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Alignment Overview

Query: NF17754_low_33 (Length: 242)

Name: NF17754_low_33
Description: NF17754
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF17754_low_33
NF17754_low_33
[»] chr5 (22 HSPs)
chr5 (11-238)||(25426628-25426855)
chr5 (11-238)||(12374-12601)
chr5 (11-238)||(18778017-18778244)
chr5 (11-238)||(19499899-19500126)
chr5 (11-238)||(22366506-22366733)
chr5 (11-238)||(21073620-21073847)
chr5 (11-238)||(43443420-43443647)
chr5 (11-238)||(4200010-4200237)
chr5 (11-238)||(27009841-27010068)
chr5 (11-235)||(23506965-23507188)
chr5 (11-235)||(27182587-27182810)
chr5 (11-235)||(22053873-22054096)
chr5 (63-238)||(29188309-29188483)
chr5 (11-235)||(18531107-18531330)
chr5 (22-238)||(34939289-34939503)
chr5 (128-235)||(20623085-20623192)
chr5 (128-235)||(21233568-21233675)
chr5 (129-235)||(25900446-25900552)
chr5 (128-235)||(16536313-16536420)
chr5 (128-235)||(37052860-37052967)
chr5 (15-55)||(29190482-29190522)
chr5 (11-52)||(17471803-17471844)
[»] chr6 (12 HSPs)
chr6 (11-241)||(25175563-25175793)
chr6 (11-238)||(27654008-27654235)
chr6 (11-238)||(16825777-16826006)
chr6 (15-238)||(14626155-14626377)
chr6 (15-238)||(1650130-1650352)
chr6 (22-235)||(23153458-23153670)
chr6 (22-238)||(1657785-1657999)
chr6 (11-238)||(35009476-35009702)
chr6 (22-238)||(15862484-15862697)
chr6 (79-227)||(29665941-29666089)
chr6 (190-238)||(27751603-27751651)
chr6 (175-235)||(29605612-29605672)
[»] chr2 (15 HSPs)
chr2 (11-238)||(19886686-19886913)
chr2 (11-230)||(17396697-17396916)
chr2 (11-235)||(19794744-19794967)
chr2 (16-231)||(462743-462957)
chr2 (11-235)||(8891242-8891465)
chr2 (11-235)||(20627353-20627576)
chr2 (11-235)||(36982481-36982704)
chr2 (11-235)||(43642997-43643220)
chr2 (11-235)||(24341429-24341652)
chr2 (11-225)||(7507894-7508107)
chr2 (11-238)||(25265427-25265653)
chr2 (128-235)||(19689441-19689548)
chr2 (128-235)||(23820187-23820294)
chr2 (128-235)||(14906480-14906587)
chr2 (128-235)||(20015127-20015234)
[»] chr4 (15 HSPs)
chr4 (11-238)||(47357654-47357881)
chr4 (11-238)||(10644219-10644446)
chr4 (19-235)||(13048261-13048477)
chr4 (11-235)||(13246430-13246653)
chr4 (11-235)||(54118284-54118507)
chr4 (11-235)||(15675129-15675352)
chr4 (11-235)||(31115629-31115852)
chr4 (11-235)||(26680201-26680423)
chr4 (111-235)||(121989-122112)
chr4 (79-235)||(10104290-10104445)
chr4 (11-108)||(111395-111492)
chr4 (128-235)||(10488678-10488785)
chr4 (128-235)||(16327966-16328073)
chr4 (79-235)||(40885594-40885749)
chr4 (11-55)||(10104450-10104494)
[»] chr7 (19 HSPs)
chr7 (11-238)||(10989410-10989636)
chr7 (11-238)||(2437457-2437684)
chr7 (11-238)||(13911049-13911277)
chr7 (11-238)||(13572676-13572903)
chr7 (11-235)||(18253875-18254098)
chr7 (17-235)||(25292378-25292595)
chr7 (11-238)||(16478987-16479213)
chr7 (16-235)||(11580779-11580997)
chr7 (11-238)||(47481068-47481294)
chr7 (11-235)||(13037054-13037277)
chr7 (11-232)||(36052667-36052884)
chr7 (13-235)||(16211768-16211989)
chr7 (11-231)||(3059966-3060185)
chr7 (11-235)||(7293017-7293239)
chr7 (11-238)||(13321014-13321242)
chr7 (128-235)||(11516343-11516450)
chr7 (128-235)||(15441604-15441711)
chr7 (128-235)||(30262169-30262276)
chr7 (154-238)||(296003-296087)
[»] scaffold0023 (2 HSPs)
scaffold0023 (11-238)||(36093-36320)
scaffold0023 (11-235)||(48598-48821)
[»] chr8 (19 HSPs)
chr8 (11-238)||(30120722-30120949)
chr8 (11-201)||(222753-222943)
chr8 (11-201)||(736376-736566)
chr8 (11-201)||(860271-860461)
chr8 (11-238)||(16674417-16674644)
chr8 (11-238)||(21844597-21844824)
chr8 (11-238)||(21851990-21852217)
chr8 (11-232)||(43373511-43373731)
chr8 (10-235)||(16193756-16193980)
chr8 (15-238)||(6774283-6774505)
chr8 (15-238)||(24548986-24549208)
chr8 (22-235)||(24928831-24929043)
chr8 (11-235)||(16405015-16405235)
chr8 (11-235)||(22907254-22907476)
chr8 (22-238)||(17345581-17345795)
chr8 (139-201)||(691908-691970)
chr8 (128-235)||(5238203-5238310)
chr8 (128-235)||(24661288-24661395)
chr8 (128-235)||(43685662-43685769)
[»] chr3 (24 HSPs)
chr3 (11-238)||(55316219-55316446)
chr3 (11-238)||(41270075-41270302)
chr3 (11-238)||(16821139-16821366)
chr3 (11-235)||(14842601-14842824)
chr3 (11-230)||(13975766-13975985)
chr3 (11-230)||(45860805-45861024)
chr3 (11-235)||(15936667-15936890)
chr3 (11-230)||(13954934-13955153)
chr3 (10-235)||(51158058-51158282)
chr3 (11-235)||(15859064-15859287)
chr3 (14-235)||(15938509-15938729)
chr3 (11-235)||(12030187-12030410)
chr3 (11-235)||(2049810-2050033)
chr3 (15-238)||(15614838-15615060)
chr3 (22-235)||(13838905-13839117)
chr3 (11-235)||(17912522-17912744)
chr3 (11-235)||(16744155-16744377)
chr3 (128-235)||(2449278-2449385)
chr3 (11-124)||(47984650-47984763)
chr3 (11-124)||(47993937-47994050)
chr3 (11-124)||(48003224-48003337)
chr3 (11-124)||(48012510-48012623)
chr3 (11-52)||(15468555-15468596)
chr3 (11-52)||(22275209-22275250)
[»] chr1 (15 HSPs)
chr1 (11-238)||(18601143-18601370)
chr1 (11-238)||(5072413-5072640)
chr1 (11-235)||(20931345-20931568)
chr1 (11-225)||(22227809-22228022)
chr1 (11-225)||(22232506-22232719)
chr1 (11-235)||(20913037-20913253)
chr1 (15-238)||(2116258-2116481)
chr1 (11-235)||(20893666-20893889)
chr1 (11-235)||(41394222-41394445)
chr1 (11-235)||(20445679-20445902)
chr1 (11-235)||(20531444-20531667)
chr1 (11-235)||(37844490-37844714)
chr1 (77-238)||(45051489-45051649)
chr1 (128-235)||(51452608-51452715)
chr1 (15-55)||(45051446-45051486)
[»] scaffold0076 (1 HSPs)
scaffold0076 (11-238)||(42997-43224)
[»] scaffold0008 (2 HSPs)
scaffold0008 (11-238)||(31700-31928)
scaffold0008 (11-235)||(128209-128431)
[»] scaffold0116 (1 HSPs)
scaffold0116 (11-238)||(35-262)
[»] scaffold0026 (2 HSPs)
scaffold0026 (11-207)||(64584-64780)
scaffold0026 (11-235)||(107747-107970)
[»] scaffold0772 (1 HSPs)
scaffold0772 (35-238)||(5552-5755)
[»] scaffold0139 (2 HSPs)
scaffold0139 (11-238)||(21141-21367)
scaffold0139 (11-238)||(14086-14312)
[»] scaffold0266 (2 HSPs)
scaffold0266 (13-235)||(3622-3843)
scaffold0266 (11-235)||(1124-1347)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (11-235)||(48187-48410)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (11-235)||(6104-6326)
[»] scaffold0175 (1 HSPs)
scaffold0175 (11-235)||(996-1218)
[»] scaffold0498 (1 HSPs)
scaffold0498 (11-238)||(8878-9104)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (11-225)||(5254-5466)
[»] scaffold0302 (1 HSPs)
scaffold0302 (11-235)||(12115-12336)
[»] scaffold0369 (1 HSPs)
scaffold0369 (11-225)||(3722-3936)
[»] scaffold0025 (2 HSPs)
scaffold0025 (11-235)||(148721-148944)
scaffold0025 (11-235)||(8849-9072)
[»] scaffold0215 (2 HSPs)
scaffold0215 (15-238)||(9374-9596)
scaffold0215 (15-238)||(16272-16494)
[»] scaffold0195 (2 HSPs)
scaffold0195 (11-235)||(19206-19429)
scaffold0195 (11-235)||(21290-21513)
[»] scaffold0011 (1 HSPs)
scaffold0011 (11-235)||(123204-123427)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (11-235)||(5101-5324)
[»] scaffold0077 (1 HSPs)
scaffold0077 (11-235)||(36953-37176)
[»] scaffold1711 (1 HSPs)
scaffold1711 (117-238)||(1329-1450)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (22-235)||(247482-247694)
[»] scaffold0162 (2 HSPs)
scaffold0162 (11-235)||(26455-26678)
scaffold0162 (128-238)||(8217-8327)
[»] scaffold0001 (2 HSPs)
scaffold0001 (22-235)||(171916-172128)
scaffold0001 (22-235)||(177619-177831)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (17-235)||(272031-272248)
[»] scaffold0106 (1 HSPs)
scaffold0106 (15-235)||(41733-41952)
[»] scaffold1542 (1 HSPs)
scaffold1542 (11-235)||(574-797)
[»] scaffold1560 (1 HSPs)
scaffold1560 (11-117)||(9-115)
[»] scaffold0529 (1 HSPs)
scaffold0529 (15-238)||(2966-3189)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (11-238)||(34497-34724)
[»] scaffold0104 (1 HSPs)
scaffold0104 (11-117)||(48514-48620)
[»] scaffold0420 (1 HSPs)
scaffold0420 (107-238)||(13350-13480)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (11-238)||(41648-41874)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (11-235)||(37106-37328)
[»] scaffold0132 (1 HSPs)
scaffold0132 (11-238)||(13506-13732)
[»] scaffold0622 (1 HSPs)
scaffold0622 (11-108)||(9382-9479)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (129-231)||(51226-51328)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (129-231)||(89498-89600)
[»] scaffold0141 (2 HSPs)
scaffold0141 (128-235)||(22656-22763)
scaffold0141 (128-235)||(26911-27018)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (128-235)||(1622-1729)
[»] scaffold0361 (2 HSPs)
scaffold0361 (182-238)||(3360-3416)
scaffold0361 (13-67)||(3210-3264)
[»] scaffold0066 (1 HSPs)
scaffold0066 (179-225)||(45198-45244)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 224; Significance: 1e-123; HSPs: 22)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 11 - 238
Target Start/End: Original strand, 25426628 - 25426855
Alignment:
11 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
25426628 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 25426727  T
111 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
25426728 taacaacaacttaggagaaattcaccactttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 25426827  T
211 acatcaattcatgcatacaaacataaca 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
25426828 acatcaattcatgcatacaaacataaca 25426855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 11 - 238
Target Start/End: Original strand, 12374 - 12601
Alignment:
11 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
12374 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 12473  T
111 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
12474 taacaacaacttaggagaaattcaccactttagcacaatcttcataacttatcacttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 12573  T
211 acatcaattcatgcatacaaacataaca 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
12574 acatcaattcatgcatacaaacataaca 12601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 216; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 11 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 18778244 - 18778017
Alignment:
11 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
18778244 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataatattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 18778145  T
111 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
18778144 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 18778045  T
211 acatcaattcatgcatacaaacataaca 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
18778044 acatcaattcatgcatacaaacataaca 18778017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 216; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 11 - 238
Target Start/End: Original strand, 19499899 - 19500126
Alignment:
11 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
19499899 catcatcaatccatgaatatgcataccaaagcaattattaatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 19499998  T
111 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
19499999 taacaacaacttaggagaaattcaccactttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 19500098  T
211 acatcaattcatgcatacaaacataaca 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
19500099 acatcaattcatgcatacaaacataaca 19500126  T

