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Alignment Overview

Query: NF17746_low_10 (Length: 241)

Name: NF17746_low_10
Description: NF17746
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF17746_low_10
NF17746_low_10
[»] chr3 (45 HSPs)
chr3 (11-238)||(15936663-15936890)
chr3 (14-238)||(15938505-15938729)
chr3 (11-240)||(14842595-14842824)
chr3 (10-240)||(51158052-51158282)
chr3 (11-240)||(15859058-15859287)
chr3 (11-236)||(2049810-2050035)
chr3 (11-240)||(12030181-12030410)
chr3 (22-240)||(13838905-13839123)
chr3 (15-230)||(15614838-15615053)
chr3 (11-240)||(16821139-16821369)
chr3 (11-241)||(17912515-17912744)
chr3 (11-240)||(55316219-55316449)
chr3 (11-240)||(41270075-41270305)
chr3 (11-241)||(13975755-13975985)
chr3 (11-241)||(45860805-45861035)
chr3 (11-241)||(13954923-13955153)
chr3 (11-241)||(16744148-16744377)
chr3 (142-241)||(2449271-2449370)
chr3 (112-224)||(54651558-54651671)
chr3 (11-123)||(47984650-47984762)
chr3 (11-123)||(48003224-48003336)
chr3 (174-240)||(47784784-47784851)
chr3 (175-240)||(3576456-3576522)
chr3 (176-237)||(4145835-4145896)
chr3 (174-238)||(34560061-34560126)
chr3 (11-123)||(47993937-47994049)
chr3 (11-123)||(48012510-48012622)
chr3 (174-240)||(12953126-12953193)
chr3 (174-240)||(14080671-14080738)
chr3 (174-240)||(17191703-17191770)
chr3 (174-240)||(17204843-17204910)
chr3 (178-224)||(5228481-5228527)
chr3 (176-237)||(6228646-6228708)
chr3 (178-224)||(11986216-11986262)
chr3 (178-224)||(12264834-12264880)
chr3 (178-224)||(12902132-12902178)
chr3 (178-224)||(15468382-15468428)
chr3 (178-224)||(18911161-18911207)
chr3 (178-224)||(22275377-22275423)
chr3 (178-224)||(25058907-25058953)
chr3 (178-224)||(49232604-49232650)
chr3 (176-240)||(13301487-13301552)
chr3 (176-240)||(13312143-13312208)
chr3 (176-240)||(31412351-31412416)
chr3 (176-240)||(41661729-41661794)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (11-238)||(48187-48414)
[»] chr7 (35 HSPs)
chr7 (11-238)||(18253871-18254098)
chr7 (13-240)||(16211768-16211995)
chr7 (11-240)||(36052667-36052893)
chr7 (11-239)||(16478985-16479213)
chr7 (16-240)||(11580773-11580997)
chr7 (11-240)||(13037048-13037277)
chr7 (11-240)||(47481065-47481294)
chr7 (11-240)||(2437457-2437687)
chr7 (11-240)||(13572676-13572906)
chr7 (11-240)||(10989410-10989639)
chr7 (11-240)||(3059966-3060195)
chr7 (11-240)||(13911046-13911277)
chr7 (17-241)||(25292371-25292595)
chr7 (47-240)||(13321050-13321245)
chr7 (11-241)||(7293017-7293246)
chr7 (142-241)||(11516358-11516457)
chr7 (142-241)||(15441597-15441696)
chr7 (142-241)||(30262162-30262261)
chr7 (14-234)||(296006-296224)
chr7 (174-240)||(16914946-16915013)
chr7 (174-240)||(9611470-9611537)
chr7 (174-240)||(9839041-9839108)
chr7 (174-240)||(48356806-48356873)
chr7 (174-224)||(48622708-48622758)
chr7 (176-240)||(28722274-28722339)
chr7 (174-240)||(13377691-13377758)
chr7 (178-224)||(13758538-13758584)
chr7 (176-237)||(14935524-14935586)
chr7 (176-237)||(15358961-15359023)
chr7 (176-237)||(15363117-15363179)
chr7 (178-224)||(15927736-15927782)
chr7 (178-224)||(15950833-15950879)
chr7 (178-224)||(18980063-18980109)
chr7 (174-238)||(49047694-49047759)
chr7 (174-237)||(14271920-14271984)
[»] scaffold0026 (2 HSPs)
scaffold0026 (11-238)||(107747-107974)
scaffold0026 (11-217)||(64573-64780)
[»] chr5 (34 HSPs)
chr5 (11-240)||(23506965-23507194)
chr5 (11-240)||(27182581-27182810)
chr5 (60-240)||(29188306-29188486)
chr5 (11-240)||(18531101-18531330)
chr5 (11-240)||(22053867-22054096)
chr5 (11-240)||(43443417-43443647)
chr5 (11-240)||(18778014-18778244)
chr5 (11-240)||(22366503-22366733)
chr5 (11-240)||(25426628-25426858)
chr5 (11-240)||(27009841-27010071)
chr5 (11-240)||(12374-12604)
chr5 (11-240)||(19499899-19500129)
chr5 (11-240)||(21073617-21073847)
chr5 (11-240)||(4200007-4200237)
chr5 (22-240)||(34939289-34939506)
chr5 (142-241)||(20623100-20623199)
chr5 (142-241)||(21233561-21233660)
chr5 (142-241)||(25900439-25900538)
chr5 (142-241)||(16536328-16536427)
chr5 (142-241)||(37052875-37052974)
chr5 (174-240)||(19862371-19862438)
chr5 (174-240)||(21310727-21310794)
chr5 (174-240)||(23981534-23981601)
chr5 (176-240)||(22885806-22885871)
chr5 (176-240)||(29918129-29918194)
chr5 (90-224)||(11212107-11212242)
chr5 (174-240)||(5450861-5450928)
chr5 (174-240)||(21222626-21222693)
chr5 (174-240)||(21297193-21297260)
chr5 (178-221)||(32950862-32950905)
chr5 (178-224)||(10778012-10778058)
chr5 (178-224)||(17471630-17471676)
chr5 (178-224)||(23514729-23514775)
chr5 (177-240)||(21617181-21617245)
[»] scaffold0266 (2 HSPs)
scaffold0266 (13-240)||(3616-3843)
scaffold0266 (11-241)||(1124-1354)
[»] scaffold0498 (1 HSPs)
scaffold0498 (11-240)||(8878-9107)
[»] chr8 (31 HSPs)
chr8 (11-240)||(43373502-43373731)
chr8 (10-240)||(16193750-16193980)
chr8 (15-240)||(24548986-24549211)
chr8 (15-240)||(6774280-6774505)
chr8 (11-240)||(21844594-21844824)
chr8 (11-240)||(21851987-21852217)
chr8 (22-240)||(24928825-24929043)
chr8 (11-240)||(30120722-30120952)
chr8 (11-240)||(16405009-16405235)
chr8 (11-240)||(16674414-16674644)
chr8 (11-199)||(222754-222943)
chr8 (11-199)||(736377-736566)
chr8 (11-199)||(860272-860461)
chr8 (22-240)||(17345581-17345798)
chr8 (11-241)||(22907247-22907476)
chr8 (142-241)||(5238218-5238317)
chr8 (142-241)||(24661281-24661380)
chr8 (142-241)||(43685677-43685776)
chr8 (174-240)||(26011656-26011723)
chr8 (174-240)||(15933460-15933527)
chr8 (141-199)||(691909-691967)
chr8 (174-240)||(17285366-17285433)
chr8 (174-240)||(21198170-21198237)
chr8 (174-240)||(25296320-25296387)
chr8 (174-240)||(25758340-25758407)
chr8 (178-224)||(13720970-13721016)
chr8 (178-224)||(16195399-16195445)
chr8 (178-224)||(16873093-16873139)
chr8 (178-224)||(22006300-22006346)
chr8 (179-240)||(23226094-23226156)
chr8 (176-240)||(33172392-33172457)
[»] scaffold0025 (3 HSPs)
scaffold0025 (11-240)||(148721-148950)
scaffold0025 (11-240)||(8849-9078)
scaffold0025 (174-240)||(53508-53575)
[»] scaffold0175 (1 HSPs)
scaffold0175 (11-240)||(990-1218)
[»] scaffold0302 (1 HSPs)
scaffold0302 (11-240)||(12115-12342)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (11-240)||(6098-6326)
[»] scaffold0008 (2 HSPs)
scaffold0008 (11-240)||(128203-128431)
scaffold0008 (11-240)||(31697-31928)
[»] chr1 (19 HSPs)
chr1 (11-240)||(20931345-20931574)
chr1 (11-224)||(22227809-22228022)
chr1 (11-224)||(22232506-22232719)
chr1 (15-240)||(2116258-2116484)
chr1 (11-240)||(20893660-20893889)
chr1 (11-240)||(41394222-41394451)
chr1 (11-240)||(20913037-20913259)
chr1 (11-240)||(20445679-20445908)
chr1 (11-240)||(20531444-20531673)
chr1 (77-240)||(45051489-45051652)
chr1 (11-240)||(37844484-37844714)
chr1 (11-240)||(18601140-18601370)
chr1 (11-240)||(5072410-5072640)
chr1 (142-241)||(51452623-51452722)
chr1 (174-240)||(17609090-17609157)
chr1 (174-240)||(37233878-37233945)
chr1 (178-224)||(17148735-17148781)
chr1 (176-240)||(8537928-8537993)
chr1 (176-240)||(8603167-8603232)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (11-224)||(5254-5466)
[»] scaffold0215 (2 HSPs)
scaffold0215 (15-240)||(9371-9596)
scaffold0215 (15-240)||(16269-16494)
[»] scaffold0195 (2 HSPs)
scaffold0195 (11-240)||(19206-19435)
scaffold0195 (11-240)||(21290-21519)
[»] scaffold0023 (2 HSPs)
scaffold0023 (11-240)||(48598-48827)
scaffold0023 (11-240)||(36093-36323)
[»] scaffold0011 (1 HSPs)
scaffold0011 (11-240)||(123198-123427)
[»] chr6 (25 HSPs)
chr6 (15-240)||(14626152-14626377)
chr6 (22-240)||(23153458-23153676)
chr6 (15-240)||(1650127-1650352)
chr6 (11-234)||(25175563-25175787)
chr6 (11-240)||(27654005-27654235)
chr6 (11-240)||(35009473-35009702)
chr6 (22-240)||(1657782-1657999)
chr6 (11-240)||(16825774-16826006)
chr6 (22-240)||(15862484-15862700)
chr6 (79-226)||(29665941-29666089)
chr6 (11-150)||(27740838-27740977)
chr6 (189-240)||(27751603-27751654)
chr6 (174-240)||(18629626-18629693)
chr6 (176-237)||(29605614-29605675)
chr6 (176-240)||(17083216-17083280)
chr6 (174-240)||(16887810-16887877)
chr6 (174-240)||(17557036-17557102)
chr6 (174-240)||(18381701-18381768)
chr6 (174-240)||(22361783-22361850)
chr6 (178-224)||(1556173-1556219)
chr6 (178-224)||(16232060-16232106)
chr6 (178-224)||(18086865-18086911)
chr6 (178-224)||(23977937-23977983)
chr6 (174-235)||(25651399-25651461)
chr6 (174-239)||(35136032-35136097)
[»] chr4 (31 HSPs)
chr4 (11-240)||(13246430-13246659)
chr4 (11-240)||(54118278-54118507)
chr4 (11-240)||(15675123-15675352)
chr4 (11-240)||(10644219-10644449)
chr4 (11-240)||(31115629-31115858)
chr4 (11-240)||(47357654-47357884)
chr4 (111-240)||(121989-122118)
chr4 (79-240)||(10104284-10104445)
chr4 (19-238)||(13048257-13048477)
chr4 (11-241)||(26680201-26680430)
chr4 (142-241)||(10488693-10488792)
chr4 (142-241)||(16327959-16328058)
chr4 (79-234)||(40885594-40885749)
chr4 (11-100)||(111395-111484)
chr4 (201-240)||(33240890-33240929)
chr4 (90-222)||(17145701-17145834)
chr4 (90-224)||(8374587-8374722)
chr4 (174-240)||(15044990-15045057)
chr4 (174-240)||(15109367-15109434)
chr4 (174-240)||(18276596-18276663)
chr4 (174-240)||(47535083-47535150)
chr4 (178-224)||(7132107-7132153)
chr4 (175-240)||(7964730-7964796)
chr4 (178-224)||(18169138-18169184)
chr4 (178-224)||(19020654-19020700)
chr4 (178-224)||(22738437-22738483)
chr4 (138-239)||(7850127-7850228)
chr4 (176-240)||(15013301-15013365)
chr4 (176-240)||(18238175-18238240)
chr4 (176-236)||(38764873-38764934)
chr4 (176-240)||(40904952-40905017)
[»] chr2 (26 HSPs)
chr2 (11-240)||(20627347-20627576)
chr2 (16-240)||(462743-462967)
chr2 (11-240)||(8891242-8891471)
chr2 (11-240)||(36982475-36982704)
chr2 (11-240)||(19794738-19794967)
chr2 (11-240)||(43642991-43643220)
chr2 (11-240)||(24341423-24341652)
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chr2 (11-240)||(19886683-19886913)
chr2 (11-241)||(17396686-17396916)
chr2 (11-241)||(25265423-25265653)
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Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 196; Significance: 1e-107; HSPs: 45)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 11 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 15936890 - 15936663
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgcatacctagacaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcgattaaacaagaatcaaatctcaaat 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  15936890 catcatcaatccatgaatatgcatactcaggcaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat 15936791  T
Q  111 taacaacaacttatcaaaactcaccaattgagcacaattttcaaaacttatcatttttactcatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat 210  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15936790 taacaacaacttatcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacacatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat 15936691  T
Q  211 catcaattcatgcatacaaacatatcat 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15936690 catcaattcatgcatacaaacatatcat 15936663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 14 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 15938729 - 15938505
Alignment:
Q  14 catcaatccatgaatatgcatacctagacaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcgattaaacaagaatcaaatctcaaattaa 113  Q
    |||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15938729 catcaatccatgaatatgcatactcaggcaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaa 15938630  T
Q  114 caacaacttatcaaaactcaccaattgagcacaattttcaaaacttatcatttttactcatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcat 213  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15938629 caacaacttatcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacacatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcat 15938530  T
Q  214 caattcatgcatacaaacatatcat 238  Q
    |||||||||  ||||||||||||||    
T  15938529 caattcatgattacaaacatatcat 15938505  T

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Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 11 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 14842824 - 14842595
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgcatacctagacaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcgattaaacaagaatcaaatctcaaat 110  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  14842824 catcatcaatccatgaatatgcaaacccaatcaattattcatcaatcataacatcaattaacatccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat 14842725  T
Q  111 taacaacaacttatcaaaactcaccaattgagcacaattttcaaaacttatcatttttactcatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat 210  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  14842724 taacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcataacttatcatttttacacatttgaacatgcaatttcaccaacaatcatacaattat 14842625  T
Q  211 catcaattcatgcatacaaacatatcatca 240  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14842624 cttcaattcatgcatacaaacatatcatca 14842595  T

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Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 10 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 51158282 - 51158052
Alignment:
Q  10 acatcatcaatccatgaatatgcatacctagacaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcgattaaacaagaatcaaatctcaaa 109  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||| |  |||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||| | |||||     
T  51158282 acatcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaat 51158183  T
Q  110 ttaacaacaacttatcaaaactcaccaattgagcacaattttcaaaacttatcatttttactcatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 209  Q
     ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51158182 ctaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 51158083  T
Q  210 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatca 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51158082 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatca 51158052  T

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Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 11 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 15859287 - 15859058
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgcatacctagacaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcgattaaacaagaatcaaatctcaaat 110  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |  |||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||| | ||||| |    
T  15859287 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatt 15859188  T
Q  111 taacaacaacttatcaaaactcaccaattgagcacaattttcaaaacttatcatttttactcatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat 210  Q
     |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15859187 caacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat 15859088  T
Q  211 catcaattcatgcatacaaacatatcatca 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15859087 catcaattcatgcatacaaacatatcatca 15859058  T

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Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 11 - 236
Target Start/End: Original strand, 2049810 - 2050035
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgcatacctagacaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcgattaaacaagaatcaaatctcaaat 110  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |  |||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| ||| ||||| |||||||||||||||    
T  2049810 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccatagcatcaattgaacaaaaatcaaatctcaaat 2049909  T
Q  111 taacaacaacttatcaaaactcaccaattgagcacaattttcaaaacttatcatttttactcatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat 210  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  2049910 taacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaagttatcatgtttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaattat 2050009  T
Q  211 catcaattcatgcatacaaacatatc 236  Q
    |||||||||| |||||||||||||||    
T  2050010 catcaattcaggcatacaaacatatc 2050035  T

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Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 11 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 12030410 - 12030181
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgcatacctagacaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcgattaaacaagaatcaaatctcaaat 110  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |  |||| ||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||    
T  12030410 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccataacatcaattaacaaccatagcatcaattgaacaagaatcaaatatcaaat 12030311  T
Q  111 taacaacaacttatcaaaactcaccaattgagcacaattttcaaaacttatcatttttactcatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat 210  Q
    |||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12030310 taacaataacttagcaaaattcaccaattgagcacaactttcacaacttatcacttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaattat 12030211  T
Q  211 catcaattcatgcatacaaacatatcatca 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12030210 catcaattcatgcatacaaacatatcatca 12030181  T

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Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 22 - 240
Target Start/End: Original strand, 13838905 - 13839123
Alignment:
Q  22 catgaatatgcatacctagacaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcgattaaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaact 121  Q
    |||||||||||||||| | ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||| | |||||   ||| ||||||    
T  13838905 catgaatatgcatacccaaacaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatccaaccacaact 13839004  T
Q  122 tatcaaaactcaccaattgagcacaattttcaaaacttatcatttttactcatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcat 221  Q
    || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13839005 tagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccatcaatcatacaattatcatcaattcat 13839104  T
Q  222 gcatacaaacatatcatca 240  Q
    |||||||||||||||||||    
T  13839105 gcatacaaacatatcatca 13839123  T

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Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 15 - 230
Target Start/End: Original strand, 15614838 - 15615053
Alignment:
Q  15 atcaatccatgaatatgcatacctagacaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcgattaaacaagaatcaaatctcaaattaac 114  Q
    |||||| |||||||||||||||| |  |||| |||||||||  |||||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||||||||||| |||||||||    
T  15614838 atcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacaaccataacatcaattgagcaagaatcaaatcccaaattaac 15614937  T
Q  115 aacaacttatcaaaactcaccaattgagcacaattttcaaaacttatcatttttactcatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatc 214  Q
    || |||||| ||||| ||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15614938 aataacttagcaaaattcaccaattgagcaccatattcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcctacaattatcatc 15615037  T
Q  215 aattcatgcatacaaa 230  Q
    ||||||||||||||||    
T  15615038 aattcatgcatacaaa 15615053  T

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Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 11 - 240
Target Start/End: Original strand, 16821139 - 16821369
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgcatacctagacaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcgattaaacaagaatcaaatctcaaat 110  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||| || ||||| |||||| ||||||||| ||| |||| |||||| |||||||||    
T  16821139 catcattaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat 16821238  T
Q  111 taacaacaacttatca-aaactcaccaattgagcacaattttcaaaacttatcatttttactcatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 209  Q
     ||||||||||||  | ||| ||||||||| ||||||||  ||| | |||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16821239 caacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcatagcttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 16821338  T
Q  210 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatca 240  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  16821339 tcatcaatttatgcatacaaacataacatca 16821369  T

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Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 17912744 - 17912515
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgcatacctagacaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcgattaaacaagaatcaaatctcaaat 110  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |  || | |||||||||  |||||||||||||||| | |||||||||||| |||| |||||| | ||||| |    
T  17912744 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataacatcgattgaacatgaatcatagctcaatt 17912645  T
Q  111 taacaacaacttatcaaaactcaccaattgagcacaattttcaaaacttatcatttttactcatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat 210  Q
     ||| ||||| |||||||  ||| |||||  |||||||||||| ||||| ||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17912644 caactacaacatatcaaat-tcatcaattttgcacaattttcataacttttcatttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat 17912546  T
Q  211 catcaattcatgcatacaaacatatcatcaa 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17912545 catcaattcatgcatacaaacatatcatcaa 17912515  T

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Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 11 - 240
Target Start/End: Original strand, 55316219 - 55316449
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgcatacctagacaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcgattaaacaagaatcaaatctcaaat 110  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |  ||||||||||| ||||| |  ||||| |||||| |||||||||  || |||||| |||| ||||||| |    
T  55316219 catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaact 55316318  T
Q  111 taacaacaacttatca-aaactcaccaattgagcacaattttcaaaacttatcatttttactcatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 209  Q
    |||||||||||||  | ||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |  || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  55316319 taacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaacta 55316418  T
Q  210 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatca 240  Q
     |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  55316419 acatcaattcatgcatacaaacataacatca 55316449  T

