View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF17835_low_17 (Length: 223)

Name: NF17835_low_17
Description: NF17835
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF17835_low_17
NF17835_low_17
[»] chr3 (61 HSPs)
chr3 (6-216)||(33341812-33342022)
chr3 (18-216)||(7853913-7854111)
chr3 (6-216)||(54685415-54685625)
chr3 (11-181)||(17956103-17956274)
chr3 (11-194)||(30152893-30153078)
chr3 (11-185)||(45581591-45581767)
chr3 (11-173)||(54038243-54038406)
chr3 (17-161)||(16996176-16996321)
chr3 (17-169)||(19570805-19570957)
chr3 (77-216)||(19946629-19946768)
chr3 (17-157)||(50112168-50112309)
chr3 (20-169)||(317628-317778)
chr3 (17-169)||(22144389-22144542)
chr3 (20-163)||(16182065-16182209)
chr3 (11-173)||(3992522-3992686)
chr3 (17-141)||(12349847-12349970)
chr3 (11-164)||(53771022-53771177)
chr3 (17-169)||(13817492-13817642)
chr3 (11-173)||(23492346-23492509)
chr3 (11-137)||(16261463-16261589)
chr3 (17-169)||(35123674-35123826)
chr3 (17-169)||(6154448-6154600)
chr3 (11-164)||(2844172-2844327)
chr3 (17-169)||(14298399-14298551)
chr3 (17-169)||(14304026-14304178)
chr3 (17-164)||(53898572-53898719)
chr3 (17-185)||(17523006-17523176)
chr3 (17-169)||(6146863-6147015)
chr3 (77-216)||(47784924-47785064)
chr3 (17-169)||(14295415-14295569)
chr3 (11-164)||(38167896-38168050)
chr3 (17-163)||(17100636-17100783)
chr3 (17-163)||(17101321-17101468)
chr3 (20-173)||(11329081-11329235)
chr3 (39-180)||(17139474-17139616)
chr3 (39-173)||(14528151-14528286)
chr3 (135-216)||(9303343-9303425)
chr3 (72-164)||(28558188-28558282)
chr3 (26-173)||(12560362-12560510)
chr3 (17-173)||(54423986-54424142)
chr3 (17-164)||(19260956-19261104)
chr3 (47-173)||(55440996-55441123)
chr3 (17-169)||(14301042-14301196)
chr3 (17-164)||(12349656-12349809)
chr3 (39-189)||(12488865-12489017)
chr3 (101-164)||(14059414-14059478)
chr3 (40-179)||(17204667-17204807)
chr3 (62-188)||(38811170-38811297)
chr3 (77-189)||(1990759-1990873)
chr3 (107-188)||(17960520-17960602)
chr3 (17-70)||(34439460-34439513)
chr3 (25-136)||(8631801-8631912)
chr3 (64-180)||(9590918-9591035)
chr3 (77-194)||(12952915-12953034)
chr3 (20-139)||(17938582-17938701)
chr3 (39-180)||(15876034-15876176)
chr3 (77-164)||(3576615-3576703)
chr3 (39-139)||(16880131-16880231)
chr3 (77-188)||(34559857-34559969)
chr3 (17-47)||(28558271-28558301)
chr3 (105-179)||(17191511-17191583)
[»] chr5 (30 HSPs)
chr5 (17-215)||(11583982-11584184)
chr5 (11-173)||(2031783-2031946)
chr5 (11-194)||(11342635-11342821)
chr5 (17-194)||(1168321-1168500)
chr5 (17-169)||(28261498-28261651)
chr5 (17-162)||(21397073-21397222)
chr5 (11-173)||(21204898-21205062)
chr5 (18-169)||(21646857-21647009)
chr5 (17-169)||(11337303-11337455)
chr5 (17-169)||(24475560-24475708)
chr5 (17-169)||(4865239-4865393)
chr5 (17-185)||(20712036-20712206)
chr5 (11-173)||(21650668-21650831)
chr5 (134-216)||(16105573-16105656)
chr5 (18-138)||(21906729-21906846)
chr5 (134-216)||(109075-109158)
chr5 (17-141)||(24183249-24183370)
chr5 (26-180)||(19405503-19405658)
chr5 (20-188)||(7728378-7728547)
chr5 (47-169)||(23466434-23466557)
chr5 (20-189)||(3673818-3673989)
chr5 (39-188)||(21616974-21617124)
chr5 (26-189)||(23493875-23494040)
chr5 (105-180)||(16595474-16595550)
chr5 (105-188)||(32966352-32966436)
chr5 (20-172)||(19862183-19862336)
chr5 (177-215)||(24225596-24225634)
chr5 (77-189)||(6456580-6456694)
chr5 (77-188)||(37983325-37983434)
chr5 (77-180)||(29917931-29918035)
[»] scaffold1867 (1 HSPs)
scaffold1867 (17-216)||(75-274)
[»] scaffold0833 (1 HSPs)
scaffold0833 (39-216)||(3230-3407)
[»] chr6 (32 HSPs)
chr6 (11-216)||(18583264-18583453)
chr6 (11-181)||(35015276-35015447)
chr6 (17-181)||(19983416-19983581)
chr6 (18-169)||(25744331-25744483)
chr6 (77-216)||(18823573-18823712)
chr6 (11-164)||(26089718-26089871)
chr6 (17-157)||(32898779-32898920)
chr6 (77-216)||(18839428-18839567)
chr6 (11-173)||(18002615-18002777)
chr6 (11-164)||(23994904-23995059)
chr6 (17-169)||(22440911-22441064)
chr6 (20-169)||(31628245-31628395)
chr6 (11-173)||(15742339-15742505)
chr6 (18-173)||(18777119-18777275)
chr6 (17-169)||(13014826-13014979)
chr6 (134-216)||(4991002-4991085)
chr6 (20-163)||(16086001-16086144)
chr6 (20-163)||(18432626-18432770)
chr6 (20-194)||(18398890-18399065)
chr6 (20-181)||(18381803-18381965)
chr6 (17-154)||(18570271-18570409)
chr6 (105-216)||(17083383-17083496)
chr6 (20-188)||(22361885-22362054)
chr6 (39-164)||(25367376-25367502)
chr6 (20-169)||(16106499-16106643)
chr6 (65-173)||(28195259-28195367)
chr6 (107-164)||(15740211-15740269)
chr6 (75-180)||(18629786-18629892)
chr6 (39-185)||(25651197-25651345)
chr6 (105-188)||(25919571-25919655)
chr6 (105-164)||(33324675-33324735)
chr6 (105-164)||(35136217-35136277)
[»] chr8 (40 HSPs)
chr8 (11-173)||(41506928-41507091)
chr8 (11-181)||(24716981-24717152)
chr8 (11-154)||(39115267-39115411)
chr8 (20-169)||(41246635-41246785)
chr8 (17-169)||(19993171-19993324)
chr8 (17-164)||(22234920-22235068)
chr8 (17-169)||(20573309-20573461)
chr8 (17-141)||(37611675-37611798)
chr8 (17-185)||(20481565-20481735)
chr8 (18-173)||(274416-274572)
chr8 (18-173)||(641277-641433)
chr8 (18-173)||(827083-827239)
chr8 (11-185)||(16039000-16039176)
chr8 (20-157)||(20647949-20648087)
chr8 (20-157)||(20654025-20654163)
chr8 (26-180)||(39446892-39447046)
chr8 (101-169)||(20567200-20567268)
chr8 (77-169)||(20567335-20567427)
chr8 (77-169)||(20573528-20573620)
chr8 (65-169)||(25122513-25122618)
chr8 (26-188)||(38533607-38533770)
chr8 (84-194)||(29759893-29760005)
chr8 (39-188)||(5854572-5854722)
chr8 (28-164)||(21680984-21681121)
chr8 (108-188)||(22736046-22736127)
chr8 (20-181)||(23837163-23837325)
chr8 (105-169)||(15969796-15969860)
chr8 (39-188)||(26011452-26011602)
chr8 (110-181)||(21198362-21198434)
chr8 (39-189)||(33528383-33528533)
chr8 (39-188)||(15933256-15933406)
chr8 (11-137)||(24385871-24385988)
chr8 (20-73)||(20561751-20561804)
chr8 (64-189)||(23226240-23226368)
chr8 (63-189)||(23149736-23149865)
chr8 (112-181)||(24929018-24929087)
chr8 (64-181)||(31194488-31194606)
chr8 (105-181)||(17285232-17285309)
chr8 (75-189)||(22742717-22742833)
chr8 (77-180)||(27233244-27233348)
[»] scaffold0120 (2 HSPs)
scaffold0120 (17-216)||(21442-21642)
scaffold0120 (17-216)||(31141-31341)
[»] scaffold0158 (2 HSPs)
scaffold0158 (17-216)||(24890-25088)
scaffold0158 (17-147)||(25212-25341)
[»] chr7 (37 HSPs)
chr7 (11-173)||(111388-111550)
chr7 (11-194)||(126366-126551)
chr7 (20-216)||(7284180-7284376)
chr7 (11-185)||(32494165-32494341)
chr7 (17-169)||(39046740-39046893)
chr7 (17-173)||(11287390-11287547)
chr7 (11-164)||(42056408-42056563)
chr7 (17-169)||(35094794-35094946)
chr7 (11-164)||(2190305-2190460)
chr7 (17-169)||(12758965-12759117)
chr7 (11-164)||(3049565-3049719)
chr7 (11-173)||(2028893-2029057)
chr7 (17-169)||(15822548-15822701)
chr7 (39-169)||(45452305-45452435)
chr7 (17-173)||(3894998-3895155)
chr7 (17-180)||(16570122-16570287)
chr7 (17-180)||(16595375-16595540)
chr7 (20-164)||(26070384-26070529)
chr7 (20-164)||(26094171-26094316)
chr7 (17-169)||(47289758-47289911)
chr7 (11-181)||(1937131-1937290)
chr7 (17-173)||(12248237-12248395)
chr7 (17-169)||(44865204-44865360)
chr7 (39-180)||(49047813-49047955)
chr7 (17-180)||(13274753-13274918)
chr7 (63-216)||(14272049-14272203)
chr7 (17-169)||(143622-143769)
chr7 (11-181)||(17224048-17224220)
chr7 (17-185)||(12369957-12370127)
chr7 (39-188)||(16915067-16915217)
chr7 (39-188)||(48356602-48356752)
chr7 (11-189)||(13377485-13377666)
chr7 (77-189)||(4484683-4484797)
chr7 (110-189)||(4446168-4446249)
chr7 (110-189)||(14935319-14935400)
chr7 (110-189)||(15362912-15362993)
chr7 (105-188)||(34241393-34241477)
[»] scaffold0686 (1 HSPs)
scaffold0686 (11-181)||(6202-6373)
[»] scaffold0184 (1 HSPs)
scaffold0184 (11-181)||(31399-31570)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (11-181)||(41274-41445)
[»] chr4 (36 HSPs)
chr4 (11-194)||(14951713-14951898)
chr4 (18-181)||(25119333-25119498)
chr4 (17-169)||(53704850-53705003)
chr4 (11-181)||(5682646-5682817)
chr4 (13-194)||(55376710-55376893)
chr4 (17-181)||(34395222-34395387)
chr4 (13-169)||(23270047-23270204)
chr4 (17-169)||(44055892-44056045)
chr4 (17-169)||(16732146-16732299)
chr4 (17-157)||(44346816-44346957)
chr4 (19-169)||(53907818-53907966)
chr4 (17-169)||(30457880-30458033)
chr4 (17-154)||(21959580-21959718)
chr4 (11-164)||(15272431-15272586)
chr4 (17-163)||(820033-820177)
chr4 (17-125)||(8872588-8872699)
chr4 (114-216)||(16522748-16522851)
chr4 (17-164)||(12837317-12837464)
chr4 (17-164)||(30232613-30232761)
chr4 (39-173)||(18494467-18494602)
chr4 (114-216)||(9295624-9295727)
chr4 (26-164)||(13809636-13809775)
chr4 (18-141)||(45458973-45459096)
chr4 (40-180)||(27960938-27961078)
chr4 (105-188)||(37957230-37957314)
chr4 (39-216)||(7185983-7186159)
chr4 (79-188)||(7964890-7965000)
chr4 (20-141)||(52265628-52265749)
chr4 (105-188)||(19821981-19822065)
chr4 (20-189)||(15044784-15044955)
chr4 (105-181)||(14901197-14901274)
chr4 (11-189)||(15109459-15109640)
chr4 (105-181)||(47535251-47535328)
chr4 (63-181)||(41166109-41166228)
chr4 (77-189)||(41256546-41256660)
chr4 (40-188)||(18276392-18276541)
[»] scaffold0310 (2 HSPs)
scaffold0310 (20-216)||(234-430)
scaffold0310 (140-216)||(6603-6679)
[»] scaffold0039 (2 HSPs)
scaffold0039 (11-173)||(12639-12802)
scaffold0039 (40-173)||(19049-19183)
[»] scaffold0116 (1 HSPs)
scaffold0116 (36-181)||(30056-30202)
[»] scaffold0034 (3 HSPs)
scaffold0034 (11-164)||(79846-80000)
scaffold0034 (17-141)||(46171-46295)
scaffold0034 (17-141)||(40664-40788)
[»] chr1 (25 HSPs)
chr1 (11-194)||(22366970-22367154)
chr1 (11-173)||(21859984-21860147)
chr1 (11-194)||(15861545-15861728)
chr1 (11-176)||(44035090-44035255)
chr1 (17-169)||(49967628-49967780)
chr1 (17-169)||(35522436-35522588)
chr1 (17-169)||(41212046-41212202)
chr1 (17-169)||(21718206-21718358)
chr1 (17-164)||(22403227-22403375)
chr1 (17-185)||(35054716-35054886)
chr1 (41-180)||(51627805-51627945)
chr1 (17-173)||(27329872-27330026)
chr1 (105-188)||(27674755-27674838)
chr1 (105-187)||(22829629-22829712)
chr1 (39-141)||(9784239-9784341)
chr1 (39-188)||(17608886-17609036)
chr1 (105-188)||(19603055-19603139)
chr1 (108-188)||(38033882-38033962)
chr1 (77-181)||(20177140-20177245)
chr1 (105-188)||(20955644-20955728)
chr1 (77-180)||(21194980-21195084)
chr1 (63-181)||(13377003-13377122)
chr1 (62-188)||(37234022-37234149)
chr1 (20-87)||(9784184-9784248)
chr1 (110-181)||(41229149-41229221)
[»] scaffold0016 (4 HSPs)
scaffold0016 (11-181)||(162297-162469)
scaffold0016 (17-157)||(164204-164345)
scaffold0016 (11-181)||(166383-166547)
scaffold0016 (77-181)||(116690-116795)
[»] chr2 (27 HSPs)
chr2 (11-181)||(22274688-22274858)
chr2 (17-169)||(23836822-23836975)
chr2 (17-169)||(32465835-32465988)
chr2 (11-181)||(22283921-22284091)
chr2 (17-185)||(25876036-25876206)
chr2 (63-216)||(19433495-19433649)
chr2 (11-173)||(9653015-9653179)
chr2 (18-169)||(4448251-4448402)
chr2 (13-169)||(6879414-6879571)
chr2 (11-161)||(21274168-21274319)
chr2 (17-169)||(28974026-28974179)
chr2 (17-169)||(271148-271300)
chr2 (17-181)||(25601989-25602154)
chr2 (20-185)||(36890805-36890972)
chr2 (53-169)||(27261783-27261900)
chr2 (134-216)||(24826961-24827044)
chr2 (62-188)||(3403-3529)
chr2 (40-180)||(22579999-22580140)
chr2 (114-216)||(25212977-25213081)
chr2 (17-180)||(24571408-24571572)
chr2 (154-216)||(43645824-43645886)
chr2 (105-188)||(722353-722437)
chr2 (20-185)||(67952-68119)
chr2 (148-189)||(24884643-24884684)
chr2 (105-175)||(25305416-25305487)
chr2 (62-185)||(23821767-23821892)
chr2 (62-185)||(23830846-23830971)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (11-176)||(570-736)
[»] scaffold0396 (1 HSPs)
scaffold0396 (17-162)||(11825-11970)
[»] scaffold0091 (2 HSPs)
scaffold0091 (17-169)||(32180-32333)
scaffold0091 (17-169)||(41970-42123)
[»] scaffold0021 (3 HSPs)
scaffold0021 (17-169)||(132367-132520)
scaffold0021 (17-173)||(11660-11818)
scaffold0021 (18-133)||(88289-88404)
[»] scaffold0001 (2 HSPs)
scaffold0001 (17-169)||(70739-70892)
scaffold0001 (13-169)||(60784-60940)
[»] scaffold0480 (2 HSPs)
scaffold0480 (17-169)||(5363-5516)
scaffold0480 (17-173)||(8998-9156)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (17-169)||(22668-22821)
[»] scaffold0673 (2 HSPs)
scaffold0673 (17-169)||(6962-7118)
scaffold0673 (17-169)||(939-1092)
[»] scaffold0035 (2 HSPs)
scaffold0035 (20-173)||(109582-109736)
scaffold0035 (18-173)||(118081-118237)
[»] scaffold0597 (1 HSPs)
scaffold0597 (11-173)||(1097-1261)
[»] scaffold0251 (2 HSPs)
scaffold0251 (11-173)||(13505-13669)
scaffold0251 (11-164)||(21479-21634)
[»] scaffold0175 (1 HSPs)
scaffold0175 (11-173)||(14921-15085)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (17-169)||(254931-255084)
scaffold0011 (17-169)||(261537-261690)
[»] scaffold0234 (1 HSPs)
scaffold0234 (11-173)||(17523-17686)
[»] scaffold0083 (2 HSPs)
scaffold0083 (17-169)||(14854-15004)
scaffold0083 (76-169)||(14194-14288)
[»] scaffold0240 (1 HSPs)
scaffold0240 (17-162)||(7556-7699)
[»] scaffold0014 (2 HSPs)
scaffold0014 (20-157)||(85321-85459)
scaffold0014 (11-173)||(159275-159436)
[»] scaffold0610 (1 HSPs)
scaffold0610 (17-169)||(693-846)
[»] scaffold0044 (1 HSPs)
scaffold0044 (17-157)||(38287-38428)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (17-181)||(253106-253271)
[»] scaffold0190 (1 HSPs)
scaffold0190 (17-180)||(9903-10067)
[»] scaffold0077 (1 HSPs)
scaffold0077 (17-185)||(15588-15761)
[»] scaffold0338 (1 HSPs)
scaffold0338 (17-173)||(8960-9117)
[»] scaffold0195 (1 HSPs)
scaffold0195 (17-169)||(635-788)
[»] scaffold0032 (3 HSPs)
scaffold0032 (11-173)||(55553-55717)
scaffold0032 (101-188)||(93973-94061)
scaffold0032 (77-164)||(104799-104887)
[»] scaffold0359 (2 HSPs)
scaffold0359 (20-163)||(1300-1444)
scaffold0359 (17-169)||(11771-11921)
[»] scaffold0706 (1 HSPs)
scaffold0706 (11-164)||(6662-6816)
[»] scaffold0465 (1 HSPs)
scaffold0465 (20-173)||(10094-10248)
[»] scaffold0004 (2 HSPs)
scaffold0004 (11-173)||(193607-193770)
scaffold0004 (11-164)||(186645-186799)
[»] scaffold0574 (1 HSPs)
scaffold0574 (11-173)||(9626-9789)
[»] scaffold0150 (2 HSPs)
scaffold0150 (110-216)||(28466-28573)
scaffold0150 (166-216)||(21637-21687)
[»] scaffold0037 (2 HSPs)
scaffold0037 (11-173)||(94948-95111)
scaffold0037 (17-173)||(24845-25002)
[»] scaffold0022 (3 HSPs)
scaffold0022 (17-169)||(112662-112812)
scaffold0022 (39-180)||(109556-109698)
scaffold0022 (101-188)||(103123-103211)
[»] scaffold0025 (1 HSPs)
