View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF17755_high_60 (Length: 246)

Name: NF17755_high_60
Description: NF17755
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF17755_high_60
NF17755_high_60
[»] chr5 (13 HSPs)
chr5 (114-246)||(41334571-41334703)
chr5 (110-246)||(2614553-2614689)
chr5 (114-246)||(18034042-18034174)
chr5 (112-246)||(5257055-5257189)
chr5 (110-246)||(33801529-33801665)
chr5 (139-246)||(22512365-22512472)
chr5 (120-246)||(38470639-38470765)
chr5 (113-246)||(7617193-7617326)
chr5 (113-212)||(25914903-25915002)
chr5 (170-245)||(39122397-39122472)
chr5 (104-219)||(39122254-39122369)
chr5 (114-186)||(30622627-30622699)
chr5 (115-186)||(32473303-32473374)
[»] chr8 (24 HSPs)
chr8 (111-246)||(11582826-11582961)
chr8 (111-246)||(36743388-36743523)
chr8 (118-246)||(29800862-29800990)
chr8 (113-246)||(30660649-30660782)
chr8 (114-246)||(2547056-2547188)
chr8 (115-246)||(42197344-42197475)
chr8 (113-246)||(20148820-20148953)
chr8 (113-244)||(30912469-30912600)
chr8 (114-245)||(31384725-31384856)
chr8 (120-246)||(29705422-29705548)
chr8 (114-246)||(9241612-9241744)
chr8 (115-246)||(26125695-26125825)
chr8 (120-246)||(2165877-2166003)
chr8 (112-246)||(45397376-45397509)
chr8 (114-246)||(42295255-42295386)
chr8 (114-245)||(3743832-3743963)
chr8 (113-246)||(1375602-1375735)
chr8 (142-246)||(5754963-5755067)
chr8 (114-243)||(40528542-40528671)
chr8 (112-186)||(35181636-35181710)
chr8 (113-186)||(34304908-34304980)
chr8 (210-246)||(42699317-42699353)
chr8 (141-186)||(18066653-18066698)
chr8 (114-186)||(10678060-10678132)
[»] chr7 (26 HSPs)
chr7 (111-246)||(24000917-24001052)
chr7 (120-246)||(42538345-42538471)
chr7 (113-246)||(5810831-5810964)
chr7 (114-246)||(41861736-41861868)
chr7 (114-246)||(26898310-26898442)
chr7 (120-246)||(27393174-27393300)
chr7 (113-246)||(44326238-44326371)
chr7 (118-246)||(5015455-5015583)
chr7 (113-245)||(16180264-16180396)
chr7 (112-246)||(44416840-44416974)
chr7 (113-246)||(4638106-4638239)
chr7 (109-246)||(42972912-42973049)
chr7 (114-246)||(43343532-43343664)
chr7 (120-246)||(32029731-32029857)
chr7 (113-246)||(45326080-45326213)
chr7 (114-245)||(10573810-10573941)
chr7 (113-246)||(35069781-35069914)
chr7 (114-246)||(43317503-43317635)
chr7 (138-246)||(38160511-38160619)
chr7 (120-246)||(9216361-9216487)
chr7 (114-246)||(5194139-5194271)
chr7 (114-245)||(24280504-24280635)
chr7 (113-226)||(47279631-47279744)
chr7 (112-186)||(40237039-40237113)
chr7 (113-186)||(31408540-31408613)
chr7 (113-186)||(31513407-31513480)
[»] chr6 (17 HSPs)
chr6 (120-246)||(9698247-9698373)
chr6 (112-246)||(21293583-21293717)
chr6 (113-246)||(26669916-26670049)
chr6 (118-246)||(7292807-7292935)
chr6 (115-246)||(13743130-13743261)
chr6 (115-246)||(13748630-13748761)
chr6 (113-246)||(3213460-3213593)
chr6 (113-246)||(21279989-21280122)
chr6 (120-246)||(7367609-7367735)
chr6 (114-246)||(30736042-30736174)
chr6 (113-244)||(26466861-26466992)
chr6 (108-246)||(24203889-24204027)
chr6 (113-246)||(7273242-7273375)
chr6 (115-245)||(30014404-30014534)
chr6 (113-186)||(27441662-27441735)
chr6 (114-186)||(33242523-33242595)
chr6 (103-186)||(33254034-33254118)
[»] chr3 (24 HSPs)
chr3 (112-246)||(46941113-46941247)
chr3 (113-246)||(54246055-54246188)
chr3 (113-246)||(36150190-36150323)
chr3 (113-246)||(42394326-42394459)
chr3 (114-246)||(53581766-53581898)
chr3 (114-246)||(54237156-54237288)
chr3 (114-246)||(40808925-40809057)
chr3 (114-246)||(24688310-24688442)
chr3 (114-246)||(40480809-40480941)
chr3 (114-246)||(45126836-45126968)
chr3 (112-246)||(52629888-52630022)
chr3 (113-246)||(47190933-47191066)
chr3 (122-246)||(42100748-42100872)
chr3 (103-246)||(25413741-25413886)
chr3 (114-246)||(27748623-27748746)
chr3 (115-246)||(51249368-51249499)
chr3 (113-212)||(1078312-1078411)
chr3 (113-204)||(29556866-29556956)
chr3 (113-246)||(11064629-11064762)
chr3 (167-246)||(53273645-53273724)
chr3 (113-186)||(4190172-4190245)
chr3 (114-186)||(9434244-9434316)
chr3 (117-192)||(19148882-19148957)
chr3 (134-182)||(45058584-45058632)
[»] chr1 (17 HSPs)
chr1 (114-246)||(5489836-5489968)
chr1 (114-246)||(48498870-48499002)
chr1 (114-246)||(23989431-23989563)
chr1 (114-246)||(43570994-43571126)
chr1 (112-246)||(4401388-4401522)
chr1 (115-246)||(37814838-37814969)
chr1 (108-246)||(2497464-2497602)
chr1 (113-246)||(7447885-7448018)
chr1 (113-246)||(24769406-24769539)
chr1 (112-246)||(50448166-50448300)
chr1 (113-246)||(750212-750345)
chr1 (110-246)||(4888103-4888238)
chr1 (113-186)||(44112797-44112870)
chr1 (134-184)||(47748463-47748513)
chr1 (114-186)||(35000021-35000093)
chr1 (113-186)||(35003414-35003487)
chr1 (114-186)||(45705945-45706017)
[»] scaffold0119 (1 HSPs)
scaffold0119 (113-246)||(745-878)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (113-246)||(112715-112848)
[»] chr4 (31 HSPs)
chr4 (113-246)||(27550369-27550502)
chr4 (114-246)||(27893750-27893882)
chr4 (113-246)||(27864624-27864757)
chr4 (113-246)||(55966253-55966386)
chr4 (112-246)||(23036040-23036174)
chr4 (114-244)||(43514594-43514724)
chr4 (113-246)||(28982729-28982862)
chr4 (117-246)||(48463361-48463490)
chr4 (114-246)||(33703201-33703333)
chr4 (114-246)||(35017792-35017924)
chr4 (112-246)||(31680962-31681096)
chr4 (113-246)||(1771173-1771306)
chr4 (114-246)||(23204686-23204818)
chr4 (114-246)||(43949709-43949841)
chr4 (113-246)||(43735802-43735935)
chr4 (114-246)||(25051753-25051885)
chr4 (114-246)||(51512173-51512305)
chr4 (113-243)||(28988536-28988665)
chr4 (112-243)||(41327449-41327580)
chr4 (113-245)||(21687067-21687199)
chr4 (138-246)||(39631161-39631269)
chr4 (120-246)||(12497016-12497142)
chr4 (111-246)||(27316617-27316753)
chr4 (118-246)||(45490225-45490353)
chr4 (113-246)||(41878466-41878592)
chr4 (119-243)||(41848034-41848158)
chr4 (112-246)||(56215804-56215937)
chr4 (126-246)||(46412389-46412509)
chr4 (113-186)||(19880074-19880147)
chr4 (114-186)||(55272284-55272356)
chr4 (110-186)||(3756156-3756232)
[»] chr2 (24 HSPs)
chr2 (113-246)||(19047217-19047350)
chr2 (111-245)||(4764631-4764765)
chr2 (113-246)||(30838692-30838825)
chr2 (113-246)||(43490308-43490441)
chr2 (102-246)||(42849754-42849898)
chr2 (114-246)||(1750474-1750606)
chr2 (114-246)||(43335671-43335803)
chr2 (120-246)||(12302167-12302293)
chr2 (114-246)||(16096807-16096940)
chr2 (147-246)||(13780676-13780775)
chr2 (113-243)||(34817683-34817813)
chr2 (138-246)||(42026829-42026937)
chr2 (167-245)||(8896544-8896622)
chr2 (109-246)||(39149197-39149332)
chr2 (113-186)||(34895648-34895721)
chr2 (114-186)||(11825562-11825634)
chr2 (114-186)||(16804088-16804160)
chr2 (114-186)||(16843370-16843442)
chr2 (114-186)||(43114677-43114749)
chr2 (113-186)||(6518401-6518474)
chr2 (104-186)||(18491825-18491907)
chr2 (114-186)||(4299328-4299400)
chr2 (113-186)||(41281881-41281954)
chr2 (114-186)||(966742-966814)
[»] scaffold0187 (2 HSPs)
scaffold0187 (114-246)||(14097-14228)
scaffold0187 (114-246)||(24425-24556)
[»] scaffold0385 (1 HSPs)
scaffold0385 (114-246)||(11311-11443)
[»] scaffold0157 (1 HSPs)
scaffold0157 (120-246)||(23335-23461)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (113-186)||(45626-45699)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 113; Significance: 2e-57; HSPs: 13)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 114 - 246
Target Start/End: Original strand, 41334571 - 41334703
Alignment:
Q  114 gagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataa 213  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41334571 gagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccctttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataa 41334670  T
Q  214 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatc 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41334671 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatc 41334703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 110 - 246
Target Start/End: Original strand, 2614553 - 2614689
Alignment:
Q  110 aatagagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaag 209  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  2614553 aatagagtaatgatacatgtaccacctcatgtggcaatacaccctttacacccatacaaaattctgacacgtggcaatctggaccccacacaaatagaag 2614652  T
Q  210 ataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatc 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2614653 ataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatc 2614689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 114 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 18034174 - 18034042
Alignment:
Q  114 gagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataa 213  Q
    ||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18034174 gagtgatgatacatgtaccaccccatatggcaatacaccctttacacccatataaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataa 18034075  T
Q  214 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatc 246  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18034074 agtgtggttgtgagatgaacttacaaaaatatc 18034042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 112 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 5257189 - 5257055
Alignment:
Q  112 tagagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagat 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||    
T  5257189 tagagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccctttacacccacataaaattctgacatgtggcaatcttgaccccacataaatagaagat 5257090  T
Q  212 aaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatc 246  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5257089 aaagtgtggttgtgagatgaaattaccaaaatatc 5257055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 110 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 33801665 - 33801529
Alignment:
Q  110 aatagagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaag 209  Q
    ||||||||| ||||| |||||||  |  |||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  33801665 aatagagtgatgatatatgtaccttcccatgtggcaatacactctttacacccacacaaaattctgacacgtggcaacttggatcccacacaaatagaag 33801566  T
Q  210 ataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatc 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  33801565 ataaagtgtggttgtgagatgaacttactaaaatatc 33801529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 139 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 22512472 - 22512365
Alignment:
Q  139 tgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttacc 238  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||| | |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22512472 tgtggcaatacaccctttacatccacacaaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttacc 22512373  T
Q  239 aaaatatc 246  Q
    ||||||||    
T  22512372 aaaatatc 22512365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 120 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 38470765 - 38470639
Alignment:
Q  120 tgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataaagtgtg 219  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | |||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  38470765 tgatacatgtaccacctcatatggcaatacaccctttacacccacataaaattctgatacgtggtaatctggaccccacataaatagaagataaagtgtg 38470666  T
Q  220 gttgtgagatgaacttaccaaaatatc 246  Q
     |||||| ||||| |||||||||||||    
T  38470665 attgtgaaatgaatttaccaaaatatc 38470639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 113 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 7617326 - 7617193
Alignment:
Q  113 agagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagata 212  Q
    |||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||||  |||||||| | | |||||||||||||||| |||| | || |||||| ||||||||||||    
T  7617326 agagtgatgatacatgtatcaccccatgtggcaatacaccttttacaccaacacaaaattctgacatgtgacaacttagatcccacataaatagaagata 7617227  T
Q  213 aagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatc 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7617226 aagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatc 7617193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 113 - 212
Target Start/End: Original strand, 25914903 - 25915002
Alignment:
Q  113 agagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagata 212  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25914903 agagtgatgatacatgtaccacctcatgtggcaatacaccatttacacccacacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagata 25915002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 170 - 245
Target Start/End: Original strand, 39122397 - 39122472
Alignment:
Q  170 attctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatat 245  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  39122397 attctgacatgtggcaacctaaaccccacacaaatagaagataaagtgtagttgtgagatgaatttaccaaaatat 39122472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 104 - 219
Target Start/End: Original strand, 39122254 - 39122369
Alignment:
Q  104 atatataatagagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaa 203  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| |   |||||| ||| | || ||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  39122254 atatattaaagagtggtgatacatgtaccaccccatgtgacaatatatcatttacatccacacaagattctgacatgtggcaacctaaaccccacacaaa 39122353  T
Q  204 tagaagataaagtgtg 219  Q
    ||||||||||||||||    
T  39122354 tagaagataaagtgtg 39122369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 114 - 186
Target Start/End: Original strand, 30622627 - 30622699
Alignment:
Q  114 gagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaa 186  Q
    ||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||   ||||||||| | |||||| |||||||||||||    
T  30622627 gagtggtgatacatgtacacccccatgtggcaatacacctcttacacccacacaaaattttgacatgtggcaa 30622699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 186
Target Start/End: Original strand, 32473303 - 32473374
Alignment:
Q  115 agtggtgatacatgtaccacctt-atgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaa 186  Q
    ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||   ||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  32473303 agtggtgatacatgtac-acctccatgtggcaatacacctcttacacccacacaaaattctgacatgtggcaa 32473374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 108; Significance: 2e-54; HSPs: 24)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 111 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 11582961 - 11582826
Alignment:
Q  111 atagagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaaga 210  Q
    |||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11582961 atagagtaatgatacatgtaccacctcatgtggcaatacaccctttacacccatacaaaattctgacacgtggcaatctggaccccacacaaatagaaga 11582862  T
Q  211 taaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatc 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11582861 taaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatc 11582826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 111 - 246
Target Start/End: Original strand, 36743388 - 36743523
Alignment:
Q  111 atagagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaaga 210  Q
    |||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  36743388 atagagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaatctggaccccacacaaatagaaga 36743487  T
Q  211 taaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatc 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36743488 taaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatc 36743523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 118 - 246
Target Start/End: Original strand, 29800862 - 29800990
Alignment:
Q  118 ggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataaagtg 217  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||    
T  29800862 ggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccctttacacccacataaaattctgacatgtggcaatcttgaccccacataaatagaagataaagtg 29800961  T
Q  218 tggttgtgagatgaacttaccaaaatatc 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  29800962 tggttgtgagatgaacttaccaaaatatc 29800990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 113 - 246
Target Start/End: Original strand, 30660649 - 30660782
Alignment:
Q  113 agagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagata 212  Q
    |||||| ||||||||||| || | ||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30660649 agagtgatgatacatgtatcatcctatgtggcaatacaccctttacatccacataaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagata 30660748  T
Q  213 aagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatc 246  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  30660749 aagtgtggttgtaagatgaacttaccaaaatatc 30660782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 114 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 2547188 - 2547056
Alignment:
Q  114 gagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataa 213  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  2547188 gagtgatgatacatgtaccaccctatgtggcaatacaccctttacacccacacaaaattctgacacgtggcaacttggatcccacacaaatagaagataa 2547089  T
Q  214 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatc 246  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2547088 agtgtggttgtgagatgaacttactaaaatatc 2547056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 115 - 246
Target Start/End: Original strand, 42197344 - 42197475
Alignment:
Q  115 agtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataaa 214  Q
    |||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| | |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  42197344 agtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccctttacacccacacaaaattttgacacgtggcaatctggaccccacacaaatagaagataaa 42197443  T
Q  215 gtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatc 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42197444 gtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatc 42197475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 113 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 20148953 - 20148820
Alignment:
Q  113 agagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagata 212  Q
    ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||| |||||| ||||||| ||||    
T  20148953 agagtggtgatacatgtaccacaccatgtggcaatacaccctttacacccacataaaattctgacacgtggcaatctggatcccacataaatagatgata 20148854  T
Q  213 aagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatc 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20148853 aagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatc 20148820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 113 - 244
Target Start/End: Original strand, 30912469 - 30912600
Alignment:
Q  113 agagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagata 212  Q
    |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  30912469 agagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacactctttacacccacacaaaattctgacacgtggcaacctagaccccacacaaatagaagata 30912568  T
Q  213 aagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaata 244  Q
    | ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  30912569 aggtgcggttgtgagatgaacttaccaaaata 30912600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 114 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 31384856 - 31384725
Alignment:
Q  114 gagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataa 213  Q
    ||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||| || ||||||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31384856 gagtgatgatatatgtaccaccccatgtggcaatataccctttacatccacataaaattctgacacgtagcaacctggaccccacacaaatagaagataa 31384757  T
Q  214 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatat 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31384756 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatat 31384725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 120 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 29705548 - 29705422
Alignment:
Q  120 tgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataaagtgtg 219  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  29705548 tgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccctttacacccacacaaaattctgacacgtggcaacttggaccccgcacaaatagaagataaagtgtg 29705449  T
Q  220 gttgtgagatgaacttaccaaaatatc 246  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||    
T  29705448 gttgtgagatgaacttatcaaaatatc 29705422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 114 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 9241744 - 9241612
Alignment:
Q  114 gagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataa 213  Q
    ||||| ||||||||||||||||  ||||||||| |||| |||| |||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  9241744 gagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaacacaccctttgcacccacacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacataaatagaagataa 9241645  T
Q  214 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatc 246  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  9241644 agtgtggttgtgagatgaacttacaaaaatatc 9241612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 115 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 26125825 - 26125695
Alignment:
Q  115 agtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataaa 214  Q
    |||||||||| ||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||    
T  26125825 agtggtgatatatgtaccaccccatgtggcaatacaccctttacacccgcataaaattctgacacgtggcaatctggaccc-acataaatagaagataaa 26125727  T
Q  215 gtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatc 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26125726 gtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatc 26125695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 120 - 246
Target Start/End: Original strand, 2165877 - 2166003
Alignment:
Q  120 tgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataaagtgtg 219  Q
    |||||||||||||| |  ||||| |||||||| ||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2165877 tgatacatgtaccatcccatgtgacaatacaccctttacacccacacaaaattctgacacgtggcaacctgaaccccacacaaatagaagataaagtgtg 2165976  T
Q  220 gttgtgagatgaacttaccaaaatatc 246  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||    
T  2165977 gttatgagatgaacttaccaaaatatc 2166003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 112 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 45397509 - 45397376
Alignment:
Q  112 tagagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagat 211  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||||| | |||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  45397509 tagagtgatgatacatgtaccaccc-atgtggcaacacaccctttacacccacacaaaattctgacacgtggcaatctggagcccacacaaatagaagat 45397411  T
Q  212 aaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatc 246  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  45397410 aaattgtggttgtgagatgaacttacaaaaatatc 45397376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 114 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 42295386 - 42295255
Alignment:
Q  114 gagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataa 213  Q
    ||||| ||||| |||||||| | |||||||||||| || ||||||| ||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||    
T  42295386 gagtgatgataaatgtaccatcctatgtggcaatataccctttacatccacacaaaattctgacatgtggcaacttggaccc-acataaatagaagataa 42295288  T
Q  214 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatc 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42295287 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatc 42295255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 114 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 3743963 - 3743832
Alignment:
Q  114 gagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataa 213  Q
    ||||| ||||| ||||||||||  |||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||| |||| ||| |||||||||||||    
T  3743963 gagtgatgatatatgtaccaccccatgtagcaatacaccctttacacccacataaaattctgacacgtggcaatctgaaccctacataaatagaagataa 3743864  T
Q  214 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatat 245  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  3743863 agtgtggttgtgagatgaacttatcaaaatat 3743832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 113 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 1375735 - 1375602
Alignment:
Q  113 agagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagata 212  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  ||||||||||| | || ||||| ||| ||||||| ||| || ||||||||||||||||||    
T  1375735 agagtggtgatacatgtaccaccctatgtgacaatacattctttacacccacacaagattctaacacgtggcaatctgaactccacacaaatagaagata 1375636  T
Q  213 aagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatc 246  Q
    |||||| |||||||||| || |||||||||||||    
T  1375635 aagtgtagttgtgagataaatttaccaaaatatc 1375602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 142 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 5755067 - 5754963
Alignment:
Q  142 ggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaa 241  Q
    |||||||||| ||||||||||| | |||||||| ||| |||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5755067 ggcaatacaccctttacacccacacaaaattctaacacgtggcaacttggatcccacataaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaa 5754968  T
Q  242 atatc 246  Q
    |||||    
T  5754967 atatc 5754963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 114 - 243
Target Start/End: Original strand, 40528542 - 40528671
Alignment:
Q  114 gagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataa 213  Q
    |||||||||||||||| |  ||| ||||| ||||| |   |||||| ||| | |||||| ||||||||| |||| || ||||||||||||||||||| ||    
T  40528542 gagtggtgatacatgtgcaccctcatgtgacaatatatcatttacatccacacaaaattatgacatgtgacaacttgaaccccacacaaatagaagagaa 40528641  T
Q  214 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaat 243  Q
    |||||||||||||||| || ||| ||||||    
T  40528642 agtgtggttgtgagataaatttatcaaaat 40528671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 112 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 35181710 - 35181636
Alignment:
Q  112 tagagtggtgatacatgtaccacctt-atgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaa 186  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||   ||||||||| | ||||| ||||||||||||||    
T  35181710 tagagtggtgatacatgtac-accttcatgtggcaatacacctcttacacccacacaaaatcctgacatgtggcaa 35181636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 113 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 34304980 - 34304908
Alignment:
Q  113 agagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaa 186  Q
    ||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||   ||||||||| | ||||| ||||||||||||||    
T  34304980 agagtggtgatacatgtac-accccatgtggcaatacacctcttacacccaaacaaaatcctgacatgtggcaa 34304908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 210 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 42699353 - 42699317
Alignment:
Q  210 ataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatc 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  42699353 ataaagtgtggttgtgagatgaacttacaaaaatatc 42699317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 141 - 186
Target Start/End: Original strand, 18066653 - 18066698
Alignment:
Q  141 tggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaa 186  Q
    |||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18066653 tggcaatacacctcttacacccacataaaattctgacatgtggcaa 18066698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 114 - 186
Target Start/End: Original strand, 10678060 - 10678132
Alignment:
Q  114 gagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaa 186  Q
    ||||||||||||||||||  ||  |||||||||||||    ||||||||| | ||||| ||||||||||||||    
T  10678060 gagtggtgatacatgtacacccccatgtggcaatacatctcttacacccacacaaaatcctgacatgtggcaa 10678132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 108; Significance: 2e-54; HSPs: 26)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 111 - 246
Target Start/End: Original strand, 24000917 - 24001052
Alignment:
Q  111 atagagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaaga 210  Q
    |||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24000917 atagagtaatgatacatgtaccacctcatgtggcaatacaccctttacacccatacaaaattctgacacgtggcaatctggaccccacacaaatagaaga 24001016  T