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Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 11 - 240
Target Start/End: Original strand, 41270075 - 41270305
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgcatacctagacaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcgattaaacaagaatcaaatctcaaat 110  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |  ||||||||||| ||||| |  ||||| |||||| |||||||||  || |||||| |||| ||||||| |    
T  41270075 catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaact 41270174  T
Q  111 taacaacaacttatca-aaactcaccaattgagcacaattttcaaaacttatcatttttactcatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 209  Q
    |||||||||||||  | ||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |  || ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  41270175 taacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaattccaccaacaatcatacaacta 41270274  T
Q  210 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatca 240  Q
     |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  41270275 acatcaattcatgcatacaaacataacatca 41270305  T

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Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 13975985 - 13975755
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgcatacctagacaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcgattaaacaagaatcaaatctcaaat 110  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||| |  ||||||||||| ||||| |  ||||| |||||| |||||||||  || |||||| |||| |||||||||    
T  13975985 catcaacaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaat 13975886  T
Q  111 taacaacaacttatca-aaactcaccaattgagcacaattttcaaaacttatcatttttactcatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 209  Q
    |||  ||||||||  | ||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  13975885 taatgacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttacttatttaaacatgtaattccaccaacaatcatacaatca 13975786  T
Q  210 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcaa 241  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  13975785 tcaacaattcatgcatac-aacatatcatcaa 13975755  T

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Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Original strand, 45860805 - 45861035
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgcatacctagacaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcgattaaacaagaatcaaatctcaaat 110  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||| |  ||||||||||| ||||| |  ||||| |||||| |||||||||  || |||||| |||| |||||||||    
T  45860805 catcaacaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaat 45860904  T
Q  111 taacaacaacttatca-aaactcaccaattgagcacaattttcaaaacttatcatttttactcatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 209  Q
    |||  ||||||||  | ||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  45860905 taatgacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttacttatttaaacatgtaattccaccaacaatcatacaatca 45861004  T
Q  210 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcaa 241  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  45861005 tcaacaattcatgcatac-aacatatcatcaa 45861035  T

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Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 13955153 - 13954923
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgcatacctagacaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcgattaaacaagaatcaaatctcaaat 110  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||| |  ||||||||||| ||||| |  ||||| |||||| |||||||||  || |||||| |||| |||||||||    
T  13955153 catcaacaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaat 13955054  T
Q  111 taacaacaacttatca-aaactcaccaattgagcacaattttcaaaacttatcatttttactcatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 209  Q
    |||  ||||||||  | ||| ||| |||||||||||||| |||| |||| |||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  13955053 taatgacaacttaggagaaattcatcaattgagcacaatattcataactgatcatttttacttatttaaacatgtaattccaccaacaatcatacaatca 13954954  T
Q  210 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcaa 241  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  13954953 tcaacaattcatgcatac-aacatatcatcaa 13954923  T

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Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 16744377 - 16744148
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgcatacctagacaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcgattaaacaagaatcaaatctcaaat 110  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||| |  |||| |||||||||  |||||||  |||| |||| | |||||| |||  |||||||||| | ||||| |    
T  16744377 catcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactacaacatttattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 16744278  T
Q  111 taacaacaacttatcaaaactcaccaattgagcacaattttcaaaacttatcatttttactcatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat 210  Q
     ||| | ||| | |||||  ||| | |||  |||||||||||| ||||| ||||||||||  |||| || ||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  16744277 caactataacatgtcaaat-tcatccattttgcacaattttcataacttttcatttttacatatttaaaaatgtaatttaaccaacaatcatacacttat 16744179  T
Q  211 catcaattcatgcatacaaacatatcatcaa 241  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16744178 tatcaattcatggatacaaacatatcatcaa 16744148  T

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Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 142 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 2449370 - 2449271
Alignment:
Q  142 gcacaattttcaaaacttatcatttttactcatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcaa 241  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||| ||  |||  |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2449370 gcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaa 2449271  T

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Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 112 - 224
Target Start/End: Original strand, 54651558 - 54651671
Alignment:
Q  112 aacaacaacttatcaaaactcaccaattgagcacaattttcaaaacttatcatttttactca-tttg-aacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 209  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||| | ||||| || |||||| ||||| |||  | |||| |||||| ||||||||  |||||||||||||||    
T  54651558 aacaacaacatatcaaaattcaccaattgagtataattt-cataacttaacatttatacatactttgcaacatgcaatttcactcacaatcatacaatta 54651656  T
Q  210 tcatcaattcatgca 224  Q
    |||||||||||||||    
T  54651657 tcatcaattcatgca 54651671  T

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Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 11 - 123
Target Start/End: Original strand, 47984650 - 47984762
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgcatacctagacaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcgattaaacaagaatcaaatctcaaat 110  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |    || |||||||||  |||||||||||||||| | | |||||| ||| |||| |||||| |||||||      
T  47984650 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagtcatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaaaaacatcaattgaacatgaatcacatctcaatc 47984749  T
Q  111 taacaacaactta 123  Q
     ||||||||||||    
T  47984750 caacaacaactta 47984762  T

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Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 11 - 123
Target Start/End: Original strand, 48003224 - 48003336
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgcatacctagacaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcgattaaacaagaatcaaatctcaaat 110  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |    || |||||||||  |||||||||||||||| | | |||||| ||| |||| |||||| |||||||      
T  48003224 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagtcatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaaaaacatcaattgaacatgaatcacatctcaatc 48003323  T
Q  111 taacaacaactta 123  Q
     ||||||||||||    
T  48003324 caacaacaactta 48003336  T

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Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 174 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 47784851 - 47784784
Alignment:
Q  174 tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatca 240  Q
    |||||||||| ||||||||||||||  || ||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  47784851 tttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacatatcatca 47784784  T

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Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 175 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 3576522 - 3576456
Alignment:
Q  175 ttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatca 240  Q
    ||||||||| ||||||||||||||  || ||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  3576522 ttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacatatcatca 3576456  T

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Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 176 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 4145896 - 4145835
Alignment:
Q  176 tgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatca 237  Q
    |||||||||||||||| ||||||  || ||||||||| ||||||||| || |||||||||||    
T  4145896 tgaacatgtaatttcatcaacaacaattcaattatcaccaattcatgtattcaaacatatca 4145835  T

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Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 174 - 238
Target Start/End: Original strand, 34560061 - 34560126
Alignment:
Q  174 tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcat 238  Q
    |||||||||| ||||||||||||||  || ||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||    
T  34560061 tttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcat 34560126  T

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Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 123
Target Start/End: Original strand, 47993937 - 47994049
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgcatacctagacaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcgattaaacaagaatcaaatctcaaat 110  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |    || |||||||||  |||| ||||||||||| | | |||||| ||| |||| |||||| |||||||      
T  47993937 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagtcatgattcatcaacaacaaaatcaattaacaacaaaaacatcaattgaacatgaatcacatctcaatc 47994036  T
Q  111 taacaacaactta 123  Q
     ||||||||||||    
T  47994037 caacaacaactta 47994049  T

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Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 123
Target Start/End: Original strand, 48012510 - 48012622
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgcatacctagacaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcgattaaacaagaatcaaatctcaaat 110  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |    || |||||||||  |||| ||||||||||| | | |||||| ||| |||| |||||| |||||||      
T  48012510 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagtcatgattcatcaacaacaaaatcaattaacaacaaaaacatcaattgaacatgaatcacatctcaatc 48012609  T
Q  111 taacaacaactta 123  Q
     ||||||||||||    
T  48012610 caacaacaactta 48012622  T

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Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 174 - 240
Target Start/End: Original strand, 12953126 - 12953193
Alignment:
Q  174 tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatca 240  Q
    |||||||||| ||||||||||||||  ||  |||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  12953126 tttgaacatgcaatttcaccaacaacaatctaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatca 12953193  T

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Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 174 - 240
Target Start/End: Original strand, 14080671 - 14080738
Alignment:
Q  174 tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaatt-catgcatacaaacatatcatca 240  Q
    |||||||||| || ||||| ||| |  || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14080671 tttgaacatgcaaattcactaaccacaattcaattatcatcaatttcatgcatacaaacatatcatca 14080738  T

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Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 174 - 240
Target Start/End: Original strand, 17191703 - 17191770
Alignment:
Q  174 tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatca 240  Q
    |||||||||| ||||||||||||||  || | ||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  17191703 tttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcgattatcaacaatttcatgcattcaaacatatcatca 17191770  T

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Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 174 - 240
Target Start/End: Original strand, 17204843 - 17204910
Alignment:
Q  174 tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatca 240  Q
    |||||||||| ||||||||||||||  || | ||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  17204843 tttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcgattatcaacaatttcatgcattcaaacatatcatca 17204910  T

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Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 178 - 224
Target Start/End: Original strand, 5228481 - 5228527
Alignment:
Q  178 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgca 224  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  5228481 aacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgca 5228527  T

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Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 176 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 6228708 - 6228646
Alignment:
Q  176 tgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatca 237  Q
    |||||||||||||||||||||||  || ||||||||| ||| |||||| || |||||||||||    
T  6228708 tgaacatgtaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtattcaaacatatca 6228646  T

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Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 178 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 11986262 - 11986216
Alignment:
Q  178 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgca 224  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||| || |||||||    
T  11986262 aacatgtaatttcaaccacaatcatacaattatcattaaatcatgca 11986216  T

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Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 178 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 12264880 - 12264834
Alignment:
Q  178 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgca 224  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  12264880 aacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgca 12264834  T

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Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 178 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 12902178 - 12902132
Alignment:
Q  178 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgca 224  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  12902178 aacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgca 12902132  T

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Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 178 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 15468428 - 15468382
Alignment:
Q  178 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgca 224  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  15468428 aacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgca 15468382  T

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Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 178 - 224
Target Start/End: Original strand, 18911161 - 18911207
Alignment:
Q  178 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgca 224  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  18911161 aacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgca 18911207  T

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Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 178 - 224
Target Start/End: Original strand, 22275377 - 22275423
Alignment:
Q  178 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgca 224  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  22275377 aacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgca 22275423  T

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Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 178 - 224
Target Start/End: Original strand, 25058907 - 25058953
Alignment:
Q  178 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgca 224  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  25058907 aacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgca 25058953  T

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Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 178 - 224
Target Start/End: Original strand, 49232604 - 49232650
Alignment:
Q  178 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgca 224  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  49232604 aacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgca 49232650  T

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Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 176 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 13301552 - 13301487
Alignment:
Q  176 tgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatca 240  Q
    |||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| ||| |||||| || |||||||| |||||    
T  13301552 tgaacatgcaatttcaccaacaataattcaattatcaccaatttcatgtattcaaacataccatca 13301487  T

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Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 176 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 13312208 - 13312143
Alignment:
Q  176 tgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatca 240  Q
    |||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| ||| |||||| || |||||||| |||||    
T  13312208 tgaacatgcaatttcaccaacaataattcaattatcaccaatttcatgtattcaaacataccatca 13312143  T

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Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 176 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 31412416 - 31412351
Alignment:
Q  176 tgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatca 240  Q
    |||||||| ||||||||||||||  || ||||||||| ||| |||||| || ||||||||||||||    
T  31412416 tgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtattcaaacatatcatca 31412351  T

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Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 176 - 240
Target Start/End: Original strand, 41661729 - 41661794
Alignment:
Q  176 tgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaatt-catgcatacaaacatatcatca 240  Q
    |||||||| ||||||||||||||  || |||||||||||| || |||| || ||||||||||||||    
T  41661729 tgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcatcatttccatgtattcaaacatatcatca 41661794  T

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Target: scaffold0049 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 11 - 238
Target Start/End: Original strand, 48187 - 48414
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgcatacctagacaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcgattaaacaagaatcaaatctcaaat 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  48187 catcatcaatccatgaatatgcatacccaggcaattattcatcaatcacaacatcaattaacatctataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat 48286  T
Q  111 taacaacaacttatcaaaactcaccaattgagcacaattttcaaaacttatcatttttactcatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat 210  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48287 taacaacaacttaacaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacacatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat 48386  T
Q  211 catcaattcatgcatacaaacatatcat 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  48387 catcaattcatgcatacaaacatatcat 48414  T

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Target: chr7 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 35)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 11 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 18254098 - 18253871
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgcatacctagacaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcgattaaacaagaatcaaatctcaaat 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  18254098 catcatcaatccatgaatatgcatactcaggcaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat 18253999  T
Q  111 taacaacaacttatcaaaactcaccaattgagcacaattttcaaaacttatcatttttactcatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat 210  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18253998 taacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacacatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat 18253899  T
Q  211 catcaattcatgcatacaaacatatcat 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18253898 catcaattcatgcatacaaacatatcat 18253871  T

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Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 13 - 240
Target Start/End: Original strand, 16211768 - 16211995
Alignment:
Q  13 tcatcaatccatgaatatgcatacctagacaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcgattaaacaagaatcaaatctcaaatta 112  Q
    |||| ||| |||||||||||||||| |  |||| | ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  16211768 tcattaattcatgaatatgcatacccaagcaatgaatcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatttaacaagaatcaaatctcaaatta 16211867  T
Q  113 acaacaacttatcaaaactcaccaattgagcacaattttcaaaacttatcatttttactcatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatca 212  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||    
T  16211868 acaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgcaatttcacaaacaatcttacaattatca 16211967  T
Q  213 tcaattcatgcatacaaacatatcatca 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16211968 tcaattcatgcatacaaacatatcatca 16211995  T

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Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 11 - 240
Target Start/End: Original strand, 36052667 - 36052893
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgcatacctagacaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcgattaaacaagaatcaaatctcaaat 110  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  36052667 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaaccacaacatcaattaacaaccacaacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat 36052766  T
Q  111 taacaacaacttatcaaaactcaccaattgagcacaattttcaaaacttatcatttttactcatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat 210  Q
    |||||||   ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  36052767 taacaac---ttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaattttaccaacaatcatataattat 36052863  T
Q  211 catcaattcatgcatacaaacatatcatca 240  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  36052864 catcaattcatgcatacaaacgtatcatca 36052893  T

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Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 11 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 16479213 - 16478985
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgcatacctagacaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcgattaaacaagaatcaaatctcaaat 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |  || | |||||||||  |||||||||| ||||| | |||||||| ||| | |||||||||||||||||||    
T  16479213 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaataacatcaattgagcaagaatcaaatctcaaat 16479114  T
Q  111 taacaacaacttatcaaaactcaccaattgagcacaattttcaaaacttatcatttttactcatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat 210  Q
    ||| || |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16479113 taaaaataacttaacaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat 16479014  T
Q  211 catcaattcatgcatacaaacatatcatc 239  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16479013 catcaattcatgcatacaaacataacatc 16478985  T

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Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 16 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 11580997 - 11580773
Alignment:
Q  16 tcaatccatgaatatgcatacctagacaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcgattaaacaagaatcaaatctcaaattaaca 115  Q
    ||||| |||||||||| ||||| |  |||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||| | |||||  |||||    
T  11580997 tcaattcatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatctaaca 11580898  T
Q  116 acaacttatcaaaactcaccaattgagcacaattttcaaaacttatcatttttactcatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatca 215  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11580897 acaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatca 11580798  T
Q  216 attcatgcatacaaacatatcatca 240  Q
    |||||||||||||||||||| ||||    
T  11580797 attcatgcatacaaacatattatca 11580773  T

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Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 11 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 13037277 - 13037048
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgcatacctagacaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcgattaaacaagaatcaaatctcaaat 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||| |  |||| ||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||  ||| ||||||||||| | |||||      
T  13037277 catcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaatattcataacattaattgaacaagaatcataactcaatc 13037178  T
Q  111 taacaacaacttatcaaaactcaccaattgagcacaattttcaaaacttatcatttttactcatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat 210  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |  ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  13037177 taacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgcaatttcatcaacaatcatacaattat 13037078  T
Q  211 catcaattcatgcatacaaacatatcatca 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13037077 catcaattcatgcatacaaacatatcatca 13037048  T

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Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 11 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 47481294 - 47481065
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgcatacctagacaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcgattaaacaagaatcaaatctcaaat 110  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |  |||| |||||||||  | |||||||||||| | | |||||||| ||| ||||||||||| | ||||| |    
T  47481294 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaacaaaaacatcaattaagagcgataacatcaattgaacaagaatcataactcaatt 47481195  T
Q  111 taacaacaacttatcaaaactcaccaattgagcacaattttcaaaacttatcatttttactcatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat 210  Q
     |||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  47481194 caacaacaacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcactaacaatcatacaattat 47481095  T
Q  211 catcaattcatgcatacaaacatatcatca 240  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  47481094 catcaattcatgcatacaaacataacatca 47481065  T

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Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 11 - 240
Target Start/End: Original strand, 2437457 - 2437687
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgcatacctagacaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcgattaaacaagaatcaaatctcaaat 110  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||  |  ||||||||||||||||| || ||||| |||||| |||||||||  || |||||||||||||||||| ||    
T  2437457 catcatcaatccatgaatatgcaaactcaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcaaatctcatat 2437556  T
Q  111 taacaacaacttatcaaaact-caccaattgagcacaattttcaaaacttatcatttttactcatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 209  Q
    |||||||||||||  |||| | |||||||||| |||||| |||| |||||||||||||| |  || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  2437557 taacaacaacttaggaaaaattcaccaattgaacacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaacta 2437656  T
Q  210 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatca 240  Q
     |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2437657 acatcaattcatgcatacaaacataacatca 2437687  T

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Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 11 - 240
Target Start/End: Original strand, 13572676 - 13572906
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgcatacctagacaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcgattaaacaagaatcaaatctcaaat 110  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||| |  ||||||||||| ||||| || ||||| |||||| |||||||||  || |||||| |||| |||||||||    
T  13572676 catcaacaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaat 13572775  T
Q  111 taacaacaacttatca-aaactcaccaattgagcacaattttcaaaacttatcatttttactcatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 209  Q
    |||||||||||||  | ||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  13572776 taacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcacacaatca 13572875  T
Q  210 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatca 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13572876 tcatcaattcatgcatacaaacataacatca 13572906  T

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Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 11 - 240
Target Start/End: Original strand, 10989410 - 10989639
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgcatacctagacaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcgattaaacaagaatcaaatctcaaat 110  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||| || ||||| |||||| |||||||||  || ||||||||||| | |||||||    
T  10989410 catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 10989509  T
Q  111 taacaacaacttatca-aaactcaccaattgagcacaattttcaaaacttatcatttttactcatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 209  Q
    || ||||||||||  | ||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |  || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  10989510 ta-caacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaacta 10989608  T
Q  210 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatca 240  Q
     |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10989609 acatcaattcatgcatacaaacataacatca 10989639  T

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Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 11 - 240
Target Start/End: Original strand, 3059966 - 3060195
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgcatacctagacaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcgattaaacaagaatcaaatctcaaat 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||| |  |||| ||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||| ||| ||||||||||| | |||||      
T  3059966 catcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagtcataacatcaattgaacaagaatcataactcaatc 3060065  T
Q  111 taacaacaacttatcaaaactcaccaattgagcacaattttcaaaacttatcatttttactcatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat 210  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||| || |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||    
T  3060066 taacaacaacttaacaaaattcaccatttgagcataattttcacaatttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacagtattacaattat 3060165  T
Q  211 catcaattcatgcatacaaacatatcatca 240  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| ||||    
T  3060166 catcaattaatgcatacaaatatattatca 3060195  T

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Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 11 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 13911277 - 13911046
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgcatacctagacaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcgattaaacaagaatcaaatctcaaat 110  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |   |||||||||||||||| || ||||| |||||| ||||||||| ||| |||| |||||| |||||||||    
T  13911277 catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagaaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat 13911178  T
Q  111 taacaacaactt-atca-aaactcaccaattgagcacaattttcaaaacttatcatttttactcatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatt 208  Q
     ||||||||||| |  | ||| |||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13911177 caacaacaactttaggagaaattcaccaattgagcataatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatt 13911078  T
Q  209 atcatcaattcatgcatacaaacatatcatca 240  Q
    | |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13911077 aacatcaattcatgcatacaaacataacatca 13911046  T

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Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 17 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 25292595 - 25292371
Alignment:
Q  17 caatccatgaatatgcatacctagacaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcgattaaacaagaatcaaatctcaaattaacaa 116  Q
    ||||||||||||||||| ||| |  ||||||||||| | ||| || ||||| |||||| |||||||||  || |||||| |||| ||||||||||||| |    
T  25292595 caatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattagtcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaattaacga 25292496  T
Q  117 caacttatcaaaactcaccaattgagcacaattttcaaaacttatcatttttactcatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa 216  Q
    |||| ||  | || |||||||||||||||||| |||| | |||||| |||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  25292495 caacctaggagaattcaccaattgagcacaatattcatagcttatcctttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatcatcaacaa 25292396  T
Q  217 ttcatgcatacaaacatatcatcaa 241  Q
    ||||| |||||||||||||||||||    
T  25292395 ttcatacatacaaacatatcatcaa 25292371  T