scaffold0025 (17-185)||(146561-146731)
[»] scaffold1164 (1 HSPs)
scaffold1164 (43-194)||(1332-1485)
[»] scaffold0160 (2 HSPs)
scaffold0160 (17-164)||(3-151)
scaffold0160 (77-173)||(3492-3589)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (20-181)||(4906-5068)
[»] scaffold0117 (1 HSPs)
scaffold0117 (20-169)||(11688-11837)
[»] scaffold0068 (2 HSPs)
scaffold0068 (17-169)||(48124-48277)
scaffold0068 (17-169)||(61572-61725)
[»] scaffold0028 (3 HSPs)
scaffold0028 (114-216)||(130486-130589)
scaffold0028 (39-164)||(79521-79647)
scaffold0028 (17-86)||(89586-89655)
[»] scaffold0095 (1 HSPs)
scaffold0095 (26-180)||(33854-34008)
[»] scaffold0303 (1 HSPs)
scaffold0303 (11-164)||(147-301)
[»] scaffold0103 (1 HSPs)
scaffold0103 (20-141)||(33668-33789)
[»] scaffold0122 (1 HSPs)
scaffold0122 (75-173)||(24372-24471)
[»] scaffold0031 (3 HSPs)
scaffold0031 (42-180)||(31010-31149)
scaffold0031 (26-84)||(70676-70734)
scaffold0031 (105-188)||(97403-97487)
[»] scaffold0554 (1 HSPs)
scaffold0554 (62-173)||(1889-2001)
[»] scaffold0053 (1 HSPs)
scaffold0053 (20-181)||(76967-77129)
[»] scaffold0080 (1 HSPs)
scaffold0080 (77-188)||(43975-44087)
[»] scaffold1272 (1 HSPs)
scaffold1272 (63-185)||(270-393)
[»] scaffold0740 (2 HSPs)
scaffold0740 (18-81)||(4351-4414)
scaffold0740 (101-169)||(4284-4353)
[»] scaffold0589 (1 HSPs)
scaffold0589 (103-173)||(7807-7878)
[»] scaffold0092 (1 HSPs)
scaffold0092 (47-157)||(3308-3419)
[»] scaffold0483 (1 HSPs)
scaffold0483 (100-185)||(6622-6708)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (39-188)||(69415-69565)
[»] scaffold0700 (1 HSPs)
scaffold0700 (26-188)||(2483-2646)
[»] scaffold0231 (1 HSPs)
scaffold0231 (156-213)||(12990-13048)
[»] scaffold0013 (1 HSPs)
scaffold0013 (105-181)||(35444-35520)
[»] scaffold1734 (1 HSPs)
scaffold1734 (124-181)||(1364-1422)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (176-216)||(12694-12734)
[»] scaffold0244 (1 HSPs)
scaffold0244 (103-173)||(22715-22786)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (20-189)||(2436-2607)
[»] scaffold0090 (1 HSPs)
scaffold0090 (181-216)||(3392-3427)
[»] scaffold0020 (1 HSPs)
scaffold0020 (77-189)||(107967-108080)
[»] scaffold0335 (1 HSPs)
scaffold0335 (134-185)||(5823-5875)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 183; Significance: 4e-99; HSPs: 61)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 6 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 33342022 - 33341812
Alignment:
Q  6 ggtagattatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgat 105  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  33342022 ggtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattatgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatggttgat 33341923  T
Q  106 gataattcatggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgaa 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  33341922 gataattcatggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgttggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgat 33341823  T
Q  206 tttgatgatgt 216  Q
    |||||| ||||    
T  33341822 tttgattatgt 33341812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 18 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 7854111 - 7853913
Alignment:
Q  18 tcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  7854111 tcaattggtgaattatgcatgattgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatggttgatgataattcatgg 7854012  T
Q  118 cttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgaatttgatgatgt 216  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7854011 cttgggtttgcatgaatcatgattgttgttgagaaatgagttgttgttggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgattttgatgatgt 7853913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 6 - 216
Target Start/End: Original strand, 54685415 - 54685625
Alignment:
Q  6 ggtagattatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgat 105  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  54685415 ggtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatggttgat 54685514  T
Q  106 gataattcatggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgaa 205  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  54685515 gataattcatggcttggatttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgctgttgctggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgat 54685614  T
Q  206 tttgatgatgt 216  Q
    |||||||||||    
T  54685615 tttgatgatgt 54685625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 11 - 181
Target Start/End: Original strand, 17956103 - 17956274
Alignment:
Q  11 attatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataa 110  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |    
T  17956103 attatactcaattggtgtattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatgatga 17956202  T
Q  111 ttcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaat 181  Q
    | |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||    
T  17956203 tacatgacttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaat 17956274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 11 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 30153078 - 30152893
Alignment:
Q  11 attatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataa 110  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |    
T  30153078 attatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatgatga 30152979  T
Q  111 ttcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggttgataatga 194  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| |||| ||| || ||||||||||||| ||||    
T  30152978 tatatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtgttttggtgaaaatgggttgattatga 30152893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 11 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 45581767 - 45581591
Alignment:
Q  11 attatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataa 110  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  45581767 attatgctcaattggtgaattatgcatgattgttgatgaattgtgatatgtttcatgattaatggttgttgttgttgtttagtcatatggttgatgataa 45581668  T
Q  111 ttcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggt 185  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||| | ||||||| | |||||| || |||||||||    
T  45581667 ttcatggcttgggtatgcatgattcataatttgttgttgagaaataaattgttgttgttggtttggtgaaaatgggt 45581591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 11 - 173
Target Start/End: Original strand, 54038243 - 54038406
Alignment:
Q  11 attatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataa 110  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  54038243 attatgctaaattggtgaattatgcatggttgttgatgaaatgtgatatgtttcatgattaatggttgttgttgttgtttagtcatatagttgatgataa 54038342  T
Q  111 ttcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 173  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||| |||||| | ||||||| | ||||||    
T  54038343 ttcatggcttgggtatgcatgattcataatttgttgttaagaaataaattgttgttgttggttt 54038406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 17 - 161
Target Start/End: Original strand, 16996176 - 16996321
Alignment:
Q  17 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 116  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  16996176 ctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaattgttgttgttgttgtttagtcatgttgttgatgataattcatg 16996275  T
Q  117 gcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgt 161  Q
    ||||| |||||||| |||| | | ||||||||||||||||||||||    
T  16996276 gcttgagtttgcataattcttggtttgttgttgagaaatgagttgt 16996321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 17 - 169
Target Start/End: Original strand, 19570805 - 19570957
Alignment:
Q  17 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 116  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  19570805 ctcaattggtgaattatgcattgttgttggtgaattgtgataagtttcatgatcaattgttgttgttgttgtttagtcatgttgttgatgataattcatg 19570904  T
Q  117 gcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 169  Q
    ||||| |||||||| |||| || |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  19570905 gcttgagtttgcataattcttggttgttgttgagaaatgagatgttgttggtg 19570957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 77 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 19946768 - 19946629
Alignment:
Q  77 tgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt 176  Q
    ||||||||||| |  ||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19946768 tgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgataatccatggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgttggtggttttgt 19946669  T
Q  177 aaaatgggttgataatgaagaagtttgaatttgatgatgt 216  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||    
T  19946668 aaaatgggttgataatatagaagtttgattttgatgatgt 19946629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 17 - 157
Target Start/End: Original strand, 50112168 - 50112309
Alignment:
Q  17 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 116  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  50112168 ctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgtttagtcatgttgttgatgataattcatg 50112267  T
Q  117 gcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgag 157  Q
    ||||| ||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||    
T  50112268 gcttgagtttgcatgattcatggtttgtttttgagaaatgag 50112309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 20 - 169
Target Start/End: Original strand, 317628 - 317778
Alignment:
Q  20 aattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggct 119  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||    
T  317628 aattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaattgttgttgttgttgtttagtcatgttgttgatgataattcatggct 317727  T
Q  120 tgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 169  Q
    || ||||| || |||| | | ||||||| |||||||||| |||||| ||||    
T  317728 tgagtttgtataattcttggtttgttgtggagaaatgagatgttgttggtg 317778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 17 - 169
Target Start/End: Original strand, 22144389 - 22144542
Alignment:
Q  17 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 116  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| || ||| |  ||||||||||| ||||    
T  22144389 ctcaattggtgaagtatgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgttgttgttgttgttaagccatgttgttgatgataatacatg 22144488  T
Q  117 gcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 169  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||| |||||| ||||    
T  22144489 gcttgggtttgcatgattcatggtttgtggttgagaaatgagatgttgttggtg 22144542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 20 - 163
Target Start/End: Original strand, 16182065 - 16182209
Alignment:
Q  20 aattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggct 119  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||| |  |||||||||||||||||||    
T  16182065 aattggtgaattatgcattgtcgttgatgaattgtgataagtttaatgatcaattgttgttgttgttttttagtcatgttgttgatgataattcatggct 16182164  T
Q  120 tgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgttg 163  Q
    ||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||| |||||    
T  16182165 tgggtttgcataattcttggattgttgttgagaaatgagatgttg 16182209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 11 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 3992686 - 3992522
Alignment:
Q  11 attatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataa 110  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||||| ||| || |  | |||| |||    
T  3992686 attatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgttatggatgctaa 3992587  T
Q  111 ttcatggcttgggtttgcatgattcatga--ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 173  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||    
T  3992586 ttcatggcttgggtatgcatgattcataattttgttgttgtgaaataagttgttgttgttggttt 3992522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 17 - 141
Target Start/End: Original strand, 12349847 - 12349970
Alignment:
Q  17 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 116  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||    
T  12349847 ctcaattggtgaattatgcatcgtagttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgttgttgttgttgttaagtcatgttgttgatgataattcatg 12349946  T
Q  117 gcttgggtttgcatgattcatgatt 141  Q
    ||||||| |||||||||||||||||    
T  12349947 gcttggg-ttgcatgattcatgatt 12349970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 11 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 53771177 - 53771022
Alignment:
Q  11 attatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataa 110  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| || |  |  ||| |||    
T  53771177 attatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgttatgaatgctaa 53771078  T
Q  111 ttcatggcttgggtttgcatgattcatga--ttgttgttgagaaatgagttgttgt 164  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||| ||||| |||||||||    
T  53771077 ttcatggcttgggtatgcatgattcataattttgttgttgtgaaataagttgttgt 53771022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 17 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 13817642 - 13817492
Alignment:
Q  17 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 116  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||   ||||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  13817642 ctcaattggtgaattatgcattgttgttggtgaattgtgataagtttcatgatcaattgttgttgt---tgtttagtcatgttgttgatgataattcatg 13817546  T
Q  117 gcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 169  Q
    |||||||||||||| |||| | | |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  13817545 gcttgggtttgcataattcttggtttgttgttgagaaatgagatgttgttggtg 13817492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 11 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 23492509 - 23492346
Alignment:
Q  11 attatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataa 110  Q
    ||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| || |  | |||| |||    
T  23492509 attatgctcaaatggtgaattatggatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgttatggatgctaa 23492410  T
Q  111 ttcatggcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 173  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||    
T  23492409 ttcatggcttgggtatgcatgattcatagtttgttgttgtgaaataagttgttgttgttggttt 23492346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 11 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 16261589 - 16261463
