View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF17827_low_4 (Length: 244)

Name: NF17827_low_4
Description: NF17827
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF17827_low_4
NF17827_low_4
[»] chr4 (26 HSPs)
chr4 (9-235)||(15388178-15388404)
chr4 (10-235)||(14760106-14760331)
chr4 (10-235)||(14668260-14668485)
chr4 (10-235)||(5009119-5009344)
chr4 (10-235)||(6573102-6573327)
chr4 (10-235)||(17016290-17016515)
chr4 (10-235)||(34185760-34185985)
chr4 (10-235)||(18313978-18314203)
chr4 (10-235)||(24589161-24589386)
chr4 (10-235)||(54836635-54836860)
chr4 (10-235)||(14101787-14102012)
chr4 (10-235)||(20335221-20335446)
chr4 (10-235)||(24115906-24116131)
chr4 (10-235)||(27160117-27160342)
chr4 (22-235)||(39853893-39854106)
chr4 (10-235)||(15231116-15231341)
chr4 (22-235)||(18797414-18797627)
chr4 (10-235)||(36341317-36341542)
chr4 (12-235)||(1903500-1903723)
chr4 (10-235)||(33670600-33670825)
chr4 (13-235)||(15281737-15281959)
chr4 (10-235)||(21972945-21973170)
chr4 (10-235)||(30757004-30757229)
chr4 (10-235)||(31123312-31123537)
chr4 (10-235)||(40102437-40102662)
chr4 (148-235)||(22146369-22146456)
[»] chr2 (40 HSPs)
chr2 (9-235)||(27394791-27395017)
chr2 (10-235)||(23125357-23125582)
chr2 (10-235)||(37948651-37948876)
chr2 (10-235)||(12658766-12658991)
chr2 (22-235)||(27806945-27807158)
chr2 (10-235)||(34294384-34294609)
chr2 (13-235)||(27431230-27431452)
chr2 (10-228)||(28885437-28885655)
chr2 (10-235)||(20841143-20841368)
chr2 (10-235)||(39048608-39048833)
chr2 (10-235)||(11631973-11632198)
chr2 (22-235)||(13933336-13933549)
chr2 (22-235)||(257442-257655)
chr2 (10-235)||(40236738-40236963)
chr2 (22-235)||(12590050-12590263)
chr2 (10-235)||(31879516-31879741)
chr2 (10-235)||(39893299-39893524)
chr2 (10-235)||(16826127-16826352)
chr2 (10-235)||(16895128-16895353)
chr2 (10-235)||(19413290-19413515)
chr2 (10-235)||(32053033-32053258)
chr2 (10-235)||(34864914-34865139)
chr2 (10-235)||(37380907-37381132)
chr2 (10-235)||(37682684-37682909)
chr2 (10-235)||(37697949-37698174)
chr2 (10-235)||(37928599-37928824)
chr2 (22-235)||(9346775-9346988)
chr2 (10-235)||(12713390-12713615)
chr2 (22-235)||(21673964-21674177)
chr2 (32-235)||(21699960-21700163)
chr2 (13-235)||(19453212-19453434)
chr2 (120-230)||(31890285-31890395)
chr2 (120-230)||(3785833-3785943)
chr2 (120-230)||(16164820-16164930)
chr2 (120-230)||(22924942-22925052)
chr2 (120-230)||(27779574-27779684)
chr2 (120-230)||(27819331-27819441)
chr2 (120-224)||(34158184-34158288)
chr2 (120-230)||(27119864-27119974)
chr2 (161-235)||(27827841-27827915)
[»] chr8 (20 HSPs)
chr8 (9-235)||(22077672-22077898)
chr8 (10-235)||(27605666-27605891)
chr8 (10-235)||(14560854-14561079)
chr8 (10-235)||(18793934-18794159)
chr8 (10-235)||(19691328-19691553)
chr8 (10-235)||(2134021-2134246)
chr8 (10-235)||(9357855-9358080)
chr8 (22-235)||(19205123-19205336)
chr8 (10-235)||(29832556-29832781)
chr8 (10-235)||(19677677-19677902)
chr8 (22-235)||(28358713-28358926)
chr8 (10-235)||(31357758-31357983)
chr8 (10-235)||(18712714-18712939)
chr8 (10-235)||(12089484-12089709)
chr8 (10-235)||(33261964-33262189)
chr8 (10-235)||(31486632-31486857)
chr8 (120-230)||(15770914-15771024)
chr8 (143-230)||(44564347-44564434)
chr8 (137-224)||(21344943-21345030)
chr8 (10-72)||(16286631-16286694)
[»] chr3 (61 HSPs)
chr3 (10-235)||(5593200-5593425)
chr3 (10-235)||(18054454-18054679)
chr3 (10-235)||(18273895-18274120)
chr3 (10-235)||(18289196-18289421)
chr3 (10-235)||(18304497-18304722)
chr3 (12-235)||(4793478-4793701)
chr3 (13-235)||(8286313-8286535)
chr3 (9-235)||(18333821-18334047)
chr3 (10-235)||(6205095-6205320)
chr3 (10-235)||(8299163-8299388)
chr3 (10-235)||(15889548-15889773)
chr3 (10-235)||(21677895-21678120)
chr3 (9-235)||(35883957-35884183)
chr3 (10-235)||(4686847-4687072)
chr3 (10-235)||(4724823-4725048)
chr3 (10-235)||(15737937-15738162)
chr3 (10-235)||(22384421-22384646)
chr3 (10-235)||(29145599-29145824)
chr3 (10-235)||(29661813-29662038)
chr3 (10-235)||(8214927-8215152)
chr3 (10-235)||(20069232-20069457)
chr3 (22-235)||(20573686-20573899)
chr3 (22-235)||(32442355-32442568)
chr3 (10-235)||(48469119-48469344)
chr3 (10-235)||(7076398-7076623)
chr3 (10-235)||(28112797-28113022)
chr3 (10-235)||(47026645-47026870)
chr3 (10-235)||(5016906-5017131)
chr3 (10-235)||(5606157-5606382)
chr3 (10-235)||(10399336-10399561)
chr3 (10-235)||(28342369-28342594)
chr3 (10-235)||(4343519-4343744)
chr3 (10-235)||(4420107-4420332)
chr3 (10-235)||(5470180-5470405)
chr3 (10-235)||(6539585-6539810)
chr3 (10-235)||(7999752-7999977)
chr3 (10-235)||(10646265-10646490)
chr3 (22-235)||(18245945-18246158)
chr3 (10-235)||(22867691-22867916)
chr3 (10-235)||(22882750-22882975)
chr3 (10-235)||(28024474-28024699)
chr3 (15-235)||(19697687-19697907)
chr3 (13-235)||(16621333-16621555)
chr3 (10-235)||(24331355-24331580)
chr3 (10-235)||(31961298-31961523)
chr3 (10-235)||(51785215-51785440)
chr3 (10-235)||(17981792-17982017)
chr3 (10-235)||(18228388-18228613)
chr3 (10-204)||(11107226-11107420)
chr3 (120-230)||(17992779-17992889)
chr3 (120-230)||(31033084-31033194)
chr3 (120-235)||(4627087-4627202)
chr3 (120-230)||(32293930-32294040)
chr3 (120-235)||(5714375-5714490)
chr3 (120-235)||(5725285-5725400)
chr3 (120-235)||(5766968-5767083)
chr3 (148-235)||(6963276-6963363)
chr3 (50-95)||(15918749-15918794)
chr3 (50-98)||(15592891-15592939)
chr3 (50-98)||(20443349-20443397)
chr3 (50-98)||(41440475-41440523)
[»] chr7 (35 HSPs)
chr7 (10-235)||(10913554-10913779)
chr7 (10-235)||(2157802-2158027)
chr7 (10-235)||(26438485-26438710)
chr7 (10-235)||(26534558-26534783)
chr7 (10-235)||(2106848-2107073)
chr7 (10-235)||(11421464-11421689)
chr7 (10-235)||(45390448-45390673)
chr7 (13-235)||(16515115-16515337)
chr7 (10-235)||(5131224-5131449)
chr7 (10-235)||(5144025-5144250)
chr7 (10-235)||(22145423-22145648)
chr7 (22-235)||(26516032-26516245)
chr7 (10-235)||(26271771-26271996)
chr7 (10-235)||(26316533-26316758)
chr7 (13-235)||(10844851-10845073)
chr7 (10-235)||(3448534-3448759)
chr7 (10-235)||(4141931-4142156)
chr7 (10-235)||(4202617-4202842)
chr7 (10-235)||(11444115-11444340)
chr7 (22-235)||(31561075-31561288)
chr7 (13-221)||(16044550-16044758)
chr7 (13-235)||(10842679-10842901)
chr7 (22-235)||(16748202-16748415)
chr7 (10-235)||(26666599-26666824)
chr7 (10-235)||(24589219-24589444)
chr7 (32-235)||(16446691-16446894)
chr7 (120-230)||(2776592-2776702)
chr7 (120-230)||(26512386-26512496)
chr7 (120-230)||(26681796-26681906)
chr7 (120-230)||(31127245-31127355)
chr7 (120-230)||(39209829-39209939)
chr7 (10-160)||(9621878-9622028)
chr7 (127-230)||(45734658-45734761)
chr7 (120-230)||(31087312-31087422)
chr7 (50-98)||(16287201-16287249)
[»] chr6 (46 HSPs)
chr6 (10-235)||(27022364-27022589)
chr6 (10-235)||(27287107-27287332)
chr6 (10-235)||(29552785-29553010)
chr6 (10-235)||(13295694-13295919)
chr6 (10-235)||(15421063-15421288)
chr6 (10-235)||(22931627-22931852)
chr6 (10-235)||(23854072-23854297)
chr6 (10-235)||(24866944-24867169)
chr6 (10-235)||(27626454-27626679)
chr6 (10-235)||(16677368-16677593)
chr6 (10-235)||(27179684-27179909)
chr6 (10-235)||(27269330-27269555)
chr6 (10-235)||(34461249-34461474)
chr6 (10-235)||(3699311-3699536)
chr6 (10-235)||(4760991-4761216)
chr6 (10-235)||(17089186-17089411)
chr6 (10-235)||(27010959-27011184)
chr6 (10-224)||(26921605-26921819)
chr6 (10-224)||(16753049-16753263)
chr6 (10-235)||(27060734-27060959)
chr6 (10-235)||(29504644-29504869)
chr6 (10-235)||(4528513-4528738)
chr6 (10-235)||(4542517-4542742)
chr6 (10-235)||(4720878-4721103)
chr6 (10-235)||(27488361-27488586)
chr6 (10-235)||(29576242-29576467)
chr6 (10-235)||(30554759-30554984)
chr6 (32-235)||(20171797-20172000)
chr6 (32-235)||(22163991-22164194)
chr6 (10-235)||(16940770-16940995)
chr6 (10-235)||(26113155-26113380)
chr6 (10-235)||(28210682-28210907)
chr6 (10-235)||(4776108-4776333)
chr6 (120-235)||(22455857-22455972)
chr6 (83-235)||(26992096-26992248)
chr6 (120-235)||(26775370-26775485)
chr6 (120-235)||(27358853-27358968)
chr6 (120-235)||(27449196-27449311)
chr6 (120-230)||(14142142-14142252)
chr6 (120-230)||(26789154-26789264)
chr6 (120-230)||(27197523-27197633)
chr6 (120-230)||(27251602-27251712)
chr6 (127-230)||(8902451-8902554)
chr6 (127-235)||(28163836-28163944)
chr6 (136-235)||(33373174-33373273)
chr6 (120-230)||(13520940-13521049)
[»] chr5 (53 HSPs)
chr5 (10-235)||(15655455-15655680)
chr5 (10-235)||(41677943-41678168)
chr5 (10-235)||(11552593-11552818)
chr5 (10-235)||(33295766-33295991)
chr5 (10-235)||(33780727-33780952)
chr5 (10-235)||(22995814-22996039)
chr5 (10-235)||(23629208-23629433)
chr5 (10-235)||(24684842-24685067)
chr5 (10-235)||(24973144-24973369)
chr5 (22-235)||(40470247-40470460)
chr5 (10-235)||(18372231-18372456)
chr5 (10-235)||(31434702-31434927)
chr5 (10-235)||(37355340-37355565)
chr5 (13-235)||(23895447-23895669)
chr5 (10-235)||(3792779-3793004)
chr5 (10-235)||(9320714-9320939)
chr5 (10-235)||(12135413-12135638)
chr5 (10-235)||(18497422-18497647)
chr5 (10-235)||(26483632-26483857)
chr5 (10-230)||(43081493-43081713)
chr5 (10-235)||(13321527-13321752)
chr5 (10-235)||(28652480-28652705)
chr5 (10-235)||(30032666-30032891)
chr5 (10-235)||(37767688-37767913)
chr5 (10-235)||(6877543-6877768)
chr5 (10-235)||(8662172-8662397)
chr5 (10-235)||(24586612-24586837)
chr5 (10-235)||(30155269-30155494)
chr5 (10-235)||(30171707-30171932)
chr5 (10-235)||(30937873-30938098)
chr5 (10-235)||(31823104-31823329)
chr5 (10-235)||(33519618-33519843)
chr5 (10-235)||(34619756-34619981)
chr5 (10-235)||(37668183-37668408)
chr5 (10-235)||(37758221-37758446)
chr5 (16-235)||(22891707-22891926)
chr5 (13-235)||(25203519-25203741)
chr5 (13-235)||(25267674-25267896)
chr5 (22-235)||(15755549-15755762)
chr5 (10-235)||(24727207-24727432)
chr5 (10-235)||(32592971-32593196)
chr5 (10-235)||(5641026-5641251)
chr5 (10-235)||(28956482-28956707)
chr5 (10-235)||(2514300-2514525)
chr5 (120-235)||(18125113-18125228)
chr5 (121-235)||(13439380-13439494)
chr5 (120-230)||(9547411-9547521)
chr5 (120-230)||(11326985-11327095)
chr5 (120-235)||(13183490-13183605)
chr5 (120-230)||(29887899-29888009)
chr5 (120-230)||(33878479-33878588)
chr5 (148-235)||(351912-351999)
chr5 (50-98)||(34468900-34468948)
[»] scaffold0089 (3 HSPs)
scaffold0089 (13-235)||(3301-3523)
scaffold0089 (10-149)||(43877-44016)
scaffold0089 (13-84)||(32096-32167)
[»] scaffold0418 (1 HSPs)
scaffold0418 (10-235)||(9267-9492)
[»] scaffold0143 (3 HSPs)
scaffold0143 (10-235)||(30524-30749)
scaffold0143 (13-235)||(19304-19526)
scaffold0143 (120-235)||(7301-7416)
[»] chr1 (11 HSPs)
chr1 (22-235)||(21894549-21894762)
chr1 (10-235)||(51641451-51641676)
chr1 (16-235)||(20339101-20339320)
chr1 (22-235)||(10965910-10966123)
chr1 (10-235)||(28588218-28588443)
chr1 (10-235)||(3644365-3644593)
chr1 (10-235)||(10948310-10948535)
chr1 (22-235)||(41790110-41790323)
chr1 (14-235)||(16204834-16205055)
chr1 (13-221)||(20464212-20464420)
chr1 (120-230)||(28153079-28153189)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (10-235)||(15812-16037)
[»] scaffold0260 (1 HSPs)
scaffold0260 (16-235)||(1424-1643)
[»] scaffold0144 (1 HSPs)
scaffold0144 (10-235)||(22991-23216)
[»] scaffold0415 (1 HSPs)
scaffold0415 (10-235)||(9253-9478)
[»] scaffold0336 (1 HSPs)
scaffold0336 (10-235)||(12802-13027)
[»] scaffold0237 (1 HSPs)
scaffold0237 (10-235)||(11728-11953)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (10-235)||(11180-11405)
[»] scaffold0159 (2 HSPs)
scaffold0159 (10-235)||(5979-6204)
scaffold0159 (10-83)||(23110-23183)
[»] scaffold0322 (1 HSPs)
scaffold0322 (13-235)||(9279-9501)
[»] scaffold0748 (1 HSPs)
scaffold0748 (13-235)||(5471-5693)
[»] scaffold1888 (1 HSPs)
scaffold1888 (10-98)||(1154-1242)
[»] scaffold0099 (1 HSPs)
scaffold0099 (21-224)||(43541-43754)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (25-86)||(33706-33770)
[»] scaffold0094 (1 HSPs)
scaffold0094 (50-98)||(35177-35225)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 203; Significance: 1e-111; HSPs: 26)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 9 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 15388404 - 15388178
Alignment:
Q  9 accacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaa 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15388404 accacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaa 15388305  T
Q  109 tttctcaaaatgaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgc 208  Q
    || |||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15388304 ttactcagaaagaatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgc 15388205  T
Q  209 cagtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||    
T  15388204 cagtggaaggaaggcccttgattatgt 15388178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 10 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 14760331 - 14760106
Alignment:
Q  10 ccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaat 109  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||      
T  14760331 ccacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccaatcttcaagc 14760232  T
Q  110 ttctcaaaatgaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgcc 209  Q
    | |||| || |||||| |||||| | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  14760231 tactcagaaagaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccacc 14760132  T
Q  210 agtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
     |||||||||||||| ||||| ||||    
T  14760131 cgtggaaggaaggcctttgattatgt 14760106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 10 - 235
Target Start/End: Original strand, 14668260 - 14668485
Alignment:
Q  10 ccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaat 109  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  |||||      
T  14668260 ccacagaccgagaagcaagtcagagatttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagc 14668359  T
Q  110 ttctcaaaatgaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgcc 209  Q
    | |||| || |||||| |||||| | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  14668360 tactcagaaagaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccacc 14668459  T
Q  210 agtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
     |||||||||||||| ||||| ||||    
T  14668460 cgtggaaggaaggcctttgattatgt 14668485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 10 - 235
Target Start/End: Original strand, 5009119 - 5009344
Alignment:
Q  10 ccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaat 109  Q
    |||||||| || ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  |||||      
T  5009119 ccacagacagagaagcaagtcagaggtttcctcggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagc 5009218  T
Q  110 ttctcaaaatgaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgcc 209  Q
    | ||||  | |||||| |||||| | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  5009219 tactcaggaagaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattatctgctggaaccacctatccttgtcccacc 5009318  T
Q  210 agtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
     |||||||||||||| ||||| ||||    
T  5009319 cgtggaaggaaggcctttgattatgt 5009344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 10 - 235
Target Start/End: Original strand, 6573102 - 6573327
Alignment:
Q  10 ccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaat 109  Q
    |||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  |||||      
T  6573102 ccacagacagagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagc 6573201  T
Q  110 ttctcaaaatgaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgcc 209  Q
    | || | || |||||| |||||| | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  6573202 tacttagaaagaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccacc 6573301  T
Q  210 agtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
     |||||||||||||| ||||| ||||    
T  6573302 cgtggaaggaaggcctttgattatgt 6573327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 10 - 235
Target Start/End: Original strand, 17016290 - 17016515
Alignment:
Q  10 ccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaat 109  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  |||||      
T  17016290 ccacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagc 17016389  T
Q  110 ttctcaaaatgaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgcc 209  Q
    | |||| || |||||| ||| || | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  17016390 tactcagaaagaatcagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccacc 17016489  T
Q  210 agtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
     |||||||||||||| ||||| ||||    
T  17016490 cgtggaaggaaggcctttgattatgt 17016515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 10 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 34185985 - 34185760
Alignment:
Q  10 ccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaat 109  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |  |||||      
T  34185985 ccacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcggaccgatcttcaagc 34185886  T
Q  110 ttctcaaaatgaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgcc 209  Q
    | |||| || |||||| |||||| | |||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  34185885 tactcagaaagaatcagcctattgtatggaatgatgaatgtcaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccacc 34185786  T
Q  210 agtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
     |||||||||||||| ||||| ||||    
T  34185785 cgtggaaggaaggcctttgattatgt 34185760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 10 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 18314203 - 18313978
Alignment:
Q  10 ccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaat 109  Q
    |||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  |||||      
T  18314203 ccacagacagagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagc 18314104  T
Q  110 ttctcaaaatgaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgcc 209  Q
    | || |  | |||||| |||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  18314103 tactgagcaagaatcagcctattgtatggaacgatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccacc 18314004  T
Q  210 agtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
     |||||||||||||| ||||| ||||    
T  18314003 cgtggaaggaaggcctttgattatgt 18313978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 10 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 24589386 - 24589161
Alignment:
Q  10 ccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaat 109  Q
    |||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  |||||      
T  24589386 ccacagactgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagc 24589287  T
Q  110 ttctcaaaatgaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgcc 209  Q
    | |||| || |||||| |||||| | |||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||  |||| ||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  24589286 tactcagaaagaatcagcctattgtatggaatgatgaatgtcaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctagaaccacctatccttgtcccacc 24589187  T
Q  210 agtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
     |||||||||||||| ||||| ||||    
T  24589186 cgtggaaggaaggcctttgattatgt 24589161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 10 - 235
Target Start/End: Original strand, 54836635 - 54836860
Alignment:
Q  10 ccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaat 109  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |  |||||      
T  54836635 ccacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcggacgtctgaattacatctcccggttcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagc 54836734  T
Q  110 ttctcaaaatgaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgcc 209  Q
    | |||| || |||||| |||||| | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  54836735 tactcagaaagaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccacc 54836834  T
Q  210 agtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
     |||||||||||||| ||||| ||||    
T  54836835 cgtggaaggaaggcctttgattatgt 54836860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 10 - 235
Target Start/End: Original strand, 14101787 - 14102012
Alignment:
Q  10 ccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaat 109  Q
    |||||||| || ||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||      
T  14101787 ccacagacagagaagcaagtcagaggcttcctcggacgtttgaattacatctctcgattcatatctcacatgaccgcaacttgcgggccaatcttcaagc 14101886  T
Q  110 ttctcaaaatgaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgcc 209  Q
    | |||| || |||||| ||| || | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  14101887 tactcagaaagaatcagcctgttgtatggaatgatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccacc 14101986  T
Q  210 agtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
     |||||||||||||| ||||| ||||    
T  14101987 cgtggaaggaaggccgttgatcatgt 14102012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 10 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 20335446 - 20335221
Alignment:
Q  10 ccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaat 109  Q
    |||| |||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  |||||      
T  20335446 ccacggaccgagaagcaagtcagaggtttcctcggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagc 20335347  T
Q  110 ttctcaaaatgaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgcc 209  Q
    | |||| || |||||| ||| || | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  20335346 tactcagaaagaatcagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccacc 20335247  T
Q  210 agtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
     || ||||||||||| ||||| ||||    
T  20335246 cgtagaaggaaggcctttgattatgt 20335221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 10 - 235
Target Start/End: Original strand, 24115906 - 24116131
Alignment:
Q  10 ccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaat 109  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  |||||      
T  24115906 ccacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagc 24116005  T
Q  110 ttctcaaaatgaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgcc 209  Q
    | |||| || |||||| ||| |  | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  24116006 tactcagaaagaatcagcctgtcgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccccctatccttgtcccacc 24116105  T
Q  210 agtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
     |||||||||||||| ||||| ||||    
T  24116106 cgtggaaggaaggcctttgattatgt 24116131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 10 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 27160342 - 27160117
Alignment:
Q  10 ccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaat 109  Q
    |||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  |||||      
T  27160342 ccacagacagagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacctgcgggccgatcttcaagc 27160243  T
Q  110 ttctcaaaatgaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgcc 209  Q
    | || | || ||| || ||| || | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  27160242 tgcttagaaagaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccacc 27160143  T
Q  210 agtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
     |||||||||||||| ||||| ||||    
T  27160142 cgtggaaggaaggcctttgattatgt 27160117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 22 - 235
Target Start/End: Original strand, 39853893 - 39854106
Alignment:
Q  22 aagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaatttctcaaaatga 121  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |  |||||  | || | || ||    
T  39853893 aagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccacaacctgcgggcctatcttcaagctgcttagaaaga 39853992  T
Q  122 atcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgccagtggaaggaag 221  Q
    | || |||||| | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||    
T  39853993 accagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattatctgctggaaccacctatcctcgtcccacccgtggaaggaag 39854092  T
Q  222 gcccttgatgatgt 235  Q
    ||| ||||| ||||    
T  39854093 gcctttgattatgt 39854106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 10 - 235
Target Start/End: Original strand, 15231116 - 15231341
Alignment:
Q  10 ccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaat 109  Q
    ||||||||||| || |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||      
T  15231116 ccacagaccgagaaacaagtcagaggtttcctcgggcgattgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagc 15231215  T
Q  110 ttctcaaaatgaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgcc 209  Q
    | ||||  | |||||| |||||| | |||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  15231216 tactcaggaagaatcagcctattgtatggaacgatgaatgccaaggagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccacc 15231315  T
Q  210 agtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
     ||||||||||| || ||||| ||||    
T  15231316 cgtggaaggaagacctttgattatgt 15231341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 22 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 18797627 - 18797414
Alignment:
Q  22 aagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaatttctcaaaatga 121  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||  | || | || ||    
T  18797627 aagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagctgcttagaaaga 18797528  T
Q  122 atcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgccagtggaaggaag 221  Q
    | || ||| || | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  | || |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  18797527 accagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaagtacctgctggaaccacctatccttgtcccacccgtggaaggaag 18797428  T
Q  222 gcccttgatgatgt 235  Q
    ||| ||||| ||||    
T  18797427 gccgttgatcatgt 18797414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 10 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 36341542 - 36341317
Alignment:
Q  10 ccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaat 109  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  |||||      
T  36341542 ccacagacagagaaacaagtcagaggtttcctcggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagc 36341443  T
Q  110 ttctcaaaatgaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgcc 209  Q
    | |||| || |||||| |||||  | |||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  36341442 tactcagaaagaatcagcctatcgtatggaatgatgaaagccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccacc 36341343  T
Q  210 agtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
     |||||||||||||| ||||| ||||    
T  36341342 cgtggaaggaaggcctttgattatgt 36341317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 12 - 235
Target Start/End: Original strand, 1903500 - 1903723
Alignment:
Q  12 acagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaattt 111  Q
    ||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |  ||||| ||     
T  1903500 acagaccgagaaacaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcagcctgcgggccgatcttcaagtta 1903599  T
Q  112 ctcaaaatgaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgccag 211  Q
    ||||  | |||||| |||||| | |||||   ||||||||| | ||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| || |    
T  1903600 ctcaggaagaatcagcctattgtatggaacgttgaatgccaaggagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccacccg 1903699  T
Q  212 tggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||    
T  1903700 tggaaggaaggcctttgattatgt 1903723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 10 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 33670825 - 33670600
Alignment:
Q  10 ccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaat 109  Q
    |||||||| || ||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |  |||||      
T  33670825 ccacagacagagaagcaagtcagaggcttcctcggacgtttgaattacatctctcgattcatatcgcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagc 33670726  T
Q  110 ttctcaaaatgaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgcc 209  Q
    | |||| || |||||| ||| || | |||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  33670725 tactcagaaagaatcagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgacagcatcaagaattatctgctggaaccacctatccttgtcccacc 33670626  T
Q  210 agtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
     |||||||||||||| ||||| ||||    
T  33670625 cgtggaaggaaggcctttgattatgt 33670600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 13 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 15281959 - 15281737
Alignment:
Q  13 cagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaatttc 112  Q
    |||||||| || |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  |||||  | |    
T  15281959 cagaccgagaaacaagtcagaggtttcctcgggcgattgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagctac 15281860  T
Q  113 tcaaaatgaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgccagt 212  Q
    |||  | |||||| |||||| | |||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  15281859 tcaggaagaatcagcctattgtatggaacgatgaatgccaaggagcttttgatagcatcaagatttacctgctggaaccacctatccttgtcccacccgt 15281760  T
Q  213 ggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    |||||||||||| ||||| ||||    
T  15281759 ggaaggaaggcctttgattatgt 15281737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 10 - 235
Target Start/End: Original strand, 21972945 - 21973170
Alignment:
Q  10 ccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaat 109  Q
    |||||||| || ||||||||| |||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  |||||      
T  21972945 ccacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacctgcgggccgatcttcaagc 21973044  T
Q  110 ttctcaaaatgaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgcc 209  Q
    | || | || ||| || ||| || | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  21973045 tacttagaaagaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccacc 21973144  T
Q  210 agtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
     |||||||||||||| ||||| ||||    
T  21973145 cgtggaaggaaggcctttgattatgt 21973170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 10 - 235
Target Start/End: Original strand, 30757004 - 30757229
Alignment:
Q  10 ccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaat 109  Q
    |||||||| || ||||||||| |||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  |||||      
T  30757004 ccacagacagagaagcaagtcagaggtttcctgggacgcttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacctgcgggccgatcttcaagc 30757103  T
Q  110 ttctcaaaatgaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgcc 209  Q
    | || | || ||| || ||| || | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  30757104 tacttagaaagaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccacc 30757203  T
Q  210 agtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
     |||||||||||||| ||||| ||||    
T  30757204 cgtggaaggaaggcctttgattatgt 30757229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 10 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 31123537 - 31123312
Alignment:
Q  10 ccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaat 109  Q
    |||||||| || ||||||||| |||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  |||||      
T  31123537 ccacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacctgcgggccgatcttcaagc 31123438  T
Q  110 ttctcaaaatgaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgcc 209  Q