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Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 216; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 11 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 22366733 - 22366506
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11 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
22366733 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacaactcaaat 22366634  T
111 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
22366633 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 22366534  T
211 acatcaattcatgcatacaaacataaca 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
22366533 acatcaattcatgcatacaaacataaca 22366506  T

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Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 11 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 21073847 - 21073620
Alignment:
11 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
21073847 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattgataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 21073748  T
111 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 210  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
21073747 taacaacaacttagaagaaattcaccactttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 21073648  T
211 acatcaattcatgcatacaaacataaca 238  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||    
21073647 acatccattcatgcatacaaacataaca 21073620  T

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Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 11 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 43443647 - 43443420
Alignment:
11 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 110  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
43443647 catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagactcacatctcaaat 43443548  T
111 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 210  Q
     ||||||||||||| |||||||||||  || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
43443547 caacaacaacttagaagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaacta 43443448  T
211 acatcaattcatgcatacaaacataaca 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
43443447 acatcaattcatgcatacaaacataaca 43443420  T

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Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 172; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 11 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 4200237 - 4200010
Alignment:
11 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 110  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||    
4200237 catcatcaacccatgaatatgcaaacccaagcaatcattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat 4200138  T
111 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 210  Q
     ||||||||| || ||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
4200137 caacaacaacataagagaaattcaccaatttagcataatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaacta 4200038  T
211 acatcaattcatgcatacaaacataaca 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
4200037 acatcaattcatgcatacaaacataaca 4200010  T

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Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 11 - 238
Target Start/End: Original strand, 27009841 - 27010068
Alignment:
11 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 110  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
27009841 catcaacaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaat 27009940  T
111 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || || ||||| ||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||| | ||||||  |    
27009941 taacaacaacttaggagaaattcaccaattgagtacaatattcataacttatcatttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacactcatacaatca 27010040  T
211 acatcaattcatgcatacaaacataaca 238  Q
     |||||||||||||||||||||||||||    
27010041 tcatcaattcatgcatacaaacataaca 27010068  T

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Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Original strand, 23506965 - 23507188
Alignment:
11 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 110  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| | |||||||    
23506965 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat 23507064  T
111 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 210  Q
    |||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
23507065 taacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 23507163  T
211 acatcaattcatgcatacaaacata 235  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
23507164 tcatcaattcatgcatacaaacata 23507188  T

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Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 27182810 - 27182587
Alignment:
11 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 110  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||| || || ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| |||||||      
27182810 catcatcaattcatgaatatgcatactcaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatc 27182711  T
111 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 210  Q
    |||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||| | | ||| |||||||||||||||| ||||||| |||||| ||    
27182710 taacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcatcaacaatcatacaatta 27182612  T
211 acatcaattcatgcatacaaacata 235  Q
     ||||| ||||||||||||||||||    
27182611 tcatcagttcatgcatacaaacata 27182587  T

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Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 22054096 - 22053873
Alignment:
11 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 110  Q
    |||||||||| |||||||||| | ||||||||||| |||||||||  | || ||||| |||||   ||||||||| ||||||| |||||| | ||||| |    
22054096 catcatcaattcatgaatatgtagacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacagcaataacatcaattgaacatgaatcatatctcaatt 22053997  T
111 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 210  Q
     ||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
22053996 caacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaacta 22053898  T
211 acatcaattcatgcatacaaacata 235  Q
     ||||||||||| ||||||||||||    
22053897 tcatcaattcatacatacaaacata 22053873  T

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Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 63 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 29188483 - 29188309
Alignment:
63 atcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttat 162  Q
    ||||| |||||  |||||||||| |||| ||||||||| | ||||||||||||| ||||||| | |||||||||  || ||||| || |||| |||||||    
29188483 atcaattaacaaccataacatcaattgagcaagaatcaaatctcaaattaacaataacttagca-aaattcaccaattgagcaccattttcacaacttat 29188385  T
163 catttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataaca 238  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
29188384 catttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataaca 29188309  T

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Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 18531330 - 18531107
Alignment:
11 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 110  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||| |||||| |||||||||  | || ||||| |||||   ||||||||| ||||||| |||||| | ||||| |    
18531330 catcatcaattcatgaatatgtatacccgagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacagcaataacatcaattgaacatgaatcatatctcaatt 18531231  T
111 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 210  Q
     ||||||||||||| | |||||||||  || | |||||| |||| |||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
18531230 caacaacaacttagca-aaattcaccaattgaacacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 18531132  T
211 acatcaattcatgcatacaaacata 235  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
18531131 tcatcaattcatgcatacaaacata 18531107  T

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Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 22 - 238
Target Start/End: Original strand, 34939289 - 34939503
Alignment:
22 catgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaact 121  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||  | || ||||| |||||   |||||||||  ||||||||||||| ||||||| || ||||  |||    
34939289 catgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaattaacagcaataacatcaactgaacaagaatcataactcaa-ttcacaatgact 34939387  T
122 taggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattca 221  Q
    ||| | |||| || |  || |||||||| ||||||||||  ||||||| ||||  ||||||||| |||||||||||||| |||||| || ||||||||||    
34939388 tagca-aaatccatcaattgagcacaattttcataacttcacatttttacataattgaacatgtgatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattca 34939486  T
222 tgcatacaaacataaca 238  Q
    |||||||||||||||||    
34939487 tgcatacaaacataaca 34939503  T

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Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 128 - 235
Target Start/End: Original strand, 20623085 - 20623192
Alignment:
128 aaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 227  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
20623085 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 20623184  T
228 caaacata 235  Q
    ||||||||    
20623185 caaacata 20623192  T

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Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 128 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 21233675 - 21233568
Alignment:
128 aaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 227  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
21233675 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 21233576  T
228 caaacata 235  Q
    ||||||||    
21233575 caaacata 21233568  T

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Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 129 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 25900552 - 25900446
Alignment:
129 aattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatac 228  Q
    |||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  |||||   ||||| |||||| ||||||||| |||||| || |||||||||||||||||    
25900552 aattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatataatttaaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatac 25900453  T
229 aaacata 235  Q
    |||||||    
25900452 aaacata 25900446  T

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Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 128 - 235
Target Start/End: Original strand, 16536313 - 16536420
Alignment:
128 aaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 227  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  |||||   |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  || ||||||||||||    
16536313 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattataaattcatgcata 16536412  T
228 caaacata 235  Q
    ||||||||    
16536413 caaacata 16536420  T

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Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 128 - 235
Target Start/End: Original strand, 37052860 - 37052967
Alignment:
128 aaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 227  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| ||||||   |||||   |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
37052860 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcatttccacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 37052959  T
228 caaacata 235  Q
    ||||||||    
37052960 caaacata 37052967  T

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Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 15 - 55
Target Start/End: Complemental strand, 29190522 - 29190482
Alignment:
15 atcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaa 55  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
29190522 atcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaa 29190482  T

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Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 11 - 52
Target Start/End: Complemental strand, 17471844 - 17471803
Alignment:
11 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcat 52  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||    
17471844 catcatcaattcatgaatatgcgtacccaagcaatgattcat 17471803  T

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Target: chr6 (Bit Score: 223; Significance: 1e-123; HSPs: 12)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Original strand, 25175563 - 25175793
Alignment:
11 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
25175563 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 25175662  T
111 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
25175663 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 25175762  T
211 acatcaattcatgcatacaaacataacaaca 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
25175763 acatcaattcatgcatacaaacataacaaca 25175793  T

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Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 11 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 27654235 - 27654008
Alignment:
11 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 110  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
27654235 catcattaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcattggaacaagaatcacaactcaaat 27654136  T
111 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
27654135 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 27654036  T
211 acatcaattcatgcatacaaacataaca 238  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||    
27654035 acatcaattcatgcatacaagcataaca 27654008  T

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Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 11 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 16826006 - 16825777
Alignment:
11 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
16826006 catcatcaatccatgaatatgcataacaaagcaattattcatcaatcataatatcagataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 16825907  T
111 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatta--tacaac 208  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
16825906 taacaacaaattaggagaaatccaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattaattacaac 16825807  T
209 taacatcaattcatgcatacaaacataaca 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
16825806 taacatcaattcatgcatacaaacataaca 16825777  T

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Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 15 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 14626377 - 14626155
Alignment:
15 atcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaac 114  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  | || ||||| |||||  |||||||||| |||| ||||||||| | ||||| |||||    
14626377 atcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacaaccataacatcaattgagcaagaatcaaatctcaagttaac 14626278  T
115 aacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacat 214  Q
    |||||||||| | || ||||||  ||   |||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || |||    
14626277 aacaacttagcataa-ttcaccaattgcacacaattttcataacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcat 14626179  T
215 caattcatgcatacaaacataaca 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
14626178 caattcatgcatacaaacataaca 14626155  T

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Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 15 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 1650352 - 1650130
Alignment:
15 atcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaac 114  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||  | || |||||||||||   ||||||||| |||| ||||||||| | |||||||||||    
1650352 atcaattcatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaataacatcaattgagcaagaatcaaatctcaaattaac 1650253  T
115 aacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacat 214  Q
     | ||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || |||    
1650252 cataacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcattcttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcat 1650154  T
215 caattcatgcatacaaacataaca 238  Q
    |||||||||||||||||| |||||    
1650153 caattcatgcatacaaacgtaaca 1650130  T

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Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 22 - 235
Target Start/End: Original strand, 23153458 - 23153670
Alignment:
22 catgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaact 121  Q
    |||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| || || ||||| |||||  ||||| |||| |||||||||||||| |||||||  |||||||||||    
23153458 catgaatatgtatacccaagtaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataatatcaattgaacaagaatcataactcaatctaacaacaact 23153557  T
122 taggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattca 221  Q
    ||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||| | | ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||    
23153558 tagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattca 23153656  T
222 tgcatacaaacata 235  Q
    ||||||||||||||    
23153657 tgcatacaaacata 23153670  T

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Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 22 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 1657999 - 1657785
Alignment:
22 catgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaact 121  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||  | || ||||| |||||   |||||||||  ||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    
1657999 catgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataacatcaactgaacaagaatcataactcaa-ttcacaataact 1657901  T
122 taggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattca 221  Q
    ||| | |||| || |  || |||||||| ||||||||||  ||||||| ||||  ||||||||| |||||||||||||| |||||| || ||||||||||    
1657900 tagca-aaatccatcaattgagcacaattttcataacttcacatttttacataattgaacatgtgatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattca 1657802  T
222 tgcatacaaacataaca 238  Q
    ||||| |||||||||||    
1657801 tgcatccaaacataaca 1657785  T

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Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 11 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 35009702 - 35009476
Alignment:
11 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 110  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  | || ||||| |||||   | ||||||| ||||||| |  || || |  || |    
35009702 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaacaacatcaattgaacatggttctcatcataatt 35009603  T
111 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 210  Q
     ||||||||| ||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
35009602 caacaacaacatagca-aaattcaccaattgagcacaattttcaaaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 35009504  T
211 acatcaattcatgcatacaaacataaca 238  Q
     ||||||||||||||||||||| |||||    
35009503 tcatcaattcatgcatacaaacttaaca 35009476  T

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Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 22 - 238
Target Start/End: Original strand, 15862484 - 15862697
Alignment:
22 catgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaact 121  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||  | || ||||| || ||   ||||||| | | |||||||||||| ||||||| || |||| ||||    
15862484 catgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaattatcagcaataacataaat-gaacaagaatcataactcaa-ttcacaataact 15862581  T
122 taggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattca 221  Q
    ||| | |||| || |  || |||||||| ||||||||||  ||||| | ||||  ||||||||| |||||||||||||| |||||| || ||||||||||    
15862582 tagca-aaatccatcaattgagcacaattttcataacttcacatttatacataattgaacatgtgatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattca 15862680  T
222 tgcatacaaacataaca 238  Q
    |||||||||||||||||    
15862681 tgcatacaaacataaca 15862697  T

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Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 79 - 227
Target Start/End: Original strand, 29665941 - 29666089
Alignment:
79 aacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcata-tat 177  Q
    ||||||| ||||||| |||||| | ||||  | ||||||||||||| | |||||||||  || || ||||| ||||||||||  ||||| |||||| | |    
29665941 aacatcaattgaacatgaatcatatctcatttcaacaacaacttagca-aaattcaccaattgagtacaat-ttcataacttgacatttatgcatacttt 29666038  T
178 gaa-catgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 227  Q
    ||| |||||||||||||| ||||| |||||| || ||||||||||| ||||    
29666039 gaaacatgtaatttcacccacaatcatacaattatcatcaattcatacata 29666089  T

