View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF17747_low_10 (Length: 239)

Name: NF17747_low_10
Description: NF17747
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF17747_low_10
NF17747_low_10
[»] scaffold0621 (2 HSPs)
scaffold0621 (1-235)||(6564-6798)
scaffold0621 (1-239)||(8495-8737)
[»] chr1 (42 HSPs)
chr1 (1-239)||(22921722-22921961)
chr1 (1-239)||(33681036-33681275)
chr1 (1-239)||(22237656-22237896)
chr1 (1-239)||(52927835-52928062)
chr1 (1-239)||(21861422-21861662)
chr1 (1-239)||(21754074-21754303)
chr1 (1-239)||(21896111-21896348)
chr1 (1-235)||(20248308-20248539)
chr1 (80-239)||(35981541-35981700)
chr1 (80-239)||(49261448-49261607)
chr1 (53-239)||(50686694-50686881)
chr1 (1-239)||(16368139-16368378)
chr1 (80-236)||(20636957-20637113)
chr1 (1-233)||(20918633-20918863)
chr1 (1-239)||(50613969-50614209)
chr1 (1-239)||(50621797-50622037)
chr1 (1-139)||(14295507-14295643)
chr1 (1-236)||(41049891-41050128)
chr1 (1-150)||(21161745-21161892)
chr1 (1-161)||(16758678-16758841)
chr1 (1-85)||(35261086-35261170)
chr1 (1-132)||(45574846-45574979)
chr1 (169-239)||(12271744-12271815)
chr1 (24-139)||(22130863-22130976)
chr1 (1-94)||(50210212-50210305)
chr1 (40-139)||(51130632-51130729)
chr1 (1-132)||(13988892-13989024)
chr1 (1-132)||(21475091-21475223)
chr1 (1-132)||(21923295-21923427)
chr1 (1-91)||(34509809-34509899)
chr1 (1-150)||(16093825-16093977)
chr1 (1-98)||(21026709-21026806)
chr1 (1-94)||(21840793-21840885)
chr1 (1-98)||(22532298-22532395)
chr1 (1-98)||(27250724-27250821)
chr1 (1-132)||(23593739-23593871)
chr1 (1-132)||(29298163-29298294)
chr1 (1-48)||(38801433-38801480)
chr1 (1-132)||(433038-433168)
chr1 (1-132)||(26064967-26065100)
chr1 (1-43)||(20847205-20847246)
chr1 (1-37)||(20454610-20454645)
[»] scaffold0102 (1 HSPs)
scaffold0102 (1-235)||(19293-19528)
[»] scaffold0278 (1 HSPs)
scaffold0278 (1-235)||(5672-5906)
[»] scaffold0023 (8 HSPs)
scaffold0023 (1-239)||(40027-40266)
scaffold0023 (1-239)||(100403-100642)
scaffold0023 (180-239)||(101602-101661)
scaffold0023 (1-132)||(94437-94569)
scaffold0023 (1-132)||(44480-44613)
scaffold0023 (1-45)||(119904-119948)
scaffold0023 (1-132)||(17444-17576)
scaffold0023 (2-49)||(101529-101576)
[»] chr7 (61 HSPs)
chr7 (1-235)||(67774-68008)
chr7 (1-235)||(18005675-18005910)
chr7 (1-239)||(44014207-44014440)
chr7 (1-235)||(16219574-16219809)
chr7 (1-238)||(47831836-47832074)
chr7 (4-239)||(16056360-16056595)
chr7 (1-235)||(810988-811223)
chr7 (3-239)||(22072944-22073183)
chr7 (1-239)||(15754742-15754979)
chr7 (1-237)||(34200815-34201049)
chr7 (1-238)||(12901352-12901595)
chr7 (1-237)||(28505156-28505390)
chr7 (80-239)||(9389550-9389709)
chr7 (1-237)||(11995885-11996119)
chr7 (1-139)||(16495431-16495567)
chr7 (141-236)||(16324175-16324270)
chr7 (1-239)||(20220042-20220280)
chr7 (1-95)||(12255789-12255885)
chr7 (1-149)||(2280061-2280211)
chr7 (57-239)||(15113028-15113211)
chr7 (1-132)||(13647354-13647487)
chr7 (1-162)||(1867924-1868087)
chr7 (1-98)||(38227510-38227606)
chr7 (57-239)||(15116565-15116748)
chr7 (1-158)||(14044775-14044935)
chr7 (1-158)||(14354805-14354965)
chr7 (1-149)||(19486686-19486836)
chr7 (1-98)||(10063813-10063910)
chr7 (1-98)||(18456408-18456504)
chr7 (1-132)||(18430738-18430870)
chr7 (1-94)||(3564363-3564456)
chr7 (1-98)||(26212025-26212122)
chr7 (1-98)||(12698860-12698958)
chr7 (1-149)||(15008441-15008591)
chr7 (1-132)||(456347-456479)
chr7 (1-132)||(11393291-11393423)
chr7 (1-132)||(11972522-11972654)
chr7 (1-132)||(14949126-14949258)
chr7 (1-132)||(15376717-15376849)
chr7 (1-132)||(16232546-16232678)
chr7 (1-132)||(18640298-18640430)
chr7 (1-132)||(20385127-20385259)
chr7 (1-132)||(21189599-21189731)
chr7 (1-132)||(24702264-24702396)
chr7 (1-132)||(27216886-27217018)
chr7 (1-132)||(32125517-32125649)
chr7 (1-132)||(41522943-41523075)
chr7 (1-132)||(41525405-41525537)
chr7 (4-94)||(48273421-48273511)
chr7 (1-98)||(9509218-9509315)
chr7 (1-132)||(17061919-17062051)
chr7 (1-91)||(10589068-10589158)
chr7 (1-132)||(16410085-16410217)
chr7 (1-132)||(24704714-24704843)
chr7 (1-94)||(24275197-24275289)
chr7 (1-132)||(44116535-44116667)
chr7 (1-94)||(15144037-15144129)
chr7 (1-98)||(16386242-16386340)
chr7 (5-91)||(40443424-40443509)
chr7 (57-93)||(16324135-16324171)
chr7 (2-42)||(27847881-27847921)
[»] chr2 (48 HSPs)
chr2 (2-239)||(25175880-25176118)
chr2 (1-239)||(28406005-28406245)
chr2 (2-239)||(7585-7824)
chr2 (1-239)||(18786755-18786995)
chr2 (1-239)||(22134070-22134298)
chr2 (1-239)||(23207306-23207546)
chr2 (53-239)||(23791356-23791543)
chr2 (1-133)||(7679614-7679746)
chr2 (1-139)||(23071905-23072041)
chr2 (1-132)||(19671859-19671991)
chr2 (53-239)||(25108970-25109157)
chr2 (57-238)||(22459415-22459598)
chr2 (1-132)||(22105438-22105571)
chr2 (1-149)||(23708561-23708711)
chr2 (1-98)||(298809-298907)
chr2 (53-161)||(24697536-24697645)
chr2 (1-132)||(20520152-20520285)
chr2 (1-98)||(23060542-23060639)
chr2 (1-132)||(18808969-18809101)
chr2 (1-132)||(23130888-23131020)
chr2 (1-132)||(23133355-23133487)
chr2 (1-132)||(23709536-23709668)
chr2 (1-132)||(23712017-23712149)
chr2 (1-132)||(24367800-24367932)
chr2 (1-132)||(34402526-34402658)
chr2 (1-132)||(39682339-39682471)
chr2 (1-98)||(23076471-23076568)
chr2 (1-98)||(23654381-23654478)
chr2 (1-70)||(38138-38206)
chr2 (1-129)||(23135616-23135745)
chr2 (1-132)||(571423-571555)
chr2 (1-132)||(6726021-6726153)
chr2 (1-91)||(20309137-20309225)
chr2 (1-132)||(21155064-21155196)
chr2 (1-149)||(22413078-22413230)
chr2 (1-132)||(28577125-28577257)
chr2 (1-132)||(32039502-32039634)
chr2 (1-98)||(22731229-22731326)
chr2 (1-98)||(23285894-23285987)
chr2 (1-126)||(23004777-23004905)
chr2 (1-94)||(23103396-23103487)
chr2 (1-98)||(23660052-23660148)
chr2 (1-132)||(24898199-24898332)
chr2 (1-132)||(24900682-24900815)
chr2 (1-132)||(24903159-24903292)
chr2 (1-132)||(24905636-24905769)
chr2 (1-132)||(24908111-24908244)
chr2 (1-132)||(32214925-32215057)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (1-235)||(2502-2737)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (1-235)||(14554-14789)
[»] chr8 (54 HSPs)
chr8 (1-235)||(23760698-23760936)
chr8 (1-239)||(38855105-38855343)
chr8 (1-235)||(21673733-21673967)
chr8 (1-236)||(6520397-6520632)
chr8 (1-239)||(21285626-21285865)
chr8 (1-235)||(26355557-26355790)
chr8 (1-237)||(5866132-5866366)
chr8 (1-239)||(983255-983498)
chr8 (1-237)||(21491024-21491258)
chr8 (1-237)||(17140945-17141179)
chr8 (1-238)||(37116376-37116616)
chr8 (1-239)||(20498591-20498831)
chr8 (1-239)||(17266845-17267086)
chr8 (1-237)||(21255251-21255485)
chr8 (1-235)||(21249413-21249645)
chr8 (1-239)||(24353049-24353292)
chr8 (1-167)||(13508009-13508177)
chr8 (53-239)||(22364744-22364930)
chr8 (1-167)||(13597541-13597709)
chr8 (1-161)||(17439436-17439599)
chr8 (1-132)||(17612069-17612202)
chr8 (1-98)||(22626765-22626861)
chr8 (1-98)||(16092337-16092434)
chr8 (1-98)||(21918995-21919092)
chr8 (1-98)||(22875094-22875190)
chr8 (1-91)||(16199647-16199736)
chr8 (1-91)||(31971286-31971375)
chr8 (1-132)||(1484428-1484560)
chr8 (1-132)||(5853296-5853428)
chr8 (1-132)||(14409448-14409580)
chr8 (1-132)||(20046199-20046331)
chr8 (1-132)||(20403253-20403385)
chr8 (1-132)||(22001779-22001911)
chr8 (1-91)||(28649046-28649136)
chr8 (1-98)||(7372807-7372904)
chr8 (1-98)||(20536237-20536334)
chr8 (1-131)||(19801387-19801517)
chr8 (1-98)||(26219743-26219838)
chr8 (1-132)||(15203235-15203367)
chr8 (1-132)||(16413320-16413452)
chr8 (1-91)||(21395984-21396072)
chr8 (1-91)||(21790477-21790565)
chr8 (53-100)||(40492844-40492891)
chr8 (1-98)||(18818404-18818501)
chr8 (1-98)||(21923923-21924020)
chr8 (1-85)||(6759287-6759371)
chr8 (1-85)||(23406408-23406492)
chr8 (1-98)||(26225288-26225383)
chr8 (1-49)||(18879276-18879323)
chr8 (1-132)||(4483307-4483438)
chr8 (1-91)||(21389454-21389542)
chr8 (1-91)||(21778780-21778868)
chr8 (1-43)||(45131047-45131088)
chr8 (48-139)||(21383887-21383978)
[»] scaffold1257 (1 HSPs)
scaffold1257 (30-239)||(2071-2281)
[»] scaffold0628 (1 HSPs)
scaffold0628 (1-239)||(2657-2898)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (1-239)||(10556-10795)
[»] scaffold0028 (7 HSPs)
scaffold0028 (1-231)||(62227-62455)
scaffold0028 (1-239)||(132687-132919)
scaffold0028 (1-132)||(134237-134369)
scaffold0028 (1-132)||(136706-136838)
scaffold0028 (1-132)||(139175-139307)
scaffold0028 (1-132)||(144113-144245)
scaffold0028 (1-132)||(141644-141776)
[»] chr3 (71 HSPs)
chr3 (1-239)||(15470953-15471191)
chr3 (1-239)||(16103809-16104047)
chr3 (1-239)||(16097357-16097596)
chr3 (2-235)||(14234517-14234753)
chr3 (1-239)||(32307706-32307935)
chr3 (1-239)||(13210182-13210419)
chr3 (1-239)||(49667938-49668168)
chr3 (1-191)||(12174164-12174351)
chr3 (9-239)||(1644537-1644757)
chr3 (2-239)||(37251020-37251259)
chr3 (1-235)||(9512949-9513171)
chr3 (1-235)||(9520924-9521146)
chr3 (80-239)||(1465264-1465423)
chr3 (81-239)||(49389483-49389642)
chr3 (1-149)||(52523669-52523821)
chr3 (1-239)||(22110204-22110444)
chr3 (1-98)||(27165276-27165373)
chr3 (1-149)||(24340665-24340815)
chr3 (1-98)||(23274716-23274813)
chr3 (1-98)||(12399238-12399335)
chr3 (1-98)||(53301545-53301643)
chr3 (1-132)||(43925987-43926121)
chr3 (1-149)||(37642207-37642357)
chr3 (1-98)||(42386439-42386536)
chr3 (142-239)||(43927304-43927401)
chr3 (184-239)||(12934165-12934221)
chr3 (1-98)||(14572618-14572714)
chr3 (1-98)||(21618475-21618570)
chr3 (1-98)||(36166624-36166719)
chr3 (1-94)||(606324-606418)
chr3 (1-91)||(18438563-18438653)
chr3 (1-132)||(43550482-43550615)
chr3 (1-98)||(14972883-14972980)
chr3 (1-98)||(17487885-17487982)
chr3 (1-98)||(17499367-17499464)
chr3 (1-70)||(11424783-11424851)
chr3 (2-149)||(22147467-22147616)
chr3 (1-98)||(24153204-24153300)
chr3 (34-149)||(2051141-2051260)
chr3 (1-132)||(7781351-7781483)
chr3 (1-132)||(8899120-8899252)
chr3 (1-132)||(16282815-16282947)
chr3 (1-132)||(17446659-17446791)
chr3 (1-132)||(17463204-17463336)
chr3 (1-132)||(17672652-17672784)
chr3 (1-132)||(29172587-29172719)
chr3 (1-132)||(34159352-34159484)
chr3 (1-132)||(38961895-38962027)
chr3 (1-132)||(45606911-45607043)
chr3 (1-132)||(53070657-53070789)
chr3 (1-132)||(55476517-55476649)
chr3 (1-98)||(13442303-13442400)
chr3 (1-98)||(43840961-43841058)
chr3 (1-98)||(14576828-14576924)
chr3 (1-41)||(28194719-28194759)
chr3 (1-129)||(28848618-28848747)
chr3 (1-132)||(9707611-9707743)
chr3 (1-132)||(12567586-12567718)
chr3 (1-132)||(13544051-13544183)
chr3 (1-132)||(16454285-16454417)
chr3 (1-91)||(20698437-20698527)
chr3 (1-94)||(6469178-6469270)
chr3 (1-98)||(23083356-23083453)
chr3 (1-98)||(26686916-26687013)
chr3 (1-94)||(40213720-40213812)
chr3 (1-89)||(55500968-55501055)
chr3 (1-132)||(13151794-13151927)
chr3 (1-132)||(13154259-13154392)
chr3 (1-132)||(10247727-10247859)
chr3 (1-94)||(25476384-25476477)
chr3 (206-235)||(12171963-12171992)
[»] scaffold0476 (1 HSPs)
scaffold0476 (1-239)||(12795-13034)
[»] chr4 (47 HSPs)
chr4 (1-239)||(39706142-39706380)
chr4 (1-235)||(12288066-12288302)
chr4 (1-239)||(12774036-12774265)
chr4 (1-239)||(13703-13943)
chr4 (7-239)||(8846391-8846640)
chr4 (80-236)||(15099457-15099613)
chr4 (80-239)||(15190424-15190583)
chr4 (1-237)||(15551846-15552079)
chr4 (1-239)||(53082003-53082244)
chr4 (10-237)||(16596686-16596911)
chr4 (1-239)||(46640309-46640548)
chr4 (1-239)||(43198408-43198647)
chr4 (1-95)||(52243192-52243288)
chr4 (1-94)||(16377522-16377613)
chr4 (1-98)||(23374354-23374451)
chr4 (1-98)||(8574864-8574959)
chr4 (1-132)||(44615314-44615446)
chr4 (1-98)||(16270231-16270327)
chr4 (1-132)||(12311-12443)
chr4 (1-91)||(7088906-7088996)
chr4 (1-132)||(15118356-15118488)
chr4 (1-132)||(18215278-18215410)
chr4 (1-132)||(19618176-19618308)
chr4 (1-132)||(44773091-44773223)
chr4 (1-132)||(52312536-52312668)
chr4 (1-98)||(7798803-7798900)
chr4 (1-98)||(12902786-12902883)
chr4 (1-98)||(14280342-14280438)
chr4 (1-98)||(22636464-22636561)
chr4 (1-98)||(54798749-54798846)
chr4 (1-98)||(6899920-6900016)
chr4 (1-98)||(16239965-16240061)
chr4 (1-97)||(52873363-52873459)
chr4 (1-132)||(44928883-44929016)
chr4 (1-94)||(14038677-14038770)
chr4 (1-98)||(44052858-44052955)
chr4 (2-98)||(7893733-7893829)
chr4 (54-95)||(15464929-15464970)
chr4 (1-49)||(3096322-3096369)
chr4 (1-89)||(14053306-14053393)
chr4 (1-37)||(17046516-17046552)
chr4 (1-129)||(18239426-18239555)
chr4 (1-132)||(1837513-1837645)
chr4 (1-132)||(19242725-19242857)
chr4 (1-43)||(17333306-17333347)
chr4 (141-229)||(14164719-14164807)
chr4 (1-132)||(15355328-15355461)
[»] chr5 (44 HSPs)
chr5 (1-239)||(21502007-21502248)
chr5 (1-239)||(21329350-21329589)
chr5 (1-239)||(21565571-21565810)
chr5 (1-239)||(26011888-26012127)
chr5 (1-239)||(20026793-20027033)
chr5 (1-235)||(22959392-22959624)
chr5 (5-235)||(19668931-19669161)
chr5 (1-237)||(19660693-19660927)
chr5 (1-239)||(22178072-22178313)
chr5 (80-239)||(21741398-21741545)
chr5 (1-132)||(22144078-22144211)
chr5 (1-73)||(36314606-36314678)
chr5 (1-98)||(21729059-21729156)
chr5 (1-98)||(21808384-21808481)
chr5 (1-98)||(23390491-23390588)
chr5 (24-126)||(29448054-29448159)
chr5 (1-149)||(40725882-40726032)
chr5 (1-98)||(22075048-22075145)
chr5 (1-98)||(22412213-22412309)
chr5 (1-98)||(24493598-24493694)
chr5 (3-94)||(9077983-9078074)
chr5 (1-132)||(264772-264904)
chr5 (1-97)||(8286838-8286935)
chr5 (1-132)||(10732944-10733076)
chr5 (1-132)||(11581203-11581335)
chr5 (1-132)||(29329960-29330092)
chr5 (1-132)||(39363410-39363542)
chr5 (1-98)||(1096496-1096593)
chr5 (1-98)||(13025340-13025436)
chr5 (1-98)||(13095524-13095620)
chr5 (1-132)||(20902012-20902145)
chr5 (1-96)||(25431423-25431518)
chr5 (1-132)||(20909038-20909170)
chr5 (1-91)||(24529249-24529339)
chr5 (1-132)||(42245369-42245501)
chr5 (1-78)||(21997549-21997626)
chr5 (1-98)||(25421561-25421658)
chr5 (38-98)||(20766115-20766175)
chr5 (1-132)||(29346006-29346138)
chr5 (1-44)||(37723932-37723975)
chr5 (2-43)||(21293020-21293060)
chr5 (1-42)||(26740697-26740737)
chr5 (1-132)||(18319037-18319170)
chr5 (1-129)||(39245162-39245291)
[»] scaffold0555 (1 HSPs)
scaffold0555 (4-239)||(10394-10630)
[»] chr6 (60 HSPs)
chr6 (4-238)||(23019438-23019673)
chr6 (1-239)||(19652224-19652461)
chr6 (31-239)||(22080592-22080800)
chr6 (1-239)||(19668400-19668640)
chr6 (1-239)||(1561332-1561569)
chr6 (1-239)||(28496327-28496563)
chr6 (1-239)||(29808738-29808974)
chr6 (1-239)||(9098378-9098606)
chr6 (1-239)||(20109167-20109409)
chr6 (1-73)||(27333238-27333310)
chr6 (1-73)||(27393978-27394050)
chr6 (1-87)||(4185827-4185913)
chr6 (1-87)||(4186396-4186482)
chr6 (139-239)||(27333138-27333238)
chr6 (139-239)||(27393878-27393978)
chr6 (1-145)||(31155346-31155489)
chr6 (1-98)||(16496273-16496370)
chr6 (27-87)||(4668217-4668277)
chr6 (27-87)||(4675064-4675124)
chr6 (1-132)||(1595575-1595707)
chr6 (1-95)||(25644349-25644444)
chr6 (1-149)||(8227453-8227603)
chr6 (1-94)||(29060569-29060662)
chr6 (103-239)||(35008282-35008418)
chr6 (1-236)||(23076759-23076997)
chr6 (1-132)||(22782253-22782385)
chr6 (1-94)||(19303540-19303632)
chr6 (1-85)||(20076729-20076812)
chr6 (103-195)||(28103796-28103887)
chr6 (1-132)||(2291184-2291316)
chr6 (1-132)||(12742343-12742475)
chr6 (1-132)||(18334596-18334728)
chr6 (1-132)||(19005072-19005204)
chr6 (1-132)||(19858923-19859055)
chr6 (1-132)||(24422573-24422705)
chr6 (1-132)||(30676714-30676846)
chr6 (1-132)||(33861820-33861952)
chr6 (1-132)||(33864304-33864436)
chr6 (1-94)||(18409826-18409919)
chr6 (1-98)||(20360955-20361052)
chr6 (1-91)||(16920634-16920722)
chr6 (53-159)||(18696569-18696675)
chr6 (1-98)||(17287791-17287888)
chr6 (1-94)||(25629354-25629447)
chr6 (1-94)||(25688528-25688620)
chr6 (53-161)||(18706387-18706495)
chr6 (1-132)||(20556898-20557028)
chr6 (1-129)||(1540918-1541047)
chr6 (1-37)||(22831532-22831568)
chr6 (1-91)||(20638285-20638375)
chr6 (1-132)||(34963399-34963531)
chr6 (1-91)||(35245615-35245703)
chr6 (1-78)||(25656655-25656731)
chr6 (53-239)||(18177524-18177712)
chr6 (53-239)||(18199268-18199456)
chr6 (53-239)||(18204159-18204347)
chr6 (2-94)||(20593803-20593895)
chr6 (1-132)||(16448530-16448663)
chr6 (103-151)||(18896256-18896304)
chr6 (1-70)||(33443076-33443146)
[»] scaffold0034 (1 HSPs)
scaffold0034 (1-239)||(32565-32803)
[»] scaffold0010 (2 HSPs)
scaffold0010 (1-239)||(129934-130173)
scaffold0010 (1-95)||(60713-60808)
[»] scaffold1984 (1 HSPs)
scaffold1984 (2-238)||(159-395)
[»] scaffold0333 (2 HSPs)
scaffold0333 (1-239)||(6640-6879)
scaffold0333 (1-239)||(14020-14259)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (1-235)||(5980-6215)
[»] scaffold0037 (1 HSPs)
scaffold0037 (1-239)||(22527-22762)
[»] scaffold0556 (2 HSPs)
scaffold0556 (1-235)||(6841-7073)
scaffold0556 (54-239)||(8097-8283)
[»] scaffold0001 (1 HSPs)
scaffold0001 (1-239)||(160713-160951)
[»] scaffold1765 (1 HSPs)
scaffold1765 (1-239)||(1111-1350)
[»] scaffold0138 (2 HSPs)
scaffold0138 (1-239)||(12968-13207)
scaffold0138 (53-239)||(18090-18277)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (1-239)||(45645-45884)
[»] scaffold0530 (1 HSPs)
scaffold0530 (1-235)||(892-1126)
[»] scaffold0218 (2 HSPs)
scaffold0218 (1-239)||(7929-8166)
scaffold0218 (19-237)||(29135-29354)
[»] scaffold0021 (3 HSPs)
scaffold0021 (1-238)||(136221-136461)
scaffold0021 (1-238)||(144929-145169)
scaffold0021 (1-94)||(174795-174886)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (2-239)||(53401-53640)
[»] scaffold0261 (1 HSPs)
scaffold0261 (5-237)||(15694-15924)
[»] scaffold0420 (1 HSPs)
scaffold0420 (1-239)||(6135-6376)
[»] scaffold0139 (1 HSPs)
scaffold0139 (1-239)||(38345-38586)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (1-239)||(12597-12836)
[»] scaffold0046 (3 HSPs)
scaffold0046 (1-237)||(11321-11555)
scaffold0046 (1-139)||(2026-2162)
scaffold0046 (1-91)||(28443-28533)
[»] scaffold0040 (1 HSPs)
scaffold0040 (4-238)||(103492-103720)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (3-233)||(7917-8151)
[»] scaffold0022 (3 HSPs)
scaffold0022 (1-208)||(128853-129062)
scaffold0022 (1-236)||(78351-78587)
scaffold0022 (1-98)||(116456-116551)
[»] scaffold0006 (2 HSPs)
scaffold0006 (1-239)||(97034-97274)
scaffold0006 (1-239)||(106312-106552)
[»] scaffold0175 (1 HSPs)
scaffold0175 (1-235)||(34152-34384)
[»] scaffold1351 (1 HSPs)
scaffold1351 (53-235)||(87-270)
[»] scaffold0150 (1 HSPs)
scaffold0150 (1-225)||(32127-32345)
[»] scaffold0080 (2 HSPs)
scaffold0080 (1-239)||(19737-19977)
scaffold0080 (1-98)||(39942-40038)
[»] scaffold0184 (1 HSPs)
scaffold0184 (1-139)||(1025-1161)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (1-79)||(23897-23975)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (1-98)||(38697-38794)
[»] scaffold2014 (1 HSPs)
scaffold2014 (1-98)||(1061-1158)
[»] scaffold0020 (2 HSPs)
scaffold0020 (1-78)||(15792-15869)
scaffold0020 (160-239)||(15685-15765)
[»] scaffold0737 (1 HSPs)
scaffold0737 (53-239)||(1650-1836)
[»] scaffold0461 (1 HSPs)
scaffold0461 (1-149)||(11493-11643)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (1-149)||(38198-38348)
[»] scaffold0540 (1 HSPs)
scaffold0540 (1-98)||(3146-3242)
[»] scaffold1403 (1 HSPs)
scaffold1403 (1-239)||(579-817)
[»] scaffold0247 (1 HSPs)
scaffold0247 (1-149)||(17969-18119)
[»] scaffold0161 (1 HSPs)
scaffold0161 (30-237)||(2300-2505)
[»] scaffold0123 (2 HSPs)
scaffold0123 (1-132)||(25135-25268)
scaffold0123 (53-161)||(619-727)
[»] scaffold0357 (2 HSPs)
scaffold0357 (1-91)||(13157-13247)
scaffold0357 (1-95)||(16098-16192)
[»] scaffold0141 (1 HSPs)
scaffold0141 (1-98)||(39506-39602)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (1-98)||(75210-75306)
[»] scaffold0908 (1 HSPs)
scaffold0908 (1-94)||(3185-3278)
[»] scaffold0165 (1 HSPs)
scaffold0165 (1-95)||(27747-27841)
[»] scaffold0475 (1 HSPs)
scaffold0475 (27-87)||(9133-9193)
[»] scaffold0211 (2 HSPs)
scaffold0211 (184-239)||(28664-28720)
scaffold0211 (1-56)||(28806-28862)
[»] scaffold0403 (1 HSPs)
scaffold0403 (1-91)||(4878-4968)
[»] scaffold0122 (2 HSPs)
scaffold0122 (1-98)||(44702-44799)
scaffold0122 (1-94)||(26064-26157)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (1-98)||(1880-1977)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (1-226)||(267689-267916)
[»] scaffold0120 (3 HSPs)
scaffold0120 (1-98)||(32952-33048)
scaffold0120 (1-98)||(45957-46053)
scaffold0120 (1-94)||(16142-16235)
[»] scaffold0026 (2 HSPs)
scaffold0026 (1-98)||(25925-26021)
scaffold0026 (1-98)||(39887-39983)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (1-98)||(13240-13337)
[»] scaffold0056 (1 HSPs)
scaffold0056 (1-94)||(17214-17309)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (1-132)||(20383-20514)
[»] scaffold0145 (2 HSPs)
scaffold0145 (1-98)||(32971-33067)
scaffold0145 (2-98)||(38791-38886)
[»] scaffold0042 (1 HSPs)
scaffold0042 (1-98)||(24297-24395)
[»] scaffold1137 (1 HSPs)
scaffold1137 (84-239)||(2156-2303)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (1-132)||(20773-20905)
[»] scaffold0134 (1 HSPs)
scaffold0134 (1-132)||(37847-37979)
[»] scaffold0106 (2 HSPs)
scaffold0106 (1-91)||(1318-1406)
scaffold0106 (1-91)||(7295-7383)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (1-91)||(51611-51699)
[»] scaffold0003 (2 HSPs)
scaffold0003 (1-132)||(158454-158586)
scaffold0003 (1-94)||(339949-340039)
[»] scaffold0490 (1 HSPs)
scaffold0490 (1-98)||(1981-2078)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (1-94)||(10799-10891)
[»] scaffold0114 (1 HSPs)
scaffold0114 (1-91)||(15466-15555)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (30-149)||(225465-225585)
[»] scaffold0444 (1 HSPs)
scaffold0444 (1-129)||(13418-13547)
[»] scaffold0716 (1 HSPs)
scaffold0716 (1-132)||(4720-4852)
[»] scaffold0456 (1 HSPs)
scaffold0456 (1-91)||(10427-10515)
[»] scaffold0230 (1 HSPs)
scaffold0230 (1-132)||(13973-14105)
[»] scaffold1842 (1 HSPs)
scaffold1842 (1-98)||(1043-1140)
[»] scaffold0427 (1 HSPs)
scaffold0427 (1-91)||(13526-13615)
[»] scaffold0363 (1 HSPs)
scaffold0363 (1-94)||(9268-9360)
[»] scaffold0292 (2 HSPs)
scaffold0292 (1-98)||(3499-3596)
scaffold0292 (1-98)||(372-468)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (1-91)||(32096-32184)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (1-98)||(51942-52039)
scaffold0011 (1-98)||(167973-168070)
[»] scaffold0351 (1 HSPs)
scaffold0351 (1-89)||(16311-16397)
[»] scaffold0121 (1 HSPs)
scaffold0121 (1-98)||(8528-8621)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (8-91)||(20946-21030)
[»] scaffold0718 (1 HSPs)
scaffold0718 (1-91)||(5132-5220)
[»] scaffold0149 (1 HSPs)
scaffold0149 (1-132)||(29958-30090)
[»] scaffold0044 (1 HSPs)
scaffold0044 (5-132)||(40430-40558)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (1-132)||(11314-11446)
[»] scaffold0228 (3 HSPs)
scaffold0228 (9-98)||(4544-4633)
scaffold0228 (9-98)||(12126-12215)
scaffold0228 (9-98)||(22078-22167)
[»] scaffold0217 (1 HSPs)
scaffold0217 (1-94)||(16599-16692)
[»] scaffold0070 (1 HSPs)
scaffold0070 (1-98)||(4553-4650)
[»] scaffold0647 (1 HSPs)
scaffold0647 (1-98)||(6116-6216)
[»] scaffold0090 (1 HSPs)
scaffold0090 (1-79)||(2704-2784)
[»] scaffold0358 (1 HSPs)
scaffold0358 (1-49)||(4741-4788)
[»] scaffold0130 (1 HSPs)
scaffold0130 (54-98)||(27912-27956)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (1-132)||(161093-161226)