Q  211 taaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatc 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24001017 taaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatc 24001052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 120 - 246
Target Start/End: Original strand, 42538345 - 42538471
Alignment:
Q  120 tgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataaagtgtg 219  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42538345 tgatacatgtaccacctcatgtggcaatacaccctttacacccatacaaaattctgacacgtggcaatctggaccccacacaaatagaagataaagtgtg 42538444  T
Q  220 gttgtgagatgaacttaccaaaatatc 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  42538445 gttgtgagatgaacttaccaaaatatc 42538471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 113 - 246
Target Start/End: Original strand, 5810831 - 5810964
Alignment:
Q  113 agagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagata 212  Q
    |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5810831 agagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccctttacacccatacaaaattttgacatgtggcaacttggaccccacacaaatagaagata 5810930  T
Q  213 aagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatc 246  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5810931 aagtgtggttgtgagatgaacttatcaaaatatc 5810964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 114 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 41861868 - 41861736
Alignment:
Q  114 gagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataa 213  Q
    |||||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  41861868 gagtggtgatacatgtaccactccatgtggcaatacaccctttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccatacaaatagaagataa 41861769  T
Q  214 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatc 246  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  41861768 agtgtggttgtgagataaacttaccaaaatatc 41861736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 114 - 246
Target Start/End: Original strand, 26898310 - 26898442
Alignment:
Q  114 gagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataa 213  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26898310 gagtggtgatacatgtaccatcctatgtggcaatacaccttttacacccacataaaattctgacacgtggtaacctggaccccacacaaatagaatataa 26898409  T
Q  214 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatc 246  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26898410 agtgtggttgtaagatgaacttaccaaaatatc 26898442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 120 - 246
Target Start/End: Original strand, 27393174 - 27393300
Alignment:
Q  120 tgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataaagtgtg 219  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27393174 tgatacatgtaccaccccatgtggcaatacatcctttacacccacataaaattctgacatgaggcaacctggaccccacataaatagaagataaagtgtg 27393273  T
Q  220 gttgtgagatgaacttaccaaaatatc 246  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||    
T  27393274 gttgtgagatgaacttacaaaaatatc 27393300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 113 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 44326371 - 44326238
Alignment:
Q  113 agagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagata 212  Q
    ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||| |||||| ||||||| ||||    
T  44326371 agagtggtgatacatgtaccacaccatgtggcaatacaccctttacacccacataaaattctgacacgtggcaatctggatcccacataaatagatgata 44326272  T
Q  213 aagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatc 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44326271 aagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatc 44326238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 118 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 5015583 - 5015455
Alignment:
Q  118 ggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataaagtg 217  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||  ||||||| || | |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5015583 ggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccttttacactcacacaaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatagaagataaagtg 5015484  T
Q  218 tggttgtgagatgaacttaccaaaatatc 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5015483 tggttgtgagatgaacttaccaaaatatc 5015455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 113 - 245
Target Start/End: Original strand, 16180264 - 16180396
Alignment:
Q  113 agagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagata 212  Q
    |||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||| ||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16180264 agagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccttttacatccacacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagata 16180363  T
Q  213 aagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatat 245  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16180364 aagtgtggttgtgagatgaatttaccaaaatat 16180396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 112 - 246
Target Start/End: Original strand, 44416840 - 44416974
Alignment:
Q  112 tagagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagat 211  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| ||| | ||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  44416840 tagagtgatgatacatgtaccacctcatgtggcaatacaccttttacatccacacaaatttctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatagaagat 44416939  T
Q  212 aaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatc 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  44416940 aaagtgtggttgtgagatgaacttatcaaaatatc 44416974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 113 - 246
Target Start/End: Original strand, 4638106 - 4638239
Alignment:
Q  113 agagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagata 212  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||| ||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4638106 agagtggtgatacatgtaccaccctacgtgacaatacaccctttacatccatacaagattctgacacgtggtaacctagaccccacacaaatagaagata 4638205  T
Q  213 aagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatc 246  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4638206 aagtatggttgtgagatgaacttaccaaaatatc 4638239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 109 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 42973049 - 42972912
Alignment:
Q  109 taatagagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaa 208  Q
    |||||||||  |||||||||||| | | |||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  42973049 taatagagtaatgatacatgtactatcctatgtggcaatacaccatttacacccacacaaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatagaa 42972950  T
Q  209 gataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatc 246  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42972949 gataaaatgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatc 42972912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 114 - 246
Target Start/End: Original strand, 43343532 - 43343664
Alignment:
Q  114 gagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataa 213  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| ||| | ||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  43343532 gagtgatgatacatgtaccacctcatgtggcaatacaccttttacatccacacaaatttctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatagaagataa 43343631  T
Q  214 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatc 246  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  43343632 agtgtggttgtgagatgaacttatcaaaatatc 43343664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 120 - 246
Target Start/End: Original strand, 32029731 - 32029857
Alignment:
Q  120 tgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataaagtgtg 219  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  32029731 tgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccctttacacccacacaaaattctgacacgtggcaacttggaccccacataaatagaagataaagtgtg 32029830  T
Q  220 gttgtgagatgaacttaccaaaatatc 246  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||    
T  32029831 gttgttagatgaatttaccaaaatatc 32029857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 113 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 45326213 - 45326080
Alignment:
Q  113 agagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagata 212  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||  |||||||||| |||||||||||||| |||| |  |||||||||||| ||||||||||||    
T  45326213 agagtggtgatacatgtaccaccccatgtgacaatacaccatttacacccacataaaattctgacaggtggtagtctggaccccacataaatagaagata 45326114  T
Q  213 aagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatc 246  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  45326113 aagtgtgattgtgagatgaacttaccaaaatatc 45326080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 114 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 10573941 - 10573810
Alignment:
Q  114 gagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataa 213  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| |  ||||||||||| |||||||||||| ||||||||| || ||||||||| |||||||||||||    
T  10573941 gagtggtgatacatgtaccaccgcatgtgacaatatatcctttacacccacataaaattctgatatgtggcaatcttgaccccacataaatagaagataa 10573842  T
Q  214 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatat 245  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  10573841 agtgtggttgtgagatgaatttaccaaaatat 10573810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 113 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 35069914 - 35069781
Alignment:
Q  113 agagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagata 212  Q
    |||||| |||||||||||||| | |||||||||||| |  ||||||| | | | |||||||||||| |||||||| |||||| |||| ||||||||||||    
T  35069914 agagtgatgatacatgtaccatcctatgtggcaatatatcctttacatctacacaaaattctgacacgtggcaacttggacctcacataaatagaagata 35069815  T
Q  213 aagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatc 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35069814 aagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatc 35069781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 114 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 43317635 - 43317503
Alignment:
Q  114 gagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataa 213  Q
    ||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||| | ||||||||| | |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||  |    
T  43317635 gagtggtgatacatgtacacccttgtgtggcaatacaccccttacacccacacaaaattctgacatgtggcaatctagaccccacacaaatagaagagta 43317536  T
Q  214 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatc 246  Q
    |||||| |||||||||||| ||| |||||||||    
T  43317535 agtgtgattgtgagatgaatttatcaaaatatc 43317503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 138 - 246
Target Start/End: Original strand, 38160511 - 38160619
Alignment:
Q  138 atgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttac 237  Q
    |||||||||||||| | ||||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  38160511 atgtggcaatacaccccttacacccacacaaaattctgacacgtggcaacttggaccccacataaatagaagataaagtgtagttgtgagatgaagttac 38160610  T
Q  238 caaaatatc 246  Q
     ||||||||    
T  38160611 taaaatatc 38160619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 120 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 9216487 - 9216361
Alignment:
Q  120 tgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataaagtgtg 219  Q
    ||||| || |||||||  ||||| ||||||||  |||||| ||| | |||||||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9216487 tgatatatataccaccccatgtgacaatacaccttttacatccacacaaaattctgacatgcggcaacttaaaccccacacaaatagaagataaaatgtg 9216388  T
Q  220 gttgtgagatgaacttaccaaaatatc 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  9216387 gttgtgagatgaacttaccaaaatatc 9216361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 114 - 246
Target Start/End: Original strand, 5194139 - 5194271
Alignment:
Q  114 gagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataa 213  Q
    |||| |||||||||||||  |||| ||||||||||||  | ||||||||| | |||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||  |    
T  5194139 gagtagtgatacatgtacacccttgtgtggcaatacaacccttacacccacacaaaattttgacatgtggcaatctagaccccacacaaatagaagagta 5194238  T
Q  214 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatc 246  Q
    |||||| |||||||||||| ||| |||||||||    
T  5194239 agtgtgattgtgagatgaatttatcaaaatatc 5194271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 114 - 245
Target Start/End: Original strand, 24280504 - 24280635
Alignment:
Q  114 gagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataa 213  Q
    ||||||||||||||||||  | ||| |||  |||||||   |||||| |  | |||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  24280504 gagtggtgatacatgtacacctttacgtgataatacacctcttacactcgcacaaaattctgatatatggcaacttggaccccacacaaatagaagagaa 24280603  T
Q  214 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatat 245  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  24280604 agtgtgattgtgagatgaatttaccaaaatat 24280635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 113 - 226
Target Start/End: Original strand, 47279631 - 47279744
Alignment:
Q  113 agagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagata 212  Q
    ||||||||||||||||||||| |  || || |||||||| ||||| ||||| |||||||||||| |||||| || ||||| || | | ||||||||||||    
T  47279631 agagtggtgatacatgtaccatcccatctgacaatacaccctttatacccacataaaattctgatatgtggtaatctggatcctatataaatagaagata 47279730  T
Q  213 aagtgtggttgtga 226  Q
    ||||||||||||||    
T  47279731 aagtgtggttgtga 47279744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 112 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 40237113 - 40237039
Alignment:
Q  112 tagagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaa 186  Q
    ||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||   ||||||||| | ||||| ||||||||||||||    
T  40237113 tagagtggtgatacatgtacacccccatgtggcaatacacctcttacacccacacaaaatcctgacatgtggcaa 40237039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 113 - 186
Target Start/End: Original strand, 31408540 - 31408613