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Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 190 - 238
Target Start/End: Original strand, 27751603 - 27751651
Alignment:
190 tcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataaca 238  Q
    ||||||||||| |||||| |  |||||||||||||||||||||||||||    
27751603 tcaccaacaatcatacaattgtcatcaattcatgcatacaaacataaca 27751651  T

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Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 175 - 235
Target Start/End: Original strand, 29605612 - 29605672
Alignment:
175 tatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacata 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||  || ||| || ||  ||||||||||| ||||||||    
29605612 tatgaacatgtaatttcaccaacaacaattcaattatcactaattcatgcattcaaacata 29605672  T

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Target: chr2 (Bit Score: 220; Significance: 1e-121; HSPs: 15)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 11 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 19886913 - 19886686
Alignment:
11 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
19886913 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 19886814  T
111 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
19886813 taacaacaacttaggagaaattcaccactttagcacaatcttcataacttatcacttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 19886714  T
211 acatcaattcatgcatacaaacataaca 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
19886713 acatcaattcatgcatacaaacataaca 19886686  T

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Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 11 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 17396916 - 17396697
Alignment:
11 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 110  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
17396916 catcaacaatccatgaatatgcaaacccaagcaattatccattaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaat 17396817  T
111 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 210  Q
    |||  |||||||||||||||||||||  || |||||||| ||||||||||||||||||| | ||| | |||||||||||||||||||||| ||||||  |    
17396816 taatgacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttacttatttaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatca 17396717  T
211 acatcaattcatgcatacaa 230  Q
     || ||||||||||||||||    
17396716 tcaacaattcatgcatacaa 17396697  T

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Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 19794967 - 19794744
Alignment:
11 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||| ||||| ||||    ||||||||| |||||||||||||| ||||||| |    
19794967 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactataacatcaattaacggaaataacatcaattgaacaagaatcataactcaatt 19794868  T
111 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 210  Q
     ||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||| | | ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
19794867 caacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 19794769  T
211 acatcaattcatgcatacaaacata 235  Q
      |||||||||||||||||||||||    
19794768 ttatcaattcatgcatacaaacata 19794744  T

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Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 16 - 231
Target Start/End: Original strand, 462743 - 462957
Alignment:
16 tcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaaca 115  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  | ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| |||||||  |||||    
462743 tcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaatcacgacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatctaaca 462842  T
116 acaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatc 215  Q
    ||||||||| | |||||||||  || | |||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| || ||||    
462843 acaacttagca-aaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatc 462941  T
216 aattcatgcatacaaa 231  Q
    ||||||||||||||||    
462942 aattcatgcatacaaa 462957  T

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Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Original strand, 8891242 - 8891465
Alignment:
11 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| ||| |  |||||||||| |||||||||||||| |||||||      
8891242 catcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaatagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatc 8891341  T
111 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 210  Q
    |||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||| | | ||| ||||||||||||||| |||||||| |||||| ||    
8891342 taacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcgccaacaatcatacaatta 8891440  T
211 acatcaattcatgcatacaaacata 235  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
8891441 tcatcaattcatgcatacaaacata 8891465  T

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Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 20627576 - 20627353
Alignment:
11 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 110  Q
    |||| ||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| || || | ||| |||||  ||||| |||| |||||||||||| | | |||||||    
20627576 catcctcaattcatgaatatccatacccaagcaatgattcatcaaccacaacaccaattaacaaccataaaatcaattgaacaagaattaaatctcaaat 20627477  T
111 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 210  Q
    |||||||||||||  | |||||||||  || |||||||| |||| || ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| |||||| ||    
20627476 taacaacaacttaaca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaagttatcatttttacatatttggacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 20627378  T
211 acatcaattcatgcatacaaacata 235  Q
     ||||||||| ||||||||||||||    
20627377 tcatcaattcgtgcatacaaacata 20627353  T

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Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 36982704 - 36982481
Alignment:
11 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 110  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||  | || ||||| |||||   ||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |    
36982704 catcatcaattcatgaatatgcatacccaaacaatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataacatcaattgaacaggaatcataactcaatt 36982605  T
111 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 210  Q
     ||||||||||| | | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||    
36982604 caacaacaacttggca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccagcaatcttacaatta 36982506  T
211 acatcaattcatgcatacaaacata 235  Q
     |||||||||||| |||||||||||    
36982505 tcatcaattcatgaatacaaacata 36982481  T

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Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 43643220 - 43642997
Alignment:
11 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 110  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||  | || ||||| |||||   ||| ||||| |||||||||||||| | |||||||    
43643220 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaactacaacatcaattaacagcaatagcatcaattgaacaagaatcatatctcaaat 43643121  T
111 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 210  Q
    ||| ||||||| || | |||||||||  || |||||||| |||| |||||| ||||| | | ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
43643120 taataacaactaagaa-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttaacatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 43643022  T
211 acatcaattcatgcatacaaacata 235  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
43643021 tcatcaattcatgcatacaaacata 43642997  T

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Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 24341652 - 24341429
Alignment:
11 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 110  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||    || ||||| |||||   ||||||||| ||||||| |||||| | ||||| |    
24341652 catcatcaattcatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaacaggaacatcaattaacaacaataacatcaattgaacatgaatcatatctcaatt 24341553  T
111 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 210  Q
     ||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||  ||||||| ||||  ||||||| |||||||||||||||| |||||| ||    
24341552 caacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatataatttcaccaacaatcatacaatta 24341454  T
211 acatcaattcatgcatacaaacata 235  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
24341453 tcatcaattcatgcatacaaacata 24341429  T

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Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 11 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 7508107 - 7507894
Alignment:
11 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaa-caagaatcacaactcaaa 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||  | || |||||||||||   ||||||||| || || || |||||| | |||||     
7508107 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaataacatcaattaaaacatgaatcatatctcaa- 7508009  T
110 ttaacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaact 209  Q
    |||||||||||||||   |||||||||  || | |||||| |||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |    
7508008 ttaacaacaacttagcc-aaattcaccaattgaacacaattttcataacttattatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatt 7507910  T
210 aacatcaattcatgca 225  Q
    | ||||||||||||||    
7507909 atcatcaattcatgca 7507894  T

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Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 11 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 25265653 - 25265427
Alignment:
11 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 110  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||| ||  | || ||||| |||||   | ||||||| ||||||| |  || || |  || |    
25265653 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagccatgattcataaacaacaacatcaattaacaacaacaacatcaattgaacatggttctcatcataatt 25265554  T
111 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 210  Q
     ||||||||| ||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
25265553 caacaacaacatagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 25265455  T
211 acatcaattcatgcatacaaacataaca 238  Q
     |||||||||||||||||||||||||||    
25265454 tcatcaattcatgcatacaaacataaca 25265427  T

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Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 128 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 19689548 - 19689441
Alignment:
128 aaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 227  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
19689548 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 19689449  T
228 caaacata 235  Q
    ||||||||    
19689448 caaacata 19689441  T

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Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 128 - 235
Target Start/End: Original strand, 23820187 - 23820294
Alignment:
128 aaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 227  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
23820187 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 23820286  T
228 caaacata 235  Q
    ||||||||    
23820287 caaacata 23820294  T

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Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 128 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 14906587 - 14906480
Alignment:
128 aaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 227  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  |||||   |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
14906587 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 14906488  T
228 caaacata 235  Q
    ||||||||    
14906487 caaacata 14906480  T

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Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 128 - 235
Target Start/End: Original strand, 20015127 - 20015234
Alignment:
128 aaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 227  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  |||||   |||||||||||| ||||||||| | |||| ||  ||||||||||||||     
20015127 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcacacaattattatcaattcatgcatg 20015226  T
228 caaacata 235  Q
    ||||||||    
20015227 caaacata 20015234  T

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Target: chr4 (Bit Score: 208; Significance: 1e-114; HSPs: 15)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 11 - 238
Target Start/End: Original strand, 47357654 - 47357881
Alignment:
11 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 110  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
47357654 catcatcaatccatgaatatacatacccaatcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 47357753  T
111 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
47357754 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 47357853  T
211 acatcaattcatgcatacaaacataaca 238  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||    
47357854 acatcaatccatgcatacaaacataaca 47357881  T

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Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 164; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 11 - 238
Target Start/End: Original strand, 10644219 - 10644446
Alignment:
11 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 110  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||    
10644219 catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat 10644318  T
111 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 210  Q
     |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| ||    
10644319 caacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcactaacaatcatacaatta 10644418  T
211 acatcaattcatgcatacaaacataaca 238  Q
     |||||||||||||||||||||||||||    
10644419 tcatcaattcatgcatacaaacataaca 10644446  T

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Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 19 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 13048477 - 13048261
Alignment:
19 atccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaaca 118  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||    
13048477 atccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatctaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaactaacaaca 13048378  T
119 acttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaat 218  Q
    |||||||||||||||| |  || |||||||| ||||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||  | ||||||     
13048377 acttaggagaaattcatcaattgagcacaatattcataacttatcctttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatcatcatcaaa 13048278  T
219 tcatgcatacaaacata 235  Q
    |||||||||||||||||    
13048277 tcatgcatacaaacata 13048261  T

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Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Original strand, 13246430 - 13246653
Alignment:
11 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| |||||||      
13246430 catcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatc 13246529  T
111 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 210  Q
    |||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||| | | ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
13246530 taacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 13246628  T
211 acatcaattcatgcatacaaacata 235  Q
     ||| ||||||||||||||||||||    
13246629 tcattaattcatgcatacaaacata 13246653  T

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Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 54118507 - 54118284
Alignment:
11 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 110  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| |||||   ||||||||| |||||||||||||| |||| ||      
54118507 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaactataacatcaattgaacaagaatcataactaaatc 54118408  T
111 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 210  Q
    |||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| ||||||||| || | | ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
54118407 taacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcaattgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 54118309  T
211 acatcaattcatgcatacaaacata 235  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
54118308 tcatcaattcatgcatacaaacata 54118284  T

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Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 15675352 - 15675129
Alignment:
11 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 110  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||  | || ||||| |||||   ||||||||| ||||||| |||||| | ||||| |    
15675352 catcatcaattcatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataacatcaattgaacatgaatcatatctcaatt 15675253  T
111 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 210  Q
     ||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
15675252 caacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 15675154  T
211 acatcaattcatgcatacaaacata 235  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
15675153 tcatcaattcatgcatacaaacata 15675129  T

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Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Original strand, 31115629 - 31115852
Alignment:
11 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 110  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||  | || ||||| |||||   ||||||||| ||||||| |||||| | ||||| |    
31115629 catcatcaattcatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataacatcaattgaacatgaatcatatctcaatt 31115728  T
111 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 210  Q
     ||||||||||||||| |||||||||  || |||| ||| |||| |||||  ||||||| ||||   ||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
31115729 caacaacaacttagga-aaattcaccaattgagcataattttcacaacttcacatttttacataatggaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 31115827  T
211 acatcaattcatgcatacaaacata 235  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
31115828 tcatcaattcatgcatacaaacata 31115852  T

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Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Original strand, 26680201 - 26680423
Alignment:
11 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 110  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||  | || ||| | || |||  | ||||||| ||| |||||||||| | ||||| |    
26680201 catcatcaatccatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 26680300  T
111 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 210  Q
     ||| ||||| |  |  ||||||| |  ||| ||||||| |||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| ||    
26680301 caactacaacat--gtcaaattcatctattttgcacaattttcataacttttcatttttacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaatta 26680398  T
211 acatcaattcatgcatacaaacata 235  Q
      |||||||||||||||||||||||    
26680399 ttatcaattcatgcatacaaacata 26680423  T

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Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 111 - 235
Target Start/End: Original strand, 121989 - 122112
Alignment:
111 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 210  Q
    |||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| ||    
121989 taacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaatta 122087  T
211 acatcaattcatgcatacaaacata 235  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
122088 tcatcaattcatgcatacaaacata 122112  T

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Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 79 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 10104445 - 10104290
Alignment:
79 aacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatg 178  Q
    ||||||| ||||||| |||||| | ||||| | ||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||  ||||||| ||||  ||    
10104445 aacatcaattgaacatgaatcatatctcaattcaacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattg 10104347  T
179 aacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacata 235  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||    
10104346 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacata 10104290  T

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Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 11 - 108
Target Start/End: Original strand, 111395 - 111492
Alignment:
11 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaa 108  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| |||||||    
111395 catcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattgaacaagaatcataactcaa 111492  T

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Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 128 - 235
Target Start/End: Original strand, 10488678 - 10488785
Alignment:
128 aaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 227  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  |||||   |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
10488678 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 10488777  T
228 caaacata 235  Q
    ||||||||    
10488778 caaacata 10488785  T

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Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 128 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 16328073 - 16327966
Alignment:
128 aaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 227  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  |||||   |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
16328073 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 16327974  T
228 caaacata 235  Q
    ||||||||    
16327973 caaacata 16327966  T