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Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 47 - 240
Target Start/End: Original strand, 13321050 - 13321245
Alignment:
Q  47 attcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcgattaaacaagaatcaaatctcaaattaacaa-caacttatcaaaactcaccaattgagcac 145  Q
    |||||||||  |||||||||||||||| | |||||||| ||| |||| |||||| ||||||| | ||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  13321050 attcatcaacaacaacatcaattaacaacaataacatcaattgaacatgaatcatatctcaattcaacaatcaacttagcaaaattcaccaattgagcac 13321149  T
Q  146 aattttcaaaacttatcatttttactca-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatca 240  Q
    ||||| || |||||  ||||| |||  | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13321150 aattt-cataacttgacatttatacatactttgaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatca 13321245  T

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Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Original strand, 7293017 - 7293246
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgcatacctagacaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcgattaaacaagaatcaaatctcaaat 110  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |  |||| |||||||||  |||||||| |||| |||| | |||||| |||  |||||||||| | ||||| |    
T  7293017 catcatcaatccatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 7293116  T
Q  111 taacaacaacttatcaaaactcaccaattgagcacaattttcaaaacttatcatttttactcatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat 210  Q
     ||||||||| | |||||  ||| | |||  |||||||||||| ||||| ||||||| ||  |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  7293117 caacaacaacatgtcaaat-tcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattat 7293215  T
Q  211 catcaattcatgcatacaaacatatcatcaa 241  Q
     || |||||||||||||||||||||||||||    
T  7293216 tattaattcatgcatacaaacatatcatcaa 7293246  T

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Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 142 - 241
Target Start/End: Original strand, 11516358 - 11516457
Alignment:
Q  142 gcacaattttcaaaacttatcatttttactcatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcaa 241  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||| ||  |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11516358 gcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaa 11516457  T

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Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 142 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 15441696 - 15441597
Alignment:
Q  142 gcacaattttcaaaacttatcatttttactcatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcaa 241  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||| ||  |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15441696 gcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaa 15441597  T

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Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 142 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 30262261 - 30262162
Alignment:
Q  142 gcacaattttcaaaacttatcatttttactcatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcaa 241  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||| ||  |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30262261 gcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaa 30262162  T

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Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 14 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 296224 - 296006
Alignment:
Q  14 catcaatccatgaatatgcatacctagacaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcgattaaacaagaatcaaatctcaaattaa 113  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |  || | |||||||||   ||||||||||||| | | | |||||| ||| |||| |||||| | | ||| | ||    
T  296224 catcaatccatgaataagcatacccaatcagtaattcatcaa---caacatcaattaatagcaacaacatcaattgaacatgaatcacaacacaattcaa 296128  T
Q  114 -caacaacttatcaaaactcaccaattgagcacaattttcaaaacttatcatttttactcatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatca 212  Q
     || ||| ||| ||||| |||||| |||   | |||||| | ||||| ||||||||||  | || |||||| |||||||||||||||||||  |||||||    
T  296127 acatcaatttagcaaaattcaccatttggatataatttttataacttctcatttttacataattcaacatgaaatttcaccaacaatcataacattatca 296028  T
Q  213 tcaattcatgcatacaaacata 234  Q
    || ||||||||| |||||||||    
T  296027 tcgattcatgcacacaaacata 296006  T

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Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 174 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 16915013 - 16914946
Alignment:
Q  174 tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatca 240  Q
    |||||||||| ||||||||||||||  || ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  16915013 tttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcatcaatttcatgcattcaaacatatcatca 16914946  T

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Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 174 - 240
Target Start/End: Original strand, 9611470 - 9611537
Alignment:
Q  174 tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatca 240  Q
    |||||||||| ||||||||||||||  || ||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  9611470 tttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatca 9611537  T

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Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 174 - 240
Target Start/End: Original strand, 9839041 - 9839108
Alignment:
Q  174 tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatca 240  Q
    |||||||||| ||||||||||||||  || ||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  9839041 tttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatca 9839108  T

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Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 174 - 240
Target Start/End: Original strand, 48356806 - 48356873
Alignment:
Q  174 tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatca 240  Q
    |||||||||| ||||||||||||||  || ||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  48356806 tttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatca 48356873  T

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Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 174 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 48622758 - 48622708
Alignment:
Q  174 tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgca 224  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  48622758 tttgaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgca 48622708  T

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Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 176 - 240
Target Start/End: Original strand, 28722274 - 28722339
Alignment:
Q  176 tgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatca 240  Q
    |||||||| ||||||||||||||  || ||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  28722274 tgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatca 28722339  T

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Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 174 - 240
Target Start/End: Original strand, 13377691 - 13377758
Alignment:
Q  174 tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatca 240  Q
    |||||||||| ||||||||||||||  || ||||||||| ||| ||||||||| |||||||| |||||    
T  13377691 tttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatca 13377758  T

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Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 178 - 224
Target Start/End: Original strand, 13758538 - 13758584
Alignment:
Q  178 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgca 224  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  13758538 aacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgca 13758584  T

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Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 176 - 237
Target Start/End: Original strand, 14935524 - 14935586
Alignment:
Q  176 tgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatca 237  Q
    |||||||| ||||||||||||||  || ||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||    
T  14935524 tgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatca 14935586  T

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Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 176 - 237
Target Start/End: Original strand, 15358961 - 15359023
Alignment:
Q  176 tgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatca 237  Q
    |||||||| ||||||||||||||  || ||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||    
T  15358961 tgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatca 15359023  T

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Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 176 - 237
Target Start/End: Original strand, 15363117 - 15363179
Alignment:
Q  176 tgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatca 237  Q
    |||||||| ||||||||||||||  || ||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||    
T  15363117 tgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatca 15363179  T

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Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 178 - 224
Target Start/End: Original strand, 15927736 - 15927782
Alignment:
Q  178 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgca 224  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  15927736 aacatgtaatttcacccacaagcataccataatcatcaattcatgca 15927782  T

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Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 178 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 15950879 - 15950833
Alignment:
Q  178 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgca 224  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  15950879 aacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgca 15950833  T

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Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 178 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 18980109 - 18980063
Alignment:
Q  178 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgca 224  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  18980109 aacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgca 18980063  T

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Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 174 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 49047759 - 49047694
Alignment:
Q  174 tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcat 238  Q
    |||||||||| ||||||||||||||  || ||||||||| ||| ||||||||| ||||||| ||||    
T  49047759 tttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacatgtcat 49047694  T

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Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 174 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 14271984 - 14271920
Alignment:
Q  174 tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatca 237  Q
    |||||||||| ||||||||||||||  ||  |||||||| ||| ||||||||| |||||||||||    
T  14271984 tttgaacatgcaatttcaccaacaacaattgaattatcaacaatttcatgcattcaaacatatca 14271920  T

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Target: scaffold0026 (Bit Score: 184; Significance: 1e-99; HSPs: 2)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 11 - 238
Target Start/End: Original strand, 107747 - 107974
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgcatacctagacaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcgattaaacaagaatcaaatctcaaat 110  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  107747 catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat 107846  T
Q  111 taacaacaacttatcaaaactcaccaattgagcacaattttcaaaacttatcatttttactcatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat 210  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  107847 taacaacaacttatcaaaattcaccaattgagcacaatttttacaacttatcatttttgcacatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat 107946  T
Q  211 catcaattcatgcatacaaacatatcat 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  107947 catcaattcatgcatacaaacatatcat 107974  T

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Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 11 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 64780 - 64573
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgcatacctagacaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcgattaaacaagaatcaaatctcaaat 110  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||| |  ||||||||||| ||||| || ||||| |||||| |||||||||  || |||||| |||| |||||||||    
T  64780 catcaacaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaat 64681  T
Q  111 taacaacaacttatca-aaactcaccaattgagcacaattttcaaaacttatcatttttactcatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 209  Q
    |||||||||||||  | ||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  64680 taacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatca 64581  T
Q  210 tcatcaat 217  Q
    ||||||||    
T  64580 tcatcaat 64573  T

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Target: chr5 (Bit Score: 178; Significance: 4e-96; HSPs: 34)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 11 - 240
Target Start/End: Original strand, 23506965 - 23507194
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgcatacctagacaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcgattaaacaagaatcaaatctcaaat 110  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  23506965 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat 23507064  T
Q  111 taacaacaacttatcaaaactcaccaattgagcacaattttcaaaacttatcatttttactcatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat 210  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23507065 taacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat 23507164  T
Q  211 catcaattcatgcatacaaacatatcatca 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23507165 catcaattcatgcatacaaacatatcatca 23507194  T

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Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 11 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 27182810 - 27182581
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgcatacctagacaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcgattaaacaagaatcaaatctcaaat 110  Q
    |||||||||| |||||||||||||||  |  |||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||| | |||||      
T  27182810 catcatcaattcatgaatatgcatactcaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatc 27182711  T
Q  111 taacaacaacttatcaaaactcaccaattgagcacaattttcaaaacttatcatttttactcatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat 210  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27182710 taacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcatcaacaatcatacaattat 27182611  T
Q  211 catcaattcatgcatacaaacatatcatca 240  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27182610 catcagttcatgcatacaaacatatcatca 27182581  T

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Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 60 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 29188486 - 29188306
Alignment:
Q  60 aacatcaattaacatccataacatcgattaaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaacttatcaaaactcaccaattgagcacaattttcaaaactt 159  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  29188486 aacatcaattaacaaccataacatcaattgagcaagaatcaaatctcaaattaacaataacttagcaaaattcaccaattgagcaccattttcacaactt 29188387  T
Q  160 atcatttttactcatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatca 240  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  29188386 atcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatca 29188306  T

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Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 11 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 18531330 - 18531101
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgcatacctagacaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcgattaaacaagaatcaaatctcaaat 110  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||    |||| |||||||||  |||||||||||||||| | |||||||| ||| |||| |||||| ||||||| |    
T  18531330 catcatcaattcatgaatatgtatacccgagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacagcaataacatcaattgaacatgaatcatatctcaatt 18531231  T
Q  111 taacaacaacttatcaaaactcaccaattgagcacaattttcaaaacttatcatttttactcatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat 210  Q
     |||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||  |||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18531230 caacaacaacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat 18531131  T
Q  211 catcaattcatgcatacaaacatatcatca 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18531130 catcaattcatgcatacaaacatatcatca 18531101  T

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Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 11 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 22054096 - 22053867
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgcatacctagacaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcgattaaacaagaatcaaatctcaaat 110  Q
    |||||||||| |||||||||| | ||| |  |||| |||||||||  |||||||||||||||| | |||||||| ||| |||| |||||| ||||||| |    
T  22054096 catcatcaattcatgaatatgtagacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacagcaataacatcaattgaacatgaatcatatctcaatt 22053997  T
Q  111 taacaacaacttatcaaaactcaccaattgagcacaattttcaaaacttatcatttttactcatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat 210  Q
     |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  22053996 caacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaactat 22053897  T
Q  211 catcaattcatgcatacaaacatatcatca 240  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22053896 catcaattcatacatacaaacatatcatca 22053867  T

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Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 11 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 43443647 - 43443417
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgcatacctagacaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcgattaaacaagaatcaaatctcaaat 110  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||| || ||||| |||||| |||||||||  || ||||||| ||| |||||||||    
T  43443647 catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagactcacatctcaaat 43443548  T
Q  111 taacaacaacttatca-aaactcaccaattgagcacaattttcaaaacttatcatttttactcatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 209  Q
     ||||||||||||  | ||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |  || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  43443547 caacaacaacttagaagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaacta 43443448  T
Q  210 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatca 240  Q
     |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  43443447 acatcaattcatgcatacaaacataacatca 43443417  T

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Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 11 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 18778244 - 18778014
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgcatacctagacaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcgattaaacaagaatcaaatctcaaat 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||| || ||||| ||| || |||||||||  || ||||||||||| | |||||||    
T  18778244 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataatattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 18778145  T
Q  111 taacaacaacttatca-aaactcaccaattgagcacaattttcaaaacttatcatttttactcatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 209  Q
    |||||||||||||  | ||| ||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  18778144 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 18778045  T
Q  210 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatca 240  Q
     |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18778044 acatcaattcatgcatacaaacataacatca 18778014  T

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Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 11 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 22366733 - 22366503
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgcatacctagacaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcgattaaacaagaatcaaatctcaaat 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||| || ||||| |||||| |||||||||  || |||||| |||| | |||||||    
T  22366733 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacaactcaaat 22366634  T
Q  111 taacaacaacttatca-aaactcaccaattgagcacaattttcaaaacttatcatttttactcatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 209  Q
    |||||||||||||  | ||| ||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  22366633 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 22366534  T
Q  210 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatca 240  Q
     |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22366533 acatcaattcatgcatacaaacataacatca 22366503  T

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Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 11 - 240
Target Start/End: Original strand, 25426628 - 25426858
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgcatacctagacaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcgattaaacaagaatcaaatctcaaat 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||| || ||||| |||||| |||||||||  || ||||||||||| | |||||||    
T  25426628 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 25426727  T
Q  111 taacaacaacttatca-aaactcaccaattgagcacaattttcaaaacttatcatttttactcatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 209  Q
    |||||||||||||  | ||| |||||| || |||||||| |||| |||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  25426728 taacaacaacttaggagaaattcaccactttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 25426827  T
Q  210 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatca 240  Q
     |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  25426828 acatcaattcatgcatacaaacataacatca 25426858  T

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Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 11 - 240
Target Start/End: Original strand, 27009841 - 27010071
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgcatacctagacaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcgattaaacaagaatcaaatctcaaat 110  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||| |  ||||||||||| ||||| || ||||| |||||| |||||||||  || |||||| |||| |||||||||    
T  27009841 catcaacaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaat 27009940  T
Q  111 taacaacaacttatca-aaactcaccaattgagcacaattttcaaaacttatcatttttactcatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 209  Q
    |||||||||||||  | ||| |||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  27009941 taacaacaacttaggagaaattcaccaattgagtacaatattcataacttatcatttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacactcatacaatca 27010040  T
Q  210 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatca 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27010041 tcatcaattcatgcatacaaacataacatca 27010071  T

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Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 11 - 240
Target Start/End: Original strand, 12374 - 12604
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgcatacctagacaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcgattaaacaagaatcaaatctcaaat 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||| || ||||| |||||| |||||||||  || ||||||||||| | |||||||    
T  12374 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 12473  T
Q  111 taacaacaacttatca-aaactcaccaattgagcacaattttcaaaacttatcatttttactcatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 209  Q
    |||||||||||||  | ||| |||||| || |||||||| |||| ||||||||| |||| |  || |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  12474 taacaacaacttaggagaaattcaccactttagcacaatcttcataacttatcacttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 12573  T
Q  210 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatca 240  Q
     |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  12574 acatcaattcatgcatacaaacataacatca 12604  T

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Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 11 - 240
Target Start/End: Original strand, 19499899 - 19500129
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgcatacctagacaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcgattaaacaagaatcaaatctcaaat 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||||| || ||||| |||||| |||||||||  || ||||||||||| | |||||||    
T  19499899 catcatcaatccatgaatatgcataccaaagcaattattaatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 19499998  T
Q  111 taacaacaacttatca-aaactcaccaattgagcacaattttcaaaacttatcatttttactcatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 209  Q
    |||||||||||||  | ||| |||||| || |||||||| |||| |||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  19499999 taacaacaacttaggagaaattcaccactttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 19500098  T
Q  210 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatca 240  Q
     |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19500099 acatcaattcatgcatacaaacataacatca 19500129  T

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Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 11 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 21073847 - 21073617
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgcatacctagacaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcgattaaacaagaatcaaatctcaaat 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||| || ||||| ||||||  ||||||||  || ||||||||||| | |||||||    
T  21073847 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattgataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 21073748  T
Q  111 taacaacaacttatca-aaactcaccaattgagcacaattttcaaaacttatcatttttactcatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 209  Q
    |||||||||||||  | ||| |||||| || |||||||| |||| |||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  21073747 taacaacaacttagaagaaattcaccactttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 21073648  T
Q  210 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatca 240  Q
     |||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  21073647 acatccattcatgcatacaaacataacatca 21073617  T

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Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 11 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 4200237 - 4200007
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgcatacctagacaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcgattaaacaagaatcaaatctcaaat 110  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||| |  |||| |||||||||||| || ||||| |||||| ||||||||| ||| |||| |||||| |||||||||    
T  4200237 catcatcaacccatgaatatgcaaacccaagcaatcattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat 4200138  T
Q  111 taacaacaacttatca-aaactcaccaattgagcacaattttcaaaacttatcatttttactcatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 209  Q
     ||||||||| ||  | ||| ||||||||| |||| ||| |||| |||||||||||||| |  || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  4200137 caacaacaacataagagaaattcaccaatttagcataatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaacta 4200038  T
Q  210 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatca 240  Q
     |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  4200037 acatcaattcatgcatacaaacataacatca 4200007  T

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Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 22 - 240
Target Start/End: Original strand, 34939289 - 34939506
Alignment:
Q  22 catgaatatgcatacctagacaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcgattaaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaact 121  Q
    |||||||||||||||| |  || | |||||||||  |||||||||||||||| | |||||||| | | ||||||||||| | ||||| || ||||  |||    
T  34939289 catgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaattaacagcaataacatcaactgaacaagaatcataactcaa-ttcacaatgact 34939387  T
Q  122 tatcaaaactcaccaattgagcacaattttcaaaacttatcatttttactcatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcat 221  Q
    || |||||  || ||||||||||||||||||| |||||  |||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34939388 tagcaaaatccatcaattgagcacaattttcataacttcacatttttacataattgaacatgtgatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcat 34939487  T
Q  222 gcatacaaacatatcatca 240  Q
    ||||||||||||| |||||    
T  34939488 gcatacaaacataacatca 34939506  T

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Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 142 - 241
Target Start/End: Original strand, 20623100 - 20623199
Alignment:
Q  142 gcacaattttcaaaacttatcatttttactcatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcaa 241  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||| ||  |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20623100 gcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaa 20623199  T

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Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 142 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 21233660 - 21233561
Alignment:
Q  142 gcacaattttcaaaacttatcatttttactcatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcaa 241  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||| ||  |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21233660 gcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaa 21233561  T

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Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 142 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 25900538 - 25900439
Alignment:
Q  142 gcacaattttcaaaacttatcatttttactcatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcaa 241  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||| ||  |||  ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25900538 gcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatataatttaaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcaa 25900439  T

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Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 142 - 241
Target Start/End: Original strand, 16536328 - 16536427
Alignment:
Q  142 gcacaattttcaaaacttatcatttttactcatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcaa 241  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||| ||  |||  |||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  16536328 gcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattataaattcatgcatacaaacatatcatcaa 16536427  T

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Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 142 - 241
Target Start/End: Original strand, 37052875 - 37052974
Alignment:
Q  142 gcacaattttcaaaacttatcatttttactcatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcaa 241  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||  ||  |||  |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37052875 gcacaattttcataacttttcatttccacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaa 37052974  T

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Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 174 - 240
Target Start/End: Original strand, 19862371 - 19862438
Alignment:
Q  174 tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatca 240  Q
    |||||||||| ||||||||||||||  || ||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  19862371 tttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacatatcatca 19862438  T

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Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 174 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 21310794 - 21310727
Alignment:
Q  174 tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatca 240  Q
    |||||||||| ||||||||||||||  || ||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  21310794 tttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatca 21310727  T

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Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 174 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 23981601 - 23981534
Alignment:
Q  174 tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaatt-catgcatacaaacatatcatca 240  Q
    |||||||||| || |||||||||||  || ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23981601 tttgaacatgcaaattcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcatacaaacatatcatca 23981534  T

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Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 176 - 240
Target Start/End: Original strand, 22885806 - 22885871
Alignment:
Q  176 tgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatca 240  Q
    |||||||| ||||||||||||||  || ||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  22885806 tgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatca 22885871  T

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Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 176 - 240
Target Start/End: Original strand, 29918129 - 29918194
Alignment:
Q  176 tgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatca 240  Q
    |||||||| ||||||||||||||  || ||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||    
T  29918129 tgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcatcaatttcatgtattcaaacatatcatca 29918194  T

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Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 90 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 11212242 - 11212107
Alignment:
Q  90 aacaagaatcaaatctcaaattaacaacaacttatcaaaactcaccaattgagcacaattttcaaaacttatcatttttactca-tttgaa-catgtaat 187  Q
    |||| |||||| ||||||  | ||||||||| ||| |||| |||| | ||||| | ||||| || |||||| ||||| ||| || |||||| ||||||||    
T  11212242 aacatgaatcacatctcatttcaacaacaacatattaaaattcactacttgagtataattt-cataacttaacatttatacacactttgaaacatgtaat 11212144  T
Q  188 ttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgca 224  Q
    |||||| |||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  11212143 ttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgca 11212107  T

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Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 174 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 5450928 - 5450861
Alignment:
Q  174 tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatca 240  Q
    |||||||||| ||||||||||||||  || ||||||||| ||| ||||||||| |||||||| |||||    
T  5450928 tttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatca 5450861  T