Alignment:
Q  113 agagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaa 186  Q
    |||||||||||||||||||  ||  ||||| ||||||||   ||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  31408540 agagtggtgatacatgtacacccccatgtgacaatacacctcttacacccacataaaatcctgacatgtggcaa 31408613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 113 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 31513480 - 31513407
Alignment:
Q  113 agagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaa 186  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||   ||||| | | | ||||| ||||||||||||||    
T  31513480 agagtggtgatacatgtacacccttatgtggcaatacacctcttacatctacacaaaatcctgacatgtggcaa 31513407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 107; Significance: 9e-54; HSPs: 17)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 120 - 246
Target Start/End: Original strand, 9698247 - 9698373
Alignment:
Q  120 tgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataaagtgtg 219  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9698247 tgatacatgtaccacctcatgtggcaatacaccctttacacccatacaaaattctgacacgtggcaatctggaccccacacaaatagaagataaagtgtg 9698346  T
Q  220 gttgtgagatgaacttaccaaaatatc 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  9698347 gttgtgagatgaacttaccaaaatatc 9698373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 112 - 246
Target Start/End: Original strand, 21293583 - 21293717
Alignment:
Q  112 tagagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagat 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  21293583 tagagtggtgatacatgtaccacctcatgtggcaatacaccctttacacccacataaaattctgacacgtggcaatctggaccccacataaatagaagat 21293682  T
Q  212 aaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatc 246  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  21293683 aaagtgtggttgtgaaatgaatttaccaaaatatc 21293717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 113 - 246
Target Start/End: Original strand, 26669916 - 26670049
Alignment:
Q  113 agagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagata 212  Q
    |||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26669916 agagcggtgatatatgtaccacctcatgtggcaatacaccctttacacccacacaaaattctgacacgtggcaacctggactccacacaaatagaagata 26670015  T
Q  213 aagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatc 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26670016 aagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatc 26670049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 118 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 7292935 - 7292807
Alignment:
Q  118 ggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataaagtg 217  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7292935 ggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccctttacacacaaacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataaagtg 7292836  T
Q  218 tggttgtgagatgaacttaccaaaatatc 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  7292835 tggttgtgagatgaacttaccaaaatatc 7292807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 115 - 246
Target Start/End: Original strand, 13743130 - 13743261
Alignment:
Q  115 agtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataaa 214  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||||| | || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13743130 agtggtgatacatgtaccaccctatgtggcaatatatcctttacacccacacaagattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataaa 13743229  T
Q  215 gtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatc 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13743230 gtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatc 13743261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 115 - 246
Target Start/End: Original strand, 13748630 - 13748761
Alignment:
Q  115 agtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataaa 214  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||||| | || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13748630 agtggtgatacatgtaccaccctatgtggcaatatatcctttacacccacacaagattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataaa 13748729  T
Q  215 gtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatc 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13748730 gtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatc 13748761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 113 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 3213593 - 3213460
Alignment:
Q  113 agagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagata 212  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  3213593 agagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccctttacacccacataaaattctgacacgtggcaatctggaccccacataaatagaagata 3213494  T
Q  213 aagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatc 246  Q
    |||| ||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  3213493 aagtatggttgtgaaatgaatttaccaaaatatc 3213460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 113 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 21280122 - 21279989
Alignment:
Q  113 agagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagata 212  Q
    |||||| ||||||||||||||||  ||||||||||| || ||||||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21280122 agagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatataccctttacacccacacaaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatagaagata 21280023  T
Q  213 aagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatc 246  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21280022 aagtgtggttgtgagatgaatttaccaaaatatc 21279989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 120 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 7367735 - 7367609
Alignment:
Q  120 tgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataaagtgtg 219  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||    
T  7367735 tgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccctttacacccacacaaaattctgacacgtggcaacctggatcccacataaatagaaaataaagtgtg 7367636  T
Q  220 gttgtgagatgaacttaccaaaatatc 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  7367635 gttgtgagatgaacttaccaaaatatc 7367609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 114 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 30736174 - 30736042
Alignment:
Q  114 gagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataa 213  Q
    ||||| |||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||| ||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  30736174 gagtgatgatacatgtaccatcccatgtggcaatacaccctttacatccacacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacataaatagaagataa 30736075  T
Q  214 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatc 246  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  30736074 agtgtgattgtgagatgaacttaccaaaatatc 30736042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 113 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 26466992 - 26466861
Alignment:
Q  113 agagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagata 212  Q
    |||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||  |||||||||||| ||||| |||| | ||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  26466992 agagtgatgatacatttaccaccctatgtggcaatacaccttttacacccatacaaaatcctgatacgtggcaacctgaaccccaaacaaatagaagata 26466893  T
Q  213 aagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaata 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26466892 aagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaata 26466861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 108 - 246
Target Start/End: Original strand, 24203889 - 24204027
Alignment:
Q  108 ataatagagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaataga 207  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||   ||||| |||||||| ||||||| ||| | |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  24203889 ataattgagtgatgatacatgtaccactccatgtgacaatacaccctttacatccacacaaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaataga 24203988  T
Q  208 agataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatc 246  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24203989 atataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatc 24204027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 113 - 246
Target Start/End: Original strand, 7273242 - 7273375
Alignment:
Q  113 agagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagata 212  Q
    |||||| |||| |||||||||||  |||||| ||||||| ||||||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  7273242 agagtgatgatgcatgtaccaccccatgtggtaatacactctttacacccacacaaaattctgacacgtggcaacttggaccccacataaatagaagata 7273341  T
Q  213 aagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatc 246  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  7273342 aagtgtgattgtgagatgaacttaccaaaatatc 7273375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 115 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 30014534 - 30014404
Alignment:
Q  115 agtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataaa 214  Q
    |||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||||| ||| | |||||||||||| |||| ||| ||||||||| | ||||||||||||||    
T  30014534 agtgatgatacatgtatcaccccatgtggcaatacaccctttacatccacacaaaattctgacacgtggtaacttggaccccatataaatagaagataaa 30014435  T
Q  215 gtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatat 245  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  30014434 gtatggttgtgagatgaacttaccaaaatat 30014404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 113 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 27441735 - 27441662
Alignment:
Q  113 agagtggtgatacatgtac-caccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaa 186  Q
    ||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||   ||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  27441735 agagtggtgatacatgtacacaccc-atgtggcaatacacctcttacacccacataaaatcctgacatgtggcaa 27441662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 114 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 33242595 - 33242523
Alignment:
Q  114 gagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaa 186  Q
    ||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||   ||||||||| | ||||| ||||||||||||||    
T  33242595 gagtggtgatacatgtacacccccatgtggcaatacacctcttacacccacacaaaatcctgacatgtggcaa 33242523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 103 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 33254118 - 33254034
Alignment:
Q  103 tatatata-atagagtggtgatacatgtaccacctt-atgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaa 186  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||  |||| ||||| | ||||| | ||||||||||||    
T  33254118 tatatatatatagagtggtgatacatgtac-acctccatgtggcaatacaccttttatacccacacaaaatccggacatgtggcaa 33254034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 107; Significance: 9e-54; HSPs: 24)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 112 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 46941247 - 46941113
Alignment:
Q  112 tagagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagat 211  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  46941247 tagagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacactctttacacccacataaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatagaagat 46941148  T
Q  212 aaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatc 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46941147 aaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatc 46941113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 113 - 246
Target Start/End: Original strand, 54246055 - 54246188
Alignment:
Q  113 agagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagata 212  Q
    |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54246055 agagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacattctttacacccacataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagata 54246154  T
Q  213 aagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatc 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  54246155 aagtgtggttgtgagatgaacttacaaaaatatc 54246188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 113 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 36150323 - 36150190
Alignment:
Q  113 agagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagata 212  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| ||| | |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  36150323 agagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccctttacatccacacaaaattctgacacgtggcaacctggactccacacaaatagaagata 36150224  T
Q  213 aagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatc 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36150223 aagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatc 36150190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 113 - 246
Target Start/End: Original strand, 42394326 - 42394459
Alignment:
Q  113 agagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagata 212  Q
    |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  42394326 agagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccctttacacccatacaaaattttgacacgtggcaatctggaccccacacaaatagaagata 42394425  T
Q  213 aagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatc 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42394426 aagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatc 42394459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 114 - 246
Target Start/End: Original strand, 53581766 - 53581898
Alignment:
Q  114 gagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataa 213  Q
    ||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53581766 gagtgatgatacctgtaccaccctatgtggcaatacaccctttacacccacacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataa 53581865  T
Q  214 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatc 246  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  53581866 agtgtggttgtgagatgaacttatcaaaatatc 53581898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 114 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 54237288 - 54237156
