View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF17757_high_2 (Length: 427)

Name: NF17757_high_2
Description: NF17757
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF17757_high_2
NF17757_high_2
[»] chr6 (44 HSPs)
chr6 (9-413)||(26143460-26143864)
chr6 (9-413)||(25580314-25580718)
chr6 (9-413)||(25483651-25484055)
chr6 (9-413)||(25539135-25539539)
chr6 (9-413)||(26056514-26056918)
chr6 (9-413)||(26076484-26076888)
chr6 (9-413)||(26656557-26656961)
chr6 (9-413)||(26762528-26762932)
chr6 (9-413)||(26647071-26647475)
chr6 (9-413)||(26753039-26753443)
chr6 (9-358)||(26862227-26862576)
chr6 (9-407)||(26884668-26885066)
chr6 (9-355)||(27337281-27337627)
chr6 (9-355)||(27398021-27398367)
chr6 (9-360)||(27530487-27530838)
chr6 (9-257)||(25511640-25511888)
chr6 (9-413)||(26623863-26624267)
chr6 (9-413)||(26729840-26730244)
chr6 (9-360)||(28786883-28787234)
chr6 (9-360)||(28793004-28793355)
chr6 (9-360)||(27717685-27718036)
chr6 (9-360)||(27610306-27610657)
chr6 (9-403)||(31285161-31285555)
chr6 (9-360)||(25492505-25492856)
chr6 (9-360)||(28781746-28782097)
chr6 (9-413)||(27215044-27215448)
chr6 (9-360)||(27603890-27604241)
chr6 (9-349)||(27705590-27705930)
chr6 (9-349)||(26803102-26803442)
chr6 (12-349)||(27426801-27427138)
chr6 (9-349)||(27679606-27679946)
chr6 (9-360)||(27697772-27698123)
chr6 (303-413)||(25511530-25511640)
chr6 (9-362)||(27592207-27592560)
chr6 (155-360)||(26824464-26824669)
chr6 (9-349)||(27676806-27677146)
chr6 (162-245)||(28140295-28140378)
chr6 (168-244)||(26937790-26937866)
chr6 (155-237)||(28097775-28097857)
chr6 (191-256)||(26849461-26849526)
chr6 (174-262)||(28243538-28243626)
chr6 (155-237)||(26950511-26950593)
chr6 (191-256)||(26975700-26975765)
chr6 (174-246)||(29843338-29843410)
[»] chr1 (3 HSPs)
chr1 (8-360)||(28126860-28127212)
chr1 (8-352)||(28163561-28163904)
chr1 (9-360)||(267526-267877)
[»] chr4 (7 HSPs)
chr4 (9-360)||(18678742-18679093)
chr4 (9-360)||(18698582-18698933)
chr4 (9-349)||(18654659-18654999)
chr4 (9-349)||(18730686-18731026)
chr4 (9-349)||(18723267-18723607)
chr4 (12-349)||(18074417-18074754)
chr4 (154-262)||(5090284-5090392)
[»] scaffold0419 (1 HSPs)
scaffold0419 (9-360)||(8132-8483)
[»] scaffold0277 (2 HSPs)
scaffold0277 (9-360)||(12861-13212)
scaffold0277 (9-360)||(3898-4249)
[»] scaffold0349 (1 HSPs)
scaffold0349 (9-360)||(2725-3076)
[»] chr8 (1 HSPs)
chr8 (9-360)||(29273024-29273375)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (12-349)||(60225-60562)
[»] chr2 (2 HSPs)
chr2 (155-254)||(3280410-3280509)
chr2 (155-260)||(17992547-17992652)
[»] chr5 (1 HSPs)
chr5 (155-254)||(16691618-16691717)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (174-262)||(43700-43788)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 364; Significance: 0; HSPs: 44)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 364; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 26143864 - 26143460
Alignment:
Q  9 acatcatcaagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttccttaatgattgaaattccctcactaacatctcctaacttttggttcaatttaactg 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26143864 acatcatcaagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttccttaatgattgaaattccctcactaacatctcctaacttatggttcaatttaactg 26143765  T
Q  109 ttcttaaaaggagatcttcctggagatgtttcagtttattatgacttgaattctctctgacattatgaagaaaacatacactttcaaattgatcagcaac 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26143764 ttcttaaaaggagatcttcctggagatgtttcaggttattatgacttgaattctctctgacattatgaagaaaacatacaccttcaaattgatcagcaac 26143665  T
Q  209 aaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccatgtcaagaagc 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26143664 aaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagtaccaaaaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccatgtcaagaagc 26143565  T
Q  309 aatttcacttgttctattcgggactgtaatccaacagggtatttggctacatttnnnnnnncatgattgatattgttggagatgtcttcgactatcttct 408  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26143564 aatttcacttcttctattcgggactgtaatccaacagggtatttggctacatttaaaaaaacatgattgatattgttggagatgtcttcgactatcttct 26143465  T
Q  409 caata 413  Q
    |||||    
T  26143464 caata 26143460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 9 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 25580718 - 25580314
Alignment:
Q  9 acatcatcaagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttccttaatgattgaaattccctcactaacatctcctaacttttggttcaatttaactg 108  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||  |||||||||     
T  25580718 acatcatcaaaaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttccttaatgattgaaattccctcactaacatctactaacttaaagtaaaatttaacta 25580619  T
Q  109 ttcttaaaaggagatcttcctggagatgtttcagtttattatgacttgaattctctctgacattatgaagaaaacatacactttcaaattgatcagcaac 208  Q
    || ||||||||||||  |  |||||||||||||  |||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25580618 ttattaaaaggagataataatggagatgtttcaagttattaagaattgaaatctctctgacattatgaagaaaacatacaccttcaaattgatcagcaac 25580519  T
Q  209 aaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccatgtcaagaagc 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  25580518 aaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgtggaccacatcctcagagcccatgtcaagaagc 25580419  T
Q  309 aatttcacttgttctattcgggactgtaatccaacagggtatttggctacatttnnnnnnncatgattgatattgttggagatgtcttcgactatcttct 408  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25580418 aatttcacttgttctattcgggactgtaatccaacagggtatttggctacgtttaaaaaaacatgattgatattgttggagatgtcttcgactatcttct 25580319  T
Q  409 caata 413  Q
    |||||    
T  25580318 caata 25580314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 9 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 25484055 - 25483651
Alignment:
Q  9 acatcatcaagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttccttaatgattgaaattccctcactaacatctcctaacttttggttcaatttaactg 108  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||| |||||||   ||  |||||||||     
T  25484055 acatcatcaacaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttcctttatgattggtattccctcactaacatcttctaacttaccgtcaaatttaacta 25483956  T
Q  109 ttcttaaaaggag-atcttcctggagatgtttcagtttattatgacttgaattctctctgacattatgaagaaaacatacactttcaaattgatcagcaa 207  Q
    || || ||||||| |||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25483955 tttttgaaaggagcatcttt-tggagatgtttcaggttattatgacttgaattctctctgacattatgaagaaaacatacaccttcaaattgatcagcaa 25483857  T
Q  208 caaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccatgtcaagaag 307  Q
     ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25483856 gaaaattaaaaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagtaccaaaaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccatgtcaagaag 25483757  T
Q  308 caatttcacttgttctattcgggactgtaatccaacagggtatttggctacatttnnnnnnncatgattgatattgttggagatgtcttcgactatcttc 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||       |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  25483756 caatttcacttgttctattcgggactgtaatccaacagggtatttggctacgtttaaaaaatcatgattgatattgttggagatgtattggactatcttc 25483657  T
Q  408 tcaata 413  Q
    ||||||    
T  25483656 tcaata 25483651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 9 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 25539539 - 25539135
Alignment:
Q  9 acatcatcaagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttccttaatgattgaaattccctcactaacatctcctaacttttggttcaatttaactg 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||| |||||||   ||  |||||||||     
T  25539539 acatcatcaagaatcaaaagaatcttctttttagatagtctttcctttatgattgttattccctcactaacatcttctaacttaccgtcaaatttaacta 25539440  T
Q  109 ttcttaaaaggagatcttcctggagatgtttcagtttattatgacttgaattctctctgacattatgaagaaaacatacactttcaaattgatcagcaac 208  Q
    || || ||||||| |  |  |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  25539439 tttttgaaaggagcttcttttggagatgtttcaagttattatgacttgaattctctctgacattatgaagaaaacatacaacttcaaattgatcagcaac 25539340  T
Q  209 aaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccatgtcaagaagc 308  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25539339 aaaattaaaaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccaagtcaagaagc 25539240  T
Q  309 aatttcacttgttctattcgggactgtaatccaacagggtatttggctacatttnnnnnnncatgattgatattgttggagatgtcttcgactatcttct 408  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25539239 aatttcacttgttctattggggactgtaatccaacagggtatttggccacatataaaaaaacatgattgatattgttggagatgtcttcgactatcttct 25539140  T
Q  409 caata 413  Q
    |||||    
T  25539139 caata 25539135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 9 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 26056918 - 26056514
Alignment:
Q  9 acatcatcaagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttccttaatgattgaaattccctcactaacatctcctaacttttggttcaatttaactg 108  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||||||||||||| ||||||    ||  |||||||||     
T  26056918 acatcgtcaagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttcctttataattggtattccctcactaacatcttctaactgaccgtcaaatttaacta 26056819  T
Q  109 ttcttaaaaggagatcttcctggagatgtttcagtttattatgacttgaattctctctgacattatgaagaaaacatacactttcaaattgatcagcaac 208  Q
    || || ||||||| |  | ||||||||||||||  || ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  26056818 tttttgaaaggagcttcttctggagatgtttcaagttcttaagagttgaattctctctgacattatgaagaaaacatacaccttcaaattgatcagcaat 26056719  T
Q  209 aaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccatgtcaagaagc 308  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26056718 agaattaaaaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccggtaccaaaaattcctaccatgcggacctcattctcagagcccatgtcaagaagc 26056619  T
Q  309 aatttcacttgttctattcgggactgtaatccaacagggtatttggctacatttnnnnnnncatgattgatattgttggagatgtcttcgactatcttct 408  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||       |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  26056618 aatttcacttgttctattcgggactgcaatccaacagggtatttggctacgtttaaaaaaacatgattgatcttgttggagatgccttcgactatcttct 26056519  T
Q  409 caata 413  Q
    |||||    