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Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 174 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 21222693 - 21222626
Alignment:
Q  174 tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatca 240  Q
    |||||||||| ||||||||||||||  ||  |||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  21222693 tttgaacatgcaatttcaccaacaacaatttaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatca 21222626  T

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Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 174 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 21297260 - 21297193
Alignment:
Q  174 tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatca 240  Q
    |||||||||| ||||||||||||||  || ||||||||| ||| ||||||| | ||||||||||||||    
T  21297260 tttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcgttcaaacatatcatca 21297193  T

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Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 178 - 221
Target Start/End: Original strand, 32950862 - 32950905
Alignment:
Q  178 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcat 221  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||    
T  32950862 aacatgtaatttcaaccacaatcatacaattatcatcaaatcat 32950905  T

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Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 178 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 10778058 - 10778012
Alignment:
Q  178 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgca 224  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  10778058 aacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgca 10778012  T

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Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 178 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 17471676 - 17471630
Alignment:
Q  178 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgca 224  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  17471676 aacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgca 17471630  T

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Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 178 - 224
Target Start/End: Original strand, 23514729 - 23514775
Alignment:
Q  178 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgca 224  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  23514729 aacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgca 23514775  T

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Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 177 - 240
Target Start/End: Original strand, 21617181 - 21617245
Alignment:
Q  177 gaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaatt-catgcatacaaacatatcatca 240  Q
    ||||||| |||||||| |||||  || ||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  21617181 gaacatgcaatttcactaacaacaatccaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatca 21617245  T

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Target: scaffold0266 (Bit Score: 176; Significance: 6e-95; HSPs: 2)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 13 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 3843 - 3616
Alignment:
Q  13 tcatcaatccatgaatatgcatacctagacaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcgattaaacaagaatcaaatctcaaatta 112  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  3843 tcatcaatccatcaatatgcatacccaagcaattattcctcaatcacaacatcaattaacatccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaatta 3744  T
Q  113 acaacaacttatcaaaactcaccaattgagcacaattttcaaaacttatcatttttactcatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatca 212  Q
    ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3743 acaacaacttagcaaaatttaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatca 3644  T
Q  213 tcaattcatgcatacaaacatatcatca 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3643 tcaattcatgcatacaaacatatcatca 3616  T

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Target: scaffold0266; HSP #2
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Original strand, 1124 - 1354
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgcatacctagacaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcgattaaacaagaatcaaatctcaaat 110  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||| |  |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  1124 catcatcaattcatgaatatgcacacccaagcaattattcatcaaccacaatatcaattaacaaccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat 1223  T
Q  111 taacaacaacttatcaaaactcaccaattgagcacaattttcaaaacttatcatttttactcatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat 210  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1224 taacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat 1323  T
Q  211 catcaattcatgcatacaaacatatcatcaa 241  Q
     |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1324 tatcaattcatgcatactaacatatcatcaa 1354  T

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Target: scaffold0498 (Bit Score: 166; Significance: 6e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0498
Description:

Target: scaffold0498; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 11 - 240
Target Start/End: Original strand, 8878 - 9107
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgcatacctagacaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcgattaaacaagaatcaaatctcaaat 110  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  8878 catcatcaatacatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat 8977  T
Q  111 taacaacaacttatcaaaactcaccaattgagcacaattttcaaaacttatcatttttactcatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat 210  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||  | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8978 taacaacaacttaacaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttaacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaattat 9077  T
Q  211 catcaattcatgcatacaaacatatcatca 240  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  9078 catcgattcatgcatacaaacataacatca 9107  T

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Target: chr8 (Bit Score: 166; Significance: 6e-89; HSPs: 31)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 11 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 43373731 - 43373502
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgcatacctagacaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcgattaaacaagaatcaaatctcaaat 110  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  43373731 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaaccacaacatcaattaacaaccatagcatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat 43373632  T
Q  111 taacaacaacttatcaaaactcaccaattgagcacaattttcaaaacttatcatttttactcatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat 210  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  43373631 taacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatataattat 43373532  T
Q  211 catcaattcatgcatacaaacatatcatca 240  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  43373531 catcaattcatgcatacaaacgtatcatca 43373502  T

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Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 10 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 16193980 - 16193750
Alignment:
Q  10 acatcatcaatccatgaatatgcatacctagacaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcgattaaacaagaatcaaatctcaaa 109  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||| |  |||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  16193980 acatcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaa 16193881  T
Q  110 ttaacaacaacttatcaaaactcaccaattgagcacaattttcaaaacttatcatttttactcatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 209  Q
    |||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16193880 ttaacaacaatttggcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttccccaacaatcatacaatta 16193781  T
Q  210 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatca 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16193780 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatca 16193750  T

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Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 15 - 240
Target Start/End: Original strand, 24548986 - 24549211
Alignment:
Q  15 atcaatccatgaatatgcatacctagacaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcgattaaacaagaatcaaatctcaaattaac 114  Q
    |||||| |||||||||||||||| |  |||| |||||||||  |||||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||||||||||| |||||||||    
T  24548986 atcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacaaccataacatcaattgagcaagaatcaaatcccaaattaac 24549085  T
Q  115 aacaacttatcaaaactcaccaattgagcacaattttcaaaacttatcatttttactcatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatc 214  Q
    || |||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24549086 aataacttagcaaaattcaccaattgagcaccattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatc 24549185  T
Q  215 aattcatgcatacaaacatatcatca 240  Q
    |||||||||||||||||||| |||||    
T  24549186 aattcatgcatacaaacataacatca 24549211  T

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Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 15 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 6774505 - 6774280
Alignment:
Q  15 atcaatccatgaatatgcatacctagacaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcgattaaacaagaatcaaatctcaaattaac 114  Q
    |||||| |||||||||||||||| |  || | |||||||||  |||||||||| ||||| | |||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||    
T  6774505 atcaattcatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaataacatcaattgagcaagaatcaaatctcaaattaac 6774406  T
Q  115 aacaacttatcaaaactcaccaattgagcacaattttcaaaacttatcatttttactcatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatc 214  Q
    || |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6774405 aataacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatc 6774306  T
Q  215 aattcatgcatacaaacatatcatca 240  Q
    |||||||||||||||||||| |||||    
T  6774305 aattcatgcatacaaacataacatca 6774280  T

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Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 11 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 21844824 - 21844594
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgcatacctagacaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcgattaaacaagaatcaaatctcaaat 110  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||| || ||||| |||||| |||||||||  || ||||| ||||| |||||||||    
T  21844824 catcaacaatcaatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaaaaatcacatctcaaat 21844725  T
Q  111 taacaacaacttatca-aaactcaccaattgagcacaattttcaaaacttatcatttttactcatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 209  Q
    |||||||||||||  | ||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  21844724 taacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatca 21844625  T
Q  210 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatca 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21844624 tcatcaattcatgcatacaaacataacatca 21844594  T

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Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 11 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 21852217 - 21851987
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgcatacctagacaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcgattaaacaagaatcaaatctcaaat 110  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||| || ||||| |||||| |||||||||  || ||||||||||| |||||||||    
T  21852217 catcaacaatcaatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacatctcaaat 21852118  T
Q  111 taacaacaacttatca-aaactcaccaattgagcacaattttcaaaacttatcatttttactcatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 209  Q
    |||||||||||||  | ||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||  |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  21852117 taacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttacatatttaaacatttaatttcaccaacaatcatacaatca 21852018  T
Q  210 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatca 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21852017 tcatcaattcatgcatacaaacataacatca 21851987  T

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Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 22 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 24929043 - 24928825
Alignment:
Q  22 catgaatatgcatacctagacaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcgattaaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaact 121  Q
    |||||||||||||||| |  |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||| |||||||  || | |||||   ||| ||||||    
T  24929043 catgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaatcacaacatcaattaacaaccataacctcaattgaacaagagacataactcaatccaaccacaact 24928944  T
Q  122 tatcaaaactcaccaattgagcacaattttcaaaacttatcatttttactcatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcat 221  Q
    || | ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24928943 tagcgaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcat 24928844  T
Q  222 gcatacaaacatatcatca 240  Q
    |||||||||||||| ||||    
T  24928843 gcatacaaacatataatca 24928825  T

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Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 11 - 240
Target Start/End: Original strand, 30120722 - 30120952
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgcatacctagacaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcgattaaacaagaatcaaatctcaaat 110  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||| || ||||| |||||| ||||||||| ||| |||| |||||| |||||||||    
T  30120722 catcatcaatcgatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat 30120821  T
Q  111 taacaacaacttatca-aaactcaccaattgagcacaattttcaaaacttatcatttttactcatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 209  Q
    |||||||||||||  | ||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |  || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  30120822 taacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaacta 30120921  T
Q  210 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatca 240  Q
     ||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  30120922 acataaattcatgcatacaaacataacatca 30120952  T

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Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 11 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 16405235 - 16405009
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgcatacctagacaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcgattaaacaagaatcaaatctcaaat 110  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||| |  || | |||||||||  | |||||||||||||| | |||||||| ||| ||||||||||| || |||| |    
T  16405235 catcatcaattcatgaatttgcatacccaagcagtgattcatcaactaaaacatcaattaacaacaataacatcaattgaacaagaatcatatgtcaatt 16405136  T
Q  111 taacaacaacttatcaaaactcaccaattgagcacaattttcaaaacttatcatttttactcatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat 210  Q
    |||||||   ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| | |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16405135 taacaac---ttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttaacatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat 16405039  T
Q  211 catcaattcatgcatacaaacatatcatca 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16405038 catcaattcatgcatacaaacatatcatca 16405009  T

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Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 11 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 16674644 - 16674414
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgcatacctagacaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcgattaaacaagaatcaaatctcaaat 110  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||  |  ||||||||||| ||||| |  ||||| |||||| |||||||||  || |||||| |||| ||||||| |    
T  16674644 catcatcaatccatgaatatgcaaactcaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaact 16674545  T
Q  111 taacaacaacttatca-aaactcaccaattgagcacaattttcaaaacttatcatttttactcatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 209  Q
    |||||||||||||  | ||| ||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||| |  || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16674544 taacaacaacttaggagaaattcaccaattaagcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaacta 16674445  T
Q  210 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatca 240  Q
     ||| |||||||||||| ||||||| |||||    
T  16674444 acataaattcatgcataaaaacataacatca 16674414  T

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Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 11 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 222943 - 222754
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgcatacctagacaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcgattaaacaagaatcaaatctcaaat 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||| || ||||| |||||| |||||||||  || ||||||||||| | |||||||    
T  222943 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 222844  T
Q  111 taacaacaacttatca-aaactcaccaattgagcacaattttcaaaacttatcatttttactcatttgaacatgtaatttcaccaacaat 199  Q
    |||||||||||||  | ||| ||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||| |  || ||||||||||||||||||||||||    
T  222843 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaat 222754  T

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Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 11 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 736566 - 736377
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgcatacctagacaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcgattaaacaagaatcaaatctcaaat 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||| || ||||| |||||| |||||||||  || ||||||||||| | |||||||    
T  736566 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 736467  T
Q  111 taacaacaacttatca-aaactcaccaattgagcacaattttcaaaacttatcatttttactcatttgaacatgtaatttcaccaacaat 199  Q
    |||||||||||||  | ||| ||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||| |  || ||||||||||||||||||||||||    
T  736466 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaat 736377  T

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Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 11 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 860461 - 860272
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgcatacctagacaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcgattaaacaagaatcaaatctcaaat 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||| || ||||| |||||| |||||||||  || ||||||||||| | |||||||    
T  860461 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 860362  T
Q  111 taacaacaacttatca-aaactcaccaattgagcacaattttcaaaacttatcatttttactcatttgaacatgtaatttcaccaacaat 199  Q
    |||||||||||||  | ||| ||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||| |  || ||||||||||||||||||||||||    
T  860361 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaat 860272  T

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Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 22 - 240
Target Start/End: Original strand, 17345581 - 17345798
Alignment:
Q  22 catgaatatgcatacctagacaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcgattaaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaact 121  Q
    |||||||||||||||| |  || | |||||||||  |||||||||||||||| | |||| ||| | | ||||||||||| | ||||| || |||| ||||    
T  17345581 catgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataatatcaactgaacaagaatcataactcaa-ttcacaataact 17345679  T
Q  122 tatcaaaactcaccaattgagcacaattttcaaaacttatcatttttactcatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcat 221  Q
    || |||||  || ||||||||||||||||||| |||||  |||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17345680 tagcaaaatccatcaattgagcacaattttcataacttcacatttttacataattgaacatgtgatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcat 17345779  T
Q  222 gcatacaaacatatcatca 240  Q
    ||||| ||||||| |||||    
T  17345780 gcatataaacataacatca 17345798  T

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Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 22907476 - 22907247
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgcatacctagacaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcgattaaacaagaatcaaatctcaaat 110  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |  |||| |||||||||  |||||||| |||| |||| | |||||| |||  |||||||||| | ||||| |    
T  22907476 catcatcaatccatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 22907377  T
Q  111 taacaacaacttatcaaaactcaccaattgagcacaattttcaaaacttatcatttttactcatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat 210  Q
     ||| ||||| | |||||  ||| | |||  |||||||||||| ||||| ||||||| ||  |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22907376 caactacaacatgtcaaat-tcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattat 22907278  T
Q  211 catcaattcatgcatacaaacatatcatcaa 241  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22907277 tatcaattcatgcatacaaacatatcatcaa 22907247  T

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Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 142 - 241
Target Start/End: Original strand, 5238218 - 5238317
Alignment:
Q  142 gcacaattttcaaaacttatcatttttactcatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcaa 241  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||| ||  |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5238218 gcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaa 5238317  T

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Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 142 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 24661380 - 24661281
Alignment:
Q  142 gcacaattttcaaaacttatcatttttactcatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcaa 241  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||| ||  |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24661380 gcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaa 24661281  T

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Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 142 - 241
Target Start/End: Original strand, 43685677 - 43685776
Alignment:
Q  142 gcacaattttcaaaacttatcatttttactcatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcaa 241  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||| ||  |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43685677 gcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaa 43685776  T

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Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 174 - 240
Target Start/End: Original strand, 26011656 - 26011723
Alignment:
Q  174 tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatca 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||  || ||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  26011656 tttgaacatgtaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatca 26011723  T

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Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 174 - 240
Target Start/End: Original strand, 15933460 - 15933527
Alignment:
Q  174 tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatca 240  Q
    |||||||||| ||||||||||||||  || ||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  15933460 tttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatca 15933527  T

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Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 141 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 691967 - 691909
Alignment:
Q  141 agcacaattttcaaaacttatcatttttactcatttgaacatgtaatttcaccaacaat 199  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||| |  || ||||||||||||||||||||||||    
T  691967 agcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaat 691909  T

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Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 174 - 240
Target Start/End: Original strand, 17285366 - 17285433
Alignment:
Q  174 tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatca 240  Q
    |||||||||| ||||||||||||||  || ||||||||| ||| |||||||||  |||||||||||||    
T  17285366 tttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcatttaaacatatcatca 17285433  T

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Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 174 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 21198237 - 21198170
Alignment:
Q  174 tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatca 240  Q
    |||||||||| ||||||||||||||  || ||||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  21198237 tttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatctacaacttcatgcattcaaacatatcatca 21198170  T

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Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 174 - 240
Target Start/End: Original strand, 25296320 - 25296387
Alignment:
Q  174 tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatca 240  Q
    |||||||||| |||||||||||||   || |||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  25296320 tttgaacatgcaatttcaccaacagcaattcaattatcattaatttcatgcattcaaacatatcatca 25296387  T

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Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 174 - 240
Target Start/End: Original strand, 25758340 - 25758407
Alignment:
Q  174 tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatca 240  Q
    |||||||||| |||||||||||||   || |||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  25758340 tttgaacatgcaatttcaccaacagcaattcaattatcattaatttcatgcattcaaacatatcatca 25758407  T

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Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 178 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 13721016 - 13720970
Alignment:
Q  178 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgca 224  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  13721016 aacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgca 13720970  T

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Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 178 - 224
Target Start/End: Original strand, 16195399 - 16195445
Alignment:
Q  178 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgca 224  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  16195399 aacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgca 16195445  T

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Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 178 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 16873139 - 16873093
Alignment:
Q  178 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgca 224  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  16873139 aacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgca 16873093  T

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Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 178 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 22006346 - 22006300
Alignment:
Q  178 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgca 224  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  22006346 aacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgca 22006300  T

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Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 179 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 23226156 - 23226094
Alignment:
Q  179 acatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaatt-catgcatacaaacatatcatca 240  Q
    ||||| || |||||||||||  |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23226156 acatgcaaattcaccaacaacaactcaattatcatcaatttcatgcatacaaacatatcatca 23226094  T

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Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 176 - 240
Target Start/End: Original strand, 33172392 - 33172457
Alignment:
Q  176 tgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatca 240  Q
    |||||||| ||||||||||||||  || ||||||||| ||| |||||| || ||||||||||||||    
T  33172392 tgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtattcaaacatatcatca 33172457  T

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Target: scaffold0025 (Bit Score: 162; Significance: 1e-86; HSPs: 3)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 11 - 240
Target Start/End: Original strand, 148721 - 148950
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgcatacctagacaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcgattaaacaagaatcaaatctcaaat 110  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||| |  |||| ||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  148721 catcatcaattcatgaatatacatacccaagcaatgattcatcaaccacaacttcaattaacaaccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat 148820  T
Q  111 taacaacaacttatcaaaactcaccaattgagcacaattttcaaaacttatcatttttactcatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat 210  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  148821 taacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaattat 148920  T
Q  211 catcaattcatgcatacaaacatatcatca 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  148921 catcaattcatgcatacaaacatatcatca 148950  T

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Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 11 - 240
Target Start/End: Original strand, 8849 - 9078
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgcatacctagacaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcgattaaacaagaatcaaatctcaaat 110  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||| |  |||| |||||||||  |||||||||||||| | | |||||||| ||| ||||  ||||| ||||||| |    
T  8849 catcatcaattcatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaatagcaataacatcaattgaacattaatcatatctcaatt 8948  T
Q  111 taacaacaacttatcaaaactcaccaattgagcacaattttcaaaacttatcatttttactcatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat 210  Q
     |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8949 caacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat 9048  T
Q  211 catcaattcatgcatacaaacatatcatca 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9049 catcaattcatgcatacaaacatatcatca 9078  T

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Target: scaffold0025; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 174 - 240
Target Start/End: Original strand, 53508 - 53575
Alignment:
Q  174 tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaat-tcatgcatacaaacatatcatca 240  Q
    |||||||||| ||||||||||||||  || ||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||    
T  53508 tttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatatcatgcattcaaacatatcatca 53575  T

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Target: scaffold0175 (Bit Score: 158; Significance: 3e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 11 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 1218 - 990
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgcatacctagacaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcgattaaacaagaatcaaatctcaaat 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||  || ||||||||| ||||||||| |    
T  1218 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataacataaattaacatccataacatcacttgaacaagaataaaatctcaa-t 1120  T
Q  111 taacaacaacttatcaaaactcaccaattgagcacaattttcaaaacttatcatttttactcatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat 210  Q
    ||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1119 taacaacaacttagcaaaattcatcaattgagcacaattttcacaacttattatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat 1020  T
Q  211 catcaattcatgcatacaaacatatcatca 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1019 catcaattcatgcatacaaacatatcatca 990  T

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Target: scaffold0302 (Bit Score: 155; Significance: 2e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0302
Description:

Target: scaffold0302; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 11 - 240
Target Start/End: Original strand, 12115 - 12342
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgcatacctagacaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcgattaaacaagaatcaaatctcaaat 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |    
T  12115 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatgaatcataacatcaattaacattcataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaatt 12214  T
Q  111 taacaacaacttatcaaaactcaccaattgagcacaattttcaaaacttatcatttttactcatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat 210  Q
      ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12215 --acaacaacttaacaaaattcaccaatttagcacaattttcacaacttatcatttttacacatttaaacatgtattttcaccaacaatcatacaattat 12312  T
Q  211 catcaattcatgcatacaaacatatcatca 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12313 catcaattcatgcatacaaacatatcatca 12342  T

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Target: scaffold0413 (Bit Score: 154; Significance: 8e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 11 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 6326 - 6098
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgcatacctagacaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcgattaaacaagaatcaaatctcaaat 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||| |    
T  6326 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataacaaaaattaacatccataacatcacttgaacaagaatcaaatctcaa-t 6228  T
Q  111 taacaacaacttatcaaaactcaccaattgagcacaattttcaaaacttatcatttttactcatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat 210  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||| | ||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6227 taacaacaacttagcaaaattcaccaattcagcacaatttttacaacttattatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat 6128  T
Q  211 catcaattcatgcatacaaacatatcatca 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6127 catcaattcatgcatacaaacatatcatca 6098  T