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Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 79 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 40885749 - 40885594
Alignment:
79 aacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcata-tat 177  Q
    ||||||| ||||||| |||||| | ||||| | ||||| ||||||| | || ||||||  || |||| ||| ||||||||||  ||||| | |||| | |    
40885749 aacatcaattgaacatgaatcatatctcaattcaacaataacttagca-aagttcaccaattgagcataat-ttcataacttgacatttatacatacttt 40885652  T
178 gaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacata 235  Q
    ||||||||||||||||||||||  || ||| || || |||||||||||||||||||||    
40885651 gaacatgtaatttcaccaacaaacattcaattatcaccaattcatgcatacaaacata 40885594  T

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Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 55
Target Start/End: Complemental strand, 10104494 - 10104450
Alignment:
11 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaa 55  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
10104494 catcatcaattcatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaa 10104450  T

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Target: chr7 (Bit Score: 196; Significance: 1e-107; HSPs: 19)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 11 - 238
Target Start/End: Original strand, 10989410 - 10989636
Alignment:
11 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 110  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
10989410 catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 10989509  T
111 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 210  Q
    || |||||||||||||||||||||||  || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
10989510 ta-caacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaacta 10989608  T
211 acatcaattcatgcatacaaacataaca 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
10989609 acatcaattcatgcatacaaacataaca 10989636  T

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Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 11 - 238
Target Start/End: Original strand, 2437457 - 2437684
Alignment:
11 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 110  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||    
2437457 catcatcaatccatgaatatgcaaactcaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcaaatctcatat 2437556  T
111 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 210  Q
    |||||||||||||||| |||||||||  || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
2437557 taacaacaacttaggaaaaattcaccaattgaacacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaacta 2437656  T
211 acatcaattcatgcatacaaacataaca 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
2437657 acatcaattcatgcatacaaacataaca 2437684  T

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Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 11 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 13911277 - 13911049
Alignment:
11 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 110  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||    
13911277 catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagaaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat 13911178  T
111 taacaacaactt-aggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaact 209  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||  || |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
13911177 caacaacaactttaggagaaattcaccaattgagcataatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatt 13911078  T
210 aacatcaattcatgcatacaaacataaca 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
13911077 aacatcaattcatgcatacaaacataaca 13911049  T

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Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 11 - 238
Target Start/End: Original strand, 13572676 - 13572903
Alignment:
11 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 110  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
13572676 catcaacaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaat 13572775  T
111 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| | ||||  |    
13572776 taacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcacacaatca 13572875  T
211 acatcaattcatgcatacaaacataaca 238  Q
     |||||||||||||||||||||||||||    
13572876 tcatcaattcatgcatacaaacataaca 13572903  T

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Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 18254098 - 18253875
Alignment:
11 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| || ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| | |||||||    
18254098 catcatcaatccatgaatatgcatactcaggcaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat 18253999  T
111 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 210  Q
    |||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
18253998 taacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacacatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 18253900  T
211 acatcaattcatgcatacaaacata 235  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
18253899 tcatcaattcatgcatacaaacata 18253875  T

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Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 17 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 25292595 - 25292378
Alignment:
17 caatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaa 116  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |    
25292595 caatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattagtcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaattaacga 25292496  T
117 caacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatca 216  Q
    |||| |||||| ||||||||  || |||||||| |||||| |||||| ||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||  | || ||    
25292495 caacctaggag-aattcaccaattgagcacaatattcatagcttatcctttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatcatcaaca 25292397  T
217 attcatgcatacaaacata 235  Q
    |||||| ||||||||||||    
25292396 attcatacatacaaacata 25292378  T

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Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 11 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 16479213 - 16478987
Alignment:
11 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||  | || |||||||||||   ||||||||| |||| ||||||||| | |||||||    
16479213 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaataacatcaattgagcaagaatcaaatctcaaat 16479114  T
111 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 210  Q
    ||| || ||||||  | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
16479113 taaaaataacttaaca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 16479015  T
211 acatcaattcatgcatacaaacataaca 238  Q
     |||||||||||||||||||||||||||    
16479014 tcatcaattcatgcatacaaacataaca 16478987  T

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Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 16 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 11580997 - 11580779
Alignment:
16 tcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaaca 115  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||| || || ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| |||||||  |||||    
11580997 tcaattcatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatctaaca 11580898  T
116 acaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatc 215  Q
    ||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||| | | ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||    
11580897 acaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatc 11580799  T
216 aattcatgcatacaaacata 235  Q
    ||||||||||||||||||||    
11580798 aattcatgcatacaaacata 11580779  T

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Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 11 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 47481294 - 47481068
Alignment:
11 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 110  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  | || ||||| ||| |   ||||||||| |||||||||||||| ||||||| |    
47481294 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaacaaaaacatcaattaagagcgataacatcaattgaacaagaatcataactcaatt 47481195  T
111 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 210  Q
     ||||||||||||| | |||||||||  || | |||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| ||    
47481194 caacaacaacttagca-aaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcactaacaatcatacaatta 47481096  T
211 acatcaattcatgcatacaaacataaca 238  Q
     |||||||||||||||||||||||||||    
47481095 tcatcaattcatgcatacaaacataaca 47481068  T

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Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 13037277 - 13037054
Alignment:
11 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| ||| ||||||||||| | |||||||||||||| |||||||      
13037277 catcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaatattcataacattaattgaacaagaatcataactcaatc 13037178  T
111 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 210  Q
    |||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||| | | ||| |||||||| ||||||| ||||||| |||||| ||    
13037177 taacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgcaatttcatcaacaatcatacaatta 13037079  T
211 acatcaattcatgcatacaaacata 235  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
13037078 tcatcaattcatgcatacaaacata 13037054  T

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Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 11 - 232
Target Start/End: Original strand, 36052667 - 36052884
Alignment:
11 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 110  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| |||||  || ||||||| |||||||||||||| | |||||||    
36052667 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaaccacaacatcaattaacaaccacaacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat 36052766  T
111 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 210  Q
    |||||||   |||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| ||| || ||    
36052767 taacaac---ttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaattttaccaacaatcatataatta 36052862  T
211 acatcaattcatgcatacaaac 232  Q
     |||||||||||||||||||||    
36052863 tcatcaattcatgcatacaaac 36052884  T

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Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 13 - 235
Target Start/End: Original strand, 16211768 - 16211989
Alignment:
13 tcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaatta 112  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||| || || ||||| |||||  |||||||||| || ||||||||||| | |||||||||    
16211768 tcattaattcatgaatatgcatacccaagcaatgaatcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatttaacaagaatcaaatctcaaatta 16211867  T
113 acaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaac 212  Q
    |||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||  ||||| || |    
16211868 acaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgcaatttcacaaacaatcttacaattatc 16211966  T
213 atcaattcatgcatacaaacata 235  Q
    |||||||||||||||||||||||    
16211967 atcaattcatgcatacaaacata 16211989  T

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Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 11 - 231
Target Start/End: Original strand, 3059966 - 3060185
Alignment:
11 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||      
3059966 catcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagtcataacatcaattgaacaagaatcataactcaatc 3060065  T
111 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 210  Q
    |||||||||||||  | |||||||||  || |||| ||| |||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |  ||||| ||    
3060066 taacaacaacttaaca-aaattcaccatttgagcataattttcacaatttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacagtattacaatta 3060164  T
211 acatcaattcatgcatacaaa 231  Q
     |||||||| |||||||||||    
3060165 tcatcaattaatgcatacaaa 3060185  T

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Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Original strand, 7293017 - 7293239
Alignment:
11 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 110  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||  | || ||| | || |||  | ||||||| ||| |||||||||| | ||||| |    
7293017 catcatcaatccatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 7293116  T
111 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 210  Q
     ||||||||| |  |  ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| ||    
7293117 caacaacaacat--gtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaatta 7293214  T
211 acatcaattcatgcatacaaacata 235  Q
      || ||||||||||||||||||||    
7293215 ttattaattcatgcatacaaacata 7293239  T

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Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 11 - 238
Target Start/End: Original strand, 13321014 - 13321242
Alignment:
11 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 110  Q
    |||||||||| ||||||| |||| |||||||  || |||||||||  | || ||||| |||||   ||||||||| ||||||| |||||| | ||||| |    
13321014 catcatcaattcatgaatgtgcaaacccaagtcatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataacatcaattgaacatgaatcatatctcaatt 13321113  T
111 taacaa-caacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcata-tatgaa-catgtaatttcaccaacaattatacaa 207  Q
     ||||| |||||||| | |||||||||  || |||||||| ||||||||||  ||||| | |||| | |||| |||||||||||||||||||| ||||||    
13321114 caacaatcaacttagca-aaattcaccaattgagcacaat-ttcataacttgacatttatacatactttgaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaa 13321211  T
208 ctaacatcaattcatgcatacaaacataaca 238  Q
     || |||||||||||||||||||||||||||    
13321212 ttatcatcaattcatgcatacaaacataaca 13321242  T

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Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 128 - 235
Target Start/End: Original strand, 11516343 - 11516450
Alignment:
128 aaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 227  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
11516343 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 11516442  T
228 caaacata 235  Q
    ||||||||    
11516443 caaacata 11516450  T

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Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 128 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 15441711 - 15441604
Alignment:
128 aaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 227  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
15441711 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 15441612  T
228 caaacata 235  Q
    ||||||||    
15441611 caaacata 15441604  T

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Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 128 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 30262276 - 30262169
Alignment:
128 aaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 227  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
30262276 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 30262177  T
228 caaacata 235  Q
    ||||||||    
30262176 caaacata 30262169  T

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Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 154 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 296087 - 296003
Alignment:
154 ataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataaca 238  Q
    ||||||| |||||||| ||||  | |||||| ||||||||||||||| |||  | || |||| ||||||||| ||||||||||||    
296087 ataacttctcatttttacataattcaacatgaaatttcaccaacaatcataacattatcatcgattcatgcacacaaacataaca 296003  T

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Target: scaffold0023 (Bit Score: 184; Significance: 1e-99; HSPs: 2)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 11 - 238
Target Start/End: Original strand, 36093 - 36320
Alignment:
11 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 110  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||    
36093 catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcatattatcaaataacattcataacatctattgaacatgaatcacatctcaaat 36192  T
111 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
36193 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaatatgtaatttcaccaacaatcatacaacta 36292  T
211 acatcaattcatgcatacaaacataaca 238  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||    
36293 acatcaattcatacatacaaacataaca 36320  T

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Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Original strand, 48598 - 48821
Alignment:
11 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 110  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| ||| |  |||||||||| |||||||||||||| |||||||      
48598 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaatagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatc 48697  T
111 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 210  Q
    || ||||||||||| | |||||||||   | |||||||| |||| |||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
48698 tagcaacaacttagca-aaattcaccaactgagcacaattttcacaacttatcattttttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 48796  T
211 acatcaattcatgcatacaaacata 235  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
48797 tcatcaattcatgcatacaaacata 48821  T

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Target: chr8 (Bit Score: 184; Significance: 1e-99; HSPs: 19)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 11 - 238
Target Start/End: Original strand, 30120722 - 30120949
Alignment:
11 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 110  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||    
30120722 catcatcaatcgatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat 30120821  T
111 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
30120822 taacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaacta 30120921  T
211 acatcaattcatgcatacaaacataaca 238  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||    
30120922 acataaattcatgcatacaaacataaca 30120949  T

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Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 11 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 222943 - 222753
Alignment:
11 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
222943 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 222844  T
111 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatt 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
222843 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatt 222753  T

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Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 11 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 736566 - 736376
Alignment:
11 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
736566 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 736467  T
111 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatt 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
736466 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatt 736376  T

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Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 11 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 860461 - 860271
Alignment:
11 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
860461 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 860362  T
111 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatt 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
860361 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatt 860271  T

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Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 172; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 11 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 16674644 - 16674417
Alignment:
11 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 110  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |    
16674644 catcatcaatccatgaatatgcaaactcaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaact 16674545  T
111 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
16674544 taacaacaacttaggagaaattcaccaattaagcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaacta 16674445  T
211 acatcaattcatgcatacaaacataaca 238  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||    
16674444 acataaattcatgcataaaaacataaca 16674417  T

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Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 164; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 11 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 21844824 - 21844597
Alignment:
11 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 110  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
21844824 catcaacaatcaatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaaaaatcacatctcaaat 21844725  T
111 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||  |    
21844724 taacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatca 21844625  T
211 acatcaattcatgcatacaaacataaca 238  Q
     |||||||||||||||||||||||||||    
21844624 tcatcaattcatgcatacaaacataaca 21844597  T

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Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 164; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 11 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 21852217 - 21851990
Alignment:
11 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 110  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
21852217 catcaacaatcaatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacatctcaaat 21852118  T
111 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||||||||||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||||||| ||||||  |    
21852117 taacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttacatatttaaacatttaatttcaccaacaatcatacaatca 21852018  T
211 acatcaattcatgcatacaaacataaca 238  Q
     |||||||||||||||||||||||||||    
21852017 tcatcaattcatgcatacaaacataaca 21851990  T

