View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF17755_low_36 (Length: 379)

Name: NF17755_low_36
Description: NF17755
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF17755_low_36
NF17755_low_36
[»] chr3 (34 HSPs)
chr3 (11-379)||(16744007-16744377)
chr3 (22-345)||(13838905-13839232)
chr3 (11-272)||(17912483-17912744)
chr3 (11-345)||(14842487-14842824)
chr3 (11-345)||(2049810-2050147)
chr3 (11-345)||(12030073-12030410)
chr3 (11-298)||(15858996-15859287)
chr3 (107-272)||(2449238-2449404)
chr3 (10-282)||(51158008-51158282)
chr3 (210-378)||(19231982-19232154)
chr3 (11-265)||(15936634-15936890)
chr3 (14-265)||(15938476-15938729)
chr3 (226-345)||(19260749-19260869)
chr3 (140-272)||(13975722-13975853)
chr3 (140-272)||(45860937-45861068)
chr3 (140-272)||(13954890-13955021)
chr3 (15-260)||(15614838-15615085)
chr3 (11-238)||(16821139-16821369)
chr3 (314-378)||(3992873-3992938)
chr3 (311-379)||(15857129-15857198)
chr3 (11-120)||(47984650-47984759)
chr3 (11-120)||(48003224-48003333)
chr3 (314-378)||(55513193-55513258)
chr3 (140-260)||(55316351-55316471)
chr3 (314-378)||(2844514-2844579)
chr3 (11-120)||(47993937-47994046)
chr3 (11-120)||(48012510-48012619)
chr3 (140-260)||(41270207-41270327)
chr3 (314-368)||(17955861-17955916)
chr3 (314-374)||(45581954-45582016)
chr3 (314-378)||(54037991-54038056)
chr3 (314-378)||(7854305-7854370)
chr3 (215-256)||(14080715-14080756)
chr3 (11-128)||(12264932-12265049)
[»] chr8 (25 HSPs)
chr8 (11-272)||(22907214-22907476)
chr8 (10-345)||(16193643-16193980)
chr8 (11-378)||(16404867-16405235)
chr8 (22-345)||(24928716-24929043)
chr8 (11-345)||(43373392-43373731)
chr8 (107-272)||(5238184-5238350)
chr8 (107-272)||(24661248-24661414)
chr8 (107-272)||(43685643-43685809)
chr8 (22-272)||(17345581-17345832)
chr8 (15-260)||(6774258-6774505)
chr8 (15-260)||(24548986-24549233)
chr8 (140-238)||(21844594-21844692)
chr8 (140-238)||(21851987-21852085)
chr8 (314-378)||(274766-274831)
chr8 (314-378)||(641018-641083)
chr8 (314-378)||(826824-826889)
chr8 (314-378)||(24716729-24716794)
chr8 (140-260)||(30120854-30120974)
chr8 (140-260)||(16674392-16674512)
chr8 (28-122)||(23837214-23837308)
chr8 (215-256)||(23226076-23226117)
chr8 (11-197)||(222754-222943)
chr8 (11-197)||(736377-736566)
chr8 (11-197)||(860272-860461)
chr8 (314-378)||(39115598-39115663)
[»] chr4 (22 HSPs)
chr4 (11-272)||(26680201-26680463)
chr4 (11-378)||(54118135-54118507)
chr4 (140-345)||(122020-122226)
chr4 (11-345)||(13246430-13246769)
chr4 (11-345)||(15675009-15675352)
chr4 (107-272)||(10488659-10488825)
chr4 (107-272)||(16327926-16328092)
chr4 (11-245)||(31115629-31115865)
chr4 (75-345)||(10104170-10104449)
chr4 (140-272)||(13048221-13048353)
chr4 (210-345)||(33240901-33241043)
chr4 (11-238)||(10644219-10644449)
chr4 (11-109)||(111395-111493)
chr4 (314-378)||(25119074-25119139)
chr4 (11-260)||(47357654-47357906)
chr4 (75-256)||(40885570-40885753)
chr4 (28-122)||(41166083-41166177)
chr4 (314-378)||(5682395-5682460)
chr4 (11-56)||(10104449-10104494)
chr4 (35-122)||(15044851-15044938)
chr4 (10-122)||(52265645-52265758)
chr4 (58-122)||(13809647-13809711)
[»] scaffold0078 (2 HSPs)
scaffold0078 (11-272)||(37066-37328)
scaffold0078 (314-378)||(41632-41697)
[»] chr7 (25 HSPs)
chr7 (11-272)||(7293017-7293279)
chr7 (11-378)||(3059966-3060336)
chr7 (13-345)||(16211768-16212103)
chr7 (11-345)||(13036938-13037277)
chr7 (16-345)||(11580661-11580997)
chr7 (11-345)||(36052667-36053003)
chr7 (107-272)||(11516324-11516490)
chr7 (107-272)||(15441564-15441730)
chr7 (107-272)||(30262129-30262295)
chr7 (11-272)||(47481031-47481294)
chr7 (11-265)||(18253842-18254098)
chr7 (11-271)||(13321014-13321278)
chr7 (140-272)||(25292338-25292470)
chr7 (11-237)||(16478985-16479213)
chr7 (140-238)||(13572808-13572906)
chr7 (314-378)||(32493913-32493978)
chr7 (140-260)||(10989541-10989661)
chr7 (144-337)||(295900-296094)
chr7 (148-238)||(13911046-13911136)
chr7 (314-378)||(1936884-1936949)
chr7 (141-238)||(2437590-2437687)
chr7 (314-374)||(126738-126799)
chr7 (230-272)||(14113989-14114031)
chr7 (230-272)||(14423639-14423681)
chr7 (314-378)||(111136-111201)
[»] chr1 (18 HSPs)
chr1 (11-379)||(41394222-41394593)
chr1 (11-345)||(20445679-20446019)
chr1 (11-333)||(20531444-20531770)
chr1 (11-345)||(20931345-20931682)
chr1 (11-345)||(37844374-37844714)
chr1 (11-345)||(20893551-20893889)
chr1 (11-345)||(20913037-20913367)
chr1 (107-272)||(51452589-51452755)
chr1 (15-238)||(2116258-2116484)
chr1 (11-222)||(22227809-22228022)
chr1 (11-222)||(22232506-22232719)
chr1 (140-238)||(45051554-45051652)
chr1 (314-378)||(21860334-21860399)
chr1 (314-378)||(44034838-44034903)
chr1 (140-238)||(18601140-18601238)
chr1 (140-260)||(5072388-5072508)
chr1 (334-378)||(41218749-41218793)
chr1 (334-379)||(27675139-27675184)
[»] chr2 (22 HSPs)
chr2 (11-378)||(19794596-19794967)
chr2 (11-378)||(43642848-43643220)
chr2 (11-345)||(36982364-36982704)
chr2 (11-378)||(20627205-20627576)
chr2 (16-345)||(462743-463075)
chr2 (11-339)||(8891242-8891574)
chr2 (107-272)||(19689401-19689567)
chr2 (107-272)||(23820168-23820334)
chr2 (107-272)||(14906440-14906606)
chr2 (11-345)||(24341309-24341652)
chr2 (107-272)||(20015108-20015274)
chr2 (11-272)||(25265390-25265653)
chr2 (140-272)||(17396653-17396784)
chr2 (11-222)||(7507894-7508107)
chr2 (252-345)||(22863171-22863267)
chr2 (314-378)||(22275045-22275110)
chr2 (314-378)||(22284278-22284343)
chr2 (315-378)||(15633538-15633602)
chr2 (11-260)||(19886661-19886913)
chr2 (330-379)||(19660217-19660266)
chr2 (28-88)||(9636761-9636821)
chr2 (44-88)||(24884718-24884762)
[»] scaffold0266 (2 HSPs)
scaffold0266 (11-345)||(1124-1462)
scaffold0266 (13-345)||(3508-3843)
[»] scaffold0023 (2 HSPs)
scaffold0023 (11-345)||(48598-48935)
scaffold0023 (140-238)||(36225-36323)
[»] scaffold0077 (2 HSPs)
scaffold0077 (11-346)||(36836-37176)
scaffold0077 (334-378)||(15334-15378)
[»] scaffold0195 (2 HSPs)
scaffold0195 (11-337)||(19206-19537)
scaffold0195 (11-272)||(21290-21553)
[»] scaffold0001 (2 HSPs)
scaffold0001 (22-345)||(171916-172242)
scaffold0001 (22-345)||(177619-177945)
[»] chr5 (23 HSPs)
chr5 (11-345)||(23506965-23507302)
chr5 (11-345)||(27182471-27182810)
chr5 (11-345)||(18530988-18531330)
chr5 (107-272)||(20623066-20623232)
chr5 (107-272)||(21233528-21233694)
chr5 (11-345)||(22053753-22054096)
chr5 (110-272)||(37052844-37053007)
chr5 (107-272)||(16536294-16536460)
chr5 (107-270)||(25900408-25900571)
chr5 (22-272)||(34939289-34939540)
chr5 (140-260)||(29188284-29188404)
chr5 (142-238)||(27009975-27010071)
chr5 (11-238)||(4200007-4200237)
chr5 (11-260)||(22366481-22366733)
chr5 (11-260)||(25426628-25426880)
chr5 (11-238)||(18778014-18778244)
chr5 (140-238)||(43443417-43443515)
chr5 (11-260)||(12374-12626)
chr5 (140-260)||(19500031-19500151)
chr5 (11-260)||(21073595-21073847)
chr5 (11-122)||(23493917-23494029)
chr5 (58-122)||(7728466-7728530)
chr5 (334-378)||(11584394-11584438)
[»] scaffold0106 (1 HSPs)
scaffold0106 (15-345)||(41733-42066)
[»] scaffold0175 (1 HSPs)
scaffold0175 (11-345)||(882-1218)
[»] chr6 (18 HSPs)
chr6 (22-345)||(23153458-23153786)
chr6 (15-301)||(14626089-14626377)
chr6 (11-272)||(35009439-35009702)
chr6 (22-272)||(1657748-1657999)
chr6 (22-272)||(15862484-15862734)
chr6 (15-260)||(1650105-1650352)
chr6 (277-345)||(23148266-23148335)
chr6 (314-378)||(19983159-19983224)
chr6 (11-232)||(25175563-25175787)
chr6 (314-378)||(35015024-35015089)
chr6 (11-114)||(27740838-27740941)
chr6 (189-272)||(27751605-27751688)
chr6 (11-260)||(27653983-27654235)
chr6 (28-121)||(18381821-18381914)
chr6 (75-272)||(29665937-29666137)
chr6 (314-378)||(18583640-18583705)
chr6 (11-98)||(22361926-22362014)
chr6 (58-122)||(25367374-25367438)
[»] scaffold0302 (1 HSPs)
scaffold0302 (11-345)||(12115-12450)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (17-345)||(272031-272362)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (22-345)||(247366-247694)
[»] scaffold0008 (2 HSPs)
scaffold0008 (11-345)||(128095-128431)
scaffold0008 (148-238)||(31697-31787)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (11-345)||(5990-6326)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (140-333)||(51121-51314)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (11-336)||(4996-5324)
[»] scaffold0162 (2 HSPs)
scaffold0162 (11-345)||(26340-26678)
scaffold0162 (11-272)||(8180-8440)
[»] scaffold0141 (2 HSPs)
scaffold0141 (107-272)||(26892-27058)
scaffold0141 (107-265)||(22637-22796)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (107-272)||(1582-1748)
[»] scaffold0011 (1 HSPs)
scaffold0011 (11-345)||(123087-123427)
[»] scaffold0498 (1 HSPs)
scaffold0498 (11-345)||(8878-9215)
[»] scaffold0025 (3 HSPs)
scaffold0025 (11-334)||(8849-9180)
scaffold0025 (11-304)||(148721-149018)
scaffold0025 (252-345)||(146844-146938)
[»] scaffold0028 (2 HSPs)
scaffold0028 (140-345)||(89378-89586)
scaffold0028 (221-345)||(107708-107835)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (11-265)||(48187-48443)
[»] scaffold0132 (2 HSPs)
scaffold0132 (11-272)||(13506-13769)
scaffold0132 (314-378)||(42677-42739)
[»] scaffold0026 (3 HSPs)
scaffold0026 (11-265)||(107747-108003)
scaffold0026 (140-203)||(64585-64648)
scaffold0026 (215-257)||(89863-89905)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (11-272)||(41648-41911)
[»] scaffold1542 (1 HSPs)
scaffold1542 (11-272)||(534-797)
[»] scaffold0772 (1 HSPs)
scaffold0772 (140-265)||(5660-5785)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (11-272)||(34460-34724)
[»] scaffold0215 (2 HSPs)
scaffold0215 (15-238)||(9371-9596)
scaffold0215 (15-238)||(16269-16494)
[»] scaffold0529 (1 HSPs)
scaffold0529 (15-261)||(2966-3215)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (11-222)||(5254-5466)
[»] scaffold0420 (1 HSPs)
scaffold0420 (140-238)||(13347-13445)
[»] scaffold0116 (1 HSPs)
scaffold0116 (140-238)||(167-265)
[»] scaffold0622 (1 HSPs)
scaffold0622 (11-109)||(9382-9480)
[»] scaffold0369 (1 HSPs)
scaffold0369 (11-222)||(3722-3936)
[»] scaffold0076 (1 HSPs)
scaffold0076 (11-237)||(42997-43226)
[»] scaffold0139 (2 HSPs)
scaffold0139 (140-238)||(14083-14181)
scaffold0139 (143-238)||(21138-21233)
[»] scaffold0034 (1 HSPs)
scaffold0034 (314-378)||(80187-80252)
[»] scaffold1711 (1 HSPs)
scaffold1711 (140-260)||(1304-1424)
[»] scaffold0066 (1 HSPs)
scaffold0066 (11-222)||(54416-54630)
[»] scaffold0016 (2 HSPs)
scaffold0016 (313-378)||(162045-162111)
scaffold0016 (313-378)||(166131-166197)
[»] scaffold0686 (2 HSPs)
scaffold0686 (314-378)||(5744-5809)
scaffold0686 (314-378)||(5950-6015)
[»] scaffold0184 (1 HSPs)
scaffold0184 (314-378)||(31147-31212)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (313-378)||(319-385)
[»] scaffold0361 (2 HSPs)
scaffold0361 (189-272)||(3370-3453)
scaffold0361 (13-65)||(3210-3262)
[»] scaffold0104 (1 HSPs)
scaffold0104 (11-100)||(48514-48603)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (35-122)||(197390-197477)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (11-88)||(104793-104871)
[»] scaffold0970 (1 HSPs)
scaffold0970 (28-89)||(2471-2532)
[»] scaffold0456 (2 HSPs)
scaffold0456 (215-256)||(1546-1587)
scaffold0456 (215-256)||(8691-8732)
[»] scaffold0123 (1 HSPs)
scaffold0123 (215-256)||(8216-8257)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (147-265)||(56106-56226)
[»] scaffold0058 (1 HSPs)
scaffold0058 (215-256)||(70307-70348)
[»] scaffold1164 (1 HSPs)
scaffold1164 (334-378)||(1721-1765)
[»] scaffold0876 (1 HSPs)
scaffold0876 (334-378)||(114-158)
[»] scaffold0700 (1 HSPs)
scaffold0700 (35-99)||(2548-2612)
[»] scaffold0122 (1 HSPs)
scaffold0122 (334-378)||(19817-19861)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 291; Significance: 1e-163; HSPs: 34)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 11 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 16744377 - 16744007
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 110  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16744377 catcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactacaacatttattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 16744278  T
Q  111 caactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttatt 209  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  16744277 caactataacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcatttttacatatttaaaaatgtaatttaaccaacaatcatacacttatt 16744178  T
Q  210 atcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaat 309  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16744177 atcaattcatggatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttaacaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaat 16744078  T
Q  310 gatgatgattatggtaaagactaacc-ccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcacttta 379  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16744077 gatgatgattatggtaaagactaacctcgttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttta 16744007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 22 - 345
Target Start/End: Original strand, 13838905 - 13839232
Alignment:
Q  22 catgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaaca 121  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||| || | | ||||||||||| |||||||||||| |||||| |||| |||||     
T  13838905 catgaatatgcatacccaaacaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatccaaccacaact 13839004  T
Q  122 tgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcat 219  Q
    |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| | | ||||| |||||| ||| | |||| |||||||||| |||| ||||||||||    
T  13839005 tagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccatcaatcatacaattatcatcaattcat 13839104  T
Q  220 gcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaa-ttcacaaaatgatgatgat 318  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13839105 gcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattattcataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttcacaaaatgatgatgat 13839204  T
Q  319 tatggtaaagactaa-ccccttacctta 345  Q
    |||| | |||||||| ||||||||||||    
T  13839205 tatgatgaagactaacccccttacctta 13839232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 11 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 17912744 - 17912483
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 110  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||| |  |||||||||||| |||||||| |||| || ||| |||||| |||| ||| ||||||||||||||||    
T  17912744 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataacatcgattgaacatgaatcatagctcaatt 17912645  T
Q  111 caactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttatt 209  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||| ||||     
T  17912644 caactacaacatatcaaattcatcaattttgcacaattttcataacttttcatttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatc 17912545  T
Q  210 atcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 272  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  17912544 atcaattcatgcatacaaacatatcatc-aagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 17912483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 11 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 14842824 - 14842487
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 110  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||| | || |||||||||  | |||||| |||| |||| | ||||||||||| |||||||||| | ||||| |    
T  14842824 catcatcaatccatgaatatgcaaacccaatcaattattcatcaatcataacatcaattaacatccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat 14842725  T
Q  111 caactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttat 208  Q
     ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||||||||| |||||| |||| |||| |||||| ||| | ||||||||||||||| ||||    
T  14842724 taacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcataacttatcatttttacacatttgaacatgcaatttcaccaacaatcatacaattat 14842625  T
Q  209 tatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaa 308  Q
      |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||  ||||     
T  14842624 cttcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataatcacaattcatacaacatttgagaatttgcaaag 14842525  T
Q  309 tgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttacctta 345  Q
    ||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  14842524 tgaagatgattatgataaagactaacccccttacctta 14842487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 11 - 345
Target Start/End: Original strand, 2049810 - 2050147
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 110  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||| | ||||||||||||| |||||||| |||| || | | | ||||||||| |||| ||||| | ||||| |    
T  2049810 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccatagcatcaattgaacaaaaatcaaatctcaaat 2049909  T
Q  111 caactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttat 208  Q
     ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| || || |||| | ||||||||| |||||| ||| | |||||||||| |||| ||||    
T  2049910 taacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaagttatcatgtttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaattat 2050009  T
Q  209 tatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaa 308  Q
     ||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  2050010 catcaattcaggcatacaaacatatcgtcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataagcaaaattgatacaacatttgaaatttcacaaaa 2050109  T
Q  309 tgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttacctta 345  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  2050110 tgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 2050147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 11 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 12030410 - 12030073
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 110  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||| | ||||||||||||| | |||||| |||| || | | | ||||||||| |||||||||| |  |||| |    
T  12030410 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccataacatcaattaacaaccatagcatcaattgaacaagaatcaaatatcaaat 12030311  T
Q  111 caactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttat 208  Q
     ||| | ||| |  |||| |||| | |||  |||||| ||||| ||||| ||| || ||||||||| |||||| ||| | |||||||||| |||| ||||    
T  12030310 taacaataacttagcaaaattcaccaattgagcacaactttcacaacttatcacttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaattat 12030211  T
Q  209 tatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaa 308  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  12030210 catcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataagcaaaagtcatacaacatttgaaatttcacaaaa 12030111  T
Q  309 tgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttacctta 345  Q
    |||||||||||||| ||| || ||| ||||||||||||    
T  12030110 tgatgatgattatgataatgattaacccccttacctta 12030073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 11 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 15859287 - 15858996
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 110  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||| | ||||||||||||| |||||||| |||| || | | ||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  15859287 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatt 15859188  T
Q  111 caactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttat 208  Q
    |||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| | ||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| ||||    
T  15859187 caacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat 15859088  T
Q  209 tatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaa 298  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||   ||||||||||||||| ||||||    
T  15859087 catcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacaattgaaa 15858996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 107 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 2449404 - 2449238
Alignment:
Q  107 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact 205  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| |    
T  2449404 aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat 2449305  T
Q  206 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 272  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  2449304 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 2449238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 10 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 51158282 - 51158008
Alignment:
Q  10 acatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaat 109  Q
    ||||| ||||| |||||||||| |||||||| | ||||||||||||| |||||||| |||| || | | ||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  51158282 acatcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaat 51158183  T
Q  110 tcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacactta 207  Q
      ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| |||    
T  51158182 ctaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 51158083  T
Q  208 ttatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataatcaaaatt 282  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  51158082 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataagcaaaatt 51158008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 210 - 378
Target Start/End: Original strand, 19231982 - 19232154
Alignment:
Q  210 atcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaa-ttcacaa 306  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||   ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19231982 atcaattcatgaatataaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaatttcacaa 19232081  T
Q  307 aatgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcacttt 378  Q
    |||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  19232082 aatgatgatgattaagataaagactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctaacttcacttt 19232154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 11 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 15936890 - 15936634
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 110  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||  | || |||||||||  |||||||| |||| |||| | ||||||||||| |||||||||| | ||||| |    
T  15936890 catcatcaatccatgaatatgcatactcaggcaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat 15936791  T
Q  111 caactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttat 208  Q
     ||| ||||| | ||||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| |||| |||| |||||| ||| | ||||||||||||||| ||||    
T  15936790 taacaacaacttatcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacacatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat 15936691  T
Q  209 tatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaat 265  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||| ||||||    
T  15936690 catcaattcatgcatacaaacatatcattacagttggagcacgaatttagtaacaat 15936634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 14 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 15938729 - 15938476
Alignment:
Q  14 catcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaa 113  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||  | || |||||||||  |||||||| |||| |||| | ||||||||||| |||||||||| | ||||| | ||    
T  15938729 catcaatccatgaatatgcatactcaggcaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaa 15938630  T
Q  114 ctacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattat 211  Q
    | ||||| | ||||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| |||| |||| |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||    
T  15938629 caacaacttatcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacacatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcat 15938530  T
Q  212 caattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaat 265  Q
    |||||||||  |||||||||||||| | |||||||||||  |||||| ||||||    
T  15938529 caattcatgattacaaacatatcattacagttggagcacgtatttagtaacaat 15938476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 226 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 19260869 - 19260749
Alignment:
Q  226 aaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggta 325  Q
    ||||||||||||| | || |||||| |||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||    
T  19260869 aaacatatcatcataattagagcacgaatttagcaacaattatccataaaaaaaattcatacaacatttgaaaacttacaaaatgatgatgattatgata 19260770  T
Q  326 aagactaa-ccccttacctta 345  Q
    |||||||| ||||||||||||    
T  19260769 aagactaacccccttacctta 19260749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 140 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 13975853 - 13975722
Alignment:
Q  140 gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaa 239  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| ||| |||||||||||| |||   ||||||||||||||| | || | |||||||||||||| |||||||||||||    
T  13975853 gcacaatattcataacttatcatttttacttatttaaacatgtaattccaccaacaatcatacaatcatcaacaattcatgcatac-aacatatcatcaa 13975755  T
Q  240 agttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 272  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  13975754 agttggagcacgaatttagcaacaattatccat 13975722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 140 - 272
Target Start/End: Original strand, 45860937 - 45861068
Alignment:
Q  140 gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaa 239  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| ||| |||||||||||| |||   ||||||||||||||| | || | |||||||||||||| |||||||||||||    
T  45860937 gcacaatattcataacttatcatttttacttatttaaacatgtaattccaccaacaatcatacaatcatcaacaattcatgcatac-aacatatcatcaa 45861035  T
Q  240 agttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 272  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  45861036 agttggagcacgaatttagcaacaattatccat 45861068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 140 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 13955021 - 13954890
Alignment:
Q  140 gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaa 239  Q
    ||||||| |||||||||  |||||| ||| |||||||||||| |||   ||||||||||||||| | || | |||||||||||||||| |||||||||||    
T  13955021 gcacaatattcataactgatcatttttacttatttaaacatgtaattccaccaacaatcatacaatcatcaacaattcatgcatacaa-catatcatcaa 13954923  T
Q  240 agttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 272  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  13954922 agttggagcacgaatttagcaacaattatccat 13954890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 15 - 260
Target Start/End: Original strand, 15614838 - 15615085
Alignment:
Q  15 atcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaac 114  Q
    |||||| |||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| || | | |||||||||||  ||||||||| | | ||| | |||    
T  15614838 atcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacaaccataacatcaattgagcaagaatcaaatcccaaattaac 15614937  T
Q  115 tacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatc 212  Q
     | ||| |  |||| |||| | |||  |||| || |||| ||||| |||||| ||||||||| |||||| ||| | |||||||||| |||| |||| |||    
T  15614938 aataacttagcaaaattcaccaattgagcaccatattcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcctacaattatcatc 15615037  T
Q  213 aattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagca 260  Q
    |||||||||||||||| ||| || || |||  |||||||||| |||||    
T  15615038 aattcatgcatacaaatataacaccacagtaagagcacaaatctagca 15615085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 11 - 238
Target Start/End: Original strand, 16821139 - 16821369
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 110  Q
    |||||| |||||||||||||| | |||||| | || |||||||||  | || ||| | || |||  | ||||||||||| ||| |||||| | ||||| |    
T  16821139 catcattaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat 16821238  T
Q  111 caactacaacat--gtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacactta 207  Q
    |||| ||||| |  |  ||||||| | |||| |||||||  ||||| |||  ||||| ||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| |||    
T  16821239 caacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcatagcttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 16821338  T
Q  208 ttatcaattcatgcatacaaacatatcatca 238  Q
    | ||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  16821339 tcatcaatttatgcatacaaacataacatca 16821369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 314 - 378
Target Start/End: Original strand, 3992873 - 3992938
Alignment:
Q  314 atgattatggtaaagactaacccc-ttaccttaattatctccaactactagctctagcttcacttt 378  Q
    ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3992873 atgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttt 3992938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 311 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 15857198 - 15857129
Alignment:
Q  311 atgatgattatggtaaagactaacccc-ttaccttaattatctccaactactagctctagcttcacttta 379  Q
    |||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  15857198 atgatgattatgatgaagactaacccccttaccttaattatctccaagtattagctctagcttcacttta 15857129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 11 - 120
Target Start/End: Original strand, 47984650 - 47984759
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 110  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||   ||||||||||||| |||||||| |||| || ||| ||||||||||| ||| |||||| | ||||||     
T  47984650 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagtcatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaaaaacatcaattgaacatgaatcacatctcaatc 47984749  T
Q  111 caactacaac 120  Q
    |||| |||||    
T  47984750 caacaacaac 47984759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 11 - 120
Target Start/End: Original strand, 48003224 - 48003333
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 110  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||   ||||||||||||| |||||||| |||| || ||| ||||||||||| ||| |||||| | ||||||     
T  48003224 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagtcatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaaaaacatcaattgaacatgaatcacatctcaatc 48003323  T
Q  111 caactacaac 120  Q
    |||| |||||    
T  48003324 caacaacaac 48003333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 314 - 378
Target Start/End: Original strand, 55513193 - 55513258
Alignment:
Q  314 atgattatggtaaagactaacccc-ttaccttaattatctccaactactagctctagcttcacttt 378  Q
    ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  55513193 atgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttt 55513258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 140 - 260
Target Start/End: Original strand, 55316351 - 55316471
Alignment:
Q  140 gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaa 239  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| | |||||| ||| | |||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||| |||||     
T  55316351 gcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcac 55316450  T
Q  240 agttggagcacaaatttagca 260  Q
    ||   |||||| |||||||||    
T  55316451 agcaagagcacgaatttagca 55316471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 314 - 378
Target Start/End: Original strand, 2844514 - 2844579
Alignment:
Q  314 atgattatggtaaagactaacccc-ttaccttaattatctccaactactagctctagcttcacttt 378  Q
    ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  2844514 atgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctcaaactattagctctagcttcacttt 2844579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 11 - 120
Target Start/End: Original strand, 47993937 - 47994046
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 110  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||   ||||||||||||| |||| ||| |||| || ||| ||||||||||| ||| |||||| | ||||||     
T  47993937 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagtcatgattcatcaacaacaaaatcaattaacaacaaaaacatcaattgaacatgaatcacatctcaatc 47994036  T
Q  111 caactacaac 120  Q
    |||| |||||    
T  47994037 caacaacaac 47994046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 11 - 120
Target Start/End: Original strand, 48012510 - 48012619
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 110  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||   ||||||||||||| |||| ||| |||| || ||| ||||||||||| ||| |||||| | ||||||     
T  48012510 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagtcatgattcatcaacaacaaaatcaattaacaacaaaaacatcaattgaacatgaatcacatctcaatc 48012609  T
Q  111 caactacaac 120  Q
    |||| |||||    
T  48012610 caacaacaac 48012619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 140 - 260
Target Start/End: Original strand, 41270207 - 41270327
Alignment:
Q  140 gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaa 239  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| | |||||| |||   |||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||| |||||     
T  41270207 gcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaattccaccaacaatcatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcac 41270306  T
Q  240 agttggagcacaaatttagca 260  Q
    ||   |||||| |||||||||    
T  41270307 agcaagagcacgaatttagca 41270327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 314 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 17955916 - 17955861
Alignment:
Q  314 atgattatggtaaagactaacccc-ttaccttaattatctccaactactagctcta 368  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17955916 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactattagctcta 17955861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 314 - 374
Target Start/End: Original strand, 45581954 - 45582016
Alignment:
Q  314 atgattatggtaaagactaacccc--ttaccttaattatctccaactactagctctagcttca 374  Q
    ||||||||| |||| |||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  45581954 atgattatgataaaaactaaccccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttca 45582016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 314 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 54038056 - 54037991
Alignment:
Q  314 atgattatggtaaagactaacccc-ttaccttaattatctccaactactagctctagcttcacttt 378  Q
    ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||    
T  54038056 atgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatcaccaactattagctcaagcttcacttt 54037991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 314 - 378
Target Start/End: Original strand, 7854305 - 7854370
Alignment:
Q  314 atgattatggtaaagactaacccc-ttaccttaattatctccaactactagctctagcttcacttt 378  Q
    ||||||||| | || ||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||    
T  7854305 atgattatgatgaaaactaacccccttaccttaattatcaccaactattagctcaagcttcacttt 7854370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 215 - 256
Target Start/End: Original strand, 14080715 - 14080756
Alignment:
Q  215 ttcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaattt 256  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  14080715 ttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaattt 14080756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 12265049 - 12264932
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 110  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||   || ||||| | || ||||||||  |||  | ||||||||||||| | ||| |||||| | |||| ||    
T  12265049 catcatcaatccataattatgtatacccaagtcataattcacccacaacaacatcagttaatagcaacaacatcaatggaacatgaatcacatctcattt 12264950  T
Q  111 caactacaacatgtcaaa 128  Q
    |||| ||||||| |||||    
T  12264949 caacaacaacatatcaaa 12264932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 215; Significance: 1e-118; HSPs: 25)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 11 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 22907476 - 22907214
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22907476 catcatcaatccatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 22907377  T
Q  111 caactacaacatgtcaaattcatcca-tttgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttatt 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||    
T  22907376 caactacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattatt 22907277  T
Q  210 atcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 272  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  22907276 atcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 22907214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 10 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 16193980 - 16193643
Alignment:
Q  10 acatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaat 109  Q
    ||||| ||||| |||||||||| |||||||| | ||||||||||||| |||||||| |||| || | | ||||||||||| |||||||||| | |||||     
T  16193980 acatcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaa 16193881  T
Q  110 tcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacactta 207  Q
    | ||| ||||  || |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||| ||| |  |||||||||||||| |||    
T  16193880 ttaacaacaatttggcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttccccaacaatcatacaatta 16193781  T
Q  208 ttatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaattcacaaa 307  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||    
T  16193780 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataagcaaaattcatacaatatttgaaaatttaccaa 16193681  T
Q  308 atgatgatgattatggtaaagactaaccccttacctta 345  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16193680 atgatgatgattatgataaagactaaccccttacctta 16193643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 11 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 16405235 - 16404867
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 110  Q
    |||||||||| ||||||| || |||||||| |  |||||||||||||| |||||| |||| || ||| ||||||||||| ||||||||||||  ||||||    
T  16405235 catcatcaattcatgaatttgcatacccaagcagtgattcatcaactaaaacatcaattaacaacaataacatcaattgaacaagaatcatatgtcaatt 16405136  T
Q  111 caactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttat 208  Q
     |||   ||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| |||||  ||||| | | ||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| ||||    
T  16405135 taac---aacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttaacatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat 16405039  T
Q  209 tatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaattcacaa 306  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||| |||||| ||   ||||||||||||||||||||||||| || |    
T  16405038 catcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaataattatccatcatgcaaaaattcatacaacatttgaaaatttac-a 16404940  T
Q  307 aatgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcacttt 378  Q
    ||| |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16404939 aataatgatgattatgatgaagactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttt 16404867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 22 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 24929043 - 24928716
Alignment:
Q  22 catgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaaca 121  Q
    |||||||||| |||||||| | ||||||||||||  |||||||| |||| || | | ||| ||||||| ||||||  |||| |||||| |||| |||||     
T  24929043 catgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaatcacaacatcaattaacaaccataacctcaattgaacaagagacataactcaatccaaccacaact 24928944  T
Q  122 tgtc-aaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcat 219  Q
    |  | ||||||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| | | ||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  24928943 tagcgaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcat 24928844  T
Q  220 gcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaa-ttcacaaaatgatgatgat 318  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  24928843 gcatacaaacatataatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttcacaaaatgacgatgat 24928744  T
Q  319 tatggtaaagactaacccc-ttacctta 345  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||    
T  24928743 tatgataaagactaaccccattacctta 24928716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 11 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 43373731 - 43373392
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 110  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||| | || |||||||||| |||||||| |||| || | | | ||||||||| |||||||||| | ||||| |    
T  43373731 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaaccacaacatcaattaacaaccatagcatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat 43373632  T
Q  111 caactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttat 208  Q
     ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||| | ||||    
T  43373631 taacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatataattat 43373532  T
Q  209 tatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaattcacaa 306  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||  ||| |||||| ||   |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  43373531 catcaattcatgcatacaaacgtatcatcacagttggagcacgaatttagcattaattatccattatacaaaaattcatacaacatttgaaatttcacaa 43373432  T
Q  307 aatgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttacctta 345  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  43373431 aatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 43373392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 107 - 272
Target Start/End: Original strand, 5238184 - 5238350
Alignment:
Q  107 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact 205  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |    
T  5238184 aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat 5238283  T
Q  206 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 272  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  5238284 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 5238350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 107 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 24661414 - 24661248
Alignment:
Q  107 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact 205  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |    
