaacaccacaagcataaacaa 110  Q
    ||||||||||||||||||||||   |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  31979373 agcaaaggaagtggtaatcaatagataaagtgtcttcaagcaacaacaac-aaaaacagacctaaatctaagtgtagagcaacatcacaagcataatcaa 31979471  T
Q  111 agcac-aaagataagcaatgaaaga-aggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctct 208  Q
    ||||  ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||    
T  31979472 agcaataaagataagcaatgaaatagaggaacaaacacaccaa--gattgttgacccagttcggtccaatatgacataatctgggggagagagcagccct 31979569  T
Q  209 ccaatccactatgatgaaagtgttacaaga----------aaaatagtttgcaagcttacacaagaacaagacttaatttctaccca--tttgtgtttct 296  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||| |          ||| ||  ||  ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||  |||||||  |     
T  31979570 ccaatccactaagatgaaagtgttgcaaaagagttacaagaaattaacttataagcttacaaaagaacaagacctaatttctacccatttttgtgtcacc 31979669  T
Q  297 cactctctcaataatgaaccctaaagggaagacacaaaaggaagcttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaaatgtttacaatgtttctc 396  Q
    ||| |||||   |||||| ||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  31979670 cacactctc---aatgaatcct-aagagaaaacacaaaaggaagcttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttctc 31979765  T
Q  397 aacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatccaagtttctctctcttcaagctctccttcaaaatctgcaca- 495  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||  ||||||||  |||||||||| | |     
T  31979766 aacccaaaagaacctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgcagtccaagtttctctctctaaaagctctctctcaaaatctggaaag 31979865  T
Q  496 agaacact----taaataacagtcttcagctgataaaatcgtgccacgttt-tccaaatcatgccacgattgatgcgtacgacccaaggtacgacc 586  Q
    | ||||||    || ||| |||||||||  ||  ||||||||| ||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||| ||| ||||||||    
T  31979866 aaaacacttatatatatagcagtcttcaattgtcaaaatcgtgtcacgtttgtccaaatcgtgacacgattggtgcgtacgactcaaagtacgacc 31979961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 120 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 5572369 - 5571945
Alignment:
Q  120 ataagcaatgaaagaag-gaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccact 218  Q
    ||||||| ||||||||  |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||    
T  5572369 ataagcagtgaaagaaatgaacaaacacaccaa--gattgttgacccaattcggtccaatatgacctaatctaggggagagagcagccctccaatccact 5572272  T
Q  219 atgatgaaagtgttacaaga----------aaaatagtttgcaagcttacacaagaacaagacttaatttctacccattt-gtgtttctcactctctcaa 307  Q
    |||||||||||||||||| |          ||| ||| ||  ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||  | ||| |||||||    
T  5572271 atgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttataagcttacacaagaacaagacctaatttctacgcattttgtgtcacccacactctcaa 5572172  T
Q  308 taatgaaccctaaagggaagacacaaaaggaagcttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaaatgtttacaatgtttctcaacccaagaga 407  Q
    |   ||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5572171 t---gaatcctaa-gagaaaacacaaaaggaagcttttgatcattccaatagtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga 5572076  T
Q  408 tcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatccaagtttctctctcttcaagctctccttcaaaatctgcacaagaacacttaaa 507  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| || |||||||||||||| |    
T  5572075 tccccactacaaagacacccaaccctaaagttacctccattgtaatccaagtttctctctc-taaagctctccttcaaaaactccacaagaacacttata 5571977  T
Q  508 taacagtcttcagctgataaaatcgtgccacg 539  Q
    || |||||||||| ||  ||||||||| ||||    
T  5571976 tagcagtcttcagttgtcaaaatcgtgtcacg 5571945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 12 - 394
Target Start/End: Original strand, 18232705 - 18233097
Alignment:
Q  12 agcaaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaactaaaaacagacctaga-cttagtgtagagcaacaccacaagcataaacaa 110  Q
    ||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18232705 agcaaaggaagtggtaatcaatagataaagtgtctccaagcaacaacaac-aaaaacaaacctagatctaagtgtagagcaacaccacaagcataatcaa 18232803  T
Q  111 agcac-aaagataagcaatgaaaga-aggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctct 208  Q
    ||||  |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  18232804 agcaataaagataagcgatgaaagagaggaacaaacacaccaa--gattgttgactcaaatcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcaaccct 18232901  T
Q  209 ccaatccactatgatgaaagtgttacaaga----------aaaatagtttgcaagcttacacaagaacaagacttaatttctaccca-tttgtgtttctc 297  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |          |||  || ||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||  | |    
T  18232902 ccaattcactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaatcagcttataagcttacacaagaacaagacctaatttctacccattttgtgtcaccc 18233001  T
Q  298 actctctcaataatgaaccctaaagggaagacacaaaaggaagcttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaaatgtttacaatgtttc 394  Q
    || |||||||||||||| ||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  18233002 acactctcaataatgaatcct-aagagaaaacacaaaaggaagcttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttc 18233097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 16 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 21801583 - 21801113
Alignment:
Q  16 aaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaactaaaaacagacctaga-cttagtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagca 114  Q
    ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| | || |||||||| ||| ||||||| ||||| |||||||    
T  21801583 aaggaagtggtaatcaatagataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaatcagacctaaatctaagtgtagaacaataccacaatcataatcaaagca 21801484  T
Q  115 c-aaagataagcaatgaaagaa-ggaacaaacacaccaaa----agattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctct 208  Q
      ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    | | |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  21801483 ataaagataagtaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaagataaaagtgttgacc-agttcagtccaatatgacctaatctgggggagcgagcagctct 21801385  T
Q  209 ccaatccactatgatgaaagtgttacaaga----------aaaatagtttgcaagcttacacaagaacaagacttaatttctacccattt-gtgtttctc 297  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||| |          ||| ||  ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||  | |    
T  21801384 ccaatccactaagataaaagtgttacaaaagagttacaagaaattatcttataagcttacaaaagaacaagacttaatttctacccattttgtgtcaccc 21801285  T
Q  298 actctctcaataatgaaccctaaagggaagacacaaaaggaagctttt-gatccttccaatggtgaaatctcactacccaaaatgtttacaatgtttctc 396  Q
    || |||||||  ||||||||||| | ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |    
T  21801284 acactctcaa--atgaaccctaa-gagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatgttgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttccc 21801188  T
Q  397 aacc--caagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatc-caagtttctctctc 468  Q
    ||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| || ||||||||||||||    
T  21801187 aaccctcaagagaacctcactacaaagacactcaaccctcaagttacctgctttgtattctcaagtttctctctc 21801113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 12 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 10077402 - 10077031
Alignment:
Q  12 agcaaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaactaaaaacagacctaga-cttagtgtagagcaacaccacaagcataaacaa 110  Q
    ||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  10077402 agcaaaggaagtggtaatcaatagataaagtgtctccaagcaacaacaac-aaaaacagacctaaatctaagtgtagagcaacaccacaagcataatcaa 10077304  T
Q  111 agcac-aaagataagcaatgaaagaa-ggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctct 208  Q
    ||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  10077303 agcaataaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaa--gattgttgacccaattcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccct 10077206  T
Q  209 ccaatccactatgatgaaagtgttacaaga----------aaaatagtttgcaagcttacacaagaacaagacttaatttctacccatttgtgtttctca 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |          ||| ||| ||  ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||| || |     
T  10077205 ccaatccactatgatgaaagtgttacaaaaaagttacaagaaattagcttataagcttacaaaagaacaagacctaatttctacccattt-tgtgtcacc 10077107  T
Q  299 ctctctcaataatgaaccctaaagggaagacacaaaaggaagc-ttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaa 377  Q
    | | |||   |||||| ||| |||  || |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10077106 cacactc---aatgaatcct-aagataaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtcaaatctcactacccaa 10077031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 47 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 5674971 - 5674411
Alignment:
Q  47 ccaagcaacaacaactaaaaacagacctagacttagtgtagagcaacaccacaagcataa-acaaagcaca-aagataagcaatgaaagaaggaacaaac 144  Q
    ||||||||||||||| |||| ||| ||||| || ||||||||||||||||||||  | || |||||||| | || |||||||| ||||||| ||||||||    
T  5674971 ccaagcaacaacaac-aaaaccagccctagtct-agtgtagagcaacaccacaaagagaatacaaagcaaacaatataagcaa-gaaagaaagaacaaac 5674875  T
Q  145 acaccaaa-agattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactatgatgaaagtgttacaa------- 236  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||           
T  5674874 acaccaaagagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggtta 5674776  T
Q  237 ---gaaa-aatagtttgcaagcttacacaagaa-caagacttaatttctacccatttgtgtttctc-actctctcaataatgaaccctaaagg-gaagac 329  Q
       |||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||  |||||||| || ||||||| | |||||| ||||| ||||||||||| | ||||||    
T  5674775 caagaaacaatagcttgcaagcttacacaagaaacaagacctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaata-tgaaccctaaaagagaagac 5674677  T
Q  330 acaaaaggaagcttttgatccttccaatggtgaaatc-tcactacccaaaatgtttacaatgtttctc--aacccaagagatcctcactacaaagacact 426  Q
    || | |||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||  || ||||||||||| ||  |||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  5674676 actagaggaagctttagatccttccaatggtgaactcctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctctacaaagacact 5674577  T
Q  427 caaccctaaagttacctcctttgtaatccaagtttctctctc--------ttcaagctctccttcaaaatctgcacaagaacac-ttaaataacagtctt 517  Q
    |||||||   ||| ||||||||||||||||||||| ||||||        | |||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||  || |||    
T  5674576 caaccctttggttccctcctttgtaatccaagtttatctctctaagctcttccaagctctcc-tccaaatctgcacaagaacactttaaatactagcctt 5674478  T
Q  518 cagctgataaaatcgtgccacgttttccaaatcatgccacgattgatgcgtacgacccaaggtacgacc 586  Q
    |  |||||| ||||||| |||| |||||| ||| || |||||||  |||||||| ||||||||| ||||    
T  5674477 cctctgatacaatcgtgtcacgatttccagatcgtgtcacgatt--tgcgtacgtcccaaggtatgacc 5674411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 92 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 24436127 - 24435625
Alignment:
Q  92 acaccacaagcataaacaaagca-caaagataagcaatgaaagaaggaa--caaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaat 188  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||| || | ||||| |||  |||||||||||| |   || | |||||||||| |||||||||||||| |    
T  24436127 acacaacaagcataaacaaagcaacaaagataagaaa-gcaagaaagaaaacaaacacaccaaga---tggtaacccagttcgatccaatatgacctact 24436032  T
Q  189 ctgggggagagagcatctctccaatccactatgatgaaagtgttacaa--gaa--------aaatagtttgcaagcttacacaagaacaagacttaattt 278  Q
    || |||||||||||| | |||| |||||||| ||||||| ||||||||  |||        || ||| ||  ||||||||| || |||||||| ||||||    
T  24436031 ctaggggagagagcagccctccgatccactaggatgaaaatgttacaaatgaattacaagaaattagcttataagcttacaaaaaaacaagacctaattt 24435932  T
Q  279 ctacccatttgtgtttctcactctctcaataatgaaccctaaagggaagacacaaaaggaagctttt-gatccttccaatggtgaaatctcactacccaa 377  Q
    |||||||||| | | || | | |  ||| ||||||| ||||| | ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24435931 ctacccatttttatatcacccacattca-taatgaatcctaa-gagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaa 24435834  T
Q  378 aatgtttacaatgtttctcaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatccaagtttctctctcttcaagctc 477  Q
      ||||||||||||||| |||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  24435833 ggtgtttacaatgtttcccaactcaagagaacctcac-acaaagacactcaaccctaaagttatctcctttgtaatcctagtttctctctcttcaagcta 24435735  T
Q  478 tccttcaaaatctgcacaagaacacttaaataacagtcttcagctgataaaatcgtgccacg-ttttccaaatcatgccacgattgatgcgtacgaccca 576  Q
    | ||||||||| |||| |  |||||||| ||| ||||||||| |||  ||| ||||| |||| ||  ||||||| || |||| ||| ||||||| |||||    
T  24435734 ttcttcaaaatttgcaaacaaacacttatatagcagtcttcaactgtcaaattcgtgtcacgattggccaaatcgtgacacggttggtgcgtacaaccca 24435635  T
Q  577 aggtacgacc 586  Q
    ||||||||||    
T  24435634 aggtacgacc 24435625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 396 - 586
Target Start/End: Original strand, 18234336 - 18234527
Alignment:
Q  396 caacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatccaagtttctctctcttcaagctctccttcaaaatctgcaca 495  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18234336 caacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagctacctcctttgtaatccaagtttctttctcttcaagctctccttcaaaaactgcaca 18234435  T
Q  496 agaacacttaaataacagtcttcagctgataaaatcgtgccacgttt-tccaaatcatgccacgattgatgcgtacgacccaaggtacgacc 586  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18234436 agaacacttatatagcagtcttcagctgtcaaaatcgtgtcacgtttgtccaaatcgtgacacgattggtgcgtacgacccaaggtacgacc 18234527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 63 - 401
Target Start/End: Original strand, 4629863 - 4630211
Alignment:
Q  63 aaaaacagacctaga-cttagtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagcac-aaagataagcaatgaaagaa-ggaacaaacacaccaaaagattgt 159  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||    
T  4629863 aaaaacagacctaaatctaagtgtagagcaacaccacaagcataatcaaagcaataaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacatcaaa-gattgt 4629961  T
Q  160 tgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaga----------aaaatagtttg 249  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |          ||| ||  ||     
T  4629962 tgactcagttcagtccaatatgacctaatctagggaagagagcagctctccaatccactaagatgaaagtgttacaaaatagttacaagaaattaactta 4630061  T
Q  250 caagcttacacaagaacaagacttaatttctaccca-tttgtgtttctcactctctcaataatgaaccctaaagggaagacacaaaaggaagcttttgat 348  Q
     ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | |||||||  | ||  ||||||  |||||| ||| ||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  4630062 taagcttacaaaagaacaagacctaatttctacctattttgtgtcacccaaactctca--aatgaatcct-aagagaaaacacaaaaggaagcttttgat 4630158  T
Q  349 ccttccaatggtgaaatctcactacccaaaatgtttacaatgtttctcaaccc 401  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||| ||||||    
T  4630159 ccttccaatggtgaaatctcactacccaatgtgtttaaaatgtttcccaaccc 4630211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 404 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 10077027 - 10076844
Alignment:
Q  404 gagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatccaagtttctctctcttcaagctctccttcaaaatctgcacaagaacact 503  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||      
T  10077027 gagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatccaagtttctctctcttaaagctctccttcaaaatctgcacaagaacata 10076928  T
Q  504 taaataacagtcttcagctgataaaatcgtgccacgttt-tccaaatcatgccacgattgatgcgtacgacccaaggtacgacc 586  Q
    || ||| || ||||||||||  ||| ||||| ||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10076927 tatatagcaatcttcagctgtcaaagtcgtgtcacgtttgtccaaatcgtgacacgattggtgcgtacgacccaaggtacgacc 10076844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 419 - 539
Target Start/End: Original strand, 23896628 - 23896748
Alignment:
Q  419 aagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatccaagtttctctctcttcaagctctccttcaaaatctgcacaagaacacttaaataacagtcttc 518  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| ||| ||||||||    
T  23896628 aagacactcaactctaaagttacctcctttgtaatccaagtttctctctcttcaagctcttcttcaaaatatgcacaagaactcttatatagcagtcttc 23896727  T
Q  519 agctgataaaatcgtgccacg 539  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  23896728 agctgataaaatcgtgccacg 23896748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 383 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 21272846 - 21272642
Alignment:
Q  383 ttacaatgtttctcaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatccaagtttctctctcttcaagctctcctt 482  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| |||    
T  21272846 ttacaatgtttcgcaacccaagagaacctcactacaaagacactcaaccctaaagttaccccctttgtaatcaaagtttctctcacttcaagttctactt 21272747  T
Q  483 caaaatctgcacaagaacacttaaataacagtcttcagctgataaaatcgtgccacg-ttttccaaatcatgccacgattgatgcgtacgacccaaggta 581  Q
    ||||| ||||| |  |||||||| ||| |||||||||| ||  ||||| ||| |||| ||  ||||||| || |||| ||| ||||||||| ||||||||    
T  21272746 caaaaactgcaaagaaacacttatatagcagtcttcagttgtcaaaattgtgtcacgattggccaaatcttgacacggttggtgcgtacgatccaaggta 21272647  T
Q  582 cgacc 586  Q
     ||||    
T  21272646 tgacc 21272642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 380 - 586
Target Start/End: Original strand, 33160558 - 33160765
Alignment:
Q  380 tgtttacaatgtttctcaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttg-taatccaag-tttctctctcttcaagctc 477  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |   | | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |   ||||| ||||||||||||| |||||    
T  33160558 tgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaat-caaagactctcaaccctaaagttacctcctttgattccccaagttttctctctcttccagctc 33160656  T
Q  478 tccttcaaaatctgcacaagaacacttaaataacagtcttcagctgataaaatcgtgccacgttttcca--aatcatgccacgattgatgcgtacgaccc 575  Q
    ||| |||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| |  ||||| ||| |||||||||||  |||| || |||||||||||||||||||||    
T  33160657 tccatcaaaatctgca-aagaacacttatatagcagtcttcagc-gtcaaaattgtgtcacgttttccatcaatcgtgtcacgattgatgcgtacgaccc 33160754  T
Q  576 aaggtacgacc 586  Q
    || ||||||||    
T  33160755 aatgtacgacc 33160765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 380 - 586
Target Start/End: Original strand, 5406403 - 5406609
Alignment:
Q  380 tgtttacaatgtttctcaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatcc-aagtttctctctcttcaagctct 478  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||| |   | | ||||||| || |||||||||||| |||||||||   ||| ||||||||||||||||||||||     
T  5406403 tgtttacaatgtttcccaacccgagagaactctaat-caaagaccctaaaccctaaagttgcctcctttgatttcccaagtttctctctcttcaagctca 5406501  T
Q  479 ccttcaaaatctgcacaagaacacttaaataacagtcttcagctgataaaatcgtgccacgtttt--ccaaatcatgccacgattgatgcgtacgaccca 576  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| ||| || |||||||| |   |||||||| ||||||||  || |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5406502 ccttcaaaatctgca-aataacacttatatagcaatcttcagc-gtcgaaatcgtgtcacgtttttccccaatcgtgccacgattgatgcgtacgaccca 5406599  T
Q  577 aggtacgacc 586  Q
    ||||||||||    
T  5406600 aggtacgacc 5406609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 380 - 586
Target Start/End: Original strand, 5410728 - 5410934
Alignment:
Q  380 tgtttacaatgtttctcaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatcc-aagtttctctctcttcaagctct 478  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||| |   | | ||||||| || |||||||||||| |||||||||   ||| ||||||||||||||||||||||     
T  5410728 tgtttacaatgtttcccaacccgagagaactctaat-caaagaccctaaaccctaaagttgcctcctttgatttcccaagtttctctctcttcaagctca 5410826  T
Q  479 ccttcaaaatctgcacaagaacacttaaataacagtcttcagctgataaaatcgtgccacgtttt--ccaaatcatgccacgattgatgcgtacgaccca 576  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| ||| || |||||||| |   |||||||| ||||||||  || |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5410827 ccttcaaaatctgca-aataacacttatatagcaatcttcagc-gtcgaaatcgtgtcacgtttttccccaatcgtgccacgattgatgcgtacgaccca 5410924  T
Q  577 aggtacgacc 586  Q
    ||||||||||    
T  5410925 aggtacgacc 5410934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 342 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 31076834 - 31076688
Alignment:
Q  342 ttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaaatgtttacaatgtttctcaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttac 441  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||  ||||||||| |||||||||||||||  | | |||||||||||||||||||||||| |||||     
T  31076834 ttttgatcattccaatggtgaaatctcaatacctaaggtgtttacaaagtttctcaacccaaggcaacgtcactacaaagacactcaaccctatagttat 31076735  T
Q  442 ctcctttgtaat-ccaagtttctctctcttcaagctctccttcaaaa 487  Q
    |||||||||| | |||||||||| ||||||||| || || |||||||    
T  31076734 ctcctttgtattcccaagtttctttctcttcaaactttctttcaaaa 31076688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 380 - 586
Target Start/End: Original strand, 31404878 - 31405085
Alignment:
Q  380 tgtttacaatgtttctcaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatcc-aagtttctctctcttcaagctct 478  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| |   | |  |||||| || |||||||||||| |||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||    
T  31404878 tgtttacaatgttttccaacccaagagaactctaatcaaaagaccctaaaccctaaagttgcctcctttgatttcccaagtttctctctcttcaagctct 31404977  T
Q  479 ccttcaaaatctgcacaagaacacttaaataacagtcttcagctgataaaatcgtgccacgtttt--ccaaatcatgccacgattgatgcgtacgaccca 576  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| ||| | ||||||||| |   |||||||| ||||||||  || |||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  31404978 ccttcaaaatctgca-aataacacttatatagctgtcttcagc-gtcgaaatcgtgtcacgtttttccccaatcgtgccacgattgatgcgtacgaccta 31405075  T
Q  577 aggtacgacc 586  Q
    ||||||||||    
T  31405076 aggtacgacc 31405085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 380 - 586
Target Start/End: Original strand, 30834741 - 30834948
Alignment:
Q  380 tgtttacaatgtttctcaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatc-caagtttctctctcttcaagctct 478  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |   | | |||||||  | |||||||||||| | |||||||   || ||||||||||||||||||||||||    
T  30834741 tgtttacaatgtttctcaacccaagagaactctaat-caaagaccataaaccctaaagttgcttcctttgatttctcaagtttctctctcttcaagctct 30834839  T
Q  479 ccttcaaaatctgcacaagaacacttaaataacagtcttcagctgataaaatcgtgccacgtttt---ccaaatcatgccacgattgatgcgtacgaccc 575  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||   |||||| | ||  ||||||||| ||||||||   || |||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  30834840 ccttcaaaatctgca-aagaacacttatatagttgtcttctg-tgtcaaaatcgtgtcacgttttttccccaatcgtgccacgattgatgcgtacgatcc 30834937  T
Q  576 aaggtacgacc 586  Q
    |||||||||||    
T  30834938 aaggtacgacc 30834948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 454 - 586
Target Start/End: Original strand, 5411512 - 5411644
Alignment:
Q  454 ccaagtttctctctcttcaagctctccttcaaaatctgcacaagaacacttaaataacagtcttcagctgataaaatcgtgccacgtttt--ccaaatca 551  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||| |   |||||||| ||| ||||  || ||||     
T  5411512 ccaagtttctctctcttcaagctcaccttcaaaatctgca-aagaacacttatatagcaatcttcagc-gtcgaaatcgtgtcacatttttccccaatcg 5411609  T
Q  552 tgccacgattgatgcgtacgacccaaggtacgacc 586  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5411610 tgccacgattgatgcgtacgacccaaggtacgacc 5411644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 380 - 586
Target Start/End: Original strand, 16452534 - 16452740
Alignment:
Q  380 tgtttacaatgtttctcaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatcc-aagtttctctctcttcaagctct 478  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |   | | ||||||| || ||| |||||||| | | |||||   ||| ||||||||||||||||||||||     
T  16452534 tgtttacaatgtttctcaacccaagagaactctaat-caaagaccctaaactctaaagttgcttactttgatttcccaagtttctctctcttcaagctca 16452632  T
Q  479 ccttcaaaatctgcacaagaacacttaaataacagtcttcagctgataaaatcgtgccacgtttt--ccaaatcatgccacgattgatgcgtacgaccca 576  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||| | ||||||| | |   |||||||| ||||||||  || |||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  16452633 ccttcaaaatctgca-aagaacacttatatagctgtcttcatc-gtctaaatcgtgtcacgtttttccccaatcgtgccatgattgatgcgtacgaccca 16452730  T
Q  577 aggtacgacc 586  Q
    ||||||||||    
T  16452731 aggtacgacc 16452740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 342 - 468
Target Start/End: Original strand, 14521872 - 14522002
Alignment:
Q  342 ttttgatccttccaatggtgaaat-ctcactacccaaaatgtttacaatgtttctcaaccc--aagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagt 438  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||  |||||| ||| |||||||||||| | |||||||||||    
T  14521872 tttttatccttccaatggtgaaattctcactacccaaggtgtttacaatgtttcccaaccctcaagagaacctaactacaaagacattaaaccctaaagt 14521971  T
Q  439 tacctcctttgtaatcc-aagtttctctctc 468  Q
    |||||| |||||| ||| | |||||||||||    
T  14521972 tacctcatttgtattcctaggtttctctctc 14522002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 380 - 521
Target Start/End: Original strand, 9183236 - 9183376
Alignment:
Q  380 tgtttacaatgtttctcaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatcc-aagtttctctctcttcaagctct 478  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||| |   | | ||||||| |||||||||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||    
T  9183236 tgtttacaatgtttcccaacccaggagaactctaat-caaagaccctcaaccctaaagttacctcctttgatttcccaagtttctctctcttcaagctct 9183334  T
Q  479 ccttcaaaatctgcacaagaacacttaaataacagtcttcagc 521  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||| |||  ||||||||||    
T  9183335 ccttcaaaatctgca-aagaaaacttatatagtagtcttcagc 9183376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 454 - 586
Target Start/End: Original strand, 5407187 - 5407319
Alignment:
Q  454 ccaagtttctctctcttcaagctctccttcaaaatctgcacaagaacacttaaataacagtcttcagctgataaaatcgtgccacgttttcc--aaatca 551  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||| |   |||||||| ||| |||| |   ||||     
T  5407187 ccaagtttctctctcttcaagctcaccttcaaaatctgca-aagaacacttatatagcaatcttcagc-gtcgaaatcgtgtcacatttttcttcaatcg 5407284  T
Q  552 tgccacgattgatgcgtacgacccaaggtacgacc 586  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5407285 tgtcacgattgatgcgtacgacccaaggtacgacc 5407319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 108 - 236
Target Start/End: Original strand, 27165639 - 27165767
Alignment:
Q  108 caaagcacaaagataagcaatgaaagaa--ggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatc 205  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| | ||||||| |||| | |    
T  27165639 caaagcaaaaagataagcaatgaaagaaaaggaacaaccacaccaaa-gattgtttacccagt-cggtccaatatgacctactatgggggacagagtagc 27165736  T
Q  206 tctccaatccactatgatgaaagtgttacaa 236  Q
     |||||||| |||| |||||||||| |||||    
T  27165737 cctccaatcaactaagatgaaagtgatacaa 27165767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 380 - 584
Target Start/End: Original strand, 33211390 - 33211594
Alignment:
Q  380 tgtttacaatgtttctcaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatcc-aagtttctctctcttcaagctct 478  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |   | | ||||||| ||||||  |||||||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||  |||    
T  33211390 tgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaat-caaagaccctcaactgtaaagttacctcctttgatttcccaagtttctctctcttcaacttct 33211488  T
Q  479 ccttcaaaatctgcacaagaacacttaaataacagtcttcagctgataaaatcgtgccacgtttt-ccaaatcatgccacgattgatgcgtacgacccaa 577  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||| ||| |||| || |||||  ||||||||| || |||||  |||||| || || | ||| ||||||||||||||    
T  33211489 ccttcacaatctgca-aagaacacttatatagcagtattgagctgtcaaaatcgtgtcatgttttgtcaaatcgtgacatggttggtgcgtacgacccaa 33211587  T
Q  578 ggtacga 584  Q
     ||||||    
T  33211588 agtacga 33211594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 152 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 14742520 - 14742438
Alignment:
Q  152 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactatgatgaaagtgttacaa 236  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  14742520 aagattgttgacccagttcag-ccaatatgacctaatttgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaa 14742438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 152 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 22010781 - 22010699
Alignment:
Q  152 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactatgatgaaagtgttacaa 236  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  22010781 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaa 22010699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 12 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 5572833 - 5572739
Alignment:
Q  12 agcaaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaactaaaaacagacctaga-cttagtgtagagcaacaccacaagcataa 106  Q
    ||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| | |||||||||| || | || ||||||||||||||||||||||||||    
T  5572833 agcaaaggaagtggtaatcaatagataaagtgtctccaagcaacaacagc-aaaaacagacataaatctaagtgtagagcaacaccacaagcataa 5572739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 493 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 26253843 - 26253750
Alignment:
Q  493 acaagaacacttaaataacagtcttcagctgataaaatcgtgccacgttttccaaatcatgccacgattgatgcgtacgacccaaggtacgacc 586  Q
    |||||||||||||||||  ||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||| |||||| | ||| ||||||||    
T  26253843 acaagaacacttaaatacaagtctccaactgataaaatcgtgccacgatttccaaatcgtgtcacgattgatacgtacgtcacaaagtacgacc 26253750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 380 - 539
Target Start/End: Original strand, 2171735 - 2171894
Alignment:
Q  380 tgtttacaatgtttctcaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatcc-aagtttctctctcttcaagctct 478  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||  |||    ||||||| || ||||||| |||| |  ||||||   ||| |||||||||||||||| |||||     
T  2171735 tgtttacaatgtttcccaacccaagagaaactctaatcaaagaccctaaaccctagagttgctccctttgatttcccaagtttctctctcttctagctca 2171834  T
Q  479 ccttcaaaatctgcacaagaacacttaaataacagtcttcagctgataaaatcgtgccacg 539  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||  || ||||  |||||||||||||| ||||    
T  2171835 ccttcaaa-tctgcacaagaacacttaaatactagccttccactgataaaatcgtgtcacg 2171894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 152 - 236
Target Start/End: Original strand, 11856975 - 11857057
Alignment:
Q  152 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactatgatgaaagtgttacaa 236  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  11856975 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaa 11857057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 156 - 220
Target Start/End: Original strand, 12195515 - 12195579
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  12195515 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactat 12195579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 152 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 14737660 - 14737578
Alignment:
Q  152 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactatgatgaaagtgttacaa 236  Q
    ||||||||||| ||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  14737660 aagattgttgatccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaa 14737578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 156 - 220
Target Start/End: Original strand, 26932562 - 26932626
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  26932562 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcaaccctccaatccactat 26932626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 152 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 28155653 - 28155571
Alignment:
Q  152 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactatgatgaaagtgttacaa 236  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  28155653 aagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaa 28155571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 152 - 236
Target Start/End: Original strand, 28184506 - 28184588
Alignment:
Q  152 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactatgatgaaagtgttacaa 236  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||| |||||||||||||    
T  28184506 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatctaatatga-gaaagtgttacaa 28184588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 152 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 33336026 - 33335944
Alignment:
Q  152 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactatgatgaaagtgttacaa 236  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  33336026 aagattgttgacccagttcag-ccaatgtgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaa 33335944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 141 - 236
Target Start/End: Original strand, 14521663 - 14521758
Alignment:
Q  141 aaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactatgatgaaagtgttacaa 236  Q
    ||||||||||| | | |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||| ||||||||| || || |||||||||| |||||    
T  14521663 aaacacaccaagaaaatgttgacctagttcggtccaatatgacctactctcgaggagagagcacctctccaattcaataagatgaaagtgatacaa 14521758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 138 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 16569207 - 16569125
Alignment:
Q  138 aacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga-gcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||    
T  16569207 aacaaacacaccaaa-gattgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctggaggagagattgatctctccaatccactat 16569125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 380 - 521
Target Start/End: Original strand, 5413597 - 5413737
Alignment:
Q  380 tgtttacaatgtttctcaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatcc-aagtttctctctcttcaagctct 478  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||| |   | | ||||||| || |||||||||||| |||||||||   ||| |||||||||| |||||||||||     
T  5413597 tgtttacaatgtttcccaacccgagagaactctaat-caaagaccctaaaccctaaagttgcctcctttgatttcccaagtttctctatcttcaagctca 5413695  T
Q  479 ccttcaaaatctgcacaagaacacttaaataacagtcttcagc 521  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||| || ||||||||    
T  5413696 ccttcaaaatctgca-aagaacacttatatagcaatcttcagc 5413737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 156 - 220
Target Start/End: Original strand, 4816231 - 4816295
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  4816231 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactat 4816295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 156 - 220
Target Start/End: Original strand, 5273216 - 5273280
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  5273216 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactat 5273280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 152 - 236
Target Start/End: Original strand, 6005418 - 6005500
Alignment:
Q  152 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactatgatgaaagtgttacaa 236  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  6005418 aagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaa 6005500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 156 - 220
Target Start/End: Original strand, 19704567 - 19704631
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  19704567 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactat 19704631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 156 - 220
Target Start/End: Original strand, 20915356 - 20915420
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  20915356 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactat 20915420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 156 - 220
Target Start/End: Original strand, 29754709 - 29754773
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| | |||| |||||||||    
T  29754709 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactat 29754773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 156 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 33309170 - 33309106
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| | |||| |||||||||    
T  33309170 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactat 33309106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 152 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 33330529 - 33330447
Alignment:
Q  152 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactatgatgaaagtgttacaa 236  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  33330529 aagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaa 33330447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 15 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 26258233 - 26258182
Alignment:
Q  15 aaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaactaaaa 66  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26258233 aaaggaagtggtaaccaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaa 26258182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 139 - 220
Target Start/End: Original strand, 9183015 - 9183096
Alignment:
Q  139 acaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga-gcatctctccaatccactat 220  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||| |||||||   ||||||||||||||||||    
T  9183015 acaaacacaccaaa-gattgttgacccagttcggtccaacttgacataatctggaggagagattgatctctccaatccactat 9183096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 152 - 221
Target Start/End: Original strand, 6438502 - 6438570
Alignment:
Q  152 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactatg 221  Q
    |||||||||| |||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  6438502 aagattgttgtcccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg 6438570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 156 - 220
Target Start/End: Original strand, 11983029 - 11983093
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| | |||| |||||||||    
T  11983029 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactat 11983093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 152 - 236
Target Start/End: Original strand, 16838745 - 16838827
Alignment:
Q  152 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactatgatgaaagtgttacaa 236  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| || | ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  16838745 aagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcttaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaa 16838827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 156 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 30967515 - 30967451
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  30967515 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtttgggggagagagcagctctccgatccactat 30967451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 156 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 33311439 - 33311375
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| | |||| |||||||||    
T  33311439 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagaaagcagccctccgatccactat 33311375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 156 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 13878908 - 13878837
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaat-atgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactatgatgaa 226  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||    
T  13878908 ttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactataatgaa 13878837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 156 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 13883656 - 13883585
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaat-atgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactatgatgaa 226  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||    
T  13883656 ttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactataatgaa 13883585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 156 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 16786100 - 16786029
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaat-atgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactatgatgaa 226  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||    
T  16786100 ttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactataatgaa 16786029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 138 - 216
Target Start/End: Original strand, 33211168 - 33211246
Alignment:
Q  138 aacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga-gcatctctccaatcca 216  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||    
T  33211168 aacaaacataccaaa-gattgttgacccagttcggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatcca 33211246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 527 - 586
Target Start/End: Original strand, 16452790 - 16452851
Alignment:
Q  527 aaatcgtgccacgtttt--ccaaatcatgccacgattgatgcgtacgacccaaggtacgacc 586  Q
    |||||||| ||||||||  || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16452790 aaatcgtgtcacgtttttccccaatcgtgccacgattgatgcgtacgacccaaggtacgacc 16452851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 454 - 539
Target Start/End: Original strand, 6097713 - 6097797
Alignment:
Q  454 ccaagtttctctctcttcaagctctccttcaaaatctgcacaagaacacttaaataacagtcttcagctgataaaatcgtgccacg 539  Q
    |||||||||||||||| |   ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||  |||||||||||||| ||||    
T  6097713 ccaagtttctctctctactctctcaccttcaaa-tctgcacaagaacacttaaatactagtcttcccctgataaaatcgtgtcacg 6097797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 153 - 220
Target Start/End: Original strand, 603085 - 603153
Alignment:
Q  153 agattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga-gcatctctccaatccactat 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||   || |||||||||||||||    
T  603085 agattgttgacccagttcggtccaacttgacctaatcttggggagagattgatttctccaatccactat 603153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 156 - 220
Target Start/End: Original strand, 2628886 - 2628950
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| | |||| |||||||||    
T  2628886 ttgttgacccaattcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactat 2628950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 342 - 430
Target Start/End: Original strand, 5385794 - 5385881
Alignment:
Q  342 ttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaaatgtttacaatgtttctcaacccaagagatcctcactacaaagacactcaac 430  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||  ||  || || |||||||||| |||||||  || ||||||||||||||||||||||    
T  5385794 tttttatccttctaatggtgaaatctcactacttaaggtgattgcaatgtttcttaacccaa-tgaacctcactacaaagacactcaac 5385881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 156 - 220
Target Start/End: Original strand, 14458767 - 14458831
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| | |||  |||||||||    
T  14458767 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctctgatccactat 14458831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 156 - 220
Target Start/End: Original strand, 14507176 - 14507240
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| | |||| || ||||||    
T  14507176 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgattcactat 14507240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 156 - 220
Target Start/End: Original strand, 26066124 - 26066188
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||| | |||| |||||||||    
T  26066124 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccgatccactat 26066188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 156 - 220
Target Start/End: Original strand, 26068395 - 26068459
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||| | |||| |||||||||    
T  26068395 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccgatccactat 26068459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 455 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 411997 - 411868
Alignment:
Q  455 caagtttctctctcttcaagctctccttcaaaatctgcacaagaacacttaaataacagtcttcagctgataaaatcgtgccacgttttccaaatcatgc 554  Q
    ||||||||||||||||| | ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||   | ||||  |||||||||||||| |||| |||||  ||  ||     
T  411997 caagtttctctctcttccaactc-ccttcaaa-tctgcacaagaacacttaaatacatgccttccactgataaaatcgtgtcacgatttcctgattgtgt 411900  T
Q  555 cacgattgatgcgtacgacccaaggtacgacc 586  Q
    |||||||| ||| | || ||||||||| ||||    
T  411899 cacgattggtgcatccgtcccaaggtatgacc 411868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 156 - 203
Target Start/End: Original strand, 1230249 - 1230296
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagca 203  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  1230249 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagca 1230296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 547 - 586
Target Start/End: Original strand, 5413820 - 5413859
Alignment:
Q  547 aatcatgccacgattgatgcgtacgacccaaggtacgacc 586  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5413820 aatcgtgccacgattgatgcgtacgacccaaggtacgacc 5413859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 156 - 226
Target Start/End: Original strand, 35201327 - 35201398
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaata-tgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactatgatgaa 226  Q
    ||||| ||||||||||||| |||| ||||||| ||| |||||||||||| |||||| ||||||||| |||||    
T  35201327 ttgtttacccagttcggtctaataatgacctagtcttggggagagagcagctctccgatccactataatgaa 35201398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 417 - 479
Target Start/End: Original strand, 3039157 - 3039219
Alignment:
Q  417 caaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatccaagtttctctctcttcaagctctc 479  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||    |||||||| |||||||| ||||||||    
T  3039157 caaagaccctcaaccctaaagttacctcctttgattcccaagtttttctctcttgaagctctc 3039219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 156 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 25941851 - 25941781
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaat-atgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactatgatga 225  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||  |||||||| ||||    
T  25941851 ttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctccgttccactataatga 25941781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 151 - 220
Target Start/End: Original strand, 26954281 - 26954351
Alignment:
Q  151 aaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga-gcatctctccaatccactat 220  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||  ||||||| | |||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  26954281 aaagattgttgacctagttcggtccaacttgacctactttgggggagagattgatctctccaatccactat 26954351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #84
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 162 - 225
Target Start/End: Original strand, 5165819 - 5165883
Alignment:
Q  162 acccagttcggtccaat-atgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactatgatga 225  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| |||| ||||||| |||||||| ||||    
T  5165819 acccagttcggtctaatgatgacctactctgggggagatagcaactctccattccactataatga 5165883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #85
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 546 - 586
Target Start/End: Original strand, 9183381 - 9183421
Alignment:
Q  546 aaatcatgccacgattgatgcgtacgacccaaggtacgacc 586  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9183381 aaatcgtgtcacgattgatgcgtacgacccaaggtacgacc 9183421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #86
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 156 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 26065295 - 26065232
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||| | |||| |||||||||    
T  26065295 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccctccgatccactat 26065232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #87
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 156 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 26085264 - 26085201
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||| | |||| |||||||||    
T  26085264 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccctccgatccactat 26085201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #88
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 156 - 220
Target Start/End: Original strand, 28241321 - 28241385
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||||||||||||  | ||||| |||||||||||||||| | |||| || ||||||    
T  28241321 ttgttgacccagttcggtccaaattcacctagtctgggggagagagcagccctccgattcactat 28241385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #89
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 156 - 220
Target Start/End: Original strand, 30034603 - 30034667
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||| | |||||||||||||||| | |||| |||| ||||    
T  30034603 ttgttgacccagttcggtccaaattgacccagtctgggggagagagcagccctccgatccgctat 30034667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #90
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 463 - 546
Target Start/End: Original strand, 3073039 - 3073121
Alignment:
Q  463 tctctcttcaagctctccttcaaaatctgcacaagaacacttaaataacagtcttcagctgataaaatcgtgccacgttttcca 546  Q
    ||||||||| | ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  || | ||  |||||||||||||| |||| ||||||    
T  3073039 tctctcttccaactctc-ttccaaatctgcacaagaacacttaaatactagccctccactgataaaatcgtgtcacgatttcca 3073121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #91
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 156 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 9020240 - 9020193
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagca 203  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| | ||||||||||||||    
T  9020240 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtttgggggagagagca 9020193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #92
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 156 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 15346661 - 15346614
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagca 203  Q
    ||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  15346661 ttgtttacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagca 15346614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #93
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 148 - 220
Target Start/End: Original strand, 3808699 - 3808773
Alignment:
Q  148 ccaaaagattgttgacccagttcggtccaat-atgacctaatctgggggagaga-gcatctctccaatccactat 220  Q
    |||| |||||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||   ||||||||||||||||||    
T  3808699 ccaagagattgttcacctagttcggtccaatcatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactat 3808773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #94
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 156 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 17038416 - 17038346
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaat-atgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactatgatga 225  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| |||||| | |||||||||||||||| ||||||  |||||||| ||||    
T  17038416 ttgtttacccagttcggtctaatgatgaccaagtctgggggagagagcagctctccgttccactataatga 17038346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #95
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 156 - 225
Target Start/End: Original strand, 17694852 - 17694922
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaat-atgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactatgatga 225  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| |||||||| ||| |||||||||||| ||||||  |||||||| ||||    
T  17694852 ttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctaggggagagagcagctctccgttccactataatga 17694922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #96
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 156 - 225
Target Start/End: Original strand, 25465899 - 25465969
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaat-atgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactatgatga 225  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| ||| |||| |||||||||||||||| ||||||  |||||||| ||||    
T  25465899 ttgtttacccagttcggtctaatgatggcctagtctgggggagagagcagctctccgttccactataatga 25465969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #97
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 138 - 220
Target Start/End: Original strand, 2171513 - 2171597
Alignment:
Q  138 aacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtcc-aatatgacctaatctgggggagaga-gcatctctccaatccactat 220  Q
    |||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| ||  ||||||| ||||| |||||||   | ||||||||||||||||    
T  2171513 aacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactat 2171597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #98
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 138 - 220
Target Start/End: Original strand, 5406182 - 5406265
Alignment:
Q  138 aacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcgg-tccaatatgacctaatctgggggagaga-gcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| || ||  ||||||| ||||| |||||||   ||||||||||||||||||    
T  5406182 aacaaacacaccaaa-gattgttcacccagttcggttcaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactat 5406265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #99
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 138 - 220
Target Start/End: Original strand, 5410507 - 5410590
Alignment:
Q  138 aacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcgg-tccaatatgacctaatctgggggagaga-gcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| || ||  ||||||| ||||| |||||||   ||||||||||||||||||    
T  5410507 aacaaacacaccaaa-gattgttcacccagttcggttcaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactat 5410590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #100
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 156 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 11262774 - 11262726
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaata-tgacctaatctgggggagagagca 203  Q
    ||||| |||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  11262774 ttgtttaccccgttcggtccaatactgacctagtctgggggagagagca 11262726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #101
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 138 - 220
Target Start/End: Original strand, 16452311 - 16452394
Alignment:
Q  138 aacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtcc-aatatgacctaatctgggggagaga-gcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||  ||||||| ||||| |||||||   | ||||||||||||||||    
T  16452311 aacaaacacaccaaa-gattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactat 16452394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #102
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 156 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 19696756 - 19696708
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaata-tgacctaatctgggggagagagca 203  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||    
T  19696756 ttgtttacccagttcggtccaatactgacctagtctgggagagagagca 19696708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #103
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 78 - 114
Target Start/End: Original strand, 20504812 - 20504848
Alignment:
Q  78 cttagtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagca 114  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  20504812 cttagtgtaaaggaacaccacaagcataaacaaagca 20504848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #104
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 157 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 21589098 - 21589034
Alignment:
Q  157 tgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga-gcatctctccaatccactat 220  Q
    |||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||   ||||||||||||||||||    
T  21589098 tgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactat 21589034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #105
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 157 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 21593831 - 21593767
Alignment:
Q  157 tgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga-gcatctctccaatccactat 220  Q
    |||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||   ||||||||||||||||||    
T  21593831 tgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactat 21593767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #106
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 156 - 203
Target Start/End: Original strand, 22857952 - 22858000
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaata-tgacctaatctgggggagagagca 203  Q
    ||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  22857952 ttgtttacacagttcggtccaatactgacctagtctgggggagagagca 22858000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #107
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 156 - 226
Target Start/End: Original strand, 26887227 - 26887296
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaat-atgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactatgatgaa 226  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| |||||||| |||||||  ||||||| |||||| ||||||||| |||||    
T  26887227 ttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctgggg--gagagcagctctccgatccactataatgaa 26887296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #108
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 417 - 449
Target Start/End: Original strand, 26954526 - 26954558
Alignment:
Q  417 caaagacactcaaccctaaagttacctcctttg 449  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26954526 caaagactctcaaccctaaagttacctcctttg 26954558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #109
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 546 - 586
Target Start/End: Original strand, 26954674 - 26954714
Alignment:
Q  546 aaatcatgccacgattgatgcgtacgacccaaggtacgacc 586  Q
    ||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26954674 aaatcgtgacacggttgatgcgtacgacccaaggtacgacc 26954714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #110
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 172 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 31077018 - 31076954
Alignment:
Q  172 gtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactatgatgaaagtgttacaa 236  Q
    ||||||||||||||| |||   ||||| |||| ||||||||||||||| ||| |||||| |||||    
T  31077018 gtccaatatgacctactctctaggagatagcagctctccaatccactaagataaaagtgatacaa 31076954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #111
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 138 - 220
Target Start/End: Original strand, 31404657 - 31404740
Alignment:
Q  138 aacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatat-gacctaatctgggggagagagc-atctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  | | |||| ||||| |||||||   ||||||||||||||||||    
T  31404657 aacaaacacaccaaa-gattgttcacccagttcggtccaaacttggcctactctggaggagagattgatctctccaatccactat 31404740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #112
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 159 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 32280308 - 32280264
Alignment:
Q  159 ttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagca 203  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  32280308 ttgaccaagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagca 32280264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 411; Significance: 0; HSPs: 182)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 411; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 586
Target Start/End: Original strand, 2479199 - 2479779
Alignment:
Q  12 agcaaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaactaaaaacagacctagacttagtgtagagcaacaccacaagcataaacaaa 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2479199 agcaaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctctaagcaacaacaac-aaaaacagacctagtct-agtgtagagcaacaccacaagcatatacaaa 2479296  T
Q  112 gcacaaagataagcaatgaaagaaggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctcca 211  Q
    | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| ||||| |    
T  2479297 gaacaaagataagcaatgaaagaagaaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggttcaatatgacctaatctagggg-gagagcagctctcaa 2479395  T
Q  212 atccactatgatgaaagtgttacaa-ga--------aaaatagtttgcaagcttacacaagaacaagacttaatttctacccatttgtgtttctcactct 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||        ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  2479396 atccactatgatgaaagtgttacaaagagttataagaaaatagcttgcaagcttacacaagaacaagacctaatttctacccatgtgtgtttcccactct 2479495  T
Q  303 ctcaataatgaaccctaaagggaagacacaaaaggaagcttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaaatgtttacaatgtttctcaaccca 402  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||    
T  2479496 ctcaataatgaaccctaaagagaagatataaaaggaagcttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttcccaaccca 2479595  T
Q  403 agagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatccaagtttctctctcttcaagctctccttcaaaatctgcacaagaacac 502  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  2479596 agagatcctcactataaagacactcaaccctaaagttccctcctttgtaatccaagtttctctctcttcaagctcttctccaaaatctgcacaagaacac 2479695  T
Q  503 ttaaataacagtcttcagctgataaaatcgtgccacgttttccaaatcatgccacgattgatgcgtacgacccaaggtacgacc 586  Q
    ||| |||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2479696 ttatatactagtcttcaactgataaaatcgtgccacgttttccaaatcatgccatgattgatgcgtacgacccaaggtacgacc 2479779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 336; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 474
Target Start/End: Original strand, 47263540 - 47263997
Alignment:
Q  12 agcaaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaactaaaaacagacctagacttagtgtagagcaacaccacaagcataaacaaa 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47263540 agcaaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaaaaac-aaaaatagacctagtct-agtgtagagcaacaccacaagcataaacaaa 47263637  T
Q  112 gcacaaagataagcaatgaaagaaggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctcca 211  Q
    | | ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || |||||||    
T  47263638 gaataaagataagcaatgaaataagaaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagag--cagctctcca 47263735  T
Q  212 atccactatgatgaaagtgttacaagaaaaatagtttgcaagcttacacaagaacaagacttaatttctacccatttgtgtttctcactctctcaataat 311  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  47263736 atccactatgatgaaagtgttataagaaaa-tagcttgcaagcttacacaagaacaagacctaatttctatccatttgtgtttcccactctctcaataat 47263834  T
Q  312 gaaccctaaagggaagacacaaaaggaagcttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaaatgtttacaatgtttctcaacccaagagatcct 411  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||| ||||| ||||||| ||    
T  47263835 gaaccctaaatagaagacacaaaaggaagcttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaggtatttacaatgtttcccaaccgaagagattct 47263934  T
Q  412 cactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatccaagtttctctctcttcaag 474  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  47263935 cactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttataatccaagtttctctctcttcaag 47263997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 12 - 584
Target Start/End: Original strand, 21988766 - 21989349
Alignment:
Q  12 agcaaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaactaaaaacagacctaga-cttagtgtagagcaacaccacaagcataaacaa 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||   |||||||| | ||  ||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  21988766 agcaaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtcaccaagcaacaacaacaaactccagacctaaatctgggtgtagagcaacaccacaaacataatcaa 21988865  T
Q  111 agcac-aaagataagcaatgaaagaa--ggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctc 207  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  || |||    
T  21988866 agcaataaagataagcaatgaaagaaaaggaacaaacacaccga--gattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctggaggagag--caactc 21988961  T
Q  208 tccaatccactatgatgaaagtgttacaagaa-----------aaatagtttgcaagcttacacaagaacaagacttaatttctacccatttgtgtttct 296  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||           |||||| ||||||||||| ||||||| || || || ||||||||||||| ||| ||     
T  21988962 tccaatccactttgatgaaagtgttacaaaaagagttacaagaaaatagattgcaagcttatacaagaataaaacctagtttctacccattt-tgtgtca 21989060  T
Q  297 cactctctcaata-atgaaccctaaagggaagacacaaaaggaagcttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaaatgtttacaatgtttct 395  Q
    | | |||| || | ||||||||||||| ||| |||  ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||     
T  21989061 cccactctaaaaatatgaaccctaaagagaaaacaataaaggaagcttatgatccttccaatggtaaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttcc 21989160  T
Q  396 caacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatccaagtttctctctcttcaagctctccttcaaaatctgcaca 495  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21989161 caacccaagagatcctcactacaaagacactcaaacctaaagttacctcctttgtaatccaagtttctctcacttcaagctctccttcaaaatctgcaca 21989260  T
Q  496 agaacacttaaataacagtcttcagctgataaaatcgtgccacgttttccaaatcatgccacgattgatgcgtacgacccaaggtacga 584  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  21989261 agaacacttatatagcagtcttcagctgtcaaaatcgtgtcacattttccaaatcatgacacgattgctgcgtatgacccaaggtacga 21989349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 15 - 586
Target Start/End: Original strand, 18413506 - 18414093
Alignment:
Q  15 aaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaactaaaaacagacctagacttagtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagca 114  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  18413506 aaaggaagtggtaatctatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaac-aaaaacagccctagtct-agtgtagagcaacaccacaagcaaatacaaagca 18413603  T
Q  115 -caaagataagcaatgaaagaaggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaat 213  Q
     | ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  18413604 accaagataagcaa-gaaagaaagaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggg-agagagcagctctccaat 18413700  T
Q  214 ccactatgatgaaagtgttacaa----------gaaaaatagtttgcaagcttacacaagaacaagacttaatttctacccatttgtgtttctc-actct 302  Q
    |||||||||||||||||||||||          ||||||||| ||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||| | |||||    
T  18413701 ccactatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaaaatagattgcaagcttacacaagaacaagtcctagtttctacccatttgtgtttccccactct 18413800  T
Q  303 ctcaataatgaaccctaaagggaagacacaaaaggaagcttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaaatgtttacaatgtttctc--aacc 400  Q
    | ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||| ||  ||||    
T  18413801 cacaata-tgaaccctaaaaggaagacacaagaggaagcttaagatccttccaatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacattgtttttcccaacc 18413899  T
Q  401 caagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatccaagtttctctctc--------ttcaagctctccttcaaaatctgc 492  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||        | ||||||||||| ||||||||||    
T  18413900 caagagatcctcactacaaagacactcaaccctagagttccctcctttgtaatccaagtttctctctctaagctcttccaagctctcctccaaaatctgc 18413999  T
Q  493 acaagaacacttaaataacagtcttcagctgataaaatcgtgccacgttttccaaatcatgccacgattgatgcgtacgacccaaggtacgacc 586  Q
    |||||||||||||||||  |||||||   ||||||||| ||| |||| ||||||| || || |||||||| | |||||| | ||||||||||||    
T  18414000 acaagaacacttaaatactagtcttccaatgataaaattgtgtcacgatttccaagtcgtgtcacgattggtacgtacgtcacaaggtacgacc 18414093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 15 - 586
Target Start/End: Original strand, 18408629 - 18409217
Alignment:
Q  15 aaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaactaaaaacagacctagacttagtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagca 114  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | ||| || |||||||||||||||||||| || | ||||||||    
T  18408629 aaaggaagtggtaatctatgtgtaaagtgtctccacgcaacaacaac-aaaaacagccgtagtct-agtgtagagcaacaccacaaacaaatacaaagca 18408726  T
Q  115 ca-aagataagcaatgaaagaaggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaat 213  Q
     | ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18408727 aacaagataagcaa-gaaagaaagaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 18408824  T
Q  214 ccactatgatgaaagtgttacaa----------gaaaaatagtttgcaagcttacacaagaacaagacttaatttctacccatttgtgtttctc-actct 302  Q
    ||| |||||||||||||||||||          ||||||||  ||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||| | |||||    
T  18408825 ccagtatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaaaataacttgcaagcttacacaagaacaagtcctagtttctacccatttgtgtttccccactct 18408924  T
Q  303 ctcaataatgaaccctaaagggaagacacaaaaggaagcttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaaatgtttacaatgtttctc--aacc 400  Q
    | ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||  |||||||  |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||  ||||    
T  18408925 cacaata-tgaaccctaaaaggaagacacaagaggaagcttaagatccttttaatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttttcccaacc 18409023  T
Q  401 caagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatccaagtttctctctc--------ttcaagctctccttcaaaatctgc 492  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||        | ||||||||||| ||||||||||    
T  18409024 caagagatcctcactacaaagacactcaaccctagagttccctcctttgtaatctaagtttctctctctaagctcttccaagctctcctccaaaatctgc 18409123  T
Q  493 acaagaacacttaaataacagtcttcagctgataaaatcgtgccacgttttccaaatcatgccacgattgatgcgtacgacccaaggtacgacc 586  Q
    || ||||||||||||||  |||||||  |||||||||||||| |||| ||||||| || || |||||||| | |||||| | ||||||||||||    
T  18409124 acgagaacacttaaatactagtcttccactgataaaatcgtgtcacgatttccaagtcgtgtcacgattggtacgtacgtcacaaggtacgacc 18409217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 255; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 12 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 2647934 - 2647350
Alignment:
Q  12 agcaaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaactaaaaacagacctaga-cttagtgtagagcaacaccacaagcataaacaa 110  Q
    |||||||||| |||||||||||   |||| | ||||||| |||||||||| ||||||||||||| | || ||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  2647934 agcaaaggaaatggtaatcaatagataaaatatctccaaacaacaacaacaaaaaacagacctaaatctaagtttagagcaacaccacaagcataatcaa 2647835  T
Q  111 agcac-aaagataagcaatgaaagaa-ggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctct 208  Q
    ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||  ||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| | ||    
T  2647834 agcaataaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacatcaa--gattgttgacccaattcggcccaatatgacctattctgggggagagagcagccct 2647737  T
Q  209 ccaatccactatgatgaaagtgttacaaga----------aaaatagtttgcaagcttacacaagaacaagacttaatttctacccattt-gtgtttctc 297  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |          ||| ||| ||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||  | |    
T  2647736 ccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttataagcttacacaagaacaagacctaatttctacccattttgtgtcaccc 2647637  T
Q  298 actctctcaataatgaaccctaaagggaagacacaaaaggaagctttt-gatccttccaatggtgaaatctcactacccaaaatgtttacaatgtttctc 396  Q
    || ||||||||   ||| ||||| | ||| |||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||| ||||||| |    
T  2647636 acactctcaat---gaatcctaa-gagaaaacacaaaatgaagttttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaggtgcttaccatgtttccc 2647541  T
Q  397 aacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatccaagtttctctctcttcaagctctccttcaaaatctgcacaa 496  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||    
T  2647540 aacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttatctcctttgtagtccaagtttctctctctaaaatctctccttcaaaatctgcacaa 2647441  T
Q  497 gaacacttaaataacagtcttcagctgataaaatcgtgccacgttt-tccaaatcatgccacgattgatgcgtacgacccaaggtacgacc 586  Q
    ||||||||  ||| ||||||||||||   ||||||||  ||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  2647440 gaacacttttatagcagtcttcagctctcaaaatcgtatcacgtttgtccaaatcgtgacacgattggtgcgtacgacccaaggtacgacc 2647350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 245; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 15 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 9185396 - 9184920
Alignment:
Q  15 aaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaactaaaaacagacctaga-cttagtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagc 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9185396 aaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaac--aaaacagacctagatctaagtgtagagaaacaccacaagcataaacaaagc 9185299  T
Q  114 ac-aaagataagcaatgaaaga-aggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctcca 211  Q
    |  ||||||||||||||||||| ||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  9185298 aataaagataagcaatgaaagagaggaacaaacacc----aagattgttgacccagttcggtccaatataacctagtctgggggagagagaagctctcca 9185203  T
Q  212 atccactatgatgaaagtgttacaagaaaaatagtttgcaagcttacacaagaacaagacttaatttctacccatttgt-gtttctcactctctcaataa 310  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |  | || | | | |||  |||    
T  9185202 atccactaagatgaaagtgttacaagaaaaatagcttgcaagcttacacaagaacaagtcctaatttctacccatttttcatatcacccacactc-ttaa 9185104  T
Q  311 tgaaccctaaagggaagacacaaaaggaagc-ttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaaatgtttacaatgtttctcaacccaagagatc 409  Q
    |||| ||| ||| ||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  9185103 tgaatcct-aagagaaaacacacaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaac 9185005  T
Q  410 ctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatccaagtttctctctcttcaagctctc-cttcaaaatctgca 493  Q
    || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||  || ||||| ||| ||||||||||    
T  9185004 cttactacaaagatactcaaccctaaagttacctcctttgcaatcaatgtttctctctctaaaacctctctcttaaaaatctgca 9184920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 245; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 12 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 46516548 - 46515967
Alignment:
Q  12 agcaaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaactaaaaacagacctaga-cttagtgtagagcaacaccacaagcataaacaa 110  Q
    ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||||||| |||||||||| || | || |||||| |||||||||| |||||||| |||    
T  46516548 agcaaaggaagtggtaatcaatagataaagtgtctccaaacaacaacaacaaaaaacagacttaaatctaagtgtaaagcaacaccaaaagcataatcaa 46516449  T
Q  111 agcacaa-agataagcaatgaaagaa-ggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctct 208  Q
    ||||  | |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||    
T  46516448 agcaatagagataaacaatgaaagaaaggaacaaacacaccaa--gattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctaggggagagagcagccct 46516351  T
Q  209 ccaatccactatgatgaaagtgttacaaga----------aaaatagtttgcaagcttacacaagaacaagacttaatttctacccattt-gtgtttctc 297  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |          ||| ||| ||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||  | |    
T  46516350 ccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttaaaagcttacacaagaacaagacataatttctacccattttgtgtcaccc 46516251  T
Q  298 actctctc---aataatgaaccctaaagggaagacacaaaaggaagctttt-gatccttccaatggtgaaatctcactacccaaaatgtttacaatgttt 393  Q
    || | | |   |  |||||| | ||| | ||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  46516250 acacacactccaccaatgaatcttaa-gagaaaacacaaaatgaagctttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgttt 46516152  T
Q  394 ctcaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatccaagtttctctctcttcaagctctccttcaaaatctgca 493  Q
    | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  46516151 cccaactcaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatccaagtttctctctct--aagctccccttcaaaatctgca 46516054  T
Q  494 caagaacacttaaataacagtcttcagctgataaaatcgtgccacgtttt-ccaaatcatgccacgattgatgcgtacgacccaaggt 580  Q
     ||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||| || || | ||| ||| |||||||||||||    
T  46516053 -aagaacacttatatagcagtcttcagctgtcaaaatcgtgtcacgttttgccaaatcgtgacatgcttggtgcatacgacccaaggt 46515967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 14 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 33332685 - 33332103
Alignment:
Q  14 caaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaactaaaaacagacctaga-cttagtgtagagcaacaccacaagcataaacaaag 112  Q
    ||||||||||||||||||||   |||||||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||| | || ||||||||||||||||| |||||||| ||||     
T  33332685 caaaggaagtggtaatcaatagataaagtgtatccaaacaacaacaac-aaaaacaaacctaaatctaagtgtagagcaacaccataagcataatcaaat 33332587  T
Q  113 cac-aaagataagcaatgaaagaa-ggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctcc 210  Q
    ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  33332586 caataaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaa--gattgttgacccagttcgatctaatatgacctaatctgggggagagagcagccctcc 33332489  T
Q  211 aatccactatgatgaaagtgttacaaga----------aaaatagtttgcaagcttacacaagaacaagacttaatttctacccatttgtgtttctc--a 298  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |          ||| ||| ||  ||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||| ||| || |  |    
T  33332488 aatccactaagatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttataagcttacaaaagaacaagacctaatttctactcatttttgtatcacgca 33332389  T
Q  299 ctctctcaataatgaaccctaaagggaagacacaaaaggaagctttt-gatccttccaatggtgaaatctcactacccaaaatgtttacaatgtttctca 397  Q
    | |||||||| ||    ||||| | ||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  33332388 cactctcaatgatt---cctaa-gagaaaacacaaagggaagctttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaagatgtttacaatgtttctca 33332293  T
Q  398 acccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatccaagtttctctctcttcaagctctccttcaaaatctgcacaag 497  Q
    |||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||| |      
T  33332292 acccaagagaaccttactacaaaaacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatccaagtttctatctctcaaagctctccttcaaaatctgcaaaga 33332193  T
Q  498 aacacttaaataacagtcttcagctgataaaatcgtgccac-gttttccaaatcatgccacgattgatgcgtacgacccaaggtacgacc 586  Q
    |||||| | ||| ||||||||| |||  ||||||||| |||  || |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  33332192 aacactaatatagcagtcttcaactgtcaaaatcgtgtcacaattgtccaaatcgtgacacgattggtgcgtacgacccaaggtacgacc 33332103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 15 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 9190241 - 9189777
Alignment:
Q  15 aaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaactaaaaacagacctaga-cttagtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagc 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9190241 aaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaac--aaaacaaacctagatctaagtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagc 9190144  T
Q  114 ac-aaagataagcaatgaaaga-aggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctcca 211  Q
    |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  9190143 aataaagataagcaatgaaagagaggaacaaacacaccaa--gattgttgacccagttcggtccaatatgacctagtctgggggagagagcagctctcca 9190046  T
Q  212 atccactatgatgaaagtgtt----------acaagaaaaatagtttgcaagcttacacaagaacaagacttaatttctacccatttgt-gtttctcact 300  Q
    |||||||| ||||||||||||          ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |  | || | |     
T  9190045 atccactaagatgaaagtgttacaatgagttacaagaaaaatagcttgcaagcttacacaagaacaagtcctaatttctacccatttttcatatcaccca 9189946  T
Q  301 ctctcaataatgaaccctaaagggaagacacaaaaggaagc-ttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaaatgtttacaatgtttctcaac 399  Q
    | |||  ||||||| ||| ||| ||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||    
T  9189945 cactc-ttaatgaatcct-aagagaaaacacacaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttcccaac 9189848  T
Q  400 ccaagagatcctcactacaaag-acactcaaccctaaagttacctcctttgtaatccaagtttctctctct 469  Q
    |||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  9189847 ccaagagaaccttactacaaagaacactcaaccctaaagttatctcctttgcaatccaagtttctctctct 9189777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 12 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 44848922 - 44848567
Alignment:
Q  12 agcaaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaactaaaaa--cagacctagacttagtgtagagcaacaccacaagcataaaca 109  Q
    |||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  44848922 agcaaaggtagtgctaatcaatgtgcaaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaaaaacagacctagtct-agtgtagagcaacaccacaagcatataca 44848824  T
Q  110 aagcacaaagataagcaatgaaagaaggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctc 209  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  44848823 aagaacaaagataagcaatgaaagaaggaacatacacaccaaaagattgttgacccagttcggttcaatatgacctaacctgggggagagagcagctctc 44848724  T
Q  210 caatccactatgatgaaagtgttac-aaga--------aaaatagtttgcaagcttacacaagaacaagacttaatttctacccatttgtgtttctcact 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||        |||| || ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  44848723 caatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaaaaagcttgcaagcttacacaagaataagacctaatttctacccatttgtgtttcccact 44848624  T
Q  301 ctctcaataatgaaccctaaagggaagacacaaaaggaagcttttgatccttccaat 357  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44848623 ctctcaataatgaactctaaagagaagacacaaaaggaagcttttgatccttccaat 44848567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 15 - 469
Target Start/End: Original strand, 21639673 - 21640138
Alignment:
Q  15 aaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaactaaaaacagacctagacttagtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagca 114  Q
    ||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||   | ||||||||    
T  21639673 aaagggagtggtaatctatgagtaaagtgtctccaagcaacaacaac-aaaaacagccctagtct-agtgtagagcaacaccacaagagaatacaaagca 21639770  T
Q  115 ca-aagataagcaatgaaagaaggaacaaacacaccaaaa-gattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaa 212  Q
     | ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21639771 aacaagataagcaa-gaaaggaagaacaaacacaccaaaaagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaa 21639868  T
Q  213 tccactatgatgaaagtgttacaa----------gaaaaatagtttgcaagcttacacaagaacaagacttaatttctacccatttgtgtttctc-actc 301  Q
    |||||||| |||||||||||||||          ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| | ||||    
T  21639869 tccactataatgaaagtgttacaaagggttacaagaaaaatagcttgcaagcttacacaagaacaagacctagattctacccatttgtgtttccccactc 21639968  T
Q  302 tctcaataatgaaccctaaagg-gaagacacaaaaggaagcttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaaatgtttacaatgtttctc--aa 398  Q
    || ||||| ||||||||||| | |||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||  ||    
T  21639969 tcacaata-tgaaccctaaaagagaagacactagaggaagctttagatccttccaatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttttcccaa 21640067  T
Q  399 cccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatccaagtttctctctct 469  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21640068 cccaagagatcctctctacaaagacactcaaccctagagttccctcctttgtaatccaagtttctctctct 21640138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 15 - 586
Target Start/End: Original strand, 21645871 - 21646461
Alignment:
Q  15 aaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaactaaaaacagacctagacttagtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagca 114  Q
    ||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||   | ||||| ||    
T  21645871 aaagggagtggtaatctatgagtaaagtgtctccaagcaacaacaac-aaaaacagccctagtct-agtgtagagcaacaccacaagagaatacaaaaca 21645968  T
Q  115 ca-aagataagcaatgaaagaaggaacaaacacaccaaaa-gattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaa 212  Q
     | ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||| |||||||| ||| |||||||| ||||||||    
T  21645969 aacaagataagcaa-gaaaggaagaacaaacacaccaaaaagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctagggaagagagcagctctccaa 21646066  T
Q  213 tccactatgatgaaagtgtta----------caagaaaaatagtttgcaagcttacacaagaacaagacttaatttctacccatttgtgtttctc-actc 301  Q
    |||||||||||||||||||||          |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| | ||||    
T  21646067 tccactatgatgaaagtgttaaaaagggttacaagaaaaatagcttgcaagcttacacaagaacaagacctagattctacccatttgtgtttccccactc 21646166  T
Q  302 tctcaataatgaaccctaaagg-gaagacacaaaaggaagcttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaaatgtttacaatgtttctc--aa 398  Q
    || ||||| ||||||||||| | |||||||| | |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||  ||    
T  21646167 tcacaata-tgaaccctaaaagagaagacactagaggaagatttagatccttccaatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttttcccaa 21646265  T
Q  399 cccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatccaagtttctctctc--------ttcaagctctccttcaaaatct 490  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||        | |||||||| |  ||||||||    
T  21646266 cccaagagatcctctctacaaagacactcaaccctagagtttcctcctttgtaatctaagtttctctctctaagctcttccaagctcttccccaaaatct 21646365  T
Q  491 gcacaagaacacttaaataacagtcttcagctgataaaatcgtgccacgttttccaaatcatgccacgattgatgcgtacgacccaaggtacgacc 586  Q
    |||||||||||||||||||  || ||||  |||||||||||||| |||| |||||| ||| || |||||||    |||||| ||||||||| ||||    
T  21646366 gcacaagaacacttaaatactagccttcctctgataaaatcgtgtcacgatttccagatcgtggcacgatttgaacgtacgtcccaaggtatgacc 21646461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 18 - 468
Target Start/End: Original strand, 29159669 - 29160133
Alignment:
Q  18 ggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaactaaaaacagacctaga-cttagtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagcac- 115  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||| |||||||      
T  29159669 ggaagtggtaatcaatagataaagtgtctccaagcaacaacaac-aaaaacagacctaaatctaagtgtagagcaacaccacaagcataatcaaagcaat 29159767  T
Q  116 aaagataagcaatgaaaga-aggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatc 214  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  29159768 aaagataagcaatgaaagagaggaacaaacacaccaa--gattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctaggggagagagcagctctccaatc 29159865  T
Q  215 cactatgatgaaagtgttacaaga----------aaaatagtttgcaagcttacacaagaacaagacttaatttctaccca--tttgtgtttctcactct 302  Q
    |||||||||||||||||||||| |          ||| ||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||  | ||||||    
T  29159866 cactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaagcttacacaagaacaagacctaatttctacccatttttgtgtcacccactct 29159965  T
Q  303 ctcaataatgaaccctaaagggaagacacaaaaggaagc-ttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaaatgtttacaatgtttctcaacc- 400  Q
    | |||| ||||| ||| ||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||     
T  29159966 cacaat-atgaatcct-aagagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatgttgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttcccaaccc 29160063  T
Q  401 -caagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaat-ccaagtttctctctc 468  Q
     ||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  29160064 tcaagagaacctcactataaagacactcaacccaaaagttacctcctttgtattcccaagtttctctctc 29160133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 12 - 493
Target Start/End: Original strand, 20283949 - 20284439
Alignment:
Q  12 agcaaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaactaaaaacagacctaga-cttagtgtagagcaacaccacaagcataaacaa 110  Q
    |||||| |||||| |||||||||  ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  20283949 agcaaaagaagtgataatcaatggataaagtgtctccaagaaacaacaac-aaaaacagacctaaatctaagtgtagagcaacaccacaagcataatcaa 20284047  T
Q  111 agcac-aaagataagcaatgaaagaa-ggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctct 208  Q
    ||||  ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  20284048 agcaataaagataagaaatgaaagaaaggaacaaacacaccaa--gattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccct 20284145  T
Q  209 ccaatccactatgatgaaagtgttaca---------agaaaaatagtttgcaagcttacacaagaacaagacttaatttctacccattt---gtgtttct 296  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||         |  ||| ||| ||  ||||||||| ||||||||| | |||||||||||| |||    | |  |     
T  20284146 ccaatccactaagatgaaagtgttacaatgcgttacaagaaattagcttataagcttacaaaagaacaagtcctaatttctacccttttttcatatcacc 20284245  T
Q  297 cactctctcaataatgaaccctaaagggaagacacaaaaggaagc-ttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaaatgtttacaatgtttct 395  Q
    ||| |||||   |||||| ||| ||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||     
T  20284246 cacactctc---aatgaatcct-aagagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttcc 20284341  T
Q  396 caacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatccaagtttctctctcttcaagctctccttcaaaatctgca 493  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  || |||||||||||||| ||||    
T  20284342 caacccaagagaacctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttataatccaagtttctctctctcaaaactctccttcaaaatttgca 20284439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 12 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 4796907 - 4796322
Alignment:
Q  12 agcaaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaactaaaaa--cagacctaga-cttagtgtagagcaacaccacaagcataaac 108  Q
    ||||||||||||||||||||||   |||||| |||||||||||||||||| |||||  |||||||| | || |||||||||||||||||||||||||| |    
T  4796907 agcaaaggaagtggtaatcaatagataaagtttctccaagcaacaacaacaaaaaaaacagacctaaatctaagtgtagagcaacaccacaagcataatc 4796808  T
Q  109 aaagcac-aaagataagcaatgaaagaa-ggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatct 206  Q
    ||||||  ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |     
T  4796807 aaagcaataaagataagcaatgagagaaaggaacaaacacaccaa--gattgttaacccagttcggtccaaaatgacctaatctgggggagaaagcagcc 4796710  T
Q  207 ctccaatccactatgatgaaagtgttacaaga----------aaaatagtttgcaagcttacacaagaacaagacttaatttctacccattt-gtgtttc 295  Q
    ||| ||||||||||||||||| |||||||| |          ||| ||| ||  ||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||| ||||  |    
T  4796709 ctcaaatccactatgatgaaattgttacaaaagagttacaagaaattagcttataagcttacacaagaacaagacctcatttatacccattttgtgtcac 4796610  T
Q  296 tcactctctcaataatgaaccctaaagggaagacacaaaaggaagctttt-gatccttccaatggtgaaatctcactacccaaaatgtttacaatgtttc 394  Q
      ||  |||||||   ||| ||||| | ||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||     
T  4796609 ctacattctcaat---gaatcctaa-gagaaaacacaaaaagaagctttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttt 4796514  T
Q  395 tcaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatccaagtttctctctcttcaagctctccttcaaaatctgcac 494  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||    
T  4796513 ccaacccaagagatcctcactacaaagacactcaa-cctaaagttacctcctttgtaatccaagtttctctcactccaagctcttcttcaaaatctacac 4796415  T
Q  495 aagaacacttaaataacagtcttcagctgataaaatcgtgccacgttt-tccaaatcatgccacgattgatgcgtacgacccaaggtacgacc 586  Q
    | ||||||||| ||| || |||||| ||   ||||||||| ||||||| || ||||  ||  ||  ||| ||||||||| |||||||||||||    
T  4796414 aggaacacttatatagcaatcttcaactatcaaaatcgtgtcacgtttgtctaaattgtgatacatttggtgcgtacgatccaaggtacgacc 4796322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 15 - 509
Target Start/End: Original strand, 2580251 - 2580755
Alignment:
Q  15 aaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaactaaaaacagacctaga-cttagtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagc 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||| | || |||||||||  |||||||||| |||| ||||||    
T  2580251 aaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtcttcaagcaacaacaac--aaaacagacctaaatctaagtgtagagatacaccacaagtataaccaaagc 2580348  T
Q  114 ac-aaagataagcaatgaaagaag----gaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctct 208  Q
    |  ||||||||||||||||| |||    |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  2580349 aataaagataagcaatgaaaaaagagaggaacaaacacaccaa--gattgttgacccaattcggtccaatatgacctagtctgggggagagagcagctct 2580446  T
Q  209 ccaatccactatgatgaaagtgttacaa-ga--------aaaatagtttgcaagcttacacaagaacaagacttaatttctacccattt---gtgtttct 296  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||        ||||||| ||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||    | |  |     
T  2580447 ccaatccactaagatgaaagtgttacaatgagttacaagaaaatagcttgcaagcttacacaagaacaagtcctagtttctacccatttttcatatcacc 2580546  T
Q  297 cactctctcaataatgaaccctaaagggaagacacaaaaggaagc-ttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaaatgtttacaatgtttct 395  Q
    ||| |||||   |||||| ||| ||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||      
T  2580547 cacactctc---aatgaatcct-aagagaaaacacaaaaggaagctttttgatcctttcaatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgttttc 2580642  T
Q  396 caacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatccaagtttctctctcttcaagctctccttcaaaatctgcaca 495  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  || |||| |||||||||||||| |    
T  2580643 caacccaagagaacctcac-acaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgcaatccaagtttctctctctaaaacctctacttcaaaatctgcaaa 2580741  T
Q  496 agaacacttaaata 509  Q
      ||||||||||||    
T  2580742 gaaacacttaaata 2580755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 12 - 404
Target Start/End: Original strand, 49091522 - 49091924
Alignment:
Q  12 agcaaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaactaaaaacagacctagactta-gtgtagagcaacaccacaagcataaacaa 110  Q
    ||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  49091522 agcaaaggaagtggtaatcaatagataaagtgtctccaagcaacaacaac-aaaaacagacctagatttaagtgtagagcaacaccacaagcataatcaa 49091620  T
Q  111 agcacaaagataagcaatgaaagaa-ggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctc 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  49091621 agcacaaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacgcaccaa--gattgttgacccagtttagtccaatatgacctaatctggggaagagagcaactctc 49091718  T
Q  210 caatccactatgatgaaagtgttacaaga----------aaaatagtttgcaagcttacacaagaacaagacttaatttctacccatt-tgtgtttctca 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |          ||| ||  ||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||  | ||    
T  49091719 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattaccttataagcttacacaagaacaagacctaatttctacccattctgtgtcaccca 49091818  T
Q  299 ctctctcaataatgaaccctaaagggaagacacaaaaggaagc-ttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaaatgtttacaatgtttctca 397  Q
    | ||||| |||||||| ||| ||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||| ||    
T  49091819 cactctccataatgaatcct-aagagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaggtgttttcaatgtttccca 49091917  T
Q  398 acccaag 404  Q
    |||||||    
T  49091918 acccaag 49091924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 12 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 23403250 - 23402784
Alignment:
Q  12 agcaaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaactaaaaacagacctagactta-gtgtagagcaacaccacaagcataaacaa 110  Q
    ||||||||||||| |||||||||  |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |  || ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  23403250 agcaaaggaagtgataatcaatggataaagtgtttccaagcaacaacaac-aaaaacagacctaaatgtaagtgtagagcaacaccacaagcataatcaa 23403152  T
Q  111 agcac-aaagataagcaatgaaagaa-ggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctct 208  Q
    ||||  ||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||| | ||    
T  23403151 agcaataaatataagcaatgaaagaaaggaacaaacacactaa--gattgttgacccaattcggtctaatatgacctaatctgagggagtgagcagccct 23403054  T
Q  209 ccaatccactatgatgaaagtgttacaa-ga--------aaaatagtttgcaagcttacacaagaacaagacttaatttctacccatttgtg---tttct 296  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||| ||        ||| ||| ||  ||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||| |    |  ||    
T  23403053 ccaatctactaagatgaaagtgttacaatgagttacaagaaattagcttataagcttacaaaagaacaagtcctaatttctacccatttttcacatcact 23402954  T
Q  297 cactctctcaataatgaaccctaaagggaagacacaaaaggaagctttt-gatccttccaatggtgaaatctcactacccaaaatgtttacaatgtttct 395  Q
    ||| ||||||||   ||| ||||| | ||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||     
T  23402953 cacactctcaat---gaatcctaa-gagaaaacacaaaaggaagctttttgatcattccaatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttcc 23402858  T
Q  396 caacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatccaagtttctctctct 469  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23402857 caacccaagagaacctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatccaagtttctctctct 23402784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 350 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 44848015 - 44847779
Alignment:
Q  350 cttccaatggtgaaatctcactacccaaaatgtttacaatgtttctcaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttg 449  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  44848015 cttccaatggtgaaatctcactatccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctccttta 44847916  T
Q  450 taatccaagtttctctctcttcaagctctccttcaaaatctgcacaagaacacttaaataacagtcttcagctgataaaatcgtgccacgttttccaaat 549  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44847915 taatccaagtttctctctcttcaagctcttcaccaaaatctacacaagaacacttatatagccgtcttcagctgataaaatcgtgccacgttttccaaat 44847816  T
Q  550 catgccacgattgatgcgtacgacccaaggtacgacc 586  Q
    | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  44847815 cgtgccacgattgatacgtacgacccaaggtacgacc 44847779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 179; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 12 - 394
Target Start/End: Original strand, 21983142 - 21983537
Alignment:
Q  12 agcaaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaactaaaaacagacctaga-cttagtgtagagcaacaccacaagcataaacaa 110  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||   |||||||| | ||  ||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  21983142 agcaaatgaagtggtaatcaatgtgtaaagtatctccaagcaacaacaacaaactccagacctaaatctgggtgtagagcaacaccacaaacataatcaa 21983241  T
Q  111 agcacaa-agataagcaatgaaagaa--ggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctc 207  Q
    ||||  | |||||||||| |||||||  ||||||||  |||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  21983242 agcaatagagataagcaacgaaagaaaaggaacaaatgcaccga--gattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctc 21983339  T
Q  208 tccaatccactatgatgaaagtgttacaaga-----------aaaatagtttgcaagcttacacaagaacaagacttaatttctaccca-tttgtgtttc 295  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |           ||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||  |    
T  21983340 tccaatccactatgatgaaagtgttacaaaaagagttacaagaaaatagcttgcaagcttacacaagaacaagacctagtttctacccattttgtgtcac 21983439  T
Q  296 tcactctctcaataatgaaccctaaagggaagacacaaaaggaagcttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaaatgtttacaatgtttc 394  Q
     |||||||  ||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  21983440 ccactctcaaaat-atgaaccctaaagagaaaacacaaaaggaagcttatgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttc 21983537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 15 - 389
Target Start/End: Original strand, 55802 - 56195
Alignment:
Q  15 aaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaactaaa--------aacagacctaga-cttagtgtagagcaacaccacaagcata 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||        |||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||    
T  55802 aaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaataaaataaaaaaaaacagacctagatctaagtatagagcaacaccacaagcata 55901  T
Q  106 aacaaagcacaaagataagcaatgaaag--aaggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagca 203  Q
    | |||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  55902 atcaaagcacaaagataagcaatggaaggaaaggaacaaacacacc--aagattattgacccagttcggtccaatatgacctaatct-ggggagagagca 55998  T
Q  204 tctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaga----------aaaatagtttgcaagcttacacaagaacaagacttaatttctaccca-tttgtgt 292  Q
     | |||||||||||||||||||||||||||||| |          ||| ||| ||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  55999 gccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttataagcttacacaagaacaagacctaatttctacccattttgtgt 56098  T
Q  293 ttctcactctctcaataatgaaccctaaagggaagacacaaaaggaagc-ttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaaatgtttacaat 389  Q
      | ||| |||||||||||||| ||| ||| ||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  56099 cacccacactctcaataatgaatcct-aagagaaaacacaaaaagaagctttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaat 56195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 21 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 1533671 - 1533208
Alignment:
Q  21 agtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaactaaaaacagacctagacttagtgtagagcaacaccacaagcataa-acaaagcaca-aa 118  Q
    |||||||||||||| | |||  || |||||||||||||||| |||| ||| || || || ||||||||||||||||||||  | || |||||||| | ||    
T  1533671 agtggtaatcaatgagaaaaaagtttccaagcaacaacaac-aaaaccagccccagtct-agtgtagagcaacaccacaaagagaatacaaagcaaacaa 1533574  T
Q  119 gataagcaatgaaagaaggaacaaacacaccaa-aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccac 217  Q
     |||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  1533573 tataagcaa-gaaagaaagaacaaacacaccaataagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcatctctccaatccaa 1533476  T
Q  218 tatgatgaaagtgttacaa----------gaaa-aatagtttgcaagcttacacaagaa-caagacttaatttctacccatttgtgttt-ctcactctct 304  Q
    |||||||||||||||||||          |||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||  |||||||| || |||||| | |||||||     
T  1533475 tatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagcttgcaagcttacacaagaaacaagacctagattctaccctttggtgttttcccactctca 1533376  T
Q  305 caataatgaaccctaaagg-gaagacacaaaaggaagcttttgatccttccaatggtgaaatc-tcactacccaaaatgtttacaatgtttctc--aacc 400  Q
    ||||| ||||||||||| | |||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||  || ||||||||||| ||  ||||    
T  1533375 caata-tgaaccctaaaagagaagacactagaggaagctttagatccttccaatggtgaactcctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacc 1533277  T
Q  401 caagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatccaagtttctctctct 469  Q
    |||||||  ||| ||||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1533276 caagagacactctctacaaagacactcaaccctttggttccctcctttgtaatccaagtttctctctct 1533208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 380 - 586
Target Start/End: Original strand, 49091926 - 49092134
Alignment:
Q  380 tgtttacaatgtttctcaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatccaagtttctctctcttcaagctctc 479  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49091926 tgttttcaatgtttcccaacccaagatatcctcagtacaaagacactcaaccttaaagttacctcctttgtaatccaagtttctctctcttcaagctctc 49092025  T
Q  480 cttcaaaatctgcacaagaacacttaaataacagtcttcagctgataaaatcgtgccacgttt--tccaaatcatgccacgattgatgcgtacgacccaa 577  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| |||||||  | |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||    
T  49092026 cttcaaaatctgcacaagaacacttatatagcagtcttcagctgtcaaaatcgtgtcacgttttgttcaaatcgtgtcactattggtgcatacgatccaa 49092125  T
Q  578 ggtacgacc 586  Q
    |||||||||    
T  49092126 ggtacgacc 49092134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 12 - 404
Target Start/End: Original strand, 35960674 - 35961078
Alignment:
Q  12 agcaaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaacta-aaaacagacctaga-cttagtgtagagcaacaccacaagcataaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||| | ||||||| |||| | || ||||||||| |||||||| |||||||| |    
T  35960674 agcaaaggaagtggtaatcaatagataaagtgtttccaagcaacaacaacaacaaaacaggcctaaatctaagtgtagagaaacaccaccagcataaata 35960773  T
Q  110 aagcac-aaagataagcaatgaaagaag-gaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctc 207  Q
    |||||  ||||||||| ||| || |||  |||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  35960774 aagcaataaagataagaaattaatgaaatgaacaaacacaccaa--gattgttgaccgagttcggttcaatatgacctaatctgggggagagagcagccc 35960871  T
Q  208 tccaatccactatgatgaaagtgttacaa--ga--------aaaatagtttgcaagcttacacaagaacaagacttaatttctacccatttgtgtttctc 297  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||  ||        ||| ||| ||  ||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||   | || |    
T  35960872 tccaaaccactatgatgaaagtgttacaaatgagttagaagaaattagcttataagcttacaaaagaacaatacctaatttctacccattttcatatcac 35960971  T
Q  298 actctctcaataatgaaccctaaagggaagacacaaaaggaagc-ttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaaatgtttacaatgtttctc 396  Q
     | | |||||  |||||  || ||| ||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||| |    
T  35960972 ccacactcaaagatgaa-tcttaagagaaaacgcaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatctcactacctaaggtgtttacaatgtttccc 35961070  T
Q  397 aacccaag 404  Q
    ||||||||    
T  35961071 aacccaag 35961078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 328 - 491
Target Start/End: Original strand, 3047438 - 3047603
Alignment:
Q  328 acacaaaaggaagctttt-gatccttccaatggtgaaatctcactacccaaaatgtttacaatgtttctcaacccaagagatcctcactacaaagacact 426  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||| | |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3047438 acacaaaaggaagctttttgatccttccaatgatgaaatctcactacccaagatgattatagtgtttcccaacccaagagaacctcactacaaagacact 3047537  T
Q  427 caaccctaaagttacctcctttgtaat-ccaagtttctctctcttcaagctctccttcaaaatctg 491  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  3047538 caaccctaaagttacctcctttgtaatcccaagtttctctctcttaaagctcttcttcaaaatctg 3047603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 80 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 5817439 - 5817040
Alignment:
Q  80 tagtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagcacaaa-gataagcaatgaaagaa-ggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaa 177  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||  ||  || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||    
T  5817439 tagtgtagaacaacaccacaagcataatcaacacaataatgataagcaatgtaagaaaggaacaaacacaccaaa-gattgttaactcagttcggtccaa 5817341  T
Q  178 tatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactatgatgaaagtgttacaag------aaaaatagtttgca----agcttacacaagaaca 267  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||  ||||||||| |||||       | ||  | ||||||    |||| ||| |||||||    
T  5817340 tatgacctactctgggg-agagagcagctctccaatccactaatatgaaagtgatacaaaggggttacaagaaatttgcataagagctcaca-aagaaca 5817243  T
Q  268 agacttaatttctacccatttgt---gtttctcactctctcaataatgaaccctaaagggaagacacaaaaggaagctttt-gatccttccaatggtgaa 363  Q
    | || ||||||||| |||||| |   ||  ||||| ||||||||   ||| ||||| |  || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5817242 aaacctaatttctatccatttttcaagtcactcacactctcaat---gaatcctaa-gaaaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaa 5817147  T
Q  364 atctcactacccaaaatgtttacaatgtttctcaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaat-ccaagtttc 462  Q
    |||||||| |||||  | ||||||||||||| ||||| || ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  5817146 atctcactccccaaggtatttacaatgtttcccaaccaaatagaacctcactacaaagacactcaaccataaagttacctcctttgtattcccaagtttc 5817047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 396 - 586
Target Start/End: Original strand, 79641 - 79833
Alignment:
Q  396 caacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatccaagtttctctctcttcaagctctccttcaaaatctgcaca 495  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  79641 caacccaaaagatcctcactacaaagacactcaatcttaaagttacctcctttgtaatccaagtttctctctcttcaagctctccttcaaaatctgcaca 79740  T
Q  496 agaacacttaaataacagtcttcagctgataaaatcgtgccacgttt--tccaaatcatgccacgattgatgcgtacgacccaaggtacgacc 586  Q
    ||||||| || |||  |||||||| |||  | ||||||| ||| |||  |||||||| || |  ||||| ||| || ||||||| ||||||||    
T  79741 agaacacatatatagtagtcttcaactgtcagaatcgtgtcacattttgtccaaatcgtgacgtgattggtgcatatgacccaatgtacgacc 79833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 117 - 586
Target Start/End: Original strand, 2057931 - 2058424
Alignment:
Q  117 aagataagcaatgaaagaaggaacaaacacaccaa-aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatcc 215  Q
    |||||||||||| |||| | ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  2057931 aagataagcaataaaaggaagaacaaa-acaccaagaagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcc 2058028  T
Q  216 actatgatgaaagt----------gttacaagaaa-aatagtttgcaagcttacacaagaacaagacttaatttctacccatttg-tgttt-ctcactct 302  Q
    | ||||||||||||          ||||||||||| |||||  | |||||||||||||||||||| | ||  |||||||||| || ||||| | ||||||    
T  2058029 aatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagcattcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccatatgttgtttccccactct 2058128  T
Q  303 ctcaataatgaaccct-aaagggaagacacaaaaggaagcttttgatccttcc---aatggtgaaat-ctcactacccaaaatgtttacaatg--tttct 395  Q
    | |||| ||||||||| |||| |||||||| | |||||||||| |||||| ||   | |  |||| | ||||||||||||  || ||||||||  ||||     
T  2058129 cacaat-atgaaccctaaaagagaagacactagaggaagctttagatcctcccccaactaatgaactcctcactacccaaggtgattacaatgtttttcc 2058227  T
Q  396 caacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatccaagtt-tctct-----ctctt-caagctctccttcaaaat 488  Q
    ||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||| |||||     ||||| ||||||||| ||  ||||    
T  2058228 caacccaagagacactctctacaaagacactcaaccctttggttccctcctttgtaatccaagttctctctctaagctcttccaagctctcttttcaaat 2058327  T
Q  489 ctgcacaagaacac-ttaaataacagtcttcagctgataaaatcgtgccacgttttccaaatcatgccacgattgatgcgtacgacccaaggtacgacc 586  Q
    ||||||||||||||  || |||  || ||||  ||||   |||||||||||| |||||| ||| || |||||||  ||||||| |||||||||| ||||    
T  2058328 ctgcacaagaacacaatatatactagccttcctctgaagcaatcgtgccacgatttccagatcgtgtcacgatt--tgcgtacaacccaaggtatgacc 2058424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 426 - 586
Target Start/End: Original strand, 2761552 - 2761713
Alignment:
Q  426 tcaaccctaaagttacctcctttgtaatcc-aagtttctctctcttcaagctctccttcaaaatctgcacaagaacacttaaataacagtcttcagctga 524  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||     
T  2761552 tcaaccctaaagttacctcctttgatttcccaagtttatctctcttcaagctctccttcaaaatctgca-aagaacacttatatagcagtcttcagctgt 2761650  T
Q  525 taaaatcgtgccacgtttt-ccaaatcatgccacgattgatgcgtacgacccaaggtacgacc 586  Q
     ||||||||| |||||||| ||||||| || |||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  2761651 caaaatcgtgtcacgttttcccaaatcgtgacacgtttggtgcgtacgacccaaggtacgacc 2761713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 380 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 18126607 - 18126401
Alignment:
Q  380 tgtttacaatgtttctcaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatcc-aagtttctctctcttcaagctct 478  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||| |   | | ||||||| |||||||||||||||||||||||||   ||| |||||||||||| ||||||||||    
T  18126607 tgtttacaatgtttcccaacccatgagaactctaat-caaagaccctcaaccctaaagttacctcctttgatttcccaagtttctctctattcaagctct 18126509  T
Q  479 ccttcaaaatctgcacaagaacacttaaataacagtcttcagctgataaaatcgtgccacgttttc-caaatcatgccacgattgatgcgtacgacccaa 577  Q
     |||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| |||||  ||||||||| ||||||||| |||||| || |||| ||| ||||||||||||||    
T  18126508 tcttcaaaatctgca-aagaacacttatatatcagtctttagctgtcaaaatcgtgtcacgttttctcaaatcgtgacacgtttggtgcgtacgacccaa 18126410  T
Q  578 ggtacgacc 586  Q
    |||||||||    
T  18126409 ggtacgacc 18126401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 12 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 9235794 - 9235634
Alignment:
Q  12 agcaaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaac-taaaaacagacctaga-cttagtgtagagcaacaccacaagcataaaca 109  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | || | |||||||||||||||||||||||| ||    
T  9235794 agcaaaggaagtggtaatcaatggataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaaaacagacctaaatctaaatgtagagcaacaccacaagcataatca 9235695  T
Q  110 aagc-acaaagataagcaatgaaag-aaggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttc 170  Q
    |||| | |||||||||||||||||| || |||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  9235694 aagcaataaagataagcaatgaaagaaatgaacaaacacacc--aagattgttgacccagttc 9235634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 380 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 23555003 - 23554797
Alignment:
Q  380 tgtttacaatgtttctcaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatcc-aagtttctctctcttcaagctct 478  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||| |   | | |||||||  |||||||| |||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||    
T  23555003 tgtttacaatgtttcccaactcaagagaactctaat-caaagaccttcaaccctgaagttacctcctttgatttcccaagtttctctctcttcaagctct 23554905  T
Q  479 ccttcaaaatctgcacaagaacacttaaataacagtcttcagctgataaaatcgtgccacgttttcca--aatcatgccacgattgatgcgtacgaccca 576  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| |  ||||||||| |||||||||||  |||| || ||||||||||||||||||||||    
T  23554904 ccttcaaaatctgca-aagaacacttatatagcagtcttcagc-gtcaaaatcgtgtcacgttttccattaatcgtgtcacgattgatgcgtacgaccca 23554807  T
Q  577 aggtacgacc 586  Q
    | ||||||||    
T  23554806 atgtacgacc 23554797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 12 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 28617465 - 28617238
Alignment:
Q  12 agcaaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaacta-aaaacagaccta-gacttagtgtaga-gcaacaccacaagcataaac 108  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||  |  |||| ||||| ||| | |||| ||||||| | ||||| ||| | |||||||||||||||||  |    
T  28617465 agcaaaggaagtggtaatcaatgagtaaagtagcctcaagaaacaagaacaacaaaatagacctaagtcttagagtaaaagcaacaccacaagcatattc 28617366  T
Q  109 aaagca-caaagataagcaatgaaagaaggaa-caaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatct 206  Q
    |||||| |||||||||||||  || |||| || |||||||||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  28617365 aaagcaacaaagataagcaagaaaggaagaaaacaaacacaccaata--ttgtttacccagttcggtccaatatgacctactctgggggagagagcagct 28617268  T
Q  207 ctccaatccactatgatgaaagtgttacaa 236  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  28617267 ctccaatccactaagatgaaagtgatacaa 28617238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 380 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 1113620 - 1113413
Alignment:
Q  380 tgtttacaatgtttctcaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatcc-aagtttctctctcttcaagctct 478  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |   | | ||||||| ||||||||||||||||| |||||||   ||| |||||||||||||||||| ||||    
T  1113620 tgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaat-caaagaccctcaaccctaaagttacttcctttgatttcccaagtttctctctcttcaacctct 1113522  T
Q  479 ccttcaaaatctgcacaagaacacttaaataacagtcttcagctgataaaatcgtgccacgtttt-ccaaatcatgccacgattgatgcgtacgacccaa 577  Q
     ||||||||||||||||  |||||||| |||||||| ||||||||  ||||||||| |||||||| ||||  | || |||| ||| ||||||||||||||    
T  1113521 tcttcaaaatctgcacagaaacacttatataacagtattcagctgtcaaaatcgtgtcacgttttgccaatacgtgacacgtttggtgcgtacgacccaa 1113422  T
Q  578 ggtacgacc 586  Q
    |||||||||    
T  1113421 ggtacgacc 1113413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 380 - 586
Target Start/End: Original strand, 14070038 - 14070244
Alignment:
Q  380 tgtttacaatgtttctcaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatcc-aagtttctctctcttcaagctct 478  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||| |   | | ||||||| |||| ||||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||| ||    
T  14070038 tgtttacaatgttacccaacccaagagaactctaat-caaagaccctcagccctaaagttacctcctttgatttcccaagtttctctctcttcaagccct 14070136  T
Q  479 ccttcaaaatctgcacaagaacacttaaataacagtcttcagctgataaaatcgtgccacgtttt-ccaaatcatgccacgattgatgcgtacgacccaa 577  Q
    |||| |||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||| || |||| ||| ||| ||||||||||    
T  14070137 cctttaaaatcggca-aagaacacttatataacagtcttcagctgtcaaaatcgtgtcacgttttcccaaatcgtgacacgtttggtgcatacgacccaa 14070235  T
Q  578 ggtacgacc 586  Q
    |||||||||    
T  14070236 ggtacgacc 14070244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 380 - 586
Target Start/End: Original strand, 14380066 - 14380272
Alignment:
Q  380 tgtttacaatgtttctcaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatcc-aagtttctctctcttcaagctct 478  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||| |   | | ||||||| |||| ||||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||| ||    
T  14380066 tgtttacaatgttacccaacccaagagaactctaat-caaagaccctcagccctaaagttacctcctttgatttcccaagtttctctctcttcaagccct 14380164  T
Q  479 ccttcaaaatctgcacaagaacacttaaataacagtcttcagctgataaaatcgtgccacgtttt-ccaaatcatgccacgattgatgcgtacgacccaa 577  Q
    |||| |||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||| || |||| ||| ||| ||||||||||    
T  14380165 cctttaaaatcggca-aagaacacttatataacagtcttcagctgtcaaaatcgtgtcacgttttcccaaatcgtgacacgtttggtgcatacgacccaa 14380263  T
Q  578 ggtacgacc 586  Q
    |||||||||    
T  14380264 ggtacgacc 14380272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 380 - 586
Target Start/End: Original strand, 47676341 - 47676547
Alignment:
Q  380 tgtttacaatgtttctcaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatcc-aagtttctctctcttcaagctct 478  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |   | | ||||||| |||||||||||||||| ||||||||   ||| ||||||||||||||||||||||     
T  47676341 tgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaat-caaagaccctcaaccctaaagttatctcctttgatttcccaagtttctctctcttcaagctcc 47676439  T
Q  479 ccttcaaaatctgcacaagaacacttaaataacagtcttcagctgataaaatcgtgccacgttttcc-aaatcatgccacgattgatgcgtacgacccaa 577  Q
     |||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| |||  ||||| ||| |||||||||| ||||| || |||| ||| ||||||||||||||    
T  47676440 tcttcaaaatctgca-aagaacacttatatatcagtcttcaactgtcaaaattgtgtcacgttttccaaaatcgtgacacgtttggtgcgtacgacccaa 47676538  T
Q  578 ggtacgacc 586  Q
    |||||||||    
T  47676539 ggtacgacc 47676547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 372 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 48491550 - 48491335
Alignment:
Q  372 acccaaaatgtttacaatgtttctcaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttg--taatccaagtttctctctct 469  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |   | | ||||||| |||||||||||||||||||||||||  | || |||||||||||||||    
T  48491550 acccaaagtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaat-caaagaccctcaaccctaaagttacctcctttgatttat-caagtttctctctct 48491453  T
Q  470 tcaagctctccttcaaaatctgcacaagaacacttaaataacagtcttcagctgataaaatcgtgccacgtttt-ccaaatcatgccacgattgatgcgt 568  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |  || || ||   |||||| || |||||||| ||||||| || |||| ||| |||||    
T  48491452 tcaacctcttcttcaaaatctgcacaagaacacttaaatagtaccctgcaactatcaaaatcatgtcacgttttgccaaatcgtgacacggttggtgcgt 48491353  T
Q  569 acgacccaaggtacgacc 586  Q
    ||||||||||||||||||    
T  48491352 acgacccaaggtacgacc 48491335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 380 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 4586124 - 4585918
Alignment:
Q  380 tgtttacaatgtttctcaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatcc-aagtttctctctcttcaagctct 478  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |   | | ||||||  ||||||||||||||||| |||||||   ||| |||||| ||||||||| | ||||    
T  4586124 tgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaat-caaagagcctcaaccctaaagttacatcctttgatttcccaagtttttctctcttctaactct 4586026  T
Q  479 ccttcaaaatctgcacaagaacacttaaataacagtcttcagctgataaaatcgtgccacgtttt-ccaaatcatgccacgattgatgcgtacgacccaa 577  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||  ||||||||| ||| |||| ||||||| || || | ||| ||||||||||||||    
T  4586025 ccttcaaaatctgca-aagaacacttatataacagtctttagctgtcaaaatcgtgtcacattttcccaaatcgtgacatgtttggtgcgtacgacccaa 4585927  T
Q  578 ggtacgacc 586  Q
    |||||||||    
T  4585926 ggtacgacc 4585918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 43 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 20357755 - 20357320
Alignment:
Q  43 gtctccaagc-aacaacaactaaaaacagacctagacttagtgtagagcaacaccacaagcata---aacaaagcaca-aagataagcaatgaaagaagg 137  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||   | |   ||||||||| | |||||||||||  |||| | |    
T  20357755 gtctccaagctaacaacaac-aaaaacagccctagact-agtgtagagcaaaaccacacaaagagataacaaagcaaacaagataagcaagaaaaggaag 20357658  T
Q  138 aacaaacacaccaa-aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactatga-----tg----aaa 227  Q
    |||||| | ||||| ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||     ||    |||    
T  20357657 aacaaa-ataccaagaagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatttgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaa 20357560  T
Q  228 gtgttacaagaaa-aatagtttgcaagc-ttacacaagaacaagacttaatttctacccatttgtgttt-ctcactctctcaataatgaaccct-aaagg 323  Q
    | ||||||||||| |||||  | ||||| ||||||||||||| | | ||  |||||||||| ||||||| | ||||||| |||| ||||||||| ||||     
T  20357559 gggttacaagaaacaatagccttcaagctttacacaagaacatgccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaat-atgaaccctaaaaga 20357461  T
Q  324 gaagacacaaaaggaagcttttgatccttccaa-tggtgaaat-ctcactacccaaaatgtttacaatg--tttctcaacccaagagatcctcactacaa 419  Q
    |||||||| | |||||||||| ||||||||||| |  |||| | ||||||||||||  || ||||||||  |||| ||||||||||||  ||| | ||||    
T  20357460 gaagacactagaggaagctttagatccttccaactaatgaactcctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaa 20357361  T
Q  420 agacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatccaagtt 460  Q
    ||||||||||||||   ||| |||||||||| |||||||||    
T  20357360 agacactcaaccctttggttccctcctttgttatccaagtt 20357320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 429 - 586
Target Start/End: Original strand, 21983541 - 21983686
Alignment:
Q  429 accctaaagttacctcctttgtaatccaagtttctctctcttcaagctctccttcaaaatctgcacaagaacacttaaataacagtcttcagctgataaa 528  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||            |||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||| |  |||    
T  21983541 accctaaagttacctcctttgtaatccaagtttctctcacttc------------aaaatctgcacaagaacacttatatagctgtcttcagcggtcaaa 21983628  T
Q  529 atcgtgccacgttttccaaatcatgccacgattgatgcgtacgacccaaggtacgacc 586  Q
    |||||| ||||||||||||||| || ||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  21983629 atcgtgtcacgttttccaaatcgtgacacaattggtgcgtacgacccaaggtacgacc 21983686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 380 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 48489394 - 48489187
Alignment:
Q  380 tgtttacaatgtttctcaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatcc-aagtttctctctcttcaagctct 478  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |   | | |||||||  ||||||||||||||||||||||||   ||| |||||||||| ||||||| ||||    
T  48489394 tgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaat-caaagaccatcaaccctaaagttacctcctttgatttcccaagtttctctatcttcaatctct 48489296  T
Q  479 ccttcaaaatctgcacaagaacacttaaataacagtcttcagctgataaaatcgtgccacgtttt-ccaaatcatgccacgattgatgcgtacgacccaa 577  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||  |  || || |||  |||||| || |||||||| ||||||| || |||||||| ||||||| ||||||    
T  48489295 tcttcaaaatctgcacaagaacacttaaatagtaccctgcaactgtcaaaatcatgtcacgttttgccaaatcgtgacacgattggtgcgtacaacccaa 48489196  T
Q  578 ggtacgacc 586  Q
    |||| ||||    
T  48489195 ggtatgacc 48489187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 417 - 543
Target Start/End: Original strand, 30024973 - 30025099
Alignment:
Q  417 caaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatcc-aagtttctctctcttcaagctctccttcaaaatctgcacaagaacacttaaataacagtc 515  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||  ||||    
T  30024973 caaagaccctcaaccctaaagttacctcctttgatttcccaagtttctctctcttcaagctctcattcaaaatctgca-aagaacacttatatagtagtc 30025071  T
Q  516 ttcagctgataaaatcgtgccacgtttt 543  Q
    ||||||||  ||||||||| ||||||||    
T  30025072 ttcagctgtcaaaatcgtgtcacgtttt 30025099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 380 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 4178738 - 4178532
Alignment:
Q  380 tgtttacaatgtttctcaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatc-caagtttctctctcttcaagctct 478  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |   | | ||||||| || |||||||||||| | |||||||   || |||||||||||||||||||||||     
T  4178738 tgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaat-caaagaccctaaaccctaaagttgcttcctttgatttctcaagtttctctctcttcaagctca 4178640  T
Q  479 ccttcaaaatctgcacaagaacacttaaataacagtcttcagctgataaaatcgtgccacgtttt--ccaaatcatgccacgattgatgcgtacgaccca 576  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  ||| | |||||| || |  ||||||||| ||||||||  || |||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  4178639 ccttcaaaatctgca-aagaacacttttatagctgtcttctgc-gtcaaaatcgtgtcacgtttttccccaatcttgccacgattgatgcgtacgatcca 4178542  T
Q  577 aggtacgacc 586  Q
    ||||||||||    
T  4178541 aggtacgacc 4178532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 455 - 588
Target Start/End: Original strand, 25767234 - 25767366
Alignment:
Q  455 caagtttctctctcttcaagctctccttcaaaatctgcacaagaacacttaaataacagtcttcagctgataaaatcgtgccacgttttccaaatcatgc 554  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||   ||||||||||||| |||| ||||||| || ||     
T  25767234 caagtttctctctcttca-gctctccttcaaaatctgcacaagaacacttaaatactagtcttccattgataaaatcgtgtcacgatttccaagtcgtgt 25767332  T
Q  555 cacgattgatgcgtacgacccaaggtacgacctg 588  Q
    |||||||| | |||||| | ||||| ||||||||    
T  25767333 cacgattggtacgtacgtcacaaggcacgacctg 25767366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 494 - 586
Target Start/End: Original strand, 47263994 - 47264086
Alignment:
Q  494 caagaacacttaaataacagtcttcagctgataaaatcgtgccacgttttccaaatcatgccacgattgatgcgtacgacccaaggtacgacc 586  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  47263994 caagaacacttatatagcagtcttcagctgataaaatcgtgccacgttttccaaatcgtgtcaagattgatacgtacgacccaagatacgacc 47264086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 380 - 586
Target Start/End: Original strand, 24514965 - 24515171
Alignment:
Q  380 tgtttacaatgtttctcaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatcc-aagtttctctctcttcaagctct 478  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |   | | ||||||| || |||||||||||| | |||||||   ||| ||||||||||||||||||||||     
T  24514965 tgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaat-caaagaccctaaaccctaaagttgcttcctttgatttcccaagtttctctctcttcaagctcc 24515063  T
Q  479 ccttcaaaatctgcacaagaacacttaaataacagtcttcagctgataaaatcgtgccacgtttt--ccaaatcatgccacgattgatgcgtacgaccca 576  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||| | |||||| || |   |||||||| | ||||||  || |||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  24515064 ccttcaaaatctgca-aagaacacttatatagctgtcttctgc-gtctaaatcgtgtcgcgtttttccccaatcgtgccacgattgatgcgtacgatcca 24515161  T
Q  577 aggtacgacc 586  Q
    ||||||||||    
T  24515162 aggtacgacc 24515171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 380 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 35853878 - 35853670
Alignment:
Q  380 tgtttacaatgtttctcaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatcc-aagtttctctctcttcaagctct 478  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| | |||   ||||||| || |||||||||||| |  ||||||   ||| |||||||||||||||||||||||    
T  35853878 tgtttacaatgtttcccaacccaagagaac-tcaaatcaaagaccctaaaccctaaagttgctacctttgatttcctaagtttctctctcttcaagctct 35853780  T
Q  479 ccttcaaaatctgcacaagaacacttaaataacagtcttcagctgataaaatcgtgccacgtttt----ccaaatcatgccacgattgatgcgtacgacc 574  Q
     |||||||||||||| ||||||||||| ||| | |||||| || |  ||||||||| ||||||||     | |||| ||||||||||||||||||||| |    
T  35853779 tcttcaaaatctgca-aagaacacttatatagctgtcttctgc-gtcaaaatcgtgtcacgtttttttctccaatcgtgccacgattgatgcgtacgatc 35853682  T
Q  575 caaggtacgacc 586  Q
    ||||||||||||    
T  35853681 caaggtacgacc 35853670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 380 - 584
Target Start/End: Complemental strand, 29991018 - 29990814
Alignment:
Q  380 tgtttacaatgtttctcaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatcc-aagtttctctctcttcaagctct 478  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |   | | ||||||| || ||||||||||||  ||||||||   ||| |||||||||||||||||| |||     
T  29991018 tgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaat-caaagaccctaaaccctaaagttgtctcctttgatttcccaagtttctctctcttcaaactca 29990920  T
Q  479 ccttcaaaatctgcacaagaacacttaaataacagtcttcagctgataaaatcgtgccacgtttt--ccaaatcatgccacgattgatgcgtacgaccca 576  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||| |   |||||||| ||| ||||  || |||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  29990919 ccttcaaaatctgca-aagaacacttatatagcaatcttcagc-gtcgaaatcgtgtcacatttttccccaatcgtgccacgattgatgcgtacgactca 29990822  T
Q  577 aggtacga 584  Q
    ||||||||    
T  29990821 aggtacga 29990814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 380 - 586
Target Start/End: Original strand, 47674148 - 47674354
Alignment:
Q  380 tgtttacaatgtttctcaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatcc-aagtttctctctcttcaagctct 478  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| |   | | |||||||  |||||| | |||||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||||     
T  47674148 tgtttacaatgttttccaacccaagagaactctaat-caaagaccttcaaccttgaagttacctcctttgatttcccaagtttctctctcttcaagctcc 47674246  T
Q  479 ccttcaaaatctgcacaagaacacttaaataacagtcttcagctgataaaatcgtgccacgttttcc-aaatcatgccacgattgatgcgtacgacccaa 577  Q
     |||||||||||||| |||||||| || ||| |||||||||||||  |||||| || || ||||||| ||||| || |||| ||| ||||||| ||||||    
T  47674247 tcttcaaaatctgca-aagaacacctatatagcagtcttcagctgtcaaaatcatgtcatgttttccaaaatcgtgacacgtttggtgcgtacaacccaa 47674345  T
Q  578 ggtacgacc 586  Q
    |||||||||    
T  47674346 ggtacgacc 47674354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 380 - 584
Target Start/End: Complemental strand, 6570557 - 6570352
Alignment:
Q  380 tgtttacaatgtttctcaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatc-caagtttctctctcttcaagctct 478  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||| ||  | | ||||||||||||| |||||||||||||||||||   || |||||||  | ||||| |||||||    
T  6570557 tgtttacaatgtttcccaccccaagagaaccctagt-caaagacactcaatcctaaagttacctcctttgatttctcaagttttcccctctttaagctct 6570459  T
Q  479 ccttcaaaatctgcacaagaacacttaaataacagtcttcagctgataaaatcgtgccacg-ttttccaaatcatgccacgattgatgcgtacgacccaa 577  Q
    |||||||||| |||| |  |||||||||| || ||| ||||| ||  |||| |||| |||| ||  ||||||| || |||| |||||||||| |||||||    
T  6570458 ccttcaaaatatgcaaagaaacacttaaacaatagttttcagttgtcaaaaacgtgtcacgattggccaaatcgtgacacggttgatgcgtatgacccaa 6570359  T
Q  578 ggtacga 584  Q
    |||||||    
T  6570358 ggtacga 6570352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 117 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 24024447 - 24024328
Alignment:
Q  117 aagataagcaatgaaagaaggaacaaacacaccaaa--agattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatc 214  Q
    |||||||||||  |||| | ||||||| ||||| ||  |||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24024447 aagataagcaagaaaaggaagaacaaaaacaccgaacaagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatc 24024349  T
Q  215 cactatgatgaaagtgttacaa 236  Q
    || ||||| |||||||||||||    
T  24024348 caatatga-gaaagtgttacaa 24024328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 380 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 43864207 - 43864083
Alignment:
Q  380 tgtttacaatgtttctcaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatcc-aagtttctctctcttcaagctct 478  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| | | | | ||||||| |||||||||||||||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||| |    
T  43864207 tgtttacaatgtttcccaacccaagagaactttaat-caaagaccctcaaccctaaagttacctcctttgatttcccaagtttctctctcttcaagctat 43864109  T
Q  479 ccttcaaaatctgcacaagaacactta 505  Q
     ||||||||||| || |||||||||||    
T  43864108 tcttcaaaatctaca-aagaacactta 43864083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 328 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 9235495 - 9235398
Alignment:
Q  328 acacaaaaggaagctttt-gatccttccaatggtgaaatctcactacccaaaatgtttacaatgtttctcaacccaagagatcctcactacaaagaca 424  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||| ||||||    
T  9235495 acacaaaaggaagctttttgatccttgcaatggtgaaatatcactatccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaatctcactacgaagaca 9235398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 122 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 30814637 - 30814539
Alignment:
Q  122 aagcaatgaaagaa-ggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga-gcatctctccaatccacta 219  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||   |||||||||||||||||    
T  30814637 aagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaaa--ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatatgggggagagattgatctctccaatccacta 30814540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 152 - 236
Target Start/End: Original strand, 4866731 - 4866813
Alignment:
Q  152 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactatgatgaaagtgttacaa 236  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  4866731 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaa 4866813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 152 - 236
Target Start/End: Original strand, 19992314 - 19992396
Alignment:
Q  152 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactatgatgaaagtgttacaa 236  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  19992314 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaaagtgttacaa 19992396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 135 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 48489619 - 48489532
Alignment:
Q  135 aggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga-gcatctctccaatccactatga 222  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  48489619 aggaacaaacacaccaaa-gattgtttacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatga 48489532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 138 - 220
Target Start/End: Original strand, 41317417 - 41317499
Alignment:
Q  138 aacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga-gcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  41317417 aacaaacacaccaaa-gattgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactat 41317499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 138 - 219
Target Start/End: Original strand, 12097850 - 12097931
Alignment:
Q  138 aacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga-gcatctctccaatccacta 219  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  12097850 aacaaacacaccaaa-gattgttgacctagttcggtccaacttgacctaatctgggggagagattcatctctccaatccacta 12097931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 135 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 27348005 - 27347920
Alignment:
Q  135 aggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga-gcatctctccaatccactat 220  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||   |||||| |||||||||||    
T  27348005 aggaacaaacacaccaaa-gattgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctgcaatccactat 27347920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 380 - 561
Target Start/End: Complemental strand, 39731340 - 39731159
Alignment:
Q  380 tgtttacaatgtttctcaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttg-taatccaagtttctctctcttcaagctct 478  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||  |||    ||||||| || ||||||| ||||||  |||||| |   |||||||||||||||||| | ||||    
T  39731340 tgtttacaatgtttcccaacccaagagaagctctaatcaaagaccctaaaccctagagttactccctttgatttcccaagtttctctctcttccaactct 39731241  T
Q  479 ccttcaaaatctgcacaagaacacttaaataacagtcttcagctgataaaatcgtgccacgttttccaaatcatgccacgatt 561  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||   ||||||||||||| |||| ||| || ||| || |||||||    
T  39731240 -cttcaaaatctgcacaagaacacttaaatactagccttccattgataaaatcgtgtcacgattttcagatcgtgtcacgatt 39731159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 94 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 22270204 - 22270076
Alignment:
Q  94 accacaagcataaacaaagcac-aaagataagcaatgaaagaa-ggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctg 191  Q
    ||||||| ||||| |||||||  |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||    
T  22270204 accacaatcataatcaaagcaataaagataaacaatgaaagaaaggaacaaacacaccaagagat-gttcacccagttcggtccaacttgacctactctg 22270106  T
Q  192 ggggagaga-gcatctctccaatccactat 220  Q
    | |||||||   ||||||||||||||||||    
T  22270105 gaggagagattgatctctccaatccactat 22270076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 152 - 236
Target Start/End: Original strand, 12396912 - 12396994
Alignment:
Q  152 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactatgatgaaagtgttacaa 236  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  12396912 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaa 12396994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 152 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 31109667 - 31109585
Alignment:
Q  152 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactatgatgaaagtgttacaa 236  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  31109667 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctaggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaa 31109585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 156 - 220
Target Start/End: Original strand, 31155911 - 31155975
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  31155911 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactat 31155975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 380 - 519
Target Start/End: Original strand, 31733174 - 31733312
Alignment:
Q  380 tgtttacaatgtttctcaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatc-caagtttctctctcttcaagctct 478  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |   | | ||||||| |||||| ||||||||||||| ||||   || ||||||||||||||||| |||| |    
T  31733174 tgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaat-caaagaccctcaactctaaagttacctcttttgatttctcaagtttctctctcttccagcttt 31733272  T
Q  479 ccttcaaaatctgcacaagaacacttaaataacagtcttca 519  Q
     |||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  31733273 tcttcaaaatctgca-aagaacacttatatagcagtcttca 31733312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 380 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 48408766 - 48408608
Alignment:
Q  380 tgtttacaatgtttctcaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatcc-aagtttctctctcttcaagctct 478  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||  |||    ||||||| || ||||||| |||| |  ||||||   ||| ||||||||||||||||  |||||    
T  48408766 tgtttacaatgtttcccaacccaagagaaactctaatcaaagaccctaaaccctagagttgctccctttgatttcccaagtttctctctcttcc-gctct 48408668  T
Q  479 ccttcaaaatctgcacaagaacacttaaataacagtcttcagctgataaaatcgtgccacg 539  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||  |||||||||||||| ||||    
T  48408667 c-ttcaaaatctgcacaagaacacttaaatactagtcttccactgataaaatcgtgtcacg 48408608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 138 - 220
Target Start/End: Original strand, 41648994 - 41649076
Alignment:
Q  138 aacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga-gcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  41648994 aacaaacacaccaaa-gattgttgacccagttcggtccaacttgacctaatttgggggagagattgatctctccaatccactat 41649076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 139 - 220
Target Start/End: Original strand, 14069817 - 14069898
Alignment:
Q  139 acaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga-gcatctctccaatccactat 220  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||   ||||||||||||||||||    
T  14069817 acaaacacaccaaa-gattgttgacccagttcggtccaacttgacctaatcttggggagagattgatctctccaatccactat 14069898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 139 - 220
Target Start/End: Original strand, 14379845 - 14379926
Alignment:
Q  139 acaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga-gcatctctccaatccactat 220  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||   ||||||||||||||||||    
T  14379845 acaaacacaccaaa-gattgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctaggggagagattgatctctccaatccactat 14379926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 380 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 19502141 - 19502028
Alignment:
Q  380 tgtttacaatgtttctcaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatc-caagtttctctctcttcaagctct 478  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |   | | ||||||| |||||||||||||||||||| ||||   || ||||||| |||||||| |||||||    
T  19502141 tgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaat-caaagaccctcaaccctaaagttacctcatttgatttctcaagtttgtctctctttaagctct 19502043  T
Q  479 ccttcaaaatctgca 493  Q
    |||||||||||||||    
T  19502042 ccttcaaaatctgca 19502028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 380 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 26417279 - 26417070
Alignment:
Q  380 tgtttacaatgtttctcaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatc-caagtttctctctcttcaagctct 478  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||| |   | | ||||||| |||||||||||||||||||||||||   || ||||||  | ||||||||||||||    
T  26417279 tgtttacaatgtttcccaatccaagagaactctaat-caaagaccctcaaccctaaagttacctcctttgatttctcaagtt--tatctcttcaagctct 26417183  T
Q  479 ccttcaaaatctgcacaag-----aacacttaaataacagtcttcagctgataaaatcgtgccacg-ttttccaaatcatgccacgattgatgcgtacga 572  Q
     |||||||||||||| |||     |||||||| ||| ||||||||| | |  ||||||||| |||| ||  ||||||| || |||| ||| |||||||||    
T  26417182 tcttcaaaatctgca-aagaaattaacacttatatagcagtcttcaaccgtcaaaatcgtgtcacgattggccaaatcgtgacacggttggtgcgtacga 26417084  T
Q  573 cccaaggtacgacc 586  Q
    ||||||||||||||    
T  26417083 cccaaggtacgacc 26417070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 156 - 220
Target Start/End: Original strand, 1049296 - 1049360
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  1049296 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactat 1049360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 156 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 2935557 - 2935493
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| | |||| |||||||||    
T  2935557 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactat 2935493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 156 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 3036013 - 3035949
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  3036013 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactat 3035949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 156 - 220
Target Start/End: Original strand, 7351652 - 7351716
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  7351652 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtatgggggagagagcagccctccaatccactat 7351716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 141 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 8153524 - 8153445
Alignment:
Q  141 aaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga-gcatctctccaatccactat 220  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  8153524 aaacacaccaaa-gattgttgacccagttcagtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactat 8153445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 156 - 220
Target Start/End: Original strand, 9027194 - 9027258
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| | |||| |||||||||    
T  9027194 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctcctatccactat 9027258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 152 - 236
Target Start/End: Original strand, 12406332 - 12406414
Alignment:
Q  152 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactatgatgaaagtgttacaa 236  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||  | |||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  12406332 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagaatagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaa 12406414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 156 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 22108355 - 22108291
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| | |||| |||||||||    
T  22108355 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactat 22108291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 156 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 22137366 - 22137302
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| | |||| |||||||||    
T  22137366 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactat 22137302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 152 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 24261407 - 24261325
Alignment:
Q  152 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactatgatgaaagtgttacaa 236  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  24261407 aagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaa 24261325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 152 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 24266286 - 24266204
Alignment:
Q  152 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactatgatgaaagtgttacaa 236  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  24266286 aagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaa 24266204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 156 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 40550115 - 40550051
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| | |||| |||||||||    
T  40550115 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactat 40550051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 156 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 40552393 - 40552329
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| | |||| |||||||||    
T  40552393 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactat 40552329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 135 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 26417504 - 26417419
Alignment:
Q  135 aggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga-gcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||   ||||||||||||||||||    
T  26417504 aggaacaaacacaccaagaaattgttgacccagtttggtccaatttgacctaacct-ggggagagattgatctctccaatccactat 26417419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 135 - 216
Target Start/End: Original strand, 31732949 - 31733030
Alignment:
Q  135 aggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga-gcatctctccaatcca 216  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||    
T  31732949 aggaacaaactcaccaaa-gattgttgacccagttcggtccaacttgacctaatttgggggagagattgatctctccaatcca 31733030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 135 - 220
Target Start/End: Original strand, 47676116 - 47676201
Alignment:
Q  135 aggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga-gcatctctccaatccactat 220  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||   ||||||||| ||||||||    
T  47676116 aggaacaaacacaccaaa-gattgttgatccagttcggtccaacttgacctaatatgggggagagattgatctctccattccactat 47676201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 526 - 586
Target Start/End: Original strand, 3050493 - 3050554
Alignment:
Q  526 aaaatcgtgccacg-ttttccaaatcatgccacgattgatgcgtacgacccaaggtacgacc 586  Q
    ||||||||| |||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3050493 aaaatcgtgtcacgattttccaaatgatgtcacgattgatgcgtacgacccaaggtacgacc 3050554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 152 - 221
Target Start/End: Original strand, 16880074 - 16880142
Alignment:
Q  152 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactatg 221  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  16880074 aagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg 16880142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 152 - 221
Target Start/End: Original strand, 16884930 - 16884998
Alignment:
Q  152 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactatg 221  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  16884930 aagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg 16884998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 20297648 - 20297587
Alignment:
Q  159 ttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactat 220  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  20297648 ttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactat 20297587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 156 - 220
Target Start/End: Original strand, 1046925 - 1046989
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  1046925 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtgtgggggagagagcagccctccaatccactat 1046989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 156 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 1606668 - 1606604
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||| | |||| |||||||||    
T  1606668 ttgttgacccagttcggtccaatctgatctagtctgggggagagagcagccctccgatccactat 1606604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 467 - 523
Target Start/End: Original strand, 2759071 - 2759126
Alignment:
Q  467 tcttcaagctctccttcaaaatctgcacaagaacacttaaataacagtcttcagctg 523  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  2759071 tcttcaagctctccttcaaaatctgca-aagaacacttatatagcagtcttcagctg 2759126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 156 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 20299749 - 20299685
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| | |||| |||||||||    
T  20299749 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcaaccctccgatccactat 20299685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 156 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 20626327 - 20626263
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| | |||| |||||||||    
T  20626327 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactat 20626263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 156 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 20630218 - 20630154
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| | |||| |||||||||    
T  20630218 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactat 20630154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #101
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 156 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 20642637 - 20642573
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| | |||| |||||||||    
T  20642637 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactat 20642573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #102
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 156 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 38394275 - 38394211
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| | |||| |||||||||    
T  38394275 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactat 38394211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #103
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 156 - 220
Target Start/End: Original strand, 40836743 - 40836807
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| | |||| |||||||||    
T  40836743 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactat 40836807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #104
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 156 - 226
Target Start/End: Original strand, 3320051 - 3320122
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaat-atgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactatgatgaa 226  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||    
T  3320051 ttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactataatgaa 3320122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #105
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 156 - 226
Target Start/End: Original strand, 3324799 - 3324870
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaat-atgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactatgatgaa 226  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||    
T  3324799 ttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactataatgaa 3324870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #106
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 138 - 220
Target Start/End: Original strand, 24525485 - 24525567
Alignment:
Q  138 aacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga-gcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||  ||||||||||| |||||||||   ||||||||||||||||||    
T  24525485 aacaaacacaccaaa-gattattgacccagttccgtccaacttgacctaatcttggggagagattgatctctccaatccactat 24525567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #107
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 156 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 25405574 - 25405503
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaat-atgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactatgatgaa 226  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||    
T  25405574 ttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactataatgaa 25405503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #108
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 138 - 220
Target Start/End: Original strand, 36146391 - 36146473
Alignment:
Q  138 aacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga-gcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||| |||||||||||   ||||||| ||||||||||    
T  36146391 aacaaacacaccaaa-gattgttgacctagttcggtccaacttgacctaatatgggggagagattgatctctcaaatccactat 36146473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #109
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 135 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 4586349 - 4586264
Alignment:
Q  135 aggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga-gcatctctccaatccactat 220  Q
    |||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||  |||| |||| |||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  4586349 aggaacaaacacacgaaa-gattgtcgacccagttcggtccaagttgacataatatgggggagagattgatctctccaatccactat 4586264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #110
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 156 - 225
Target Start/End: Original strand, 8378504 - 8378574
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaat-atgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactatgatga 225  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||    
T  8378504 ttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcaactctccgatccactataatga 8378574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #111
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 155 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 43864413 - 43864347
Alignment:
Q  155 attgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga-gcatctctccaatccactat 220  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||   ||||||||||||||||||    
T  43864413 attgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggagagagattgatctctccaatccactat 43864347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #112
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 478 - 586
Target Start/End: Original strand, 4538853 - 4538962
Alignment:
Q  478 tccttcaaaatctgcacaagaacacttaaataacagtcttcagctgataaaatcgtgccacgtttt-ccaaatcatgccacgattgatgcgtacgaccca 576  Q
    |||||||||||||||| |  |||||||| ||| ||||||| |||||  ||||||||| ||  |||| ||||||| || |||| ||| ||||||||| |||    
T  4538853 tccttcaaaatctgcaaagaaacacttatatagcagtctttagctgtcaaaatcgtgtcatattttgccaaatcgtgacacgtttggtgcgtacgatcca 4538952  T
Q  577 aggtacgacc 586  Q
    ||||||||||    
T  4538953 aggtacgacc 4538962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #113
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 135 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 18126832 - 18126768
Alignment:
Q  135 aggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga 200  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||  ||||||| |||||||||||||    
T  18126832 aggaacaaacacaccaaa-gattgttgacccaggtcggtcaaacttgacctagtctgggggagaga 18126768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #114
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 152 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 21812322 - 21812254
Alignment:
Q  152 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactatg 221  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| || ||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||    
T  21812322 aagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctttccaatccaatatg 21812254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #115
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 156 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 1850270 - 1850206
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||||| | |||| |||||||||    
T  1850270 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgatccactat 1850206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #116
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 168 - 220
Target Start/End: Original strand, 7349285 - 7349337
Alignment:
Q  168 ttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  7349285 ttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactat 7349337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #117
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 156 - 220
Target Start/End: Original strand, 7470022 - 7470086
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||| ||||| | |||| |||||||||    
T  7470022 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagggagcagccctccgatccactat 7470086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #118
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 156 - 220
Target Start/End: Original strand, 7471980 - 7472044
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| |  ||| |||||||||    
T  7471980 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccatccgatccactat 7472044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #119
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 156 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 25542817 - 25542753
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||||||||||||  | ||||| ||| |||||||||||| |||||| |||||||||    
T  25542817 ttgttgacccagttcggtccaaattaacctagtctaggggagagagcagctctccgatccactat 25542753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #120
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 156 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 40946617 - 40946553
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| | || | |||||||||    
T  40946617 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagcccttcgatccactat 40946553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #121
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 156 - 200
Target Start/End: Original strand, 42330997 - 42331041
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga 200  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  42330997 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctaatctgggggagaga 42331041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #122
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 156 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 44724868 - 44724804
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| | ||||  ||||||||    
T  44724868 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactat 44724804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #123
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 156 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 48457942 - 48457878
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| | ||||  ||||||||    
T  48457942 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactat 48457878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #124
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 156 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 7069961 - 7069890
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaat-atgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactatgatgaa 226  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| |||| | ||||||||| |||||    
T  7069961 ttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctcttcgatccactataatgaa 7069890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #125
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 156 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 11759416 - 11759369
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagca 203  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  11759416 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagca 11759369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #126
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 156 - 203
Target Start/End: Original strand, 13099474 - 13099521
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagca 203  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  13099474 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagca 13099521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #127
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 138 - 220
Target Start/End: Original strand, 38671205 - 38671287
Alignment:
Q  138 aacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga-gcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||| | ||||||| |||   |||||| |||||||||||    
T  38671205 aacaaacacaccaaa-gattgttgacccagttcggtccaacttgacctattttgggggatagatttatctcttcaatccactat 38671287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #128
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 156 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 2121081 - 2121011
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaat-atgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactatgatga 225  Q
    ||||| ||||| ||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||    
T  2121081 ttgtttacccaattcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactataatga 2121011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #129
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 236
Target Start/End: Original strand, 3047111 - 3047339
Alignment:
Q  12 agcaaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaacta----aaaacagacctaga-cttagtgtagagcaacaccacaagcataa 106  Q
    ||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||  |||||||||||||| |    |||| ||  ||| | ||  ||||| |||||||||||||||||||    
T  3047111 agcaaagaaagtgataatcaatgagtaaagtgtcctcaagcaacaacaacaataacaaaatagttctaaaactgtgtgtaaagcaacaccacaagcataa 3047210  T
Q  107 acaaagcacaaagataa----gcaatgaaagaaggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatct-gggggagagag 201  Q
     |||| ||  |||||||    |||| |||||||  ||||||||||||||  ||| ||  ||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||    
T  3047211 tcaaatcaacaagataataaagcaa-gaaagaa--aacaaacacaccaa--gatcgta-acccagttcggtccaatatgacctgctctggggggagagag 3047304  T
Q  202 catctctccaatccactatgatgaaagtgttacaa 236  Q
    |   | ||||||||||||  ||||||||| |||||    
T  3047305 ccgttatccaatccactaatatgaaagtggtacaa 3047339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #130
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 527 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 19495789 - 19495728
Alignment:
Q  527 aaatcgtgccacgtttt--ccaaatcatgccacgattgatgcgtacgacccaaggtacgacc 586  Q
    |||||||| ||||||||  ||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19495789 aaatcgtgtcacgtttttcccagatcgtgtcacgattgatgcgtacgacccaaggtacgacc 19495728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #131
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 156 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 25351533 - 25351463
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaat-atgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactatgatga 225  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||| || |||||| ||||||||| ||||    
T  25351533 ttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagaacagctctccgatccactataatga 25351463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #132
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 156 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 25357227 - 25357157
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaat-atgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactatgatga 225  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||| ||||||| | ||||||||| ||||    
T  25357227 ttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagatcatctcttcgatccactataatga 25357157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #133
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 156 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 25410312 - 25410242
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaat-atgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactatgatga 225  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||  |||||||| ||||    
T  25410312 ttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctccgttccactataatga 25410242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #134
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 151 - 220
Target Start/End: Original strand, 30024727 - 30024797
Alignment:
Q  151 aaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga-gcatctctccaatccactat 220  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| |||||||||| ||   ||||||||||||||||||    
T  30024727 aaagattgttgatccagttcggtccaacttgacctactctgggggagtgattgatctctccaatccactat 30024797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #135
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 156 - 225
Target Start/End: Original strand, 34546880 - 34546950
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaat-atgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactatgatga 225  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||  |||||||| ||||    
T  34546880 ttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctccgttccactataatga 34546950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #136
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 380 - 449
Target Start/End: Original strand, 38671427 - 38671495
Alignment:
Q  380 tgtttacaatgtttctcaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttg 449  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |   | | ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  38671427 tgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaat-caaagaccctcaaccctaaagttacctcctttg 38671495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #137
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 156 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 44853 - 44789
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| |||| || |||  ||||||||    
T  44853 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaagcagctatccgttccactat 44789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #138
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 141 - 220
Target Start/End: Original strand, 2759183 - 2759262
Alignment:
Q  141 aaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga-gcatctctccaatccactat 220  Q
    |||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||| |||||   || |||||||||||||||    
T  2759183 aaacacaccaat-gattgttgaccaagttcggtccaacttgacctaatctggggaagagattgatatctccaatccactat 2759262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #139
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 156 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 3878866 - 3878802
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||||||||||||  | || || |||||||||||||||| | |||| |||||||||    
T  3878866 ttgttgacccagttcggtccaaattaacatagtctgggggagagagcagccctccgatccactat 3878802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #140
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 156 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 11081800 - 11081752
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaata-tgacctaatctgggggagagagca 203  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  11081800 ttgtttacccagttcggtccaatattgacctagtctgggggagagagca 11081752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #141
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 156 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 18345830 - 18345766
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactat 220  Q
    |||||||||||| |||||||||  ||||||| ||||||||||||| || | |||| |||||||||    
T  18345830 ttgttgacccagctcggtccaaattgacctagtctgggggagagaacagccctccgatccactat 18345766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #142
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 138 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 29991239 - 29991156
Alignment:
Q  138 aacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtcc-aatatgacctaatctgggggagaga-gcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||  ||||||| ||||| |||||||   ||||||||||||||||||    
T  29991239 aacaaacacaccaaa-gattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactat 29991156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #143
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 138 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 35854101 - 35854017
Alignment:
Q  138 aacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtcc-aatatgacctaatctgggggagaga-gcatctctccaatccactat 220  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||  ||||||| ||||| |||||||   | ||||||||||||||||    
T  35854101 aacaaacacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactat 35854017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #144
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 156 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 38396923 - 38396859
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| |||| ||||||||| | | |||| |||||||||    
T  38396923 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgagggagagagaagccctccgatccactat 38396859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #145
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 417 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 40808517 - 40808485
Alignment:
Q  417 caaagacactcaaccctaaagttacctcctttg 449  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40808517 caaagacactcaaccctaaagttacctcctttg 40808485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #146
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 138 - 220
Target Start/End: Original strand, 495966 - 496048
Alignment:
Q  138 aacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga-gcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||  ||||||| | | |||||||||   ||||||||||||||||||    
T  495966 aacaaacacaccaaa-gattgttgacccggttctgtccaacttgacctactataggggagagattgatctctccaatccactat 496048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #147
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 138 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 1113842 - 1113760
Alignment:
Q  138 aacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga-gcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| || ||||||| ||  ||||||||| |||||||||||   |||||||||||| |||||    
T  1113842 aacaaacacaccaaa-gattgttgactcaattcggtcaaacttgacctaatatgggggagagattgatctctccaatctactat 1113760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #148
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 156 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 7074968 - 7074897
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaat-atgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactatgatgaa 226  Q
    ||||| |||| |||||||| ||| |||||||| |||||||||||| ||| |||||| ||||||||| |||||    
T  7074968 ttgtttacccggttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagtgcagctctccgatccactataatgaa 7074897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #149
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 156 - 226
Target Start/End: Original strand, 15540996 - 15541067
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaat-atgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactatgatgaa 226  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| |||| | || |||||| |||||    
T  15540996 ttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctacgatacactataatgaa 15541067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #150
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 155 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 21369825 - 21369754
Alignment:
Q  155 attgttgacccagttcggtccaat-atgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactatgatga 225  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||||| ||||||  |||||||| ||||    
T  21369825 attgtttacccagttcggtccaatgatgacctactatggcggagagagcagctctccgttccactataatga 21369754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #151
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 156 - 203
Target Start/End: Original strand, 21592143 - 21592190
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagca 203  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| | ||||||||||||||    
T  21592143 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagca 21592190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #152
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 156 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 21990439 - 21990392
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagca 203  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| ||||||||||||    
T  21990439 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtcttggggagagagca 21990392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #153
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 156 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 24748884 - 24748837
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagca 203  Q
    |||||||| |||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||    
T  24748884 ttgttgactcagttcggtccaaattgacctaatctggaggagagagca 24748837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #154
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 156 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 28487842 - 28487795
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagca 203  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  28487842 ttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagca 28487795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #155
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 156 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 2075297 - 2075227
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaat-atgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactatgatga 225  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| || |||  |||||||| ||||    
T  2075297 ttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctttccgttccactataatga 2075227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #156
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 168 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 6046772 - 6046714
Alignment:
Q  168 ttcggtccaata-tgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactatgatga 225  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||| || |||||||| ||||    
T  6046772 ttcggtccaatactgacctagtctgggggagagagcagctcttcattccactataatga 6046714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #157
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 417 - 478
Target Start/End: Original strand, 12098113 - 12098175
Alignment:
Q  417 caaagacactcaaccctaaagttacctcctttg-taatccaagtttctctctcttcaagctct 478  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |   |||||||| |||||||| |||||||    
T  12098113 caaagaccctcaaccctaaagttacctcctttgatttcccaagtttttctctcttgaagctct 12098175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #158
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 417 - 478
Target Start/End: Original strand, 41317688 - 41317750
Alignment:
Q  417 caaagacactcaaccctaaagttacctcctttg-taatccaagtttctctctcttcaagctct 478  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |   || |||||||||||||| |||||||    
T  41317688 caaagaccctcaaccctaaagttacctcctttgatttccctagtttctctctcttgaagctct 41317750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #159
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 156 - 225
Target Start/End: Original strand, 44010750 - 44010820
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaat-atgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactatgatga 225  Q
    ||||| ||| ||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||  |||||||| ||||    
T  44010750 ttgtttaccaagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctccgttccactataatga 44010820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #160
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 135 - 220
Target Start/End: Original strand, 47673924 - 47674008
Alignment:
Q  135 aggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga-gcatctctccaatccactat 220  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||  |||| |||| | |||||||||   ||||||||||||||||||    
T  47673924 aggaacaaacacaccaaa-gattgttgattcagttcggtccaacttgacttaatat-ggggagagattgatctctccaatccactat 47674008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #161
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 135 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 48491766 - 48491682
Alignment:
Q  135 aggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga-gcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||| ||| |||| || ||||  |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  48491766 aggaacaaacacatcaaa-gattgtttaccaagtttgg-ccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactat 48491682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #162
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 159 - 200
Target Start/End: Original strand, 2360975 - 2361016
Alignment:
Q  159 ttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga 200  Q
    ||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||    
T  2360975 ttgacccagttcggttcaacttgacctaatctgggggagaga 2361016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #163
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 159 - 220
Target Start/End: Original strand, 7094463 - 7094524
Alignment:
Q  159 ttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactat 220  Q
    |||||||||||| ||||||  ||||||| |||||||||||||||| | |||| || ||||||    
T  7094463 ttgacccagttcagtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgattcactat 7094524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #164
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 156 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 11355547 - 11355494
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctc 209  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||| || ||| |||||||||||| |||||    
T  11355547 ttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtctaggggagagagcagctctc 11355494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #165
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 380 - 449
Target Start/End: Original strand, 24526102 - 24526170
Alignment:
Q  380 tgtttacaatgtttctcaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttg 449  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||| ||  | | ||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  24526102 tgtttacaatgtttcccaacctaagagaaccataat-caaagaccctcaaccctaaagttatctcctttg 24526170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #166
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 380 - 449
Target Start/End: Original strand, 31105598 - 31105666
Alignment:
Q  380 tgtttacaatgtttctcaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttg 449  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| | |   | | ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  31105598 tgtttacaatgtttctcaccccaagataactataat-caaagaccctcaaccctaaagttacctcctttg 31105666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #167
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 156 - 225
Target Start/End: Original strand, 31435046 - 31435115
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactatgatga 225  Q
    |||||||||||||||||| |||  ||||||| | |||||||||||||| | ||||  |||||||| ||||    
T  31435046 ttgttgacccagttcggtacaaattgacctagtttgggggagagagcagccctccgttccactataatga 31435115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #168
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 454 - 539
Target Start/End: Original strand, 43504427 - 43504511
Alignment:
Q  454 ccaagtttctctctcttcaagctctccttcaaaatctgcacaagaacacttaaataacagtcttcagctgataaaatcgtgccacg 539  Q
    |||||||||||||||||| | | || ||||||| |||||||| |||||||||||||  || | ||  |||||||||||||| ||||    
T  43504427 ccaagtttctctctcttccaacccttcttcaaa-tctgcacaggaacacttaaatactagccctccactgataaaatcgtgtcacg 43504511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #169
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 156 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 35918 - 35854
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||| ||||||| |||| ||||||  ||||||||    
T  35918 ttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagaaagcagctctccgttccactat 35854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #170
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 145 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 2390461 - 2390385
Alignment:
Q  145 acaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga-gcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||| ||||| || ||| ||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||   ||||||||||||||||||    
T  2390461 acaccaagagattattcacctagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactat 2390385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #171
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 145 - 220
Target Start/End: Original strand, 6359941 - 6360017
Alignment:
Q  145 acaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga-gcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||| |||||  ||||||||| ||||| |||||   |||||||||||| |||||    
T  6359941 acaccaagaaattgttgacccagttcgatccaacttgacctaatatggggaagagattgatctctccaatcaactat 6360017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #172
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 156 - 220
Target Start/End: Original strand, 7092213 - 7092276
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||| | |||| || ||||||    
T  7092213 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccctccgattcactat 7092276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #173
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 372 - 412
Target Start/End: Original strand, 12098056 - 12098096
Alignment:
Q  372 acccaaaatgtttacaatgtttctcaacccaagagatcctc 412  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  12098056 acccaagatgtttacaatgtttcccaacccaagagaacctc 12098096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #174
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 153 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 20344068 - 20344000
Alignment:
Q  153 agattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcat-ctctccaatccactat 220  Q
    |||||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||   | ||||||||||||||||    
T  20344068 agattgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactat 20344000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #175
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 138 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 23555226 - 23555143
Alignment:
Q  138 aacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtcc-aatatgacctaatctgggggagaga-gcatctctccaatccactat 220  Q
    |||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||| ||  ||||||| ||||| |||||||   ||||||||||||||||||    
T  23555226 aacaaacacatcaaa-gattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactat 23555143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #176
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 431 - 478
Target Start/End: Original strand, 23565315 - 23565363
Alignment:
Q  431 cctaaagttacctcctttgtaatcc-aagtttctctctcttcaagctct 478  Q
    |||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||    
T  23565315 cctaaagttacctcctttgatatcccaagtttctctctcttgaagctct 23565363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #177
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 138 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 24790028 - 24789944
Alignment:
Q  138 aacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtcc-aatatgacctaatctgggggagagagcat-ctctccaatccactat 220  Q
    |||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| ||  ||||||| ||||| |||||||   | ||||||||||||||||    
T  24790028 aacaaagacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagatagtactctccaatccactat 24789944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #178
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 138 - 174
Target Start/End: Original strand, 25766941 - 25766977
Alignment:
Q  138 aacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtc 174  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  25766941 aacaaacacaccaagagattgttcacccagttcggtc 25766977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #179
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 156 - 220
Target Start/End: Original strand, 27306230 - 27306294
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactat 220  Q
    |||||||||||||| |||||||  ||||||| ||| |||||||||||| | ||||  ||||||||    
T  27306230 ttgttgacccagtttggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccgttccactat 27306294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #180
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 391 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 31109468 - 31109388
Alignment:
Q  391 tttctcaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccc-taaagttacctcctttgtaatccaagtttctctctctt 470  Q
    |||| ||||||||||||  ||| | ||||||||||||||||| ||  ||| |||||||||  |||||||||| ||||||||    
T  31109468 tttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccatatggttccctcctttgctatccaagtttttctctctt 31109388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #181
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 157 - 220
Target Start/End: Original strand, 32358055 - 32358119
Alignment:
Q  157 tgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga-gcatctctccaatccactat 220  Q
    |||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||   ||||||||||||||||||    
T  32358055 tgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactat 32358119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #182
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 540 - 584
Target Start/End: Original strand, 32358419 - 32358463
Alignment:
Q  540 ttttccaaatcatgccacgattgatgcgtacgacccaaggtacga 584  Q
    |||||||||||||| |||| ||| ||||||||| |||||||||||    
T  32358419 ttttccaaatcatgacacgtttggtgcgtacgatccaaggtacga 32358463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 411; Significance: 0; HSPs: 156)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 411; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 576
Target Start/End: Complemental strand, 26645134 - 26644561
Alignment:
Q  12 agcaaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaactaaaaacagacctagacttagtgtagagcaacaccacaagcataaacaaa 111  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26645134 agcaaatgaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctttaagcaacaacaac-aaaagcagacctagacttagtgtagagcaacaccacaagcataaacaaa 26645036  T
Q  112 gcacaaagataagcaatgaaagaa-ggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctcc 210  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26645035 gcacaaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctcc 26644936  T
Q  211 aatccactatgatgaaagtgttacaa-ga--------aaaatagtttgcaagcttacacaagaacaagacttaatttctacccatttgtgtttctcactc 301  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||        ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26644935 aatccattatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaaatagcttgcaagcttacacaagaacaagacctaatttctacccatttgtgtttctcactc 26644836  T
Q  302 tctcaataatgaaccctaaagggaagacacaaaaggaagcttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaaatgtttacaatgtttctcaaccc 401  Q
    ||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| ||||||    
T  26644835 tctcaatgatgaaccctaa-gagaagacacaaaaggaagcttttgatccttccaatggtgaaatctcactactcaaggtgtttacaatgtttcccaaccc 26644737  T
Q  402 aagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatccaagtttctctctcttcaagctctcc-ttcaaaatctgcacaagaac 500  Q
    || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  26644736 aaaagatcttcactacaaagacactcaaccctaaaattatctcctttgtaatccaagtttctctctcttcaggctctcctttcaaaatctgcataagaac 26644637  T
Q  501 acttaaataacagtcttcagctgataaaatcgtgccacgttttccaaatcatgccacgattgatgcgtacgaccca 576  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  26644636 acttatatagcagtcttcagctgataaaatcgtgccacgttttccaaatcgtgccacgattggtgcgtacgaccca 26644561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 401; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 586
Target Start/End: Original strand, 3281571 - 3282150
Alignment:
Q  15 aaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaactaaaaacagacctagacttagtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagca 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3281571 aaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaaa-agacatagactttgtgtagagcaacaccacaagaataaacaaagca 3281669  T
Q  115 caaagataagcaatgaaagaa-ggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaat 213  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  3281670 caaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacatcaaaagattattgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaat 3281769  T
Q  214 ccactatgatgaaagtgttacaa-ga--------aaaatagtttgcaagcttacacaagaacaagacttaatttctacccatttgtgtttctcactctct 304  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||        ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  3281770 ccacgatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaaatagcttgcaagcttacacaagaacaagacctaatttctacccatttgtgtttcccactctct 3281869  T
Q  305 caataatgaaccctaaagggaagacacaaaaggaagcttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaaatgtttacaatgtttctcaacccaag 404  Q
    |||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||    
T  3281870 caatgatgaaccctaa-gagaagacacaaaaggaagcttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaag 3281968  T
Q  405 agatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatccaagtttctctctcttcaagctctccttcaaaatctgcacaagaacactt 504  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3281969 agatcctcactacaaagacactcaaccataaagttacctcatttgtaatccaagtttctctcacttcaagctctccttcaaaatctgcataagaacactt 3282068  T
Q  505 aaataacagtcttcagctgataaaatcgtgccacgttttccaaatcatgccacgattgatgcgtacgacccaaggtacgacc 586  Q
    | ||| |||||||||||||  ||||||||| |||||||| |||||| || |||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  3282069 atatagcagtcttcagctgtcaaaatcgtgtcacgtttttcaaatcgtggcacgattggtgcgtacgacccaaggtatgacc 3282150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 400; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 586
Target Start/End: Original strand, 37069628 - 37070211
Alignment:
Q  12 agcaaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaactaaaaa-cagacctagacttagtgtagagcaacaccacaagcataaacaa 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  37069628 agcaaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaaaaaaaaaaaaacagacttagacttaatgtagagcaacaccacaagcataaacaa 37069727  T
Q  111 agcacaaagataagcaatgaaagaa-ggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctc 209  Q
    ||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37069728 agcacaaagataagcaacgaaataaaggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctc 37069827  T
Q  210 caatccactatgatgaaagtgttacaa-ga-----aaaatagtttgcaagcttacacaagaacaagacttaatttctacccatttgtgtttctcactctc 303  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| ||     ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| |    
T  37069828 cgatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaaaatagtttgcaagcttacacaagaacaagacctaatttctacccatttgtgttacccactcac 37069927  T
Q  304 tcaataatgaaccctaaagggaagacacaaaaggaagcttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaaatgtttacaatgtttctcaacccaa 403  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||| ||||||||    
T  37069928 tcaataatgaaccataaagagaagacacaaaaggaagcttttgatccttccaatggtgaaatctcattatccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaa 37070027  T
Q  404 gagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatccaagtttctctctcttcaagctctccttcaaaatctgcacaagaacact 503  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  37070028 gagatcctcactacaaagacactcaaccataaagttacctcctttgtaatccaagtttctctctcttccagctctacttcaaaatctgcacaagaacact 37070127  T
Q  504 taaataacagtcttcagctgataaaatcgtgccacg-ttttccaaatcatgccacgattgatgcgtacgacccaaggtacgacc 586  Q
    || ||| ||||||| |||||  |||||  || |||| ||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  37070128 tatatagcagtctttagctgtcaaaattatgtcacgattttccaaatcgtggcacgattggtgcgtacgacccaaggtacgacc 37070211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 392; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 13604857 - 13604276
Alignment:
Q  15 aaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaactaaaaacagacctagacttagtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagca 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||   ||||||||| ||| || ||| |||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  13604857 aaaggaagtgataatcaatgtgtaaagtgtctccaaacaacaacaaagcaaaacagacatagtct-agtatagagcaacatcacaagcatatacaaagca 13604759  T
Q  115 c-aaagataagcaatgaaagaaggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaat 213  Q
      ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  13604758 ataaagataagtaatgaaagaaggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttaggttcaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaat 13604659  T
Q  214 ccactatgatgaaagtgttacaa----------gaaaaatagtttgcaagcttacacaagaacaagacttaatttctacccatttgtgtttctcactctc 303  Q
    |||||||||||||| ||||||||          ||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13604658 ccactatgatgaaaatgttacaaagagttacaagaaaaatagcttgcaaacttacacaagaacaagacctaatttctacccatttgtgtttcccactctc 13604559  T
Q  304 tcaataatgaaccctaaagggaagacacaaaaggaagcttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaaatgtttacaatgtttctcaacccaa 403  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||    
T  13604558 tcaataatgaaccctaaagagaagacacaaaaggaagcttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaa 13604459  T
Q  404 gagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatccaagtttctctctcttcaagctctccttcaaaatctgcacaagaacact 503  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  13604458 gagatcctcactacaaagatactcaaccctaaagttccctcctttgtaatccaagtttctctctctttaagctctcctccaaaatttgcacaagaacact 13604359  T
Q  504 taaataacagtcttcagctgataaaatcgtgccacgttttccaaatcatgccacgattgatgcgtacgacccaaggtacgacc 586  Q
    || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13604358 tatatagcagtcttcagctgataaaatcgtgccacgttttccaaatcgtgtcacgattgatacgtacgacccaaggtacgacc 13604276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 388; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 21536806 - 21536224
Alignment:
Q  12 agcaaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaactaaaaacagacctagacttagtgtagagcaacaccacaagcataaacaaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21536806 agcaaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaatcaacaacaac-aaaaatagacctagacttactgtagagcaacaccacaagcatagacaaa 21536708  T
Q  112 gcacaaagataagcaatgaaagaa-ggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctcc 210  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21536707 gcacaaagataagcgatgaaagaaaggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtaaaaaatgacctaatctgggggagagagcagctctcc 21536608  T
Q  211 aatccactatgatgaaagtgttacaa-ga--------aaaatagtttgcaagcttacacaagaacaagacttaatttctacccatttgtgtttctcactc 301  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||        ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| | |||||    
T  21536607 aatccactataatgaaagtgttacaaagagttacaagaaaatagcttgcaagcttacacaagaacaatacttaatttctacccgtttgtgttacccactc 21536508  T
Q  302 tctcaataatgaaccctaaagggaagacacaaaaggaagcttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaaatgtttacaatgtttctcaaccc 401  Q
    ||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||  |||||     
T  21536507 tctcaatgatgaaccctaa-gagaagacacaaaaggaagctttcgatccttccaatggtgaaatcttactacccaaggtgtttacaatgttttccaacct 21536409  T
Q  402 aagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatccaagtttctctctcttcaagctctccttcaaaatctgcacaagaaca 501  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21536408 aagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatccaagtttctctcacttcaagctctccttcaaaatctgcacaagaaca 21536309  T
Q  502 cttaaataacagtcttcagctgataaaatcgtgccacgttttccaaatcatgccacgattgatgcgtacgacccaaggtacgacc 586  Q
    |||| ||| |||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||  | |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21536308 cttatatagcagtcttcagctgtcaaaatcgtgtcacgttttccaaatcggggcacgattggtgcgtacgacccaaggtacgacc 21536224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 313; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 12 - 586
Target Start/End: Original strand, 29651670 - 29652257
Alignment:
Q  12 agcaaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaactaaaaacagacctaga-cttagtgtagagcaacaccacaagcataaacaa 110  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||  || |||||||||| |||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  29651670 agcaaaggaagtggtaatcaatgaataaagtgtctataatcaacaacaacaaaaaacagacttagatctaagtgtagagcaacaccacaagcataatcaa 29651769  T
Q  111 agcac-aaagataagcaatgaaagaa-ggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctct 208  Q
    ||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  29651770 agcaataaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaa--gatttttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagcact 29651867  T
Q  209 ccaatccactatgatgaaagtgttacaaga----------aaaatagtttgcaagcttacacaagaacaagacttaatttctacccattt-gtgtttctc 297  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |          ||| ||  ||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||  | |    
T  29651868 ccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagaattacaagaaattaacttataagcttacacaagaacaagacctaatttctacccattttgtgtcaccc 29651967  T
Q  298 actctctcaataatgaaccctaaagggaagacacaaaaggaagctttt-gatccttccaatggtgaaatctcactacccaaaatgtttacaatgtttctc 396  Q
    || |||||||||||||| ||||| | ||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |    
T  29651968 acactctcaataatgaatcctaa-gagaaaacacaaaaggaaactttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttccc 29652066  T
Q  397 aacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatccaagtttctctctcttcaagctctccttcaaaatctgcacaa 496  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  29652067 aacccaaaagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatccaagtttctctcttttcaagctctccttcaaaatctgcacaa 29652166  T
Q  497 gaacacttaaataacagtcttcagctgataaaatcgtgccacgttt-tccaaatcatgccacgattgatgcgtacgacccaaggtacgacc 586  Q
     |||||||| ||| |||||||||||||  |||||| || ||||||| |||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  29652167 aaacacttatatagcagtcttcagctgtcaaaatcatgtcacgtttgtccaaatcgtgacacgattggtgtgtacgacccaaggtacgacc 29652257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 15 - 586
Target Start/End: Original strand, 13598259 - 13598844
Alignment:
Q  15 aaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaacta--aaaacagacctaga-cttagtgtagagcaacaccacaagcataaacaaa 111  Q
    |||||||||||||||||||  || |||||||||||| |||||||||| |  |||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  13598259 aaaggaagtggtaatcaata-gttaagtgtctccaaacaacaacaacaacaaaaacagacctagatctaagtgtagagaaacaccacaagcataatcaaa 13598357  T
Q  112 gcac-aaagataagcaatgaaagaa-ggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctc 209  Q
    |||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||     
T  13598358 gcaataaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaa--gattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctt 13598455  T
Q  210 caatccactatgatgaaagtgttacaaga----------aaaatagtttgcaagcttacacaagaacaagacttaatttctacccattt-gtgtttctca 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |          ||| ||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  | ||    
T  13598456 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagagatacaagaaattagcttataagcttacacaagaacaagacttaatttctactcattttgtgtcaccca 13598555  T
Q  299 ctctctcaataatgaaccctaaagggaagacacaaaaggaagctttt-gatccttccaatggtgaaatctcactacccaaaatgtttacaatgtttctca 397  Q
    | |||||||| ||||| ||||| | ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||  ||    
T  13598556 cactctcaatgatgaatcctaa-gagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttgcca 13598654  T
Q  398 acccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatccaagtttctctctcttcaagctctccttcaaaatctgcacaag 497  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13598655 acccaagagatcctcactacaaagacactcaaccataaagttacctcctttgtaatccaattttctctctcttcaagctctccttcaaaatctgcacaag 13598754  T
Q  498 aacacttaaataacagtcttcagctgataaaatcgtgccacgttt-tccaaatcatgccacgattgatgcgtacgacccaaggtacgacc 586  Q
    |||| ||| ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||| |||||||  || |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13598755 aacatttatatagcagtcttcagctgtcaaaatcgtgtcacgtttgtccaaattgtgacacgattggtgcgtacgacccaaggtacgacc 13598844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 15 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 19361669 - 19361122
Alignment:
Q  15 aaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaactaaaaa----cagacctagacttagtgtagagcaacaccacaagcataaacaa 110  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||    ||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  19361669 aaaggaagtggtaatctatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaaaaaaaaaaaaacagccctagtct-agtgtagagcaacaccacaagcaaatacaa 19361571  T
Q  111 agca-caaagataagcaatgaaagaaggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctc 209  Q
    |||| | |||||||||||  |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  19361570 agcaaccaagataagcaagaaaaggaagaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcagtc-aatatgacctaatatgggggagagagcagctctc 19361472  T
Q  210 caatccactatgatgaaagtgttacaa----------gaaaaatagtttgcaagcttacacaagaacaagacttaatttctacccatttgtgtttctc-a 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||          ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| | |    
T  19361471 caatccactatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaaaatagtttgcaagcttacacaagaacaagacctagattctacccatttgtgtttcccca 19361372  T
Q  299 ctctctcaataatgaaccctaaagg-gaagacacaaaaggaagcttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaaatgtttacaatgttt-ctc 396  Q
    ||||||||||| ||||||||||| | |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| | |    
T  19361371 ctctctcaata-tgaaccctaaaagagaagacacaagaggaagctttagatccttccaatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgttttccc 19361273  T
Q  397 aacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatccaagtttctctctc--------ttcaagctctccttcaaaat 488  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||        | ||||||||||| ||||||    
T  19361272 aacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctagagttccctcctttgtaatctaagtttctctctctaagctcttccaagctctcctccaaaat 19361173  T
Q  489 ctgcacaagaacacttaaataacagtcttcagctgataaaatcgtgccacg 539  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||  |||||||||||||| ||||    
T  19361172 ctgcacaagaacacttaaatactagtcttccactgataaaatcgtgtcacg 19361122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 15 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 19359079 - 19358533
Alignment:
Q  15 aaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaactaaaaa---cagacctagacttagtgtagagcaacaccacaagcataaacaaa 111  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||   ||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  19359079 aaaggaagtggtaatctatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaaaatacagccctagtct-agtgtagagcaacaccacaagcaaatacaaa 19358981  T
Q  112 gca-caaagataagcaatgaaagaaggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctcc 210  Q
    ||| | |||||||||||  |||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  19358980 gcaaccaagataagcaagaaaaggaagaacaaacacatcaaaagattgttgacccagttcagtc-aatatgacctaatatgggggagagagcagctctcc 19358882  T
Q  211 aatccactatgatgaaagtgttacaa----------gaaaaatagtttgcaagcttacacaagaacaagacttaatttctacccatttgtgtttctc-ac 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||          ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| | ||    
T  19358881 aatccactatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaaaatagcttgcaagcttacacaagaacaagacctagattctacccatttgtgtttccccac 19358782  T
Q  300 tctctcaataatgaaccctaaagg-gaagacacaaaaggaagcttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaaatgtttacaatgttt-ctca 397  Q
    |||||||||| ||||||||||| | |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| | ||    
T  19358781 tctctcaata-tgaaccctaaaagagaagacacaagaggaagctttagatccttccaatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgttttccca 19358683  T
Q  398 acccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatccaagtttctctctc--------ttcaagctctccttcaaaatc 489  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||        | ||||||||||| |||||||    
T  19358682 acccaaaagatcctcactacaaagacactcaaccctagagttccctcctttgtaatccaagtttctctctctaagctcttccaagctctcctccaaaatc 19358583  T
Q  490 tgcacaagaacacttaaataacagtcttcagctgataaaatcgtgccacg 539  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||  |||||||||||||| ||||    
T  19358582 tgcacaagaacacttaaatactagtcttccactgataaaatcgtgtcacg 19358533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 15 - 561
Target Start/End: Complemental strand, 24203001 - 24202437
Alignment:
Q  15 aaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaa-caacaactaaaaacagacctagacttagtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagc 113  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||   | |||||||    
T  24203001 aaagggagtggtaatctatgtgtaaagtgtctccaagcaaacaacaac--aaaacagccctaaact-agtgtagagcaacaccacaagagaatacaaagc 24202905  T
Q  114 aca-aagataagcaatgaaagaaggaacaaacacaccaaaa-gattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctcca 211  Q
    | | ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24202904 aaacaagataagcaa-gaaaggaagaacaaacacaccaaaaagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 24202807  T
Q  212 atccactatgatgaaagtgttacaa----------gaaaaatagtttgcaagcttacacaagaacaagacttaatttctacccatttgtgtttctc-act 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||          ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| | |||    
T  24202806 atccactatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaaaatagcttgcaagcttacacaagaacaagacctagattctacccatttgtgtttccccact 24202707  T
Q  301 ctctcaataatgaaccctaaagg-gaagacacaaaaggaagcttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaaatgtttacaatgtttctc--a 397  Q
    ||| ||||| ||||||||||| | |||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||  || ||||||||||| ||  |    
T  24202706 ctcacaata-tgaaccctaaaagagaagacactagaggaagctttagatccttccaatggtgagatctcactacccaaggtgattacaatgtttttccca 24202608  T
Q  398 acccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatccaagtttctctctc--------ttcaagctctccttcaaaatc 489  Q
    ||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||        | |||||||| || ||||||     
T  24202607 acccaagagacactctctacaaagacactcaaccctaaagttccctcctttgtaatccaagtttctctctctaagctcttccaagctct-ctccaaaata 24202509  T
Q  490 tgcacaagaacacttaaataacagtcttcagctgataaaatcgtgccacgttttccaaatcatgccacgatt 561  Q
    ||||||||||||||||||||  || ||||  |||||| ||||||| |||| |||||| ||| || |||||||    
T  24202508 tgcacaagaacacttaaatactagccttcctctgatacaatcgtgtcacgatttccagatcgtgtcacgatt 24202437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 14 - 468
Target Start/End: Original strand, 19072788 - 19073256
Alignment:
Q  14 caaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaactaaaaacagacctaga-cttagtgtagagcaacaccacaagcataaacaaag 112  Q
    |||||||||| |||||||||   ||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||| | || |||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  19072788 caaaggaagtagtaatcaatagataaagtgtctcgaagcaacaacaacaaaaatcagacctaaatctaagtgtagagcaacaccacaagcataatcaaaa 19072887  T
Q  113 cac-aaagataagcaatgaaagaa-ggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctcc 210  Q
    ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19072888 caataaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaa-gattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctcc 19072986  T
Q  211 aatccactatgatgaaagtgttacaaga----------aaaatagtttgcaagcttacacaagaacaagacttaatttctaccca-tttgtgtttctcac 299  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |          ||| ||| ||  ||||||||| |||||||| || ||||||||||||| |||||||  |||||    
T  19072987 aatccactaagatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttataagcttacaaaagaacaatacctaatttctacccattttgtgtcactcac 19073086  T
Q  300 tctctcaataatgaaccctaaagggaagacacaaaaggaagc-ttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaaatgtttacaatgtttctcaa 398  Q
     ||||||  |||||||||| ||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| |||    
T  19073087 actctca--aatgaaccct-aagagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatctcactatccaaggtgtttacaatgtttcccaa 19073183  T
Q  399 cc--caagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaat-ccaagtttctctctc 468  Q
    ||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  19073184 ccctcaagagaacctcactacaaagacactcaaccctcaagttacctcctttgtattcccaagtttctctctc 19073256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 14 - 468
Target Start/End: Original strand, 19120678 - 19121146
Alignment:
Q  14 caaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaactaaaaacagacctaga-cttagtgtagagcaacaccacaagcataaacaaag 112  Q
    |||||||||| |||||||||   ||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||| | || |||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  19120678 caaaggaagtagtaatcaatagataaagtgtctcgaagcaacaacaacaaaaatcagacctaaatctaagtgtagagcaacaccacaagcataatcaaaa 19120777  T
Q  113 cac-aaagataagcaatgaaagaa-ggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctcc 210  Q
    ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19120778 caataaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaa-gattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctcc 19120876  T
Q  211 aatccactatgatgaaagtgttacaaga----------aaaatagtttgcaagcttacacaagaacaagacttaatttctaccca-tttgtgtttctcac 299  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |          ||| ||| ||  ||||||||| |||||||| || ||||||||||||| |||||||  |||||    
T  19120877 aatccactaagatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttataagcttacaaaagaacaatacctaatttctacccattttgtgtcactcac 19120976  T
Q  300 tctctcaataatgaaccctaaagggaagacacaaaaggaagc-ttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaaatgtttacaatgtttctcaa 398  Q
     ||||||  |||||||||| ||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| |||    
T  19120977 actctca--aatgaaccct-aagagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatctcactatccaaggtgtttacaatgtttcccaa 19121073  T
Q  399 cc--caagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaat-ccaagtttctctctc 468  Q
    ||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  19121074 ccctcaagagaacctcactacaaagacactcaaccctcaagttacctcctttgtattcccaagtttctctctc 19121146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 15 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 47704171 - 47703704
Alignment:
Q  15 aaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaactaaaaacagacctaga-cttagtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagc 113  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| | || |||||||||||||||||||||  ||| ||||||    
T  47704171 aaaggaagtggtaatcaatagataaagtgtctccaagcagcaacaacaaaaaatagacctaaatctaagtgtagagcaacaccacaagtttaatcaaagc 47704072  T
Q  114 ac-aaagataagcaatgaaagaa-ggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctcca 211  Q
    |  |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  47704071 aataaagataagcaatgaaagaaaggaaaaaacacaccaa--gattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctcca 47703974  T
Q  212 atccactatgatgaaagtgttacaaga----------aaaatagtttgcaagcttacacaagaacaagacttaatttctaccca-tttgtgtttctcact 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |          ||| ||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||  | ||||    
T  47703973 atccactatgatgaaagtgttacaaaagaattacaagaaattagcttacaagcttacacaagaacaagacctaatttctacccattttgtgtcacccact 47703874  T
Q  301 ctctcaataatgaaccctaaagggaagacacaaaaggaag-cttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaaatgtttacaatgtttctcaac 399  Q
    ||| |||| ||||| ||| ||| ||| |||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||    
T  47703873 ctcacaat-atgaatcct-aagagaaaacacaaaaggaagtttttttatcattccaatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttcccaac 47703776  T
Q  400 c--caagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatc-caagtttctctctc 468  Q
    |  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  47703775 cctcaagagaacctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtattctcaagtttctctctc 47703704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 12 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 47099060 - 47098572
Alignment:
Q  12 agcaaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaactaaaaacagacctaga-cttagtgtagagcaacaccacaagcataaacaa 110  Q
    ||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| | || ||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  47099060 agcaaaggaagtggtaatcaatagataaagtgtctccaagtaacaacaac--aaaacagacctaaatctaagtgtagagcaacaccacaagtataatcaa 47098963  T
Q  111 agcac-aaagataagcaatgaaagaa-ggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctct 208  Q
    ||||  ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||    
T  47098962 agcaataaagataagcaatcaaagaaaggaacaaacacaccaa--gattgttgacccagttcggtccaatatgaccgaatctgggggagagagcagccct 47098865  T
Q  209 ccaatccactatgatgaaagtgttacaa-ga--------aaaatagtttgcaagcttacacaagaacaagacttaatttctacccatttgtgtttctc-- 297  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||        ||| ||| ||  ||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||     || |      
T  47098864 ccaatccactaagatgaaagtgttacaatgagttacaagaaattagcttataagcttacaaaagaacaagtcctaatttctacccattttcacatcaccc 47098765  T
Q  298 actctctcaataatgaaccctaaagggaagacacaaaaggaagctttt-gatccttccaatggtgaaatctcactacccaaaatgtttacaatgtttctc 396  Q
    || ||||||||   ||| ||||| |  || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |    
T  47098764 acactctcaat---gaaacctaa-gaaaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttccc 47098669  T
Q  397 aacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatccaagtttctctctcttcaagctctccttcaaaatctgca 493  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||    
T  47098668 aacccaagagaacctcgctacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatccaagtttctctctctaaaagctctcattcaaaatctgca 47098572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 15 - 493
Target Start/End: Original strand, 32889302 - 32889788
Alignment:
Q  15 aaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaactaaaaacagacctaga-cttagtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagc 113  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||| ||| | || ||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  32889302 aaagaaagtgataatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaataacaac--aaaacagatctaaatctaagtgtagagcaacaccacaagtataaccaaagc 32889399  T
Q  114 ac-aaagataagcaatgaaa-ga-aggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctcc 210  Q
    |  ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||    
T  32889400 aataaagataagcaatgaaaagagaggaacaaacacaccaa--gattgttgatctagttcggtccaatatgacctagtctgggggatagagcagctctcc 32889497  T
Q  211 aatccactatgatgaaagt----------gttacaagaaaaatagtttgcaagcttacacaagaacaagacttaatttctacccattt---gtgtttctc 297  Q
    ||||||||| |||||||||          |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    | |  | |    
T  32889498 aatccactaagatgaaagtgttacaatgagttacaagaaaaatagcttgcaagcttacacaagaacaagtcctaatttctacccatttttcatatcaccc 32889597  T
Q  298 actctctcaataatgaaccctaaagggaagacacaaaaggaagcttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaaatgtttacaatgtttctca 397  Q
    || |||||   |||||| ||| ||| ||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||    
T  32889598 acactctc---aatgaatcct-aagagaaaacacaaaa-gaagcttttgaaccttccaatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttccca 32889692  T
Q  398 acccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatccaagtttctctctcttcaagctctccttcaaaatctgca 493  Q
    |||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  || |||| ||||||||| ||||    
T  32889693 acccaaaaaaacctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgcaatccaagtttctctctctaaaatctctacttcaaaatatgca 32889788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 15 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 19380309 - 19379917
Alignment:
Q  15 aaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaactaaaaa----cagacctagacttagtgtagagcaacaccacaagcataaacaa 110  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||    ||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  19380309 aaaggaagtggtaatctatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaaaaaaaaaaaaacagccctagtct-agtgtagagcaacaccacaagcaaatacaa 19380211  T
Q  111 agca-caaagataagcaatgaaagaaggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctc 209  Q
    |||| | |||||||||||  |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  19380210 agcaaccaagataagcaagaaaaggaagaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcagtc-aatatgacctaatatgggggagagagcagctctc 19380112  T
Q  210 caatccactatgatgaaagtgttacaa----------gaaaaatagtttgcaagcttacacaagaacaagacttaatttctacccatttgtgtttctc-a 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||          ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| | |    
T  19380111 caatccactatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaaaatagtttgcaagcttacacaagaacaagacctagattctacccatttgtgtttcccca 19380012  T
Q  299 ctctctcaataatgaaccctaaagg-gaagacacaaaaggaagcttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaaatgtttacaatgttt 393  Q
    ||||||||||| ||||||||||| | |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  19380011 ctctctcaata-tgaaccctaaaagagaagacacaagaggaagctttagatccttccaatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgttt 19379917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 12 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 16124754 - 16124340
Alignment:
Q  12 agcaaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaactaaaaacagacctaga-cttagtgtagagcaacaccacaagcataaacaa 110  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| || | |||||||||||||||||| ||||| |||    
T  16124754 agcaaaggaagtggtaatcaatgaataaaatgtgtccaagcaacaacaac-aaaaacagacctagatctaaatgtagagcaacaccacaaacataatcaa 16124656  T
Q  111 agcac-aaagataagcaatgaaagaa--ggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctc 207  Q
    ||||  |||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  16124655 agcaataaagataagctatgaaagaaaaggaacaaacacaccaa--gattgttgactcagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccc 16124558  T
Q  208 tccaatccactatgatgaaagtgttacaaga----------aaaatagtttgcaagcttacacaagaacaagacttaatttctaccca-tttgtgtttct 296  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |          ||| ||| ||  ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |     
T  16124557 tccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttataagcttacataagaacaagacctaatttctacccattttgtgttacc 16124458  T
Q  297 cactctctcaataatgaaccctaaagggaagacacaaaaggaagc-ttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaaatgtttacaatgtttct 395  Q
    ||| || ||||||||||| ||| ||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||     
T  16124457 cacactttcaataatgaatcct-aagagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttcc 16124359  T
Q  396 caacccaagagatcctcac 414  Q
    |||||||||||||||||||    
T  16124358 caacccaagagatcctcac 16124340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 19 - 469
Target Start/End: Original strand, 9476130 - 9476588
Alignment:
Q  19 gaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaactaaaaacagacctagactta-gtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagcacaa 117  Q
    ||||| ||||| ||||  ||||||||||||||||||||| |||  ||||||||| || |  || |||||||  |||| ||||||||||| ||||||| ||    
T  9476130 gaagtagtaattaatggataaagtgtctccaagcaacaataac--aaaacagacataaatataagtgtagaa-aacatcacaagcataatcaaagcaaaa 9476226  T
Q  118 a-gataagcaatgaaagaa-ggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatcc 215  Q
    | ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  9476227 aagataaacaatgaaagaaaggaacaaacacaccaa--gattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctaggggagagagcagctctccaatcc 9476324  T
Q  216 actatgatgaaagtgttacaaga----------aaaatagtttgcaagcttacacaagaacaagacttaatttctacccattt-gtgtttctcactctct 304  Q
    |||||||||||||| |||||| |          ||| ||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||  |||||||||     
T  9476325 actatgatgaaagtattacaaaagagttataagaaattagcttacaagcttacacaagaacaagacctaatttctatccattttgtgtcactcactctca 9476424  T
Q  305 caataatgaaccctaaagggaagacacaaaaggaagctttt-gatccttccaatggtgaaatctcactacccaaaatgtttacaatgtttctcaacccaa 403  Q
    ||||  |||| | ||| | ||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||    
T  9476425 caatg-tgaatcttaa-gagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttcaaatggtgaaatctcactacccaagatgtttacaatgtttcccaaccaaa 9476522  T
Q  404 gagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatccaagtttctctctct 469  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9476523 gagaacctcactacaaagacattcaacccaaaagttacctcctttgtaatccaagtttctctctct 9476588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 174; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 247 - 588
Target Start/End: Complemental strand, 19366300 - 19365948
Alignment:
Q  247 ttgcaagcttacacaagaacaagacttaatttctacccatttgtgtttctc-actctctcaataatgaaccctaaagg-gaagacacaaaaggaagcttt 344  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||| | |||||||||| ||||||||||    
T  19366300 ttgcaagcttacacaagaacaagacctagattctacccatttgtgtttccccactctctcaata-tgaaccctaaaagagaagacacaagaggaagcttt 19366202  T
Q  345 tgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaaatgtttacaatgtttctc--aacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacc 442  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  19366201 agatccttccaatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatatttttcccaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctagagttccc 19366102  T
Q  443 tcctttgtaatccaagtttctctctc--------ttcaagctctccttcaaaatctgcacaagaacacttaaataacagtcttcagctgataaaatcgtg 534  Q
    ||||||||||||||||||||||||||        | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||||||    
T  19366101 tcctttgtaatccaagtttctctctctaagctcttccaagctctcctccaaaatctgcacaagaacacttaaatactagtcttccactgataaaatcgtg 19366002  T
Q  535 ccacgttttccaaatcatgccacgattgatgcgtacgacccaaggtacgacctg 588  Q
     |||| ||||||| || || |||||||| | |||||| | ||| ||||||||||    
T  19366001 tcacgatttccaagtcgtgtcacgattggtacgtacgtcacaatgtacgacctg 19365948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 133; E-Value: 7e-69
Query Start/End: Original strand, 12 - 236
Target Start/End: Original strand, 775532 - 775756
Alignment:
Q  12 agcaaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaactaaaaacagacctaga-cttagtgtagagcaacaccacaagcataaacaa 110  Q
    ||||||||||||||||| ||||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  775532 agcaaaggaagtggtaaccaatagataaagtgtctccaagcaacaacaac-aaaaacagacctaaatctaagtgtagagcaacaccacaagcataatcaa 775630  T
Q  111 agcac-aaagataagcaatgaaagaa-ggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctct 208  Q
    ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  775631 agcaataaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacatcaa--gattgttgacccaattcggtccaatatgacctaatctgggggagagagtagctct 775728  T
Q  209 ccaatccactatgatgaaagtgttacaa 236  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  775729 ccaatccactaagatgaaagtgttacaa 775756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 15 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 27104602 - 27104385
Alignment:
Q  15 aaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaactaaaaacagacctaga-cttagtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagc 113  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||     |||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27104602 aaaggaagtggtaatcaatagataaagtgtctccaagcaacaacaa-----aacagacctaaatctaagtgtagagcaacaccacaagcataatcaaagc 27104508  T
Q  114 ac-aaagataagcaatgaaagaa-ggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctcca 211  Q
    |  ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27104507 aataaagataagcaatgaaataaaggaacaaacacaccaa--gattgttgacacagttcggtccaatataacctaatctgggggagagagcagctctcca 27104410  T
Q  212 atccactatgatgaaagtgttacaa 236  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  27104409 atccactatgatgaaagtgttacaa 27104385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 123; E-Value: 7e-63
Query Start/End: Original strand, 328 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 47102752 - 47102586
Alignment:
Q  328 acacaaaaggaagctttt-gatccttccaatggtgaaatctcactacccaaaatgtttacaatgtttctcaacccaagagatcctcactacaaagacact 426  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  47102752 acacaaaagaaagctttttgatccttccaatgatgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaacctcactacaaagacact 47102653  T
Q  427 caaccctaaagttacctcctttgtaatccaagtttctctctcttcaagctctccttcaaaatctgca 493  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||    
T  47102652 caaccctaaagttacctcctttgtaatccaagtttctctctctaaaagctctcattcaaaatctgca 47102586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 12 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 47103077 - 47102854
Alignment:
Q  12 agcaaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaactaaaaacagacctaga-cttagtgtagagcaacaccacaagcataaacaa 110  Q
    |||||| |||||||||||||||   ||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||| | || ||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  47103077 agcaaatgaagtggtaatcaatagataaagtgtctcaaagcaacaacaac--aaaacagacctaaatctaagtgtagagcaacaccacaagtataatcaa 47102980  T
Q  111 agcac-aaagataagcaatgaaagaa-ggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctct 208  Q
    ||||  ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |  |    
T  47102979 agcaataaagataagcaatcaaagaaaggaacaaacacaccaaaa--ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctaggggagagagcagccat 47102882  T
Q  209 ccaatccactatgatgaaagtgttacaa 236  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  47102881 ccaatccactaagatgaaaatgttacaa 47102854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 251 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 40816802 - 40816585
Alignment:
Q  251 aagcttacacaagaacaagacttaatttctacccatttgtgtttctcactctctcaataatgaaccctaaagggaagacacaaaaggaagctttt-gatc 349  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||  | ||| ||||||||   ||| ||||| | ||| |||||||||||||||||| ||||    
T  40816802 aagcttacaaaagaacaagacctaatttctactcatttgtgtcacccacactctcaat---gaatcctaa-gagaaaacacaaaaggaagctttttgatc 40816707  T
Q  350 cttccaatggtgaaatctcactacccaaaatgtttacaatgtttctcaacc--caagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctt 447  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  40816706 cttccaatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttcccaaccctcaagagaacctcactacaaagacactcaaccctcaagttacctcctt 40816607  T
Q  448 tgtaat-ccaagtttctctctc 468  Q
    |||| | |||||||||||||||    
T  40816606 tgtattcccaagtttctctctc 40816585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 380 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 10925186 - 10924980
Alignment:
Q  380 tgtttacaatgtttctcaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttg-taatccaagtttctctctcttcaagctct 478  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |   | | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||    
T  10925186 tgtttacaatgtttcccaacccaagagaactataat-caaagaccctcaaccctaaagttacctcctttgattttccaagtttctctctcttcaagctct 10925088  T
Q  479 ccttcaaaatctgcacaagaacacttaaataacagtcttcagctgataaaatcgtgccacgtttt-ccaaatcatgccacgattgatgcgtacgacccaa 577  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||| || |||| |||||||||| |||||||    
T  10925087 ccttcaaaatctgca-aagaacacttatataacagtcttcagctgtcaaaatcgtgtcacgttttgccaaatcgtgacacggttgatgcgtatgacccaa 10924989  T
Q  578 ggtacgacc 586  Q
    |||| ||||    
T  10924988 ggtatgacc 10924980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 328 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 27104314 - 27104132
Alignment:
Q  328 acacaaaaggaagctttt-gatccttccaatggtgaaatctcactacccaaaatgtttacaatgtttctcaacccaagagatcctcactacaaagacact 426  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||  || ||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27104314 acacaaaaggaagctttttgattcttccaatggtgaaatctcactacccaaggtgcttataatgtttcccaacccaagaga-cctcactacaaagacact 27104216  T
Q  427 caaccctaaagttacctcctttgtaatccaagtttctctctcttcaagctctc-cttcaaaatctgcacaagaacacttaaata 509  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||  |||||||||| |  ||||||||||||    
T  27104215 caaccttaaagttacctcctttgtaatccaagtttctctctctaaaagctctctctcaaaaatctgcaaagaaacacttaaata 27104132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 328 - 508
Target Start/End: Original strand, 22819615 - 22819795
Alignment:
Q  328 acacaaaaggaagctttt-gatccttccaatggtgaaatctcactacccaaaatgtttacaatgtttctcaacccaagagatcctcactacaaagacact 426  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22819615 acacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatgtaactacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaacctcactacaaagacact 22819714  T
Q  427 caaccctaaagttacctcctttgt-aatccaagtttctctctcttcaagctctccttcaaaatctgcacaagaacacttaaat 508  Q
     || |||||||||||||||||||| || |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| || |||  |||||||||||    
T  22819715 aaatcctaaagttacctcctttgtaaacccaagtt--tctctcttcaaactctccttcaaaatttgaacagaaacacttaaat 22819795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 334 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 9022813 - 9022638
Alignment:
Q  334 aaggaagcttttg-atccttccaatggtgaaatctcactacccaaaatgtttacaatgtttctcaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccc 432  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||  ||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||    
T  9022813 aaggaagcttttttatccttccaatggtgaaatctcactacgaaaggtgtttacaatgtttctcaacccaagagaacctcactacaaagacattcaa-cc 9022715  T
Q  433 taaagttacctcctttgt-aatccaagtttctctctcttcaagctctccttcaaaatctgcacaagaacacttaaat 508  Q
     |||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||||    
T  9022714 aaaagatacctcctttgtaaacccaagtttctctctcttcaagctctccttcaaaatctgaactgaaacacttaaat 9022638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 417 - 586
Target Start/End: Original strand, 28220467 - 28220637
Alignment:
Q  417 caaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatcc-aagtttctctctcttcaagctctccttcaaaatctgcacaagaacacttaaataacagtc 515  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||    
T  28220467 caaagaccctcaaccctaaagttacctcctttgatttcccaagtttctctctcttcaagctcaccttcaaaatctgca-aagaacacttatatagcagtc 28220565  T
Q  516 ttcagctgataaaatcgtgccacgtttt-ccaaatcatgccacgattgatgcgtacgacccaaggtacgacc 586  Q
    ||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||| || |||| ||  |||||||||||||||||||||||    
T  28220566 ttcagctgtcaaaatcgtgtcacgttttcccaaatcgtgacacgttttgtgcgtacgacccaaggtacgacc 28220637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 417 - 586
Target Start/End: Original strand, 28223662 - 28223832
Alignment:
Q  417 caaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatcc-aagtttctctctcttcaagctctccttcaaaatctgcacaagaacacttaaataacagtc 515  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||    
T  28223662 caaagaccctcaaccctaaagttacctcctttgatttcccaagtttctctctcttcaagctcaccttcaaaatctgca-aagaacacttatatagcagtc 28223760  T
Q  516 ttcagctgataaaatcgtgccacgtttt-ccaaatcatgccacgattgatgcgtacgacccaaggtacgacc 586  Q
    ||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||  || |||| ||  |||||||||||||||||||||||    
T  28223761 ttcagctgtcaaaatcgtgtcacgttttcccaaattgtgacacgttttgtgcgtacgacccaaggtacgacc 28223832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 417 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 49918276 - 49918106
Alignment:
Q  417 caaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatcc-aagtttctctctcttcaagctctccttcaaaatctgcacaagaacacttaaataacagtc 515  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||    
T  49918276 caaagaccttcaaccctaaagttacctcctttgatttcccaagtttctctctcttcaagctctacttcaaaatctgca-aagaacacttatatagcagtc 49918178  T
Q  516 ttcagctgataaaatcgtgccacgtttt-ccaaatcatgccacgattgatgcgtacgacccaaggtacgacc 586  Q
    ||||||||  ||||||||| ||| |||| ||||||| || |||||||| || ||||||||||||||| ||||    
T  49918177 ttcagctgtcaaaatcgtgtcacattttcccaaatcgtgacacgattggtgtgtacgacccaaggtatgacc 49918106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 380 - 581
Target Start/End: Complemental strand, 3206950 - 3206749
Alignment:
Q  380 tgtttacaatgtttctcaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatcc-aagtttctctctcttcaagctct 478  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| | | | | ||||||| |||||||||||||||||||||||||   ||| ||||||||||||||||| |||||    
T  3206950 tgtttacaatgtttcccaacccaagagaactttaat-caaagaccctcaaccctaaagttacctcctttgatttcccaagtttctctctcttcatgctct 3206852  T
Q  479 ccttcaaaatctgcacaagaacacttaaataacagtcttcagctgataaaatcgtgccacgtttt--ccaaatcatgccacgattgatgcgtacgaccca 576  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| ||| || |||||||| |   |||||||| ||||||||  ||||||  || ||||||||||||||||||||||    
T  3206851 ccttcaaaatcttca-aagaacacttatatagcaatcttcagc-gtcgaaatcgtgtcacgtttttcccaaattgtgtcacgattgatgcgtacgaccca 3206754  T
Q  577 aggta 581  Q
    |||||    
T  3206753 aggta 3206749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 380 - 582
Target Start/End: Complemental strand, 31659201 - 31658999
Alignment:
Q  380 tgtttacaatgtttctcaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatcc-aagtttctctctcttcaagctct 478  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||| |   | | ||||||| |||||||||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||    
T  31659201 tgtttacaatgtttccgaacccaagagaactctaat-caaagaccctcaaccctaaagttacctcctttgatttcccaagtttctctctcttcaagctct 31659103  T
Q  479 ccttcaaaatctgcacaagaacacttaaataacagtcttcagctgataaaatcgtgccacgtttt-ccaaatcatgccacgattgatgcgtacgacccaa 577  Q
    |  |||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| |||  ||||||||| ||| |||| ||||||| || |||| ||| ||||||||||||||    
T  31659102 ctctcaaaatctgca-aagaacacttatatagcagtcttcaactgtcaaaatcgtgtcacattttaccaaatcgtgacacgtttggtgcgtacgacccaa 31659004  T
Q  578 ggtac 582  Q
    |||||    
T  31659003 ggtac 31658999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 380 - 582
Target Start/End: Complemental strand, 44455123 - 44454920
Alignment:
Q  380 tgtttacaatgtttctcaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaat-ccaagtttctctctcttcaagctct 478  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| | |   | | ||||||| |||||||||||||||||||||||||   | |||||||||||||||| ||| ||||    
T  44455123 tgtttacaatgtttcccaacccaagaaaactctaat-caaagaccctcaaccctaaagttacctcctttgatttaccaagtttctctctctacaacctct 44455025  T
Q  479 ccttcaaaatctgcacaagaacacttaaataacagtcttcagctgataaaatcgtgccacgtttt-ccaaatcatgccacgattgatgcgtacgacccaa 577  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |  || || |||  |||||||||||||||||| ||||||| || |||| ||  ||||||||||||||    
T  44455024 ccttcaaaatctgcacaagaacacttaaatagtaccctgcaactgtcaaaatcgtgccacgttttgccaaatcgtgacacgtttagtgcgtacgacccaa 44454925  T
Q  578 ggtac 582  Q
    |||||    
T  44454924 ggtac 44454920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 454 - 580
Target Start/End: Original strand, 30476727 - 30476853
Alignment:
Q  454 ccaagtttctctctcttcaagctctccttcaaaatctgcacaagaacacttaaataacagtcttcagctgataaaatcgtgccacgtttt-ccaaatcat 552  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||| |    
T  30476727 ccaagtttctctctcttcaagctctccttcaaaatctgca-aagaacacttatatagcagtcttcagctgtcaaaatcgtgtcacgttttcccaaatcgt 30476825  T
Q  553 gccacgattgatgcgtacgacccaaggt 580  Q
    | |||| ||| || ||||||||||||||    
T  30476826 gacacgtttggtgtgtacgacccaaggt 30476853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 12 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 40816970 - 40816845
Alignment:
Q  12 agcaaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaactaaaaacagacctaga-cttagtgtagagcaacaccacaagcataaacaa 110  Q
    ||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | || |||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  40816970 agcaaaggaagtggtaatcaatagataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaaacagacctaaatctaagtgtagagcaacaccacgagcataatcaa 40816871  T
Q  111 agc-acaaagataagcaatgaaagaa 135  Q
    ||| | ||||||||| ||||||||||    
T  40816870 agcaataaagataagtaatgaaagaa 40816845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 380 - 523
Target Start/End: Complemental strand, 3156829 - 3156687
Alignment:
Q  380 tgtttacaatgtttctcaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatcc-aagtttctctctcttcaagctct 478  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||| |   | | ||||||| |||||||||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||| ||||||    
T  3156829 tgtttacaatgtttccaaacccaagagaactctaat-caaagaccctcaaccctaaagttacctcctttgatttcccaagtttctctctcttccagctct 3156731  T
Q  479 ccttcaaaatctgcacaagaacacttaaataacagtcttcagctg 523  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3156730 ccttcaaaatctgca-aagaacacttatataacagtcttcagctg 3156687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 417 - 544
Target Start/End: Original strand, 37503795 - 37503922
Alignment:
Q  417 caaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatcc-aagtttctctctcttcaagctctccttcaaaatctgcacaagaacacttaaataacagtc 515  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||   ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||    
T  37503795 caaagaccctcaaccctaaagtcacctcctttgatttcccaagtttctctctcttcaacctctccttcaaaatctgca-aagaacacttatatatcagtc 37503893  T
Q  516 ttcagctgataaaatcgtgccacgttttc 544  Q
    ||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  37503894 ttcagctgtaaaaatcgtgtcacgttttc 37503922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 52 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 24787563 - 24787129
Alignment:
Q  52 caacaacaactaaaaacagacctagacttagtgtagagcaacaccacaagcata---aacaaagcaca-aagataagcaatgaaagaaggaacaaacaca 147  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||   | |   ||||||||| | |||||||||||  |||| | ||||||| |||    
T  24787563 caacaacaacaaaaaacagccctagactta-tgtagagcaaaaccacacaaagagataacaaagcaaacaagataagcaagaaaaggaagaacaaa-aca 24787466  T
Q  148 ccaa-aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactatga-----tg----aaagtgttacaag 237  Q
    |||| ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||     ||    |||| ||||||||    
T  24787465 ccaagaagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggggagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaagggttacaag 24787367  T
Q  238 aaa-aatagtttgcaagc-ttacacaagaacaagacttaatttctacccatttgtgtttctc-actctctcaataatgaaccct-aaagggaagacacaa 333  Q
    ||| |||||  | ||||| ||||||||||||||  | ||  |||||||| || ||||||| | |||||| |||| ||||||||| |||| |||||||| |    
T  24787366 aaacaatagccttcaagcattacacaagaacaaatcctagattctaccctttggtgtttcccaactctcacaat-atgaaccctaaaagagaagacacta 24787268  T
Q  334 aaggaagcttttgatccttccaa-tggtgaaat-ctcactacccaaaatgtttacaatg--tttctcaacccaagagatcctcactacaaagacactcaa 429  Q
     |||||||||| ||||||||||| |  |||| | |||||| |||||  || ||| ||||  |||| ||||||||||||  ||| | ||||||||||||||    
T  24787267 gaggaagctttagatccttccaactaatgaactcctcactgcccaaggtgattataatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaa 24787168  T
Q  430 ccctaaagttacctcctttgtaatccaagtttctctctct 469  Q
    ||||   ||| |||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  24787167 ccctttggttccctcctttgttatccaag-ttctctctct 24787129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 380 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 1833485 - 1833279
Alignment:
Q  380 tgtttacaatgtttctcaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatcc-aagtttctctctcttcaagctct 478  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||| |   | | ||||||| ||||||| |||||||| ||||||||   ||| |||||||||||||||||| ||||    
T  1833485 tgtttacaatgtttcccaatccaagagaactctaat-caaagaccctcaaccttaaagttatctcctttgatttcccaagtttctctctcttcaatctct 1833387  T
Q  479 ccttcaaaatctgcacaagaacacttaaataacagtcttcagctgataaaatcgtgccacgttttc-caaatcatgccacgattgatgcgtacgacccaa 577  Q
    | ||||||||||||| ||||| ||||| |||  ||||||||||||  ||||||||| ||||||||| |||||| || |||| ||| ||||||| ||||||    
T  1833386 cattcaaaatctgca-aagaatacttatataggagtcttcagctgtcaaaatcgtgtcacgttttcgcaaatcgtgacacgtttggtgcgtacaacccaa 1833288  T
Q  578 ggtacgacc 586  Q
    |||| ||||    
T  1833287 ggtatgacc 1833279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 75 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 17345693 - 17345532
Alignment:
Q  75 agacttagtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagc-acaaagataagcaatgaaagaag-gaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcgg 172  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||  ||||||| |||  |||||||| || |||||||||||    
T  17345693 agacttagtgtagaacaacaccataagcataatcaaagccataaagataagcaatgaaagaaatgaacaaaaacat-aaaagattattaacccagttcgg 17345595  T
Q  173 tccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactatgatgaaagtgttacaa 236  Q
    || ||||||||||| ||| ||||| |||| | ||||||||||||||| |||||| ||| |||||    
T  17345594 tctaatatgacctactct-ggggaaagaggagctctccaatccactaagatgaacgtggtacaa 17345532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 380 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 3189294 - 3189154
Alignment:
Q  380 tgtttacaatgtttctcaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatcc-aagtttctctctcttcaagctct 478  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| | | | | ||||||| |||||||||||||||||||||||||   ||| ||||||||||||||||| |||||    
T  3189294 tgtttacaatgtttcccaacccaagagaactttaat-caaagaccctcaaccctaaagttacctcctttgatttcccaagtttctctctcttcatgctct 3189196  T
Q  479 ccttcaaaatctgcacaagaacacttaaataacagtcttcagc 521  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| ||| || ||||||||    
T  3189195 ccttcaaaatcttca-aagaacacttatatagcaatcttcagc 3189154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 380 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 3198111 - 3197971
Alignment:
Q  380 tgtttacaatgtttctcaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatcc-aagtttctctctcttcaagctct 478  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| | | | | ||||||| |||||||||||||||||||||||||   ||| ||||||||||||||||| |||||    
T  3198111 tgtttacaatgtttcccaacccaagagaactttaat-caaagaccctcaaccctaaagttacctcctttgatttcccaagtttctctctcttcatgctct 3198013  T
Q  479 ccttcaaaatctgcacaagaacacttaaataacagtcttcagc 521  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| ||| || ||||||||    
T  3198012 ccttcaaaatcttca-aagaacacttatatagcaatcttcagc 3197971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 380 - 586
Target Start/End: Original strand, 13316523 - 13316729
Alignment:
Q  380 tgtttacaatgtttctcaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatcc-aagtttctctctcttcaagctct 478  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |   | | ||||||| || |||||||||||| |  ||||||   ||| ||||||||||||||||||||||     
T  13316523 tgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaat-caaagaccctaaaccctaaagttgctacctttgatttcccaagtttctctctcttcaagctca 13316621  T
Q  479 ccttcaaaatctgcacaagaacacttaaataacagtcttcagctgataaaatcgtgccacgtttt--ccaaatcatgccacgattgatgcgtacgaccca 576  Q
     |||||||||||||| ||||||||||| ||| | |||||| || |  ||||||||| ||||||||  || | || ||||||||||||||||||||| |||    
T  13316622 tcttcaaaatctgca-aagaacacttatatagctgtcttctgc-gtcaaaatcgtgtcacgtttttccccactcgtgccacgattgatgcgtacgatcca 13316719  T
Q  577 aggtacgacc 586  Q
    ||||||||||    
T  13316720 aggtacgacc 13316729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 380 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 20762635 - 20762429
Alignment:
Q  380 tgtttacaatgtttctcaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatcc-aagtttctctctcttcaagctct 478  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |   | | ||||||| || |||||||||||| | |||||||   ||| |||||||||||||||||||||||    
T  20762635 tgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaat-caaagaccctaaaccctaaagttgcttcctttgatttcccaagtttctctctcttcaagctct 20762537  T
Q  479 ccttcaaaatctgcacaagaacacttaaataacagtcttcagctgataaaatcgtgccacgtttt--ccaaatcatgccacgattgatgcgtacgaccca 576  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||| ||| | |||||| || |   |||||||| ||||||||  || |||| ||||||||||||||||| ||| | |    
T  20762536 ctttcaaaatctgca-aagaacacttatatagctgtcttctgc-gtcgaaatcgtgtcacgtttttccccaatcgtgccacgattgatgcgttcgatcaa 20762439  T
Q  577 aggtacgacc 586  Q
    ||||||||||    
T  20762438 aggtacgacc 20762429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 380 - 573
Target Start/End: Original strand, 4552842 - 4553046
Alignment:
Q  380 tgtttacaatgtttctcaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaat---ccaagtttctctctcttcaagct 476  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  |||||| |||||||||||||||||||||||  ||||   |||||||   ||||||| |||||    
T  4552842 tgtttacaatgtttctcaacccaagagaacctcaat-taaagaccctcaaccctaaagttacctcctt--taatttcccaagttctcctctcttgaagct 4552938  T
Q  477 ct----------ccttcaaaatctgcacaagaacacttaaataacagtcttcagctgataaaatcgtgccacgtttt-ccaaatcatgccacgattgatg 565  Q
    ||          ||||||||||||||| |  |||||||| |||||||||||||||||  |||| |||| |||||||| ||||||| || |||| ||||||    
T  4552939 ctcttgaaccacccttcaaaatctgcaaagaaacacttatataacagtcttcagctgtcaaaaacgtgtcacgttttgccaaatcgtgacacggttgatg 4553038  T
Q  566 cgtacgac 573  Q
    ||||||||    
T  4553039 cgtacgac 4553046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 152 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 25445173 - 25445091
Alignment:
Q  152 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactatgatgaaagtgttacaa 236  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  25445173 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaa 25445091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 380 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 46064881 - 46064675
Alignment:
Q  380 tgtttacaatgtttctcaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatcc-aagtttctctctcttcaagctct 478  Q
    ||||||||||||||  || ||||||||| ||  | | ||||||| ||||||  ||||||||||| |||||   ||| |||||| |||||||| |||||||    
T  46064881 tgtttacaatgttttccaccccaagagaaccataat-caaagaccctcaacaataaagttaccttctttgatttcccaagtttttctctcttgaagctct 46064783  T
Q  479 ccttcaaaatctgcacaagaacacttaaataacagtcttcagctgataaaatcgtgccacg-ttttccaaatcatgccacgattgatgcgtacgacccaa 577  Q
    |||| ||||| || |   |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| || | ||  ||||||| || |||| ||||| ||||||||||||    
T  46064782 ccttaaaaat-tgaattggaacacttaaataacagtcttcagctgtcaaaatcgtgacatgattggccaaatcgtgtcacggttgatacgtacgacccaa 46064684  T
Q  578 ggtacgacc 586  Q
    |||||||||    
T  46064683 ggtacgacc 46064675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 138 - 220
Target Start/End: Original strand, 28265537 - 28265619
Alignment:
Q  138 aacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga-gcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  28265537 aacaaacacaccaaa-gattgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactat 28265619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 135 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 3157053 - 3156968
Alignment:
Q  135 aggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga-gcatctctccaatccactat 220  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  3157053 aggaacaaacacaccaaa-gattgttgacccagttcggtccaacttgacctaatatgggggagagattgatctctccaatccactat 3156968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 139 - 220
Target Start/End: Original strand, 28220210 - 28220291
Alignment:
Q  139 acaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga-gcatctctccaatccactat 220  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  28220210 acaaacacaccaaa-gattgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactat 28220291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 156 - 220
Target Start/End: Original strand, 9459419 - 9459483
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  9459419 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactat 9459483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 156 - 220
Target Start/End: Original strand, 9463246 - 9463310
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  9463246 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactat 9463310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 156 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 16226446 - 16226382
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  16226446 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactat 16226382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 387 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 17345414 - 17345350
Alignment:
Q  387 aatgtttctcaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgta 451  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  17345414 aatgtttctcaactcaagagaacctcactacaaagacactcaaccctaaatgtacctcctttgta 17345350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 152 - 236
Target Start/End: Original strand, 41390582 - 41390664
Alignment:
Q  152 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactatgatgaaagtgttacaa 236  Q
    |||||||||||||||| || | |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  41390582 aagattgttgacccagatcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaa 41390664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 152 - 236
Target Start/End: Original strand, 41398237 - 41398319
Alignment:
Q  152 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactatgatgaaagtgttacaa 236  Q
    |||||||||||||||| || | |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  41398237 aagattgttgacccaggtcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaa 41398319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 15 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 50521337 - 50521165
Alignment:
Q  15 aaaggaagtggtaatcaatgtgtaaa-gt-gtctccaagcaacaacaactaaaaacagaccta-gacttagtgtagagcaacaccacaagcataaacaaa 111  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||||||||  |||| ||||||| | | ||||||||| ||||||||||| ||||| ||||    
T  50521337 aaaggaagtggtaatcaatgagtaaaagtagtctcaaa-caacaacaac--aaaatagacctaagtcctagtgtagaacaacaccacaaacataatcaaa 50521241  T
Q  112 gcac-aaagataagcaatgaaagaa-ggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacct 185  Q
    |||  ||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||   ||| | |||||||||||| |||||||||||    
T  50521240 gcaataaagagaaacaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaagatttggtaacccagttcggttcaatatgacct 50521165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 138 - 220
Target Start/End: Original strand, 834150 - 834232
Alignment:
Q  138 aacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga-gcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  834150 aacaaacacaccaaa-gattgttgacccagttcggtccaacttgacctactctgggggagagatagatctctccaatccactat 834232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 138 - 220
Target Start/End: Original strand, 3847104 - 3847186
Alignment:
Q  138 aacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga-gcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||    
T  3847104 aacaaacacaccaaa-gattgttgaccaagttcggtccaacttgacctaatctggggaagagatggatctctccaatccactat 3847186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 139 - 220
Target Start/End: Original strand, 28223405 - 28223486
Alignment:
Q  139 acaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga-gcatctctccaatccactat 220  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  28223405 acaaacacaccaaa-gattgttgacccagttcggtccaacttgacctaatatgggggagagattgatctctccaatccactat 28223486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 135 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 31659426 - 31659341
Alignment:
Q  135 aggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga-gcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||    
T  31659426 aggaataaacacaccaaa-gattgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgagggagagattgatctctccaatccactat 31659341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 135 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 44455348 - 44455263
Alignment:
Q  135 aggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga-gcatctctccaatccactat 220  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  44455348 aggaacaaacacaccaaa-gatcgttgacccagttcggtcaaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactat 44455263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 135 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 49918538 - 49918453
Alignment:
Q  135 aggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga-gcatctctccaatccactat 220  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  49918538 aggaacaaacacaccaaa-gattgttgacctagttcggtccaacttgacctaatttgggggagagattgatctctccaatccactat 49918453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 152 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 1055095 - 1055027
Alignment:
Q  152 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactatg 221  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  1055095 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcaactctccaatccaatatg 1055027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 152 - 221
Target Start/End: Original strand, 39445501 - 39445569
Alignment:
Q  152 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactatg 221  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  39445501 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg 39445569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 152 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 44023957 - 44023889
Alignment:
Q  152 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactatg 221  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  44023957 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg 44023889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 156 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 23786118 - 23786054
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| | |||| |||||||||    
T  23786118 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactat 23786054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 156 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 51752642 - 51752578
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  51752642 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactat 51752578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 380 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 51765358 - 51765200
Alignment:
Q  380 tgtttacaatgtttctcaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatcc-aagtttctctctcttcaagctct 478  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||  |||    ||||||| || ||||||| ||||||  ||||||   ||| ||||||||| |||||| | |||     
T  51765358 tgtttacaatgtttc-caacccaagagaagctctaatcaaagaccctaaaccctagagttactccctttgatttcccaagtttctcactcttccaactc- 51765261  T
Q  479 ccttcaaaatctgcacaagaacacttaaataacagtcttcagctgataaaatcgtgccacg 539  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||  |||||||||||||| ||||    
T  51765260 ccttcaaaatctgcacaagaacacttaaatactagccttccactgataaaatcgtgtcacg 51765200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 138 - 220
Target Start/End: Original strand, 45644337 - 45644419
Alignment:
Q  138 aacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga-gcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||    
T  45644337 aacaagcacaccaaa-gattgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagatattgatctctccaatccactat 45644419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 138 - 220
Target Start/End: Original strand, 50167158 - 50167240
Alignment:
Q  138 aacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga-gcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  50167158 aacaaacacaccaaa-gattgttgacctagttcggtccaacttgagctaatctgggggagagattgatctctccaatccactat 50167240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 138 - 200
Target Start/End: Original strand, 13137959 - 13138020
Alignment:
Q  138 aacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga 200  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  13137959 aacaaacacatcaaa-gattgttgacccagttcggtccaatatgacctactctaggggagaga 13138020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 135 - 220
Target Start/End: Original strand, 37503537 - 37503622
Alignment:
Q  135 aggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga-gcatctctccaatccactat 220  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||  |||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  37503537 aggaacaaacacaccaaa-gattgttgacctagttcgatccaacttgacataatctgggggagagattgatctctccaatccactat 37503622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 417 - 505
Target Start/End: Original strand, 37560110 - 37560198
Alignment:
Q  417 caaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatc-caagtttctctctcttcaagctctccttcaaaatctgcacaagaacactta 505  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||| ||||   || |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||    
T  37560110 caaagaccctcaaccttaaagttacctcatttgatttctcaagtttctctctcttcaagctttacttcaaaatctgca-aagaacactta 37560198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 454 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 40282273 - 40282141
Alignment:
Q  454 ccaagtttctctctcttcaagctctc-cttcaaaatctgcacaagaacacttaaataacagtcttcagctgataaaatcgtgccacgttttccaaatcat 552  Q
    |||||||||||||||||| | ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||   | ||||  |||||||||||||| |||| |||||  ||| |    
T  40282273 ccaagtttctctctcttccaactctctcttcaaa-tctgcacaagaacacttaaatacatgccttccactgataaaatcgtgtcacgatttcctgatcgt 40282175  T
Q  553 gccacgattgatgcgtacgacccaaggtacgacc 586  Q
    | |||||||| ||| | || ||||||||| ||||    
T  40282174 gtcacgattggtgcatccgtcccaaggtatgacc 40282141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 138 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 46065103 - 46065019
Alignment:
Q  138 aacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga-gcatctctccaatccactatga 222  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||  ||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  46065103 aacaaacacaccaaa-gattgtttacccagttcgatccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatga 46065019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 156 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 6823293 - 6823229
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| | |||| |||||||||    
T  6823293 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactat 6823229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 156 - 220
Target Start/End: Original strand, 10399830 - 10399894
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| | |||| |||||||||    
T  10399830 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactat 10399894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 156 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 13358852 - 13358788
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| | |||| |||||||||    
T  13358852 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactat 13358788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 164 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 16231834 - 16231778
Alignment:
Q  164 ccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  16231834 ccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactat 16231778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 156 - 220
Target Start/End: Original strand, 27336942 - 27337006
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| | |||| |||||||||    
T  27336942 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactat 27337006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 156 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 28840958 - 28840894
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| | |||| |||||||||    
T  28840958 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactat 28840894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 156 - 220
Target Start/End: Original strand, 31735523 - 31735587
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| | |||| |||||||||    
T  31735523 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactat 31735587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 372 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 41360886 - 41360807
Alignment:
Q  372 acccaaaatgtttacaatgtttctcaaccc--aagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttg 449  Q
    |||||| |||||||| ||||||| ||||||  |||||| |||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||    
T  41360886 acccaagatgtttacgatgtttcccaaccctcaagagaacctcactacacatgcactcaaccctaaagttacctcctttg 41360807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 138 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 41361100 - 41361040
Alignment:
Q  138 aacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggaga 198  Q
    |||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  41361100 aacaaacacaccaagatattgttgacctagttcggtccaatatgacctactatgggggaga 41361040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 152 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 43988548 - 43988466
Alignment:
Q  152 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactatgatgaaagtgttacaa 236  Q
    ||||||||| ||||||||| | ||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  43988548 aagattgtttacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaa 43988466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 156 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 47179991 - 47179928
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||| | ||||||||||||||    
T  47179991 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtct-ggggagagagcagccctccaatccactat 47179928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 156 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 51750318 - 51750254
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| | |||| |||||||||    
T  51750318 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactat 51750254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 156 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 51757809 - 51757745
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||| ||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  51757809 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactat 51757745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 138 - 216
Target Start/End: Original strand, 4552620 - 4552698
Alignment:
Q  138 aacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga-gcatctctccaatcca 216  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||| ||||||||   ||||||||||||||    
T  4552620 aacaaacacaccaaa-gattgttgacccagttcggtccaacttgacctactctgagggagagattgatctctccaatcca 4552698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 156 - 203
Target Start/End: Original strand, 12302507 - 12302554
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagca 203  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  12302507 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctaatctgggggagagagca 12302554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 138 - 220
Target Start/End: Original strand, 13659319 - 13659401
Alignment:
Q  138 aacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga-gcatctctccaatccactat 220  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||  | ||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  13659319 aacaaatacaccaaa-gattgttgacccagttcggtccaacttaacctactctgggggagagattgatctctccaatccactat 13659401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 142 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 19754676 - 19754598
Alignment:
Q  142 aacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga-gcatctctccaatccactat 220  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||    
T  19754676 aacacaccaaaa-attgttgacccacttcggtccaacttgacctaatctgagggagagattgatctctccaatccactat 19754598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 135 - 220
Target Start/End: Original strand, 37559847 - 37559933
Alignment:
Q  135 aggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatct-gggggagaga-gcatctctccaatccactat 220  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||   ||||||||||| ||||||    
T  37559847 aggaacaaacacaccaaa-gattgttgaccaagttcggtccaacttgacctaatctagggggagagattgatctctccaattcactat 37559933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 138 - 220
Target Start/End: Original strand, 40122179 - 40122261
Alignment:
Q  138 aacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga-gcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||| |||||||||||   ||||||| ||||||||||    
T  40122179 aacaaacacaccaaa-gattgttgacctagttcggtccaacttgacctaatatgggggagagattgatctctctaatccactat 40122261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 138 - 220
Target Start/End: Original strand, 50169193 - 50169275
Alignment:
Q  138 aacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga-gcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||   |||||| |||||||||||    
T  50169193 aacaaacacaccaaa-gattgttgatccagttcggtccaacttgacctaatctaggggagagattgatctcttcaatccactat 50169275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 156 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 39462798 - 39462744
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctcc 210  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  39462798 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagctctcc 39462744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #99
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 141 - 220
Target Start/End: Original strand, 196893 - 196973
Alignment:
Q  141 aaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatct-gggggagaga-gcatctctccaatccactat 220  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  196893 aaacacaccaaa-gattgttgatccagttcggtccaacttgacctaatctggggggagagataaatctctccaatccactat 196973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #100
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 380 - 449
Target Start/End: Original strand, 834372 - 834440
Alignment:
Q  380 tgtttacaatgtttctcaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttg 449  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| | | | | ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  834372 tgtttacaatgtttcccaacccaagagaactttaat-caaagaccctcaaccctaaagttacctcctttg 834440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #101
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 156 - 225
Target Start/End: Original strand, 28207070 - 28207139
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactatgatga 225  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| | ||||  | |||||||||||    
T  28207070 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactatgatga 28207139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #102
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 454 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 9987098 - 9986967
Alignment:
Q  454 ccaagtttctctctcttcaagctctccttcaaaatctgcacaagaacacttaaataacagtcttcagctgataaaatcgtgccacgttttccaaatcatg 553  Q
    |||||| | ||||||||| | ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||  || | ||  |||||||||| ||| |||| |||||| ||| ||    
T  9987098 ccaagtctatctctcttccaactcaccttcaaa-tctgcacaagaacacttaaatactagccctccactgataaaattgtgtcacgatttccagatcgtg 9987000  T
Q  554 ccacgattgatgcgtacgacccaaggtacgacc 586  Q
     |||||||| ||| | || ||||||||| ||||    
T  9986999 tcacgattggtgcatccgtcccaaggtatgacc 9986967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #103
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 380 - 487
Target Start/End: Original strand, 13138179 - 13138286
Alignment:
Q  380 tgtttacaatgtttctcaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttg-taatccaagtttctctctcttcaagctct 478  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||| ||  | | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |   |||||||| |||||||| |||||||    
T  13138179 tgtttacaatgtttcccaccccaagagaaccctaat-caaagaccctcaaccctaaagttacctcctttgatttcccaagtttttctctcttgaagctct 13138277  T
Q  479 ccttcaaaa 487  Q
     | ||||||    
T  13138278 tcctcaaaa 13138286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #104
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 156 - 220
Target Start/End: Original strand, 15294836 - 15294900
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| | |||| || ||||||    
T  15294836 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgattcactat 15294900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #105
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 156 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 23816165 - 23816105
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatcca 216  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||||||| |||| |||||    
T  23816165 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcatccctccgatcca 23816105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #106
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 156 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 47177640 - 47177577
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactat 220  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| |||||||||||| | ||||||||||||||    
T  47177640 ttgttgacccagttcgatccaatctgacctagtct-ggggagagagcagccctccaatccactat 47177577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #107
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 380 - 509
Target Start/End: Original strand, 197113 - 197243
Alignment:
Q  380 tgtttacaatgtttctcaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttg-taatccaagtttctctctcttcaagctct 478  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |   | | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||  ||||||| ||| |||    
T  197113 tgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaat-caaagaccctcaaccctaaagttacctcctttgattttccaagttttcctctcttgaagttct 197211  T
Q  479 c-cttcaaaatctgcacaagaacacttaaata 509  Q
    | ||  |||||||||| |  ||||||||||||    
T  197212 cactcaaaaatctgcaaagaaacacttaaata 197243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #108
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 156 - 203
Target Start/End: Original strand, 2510327 - 2510374
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagca 203  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  2510327 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagca 2510374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #109
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 156 - 203
Target Start/End: Original strand, 17324638 - 17324685
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagca 203  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  17324638 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagca 17324685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #110
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 156 - 203
Target Start/End: Original strand, 50307548 - 50307595
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagca 203  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  50307548 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagca 50307595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #111
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 156 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 2232772 - 2232710
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaat-atgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccac 217  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  2232772 ttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccac 2232710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #112
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 156 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 9526648 - 9526578
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaat-atgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactatgatga 225  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||  |||||||| ||||    
T  9526648 ttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctccgttccactataatga 9526578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #113
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 156 - 225
Target Start/End: Original strand, 21353348 - 21353418
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaat-atgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactatgatga 225  Q
    ||||| ||||||||||||| ||  |||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||    
T  21353348 ttgtttacccagttcggtctaaagatgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactataatga 21353418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #114
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 380 - 509
Target Start/End: Original strand, 23555470 - 23555599
Alignment:
Q  380 tgtttacaatgtttctcaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttg-taatccaagtttctctctcttcaagctct 478  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| | | | | ||||||  ||||||||| ||||||||||||||| |   |||||||| |||||||| |||||||    
T  23555470 tgtttacaatgtttcccaacccaagagaactttaat-caaagatcctcaaccctgaagttacctcctttgatttcccaagtttttctctcttgaagctct 23555568  T
Q  479 ccttcaaaatctgcacaagaacacttaaata 509  Q
    |  ||||||  || || | ||||||||||||    
T  23555569 ctctcaaaaaatgaactaaaacacttaaata 23555599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #115
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 135 - 177
Target Start/End: Original strand, 30476426 - 30476467
Alignment:
Q  135 aggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaa 177  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  30476426 aggaacaaacacaccaaa-gattgttgacccagttcggtccaa 30476467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #116
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 156 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 13215365 - 13215296
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactatgatga 225  Q
    |||||||| |||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| | ||||  |||||||| ||||    
T  13215365 ttgttgacgcagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactataatga 13215296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #117
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 454 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 21053854 - 21053746
Alignment:
Q  454 ccaagtttctctctcttcaagctctc-cttcaaaatctgcacaagaacacttaaataacagtcttcagctgataaaatcgtgccacgttttccaaatcat 552  Q
    |||||| ||||||||||| | ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||   | ||||  |||||||||||||| |||| |||||  ||| |    
T  21053854 ccaagtctctctctcttccaactctcacttcaaa-tctgcacaagaacacttaaatacatgccttccactgataaaatcgtgtcacgatttcctgatcgt 21053756  T
Q  553 gccacgattg 562  Q
    | ||||||||    
T  21053755 gtcacgattg 21053746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #118
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 138 - 220
Target Start/End: Original strand, 8550769 - 8550852
Alignment:
Q  138 aacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtcc-aatatgacctaatctgggggagaga-gcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||  ||||||| ||||| |||||||   ||||||||||||||||||    
T  8550769 aacaaacacaccaaa-gattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactat 8550852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #119
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 149 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 19752861 - 19752789
Alignment:
Q  149 caaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga-gcatctctccaatccactat 220  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||   ||||||||||||| ||||    
T  19752861 caaaagattgttgacctagttcggtccaacttgacctaatatgggagagagattgatctctccaatcctctat 19752789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #120
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 156 - 220
Target Start/End: Original strand, 27339133 - 27339197
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||||||||| || | |||| |||||||||    
T  27339133 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagatcagccctccgatccactat 27339197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #121
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 156 - 200
Target Start/End: Original strand, 28998255 - 28998299
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga 200  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  28998255 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 28998299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #122
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 156 - 200
Target Start/End: Original strand, 29003971 - 29004015
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga 200  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  29003971 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 29004015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #123
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 156 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 47906549 - 47906485
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||| | |||||||||||||||| | |||| || ||||||    
T  47906549 ttgttgacccagttcggtccaaattgaccaagtctgggggagagagcagccctccgattcactat 47906485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #124
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 156 - 203
Target Start/End: Original strand, 3579619 - 3579666
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagca 203  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| ||||||||||||    
T  3579619 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagca 3579666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #125
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 156 - 203
Target Start/End: Original strand, 6115104 - 6115151
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagca 203  Q
    ||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  6115104 ttgtttacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagca 6115151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #126
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 138 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 10925411 - 10925329
Alignment:
Q  138 aacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga-gcatctctccaatccactat 220  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||  | ||||||||| |||||||||   || |||||||||||||||    
T  10925411 aacaaacacatcaaa-gattgttgacccagttcgatccaactttacctaatctaggggagagattgatttctccaatccactat 10925329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #127
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 156 - 203
Target Start/End: Original strand, 11457477 - 11457524
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagca 203  Q
    ||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  11457477 ttgttgaccaagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagca 11457524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #128
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 156 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 15823825 - 15823778
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagca 203  Q
    ||||||||||||||||||| ||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  15823825 ttgttgacccagttcggtctaaattgacctagtctgggggagagagca 15823778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #129
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 156 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 16429237 - 16429190
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagca 203  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  16429237 ttgttgacccaattcggtccaaattgacctagtctgggggagagagca 16429190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #130
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 162 - 236
Target Start/End: Original strand, 22819438 - 22819513
Alignment:
Q  162 acccagttcggtccaatatgacctaatct-gggggagagagcatctctccaatccactatgatgaaagtgttacaa 236  Q
    ||||| || |||||||||||||||| ||| ||||||||||| | | ||||||||||| | |||||||||| |||||    
T  22819438 acccaatttggtccaatatgacctactctggggggagagagtagccctccaatccaccaagatgaaagtgatacaa 22819513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #131
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 156 - 220
Target Start/End: Original strand, 46431708 - 46431774
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatct--gggggagagagcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| |||  ||||||||||||| | |||| |||||||||    
T  46431708 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggggagagagcagccctccgatccactat 46431774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #132
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 156 - 209
Target Start/End: Original strand, 4144683 - 4144737
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaat-atgacctaatctgggggagagagcatctctc 209  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  4144683 ttgtttacccagttcggtctaatgatgacctactctgggggagagagcagctctc 4144737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #133
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 166 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 9023922 - 9023852
Alignment:
Q  166 agttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactatgatgaaagtgttacaa 236  Q
    |||||| |||||||||||||| | ||||| | | || | ||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  9023922 agttcgctccaatatgacctattatggggaatatagtagctctccaatccactaagatgaaagtgatacaa 9023852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #134
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 156 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 15916671 - 15916601
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatat-gacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactatgatga 225  Q
    ||||| |||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||| | ||||  |||||||| ||||    
T  15916671 ttgtttacccagttcggtccaaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactataatga 15916601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #135
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 156 - 201
Target Start/End: Original strand, 26613240 - 26613286
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaata-tgacctaatctgggggagagag 201  Q
    ||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  26613240 ttgtttacccagttcggtcaaatactgacctaatctgggggagagag 26613286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #136
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 252 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 27104367 - 27104333
Alignment:
Q  252 agcttacacaagaacaagacttaatttctacccat 286  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27104367 agcttacacaagaacaagacctaatttctacccat 27104333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #137
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 417 - 478
Target Start/End: Original strand, 28265807 - 28265869
Alignment:
Q  417 caaagacactcaaccctaaagttacctcctttg-taatccaagtttctctctcttcaagctct 478  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |   || |||||||||||||| |||||||    
T  28265807 caaagaccctcaaccctaaagttacctcctttgatttccctagtttctctctcttgaagctct 28265869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #138
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 417 - 478
Target Start/End: Original strand, 50167429 - 50167491
Alignment:
Q  417 caaagacactcaaccctaaagttacctcctttg-taatccaagtttctctctcttcaagctct 478  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |   || |||||||||||||| |||||||    
T  50167429 caaagaccctcaaccctaaagttacctcctttgatttccctagtttctctctcttgaagctct 50167491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #139
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 159 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 2617792 - 2617731
Alignment:
Q  159 ttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||| |||||||||||||  ||||||| |||| ||||||||||| | |||| |||||||||    
T  2617792 ttgactcagttcggtccaaattgacctagtctgagggagagagcagccctccgatccactat 2617731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #140
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 156 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 13762115 - 13762070
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagag 201  Q
    ||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  13762115 ttgttgacccagttcagtccaaattgacctagtctgggggagagag 13762070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #141
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 156 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 20302737 - 20302692
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagag 201  Q
    ||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  20302737 ttgttgaccaagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagag 20302692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #142
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 156 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 27916777 - 27916712
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaata-tgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| | ||||  ||||||||    
T  27916777 ttgtttacccaattcggtccaatactgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactat 27916712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #143
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 145 - 220
Target Start/End: Original strand, 42297963 - 42298040
Alignment:
Q  145 acaccaaaagattgttgacccagttcggtccaa-tatgacctaatctgggggagaga-gcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||  |||||||| ||||| |||||||   |||||| |||||||||||    
T  42297963 acaccaagagattgttcacccagttcggtccaaccatgacctactctggaggagagattgatctcttcaatccactat 42298040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #144
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 372 - 449
Target Start/End: Original strand, 45644552 - 45644628
Alignment:
Q  372 acccaaaatgtttacaatgtttctcaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttg 449  Q
    |||||| |||||||||||||||  ||||| |||||| ||  | | ||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  45644552 acccaagatgtttacaatgttttccaacctaagagaaccctaat-caaagaccctcaaccctaaagttatctcctttg 45644628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #145
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 158 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 47451919 - 47451874
Alignment:
Q  158 gttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagca 203  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||| | ||||||||||||||    
T  47451919 gttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagca 47451874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #146
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 138 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 3189516 - 3189433
Alignment:
Q  138 aacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatat-gacctaatctgggggagagagc-atctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  | |||||| |||||  ||||||   ||||||||||||||||||    
T  3189516 aacaaacacaccaaa-gattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggatgagagattgatctctccaatccactat 3189433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #147
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 138 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 3198333 - 3198250
Alignment:
Q  138 aacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatat-gacctaatctgggggagagagc-atctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  | |||||| |||||  ||||||   ||||||||||||||||||    
T  3198333 aacaaacacaccaaa-gattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggatgagagattgatctctccaatccactat 3198250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #148
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 138 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 3207172 - 3207089
Alignment:
Q  138 aacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatat-gacctaatctgggggagagagc-atctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  | |||||| |||||  ||||||   ||||||||||||||||||    
T  3207172 aacaaacacaccaaa-gattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggatgagagattgatctctccaatccactat 3207089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #149
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 157 - 220
Target Start/End: Original strand, 13547090 - 13547154
Alignment:
Q  157 tgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga-gcatctctccaatccactat 220  Q
    |||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||   ||||||||||||||||||    
T  13547090 tgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactat 13547154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #150
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 157 - 220
Target Start/End: Original strand, 13549001 - 13549065
Alignment:
Q  157 tgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga-gcatctctccaatccactat 220  Q
    |||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||   ||||||||||||||||||    
T  13549001 tgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactat 13549065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #151
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 156 - 203
Target Start/End: Original strand, 14183592 - 14183640
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaata-tgacctaatctgggggagagagca 203  Q
    ||||| |||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||    
T  14183592 ttgtttacccagttcggtccaaaactgacctagtctgggggagagagca 14183640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #152
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 544 - 584
Target Start/End: Complemental strand, 16455445 - 16455405
Alignment:
Q  544 ccaaatcatgccacgattgatgcgtacgacccaaggtacga 584  Q
    ||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16455445 ccaaatcgtgtcacggttgatgcgtacgacccaaggtacga 16455405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #153
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 156 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 20291735 - 20291671
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||| ||| | ||||||||||| || | |||| |||||||||    
T  20291735 ttgttgacccagttcggtccaaattgatctagtgtgggggagagaacaaccctccgatccactat 20291671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #154
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 138 - 220
Target Start/End: Original strand, 20622218 - 20622302
Alignment:
Q  138 aacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtcc-aatatgacctaatctgggggagagagcat-ctctccaatccactat 220  Q
    |||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| ||  ||||||| ||||| |||||||   | ||||||||||||||||    
T  20622218 aacaaagacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactat 20622302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #155
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 157 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 37168465 - 37168401
Alignment:
Q  157 tgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga-gcatctctccaatccactat 220  Q
    |||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||   ||||||||||||||||||    
T  37168465 tgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactat 37168401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #156
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 138 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 40282564 - 40282480
Alignment:
Q  138 aacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtcc-aatatgacctaatctgggggagagagcat-ctctccaatccactat 220  Q
    |||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| ||  ||||||| ||||| |||||||   | ||||||||||||||||    
T  40282564 aacaaagacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactat 40282480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140 (Bit Score: 397; Significance: 0; HSPs: 3)
Name: scaffold0140
Description:

Target: scaffold0140; HSP #1
Raw Score: 397; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 8653 - 8071
Alignment:
Q  15 aaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaactaaaaacagacctagacttagtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagca 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||| |||| ||    
T  8653 aaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaataacaacaaaaaacagacctagtct-agtgtagagcaacaccacaagtataaccaaaaca 8555  T
Q  115 c-aaagataagcaatgaaagaaggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaat 213  Q
      ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8554 ataaagataagcaatgaaagaagaaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaat 8455  T
Q  214 ccactatgatgaaagtgttacaa----------gaaaaatagtttgcaagcttacacaagaacaagacttaatttctacccatttgtgtttctcactctc 303  Q
    |||||||||||||||||||||||          ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||    
T  8454 ccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaaaatagcttgcaagcttacacaagaacaagacctaatttctacgtatttgtgtttcccactctc 8355  T
Q  304 tcaataatgaaccctaaagg-gaagacacaaaaggaagcttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaaatgtttacaatgtttctcaaccca 402  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||    
T  8354 tcaataatgaaccctaaaagagaagacacaaaaggaagcttttaatccttccaatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttcccaaccca 8255  T
Q  403 agagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatccaagtttctctctcttcaagctctccttcaaaatctgcacaagaacac 502  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||| ||||||    
T  8254 agagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttccctcctttgtaatccaagtttctctctcttccagctctcctccgaaaactgcacacgaacac 8155  T
Q  503 ttaaataacagtcttcagctgataaaatcgtgccacgttttccaaatcatgccacgattgatgcgtacgacccaaggtacgacc 586  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  8154 ttaaataccagtcttcagctgataaaatcatgccacgattttcaaatcgtgtcacgattgatacgtacgacccaaggtacgacc 8071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 156 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 22403 - 22339
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| | |||| |||||||||    
T  22403 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactat 22339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140; HSP #3
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 156 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 24678 - 24614
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| | |||| |||||||||    
T  24678 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactat 24614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 392; Significance: 0; HSPs: 4)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 392; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 133514 - 132933
Alignment:
Q  15 aaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaactaaaaacagacctagacttagtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagca 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||   ||||||||| ||| || ||| |||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  133514 aaaggaagtgataatcaatgtgtaaagtgtctccaaacaacaacaaagcaaaacagacatagtct-agtatagagcaacatcacaagcatatacaaagca 133416  T
Q  115 c-aaagataagcaatgaaagaaggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaat 213  Q
      ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  133415 ataaagataagtaatgaaagaaggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttaggttcaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaat 133316  T
Q  214 ccactatgatgaaagtgttacaa----------gaaaaatagtttgcaagcttacacaagaacaagacttaatttctacccatttgtgtttctcactctc 303  Q
    |||||||||||||| ||||||||          ||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  133315 ccactatgatgaaaatgttacaaagagttacaagaaaaatagcttgcaaacttacacaagaacaagacctaatttctacccatttgtgtttcccactctc 133216  T
Q  304 tcaataatgaaccctaaagggaagacacaaaaggaagcttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaaatgtttacaatgtttctcaacccaa 403  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||    
T  133215 tcaataatgaaccctaaagagaagacacaaaaggaagcttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaa 133116  T
Q  404 gagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatccaagtttctctctcttcaagctctccttcaaaatctgcacaagaacact 503  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  133115 gagatcctcactacaaagaaactcaaccctaaagttccctcctttgtaatccaagtttctctctctttaagctctcctccaaaatttgcacaagaacact 133016  T
Q  504 taaataacagtcttcagctgataaaatcgtgccacgttttccaaatcatgccacgattgatgcgtacgacccaaggtacgacc 586  Q
    || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  133015 tatatagcagtcttcagctgataaaatcgtgccacgttttccaaatcgtgtcacgattgatacgtacgacccaaggtacgacc 132933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 15 - 586
Target Start/End: Original strand, 5544 - 6129
Alignment:
Q  15 aaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaacta--aaaacagacctaga-cttagtgtagagcaacaccacaagcataaacaaa 111  Q
    |||||||||||||||||||  || |||||||||||| |||||||||| |  |||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  5544 aaaggaagtggtaatcaata-gttaagtgtctccaaacaacaacaacaacaaaaacagacctagatctaagtgtagagaaacaccacaagcataatcaaa 5642  T
Q  112 gcac-aaagataagcaatgaaagaa-ggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctc 209  Q
    |||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||     
T  5643 gcaataaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaa--gattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctt 5740  T
Q  210 caatccactatgatgaaagtgttacaaga----------aaaatagtttgcaagcttacacaagaacaagacttaatttctacccattt-gtgtttctca 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |          ||| ||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  | ||    
T  5741 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagagatacaagaaattagcttataagcttacacaagaacaagacttaatttctactcattttgtgtcaccca 5840  T
Q  299 ctctctcaataatgaaccctaaagggaagacacaaaaggaagctttt-gatccttccaatggtgaaatctcactacccaaaatgtttacaatgtttctca 397  Q
    | |||||||| ||||| ||||| | ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||  ||    
T  5841 cactctcaatgatgaatcctaa-gagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttgcca 5939  T
Q  398 acccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatccaagtttctctctcttcaagctctccttcaaaatctgcacaag 497  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5940 acccaagagatcctcactacaaagacactcaaccataaagttacctcctttgtaatccaattttctctctcttcaagctctccttcaaaatctgcacaag 6039  T
Q  498 aacacttaaataacagtcttcagctgataaaatcgtgccacgttt-tccaaatcatgccacgattgatgcgtacgacccaaggtacgacc 586  Q
    |||| ||| ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||| |||||||  || |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6040 aacatttatatagcagtcttcagctgtcaaaatcgtgtcacgtttgtccaaattgtgacacgattggtgcgtacgacccaaggtacgacc 6129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #3
Raw Score: 297; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 12 - 586
Target Start/End: Original strand, 2352 - 2937
Alignment:
Q  12 agcaaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaactaaaaacagacctaga-cttagtgtagagcaacaccacaagcataaacaa 110  Q
    ||||||||||||| | ||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  2352 agcaaaggaagtgttgatcaatagataaagtgtctccaagcaacaacaac-aaaaacagacctagatctaagtgtagaacaacaccacaagcataatcaa 2450  T
Q  111 agcac-aaagataagcaatgaaagaa-ggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctct 208  Q
    ||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| | ||    
T  2451 agcaataaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaa--gattgttgacccagttcgctccaatatgacctaatctgggggagacagcagccct 2548  T
Q  209 ccaatccactatgatgaaagtgttacaaga----------aaaatagtttgcaagcttacacaagaacaagacttaatttctacccattt-gtgtttctc 297  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |          ||| ||| ||  ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||  | |    
T  2549 ccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagaattataagaaattagcttataagcttacacaagaacaagaactaatttctacccattttgtgtcaccc 2648  T
Q  298 actctctcaataatgaaccctaaagggaagacacaaaaggaagctttt-gatccttccaatggtgaaatctcactacccaaaatgtttacaatgtttctc 396  Q
    || |||||||| ||||| ||||| |  || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| |    
T  2649 acactctcaatgatgaatcctaa-gataaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatctcactacgcaaggtgtttacaatgtttccc 2747  T
Q  397 aacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatccaagtttctctctcttcaagctctccttcaaaatctgcacaa 496  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2748 aacccaagagatcctcactacaaagaaacttaaccctaaagttaccttttttgtaatccaa-tttctctctcttcaagctctccttcaaaatctgcacaa 2846  T
Q  497 gaacacttaaataacagtcttcagctgataaaatcgtgccacgttt-tccaaatcatgccacgattgatgcgtacgacccaaggtacgacc 586  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  2847 gaacacttatatagcagtcttcagctgttaaaatcgtgtcacgtttgtccaaatcgtgacacgattggtgcgtacgacccaaggtacgacc 2937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #4
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 138 - 220
Target Start/End: Original strand, 149080 - 149162
Alignment:
Q  138 aacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga-gcatctctccaatccactat 220  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||  | ||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  149080 aacaaatacaccaaa-gattgttgacccagttcggtccaacttaacctactctgggggagagattgatctctccaatccactat 149162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 387; Significance: 0; HSPs: 135)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 387; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 574
Target Start/End: Original strand, 7412197 - 7412771
Alignment:
Q  12 agcaaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaactaaaaa----cagacctagacttagtgtagagcaacaccacaagcataaa 107  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||  |||||    ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |    
T  7412197 agcaaaggaagtggtaatgaatgtgtaaagtgtctccaagcaaaaaaaaaaaaaaaaaaacagacctagtct-agtgtagagcaacaccacaagcatata 7412295  T
Q  108 caaagcacaaagataagcaatgaaagaaggaacaaacacaccaa-aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatct 206  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  7412296 caaagaacaaagataagcaatgaaagaaggaacaaacacaccatgaaaattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagct 7412395  T
Q  207 ctccaatccactatgatgaaagtgttacaa-ga--------aaaatagtttgcaagcttacacaagaacaagacttaatttctacccatttgtgtttctc 297  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||        ||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  7412396 ctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaaataacttgcaagcttacacaagaacaagacctaatttctacccatttgtgtttccc 7412495  T
Q  298 actctctcaataatgaaccctaaagggaagacacaaaaggaagcttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaaatgtttacaatgtttctca 397  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||    
T  7412496 actctctcaataatgaaccctaa-gagaagacataaaaggaagcttttgatcctttcaatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttccca 7412594  T
Q  398 acccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatccaagtttctctctcttcaagctctccttcaaaatctgcacaag 497  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7412595 acccaagagatcctctctacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatccaagtttctctctcttcaagctctccttcaaaatctgcacaag 7412694  T
Q  498 aacacttaaataacagtcttcagctgataaaatcgtgccacgttttccaaatcatgccacgattgatgcgtacgacc 574  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||    
T  7412695 aacacttatatagcagtcttcagctgataaaatcgtgccacgttttccaaatcgtgccatgattgatacgtacgacc 7412771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 380; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 534
Target Start/End: Original strand, 4455888 - 4456419
Alignment:
Q  12 agcaaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaactaaaaacagacctagacttagtgtagagcaacaccacaagcataaacaaa 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4455888 agcaaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacagc-aaaaacagacctggacttagtgtagagcaacacaacaagcataaacaaa 4455986  T
Q  112 gcacaaagataagcaatgaaagaa-ggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctcc 210  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4455987 gcacaaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaaagattgctgacccggttcggtccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcc 4456086  T
Q  211 aatccactatgatgaaagtgttacaa-ga--------aaaatagtttgcaagcttacacaagaacaagacttaatttctacccatttgtgtttctcactc 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||        ||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||    
T  4456087 aatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaaatagctggcaagcttacacaagaacaagacataatttctacccatttgtgttacccactc 4456186  T
Q  302 tctcaataatgaaccctaaagggaagacacaaaaggaagcttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaaatgtttacaatgtttctcaaccc 401  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||    
T  4456187 tctcaatgatgaaccctaaagagaagacacaaaaggaagcttttgatccttctaatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttcccaaccc 4456286  T
Q  402 aagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatccaagtttctctctcttcaagctctccttcaaaatctgcacaagaaca 501  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4456287 aagagatcctcactacagagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatccaagtttctctctcttcaagctcttcttcaaaatctgcacaagaaca 4456386  T
Q  502 cttaaataacagtcttcagctgataaaatcgtg 534  Q
    |||| ||| | |||||||||||  |||||||||    
T  4456387 cttatatagccgtcttcagctgtcaaaatcgtg 4456419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 360; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 550
Target Start/End: Complemental strand, 19175994 - 19175441
Alignment:
Q  12 agcaaaggaagtggtaatcaat----gtgtaaagtgtctccaagcaacaacaactaaaaacagacctagacttagtgtagagcaacaccacaagcataaa 107  Q
    ||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19175994 agcaaaggaagtggtaatcaattaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaac--aaagcagacctagacttagtgtagagcaacaccacaagcataaa 19175897  T
Q  108 caaagcacaaagataagcaatgaaagaa-ggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatct 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  19175896 caaagcacaaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacacaaaaagattgttgacctagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcaact 19175797  T
Q  207 ctccaatccactatgatgaaagtgttacaa----------gaaaaatagtttgcaagcttacacaagaacaagacttaatttctacccatttgtgtttct 296  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||          |||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||     
T  19175796 ctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaaaatagcctgcaagcttacacaagaacaagacctaacttctacacatttgtgtttcc 19175697  T
Q  297 cactctctcaataatgaaccctaaagggaagacacaaaaggaagcttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaaatgtttacaatgtttctc 396  Q
    |||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |    
T  19175696 cactctctcaatgatgaaccctaa-gagaagacacaaaaggaaacttttgatccttccaatagtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttccc 19175598  T
Q  397 aacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatccaagtttctctctcttcaagc---tctccttcaaaatctgca 493  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   |||||||||||| ||| |    
T  19175597 aatccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatccaagtttctctcacttcaagctgatctccttcaaaaactgta 19175498  T
Q  494 caagaacacttaaataacagtcttcagctgataaaatcgtgccacgttttccaaatc 550  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||  |||||||||||||||    
T  19175497 caagaacacttatataacagtcttcagctgtcaaaatcgtatcacgttttccaaatc 19175441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 12 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 5702720 - 5702133
Alignment:
Q  12 agcaaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaactaaaaacagacctaga-cttagtgtagagcaacaccacaagcataaacaa 110  Q
    |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||  ||    
T  5702720 agcaaatgaagtggtaatcaatgaataaagtgtctcctagcaacaacaac-aaaaacagacctagatctaagtgtagagcatcaccacaagcataattaa 5702622  T
Q  111 agcacaa-agataagcaatgaaagaa-ggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctct 208  Q
    ||||  | |||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  5702621 agcaatagagataagctatgaaggaaaggaacaaacacaccaa--gattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcatccct 5702524  T
Q  209 ccaatccactatgatgaaagtgttacaaga----------aaaatagtttgcaagcttacacaagaacaagacttaatttctacccattt-gtgtttctc 297  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |          ||| ||| ||  |||||||||||||| ||| || |||||||||||||||| | ||  | |    
T  5702523 ccaatcccctatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttataagcttacacaagagcaaaacctaatttctacccattttgagtcaccc 5702424  T
Q  298 actctctcaataatgaaccctaaagggaagacacaaaaggaagctttt-gatccttccaatggtgaaatctcactacccaaaatgtttacaatgtttctc 396  Q
    || |||||||||||||| |||||  | || |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||| |    
T  5702423 acactctcaataatgaatcctaagagaaaaacacaaaaggaagctttttgatcattccaatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatatttccc 5702324  T
Q  397 aacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatccaagtttctctctcttcaagctctccttcaaaatctgcacaa 496  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5702323 aacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatccaagtttctctctcttcaacctctccttcaaaatctgcacaa 5702224  T
Q  497 gaacacttaaataacagtcttcagctgataaaatcgtgccacgtttt-ccaaatcatgccacgattgatgcgtacgacccaaggtacgacc 586  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||| || |||||||| ||||||| | |||||||||||||    
T  5702223 gaacacttatatagcagtcttcagctgtcaaaatcgtgacacgttttgccaaatcgtgacacgattggtgcgtacaatccaaggtacgacc 5702133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 15 - 546
Target Start/End: Original strand, 26287766 - 26288295
Alignment:
Q  15 aaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaactaaaaacagacctagacttagtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagca 114  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  26287766 aaaggaagtggtaatctatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaac-aaaaacagccctagtct-agtgtagagcaacaccacaagcaaatacaaagca 26287863  T
Q  115 -caaagataagcaatgaaagaaggaacaaacacaccaaaa-gattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaa 212  Q
     | ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26287864 accaagataagcaa-gaaaggaagaacaaacacaccaaaaagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaa 26287961  T
Q  213 tccactatgatgaaagtgttacaagaaaaatagtttgcaagcttacacaagaacaagacttaatttctacccatttgtgtttctcactctctcaataatg 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||| | ||||||| |||| |||    
T  26287962 tccactatgatgaaagtgttacaagaaaaatagcttgcaagcttacacaagaacaagtcctagtttctacccatttgtgttccccactctcacaat-atg 26288060  T
Q  313 aaccct-aaagggaagacacaaaaggaagcttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaaatgtttacaatg--tttctcaacccaagagatc 409  Q
    |||||| |||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  |||| |||| ||||||||     
T  26288061 aaccctaaaagagaagacacaagaggaagctttagatccttccaatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttttcccaactcaagagatt 26288160  T
Q  410 ctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatccaagtttctctctcttcaagctctccttcaaaatctgcacaagaacacttaaata 509  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  26288161 ctctctacaaagacattcaaccctagagttcccccctttgtaatccaagtttctctctct--aagctcttctccaaaatctgcacaagaacacttaaata 26288258  T
Q  510 acagtcttcagctgataaaatcgtgccacgttttcca 546  Q
      || ||||  |||||||||||||| |||| ||||||    
T  26288259 ctagccttccactgataaaatcgtgtcacgatttcca 26288295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 15 - 546
Target Start/End: Original strand, 26313017 - 26313546
Alignment:
Q  15 aaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaactaaaaacagacctagacttagtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagca 114  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  26313017 aaaggaagtggtaatctatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaac-aaaaacagccctagtct-agtgtagagcaacaccacaagcaaatacaaagca 26313114  T
Q  115 -caaagataagcaatgaaagaaggaacaaacacaccaaaa-gattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaa 212  Q
     | ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26313115 accaagataagcaa-gaaaggaagaacaaacacaccaaaaagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaa 26313212  T
Q  213 tccactatgatgaaagtgttacaagaaaaatagtttgcaagcttacacaagaacaagacttaatttctacccatttgtgtttctcactctctcaataatg 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||| | ||||||| |||| |||    
T  26313213 tccactatgatgaaagtgttacaagaaaaatagcttgcaagcttacacaagaacaagtcctagtttctacccatttgtgttccccactctcacaat-atg 26313311  T
Q  313 aaccct-aaagggaagacacaaaaggaagcttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaaatgtttacaatg--tttctcaacccaagagatc 409  Q
    |||||| |||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  |||| |||| ||||||||     
T  26313312 aaccctaaaagagaagacacaagaggaagctttagatccttccaatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttttcccaactcaagagatt 26313411  T
Q  410 ctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatccaagtttctctctcttcaagctctccttcaaaatctgcacaagaacacttaaata 509  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  26313412 ctctctacaaagacattcaaccctagagttcccccctttgtaatccaagtttctctctct--aagctcttctccaaaatctgcacaagaacacttaaata 26313509  T
Q  510 acagtcttcagctgataaaatcgtgccacgttttcca 546  Q
      || ||||  |||||||||||||| |||| ||||||    
T  26313510 ctagccttccactgataaaatcgtgtcacgatttcca 26313546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 37 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 4696808 - 4696306
Alignment:
Q  37 taaagtgtctccaagcaacaacaactaaaaacagacctaga-cttagtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagcac-aaagataagcaatgaaaga 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || | || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||  |||||||||||||||||||    
T  4696808 taaagtgtctccaagcaacaacaac-aaaaacagacataaatctaagtgtagagcaacaccacaaacataatcaaagcaataaagataagcaatgaaaga 4696710  T
Q  135 ag-gaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactatgatgaaagtgtta 233  Q
    |  |||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||    
T  4696709 aatgaacaaacacaccaa--gattgttgacccagttcgatccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagagtta 4696612  T
Q  234 caagaaaaatagtttgcaagcttacacaagaacaagacttaatttctacccattt-gtgtttctcactctctcaataatgaaccctaaagggaagacaca 332  Q
    |||||||  ||| ||  |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||  | ||| |||||| |   ||| ||||| | ||| |||||    
T  4696611 caagaaat-tagcttataagcttacgcaagaacaagacctaatttctacccattttgtgtcacccacactctcatt---gaatcctaa-gagaaaacaca 4696517  T
Q  333 aaaggaagctttt-gatccttccaatggtgaaatctcactacccaaaatgtttacaatgtttctcaacccaagagatcctcactacaaagacactcaacc 431  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4696516 aaaggaagctttttgatctttccaatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagatcctcactacaaagacactcaacc 4696417  T
Q  432 ctaaagttacctcctttgtaatccaagtttctctctcttcaagctctccttcaaaatctgcacaagaacacttaaataacagtcttcagctgataaaatc 531  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||  ||||||    
T  4696416 ctaaagttatctcctttgtaatccaagtttctctctcttcaagctctccttcaaaatctgcacaagaacccttatataacggtcttcagctgtcaaaatc 4696317  T
Q  532 gtgccacgttt 542  Q
    ||| |||||||    
T  4696316 gtgtcacgttt 4696306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 12 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 23799815 - 23799229
Alignment:
Q  12 agcaaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaactaaaaacagacctaga-cttagtgtagagcaacaccacaagcataaacaa 110  Q
    ||||||| ||||| ||||||||   ||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||| || ||||||||| |  ||||||| ||||| |||    
T  23799815 agcaaagaaagtgttaatcaatagataaagtgtctccaagaaacaacaacaaaaaatagacctagatctaagtgtagagaagtaccacaaacataatcaa 23799716  T
Q  111 agcacaa-agataagcaatgaaagaa-ggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctct 208  Q
    ||||  | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | ||    
T  23799715 agcaatagagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaa--gattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatttggaggagagagcagccct 23799618  T
Q  209 ccaatccactatgatgaaagtgttacaaga----------aaaatagtttgcaagcttacacaagaacaagacttaatttctacccattt-gtgtttctc 297  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |          ||| ||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||  | |    
T  23799617 ccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaagcttacacaagaacaagacctaatttctacccattttgtgtcaccc 23799518  T
Q  298 actctctcaataatgaaccctaaagggaagacacaaaaggaagctttt-gatccttccaatggtgaaatctcactacccaaaatgtttacaatgtttctc 396  Q
    ||| || ||||| |||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||  ||||||||||||| | |    
T  23799517 actgtcacaata-tgaatcctaa-gggaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatctccctactcaaggtgtttacaatgttcccc 23799420  T
Q  397 aacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatccaagtttctctctcttcaagctctccttcaaaatctgcacaa 496  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  23799419 aacccaagagatcctctctacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatccaagtttctctctcttcaagctatccttcaaaatatgcacaa 23799320  T
Q  497 gaacacttaaataacagtcttcagctgataaaatcgtgccacgttt-tccaaatcatgccacgattgatgcgtacgacccaaggtacgacc 586  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||| |||||||| || ||| |||| |||||||||||||| ||||||||    
T  23799319 gaacacttatatagcagtcttcagctgtcaaaatcgtgtcacgtttgtccaaatcgtgacacaattggtgcgtacgacccaacgtacgacc 23799229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 15 - 546
Target Start/End: Original strand, 26301011 - 26301552
Alignment:
Q  15 aaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaactaaaaacagaccta--gactta-----gtgtagag---caaca-ccacaagca 103  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||| ||||  | || |     ||||| ||   ||||| |||||||||    
T  26301011 aaaggaagtggtaatctatgtgtaaagtgtcaacaagcaacaacaac-aaaaacagccctatggcctaatctatgtgtaaagtgtcaacaaccacaagca 26301109  T
Q  104 taaacaaagca-caaagataagcaatgaaagaaggaacaaacacaccaaaa-gattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagag 201  Q
     | |||||||| | ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||    
T  26301110 aatacaaagcaaccaagataagcaa-gaaaggaagaacaaacacaccaaaaagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagag 26301207  T
Q  202 catctctccaatccactatgatgaaagtgttacaagaaaaatagtttgcaagcttacacaagaacaagacttaatttctacccatttgtgtttctcactc 301  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||| | |||||    
T  26301208 cagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaagaaaaatagcttgcaagcttacacaagaacaagtcctagtttctacccatttgtgttccccactc 26301307  T
Q  302 tctcaataatgaaccct-aaagggaagacacaaaaggaagcttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaaatgtttacaatg--tttctcaa 398  Q
    || |||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  |||| |||    
T  26301308 tcacaat-atgaaccctaaaagagaagacacaagaggaagctttagatccttccaatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttttcccaa 26301406  T
Q  399 cccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatccaagtttctctctcttcaagctctccttcaaaatctgcacaaga 498  Q
    | |||||||| ||| ||||||||||| ||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| || ||||||||||||||||    
T  26301407 ctcaagagattctctctacaaagacattcaaccctagagttcccccctttgtaatccaagtttctctctct--aagctcttctccaaaatctgcacaaga 26301504  T
Q  499 acacttaaataacagtcttcagctgataaaatcgtgccacgttttcca 546  Q
    |||||||||||  || ||||  |||||||||||||| |||| ||||||    
T  26301505 acacttaaatactagccttccactgataaaatcgtgtcacgatttcca 26301552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 230; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 15 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 31071462 - 31071035
Alignment:
Q  15 aaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaactaaaaacagacctagacttagtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagca 114  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  31071462 aaaggaagtggtaatctatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaac-aaaaacagccctagtct-agtgtagagcaacaccacaagcaaatacaaagca 31071365  T
Q  115 -caaagataagcaatgaaagaaggaacaaacacaccaaaa-gattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaa 212  Q
     | ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  31071364 accaagataagcaa-gaaaggaagaacaaacacaccaaaaagattgttgaccgagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaa 31071266  T
Q  213 tccactatgatgaaagtgtt----------acaagaaaaatagtttgcaagcttacacaagaacaagacttaatttctacccatttgtgttt-ctcactc 301  Q
    ||||||||||||||||||||          ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||| | |||||    
T  31071265 tccactatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaaaatagcttgcaagcttacacaagaacaagtcctagtttctacccatttgtgtttccccactc 31071166  T
Q  302 tctcaataatgaaccct-aaagggaagacacaaaaggaagcttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaaatgtttacaatg--tttctcaa 398  Q
    || |||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  |||| |||    
T  31071165 tcacaat-atgaaccctaaaagagaagacacaagaggaagcttaagatccttccaatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttttcccaa 31071067  T
Q  399 cccaagagatcctcactacaaagacactcaac 430  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31071066 cccaagagatcctcactacaaagacactcaac 31071035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 15 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 26403464 - 26402997
Alignment:
Q  15 aaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaactaaaaacagacctaga-cttagtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagc 113  Q
    |||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26403464 aaaggaagtggtaatcaatagataatgtgtctccaagcaataacaac-aaaaacagacctaaatctaagtgtagagcaacaccacaagcataatcaaagc 26403366  T
Q  114 ac-aaagataagcaatgaaaga-aggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctcca 211  Q
    |  |||||||||||||||||   |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26403365 aataaagataagcaatgaaaacgaggaacaaacacaccaa--gattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctcca 26403268  T
Q  212 atccactatgatgaaagtgttaca----------agaaaaatagtttgcaagcttacacaagaacaagacttaatttctaccca-tttgtgtttctcact 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||          || ||| ||| || ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||  ||||||    
T  26403267 atccactatgatgaaagtgttacaaaagagttataggaaattagcttacaagcttgcacaagaacaagacctaatttctacccattttgtgtcactcact 26403168  T
Q  301 ctctcaataatgaaccctaaagggaagacacaaaaggaagc-ttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaaatgtttacaatgtttctcaac 399  Q
    ||| |||| ||||| | | ||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||    
T  26403167 ctcacaat-atgaatcat-aagagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttcccaac 26403070  T
Q  400 c--caagagatcctcactacaaagacactcaaccct-aaagttacctcctttgtaatcc-aagtttctctctc 468  Q
    |  ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| | |||||||||||    
T  26403069 cctcaagagaacctcactacaaagacactcaaccctaaaagttacctcctttgtattcctaggtttctctctc 26402997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 15 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 19752627 - 19752148
Alignment:
Q  15 aaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaactaaaaacagacctaga-cttagtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagc 113  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| | || ||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  19752627 aaaggaagtggtaatcaatatataaagtgtctccaagcaacaacaac--aaaacagacctaaatctaagtgtagtgcaacaccacaagcataatcaaagc 19752530  T
Q  114 acaa-agataagcaatgaaaga-aggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctcca 211  Q
    |  | ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||    
T  19752529 aatagagataagtaatgaaagagaggaacaaacacaccaa--gattgttgacctagttcggtccaatatgacctagtctaggggagagagcagctctcca 19752432  T
Q  212 atccactatgatgaaagtgtt----------acaagaaaaatagtttgcaagcttacacaagaacaagacttaatttctacccattt---gtgtttctca 298  Q
    |||||||| ||||||||||||          ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    | |  | ||    
T  19752431 atccactaagatgaaagtgttacaatgagttacaagaaaaatagcttgcaagcttacacaagaacaagtcctaatttctacccatttttcatatcaccca 19752332  T
Q  299 ctctctcaataatgaaccctaaagggaagacacaaaaggaagc-ttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaaatgtttacaatgtttctca 397  Q
    | |||||   |||||| ||| ||| ||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||| |||| ||    
T  19752331 cactctc---aatgaatcct-aagagaaaacac-aaaggaagctttttgatccttccaatgatgaaatctcactacccaaggtgtttacaatatttcaca 19752237  T
Q  398 acccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatccaagtttctctctcttcaagctctccttcaaa 486  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  || ||||||||||||    
T  19752236 acccaagagaacctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgcgatccaagtttctctctctaaaacctctccttcaaa 19752148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 15 - 561
Target Start/End: Complemental strand, 1262185 - 1261621
Alignment:
Q  15 aaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaactaaaaacagacctagacttagtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagca 114  Q
    ||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||   | |||| |||    
T  1262185 aaagggagtggtaatctatgagtaaagtgtctccaagcaacaacaac-aaaaacagccctagtct-agtgtagagcaacaccacaagagaatacaa-gca 1262089  T
Q  115 ca-aagataagcaatgaaagaaggaacaaacacaccaaaa-gattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaa 212  Q
     | ||||||||  | ||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1262088 aacaagataagata-gaaaggaagaacaaacacaccaaaaagattgttgacccagttcaa-ccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaa 1261991  T
Q  213 tccactatgatgaaagtgttacaa----------gaaaaatagtttgcaagcttacacaagaacaagacttaatttctacccatttgtgtttctc-actc 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||          ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||| | ||||    
T  1261990 tccactatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaaaatagcttgcaagcttacacaagtacaagacctagattctacccatttgtgtttccccactc 1261891  T
Q  302 tctcaataatgaaccctaaagg-gaagacacaaaaggaagcttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaaatgtttacaatgtttctc--aa 398  Q
    || ||||| ||||||||||| | |||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||  ||    
T  1261890 tcacaata-tgaaccctaaaagagaagacactagaggaagctttagatccttccaatggtgaaatctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaa 1261792  T
Q  399 cccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatccaagtttctctctc--------ttcaagctctccttcaaaatct 490  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||        | |||||||||||||||||       
T  1261791 cccaagagaccctctctacaaagacactcaaccctagagttccctcctttgtaatccaagtttctctctctaagctcttccaagctctccttcaaaa-aa 1261693  T
Q  491 gcacaagaacac-ttaaataacagtcttcagctgataaaatcgtgccacgttttccaaatcatgccacgatt 561  Q
    |||||||||||| |||||||  || ||||  |||||||||||||| |||| |||||| ||| || |||||||    
T  1261692 gcacaagaacactttaaatactagccttcctctgataaaatcgtgtcacgatttccagatcgtgtcacgatt 1261621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 15 - 451
Target Start/End: Original strand, 6127082 - 6127533
Alignment:
Q  15 aaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaactaaaaacagacctagactta-gtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagc 113  Q
    |||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||||| |||||||||  || | ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6127082 aaaggaagtggtaatcaatagattaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaaacagatataaatttaagtgtagagcaacaccacaagcataatcaaagc 6127181  T
Q  114 ac-aaagataagcaatgaaaga-aggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctcca 211  Q
    || ||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  6127182 actaaagataagcaatgaaagagatgaacaaacacatcaaat-attgttgactcagttcggtccaatatgacctaatttggggaagagagcagctctcca 6127280  T
Q  212 atccactatgatgaaagtgttacaaga----------aaaatagtttgcaagcttacacaagaacaagacttaatttctaccca-tttgtgtttctcact 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |          ||| ||| ||  ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||  | |||     
T  6127281 atccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttataagcttacaaaagaacaagacctaatttctacccattttgtgtcacccaca 6127380  T
Q  301 ctctcaataatgaaccctaaagggaagacacaaaaggaagc-ttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaaatgtttacaatgtttctcaac 399  Q
    |||||||||||||| ||| ||| ||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6127381 ctctcaataatgaatcct-aagagaaaacacaaaagaaagctttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaaatgtttacaatgtttcccaac 6127479  T
Q  400 c--caagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgta 451  Q
    |  ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||    
T  6127480 cctcaagagaacctcactacaaagacactcaaccctcaagttatctcttttgta 6127533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 128; E-Value: 7e-66
Query Start/End: Original strand, 12 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 9766057 - 9765848
Alignment:
Q  12 agcaaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaactaaaaacagacctaga-cttagtgtagagcaacaccacaagcataaacaa 110  Q
    ||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | || |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  9766057 agcaaaggaagtgataatcaatagataaagtgtctccaagcaacaacaac-aaaaacaaacctaaatctaagtgtagagcaacaccacaagcataatcaa 9765959  T
Q  111 agcac-aaagataagcaatgaaagaagg-aacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctct 208  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9765958 agcaataaagataagcaatgaaagaagggaacaaacacaccaat-gattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctct 9765860  T
Q  209 ccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||    
T  9765859 ccaatccactat 9765848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 329 - 586
Target Start/End: Original strand, 3051305 - 3051565
Alignment:
Q  329 cacaaaaggaagctttt-gatccttccaatggtgaaatctcactacccaaaatgtttacaatgtttctcaacccaagagatcctcactacaaagacactc 427  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| || ||||||||||||||||    
T  3051305 cacaaaaggaagctttttgatctttccaatggtgaaatctcactacccaagatgtttacaatgtttcccaactcaagagaaccccactacaaagacactc 3051404  T
Q  428 aaccctaaagttacctcctttgtaat-ccaagtttctctctcttcaagctctccttcaaaatctgcacaagaacacttaaataacagtcttcagctgata 526  Q
    ||||||||||||  ||||||| || | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |  |||||||| |||  | ||| |||||   |    
T  3051405 aaccctaaagttctctcctttatagtcccaagtttctctctcttcaagctctctttcaaaatctgcatagaaacacttatatagtactctgcagctatca 3051504  T
Q  527 aaatcgtgccacgttttccaaa-tcatgccacgattgatgcgtacgacccaaggtacgacc 586  Q
    |||| ||| |||| || ||||| || || |||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  3051505 aaattgtgtcacgattgccaaattcgtgtcacgattgatgcatacgacccaatgtacgacc 3051565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 46 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 33038011 - 33037572
Alignment:
Q  46 tccaagcaacaacaactaaaaacagacctagacttagtgtagagcaacaccacaagcataaa---caaagcacaa--agataagcaatgaaagaaggaac 140  Q
    |||||||||||||||| | |||||| |||||||| |||||||||||| ||||||   | | |   ||||||| ||  ||||||||||  ||||||| |||    
T  33038011 tccaagcaacaacaacaataaacagccctagact-agtgtagagcaaaaccacacaaagagataccaaagcaaaacaagataagcaagaaaagaag-aac 33037914  T
Q  141 aaacacaccaa-aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactatga-----tg----aaagtg 230  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||     ||    |||| |    
T  33037913 aaa-acaccaagaagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaggg 33037816  T
Q  231 ttacaagaaa-aatagtttgcaagcttacacaagaacaagacttaatttctacccatttgtgttt-ctcactctctcaataatgaaccctaaagggaaga 328  Q
    |||||||||| |||||  | |||||||||||||||||||  | ||  |||||||||| ||||||| | ||||||| |||| ||||||||||||| |||||    
T  33037815 ttacaagaaacaatagccttcaagcttacacaagaacaaaccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaat-atgaaccctaaagagaaga 33037717  T
Q  329 cacaaaaggaagcttttgatccttccaa-tggtgaaat-ctcactacccaaaatgtttacaatg--tttctcaacccaagagatcctcactacaaagaca 424  Q
    ||| | |||||||||| ||||||||||| |  |||| | ||||||||||||  || ||||||||  |||| ||||||||||||  ||| |||| ||||||    
T  33037716 cactagaggaagctttagatccttccaactaatgaactcctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctctacgaagaca 33037617  T
Q  425 ctcaaccctaaagttacctcctttgtaatccaagtttctctctct 469  Q
    |||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  33037616 ctcaaccctttggttccctcctttgtaatccaagtttctctctct 33037572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 21 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 4760306 - 4759838
Alignment:
Q  21 agtggtaatcaatgtgtaaagtg-tctccaagcaacaacaactaaaaacagacctagacttagtgtagagcaacaccacaagcata---aacaaagcaca 116  Q
    |||||||||||||| | ||| || | |||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||   | |   ||||||||| |    
T  4760306 agtggtaatcaatgagcaaaatggtttccaagcaacaacaac-aaaaacagccctagact-agtgtagagcaaaaccacacaaagagataacaaagcata 4760209  T
Q  117 aa---gataagcaatgaaagaaggaacaaacacaccaa-aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaa 212  Q
    ||   ||||||||| ||||| | ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  4760208 aacaagataagcaa-gaaaggaagaacaaa-acatcaagaagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaa 4760112  T
Q  213 tccactatgatgaaagtgtt----------acaagaaa-aatagtttgcaagcttacacaagaacaagacttaatttctacccatttgtgttt-ctcact 300  Q
    |||| |||||||||||||||          |||||||| |||||  | |||||||||||||||||||| | ||  |||||||||| ||||||| | ||||    
T  4760111 tccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccact 4760012  T
Q  301 ctctcaataatgaaccct-aaagggaagacacaaaaggaagcttttgatccttccaa-tggtgaaat-ctcactacccaaaatgtttacaatg---tttc 394  Q
    ||| |||| ||||||||| |||| |||||||| | |||||||||| ||||||||||| |  |||| | ||||||||||||  || ||||||||   ||||    
T  4760011 ctcacaat-atgaaccctaaaagagaagacactagaggaagctttagatccttccaactaatgaactcctcactacccaaggtgattacaatgttttttc 4759913  T
Q  395 tcaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatccaagtttctctctct 469  Q
     ||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||   ||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  4759912 ccaacccaagagactctctctacaaagacactcaaccctttggttacctcctttgcaatccaagattctctctct 4759838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 46 - 469
Target Start/End: Original strand, 36979270 - 36979709
Alignment:
Q  46 tccaagcaacaacaactaaaaacagacctagacttagtgtagagcaacaccacaagcataaa---caaagcacaa--agataagcaatgaaagaaggaac 140  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||   | | |   ||||||| ||  |||||||||| ||||| | ||||    
T  36979270 tccaagcaacaacaac-aaaaacagccctagact-agtgtagagcaaaaccacacaaagagataccaaagcaaaacaagataagcaa-gaaaggaagaac 36979366  T
Q  141 aaacacaccaa-aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactatgatgaaagt---------- 229  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||              
T  36979367 aaa-acaccaagaagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagg 36979464  T
Q  230 gttacaagaaa-aatagtttgcaagcttacacaagaacaagacttaatttctacccatttgtgttt-ctcactctctcaataatgaaccct-aaagggaa 326  Q
    ||||||||||| |||||  | |||||||||||||||||||  | ||  |||||||| || |||||| | ||||||| |||| ||||||||| |||| |||    
T  36979465 gttacaagaaacaatagccttcaagcttacacaagaacaaaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaat-atgaaccctaaaagagaa 36979563  T
Q  327 gacacaaaaggaagcttttgatccttccaa-tggtgaaat-ctcactacccaaaatgtttacaatg-tttctcaacccaagagatcctcactacaaagac 423  Q
    ||||| | |||||||||| ||||||||||| |  |||| | ||||||||||||  || |||||||| |||| ||||| ||||||  ||| ||||||||||    
T  36979564 gacactagaggaagctttagatccttccaactaatgaactcctcactacccaaggtgattacaatgttttcccaacctaagagacactctctacaaagac 36979663  T
Q  424 actcaaccctaaagttacctcctttgtaatccaagtttctctctct 469  Q
    ||||||||||   ||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  36979664 actcaaccctttggttcccttctttgtaatccaagtttctctctct 36979709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 91; E-Value: 9e-44
Query Start/End: Original strand, 380 - 584
Target Start/End: Complemental strand, 43036386 - 43036182
Alignment:
Q  380 tgtttacaatgtttctcaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatcc-aagtttctctctcttcaagctct 478  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |   | | ||||||| |||||||||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||| ||||    
T  43036386 tgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaat-caaagaccctcaaccctaaagttacctcctttgatttcccaagtttctctctcttcaacctct 43036288  T
Q  479 ccttcaaaatctgcacaagaacacttaaataacagtcttcagctgataaaatcgtgccacgtttt-ccaaatcatgccacgattgatgcgtacgacccaa 577  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||| || |||| ||| ||||||||| ||||    
T  43036287 cattcaaaatctgca-aagaacacttatataacagtcttcagctgtcaaaatcgtgtcacgttttcccaaatcgtgacacgtttggtgcgtacgatccaa 43036189  T
Q  578 ggtacga 584  Q
    |||||||    
T  43036188 ggtacga 43036182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 328 - 487
Target Start/End: Original strand, 28307746 - 28307907
Alignment:
Q  328 acacaaaaggaagcttttg-atccttccaatggtgaaatctcactacccaaaatgtttacaatgtttctcaacccaagagatcctcactacaaagacact 426  Q
    ||||||||| ||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||  |||| |||||||||| ||||| |||||| ||   |||||||||||||    
T  28307746 acacaaaagaaagcttttttatccttccaattgtgaaatctcactacccaaggtgttaacaatgtttcccaacctaagagaaccgtgctacaaagacact 28307845  T
Q  427 caaccctaaagttacctcctttgtaatcc-aagtttctctctcttcaagctctccttcaaaa 487  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28307846 caactctaaagttacctcctttgtaatcctaagtttctctctcttcaagctctcattcaaaa 28307907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 380 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 30143305 - 30143099
Alignment:
Q  380 tgtttacaatgtttctcaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatcc-aagtttctctctcttcaagctct 478  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |   | | ||||||| |||||||||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||    
T  30143305 tgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaat-caaagaccctcaaccctaaagttacctcctttgatttcccaagtttctctctcttcaagctct 30143207  T
Q  479 ccttcaaaatctgcacaagaacacttaaataacagtcttcagctgataaaatcgtgccacgtttt-ccaaatcatgccacgattgatgcgtacgacccaa 577  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||| ||  ||||||||| |||||||| ||||||| || |||| ||| ||||||||||||||    
T  30143206 ccttcaaaatctaca-aagaacacttatatagcagtcttcagttgtcaaaatcgtgtcacgttttgccaaatcgtgacacggttggtgcgtacgacccaa 30143108  T
Q  578 ggtacgacc 586  Q
     ||||||||    
T  30143107 agtacgacc 30143099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 380 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 15212749 - 15212543
Alignment:
Q  380 tgtttacaatgtttctcaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatcc-aagtttctctctcttcaagctct 478  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |   | | ||||||| |||||||||||||||||||| ||||   ||| |||||||||||||||||||||||    
T  15212749 tgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaat-caaagaccctcaaccctaaagttacctcatttgatttcccaagtttctctctcttcaagctct 15212651  T
Q  479 ccttcaaaatctgcacaagaacacttaaataacagtcttcagctgataaaatcgtgccacgttttcc-aaatcatgccacgattgatgcgtacgacccaa 577  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||| ||| |||||||||||||  | ||||||| ||| |||||| ||||| || |||| ||| ||||||||||||||    
T  15212650 ccttcaaaatctgta-aagaacacttatatagcagtcttcagctgtcacaatcgtgtcacattttcctaaatcgtgacacgtttggtgcgtacgacccaa 15212552  T
Q  578 ggtacgacc 586  Q
    |||||||||    
T  15212551 ggtacgacc 15212543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 46 - 460
Target Start/End: Original strand, 30655533 - 30655970
Alignment:
Q  46 tccaagcaacaacaactaaaaacagacctagacttagtgtagagcaacaccacaagcata-----aacaaagcacaaa---gataagcaatgaaagaagg 137  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||  ||||     ||||||||| |||   ||||||||| ||||| | |    
T  30655533 tccaagcaacaacaacaaaaaacagccctagact-agtgtagagcaaaaccaca--catagagataacaaagcataaacaagataagcaa-gaaaggaag 30655628  T
Q  138 aacaaaca---caccaa-aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactatgatgaaagt---- 229  Q
    |||||| |   |||||| ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||        
T  30655629 aacaaaaaaaacaccaagaagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatctaatatgatgaaagtgtta 30655727  T
Q  230 ------gttacaagaaa-aatagtttgcaagcttacacaagaacaagacttaatttctacccatttgtgttt-ctcactctctcaataatgaaccct-aa 320  Q
          ||||||||||| |||||  | |||||||||||||||||||  | ||  |||||||| || |||||| | ||||||| |||| ||||||||| ||    
T  30655728 caaagggttacaagaaacaatagccttcaagcttacacaagaacaaaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaat-atgaaccctaaa 30655826  T
Q  321 agggaagacacaaaaggaagcttttgatccttccaa-tggtgaaat-ctcactacccaaaatgtttacaatg--tttctcaacccaagagatcctcacta 416  Q
    || |||||||| | |||||||||| ||||||||||| |  |||| | ||||||||||||  || ||||||||  |||| ||||||||||||  ||| | |    
T  30655827 agagaagacactagaggaagctttagatccttccaactaatgaactcctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaa 30655926  T
Q  417 caaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatccaagtt 460  Q
    |||||||||||||||||   ||| |||||||||| |||||||||    
T  30655927 caaagacactcaaccctttggttccctcctttgttatccaagtt 30655970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 152 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 10689239 - 10688903
Alignment:
Q  152 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactatgatgaaagtgt----------tacaagaaa- 240  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||          |||||||||     
T  10689239 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacagagggttacaagaaac 10689141  T
Q  241 aatagtttgcaagcttacacaagaacaagacttaatttctacccatttg-tgttt-ctcactctctcaataatgaaccct-aaagggaagacacaaaagg 337  Q
    |||||  | |||||||||||||||||||| | ||  |||||||||| || ||||| | ||||||| |||| ||||||||| |||| |||||||| | |||    
T  10689140 aatagccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccatatgttgtttccccactctcacaat-atgaaccctaaaagagaagacactagagg 10689042  T
Q  338 aagcttttgatccttcc---aatggtgaaat-ctcactacccaaaatgtttacaatg--tttctcaacccaagagatcctcactacaaagacactcaacc 431  Q
    ||||||| |||||| ||   | |  |||| | ||||||||||||  || ||||||||  |||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||    
T  10689041 aagctttagatcctcccccaactaatgaactcctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctctacaaagacactcaacc 10688942  T
Q  432 ctaaagttacctcctttgtaatccaagtttctctctctt 470  Q
    ||   ||| |||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  10688941 ctttggttccctcctttgttatccaagtttctctttctt 10688903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 380 - 586
Target Start/End: Original strand, 12702843 - 12703050
Alignment:
Q  380 tgtttacaatgtttctcaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatcc-aagtttctctctcttcaagctct 478  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |   | | ||||||| |||||||||||| ||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||    
T  12702843 tgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaat-caaagaccctcaaccctaaatttacctcctttgatttcccaagtttctctctcttcaagctct 12702941  T
Q  479 ccttcaaaatctgcacaagaacacttaaataacagtcttcagctgataaaatcgtgccacgtttt--ccaaatcatgccacgattgatgcgtacgaccca 576  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| |||||| |||||| |||  ||||||||| ||||||||  ||||||| || ||||  || |||||||||||||    
T  12702942 ccttcaaaatatgca-aagaacacttacataacaatcttcaactgtcaaaatcgtgtcacgtttttcccaaatcgtgacacgtatggtgcgtacgaccca 12703040  T
Q  577 aggtacgacc 586  Q
    | ||||||||    
T  12703041 atgtacgacc 12703050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 117 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 18870692 - 18870325
Alignment:
Q  117 aagataagcaatgaaagaaggaacaaacacaccaa-aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatcc 215  Q
    ||||||||||| ||||| | ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18870692 aagataagcaa-gaaaggaagaacaaa-acaccaagaagattgttgacccagttca-tccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcc 18870596  T
Q  216 actatgatgaaagtgtt-----------acaagaaa-aatagtttgcaagcttacacaagaacaagacttaatttctacccatttgtgttt-ctcactct 302  Q
    | ||| |||||||||||           |||||||| |||||  | |||||||||||||||||||  | ||  |||||||| || || ||| | ||||||    
T  18870595 aatataatgaaagtgttacaaaagggttacaagaaacaatagcattcaagcttacacaagaacaaaccctagattctaccctttggtatttccccactct 18870496  T
Q  303 ctcaataatgaaccct-aaagggaagacacaaaaggaagcttttgatccttccaa-tggtgaaat-ctcactacccaaaatgtttacaatg--tttctca 397  Q
    | |||| ||||||||| |||| |||||||| | |||||||||| ||||||||||| |  |||| | ||||||||||||  || ||||||||  |||| ||    
T  18870495 cacaat-atgaaccctaaaagagaagacactagaggaagctttagatccttccaactaatgaactcctcactacccaaggtgattacaatgtttttccca 18870397  T
Q  398 acccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatccaagtttctctctct 469  Q
    ||||||||||  ||| | ||||||||||||||||||   ||| |||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  18870396 acccaagagacactctcaacaaagacactcaaccctttggttccctcctttgttatccatgtttctctctct 18870325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 417 - 586
Target Start/End: Original strand, 34254569 - 34254739
Alignment:
Q  417 caaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatcc-aagtttctctctcttcaagctctccttcaaaatctgcacaagaacacttaaataacagtc 515  Q
    ||||||| || |||||||||||| |||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || ||    
T  34254569 caaagaccctaaaccctaaagttgcctcctttgatttcccaagtttctctctcttcaagctctccttcaaaatctgca-aagaacacttatatagcaatc 34254667  T
Q  516 ttcagctgataaaatcgtgccacgtttt--ccaaatcatgccacgattgatgcgtacgacccaaggtacgacc 586  Q
    |||||| |   |||||||| ||||||||  || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34254668 ttcagc-gtcgaaatcgtgtcacgtttttccccaatcgtgccacgattgatgcgtacgacccaaggtacgacc 34254739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 380 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 33352113 - 33351907
Alignment:
Q  380 tgtttacaatgtttctcaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatcc-aagtttctctctcttcaagctct 478  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |   | | ||||||| ||||||||||||||||||| |||||   ||| |||||||||||||||| | |||     
T  33352113 tgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaat-caaagaccctcaaccctaaagttaccttctttgatttcccaagtttctctctcttccacctca 33352015  T
Q  479 ccttcaaaatctgcacaagaacacttaaataacagtcttcagctgataaaatcgtgccacgttttcc-aaatcatgccacgattgatgcgtacgacccaa 577  Q
    |||||||||| |||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| |||||||||| |||||||| |||| ||| |||||| |||||||    
T  33352014 ccttcaaaatttgca-aagaaaacttatatagcagtcttcagctgtcaaaatcgtgtcacgttttcccaaatcatgacacgtttggtgcgtatgacccaa 33351916  T
Q  578 ggtacgacc 586  Q
    |||||||||    
T  33351915 ggtacgacc 33351907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 78 - 230
Target Start/End: Original strand, 6813608 - 6813761
Alignment:
Q  78 cttagtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagcac-aaagataagcaatgaaagaa-ggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtcc 175  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  6813608 cttagtgtagaacaacatcacaagcataatcaaagcaataaagataagaaatgaaagaaaggaacaaacataccaaa-gattgttaacccagttcggtcc 6813706  T
Q  176 aatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactatgatgaaagtg 230  Q
    ||||| |||||  || |||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||    
T  6813707 aatataacctacactaggggagagagcagctctccaatccaataagatgaaagtg 6813761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 380 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 17982616 - 17982410
Alignment:
Q  380 tgtttacaatgtttctcaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatcc-aagtttctctctcttcaagctct 478  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |   | | ||||||| || |||||||||||| | |||||||   ||| |||||||||||||||||||||||    
T  17982616 tgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaat-caaagaccctaaaccctaaagttgcttcctttgatttcccaagtttctctctcttcaagctct 17982518  T
Q  479 ccttcaaaatctgcacaagaacacttaaataacagtcttcagctgataaaatcgtgccacgtttt--ccaaatcatgccacgattgatgcgtacgaccca 576  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||| | |||||| || |  ||||||||| ||||||||  || |||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  17982517 ccttcaaaatctgca-aagaacacttatatagctgtcttctgc-gtcaaaatcgtgtcacgtttttccccaatcgtgccacgattgatgcgtacgatcca 17982420  T
Q  577 aggtacgacc 586  Q
    ||||||||||    
T  17982419 aggtacgacc 17982410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 117 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 18853298 - 18852931
Alignment:
Q  117 aagataagcaatgaaagaaggaacaaacacaccaa-aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatcc 215  Q
    ||||||||||| ||||| | ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18853298 aagataagcaa-gaaaggaagaacaaa-acaccaagaagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcc 18853202  T
Q  216 actatgatgaaagtgtt-----------acaagaaa-aatagtttgcaagcttacacaagaacaagacttaatttctacccatttgtgttt-ctcactct 302  Q
    | ||| |||||||||||           |||||||| |||||  | |||||||||||||||||||  | ||  || ||||| || || ||| | ||||||    
T  18853201 aatataatgaaagtgttacaaaagggttacaagaaacaatagcattcaagcttacacaagaacaaaccctagattttaccctttggtatttccccactct 18853102  T
Q  303 ctcaataatgaaccct-aaagggaagacacaaaaggaagcttttgatccttccaa-tggtgaaat-ctcactacccaaaatgtttaca--atgtttctca 397  Q
    | |||| ||||||||| |||| |||||||| | |||||||||| ||||||||||| |  |||| | ||||||||||||  || |||||  || |||| ||    
T  18853101 cacaat-atgaaccctaaaagagaagacactagaggaagctttagatccttccaactaatgaactcctcactacccaaggtgattacaatatttttccca 18853003  T
Q  398 acccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatccaagtttctctctct 469  Q
    ||||||||||  ||| | ||||||||||||||||||   ||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18853002 acccaagagacactctcaacaaagacactcaaccctttggttccctcctttgttatccaagtttctctctct 18852931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 342 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 5990459 - 5990315
Alignment:
Q  342 ttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaaatgtttacaatgtttctcaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttac 441  Q
    |||||| | ||| |||||||||||||||| | |||| ||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  5990459 ttttgacctttcgaatggtgaaatctcacaaaccaagatgattacaatgtttcccaacccaagagaacctcact--aaagacactcaaccctaaagttac 5990362  T
Q  442 ctcctttgta-atccaagtttctctctcttcaagctctccttcaaaa 487  Q
    |  |||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  5990361 cgtctttgtatttccaagtttctctctcttctagctctccttaaaaa 5990315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 380 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 4731621 - 4731415
Alignment:
Q  380 tgtttacaatgtttctcaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttg-taatccaagtttctctctcttcaagctct 478  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |   | | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |  | ||||||||||||||||||| | ||    
T  4731621 tgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaat-caaagaccctcaaccctaaagttacctcctttgatttttcaagtttctctctcttcaaccgct 4731523  T
Q  479 ccttcaaaatctgcacaagaacacttaaataacagtcttcagctgataaaatcgtgccacgtttt-ccaaatcatgccacgattgatgcgtacgacccaa 577  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| |||  |||||||||||   ||||||||| |||||||| ||||||| || |||  ||| ||| |||| |||||    
T  4731522 ccttcaaaatctaca-aagaacacttatatagtagtcttcagctatcaaaatcgtgtcacgttttgccaaatcgtgacacagttggtgcctacggcccaa 4731424  T
Q  578 ggtacgacc 586  Q
    |||||||||    
T  4731423 ggtacgacc 4731415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 380 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 42498157 - 42498017
Alignment:
Q  380 tgtttacaatgtttctcaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatcc-aagtttctctctcttcaagctct 478  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||| | | | | ||||||| |||||||||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||    
T  42498157 tgtttacaacgtttcccaacccaagagaactttaat-caaagaccctcaaccctaaagttacctcctttgatttcccaagtttctctctcttcaagctct 42498059  T
Q  479 ccttcaaaatctgcacaagaacacttaaataacagtcttcagc 521  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||| ||| |||||||||||    
T  42498058 ccttcaaaatctgca-aagaacagttatatagcagtcttcagc 42498017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 342 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 9054318 - 9054193
Alignment:
Q  342 ttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaaatgtttacaatgtttctcaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttac 441  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||| |||||||  ||||||||||||  ||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  9054318 ttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaggtgattataatgttttccaacccaagagaatctcactacaaaaacactcaatcctaaagttac 9054219  T
Q  442 ctcctttgta-atccaagtttctctc 466  Q
    ||  ||||||  ||||||||||||||    
T  9054218 cttatttgtatttccaagtttctctc 9054193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 417 - 586
Target Start/End: Original strand, 19948562 - 19948732
Alignment:
Q  417 caaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatcc-aagtttctctctcttcaagctctccttcaaaatctgcacaagaacacttaaataacagtc 515  Q
    ||||||| || |||||||||||| | |||||||   ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||   |||    
T  19948562 caaagactctaaaccctaaagttgcttcctttgatttcccaagtttctctctcttcaagctctccttcaaaatctgca-aagaacacttatatagttgtc 19948660  T
Q  516 ttcagctgataaaatcgtgccacgtttt--ccaaatcatgccacgattgatgcgtacgacccaaggtacgacc 586  Q
    ||| || |  ||||||||| ||||||||  || |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19948661 ttctgc-gtcaaaatcgtgtcacgtttttccccaatcgtgccacgattgatgcgtacgatccaaggtacgacc 19948732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 417 - 582
Target Start/End: Original strand, 34256745 - 34256911
Alignment:
Q  417 caaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatcc-aagtttctctctcttcaagctctccttcaaaatctgcacaagaacacttaaataacagtc 515  Q
    ||||||| || |||||||||||| |||||||||   ||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || ||    
T  34256745 caaagaccctaaaccctaaagttgcctcctttgatttcccaagtttatctttcttcaagctctccttcaaaatctgca-aagaacacttatatagcaatc 34256843  T
Q  516 ttcagctgataaaatcgtgccacgtttt--ccaaatcatgccacgattgatgcgtacgacccaaggtac 582  Q
    |||||| |   |||||||| ||||||||  || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34256844 ttcagc-gtcgaaatcgtgtcacgtttttccccaatcgtgccacgattgatgcgtacgacccaaggtac 34256911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 328 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 7493086 - 7492976
Alignment:
Q  328 acacaaaaggaagctttt-gatccttccaatggtgaaatctcactacccaaaatgtttacaatgtttctcaacccaagagatcctcactacaaagacact 426  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||  | ||    
T  7493086 acactaaaggaagctttttgatccttctaattgtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttcccaatccaagagaacctcactacaaatgctct 7492987  T
Q  427 caaccctaaag 437  Q
    |||||||||||    
T  7492986 caaccctaaag 7492976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 380 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 31218220 - 31218014
Alignment:
Q  380 tgtttacaatgtttctcaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatcc-aagtttctctctcttcaagctct 478  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |   | | ||||||| || |||||||||||| | |||||||   ||| |||||||||||||||||||||||    
T  31218220 tgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaat-caaagaccctaaaccctaaagttgcttcctttgatttcccaagtttctctctcttcaagctct 31218122  T
Q  479 ccttcaaaatctgcacaagaacacttaaataacagtcttcagctgataaaatcgtgccacg--ttttccaaatcatgccacgattgatgcgtacgaccca 576  Q
     ||||||||||| || ||||||||||| ||| | |||||| || |  ||||||||| ||||  |||||| |||| || ||||||||||||||| || |||    
T  31218121 tcttcaaaatctaca-aagaacacttatatagctgtcttctgc-gtcaaaatcgtgtcacgttttttcccaatcgtgtcacgattgatgcgtatgatcca 31218024  T
Q  577 aggtacgacc 586  Q
    ||||||||||    
T  31218023 aggtacgacc 31218014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 454 - 586
Target Start/End: Original strand, 1746497 - 1746629
Alignment:
Q  454 ccaagtttctctctcttcaagctctccttcaaaatctgcacaagaacacttaaataacagtcttcagctgataaaatcgtgccacgtttt--ccaaatca 551  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||   |||||| || |  ||||||||| ||||||||  || ||||     
T  1746497 ccaagtttctctctcttccagctcttcttcaaaatctgca-aagaacacttatatagttgtcttctgc-gtcaaaatcgtgtcacgtttttccccaatcg 1746594  T
Q  552 tgccacgattgatgcgtacgacccaaggtacgacc 586  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1746595 tgccacgattgatgcgtacgatccaaggtacgacc 1746629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 135 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 4733894 - 4733809
Alignment:
Q  135 aggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagc-atctctccaatccactat 220  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  4733894 aggaacaaacacaccaaa-gactgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagagatcgatctctccaatccactat 4733809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 417 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 27811205 - 27811080
Alignment:
Q  417 caaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatcc-aagtttctctctcttcaagctctccttcaaaatctgcacaagaacacttaaataacagtc 515  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||   ||| || ||||||||||||| |||| ||||||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||    
T  27811205 caaagaccctcaaccctaaatttacctcctttgatttcccaattttctctctcttccagctttccttcaaaatatgca-aagaacacttatatagcagtc 27811107  T
Q  516 ttcagctgataaaatcgtgccacgttt 542  Q
    ||||||||  ||||||||| |||||||    
T  27811106 ttcagctgtcaaaatcgtgacacgttt 27811080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 152 - 236
Target Start/End: Original strand, 6311298 - 6311380
Alignment:
Q  152 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactatgatgaaagtgttacaa 236  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  6311298 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaa 6311380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 152 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 7290010 - 7289928
Alignment:
Q  152 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactatgatgaaagtgttacaa 236  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  7290010 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaa 7289928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 152 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 25328362 - 25328280
Alignment:
Q  152 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactatgatgaaagtgttacaa 236  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  25328362 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaa 25328280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 135 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 4731846 - 4731761
Alignment:
Q  135 aggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagc-atctctccaatccactat 220  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  4731846 aggaacaaacacaccaaa-gattgttgacccaattcggtccaacttgaccgaatctgggggagagatcgatctctccaatccactat 4731761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 135 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 15212974 - 15212893
Alignment:
Q  135 aggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga-gcatctctccaatcca 216  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||    
T  15212974 aggaacaaacacaccaaa-gattgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatcca 15212893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 135 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 33352338 - 33352253
Alignment:
Q  135 aggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga-gcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  33352338 aggaacaaacacatcaaa-gattgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactat 33352253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 380 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 44303817 - 44303611
Alignment:
Q  380 tgtttacaatgtttctcaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatc-caagtttctctctcttcaagctct 478  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |   | | ||||||| || ||||||||||||   |||||||   || ||||||||||||||||||||||||    
T  44303817 tgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaat-caaagaccctaaaccctaaagttgtttcctttgatttctcaagtttctctctcttcaagctct 44303719  T
Q  479 ccttcaaaatctgcacaagaacacttaaataacagtcttcagctgataaaatcgtgccacg--ttttccaaatcatgccacgattgatgcgtacgaccca 576  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||| ||| | |||||| || |   |||||||| ||||  ||| || |||| |||||| ||||||||||| || |||    
T  44303718 ctttcaaaatctgca-aagaacacttatatagctgtcttctgc-gtcgaaatcgtgtcacgattttccccaatcgtgccacaattgatgcgtatgatcca 44303621  T
Q  577 aggtacgacc 586  Q
    ||||||||||    
T  44303620 aggtacgacc 44303611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 78 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 9055008 - 9054850
Alignment:
Q  78 cttagtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagcac-aaagataagcaatgaaagaaggaa-caaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtcc 175  Q
    ||||| |||||  ||||||||||| |||| |||||||  |||||||||  |||||||||| || |||||||||||| |  || || || | |||| ||||    
T  9055008 cttagcgtagaataacaccacaagtataatcaaagcaataaagataagtcatgaaagaagcaatcaaacacaccaata--ttatttactctgttcagtcc 9054911  T
Q  176 aatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactatgatgaaagtgttacaa 236  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| |||||    
T  9054910 aatatgacctactctggaggagagagcagctctctaatccactaagatgaaagtgatacaa 9054850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 380 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 4733772 - 4733610
Alignment:
Q  380 tgtttacaatgtttctcaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttg-taatccaagtt--tctctctcttcaagct 476  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |   | | ||||||| |||||||||||||||||||| |||| |   |||||||  ||||||||||||| ||    
T  4733772 tgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaat-caaagaccctcaaccctaaagttacctcttttgatttcccaagtttctctctctcttcaacct 4733674  T
Q  477 ctccttcaaaatctgc-acaagaacacttaaataacagtcttcagctgataaaatcgtgccacg 539  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||| |||  |||||||| |||  ||||||||| ||||    
T  4733673 ctccttcaaaatctgcaaaaagaacacttatatagtagtcttcaactgtcaaaatcgtgacacg 4733610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 380 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 9765712 - 9765622
Alignment:
Q  380 tgtttacaatgtttctcaaccc--aagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaat-ccaagtttctctctc 468  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  9765712 tgtttacaatgtttcccaaccctcaagagaacctcact-caaagacactcaaccctcaagttacctcctttgtattcccaagtttctctctc 9765622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 156 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 43079937 - 43079873
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  43079937 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactat 43079873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 156 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 43082308 - 43082244
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  43082308 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactat 43082244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 138 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 40321265 - 40321183
Alignment:
Q  138 aacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga-gcatctctccaatccactat 220  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  40321265 aacaaacacatcaaa-gattgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactat 40321183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 135 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 43036611 - 43036526
Alignment:
Q  135 aggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga-gcatctctccaatccactat 220  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||   ||||||| ||||||||||    
T  43036611 aggaacaaacacaccaaa-gattgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctggaggagagattgatctctcaaatccactat 43036526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 136 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 27811465 - 27811381
Alignment:
Q  136 ggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga-gcatctctccaatccactat 220  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||   |||||| |||||||||||    
T  27811465 ggaaaaaacacaccaaa-gattgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctcttcaatccactat 27811381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 152 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 39784906 - 39784838
Alignment:
Q  152 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactatg 221  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  39784906 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg 39784838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 152 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 10684348 - 10684266
Alignment:
Q  152 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactatgatgaaagtgttacaa 236  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  10684348 aagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaa 10684266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 145 - 220
Target Start/End: Original strand, 10930188 - 10930264
Alignment:
Q  145 acaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga-gcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  10930188 acaccaagaaattgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactat 10930264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 156 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 18811042 - 18810978
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactat 220  Q
    |||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  18811042 ttgttgacccagttcggttcaaattgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactat 18810978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 380 - 539
Target Start/End: Original strand, 19945565 - 19945722
Alignment:
Q  380 tgtttacaatgtttctcaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatcc-aagtttctctctcttcaagctct 478  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||| |   | | ||||||| || |||||||||||| | |||||||   ||| |||||| ||||||||||||||||    
T  19945565 tgtttacaatgtttcccgacccaagagaactctaat-caaagactctaaaccctaaagttgcttcctttgatttcccaagtttgtctctcttcaagctct 19945663  T
Q  479 ccttcaaaatctgcacaagaacacttaaataacagtcttcagctgataaaatcgtgccacg 539  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||| | |||||| || |  ||||||||||||||    
T  19945664 ccttcaaaatctgca-aagaacacttatatagctgtcttctgc-gtcaaaatcgtgccacg 19945722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 152 - 236
Target Start/End: Original strand, 35745392 - 35745474
Alignment:
Q  152 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactatgatgaaagtgttacaa 236  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  35745392 aagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaa 35745474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 156 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 44721178 - 44721114
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  44721178 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgcgggagagagcagctctccaatccactat 44721114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 138 - 220
Target Start/End: Original strand, 4743197 - 4743279
Alignment:
Q  138 aacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga-gcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  4743197 aacaaacacaccaaa-gattgttgacccagttcggtccaacttgacctactttgggggagagattgatctctccaatccactat 4743279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 138 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 5689456 - 5689374
Alignment:
Q  138 aacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga-gcatctctccaatccactat 220  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  5689456 aacaaacacatcaaa-gattgttgacccagttcggtccaacttgaccaaatctgggggagagattgatctctccaatccactat 5689374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 138 - 236
Target Start/End: Original strand, 3051107 - 3051204
Alignment:
Q  138 aacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactatgatgaaagtgttacaa 236  Q
    ||||||||||||||| ||||  | ||||| ||||||| ||||| ||||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  3051107 aacaaacacaccaaa-gattagtaacccaattcggtctaatataacctcctctggaggagagagcacctctccaatccactaagatgaaagtgatacaa 3051204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 483 - 561
Target Start/End: Complemental strand, 31043191 - 31043113
Alignment:
Q  483 caaaatctgcacaagaacacttaaataacagtcttcagctgataaaatcgtgccacgttttccaaatcatgccacgatt 561  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||  |||||||||||||| |||| ||||||| || || |||||||    
T  31043191 caaaatctgcacaagaacacttaaatactagtcttccactgataaaatcgtgtcacgatttccaagtcgtgtcacgatt 31043113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 151 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 40221918 - 40221848
Alignment:
Q  151 aaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga-gcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  40221918 aaagattattgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactat 40221848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 152 - 229
Target Start/End: Original strand, 28307561 - 28307638
Alignment:
Q  152 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactatgatgaaagt 229  Q
    ||||||| | |||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||||| ||||||||||||||| |||| ||||    
T  28307561 aagattggtaacccagttcggtccaaaatgacctactctggggatgagagcagctctccaatccactaagatggaagt 28307638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 156 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 3874345 - 3874281
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| | |||| |||||||||    
T  3874345 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactat 3874281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 141 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 6599154 - 6599075
Alignment:
Q  141 aaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga-gcatctctccaatccactat 220  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||   ||||||| ||||||||||    
T  6599154 aaacacaccaaa-gattgttgacccagttcggtccaacttgacctaatatgggggagagattgatctctctaatccactat 6599075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 141 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 6674607 - 6674528
Alignment:
Q  141 aaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga-gcatctctccaatccactat 220  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||   ||||||| ||||||||||    
T  6674607 aaacacaccaaa-gattgttgacccagttcggtccaacttgacctaatatgggggagagattgatctctctaatccactat 6674528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 342 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 13204681 - 13204562
Alignment:
Q  342 ttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaaatgtttacaatgtttctcaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttac 441  Q
    ||||||| || |||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||         ||||||||| ||||| |||||||||| | || | |||||||||    
T  13204681 ttttgattctcccaacggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaat---------cccaagagaacctcattacaaagacatttaaacataaagttac 13204591  T
Q  442 ctcctttgta-atccaagtttctctctct 469  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||    
T  13204590 ctcctttgtatttccaagtttctctctct 13204562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 156 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 18813216 - 18813152
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||| ||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  18813216 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctaatatgggggagagagcagccctccaatccactat 18813152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 138 - 198
Target Start/End: Original strand, 19491681 - 19491741
Alignment:
Q  138 aacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggaga 198  Q
    |||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  19491681 aacaaacacaccaagatattgttgacctagttcggtccaatatgacctactatgggggaga 19491741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 372 - 449
Target Start/End: Original strand, 19491895 - 19491974
Alignment:
Q  372 acccaaaatgtttacaatgtttctcaaccc--aagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttg 449  Q
    |||||| |||||||| ||||||| ||||||  |||||| |||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||    
T  19491895 acccaagatgtttacgatgtttcccaaccctcaagagaacctcactacacatgcactcaaccctaaagttacctcctttg 19491974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 156 - 220
Target Start/End: Original strand, 22684653 - 22684717
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| | ||||  ||||||||    
T  22684653 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctaatctgggggagagagcagccctccgttccactat 22684717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 156 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 27829631 - 27829567
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| | |||| |||||||||    
T  27829631 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactat 27829567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 454 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 2627631 - 2627577
Alignment:
Q  454 ccaagtttctctctcttcaagctctccttcaaaatctgcacaagaacacttaaata 509  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  2627631 ccaagtttctctctcttccaactctccttcaaa-tctgcacaagaacacttaaata 2627577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 138 - 216
Target Start/End: Original strand, 12702617 - 12702695
Alignment:
Q  138 aacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga-gcatctctccaatcca 216  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||   ||||||||||||||    
T  12702617 aacaaacataccaaa-gattgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctaggggagagattgatctctccaatcca 12702695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 156 - 226
Target Start/End: Original strand, 16757268 - 16757339
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaat-atgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactatgatgaa 226  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||    
T  16757268 ttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactataatgaa 16757339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 156 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 25684824 - 25684753
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaat-atgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactatgatgaa 226  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||    
T  25684824 ttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactataatgaa 25684753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 156 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 28890947 - 28890877
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaat-atgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactatgatga 225  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||    
T  28890947 ttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactataatga 28890877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #86
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 135 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 30143528 - 30143443
Alignment:
Q  135 aggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga-gcatctctccaatccactat 220  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||| || |||  |||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  30143528 aggaacaaacacaccaaa-gattgttgactcagttcagttcaacttgaccttatctgggggagagattgatctctccaatccactat 30143443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #87
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 156 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 609069 - 609005
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||| || |||||||||||||||| | |||| |||||||||    
T  609069 ttgttgacccagttcggtccaaattgacttagtctgggggagagagcagccctccgatccactat 609005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #88
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 156 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 4424353 - 4424289
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| | |||  |||||||||    
T  4424353 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctctgatccactat 4424289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #89
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 156 - 220
Target Start/End: Original strand, 24873181 - 24873245
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactat 220  Q
    |||||||| || ||||||||||| ||||||| | |||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  24873181 ttgttgactcaattcggtccaatctgacctagtatgggggagagagcagccctccaatccactat 24873245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #90
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 156 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 27827320 - 27827256
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||| || |||||||||||||||| | |||| |||||||||    
T  27827320 ttgttgacccagttcggtccaaattgacttagtctgggggagagagcagccctccgatccactat 27827256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #91
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 156 - 220
Target Start/End: Original strand, 28251567 - 28251631
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||||| | |||| |||||||||    
T  28251567 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgatccactat 28251631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #92
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 156 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 32339644 - 32339580
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||| ||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| | |||| |||||||||    
T  32339644 ttgttaacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactat 32339580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #93
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 138 - 220
Target Start/End: Original strand, 3303653 - 3303735
Alignment:
Q  138 aacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga-gcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||   |||||| |||||||||||    
T  3303653 aacaaacacaccaaa-gattgtttacccagttcggtccaacttgacctactgtgggggagagattgatctcttcaatccactat 3303735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #94
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 156 - 226
Target Start/End: Original strand, 4812488 - 4812559
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaat-atgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactatgatgaa 226  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| |||||||| ||| |||||||||||| |||||| ||||||||| |||||    
T  4812488 ttgtttacccagttcggtctaattatgacctagtcttggggagagagcagctctccgatccactataatgaa 4812559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #95
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 156 - 203
Target Start/End: Original strand, 14419190 - 14419237
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagca 203  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  14419190 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagca 14419237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #96
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 156 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 28328089 - 28328018
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaat-atgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactatgatgaa 226  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||  |||||||| |||||    
T  28328089 ttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctccgttccactataatgaa 28328018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #97
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 156 - 203
Target Start/End: Original strand, 30480503 - 30480550
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagca 203  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  30480503 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagca 30480550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #98
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 138 - 200
Target Start/End: Original strand, 1345354 - 1345415
Alignment:
Q  138 aacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||  ||||||| |||||||||||||    
T  1345354 aacaaacacaccaaa-gattgttgacctagttcggtctaacttgacctactctgggggagaga 1345415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #99
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 335 - 460
Target Start/End: Original strand, 6311493 - 6311622
Alignment:
Q  335 aggaagcttttgatccttccaa-tggtgaaatc-tcactacccaaaatgtttacaatgtttctc--aacccaagagatcctcactacaaagacactcaac 430  Q
    |||||||||||||||||||||| |  |||| || |||||||||||  || ||||||||||| ||  |||||||||||  ||| | |||||||||||||||    
T  6311493 aggaagcttttgatccttccaactaatgaactcctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaac 6311592  T
Q  431 cctaaagttacctcctttgtaatccaagtt 460  Q
    |||   ||| |||||||||  |||||||||    
T  6311593 cctttggttccctcctttgctatccaagtt 6311622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #100
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 417 - 478
Target Start/End: Original strand, 11712244 - 11712306
Alignment:
Q  417 caaagacactcaaccctaaagttacctcctttg-taatccaagtttctctctcttcaagctct 478  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  | ||||||||||||||| |||||||    
T  11712244 caaagacactcaaccctaaagttacctcatttgataccctaagtttctctctcttgaagctct 11712306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #101
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 380 - 449
Target Start/End: Original strand, 3303875 - 3303943
Alignment:
Q  380 tgtttacaatgtttctcaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttg 449  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||  | | ||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  3303875 tgtttacaatgtttcccaacccaagagaaccctaat-caaagaccctcaaccgtaaagttacctcctttg 3303943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #102
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 387 - 487
Target Start/End: Original strand, 3318761 - 3318862
Alignment:
Q  387 aatgtttctcaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatc-caagtttctctctcttcaagctctccttcaa 485  Q
    ||||||||  ||||||||||| |||| |  ||||||| |||||||||||||||||||| |||| | || ||| ||||||||| || ||||||| | ||||    
T  3318761 aatgtttcctaacccaagagaacctcccaccaaagaccctcaaccctaaagttacctcatttgaattctcaactttctctcttttgaagctctgcctcaa 3318860  T
Q  486 aa 487  Q
    ||    
T  3318861 aa 3318862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #103
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 156 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 14808096 - 14808051
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagag 201  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  14808096 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagag 14808051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #104
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 156 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 15809553 - 15809489
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||| | |||  |||||||||    
T  15809553 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctctgatccactat 15809489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #105
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 156 - 220
Target Start/End: Original strand, 28283221 - 28283284
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||| | |||| |||||||||    
T  28283221 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccctccgatccactat 28283284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #106
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 156 - 222
Target Start/End: Original strand, 33079685 - 33079753
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgaccta-atctggggg-agagagcatctctccaatccactatga 222  Q
    ||||| ||||||||||  ||||||||||||| ||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||    
T  33079685 ttgttaacccagttcgacccaatatgacctacatctggggggagagatcagctctccaatccactatga 33079753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #107
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 372 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 41266940 - 41266840
Alignment:
Q  372 acccaaaatgtttacaa-tgtttctcaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatcc-aagtttctctctct 469  Q
    ||||||| | ||||||| ||| || |||||||||||| |||| |  |||||||| ||||||||||||||||||| ||||  |||| | ||||||||||||    
T  41266940 acccaaagtatttacaactgtctcccaacccaagagaacctctcaccaaagacattcaaccctaaagttacctcatttgatatcctaggtttctctctct 41266841  T
Q  470 t 470  Q
    |    
T  41266840 t 41266840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #108
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 141 - 220
Target Start/End: Original strand, 41366601 - 41366679
Alignment:
Q  141 aaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga-gcatctctccaatccactat 220  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||  |||||||||||  ||||||||   ||||||||||||||||||    
T  41366601 aaacacaccaaa-gattgttgtcccagttcggtccaacttgacctaatct-agggagagattgatctctccaatccactat 41366679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #109
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 138 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 42498380 - 42498297
Alignment:
Q  138 aacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtcc-aatatgacctaatctgggggagaga-gcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||  ||||||| ||||| |||||||   ||||||||||||||||||    
T  42498380 aacaaacacaccaaa-gattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactat 42498297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #110
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 156 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 43530450 - 43530386
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| |||| |||| | |||| |||||||||    
T  43530450 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggagagacagcagccctccgatccactat 43530386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #111
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 156 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 15073046 - 15072999
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagca 203  Q
    ||||||||||||||||||| ||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  15073046 ttgttgacccagttcggtctaaattgacctagtctgggggagagagca 15072999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #112
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 163 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 17847848 - 17847785
Alignment:
Q  163 cccagttcggtccaata-tgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactatgatga 225  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||| | ||||| |||||||| ||||    
T  17847848 cccagtttggtccaatactgacctagtctgggggagagagcagccctccattccactataatga 17847785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #113
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 156 - 203
Target Start/End: Original strand, 37214264 - 37214311
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagca 203  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||    
T  37214264 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagca 37214311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #114
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 156 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 41382997 - 41382950
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagca 203  Q
    ||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  41382997 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagca 41382950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #115
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 156 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 41385079 - 41385032
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagca 203  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| | ||||||||||||||    
T  41385079 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagca 41385032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #116
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 546 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 42498012 - 42497973
Alignment:
Q  546 aaatcatgccacgattgatgcgtacgacccaaggtacgac 585  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  42498012 aaatcatgtcacgattgatgcgtaggacccaaggtacgac 42497973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #117
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 481 - 586
Target Start/End: Original strand, 4743498 - 4743604
Alignment:
Q  481 ttcaaaatctgcacaagaacacttaaataacagtcttcagctgataaaatcgtgccacgtttt-ccaaatcatgccacgattgatgcgtacgacccaagg 579  Q
    ||||||||||||| |  |||||||| ||| ||||||||| |||  |||  ||||  ||||||| ||||||  || |||| ||||||||||||||||| ||    
T  4743498 ttcaaaatctgcaaagaaacacttatatagcagtcttcatctgtcaaatacgtgtgacgttttgccaaattgtgacacggttgatgcgtacgacccacgg 4743597  T
Q  580 tacgacc 586  Q
    |||||||    
T  4743598 tacgacc 4743604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #118
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 546 - 584
Target Start/End: Original strand, 19945710 - 19945748
Alignment:
Q  546 aaatcatgccacgattgatgcgtacgacccaaggtacga 584  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19945710 aaatcgtgccacgattgatgcgtacgatccaaggtacga 19945748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #119
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 156 - 225
Target Start/End: Original strand, 23179561 - 23179631
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaat-atgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactatgatga 225  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| || |||  |||||||| ||||    
T  23179561 ttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctatccgttccactataatga 23179631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #120
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 179 - 225
Target Start/End: Original strand, 29554809 - 29554855
Alignment:
Q  179 atgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactatgatga 225  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||    
T  29554809 atgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactataatga 29554855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #121
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 374 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 38863841 - 38863743
Alignment:
Q  374 ccaaaatgtttacaa-tgtttctcaacccaagaga--tcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttg-taatccaagtttctctctct 469  Q
    |||| |||||||||| |||||| ||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||| |||||||| ||| |||| |  || ||||||||||||||    
T  38863841 ccaagatgtttacaaatgtttcccaacccaagagaactcctcacta--aagacactcaaccttaaagttagctcatttgattttcaaagtttctctctct 38863744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #122
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 545 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 10014957 - 10014916
Alignment:
Q  545 caaatcatgccacgattgatgcgtacgacccaaggtacgacc 586  Q
    |||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10014957 caaatcgtgacacgattgatgcatacgacccaaggtacgacc 10014916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #123
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 156 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 15956293 - 15956248
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagag 201  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  15956293 ttgttgacccagttcagtccaaattgacctaatctgagggagagag 15956248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #124
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 156 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 25952856 - 25952787
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactatgatga 225  Q
    ||||||||| ||||||||||||  | ||||| |||||||||||||||| | ||||  |||||||| ||||    
T  25952856 ttgttgacctagttcggtccaaatttacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactataatga 25952787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #125
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 417 - 480
Target Start/End: Original strand, 1292704 - 1292768
Alignment:
Q  417 caaagacactcaaccctaaagttacctcctttg-taatccaagtttctctctcttcaagctctcc 480  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||| |  |||||||||  ||||||| |||||||||    
T  1292704 caaagaccctcaaccctaaagttacctcatttgattttccaagttttcctctcttgaagctctcc 1292768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #126
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 426 - 489
Target Start/End: Original strand, 1872173 - 1872237
Alignment:
Q  426 tcaaccctaaagttacctcctttgtaatc-caagtttctctctcttcaagctctccttcaaaatc 489  Q
    |||||||||||||||| | |||||   || |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  1872173 tcaaccctaaagttactttctttgatttctcaagtttctctctcttgaagctctccctcaaaatc 1872237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #127
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 380 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 4162463 - 4162400
Alignment:
Q  380 tgtttacaatgtttctcaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctc 444  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| ||  | | ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4162463 tgtttacaatgttttccaacccaagagaaccctaat-caaagaccctcaaccctaaagttacctc 4162400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #128
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 156 - 200
Target Start/End: Original strand, 15185714 - 15185758
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga 200  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||    
T  15185714 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagaga 15185758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #129
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 138 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 17982839 - 17982756
Alignment:
Q  138 aacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtcc-aatatgacctaatctgggggagaga-gcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||  ||||||| ||||| |||||||   | ||||||||||||||||    
T  17982839 aacaaacacaccaaa-gattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactat 17982756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #130
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 157 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 18141987 - 18141923
Alignment:
Q  157 tgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga-gcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||| ||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||   ||||||||||||||||||    
T  18141987 tgttggcccagtttggtccaacttgacctaatctaggggagagattgatctctccaatccactat 18141923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #131
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 387 - 470
Target Start/End: Original strand, 29796535 - 29796618
Alignment:
Q  387 aatgtttctcaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatc-caagtttctctctctt 470  Q
    |||||||| |||||||||||| || | |  ||||||  |||||||||||||||||||||||||   || ||||||||||||||||    
T  29796535 aatgtttcccaacccaagagaacc-ctcgccaaagatcctcaaccctaaagttacctcctttgatttctcaagtttctctctctt 29796618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #132
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 138 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 30291793 - 30291710
Alignment:
Q  138 aacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgg-gggagaga-gcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||  || | |||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||    
T  30291793 aacaaacacaccaaa-gattgttgattcagttcggtccaacttggcataatctggagggagagattgatctctccaatccactat 30291710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #133
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 159 - 203
Target Start/End: Original strand, 33541413 - 33541457
Alignment:
Q  159 ttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagca 203  Q
    |||||||| ||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  33541413 ttgacccaattcggtccaaattgacctagtctgggggagagagca 33541457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #134
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 138 - 220
Target Start/End: Original strand, 34254313 - 34254396
Alignment:
Q  138 aacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatat-gacctaatctgggggagagagc-atctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  | |||||| ||| | |||||||   ||||||||||||||||||    
T  34254313 aacaaacacaccaaa-gattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgatctctccaatccactat 34254396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #135
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 138 - 220
Target Start/End: Original strand, 34256489 - 34256572
Alignment:
Q  138 aacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatat-gacctaatctgggggagagagc-atctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  | |||||| ||| | |||||||   ||||||||||||||||||    
T  34256489 aacaaacacaccaaa-gattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgatctctccaatccactat 34256572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 386; Significance: 0; HSPs: 167)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 386; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 5396911 - 5396372
Alignment:
Q  12 agcaaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaactaaaaacagacctagact---tagtgtagagcaacaccacaagcataaac 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5396911 agcaaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaac-aaaaacagacctagactaattagtgtagagcaacaccacaagcataaac 5396813  T
Q  109 aaagcacaaagataagcaatgaaagaa-ggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctc 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  5396812 aaagcacaaagataagcaatgaaagaaaggaagaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctggaggagagagcagctc 5396713  T
Q  208 tccaatccactatgatgaaagtgttacaa-ga--------aaaatagtttgcaagcttacacaagaacaagacttaatttctacccatttgtgtttctca 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||        ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  5396712 tccaatccactatgatgaaagtgttgcaaagagttacaagaaaatagcttgcaagcttacacaagaacaagacctaatttctacccatttgtgttactca 5396613  T
Q  299 ctctctcaataatgaaccctaaagggaagacacaaaaggaagcttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaaatgtttacaatgtttctcaa 398  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||    
T  5396612 ctctctcaatgatgaaccctaaagagaagacacaaaagaaagcttttgattcttccaatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttcccaa 5396513  T
Q  399 cccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatccaagtttctctctcttcaagctctccttcaaaatctgcacaaga 498  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  5396512 cccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagtaacctcctttgtaatccaagtttctctctcttccagctctccttcaaaatctgctcaaga 5396413  T
Q  499 acacttaaataacagtcttcagctgataaaatcgtgccacg 539  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||    
T  5396412 acacttatatagcagtcttcagctgtcaaaatcgtggcacg 5396372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 382; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 8689712 - 8689150
Alignment:
Q  15 aaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaactaaaaacagacctagacttagtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagca 114  Q
    ||||||||||||||||     |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8689712 aaaggaagtggtaatc-----gtaaagtgtctccaagtaacaacaac-aaaaacagacctagacttaatgcagagcaacaccacaagcataaacaaagca 8689619  T
Q  115 caaagataagcaatgaaagaagg-aacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaat 213  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||   | |||||| ||    
T  8689618 caaagataagcaatgaaagaaagtaacaaacacaccaaaagattgttgatccagttcggtccaatatgatctaatatgggggagagg--agctctcctat 8689521  T
Q  214 ccactatgatgaaagtgttacaagaaaaatagtttgcaagcttacacaagaacaagacttaatttctacccatttgtgtttctcactctctcaataatga 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  8689520 ccactatgatgaaagtgttacaagaaaa-tagcttgcaagcttacacaagaacaagacctaatttctaccaatttgtgtttcccactctctcaatgatga 8689422  T
Q  314 accctaaagggaagacacaaaaggaagcttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaaatgtttacaatgtttctcaacccaagagatcctca 413  Q
    ||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  8689421 accctaa-gagaagacacaaaaggaaacttttgatccttccaatggtgaaatctcactatccaaggtgtttaaaatgtttcccaacccaagagatcctca 8689323  T
Q  414 ctacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatccaagtttctctctcttcaagctctccttcaaaatctgcacaagaacacttaaataacag 513  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  8689322 ctacaaagacactaaaccctaaagttacctcctttgtaatccaagtttctctcacttcaagctctccttcaaaatctgcacaagaacacttatatagcag 8689223  T
Q  514 tcttcagctgataaaatcgtgccacgttttccaaatcatgccacgattgatgcgtacgacccaaggtacgacc 586  Q
    ||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8689222 tcttcagctgtcaaaatcgtgtcacgttttccaaatcgtggcacgattggtgcgtacgacccaaggtacgacc 8689150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 361; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 31985866 - 31985288
Alignment:
Q  15 aaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaactaaaaacagacctagacttagtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagca 114  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  31985866 aaaggaagtggtaatctatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaaacagacctagtct-agtgtagagcaactccacaagcatatacaaagca 31985768  T
Q  115 c-aaagataagcaatgaaagaaggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaat 213  Q
      |||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  31985767 ataaagataagcaa-gaaaggaagaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggg-agagagcagctctccaat 31985670  T
Q  214 ccactatgatgaaagtgttacaa----------gaaaaatagtttgcaagcttacacaagaacaagacttaatttctacccatttgtgtttctcactctc 303  Q
    |||||||||||||||||||||||          ||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  31985669 ccactatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaaaatagcttgcaagcttacacaagaacaagtcctaatttctacccatttgtgtttcccactctc 31985570  T
Q  304 tcaataatgaaccctaaagg-gaagacacaaaaggaagcttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaaatgtttacaatgtttctcaaccca 402  Q
     ||||  ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||| |||||||    
T  31985569 acaatg-tgaaccctaaaagagaagacacaaaaggaagcttttgatccttcccatggtgaaatttcactacccaaggtgtttacaatgtttcccaaccca 31985471  T
Q  403 agagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatccaagtttctctctcttcaagctctccttcaaaatctgcacaagaacac 502  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  31985470 agagatcctcaatacaaaaacactcaaccctaaagttccctcctttgtaatccaagtttctctctcttcaagctc-acttcaaaatctgcacaagaacac 31985372  T
Q  503 ttaaataacagtcttcagctgataaaatcgtgccacgttttccaaatcatgccacgattgatgcgtacgacccaaggtacgacc 586  Q
    |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  31985371 ttaaatactagtcttcaactgataaaatcgtgccacgatttccaaatcgtgtcacgattgatgcgtacgtcacaaggtacgacc 31985288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 349; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 5269431 - 5268853
Alignment:
Q  12 agcaaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaacta--aaaacagacctaga-cttagtgtagagcaacaccacaagcataaac 108  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |  |||| | ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |    
T  5269431 agcaaaggaagtggtaatcaatggataaagtgtctccaagcaacaacaacaacaaaaatatacctagatctaagtgtagagcaacaccacaagcataatc 5269332  T
Q  109 aaagcac-aaagataagcaatgaaagaa-ggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatct 206  Q
    ||||||  ||| ||||| |||||||||| |||||||||||| |||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  5269331 aaagcaataaatataagaaatgaaagaaaggaacaaacacaacaa--gattgttgacctagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagcc 5269234  T
Q  207 ctccaatccactatgatgaaagtgttacaagaaaaatagtttgcaagcttacacaagaacaagacttaatttctacccatt-tgtgtttctcactctctc 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||  | ||| |||||    
T  5269233 ctccaatccactatgatgaaagtgttacaagaaat-tagcttataagcttacacaagaacaagacctaatttctacccattgtgtgtcacccacactctc 5269135  T
Q  306 aataatgaaccctaaagggaagacacaaaaggaagctttt-gatccttccaatggtgaaatctcactacccaaaatgtttacaatgtttctcaacccaag 404  Q
    ||||||||| ||||| | ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| |||||||||    
T  5269134 aataatgaatcctaa-gagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatctcactatccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaag 5269036  T
Q  405 agatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatccaagtttctctctcttcaagctctccttcaaaatctgcacaagaacactt 504  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5269035 agatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatccaagtttctctctcttcaagctctccttcaaaatctgcacaagaacactt 5268936  T
Q  505 aaataacagtcttcagctgataaaatcgtgccacgttt-tccaaatcatgccacgattgatgcgtacgacccaaggtacgacc 586  Q
    | ||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5268935 atatagcagtcttcagctgttaaaatcgtgtcacgtttgtccaaatcgtgacacgattggtgcgtacgacccaaggtacgacc 5268853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 325; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 586
Target Start/End: Original strand, 3777413 - 3777992
Alignment:
Q  15 aaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaactaaaaacagacctaga-cttagtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagc 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||| ||| ||||||||||||| ||||||    
T  3777413 aaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaac-aaaaacagacctagatctaagtgtagaacaaaaccacaagcataatcaaagc 3777511  T
Q  114 acaaagataagcaatgaaagaa-ggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaa 212  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||| | ||||||||    
T  3777512 acaaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccga--gattgttgacccagttcggtccaatataacctaatctagaggagagagtagctctccaa 3777609  T
Q  213 tccactatgatgaaagtgttacaa-ga--------aaaatagtttgcaagcttacacaagaacaagacttaatttctacccattt-gtgtttctcactct 302  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||        ||||||| |||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||  | ||||||    
T  3777610 tccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaaatagcttgcaaacttacacaagaacaagatctaatttctacccattttgtgtcacccactct 3777709  T
Q  303 ctcaataatgaaccctaaagggaagacacaaaaggaagctttt-gatccttccaatggtgaaatctcactacccaaaatgtttacaatgtttctcaaccc 401  Q
    | ||||| |||| ||||| | ||| | |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||    
T  3777710 cacaata-tgaatcctaa-gagaaaatacaaaaggaagctttttgatcattccaatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttcccaaccc 3777807  T
Q  402 aagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatccaagtttctctctcttcaagctctccttcaaaatctgcacaagaaca 501  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3777808 aagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatccaagtttctctctcttcaagctcaccttcaaaatctgcacaagaaca 3777907  T
Q  502 cttaaataacagtcttcagctgataaaatcgtgccacgttttccaaatcatgccacgattgatgcgtacgacccaaggtacgacc 586  Q
     ||| ||| |||||||||||||  |||||| || || |||||||||| | || |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3777908 tttatatagcagtcttcagctgtcaaaatcatgtcaagttttccaaaacgtggcacgattggtgcgtacgacccaaggtacgacc 3777992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 12 - 586
Target Start/End: Original strand, 5147537 - 5148121
Alignment:
Q  12 agcaaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaactaaaaacagacctaga-cttagtgtagagcaacaccacaagcataaacaa 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||| | || |||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  5147537 agcaaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagaaacaacaac-aataacagacctaaatctaagtgtagagcaacaccacaaacataatcaa 5147635  T
Q  111 agcacaa-agataagcaatgaaagaa-ggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctct 208  Q
    | ||  | |||||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||    
T  5147636 aacaatagagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccga--gattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatttgggggagggagcagctct 5147733  T
Q  209 ccaatccactatgatgaaagtgttacaaga----------aaaatagtttgcaagcttacacaagaacaagacttaatttctacccattt-gtgtttctc 297  Q
    ||| |||| ||||||||||||||||||| |          ||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||  | |    
T  5147734 ccagtccattatgatgaaagtgttacaaaatagttacaagaaaatagcttgcaagcttacacaagaacaaggcctaatttctacccattttgtgtcaccc 5147833  T
Q  298 actctctcaataatgaaccctaaagggaagacacaaaaggaagcttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaaatgtttacaatgtttctca 397  Q
    | |||| ||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||| ||    
T  5147834 attctcacaata-tgaaccctaaagagaaaacacaaaaggaagcttatgatccttccaatggtgaaatctcattatccaatgtgtttacaatgtttccca 5147932  T
Q  398 acccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatccaagtttctctctcttcaagctctccttcaaaatctgcacaag 497  Q
    || ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5147933 actcaagagatccttactacaaagacactaaaccctaaagttacctcctgtgtaatccaagtttctctcatttcaagctctccttcaaaatctgcacaag 5148032  T
Q  498 aacacttaaataacagtcttcagctgataaaatcgtgccacgttttccaaatcatgccacgattgatgcgtacgacccaaggtacgacc 586  Q
    |||||||| ||| ||||||| | ||||||| |||||| |||||||| |||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5148033 aacacttatatagcagtcttaaactgataagatcgtgtcacgttttgcaaatcgtgacacgattggtgcgtacgacccaaggtacgacc 5148121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 297; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 12 - 574
Target Start/End: Original strand, 10047239 - 10047808
Alignment:
Q  12 agcaaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaactaaaaacagacctaga-cttagtgtagagcaacaccacaagcataaacaa 110  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||| ||||| |||| |||| || |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  10047239 agcaaaggaagtggtaatcaatggataaagtgtctccaagcaataacaac-aaaaatagacatagatctaagtgtagagcaacaccacaagcataatcaa 10047337  T
Q  111 agcac-aaagataagcaatgaaagaa-ggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctct 208  Q
    ||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  10047338 agcaataaagataaacaatgaaagaaaggaacaaacacaccaa--gattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccct 10047435  T
Q  209 ccaatccactatgatgaaagtgttacaaga----------aaaatagtttgcaagcttacacaagaacaagacttaatttctacccattt-gtgtttctc 297  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |          ||| ||| ||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||  | |    
T  10047436 ccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttataagcttacacaagaacaagacctaatttctacccattttgtgtcaccc 10047535  T
Q  298 actctctcaataatgaaccctaaagggaagacacaaaaggaagctttt-gatccttccaatggtgaaatctcactacccaaaatgtttacaatgtttctc 396  Q
    || |||||||||||||| ||||| |  || ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |    
T  10047536 acactctcaataatgaatcctaa-gacaaaacacaaaaggaagttttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttccc 10047634  T
Q  397 aacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatccaagtttctctctcttcaagctctccttcaaaatctgcacaa 496  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10047635 aacccaagagatcctcattacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatccaagtttctctctcttcaagctctccttcaaaatctgcacaa 10047734  T
Q  497 gaacacttaaataacagtcttcagctgataaaatcgtgccacgttt-tccaaatcatgccacgattgatgcgtacgacc 574  Q
    ||||||||     | |||||||| |||  ||||||||| ||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||    
T  10047735 gaacactt-----atagtcttcaactgtcaaaatcgtgtcacgtttgtccaaatcgtgacacgattggtgcgtacgacc 10047808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 12 - 586
Target Start/End: Original strand, 5143119 - 5143704
Alignment:
Q  12 agcaaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaactaaaaacagacctaga-cttagtgtagagcaacaccacaagcataaacaa 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| | || |||||||| ||||||||||| ||||| |||    
T  5143119 agcaaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaaacaacaacaac-aaaaacagacctaaatctaagtgtagaacaacaccacaaacataatcaa 5143217  T
Q  111 agcacaa-agataagcaatgaaagaa-ggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctct 208  Q
    | ||  | |||||||||||||||||| |||||||||||||  |  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5143218 aacaatagagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacactga--gattgttgacctagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctct 5143315  T
Q  209 ccaatccactatgatgaaagtgttacaagaaa----------aatagtttgcaagcttacacaagaacaagacttaatttctacccattt-gtgtttctc 297  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||          ||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||    |    
T  5143316 ccaacccactatgatgaaagtgttacaaaaaatttacaagaaaatagcttgcaagcatacacaagaacaagacctaatttctactcattttgtgtcagcc 5143415  T
Q  298 actctctcaataatgaaccctaaagggaagacacaaaaggaagcttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaaatgtttacaatgtttctca 397  Q
    ||||||  |||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||||| ||    
T  5143416 actctcagaata-tgaaccctaaagagaaaacacaaaaggaagcttatgatccttccaatggtgaaatctcactacctaaggtgtttacaaagtttccca 5143514  T
Q  398 acccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatccaagtttctctctcttcaagctctccttcaaaatctgcacaag 497  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5143515 atccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctctgtaatccaagtttctcttacttcaagctctccttcaaaatctgcacaag 5143614  T
Q  498 aacacttaaataacagtcttcagctgat-aaaatcgtgccacgttttccaaatcatgccacgattgatgcgtacgacccaaggtacgacc 586  Q
    |||||||| ||| ||||||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||| || |||||||| |||| || ||||||||| |||||    
T  5143615 aacacttatatagcagtcttcagtagataaaaatcgtgtcacgttttccaaatcgtgacacgattggtgcgcacaacccaaggtgcgacc 5143704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 12 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 25862259 - 25861686
Alignment:
Q  12 agcaaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaactaaaaacagacctaga-cttagtgtagagcaacaccacaagcataaacaa 110  Q
    ||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  25862259 agcaaaggaagtggtaatcaatagataaagtgtctccaagcaacaacaac-aaaaacagacctaaatctaagtgtagagcaacaccacaagcataatcaa 25862161  T
Q  111 agcac-aaagataagcaatgaaagaa-ggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctct 208  Q
    ||||  |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  | ||    
T  25862160 agcaataaagataagcaatgaaagaaaggaataaacacaccaa--gattgttgactcagttcggtccaatatgacctaatatggggaagagagcggccct 25862063  T
Q  209 ccaatccactatgatgaaagtgttacaagaaaaatagtttgcaagcttacacaagaacaagacttaatttctacccattt-gtgtttctcactctctcaa 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||  ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||  | ||| |||||||    
T  25862062 ccaatccactatgatgaaagtgttacaagaaat-tagcttataagcttacacaagaacaagacctaattcctacccattttgtgtcacccacactctcaa 25861964  T
Q  308 taatgaaccctaaagggaagacacaaaaggaagctttt-gatccttccaatggtgaaatctcactacccaaaatgtttacaatgtttctcaacccaagag 406  Q
    |   ||| |||||  | || ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| |||||||||||    
T  25861963 t---gaatcctaagagaaaaacacaaaaggaagttttttgatccttccaatggtgaaatctcactactcaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagag 25861867  T
Q  407 atcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatccaagtttctctctcttcaagctctccttcaaaatctgcacaagaacacttaa 506  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |  ||||||||     
T  25861866 atcctcactacaaagacactcaaccctaaagttaccttctttgtaatccaagtttctctctctaaaagctctccttcaaaatctgcaaagaaacacttat 25861767  T
Q  507 ataacagtcttcagctgataaaatcgtgccacgttt-tccaaatcatgccacgattgatgcgtacgacccaaggtacgacc 586  Q
    |||  |||||||| |||  ||||||||| ||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25861766 atagaagtcttcaactgtcaaaatcgtgtcacgtttgtccaaatcgtgacacgattgatgcgtacgacccaaggtacgacc 25861686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 15 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 28468760 - 28468224
Alignment:
Q  15 aaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaactaaaaacagacctagacttagtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagca 114  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  28468760 aaaggaagtggtaatctatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaac-aaaaacagccctagtct-agtgtagagcaacaccacaagcaaatacaaagca 28468663  T
Q  115 -caaagataagcaatgaaagaaggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaat 213  Q
     | ||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  28468662 accaagataagcaa-gaaaggaagaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcag-ccaatatgacctaatctggaggagagagcagctctccaat 28468565  T
Q  214 ccactatgatgaaagtgttacaagaaaaa-tagtttgcaagcttacacaagaacaagacttaatttctacccatttgtgtttctc-actctctcaataat 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||| | |||||||||||| |    
T  28468564 ccactatgatgaaagtgttacaagaaaaaatagtttgcaagcttacacaataacaagacctagattctacccatttgtgtttccccactctctcaata-t 28468466  T
Q  312 gaaccctaaagg-gaagacacaaaaggaagcttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaaatgtttacaatgtttctc--aacccaagagat 408  Q
    |||||||||| | |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||| ||  ||||||||||||    
T  28468465 gaaccctaaaagagaagacacaagaggaagctttagatccttccaatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatatttttcccaacccaagagat 28468366  T
Q  409 cctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatccaagtttctctctc--------ttcaagctctccttcaaaatctgcacaagaac 500  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||        | ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28468365 cctcactacaaagacacttaaccctagagttccctcctttgtaatccaagtttctctctctaagctcttccaagctctcctccaaaatctgcacaagaac 28468266  T
Q  501 acttaaata--ac-agtcttcagctgataaaatcgtgccacg 539  Q
    |||||||||  || |||||||  |||||||||||||| ||||    
T  28468265 acttaaatactactagtcttccactgataaaatcgtgtcacg 28468224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 94 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 36315384 - 36314883
Alignment:
Q  94 accacaagcataaacaaagcacaa-agataagcaatgaaagaa-ggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctg 191  Q
    ||||||||||||| |||||||  | |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36315384 accacaagcataatcaaagcaatagagataaacaatgaaagaaaggaacaaacacaccaa--gaatgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctg 36315287  T
Q  192 ggggagagagcatctctccaatccactatgatgaaagtgttacaa-ga--------aaaatagtttgcaagcttacacaagaacaagacttaatttctac 282  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||        ||| ||| ||  |||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  36315286 ggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaattagcttagaagcttacacaagagcaagacctaatttctac 36315187  T
Q  283 ccatttgtgtttctcactctctcaataatgaaccctaaagggaagacacaaaaggaagcttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaaatgt 382  Q
    ||||||||||| | ||| |||||||||||||| ||||  |  || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||    
T  36315186 ccatttgtgttacccacactctcaataatgaatcctac-gaaaaaacacaaaaggaagcttttgatccttccaatggttaaatctcactacccaatgtgt 36315088  T
Q  383 ttacaatgtttctcaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatccaagtttctctctcttcaagctctcctt 482  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  36315087 ttacaatgtttcccaacccaagagatcctctctacaaagacactaaaccctaaagttacctcctttgtaatccaagtttatctctcttcaagctctcctt 36314988  T
Q  483 caaaatctgcacaagaacacttaaataacagtcttcagctgataaaatcgtgccacgttt-tccaaatcatgccacgattgatgcgtacgacccaaggta 581  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  36314987 caaaatctgcacaagaacacttatatagcagtcttcagctgtcaaaatcgtgtcacgtttgtccaaatcgtgacacgattggtgcgtacgacccaaggta 36314888  T
Q  582 cgacc 586  Q
    |||||    
T  36314887 cgacc 36314883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 94 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 36329593 - 36329092
Alignment:
Q  94 accacaagcataaacaaagcacaa-agataagcaatgaaagaa-ggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctg 191  Q
    ||||||||||||| |||||||  | |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36329593 accacaagcataatcaaagcaatagagataaacaatgaaagaaaggaacaaacacaccaa--gaatgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctg 36329496  T
Q  192 ggggagagagcatctctccaatccactatgatgaaagtgttacaa-ga--------aaaatagtttgcaagcttacacaagaacaagacttaatttctac 282  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||        ||| ||| ||  |||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  36329495 ggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaattagcttagaagcttacacaagagcaagacctaatttctac 36329396  T
Q  283 ccatttgtgtttctcactctctcaataatgaaccctaaagggaagacacaaaaggaagcttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaaatgt 382  Q
    ||||||||||| | ||| |||||||||||||| ||||  |  || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||    
T  36329395 ccatttgtgttacccacactctcaataatgaatcctac-gaaaaaacacaaaaggaagcttttgatccttccaatggttaaatctcactacccaatgtgt 36329297  T
Q  383 ttacaatgtttctcaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatccaagtttctctctcttcaagctctcctt 482  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  36329296 ttacaatgtttcccaacccaagagatcctctctacaaagacactaaaccctaaagttacctcctttgtaatccaagtttatctctcttcaagctctcctt 36329197  T
Q  483 caaaatctgcacaagaacacttaaataacagtcttcagctgataaaatcgtgccacgttt-tccaaatcatgccacgattgatgcgtacgacccaaggta 581  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  36329196 caaaatctgcacaagaacacttatatagcagtcttcagctgtcaaaatcgtgtcacgtttgtccaaatcgtgacacgattggtgcgtacgacccaaggta 36329097  T
Q  582 cgacc 586  Q
    |||||    
T  36329096 cgacc 36329092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 107 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 16623435 - 16622947
Alignment:
Q  107 acaaagcacaaagataagcaatgaaagaa--ggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcat 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||     
T  16623435 acaaagcacaaagataagcaatgaaagaaaaggaacaaacacaccaa--gattgttgacccagttcggttcaatatgacctaatctggaggagagagcag 16623338  T
Q  205 ctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaga----------aaaatagtttgcaagcttacacaagaacaagacttaatttctacccattt-gtgtt 293  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |          ||| ||| |   ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||     
T  16623337 ctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagctaataagcttacagaagaacaagacctaatttctacccattttgtgtc 16623238  T
Q  294 tctcactctctcaataatgaaccctaaagggaagacacaaaaggaagcttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaaatgtttacaatgttt 393  Q
     | ||||||| ||||| |||| |||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  16623237 acccactctcacaata-tgaatcctaaaagaaa-acacaaaaggaagcttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgttt 16623140  T
Q  394 ctcaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatccaagtttctctctcttcaagctctccttcaaaatctgca 493  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16623139 cccaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatccaagtttctctctcttctagctctccttcaaaatctgca 16623040  T
Q  494 caagaacacttaaataacagtcttcagctgataaaatcgtgccacgttttccaaatcatgccacgattgatgcgtacgacccaaggtacgacc 586  Q
    ||| |||||||| ||| ||| ||||| |||  ||||||||| ||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16623039 caaaaacacttatatagcagccttcacctgtcaaaatcgtgtcacgttttccaaatcgtgacacgattggtgcgtacgacccaaggtacgacc 16622947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 12 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 38152677 - 38152091
Alignment:
Q  12 agcaaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaacta-aaaacagacctaga-cttagtgtagagcaacaccacaagcataaaca 109  Q
    |||||| ||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  38152677 agcaaatgaagtggtaatcaatgtatgaagtgtttccaagcaacaacaacaataaaacagacctagatctaagtgtatagcaacaccacaagcataatca 38152578  T
Q  110 aagcacaaagataagcaatgaaagaa-ggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctct 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  38152577 aagcacaaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaa--gattgttgacccagttcggtccaatatgacataatctgggggagagagcagctct 38152480  T
Q  209 ccaatccactatgatgaaagtgttacaaga----------aaaatagtttgcaagcttacacaagaacaagacttaatttctaccca-tttgtgtttctc 297  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |          ||| ||| ||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||  | |    
T  38152479 ccaatccactatggtgaaagtgttacaaaagagttataagaaattagcttataagcttacacaagaacaagacctaatttctaccaattttgtgtcaccc 38152380  T
Q  298 actctctcaataatgaaccctaaagggaagacacaaaaggaagcttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaaatgtttacaatgtttctca 397  Q
    || |||||||||||||| ||| ||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||  |||||||||| |||| ||    
T  38152379 acactctcaataatgaatcct-aagagaaaacacaaatggaagcttttgatccttccaatggtgaattgtcactacccaaggtgtttacaatatttccca 38152281  T
Q  398 acccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatcc-aagtttctctctcttcaagctctccttcaaaatctgcacaa 496  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||     
T  38152280 tcccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcatttgtaatccaaattttctctctcttccagctct-tttcaaaatctgcacag 38152182  T
Q  497 gaacacttaaataacagtcttcagctgataaaatcgtgccac-gttttccaaatcatgccacgattgatgcgtacgacccaaggtacgacc 586  Q
    ||||||||| ||| |||| ||||||||  ||||||||| |||  |||| ||||   |   ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  38152181 gaacacttatatagcagtattcagctgtcaaaatcgtgtcacattttttcaaaatgtaaaacgattgatgcgtacgatccaaggtacgacc 38152091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 12 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 6743657 - 6743068
Alignment:
Q  12 agcaaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaactaaaaacagacctaga-------cttagtgtagagcaacaccacaagcat 104  Q
    ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||||||||  |||||| ||||| |       || ||||||||||||||||||||||||    
T  6743657 agcaaaggaagtggtaatcaatagataaagtgtctccaaacaacaacaac--aaaacaaacctaaatctaaatctgagtgtagagcaacaccacaagcat 6743560  T
Q  105 aaacaaagcacaaaga--taagcaatgaaagaa-ggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagag 201  Q
    || ||||||| | |||  |||| |||| ||||| |||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  6743559 aatcaaagcatatagagataagaaatggaagaaaggaacaaacacaccaaga---tgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctacgggagagag 6743463  T
Q  202 catctctccaatccactatgatgaaagtgttacaagaaa------aatagtttgca---agcttacacaagaacaagacttaatttctacccattt-gtg 291  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||||||| | |      || | || ||    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  6743462 cagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagctacaaaaaattagcttatagcttacaaaagaacaagacctaatttctacccattttgtg 6743363  T
Q  292 tttctcactctctcaataatgaaccctaaagggaagacacaaaaggaagcttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaaatgtttacaatgt 391  Q
    |  | ||| |||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||    
T  6743362 tcacccacactctcaataatgaatcctaa-gagaaaacacaaaaggaagtttttgatccttccaatggtgaaatctcattacccaaggtgtttacaatgt 6743264  T
Q  392 ttctcaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatccaagtttctctctcttcaagctctccttcaaaatctg 491  Q
    ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  6743263 ttcccaacccaagagatcctcgctacaaagacactcaaacctcaagttacctcctttgtaatccaagtttctctctcttcaagctctacttcaaaatctg 6743164  T
Q  492 cacaagaacacttaaataacagtcttcagctgataaaatcgtgccacgtttt-ccaaatcatgccacgattgatgcgtacgacccaaggtacgacc 586  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||| |||  ||||| ||| || ||||| ||||||| || |||||||  |||||||| ||||||||||||||    
T  6743163 cacaagaacacttatatagcagtcttcaactgtcaaaattgtgtcaagttttcccaaatcgtgacacgattagtgcgtacgtcccaaggtacgacc 6743068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 245; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 12 - 586
Target Start/End: Original strand, 54867042 - 54867623
Alignment:
Q  12 agcaaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaactaaaaa-cagacctaga-cttagtgtagagcaacaccacaagcataaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  54867042 agcaaaggaagtggtaatcaatagataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaaaacagacatagatctaagtgtagagcaacaccacaagcataatca 54867141  T
Q  110 aagcac-aaagataagcaatgaaagaa-ggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctc 207  Q
    ||| |  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| | |    
T  54867142 aagtaataaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaa--gattgttgacccagttcggtccaatatgacctagtctgggg-agagagcagccc 54867238  T
Q  208 tccaatccactatgatgaaagtgttacaaga----------aaaatagtttgcaagcttacacaagaacaagacttaatttctacccatttgtgtttctc 297  Q
    | ||||| |||||||||||| |||||||| |          ||| ||| ||  |||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||| ||      
T  54867239 ttcaatcaactatgatgaaaatgttacaaaatagttataagaaattagcttataagcttacacaagaacaatacctaatttctacccattt-tgtgtcat 54867337  T
Q  298 actctctcaataatgaaccctaa-agggaagacacaaaaggaagctttt-gatccttccaatggtgaaatctcactacccaaaatgtttacaatgtttct 395  Q
     | | ||||||   ||| ||||| ||  || ||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||   |||     
T  54867338 ccacactcaat---gaatcctaagagaaaacacaaaaaagaaagctttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccatagtgtttacaac--ttc- 54867431  T
Q  396 caacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatccaagtttctctctcttcaagctctccttcaaaatctgcaca 495  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  54867432 caacccaagagattctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatccaagtttctctctcttcaagctctcctccaaaatctgcaca 54867531  T
Q  496 agaacacttaaataacagtcttcagctgataaaatcgtgccacgttt-tccaaatcatgccacgattgatgcgtacgacccaaggtacgacc 586  Q
    |||||||||| |||  ||||||||||||  ||||||||| ||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  54867532 agaacacttatatagtagtcttcagctgtcaaaatcgtgtcacgtttgtccaaatcgtgacacgattggtgcgtacgatccaaggtacgacc 54867623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 273 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 16628838 - 16628526
Alignment:
Q  273 taatttctacccattt-gtgtttctcactctctcaataatgaaccctaaagggaagacacaaaaggaagcttttgatccttccaatggtgaaatctcact 371  Q
    |||||||||||||||| ||||  | ||||||| ||||| |||| |||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16628838 taatttctacccattttgtgtcacccactctcacaata-tgaatcctaaaagaaa-acacaaaaggaagcttttgatccttccaatggtgaaatctcact 16628741  T
Q  372 acccaaaatgtttacaatgtttctcaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatccaagtttctctctcttc 471  Q
    ||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  16628740 acccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgcaatccaattttctctctcttc 16628641  T
Q  472 aagctctccttcaaaatctgcacaagaacacttaaataacagtcttcagctgataaaatcgtgccacgttttccaaatcatgccacgattgatgcgtacg 571  Q
     ||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||| ||| ||||| |||  ||||||||| ||||||||||||||| || |||||||| ||||||||    
T  16628640 tagctctccttcaaaatctgaacaaaaacacttatatagcagccttcatctgtcaaaatcgtgtcacgttttccaaatcgtgacacgattggtgcgtacg 16628541  T
Q  572 acccaaggtacgacc 586  Q
    |||||||||||||||    
T  16628540 acccaaggtacgacc 16628526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 12 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 42599814 - 42599322
Alignment:
Q  12 agcaaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaactaaa--aacagacctaga-cttagtgtagagcaacaccacaagcataaac 108  Q
    ||||||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||| |||  |||| ||||||| || | |||||||||||||||||||||||| |    
T  42599814 agcaaaggaagtggtaatcaatagataaagtgactccaagcaacaacaacaaaacaaacaaacctagatctaaatgtagagcaacaccacaagcataatc 42599715  T
Q  109 aaagcac-aaagataagcaatgaaagaa-ggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagag--cat 204  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||||||||| |||| ||||||||||||  ||     
T  42599714 aaagcaataaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaa--gattgttgacccaattcagtccaatatgacataatatgggggagagagagcaa 42599617  T
Q  205 ctctccaatccactatgatgaaagtgttacaa-ga--------aaaatagtttgcaagcttacacaagaacaagacttaatttctacccattt-gtgttt 294  Q
    | ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||        ||| ||| ||  ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||      
T  42599616 ccctccaatccactaagatgaaaatgttacaatgagttacaagaaattagcttataagcttacaaaagaacaagacctaatttctacccattttgtgtca 42599517  T
Q  295 ctcactctctcaataatgaaccctaaagggaagacacaaaaggaagcttttg-atccttccaatggtgaaatctcactacccaaaatgtttacaatgttt 393  Q
    | | | ||||||||   ||| ||||| | ||| ||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||    
T  42599516 cccgcactctcaat---gaatcctaa-gagaaaacacaaaaggaagtttttttatccttccaatggtgaaatctcactacccaaggtgtttagaatgttt 42599421  T
Q  394 ctcaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatccaagtttctctctcttcaagctctccttcaaaatctgca 493  Q
    | ||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||    
T  42599420 cccaaccgaagagaacctcactacaaagacactcaa-cctaaagttacctcctttgtaatccaagtttctctcactaaaagctctccttcaaaatctgca 42599322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 15 - 468
Target Start/End: Original strand, 24333674 - 24334139
Alignment:
Q  15 aaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaactaaaaacagacctaga-cttagtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagc 113  Q
    |||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||   |||||||| ||||||    
T  24333674 aaaggaagtggtaatcaatagataaagtgtctccaaacaacaacaacaaaaaacagacctagatctaagtgtagagcaacac---aagcataatcaaagc 24333770  T
Q  114 ac-aaagataagcaatgaaagaaggaa-caaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctcca 211  Q
    |  |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  24333771 aataaagataagcaatgaaagaaagaaacaaacacaccaa--gattgttaactcagttcggtccaatatgacctaatttgggggagagagcagctctcca 24333868  T
Q  212 atccactatgatgaaagtgttaca----------agaaaaatagtttgcaagcttacacaag-aacaagacttaatttctaccca-tttgtgtttctcac 299  Q
    ||||||||||||||| ||||||||          | |||| ||| || |||||||||||||| || || || ||||||||||||| |||||||    |||    
T  24333869 atccactatgatgaacgtgttacaaaagagttataaaaaattagcttacaagcttacacaagaaaaaaaacctaatttctacccattttgtgtcagccac 24333968  T
Q  300 tctctcaataatgaaccctaaagggaagacacaaaaggaagc-ttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaaatgtttacaatgtttctcaa 398  Q
    |||| |||| ||||| ||| ||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||    
T  24333969 tctcacaat-atgaatcct-aagagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttcccaa 24334066  T
Q  399 cc--caagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaat-ccaagtttctctctc 468  Q
    ||  ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||    
T  24334067 ccctcaagagaacctcactacaaagactctcaaccctaaagttaccttctttgtattcccaagtttctctctc 24334139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 138; E-Value: 8e-72
Query Start/End: Original strand, 12 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 16630917 - 16630693
Alignment:
Q  12 agcaaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaactaaaaacagacctaga-cttagtgtagagcaacaccacaagcataaacaa 110  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| || |||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  16630917 agcaaaggaactggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcagcaacaac-aaaaacaaacctagatctaagtgtaaagcaacaccacaagcataatcaa 16630819  T
Q  111 agcacaaagataagcaatgaaagaa--ggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctct 208  Q
    || ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||| || ||||    
T  16630818 agaacaaagataagcaatgaaagaaaaggaacaaacacaccaa--ggttgttgacctagttcggtccaatatgacataatctggaggagagaacagctct 16630721  T
Q  209 ccaatccactatgatgaaagtgttacaa 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16630720 ccaatccactatgatgaaagtgttacaa 16630693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 19 - 236
Target Start/End: Original strand, 39245860 - 39246078
Alignment:
Q  19 gaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaactaaaaacagacctaga-cttagtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagcac-a 116  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| | || ||||||||||||||||||| |||||| |||| ||  |    
T  39245860 gaagtggtaatcaatagataaagtgtctccaaacaacaacaacaaaaaacagacctaaatctaagtgtagagcaacaccacaggcataatcaaaacaata 39245959  T
Q  117 aagataagcaatgaaagaa-ggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatcc 215  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  39245960 aagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaa--gattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatcc 39246057  T
Q  216 actatgatgaaagtgttacaa 236  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  39246058 actatgatgaaagtgttacaa 39246078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 15 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 3796755 - 3796470
Alignment:
Q  15 aaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaactaaaaacagacctaga-cttagtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagc 113  Q
    |||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| | || ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||    
T  3796755 aaaggaagtgataatcaatagataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaatcagacctaaatctaagtgtagagtaacatcacaagcataatcaaagc 3796656  T
Q  114 ac-aaagataagcaatgaaaga-aggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctcca 211  Q
    |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |    
T  3796655 aataaagataagcaatgaaagagaggaacaaacacaccaaa-gattgttgacccagttccgtccaatatgacctaatatgggggagagagcaactctcta 3796557  T
Q  212 atccactatgatgaaagtgttacaaga----------aaaatagtttgcaagcttacacaagaacaagacttaatttctacccattt 288  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |          ||| ||| || ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3796556 atccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaagcttgcacaagaacaagacctaatttctacccattt 3796470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 332 - 481
Target Start/End: Original strand, 5112425 - 5112576
Alignment:
Q  332 aaaaggaagctttt-gatccttccaatggtgaaatctcactacccaaaatgtttacaatgtttctcaacccaagagatcctcactacaaagacactcaac 430  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||     
T  5112425 aaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaacctcacaacaaagacactcaaa 5112524  T
Q  431 cctaaagttacctcctttgtaatc-caagtttctctctcttcaagctctcct 481  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  5112525 cctaaaattacctcctttgtaatctcaagtttctctctcttcaagctctcct 5112576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 46 - 469
Target Start/End: Original strand, 24741833 - 24742273
Alignment:
Q  46 tccaagcaacaacaactaaaaacagacctagacttagtgtagagcaacaccacaagcataaa---caaagcacaa--agataagcaatgaaagaaggaac 140  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||   | | |   ||||||| ||  |||||||||| ||||| | ||||    
T  24741833 tccaagcaacaacaac-aaaaacagccctagact-agtgtagagcaaaaccacacaaagagataccaaagcaaaacaagataagcaa-gaaaggaagaac 24741929  T
Q  141 aaacacaccaa-aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactatgatgaaagt---------- 229  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||              
T  24741930 aaa-acaccaagaagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagg 24742027  T
Q  230 gttacaagaaa-aatagtttgcaagcttacacaagaacaagacttaatttctacccatttgtgttt-ctcactctctcaataatgaaccct-aaagggaa 326  Q
    ||||||||||| |||||  | |||||||||||||||||||  | ||  |||||||| || |||||| | ||||||| |||| ||||||||| |||| |||    
T  24742028 gttacaagaaacaatagccttcaagcttacacaagaacaaaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaat-atgaaccctaaaagagaa 24742126  T
Q  327 gacacaaaaggaagcttttgatccttccaa-tggtgaaat-ctcactacccaaaatgtttacaatg--tttctcaacccaagagatcctcactacaaaga 422  Q
    ||||| | |||||||||| ||||||||||| |  |||| | ||||||||||||  || ||||||||  |||| ||||||||||||  ||| |||||||||    
T  24742127 gacactagaggaagctttagatccttccaactaatgaactcctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctctacaaaga 24742226  T
Q  423 cactcaaccctaaagttacctcctttgtaatccaagtttctctctct 469  Q
    |||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24742227 cactcaaccctttggttccctcctttgtaatccaagtttctctctct 24742273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 117 - 469
Target Start/End: Original strand, 29760608 - 29760974
Alignment:
Q  117 aagataagcaatgaaagaaggaacaaacacaccaa-aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatcc 215  Q
    ||||||||||| ||||| | ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  29760608 aagataagcaa-gaaaggaagaacaaa-acaccaagaagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcc 29760704  T
Q  216 actatgatgaaagt----------gttacaagaaa-aatagtttgcaagcttacacaag-aacaagacttaatttctacccatttgtgttt-ctcactct 302  Q
    | ||||||||||||          ||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||||| ||  |||||||| || |||||| | ||||||    
T  29760705 aatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagcctgcaagcttacacaagaaacaagacctagattctaccctttggtgtttccccactct 29760804  T
Q  303 ctcaataatgaaccctaaagggaagacacaaaaggaagcttttgatccttccaa-tggtgaaat-ctcactacccaaaatgtttacaatg---tttctca 397  Q
    | || | ||||||||| ||| |||||||| | |||||||||| ||||||||||| |  |||| | ||||||||||||  || ||||||||   |||| ||    
T  29760805 cacact-atgaaccct-aagagaagacactagaggaagctttagatccttccaactaatgaactcctcactacccaaggtgattacaatgttttttccca 29760902  T
Q  398 acccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatccaagtttctctctct 469  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29760903 acccaagagacactctctacaaagacactcaaccctttggttccctcctttgtaatccaagtttctcactct 29760974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 165 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 39774389 - 39774039
Alignment:
Q  165 cagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactatgatgaaagtg-----------ttacaagaaaaatagtttgcaag 253  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||  |||||||||           ||||||||||  ||| ||  |||    
T  39774389 cagttcggtccaatatgacctactctgggggatagagcagctctccaatccactaaaatgaaagtgatacaaataggttacaagaaat-tagcttaaaag 39774291  T
Q  254 cttacacaagaacaagacttaatttctacccatttg--tgtttctcactctctcaataatgaaccctaaagggaagacacaaaaggaagctttt-gatcc 350  Q
    || ||| |  |||||||| ||||||||||| ||||   |||  ||||| |||||||| |  | |||  ||| ||| | |||||||||||||||| ||||     
T  39774290 ctcacaaagaaacaagacctaatttctaccaattttcatgtcactcacactctcaatga--atccc--aagagaaaatacaaaaggaagctttttgatca 39774195  T
Q  351 ttccaatggtgaaatctcactacccaaaatgtttacaatgtttctcaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgt 450  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||||| ||||  |||||| |  ||||||||||||||||||||||||||    
T  39774194 ttccaatggtgaaaactcactacccaaggtgtttacaatgtttcccaactcaagagaacctcgttacaaataatctcaaccctaaagttacctcctttgt 39774095  T
Q  451 -aatccaagtttctctctcttcaagctctccttcaaaatctgcacaagaacactta 505  Q
     || ||||||||||||||||| || |||| |||||||||||| |||  ||||||||    
T  39774094 aaacccaagtttctctctctttaaactctacttcaaaatctgaacataaacactta 39774039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 380 - 574
Target Start/End: Original strand, 26175841 - 26176035
Alignment:
Q  380 tgtttacaatgtttctcaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatcc-aagtttctctctcttcaagctct 478  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||| | | | | ||||||| |||||| ||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||    
T  26175841 tgtttacaatgtttcccaacccaacagaactttaat-caaagaccctcaactctaaagttacctcctttgatttcccaagtttctctctcttcaagctct 26175939  T
Q  479 ccttcaaaatctgcacaagaacacttaaataacagtcttcagctgataaaatcgtgccacgtttt-ccaaatcatgccacgattgatgcgtacgacc 574  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| |||||||| | |||||||| |||| ||| |||||||||||    
T  26175940 ccttcaaaatctgca-aagaacacttatatagcagtcttcagctgtcaaaatcgtgtcacgttttgctaaatcatgacacgtttggtgcgtacgacc 26176035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 380 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 37740589 - 37740383
Alignment:
Q  380 tgtttacaatgtttctcaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatcc-aagtttctctctcttcaagctct 478  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |   | | ||||||| |||||||||||| ||||||||||||   ||| ||||||||||||||||| |||||    
T  37740589 tgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaat-caaagaccctcaaccctaaacttacctcctttgatttcccaagtttctctctcttcatgctct 37740491  T
Q  479 ccttcaaaatctgcacaagaacacttaaataacagtcttcagctgataaaatcgtgccacgtttt-ccaaatcatgccacgattgatgcgtacgacccaa 577  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||| || |||  ||| || |||||||||||    
T  37740490 ccttcaaaatctgca-aagaacacttatatagcagtcttcagctgtcaaaatcgtgtcacgttttcccaaatcgtgacacatttggtgtgtacgacccaa 37740392  T
Q  578 ggtacgacc 586  Q
    |||||||||    
T  37740391 ggtacgacc 37740383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 380 - 586
Target Start/End: Original strand, 13992490 - 13992697
Alignment:
Q  380 tgtttacaatgtttctcaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttg-taatccaagtttctctctcttcaagctct 478  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||  |||    ||||||| || |||||||||||| |  |||||| |   |||||||||||||||||||||||||    
T  13992490 tgtttacaatgtttcccaacccaagagagactctaatcaaagaccctaaaccctaaagttgctacctttgatttcccaagtttctctctcttcaagctct 13992589  T
Q  479 ccttcaaaatctgcacaagaacacttaaataacagtcttcagctgataaaatcgtgccacgttttccaaatcatgccacgattgatgcgtacgacccaag 578  Q
    || || |||||||||||||||||||||||||  |||||||  |||||||||||||| |||| |||||| ||| || |||||||||| |||||| | ||||    
T  13992590 ccctccaaatctgcacaagaacacttaaatactagtcttccactgataaaatcgtgtcacgatttccagatcgtgtcacgattgatacgtacgtcacaag 13992689  T
Q  579 gtacgacc 586  Q
    ||| ||||    
T  13992690 gtatgacc 13992697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 328 - 505
Target Start/End: Original strand, 18377543 - 18377715
Alignment:
Q  328 acacaaaaggaagctttt-gatccttccaatggtgaaatctcactacccaaaatgtttacaatgtttctcaacccaagagatcctcactacaaagacact 426  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||   |||||||||||||  || ||||||||| |||||||||||| |||||    
T  18377543 acacaaaatgaagctttttgatccttccaatggtaaaatctcattacccaaggggtttacaatgttttccatcccaagagaacctcactacaaatacact 18377642  T
Q  427 caaccctaaagttacctcctttgtaatccaagtttctctctcttcaagctctccttcaaaatctgcacaagaacactta 505  Q
    |      ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||  ||||||||    
T  18377643 c------aaagttaactcctttgtaatccaagtttctttctcttcaagctctccttcaaaaactgaacagaaacactta 18377715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 328 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 3793993 - 3793849
Alignment:
Q  328 acacaaaaggaagctttt-gatccttccaatggtgaaatctcactacccaaaatgtttacaatgtttctcaaccc--aagagatcctcactacaaagaca 424  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||  ||||||  |||||| |||||||| |||||||    
T  3793993 acacaaaaggaagctttttgatcctttctatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgttttccaaccctcaagagaacctcactataaagaca 3793894  T
Q  425 ctcaaccctaaagttacctcctttgtaat-ccaagtttctctctc 468  Q
    |||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||    
T  3793893 ctcaaccctaaagttacctcctttatattcccaagtttctctctc 3793849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 380 - 574
Target Start/End: Original strand, 12739755 - 12739949
Alignment:
Q  380 tgtttacaatgtttctcaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatc-caagtttctctctcttcaagctct 478  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |   | | ||||||| |||||||||||||||||||||||||   || ||||||||||||||||||| |||     
T  12739755 tgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaat-caaagaccctcaaccctaaagttacctcctttgatttctcaagtttctctctcttcaacctcc 12739853  T
Q  479 ccttcaaaatctgcacaagaacacttaaataacagtcttcagctgataaaatcgtgccacgttttcc-aaatcatgccacgattgatgcgtacgacc 574  Q
     |||||||||||| | ||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| |||||||||| |||||||  |||||||| |||||||||||    
T  12739854 acttcaaaatctgta-aagaacacttatatagcagtcttcagctgtcaaaatcgtgtcacgttttccaaaatcataacacgattggtgcgtacgacc 12739949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 380 - 574
Target Start/End: Original strand, 12747961 - 12748155
Alignment:
Q  380 tgtttacaatgtttctcaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatc-caagtttctctctcttcaagctct 478  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |   | | ||||||| |||||||||||||||||||||||||   || ||||||||||||||||||| |||     
T  12747961 tgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaat-caaagaccctcaaccctaaagttacctcctttgatttctcaagtttctctctcttcaacctcc 12748059  T
Q  479 ccttcaaaatctgcacaagaacacttaaataacagtcttcagctgataaaatcgtgccacgttttcc-aaatcatgccacgattgatgcgtacgacc 574  Q
     |||||||||||| | ||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| |||||||||| |||||||  |||||||| |||||||||||    
T  12748060 acttcaaaatctgta-aagaacacttatatagcagtcttcagctgtcaaaatcgtgtcacgttttccaaaatcataacacgattggtgcgtacgacc 12748155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 372 - 582
Target Start/End: Original strand, 34570611 - 34570821
Alignment:
Q  372 acccaaaatgtttacaatgtttctcaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatcc-aagtttctctctctt 470  Q
    |||||| |||||| ||||||||| |||||||||||| |   | | ||||||| ||||||||||||| |||||||||||   ||| |||||||||||| ||    
T  34570611 acccaagatgttttcaatgtttcccaacccaagagaactctaat-caaagaccctcaaccctaaagctacctcctttgatttcccaagtttctctctgtt 34570709  T
Q  471 caagctctccttcaaaatctgcacaagaacacttaaataacagtcttcagctgataaaatcgtgccacgtttt-ccaaatcatgccacgattgatgcgta 569  Q
    | ||||||||||||||||||||| |||||||| || |||  ||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||| || |||| ||| ||||||    
T  34570710 ccagctctccttcaaaatctgca-aagaacacatatatagtagtcttcagctgtcaaaatcgtgtcacgttttcccaaatcgtgacacgtttggtgcgta 34570808  T
Q  570 cgacccaaggtac 582  Q
    |||||||||||||    
T  34570809 cgacccaaggtac 34570821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 380 - 586
Target Start/End: Original strand, 52082862 - 52083068
Alignment:
Q  380 tgtttacaatgtttctcaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatcc-aagtttctctctcttcaagctct 478  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |   | | ||||||| |||||||||||||||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||| |    
T  52082862 tgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaat-caaagaccctcaaccctaaagttacctcctttgatttcccaagtttctctctcttcaagctgt 52082960  T
Q  479 ccttcaaaatctgcacaagaacacttaaataacagtcttcagctgataaaatcgtgccacgtttt--ccaaatcatgccacgattgatgcgtacgaccca 576  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| |||  |||||||||| |   |||||||| ||||||||  ||||||| || |||||||||||| |||||||||    
T  52082961 ccttcaaaatttgca-aagaacacttatataggagtcttcagc-gtcgaaatcgtgtcacgtttttcccaaatcgtgtcacgattgatgcttacgaccca 52083058  T
Q  577 aggtacgacc 586  Q
    ||||| ||||    
T  52083059 aggtatgacc 52083068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 380 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 5429642 - 5429437
Alignment:
Q  380 tgtttacaatgtttctcaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatcc-aagtttctctctcttcaagctct 478  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |   | | ||||||| ||||||||||||||||| |||||||   ||| |||||||||||||||||||||||    
T  5429642 tgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaat-caaagaccctcaaccctaaagttacttcctttgatttcccaagtttctctctcttcaagctct 5429544  T
Q  479 ccttcaaaatctgcacaagaacacttaaataacagtcttcagctgataaaatcgtgccacgtttt-ccaaatcatgccacgattgatgcgtacgacccaa 577  Q
    |||||||  |||||| ||||||||||| ||| |||| |||||| |  ||||||||| || ||||| ||| ||| || |||||||| ||||||||||||||    
T  5429543 ccttcaaggtctgca-aagaacacttatatagcagttttcagc-gtcaaaatcgtgtcatgttttcccacatcgtgacacgattggtgcgtacgacccaa 5429446  T
Q  578 ggtacgacc 586  Q
    |||||||||    
T  5429445 ggtacgacc 5429437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 12 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 16624246 - 16624143
Alignment:
Q  12 agcaaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaactaaaaacagacctagactt-agtgtagagcaacaccacaagcataaacaa 110  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  16624246 agcaaaggaagtgataatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaac-aaaaacagacctagatttaagtgtagagcaacaccacaagaataatcaa 16624148  T
Q  111 agcac 115  Q
    |||||    
T  16624147 agcac 16624143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 380 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 29254457 - 29254251
Alignment:
Q  380 tgtttacaatgtttctcaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatcc-aagtttctctctcttcaagctct 478  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |   ||| |||||||  ||||||||||||||| ||||||||   ||| |||||||||||||| ||| |||     
T  29254457 tgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctact-caaagaccttcaaccctaaagttatctcctttgatttcccaagtttctctctctacaacctca 29254359  T
Q  479 ccttcaaaatctgcacaagaacacttaaataacagtcttcagctgataaaatcgtgccacg-ttttccaaatcatgccacgattgatgcgtacgacccaa 577  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||||| || |||| ||| ||||||||| ||||    
T  29254358 ccttcaaaatctgca-aagaacacttatatagcagtcttcagctgtcaaaatcgtgtcacgtttttccaaatcgtgacacgtttggtgcgtacgatccaa 29254260  T
Q  578 ggtacgacc 586  Q
      |||||||    
T  29254259 aatacgacc 29254251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 380 - 574
Target Start/End: Original strand, 56178841 - 56179035
Alignment:
Q  380 tgtttacaatgtttctcaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatcc-aagtttctctctcttcaagctct 478  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |   | | |||||||  ||||||||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||    
T  56178841 tgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaat-caaagaccttcaaccctaaagttacctcctttgatttcccaagtttctctctcttcaagctct 56178939  T
Q  479 ccttcaaaatctgcacaagaacacttaaataacagtcttcagctgataaaatcgtgccacgtttt--ccaaatcatgccacgattgatgcgtacgacc 574  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |   |||||||| ||| ||||  ||| ||| || ||||||||||||||||||||    
T  56178940 ctttcaaaatctgca-aagaacacttatataacagtcttcagc-gtcgaaatcgtgtcacatttttcccagatcgtgtcacgattgatgcgtacgacc 56179035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 417 - 586
Target Start/End: Original strand, 52093905 - 52094075
Alignment:
Q  417 caaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatcc-aagtttctctctcttcaagctctccttcaaaatctgcacaagaacacttaaataacagtc 515  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| |||  ||||    
T  52093905 caaagaccctcaaccctaaagttacctcctttgatttcccaagtttctctctcttcaagctgtccttcaaaatttgca-aagaacacttatataggagtc 52094003  T
Q  516 ttcagctgataaaatcgtgccacgtttt--ccaaatcatgccacgattgatgcgtacgacccaaggtacgacc 586  Q
    |||||| |   |||||||| ||||||||  ||||||| || |||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  52094004 ttcagc-gtcgaaatcgtgtcacgtttttcccaaatcgtgtcacgattgatgcttacgacccaaggtatgacc 52094075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 12 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 1983536 - 1983070
Alignment:
Q  12 agcaaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaactaaaaacagacctaga-cttagtgtagagcaacaccacaagcataaacaa 110  Q
    ||||||||||||  |||||||||  |||||||  | |||||||||||||| | |||| ||| || | || |||||| |||| |||||||| ||||| |||    
T  1983536 agcaaaggaagtaataatcaatggataaagtgggttcaagcaacaacaacaacaaactgacttaaatctaagtgtaaagcatcaccacaaacataatcaa 1983437  T
Q  111 agcacaaagataagcaatgaaagaaggaa--caaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctct 208  Q
    | ||  || ||||| || | ||||| |||  |||||||||||| |   || | ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| ||||    
T  1983436 aacaacaatataagaaa-gcaagaaagaaaacaaacacaccaata---tggtaacccagttcggtccaatatgacctactatgggggagatagcagctct 1983341  T
Q  209 ccaatccactatgatgaaagtg-----------ttacaagaaaaatagtttgcaagcttacacaagaacaagacttaatttctacccatttgtgtttctc 297  Q
    ||||||||||| ||| ||||||           ||||||||||  ||| ||||||||| ||| |||||||| || ||||||||| || |||     || |    
T  1983340 ccaatccactaggatcaaagtgatacaaaggggttacaagaaat-tagcttgcaagctcaca-aagaacaaaacataatttctatcctttttcaagtcac 1983243  T
Q  298 --actctctcaataatgaaccctaaagggaagacacaaaaggaagcttttg-atccttccaatggtgaaa-tctcactacccaaaatgtttacaatgttt 393  Q
      || ||||||||   ||| ||||| | ||| || |||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||| |||| |||   |||||||||||||     
T  1983242 ctacactctcaat---gaatcctaa-gagaaaacccaaaaggaagcttttttatccttccaatggtgaaaatcttactaaccagggtgtttacaatgtta 1983147  T
Q  394 ctcaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgt-aatccaagtttctctctct 469  Q
    | |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||| |||||||||    
T  1983146 cacaacccaagataacctcactacaaagacactcaaccctaaagttaccttctttgtaaacccaagtctctctctct 1983070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 380 - 586
Target Start/End: Original strand, 9927662 - 9927872
Alignment:
Q  380 tgtttacaatgtttctcaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatcc-aagtttctctctcttcaagctct 478  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| | | | | ||||||| |||||||||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||| ||    
T  9927662 tgtttacaatgtttcccaacccaagagaactttaat-caaagaccctcaaccctaaagttacctcctttgatttcccaagtttctctctcttcaagccct 9927760  T
Q  479 ccttcaaaatctgcacaagaacacttaaataacagtct---tcagctgataaaa-tcgtgccacgtttt-ccaaatcatgccacgattgatgcgtacgac 573  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||  || ||||||   |||||||  |||| | ||| |||||||| ||||||| || |||| ||| ||||||||||    
T  9927761 ccttcaaaatctgca-gagaacacttatttagcagtcttcatcagctgccaaaatttgtgtcacgttttcccaaatcgtgacacgtttggtgcgtacgac 9927859  T
Q  574 ccaaggtacgacc 586  Q
    |||||| ||||||    
T  9927860 ccaaggaacgacc 9927872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 380 - 586
Target Start/End: Original strand, 54200111 - 54200317
Alignment:
Q  380 tgtttacaatgtttctcaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatcc-aagtttctctctcttcaagctct 478  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |   | | ||||||| |||||||||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||  ||||||    
T  54200111 tgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaat-caaagaccctcaaccctaaagttacctcctttgatttcctaagtttctctctctttcagctct 54200209  T
Q  479 ccttcaaaatctgcacaagaacacttaaataacagtcttcagctgataaaatcgtgccacgtttt-ccaaatcatgccacgattgatgcgtacgacccaa 577  Q
     |||||||| || || ||||||||||| ||| ||||||||||||   ||||||||| ||| |||| ||||||| || |  | ||| ||||||||||||||    
T  54200210 tcttcaaaaactaca-aagaacacttatatagcagtcttcagctatcaaaatcgtgtcacattttcccaaatcgtgactagtttggtgcgtacgacccaa 54200308  T
Q  578 ggtacgacc 586  Q
    |||||||||    
T  54200309 ggtacgacc 54200317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 380 - 574
Target Start/End: Complemental strand, 48143005 - 48142810
Alignment:
Q  380 tgtttacaatgtttctcaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttg-taatccaagtttctctctcttcaagctct 478  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |   | | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |   |||||||||||||||||| ||||||    
T  48143005 tgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaat-caaagaccctcaaccctaaagttacctcctttgatttcccaagtttctctctcttctagctct 48142907  T
Q  479 c-cttcaaaatctgcacaagaacacttaaataacagtcttcagctgataaaatcgtgccacgtttt--ccaaatcatgccacgattgatgcgtacgacc 574  Q
    | |||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||| |   |||||||| ||||||||  ||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  48142906 ctcttcaaaaactgca-aagaacacttatatagcagacttcagc-gtcgaaatcgtgtcacgtttttcccaaatcgtgtcacgattgatgcgtacgacc 48142810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 380 - 586
Target Start/End: Original strand, 52095567 - 52095771
Alignment:
Q  380 tgtttacaatgtttctcaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatcc-aagtttctctctcttcaagctct 478  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |   | | ||||| | |||||||||||||||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||| |    
T  52095567 tgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaat-caaagtccctcaaccctaaagttacctcctttgatttcccaagtttctctctcttcaagctgt 52095665  T
Q  479 ccttcaaaatctgcacaagaacacttaaataacagtcttcagctgataaaatcgtgccacgtttt--ccaaatcatgccacgattgatgcgtacgaccca 576  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||||| |   |||||||  ||||||||  | | ||| || |||||||||||| |||||||||    
T  52095666 ccttcaaaatctaca-aagaacacttatatagcagtcttcagc-gtcgaaatcgt--cacgtttttcctatatcgtgtcacgattgatgcttacgaccca 52095761  T
Q  577 aggtacgacc 586  Q
    ||||||||||    
T  52095762 aggtacgacc 52095771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 380 - 582
Target Start/End: Original strand, 30000010 - 30000212
Alignment:
Q  380 tgtttacaatgtttctcaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatcc-aagtttctctctcttcaagctct 478  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||| |   | | ||||||| || ||||||||||||  ||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||    
T  30000010 tgtttacaatgtttccaaacccaagagaactctaat-caaagaccctaaaccctaaagttgtctcctttgatttcccaagtttctctctcttcaagctct 30000108  T
Q  479 ccttcaaaatctgcacaagaacacttaaataacagtcttcagctgataaaatcgtgccacgtttt--ccaaatcatgccacgattgatgcgtacgaccca 576  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| ||| || |||||||| |   |||||||| ||| ||||  || |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  30000109 ccttcaaaatctgca-aaaaacacttatatagcaatcttcagc-gtcgaaatcgtgtcacatttttccccaatcgtgccacgattgatgcgtacgaccca 30000206  T
Q  577 aggtac 582  Q
    ||||||    
T  30000207 aggtac 30000212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 380 - 468
Target Start/End: Original strand, 6542386 - 6542475
Alignment:
Q  380 tgtttacaatgtttctcaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatcc-aagtttctctctc 468  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||    
T  6542386 tgtttacaatgtttcccaacccaagagaacctcattacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtattcctaggtttctctctc 6542475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 380 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 51337027 - 51336938
Alignment:
Q  380 tgtttacaatgtttctcaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatcc-aagtttctctctc 468  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||    
T  51337027 tgtttacaatgttttccaacccaagagaacctcactacaaagacattcaaccctaaagttacttcctttgtattcctaagtttctctctc 51336938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 417 - 539
Target Start/End: Original strand, 12745677 - 12745799
Alignment:
Q  417 caaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatcc-aagtttctctctcttcaagctctccttcaaaatctgcacaagaacacttaaataacagtc 515  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||| |  ||| |||||||||||||||||| |||  |||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||    
T  12745677 caaagaccctcaactctaaagttacctccttttttttcccaagtttctctctcttcaacctcaacttcaaaatctgca-aagaacacttatatagcagtc 12745775  T
Q  516 ttcagctgataaaatcgtgccacg 539  Q
    ||||||||  ||||||||| ||||    
T  12745776 ttcagctgtcaaaatcgtgacacg 12745799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 374 - 574
Target Start/End: Original strand, 5370285 - 5370486
Alignment:
Q  374 ccaaaatgtttacaatgtttctcaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatc-caagtttctctctcttca 472  Q
    ||||| ||||||||||||||| || ||||||||| |   | | ||||||| || ||||||||||||  ||||||||   || ||||||||||||||||||    
T  5370285 ccaaagtgtttacaatgtttcccagcccaagagaactataat-caaagaccctaaaccctaaagttgtctcctttgatttctcaagtttctctctcttca 5370383  T
Q  473 agctctccttcaaaatctgcacaagaacacttaaataacagtcttcagctgataaaatcgtgccacgtttt---ccaaatcatgccacgattgatgcgta 569  Q
    || |||||||||||||||||| ||||||||||| |||   ||||||||| |   |||||||| ||||||||   || |||| ||||||||||||||||||    
T  5370384 agttctccttcaaaatctgca-aagaacacttatatagttgtcttcagc-gtcgaaatcgtgtcacgttttttccccaatcgtgccacgattgatgcgta 5370481  T
Q  570 cgacc 574  Q
    |||||    
T  5370482 cgacc 5370486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 135 - 220
Target Start/End: Original strand, 12739530 - 12739615
Alignment:
Q  135 aggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga-gcatctctccaatccactat 220  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  12739530 aggaacaaacacaccaaa-gattgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactat 12739615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 135 - 220
Target Start/End: Original strand, 26175616 - 26175701
Alignment:
Q  135 aggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga-gcatctctccaatccactat 220  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  26175616 aggaacaaacacaccaaa-gattgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactat 26175701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 48 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 34496024 - 34495836
Alignment:
Q  48 caagcaacaacaactaaaaacagacctaga-cttagtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagcacaaagataagcaatgaaagaaggaa--caaac 144  Q
    |||||||||||||| | |||||| || | | || |||||| |||| || ||||||||||| |||||||  || | |||||||||||||| |||  |||||    
T  34496024 caagcaacaacaacaacaaacagtcccaaaactaagtgtaaagcatcaacacaagcataatcaaagcaataaaacaagcaatgaaagaaagaaaacaaac 34495925  T
Q  145 acaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactatgatgaaagtgttacaa 236  Q
    ||||||| |   || | ||| |||||||||||| ||||| || |||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  34495924 acaccaaga---tggtaacctagttcggtccaacatgacttactctgggggagagagcagccctccaatccactaagatgaaagtgatacaa 34495836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 152 - 236
Target Start/End: Original strand, 3814025 - 3814107
Alignment:
Q  152 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactatgatgaaagtgttacaa 236  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  3814025 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaaagtgttacaa 3814107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 152 - 236
Target Start/End: Original strand, 5732666 - 5732748
Alignment:
Q  152 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactatgatgaaagtgttacaa 236  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  5732666 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaa 5732748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 152 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 9224491 - 9224409
Alignment:
Q  152 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactatgatgaaagtgttacaa 236  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  9224491 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaa 9224409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 152 - 236
Target Start/End: Original strand, 51520458 - 51520540
Alignment:
Q  152 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactatgatgaaagtgttacaa 236  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  51520458 aagattgttgacccagttctg-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaa 51520540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 138 - 220
Target Start/End: Original strand, 48893621 - 48893703
Alignment:
Q  138 aacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga-gcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  48893621 aacaaacacaccaaa-gattgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactat 48893703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 135 - 220
Target Start/End: Original strand, 9927438 - 9927523
Alignment:
Q  135 aggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga-gcatctctccaatccactat 220  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  9927438 aggaacaaacacaccaaa-gattgttgactcagttcggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactat 9927523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 135 - 220
Target Start/End: Original strand, 12743905 - 12743990
Alignment:
Q  135 aggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga-gcatctctccaatccactat 220  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  12743905 aggaacaaacacaccaaa-gattgttgacccagttcggtccaacttgacctaatatgggggagagattgatctctccaatccactat 12743990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 135 - 220
Target Start/End: Original strand, 12745294 - 12745379
Alignment:
Q  135 aggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga-gcatctctccaatccactat 220  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  12745294 aggaacaaacacaccaaa-gattgttgacccagttcggtccaacttgacctaatatgggggagagattgatctctccaatccactat 12745379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 152 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 9229278 - 9229196
Alignment:
Q  152 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactatgatgaaagtgttacaa 236  Q
    ||||||||| ||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  9229278 aagattgttaacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaa 9229196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 156 - 220
Target Start/End: Original strand, 16931789 - 16931853
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  16931789 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactat 16931853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 156 - 220
Target Start/End: Original strand, 16934143 - 16934207
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  16934143 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactat 16934207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 156 - 220
Target Start/End: Original strand, 22780373 - 22780437
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  22780373 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactat 22780437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 156 - 220
Target Start/End: Original strand, 44599838 - 44599902
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  44599838 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactat 44599902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 152 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 45347901 - 45347819
Alignment:
Q  152 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactatgatgaaagtgttacaa 236  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  45347901 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcttaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaa 45347819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 152 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 45357380 - 45357298
Alignment:
Q  152 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactatgatgaaagtgttacaa 236  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  45357380 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcataatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaa 45357298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 138 - 220
Target Start/End: Original strand, 52467337 - 52467419
Alignment:
Q  138 aacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga-gcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||   ||||||||||||||||||    
T  52467337 aacaaacacaccaaa-gattgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctcggggagagattgatctctccaatccactat 52467419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 380 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 4587921 - 4587820
Alignment:
Q  380 tgtttacaatgtttctcaacccaagagatcctcactac-aaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatccaagtttctctctcttcaagctct 478  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||| |||||| ||| || || |||||||| |||||||    
T  4587921 tgtttacaatgtttcccaacccatgagaacctcactacaaaagacacttaaccctaaagttatctcatttgtattcctaggtt-tctctcttgaagctct 4587823  T
Q  479 cct 481  Q
    |||    
T  4587822 cct 4587820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 162 - 236
Target Start/End: Original strand, 5112247 - 5112321
Alignment:
Q  162 acccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactatgatgaaagtgttacaa 236  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  5112247 acccagttcggtccaatatgatctactttgggggtgagagcagctctccaatccactaatatgaaagtgttacaa 5112321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 135 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 5429867 - 5429782
Alignment:
Q  135 aggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga-gcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  5429867 aggaacaaacacatcaaa-gattgttgacccagttcggtccaacttaacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactat 5429782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 135 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 29254682 - 29254597
Alignment:
Q  135 aggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga-gcatctctccaatccactat 220  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||   ||||||||||||||||||    
T  29254682 aggaacaaacacaccaaa-gattgttgacccagttcggtccaacttgacctaatttgggagagagattgatctctccaatccactat 29254597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 135 - 220
Target Start/End: Original strand, 34570394 - 34570479
Alignment:
Q  135 aggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga-gcatctctccaatccactat 220  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||  | |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  34570394 aggaacaaacacaccaaa-gattgttgacccagttcgatccaacttaacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactat 34570479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 152 - 221
Target Start/End: Original strand, 18855728 - 18855796
Alignment:
Q  152 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactatg 221  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  18855728 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg 18855796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 454 - 574
Target Start/End: Complemental strand, 35662098 - 35661978
Alignment:
Q  454 ccaagtttctctctcttcaagctctccttcaaaatctgcacaagaacacttaaataacagtcttcagctgataaaatcgtgccacgtttt-ccaaatcat 552  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||| ||  ||||| ||  |||||||| ||||||| |    
T  35662098 ccaagtttttctctcttcaacctctccatcaaaatctgca-aagaacacttatatagcagtcttcagttgtcaaaattgtatcacgttttgccaaatcgt 35662000  T
Q  553 gccacgattgatgcgtacgacc 574  Q
    | |||| ||| |||||||||||    
T  35661999 gacacggttggtgcgtacgacc 35661978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 156 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 6765177 - 6765113
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  6765177 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactat 6765113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 156 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 7941656 - 7941592
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  7941656 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactat 7941592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 156 - 220
Target Start/End: Original strand, 18709164 - 18709228
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||    
T  18709164 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagtcctccaatccactat 18709228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 156 - 220
Target Start/End: Original strand, 22782738 - 22782802
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  22782738 ttgttgatccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactat 22782802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 454 - 546
Target Start/End: Original strand, 31495589 - 31495680
Alignment:
Q  454 ccaagtttctctctcttcaagctctccttcaaaatctgcacaagaacacttaaataacagtcttcagctgataaaatcgtgccacgttttcca 546  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||  || | ||  |||||||||||||| |||| ||||||    
T  31495589 ccaagtttctctctcttccaactctccttc-aaatctgcacaagaacacttaaatattagccctccactgataaaatcgtgtcacgatttcca 31495680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 151 - 218
Target Start/End: Original strand, 36463384 - 36463452
Alignment:
Q  151 aaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga-gcatctctccaatccact 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  36463384 aaagattgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccact 36463452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 152 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 56146795 - 56146713
Alignment:
Q  152 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactatgatgaaagtgttacaa 236  Q
    ||||||||||  ||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  56146795 aagattgttggtccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaa 56146713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 138 - 220
Target Start/End: Original strand, 46147374 - 46147456
Alignment:
Q  138 aacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga-gcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||   || |||||||||||||||    
T  46147374 aacaaacacaccaaa-gattgttgacccagttcggtccaacttgacctaatttgggggagagattgatgtctccaatccactat 46147456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 138 - 220
Target Start/End: Original strand, 47038394 - 47038476
Alignment:
Q  138 aacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga-gcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| || |||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  47038394 aacaaacacaccaaa-gattgttgacccagttcggtccaacttgacttactctgggggagagattgatctctccaatccactat 47038476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 151 - 220
Target Start/End: Original strand, 27416960 - 27417030
Alignment:
Q  151 aaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga-gcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  27416960 aaagattgttgactcagttcggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactat 27417030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 135 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 37740813 - 37740728
Alignment:
Q  135 aggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga-gcatctctccaatccactat 220  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||  ||||| |||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  37740813 aggaacaaacacacaaaaa-attgttgacacagttcggtccaacttgaccaaatctgggggagagattgatctctccaatccactat 37740728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 380 - 451
Target Start/End: Original strand, 48893847 - 48893920
Alignment:
Q  380 tgtttacaatgtttctcaaccc--aagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgta 451  Q
    |||||||||||||||  |||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  48893847 tgtttacaatgtttccaaaccctaaagagaacctcactacaaagacactcaaccctcaaattacctcctttgta 48893920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 140 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 5872003 - 5871923
Alignment:
Q  140 caaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga-gcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||    
T  5872003 caaacacaccaaa-gattgttgacccagttcggtcaaacttgacctaatctgggggagagattgatctctctaatccactat 5871923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 417 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 36994451 - 36994375
Alignment:
Q  417 caaagacactcaaccctaaagttacctcctttg-taatccaagtttctctctcttcaagctctccttcaaaatctgca 493  Q
    ||||||| |||||||  |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  36994451 caaagaccctcaacca-aaagttacctcctttgattttccaagtttctctctcttcaacctctccttcaaaatctgca 36994375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 135 - 200
Target Start/End: Original strand, 54199887 - 54199950
Alignment:
Q  135 aggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga 200  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||    
T  54199887 aggaacaaacacaccaaaa-attgttgacccagttcg-tccaacttgacctaatctgggggagaga 54199950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 156 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 5198753 - 5198689
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactat 220  Q
    |||||||| |||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  5198753 ttgttgacacagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactat 5198689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 156 - 220
Target Start/End: Original strand, 5635476 - 5635540
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| | |||| |||||||||    
T  5635476 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactat 5635540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 156 - 220
Target Start/End: Original strand, 8631419 - 8631483
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| | |||| |||||||||    
T  8631419 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactat 8631483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 156 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 9148585 - 9148521
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| | ||||  ||||||||    
T  9148585 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactat 9148521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 156 - 220
Target Start/End: Original strand, 11008568 - 11008632
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||| ||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  11008568 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactat 11008632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 156 - 220
Target Start/End: Original strand, 17662245 - 17662309
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| | |||| |||||||||    
T  17662245 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactat 17662309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 342 - 449
Target Start/End: Original strand, 37782062 - 37782170
Alignment:
Q  342 ttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaaatgtttac-aatgtttctcaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagtta 440  Q
    ||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||  ||||||| |||||||  |||||||||||| |||| |  |||||| | ||||| |||||||||    
T  37782062 ttttgattcttccaataatgaaatctcactacccaaggtgtttacaaatgttttccaacccaagagagcctctcaccaaagatattcaactctaaagtta 37782161  T
Q  441 cctcctttg 449  Q
    |||| ||||    
T  37782162 cctcatttg 37782170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 156 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 11853730 - 11853659
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaat-atgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactatgatgaa 226  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||    
T  11853730 ttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactataatgaa 11853659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 138 - 220
Target Start/End: Original strand, 45687165 - 45687247
Alignment:
Q  138 aacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga-gcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||| ||| |||||||   ||||||||||||||||||    
T  45687165 aacaaacacaccaaa-gattgttgacccagttcggtccaacttgacataatatggaggagagatagatctctccaatccactat 45687247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 387 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 6677424 - 6677362
Alignment:
Q  387 aatgtttctcaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttg 449  Q
    |||||||| |||||||||||| || |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6677424 aatgtttcccaacccaagagaacccctgaacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttg 6677362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 156 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 18587148 - 18587078
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaat-atgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactatgatga 225  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||    
T  18587148 ttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactataatga 18587078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 156 - 220
Target Start/End: Original strand, 2484873 - 2484937
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| | |||| |||||||||    
T  2484873 ttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactat 2484937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 156 - 220
Target Start/End: Original strand, 9174146 - 9174210
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||| || | ||||||||||||||    
T  9174146 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggcagagaacagccctccaatccactat 9174210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 156 - 220
Target Start/End: Original strand, 9176474 - 9176538
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactat 220  Q
    |||||||| | |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  9176474 ttgttgactctgttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactat 9176538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 156 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 11435287 - 11435223
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||| | |||| |||||||||    
T  11435287 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccgatccactat 11435223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 156 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 11437695 - 11437631
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||| | |||| |||||||||    
T  11437695 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccgatccactat 11437631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 156 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 18847485 - 18847422
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||| | ||||||||||||||    
T  18847485 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccctccaatccactat 18847422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 156 - 220
Target Start/End: Original strand, 22044391 - 22044455
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| |||| ||||||||||| | |||| |||||||||    
T  22044391 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgagggagagagcagccctccgatccactat 22044455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 156 - 220
Target Start/End: Original strand, 22046686 - 22046750
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| |||| ||||||||||| | |||| |||||||||    
T  22046686 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgagggagagagcagccctccgatccactat 22046750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 156 - 220
Target Start/End: Original strand, 22132392 - 22132456
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| | | |||||||||||| | ||||||||||||||    
T  22132392 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtataggggagagagcagccctccaatccactat 22132456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #112
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 156 - 220
Target Start/End: Original strand, 22134618 - 22134681
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||| | ||||||||||||||    
T  22134618 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccctccaatccactat 22134681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #113
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 156 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 24348551 - 24348487
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||||| | |||| |||||||||    
T  24348551 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgatccactat 24348487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #114
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 156 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 24889129 - 24889065
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| | ||||  ||||||||    
T  24889129 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactat 24889065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #115
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 145 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 26364415 - 26364339
Alignment:
Q  145 acaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga-gcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||| | |||||||||||||||| ||| ||  |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  26364415 acaccaagaaattgttgacccagttcagtcaaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactat 26364339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #116
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 156 - 220
Target Start/End: Original strand, 31849599 - 31849663
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactat 220  Q
    |||||||||||||||||| |||  ||||||| |||||||||||||||| | |||| |||||||||    
T  31849599 ttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactat 31849663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #117
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 138 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 36994708 - 36994627
Alignment:
Q  138 aacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga-gcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||  ||| ||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  36994708 aacaaacacgccaaaa--ttgttgacccagttcggtccaacttgatctaatatgggggagagattgatctctccaatccactat 36994627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #118
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 156 - 220
Target Start/End: Original strand, 37089372 - 37089436
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| | ||||  ||||||||    
T  37089372 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactat 37089436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #119
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 12 - 236
Target Start/End: Original strand, 37781722 - 37781946
Alignment:
Q  12 agcaaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaactaaaaacagacctaga-cttagtgtagagcaacaccacaagcataaacaa 110  Q
    |||||| ||||| || || |||| ||||||| ||  ||| |||||||| | | ||| ||||||||| || |||||  ||||||||||||||||||  |||    
T  37781722 agcaaaagaagtagtcattaatgagtaaagtatcatcaatcaacaacatcaacaaatagacctagatctaagtgtgaagcaacaccacaagcatattcaa 37781821  T
Q  111 agca-caaagataagcaatgaaagaaggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaa-tatgacctaatctgggggagagagcatctct 208  Q
    |||| |||||||||| ||| | ||||| ||  |||| ||||| |  ||||| ||||||||||||  || ||||||||| | | || ||||||| | ||||    
T  37781822 agcaacaaagataagaaataatagaagaaaacaacaaaccaata--ttgtttacccagttcggtttaaatatgacctact-tcggagagagagtaactct 37781918  T
Q  209 ccaatccactatgatgaaagtgttacaa 236  Q
    |||||||||||| || |||||| |||||    
T  37781919 ccaatccactataataaaagtgatacaa 37781946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #120
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 156 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 38409537 - 38409473
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||||| | |||| |||||||||    
T  38409537 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgatccactat 38409473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #121
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 156 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 4215639 - 4215592
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagca 203  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  4215639 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagca 4215592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #122
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 156 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 16455575 - 16455528
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagca 203  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  16455575 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagca 16455528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #123
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 156 - 203
Target Start/End: Original strand, 22800862 - 22800909
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagca 203  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  22800862 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagca 22800909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #124
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 156 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 24879323 - 24879276
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagca 203  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  24879323 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagca 24879276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #125
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 156 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 24880785 - 24880738
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagca 203  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  24880785 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagca 24880738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #126
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 156 - 203
Target Start/End: Original strand, 38928177 - 38928224
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagca 203  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  38928177 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagca 38928224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #127
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 156 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 40637407 - 40637360
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagca 203  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  40637407 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagca 40637360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #128
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 156 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 4885056 - 4884986
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaat-atgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactatgatga 225  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||  |||||||| ||||    
T  4885056 ttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctccgttccactataatga 4884986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #129
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 156 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 8529449 - 8529379
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaat-atgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactatgatga 225  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||  |||||||| ||||    
T  8529449 ttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctccgttccactataatga 8529379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #130
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 151 - 220
Target Start/End: Original strand, 13009439 - 13009509
Alignment:
Q  151 aaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagc-atctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||  ||||||||| ||| ||||||| | ||||||||||||||||||    
T  13009439 aaagattgttgacacagttcggtctaacttgacctaatttggaggagagatcgatctctccaatccactat 13009509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #131
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 156 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 19096216 - 19096162
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctcc 210  Q
    |||||||||||||| |||||||  ||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  19096216 ttgttgacccagtttggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagctctcc 19096162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #132
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 145 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 2209894 - 2209817
Alignment:
Q  145 acaccaaaagattgttgacccagttcggtccaa-tatgacctaatctgggggagaga-gcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||  |||||||| ||||| |||||||   ||||||||||||||||||    
T  2209894 acaccaagagattgttcacccagttcggtccaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactat 2209817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #133
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 156 - 201
Target Start/End: Original strand, 14789428 - 14789473
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagag 201  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  14789428 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagag 14789473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #134
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 25 - 236
Target Start/End: Original strand, 18377244 - 18377443
Alignment:
Q  25 gtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaactaaaaacagacct-agacttagtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagc-acaaagata 122  Q
    ||||||||||  |||||||||  |||||||||||||| | |||||| ||| | ||| |||||| ||||  ||||||||||||| |||||| ||||| |||    
T  18377244 gtaatcaatggataaagtgtcctcaagcaacaacaacaacaaacagtcctaaaactaagtgtaaagcataaccacaagcataatcaaagcaacaaaaata 18377343  T
Q  123 agcaatgaaagaaggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactatga 222  Q
    || |           |||||||||||||| |   || | ||||||||| || | |||||||||| ||||| |||||||||| | ||||| ||||||| ||    
T  18377344 agaa-----------aacaaacacaccaaga---tggtaacccagttcagttctatatgacctactctggaggagagagcagccctccattccactaaga 18377429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #135
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 526 - 586
Target Start/End: Original strand, 27417519 - 27417580
Alignment:
Q  526 aaaatcgtgccacgttttcc-aaatcatgccacgattgatgcgtacgacccaaggtacgacc 586  Q
    ||||||||| |||| ||||| ||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27417519 aaaatcgtgtcacgatttcccaaatcgtgacacggttgatgcgtacgacccaaggtacgacc 27417580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #136
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 156 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 36378626 - 36378557
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactatgatga 225  Q
    ||||| ||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| | ||||  |||||||| ||||    
T  36378626 ttgtttacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactataatga 36378557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #137
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 162 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 10113198 - 10113134
Alignment:
Q  162 acccagttcggtccaata-tgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactatgatga 225  Q
    |||||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||||||| ||||||| |||||||| ||||    
T  10113198 acccagttcggtccaatactaacctagtcttggggagagagcagctctccattccactataatga 10113134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #138
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 156 - 220
Target Start/End: Original strand, 11006237 - 11006301
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||| ||| ||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| | |||| |||||||||    
T  11006237 ttgttaacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactat 11006301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #139
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 156 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 51015578 - 51015514
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| |||| |||||||||||   |||| |||||||||    
T  51015578 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgagggagagagcagacctccgatccactat 51015514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #140
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 145 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 54883199 - 54883123
Alignment:
Q  145 acaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga-gcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||  |||| |||||||| |||||||   ||| ||||||||||||||    
T  54883199 acaccaagaaattgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctggaggagagattgatccctccaatccactat 54883123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #141
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 138 - 220
Target Start/End: Original strand, 56178619 - 56178702
Alignment:
Q  138 aacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtcc-aatatgacctaatctgggggagaga-gcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||  ||||||| ||||| |||||||   ||||||||||||||||||    
T  56178619 aacaaacacaccaaa-gattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactat 56178702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #142
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 138 - 220
Target Start/End: Original strand, 6542162 - 6542244
Alignment:
Q  138 aacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga-gcatctctccaatccactat 220  Q
    |||||||||||||| | || ||| ||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  6542162 aacaaacacaccaagaaat-gtttacccagttcggtccaacttgacctaccctgggggagagattgatctctccaatccactat 6542244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #143
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 156 - 203
Target Start/End: Original strand, 12395845 - 12395892
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagca 203  Q
    |||||||||| |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  12395845 ttgttgaccctgttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagca 12395892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #144
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 156 - 203
Target Start/End: Original strand, 12400807 - 12400854
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagca 203  Q
    |||||||||| |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  12400807 ttgttgaccctgttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagca 12400854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #145
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 156 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 14633651 - 14633604
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagca 203  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| |||| |||||||||||    
T  14633651 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgagggagagagca 14633604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #146
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 156 - 203
Target Start/End: Original strand, 36919584 - 36919631
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagca 203  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| ||||||||||||    
T  36919584 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagca 36919631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #147
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 400 - 470
Target Start/End: Original strand, 37755149 - 37755220
Alignment:
Q  400 ccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttg-taatccaagtttctctctctt 470  Q
    |||||||| |||| |  ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  37755149 ccaagagaacctctcaccaaagactctcaatcctaaagttacctcctttgattttccaagtttctctctctt 37755220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #148
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 156 - 203
Target Start/End: Original strand, 40091415 - 40091462
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagca 203  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| | ||||||||||||||    
T  40091415 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagca 40091462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #149
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 156 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 48486652 - 48486605
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagca 203  Q
    ||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  48486652 ttgttgacccagttcagtccaaattgacctagtctgggggagagagca 48486605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #150
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 138 - 220
Target Start/End: Original strand, 52095345 - 52095427
Alignment:
Q  138 aacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga-gcatctctccaatccactat 220  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||  |  |||| ||||| |||||||   ||||||||||||||||||    
T  52095345 aacaaacacaccaaaa-attgttcacccagttcggtccaaacttgcctactctggaggagagattgatctctccaatccactat 52095427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #151
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 387 - 477
Target Start/End: Original strand, 52467567 - 52467657
Alignment:
Q  387 aatgtttctcaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttg-taatccaagtttctctctcttcaagctc 477  Q
    |||||||| |||||||||||| ||  | | ||||||| |||||||||||| |||||||||||| | | || |||||||||||||| ||||||    
T  52467567 aatgtttcccaacccaagagaaccctaat-caaagaccctcaaccctaaaattacctcctttgattaccctagtttctctctcttgaagctc 52467657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #152
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 164 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 15831315 - 15831253
Alignment:
Q  164 ccagttcggtccaat-atgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactatgatga 225  Q
    ||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||  |||||||| ||||    
T  15831315 ccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctccgttccactataatga 15831253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #153
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 164 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 19323020 - 19322958
Alignment:
Q  164 ccagttcggtccaata-tgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactatgatga 225  Q
    |||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||||| ||||    
T  19323020 ccagttcggtccaaaactgacctagtctgggggagagagcatccctccgttccactataatga 19322958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #154
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 15 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 36315446 - 36315386
Alignment:
Q  15 aaaggaagtggtaatcaatg--tgtaaagtgtctccaagcaacaacaactaaaaacagacct 74  Q
    ||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  36315446 aaaggaagtggtaatcaatggacaaaaagtgtctccaagcaacaacaac-aaaaacagacct 36315386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #155
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 15 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 36329655 - 36329595
Alignment:
Q  15 aaaggaagtggtaatcaatg--tgtaaagtgtctccaagcaacaacaactaaaaacagacct 74  Q
    ||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  36329655 aaaggaagtggtaatcaatggacaaaaagtgtctccaagcaacaacaac-aaaaacagacct 36329595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #156
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 164 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 36769653 - 36769591
Alignment:
Q  164 ccagttcggtccaat-atgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactatgatga 225  Q
    ||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||  |||||||| ||||    
T  36769653 ccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctccgttccactataatga 36769591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #157
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 417 - 478
Target Start/End: Original strand, 46147596 - 46147658
Alignment:
Q  417 caaagacactcaaccctaaagttacctcctttg-taatccaagtttctctctcttcaagctct 478  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |   |||||||| |||||||| |||||||    
T  46147596 caaagaccctcaaccctaaagttacctcctttgatttcccaagtttttctctcttgaagctct 46147658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #158
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 156 - 220
Target Start/End: Original strand, 4556060 - 4556125
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaat-atgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||| ||||||||||||  ||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  4556060 ttgtttacccagttcggtttaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctccgttccactat 4556125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #159
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 156 - 201
Target Start/End: Original strand, 14787429 - 14787474
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagag 201  Q
    |||||||||||||| |||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  14787429 ttgttgacccagtttggtccaaattgacctagtctgggggagagag 14787474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #160
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 94 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 21688478 - 21688376
Alignment:
Q  94 accacaagcataaacaaagcac-aaagataagcaatgaaagaaggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgg 192  Q
    ||||||| ||||| |||||||  |||||||||||||||||||||  | ||  ||||||| | ||||||||| || ||||||| ||  ||||||||||| |    
T  21688478 accacaatcataatcaaagcaataaagataagcaatgaaagaag--ataacaacaccaagaaattgttgactcaattcggtctaacttgacctaatctag 21688381  T
Q  193 gggag 197  Q
    |||||    
T  21688380 gggag 21688376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #161
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 156 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 26557919 - 26557854
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaata-tgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||| || |||||||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  26557919 ttgtttacctagttcggtccaatactgacttagtctgggggagagagcagctctccgttccactat 26557854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #162
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 156 - 203
Target Start/End: Original strand, 16185834 - 16185882
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaata-tgacctaatctgggggagagagca 203  Q
    ||||| |||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||    
T  16185834 ttgtttacccagttcggtccaaaactgacctagtctgggggagagagca 16185882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #163
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 546 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 24968907 - 24968867
Alignment:
Q  546 aaatcatgccacgattgatgcgtacgacccaaggtacgacc 586  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  24968907 aaatcatgtcacgattgaagcgtacgacccaatgtacgacc 24968867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #164
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 156 - 220
Target Start/End: Original strand, 26085977 - 26086041
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactat 220  Q
    |||||||| |||||||||||||  ||||||| |||| ||||||||||| |  ||| |||||||||    
T  26085977 ttgttgacacagttcggtccaaattgacctagtctgagggagagagcagccttccgatccactat 26086041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #165
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 156 - 203
Target Start/End: Original strand, 38890224 - 38890272
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaata-tgacctaatctgggggagagagca 203  Q
    ||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||    
T  38890224 ttgtttacccagttcggtccaaaactgacctaatcttggggagagagca 38890272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #166
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 417 - 449
Target Start/End: Original strand, 45687437 - 45687469
Alignment:
Q  417 caaagacactcaaccctaaagttacctcctttg 449  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  45687437 caaagaccctcaaccctaaagttacctcctttg 45687469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #167
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 138 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 48143229 - 48143146
Alignment:
Q  138 aacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatat-gacctaatctgggggagagagc-atctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||  | |||||| ||||| |||||||   ||||||||||||||||||    
T  48143229 aacaaacacaccaaa-gattgttcacccagtttggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactat 48143146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036 (Bit Score: 303; Significance: 1e-170; HSPs: 1)
Name: scaffold0036
Description:

Target: scaffold0036; HSP #1
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 12 - 545
Target Start/End: Original strand, 85545 - 86085
Alignment:
Q  12 agcaaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaactaaaaacagacctaga-cttagtgtagagcaacaccacaagcataaacaa 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  85545 agcaaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaat--aaaacagacctagatctaagtgtagagcaacatcacaagcataaccaa 85642  T
Q  111 agcacaaagataagcaatgaaagaag-gaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctc 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| | |  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  85643 agcacaaagataagcaatgaaagaaaagaacaaacacatcta--gattgttgacccagttcagtccaatatgacctaatctgggggagagagcggctctc 85740  T
Q  210 caatccactatgatgaaagtgttacaa-ga--------aaaatagtttgcaagcttacacaagaacaagacttaatttctacccattt-gtgtttctcac 299  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||        ||| ||| ||  |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||| || |||    
T  85741 caatccaccatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaattagcttaaaagcttacacaagagcaagacctaatttctacccattttgtgtctcccac 85840  T
Q  300 tctctcaataatgaaccctaaagggaagacacaaaaggaagcttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaaatgtttacaatgtttctcaac 399  Q
    || | ||||| ||||  ||||  | || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  85841 tcccacaata-tgaattctaagagaaaaacacaaaaggaagtttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaagtgtttacaatgtttcccaac 85939  T
Q  400 ccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatccaagtttctctctcttcaagctctccttcaaaatctgcacaagaa 499  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  85940 ccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatccaagtttctctcacttcaagctatccttcaaaatctgcacaagaa 86039  T
Q  500 cacttaaataacagtcttcagctgataaaatcgtgccacgttttcc 545  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||    
T  86040 cacttatatagcagtcttcagttgtcaaaatcgtgtcacgttttcc 86085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188 (Bit Score: 262; Significance: 1e-146; HSPs: 2)
Name: scaffold0188
Description:

Target: scaffold0188; HSP #1
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 15 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 18185 - 17641
Alignment:
Q  15 aaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaactaaaaacagacctagacttagtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagca 114  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||   | ||||||||    
T  18185 aaaggaagtggtaatctatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaaccagccctagact-agtgtagagcaacaccacaagagaatacaaagca 18087  T
Q  115 ca-aagataagcaatgaaagaaggaacaaacacaccaaaa-gattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaa 212  Q
     | ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18086 aacaagataagcaa-gaaaggaagaacaaacacaccaaaaagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaa 17989  T
Q  213 tccactatgatgaaagtgttacaa----------gaaaaatagtttgcaagcttacacaagaacaagacttaatttctacccatttgtgtttctc-actc 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||          ||||||||| ||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||| | ||||    
T  17988 tccactatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaaaatagcttgcaagcttacacaagaacaagtcatagtttctacccatttgtgtttccccactc 17889  T
Q  302 tctcaataatgaaccctaaagg-gaagacacaaaaggaagcttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaaatgtttacaatgtttctc--aa 398  Q
    || ||||| ||||||||||| | |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||  ||    
T  17888 tcacaata-tgaaccctaaaagagaagacacaagaggaagctttagatccttccaatggtgaaatctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaa 17790  T
Q  399 cccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatccaagtttctctctc--------ttcaagctctccttcaaaatct 490  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||        | ||||||||||||||||||||    
T  17789 cccaagagatcctctctacaaagacactcaaccctagagttccctcctttgtaatccaagtttctctctctaagctcttccaagctctccttcaaaatct 17690  T
Q  491 gcacaagaacacttaaataacagtcttcagctgataaaatcgtgccacg 539  Q
    |||||||||||||||||||  || ||||  |||||||||||||| ||||    
T  17689 gcacaagaacacttaaatactagccttccactgataaaatcgtgtcacg 17641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188; HSP #2
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 15 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 24278 - 23812
Alignment:
Q  15 aaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaactaaaaacagacctagacttagtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagca 114  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||   | |||||| |    
T  24278 aaaggaagtggtaatctatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaaccagccctagact-agtgtagagcaacaccacaagagaatacaaagaa 24180  T
Q  115 ca-aagataagcaatgaaagaaggaacaaacacaccaaaa-gattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaa 212  Q
     | |||||||| || ||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24179 aacaagataagaaa-gaaaggaagaacaaacacaccaaaaagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaa 24082  T
Q  213 tccactatgatgaaagtgttacaa----------gaaaaatagtttgcaagcttacacaagaacaagacttaatttctacccatttgtgtttctc-actc 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||          ||||||||| ||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||| | ||||    
T  24081 tccactatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaaaatagcttgcaagcttacacaagaacaagtcatagtttctacccatttgtgtttccccactc 23982  T
Q  302 tctcaataatgaaccctaaagg-gaagacacaaaaggaagcttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaaatgtttacaatgtttctc--aa 398  Q
    || ||||| ||||||||||| | |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||  ||    
T  23981 tcacaata-tgaaccctaaaagagaagacacaagaggaagctttagatccttccaatggtgaaatctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaa 23883  T
Q  399 cccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatccaagtttctctctct 469  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23882 cccaagagatcctctctacaaagacactcaaccctagagttccctcctttgtaatccaagtttctctctct 23812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0098 (Bit Score: 204; Significance: 1e-111; HSPs: 2)
Name: scaffold0098
Description:

Target: scaffold0098; HSP #1
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 316 - 586
Target Start/End: Original strand, 45371 - 45642
Alignment:
Q  316 cctaaagggaagacacaaaaggaagcttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaaatgtttacaatgtttctcaacccaagagatcctcact 415  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  45371 cctaaagagaagacacaaaaggaagcttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttcacaacccaagagatcctcact 45470  T
Q  416 acaaa-gacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatccaagtttctctctcttcaagctctccttcaaaatctgcacaagaacacttaaataacagt 514  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||| |||||||||||||||||||| || |    
T  45471 acaaaagacattcaaccctaaagttacctcctttgtaatccaagtttctctctcttcaagctcttttccaaaatttgcacaagaacacttaaataccaat 45570  T
Q  515 cttcagctgataaaatcgtgccacgttttccaaatcatgccacgattgatgcgtacgacccaaggtacgacc 586  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  45571 cttcagctgataaaatcgtgccacgttttccaaatcgtgtcacgattgatatgtacgacccaaggtacgacc 45642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0098; HSP #2
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 12 - 268
Target Start/End: Original strand, 45115 - 45368
Alignment:
Q  12 agcaaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaactaaaaacagacctagacttagtgtagagcaacaccacaagcataaacaaa 111  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  45115 agcaaatgaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaac-aaaaacagaccaagtct-agtgtagagcaacaccacaaacatatacaaa 45212  T
Q  112 gcacaaagataagcaatgaaagaaggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctcca 211  Q
    | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  45213 gaacaaagataagcaatgaaagaatgaacaaacacaccaaaagattgttgactcagttcggttcaatatgacctaatctgggggagagagcagctctcca 45312  T
Q  212 atccactatgatgaaagtgttacaagaaaaatagtttgcaagcttacacaagaacaa 268  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  45313 atccactatgatgaaagcgttacaag-aaaatagtttgcaaacttacgcaagaacaa 45368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0148 (Bit Score: 188; Significance: 1e-101; HSPs: 1)
Name: scaffold0148
Description:

Target: scaffold0148; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 19 - 468
Target Start/End: Original strand, 10595 - 11059
Alignment:
Q  19 gaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaactaaaaacagacctaga-cttagtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagcac-a 116  Q
    |||||||||||| ||   ||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||| |||||||  |    
T  10595 gaagtggtaatcgatagataaagttactccaagcaacaacaacaaaaaacagacctaaatctaagtgtagagcaacaccacaagcataatcaaagcaata 10694  T
Q  117 aagataagcaatgaaaga-aggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatcc 215  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  10695 aagataagcaatgaaagagaggaacaaacacaccaa--gattattgacccagttcggtccaatatgacctaatttgggggagagagcagctctccaatcc 10792  T
Q  216 actatgatgaaagtgttacaaga----------aaaatagtttgcaagcttacacaagaacaagacttaatttctaccca-tttgtgtttctcactctct 304  Q
    |||| |||||||||||||||| |          ||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| | | |||||||  | |||||||     
T  10793 actaagatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagtttacaagcttacacaagaacaagacctaatttctatctattttgtgtcacccactctca 10892  T
Q  305 caataatgaaccctaaagggaagaca-caaaaggaagc-ttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaaatgtttacaatgtttctcaacc-- 400  Q
      || ||||| ||| ||| ||| |||  |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||      
T  10893 tgat-atgaatcct-aagagaaaacagaaaaaagaagctttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttcccaaccct 10990  T
Q  401 caagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatcc-aagtttctctctc 468  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  10991 caagagaacctcactacaaagacactcaaccataaagttacctcctttgtattccaaagtttctctctc 11059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0176 (Bit Score: 166; Significance: 1e-88; HSPs: 1)
Name: scaffold0176
Description:

Target: scaffold0176; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 12 - 542
Target Start/End: Original strand, 17126 - 17650
Alignment:
Q  12 agcaaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaactaaaaacagacctaga-cttagtgtagagcaacaccacaagcataaacaa 110  Q
    ||||||||||||||||||||||   |||| ||||||||| |||||||||    ||||| ||||| | || ||| ||||||||||||||||||||||  ||    
T  17126 agcaaaggaagtggtaatcaatagataaaatgtctccaaacaacaacaa----aaacatacctaaatctaagtatagagcaacaccacaagcataattaa 17221  T
Q  111 agcac-aaagataagcaatgaaagaa-ggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctct 208  Q
    ||||  ||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||| | ||    
T  17222 agcaataaagataagaaatgaaagaaaggagcaaacacaccaaaa--ttgttgacccagttcggttcaatatgacctaatatgggaaagagagcaaccct 17319  T
Q  209 ccaatccactatgatgaaagtgttacaaga----------aaaatagtttgcaagcttacacaagaacaagacttaatttctacccattt-gtgtttctc 297  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |          ||| ||| ||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||  |||    
T  17320 ccaatccattatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttataagcttacacaagaacaagacctaatttctacctattttgtgtcactc 17419  T
Q  298 actctctcaataatgaaccctaaagggaagacacaaaaggaagcttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaaatgtttacaatgtttctca 397  Q
    || ||||   ||||||| ||||| | ||| ||||||||||||| ||||||          ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||    
T  17420 acactct---taatgaatcctaa-gagaaaacacaaaaggaagtttttga----------ggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttccca 17505  T
Q  398 acccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatccaagtttctctctc-ttcaagctctccttcaaaatctgcacaa 496  Q
    | ||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||| | ||||||||||| || ||    
T  17506 atccaagagatctccactacaaagacactcaaccgtaaagttacctcctatgtaatccaaggttctctctctttcaagctatacttcaaaatctaca-aa 17604  T
Q  497 gaacacttaaataacagtcttcagctgataaaatcgtgccacgttt 542  Q
    ||||||||| ||| |||| ||||||||  ||||||||| |||||||    
T  17605 gaacacttatatagcagttttcagctgtcaaaatcgtgacacgttt 17650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 80; Significance: 3e-37; HSPs: 2)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 417 - 586
Target Start/End: Original strand, 20656 - 20826
Alignment:
Q  417 caaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatccaa-gtttctctctcttcaagctctccttcaaaatctgcacaagaacacttaaataacagtc 515  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||   ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||     
T  20656 caaagaccctcaaccctaaagttacctcctttgatttccaaagtttctctctcttctagctctccttcaaaatctgca-aagaacacttatataacagtt 20754  T
Q  516 ttcagctgataaaatcgtgccacgtttt-ccaaatcatgccacgattgatgcgtacgacccaaggtacgacc 586  Q
    |||||||   |||||||||  ||||||| ||||||| || |||| ||  |||||||||||||||||||||||    
T  20755 ttcagctatcaaaatcgtgttacgttttgccaaatcgtgacacgtttagtgcgtacgacccaaggtacgacc 20826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 135 - 216
Target Start/End: Original strand, 20395 - 20476
Alignment:
Q  135 aggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga-gcatctctccaatcca 216  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||    
T  20395 aggaacaaacacaccaaaa-attgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatcca 20476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0491 (Bit Score: 72; Significance: 2e-32; HSPs: 2)
Name: scaffold0491
Description:

Target: scaffold0491; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 380 - 586
Target Start/End: Original strand, 11366 - 11572
Alignment:
Q  380 tgtttacaatgtttctcaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatcc-aagtttctctctcttcaagctct 478  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||  |||    |||||||  | ||||||| ||||||  ||||||   ||| |||||||||||||||| | ||||    
T  11366 tgtttacaatgtttcccaacccaagagaagctctaatcaaagaccataaaccctagagttactccctttgatttcccaagtttctctctcttccaactct 11465  T
Q  479 ccttcaaaatctgcacaagaacacttaaataacagtcttcagctgataaaatcgtgccacgttttccaaatcatgccacgattgatgcgtacgacccaag 578  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||  || ||||  |||||||||||||| |||| |||||| ||| || |||||||| |||||||| ||||||    
T  11466 c-ttcaaaatctgcacaagaacacttaaatactagccttccactgataaaatcgtgtcacgatttccagatcgtgtcacgattggtgcgtacgtcccaag 11564  T
Q  579 gtacgacc 586  Q
    ||||||||    
T  11565 gtacgacc 11572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0491; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 382 - 539
Target Start/End: Original strand, 8942 - 9099
Alignment:
Q  382 tttacaatgtttctcaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatcc-aagtttctctctcttcaagctctcc 480  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||  |||    ||||||| || || |||| ||||||  ||||||   ||| |||||||||||||||| | |||||     
T  8942 tttacaatgtttcccaacccaagagaagctctaatcaaagaccctaaagcctagagttactccctttgatttcccaagtttctctctcttccaactctc- 9040  T
Q  481 ttcaaaatctgcacaagaacacttaaataacagtcttcagctgataaaatcgtgccacg 539  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  || ||||  |||||||||||||| ||||    
T  9041 ttcaaaatctgcacaagaacacttaaatactagccttccactgataaaatcgtgtcacg 9099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1805 (Bit Score: 70; Significance: 3e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold1805
Description:

Target: scaffold1805; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 12 - 89
Target Start/End: Original strand, 1268 - 1344
Alignment:
Q  12 agcaaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaactaaaaacagacctagacttagtgtagag 89  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1268 agcaaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaac-aaaaacagacctagacttagtgtagag 1344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 67; Significance: 2e-29; HSPs: 4)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 342 - 487
Target Start/End: Original strand, 23731 - 23877
Alignment:
Q  342 ttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaaatgtttacaatgtttctcaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttac 441  Q
    |||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||  || ||||||| |||  |||||||| ||| |||||||| |||||| ||||||| |||||||||    
T  23731 tttttatccttctaatggtgacatctcactacccaaggtgattacaattttttccaacccaatagaacctcactataaagacgctcaaccttaaagttac 23830  T
Q  442 ctcctttgtaatc-caagtttctctctcttcaagctctccttcaaaa 487  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||| ||| ||| ||||||||    
T  23831 ctccattgtaatctcaagtttctctctcttaaagatcttcttcaaaa 23877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 166 - 236
Target Start/End: Original strand, 23542 - 23612
Alignment:
Q  166 agttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactatgatgaaagtgttacaa 236  Q
    ||||||||||||||||||||| | | ||||||| || | || |||||| ||||| |||||||||| |||||    
T  23542 agttcggtccaatatgacctactttaggggagaaagaagctatccaattcactaagatgaaagtgatacaa 23612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 162 - 236
Target Start/End: Original strand, 43264 - 43338
Alignment:
Q  162 acccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactatgatgaaagtgttacaa 236  Q
    |||||| || ||||||||||||||| ||| | ||||||| ||  |||| ||||||||| |||||||||| |||||    
T  43264 acccagatccgtccaatatgacctactctagaggagagaacaattctctaatccactaagatgaaagtgatacaa 43338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 61
Target Start/End: Original strand, 43117 - 43166
Alignment:
Q  12 agcaaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaac 61  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  ||| ||||||||||    
T  43117 agcaaaggaagtggtaatcaatgagtaaagtatcctcaaccaacaacaac 43166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 62; Significance: 2e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 417 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 434460 - 434290
Alignment:
Q  417 caaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatcc-aagtttctctctcttcaagctctccttcaaaatctgcacaagaacacttaaataacagtc 515  Q
    ||||||| || |||||||||||| | |||||||   ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  ||| | |||    
T  434460 caaagaccctaaaccctaaagttgcttcctttgatttcccaagtttctctctcttcaagctcaccttcaaaatctgca-aagaacacttttatagcggtc 434362  T
Q  516 ttcagctgataaaatcgtgccacgtttt--ccaaatcatgccacgattgatgcgtacgacccaaggtacgacc 586  Q
    ||| || |  ||||||||||||||||||  || |||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  434361 ttctgc-gtcaaaatcgtgccacgtttttccccaatcgtgccacgatttatgcgtacgatccaaggtacgacc 434290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1519 (Bit Score: 60; Significance: 3e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold1519
Description:

Target: scaffold1519; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 471 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 779 - 664
Alignment:
Q  471 caagctctccttcaaaatctgcacaagaacacttaaataacagtcttcagctgataaaatcgtgccacgttttccaaatcatgccacgattgatgcgtac 570  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||  |||||||||||||| |||| |||||||||| || ||| |||| | |||||    
T  779 caagctctcctccaaaatctgcacaagaacacttaaatactagtcttccactgataaaatcgtgtcacgatttccaaatcgtgtcacaattggtacgtac 680  T
Q  571 gacccaaggtacgacc 586  Q
    | | ||||||||||||    
T  679 gtcacaaggtacgacc 664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 55; Significance: 3e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 417 - 582
Target Start/End: Complemental strand, 114517 - 114347
Alignment:
Q  417 caaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatc-caagtttctctctcttcaagctctccttcaaaatctgcacaag----aacacttaaataac 511  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||   || ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||    |||||||| ||| |    
T  114517 caaagaccctcaaccctaaagttacctcctttgatttctcaagtttctctctcttcaagctcacattcaaaatctgca-aagatctaacacttatatagc 114419  T
Q  512 agtcttcagctgat-aaaatcgtgccacgttttcca--aatcatgccacgattgatgcgtacgacccaaggtac 582  Q
    || |||||||  ||  |||||||| |||||||||||  |||| || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  114418 agccttcagc--atcgaaatcgtgtcacgttttccatcaatcgtgtcacgagtgatgcgtacgacccaaggtac 114347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0355 (Bit Score: 53; Significance: 4e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0355
Description:

Target: scaffold0355; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 152 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 9726 - 9644
Alignment:
Q  152 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactatgatgaaagtgttacaa 236  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  9726 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaa 9644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0267 (Bit Score: 49; Significance: 1e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0267
Description:

Target: scaffold0267; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 156 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 329 - 265
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  329 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactat 265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0135 (Bit Score: 49; Significance: 1e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0135
Description:

Target: scaffold0135; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 152 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 35146 - 35064
Alignment:
Q  152 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactatgatgaaagtgttacaa 236  Q
    ||||||||| ||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  35146 aagattgttaacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaa 35064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0464 (Bit Score: 46; Significance: 6e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0464
Description:

Target: scaffold0464; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 152 - 221
Target Start/End: Original strand, 364 - 432
Alignment:
Q  152 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactatg 221  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  364 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg 432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0286 (Bit Score: 46; Significance: 6e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0286
Description:

Target: scaffold0286; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 454 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 22233 - 22149
Alignment:
Q  454 ccaagtttctctctcttcaagctctccttcaaaatctgcacaagaacacttaaataacagtcttcagctgataaaatcgtgccacg 539  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||  || ||||  |||||||||||||| ||||    
T  22233 ccaagtttctctctcttctagctcaccttcaaa-tctgcacaagaacacttaaatactagccttccactgataaaatcgtgtcacg 22149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0286; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 138 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 11744 - 11660
Alignment:
Q  138 aacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtcc-aatatgacctaatctgggggagaga-gcatctctccaatccactat 220  Q
    |||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| ||  ||||||| ||||| |||||||   | ||||||||||||||||    
T  11744 aacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactat 11660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0197 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0197
Description:

Target: scaffold0197; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 152 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 14393 - 14311
Alignment:
Q  152 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactatgatgaaagtgttacaa 236  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  14393 aagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaa 14311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0197; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 152 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 19249 - 19189
Alignment:
Q  152 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaat 213  Q
    ||||||||||||||||||| | ||| | || ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19249 aagattgttgacccagttcag-ccattgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 19189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0154 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0154
Description:

Target: scaffold0154; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 156 - 220
Target Start/End: Original strand, 11473 - 11537
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactat 220  Q
    |||||||||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11473 ttgttgacccggttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagctctccaatccactat 11537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 156 - 220
Target Start/End: Original strand, 69292 - 69356
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  69292 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactat 69356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0477 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0477
Description:

Target: scaffold0477; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 402 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 5794 - 5728
Alignment:
Q  402 aagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgtaatcc-aagtttctctct 467  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | ||||||||||    
T  5794 aagagaacctcactacaaagacactcaaccctcaagttacctcctttgtattcctaggtttctctct 5728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0060 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0060
Description:

Target: scaffold0060; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 379 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 33429 - 33368
Alignment:
Q  379 atgtttacaatgtttctcaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagtta 440  Q
    ||||||| |||||||  |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  33429 atgtttataatgttttccaacccaagagatcgtcactacaaagacattcaaccctaaagtta 33368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 152 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 182048 - 181980
Alignment:
Q  152 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactatg 221  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  182048 aagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg 181980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0472 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0472
Description:

Target: scaffold0472; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 156 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 6487 - 6423
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactat 220  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| | |||| |||||||||    
T  6487 ttgttgactcagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactat 6423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0370 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0370
Description:

Target: scaffold0370; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 156 - 220
Target Start/End: Original strand, 1453 - 1517
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| | |||| |||||||||    
T  1453 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactat 1517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0259 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0259
Description:

Target: scaffold0259; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 152 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 2335 - 2253
Alignment:
Q  152 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactatgatgaaagtgttacaa 236  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| || ||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  2335 aagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagtagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaa 2253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 156 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 29458 - 29394
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| | |||| |||||||||    
T  29458 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactat 29394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 152 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 149040 - 148958
Alignment:
Q  152 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactatgatgaaagtgttacaa 236  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| || ||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  149040 aagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagtagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaa 148958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1050 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1050
Description:

Target: scaffold1050; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 156 - 226
Target Start/End: Original strand, 3070 - 3141
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaat-atgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactatgatgaa 226  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||    
T  3070 ttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactataatgaa 3141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0209 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0209
Description:

Target: scaffold0209; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 156 - 225
Target Start/End: Original strand, 16986 - 17056
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaat-atgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactatgatga 225  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||    
T  16986 ttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactataatga 17056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0250 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0250
Description:

Target: scaffold0250; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 156 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 3167 - 3103
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactat 220  Q
    |||||||| |||||||||||||  ||||||| ||| ||||||| |||| | ||||||||||||||    
T  3167 ttgttgactcagttcggtccaaattgacctagtctcggggagatagcagccctccaatccactat 3103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0131
Description:

Target: scaffold0131; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 156 - 220
Target Start/End: Original strand, 14382 - 14446
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||| | ||||  ||||||||    
T  14382 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccgttccactat 14446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 156 - 220
Target Start/End: Original strand, 41483 - 41547
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactat 220  Q
    ||||||||||||||||||||||  | ||||| |||||||||||||||| | |||| || ||||||    
T  41483 ttgttgacccagttcggtccaaattcacctagtctgggggagagagcagccctccgattcactat 41547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 156 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 79473 - 79409
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactat 220  Q
    |||||||||||||| |||||||  ||||||| |||||||||||||||| | ||||  ||||||||    
T  79473 ttgttgacccagtttggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactat 79409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0891 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0891
Description:

Target: scaffold0891; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 156 - 203
Target Start/End: Original strand, 4679 - 4726
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagca 203  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  4679 ttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagca 4726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 3)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 156 - 203
Target Start/End: Original strand, 183641 - 183688
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagca 203  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| |||| |||||||||||    
T  183641 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgagggagagagca 183688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 156 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 50302 - 50257
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagag 201  Q
    |||||||||||||| |||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  50302 ttgttgacccagttaggtccaaattgacctagtctgggggagagag 50257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 156 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 52301 - 52256
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagag 201  Q
    |||||||||||||| |||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  52301 ttgttgacccagtttggtccaaattgacctagtctgggggagagag 52256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0256 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0256
Description:

Target: scaffold0256; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 156 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 16507 - 16453
Alignment:
Q  156 ttgttgacccagttcggtccaat-atgacctaatctgggggagagagcatctctc 209  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  16507 ttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctc 16453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000005; HSPs: 2)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 162 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 29580 - 29506
Alignment:
Q  162 acccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccaatccactatgatgaaagtgttacaa 236  Q
    |||||| || ||||||||||||||| ||| | ||||||| ||  |||| ||||||||| |||||||||| |||||    
T  29580 acccagatccgtccaatatgacctactctagaggagagaacaattctctaatccactaagatgaaagtgatacaa 29506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 29727 - 29678
Alignment:
Q  12 agcaaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaac 61  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  ||| ||||||||||    
T  29727 agcaaaggaagtggtaatcaatgagtaaagtatcctcaaccaacaacaac 29678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 526 - 586
Target Start/End: Original strand, 80851 - 80912
Alignment:
Q  526 aaaatcgtgccacgttttcc-aaatcatgccacgattgatgcgtacgacccaaggtacgacc 586  Q
    ||||||||| |||| ||||| ||||| || |||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  80851 aaaatcgtgtcacgatttcccaaatcgtgacacgtttggtgcgtacgacccaaggtacgacc 80912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University