View Alignment
This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.
| Legend |
| | Query |
| | Query hiting target |
| Query hiting target's complemental strand |
| | Query's complemental strand hiting target |
| Query's complemental strand hiting target's complemental strand |
|
Alignment Overview
Query: NF17754_low_33 (Length: 242)
Name: NF17754_low_33
Description: NF17754
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)
| [»] NF17754_low_33 |
 |  |
|
| [»] scaffold0023 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0076 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0008 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0116 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0026 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0772 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0139 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0266 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0049 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0413 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0175 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0498 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0022 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0302 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0369 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0025 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0215 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0195 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0011 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0218 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0077 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold1711 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0012 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0162 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0001 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0009 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0106 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold1542 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold1560 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0529 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0075 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0104 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0420 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0125 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0078 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0132 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0622 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0018 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0028 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0141 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0124 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0361 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0066 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 224; Significance: 1e-123; HSPs: 22)
Name: chr5
Description:
Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 11 - 238
Target Start/End: Original strand, 25426628 - 25426855
Alignment:
| Q |
11 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
110 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25426628 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
25426727 |
T |
 |
| Q |
111 |
taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
210 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25426728 |
taacaacaacttaggagaaattcaccactttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
25426827 |
T |
 |
| Q |
211 |
acatcaattcatgcatacaaacataaca |
238 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25426828 |
acatcaattcatgcatacaaacataaca |
25426855 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 11 - 238
Target Start/End: Original strand, 12374 - 12601
Alignment:
| Q |
11 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
110 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12374 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
12473 |
T |
 |
| Q |
111 |
taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
210 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12474 |
taacaacaacttaggagaaattcaccactttagcacaatcttcataacttatcacttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
12573 |
T |
 |
| Q |
211 |
acatcaattcatgcatacaaacataaca |
238 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12574 |
acatcaattcatgcatacaaacataaca |
12601 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 216; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 11 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 18778244 - 18778017
Alignment:
| Q |
11 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
110 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18778244 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataatattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
18778145 |
T |
 |
| Q |
111 |
taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
210 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18778144 |
taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
18778045 |
T |
 |
| Q |
211 |
acatcaattcatgcatacaaacataaca |
238 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18778044 |
acatcaattcatgcatacaaacataaca |
18778017 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 216; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 11 - 238
Target Start/End: Original strand, 19499899 - 19500126
Alignment:
| Q |
11 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
110 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19499899 |
catcatcaatccatgaatatgcataccaaagcaattattaatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
19499998 |
T |
 |
| Q |
111 |
taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
210 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19499999 |
taacaacaacttaggagaaattcaccactttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
19500098 |
T |
 |
| Q |
211 |
acatcaattcatgcatacaaacataaca |
238 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19500099 |
acatcaattcatgcatacaaacataaca |
19500126 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 216; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 11 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 22366733 - 22366506
Alignment:
| Q |
11 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
110 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
22366733 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacaactcaaat |
22366634 |
T |
 |
| Q |
111 |
taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
210 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22366633 |
taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
22366534 |
T |
 |
| Q |
211 |
acatcaattcatgcatacaaacataaca |
238 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22366533 |
acatcaattcatgcatacaaacataaca |
22366506 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 11 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 21073847 - 21073620
Alignment:
| Q |
11 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
110 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21073847 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattgataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
21073748 |
T |
 |
| Q |
111 |
taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
210 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21073747 |
taacaacaacttagaagaaattcaccactttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
21073648 |
T |
 |
| Q |
211 |
acatcaattcatgcatacaaacataaca |
238 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21073647 |
acatccattcatgcatacaaacataaca |
21073620 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 11 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 43443647 - 43443420
Alignment:
| Q |
11 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
110 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |
|
|
| T |
43443647 |
catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagactcacatctcaaat |
43443548 |
T |
 |
| Q |
111 |
taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
210 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
43443547 |
caacaacaacttagaagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaacta |
43443448 |
T |
 |
| Q |
211 |
acatcaattcatgcatacaaacataaca |
238 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
43443447 |
acatcaattcatgcatacaaacataaca |
43443420 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 172; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 11 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 4200237 - 4200010
Alignment:
| Q |
11 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
110 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| |
|
|
| T |
4200237 |
catcatcaacccatgaatatgcaaacccaagcaatcattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat |
4200138 |
T |
 |
| Q |
111 |
taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
210 |
Q |
| |
|
||||||||| || |||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
4200137 |
caacaacaacataagagaaattcaccaatttagcataatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaacta |
4200038 |
T |
 |
| Q |
211 |
acatcaattcatgcatacaaacataaca |
238 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4200037 |
acatcaattcatgcatacaaacataaca |
4200010 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 11 - 238
Target Start/End: Original strand, 27009841 - 27010068
Alignment:
| Q |
11 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
110 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |
|
|
| T |
27009841 |
catcaacaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaat |
27009940 |
T |
 |
| Q |
111 |
taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
210 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||| | |||||| | |
|
|
| T |
27009941 |
taacaacaacttaggagaaattcaccaattgagtacaatattcataacttatcatttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacactcatacaatca |
27010040 |
T |
 |
| Q |
211 |
acatcaattcatgcatacaaacataaca |
238 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27010041 |
tcatcaattcatgcatacaaacataaca |
27010068 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Original strand, 23506965 - 23507188
Alignment:
| Q |
11 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
110 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||| | ||||||| |
|
|
| T |
23506965 |
catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat |
23507064 |
T |
 |
| Q |
111 |
taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
210 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | ||||||||| || |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || |
|
|
| T |
23507065 |
taacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
23507163 |
T |
 |
| Q |
211 |
acatcaattcatgcatacaaacata |
235 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23507164 |
tcatcaattcatgcatacaaacata |
23507188 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 27182810 - 27182587
Alignment:
| Q |
11 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
110 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||| || || ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
27182810 |
catcatcaattcatgaatatgcatactcaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatc |
27182711 |
T |
 |
| Q |
111 |
taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
210 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | ||||||||| || |||||||| |||| |||||||||||| | | ||| |||||||||||||||| ||||||| |||||| || |
|
|
| T |
27182710 |
taacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcatcaacaatcatacaatta |
27182612 |
T |
 |
| Q |
211 |
acatcaattcatgcatacaaacata |
235 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27182611 |
tcatcagttcatgcatacaaacata |
27182587 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 22054096 - 22053873
Alignment:
| Q |
11 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
110 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||| | ||||||||||| ||||||||| | || ||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||| | ||||| | |
|
|
| T |
22054096 |
catcatcaattcatgaatatgtagacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacagcaataacatcaattgaacatgaatcatatctcaatt |
22053997 |
T |
 |
| Q |
111 |
taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
210 |
Q |
| |
|
||||||||||||| | ||||||||| || |||||||| |||| ||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
22053996 |
caacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaacta |
22053898 |
T |
 |
| Q |
211 |
acatcaattcatgcatacaaacata |
235 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
22053897 |
tcatcaattcatacatacaaacata |
22053873 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 63 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 29188483 - 29188309
Alignment:
| Q |
63 |
atcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttat |
162 |
Q |
| |
|
||||| ||||| |||||||||| |||| ||||||||| | ||||||||||||| ||||||| | ||||||||| || ||||| || |||| ||||||| |
|
|
| T |
29188483 |
atcaattaacaaccataacatcaattgagcaagaatcaaatctcaaattaacaataacttagca-aaattcaccaattgagcaccattttcacaacttat |
29188385 |
T |
 |
| Q |
163 |
catttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataaca |
238 |
Q |
| |
|
||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
29188384 |
catttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataaca |
29188309 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 18531330 - 18531107
Alignment:
| Q |
11 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
110 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||| |||||| |||||| ||||||||| | || ||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||| | ||||| | |
|
|
| T |
18531330 |
catcatcaattcatgaatatgtatacccgagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacagcaataacatcaattgaacatgaatcatatctcaatt |
18531231 |
T |
 |
| Q |
111 |
taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
210 |
Q |
| |
|
||||||||||||| | ||||||||| || | |||||| |||| ||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || |
|
|
| T |
18531230 |
caacaacaacttagca-aaattcaccaattgaacacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
18531132 |
T |
 |
| Q |
211 |
acatcaattcatgcatacaaacata |
235 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18531131 |
tcatcaattcatgcatacaaacata |
18531107 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 22 - 238
Target Start/End: Original strand, 34939289 - 34939503
Alignment:
| Q |
22 |
catgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaact |
121 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| | ||||||||| | || ||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||| || |||| ||| |
|
|
| T |
34939289 |
catgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaattaacagcaataacatcaactgaacaagaatcataactcaa-ttcacaatgact |
34939387 |
T |
 |
| Q |
122 |
taggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattca |
221 |
Q |
| |
|
||| | |||| || | || |||||||| |||||||||| ||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| |||||| || |||||||||| |
|
|
| T |
34939388 |
tagca-aaatccatcaattgagcacaattttcataacttcacatttttacataattgaacatgtgatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattca |
34939486 |
T |
 |
| Q |
222 |
tgcatacaaacataaca |
238 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |
|
|
| T |
34939487 |
tgcatacaaacataaca |
34939503 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 128 - 235
Target Start/End: Original strand, 20623085 - 20623192
Alignment:
| Q |
128 |
aaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata |
227 |
Q |
| |
|
||||||| || ||| ||||||| |||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| || ||||||||||||||| |
|
|
| T |
20623085 |
aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata |
20623184 |
T |
 |
| Q |
228 |
caaacata |
235 |
Q |
| |
|
|||||||| |
|
|
| T |
20623185 |
caaacata |
20623192 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 128 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 21233675 - 21233568
Alignment:
| Q |
128 |
aaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata |
227 |
Q |
| |
|
||||||| || ||| ||||||| |||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| || ||||||||||||||| |
|
|
| T |
21233675 |
aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata |
21233576 |
T |
 |
| Q |
228 |
caaacata |
235 |
Q |
| |
|
|||||||| |
|
|
| T |
21233575 |
caaacata |
21233568 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 129 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 25900552 - 25900446
Alignment:
| Q |
129 |
aattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatac |
228 |
Q |
| |
|
|||||| || ||| ||||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||| || ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25900552 |
aattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatataatttaaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatac |
25900453 |
T |
 |
| Q |
229 |
aaacata |
235 |
Q |
| |
|
||||||| |
|
|
| T |
25900452 |
aaacata |
25900446 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 128 - 235
Target Start/End: Original strand, 16536313 - 16536420
Alignment:
| Q |
128 |
aaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata |
227 |
Q |
| |
|
||||||| || ||| ||||||| |||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||| |||||| || || |||||||||||| |
|
|
| T |
16536313 |
aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattataaattcatgcata |
16536412 |
T |
 |
| Q |
228 |
caaacata |
235 |
Q |
| |
|
|||||||| |
|
|
| T |
16536413 |
caaacata |
16536420 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 128 - 235
Target Start/End: Original strand, 37052860 - 37052967
Alignment:
| Q |
128 |
aaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata |
227 |
Q |
| |
|
||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||| ||||| |||||||||||| ||||||||| |||||| || ||||||||||||||| |
|
|
| T |
37052860 |
aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcatttccacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata |
37052959 |
T |
 |
| Q |
228 |
caaacata |
235 |
Q |
| |
|
|||||||| |
|
|
| T |
37052960 |
caaacata |
37052967 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 15 - 55
Target Start/End: Complemental strand, 29190522 - 29190482
Alignment:
| Q |
15 |
atcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaa |
55 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
29190522 |
atcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaa |
29190482 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 11 - 52
Target Start/End: Complemental strand, 17471844 - 17471803
Alignment:
| Q |
11 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcat |
52 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
17471844 |
catcatcaattcatgaatatgcgtacccaagcaatgattcat |
17471803 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6 (Bit Score: 223; Significance: 1e-123; HSPs: 12)
Name: chr6
Description:
Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Original strand, 25175563 - 25175793
Alignment:
| Q |
11 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
110 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25175563 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
25175662 |
T |
 |
| Q |
111 |
taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
210 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25175663 |
taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
25175762 |
T |
 |
| Q |
211 |
acatcaattcatgcatacaaacataacaaca |
241 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25175763 |
acatcaattcatgcatacaaacataacaaca |
25175793 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 11 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 27654235 - 27654008
Alignment:
| Q |
11 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
110 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27654235 |
catcattaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcattggaacaagaatcacaactcaaat |
27654136 |
T |
 |
| Q |
111 |
taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
210 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27654135 |
taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
27654036 |
T |
 |
| Q |
211 |
acatcaattcatgcatacaaacataaca |
238 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
27654035 |
acatcaattcatgcatacaagcataaca |
27654008 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 11 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 16826006 - 16825777
Alignment:
| Q |
11 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
110 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16826006 |
catcatcaatccatgaatatgcataacaaagcaattattcatcaatcataatatcagataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
16825907 |
T |
 |
| Q |
111 |
taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatta--tacaac |
208 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
16825906 |
taacaacaaattaggagaaatccaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattaattacaac |
16825807 |
T |
 |
| Q |
209 |
taacatcaattcatgcatacaaacataaca |
238 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16825806 |
taacatcaattcatgcatacaaacataaca |
16825777 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 15 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 14626377 - 14626155
Alignment:
| Q |
15 |
atcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaac |
114 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || ||||| ||||| |||||||||| |||| ||||||||| | ||||| ||||| |
|
|
| T |
14626377 |
atcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacaaccataacatcaattgagcaagaatcaaatctcaagttaac |
14626278 |
T |
 |
| Q |
115 |
aacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacat |
214 |
Q |
| |
|
|||||||||| | || |||||| || |||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||| |
|
|
| T |
14626277 |
aacaacttagcataa-ttcaccaattgcacacaattttcataacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcat |
14626179 |
T |
 |
| Q |
215 |
caattcatgcatacaaacataaca |
238 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14626178 |
caattcatgcatacaaacataaca |
14626155 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 15 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 1650352 - 1650130
Alignment:
| Q |
15 |
atcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaac |
114 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||| | || ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| | ||||||||||| |
|
|
| T |
1650352 |
atcaattcatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaataacatcaattgagcaagaatcaaatctcaaattaac |
1650253 |
T |
 |
| Q |
115 |
aacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacat |
214 |
Q |
| |
|
| ||||||| | ||||||||| || |||||||| |||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||| |
|
|
| T |
1650252 |
cataacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcattcttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcat |
1650154 |
T |
 |
| Q |
215 |
caattcatgcatacaaacataaca |
238 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
1650153 |
caattcatgcatacaaacgtaaca |
1650130 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 22 - 235
Target Start/End: Original strand, 23153458 - 23153670
Alignment:
| Q |
22 |
catgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaact |
121 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| || || ||||| ||||| ||||| |||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
23153458 |
catgaatatgtatacccaagtaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataatatcaattgaacaagaatcataactcaatctaacaacaact |
23153557 |
T |
 |
| Q |
122 |
taggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattca |
221 |
Q |
| |
|
||| | ||||||||| || |||||||| |||| |||||||||||| | | ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||| |
|
|
| T |
23153558 |
tagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattca |
23153656 |
T |
 |
| Q |
222 |
tgcatacaaacata |
235 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |
|
|
| T |
23153657 |
tgcatacaaacata |
23153670 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 22 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 1657999 - 1657785
Alignment:
| Q |
22 |
catgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaact |
121 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| | ||||||||| | || ||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||| || |||| |||| |
|
|
| T |
1657999 |
catgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataacatcaactgaacaagaatcataactcaa-ttcacaataact |
1657901 |
T |
 |
| Q |
122 |
taggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattca |
221 |
Q |
| |
|
||| | |||| || | || |||||||| |||||||||| ||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| |||||| || |||||||||| |
|
|
| T |
1657900 |
tagca-aaatccatcaattgagcacaattttcataacttcacatttttacataattgaacatgtgatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattca |
1657802 |
T |
 |
| Q |
222 |
tgcatacaaacataaca |
238 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
1657801 |
tgcatccaaacataaca |
1657785 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 11 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 35009702 - 35009476
Alignment:
| Q |
11 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
110 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || ||||| ||||| | ||||||| ||||||| | || || | || | |
|
|
| T |
35009702 |
catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaacaacatcaattgaacatggttctcatcataatt |
35009603 |
T |
 |
| Q |
111 |
taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
210 |
Q |
| |
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||||||||| ||| | ||||||||| || |||||||| |||| ||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || |
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| T |
35009602 |
caacaacaacatagca-aaattcaccaattgagcacaattttcaaaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
35009504 |
T |
 |
| Q |
211 |
acatcaattcatgcatacaaacataaca |
238 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
35009503 |
tcatcaattcatgcatacaaacttaaca |
35009476 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 22 - 238
Target Start/End: Original strand, 15862484 - 15862697
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121 |
Q |
| |
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|
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| T |
15862484 |
catgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaattatcagcaataacataaat-gaacaagaatcataactcaa-ttcacaataact |
15862581 |
T |
 |
| Q |
122 |
taggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattca |
221 |
Q |
| |
|
||| | |||| || | || |||||||| |||||||||| ||||| | |||| ||||||||| |||||||||||||| |||||| || |||||||||| |
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| T |
15862582 |
tagca-aaatccatcaattgagcacaattttcataacttcacatttatacataattgaacatgtgatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattca |
15862680 |
T |
 |
| Q |
222 |
tgcatacaaacataaca |
238 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15862681 |
tgcatacaaacataaca |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 79 - 227
Target Start/End: Original strand, 29665941 - 29666089
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79 |
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177 |
Q |
| |
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||||||| ||||||| |||||| | |||| | ||||||||||||| | ||||||||| || || ||||| |||||||||| ||||| |||||| | | |
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|
| T |
29665941 |
aacatcaattgaacatgaatcatatctcatttcaacaacaacttagca-aaattcaccaattgagtacaat-ttcataacttgacatttatgcatacttt |
29666038 |
T |
 |
| Q |
178 |
gaa-catgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata |
227 |
Q |
| |
|
||| |||||||||||||| ||||| |||||| || ||||||||||| |||| |
|
|
| T |
29666039 |
gaaacatgtaatttcacccacaatcatacaattatcatcaattcatacata |
29666089 |
T |
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Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
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Target Start/End: Original strand, 27751603 - 27751651
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190 |
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238 |
Q |
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||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27751603 |
tcaccaacaatcatacaattgtcatcaattcatgcatacaaacataaca |
27751651 |
T |
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Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 175 - 235
Target Start/End: Original strand, 29605612 - 29605672
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175 |
tatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacata |
235 |
Q |
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||||||||||||||||||||||||| || ||| || || ||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
29605612 |
tatgaacatgtaatttcaccaacaacaattcaattatcactaattcatgcattcaaacata |
29605672 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2 (Bit Score: 220; Significance: 1e-121; HSPs: 15)
Name: chr2
Description:
Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
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Target Start/End: Complemental strand, 19886913 - 19886686
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Q |
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catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
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T |
 |
| Q |
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taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
210 |
Q |
| |
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|
| T |
19886813 |
taacaacaacttaggagaaattcaccactttagcacaatcttcataacttatcacttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
19886714 |
T |
 |
| Q |
211 |
acatcaattcatgcatacaaacataaca |
238 |
Q |
| |
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|||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19886713 |
acatcaattcatgcatacaaacataaca |
19886686 |
T |
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Target: chr2; HSP #2
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Query Start/End: Original strand, 11 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 17396916 - 17396697
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catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
110 |
Q |
| |
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|
| T |
17396916 |
catcaacaatccatgaatatgcaaacccaagcaattatccattaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaat |
17396817 |
T |
 |
| Q |
111 |
taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
210 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||| | ||| | |||||||||||||||||||||| |||||| | |
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| T |
17396816 |
taatgacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttacttatttaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatca |
17396717 |
T |
 |
| Q |
211 |
acatcaattcatgcatacaa |
230 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||| |
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|
| T |
17396716 |
tcaacaattcatgcatacaa |
17396697 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 19794967 - 19794744
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catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
110 |
Q |
| |
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|
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| T |
19794967 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactataacatcaattaacggaaataacatcaattgaacaagaatcataactcaatt |
19794868 |
T |
 |
| Q |
111 |
taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
210 |
Q |
| |
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|
| T |
19794867 |
caacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
19794769 |
T |
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| Q |
211 |
acatcaattcatgcatacaaacata |
235 |
Q |
| |
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||||||||||||||||||||||| |
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| T |
19794768 |
ttatcaattcatgcatacaaacata |
19794744 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 16 - 231
Target Start/End: Original strand, 462743 - 462957
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16 |
tcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaaca |
115 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||| |
|
|
| T |
462743 |
tcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaatcacgacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatctaaca |
462842 |
T |
 |
| Q |
116 |
acaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatc |
215 |
Q |
| |
|
||||||||| | ||||||||| || | |||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| || |||| |
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|
| T |
462843 |
acaacttagca-aaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatc |
462941 |
T |
 |
| Q |
216 |
aattcatgcatacaaa |
231 |
Q |
| |
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|||||||||||||||| |
|
|
| T |
462942 |
aattcatgcatacaaa |
462957 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
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11 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
110 |
Q |
| |
|
|||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| ||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
8891242 |
catcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaatagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatc |
8891341 |
T |
 |
| Q |
111 |
taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
210 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | ||||||||| || |||||||| |||| |||||||||||| | | ||| ||||||||||||||| |||||||| |||||| || |
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|
| T |
8891342 |
taacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcgccaacaatcatacaatta |
8891440 |
T |
 |
| Q |
211 |
acatcaattcatgcatacaaacata |
235 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8891441 |
tcatcaattcatgcatacaaacata |
8891465 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 20627576 - 20627353
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| Q |
11 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
110 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| || || | ||| ||||| ||||| |||| |||||||||||| | | ||||||| |
|
|
| T |
20627576 |
catcctcaattcatgaatatccatacccaagcaatgattcatcaaccacaacaccaattaacaaccataaaatcaattgaacaagaattaaatctcaaat |
20627477 |
T |
 |
| Q |
111 |
taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
210 |
Q |
| |
|
||||||||||||| | ||||||||| || |||||||| |||| || ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| |||||| || |
|
|
| T |
20627476 |
taacaacaacttaaca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaagttatcatttttacatatttggacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
20627378 |
T |
 |
| Q |
211 |
acatcaattcatgcatacaaacata |
235 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
20627377 |
tcatcaattcgtgcatacaaacata |
20627353 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 36982704 - 36982481
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catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
110 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | || ||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||| ||||||| | |
|
|
| T |
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catcatcaattcatgaatatgcatacccaaacaatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataacatcaattgaacaggaatcataactcaatt |
36982605 |
T |
 |
| Q |
111 |
taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
210 |
Q |
| |
|
||||||||||| | | ||||||||| || |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||| || |
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| T |
36982604 |
caacaacaacttggca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccagcaatcttacaatta |
36982506 |
T |
 |
| Q |
211 |
acatcaattcatgcatacaaacata |
235 |
Q |
| |
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|||||||||||| ||||||||||| |
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|
| T |
36982505 |
tcatcaattcatgaatacaaacata |
36982481 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 43643220 - 43642997
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11 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
110 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||| | || ||||| ||||| ||| ||||| |||||||||||||| | ||||||| |
|
|
| T |
43643220 |
catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaactacaacatcaattaacagcaatagcatcaattgaacaagaatcatatctcaaat |
43643121 |
T |
 |
| Q |
111 |
taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
210 |
Q |
| |
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||| ||||||| || | ||||||||| || |||||||| |||| |||||| ||||| | | ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || |
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| T |
43643120 |
taataacaactaagaa-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttaacatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
43643022 |
T |
 |
| Q |
211 |
acatcaattcatgcatacaaacata |
235 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
43643021 |
tcatcaattcatgcatacaaacata |
43642997 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 24341652 - 24341429
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| Q |
11 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
110 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||| || ||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||| | ||||| | |
|
|
| T |
24341652 |
catcatcaattcatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaacaggaacatcaattaacaacaataacatcaattgaacatgaatcatatctcaatt |
24341553 |
T |
 |
| Q |
111 |
taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
210 |
Q |
| |
|
||||||||||||| | ||||||||| || |||||||| |||| ||||| ||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||| |||||| || |
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|
| T |
24341552 |
caacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatataatttcaccaacaatcatacaatta |
24341454 |
T |
 |
| Q |
211 |
acatcaattcatgcatacaaacata |
235 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24341453 |
tcatcaattcatgcatacaaacata |
24341429 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 11 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 7508107 - 7507894
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11 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaa-caagaatcacaactcaaa |
109 |
Q |
| |
|
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| T |
7508107 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaataacatcaattaaaacatgaatcatatctcaa- |
7508009 |
T |
 |
| Q |
110 |
ttaacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaact |
209 |
Q |
| |
|
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| T |
7508008 |
ttaacaacaacttagcc-aaattcaccaattgaacacaattttcataacttattatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatt |
7507910 |
T |
 |
| Q |
210 |
aacatcaattcatgca |
225 |
Q |
| |
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| |||||||||||||| |
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| T |
7507909 |
atcatcaattcatgca |
7507894 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #11
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Query Start/End: Original strand, 11 - 238
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11 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
110 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||| || | || ||||| ||||| | ||||||| ||||||| | || || | || | |
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|
| T |
25265653 |
catcatcaattcatgaatatgcatacccaagccatgattcataaacaacaacatcaattaacaacaacaacatcaattgaacatggttctcatcataatt |
25265554 |
T |
 |
| Q |
111 |
taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
210 |
Q |
| |
|
||||||||| ||| | ||||||||| || |||||||| |||| ||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || |
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|
| T |
25265553 |
caacaacaacatagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
25265455 |
T |
 |
| Q |
211 |
acatcaattcatgcatacaaacataaca |
238 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| |
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| T |
25265454 |
tcatcaattcatgcatacaaacataaca |
25265427 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 128 - 235
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Alignment:
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227 |
Q |
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|
|
| T |
19689548 |
aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata |
19689449 |
T |
 |
| Q |
228 |
caaacata |
235 |
Q |
| |
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|||||||| |
|
|
| T |
19689448 |
caaacata |
19689441 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 128 - 235
Target Start/End: Original strand, 23820187 - 23820294
Alignment:
| Q |
128 |
aaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata |
227 |
Q |
| |
|
||||||| || ||| ||||||| |||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| || ||||||||||||||| |
|
|
| T |
23820187 |
aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata |
23820286 |
T |
 |
| Q |
228 |
caaacata |
235 |
Q |
| |
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|||||||| |
|
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caaacata |
23820294 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 128 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 14906587 - 14906480
Alignment:
| Q |
128 |
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227 |
Q |
| |
|
||||||| || ||| ||||||| |||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||| |||||| || ||||||||||||||| |
|
|
| T |
14906587 |
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T |
 |
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228 |
caaacata |
235 |
Q |
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|||||||| |