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Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 11 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 43373731 - 43373511
Alignment:
11 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 110  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| |||||  |||| ||||| |||||||||||||| | |||||||    
43373731 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaaccacaacatcaattaacaaccatagcatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat 43373632  T
111 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 210  Q
    |||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| || ||    
43373631 taacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatataatta 43373533  T
211 acatcaattcatgcatacaaac 232  Q
     |||||||||||||||||||||    
43373532 tcatcaattcatgcatacaaac 43373511  T

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Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 10 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 16193980 - 16193756
Alignment:
10 acatcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaa 109  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| | ||||||    
16193980 acatcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaa 16193881  T
110 ttaacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaact 209  Q
    |||||||||| || | | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||| |    
16193880 ttaacaacaatttggca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttccccaacaatcatacaatt 16193782  T
210 aacatcaattcatgcatacaaacata 235  Q
    | ||||||||||||||||||||||||    
16193781 atcatcaattcatgcatacaaacata 16193756  T

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Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 15 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 6774505 - 6774283
Alignment:
15 atcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaac 114  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||  | || |||||||||||   ||||||||| |||| ||||||||| | |||||||||||    
6774505 atcaattcatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaataacatcaattgagcaagaatcaaatctcaaattaac 6774406  T
115 aacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacat 214  Q
    || ||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || |||    
6774405 aataacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcat 6774307  T
215 caattcatgcatacaaacataaca 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
6774306 caattcatgcatacaaacataaca 6774283  T

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Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 15 - 238
Target Start/End: Original strand, 24548986 - 24549208
Alignment:
15 atcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaac 114  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  | || ||||| |||||  |||||||||| |||| ||||||||| | | |||||||||    
24548986 atcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacaaccataacatcaattgagcaagaatcaaatcccaaattaac 24549085  T
115 aacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacat 214  Q
    || ||||||| | |||||||||  || ||||| || |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || |||    
24549086 aataacttagca-aaattcaccaattgagcaccattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcat 24549184  T
215 caattcatgcatacaaacataaca 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
24549185 caattcatgcatacaaacataaca 24549208  T

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Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 22 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 24929043 - 24928831
Alignment:
22 catgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaact 121  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| |||||  |||||| ||| ||||||||||  || |||||||   ||| ||||||    
24929043 catgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaatcacaacatcaattaacaaccataacctcaattgaacaagagacataactcaatccaaccacaact 24928944  T
122 taggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattca 221  Q
    |||  ||||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||| | | ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||    
24928943 tagc-gaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattca 24928845  T
222 tgcatacaaacata 235  Q
    ||||||||||||||    
24928844 tgcatacaaacata 24928831  T

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Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 16405235 - 16405015
Alignment:
11 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 110  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||| | |||||||||  | || ||||| |||||   ||||||||| |||||||||||||| |  |||| |    
16405235 catcatcaattcatgaatttgcatacccaagcagtgattcatcaactaaaacatcaattaacaacaataacatcaattgaacaagaatcatatgtcaatt 16405136  T
111 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 210  Q
    |||||||   |||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||| ||||| | | ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
16405135 taacaac---ttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttaacatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 16405040  T
211 acatcaattcatgcatacaaacata 235  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
16405039 tcatcaattcatgcatacaaacata 16405015  T

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Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 22907476 - 22907254
Alignment:
11 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 110  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||  | || ||| | || |||  | ||||||| ||| |||||||||| | ||||| |    
22907476 catcatcaatccatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 22907377  T
111 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 210  Q
     ||| ||||| |  |  ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| ||    
22907376 caactacaacat--gtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaatta 22907279  T
211 acatcaattcatgcatacaaacata 235  Q
      |||||||||||||||||||||||    
22907278 ttatcaattcatgcatacaaacata 22907254  T

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Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 22 - 238
Target Start/End: Original strand, 17345581 - 17345795
Alignment:
22 catgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaact 121  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||  | || ||||| |||||   |||| ||||  ||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    
17345581 catgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataatatcaactgaacaagaatcataactcaa-ttcacaataact 17345679  T
122 taggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattca 221  Q
    ||| | |||| || |  || |||||||| ||||||||||  ||||||| ||||  ||||||||| |||||||||||||| |||||| || ||||||||||    
17345680 tagca-aaatccatcaattgagcacaattttcataacttcacatttttacataattgaacatgtgatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattca 17345778  T
222 tgcatacaaacataaca 238  Q
    |||||| ||||||||||    
17345779 tgcatataaacataaca 17345795  T

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Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 139 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 691970 - 691908
Alignment:
139 tttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
691970 tttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatt 691908  T

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Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 128 - 235
Target Start/End: Original strand, 5238203 - 5238310
Alignment:
128 aaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 227  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
5238203 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 5238302  T
228 caaacata 235  Q
    ||||||||    
5238303 caaacata 5238310  T

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Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 128 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 24661395 - 24661288
Alignment:
128 aaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 227  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
24661395 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 24661296  T
228 caaacata 235  Q
    ||||||||    
24661295 caaacata 24661288  T

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Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 128 - 235
Target Start/End: Original strand, 43685662 - 43685769
Alignment:
128 aaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 227  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
43685662 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 43685761  T
228 caaacata 235  Q
    ||||||||    
43685762 caaacata 43685769  T

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Target: chr3 (Bit Score: 184; Significance: 1e-99; HSPs: 24)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 11 - 238
Target Start/End: Original strand, 55316219 - 55316446
Alignment:
11 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 110  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |    
55316219 catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaact 55316318  T
111 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
55316319 taacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaacta 55316418  T
211 acatcaattcatgcatacaaacataaca 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
55316419 acatcaattcatgcatacaaacataaca 55316446  T

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Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 11 - 238
Target Start/End: Original strand, 41270075 - 41270302
Alignment:
11 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 110  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |    
41270075 catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaact 41270174  T
111 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
41270175 taacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaattccaccaacaatcatacaacta 41270274  T
211 acatcaattcatgcatacaaacataaca 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
41270275 acatcaattcatgcatacaaacataaca 41270302  T

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Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 11 - 238
Target Start/End: Original strand, 16821139 - 16821366
Alignment:
11 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 110  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||    
16821139 catcattaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat 16821238  T
111 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 210  Q
     |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  ||||| |||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
16821239 caacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcatagcttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 16821338  T
211 acatcaattcatgcatacaaacataaca 238  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||    
16821339 tcatcaatttatgcatacaaacataaca 16821366  T

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Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 14842824 - 14842601
Alignment:
11 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 110  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| | |||||||    
14842824 catcatcaatccatgaatatgcaaacccaatcaattattcatcaatcataacatcaattaacatccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat 14842725  T
111 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 210  Q
    |||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| ||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||| |||||| ||    
14842724 taacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcataacttatcatttttacacatttgaacatgcaatttcaccaacaatcatacaatta 14842626  T
211 acatcaattcatgcatacaaacata 235  Q
     | ||||||||||||||||||||||    
14842625 tcttcaattcatgcatacaaacata 14842601  T

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Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 11 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 13975985 - 13975766
Alignment:
11 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 110  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
13975985 catcaacaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaat 13975886  T
111 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 210  Q
    |||  |||||||||||||||||||||  || |||||||| ||||||||||||||||||| | ||| | ||||||||||| |||||||||| ||||||  |    
13975885 taatgacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttacttatttaaacatgtaattccaccaacaatcatacaatca 13975786  T
211 acatcaattcatgcatacaa 230  Q
     || ||||||||||||||||    
13975785 tcaacaattcatgcatacaa 13975766  T

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Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 11 - 230
Target Start/End: Original strand, 45860805 - 45861024
Alignment:
11 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 110  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
45860805 catcaacaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaat 45860904  T
111 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 210  Q
    |||  |||||||||||||||||||||  || |||||||| ||||||||||||||||||| | ||| | ||||||||||| |||||||||| ||||||  |    
45860905 taatgacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttacttatttaaacatgtaattccaccaacaatcatacaatca 45861004  T
211 acatcaattcatgcatacaa 230  Q
     || ||||||||||||||||    
45861005 tcaacaattcatgcatacaa 45861024  T

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Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 15936890 - 15936667
Alignment:
11 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| || ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| | |||||||    
15936890 catcatcaatccatgaatatgcatactcaggcaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat 15936791  T
111 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 210  Q
    |||||||||||||  | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
15936790 taacaacaacttatca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacacatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 15936692  T
211 acatcaattcatgcatacaaacata 235  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
15936691 tcatcaattcatgcatacaaacata 15936667  T

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Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 11 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 13955153 - 13954934
Alignment:
11 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 110  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
13955153 catcaacaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaat 13955054  T
111 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 210  Q
    |||  ||||||||||||||||||| |  || |||||||| ||||||||| ||||||||| | ||| | ||||||||||| |||||||||| ||||||  |    
13955053 taatgacaacttaggagaaattcatcaattgagcacaatattcataactgatcatttttacttatttaaacatgtaattccaccaacaatcatacaatca 13954954  T
211 acatcaattcatgcatacaa 230  Q
     || ||||||||||||||||    
13954953 tcaacaattcatgcatacaa 13954934  T

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Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 10 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 51158282 - 51158058
Alignment:
10 acatcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaa 109  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| |||||||     
51158282 acatcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaat 51158183  T
110 ttaacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaact 209  Q
     |||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |    
51158182 ctaacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatt 51158084  T
210 aacatcaattcatgcatacaaacata 235  Q
    | ||||||||||||||||||||||||    
51158083 atcatcaattcatgcatacaaacata 51158058  T

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Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 15859287 - 15859064
Alignment:
11 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 110  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| ||||||| |    
15859287 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatt 15859188  T
111 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 210  Q
     ||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
15859187 caacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 15859089  T
211 acatcaattcatgcatacaaacata 235  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
15859088 tcatcaattcatgcatacaaacata 15859064  T

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Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 15938729 - 15938509
Alignment:
14 catcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaa 113  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| || ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||    
15938729 catcaatccatgaatatgcatactcaggcaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaa 15938630  T
114 caacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaaca 213  Q
    ||||||||||  | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||    
15938629 caacaacttatca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacacatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatca 15938531  T
214 tcaattcatgcatacaaacata 235  Q
    ||||||||||  ||||||||||    
15938530 tcaattcatgattacaaacata 15938509  T

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Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 12030410 - 12030187
Alignment:
11 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 110  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| |||||  |||| ||||| |||||||||||||| |  ||||||    
12030410 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccataacatcaattaacaaccatagcatcaattgaacaagaatcaaatatcaaat 12030311  T
111 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 210  Q
    |||||| ||||||| | |||||||||  || |||||||  |||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| ||    
12030310 taacaataacttagca-aaattcaccaattgagcacaactttcacaacttatcacttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaatta 12030212  T
211 acatcaattcatgcatacaaacata 235  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
12030211 tcatcaattcatgcatacaaacata 12030187  T

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Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Original strand, 2049810 - 2050033
Alignment:
11 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 110  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| |||||  |||| ||||| |||||||| ||||| | |||||||    
2049810 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccatagcatcaattgaacaaaaatcaaatctcaaat 2049909  T
111 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 210  Q
    |||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| || ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| ||    
2049910 taacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaagttatcatgtttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaatta 2050008  T
211 acatcaattcatgcatacaaacata 235  Q
     |||||||||| |||||||||||||    
2050009 tcatcaattcaggcatacaaacata 2050033  T

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Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 15 - 238
Target Start/End: Original strand, 15614838 - 15615060
Alignment:
15 atcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaac 114  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  | || ||||| |||||  |||||||||| |||| ||||||||| | | |||||||||    
15614838 atcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacaaccataacatcaattgagcaagaatcaaatcccaaattaac 15614937  T
115 aacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacat 214  Q
    || ||||||| | |||||||||  || ||||| || |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| || |||    
15614938 aataacttagca-aaattcaccaattgagcaccatattcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcctacaattatcat 15615036  T
215 caattcatgcatacaaacataaca 238  Q
    ||||||||||||||||| ||||||    
15615037 caattcatgcatacaaatataaca 15615060  T

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Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 22 - 235
Target Start/End: Original strand, 13838905 - 13839117
Alignment:
22 catgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaact 121  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||| || || ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| |||||||   ||| ||||||    
13838905 catgaatatgcatacccaaacaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatccaaccacaact 13839004  T
122 taggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattca 221  Q
    ||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||| | | ||| ||||||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||    
13839005 tagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccatcaatcatacaattatcatcaattca 13839103  T
222 tgcatacaaacata 235  Q
    ||||||||||||||    
13839104 tgcatacaaacata 13839117  T

