View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF17777_low_19 (Length: 371)

Name: NF17777_low_19
Description: NF17777
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF17777_low_19
NF17777_low_19
[»] chr7 (6 HSPs)
chr7 (14-355)||(14627299-14627640)
chr7 (14-248)||(14652716-14652950)
chr7 (14-252)||(14661151-14661389)
chr7 (14-243)||(14750119-14750348)
chr7 (14-252)||(14758032-14758270)
chr7 (14-204)||(14765240-14765430)
[»] chr5 (5 HSPs)
chr5 (14-355)||(17701853-17702194)
chr5 (14-248)||(17690802-17691036)
chr5 (14-252)||(17683872-17684110)
chr5 (14-252)||(17570265-17570503)
chr5 (14-204)||(17563169-17563359)
[»] chr1 (4 HSPs)
chr1 (17-217)||(15196324-15196524)
chr1 (17-217)||(15216742-15216942)
chr1 (14-205)||(15195685-15195876)
chr1 (14-205)||(15216103-15216294)
[»] scaffold1961 (1 HSPs)
scaffold1961 (14-217)||(22-225)
[»] chr8 (1 HSPs)
chr8 (132-217)||(24395647-24395732)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 318; Significance: 1e-179; HSPs: 6)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 14 - 355
Target Start/End: Original strand, 14627299 - 14627640
Alignment:
Q  14 gaacctgtggagagaaaatgttatttattcaaaccagataaggactcgactgtcgaatacgcttttggagtttatatttaaggagcgtgccggggaagat 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  14627299 gaacctgtggagagaaaatgttatttattcaaaccagataaggaatcgattgtcgaatacgcttttggagtttgtatttaaagagcgtgccggggaagat 14627398  T
Q  114 gttaatagagaactgattagaaatgttacaaagatgctaattgatttaggtccttctgtttatgagcaagtttttgagactccttttctgcaagttttag 213  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14627399 gttaacagagaactgattagaaatgttacaaagatgctaattgatttaggtccttctgtttatgagcaagtatttgagactccttttctgcaagttttag 14627498  T
Q  214 ctgaatcttacaaggctgaatcccataaatatattgagtttgtgtagttgctttagttggaatcctattaaggatacatgttgcaattttaagtgcttct 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14627499 ctgaatcttacaaggctgaatcccataaatatattgagtttgtgtagttgctttagttggaatcctattaaggatacatgttgcaattttaagtgcttct 14627598  T
Q  314 ccctagtgtgattctagtaagttagaaagagcagtcatactt 355  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14627599 ccctagtgtgattctagtaagttagaaagagcagtcatactt 14627640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 14 - 248
Target Start/End: Original strand, 14652716 - 14652950
Alignment:
Q  14 gaacctgtggagagaaaatgttatttattcaaaccagataaggactcgactgtcgaatacgcttttggagtttatatttaaggagcgtgccggggaagat 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  14652716 gaacctgtggagagaaaatgttatttattcaaaccagataaggactcgattgtcgaatacgcttttggagtttgtatttaaggagcgtgccggggaagat 14652815  T
Q  114 gttaatagagaactgattagaaatgttacaaagatgctaattgatttaggtccttctgtttatgagcaagtttttgagactccttttctgcaagttttag 213  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14652816 gttaacagagaactgattagaaatgttacaaagatgctgatggatttaggtccttctgtttatgagcaagtatttgagactccttttctgcaagttttag 14652915  T
Q  214 ctgaatcttacaaggctgaatcccataaatatatt 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14652916 ctgaatcttacaaggctgaatcccagaaatatatt 14652950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 14 - 252
Target Start/End: Original strand, 14661151 - 14661389
Alignment:
Q  14 gaacctgtggagagaaaatgttatttattcaaaccagataaggactcgactgtcgaatacgcttttggagtttatatttaaggagcgtgccggggaagat 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  14661151 gaacctgtggagagaaaatgttatttattcaaaccagataaggactcgactgtcgaatacgcttttggagtttgtattcaaggagcgtgccggggaagat 14661250  T
Q  114 gttaatagagaactgattagaaatgttacaaagatgctaattgatttaggtccttctgtttatgagcaagtttttgagactccttttctgcaagttttag 213  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14661251 gttaacagagaactgattagaaatgttacaaagatgctaattgatttaggtccttctgtttatgagcaagaatttgagactccttttctgcaagttttag 14661350  T
Q  214 ctgaatcttacaaggctgaatcccataaatatattgagt 252  Q
    ||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||    
T  14661351 ctgaatcttacaaggctgaatctgagaaatatattgagt 14661389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 14 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 14750348 - 14750119
Alignment:
Q  14 gaacctgtggagagaaaatgttatttattcaaaccagataaggactcgactgtcgaatacgcttttggagtttatatttaaggagcgtgccggggaagat 113  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||| | |||||||    
T  14750348 gaacctgtggagagagaatgttatttattcaaaccagataaggactcgactgtcgaatacgcttttggagtttgtattcaaggagcatgctgcggaagat 14750249  T
Q  114 gttaatagagaactgattagaaatgttacaaagatgctaattgatttaggtccttctgtttatgagcaagtttttgagactccttttctgcaagttttag 213  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |  ||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||| |||  ||||||||||||||| | ||||||| ||    
T  14750248 gttaatagagaaccgattagaaatctatcaaagatgctaatggatttaggtccctttgtttatgaggaagaatttgagactccttttttacaagtttcag 14750149  T
Q  214 ctgaatcttacaaggctgaatcccataaat 243  Q
    |||| |  || | |||||||||||| ||||    
T  14750148 ctgagttctatagggctgaatcccagaaat 14750119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 14 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 14758270 - 14758032
Alignment:
Q  14 gaacctgtggagagaaaatgttatttattcaaaccagataaggactcgactgtcgaatacgcttttggagtttatatttaaggagcgtgccggggaagat 113  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||  |||  ||||| ||||| |||||||||    
T  14758270 gaacctgtggacagagaatgttatttactcaaaacagatcaggactcgactgtcgaatatgcttttggaattagtatgcaaggaacgtgctggggaagat 14758171  T
Q  114 gttaatagagaactgattagaaatgttacaaagatgctaattgatttaggtccttctgtttatgagcaagtttttgagactccttttctgcaagttttag 213  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||  || |||||| | ||||| ||||||| ||    
T  14758170 gttaatatagaactgattaaaaatattacaaagatgctaatggatttaggttcttctgtttaagagcaagaattcgagacttcgtttctacaagtttcag 14758071  T
Q  214 ctgaatcttacaaggctgaatcccataaatatattgagt 252  Q
    |||| |  |||| ||||||||| || |||| ||| ||||    
T  14758070 ctgagttctacagggctgaatctcagaaatttatcgagt 14758032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 14 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 14765430 - 14765240
Alignment:
Q  14 gaacctgtggagagaaaatgttatttattcaaaccagataaggactcgactgtcgaatacgcttttggagtttatatttaaggagcgtgccggggaagat 113  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||  ||   |  ||||||||||| |||| |    
T  14765430 gaacctgtggagagaaaatgttcttcattcaaaccagataaggactcgactgttgaatatgcttttggaattagtacacagtgagcgtgccggcgaagtt 14765331  T
Q  114 gttaatagagaactgattagaaatgttacaaagatgctaattgatttaggtccttctgtttatgagcaagtttttgagactccttttctgc 204  Q
    |||||||||| ||||||||||| | | ||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||| |||  ||||||| |||||||||||    
T  14765330 gttaatagaggactgattagaagtataacaaagatgctaattgatacaggtccttccgtttatgaggaagaatttgagaatccttttctgc 14765240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 302; Significance: 1e-170; HSPs: 5)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 14 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 17702194 - 17701853
Alignment:
Q  14 gaacctgtggagagaaaatgttatttattcaaaccagataaggactcgactgtcgaatacgcttttggagtttatatttaaggagcgtgccggggaagat 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||    
T  17702194 gaacctgtggagagaaaatgttatttattcaaaccagataaggactcgactgtcgaatacgcttttggagtttgtacttaaagagcgtgccggggaagat 17702095  T
Q  114 gttaatagagaactgattagaaatgttacaaagatgctaattgatttaggtccttctgtttatgagcaagtttttgagactccttttctgcaagttttag 213  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17702094 gttaacagagaactgattagaaatgttacaaagatgctaattgatttaggtccttctgtttatgagcaagtatttgagactccttttctgcaagttttag 17701995  T
Q  214 ctgaatcttacaaggctgaatcccataaatatattgagtttgtgtagttgctttagttggaatcctattaaggatacatgttgcaattttaagtgcttct 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17701994 ctgaatcttacaaggctgaatcccataaatatattgagtttgtgtagttgctttagttggaatcttattaaggaaacatgttgcaattttaagtgcttct 17701895  T
Q  314 ccctagtgtgattctagtaagttagaaagagcagtcatactt 355  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||    
T  17701894 ccctagtgtgattctagtaagttagaaatagaaatcatactt 17701853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 14 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 17691036 - 17690802
Alignment:
Q  14 gaacctgtggagagaaaatgttatttattcaaaccagataaggactcgactgtcgaatacgcttttggagtttatatttaaggagcgtgccggggaagat 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  17691036 gaacctgtggagagaaaatgttatttattcaaaccagataaggaatcgattgtcgaatatgcttttggagtttgtattcaaggagcgtgccggggaagat 17690937  T