    | || | || ||| || ||| || | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  31123437 tacttagaaagaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccacc 31123338  T
Q  210 agtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
     |||||||||||||| ||||| ||||    
T  31123337 cgtggaaggaaggcctttgattatgt 31123312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 10 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 40102662 - 40102437
Alignment:
Q  10 ccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaat 109  Q
    |||||||| || ||||||||| |||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||      
T  40102662 ccacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagc 40102563  T
Q  110 ttctcaaaatgaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgcc 209  Q
    | || |  | ||| || ||| || | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  40102562 tactaaggaagaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccacc 40102463  T
Q  210 agtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
     |||||||||||||| ||||| ||||    
T  40102462 cgtggaaggaaggccgttgatcatgt 40102437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 148 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 22146456 - 22146369
Alignment:
Q  148 tgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgccagtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||  ||| || | ||||| || || || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||    
T  22146456 tgccagaaagcttttgatagcatcaaagggtatttgttagaacctccgattctggtccctccagttgaaggaaggcctttgatcatgt 22146369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 203; Significance: 1e-111; HSPs: 40)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 9 - 235
Target Start/End: Original strand, 27394791 - 27395017
Alignment:
Q  9 accacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaa 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27394791 accacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaa 27394890  T
Q  109 tttctcaaaatgaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgc 208  Q
    || |||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27394891 ttactcagaaagaatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgc 27394990  T
Q  209 cagtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||    
T  27394991 cagtggaaggaaggcccttgattatgt 27395017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 10 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 23125582 - 23125357
Alignment:
Q  10 ccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaat 109  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||      
T  23125582 ccacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagc 23125483  T
Q  110 ttctcaaaatgaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgcc 209  Q
    | |||| || |||||| |||||| | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| || ||    
T  23125482 tactcagaaagaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaaaaattacctgctggaaccacctatccttgtgccacc 23125383  T
Q  210 agtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
     |||||||||||||| ||||| ||||    
T  23125382 cgtggaaggaaggcctttgattatgt 23125357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 10 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 37948876 - 37948651
Alignment:
Q  10 ccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaat 109  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||      
T  37948876 ccacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagc 37948777  T
Q  110 ttctcaaaatgaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgcc 209  Q
    | || | || ||| || |||||| | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  37948776 tgcttagaaagaaccagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccacc 37948677  T
Q  210 agtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
     |||||||||||||| ||||| ||||    
T  37948676 cgtggaaggaaggcctttgatcatgt 37948651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 10 - 235
Target Start/End: Original strand, 12658766 - 12658991
Alignment:
Q  10 ccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaat 109  Q
    ||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||      
T  12658766 ccacaaaccgagaagcaagtcagaggtttcctcggacgattgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagc 12658865  T
Q  110 ttctcaaaatgaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgcc 209  Q
    | |||| || |||||| |||||| | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  12658866 tactcagaaagaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccacc 12658965  T
Q  210 agtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
     |||||||||||||| ||||| ||||    
T  12658966 cgtggaaggaaggcctttgattatgt 12658991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 22 - 235
Target Start/End: Original strand, 27806945 - 27807158
Alignment:
Q  22 aagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaatttctcaaaatga 121  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||  | || | || ||    
T  27806945 aagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagctgcttagaaaga 27807044  T
Q  122 atcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgccagtggaaggaag 221  Q
    | || |||||| | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  27807045 accagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccacccgtggaaggaag 27807144  T
Q  222 gcccttgatgatgt 235  Q
    ||| ||||| ||||    
T  27807145 gcctttgatcatgt 27807158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 10 - 235
Target Start/End: Original strand, 34294384 - 34294609
Alignment:
Q  10 ccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaat 109  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  |||||      
T  34294384 ccacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagc 34294483  T
Q  110 ttctcaaaatgaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgcc 209  Q
    | |||| || |||||| |||||| | |||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  34294484 tactcagaaagaatcagcctattgtatggaacgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccacc 34294583  T
Q  210 agtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
     |||||||||||||| ||||| ||||    
T  34294584 cgtggaaggaaggcctttgattatgt 34294609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 13 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 27431452 - 27431230
Alignment:
Q  13 cagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaatttc 112  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||  | |    
T  27431452 cagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcggacgattgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagctac 27431353  T
Q  113 tcaaaatgaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgccagt 212  Q
    ||| || |||| | |||||| | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  27431352 tcagaaagaattagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccacccgt 27431253  T
Q  213 ggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    |||||||||||| ||||| ||||    
T  27431252 ggaaggaaggcctttgattatgt 27431230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 10 - 228
Target Start/End: Original strand, 28885437 - 28885655
Alignment:
Q  10 ccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaat 109  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    |||||      
T  28885437 ccacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccggtcttcaagc 28885536  T
Q  110 ttctcaaaatgaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgcc 209  Q
    | |||| || ||||||||||||| | |||||| ||||||| || ||||||||||| ||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  28885537 tactcagaaagaatcaacctattgtatggaatgatgaatgtcaagaagcttttgacagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccacc 28885636  T
Q  210 agtggaaggaaggcccttg 228  Q
     ||||||||||||||||||    
T  28885637 cgtggaaggaaggcccttg 28885655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 10 - 235
Target Start/End: Original strand, 20841143 - 20841368
Alignment:
Q  10 ccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaat 109  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  |||||      
T  20841143 ccacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagc 20841242  T
Q  110 ttctcaaaatgaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgcc 209  Q
    | |||| || |||||| |||||| | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||||||||||||||||| ||    
T  20841243 tactcagaaagaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctactggaaccacctatccttgtcccacc 20841342  T
Q  210 agtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
      ||||||||||||| ||||| ||||    
T  20841343 catggaaggaaggcctttgattatgt 20841368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 10 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 39048833 - 39048608
Alignment:
Q  10 ccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaat 109  Q
    |||||||| || ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||      
T  39048833 ccacagactgagaagcaagtaagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagc 39048734  T
Q  110 ttctcaaaatgaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgcc 209  Q
    | || |  | |||||| |||||| | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  39048733 tactaaggaagaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccacc 39048634  T
Q  210 agtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
     |||||||||||||| ||||| ||||    
T  39048633 cgtggaaggaaggcctttgatcatgt 39048608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 10 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 11632198 - 11631973
Alignment:
Q  10 ccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaat 109  Q
    |||||||| || ||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  |||||      
T  11632198 ccacagacagagaagcaagtcagaggcttcctcggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagc 11632099  T
Q  110 ttctcaaaatgaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgcc 209  Q
    | ||||  | |||||| |||||| | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  11632098 tactcaggaagaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccacc 11631999  T
Q  210 agtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
     |||||||||||||| ||||| ||||    
T  11631998 cgtggaaggaaggcctttgattatgt 11631973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 22 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 13933549 - 13933336
Alignment:
Q  22 aagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaatttctcaaaatga 121  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  |||||  | || |  | ||    
T  13933549 aagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagctactaaggaaga 13933450  T
Q  122 atcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgccagtggaaggaag 221  Q
    |||| |||||| | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  13933449 atcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccacccgtggaaggaag 13933350  T
Q  222 gcccttgatgatgt 235  Q
    ||| ||||| ||||    
T  13933349 gcctttgattatgt 13933336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 22 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 257655 - 257442
Alignment:
Q  22 aagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaatttctcaaaatga 121  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |  |||||  | || | || ||    
T  257655 aagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcggaccgatcttcaagctgcttagaaaga 257556  T
Q  122 atcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgccagtggaaggaag 221  Q
    | || ||| || | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  257555 accagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccacccgtggaaggaag 257456  T
Q  222 gcccttgatgatgt 235  Q
    ||| ||||| ||||    
T  257455 gccgttgatcatgt 257442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 10 - 235
Target Start/End: Original strand, 40236738 - 40236963
Alignment:
Q  10 ccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaat 109  Q
    |||||||| || ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |  |||||      
T  40236738 ccacagacagagaagcaagtcagaggtttcctcggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgactgcaacctgcgggccgatcttcaagc 40236837  T
Q  110 ttctcaaaatgaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgcc 209  Q
    | || | || ||| || |||||| | ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  40236838 tgcttagaaagaaccagcctattgtatggaataatgaatgccaagaagctttcgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccacc 40236937  T
Q  210 agtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
     |||||||||||||| ||||| ||||    
T  40236938 cgtggaaggaaggcctttgattatgt 40236963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 22 - 235
Target Start/End: Original strand, 12590050 - 12590263
Alignment:
Q  22 aagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaatttctcaaaatga 121  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  |||||  | |||| || ||    
T  12590050 aagcaagtcagaggtttcctcggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagctactcagaaaga 12590149  T
Q  122 atcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgccagtggaaggaag 221  Q
    | || ||| || | |||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  12590150 accagcctgttgtatggaacgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccacccgtggaaggaag 12590249  T
Q  222 gcccttgatgatgt 235  Q
    ||| ||||| ||||    
T  12590250 gcctttgatcatgt 12590263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 10 - 235
Target Start/End: Original strand, 31879516 - 31879741
Alignment:
Q  10 ccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaat 109  Q
    |||||||| || ||||||||| |||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||      
T  31879516 ccacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgtgggccgattttcaagc 31879615  T
Q  110 ttctcaaaatgaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgcc 209  Q
    | || | || ||| || ||| || | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  31879616 tgcttagaaagaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccacc 31879715  T
Q  210 agtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
     |||||||||||||| ||||| ||||    
T  31879716 cgtggaaggaaggcctttgattatgt 31879741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 10 - 235
Target Start/End: Original strand, 39893299 - 39893524
Alignment:
Q  10 ccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaat 109  Q
    |||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |  |||||      
T  39893299 ccacagacagagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccggttcatatctcacatgaccgcaacctgtgggccgatcttcaagc 39893398  T
Q  110 ttctcaaaatgaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgcc 209  Q
    | || | || ||| || ||| || | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  39893399 tacttagaaagaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccacc 39893498  T
Q  210 agtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
     |||||||||||||| ||||| ||||    
T  39893499 cgtggaaggaaggcctttgattatgt 39893524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 10 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 16826352 - 16826127
Alignment:
Q  10 ccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaat 109  Q
    |||||||| || ||||||||| |||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  |||||      
T  16826352 ccacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacctgcgggccgatcttcaagc 16826253  T
Q  110 ttctcaaaatgaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgcc 209  Q
    | || | || ||| || ||| || | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16826252 tacttagaaagaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccacc 16826153  T
Q  210 agtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
     |||||||||||||| ||||| ||||    
T  16826152 cgtggaaggaaggcctttgattatgt 16826127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 10 - 235
Target Start/End: Original strand, 16895128 - 16895353
Alignment:
Q  10 ccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaat 109  Q
    |||||||| || ||||||||| |||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  |||||      
T  16895128 ccacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacctgcgggccgatcttcaagc 16895227  T
Q  110 ttctcaaaatgaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgcc 209  Q
    | || | || ||| || ||| || | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16895228 tacttagaaagaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccacc 16895327  T
Q  210 agtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
     |||||||||||||| ||||| ||||    
T  16895328 cgtggaaggaaggcctttgattatgt 16895353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 10 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 19413515 - 19413290
Alignment:
Q  10 ccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaat 109  Q
    |||||||| || ||||||||| |||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  |||||      
T  19413515 ccacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacctgcgggccgatcttcaagc 19413416  T
Q  110 ttctcaaaatgaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgcc 209  Q
    | || | || ||| || ||| || | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  19413415 tacttagaaagaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccacc 19413316  T
Q  210 agtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
     |||||||||||||| ||||| ||||    
T  19413315 cgtggaaggaaggcctttgattatgt 19413290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 10 - 235
Target Start/End: Original strand, 32053033 - 32053258
Alignment:
Q  10 ccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaat 109  Q
    |||||||| || ||||||||| |||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  |||||      
T  32053033 ccacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacctgcgggccgatcttcaagc 32053132  T
Q  110 ttctcaaaatgaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgcc 209  Q
    | || | || ||| || ||| || | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  32053133 tacttagaaagaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccacc 32053232  T
Q  210 agtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
     |||||||||||||| ||||| ||||    
T  32053233 cgtggaaggaaggcctttgattatgt 32053258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 10 - 235
Target Start/End: Original strand, 34864914 - 34865139
Alignment:
Q  10 ccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaat 109  Q
    |||||||| || ||||||||| |||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  |||||      
T  34864914 ccacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacctgcgggccgatcttcaagc 34865013  T
Q  110 ttctcaaaatgaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgcc 209  Q
    | || | || ||| || ||| || | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  34865014 tacttagaaagaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtccctcc 34865113  T
Q  210 agtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
     |||||||||||||| ||||| ||||    
T  34865114 cgtggaaggaaggcctttgattatgt 34865139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 10 - 235
Target Start/End: Original strand, 37380907 - 37381132
Alignment:
Q  10 ccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaat 109  Q
    ||||||||||| || |||||| ||||||||||||| |  ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |  |||||      
T  37380907 ccacagaccgagaaacaagtcagaggtttcctcggacacttgaattacatctcccggttcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagc 37381006  T
Q  110 ttctcaaaatgaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgcc 209  Q
    | ||||  | |||||| ||| || | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  37381007 tactcaggaagaatcagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccacc 37381106  T
Q  210 agtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
     |||||||||||||| ||||| ||||    
T  37381107 cgtggaaggaaggcctttgatcatgt 37381132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 10 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 37682909 - 37682684
Alignment:
Q  10 ccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaat 109  Q
    |||||||| || ||||||||| |||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  |||||      
T  37682909 ccacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacctgcgggccgatcttcaagc 37682810  T
Q  110 ttctcaaaatgaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgcc 209  Q
    | || | || ||| || ||| || | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  37682809 tacttagaaagaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccacc 37682710  T
Q  210 agtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
     |||||||||||||| ||||| ||||    
T  37682709 cgtggaaggaaggcctttgattatgt 37682684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 10 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 37698174 - 37697949
Alignment:
Q  10 ccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaat 109  Q
    |||||||| || ||||||||| |||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  |||||      
T  37698174 ccacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacctgcgggccgatcttcaagc 37698075  T
Q  110 ttctcaaaatgaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgcc 209  Q
    | || | || ||| || ||| || | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  37698074 tacttagaaagaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccacc 37697975  T
Q  210 agtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
     |||||||||||||| ||||| ||||    
T  37697974 cgtggaaggaaggcctttgattatgt 37697949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 10 - 235
Target Start/End: Original strand, 37928599 - 37928824
Alignment:
Q  10 ccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaat 109  Q
    |||||||| || ||||||||| |||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  |||||      
T  37928599 ccacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacctgcgggccgatcttcaagc 37928698  T
Q  110 ttctcaaaatgaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgcc 209  Q
    | || | || ||| || ||| || | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  37928699 tacttagaaagaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccacc 37928798  T
Q  210 agtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
     |||||||||||||| ||||| ||||    
T  37928799 cgtggaaggaaggcctttgattatgt 37928824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 22 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 9346988 - 9346775
Alignment:
Q  22 aagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaatttctcaaaatga 121  Q
    ||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  |||||  | || | || ||    
T  9346988 aagcaagtcagaggcttcctcggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagctacttagaaaga 9346889  T
Q  122 atcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgccagtggaaggaag 221  Q
    | || ||| || | |||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  9346888 accagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgacagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccacccgtggaaggaag 9346789  T
Q  222 gcccttgatgatgt 235  Q
    ||| ||||| ||||    
T  9346788 gcctttgattatgt 9346775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 10 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 12713615 - 12713390
Alignment:
Q  10 ccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaat 109  Q
    |||||||| || ||||||||| |||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  |||||      
T  12713615 ccacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacctgcgggccgatcttcaagc 12713516  T
Q  110 ttctcaaaatgaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgcc 209  Q
    | || | || ||| || ||| || | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||||||||||||||||| ||    
T  12713515 tacttagaaagaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctactggaaccacctatccttgtccctcc 12713416  T
Q  210 agtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
     |||||||||||||| ||||| ||||    
T  12713415 cgtggaaggaaggcctttgatcatgt 12713390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 22 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 21674177 - 21673964
Alignment:
Q  22 aagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaatttctcaaaatga 121  Q
    ||||||||| |||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  |||||  | || | || ||    
T  21674177 aagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacctgcgggccgatcttcaagctacttagaaaga 21674078  T
Q  122 atcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgccagtggaaggaag 221  Q
    | || ||| || | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  21674077 accagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccacccgtggaaggaag 21673978  T
Q  222 gcccttgatgatgt 235  Q
    ||| ||||| ||||    
T  21673977 gcctttgattatgt 21673964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 32 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 21700163 - 21699960
Alignment:
Q  32 gaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaatttctcaaaatgaatcaacctat 131  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  |||||  | ||||  | |||||| |||||    
T  21700163 gaggtttcctcgggcgattgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagctactcaggaagaatcagcctat 21700064  T
Q  132 tatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgccagtggaaggaaggcccttgatg 231  Q
    | | |||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||     
T  21700063 tgtatggaacgatgaatgccaaggagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccaccaatccttgtcccacccgtggaaggaaggcctttgatt 21699964  T
Q  232 atgt 235  Q
    ||||    
T  21699963 atgt 21699960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 13 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 19453434 - 19453212
Alignment:
Q  13 cagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaatttc 112  Q
    |||||||| || |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  |||||  | |    
T  19453434 cagaccgagaaacaagtcagaggtttcctcgggcgattgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagctac 19453335  T
Q  113 tcaaaatgaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgccagt 212  Q
    |||  | |||||| |||||| | |||||  |||||||||| | |||||||||| |||||||  ||||  || |||||||||||||||||||||| || ||    
T  19453334 tcaggaagaatcagcctattgtatggaacgatgaatgccaaggagcttttgatggcatcaagaattacttgttggaaccacctatccttgtcccacccgt 19453235  T
Q  213 ggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    |||||||||||| ||||| ||||    
T  19453234 ggaaggaaggcctttgattatgt 19453212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 120 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 31890395 - 31890285
Alignment:
Q  120 gaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgccagtggaagga 219  Q
    |||||| |||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  31890395 gaatcagcctattgtatggaacaatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtccctcccgtggaagga 31890296  T
Q  220 aggcccttgat 230  Q
    ||||| |||||    
T  31890295 aggcctttgat 31890285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 120 - 230
Target Start/End: Original strand, 3785833 - 3785943
Alignment:
Q  120 gaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgccagtggaagga 219  Q
    |||||| |||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  3785833 gaatcagcctattgtatggaacgatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaagaattaactgctggaaccacctatccttgtccctcccgtggaagga 3785932  T
Q  220 aggcccttgat 230  Q
    ||||| |||||    
T  3785933 aggcctttgat 3785943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 120 - 230
Target Start/End: Original strand, 16164820 - 16164930
Alignment:
Q  120 gaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgccagtggaagga 219  Q
    |||||| |||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  16164820 gaatcagcctattgtatggaacgatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtccctcccgtggaagga 16164919  T
Q  220 aggcccttgat 230  Q
    ||||| |||||    
T  16164920 aggcctttgat 16164930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 120 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 22925052 - 22924942
Alignment:
Q  120 gaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgccagtggaagga 219  Q
    ||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  22925052 gaatcaacctattgtatggaacgatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtccctcccgtggaagga 22924953  T
Q  220 aggcccttgat 230  Q
    || || |||||    
T  22924952 agacctttgat 22924942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 120 - 230
Target Start/End: Original strand, 27779574 - 27779684
Alignment:
Q  120 gaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgccagtggaagga 219  Q
    |||||| |||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  27779574 gaatcagcctattgtatggaacgatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtccctcccgtggaagga 27779673  T
Q  220 aggcccttgat 230  Q
    ||||| |||||    
T  27779674 aggcctttgat 27779684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 120 - 230
Target Start/End: Original strand, 27819331 - 27819441
Alignment:
Q  120 gaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgccagtggaagga 219  Q
    |||||| |||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  27819331 gaatcagcctattgtatggaacgatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtccctcccgtggaagga 27819430  T
Q  220 aggcccttgat 230  Q
    ||||| |||||    
T  27819431 aggcctttgat 27819441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 120 - 224
Target Start/End: Original strand, 34158184 - 34158288
Alignment:
Q  120 gaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgccagtggaagga 219  Q
    |||||| |||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  34158184 gaatcagcctattgtatggaacgatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtccctcccgtggaagga 34158283  T
Q  220 aggcc 224  Q
    |||||    
T  34158284 aggcc 34158288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 120 - 230
Target Start/End: Original strand, 27119864 - 27119974
Alignment:
Q  120 gaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgccagtggaagga 219  Q
    |||||| |||||| | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||  || |||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  27119864 gaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacttgttggaaccacctatccttgtcccacccgtggaagga 27119963  T
Q  220 aggcccttgat 230  Q
    ||||| |||||    
T  27119964 aggcctttgat 27119974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 161 - 235
Target Start/End: Original strand, 27827841 - 27827915
Alignment:
Q  161 ttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgccagtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    |||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||    
T  27827841 ttgatagcatcaagagttacctgctggaaccacctatccttgtcccacccgtggaaggaaggcctttgattatgt 27827915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 20)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 9 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 22077898 - 22077672
Alignment:
Q  9 accacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22077898 accacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctgatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaa 22077799  T
Q  109 tttctcaaaatgaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgc 208  Q
    || |||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22077798 ttactcagaaagaatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgc 22077699  T
Q  209 cagtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||    
T  22077698 cagtggaaggaaggcccttgattatgt 22077672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 10 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 27605891 - 27605666
Alignment:
Q  10 ccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaat 109  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||      
T  27605891 ccacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagc 27605792  T
Q  110 ttctcaaaatgaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgcc 209  Q
    | |||| || |||||| |||||| | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  27605791 tactcagaaagaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccacc 27605692  T
Q  210 agtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
     |||||||||||||| ||||| ||||    
T  27605691 cgtggaaggaaggcctttgattatgt 27605666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 10 - 235
Target Start/End: Original strand, 14560854 - 14561079
Alignment:
Q  10 ccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaat 109  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  |||||      
T  14560854 ccacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagc 14560953  T
Q  110 ttctcaaaatgaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgcc 209  Q
    | |||| || ||||||||||||| | |||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  14560954 tactcagaaagaatcaacctattgtatggaatgatgaatgtcaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccacc 14561053  T
Q  210 agtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
     |||||||||||||| ||||| ||||    
T  14561054 cgtggaaggaaggcctttgattatgt 14561079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 10 - 235
Target Start/End: Original strand, 18793934 - 18794159
Alignment:
Q  10 ccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaat 109  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  |||||      
T  18793934 ccacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttaaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagc 18794033  T
Q  110 ttctcaaaatgaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgcc 209  Q
    | |||| || |||||| |||||| | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  18794034 tactcagaaagaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccacc 18794133  T
Q  210 agtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
     |||||||||||||| ||||| ||||    
T  18794134 cgtggaaggaaggcctttgattatgt 18794159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 10 - 235
Target Start/End: Original strand, 19691328 - 19691553
Alignment:
Q  10 ccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaat 109  Q
    ||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||      
T  19691328 ccacaaaccgagaagcaagtcagaggtttcctcggacgattgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagc 19691427  T
Q  110 ttctcaaaatgaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgcc 209  Q
    | |||| || |||||| |||||| | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  19691428 tactcagaaagaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccacc 19691527  T
Q  210 agtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
     | |||||||||||| ||||| ||||    
T  19691528 cgcggaaggaaggcctttgattatgt 19691553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 10 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 2134246 - 2134021
Alignment:
Q  10 ccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaat 109  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |  |||||      
T  2134246 ccacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacttgcgggccgatcttcaagc 2134147  T
Q  110 ttctcaaaatgaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgcc 209  Q
    | |||| || |||||| |||||| | |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||| || ||||||||||||||||||||||| ||    
T  2134146 tactcagaaagaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcctttgatagcatcaagaattacctactggaaccacctatccttgtcccacc 2134047  T
Q  210 agtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
     |||||||||||||| ||||| ||||    
T  2134046 cgtggaaggaaggcctttgattatgt 2134021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 10 - 235
Target Start/End: Original strand, 9357855 - 9358080
Alignment:
Q  10 ccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaat 109  Q
    |||||||| || ||||||||| |||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||      
T  9357855 ccacagacagagaagcaagtcagaggtttcctgggacgcttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccaatcttcaagc 9357954  T
Q  110 ttctcaaaatgaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgcc 209  Q
    | |||| || ||| || ||| || | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  9357955 tactcagaaagaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccacc 9358054  T
Q  210 agtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
     |||||||||||||| ||||| ||||    
T  9358055 cgtggaaggaaggcctttgatcatgt 9358080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 22 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 19205336 - 19205123
Alignment:
Q  22 aagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaatttctcaaaatga 121  Q
    ||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |  |||||  | ||||  | ||    
T  19205336 aagcaagtcagaggcttcctcggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacttgcgggccgatcttcaagctactcaggaaga 19205237  T
Q  122 atcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgccagtggaaggaag 221  Q
    |||| |||||| | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  19205236 atcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattatctgctggaaccacctatccttgtcccacccgtggaaggaag 19205137  T
Q  222 gcccttgatgatgt 235  Q
    ||| ||||| ||||    
T  19205136 gcctttgattatgt 19205123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 10 - 235
Target Start/End: Original strand, 29832556 - 29832781
Alignment:
Q  10 ccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaat 109  Q
    |||||||| || ||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  |||||      
T  29832556 ccacagacagagaagcaagtcagaggtttcctgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagc 29832655  T
Q  110 ttctcaaaatgaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgcc 209  Q
    | |||| || ||| || ||| || | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  29832656 tactcagaaagaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccacc 29832755  T
Q  210 agtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
     |||||||||||||| ||||| ||||    
T  29832756 cgtggaaggaaggcctttgattatgt 29832781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 10 - 235
Target Start/End: Original strand, 19677677 - 19677902
Alignment:
Q  10 ccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaat 109  Q
    |||||||| || ||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |  |||||      
T  19677677 ccacagacagagaagcaagtcagaggcttcctcggacgtttgaattacatctctcgattcatatcgcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagc 19677776  T
Q  110 ttctcaaaatgaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgcc 209  Q
    | |||| || |||||| ||| || | |||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  19677777 tactcagaaagaatcagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgacagcatcaagaattatctgctggaaccacctatccttgtcccacc 19677876  T
Q  210 agtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
     |||||||||||||| ||||| ||||    
T  19677877 cgtggaaggaaggcctttgattatgt 19677902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 22 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 28358926 - 28358713
Alignment:
Q  22 aagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaatttctcaaaatga 121  Q
    ||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  |||||  | |||| || ||    
T  28358926 aagcaagtcagaggcttcctcggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagctactcagaaaga 28358827  T
Q  122 atcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgccagtggaaggaag 221  Q
    |||| ||| || | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  | | |||||||||    
T  28358826 atcagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattatctgctggaaccacctatccttgtcccatccgcggaaggaag 28358727  T
Q  222 gcccttgatgatgt 235  Q
    ||| ||||| ||||    
T  28358726 gcctttgattatgt 28358713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 10 - 235
Target Start/End: Original strand, 31357758 - 31357983
Alignment:
Q  10 ccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaat 109  Q
    |||||||| || ||||||||| |||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  |||||      
T  31357758 ccacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacctgcgggccgatcttcaagc 31357857  T
Q  110 ttctcaaaatgaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgcc 209  Q
    | || |||| ||| || ||| || | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  31357858 tacttaaaaagaaccaccctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccacc 31357957  T
Q  210 agtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
     |||||||||||||| ||||| ||||    
T  31357958 cgtggaaggaaggcctttgattatgt 31357983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 10 - 235
Target Start/End: Original strand, 18712714 - 18712939
Alignment:
Q  10 ccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaat 109  Q
    ||||||||||| || |||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |  |||||      
T  18712714 ccacagaccgagaaacaagtcagaggtttcctcggacgcttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctacgggccgatcttcaagc 18712813  T
Q  110 ttctcaaaatgaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgcc 209  Q
    | |||| || |||||| ||| || | |||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  18712814 tactcagaaagaatcagcctgttgtatggaatgatgaatgtcaagaagcttttgatagcatcaagagttacctgctggaaccacctatccttgtcccacc 18712913  T
Q  210 agtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
     |||||||||||||| ||||| ||||    
T  18712914 cgtggaaggaaggcctttgattatgt 18712939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 10 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 12089709 - 12089484
Alignment:
Q  10 ccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaat 109  Q
    |||||||| || ||||||||| |||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |  |||||      
T  12089709 ccacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgactgcaacctgcgggccgatcttcaagc 12089610  T
Q  110 ttctcaaaatgaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgcc 209  Q
    | || | || ||| || ||| || | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  12089609 tacttagaaagaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccacc 12089510  T
Q  210 agtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
     |||||||||||||| ||||| ||||    
T  12089509 cgtggaaggaaggcctttgattatgt 12089484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 10 - 235
Target Start/End: Original strand, 33261964 - 33262189
Alignment:
Q  10 ccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaat 109  Q
    |||||||| || ||||||||| |||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||      
T  33261964 ccacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgtgggccgattttcaagc 33262063  T
Q  110 ttctcaaaatgaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgcc 209  Q
    | || | || ||| || ||| || | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||  || |||||||||||||||||||||| ||    
T  33262064 tacttagaaagaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacttgttggaaccacctatccttgtcccacc 33262163  T
Q  210 agtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
     |||||||||||||| ||||| ||||    
T  33262164 cgtggaaggaaggcctttgattatgt 33262189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 10 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 31486857 - 31486632
Alignment:
Q  10 ccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaat 109  Q
    |||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |  |||||      
T  31486857 ccacagacagagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtctgaattacatctcccggttcatatctcacatgaccgcaacctgtgggccgatcttcaagc 31486758  T
Q  110 ttctcaaaatgaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgcc 209  Q
    | || | ||  || || ||| || | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||  || |||||||||||||||||||||| ||    
T  31486757 tgcttagaaaaaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacttgttggaaccacctatccttgtcccacc 31486658  T
Q  210 agtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
     |||||||||||||| ||||| ||||    
T  31486657 cgtggaaggaaggcctttgatcatgt 31486632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 120 - 230
Target Start/End: Original strand, 15770914 - 15771024
Alignment:
Q  120 gaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgccagtggaagga 219  Q
    |||||| |||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  15770914 gaatcagcctattgtatggaacgatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtccctcccgtggaagga 15771013  T
Q  220 aggcccttgat 230  Q
    ||||| |||||    
T  15771014 aggcctttgat 15771024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 143 - 230
Target Start/End: Original strand, 44564347 - 44564434
Alignment:
Q  143 atgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgccagtggaaggaaggcccttgat 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||    
T  44564347 atgaatgccaggaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtccctcccgtggaaggaaggcctttgat 44564434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 137 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 21345030 - 21344943
Alignment:
Q  137 ggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgccagtggaaggaaggcc 224  Q
    ||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  21345030 ggaatgatgaatgtcaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccacccgtggaaggaaggcc 21344943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 10 - 72
Target Start/End: Original strand, 16286631 - 16286694
Alignment:
Q  10 ccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcg-ggcgtttgaattacatctcccgattcata 72  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||    
T  16286631 ccacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgagacgattgaattacatctcccgattcata 16286694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 134; Significance: 7e-70; HSPs: 61)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 10 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 5593425 - 5593200
Alignment:
Q  10 ccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaat 109  Q
    |||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||      
T  5593425 ccacagacagagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccaatcttcaagc 5593326  T
Q  110 ttctcaaaatgaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgcc 209  Q
    | |||| || |||||| ||| || | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  5593325 tactcagaaagaatcagcctgttgtatggaatgatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccacc 5593226  T
Q  210 agtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
     |||||||||||||| ||||| ||||    
T  5593225 cgtggaaggaaggccgttgatcatgt 5593200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 10 - 235
Target Start/End: Original strand, 18054454 - 18054679
Alignment:
Q  10 ccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaat 109  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||      
T  18054454 ccacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagc 18054553  T
Q  110 ttctcaaaatgaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgcc 209  Q
    | |||| || |||||| |||||| | |||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  18054554 tactcagaaagaatcagcctattgtatggaatgatgaatgtcaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccacc 18054653  T
Q  210 agtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
     |||||||||||||| ||||| ||||    
T  18054654 cgtggaaggaaggcctttgattatgt 18054679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 10 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 18274120 - 18273895
Alignment:
Q  10 ccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaat 109  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||      
T  18274120 ccacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccaatcttcaagc 18274021  T
Q  110 ttctcaaaatgaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgcc 209  Q
    | |||| || |||||| |||||| | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  18274020 tactcagaaagaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccacc 18273921  T
Q  210 agtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
     |||||||||||||| ||||| ||||    
T  18273920 cgtggaaggaaggcctttgattatgt 18273895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 10 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 18289421 - 18289196
Alignment:
Q  10 ccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaat 109  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||      
T  18289421 ccacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccaatcttcaagc 18289322  T
Q  110 ttctcaaaatgaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgcc 209  Q
    | |||| || |||||| |||||| | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  18289321 tactcagaaagaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccacc 18289222  T
Q  210 agtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
     |||||||||||||| ||||| ||||    
T  18289221 cgtggaaggaaggcctttgattatgt 18289196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 10 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 18304722 - 18304497
Alignment:
Q  10 ccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaat 109  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||      
T  18304722 ccacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccaatcttcaagc 18304623  T
Q  110 ttctcaaaatgaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgcc 209  Q
    | |||| || |||||| |||||| | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  18304622 tactcagaaagaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccacc 18304523  T
Q  210 agtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
     |||||||||||||| ||||| ||||    
T  18304522 cgtggaaggaaggcctttgattatgt 18304497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 12 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 4793701 - 4793478
Alignment:
Q  12 acagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaattt 111  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  |||||  |     
T  4793701 acagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagcta 4793602  T
Q  112 ctcaaaatgaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgccag 211  Q
    |||| || |||||| |||||| | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| || |    
T  4793601 ctcagaaagaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccacccg 4793502  T
Q  212 tggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||    
T  4793501 tggaaggaaggcctttgattatgt 4793478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 13 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 8286535 - 8286313
Alignment:
Q  13 cagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaatttc 112  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  |||||  | |    
T  8286535 cagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagctac 8286436  T
Q  113 tcaaaatgaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgccagt 212  Q
    ||| || |||||| |||||| | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  8286435 tcagaaagaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccacccgt 8286336  T
Q  213 ggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    |||||||||||| ||||| ||||    
T  8286335 ggaaggaaggcctttgattatgt 8286313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 9 - 235
Target Start/End: Original strand, 18333821 - 18334047
Alignment:
Q  9 accacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaa 108  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  |||||     
T  18333821 accacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaag 18333920  T
Q  109 tttctcaaaatgaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgc 208  Q
     | |||| || |||||| |||||| | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||| |    
T  18333921 ctactcagaaagaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccccctatccttgtcccac 18334020  T
Q  209 cagtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    | |||||||||||||| ||||| ||||    
T  18334021 ccgtggaaggaaggcctttgattatgt 18334047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 10 - 235
Target Start/End: Original strand, 6205095 - 6205320
Alignment:
Q  10 ccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaat 109  Q
    |||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  |||||      
T  6205095 ccacagactgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagc 6205194  T
Q  110 ttctcaaaatgaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgcc 209  Q
    | |||| || |||||| |||||| | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  6205195 tactcagaaagaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctgaaaccacctatccttgtcccacc 6205294  T
Q  210 agtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
     |||||||||||||||||||| ||||    
T  6205295 cgtggaaggaaggcccttgattatgt 6205320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 10 - 235
Target Start/End: Original strand, 8299163 - 8299388
Alignment:
Q  10 ccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaat 109  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  |||||      
T  8299163 ccacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagc 8299262  T
Q  110 ttctcaaaatgaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgcc 209  Q
    | |||| || ||||||||||||| | |||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  8299263 tactcagaaagaatcaacctattgtatggaatgatgaatgtcaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccacc 8299362  T
Q  210 agtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
     |||||||||||||| ||||| ||||    
T  8299363 cgtggaaggaaggcctttgattatgt 8299388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 10 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 15889773 - 15889548
Alignment:
Q  10 ccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaat 109  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  |||||      
T  15889773 ccacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagc 15889674  T
Q  110 ttctcaaaatgaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgcc 209  Q
    | |||| || |||||| |||||| | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  15889673 tcctcagaaagaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccacc 15889574  T
Q  210 agtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
     |||||||||||||| ||||| ||||    
T  15889573 cgtggaaggaaggcctttgattatgt 15889548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 10 - 235
Target Start/End: Original strand, 21677895 - 21678120
Alignment:
Q  10 ccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaat 109  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  |||||      
T  21677895 ccacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagc 21677994  T
Q  110 ttctcaaaatgaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgcc 209  Q
    | |||| || |||||| |||||| | |||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  21677995 tactcagaaagaatcagcctattgtatggaatgatgaatgtcaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccacc 21678094  T
Q  210 agtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
     |||||||||||||| ||||| ||||    
T  21678095 cgtggaaggaaggcctttgattatgt 21678120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 9 - 235
Target Start/End: Original strand, 35883957 - 35884183
Alignment:
Q  9 accacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaa 108  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  |||||     
T  35883957 accacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaag 35884056  T
Q  109 tttctcaaaatgaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgc 208  Q
     | |||| || |||||| ||| || | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  35884057 ctactcagaaagaatcagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccac 35884156  T
Q  209 cagtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    | |||||||||||||| ||||| ||||    
T  35884157 ccgtggaaggaaggcctttgattatgt 35884183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 10 - 235
Target Start/End: Original strand, 4686847 - 4687072
Alignment:
Q  10 ccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaat 109  Q
    |||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  |||||      
T  4686847 ccacagactgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagc 4686946  T
Q  110 ttctcaaaatgaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgcc 209  Q
    | |||| || |||||| |||||| | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||| |||||||||||||||| || ||    
T  4686947 tactcagaaagaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctgaaaccacctatccttgttccacc 4687046  T
Q  210 agtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
     |||||||||||||||||||| ||||    
T  4687047 cgtggaaggaaggcccttgattatgt 4687072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 10 - 235
Target Start/End: Original strand, 4724823 - 4725048
Alignment:
Q  10 ccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaat 109  Q
    |||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  |||||      
T  4724823 ccacagactgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagc 4724922  T
Q  110 ttctcaaaatgaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgcc 209  Q
    | |||| || |||||| |||||| | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||| |||||||||||||||| || ||    
T  4724923 tactcagaaagaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctgaaaccacctatccttgttccacc 4725022  T
Q  210 agtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
     |||||||||||||||||||| ||||    
T  4725023 cgtggaaggaaggcccttgattatgt 4725048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 10 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 15738162 - 15737937
Alignment:
Q  10 ccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaat 109  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  |||||      
T  15738162 ccacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagc 15738063  T
Q  110 ttctcaaaatgaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgcc 209  Q
    | |||| || |||||| |||| | | |||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  15738062 tactcagaaagaatcagcctactgtatggaatgatgaatgtcaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccacc 15737963  T
Q  210 agtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
     |||||||||||||| ||||| ||||    
T  15737962 cgtggaaggaaggcctttgattatgt 15737937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 10 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 22384646 - 22384421
Alignment:
Q  10 ccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaat 109  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  |||||      
T  22384646 ccacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgaacgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagc 22384547  T
Q  110 ttctcaaaatgaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgcc 209  Q
    | |||| || ||||||||||||| | |||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  22384546 tactcagaaagaatcaacctattgtatggaatgatgaatgtcaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccacc 22384447  T
Q  210 agtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
     |||||||||||||| ||||| ||||    
T  22384446 cgtggaaggaaggcctttgattatgt 22384421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 10 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 29145824 - 29145599
Alignment:
Q  10 ccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaat 109  Q
    ||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  |||||      
T  29145824 ccacagaccgagaagcaagttagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagc 29145725  T
Q  110 ttctcaaaatgaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgcc 209  Q
    | |||| || |||||| |||||| | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  29145724 tactcagaaagaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccacc 29145625  T
Q  210 agtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
     ||||| |||||||| ||||| ||||    
T  29145624 cgtggagggaaggcctttgattatgt 29145599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 10 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 29662038 - 29661813
Alignment:
Q  10 ccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaat 109  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||      
T  29662038 ccacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagc 29661939  T
Q  110 ttctcaaaatgaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgcc 209  Q
    | || |  | |||||| |||||| | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  29661938 tactaaggaagaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccacc 29661839  T
Q  210 agtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
     |||||||||||||| ||||| ||||    
T  29661838 cgtggaaggaaggcctttgatcatgt 29661813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 10 - 235
Target Start/End: Original strand, 8214927 - 8215152
Alignment:
Q  10 ccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaat 109  Q
    |||||||| || ||||||||| |||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  |||||      
T  8214927 ccacagacagagaagcaagtcagaggtttcctgggacgcttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagc 8215026  T
Q  110 ttctcaaaatgaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgcc 209  Q
    | |||| ||  ||||| ||| || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  8215027 tgctcagaaaaaatcagcctgttgtgtggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattatctgctggaaccacctatccttgtcccacc 8215126  T
Q  210 agtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
     |||||||||||||| ||||| ||||    
T  8215127 cgtggaaggaaggcctttgattatgt 8215152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 10 - 235
Target Start/End: Original strand, 20069232 - 20069457
Alignment:
Q  10 ccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaat 109  Q
    |||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |  |||||      
T  20069232 ccacagactgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccggttcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagc 20069331  T
Q  110 ttctcaaaatgaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgcc 209  Q