T  26056518 caata 26056514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 9 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 26076888 - 26076484
Alignment:
Q  9 acatcatcaagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttccttaatgattgaaattccctcactaacatctcctaacttttggttcaatttaactg 108  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||||||||||||| ||| ||    ||  |||||||||     
T  26076888 acatcgtcaagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttcctttataattggtattccctcactaacatcttctatctgaccgtcaaatttaacta 26076789  T
Q  109 ttcttaaaaggagatcttcctggagatgtttcagtttattatgacttgaattctctctgacattatgaagaaaacatacactttcaaattgatcagcaac 208  Q
    || || ||||||| |  | ||||||||||||||  || ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  26076788 tttttgaaaggagcttcttctggagatgtttcaagttcttaagagttgaattctctctgacattatgaagaaaacatacaccttcaaattgatcagcaat 26076689  T
Q  209 aaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccatgtcaagaagc 308  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26076688 agaattaaaaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccggtaccaaaaattcctaccatgcggacctcattctcagagcccatgtcaagaagc 26076589  T
Q  309 aatttcacttgttctattcgggactgtaatccaacagggtatttggctacatttnnnnnnncatgattgatattgttggagatgtcttcgactatcttct 408  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||       |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  26076588 aatttcacttgttctattcgggactgcaatccaacagggtatttggctacgtttaaaaaaacatgattgatcttgttggagatgccttcgactatcttct 26076489  T
Q  409 caata 413  Q
    |||||    
T  26076488 caata 26076484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 9 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 26656961 - 26656557
Alignment:
Q  9 acatcatcaagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttccttaatgattgaaattccctcactaacatctcctaacttttggttcaatttaactg 108  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    |||| | |||| |    
T  26656961 acatcatcgagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttcctttatgattggaattccctcactaacatctcctaacttaatattcactctaacag 26656862  T
Q  109 ttcttaaaaggagatcttcctggagatgtttcagtttattatgacttgaattctctctgacattatgaagaaaacatacactttcaaattgatcagcaac 208  Q
    || || ||||||| || ||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  26656861 tttttgaaaggagctcctcctggagatgtttcaaattattatgagctgaattctctctgacattgtgaagaaaacatacaccttcaaattgatcagcgac 26656762  T
Q  209 aaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccatgtcaagaagc 308  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||| ||| | |||||||||    
T  26656761 aaaattataaattgctttggcaagtgttgatttacccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgagaacctcatccttagatcccttatcaagaagc 26656662  T
Q  309 aatttcacttgttctattcgggactgtaatccaacagggtatttggctacatttnnnnnnncatgattgatattgttggagatgtcttcgactatcttct 408  Q
    ||||||||||||| || ||| |||| ||||||||||||||||||||| |||| |       || ||||||| |||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  26656661 aatttcacttgttgtactcgagactctaatccaacagggtatttggcaacatgtaaaaaaacacgattgatcttgtcggagatgtctttgactatattct 26656562  T
Q  409 caata 413  Q
    |||||    
T  26656561 caata 26656557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 9 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 26762932 - 26762528
Alignment:
Q  9 acatcatcaagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttccttaatgattgaaattccctcactaacatctcctaacttttggttcaatttaactg 108  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    |||| | |||| |    
T  26762932 acatcatcgagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttcctttatgattggaattccctcactaacatctcctaacttaatattcactctaacag 26762833  T
Q  109 ttcttaaaaggagatcttcctggagatgtttcagtttattatgacttgaattctctctgacattatgaagaaaacatacactttcaaattgatcagcaac 208  Q
    || || ||||||| || ||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  26762832 tttttgaaaggagctcctcctggagatgtttcaaattattatgagctgaattctctctgacattgtgaagaaaacatacaccttcaaattgatcagcgac 26762733  T
Q  209 aaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccatgtcaagaagc 308  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||| ||| | |||||||||    
T  26762732 aaaattataaattgctttggcaagtgttgatttacccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgagaacctcatccttagatcccttatcaagaagc 26762633  T
Q  309 aatttcacttgttctattcgggactgtaatccaacagggtatttggctacatttnnnnnnncatgattgatattgttggagatgtcttcgactatcttct 408  Q
    ||||||||||||| || ||| |||| ||||||||||||||||||||| |||| |       || ||||||| |||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  26762632 aatttcacttgttgtactcgagactctaatccaacagggtatttggcaacatgtaaaaaaacacgattgatcttgtcggagatgtctttgactatattct 26762533  T
Q  409 caata 413  Q
    |||||    
T  26762532 caata 26762528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 9 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 26647475 - 26647071
Alignment:
Q  9 acatcatcaagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttccttaatgattgaaattccctcactaacatctcctaacttttggttcaatttaactg 108  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||| || || ||| |||||   ||||| ||||||||    
T  26647475 acatcatcgagaatcaaaagaatcttctttctacatagcctttccttaatgattggaattccctcacaaatatgtccaaacttaatgttcactttaactg 26647376  T
Q  109 ttcttaaaaggagatcttcctggagatgtttcagtttattatgacttgaattctctctgacattatgaagaaaacatacactttcaaattgatcagcaac 208  Q
    || || ||||||| || | ||||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  26647375 tttttgaaaggagctccttctggagatgtttcaagttattatgagctgaattctctctgacattatgaagaaagcatacaccttcaaattgatcagcaac 26647276  T
Q  209 aaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccatgtcaagaagc 308  Q
    |||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  ||||| | || |||||  |  | |||||||||    
T  26647275 aaaattataaatcgctttggcaagtgttgatttacccaaacctccagtaccataaagtcctaccatatggaccccttcatcagattctttatcaagaagc 26647176  T
Q  309 aatttcacttgttctattcgggactgtaatccaacagggtatttggctacatttnnnnnnncatgattgatattgttggagatgtcttcgactatcttct 408  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |       || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  26647175 aatttcacttgttctaatcgggactctaatccaacagggtatttggctacatgtaaaatgacacgattgatcttgttggagatgtcttcgactatcttcc 26647076  T
Q  409 caata 413  Q
    |||||    
T  26647075 caata 26647071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 9 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 26753443 - 26753039
Alignment:
Q  9 acatcatcaagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttccttaatgattgaaattccctcactaacatctcctaacttttggttcaatttaactg 108  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||| || || ||| |||||   ||||| ||||||||    
T  26753443 acatcatcgagaatcaaaagaatcttctttctacatagcctttccttaatgattggaattccctcacaaatatgtccaaacttaatgttcactttaactg 26753344  T
Q  109 ttcttaaaaggagatcttcctggagatgtttcagtttattatgacttgaattctctctgacattatgaagaaaacatacactttcaaattgatcagcaac 208  Q
    || || ||||||| || | ||||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  26753343 tttttgaaaggagctccttctggagatgtttcaagttattatgagctgaattctctctgacattatgaagaaagcatacaccttcaaattgatcagcaac 26753244  T
Q  209 aaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccatgtcaagaagc 308  Q
    |||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  ||||| | || |||||  |  | |||||||||    
T  26753243 aaaattataaatcgctttggcaagtgttgatttacccaaacctccagtaccataaagtcctaccatatggaccccttcatcagattctttatcaagaagc 26753144  T
Q  309 aatttcacttgttctattcgggactgtaatccaacagggtatttggctacatttnnnnnnncatgattgatattgttggagatgtcttcgactatcttct 408  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |       || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  26753143 aatttcacttgttctaatcgggactctaatccaacagggtatttggctacatgtaaaatgacacgattgatcttgttggagatgtcttcgactatcttcc 26753044  T
Q  409 caata 413  Q
    |||||    
T  26753043 caata 26753039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 9 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 26862576 - 26862227
Alignment:
Q  9 acatcatcaagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttccttaatgattgaaattccctcactaacatctcctaacttttggttcaatttaactg 108  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||  |||||||||||| || | || ||||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||    
T  26862576 acatcatcgagaatcaaaagaatcttcattctatttagtctttcctttataagtggaattccctcactagcatctcctaacttaatgttcaatttaactg 26862477  T
Q  109 ttcttaaaaggagatcttcctggagatgtttcagtttattatgacttgaattctctctgacattatgaagaaaacatacactttcaaattgatcagcaac 208  Q
    || ||||||| || || | ||||||||||||||   |||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  26862476 tttttaaaagaagctccttctggagatgtttcaagctattatgagttgaattctctctaactttatgaagaaaacatacaccttcaaattgatcggcaac 26862377  T
Q  209 aaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccatgtcaagaagc 308  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| | || |||||  |||| |||||||||    
T  26862376 aaaattataaattgcttttgcaagtgttgatttccccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgtgtaccccttcatcagattccatatcaagaagc 26862277  T
Q  309 aatttcacttgttctattcgggactgtaatccaacagggtatttggctac 358  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26862276 aatttcacttgttctactcgggactttaatccaacagggtatttggctac 26862227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 9 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 26885066 - 26884668
Alignment:
Q  9 acatcatcaagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttccttaatgattgaaattccctcactaacatctcctaacttttggttcaatttaactg 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||   ||| ||||||| ||    
T  26885066 acatcatcaagaatcaaaagaatcttctttctatgtagtctttcctttatgagtggaattccctcactaacatctcctaacttaatgtttaatttaattg 26884967  T
Q  109 ttcttaaaaggagatcttcctggagatgtttcagtttattatgacttgaattctctctgacattatgaagaaaacatacactttcaaattgatcagcaac 208  Q
    || |||||||||| || ||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26884966 tttttaaaaggagttcctcctggagatgtttcaagttattatgagttgaattctccctgactttatgcagaaaacatacacattcaaattgatcagcaac 26884867  T
Q  209 aaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccatgtcaagaagc 308  Q
    | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| | ||| | || | |||  || | |||||||||    