|
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 128 - 235
Target Start/End: Original strand, 20015127 - 20015234
Alignment:
| Q |
128 |
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227 |
Q |
| |
|
||||||| || ||| ||||||| |||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||| | |||| || |||||||||||||| |
|
|
| T |
20015127 |
aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcacacaattattatcaattcatgcatg |
20015226 |
T |
 |
| Q |
228 |
caaacata |
235 |
Q |
| |
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|
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caaacata |
20015234 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4 (Bit Score: 208; Significance: 1e-114; HSPs: 15)
Name: chr4
Description:
Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 11 - 238
Target Start/End: Original strand, 47357654 - 47357881
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110 |
Q |
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|
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catcatcaatccatgaatatacatacccaatcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
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T |
 |
| Q |
111 |
taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
210 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
47357754 |
taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
47357853 |
T |
 |
| Q |
211 |
acatcaattcatgcatacaaacataaca |
238 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
47357854 |
acatcaatccatgcatacaaacataaca |
47357881 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 164; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 11 - 238
Target Start/End: Original strand, 10644219 - 10644446
Alignment:
| Q |
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110 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
10644219 |
catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat |
10644318 |
T |
 |
| Q |
111 |
taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
210 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
10644319 |
caacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcactaacaatcatacaatta |
10644418 |
T |
 |
| Q |
211 |
acatcaattcatgcatacaaacataaca |
238 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10644419 |
tcatcaattcatgcatacaaacataaca |
10644446 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 19 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 13048477 - 13048261
Alignment:
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19 |
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118 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||| |
|
|
| T |
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atccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatctaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaactaacaaca |
13048378 |
T |
 |
| Q |
119 |
acttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaat |
218 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| | || |||||||| ||||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| |||||| | |||||| |
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|
| T |
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acttaggagaaattcatcaattgagcacaatattcataacttatcctttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatcatcatcaaa |
13048278 |
T |
 |
| Q |
219 |
tcatgcatacaaacata |
235 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13048277 |
tcatgcatacaaacata |
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T |
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Back To:
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Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Original strand, 13246430 - 13246653
Alignment:
| Q |
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110 |
Q |
| |
|
|||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
13246430 |
catcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatc |
13246529 |
T |
 |
| Q |
111 |
taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
210 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
13246530 |
taacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
13246628 |
T |
 |
| Q |
211 |
acatcaattcatgcatacaaacata |
235 |
Q |
| |
|
||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13246629 |
tcattaattcatgcatacaaacata |
13246653 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 54118507 - 54118284
Alignment:
| Q |
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110 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||| |||| || |
|
|
| T |
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catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaactataacatcaattgaacaagaatcataactaaatc |
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T |
 |
| Q |
111 |
taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
210 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | ||||||||| || |||||||| |||| ||||||||| || | | ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || |
|
|
| T |
54118407 |
taacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcaattgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
54118309 |
T |
 |
| Q |
211 |
acatcaattcatgcatacaaacata |
235 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
54118308 |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 15675352 - 15675129
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| Q |
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110 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||| | || ||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||| | ||||| | |
|
|
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T |
 |
| Q |
111 |
taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
210 |
Q |
| |
|
||||||||||||| | ||||||||| || |||||||| |||| ||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || |
|
|
| T |
15675252 |
caacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
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T |
 |
| Q |
211 |
acatcaattcatgcatacaaacata |
235 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |
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|
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15675153 |
tcatcaattcatgcatacaaacata |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Original strand, 31115629 - 31115852
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| Q |
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110 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||| | || ||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||| | ||||| | |
|
|
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T |
 |
| Q |
111 |
taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
210 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||| || |||| ||| |||| ||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| || |
|
|
| T |
31115729 |
caacaacaacttagga-aaattcaccaattgagcataattttcacaacttcacatttttacataatggaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
31115827 |
T |
 |
| Q |
211 |
acatcaattcatgcatacaaacata |
235 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31115828 |
tcatcaattcatgcatacaaacata |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Original strand, 26680201 - 26680423
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110 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| | || ||| | || ||| | ||||||| ||| |||||||||| | ||||| | |
|
|
| T |
26680201 |
catcatcaatccatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt |
26680300 |
T |
 |
| Q |
111 |
taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
210 |
Q |
| |
|
||| ||||| | | ||||||| | ||| ||||||| |||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| || |
|
|
| T |
26680301 |
caactacaacat--gtcaaattcatctattttgcacaattttcataacttttcatttttacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaatta |
26680398 |
T |
 |
| Q |
211 |
acatcaattcatgcatacaaacata |
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Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |
|
|
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #9
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Query Start/End: Original strand, 111 - 235
Target Start/End: Original strand, 121989 - 122112
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|
|||||||||||||| | ||||||||| || |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| || |
|
|
| T |
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taacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaatta |
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T |
 |
| Q |
211 |
acatcaattcatgcatacaaacata |
235 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |
|
|
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122088 |
tcatcaattcatgcatacaaacata |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
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178 |
Q |
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|
||||||| ||||||| |||||| | ||||| | ||||||||||||| | ||||||||| || |||||||| |||| ||||| ||||||| |||| || |
|
|
| T |
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10104347 |
T |
 |
| Q |
179 |
aacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacata |
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Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10104346 |
aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacata |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 11 - 108
Target Start/End: Original strand, 111395 - 111492
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11 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaa |
108 |
Q |
| |
|
|||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
111395 |
catcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattgaacaagaatcataactcaa |
111492 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 128 - 235
Target Start/End: Original strand, 10488678 - 10488785
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227 |
Q |
| |
|
||||||| || ||| ||||||| |||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||| |||||| || ||||||||||||||| |
|
|
| T |
10488678 |
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T |
 |
| Q |
228 |
caaacata |
235 |
Q |
| |
|
|||||||| |
|
|
| T |
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caaacata |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 128 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 16328073 - 16327966
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Q |
| |
|
||||||| || ||| ||||||| |||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||| |||||| || ||||||||||||||| |
|
|
| T |
16328073 |
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16327974 |
T |
 |
| Q |
228 |
caaacata |
235 |
Q |
| |
|
|||||||| |
|
|
| T |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 79 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 40885749 - 40885594
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79 |
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177 |
Q |
| |
|
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|
| T |
40885749 |
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T |
 |
| Q |
178 |
gaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacata |
235 |
Q |
| |
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|||||||||||||||||||||| || ||| || || ||||||||||||||||||||| |
|
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40885651 |
gaacatgtaatttcaccaacaaacattcaattatcaccaattcatgcatacaaacata |
40885594 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 55
Target Start/End: Complemental strand, 10104494 - 10104450
Alignment:
| Q |
11 |
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55 |
Q |
| |
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|
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| T |
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catcatcaattcatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaa |
10104450 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7 (Bit Score: 196; Significance: 1e-107; HSPs: 19)
Name: chr7
Description:
Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 11 - 238
Target Start/End: Original strand, 10989410 - 10989636
Alignment:
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catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
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Q |
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T |
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taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
210 |
Q |
| |
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|
|
| T |
10989510 |
ta-caacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaacta |
10989608 |
T |
 |
| Q |
211 |
acatcaattcatgcatacaaacataaca |
238 |
Q |
| |
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| T |
10989609 |
acatcaattcatgcatacaaacataaca |
10989636 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 11 - 238
Target Start/End: Original strand, 2437457 - 2437684
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| Q |
11 |
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110 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
2437457 |
catcatcaatccatgaatatgcaaactcaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcaaatctcatat |
2437556 |
T |
 |
| Q |
111 |
taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
210 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
2437557 |
taacaacaacttaggaaaaattcaccaattgaacacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaacta |
2437656 |
T |
 |
| Q |
211 |
acatcaattcatgcatacaaacataaca |
238 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
2437657 |
acatcaattcatgcatacaaacataaca |
2437684 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 11 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 13911277 - 13911049
Alignment:
| Q |
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catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
110 |
Q |
| |
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|
| T |
13911277 |
catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagaaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat |
13911178 |
T |
 |
| Q |
111 |
taacaacaactt-aggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaact |
209 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||||| || |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |
|
|
| T |
13911177 |
caacaacaactttaggagaaattcaccaattgagcataatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatt |
13911078 |
T |
 |
| Q |
210 |
aacatcaattcatgcatacaaacataaca |
238 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13911077 |
aacatcaattcatgcatacaaacataaca |
13911049 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 11 - 238
Target Start/End: Original strand, 13572676 - 13572903
Alignment:
| Q |
11 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
110 |
Q |
| |
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||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |
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|
| T |
13572676 |
catcaacaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaat |
13572775 |
T |
 |
| Q |
111 |
taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
210 |
Q |
| |
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| T |
13572776 |
taacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcacacaatca |
13572875 |
T |
 |
| Q |
211 |
acatcaattcatgcatacaaacataaca |
238 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13572876 |
tcatcaattcatgcatacaaacataaca |
13572903 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 18254098 - 18253875
Alignment:
| Q |
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catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
110 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
18254098 |
catcatcaatccatgaatatgcatactcaggcaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat |
18253999 |
T |
 |
| Q |
111 |
taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
210 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | ||||||||| || |||||||| |||| |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| |||||| || |
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|
| T |
18253998 |
taacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacacatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
18253900 |
T |
 |
| Q |
211 |
acatcaattcatgcatacaaacata |
235 |
Q |
| |
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|||||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
18253899 |
tcatcaattcatgcatacaaacata |
18253875 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 17 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 25292595 - 25292378
Alignment:
| Q |
17 |
caatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaa |
116 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| | |
|
|
| T |
25292595 |
caatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattagtcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaattaacga |
25292496 |
T |
 |
| Q |
117 |
caacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatca |
216 |
Q |
| |
|
|||| |||||| |||||||| || |||||||| |||||| |||||| ||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| |||||| | || || |
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|
| T |
25292495 |
caacctaggag-aattcaccaattgagcacaatattcatagcttatcctttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatcatcaaca |
25292397 |
T |
 |
| Q |
217 |
attcatgcatacaaacata |
235 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
25292396 |
attcatacatacaaacata |
25292378 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 11 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 16479213 - 16478987
Alignment:
| Q |
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catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
110 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| | || ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| | ||||||| |
|
|
| T |
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catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaataacatcaattgagcaagaatcaaatctcaaat |
16479114 |
T |
 |
| Q |
111 |
taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
210 |
Q |
| |
|
||| || |||||| | ||||||||| || |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || |
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|
| T |
16479113 |
taaaaataacttaaca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
16479015 |
T |
 |
| Q |
211 |
acatcaattcatgcatacaaacataaca |
238 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
16479014 |
tcatcaattcatgcatacaaacataaca |
16478987 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 16 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 11580997 - 11580779
Alignment:
| Q |
16 |
tcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaaca |
115 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||| || || ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||| |
|
|
| T |
11580997 |
tcaattcatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatctaaca |
11580898 |
T |
 |
| Q |
116 |
acaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatc |
215 |
Q |
| |
|
||||||||| | ||||||||| || |||||||| |||| |||||||||||| | | ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || |||| |
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|
| T |
11580897 |
acaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatc |
11580799 |
T |
 |
| Q |
216 |
aattcatgcatacaaacata |
235 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11580798 |
aattcatgcatacaaacata |
11580779 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 11 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 47481294 - 47481068
Alignment:
| Q |
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catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
110 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || ||||| ||| | ||||||||| |||||||||||||| ||||||| | |
|
|
| T |
47481294 |
catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaacaaaaacatcaattaagagcgataacatcaattgaacaagaatcataactcaatt |
47481195 |
T |
 |
| Q |
111 |
taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
210 |
Q |
| |
|
||||||||||||| | ||||||||| || | |||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| || |
|
|
| T |
47481194 |
caacaacaacttagca-aaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcactaacaatcatacaatta |
47481096 |
T |
 |
| Q |
211 |
acatcaattcatgcatacaaacataaca |
238 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
47481095 |
tcatcaattcatgcatacaaacataaca |
47481068 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 13037277 - 13037054
Alignment:
| Q |
11 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
110 |
Q |
| |
|
|||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| ||| ||||||||||| | |||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
13037277 |
catcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaatattcataacattaattgaacaagaatcataactcaatc |
13037178 |
T |
 |
| Q |
111 |
taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