T  24661414 aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat 24661315  T
Q  206 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 272  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  24661314 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 24661248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 107 - 272
Target Start/End: Original strand, 43685643 - 43685809
Alignment:
Q  107 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact 205  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |    
T  43685643 aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat 43685742  T
Q  206 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 272  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  43685743 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 43685809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 22 - 272
Target Start/End: Original strand, 17345581 - 17345832
Alignment:
Q  22 catgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaaca 121  Q
    |||||||||| |||||||| |  |||||||||||| |||||||| |||| || ||| || ||||| || |||||||||||| ||||||||| | | |||     
T  17345581 catgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataatatcaactgaacaagaatcataactcaattca-caataact 17345679  T
Q  122 tgtcaaattc-atccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcat 219  Q
    |  |||| || ||| |||  ||||||||||||||||||| ||||| |||||| || ||||||  || | ||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  17345680 tagcaaaatccatcaattgagcacaattttcataacttcacatttttacataattgaacatgtgatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcat 17345779  T
Q  220 gcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 272  Q
    ||||| ||||||| ||||| |||| |||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  17345780 gcatataaacataacatcacagttagagcacgaatttcgcaacaattatccat 17345832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 15 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 6774505 - 6774258
Alignment:
Q  15 atcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaac 114  Q
    |||||| |||||||||| |||||||| |  |||||||||||| |||||||| | || || ||| |||||||||||  ||||||||| | ||||| | |||    
T  6774505 atcaattcatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaataacatcaattgagcaagaatcaaatctcaaattaac 6774406  T
Q  115 tacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatc 212  Q
     | ||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| |||    
T  6774405 aataacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatc 6774306  T
Q  213 aattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagca 260  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||  |||||| ||| |||||    
T  6774305 aattcatgcatacaaacataacatcacagtaagagcacgaatctagca 6774258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 15 - 260
Target Start/End: Original strand, 24548986 - 24549233
Alignment:
Q  15 atcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaac 114  Q
    |||||| |||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| || | | |||||||||||  ||||||||| | | ||| | |||    
T  24548986 atcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacaaccataacatcaattgagcaagaatcaaatcccaaattaac 24549085  T
Q  115 tacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatc 212  Q
     | ||| |  |||| |||| | |||  |||| ||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| |||    
T  24549086 aataacttagcaaaattcaccaattgagcaccattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatc 24549185  T
Q  213 aattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagca 260  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||  |||||| ||| |||||    
T  24549186 aattcatgcatacaaacataacatcacagtaagagcacgaatctagca 24549233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 140 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 21844692 - 21844594
Alignment:
Q  140 gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca 238  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21844692 gcacaatattcataacttatcatttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatcatcatcaattcatgcatacaaacataacatca 21844594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 140 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 21852085 - 21851987
Alignment:
Q  140 gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca 238  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||  ||| | ||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21852085 gcacaatattcataacttatcatttttacatatttaaacatttaatttcaccaacaatcatacaatcatcatcaattcatgcatacaaacataacatca 21851987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 314 - 378
Target Start/End: Original strand, 274766 - 274831
Alignment:
Q  314 atgattatggtaaagactaacccc-ttaccttaattatctccaactactagctctagcttcacttt 378  Q
    ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  274766 atgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttt 274831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 314 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 641083 - 641018
Alignment:
Q  314 atgattatggtaaagactaacccc-ttaccttaattatctccaactactagctctagcttcacttt 378  Q
    ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  641083 atgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttt 641018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 314 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 826889 - 826824
Alignment:
Q  314 atgattatggtaaagactaacccc-ttaccttaattatctccaactactagctctagcttcacttt 378  Q
    ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  826889 atgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttt 826824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 314 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 24716794 - 24716729
Alignment:
Q  314 atgattatggtaaagactaacccc-ttaccttaattatctccaactactagctctagcttcacttt 378  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  24716794 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatcaccaactattagctctagcttcacttt 24716729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 140 - 260
Target Start/End: Original strand, 30120854 - 30120974
Alignment:
Q  140 gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaa 239  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| | |||||| ||| | |||||||||||||||  ||  || |||||||||||||||||||| |||||     
T  30120854 gcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacataaattcatgcatacaaacataacatcac 30120953  T
Q  240 agttggagcacaaatttagca 260  Q
    ||   |||||| |||||||||    
T  30120954 agcaagagcacgaatttagca 30120974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 140 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 16674512 - 16674392
Alignment:
Q  140 gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaa 239  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| | |||||| ||| | |||||||||||||||  ||  || |||||||||||| ||||||| |||||     
T  16674512 gcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacataaattcatgcataaaaacataacatcac 16674413  T
Q  240 agttggagcacaaatttagca 260  Q
    ||   |||||| |||||||||    
T  16674412 agaaagagcacgaatttagca 16674392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 28 - 122
Target Start/End: Original strand, 23837214 - 23837308
Alignment:
Q  28 tatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat 122  Q
    |||| |||||||| | |||| |||||||| ||||||||  |||||| ||||||||||||||| ||| || || || | ||||||||| |||||||    
T  23837214 tatgaatacccaagccatgaatcatcaacaacaacatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgactcttaccacaattcaacaacaacat 23837308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 215 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 23226117 - 23226076
Alignment:
Q  215 ttcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaattt 256  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  23226117 ttcatgcatacaaacatatcatcatagttagagcacaaattt 23226076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 222943 - 222754
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 110  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| | || |||||||||  | || ||| | || |||  | ||||||| ||| |||||||||| | ||||| |    
T  222943 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 222844  T
Q  111 caactacaac--atgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaat 197  Q
     ||| |||||  | |  ||||||| | |||| ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| | |||||| ||| | |||||||||    
T  222843 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaat 222754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 736566 - 736377
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 110  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| | || |||||||||  | || ||| | || |||  | ||||||| ||| |||||||||| | ||||| |    
T  736566 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 736467  T
Q  111 caactacaac--atgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaat 197  Q
     ||| |||||  | |  ||||||| | |||| ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| | |||||| ||| | |||||||||    
T  736466 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaat 736377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 860461 - 860272
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 110  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| | || |||||||||  | || ||| | || |||  | ||||||| ||| |||||||||| | ||||| |    
T  860461 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 860362  T
Q  111 caactacaac--atgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaat 197  Q
     ||| |||||  | |  ||||||| | |||| ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| | |||||| ||| | |||||||||    
T  860361 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaat 860272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 314 - 378
Target Start/End: Original strand, 39115598 - 39115663
Alignment:
Q  314 atgattatggtaaagactaac-cccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcacttt 378  Q
    ||||||||| | || |||||| ||||||||||||||||  ||||||| |||||| |||||||||||    
T  39115598 atgattatgatgaaaactaacacccttaccttaattattaccaactattagctcaagcttcacttt 39115663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 215; Significance: 1e-118; HSPs: 22)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 11 - 272
Target Start/End: Original strand, 26680201 - 26680463
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26680201 catcatcaatccatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 26680300  T
Q  111 caactacaacatgtcaaattcatcca-tttgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttatt 209  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||    
T  26680301 caactacaacatgtcaaattcatctattttgcacaattttcataacttttcatttttacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattatt 26680400  T
Q  210 atcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 272  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  26680401 atcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 26680463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 11 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 54118507 - 54118135
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 110  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||| | ||||||||||||| |||||||| |||| || | | ||||||||||| |||||||||||| || |||     
T  54118507 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaactataacatcaattgaacaagaatcataactaaatc 54118408  T
Q  111 caactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttat 208  Q
     ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| ||| || | | ||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| ||||    
T  54118407 taacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcaattgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat 54118308  T
Q  209 tatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaattcacaa 306  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||| |||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54118307 catcaattcatgcatacaaacatatcatcacaattggagcacgaatttagcaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaattcacaa 54118208  T
Q  307 aatgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcacttt 378  Q
    ||| |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  54118207 aataatgatgattatgatgaagactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttt 54118135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 140 - 345
Target Start/End: Original strand, 122020 - 122226
Alignment:
Q  140 gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaa 239  Q
    |||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||| ||| | |||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  122020 gcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcac 122119  T
Q  240 agttggagcacaaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaa-cccct 338  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  122120 agttggagcacaaatttagcaacaattatccataagcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaatcccct 122219  T
Q  339 tacctta 345  Q
    |||||||    
T  122220 tacctta 122226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 11 - 345
Target Start/End: Original strand, 13246430 - 13246769
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 110  Q
    |||| ||||| |||||||||| |||||||| | ||||||||||||| |||||||| |||| || | | ||||||||||| |||||||||||| ||||||     
T  13246430 catcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatc 13246529  T
Q  111 caactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttat 208  Q
     ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| | | ||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| ||||    
T  13246530 taacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat 13246629  T
Q  209 tatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaattcacaa 306  Q
     || |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| ||||||| |||||| ||   ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13246630 cattaattcatgcatacaaacatatcatcacagttgtagcacgaatttaacaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaatttacaa 13246729  T
Q  307 aatgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttacctta 345  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  13246730 aatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 13246769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 11 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 15675352 - 15675009
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 110  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||| |||| || ||| ||||||||||| ||| |||||||| |||||||    
T  15675352 catcatcaattcatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataacatcaattgaacatgaatcatatctcaatt 15675253  T
Q  111 caactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttat 208  Q
    |||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| |||||| ||||| |||||| || |||||| ||| | ||||||||||||||| ||||    
T  15675252 caacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat 15675153  T
Q  209 tatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatcca--taatcaaaattcatacaacatttgaaaattcacaa 306  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||  ||   ||||||||||| ||||||||||| |  |||    
T  15675152 catcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccaattatgaaaaattcataccacatttgaaaaattgcaa 15675053  T
Q  307 a----atgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttacctta 345  Q
    |    ||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||    
T  15675052 aaatgatgatgatgattatgatgaagactaacccccttacctta 15675009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 107 - 272
Target Start/End: Original strand, 10488659 - 10488825
Alignment:
Q  107 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact 205  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| |    
T  10488659 aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat 10488758  T
Q  206 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 272  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  10488759 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 10488825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 107 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 16328092 - 16327926
Alignment:
Q  107 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact 205  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| |    
T  16328092 aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat 16327993  T
Q  206 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 272  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  16327992 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 16327926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 11 - 245
Target Start/End: Original strand, 31115629 - 31115865
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 110  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||| |||| || ||| ||||||||||| ||| |||||||| |||||||    
T  31115629 catcatcaattcatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataacatcaattgaacatgaatcatatctcaatt 31115728  T
Q  111 caactacaacat-gtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttat 208  Q
    |||| ||||| | |  ||||||| | |||  ||| |||||||| |||||| ||||| |||||| |  |||||| ||| | ||||||||||||||| ||||    
T  31115729 caacaacaacttaggaaaattcaccaattgagcataattttcacaacttcacatttttacataatggaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat 31115828  T
Q  209 tatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttgg 245  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31115829 catcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttgg 31115865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 75 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 10104449 - 10104170
Alignment:
Q  75 caacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatat 172  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| |||||| ||||| ||||||     
T  10104449 caacaacatcaattgaacatgaatcatatctcaattcaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataa 10104350  T
Q  173 ttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatcca- 271  Q
    || |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||| |||||     
T  10104349 ttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacggatttagcaacaattatccaa 10104250  T
Q  272 -taatcaaaattcatacaacatttgaaaattcacaaa----atgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttacctta 345  Q
     ||   ||||||||||| ||||||||||| |   |||    ||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||    
T  10104249 ttatgaaaaattcataccacatttgaaaaattgtaaaaatgatgatgatgattatgatgaagactaacccccttacctta 10104170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 140 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 13048353 - 13048221
Alignment:
Q  140 gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaa 239  Q
    ||||||| |||||||||| || ||| |||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||  |    
T  13048353 gcacaatattcataacttatcctttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatcatcatcaaatcatgcatacaaacatatcattga 13048254  T
Q  240 agttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 272  Q
    ||||||||||  |||||||||||||| ||||||    
T  13048253 agttggagcatgaatttagcaacaattatccat 13048221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 210 - 345
Target Start/End: Original strand, 33240901 - 33241043
Alignment:
Q  210 atcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatcca--taatcaaaattcatacaacatttgaaaattcacaaa 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||  ||   ||||||||||| ||||||||||| |  ||||    
T  33240901 atcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccaattatgaaaaattcataccacatttgaaaaattgcaaa 33241000  T
Q  308 ----atgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttacctta 345  Q
        ||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||    
T  33241001 aatgatgatgatgattatgatgaagactaacccccttacctta 33241043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 11 - 238
Target Start/End: Original strand, 10644219 - 10644449
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 110  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||| | || |||||||||  | || ||| | || |||  | ||||||||||| ||| |||||| | ||||| |    
T  10644219 catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat 10644318  T
Q  111 caactacaacat--gtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacactta 207  Q
    |||| ||||| |  |  ||||||| | |||| |||||||  |||||||||  ||||| ||||||||| |||||| ||| | || |||||||||||| |||    
T  10644319 caacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcactaacaatcatacaatta 10644418  T
Q  208 ttatcaattcatgcatacaaacatatcatca 238  Q
    | ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10644419 tcatcaattcatgcatacaaacataacatca 10644449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 11 - 109
Target Start/End: Original strand, 111395 - 111493
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaat 109  Q
    |||| ||||| |||||||||| |||||||| | ||||||||||||| |||||||| |||| || | | ||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  111395 catcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattgaacaagaatcataactcaat 111493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 314 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 25119139 - 25119074
Alignment:
Q  314 atgattatggtaaagactaac-cccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcacttt 378  Q
    ||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25119139 atgattatgataaaaactaactcccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttt 25119074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 11 - 260
Target Start/End: Original strand, 47357654 - 47357906
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 110  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||| | || |||||||||  | || ||| | || |||  | ||||||| ||| |||||||||| | ||||| |    
T  47357654 catcatcaatccatgaatatacatacccaatcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 47357753  T
Q  111 caactacaacat--gtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacactta 207  Q
     ||| ||||| |  |  ||||||| | |||| ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| | |||||| ||| | ||||||||| |||||  ||    
T  47357754 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 47357853  T
Q  208 ttatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagca 260  Q
      |||||| |||||||||||||||| ||||| ||   |||||| |||||||||    
T  47357854 acatcaatccatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 47357906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 75 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 40885753 - 40885570
Alignment:
Q  75 caacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacata- 171  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| | ||| |  |||| |||| | |||  ||| ||||| ||||||||  ||||| ||||||     
T  40885753 caacaacatcaattgaacatgaatcatatctcaattcaacaataacttagcaaagttcaccaattgagcataattt-cataacttgacatttatacatac 40885655  T
Q  172 tttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaattt 256  Q
    ||| |||||| ||| | |||||||| ||| || |||| | ||||||||||||||||||||| || || |||||||| || |||||    
T  40885654 tttgaacatgtaatttcaccaacaaacattcaattatcaccaattcatgcatacaaacatagcaccacagttggagtacgaattt 40885570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 28 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 41166177 - 41166083
Alignment:
Q  28 tatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat 122  Q
    |||| |||||||| | ||||||||||||| ||||||||  |||||| ||||||||||||||| ||| || || |  | ||||||||| |||||||    
T  41166177 tatgaatacccaagccatgattcatcaacaacaacatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgactcttgccacaattcaacaacaacat 41166083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 314 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 5682460 - 5682395
Alignment:
Q  314 atgattatggtaaagactaaccc-cttaccttaattatctccaactactagctctagcttcacttt 378  Q
    ||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||  ||||||||||    
T  5682460 atgattatgataaaaactaacccacttaccttaattatcaccaactattagctcatgcttcacttt 5682395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 11 - 56
Target Start/End: Complemental strand, 10104494 - 10104449
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaac 56  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  10104494 catcatcaattcatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaac 10104449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 35 - 122
Target Start/End: Original strand, 15044851 - 15044938
Alignment:
Q  35 acccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat 122  Q
    |||||| | |||| |||||| | ||||||||  |||||| ||||||||||||||| ||| ||||| || | ||||||||| |||||||    
T  15044851 acccaagccatgaatcatcatcaacaacatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatcttatcacaattcaacaacaacat 15044938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 10 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 52265758 - 52265645
Alignment:
Q  10 acatcatcaatccatgaat-atgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaa 108  Q
    ||||||||||  ||||||| ||| | |||||| | |||| ||||||||  ||| |||  |||||| ||||||||||||||| ||| ||||| || | |||    
T  52265758 acatcatcaaatcatgaattatgaacacccaagccatgaatcatcaacatcaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatcttatcacaa 52265659  T
Q  109 ttcaactacaacat 122  Q
    |||||| |||||||    
T  52265658 ttcaacaacaacat 52265645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 58 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 13809711 - 13809647
Alignment:
Q  58 acaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat 122  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||  || ||||| || | ||||||||| |||||||    
T  13809711 acaacatcaattagcaacaacaacatcaattgatcatgaatcttatcacaattcaacaacaacat 13809647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 207; Significance: 1e-113; HSPs: 2)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 11 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 37328 - 37066
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  37328 catcatcaatccatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatc 37229  T
Q  111 caactacaacatgtcaaattcatcca-tttgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttatt 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||    
T  37228 caactacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattatt 37129  T
Q  210 atcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 272  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  37128 atcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 37066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 314 - 378
Target Start/End: Original strand, 41632 - 41697
Alignment:
Q  314 atgattatggtaaagactaacccc-ttaccttaattatctccaactactagctctagcttcacttt 378  Q
    |||||| || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  41632 atgattgtgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttt 41697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 207; Significance: 1e-113; HSPs: 25)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 11 - 272
Target Start/End: Original strand, 7293017 - 7293279
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7293017 catcatcaatccatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 7293116  T
Q  111 caactacaacatgtcaaattcatcca-tttgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttatt 209  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||    
T  7293117 caacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattatt 7293216  T
Q  210 atcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 272  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  7293217 attaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 7293279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 11 - 378
Target Start/End: Original strand, 3059966 - 3060336
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 110  Q
    |||| ||||| |||||||||| |||||||| | ||||||||||||| |||||||| |||| ||   | ||||||||||| |||||||||||| ||||||     
T  3059966 catcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagtcataacatcaattgaacaagaatcataactcaatc 3060065  T
Q  111 caactacaacatgtcaaa-ttcatccatttg--cacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacactta 207  Q
     ||| ||||| |  |||| |||| |||||||  || |||||||| || || |||||| ||||||||| |||||| ||| | ||||||| |  |||| |||    
T  3060066 taacaacaacttaacaaaattca-ccatttgagcataattttcacaatttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacagtattacaatta 3060164  T
Q  208 ttatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaattcacaaa 307  Q
    | ||||||| ||||||||||| |||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  3060165 tcatcaattaatgcatacaaatatattatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataagcaaaattcatataacatttgaaaatttacaaa 3060264  T
Q  308 atgatgatgattatggtaaagac-taaccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcacttt 378  Q
    ||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3060265 atgatgatgattatgataaagacttacccccttaccttcattatctccaactattagctctagcttcacttt 3060336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 13 - 345
Target Start/End: Original strand, 16211768 - 16212103
Alignment:
Q  13 tcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattca 112  Q
    |||| ||| |||||||||| |||||||| | |||| |||||||| |||||||| |||| || | | ||||||||||  |||||||||| | ||||| | |    
T  16211768 tcattaattcatgaatatgcatacccaagcaatgaatcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatttaacaagaatcaaatctcaaatta 16211867  T
Q  113 actacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttatta 210  Q
    || ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||| ||| | || ||||||| |||| |||| |    
T  16211868 acaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgcaatttcacaaacaatcttacaattatca 16211967  T
Q  211 tcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatg 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16211968 tcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattgtccataagcaaaattcatacaacatttgaaatttcacaaaatg 16212067  T
Q  311 atgatgattatggtaaagactaa-ccccttacctta 345  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  16212068 atgatgattatgataaagactaacccccttacctta 16212103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 11 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 13037277 - 13036938
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 110  Q
    |||| ||||| |||||||||| |||||||| | ||||||||||||| |||||||| ||||  ||  | ||||| ||||| |||||||||||| ||||||     
T  13037277 catcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaatattcataacattaattgaacaagaatcataactcaatc 13037178  T
Q  111 caactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttat 208  Q
     ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| | | ||||| |||||| ||| | | ||||||||||||| ||||    
T  13037177 taacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgcaatttcatcaacaatcatacaattat 13037078  T
Q  209 tatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaattcacaa 306  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||   ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13037077 catcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaatttacaa 13036978  T
Q  307 aatgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttacctta 345  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  13036977 aatgatgatgattatggtgaagactaacccccttacctta 13036938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 16 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 11580997 - 11580661
Alignment:
Q  16 tcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaact 115  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||| |||| || | | ||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||     
T  11580997 tcaattcatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatctaaca 11580898  T
Q  116 acaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatca 213  Q
    ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| | | ||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||    
T  11580897 acaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatca 11580798  T
Q  214 attcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataat---caaaattcatacaacatttgaaaattcac-aaaat 309  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||| ||| |||||| ||    ||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  11580797 attcatgcatacaaacatattatcacagttggagcacgaatttagcaataattatccattatgcaaaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaaat 11580698  T
Q  310 gatgatgattatggtaaagactaa-ccccttacctta 345  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  11580697 gatgatgattatgataaagactaatccccttacctta 11580661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 11 - 345
Target Start/End: Original strand, 36052667 - 36053003
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 110  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||| | || |||||||||| |||||||| |||| || | ||||||||||||| |||||||||| | ||||| |    
T  36052667 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaaccacaacatcaattaacaaccacaacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat 36052766  T
Q  111 caactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttat 208  Q
     |||   ||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||| | ||||    
T  36052767 taac---aacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaattttaccaacaatcatataattat 36052863  T
Q  209 tatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaattcacaa 306  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| | ||||||||||||||| |||||| ||   |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  36052864 catcaattcatgcatacaaacgtatcatcacagttggagtataaatttagcaacaattatccattatacaaaaattcatacaacatttgaaatttcacaa 36052963  T
Q  307 aatgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttacctta 345  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  36052964 aatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 36053003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 107 - 272
Target Start/End: Original strand, 11516324 - 11516490
Alignment:
Q  107 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact 205  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |    
T  11516324 aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat 11516423  T
Q  206 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 272  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  11516424 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 11516490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 107 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 15441730 - 15441564
Alignment:
Q  107 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact 205  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |    
T  15441730 aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat 15441631  T
Q  206 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 272  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  15441630 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 15441564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 107 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 30262295 - 30262129
Alignment:
Q  107 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact 205  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |    
T  30262295 aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat 30262196  T
Q  206 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 272  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  30262195 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 30262129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 11 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 47481294 - 47481031
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 110  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||| | ||||||||||||| | |||||| ||||  | | | ||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  47481294 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaacaaaaacatcaattaagagcgataacatcaattgaacaagaatcataactcaatt 47481195  T
Q  111 caactacaacatgtcaaa-ttcatccatttg--cacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacactta 207  Q
    |||| ||||| |  |||| |||| ||| |||  ||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||| ||| | || |||||||||||| |||    
T  47481194 caacaacaacttagcaaaattca-ccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcactaacaatcatacaatta 47481096  T
Q  208 ttatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 272  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||||||||||| ||||||    
T  47481095 tcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagttagagcacgaatttagcaacaattatccat 47481031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 11 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 18254098 - 18253842
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 110  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||  | || |||||||||  |||||||| |||| |||| | ||||||||||| |||||||||| | ||||| |    
T  18254098 catcatcaatccatgaatatgcatactcaggcaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat 18253999  T
Q  111 caactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttat 208  Q
     ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| |||| |||| |||||| ||| | ||||||||||||||| ||||    
T  18253998 taacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacacatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat 18253899  T
Q  209 tatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaat 265  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||| ||||||    
T  18253898 catcaattcatgcatacaaacatatcattacagttggagcacgaatttagtaacaat 18253842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 11 - 271
Target Start/End: Original strand, 13321014 - 13321278
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 110  Q
    |||||||||| ||||||| || | ||||||   ||||||||||||| |||||||| |||| || ||| ||||||||||| ||| |||||||| |||||||    
T  13321014 catcatcaattcatgaatgtgcaaacccaagtcatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataacatcaattgaacatgaatcatatctcaatt 13321113  T
Q  111 caacta-caacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattt--aaacatggaatctaaccaacaatcatacact 205  Q
    |||| | |||| |  |||| |||| | |||  ||||||||| ||||||||  ||||| |||||| ||  ||||||| ||| | ||||||||||||||| |    
T  13321114 caacaatcaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattt-cataacttgacatttatacatactttgaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaat 13321212  T
Q  206 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatcca 271  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||||||||||| |||||    
T  13321213 tatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagttagagcacgaatttagcaacaattatcca 13321278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 140 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 25292470 - 25292338
Alignment:
Q  140 gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaa 239  Q
    ||||||| |||||| ||| || ||| |||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||| | || | |||||||| |||||||||||||||||||    
T  25292470 gcacaatattcatagcttatcctttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatcatcaacaattcatacatacaaacatatcatcaa 25292371  T
Q  240 agttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 272  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25292370 agttggagcacaaatttagcaacaattatccat 25292338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 11 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 16479213 - 16478985
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 110  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||| |||||||| | || || ||| |||||||||||  ||||||||| | ||||| |    
T  16479213 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaataacatcaattgagcaagaatcaaatctcaaat 16479114  T
Q  111 caactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttat 208  Q
     ||  | ||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| ||||    
T  16479113 taaaaataacttaacaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat 16479014  T
Q  209 tatcaattcatgcatacaaacatatcatc 237  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16479013 catcaattcatgcatacaaacataacatc 16478985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 140 - 238
Target Start/End: Original strand, 13572808 - 13572906
Alignment:
Q  140 gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca 238  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||| | ||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13572808 gcacaatattcataacttatcatttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcacacaatcatcatcaattcatgcatacaaacataacatca 13572906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 314 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 32493978 - 32493913
Alignment:
Q  314 atgattatggtaaagactaacccc-ttaccttaattatctccaactactagctctagcttcacttt 378  Q
    ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  32493978 atgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttt 32493913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 140 - 260
Target Start/End: Original strand, 10989541 - 10989661
Alignment:
Q  140 gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaa 239  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| | |||||| ||| | |||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||| |||||     
T  10989541 gcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcac 10989640  T
Q  240 agttggagcacaaatttagca 260  Q
    ||   |||||| |||||||||    
T  10989641 agcaagagcacgaatttagca 10989661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 144 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 296094 - 295900
Alignment:
Q  144 aattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagtt 243  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||| || |||||| ||| | |||||||||||||   |||| ||| ||||||||| ||||||||| || |  | ||    
T  296094 aatttttataacttctcatttttacataattcaacatgaaatttcaccaacaatcataacattatcatcgattcatgcacacaaacataacacctcaatt 295995  T
Q  244 ggagcacaaatttagcaacaatcatccataat-caaaa-ttcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaacccc 337  Q
     || ||| |||||||||||||| || ||| || ||||| |||||||||  ||||||||| || ||||||||||  |||||| | ||||| ||||||    
T  295994 agaacacgaatttagcaacaattattcattatgcaaaatttcatacaaagtttgaaaatgca-aaaatgatgagaattatgttgaagacaaacccc 295900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 13911136 - 13911046
Alignment:
Q  148 ttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca 238  Q
    |||||||||| |||||| | ||||| | |||||| ||| | ||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13911136 ttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattaacatcaattcatgcatacaaacataacatca 13911046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 314 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 1936949 - 1936884
Alignment:
Q  314 atgattatggtaaagactaacc-ccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcacttt 378  Q
    ||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  1936949 atgattatgataaaaactaacctccttaccttaattatctccaactattaactctagcttcacttt 1936884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 141 - 238
Target Start/End: Original strand, 2437590 - 2437687
Alignment:
Q  141 cacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca 238  Q
    |||||| |||||||||| |||||| | ||||| | |||||| ||| | |||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2437590 cacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatca 2437687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 314 - 374
Target Start/End: Original strand, 126738 - 126799
Alignment:
Q  314 atgattatggtaaagactaacccc-ttaccttaattatctccaactactagctctagcttca 374  Q
    ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  126738 atgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctaacttca 126799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 230 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 14114031 - 14113989
Alignment:
Q  230 atatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 272  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  14114031 atatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 14113989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 230 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 14423681 - 14423639
Alignment:
Q  230 atatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 272  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  14423681 atatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 14423639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 314 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 111201 - 111136
Alignment:
Q  314 atgattatggtaaagactaacccc-ttaccttaattatctccaactactagctctagcttcacttt 378  Q
    ||||||||| | || ||||||||| |||||||||||||| ||||||  |||||| |||||||||||    
T  111201 atgattatgatgaaaactaacccccttaccttaattatcaccaacttttagctcaagcttcacttt 111136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 184; Significance: 2e-99; HSPs: 18)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 11 - 379
Target Start/End: Original strand, 41394222 - 41394593
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 110  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||| |||||||| | || || ||| |||||||||||  ||||||||| | |||||      
T  41394222 catcatcaatccatgaatatgcatacccaatcagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaataacatcaattgagcaagaatcaaatctcaaca 41394321  T
Q  111 caactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttat 208  Q
     ||| | ||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||| ||  | ||||||||||||||| ||||    
T  41394322 taacaataacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaacttcaccaacaatcatacaattat 41394421  T
Q  209 tatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaa 308  Q
     ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  41394422 catcaatttatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaa 41394521  T
Q  309 tgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcacttta 379  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  41394522 tgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttta 41394593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 11 - 345
Target Start/End: Original strand, 20445679 - 20446019
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 110  Q
    |||| ||||| |||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| || | | |||||||||||  ||||||||||| | |||||    
T  20445679 catcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacagccataacatcaattgatcaagaatcataacacaatt 20445778  T
Q  111 caactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttat 208  Q
    |||| ||||| |  |||| |||| | |||  ||||||||||||  |||| |||||| | | || || |||||| ||| | ||||||||||||||| ||||    
T  20445779 caacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcaccacttatcatttgttcctacttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat 20445878  T
Q  209 tatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaa-ttcaca 305  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||| |||||| ||   ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20445879 catcaattcatgcatacaaacatatcatcacaattggagcacgaatttagcaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaatttcaca 20445978  T
Q  306 aaatgatgatgattatggtaaagactaac-cccttacctta 345  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  20445979 aaatgatgatgattatgataaagactaactcccttacctta 20446019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 11 - 333
Target Start/End: Original strand, 20531444 - 20531770
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 110  Q
    |||| ||||| |||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| || | | |||||||||||  ||||||||||| | |||||    
T  20531444 catcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacagccataacatcaattgatcaagaatcataacacaatt 20531543  T
Q  111 caactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttat 208  Q
    |||| ||||| |  |||| |||| | |||  ||||||||||||  |||| |||||| | | || || |||||| ||| | ||||||||||||||| ||||    
T  20531544 caacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcaccacttatcatttgttcctacttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat 20531643  T
Q  209 tatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaattcacaa 306  Q
     |||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||| |||||||||||||| |||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20531644 catcaattcatgcatacaaacatattatcacatttggagcacgaatttagcaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaattcacaa 20531743  T
Q  307 aatgatgatgattatggtaaagactaa 333  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||    
T  20531744 aatgatgatgattatgataaagactaa 20531770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 11 - 345
Target Start/End: Original strand, 20931345 - 20931682
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 110  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||||   || |||||||||| |||||||| |||| || | | ||||||||||| |||||||||| | ||||| |    
T  20931345 catcattaattcatgaatatgcatacccaagaaattattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat 20931444  T
Q  111 caactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttat 208  Q
     ||| ||||  |  |||| |||| | |||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||| | |||||| ||| | |||||||||| |||| ||||    
T  20931445 taacaacaatttagcaaaattcaccaatttagcacaattttcataacttatcatttttacatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaattat 20931544  T
Q  209 tatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaa 308  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||| |||||||||  |||||    
T  20931545 catcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataagcaaacttcatacaacaattgaaaatttgcaaaa 20931644  T
Q  309 tgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttacctta 345  Q
    ||| |||||||||| ||||| |||| ||||||||||||    
T  20931645 tgaggatgattatgataaaggctaacccccttacctta 20931682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 11 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 37844714 - 37844374
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 110  Q
    |||| ||||| |||||||||| |||||||| | |||| |||||||| |||||||| |||| || | | ||||||||||| |||||||||||| ||||||     
T  37844714 catcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgactcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatc 37844615  T
Q  111 caactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttca-taacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacactta 207  Q
     ||| ||||| |  |||| |||||  |||  |||||||||||| ||  || |||||| | | || || |||||| ||| | ||||||||||||||| |||    
T  37844614 taacaacaacttagcaaaattcattaattgagcacaattttcactattttatcatttgttcctacttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 37844515  T
Q  208 ttatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaattcaca 305  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||| |||||| ||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  37844514 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcatgaatttagcaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaattcaca 37844415  T
Q  306 aaatgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttacctta 345  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  37844414 aaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 37844374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 11 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 20893889 - 20893551
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 110  Q
    ||||||||||  ||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||| ||   | ||||||||||| ||||||||||||  |||||     
T  20893889 catcatcaatttatgaatatgcatacccaaacaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagtcataacatcaattgaacaagaatcataaatcaatc 20893790  T
Q  111 caactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttat 208  Q
     ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| | | ||||| |||||| ||| | | ||||||||||||| ||||    
T  20893789 taacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaacaacaatcatacaattat 20893690  T
Q  209 tatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaattcacaa 306  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||| |||||| ||   ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20893689 catcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcaagaatttagcaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaatt-acaa 20893591  T
Q  307 aatgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttacctta 345  Q
    |||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||    
T  20893590 aatgatgatgattatgatgaagactaacccccttacctta 20893551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 11 - 345
Target Start/End: Original strand, 20913037 - 20913367
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 110  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||| | || |||||||||| |||| ||| |||| || | | ||||||||||| ||||||||||      ||||    
T  20913037 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaaccacaagatcaattaacaaccataacatcaattgaacaagaatca------aatt 20913130  T
Q  111 caactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttat 208  Q
     ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||||||||| |||||| ||||||| | |||||| ||| | |||||||||| |||| ||||    
T  20913131 -aacaacaactttgcaaaattcaccaattgagcacaattttcataacttatcatttttacatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaattat 20913229  T
Q  209 tatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaa 308  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||| |||||||||  |||||    
T  20913230 catcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccgtaagcaaaattcatacaacaattgaaaatttgcaaaa 20913329  T
Q  309 tgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttacctta 345  Q
    ||| |||||||| | |||||||||| ||||||||||||    
T  20913330 tgaggatgattacgataaagactaacccccttacctta 20913367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 107 - 272
Target Start/End: Original strand, 51452589 - 51452755
Alignment:
Q  107 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact 205  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |    
T  51452589 aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat 51452688  T
Q  206 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 272  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||    
T  51452689 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttgaagcacgaatttagcaacaattatccat 51452755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 15 - 238
Target Start/End: Original strand, 2116258 - 2116484
Alignment:
Q  15 atcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagc-tcaattcaa 113  Q
    |||||| |||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| || | | |||||||||||  ||||||||| |   |||| | ||    
T  2116258 atcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacaaccataacatcaattgagcaagaatcaaaatatcaaattaa 2116357  T
Q  114 ctacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattat 211  Q
    | | ||| |  |||| |||| | |||  |||| ||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||    
T  2116358 caataacttagcaaaattcaccaattgagcaccattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcat 2116457  T
Q  212 caattcatgcatacaaacatatcatca 238  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||    
T  2116458 caattcatgcatacaaacataacatca 2116484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 11 - 222
Target Start/End: Original strand, 22227809 - 22228022
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 110  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||| | || |||||||||  | |||||| |||| |||  | ||||||||||| |||||||||| | ||||| |    
T  22227809 catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataacatcaattaacattcataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat 22227908  T
Q  111 caactacaacatgtcaaa-ttcatccatttg-cacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttat 208  Q
     ||| ||||| |  |||| |||| | ||| | ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||| ||| | || |||||||||||| ||||    
T  22227909 taacaacaacttagcaaaattcaacaattggacacaattttcataacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcactaacaatcatacaattat 22228008  T
Q  209 tatcaattcatgca 222  Q
     |||||||||||||    
T  22228009 catcaattcatgca 22228022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 11 - 222
Target Start/End: Original strand, 22232506 - 22232719
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 110  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||| | || |||||||||  | |||||| |||| |||  | ||||||||||| |||||||||| | ||||| |    
T  22232506 catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataacatcaattaacattcataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat 22232605  T
Q  111 caactacaacatgtcaaa-ttcatccatttg-cacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttat 208  Q
     ||| ||||| |  |||| |||| | ||| | ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||| ||| | || |||||||||||| ||||    
T  22232606 taacaacaacttagcaaaattcaacaattggacacaattttcataacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcactaacaatcatacaattat 22232705  T
Q  209 tatcaattcatgca 222  Q
     |||||||||||||    
T  22232706 catcaattcatgca 22232719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 140 - 238
Target Start/End: Original strand, 45051554 - 45051652
Alignment:
Q  140 gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca 238  Q
    |||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| || |||||    
T  45051554 gcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacgtaacatca 45051652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 314 - 378
Target Start/End: Original strand, 21860334 - 21860399
Alignment:
Q  314 atgattatggtaaagactaacccc-ttaccttaattatctccaactactagctctagcttcacttt 378  Q
    ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21860334 atgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttt 21860399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 314 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 44034903 - 44034838
Alignment:
Q  314 atgattatggtaaagactaacccc-ttaccttaattatctccaactactagctctagcttcacttt 378  Q
    ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  44034903 atgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttt 44034838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 140 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 18601238 - 18601140
Alignment:
Q  140 gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca 238  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| | |||||| ||| | |||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18601238 gcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatca 18601140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 140 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 5072508 - 5072388
Alignment:
Q  140 gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaa 239  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| | |||||| ||| | |||||||||||||||  ||  ||||||||||||||| ||||||| |||||     
T  5072508 gcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacatcaattcatgcatataaacataacatcac 5072409  T
Q  240 agttggagcacaaatttagca 260  Q
    ||   |||||| |||||||||    
T  5072408 agcaagagcacgaatttagca 5072388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 334 - 378
Target Start/End: Original strand, 41218749 - 41218793
Alignment:
Q  334 ccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcacttt 378  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||    
T  41218749 ccccttaccttaattatcaccaactattagctcaagcttcacttt 41218793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 334 - 379
Target Start/End: Original strand, 27675139 - 27675184
Alignment:
Q  334 ccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcacttta 379  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||| | ||||||||||||    
T  27675139 ccccttaccttaattatctccaattcctagcccaagcttcacttta 27675184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 166; Significance: 9e-89; HSPs: 22)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 11 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 19794967 - 19794596
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 110  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||| |||||| |||| |   || ||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  19794967 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactataacatcaattaacggaaataacatcaattgaacaagaatcataactcaatt 19794868  T
Q  111 caactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttat 208  Q
    |||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| | | ||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| ||||    
T  19794867 caacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat 19794768  T
Q  209 tatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaattcacaa 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| | ||||| |||||| ||   ||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  19794767 tatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttaacgacaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttg-aaatttacaa 19794669  T
Q  307 aatgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcacttt 378  Q
    ||| |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19794668 aataatgatgattatgatgaagactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttt 19794596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 11 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 43643220 - 43642848
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 110  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||| |  ||||||||||||||||||||| |||| || ||| | ||||||||| |||||||||||| ||||| |    
T  43643220 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaactacaacatcaattaacagcaatagcatcaattgaacaagaatcatatctcaaat 43643121  T
Q  111 caactacaac-atgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttat 208  Q
     ||  ||||| | |  ||||||| | |||  |||||||||||| |||||  ||||| | | ||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| ||||    
T  43643120 taataacaactaagaaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttaacatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat 43643021  T
Q  209 tatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaattcacaa 306  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||  ||   ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43643020 catcaattcatgcatacaaacatatcatcacaattggagcacaaatttagcaacaattatccactatgcaaaaattcatacaacatttgaaaattcacaa 43642921  T
Q  307 aatgatgatgattatggtaaagactaacc-ccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcacttt 378  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  43642920 aatgatgatgattatgataaagactaacctccttcccttaattatctccaactattagctctagcttcacttt 43642848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 11 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 36982704 - 36982364
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 110  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||| || ||| ||||||||||| ||| |||||||| |||||||    
T  36982704 catcatcaattcatgaatatgcatacccaaacaatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataacatcaattgaacaggaatcataactcaatt 36982605  T
Q  111 caactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttat 208  Q
    |||| ||||| || |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||| ||| | |||| ||||| |||| ||||    
T  36982604 caacaacaacttggcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccagcaatcttacaattat 36982505  T
Q  209 tatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaattcac-a 305  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||   ||||||||||||||||||||||||| || |    
T  36982504 catcaattcatgaatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaatttacaa 36982405  T
Q  306 aaatgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttacctta 345  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  36982404 aaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 36982364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 11 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 20627576 - 20627205
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 110  Q
    |||| ||||| |||||||||  |||||||| | ||||||||||||| |||||| | |||| || | | || |||||||| |||||||| | | ||||| |    
T  20627576 catcctcaattcatgaatatccatacccaagcaatgattcatcaaccacaacaccaattaacaaccataaaatcaattgaacaagaattaaatctcaaat 20627477  T
Q  111 caactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttat 208  Q
     ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| || || |||||| |||||||||  ||||| ||| | ||||||||||||||| ||||    
T  20627476 taacaacaacttaacaaaattcaccaattgagcacaattttcacaagttatcatttttacatatttggacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat 20627377  T
Q  209 tatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaa-ttcacaaa 307  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| || |||||    
T  20627376 catcaattcgtgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttaacaacaattatccataatcataattcatacaatatttgaaaattttacaaa 20627277  T
Q  308 atgatgatgattatggtaaagactaacccc-ttaccttaattatctccaactactagctctagcttcacttt 378  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20627276 atgatgatgattatgataaagactaaccccgttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttt 20627205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 16 - 345
Target Start/End: Original strand, 462743 - 463075
Alignment:
Q  16 tcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaact 115  Q
    ||||| |||||||||| |||||||| | ||||||||||||  || ||||| |||| || | | ||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||     
T  462743 tcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaatcacgacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatctaaca 462842  T
Q  116 acaacatgtcaaa-ttcatccatttg--cacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatc 212  Q
    ||||| |  |||| |||| ||| |||  ||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||| ||| | |||||||||| |||| |||| |||    
T  462843 acaacttagcaaaattca-ccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatc 462941  T
Q  213 aattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgat 312  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  462942 aattcatgcatacaaatatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataagcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgat 463041  T
Q  313 gatgattatggtaaagactaa-ccccttacctta 345  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  463042 gatgattatgataaagactaacccccttacctta 463075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 11 - 339
Target Start/End: Original strand, 8891242 - 8891574
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 110  Q
    |||| ||||| |||||||||| |||||||| | ||||||||||||| |||||||| ||||  | | | ||||||||||| |||||||||||| ||||||     
T  8891242 catcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaatagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatc 8891341  T
Q  111 caactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttat 208  Q
     ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| | | ||||| |||||| ||| |  |||||||||||||| ||||    
T  8891342 taacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcgccaacaatcatacaattat 8891441  T
Q  209 tatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaattcacaa 306  Q
     |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||   ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8891442 catcaattcatgcatacaaacatattatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaatttacaa 8891541  T
Q  307 aatgatgatgattatggtaaagactaacccctt 339  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8891542 aatgatgatgattatgataaagactaacccctt 8891574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 107 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 19689567 - 19689401
Alignment:
Q  107 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact 205  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |    
T  19689567 aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat 19689468  T
Q  206 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 272  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  19689467 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 19689401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 107 - 272
Target Start/End: Original strand, 23820168 - 23820334
Alignment:
Q  107 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact 205  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |    
T  23820168 aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat 23820267  T
Q  206 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 272  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  23820268 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 23820334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 107 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 14906606 - 14906440
Alignment:
Q  107 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact 205  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| |    
T  14906606 aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat 14906507  T
Q  206 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 272  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  14906506 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 14906440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 11 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 24341652 - 24341309
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 110  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||   |||||| |||| || ||| ||||||||||| ||| |||||||| |||||||    
T  24341652 catcatcaattcatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaacaggaacatcaattaacaacaataacatcaattgaacatgaatcatatctcaatt 24341553  T
Q  111 caactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttat 208  Q
    |||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| |||||| ||||| |||||| || |||||  ||| | ||||||||||||||| ||||    
T  24341552 caacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatataatttcaccaacaatcatacaattat 24341453  T
Q  209 tatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatcca--taatcaaaattcatacaacatttgaaaattcacaa 306  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||||||||||| |||||  ||   ||||||||||| ||||||||||| |  |||    
T  24341452 catcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttgaagcatgaatttagcaacaattatccaattatgaaaaattcataccacatttgaaaaattgcaa 24341353  T
Q  307 a----atgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttacctta 345  Q
    |    ||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||    
T  24341352 aaatgatgatgatgattatgatgaagactaacccccttacctta 24341309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 107 - 272
Target Start/End: Original strand, 20015108 - 20015274
Alignment:
Q  107 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact 205  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| ||| |    
T  20015108 aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcacacaat 20015207  T
Q  206 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 272  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  20015208 tattatcaattcatgcatgcaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 20015274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 11 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 25265653 - 25265390
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 110  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||| | ||||||||| ||| |||||||| |||| || ||||||||||||||| ||| |  ||  | |  ||||    
T  25265653 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagccatgattcataaacaacaacatcaattaacaacaacaacatcaattgaacatggttctcatcataatt 25265554  T
Q  111 caactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttat 208  Q
    |||| |||||||  |||| |||| | |||  |||||||||||| |||||| ||||| |||||| || |||||| ||| | ||||||||||||||| ||||    
T  25265553 caacaacaacatagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat 25265454  T
Q  209 tatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 272  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||    
T  25265453 catcaattcatgcatacaaacataacatcaaagttagagcacgaatttagcaacaattatccat 25265390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 140 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 17396784 - 17396653
Alignment:
Q  140 gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaa 239  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| ||| |||||||||||| ||| | ||||||||||||||| | || | |||||||||||||| |||||||||||||    
T  17396784 gcacaatattcataacttatcatttttacttatttaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatcatcaacaattcatgcatac-aacatatcatcaa 17396686  T
Q  240 agttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 272  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  17396685 agttggagcacgaatttagcaacaattatccat 17396653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 11 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 7508107 - 7507894
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgca-caagaatcatagctcaat 109  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||| |||||||| | || || ||| ||||||||||  | || |||||||| ||||||    
T  7508107 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaataacatcaattaaaacatgaatcatatctcaat 7508008  T
Q  110 tcaactacaacat-gtcaaattcatccatttg--cacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacactt 206  Q
    | ||| ||||| | | |||||||| ||| |||  ||||||||||||||||| | |||| ||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| ||    
T  7508007 t-aacaacaacttagccaaattca-ccaattgaacacaattttcataacttattatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatt 7507910  T
Q  207 attatcaattcatgca 222  Q
    || |||||||||||||    
T  7507909 atcatcaattcatgca 7507894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 252 - 345
Target Start/End: Original strand, 22863171 - 22863267
Alignment:
Q  252 aatttagcaacaatcatccataatc--aaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttacctta 345  Q
    |||||||||||||| |||||| ||   ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  22863171 aatttagcaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacaattgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 22863267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 314 - 378
Target Start/End: Original strand, 22275045 - 22275110
Alignment:
Q  314 atgattatggtaaagactaacccc-ttaccttaattatctccaactactagctctagcttcacttt 378  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22275045 atgattatgataaaggctaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttt 22275110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 314 - 378
Target Start/End: Original strand, 22284278 - 22284343
Alignment:
Q  314 atgattatggtaaagactaacccc-ttaccttaattatctccaactactagctctagcttcacttt 378  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  22284278 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctaacttcacttt 22284343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 315 - 378
Target Start/End: Original strand, 15633538 - 15633602
Alignment:
Q  315 tgattatggtaaagactaacc-ccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcacttt 378  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  15633538 tgattatgataaagactaacctccttaccttaattatctccaactattaactctagcttcacttt 15633602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 11 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 19886913 - 19886661
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 110  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| | || |||||||||  | || ||| | || |||  | ||||||| ||| |||||||||| | ||||| |    
T  19886913 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 19886814  T
Q  111 caactacaacat--gtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacactta 207  Q
     ||| ||||| |  |  ||||||| |  ||| ||||||| |||||||||| ||| || | ||||| | |||||| ||| | ||||||||| |||||  ||    
T  19886813 taacaacaacttaggagaaattcaccactttagcacaatcttcataacttatcacttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 19886714  T
Q  208 ttatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagca 260  Q
      ||||||||||||||||||||||| ||||| ||   |||||| |||||||||    
T  19886713 acatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 19886661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 330 - 379
Target Start/End: Original strand, 19660217 - 19660266
Alignment:
Q  330 ctaaccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcacttta 379  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| | ||||| | ||||||||||||    
T  19660217 ctaaccccttaccttaattatcaccaattcctagcccaagcttcacttta 19660266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 28 - 88
Target Start/End: Original strand, 9636761 - 9636821
Alignment:
Q  28 tatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaatt 88  Q
    |||| |||||||||| |||| |||||||| |||| |||| ||| || ||||||||||||||    
T  9636761 tatgaatacccaaactatgaatcatcaacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaatt 9636821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 44 - 88
Target Start/End: Original strand, 24884718 - 24884762
Alignment:
Q  44 atgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaatt 88  Q
    |||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  24884718 atgaatcatcaacaacaatatctattagcaacaacaacatcaatt 24884762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 151; Significance: 8e-80; HSPs: 2)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 11 - 345
Target Start/End: Original strand, 1124 - 1462
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 110  Q
    |||||||||| |||||||||| | |||||| | || |||||||||| |||| ||| |||| || | | ||||||||||| |||||||||| | ||||| |    
T  1124 catcatcaattcatgaatatgcacacccaagcaattattcatcaaccacaatatcaattaacaaccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat 1223  T
Q  111 caactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttat 208  Q
     ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| ||||    
T  1224 taacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat 1323  T
Q  209 tatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaa-ttcacaaa 307  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1324 tatcaattcatgcatactaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccataagaaaaattcatacaacatttgaaaatttcacaaa 1423  T
Q  308 atgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttacctta 345  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  1424 atgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 1462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266; HSP #2
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 13 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 3843 - 3508
Alignment:
Q  13 tcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattca 112  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||| | || |||| ||||  |||||||| |||| |||| | ||||||||||| |||||||||| | ||||| | |    
T  3843 tcatcaatccatcaatatgcatacccaagcaattattcctcaatcacaacatcaattaacatccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaatta 3744  T
Q  113 actacaacatgtcaaattcatccatttg--cacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttatta 210  Q
    || ||||| |  |||| |   ||| |||  ||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| |    
T  3743 acaacaacttagcaaaatttaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatca 3644  T
Q  211 tcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatg 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  3643 tcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatctataatcaaaattcatacaacttttgaaaatttacaaaatg 3544  T
Q  311 atgatgattatggtaaagactaa-ccccttacctta 345  Q
    | ||||||||||  ||||||||| ||||||||||||    
T  3543 aagatgattatgacaaagactaacccccttacctta 3508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 150; Significance: 3e-79; HSPs: 2)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 11 - 345
Target Start/End: Original strand, 48598 - 48935
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 110  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||| | ||||||||||||| |||||||| ||||  | | | ||||||||||| |||||||||||| ||||||     
T  48598 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaatagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatc 48697  T
Q  111 caactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttat 208  Q
     | | ||||| |  |||| |||| | | |  |||||||||||| ||||| |||||| | | ||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| ||||    
T  48698 tagcaacaacttagcaaaattcaccaactgagcacaattttcacaacttatcattttttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat 48797  T
Q  209 tatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaa 308  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  48798 catcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataagcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaa 48897  T
Q  309 tgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttacctta 345  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  48898 tgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 48935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 140 - 238
Target Start/End: Original strand, 36225 - 36323
Alignment:
Q  140 gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca 238  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| | || ||| ||| | |||||||||||||||  ||  |||||||||| |||||||||||| |||||    
T  36225 gcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaatatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacatcaattcatacatacaaacataacatca 36323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 146; Significance: 8e-77; HSPs: 2)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 11 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 37176 - 36836
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 110  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||| | ||||||||||||| |||||||| |||| || | | ||| ||||||| |||||| ||||| ||||||     
T  37176 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacgtcaattgaacaagattcataactcaatc 37077  T
Q  111 caactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttat 208  Q
    |||| ||||| |  |||| |||| | |||| |||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||| ||| | |||||||| | |||| ||||    
T  37076 caaccacaacttagcaaaattcaccaatttagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaagcttacaattat 36977  T
Q  209 tatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaattcacaa 306  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||| |||||| ||   |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  36976 catcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttaacaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaatttcacaa 36877  T
Q  307 aatgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttaccttaa 346  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  36876 aatgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttaa 36836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 334 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 15378 - 15334
Alignment:
Q  334 ccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcacttt 378  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||    
T  15378 ccccttaccttaattatctccaactattagcccaagcttcacttt 15334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195 (Bit Score: 145; Significance: 3e-76; HSPs: 2)
Name: scaffold0195
Description:

Target: scaffold0195; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 11 - 337
Target Start/End: Original strand, 19206 - 19537
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 110  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||| | ||||||||||||| |||||||| |||| || ||| ||||||||||| ||| |||||||| |||||||    
T  19206 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacagcaataacatcaattgaacaggaatcataactcaatt 19305  T
Q  111 caactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttat 208  Q
    |||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||| ||| | |||||||||| |||| ||||    
T  19306 caacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaattat 19405  T
Q  209 tatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaattcac-a 305  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||   ||||||||||||||||||||||||| || |    
T  19406 catcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaatttacaa 19505  T
Q  306 aaatgatgatgattatggtaaagactaacccc 337  Q
    |||| |||||||||||| | ||||||||||||    
T  19506 aaattatgatgattatgatgaagactaacccc 19537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195; HSP #2
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 11 - 272
Target Start/End: Original strand, 21290 - 21553
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 110  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||| | ||||||||||||| |||||||| |||| || ||| ||||||||||| ||| |||||||| |||||||    
T  21290 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacagcaataacatcaattgaacaggaatcataactcaatt 21389  T
Q  111 caactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttat 208  Q
    |||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||| ||| | |||||||||| |||| ||||    
T  21390 caacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaattat 21489  T
Q  209 tatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 272  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  21490 catcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 21553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 143; Significance: 5e-75; HSPs: 2)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 22 - 345
Target Start/End: Original strand, 171916 - 172242
Alignment:
Q  22 catgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaaca 121  Q
    |||||||||| ||||| || | ||||||||||||| |||||||| |||| || | | ||||||||||| ||||||||| || ||||||||||| |||||     
T  171916 catgaatatgcatacctaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcgtaactcaattcaaccacaact 172015  T
Q  122 tgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcat 219  Q
    |  |||| |||| | |||| |||||||||||| ||||| |||||| | | ||||| |||||| ||| | |||| |||||||||| |||| ||||||||||    
T  172016 tagcaaaattcaccaatttagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccatcaatcatacaattatcatcaattcat 172115  T
Q  220 gcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgatt 319  Q
     |||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  172116 ccatacaaacatatcatcacagttggagcacgtatttagcaacagttatccataatcaaaatttatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgatt 172215  T
Q  320 atggtaaagactaa-ccccttacctta 345  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||    
T  172216 atgataaagactaacccccttacctta 172242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 22 - 345
Target Start/End: Original strand, 177619 - 177945
Alignment:
Q  22 catgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaaca 121  Q
    |||||||||| ||||| || | ||||||||||||| |||||||| |||| || | | ||||||||||| ||||||||| || ||||||||||| |||||     
T  177619 catgaatatgcatacctaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcgtaactcaattcaaccacaact 177718  T
Q  122 tgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcat 219  Q
    |  |||| |||| | |||| |||||||||||| ||||| |||||| | | ||||| |||||| ||| | |||| |||||||||| |||| ||||||||||    
T  177719 tagcaaaattcaccaatttagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccatcaatcatacaattatcatcaattcat 177818  T
Q  220 gcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgatt 319  Q
     |||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  177819 ccatacaaacatatcatcacagttggagcacgtatttagcaacagttatccataatcaaaatttatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgatt 177918  T
Q  320 atggtaaagactaa-ccccttacctta 345  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||    
T  177919 atgataaagactaacccccttacctta 177945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 138; Significance: 5e-72; HSPs: 23)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 11 - 345
Target Start/End: Original strand, 23506965 - 23507302
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 110  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||| | || |||||||||| |||||||| |||| || | | ||||||||||| |||||||||| | ||||| |    
T  23506965 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat 23507064  T
Q  111 caactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttat 208  Q
     ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| ||||    
T  23507065 taacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat 23507164  T
Q  209 tatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaa 308  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||  | ||||||    
T  23507165 catcaattcatgcatacaaacatatcatcacaaatggagcacgaatttagcaacaattatccataagcaaaattcatacaacatttgaaatcttacaaaa 23507264  T
Q  309 tgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttacctta 345  Q
    ||  |||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  23507265 tggagatgattatgataaagactaacccccttacctta 23507302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 11 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 27182810 - 27182471
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 110  Q
    |||||||||| |||||||||| |||| ||| | ||||||||||||| |||||||| |||| || | | ||||||||||| |||||||||||| ||||||     
T  27182810 catcatcaattcatgaatatgcatactcaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatc 27182711  T
Q  111 caactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttat 208  Q
     ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| | | ||||| |||||| ||| | | ||||||||||||| ||||    
T  27182710 taacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcatcaacaatcatacaattat 27182611  T
Q  209 tatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaattcacaa 306  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||| |||||| ||   ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27182610 catcagttcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcatgaatttagcaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaatttacaa 27182511  T
Q  307 aatgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttacctta 345  Q
    |||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||    
T  27182510 aatgatgatgattatgatgaagactaacccccttacctta 27182471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 11 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 18531330 - 18530988
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 110  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| | | ||||||||||||| |||||||| |||| || ||| ||||||||||| ||| |||||||| |||||||    
T  18531330 catcatcaattcatgaatatgtatacccgagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacagcaataacatcaattgaacatgaatcatatctcaatt 18531231  T
Q  111 caactacaacatgtcaaa-ttcatccatttg--cacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacactta 207  Q
    |||| ||||| |  |||| |||| ||| |||  ||||||||||| |||||| ||||| |||||| || |||||| ||| | ||||||||||||||| |||    
T  18531230 caacaacaacttagcaaaattca-ccaattgaacacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 18531132  T
Q  208 ttatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatcc-ataatcaaa-attcatacaacatttgaaaattcaca 305  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||| || || ||| |||||||| ||||||||||| |  ||    
T  18531131 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccaattatgaaacattcataccacatttgaaaaattgca 18531032  T
Q  306 aaatgatgat---gattatggtaaagactaa-ccccttacctta 345  Q
    ||||||||||   ||||||| | |||||||| ||||||||||||    
T  18531031 aaatgatgatgacgattatgatgaagactaacccccttacctta 18530988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 107 - 272
Target Start/End: Original strand, 20623066 - 20623232
Alignment:
Q  107 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact 205  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |    
T  20623066 aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat 20623165  T
Q  206 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 272  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  20623166 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 20623232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 107 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 21233694 - 21233528
Alignment:
Q  107 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact 205  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |    
T  21233694 aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat 21233595  T
Q  206 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 272  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  21233594 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 21233528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 11 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 22054096 - 22053753
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 110  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||| |||||||| |||| || ||| ||||||||||| ||| |||||||| |||||||    
T  22054096 catcatcaattcatgaatatgtagacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacagcaataacatcaattgaacatgaatcatatctcaatt 22053997  T
Q  111 caactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttat 208  Q
    |||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| |||||| ||||| |||||| || |||||| ||| | |||||||||||||||  |||    
T  22053996 caacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaactat 22053897  T
Q  209 tatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatcca--taatcaaaattcatacaacatttgaaaa--ttcac 304  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||  ||   ||||||||||| |||||||||||  ||||     
T  22053896 catcaattcatacatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccaattatgaaaaattcataccacatttgaaaaatttcaa 22053797  T
Q  305 aaa--atgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttacctta 345  Q
    |||  ||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||    
T  22053796 aaatgatgatgatgattatgatgaagactaacccccttacctta 22053753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 110 - 272
Target Start/End: Original strand, 37052844 - 37053007
Alignment:
Q  110 tcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttat 208  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||    
T  37052844 tcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcatttccacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattat 37052943  T
Q  209 tatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 272  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  37052944 tatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 37053007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 107 - 272
Target Start/End: Original strand, 16536294 - 16536460
Alignment:
Q  107 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact 205  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| |    
T  16536294 aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat 16536393  T
Q  206 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 272  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  16536394 tattataaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 16536460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 107 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 25900571 - 25900408
Alignment:
Q  107 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact 205  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||  ||| ||||||||||||||||| |    
T  25900571 aattcaacaacaacatgtcaa-ttcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatataatttaaccaacaatcatacaat 25900473  T
Q  206 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatcc 270  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  25900472 tatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatcc 25900408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 22 - 272
Target Start/End: Original strand, 34939289 - 34939540
Alignment:
Q  22 catgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaaca 121  Q
    |||||||||| |||||||| |  |||||||||||| |||||||| |||| || ||| |||||||| || |||||||||||| ||||||||| | |  ||     
T  34939289 catgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaattaacagcaataacatcaactgaacaagaatcataactcaattca-caatgact 34939387  T
Q  122 tgtcaaattc-atccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcat 219  Q
    |  |||| || ||| |||  ||||||||||||||||||| ||||| |||||| || ||||||  || | ||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  34939388 tagcaaaatccatcaattgagcacaattttcataacttcacatttttacataattgaacatgtgatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcat 34939487  T
Q  220 gcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 272  Q
    ||||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||||||||| | ||||||    
T  34939488 gcatacaaacataacatcacagttagagcacgaatttagcaacagttatccat 34939540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 140 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 29188404 - 29188284
Alignment:
Q  140 gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaa 239  Q
    |||| ||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||     
T  29188404 gcaccattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcac 29188305  T
Q  240 agttggagcacaaatttagca 260  Q
    |||  |||||| ||| |||||    
T  29188304 agtaagagcacgaatctagca 29188284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 142 - 238
Target Start/End: Original strand, 27009975 - 27010071
Alignment:
Q  142 acaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca 238  Q
    ||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||| | ||||||| ||||||| | || ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27009975 acaatattcataacttatcatttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacactcatacaatcatcatcaattcatgcatacaaacataacatca 27010071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 11 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 4200237 - 4200007
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 110  Q
    ||||||||| ||||||||||| | |||||| | || |||||||||  | || ||| | || |||  | ||||||||||| ||| |||||| | ||||| |    
T  4200237 catcatcaacccatgaatatgcaaacccaagcaatcattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat 4200138  T
Q  111 caactacaacat--gtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacactta 207  Q
    |||| |||||||  |  ||||||| | |||| ||| ||| |||||||||| |||||| | ||||| | |||||| ||| | |||||||||||||||  ||    
T  4200137 caacaacaacataagagaaattcaccaatttagcataatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaacta 4200038  T
Q  208 ttatcaattcatgcatacaaacatatcatca 238  Q
      ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  4200037 acatcaattcatgcatacaaacataacatca 4200007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 11 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 22366733 - 22366481
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 110  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| | || |||||||||  | || ||| | || |||  | ||||||| ||| ||||| |||| | ||||| |    
T  22366733 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacaactcaaat 22366634  T
Q  111 caactacaacat--gtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacactta 207  Q
     ||| ||||| |  |  ||||||| | |||| ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| | |||||| ||| | ||||||||| |||||  ||    
T  22366633 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 22366534  T
Q  208 ttatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagca 260  Q
      ||||||||||||||||||||||| ||||| ||   |||||| |||||||||    
T  22366533 acatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 22366481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 11 - 260
Target Start/End: Original strand, 25426628 - 25426880
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 110  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| | || |||||||||  | || ||| | || |||  | ||||||| ||| |||||||||| | ||||| |    
T  25426628 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 25426727  T
Q  111 caactacaacat--gtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacactta 207  Q
     ||| ||||| |  |  ||||||| |  ||| ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| | |||||| ||| | ||||||||| |||||  ||    
T  25426728 taacaacaacttaggagaaattcaccactttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 25426827  T
Q  208 ttatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagca 260  Q
      ||||||||||||||||||||||| ||||| ||   |||||| |||||||||    
T  25426828 acatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 25426880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 11 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 18778244 - 18778014
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 110  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| | || |||||||||  | || ||| | ||  ||  | ||||||| ||| |||||||||| | ||||| |    
T  18778244 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataatattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 18778145  T
Q  111 caactacaacat--gtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacactta 207  Q
     ||| ||||| |  |  ||||||| | |||| ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| | |||||| ||| | ||||||||| |||||  ||    
T  18778144 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 18778045  T
Q  208 ttatcaattcatgcatacaaacatatcatca 238  Q
      ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18778044 acatcaattcatgcatacaaacataacatca 18778014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 140 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 43443515 - 43443417
Alignment:
Q  140 gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca 238  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| | |||||| ||| | |||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  43443515 gcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatca 43443417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 11 - 260
Target Start/End: Original strand, 12374 - 12626
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 110  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| | || |||||||||  | || ||| | || |||  | ||||||| ||| |||||||||| | ||||| |    
T  12374 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 12473  T
Q  111 caactacaacat--gtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacactta 207  Q
     ||| ||||| |  |  ||||||| |  ||| ||||||| |||||||||| ||| || | ||||| | |||||| ||| | ||||||||| |||||  ||    
T  12474 taacaacaacttaggagaaattcaccactttagcacaatcttcataacttatcacttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 12573  T
Q  208 ttatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagca 260  Q
      ||||||||||||||||||||||| ||||| ||   |||||| |||||||||    
T  12574 acatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 12626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 140 - 260
Target Start/End: Original strand, 19500031 - 19500151
Alignment:
Q  140 gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaa 239  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| | |||||| ||| | ||||||||| |||||  ||  ||||||||||||||||||||||| |||||     
T  19500031 gcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcac 19500130  T
Q  240 agttggagcacaaatttagca 260  Q
    ||   |||||| |||||||||    
T  19500131 agcaagagcacgaatttagca 19500151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 21073847 - 21073595
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 110  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| | || |||||||||  | || ||| | || |||  | ||||||| ||| |||||||||| | ||||| |    
T  21073847 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattgataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 21073748  T
Q  111 caactacaacatgtca--aattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacactta 207  Q
     ||| ||||| |   |  |||||| |  ||| ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| | |||||| ||| | ||||||||| |||||  ||    
T  21073747 taacaacaacttagaagaaattcaccactttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 21073648  T
Q  208 ttatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagca 260  Q
      ||| ||||||||||||||||||| ||||| ||   |||||| |||||||||    
T  21073647 acatccattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 21073595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 122
Target Start/End: Original strand, 23493917 - 23494029
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaat-atgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaat 109  Q
    |||||||||  ||||||| ||| | |||||| | |||| |||||| | ||||||||  |||||| ||||||||||||||| ||| ||||| || | ||||    
T  23493917 catcatcaaatcatgaattatgaacacccaagccatgaatcatcatcaacaacatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatcttatcacaat 23494016  T
Q  110 tcaactacaacat 122  Q
    ||||| |||||||    
T  23494017 tcaacaacaacat 23494029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 58 - 122
Target Start/End: Original strand, 7728466 - 7728530
Alignment:
Q  58 acaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat 122  Q
    ||||||||  |||||| ||||||||||||||| ||| ||||| || | ||||||||| |||||||    
T  7728466 acaacatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatcttatcacaattcaacaacaacat 7728530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 334 - 378
Target Start/End: Original strand, 11584394 - 11584438
Alignment:
Q  334 ccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcacttt 378  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| || ||| |||||||||||    
T  11584394 ccccttaccttaattatcaccaactattaactcaagcttcacttt 11584438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 134; Significance: 1e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 15 - 345
Target Start/End: Original strand, 41733 - 42066
Alignment:
Q  15 atcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaac 114  Q
    |||||| |||||||||| |||||||| | ||||||||||| |||||||| | |||| || | | | ||||||||| |||||||||||| ||||||  |||    
T  41733 atcaattcatgaatatgcatacccaaccaatgattcatcatctacaacaacaattaacagccatagcatcaattgaacaagaatcataactcaatctaac 41832  T
Q  115 tacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatc 212  Q
     ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| || || |||||| ||||||||| | |||| ||| | |||||||||   ||| |||| |||    
T  41833 aacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaaattatcatttttacatatttgagcatgtaatttcaccaacaatatgacaattatcatc 41932  T
Q  213 aattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgat 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41933 aattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataagcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgat 42032  T
Q  313 gatgattatggtaaagactaa-ccccttacctta 345  Q
    |||||||||| ||||||| || ||||||||||||    
T  42033 gatgattatgataaagaccaacccccttacctta 42066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 130; Significance: 3e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 11 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 1218 - 882
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 110  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| | || |||||||||  | |||||  |||| |||| | ||||||| ||| |||||||| | | |||||||    
T  1218 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataacataaattaacatccataacatcacttgaacaagaataaaatctcaatt 1119  T
Q  111 caactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttat 208  Q
     ||| ||||| |  |||| |||||| |||  |||||||||||| ||||| | |||| ||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| ||||    
T  1118 -aacaacaacttagcaaaattcatcaattgagcacaattttcacaacttattatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat 1020  T
Q  209 tatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaa 308  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||   |||     
T  1019 catcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataatcacaattcatacaacatttgagaatttgtaaag 920  T
Q  309 tgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttacctta 345  Q
    ||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  919 tgaagatgattatgataaagactaacccccttacctta 882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 130; Significance: 3e-67; HSPs: 18)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 22 - 345
Target Start/End: Original strand, 23153458 - 23153786
Alignment:
Q  22 catgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaaca 121  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||||||||| |||||||| |||| || | | || |||||||| |||||||||||| ||||||  ||| |||||     
T  23153458 catgaatatgtatacccaagtaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataatatcaattgaacaagaatcataactcaatctaacaacaact 23153557  T
Q  122 tgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcat 219  Q
    |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| | | ||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  23153558 tagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcat 23153657  T
Q  220 gcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatga 317  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||||| ||   ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23153658 gcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagaaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatga 23153757  T
Q  318 ttatggtaaagactaa-ccccttacctta 345  Q
    ||||| | |||||||| ||||||||||||    
T  23153758 ttatgatgaagactaacccccttacctta 23153786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 15 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 14626377 - 14626089
Alignment:
Q  15 atcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaac 114  Q
    |||||| |||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| || | | |||||||||||  ||||||||| | ||||| | |||    
T  14626377 atcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacaaccataacatcaattgagcaagaatcaaatctcaagttaac 14626278  T
Q  115 tacaacatgtca-aattcatccatttgcaca--attttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattat 211  Q
     ||||| |  || |||||| ||| |||||||  ||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||    
T  14626277 aacaacttagcataattca-ccaattgcacacaattttcataacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcat 14626179  T
Q  212 caattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatt 301  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||   |||||| |||||||||| ||| ||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||    
T  14626178 caattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcaataattatccataatcacaattcaaacaacatttgagaatt 14626089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 11 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 35009702 - 35009439
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 110  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||| | ||||||||||||| |||||||| |||| || ||||||||||||||| ||| |  ||  | |  ||||    
T  35009702 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaacaacatcaattgaacatggttctcatcataatt 35009603  T
Q  111 caactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttat 208  Q
    |||| |||||||  |||| |||| | |||  |||||||||||| |||||| ||||| |||||| || |||||| ||| | ||||||||||||||| ||||    
T  35009602 caacaacaacatagcaaaattcaccaattgagcacaattttcaaaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat 35009503  T
Q  209 tatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 272  Q
     |||||||||||||||||||| || ||||| |||| |||||| |||||||||||||| ||||||    
T  35009502 catcaattcatgcatacaaacttaacatcacagttagagcacgaatttagcaacaattatccat 35009439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 22 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 1657999 - 1657748
Alignment:
Q  22 catgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaaca 121  Q
    |||||||||| |||||||| |  |||||||||||| |||||||| |||| || ||| |||||||| || |||||||||||| ||||||||| | | |||     
T  1657999 catgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataacatcaactgaacaagaatcataactcaattca-caataact 1657901  T
Q  122 tgtcaaattc-atccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcat 219  Q
    |  |||| || ||| |||  ||||||||||||||||||| ||||| |||||| || ||||||  || | ||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  1657900 tagcaaaatccatcaattgagcacaattttcataacttcacatttttacataattgaacatgtgatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcat 1657801  T
Q  220 gcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 272  Q
    |||| |||||||| ||||| |||| |||||| |||||||||||||| ||||||    
T  1657800 gcatccaaacataacatcacagttagagcacgaatttagcaacaattatccat 1657748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 22 - 272
Target Start/End: Original strand, 15862484 - 15862734
Alignment:
Q  22 catgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaaca 121  Q
    |||||||||| |||||||| |  |||||||||||| |||||||| |||| || ||| ||||| ||| | |||||||||||| ||||||||| | | |||     
T  15862484 catgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaattatcagcaataacataaat-gaacaagaatcataactcaattca-caataact 15862581  T
Q  122 tgtcaaattc-atccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcat 219  Q
    |  |||| || ||| |||  ||||||||||||||||||| ||||| |||||| || ||||||  || | ||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  15862582 tagcaaaatccatcaattgagcacaattttcataacttcacatttatacataattgaacatgtgatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcat 15862681  T
Q  220 gcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 272  Q
    ||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||| |||||| ||||||    
T  15862682 gcatacaaacataacatcacagttagagcacgaatttagtaacaattatccat 15862734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 15 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 1650352 - 1650105
Alignment:
Q  15 atcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaac 114  Q
    |||||| |||||||||| |||||||| |  |||||||||||| |||||||| | || || ||| |||||||||||  ||||||||| | ||||| | |||    
T  1650352 atcaattcatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaataacatcaattgagcaagaatcaaatctcaaattaac 1650253  T
Q  115 tacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatc 212  Q
     | ||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||  ||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| |||    
T  1650252 cataacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcattcttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatc 1650153  T
Q  213 aattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagca 260  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| |||  |||||| ||| |||||    
T  1650152 aattcatgcatacaaacgtaacatcacagtaagagcacgaatctagca 1650105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 277 - 345
Target Start/End: Original strand, 23148266 - 23148335
Alignment:
Q  277 aaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttacctta 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||    
T  23148266 aaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgatgaagactaacccccttacctta 23148335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 314 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 19983224 - 19983159
Alignment:
Q  314 atgattatggtaaagactaacccc-ttaccttaattatctccaactactagctctagcttcacttt 378  Q
    ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19983224 atgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttt 19983159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 11 - 232
Target Start/End: Original strand, 25175563 - 25175787
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 110  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| | || |||||||||  | || ||| | || |||  | ||||||| ||| |||||||||| | ||||| |    
T  25175563 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 25175662  T
Q  111 caactacaacat--gtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacactta 207  Q
     ||| ||||| |  |  ||||||| | |||| ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| | |||||| ||| | ||||||||| |||||  ||    
T  25175663 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 25175762  T
Q  208 ttatcaattcatgcatacaaacata 232  Q
      |||||||||||||||||||||||    
T  25175763 acatcaattcatgcatacaaacata 25175787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 314 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 35015089 - 35015024
Alignment:
Q  314 atgattatggtaaagactaacccc-ttaccttaattatctccaactactagctctagcttcacttt 378  Q
    ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  35015089 atgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttt 35015024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 11 - 114
Target Start/End: Original strand, 27740838 - 27740941
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 110  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||| || ||||||||   ||  | |||| |||||||||| ||| |||||||| |||||||    
T  27740838 catcatcaattcatgaatatgcatacccaaaccatgattcatccacaacaacatcagataatagcaaccacatcaattgaacatgaatcatatctcaatt 27740937  T
Q  111 caac 114  Q
    ||||    
T  27740938 caac 27740941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 189 - 272
Target Start/End: Original strand, 27751605 - 27751688
Alignment:
Q  189 accaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 272  Q
    ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||| ||||| | || |||||| |||||||| ||| | ||||||    
T  27751605 accaacaatcatacaattgtcatcaattcatgcatacaaacataacatcacaattagagcacgaatttagctacatttatccat 27751688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 27654235 - 27653983
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 110  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||| | || |||||||||  | || ||| | || |||  | ||||||| | | |||||||||| | ||||| |    
T  27654235 catcattaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcattggaacaagaatcacaactcaaat 27654136  T
Q  111 caactacaacat--gtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacactta 207  Q
     ||| ||||| |  |  ||||||| | |||| ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| | |||||| ||| | ||||||||| |||||  ||    
T  27654135 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 27654036  T
Q  208 ttatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagca 260  Q
      |||||||||||||||||| |||| ||||| ||   |||||| |||||||||    
T  27654035 acatcaattcatgcatacaagcataacatcacagcaagagcacgaatttagca 27653983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 28 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 18381914 - 18381821
Alignment:
Q  28 tatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaaca 121  Q
    |||| |||||||| | |||| |||||||| ||||||||  |||||| ||||||||||||||| ||| || || || | ||||||||| ||||||    
T  18381914 tatgaatacccaagccatgaatcatcaacaacaacatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgactcttatcacaattcaacaacaaca 18381821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 75 - 272
Target Start/End: Original strand, 29665937 - 29666137
Alignment:
Q  75 caacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatat 172  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||| |||| |||||| ||||| |  |||| |||| | |||  | ||||||| ||||||||  ||||| | ||||     
T  29665937 caacaacatcaattgaacatgaatcatatctcatttcaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagtacaattt-cataacttgacatttatgcatac 29666035  T
Q  173 tt--aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatcc 270  Q
    ||  ||||||| ||| | ||| ||||||||||| |||| |||||||||| ||||  || ||| ||||| || | |||||| |||||| ||||||| ||||    
T  29666036 tttgaaacatgtaatttcacccacaatcatacaattatcatcaattcatacataagaaaataacatcacagctagagcacgaatttaacaacaattatcc 29666135  T
Q  271 at 272  Q
    ||    
T  29666136 at 29666137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 314 - 378
Target Start/End: Original strand, 18583640 - 18583705
Alignment:
Q  314 atgattatggtaaagactaacccc-ttaccttaattatctccaactactagctctagcttcacttt 378  Q
    ||||||||| | || ||||||||| |||||||||||||| ||||||| || ||| |||||||||||    
T  18583640 atgattatgatgaaaactaacccccttaccttaattatcaccaactattaactcaagcttcacttt 18583705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 11 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 22362014 - 22361926
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaat-atgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaat 98  Q
    |||||||||| ||||||| ||| | |||||| | |||| |||||||| |||| |||  |||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  22362014 catcatcaattcatgaattatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaat 22361926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 58 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 25367438 - 25367374
Alignment:
Q  58 acaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat 122  Q
    ||||||||  |||||| ||||||||||||||| ||| ||||| || | ||||||||| |||||||    
T  25367438 acaacatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatcttatcacaattcaacaacaacat 25367374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0302 (Bit Score: 124; Significance: 1e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0302
Description:

Target: scaffold0302; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 11 - 345
Target Start/End: Original strand, 12115 - 12450
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 110  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| | || |||||| ||  | |||||| |||| |||  | ||||||||||| |||||||||| | |||||||    
T  12115 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatgaatcataacatcaattaacattcataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaatt 12214  T
Q  111 caactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttat 208  Q
      || ||||| |  |||| |||| | |||| |||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||||||||| | | | ||||||||||||||| ||||    
T  12215 --acaacaacttaacaaaattcaccaatttagcacaattttcacaacttatcatttttacacatttaaacatgtattttcaccaacaatcatacaattat 12312  T
Q  209 tatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataatcaaaa-ttcatacaacatttgaaaattcacaaa 307  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| || |||||    
T  12313 catcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttagagcacgaatttagcaacaattatccataatcaaaatttcatacagcatttgaaagtt-acaaa 12411  T
Q  308 atgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttacctta 345  Q
    || | |||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  12412 attaagatgattatgataaagactaacccccttacctta 12450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 124; Significance: 1e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 17 - 345
Target Start/End: Original strand, 272031 - 272362
Alignment:
Q  17 caatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaacta 116  Q
    |||| |||||||||| |||||||| | ||||||||||||| |||||||| |||| || | | |||| |||||| |||||||||||| |||||| |||| |    
T  272031 caattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagctataacaccaattgaacaagaatcataactcaatccaacca 272130  T
Q  117 caacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaa 214  Q
    |||| |  |||| |||| | |||| |||||||||||| ||||| |||||| | | ||||| |||||| ||| |  ||| |||||||||| |||| |||||    
T  272131 caacttagcaaaattcaccaatttagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttctccatcaatcatacaattatcatcaa 272230  T
Q  215 ttcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatga 314  Q
    ||||| |||||||||||||||| | |||||||| ||  ||||||||| | | |||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  272231 ttcattcatacaaacatatcattacagttggagtacgtatttagcaatatttatccataatcaaaatttatacaatatttgaaaatttacaaaatgatga 272330  T
Q  315 tgattatggtaaagactaa-ccccttacctta 345  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  272331 tgattatgataaagactaacccccttacctta 272362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 123; Significance: 4e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 22 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 247694 - 247366
Alignment:
Q  22 catgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaaca 121  Q
    |||||||||| |||||||| | ||||||||||||| |||||||| |||| ||   | ||||||||||| |||||||||||| ||||||  ||| |||||     
T  247694 catgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagtcataacatcaattgaacaagaatcataactcaatctaacaacaact 247595  T
Q  122 tgtcaaattcatccatttg--cacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcat 219  Q
    |  |||| |   ||| |||  ||||||||||| ||||| |||||| | | ||||| |||||| ||| | |||  |||||||||| |||| ||||||||||    
T  247594 tagcaaaatttaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgaaatttcaccctcaatcatacaattatcatcaattcat 247495  T
Q  220 gcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatga 317  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||   ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  247494 gcatacaaacatatcattacagttggagcacgaatttagcaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatga 247395  T
Q  318 ttatggtaaagactaa-ccccttacctta 345  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  247394 ttatgataaagactaacccccttacctta 247366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 123; Significance: 4e-63; HSPs: 2)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 11 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 128431 - 128095
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 110  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||| | || |||||||||  |||||||| |||| |||| | ||||||||||| |||||||||| | |||||||    
T  128431 catcatcaattcatgaatatgcatacccaatcaattattcatcaatcacaacatccattaacatccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaatt 128332  T
Q  111 caactacaacatgtcaaattcatccatttg--cacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttat 208  Q
     ||| ||||| |  |||| |   ||| |||  ||||||||||| |||||  ||  | |||| |||| |||||| ||| | |||||||||| |||| ||||    
T  128331 -aacaacaacctaacaaaattcgccaattgagcacaattttcacaacttaacacctttacacatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaattat 128233  T
Q  209 tatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaa 308  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  |||||    
T  128232 catcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttgaagcacgaatttagcaacaattatccataagcaaaattcatacaacttttgaaaatttgcaaaa 128133  T
Q  309 tgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttacctta 345  Q
    ||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  128132 tgaagatgattatgataaagactaacccccttacctta 128095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 148 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 31787 - 31697
Alignment:
Q  148 ttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca 238  Q
    |||||||||| |||||| | ||||| | || ||| ||| | |||||||||||||||  ||  |||||||||||||| |||||||| |||||    
T  31787 ttcataacttatcatttttgcatatatgaatatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacatcaattcatgcattcaaacataacatca 31697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 122; Significance: 2e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 11 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 6326 - 5990
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 110  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| | || |||||||||  | ||||   |||| |||| | ||||||| ||| |||||||||| | |||||||    
T  6326 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataacaaaaattaacatccataacatcacttgaacaagaatcaaatctcaatt 6227  T
Q  111 caactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttat 208  Q
     ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||| | ||||| | |||| ||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| ||||    
T  6226 -aacaacaacttagcaaaattcaccaattcagcacaatttttacaacttattatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat 6128  T
Q  209 tatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaa 308  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||  ||||     
T  6127 catcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataatcacaattcatacaacatttgagaatttgcaaag 6028  T
Q  309 tgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttacctta 345  Q
    |||  ||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  6027 tgaaaatgattatgataaagactaacccccttacctta 5990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 122; Significance: 2e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 140 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 51314 - 51121
Alignment:
Q  140 gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaa 239  Q
    |||||||||||| ||||| |||||| ||| ||||| |||||| ||| | |||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||     
T  51314 gcacaattttcacaacttatcatttttacctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaattcatgcatacaaatatatcatcac 51215  T
Q  240 agttggagcacaaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaa 333  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  51214 agttggagcacgaatttagcaacaattatccataagcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaa 51121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 121; Significance: 7e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 11 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 5324 - 4996
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 110  Q
    |||| ||||| |||||||||| |||||||| | ||||||||||||  |||||||| |||| || | | ||||||||||| |||||||||||| |||| |     
T  5324 catcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaatcacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcattc 5225  T
Q  111 caactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttat 208  Q
     ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||| | | | |||||||||| |||| ||||    
T  5224 taacaacaactttgcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtactttcaccaacaatcttacaattat 5125  T
Q  209 tatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataat-caaaattcatacaacatttgaaaattcacaaa 307  Q
     ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||| || |||||||||||||| |||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  5124 catcaattcacgcatacaaacatatcgtcacagttggagtacgaatttagcaacaattatccattatgaaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaa 5025  T
Q  308 atgatgatgattatggtaaagactaaccc 336  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  5024 atgataatgattatgataaagactaaccc 4996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 119; Significance: 1e-60; HSPs: 2)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 11 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 26678 - 26340
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 110  Q
    |||| ||||| ||| |||||| |||||||| | ||||||||||||  |||||||| |||| || | | ||||||||||| |||||||||||| |||| |     
T  26678 catcctcaattcatcaatatgcatacccaagcaatgattcatcaatcacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcattc 26579  T
Q  111 caactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttat 208  Q
     ||| ||||| |  |||| |||| | |||  | |||||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||| | | | ||||| |||| |||| ||||    
T  26578 taacaacaacttagcaaaattcaccaattgagaacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtactttcaccaataatcttacaattat 26479  T
Q  209 tatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataat-caaaattcatacaacatttgaaaattcacaaa 307  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||| ||  ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26478 catcaattcacgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatacattatgaaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaa 26379  T
Q  308 atgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttacctta 345  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  26378 atgatcatgattatgataaagactaacccccttacctta 26340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 11 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 8440 - 8180
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 110  Q
    |||||||||| |||| ||||| |||||||| | ||||||||| ||| |||||||| |||| || ||||||||||||||| ||| |  ||  | |  ||||    
T  8440 catcatcaattcatgtatatgcatacccaagccatgattcataaacaacaacatcaattaacaacaacaacatcaattgaacatggttctcatcataatt 8341  T
Q  111 caactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttat 208  Q
    ||||   |||||  |||| |||| | |||  |||||||||||| |||||| ||||| |||||| || ||| || ||| | ||||||||||||||| ||||    
T  8340 caac---aacatagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacctgtaatttcaccaacaatcatacaattat 8244  T
Q  209 tatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 272  Q
     | ||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||||||||||| ||||||    
T  8243 caccaattcatgcatacaaacataacatcacagttagagcacgaatttagcaacaattatccat 8180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 119; Significance: 1e-60; HSPs: 2)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 107 - 272
Target Start/End: Original strand, 26892 - 27058
Alignment:
Q  107 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact 205  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| |    
T  26892 aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat 26991  T
Q  206 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 272  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  26992 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 27058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #2
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 107 - 265
Target Start/End: Original strand, 22637 - 22796
Alignment:
Q  107 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact 205  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| |    
T  22637 aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat 22736  T
Q  206 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaat 265  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22737 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaat 22796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 119; Significance: 1e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 107 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 1748 - 1582
Alignment:
Q  107 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact 205  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| |    
T  1748 aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat 1649  T
Q  206 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 272  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  1648 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 1582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 118; Significance: 4e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 11 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 123427 - 123087
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 110  Q
    |||| ||||| |||||||||| |||||||| | || |||||||||| |||||||| |||| || | | ||||||||||| |||||||||||| || |||     
T  123427 catcttcaattcatgaatatgcatacccaagccattattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattgaacaagaatcataacttaatc 123328  T
Q  111 caactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttat 208  Q
     ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| | | ||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| ||||    
T  123327 taacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat 123228  T
Q  209 tatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaattcac-a 305  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||| |||||| ||   ||||||||||||||||||| ||||| || |    
T  123227 catcaattcatgcatacaaacatatcatcacaattggagcacgaatttagcaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttgcaaatttacaa 123128  T
Q  306 aaatgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttacctta 345  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  123127 aaattatgatgattatggtgaagactaacccccttacctta 123087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0498 (Bit Score: 114; Significance: 1e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0498
Description:

Target: scaffold0498; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 11 - 345
Target Start/End: Original strand, 8878 - 9215
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 110  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||| | || |||||||||  |||||||| |||| |||| | ||||||||||| |||||||||| | ||||| |    
T  8878 catcatcaatacatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat 8977  T
Q  111 caactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttat 208  Q
     ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| |||||  ||||| |||||| || |||||| ||| | |||||||||| |||| ||||    
T  8978 taacaacaacttaacaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttaacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaattat 9077  T
Q  209 tatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaa 308  Q
     ||| ||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||| ||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||| ||||||||||  |||||    
T  9078 catcgattcatgcatacaaacataacatcacaaatggagcacgaatttagcaacaattttccataagcaaaattcgtacaacttttgaaaatttgcaaaa 9177  T
Q  309 tgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttacctta 345  Q
    ||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  9178 tgaagatgattatgataaagactaacccccttacctta 9215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 112; Significance: 2e-56; HSPs: 3)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 11 - 334
Target Start/End: Original strand, 8849 - 9180
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 110  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||| ||||  | ||| ||||||||||| |||  ||||||| |||||||    
T  8849 catcatcaattcatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaatagcaataacatcaattgaacattaatcatatctcaatt 8948  T
Q  111 caactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttat 208  Q
    |||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| |||||| ||||| |||||| || |||||| ||| | ||||||||||||||| ||||    
T  8949 caacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat 9048  T
Q  209 tatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatcca--taatcaaaattcatacaacatttgaaaattcacaa 306  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| |||||  ||   ||||| ||||| ||||||||||| |  |||    
T  9049 catcaattcatgcatacaaacatatcatcacagatggagcacgaatttagcaacaattatccaattatgaaaaatacataccacatttgaaaaattgcaa 9148  T
Q  307 a----atgatgatgattatggtaaagactaac 334  Q
    |    ||||||||||||||| | |||||||||    
T  9149 aaatgatgatgatgattatgatgaagactaac 9180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 11 - 304
Target Start/End: Original strand, 148721 - 149018
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 110  Q
    |||||||||| |||||||||  |||||||| | ||||||||||||| ||||| || |||| || | | ||||||||||| |||||||||| | ||||| |    
T  148721 catcatcaattcatgaatatacatacccaagcaatgattcatcaaccacaacttcaattaacaaccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat 148820  T
Q  111 caactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttat 208  Q
     ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||| ||| | |||||||||| |||| ||||    
T  148821 taacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaattat 148920  T
Q  209 tatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaattcac 304  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| || ||   |||||||||||||||||||||| |||||    
T  148921 catcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacaaatttaacaacaattatcaattatgcaaaaattcatacaacatttgaaatttcac 149018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #3
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 252 - 345
Target Start/End: Original strand, 146844 - 146938
Alignment:
Q  252 aatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttacctta 345  Q
    ||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  146844 aatttaggaacaattatccataagcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 146938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 98; Significance: 3e-48; HSPs: 2)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 140 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 89586 - 89378
Alignment:
Q  140 gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaa 239  Q
    |||||||||||| ||||| | |||| | | ||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||     
T  89586 gcacaattttcacaacttataatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaatatatcatcac 89487  T
Q  240 agttggagcacaaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaa-ccc 336  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||   |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||| | |||||||| |||    
T  89486 agttggagcacgaatttagcaacaattatccattatgcaaaaattcatagaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgatcatgatgaagactaacccc 89387  T
Q  337 cttacctta 345  Q
    |||||||||    
T  89386 cttacctta 89378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 221 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 107835 - 107708
Alignment:
Q  221 catacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataatc--aaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgat 318  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||| |||||| ||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  107835 catacaaatatatcatcacagttggagcacgaatttagcaaaaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgat 107736  T
Q  319 tatggtaaagactaa-ccccttacctta 345  Q
     ||| | |||||||| ||||||||||||    
T  107735 catgatgaagactaacccccttacctta 107708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 11 - 265
Target Start/End: Original strand, 48187 - 48443
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 110  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||  | || |||||||||  |||||||| |||| |||| | ||||||||||| |||||||||| | ||||| |    
T  48187 catcatcaatccatgaatatgcatacccaggcaattattcatcaatcacaacatcaattaacatctataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat 48286  T
Q  111 caactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttat 208  Q
     ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| |||| |||| |||||| ||| | ||||||||||||||| ||||    
T  48287 taacaacaacttaacaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacacatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat 48386  T
Q  209 tatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaat 265  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||    
T  48387 catcaattcatgcatacaaacatatcattacagttggagcacgaatttagcaacaat 48443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 96; Significance: 5e-47; HSPs: 2)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 11 - 272
Target Start/End: Original strand, 13506 - 13769
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 110  Q
    |||| ||||| |||||||||| ||||||||   ||||||||||||| |||||||| |||| || ||||||||||||||| ||| |  ||  | |  ||||    
T  13506 catcgtcaattcatgaatatgcatacccaagtcatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaacaacatcaattgaacatggttctcatcataatt 13605  T
Q  111 caactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttat 208  Q
    |||| |||||||  |||| |||||| |||  |||||||||||| |||||| ||||| |||||| || |||||| ||| | ||||||||||||||| ||||    
T  13606 caacaacaacatagcaaaattcatcaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat 13705  T
Q  209 tatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 272  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||    
T  13706 catcaattcatgcatacaaacataacatcaaagttagagcacgaatttagcaacaattatccat 13769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 314 - 378
Target Start/End: Original strand, 42677 - 42739
Alignment:
Q  314 atgattatggtaaagactaacccc-ttaccttaattatctccaactactagctctagcttcacttt 378  Q
    ||||||||| |||| ||||||||| |||||||   |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  42677 atgattatgataaaaactaacccccttacctt---tatctccaactattagctctagcttcacttt 42739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 89; Significance: 8e-43; HSPs: 3)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 11 - 265
Target Start/End: Original strand, 107747 - 108003
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 110  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||| | || |||||||||  |||||||| |||| |||| | ||||||||||| |||||||||| | ||||| |    
T  107747 catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat 107846  T
Q  111 caactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttat 208  Q
     ||| ||||| | ||||| |||| | |||  |||||||||| | ||||| |||||| | || |||| |||||| ||| | ||||||||||||||| ||||    
T  107847 taacaacaacttatcaaaattcaccaattgagcacaatttttacaacttatcatttttgcacatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat 107946  T
Q  209 tatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaat 265  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||| ||||||    
T  107947 catcaattcatgcatacaaacatatcattacagttggagcacgaatttagtaacaat 108003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 140 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 64648 - 64585
Alignment:
Q  140 gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcataca 203  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  64648 gcacaatattcataacttatcatttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcataca 64585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 215 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 89905 - 89863
Alignment:
Q  215 ttcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaattta 257  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  89905 ttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaattta 89863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 86; Significance: 5e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 11 - 272
Target Start/End: Original strand, 41648 - 41911
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 110  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||| | ||||||||||||| ||||||||  ||| || ||||||||||||||| ||| |  ||  | |  ||||    
T  41648 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcatttaacaacaacaacatcaattgaacatggttctcatcataatt 41747  T
Q  111 caactacaacatgtcaaa-ttcatccatttg--cacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacactta 207  Q
    |||| |||||||  |||| |||| ||| |||  ||||||||||| |||||| ||||| |||||| || |||||| ||| | ||||||||||||||| |||    
T  41748 caacaacaacatagcaaaattca-ccaattgaacacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 41846  T
Q  208 ttatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 272  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||| ||||||| ||||||    
T  41847 tcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagttagagcacgaatttaacaacaattatccat 41911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1542 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold1542
Description:

Target: scaffold1542; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 11 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 797 - 534
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 110  Q
    |||| ||||| | |||||||| |||||||| | ||||||||||||| |||||||| ||||||| | | ||||||||||  |||||||||||| || |||     
T  797 catcctcaattcctgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattagcagccataacatcaattaaacaagaatcataacttaatc 698  T
Q  111 caactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttat 208  Q
     |||   ||| |  |||| |||| | |||  | |||||||||| ||||  |||||| | | ||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| ||||    
T  697 taacagtaacttagcaaaattcaccaattgagtacaattttcacaactcatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattat 598  T
Q  209 tatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 272  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  597 catcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0772 (Bit Score: 78; Significance: 3e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0772
Description:

Target: scaffold0772; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 140 - 265
Target Start/End: Original strand, 5660 - 5785
Alignment:
Q  140 gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaa 239  Q
    ||||||| ||||| |||| |||||| |||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5660 gcacaatattcatgacttatcatttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatcatcatcaattcatgcatacaaacataacatcaa 5759  T
Q  240 agttggagcacaaatttagcaacaat 265  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||    
T  5760 agttggagcacgaatttagcaacaat 5785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 11 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 34724 - 34460
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgca-caagaatcatagctcaat 109  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||||| |||||||| | || || ||| ||||||||||  | || |||||||| ||||||    
T  34724 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagtagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaataacatcaattaaaacatgaatcatatctcaat 34625  T
Q  110 tcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacactta 207  Q
    ||||| ||||| |  |||| |||| | |||  | |||||||||| ||||||  |||| |||| | || |||||| ||| | ||||||||||||||| |||    
T  34624 tcaacaacaacttagcaaaattcacctattgagaacaattttcacaacttcatatttttacacaattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 34525  T
Q  208 ttatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 272  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||||||| ||| ||||||    
T  34524 tcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagttagagcacgaatttagcaataattatccat 34460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 15 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 9596 - 9371
Alignment:
Q  15 atcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaac 114  Q
    |||||| |||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| || | | ||||||| |||  ||||||||| | ||||| | |||    
T  9596 atcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacaaccataacatcatttgagcaagaatcaaatctcaaattaac 9497  T
Q  115 tacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatc 212  Q
     | ||| |  |||| |||| | |||  |||| ||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| |||    
T  9496 aataacttagcaaaattcaccaattgagcaccattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatc 9397  T
Q  213 aattcatgcatacaaacatatcatca 238  Q
    |||||||||||||||||||| |||||    
T  9396 aattcatgcatacaaacataacatca 9371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 15 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 16494 - 16269
Alignment:
Q  15 atcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaac 114  Q
    |||||| |||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| || | | ||||||| |||  ||||||||| | ||||| | |||    
T  16494 atcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacaaccataacatcatttgagcaagaatcaaatctcaaattaac 16395  T
Q  115 tacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatc 212  Q
     | ||| |  |||| |||| | |||  |||| ||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| |||    
T  16394 aataacttagcaaaattcaccaattgagcaccattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatc 16295  T
Q  213 aattcatgcatacaaacatatcatca 238  Q
    |||||||||||||||||||| |||||    
T  16294 aattcatgcatacaaacataacatca 16269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0529 (Bit Score: 66; Significance: 4e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0529
Description:

Target: scaffold0529; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 15 - 261
Target Start/End: Original strand, 2966 - 3215
Alignment:
Q  15 atcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgca-caagaatcatagctcaattcaa 113  Q
    |||||| |||||||||| |||| ||| |  |||||||||||| |||||||| | || || ||| ||||||||||  | || |||||||| ||||||||||    
T  2966 atcaattcatgaatatgcatacacaagcagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaataacatcaattaaaacatgaatcatatctcaattcaa 3065  T
Q  114 ctacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattat 211  Q
    | ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| |||||| ||||| |||||| || |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||    
T  3066 caacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcat 3165  T
Q  212 caattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaa 261  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||| ||   |||||| ||||||||||    
T  3166 caattcatggatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcaa 3215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 56; Significance: 4e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 11 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 5466 - 5254
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 110  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||| | || |||||| ||  |||||||| |||| |||  | ||||||||||| |||||||||| | ||||| |    
T  5466 catcatcaatccatgaatatgca-acccaagcaattattcattaatcacaacatcaattaacattcataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat 5368  T
Q  111 caactacaacatgtcaaa-ttcatccatttg--cacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacactta 207  Q
     ||| |||||    |||| |||| ||| |||  ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| |||    
T  5367 taacaacaactcagcaaaattca-ccaattgaacacaattttcataacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 5269  T
Q  208 ttatcaattcatgca 222  Q
    | |||||||||||||    
T  5268 tcatcaattcatgca 5254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 140 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 13445 - 13347
Alignment:
Q  140 gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca 238  Q
    |||| ||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13445 gcaccattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatca 13347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 140 - 238
Target Start/End: Original strand, 167 - 265
Alignment:
Q  140 gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca 238  Q
    ||||||| | |||||||| |||||| |||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  167 gcacaatatacataacttatcatttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatcatcatcaattcatgcatacaaacataacatca 265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0622 (Bit Score: 51; Significance: 4e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0622
Description:

Target: scaffold0622; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 11 - 109
Target Start/End: Original strand, 9382 - 9480
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaat 109  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||| | ||||||||||||| |||||||| |||| || | | ||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  9382 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaat 9480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0369 (Bit Score: 51; Significance: 4e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0369
Description:

Target: scaffold0369; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 11 - 222
Target Start/End: Original strand, 3722 - 3936
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 110  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||   || |||||||||  | |||||| |||| |||  | ||||||||||| |||||||||| | ||||| |    
T  3722 catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagtaattattcatcaatcataacatcaattaacattcataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat 3821  T
Q  111 caactacaacatgtcaaa-ttcatccatttg-cacaattttcataacttctcatttct-acatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacactta 207  Q
     ||| ||||| |  |||| |||| | ||| | |||||||| |||||||| |||||| | |||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| |||    
T  3822 taacaacaacttagcaaaattcaccaattggacacaatttccataacttatcattttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 3921  T
Q  208 ttatcaattcatgca 222  Q
    | |||||||||||||    
T  3922 tcatcaattcatgca 3936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 51; Significance: 4e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 11 - 237
Target Start/End: Original strand, 42997 - 43226
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 110  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||| | || |||||||||  | || ||| | || |||  | ||||||| ||| ||| |||||| | ||||| |    
T  42997 catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcacttgaacacgaatcacatctcaaat 43096  T
Q  111 caactacaacat--gtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacactta 207  Q
     ||| ||||| |  |  ||||||| | |||| ||||||| ||||||||||  ||||| ||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| |||    
T  43097 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 43196  T
Q  208 ttatcaattcatgcatacaaacatatcatc 237  Q
    | ||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  43197 tcatcaattcatgcatagaaacataacatc 43226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 47; Significance: 9e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 140 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 14181 - 14083
Alignment:
Q  140 gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca 238  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| ||||||||| |||||| ||| | || |||||||||| | |||| ||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  14181 gcacaatcttcataacttatcatttttacatatttcaacatgtaatttcactaacaatcatataattatcatcaattcatgcatacagacataacatca 14083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 143 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 21233 - 21138
Alignment:
Q  143 caattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca 238  Q
    |||| |||||||||| |||||| ||||||||| |||||| ||| | || |||||||||| | |||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||    
T  21233 caatcttcataacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcactaacaatcatataattatcatcaattaatggatacaaacataacatca 21138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 46; Significance: 4e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 314 - 378
Target Start/End: Original strand, 80187 - 80252
Alignment:
Q  314 atgattatggtaaagactaacccc-ttaccttaattatctccaactactagctctagcttcacttt 378  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  80187 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactattagctcaagcttcacttt 80252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1711 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold1711
Description:

Target: scaffold1711; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 140 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 1424 - 1304
Alignment:
Q  140 gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaa 239  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| | |||||| ||| | |||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||| |||||     
T  1424 gcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcac 1325  T
Q  240 agttggagcacaaatttagca 260  Q
    ||   |||||| |||||||||    
T  1324 agcaagagcacgaatttagca 1304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 11 - 222
Target Start/End: Original strand, 54416 - 54630
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 110  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||| | || ||||||||  |||  | ||||||||||||| | ||| |||||| | |||| ||    
T  54416 catcatcaatccataaatatgtatacccaactcatgattcacccacaacaacatcagttaatagcaacaacatcaatggaacatgaatcacatctcattt 54515  T
Q  111 caactacaacatgtc-aaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacata--tttaaacatggaatctaaccaacaatcatacactt 206  Q
    |||| ||||||| || ||||||| | |||  | |||| |||||||||||  ||||| ||||||  || ||||||| ||| | ||| ||||||||||| ||    
T  54516 caacaacaacatatcaaaattcaccaattgagtacaa-tttcataacttgacatttatacatactttgaaacatgcaatttcacccacaatcatacaatt 54614  T
Q  207 attatcaattcatgca 222  Q
    || |||||||||||||    
T  54615 atcatcaattcatgca 54630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 313 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 162111 - 162045
Alignment:
Q  313 gatgattatggtaaagactaacccc-ttaccttaattatctccaactactagctctagcttcacttt 378  Q
    |||||||||| | || ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  162111 gatgattatgatgaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttt 162045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 313 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 166197 - 166131
Alignment:
Q  313 gatgattatggtaaagactaacccc-ttaccttaattatctccaactactagctctagcttcacttt 378  Q
    |||||||||| | || ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  166197 gatgattatgatgaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttt 166131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0686 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000009; HSPs: 2)
Name: scaffold0686
Description:

Target: scaffold0686; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 314 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 5809 - 5744
Alignment:
Q  314 atgattatggtaaagactaacccc-ttaccttaattatctccaactactagctctagcttcacttt 378  Q
    ||||||||| | || ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5809 atgattatgatgaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttt 5744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0686; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 314 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 6015 - 5950
Alignment:
Q  314 atgattatggtaaagactaacccc-ttaccttaattatctccaactactagctctagcttcacttt 378  Q
    ||||||||| | || ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6015 atgattatgatgaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttt 5950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 314 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 31212 - 31147
Alignment:
Q  314 atgattatggtaaagactaacccc-ttaccttaattatctccaactactagctctagcttcacttt 378  Q
    |||||| || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  31212 atgattgtgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttt 31147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 313 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 385 - 319
Alignment:
Q  313 gatgattatggtaaagactaacccc-ttaccttaattatctccaactactagctctagcttcacttt 378  Q
    |||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||    
T  385 gatgattatgataaagaataaccccgttaccttaattatcaccaactattagctcaagcttcacttt 319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0361 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0361
Description:

Target: scaffold0361; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 189 - 272
Target Start/End: Original strand, 3370 - 3453
Alignment:
Q  189 accaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 272  Q
    |||||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||| || ||||| || | |||||| ||||||||| |||| ||||||    
T  3370 accaacaatcatacaaatatcattaattcatgcatacaaacttaacatcacagctagagcacgaatttagcatcaattatccat 3453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0361; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 13 - 65
Target Start/End: Original strand, 3210 - 3262
Alignment:
Q  13 tcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatc 65  Q
    |||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||||||||  ||||||||    
T  3210 tcatcaattcatgaatatgcctacccaaacaatgattcatcaatcacaacatc 3262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 11 - 100
Target Start/End: Original strand, 48514 - 48603
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatca 100  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||| | || |||||||||  | |||||| |||| |||| | |||||||| || ||||||||||    
T  48514 catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataacatcaattaacatccataacatcaagtgaacaagaatca 48603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 35 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 197477 - 197390
Alignment:
Q  35 acccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat 122  Q
    |||||||| |||| |||||||| |||| |||  |||||| ||||||||||||||| ||| |||||  | | ||||||||| |||||||    
T  197477 acccaaaccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatctcatcacaattcaacaacaacat 197390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 104871 - 104793
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaat-atgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaatt 88  Q
    |||||||||| ||||||| ||| |||||||| | |||| |||||||| |||| |||  |||||| ||||||||||||||    
T  104871 catcatcaattcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaatt 104793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0970 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0970
Description:

Target: scaffold0970; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 28 - 89
Target Start/End: Original strand, 2471 - 2532
Alignment:
Q  28 tatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattg 89  Q
    |||| |||||||| | |||| |||||||| ||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  2471 tatgaatacccaagccatgaatcatcaacaacaacatcacttagcaacaacaacatcaattg 2532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0456
Description:

Target: scaffold0456; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 215 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 1587 - 1546
Alignment:
Q  215 ttcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaattt 256  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||    
T  1587 ttcatgcatacaaacatatcatcatagttagagcacgaattt 1546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 215 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 8732 - 8691
Alignment:
Q  215 ttcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaattt 256  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||    
T  8732 ttcatgcatacaaacatatcatcatagttagagcacgaattt 8691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 215 - 256
Target Start/End: Original strand, 8216 - 8257
Alignment:
Q  215 ttcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaattt 256  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||    
T  8216 ttcatgcatacaaacatatcatcatagttagagcacgaattt 8257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 147 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 56226 - 56106
Alignment:
Q  147 tttcataacttctcatttctacatattt--aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttg 244  Q
    |||||||||||  ||||| |||||| ||  ||||||| ||| | | | ||||||||||| |||| ||||| ||||||| || || ||| ||||| ||||     
T  56226 tttcataacttgacatttatacatactttaaaacatgtaatttcagccacaatcatacaattatcatcaaatcatgcacacgaaaataacatcacagtta 56127  T
Q  245 gagcacaaatttagcaacaat 265  Q
    |||||| |||||| |||||||    
T  56126 gagcacgaatttaacaacaat 56106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 215 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 70348 - 70307
Alignment:
Q  215 ttcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaattt 256  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||    
T  70348 ttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagtacgaattt 70307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1164 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold1164
Description:

Target: scaffold1164; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 334 - 378
Target Start/End: Original strand, 1721 - 1765
Alignment:
Q  334 ccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcacttt 378  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| || ||| |||||||||||    
T  1721 ccccttaccttaattatcaccaactattaactcaagcttcacttt 1765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0876 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0876
Description:

Target: scaffold0876; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 334 - 378
Target Start/End: Original strand, 114 - 158
Alignment:
Q  334 ccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcacttt 378  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| || ||| |||||||||||    
T  114 ccccttaccttaattatcaccaactattaactcaagcttcacttt 158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0700 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0700
Description:

Target: scaffold0700; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 35 - 99
Target Start/End: Original strand, 2548 - 2612
Alignment:
Q  35 acccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatc 99  Q
    |||||||| |||| |||||||| |||| |||  |||||| ||||||||||||||| ||| |||||    
T  2548 acccaaaccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatc 2612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 334 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 19861 - 19817
Alignment:
Q  334 ccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcacttt 378  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| || ||| |||||||||||    
T  19861 ccccttaccttaattatcaccaactattaactcaagcttcacttt 19817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University