T  26884866 ataattataaattgcttttgcaagtgttgatttacccaagcctccagtaccataaattcctaccatgtgtaccccttcgttagattccttatcaagaagc 26884767  T
Q  309 aatttcacttgttctattcgggactgtaatccaacagggtatttggctacatttnnnnnnncatgattgatattgttggagatgtcttcgactatcttc 407  Q
    ||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |       || ||||||| |||| |||||| |||||||||||||||    
T  26884766 aattttaattgttgtactcggtactgtaatccaacagggtatttggctacatgtaaaacaacacgattgattttgtcggagatatcttcgactatcttc 26884668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 9 - 355
Target Start/End: Original strand, 27337281 - 27337627
Alignment:
Q  9 acatcatcaagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttccttaatgattgaaattccctcactaacatctcctaacttttggttcaatttaactg 108  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||  |||||||| ||||||   ||||| || |||||    
T  27337281 acatcatcgagaatcaaaagaatcttcttcctacatagcctttccttaatgattggaattccctcagaaacatctcttaacttaatgttcagttgaactg 27337380  T
Q  109 ttcttaaaaggagatcttcctggagatgtttcagtttattatgacttgaattctctctgacattatgaagaaaacatacactttcaaattgatcagcaac 208  Q
    || || ||||||| || | ||||||||||||||  || ||| ||  |||||||||||| |||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||     
T  27337381 tttttgaaaggagctccttctggagatgtttcaagtttttacgagctgaattctctctaacattatgaagaaagcatactccttcaaattgatcagcaat 27337480  T
Q  209 aaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccatgtcaagaagc 308  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||  |||| | || |||||  ||   |||||||||    
T  27337481 gaaattataaattgcttttgcaagtgttgattttcccaagcctctagtaccataaagtcctaccatgttgaccccttcatcagattcctcatcaagaagc 27337580  T
Q  309 aatttcacttgttctattcgggactgtaatccaacagggtatttggc 355  Q
    ||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27337581 aattttacttgttgtactcgggactgtaatccaacagggtatttggc 27337627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 9 - 355
Target Start/End: Original strand, 27398021 - 27398367
Alignment:
Q  9 acatcatcaagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttccttaatgattgaaattccctcactaacatctcctaacttttggttcaatttaactg 108  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||  |||||||| ||||||   ||||| || |||||    
T  27398021 acatcatcgagaatcaaaagaatcttcttcctacatagcctttccttaatgattggaattccctcagaaacatctcttaacttaatgttcagttgaactg 27398120  T
Q  109 ttcttaaaaggagatcttcctggagatgtttcagtttattatgacttgaattctctctgacattatgaagaaaacatacactttcaaattgatcagcaac 208  Q
    || || ||||||| || | ||||||||||||||  || ||| ||  |||||||||||| |||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||     
T  27398121 tttttgaaaggagctccttctggagatgtttcaagtttttacgagctgaattctctctaacattatgaagaaagcatactccttcaaattgatcagcaat 27398220  T
Q  209 aaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccatgtcaagaagc 308  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||  |||| | || |||||  ||   |||||||||    
T  27398221 gaaattataaattgcttttgcaagtgttgattttcccaagcctctagtaccataaagtcctaccatgttgaccccttcatcagattcctcatcaagaagc 27398320  T
Q  309 aatttcacttgttctattcgggactgtaatccaacagggtatttggc 355  Q
    ||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27398321 aattttacttgttgtactcgggactgtaatccaacagggtatttggc 27398367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 9 - 360
Target Start/End: Original strand, 27530487 - 27530838
Alignment:
Q  9 acatcatcaagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttccttaatgattgaaattccctcactaacatctcctaacttttggttcaatttaactg 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||   || |||| ||||||    
T  27530487 acatcatcaagaatcaaaagaatcttctttctacatagcctttgcttaatgattggaattccctgactaacacctcctaacttaatgtccaatctaactg 27530586  T
Q  109 ttcttaaaaggagatcttcctggagatgtttcagtttattatgacttgaattctctctgacattatgaagaaaacatacactttcaaattgatcagcaac 208  Q
    || |||||||||| |  || |||||||||||||  ||||    | | |||||| |||| ||||| |  |||||||||| |  |||||||||||||||||     
T  27530587 tttttaaaaggagtttctcttggagatgtttcaagttatctgaagtcgaattcactctcacattttctagaaaacataaaacttcaaattgatcagcaat 27530686  T
Q  209 aaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccatgtcaagaagc 308  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||       |||||| ||    
T  27530687 gaaattataaattgcttttgcaagtgttgatttacctatgcctccagtaccataaagtcctaccatgtggacctcatcatcagatttttcatcaagatgc 27530786  T
Q  309 aatttcacttgttctattcgggactgtaatccaacagggtatttggctacat 360  Q
      |||||| |||| || ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  27530787 cctttcacatgttgtactcgggactgtaatccaacaggatatttggcaacat 27530838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 9 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 25511888 - 25511640
Alignment:
Q  9 acatcatcaagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttccttaatgattgaaattccctcactaacatctcctaacttttggttcaatttaactg 108  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||||||||||||| ||| ||    ||  |||||||||     
T  25511888 acatcgtcaagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttcctttataattggtattccctcactaacatcttctatctgaccgtcaaatttaacta 25511789  T
Q  109 ttcttaaaaggagatcttcctggagatgtttcagtttattatgacttgaattctctctgacattatgaagaaaacatacactttcaaattgatcagcaac 208  Q
    || || ||||||| |  | ||||||||||||||  || ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  25511788 tttttgaaaggagcttcttctggagatgtttcaagttcttaagagttgaattctctctgacattatgaagaaaacatacactttcaaattgatcagcaat 25511689  T
Q  209 aaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagta 257  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  25511688 agaattaaaaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctctagta 25511640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 9 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 26624267 - 26623863
Alignment:
Q  9 acatcatcaagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttccttaatgattgaaattccctcactaacatctcctaacttttggttcaatttaactg 108  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   | |||||    | ||||  |  ||    
T  26624267 acatcatcgagaatcaaaagaatcttctttctacatagcctttccttaatgattgaaattccctcactaacatggtccaacttaatttccaatccagttg 26624168  T
Q  109 ttcttaaaaggagatcttcctggagatgtttcagtttattatgacttgaattctctctgacattatgaagaaaacatacactttcaaattgatcagcaac 208  Q
    || | |||||||| |  || |||||||||||||  ||||| |||  |||||||||||| |||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  26624167 ttttaaaaaggagcttctcttggagatgtttcaagttattttgagctgaattctctctcacatcatgaagaaaacataaaccttcaaattgatcagcaac 26624068  T
Q  209 aaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccatgtcaagaagc 308  Q
    ||| ||||| | |||| |||||||||||||||| |||| ||||||| | ||||| | ||| |||||  ||||| |||| ||||| ||  | ||||||||     
T  26624067 aaagttatagattgctcttgcaagtgttgatttgcccaagcctccaatcccatacattccaaccatatggaccccatcatcagatccattatcaagaagt 26623968  T
Q  309 aatttcacttgttctattcgggactgtaatccaacagggtatttggctacatttnnnnnnncatgattgatattgttggagatgtcttcgactatcttct 408  Q
     |||||||||||| || | | ||||||||||||||||||||||| || |||| |       || ||||||| ||||||||||||| || ||||||||| |    
T  26623967 gatttcacttgttgtagttgagactgtaatccaacagggtatttagcaacatgtaagggcacacgattgatcttgttggagatgtatttgactatctttt 26623868  T
Q  409 caata 413  Q
    |||||    
T  26623867 caata 26623863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 9 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 26730244 - 26729840
Alignment:
Q  9 acatcatcaagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttccttaatgattgaaattccctcactaacatctcctaacttttggttcaatttaactg 108  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   | |||||    | ||||  |  ||    
T  26730244 acatcatcgagaatcaaaagaatcttctttctacatagcctttccttaatgattgaaattccctcactaacatggtccaacttaatttccaatccagttg 26730145  T
Q  109 ttcttaaaaggagatcttcctggagatgtttcagtttattatgacttgaattctctctgacattatgaagaaaacatacactttcaaattgatcagcaac 208  Q
    || | |||||||| |  || |||||||||||||  ||||| |||  |||||||||||| |||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  26730144 ttttaaaaaggagcttctcttggagatgtttcaagttattttgagctgaattctctctcacatcatgaagaaaacataaaccttcaaattgatcagcaac 26730045  T
Q  209 aaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccatgtcaagaagc 308  Q
    ||| ||||| | |||| |||||||||||||||| |||| ||||||| | ||||| | ||| |||||  ||||| |||| ||||| ||  | ||||||||     
T  26730044 aaagttatagattgctcttgcaagtgttgatttgcccaagcctccaatcccatacattccaaccatatggaccccatcatcagatccattatcaagaagt 26729945  T
Q  309 aatttcacttgttctattcgggactgtaatccaacagggtatttggctacatttnnnnnnncatgattgatattgttggagatgtcttcgactatcttct 408  Q
     |||||||||||| || | | ||||||||||||||||||||||| || |||| |       || ||||||| ||||||||||||| || ||||||||| |    
T  26729944 gatttcacttgttgtagttgagactgtaatccaacagggtatttagcaacatgtaagggcacacgattgatcttgttggagatgtatttgactatctttt 26729845  T
Q  409 caata 413  Q
    |||||    
T  26729844 caata 26729840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 9 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 28787234 - 28786883
Alignment:
Q  9 acatcatcaagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttccttaatgattgaaattccctcactaacatctcctaacttttggttcaatttaactg 108  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||| ||   || |||||||| ||    | |||||||||||||||| ||||||||||    |||| || || ||    
T  28787234 acatcatcgagaatcaaaagagtcttctttgtatgcagcctttcctttatataaggaattccctcactaacacctcctaacttaattttcagttgaagtg 28787135  T
Q  109 ttcttaaaaggagatcttcctggagatgtttcagtttattatgacttgaattctctctgacattatgaagaaaacatacactttcaaattgatcagcaac 208  Q
    || ||||||||||  | |||||||||||||||| ||||||   |  |||||||||||| ||||| | ||||||||||   | |||||||||||||| ||     
T  28787134 tttttaaaaggagcacctcctggagatgtttcaatttatttgaagctgaattctctctcacattttcaagaaaacatgagcattcaaattgatcagaaat 28787035  T
Q  209 aaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccatgtcaagaagc 308  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||| ||    |||||||||    
T  28787034 aaaattataaattgcttttccaagtgttgatttacccaagcctccagtaccataaagtcctaccatgcggactccatcatcagatccttcatcaagaagc 28786935  T
Q  309 aatttcacttgttctattcgggactgtaatccaacagggtatttggctacat 360  Q
     |||||||||||| || ||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||    