210 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | ||||||||| || |||||||| |||| |||||||||||| | | ||| |||||||| ||||||| ||||||| |||||| || |
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|
| T |
13037177 |
taacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgcaatttcatcaacaatcatacaatta |
13037079 |
T |
 |
| Q |
211 |
acatcaattcatgcatacaaacata |
235 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13037078 |
tcatcaattcatgcatacaaacata |
13037054 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 11 - 232
Target Start/End: Original strand, 36052667 - 36052884
Alignment:
| Q |
11 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
110 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| ||||| || ||||||| |||||||||||||| | ||||||| |
|
|
| T |
36052667 |
catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaaccacaacatcaattaacaaccacaacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat |
36052766 |
T |
 |
| Q |
111 |
taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
210 |
Q |
| |
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||||||| |||| | ||||||||| || |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| ||| || || |
|
|
| T |
36052767 |
taacaac---ttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaattttaccaacaatcatataatta |
36052862 |
T |
 |
| Q |
211 |
acatcaattcatgcatacaaac |
232 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
36052863 |
tcatcaattcatgcatacaaac |
36052884 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 13 - 235
Target Start/End: Original strand, 16211768 - 16211989
Alignment:
| Q |
13 |
tcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaatta |
112 |
Q |
| |
|
|||| ||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||| || || ||||| ||||| |||||||||| || ||||||||||| | ||||||||| |
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|
| T |
16211768 |
tcattaattcatgaatatgcatacccaagcaatgaatcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatttaacaagaatcaaatctcaaatta |
16211867 |
T |
 |
| Q |
113 |
acaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaac |
212 |
Q |
| |
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| T |
16211868 |
acaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgcaatttcacaaacaatcttacaattatc |
16211966 |
T |
 |
| Q |
213 |
atcaattcatgcatacaaacata |
235 |
Q |
| |
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||||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
16211967 |
atcaattcatgcatacaaacata |
16211989 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 11 - 231
Target Start/End: Original strand, 3059966 - 3060185
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catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
110 |
Q |
| |
|
|||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |
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|
| T |
3059966 |
catcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagtcataacatcaattgaacaagaatcataactcaatc |
3060065 |
T |
 |
| Q |
111 |
taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
210 |
Q |
| |
|
||||||||||||| | ||||||||| || |||| ||| |||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| | ||||| || |
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| T |
3060066 |
taacaacaacttaaca-aaattcaccatttgagcataattttcacaatttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacagtattacaatta |
3060164 |
T |
 |
| Q |
211 |
acatcaattcatgcatacaaa |
231 |
Q |
| |
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|||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
3060165 |
tcatcaattaatgcatacaaa |
3060185 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Original strand, 7293017 - 7293239
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Q |
| |
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|
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7293017 |
catcatcaatccatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt |
7293116 |
T |
 |
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111 |
taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
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Q |
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| T |
7293117 |
caacaacaacat--gtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaatta |
7293214 |
T |
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| Q |
211 |
acatcaattcatgcatacaaacata |
235 |
Q |
| |
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|| |||||||||||||||||||| |
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| T |
7293215 |
ttattaattcatgcatacaaacata |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
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Target Start/End: Original strand, 13321014 - 13321242
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110 |
Q |
| |
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| T |
13321014 |
catcatcaattcatgaatgtgcaaacccaagtcatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataacatcaattgaacatgaatcatatctcaatt |
13321113 |
T |
 |
| Q |
111 |
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207 |
Q |
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| T |
13321114 |
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13321211 |
T |
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| Q |
208 |
ctaacatcaattcatgcatacaaacataaca |
238 |
Q |
| |
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| T |
13321212 |
ttatcatcaattcatgcatacaaacataaca |
13321242 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #16
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Target Start/End: Original strand, 11516343 - 11516450
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227 |
Q |
| |
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aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata |
11516442 |
T |
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caaacata |
235 |
Q |
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caaacata |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 128 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 15441711 - 15441604
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227 |
Q |
| |
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aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata |
15441612 |
T |
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| Q |
228 |
caaacata |
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Q |
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caaacata |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 128 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 30262276 - 30262169
Alignment:
| Q |
128 |
aaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata |
227 |
Q |
| |
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30262276 |
aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata |
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T |
 |
| Q |
228 |
caaacata |
235 |
Q |
| |
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30262176 |
caaacata |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 154 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 296087 - 296003
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238 |
Q |
| |
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ataacttctcatttttacataattcaacatgaaatttcaccaacaatcataacattatcatcgattcatgcacacaaacataaca |
296003 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0023 (Bit Score: 184; Significance: 1e-99; HSPs: 2)
Name: scaffold0023
Description:
Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
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Target Start/End: Original strand, 36093 - 36320
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Q |
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catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcatattatcaaataacattcataacatctattgaacatgaatcacatctcaaat |
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T |
 |
| Q |
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taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
210 |
Q |
| |
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| T |
36193 |
taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaatatgtaatttcaccaacaatcatacaacta |
36292 |
T |
 |
| Q |
211 |
acatcaattcatgcatacaaacataaca |
238 |
Q |
| |
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| T |
36293 |
acatcaattcatacatacaaacataaca |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Original strand, 48598 - 48821
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catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
110 |
Q |
| |
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| T |
48598 |
catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaatagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatc |
48697 |
T |
 |
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111 |
taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
210 |
Q |
| |
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| T |
48698 |
tagcaacaacttagca-aaattcaccaactgagcacaattttcacaacttatcattttttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
48796 |
T |
 |
| Q |
211 |
acatcaattcatgcatacaaacata |
235 |
Q |
| |
|
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| T |
48797 |
tcatcaattcatgcatacaaacata |
48821 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8 (Bit Score: 184; Significance: 1e-99; HSPs: 19)
Name: chr8
Description:
Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 11 - 238
Target Start/End: Original strand, 30120722 - 30120949
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| Q |
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catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
110 |
Q |
| |
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|
|
| T |
30120722 |
catcatcaatcgatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat |
30120821 |
T |
 |
| Q |
111 |
taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
210 |
Q |
| |
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| T |
30120822 |
taacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaacta |
30120921 |
T |
 |
| Q |
211 |
acatcaattcatgcatacaaacataaca |
238 |
Q |
| |
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| T |
30120922 |
acataaattcatgcatacaaacataaca |
30120949 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 11 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 222943 - 222753
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| Q |
11 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
110 |
Q |
| |
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| T |
222943 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
222844 |
T |
 |
| Q |
111 |
taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatt |
201 |
Q |
| |
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|
| T |
222843 |
taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatt |
222753 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 11 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 736566 - 736376
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| Q |
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110 |
Q |
| |
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|
| T |
736566 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
736467 |
T |
 |
| Q |
111 |
taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatt |
201 |
Q |
| |
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|
|
| T |
736466 |
taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatt |
736376 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 11 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 860461 - 860271
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| Q |
11 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
110 |
Q |
| |
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|
|
| T |
860461 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
860362 |
T |
 |
| Q |
111 |
taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatt |
201 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
860361 |
taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatt |
860271 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 172; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 11 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 16674644 - 16674417
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| Q |
11 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
110 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| | |
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|
| T |
16674644 |
catcatcaatccatgaatatgcaaactcaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaact |
16674545 |
T |
 |
| Q |
111 |
taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
210 |
Q |
| |
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| T |
16674544 |
taacaacaacttaggagaaattcaccaattaagcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaacta |
16674445 |
T |
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| Q |
211 |
acatcaattcatgcatacaaacataaca |
238 |
Q |
| |
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| T |
16674444 |
acataaattcatgcataaaaacataaca |
16674417 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #6
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Query Start/End: Original strand, 11 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 21844824 - 21844597
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catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
110 |
Q |
| |
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||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |
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|
| T |
21844824 |
catcaacaatcaatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaaaaatcacatctcaaat |
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T |
 |
| Q |
111 |
taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
210 |
Q |
| |
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| T |
21844724 |
taacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatca |
21844625 |
T |
 |
| Q |
211 |
acatcaattcatgcatacaaacataaca |
238 |
Q |
| |
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| T |
21844624 |
tcatcaattcatgcatacaaacataaca |
21844597 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 164; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 11 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 21852217 - 21851990
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| Q |
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catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
110 |
Q |
| |
|
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|
| T |
21852217 |
catcaacaatcaatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacatctcaaat |
21852118 |
T |
 |
| Q |
111 |
taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
210 |
Q |
| |
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| T |
21852117 |
taacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttacatatttaaacatttaatttcaccaacaatcatacaatca |
21852018 |
T |
 |
| Q |
211 |
acatcaattcatgcatacaaacataaca |
238 |
Q |
| |
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|
| T |
21852017 |
tcatcaattcatgcatacaaacataaca |
21851990 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 11 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 43373731 - 43373511
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11 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
110 |
Q |
| |
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| T |
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catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaaccacaacatcaattaacaaccatagcatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat |
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T |
 |
| Q |
111 |
taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
210 |
Q |
| |
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| T |
43373631 |
taacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatataatta |
43373533 |
T |
 |
| Q |
211 |
acatcaattcatgcatacaaac |
232 |
Q |
| |
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| T |
43373532 |
tcatcaattcatgcatacaaac |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #9
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Query Start/End: Original strand, 10 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 16193980 - 16193756
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acatcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaa |
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Q |
| |
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| T |
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acatcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaa |
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T |
 |
| Q |
110 |
ttaacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaact |
209 |
Q |
| |
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| T |
16193880 |
ttaacaacaatttggca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttccccaacaatcatacaatt |
16193782 |
T |
 |
| Q |
210 |
aacatcaattcatgcatacaaacata |
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Q |
| |
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| T |
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 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 15 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 6774505 - 6774283
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| Q |
15 |
atcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaac |
114 |
Q |
| |
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| T |
6774505 |
atcaattcatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaataacatcaattgagcaagaatcaaatctcaaattaac |
6774406 |
T |
 |
| Q |
115 |
aacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacat |
214 |
Q |
| |
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| T |
6774405 |
aataacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcat |
6774307 |
T |
 |
| Q |
215 |
caattcatgcatacaaacataaca |
238 |
Q |
| |
|
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|
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| T |
6774306 |
caattcatgcatacaaacataaca |
6774283 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 15 - 238
Target Start/End: Original strand, 24548986 - 24549208
Alignment:
| Q |
15 |
atcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaac |
114 |
Q |
| |
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|
| T |
24548986 |
atcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacaaccataacatcaattgagcaagaatcaaatcccaaattaac |
24549085 |
T |
 |
| Q |
115 |
aacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacat |
214 |
Q |
| |
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|| ||||||| | ||||||||| || ||||| || |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||| |
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|
| T |
24549086 |
aataacttagca-aaattcaccaattgagcaccattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcat |
24549184 |
T |
 |
| Q |
215 |
caattcatgcatacaaacataaca |
238 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |
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| T |
24549185 |
caattcatgcatacaaacataaca |
24549208 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 22 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 24929043 - 24928831
Alignment:
| Q |
22 |
catgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaact |
121 |
Q |
| |
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| T |
24929043 |
catgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaatcacaacatcaattaacaaccataacctcaattgaacaagagacataactcaatccaaccacaact |
24928944 |
T |
 |
| Q |
122 |
taggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattca |
221 |
Q |
| |
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| T |
24928943 |
tagc-gaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattca |
24928845 |
T |
 |
| Q |
222 |
tgcatacaaacata |
235 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |
|
|
| T |
24928844 |
tgcatacaaacata |
24928831 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 16405235 - 16405015
Alignment:
| Q |
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catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
110 |
Q |
| |
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|
| T |
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catcatcaattcatgaatttgcatacccaagcagtgattcatcaactaaaacatcaattaacaacaataacatcaattgaacaagaatcatatgtcaatt |
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T |
 |
| Q |
111 |
taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
210 |
Q |
| |
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| T |
16405135 |
taacaac---ttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttaacatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
16405040 |
T |
 |
| Q |
211 |
acatcaattcatgcatacaaacata |
235 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
16405039 |
tcatcaattcatgcatacaaacata |
16405015 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 22907476 - 22907254