    | |||| || |||||| |||||  | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  20069332 tactcagaaagaatcagcctatcgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctagaaccacctatccttgtcccacc 20069431  T
Q  210 agtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
     |||||||||||||| ||||| ||||    
T  20069432 cgtggaaggaaggcctttgattatgt 20069457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 22 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 20573899 - 20573686
Alignment:
Q  22 aagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaatttctcaaaatga 121  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||  | || | || ||    
T  20573899 aagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcggaccgattttcaagctgcttagaaaga 20573800  T
Q  122 atcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgccagtggaaggaag 221  Q
    | || |||||| | |||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  20573799 accagcctattgtatggaatgaggaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccacccgtggaaggaag 20573700  T
Q  222 gcccttgatgatgt 235  Q
    ||| ||||| ||||    
T  20573699 gcctttgatcatgt 20573686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 22 - 235
Target Start/End: Original strand, 32442355 - 32442568
Alignment:
Q  22 aagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaatttctcaaaatga 121  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  |||||  | |||| || ||    
T  32442355 aagcaagtcagaggtttcctcggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagctactcagaaaga 32442454  T
Q  122 atcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgccagtggaaggaag 221  Q
    ||||  || || | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  32442455 atcagtctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccgcccgtggaaggaag 32442554  T
Q  222 gcccttgatgatgt 235  Q
    ||| ||||| ||||    
T  32442555 gcctttgattatgt 32442568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 10 - 235
Target Start/End: Original strand, 48469119 - 48469344
Alignment:
Q  10 ccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaat 109  Q
    |||||||| || || ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||      
T  48469119 ccacagacagagaaacaagtcataggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagc 48469218  T
Q  110 ttctcaaaatgaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgcc 209  Q
    | || | || ||| || ||| || | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  48469219 tgcttagaaagaaccagcctgttgtatggaataatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccacc 48469318  T
Q  210 agtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
     |||||||||||||| ||||| ||||    
T  48469319 cgtggaaggaaggccgttgatcatgt 48469344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 10 - 235
Target Start/End: Original strand, 7076398 - 7076623
Alignment:
Q  10 ccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaat 109  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| || |  |||||      
T  7076398 ccacagaccgagaagcaagtcagaggcttcctcggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcgcatgaccgcaacctgcggaccgatcttcaagc 7076497  T
Q  110 ttctcaaaatgaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgcc 209  Q
    | |||| || ||| || |||||| | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  7076498 tactcagaaagaaccagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccacc 7076597  T
Q  210 agtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
     |||||||||||||| ||||| ||||    
T  7076598 cgtggaaggaaggcctttgattatgt 7076623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 10 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 28113022 - 28112797
Alignment:
Q  10 ccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaat 109  Q
    |||||||| || ||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |  |||||      
T  28113022 ccacagacagagaagcaagtcagaggcttcctcggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgacagcaacctgcgggccgatcttcaagc 28112923  T
Q  110 ttctcaaaatgaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgcc 209  Q
    | |||| || |||||| ||| || | |||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  28112922 tactcagaaagaatcagcctgttgtatggaatgatgaatgccaaggagcttttgatagcatcaagaattatctgctggaaccacctatccttgtcccacc 28112823  T
Q  210 agtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
     |||||||||||||| ||||| ||||    
T  28112822 cgtggaaggaaggcctttgattatgt 28112797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 10 - 235
Target Start/End: Original strand, 47026645 - 47026870
Alignment:
Q  10 ccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaat 109  Q
    |||||||| || ||||||||| |||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||      
T  47026645 ccacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacttgcgggccaatcttcaagc 47026744  T
Q  110 ttctcaaaatgaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgcc 209  Q
    | ||||  | |||||| |||||| | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  47026745 tactcaggaagaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccacc 47026844  T
Q  210 agtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
     |||||||||||||| ||||| ||||    
T  47026845 cgtggaaggaaggcctttgattatgt 47026870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 10 - 235
Target Start/End: Original strand, 5016906 - 5017131
Alignment:
Q  10 ccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaat 109  Q
    |||||||| || ||||||||| |||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||      
T  5016906 ccacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgtgggccgattttcaagc 5017005  T
Q  110 ttctcaaaatgaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgcc 209  Q
    | || | || ||| || ||| || | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  5017006 tgcttagaaagaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccacc 5017105  T
Q  210 agtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
     |||||||||||||| ||||| ||||    
T  5017106 cgtggaaggaaggcctttgattatgt 5017131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 10 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 5606382 - 5606157
Alignment:
Q  10 ccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaat 109  Q
    |||||||| || ||||||||| |||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  |||||      
T  5606382 ccacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacctgcgggccgatcttcaagc 5606283  T
Q  110 ttctcaaaatgaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgcc 209  Q
    | |||| || ||| || ||| || | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  5606282 tactcagaaagaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccacc 5606183  T
Q  210 agtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
     |||||||||||||| ||||| ||||    
T  5606182 cgtggaaggaaggcctttgattatgt 5606157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 10 - 235
Target Start/End: Original strand, 10399336 - 10399561
Alignment:
Q  10 ccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaat 109  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  |||||      
T  10399336 ccacagacagagaaacaagtcagaggtttcctcggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagc 10399435  T
Q  110 ttctcaaaatgaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgcc 209  Q
    | |||| || ||| || ||| || | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  10399436 tactcagaaagaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctagaaccacctatccttgtcccacc 10399535  T
Q  210 agtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
     |||||||||||||| ||||| ||||    
T  10399536 cgtggaaggaaggcctttgattatgt 10399561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 10 - 235
Target Start/End: Original strand, 28342369 - 28342594
Alignment:
Q  10 ccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaat 109  Q
    |||||||| || ||||||||| |||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |  |||||      
T  28342369 ccacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacttgcgggccgatcttcaagc 28342468  T
Q  110 ttctcaaaatgaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgcc 209  Q
    | |||| || ||| || |||||| | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  28342469 tactcagaaagaaccagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccacc 28342568  T
Q  210 agtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
     |||||||||||||| ||||| ||||    
T  28342569 cgtggaaggaaggcctttgattatgt 28342594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 10 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 4343744 - 4343519
Alignment:
Q  10 ccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaat 109  Q
    |||||||| || ||||||||| |||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  |||||      
T  4343744 ccacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacctgcgggccgatcttcaagc 4343645  T
Q  110 ttctcaaaatgaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgcc 209  Q
    | || | || ||| || ||| || | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  4343644 tacttagaaagaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccacc 4343545  T
Q  210 agtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
     |||||||||||||| ||||| ||||    
T  4343544 cgtggaaggaaggcctttgattatgt 4343519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 10 - 235
Target Start/End: Original strand, 4420107 - 4420332
Alignment:
Q  10 ccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaat 109  Q
    |||||||| || ||||||||| |||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  |||||      
T  4420107 ccacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacctgcgggccgatcttcaagc 4420206  T
Q  110 ttctcaaaatgaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgcc 209  Q
    | || | || ||| || ||| || | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  4420207 tacttagaaagaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtccctcc 4420306  T
Q  210 agtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
     |||||||||||||| ||||| ||||    
T  4420307 cgtggaaggaaggcctttgattatgt 4420332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 10 - 235
Target Start/End: Original strand, 5470180 - 5470405
Alignment:
Q  10 ccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaat 109  Q
    |||||||| || ||||||||| |||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |  |||||      
T  5470180 ccacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacttgcgggccgatcttcaagc 5470279  T
Q  110 ttctcaaaatgaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgcc 209  Q
    | |||| || ||| || ||| || | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  5470280 tactcagaaagaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtccctcc 5470379  T
Q  210 agtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
     |||||||||||||| ||||| ||||    
T  5470380 cgtggaaggaaggcctttgattatgt 5470405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 10 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 6539810 - 6539585
Alignment:
Q  10 ccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaat 109  Q
    |||||||| || ||||||||| |||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  |||||      
T  6539810 ccacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacctgcgggccgatcttcaagc 6539711  T
Q  110 ttctcaaaatgaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgcc 209  Q
    | || | || ||| || ||| || | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  6539710 tacttagaaagaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccacc 6539611  T
Q  210 agtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
     |||||||||||||| ||||| ||||    
T  6539610 cgtggaaggaaggcctttgattatgt 6539585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 10 - 235
Target Start/End: Original strand, 7999752 - 7999977
Alignment:
Q  10 ccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaat 109  Q
    |||||||| || ||||||||| |||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  |||||      
T  7999752 ccacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacctgcgggccgatcttcaagc 7999851  T
Q  110 ttctcaaaatgaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgcc 209  Q
    | || | || ||| || ||| || | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  7999852 tacttagaaagaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtccctcc 7999951  T
Q  210 agtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
     |||||||||||||| ||||| ||||    
T  7999952 cgtggaaggaaggcctttgattatgt 7999977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 10 - 235
Target Start/End: Original strand, 10646265 - 10646490
Alignment:
Q  10 ccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaat 109  Q
    |||||||| || ||||||||| |||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  |||||      
T  10646265 ccacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacctgcgggccgatcttcaagc 10646364  T
Q  110 ttctcaaaatgaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgcc 209  Q
    | || | || ||| || ||| || | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  10646365 tacttagaaagaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtccctcc 10646464  T
Q  210 agtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
     |||||||||||||| ||||| ||||    
T  10646465 cgtggaaggaaggcctttgattatgt 10646490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 22 - 235
Target Start/End: Original strand, 18245945 - 18246158
Alignment:
Q  22 aagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaatttctcaaaatga 121  Q
    ||||||||| |||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  |||||| | || | || ||    
T  18245945 aagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacctgcgggccgatcttcaaactacttagaaaga 18246044  T
Q  122 atcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgccagtggaaggaag 221  Q
    | || ||| || | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  18246045 accagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccacccgtggaaggaag 18246144  T
Q  222 gcccttgatgatgt 235  Q
    ||| ||||| ||||    
T  18246145 gcctttgattatgt 18246158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 10 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 22867916 - 22867691
Alignment:
Q  10 ccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaat 109  Q
    |||||||| || ||||||||| |||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  |||||      
T  22867916 ccacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacctgcgggccgatcttcaagc 22867817  T
Q  110 ttctcaaaatgaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgcc 209  Q
    | || | || ||| || ||| || | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  22867816 tacttagaaagaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtccctcc 22867717  T
Q  210 agtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
     |||||||||||||| ||||| ||||    
T  22867716 cgtggaaggaaggcctttgattatgt 22867691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 10 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 22882975 - 22882750
Alignment:
Q  10 ccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaat 109  Q
    |||||||| || ||||||||| |||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  |||||      
T  22882975 ccacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacctgcgggccgatcttcaagc 22882876  T
Q  110 ttctcaaaatgaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgcc 209  Q
    | || | || ||| || ||| || | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  22882875 tacttagaaagaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtccctcc 22882776  T
Q  210 agtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
     |||||||||||||| ||||| ||||    
T  22882775 cgtggaaggaaggcctttgattatgt 22882750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 10 - 235
Target Start/End: Original strand, 28024474 - 28024699
Alignment:
Q  10 ccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaat 109  Q
    |||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |  |||||      
T  28024474 ccacagacagagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccggttcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagc 28024573  T
Q  110 ttctcaaaatgaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgcc 209  Q
    | |||| || ||| || ||| || | |||||| |||||||||| || |||||||||||||||||  ||||  || |||||||||||||||||||||| ||    
T  28024574 tactcagaaagaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaggcttttgatagcatcaagaattacttgttggaaccacctatccttgtcccacc 28024673  T
Q  210 agtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
     |||||||||||||| ||||| ||||    
T  28024674 cgtggaaggaaggcctttgattatgt 28024699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 15 - 235
Target Start/End: Original strand, 19697687 - 19697907
Alignment:
Q  15 gaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaatttctc 114  Q
    |||||| || |||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |  |||||  | |||    
T  19697687 gaccgagaaacaagtcagaggtttcctcggacgattgaattacatctcccaattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagctactc 19697786  T
Q  115 aaaatgaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgccagtgg 214  Q
    || | |||||| |||||| | |||||  |||||||||| ||||||||||||||| ||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  19697787 aagaagaatcagcctattgtatggaacgatgaatgccaagaagcttttgatagcgtcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccacccgtgg 19697886  T
Q  215 aaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    |||||||||| ||||| ||||    
T  19697887 aaggaaggcctttgattatgt 19697907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 13 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 16621555 - 16621333
Alignment:
Q  13 cagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaatttc 112  Q
    |||||||| || |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  |||||  | |    
T  16621555 cagaccgagaaacaagtcagaggtttcctcgggcgattgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagctac 16621456  T
Q  113 tcaaaatgaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgccagt 212  Q
    |||  | |||||| |||||| | |||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||  |||| ||||| ||||| |||||||||||||| || ||    
T  16621455 tcaggaagaatcagcctattgtatggaacgatgaatgccaaggagcttttgatagcatcaagaattacctgctagaacctcctatccttgtcccacccgt 16621356  T
Q  213 ggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    |||||||||||| ||||| ||||    
T  16621355 ggaaggaaggcctttgattatgt 16621333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 10 - 235
Target Start/End: Original strand, 24331355 - 24331580
Alignment:
Q  10 ccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaat 109  Q
    |||||||| || ||||||||| |||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  |||||      
T  24331355 ccacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacctgcgggccgatcttcaagc 24331454  T
Q  110 ttctcaaaatgaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgcc 209  Q
    | || | || ||| || ||| || | |||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  24331455 tacttagaaagaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaaaaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccacc 24331554  T
Q  210 agtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
     |||||||||||||| ||||| ||||    
T  24331555 cgtggaaggaaggcctttgattatgt 24331580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 10 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 31961523 - 31961298
Alignment:
Q  10 ccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaat 109  Q
    |||||||| || ||||||||| |||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  |||||      
T  31961523 ccacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacctgcgggccgatcttcaagc 31961424  T
Q  110 ttctcaaaatgaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgcc 209  Q
    | || | || ||| || ||| || | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  31961423 tacttagaaagaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctattcttgtccctcc 31961324  T
Q  210 agtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
     |||||||||||||| ||||| ||||    
T  31961323 cgtggaaggaaggcctttgattatgt 31961298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 10 - 235
Target Start/End: Original strand, 51785215 - 51785440
Alignment:
Q  10 ccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaat 109  Q
    |||||||| || ||||||||| |||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  |||||      
T  51785215 ccacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacctgcgggccgatcttcaagc 51785314  T
Q  110 ttctcaaaatgaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgcc 209  Q
    | || | || ||| || ||| || | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||||||||||||||||| ||    
T  51785315 tacttagaaagaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctactggaaccacctatccttgtccctcc 51785414  T
Q  210 agtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
     |||||||||||||| ||||| ||||    
T  51785415 cgtggaaggaaggcctttgatcatgt 51785440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 10 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 17982017 - 17981792
Alignment:
Q  10 ccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaat 109  Q
    |||||||| || ||||||||| |||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  |||||      
T  17982017 ccacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacctgcgggccgatcttcaagc 17981918  T
Q  110 ttctcaaaatgaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgcc 209  Q
    | || | || ||| || ||| || | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||  || |||||||||||||||||||||| ||    
T  17981917 tacttagaaagaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacttgttggaaccacctatccttgtcccacc 17981818  T
Q  210 agtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
     |||||||||||||| ||||| ||||    
T  17981817 cgtggaaggaaggcctttgatcatgt 17981792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 10 - 235
Target Start/End: Original strand, 18228388 - 18228613
Alignment:
Q  10 ccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaat 109  Q
    |||||||| || ||||||||| |||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  |||||      
T  18228388 ccacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacctgcgggccgatcttcaagc 18228487  T
Q  110 ttctcaaaatgaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgcc 209  Q
    | || | || ||| || ||| || | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||  || |||||||||||||||||||||| ||    
T  18228488 tacttagaaagaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacttgttggaaccacctatccttgtcccacc 18228587  T
Q  210 agtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
     |||||||||||||| ||||| ||||    
T  18228588 cgtggaaggaaggcctttgatcatgt 18228613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 10 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 11107420 - 11107226
Alignment:
Q  10 ccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaat 109  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| |  |||||      
T  11107420 ccacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacttgtgggccgatcttcaagc 11107321  T
Q  110 ttctcaaaatgaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtc 204  Q
    | |||| || || ||| |||||| | |||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||  || ||||||||||||||||||||    
T  11107320 tactcagaaagagtcagcctattgtatggaatgaagaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacttgttggaaccacctatccttgtc 11107226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 120 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 17992889 - 17992779
Alignment:
Q  120 gaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgccagtggaagga 219  Q
    ||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  17992889 gaatcaacctattgtatggaacgatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtccctcccgtggaagga 17992790  T
Q  220 aggcccttgat 230  Q
    ||||| |||||    
T  17992789 aggcctttgat 17992779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 120 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 31033194 - 31033084
Alignment:
Q  120 gaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgccagtggaagga 219  Q
    |||||| |||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  31033194 gaatcagcctattatatggaacgatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtccctcccgtggaagga 31033095  T
Q  220 aggcccttgat 230  Q
    ||||| |||||    
T  31033094 aggcctttgat 31033084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 120 - 235
Target Start/End: Original strand, 4627087 - 4627202
Alignment:
Q  120 gaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgccagtggaagga 219  Q
    |||||| |||||| | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  4627087 gaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccacccgtggaagga 4627186  T
Q  220 aggcccttgatgatgt 235  Q
    ||||| ||||| ||||    
T  4627187 aggcctttgattatgt 4627202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 120 - 230
Target Start/End: Original strand, 32293930 - 32294040
Alignment:
Q  120 gaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgccagtggaagga 219  Q
    |||||| |||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  32293930 gaatcagcctattgtatggaacgatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtccctcccgtggaagga 32294029  T
Q  220 aggcccttgat 230  Q
    ||||| |||||    
T  32294030 aggcctttgat 32294040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 120 - 235
Target Start/End: Original strand, 5714375 - 5714490
Alignment:
Q  120 gaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgccagtggaagga 219  Q
    |||||| |||||| | |||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  5714375 gaatcagcctattgtatggaacgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccacccgtggaagga 5714474  T
Q  220 aggcccttgatgatgt 235  Q
    ||||| ||||| ||||    
T  5714475 aggcctttgatcatgt 5714490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 120 - 235
Target Start/End: Original strand, 5725285 - 5725400
Alignment:
Q  120 gaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgccagtggaagga 219  Q
    |||||| |||||| | |||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  5725285 gaatcagcctattgtatggaacgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccacccgtggaagga 5725384  T
Q  220 aggcccttgatgatgt 235  Q
    ||||| ||||| ||||    
T  5725385 aggcctttgatcatgt 5725400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 120 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 5767083 - 5766968
Alignment:
Q  120 gaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgccagtggaagga 219  Q
    |||||| |||||| | |||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  5767083 gaatcagcctattgtatggaacgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccacccgtggaagga 5766984  T
Q  220 aggcccttgatgatgt 235  Q
    ||||| ||||| ||||    
T  5766983 aggcctttgatcatgt 5766968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 6963363 - 6963276
Alignment:
Q  148 tgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgccagtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||  ||| || | ||||| || || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||    
T  6963363 tgccagaaagcttttgatagcatcaaagggtatttgttagaacctccgattcttgtccctccagttgaaggaaggcctttgatcatgt 6963276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 50 - 95
Target Start/End: Original strand, 15918749 - 15918794
Alignment:
Q  50 tgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgg 95  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  15918749 tgaattacatctcccgtttcatttctcatatgacagcaacgtgcgg 15918794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 50 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 15592939 - 15592891
Alignment:
Q  50 tgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggcc 98  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||| ||||    
T  15592939 tgaattacatctcccgtttcatttctcatatgacagcaacgtgcaggcc 15592891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 50 - 98
Target Start/End: Original strand, 20443349 - 20443397
Alignment:
Q  50 tgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggcc 98  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || |||||    
T  20443349 tgaattacatctcccgtttcatctctcatatgactgcaacatgtgggcc 20443397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 50 - 98
Target Start/End: Original strand, 41440475 - 41440523
Alignment:
Q  50 tgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggcc 98  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || |||||    
T  41440475 tgaattacatctcccgtttcatctctcatatgactgcaacatgtgggcc 41440523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 130; Significance: 2e-67; HSPs: 35)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 10 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 10913779 - 10913554
Alignment:
Q  10 ccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaat 109  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  |||||      
T  10913779 ccacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagc 10913680  T
Q  110 ttctcaaaatgaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgcc 209  Q
    | |||| || |||||| |||||| | |||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  10913679 tactcagaaagaatcagcctattgtatggaatgatgaatgtcaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccacc 10913580  T
Q  210 agtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
     |||||||||||||| ||||| ||||    
T  10913579 cgtggaaggaaggcctttgattatgt 10913554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 10 - 235
Target Start/End: Original strand, 2157802 - 2158027
Alignment:
Q  10 ccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaat 109  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  |||||      
T  2157802 ccacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagc 2157901  T
Q  110 ttctcaaaatgaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgcc 209  Q
    | || |  | |||||| |||||| | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  2157902 tactgaggaagaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccacc 2158001  T
Q  210 agtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
     |||||||||||||| ||||| ||||    
T  2158002 cgtggaaggaaggcctttgattatgt 2158027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 10 - 235
Target Start/End: Original strand, 26438485 - 26438710
Alignment:
Q  10 ccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaat 109  Q
    ||||||||||| || |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||      
T  26438485 ccacagaccgagaaacaagtcagaggtttcctcggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagc 26438584  T
Q  110 ttctcaaaatgaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgcc 209  Q
    | || | || ||| || |||||| | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  26438585 tgcttagaaagaaccagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattatctgctggaaccacctatcctcgtcccacc 26438684  T
Q  210 agtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
     |||||||||||||| ||||| ||||    
T  26438685 cgtggaaggaaggccgttgatcatgt 26438710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 10 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 26534783 - 26534558
Alignment:
Q  10 ccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaat 109  Q
    ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  |||||      
T  26534783 ccacaaaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatttcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagc 26534684  T
Q  110 ttctcaaaatgaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgcc 209  Q
    | |||| || |||||| |||||| | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  26534683 tactcagaaagaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccacc 26534584  T
Q  210 agtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
     |||||||||||||| ||||| ||||    
T  26534583 cgtggaaggaaggcctttgatcatgt 26534558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 10 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 2107073 - 2106848
Alignment:
Q  10 ccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaat 109  Q
    ||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  |||||      
T  2107073 ccacataccgagaagcaagtcagaggtttcctcggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagc 2106974  T
Q  110 ttctcaaaatgaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgcc 209  Q
    | |||| || ||||||||||||| | |||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  2106973 tactcagaaagaatcaacctattgtatggaatgatgaatgtcaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccacc 2106874  T
Q  210 agtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
     ||||||||||| || ||||| ||||    
T  2106873 cgtggaaggaagacctttgattatgt 2106848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 10 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 11421689 - 11421464
Alignment:
Q  10 ccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaat 109  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||      
T  11421689 ccacagaccgagaagcaagtcagagggttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagc 11421590  T
Q  110 ttctcaaaatgaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgcc 209  Q
    | |||| || |||||| ||| || | |||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  11421589 tactcagaaagaatcagcctgttgtatggaatgatgaatgtcaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccacc 11421490  T
Q  210 agtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
     ||||||||||| || ||||| ||||    
T  11421489 cgtggaaggaagacctttgattatgt 11421464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 10 - 235
Target Start/End: Original strand, 45390448 - 45390673
Alignment:
Q  10 ccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaat 109  Q
    |||||||| || ||||||||| |||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||     
T  45390448 ccacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacctgcgggccaatcttcaaac 45390547  T
Q  110 ttctcaaaatgaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgcc 209  Q
    | |||| || |||||| ||| || | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  45390548 tactcagaaagaatcagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccacc 45390647  T
Q  210 agtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
     |||||||||||||| ||||| ||||    
T  45390648 cgtggaaggaaggcctttgattatgt 45390673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 13 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 16515337 - 16515115
Alignment:
Q  13 cagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaatttc 112  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  |||||  | |    
T  16515337 cagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcggacgattgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggctgatcttcaagctac 16515238  T
Q  113 tcaaaatgaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgccagt 212  Q
    ||| || |||||| |||||| | |||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  16515237 tcagaaagaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaatcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccacccgt 16515138  T
Q  213 ggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    |||||||||||| ||||| ||||    
T  16515137 ggaaggaaggcctttgattatgt 16515115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 10 - 235
Target Start/End: Original strand, 5131224 - 5131449
Alignment:
Q  10 ccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaat 109  Q
    |||||||| || ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  |||||      
T  5131224 ccacagacagagaagcaagtcagaggtttcctcggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagc 5131323  T
Q  110 ttctcaaaatgaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgcc 209  Q
    | |||| || |||||| ||| || | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  5131324 tactcagaaagaatcagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccacc 5131423  T
Q  210 agtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
     |||||||| ||||| ||||| ||||    
T  5131424 cgtggaagggaggcctttgattatgt 5131449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 10 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 5144250 - 5144025
Alignment:
Q  10 ccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaat 109  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  |||||      
T  5144250 ccacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcggacgtttgaataacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagc 5144151  T
Q  110 ttctcaaaatgaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgcc 209  Q
    | |||| || ||| || |||||| | |||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  5144150 tactcagaaagaaccagcctattgtatggaatgatgaatgtcaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccacc 5144051  T
Q  210 agtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
     |||||||||||||| ||||| ||||    
T  5144050 cgtggaaggaaggcctttgatcatgt 5144025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 10 - 235
Target Start/End: Original strand, 22145423 - 22145648
Alignment:
Q  10 ccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaat 109  Q
    ||||||||||| || |||||  ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  |||||      
T  22145423 ccacagaccgagaaacaagttagaggtttcctcggacgcttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagc 22145522  T
Q  110 ttctcaaaatgaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgcc 209  Q
    | |||| || |||||| |||||| | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  22145523 tactcagaaagaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccacc 22145622  T
Q  210 agtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
     |||||||||||||| ||||| ||||    
T  22145623 cgtggaaggaaggcctttgatcatgt 22145648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 22 - 235
Target Start/End: Original strand, 26516032 - 26516245
Alignment:
Q  22 aagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaatttctcaaaatga 121  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||  | || |  | ||    
T  26516032 aagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagctactaaggaaga 26516131  T
Q  122 atcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgccagtggaaggaag 221  Q
    |||| |||||| | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  26516132 atcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgttggaaccacctatccttgtcccacccgtggaaggaag 26516231  T
Q  222 gcccttgatgatgt 235  Q
    ||| ||||| ||||    
T  26516232 gcctttgatcatgt 26516245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 10 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 26271996 - 26271771
Alignment:
Q  10 ccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaat 109  Q
    |||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  |||||      
T  26271996 ccacagacagagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagc 26271897  T
Q  110 ttctcaaaatgaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgcc 209  Q
    | || | || ||| || ||| || | |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  26271896 tacttagaaagaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcctttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccacc 26271797  T
Q  210 agtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
     |||||||||||||| ||||| ||||    
T  26271796 cgtggaaggaaggcctttgattatgt 26271771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 10 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 26316758 - 26316533
Alignment:
Q  10 ccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaat 109  Q
    |||||||| || ||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |  |||||      
T  26316758 ccacagacagagaagcaagtcagaggcttcctcggacgtttgaattacatctctcgattcatatctcacatgaccgcaacttgcgggccgatcttcaagc 26316659  T
Q  110 ttctcaaaatgaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgcc 209  Q
    | ||||  | |||||| |||||| | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  26316658 tactcaggaagaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattatctgctggaaccacctatccttgtcccacc 26316559  T
Q  210 agtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
     |||||||||||||| ||||| ||||    
T  26316558 cgtggaaggaaggcctttgattatgt 26316533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 13 - 235
Target Start/End: Original strand, 10844851 - 10845073
Alignment:
Q  13 cagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaatttc 112  Q
    |||||||| || |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  |||||  | |    
T  10844851 cagaccgagaaacaagtcagaggtttcctcgggcgattgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagctac 10844950  T
Q  113 tcaaaatgaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgccagt 212  Q
    |||  | |||||| |||||| | |||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||    
T  10844951 tcaggaagaatcagcctattgtatggaacgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctgtaaccacctatccttgtcccacccgt 10845050  T
Q  213 ggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    |||||||||||| ||||| ||||    
T  10845051 ggaaggaaggcctttgattatgt 10845073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 10 - 235
Target Start/End: Original strand, 3448534 - 3448759
Alignment:
Q  10 ccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaat 109  Q
    |||||||| || ||||||||| |||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  |||||      
T  3448534 ccacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacctgcgggccgatcttcaagc 3448633  T
Q  110 ttctcaaaatgaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgcc 209  Q
    | || | || ||| || ||| || | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  3448634 tacttagaaagaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccacc 3448733  T
Q  210 agtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
     |||||||||||||| ||||| ||||    
T  3448734 cgtggaaggaaggccgttgatcatgt 3448759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 10 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 4142156 - 4141931
Alignment:
Q  10 ccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaat 109  Q
    |||||||| || ||||||||| |||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  |||||      
T  4142156 ccacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacctgcgggccgatcttcaagc 4142057  T
Q  110 ttctcaaaatgaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgcc 209  Q
    | || | || ||| || ||| || | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  4142056 tacttagaaagaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccacc 4141957  T
Q  210 agtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
     |||||||||||||| ||||| ||||    
T  4141956 cgtggaaggaaggcctttgattatgt 4141931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 10 - 235
Target Start/End: Original strand, 4202617 - 4202842
Alignment:
Q  10 ccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaat 109  Q
    |||||||| || ||||||||  |||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |  |||||      
T  4202617 ccacagacagagaagcaagttagaggcttcctcggacgtttgaattacatctctcgattcatatctcacatgaccgcaacttgcgggccgatcttcaagc 4202716  T
Q  110 ttctcaaaatgaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgcc 209  Q
    | |||| || ||  || |||||| | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  4202717 tactcagaaagagccagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattatctgctggaaccacctatccttgtcccacc 4202816  T
Q  210 agtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
     |||||||||||||| ||||| ||||    
T  4202817 cgtggaaggaaggcctttgattatgt 4202842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 10 - 235
Target Start/End: Original strand, 11444115 - 11444340
Alignment:
Q  10 ccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaat 109  Q
    |||||||| || ||||||||| |||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  |||||      
T  11444115 ccacagacagagaagcaagtcagaggtttcctgggacgcttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacctgcgggccgatcttcaagc 11444214  T
Q  110 ttctcaaaatgaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgcc 209  Q
    | || | || ||| || ||| || | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  11444215 tacttagaaagaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccacc 11444314  T
Q  210 agtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
     |||||||||||||| ||||| ||||    
T  11444315 cgtggaaggaaggccgttgatcatgt 11444340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 22 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 31561288 - 31561075
Alignment:
Q  22 aagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaatttctcaaaatga 121  Q
    ||||||||| |||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  |||||| | || | || ||    
T  31561288 aagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacctgcgggccgatcttcaaactacttagaaaga 31561189  T
Q  122 atcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgccagtggaaggaag 221  Q
    | || ||| || | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  31561188 accagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccacccgtggaaggaag 31561089  T
Q  222 gcccttgatgatgt 235  Q
    ||| ||||| ||||    
T  31561088 gcctttgattatgt 31561075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 13 - 221
Target Start/End: Original strand, 16044550 - 16044758
Alignment:
Q  13 cagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaatttc 112  Q
    |||||||| || |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  ||||| || |    
T  16044550 cagaccgagaaacaagtcagaggtttcctcgggcgattgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagttac 16044649  T
Q  113 tcaaaatgaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgccagt 212  Q
    |||  | |||||| |||||| | |||||  |||||||||| || |||||| ||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||| || ||    
T  16044650 tcaggaagaatcagcctattgtatggaacgatgaatgccaagaggcttttaatagcatcaagaattacctgttggaaccacctatccttgtcccacccgt 16044749  T
Q  213 ggaaggaag 221  Q
    |||||||||    
T  16044750 ggaaggaag 16044758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 13 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 10842901 - 10842679
Alignment:
Q  13 cagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaatttc 112  Q
    |||||||| || |||||  |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||  | |    
T  10842901 cagaccgagaaacaagttagaggtttcctcgggcgattgcattacatctcccgatttatatctcatatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagctac 10842802  T
Q  113 tcaaaatgaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgccagt 212  Q
    |||  | |||||| |||||| | |||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||| || ||    
T  10842801 tcaggaagaatcagcctattgtatggaacgatgaatgccaaggagcttttgatagcatcaagaattacctgttggaaccacctatccttgtcccacccgt 10842702  T
Q  213 ggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    |||||||||||| ||||| ||||    
T  10842701 ggaaggaaggcctttgattatgt 10842679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 22 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 16748415 - 16748202
Alignment:
Q  22 aagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaatttctcaaaatga 121  Q
    ||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||||| |  |||||  | ||||  | ||    
T  16748415 aagcaagtcagaggcttcctcggacgtttgaattacatctctcgattcatatctcacatgaccgcaacttgtgggccgatcttcaagctactcaggaaga 16748316  T
Q  122 atcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgccagtggaaggaag 221  Q
    |||||||| || | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||    
T  16748315 atcaacctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagagttatctgctggaaccacctatcctcgtcccacccgtggaaggaag 16748216  T
Q  222 gcccttgatgatgt 235  Q
    ||| ||||| ||||    
T  16748215 gcctttgattatgt 16748202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 10 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 26666824 - 26666599
Alignment:
Q  10 ccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaat 109  Q
    |||||||| || ||||||||| |||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  |||||      
T  26666824 ccacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacctgcgggccgatcttcaagc 26666725  T
Q  110 ttctcaaaatgaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgcc 209  Q
    | || | || ||| || ||| |  | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||| || ||    
T  26666724 tacttagaaagaaccagcctgtcgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgttccacc 26666625  T
Q  210 agtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
     |||||||||||||| ||||| ||||    
T  26666624 cgtggaaggaaggcctttgattatgt 26666599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 10 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 24589444 - 24589219
Alignment:
Q  10 ccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaat 109  Q
    |||||||| || ||||||||| |||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  |||||      
T  24589444 ccacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacctgcgggccgatcttcaagc 24589345  T
Q  110 ttctcaaaatgaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgcc 209  Q
    | || | || ||| || ||| || | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||  || ||||| |||||||||||||||| ||    
T  24589344 tacttagaaagaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacttgttggaatcacctatccttgtcccacc 24589245  T
Q  210 agtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
     |||||||||||||| ||||| ||||    
T  24589244 cgtggaaggaaggcctttgatcatgt 24589219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 32 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 16446894 - 16446691
Alignment:
Q  32 gaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaatttctcaaaatgaatcaacctat 131  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |  |||||  | ||||  | ||||||  ||||    
T  16446894 gaggtttcctcgggtgattgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcaggccgatcttcaagctactcaggaagaatcagactat 16446795  T
Q  132 tatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgccagtggaaggaaggcccttgatg 231  Q
    | | |||||  |||||||||| |  |||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||     
T  16446794 tgtatggaacgatgaatgccaaggggcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccacccgtggaaggaaggcctttgatt 16446695  T
Q  232 atgt 235  Q
    ||||    
T  16446694 atgt 16446691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 120 - 230
Target Start/End: Original strand, 2776592 - 2776702
Alignment:
Q  120 gaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgccagtggaagga 219  Q
    |||||| |||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  2776592 gaatcagcctattgtatggaacgatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtccctcccgtggaagga 2776691  T
Q  220 aggcccttgat 230  Q
    ||||| |||||    
T  2776692 aggcctttgat 2776702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 120 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 26512496 - 26512386
Alignment:
Q  120 gaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgccagtggaagga 219  Q
    |||||| |||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  26512496 gaatcagcctattgtatggaacgatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtccctcccgtggaagga 26512397  T
Q  220 aggcccttgat 230  Q
    ||||| |||||    
T  26512396 aggcctttgat 26512386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 120 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 26681906 - 26681796
Alignment:
Q  120 gaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgccagtggaagga 219  Q
    |||||| |||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  26681906 gaatcagcctattgtatggaacgatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtccctcccgtggaagga 26681807  T
Q  220 aggcccttgat 230  Q
    ||||| |||||    
T  26681806 aggcctttgat 26681796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 120 - 230
Target Start/End: Original strand, 31127245 - 31127355
Alignment:
Q  120 gaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgccagtggaagga 219  Q
    |||||| |||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  31127245 gaatcagcctattgtatggaacgatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtccctcccgtggaagga 31127344  T
Q  220 aggcccttgat 230  Q
    ||||| |||||    
T  31127345 aggcctttgat 31127355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 120 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 39209939 - 39209829
Alignment:
Q  120 gaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgccagtggaagga 219  Q
    ||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  39209939 gaatcaacctattgtatggaacgatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaagaattacttgctggaaccacctatccttgtccctcccgtggaagga 39209840  T
Q  220 aggcccttgat 230  Q
    ||||| |||||    
T  39209839 aggcctttgat 39209829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 10 - 160
Target Start/End: Original strand, 9621878 - 9622028
Alignment:
Q  10 ccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaat 109  Q
    |||||||| || ||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |  |||||      
T  9621878 ccacagacagagaagcaagtcagaggcttcctcggacgtttgaattacatctctcgattcatatctcacatgaccgcaacttgcgggccgatcttcaagc 9621977  T
Q  110 ttctcaaaatgaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagctt 160  Q
    | ||||  | |||||| |||||| | |||||| |||||||||| |||||||    
T  9621978 tactcaggaagaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagctt 9622028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 127 - 230
Target Start/End: Original strand, 45734658 - 45734761
Alignment:
Q  127 cctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgccagtggaaggaaggccct 226  Q
    |||||| | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |    
T  45734658 cctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtccctcccgtggaaggaagacctt 45734757  T
Q  227 tgat 230  Q
    ||||    
T  45734758 tgat 45734761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 120 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 31087422 - 31087312
Alignment:
Q  120 gaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgccagtggaagga 219  Q
    |||||| |||||| | |||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||| || |||||||||||||| || |||||||||    
T  31087422 gaatcagcctattgtatggaacgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggagccccctatccttgtccctcccgtggaagga 31087323  T
Q  220 aggcccttgat 230  Q
    ||||| |||||    
T  31087322 aggcctttgat 31087312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 50 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 16287249 - 16287201
Alignment:
Q  50 tgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggcc 98  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || |||||    
T  16287249 tgaattacatctcccgtttcatttctcatatgactgcaacatgtgggcc 16287201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 130; Significance: 2e-67; HSPs: 46)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 10 - 235
Target Start/End: Original strand, 27022364 - 27022589
Alignment:
Q  10 ccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaat 109  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |  |||||      
T  27022364 ccacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgatttatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagc 27022463  T
Q  110 ttctcaaaatgaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgcc 209  Q
    | |||| || |||||| |||||| | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  27022464 tactcagaaagaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccacc 27022563  T
Q  210 agtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
     |||||||||||||| ||||| ||||    
T  27022564 cgtggaaggaaggcctttgattatgt 27022589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 10 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 27287332 - 27287107
Alignment:
Q  10 ccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaat 109  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||      
T  27287332 ccacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagc 27287233  T
Q  110 ttctcaaaatgaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgcc 209  Q
    | |||| ||  ||||| |||||| | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  27287232 tactcagaaataatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccacc 27287133  T
Q  210 agtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
     |||||||||||||| ||||| ||||    
T  27287132 tgtggaaggaaggcctttgattatgt 27287107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 10 - 235
Target Start/End: Original strand, 29552785 - 29553010
Alignment:
Q  10 ccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaat 109  Q
    |||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  |||||      
T  29552785 ccacagactgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagc 29552884  T
Q  110 ttctcaaaatgaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgcc 209  Q
    | |||| || |||||| |||||| | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  29552885 tactcagaaagaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccacc 29552984  T
Q  210 agtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
     |||||||||||||| ||||| ||||    
T  29552985 cgtggaaggaaggcctttgattatgt 29553010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 10 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 13295919 - 13295694
Alignment:
Q  10 ccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaat 109  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  |||||      
T  13295919 ccacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagc 13295820  T
Q  110 ttctcaaaatgaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgcc 209  Q
    | |||| || |||||| |||||| | |||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  13295819 tactcagaaagaatcagcctattgtatggaatgatgaatgctaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccacc 13295720  T
Q  210 agtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
     |||||||||||||| ||||| ||||    
T  13295719 cgtggaaggaaggcctttgattatgt 13295694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 10 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 15421288 - 15421063
Alignment:
Q  10 ccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaat 109  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  |||||      
T  15421288 ccacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagc 15421189  T
Q  110 ttctcaaaatgaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgcc 209  Q
    | |||| || |||||| ||| || | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  15421188 tactcagaaagaatcagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccacc 15421089  T
Q  210 agtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
     |||||||||||||| ||||| ||||    
T  15421088 cgtggaaggaaggcctttgattatgt 15421063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 10 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 22931852 - 22931627
Alignment:
Q  10 ccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaat 109  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  |||||      
T  22931852 ccacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagc 22931753  T
Q  110 ttctcaaaatgaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgcc 209  Q
    | |||| || |||||| |||||| | |||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  22931752 tactcagaaagaatcagcctattgtatggaatgatgaatgtcaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaactacctatccttgtcccacc 22931653  T
Q  210 agtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
     |||||||||||||| ||||| ||||    
T  22931652 cgtggaaggaaggcctttgattatgt 22931627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 10 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 23854297 - 23854072
Alignment:
Q  10 ccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaat 109  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  |||||      
T  23854297 ccacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagc 23854198  T
Q  110 ttctcaaaatgaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgcc 209  Q
    | |||| || |||||| |||||| | |||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  23854197 tactcagaaagaatcagcctattgtatggaatgatgaatgtcaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaactacctatccttgtcccacc 23854098  T
Q  210 agtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
     |||||||||||||| ||||| ||||    
T  23854097 cgtggaaggaaggcctttgattatgt 23854072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 10 - 235
Target Start/End: Original strand, 24866944 - 24867169
Alignment:
Q  10 ccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaat 109  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || ||      
T  24866944 ccacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccgatctttaagc 24867043  T
Q  110 ttctcaaaatgaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgcc 209  Q
    | |||| || |||||| |||||| | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  24867044 tactcagaaagaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagagttacctgctggaaccacctatccttgtcccacc 24867143  T
Q  210 agtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
     |||||||||||||| ||||| ||||    
T  24867144 cgtggaaggaaggcctttgattatgt 24867169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 10 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 27626679 - 27626454
Alignment:
Q  10 ccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaat 109  Q
    |||| |||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  |||||      
T  27626679 ccacggaccgagaagcaagtcagaggtttcctcggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacctgcgggccgatcttcaagc 27626580  T
Q  110 ttctcaaaatgaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgcc 209  Q
    | |||| || |||||| |||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  27626579 tactcagaaagaatcagcctattgtgtggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctgaaaccacctatccttgtcccacc 27626480  T
Q  210 agtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
     |||||||||||||| ||||| ||||    
T  27626479 cgtggaaggaaggcctttgattatgt 27626454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 10 - 235
Target Start/End: Original strand, 16677368 - 16677593
Alignment:
Q  10 ccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaat 109  Q
    |||||||| || || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |  |||||      