T  28786934 gatttcacttgttgtactcgagactgcaatccaacagggtaattggcaacat 28786883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 9 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 28793355 - 28793004
Alignment:
Q  9 acatcatcaagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttccttaatgattgaaattccctcactaacatctcctaacttttggttcaatttaactg 108  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||  ||| |||||||| ||    | |||||||||||||||| ||||||||||    |||| || || ||    
T  28793355 acatcatcgagaatcaaaagaatcttctttgtatgtagcctttcctttatataaggaattccctcactaacacctcctaacttaattttcagttgaagtg 28793256  T
Q  109 ttcttaaaaggagatcttcctggagatgtttcagtttattatgacttgaattctctctgacattatgaagaaaacatacactttcaaattgatcagcaac 208  Q
    || ||||||||||  | |||||||||||||||| | ||||   |  |||| ||||||| ||||| | ||||||||||   | |||||||||||||| ||     
T  28793255 tttttaaaaggagcacctcctggagatgtttcaatctatttgaagctgaactctctctcacattttcaagaaaacatgagcattcaaattgatcagaaat 28793156  T
Q  209 aaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccatgtcaagaagc 308  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||| ||    |||||||||    
T  28793155 aaaattataaattgcttttccaagtgttgatttacccaagcctccagtaccataaagtcctaccatgcggactccatcatcagatccttcatcaagaagc 28793056  T
Q  309 aatttcacttgttctattcgggactgtaatccaacagggtatttggctacat 360  Q
     |||||||||||| || ||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||    
T  28793055 gatttcacttgttgtactcgagactgcaatccaacagggtaattggcaacat 28793004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 9 - 360
Target Start/End: Original strand, 27717685 - 27718036
Alignment:
Q  9 acatcatcaagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttccttaatgattgaaattccctcactaacatctcctaacttttggttcaattt-aact 107  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||| |||||||| ||    | |||||||||||||||| |||| |||||    ||||| || || |    
T  27717685 acatcatcaagaatcaaaagaaccttctttctatgtagcctttcctttatataaggaattccctcactaacacctccaaacttaat-ttcaagttgaagt 27717783  T
Q  108 gttcttaaaaggagatcttcctggagatgtttcagtttattatgacttgaattctctctgacattatgaagaaaacatacactttcaaattgatcagcaa 207  Q
    ||| |||||||||| || | ||| |||||||||| ||||||   | ||||||||||||| ||||| | ||||||||||   | |||||||||||||||||    
T  27717784 gtttttaaaaggagctccttctgaagatgtttcaatttatttgaagttgaattctctctcacattttcaagaaaacatgagcattcaaattgatcagcaa 27717883  T
Q  208 caaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccatgtcaagaag 307  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||| ||||| |     ||||||||    
T  27717884 taaaattataaattgcttttgcaagtgttgatttacccaatcctccagtaccataaagtcctaccatgtggactccatcatcagatctttcatcaagaag 27717983  T
Q  308 caatttcacttgttctattcgggactgtaatccaacagggtatttggctacat 360  Q
    | |||||||||||| || ||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||    
T  27717984 cgatttcacttgttgtactcgagactgcaatccaacagggtaattggcaacat 27718036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 9 - 360
Target Start/End: Original strand, 27610306 - 27610657
Alignment:
Q  9 acatcatcaagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttccttaatgattgaaattccctcactaacatctcctaacttttggttcaattt-aact 107  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||| |||||||| ||    | |||||||||||||||| |||| |||||    ||||| || || |    
T  27610306 acatcatcaagaatcaaaagaaccttctttctatgtagcctttcctttatataaggaattccctcactaacacctccaaacttaat-ttcaagttgaagt 27610404  T
Q  108 gttcttaaaaggagatcttcctggagatgtttcagtttattatgacttgaattctctctgacattatgaagaaaacatacactttcaaattgatcagcaa 207  Q
    ||| |||||||||| || ||||| |||||||||| ||||||   | ||||||||||||| ||||| | ||||||||||   | |||||||||||||||||    
T  27610405 gtttttaaaaggagctcctcctgaagatgtttcaatttatttgaagttgaattctctctcacattttcaagaaaacatgagcattcaaattgatcagcaa 27610504  T
Q  208 caaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccatgtcaagaag 307  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||| ||||| |     ||||||||    
T  27610505 taaaattataaattgcttttgcaagtgttgatttacccaatcctccagtaccataaagtcctaccatgtggactccatcatcagatctttcatcaagaag 27610604  T
Q  308 caatttcacttgttctattcgggactgtaatccaacagggtatttggctacat 360  Q
    | ||||||||| || || | | ||||| |||||||||||||| ||||| ||||    
T  27610605 cgatttcacttcttgtacttgagactgcaatccaacagggtaattggcaacat 27610657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 9 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 31285555 - 31285161
Alignment:
Q  9 acatcatcaagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttccttaatgattgaaattccctcactaacatctcctaacttttggttcaatttaactg 108  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||   |||||||    | ||||  || ||    
T  31285555 acatcatcgagaatcaaaagaatcttctttctacatagcctttccttaatgattggaattccctcactaacatggtctaacttaatttccaatccaattg 31285456  T
Q  109 ttcttaaaaggagatcttcctggagatgtttcagtttattatgacttgaattctctctgacattatgaagaaaacatacactttcaaattgatcagcaac 208  Q
    || | |||||||| |  || |||||||||||||  ||||| | |  |||||||||||| |||| ||||||||||||||  |  |||||||||||| |||     
T  31285455 ttttcaaaaggagcttctcttggagatgtttcaagttatttttagctgaattctctctcacatcatgaagaaaacataatccgtcaaattgatcaccaat 31285356  T
Q  209 aaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccatgtcaagaagc 308  Q
    ||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||||||  | |||||||||||||||||| | ||| | |  | ||   || | |||||||||    
T  31285355 aaaattatagattgctcttgcaagtgttgatttacccaagcctcctatcccataaagtcctaccatgtgtacccctttattagtttccttatcaagaagc 31285256  T
Q  309 aatttcacttgttctattcgggactgtaatccaacagggtatttggctacatttnnnnnnncatgattgatattgttggagatgtcttcgactat 403  Q
    ||||||||||||| ||||||  |||  |||||||||||||| ||||| |||| |       || ||||||| ||||||||||||| || ||||||    
T  31285255 aatttcacttgttgtattcgaaacttaaatccaacagggtaattggcaacatgtaagggcacacgattgatcttgttggagatgtatttgactat 31285161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 9 - 360
Target Start/End: Original strand, 25492505 - 25492856
Alignment:
Q  9 acatcatcaagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttccttaatgattgaaattccctcactaacatctcctaacttttggttcaatttaactg 108  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||| ||  || ||||||| ||||||||||||||||  || ||||||   ||  ||| ||||      
T  25492505 acatcatcgagaatcaaaagaatcttctctctacatagtccttgttttatgattgcaattccctcactaacacttcttaacttaatgtctaatctaacca 25492604  T
Q  109 ttcttaaaaggagatcttcctggagatgtttca-gtttattatgacttgaattctctctgacattatgaagaaaacatacactttcaaattgatcagcaa 207  Q
    || |  ||||||| | ||||||||||| ||||| |||| ||  || ||||||||||||| ||||     |||||||||| || |||||||||||||||||    
T  25492605 ttttcgaaaggagtttttcctggagatctttcaagtttcttg-gagttgaattctctctcacatctcctagaaaacataaaccttcaaattgatcagcaa 25492703  T
Q  208 caaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccatgtcaagaag 307  Q
      || ||||| | || ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||  ||   || |||||    
T  25492704 tgaagttatagattgattttgcaagtgttgatttacctaagcctccagtaccataaagtcctaccatgtggaactcatcctcagatacctcatctagaag 25492803  T
Q  308 caatttcacttgttctattcgggactgtaatccaacagggtatttggctacat 360  Q
    ||||||||| |||| || |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  25492804 caatttcacgtgttgtactcgggattgtaatccaacagggtatttggcaacat 25492856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 9 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 28782097 - 28781746
Alignment:
Q  9 acatcatcaagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttccttaatgattgaaattccctcactaacatctcctaacttttggttcaatttaactg 108  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||| ||   || |||||||| ||    | |||||||||||||||| ||||||||||    |||| || || ||    
T  28782097 acatcatcgagaatcaaaagagtcttctttgtatgcagcctttcctttatataaggaattccctcactaacacctcctaacttaattttcagttgaagtg 28781998  T
Q  109 ttcttaaaaggagatcttcctggagatgtttcagtttattatgacttgaattctctctgacattatgaagaaaacatacactttcaaattgatcagcaac 208  Q
     | |||||||||| || |||||||||||||||| ||||||   |  |||||||||||| ||||| | ||||||||||   | |||||||||||||||||     
T  28781997 cttttaaaaggagctcctcctggagatgtttcaatttatttgaagctgaattctctctcacattttcaagaaaacatgagcattcaaattgatcagcaat 28781898  T
Q  209 aaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccatgtcaagaagc 308  Q
     || ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||  |||  ||| | ||     ||||||||    
T  28781897 taagttataaactgcttttacaagtgttgatttacccaagcctccagtaccataaagtcctaccatcctgactccattatcatatccttcaccaagaagc 28781798  T
Q  309 aatttcacttgttctattcgggactgtaatccaacagggtatttggctacat 360  Q
     |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  28781797 gatttcacttgttgtactcgggactgtaatccaacagggtaattggcaacat 28781746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 9 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 27215448 - 27215044
Alignment:
Q  9 acatcatcaagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttccttaatgattgaaattccctcactaacatctcctaacttttggttcaatttaactg 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||  |||  || ||  ||| ||| |||||||||||| |||||||||| | ||  ||| |||| |    
T  27215448 acatcatcaagaatcaaaagaatcttcttttgacatagcattttttttatctttgtaatcccctcactaacacctcctaacttatcgtctaatctaaccg 27215349  T
Q  109 ttcttaaaaggagatcttcctggagatgtttcagtttattatgacttgaattctctctgacattatgaagaaaacatacactttcaaattgatcagcaac 208  Q
    || | | |||||  | |||||| || |||||||  |||||   | ||||||||||| | ||||  |  |||||| ||  || |||||| ||||||||||     
T  27215348 ttttcataaggatcttttcctgcaggtgtttcaagttatttaaagttgaattctctttcacatcttctagaaaatatgaaccttcaaactgatcagcaat 27215249  T
Q  209 aaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccatgtcaagaagc 308  Q
     |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||| ||||||| |||| ||| ||| |||||||||||    
T  27215248 gaaattaaaaattgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagctccatgaagtcctaccatgtggacctcttccttagatcccttgtcaagaagc 27215149  T
Q  309 aatttcacttgttctattcgggactgtaatccaacagggtatttggctacatttnnnnnnncatgattgatattgttggagatgtcttcgactatcttct 408  Q
    ||||| ||||||| |||| |||  |||||||||||||||| |||||| |||| |       || ||||  | ||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  27215148 aattttacttgttgtatttgggtatgtaatccaacagggtgtttggcaacatgtaaaaaatcacgattcgtcttgtttgagatgtcttcaactatcttct 27215049  T
Q  409 caata 413  Q
    |||||    
T  27215048 caata 27215044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 9 - 360