Q  114 gttaatagagaactgattagaaatgttacaaagatgctaattgatttaggtccttctgtttatgagcaagtttttgagactccttttctgcaagttttag 213  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17690936 gttaacagagaactgattagaaatgttacaaagatgctaattgatttaggtccttctgtttatgagcaagtatttgagactccttttctgcaagttttag 17690837  T
Q  214 ctgaatcttacaaggctgaatcccataaatatatt 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17690836 ctgaatcttacaaggctgaatcccagaaatatatt 17690802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 14 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 17684110 - 17683872
Alignment:
Q  14 gaacctgtggagagaaaatgttatttattcaaaccagataaggactcgactgtcgaatacgcttttggagtttatatttaaggagcgtgccggggaagat 113  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  17684110 gaacctgtggagagaaattgttatttattcaaaccagataaggactcaactgtcgaatacgcttttggagtttgtatttaaggagtgtgccggggaagat 17684011  T
Q  114 gttaatagagaactgattagaaatgttacaaagatgctaattgatttaggtccttctgtttatgagcaagtttttgagactccttttctgcaagttttag 213  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17684010 gttaacagagaactgattagaaatgttacaaagatgctaattgatttaggtccttctgtttatgagcaagaatttgagactccttttctgcaagttttag 17683911  T
Q  214 ctgaatcttacaaggctgaatcccataaatatattgagt 252  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||    
T  17683910 ctgaatcttacaaggctgaatccgagaaatatatcgagt 17683872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 14 - 252
Target Start/End: Original strand, 17570265 - 17570503
Alignment:
Q  14 gaacctgtggagagaaaatgttatttattcaaaccagataaggactcgactgtcgaatacgcttttggagtttatatttaaggagcgtgccggggaagat 113  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||  |||  ||||| ||||| |||||||||    
T  17570265 gaacctgtggacagagaatgttatttactcaaaacagatcaggactcgactgtcgaatatgcttttggaattagtatgcaaggaacgtgctggggaagat 17570364  T
Q  114 gttaatagagaactgattagaaatgttacaaagatgctaattgatttaggtccttctgtttatgagcaagtttttgagactccttttctgcaagttttag 213  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||  || |||||| | ||||| ||||||| ||    
T  17570365 gttaatatagaactgattaaaaatattacaaagatgctaatggatttaggttcttctgtttatgagcaagaattcgagacttcgtttctacaagtttcag 17570464  T
Q  214 ctgaatcttacaaggctgaatcccataaatatattgagt 252  Q
    |||| |  |||| ||||||||| || |||| ||| ||||    
T  17570465 ctgagttctacagggctgaatctcagaaatttatcgagt 17570503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 14 - 204
Target Start/End: Original strand, 17563169 - 17563359
Alignment:
Q  14 gaacctgtggagagaaaatgttatttattcaaaccagataaggactcgactgtcgaatacgcttttggagtttatatttaaggagcgtgccggggaagat 113  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||  ||   |  ||||||||||| |||| |    
T  17563169 gaacctgtggagagaaaatgttcttcattcaaaccagataaggactcgactgttgaatatgcttttggaattagtacgcagtgagcgtgccggcgaagtt 17563268  T
Q  114 gttaatagagaactgattagaaatgttacaaagatgctaattgatttaggtccttctgtttatgagcaagtttttgagactccttttctgc 204  Q
    |||||||||| ||||||||||| | | ||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| | |||  ||||||| |||||||||||    
T  17563269 gttaatagaggactgattagaagtataacaaagatgctaattgatacaggtccttccgtttatggggaagaatttgagaatccttttctgc 17563359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 4)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 17 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 15196524 - 15196324
Alignment:
Q  17 cctgtggagagaaaatgttatttattcaaaccagataaggactcgactgtcgaatacgcttttggagtttatatttaaggagcgtgccggggaagatgtt 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||  ||  |||  |||||   ||| || |||| ||||    
T  15196524 cctgtggagagaaaatgttatttattcaaaccagataaggactcgattgtcgaatatgcttttggtattagtatgcaaggactatgctggagaagttgtt 15196425  T
Q  117 aatagagaactgattagaaatgttacaaagatgctaattgatttaggtccttctgtttatgagcaagtttttgagactccttttctgcaagttttagctg 216  Q
     ||||| ||||||||||| || | ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||  |||||  ||||||| |||||| |||||||||| |||||    
T  15196424 gatagaaaactgattagatatataacaaatatgctaatggatttaggtccttccgtttatatgcaagaatttgagaatcctttgctgcaagtttcagctg 15196325  T
Q  217 a 217  Q
    |    