Alignment Details
Target: scaffold0621 (Bit Score: 215; Significance: 1e-118; HSPs: 2)
Name: scaffold0621
Description:

Target: scaffold0621; HSP #1
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 6564 - 6798
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6564 ctcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatatca 6663  T
Q  101 acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagataacaact 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6664 acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaacaacaacagcaagataacaact 6763  T
Q  201 tagtttctaacctctaagatcaactcacatcaact 235  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6764 tagtttttaacctctaagatcaactcacatcaact 6798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621; HSP #2
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Original strand, 8495 - 8737
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat-c 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| |    
T  8495 ctcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaaacagcatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacatctcaaatattc 8594  T
Q  100 a-acataattcatataatgtatatacaat--tatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagataa- 195  Q
    | | ||||||||  |||||||||||||||  |||||  |||||  |||||||| |  ||||||  || ||| ||||||| || |||| |||||||||||     
T  8595 atatataattcaagtaatgtatatacaatattatatcacattataaacaacatcaattcatatacat-cagtcttactggaacaacatcagcaagataaa 8693  T
Q  196 caacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtg 239  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8694 caacttagtttcttacctctaagatcaattcacatcaactcgtg 8737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 204; Significance: 1e-111; HSPs: 42)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 22921961 - 22921722
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22921961 ctcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatatca 22921862  T
Q  101 acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aacaac 199  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  22921861 acaaaattcatataatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaacaacaacagcaagataaacaac 22921762  T
Q  200 ttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtg 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22921761 ttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtg 22921722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Original strand, 33681036 - 33681275
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc- 99  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||     
T  33681036 ctcatgcaacttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcgtcaacatctcaaatatca 33681135  T
Q  100 aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aacaa 198  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||| |  ||||||  | |||| ||||||  || ||||||| |||||| |||||    
T  33681136 aacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgca-tcagtcttactagaacaacaacaacaagataaacaa 33681234  T
Q  199 cttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtg 239  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33681235 cttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtg 33681275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Original strand, 22237656 - 22237896
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc- 99  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||     
T  22237656 ctcatgaagcttagttaaataacaaacagcgacataggcattatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatca 22237755  T
Q  100 aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaa-cagcaagat-aaca 197  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||  |||||||| |  ||||||  | |||| ||  ||| || ||||| ||||||||| ||||    
T  22237756 aacataattcatgtaatgtatatacaattatataactttagaaacaacatcaattcatatgta-tcagtctcgctggaacaacaatcagcaagataaaca 22237854  T
Q  198 acttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtg 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22237855 acttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtg 22237896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 52928062 - 52927835
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||            ||||||||||||||    
T  52928062 ctcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat------------catctcaaatatca 52927975  T
Q  101 a-cataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagataa-caa 198  Q
    | |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||| |  ||||||  || ||| ||||||| || ||||| |||||||||| |||    
T  52927974 aacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgcat-cagtcttactggaacaacaatagcaagataaacaa 52927876  T
Q  199 cttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtg 239  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52927875 cttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtg 52927835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 21861662 - 21861422
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaata-tc 99  Q
    |||||||||||||| |||  ||| ||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||| | ||    
T  21861662 ctcatgcagcttagctaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaacagcatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacatctcaaacattc 21861563  T
Q  100 a-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aaca 197  Q
    | | ||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||  |||||||| | |||||| | ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  21861562 atatataattcaagtaatgtatatacaattatatcacattataaacaacatcatatcataat-attcaggcttactgaaacaacaatagcaagataaaca 21861464  T
Q  198 acttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtg 239  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21861463 acttagtttcttacctctaagatcaactcacatcaactcgtg 21861422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Original strand, 21754074 - 21754303
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  21754074 ctcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcaaatgcaa-tcaacaacatctcaattatca 21754172  T
Q  101 acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aacaac 199  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||        |||||  |||||||| |  ||||||  | |||| ||||||| || ||  |||||||||| ||||||    
T  21754173 acataatccatttaatgtatatacaa--------cattataaacaacatcaattcatatgca-tcagtcttactggaacaatgacagcaagataaacaac 21754263  T
Q  200 ttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtg 239  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21754264 ttagtttctaacctctgagatcaactcacatcaactcgtg 21754303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 21896348 - 21896111
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaata-tc 99  Q
    |||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||| |||||| |||| || ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||| | ||    
T  21896348 ctcatgcaacttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatacaaaacagcatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacatctcaaacattc 21896249  T
Q  100 a-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aaca 197  Q
    | | ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||  |||||||| | |||||| | |||||||||||||||   ||||||| |||||| ||||    
T  21896248 atatataattcatgtaatgtatatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcataat-attcaggcttactga---aacaacaacaagataaaca 21896153  T
Q  198 acttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtg 239  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  21896152 acttagtttcttacatctaagatcaactcacatcaactcgtg 21896111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 20248308 - 20248539
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc- 99  Q
    |||||||| |||||||||| ||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   || |||||||     
T  20248308 ctcatgcaacttagttaaaaaacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaa---cttaaatatca 20248404  T
Q  100 aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aacaa 198  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||    ||||||  | |||| |||||||  | ||||||| |||||| || ||    
T  20248405 aacataagtcatgtaatgtatatacaattatatatcattataaacaacatggattcatatgca-tcagtcttactg-gacaacaacatcaagataaataa 20248502  T
Q  199 cttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaact 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  20248503 cttagtttctaacctctaagatcaatttacatcaact 20248539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 80 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 35981700 - 35981541
Alignment:
Q  80 tcaacaacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaat 179  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| || ||||||||||  |||  ||| ||||||||||| |||    
T  35981700 tcaacaacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatgcaattatataacattatcatcaacattagaatata-caatccaggcttactggaat 35981602  T
Q  180 aacaacagcaagat-aacaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtg 239  Q
     |||||| |||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  35981601 gacaacatcaagataaataacttagtttctaacctccaagatcaactcacatcaattcgtg 35981541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 80 - 239
Target Start/End: Original strand, 49261448 - 49261607
Alignment:
Q  80 tcaacaacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaat 179  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||  |||  ||||| ||||||||| ||     
T  49261448 tcaacaacatctcaaatatcaacataatttatataatgtatatacaattatataacattatcatcaacattagaatata-caattccggcttactggaag 49261546  T
Q  180 aacaacagcaagat-aacaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtg 239  Q
     |||||| |||| | || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  49261547 gacaacatcaaggtaaataacttagtttctaacctccaagatcaactcacatcaactcgtg 49261607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 53 - 239
Target Start/End: Original strand, 50686694 - 50686881
Alignment:
Q  53 tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacatta 151  Q
    ||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||| |||| | ||||||||| ||||| ||||||| ||||||  |||||  ||||||||      
T  50686694 tcatgatataacaatgtcaaatgcaaatcaacaacatctcaaacatcatatataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatcg 50686793  T
Q  152 gatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagataa-caacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtg 239  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| ||| | | ||||||||||| ||||||||||    
T  50686794 gatcata-taattcaggcttactgaaacaacaacagtaagataagcaacttagtttcttacccccatgatcaactcacgtcaactcgtg 50686881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 16368378 - 16368139
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 98  Q
    ||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||| ||  ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||  ||    
T  16368378 ctcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagcatataaaacaattcatgatataacaatatc-aatgcaaatcaacaacatctcaac-at 16368281  T
Q  99 caac-ataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagataa-c 196  Q
    |    ||||||||| ||||| ||||||| ||||||  |||||  |||||||| | ||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |    
T  16368280 cgtttataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatcaaatcatat-aattcaggcttactgaaacaacaacagtaagataaac 16368182  T
Q  197 aacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtg 239  Q
    |||||| ||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  16368181 aacttaatttcttacccctatgatcaactcacatcaactcgtg 16368139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 80 - 236
Target Start/End: Original strand, 20636957 - 20637113
Alignment:
Q  80 tcaacaacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaat 179  Q
    ||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |  |||  ||||||||||||||| |||    
T  20636957 tcaacaacatcccaaatacaaacataattcatataatgtatatacaattatataacattatcatcaacattaaaaaata-caattcaggcttactggaat 20637055  T
Q  180 aacaacagcaagat-aacaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactc 236  Q
     |||||| |||| | || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20637056 gacaacatcaaggtaaataacttagtttctaacctccaagatcaactcacatcaactc 20637113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Original strand, 20918633 - 20918863
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc- 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| || |||||||   ||||| ||||     
T  20918633 ctcatgcagcttagttaaataacaaactgcaacataggcagtatgcaaaccatcatgatataataatatcgaatgtaaatcaacaa---ctcaattatca 20918729  T
Q  100 aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aacaa 198  Q
    ||| ||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||  | |||||| |  |||||   | | || ||||||| || |  |||| |||| | ||| |    
T  20918730 aacttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacatcaattcataagca-tgagtcttactggaacattaacaacaaggtaaacga 20918828  T
Q  199 cttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaa 233  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20918829 cttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaa 20918863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 50614209 - 50613969
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 98  Q
    ||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||   ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||    
T  50614209 ctcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtacataaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaacat 50614110  T
Q  99 caac-ataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaaga-taac 196  Q
    |    ||||||||| ||||| ||||||| ||||||  |||||| | |||||| | ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| | ||||  |||    
T  50614109 cttttataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattaatatcaacatcaaatcatat-aattcaggcttactgaagtaacaacggtaagacaaac 50614011  T
Q  197 aacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtg 239  Q
    |||||||||||| ||| |   |||||| |||||||||||||||    
T  50614010 aacttagtttcttacc-ccctgatcaattcacatcaactcgtg 50613969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 50622037 - 50621797
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 98  Q
    ||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||   ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||    
T  50622037 ctcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtacataaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaacat 50621938  T
Q  99 caac-ataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaaga-taac 196  Q
    |    ||||||||| ||||| ||||||| ||||||  |||||| | |||||| | ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| | ||||  |||    
T  50621937 cttttataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattaatatcaacatcaaatcatat-aattcaggcttactgaagtaacaacggtaagacaaac 50621839  T
Q  197 aacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtg 239  Q
    |||||||||||| ||| |   |||||| |||||||||||||||    
T  50621838 aacttagtttcttacc-ccctgatcaattcacatcaactcgtg 50621797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 14295643 - 14295507
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| || |||||||   ||||| |||||    
T  14295643 ctcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggtagtatgcaaaccatcatgatataataatatcgaatgtaaatcaacaa---ctcaattatca 14295547  T
Q  101 -acataattcatataatgtatatacaattatataccatta 139  Q
     || ||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  14295546 gacttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacatta 14295507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 41050128 - 41049891
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 98  Q
    |||||||||||||||||   ||| ||||||||||||| ||||||  |||  |  |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| || ||    
T  41050128 ctcatgcagcttagttactaaacgaacagcaacataggcagtatataaaatagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctc-aacat 41050030  T
Q  99 ca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagataa-c 196  Q
    || | ||||||||  ||||| |||||||| |||||  |||||  |||||| | | |||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||      
T  41050029 catatataattcaagtaatgcatatacaaatatatcacattattaacaacgtcaaatcata-taattcaggcttactgaaacaacaacagtaagataaga 41049931  T
Q  197 aacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactc 236  Q
    ||| ||||| || ||| ||| |||||||||||||||||||    
T  41049930 aacctagttccttacccctatgatcaactcacatcaactc 41049891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Original strand, 21161745 - 21161892
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaat-atc 99  Q
    |||||||| |||||||||| ||| |||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||   ||| || |||    
T  21161745 ctcatgcaacttagttaaacaacaaacagcaacaaa-acagtatgcaaatcatcgtgatataacaatatcgaatgcaattcatcaac--ttcatatcatc 21161841  T
Q  100 aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacatt 150  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||| ||||||| ||| ||| ||| ||||    
T  21161842 aacataaatcatacaatgtttatacacttatataacatcaacgacatcatt 21161892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 161
Target Start/End: Original strand, 16758678 - 16758841
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 98  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||| |||   |    
T  16758678 ctcatgcaacttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaccagttcatgatataacaatatcaaatacaatacaacaacatcacaacatt 16758777  T
Q  99 ca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatatta 161  Q
    || | ||||||||  ||||| ||||||||||||||  |||||  |||||||  | |||||||||    
T  16758778 catatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacaacaaatcatatta 16758841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 35261170 - 35261086
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaaca 85  Q
    ||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  35261170 ctcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaacagcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaaca 35261086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 45574979 - 45574846
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| || ||||| |||| |||| | ||||||| |||||||| |||||| |||     
T  45574979 ctcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagtatgcaaaaacagcatgacataataataccaaatgcaagtcaacaacgtctcaattatt 45574881  T
Q  100 aac--ataattcatataatgtatatacaattatat 132  Q
    |||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  45574880 aacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 45574846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 169 - 239
Target Start/End: Original strand, 12271744 - 12271815
Alignment:
Q  169 cttactgaaataacaacagcaagataa-caacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtg 239  Q
    |||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12271744 cttactgaaacaataacagcaggataaacaacttagtttcttacctctaagatcaactcacatcaactcgtg 12271815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 24 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 22130976 - 22130863
Alignment:
Q  24 caacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatat 122  Q
    |||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||| || |||||||   ||||| |||| ||| ||| |||| ||||| ||||    
T  22130976 caacagcaacataggcagtatccaaaccatcatgatataataatatcgaatgtaaatcaacaa---ctcaattatcaaacttaagtcatgtaatgcatat 22130880  T
Q  123 acaattatataccatta 139  Q
    ||||||||||| |||||    
T  22130879 acaattatataacatta 22130863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 50210305 - 50210212
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaat-catcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaa 94  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||  || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  50210305 ctcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaa 50210212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 40 - 139
Target Start/End: Original strand, 51130632 - 51130729
Alignment:
Q  40 agtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccatt 138  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| || |||||||   ||||| ||||| || ||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  51130632 agtatgcaaaccatcatgatataataatatcgaatgtaaatcaacaa---ctcaattatcagacttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacatt 51130728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Original strand, 13988892 - 13989024
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||     
T  13988892 ctcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattatt 13988989  T
Q  100 aac--ataattcatataatgtatatacaattatat 132  Q
     ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  13988990 cacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 13989024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 21475223 - 21475091
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||     
T  21475223 ctcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattatt 21475126  T
Q  100 aac--ataattcatataatgtatatacaattatat 132  Q
     ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  21475125 cacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 21475091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 21923427 - 21923295
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||     
T  21923427 ctcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattatt 21923330  T
Q  100 aac--ataattcatataatgtatatacaattatat 132  Q
     ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  21923329 cacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 21923295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 91
Target Start/End: Original strand, 34509809 - 34509899
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatct 91  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | ||| || ||||| ||||  ||||| ||||||| ||||||||||||    
T  34509809 ctcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataatgatatcaaatgcaagtcaacaacatct 34509899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 16093977 - 16093825
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaa-caacatctcaaata 97  Q
    |||||||| | |||||||  ||| || |||||||||| ||||||  ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||| |    
T  16093977 ctcatgcaacatagttaataaacaaatagcaacataggcagtatagaaaacagctcatgatataacaatatc-aatgcaaatcaaacaacatctcaaaca 16093879  T
Q  98 tca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacatt 150  Q
    ||| |  |||||||| |||||||||||||| |||||  |||||| | |||||||    
T  16093878 tcataggtaattcatgtaatgtatatacaaatatatcacattaaaatcaacatt 16093825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Original strand, 21026709 - 21026806
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 98  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||| | |||||| |||||  |||  ||||| | |||||||||||||||||| ||||||    
T  21026709 ctcatgcagcttagttaaataa-caacagcaatataggcagtatacaaaatcagcatgacgtaaatatatcaattgcaattcaacaacatcttaaatat 21026806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Original strand, 21840793 - 21840885
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaa 94  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| | ||| |||||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| ||||||    
T  21840793 ctcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacacag-cagtatacaaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaa 21840885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Original strand, 22532298 - 22532395
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaat-catcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 98  Q
    ||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||  || ||||| |||| |||||| | |||||||||||||||||| ||||||    
T  22532298 ctcatgcaatttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatccattgcaattcaacaacatcttaaatat 22532395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 27250821 - 27250724
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 98  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | ||||||||| |||||||| ||||||    
T  27250821 ctcatgcagcttagttaaataa-caatagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaattcatcaacatcttaaatat 27250724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 23593871 - 23593739
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||     
T  23593871 ctcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattatt 23593774  T
Q  100 aac--ataattcatataatgtatatacaattatat 132  Q
     ||  ||||||||  ||||| ||||| ||||||||    
T  23593773 cacatataattcaagtaatgcatatataattatat 23593739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Original strand, 29298163 - 29298294
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||     
T  29298163 ctcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatga-ataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattatt 29298259  T
Q  100 aac--ataattcatataatgtatatacaattatat 132  Q
     ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  29298260 cacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 29298294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 48
Target Start/End: Complemental strand, 38801480 - 38801433
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaa 48  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||    
T  38801480 ctcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtgtgcaa 38801433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Original strand, 433038 - 433168
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaat-catcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||     |||||| || |||||| ||||  ||||| || |||| |||||| ||||||| ||||||||||||||| |||     
T  433038 ctcatgcagcttagttaaataacg----gcaacacaggcagtatacaaaaacatcaagacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaattatt 433133  T
Q  100 aac--ataattcatataatgtatatacaattatat 132  Q
     ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  433134 cacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 433168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Original strand, 26064967 - 26065100
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 98  Q
    |||||||||||||||| |  ||| ||||||||||||| |||||   |||  |  |||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||| ||    
T  26064967 ctcatgcagcttagttgataaacaaacagcaacataggcagtacataaaataattcatgatataacaatacc-aatgcaaatcaacaacatctcaaagat 26065065  T
Q  99 ca-acataattcatataatgtatatacaattatat 132  Q
    || | ||||||||  ||||  |||||||| |||||    
T  26065066 catatataattcaagtaatacatatacaaatatat 26065100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 43
Target Start/End: Complemental strand, 20847246 - 20847205
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagta 43  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  20847246 ctcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagta 20847205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 37
Target Start/End: Complemental strand, 20454645 - 20454610
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatag 37  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20454645 ctcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacatag 20454610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 1)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 19293 - 19528
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19293 ctcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatatca 19392  T
Q  101 acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aacaac 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||| ||||||    
T  19393 acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcagggttactgaaacaacaacatcaagataaacaac 19492  T
Q  200 ttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaact 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19493 ttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaact 19528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 1)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 5672 - 5906
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatca 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5672 ctcatgcagcttagtaaaataacaaacagcaacataggcagtatgaaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatatca 5771  T
Q  101 acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagataacaact 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||    
T  5772 acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaacaacaacaacaagataaaaact 5871  T
Q  201 tagtttctaacctctaagatcaactcacatcaact 235  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  5872 tagtttttaacctctaagatcaactcacatcaact 5906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 196; Significance: 1e-107; HSPs: 8)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 40266 - 40027
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  40266 ctcatgcagcttagttaaataataaacagcaacataggcagtaggcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatatca 40167  T
Q  101 acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aacaac 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| | ||||||    
T  40166 acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacataagatcatattaattcaggcttactgaaacaacaacatcaaggtaaacaac 40067  T
Q  200 ttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtg 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40066 ttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtg 40027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Original strand, 100403 - 100642
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  100403 ctcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataataatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatatta 100502  T
Q  101 acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aacaac 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||    
T  100503 acataattcatataatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagatcatattaatttaggcttactgaaacaacaacaacaagataaacaac 100602  T
Q  200 ttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtg 239  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  100603 ttagtttctaacctctaagagcaagtcacatcaactcgtg 100642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 180 - 239
Target Start/End: Original strand, 101602 - 101661
Alignment:
Q  180 aacaacagcaagataacaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtg 239  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  101602 aacaacaacaagagaacaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtg 101661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Original strand, 94437 - 94569
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||     
T  94437 ctcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattatt 94534  T
Q  100 aac--ataattcatataatgtatatacaattatat 132  Q
     ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  94535 cacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 94569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #5
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Original strand, 44480 - 44613
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaat--catcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 98  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||   || ||||| |||| |||||| ||||||| ||||||||||||||| |||    
T  44480 ctcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaattat 44577  T
Q  99 caac--ataattcatataatgtatatacaattatat 132  Q
      ||  ||||||||  ||||| ||||| ||||||||    
T  44578 tcacatataattcaagtaatgcatatagaattatat 44613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #6
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 45
Target Start/End: Original strand, 119904 - 119948
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatg 45  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  119904 ctcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatg 119948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #7
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 17576 - 17444
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||| || |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||     
T  17576 ctcatgcagcttagttaaataa-caatagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattatt 17479  T
Q  100 aac--ataattcatataatgtatatacaattatat 132  Q
     ||  ||||||||  ||||| ||||| ||||||||    
T  17478 cacatataattcaagtaatgcatatataattatat 17444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #8
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 2 - 49
Target Start/End: Original strand, 101529 - 101576
Alignment:
Q  2 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaa 49  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| |||||||||||    
T  101529 tcatgcagcttagttaaacaacaaacaacaacataggcagtatgcaaa 101576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 196; Significance: 1e-107; HSPs: 61)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 67774 - 68008
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  67774 ctcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaa-tatca 67872  T
Q  101 acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aacaac 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  67873 acataattcatataatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagatcatattaattcaggctcactgaaacaacaacagcaagataaacaac 67972  T
Q  200 ttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaact 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  67973 ttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaact 68008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 18005675 - 18005910
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18005675 ctcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataagcagtatggaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatatca 18005774  T
Q  101 acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aacaac 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  18005775 acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggcttactgaaacaacaacagcaagataaacaac 18005874  T
Q  200 ttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaact 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18005875 ttagtttctaacctctaagatcaactcatatcaact 18005910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Original strand, 44014207 - 44014440
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   |||||||||||||    
T  44014207 ctcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaac---atctcaaatatca 44014303  T
Q  101 acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagataacaact 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  44014304 acataattcatataatgtatatacagttatataccattaaaaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaacaacaacagcaagataacaact 44014403  T
Q  201 tagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtg 239  Q
    |||||| ||||||||  |||||||||||||||| |||||    
T  44014404 tagtttttaacctct--gatcaactcacatcaattcgtg 44014440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 16219809 - 16219574
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc- 99  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||| |||     
T  16219809 ctcatgtagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatcttaaacatca 16219710  T
Q  100 aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aacaa 198  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  16219709 aacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattata-taattcaggcttactgaaacaacaacagcaagataaacaa 16219611  T
Q  199 cttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaact 235  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  16219610 cttagtttctaacctccaagatcaactaacatcaact 16219574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Original strand, 47831836 - 47832074
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc- 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||| |||     
T  47831836 ctcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacatagacagtatgcatatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatcataaacatca 47831935  T
Q  100 aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aacaa 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||| || ||    
T  47831936 aacataattcatataatgtatatacaattatataacattagcgacaacattagattata-caattcaggcttactgaaacaacaacaacaagataaataa 47832034  T
Q  199 cttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgt 238  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  47832035 cttagtttctaacctccaagatcaactcacatcaactcgt 47832074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 4 - 239
Target Start/End: Original strand, 16056360 - 16056595
Alignment:
Q  4 atgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatcaa-c 102  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||| |    
T  16056360 atgcaccttagttaaataacaaacagcaacatagacattatgcaaa-caacatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaacatcaaac 16056458  T
Q  103 ataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aacaactt 201  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| |||| ||||||| |||||| ||||||||    
T  16056459 ataattcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattata-tcattcaggcttaccgaaacaacaacatcaagataaacaactt 16056557  T
Q  202 agtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtg 239  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16056558 agtttcttacctctaagatcaactcacatcaactcgtg 16056595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 811223 - 810988
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc- 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||  ||| |||     
T  811223 ctcatgcagcttagttaaataacaaatagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcattaacatcataaacatca 811124  T
Q  100 aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aacaa 198  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||  ||||||||||||| || ||    
T  811123 aacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattagcaacaacattagattata-caattcaggcttactgaaactacaacagcaagataaataa 811025  T
Q  199 cttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaact 235  Q
    ||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||    
T  811024 cttagtttctaacttccaaggtcaactcacatcaact 810988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 3 - 239
Target Start/End: Original strand, 22072944 - 22073183
Alignment:
Q  3 catgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatc-atcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatcaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| || |||||||| | | ||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||| |||||    
T  22072944 catgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcactatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaa 22073043  T
Q  102 -cataat-tcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaaga-taacaa 198  Q
     |||||  |||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||  |||||    
T  22073044 acataaactcatgtaatgtatatgcaattatataacattaacaacaacattagattata-taattcaggcttactgaaacaacaacatcaagacaaacaa 22073142  T
Q  199 cttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtg 239  Q
    ||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22073143 cttagttccttacctgtaagatcaactcacatcaactcgtg 22073183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 15754979 - 15754742
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc- 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| || | ||| ||||  |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||   ||||||||||     
T  15754979 ctcatgcagcttagttaaataacaaataacaatataggtagtatgcaaaccatcatgatataataatatcgaatgcaaatcaacaa---ctcaaatatca 15754883  T
Q  100 aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattaga-tcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aaca 197  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||  | |||||||| | ||||||  | |||| ||||||| ||||  ||||||||||| ||||    
T  15754882 aacataagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattaaattcatatgca-tcagtcttactggaatattaacagcaagataaaca 15754784  T
Q  198 acttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtg 239  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15754783 acttagtttctaacctctaggatcaactcacatcaactcgtg 15754742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Original strand, 34200815 - 34201049
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc- 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| || |||||||   ||||| ||||     
T  34200815 ctcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaccatcatgatataataatatcgaatgtaaatcaacaa---ctcaattatca 34200911  T
Q  100 aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aacaa 198  Q
    ||| ||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||  |||||   | |||| |||||||  | |  ||||||||| | |||||    
T  34200912 aacttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattaattcataagca-tcagtcttactgggacattaacagcaaggtaaacaa 34201010  T
Q  199 cttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcg 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34201011 cttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcg 34201049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Original strand, 12901352 - 12901595
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 98  Q
    ||||||||||||||||||  ||| |||| |||||||| |||||| ||||  |  |||||||||||||||||| |||||||  || ||||||| |||  ||    
T  12901352 ctcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtatacaaaataattcatgatataacaatatcaaatgcaaaacagcaacatcacaac-at 12901450  T
Q  99 ca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagataa-c 196  Q
    || ||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| |    
T  12901451 catacataattcatgtaatgtatatacaactatataacattaacaacaacattaaatcatat-aattcaagcttactgaaacaacaacaacaagataaac 12901549  T
Q  197 aacttagtttc-ta---acctctaagatcaactcacatcaactcgt 238  Q
    ||||||||||| ||   ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12901550 aacttagtttcctacgtacctccaagatcaactcacatcaactcgt 12901595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 28505390 - 28505156
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc- 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||  || ||| |||   ||||| ||||     
T  28505390 ctcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaccatcatgatataataatatcggatataaatcagcaa---ctcaattatca 28505294  T
Q  100 aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aacaa 198  Q
    ||| ||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||  |||||   | |||| ||||||| || |   ||| |||| | |||||    
T  28505293 aacttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattaattcataagca-tcagtcttactggaacattgacaacaaggtaaacaa 28505195  T
Q  199 cttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcg 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28505194 cttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcg 28505156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 80 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 9389709 - 9389550
Alignment:
Q  80 tcaacaacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaat 179  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||| ||||||  |||  ||| ||||||||||| |||    
T  9389709 tcaacaacatctcatatatcaacataattcatacaatgtatatacaattatataacattatcatcaatattagaatata-caatccaggcttactggaat 9389611  T
Q  180 aacaacagcaagat-aacaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtg 239  Q
     |||||| |||| |  | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9389610 gacaacatcaaggtcgataacttagtttctaacctccaagatcaactcacatcaactcgtg 9389550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 11996119 - 11995885
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc- 99  Q
    |||||||| ||||||||| |||| |||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||   ||||||||||     
T  11996119 ctcatgcatcttagttaattaacaaacaacaacataggcagtatgcaaaccatcatgatataataatattgaatgtaaatcaacaa---ctcaaatatca 11996023  T
Q  100 aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aacaa 198  Q
    ||| ||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||  |||||   | |||| |||||||  | |  ||||||||| | |||||    
T  11996022 aacttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattaattcataagca-tcagtcttactgggacattaacagcaaggtaaacaa 11995924  T
Q  199 cttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcg 237  Q
     ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11995923 attagtttctaacctctaagataaactcacatcaactcg 11995885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Original strand, 16495431 - 16495567
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| || |||||||   ||||| |||||    
T  16495431 ctcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaaccatcatgatataataatatcgaatgtaaatcaacaa---ctcaattatca 16495527  T
Q  101 -acataattcatataatgtatatacaattatataccatta 139  Q
     || ||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  16495528 gacttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacatta 16495567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 141 - 236
Target Start/End: Original strand, 16324175 - 16324270
Alignment:
Q  141 caacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aacaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactc 236  Q
    |||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16324175 caacaacattagattatac-aattcaggcttactgaaacaacaacagcaagatcaacaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactc 16324270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 20220280 - 20220042
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 98  Q
    ||||| ||||||||||||  ||| |||| |||||||| |||||   ||| ||  |||||||||||||||||| |||||||   | |||||||||||| ||    
T  20220280 ctcatacagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtacataaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaa---atcaacatctcaaacat 20220184  T
Q  99 ca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagataa-c 196  Q
    || | ||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||  |||||||| | |||||  ||| |||||||||||| || |||||||| ||||||| |    
T  20220183 catatataattcatgtaatgcatatacaattatatcacattattaacaacatcaaatcat-ctaaatcaggcttactggaacaacaacagtaagataagc 20220085  T
Q  197 aacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtg 239  Q
    |||||||||||| ||| ||  ||||| ||||||||||||||||    
T  20220084 aacttagtttcttacccctgtgatcacctcacatcaactcgtg 20220042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 12255885 - 12255789
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaa 95  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||    
T  12255885 ctcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacatagtcagtatgcaaatcaattcatgatataacaatatcaaatgaaattctacaacatctcaaa 12255789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 2280211 - 2280061
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaata-tc 99  Q
    ||||||||||||||||||  ||| |||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  2280211 ctcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtatgcaaaacagcatgatataataatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaatattc 2280112  T
Q  100 a-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacat 149  Q
    | | |||||||| |||||  ||||| ||||||||  |||||  ||||||||    
T  2280111 atatataattcaaataatacatataaaattatatcacattataaacaacat 2280061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 57 - 239
Target Start/End: Original strand, 15113028 - 15113211
Alignment:
Q  57 gatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatc 155  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||   ||| | |||| |||  |||| |||||||||||||||  |||||  |  ||||| |  ||    
T  15113028 gatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacatctcaatattcacatataactcaagtaatatatatacaattatatcacattataattaacatcaactc 15113127  T
Q  156 atattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagataa-caacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtg 239  Q
    |||| ||| ||| |||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15113128 atataaat-cagtcttactgaaacaataacagcaggataaacaacttagtttcttacctctaagatcaactcacatcaactcgtg 15113211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Original strand, 13647354 - 13647487
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||     
T  13647354 ctcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagtatgcaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattatt 13647452  T
Q  100 aac--ataattcatataatgtatatacaattatat 132  Q
     ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  13647453 cacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 13647487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 1868087 - 1867924
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 98  Q
    ||||||||||||||||||  ||| |||| |||||||| ||||||  ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||| ||    
T  1868087 ctcatgcagcttagttaataaactaacaacaacataggcagtatataaaacagctcatgatataacaatatc-aatgcaaatgaacaacatctcaaacat 1867989  T
Q  99 ca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaa 162  Q
    || | ||||||||| ||||| |||||||| |||||  |||||  |||||||| | ||||| ||||    
T  1867988 catatataattcatgtaatgcatatacaaatatatcacattattaacaacatcaaatcatcttaa 1867924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Original strand, 38227510 - 38227606
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 98  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||| |||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||||||| ||||||    
T  38227510 ctcatgcagcttagttaaataac-aatagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatcttaaatat 38227606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 57 - 239
Target Start/End: Original strand, 15116565 - 15116748
Alignment:
Q  57 gatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatc 155  Q
    |||||||||||||| | ||||| ||| |||||||||||   ||| | |||| |||  |||| |||||||||||||||  |||||  || ||||| |  ||    
T  15116565 gatataacaatatcaattgcaagtcatcaacatctcaatattcacatataactcaagtaatatatatacaattatatcacattataaataacatcaactc 15116664  T
Q  156 atattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagataa-caacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtg 239  Q
    ||||  || ||| |||||||||| || ||||| | ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15116665 atatacat-cagtcttactgaaacaataacagtaggataaacaacttagtttcttacctctaagatcaactcacatcaactcgtg 15116748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Original strand, 14044775 - 14044935
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaa-caacatctcaaata 97  Q
    ||||||||||||||||||  ||| || |||||||||| |||||   ||| ||  || ||||||||||||||| ||| ||| |||| |||||||||||| |    
T  14044775 ctcatgcagcttagttaataaacaaaaagcaacataggcagtacataaaacagctcctgatataacaatatc-aatacaaatcaatcaacatctcaaaca 14044873  T
Q  98 tca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcata 158  Q
    ||| | ||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||| ||| ||||||| ||||||    
T  14044874 tcatatataattcatgtaatgtatatacaactatataacattatcaaaaacattaaatcata 14044935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Original strand, 14354805 - 14354965
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaa-caacatctcaaata 97  Q
    ||||||||||||||||||  ||| || |||||||||| |||||   ||| ||  || ||||||||||||||| ||| ||| |||| |||||||||||| |    
T  14354805 ctcatgcagcttagttaataaacaaaaagcaacataggcagtacataaaacagctcctgatataacaatatc-aatacaaatcaatcaacatctcaaaca 14354903  T
Q  98 tca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcata 158  Q
    ||| | ||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||| ||| ||||||| ||||||    
T  14354904 tcatatataattcatgtaatgtatatacaactatataacattatcaaaaacattaaatcata 14354965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 19486836 - 19486686
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaat-atc 99  Q
    |||||||||||||||||  |||  | ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| | | || | ||||||||||||||| |||    
T  19486836 ctcatgcagcttagttagttaatgatcagcaacataggcagtatgcaaaacatcatgatataataatatcgcacgtaagtaaacaacatctcaaataatc 19486737  T
Q  100 a-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacat 149  Q
    | | ||||||||  | ||| ||||||||||||||  |||||  ||||||||    
T  19486736 acatataattcaagttatgcatatacaattatatcacattataaacaacat 19486686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 10063910 - 10063813
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 98  Q
    |||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||| | ||||||| | ||||||||||||| |||||||||  ||| | |||||||||||||||||    
T  10063910 ctcatgcaacttagttaattaacaatcagcaacataggcggtatgcacaacatcatgatataataatatcgaacacaagtaaacaacatctcaaatat 10063813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 18456504 - 18456408
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 98  Q
    ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||| |||||| |||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||||||| ||||||    
T  18456504 ctcatgcagcttagttaaataacgat-agcaacataggcagtatacaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatcttaaatat 18456408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Original strand, 18430738 - 18430870
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaat-catcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||  |||  |||||||| |||| |||||| ||||||| ||||||||||||||| |||     
T  18430738 ctcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatataaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaattatt 18430835  T
Q  100 aac--ataattcatataatgtatatacaattatat 132  Q
     ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  18430836 cacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 18430870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 3564456 - 3564363
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaa 94  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||| || |||||||||||||||    
T  3564456 ctcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaa 3564363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Original strand, 26212025 - 26212122
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaa-tcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 98  Q
    ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| ||| ||||| |||| |||||| | |||||||||||||||||| ||||||    
T  26212025 ctcatacaacttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataataatatcaattgcaattcaacaacatcttaaatat 26212122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Original strand, 12698860 - 12698958
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaa--tcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 98  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||   || ||||| |||| |||||| | ||||||||| |||||||| ||||||    
T  12698860 ctcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagtatacaaaacacagcatgacataataatatcaattgcaattcatcaacatcttaaatat 12698958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 15008591 - 15008441
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 98  Q
    ||||||||||||||||||  ||| |||| ||||||||  |||||  ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||| ||    
T  15008591 ctcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggtagtatataaaacagttcatgatataacaatatc-aatgcaaatcaacaacacctcaaacat 15008493  T
Q  99 ca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacat 149  Q
    || | ||||||||  ||||| |||||||| |||||  |||||  ||||||||    
T  15008492 catatataattcaagtaatgcatatacaaatatatcacattattaacaacat 15008441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Original strand, 456347 - 456479
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||     
T  456347 ctcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattatt 456444  T
Q  100 aac--ataattcatataatgtatatacaattatat 132  Q
     ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  456445 cacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 456479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 11393423 - 11393291
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||     
T  11393423 ctcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattatt 11393326  T
Q  100 aac--ataattcatataatgtatatacaattatat 132  Q
     ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  11393325 cacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 11393291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Original strand, 11972522 - 11972654
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||     
T  11972522 ctcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattatt 11972619  T
Q  100 aac--ataattcatataatgtatatacaattatat 132  Q
     ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  11972620 cacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 11972654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 14949258 - 14949126
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||     
T  14949258 ctcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattatt 14949161  T
Q  100 aac--ataattcatataatgtatatacaattatat 132  Q
     ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  14949160 cacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 14949126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 15376849 - 15376717
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||     
T  15376849 ctcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattatt 15376752  T
Q  100 aac--ataattcatataatgtatatacaattatat 132  Q
     ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  15376751 cacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 15376717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Original strand, 16232546 - 16232678
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||     
T  16232546 ctcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattatt 16232643  T
Q  100 aac--ataattcatataatgtatatacaattatat 132  Q
     ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  16232644 cacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 16232678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Original strand, 18640298 - 18640430
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||     
T  18640298 ctcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattatt 18640395  T
Q  100 aac--ataattcatataatgtatatacaattatat 132  Q
     ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  18640396 cacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 18640430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 20385259 - 20385127
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||     
T  20385259 ctcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattatt 20385162  T
Q  100 aac--ataattcatataatgtatatacaattatat 132  Q
     ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  20385161 cacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 20385127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 21189731 - 21189599
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||     
T  21189731 ctcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattatt 21189634  T
Q  100 aac--ataattcatataatgtatatacaattatat 132  Q
     ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  21189633 cacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 21189599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Original strand, 24702264 - 24702396
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||     
T  24702264 ctcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattatt 24702361  T
Q  100 aac--ataattcatataatgtatatacaattatat 132  Q
     ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  24702362 cacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 24702396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Original strand, 27216886 - 27217018
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||     
T  27216886 ctcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattatt 27216983  T
Q  100 aac--ataattcatataatgtatatacaattatat 132  Q
     ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  27216984 cacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 27217018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Original strand, 32125517 - 32125649
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||     
T  32125517 ctcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattatt 32125614  T
Q  100 aac--ataattcatataatgtatatacaattatat 132  Q
     ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  32125615 cacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 32125649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Original strand, 41522943 - 41523075
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||     
T  41522943 ctcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattatt 41523040  T
Q  100 aac--ataattcatataatgtatatacaattatat 132  Q
     ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  41523041 cacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 41523075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Original strand, 41525405 - 41525537
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||     
T  41525405 ctcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattatt 41525502  T
Q  100 aac--ataattcatataatgtatatacaattatat 132  Q
     ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  41525503 cacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 41525537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 4 - 94
Target Start/End: Original strand, 48273421 - 48273511
Alignment:
Q  4 atgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaat-catcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaa 94  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||| ||||  || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  48273421 atgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaa 48273511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Original strand, 9509218 - 9509315
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaa-atcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 98  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||| ||| | || ||||| |||| |||||| | ||||||||| |||||||| ||||||    
T  9509218 ctcatgcagcttagttaaataa-caacagtaacataggcagtatacaataacagcatgacataataatatcaattgcaattcatcaacatcttaaatat 9509315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 17062051 - 17061919
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||  || |||||| ||||  | ||||| |||| |||||| ||||||| ||| |||| |||||| ||| |    