Alignment:
Q  11 attatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataa 110  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| || |  | |||| |||    
T  16261589 attatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgttatggatgctaa 16261490  T
Q  111 ttcatggcttgggtttgcatgattcat 137  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||    
T  16261489 ttcatggcttgggtatgcatgattcat 16261463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 17 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 35123826 - 35123674
Alignment:
Q  17 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 116  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||  |||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |  ||||| |  ||||||||||||||||    
T  35123826 ctcaattggtgaattatgctttgttgttattgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgataattcatg 35123727  T
Q  117 gcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 169  Q
    | |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||| ||||    
T  35123726 gtttgggtttgcatgattcatgatttgtgttgagaaatgagatgttgttggtg 35123674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 17 - 169
Target Start/End: Original strand, 6154448 - 6154600
Alignment:
Q  17 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 116  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||| |  ||||||||||||||||    
T  6154448 ctcaattggtgaattatgcattgttattgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgttgttgttattgttaagtcatgttgttgatgataattcatg 6154547  T
Q  117 gcttgggtttgcatgattcatgattgt-tgttgagaaatgagttgttgtcggtg 169  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||| | | | |||||||||| |||||| ||||    
T  6154548 gcttggg-ttgcatgattcataattttgtatggagaaatgagatgttgttggtg 6154600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 11 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 2844327 - 2844172
Alignment:
Q  11 attatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataa 110  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||||| ||| || |  | |||| |||    
T  2844327 attatgctcaattggtgaattatgcatggttcttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgttatggatgctaa 2844228  T
Q  111 ttcatggcttgggtttgcatgattcatga--ttgttgttgagaaatgagttgttgt 164  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||| ||| | |||||||||    
T  2844227 ttcatggcttgggtatgcatgattcataattttgttgttgtgaagtaagttgttgt 2844172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 17 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 14298551 - 14298399
Alignment:
Q  17 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 116  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||  ||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||| ||  |  ||||| |  ||||||||||||||||    
T  14298551 ctcaattggtgaattatgctttgttgttgtcgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttattaatatgtcatgttgttgatgataattcatg 14298452  T
Q  117 gcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 169  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||| ||||    
T  14298451 gcttgggtttgcatgattcatgatttgtgttgagaaatgagatgttgttggtg 14298399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 17 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 14304178 - 14304026
Alignment:
Q  17 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 116  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||  ||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||| ||  |  ||||| |  ||||||||||||||||    
T  14304178 ctcaattggtgaattatgctttgttgttgtcgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttattaatatgtcatgttgttgatgataattcatg 14304079  T
Q  117 gcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 169  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||| ||||    
T  14304078 gcttgggtttgcatgattcatgatttgtgttgagaaatgagatgttgttggtg 14304026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 17 - 164
Target Start/End: Original strand, 53898572 - 53898719
Alignment:
Q  17 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 116  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| || ||| ||||| ||||||||||||||   ||||||||||| |  ||||| |  ||| ||||||||||||    
T  53898572 ctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgcattgtgataagtttcatgatcaattaatgttgttgttgatatgtcatgttgttggtgataattcatg 53898671  T
Q  117 gcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgt 164  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||| ||||||    
T  53898672 gcttgggtttgcaagattcatgatttatgttgagaaatgagatgttgt 53898719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 17 - 185
Target Start/End: Original strand, 17523006 - 17523176
Alignment:
Q  17 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgt-ttgatgataattcat 115  Q
    |||||||||||||||||||   ||| |||||||||| ||||| ||||||||| |||| | ||||||||||| | |||||  | | |||||||||||||||    
T  17523006 ctcaattggtgaattatgctatgttattgatgaattgtgataagtttcatgaccaattgatgttgttgttgctaagtcaattttgttgatgataattcat 17523105  T
Q  116 ggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggt 185  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||| |||||| |||| ||| || |||||||||    
T  17523106 ggcttgggtttgcatgatttatgatttgtgttgagaaatgagatgttgttggtgttttggtgaaaatgggt 17523176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 17 - 169
Target Start/End: Original strand, 6146863 - 6147015
Alignment:
Q  17 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 116  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||| |||||||||| |||||| |  ||||| ||||||||||    
T  6146863 ctcaattggtgaatcatgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcatggtcaattgttgctgttgttgttaagtcatgttgttgataataattcatg 6146962  T
Q  117 gcttgggtttgcatgattcatgattgt-tgttgagaaatgagttgttgtcggtg 169  Q
    |||||||||| |||||||||||||| | | | |||||||||| |||||| ||||    
T  6146963 gcttgggttt-catgattcatgattttgtatggagaaatgagatgttgttggtg 6147015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 77 - 216
Target Start/End: Original strand, 47784924 - 47785064
Alignment:
Q  77 tgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttg 175  Q
    ||||||||||||| ||| || |  ||| | || ||||||||||||||| | ||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||| || ||    
T  47784924 tgttgttgttgttaagtgatgttgttgttaatgattcatggcttgggtgttcataattcatgatttgttggtgagaaatgagttgttgttggtgattctg 47785023  T
Q  176 taaaatgggttgataatgaagaagtttgaatttgatgatgt 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  47785024 taaaatgggttgataatgaagaagtttgattttgatgatgt 47785064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 17 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 14295569 - 14295415
Alignment:
Q  17 ctcaattggt-gaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcat 115  Q
    |||||||||| |||||||||   ||||||| |||||| ||||| | |||||||||||| | ||||||||||  | ||| || |  |||||||||||||||    
T  14295569 ctcaattggttgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgttgtttctaagtgatgttgttgatgataattcat 14295470  T
Q  116 ggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 169  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  14295469 ggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatgagatgttgttggtg 14295415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 11 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 38168050 - 38167896
Alignment:
Q  11 attatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataa 110  Q
    ||||| |||||||||||||||||||   |||||||||||||| | ||| |||||||||||||| | ||||||||||||| ||| || |  | |||| |||    
T  38168050 attatgctcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtaataagtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgttatggatgttaa 38167951  T
Q  111 ttcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgt 164  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||| |||||||||    
T  38167950 ttcatggcttgggtatgcatgattcataatttgttgttgtgaaataagttgttgt 38167896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 17 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 17100783 - 17100636
Alignment:
Q  17 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 116  Q
    |||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | |||| |||||||| ||| || |  | |||| |||||||||    
T  17100783 ctcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttattgttgttaagtgatgttatggatgttaattcatg 17100684  T
Q  117 gcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttg 163  Q
    |||||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||||||    
T  17100683 gcttgggtatgcatgattcataatttgttgttgtgaaataagttgttg 17100636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 17 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 17101468 - 17101321
Alignment:
Q  17 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 116  Q
    |||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | |||| |||||||| ||| || |  | |||| |||||||||    
T  17101468 ctcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttattgttgttaagtgatgttatggatgttaattcatg 17101369  T
Q  117 gcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttg 163  Q
    |||||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||||||    
T  17101368 gcttgggtatgcatgattcataatttgttgttgtgaaataagttgttg 17101321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 20 - 173
Target Start/End: Original strand, 11329081 - 11329235
Alignment:
Q  20 aattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggct 119  Q
    ||||| ||||||||||   ||||||| |||||| ||||| | |||||||||||| | ||||||||||| | ||| || |  |||||||||||||||||||    
T  11329081 aattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgataattcatggct 11329180  T
Q  120 tgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 173  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  11329181 tgggtatgcatgattcatgatttgttgatgagaaatgagatgttgttggtagttt 11329235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 39 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 17139616 - 17139474
Alignment:
Q  39 gttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatg 138  Q
    ||||||| |||||| ||||| | |||||||||||| | ||||||||||| | ||| || |  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17139616 gttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgataattcatggcttgggtatgcatgattcatg 17139517  T
Q  139 a-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaa 180  Q
    | ||||||||| |||||||| |||||| ||| |||| ||||||    
T  17139516 atttgttgttgcgaaatgagatgttgttggtagtttggtaaaa 17139474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 39 - 173
Target Start/End: Original strand, 14528151 - 14528286
Alignment:
Q  39 gttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatg 138  Q
    ||||||| |||||| ||||| | |||||||||||| | ||||||||||| | ||| || |  |||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  14528151 gttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatggtaattcatggcttgggtatgaatgattcatg 14528250  T
Q  139 a-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 173  Q
    | |||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  14528251 atttgttgttgagaaatgagatgttgttggtggttt 14528286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 135 - 216
Target Start/End: Original strand, 9303343 - 9303425
Alignment:
Q  135 catgattgttgttgagaaa-tgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgaatttgatgatgt 216  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  9303343 catgattgttgttgagaaaatgagttgttgttggtggttttgtaaaacgggttgataaagaagaagtttgattttgatgatgt 9303425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 72 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 28558282 - 28558188
Alignment:
Q  72 atggttgttg-ttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgt 164  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||| | |||||||    
T  28558282 atggttgttgattgttgtttagtcatatggttgatgataattcatggcttgggtatgcatgattcataatttgttgttgagaaataaattgttgt 28558188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 26 - 173
Target Start/End: Original strand, 12560362 - 12560510
Alignment:
Q  26 tgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtt 125  Q
    ||||||||||   ||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| | ||| || |  | |||| |||||| ||||||||||     
T  12560362 tgaattatgctatgttgttgttgaattgtgatatgattcatgatcaatggatgttgttgttgctaagtgatgttgtggatgttaattcctggcttgggta 12560461  T
Q  126 tgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 173  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  12560462 tgcatgattcatgatttgatgttgagaaatgagatgttgttggtagttt 12560510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 17 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 54424142 - 54423986
Alignment:
Q  17 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 116  Q
    |||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||| ||| | ||| |  |  | |||||| |||||||    
T  54424142 ctcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttattgctaagtgacgttgtggatgattattcatg 54424043  T
Q  117 gcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 173  Q
    |||||||| ||||||||||||||||  |  |||||||| ||||||||| | ||||||    
T  54424042 gcttgggtatgcatgattcatgatttgttatgagaaataagttgttgttgttggttt 54423986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 17 - 164
Target Start/End: Original strand, 19260956 - 19261104
Alignment:
Q  17 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 116  Q
    ||||||||||||||||| |   |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||||| | | || |  |  ||| |||||||||    
T  19260956 ctcaattggtgaattatactaagttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaaatgatgttatgaatgttaattcatg 19261055  T
Q  117 gcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgt 164  Q
    |||||||| |||||||||||| | ||||||||  ||||| |||||||||    
T  19261056 gcttgggtatgcatgattcataatttgttgttatgaaataagttgttgt 19261104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 47 - 173
Target Start/End: Original strand, 55440996 - 55441123
Alignment:
Q  47 tgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttg 145  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||| | |||||||| || | ||| || |  |||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| || |||    
T  55440996 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgatgctaagtgatgttgttgatgataattcatgacttgggtatgcataattcatgattttttg 55441095  T
Q  146 ttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 173  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||    