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Target: scaffold0008 (Bit Score: 154; Significance: 8e-82; HSPs: 2)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 11 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 128431 - 128203
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgcatacctagacaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcgattaaacaagaatcaaatctcaaat 110  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |    
T  128431 catcatcaattcatgaatatgcatacccaatcaattattcatcaatcacaacatccattaacatccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaa-t 128333  T
Q  111 taacaacaacttatcaaaactcaccaattgagcacaattttcaaaacttatcatttttactcatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat 210  Q
    |||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||| |||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  128332 taacaacaacctaacaaaattcgccaattgagcacaattttcacaacttaacacctttacacatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaattat 128233  T
Q  211 catcaattcatgcatacaaacatatcatca 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  128232 catcaattcatgcatacaaacatatcatca 128203  T

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Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 11 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 31928 - 31697
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgcatacctagacaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcgattaaacaagaatcaaatctcaaat 110  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||| || || || |||||| ||||||||| ||| |||| |||||| |||||||||    
T  31928 catcattaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatattaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat 31829  T
Q  111 taacaacaactt-atca-aaactcaccaattgagcacaattttcaaaacttatcatttttactcatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatt 208  Q
     ||||||||||| |  | ||| |||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||| |  || |||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  31828 caacaacaactttaggagaaattcaccaattgagcataatattcataacttatcatttttgcatatatgaatatgtaatttcaccaacaatcatacaact 31729  T
Q  209 atcatcaattcatgcatacaaacatatcatca 240  Q
    | ||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  31728 aacatcaattcatgcattcaaacataacatca 31697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 154; Significance: 8e-82; HSPs: 19)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 11 - 240
Target Start/End: Original strand, 20931345 - 20931574
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgcatacctagacaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcgattaaacaagaatcaaatctcaaat 110  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||| |   ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  20931345 catcattaattcatgaatatgcatacccaagaaattattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat 20931444  T
Q  111 taacaacaacttatcaaaactcaccaattgagcacaattttcaaaacttatcatttttactcatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat 210  Q
    ||||||||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20931445 taacaacaatttagcaaaattcaccaatttagcacaattttcataacttatcatttttacatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaattat 20931544  T
Q  211 catcaattcatgcatacaaacatatcatca 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20931545 catcaattcatgcatacaaacatatcatca 20931574  T

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Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 11 - 224
Target Start/End: Original strand, 22227809 - 22228022
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgcatacctagacaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcgattaaacaagaatcaaatctcaaat 110  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  22227809 catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataacatcaattaacattcataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat 22227908  T
Q  111 taacaacaacttatcaaaactcaccaattgagcacaattttcaaaacttatcatttttactcatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat 210  Q
    ||||||||||||| ||||| ||| ||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22227909 taacaacaacttagcaaaattcaacaattggacacaattttcataacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcactaacaatcatacaattat 22228008  T
Q  211 catcaattcatgca 224  Q
    ||||||||||||||    
T  22228009 catcaattcatgca 22228022  T

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Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 11 - 224
Target Start/End: Original strand, 22232506 - 22232719
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgcatacctagacaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcgattaaacaagaatcaaatctcaaat 110  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  22232506 catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataacatcaattaacattcataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat 22232605  T
Q  111 taacaacaacttatcaaaactcaccaattgagcacaattttcaaaacttatcatttttactcatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat 210  Q
    ||||||||||||| ||||| ||| ||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22232606 taacaacaacttagcaaaattcaacaattggacacaattttcataacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcactaacaatcatacaattat 22232705  T
Q  211 catcaattcatgca 224  Q
    ||||||||||||||    
T  22232706 catcaattcatgca 22232719  T

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Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 15 - 240
Target Start/End: Original strand, 2116258 - 2116484
Alignment:
Q  15 atcaatccatgaatatgcatacctagacaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcgattaaacaagaatcaaa-tctcaaattaa 113  Q
    |||||| |||||||||||||||| |  |||| |||||||||  |||||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||||||||| | |||||||||    
T  2116258 atcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacaaccataacatcaattgagcaagaatcaaaatatcaaattaa 2116357  T
Q  114 caacaacttatcaaaactcaccaattgagcacaattttcaaaacttatcatttttactcatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcat 213  Q
    ||| |||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2116358 caataacttagcaaaattcaccaattgagcaccattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcat 2116457  T
Q  214 caattcatgcatacaaacatatcatca 240  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||    
T  2116458 caattcatgcatacaaacataacatca 2116484  T

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Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 11 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 20893889 - 20893660
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgcatacctagacaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcgattaaacaagaatcaaatctcaaat 110  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||| | ||||| ||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||| ||| ||||||||||| |  ||||      
T  20893889 catcatcaatttatgaatatgcatacccaaacaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagtcataacatcaattgaacaagaatcataaatcaatc 20893790  T
Q  111 taacaacaacttatcaaaactcaccaattgagcacaattttcaaaacttatcatttttactcatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat 210  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20893789 taacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaacaacaatcatacaattat 20893690  T
Q  211 catcaattcatgcatacaaacatatcatca 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20893689 catcaattcatgcatacaaacatatcatca 20893660  T

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Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 11 - 240
Target Start/End: Original strand, 41394222 - 41394451
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgcatacctagacaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcgattaaacaagaatcaaatctcaaat 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |  || | |||||||||  |||||||||| ||||| | |||||||| ||| | |||||||||||||||||      
T  41394222 catcatcaatccatgaatatgcatacccaatcagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaataacatcaattgagcaagaatcaaatctcaaca 41394321  T
Q  111 taacaacaacttatcaaaactcaccaattgagcacaattttcaaaacttatcatttttactcatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat 210  Q
    |||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  41394322 taacaataacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaacttcaccaacaatcatacaattat 41394421  T
Q  211 catcaattcatgcatacaaacatatcatca 240  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  41394422 catcaatttatgcatacaaacatatcatca 41394451  T

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Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 11 - 240
Target Start/End: Original strand, 20913037 - 20913259
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgcatacctagacaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcgattaaacaagaatcaaatctcaaat 110  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||       ||    
T  20913037 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaaccacaagatcaattaacaaccataacatcaattgaacaagaatcaa-------at 20913129  T
Q  111 taacaacaacttatcaaaactcaccaattgagcacaattttcaaaacttatcatttttactcatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat 210  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20913130 taacaacaactttgcaaaattcaccaattgagcacaattttcataacttatcatttttacatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaattat 20913229  T
Q  211 catcaattcatgcatacaaacatatcatca 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20913230 catcaattcatgcatacaaacatatcatca 20913259  T

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Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 11 - 240
Target Start/End: Original strand, 20445679 - 20445908
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgcatacctagacaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcgattaaacaagaatcaaatctcaaat 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||| |  |||| |||||||||  |||||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||||||| | | ||| |    
T  20445679 catcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacagccataacatcaattgatcaagaatcataacacaatt 20445778  T
Q  111 taacaacaacttatcaaaactcaccaattgagcacaattttcaaaacttatcatttttactcatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat 210  Q
     |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||| | |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20445779 caacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcaccacttatcatttgttcctacttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat 20445878  T
Q  211 catcaattcatgcatacaaacatatcatca 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20445879 catcaattcatgcatacaaacatatcatca 20445908  T

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Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 11 - 240
Target Start/End: Original strand, 20531444 - 20531673
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgcatacctagacaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcgattaaacaagaatcaaatctcaaat 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||| |  |||| |||||||||  |||||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||||||| | | ||| |    
T  20531444 catcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacagccataacatcaattgatcaagaatcataacacaatt 20531543  T
Q  111 taacaacaacttatcaaaactcaccaattgagcacaattttcaaaacttatcatttttactcatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat 210  Q
     |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||| | |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20531544 caacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcaccacttatcatttgttcctacttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat 20531643  T
Q  211 catcaattcatgcatacaaacatatcatca 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20531644 catcaattcatgcatacaaacatattatca 20531673  T

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Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 77 - 240
Target Start/End: Original strand, 45051489 - 45051652
Alignment:
Q  77 ataacatcgattaaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaacttatcaaaactcaccaattgagcacaattttcaaaacttatcatttttactcattt 176  Q
    |||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||    
T  45051489 ataacatcaattgagcaagaatcaaatctcaaattaaccataacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatattt 45051588  T
Q  177 gaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatca 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  45051589 gaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacgtaacatca 45051652  T

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Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 11 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 37844714 - 37844484
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgcatacctagacaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcgattaaacaagaatcaaatctcaaat 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||| |  |||| | ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||| | |||||      
T  37844714 catcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgactcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatc 37844615  T
Q  111 taacaacaacttatcaaaactcaccaattgagcacaattttca-aaacttatcatttttactcatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 209  Q
    ||||||||||||| ||||| |||  ||||||||||||||||||  |  ||||||||| | |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37844614 taacaacaacttagcaaaattcattaattgagcacaattttcactattttatcatttgttcctacttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 37844515  T
Q  210 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatca 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37844514 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatca 37844484  T

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Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 11 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 18601370 - 18601140
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgcatacctagacaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcgattaaacaagaatcaaatctcaaat 110  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |  ||||||||||| ||||| |  ||||| |||||| |||||||||  || |||||| |||| ||||||| |    
T  18601370 catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaact 18601271  T
Q  111 taacaacaacttatca-aaactcaccaattgagcacaattttcaaaacttatcatttttactcatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 209  Q
    |||||||||||||  | ||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |  || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  18601270 taacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaacta 18601171  T
Q  210 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatca 240  Q
     |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18601170 acatcaattcatgcatacaaacataacatca 18601140  T

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Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 11 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 5072640 - 5072410
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgcatacctagacaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcgattaaacaagaatcaaatctcaaat 110  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |  ||||||||||| ||||| |  ||||| |||||| |||||||||  || |||||| |||| ||||||| |    
T  5072640 catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaact 5072541  T
Q  111 taacaacaacttatca-aaactcaccaattgagcacaattttcaaaacttatcatttttactcatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 209  Q
    |||||||||||||  | ||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |  || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  5072540 taacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaacta 5072441  T
Q  210 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatca 240  Q
     |||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  5072440 acatcaattcatgcatataaacataacatca 5072410  T

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Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 142 - 241
Target Start/End: Original strand, 51452623 - 51452722
Alignment:
Q  142 gcacaattttcaaaacttatcatttttactcatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcaa 241  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||| ||  |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51452623 gcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaa 51452722  T

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Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 174 - 240
Target Start/End: Original strand, 17609090 - 17609157
Alignment:
Q  174 tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatca 240  Q
    |||||||||| ||||||||||||||  || ||||||||| ||| ||||||||| |||| |||||||||    
T  17609090 tttgaacatgcaatttcaccaacaacaatccaattatcaccaatttcatgcattcaaatatatcatca 17609157  T

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Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 174 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 37233945 - 37233878
Alignment:
Q  174 tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaatt-catgcatacaaacatatcatca 240  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||  || ||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  37233945 tttgaacatgcaattttaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatca 37233878  T

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Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 178 - 224
Target Start/End: Original strand, 17148735 - 17148781
Alignment:
Q  178 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgca 224  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  17148735 aacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgca 17148781  T

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Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 176 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 8537993 - 8537928
Alignment:
Q  176 tgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatca-tcaattcatgcatacaaacatatcatca 240  Q
    |||||||| ||||||||||||||  || ||||||||| | | ||||||||| ||||||||||||||    
T  8537993 tgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcactaatttcatgcattcaaacatatcatca 8537928  T

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Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 176 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 8603232 - 8603167
Alignment:
Q  176 tgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatca-tcaattcatgcatacaaacatatcatca 240  Q
    |||||||| ||||||||||||||  || ||||||||| | | ||||||||| ||||||||||||||    
T  8603232 tgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcactaatttcatgcattcaaacatatcatca 8603167  T

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Target: scaffold0022 (Bit Score: 150; Significance: 2e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 11 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 5466 - 5254
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgcatacctagacaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcgattaaacaagaatcaaatctcaaat 110  Q
    |||||||||||||||||||||||  || || ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  5466 catcatcaatccatgaatatgcaacccaag-caattattcattaatcacaacatcaattaacattcataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat 5368  T
Q  111 taacaacaacttatcaaaactcaccaattgagcacaattttcaaaacttatcatttttactcatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat 210  Q
    ||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5367 taacaacaactcagcaaaattcaccaattgaacacaattttcataacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat 5268  T
Q  211 catcaattcatgca 224  Q
    ||||||||||||||    
T  5267 catcaattcatgca 5254  T

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Target: scaffold0215 (Bit Score: 146; Significance: 5e-77; HSPs: 2)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 15 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 9596 - 9371
Alignment:
Q  15 atcaatccatgaatatgcatacctagacaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcgattaaacaagaatcaaatctcaaattaac 114  Q
    |||||| |||||||||||||||| |  |||| |||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||  || | |||||||||||||||||||||||    
T  9596 atcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacaaccataacatcatttgagcaagaatcaaatctcaaattaac 9497  T
Q  115 aacaacttatcaaaactcaccaattgagcacaattttcaaaacttatcatttttactcatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatc 214  Q
    || |||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9496 aataacttagcaaaattcaccaattgagcaccattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatc 9397  T
Q  215 aattcatgcatacaaacatatcatca 240  Q
    |||||||||||||||||||| |||||    
T  9396 aattcatgcatacaaacataacatca 9371  T

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Target: scaffold0215; HSP #2
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 15 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 16494 - 16269
Alignment:
Q  15 atcaatccatgaatatgcatacctagacaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcgattaaacaagaatcaaatctcaaattaac 114  Q
    |||||| |||||||||||||||| |  |||| |||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||  || | |||||||||||||||||||||||    
T  16494 atcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacaaccataacatcatttgagcaagaatcaaatctcaaattaac 16395  T
Q  115 aacaacttatcaaaactcaccaattgagcacaattttcaaaacttatcatttttactcatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatc 214  Q
    || |||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16394 aataacttagcaaaattcaccaattgagcaccattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatc 16295  T
Q  215 aattcatgcatacaaacatatcatca 240  Q
    |||||||||||||||||||| |||||    
T  16294 aattcatgcatacaaacataacatca 16269  T

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Target: scaffold0195 (Bit Score: 142; Significance: 1e-74; HSPs: 2)
Name: scaffold0195
Description:

Target: scaffold0195; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 11 - 240
Target Start/End: Original strand, 19206 - 19435
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgcatacctagacaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcgattaaacaagaatcaaatctcaaat 110  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |  |||| |||||||||  |||||||||||||||| | |||||||| ||| |||| |||||| | ||||| |    
T  19206 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacagcaataacatcaattgaacaggaatcataactcaatt 19305  T
Q  111 taacaacaacttatcaaaactcaccaattgagcacaattttcaaaacttatcatttttactcatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat 210  Q
     |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19306 caacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaattat 19405  T
Q  211 catcaattcatgcatacaaacatatcatca 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19406 catcaattcatgcatacaaacatatcatca 19435  T

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Target: scaffold0195; HSP #2
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 11 - 240
Target Start/End: Original strand, 21290 - 21519
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgcatacctagacaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcgattaaacaagaatcaaatctcaaat 110  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |  |||| |||||||||  |||||||||||||||| | |||||||| ||| |||| |||||| | ||||| |    
T  21290 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacagcaataacatcaattgaacaggaatcataactcaatt 21389  T
Q  111 taacaacaacttatcaaaactcaccaattgagcacaattttcaaaacttatcatttttactcatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat 210  Q
     |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21390 caacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaattat 21489  T
Q  211 catcaattcatgcatacaaacatatcatca 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21490 catcaattcatgcatacaaacatatcatca 21519  T

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Target: scaffold0023 (Bit Score: 142; Significance: 1e-74; HSPs: 2)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 11 - 240
Target Start/End: Original strand, 48598 - 48827
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgcatacctagacaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcgattaaacaagaatcaaatctcaaat 110  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |  |||| ||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||| ||| ||||||||||| | |||||      
T  48598 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaatagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatc 48697  T
Q  111 taacaacaacttatcaaaactcaccaattgagcacaattttcaaaacttatcatttttactcatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat 210  Q
    || |||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48698 tagcaacaacttagcaaaattcaccaactgagcacaattttcacaacttatcattttttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat 48797  T
Q  211 catcaattcatgcatacaaacatatcatca 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48798 catcaattcatgcatacaaacatatcatca 48827  T

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Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 11 - 240
Target Start/End: Original strand, 36093 - 36323
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgcatacctagacaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcgattaaacaagaatcaaatctcaaat 110  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||| |  ||||| |||||| ||||||||| ||| |||| |||||| |||||||||    
T  36093 catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcatattatcaaataacattcataacatctattgaacatgaatcacatctcaaat 36192  T
Q  111 taacaacaacttatca-aaactcaccaattgagcacaattttcaaaacttatcatttttactcatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 209  Q
    |||||||||||||  | ||| ||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||| |  || |||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  36193 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaatatgtaatttcaccaacaatcatacaacta 36292  T
Q  210 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatca 240  Q
     ||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  36293 acatcaattcatacatacaaacataacatca 36323  T

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Target: scaffold0011 (Bit Score: 142; Significance: 1e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 11 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 123427 - 123198
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgcatacctagacaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcgattaaacaagaatcaaatctcaaat 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||| |  | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||| | || ||      
T  123427 catcttcaattcatgaatatgcatacccaagccattattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattgaacaagaatcataacttaatc 123328  T
Q  111 taacaacaacttatcaaaactcaccaattgagcacaattttcaaaacttatcatttttactcatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat 210  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  123327 taacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat 123228  T
Q  211 catcaattcatgcatacaaacatatcatca 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  123227 catcaattcatgcatacaaacatatcatca 123198  T

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Target: chr6 (Bit Score: 142; Significance: 1e-74; HSPs: 25)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 15 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 14626377 - 14626152
Alignment:
Q  15 atcaatccatgaatatgcatacctagacaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcgattaaacaagaatcaaatctcaaattaac 114  Q
    |||||| |||||||||||||||| |  |||| |||||||||  |||||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||||||||||||||| |||||    
T  14626377 atcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacaaccataacatcaattgagcaagaatcaaatctcaagttaac 14626278  T
Q  115 aacaacttatcaaaactcaccaattgagcacaattttcaaaacttatcatttttactcatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatc 214  Q
    ||||||||| || || ||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14626277 aacaacttagcataattcaccaattgcacacaattttcataacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatc 14626178  T
Q  215 aattcatgcatacaaacatatcatca 240  Q
    |||||||||||||||||||| |||||    
T  14626177 aattcatgcatacaaacataacatca 14626152  T

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Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 22 - 240
Target Start/End: Original strand, 23153458 - 23153676
Alignment:
Q  22 catgaatatgcatacctagacaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcgattaaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaact 121  Q
    |||||||||| ||||| |   ||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||| ||| ||||||||||| | |||||  |||||||||||    
T  23153458 catgaatatgtatacccaagtaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataatatcaattgaacaagaatcataactcaatctaacaacaact 23153557  T
Q  122 tatcaaaactcaccaattgagcacaattttcaaaacttatcatttttactcatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcat 221  Q
    || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23153558 tagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcat 23153657  T
Q  222 gcatacaaacatatcatca 240  Q
    |||||||||||||||||||    
T  23153658 gcatacaaacatatcatca 23153676  T

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Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 15 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 1650352 - 1650127
Alignment:
Q  15 atcaatccatgaatatgcatacctagacaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcgattaaacaagaatcaaatctcaaattaac 114  Q
    |||||| |||||||||||||||| |  || | |||||||||  |||||||||| ||||| | |||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||    
T  1650352 atcaattcatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaataacatcaattgagcaagaatcaaatctcaaattaac 1650253  T
Q  115 aacaacttatcaaaactcaccaattgagcacaattttcaaaacttatcatttttactcatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatc 214  Q
     | |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1650252 cataacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcattcttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatc 1650153  T
Q  215 aattcatgcatacaaacatatcatca 240  Q
    ||||||||||||||||| || |||||    
T  1650152 aattcatgcatacaaacgtaacatca 1650127  T

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Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 11 - 234
Target Start/End: Original strand, 25175563 - 25175787
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgcatacctagacaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcgattaaacaagaatcaaatctcaaat 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||| || ||||| |||||| |||||||||  || ||||||||||| | |||||||    
T  25175563 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 25175662  T
Q  111 taacaacaacttatca-aaactcaccaattgagcacaattttcaaaacttatcatttttactcatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 209  Q
    |||||||||||||  | ||| ||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  25175663 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 25175762  T
Q  210 tcatcaattcatgcatacaaacata 234  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  25175763 acatcaattcatgcatacaaacata 25175787  T

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Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 11 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 27654235 - 27654005
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgcatacctagacaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcgattaaacaagaatcaaatctcaaat 110  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||| || ||||| |||||| |||||||||  |  ||||||||||| | |||||||    
T  27654235 catcattaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcattggaacaagaatcacaactcaaat 27654136  T
Q  111 taacaacaacttatca-aaactcaccaattgagcacaattttcaaaacttatcatttttactcatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 209  Q
    |||||||||||||  | ||| ||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  27654135 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 27654036  T
Q  210 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatca 240  Q
     ||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  27654035 acatcaattcatgcatacaagcataacatca 27654005  T