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Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 17912744 - 17912522
Alignment:
11 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 110  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||  | || ||||| |||||   ||||||||  ||||||| |||||| | ||||| |    
17912744 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataacatcgattgaacatgaatcatagctcaatt 17912645  T
111 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 210  Q
     ||| ||||| ||  |  |||||| |  ||| ||||||| |||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
17912644 caactacaacatatca--aattcatcaattttgcacaattttcataacttttcatttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 17912547  T
211 acatcaattcatgcatacaaacata 235  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
17912546 tcatcaattcatgcatacaaacata 17912522  T

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Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 16744377 - 16744155
Alignment:
11 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 110  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||  | || ||  | || |||  | ||||||| ||| |||||||||| | ||||| |    
16744377 catcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactacaacatttattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 16744278  T
111 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 210  Q
     ||| | ||| |  |  ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||| ||||| | || ||||||||| ||||||||| |||||  ||    
16744277 caactataacat--gtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcatttttacatatttaaaaatgtaatttaaccaacaatcatacactta 16744180  T
211 acatcaattcatgcatacaaacata 235  Q
      ||||||||||| |||||||||||    
16744179 ttatcaattcatggatacaaacata 16744155  T

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Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 128 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 2449385 - 2449278
Alignment:
128 aaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 227  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  |||||   |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
2449385 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 2449286  T
228 caaacata 235  Q
    ||||||||    
2449285 caaacata 2449278  T

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Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 124
Target Start/End: Original strand, 47984650 - 47984763
Alignment:
11 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 110  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||  || |||||||||  | || ||||| |||||   | ||||||| ||||||| |||||||| |||||      
47984650 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagtcatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaaaaacatcaattgaacatgaatcacatctcaatc 47984749  T
111 taacaacaacttag 124  Q
     |||||||||||||    
47984750 caacaacaacttag 47984763  T

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Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 124
Target Start/End: Original strand, 47993937 - 47994050
Alignment:
11 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 110  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||  || |||||||||  | || ||||| |||||   | ||||||| ||||||| |||||||| |||||      
47993937 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagtcatgattcatcaacaacaaaatcaattaacaacaaaaacatcaattgaacatgaatcacatctcaatc 47994036  T
111 taacaacaacttag 124  Q
     |||||||||||||    
47994037 caacaacaacttag 47994050  T

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Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 124
Target Start/End: Original strand, 48003224 - 48003337
Alignment:
11 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 110  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||  || |||||||||  | || ||||| |||||   | ||||||| ||||||| |||||||| |||||      
48003224 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagtcatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaaaaacatcaattgaacatgaatcacatctcaatc 48003323  T
111 taacaacaacttag 124  Q
     |||||||||||||    
48003324 caacaacaacttag 48003337  T

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Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 124
Target Start/End: Original strand, 48012510 - 48012623
Alignment:
11 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 110  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||  || |||||||||  | || ||||| |||||   | ||||||| ||||||| |||||||| |||||      
48012510 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagtcatgattcatcaacaacaaaatcaattaacaacaaaaacatcaattgaacatgaatcacatctcaatc 48012609  T
111 taacaacaacttag 124  Q
     |||||||||||||    
48012610 caacaacaacttag 48012623  T

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Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 52
Target Start/End: Complemental strand, 15468596 - 15468555
Alignment:
11 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcat 52  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
15468596 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcat 15468555  T

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Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 11 - 52
Target Start/End: Original strand, 22275209 - 22275250
Alignment:
11 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcat 52  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||    
22275209 catcatcaattcatgaatatgcatacctaagcaatgattcat 22275250  T

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Target: chr1 (Bit Score: 184; Significance: 1e-99; HSPs: 15)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 11 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 18601370 - 18601143
Alignment:
11 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 110  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |    
18601370 catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaact 18601271  T
111 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
18601270 taacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaacta 18601171  T
211 acatcaattcatgcatacaaacataaca 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
18601170 acatcaattcatgcatacaaacataaca 18601143  T

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Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 11 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 5072640 - 5072413
Alignment:
11 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 110  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |    
5072640 catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaact 5072541  T
111 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
5072540 taacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaacta 5072441  T
211 acatcaattcatgcatacaaacataaca 238  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||    
5072440 acatcaattcatgcatataaacataaca 5072413  T

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Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Original strand, 20931345 - 20931568
Alignment:
11 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 110  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || || ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| | |||||||    
20931345 catcattaattcatgaatatgcatacccaagaaattattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat 20931444  T
111 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 210  Q
    ||||||||| |||| | |||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||    
20931445 taacaacaatttagca-aaattcaccaatttagcacaattttcataacttatcatttttacatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaatta 20931543  T
211 acatcaattcatgcatacaaacata 235  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
20931544 tcatcaattcatgcatacaaacata 20931568  T

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Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 11 - 225
Target Start/End: Original strand, 22227809 - 22228022
Alignment:
11 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 110  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||    
22227809 catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataacatcaattaacattcataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat 22227908  T
111 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 210  Q
    |||||||||||||| | ||||||| |  ||   |||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| ||    
22227909 taacaacaacttagca-aaattcaacaattggacacaattttcataacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcactaacaatcatacaatta 22228007  T
211 acatcaattcatgca 225  Q
     ||||||||||||||    
22228008 tcatcaattcatgca 22228022  T

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Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 11 - 225
Target Start/End: Original strand, 22232506 - 22232719
Alignment:
11 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 110  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||    
22232506 catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataacatcaattaacattcataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat 22232605  T
111 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 210  Q
    |||||||||||||| | ||||||| |  ||   |||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| ||    
22232606 taacaacaacttagca-aaattcaacaattggacacaattttcataacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcactaacaatcatacaatta 22232704  T
211 acatcaattcatgca 225  Q
     ||||||||||||||    
22232705 tcatcaattcatgca 22232719  T

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Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Original strand, 20913037 - 20913253
Alignment:
11 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 110  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| |||||  |||||||||| ||||||||||||||       |||    
20913037 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaaccacaagatcaattaacaaccataacatcaattgaacaagaatca-------aat 20913129  T
111 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 210  Q
    |||||||||||| | | |||||||||  || |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||    
20913130 taacaacaactttgca-aaattcaccaattgagcacaattttcataacttatcatttttacatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaatta 20913228  T
211 acatcaattcatgcatacaaacata 235  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
20913229 tcatcaattcatgcatacaaacata 20913253  T

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Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 15 - 238
Target Start/End: Original strand, 2116258 - 2116481
Alignment:
15 atcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaac-tcaaattaa 113  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  | || ||||| |||||  |||||||||| |||| ||||||||| ||  |||||||||    
2116258 atcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacaaccataacatcaattgagcaagaatcaaaatatcaaattaa 2116357  T
114 caacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaaca 213  Q
    ||| ||||||| | |||||||||  || ||||| || |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||    
2116358 caataacttagca-aaattcaccaattgagcaccattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatca 2116456  T
214 tcaattcatgcatacaaacataaca 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
2116457 tcaattcatgcatacaaacataaca 2116481  T

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Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 20893889 - 20893666
Alignment:
11 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 110  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||| |||| ||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || ||||      
20893889 catcatcaatttatgaatatgcatacccaaacaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagtcataacatcaattgaacaagaatcataaatcaatc 20893790  T
111 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 210  Q
    |||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||| | | ||| |||||||||||||||| ||||||| |||||| ||    
20893789 taacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaacaacaatcatacaatta 20893691  T
211 acatcaattcatgcatacaaacata 235  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
20893690 tcatcaattcatgcatacaaacata 20893666  T

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Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Original strand, 41394222 - 41394445
Alignment:
11 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||  | || |||||||||||   ||||||||| |||| ||||||||| | |||||      
41394222 catcatcaatccatgaatatgcatacccaatcagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaataacatcaattgagcaagaatcaaatctcaaca 41394321  T
111 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 210  Q
    |||||| ||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| ||    
41394322 taacaataacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaacttcaccaacaatcatacaatta 41394420  T
211 acatcaattcatgcatacaaacata 235  Q
     |||||||| |||||||||||||||    
41394421 tcatcaatttatgcatacaaacata 41394445  T

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Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Original strand, 20445679 - 20445902
Alignment:
11 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  | || ||||| |||||  |||||||||| |||| ||||||||| ||| ||| |    
20445679 catcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacagccataacatcaattgatcaagaatcataacacaatt 20445778  T
111 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 210  Q
     ||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| ||||  ||||||||||| | | ||  |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
20445779 caacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcaccacttatcatttgttcctacttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 20445877  T
211 acatcaattcatgcatacaaacata 235  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
20445878 tcatcaattcatgcatacaaacata 20445902  T

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Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Original strand, 20531444 - 20531667
Alignment:
11 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  | || ||||| |||||  |||||||||| |||| ||||||||| ||| ||| |    
20531444 catcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacagccataacatcaattgatcaagaatcataacacaatt 20531543  T
111 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 210  Q
     ||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| ||||  ||||||||||| | | ||  |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
20531544 caacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcaccacttatcatttgttcctacttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 20531642  T
211 acatcaattcatgcatacaaacata 235  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
20531643 tcatcaattcatgcatacaaacata 20531667  T

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Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 37844714 - 37844490
Alignment:
11 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||| || || ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| |||||||      
37844714 catcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgactcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatc 37844615  T
111 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttca-taacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaact 209  Q
    |||||||||||||| | |||||||    || |||||||| |||| ||  ||||||||| | | ||  |||||||||||||||||||||||| |||||| |    
37844614 taacaacaacttagca-aaattcattaattgagcacaattttcactattttatcatttgttcctacttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatt 37844516  T
210 aacatcaattcatgcatacaaacata 235  Q
    | ||||||||||||||||||||||||    
37844515 atcatcaattcatgcatacaaacata 37844490  T

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Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 77 - 238
Target Start/End: Original strand, 45051489 - 45051649
Alignment:
77 ataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatata 176  Q
    ||||||||| |||| ||||||||| | ||||||||||| | ||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| |||||     
45051489 ataacatcaattgagcaagaatcaaatctcaaattaaccataacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatt 45051587  T
177 tgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataaca 238  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||| |||||    
45051588 tgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacgtaaca 45051649  T

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Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 128 - 235
Target Start/End: Original strand, 51452608 - 51452715
Alignment:
128 aaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 227  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
51452608 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 51452707  T
228 caaacata 235  Q
    ||||||||    
51452708 caaacata 51452715  T

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Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 15 - 55
Target Start/End: Original strand, 45051446 - 45051486
Alignment:
15 atcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaa 55  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||    
45051446 atcaattcatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaa 45051486  T

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Target: scaffold0076 (Bit Score: 176; Significance: 6e-95; HSPs: 1)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 11 - 238
Target Start/End: Original strand, 42997 - 43224
Alignment:
11 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 110  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||    
42997 catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcacttgaacacgaatcacatctcaaat 43096  T
111 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
43097 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 43196  T
211 acatcaattcatgcatacaaacataaca 238  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||    
43197 tcatcaattcatgcatagaaacataaca 43224  T

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Target: scaffold0008 (Bit Score: 161; Significance: 5e-86; HSPs: 2)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 11 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 31928 - 31700
Alignment:
11 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 110  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||    
31928 catcattaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatattaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat 31829  T
111 taacaacaactt-aggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaact 209  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||  || |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
31828 caacaacaactttaggagaaattcaccaattgagcataatattcataacttatcatttttgcatatatgaatatgtaatttcaccaacaatcatacaact 31729  T
210 aacatcaattcatgcatacaaacataaca 238  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||    
31728 aacatcaattcatgcattcaaacataaca 31700  T

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Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 128431 - 128209
Alignment:
11 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 110  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||| | |||||| |||||||||| |||||||||||||| | ||| |||    
128431 catcatcaattcatgaatatgcatacccaatcaattattcatcaatcacaacatccattaacatccataacatcaattgaacaagaatcaaatctc-aat 128333  T
111 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 210  Q
    |||||||||| ||  | |||||| ||  || |||||||| |||| |||||| ||  ||| || || ||||||||||||||||||||||||  ||||| ||    
128332 taacaacaacctaaca-aaattcgccaattgagcacaattttcacaacttaacacctttacacatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaatta 128234  T
211 acatcaattcatgcatacaaacata 235  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
128233 tcatcaattcatgcatacaaacata 128209  T

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Target: scaffold0116 (Bit Score: 156; Significance: 5e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 11 - 238
Target Start/End: Original strand, 35 - 262
Alignment:
11 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 110  Q
    ||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
35 catcaacaattcatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaat 134  T
111 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| | ||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||  |    
135 taacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatatacataacttatcatttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatca 234  T
211 acatcaattcatgcatacaaacataaca 238  Q
     |||||||||||||||||||||||||||    
235 tcatcaattcatgcatacaaacataaca 262  T