T  55441096 ttgagaaatgagatgttgttggtggttt 55441123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 17 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 14301196 - 14301042
Alignment:
Q  17 ctcaattggt-gaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcat 115  Q
    |||||||||| |||||||||   ||||||| |||||| ||||| | |||||||||||| | ||||||||||  | ||| || |  |||||||| ||||||    
T  14301196 ctcaattggttgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgttgtttctaagtgatgttgttgatgattattcat 14301097  T
Q  116 ggcttgggtttgcatgattcatg-attgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 169  Q
    | ||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  14301096 gtctttggtttgcatgattcatgttttgttgttgagaaatgagatgttgttggtg 14301042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 17 - 164
Target Start/End: Original strand, 12349656 - 12349809
Alignment:
Q  17 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 116  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |  ||||| |  | |||||||| |||||    
T  12349656 ctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgtagatgataaatcatg 12349755  T
Q  117 gcttg-----ggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgt 164  Q
    |||||     |||||||||||||||| | ||| || |||||||| |||||||||    
T  12349756 gcttggccatggtttgcatgattcataatttgatgatgagaaataagttgttgt 12349809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 39 - 189
Target Start/End: Original strand, 12488865 - 12489017
Alignment:
Q  39 gttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatg 138  Q
    ||||||| |||||| ||||| | |||||||||||| | ||||||||||| | ||| || |  |||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||    
T  12488865 gttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgataattcatggcttgggtgttcataattcatg 12488964  T
Q  139 a-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggttgat 189  Q
    | ||  || || ||||| ||||||||| | |||||| || |||||||||||||    
T  12488965 atttaatgatgggaaataagttgttgttgttggtttggtgaaaatgggttgat 12489017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 101 - 164
Target Start/End: Original strand, 14059414 - 14059478
Alignment:
Q  101 ttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgat-tgttgttgagaaatgagttgttgt 164  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||    
T  14059414 ttgatgataattcatggcttgggtttgcataattcatgatctgttgatgagaaatgagatgttgt 14059478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 40 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 17204807 - 17204667
Alignment:
Q  40 ttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga 139  Q
    |||||| |||||| ||||| |  ||||| | ||||| ||||||||||| | ||| ||||  ||| |||| ||||||||||||||| |  || ||||||||    
T  17204807 ttgttgttgaattgtgataggaatcatgtttaatggatgttgttgttgctaagtaatattgttgttgatgattcatggcttgggtgtttataattcatga 17204708  T
Q  140 tt-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaa 179  Q
    || |||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  17204707 tttgttgatgagaaatgagttgttgttagtggttttgtaaa 17204667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 62 - 188
Target Start/End: Original strand, 38811170 - 38811297
Alignment:
Q  62 ttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatg-attgttgttgagaaatgagttg 160  Q
    |||||| ||||| | ||||||||||| | ||| || |  |||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||  ||| || | ||||||||||||    
T  38811170 ttcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgatgattcatggcttgggtgtgcataattcatgttttgatgatcagaaatgagttg 38811269  T
Q  161 ttgtcggtggttttgtaaaatgggttga 188  Q
    |||| ||||  |||||||||||||||||    
T  38811270 ttgttggtgactttgtaaaatgggttga 38811297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 77 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 1990873 - 1990759
Alignment:
Q  77 tgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtt-tgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggtttt 174  Q
    ||||||||||||| ||  ||||  ||| |||| ||||||||||||| || | ||| | |||||||| | || |||||||||||||||||| |||||||||    
T  1990873 tgttgttgttgttaagagatattgttgttgatgattcatggcttggtttgttcataaatcatgatttgatgatgagaaatgagttgttgttggtggtttt 1990774  T
Q  175 gtaaaatgggttgat 189  Q
    |||||||||||||||    
T  1990773 gtaaaatgggttgat 1990759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 107 - 188
Target Start/End: Original strand, 17960520 - 17960602
Alignment:
Q  107 ataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttga 188  Q
    |||||||||| ||||||| ||||| |||||||||| |||| || ||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||    
T  17960520 ataattcatgacttgggtgtgcataattcatgatttgttgatgggaaatgagttgttgttggtgactttgtaaaatgggttga 17960602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 17 - 70
Target Start/End: Original strand, 34439460 - 34439513
Alignment:
Q  17 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatc 70  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  34439460 ctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattatgataagtttcatgatc 34439513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 25 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 8631912 - 8631801
Alignment:
Q  25 gtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggt 124  Q
    ||||||||||| | ||||||| || ||| ||||| ||||||| |  ||| | ||||||||||| |  ||||| |  |||||||| |||||||||||||||    
T  8631912 gtgaattatgctttgttgttgttggattgtgataagtttcataacaaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgatcattcatggcttgggt 8631813  T
Q  125 ttgcatgattca 136  Q
    ||||||||||||    
T  8631812 ttgcatgattca 8631801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 64 - 180
Target Start/End: Original strand, 9590918 - 9591035
Alignment:
Q  64 catgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgtt 162  Q
    |||| ||||| | ||||||||||||| ||| ||||  ||| |||| ||||||| ||||||| | |||  ||||||||| | || ||||||||||||||||    
T  9590918 catgttcaattgatgttgttgttgttaagtgatattgttgttgatgattcatgacttgggtgttcatagttcatgatttgatgatgagaaatgagttgtt 9591017  T
Q  163 gtcggtggttttgtaaaa 180  Q
    || | |||||||||||||    
T  9591018 gttgttggttttgtaaaa 9591035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 77 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 12953034 - 12952915
Alignment:
Q  77 tgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttg 175  Q
    ||||||||||| | ||  ||||  ||| |||| ||||||||||||||| | ||| | |||||| ||| || |||||||||||||||||| | ||||||||    
T  12953034 tgttgttgttgctaagagatattgttgttgatgattcatggcttgggtgttcataaatcatgatttgatgatgagaaatgagttgttgttgttggttttg 12952935  T
Q  176 t-aaaatgggttgataatga 194  Q
    | ||||||||||||| ||||    
T  12952934 taaaaatgggttgattatga 12952915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 17938701 - 17938582
Alignment:
Q  20 aattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggct 119  Q
    ||||| |||||||||| | ||||||| || ||| || |   ||||||||||||| | ||||||||||| |  ||||| |  ||||| || ||||||||||    
T  17938701 aattgatgaattatgctttgttgttgttggattgtggttattttcatgatcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgataatcattcatggct 17938602  T
Q  120 tgggtttgcatgattcatga 139  Q
    ||||||| ||||||||||||    
T  17938601 tgggtttacatgattcatga 17938582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 39 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 15876176 - 15876034
Alignment:
Q  39 gttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatg 138  Q
    ||||||| |||||| ||||| | |||||| ||||| | ||||||||||| | ||| || |  || ||||| ||||||||||| ||| | ||| |||||||    
T  15876176 gttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattgatgttgttgttggtaagtgatgttgttaatgatgattcatggcttaggtattcataattcatg 15876077  T
Q  139 a-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaa 180  Q
    | |||| | |||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||    
T  15876076 atttgtggatgagaaatgagttggtgttggtagtttggtaaaa 15876034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 77 - 164
Target Start/End: Original strand, 3576615 - 3576703
Alignment:
Q  77 tgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgt 164  Q
    ||||||||||| | ||| ||||  | | |||| ||||||||||||||| | ||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  3576615 tgttgttgttgctaagtaatattgtggttgatgattcatggcttgggtgttcataattcatgatttgttgatgagaaatgagttgttgt 3576703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 39 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 16880231 - 16880131
Alignment:
Q  39 gttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatg 138  Q
    ||||||| |||||| ||||| | |||||| ||||| | |||| |||||| | ||| || |  | |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  16880231 gttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattgatgttattgttgctaagtgatgttgtggatgataattcatggcttgggtgtgcataattcatg 16880132  T
Q  139 a 139  Q
    |    
T  16880131 a 16880131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 77 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 34559969 - 34559857
Alignment:
Q  77 tgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttg 175  Q
    ||||||||||| | ||| ||||  ||| |||| |||||||||||| || | ||| | |||| ||| | || |||||| ||||||||||| | ||||||||    
T  34559969 tgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgagtgttcataaatcataatttgatgatgagaattgagttgttgttgttggttttg 34559870  T
Q  176 taaaatgggttga 188  Q
    |||||||||||||    
T  34559869 taaaatgggttga 34559857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 47
Target Start/End: Complemental strand, 28558301 - 28558271
Alignment:
Q  17 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgat 47  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28558301 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgat 28558271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 105 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 17191583 - 17191511
Alignment:
Q  105 tgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaa 179  Q
    |||| |||||||||||| || | ||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||    
T  17191583 tgatgattcatggcttgagtgttcataattcatgatttgttgatgagaaatgagttgtt---ggtggttttgtaaa 17191511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 141; Significance: 4e-74; HSPs: 30)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 17 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 11584184 - 11583982
Alignment:
Q  17 ctcaattggtgaattatgc---atggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattc 113  Q
    |||||||||||||||||||    | ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11584184 ctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgttgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatggttgatgataattc 11584085  T
Q  114 atggcttggg-tttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgaatttgatg 212  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||    
T  11584084 atggcttgggttttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgttcgtggttttgtaaaatgggttgatgatgaagaagtttgtttttgatg 11583985  T
Q  213 atg 215  Q
    |||    
T  11583984 atg 11583982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 128; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 11 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 2031946 - 2031783
Alignment:
Q  11 attatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataa 110  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  2031946 attatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatgataa 2031847  T
Q  111 ttcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 173  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||    
T  2031846 ttcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttt 2031783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 11 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 11342821 - 11342635
Alignment:
Q  11 attatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttg-ttgtttagtcatatgtttgatgata 109  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||     
T  11342821 attatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgtttgtttagtcatattgttgatgatg 11342722  T
Q  110 attcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggttgataatga 194  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||  || || ||||||||||||| ||||    
T  11342721 atatatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtgtcttggtgaaaatgggttgattatga 11342635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 17 - 194
Target Start/End: Original strand, 1168321 - 1168500
Alignment:
Q  17 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 116  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||| | |||||| |  ||||||||||||||||    
T  1168321 ctcaattggtgaattatgcaatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtcatgttgttgatgataattcatg 1168420  T
Q  117 gcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggttgataatga 194  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| |||  | ||||||||||||| ||||    
T  1168421 gcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatgagatgttgttggtgttttgatgaaaatgggttgattatga 1168500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 17 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 28261651 - 28261498
Alignment:
Q  17 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 116  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |   |||||||||||||||    
T  28261651 ctcaattggtgaattatgcattgttgttgataaattgtgatatgttttatgatcaattgttgttgttgttgtttagtcatgttgctgatgataattcatg 28261552  T
Q  117 gcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 169  Q
    |||||||||||||| |||| | | |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  28261551 gcttgggtttgcataattcttggtttgttgttgagaaatgagatgttgttggtg 28261498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 17 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 21397222 - 21397073
Alignment:
Q  17 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttg---ttgttgtttagtcatatgtttgatgataattc 113  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||   |||||||| |||||| |  |||||||||||||    
T  21397222 ctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgttgttgttattgttgttaagtcatgttgttgatgataattc 21397123  T
Q  114 atggcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgtt 162  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| ||||    