Alignment:
Q  114 gagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataa 213  Q
    ||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  54237288 gagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccctttacacccatacaatattctgacacgtggcaatctggaccccacacaaatagaagataa 54237189  T
Q  214 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatc 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54237188 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatc 54237156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 114 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 40809057 - 40808925
Alignment:
Q  114 gagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataa 213  Q
    ||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||| ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40809057 gagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccttttacatccacacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataa 40808958  T
Q  214 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatc 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40808957 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatc 40808925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 114 - 246
Target Start/End: Original strand, 24688310 - 24688442
Alignment:
Q  114 gagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataa 213  Q
    ||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||  ||||| |||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24688310 gagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacccccacacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacataaatagaagataa 24688409  T
Q  214 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatc 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24688410 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatc 24688442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 114 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 40480941 - 40480809
Alignment:
Q  114 gagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataa 213  Q
    ||||| ||||||||||| ||||  ||| |||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  40480941 gagtgatgatacatgtatcaccccatgcggcaatacaccctttacacccacacaaaattctgacacgtggcaacctggaccctacacaaatagaagataa 40480842  T
Q  214 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatc 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40480841 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatc 40480809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 114 - 246
Target Start/End: Original strand, 45126836 - 45126968
Alignment:
Q  114 gagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataa 213  Q
    |||||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| || |||||||||||| |||||||| ||||    
T  45126836 gagtggtgatacatgtaccactccatgtggcaatacaccctttacacccacataaaattctggcatgtggtaatctggaccccacataaatagaaaataa 45126935  T
Q  214 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatc 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45126936 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatc 45126968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 112 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 52630022 - 52629888
Alignment:
Q  112 tagagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagat 211  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| || ||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  52630022 tagagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccctttacacccacacaaaattctgacacgtagcaacctggaccctacataaatagaagat 52629923  T
Q  212 aaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatc 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  52629922 aaagtgtggttgtgagatgaacttacaaaaatatc 52629888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 113 - 246
Target Start/End: Original strand, 47190933 - 47191066
Alignment:
Q  113 agagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagata 212  Q
    |||||| ||||||||||||||    |||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  47190933 agagtgatgatacatgtaccattccatgtggcaatacaccctttacacccacacaaaattctgacatgtggtaacttggaccccacacaaatagaagata 47191032  T
Q  213 aagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatc 246  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  47191033 aagtgtggttgtgagatgaacttatcaaaatatc 47191066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 122 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 42100872 - 42100748
Alignment:
Q  122 atacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataaagtgtggt 221  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  42100872 atacatgtaccacctcatgtggcaatgcaccctttacacccacataaaattctgacacgtggcaacctgaactccacacaaataaaagataaaatgtggt 42100773  T
Q  222 tgtgagatgaacttaccaaaatatc 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  42100772 tgtgagatgaacttaccaaaatatc 42100748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 103 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 25413886 - 25413741
Alignment:
Q  103 tatatataat--agagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacac 200  Q
    ||||||||||  |||||| ||||||||||||||||  || || |||||||| ||||||||||| | |||| ||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  25413886 tatatataatccagagtgatgatacatgtaccaccccatatgacaatacaccctttacacccacacaaaactctgacacgtggtaacctggaccccacac 25413787  T
Q  201 aaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatc 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  25413786 aaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttacaaaaatatc 25413741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 114 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 27748746 - 27748623
Alignment:
Q  114 gagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataa 213  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||         | | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27748746 gagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacac---------cgacacaaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataa 27748656  T
Q  214 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatc 246  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  27748655 agtattgttgtgagatgaacttaccaaaatatc 27748623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 115 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 51249499 - 51249368
Alignment:
Q  115 agtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataaa 214  Q
    ||||||||||||||||   ||| || ||  ||||||| | |||||  |||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||    
T  51249499 agtggtgatacatgtatatcctcatatgataatacactccttacattcatacaaaattctgacatgtggcaatctggatcccacacaaatagaagagaaa 51249400  T
Q  215 gtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatc 246  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  51249399 gtgtggttgtgagatgaatttaccaaaatatc 51249368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 113 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 1078411 - 1078312
Alignment:
Q  113 agagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagata 212  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||| | |||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  1078411 agagtgatgatacatgtaccacctcatgtggcaatacaccctttacatccacacaaaattctgacacgtggcaacctgaactccacacaaatagaagata 1078312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 113 - 204
Target Start/End: Original strand, 29556866 - 29556956
Alignment:
Q  113 agagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaat 204  Q
    ||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  29556866 agagtggtgatacatgtaccactacatgtggcaatacacaatttacacccatataaaa-tctgacatgtggcaacctgaaccccacacaaat 29556956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 113 - 246
Target Start/End: Original strand, 11064629 - 11064762
Alignment:
Q  113 agagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagata 212  Q
    |||||||||||||||||||   ||| |||| |||||||| | ||||||||| | |||||| |||||||||| || || ||||||||||||||||||||      
T  11064629 agagtggtgatacatgtacactcttgtgtgacaatacaccccttacacccacacaaaattttgacatgtggtaatctagaccccacacaaatagaagagt 11064728  T
Q  213 aagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatc 246  Q
    ||||||| || ||||||||| | | |||||||||    
T  11064729 aagtgtgattatgagatgaattaatcaaaatatc 11064762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 167 - 246
Target Start/End: Original strand, 53273645 - 53273724
Alignment:
Q  167 aaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatc 246  Q
    |||||||||| | |||| |||||||| |||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  53273645 aaaattctgatacgtggtaacctggatcccacataaataaaagataaagtatggttgtgagatgaacttaccaaaatatc 53273724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 113 - 186
Target Start/End: Original strand, 4190172 - 4190245
Alignment:
Q  113 agagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaa 186  Q
    ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||   ||||||||| | ||||| ||||||||||||||    
T  4190172 agagtggtgatacatgtatacccttatgtggcaatacacctcttacacccacacaaaatcctgacatgtggcaa 4190245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 114 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 9434316 - 9434244
Alignment:
Q  114 gagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaa 186  Q
    ||||||||||||||||||   |  ||||||||||||||   ||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  9434316 gagtggtgatacatgtacactcccatgtggcaatacacctcttacacccacacaaaattctgacatgtggcaa 9434244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 117 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 19148957 - 19148882
Alignment:
Q  117 tggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctgga 192  Q
    |||||| ||||||||  ||  ||||||||||||||   ||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||    
T  19148957 tggtgacacatgtacacccccatgtggcaatacaccacttacacccacacaaaattctgacatatggcaacctgga 19148882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 134 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 45058632 - 45058584
Alignment:
Q  134 ccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtg 182  Q
    ||||| |||||||||||| ||| ||||||| |||||| |||||||||||    
T  45058632 ccttaggtggcaatacacccttgacacccacataaaaatctgacatgtg 45058584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 105; Significance: 1e-52; HSPs: 17)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 114 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 5489968 - 5489836
Alignment:
Q  114 gagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataa 213  Q
    ||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5489968 gagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccctttacacccacataaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatagaagataa 5489869  T
Q  214 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatc 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5489868 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatc 5489836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 114 - 246
Target Start/End: Original strand, 48498870 - 48499002
Alignment:
Q  114 gagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataa 213  Q
    ||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  48498870 gagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccctttacacccacataaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatagaagataa 48498969  T
Q  214 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatc 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48498970 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatc 48499002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 114 - 246
Target Start/End: Original strand, 23989431 - 23989563
Alignment:
Q  114 gagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataa 213  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23989431 gagtggtgatacatgtaccaccctatatggcaatacaccctttacacccacacaagattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataa 23989530  T
Q  214 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatc 246  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  23989531 agtgtggttgtgagataaatttaccaaaatatc 23989563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 114 - 246
Target Start/End: Original strand, 43570994 - 43571126
Alignment:
Q  114 gagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataa 213  Q
    ||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  43570994 gagtgatgatatatgtaccaccccatgtggcaatacaccctttacacccacataaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatagaagataa 43571093  T
Q  214 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatc 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43571094 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatc 43571126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 112 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 4401522 - 4401388
Alignment:
Q  112 tagagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagat 211  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| ||||||   |||||||||||||||||||||||    
T  4401522 tagagtgatgatacatgtaccaccctatgtggcaatacaccctttacacccacacaaaattctgacacgtggcatattggaccccacacaaatagaagat 4401423  T
Q  212 aaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatc 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4401422 aaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatc 4401388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 115 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 37814969 - 37814838
Alignment:
Q  115 agtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataaa 214  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  37814969 agtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccctttacatccatataaaattctgacacgtggcaatctggaccccacataaatagaagataaa 37814870  T