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Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 11 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 35009702 - 35009473
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgcatacctagacaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcgattaaacaagaatcaaatctcaaat 110  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |  |||| |||||||||  |||||||||||||||| | | |||||| ||| |||| |  ||  |||  || |    
T  35009702 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaacaacatcaattgaacatggttctcatcataatt 35009603  T
Q  111 taacaacaacttatcaaaactcaccaattgagcacaattttcaaaacttatcatttttactcatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat 210  Q
     ||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35009602 caacaacaacatagcaaaattcaccaattgagcacaattttcaaaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat 35009503  T
Q  211 catcaattcatgcatacaaacatatcatca 240  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||    
T  35009502 catcaattcatgcatacaaacttaacatca 35009473  T

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Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 22 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 1657999 - 1657782
Alignment:
Q  22 catgaatatgcatacctagacaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcgattaaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaact 121  Q
    |||||||||||||||| |  || | |||||||||  |||||||||||||||| | |||||||| | | ||||||||||| | ||||| || |||| ||||    
T  1657999 catgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataacatcaactgaacaagaatcataactcaa-ttcacaataact 1657901  T
Q  122 tatcaaaactcaccaattgagcacaattttcaaaacttatcatttttactcatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcat 221  Q
    || |||||  || ||||||||||||||||||| |||||  |||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1657900 tagcaaaatccatcaattgagcacaattttcataacttcacatttttacataattgaacatgtgatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcat 1657801  T
Q  222 gcatacaaacatatcatca 240  Q
    |||| |||||||| |||||    
T  1657800 gcatccaaacataacatca 1657782  T

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Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 11 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 16826006 - 16825774
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgcatacctagacaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcgattaaacaagaatcaaatctcaaat 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |  ||||||||||||||||| || ||||  |||||| |||||||||  || ||||||||||| | |||||||    
T  16826006 catcatcaatccatgaatatgcataacaaagcaattattcatcaatcataatatcagataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 16825907  T
Q  111 taacaacaacttatca-aaactcaccaattgagcacaattttcaaaacttatcatttttactcatttgaacatgtaatttcaccaacaatca--tacaat 207  Q
    ||||||||| |||  | |||  |||||||| |||||||| |||| |||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||| |  |||||     
T  16825906 taacaacaaattaggagaaatccaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattaattacaac 16825807  T
Q  208 tatcatcaattcatgcatacaaacatatcatca 240  Q
    || |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16825806 taacatcaattcatgcatacaaacataacatca 16825774  T

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Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 22 - 240
Target Start/End: Original strand, 15862484 - 15862700
Alignment:
Q  22 catgaatatgcatacctagacaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcgattaaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaact 121  Q
    |||||||||||||||| |  || | |||||||||  ||||||||||||| || | |||||||  || || ||||||||| | ||||| || |||| ||||    
T  15862484 catgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaattatcagcaataacataaatgaa-caagaatcataactcaa-ttcacaataact 15862581  T
Q  122 tatcaaaactcaccaattgagcacaattttcaaaacttatcatttttactcatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcat 221  Q
    || |||||  || ||||||||||||||||||| |||||  ||||| |||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15862582 tagcaaaatccatcaattgagcacaattttcataacttcacatttatacataattgaacatgtgatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcat 15862681  T
Q  222 gcatacaaacatatcatca 240  Q
    ||||||||||||| |||||    
T  15862682 gcatacaaacataacatca 15862700  T

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Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 79 - 226
Target Start/End: Original strand, 29665941 - 29666089
Alignment:
Q  79 aacatcgattaaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaacttatcaaaactcaccaattgagcacaattttcaaaacttatcatttttactca-tttg 177  Q
    |||||| ||| |||| |||||| ||||||  | |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| || |||||  ||||| | |  | ||||    
T  29665941 aacatcaattgaacatgaatcatatctcatttcaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagtacaattt-cataacttgacatttatgcatactttg 29666039  T
Q  178 aa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcata 226  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29666040 aaacatgtaatttcacccacaatcatacaattatcatcaattcatacata 29666089  T

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Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 11 - 150
Target Start/End: Original strand, 27740838 - 27740977
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgcatacctagacaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcgattaaacaagaatcaaatctcaaat 110  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| | || || ||||||| |  |||||||||  ||| | | |  ||||| ||| |||| |||||| ||||||| |    
T  27740838 catcatcaattcatgaatatgcatacccaaaccatgattcatccacaacaacatcagataatagcaaccacatcaattgaacatgaatcatatctcaatt 27740937  T
Q  111 taacaacaacttatcaaaactcaccaattgagcacaattt 150  Q
     |||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  27740938 caacaacgacttagcaaaattcaccaattgagcacaattt 27740977  T

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Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 189 - 240
Target Start/End: Original strand, 27751603 - 27751654
Alignment:
Q  189 tcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatca 240  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27751603 tcaccaacaatcatacaattgtcatcaattcatgcatacaaacataacatca 27751654  T

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Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 174 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 18629693 - 18629626
Alignment:
Q  174 tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatca 240  Q
    |||||||||| ||||||||||||||  || ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  18629693 tttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcatcaatttcatgcattcaaacatatcatca 18629626  T

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Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 176 - 237
Target Start/End: Original strand, 29605614 - 29605675
Alignment:
Q  176 tgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatca 237  Q
    |||||||||||||||||||||||  || |||||||||  ||||||||||| |||||||||||    
T  29605614 tgaacatgtaatttcaccaacaacaattcaattatcactaattcatgcattcaaacatatca 29605675  T

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Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 176 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 17083280 - 17083216
Alignment:
Q  176 tgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatca 240  Q
    |||||||  ||||||||||||||  || ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  17083280 tgaacatacaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaattcatgcattcaaacatatcatca 17083216  T

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Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 174 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 16887877 - 16887810
Alignment:
Q  174 tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatca 240  Q
    |||||||||| || |||||||||||   | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  16887877 tttgaacatgcaaattcaccaacaacagttcaattatcatcaatttcatgcatacaaacatattatca 16887810  T

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Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 174 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 17557102 - 17557036
Alignment:
Q  174 tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatca 240  Q
    |||||||||| ||||||||||||||  || ||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  17557102 tttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcat-caaacatatcatca 17557036  T

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Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 174 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 18381768 - 18381701
Alignment:
Q  174 tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatca 240  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||| ||| |||||| || |||| |||||||||    
T  18381768 tttgaacatgaaatttcaccaacaaccattcaattatcaacaacttcatgtattcaaaaatatcatca 18381701  T

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Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 174 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 22361850 - 22361783
Alignment:
Q  174 tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaatt-catgcatacaaacatatcatca 240  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||  || ||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  22361850 tttgaacatgaaatttcagcaacaacaattcaattatcaacaatttcatgcattcaaacatatcatca 22361783  T

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Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 178 - 224
Target Start/End: Original strand, 1556173 - 1556219
Alignment:
Q  178 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgca 224  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  1556173 aacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgca 1556219  T

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Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 178 - 224
Target Start/End: Original strand, 16232060 - 16232106
Alignment:
Q  178 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgca 224  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  16232060 aacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgca 16232106  T

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Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 178 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 18086911 - 18086865
Alignment:
Q  178 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgca 224  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  18086911 aacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgca 18086865  T

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Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 178 - 224
Target Start/End: Original strand, 23977937 - 23977983
Alignment:
Q  178 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgca 224  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  23977937 aacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgca 23977983  T

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Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 174 - 235
Target Start/End: Original strand, 25651399 - 25651461
Alignment:
Q  174 tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatat 235  Q
    |||||||||| ||||||||||||||  || ||||||||| ||| ||||||||| |||||||||    
T  25651399 tttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatat 25651461  T

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Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 174 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 35136097 - 35136032
Alignment:
Q  174 tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaatt-catgcatacaaacatatcatc 239  Q
    |||||||||| || ||||| |||||  || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  35136097 tttgaacatgcaaattcac-aacaacaattcaattatcatcaatttcatgcatacaaacatatcatc 35136032  T

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Target: chr4 (Bit Score: 142; Significance: 1e-74; HSPs: 31)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 11 - 240
Target Start/End: Original strand, 13246430 - 13246659
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgcatacctagacaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcgattaaacaagaatcaaatctcaaat 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||| |  |||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||| | |||||      
T  13246430 catcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatc 13246529  T
Q  111 taacaacaacttatcaaaactcaccaattgagcacaattttcaaaacttatcatttttactcatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat 210  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13246530 taacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat 13246629  T
Q  211 catcaattcatgcatacaaacatatcatca 240  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13246630 cattaattcatgcatacaaacatatcatca 13246659  T

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Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 11 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 54118507 - 54118278
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgcatacctagacaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcgattaaacaagaatcaaatctcaaat 110  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |  |||| ||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||| ||| ||||||||||| | || ||      
T  54118507 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaactataacatcaattgaacaagaatcataactaaatc 54118408  T
Q  111 taacaacaacttatcaaaactcaccaattgagcacaattttcaaaacttatcatttttactcatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat 210  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| || | |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54118407 taacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcaattgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat 54118308  T
Q  211 catcaattcatgcatacaaacatatcatca 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54118307 catcaattcatgcatacaaacatatcatca 54118278  T

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Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 11 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 15675352 - 15675123
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgcatacctagacaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcgattaaacaagaatcaaatctcaaat 110  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||| |  |||| |||||||||  |||||||||||||||| | |||||||| ||| |||| |||||| ||||||| |    
T  15675352 catcatcaattcatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataacatcaattgaacatgaatcatatctcaatt 15675253  T
Q  111 taacaacaacttatcaaaactcaccaattgagcacaattttcaaaacttatcatttttactcatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat 210  Q
     |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15675252 caacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat 15675153  T
Q  211 catcaattcatgcatacaaacatatcatca 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15675152 catcaattcatgcatacaaacatatcatca 15675123  T

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Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 11 - 240
Target Start/End: Original strand, 10644219 - 10644449
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgcatacctagacaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcgattaaacaagaatcaaatctcaaat 110  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||| || ||||| |||||| ||||||||| ||| |||| |||||| |||||||||    
T  10644219 catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat 10644318  T
Q  111 taacaacaacttatca-aaactcaccaattgagcacaattttcaaaacttatcatttttactcatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 209  Q
     ||||||||||||  | ||| ||||||||| ||||||||  ||| |||||| |||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10644319 caacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcactaacaatcatacaatta 10644418  T
Q  210 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatca 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10644419 tcatcaattcatgcatacaaacataacatca 10644449  T

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Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 11 - 240
Target Start/End: Original strand, 31115629 - 31115858
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgcatacctagacaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcgattaaacaagaatcaaatctcaaat 110  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||| |  |||| |||||||||  |||||||||||||||| | |||||||| ||| |||| |||||| ||||||| |    
T  31115629 catcatcaattcatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataacatcaattgaacatgaatcatatctcaatt 31115728  T
Q  111 taacaacaacttatcaaaactcaccaattgagcacaattttcaaaacttatcatttttactcatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat 210  Q
     ||||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||  | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31115729 caacaacaacttaggaaaattcaccaattgagcataattttcacaacttcacatttttacataatggaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat 31115828  T
Q  211 catcaattcatgcatacaaacatatcatca 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31115829 catcaattcatgcatacaaacatatcatca 31115858  T

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Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 11 - 240
Target Start/End: Original strand, 47357654 - 47357884
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgcatacctagacaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcgattaaacaagaatcaaatctcaaat 110  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||| || ||||| |||||| |||||||||  || ||||||||||| | |||||||    
T  47357654 catcatcaatccatgaatatacatacccaatcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 47357753  T
Q  111 taacaacaacttatca-aaactcaccaattgagcacaattttcaaaacttatcatttttactcatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 209  Q
    |||||||||||||  | ||| ||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  47357754 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 47357853  T
Q  210 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatca 240  Q
     ||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  47357854 acatcaatccatgcatacaaacataacatca 47357884  T

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Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 111 - 240
Target Start/End: Original strand, 121989 - 122118
Alignment:
Q  111 taacaacaacttatcaaaactcaccaattgagcacaattttcaaaacttatcatttttactcatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat 210  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  121989 taacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaattat 122088  T
Q  211 catcaattcatgcatacaaacatatcatca 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  122089 catcaattcatgcatacaaacatatcatca 122118  T

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Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 79 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 10104445 - 10104284
Alignment:
Q  79 aacatcgattaaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaacttatcaaaactcaccaattgagcacaattttcaaaacttatcatttttactcatttga 178  Q
    |||||| ||| |||| |||||| ||||||| | |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||  | ||||    
T  10104445 aacatcaattgaacatgaatcatatctcaattcaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattga 10104346  T
Q  179 acatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatca 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10104345 acatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatca 10104284  T

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Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 19 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 13048477 - 13048257
Alignment:
Q  19 atccatgaatatgcatacctagacaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcgattaaacaagaatcaaatctcaaattaacaaca 118  Q
    ||||||||||||||| ||| |  ||||||||||| ||||| |  ||| | |||||| |||||||||  || |||||| |||| |||||||| ||||||||    
T  13048477 atccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatctaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaactaacaaca 13048378  T
Q  119 acttatca-aaactcaccaattgagcacaattttcaaaacttatcatttttactcatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaat 217  Q
    |||||  | ||| ||| |||||||||||||| |||| |||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  13048377 acttaggagaaattcatcaattgagcacaatattcataacttatcctttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatcatcatcaaa 13048278  T
Q  218 tcatgcatacaaacatatcat 238  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  13048277 tcatgcatacaaacatatcat 13048257  T

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Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Original strand, 26680201 - 26680430
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgcatacctagacaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcgattaaacaagaatcaaatctcaaat 110  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |  |||| |||||||||  |||||||| |||| |||| | |||||| |||  |||||||||| | ||||| |    
T  26680201 catcatcaatccatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 26680300  T
Q  111 taacaacaacttatcaaaactcaccaattgagcacaattttcaaaacttatcatttttactcatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat 210  Q
     ||| ||||| | |||||  ||| | |||  |||||||||||| ||||| ||||||||||  |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26680301 caactacaacatgtcaaat-tcatctattttgcacaattttcataacttttcatttttacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattat 26680399  T
Q  211 catcaattcatgcatacaaacatatcatcaa 241  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26680400 tatcaattcatgcatacaaacatatcatcaa 26680430  T

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Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 142 - 241
Target Start/End: Original strand, 10488693 - 10488792
Alignment:
Q  142 gcacaattttcaaaacttatcatttttactcatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcaa 241  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||| ||  |||  |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10488693 gcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaa 10488792  T

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Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 142 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 16328058 - 16327959
Alignment:
Q  142 gcacaattttcaaaacttatcatttttactcatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcaa 241  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||| ||  |||  |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16328058 gcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaa 16327959  T

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Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 79 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 40885749 - 40885594
Alignment:
Q  79 aacatcgattaaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaacttatcaaaactcaccaattgagcacaattttcaaaacttatcatttttactca-tttg 177  Q
    |||||| ||| |||| |||||| ||||||| | ||||| |||||| ||||  |||||||||||||| ||||| || |||||  ||||| |||  | ||||    
T  40885749 aacatcaattgaacatgaatcatatctcaattcaacaataacttagcaaagttcaccaattgagcataattt-cataacttgacatttatacatactttg 40885651  T
Q  178 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacata 234  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  40885650 aacatgtaatttcaccaacaaacattcaattatcaccaattcatgcatacaaacata 40885594  T

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Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 11 - 100
Target Start/End: Original strand, 111395 - 111484
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgcatacctagacaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcgattaaacaagaatca 100  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||| |  |||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||    
T  111395 catcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattgaacaagaatca 111484  T

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Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 201 - 240
Target Start/End: Original strand, 33240890 - 33240929
Alignment:
Q  201 atacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatca 240  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33240890 atacaatcatcatcaattcatgcatacaaacatatcatca 33240929  T

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Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 90 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 17145834 - 17145701
Alignment:
Q  90 aacaagaatcaaatctcaaattaacaacaacttatcaaaactcaccaattgagcacaattttcaaaacttatcatttttactca-tttgaa-catgtaat 187  Q
    |||| |||||| ||||||  | ||||||||| |||||||| |||| ||||||| | ||||| || |||||| ||||| |||  | |||||| ||||||||    
T  17145834 aacatgaatcacatctcatttcaacaacaacatatcaaaattcactaattgagtataattt-cacaacttaacatttatacatactttgaaacatgtaat 17145736  T
Q  188 ttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatg 222  Q
    |||||| |||| ||||| || ||||||||||||||    
T  17145735 ttcacccacaaacataccataatcatcaattcatg 17145701  T

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Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 90 - 224
Target Start/End: Original strand, 8374587 - 8374722
Alignment:
Q  90 aacaagaatcaaatctcaaattaacaacaacttatcaaaactcaccaattgagcacaattttcaaaacttatcatttttactca-tttgaa-catgtaat 187  Q
    |||| |||||| ||||||  | ||||||||| ||| |||| |||| ||||||| | ||||| || |||||| ||||| |||  | |||||| ||||||||    
T  8374587 aacatgaatcacatctcatttcaacaacaacatattaaaattcactaattgagtataattt-cataacttaacatttatacatactttgaagcatgtaat 8374685  T
Q  188 ttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgca 224  Q
    |||||| |||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  8374686 ttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgca 8374722  T

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Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 174 - 240
Target Start/End: Original strand, 15044990 - 15045057
Alignment:
Q  174 tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatca 240  Q
    |||||||||| ||||||||||||||  || ||||||||| ||| ||||||||| |||||||| |||||    
T  15044990 tttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatca 15045057  T

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Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 174 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 15109434 - 15109367
Alignment:
Q  174 tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatca 240  Q
    |||||||||| ||||||||||||||  || ||||||||| ||| ||||||||| |||||||| |||||    
T  15109434 tttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatca 15109367  T

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Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 174 - 240
Target Start/End: Original strand, 18276596 - 18276663
Alignment:
Q  174 tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatca 240  Q
    |||||||||| ||||||||||||||  ||  |||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  18276596 tttgaacatgcaatttcaccaacaacaatttaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatca 18276663  T

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Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 174 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 47535150 - 47535083
Alignment:
Q  174 tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatca 240  Q
    ||||||| || ||||||||||||||  || ||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  47535150 tttgaacttgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatca 47535083  T

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Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 178 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 7132153 - 7132107
Alignment:
Q  178 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgca 224  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  7132153 aacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgca 7132107  T

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Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 175 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 7964796 - 7964730
Alignment:
Q  175 ttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatca 240  Q
    ||||||||| ||||||||||||||  || ||||||||| ||| |||||| || ||||||||||||||    
T  7964796 ttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtattcaaacatatcatca 7964730  T

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Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 178 - 224
Target Start/End: Original strand, 18169138 - 18169184
Alignment:
Q  178 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgca 224  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  18169138 aacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgca 18169184  T

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Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 178 - 224
Target Start/End: Original strand, 19020654 - 19020700
Alignment:
Q  178 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgca 224  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  19020654 aacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgca 19020700  T

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Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 178 - 224
Target Start/End: Original strand, 22738437 - 22738483
Alignment:
Q  178 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgca 224  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  22738437 aacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgca 22738483  T

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Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 138 - 239
Target Start/End: Original strand, 7850127 - 7850228
Alignment:
Q  138 ttgagcacaattttcaaaacttatcatttttactcatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatca 237  Q
    |||||||||||||||| |||||  |||||| ||  | ||| ||||  |||| |||||||||||| ||| || |||||||| ||| ||| |||||||| ||    
T  7850127 ttgagcacaattttcataacttcacattttcacataattggacatacaattccaccaacaatcacacagttttcatcaatacattcattcaaacataaca 7850226  T
Q  238 tc 239  Q
    ||    
T  7850227 tc 7850228  T

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Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 176 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 15013365 - 15013301
Alignment:
Q  176 tgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatca 240  Q
    |||||||| ||||||||||||||  || ||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||    
T  15013365 tgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcatcaatttcatgcattc-aacatatcatca 15013301  T

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Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 176 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 18238240 - 18238175
Alignment:
Q  176 tgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaat-tcatgcatacaaacatatcatca 240  Q
    |||||||| ||||||||||||||  || ||||||||| |||| ||||| || ||||||||||||||    
T  18238240 tgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatatcatgtattcaaacatatcatca 18238175  T

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Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 176 - 236
Target Start/End: Original strand, 38764873 - 38764934
Alignment:
Q  176 tgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatc 236  Q
    |||||||||||||||||||||||  || ||||||||| ||| ||||| ||| ||||||||||    
T  38764873 tgaacatgtaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcattcattcaaacatatc 38764934  T

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Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 176 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 40905017 - 40904952
Alignment:
Q  176 tgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatca 240  Q
    |||||||| ||||||||||||||  || ||||||||| ||| |||||| || ||||||||||||||    
T  40905017 tgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcagcaatttcatgtattcaaacatatcatca 40904952  T