Target Start/End: Original strand, 27603890 - 27604241
Alignment:
Q  9 acatcatcaagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttccttaatgattgaaattccctcactaacatctcctaacttttggttcaattt-aact 107  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||  |   || |||||||| ||    |||||||||||||||||| ||||||||||    ||||| || || |    
T  27603890 acatcatcgagaatcaaaagaatcttcattgaatgcagcctttcctttatatgagaaattccctcactaacacctcctaacttaat-ttcaagttgaagt 27603988  T
Q  108 gttcttaaaaggagatcttcctggagatgtttcagtttattatgacttgaattctctctgacattatgaagaaaacatacactttcaaattgatcagcaa 207  Q
    ||| |||||||||| || |||||||||||||||| ||||||   |  |||||||||||| ||||| | ||||||||||   | |||||||||||||||||    
T  27603989 gtttttaaaaggagctcctcctggagatgtttcaatttatttgaagctgaattctctctcacattttcaagaaaacatgagcattcaaattgatcagcaa 27604088  T
Q  208 caaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccatgtcaagaag 307  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||| ||||| |     ||||||||    
T  27604089 taaaattataaattgcttttgcaagtgttgatttacccaatcctccagtaccataaagtcctaccatgtggactccatcatcagatctttcatcaagaag 27604188  T
Q  308 caatttcacttgttctattcgggactgtaatccaacagggtatttggctacat 360  Q
      |||||||||||| || ||| ||||| ||||||| ||| || ||||| ||||    
T  27604189 agatttcacttgttgtactcgagactgcaatccaataggataattggcaacat 27604241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 9 - 349
Target Start/End: Original strand, 27705590 - 27705930
Alignment:
Q  9 acatcatcaagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttccttaatgattgaaattccctcactaacatctcctaacttttggttcaatttaactg 108  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| | || |||||||| |||| || ||| ||||||| |||||   ||||||||   ||| ||  |  ||    
T  27705590 acatcatcgagaatcaaaagaatcttctttctacacagcctttcctttatgaatggaatcccctcacaaacatgatctaactttattttcgatccagttg 27705689  T
Q  109 ttcttaaaaggagatcttcctggagatgtttcagtttattatgacttgaattctctctgacattatgaagaaaacatacactttcaaattgatcagcaac 208  Q
    || ||| ||| || |  || |||||||||||||  | ||| |||  |||||||||||| |||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  27705690 tttttagaagaagcttctcttggagatgtttcaagtcattttgagctgaattctctctcacatcatgaagaaaacataaaccttcaaattgatcagcaac 27705789  T
Q  209 aaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccatgtcaagaagc 308  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | ||| ||| ||| |||||  ||||| |||| ||||  |||   ||||||||     
T  27705790 aaaattataaattgctcttgcaagtgttgatttacccaagcctccaatgccaaaaattccaaccatatggaccccatcatcaggtccctcatcaagaagt 27705889  T
Q  309 aatttcacttgttctattcgggactgtaatccaacagggta 349  Q
     |||||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||||    
T  27705890 gatttcacttgttgtactcgagactgcaatccaacagggta 27705930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 9 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 26803442 - 26803102
Alignment:
Q  9 acatcatcaagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttccttaatgattgaaattccctcactaacatctcctaacttttggttcaatttaactg 108  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||| || |||| ||| ||||||| |||||   |||||||    ||||||  |  ||    
T  26803442 acatcatcgagaatcaaaagaatcttatttctacacagtctttcctttataattggaatcccctcacaaacatgatctaacttgattttcaatccagttg 26803343  T
Q  109 ttcttaaaaggagatcttcctggagatgtttcagtttattatgacttgaattctctctgacattatgaagaaaacatacactttcaaattgatcagcaac 208  Q
    || ||| ||| || |  || |||||||||||||  ||||| |||  |||||||||||| |||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  26803342 tttttagaagaagcttctcttggagatgtttcaagttattttgagctgaattctctctcacatcatgaagaaaacataaaccttcaaattgatcagcaac 26803243  T
Q  209 aaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccatgtcaagaagc 308  Q
    ||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| | ||||||| ||| |||||  ||||| |||| ||||  |||   |||||||||    
T  26803242 aaaattatagattgctcttgcaagtgctgatttacccaagcctccaatcccataaattccaaccatatggaccccatcatcaggtccctcatcaagaagc 26803143  T
Q  309 aatttcacttgttctattcgggactgtaatccaacagggta 349  Q
     ||||||||| || || ||| || || ||||||||||||||    
T  26803142 gatttcacttcttgtactcgagagtgcaatccaacagggta 26803102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 12 - 349
Target Start/End: Original strand, 27426801 - 27427138
Alignment:
Q  12 tcatcaagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttccttaatgattgaaattccctcactaacatctcctaacttttggttcaatttaactgttc 111  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| | |  |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| |||||||    |||| || || |||      
T  27426801 tcatcgagaatcaaaagaatcttctttctacacaacctttcctttatgattgagattccctcactgacatctgctaacttaattttcagttgaagtgtct 27426900  T
Q  112 ttaaaaggag-atcttcctggagatgtttcagtttattatgacttgaattctctctgacattatgaagaaaacatacactttcaaattgatcagcaacaa 210  Q
    || ||||||| |||| |||||| | ||||||   ||||   |  ||||||||||||||| |  | ||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  27426901 ttgaaaggagcatct-cctggaaacgtttcaagctatttgaagctgaattctctctgacttgttcaagaaaacataaaccttcaaattgatcagcaacaa 27426999  T
Q  211 aattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccatgtcaagaagcaa 310  Q
    ||||||| | |||| |||||||||||||||||||   ||||||| | ||||||| ||| |||||  ||||| |||| ||||  |||   ||||||||| |    
T  27427000 aattatagattgctcttgcaagtgttgatttacctgagcctccaatcccataaattccaaccatatggaccccatcatcaggtccctcatcaagaagcga 27427099  T
Q  311 tttcacttgttctattcgggactgtaatccaacagggta 349  Q
    ||||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||||    
T  27427100 tttcacttgttgtactcgagactgcaatccaacagggta 27427138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 9 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 27679946 - 27679606
Alignment:
Q  9 acatcatcaagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttccttaatgattgaaattccctcactaacatctcctaacttttggttcaatttaactg 108  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||| || |||||||||||||||||   |||||||    | |||      ||    
T  27679946 acatcatcgagaatcaaaagaatcttctttctacataatctttcctttatgactggaattccctcactaacatggtctaacttaatttccaaacctgttg 27679847  T
Q  109 ttcttaaaaggagatcttcctggagatgtttcagtttattatgacttgaattctctctgacattatgaagaaaacatacactttcaaattgatcagcaac 208  Q
    || |||||||||| |  || ||||||| |||||  ||||| |||  |||||||||||| |||| |||||||||||||  || ||| |||||||| |||||    
T  27679846 tttttaaaaggagcttctcttggagatatttcaagttattttgagctgaattctctctcacatcatgaagaaaacatgaaccttcgaattgatctgcaac 27679747  T
Q  209 aaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccatgtcaagaagc 308  Q
    ||||||||| | |  | |||||||||||||||| ||||  |||||| | ||||||| ||| |||||  ||||| |||| || || |||   |||||||||    
T  27679746 aaaattatagatttgtcttgcaagtgttgatttccccaaacctccaatgccataaattccaaccatatggaccccatcatcggatccctcatcaagaagc 27679647  T
Q  309 aatttcacttgttctattcgggactgtaatccaacagggta 349  Q
     |||||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||||    
T  27679646 gatttcacttgttgtactcgagactgcaatccaacagggta 27679606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 9 - 360
Target Start/End: Original strand, 27697772 - 27698123
Alignment:
Q  9 acatcatcaagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttccttaatgattgaaattccctcactaacatctcctaacttttggttcaatttaactg 108  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||   |||| ||    | | ||  |  ||    
T  27697772 acatcgtcgagaatcaaaagaatcttctttctacatagcctttccttaatgattggaattccgtcactaacatggtctaaattaatttccgatccagttg 27697871  T
Q  109 ttcttaaaaggagatcttcctggagatgtttcagtttattatgacttgaattctctctgacattatgaagaaaacatacactttcaaattgatcagcaac 208  Q
    || | |||||||| |  || |||||||||| ||  ||||| | |  |||||||  ||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  27697872 ttttaaaaaggagcttctcttggagatgttccaagttatttttagctgaattcattctcacattatgaagaaaacataaaccttcaaattgatcagcaac 27697971  T
Q  209 aaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccatgtcaagaagc 308  Q
     |||||||| | |||| |||||||||||||||| |||| ||||||| | ||| ||| ||| |||||  ||||| |||| ||||| ||  | |||||||      
T  27697972 caaattatagattgctcttgcaagtgttgattttcccaagcctccaatcccaaaaattccaaccatatggaccccatcatcagatccattatcaagaatt 27698071  T
Q  309 aatttcacttgttctattcgggactgtaatccaacagggtatttggctacat 360  Q
     ||||||||  || || | | |||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  27698072 gatttcactctttgtacttgagactgtaatccaacagggtaattggcaacat 27698123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 303 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 25511640 - 25511530
Alignment:
Q  303 agaagcaatttcacttgttctattcgggactgtaatccaacagggtatttggctacatttnnnnnnncatgattgatattgttggagatgtcttcgacta 402  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||        |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25511640 agaagcaatttcacttgttctattcgggactgcaatccaacagggtatttggctacgttcaaaaaaacatgattgatcttgttggagatgtcttcgacta 25511541  T
Q  403 tcttctcaata 413  Q
    |||||||||||    
T  25511540 tcttctcaata 25511530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 9 - 362
Target Start/End: Original strand, 27592207 - 27592560
Alignment:
Q  9 acatcatcaagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttccttaatgattgaaattccctcactaacatctcctaacttttggttcaattt-aact 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| |||||||| ||  | | |||||| || ||||||  |||||||||    ||||| || || |    
T  27592207 acatcatcaagaatcaaaagaatcttctttccatgtagcctttcctttattttaggaattccttcgctaacacttcctaacttaat-ttcaagttgaagt 27592305  T
Q  108 gttcttaaaaggagatcttcctggagatgtttcagtttattatgacttgaattctctctgacattatgaagaaaacatacactttcaaattgatcagcaa 207  Q
    ||| |||||||||| || | |||||||| |||||  |||||   |  |||| ||||| | ||||| | ||||||||||   | |||||||||||||||||    
T  27592306 gtttttaaaaggagctcctgctggagatttttcaagttatttgaagctgaactctctttcacattttcaagaaaacatgagcattcaaattgatcagcaa 27592405  T
Q  208 caaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccatgtcaagaag 307  Q
     ||| ||||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||||||| | ||||||| ||| |||||  ||||| |||  ||||| ||    ||||||||    
T  27592406 taaagttataaattgctttcgcaagtgttgattttcccaagcctccaatcccataaattccaaccatatggaccccatgatcagatccttcatcaagaag 27592505  T
Q  308 caatttcacttgttctattcgggactgtaatccaacagggtatttggctacattt 362  Q