T  17062051 ctcatgcagcttagttaaataacaatcagcaactcag-cagtatacaaaatagcatgacataataatatcaaatgcaagtcagcaacgtctcaattatta 17061953  T
Q  101 ac--ataattcatataatgtatatacaattatat 132  Q
    ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  17061952 acatataattcaagtaatgcatatacaattatat 17061919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 91
Target Start/End: Original strand, 10589068 - 10589158
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatct 91  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||| | ||| || ||||| ||||  ||||| | ||||||||||||||||||    
T  10589068 ctcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacatatgcagtatacaaaaacaacatgacataatcatatcaattgcaattcaacaacatct 10589158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Original strand, 16410085 - 16410217
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||     
T  16410085 ctcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattatt 16410182  T
Q  100 aac--ataattcatataatgtatatacaattatat 132  Q
     ||  ||||||||  ||||  ||||||||||||||    
T  16410183 cacatataattcaagtaatacatatacaattatat 16410217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Original strand, 24704714 - 24704843
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatca 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| ||||  | || || |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||      
T  24704714 ctcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaa--aacaagacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattc 24704809  T
Q  101 ac--ataattcatataatgtatatacaattatat 132  Q
    ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  24704810 acatataattcaagtaatgcatatacaattatat 24704843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Original strand, 24275197 - 24275289
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaa 94  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| ||||||    
T  24275197 ctcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaa 24275289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Original strand, 44116535 - 44116667
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc 99  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||     
T  44116535 ctcatgcagcttggttaaataa-caacagcaacacag-cagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattatt 44116632  T
Q  100 aac--ataattcatataatgtatatacaattatat 132  Q
     ||  ||||||||   |||| ||||||||||||||    
T  44116633 cacatataattcaagcaatgcatatacaattatat 44116667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 15144129 - 15144037
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaa-atcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaa 94  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||| | || || ||||| | |||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  15144129 ctcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacat-ctcagtatgcaataacagcaagatatcataatatcaaatgcaagccaacaacatctcaa 15144037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 16386340 - 16386242
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 98  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| | |||||| |||||| | |||||| ||||| ||||  ||||| | || | |||| |||||||| ||||||    
T  16386340 ctcatgcagcttagttaaataacaaacaacgacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaattgtatttcatcaacatcttaaatat 16386242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 91
Target Start/End: Original strand, 40443424 - 40443509
Alignment:
Q  5 tgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatct 91  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||  |||| || ||||| |||| |||||| | | ||||||| ||||||||    
T  40443424 tgcagcttagttaaataacaaacagcaacatacgcagtaaacaaa-cagcatgacataataatatcaatttcaattcatcaacatct 40443509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 57 - 93
Target Start/End: Original strand, 16324135 - 16324171
Alignment:
Q  57 gatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctca 93  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  16324135 gatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctca 16324171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 2 - 42
Target Start/End: Complemental strand, 27847921 - 27847881
Alignment:
Q  2 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagt 42  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||    
T  27847921 tcatgcagcttagttaaataataaacagcaacataggcagt 27847881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 48)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 2 - 239
Target Start/End: Original strand, 25175880 - 25176118
Alignment:
Q  2 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatcaa 101  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25175880 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatatcaa 25175979  T
Q  102 cataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aacaact 200  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  25175980 cataattcatataacgtatatataattatataacattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaacaacaacagcaagataaacaact 25176079  T
Q  201 tagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtg 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  25176080 tagtttctaacctctaagatcaacttacatcaattcgtg 25176118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Original strand, 28406005 - 28406245
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaa-tcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc 99  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28406005 ctcatgcaacttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatatc 28406104  T
Q  100 aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aacaa 198  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||| ||| |||||||||||||| |||||    
T  28406105 aacttaattcataaaatgtatatacaattatataccattaacaacaacaatagatcatattaaattaggcttactaaaacaacaacagcaagataaacaa 28406204  T
Q  199 cttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtg 239  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28406205 cttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtg 28406245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 2 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 7824 - 7585
Alignment:
Q  2 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaata-tca 100  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||| | |||    
T  7824 tcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaacaacatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacatctcaaacattca 7725  T
Q  101 -acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aacaa 198  Q
     | ||||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||| || ||| |||||    
T  7724 tatataattcaagtaatgtatatacaattatatcacattaacaacaacattaaatcata-taattcaggcttactgaaacaacaacaacatgataaacaa 7626  T
Q  199 cttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtg 239  Q
    |||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7625 cttagtttcctacctccaagatcaactcacatcaactcgtg 7585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 18786995 - 18786755
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 98  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||  |||||||||| ||  ||||||||||||||| || |||||||||||||||| || |||  ||    
T  18786995 ctcatgcagcttagttaaataacaatcagtaacataggtagtatgcaaaccagttcatgatataacaatctcaaatgcaattcaacaacgtcacaac-at 18786897  T
Q  99 caa-cataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagataa-c 196  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||| ||| ||||||  ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||| ||||| |    
T  18786896 caaacataattcatgtaatgtatatacaactatataacattatcaataacattcaatcatat-aatttaggcttactgaaacaacaacagcatgataaac 18786798  T
Q  197 aacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtg 239  Q
    |||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18786797 aacttagtttcctacctccaagatcaactcacatcaactcgtg 18786755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 22134298 - 22134070
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatca 100  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||  |||||    
T  22134298 ctcatgcagcttagttaaatatc-aacagcaacataggcagtatgcaaatcatcataatataacaatatcgaatgcaa-tcaataacatctcatttatca 22134201  T
Q  101 acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aacaac 199  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||        |||||  |||||||  |  ||||||  | |||| ||||||| || ||  |||||||||| ||||||    
T  22134200 acataatccatttaatgtatatacaa--------cattataaacaacaccaattcatatgca-tcagtcttactggaaaaatgacagcaagataaacaac 22134110  T
Q  200 ttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtg 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22134109 ttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtg 22134070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Original strand, 23207306 - 23207546
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 98  Q
    ||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||  ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||   |    
T  23207306 ctcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatataaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacgacatctcaacatt 23207405  T
Q  99 caacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagataa-ca 197  Q
      | ||||||||| ||||| ||||||| ||||||  |||||  |||||||| | ||||||| ||||||||||||||  || |||||||| ||||||| ||    
T  23207406 ataaataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatcaaatcatat-aattcaggcttacttgaacaacaacagtaagataagca 23207504  T
Q  198 acttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtg 239  Q
    ||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  23207505 acttagtttcttacccccaagatcaactcacatcaactcgtg 23207546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 53 - 239
Target Start/End: Original strand, 23791356 - 23791543
Alignment:
Q  53 tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacatta 151  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||| || | | ||||||||| ||||| ||||||| ||||||  |||||  |||||||| |    
T  23791356 tcatgatataaaaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaacattatatataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatca 23791455  T
Q  152 gatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagataa-caacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtg 239  Q
     ||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  23791456 aatcatat-aattcaggcttactgaaacaacaacaacaagataaacaacttagtttccaacccccaagatcaactcacatcaactcgtg 23791543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Original strand, 7679614 - 7679746
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc- 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||| |||||||  ||| |||     
T  7679614 ctcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatc-aatgtaagtcatcaacatcataaacatca 7679712  T
Q  100 aacataattcatataatgtatatacaattatata 133  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  7679713 aacataattcatgtaatgtatatataattatata 7679746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 23072041 - 23071905
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc- 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  || ||| |||   ||||| ||||     
T  23072041 ctcatgcagcttagttaaataacgaacaacaacataggcagtatgcaaaccatcatgatataataatatcgaatataaatcagcaa---ctcaattatca 23071945  T
Q  100 aacataattcatataatgtatatacaattatataccatta 139  Q
    ||| ||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  23071944 aacttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacatta 23071905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Original strand, 19671859 - 19671991
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatca 100  Q
    |||||||||||||||||| |||| | ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||||||   |||    
T  19671859 ctcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacataggcagtatgcaaaacatcatgatataataatatcgaacgcaagtaaacaacatctcaatattca 19671958  T
Q  101 -acataattcatataatgtatatacaattatat 132  Q
     | ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  19671959 catataattcaagtaatgcatatacaattatat 19671991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 53 - 239
Target Start/End: Original strand, 25108970 - 25109157
Alignment:
Q  53 tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacatta 151  Q
    |||||||||||||||||| ||   || ||||||| |||||||| |||| | ||||||||| ||||| ||||||| ||||||   ||||  |||||||| |    
T  25108970 tcatgatataacaatatcaaagcaaaatcaacaatatctcaaacatcatatataattcatgtaatgcatatacatttatatcatattattaacaacatca 25109069  T
Q  152 gatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagataa-caacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtg 239  Q
     ||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| | | | | |||||||| |||||||||||||    
T  25109070 aatcatat-aattcaggcttactgaaacaacaacagtaagataagcaacttagtttcttatccccatgatcaacttacatcaactcgtg 25109157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 57 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 22459598 - 22459415
Alignment:
Q  57 gatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatcaacata--attcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagat 154  Q
    |||||||||| ||| |||| || ||| |||||||||||||||  |||||  | |||  ||||||||||||||||||||  |||||  || ||||| |  |    
T  22459598 gatataacaacatcaaatgaaagtcatcaacatctcaaatattcacatataactcaagtaatgtatatacaattatatcacattataaataacatcaact 22459499  T
Q  155 catattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagataa-caacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgt 238  Q
    | |||  || ||| |||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22459498 cgtatacat-cagtcttactgaaacaataacagcaagataaacaacttagtttcttacctctaaggtcaactcacatcaactcgt 22459415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Original strand, 22105438 - 22105571
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||     
T  22105438 ctcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagtatgcaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacttctcaattatt 22105536  T
Q  100 aac--ataattcatataatgtatatacaattatat 132  Q
     ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  22105537 cacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 22105571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 23708711 - 23708561
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat-- 98  Q
    |||| ||||||||||||||||||  | |||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||||| ||| | |||||||||| ||      
T  23708711 ctcaagcagcttagttaaataacagatagcaacataggcagtatgcaaaacaacatgatataacaatatcaattgcaaatcatcgacatctcaaacattc 23708612  T
Q  99 caacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacat 149  Q
     || ||||||||  ||||| ||||||||||||||  |||||  ||||||||    
T  23708611 aaatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacat 23708561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 298907 - 298809
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 98  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| | |||||| ||||| ||||  ||||| | |||||||||||||||||| ||||||    
T  298907 ctcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaattgcaattcaacaacatcttaaatat 298809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 53 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 24697645 - 24697536
Alignment:
Q  53 tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacatta 151  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||| | | ||||||| ||||| ||||||| ||||||  |||||  |||||||| |    
T  24697645 tcatgatataacaatatcaaatgcaattcaacaacatctcaaacttcatatacaattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacataa 24697546  T
Q  152 gatcatatta 161  Q
     |||||||||    
T  24697545 aatcatatta 24697536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 20520285 - 20520152
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 98  Q
    ||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||  |||||   ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||    
T  20520285 ctcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacatatgcagtacataaaacagttcatgatataacaatatc-aatgcaaatcaacaacatctcaaacat 20520187  T
Q  99 ca-acataattcatataatgtatatacaattatat 132  Q
    || | ||||||||  ||||| |||||||| |||||    
T  20520186 catatataattcaagtaatgcatatacaaatatat 20520152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Original strand, 23060542 - 23060639
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 98  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | ||||| |||||||||||| ||||||    
T  23060542 ctcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatcttaaatat 23060639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Original strand, 18808969 - 18809101
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||     
T  18808969 ctcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattatt 18809066  T
Q  100 aac--ataattcatataatgtatatacaattatat 132  Q
     ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  18809067 cacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 18809101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Original strand, 23130888 - 23131020
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||     
T  23130888 ctcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattatt 23130985  T
Q  100 aac--ataattcatataatgtatatacaattatat 132  Q
     ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  23130986 cacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 23131020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Original strand, 23133355 - 23133487
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||     
T  23133355 ctcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattatt 23133452  T
Q  100 aac--ataattcatataatgtatatacaattatat 132  Q
     ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  23133453 cacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 23133487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 23709668 - 23709536
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||     
T  23709668 ctcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattatt 23709571  T
Q  100 aac--ataattcatataatgtatatacaattatat 132  Q
     ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  23709570 cacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 23709536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 23712149 - 23712017
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||     
T  23712149 ctcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattatt 23712052  T
Q  100 aac--ataattcatataatgtatatacaattatat 132  Q
     ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  23712051 cacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 23712017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Original strand, 24367800 - 24367932
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||     
T  24367800 ctcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattatt 24367897  T
Q  100 aac--ataattcatataatgtatatacaattatat 132  Q
     ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  24367898 cacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 24367932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 34402658 - 34402526
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||     
T  34402658 ctcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattatt 34402561  T
Q  100 aac--ataattcatataatgtatatacaattatat 132  Q
     ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  34402560 cacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 34402526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Original strand, 39682339 - 39682471
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||     
T  39682339 ctcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattatt 39682436  T
Q  100 aac--ataattcatataatgtatatacaattatat 132  Q
     ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  39682437 cacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 39682471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Original strand, 23076471 - 23076568
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 98  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | ||||| ||||||| |||| ||||||    
T  23076471 ctcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaatatcttaaatat 23076568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 23654478 - 23654381
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaat-catcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 98  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||| || ||||| |||||||| |||| |||||| | ||||||||| |||||||| ||||||    
T  23654478 ctcatgcagcttagttaaataa-caacaacagcataggcagcatacaaatacatcatgacataataatatcaattgcaattcatcaacatcttaaatat 23654381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 38206 - 38138
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatc 70  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| || ||||| |||| ||||||    
T  38206 ctcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatc 38138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 129
Target Start/End: Original strand, 23135616 - 23135745
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||     
T  23135616 ctcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattatt 23135713  T
Q  100 aac--ataattcatataatgtatatacaatta 129  Q
     ||  ||||||||  ||||| |||||||||||    
T  23135714 cacatataattcaagtaatgcatatacaatta 23135745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Original strand, 571423 - 571555
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| | |     
T  571423 ctcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattgtt 571520  T
Q  100 aac--ataattcatataatgtatatacaattatat 132  Q
     ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  571521 cacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 571555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Original strand, 6726021 - 6726153
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||| || |||||||| |||||| |||     
T  6726021 ctcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgtaagtcaacaacgtctcaattatt 6726118  T
Q  100 aac--ataattcatataatgtatatacaattatat 132  Q
     ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  6726119 cacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 6726153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 91
Target Start/End: Original strand, 20309137 - 20309225
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatct 91  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||| |||  || ||||| ||||  ||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  20309137 ctcatgcagcttagttaaataacaaatagcaacataggcagtatacaa--cagcatgacataattatatcaaattcaattcatcaacatct 20309225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 21155196 - 21155064
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | ||||| |||||||| |||||| |||     
T  21155196 ctcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacgtctcaattatt 21155099  T
Q  100 aac--ataattcatataatgtatatacaattatat 132  Q
     ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  21155098 cacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 21155064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 22413230 - 22413078
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatat--cgaatgcaattcaacaacatctcaaat 96  Q
    |||||||| |||||||||  ||| |||| |||||||| ||||||  ||| ||  |||||||||||||||||  | ||||||| ||||||||||||| ||     
T  22413230 ctcatgcaacttagttaataaacaaacaacaacataggcagtatataaaacagctcatgatataacaatatatcaaatgcaaatcaacaacatctc-aac 22413132  T
Q  97 atca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacat 149  Q
    |||| | ||||||||| ||||| ||||||| ||||||  |||||  ||||||||    
T  22413131 atcataaataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacat 22413078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Original strand, 28577125 - 28577257
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||  | ||||||| | ||| || |||||||||| |||||| |||||||  ||||||| |||||| |||     
T  28577125 ctcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacgca-acagtatacaaaaacagcatgatataataatatcaaatgcaagccaacaacgtctcaattatt 28577222  T
Q  100 aac--ataattcatataatgtatatacaattatat 132  Q
     ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  28577223 cacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 28577257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 32039634 - 32039502
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||     
T  32039634 ctcatgcagcttagttaaataa-caacagtaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattatt 32039537  T
Q  100 aac--ataattcatataatgtatatacaattatat 132  Q
     ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  32039536 cacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 32039502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 22731326 - 22731229
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 98  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| | | ||| || ||||| |||| |||||| | ||||||||| |||||| | ||||||    
T  22731326 ctcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaattcatcaacatattaaatat 22731229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Original strand, 23285894 - 23285987
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 98  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||  | || || |||| |||||| | ||||||||| |||||||| ||||||    
T  23285894 ctcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagtatacaaa--aaca-gacataataatatcaattgcaattcatcaacatcttaaatat 23285987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 126
Target Start/End: Original strand, 23004777 - 23004905
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 98  Q
    ||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||   |||  |  ||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||| ||    
T  23004777 ctcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggtagtacataaaatagttcaggatataataatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaacat 23004876  T
Q  99 ca-acataattcatataatgtatatacaa 126  Q
    || | ||||| || |||||| ||||||||    
T  23004877 catatataatccacataatgcatatacaa 23004905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 23103487 - 23103396
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaa 94  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||| |||| || ||||| || |  ||||| ||| ||||||| |||||||||||    
T  23103487 ctcatgcagcttagttaaataa-aaacagcaacataggcagtatacaaa-cagcatgacatgattatatcaaattcaattcatcaacatctcaa 23103396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Original strand, 23660052 - 23660148
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 98  Q
    |||||| | |||||||||| ||| ||||||||||||| |||||| | || ||  |||| |||| |||||| ||||||| |||||||||||| ||||||    
T  23660052 ctcatgtatcttagttaaacaac-aacagcaacataggcagtatacgaaacaggatgacataataatatcaaatgcaaatcaacaacatcttaaatat 23660148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 24898332 - 24898199
Alignment:
Q  1 ctcatgcagctt-agttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaat-catcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 98  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||  || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||    
T  24898332 ctcatgcagctttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattat 24898235  T
Q  99 caacata--attcatataatgtatatacaattatat 132  Q
      |||||  |||||  ||||| ||||||||||||||    
T  24898234 tcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 24898199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 24900815 - 24900682
Alignment:
Q  1 ctcatgcagctt-agttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaat-catcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 98  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||  || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||    
T  24900815 ctcatgcagctttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattat 24900718  T
Q  99 caacata--attcatataatgtatatacaattatat 132  Q
      |||||  |||||  ||||| ||||||||||||||    
T  24900717 tcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 24900682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 24903292 - 24903159
Alignment:
Q  1 ctcatgcagctt-agttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaat-catcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 98  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||  || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||    
T  24903292 ctcatgcagctttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattat 24903195  T
Q  99 caacata--attcatataatgtatatacaattatat 132  Q
      |||||  |||||  ||||| ||||||||||||||    
T  24903194 tcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 24903159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 24905769 - 24905636
Alignment:
Q  1 ctcatgcagctt-agttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaat-catcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 98  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||  || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||    
T  24905769 ctcatgcagctttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattat 24905672  T
Q  99 caacata--attcatataatgtatatacaattatat 132  Q
      |||||  |||||  ||||| ||||||||||||||    
T  24905671 tcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 24905636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 24908244 - 24908111
Alignment:
Q  1 ctcatgcagctt-agttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaat-catcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 98  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||  || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||    
T  24908244 ctcatgcagctttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattat 24908147  T
Q  99 caacata--attcatataatgtatatacaattatat 132  Q
      |||||  |||||  ||||| ||||||||||||||    
T  24908146 tcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 24908111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 32215057 - 32214925
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||     
T  32215057 ctcatgcagcttagttaaataa-caacaacaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattatt 32214960  T
Q  100 aac--ataattcatataatgtatatacaattatat 132  Q
     ||  ||||||||  ||||| ||||| ||||||||    
T  32214959 cacatataattcaagtaatgcatatataattatat 32214925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 2737 - 2502
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  2737 ctcatgcagcttagttaaataacaaacatcaacataggcagtatgtaaatcatcatgttataacaatattgaatgcaaatcaacaacatctcaaatatca 2638  T
Q  101 acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aacaac 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||    
T  2637 acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaacaacatcagcaagataaacaac 2538  T
Q  200 ttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaact 235  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2537 ttaatttctaacctctaagatcaactcacatcaact 2502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 180; Significance: 2e-97; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 14789 - 14554
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatca 100  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14789 ctcatgcagcttagttaactaacaaacagcaacataggcagtaagaaaatcatcatgatatagtaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatatca 14690  T
Q  101 acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagata-acaac 199  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  14689 acataattcatataatgtatatactattatataccattaacaaaaacattagatcatattaaatcaggcttactgaaacaacaacagcaagatatacaac 14590  T
Q  200 ttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaact 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14589 ttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaact 14554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 174; Significance: 9e-94; HSPs: 54)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 23760936 - 23760698
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  23760936 ctcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgtaaatcatcatgatataacaatattgaattcaaatcaacaacatctcaaatatca 23760837  T
Q  101 acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat----aac 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||| |     |||    
T  23760836 acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatatttattcaggcttactgaaacaacaacaacaacaaggtaaac 23760737  T
Q  197 aacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaact 235  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23760736 aacttagtttttaacctctaagatcaactcacatcaact 23760698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 172; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 38855343 - 38855105
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  38855343 ctcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatatca 38855244  T
Q  101 acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aacaac 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  38855243 acataattcatataatgtatatacaattatataacattagcaacaacattagattata-caattcaggcttactgaaacaacaacagcaagataaacaac 38855145  T
Q  200 ttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtg 239  Q
    |||||| ||||  || |||||||| |||||||||||||||    
T  38855144 ttagttcctaatgtccaagatcaattcacatcaactcgtg 38855105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 21673733 - 21673967
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatca 100  Q
    |||||||| | |||||||||||| |||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21673733 ctcatgcatcatagttaaataacaaacaacaacataggcattatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatatca 21673832  T
Q  101 acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagataacaact 200  Q
    | |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  21673833 atataatttatttaatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaagcttactgaaacaacaacaacaagataacaact 21673932  T
Q  201 tagtttctaacctctaagatcaactcacatcaact 235  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||| ||||    
T  21673933 tagtttttaacctctaatatcaactcacattaact 21673967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Original strand, 6520397 - 6520632
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||| ||||    
T  6520397 ctcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatcataaacatca 6520496  T
Q  101 acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aacaac 199  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||    
T  6520497 acataattcatgtaatgtatatacaattatataacattagcaacaacattagattata-caattcaggcttactgaaacaacaacagcaagataaataac 6520595  T
Q  200 ttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactc 236  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6520596 ttagtttctaacctccaagatcaactcacatcaactc 6520632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Original strand, 21285626 - 21285865
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc- 99  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||     
T  21285626 ctcatgcagctttgttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaaacaacatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaacatca 21285725  T
Q  100 aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aacaa 198  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||  |    
T  21285726 aacatagttcatgtaatgtatatacaattatatatcattaacaacaatattagattata-taattcaggcttactgaaacaacaacaacaagataaagca 21285824  T
Q  199 cttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtg 239  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21285825 cttagtttcttacctctaagatcaactcacatcaactcgtg 21285865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 26355790 - 26355557
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatca 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||    
T  26355790 ctcatgcagcttagttaaacaacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcacgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctcagccatca 26355692  T
Q  101 acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aacaac 199  Q
    ||||| | ||| ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||| |  ||||||  | |||| ||||||  || || ||||  ||||| ||||||    
T  26355691 acatattccatttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgca-tcagtcttactagaacaataacaaaaagataaacaac 26355593  T
Q  200 ttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaact 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26355592 ttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaact 26355557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 5866366 - 5866132
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc- 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| || |||||||   ||||| ||||     
T  5866366 ctcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaccatcatgatataataatatcgaatgtaaatcaacaa---ctcaattatca 5866270  T
Q  100 aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aacaa 198  Q
    ||| ||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||  |||||   | |||| ||||||| || |  ||||||||| | |||||    
T  5866269 aacttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattaattcataagca-tcagtcttactggaacattaacagcaaggtaaacaa 5866171  T
Q  199 cttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcg 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5866170 cttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcg 5866132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 983498 - 983255
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 98  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||  |  ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| | || ||    
T  983498 ctcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaacaagttcatgatataacaatctcaaatgcaattcaacaacatcac-aacat 983400  T
Q  99 c-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat---- 193  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||  |||||| ||||| ||||||||||  |||||| |||||||| |||||||||| ||||||| ||| ||        
T  983399 caaacataattcatgtaatgtatatacagctatataacattatcaacaacattcaatcata-taattcagacttactgaaacaacaacaacaacatgata 983301  T
Q  194 aacaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtg 239  Q
    ||||||||||||||  ||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  983300 aacaacttagtttcctacctccaagatcaactcatatcaactcgtg 983255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Original strand, 21491024 - 21491258
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc- 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||   ||||| ||||     
T  21491024 ctcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaccatcatgatataataatattgaatgtaaatcaacaa---ctcaattatca 21491120  T
Q  100 aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aacaa 198  Q
    ||| ||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||  |||||   | |||| ||||||| || |  ||||||||| | |||||    
T  21491121 aacttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattaattcataggca-tcagtcttactggaacattaacagcaaggtaaacaa 21491219  T
Q  199 cttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcg 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21491220 cttagtttctaacctctaagatcaactcacattaactcg 21491258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Original strand, 17140945 - 17141179
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc- 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  |||||||| |||| ||||||||||| || ||| |||   ||||| ||||     
T  17140945 ctcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaatccatcatgacataataatatcgaatgtaaatcatcaa---ctcaattatca 17141041  T
Q  100 aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aacaa 198  Q
    ||| ||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||  |||||   | |||| ||||||| || |  ||||||||| | |||||    
T  17141042 aacttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattaattcataagca-tcagtcttactggaacattaacagcaaggtaaacaa 17141140  T
Q  199 cttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcg 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17141141 cttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcg 17141179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Original strand, 37116376 - 37116616
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 98  Q
    ||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||   ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||    
T  37116376 ctcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtacataaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaacat 37116475  T
Q  99 ca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagataa-c 196  Q
    || | ||||||||| ||||| |||||||| |||||  |||||  |||||||| | |||||  ||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||| |    
T  37116476 catatataattcatgtaatgcatatacaaatatatcacattattaacaacatcaaatcat-ctaaatcaggcttactgaaacaacaacagtaagataagc 37116574  T
Q  197 aacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgt 238  Q
    |||||||||||| ||| | | ||||| |||||||||||||||    
T  37116575 aacttagtttcttacccccatgatcatctcacatcaactcgt 37116616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Original strand, 20498591 - 20498831
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaata-tc 99  Q
    |||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||| |||  | ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||| | ||    
T  20498591 ctcatgcaacttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgtaaaatagcatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacatctcaaacattc 20498690  T
Q  100 a-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aaca 197  Q
    | | ||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||  |||||||| | |||||| ||  |||| ||||| |||| | ||||| |||||| ||||    
T  20498691 atatataattcaagtaatgtatatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcata-tacatcagtcttaccgaaacatcaacatcaagataaaca 20498789  T
Q  198 acttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtg 239  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20498790 acttagtttcttacctccaagatcaactcacatcaactcgtg 20498831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 17267086 - 17266845
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 98  Q
    ||||||||||||||||||  ||| |||| |||||||| |||||   ||| |   |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||    
T  17267086 ctcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtacataaaacggttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaacat 17266987  T
Q  99 ca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagataa-c 196  Q
    || | ||||||| | ||||| ||||||| ||||||  |||||  |||||||| | |||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| |    
T  17266986 catatataattcttgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatcaaatcata-taattcaggctcactgaaacaacaacagtaagataagc 17266888  T
Q  197 aacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtg 239  Q
    |||||||||||| ||| |   ||||||||||||||||||||||    
T  17266887 aacttagtttcttacccccgtgatcaactcacatcaactcgtg 17266845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Original strand, 21255251 - 21255485
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaac-agcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc 99  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||  |||||||||  |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||   ||||| ||||    
T  21255251 ctcatgcagcttagttaaataaaaaaatagcaacataagcagtatgcaattcatcatgatataataatatcgaatgtaaatcaacaa---ctcaattatc 21255347  T
Q  100 -aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagataacaa 198  Q
     ||| ||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||  |||||   | |||| |||| ||| | |  ||||||| | ||||||    
T  21255348 aaacttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattaattcataagca-tcagtcttagtgagacattaacagcagggtaacaa 21255446  T
Q  199 cttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcg 237  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21255447 cttagttcctaacctctaagataaactcacatcaactcg 21255485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 21249413 - 21249645
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaac-agcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc 99  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||  |||||||||  |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||   ||||| ||||    
T  21249413 ctcatgcagcttagttaaataaaaaaatagcaacataagcagtatgcaattcatcatgatataataatatcgaatgtaaatcaacaa---ctcaattatc 21249509  T
Q  100 -aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagataacaa 198  Q
     ||| ||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||  |||||   | |||| |||| ||| | |  ||||||| | ||||||    
T  21249510 aaacttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattaattcataagca-tcagtcttagtgagacattaacagcagggtaacaa 21249608  T
Q  199 cttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaact 235  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21249609 cttagttcctaacctctaagataaactcacatcaact 21249645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Original strand, 24353049 - 24353292
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 98  Q
    ||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||   ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||    
T  24353049 ctcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtacataaaacagttcatgatataacaatatc-aatgcaaatcaacaacatctcaaacat 24353147  T
Q  99 ca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagca---agata 194  Q
    |  | | ||||||| ||||| ||||||| ||||||   ||||  |||||||| | ||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||   |||||    
T  24353148 cgtatacaattcatgtaatgcatatacatttatatcatattattaacaacatcaaatcatat-aattcaggcttactgaaacaacaacaacagtaagata 24353246  T
Q  195 a-caacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtg 239  Q
    | ||||||||||||| | | | | ||||||||||||||||||||||    
T  24353247 agcaacttagtttcttatccccatgatcaactcacatcaactcgtg 24353292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 13508177 - 13508009
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatca 100  Q
    |||||||||||||||||| |||| | ||||||||||| || |||||| | ||||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||||||||||      
T  13508177 ctcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacataggcaatatgcacaacatcatgatataataatatcgaacgcaagtaaacaacatctcaaatattc 13508078  T
Q  101 ac--ataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcag 167  Q
    ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||  |||||  |||||||| | |||||  ||||||||    
T  13508077 acatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcatcataattcag 13508009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 53 - 239
Target Start/End: Original strand, 22364744 - 22364930
Alignment:
Q  53 tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacatta 151  Q
    |||||||||||||||||| || | || |||||||||||||||| |||| | ||||||||| ||||| ||||||| ||||||  | |||  |||||||| |    
T  22364744 tcatgatataacaatatcaaa-gaaaatcaacaacatctcaaacatcatatataattcatgtaatgcatatacatttatatcactttattaacaacatca 22364842  T
Q  152 gatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagataa-caacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtg 239  Q
     ||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| | | | |   ||||||||||||||||||||||    
T  22364843 aatcatat-aattcaggcttactgaaacaacaacagtaagataagcaacttagtttattatccccctgatcaactcacatcaactcgtg 22364930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 13597709 - 13597541
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatca 100  Q
    |||||||||||||||||| |||| | ||||||||||  ||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||| |||||||      
T  13597709 ctcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacataagcagaatgcaaaacatcatgatataataatatcgaacgcaagtaaacaacatcccaaatattc 13597610  T
Q  101 ac--ataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcag 167  Q
    ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||  |||||  |||||||| | |||||  ||||||||    
T  13597609 acatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcatcataattcag 13597541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 17439599 - 17439436
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 98  Q
    ||||||||||||||||||  ||| |||| |||||||| |||||   ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||    
T  17439599 ctcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtacataaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaacat 17439500  T
Q  99 ca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatatta 161  Q
    || | ||||||||| ||||| |||||||| |||||  |||||  | |||||||| |||||||||    
T  17439499 catatataattcatgtaatgcatatacaaatatatcacattattatcaacattaaatcatatta 17439436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 17612202 - 17612069
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaat-atc 99  Q
    |||||||||||||||||| |||| | || |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| | | || | ||||||||||||||| |||    
T  17612202 ctcatgcagcttagttaattaacaatcaacaacataggcagtatgcaaaacatcatgatataataatatcgcacgtaagtaaacaacatctcaaataatc 17612103  T
Q  100 a-acataattcatataatgtatatacaattatat 132  Q
    | | ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  17612102 acatataattcaagtaatgcatatacaattatat 17612069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Original strand, 22626765 - 22626861
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 98  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| || ||||| |||| |||||| ||| ||| |||||||||||| ||||||    
T  22626765 ctcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaacaacatgacataataatatcaaatacaaatcaacaacatcttaaatat 22626861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 16092434 - 16092337
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaat-catcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 98  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||| ||||  || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  16092434 ctcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaatat 16092337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 21919092 - 21918995
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaat-catcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 98  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||  || ||||| |||| |||||| | |||||||||||||||||| ||||||    
T  21919092 ctcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaattcaacaacatcttaaatat 21918995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Original strand, 22875094 - 22875190
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 98  Q
    ||||||||||||||||||||| | | |||||||| || |||||| |||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  22875094 ctcatgcagcttagttaaatagc-agcagcaacacaggcagtatacaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaatat 22875190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 16199736 - 16199647
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatct 91  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| |||||| | | ||||||| | ||||||    
T  16199736 ctcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtattcaaa-caacatgacataataatatcaatttcaattcatctacatct 16199647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 91
Target Start/End: Original strand, 31971286 - 31971375
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatct 91  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| || ||||| |||| |||||| | | ||||||| ||||||||    
T  31971286 ctcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaacaacatgacataataatatcaattccaattcatcaacatct 31971375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Original strand, 1484428 - 1484560
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||     
T  1484428 ctcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattatt 1484525  T
Q  100 aac--ataattcatataatgtatatacaattatat 132  Q
     ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  1484526 cacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 1484560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 5853428 - 5853296
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||     
T  5853428 ctcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattatt 5853331  T
Q  100 aac--ataattcatataatgtatatacaattatat 132  Q
     ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  5853330 cacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 5853296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 14409580 - 14409448
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||     
T  14409580 ctcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattatt 14409483  T
Q  100 aac--ataattcatataatgtatatacaattatat 132  Q
     ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  14409482 cacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 14409448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 20046331 - 20046199
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||     
T  20046331 ctcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattatt 20046234  T
Q  100 aac--ataattcatataatgtatatacaattatat 132  Q
     ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  20046233 tacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 20046199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Original strand, 20403253 - 20403385
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||     
T  20403253 ctcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattatt 20403350  T
Q  100 aac--ataattcatataatgtatatacaattatat 132  Q
     ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  20403351 cacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 20403385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Original strand, 22001779 - 22001911
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||     
T  22001779 ctcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattatt 22001876  T
Q  100 aac--ataattcatataatgtatatacaattatat 132  Q
     ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  22001877 cacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 22001911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 28649136 - 28649046
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatct 91  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| ||||||||||||    
T  28649136 ctcatgcagcttagttaaataa-caaaagcaacataggcagtatacgaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatct 28649046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Original strand, 7372807 - 7372904
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 98  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | ||||| |||||| ||||| ||||||    
T  7372807 ctcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacatcatcttaaatat 7372904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Original strand, 20536237 - 20536334
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 98  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | ||||||||| |||||||| ||||||    
T  20536237 ctcatgcagcttagttaaataa-caacagaaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaattcatcaacatcttaaatat 20536334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 19801517 - 19801387
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatca 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||| | ||||||| |||| || ||||| |||| |||||| || |||| |||||||| |||||| |||      
T  19801517 ctcatgcagcttagttaaataa-caatagcaacaca-acagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaacgcaagtcaacaacgtctcaattattc 19801420  T
Q  101 ac--ataattcatataatgtatatacaattata 131  Q
    ||  ||||||||  ||||| |||||||||||||    
T  19801419 acatataattcaagtaatgcatatacaattata 19801387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Original strand, 26219743 - 26219838
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 98  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| || |||||| ||||  |  |||| |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  26219743 ctcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacacag-cagtatacaaaatagtatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaatat 26219838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 15203367 - 15203235
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||| || |||||||| |||||| |||     
T  15203367 ctcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgtaagtcaacaacgtctcaattatt 15203270  T
Q  100 aac--ataattcatataatgtatatacaattatat 132  Q
     ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  15203269 cacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 15203235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 16413452 - 16413320
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||     
T  16413452 ctcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattatt 16413355  T
Q  100 aac--ataattcatataatgtatatacaattatat 132  Q
     ||  ||||||||  ||||| ||||| ||||||||    
T  16413354 cacatataattcaagtaatgcatatataattatat 16413320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 21396072 - 21395984
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatct 91  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||| |||  || ||||| ||||  ||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  21396072 ctcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaa--cagcatgagataattatatcaaattcaattcatcaacatct 21395984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 21790565 - 21790477
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatct 91  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||| |||  || ||||| ||||  ||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  21790565 ctcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaa--cagcatgagataattatatcaaattcaattcatcaacatct 21790477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 53 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 40492891 - 40492844
Alignment:
Q  53 tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatca 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  40492891 tcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaacatca 40492844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 18818501 - 18818404
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 98  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | || || |||||| ||||| ||||||    
T  18818501 ctcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagtcaacatcatcttaaatat 18818404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 21924020 - 21923923
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 98  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| | | ||| || ||||| || | |||||| | ||||| |||||||||||| ||||||    
T  21924020 ctcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagtctacaaaaacaacatgacatgataatatcaattgcaagtcaacaacatcttaaatat 21923923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 85
Target Start/End: Original strand, 6759287 - 6759371
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaaca 85  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| ||||||    
T  6759287 ctcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacacaggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagtcaaca 6759371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 85
Target Start/End: Original strand, 23406408 - 23406492
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaaca 85  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | ||||| ||||||    
T  23406408 ctcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattgcaagtcaaca 23406492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 26225383 - 26225288
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 98  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | ||| ||| |||| ||  |||| |||| |||||| ||| ||| |||||||||||||||||||    
T  26225383 ctcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-acaatatacaaaacagtatgacataataatatcaaatacaagtcaacaacatctcaaatat 26225288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 49
Target Start/End: Complemental strand, 18879323 - 18879276
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaa 49  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||    
T  18879323 ctcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagtatacaaa 18879276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Original strand, 4483307 - 4483438
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc 99  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||     
T  4483307 ctcatgcagcttagtt-aataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattatt 4483403  T
Q  100 aac--ataattcatataatgtatatacaattatat 132  Q
     ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  4483404 cacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 4483438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 21389542 - 21389454
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatct 91  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||||| |||  || ||||| ||||  ||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  21389542 ctcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggtagtatacaa--cagcatgacataattatatcaaattcaattcatcaacatct 21389454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 21778868 - 21778780
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatct 91  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||||| |||  || ||||| ||||  ||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  21778868 ctcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggtagtatacaa--cagcatgacataattatatcaaattcaattcatcaacatct 21778780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 43
Target Start/End: Complemental strand, 45131088 - 45131047
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagta 43  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  45131088 ctcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagta 45131047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 48 - 139
Target Start/End: Original strand, 21383887 - 21383978
Alignment:
Q  48 aatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccatta 139  Q
    ||||||||| ||||||||||  | ||||||  ||| |||||||||||||||| ||||||||||||  ||| |||||  ||||||||| |||||    
T  21383887 aatcatcat-atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcatgcaatatatatctaattatataacatta 21383978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1257 (Bit Score: 171; Significance: 6e-92; HSPs: 1)
Name: scaffold1257
Description:

Target: scaffold1257; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 30 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 2281 - 2071
Alignment:
Q  30 caacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaatta 129  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2281 caacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaatatcagcataattcatataatgtatatacaatta 2182  T
Q  130 tataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aacaacttagtttctaacctctaagatcaactcac 228  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  2181 tataccattaacaacaacattggatcatattaaatcaggcttactgaaacaacaacagcaagataaacaacttattttctaacctctaagatcaactcac 2082  T
Q  229 atcaactcgtg 239  Q
    |||||||||||    
T  2081 atcaactcgtg 2071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0628 (Bit Score: 164; Significance: 9e-88; HSPs: 1)
Name: scaffold0628
Description:

Target: scaffold0628; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 2898 - 2657
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  2898 ctcatgcagcttagttaaataacaaacagctacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaatatca 2799  T
Q  101 acataattcatataatg----tatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aa 195  Q
     | ||||||||| ||||    ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  2798 gcttaattcataaaatgtatatatatacaat--tataccattaacaacaacaatagatcatattaaatcaggcttactgaaacaacaacagcaagataaa 2701  T
Q  196 caacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtg 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2700 caacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtg 2657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 161; Significance: 5e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Original strand, 10556 - 10795
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc- 99  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||     
T  10556 ctcatgcagcttttttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaacatcg 10655  T
Q  100 aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aacaa 198  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  10656 aacataattcatgtaatgtatatacaattatatgacattaacaacaacattagattata-taattcaggcttactgaaacaacaacagcaagataaacaa 10754  T
Q  199 cttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtg 239  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10755 cttagtttcttacctctaagatcaactcacatcaactcgtg 10795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 158; Significance: 3e-84; HSPs: 7)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 62227 - 62455
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatca 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  62227 ctcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgaaaaacatcatggtataataatatcgaatgca---caacaacatctcaaatatca 62323  T
Q  101 acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aacaac 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  62324 acataattcatataatgtatatacaattatataacattaacaacatcattagttcataacaattcaggcttactgaaacaacaacagcaagataaacaac 62423  T
Q  200 ttagtttctaacctctaagatcaactcacatc 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  62424 ttagtttctaacctctaagatcaactcacatc 62455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Original strand, 132687 - 132919
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc 99  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||   ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || ||| |||| |||||| ||||    
T  132687 ctcatgcagcttagataaataacaaacagcaacataagtagtatgcaaaatcatcatgatacaacaatatcgaatgtaa-tcatcaacgtctcaattatc 132785  T
Q  100 aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aacaa 198  Q
    |||||||| ||| |||||||||      |||| | |||||  |||||||| |  ||||||  | |||| ||||||| || |||||||| ||||| |||||    
T  132786 aacataatccatttaatgtata------tatacaacattataaacaacatcaattcatatgca-tcagtcttactggaacaacaacagtaagataaacaa 132878  T
Q  199 cttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtg 239  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  132879 cttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtg 132919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Original strand, 134237 - 134369
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaat-catcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| ||||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||     
T  134237 ctcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaatacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattatt 134334  T
Q  100 aac--ataattcatataatgtatatacaattatat 132  Q
     ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  134335 cacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 134369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Original strand, 136706 - 136838
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaat-catcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| ||||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||     
T  136706 ctcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaatacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattatt 136803  T
Q  100 aac--ataattcatataatgtatatacaattatat 132  Q
     ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  136804 cacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 136838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Original strand, 139175 - 139307
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaat-catcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| ||||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||     
T  139175 ctcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaatacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattatt 139272  T
Q  100 aac--ataattcatataatgtatatacaattatat 132  Q
     ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  139273 cacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 139307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #6
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Original strand, 144113 - 144245
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaat-catcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| ||||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||     
T  144113 ctcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaatacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattatt 144210  T
Q  100 aac--ataattcatataatgtatatacaattatat 132  Q
     ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  144211 cacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 144245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #7
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Original strand, 141644 - 141776
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaat-catcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc 99  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| ||||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||     
T  141644 ctcatgtagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaatacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattatt 141741  T
Q  100 aac--ataattcatataatgtatatacaattatat 132  Q
     ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  141742 cacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 141776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 157; Significance: 1e-83; HSPs: 71)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Original strand, 15470953 - 15471191
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc- 99  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||     
T  15470953 ctcatgcagcttagttaaataacagacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaacatca 15471052  T
Q  100 aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aacaa 198  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||    
T  15471053 aacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaac-ttagatcata-taattcaggcttactgaaacaacaacaacaagataaacaa 15471150  T
Q  199 cttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtg 239  Q
    |||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||    
T  15471151 cttagtttctaacctccaagatcatctaacatcaactcgtg 15471191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Original strand, 16103809 - 16104047
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc- 99  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  16103809 ctcatgcagcttagttaaacaacgaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctcaaatatca 16103907  T
Q  100 aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aacaa 198  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||  |||||||| |  ||||||  ||| || ||||||| || |||||||||||||| |||||    
T  16103908 aacataattcatttaatgtatataaaattatataacattataaacaacatcaattcatatggatt-agtcttactggaacaacaacagcaagataaacaa 16104006  T
Q  199 cttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtg 239  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16104007 cttagtttctaacctctaagattaactcacatcaactcgtg 16104047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Original strand, 16097357 - 16097596
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc- 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||     
T  16097357 ctcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcaatatgcaaatcatcatcatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatca 16097456  T
Q  100 aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aacaa 198  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||| |  ||||||  | |||| ||||||| || |||||||||||||| |||||    
T  16097457 aacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgca-tcagtcttactggaacaacaacagcaagataaacaa 16097555  T
Q  199 cttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtg 239  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16097556 cttagtttctaatctctaagatcaactcacatcaactcgtg 16097596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 2 - 235
Target Start/End: Original strand, 14234517 - 14234753
Alignment:
Q  2 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc-a 100  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||| ||| |    
T  14234517 tcatgcagcttagttaaataacaagcagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatcataaacatcaa 14234616  T
Q  101 acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactga--aataacaacagcaagat-aaca 197  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | |  ||||||||||||||||  || ||||||| |||||| || |    
T  14234617 acataattcatgtaatgtatatacaattatataacattagcaacaacattagatta-aacaattcaggcttactgaacaacaacaacaacaagataaata 14234715  T
Q  198 acttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaact 235  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  14234716 acttagtttctaacctccaagatcaactaacatcaact 14234753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Original strand, 32307706 - 32307935
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  32307706 ctcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctcaattatca 32307804  T
Q  101 acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aacaac 199  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||        |||||  ||||||||||  |||||   | |||| ||||||  || ||  |||||||||| ||||||    
T  32307805 acataatccatttaatgtatatacaa--------cattataaacaacattaattcataagca-tcagtcttactagaacaatgacagcaagataaacaac 32307895  T
Q  200 ttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtg 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32307896 ttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtg 32307935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 13210419 - 13210182
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc- 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||   || |||||||     
T  13210419 ctcatgcagcttagttaaataacaaatagcaacataggcagtatgcaaaccatcatgatataataatatcgaatgcaaatcaacaa---cttaaatatca 13210323  T
Q  100 aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacatt-agatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aaca 197  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||| |  ||||||  | |||| ||||||| |||   |||| |||||| ||||    
T  13210322 aacataagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattgaattcatatgca-tcagccttactggaatgttaacaacaagataaaca 13210224  T
Q  198 acttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtg 239  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13210223 acttagtttctaacctctaggatcaactcacatcaactcgtg 13210182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 49668168 - 49667938
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaa-catctcaaatatc 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  ||||    
T  49668168 ctcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaat-caacaaacatctcatttatc 49668070  T
Q  100 aacataattcatataatgtatataca--attatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aac 196  Q
    |||||||| ||| ||| |||||||||  |||||||||    |||| ||||      ||||||  | |||| ||||||| || ||  |||||||||| |||    
T  49668069 aacataatccatttaaagtatatacagcattatatac----aacatcaac------tcatatgca-tcagtcttactggaacaatgacagcaagataaac 49667981  T
Q  197 aacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtg 239  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49667980 aacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtg 49667938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 12174351 - 12174164
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc- 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||     
T  12174351 ctcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa---aacaacaactcaaatatca 12174255  T
Q  100 aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaag 191  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||   ||||||  | |||| ||||||| || ||||||||||||    
T  12174254 aacataagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacattgattcatatgca-tcagtcttactggaacaacaacagcaag 12174164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 9 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 1644757 - 1644537
Alignment:
Q  9 gcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatcaacataatt 108  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||| ||||||||||||     
T  1644757 gcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatgcaaatcatcattatataacaatatcgaatacaa-tcaacaatatctcaattatcaacataatc 1644660  T
Q  109 catataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aacaacttagtttc 207  Q
    ||| ||||||||||||||        |||||  |||||||| |  ||||||  | |||| ||||||| || || |||| |||||| ||||||||||||||    
T  1644659 catttaatgtatatacaa--------cattataaacaacatcaattcatatgca-tcagtcttactggaacaataacaacaagataaacaacttagtttc 1644569  T
Q  208 taacctctaagatcaactcacatcaactcgtg 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1644568 taacctctaagatcaactcacatcaactcgtg 1644537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 2 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 37251259 - 37251020
Alignment:
Q  2 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc 99  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||  ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||  |||    
T  37251259 tcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatataaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaac-atc 37251161  T
Q  100 a-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagataa-ca 197  Q
    | | ||||||||| ||||| ||||||| ||||||  |||||  |||||||| | ||||||| ||||||| ||||||| || |||||||| ||||||| ||    
T  37251160 ataaataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatcaaatcatat-aattcagacttactggaacaacaacagtaagataaaca 37251062  T
Q  198 acttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtg 239  Q
    ||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  37251061 acttagtttcttacccccaagatcaactcacatcaactcgtg 37251020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 9512949 - 9513171
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatca 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||  |||||    
T  9512949 ctcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaat----caacatctcatttatca 9513044  T
Q  101 acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aacaac 199  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| ||        |||||  |||||||| |  ||||||  | |||| ||||||| || || |||| |||| | ||||||    
T  9513045 acataatccatttaatgtatataaaa--------cattataaacaacatcaattcatatgca-tcagtcttactggaacaataacaacaaggtaaacaac 9513135  T
Q  200 ttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaact 235  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  9513136 ttagtttctaacctctaagattaactcacataaact 9513171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 9520924 - 9521146
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatca 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||  |||||    
T  9520924 ctcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaat----caacatctcatttatca 9521019  T
Q  101 acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagataa-caac 199  Q
    ||||||| ||| |||||||||||  |        |||||  |||||||| |  ||||||  || ||| ||||||| || || |||| |||| ||| ||||    
T  9521020 acataatccatttaatgtatataaca--------cattataaacaacatcaattcatatgcat-cagtcttactggaacaataacaacaaggtaaacaac 9521110  T
Q  200 ttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaact 235  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  9521111 ttagtttctaacctctaagattaactcacataaact 9521146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 80 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 1465423 - 1465264
Alignment:
Q  80 tcaacaacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaat 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||| || ||||||||||  | |  ||| ||||||||||| |||    
T  1465423 tcaacaacatctcaaatatcaacataattcatgtaatgtatatacaattgtataacattatcatcaacattagaata-aacaatccaggcttactggaat 1465325  T
Q  180 aacaacagcaagat-aacaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtg 239  Q
     ||| || |||| | || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1465324 gacagcatcaaggtaaataacttagtttctaacctccaagatcaactcacatcaactcgtg 1465264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 81 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 49389642 - 49389483
Alignment:
Q  81 caacaacatctcaaatatcaa-cataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaat 179  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||| |  ||||||  || ||| ||||||| ||     
T  49389642 caacaacatctcaactatcaaacataattcatttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgcat-cagtcttactggaac 49389544  T
Q  180 aacaacagcaagataa-caacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtg 239  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  49389543 aacaacaacaagataaacaacttagtttctaacctctaagatcaacacacatcaactcgtg 49389483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 52523821 - 52523669
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaata- 97  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |     
T  52523821 ctcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaaacagttcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaacat 52523722  T
Q  98 tca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacat 149  Q
    ||| | ||||||||  ||||| ||||||||||||||  |||||  ||||||||    
T  52523721 tcatatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacat 52523669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 22110444 - 22110204
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 98  Q
    ||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||   ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||  ||    
T  22110444 ctcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtacataaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacagcatctcaac-at 22110346  T
Q  99 ca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagataa-c 196  Q
    || | | ||||||| |||||  |||||| ||||||  |||||  |||||| | | ||||||  |||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |    
T  22110345 catatagaattcatgtaatgcgtatacatttatatcacattattaacaacttcaaatcatac-aattcaggcttactgaaacaacaacagtaagataagc 22110247  T
Q  197 aacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtg 239  Q
    |||||||||||| |||   | |||||||||||||||| |||||    
T  22110246 aacttagtttcttaccctcatgatcaactcacatcaattcgtg 22110204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Original strand, 27165276 - 27165373
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 98  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| || ||||||||| ||||||| ||||||| ||| ||| |||||||||||    
T  27165276 ctcatgcagcttagttaaataacaaacagcaatatagacagtatgcaaaacaacatgatataccaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatat 27165373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 24340815 - 24340665
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatca 100  Q
    |||||||||||||||||| |||| | ||||||||||  ||||||||| | ||||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||||||||||      
T  24340815 ctcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacatatgcagtatgcacaacatcatgatataataatatcgaacgcaagtaaacaacatctcaaatattc 24340716  T
Q  101 ac--ataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacat 149  Q
    ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||  |||||  ||||||||    
T  24340715 acatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacat 24340665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Original strand, 23274716 - 23274813
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 98  Q
    |||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||||||||||    
T  23274716 ctcatgcaacttagttaattaacaatcagcaacataggcagtatgcaaaacatcatgatataataatatcgaacgcaagtaaacaacatctcaaatat 23274813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Original strand, 12399238 - 12399335
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaa-tcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 98  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| ||| ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  12399238 ctcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataataatatcaaatgcaattcaacaacatcttaaatat 12399335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 53301643 - 53301545
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattca-acaacatctcaaatat 98  Q
    ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||| |||  ||| |||||||||||    
T  53301643 ctcatacaacttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaacatgatataacaatatcaaatgcaagtcattcaatatctcaaatat 53301545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Original strand, 43925987 - 43926121
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 98  Q
    ||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||   ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||    
T  43925987 ctcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtacataaaacagctcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaacat 43926086  T
Q  99 ca-acataattcatataatgtatatacaattatat 132  Q
    || | | ||||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  43926087 catatacaattcatgtaatgcatatacatttatat 43926121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 37642357 - 37642207
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaat-atc 99  Q
    |||||||||||||||||  |||  | ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| | | || | ||||||||||||||| |||    
T  37642357 ctcatgcagcttagttagttaatgatcagcaacataggcagtatgcaaaacatcatgatataataatatcgcacgtaagtaaacaacatctcaaataatc 37642258  T
Q  100 a-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacat 149  Q
    | | ||||||||  ||||| ||||||||||||||  |||||  ||||||||    
T  37642257 acatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacat 37642207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Original strand, 42386439 - 42386536
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaat-catcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 98  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||  || ||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  42386439 ctcatgcagtttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataacaatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaatat 42386536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 142 - 239
Target Start/End: Original strand, 43927304 - 43927401
Alignment:
Q  142 aacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagataa-caacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtg 239  Q
    |||||||| | ||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| ||| | | ||||||||||||||||||||||    
T  43927304 aacaacatcaaatcatat-aattcaggcttactgaaacaacaacagtaagataagcaacttagtttcttacccccatgatcaactcacatcaactcgtg 43927401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 184 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 12934221 - 12934165
Alignment:
Q  184 acagcaagataa-caacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtg 239  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12934221 acagcaagataaacaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtg 12934165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Original strand, 14572618 - 14572714
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 98  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| |||||| | ||  | |||||||||||| ||||||    
T  14572618 ctcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacatagacagtatacaaaacagcatgacataataatatcaattgagagtcaacaacatcttaaatat 14572714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Original strand, 21618475 - 21618570
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 98  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | ||||||| |||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  21618475 ctcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-acagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaatat 21618570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Original strand, 36166624 - 36166719
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 98  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| || |||||| |||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  36166624 ctcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacacag-cagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaatat 36166719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 606418 - 606324
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaa 94  Q
    ||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||| |   ||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  606418 ctcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagcacataaatcagttcatgatataacaatatc-aatgcaattcaacaacatctcaa 606324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 91
Target Start/End: Original strand, 18438563 - 18438653
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaat-catcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatct 91  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||  || |||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||    
T  18438563 ctcatgtagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgatataataatatcaaatgcaagtcaacaacatct 18438653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 43550615 - 43550482
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaat-catcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc 99  Q
    ||||||||||||||||||||||  | ||||||||||  |||||||||||  || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||     
T  43550615 ctcatgcagcttagttaaataatga-cagcaacatatgcagtatgcaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattatt 43550517  T
Q  100 aacata--attcatataatgtatatacaattatat 132  Q
     |||||  |||||  ||||||||||||||||||||    
T  43550516 cacatataattcaagtaatgtatatacaattatat 43550482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Original strand, 14972883 - 14972980
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaat-catcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 98  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||| ||||  || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||    
T  14972883 ctcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaaatcaacaacatctcatatat 14972980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Original strand, 17487885 - 17487982
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 98  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | ||||||||| |||||||| ||||||    
T  17487885 ctcatgcagcttagttaaataa-caacagcaaaatagacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaattcatcaacatcttaaatat 17487982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Original strand, 17499367 - 17499464
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 98  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | ||||||||| |||||||| ||||||    
T  17499367 ctcatgcagcttagttaaataa-caacagcaaaatagacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaattcatcaacatcttaaatat 17499464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 11424851 - 11424783
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatc 70  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||    
T  11424851 ctcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataacaatatc 11424783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 2 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 22147616 - 22147467
Alignment:
Q  2 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaat-atca 100  Q
    ||||||||||||||||  |||  | ||||||| ||| | ||||||||| ||||||||||||| ||||||| | | || | ||||||||||||||| ||||    
T  22147616 tcatgcagcttagttagttaatgatcagcaacgtaggcggtatgcaaaacatcatgatataataatatcgcacgtaagtaaacaacatctcaaataatca 22147517  T
Q  101 -acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacat 149  Q
     | ||||||||  ||||| ||||||||||||||  |||||  ||||||||    
T  22147516 catataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacat 22147467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 24153300 - 24153204
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 98  Q
    ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||  ||||| |||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||||||| ||||||    
T  24153300 ctcatgcagcttagttaaataacgat-agcaacataggtagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatcttaaatat 24153204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 34 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 2051260 - 2051141
Alignment:
Q  34 atagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaata-tca-acataattcatataatgtatatacaatta 129  Q
    |||| ||||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| | ||| | ||||||||  ||||| |||||||||||    
T  2051260 ataggcagtatgcaaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaacattcatatataattcaagtaatgcatatacaatta 2051161  T
Q  130 tataccattaacaacaacat 149  Q
    |||  |||||  ||||||||    
T  2051160 tatcacattataaacaacat 2051141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 7781483 - 7781351
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||     
T  7781483 ctcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaaatcaacaacgtctcaattatt 7781386  T
Q  100 aac--ataattcatataatgtatatacaattatat 132  Q
     ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  7781385 cacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 7781351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Original strand, 8899120 - 8899252
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||     
T  8899120 ctcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattatt 8899217  T
Q  100 aac--ataattcatataatgtatatacaattatat 132  Q
     ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  8899218 cacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 8899252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 16282947 - 16282815
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| ||||| |||||||| |||||||| |||||| |||     
T  16282947 ctcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatattgaatgcaagtcaacaacgtctcaattatt 16282850  T
Q  100 aac--ataattcatataatgtatatacaattatat 132  Q
     ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  16282849 cacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 16282815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 17446791 - 17446659
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||     
T  17446791 ctcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattatt 17446694  T
Q  100 aacata--attcatataatgtatatacaattatat 132  Q
     |||||  |||||  ||||| ||||||||||||||    
T  17446693 cacatatcattcaagtaatgcatatacaattatat 17446659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Original strand, 17463204 - 17463336
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||     
T  17463204 ctcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattatt 17463301  T
Q  100 aac--ataattcatataatgtatatacaattatat 132  Q
     ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  17463302 cacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 17463336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Original strand, 17672652 - 17672784
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||     
T  17672652 ctcatgcagcttagttaaataa-caacaacaacatag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaaatcaacaacgtctcaattatt 17672749  T
Q  100 aac--ataattcatataatgtatatacaattatat 132  Q
     ||  |||||||| |||||| ||||| ||||||||    
T  17672750 cacatataattcaaataatgcatatataattatat 17672784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 29172719 - 29172587
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||     
T  29172719 ctcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattatt 29172622  T
Q  100 aac--ataattcatataatgtatatacaattatat 132  Q
     ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  29172621 cacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 29172587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Original strand, 34159352 - 34159484
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||     
T  34159352 ctcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattatt 34159449  T
Q  100 aac--ataattcatataatgtatatacaattatat 132  Q
     ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  34159450 cacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 34159484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 38962027 - 38961895
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||     
T  38962027 ctcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattatt 38961930  T
Q  100 aac--ataattcatataatgtatatacaattatat 132  Q
     ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  38961929 cacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 38961895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 45607043 - 45606911
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||     
T  45607043 ctcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattatt 45606946  T
Q  100 aac--ataattcatataatgtatatacaattatat 132  Q
     ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  45606945 cacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 45606911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 53070789 - 53070657
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| | ||| || || || |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||     
T  53070789 ctcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacata-acagtatacaaaaacaacaagacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattatt 53070692  T
Q  100 aac--ataattcatataatgtatatacaattatat 132  Q
     ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  53070691 cacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 53070657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Original strand, 55476517 - 55476649
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||     
T  55476517 ctcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattatt 55476614  T
Q  100 aac--ataattcatataatgtatatacaattatat 132  Q
     ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  55476615 cacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 55476649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Original strand, 13442303 - 13442400
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 98  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | ||||||||| |||||||| ||||||    
T  13442303 ctcatgcagcttagttaaataa-caacggcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattgcaattcatcaacatcttaaatat 13442400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Original strand, 43840961 - 43841058
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 98  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | ||||| |||||| ||||| ||||||    
T  43840961 ctcatgcagcttagttaaataa-caacaacaacatagacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacatcatcttaaatat 43841058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 14576924 - 14576828
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 98  Q
    ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  | | || ||||| |||| |||||| | ||||| |||||||||||| ||||||    
T  14576924 ctcattcaacttagttaaataac-aacagcaacatagacagtataaacaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatcttaaatat 14576828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 41
Target Start/End: Original strand, 28194719 - 28194759
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacag 41  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28194719 ctcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacag 28194759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 28848747 - 28848618
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||     
T  28848747 ctcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattatt 28848650  T
Q  100 aac--ataattcatataatgtatatacaatta 129  Q
     ||  ||||||||  ||||| |||||||||||    
T  28848649 cacatataattcaagtaatgcatatacaatta 28848618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 9707743 - 9707611
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||| ||| |||||||| |||||| |||     
T  9707743 ctcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatacaagtcaacaacgtctcaattatt 9707646  T
Q  100 aac--ataattcatataatgtatatacaattatat 132  Q
     ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  9707645 cacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 9707611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Original strand, 12567586 - 12567718
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||| | ||| |||||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||     
T  12567586 ctcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacacag-caatatacaaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattatt 12567683  T
Q  100 aac--ataattcatataatgtatatacaattatat 132  Q
     ||  ||||||||  ||||| ||||| ||||||||    
T  12567684 cacatataattcaagtaatgcatatataattatat 12567718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Original strand, 13544051 - 13544183
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||| | ||| |||||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||     
T  13544051 ctcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacacag-caatatacaaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattatt 13544148  T
Q  100 aac--ataattcatataatgtatatacaattatat 132  Q
     ||  ||||||||  ||||| ||||| ||||||||    
T  13544149 cacatataattcaagtaatgcatatataattatat 13544183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 16454417 - 16454285
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc 99  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||     
T  16454417 ctcatgcaacttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattatt 16454320  T
Q  100 aac--ataattcatataatgtatatacaattatat 132  Q
     ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  16454319 cacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 16454285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 20698527 - 20698437
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatct 91  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | ||| || |||||  ||| |||||| | ||||||||| ||||||||    
T  20698527 ctcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacgtaataatatcaattgcaattcatcaacatct 20698437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 6469270 - 6469178
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaa 94  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| ||||||    
T  6469270 ctcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaa 6469178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 23083453 - 23083356
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 98  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| | ||| ||  |||| |||| |||||| | ||||| |||||||||||| ||||||    
T  23083453 ctcatgcagcttagttaaataa-caatagcaacataggcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatcttaaatat 23083356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Original strand, 26686916 - 26687013
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 98  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | ||||| |||||| ||||| ||||||    
T  26686916 ctcatgcagcttagttaaataa-caacaacaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacatcatcttaaatat 26687013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 40213812 - 40213720
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgca-aatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaa 94  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||| ||||| || |||||| || || |||||||| |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  40213812 ctcatgtagcttagttaaataac-aacatcaacacag-cagtatacataaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaa 40213720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 89
Target Start/End: Original strand, 55500968 - 55501055
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacat 89  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| ||||||||||    
T  55500968 ctcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacat 55501055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 13151927 - 13151794
Alignment:
Q  1 ctcatgcagctt-agttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaat-catcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 98  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||  || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||    
T  13151927 ctcatgcagctttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattat 13151830  T
Q  99 caacata--attcatataatgtatatacaattatat 132  Q
      |||||  |||||  ||||| ||||||||||||||    
T  13151829 tcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 13151794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 13154392 - 13154259
Alignment:
Q  1 ctcatgcagctt-agttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaat-catcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 98  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||  || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||    
T  13154392 ctcatgcagctttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattat 13154295  T
Q  99 caacata--attcatataatgtatatacaattatat 132  Q
      |||||  |||||  ||||| ||||||||||||||    
T  13154294 tcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 13154259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 10247859 - 10247727
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc 99  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||| || | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||     
T  10247859 ctcatacagcttagttaaataa-caacagcagcaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattatt 10247762  T
Q  100 aac--ataattcatataatgtatatacaattatat 132  Q
     ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  10247761 cacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 10247727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 25476477 - 25476384
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaat-catcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaa 94  Q
    |||||| |||||||||||| ||| |||||||||| ||  ||||| ||||  || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  25476477 ctcatgtagcttagttaaaaaac-aacagcaacacaggtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaa 25476384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 206 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 12171992 - 12171963
Alignment:
Q  206 tctaacctctaagatcaactcacatcaact 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12171992 tctaacctctaagatcaactcacatcaact 12171963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 153; Significance: 3e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Original strand, 12795 - 13034
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc- 99  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||| |||     
T  12795 ctcatgcagcttagctaaataacaaacaacaacataggcaatatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatcataaacatca 12894  T
Q  100 aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aacaa 198  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||| ||| |    
T  12895 aacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattaataacaacattagatcata-taattcaggcttactggaacaacaacagcaagataaacca 12993  T
Q  199 cttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtg 239  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12994 cttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtg 13034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 152; Significance: 1e-80; HSPs: 47)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 39706380 - 39706142
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||  ||| ||||    
T  39706380 ctcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatgaacatcataaacatca 39706281  T
Q  101 acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aacaac 199  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||    
T  39706280 acataattcatgtaatgtatatacaattatataacattagcaacaacattagatcata-taattcaggcttactaaaacaacaacagcaagataaacaac 39706182  T
Q  200 ttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtg 239  Q
    ||| || |||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  39706181 ttaattcctaatctccaagatcaactcacatcaactcgtg 39706142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 12288302 - 12288066
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 98  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | || ||    
T  12288302 ctcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaccagttcatgatataacaatatcaaatgcaattcaacaacatcac-aacat 12288204  T