T  21397122 atggcttgggtttgcatgattcatggtttgttattgagaaatgagatgtt 21397073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 11 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 21205062 - 21204898
Alignment:
Q  11 attatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataa 110  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||| || |  || ||  |||    
T  21205062 attatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatatttgttgttgttgttaagtgatgttatttattctaa 21204963  T
Q  111 ttcatggcttgggtttgcatgattcatga--ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 173  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||    
T  21204962 ttcatggcttgggtatgcatgattcataattttgttgttgtgaaataagttgttgttgttggttt 21204898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 18 - 169
Target Start/End: Original strand, 21646857 - 21647009
Alignment:
Q  18 tcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcat-atgtttgatgataattcatg 116  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  21646857 tcaattggtgaattatgtatcgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaattgttgctgttgttgtttagtcatgatg-ttgatgataattcatg 21646955  T
Q  117 gcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 169  Q
    ||||||||||| || |||  | | |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  21646956 gcttgggtttgtataattattggtttgttgttgagaaatgagatgttgttggtg 21647009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 17 - 169
Target Start/End: Original strand, 11337303 - 11337455
Alignment:
Q  17 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 116  Q
    |||| |||||||||||||    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||| | |||||| |  ||||||||||||||||    
T  11337303 ctcatttggtgaattatgttatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtcatgtcgttgatgataattcatg 11337402  T
Q  117 gcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 169  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  11337403 gcttgagtttacatgattcatgattgttgttgagaaatgagatgttgttggtg 11337455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 17 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 24475708 - 24475560
Alignment:
Q  17 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 116  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  24475708 ctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgt--tatgtttcatgatcaat---tgttgttgttgtttagtcatgttgttgatgataattcatg 24475614  T
Q  117 gcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 169  Q
    |||||||||||||| |||| | | |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  24475613 gcttgggtttgcataattcttggtttgttgttgagaaatgagatgttgttggtg 24475560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 17 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 4865393 - 4865239
Alignment:
Q  17 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataa-ttcat 115  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| | |||||||| |||| |  |||||||||| |||||    
T  4865393 ctcaattggtgaattatgcattgtggttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaattgttgttatggttgtttattcatgttgttgatgataatttcat 4865294  T
Q  116 ggcttgggtttgcatgattcatg-attgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 169  Q
    ||||||||||||||| |||| || ||||||||||||| ||||| |||||| ||||    
T  4865293 ggcttgggtttgcataattcttgaattgttgttgagagatgaggtgttgttggtg 4865239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 17 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 20712206 - 20712036
Alignment:
Q  17 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 116  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||| ||| |||||||||| | ||||||||||||| |||||| |  |||||| |||||||||    
T  20712206 ctcaattggtgaattatgctttgttgttgatgaattgtgataagttgcatgatcaattgatgttgttgttgttaagtcatgttgttgatgttaattcatg 20712107  T
Q  117 gcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggt 185  Q
    |||||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||||||| | |||||| || |||||||||    
T  20712106 gcttgggtatgcatgattcataatttgttgttgtgaaataagttgttgttgttggtttggtgaaaatgggt 20712036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 11 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 21650831 - 21650668
Alignment:
Q  11 attatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataa 110  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||||| ||| || |  |  ||| |||    
T  21650831 attatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgttatgaatgctaa 21650732  T
Q  111 ttcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 173  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||| | ||||||| | ||||| ||||||||| | ||||||    
T  21650731 ttcatggtttgggtatgcatgattcataatttgttgtggtgaaataagttgttgttgttggttt 21650668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 134 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 16105656 - 16105573
Alignment:
Q  134 tcatgattgttgttgagaaa-tgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgaatttgatgatgt 216  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  16105656 tcatgattgttgttgagaaaatgagttgttgttggtggttttgtaaaatgggttgataaagaagaagtttgattttgatgatgt 16105573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 18 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 21906846 - 21906729
Alignment:
Q  18 tcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatgg 117  Q
    ||||||| ||||||||||   |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||   || |||||||||| |||||| |  |||||||||||||||||    
T  21906846 tcaattgatgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaat---tgatgttgttgttaagtcatgttgttgatgataattcatgg 21906750  T
Q  118 cttgggtttgcatgattcatg 138  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  21906749 cttgggtttgcatgattcatg 21906729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 134 - 216
Target Start/End: Original strand, 109075 - 109158
Alignment:
Q  134 tcatgattgttgttgagaaa-tgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgaatttgatgatgt 216  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||    
T  109075 tcatgattgttgttgagaaaatgagttgttgttggtggttttgtaaaatgggttgatagagaagaagtttgattttgatgatgt 109158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 17 - 141
Target Start/End: Original strand, 24183249 - 24183370
Alignment:
Q  17 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 116  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||| |||||| ||||  |||||||||||||| | || |||||||| |  ||||| |   ||||||||||| |||    
T  24183249 ctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgaattgtgatgagtttcatgatcaattgatggtgttgttgatatgtcatgt---tgatgataattaatg 24183345  T
Q  117 gcttgggtttgcatgattcatgatt 141  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  24183346 gcttgggtttgcatgattcatgatt 24183370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 26 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 19405658 - 19405503
Alignment:
Q  26 tgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtt 125  Q
    |||||||||  | ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| | | |||||  || |  || || |  ||||||||||||||||||||||||     
T  19405658 tgaattatgattcgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatattgttactggtatgtgatgttgttgatgataattcatggcttgggta 19405559  T
Q  126 tgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaa 180  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||| |||| ||| ||||||    
T  19405558 tgcatgattcatgatttgttgtggagaaatgagatgttgttggtgttttggtaaaa 19405503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 20 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 7728547 - 7728378
Alignment:
Q  20 aattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggct 119  Q
    ||||| ||||||||||   ||||||| |||||| ||||| | |||||| ||||| | ||||||||||| | ||| || |  |||||||||||| || |||    
T  7728547 aattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgataatttatcgct 7728448  T
Q  120 tgggtttgcatgattcatg-attgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttga 188  Q
    ||||| ||||| ||||||| ||||||| ||||| ||||| |||||| ||||  |||| ||||||||||||    
T  7728447 tgggtgtgcataattcatgaattgttggtgagagatgaggtgttgttggtgactttgaaaaatgggttga 7728378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 47 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 23466557 - 23466434
Alignment:
Q  47 tgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcat-atgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgtt 144  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||| | ||| || ||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  23466557 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatgatgtt-gatgatagttcatggcttgggtatgcatgattcatgatttgtt 23466459  T
Q  145 gttgagaaatgagttgttgtcggtg 169  Q
    |||||| |||||  |||||| ||||    
T  23466458 gttgaggaatgatatgttgttggtg 23466434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 20 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 3673989 - 3673818
Alignment:
Q  20 aattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggct 119  Q
    ||||| ||||||||||   ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||| | ||  |  || |||||||| ||||||||||    
T  3673989 aattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagcgaggtggttgatgatgattcatggct 3673890  T
Q  120 tgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggttgat 189  Q
    ||||| | ||| | ||| || ||| || |||||||| ||||||||| | |||||| || |||||||||||||    
T  3673889 tgggtgttcataaatcacgatttgatgatgagaaataagttgttgttgttggtttggtgaaaatgggttgat 3673818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 39 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 21617124 - 21616974
Alignment:
Q  39 gttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatg 138  Q
    ||||||| |||||| ||||  | |||||| ||||| | ||||||||||| | ||| ||||  ||| || | ||||||||||||||| | ||| |||||||    
T  21617124 gttgttgttgaattgtgatgagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgttgattcatggcttgggtgttcataattcatg 21617025  T
Q  139 a-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttga 188  Q
    | ||| || |||||| |||| |||||| | |||||||||||||||||||||    
T  21617024 atttgatgatgagaagtgagctgttgtggttggttttgtaaaatgggttga 21616974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 26 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 23494040 - 23493875
Alignment:
Q  26 tgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtt 125  Q
    ||||||||||   ||||||| |||||| ||||| | |||||| ||||| | ||||||||||| | ||| || |  |||||||| |||||||||||||||     
T  23494040 tgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgatgattcatggcttgggtg 23493941  T
Q  126 tgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggttgat 189  Q
    | ||| |||||||| ||| || |||||||| ||||||||| | |||||| || |||||| ||||||    
T  23493940 ttcataattcatgatttgatgatgagaaataagttgttgttgttggtttggtgaaaatgagttgat 23493875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 105 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 16595550 - 16595474
Alignment:
Q  105 tgataattcatggcttgggtttgcatgattcatg-attgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaa 180  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||| ||||||    
T  16595550 tgataattcatgacttgggtgtgcatgattcatgaattgttgatgagaaatgagatgttgttggtagtttggtaaaa 16595474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 105 - 188
Target Start/End: Original strand, 32966352 - 32966436
Alignment:
Q  105 tgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgattg-ttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttga 188  Q
    ||||||||||||||||| |  ||||| |||||| |||| ||| |||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||    
T  32966352 tgataattcatggcttgagcgtgcataattcataattggttgatgagaaatgagttgttgttggtgactttgtaaaatgggttga 32966436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 20 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 19862336 - 19862183
Alignment:
Q  20 aattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggct 119  Q
    ||||| ||||||||||   ||||||| |||||| ||||| |  |||||  |||| | ||||||||||| | ||| ||||  ||| |||| ||||||| ||    
T  19862336 aattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagaatcatgtgcaattgatgttgttgttgctaagtgatattattgttgatgattcatgact 19862237  T
Q  120 tgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggtt 172  Q
    ||||| | ||| |||||||| ||| || |||||||||||||||||| |||||||    
T  19862236 tgggtgttcataattcatgatttgatgatgagaaatgagttgttgttggtggtt 19862183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 177 - 215
Target Start/End: Original strand, 24225596 - 24225634
Alignment:
Q  177 aaaatgggttgataatgaagaagtttgaatttgatgatg 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24225596 aaaatgggttgataatgaagaagtttgattttgatgatg 24225634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 77 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 6456694 - 6456580
Alignment:
Q  77 tgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttg 175  Q
    ||||||||||||| ||  ||||  ||| |||| ||||||||||||||| | ||||| |||||| ||| || |||||||| ||||||||| | || |||||    
T  6456694 tgttgttgttgttaagagatatcgttgttgatgattcatggcttgggtgttcatgaatcatgatttgatgatgagaaataagttgttgttgttgtttttg 6456595  T
Q  176 ta-aaatgggttgat 189  Q
    || ||| ||||||||    
T  6456594 tacaaacgggttgat 6456580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 77 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 37983434 - 37983325
Alignment:
Q  77 tgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttg 175  Q
    ||||||||||||| ||| ||||  ||| |||| |||||| |||||||| | ||| | ||| |||| | || ||| ||||||||||||||   ||||||||    
T  37983434 tgttgttgttgttaagtgatattgttgttgatgattcatagcttgggtgttcataaatcaggatttgatgatgaaaaatgagttgttgt---tggttttg 37983338  T
Q  176 taaaatgggttga 188  Q
    |||||||||||||    
T  37983337 taaaatgggttga 37983325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 77 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 29918035 - 29917931
Alignment:
Q  77 tgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttg 175  Q
    ||||||||||| | ||  ||||  ||| |||| ||||||||||||||| | ||| | |||||| ||| ||||||||||| | || |||||| ||||||||    
T  29918035 tgttgttgttgctaagagatattgttgttgatgattcatggcttgggtgttcataaatcatgatttgatgttgagaaataaattattgtcgttggttttg 29917936  T
Q  176 taaaa 180  Q
    |||||    
T  29917935 taaaa 29917931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1867 (Bit Score: 132; Significance: 1e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold1867
Description:

Target: scaffold1867; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 17 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 274 - 75
Alignment:
Q  17 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 116  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |  ||||| |  ||||||||||||||||    
T  274 ctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgataattcatg 175  T
Q  117 gcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgaatttgatgatgt 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  174 gcttgggtttgcatgattcatgattgttgctgagaaatgagttgttgttgttggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgattttgatgatgt 75  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0833 (Bit Score: 130; Significance: 2e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0833
Description:

Target: scaffold0833; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 39 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 3407 - 3230
Alignment:
Q  39 gttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatg 138  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |  ||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3407 gttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatg 3308  T
Q  139 attgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgaatttgatgatgt 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3307 attgttgttgagaaatgagttgttgttggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgattttgatgatgt 3230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 129; Significance: 6e-67; HSPs: 32)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 11 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 18583453 - 18583264
Alignment:
Q  11 attatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataa 110  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||                |||||||    
T  18583453 attatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaattgatgttgttgttg----------------atgataa 18583370  T
Q  111 ttcatggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgaatttga 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18583369 ttcatggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgttggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgattttga 18583270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 11 - 181
Target Start/End: Original strand, 35015276 - 35015447
Alignment:
Q  11 attatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataa 110  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |    
T  35015276 attatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatgatga 35015375  T
Q  111 ttcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaat 181  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||    
T  35015376 tacatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaat 35015447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 17 - 181
Target Start/End: Original strand, 19983416 - 19983581
Alignment:
Q  17 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 116  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||  |||||||| || ||||    
T  19983416 ctcaattagtgaattatgcatgattgttgatgaattgtgatatgtttcatggttagtggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatgatgatacatg 19983515  T
Q  117 gcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaat 181  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||    
T  19983516 gcttgggtttgcatgattcatggtttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaat 19983581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 18 - 169
Target Start/End: Original strand, 25744331 - 25744483
Alignment:
Q  18 tcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatgg 117  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||    
T  25744331 tcaagtggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaaatgttgttgttgttgtttagtcatgttgttgatgataattcatgg 25744430  T
Q  118 cttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 169  Q
    ||||||||||||| |||| | | ||||||| |||||||||| |||||| ||||    
T  25744431 cttgggtttgcataattcttggtttgttgtagagaaatgagatgttgttggtg 25744483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 77 - 216
Target Start/End: Original strand, 18823573 - 18823712
Alignment:
Q  77 tgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt 176  Q
    ||||||||||| |  ||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||    
T  18823573 tgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgataatccatggcttgggtttgcatgattcatgattgttgtggagaaatgagttgttggtggtggttttgt 18823672  T
Q  177 aaaatgggttgataatgaagaagtttgaatttgatgatgt 216  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  18823673 aaaatggcttgataaagaagaagtttgattttgatgatgt 18823712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 11 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 26089871 - 26089718
Alignment:
Q  11 attatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataa 110  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||||| ||| || |  | |||| |||    
T  26089871 attatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgttatggatgctaa 26089772  T
Q  111 ttcatggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgt 164  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||    
T  26089771 ttcatggtttgggtatgcatgattcataattgttgttgtgaaataagttgttgt 26089718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 17 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 32898920 - 32898779
Alignment:
Q  17 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 116  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| |  |||||||||||| |||    
T  32898920 ctcaattggtgaattatgcattattgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgaagttgttgttgtttagtcatgttgttgatgataattaatg 32898821  T
Q  117 gcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgag 157  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  32898820 gcttgggtttgcatgattcatggtttgttgttgagaaatgag 32898779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 77 - 216
Target Start/End: Original strand, 18839428 - 18839567
Alignment:
Q  77 tgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt 176  Q
    ||||||||||| |  ||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||    
T  18839428 tgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgataatccatggcttgggtttgcatgattcatgattgttgtggagaaatgagttgttggtggtggttttgt 18839527  T
Q  177 aaaatgggttgataatgaagaagtttgaatttgatgatgt 216  Q
    |||||| ||||| || |||||||||||| |||||||||||    
T  18839528 aaaatgagttgaaaaagaagaagtttgattttgatgatgt 18839567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 11 - 173
Target Start/End: Original strand, 18002615 - 18002777
Alignment:
Q  11 attatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataa 110  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| |  |  | |||| |||    
T  18002615 attatgctcaattgatgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgacgttatggatgctaa 18002714  T
Q  111 ttcatggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 173  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||    
T  18002715 ttcatggcttgggtatgcatgattcatacttgttgttgtgaaataagttgttgttgttggttt 18002777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 11 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 23995059 - 23994904
Alignment:
Q  11 attatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataa 110  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| || |  |  ||| |||    
T  23995059 attatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgttatgaatgctaa 23994960  T
Q  111 ttcatggcttgggtttgcatgattcatga--ttgttgttgagaaatgagttgttgt 164  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||| ||||| |||||||||    
T  23994959 ttcatggcttgggtatgcatgattcataattttgttgttgtgaaataagttgttgt 23994904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 17 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 22441064 - 22440911
Alignment:
Q  17 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 116  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||    
T  22441064 ctcaattggtgaattatgcattgttgttcatgatttgtgataagtttcatgatcaattgttgttgttgttgttaagtcatgttgttgatgataattcatg 22440965  T
Q  117 gcttgggtttgcatgattcatga--ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 169  Q
    ||||||| |||||||||||||||  ||||| | |||||||||| |||||| ||||    
T  22440964 gcttggg-ttgcatgattcatgattttgttatggagaaatgagatgttgttggtg 22440911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 20 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 31628395 - 31628245
Alignment:
Q  20 aattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggct 119  Q
    |||||||||||||||| | ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |  ||||| |  |||||||||||||||||||    
T  31628395 aattggtgaattatgctttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggct 31628296  T
Q  120 tgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 169  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||| ||||    
T  31628295 tgggtttgcatgattcatgatttgttgtggagaaatgagatgttgttggtg 31628245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 11 - 173
Target Start/End: Original strand, 15742339 - 15742505
Alignment:
Q  11 attatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatgg---ttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatga 107  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |   |||||||||||||| ||| || |  |  |||     
T  15742339 attatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatagatgttgttgttgttgttaagtgatgttatgaatgc 15742438  T
Q  108 taattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 173  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||    
T  15742439 taattcatggcttgggtatgcatgattcataatttgttgttgtgaaataagttgttgttgctggttt 15742505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 18 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 18777275 - 18777119
Alignment:
Q  18 tcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| ||| || |  | |||| ||||||||||    
T  18777275 tcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatgaatgttgttgttgttaagtgatgttatggatgctaattcatgg 18777176  T
Q  118 cttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 173  Q
    ||||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||    
T  18777175 cttgggtatgcatgattcataatttgttgttgtgaaataagttgttgttgttggttt 18777119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 17 - 169
Target Start/End: Original strand, 13014826 - 13014979
Alignment:
Q  17 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 116  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| ||||||| || |||| |||||| |  ||||||||||||| ||    
T  13014826 ctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcaagatcaattgttgttgctgatgttaagtcatgttgttgatgataattcgtg 13014925  T
Q  117 gcttgggtttgcatgattcatga--ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 169  Q
    ||||||| ||||||||||| |||  ||||| | |||||||||| |||||| ||||    
T  13014926 gcttggg-ttgcatgattcttgattttgttatggagaaatgagatgttgttggtg 13014979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 134 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 4991085 - 4991002
Alignment:
Q  134 tcatgattgttgttgagaaa-tgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgaatttgatgatgt 216  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  4991085 tcatgattgttgttgagaaaatgagttgttgttggtggttttgtaaaatgggttgataaagaagaagtttgattttgatgatgt 4991002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 20 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 16086144 - 16086001
Alignment:
Q  20 aattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggct 119  Q
    |||||||||||||| | | ||||||| |||||| ||||| |||||||||||| | | ||||||||||| |  ||||| |  || ||||||||||||| ||    
T  16086144 aattggtgaattataccttgttgttgttgaattatgataagtttcatgatcatttgatgttgttgttgatatgtcatgttgttaatgataattcatgact 16086045  T
Q  120 tgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttg 163  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| |||||    
T  16086044 tgggtttgcatgattcatgatttatgtggagaaatgagatgttg 16086001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 20 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 18432770 - 18432626
Alignment:
Q  20 aattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggct 119  Q
    |||||||||||||||| | ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| | || |||||||| |  || || |  |||||||||||||||||||    
T  18432770 aattggtgaattatgctttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgatgttgttgatatgttatgttgttgatgataattcatggct 18432671  T
Q  120 tgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgttg 163  Q
    ||||||||||||||| || | || ||||||| ||||||| |||||    
T  18432670 tgggtttgcatgattaatggtttattgttgaaaaatgagatgttg 18432626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 20 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 18399065 - 18398890
Alignment:
Q  20 aattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggct 119  Q
    ||||| ||||||||||   ||||||| |||||| ||||  | |||||| ||||| | ||||||||||| | ||| || |  |||||||||||||||||||    
T  18399065 aattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtgatgagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgataattcatggct 18398966  T
Q  120 tgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggttgataatga 194  Q
    ||||| ||||| |||||||| |  || | |||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  18398965 tgggtgtgcataattcatgaattgtgataagaaatgagttgttgttgttggttttgtaaaaatgggttgattatga 18398890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 20 - 181
Target Start/End: Original strand, 18381803 - 18381965
Alignment:
Q  20 aattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggct 119  Q
    ||||| |||||||||| | ||||||| |||||| ||||| |  ||||| ||||| | ||||||||||| | ||| || |  ||| |||| ||||||||||    
T  18381803 aattgttgaattatgctttgttgttgttgaattgtgataagagtcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgttgatgattcatggct 18381902  T
Q  120 tgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaat 181  Q
    ||||| | ||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  18381903 tgggtattcataattcatgatttgttgatgagaaatgagttgttgttggtggttttgtgaaat 18381965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 17 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 18570409 - 18570271
Alignment:
Q  17 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 116  Q