T  16677368 ccacagacagagaaacaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaatctgcgggccgatcttcaagc 16677467  T
Q  110 ttctcaaaatgaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgcc 209  Q
    | |||| || |||||| |||||| | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16677468 tactcagaaagaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccacc 16677567  T
Q  210 agtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
     |||||||||||||| ||||| ||||    
T  16677568 cgtggaaggaaggcctttgattatgt 16677593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 10 - 235
Target Start/End: Original strand, 27179684 - 27179909
Alignment:
Q  10 ccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaat 109  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  |||||      
T  27179684 ccacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagc 27179783  T
Q  110 ttctcaaaatgaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgcc 209  Q
    | |||| || |||||| |||||| | |||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  27179784 tactcagaaagaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagtttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccacc 27179883  T
Q  210 agtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
     ||||| |||||||| ||||| ||||    
T  27179884 cgtggacggaaggcctttgattatgt 27179909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 10 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 27269555 - 27269330
Alignment:
Q  10 ccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaat 109  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  |||||      
T  27269555 ccacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagc 27269456  T
Q  110 ttctcaaaatgaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgcc 209  Q
    | |||| || |||||| |||||| | |||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  27269455 tactcagaaagaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagtttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccacc 27269356  T
Q  210 agtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
     ||||| |||||||| ||||| ||||    
T  27269355 cgtggacggaaggcctttgattatgt 27269330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 10 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 34461474 - 34461249
Alignment:
Q  10 ccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaat 109  Q
    |||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||      
T  34461474 ccacagactgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagc 34461375  T
Q  110 ttctcaaaatgaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgcc 209  Q
    | || | || ||| || ||| || | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  34461374 tgcttagaaagaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccacc 34461275  T
Q  210 agtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
     |||||||||||||| ||||| ||||    
T  34461274 cgtggaaggaaggcctttgatcatgt 34461249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 10 - 235
Target Start/End: Original strand, 3699311 - 3699536
Alignment:
Q  10 ccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaat 109  Q
    |||||||| || || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  |||||      
T  3699311 ccacagacagagaaacaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagc 3699410  T
Q  110 ttctcaaaatgaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgcc 209  Q
    | || |  | |||||| |||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| |     
T  3699411 tactaaggaagaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccacg 3699510  T
Q  210 agtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
     |||||||||||||| ||||| ||||    
T  3699511 tgtggaaggaaggcctttgatcatgt 3699536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 10 - 235
Target Start/End: Original strand, 4760991 - 4761216
Alignment:
Q  10 ccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaat 109  Q
    |||||||| || ||||||||| |||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||      
T  4760991 ccacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacctgcgggccaatcttcaagc 4761090  T
Q  110 ttctcaaaatgaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgcc 209  Q
    | |||| || ||| || |||||| | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  4761091 tactcagaaagaaccagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccacc 4761190  T
Q  210 agtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
     |||||||||||||| ||||| ||||    
T  4761191 cgtggaaggaaggcctttgattatgt 4761216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 10 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 17089411 - 17089186
Alignment:
Q  10 ccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaat 109  Q
    |||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||  |||||      
T  17089411 ccacggaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgctacctgcgggccaatcttcaagc 17089312  T
Q  110 ttctcaaaatgaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgcc 209  Q
    | ||||  | |||||| |||||| |||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  17089311 tactcaggaagaatcagcctattgtgtggaacgatgaatgccaaggagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaacctcctatccttgtcccacc 17089212  T
Q  210 agtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
     |||||||||||||| ||||| ||||    
T  17089211 cgtggaaggaaggcctttgattatgt 17089186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 10 - 235
Target Start/End: Original strand, 27010959 - 27011184
Alignment:
Q  10 ccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaat 109  Q
    |||||||| || ||||||||| |||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||      
T  27010959 ccacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacctgcgggccaatcttcaagc 27011058  T
Q  110 ttctcaaaatgaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgcc 209  Q
    | |||| || ||| || |||||| | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  27011059 tactcagaaagaaccagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccacc 27011158  T
Q  210 agtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
     |||||||||||||| ||||| ||||    
T  27011159 cgtggaaggaaggcctttgattatgt 27011184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 10 - 224
Target Start/End: Original strand, 26921605 - 26921819
Alignment:
Q  10 ccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaat 109  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  |||||      
T  26921605 ccacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagc 26921704  T
Q  110 ttctcaaaatgaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgcc 209  Q
    | |||| || |||||| ||| || | |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||  |||| |||||| ||||||||||| ||||||| ||    
T  26921705 tactcagaaagaatcagcctgttgtttggaataatgaatgtcaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctgaaaccacctatctttgtcccacc 26921804  T
Q  210 agtggaaggaaggcc 224  Q
     ||||||||||||||    
T  26921805 cgtggaaggaaggcc 26921819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 10 - 224
Target Start/End: Original strand, 16753049 - 16753263
Alignment:
Q  10 ccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaat 109  Q
    ||||||||||| || |||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  |||||      
T  16753049 ccacagaccgagaaacaagtcagaggtttcctcggacgcttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagc 16753148  T
Q  110 ttctcaaaatgaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgcc 209  Q
    | |||| || |||||| |||||| | |||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||  |||| |||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  16753149 tactcagaaagaatcagcctattgtatggaatgatgaatgtcaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctgaaaccacctatccttgtcccacc 16753248  T
Q  210 agtggaaggaaggcc 224  Q
     ||||||||||||||    
T  16753249 cgtggaaggaaggcc 16753263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 10 - 235
Target Start/End: Original strand, 27060734 - 27060959
Alignment:
Q  10 ccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaat 109  Q
    |||||||| || ||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |  |||||      
T  27060734 ccacagacagagaagcaagtcagaggtttcctcggacgtctgaattacatctcccggttcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagc 27060833  T
Q  110 ttctcaaaatgaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgcc 209  Q
    | |||| || ||| || ||| || | |||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  27060834 tactcagaaagaaccagcctgttgtatggaacgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattatctgctggaaccacctatccttgtcccacc 27060933  T
Q  210 agtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
     |||||||||||||| ||||| ||||    
T  27060934 cgtggaaggaaggcctttgattatgt 27060959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 10 - 235
Target Start/End: Original strand, 29504644 - 29504869
Alignment:
Q  10 ccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaat 109  Q
    |||||||| || ||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  |||||      
T  29504644 ccacagacagagaagcaagtcagaggtttcctgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagc 29504743  T
Q  110 ttctcaaaatgaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgcc 209  Q
    | || | || ||| || ||| || | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  29504744 tgcttagaaagaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccacc 29504843  T
Q  210 agtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
     |||||||||||||| ||||| ||||    
T  29504844 cgtggaaggaaggccgttgatcatgt 29504869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 10 - 235
Target Start/End: Original strand, 4528513 - 4528738
Alignment:
Q  10 ccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaat 109  Q
    |||||||| || ||||||||| |||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||     
T  4528513 ccacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacctgcgggccgatcttcaaac 4528612  T
Q  110 ttctcaaaatgaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgcc 209  Q
    | || | || ||| || ||| || | ||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  4528613 tacttagaaagaaccagcctgttgtatgggatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccacc 4528712  T
Q  210 agtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
     |||||||||||||| ||||| ||||    
T  4528713 cgtggaaggaaggcctttgattatgt 4528738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 10 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 4542742 - 4542517
Alignment:
Q  10 ccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaat 109  Q
    |||||||| || ||||||||| |||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||      
T  4542742 ccacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgactgcaacctgcgggccgattttcaagc 4542643  T
Q  110 ttctcaaaatgaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgcc 209  Q
    | || | || ||| || ||| || | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  4542642 tacttagaaagaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccacc 4542543  T
Q  210 agtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
     |||||||||||||| ||||| ||||    
T  4542542 cgtggaaggaaggcctttgattatgt 4542517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 10 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 4721103 - 4720878
Alignment:
Q  10 ccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaat 109  Q
    |||||||| || ||||||||| |||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||      
T  4721103 ccacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgactgcaacctgcgggccgattttcaagc 4721004  T
Q  110 ttctcaaaatgaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgcc 209  Q
    | || | || ||| || ||| || | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  4721003 tacttagaaagaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccacc 4720904  T
Q  210 agtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
     |||||||||||||| ||||| ||||    
T  4720903 cgtggaaggaaggcctttgattatgt 4720878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 10 - 235
Target Start/End: Original strand, 27488361 - 27488586
Alignment:
Q  10 ccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaat 109  Q
    |||||||| || ||||||||| |||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  |||||      
T  27488361 ccacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacctgcgggccgatcttcaagc 27488460  T
Q  110 ttctcaaaatgaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgcc 209  Q
    | || | || ||| || ||| || | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  27488461 tacttagaaagaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccacc 27488560  T
Q  210 agtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
     |||||||||||||| ||||| ||||    
T  27488561 cgtggaaggaaggcctttgattatgt 27488586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 10 - 235
Target Start/End: Original strand, 29576242 - 29576467
Alignment:
Q  10 ccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaat 109  Q
    |||||||| || ||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  |||||      
T  29576242 ccacagacagagaagcaagtcagaggtttcctgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacctgcgggccgatcttcaagc 29576341  T
Q  110 ttctcaaaatgaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgcc 209  Q
    | || | || ||| || ||| || | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||||||||||||||||| ||    
T  29576342 tacttagaaagaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctactggaaccacctatccttgtccctcc 29576441  T
Q  210 agtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
     |||||||||||||| ||||| ||||    
T  29576442 cgtggaaggaaggcctttgatcatgt 29576467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 10 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 30554984 - 30554759
Alignment:
Q  10 ccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaat 109  Q
    |||||||| || ||||||||| |||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  |||||      
T  30554984 ccacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacctgcgggccgatcttcaagc 30554885  T
Q  110 ttctcaaaatgaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgcc 209  Q
    | || | || ||| || ||| || | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  30554884 tacttagaaagaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccacc 30554785  T
Q  210 agtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
     |||||||||||||| ||||| ||||    
T  30554784 cgtggaaggaaggcctttgattatgt 30554759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 32 - 235
Target Start/End: Original strand, 20171797 - 20172000
Alignment:
Q  32 gaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaatttctcaaaatgaatcaacctat 131  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  | ||||  | ||||||||| ||    
T  20171797 gaggtttcctcggacgtttgaattacatctctcgattcatatctcatatgaccgcgacctgcgggccaattttcaagctactcaggaagaatcaacccat 20171896  T
Q  132 tatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgccagtggaaggaaggcccttgatg 231  Q
    | |||||||  |||||||||| |||||||||||||| |||||   |||||||| ||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| |||||     
T  20171897 tgtgtggaacgatgaatgccaagaagcttttgatagtatcaagagttatctgcaggaaccacctatccttgtcccacccatggaaggaaggcctttgatt 20171996  T
Q  232 atgt 235  Q
    ||||    
T  20171997 atgt 20172000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 32 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 22164194 - 22163991
Alignment:
Q  32 gaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaatttctcaaaatgaatcaacctat 131  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  | ||||  | ||||||||| ||    
T  22164194 gaggtttcctcggacgtttgaattacatctctcgattcatatctcatatgaccgcgacctgcgggccaattttcaagctactcaggaagaatcaacccat 22164095  T
Q  132 tatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgccagtggaaggaaggcccttgatg 231  Q
    | |||||||  |||||||||| |||||||||||||| |||||   |||||||| ||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| |||||     
T  22164094 tgtgtggaacgatgaatgccaagaagcttttgatagtatcaagagttatctgcaggaaccacctatccttgtcccacccatggaaggaaggcctttgatt 22163995  T
Q  232 atgt 235  Q
    ||||    
T  22163994 atgt 22163991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 10 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 16940995 - 16940770
Alignment:
Q  10 ccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaat 109  Q
    |||||||| || ||||||||| |||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  |||||      
T  16940995 ccacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacctgcgggccgatcttcaagc 16940896  T
Q  110 ttctcaaaatgaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgcc 209  Q
    | || | || ||| || ||| || | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16940895 tacttagaaagaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccacc 16940796  T
Q  210 agtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
     ||||||||||| || ||||| ||||    
T  16940795 cgtggaaggaagacctttgattatgt 16940770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 10 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 26113380 - 26113155
Alignment:
Q  10 ccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaat 109  Q
    |||||||| || ||||||||| |||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |  |||||      
T  26113380 ccacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgactgcaacctgcgggccgatcttcaagc 26113281  T
Q  110 ttctcaaaatgaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgcc 209  Q
    | || | || ||| || ||| || | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  26113280 tacttagaaagaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccacc 26113181  T
Q  210 agtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
     |||||||||||||| ||||| ||||    
T  26113180 cgtggaaggaaggcctttgattatgt 26113155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 10 - 235
Target Start/End: Original strand, 28210682 - 28210907
Alignment:
Q  10 ccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaat 109  Q
    |||||||| || ||||||||| |||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |  |||||      
T  28210682 ccacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgactgcaacctgcgggccgatcttcaagc 28210781  T
Q  110 ttctcaaaatgaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgcc 209  Q
    | || | || ||| || ||| || | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  28210782 tacttagaaagaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccacc 28210881  T
Q  210 agtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
     |||||||||||||| ||||| ||||    
T  28210882 cgtggaaggaaggcctttgattatgt 28210907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 10 - 235
Target Start/End: Original strand, 4776108 - 4776333
Alignment:
Q  10 ccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaat 109  Q
    |||||||| || ||||||||| |||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |  |||||      
T  4776108 ccacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacctgtgggccgatcttcaagc 4776207  T
Q  110 ttctcaaaatgaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgcc 209  Q
    | || | || ||| || ||| || | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  4776208 tacttagaaagaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacttgctggaaccacctatccttgtccctcc 4776307  T
Q  210 agtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
     |||||||||||||| ||||| ||||    
T  4776308 cgtggaaggaaggcctttgattatgt 4776333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 120 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 22455972 - 22455857
Alignment:
Q  120 gaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgccagtggaagga 219  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||    
T  22455972 gaatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctattcttgtcccacccgtggaagga 22455873  T
Q  220 aggcccttgatgatgt 235  Q
    ||||| ||||| ||||    
T  22455872 aggcctttgattatgt 22455857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 83 - 235
Target Start/End: Original strand, 26992096 - 26992248
Alignment:
Q  83 ccgcaacctgcgggccaactttcaaatttctcaaaatgaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatct 182  Q
    |||||||||||||||| |  |||||  | |||| || |||||| |||||| | |||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||  |||| ||    
T  26992096 ccgcaacctgcgggccgatcttcaagctactcagaaagaatcagcctattctatggaatgatgaatgtcaagaagcttttgatagcatcaagaattacct 26992195  T
Q  183 gctggaaccacctatccttgtcccgccagtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||    
T  26992196 gctggaaccacctatccttgtcccacccgtggaaggaaggcctttgattatgt 26992248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 120 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 26775485 - 26775370
Alignment:
Q  120 gaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgccagtggaagga 219  Q
    |||||| |||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  26775485 gaatcagcctattgtatggaacgatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccacccgtggaagga 26775386  T
Q  220 aggcccttgatgatgt 235  Q
    ||||| ||||| ||||    
T  26775385 aggcctttgattatgt 26775370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 120 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 27358968 - 27358853
Alignment:
Q  120 gaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgccagtggaagga 219  Q
    |||||| |||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  27358968 gaatcagcctattgtatggaacgatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccacccgtggaagga 27358869  T
Q  220 aggcccttgatgatgt 235  Q
    ||||| ||||| ||||    
T  27358868 aggcctttgattatgt 27358853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 120 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 27449311 - 27449196
Alignment:
Q  120 gaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgccagtggaagga 219  Q
    |||||| |||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  27449311 gaatcagcctattgtatggaacgatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccacccgtggaagga 27449212  T
Q  220 aggcccttgatgatgt 235  Q
    ||||| ||||| ||||    
T  27449211 aggcctttgattatgt 27449196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 120 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 14142252 - 14142142
Alignment:
Q  120 gaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgccagtggaagga 219  Q
    |||||| |||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  14142252 gaatcagcctattgtatggaacgatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtccctcccgtggaagga 14142153  T
Q  220 aggcccttgat 230  Q
    ||||| |||||    
T  14142152 aggcctttgat 14142142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 120 - 230
Target Start/End: Original strand, 26789154 - 26789264
Alignment:
Q  120 gaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgccagtggaagga 219  Q
    |||||| |||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  26789154 gaatcagcctattgtatggaacgatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtccctcccgtggaagga 26789253  T
Q  220 aggcccttgat 230  Q
    ||||| |||||    
T  26789254 aggcctttgat 26789264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 120 - 230
Target Start/End: Original strand, 27197523 - 27197633
Alignment:
Q  120 gaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgccagtggaagga 219  Q
    |||||| |||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  27197523 gaatcagcctattgtatggaacgatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtccctcccgtggaagga 27197622  T
Q  220 aggcccttgat 230  Q
    ||||| |||||    
T  27197623 aggcctttgat 27197633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 120 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 27251712 - 27251602
Alignment:
Q  120 gaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgccagtggaagga 219  Q
    |||||| |||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  27251712 gaatcagcctattgtatggaacgatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtccctcccgtggaagga 27251613  T
Q  220 aggcccttgat 230  Q
    ||||| |||||    
T  27251612 aggcctttgat 27251602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 127 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 8902554 - 8902451
Alignment:
Q  127 cctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgccagtggaaggaaggccct 226  Q
    |||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   |||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |    
T  8902554 cctattgtatggaatgatgaatgccaggaagcttttgatagcatcatgaattacctgctggaaccacctatccttgtccctcccgtggaaggaaggcctt 8902455  T
Q  227 tgat 230  Q
    ||||    
T  8902454 tgat 8902451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 127 - 235
Target Start/End: Original strand, 28163836 - 28163944
Alignment:
Q  127 cctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgccagtggaaggaaggccct 226  Q
    |||||| | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |    
T  28163836 cctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccacccgtggaaggaagacctt 28163935  T
Q  227 tgatgatgt 235  Q
    |||| ||||    
T  28163936 tgattatgt 28163944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 136 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 33373273 - 33373174
Alignment:
Q  136 tggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgccagtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||    
T  33373273 tggaatgatgaatgccaagaagcttttgacagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccacccgtggaaggaaggcctttgattatgt 33373174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 120 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 13521049 - 13520940
Alignment:
Q  120 gaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgccagtggaagga 219  Q
    |||||| |||||| | |||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  13521049 gaatcagcctattgtatggaacgatgaatgcc-ggaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtccctcccgtggaagga 13520951  T
Q  220 aggcccttgat 230  Q
    ||||| |||||    
T  13520950 aggcctttgat 13520940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 130; Significance: 2e-67; HSPs: 53)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 10 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 15655680 - 15655455
Alignment:
Q  10 ccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaat 109  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  |||||      
T  15655680 ccacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagc 15655581  T
Q  110 ttctcaaaatgaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgcc 209  Q
    | |||| || |||||| || ||| | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15655580 tactcagaaagaatcagcccattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccgcc 15655481  T
Q  210 agtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
     |||||||||||||| ||||| ||||    
T  15655480 cgtggaaggaaggcctttgattatgt 15655455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 10 - 235
Target Start/End: Original strand, 41677943 - 41678168
Alignment:
Q  10 ccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaat 109  Q
    ||||||||||| ||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  ||||| |    
T  41677943 ccacagaccgagaagcaagttagaggtttcctcggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagt 41678042  T
Q  110 ttctcaaaatgaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgcc 209  Q
    | |||| || |||||| |||||| | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  41678043 tactcagaaagaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccacc 41678142  T
Q  210 agtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
     |||||||||||||| ||||| ||||    
T  41678143 cgtggaaggaaggcctttgattatgt 41678168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 10 - 235
Target Start/End: Original strand, 11552593 - 11552818
Alignment:
Q  10 ccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaat 109  Q
    |||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  |||||      
T  11552593 ccacagactgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagc 11552692  T
Q  110 ttctcaaaatgaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgcc 209  Q
    | |||| || |||||| ||| || | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  11552693 tactcagaaagaatcagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccacc 11552792  T
Q  210 agtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
     |||||||||||||| ||||| ||||    
T  11552793 cgtggaaggaaggcctttgattatgt 11552818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 10 - 235
Target Start/End: Original strand, 33295766 - 33295991
Alignment:
Q  10 ccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaat 109  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  |||||      
T  33295766 ccacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagc 33295865  T
Q  110 ttctcaaaatgaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgcc 209  Q
    | |||| || |||||| ||| || | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  33295866 tactcagaaagaatcagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccacc 33295965  T
Q  210 agtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
     |||||||||||||| ||||| ||||    
T  33295966 cgtggaaggaaggcctttgattatgt 33295991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 10 - 235
Target Start/End: Original strand, 33780727 - 33780952
Alignment:
Q  10 ccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaat 109  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  |||||      
T  33780727 ccacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagc 33780826  T
Q  110 ttctcaaaatgaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgcc 209  Q
    | |||| || |||||| |||||| | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||| || |||||||||||||| ||    
T  33780827 tactcagaaagaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggagccccctatccttgtcccacc 33780926  T
Q  210 agtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
     |||||||||||||| ||||| ||||    
T  33780927 cgtggaaggaaggcctttgattatgt 33780952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 10 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 22996039 - 22995814
Alignment:
Q  10 ccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaat 109  Q
    |||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  |||||      
T  22996039 ccacagactgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagc 22995940  T
Q  110 ttctcaaaatgaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgcc 209  Q
    | |||| || |||||| ||| || | |||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  22995939 tactcagaaagaatcagcctgttgtatggaatgatgaatgtcaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccacc 22995840  T
Q  210 agtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
     |||||||||||||| ||||| ||||    
T  22995839 cgtggaaggaaggcctttgattatgt 22995814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 10 - 235
Target Start/End: Original strand, 23629208 - 23629433
Alignment:
Q  10 ccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaat 109  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |  |||||      
T  23629208 ccacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctacgggccgatcttcaagc 23629307  T
Q  110 ttctcaaaatgaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgcc 209  Q
    | |||| || |||||| ||| || | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  23629308 tactcagaaagaatcagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccacc 23629407  T
Q  210 agtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
     |||||||||||||| ||||| ||||    
T  23629408 cgtggaaggaaggcctttgattatgt 23629433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 10 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 24685067 - 24684842
Alignment:
Q  10 ccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaat 109  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  || ||      
T  24685067 ccacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatctttaagc 24684968  T
Q  110 ttctcaaaatgaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgcc 209  Q
    | |||| || |||||| |||||| | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  24684967 tactcagaaagaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagagttacctgctggaaccacctatccttgtcccacc 24684868  T
Q  210 agtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
     |||||||||||||| ||||| ||||    
T  24684867 cgtggaaggaaggcctttgattatgt 24684842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 10 - 235
Target Start/End: Original strand, 24973144 - 24973369
Alignment:
Q  10 ccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaat 109  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  |||||      
T  24973144 ccacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcggacgcttaaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagc 24973243  T
Q  110 ttctcaaaatgaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgcc 209  Q
    | || | || |||||| |||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  24973244 tacttagaaagaatcagcctattgtatggaataatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccacc 24973343  T
Q  210 agtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
     |||||||||||||| ||||| ||||    
T  24973344 cgtggaaggaaggcctttgattatgt 24973369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 22 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 40470460 - 40470247
Alignment:
Q  22 aagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaatttctcaaaatga 121  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||  | || | || ||    
T  40470460 aagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagctgcttagaaaga 40470361  T
Q  122 atcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgccagtggaaggaag 221  Q
    | || |||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||| || |||||||||||||| || |||||||||||    
T  40470360 accagcctattgtatggaatgatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggagccccctatccttgtcccacccgtggaaggaag 40470261  T
Q  222 gcccttgatgatgt 235  Q
    ||| ||||| ||||    
T  40470260 gcctttgattatgt 40470247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 10 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 18372456 - 18372231
Alignment:
Q  10 ccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaat 109  Q
    |||||||| || ||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||      
T  18372456 ccacagacagagaagcaagtcagaggcttcctcggacgtttgaattacatctctcgattcatatctcacatgaccgcaacttgcgggccaatcttcaagc 18372357  T
Q  110 ttctcaaaatgaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgcc 209  Q
    | |||| || |||||| ||| || | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  18372356 tactcagaaagaatcagcctgttgtatggaatgatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccacc 18372257  T
Q  210 agtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
     |||||||||||||| ||||| ||||    
T  18372256 cgtggaaggaaggccgttgatcatgt 18372231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 10 - 235
Target Start/End: Original strand, 31434702 - 31434927
Alignment:
Q  10 ccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaat 109  Q
    |||||||| || ||||||||| |||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||      
T  31434702 ccacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacctgcgggccaatcttcaagc 31434801  T
Q  110 ttctcaaaatgaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgcc 209  Q
    | |||| || ||| || |||||| | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  31434802 tactcagaaagaaccagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccacc 31434901  T
Q  210 agtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
     |||||||||||||| ||||| ||||    
T  31434902 cgtggaaggaaggcctttgattatgt 31434927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 10 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 37355565 - 37355340
Alignment:
Q  10 ccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaat 109  Q
    |||||||| || ||||||||| |||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||      
T  37355565 ccacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaatcttcaagc 37355466  T
Q  110 ttctcaaaatgaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgcc 209  Q
    | |||| || ||| || ||| || | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  37355465 tactcagaaagaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccacc 37355366  T
Q  210 agtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
     |||||||||||||| ||||| ||||    
T  37355365 cgtggaaggaaggcctttgattatgt 37355340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 13 - 235
Target Start/End: Original strand, 23895447 - 23895669
Alignment:
Q  13 cagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaatttc 112  Q
    |||||||| || |||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  |||||  | |    
T  23895447 cagaccgagaaacaagtcagaggtttcctcggacgattgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagctac 23895546  T
Q  113 tcaaaatgaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgccagt 212  Q
    ||| || |||||| |||||| | |||||  |||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  23895547 tcagaaagaatcagcctattgtatggaacgatgaatgccaagaagcttatgatagcatcaaaaattacctgctggaaccacctatccttgtcccacccgt 23895646  T
Q  213 ggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    |||||||||||| ||||| ||||    
T  23895647 ggaaggaaggcctttgattatgt 23895669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 10 - 235
Target Start/End: Original strand, 3792779 - 3793004
Alignment:
Q  10 ccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaat 109  Q
    |||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |  |||||      
T  3792779 ccacagacagagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccggttcatatctcacatgaccgcaacctgtgggccgatcttcaagc 3792878  T
Q  110 ttctcaaaatgaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgcc 209  Q
    | |||| || |||||| ||| || | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||| || |||||||||||||| ||    
T  3792879 tactcagaaagaatcagcctgttgtatggaatgatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggagccccctatccttgtcccacc 3792978  T
Q  210 agtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
     |||||||||||||| ||||| ||||    
T  3792979 cgtggaaggaaggcctttgattatgt 3793004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 10 - 235
Target Start/End: Original strand, 9320714 - 9320939
Alignment:
Q  10 ccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaat 109  Q
    |||||||| || ||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |  |||||      
T  9320714 ccacagacagagaagcaagtcagaggcttcctcggacgtttgaattacatctctcgattcatatctcacatgaccgcaacttgcgggccgatcttcaagc 9320813  T
Q  110 ttctcaaaatgaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgcc 209  Q
    | ||||  | |||||| |||||| | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  9320814 tactcaggaagaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattatctgctggaaccacctatccttgtcccacc 9320913  T
Q  210 agtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
     |||||||||||||| ||||| ||||    
T  9320914 cgtggaaggaaggcctttgattatgt 9320939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 10 - 235
Target Start/End: Original strand, 12135413 - 12135638
Alignment:
Q  10 ccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaat 109  Q
    |||||||| || ||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |  |||||      
T  12135413 ccacagacagagaagcaagtcagaggcttcctcggacgtttgaattacatctctcgattcatatctcacatgaccgcaacttgcgggccgatcttcaagc 12135512  T
Q  110 ttctcaaaatgaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgcc 209  Q
    | ||||  | |||||| |||||| | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  12135513 tactcaggaagaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattatctgctggaaccacctatccttgtcccacc 12135612  T
Q  210 agtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
     |||||||||||||| ||||| ||||    
T  12135613 cgtggaaggaaggcctttgattatgt 12135638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 10 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 18497647 - 18497422
Alignment:
Q  10 ccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaat 109  Q
    |||||||| || || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  |||||      
T  18497647 ccacagacagagaaacaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagc 18497548  T
Q  110 ttctcaaaatgaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgcc 209  Q
    | || | || ||| || ||| || | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  18497547 tgcttagaaagaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccacc 18497448  T
Q  210 agtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
     |||||||||||||| ||||| ||||    
T  18497447 cgtggaaggaaggcctttgatcatgt 18497422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 10 - 235
Target Start/End: Original strand, 26483632 - 26483857
Alignment:
Q  10 ccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaat 109  Q
    |||||||| || ||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |  |||||      
T  26483632 ccacagacagagaagcaagtcagaggcttcctcggacgtttgaattacatctctcgattcatatctcacatgaccgcaacttgcgggccgatcttcaagc 26483731  T
Q  110 ttctcaaaatgaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgcc 209  Q
    | ||||  | |||||| |||||| | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  26483732 tactcaggaagaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattatctgctggaaccacctatccttgtcccacc 26483831  T
Q  210 agtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
     |||||||||||||| ||||| ||||    
T  26483832 cgtggaaggaaggcctttgattatgt 26483857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 10 - 230
Target Start/End: Original strand, 43081493 - 43081713
Alignment:
Q  10 ccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaat 109  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  |||||      
T  43081493 ccacagaccgagaagcaagtcagaggcttcctcggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagc 43081592  T
Q  110 ttctcaaaatgaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgcc 209  Q
    | || | || ||| || ||| || | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  43081593 tacttagaaagaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccacc 43081692  T
Q  210 agtggaaggaaggcccttgat 230  Q
     |||||||||||||| |||||    
T  43081693 cgtggaaggaaggcctttgat 43081713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 10 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 13321752 - 13321527
Alignment:
Q  10 ccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaat 109  Q
    |||||||| || ||||||||| |||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||| |    
T  13321752 ccacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacctgcgggccgatcttcaagt 13321653  T
Q  110 ttctcaaaatgaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgcc 209  Q
    | || | || ||| || ||| || | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  13321652 tacttagaaagaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtccctcc 13321553  T
Q  210 agtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
     |||||||||||||| ||||| ||||    
T  13321552 cgtggaaggaaggcctttgattatgt 13321527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 10 - 235
Target Start/End: Original strand, 28652480 - 28652705
Alignment:
Q  10 ccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaat 109  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  |||||      
T  28652480 ccacagaccgagaagcaagtcagaggcttcctcggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagc 28652579  T
Q  110 ttctcaaaatgaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgcc 209  Q
    | || | || ||| || ||| || | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  28652580 tacttagaaagaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacttgctggaaccacctatccttgtcccacc 28652679  T
Q  210 agtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
     |||||||||||||| ||||| ||||    
T  28652680 cgtggaaggaaggcctttgattatgt 28652705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 10 - 235
Target Start/End: Original strand, 30032666 - 30032891
Alignment:
Q  10 ccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaat 109  Q
    |||||||| || ||||||||| |||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || ||      
T  30032666 ccacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccgatctttaagc 30032765  T
Q  110 ttctcaaaatgaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgcc 209  Q
    | || | || ||| || |||||| | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  30032766 tgcttagaaagaaccagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccacc 30032865  T
Q  210 agtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
     |||||||||||||| ||||| ||||    
T  30032866 cgtggaaggaaggcctttgattatgt 30032891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 10 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 37767913 - 37767688
Alignment:
Q  10 ccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaat 109  Q
    |||||||| || ||||||||| |||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||     
T  37767913 ccacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacctgcgggccgatcttcaaac 37767814  T
Q  110 ttctcaaaatgaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgcc 209  Q
    | || | || ||| || ||| || | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  37767813 tacttagaaagaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccacc 37767714  T
Q  210 agtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
     |||||||||||||| ||||| ||||    
T  37767713 cgtggaaggaaggcctttgattatgt 37767688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 10 - 235
Target Start/End: Original strand, 6877543 - 6877768
Alignment:
Q  10 ccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaat 109  Q
    |||||||| || ||||||||| |||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||| |    
T  6877543 ccacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacctgcgggccgatcttcaagt 6877642  T
Q  110 ttctcaaaatgaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgcc 209  Q
    | || | || ||| || ||| || | ||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  6877643 tacttagaaagaaccagcctgttgtatgggatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccacc 6877742  T
Q  210 agtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
     |||||||||||||| ||||| ||||    
T  6877743 cgtggaaggaaggccgttgatcatgt 6877768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 10 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 8662397 - 8662172
Alignment:
Q  10 ccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaat 109  Q
    |||||||| || ||||||||| |||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  |||||      
T  8662397 ccacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacctgcgggccgatcttcaagc 8662298  T
Q  110 ttctcaaaatgaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgcc 209  Q
    | || | || ||| || ||| || | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  8662297 tacttagaaagaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccacc 8662198  T
Q  210 agtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
     |||||||||||||| ||||| ||||    
T  8662197 cgtggaaggaaggcctttgattatgt 8662172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 10 - 235
Target Start/End: Original strand, 24586612 - 24586837
Alignment:
Q  10 ccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaat 109  Q
    |||||||| || ||||||||| |||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  |||||      
T  24586612 ccacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacctgcgggccgatcttcaagc 24586711  T
Q  110 ttctcaaaatgaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgcc 209  Q
    | || | || ||| || ||| || | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  24586712 tacttagaaagaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtccctcc 24586811  T
Q  210 agtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
     |||||||||||||| ||||| ||||    
T  24586812 cgtggaaggaaggcctttgattatgt 24586837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 10 - 235
Target Start/End: Original strand, 30155269 - 30155494
Alignment:
Q  10 ccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaat 109  Q
    |||||||| || ||||||||| |||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  |||||      
T  30155269 ccacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacctgcgggccgatcttcaagc 30155368  T
Q  110 ttctcaaaatgaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgcc 209  Q
    | || | || ||| || ||| || | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  30155369 tacttagaaagaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccacc 30155468  T
Q  210 agtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
     |||||||||||||| ||||| ||||    
T  30155469 cgtggaaggaaggcctttgattatgt 30155494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 10 - 235
Target Start/End: Original strand, 30171707 - 30171932
Alignment:
Q  10 ccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaat 109  Q
    |||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |  |||||      
T  30171707 ccacagacagagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccggttcatatctcacatgaccgcaacctgtgggccgatcttcaagc 30171806  T
Q  110 ttctcaaaatgaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgcc 209  Q
    | || | ||  || || |||||| | |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  30171807 tgcttagaaaaaaccagcctattgtatggaatgatgagtgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccacc 30171906  T
Q  210 agtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
     |||||||||||||| ||||| ||||    
T  30171907 cgtggaaggaaggccgttgatcatgt 30171932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 10 - 235
Target Start/End: Original strand, 30937873 - 30938098
Alignment:
Q  10 ccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaat 109  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  |||||      
T  30937873 ccacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagc 30937972  T
Q  110 ttctcaaaatgaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgcc 209  Q
    | || |  | |||||| |||||| | |||||  |||||||||| |||||||||||||||| |||   ||| ||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  30937973 tactgaggaagaatcagcctattgtatggaacgatgaatgccaagaagcttttgatagcaccaagagttacctgctggaaccacatatccttgtcccacc 30938072  T
Q  210 agtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
     |||||||||||||| ||||| ||||    
T  30938073 cgtggaaggaaggcctttgattatgt 30938098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 10 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 31823329 - 31823104
Alignment:
Q  10 ccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaat 109  Q
    |||||||| || ||||||||| |||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  |||||      
T  31823329 ccacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacctgcgggccgatcttcaagc 31823230  T
Q  110 ttctcaaaatgaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgcc 209  Q
    | || | || ||| || ||| || | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  31823229 tacttagaaagaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtccctcc 31823130  T
Q  210 agtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
     |||||||||||||| ||||| ||||    
T  31823129 cgtggaaggaaggcctttgattatgt 31823104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 10 - 235
Target Start/End: Original strand, 33519618 - 33519843
Alignment:
Q  10 ccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaat 109  Q
    |||||||| || ||||||||| |||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  |||||      
T  33519618 ccacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacctgcgggccgatcttcaagc 33519717  T
Q  110 ttctcaaaatgaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgcc 209  Q
    | || | || ||| || ||| || | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  33519718 tacttagaaagaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccacc 33519817  T
Q  210 agtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
     |||||||||||||| ||||| ||||    
T  33519818 cgtggaaggaaggcctttgattatgt 33519843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 10 - 235
Target Start/End: Original strand, 34619756 - 34619981
Alignment:
Q  10 ccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaat 109  Q
    |||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |  |||||      
T  34619756 ccacagacagagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccggttcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagc 34619855  T
Q  110 ttctcaaaatgaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgcc 209  Q
    | |||| || ||| || ||| || | |||||| |||||||||| || |||||||||||||||||  ||||  || |||||||||||||||||||||| ||    
T  34619856 tactcagaaagaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaggcttttgatagcatcaagaattacttgttggaaccacctatccttgtcccacc 34619955  T
Q  210 agtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
     |||||||||||||| ||||| ||||    
T  34619956 cgtggaaggaaggcctttgattatgt 34619981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 10 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 37668408 - 37668183
Alignment:
Q  10 ccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaat 109  Q
    |||||||| || ||||||||| |||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  |||||      
T  37668408 ccacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacctgcgggccgatcttcaagc 37668309  T
Q  110 ttctcaaaatgaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgcc 209  Q
    | || | || ||| || ||| || | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  37668308 tacttagaaagaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccacc 37668209  T
Q  210 agtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
     |||||||||||||| ||||| ||||    
T  37668208 cgtggaaggaaggcctttgattatgt 37668183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 10 - 235
Target Start/End: Original strand, 37758221 - 37758446
Alignment:
Q  10 ccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaat 109  Q
    |||||||| || ||||||||| |||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  |||||      
T  37758221 ccacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacctgcgggccgatcttcaagc 37758320  T
Q  110 ttctcaaaatgaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgcc 209  Q
    | || | || ||| || ||| || | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  37758321 tacttagaaagaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccacc 37758420  T
Q  210 agtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
     |||||||||||||| ||||| ||||    
T  37758421 cgtggaaggaaggcctttgattatgt 37758446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 16 - 235
Target Start/End: Original strand, 22891707 - 22891926
Alignment:
Q  16 accgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaatttctca 115  Q
    ||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || |  |||||  | ||||    
T  22891707 accgagaaacaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctctcgattcatatctcacatgaccgcaacctgcggcccgatcttcaagctactca 22891806  T
Q  116 aaatgaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgccagtgga 215  Q
      | |||||| |||||| | |||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  22891807 ggaagaatcagcctattgtatggaacgatgaatgccaaggagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccacccgtgga 22891906  T
Q  216 aggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    ||||||||| ||||| ||||    
T  22891907 aggaaggcctttgattatgt 22891926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 13 - 235
Target Start/End: Original strand, 25203519 - 25203741
Alignment:
Q  13 cagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaatttc 112  Q
    |||||||| || |||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  |||||  | |    
T  25203519 cagaccgagaaacaagtcagaggtttcctcggacgattgaattacatctcccgattcatatctcacatgactgcaacctgcgggccaatcttcaagctac 25203618  T
Q  113 tcaaaatgaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgccagt 212  Q
    |||  | |||||| |||||| | |||||  |||| ||||| | ||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  25203619 tcaggaagaatcagcctattgtatggaacgatgactgccaaggagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccacccgt 25203718  T
Q  213 ggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    |||||||||||| ||||| ||||    
T  25203719 ggaaggaaggcctttgattatgt 25203741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 13 - 235
Target Start/End: Original strand, 25267674 - 25267896
Alignment:
Q  13 cagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaatttc 112  Q
    |||||||| || |||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  |||||  | |    
T  25267674 cagaccgagaaacaagtcagaggtttcctcggacgattgaattacatctcccgattcatatctcacatgactgcaacctgcgggccaatcttcaagctac 25267773  T
Q  113 tcaaaatgaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgccagt 212  Q
    |||  | |||||| |||||| | |||||  |||| ||||| | ||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  25267774 tcaggaagaatcagcctattgtatggaacgatgactgccaaggagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccacccgt 25267873  T
Q  213 ggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    |||||||||||| ||||| ||||    
T  25267874 ggaaggaaggcctttgattatgt 25267896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 22 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 15755762 - 15755549
Alignment:
Q  22 aagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaatttctcaaaatga 121  Q
    ||||||||| |||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  |||||  | || | || ||    
T  15755762 aagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacctgcgggccgatcttcaagctacttagaaaga 15755663  T
Q  122 atcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgccagtggaaggaag 221  Q
    | || ||| || | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  15755662 accagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccacccgtggaaggaag 15755563  T
Q  222 gcccttgatgatgt 235  Q
    ||| ||||| ||||    
T  15755562 gcctttgatcatgt 15755549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 10 - 235
Target Start/End: Original strand, 24727207 - 24727432
Alignment:
Q  10 ccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaat 109  Q
    |||||||| || ||||||||| |||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  |||||      
T  24727207 ccacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacctgcgggccgatcttcaagc 24727306  T
Q  110 ttctcaaaatgaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgcc 209  Q
    | || | || ||| || ||| || | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||||||||||||||||| ||    
T  24727307 tacttagaaagaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctactggaaccacctatccttgtccctcc 24727406  T
Q  210 agtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
     |||||||||||||| ||||| ||||    
T  24727407 cgtggaaggaaggcctttgatcatgt 24727432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 10 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 32593196 - 32592971
Alignment:
Q  10 ccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaat 109  Q
    |||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| |  |||||      
T  32593196 ccacagacagagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctctcggttcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagc 32593097  T
Q  110 ttctcaaaatgaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgcc 209  Q
    | |||| || ||| || ||| || | |||||| |||||||||| || |||||||||||||||||  ||||  || |||||||||||||||||||||| ||    
T  32593096 tactcagaaagaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaggcttttgatagcatcaagaattacttgttggaaccacctatccttgtcccacc 32592997  T
Q  210 agtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
     |||||||||||||| ||||| ||||    
T  32592996 cgtggaaggaaggcctttgattatgt 32592971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 10 - 235
Target Start/End: Original strand, 5641026 - 5641251
Alignment:
Q  10 ccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaat 109  Q
    |||||||| || ||||||||| |||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  |||||      
T  5641026 ccacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacctgcgggccgatcttcaagc 5641125  T
Q  110 ttctcaaaatgaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgcc 209  Q
    | || | || ||| || ||| || | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||  || |||||||||||||||||||||| ||    
T  5641126 tacttagaaagaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacttgttggaaccacctatccttgtcccacc 5641225  T
Q  210 agtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
     |||||||||||||| ||||| ||||    
T  5641226 cgtggaaggaaggcctttgatcatgt 5641251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 10 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 28956707 - 28956482
Alignment:
Q  10 ccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaat 109  Q
    |||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |  |||||      
T  28956707 ccacagacagagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccggttcatatctcacatgaccgcaacctgtgggccgatcttcaagc 28956608  T
Q  110 ttctcaaaatgaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgcc 209  Q
    | || | ||  || || |||||| | |||||| |||||||||| || |||||||||||||||||  ||||  || |||||||||||||||||||||| ||    
T  28956607 tgcttagaaaaaaccagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaggcttttgatagcatcaagaattacttgttggaaccacctatccttgtcccacc 28956508  T
Q  210 agtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
     |||||||||||||| ||||| ||||    
T  28956507 cgtggaaggaaggcctttgattatgt 28956482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 10 - 235
Target Start/End: Original strand, 2514300 - 2514525
Alignment:
Q  10 ccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaat 109  Q
    |||||||| || ||||||||| |||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  |||||      
T  2514300 ccacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagc 2514399  T
Q  110 ttctcaaaatgaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgcc 209  Q
    | |||| || ||| || ||| || | |||||| |||||||||| || |||||||||||||||||   |||  || |||||||||||||||||||||| ||    
T  2514400 tactcagaaagaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaggcttttgatagcatcaagagttacttgttggaaccacctatccttgtcccacc 2514499  T