Q  215 gtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatc 246  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  37814869 gtgtggttgtgaaatgaatttaccaaaatatc 37814838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 108 - 246
Target Start/End: Original strand, 2497464 - 2497602
Alignment:
Q  108 ataatagagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaataga 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||| ||| ||||| |||||| |||||||    
T  2497464 ataatagagtggtgatacatgtaccacaccatgtggcaatacaccctttatacccacataaaattctgacacgtgacaatctggatcccacataaataga 2497563  T
Q  208 agataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatc 246  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2497564 tgataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatc 2497602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 113 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 7448018 - 7447885
Alignment:
Q  113 agagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagata 212  Q
    |||||| ||||||||||||||    |||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7448018 agagtgatgatacatgtaccattccatgtggcaatacaccctttacacccacacaaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatagaagata 7447919  T
Q  213 aagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatc 246  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  7447918 aagtgtggttgtgagatgaacttatcaaaatatc 7447885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 113 - 246
Target Start/End: Original strand, 24769406 - 24769539
Alignment:
Q  113 agagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagata 212  Q
    |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| ||| | |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24769406 agagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacactctttacatccacacaaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatagaagata 24769505  T
Q  213 aagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatc 246  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  24769506 aagtgtggttgtgataagaacttaccaaaatatc 24769539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 112 - 246
Target Start/End: Original strand, 50448166 - 50448300
Alignment:
Q  112 tagagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagat 211  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| |||||||| |||| |||||| |||||||||||    
T  50448166 tagagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccctttacacccacacaaaattctgacacgtggcaacatggaacccacaaaaatagaagat 50448265  T
Q  212 aaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatc 246  Q
    ||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  50448266 aaaatgtggttgtaagatgaacttacaaaaatatc 50448300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 113 - 246
Target Start/End: Original strand, 750212 - 750345
Alignment:
Q  113 agagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagata 212  Q
    |||||| |||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  750212 agagtgatgatacatgtaccatcccatgtggcaatacaccctttacacccacacaaaattctgacacgtggtaacatggaccccacacaaatagaagata 750311  T
Q  213 aagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatc 246  Q
    |||||||||| ||||||||| ||| |||||||||    
T  750312 aagtgtggttttgagatgaatttatcaaaatatc 750345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 110 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 4888238 - 4888103
Alignment:
Q  110 aatagagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaag 209  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||| |  ||||||| ||| | |||||||||| |  ||||||  ||||| ||||||||||||||     
T  4888238 aatagagtgatgatacatgtaccaccc-atgtggcaatatatcctttacatccacacaaaattctgatacatggcaatttggacaccacacaaatagaaa 4888140  T
Q  210 ataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatc 246  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4888139 ataaagtgtggttgtgagataaacttaccaaaatatc 4888103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 113 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 44112870 - 44112797
Alignment:
Q  113 agagtggtgatacatgtaccacctt-atgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaa 186  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||   ||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  44112870 agagtggtgatacatgtac-accttcatgtggcaatacacctcttacacccacacaaaattctgacatgtggcaa 44112797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 134 - 184
Target Start/End: Original strand, 47748463 - 47748513
Alignment:
Q  134 ccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggc 184  Q
    ||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  47748463 ccttaggtggcaatacacccttgacacccatataaaaatctgacatgtggc 47748513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 114 - 186
Target Start/End: Original strand, 35000021 - 35000093
Alignment:
Q  114 gagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaa 186  Q
    ||||||||||||||||||  ||  |||||||||||||    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  35000021 gagtggtgatacatgtacacccccatgtggcaatacatctcttacacccatacaaaatcctgacatgtggcaa 35000093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 113 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 35003487 - 35003414
Alignment:
Q  113 agagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaa 186  Q
    |||||||||||||||| ||  ||  ||||||||||||||   ||||||||| | ||||| ||||||||||||||    
T  35003487 agagtggtgatacatgcacacccccatgtggcaatacacctcttacacccacacaaaatcctgacatgtggcaa 35003414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 114 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 45706017 - 45705945
Alignment:
Q  114 gagtggtgatacatgtaccacctt-atgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaa 186  Q
    |||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||   ||||||||| | ||||| ||||||||||||||    
T  45706017 gagtggtgatacatgtac-acctccatgtggcaatacacctcttacacccacacaaaatcctgacatgtggcaa 45705945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0119 (Bit Score: 102; Significance: 9e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0119
Description:

Target: scaffold0119; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 113 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 878 - 745
Alignment:
Q  113 agagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagata 212  Q
    |||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  878 agagcggtgatatatgtaccacctcatgtggcaatacaccctttacacccacacaaaattctgacacgtggcaacctggactccacacaaatagaagata 779  T
Q  213 aagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatc 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  778 aagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatc 745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 102; Significance: 9e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 113 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 112848 - 112715
Alignment:
Q  113 agagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagata 212  Q
    |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  112848 agagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccctttacacccatacaaaattttgacacgtggcaatctggaccccacacaaatagaagata 112749  T
Q  213 aagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatc 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  112748 aagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatc 112715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 102; Significance: 9e-51; HSPs: 31)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 113 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 27550502 - 27550369
Alignment:
Q  113 agagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagata 212  Q
    |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27550502 agagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccctttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacataaatagaagata 27550403  T
Q  213 aagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatc 246  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27550402 aagtgtggttgtaagatgaacttaccaaaatatc 27550369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 114 - 246
Target Start/End: Original strand, 27893750 - 27893882
Alignment:
Q  114 gagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataa 213  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||    
T  27893750 gagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccctttacacccacataaaattctgacatgtggcaatcttgaccccacataaatagaagataa 27893849  T
Q  214 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatc 246  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27893850 agtgtggttgtgagatgaaattaccaaaatatc 27893882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 113 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 27864757 - 27864624
Alignment:
Q  113 agagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagata 212  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||| || ||| |||||||| |||||||| |||    
T  27864757 agagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccctttacatccacataaaattctgacatgtggtaatctgaaccccacataaatagaaaata 27864658  T
Q  213 aagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatc 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27864657 aagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatc 27864624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 113 - 246
Target Start/End: Original strand, 55966253 - 55966386
Alignment:
Q  113 agagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagata 212  Q
    ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||| || ||||||||| ||||||||||||    
T  55966253 agagtggtgatacatgtaccactccatgtggcaatacaccctttacacccacataaaattctgacaggtggcaatctagaccccacataaatagaagata 55966352  T
Q  213 aagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatc 246  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55966353 aattgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatc 55966386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 112 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 23036174 - 23036040
Alignment:
Q  112 tagagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagat 211  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| |||  ||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23036174 tagagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaacacatcctttacacccacacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacataaatagaagat 23036075  T
Q  212 aaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatc 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23036074 aaagtgtggttgtgagatgaacttacaaaaatatc 23036040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 114 - 244
Target Start/End: Original strand, 43514594 - 43514724
Alignment:
Q  114 gagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataa 213  Q
    ||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| ||| | |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  43514594 gagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacactctttacatccacaaaaaattctgacacgtggcaacctagaccccacacaaatagaagataa 43514693  T
Q  214 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaata 244  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43514694 ggtgtggttgtgagatgaacttaccaaaata 43514724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 113 - 246
Target Start/End: Original strand, 28982729 - 28982862
Alignment:
Q  113 agagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagata 212  Q
    |||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||| ||| | |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28982729 agagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccttttacatccacacaaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatagaagata 28982828  T
Q  213 aagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatc 246  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28982829 aagtgcggttgtgagatgaacttaccaaaatatc 28982862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 117 - 246
Target Start/End: Original strand, 48463361 - 48463490
Alignment:
Q  117 tggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataaagt 216  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||| |||||||| |||||||| |||||||    
T  48463361 tggtgatacatgtaccactctatgtggcaatacaccctttacacccacataaaattctgacatgtggtaatctgaaccccacataaatagaaaataaagt 48463460  T
Q  217 gtggttgtgagatgaacttaccaaaatatc 246  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||    
T  48463461 atggttgtgagatgaacttaccaaaatatc 48463490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 114 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 33703333 - 33703201
Alignment:
Q  114 gagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataa 213  Q
    ||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||    
T  33703333 gagtgatgatacatgtaccaccccatatggcaatacaccctttacacccacacaaaattctgacacgtggcaacttggatcccgcacaaatagaagataa 33703234  T
Q  214 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatc 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33703233 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatc 33703201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 114 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 35017924 - 35017792
Alignment:
Q  114 gagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataa 213  Q
    ||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||   |||||| ||| | |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  35017924 gagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacatcttttacatccacacaaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatagaagataa 35017825  T
Q  214 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatc 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35017824 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatc 35017792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 112 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 31681096 - 31680962
Alignment:
Q  112 tagagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagat 211  Q
    ||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||| ||||||| ||  |||||||| |||||||||||    