    | |||||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||||  |||| ||||||    
T  27592506 cgatttcacttgttgtactcgagactgcaatccaacagggtaagtggcaacattt 27592560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 155 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 26824669 - 26824464
Alignment:
Q  155 tgaattctctctgacattatgaagaaaacatacactttcaaattgatcagcaacaaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctcca 254  Q
    |||||||||||| || || | ||||||||| | |  |||||||| |||||||| | ||||| ||  |||||||||||||||||||||||| |  ||||||    
T  26824669 tgaattctctctcacgttctcaagaaaacaaaaaacttcaaatttatcagcaatagaattaaaagttgcttttgcaagtgttgatttacctaaacctcca 26824570  T
Q  255 gtaccataaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccatgtcaagaagcaatttcacttgttctattcgggactgtaatccaacagggtatttgg 354  Q
     |||| ||||||||||||||  ||||| |||| |||||  |  | ||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26824569 ataccgtaaagtcctaccatatggaccacatcatcagattcgttatcaagaagagatttcacttgttgtactcgggactgtaatccaaccgggtatttgg 26824470  T
Q  355 ctacat 360  Q
    | ||||    
T  26824469 caacat 26824464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 9 - 349
Target Start/End: Original strand, 27676806 - 27677146
Alignment:
Q  9 acatcatcaagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttccttaatgattgaaattccctcactaacatctcctaacttttggttcaattt-aact 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| |||||||| ||  | | |||||| || ||||||  |||||||||    ||||| || || |    
T  27676806 acatcatcaagaatcaaaagaatcttctttccatgtagcctttcctttattttaggaattccttcgctaacacttcctaacttaat-ttcaagttgaagt 27676904  T
Q  108 gttcttaaaaggagatcttcctggagatgtttcagtttattatgacttgaattctctctgacattatgaagaaaacatacactttcaaattgatcagcaa 207  Q
    ||| |||||||||| || | |||||||| |||||  |||||   |  |||| ||||| | ||||| | ||||||||||   | |||||||||||||||||    
T  27676905 gtttttaaaaggagctcctgctggagatttttcaagttatttgaagctgaactctctttcacattttcaagaaaacatgagcattcaaattgatcagcaa 27677004  T
Q  208 caaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccatgtcaagaag 307  Q
     ||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||||||| | ||||||| ||| |||||  ||||| |||  ||||| ||    ||||||||    
T  27677005 taaaattataaattgctttcgcaagtgttgattttcccaagcctccaatcccataaattccaaccatatggaccccatgatcagatccttcatcaagaag 27677104  T
Q  308 caatttcacttgttctattcgggactgtaatccaacagggta 349  Q
    | |||||| ||||| || ||| ||||| ||||||||||||||    
T  27677105 cgatttcatttgttgtactcgagactgcaatccaacagggta 27677146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 162 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 28140378 - 28140295
Alignment:
Q  162 tctctgacattatgaagaaaacatacactttcaaattgatcagcaacaaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttaccc 245  Q
    ||||| ||||||||||||||||| | || |||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||    
T  28140378 tctctcacattatgaagaaaacacaaacattcaaattgatcggcaataaaattataaattgcttgtgcaagtgttgttttaccc 28140295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 168 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 26937866 - 26937790
Alignment:
Q  168 acattatgaagaaaacatacactttcaaattgatcagcaacaaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacc 244  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||  |||||||||| ||||  ||||||||||||||||||    
T  26937866 acattatgaagaaaacacaaactttcaaattgatcaccaatcaaattataaattgctcgtgcaagtgttgatttacc 26937790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 155 - 237
Target Start/End: Original strand, 28097775 - 28097857
Alignment:
Q  155 tgaattctctctgacattatgaagaaaacatacactttcaaattgatcagcaacaaaattataaactgcttttgcaagtgttg 237  Q
    |||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||| |||||||||| ||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28097775 tgaattttctctcacattgtgaaggaaacagacacattcaaattgaccagcaatgaaattataaaccgcttttgcaagtgttg 28097857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 191 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 26849526 - 26849461
Alignment:
Q  191 ttcaaattgatcagcaacaaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagt 256  Q
    |||||||||||||||||   |||||||||||||||  |||||||||| ||| ||||| ||||||||    
T  26849526 ttcaaattgatcagcaatcgaattataaactgcttgagcaagtgttgtttttcccattcctccagt 26849461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 174 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 28243626 - 28243538
Alignment:
Q  174 tgaagaaaacatacactttcaaattgatcagcaacaaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagtaccata 262  Q
    ||||||||||||| ||  |||||||||||||| |   |||||||||||||| ||||||||||||  || ||||| || ||||| |||||    
T  28243626 tgaagaaaacataaacaatcaaattgatcagctatggaattataaactgctcttgcaagtgttgtctttcccattccaccagtcccata 28243538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 155 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 26950593 - 26950511
Alignment:
Q  155 tgaattctctctgacattatgaagaaaacatacactttcaaattgatcagcaacaaaattataaactgcttttgcaagtgttg 237  Q
    |||||| ||||| ||||| ||||||||||||   | ||||||||||| |||||  || |||||||||||||  ||||||||||    
T  26950593 tgaattttctctcacattgtgaagaaaacatttgcattcaaattgattagcaatcaagttataaactgcttgagcaagtgttg 26950511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 191 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 26975765 - 26975700
Alignment:
Q  191 ttcaaattgatcagcaacaaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagt 256  Q
    ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||| || |||||    
T  26975765 ttcaaattgattagcaatcaaattataaactgcttgagcaagtgttgtcttacccattcccccagt 26975700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 174 - 246
Target Start/End: Original strand, 29843338 - 29843410
Alignment:
Q  174 tgaagaaaacatacactttcaaattgatcagcaacaaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttaccca 246  Q
    ||||||||||| | || |||||||| ||||||||  |||||||||| ||||   |||||||||| ||||||||    
T  29843338 tgaagaaaacacaaacattcaaatttatcagcaatcaaattataaattgctcgagcaagtgttgttttaccca 29843410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 141; Significance: 9e-74; HSPs: 3)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 8 - 360
Target Start/End: Original strand, 28126860 - 28127212
Alignment:
Q  8 gacatcatcaagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttccttaatgattgaaattccctcactaacatctcctaacttttggttcaatttaact 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||  || ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||   || ||||  ||||    
T  28126860 gacatcatcaagaatcaaaagaatcttctttctgcatagcctttgttttatgattgcaattccctcactaacacctcctaacttaatgtccaatccaact 28126959  T
Q  108 gttcttaaaaggagatcttcctggagatgtttcagtttattatgacttgaattctctctgacattatgaagaaaacatacactttcaaattgatcagcaa 207  Q
    ||| | |||||||| | ||| |||||||||||||  ||||   || ||||| ||||||| ||||  |  |||||||||| || |||||||||||||||||    
T  28126960 gttttcaaaaggagcttttcttggagatgtttcaaattatatggagttgaaatctctctcacatcttctagaaaacataaaccttcaaattgatcagcaa 28127059  T
Q  208 caaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccatgtcaagaag 307  Q
      |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| | ||| | || |||||    
T  28127060 tgaaattataaattgcttttgcaagtgttgatttacccaagcctccaataccataaagtcctaccatgtggacctcatcatcatatcccttatcgagaag 28127159  T
Q  308 caatttcacttgttctattcgggactgtaatccaacagggtatttggctacat 360  Q
    ||| |||||||||| || | ||  ||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  28127160 caaattcacttgttgtacttggtcctgtaatccaacaggatatttggcaacat 28127212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 8 - 352
Target Start/End: Original strand, 28163561 - 28163904
Alignment:
Q  8 gacatcatcaagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttccttaatgattgaaattccctcactaacatctcctaacttttggttcaatttaact 107  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||  ||| ||||  || ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||   || | || |||||    
T  28163561 gacatcatcaagaatcaaaagaattttatttctatgtagcctttgttttatgattgtaattccctcactaacacctcctaacttaatgtccgatctaact 28163660  T
Q  108 gttcttaaaaggagatcttcctggagatgtttcagtttattatgacttgaattctctctgacattatgaagaaaacatacactttcaaattgatcagcaa 207  Q
    ||| | |||| ||| |||||||||||||||||||  ||     || ||||||||||||| ||||  |  |||||||||| || |||||||||||||||||    
T  28163661 gtt-tcaaaaagagctcttcctggagatgtttcaagttggatggagttgaattctctctcacatcttctagaaaacataaaccttcaaattgatcagcaa 28163759  T
Q  208 caaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccatgtcaagaag 307  Q
      |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| | ||| | || |||||    
T  28163760 tgaaattataaattgcttttgcaagtgttgatttacccaagcctccagtatcataaagtcctaccatgtggacctcatcatcatatcccttatcgagaag 28163859  T
Q  308 caatttcacttgttctattcgggactgtaatccaacagggtattt 352  Q
    |||||||||||||| || | | || |||||||||||||| |||||    
T  28163860 caatttcacttgttgtacttgagattgtaatccaacaggatattt 28163904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 9 - 360
Target Start/End: Original strand, 267526 - 267877
Alignment:
Q  9 acatcatcaagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttccttaatgattgaaattccctcactaacatctcctaacttttggttcaatttaactg 108  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||   |||||||    | ||||  |  ||    
T  267526 acatcatcgagaatcaaaagaatcttctttctacatagcctttccttaatgattggaatgccctcactaacatggtctaacttaatttccaatccagttg 267625  T
Q  109 ttcttaaaaggagatcttcctggagatgtttcagttta-ttatgacttgaattctctctgacattatgaagaaaacatacactttcaaattgatcagcaa 207  Q
    || |||||||||| |  || |||||||||||||  ||| ||||  || ||||| ||||| |||| ||||||||||||||  | |||||||||||||||||    
T  267626 tttttaaaaggagcttctcttggagatgtttcaagttacttatagct-gaattttctctcacatcatgaagaaaacataatccttcaaattgatcagcaa 267724  T
Q  208 caaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccatgtcaagaag 307  Q
     ||||||||| | |||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| | ||||||| ||| |||||  ||||| |||| ||||| ||  | ||||||||    
T  267725 taaaattatagattgctcttgcaagggttgatttacccaagcctccaatcccataaattccaaccatatggaccccatcatcagatccattatcaagaag 267824  T
Q  308 caatttcacttgttctattcgggactgtaatccaacagggtatttggctacat 360  Q
    |||||||||||||| || | | |||  ||||||||||||||| ||||| ||||    