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| Q |
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catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
110 |
Q |
| |
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||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| | || ||| | || ||| | ||||||| ||| |||||||||| | ||||| | |
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|
| T |
22907476 |
catcatcaatccatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt |
22907377 |
T |
 |
| Q |
111 |
taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
210 |
Q |
| |
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||| ||||| | | ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| || |
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|
| T |
22907376 |
caactacaacat--gtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaatta |
22907279 |
T |
 |
| Q |
211 |
acatcaattcatgcatacaaacata |
235 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22907278 |
ttatcaattcatgcatacaaacata |
22907254 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 22 - 238
Target Start/End: Original strand, 17345581 - 17345795
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| Q |
22 |
catgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaact |
121 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| | ||||||||| | || ||||| ||||| |||| |||| ||||||||||||| ||||||| || |||| |||| |
|
|
| T |
17345581 |
catgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataatatcaactgaacaagaatcataactcaa-ttcacaataact |
17345679 |
T |
 |
| Q |
122 |
taggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattca |
221 |
Q |
| |
|
||| | |||| || | || |||||||| |||||||||| ||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| |||||| || |||||||||| |
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|
| T |
17345680 |
tagca-aaatccatcaattgagcacaattttcataacttcacatttttacataattgaacatgtgatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattca |
17345778 |
T |
 |
| Q |
222 |
tgcatacaaacataaca |
238 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||| |
|
|
| T |
17345779 |
tgcatataaacataaca |
17345795 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 139 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 691970 - 691908
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| Q |
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201 |
Q |
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||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
691970 |
tttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatt |
691908 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 128 - 235
Target Start/End: Original strand, 5238203 - 5238310
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Q |
| |
|
||||||| || ||| ||||||| |||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| || ||||||||||||||| |
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|
| T |
5238203 |
aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata |
5238302 |
T |
 |
| Q |
228 |
caaacata |
235 |
Q |
| |
|
|||||||| |
|
|
| T |
5238303 |
caaacata |
5238310 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 128 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 24661395 - 24661288
Alignment:
| Q |
128 |
aaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata |
227 |
Q |
| |
|
||||||| || ||| ||||||| |||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| || ||||||||||||||| |
|
|
| T |
24661395 |
aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata |
24661296 |
T |
 |
| Q |
228 |
caaacata |
235 |
Q |
| |
|
|||||||| |
|
|
| T |
24661295 |
caaacata |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 128 - 235
Target Start/End: Original strand, 43685662 - 43685769
Alignment:
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227 |
Q |
| |
|
||||||| || ||| ||||||| |||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| || ||||||||||||||| |
|
|
| T |
43685662 |
aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata |
43685761 |
T |
 |
| Q |
228 |
caaacata |
235 |
Q |
| |
|
|||||||| |
|
|
| T |
43685762 |
caaacata |
43685769 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3 (Bit Score: 184; Significance: 1e-99; HSPs: 24)
Name: chr3
Description:
Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 11 - 238
Target Start/End: Original strand, 55316219 - 55316446
Alignment:
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catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
110 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| | |
|
|
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catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaact |
55316318 |
T |
 |
| Q |
111 |
taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
210 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
55316319 |
taacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaacta |
55316418 |
T |
 |
| Q |
211 |
acatcaattcatgcatacaaacataaca |
238 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
55316419 |
acatcaattcatgcatacaaacataaca |
55316446 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 11 - 238
Target Start/End: Original strand, 41270075 - 41270302
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catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
110 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| | |
|
|
| T |
41270075 |
catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaact |
41270174 |
T |
 |
| Q |
111 |
taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
210 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
41270175 |
taacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaattccaccaacaatcatacaacta |
41270274 |
T |
 |
| Q |
211 |
acatcaattcatgcatacaaacataaca |
238 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41270275 |
acatcaattcatgcatacaaacataaca |
41270302 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 11 - 238
Target Start/End: Original strand, 16821139 - 16821366
Alignment:
| Q |
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catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
110 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| |
|
|
| T |
16821139 |
catcattaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat |
16821238 |
T |
 |
| Q |
111 |
taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
210 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || |
|
|
| T |
16821239 |
caacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcatagcttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
16821338 |
T |
 |
| Q |
211 |
acatcaattcatgcatacaaacataaca |
238 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16821339 |
tcatcaatttatgcatacaaacataaca |
16821366 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 14842824 - 14842601
Alignment:
| Q |
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catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
110 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| | ||||||| |
|
|
| T |
14842824 |
catcatcaatccatgaatatgcaaacccaatcaattattcatcaatcataacatcaattaacatccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat |
14842725 |
T |
 |
| Q |
111 |
taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
210 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | ||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||| |||||| || |
|
|
| T |
14842724 |
taacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcataacttatcatttttacacatttgaacatgcaatttcaccaacaatcatacaatta |
14842626 |
T |
 |
| Q |
211 |
acatcaattcatgcatacaaacata |
235 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14842625 |
tcttcaattcatgcatacaaacata |
14842601 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 11 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 13975985 - 13975766
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11 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
110 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |
|
|
| T |
13975985 |
catcaacaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaat |
13975886 |
T |
 |
| Q |
111 |
taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
210 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||| | ||| | ||||||||||| |||||||||| |||||| | |
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|
| T |
13975885 |
taatgacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttacttatttaaacatgtaattccaccaacaatcatacaatca |
13975786 |
T |
 |
| Q |
211 |
acatcaattcatgcatacaa |
230 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
13975785 |
tcaacaattcatgcatacaa |
13975766 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 11 - 230
Target Start/End: Original strand, 45860805 - 45861024
Alignment:
| Q |
11 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
110 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |
|
|
| T |
45860805 |
catcaacaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaat |
45860904 |
T |
 |
| Q |
111 |
taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
210 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||| | ||| | ||||||||||| |||||||||| |||||| | |
|
|
| T |
45860905 |
taatgacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttacttatttaaacatgtaattccaccaacaatcatacaatca |
45861004 |
T |
 |
| Q |
211 |
acatcaattcatgcatacaa |
230 |
Q |
| |
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|
|
| T |
45861005 |
tcaacaattcatgcatacaa |
45861024 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
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Target Start/End: Complemental strand, 15936890 - 15936667
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11 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
110 |
Q |
| |
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|||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| || ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| | ||||||| |
|
|
| T |
15936890 |
catcatcaatccatgaatatgcatactcaggcaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat |
15936791 |
T |
 |
| Q |
111 |
taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
210 |
Q |
| |
|
||||||||||||| | ||||||||| || |||||||| |||| |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| |||||| || |
|
|
| T |
15936790 |
taacaacaacttatca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacacatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
15936692 |
T |
 |
| Q |
211 |
acatcaattcatgcatacaaacata |
235 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15936691 |
tcatcaattcatgcatacaaacata |
15936667 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
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Target Start/End: Complemental strand, 13955153 - 13954934
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| Q |
11 |
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110 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |
|
|
| T |
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catcaacaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaat |
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T |
 |
| Q |
111 |
taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
210 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||||||||| | || |||||||| ||||||||| ||||||||| | ||| | ||||||||||| |||||||||| |||||| | |
|
|
| T |
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taatgacaacttaggagaaattcatcaattgagcacaatattcataactgatcatttttacttatttaaacatgtaattccaccaacaatcatacaatca |
13954954 |
T |
 |
| Q |
211 |
acatcaattcatgcatacaa |
230 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
13954953 |
tcaacaattcatgcatacaa |
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T |
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Back To:
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Target: chr3; HSP #9
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Target Start/End: Complemental strand, 51158282 - 51158058
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10 |
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109 |
Q |
| |
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|
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51158282 |
acatcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaat |
51158183 |
T |
 |
| Q |
110 |
ttaacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaact |
209 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | ||||||||| || |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| | |
|
|
| T |
51158182 |
ctaacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatt |
51158084 |
T |
 |
| Q |
210 |
aacatcaattcatgcatacaaacata |
235 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
51158083 |
atcatcaattcatgcatacaaacata |
51158058 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 15859287 - 15859064
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| Q |
11 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
110 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||| | |
|
|
| T |
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catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatt |
15859188 |
T |
 |
| Q |
111 |
taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
210 |
Q |
| |
|
||||||||||||| | ||||||||| || |||||||| |||| |||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || |
|
|
| T |
15859187 |
caacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
15859089 |
T |
 |
| Q |
211 |
acatcaattcatgcatacaaacata |
235 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15859088 |
tcatcaattcatgcatacaaacata |
15859064 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #11
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Target Start/End: Complemental strand, 15938729 - 15938509
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14 |
catcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaa |
113 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| || ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| | |||||||||| |
|
|
| T |
15938729 |
catcaatccatgaatatgcatactcaggcaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaa |
15938630 |
T |
 |
| Q |
114 |
caacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaaca |
213 |
Q |
| |
|
|||||||||| | ||||||||| || |||||||| |||| |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| |||||| || || |
|
|
| T |
15938629 |
caacaacttatca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacacatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatca |
15938531 |
T |
 |
| Q |
214 |
tcaattcatgcatacaaacata |
235 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
15938530 |
tcaattcatgattacaaacata |
15938509 |
T |
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Back To:
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Target: chr3; HSP #12
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Target Start/End: Complemental strand, 12030410 - 12030187
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catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
110 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| ||||| |||| ||||| |||||||||||||| | |||||| |
|
|
| T |
12030410 |
catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccataacatcaattaacaaccatagcatcaattgaacaagaatcaaatatcaaat |
12030311 |
T |
 |
| Q |
111 |
taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
210 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||| | ||||||||| || ||||||| |||| ||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| || |
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|
| T |
12030310 |
taacaataacttagca-aaattcaccaattgagcacaactttcacaacttatcacttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaatta |
12030212 |
T |
 |
| Q |
211 |
acatcaattcatgcatacaaacata |
235 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12030211 |
tcatcaattcatgcatacaaacata |
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T |
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Target: chr3; HSP #13
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Target Start/End: Original strand, 2049810 - 2050033
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catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
110 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| ||||| |||| ||||| |||||||| ||||| | ||||||| |
|
|
| T |
2049810 |
catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccatagcatcaattgaacaaaaatcaaatctcaaat |
2049909 |
T |
 |
| Q |
111 |
taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
210 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | ||||||||| || |||||||| |||| || ||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| || |
|
|
| T |
2049910 |
taacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaagttatcatgtttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaatta |
2050008 |
T |
 |
| Q |
211 |
acatcaattcatgcatacaaacata |
235 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
2050009 |
tcatcaattcaggcatacaaacata |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #14
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| Q |
15 |
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114 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || ||||| ||||| |||||||||| |||| ||||||||| | | ||||||||| |
|
|
| T |
15614838 |
atcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacaaccataacatcaattgagcaagaatcaaatcccaaattaac |
15614937 |
T |
 |
| Q |
115 |
aacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacat |
214 |
Q |
| |
|
|| ||||||| | ||||||||| || ||||| || |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| || ||| |
|
|
| T |
15614938 |
aataacttagca-aaattcaccaattgagcaccatattcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcctacaattatcat |
15615036 |
T |
 |
| Q |
215 |
caattcatgcatacaaacataaca |
238 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
15615037 |
caattcatgcatacaaatataaca |
15615060 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #15
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Target Start/End: Original strand, 13838905 - 13839117
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121 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||| ||||||||| || || ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||| |||||| |
|
|
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13838905 |
catgaatatgcatacccaaacaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatccaaccacaact |
13839004 |
T |
 |
| Q |
122 |
taggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattca |
221 |
Q |
| |
|
||| | ||||||||| || |||||||| |||| |||||||||||| | | ||| ||||||||||||||||||| |||| |||||| || |||||||||| |
|
|
| T |
13839005 |
tagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccatcaatcatacaattatcatcaattca |
13839103 |
T |
 |
| Q |
222 |
tgcatacaaacata |
235 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |
|
|
| T |
13839104 |
tgcatacaaacata |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #16
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catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
110 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||| | || ||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||| | ||||| | |
|
|
| T |
17912744 |
catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataacatcgattgaacatgaatcatagctcaatt |
17912645 |
T |
 |
| Q |
111 |
taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
210 |
Q |
| |
|
||| ||||| || | |||||| | ||| ||||||| |||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| |||||| || |
|
|
| T |
17912644 |
caactacaacatatca--aattcatcaattttgcacaattttcataacttttcatttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
17912547 |
T |
 |
| Q |
211 |
acatcaattcatgcatacaaacata |
235 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17912546 |
tcatcaattcatgcatacaaacata |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #17
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catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
110 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||| | || || | || ||| | ||||||| ||| |||||||||| | ||||| | |
|
|
| T |
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catcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactacaacatttattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt |
16744278 |
T |
 |
| Q |
111 |
taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
210 |
Q |
| |
|
||| | ||| | | ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||| ||||| | || ||||||||| ||||||||| ||||| || |
|
|
| T |
16744277 |
caactataacat--gtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcatttttacatatttaaaaatgtaatttaaccaacaatcatacactta |
16744180 |
T |
 |
| Q |
211 |
acatcaattcatgcatacaaacata |
235 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
16744179 |
ttatcaattcatggatacaaacata |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #18
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227 |
Q |
| |
|
||||||| || ||| ||||||| |||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||| |||||| || ||||||||||||||| |
|
|
| T |
2449385 |
aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata |
2449286 |
T |
 |
| Q |
228 |
caaacata |
235 |
Q |
| |
|
|||||||| |