T  15196324 a 15196324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 17 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 15216942 - 15216742
Alignment:
Q  17 cctgtggagagaaaatgttatttattcaaaccagataaggactcgactgtcgaatacgcttttggagtttatatttaaggagcgtgccggggaagatgtt 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||  ||  |||  |||||   ||| || |||| ||||    
T  15216942 cctgtggagagaaaatgttatttattcaaaccagataaggactcgattgtcgaatatgcttttggtattagtatgcaaggactatgctggagaagttgtt 15216843  T
Q  117 aatagagaactgattagaaatgttacaaagatgctaattgatttaggtccttctgtttatgagcaagtttttgagactccttttctgcaagttttagctg 216  Q
     ||||| ||||||||||| || | ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||  |||||  ||||||| |||||| |||||||||| |||||    
T  15216842 gatagaaaactgattagatatataacaaatatgctaatggatttaggtccttccgtttatatgcaagaatttgagaatcctttgctgcaagtttcagctg 15216743  T
Q  217 a 217  Q
    |    
T  15216742 a 15216742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 14 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 15195876 - 15195685
Alignment:
Q  14 gaacctgtggagagaaaatgttatttattcaaaccagataaggactcgactgtcgaatacgcttttggagtttatatttaaggagcgtgccggggaagat 113  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||  |||  ||| |   ||| || |||| |    
T  15195876 gaacctgtggagcgaaaatgttatttattcaaaccagataaggactcgattgtcgaatacgctttgggaattagtatgcaagtactatgctggagaagtt 15195777  T
Q  114 gttaatagagaactgattagaaatgttacaaagatgctaattgatttaggtccttctgtttatgagcaagtttttgagactccttttctgca 205  Q
    ||||| | | || ||||||||||| | ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||| |||||  ||||||| ||||||||||||    
T  15195776 gttaacataaaagtgattagaaatataacaaatatgctaatggatttaggaccttccgtttatgtgcaagaatttgagaatccttttctgca 15195685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 14 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 15216294 - 15216103
Alignment:
Q  14 gaacctgtggagagaaaatgttatttattcaaaccagataaggactcgactgtcgaatacgcttttggagtttatatttaaggagcgtgccggggaagat 113  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||  |||  ||| |   ||| || |||| |    
T  15216294 gaacctgtggagcgaaaatgttatttattcaaaccagataaggactcgattgtcgaatacgctttgggaattagtatgcaagtactatgctggagaagtt 15216195  T
Q  114 gttaatagagaactgattagaaatgttacaaagatgctaattgatttaggtccttctgtttatgagcaagtttttgagactccttttctgca 205  Q
    ||||| | | || ||||||||||| | ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||| |||||  ||||||| ||||||||||||    
T  15216194 gttaacataaaagtgattagaaatataacaaatatgctaatggatttaggaccttccgtttatgtgcaagaatttgagaatccttttctgca 15216103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1961 (Bit Score: 76; Significance: 5e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold1961
Description:

Target: scaffold1961; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 14 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 225 - 22
Alignment:
Q  14 gaacctgtggagagaaaatgttatttattcaaaccagataaggactcgactgtcgaatacgcttttggagtttatatttaaggagcgtgccggggaagat 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||| ||||||||  || ||||  |||||   ||| | |||||      
T  225 gaacctgtggagagaaaatgttatttattcaaaccagataaggactcgatttttgaatatgcttttgggattaatatgcaaggactatgctgaggaagtc 126  T
Q  114 gttaatagagaactgattagaaatgttacaaagatgctaattgatttaggtccttctgtttatgagcaagtttttgagactccttttctgcaagttttag 213  Q
    ||||||| | |||||||||||||  | || || |||||||| |||||||||||||| ||||||  |||||  ||||||| |||||| |||||||||| ||    
T  125 gttaataaaaaactgattagaaaaataacgaatatgctaatggatttaggtccttccgtttatatgcaagaatttgagaatcctttgctgcaagtttcag 26  T
Q  214 ctga 217  Q
    ||||    
T  25 ctga 22  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000005; HSPs: 1)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 132 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 24395732 - 24395647
Alignment:
Q  132 agaaatgttacaaagatgctaattgatttaggtccttctgtttatgagcaagtttttgagactccttttctgcaagttttagctga 217  Q
    |||||| | ||||| |||||||| |||||||||||  |||||||||  |||| ||||||| ||| |||||| ||||||| ||||||    
T  24395732 agaaatataacaaaaatgctaatggatttaggtccagctgtttatggtcaagattttgaggctcattttcttcaagtttcagctga 24395647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University