T  267825 caatttcacttgttgtacttgagaccataatccaacagggtaattggcaacat 267877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 116; Significance: 7e-59; HSPs: 7)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 9 - 360
Target Start/End: Original strand, 18678742 - 18679093
Alignment:
Q  9 acatcatcaagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttccttaatgattgaaattccctcactaacatctcctaacttttggttcaatttaactg 108  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||  ||| |||||||| ||    | |||||||||||||||| ||||||||||    |||| |  || ||    
T  18678742 acatcatcgagaatcaaaagaatcttctttgtatgtagcctttcctttatataaggaattccctcactaacacctcctaacttaattttcagtgaaagtg 18678841  T
Q  109 ttcttaaaaggagatcttcctggagatgtttcagtttattatgacttgaattctctctgacattatgaagaaaacatacactttcaaattgatcagcaac 208  Q
    || |||||||||| || |||||||||||||||| || |||   |  |||||||||||| ||||| | ||||||||||   | |||||||||||||||||     
T  18678842 tttttaaaaggagttcctcctggagatgtttcaattgatttgaagctgaattctctctcacattttcaagaaaacatgagcattcaaattgatcagcaat 18678941  T
Q  209 aaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccatgtcaagaagc 308  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  |||| | ||| |     |||||||||    
T  18678942 aaaattataaattgcttttgcaagtgttaatttacccatgcctccaatgccataaagtcctaccatgcggactccatcataagatcattcatcaagaagc 18679041  T
Q  309 aatttcacttgttctattcgggactgtaatccaacagggtatttggctacat 360  Q
     |||||||||||| || ||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||    
T  18679042 gatttcacttgttgtactcgagactgcaatccaacagggtaattggcaacat 18679093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 9 - 360
Target Start/End: Original strand, 18698582 - 18698933
Alignment:
Q  9 acatcatcaagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttccttaatgattgaaattccctcactaacatctcctaacttttggttcaatttaactg 108  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||   || |||||||| ||    | |||||||||||||||| ||||||||||    |||| |   | ||    
T  18698582 acatcatcgagaatcaaaagaatcttctttgtatgcagcctttcctttatataaggaattccctcactaacacctcctaacttaattttcagtgctagtg 18698681  T
Q  109 ttcttaaaaggagatcttcctggagatgtttcagtttattatgacttgaattctctctgacattatgaagaaaacatacactttcaaattgatcagcaac 208  Q
    || |||||||||| || |||||||||||||||| || |||   |  |||||||||||| ||||| | ||||||||||   | |||||||||||||||||     
T  18698682 tttttaaaaggagttcctcctggagatgtttcaattgatttgaagctgaattctctctcacattttcaagaaaacatgagcattcaaattgatcagcaat 18698781  T
Q  209 aaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccatgtcaagaagc 308  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||  |||| ||||| ||  | |||||||||    
T  18698782 aaaattataaattgctttcgcaagtgttgatttacccatgcctccaatgccataaagtcctaacatgcggactccatcatcagatcctttatcaagaagc 18698881  T
Q  309 aatttcacttgttctattcgggactgtaatccaacagggtatttggctacat 360  Q
      ||||||||||| || ||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||    
T  18698882 gctttcacttgttgtactcgagactgcaatccaacagggtaattggcaacat 18698933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 9 - 349
Target Start/End: Original strand, 18654659 - 18654999
Alignment:
Q  9 acatcatcaagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttccttaatgattgaaattccctcactaacatctcctaacttttggttcaatttaactg 108  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||  ||| |||||||| ||    | |||||||||||||||| ||||||||||    |||| |  || ||    
T  18654659 acatcatcgagaatcaaaagaatcttctttgtatgtagcctttcctttatataaggaattccctcactaacacctcctaacttaattttcagtgaaagtg 18654758  T
Q  109 ttcttaaaaggagatcttcctggagatgtttcagtttattatgacttgaattctctctgacattatgaagaaaacatacactttcaaattgatcagcaac 208  Q
    || |||||||||| || |||||||||||||||| || |||   |  |||||| ||||| ||||| | ||||||||||   | |||||||||||||||||     
T  18654759 tttttaaaaggagttcctcctggagatgtttcaattgatttgaagatgaattttctctcacattttcaagaaaacatgagcattcaaattgatcagcaat 18654858  T
Q  209 aaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccatgtcaagaagc 308  Q
    | |||||| || || |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||  || | ||||| ||  | |||||||||    
T  18654859 acaattattaattgattttgcaagtgttgattttcccatgcctccaataccataaagtcctatcatgcggactccaccatcagatcctttatcaagaagc 18654958  T
Q  309 aatttcacttgttctattcgggactgtaatccaacagggta 349  Q
     |||||||||||| || ||| ||||| || |||||||||||    
T  18654959 gatttcacttgttgtactcgagactgcaacccaacagggta 18654999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 9 - 349
Target Start/End: Original strand, 18730686 - 18731026
Alignment:
Q  9 acatcatcaagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttccttaatgattgaaattccctcactaacatctcctaacttttggttcaatttaactg 108  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||  ||| |||||||| ||    | |||||||||||||||| ||||||||||    |||| |   | ||    
T  18730686 acatcatcgagaatcaaaagaatcttctttgtatgtagcctttcctttatatagggaattccctcactaacacctcctaacttaattttcagtgctagtg 18730785  T
Q  109 ttcttaaaaggagatcttcctggagatgtttcagtttattatgacttgaattctctctgacattatgaagaaaacatacactttcaaattgatcagcaac 208  Q
    || |||||||||| || |||||||||||||||| || |||   |  |||||||||||| ||||| | ||||||||||   | |||||||||||||||||     
T  18730786 tttttaaaaggagttcctcctggagatgtttcaattgatttgaagctgaattctctctcacattttcaagaaaacatgagcattcaaattgatcagcaat 18730885  T
Q  209 aaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccatgtcaagaagc 308  Q
    ||||||||||| | |||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||  || | | ||| ||  | |||||||||    
T  18730886 aaaattataaattactttagcaagtgttgattttcccatgcctccaataccataaagtcctatcatgcggactccaccataagatcctttatcaagaagc 18730985  T
Q  309 aatttcacttgttctattcgggactgtaatccaacagggta 349  Q
     |||||||||||| || ||| ||||| || |||||||||||    
T  18730986 gatttcacttgttgtactcgagactgcaacccaacagggta 18731026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 9 - 349
Target Start/End: Original strand, 18723267 - 18723607
Alignment:
Q  9 acatcatcaagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttccttaatgattgaaattccctcactaacatctcctaacttttggttcaatttaactg 108  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||  ||| |||| ||| ||    | ||||| |||||||||| ||||||| ||    |||| |  || ||    
T  18723267 acatcatcgagaatcaaaagaatcttctttgtatgtagccttttctttatataaggaattctctcactaacacctcctaagttaattttcagtgaaagtg 18723366  T
Q  109 ttcttaaaaggagatcttcctggagatgtttcagtttattatgacttgaattctctctgacattatgaagaaaacatacactttcaaattgatcagcaac 208  Q
    || |||||||||| || |||||||||||||||| || |||   |  |||||||||||| || || | ||||||||||   | |||||||||||||||||     
T  18723367 tttttaaaaggagttcctcctggagatgtttcaattgatttgaagctgaattctctctcacgttttcaagaaaacatgagcattcaaattgatcagcaat 18723466  T
Q  209 aaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccatgtcaagaagc 308  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||  || | | ||| ||  | |||||||||    
T  18723467 aaaattataaattccttttgcaagtgttgattttcccatgcctccaataccataaagtcctatcatgcggactccaccattagatcctttatcaagaagc 18723566  T
Q  309 aatttcacttgttctattcgggactgtaatccaacagggta 349  Q
     |||||||||||| || ||| ||||| || |||||||||||    
T  18723567 gatttcacttgttgtactcgagactgcaacccaacagggta 18723607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 12 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 18074754 - 18074417
Alignment:
Q  12 tcatcaagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttccttaatgattgaaattccctcactaacatctcctaacttttggttcaatttaactgttc 111  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| | |  |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| |||||||    |||| || || |||      
T  18074754 tcatcgagaatcaaaagaatcttctttctacacaacctttcctttatgattgagattccctcactgacatctgctaacttaattttcagttgaagtgtct 18074655  T
Q  112 ttaaaaggag-atcttcctggagatgtttcagtttattatgacttgaattctctctgacattatgaagaaaacatacactttcaaattgatcagcaacaa 210  Q
    || ||||||| |||| |||||| | ||||||   ||||   |  ||||||||||||||| |  | ||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  18074654 ttgaaaggagcatct-cctggaaacgtttcaagctatttgaagctgaattctctctgacttgttcaagaaaacataaaccttcaaattgatcagcaacaa 18074556  T
Q  211 aattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccatgtcaagaagcaa 310  Q
    ||||||| | |||| |||||||||||||||||||   ||||||| | ||||||| ||| |||||  ||||| |||| ||||  |||   ||||||||| |    
T  18074555 aattatagattgctcttgcaagtgttgatttacctgagcctccaatcccataaattccaaccatatggaccccatcatcaggtccctcatcaagaagcga 18074456  T
Q  311 tttcacttgttctattcgggactgtaatccaacagggta 349  Q
    ||||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||||    
T  18074455 tttcacttgttgtactcgagactgcaatccaacagggta 18074417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 154 - 262
Target Start/End: Original strand, 5090284 - 5090392
Alignment:
Q  154 ttgaattctctctgacattatgaagaaaacatacactttcaaattgatcagcaacaaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctcc 253  Q
    ||||||| ||||| |||||  |||||||||| | || ||||||||||| |||||  ||||| |||| ||||||| ||||||| | ||||||||| |||||    
T  5090284 ttgaattttctctcacattgggaagaaaacaaagacattcaaattgatgagcaatgaaattgtaaattgcttttccaagtgtggttttacccattcctcc 5090383  T
Q  254 agtaccata 262  Q
    ||| |||||    
T  5090384 agtcccata 5090392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0419 (Bit Score: 112; Significance: 2e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0419
Description:

Target: scaffold0419; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 9 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 8483 - 8132
Alignment:
Q  9 acatcatcaagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttccttaatgattgaaattccctcactaacatctcctaacttttggttcaatttaactg 108  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||| ||   || |||||||| ||    | ||||||||||||||||  |||||||||    |||  || || ||    
T  8483 acatcatcgagaatcaaaagagtcttctttgtatgcagcctttcctttatataaggaattccctcactaacacttcctaacttagttttctgttgaagtg 8384  T
Q  109 ttcttaaaaggagatcttcctggagatgtttcagtttattatgacttgaattctctctgacattatgaagaaaacatacactttcaaattgatcagcaac 208  Q
    || |||||||||| || |||||||||||||||| ||||||   |  |||||||||||| ||||| | ||||||||||   | |||||||||||||| ||     
T  8383 tttttaaaaggagttcctcctggagatgtttcaatttatttgaagctgaattctctctcacattttcaagaaaacatgagcattcaaattgatcagaaat 8284  T