|
|
| T |
2449285 |
caaacata |
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T |
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catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
110 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||| | || ||||| ||||| | ||||||| ||||||| |||||||| ||||| |
|
|
| T |
47984650 |
catcatcaattcatgaatatgcatacccaagtcatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaaaaacatcaattgaacatgaatcacatctcaatc |
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T |
 |
| Q |
111 |
taacaacaacttag |
124 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |
|
|
| T |
47984750 |
caacaacaacttag |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #20
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110 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||| | || ||||| ||||| | ||||||| ||||||| |||||||| ||||| |
|
|
| T |
47993937 |
catcatcaattcatgaatatgcatacccaagtcatgattcatcaacaacaaaatcaattaacaacaaaaacatcaattgaacatgaatcacatctcaatc |
47994036 |
T |
 |
| Q |
111 |
taacaacaacttag |
124 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |
|
|
| T |
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caacaacaacttag |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #21
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catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
110 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||| | || ||||| ||||| | ||||||| ||||||| |||||||| ||||| |
|
|
| T |
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catcatcaattcatgaatatgcatacccaagtcatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaaaaacatcaattgaacatgaatcacatctcaatc |
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T |
 |
| Q |
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taacaacaacttag |
124 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |
|
|
| T |
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caacaacaacttag |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #22
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Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||| | || ||||| ||||| | ||||||| ||||||| |||||||| ||||| |
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|
| T |
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 |
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taacaacaacttag |
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| |
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|
|
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T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 52
Target Start/End: Complemental strand, 15468596 - 15468555
Alignment:
| Q |
11 |
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52 |
Q |
| |
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|
|
| T |
15468596 |
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15468555 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 11 - 52
Target Start/End: Original strand, 22275209 - 22275250
Alignment:
| Q |
11 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcat |
52 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||| |
|
|
| T |
22275209 |
catcatcaattcatgaatatgcatacctaagcaatgattcat |
22275250 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1 (Bit Score: 184; Significance: 1e-99; HSPs: 15)
Name: chr1
Description:
Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 11 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 18601370 - 18601143
Alignment:
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Q |
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|
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| T |
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catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaact |
18601271 |
T |
 |
| Q |
111 |
taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
210 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
18601270 |
taacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaacta |
18601171 |
T |
 |
| Q |
211 |
acatcaattcatgcatacaaacataaca |
238 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18601170 |
acatcaattcatgcatacaaacataaca |
18601143 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 11 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 5072640 - 5072413
Alignment:
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catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
110 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| | |
|
|
| T |
5072640 |
catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaact |
5072541 |
T |
 |
| Q |
111 |
taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
210 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
5072540 |
taacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaacta |
5072441 |
T |
 |
| Q |
211 |
acatcaattcatgcatacaaacataaca |
238 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
5072440 |
acatcaattcatgcatataaacataaca |
5072413 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Original strand, 20931345 - 20931568
Alignment:
| Q |
11 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
110 |
Q |
| |
|
|||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||| | ||||||| |
|
|
| T |
20931345 |
catcattaattcatgaatatgcatacccaagaaattattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat |
20931444 |
T |
 |
| Q |
111 |
taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
210 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| | ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |
|
|
| T |
20931445 |
taacaacaatttagca-aaattcaccaatttagcacaattttcataacttatcatttttacatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaatta |
20931543 |
T |
 |
| Q |
211 |
acatcaattcatgcatacaaacata |
235 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20931544 |
tcatcaattcatgcatacaaacata |
20931568 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 11 - 225
Target Start/End: Original strand, 22227809 - 22228022
Alignment:
| Q |
11 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
110 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||| |
|
|
| T |
22227809 |
catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataacatcaattaacattcataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat |
22227908 |
T |
 |
| Q |
111 |
taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
210 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | ||||||| | || |||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| || |
|
|
| T |
22227909 |
taacaacaacttagca-aaattcaacaattggacacaattttcataacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcactaacaatcatacaatta |
22228007 |
T |
 |
| Q |
211 |
acatcaattcatgca |
225 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |
|
|
| T |
22228008 |
tcatcaattcatgca |
22228022 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 11 - 225
Target Start/End: Original strand, 22232506 - 22232719
Alignment:
| Q |
11 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
110 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||| |
|
|
| T |
22232506 |
catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataacatcaattaacattcataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat |
22232605 |
T |
 |
| Q |
111 |
taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
210 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | ||||||| | || |||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| || |
|
|
| T |
22232606 |
taacaacaacttagca-aaattcaacaattggacacaattttcataacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcactaacaatcatacaatta |
22232704 |
T |
 |
| Q |
211 |
acatcaattcatgca |
225 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |
|
|
| T |
22232705 |
tcatcaattcatgca |
22232719 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Original strand, 20913037 - 20913253
Alignment:
| Q |
11 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
110 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
20913037 |
catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaaccacaagatcaattaacaaccataacatcaattgaacaagaatca-------aat |
20913129 |
T |
 |
| Q |
111 |
taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
210 |
Q |
| |
|
|||||||||||| | | ||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |
|
|
| T |
20913130 |
taacaacaactttgca-aaattcaccaattgagcacaattttcataacttatcatttttacatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaatta |
20913228 |
T |
 |
| Q |
211 |
acatcaattcatgcatacaaacata |
235 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20913229 |
tcatcaattcatgcatacaaacata |
20913253 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 15 - 238
Target Start/End: Original strand, 2116258 - 2116481
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| Q |
15 |
atcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaac-tcaaattaa |
113 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || ||||| ||||| |||||||||| |||| ||||||||| || ||||||||| |
|
|
| T |
2116258 |
atcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacaaccataacatcaattgagcaagaatcaaaatatcaaattaa |
2116357 |
T |
 |
| Q |
114 |
caacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaaca |
213 |
Q |
| |
|
||| ||||||| | ||||||||| || ||||| || |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || || |
|
|
| T |
2116358 |
caataacttagca-aaattcaccaattgagcaccattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatca |
2116456 |
T |
 |
| Q |
214 |
tcaattcatgcatacaaacataaca |
238 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2116457 |
tcaattcatgcatacaaacataaca |
2116481 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 20893889 - 20893666
Alignment:
| Q |
11 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
110 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||| |
|
|
| T |
20893889 |
catcatcaatttatgaatatgcatacccaaacaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagtcataacatcaattgaacaagaatcataaatcaatc |
20893790 |
T |
 |
| Q |
111 |
taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
210 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | ||||||||| || |||||||| |||| |||||||||||| | | ||| |||||||||||||||| ||||||| |||||| || |
|
|
| T |
20893789 |
taacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaacaacaatcatacaatta |
20893691 |
T |
 |
| Q |
211 |
acatcaattcatgcatacaaacata |
235 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20893690 |
tcatcaattcatgcatacaaacata |
20893666 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Original strand, 41394222 - 41394445
Alignment:
| Q |
11 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
110 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||| | || ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| | ||||| |
|
|
| T |
41394222 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaatcagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaataacatcaattgagcaagaatcaaatctcaaca |
41394321 |
T |
 |
| Q |
111 |
taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
210 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||| | ||||||||| || |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| || |
|
|
| T |
41394322 |
taacaataacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaacttcaccaacaatcatacaatta |
41394420 |
T |
 |
| Q |
211 |
acatcaattcatgcatacaaacata |
235 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
41394421 |
tcatcaatttatgcatacaaacata |
41394445 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Original strand, 20445679 - 20445902
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| Q |
11 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
110 |
Q |
| |
|
|||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || ||||| ||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||| ||| | |
|
|
| T |
20445679 |
catcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacagccataacatcaattgatcaagaatcataacacaatt |
20445778 |
T |
 |
| Q |
111 |
taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
210 |
Q |
| |
|
||||||||||||| | ||||||||| || |||||||| |||| ||||||||||| | | || |||||||||||||||||||||||| |||||| || |
|
|
| T |
20445779 |
caacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcaccacttatcatttgttcctacttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
20445877 |
T |
 |
| Q |
211 |
acatcaattcatgcatacaaacata |
235 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20445878 |
tcatcaattcatgcatacaaacata |
20445902 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Original strand, 20531444 - 20531667
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| Q |
11 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
110 |
Q |
| |
|
|||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || ||||| ||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||| ||| | |
|
|
| T |
20531444 |
catcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacagccataacatcaattgatcaagaatcataacacaatt |
20531543 |
T |
 |
| Q |
111 |
taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
210 |
Q |
| |
|
||||||||||||| | ||||||||| || |||||||| |||| ||||||||||| | | || |||||||||||||||||||||||| |||||| || |
|
|
| T |
20531544 |
caacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcaccacttatcatttgttcctacttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
20531642 |
T |
 |
| Q |
211 |
acatcaattcatgcatacaaacata |
235 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20531643 |
tcatcaattcatgcatacaaacata |
20531667 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 37844714 - 37844490
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| Q |
11 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
110 |
Q |
| |
|
|||| ||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||| || || ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
37844714 |
catcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgactcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatc |
37844615 |
T |
 |
| Q |
111 |
taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttca-taacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaact |
209 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | ||||||| || |||||||| |||| || ||||||||| | | || |||||||||||||||||||||||| |||||| | |
|
|
| T |
37844614 |
taacaacaacttagca-aaattcattaattgagcacaattttcactattttatcatttgttcctacttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatt |
37844516 |
T |
 |
| Q |
210 |
aacatcaattcatgcatacaaacata |
235 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37844515 |
atcatcaattcatgcatacaaacata |
37844490 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 77 - 238
Target Start/End: Original strand, 45051489 - 45051649
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77 |
ataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatata |
176 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| ||||||||| | ||||||||||| | ||||||| | ||||||||| || |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
45051489 |
ataacatcaattgagcaagaatcaaatctcaaattaaccataacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatt |
45051587 |
T |
 |
| Q |
177 |
tgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataaca |
238 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
45051588 |
tgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacgtaaca |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 128 - 235
Target Start/End: Original strand, 51452608 - 51452715
Alignment:
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128 |
aaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata |
227 |
Q |
| |
|
||||||| || ||| ||||||| |||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| || ||||||||||||||| |
|
|
| T |
51452608 |
aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata |
51452707 |
T |
 |
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228 |
caaacata |
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Q |
| |
|
|||||||| |
|
|
| T |
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caaacata |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 15 - 55
Target Start/End: Original strand, 45051446 - 45051486
Alignment:
| Q |
15 |
atcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaa |
55 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||| |
|
|
| T |
45051446 |
atcaattcatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaa |
45051486 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0076 (Bit Score: 176; Significance: 6e-95; HSPs: 1)
Name: scaffold0076
Description:
Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 11 - 238
Target Start/End: Original strand, 42997 - 43224
Alignment:
| Q |
11 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
110 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| |
|
|
| T |
42997 |
catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcacttgaacacgaatcacatctcaaat |
43096 |
T |
 |
| Q |
111 |
taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
210 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || |
|
|
| T |
43097 |
taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
43196 |
T |
 |
| Q |
211 |
acatcaattcatgcatacaaacataaca |
238 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
43197 |
tcatcaattcatgcatagaaacataaca |
43224 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0008 (Bit Score: 161; Significance: 5e-86; HSPs: 2)
Name: scaffold0008
Description:
Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 11 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 31928 - 31700
Alignment:
| Q |
11 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
110 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| |
|
|
| T |
31928 |
catcattaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatattaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat |
31829 |
T |
 |
| Q |
111 |
taacaacaactt-aggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaact |
209 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||||| || |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
31828 |
caacaacaactttaggagaaattcaccaattgagcataatattcataacttatcatttttgcatatatgaatatgtaatttcaccaacaatcatacaact |
31729 |
T |
 |
| Q |
210 |
aacatcaattcatgcatacaaacataaca |
238 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
31728 |
aacatcaattcatgcattcaaacataaca |
31700 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 128431 - 128209
Alignment:
| Q |
11 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
110 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||| | |||||| |||||||||| |||||||||||||| | ||| ||| |
|
|
| T |
128431 |
catcatcaattcatgaatatgcatacccaatcaattattcatcaatcacaacatccattaacatccataacatcaattgaacaagaatcaaatctc-aat |
128333 |
T |
 |
| Q |
111 |
taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
210 |
Q |
| |
|
|||||||||| || | |||||| || || |||||||| |||| |||||| || ||| || || |||||||||||||||||||||||| ||||| || |
|
|
| T |
128332 |
taacaacaacctaaca-aaattcgccaattgagcacaattttcacaacttaacacctttacacatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaatta |
128234 |
T |
 |
| Q |
211 |
acatcaattcatgcatacaaacata |
235 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
128233 |
tcatcaattcatgcatacaaacata |
128209 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0116 (Bit Score: 156; Significance: 5e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:
Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 11 - 238
Target Start/End: Original strand, 35 - 262
Alignment:
| Q |
11 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
110 |
Q |
| |
|
||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |
|
|
| T |
35 |
catcaacaattcatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaat |
134 |
T |
 |
| Q |
111 |
taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
210 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| || |||||||| | ||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| |||||| | |
|
|
| T |
135 |
taacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatatacataacttatcatttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatca |
234 |
T |
 |
| Q |
211 |
acatcaattcatgcatacaaacataaca |
238 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
235 |
tcatcaattcatgcatacaaacataaca |
262 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0026 (Bit Score: 145; Significance: 2e-76; HSPs: 2)
Name: scaffold0026
Description:
Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 11 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 64780 - 64584
Alignment:
| Q |
11 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
110 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |
|
|
| T |
64780 |
catcaacaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaat |
64681 |
T |
 |
| Q |
111 |
taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaa |
207 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
64680 |
taacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaa |
64584 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Original strand, 107747 - 107970
Alignment:
| Q |
11 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
110 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| | ||||||| |
|
|
| T |
107747 |
catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat |
107846 |
T |
 |
| Q |
111 |
taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
210 |
Q |
| |
|
||||||||||||| | ||||||||| || |||||||| || | ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||| || |
|
|
| T |
107847 |
taacaacaacttatca-aaattcaccaattgagcacaatttttacaacttatcatttttgcacatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
107945 |
T |
 |
| Q |
211 |
acatcaattcatgcatacaaacata |
235 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
107946 |
tcatcaattcatgcatacaaacata |
107970 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0772 (Bit Score: 140; Significance: 2e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0772
Description:
Target: scaffold0772; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 35 - 238
Target Start/End: Original strand, 5552 - 5755
Alignment:
| Q |
35 |
acccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttaggagaaattca |
134 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5552 |
acccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaattaacaacaacttaggagaaattca |
5651 |
T |
 |
| Q |
135 |
cccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacat |
234 |
Q |
| |
|
|| || |||||||| ||||| ||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5652 |
ccaattgagcacaatattcatgacttatcatttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatcatcatcaattcatgcatacaaacat |
5751 |
T |
 |
| Q |
235 |
aaca |
238 |
Q |
| |
|
|||| |
|
|
| T |
5752 |
aaca |
5755 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0139 (Bit Score: 136; Significance: 5e-71; HSPs: 2)
Name: scaffold0139
Description:
Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 11 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 21367 - 21141
Alignment:
| Q |
11 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
110 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||| |
|
|
| T |
21367 |
catcattaatccatgaatatgcaaactcaagcaattattcatcaatcataacatcaaataacattcataacatcaattgaacaagaatccaatctcaaat |
21268 |
T |
 |
| Q |
111 |
taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
210 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| ||| || || |
|
|
| T |
21267 |
taacaacaacttagga-aaattcaccaattgagctcaatcttcataacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcactaacaatcatataatta |
21169 |
T |
 |
| Q |
211 |
acatcaattcatgcatacaaacataaca |
238 |
Q |
| |
|
|||||||| ||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
21168 |
tcatcaattaatggatacaaacataaca |
21141 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 11 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 14312 - 14086
Alignment:
| Q |
11 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
110 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| | ||||||||||||| | ||||||| |
|
|
| T |
14312 |
catcatcaatccatgaatatgcaaactcaagcaattattcatcaatcataacatcaaacaacattcataacattaattgaacaagaatccaatctcaaat |
14213 |
T |
 |
| Q |
111 |
taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
210 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| |||||| ||| || || |
|
|
| T |
14212 |
tatcaacaacttagga-aaattcaccaattgagcacaatcttcataacttatcatttttacatatttcaacatgtaatttcactaacaatcatataatta |
14114 |
T |
 |
| Q |
211 |
acatcaattcatgcatacaaacataaca |
238 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
14113 |
tcatcaattcatgcatacagacataaca |
14086 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0266 (Bit Score: 131; Significance: 4e-68; HSPs: 2)
Name: scaffold0266
Description:
Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 13 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 3843 - 3622
Alignment:
| Q |
13 |
tcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaatta |
112 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| |
|
|
| T |
3843 |
tcatcaatccatcaatatgcatacccaagcaattattcctcaatcacaacatcaattaacatccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaatta |
3744 |
T |
 |
| Q |
113 |
acaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaac |
212 |
Q |
| |
|
|||||||||||| | ||||| ||| || |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || | |
|
|
| T |
3743 |
acaacaacttagca-aaatttaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatc |
3645 |
T |
 |
| Q |
213 |
atcaattcatgcatacaaacata |
235 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3644 |
atcaattcatgcatacaaacata |
3622 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0266; HSP #2
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Original strand, 1124 - 1347
Alignment:
| Q |
11 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
110 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||| | ||||||| |
|
|
| T |
1124 |
catcatcaattcatgaatatgcacacccaagcaattattcatcaaccacaatatcaattaacaaccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat |
1223 |
T |
 |
| Q |
111 |
taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
210 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | ||||||||| || |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || |
|
|
| T |
1224 |
taacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
1322 |
T |
 |
| Q |
211 |
acatcaattcatgcatacaaacata |
235 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
1323 |
ttatcaattcatgcatactaacata |
1347 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0049 (Bit Score: 129; Significance: 7e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:
Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Original strand, 48187 - 48410
Alignment:
| Q |
11 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
110 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||| | ||||||| |
|
|
| T |
48187 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaggcaattattcatcaatcacaacatcaattaacatctataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat |
48286 |
T |
 |
| Q |
111 |
taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
210 |
Q |
| |
|
||||||||||||| | ||||||||| || |||||||| |||| |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| |||||| || |
|
|
| T |
48287 |
taacaacaacttaaca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacacatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
48385 |
T |
 |
| Q |
211 |
acatcaattcatgcatacaaacata |
235 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
48386 |
tcatcaattcatgcatacaaacata |
48410 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0413 (Bit Score: 125; Significance: 2e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:
Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 6326 - 6104
Alignment:
| Q |
11 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
110 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||| |||||||||| |||||||||||||| | ||| ||| |
|
|
| T |
6326 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataacaaaaattaacatccataacatcacttgaacaagaatcaaatctc-aat |
6228 |
T |
 |
| Q |
111 |
taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
210 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | ||||||||| || |||||||| || | ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || |
|
|
| T |
6227 |
taacaacaacttagca-aaattcaccaattcagcacaatttttacaacttattatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
6129 |
T |
 |
| Q |
211 |
acatcaattcatgcatacaaacata |
235 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6128 |
tcatcaattcatgcatacaaacata |
6104 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0175 (Bit Score: 125; Significance: 2e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0175
Description:
Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 1218 - 996
Alignment:
| Q |
11 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
110 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||| |||||||||| |||||||||||| | | ||| ||| |
|
|
| T |
1218 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataacataaattaacatccataacatcacttgaacaagaataaaatctc-aat |
1120 |
T |
 |
| Q |
111 |
taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
210 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | ||||||| | || |||||||| |||| ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || |
|
|
| T |
1119 |
taacaacaacttagca-aaattcatcaattgagcacaattttcacaacttattatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
1021 |
T |
 |
| Q |
211 |
acatcaattcatgcatacaaacata |
235 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1020 |
tcatcaattcatgcatacaaacata |
996 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0498 (Bit Score: 124; Significance: 7e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0498
Description:
Target: scaffold0498; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 11 - 238
Target Start/End: Original strand, 8878 - 9104
Alignment:
| Q |
11 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
110 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| | ||||||| |
|
|
| T |
8878 |
catcatcaatacatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat |
8977 |
T |
 |
| Q |
111 |
taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
210 |
Q |
| |
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|
|
| T |
8978 |
taacaacaacttaaca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttaacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaatta |
9076 |
T |
 |
| Q |
211 |
acatcaattcatgcatacaaacataaca |
238 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9077 |
tcatcgattcatgcatacaaacataaca |
9104 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0022 (Bit Score: 123; Significance: 3e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:
Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 11 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 5466 - 5254
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| Q |
11 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
110 |
Q |
| |
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|
|
| T |
5466 |
catcatcaatccatgaatatgca-acccaagcaattattcattaatcacaacatcaattaacattcataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat |
5368 |
T |
 |
| Q |
111 |
taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
210 |
Q |
| |
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||||||||||| || | ||||||||| || | |||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || |
|
|
| T |
5367 |
taacaacaactcagca-aaattcaccaattgaacacaattttcataacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
5269 |
T |
 |
| Q |
211 |
acatcaattcatgca |
225 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |
|
|
| T |
5268 |
tcatcaattcatgca |
5254 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0302 (Bit Score: 122; Significance: 1e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0302
Description:
Target: scaffold0302; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Original strand, 12115 - 12336
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| Q |
11 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
110 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||| |
|
|
| T |
12115 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatgaatcataacatcaattaacattcataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaa-- |
12212 |
T |
 |
| Q |
111 |
taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
210 |
Q |
| |
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| ||||||||||| | ||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| || || | |||||||| ||||||||||||| |||||| || |
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| T |
12213 |
ttacaacaacttaaca-aaattcaccaatttagcacaattttcacaacttatcatttttacacatttaaacatgtattttcaccaacaatcatacaatta |
12311 |
T |
 |
| Q |
211 |
acatcaattcatgcatacaaacata |
235 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12312 |
tcatcaattcatgcatacaaacata |
12336 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0369 (Bit Score: 120; Significance: 2e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0369
Description:
Target: scaffold0369; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 11 - 225
Target Start/End: Original strand, 3722 - 3936
Alignment:
| Q |
11 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
110 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
3722 |
catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagtaattattcatcaatcataacatcaattaacattcataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat |
3821 |
T |
 |
| Q |
111 |
taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatca-tttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaact |
209 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
3822 |
taacaacaacttagca-aaattcaccaattggacacaatttccataacttatcattttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatt |
3920 |
T |
 |
| Q |
210 |
aacatcaattcatgca |
225 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||| |
|
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| T |
3921 |
atcatcaattcatgca |
3936 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0025 (Bit Score: 117; Significance: 1e-59; HSPs: 2)
Name: scaffold0025
Description:
Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Original strand, 148721 - 148944
Alignment:
| Q |
11 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
110 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
148721 |
catcatcaattcatgaatatacatacccaagcaatgattcatcaaccacaacttcaattaacaaccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat |
148820 |
T |
 |
| Q |
111 |
taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
210 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
148821 |
taacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaatta |
148919 |
T |
 |
| Q |
211 |
acatcaattcatgcatacaaacata |
235 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
148920 |
tcatcaattcatgcatacaaacata |
148944 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Original strand, 8849 - 9072
Alignment:
| Q |
11 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
110 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
8849 |
catcatcaattcatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaatagcaataacatcaattgaacattaatcatatctcaatt |
8948 |
T |
 |
| Q |
111 |
taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
210 |
Q |
| |
|
||||||||||||| | ||||||||| || |||||||| |||| ||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || |
|
|
| T |
8949 |
caacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
9047 |
T |
 |
| Q |
211 |
acatcaattcatgcatacaaacata |
235 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9048 |
tcatcaattcatgcatacaaacata |
9072 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0215 (Bit Score: 116; Significance: 4e-59; HSPs: 2)
Name: scaffold0215
Description:
Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 15 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 9596 - 9374
Alignment:
| Q |
15 |
atcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaac |
114 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || ||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||| |
|
|
| T |
9596 |
atcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacaaccataacatcatttgagcaagaatcaaatctcaaattaac |
9497 |
T |
 |
| Q |
115 |
aacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacat |
214 |
Q |
| |
|
|| ||||||| | ||||||||| || ||||| || |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||| |
|
|
| T |
9496 |
aataacttagca-aaattcaccaattgagcaccattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcat |
9398 |
T |
 |
| Q |
215 |
caattcatgcatacaaacataaca |
238 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9397 |
caattcatgcatacaaacataaca |
9374 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0215; HSP #2
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 15 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 16494 - 16272
Alignment:
| Q |
15 |
atcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaac |
114 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || ||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||| |
|
|
| T |
16494 |
atcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacaaccataacatcatttgagcaagaatcaaatctcaaattaac |
16395 |
T |
 |
| Q |
115 |
aacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacat |
214 |
Q |
| |
|
|| ||||||| | ||||||||| || ||||| || |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||| |
|
|
| T |
16394 |
aataacttagca-aaattcaccaattgagcaccattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcat |
16296 |
T |
 |
| Q |
215 |
caattcatgcatacaaacataaca |
238 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16295 |
caattcatgcatacaaacataaca |
16272 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0195 (Bit Score: 109; Significance: 6e-55; HSPs: 2)
Name: scaffold0195
Description:
Target: scaffold0195; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Original strand, 19206 - 19429
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| Q |
11 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
110 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || ||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||| ||||||| | |
|
|
| T |
19206 |
catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacagcaataacatcaattgaacaggaatcataactcaatt |
19305 |
T |
 |
| Q |
111 |
taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
210 |
Q |
| |
|
||||||||||||| | ||||||||| || |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| || |
|
|
| T |
19306 |
caacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaatta |
19404 |
T |
 |
| Q |
211 |
acatcaattcatgcatacaaacata |
235 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19405 |
tcatcaattcatgcatacaaacata |
19429 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0195; HSP #2
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Original strand, 21290 - 21513
Alignment:
| Q |
11 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
110 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || ||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||| ||||||| | |
|
|
| T |
21290 |
catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacagcaataacatcaattgaacaggaatcataactcaatt |
21389 |
T |
 |
| Q |
111 |
taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
210 |
Q |
| |
|
||||||||||||| | ||||||||| || |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| || |
|
|
| T |
21390 |
caacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaatta |
21488 |
T |
 |
| Q |
211 |
acatcaattcatgcatacaaacata |
235 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21489 |
tcatcaattcatgcatacaaacata |
21513 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0011 (Bit Score: 109; Significance: 6e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0011
Description:
Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 123427 - 123204
Alignment:
| Q |
11 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
110 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||| |||| || |
|
|
| T |
123427 |
catcttcaattcatgaatatgcatacccaagccattattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattgaacaagaatcataacttaatc |
123328 |
T |
 |
| Q |
111 |
taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
210 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | ||||||||| || |||||||| |||| |||||||||||| | | ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || |
|
|
| T |
123327 |
taacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
123229 |
T |
 |
| Q |
211 |
acatcaattcatgcatacaaacata |
235 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
123228 |
tcatcaattcatgcatacaaacata |
123204 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0218 (Bit Score: 105; Significance: 1e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:
Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 5324 - 5101
Alignment:
| Q |
11 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
110 |
Q |
| |
|
|||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
5324 |
catcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaatcacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcattc |
5225 |
T |
 |
| Q |
111 |
taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
210 |
Q |
| |
|
|||||||||||| | | ||||||||| || |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||| || |
|
|
| T |
5224 |
taacaacaactttgca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtactttcaccaacaatcttacaatta |
5126 |
T |
 |
| Q |
211 |
acatcaattcatgcatacaaacata |
235 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
5125 |
tcatcaattcacgcatacaaacata |
5101 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0077 (Bit Score: 105; Significance: 1e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:
Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 37176 - 36953
Alignment:
| Q |
11 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
110 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| ||||| |||||| ||| |||||||||| ||| ||||||| |
|
|
| T |
37176 |
catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacgtcaattgaacaagattcataactcaatc |
37077 |
T |
 |
| Q |
111 |
taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
210 |
Q |
| |
|
||| ||||||||| | ||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || |
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|
| T |
37076 |
caaccacaacttagca-aaattcaccaatttagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaagcttacaatta |
36978 |
T |
 |
| Q |