T  31681096 tagagtggtgatacatgtagcatcccatgtggcaatacaccctttacacctacataaaattctgacacgtggcaatctaaaccccacataaatagaagat 31680997  T
Q  212 aaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatc 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31680996 aaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatc 31680962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 113 - 246
Target Start/End: Original strand, 1771173 - 1771306
Alignment:
Q  113 agagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagata 212  Q
    |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||| | |||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  1771173 agagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccctttacacccacacaaaattctgagacgtggcaacttggaccccacataaatagaagata 1771272  T
Q  213 aagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatc 246  Q
    || ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1771273 aaatgtggttgtgagatgaacttatcaaaatatc 1771306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 114 - 246
Target Start/End: Original strand, 23204686 - 23204818
Alignment:
Q  114 gagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataa 213  Q
    ||||| ||||||| |||||| |  ||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23204686 gagtgatgatacacgtaccatcccatgtggcaatatatcctttacacccacataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacataaatagaagataa 23204785  T
Q  214 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatc 246  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  23204786 agtgtggttgtgacatgaacttacaaaaatatc 23204818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 114 - 246
Target Start/End: Original strand, 43949709 - 43949841
Alignment:
Q  114 gagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataa 213  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| ||||||   |||| ||| ||||||||||||||||    
T  43949709 gagtgatgatacatgtaccaccctatttggcaatacaccctttatacccatacaaaattctgacacgtggcatattggatcccgcacaaatagaagataa 43949808  T
Q  214 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatc 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43949809 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatc 43949841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 113 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 43735935 - 43735802
Alignment:
Q  113 agagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagata 212  Q
    |||||| ||||||||||||||||  | |||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||| ||| |||| |||| |||||||||||||||||||    
T  43735935 agagtgatgatacatgtaccaccccacgtggcaatacaccctttacatccacataaaattctgacacgtgacaacttggatcccacacaaatagaagata 43735836  T
Q  213 aagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatc 246  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  43735835 aagtgtgattgtgagatgaacttatcaaaatatc 43735802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 114 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 25051885 - 25051753
Alignment:
Q  114 gagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataa 213  Q
    ||||| ||||||||||||||||  | |||||||||||   |||||| ||| | |||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  25051885 gagtgatgatacatgtaccaccccacgtggcaatacatcatttacatccacacaaaattctgacacgtggcaacttggaccccacataaatagaagataa 25051786  T
Q  214 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatc 246  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  25051785 agtgtgattgtgagatgaacttaccaaaatatc 25051753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 114 - 246
Target Start/End: Original strand, 51512173 - 51512305
Alignment:
Q  114 gagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataa 213  Q
    ||||| ||||||||||||||||  | |||||||||||   || | ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  51512173 gagtgatgatacatgtaccaccccacgtggcaatacatctttaatacccacacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaataaaagataa 51512272  T
Q  214 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatc 246  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  51512273 agtgtggttataagatgaacttaccaaaatatc 51512305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 113 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 28988665 - 28988536
Alignment:
Q  113 agagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagata 212  Q
    |||||||||||||||||||  ||| ||||| |||||||| | |||| | |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  28988665 agagtggtgatacatgtacaccctcatgtgacaatacaccccttac-ctcatacaaaattctgacatatggcaacctggaccccacacaaatagaagaga 28988567  T
Q  213 aagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaat 243  Q
    |||||||||| ||||||||| ||| ||||||    
T  28988566 aagtgtggttatgagatgaatttatcaaaat 28988536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 112 - 243
Target Start/End: Original strand, 41327449 - 41327580
Alignment:
Q  112 tagagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagat 211  Q
    |||||| |||||||||||||  | | || ||||||||||| | |||||| || | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  41327449 tagagtagtgatacatgtacatcttaatctggcaatacaccccttacactcacaaaaaattctaacatgtggcaacctggaccccacacaaattgaagag 41327548  T
Q  212 aaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaat 243  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  41327549 aaagtgtggatgtgagatgaatttaccaaaat 41327580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 113 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 21687199 - 21687067
Alignment:
Q  113 agagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagata 212  Q
    |||||| ||||| |||||||| | ||||||||||||||  |||||||  || | |||||||||||| ||||||||||| || ||| ||||||||||||||    
T  21687199 agagtgatgatatatgtaccaacctatgtggcaatacattctttacattcacacaaaattctgacacgtggcaacctgaactccagacaaatagaagata 21687100  T
Q  213 aagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatat 245  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| |||||||    
T  21687099 aagtatggttatgagatgaacttactaaaatat 21687067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 138 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 39631269 - 39631161
Alignment:
Q  138 atgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttac 237  Q
    ||||| |||||||  ||||||||||| | |||||||||||| ||| ||   || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39631269 atgtgacaatacatcctttacacccacacaaaattctgacacgtgacatattgaaccccacacaaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttac 39631170  T
Q  238 caaaatatc 246  Q
    |||||||||    
T  39631169 caaaatatc 39631161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 120 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 12497142 - 12497016
Alignment:
Q  120 tgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataaagtgtg 219  Q
    ||||||||| ||||||  ||||| ||||||||  |||||||||| | |||||||| ||| |||||||  || ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12497142 tgatacatgcaccaccccatgtgacaatacacgttttacacccacacaaaattctaacacgtggcaaattgaacctcacacaaatagaagataaagtgtg 12497043  T
Q  220 gttgtgagatgaacttaccaaaatatc 246  Q
     |||| |||||||||||||||||||||    
T  12497042 attgtaagatgaacttaccaaaatatc 12497016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 111 - 246
Target Start/End: Original strand, 27316617 - 27316753
Alignment:
Q  111 atagagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaa-ttctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaag 209  Q
    |||||||| |||||||| || || |  ||||| |||||||| ||||||| ||| | |||| |||||||| |||||||| ||||| ||| | |||||||||    
T  27316617 atagagtgatgatacatttatcatcccatgtgacaatacaccctttacatccacacaaaaattctgacacgtggcaacttggactccaaataaatagaag 27316716  T
Q  210 ataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatc 246  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27316717 ataaagtgtggttatgagatgaacttaccaaaatatc 27316753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 118 - 246
Target Start/End: Original strand, 45490225 - 45490353
Alignment:
Q  118 ggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataaagtg 217  Q
    |||||||||||||  ||| |||||||||||| |   |||||||||| | || ||||||||| ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||    
T  45490225 ggtgatacatgtagtaccctatgtggcaatatatcatttacacccacacaagattctgacacgtggcaacctggatcccgtacaaatagaagataaagtg 45490324  T
Q  218 tggttgtgagatgaacttaccaaaatatc 246  Q
    ||||||||||||||| |||| ||| ||||    
T  45490325 tggttgtgagatgaatttactaaagtatc 45490353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 113 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 41878592 - 41878466
Alignment:
Q  113 agagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagata 212  Q
    |||||||||||||||||||||||| |       |||||| ||||||||| | | |||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  41878592 agagtggtgatacatgtaccacctga-------atacactctttacaccaacacaaaattctgacacgtgacaatctggaccccacacaaatagaagaga 41878500  T
Q  213 aagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatc 246  Q
    | || ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  41878499 aggtttggttgtgagatgaacttatcaaaatatc 41878466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 119 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 41848158 - 41848034
Alignment:
Q  119 gtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataaagtgt 218  Q
    |||||||||||||  ||  |||||||||||||| | ||||| |||   |||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  41848158 gtgatacatgtacacccccatgtggcaatacaccccttacatccacgcaaaattctgacatgtgacaatctgaaccccacacaaatagaagagaaagtgt 41848059  T
Q  219 ggttgtgagatgaacttaccaaaat 243  Q
    ||||||| |||||| || |||||||    
T  41848058 ggttgtgcgatgaatttgccaaaat 41848034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 112 - 246
Target Start/End: Original strand, 56215804 - 56215937
Alignment:
Q  112 tagagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagat 211  Q
    ||||||||||||||||||||  |   ||||||| ||||||   ||||||||| | ||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||| |||     
T  56215804 tagagtggtgatacatgtacaccaccatgtggccatacacctcttacacccacacaaaattctgacatatagcaacctagaccccacacaaatag-agag 56215902  T
Q  212 aaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatc 246  Q
    |||||||||||||||||| || || ||||||||||    
T  56215903 aaagtgtggttgtgagataaattttccaaaatatc 56215937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 126 - 246
Target Start/End: Original strand, 46412389 - 46412509
Alignment:
Q  126 atgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataaagtgtggttgtg 225  Q
    |||||||||| ||| || ||||| ||  |||||| | | | |||||||||||| |||||||  |  |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  46412389 atgtaccaccctatatgacaatatactttttacatctacacaaaattctgacacgtggcaatttaaaccccacataaatagaagataaagtgtggttgtg 46412488  T
Q  226 agatgaacttaccaaaatatc 246  Q
    ||| |||||||||||||||||    
T  46412489 agaagaacttaccaaaatatc 46412509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 113 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 19880147 - 19880074
Alignment:
Q  113 agagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaa 186  Q
    |||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||   ||||||||| | ||||| ||||||||||||||    
T  19880147 agagtggtgatacatgtacacccccatgtggcaatacacctcttacacccacacaaaatcctgacatgtggcaa 19880074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 114 - 186
Target Start/End: Original strand, 55272284 - 55272356
Alignment:
Q  114 gagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaa 186  Q
    ||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||   ||||||||| | ||||| ||||||||||||||    
T  55272284 gagtggtgatacatgtacacccccatgtggcaatacacctcttacacccacacaaaatcctgacatgtggcaa 55272356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 110 - 186
Target Start/End: Original strand, 3756156 - 3756232
Alignment:
Q  110 aatagagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacact-ttacacccatataaaattctgacatgtggcaa 186  Q
    ||||||||||||||||||||||   |  ||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||  |||||||||||||    
T  3756156 aatagagtggtgatacatgtacactcccatgtggcaataca-actcttacacccacataaaatcatgacatgtggcaa 3756232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 102; Significance: 9e-51; HSPs: 24)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 113 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 19047350 - 19047217
Alignment:
Q  113 agagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagata 212  Q
    |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19047350 agagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccctttacacccatacaaaattttgacacgtggcaatctggaccccacacaaatagaagata 19047251  T
Q  213 aagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatc 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19047250 aagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatc 19047217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 111 - 245
Target Start/End: Original strand, 4764631 - 4764765
Alignment:
Q  111 atagagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaaga 210  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| ||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4764631 atagagtgatgatacatgtaccacctcatgtggcaatacaccttttacatccacacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaaga 4764730  T
Q  211 taaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatat 245  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4764731 taaagtgtggttgtgagatgaatttaccaaaatat 4764765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 113 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 30838825 - 30838692
Alignment:
Q  113 agagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagata 212  Q
    |||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||||| | | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30838825 agagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccttttacacctacacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagata 30838726  T