Q  99 c-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aac 196  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  12288203 caaacataattcatgtaatgtatatacaactatataacattaccaacaacattaaatcata-taattcaggcttactgaaacaacaacagcaagataaac 12288105  T
Q  197 aacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaact 235  Q
    |||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||    
T  12288104 aacttagtttcctacctccaagatcaactcacatcaact 12288066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Original strand, 12774036 - 12774265
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||    
T  12774036 ctcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatacaa-tcaacaacatctcaattatca 12774134  T
Q  101 acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aacaac 199  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||        |||||  |||||||| |  ||||||  | |||| ||||||| || |||||||||||||| ||||||    
T  12774135 acataatccatttaatgtatatacaa--------cattataaacaacatcaattcatatgca-tcagtcttactggaacaacaacagcaagataaacaac 12774225  T
Q  200 ttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtg 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12774226 ttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtg 12774265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 13943 - 13703
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaata-tc 99  Q
    ||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||| ||    
T  13943 ctcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaacaacatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacatctcaaatattc 13844  T
Q  100 a-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aaca 197  Q
    | | ||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||  |||||||| | ||||||  |  |||| ||||||| || | |||||  ||||| ||||    
T  13843 atatataattcaagtaatgtatatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcata-aacatcagtcttactggaacatcaacataaagataaaca 13745  T
Q  198 acttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtg 239  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13744 acttagtttcttacctctaagatcaactcacatcaactcgtg 13703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 7 - 239
Target Start/End: Original strand, 8846391 - 8846640
Alignment:
Q  7 cagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgc----------------aattcaacaacatc 90  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||                || ||| |||||||    
T  8846391 cagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgagataacaatatcgaatgctaacaatatcgaatgcaagtcatcaacatc 8846490  T
Q  91 tcaaatatcaa-cataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagca 189  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||| |  ||||||  || ||| ||||||| || ||||||  ||    
T  8846491 tcaaatatcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgcat-cagtcttactggaacaacaactaca 8846589  T
Q  190 agataa-caacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtg 239  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  8846590 agataaacaacttagtttctaatctctaagttcaactcacatcaactcgtg 8846640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 80 - 236
Target Start/End: Original strand, 15099457 - 15099613
Alignment:
Q  80 tcaacaacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaat 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||  |||  ||| ||||||||||| |||    
T  15099457 tcaacaacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaattatataacattatcatcaacattagaatata-caatccaggcttactggaat 15099555  T
Q  180 aacaacagcaagat-aacaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactc 236  Q
     |||||| |||| | || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15099556 gacaacatcaaggtaaataacttagtttctaacctccaagatcaactcacatcaactc 15099613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 80 - 239
Target Start/End: Original strand, 15190424 - 15190583
Alignment:
Q  80 tcaacaacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaat 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||  |||  ||| ||||||||||| |||    
T  15190424 tcaacaacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaattatataacattatcatcaacattagaatata-caatccaggcttactggaat 15190522  T
Q  180 aacaacagcaagat-aacaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtg 239  Q
     |||||| |||| | || |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  15190523 gacaacatcaaggtaaataacttagtttctaacccccaagatcaactcacatcaactcgtg 15190583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Original strand, 15551846 - 15552079
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc- 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| ||||||||| | || |||||||   ||||| ||||     
T  15551846 ctcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaatccatcatgatataataatatcgaaggtaaatcaacaa---ctcaattatca 15551942  T
Q  100 aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagataacaac 199  Q
    ||| ||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||  | |||||||   |||||   | |||| |||||||  | |  ||||||| | |||||||    
T  15551943 aacttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattgattcataagca-tcagtcttactgggacattaacagcagggtaacaac 15552041  T
Q  200 ttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcg 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15552042 ttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcg 15552079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 53082244 - 53082003
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 98  Q
    ||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||  |||||   ||| ||  |||||||||||||||||| || |||| |||| ||||||||||| ||    
T  53082244 ctcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataagcagtacataaaacagttcatgatataacaatatcaaa-gcaaatcaataacatctcaaacat 53082146  T
Q  99 ca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagataa-c 196  Q
    || | ||||||||| ||||| ||||||| ||||||  |||||  |||||||| | ||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |    
T  53082145 catatataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatcaaatcatat-aattcaggcttactgaaacaacaacagtaagataagc 53082047  T
Q  197 aacttagtttc-taacctctaagatcaactcacatcaactcgtg 239  Q
    ||||||||||| || || | ||||||||||||||||||||||||    
T  53082046 aacttagtttcttaccccccaagatcaactcacatcaactcgtg 53082003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 10 - 237
Target Start/End: Original strand, 16596686 - 16596911
Alignment:
Q  10 cttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc-aacataatt 108  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||   ||||| |||| ||| ||| |    
T  16596686 cttagttaaataacaaacagcaacataggtagtatgcaaaccatcatgatataataatatcgaatgtaaatcatcaa---ctcaattatcaaacttaagt 16596782  T
Q  109 catataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aacaacttagtttc 207  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||  | |||   | |||| ||||||  || |  ||||||||| | ||||||||||||||    
T  16596783 catgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattaatttataagca-tcagtcttacttgaacattaacagcaaggtaaacaacttagtttc 16596881  T
Q  208 taacctctaagatcaactcacatcaactcg 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16596882 taacctctaagatcaactcacatcaactcg 16596911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 46640548 - 46640309
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 98  Q
    ||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||  ||| ||  |||||||||||||||||| |||| || |||| |||||||| || ||    
T  46640548 ctcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacatagacagtatataaaacagttcatgatataacaatatcaaatgaaaatcaataacatctc-aacat 46640450  T
Q  99 ca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagataa-c 196  Q
    || | ||||||||| ||||| ||||||| ||||||  ||| |  |||||||| | |||||| ||||||||| ||||||||| || ||||| ||||||| |    
T  46640449 catatataattcatgtaatgcatatacatttatatcacatcattaacaacatcaaatcata-taattcaggtttactgaaacaataacagtaagataagc 46640351  T
Q  197 aacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtg 239  Q
    |||||||||||| ||| | | ||||||||||||||||||||||    
T  46640350 aacttagtttcttacc-ccatgatcaactcacatcaactcgtg 46640309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 43198647 - 43198408
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaata- 97  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||  |||||||||||| ||||| ||||||| ||| ||| ||||||||||     
T  43198647 ctcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacaatatgcaaaacaattcatgatataaccatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatat 43198548  T
Q  98 tca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aa 195  Q
    ||| | ||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||  |||||||| |  ||||||  ||| || ||||||| || | ||||| |||||| ||    
T  43198547 tcatatataattcaagtaatgtatatacaattatatcacattataaacaacatcaattcatatgcatt-agtcttactggaacatcaacaacaagataaa 43198449  T
Q  196 caacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtg 239  Q
    ||||||||||| | ||||||   | |||||||||||||||||||    
T  43198448 caacttagttttttacctct---agcaactcacatcaactcgtg 43198408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 52243288 - 52243192
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaa 95  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  52243288 ctcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcagttcatgatataacaatatcaaatgaaattcaacaacatctcaaa 52243192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 16377613 - 16377522
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaa 94  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  16377613 ctcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaa-cagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaa 16377522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 23374451 - 23374354
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaa-tcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 98  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| ||| ||||| ||||  ||||| | |||||||||||||||||| ||||||    
T  23374451 ctcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaattgcaattcaacaacatcttaaatat 23374354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 8574959 - 8574864
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 98  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | ||||||| |||| || ||||| |||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  8574959 ctcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-acagtatacaaaacaacatgacataataatatcaaatgtaattcaacaacatctcaaatat 8574864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Original strand, 44615314 - 44615446
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaat-catcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| ||||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||     
T  44615314 ctcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaatacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattatt 44615411  T
Q  100 aac--ataattcatataatgtatatacaattatat 132  Q
     ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  44615412 cacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 44615446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 16270327 - 16270231
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 98  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| |||||| |||| || ||||| |||| |||||| ||||||| | |||||||||| ||||||    
T  16270327 ctcatgcagcttaattaaataa-caatagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagttaacaacatcttaaatat 16270231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 12443 - 12311
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||     
T  12443 ctcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattatt 12346  T
Q  100 aac--ataattcatataatgtatatacaattatat 132  Q
     ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  12345 cacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 12311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 91
Target Start/End: Original strand, 7088906 - 7088996
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatct 91  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | ||||||||| ||||||||    
T  7088906 ctcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaattcatcaacatct 7088996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 15118488 - 15118356
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||     
T  15118488 ctcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattatt 15118391  T
Q  100 aac--ataattcatataatgtatatacaattatat 132  Q
     ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  15118390 cacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 15118356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 18215410 - 18215278
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||     
T  18215410 ctcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattatt 18215313  T
Q  100 aac--ataattcatataatgtatatacaattatat 132  Q
     ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  18215312 cacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 18215278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 19618308 - 19618176
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| | ||| |||||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||     
T  19618308 ctcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacacag-cagtatacaaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattatt 19618211  T
Q  100 aac--ataattcatataatgtatatacaattatat 132  Q
     ||  ||||||||  ||||| ||||| ||||||||    
T  19618210 cacctataattcaagtaatgcatatataattatat 19618176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 44773223 - 44773091
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||     
T  44773223 ctcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattatt 44773126  T
Q  100 aac--ataattcatataatgtatatacaattatat 132  Q
     ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  44773125 cacaaataattcaagtaatgcatatacaattatat 44773091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Original strand, 52312536 - 52312668
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||     
T  52312536 ctcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattatt 52312633  T
Q  100 aac--ataattcatataatgtatatacaattatat 132  Q
     ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  52312634 cacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 52312668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Original strand, 7798803 - 7798900
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 98  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | ||||| ||| |||||||| ||||||    
T  7798803 ctcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcatcaacatcttaaatat 7798900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Original strand, 12902786 - 12902883
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 98  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | || |||||| |||||||| ||||||    
T  12902786 ctcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaattcatcaacatcttaaatat 12902883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Original strand, 14280342 - 14280438
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaat-catcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 98  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  | |||||| ||||  || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  14280342 ctcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacgg-cagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaatat 14280438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Original strand, 22636464 - 22636561
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 98  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| | | ||| || ||||| |||| |||||| | ||||||||| |||||||| ||||||    
T  22636464 ctcatgcagcttagttaaataa-caacaacaacatagacagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaattcatcaacatcttaaatat 22636561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 54798846 - 54798749
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaat-catcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 98  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||| |  |||||| ||||  || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  54798846 ctcatgcagcttagttgaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaatat 54798749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Original strand, 6899920 - 6900016
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 98  Q
    |||||||| |||||||||||||| || |||||||||| |||||| |||| || |||   |||| |||||| ||||||| |||||||||||| ||||||    
T  6899920 ctcatgcatcttagttaaataac-aatagcaacataggcagtatacaaaacaacatagcataataatatcaaatgcaagtcaacaacatcttaaatat 6900016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 16240061 - 16239965
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 98  Q
    |||||||| |||| ||||||||| || ||||| |||| |||||| |||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||||||| ||||||    
T  16240061 ctcatgcaacttaattaaataac-aatagcaaaataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatcttaaatat 16239965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 52873459 - 52873363
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaata 97  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | ||||| |||||| ||||| |||||    
T  52873459 ctcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacatcatcttaaata 52873363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 44929016 - 44928883
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| ||| || ||||||| |||| |||||||||| |||     
T  44929016 ctcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacacaagcagtatacaaaaacagcatgacataataatgtcaaatgcaagtcaataacatctcaattatt 44928918  T
Q  100 aac--ataattcatataatgtatatacaattatat 132  Q
     ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  44928917 cacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 44928883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Original strand, 14038677 - 14038770
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaa 94  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  |||||| | ||| || ||||  |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  14038677 ctcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacacatgcagtatacaaaaacaacatggcataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaa 14038770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Original strand, 44052858 - 44052955
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 98  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | ||||||||| |||||||| ||||||    
T  44052858 ctcatgcagctcagttaaataa-caacatcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaattcatcaacatcttaaatat 44052955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 2 - 98
Target Start/End: Original strand, 7893733 - 7893829
Alignment:
Q  2 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 98  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | ||||| |||||| ||||| ||||||    
T  7893733 tcatgcagcttagttaaataa-caatagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacatcatcttaaatat 7893829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 54 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 15464970 - 15464929
Alignment:
Q  54 catgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaa 95  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  15464970 catgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaa 15464929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 49
Target Start/End: Original strand, 3096322 - 3096369
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaa 49  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||    
T  3096322 ctcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagtatacaaa 3096369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 14053393 - 14053306
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacat 89  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||| || |||||||||||| |||| || ||||| |||| |||||| | | ||||||| ||||||    
T  14053393 ctcatgcaacttagttaaataacaaacaacagcatagacagtatacaaa-cagcatgacataataatatcaatttcaattcatcaacat 14053306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 37
Target Start/End: Original strand, 17046516 - 17046552
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatag 37  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17046516 ctcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatag 17046552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 18239555 - 18239426
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| || | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||     
T  18239555 ctcatgcagcttagttaaataa-caacagcagcaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattatt 18239458  T
Q  100 aac--ataattcatataatgtatatacaatta 129  Q
     ||  ||||||||  ||||| |||||||||||    
T  18239457 cacatataattcaagtaatgcatatacaatta 18239426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 1837645 - 1837513
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||| | ||||||| |||||||| |||||| |||     
T  1837645 ctcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataataccaaatgcaagtcaacaacgtctcaattatt 1837548  T
Q  100 aac--ataattcatataatgtatatacaattatat 132  Q
     ||  ||||||||  ||||| |||||| |||||||    
T  1837547 cacatataattcaagtaatgcatatacgattatat 1837513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Original strand, 19242725 - 19242857
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||     
T  19242725 ctcatgcagcttagttaaataa-caacagcgacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattatt 19242822  T
Q  100 aac--ataattcatataatgtatatacaattatat 132  Q
     ||  ||||||||  ||||| ||||| ||||||||    
T  19242823 cacatataattcaagtaatgcatatataattatat 19242857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 43
Target Start/End: Original strand, 17333306 - 17333347
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagta 43  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  17333306 ctcatgcagcttagttaa-taaacaacagcaacatagacagta 17333347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 141 - 229
Target Start/End: Original strand, 14164719 - 14164807
Alignment:
Q  141 caacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aacaacttagtttctaacctctaagatcaactcaca 229  Q
    |||||||||  |||||||| | ||||||||||||  || |||||||||||||| |||||||||||| | |||| ||| ||||| ||||||    
T  14164719 caacaacataggatcatatga-ttcaggcttactagaacaacaacagcaagataaacaacttagttcccaacccctaggatcatctcaca 14164807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 15355461 - 15355328
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaa-caacatctcaaatat 98  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||| || |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||| |||| |||||| |||    
T  15355461 ctcatgcagcttagttaaataa-caacagcgacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaatcaacgtctcaattat 15355364  T
Q  99 caac--ataattcatataatgtatatacaattatat 132  Q
      ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  15355363 tcacatataattcaattaatgcatatacaattatat 15355328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 150; Significance: 2e-79; HSPs: 44)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 21502248 - 21502007
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatca 100  Q
    ||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||| ||| ||||    
T  21502248 ctcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgtaaatcagcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcatcatcttaaacatca 21502149  T
Q  101 a-cataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aacaa 198  Q
    | |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  21502148 aacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaacaacaacagcaagataaacaa 21502049  T
Q  199 cttag-tttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtg 239  Q
    ||||| |||||||| || |||||||||| |||||||||||||    
T  21502048 cttagttttctaacttccaagatcaactaacatcaactcgtg 21502007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 21329589 - 21329350
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc- 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||| |||||||  ||| |||     
T  21329589 ctcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcataatataacaatatcgaattcaagtcatcaacatcataaacatca 21329490  T
Q  100 aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aacaa 198  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||    
T  21329489 aacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattagcaacaacattagattata-caattcaggcttactgaaacaacaacaacaagataaacaa 21329391  T
Q  199 cttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtg 239  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21329390 cttagtttcttacctctaagatcaactcacatcaactcgtg 21329350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Original strand, 21565571 - 21565810
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc- 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||     
T  21565571 ctcatgcagcttagttaaataacaaatagcaacataggcagtatccaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatttcaaatatca 21565670  T
Q  100 aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aacaa 198  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||| |  ||||||  | |||| ||||||  || ||||||| |||||| |||||    
T  21565671 aacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgca-tcagtcttactagaacaacaacaacaagataaacaa 21565769  T
Q  199 cttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtg 239  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21565770 cttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtg 21565810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 26012127 - 26011888
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc- 99  Q
    ||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||  | |||||||||||||||| |||     
T  26012127 ctcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaagcaacatgatataacaatatcaaatgtgaatcaacaacatctcaaacatca 26012028  T
Q  100 aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aacaa 198  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||| ||| || |||||||||||||||| ||||| | |||||| |||||    
T  26012027 aacataattcatgtaatgtatatacaattatataacatcaacaacaacatcagattata-tagttcaggcttactgaaacaacaataacaagataaacaa 26011929  T
Q  199 cttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtg 239  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26011928 cttagtttctaacctccaagatcaactcacatcaactcgtg 26011888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 20027033 - 20026793
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 98  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| ||  ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||  ||    
T  20027033 ctcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatccaaaacagttcatgatataataatatcaaatgcaattcaacaacatcacaac-at 20026935  T
Q  99 caa-cataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagataa-c 196  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||| ||| ||| |||||||| |    
T  20026934 caaacataattcatgtaatgtatatacaactatatagcattatcaacaacattaaaacatat-aattcaggcttactgaaacaactacaacaagataaac 20026836  T
Q  197 aacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtg 239  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20026835 aacttagtttcttacctctaagatcaactcacatcgactcgtg 20026793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 22959624 - 22959392
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc- 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||   ||||||||||     
T  22959624 ctcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatattgaatgcaaatcaacaa---ctcaaatatca 22959528  T
Q  100 aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aacaa 198  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||   | |||||||   ||||||  | |||| ||||||| || || |||| |||||| |||||    
T  22959527 aacataagtcatgtaatgtatatacaattatataacattttaaccaacattgattcatatgca-tcagtcttactggaacaaaaacaacaagataaacaa 22959429  T
Q  199 cttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaact 235  Q
    ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22959428 cttggtttttaacctctaagatcaactcacatcaact 22959392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 5 - 235
Target Start/End: Original strand, 19668931 - 19669161
Alignment:
Q  5 tgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc-aaca 103  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||| ||||    
T  19668931 tgcagctcagttaaataacaaacaacaacatagacagtatgcaaatcatcgtgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaa---ctcaaatatcaaaca 19669027  T
Q  104 taattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacatta--gatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aacaact 200  Q
    ||| || | ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||| |    ||||||  | |||| ||||||| || ||||||| |||||| ||| |||    
T  19669028 taagtcctgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaatattcatatgca-tcagtcttactggaacaacaacaacaagataaacgact 19669126  T
Q  201 tagtttctaacctctaagatcaactcacatcaact 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19669127 tagtttctaacctctaagatcaactcacatcaact 19669161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 19660927 - 19660693
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc- 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||  |||||||||  || |||||||   ||||| ||||     
T  19660927 ctcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaccatcttgatataatgatatcgaatataaatcaacaa---ctcaattatca 19660831  T
Q  100 aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aacaa 198  Q
    ||| ||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||  |||||   | |||| ||||||| || |  ||||||||| | |||||    
T  19660830 aacttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattaattcataagca-tcagtcttactggaacattaacagcaaggtaaacaa 19660732  T
Q  199 cttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcg 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19660731 cttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcg 19660693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 22178313 - 22178072
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 98  Q
    |||||||| |||||||||  ||| |||| |||||||| ||||||  ||| ||  ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||    
T  22178313 ctcatgcaacttagttaataaacaaacaacaacataggcagtatataaaacagctcatgatatgacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaacat 22178214  T
Q  99 ca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagataa-c 196  Q
    || | ||||||||| ||||| ||||||| ||||||  |||||  ||||||||   |||||| ||||| ||| ||||||||| |||||||| ||||||| |    
T  22178213 catatataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatccaatcata-taatttaggtttactgaaacaacaacagtaagataagc 22178115  T
Q  197 aacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtg 239  Q
    |||||||||||| ||| | | ||||||||||||||||||||||    
T  22178114 aacttagtttcttacccccatgatcaactcacatcaactcgtg 22178072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 80 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 21741545 - 21741398
Alignment:
Q  80 tcaacaacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaat 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||            |||||||||  |||  ||| ||||||||||| |||    
T  21741545 tcaacaacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaattatat------------aacattagaatata-caatccaggcttactggaat 21741459  T
Q  180 aacaacagcaagataa-caacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtg 239  Q
     |||||| |||| |||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21741458 gacaacatcaaggtaattaacttagtttctaacctccaagatcaactcacatcaactcgtg 21741398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Original strand, 22144078 - 22144211
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaata-tc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||  |||||||||| || ||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||| | ||    
T  22144078 ctcatgcagcttagttaaataacagacatcaacataggtagtatgcaaaacaacatgatataacaatatcaattgcaaatcaacaacatctcaaacattc 22144177  T
Q  100 a-acataattcatataatgtatatacaattatat 132  Q
    | | ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  22144178 atatataattcaagtaatgcatatacaattatat 22144211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 73
Target Start/End: Original strand, 36314606 - 36314678
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaa 73  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  36314606 ctcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggtagtatgcaaaccatcatgatataataatatcgaa 36314678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 21729156 - 21729059
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaa-tcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 98  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| ||| ||||| |||| |||||| | |||||||||||||||||| ||||||    
T  21729156 ctcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataataatatcaattgcaattcaacaacatcttaaatat 21729059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 21808481 - 21808384
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaa-tcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 98  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| ||| ||||| |||| |||||| | |||||||||||||||||| ||||||    
T  21808481 ctcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataataatatcaattgcaattcaacaacatcttaaatat 21808384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 23390588 - 23390491
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 98  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | ||||||||| |||||||| ||||||    
T  23390588 ctcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacatagacagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattgcaattcatcaacatcttaaatat 23390491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 24 - 126
Target Start/End: Original strand, 29448054 - 29448159
Alignment:
Q  24 caacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatca-acataattcatataatgtat 120  Q
    |||||||||||||| ||||||  ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||| || |||||||| ||||| ||    
T  29448054 caacagcaacataggcagtatataaaacagctcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaacatcatacgtaattcatgtaatgcat 29448153  T
Q  121 atacaa 126  Q
    ||||||    
T  29448154 atacaa 29448159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 149
Target Start/End: Original strand, 40725882 - 40726032
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaat-atc 99  Q
    |||||||||||||||||  |||  | ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| | | || | ||||||||||||||| |||    
T  40725882 ctcatgcagcttagttagttaatgatcagcaacgtaggcagtatgcaaagcatcatgatataataatatcgcacgtaagtaaacaacatctcaaataatc 40725981  T
Q  100 a-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacat 149  Q
    | | ||||||||  ||||| ||||||||||||||  |||||  ||||||||    
T  40725982 acatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacat 40726032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Original strand, 22075048 - 22075145
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaa-tcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 98  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||| |||| ||| ||||| |||| |||||| | |||||||||||||||||| ||||||    
T  22075048 ctcattcagcttagttaaataac-aacagcaacataggaagtatacaaaatcaacatgacataataatatcaattgcaattcaacaacatcttaaatat 22075145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Original strand, 22412213 - 22412309
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 98  Q
    |||||| |||||||||||||||| |  | |||||||| |||||| |||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  22412213 ctcatgtagcttagttaaataacgataa-caacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaatat 22412309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Original strand, 24493598 - 24493694
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 98  Q
    |||||||||||| ||||| |||| || |||||||||| |||||| |||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||||||| ||||||    
T  24493598 ctcatgcagcttggttaagtaac-aatagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatcttaaatat 24493694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 94
Target Start/End: Original strand, 9077983 - 9078074
Alignment:
Q  3 catgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaa 94  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | ||||| |||||||||||||||    
T  9077983 catgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagtatacgaaaacagcatgacataataatatcaagtgcaagtcaacaacatctcaa 9078074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 264904 - 264772
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||     
T  264904 ctcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattatt 264807  T
Q  100 aac--ataattcatataatgtatatacaattatat 132  Q
     ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  264806 cacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 264772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 8286935 - 8286838
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc--aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaata 97  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |  ||| || ||||| |||| |||||| | ||||||||| |||||||| |||||    
T  8286935 ctcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagtatacaaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaattcatcaacatcttaaata 8286838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 10733076 - 10732944
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||     
T  10733076 ctcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattatt 10732979  T
Q  100 aac--ataattcatataatgtatatacaattatat 132  Q
     ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  10732978 cacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 10732944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 11581335 - 11581203
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||| ||| |||||| |||     
T  11581335 ctcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagtcaataacgtctcaattatt 11581238  T
Q  100 aac--ataattcatataatgtatatacaattatat 132  Q
     ||  ||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  11581237 cacgtataattcaagtaatgtatatacaattatat 11581203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Original strand, 29329960 - 29330092
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||     
T  29329960 ctcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattatt 29330057  T
Q  100 aac--ataattcatataatgtatatacaattatat 132  Q
     ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  29330058 cacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 29330092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Original strand, 39363410 - 39363542
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||     
T  39363410 ctcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattatt 39363507  T
Q  100 aac--ataattcatataatgtatatacaattatat 132  Q
     ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  39363508 cacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 39363542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Original strand, 1096496 - 1096593
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 98  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||  ||||||| ||| || ||| | |||| |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||    
T  1096496 ctcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacacaggtagtatgcaaaaacaacataacataataatatcaaatgcaaatcaacaacatctcacatat 1096593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Original strand, 13025340 - 13025436
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 98  Q
    |||||||||| |||||||||||| || |||||||||| |||||| |||| || ||||| |||   ||||| ||||||| |||||||||||| ||||||    
T  13025340 ctcatgcagcatagttaaataac-aatagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacatattgatatcaaatgcaagtcaacaacatcttaaatat 13025436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Original strand, 13095524 - 13095620
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 98  Q
    |||||||||| |||||||||||| || |||||||||| |||||| |||| || ||||| |||   ||||| ||||||| |||||||||||| ||||||    
T  13095524 ctcatgcagcatagttaaataac-aatagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacatattgatatcaaatgcaagtcaacaacatcttaaatat 13095620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 20902145 - 20902012
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaa--ata 97  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | ||||| |||||||| ||||||  ||     
T  20902145 ctcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaagtgcaagtcaacaacgtctcaattatt 20902048  T
Q  98 tca-acataattcatataatgtatatacaattatat 132  Q
    ||| | |||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  20902047 tcacatataattcaaataatgcatatacaattatat 20902012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 96
Target Start/End: Original strand, 25431423 - 25431518
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaat 96  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | ||||| |||||||||||| ||||    
T  25431423 ctcatgcatcttagttaaataa-caacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatcttaaat 25431518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Original strand, 20909038 - 20909170
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||     
T  20909038 ctcatgcagcttagttaaataa-caaaagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattatt 20909135  T
Q  100 aac--ataattcatataatgtatatacaattatat 132  Q
     ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  20909136 cacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 20909170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 91
Target Start/End: Original strand, 24529249 - 24529339
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatct 91  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| | ||| || ||||| ||||  ||||| ||||||| ||||||||||||    
T  24529249 ctcatgcagcttagttaaataa-caacaacaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataatgatatcaaatgcaagtcaacaacatct 24529339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 42245501 - 42245369
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc 99  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||     
T  42245501 ctcatgcaacttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattatt 42245404  T
Q  100 aac--ataattcatataatgtatatacaattatat 132  Q
     ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  42245403 cacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 42245369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 21997626 - 21997549
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa 78  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||||||    
T  21997626 ctcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaa 21997549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Original strand, 25421561 - 25421658
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 98  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | ||||| |||||| ||||| ||||||    
T  25421561 ctcatgcagcttagttaaataa-caacaacaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattgcaagtcaacagcatcttaaatat 25421658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 38 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 20766175 - 20766115
Alignment:
Q  38 acagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 98  Q
    ||||||| |||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  20766175 acagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaatat 20766115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Original strand, 29346006 - 29346138
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc 99  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||| || | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||     
T  29346006 ctcatacagcttagttaaataa-caacagcatcaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattatt 29346103  T
Q  100 aac--ataattcatataatgtatatacaattatat 132  Q
     ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  29346104 cacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 29346138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 44
Target Start/End: Original strand, 37723932 - 37723975
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtat 44  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||    
T  37723932 ctcatgcagcttagttaaataacagacagcaacataggcagtat 37723975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 2 - 43
Target Start/End: Complemental strand, 21293060 - 21293020
Alignment:
Q  2 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagta 43  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  21293060 tcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagta 21293020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 42
Target Start/End: Complemental strand, 26740737 - 26740697
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagt 42  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  26740737 ctcatgcagcttagttaa-taaacaacagcaacatagacagt 26740697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 18319170 - 18319037
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaa-caacatctcaaatat 98  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||| || |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||| |||| |||||| |||    
T  18319170 ctcatgcagcttagttaaataa-caacagcgacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaatcaacgtctcaattat 18319073  T
Q  99 caac--ataattcatataatgtatatacaattatat 132  Q
      ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  18319072 tcacatataattcaattaatgcatatacaattatat 18319037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 129
Target Start/End: Original strand, 39245162 - 39245291
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||| ||| || ||| |||     
T  39245162 ctcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaataacgtcccaattatt 39245259  T
Q  100 aac--ataattcatataatgtatatacaatta 129  Q
     ||  ||||||||  ||||| |||||||||||    
T  39245260 cacatataattcaagtaatgcatatacaatta 39245291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0555 (Bit Score: 146; Significance: 5e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0555
Description:

Target: scaffold0555; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 4 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 10630 - 10394
Alignment:
Q  4 atgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc-aac 102  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||    
T  10630 atgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaac 10531  T
Q  103 ataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aacaactt 201  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||| |  ||||||  | |||| ||||||| || ||||||| |||||| ||||||||    
T  10530 ataattcatgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgca-tcagtcttactggaacaacaacaacaagataaacaactt 10432  T
Q  202 agtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtg 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10431 agtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtg 10394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 145; Significance: 2e-76; HSPs: 60)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 4 - 238
Target Start/End: Original strand, 23019438 - 23019673
Alignment:
Q  4 atgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc-aac 102  Q
    |||||||||||||||  ||| ||||||||||||  ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||| |||    
T  23019438 atgcagcttagttaataaacaaacagcaacataagcagtatgcaaaacaacatgatataacaatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaacatcaaac 23019537  T
Q  103 ataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aacaactt 201  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||| || |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  23019538 ataattcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacgacattagattata-tagttcaggcttactgaaacaacaacagcaagataaacaactt 23019636  T
Q  202 agtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgt 238  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23019637 agtttctaacctccaagatcaactcacatcaactcgt 23019673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Original strand, 19652224 - 19652461
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatca 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  19652224 ctcatgcagcttagttaaacaacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctcaaacatca 19652322  T
Q  101 acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aacaac 199  Q
    ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||| |||||  |||||||| |  ||||||  | |||| ||||||| || || ||||||||||| ||||||    
T  19652323 acataatccatttaaagtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgca-tcagtcttactggaacaataacagcaagataaacaac 19652421  T
Q  200 ttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtg 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19652422 ttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtg 19652461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 31 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 22080800 - 22080592
Alignment:
Q  31 aacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaattat 130  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||| |||  ||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  22080800 aacataggcagtatgcaaaacatcatgatataacaatatcgaatgcacag-aacaacatctcaaacatcgtcataattaatataatgtatatacatttat 22080702  T
Q  131 ataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagataa-caacttagtttctaacctctaagatcaactcaca 229  Q
    ||| ||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22080701 ataacattaacaacatcattaggtcatatcaatttaggcttactgaaacaacaagagcaagataagcaacttagtttctaacctctaagatcaactcaca 22080602  T
Q  230 tcaactcgtg 239  Q
    ||||||||||    
T  22080601 tcaactcgtg 22080592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Original strand, 19668400 - 19668640
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 98  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||  ||    
T  19668400 ctcatgcagcttagttaattaacaaacagcaacatagatagtatgcaaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatcacaac-at 19668498  T
Q  99 ca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagataa-c 196  Q
    || || |||||||| |||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| || |||||||  || ||| |||||||||| |||||||||||||||| |    
T  19668499 catacgtaattcatgtaatgtatatacaactatataacattatcaacaacactacatcatatacat-cagacttactgaaacaacaacagcaagataaac 19668597  T
Q  197 aacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtg 239  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19668598 aacttagtttcttacctccaagatcaactcacatcaactcgtg 19668640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Original strand, 1561332 - 1561569
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc- 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| || | ||| ||||  |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||   ||||||||||     
T  1561332 ctcatgcagcttagttaaataacaaataacaatataggtagtatgcaaaccatcatgatataataatatcgaatgcaaatcaacaa---ctcaaatatca 1561428  T
Q  100 aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattaga-tcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aaca 197  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||  | |||||||| | ||||||  | |||| ||||||| ||||  ||||||||||| ||||    
T  1561429 aacataagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattaaattcatatgca-tcagtcttactggaatattaacagcaagataaaca 1561527  T
Q  198 acttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtg 239  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1561528 acttagtttctaacctctaggatcaactcacatcaactcgtg 1561569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 28496563 - 28496327
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc- 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| || |||||||   ||||||||||     
T  28496563 ctcatgcagcttagttaaataacaattagcaacataggcagtatgcaaaccatcatgatataataatatcgaatgtaaatcaacaa---ctcaaatatca 28496467  T
Q  100 aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aacaa 198  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||  ||||||  | |||| ||||||| || |  ||||||||| | |||||    
T  28496466 aacataagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattaattcatatgca-tcagtcttactggaacattaacagcaaggtaaacaa 28496368  T
Q  199 cttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtg 239  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28496367 cttagtttctaaactctaagatcaactcacatcaactcgtg 28496327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 29808974 - 29808738
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc- 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| || |||||||   ||||||||||     
T  29808974 ctcatgcagcttagttaaataacaattagcaacataggcagtatgcaaaccatcatgatataataatatcgaatgtaaatcaacaa---ctcaaatatca 29808878  T
Q  100 aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aacaa 198  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||  ||||||  | |||| ||||||| || |  ||||||||| | |||||    
T  29808877 aacataagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattaattcatatgca-tcagtcttactggaacattaacagcaaggtaaacaa 29808779  T
Q  199 cttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtg 239  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  29808778 cttagtttctaaactctaagatcaactcacatcaactcgtg 29808738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 9098606 - 9098378
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 98  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||| ||  |||||||||||||||||| |||||| ||||||||| || | || ||    
T  9098606 ctcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacaaaggcagtatgcaaaacaattcatgatataacaatatcaaatgcatttcaacaacttcac-aacat 9098508  T
Q  99 c-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aac 196  Q
    | |||||||||||| ||||||||||| ||||||||            ||||||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||    
T  9098507 caaacataattcatgtaatgtatatataattatat------------aacattaaatcata-taattcaggcttactgaaacaataactgcaagataaac 9098421  T
Q  197 aacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtg 239  Q
    || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9098420 aaattagtttcttacctctaagatcaactcacatcaactcgtg 9098378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Original strand, 20109167 - 20109409
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaata-tc 99  Q
    ||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||| || ||| ||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||| ||    
T  20109167 ctcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaacaacataatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacatctcaaatattc 20109266  T
Q  100 a-acataattcatataatgtatataca--attatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aa 195  Q
    | | ||||||||  |||||||||||||  |||||||  |||||  |||||||| |  | ||| ||  |||| ||||||  ||  ||| ||||||||| ||    
T  20109267 atatataattcaagtaatgtatatacaatattatatcacattataaacaacatcaattgata-tacatcagtcttactagaaagacatcagcaagataaa 20109365  T
Q  196 caacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtg 239  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20109366 caacttagtttcttacctctaagatcaactcacatcaactcgtg 20109409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 27333310 - 27333238
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaa 73  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27333310 ctcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaa 27333238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 27394050 - 27393978
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaa 73  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27394050 ctcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaa 27393978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 4185913 - 4185827
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaac 87  Q
    |||||||||| |||||||| |||  |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4185913 ctcatgcagcatagttaaacaacagacagcaacataggcagtatgcaactcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcatcaac 4185827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 87
Target Start/End: Original strand, 4186396 - 4186482
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaac 87  Q
    |||||||||| |||||||| |||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4186396 ctcatgcagcatagttaaacaacaggcagcaacatagacagtatgcaactcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcatcaac 4186482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 139 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 27333238 - 27333138
Alignment:
Q  139 aacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagataa-caacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcg 237  Q
    |||||||||||| ||| |||  |||||||||||||||||| | ||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27333238 aacaacaacattggattatac-aattcaggcttactgaaacagcaacatcaagataaacaatttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcg 27333140  T
Q  238 tg 239  Q
    ||    
T  27333139 tg 27333138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 139 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 27393978 - 27393878
Alignment:
Q  139 aacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagataa-caacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcg 237  Q
    |||||||||||| ||| |||  |||||||||||||||||| | ||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27393978 aacaacaacattggattatac-aattcaggcttactgaaacagcaacatcaagataaacaatttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcg 27393880  T
Q  238 tg 239  Q
    ||    
T  27393879 tg 27393878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 31155489 - 31155346
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaa-cagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaat-at 98  Q
    |||||||| |||||||||||||| || ||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||   ||| || ||    
T  31155489 ctcatgcaacttagttaaataacaaaacagcaac-taaacagtatgcaagtcatcgtgatataacaatatcgaatgcaattcatcaac--ttcatatcat 31155393  T
Q  99 caacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaaca 145  Q
    |||||||| ||||  ||||| |||||| ||||||| ||| |||||||    
T  31155392 caacataaatcatgcaatgtttatacatttatataacatcaacaaca 31155346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Original strand, 16496273 - 16496370
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaa-tcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 98  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| ||| ||||| |||| |||||| | |||||||||||||||||| ||||||    
T  16496273 ctcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataataatatcaattgcaattcaacaacatcttaaatat 16496370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 27 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 4668277 - 4668217
Alignment:
Q  27 cagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaac 87  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4668277 cagcaacataggcagtatgcaactcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcatcaac 4668217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 27 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 4675124 - 4675064
Alignment:
Q  27 cagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaac 87  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4675124 cagcaacataggcagtatgcaactcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcatcaac 4675064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Original strand, 1595575 - 1595707
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaat-catcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||  || ||||| |||| |||||| |||||||||||||||| |||||| |||     
T  1595575 ctcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacata-acagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaattcaacaacgtctcaattatt 1595672  T
Q  100 aac--ataattcatataatgtatatacaattatat 132  Q
     ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  1595673 cacatataattcaagtaatggatatacaattatat 1595707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Original strand, 25644349 - 25644444
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaa 95  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| ||| || | ||||||||||||||| |||| || ||| ||||||||||||    
T  25644349 ctcatgcagcttagttaaataacagacagcaacataggcagtatgcaaaaacagcgtgatataacaatatcaaatgtaagtcatcaacatctcaaa 25644444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 8227603 - 8227453
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaat-atc 99  Q
    |||||||||||||||||  |||  | ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| | | || | ||||||||||||||| |||    
T  8227603 ctcatgcagcttagttagttaatgatcagcaacgtaggcagtatgcaaaacatcatgatataataatatcgcacgtaagtaaacaacatctcaaataatc 8227504  T
Q  100 a-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacat 149  Q
    | | ||||||||  ||||| ||||||||||||||  |||||  ||||||||    
T  8227503 acatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacat 8227453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Original strand, 29060569 - 29060662
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaat-catcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaa 94  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||  || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  29060569 ctcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaa 29060662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 103 - 239
Target Start/End: Original strand, 35008282 - 35008418
Alignment:
Q  103 ataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagataa-caactt 201  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| |||||  |||||  |||||||| | ||||| |  || |||||||||||||| || ||||| ||||||| ||||||    
T  35008282 ataattcatgtaatgaatatacaaatatatcacattattaacaacatcaaatcatctatat-caggcttactgaaacaataacagtaagataagcaactt 35008380  T
Q  202 agtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtg 239  Q
    ||||||| ||| | | ||||||||||||||||||||||    
T  35008381 agtttcttacccccatgatcaactcacatcaactcgtg 35008418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Original strand, 23076759 - 23076997
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcat--catgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 98  Q
    ||||||||||||||||||  ||| |||| |||||||| |||||   ||| |||  |  ||||||| |||||| | ||  | ||||||||| || ||| ||    
T  23076759 ctcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtacataaaacatatccagatataataatatcaagtgataatcaacaacaacttaaacat 23076858  T
Q  99 ca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagataa-c 196  Q
    || | ||||||||| ||||| |||||||| |||||  |||||  |||||||| | ||||| |  || |||||||||||||| |||||||| ||||||| |    
T  23076859 catatataattcatgtaatgcatatacaaatatatcacattattaacaacatcaaatcatctatat-caggcttactgaaacaacaacagtaagataagc 23076957  T
Q  197 aacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactc 236  Q
    || ||||||||| ||| | | |||||||||||||||||||    
T  23076958 aaattagtttcttacccccatgatcaactcacatcaactc 23076997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Original strand, 22782253 - 22782385
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaata-t 98  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| || |    
T  22782253 ctcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattatt 22782350  T
Q  99 ca-acataattcatataatgtatatacaattatat 132  Q
    || ||||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  22782351 cacacataattcaagtaatgcatatacaattatat 22782385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 19303632 - 19303540
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaa 94  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||  ||||| |||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  19303632 ctcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacacaggaagtatacaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaa 19303540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 85
Target Start/End: Original strand, 20076729 - 20076812
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaaca 85  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||  |||| || ||||| |||| |||||| ||||||| ||||||    
T  20076729 ctcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtaaacaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaaatcaaca 20076812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 103 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 28103887 - 28103796
Alignment:
Q  103 ataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagataa 195  Q
    |||||||| |||||| ||||||| ||||||  |||||  |||||||| | ||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  28103887 ataattcacataatgcatatacatttatatcacattattaacaacatcaaatcatat-aattcaggcttactgaaacaacaacagtaagataa 28103796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 2291316 - 2291184
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||     
T  2291316 ctcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattatt 2291219  T
Q  100 aac--ataattcatataatgtatatacaattatat 132  Q
     ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  2291218 cacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 2291184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Original strand, 12742343 - 12742475
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||     
T  12742343 ctcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattatt 12742440  T
Q  100 aac--ataattcatataatgtatatacaattatat 132  Q
     ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  12742441 cacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 12742475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 18334728 - 18334596
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||     
T  18334728 ctcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattatt 18334631  T
Q  100 aac--ataattcatataatgtatatacaattatat 132  Q
     ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  18334630 cacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 18334596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Original strand, 19005072 - 19005204
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||     
T  19005072 ctcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattatt 19005169  T
Q  100 aac--ataattcatataatgtatatacaattatat 132  Q
     ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  19005170 cacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 19005204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 19859055 - 19858923
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||     
T  19859055 ctcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattatt 19858958  T
Q  100 aac--ataattcatataatgtatatacaattatat 132  Q
     ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  19858957 cacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 19858923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Original strand, 24422573 - 24422705
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||     
T  24422573 ctcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattatt 24422670  T
Q  100 aac--ataattcatataatgtatatacaattatat 132  Q
     ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  24422671 cacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 24422705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 30676846 - 30676714
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| | ||| || |||||||||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||     
T  30676846 ctcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgatataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattatt 30676749  T
Q  100 aac--ataattcatataatgtatatacaattatat 132  Q
     ||  ||||||||  ||||| ||||| ||||||||    
T  30676748 cacatataattcaagtaatgcatatataattatat 30676714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Original strand, 33861820 - 33861952
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||     
T  33861820 ctcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattatt 33861917  T
Q  100 aac--ataattcatataatgtatatacaattatat 132  Q
     ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  33861918 cacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 33861952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Original strand, 33864304 - 33864436
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||     
T  33864304 ctcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattatt 33864401  T
Q  100 aac--ataattcatataatgtatatacaattatat 132  Q
     ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  33864402 cacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 33864436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 18409919 - 18409826
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaa 94  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  18409919 ctcatgcagctcagttaaataac-aacagcaacacaggcagtatacgaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaa 18409826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 20361052 - 20360955
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 98  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| || | ||| || ||||| |||| |||||| | ||||||||| |||||||| ||||||    
T  20361052 ctcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagcatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaattcatcaacatcttaaatat 20360955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 16920722 - 16920634
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatct 91  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||| |||  |||||||| ||||  ||||| ||| | ||||| ||||||||    
T  16920722 ctcatgcagcttagttaaataacaaacagcagcataggcagtatacaa--catcatgacataagtatatcaaattccattcatcaacatct 16920634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 53 - 159
Target Start/End: Original strand, 18696569 - 18696675
Alignment:
Q  53 tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacatta 151  Q
    |||||||||||||||||| || |||| |||| |||||||| || |||| | ||||||||| ||||| ||||||| ||||||  |||||  ||||||||||    
T  18696569 tcatgatataacaatatc-aaagcaaatcaataacatctccaacatcatatataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatta 18696667  T
Q  152 gatcatat 159  Q
     |||||||    
T  18696668 aatcatat 18696675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 17287888 - 17287791
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaa-tcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 98  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||  || ||||| |||| |||||| | ||||| |||||| ||||| ||||||    
T  17287888 ctcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggtagtatacaaacacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacatcatcttaaatat 17287791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 25629447 - 25629354
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaa 94  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||| |||| |  |||||| | ||| || ||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  25629447 ctcatgcagcttagttaaattac-aacaggaacacatgcagtatacgaaaacagcatgacataacaatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaa 25629354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Original strand, 25688528 - 25688620
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaa 94  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | ||||| |||||||| ||||||    
T  25688528 ctcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacata-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaactgcaagtcaacaacgtctcaa 25688620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 53 - 161
Target Start/End: Original strand, 18706387 - 18706495
Alignment:
Q  53 tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacatta 151  Q
    |||||||||||||||||| || |||| |||| ||||||| ||| |||| | ||||||||| ||||| ||||||| ||||||  |||||  |||||||| |    
T  18706387 tcatgatataacaatatc-aaagcaaatcaataacatcttaaacatcatatataattcatgtaatgcatatacatttatatgacattattaacaacatca 18706485  T
Q  152 gatcatatta 161  Q
     |||||||||    
T  18706486 aatcatatta 18706495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 20557028 - 20556898
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||  |||| |||||| ||||||| |||||||| |||| ||| ||    
T  20557028 ctcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatggcataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctc-aatttc 20556932  T
Q  100 a-acataattcatataatgtatatacaattatat 132  Q
    | | ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  20556931 acatataattcaagtaatgcatatacaattatat 20556898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 1541047 - 1540918
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| ||  |||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||     
T  1541047 ctcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagtatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattatt 1540950  T
Q  100 aac--ataattcatataatgtatatacaatta 129  Q
     ||  ||||||||  ||||| |||||||||||    
T  1540949 cacatataattcaagtaatgcatatacaatta 1540918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 37
Target Start/End: Original strand, 22831532 - 22831568
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatag 37  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22831532 ctcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatag 22831568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 20638375 - 20638285
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatct 91  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | ||||||| | ||||||||    
T  20638375 ctcatgcagcttagttaaataa-caacaacaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattgcaatttatcaacatct 20638285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Original strand, 34963399 - 34963531
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc 99  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||     
T  34963399 ctcatgcaacttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattatt 34963496  T
Q  100 aac--ataattcatataatgtatatacaattatat 132  Q
     ||  ||||||||  ||||| ||||| ||||||||    
T  34963497 cacatataattcaagtaatgcatatataattatat 34963531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 91
Target Start/End: Original strand, 35245615 - 35245703
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatct 91  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||| |||||||| |||||| |||  || ||||| |||| |||||| | | ||||||| ||||||||    
T  35245615 ctcatgcagcttagttaattaacaaacaccaacataggcagtatacaa--caacatgacataataatatcaatttcaattcatcaacatct 35245703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 78
Target Start/End: Original strand, 25656655 - 25656731
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa 78  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||||||    
T  25656655 ctcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacatag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaa 25656731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 53 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 18177712 - 18177524
Alignment:
Q  53 tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaac-atctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacatt 150  Q
    |||||||||||||||||| ||||  | |||||| | |||| ||| |||| | ||||||||  ||||| ||||||| ||||||  |||||  ||||||||     
T  18177712 tcatgatataacaatatcaaatgataatcaacatcaatcttaaacatcatatataattcacttaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatc 18177613  T
Q  151 agatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagataa-caacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtg 239  Q
    | ||||| |||  |||| |||||||||| ||||||||||  |||| ||||||  ||||  ||| | | |||||||||||| |||||||||    
T  18177612 aaatcat-ttatatcagacttactgaaacaacaacagcagtataagcaacttcatttcctaccccaaggatcaactcacaacaactcgtg 18177524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 53 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 18199456 - 18199268
Alignment:
Q  53 tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaac-atctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacatt 150  Q
    |||||||||||||||||| ||||  | |||||| | |||| ||| |||| | ||||||||  ||||| ||||||| ||||||  |||||  ||||||||     
T  18199456 tcatgatataacaatatcaaatgataatcaacatcaatcttaaacatcatatataattcacttaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatc 18199357  T
Q  151 agatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagataa-caacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtg 239  Q
    | ||||| |||  |||| |||||||||| ||||||||||  |||| ||||||  ||||  ||| | | |||||||||||| |||||||||    
T  18199356 aaatcat-ttatatcagacttactgaaacaacaacagcagtataagcaacttcatttcctaccccaaggatcaactcacaacaactcgtg 18199268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 53 - 239
Target Start/End: Original strand, 18204159 - 18204347
Alignment:
Q  53 tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaac-atctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacatt 150  Q
    |||||||||||||||||| ||||  | |||||| | |||| ||| |||| | ||||||||  ||||| ||||||| ||||||  |||||  ||||||||     
T  18204159 tcatgatataacaatatcaaatgataatcaacatcaatcttaaacatcatatataattcacttaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatc 18204258  T
Q  151 agatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagataa-caacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtg 239  Q
    | ||||| |||  |||| |||||||||| ||||||||||  |||| ||||||  ||||  ||| | | |||||||||||| |||||||||    
T  18204259 aaatcat-ttacatcagacttactgaaacaacaacagcagtataagcaacttcatttcctaccccaaggatcaactcacaacaactcgtg 18204347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 2 - 94
Target Start/End: Original strand, 20593803 - 20593895
Alignment:
Q  2 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaa 94  Q
    |||||||||| ||||||||||  |||||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  20593803 tcatgcagctcagttaaataaa-aacagcaacacatgcagtatacgaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaa 20593895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 16448663 - 16448530
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaa-caacatctcaaatat 98  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||| || |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||| |||| |||||| |||    
T  16448663 ctcatgcagcttagttaaataa-caacagcgacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaatcaacgtctcaattat 16448566  T
Q  99 caac--ataattcatataatgtatatacaattatat 132  Q
      ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  16448565 tcacatataattcaattaatgcatatacaattatat 16448530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 103 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 18896304 - 18896256
Alignment:
Q  103 ataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacatta 151  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||  ||||||||||    
T  18896304 ataattcacataatgcatatacaattatatcccattactaacaacatta 18896256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 70
Target Start/End: Original strand, 33443076 - 33443146
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatc 70  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||  ||| ||  ||| ||||||||||||||    
T  33443076 ctcatgcagcttagttaa-taaacaacagcaacataggcagtatataaaacatctcaagatataacaatatc 33443146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 141; Significance: 5e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Original strand, 32565 - 32803
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc- 99  Q
    ||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||     
T  32565 ctcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaacaacatgatataacaatatcaaatgcaa-tcaacaacatctcaaacatca 32663  T
Q  100 aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aacaa 198  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || |||| |||||| |||||    
T  32664 aacataattcatgtaatgtatatacaactatataacattaacaaaaacattagattata-taattcaggcttactgaaacaataacaacaagataaacaa 32762  T
Q  199 cttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtg 239  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32763 cttagtttcttacctctaagatcaactcacatcaactcgtg 32803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 141; Significance: 5e-74; HSPs: 2)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Original strand, 129934 - 130173
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc- 99  Q
    |||||||| ||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||     
T  129934 ctcatgcatcttagttaaataacacacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatca 130033  T
Q  100 aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aacaa 198  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||   |||||||| |  ||||||  | |||| ||||||| || |||||||||||||| |||||    
T  130034 aacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattgtaaacaacatcaattcatatgca-tcagtcttactggaacaacaacagcaagataaacaa 130132  T
Q  199 cttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtg 239  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  130133 cttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtg 130173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 60808 - 60713
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaa 95  Q
    ||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||| |||| ||  |||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  60808 ctcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatacaaaacagctcatgatataccaatatc-aatgcaaatcaacaacatctcaaa 60713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1984 (Bit Score: 138; Significance: 3e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold1984
Description:

Target: scaffold1984; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 2 - 238
Target Start/End: Original strand, 159 - 395
Alignment:
Q  2 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc-a 100  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  159 tcatgcagcttagttaaacaacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatatcaa 258  T
Q  101 acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagataacaact 200  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||  |||||||| |  ||||||  | |||| || |||  || |||||||||||||||||||||    
T  259 acataattcatgtaatgtatatacaattatataatattataaacaacatcaattcatatgta-tcagtctcactagaacaacaacagcaagataacaact 357  T
Q  201 tagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgt 238  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  358 cagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgt 395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 133; Significance: 3e-69; HSPs: 2)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Original strand, 6640 - 6879
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | | || |||   ||| ||||    
T  6640 ctcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatgatgatataacaatatcgaatgcaagttatcatcattataaacatca 6739  T
Q  101 a-cataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aacaa 198  Q
    | |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||||||| |||||    
T  6740 aacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagatcata-taattcaagcttactaaaacaacaacagcaagataaacaa 6838  T
Q  199 cttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtg 239  Q
    ||||| |||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  6839 cttagattctaatctccaagttcaactcacatcaactcgtg 6879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333; HSP #2
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Original strand, 14020 - 14259
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | | || |||   ||| ||||    
T  14020 ctcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatgatgatataacaatatcgaatgcaagttatcatcattataaacatca 14119  T
Q  101 a-cataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aacaa 198  Q
    | |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||||||| |||||    
T  14120 aacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagatcata-taattcaagcttactaaaacaacaacagcaagataaacaa 14218  T
Q  199 cttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtg 239  Q
    ||||| |||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  14219 cttagattctaatctccaagttcaactcacatcaactcgtg 14259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 133; Significance: 3e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 6215 - 5980
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc- 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||  ||| |||     
T  6215 ctcatgcagcttagttaaataacaaacagtaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcattaacatcataaacatca 6116  T
Q  100 aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aacaa 198  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||    
T  6115 aacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattagcaacaacattagattata-caattcaggcttactgaaacaataacagcaagataaataa 6017  T
Q  199 cttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaact 235  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  6016 cttagtttttaacctccaagatcaactaacatcaact 5980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 132; Significance: 1e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 22762 - 22527
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc- 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||     
T  22762 ctcatgcagcttagttaaataacaaacagcgacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatca 22663  T
Q  100 aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaaga-taacaa 198  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||| |    ||||  | |||| ||||||| || | ||||| |||||  |||||    
T  22662 aacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacatca----atatgca-tcagtcttactggaacagcaacatcaagacaaacaa 22568  T
Q  199 cttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtg 239  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22567 cttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtg 22527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556 (Bit Score: 131; Significance: 4e-68; HSPs: 2)
Name: scaffold0556
Description:

Target: scaffold0556; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 6841 - 7073
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc- 99  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||   ||||||||||     
T  6841 ctcatgcagctcagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatattgaatgcaaatcaacaa---ctcaaatatca 6937  T
Q  100 aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aacaa 198  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||  ||||||  | |||| ||||||| || |||||||||||||| |||||    
T  6938 aacataagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacattaattcatatgca-tcagtcttactggaacaacaacagcaagataaacaa 7036  T
Q  199 cttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaact 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7037 cttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaact 7073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556; HSP #2
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 54 - 239
Target Start/End: Original strand, 8097 - 8283
Alignment:
Q  54 catgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatcaa-cataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattag 152  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8097 catgatataacaatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattag 8196  T
Q  153 atcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aacaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtg 239  Q
    || ||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8197 attata-taattcaggcttactgaaacaacaacagcaggataaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgtg 8283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 129; Significance: 7e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Original strand, 160713 - 160951
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc- 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||     
T  160713 ctcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcaaatgcaa-tcaacaacatgtcaaatatca 160811  T
Q  100 aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aacaa 198  Q
    ||||||| |||| |||| |||||||||||||||| |||||  |||||||| |  ||||||  | |||| ||||| |||| ||||||| |||||| |||||    
T  160812 aacataagtcatgtaatatatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgca-tcagtcttaccgaaacaacaacaacaagataaacaa 160910  T
Q  199 cttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtg 239  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  160911 cttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtg 160951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1765 (Bit Score: 125; Significance: 2e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold1765
Description:

Target: scaffold1765; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Original strand, 1111 - 1350
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc- 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| |||||| ||||| |||     
T  1111 ctcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatacaggtcatcaacatttcaaacatca 1210  T
Q  100 aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aacaa 198  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| | |||||| ||  |||| ||||||| || ||||||| |||||| || ||    
T  1211 aacataattcatggaatgtatatacaactatataacattaacaacaacatcaaatcata-tacatcagtcttactggaacaacaacaacaagataaaaaa 1309  T
Q  199 cttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtg 239  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1310 cttagtttcttacctctaagatcaactcacatcaactcgtg 1350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 125; Significance: 2e-64; HSPs: 2)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Original strand, 12968 - 13207
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc- 99  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||| |||     
T  12968 ctcatgctgctcagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcagcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatcataaacatca 13067  T
Q  100 aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aacaa 198  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||   |||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||    
T  13068 aacataattcgtgtaatgtatatacaattatataacattagcaacaacattagattat-ccaattcaggcttactgaaacaacaacagcaagataaataa 13166  T
Q  199 cttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtg 239  Q
    |||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||    
T  13167 cttagtttctaatctccatgatcaactcacatcaactcgtg 13207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #2
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 53 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 18277 - 18090
Alignment:
Q  53 tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacatta 151  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||| | ||||||||| ||||| ||||||| ||||||  |||||| |||||||| |    
T  18277 tcatgatatgacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaacatcatatataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattaataacaacatca 18178  T
Q  152 gatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagataa-caacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtg 239  Q
     | |||| ||||||||||||||||||| ||||||||  |||||| ||||||||||||| ||| | | ||||| ||||||||||||||||    
T  18177 aaacata-taattcaggcttactgaaacaacaacagtgagataagcaacttagtttcttacccccatgatcatctcacatcaactcgtg 18090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 121; Significance: 4e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 45884 - 45645
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc- 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||| ||||     
T  45884 ctcatgcagcttagttaaataacaaacagaaaaataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgtaagtcatcaacatctcaattatca 45785  T
Q  100 aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aacaa 198  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||  |||||||| |  ||||||  | |||| ||||||| || ||  ||||||| || |||||    
T  45784 aacataattcatgtgatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgca-tcagtcttactggaacaattacagcaatataaacaa 45686  T
Q  199 cttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtg 239  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45685 cttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtg 45645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0530 (Bit Score: 118; Significance: 2e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0530
Description:

Target: scaffold0530; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 1126 - 892
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc- 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||  ||| |||     
T  1126 ctcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggtagtatgcagatcatcatgatataacaacatcgaatgcaagtcatcaacatcataaacatca 1027  T
Q  100 aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aacaa 198  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  |   |||||||||||||||||| ||||||| |||||| || ||    
T  1026 aacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattagcaacaacattagat--ttacaattcaggcttactgaaacaacaacaacaagataaataa 929  T
Q  199 cttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaact 235  Q
    ||||||||||||| || |||||||||| |||||||||    
T  928 cttagtttctaacttccaagatcaactaacatcaact 892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 114; Significance: 6e-58; HSPs: 2)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 8166 - 7929
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 98  Q
    ||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||| |||| ||  |||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| |||  ||    
T  8166 ctcatgcagcttagttaacaaacaaacagcaacataggcagtatacaaaccagttcatgatataacaatatcaaatacaaatcaacaacatcacaac-at 8068  T
Q  99 ca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagataa-c 196  Q
    || | ||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||   |||||||||||||| |    
T  8067 catatataattcatgtaatgtatatacaactatataacattatcaacaacattaaatcatat-aattcaggcttactgaaa---caacagcaagataaac 7972  T
Q  197 aacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtg 239  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7971 aacttagtttcttacctctaagatcaactcacatcaactcgtg 7929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 19 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 29354 - 29135
Alignment:
Q  19 ataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatcaa-cataattcatataatg 117  Q
    ||||| |||||||||||||  ||||| ||||  |||||||||||| ||||||||||| || ||| ||||   |||| |||||| | ||| |||| || ||    
T  29354 ataacaaacagcaacataggtagtattcaaactatcatgatataataatatcgaatgtaaatcagcaac---tcaattatcaaacttaagtcatgtactg 29258  T
Q  118 tatatacaattatataccat---taacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagataa-caacttagtttctaacct 213  Q
    |||||||||||||||| |||   ||  | ||||||||  |||||   || ||| ||||||| || |  ||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  29257 tatatacaattatataacataattataagcaacattaattcataagcat-cagtcttactggaacattaacagcaaggtaaacaacttagtttctaacct 29159  T
Q  214 ctaagatcaactcacatcaactcg 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  29158 ctaagatcaactcacatcaactcg 29135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 100; Significance: 1e-49; HSPs: 3)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 136461 - 136221
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 98  Q
    |||||||| |||||||||  ||| |||||| |||||| |||||  |||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||   ||    
T  136461 ctcatgcaacttagttaataaacaaacagcgacataggcagtacacaaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatcacatc-at 136363  T
Q  99 ca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacatt-agatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aa 195  Q
    |  ||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  136362 cgtacataattcatgtaatgtatatacaactatataacattaacaacaacattaaaatcata-taattcaggcttactgaaacaacaacagcaagataaa 136264  T
Q  196 caacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgt 238  Q
    ||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  136263 caacttagtttcctacctccaagatcaactcacatcaactcgt 136221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 145169 - 144929
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 98  Q
    |||||||| |||||||||  ||| |||||| |||||| |||||  |||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||   ||    
T  145169 ctcatgcaacttagttaataaacaaacagcgacataggcagtacacaaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatcacatc-at 145071  T
Q  99 ca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacatt-agatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aa 195  Q
    |  ||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  145070 cgtacataattcatgtaatgtatatacaactatataacattaacaacaacattaaaatcata-taattcaggcttactgaaacaacaacagcaagataaa 144972  T
Q  196 caacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgt 238  Q
    ||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  144971 caacttagtttcctacctccaagatcaactcacatcaactcgt 144929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Original strand, 174795 - 174886
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaa 94  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||  || ||||| || |  ||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  174795 ctcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatacaa--cagcatgacatgattatatcaaattcaattcaacaacatctcaa 174886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 97; Significance: 8e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 2 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 53640 - 53401
Alignment:
Q  2 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaata-tca 100  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||| |||    
T  53640 tcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaacaacatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacatctcaaatattca 53541  T
Q  101 -acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aacaa 198  Q
     | ||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||  |||||||| | ||||||  |  |||| ||||||| || | |||||  ||||| |||||    
T  53540 tatataattcaagtaatgtatatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcata-aacatcagtcttactggaacatcaacataaagataaacaa 53442  T
Q  199 cttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtg 239  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53441 cttagtttcttacctctaagatcaactcacatcaactcgtg 53401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 93; Significance: 2e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 5 - 237
Target Start/End: Original strand, 15694 - 15924
Alignment:
Q  5 tgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc-aaca 103  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||| || |||||||   ||||| |||| |||     
T  15694 tgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatacaaaccatcatgatataataatatcgaatgtaaatcaacaa---ctcaattatcaaact 15790  T
Q  104 taattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aacaactta 202  Q
    ||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||  |||||  || |||| ||||||| |  |  ||||||||| | |||||||||    
T  15791 taagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattatttcataagaa-tcagtcttactggatcattaacagcaaggtaaacaactta 15889  T
Q  203 gtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcg 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15890 gtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcg 15924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 92; Significance: 8e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 6376 - 6135
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 98  Q
    |||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||  ||| ||  ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||    
T  6376 ctcatgcaacttagttaatgaacaaacagcaacataggcagtatataaaacagctcatgatatgacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaacat 6277  T
Q  99 ca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagataa-c 196  Q
    || | ||||||||| ||||| ||||||| ||||||  |||||| |||||||| | |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  |||||| |    
T  6276 catatataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattaataacaacatcaaatcata-taattcaggcttactgaaacaacaacagtgagataagc 6178  T
Q  197 aacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtg 239  Q
    |||||||||||| ||| | | ||||| ||||||||||||||||    
T  6177 aacttagtttcttacccccatgatcatctcacatcaactcgtg 6135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 92; Significance: 8e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Original strand, 38345 - 38586
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 98  Q
    ||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||  ||| ||  ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  38345 ctcatgcagcttagttaatgaacaaacagcaacataggcagtatataaaacagctcatgatatgacaatatcaaatgcaattcaacaacatctcaaacat 38444  T
Q  99 ca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagataa-c 196  Q
    || | ||||||||| ||||| |||||||  |||||  ||||||   |||||| | |||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |    
T  38445 catatataattcatgtaatgcatatacatatatatcacattaatctcaacatcaaatcata-taattcaggcttactgaaacaacaacagtaagataagc 38543  T
Q  197 aacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtg 239  Q
    |||||||||||| ||| |   ||||||||||||||||||||||    
T  38544 aacttagtttcttacccccgtgatcaactcacatcaactcgtg 38586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 91; Significance: 3e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Original strand, 12597 - 12836
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaata--t 98  Q
    |||||| |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||  |    
T  12597 ctcatgtagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaacagcatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacatctcaaatactt 12696  T
Q  99 caacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aaca 197  Q
      | ||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||  |||||||| | || |||   ||| || |||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  12697 atatataattca-gtaatgtatatacaattatatcacattataaacaacatcaaataatacacatt-agacttactgaaacaacaacagcaagataaaca 12794  T
Q  198 acttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtg 239  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12795 acttagtttattacctctaagatcaactcacatccactcgtg 12836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 85; Significance: 1e-40; HSPs: 3)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Original strand, 11321 - 11555
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc- 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| || |||||||   ||||| ||||     
T  11321 ctcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaccatcatgatataataatatcgaatgtaaatcaacaa---ctcaattatca 11417  T
Q  100 aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aacaa 198  Q
    ||| ||| |||| |||||||||||| |||||||| |||||  | ||||||||  |||||   | |||| ||||||  || |  |||| |||| | |||||    
T  11418 aacttaagtcatgtaatgtatatactattatataacattataagcaacattaattcataagca-tcagtcttacttgaacattaacaccaaggtaaacaa 11516  T
Q  199 cttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcg 237  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11517 cttagtttctaacctctaagattaactcacatcaactcg 11555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #2
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Original strand, 2026 - 2162
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc- 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| || |||||||   ||||| ||||     
T  2026 ctcatgcagcttagttaaataacaaacacaaacataggcagtatgcaaaccatcatgatataataatatcgaatgtaaatcaacaa---ctcaattatca 2122  T
Q  100 aacataattcatataatgtatatacaattatataccatta 139  Q
    ||| ||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  2123 aacttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacatta 2162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 91
Target Start/End: Original strand, 28443 - 28533
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatct 91  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | ||||||||||||||||||    
T  28443 ctcatgcagcttagttaaataa-caacaacaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattgcaattcaacaacatct 28533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 85; Significance: 1e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 4 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 103720 - 103492
Alignment:
Q  4 atgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatcaa 101  Q
    |||||||||||||||  ||  |||||||||||||  |||||  ||| ||  |||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||      ||  |    
T  103720 atgcagcttagttaataaataaacagcaacataggtagtataaaaaacaattcatgatataacaatatcaaatgcaaaacaacaacatc------at--a 103629  T
Q  102 cataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aacaact 200  Q
    |||||||||| |||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||    
T  103628 cataattcatgtaatgtatatacaactacataacattaacaacaacattaaatcata-taattcaggcttactgaaacaacaacaggaagataaagaact 103530  T
Q  201 tagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgt 238  Q
    |||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  103529 tagtttcctacctccaagatcaactcacatcaactcgt 103492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 77; Significance: 7e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 3 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 8151 - 7917
Alignment:
Q  3 catgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat-c 99  Q
    ||||||||||| ||||||||| || |||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||| ||| || |    
T  8151 catgcagcttaattaaataacaaatagcagcataggcagtatgcaaatcagctcatgatataataatatcaaatgaaattcaacaacatcttaaacattc 8052  T
Q  100 a-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagataa-ca 197  Q
    | | ||||||||  ||||||||||| ||||||||  |||||  |||||||| | |||||||  || ||| || |||| || |||| ||||||||||| ||    
T  8051 atatataattcaagtaatgtatataaaattatatcacattataaacaacatcaaatcatatacat-cagtctcactggaacaacatcagcaagataaaca 7953  T
Q  198 acttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaa 233  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  7952 acttagtttcatacctctaagatcaactcacatcaa 7917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 77; Significance: 7e-36; HSPs: 3)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 129062 - 128853
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 98  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||   ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||    
T  129062 ctcatgcagcttagttaa-taacaaacagcaacataggcagtacataaaacaattcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaacat 128964  T
Q  99 ca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagataa-c 196  Q
    || | ||||||||| ||||| |||||||| |||||  |||||  |||||||| | |||||  ||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||| |    
T  128963 catatataattcatgtaatggatatacaaatatatcacattattaacaacatcaaatcat-ctaaatcaggcttactgaaacaacaacagtaagataagc 128865  T
Q  197 aacttagtttct 208  Q
    ||||||||||||    
T  128864 aacttagtttct 128853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Original strand, 78351 - 78587
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 98  Q
    ||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||| ||  ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||  ||    
T  78351 ctcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagcatataaaacagttcatgatataacaatatc-aatgcaaatcaacaacatctcaac-at 78448  T
Q  99 caac-ataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagataa-c 196  Q
    |    ||||||||| ||||| ||||||| ||||||  |||||  |||||||| | ||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |    
T  78449 cgtttataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatcaaatcatat-aattcaggcttactgaaacaacaacagtaagataagc 78547  T
Q  197 aacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactc 236  Q
    ||||||||| || ||| | | |||||||||||||||||||    
T  78548 aacttagttgcttacccccatgatcaactcacatcaactc 78587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Original strand, 116456 - 116551
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 98  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | ||||||| |||| || ||||| ||||  ||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  116456 ctcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-acagtatacaaaacagcatgacataatcatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaatat 116551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 76; Significance: 3e-35; HSPs: 2)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Original strand, 97034 - 97274
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 98  Q
    ||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||| |||||   ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||    
T  97034 ctcatgcagcttagttaataaataaacagcaacataggcagtacataaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaacat 97133  T
Q  99 ca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagataa-c 196  Q
    || | ||||||||| ||||| |||||||| |||||  |||||  |||||||| | |||||  ||  ||||||||||||||| |||||||| |||| || |    
T  97134 catatataattcatgtaatgcatatacaaatatatcacattattaacaacatcaaatcat-ctatatcaggcttactgaaacaacaacagtaagaaaagc 97232  T
Q  197 aacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtg 239  Q
    |||||||||||| ||| | | ||||||||||||||||||||||    
T  97233 aacttagtttcttacc-ccatgatcaactcacatcaactcgtg 97274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Original strand, 106312 - 106552
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 98  Q
    ||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||| |||||   ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||    
T  106312 ctcatgcagcttagttaataaataaacagcaacataggcagtacataaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaacat 106411  T
Q  99 ca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagataa-c 196  Q
    || | ||||||||| ||||| |||||||| |||||  |||||  |||||||| | |||||  ||  ||||||||||||||| |||||||| |||| || |    
T  106412 catatataattcatgtaatgcatatacaaatatatcacattattaacaacatcaaatcat-ctatatcaggcttactgaaacaacaacagtaagaaaagc 106510  T
Q  197 aacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtg 239  Q
    |||||||||||| ||| | | ||||||||||||||||||||||    
T  106511 aacttagtttcttacc-ccatgatcaactcacatcaactcgtg 106552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 34152 - 34384
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatca 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||| |||  ||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||   |||| |||||    
T  34152 ctcatacagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaacccatcatgatataataatatcgaatgtaaatcaacaac---tcaattatca 34248  T
Q  101 a-cataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aacaa 198  Q
    | | ||| |||  |||| |||||||||||||||| |||||  | ||||||||  |||||   | |||| ||||||| || |  ||||||||| | |||||    
T  34249 aacttaagtcaagtaatatatatacaattatataacattataagcaacattaattcataagca-tcagtcttactggaaaattaacagcaaggtaaacaa 34347  T
Q  199 cttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaact 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34348 cttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaact 34384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1351 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold1351
Description:

Target: scaffold1351; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 53 - 235
Target Start/End: Original strand, 87 - 270
Alignment:
Q  53 tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacatta 151  Q
    ||||||||||||||||||  |||||| |||| ||||||||||| |||| | ||||||||| ||||| ||||||| ||||||| |||||  |||||||| |    
T  87 tcatgatataacaatatcagatgcaaatcaataacatctcaaacatcatatataattcatgtaatgcatatacatttatataacattattaacaacatca 186  T
Q  152 gatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagata-acaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaact 235  Q
     ||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||  ||||||||||||| ||| | | ||||||||||||||||||    
T  187 aatcat-ttaatttaggcttactgaaacaacaacagtaagatatgcaacttagtttcttacccccatgatcaactcacatcaact 270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150 (Bit Score: 72; Significance: 7e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0150
Description:

Target: scaffold0150; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 32127 - 32345
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaa-tcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc 99  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||| |||||||   |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||| |||| |||||| ||||    
T  32127 ctcatgcagcttagataaataacaaacaacaacataagtagtatgcaaaatcatcatgatataacaatatcgaatgtaa-tcatcaacgtctcaattatc 32225  T
Q  100 aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aacaa 198  Q
    |||||||| ||| |||||||||      |||| | |||||  |||||||| |  ||||||  | |||| ||||||| || |||||||| ||||| |||||    
T  32226 aacataatccatttaatgtata------tatacaacattataaacaacatcaattcatatgca-tcagtcttactggaacaacaacagtaagataaacaa 32318  T
Q  199 cttagtttctaacctctaagatcaact 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  32319 cttagtttctaacctctaagatcaact 32345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 72; Significance: 7e-33; HSPs: 2)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 19977 - 19737
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 98  Q
    ||||||||||||| ||||  ||| ||||||||||||| ||||||  ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  ||    
T  19977 ctcatgcagcttaattaataaacaaacagcaacataggcagtatataaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaattcaacaacatctc-agcat 19879  T
Q  99 ca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagataa-c 196  Q
    || | |||| |||| ||||| ||||||| ||||||  |||||  || ||||| | |||||| ||||||| |||||||| || |||||||| ||||||| |    
T  19878 cataaataactcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaataacatcaaatcata-taattcatgcttactggaacaacaacagtaagataagc 19780  T
Q  197 aacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtg 239  Q
    |||||||||||| ||| | |||||||||||| |||||| ||||    
T  19779 aacttagtttcttacccccaagatcaactcatatcaacccgtg 19737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Original strand, 39942 - 40038
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 98  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| |||||| |||| || ||||| |||| |||||| ||||||  |||| ||||||| ||||||    
T  39942 ctcatgcagcttaattaaataa-caatagcaacataggcagtatacaaaacaacatgacataataatatcaaatgcatgtcaataacatcttaaatat 40038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 1161 - 1025
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| || |||||||   ||||| |||||    
T  1161 ctcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaaccatcatgatataataatatcgaatgtaaatcaacaa---ctcaattatca 1065  T
Q  101 -acataattcatataatgtatatacaattatataccatta 139  Q
     || ||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  1064 gacttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacatta 1025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 67; Significance: 7e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 23975 - 23897
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaat 79  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23975 ctcatgtagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaat 23897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 66; Significance: 3e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 38794 - 38697
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 98  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||| ||| ||| |||||||||||    
T  38794 ctcatgcaccttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaacatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatat 38697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2014 (Bit Score: 62; Significance: 6e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold2014
Description:

Target: scaffold2014; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Original strand, 1061 - 1158
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 98  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||| | | ||| |||||||||||||||    
T  1061 ctcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaacagcatgatataacaatatcaaatacgaatcatcaacatctcaaatat 1158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 62; Significance: 6e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 15869 - 15792
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa 78  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15869 ctcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatgatgatataacaatatcgaatgcaa 15792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 160 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 15765 - 15685
Alignment:
Q  160 taattcaggcttactgaaataacaacagcaagataa-caacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtg 239  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15765 taattcaggcttactgaaacaacaacagcaagataaacaacttagtttctaatctccaagatcaactcacatcaactcgtg 15685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0737 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0737
Description:

Target: scaffold0737; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 53 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 1836 - 1650
Alignment:
Q  53 tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacatta 151  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| || |||| | |||||| || ||||| ||||||| ||||||  |||||  |||||| | |    
T  1836 tcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctc-aacatcatatataatttatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacgtca 1738  T
Q  152 gatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagata-acaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtg 239  Q
     |||||| |||||||||||||||| || ||||| || ||||||  ||||||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||    
T  1737 aatcata-taattcaggcttactggaacaacaatagtaagataggcaacttagtttcttaccctcaagatcaactcacatcaactcgtg 1650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0461 (Bit Score: 59; Significance: 4e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0461
Description:

Target: scaffold0461; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 149
Target Start/End: Original strand, 11493 - 11643
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaat-atc 99  Q
    |||||||||||||||||| |||| | ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| | | || | ||||||||||||||| |||    
T  11493 ctcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacataggcagtatgcaaaacatcatgatataataatatcgcacgtaagtaaacaacatctcaaataatc 11592  T
Q  100 a-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacat 149  Q
    | | ||||||||  ||||| ||||||||||||||  |||||  ||||||||    
T  11593 acatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacat 11643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 59; Significance: 4e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 38348 - 38198
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaat-atc 99  Q
    |||||||||||||||||| |||| | ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| | | || | ||||||||||||||| |||    
T  38348 ctcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacataggcagtatgcaaaacatcatgatataataatatcgcacgtaagtaaacaacatctcaaataatc 38249  T
Q  100 a-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacat 149  Q
    | | ||||||||  ||||| ||||||||||||||  |||||  ||||||||    
T  38248 acatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacat 38198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0540
Description:

Target: scaffold0540; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 3242 - 3146
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 98  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  3242 ctcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaatat 3146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1403 (Bit Score: 56; Significance: 2e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold1403
Description:

Target: scaffold1403; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Original strand, 579 - 817
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 98  Q
    ||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||| ||  ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||  ||    
T  579 ctcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagcatataaaacagttcatgatataacaatatc-aatgcaaatcaacaacatcccaac-at 676  T
Q  99 ca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aac 196  Q
    || | ||||||||| ||||| ||||||| | ||||   ||||   | || || | ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||  |||| |||    
T  677 catatataattcatgtaatgcatatacattaatatcatattatttaaaagatcaaatcatat-aattcaggcttactgaaacaacaacagttagataaac 775  T
Q  197 aacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtg 239  Q
    |||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||||    
T  776 aacttagtttcttacc-atatgatcaactcacatcaactcgtg 817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247 (Bit Score: 56; Significance: 2e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0247
Description:

Target: scaffold0247; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 18119 - 17969
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatca 100  Q
    |||||||||||||||||| |||| | ||||||||||  || |||||| | ||||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||||||||||      
T  18119 ctcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacatatgcattatgcacaacatcatgatataataatatcgaacgcaagtaaacaacatctcaaatattc 18020  T
Q  101 ac--ataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacat 149  Q
    ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||  |||||  ||||||||    
T  18019 acatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacat 17969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161 (Bit Score: 56; Significance: 2e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0161
Description:

Target: scaffold0161; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 30 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 2505 - 2300
Alignment:
Q  30 caacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaatt 128  Q
    |||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||   ||||| |||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||    
T  2505 caacttagaccgtatgcaaaccatcatgatataataatatcgaatgtaaatcagcaa---ctcaattatcaaacttaagtcatttaatgtatatacaatt 2409  T
Q  129 atataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aacaacttagtttctaacctctaagatcaactca 227  Q
    ||||| |||||  | ||||||||  |||||   | |||| ||||||| || |  || |||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2408 atataacattataagcaacattaattcataagca-tcagtcttactggaacattaatagcaaggtaaaaaacttagtttctaacctctaagatcaactca 2310  T
Q  228 catcaactcg 237  Q
    ||| ||||||    
T  2309 cataaactcg 2300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 56; Significance: 2e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Original strand, 25135 - 25268
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 98  Q
    ||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||  ||| ||  |||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| ||    
T  25135 ctcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatataaaacagctcatgatataacgatatc-aatgcaaatcaacaacatctcaaacat 25233  T
Q  99 ca-acataattcatataatgtatatacaattatat 132  Q
    || | ||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  25234 catatataattcatgtaatgtatatacaaatatat 25268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 53 - 161
Target Start/End: Original strand, 619 - 727
Alignment:
Q  53 tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacatta 151  Q
    |||||||||||||||||| || |||| |||| ||||||||||| |||| | ||||||||| ||||| ||||||| ||||||  |||||  |||||||| |    
T  619 tcatgatataacaatatc-aaagcaaatcaataacatctcaaacatcatatataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatca 717  T
Q  152 gatcatatta 161  Q
     |||||||||    
T  718 aatcatatta 727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0357
Description:

Target: scaffold0357; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 91
Target Start/End: Original strand, 13157 - 13247
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatct 91  Q
    ||||||||||||||||||  ||| |||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  13157 ctcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtatgcaaaacagcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatct 13247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 16192 - 16098
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaa 95  Q
    ||||||||||||||||||  ||| |||| ||||||||  |||||||||| || ||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||    
T  16192 ctcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggtagtatgcaaaacaacatgatataacaatatcaaatgtaaatcaacaacatctcaaa 16098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 54; Significance: 4e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Original strand, 39506 - 39602
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 98  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||| |||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  39506 ctcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaatat 39602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 54; Significance: 4e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 75306 - 75210
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 98  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||| |||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  75306 ctcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaatat 75210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0908 (Bit Score: 51; Significance: 2e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0908
Description:

Target: scaffold0908; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 3278 - 3185
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaat-catcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaa 94  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||  || |||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  3278 ctcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgatataataatatcaaatgtaattcaacaacatctcaa 3185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 51; Significance: 2e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 27841 - 27747
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaa 95  Q
    ||||||||||||||||||  ||| |||| ||||||||  |||||||||| || ||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||    
T  27841 ctcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggtagtatgcaaaacagcatgatataacaatatcaaatgtaaatcaacaacatctcaaa 27747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0475 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0475
Description:

Target: scaffold0475; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 27 - 87
Target Start/End: Original strand, 9133 - 9193
Alignment:
Q  27 cagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaac 87  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9133 cagcaacataggcagtatgcaactcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcatcaac 9193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0211
Description:

Target: scaffold0211; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 184 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 28720 - 28664
Alignment:
Q  184 acagcaagataa-caacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtg 239  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28720 acagcaagataaacaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtg 28664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 56
Target Start/End: Complemental strand, 28862 - 28806
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataacca-acagcaacatagacagtatgcaaatcatcat 56  Q
    ||||||||||||||||||| |||   |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28862 ctcatgcagcttagttaaacaacattacagcaacataggcagtatgcaaatcatcat 28806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 48; Significance: 1e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 91
Target Start/End: Original strand, 4878 - 4968
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaa-tcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatct 91  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| ||| ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  4878 ctcatgcagattagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataataatatcaaatgcaattcaacaacatct 4968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 47; Significance: 6e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 44799 - 44702
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaat-catcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 98  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||| ||||  || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  44799 ctcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaatat 44702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 26157 - 26064
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaa 94  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||| ||||||||||| ||||||    
T  26157 ctcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgtaattcaacaacgtctcaa 26064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 47; Significance: 6e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Original strand, 1880 - 1977
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 98  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | ||||||||| |||||||| ||||||    
T  1880 ctcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacatagacagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattgcaattcatcaacatcttaaatat 1977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 47; Significance: 6e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 267689 - 267916
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 98  Q
    |||||||| |||||||||  ||| |||| |||||||  ||||||  ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||| || ||    
T  267689 ctcatgcaacttagttaataaacaaacatcaacatatgcagtatataaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaatatctc-aacat 267787  T
Q  99 ca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagataa-c 196  Q
    || | ||||||||| ||||| ||||||| ||||||  |||||  |||| ||| | |||||| | || |||||||||||||| |||| ||| ||| ||| |    
T  267788 catatataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaccatcaaatcata-tcatccaggcttactgaaacaacagcagtaagctaagc 267886  T
Q  197 aacttagtttctaacctctaagatcaactc 226  Q
    |||||||||||| |||  || |||||||||    
T  267887 aacttagtttcttacccttatgatcaactc 267916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 46; Significance: 2e-17; HSPs: 3)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 33048 - 32952
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 98  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||| || |||||| |||| || ||||| |||| |||||| | |||||||||||||||||| ||||||    
T  33048 ctcatgcagcttagttaattaac-aacagcaacacaggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaattgcaattcaacaacatcttaaatat 32952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Original strand, 45957 - 46053
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 98  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||| || |||||| |||| || ||||| |||| |||||| | |||||||||||||||||| ||||||    
T  45957 ctcatgcagcttagttaattaac-aacagcaacacaggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaattgcaattcaacaacatcttaaatat 46053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Original strand, 16142 - 16235
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaa 94  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| | ||| || || ||||| | |||||| |||||||  ||||| ||||||||    
T  16142 ctcatgcagcttagttaaataa-caacaacaacataggcagtatacaaaaacagcaagatatcataatatcaaatgcaagccaacatcatctcaa 16235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 46; Significance: 2e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Original strand, 25925 - 26021
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 98  Q
    |||||| |||||||||||||||| || |||||||||| |||||| ||||  ||||||| |||| |||||| ||||||| | |||||||||||||||||    
T  25925 ctcatgaagcttagttaaataac-aatagcaacataggcagtatacaaaatatcatgacataataatatcaaatgcaagtaaacaacatctcaaatat 26021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Original strand, 39887 - 39983
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 98  Q
    |||||| |||||||||||||||| || |||||||||| |||||| ||||  ||||||| |||| |||||| ||||||| | |||||||||||||||||    
T  39887 ctcatgaagcttagttaaataac-aatagcaacataggcagtatacaaaatatcatgacataataatatcaaatgcaagtaaacaacatctcaaatat 39983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Original strand, 13240 - 13337
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 98  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | ||||||||| |||||||| ||||||    
T  13240 ctcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaattcatcaacatcttaaatat 13337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 17309 - 17214
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaat---catcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaa 94  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||    || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  17309 ctcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaa 17214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 20514 - 20383
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatca 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  |||||| |||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||      
T  20514 ctcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-tcagtatacaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattc 20417  T
Q  101 ac--ataattcatataatgtatatacaattatat 132  Q
    ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  20416 acatataattcaagtaatgcatatacaattatat 20383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000006; HSPs: 2)
Name: scaffold0145
Description:

Target: scaffold0145; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Original strand, 32971 - 33067
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 98  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| |||||| |||| || ||||| |||| |||||| ||||||| | |||||||||| ||||||    
T  32971 ctcatgcagcttaattaaataa-caatagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagttaacaacatcttaaatat 33067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 98
Target Start/End: Original strand, 38791 - 38886
Alignment:
Q  2 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 98  Q
    |||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| |||||| |||| || ||||| |||| |||||| ||||||| | |||||||||| ||||||    
T  38791 tcatgcagcttaattaaataa-caatagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaaataaacaacatcttaaatat 38886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 24395 - 24297
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaa--tcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 98  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||   || ||||| |||| |||||| | ||||||||| |||||||| ||||||    
T  24395 ctcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagtatacaaaacacagcatgacataaaaatatcaattgcaattcatcaacatcttaaatat 24297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1137 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold1137
Description:

Target: scaffold1137; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 84 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 2303 - 2156
Alignment:
Q  84 caacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataaca 183  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||        |||||  |||||||| |  ||||||  || ||| |||||||  |||| |    
T  2303 caacatctcgaatatcaacataatccatttaatgtatatacaa--------cattataaacaacatcaattcatatgcat-cagtcttactgggataaga 2213  T
Q  184 acagcaagataa-caacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtg 239  Q
     ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  2212 tcagtaagataaacaacttagtttctaacctctaagattaactcacatccactcgtg 2156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Original strand, 20773 - 20905
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||     
T  20773 ctcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattatt 20870  T
Q  100 aac--ataattcatataatgtatatacaattatat 132  Q
     ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  20871 cacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 20905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Original strand, 37847 - 37979
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||     
T  37847 ctcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattatt 37944  T
Q  100 aac--ataattcatataatgtatatacaattatat 132  Q
     ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  37945 cacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 37979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000009; HSPs: 2)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 91
Target Start/End: Original strand, 1318 - 1406
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatct 91  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| | |||  |||||||| ||||  ||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  1318 ctcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtgtacaa--catcatgacataattatatcaaattcaattcatcaacatct 1406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 91
Target Start/End: Original strand, 7295 - 7383
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatct 91  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||| |||  || ||||| ||||  ||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  7295 ctcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaa--caacatgaaataattatatcaaattcaattcatcaacatct 7383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 91
Target Start/End: Original strand, 51611 - 51699
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatct 91  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||  |||||||| ||||  ||| | ||| ||||||| ||||||||    
T  51611 ctcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatacaa--catcatgacataattataacaaattcaattcatcaacatct 51699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000009; HSPs: 2)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 158586 - 158454
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||     
T  158586 ctcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattatt 158489  T
Q  100 aac--ataattcatataatgtatatacaattatat 132  Q
     ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  158488 cacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 158454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 340039 - 339949
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaa 94  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||| |||||||| |||||| |||| || ||||| |||| |||||| ||| ||| |||||||||||||||    
T  340039 ctcatgcagcttagttaaataac--acaacaacataggcagtatacaaaacaacatgacataataatatcaaat-caagtcaacaacatctcaa 339949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0490 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0490
Description:

Target: scaffold0490; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Original strand, 1981 - 2078
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaa-tcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 98  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||| |||||| |||||| |||| ||| ||||| ||||  ||||| | |||||||||||||||||| ||||||    
T  1981 ctcatgcagcttagttaattaac-aacagcgacataggcagtatacaaaatcaacatgacataatgatatcaattgcaattcaacaacatcttaaatat 2078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Original strand, 10799 - 10891
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaa 94  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| | ||| |||||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| ||||||    
T  10799 ctcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacacag-cagtatacaaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaa 10891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 15555 - 15466
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatct 91  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| |||| || ||||| |||| |||||| | | ||||||| ||||||||    
T  15555 ctcatgcagcttagttaaataa-caagagcaacataggcagtatacaaaacaacatgacataataatatcaatttcaattcatcaacatct 15466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 149
Target Start/End: Original strand, 225465 - 225585
Alignment:
Q  30 caacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaata-tca-acataattcatataatgtatatacaat 127  Q
    |||||||| ||||||||||| || | |||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||| | ||| | ||||||||  ||||| |||||||||    
T  225465 caacatagtcagtatgcaaaacagcgtgatataataatatcaaatgcaa-tcaacaacatctcaaacattcatatataattcaagtaatgcatatacaat 225563  T
Q  128 tatataccattaacaacaacat 149  Q
    |||||  |||||  ||||||||    
T  225564 tatatcacattataaacaacat 225585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0444 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0444
Description:

Target: scaffold0444; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 129
Target Start/End: Original strand, 13418 - 13547
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||     
T  13418 ctcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattatt 13515  T
Q  100 aac--ataattcatataatgtatatacaatta 129  Q
     ||  ||||||||  ||||| |||||||||||    
T  13516 cacatataattcaagtaatgcatatacaatta 13547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0716 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0716
Description:

Target: scaffold0716; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Original strand, 4720 - 4852
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||     
T  4720 ctcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacacag-cagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattatt 4817  T
Q  100 aac--ataattcatataatgtatatacaattatat 132  Q
     ||  ||||||||  ||||| ||||| ||||||||    
T  4818 cacatataattcaagtaatgcatatataattatat 4852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0456
Description:

Target: scaffold0456; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 10515 - 10427
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatct 91  Q
    |||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||| |||||| |||  || ||||| |||| |||||| | | ||||||||||||||||    
T  10515 ctcatgcagcatagttaattaacaaacagcaacataggcagtatacaa--cagcatgacataataatatcaatttcaattcaacaacatct 10427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0230
Description:

Target: scaffold0230; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Original strand, 13973 - 14105
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc 99  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||     
T  13973 ctcatgcagcttagataaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattatt 14070  T
Q  100 aac--ataattcatataatgtatatacaattatat 132  Q
     ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  14071 cacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 14105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1842 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold1842
Description:

Target: scaffold1842; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 1140 - 1043
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 98  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| | |||  | ||||| |||| |||||| | ||||||||| |||||||| ||||||    
T  1140 ctcatgcagcttagttaaataa-caacaacaacataggcagtatacaaaaatagcatgacataataatatcaattgcaattcatcaacatcttaaatat 1043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0427 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0427
Description:

Target: scaffold0427; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 91
Target Start/End: Original strand, 13526 - 13615
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatct 91  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||| || ||||| || | |||||| | | | ||||| ||||||||    
T  13526 ctcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagtatacaaaacaacatgacatgataatatcaatttcgattcatcaacatct 13615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0363 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0363
Description:

Target: scaffold0363; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Original strand, 9268 - 9360
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtat-gcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaa 94  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||   ||| |||||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| ||||||    
T  9268 ctcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatataaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaa 9360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000008; HSPs: 2)
Name: scaffold0292
Description:

Target: scaffold0292; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Original strand, 3499 - 3596
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 98  Q
    |||||| |||||||||||||||| || |||||||||| |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | ||||||||| |||||||| ||||||    
T  3499 ctcatgtagcttagttaaataactaa-agcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaattcatcaacatcttaaatat 3596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Original strand, 372 - 468
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 98  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||||| ||||  | |||||  ||| |||||| | || || |||||||||||| ||||||    
T  372 ctcatgcagcttagttaaataa-caacaataacataggcagtatacaaaatagcatgacgtaataatatcaattggaagtcaacaacatcttaaatat 468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 91
Target Start/End: Original strand, 32096 - 32184
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatct 91  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||  |||| || ||||| |||| |||||| | | ||||||| ||||||||    
T  32096 ctcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagtaaacaaa-caacatgacataataatatcaatttcaattcatcaacatct 32184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000008; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Original strand, 51942 - 52039
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 98  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||| | ||| || ||||| |||| |||||| | ||||| |||||| ||||| ||||||    
T  51942 ctcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcaatatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacatcatcttaaatat 52039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 168070 - 167973
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 98  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| | |||  | ||||| |||| |||||| | ||||||||| |||||||| ||||||    
T  168070 ctcatgcagcttagttaaataa-caacaacaacataggcagtatacaaaaatagcatgacataataatatcaattgcaattcatcaacatcttaaatat 167973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0351 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0351
Description:

Target: scaffold0351; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 89
Target Start/End: Original strand, 16311 - 16397
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacat 89  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||| |||  || ||||| ||||  ||||| ||| ||||||| ||||||    
T  16311 ctcatgcagcttagttaaataagaaacagcaacataggcagtatacaa--cagcatgacataattatatcaaattcaattcatcaacat 16397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0121 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0121
Description:

Target: scaffold0121; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 8621 - 8528
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 98  Q
    |||||||||||||||||||||||    |||||||||| ||||||  ||| || ||||| |||| |||||| | ||||| |||||| ||||| ||||||    
T  8621 ctcatgcagcttagttaaataac----agcaacataggcagtatcaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacatcatcttaaatat 8528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 8 - 91
Target Start/End: Original strand, 20946 - 21030
Alignment:
Q  8 agcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatct 91  Q
    ||||||||||| |||| | ||||||||||| || ||||| ||| || ||||| |||| |||||| | ||||||||||||||||||    
T  20946 agcttagttaattaacaatcagcaacataggcaatatgcaaaaacaacatgacataataatatcaattgcaattcaacaacatct 21030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0718 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0718
Description:

Target: scaffold0718; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 5220 - 5132
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatct 91  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  | ||| |||  |||||||| ||||  ||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  5220 ctcatgcagcttagttaaataacaaacatcaacataggtattatacaa--catcatgacataattatatcaaattcaattcatcaacatct 5132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Original strand, 29958 - 30090
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | || || |||||||| |||||| |||     
T  29958 ctcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaagtgtaagtcaacaacgtctcaattatt 30055  T
Q  100 aac--ataattcatataatgtatatacaattatat 132  Q
     ||  |||||||| |||||  ||||||||||||||    
T  30056 cacatataattcaaataattcatatacaattatat 30090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 5 - 132
Target Start/End: Original strand, 40430 - 40558
Alignment:
Q  5 tgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatcaaca 103  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| ||  |||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||  |||    
T  40430 tgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacaggatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcaca 40527  T
Q  104 t--aattcatataatgtatatacaattatat 132  Q
    |  ||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  40528 taaaattcaagtaatgcatatacaattatat 40558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Original strand, 11314 - 11446
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc 99  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||| || |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||     
T  11314 ctcatgcaacttagttaaataa-caacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattatt 11411  T
Q  100 aacata--attcatataatgtatatacaattatat 132  Q
     |||||  |||||  ||||| ||||| ||||||||    
T  11412 cacatatgattcaagtaatgcatatataattatat 11446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 3)
Name: scaffold0228
Description:

Target: scaffold0228; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 98
Target Start/End: Original strand, 4544 - 4633
Alignment:
Q  9 gcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaat-catcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 98  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||  |||  || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  4544 gcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatataaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaatat 4633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 98
Target Start/End: Original strand, 12126 - 12215
Alignment:
Q  9 gcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaat-catcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 98  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||  |||  || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  12126 gcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatataaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaatat 12215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 98
Target Start/End: Original strand, 22078 - 22167
Alignment:
Q  9 gcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaat-catcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 98  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||  |||  || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  22078 gcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatataaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaatat 22167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0217
Description:

Target: scaffold0217; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 16692 - 16599
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaa 94  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||| || |||||| ||||||||    
T  16692 ctcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacacaagcagtatacgaaaacagcatgacataataatatcaaatggaagtcaacagcatctcaa 16599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0070 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0070
Description:

Target: scaffold0070; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Original strand, 4553 - 4650
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaa-atcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 98  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||| | || || ||||| | |||||| |||  ||||||||||||||| ||||||    
T  4553 ctcatgcaacttagttaaataa-caacaacagcataggcagtatgcaacagcagcaagatatcataatatcaaatataattcaacaacatcttaaatat 4650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0647
Description:

Target: scaffold0647; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 6216 - 6116
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataac--caacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaata 97  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||  ||||| | ||| || ||||| || | |||||| | ||||||||| |||||||| |||||    
T  6216 ctcatgcagcttagttaaataacaacaacaacaacataggtagtatacaaaaacagcatgacatgataatatcaattgcaattcatcaacatcttaaata 6117  T
Q  98 t 98  Q
    |    
T  6116 t 6116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 79
Target Start/End: Original strand, 2704 - 2784
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaat 79  Q
    ||||||||||||||| ||   || ||||||||||||| ||||||  ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||||    
T  2704 ctcatgcagcttagtcaatagacaaacagcaacataggcagtatataaaacagctcatgatataacaatatcaaatgcaat 2784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 49
Target Start/End: Original strand, 4741 - 4788
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaa 49  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| ||||    
T  4741 ctcatgcagcttagttaaataa-caacaacaacataggcagtatacaaa 4788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 54 - 98
Target Start/End: Original strand, 27912 - 27956
Alignment:
Q  54 catgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 98  Q
    ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  27912 catgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaatat 27956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 161226 - 161093
Alignment:
Q  1 ctcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaa-caacatctcaaatat 98  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||| ||| || |||||| | ||| ||| |||| |||| |||||| ||||||| |||| ||||||||||| |||    
T  161226 ctcatgcagcttagttaaat-atcaacagcgacacag-cagtatacaaaaacataatgacataataatatcaaatgcaagtcaatcaacatctcaattat 161129  T
Q  99 caac--ataattcatataatgtatatacaattatat 132  Q
      ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  161128 tcacaaataattcaattaatgcatatacaattatat 161093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University