Q  210 agtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
     |||||||||||||| ||||| ||||    
T  2514500 cgtggaaggaaggcctttgattatgt 2514525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 120 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 18125228 - 18125113
Alignment:
Q  120 gaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgccagtggaagga 219  Q
    |||||| |||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  18125228 gaatcagcctattgtatggaacgatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtccctcccgtggaagga 18125129  T
Q  220 aggcccttgatgatgt 235  Q
    ||||| ||||| ||||    
T  18125128 aggcctttgattatgt 18125113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 121 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 13439494 - 13439380
Alignment:
Q  121 aatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgccagtggaaggaa 220  Q
    ||||| |||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  13439494 aatcagcctattgtatggaacgatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccacccgtggaaggaa 13439395  T
Q  221 ggcccttgatgatgt 235  Q
    |||| ||||| ||||    
T  13439394 ggcctttgattatgt 13439380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 120 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 9547521 - 9547411
Alignment:
Q  120 gaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgccagtggaagga 219  Q
    |||||| |||||| | |||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  9547521 gaatcagcctattgtatggaacgatgaatgccaggaagcttttgatagtatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtccctcccgtggaagga 9547422  T
Q  220 aggcccttgat 230  Q
    ||||| |||||    
T  9547421 aggcctttgat 9547411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 120 - 230
Target Start/End: Original strand, 11326985 - 11327095
Alignment:
Q  120 gaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgccagtggaagga 219  Q
    ||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||||    
T  11326985 gaatcaacctattgtatggaacgatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaagaattacctgctagaaccacctatccttgtccctcccatggaagga 11327084  T
Q  220 aggcccttgat 230  Q
    ||||| |||||    
T  11327085 aggcctttgat 11327095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 120 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 13183605 - 13183490
Alignment:
Q  120 gaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgccagtggaagga 219  Q
    |||||| |||||| | |||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  13183605 gaatcagcctattgtatggaacgatgaattccaggaagcttttgatagcatcaagaattacctgttggaaccacctatccttgtcccacccgtggaagga 13183506  T
Q  220 aggcccttgatgatgt 235  Q
    ||||| ||||| ||||    
T  13183505 aggcctttgattatgt 13183490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 120 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 29888009 - 29887899
Alignment:
Q  120 gaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgccagtggaagga 219  Q
    |||||| |||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||| |  | |||||||||    
T  29888009 gaatcagcctattgtatggaacgatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtctcatccgtggaagga 29887910  T
Q  220 aggcccttgat 230  Q
    ||||| |||||    
T  29887909 aggcctttgat 29887899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 120 - 230
Target Start/End: Original strand, 33878479 - 33878588
Alignment:
Q  120 gaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgccagtggaagga 219  Q
    |||||| |||||| | |||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  33878479 gaatcagcctattgtatggaacgatgaatgcc-ggaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtccctcccgtggaagga 33878577  T
Q  220 aggcccttgat 230  Q
    ||||| |||||    
T  33878578 aggcctttgat 33878588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 351999 - 351912
Alignment:
Q  148 tgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgccagtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||  ||| || | ||||| || || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||    
T  351999 tgccagaaagcttttgatagcatcaaagggtatttgttagaacctccgattcttgtccctccagttgaaggaaggcctttgatcatgt 351912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 50 - 98
Target Start/End: Original strand, 34468900 - 34468948
Alignment:
Q  50 tgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggcc 98  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || |||||    
T  34468900 tgaattacatctcccgtttcatttctcatatgactgcaacatgtgggcc 34468948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 127; Significance: 1e-65; HSPs: 3)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 13 - 235
Target Start/End: Original strand, 3301 - 3523
Alignment:
Q  13 cagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaatttc 112  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  |||||  | |    
T  3301 cagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagctac 3400  T
Q  113 tcaaaatgaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgccagt 212  Q
    ||| || |||||| |||||| | |||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  3401 tcagaaagaatcagcctattgtatggaacgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccacccgt 3500  T
Q  213 ggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    |||||||||||| ||||| ||||    
T  3501 ggaaggaaggcctttgattatgt 3523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #2
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 10 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 44016 - 43877
Alignment:
Q  10 ccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaat 109  Q
    ||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||      
T  44016 ccacagacccagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagc 43917  T
Q  110 ttctcaaaatgaatcaacctattatgtggaataatgaatg 149  Q
    | |||| || |||||| |||||| | |||||| |||||||    
T  43916 tactcagaaagaatcagcctattgtatggaatgatgaatg 43877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #3
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 13 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 32167 - 32096
Alignment:
Q  13 cagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgacc 84  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  32167 cagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgacc 32096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0418 (Bit Score: 126; Significance: 4e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0418
Description:

Target: scaffold0418; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 10 - 235
Target Start/End: Original strand, 9267 - 9492
Alignment:
Q  10 ccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaat 109  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||      
T  9267 ccacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagc 9366  T
Q  110 ttctcaaaatgaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgcc 209  Q
    | |||| || |||||| ||| || | |||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  9367 tactcagaaagaatcagcctgttgtatggaatgatgaatgtcaagaagcttttgatagcatcaagagttacctgctggaaccacctatccttgtcccacc 9466  T
Q  210 agtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
     |||||||||||||| ||||| ||||    
T  9467 cgtggaaggaaggcctttgattatgt 9492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143 (Bit Score: 126; Significance: 4e-65; HSPs: 3)
Name: scaffold0143
Description:

Target: scaffold0143; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 10 - 235
Target Start/End: Original strand, 30524 - 30749
Alignment:
Q  10 ccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaat 109  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  |||||      
T  30524 ccacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagc 30623  T
Q  110 ttctcaaaatgaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgcc 209  Q
    | |||| || |||||| ||| || | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  30624 tactcagaaagaatcagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccacc 30723  T
Q  210 agtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
     |||||||||||||| ||||| ||||    
T  30724 cgtggaaggaaggcctttgattatgt 30749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143; HSP #2
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 13 - 235
Target Start/End: Original strand, 19304 - 19526
Alignment:
Q  13 cagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaatttc 112  Q
    |||||||| || |||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||  | |    
T  19304 cagaccgagaaacaagttagaggtttcctcgggcgattgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagctac 19403  T
Q  113 tcaaaatgaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgccagt 212  Q
    |||  | |||||| |||||| | |||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||| || ||    
T  19404 tcaggaagaatcagcctattgtatggaacgatgaatgccaaggagcttttgatagcatcaagaattacctgttggaaccacctatccttgtcccacccgt 19503  T
Q  213 ggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    |||||||||||| ||||| ||||    
T  19504 ggaaggaaggcctttgattatgt 19526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143; HSP #3
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 120 - 235
Target Start/End: Original strand, 7301 - 7416
Alignment:
Q  120 gaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgccagtggaagga 219  Q
    |||||| |||||| | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  7301 gaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattatctgctggaaccacctatccttgtcccacccgtggaagga 7400  T
Q  220 aggcccttgatgatgt 235  Q
    ||||| ||||| ||||    
T  7401 aggcctttgattatgt 7416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 122; Significance: 1e-62; HSPs: 11)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 22 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 21894762 - 21894549
Alignment:
Q  22 aagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaatttctcaaaatga 121  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  |||||  | || | || ||    
T  21894762 aagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagctacttagaaaga 21894663  T
Q  122 atcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgccagtggaaggaag 221  Q
    |||| |||||| | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  21894662 atcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccacccgtggaaggaag 21894563  T
Q  222 gcccttgatgatgt 235  Q
    ||| ||||| ||||    
T  21894562 gcctttgattatgt 21894549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 10 - 235
Target Start/End: Original strand, 51641451 - 51641676
Alignment:
Q  10 ccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaat 109  Q
    |||||||| || ||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||      
T  51641451 ccacagacagagaagcaagtcagaggcttcctcggacgtttgaattacatctctcgattcatatctcacatgaccgcaacttgcgggccaatcttcaagc 51641550  T
Q  110 ttctcaaaatgaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgcc 209  Q
    | |||| || |||||| ||| || | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  51641551 tactcagaaagaatcagcctgttgtatggaatgatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccacc 51641650  T
Q  210 agtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
     |||||||||||||| ||||| ||||    
T  51641651 cgtggaaggaaggccgttgatcatgt 51641676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 16 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 20339320 - 20339101
Alignment:
Q  16 accgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaatttctca 115  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  |||||  | ||||    
T  20339320 accgaaaagcaagtcagaggtttcctcgggcgattgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagctactca 20339221  T
Q  116 aaatgaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgccagtgga 215  Q
      | |||||| |||||| | |||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||||    
T  20339220 ggaagaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaaggagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaacctcctatccttgtcccacccgtgga 20339121  T
Q  216 aggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    ||||||||| ||||| ||||    
T  20339120 aggaaggcctttgattatgt 20339101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 22 - 235
Target Start/End: Original strand, 10965910 - 10966123
Alignment:
Q  22 aagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaatttctcaaaatga 121  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||  |||||  | ||||  | ||    
T  10965910 aagcaagtcagaggtttcctcggacgtttgaattacatctctcgattcatatctcacatgaccgcaacctgtgggccaatcttcaagctactcaggaaga 10966009  T
Q  122 atcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgccagtggaaggaag 221  Q
    |||| ||| || | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  10966010 atcagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattatctgctggaaccacctatccttgtcccacccgtggaaggaag 10966109  T
Q  222 gcccttgatgatgt 235  Q
    ||| ||||| ||||    
T  10966110 gcctttgattatgt 10966123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 10 - 235
Target Start/End: Original strand, 28588218 - 28588443
Alignment:
Q  10 ccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaat 109  Q
    |||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||      
T  28588218 ccacagacagagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtctgaattacatctcccggttcatatctcatatgaccgcaacctgtgggccgattttcaagc 28588317  T
Q  110 ttctcaaaatgaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgcc 209  Q
    | || | || ||| || ||| || | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  28588318 tgcttagaaagaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccacc 28588417  T
Q  210 agtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
     |||||||||||||| ||||| ||||    
T  28588418 cgtggaaggaaggcctttgatcatgt 28588443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 10 - 235
Target Start/End: Original strand, 3644365 - 3644593
Alignment:
Q  10 ccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaat 109  Q
    |||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||      
T  3644365 ccacagacagagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagc 3644464  T
Q  110 ttctca-aaatgaatcaacctattatgtggaataatgaatgcc-aggaagcttttgatagcatcaaag-attatctgctggaaccacctatccttgtccc 206  Q
    | || | ||| |||||| |||||| | |||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||||||||||    
T  3644465 tgcttagaaaagaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaaagaagcttttgatagcatcaaagaattacttgttggaaccacctatccttgtccc 3644564  T
Q  207 gccagtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
     || |||||||||||||| ||||| ||||    
T  3644565 acccgtggaaggaaggcctttgattatgt 3644593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 10 - 235
Target Start/End: Original strand, 10948310 - 10948535
Alignment:
Q  10 ccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaat 109  Q
    |||||||| || ||||||||| |||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  |||||      
T  10948310 ccacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacctgcgggccgatcttcaagc 10948409  T
Q  110 ttctcaaaatgaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgcc 209  Q
    | || | || ||| || ||| || | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  10948410 tacttagaaagaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccacc 10948509  T
Q  210 agtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
     |||||||||||||| ||||| ||||    
T  10948510 cgtggaaggaaggcctttgattatgt 10948535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 22 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 41790323 - 41790110
Alignment:
Q  22 aagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaatttctcaaaatga 121  Q
    ||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |  |||||  | || | || ||    
T  41790323 aagcaagtcagaggcttcctcggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgtgggccgatcttcaagctacttagaaaga 41790224  T
Q  122 atcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgccagtggaaggaag 221  Q
    | || ||| || | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  41790223 accagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattatctgctggaaccacctatccttgtcccacccgtggaaggaag 41790124  T
Q  222 gcccttgatgatgt 235  Q
    ||| ||||| ||||    
T  41790123 gcctttgattatgt 41790110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 16205055 - 16204834
Alignment:
Q  14 agaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaatttct 113  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  |||||  | ||    
T  16205055 agaccgagaagcaagtcagaggtttcctcagacgattgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagctact 16204956  T
Q  114 caaaatgaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgccagtg 213  Q
    ||  | |||||| |||||| | |||||  |||| |||||   ||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  16204955 caggaagaatcagcctattgtatggaacgatgactgccaaagagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccacccgtg 16204856  T
Q  214 gaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    ||||||||||| ||||| ||||    
T  16204855 gaaggaaggcctttgattatgt 16204834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 13 - 221
Target Start/End: Original strand, 20464212 - 20464420
Alignment:
Q  13 cagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaatttc 112  Q
    |||||||| || |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |  |||||  | |    
T  20464212 cagaccgagaaacaagtctgaggtttcctcgggcgattgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctacgggccgatcttcaagctac 20464311  T
Q  113 tcaaaatgaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgccagt 212  Q
    |||  | |||||| |||||| | |||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||  |||| ||||||||| |||||||||||||||| || ||    
T  20464312 tcaggaagaatcagcctattgtatggaacgatgaatgccaaggagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaacacctatccttgtcccacccgt 20464411  T
Q  213 ggaaggaag 221  Q
    |||||||||    
T  20464412 ggaaggaag 20464420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 120 - 230
Target Start/End: Original strand, 28153079 - 28153189
Alignment:
Q  120 gaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgccagtggaagga 219  Q
    |||||| |||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  28153079 gaatcagcctattgtatggaacgatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtccctcccgtggaagga 28153178  T
Q  220 aggcccttgat 230  Q
    ||||| |||||    
T  28153179 aggcctttgat 28153189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 118; Significance: 3e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 10 - 235
Target Start/End: Original strand, 15812 - 16037
Alignment:
Q  10 ccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaat 109  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |  |||||      
T  15812 ccacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgtgggccgatcttcaagc 15911  T
Q  110 ttctcaaaatgaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgcc 209  Q
    | || | || ||| || ||| || | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  15912 tacttagaaagaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattatctgctggaaccacctatccttgtcccacc 16011  T
Q  210 agtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
     |||||||||||||| ||||| ||||    
T  16012 cgtggaaggaaggcctttgattatgt 16037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0260 (Bit Score: 116; Significance: 4e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0260
Description:

Target: scaffold0260; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 16 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 1643 - 1424
Alignment:
Q  16 accgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaatttctca 115  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  |||||  | ||||    
T  1643 accgaaaagcaagtcagaggtttcctcgggcgattgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagctactca 1544  T
Q  116 aaatgaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgccagtgga 215  Q
      | |||||| |||||| | |||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||||    
T  1543 ggaagaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaaggagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaacctcctatccttgtcccacccgtgga 1444  T
Q  216 aggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    ||||||||| ||||| ||||    
T  1443 aggaaggcctttgattatgt 1424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0144 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0144
Description:

Target: scaffold0144; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 10 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 23216 - 22991
Alignment:
Q  10 ccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaat 109  Q
    |||||||| || ||||||||| |||||||| | || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||      
T  23216 ccacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctctcgattcatatctcatatgactgcaacttgcgggccaatcttcaagc 23117  T
Q  110 ttctcaaaatgaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgcc 209  Q
    | ||||  | |||||| |||||| | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  23116 tactcaggaagaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccacc 23017  T
Q  210 agtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
     |||||||||||||| ||||| ||||    
T  23016 cgtggaaggaaggcctttgattatgt 22991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0415 (Bit Score: 106; Significance: 4e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0415
Description:

Target: scaffold0415; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 10 - 235
Target Start/End: Original strand, 9253 - 9478
Alignment:
Q  10 ccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaat 109  Q
    |||||||| || ||||||||| |||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  |||||      
T  9253 ccacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacctgcgggccgatcttcaagc 9352  T
Q  110 ttctcaaaatgaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgcc 209  Q
    | || | || ||| || ||| || | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  9353 tacttagaaagaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccacc 9452  T
Q  210 agtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
     |||||||||||||| ||||| ||||    
T  9453 cgtggaaggaaggcctttgattatgt 9478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0336 (Bit Score: 106; Significance: 4e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0336
Description:

Target: scaffold0336; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 10 - 235
Target Start/End: Original strand, 12802 - 13027
Alignment:
Q  10 ccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaat 109  Q
    |||||||| || ||||||||| |||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||      
T  12802 ccacagacagagaagcaagtcagaggtttcctgggacgcttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccaatcttcaagc 12901  T
Q  110 ttctcaaaatgaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgcc 209  Q
    | |||| ||  || || ||| || | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  12902 tactcagaaaaaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttatcccacc 13001  T
Q  210 agtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
     |||||||||||||| ||||| ||||    
T  13002 cgtggaaggaaggcctttgatcatgt 13027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0237 (Bit Score: 106; Significance: 4e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0237
Description:

Target: scaffold0237; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 10 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 11953 - 11728
Alignment:
Q  10 ccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaat 109  Q
    |||||||| || ||||||||| |||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  |||||      
T  11953 ccacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacctgcgggccgatcttcaagc 11854  T
Q  110 ttctcaaaatgaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgcc 209  Q
    | || | || ||| || ||| || | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  11853 tacttagaaagaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccacc 11754  T
Q  210 agtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
     |||||||||||||| ||||| ||||    
T  11753 cgtggaaggaaggcctttgattatgt 11728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 102; Significance: 9e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 10 - 235
Target Start/End: Original strand, 11180 - 11405
Alignment:
Q  10 ccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaat 109  Q
    |||||||| || ||||||||| |||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |  |||||      
T  11180 ccacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgactgcaacctgcgggccgatcttcaagc 11279  T
Q  110 ttctcaaaatgaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgcc 209  Q
    | || | || ||| || ||| || | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  11280 tacttagaaagaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccacc 11379  T
Q  210 agtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
     |||||||||||||| ||||| ||||    
T  11380 cgtggaaggaaggcctttgattatgt 11405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159 (Bit Score: 94; Significance: 5e-46; HSPs: 2)
Name: scaffold0159
Description:

Target: scaffold0159; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 10 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 6204 - 5979
Alignment:
Q  10 ccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaat 109  Q
    |||||||| || ||||||||| |||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  |||||      
T  6204 ccacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagc 6105  T
Q  110 ttctcaaaatgaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgcc 209  Q
    | |||| || ||| || ||| || | |||||| |||||||||| || ||||||||||| |||||  ||||  || |||||||||||||||||||||| ||    
T  6104 tactcagaaagaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaggcttttgatagtatcaagaattacttgttggaaccacctatccttgtcccacc 6005  T
Q  210 agtggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
     |||||||||||||| ||||| ||||    
T  6004 cgtggaaggaaggccgttgatcatgt 5979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 10 - 83
Target Start/End: Original strand, 23110 - 23183
Alignment:
Q  10 ccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgac 83  Q
    |||||||| || ||||||||| |||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23110 ccacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgac 23183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322 (Bit Score: 91; Significance: 3e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0322
Description:

Target: scaffold0322; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 13 - 235
Target Start/End: Original strand, 9279 - 9501
Alignment:
Q  13 cagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaatttc 112  Q
    |||||||| || |||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  ||||| || |    
T  9279 cagaccgagaaacaagtcagaggcttcctcgggcgattgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagttac 9378  T
Q  113 tcaaaatgaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgccagt 212  Q
    ||   | |||||| |||||| | |||||  ||||||| || |  |||||||||| ||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| |  ||    
T  9379 tctggaagaatcagcctattgtatggaacgatgaatgtcaaggggcttttgataacatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccacttgt 9478  T
Q  213 ggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    |||||||||||| ||||| ||||    
T  9479 ggaaggaaggcctttgattatgt 9501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0748 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0748
Description:

Target: scaffold0748; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 13 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 5693 - 5471
Alignment:
Q  13 cagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaactttcaaatttc 112  Q
    ||||| || ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||  | ||||||||||| ||||| || ||||||||||| |  |||||  | |    
T  5693 cagactgagaagcaagtcagaggttttctcgggcgtttgaattatatctcaaggttcatatctcacatgactgccacctgcgggccgatcttcaagctac 5594  T
Q  113 tcaaaatgaatcaacctattatgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgccagt 212  Q
    |||  |  ||||||||| |  | || ||| |||||||||| || |||||||||||||||||  |||| ||| | || ||||||||||||||||| || ||    
T  5593 tcaggaaaaatcaacctgtggtatgaaatgatgaatgccaagaggcttttgatagcatcaagaattacctgttagagccacctatccttgtcccacctgt 5494  T
Q  213 ggaaggaaggcccttgatgatgt 235  Q
    |||||||||| | ||||| ||||    
T  5493 ggaaggaaggtcgttgatcatgt 5471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1888 (Bit Score: 57; Significance: 6e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold1888
Description:

Target: scaffold1888; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 10 - 98
Target Start/End: Original strand, 1154 - 1242
Alignment:
Q  10 ccacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggcc 98  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||  ||  ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1154 ccacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgaacgaatgaataacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggcc 1242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099 (Bit Score: 48; Significance: 1e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0099
Description:

Target: scaffold0099; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 21 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 43754 - 43541
Alignment:
Q  21 aaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaa-ttacatctcccgattcatatctcatatgaccgc-aacctgcgggccaactttcaaatttc-tcaaa 117  Q
    |||||||||| ||||||||||||| || || || |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |  |||||  | | | | |    
T  43754 aaagcaagtcagaggtttcctcggacgcttaaaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaaacctgcgggccgatcttcaagctactttaga 43655  T
Q  118 atgaatca-acctattatgtggaat--aatgaatgccaggaagctttt--gatagcatcaa-agattatctgctggaaccacc-tatccttgtcccgcca 210  Q
    | ||||||  |||||| | ||||||  | ||||||||| |||||||||   |||||||||| | |||| |||||||||||||| |||||||||||| ||     
T  43654 aagaatcagtcctattgtatggaattaattgaatgccaagaagctttttgtatagcatcaagaaattacctgctggaaccaccttatccttgtcccaccc 43555  T
Q  211 gtggaaggaaggcc 224  Q
    ||||||||||||||    
T  43554 gtggaaggaaggcc 43541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 25 - 86
Target Start/End: Original strand, 33706 - 33770
Alignment:
Q  25 caagtccgaggtttcctcggg-cgtttgaattacatctcccga-ttc-atatctcatatgaccgc 86  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||    
T  33706 caagtcagaggtttcctcggggcgtttgaattacatctcccgacttctatatctcacatgaccgc 33770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0094 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0094
Description:

Target: scaffold0094; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 50 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 35225 - 35177
Alignment:
Q  50 tgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggcc 98  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  35225 tgaattacatctcccgtttcatttctcatatgacggcaacgtgcgggcc 35177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University