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Target: scaffold0026 (Bit Score: 145; Significance: 2e-76; HSPs: 2)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 11 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 64780 - 64584
Alignment:
11 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 110  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
64780 catcaacaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaat 64681  T
111 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaa 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||    
64680 taacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaa 64584  T

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Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Original strand, 107747 - 107970
Alignment:
11 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 110  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| | |||||||    
107747 catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat 107846  T
111 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 210  Q
    |||||||||||||  | |||||||||  || |||||||| || | ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
107847 taacaacaacttatca-aaattcaccaattgagcacaatttttacaacttatcatttttgcacatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 107945  T
211 acatcaattcatgcatacaaacata 235  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
107946 tcatcaattcatgcatacaaacata 107970  T

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Target: scaffold0772 (Bit Score: 140; Significance: 2e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0772
Description:

Target: scaffold0772; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 35 - 238
Target Start/End: Original strand, 5552 - 5755
Alignment:
35 acccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttaggagaaattca 134  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
5552 acccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaattaacaacaacttaggagaaattca 5651  T
135 cccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacat 234  Q
    ||  || |||||||| ||||| ||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||||    
5652 ccaattgagcacaatattcatgacttatcatttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatcatcatcaattcatgcatacaaacat 5751  T
235 aaca 238  Q
    ||||    
5752 aaca 5755  T

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Target: scaffold0139 (Bit Score: 136; Significance: 5e-71; HSPs: 2)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 11 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 21367 - 21141
Alignment:
11 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 110  Q
    |||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  | |||||||    
21367 catcattaatccatgaatatgcaaactcaagcaattattcatcaatcataacatcaaataacattcataacatcaattgaacaagaatccaatctcaaat 21268  T
111 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 210  Q
    |||||||||||||||| |||||||||  || ||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| ||| || ||    
21267 taacaacaacttagga-aaattcaccaattgagctcaatcttcataacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcactaacaatcatataatta 21169  T
211 acatcaattcatgcatacaaacataaca 238  Q
     |||||||| ||| ||||||||||||||    
21168 tcatcaattaatggatacaaacataaca 21141  T

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Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 11 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 14312 - 14086
Alignment:
11 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 110  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| | |||||||||||||  | |||||||    
14312 catcatcaatccatgaatatgcaaactcaagcaattattcatcaatcataacatcaaacaacattcataacattaattgaacaagaatccaatctcaaat 14213  T
111 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 210  Q
    || ||||||||||||| |||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| |||||| ||| || ||    
14212 tatcaacaacttagga-aaattcaccaattgagcacaatcttcataacttatcatttttacatatttcaacatgtaatttcactaacaatcatataatta 14114  T
211 acatcaattcatgcatacaaacataaca 238  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||    
14113 tcatcaattcatgcatacagacataaca 14086  T

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Target: scaffold0266 (Bit Score: 131; Significance: 4e-68; HSPs: 2)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 13 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 3843 - 3622
Alignment:
13 tcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaatta 112  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| | |||||||||    
3843 tcatcaatccatcaatatgcatacccaagcaattattcctcaatcacaacatcaattaacatccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaatta 3744  T
113 acaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaac 212  Q
    |||||||||||| | ||||| |||  || |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || |    
3743 acaacaacttagca-aaatttaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatc 3645  T
213 atcaattcatgcatacaaacata 235  Q
    |||||||||||||||||||||||    
3644 atcaattcatgcatacaaacata 3622  T

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Target: scaffold0266; HSP #2
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Original strand, 1124 - 1347
Alignment:
11 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 110  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| | |||||||    
1124 catcatcaattcatgaatatgcacacccaagcaattattcatcaaccacaatatcaattaacaaccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat 1223  T
111 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 210  Q
    |||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
1224 taacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 1322  T
211 acatcaattcatgcatacaaacata 235  Q
      |||||||||||||||| ||||||    
1323 ttatcaattcatgcatactaacata 1347  T

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Target: scaffold0049 (Bit Score: 129; Significance: 7e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Original strand, 48187 - 48410
Alignment:
11 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||| ||||||  ||||||||| |||||||||||||| | |||||||    
48187 catcatcaatccatgaatatgcatacccaggcaattattcatcaatcacaacatcaattaacatctataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat 48286  T
111 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 210  Q
    |||||||||||||  | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
48287 taacaacaacttaaca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacacatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 48385  T
211 acatcaattcatgcatacaaacata 235  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
48386 tcatcaattcatgcatacaaacata 48410  T

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Target: scaffold0413 (Bit Score: 125; Significance: 2e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 6326 - 6104
Alignment:
11 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || |||||| |||||||||| |||||||||||||| | ||| |||    
6326 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataacaaaaattaacatccataacatcacttgaacaagaatcaaatctc-aat 6228  T
111 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 210  Q
    |||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| || | ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
6227 taacaacaacttagca-aaattcaccaattcagcacaatttttacaacttattatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 6129  T
211 acatcaattcatgcatacaaacata 235  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
6128 tcatcaattcatgcatacaaacata 6104  T

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Target: scaffold0175 (Bit Score: 125; Significance: 2e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 1218 - 996
Alignment:
11 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||| |||||||||| |||||||||||| | | ||| |||    
1218 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataacataaattaacatccataacatcacttgaacaagaataaaatctc-aat 1120  T
111 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 210  Q
    |||||||||||||| | ||||||| |  || |||||||| |||| ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
1119 taacaacaacttagca-aaattcatcaattgagcacaattttcacaacttattatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 1021  T
211 acatcaattcatgcatacaaacata 235  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
1020 tcatcaattcatgcatacaaacata 996  T

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Target: scaffold0498 (Bit Score: 124; Significance: 7e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0498
Description:

Target: scaffold0498; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 11 - 238
Target Start/End: Original strand, 8878 - 9104
Alignment:
11 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 110  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| | |||||||    
8878 catcatcaatacatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat 8977  T
111 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 210  Q
    |||||||||||||  | |||||||||  || |||||||| |||| |||||| ||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||  ||||| ||    
8978 taacaacaacttaaca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttaacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaatta 9076  T
211 acatcaattcatgcatacaaacataaca 238  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||    
9077 tcatcgattcatgcatacaaacataaca 9104  T

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Target: scaffold0022 (Bit Score: 123; Significance: 3e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 11 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 5466 - 5254
Alignment:
11 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 110  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||    
5466 catcatcaatccatgaatatgca-acccaagcaattattcattaatcacaacatcaattaacattcataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat 5368  T
111 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 210  Q
    ||||||||||| || | |||||||||  || | |||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
5367 taacaacaactcagca-aaattcaccaattgaacacaattttcataacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 5269  T
211 acatcaattcatgca 225  Q
     ||||||||||||||    
5268 tcatcaattcatgca 5254  T

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Target: scaffold0302 (Bit Score: 122; Significance: 1e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0302
Description:

Target: scaffold0302; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Original strand, 12115 - 12336
Alignment:
11 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||      
12115 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatgaatcataacatcaattaacattcataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaa-- 12212  T
111 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 210  Q
    | |||||||||||  | |||||||||  ||||||||||| |||| |||||||||||||| || || | |||||||| ||||||||||||| |||||| ||    
12213 ttacaacaacttaaca-aaattcaccaatttagcacaattttcacaacttatcatttttacacatttaaacatgtattttcaccaacaatcatacaatta 12311  T
211 acatcaattcatgcatacaaacata 235  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
12312 tcatcaattcatgcatacaaacata 12336  T

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Target: scaffold0369 (Bit Score: 120; Significance: 2e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0369
Description:

Target: scaffold0369; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 11 - 225
Target Start/End: Original strand, 3722 - 3936
Alignment:
11 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 110  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||    
3722 catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagtaattattcatcaatcataacatcaattaacattcataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat 3821  T
111 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatca-tttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaact 209  Q
    |||||||||||||| | |||||||||  ||   |||||| | |||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |    
3822 taacaacaacttagca-aaattcaccaattggacacaatttccataacttatcattttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatt 3920  T
210 aacatcaattcatgca 225  Q
    | ||||||||||||||    
3921 atcatcaattcatgca 3936  T

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Target: scaffold0025 (Bit Score: 117; Significance: 1e-59; HSPs: 2)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Original strand, 148721 - 148944
Alignment:
11 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 110  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| || ||  |||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| | |||||||    
148721 catcatcaattcatgaatatacatacccaagcaatgattcatcaaccacaacttcaattaacaaccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat 148820  T
111 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 210  Q
    |||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| ||    
148821 taacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaatta 148919  T
211 acatcaattcatgcatacaaacata 235  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
148920 tcatcaattcatgcatacaaacata 148944  T

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Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Original strand, 8849 - 9072
Alignment:
11 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 110  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||  | || ||||| ||| |   ||||||||| |||||||  ||||| | ||||| |    
8849 catcatcaattcatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaatagcaataacatcaattgaacattaatcatatctcaatt 8948  T
111 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 210  Q
     ||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
8949 caacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 9047  T
211 acatcaattcatgcatacaaacata 235  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
9048 tcatcaattcatgcatacaaacata 9072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 116; Significance: 4e-59; HSPs: 2)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 15 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 9596 - 9374
Alignment:
15 atcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaac 114  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  | || ||||| |||||  ||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||    
9596 atcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacaaccataacatcatttgagcaagaatcaaatctcaaattaac 9497  T
115 aacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacat 214  Q
    || ||||||| | |||||||||  || ||||| || |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || |||    
9496 aataacttagca-aaattcaccaattgagcaccattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcat 9398  T
215 caattcatgcatacaaacataaca 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
9397 caattcatgcatacaaacataaca 9374  T

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Target: scaffold0215; HSP #2
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 15 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 16494 - 16272
Alignment:
15 atcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaac 114  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  | || ||||| |||||  ||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||    
16494 atcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacaaccataacatcatttgagcaagaatcaaatctcaaattaac 16395  T
115 aacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacat 214  Q
    || ||||||| | |||||||||  || ||||| || |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || |||    
16394 aataacttagca-aaattcaccaattgagcaccattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcat 16296  T
215 caattcatgcatacaaacataaca 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
16295 caattcatgcatacaaacataaca 16272  T

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Target: scaffold0195 (Bit Score: 109; Significance: 6e-55; HSPs: 2)
Name: scaffold0195
Description:

Target: scaffold0195; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Original strand, 19206 - 19429
Alignment:
11 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 110  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  | || ||||| |||||   ||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |    
19206 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacagcaataacatcaattgaacaggaatcataactcaatt 19305  T
111 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 210  Q
     ||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| ||    
19306 caacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaatta 19404  T
211 acatcaattcatgcatacaaacata 235  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
19405 tcatcaattcatgcatacaaacata 19429  T

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Target: scaffold0195; HSP #2
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Original strand, 21290 - 21513
Alignment:
11 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 110  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  | || ||||| |||||   ||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |    
21290 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacagcaataacatcaattgaacaggaatcataactcaatt 21389  T
111 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 210  Q
     ||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| ||    
21390 caacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaatta 21488  T
211 acatcaattcatgcatacaaacata 235  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
21489 tcatcaattcatgcatacaaacata 21513  T

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Target: scaffold0011 (Bit Score: 109; Significance: 6e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 123427 - 123204
Alignment:
11 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 110  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| || || ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| |||| ||      
123427 catcttcaattcatgaatatgcatacccaagccattattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattgaacaagaatcataacttaatc 123328  T
111 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 210  Q
    |||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||| | | ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
123327 taacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 123229  T
211 acatcaattcatgcatacaaacata 235  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
123228 tcatcaattcatgcatacaaacata 123204  T

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Target: scaffold0218 (Bit Score: 105; Significance: 1e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 5324 - 5101
Alignment:
11 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| ||||||       
5324 catcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaatcacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcattc 5225  T
111 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 210  Q
    |||||||||||| | | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||  ||||| ||    
5224 taacaacaactttgca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtactttcaccaacaatcttacaatta 5126  T
211 acatcaattcatgcatacaaacata 235  Q
     |||||||||| |||||||||||||    
5125 tcatcaattcacgcatacaaacata 5101  T

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Target: scaffold0077 (Bit Score: 105; Significance: 1e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 37176 - 36953
Alignment:
11 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 110  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| |||||  |||||| ||| |||||||||| ||| |||||||      
37176 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacgtcaattgaacaagattcataactcaatc 37077  T
111 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 210  Q
     ||| ||||||||| | |||||||||  ||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||   ||||| ||    
37076 caaccacaacttagca-aaattcaccaatttagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaagcttacaatta 36978  T
211 acatcaattcatgcatacaaacata 235  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
36977 tcatcaattcatgcatacaaacata 36953  T

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Target: scaffold1711 (Bit Score: 102; Significance: 9e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold1711
Description:

Target: scaffold1711; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 117 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 1450 - 1329
Alignment:
117 caacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatca 216  Q
    ||||||||||||||||||||  || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
1450 caacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacatca 1351  T
217 attcatgcatacaaacataaca 238  Q
    ||||||||||||||||||||||    
1350 attcatgcatacaaacataaca 1329  T

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Target: scaffold0012 (Bit Score: 98; Significance: 2e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 22 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 247694 - 247482
Alignment:
22 catgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaact 121  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||  |||||||||||    
247694 catgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagtcataacatcaattgaacaagaatcataactcaatctaacaacaact 247595  T
122 taggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattca 221  Q
    ||| | ||||| |||  || |||||||| |||| |||||||||||| | | ||| |||||||| |||||||||  |||| |||||| || ||||||||||    
247594 tagca-aaatttaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgaaatttcaccctcaatcatacaattatcatcaattca 247496  T
222 tgcatacaaacata 235  Q
    ||||||||||||||    
247495 tgcatacaaacata 247482  T

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Target: scaffold0162 (Bit Score: 97; Significance: 9e-48; HSPs: 2)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 26678 - 26455
Alignment:
11 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 110  Q
    |||| ||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| ||||||       
26678 catcctcaattcatcaatatgcatacccaagcaatgattcatcaatcacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcattc 26579  T
111 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 210  Q
    |||||||||||||| | |||||||||  || || ||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||| |||  ||||| ||    
26578 taacaacaacttagca-aaattcaccaattgagaacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtactttcaccaataatcttacaatta 26480  T
211 acatcaattcatgcatacaaacata 235  Q
     |||||||||| |||||||||||||    
26479 tcatcaattcacgcatacaaacata 26455  T

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Target: scaffold0162; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 128 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 8327 - 8217
Alignment:
128 aaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 227  Q
    |||||||||  || |||||||| |||| |||||  ||||||| ||||  ||||| |||||||||||||||||| |||||| || || |||||||||||||    
8327 aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacctgtaatttcaccaacaatcatacaattatcaccaattcatgcata 8228  T
228 caaacataaca 238  Q
    |||||||||||    
8227 caaacataaca 8217  T

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Target: scaffold0001 (Bit Score: 94; Significance: 5e-46; HSPs: 2)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 22 - 235
Target Start/End: Original strand, 171916 - 172128
Alignment:
22 catgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaact 121  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || || ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||  ||||||| | ||| ||||||    
171916 catgaatatgcatacctaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcgtaactcaattcaaccacaact 172015  T
122 taggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattca 221  Q
    ||| | |||||||||  ||||||||||| |||| |||||||||||| | | ||| ||||||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||    
172016 tagca-aaattcaccaatttagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccatcaatcatacaattatcatcaattca 172114  T
222 tgcatacaaacata 235  Q
    | ||||||||||||    
172115 tccatacaaacata 172128  T

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Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 22 - 235
Target Start/End: Original strand, 177619 - 177831
Alignment:
22 catgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaact 121  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || || ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||  ||||||| | ||| ||||||    
177619 catgaatatgcatacctaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcgtaactcaattcaaccacaact 177718  T
122 taggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattca 221  Q
    ||| | |||||||||  ||||||||||| |||| |||||||||||| | | ||| ||||||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||    
177719 tagca-aaattcaccaatttagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccatcaatcatacaattatcatcaattca 177817  T
222 tgcatacaaacata 235  Q
    | ||||||||||||    
177818 tccatacaaacata 177831  T

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Target: scaffold0009 (Bit Score: 87; Significance: 8e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 17 - 235
Target Start/End: Original strand, 272031 - 272248
Alignment:
17 caatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaa 116  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| |||||   |||||| || |||||||||||||| |||||||   ||| |    
272031 caattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagctataacaccaattgaacaagaatcataactcaatccaacca 272130  T
117 caacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatca 216  Q
    |||||||| | |||||||||  ||||||||||| |||| |||||||||||| | | ||| ||||||||||||||| ||| |||| |||||| || |||||    
272131 caacttagca-aaattcaccaatttagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttctccatcaatcatacaattatcatca 272229  T
217 attcatgcatacaaacata 235  Q
    |||||| ||||||||||||    
272230 attcattcatacaaacata 272248  T

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Target: scaffold0106 (Bit Score: 85; Significance: 1e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 15 - 235
Target Start/End: Original strand, 41733 - 41952
Alignment:
15 atcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaac 114  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||   | || | ||| |||||  |||| ||||| |||||||||||||| |||||||  ||||    
41733 atcaattcatgaatatgcatacccaaccaatgattcatcatctacaacaacaattaacagccatagcatcaattgaacaagaatcataactcaatctaac 41832  T
115 aacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacat 214  Q
    |||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| || ||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||   |||| || |||    
41833 aacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaaattatcatttttacatatttgagcatgtaatttcaccaacaatatgacaattatcat 41931  T
215 caattcatgcatacaaacata 235  Q
    |||||||||||||||||||||    
41932 caattcatgcatacaaacata 41952  T

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Target: scaffold1542 (Bit Score: 81; Significance: 3e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold1542
Description:

Target: scaffold1542; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 797 - 574
Alignment:
11 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 110  Q
    |||| ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| || ||  |||||||||| || ||||||||||| |||| ||      
797 catcctcaattcctgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattagcagccataacatcaattaaacaagaatcataacttaatc 698  T
111 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 210  Q
    |||||  ||||||| | |||||||||  || || ||||| |||| |||| ||||||| | | ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
697 taacagtaacttagca-aaattcaccaattgagtacaattttcacaactcatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 599  T
211 acatcaattcatgcatacaaacata 235  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
598 tcatcaattcatgcatacaaacata 574  T

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Target: scaffold1560 (Bit Score: 79; Significance: 5e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold1560
Description:

Target: scaffold1560; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 11 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 115 - 9
Alignment:
11 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 110  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |  ||||||    
115 catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataacatcaattaacattcataatatcatttgaacaagaatcaaatatcaaat 16  T
111 taacaac 117  Q
    |||||||    
15 taacaac 9  T

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Target: scaffold0529 (Bit Score: 77; Significance: 7e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0529
Description:

Target: scaffold0529; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 15 - 238
Target Start/End: Original strand, 2966 - 3189
Alignment:
15 atcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaa-caagaatcacaactcaaattaa 113  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||| | |||||||||  | || |||||||||||   ||||||||| || || || |||||| | ||||| | ||    
2966 atcaattcatgaatatgcatacacaagcagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaataacatcaattaaaacatgaatcatatctcaattcaa 3065  T
114 caacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaaca 213  Q
    ||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||    
3066 caacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatca 3164  T
214 tcaattcatgcatacaaacataaca 238  Q
    |||||||||| ||||||||||||||    
3165 tcaattcatggatacaaacataaca 3189  T

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Target: scaffold0075 (Bit Score: 77; Significance: 7e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 11 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 34724 - 34497
Alignment:
11 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaa-caagaatcacaactcaaa 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||  | || |||||||||||   ||||||||| || || || |||||| | |||||     
34724 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagtagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaataacatcaattaaaacatgaatcatatctcaat 34625  T
110 ttaacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaact 209  Q
    | ||||||||||||| | |||||||||  || || ||||| |||| |||||   |||||| || |  |||||||||||||||||||||||| |||||| |    
34624 tcaacaacaacttagca-aaattcacctattgagaacaattttcacaacttcatatttttacacaattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatt 34526  T
210 aacatcaattcatgcatacaaacataaca 238  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||    
34525 atcatcaattcatgcatacaaacataaca 34497  T

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Target: scaffold0104 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 11 - 117
Target Start/End: Original strand, 48514 - 48620
Alignment:
11 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 110  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
48514 catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataacatcaattaacatccataacatcaagtgaacaagaatcaaatctcaaat 48613  T
111 taacaac 117  Q
    |||||||    
48614 taacaac 48620  T

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Target: scaffold0420 (Bit Score: 72; Significance: 7e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 107 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 13480 - 13350
Alignment:
107 aaattaacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattataca 206  Q
    |||||||||| ||||||| | |||||||||  || ||||| || |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
13480 aaattaacaataacttagca-aaattcaccaattgagcaccattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcataca 13382  T
207 actaacatcaattcatgcatacaaacataaca 238  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||||    
13381 attatcatcaattcatgcatacaaacataaca 13350  T

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Target: scaffold0125 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 11 - 238
Target Start/End: Original strand, 41648 - 41874
Alignment:
11 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 110  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  | || ||||  |||||   | ||||||| ||||||| |  || || |  || |    
41648 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcatttaacaacaacaacatcaattgaacatggttctcatcataatt 41747  T
111 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 210  Q
     ||||||||| ||| | |||||||||  || | |||||| |||| |||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
41748 caacaacaacatagca-aaattcaccaattgaacacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 41846  T
211 acatcaattcatgcatacaaacataaca 238  Q
     |||||||||||||||||||||||||||    
41847 tcatcaattcatgcatacaaacataaca 41874  T

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Target: scaffold0078 (Bit Score: 62; Significance: 7e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 37328 - 37106
Alignment:
11 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 110  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||  | || ||| | || |||  | ||||||| ||| |||||||||| | |||||      
37328 catcatcaatccatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatc 37229  T
111 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 210  Q
     ||| ||||| |  |  ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  |||||   |||||||||||| ||||||||| |||||| ||    
37228 caactacaacat--gtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaatta 37131  T
211 acatcaattcatgcatacaaacata 235  Q
      |||||||||||||||||||||||    
37130 ttatcaattcatgcatacaaacata 37106  T

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Target: scaffold0132 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 11 - 238
Target Start/End: Original strand, 13506 - 13732
Alignment:
11 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 110  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||  || |||||||||  | || ||||| |||||   | ||||||| ||||||| |  || || |  || |    
13506 catcgtcaattcatgaatatgcatacccaagtcatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaacaacatcaattgaacatggttctcatcataatt 13605  T
111 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 210  Q
     ||||||||| ||| | ||||||| |  || |||||||| |||| |||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
13606 caacaacaacatagca-aaattcatcaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 13704  T
211 acatcaattcatgcatacaaacataaca 238  Q
     |||||||||||||||||||||||||||    
13705 tcatcaattcatgcatacaaacataaca 13732  T

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Target: scaffold0622 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0622
Description:

Target: scaffold0622; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 11 - 108
Target Start/End: Original strand, 9382 - 9479
Alignment:
11 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaa 108  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| |||||||    
9382 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaa 9479  T

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Target: scaffold0018 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 129 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 51328 - 51226
Alignment:
129 aattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatac 228  Q
    ||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||    
51328 aattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaattcatgcatac 51229  T
229 aaa 231  Q
    |||    
51228 aaa 51226  T

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Target: scaffold0028 (Bit Score: 51; Significance: 2e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 129 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 89600 - 89498
Alignment:
129 aattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatac 228  Q
    ||||||||  || |||||||| |||| ||||||| |||| | | ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||    
89600 aattcaccaattgagcacaattttcacaacttataatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatac 89501  T
229 aaa 231  Q
    |||    
89500 aaa 89498  T

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Target: scaffold0141 (Bit Score: 48; Significance: 1e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 128 - 235
Target Start/End: Original strand, 22656 - 22763
Alignment:
128 aaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 227  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  |||||   |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
22656 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 22755  T
228 caaacata 235  Q
    ||||||||    
22756 caaacata 22763  T

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Target: scaffold0141; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 128 - 235
Target Start/End: Original strand, 26911 - 27018
Alignment:
128 aaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 227  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  |||||   |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
26911 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 27010  T
228 caaacata 235  Q
    ||||||||    
27011 caaacata 27018  T

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Target: scaffold0124 (Bit Score: 48; Significance: 1e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 128 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 1729 - 1622
Alignment:
128 aaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 227  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  |||||   |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
1729 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 1630  T
228 caaacata 235  Q
    ||||||||    
1629 caaacata 1622  T

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Target: scaffold0361 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000005; HSPs: 2)
Name: scaffold0361
Description:

Target: scaffold0361; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 182 - 238
Target Start/End: Original strand, 3360 - 3416
Alignment:
182 atgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataaca 238  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| || ||| ||||||||||||||||| |||||    
3360 atgtaatttcaccaacaatcatacaaatatcattaattcatgcatacaaacttaaca 3416  T

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Target: scaffold0361; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 67
Target Start/End: Original strand, 3210 - 3264
Alignment:
13 tcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaa 67  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||| || |||||    
3210 tcatcaattcatgaatatgcctacccaaacaatgattcatcaatcacaacatcaa 3264  T

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Target: scaffold0066 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 179 - 225
Target Start/End: Original strand, 45198 - 45244
Alignment:
179 aacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgca 225  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||| || ||||||||||||||    
45198 aacatgtaatttcacccacaatcatacaattatcatcaattcatgca 45244  T

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