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Target: chr2 (Bit Score: 142; Significance: 1e-74; HSPs: 26)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 11 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 20627576 - 20627347
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgcatacctagacaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcgattaaacaagaatcaaatctcaaat 110  Q
    |||| ||||| ||||||||| |||||| |  |||| ||||||||| ||||||| ||||||||| |||||| ||| ||| ||||||||| |||||||||||    
T  20627576 catcctcaattcatgaatatccatacccaagcaatgattcatcaaccacaacaccaattaacaaccataaaatcaattgaacaagaattaaatctcaaat 20627477  T
Q  111 taacaacaacttatcaaaactcaccaattgagcacaattttcaaaacttatcatttttactcatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat 210  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20627476 taacaacaacttaacaaaattcaccaattgagcacaattttcacaagttatcatttttacatatttggacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat 20627377  T
Q  211 catcaattcatgcatacaaacatatcatca 240  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20627376 catcaattcgtgcatacaaacatatcatca 20627347  T

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Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 16 - 240
Target Start/End: Original strand, 462743 - 462967
Alignment:
Q  16 tcaatccatgaatatgcatacctagacaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcgattaaacaagaatcaaatctcaaattaaca 115  Q
    ||||| |||||||||||||||| |  |||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||| | |||||  |||||    
T  462743 tcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaatcacgacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatctaaca 462842  T
Q  116 acaacttatcaaaactcaccaattgagcacaattttcaaaacttatcatttttactcatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatca 215  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  462843 acaacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatca 462942  T
Q  216 attcatgcatacaaacatatcatca 240  Q
    ||||||||||||||| |||||||||    
T  462943 attcatgcatacaaatatatcatca 462967  T

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Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 11 - 240
Target Start/End: Original strand, 8891242 - 8891471
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgcatacctagacaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcgattaaacaagaatcaaatctcaaat 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||| |  |||| ||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||| ||| ||||||||||| | |||||      
T  8891242 catcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaatagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatc 8891341  T
Q  111 taacaacaacttatcaaaactcaccaattgagcacaattttcaaaacttatcatttttactcatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat 210  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8891342 taacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcgccaacaatcatacaattat 8891441  T
Q  211 catcaattcatgcatacaaacatatcatca 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8891442 catcaattcatgcatacaaacatattatca 8891471  T

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Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 11 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 36982704 - 36982475
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgcatacctagacaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcgattaaacaagaatcaaatctcaaat 110  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| | ||||| |||||||||  |||||||||||||||| | |||||||| ||| |||| |||||| | ||||| |    
T  36982704 catcatcaattcatgaatatgcatacccaaacaatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataacatcaattgaacaggaatcataactcaatt 36982605  T
Q  111 taacaacaacttatcaaaactcaccaattgagcacaattttcaaaacttatcatttttactcatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat 210  Q
     |||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  36982604 caacaacaacttggcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccagcaatcttacaattat 36982505  T
Q  211 catcaattcatgcatacaaacatatcatca 240  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  36982504 catcaattcatgaatacaaacatatcatca 36982475  T

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Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 11 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 19794967 - 19794738
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgcatacctagacaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcgattaaacaagaatcaaatctcaaat 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |  |||| |||||||||  | |||||||||||||    |||||||| ||| ||||||||||| | ||||| |    
T  19794967 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactataacatcaattaacggaaataacatcaattgaacaagaatcataactcaatt 19794868  T
Q  111 taacaacaacttatcaaaactcaccaattgagcacaattttcaaaacttatcatttttactcatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat 210  Q
     |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19794867 caacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat 19794768  T
Q  211 catcaattcatgcatacaaacatatcatca 240  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19794767 tatcaattcatgcatacaaacatatcatca 19794738  T

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Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 11 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 43643220 - 43642991
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgcatacctagacaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcgattaaacaagaatcaaatctcaaat 110  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |  || | |||||||||  |||||||||||||||| | ||| |||| ||| ||||||||||| |||||||||    
T  43643220 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaactacaacatcaattaacagcaatagcatcaattgaacaagaatcatatctcaaat 43643121  T
Q  111 taacaacaacttatcaaaactcaccaattgagcacaattttcaaaacttatcatttttactcatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat 210  Q
    ||| ||||||| |  |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| | |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43643120 taataacaactaagaaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttaacatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat 43643021  T
Q  211 catcaattcatgcatacaaacatatcatca 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43643020 catcaattcatgcatacaaacatatcatca 43642991  T

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Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 11 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 24341652 - 24341423
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgcatacctagacaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcgattaaacaagaatcaaatctcaaat 110  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||| |  |||| |||||||||    |||||||||||||| | |||||||| ||| |||| |||||| ||||||| |    
T  24341652 catcatcaattcatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaacaggaacatcaattaacaacaataacatcaattgaacatgaatcatatctcaatt 24341553  T
Q  111 taacaacaacttatcaaaactcaccaattgagcacaattttcaaaacttatcatttttactcatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat 210  Q
     |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||  | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24341552 caacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatataatttcaccaacaatcatacaattat 24341453  T
Q  211 catcaattcatgcatacaaacatatcatca 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24341452 catcaattcatgcatacaaacatatcatca 24341423  T

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Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 11 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 7508107 - 7507894
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgcatacctagacaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcgattaaa-caagaatcaaatctcaaa 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |  || | |||||||||  |||||||||| ||||| | |||||||| |||||| || |||||| |||||||     
T  7508107 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaataacatcaattaaaacatgaatcatatctcaa- 7508009  T
Q  110 ttaacaacaacttatcaaaactcaccaattgagcacaattttcaaaacttatcatttttactcatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 209  Q
    |||||||||||||| | ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7508008 ttaacaacaacttagccaaattcaccaattgaacacaattttcataacttattatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 7507909  T
Q  210 tcatcaattcatgca 224  Q
    |||||||||||||||    
T  7507908 tcatcaattcatgca 7507894  T

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Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 11 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 19886913 - 19886683
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgcatacctagacaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcgattaaacaagaatcaaatctcaaat 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||| || ||||| |||||| |||||||||  || ||||||||||| | |||||||    
T  19886913 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 19886814  T
Q  111 taacaacaacttatca-aaactcaccaattgagcacaattttcaaaacttatcatttttactcatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 209  Q
    |||||||||||||  | ||| |||||| || |||||||| |||| ||||||||| |||| |  || |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  19886813 taacaacaacttaggagaaattcaccactttagcacaatcttcataacttatcacttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 19886714  T
Q  210 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatca 240  Q
     |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19886713 acatcaattcatgcatacaaacataacatca 19886683  T

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Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 17396916 - 17396686
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgcatacctagacaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcgattaaacaagaatcaaatctcaaat 110  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||| |  ||||||| ||| ||||| || ||||| |||||| |||||||||  || |||||| |||| |||||||||    
T  17396916 catcaacaatccatgaatatgcaaacccaagcaattatccattaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaat 17396817  T
Q  111 taacaacaacttatca-aaactcaccaattgagcacaattttcaaaacttatcatttttactcatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 209  Q
    |||  ||||||||  | ||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  17396816 taatgacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttacttatttaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatca 17396717  T
Q  210 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcaa 241  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  17396716 tcaacaattcatgcatac-aacatatcatcaa 17396686  T

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Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 25265653 - 25265423
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgcatacctagacaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcgattaaacaagaatcaaatctcaaat 110  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |  | || |||||| ||  |||||||||||||||| | | |||||| ||| |||| |  ||  |||  || |    
T  25265653 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagccatgattcataaacaacaacatcaattaacaacaacaacatcaattgaacatggttctcatcataatt 25265554  T
Q  111 taacaacaacttatcaaaactcaccaattgagcacaattttcaaaacttatcatttttactcatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat 210  Q
     ||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25265553 caacaacaacatagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat 25265454  T
Q  211 catcaattcatgcatacaaacatatcatcaa 241  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25265453 catcaattcatgcatacaaacataacatcaa 25265423  T

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Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 142 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 19689533 - 19689434
Alignment:
Q  142 gcacaattttcaaaacttatcatttttactcatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcaa 241  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||| ||  |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19689533 gcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaa 19689434  T

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Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 142 - 241
Target Start/End: Original strand, 23820202 - 23820301
Alignment:
Q  142 gcacaattttcaaaacttatcatttttactcatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcaa 241  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||| ||  |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23820202 gcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaa 23820301  T

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Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 142 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 14906572 - 14906473
Alignment:
Q  142 gcacaattttcaaaacttatcatttttactcatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcaa 241  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||| ||  |||  |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14906572 gcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaa 14906473  T

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Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 142 - 241
Target Start/End: Original strand, 20015142 - 20015241
Alignment:
Q  142 gcacaattttcaaaacttatcatttttactcatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcaa 241  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||| ||  |||  |||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20015142 gcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcacacaattattatcaattcatgcatgcaaacatatcatcaa 20015241  T

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Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 174 - 240
Target Start/End: Original strand, 24884848 - 24884915
Alignment:
Q  174 tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaatt-catgcatacaaacatatcatca 240  Q
    |||||||||| ||||||||||||||  || ||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  24884848 tttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaattccatgcattcaaacatatcatca 24884915  T

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Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 176 - 240
Target Start/End: Original strand, 19660044 - 19660109
Alignment:
Q  176 tgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatca 240  Q
    |||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| ||| |||||| |||| ||||||||||||    
T  19660044 tgaacatgcaatttcaccaacaataattcaattatcaccaatttcatgtatacgaacatatcatca 19660109  T

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Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 177 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 19669191 - 19669130
Alignment:
Q  177 gaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatca 237  Q
    ||||||| ||||||||||||||  |  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19669191 gaacatgcaatttcaccaacaacaactcaattatcatcaatttcatgcatacaaacatatca 19669130  T

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Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 174 - 240
Target Start/End: Original strand, 68154 - 68221
Alignment:
Q  174 tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatca 240  Q
    |||||||||| ||||||||||||||  || ||||||||| ||| ||||||||| |||||||| |||||    
T  68154 tttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatca 68221  T

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Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 178 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 3798691 - 3798645
Alignment:
Q  178 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgca 224  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  3798691 aacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgca 3798645  T

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Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 178 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 12635956 - 12635910
Alignment:
Q  178 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgca 224  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  12635956 aacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgca 12635910  T

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Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 178 - 224
Target Start/End: Original strand, 12728560 - 12728606
Alignment:
Q  178 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgca 224  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  12728560 aacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgca 12728606  T

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Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 178 - 224
Target Start/End: Original strand, 34824643 - 34824689
Alignment:
Q  178 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgca 224  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  34824643 aacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgca 34824689  T

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Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 176 - 240
Target Start/End: Original strand, 9636909 - 9636974
Alignment:
Q  176 tgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatca 240  Q
    |||||||| ||||||||||||||  || ||||||||| ||| |||||| || ||||||||||||||    
T  9636909 tgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtattcaaacatatcatca 9636974  T

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Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 178 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 23778133 - 23778085
Alignment:
Q  178 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcata 226  Q
    |||||||||||||| | |||| ||||| || ||||||||||||||||||    
T  23778133 aacatgtaatttcatccacaaacataccataatcatcaattcatgcata 23778085  T

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Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 178 - 237
Target Start/End: Original strand, 43646059 - 43646119
Alignment:
Q  178 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatca 237  Q
    |||||| ||||||||||||||  || ||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||    
T  43646059 aacatgaaatttcaccaacaacaatccaattatcaacaacttcatgcattcaaacatatca 43646119  T

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Target: scaffold0369 (Bit Score: 139; Significance: 7e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0369
Description:

Target: scaffold0369; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 11 - 224
Target Start/End: Original strand, 3722 - 3936
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgcatacctagacaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcgattaaacaagaatcaaatctcaaat 110  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |   |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  3722 catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagtaattattcatcaatcataacatcaattaacattcataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat 3821  T
Q  111 taacaacaacttatcaaaactcaccaattgagcacaattttcaaaacttatca-tttttactcatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 209  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||| || ||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3822 taacaacaacttagcaaaattcaccaattggacacaatttccataacttatcattttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 3921  T
Q  210 tcatcaattcatgca 224  Q
    |||||||||||||||    
T  3922 tcatcaattcatgca 3936  T

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Target: scaffold0218 (Bit Score: 134; Significance: 7e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 11 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 5324 - 5099
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgcatacctagacaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcgattaaacaagaatcaaatctcaaat 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||| |  |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||| | ||||       
T  5324 catcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaatcacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcattc 5225  T
Q  111 taacaacaacttatcaaaactcaccaattgagcacaattttcaaaacttatcatttttactcatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat 210  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  5224 taacaacaactttgcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtactttcaccaacaatcttacaattat 5125  T
Q  211 catcaattcatgcatacaaacatatc 236  Q
    |||||||||| |||||||||||||||    
T  5124 catcaattcacgcatacaaacatatc 5099  T

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Target: scaffold0162 (Bit Score: 131; Significance: 4e-68; HSPs: 2)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 26678 - 26448
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgcatacctagacaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcgattaaacaagaatcaaatctcaaat 110  Q
    |||| ||||| ||| |||||||||||| |  |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||| | ||||       
T  26678 catcctcaattcatcaatatgcatacccaagcaatgattcatcaatcacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcattc 26579  T
Q  111 taacaacaacttatcaaaactcaccaattgagcacaattttcaaaacttatcatttttactcatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat 210  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||    
T  26578 taacaacaacttagcaaaattcaccaattgagaacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtactttcaccaataatcttacaattat 26479  T
Q  211 catcaattcatgcatacaaacatatcatcaa 241  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26478 catcaattcacgcatacaaacatatcatcaa 26448  T

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Target: scaffold0162; HSP #2
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 114 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 8340 - 8214
Alignment:
Q  114 caacaacttatcaaaactcaccaattgagcacaattttcaaaacttatcatttttactcatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcat 213  Q
    ||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||  | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  8340 caacaacatagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacctgtaatttcaccaacaatcatacaattatcac 8241  T
Q  214 caattcatgcatacaaacatatcatca 240  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||    
T  8240 caattcatgcatacaaacataacatca 8214  T

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Target: scaffold0139 (Bit Score: 130; Significance: 2e-67; HSPs: 2)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 11 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 21367 - 21138
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgcatacctagacaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcgattaaacaagaatcaaatctcaaat 110  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||  |  ||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  21367 catcattaatccatgaatatgcaaactcaagcaattattcatcaatcataacatcaaataacattcataacatcaattgaacaagaatccaatctcaaat 21268  T
Q  111 taacaacaacttatcaaaactcaccaattgagcacaattttcaaaacttatcatttttactcatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat 210  Q
    |||||||||||||  |||| ||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  21267 taacaacaacttaggaaaattcaccaattgagctcaatcttcataacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcactaacaatcatataattat 21168  T
Q  211 catcaattcatgcatacaaacatatcatca 240  Q
    |||||||| ||| ||||||||||| |||||    
T  21167 catcaattaatggatacaaacataacatca 21138  T

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Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 11 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 14312 - 14083
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgcatacctagacaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcgattaaacaagaatcaaatctcaaat 110  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||  |  ||||||||||||||||| ||||||||  ||||| ||||||||  ||| |||||||||| ||||||||||    
T  14312 catcatcaatccatgaatatgcaaactcaagcaattattcatcaatcataacatcaaacaacattcataacattaattgaacaagaatccaatctcaaat 14213  T
Q  111 taacaacaacttatcaaaactcaccaattgagcacaattttcaaaacttatcatttttactcatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat 210  Q
    || ||||||||||  |||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  14212 tatcaacaacttaggaaaattcaccaattgagcacaatcttcataacttatcatttttacatatttcaacatgtaatttcactaacaatcatataattat 14113  T
Q  211 catcaattcatgcatacaaacatatcatca 240  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  14112 catcaattcatgcatacagacataacatca 14083  T

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Target: scaffold0077 (Bit Score: 130; Significance: 2e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 11 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 37176 - 36947
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgcatacctagacaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcgattaaacaagaatcaaatctcaaat 110  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |  |||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| || ||| ||||||| ||| | |||||      
T  37176 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacgtcaattgaacaagattcataactcaatc 37077  T
Q  111 taacaacaacttatcaaaactcaccaattgagcacaattttcaaaacttatcatttttactcatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat 210  Q
     ||| |||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  37076 caaccacaacttagcaaaattcaccaatttagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaagcttacaattat 36977  T
Q  211 catcaattcatgcatacaaacatatcatca 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36976 catcaattcatgcatacaaacatatcatca 36947  T

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Target: scaffold0001 (Bit Score: 127; Significance: 1e-65; HSPs: 2)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 22 - 240
Target Start/End: Original strand, 171916 - 172134
Alignment:
Q  22 catgaatatgcatacctagacaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcgattaaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaact 121  Q
    ||||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||  | ||||| | ||| ||||||    
T  171916 catgaatatgcatacctaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcgtaactcaattcaaccacaact 172015  T
Q  122 tatcaaaactcaccaattgagcacaattttcaaaacttatcatttttactcatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcat 221  Q
    || ||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| | |  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  172016 tagcaaaattcaccaatttagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccatcaatcatacaattatcatcaattcat 172115  T
Q  222 gcatacaaacatatcatca 240  Q
     ||||||||||||||||||    
T  172116 ccatacaaacatatcatca 172134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 22 - 240
Target Start/End: Original strand, 177619 - 177837
Alignment:
Q  22 catgaatatgcatacctagacaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcgattaaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaact 121  Q
    ||||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||  | ||||| | ||| ||||||    
T  177619 catgaatatgcatacctaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcgtaactcaattcaaccacaact 177718  T
Q  122 tatcaaaactcaccaattgagcacaattttcaaaacttatcatttttactcatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcat 221  Q
    || ||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| | |  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  177719 tagcaaaattcaccaatttagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccatcaatcatacaattatcatcaattcat 177818  T
Q  222 gcatacaaacatatcatca 240  Q
     ||||||||||||||||||    
T  177819 ccatacaaacatatcatca 177837  T

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Target: scaffold0076 (Bit Score: 126; Significance: 4e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 11 - 239
Target Start/End: Original strand, 42997 - 43226
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgcatacctagacaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcgattaaacaagaatcaaatctcaaat 110  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||| || ||||| |||||| |||||||||  || |||| |||||| |||||||||    
T  42997 catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcacttgaacacgaatcacatctcaaat 43096  T
Q  111 taacaacaacttatca-aaactcaccaattgagcacaattttcaaaacttatcatttttactcatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 209  Q
    |||||||||||||  | ||| ||||||||| |||||||| |||| |||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43097 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 43196  T
Q  210 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatc 239  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  43197 tcatcaattcatgcatagaaacataacatc 43226  T

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Target: scaffold1542 (Bit Score: 122; Significance: 1e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold1542
Description:

Target: scaffold1542; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 11 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 797 - 568
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgcatacctagacaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcgattaaacaagaatcaaatctcaaat 110  Q
    |||| ||||| | |||||||||||||| |  |||| ||||||||| |||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||| | || ||      
T  797 catcctcaattcctgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattagcagccataacatcaattaaacaagaatcataacttaatc 698  T
Q  111 taacaacaacttatcaaaactcaccaattgagcacaattttcaaaacttatcatttttactcatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat 210  Q
    |||||  |||||| ||||| |||||||||||| |||||||||| |||| ||||||| | |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  697 taacagtaacttagcaaaattcaccaattgagtacaattttcacaactcatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat 598  T
Q  211 catcaattcatgcatacaaacatatcatca 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  597 catcaattcatgcatacaaacatatcatca 568  T

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Target: scaffold0012 (Bit Score: 121; Significance: 4e-62; HSPs: 2)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 22 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 247694 - 247478
Alignment:
Q  22 catgaatatgcatacctagacaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcgattaaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaact 121  Q
    |||||||||||||||| |  |||| ||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||| ||| ||||||||||| | |||||  |||||||||||    
T  247694 catgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagtcataacatcaattgaacaagaatcataactcaatctaacaacaact 247595  T
Q  122 tatcaaaactcaccaattgagcacaattttcaaaacttatcatttttactcatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcat 221  Q
    || ||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |  ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  247594 tagcaaaatttaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgaaatttcaccctcaatcatacaattatcatcaattcat 247495  T
Q  222 gcatacaaacatatcat 238  Q
    |||||||||||||||||    
T  247494 gcatacaaacatatcat 247478  T

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Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 178 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 34246 - 34200
Alignment:
Q  178 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgca 224  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  34246 aacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgca 34200  T

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Target: scaffold0106 (Bit Score: 118; Significance: 2e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 15 - 240
Target Start/End: Original strand, 41733 - 41958
Alignment:
Q  15 atcaatccatgaatatgcatacctagacaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcgattaaacaagaatcaaatctcaaattaac 114  Q
    |||||| |||||||||||||||| |  |||| ||||||||   |||||| ||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||||| | |||||  ||||    
T  41733 atcaattcatgaatatgcatacccaaccaatgattcatcatctacaacaacaattaacagccatagcatcaattgaacaagaatcataactcaatctaac 41832  T
Q  115 aacaacttatcaaaactcaccaattgagcacaattttcaaaacttatcatttttactcatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatc 214  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||   ||||||||||||    
T  41833 aacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaaattatcatttttacatatttgagcatgtaatttcaccaacaatatgacaattatcatc 41932  T
Q  215 aattcatgcatacaaacatatcatca 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  41933 aattcatgcatacaaacatatcatca 41958  T

