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This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.
| Legend |
| | Query |
| | Query hiting target |
| Query hiting target's complemental strand |
| | Query's complemental strand hiting target |
| Query's complemental strand hiting target's complemental strand |
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Alignment Overview
Query: NF17805_high_7 (Length: 501)
Name: NF17805_high_7
Description: NF17805
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)
| [»] NF17805_high_7 |
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Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 431; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: chr8
Description:
Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 431; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 23 - 489
Target Start/End: Original strand, 25947972 - 25948438
Alignment:
| Q |
23 |
aggaagttcaatgaagttttcacaacgtgtcaaattcaaattacgcaaagtagttaaactgccaatggattcatgaatccttgttagattaatgcagttc |
122 |
Q |
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| T |
25947972 |
aggaagttcaatcaagttttcacaacgtgtcaaattcaaattacgcaaagtagttaaactgccaatggattcatgaatccttgttagattaatgcagttc |
25948071 |
T |
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| Q |
123 |
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222 |
Q |
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| T |
25948072 |
gccaaattaattttttctaggccgagacaccaagataaatcagggattgcagcaagttggtagcagttggagaggttcatgaccattaggttctctggta |
25948171 |
T |
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| Q |
223 |
cctgctaaacaatgtgatgttatcttacaagatattatagatgttgaaaatgatatttatttgataagaaattgtatatttgttgcatgcaaaagaccac |
322 |
Q |
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| T |
25948172 |
cctgctaaacaatgtgatgttatcttacaagatattatatatgttgaaaatgatatttatttgataagaaattgtatatttgttgtatgcaaaagaccac |
25948271 |
T |
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| Q |
323 |
taatatctatattttattctagtactagactctattaaataaggaaatcatgagtatggtaacnnnnnnnncagaaaggatatcatagaattcaaagtaa |
422 |
Q |
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| T |
25948272 |
taatatctatattttattctagtactagactctattaaataaggaaatcatgagtatggtaacaaaaaaaacagaaaggatatcatagaattcaaagtaa |
25948371 |
T |
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| Q |
423 |
catgaaaataaatcctgatatataattcgttatactcttcattactatatattacattcaaaatatt |
489 |
Q |
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| T |
25948372 |
catgaaaataaatcctgatatataattcgttatactcttcattactatatattacattcaaaatatt |
25948438 |
T |
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Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 312; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 23 - 483
Target Start/End: Original strand, 25957335 - 25957795
Alignment:
| Q |
23 |
aggaagttcaatgaagttttcacaacgtgtcaaattcaaattacgcaaagtagttaaactgccaatggattcatgaatccttgttagattaatgcagttc |
122 |
Q |
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| T |
25957335 |
aggaagttcaatcaagttttcacaacgtgtcaaattcaaattaagcaatgtagttaaactgccaatggattcatgaatccttgttagattaatgcagttc |
25957434 |
T |
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| Q |
123 |
gccaaattaattttttctaggccgagacaccaagataaatcagggattgcagcaagttggtagcagttggagaggttcatgaccattaggttctctggta |
222 |
Q |
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| T |
25957435 |
accaaattaattttttctaggccgagacaccaagataaatcagggattgcagcaagttggtagcagtcggagaggttcatgaccattagggtctctggta |
25957534 |
T |
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| Q |
223 |
cctgctaaacaatgtgatgttatcttacaagatattatagatgttgaaaatgatatttatttgataagaaattgtatatttgttgcatgcaaaagaccac |
322 |
Q |
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| T |
25957535 |
cctgctaaacaatgtgatgttatcttataagatgttattgatgtcgaaaatgatatttatttgataagaaatgatatatttgttgtatgcaaaagaccaa |
25957634 |
T |
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| Q |
323 |
taatatctatattttattctagtactagactc--tattaaataaggaaatcatgagtatggtaacnnnnnnnncagaaaggatatcatagaattcaaagt |
420 |
Q |
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| T |
25957635 |
taacatctatattttattcttgtacta-actctttattaaataaggaaatcatgagcatggtaaccaaaataacagaaaggatatgataaaattcaaagt |
25957733 |
T |
|
| Q |
421 |
aacatgaaaataaatcctgatatataattcgttatactcttcattactatatattacattcaa |
483 |
Q |
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| T |
25957734 |
aatatgaaaat-aattctgagatataatacattatactctgcattactatatattacattcaa |
25957795 |
T |
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