211 |
acatcaattcatgcatacaaacata |
235 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
36977 |
tcatcaattcatgcatacaaacata |
36953 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold1711 (Bit Score: 102; Significance: 9e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold1711
Description:
Target: scaffold1711; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 117 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 1450 - 1329
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Q |
| |
|
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|
|
| T |
1450 |
caacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacatca |
1351 |
T |
 |
| Q |
217 |
attcatgcatacaaacataaca |
238 |
Q |
| |
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|||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1350 |
attcatgcatacaaacataaca |
1329 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0012 (Bit Score: 98; Significance: 2e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:
Target: scaffold0012; HSP #1
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Target Start/End: Complemental strand, 247694 - 247482
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22 |
catgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaact |
121 |
Q |
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| T |
247694 |
catgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagtcataacatcaattgaacaagaatcataactcaatctaacaacaact |
247595 |
T |
 |
| Q |
122 |
taggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattca |
221 |
Q |
| |
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||| | ||||| ||| || |||||||| |||| |||||||||||| | | ||| |||||||| ||||||||| |||| |||||| || |||||||||| |
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| T |
247594 |
tagca-aaatttaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgaaatttcaccctcaatcatacaattatcatcaattca |
247496 |
T |
 |
| Q |
222 |
tgcatacaaacata |
235 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |
|
|
| T |
247495 |
tgcatacaaacata |
247482 |
T |
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110 |
Q |
| |
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|||| ||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
26678 |
catcctcaattcatcaatatgcatacccaagcaatgattcatcaatcacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcattc |
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T |
 |
| Q |
111 |
taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
210 |
Q |
| |
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| T |
26578 |
taacaacaacttagca-aaattcaccaattgagaacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtactttcaccaataatcttacaatta |
26480 |
T |
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| Q |
211 |
acatcaattcatgcatacaaacata |
235 |
Q |
| |
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| T |
26479 |
tcatcaattcacgcatacaaacata |
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T |
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Target: scaffold0162; HSP #2
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Q |
| |
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|
| T |
8327 |
aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacctgtaatttcaccaacaatcatacaattatcaccaattcatgcata |
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T |
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| Q |
228 |
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238 |
Q |
| |
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||||||||||| |
|
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8227 |
caaacataaca |
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T |
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121 |
Q |
| |
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| T |
171916 |
catgaatatgcatacctaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcgtaactcaattcaaccacaact |
172015 |
T |
 |
| Q |
122 |
taggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattca |
221 |
Q |
| |
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| T |
172016 |
tagca-aaattcaccaatttagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccatcaatcatacaattatcatcaattca |
172114 |
T |
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| Q |
222 |
tgcatacaaacata |
235 |
Q |
| |
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| |||||||||||| |
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tccatacaaacata |
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T |
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Target: scaffold0001; HSP #2
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22 |
catgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaact |
121 |
Q |
| |
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| T |
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catgaatatgcatacctaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcgtaactcaattcaaccacaact |
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T |
 |
| Q |
122 |
taggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattca |
221 |
Q |
| |
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||| | ||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||| | | ||| ||||||||||||||||||| |||| |||||| || |||||||||| |
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| T |
177719 |
tagca-aaattcaccaatttagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccatcaatcatacaattatcatcaattca |
177817 |
T |
 |
| Q |
222 |
tgcatacaaacata |
235 |
Q |
| |
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| |||||||||||| |
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177818 |
tccatacaaacata |
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T |
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Target: scaffold0009; HSP #1
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Q |
| |
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|||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| ||||| |||||| || |||||||||||||| ||||||| ||| | |
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| T |
272031 |
caattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagctataacaccaattgaacaagaatcataactcaatccaacca |
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T |
 |
| Q |
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caacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatca |
216 |
Q |
| |
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| T |
272131 |
caacttagca-aaattcaccaatttagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttctccatcaatcatacaattatcatca |
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T |
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| Q |
217 |
attcatgcatacaaacata |
235 |
Q |
| |
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|||||| |||||||||||| |
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attcattcatacaaacata |
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T |
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Target: scaffold0106; HSP #1
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Q |
| |
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|||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||| | || | ||| ||||| |||| ||||| |||||||||||||| ||||||| |||| |
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| T |
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atcaattcatgaatatgcatacccaaccaatgattcatcatctacaacaacaattaacagccatagcatcaattgaacaagaatcataactcaatctaac |
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T |
 |
| Q |
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aacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacat |
214 |
Q |
| |
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| T |
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aacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaaattatcatttttacatatttgagcatgtaatttcaccaacaatatgacaattatcat |
41931 |
T |
 |
| Q |
215 |
caattcatgcatacaaacata |
235 |
Q |
| |
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||||||||||||||||||||| |
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| T |
41932 |
caattcatgcatacaaacata |
41952 |
T |
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Target: scaffold1542 (Bit Score: 81; Significance: 3e-38; HSPs: 1)
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Target: scaffold1542; HSP #1
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catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
110 |
Q |
| |
|
|||| ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| || || |||||||||| || ||||||||||| |||| || |
|
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catcctcaattcctgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattagcagccataacatcaattaaacaagaatcataacttaatc |
698 |
T |
 |
| Q |
111 |
taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
210 |
Q |
| |
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| T |
697 |
taacagtaacttagca-aaattcaccaattgagtacaattttcacaactcatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
599 |
T |
 |
| Q |
211 |
acatcaattcatgcatacaaacata |
235 |
Q |
| |
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|||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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tcatcaattcatgcatacaaacata |
574 |
T |
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Target: scaffold1560 (Bit Score: 79; Significance: 5e-37; HSPs: 1)
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Target: scaffold1560; HSP #1
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catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
110 |
Q |
| |
|
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|
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| T |
115 |
catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataacatcaattaacattcataatatcatttgaacaagaatcaaatatcaaat |
16 |
T |
 |
| Q |
111 |
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117 |
Q |
| |
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||||||| |
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taacaac |
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Target: scaffold0529; HSP #1
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Q |
| |
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|||||| ||||||||||||||| |||||| | ||||||||| | || ||||||||||| ||||||||| || || || |||||| | ||||| | || |
|
|
| T |
2966 |
atcaattcatgaatatgcatacacaagcagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaataacatcaattaaaacatgaatcatatctcaattcaa |
3065 |
T |
 |
| Q |
114 |
caacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaaca |
213 |
Q |
| |
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||||||||||| | ||||||||| || |||||||| |||| ||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || || |
|
|
| T |
3066 |
caacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatca |
3164 |
T |
 |
| Q |
214 |
tcaattcatgcatacaaacataaca |
238 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
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tcaattcatggatacaaacataaca |
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T |
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Target: scaffold0075; HSP #1
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Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||| | || ||||||||||| ||||||||| || || || |||||| | ||||| |
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|
| T |
34724 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagtagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaataacatcaattaaaacatgaatcatatctcaat |
34625 |
T |
 |
| Q |
110 |
ttaacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaact |
209 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||| | ||||||||| || || ||||| |||| ||||| |||||| || | |||||||||||||||||||||||| |||||| | |
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|
| T |
34624 |
tcaacaacaacttagca-aaattcacctattgagaacaattttcacaacttcatatttttacacaattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatt |
34526 |
T |
 |
| Q |
210 |
aacatcaattcatgcatacaaacataaca |
238 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
34525 |
atcatcaattcatgcatacaaacataaca |
34497 |
T |
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Target: scaffold0104; HSP #1
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Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||| | ||||||| |
|
|
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48514 |
catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataacatcaattaacatccataacatcaagtgaacaagaatcaaatctcaaat |
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T |
 |
| Q |
111 |
taacaac |
117 |
Q |
| |
|
||||||| |
|
|
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taacaac |
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T |
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Target: scaffold0420; HSP #1
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Q |
| |
|
|||||||||| ||||||| | ||||||||| || ||||| || |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |
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aaattaacaataacttagca-aaattcaccaattgagcaccattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcataca |
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T |
 |
| Q |
207 |
actaacatcaattcatgcatacaaacataaca |
238 |
Q |
| |
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| || ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13381 |
attatcatcaattcatgcatacaaacataaca |
13350 |
T |
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Target: scaffold0125 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
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catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
110 |
Q |
| |
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|
| T |
41648 |
catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcatttaacaacaacaacatcaattgaacatggttctcatcataatt |
41747 |
T |
 |
| Q |
111 |
taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
210 |
Q |
| |
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| T |
41748 |
caacaacaacatagca-aaattcaccaattgaacacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
41846 |
T |
 |
| Q |
211 |
acatcaattcatgcatacaaacataaca |
238 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41847 |
tcatcaattcatgcatacaaacataaca |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
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Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| | || ||| | || ||| | ||||||| ||| |||||||||| | ||||| |
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|
| T |
37328 |
catcatcaatccatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatc |
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T |
 |
| Q |
111 |
taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
210 |
Q |
| |
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|
| T |
37228 |
caactacaacat--gtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaatta |
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T |
 |
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211 |
acatcaattcatgcatacaaacata |
235 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
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ttatcaattcatgcatacaaacata |
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T |
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| T |
13506 |
catcgtcaattcatgaatatgcatacccaagtcatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaacaacatcaattgaacatggttctcatcataatt |
13605 |
T |
 |
| Q |
111 |
taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
210 |
Q |
| |
|
||||||||| ||| | ||||||| | || |||||||| |||| ||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || |
|
|
| T |
13606 |
caacaacaacatagca-aaattcatcaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
13704 |
T |
 |
| Q |
211 |
acatcaattcatgcatacaaacataaca |
238 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13705 |
tcatcaattcatgcatacaaacataaca |
13732 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0622 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0622
Description:
Target: scaffold0622; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 11 - 108
Target Start/End: Original strand, 9382 - 9479
Alignment:
| Q |
11 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaa |
108 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
9382 |
catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaa |
9479 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0018 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:
Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 129 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 51328 - 51226
Alignment:
| Q |
129 |
aattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatac |
228 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
51328 |
aattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaattcatgcatac |
51229 |
T |
 |
| Q |
229 |
aaa |
231 |
Q |
| |
|
||| |
|
|
| T |
51228 |
aaa |
51226 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0028 (Bit Score: 51; Significance: 2e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:
Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 129 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 89600 - 89498
Alignment:
| Q |
129 |
aattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatac |
228 |
Q |
| |
|
|||||||| || |||||||| |||| ||||||| |||| | | ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
89600 |
aattcaccaattgagcacaattttcacaacttataatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatac |
89501 |
T |
 |
| Q |
229 |
aaa |
231 |
Q |
| |
|
||| |
|
|
| T |
89500 |
aaa |
89498 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0141 (Bit Score: 48; Significance: 1e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0141
Description:
Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 128 - 235
Target Start/End: Original strand, 22656 - 22763
Alignment:
| Q |
128 |
aaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata |
227 |
Q |
| |
|
||||||| || ||| ||||||| |||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||| |||||| || ||||||||||||||| |
|
|
| T |
22656 |
aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata |
22755 |
T |
 |
| Q |
228 |
caaacata |
235 |
Q |
| |
|
|||||||| |
|
|
| T |
22756 |
caaacata |
22763 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0141; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 128 - 235
Target Start/End: Original strand, 26911 - 27018
Alignment:
| Q |
128 |
aaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata |
227 |
Q |
| |
|
||||||| || ||| ||||||| |||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||| |||||| || ||||||||||||||| |
|
|
| T |
26911 |
aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata |
27010 |
T |
 |
| Q |
228 |
caaacata |
235 |
Q |
| |
|
|||||||| |
|
|
| T |
27011 |
caaacata |
27018 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0124 (Bit Score: 48; Significance: 1e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:
Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 128 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 1729 - 1622
Alignment:
| Q |
128 |
aaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata |
227 |
Q |
| |
|
||||||| || ||| ||||||| |||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||| |||||| || ||||||||||||||| |
|
|
| T |
1729 |
aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata |
1630 |
T |
 |
| Q |
228 |
caaacata |
235 |
Q |
| |
|
|||||||| |
|
|
| T |
1629 |
caaacata |
1622 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0361 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000005; HSPs: 2)
Name: scaffold0361
Description:
Target: scaffold0361; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 182 - 238
Target Start/End: Original strand, 3360 - 3416
Alignment:
| Q |
182 |
atgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataaca |
238 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||| || ||| ||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
3360 |
atgtaatttcaccaacaatcatacaaatatcattaattcatgcatacaaacttaaca |
3416 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0361; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 67
Target Start/End: Original strand, 3210 - 3264
Alignment:
| Q |
13 |
tcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaa |
67 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||| || ||||| |
|
|
| T |
3210 |
tcatcaattcatgaatatgcctacccaaacaatgattcatcaatcacaacatcaa |
3264 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0066 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0066
Description:
Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 179 - 225
Target Start/End: Original strand, 45198 - 45244
Alignment:
| Q |
179 |
aacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgca |
225 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||| |||||| || |||||||||||||| |
|
|
| T |
45198 |
aacatgtaatttcacccacaatcatacaattatcatcaattcatgca |
45244 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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