Q  209 aaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccatgtcaagaagc 308  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||| ||||| ||    |||||||||    
T  8283 aaaattataaattgcttttccaagtgttgatttacccaagcctccagtaccataaagtcctaccatgtggactccatcatcagatccttcatcaagaagc 8184  T
Q  309 aatttcacttgttctattcgggactgtaatccaacagggtatttggctacat 360  Q
     ||||||| |||| || ||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  8183 gatttcacatgttgtactcgagactgtaatccaacagggtaattggcaacat 8132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0277 (Bit Score: 112; Significance: 2e-56; HSPs: 2)
Name: scaffold0277
Description:

Target: scaffold0277; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 9 - 360
Target Start/End: Original strand, 12861 - 13212
Alignment:
Q  9 acatcatcaagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttccttaatgattgaaattccctcactaacatctcctaacttttggttcaatttaactg 108  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||| ||   || |||||||| ||    | ||||||||||||||||  |||||||||    |||  || || ||    
T  12861 acatcatcgagaatcaaaagagtcttctttgtatgcagcctttcctttatataaggaattccctcactaacacttcctaacttagttttctgttgaagtg 12960  T
Q  109 ttcttaaaaggagatcttcctggagatgtttcagtttattatgacttgaattctctctgacattatgaagaaaacatacactttcaaattgatcagcaac 208  Q
    || |||||||||| || |||||||||||||||| ||||||   |  |||||||||||| ||||| | ||||||||||   | |||||||||||||| ||     
T  12961 tttttaaaaggagttcctcctggagatgtttcaatttatttgaagctgaattctctctcacattttcaagaaaacatgagcattcaaattgatcagaaat 13060  T
Q  209 aaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccatgtcaagaagc 308  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||| ||||| ||    |||||||||    
T  13061 aaaattataaattgcttttccaagtgttgatttacccaagcctccagtaccataaagtcctaccatgtggactccatcatcagatccttcatcaagaagc 13160  T
Q  309 aatttcacttgttctattcgggactgtaatccaacagggtatttggctacat 360  Q
     ||||||| |||| || ||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  13161 gatttcacatgttgtactcgagactgtaatccaacagggtaattggcaacat 13212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0277; HSP #2
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 9 - 360
Target Start/End: Original strand, 3898 - 4249
Alignment:
Q  9 acatcatcaagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttccttaatgattgaaattccctcactaacatctcctaacttttggttcaattt-aact 107  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||  |   || |||||||| ||    |||||||||||||||||| ||||||||||    ||||| || || |    
T  3898 acatcatcgagaatcaaaagaatcttctttgaatgcagcctttcctttatatgagaaattccctcactaacacctcctaacttaat-ttcaagttgaagt 3996  T
Q  108 gttcttaaaaggagatcttcctggagatgtttcagtttattatgacttgaattctctctgacattatgaagaaaacatacactttcaaattgatcagcaa 207  Q
    ||| |||||||||| || |||||||||||||||| ||||||   |  |||||||||||| ||||| | ||||||||||   | |||||||| ||||||||    
T  3997 gtttttaaaaggagctcctcctggagatgtttcaatttatttgaagctgaattctctctcacattttcaagaaaacatgagcattcaaattcatcagcaa 4096  T
Q  208 caaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccatgtcaagaag 307  Q
     ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |  |||  ||||| ||    ||||||||    
T  4097 taaaattataaattgcttttccaagtgttgatttacccaagcctccagtaccataaagtcctaccatgtgggctccatgatcagatccttcatcaagaag 4196  T
Q  308 caatttcacttgttctattcgggactgtaatccaacagggtatttggctacat 360  Q
    | ||||||| |||| || ||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  4197 cgatttcacatgttgtactcgagactgtaatccaacagggtaattggcaacat 4249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0349 (Bit Score: 101; Significance: 6e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0349
Description:

Target: scaffold0349; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 9 - 360
Target Start/End: Original strand, 2725 - 3076
Alignment:
Q  9 acatcatcaagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttccttaatgattgaaattccctcactaacatctcctaacttttggttcaattt-aact 107  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||| |||||||| ||    | |||||||||||||||| |||| |||||    ||||| || || |    
T  2725 acatcatcaagaatcaaaagaaccttctttctatgtagcctttcctttatataaggaattccctcactaacacctccaaacttaat-ttcaagttgaagt 2823  T
Q  108 gttcttaaaaggagatcttcctggagatgtttcagtttattatgacttgaattctctctgacattatgaagaaaacatacactttcaaattgatcagcaa 207  Q
    ||| |||||||||| ||   ||| |||||||||| ||||||   |  |||||||||||| ||||| | ||||||||||   | |||||||||||||||||    
T  2824 gtttttaaaaggagctccaactgaagatgtttcaatttatttgaagctgaattctctctcacattttcaagaaaacatgagcattcaaattgatcagcaa 2923  T
Q  208 caaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccatgtcaagaag 307  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||| ||||| |     ||||||||    
T  2924 taaaattataaattgcttttgcaagtgttgatttacccaatcctccagtaccataaagtcctaccatgtggactccatcatcagatctttcatcaagaag 3023  T
Q  308 caatttcacttgttctattcgggactgtaatccaacagggtatttggctacat 360  Q
    | |||||||||||| || ||| ||||  | |||||||||||| ||||| ||||    
T  3024 cgatttcacttgttgtactcgagacttcattccaacagggtaattggcaacat 3076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 92; Significance: 2e-44; HSPs: 1)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 9 - 360
Target Start/End: Original strand, 29273024 - 29273375
Alignment:
Q  9 acatcatcaagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttccttaatgattgaaattccctcactaacatctcctaacttttggttcaatttaactg 108  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||  ||| || ||||| || |||| ||| |||||||||||||   |||||||    | ||||  |  ||    
T  29273024 acatcatcgagaatcaaaagaattttctttctacttagcctctcctttataattggaatcccctcactaacatgatctaacttaatttccaatccagttg 29273123  T
Q  109 ttcttaaaaggagatcttcctggagatgtttcagtttattatgacttgaattctctctgacattatgaagaaaacatacactttcaaattgatcagcaac 208  Q
    || |||||||||| |  || |||||||||||||  ||||| | |  |||||||||||| |||| |||||||||||||| |  |||||||||||||||||     
T  29273124 tttttaaaaggagtttctcttggagatgtttcaagttatttttagctgaattctctctcacatcatgaagaaaacataaatcttcaaattgatcagcaaa 29273223  T
Q  209 aaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccatgtcaagaagc 308  Q
    ||||||||| | |||| ||||||| ||||||||||||| ||| ||| | ||||||| ||| |||||  ||| | |||| ||||| ||  | |||||||||    
T  29273224 aaaattatagattgctcttgcaagggttgatttacccaagccaccaatcccataaattccaaccatatggatcccatcatcagatccattatcaagaagc 29273323  T
Q  309 aatttcacttgttctattcgggactgtaatccaacagggtatttggctacat 360  Q
     |||| ||||||| || | | |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29273324 gatttgacttgttgtacttgagactgtaatccaacagggtatttggcaacat 29273375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 87; Significance: 1e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 12 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 60562 - 60225
Alignment:
Q  12 tcatcaagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttccttaatgattgaaattccctcactaacatctcctaacttttggttcaatttaactgttc 111  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| | |  |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| |||||||    |||| || || |||      
T  60562 tcatcgagaatcaaaagaatcttctttctacacaacctttcctttatgattgagattccctcactgacatctgctaacttaattttcagttgaagtgtct 60463  T
Q  112 ttaaaaggag-atcttcctggagatgtttcagtttattatgacttgaattctctctgacattatgaagaaaacatacactttcaaattgatcagcaacaa 210  Q
    || ||||||| |||| |||||| | ||||||   ||||   |  ||||||||||||||| |  | ||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  60462 ttgaaaggagcatct-cctggaaacgtttcaagctatttgaagctgaattctctctgacttgttcaagaaaacataaaccttcaaattgatcagcaacaa 60364  T
Q  211 aattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccatgtcaagaagcaa 310  Q
    ||||||| | |||| |||||||||||||||||||   ||||||| | ||||||| ||| |||||  ||||| |||| ||||  |||   ||||||||| |    
T  60363 aattatagattgctcttgcaagtgttgatttacctgagcctccaatcccataaattccaaccatatggaccccatcatcaggtccctcatcaagaagcga 60264  T
Q  311 tttcacttgttctattcgggactgtaatccaacagggta 349  Q
    ||||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||||    
T  60263 tttcacttgttgtactcgagactgcaatccaacagggta 60225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 52; Significance: 1e-20; HSPs: 2)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 155 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 3280509 - 3280410
Alignment:
Q  155 tgaattctctctgacattatgaagaaaacatacactttcaaattgatcagcaacaaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctcca 254  Q
    |||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||  ||||||||||||||| ||||||| ||||  |||||||| ||||||    
T  3280509 tgaattttctctcacattgtgaagaaaacatacacattcaaattgattagcaatgaaattataaactgctcttgcaagagttgtcttacccattcctcca 3280410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 155 - 260
Target Start/End: Original strand, 17992547 - 17992652
Alignment:
Q  155 tgaattctctctgacattatgaagaaaacatacactttcaaattgatcagcaacaaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctcca 254  Q
    |||||| ||||| ||||| ||||| |||||   || || |||||||| |||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||  || ||||| || |||    
T  17992547 tgaattttctctcacattgtgaaggaaacacttacattgaaattgattagcaaccaaattataaactgcttgagcaagagttgtcttgcccattccacca 17992646  T
Q  255 gtacca 260  Q
    ||||||    
T  17992647 gtacca 17992652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000004; HSPs: 1)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 155 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 16691717 - 16691618
Alignment:
Q  155 tgaattctctctgacattatgaagaaaacatacactttcaaattgatcagcaacaaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctcca 254  Q
    |||||| ||||| || | |||||||||||| | || |||||||||||||||||  |||||||||| ||||   |||||||||| |||||| || ||||||    
T  16691717 tgaattttctctcacgtcatgaagaaaacacaaacattcaaattgatcagcaatcaaattataaattgctcgagcaagtgttgttttaccgattcctcca 16691618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 174 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 43788 - 43700
Alignment:
Q  174 tgaagaaaacatacactttcaaattgatcagcaacaaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagtaccata 262  Q
    ||||||||||||| ||  |||||||||||||| |   |||||||||||||| ||||||||||||  || ||||| || ||||| |||||    
T  43788 tgaagaaaacataaacaatcaaattgatcagctatggaattataaactgctcttgcaagtgttgtctttcccattccaccagtcccata 43700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University