Q  213 aagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatc 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30838725 aagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatc 30838692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 113 - 246
Target Start/End: Original strand, 43490308 - 43490441
Alignment:
Q  113 agagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagata 212  Q
    |||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  43490308 agagtgatgctacatgtaccacctcatgtggcaatacaccctttacacccatacaaaattctgacacgtggcaatctggaccccacataaatagaagata 43490407  T
Q  213 aagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatc 246  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  43490408 aagtgtggttatgagatgaacttaccaaaatatc 43490441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 102 - 246
Target Start/End: Original strand, 42849754 - 42849898
Alignment:
Q  102 atatatata-atagagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacac 200  Q
    ||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  42849754 atatatatatatatagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccctttacacccacacaaaattctgacacgtggcaacttggaccccacac 42849853  T
Q  201 aaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatc 246  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  42849854 aaatagaa-ataaagtgtggttgtgagatgaacttatcaaaatatc 42849898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 114 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 1750606 - 1750474
Alignment:
Q  114 gagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataa 213  Q
    ||||| |||||  |||||||||  ||||||||| |||| |||||||| || | |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  1750606 gagtgatgatatttgtaccaccccatgtggcaacacaccctttacactcacacaaaattctgacacgtggcaatctggaccccacacaaatagaagataa 1750507  T
Q  214 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatc 246  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1750506 agtgtggttgtgagatgaacttacaaaaatatc 1750474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 114 - 246
Target Start/End: Original strand, 43335671 - 43335803
Alignment:
Q  114 gagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataa 213  Q
    ||||| ||||||||||||||||  ||||||||||| ||  |||||| ||| | |||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  43335671 gagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatataccttttacatccacacaaaattctgacacgtggcaacctggatcccacataaatagaagataa 43335770  T
Q  214 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatc 246  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  43335771 agtgtagttgtgagatgaacttaccaaaatatc 43335803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 120 - 246
Target Start/End: Original strand, 12302167 - 12302293
Alignment:
Q  120 tgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataaagtgtg 219  Q
    ||||||||||| ||||  |||||||||||||  ||||||| ||| | ||||||||||||  ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12302167 tgatacatgtatcaccccatgtggcaatacatcctttacatccacacaaaattctgacacatggtaacctggaccccacataaatagaagataaagtgtg 12302266  T
Q  220 gttgtgagatgaacttaccaaaatatc 246  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||    
T  12302267 gttgtgagatgaacttacaaaaatatc 12302293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 114 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 16096940 - 16096807
Alignment:
Q  114 gagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctgga-ccccacacaaatagaagata 212  Q
    ||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| |||||||| | || ||||||| || |||||||||    
T  16096940 gagtgatgatacatgtaccacatcatgtggcaatacaccctttacacccacacaaaattctgacacgtggcaacttagacccccacataagtagaagata 16096841  T
Q  213 aagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatc 246  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  16096840 aagtgtggttgtgagattaactcaccaaaatatc 16096807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 147 - 246
Target Start/End: Original strand, 13780676 - 13780775
Alignment:
Q  147 tacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatc 246  Q
    ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  13780676 tacaccctttacacctatacaaaattctgacatgtggcaacctggaccccacataaatagaagagaaagtgtggttgtgagatgaatttatcaaaatatc 13780775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 113 - 243
Target Start/End: Original strand, 34817683 - 34817813
Alignment:
Q  113 agagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagata 212  Q
    |||||| ||||||||||||  ||  |||||||||| | | | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||| |    
T  34817683 agagtgatgatacatgtacacccccatgtggcaatgctccccttacacccatacaaaattctgacatgtggcaacctggatcccgtacaaatagaagaga 34817782  T
Q  213 aagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaat 243  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  34817783 aagtgtggttgtgagatgaatttaccaaaat 34817813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 138 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 42026937 - 42026829
Alignment:
Q  138 atgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttac 237  Q
    |||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| || |    
T  42026937 atgtggcaatacaccccttacacccacacaaaattctgacatcttgcaacctagaccccacacaaatagaaaagaaagtgtagttgtgagatgaatttgc 42026838  T
Q  238 caaaatatc 246  Q
    |||||||||    
T  42026837 caaaatatc 42026829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 167 - 245
Target Start/End: Original strand, 8896544 - 8896622
Alignment:
Q  167 aaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatat 245  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| | |||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  8896544 aaaattctgacatgtggcaacctgaacctcacacaaatagaaaagaaagtgtgattgtgagatgaatttaccaaaatat 8896622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 109 - 246
Target Start/End: Original strand, 39149197 - 39149332
Alignment:
Q  109 taatagagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaa 208  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||  |||||| |||||||  |||||||||| | |||||| ||| | |||| ||  | ||||| ||||||||| ||    
T  39149197 taatagagtgatgatacatgtaccaccc-atgtggtaatacaccttttacacccacacaaaattatgagacgtggtaatttagaccc-acacaaataaaa 39149294  T
Q  209 gataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatc 246  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  39149295 gataaagtgtagttgtgggatgaacttaccaaaatatc 39149332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 113 - 186
Target Start/End: Original strand, 34895648 - 34895721
Alignment:
Q  113 agagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaa 186  Q
    |||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||   ||||||||| | ||||| ||||||||||||||    
T  34895648 agagtggtgatacatgtacacccccatgtggcaatacacctcttacacccacacaaaatcctgacatgtggcaa 34895721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 114 - 186
Target Start/End: Original strand, 11825562 - 11825634
Alignment:
Q  114 gagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaa 186  Q
    ||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||   ||||||||| | ||||| ||||||||||||||    
T  11825562 gagtggtgatacatgtacatccccatgtggcaatacacctcttacacccacacaaaatcctgacatgtggcaa 11825634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 114 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 16804160 - 16804088
Alignment:
Q  114 gagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaa 186  Q
    ||||||||||||||||||  || ||| || ||||||||   ||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  16804160 gagtggtgatacatgtacacccctatatgacaatacacctcttacacccacacaaaattctgacatgtggcaa 16804088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 114 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 16843442 - 16843370
Alignment:
Q  114 gagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaa 186  Q
    ||||||||||||||||||  || ||| || ||||||||   ||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  16843442 gagtggtgatacatgtacacccctatatgacaatacacctcttacacccacacaaaattctgacatgtggcaa 16843370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 114 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 43114749 - 43114677
Alignment:
Q  114 gagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaa 186  Q
    ||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||   ||||||||| | ||||| |||||| |||||||    
T  43114749 gagtggtgatacatgtacaccctcatgtggcaatacacctcttacacccacacaaaatcctgacaagtggcaa 43114677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 113 - 186
Target Start/End: Original strand, 6518401 - 6518474
Alignment:
Q  113 agagtggtgatacatgtaccacctt-atgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaa 186  Q
    ||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||||||||  |||||||||| | ||||| ||||||||||||||    
T  6518401 agagtggtgatacatgtac-acctccatgtgtcaatacaccttttacacccacacaaaatcctgacatgtggcaa 6518474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 104 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 18491907 - 18491825
Alignment:
Q  104 atatataatagagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaa 186  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||   ||||||||| | ||||| || |||||||||||    
T  18491907 atataaaaaagagtggtgatacatgtacacccccatgtggcaatacacctcttacacccacacaaaatcctaacatgtggcaa 18491825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 114 - 186
Target Start/End: Original strand, 4299328 - 4299400
Alignment:
Q  114 gagtggtgatacatgtaccacctt-atgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaa 186  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    ||||||||| | ||||| ||||||||||||||    
T  4299328 gagtggtgatacatgta-caccttcatgtggcaatacatctcttacacccacacaaaatcctgacatgtggcaa 4299400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 113 - 186
Target Start/End: Original strand, 41281881 - 41281954
Alignment:
Q  113 agagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaa 186  Q
    |||||||||||||||||||  ||  || |||||||||||   ||||||||| | ||||| ||||||||||||||    
T  41281881 agagtggtgatacatgtacacccccatatggcaatacacctcttacacccacacaaaatcctgacatgtggcaa 41281954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 114 - 186
Target Start/End: Original strand, 966742 - 966814
Alignment:
Q  114 gagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaa 186  Q
    ||||||||||||||||||  ||  |||||| |||||||   ||||||||| | ||||| ||||||||||||||    
T  966742 gagtggtgatacatgtacatccccatgtggaaatacacctcttacacccacacaaaatcctgacatgtggcaa 966814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0187 (Bit Score: 89; Significance: 5e-43; HSPs: 2)
Name: scaffold0187
Description:

Target: scaffold0187; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 114 - 246
Target Start/End: Original strand, 14097 - 14228
Alignment:
Q  114 gagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataa 213  Q
    ||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| ||| | |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14097 gagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccctttacatccacacaaaattctgacacgtggcaacctgga-cccacacaaatagaagataa 14195  T
Q  214 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatc 246  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14196 agtgtggttgtgagatgaacttacaaaaatatc 14228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0187; HSP #2
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 114 - 246
Target Start/End: Original strand, 24425 - 24556
Alignment:
Q  114 gagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataa 213  Q
    ||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| ||| | |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24425 gagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccctttacatccacacaaaattctgacacgtggcaacctgga-cccacacaaatagaagataa 24523  T
Q  214 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatc 246  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24524 agtgtggttgtgagatgaacttacaaaaatatc 24556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0385 (Bit Score: 77; Significance: 7e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0385
Description:

Target: scaffold0385; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 114 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 11443 - 11311
Alignment:
Q  114 gagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataa 213  Q
    ||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||||  |||||||| | | |||||||||||| || ||||| |||||||||||  ||||||||||||    
T  11443 gagtgatgatacatgtaccatcccatgtggcaatacactatttacacctacacaaaattctgacacgtagcaacttggaccccacatcaatagaagataa 11344  T
Q  214 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatc 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11343 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatc 11311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0157 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0157
Description:

Target: scaffold0157; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 120 - 246
Target Start/End: Original strand, 23335 - 23461
Alignment:
Q  120 tgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataaagtgtg 219  Q
    ||||||||| ||||||  ||||| ||||||||  |||||||||| | |||||||| ||| |||||||  || ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23335 tgatacatgcaccaccccatgtgacaatacacgttttacacccacacaaaattctaacacgtggcaaattgaacctcacacaaatagaagataaagtgtg 23434  T
Q  220 gttgtgagatgaacttaccaaaatatc 246  Q
     |||| |||||||||||||||||||||    
T  23435 attgtaagatgaacttaccaaaatatc 23461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 113 - 186
Target Start/End: Original strand, 45626 - 45699
Alignment:
Q  113 agagtggtgatacatgtac-caccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaa 186  Q
    ||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||   ||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  45626 agagtggtgatacatgtacacaccc-atgtggcaatacacctcttacacccacataaaatcctgacatgtggcaa 45699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University