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Target: scaffold0116 (Bit Score: 115; Significance: 2e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 11 - 240
Target Start/End: Original strand, 35 - 265
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgcatacctagacaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcgattaaacaagaatcaaatctcaaat 110  Q
    ||||| |||| |||||||||||| ||| |  ||||||||||| ||||| || ||||| |||||| |||||||||  || |||||| |||| |||||||||    
T  35 catcaacaattcatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaat 134  T
Q  111 taacaacaacttatca-aaactcaccaattgagcacaattttcaaaacttatcatttttactcatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 209  Q
    |||||||||||||  | ||| |||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  135 taacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatatacataacttatcatttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatca 234  T
Q  210 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatca 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  235 tcatcaattcatgcatacaaacataacatca 265  T

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Target: scaffold0075 (Bit Score: 115; Significance: 2e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 11 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 34724 - 34494
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgcatacctagacaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcgattaaa-caagaatcaaatctcaaa 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |   | | |||||||||  |||||||||| ||||| | |||||||| |||||| || |||||| |||||||     
T  34724 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagtagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaataacatcaattaaaacatgaatcatatctcaat 34625  T
Q  110 ttaacaacaacttatcaaaactcaccaattgagcacaattttcaaaacttatcatttttactcatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 209  Q
    | |||||||||||| ||||| ||||| |||||| |||||||||| |||||   |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34624 tcaacaacaacttagcaaaattcacctattgagaacaattttcacaacttcatatttttacacaattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 34525  T
Q  210 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatca 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  34524 tcatcaattcatgcatacaaacataacatca 34494  T

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Target: scaffold0529 (Bit Score: 111; Significance: 4e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0529
Description:

Target: scaffold0529; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 15 - 240
Target Start/End: Original strand, 2966 - 3192
Alignment:
Q  15 atcaatccatgaatatgcatacctagacaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcgattaaa-caagaatcaaatctcaaattaa 113  Q
    |||||| |||||||||||||||  |  || | |||||||||  |||||||||| ||||| | |||||||| |||||| || |||||| ||||||| | ||    
T  2966 atcaattcatgaatatgcatacacaagcagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaataacatcaattaaaacatgaatcatatctcaattcaa 3065  T
Q  114 caacaacttatcaaaactcaccaattgagcacaattttcaaaacttatcatttttactcatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcat 213  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3066 caacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcat 3165  T
Q  214 caattcatgcatacaaacatatcatca 240  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||    
T  3166 caattcatggatacaaacataacatca 3192  T

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Target: scaffold0009 (Bit Score: 110; Significance: 1e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 17 - 238
Target Start/End: Original strand, 272031 - 272252
Alignment:
Q  17 caatccatgaatatgcatacctagacaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcgattaaacaagaatcaaatctcaaattaacaa 116  Q
    |||| |||||||||||||||| |  |||| ||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| | ||| ||||||||||| | |||||   ||| |    
T  272031 caattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagctataacaccaattgaacaagaatcataactcaatccaacca 272130  T
Q  117 caacttatcaaaactcaccaattgagcacaattttcaaaacttatcatttttactcatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa 216  Q
    ||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| | |  |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  272131 caacttagcaaaattcaccaatttagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttctccatcaatcatacaattatcatcaa 272230  T
Q  217 ttcatgcatacaaacatatcat 238  Q
    ||||| ||||||||||||||||    
T  272231 ttcattcatacaaacatatcat 272252  T

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Target: scaffold0772 (Bit Score: 105; Significance: 1e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0772
Description:

Target: scaffold0772; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 42 - 241
Target Start/End: Original strand, 5559 - 5759
Alignment:
Q  42 caattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcgattaaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaacttatca-aaactcaccaattg 140  Q
    ||||||||||| ||||| |  ||||| |||||| |||||||||  || |||||| |||| ||||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||    
T  5559 caattattcattaatcatattatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaattaacaacaacttaggagaaattcaccaattg 5658  T
Q  141 agcacaattttcaaaacttatcatttttactcatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatca 240  Q
    |||||||| ||||  |||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  5659 agcacaatattcatgacttatcatttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatcatcatcaattcatgcatacaaacataacatca 5758  T
Q  241 a 241  Q
    |    
T  5759 a 5759  T

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Target: scaffold0420 (Bit Score: 102; Significance: 9e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 107 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 13480 - 13347
Alignment:
Q  107 aaattaacaacaacttatcaaaactcaccaattgagcacaattttcaaaacttatcatttttactcatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaa 206  Q
    |||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13480 aaattaacaataacttagcaaaattcaccaattgagcaccattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaa 13381  T
Q  207 ttatcatcaattcatgcatacaaacatatcatca 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13380 ttatcatcaattcatgcatacaaacataacatca 13347  T

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Target: scaffold0125 (Bit Score: 98; Significance: 2e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 11 - 240
Target Start/End: Original strand, 41648 - 41877
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgcatacctagacaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcgattaaacaagaatcaaatctcaaat 110  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |  |||| |||||||||  ||||||||| |||||| | | |||||| ||| |||| |  ||  |||  || |    
T  41648 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcatttaacaacaacaacatcaattgaacatggttctcatcataatt 41747  T
Q  111 taacaacaacttatcaaaactcaccaattgagcacaattttcaaaacttatcatttttactcatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat 210  Q
     ||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||  |||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41748 caacaacaacatagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat 41847  T
Q  211 catcaattcatgcatacaaacatatcatca 240  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  41848 catcaattcatgcatacaaacataacatca 41877  T

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Target: scaffold0132 (Bit Score: 91; Significance: 3e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Original strand, 13506 - 13736
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgcatacctagacaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcgattaaacaagaatcaaatctcaaat 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||| |    || |||||||||  |||||||||||||||| | | |||||| ||| |||| |  ||  |||  || |    
T  13506 catcgtcaattcatgaatatgcatacccaagtcatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaacaacatcaattgaacatggttctcatcataatt 13605  T
Q  111 taacaacaacttatcaaaactcaccaattgagcacaattttcaaaacttatcatttttactcatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat 210  Q
     ||||||||| || ||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||  |||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13606 caacaacaacatagcaaaattcatcaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat 13705  T
Q  211 catcaattcatgcatacaaacatatcatcaa 241  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13706 catcaattcatgcatacaaacataacatcaa 13736  T

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Target: scaffold0018 (Bit Score: 90; Significance: 1e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 131 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 51325 - 51216
Alignment:
Q  131 tcaccaattgagcacaattttcaaaacttatcatttttactcatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaa 230  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  51325 tcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaattcatgcatacaaa 51226  T
Q  231 catatcatca 240  Q
     |||||||||    
T  51225 tatatcatca 51216  T

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Target: scaffold0028 (Bit Score: 83; Significance: 2e-39; HSPs: 2)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 110 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 89618 - 89488
Alignment:
Q  110 ttaacaacaacttatcaaaactcaccaattgagcacaattttcaaaacttatcatttttactcatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 209  Q
    |||||||||||  | || || ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| | |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  89618 ttaacaacaacaaagcataattcaccaattgagcacaattttcacaacttataatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 89519  T
Q  210 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatca 240  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  89518 tcatcaattcatgcatacaaatatatcatca 89488  T

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Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 177 - 240
Target Start/End: Original strand, 79704 - 79768
Alignment:
Q  177 gaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaatt-catgcatacaaacatatcatca 240  Q
    ||||||| |||||||||| |||  |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  79704 gaacatgcaatttcaccaccaacaactcaattatcatcaatttcatgcatacaaacatatcatca 79768  T

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Target: scaffold0078 (Bit Score: 79; Significance: 5e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 37328 - 37099
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgcatacctagacaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcgattaaacaagaatcaaatctcaaat 110  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |  |||| |||||||||  |||||||| |||| |||| | |||||| |||  |||||||||| | |||||      
T  37328 catcatcaatccatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatc 37229  T
Q  111 taacaacaacttatcaaaactcaccaattgagcacaattttcaaaacttatcatttttactcatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat 210  Q
     ||| ||||| | |||||  ||| | |||  |||||||||||| ||||| ||||||| ||  |||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  37228 caactacaacatgtcaaat-tcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattat 37130  T
Q  211 catcaattcatgcatacaaacatatcatcaa 241  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37129 tatcaattcatgcatacaaacatatcatcaa 37099  T

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Target: scaffold0104 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 11 - 117
Target Start/End: Original strand, 48514 - 48620
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgcatacctagacaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcgattaaacaagaatcaaatctcaaat 110  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||    
T  48514 catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataacatcaattaacatccataacatcaagtgaacaagaatcaaatctcaaat 48613  T
Q  111 taacaac 117  Q
    |||||||    
T  48614 taacaac 48620  T

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Target: scaffold1711 (Bit Score: 74; Significance: 5e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold1711
Description:

Target: scaffold1711; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 131 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 1435 - 1326
Alignment:
Q  131 tcaccaattgagcacaattttcaaaacttatcatttttactcatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaa 230  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |  || ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  1435 tcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacatcaattcatgcatacaaa 1336  T
Q  231 catatcatca 240  Q
    |||| |||||    
T  1335 cataacatca 1326  T

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Target: scaffold0141 (Bit Score: 64; Significance: 4e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 142 - 241
Target Start/End: Original strand, 22671 - 22770
Alignment:
Q  142 gcacaattttcaaaacttatcatttttactcatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcaa 241  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||| ||  |||  |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22671 gcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaa 22770  T

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Target: scaffold0141; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 142 - 241
Target Start/End: Original strand, 26926 - 27025
Alignment:
Q  142 gcacaattttcaaaacttatcatttttactcatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcaa 241  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||| ||  |||  |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26926 gcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaa 27025  T

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Target: scaffold0124 (Bit Score: 64; Significance: 4e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 142 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 1714 - 1615
Alignment:
Q  142 gcacaattttcaaaacttatcatttttactcatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcaa 241  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||| ||  |||  |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1714 gcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaa 1615  T

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Target: scaffold1560 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold1560
Description:

Target: scaffold1560; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 11 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 115 - 9
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgcatacctagacaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcgattaaacaagaatcaaatctcaaat 110  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||  || |||||||||||||| ||||||    
T  115 catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataacatcaattaacattcataatatcatttgaacaagaatcaaatatcaaat 16  T
Q  111 taacaac 117  Q
    |||||||    
T  15 taacaac 9  T

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Target: scaffold0066 (Bit Score: 57; Significance: 6e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 90 - 224
Target Start/End: Original strand, 45109 - 45244
Alignment:
Q  90 aacaagaatcaaatctcaaattaacaacaacttatcaaaactcaccaattgagcacaattttcaaaacttatcatttttac-tcatttg-aacatgtaat 187  Q
    |||| |||||| ||||||  | ||||||||| |||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||  ||||| ||| |  |||| ||||||||||    
T  45109 aacatgaatcacatctcatttcaacaacaacatatcaaaattcaccaattgagtacaa-tttcaaaacttgacatttatacatactttgaaacatgtaat 45207  T
Q  188 ttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgca 224  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45208 ttcacccacaatcatacaattatcatcaattcatgca 45244  T

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Target: scaffold0066; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 90 - 224
Target Start/End: Original strand, 54495 - 54630
Alignment:
Q  90 aacaagaatcaaatctcaaattaacaacaacttatcaaaactcaccaattgagcacaattttcaaaacttatcatttttactca-tttgaa-catgtaat 187  Q
    |||| |||||| ||||||  | ||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||| || |||||  ||||| |||  | |||||| |||| |||    
T  54495 aacatgaatcacatctcatttcaacaacaacatatcaaaattcaccaattgagtacaattt-cataacttgacatttatacatactttgaaacatgcaat 54593  T
Q  188 ttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgca 224  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54594 ttcacccacaatcatacaattatcatcaattcatgca 54630  T

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Target: scaffold0622 (Bit Score: 54; Significance: 4e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0622
Description:

Target: scaffold0622; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 11 - 100
Target Start/End: Original strand, 9382 - 9471
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgcatacctagacaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcgattaaacaagaatca 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |  |||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||    
T  9382 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatca 9471  T

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Target: scaffold0361 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0361
Description:

Target: scaffold0361; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 181 - 240
Target Start/End: Original strand, 3360 - 3419
Alignment:
Q  181 atgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatca 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| || |||||    
T  3360 atgtaatttcaccaacaatcatacaaatatcattaattcatgcatacaaacttaacatca 3419  T

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Target: scaffold0361; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 13 - 69
Target Start/End: Original strand, 3210 - 3266
Alignment:
Q  13 tcatcaatccatgaatatgcatacctagacaattattcatcaatcacaacatcaatt 69  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| | ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3210 tcatcaattcatgaatatgcctacccaaacaatgattcatcaatcacaacatcaatt 3266  T

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Target: scaffold0123 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 174 - 240
Target Start/End: Original strand, 8172 - 8239
Alignment:
Q  174 tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatca 240  Q
    |||||||||| || |||||||||||  || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8172 tttgaacatgcaaattcaccaacaacaattcaattatcatcaatttcatgcatacaaacatatcatca 8239  T

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Target: scaffold0084 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 112 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 56262 - 56149
Alignment:
Q  112 aacaacaacttatcaaaactcaccaattgagcacaattttcaaaacttatcatttttactcatttgaa--catgtaatttcaccaacaatcatacaatta 209  Q
    |||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| || |||||  ||||| |||  | || ||  |||||||||||| | |||||||||||||||    
T  56262 aacaacaacttagcaaaattcaccatttgagcacaattt-cataacttgacatttatacatactttaaaacatgtaatttcagccacaatcatacaatta 56164  T
Q  210 tcatcaattcatgca 224  Q
    ||||||| |||||||    
T  56163 tcatcaaatcatgca 56149  T

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Target: scaffold0892 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0892
Description:

Target: scaffold0892; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 174 - 222
Target Start/End: Original strand, 3577 - 3625
Alignment:
Q  174 tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatg 222  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||    
T  3577 tttgaacatgtaatttcacccacaatcataccataatcatcaattcatg 3625  T

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Target: scaffold0700 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0700
Description:

Target: scaffold0700; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 174 - 240
Target Start/End: Original strand, 2687 - 2754
Alignment:
Q  174 tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatca 240  Q
    |||||||||| ||||||||||||||  || ||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  2687 tttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcatccaaacatatcatca 2754  T

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Target: scaffold0483 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0483
Description:

Target: scaffold0483; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 174 - 240
Target Start/End: Original strand, 6823 - 6890
Alignment:
Q  174 tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatca 240  Q
    |||||||||| ||||||||||||||  || ||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  6823 tttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacatatcatca 6890  T

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Target: scaffold0151 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0151
Description:

Target: scaffold0151; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 174 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 22507 - 22440
Alignment:
Q  174 tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaatt-catgcatacaaacatatcatca 240  Q
    |||||||||| || |||||||||||  ||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22507 tttgaacatgcaaattcaccaacaacaattaaattatcatcaatttcatgcatacaaacatatcatca 22440  T

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Target: scaffold0053 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 174 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 76932 - 76865
Alignment:
Q  174 tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatca 240  Q
    |||||||||| ||||||||||||||  || ||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  76932 tttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaatttcatgcattcaaacatatcatca 76865  T

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Target: scaffold0138 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 174 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 22514 - 22452
Alignment:
Q  174 tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatat 235  Q
    |||||||||| || |||||||||||  || ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22514 tttgaacatgcaaattcaccaacaacaattcaattatcatcaatttcatgcatacaaacatat 22452  T

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Target: scaffold0017 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 174 - 224
Target Start/End: Original strand, 54038 - 54088
Alignment:
Q  174 tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgca 224  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  54038 tttgaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgca 54088  T

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Target: scaffold1272 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold1272
Description:

Target: scaffold1272; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 174 - 240
Target Start/End: Original strand, 456 - 523
Alignment:
Q  174 tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatca 240  Q
    |||||||||| ||||||||||||||  ||| |||||||| ||| ||||||||| |||||||| |||||    
T  456 tttgaacatgaaatttcaccaacaacaatataattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatca 523  T

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Target: scaffold0409 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 2)
Name: scaffold0409
Description:

Target: scaffold0409; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 174 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 1433 - 1366
Alignment:
Q  174 tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattc-atgcatacaaacatatcatca 240  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||  || ||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||    
T  1433 tttgaccatgcaatttcaccaacaacaatccaattatcaccaattttatgcatacaaacatatcatca 1366  T

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Target: scaffold0409; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 174 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 9688 - 9621
Alignment:
Q  174 tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattc-atgcatacaaacatatcatca 240  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||  || ||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||    
T  9688 tttgaccatgcaatttcaccaacaacaatccaattatcaccaattttatgcatacaaacatatcatca 9621  T

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Target: scaffold0243 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 174 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 2401 - 2334
Alignment:
Q  174 tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatca 240  Q
    |||||||||| ||||||||||||||  || ||||||||| ||| ||||||||| |||||||| |||||    
T  2401 tttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatca 2334  T

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Target: scaffold0150 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0150
Description:

Target: scaffold0150; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 174 - 240
Target Start/End: Original strand, 28698 - 28765
Alignment:
Q  174 tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatca 240  Q
    ||||||||| |||||||||||||||  || || |||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  28698 tttgaacatataatttcaccaacaacaattcagttatcaacaagttcatgcattcaaacatatcatca 28765  T

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Target: scaffold0080 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 174 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 43883 - 43816
Alignment:
Q  174 tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatca 240  Q
    |||||||||| ||||||||||||||  || ||||||||| ||| ||||||||| |||||||| |||||    
T  43883 tttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatagcatca 43816  T

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Target: scaffold0058 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 174 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 70391 - 70325
Alignment:
Q  174 tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaatt-catgcatacaaacatatcatca 240  Q
    |||||||||| || ||||| |||||| ||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  70391 tttgaacatgcaaattcac-aacaataattgaattatcatcaatttcatgcatacaaacatatcatca 70325  T

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Target: scaffold0032 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 174 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 104708 - 104641
Alignment:
Q  174 tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattca-tgcatacaaacatatcatca 240  Q
    ||||||| || || |||||||||||  || ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  104708 tttgaacctgcaaattcaccaacaacaattcaattatcatcaatttaatgcatacaaacatatcatca 104641  T

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Target: scaffold1666 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1666
Description:

Target: scaffold1666; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 178 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 84 - 38
Alignment:
Q  178 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgca 224  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  84 aacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgca 38  T

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Target: scaffold0761 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 178 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 1663 - 1617
Alignment:
Q  178 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgca 224  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  1663 aacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgca 1617  T

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Target: scaffold0467 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0467
Description:

Target: scaffold0467; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 178 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 10427 - 10381
Alignment:
Q  178 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgca 224  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  10427 aacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgca 10381  T

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Target: scaffold0193 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 176 - 237
Target Start/End: Original strand, 4769 - 4831
Alignment:
Q  176 tgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatca 237  Q
    |||||||| ||||||||||||||  || ||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||    
T  4769 tgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatca 4831  T

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Target: scaffold0598 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0598
Description:

Target: scaffold0598; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 176 - 240
Target Start/End: Original strand, 3415 - 3480
Alignment:
Q  176 tgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatca 240  Q
    |||||||| ||||||||||||||  || ||||||||| ||| |||||| || ||||||||||||||    
T  3415 tgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtattcaaacatatcatca 3480  T

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Target: scaffold0389 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0389
Description:

Target: scaffold0389; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 204 - 240
Target Start/End: Original strand, 10854 - 10891
Alignment:
Q  204 caattatcatcaatt-catgcatacaaacatatcatca 240  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10854 caattatcatcaatttcatgcatacaaacatatcatca 10891  T

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Target: scaffold0387 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0387
Description:

Target: scaffold0387; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 176 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 1045 - 980
Alignment:
Q  176 tgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatca 240  Q
    |||||||| ||||||||||||||  || ||||||||| ||| |||||| || ||||||||||||||    
T  1045 tgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtattcaaacatatcatca 980  T

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Target: scaffold0010 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 176 - 240
Target Start/End: Original strand, 31184 - 31249
Alignment:
Q  176 tgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatca 240  Q
    |||||||| ||||||||||||||  || ||||||||| ||| ||||||||| |||| |||||||||    
T  31184 tgaacatgcaatttcaccaacaacaatccaattatcaccaatttcatgcattcaaatatatcatca 31249  T

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Target: scaffold0004 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 176 - 240
Target Start/End: Original strand, 27661 - 27726
Alignment:
Q  176 tgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatca 240  Q
    |||||||| ||||||||||||||  || ||||||||| ||| |||||| || ||||||||||||||    
T  27661 tgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtattcaaacatatcatca 27726  T

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