    |||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |  || ||||||||| ||| || |  | |||| |||||||||    
T  18570409 ctcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagaagtagttgttgttaagtgatgttatggatgctaattcatg 18570310  T
Q  117 gcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaat 154  Q
    || ||||| |||||||||||| | ||||||||| |||||    
T  18570309 gcctgggtatgcatgattcataatttgttgttgtgaaat 18570271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 105 - 216
Target Start/End: Original strand, 17083383 - 17083496
Alignment:
Q  105 tgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggttgataatgaagaagttt 202  Q
    |||| ||||||||||||||| | ||| | |||||||| | || | |||||||||||||||| | || |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17083383 tgatgattcatggcttgggtgttcataaatcatgatttgatgattagaaatgagttgttgttgttgtttttgtgaaaatgggttgataatgaagaagttt 17083482  T
Q  203 gaatttgatgatgt 216  Q
    || |||||||||||    
T  17083483 gattttgatgatgt 17083496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 20 - 188
Target Start/End: Original strand, 22361885 - 22362054
Alignment:
Q  20 aattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggct 119  Q
    ||||| ||||||||||   ||||||| |||||| ||||    |||||| ||||| | ||||||||||| | ||| ||||  ||| |||| ||||||||||    
T  22361885 aattgatgaattatgctatgttgttgttgaattgtgatgaaattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggct 22361984  T
Q  120 tgggtttgcatgattcatg-attgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttga 188  Q
    ||||| | ||| ||||||| |||| || |||||| ||||||||||| | | |||||||||||||||||||    
T  22361985 tgggtgttcataattcatgaattgatgatgagaattgagttgttgttgttagttttgtaaaatgggttga 22362054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 39 - 164
Target Start/End: Original strand, 25367376 - 25367502
Alignment:
Q  39 gttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatg 138  Q
    ||||||| |||||| ||||| | |||||| ||||| | ||||||||||| | ||| || |  ||   ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  25367376 gttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttatcgataattcatggcttgggtgtgcatgattcatg 25367475  T
Q  139 -attgttgttgagaaatgagttgttgt 164  Q
     ||||||| ||||||||||| ||||||    
T  25367476 aattgttgatgagaaatgagatgttgt 25367502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 20 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 16106643 - 16106499
Alignment:
Q  20 aattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggct 119  Q
    |||||||||||||| | | ||||||| |||||| ||||| |||||||||||| | | ||||||||||| |  ||||| |  || ||||||||||||| |     
T  16106643 aattggtgaattataccttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcatttgatgttgttgttgatatgtcatgttgttaatgataattcatgac- 16106545  T
Q  120 tgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 169  Q
        ||||||||||||||||||  ||| |||||||||| |||||| ||||    
T  16106544 ----tttgcatgattcatgatttatgtggagaaatgagatgttgttggtg 16106499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 65 - 173
Target Start/End: Original strand, 28195259 - 28195367
Alignment:
Q  65 atgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttg 163  Q
    ||||||||| ||||| ||||||| | ||| || |  ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||| || ||||||||||||||| |||||    
T  28195259 atgatcaattgttgtggttgttgctaagtgatgttgttgatgataattcatggcttgagtttgcataatt-atgatttattgttgagaaatgagatgttg 28195357  T
Q  164 tcggtggttt 173  Q
    | ||| ||||    
T  28195358 ttggtagttt 28195367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 107 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 15740269 - 15740211
Alignment:
Q  107 ataattcatggcttgggtttgcatgattcatg-attgttgttgagaaatgagttgttgt 164  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||    
T  15740269 ataattcatggtttgggtgtgcatgattcatgaattgttgatgagaaatgagatgttgt 15740211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 75 - 180
Target Start/End: Original strand, 18629786 - 18629892
Alignment:
Q  75 gttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 173  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||  ||| |||| |||||||| |||||| | ||| | |||||| ||| || |||||||| ||||||||| | ||||||    
T  18629786 gttgttgttgttgttaagtgatattgttgttgatgattcatggtttgggtgttcataaatcatgatttgatgatgagaaataagttgttgttgttggttt 18629885  T
Q  174 tgtaaaa 180  Q
    |||||||    
T  18629886 tgtaaaa 18629892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 39 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 25651345 - 25651197
Alignment:
Q  39 gttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatg 138  Q
    ||||||| |||||| ||||  | |||||| ||||| | ||||||||||| | ||| ||||  ||| |||| ||||||||||||||| | ||| | |||||    
T  25651345 gttgttgttgaattatgatgagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtgttcataaatcatg 25651246  T
Q  139 att-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggt 185  Q
    ||| | || |||||| | ||||||||| | ||||||||| |||||||||    
T  25651245 attggatgatgagaattaagttgttgttgttggttttgtgaaaatgggt 25651197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 105 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 25919655 - 25919571
Alignment:
Q  105 tgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttga 188  Q
    |||| ||||||||||||||| | ||| |||||||||| |||| ||| ||||||||| |||| ||||  ||||||||||| |||||    
T  25919655 tgatgattcatggcttgggtattcataattcatgatttgttgatgaaaaatgagttattgttggtgactttgtaaaatgagttga 25919571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 105 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 33324735 - 33324675
Alignment:
Q  105 tgataattcatggcttgggtttgcatgattcatg-attgttgttgagaaatgagttgttgt 164  Q
    |||| ||||||||||||||| | ||| ||||||| |||| || ||||||||||||||||||    
T  33324735 tgatgattcatggcttgggtattcataattcatgaattggtgatgagaaatgagttgttgt 33324675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 105 - 164
Target Start/End: Original strand, 35136217 - 35136277
Alignment:
Q  105 tgataattcatggcttgggtttgcatgattcatg-attgttgttgagaaatgagttgttgt 164  Q
    |||| ||||||||||||||| | ||| ||||||| |||| || ||||||||||||||||||    
T  35136217 tgatgattcatggcttgggtattcataattcatgaattggtgatgagaaatgagttgttgt 35136277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 128; Significance: 2e-66; HSPs: 40)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 11 - 173
Target Start/End: Original strand, 41506928 - 41507091
Alignment:
Q  11 attatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataa 110  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  41506928 attatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatgataa 41507027  T
Q  111 ttcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 173  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||    
T  41507028 ttcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttt 41507091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 11 - 181
Target Start/End: Original strand, 24716981 - 24717152
Alignment:
Q  11 attatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataa 110  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||| |    
T  24716981 attatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatttgtttcatgttcaatggttgttgttgatgtttagtcatattgttgatgatga 24717080  T
Q  111 ttcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaat 181  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  24717081 tacatggcttgggtttgcatgattcataatttgttgttgataaatggattgttgttggtggttttgtaaaat 24717152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 11 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 39115411 - 39115267
Alignment:
Q  11 attatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataa 110  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  39115411 attatgctcaattggtgaattatgcatagttgttgatgaatcgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatggttgatgataa 39115312  T
Q  111 ttcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaat 154  Q
    |||||| |||| || |||||||||||| | || ||||||||||||    
T  39115311 ttcatgacttgtgtatgcatgattcataatttattgttgagaaat 39115267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 20 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 41246785 - 41246635
Alignment:
Q  20 aattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggct 119  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||||| |||||| |  |||||||||||||||||||    
T  41246785 aattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgttaagtcatgttgttgatgataattcatggct 41246686  T
Q  120 tgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 169  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||  |||||| ||||    
T  41246685 tgggtttgcatgattcatggtttgttgttgagaaatgaaatgttgttggtg 41246635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 17 - 169
Target Start/End: Original strand, 19993171 - 19993324
Alignment:
Q  17 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 116  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||  |||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  19993171 ctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataaatttcatcatcaattgttgttgttgttgtttagtcatgttgttgatgataattcatg 19993270  T
Q  117 gcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 169  Q
    ||| |||||||||| |||| | |||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  19993271 gctagggtttgcataattcttggattgttgttgagaaatgagatgttgttggtg 19993324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 17 - 164
Target Start/End: Original strand, 22234920 - 22235068
Alignment:
Q  17 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 116  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  22234920 ctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaattgttgttgttgttgtttagtcatgttgttgatgataattcatg 22235019  T
Q  117 gcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgttgt 164  Q
    | |||||||||||| |||| | | ||||||||||| | |||| ||||||    
T  22235020 gattgggtttgcataattcttggtttgttgttgaggattgagatgttgt 22235068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 17 - 169
Target Start/End: Original strand, 20573309 - 20573461
Alignment:
Q  17 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 116  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |  ||||| |  ||||||||||||||||    
T  20573309 ctcaattggtgaattatcctttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgataattcatg 20573408  T
Q  117 gcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 169  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||| ||||    
T  20573409 gcttgggtttgcatgattcatgatttgtgttgagaaatgagatgttgttggtg 20573461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 17 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 37611798 - 37611675
Alignment:
Q  17 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 116  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||| | |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||    
T  37611798 ctcaattggtgaattatgctttgttgttgatgaattgtgaaaagtttcatgatcaattgttgttgttgttgttaagtcatgtggttgatgataattcatg 37611699  T
Q  117 gcttgggtttgcatgattcatgatt 141  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||    
T  37611698 gcttggg-ttgcataattcatgatt 37611675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 17 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 20481735 - 20481565
Alignment:
Q  17 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 116  Q
    ||||||||||||||||| | | |||||||||||||| ||||| ||| |||||||||| | ||||||||||||| |||||| |  |||||| |||||||||    
T  20481735 ctcaattggtgaattatactttgttgttgatgaattgtgataagttgcatgatcaattgatgttgttgttgttaagtcatgttgttgatgttaattcatg 20481636  T
Q  117 gcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggt 185  Q
    |||||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||||||| | |||||| || |||||||||    
T  20481635 gcttgggtatgcatgattcataatttgttgttgtgaaataagttgttgttgttggtttggtgaaaatgggt 20481565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 18 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 274572 - 274416
Alignment:
Q  18 tcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||| ||||| ||| || |  | |||| ||||||||||    
T  274572 tcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttattgttaagtgatgttatggatgctaattcatgg 274473  T
Q  118 cttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 173  Q
    ||||||| ||||||| |||| | ||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||    
T  274472 cttgggtatgcatgaatcataatttgttgttgtgaaataagttgttgttgttggttt 274416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 18 - 173
Target Start/End: Original strand, 641277 - 641433
Alignment:
Q  18 tcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||| ||||| ||| || |  | |||| ||||||||||    
T  641277 tcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttattgttaagtgatgttatggatgctaattcatgg 641376  T
Q  118 cttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 173  Q
    ||||||| ||||||| |||| | ||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||    
T  641377 cttgggtatgcatgaatcataatttgttgttgtgaaataagttgttgttgttggttt 641433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 18 - 173
Target Start/End: Original strand, 827083 - 827239
Alignment:
Q  18 tcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||| ||||| ||| || |  | |||| ||||||||||    
T  827083 tcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttattgttaagtgatgttatggatgctaattcatgg 827182  T
Q  118 cttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 173  Q
    ||||||| ||||||| |||| | ||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||    
T  827183 cttgggtatgcatgaatcataatttgttgttgtgaaataagttgttgttgttggttt 827239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 11 - 185
Target Start/End: Original strand, 16039000 - 16039176
Alignment:
Q  11 attatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataa 110  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||||| ||| || |  | |||| |||    
T  16039000 attatgctcaattagtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgttatggatgctaa 16039099  T
Q  111 ttcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggt 185  Q
    || ||||||||| | |||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||||||| | |||||| || |||||||||    
T  16039100 tttatggcttggatatgcatgattcataatttgttgttgtgaaataagttgttgttgttggtttggtgaaaatgggt 16039176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 20 - 157
Target Start/End: Original strand, 20647949 - 20648087
Alignment:
Q  20 aattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggct 119  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||| ||||||| |  ||||| |  |||||| |||| |||||||    
T  20647949 aattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgtcgttgttgctaggtcatgttgttgatgttaatccatggct 20648048  T
Q  120 tgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgag 157  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||    
T  20648049 tgggtttgcatgattcatgatttgttgtggagaagtgag 20648087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 20 - 157
Target Start/End: Original strand, 20654025 - 20654163
Alignment:
Q  20 aattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggct 119  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||| ||||||| |  ||||| |  |||||| |||||||| |||    
T  20654025 aattggtgaattatgctaagttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgtcgttgttgctaggtcatgttgttgatgttaattcattgct 20654124  T
Q  120 tgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgag 157  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||    
T  20654125 tgggtttgcatgattcatgatttgttgtggagaagtgag 20654163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 26 - 180
Target Start/End: Original strand, 39446892 - 39447046
Alignment:
Q  26 tgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtt 125  Q
    ||||||||||   ||||||| |||||| ||||| | |||||||||||| | ||||||||||| | ||| || |  ||||| ||||||||||||||||||     
T  39446892 tgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgataataattcatggcttgggta 39446991  T
Q  126 tgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaa 180  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||| ||| |||| ||||||    
T  39446992 tgcatgatt-atgatttgttgttgagaaatgagatgttgttggtagtttggtaaaa 39447046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 101 - 169
Target Start/End: Original strand, 20567200 - 20567268
Alignment:
Q  101 ttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 169  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||| ||||    
T  20567200 ttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgtgttgagaaatgagatgttgttggtg 20567268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 77 - 169
Target Start/End: Original strand, 20567335 - 20567427
Alignment:
Q  77 tgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 169  Q
    ||||||||||| |  ||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||| ||||    
T  20567335 tgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgtgttgagaaatgagatgttgttggtg 20567427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 77 - 169
Target Start/End: Original strand, 20573528 - 20573620
Alignment:
Q  77 tgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 169  Q
    ||||||||||| |  ||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||| ||||    
T  20573528 tgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgtgttgagaaatgagatgttgttggtg 20573620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 65 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 25122618 - 25122513
Alignment:
Q  65 atgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga--ttgttgttgagaaatgagttgtt 162  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||| | |||||||||| ||||    
T  25122618 atgatcaatagatgttgttgttgtttagtcatgttgttgatgataattcatggcttggg-ttgcatgattcatgattttgttatggagaaatgagatgtt 25122520  T
Q  163 gtcggtg 169  Q
    || ||||    
T  25122519 gttggtg 25122513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 26 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 38533770 - 38533607
Alignment:
Q  26 tgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtt 125  Q
    ||||||||||   ||||||| |||||| ||||  | |||||| ||||| | ||||||||||| |  || || |  ||||||||||||||||||||||||     
T  38533770 tgaattatgctatgttgttgttgaattgtgatgagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaggtgatgttgttgatgataattcatggcttgggtg 38533671  T
Q  126 tgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttga 188  Q
    ||||| |||||||| |||||| ||||||||||| |||||| || |  |||||||||||||||||    
T  38533670 tgcataattcatgatttgttgatgagaaatgagatgttgttggagactttgtaaaatgggttga 38533607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 84 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 29760005 - 29759893
Alignment:
Q  84 gttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaat 181  Q
    |||||||||||||||  |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| |||| ||| ||  ||||    
T  29760005 gttgtttagtcatattgttgatgatgatatatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggtttgttgttggtgttttggtgtaaat 29759906  T
Q  182 gggttgataatga 194  Q
    |||||||| ||||    
T  29759905 gggttgattatga 29759893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 39 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 5854722 - 5854572
Alignment:
Q  39 gttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatg 138  Q
    ||||||| |||||| ||||  | |||||| ||||| | ||||||||||| | ||| ||||  ||| |||| ||||||||||||||| | ||| | |||||    
T  5854722 gttgttgttgaattgtgatgagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtgttcataaatcatg 5854623  T
Q  139 att-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttga 188  Q
    ||| | || |||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  5854622 atttgatgatgagaattgagttgttgttgttggttttgtaaaatgggttga 5854572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 28 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 21681121 - 21680984
Alignment:
Q  28 aattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttg 127  Q
    |||||||| | ||||||| |||||| ||||  |||||||||||||| | |||||||  || |  || || |  |||||||||||||||||||||||| ||    
T  21681121 aattatgctttgttgttgttgaattgtgattagtttcatgatcaattgatgttgttactggtatgtgatgttgttgatgataattcatggcttgggtatg 21681022  T
Q  128 catgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgt 164  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||| || ||||||    
T  21681021 catgattcatgatttgttgtggagaaataagatgttgt 21680984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 108 - 188
Target Start/End: Original strand, 22736046 - 22736127
Alignment:
Q  108 taattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttga 188  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| ||| |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||    
T  22736046 taattcatggcttgggtgtgcataattcatgaattgttgatgaaaaatgagttgttgttggtgactttgtaaaatgggttga 22736127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 20 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 23837325 - 23837163
Alignment:
Q  20 aattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggct 119  Q
    ||||| ||||||||||   ||||||| |||||| || || |  ||||| ||||| | ||||||||||| | ||| || |  ||| |||| ||||||||||    
T  23837325 aattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagagtcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgttgatgattcatggct 23837226  T
Q  120 tgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaat 181  Q
    ||||| | ||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  23837225 tgggtattcataattcatgatttgttgatgagaaatgagttgttggtggtggttttgtgaaat 23837163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 105 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 15969860 - 15969796
Alignment:
Q  105 tgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 169  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||| ||||    
T  15969860 tgataattcatggcttgggtgtgcataattcatgattgtagaggagaaatgagttgttgttggtg 15969796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 39 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 26011602 - 26011452
Alignment:
Q  39 gttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatg 138  Q
    ||||||| |||||| ||||  | |||||| | ||| | ||||||||||| | ||| ||||  ||| |||| ||||||||||||||| | ||| | |||||    
T  26011602 gttgttgttgaattgtgatgagattcatgttgaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtgttcataaatcatg 26011503  T
Q  139 att-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttga 188  Q
    ||| | || |||||| | ||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  26011502 atttgatgatgagaattaagttgttgttgttggttttgtaaaatgggttga 26011452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 110 - 181
Target Start/End: Original strand, 21198362 - 21198434
Alignment:
Q  110 attcatggcttgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaat 181  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||| || | |||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  21198362 attcatggcttgggtgttcataattcatgatttgtggatgagaaatgagttgttgttggtggtttggtaaaat 21198434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 39 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 33528533 - 33528383
Alignment:
Q  39 gttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatg 138  Q
    ||||||| |||||| ||||  | |||||| | ||| | ||||||||||| | ||  |||| |||| |||| ||||||||||||||| | ||| | |||||    
T  33528533 gttgttgttgaattgtgatgagattcatgtttaattgatgttgttgttgctaagagatat-tttgttgatgattcatggcttgggtgttcataaatcatg 33528435  T
Q  139 att-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttgat 189  Q
    ||| | || ||||||||| |||||||| | || |||||||||||||||||||    
T  33528434 atttgatgatgagaaatgggttgttgttgttgattttgtaaaatgggttgat 33528383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 39 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 15933406 - 15933256
Alignment:
Q  39 gttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatg 138  Q
    ||||||| |||||| ||||  | |||||| ||||| | ||||||||||| | ||| ||||  ||| |||| ||||||||||||||| |   | | |||||    
T  15933406 gttgttgttgaattatgatgagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtgtttgtaaatcatg 15933307  T
Q  139 att-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttga 188  Q
    ||| |  | |||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  15933306 atttgaagatgagaattgagttgttgttgttggttttgtaaaatgggttga 15933256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 11 - 137
Target Start/End: Original strand, 24385871 - 24385988
Alignment:
Q  11 attatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataa 110  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||| | ||         ||||||| | ||||||||||||| ||| || |  | |||| |||    
T  24385871 attatgctcaattggtgaattaagcattgttgttgatgaattgtaat---------gatcaatagatgttgttgttgttaagtgattttatggatgctaa 24385961  T
Q  111 ttcatggcttgggtttgcatgattcat 137  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||    
T  24385962 ttcatggcttgggtatgcatgattcat 24385988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 20 - 73
Target Start/End: Original strand, 20561751 - 20561804
Alignment:
Q  20 aattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaat 73  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  20561751 aattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaat 20561804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 64 - 189
Target Start/End: Original strand, 23226240 - 23226368
Alignment:
Q  64 catgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgtt 162  Q
    |||| ||||| | ||||||||||||| ||| ||||  ||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||||| ||| |  |||||||||  |||||    
T  23226240 catgttcaattgatgttgttgttgttaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtattcataattcatgatttgattatgagaaatggattgtt 23226339  T
Q  163 gtcggtggttttgta--aaatgggttgat 189  Q
    || | ||||||||||  ||||||||||||    
T  23226340 gttgttggttttgtaagaaatgggttgat 23226368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 63 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 23149865 - 23149736
Alignment:
Q  63 tcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgt 161  Q
    ||||| ||||| |||||| |||||| | ||| || |  ||| |||| |||||||||||| || | ||| |||||||||| | || ||| |||||||||||    
T  23149865 tcatgttcaatagttgtttttgttgctaagtgatgttgttgttgatgattcatggcttgagtattcataattcatgatttgatgatgaaaaatgagttgt 23149766  T
Q  162 tgtcggtggttttgta--aaatgggttgat 189  Q
    ||| | ||||||||||  ||||||||||||    
T  23149765 tgttgttggttttgtaagaaatgggttgat 23149736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 112 - 181
Target Start/End: Original strand, 24929018 - 24929087
Alignment:
Q  112 tcatggcttgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaat 181  Q
    |||| |||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||    
T  24929018 tcattgcttgggtatgcat-attcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaat 24929087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 64 - 181
Target Start/End: Original strand, 31194488 - 31194606
Alignment:
Q  64 catgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgtt 162  Q
    |||| ||||| | ||||||||||| | | | ||||  ||| |||| |||||| ||||||||   |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||    
T  31194488 catgttcaattgatgttgttgttgctaaatgatattgttgttgatgattcatagcttgggtgcacatgattcatgatttgttggtgaaaaatgagttgtt 31194587  T
Q  163 gtcggtggttttgtaaaat 181  Q
    || ||||  ||||||||||    
T  31194588 gttggtgactttgtaaaat 31194606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 105 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 17285309 - 17285232
Alignment:
Q  105 tgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaat 181  Q
    |||| ||||||||||||||| | ||| |||||||| |||  | |||||||||||||||||| ||| |||||| |||||    
T  17285309 tgatgattcatggcttgggtattcataattcatgacttgaggatgagaaatgagttgttgttggtagttttgcaaaat 17285232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 75 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 22742833 - 22742717
Alignment:
Q  75 gttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 173  Q
    ||||||||||||||| ||  ||||  ||| |||| |||| |||||||||| | ||| | || | | |||||| |||||||| ||||||||| | ||||||    
T  22742833 gttgttgttgttgttgaggaatattgttgttgatgattcgtggcttgggtgttcataaatcttggtttgttgatgagaaataagttgttgttgttggttt 22742734  T
Q  174 tgt-aaaatgggttgat 189  Q
    ||| |||||||||||||    
T  22742733 tgtaaaaatgggttgat 22742717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 77 - 180
Target Start/End: Original strand, 27233244 - 27233348
Alignment:
Q  77 tgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttg 175  Q
    ||||||||||||| ||  ||||  ||| |||| ||||||||||||||| | ||| | |||||||| | |  |||||||| ||||||||| | ||||||||    
T  27233244 tgttgttgttgttaagagatattgttgttgatgattcatggcttgggtgttcataaatcatgatttgataatgagaaataagttgttgttgttggttttg 27233343  T
Q  176 taaaa 180  Q
    |||||    
T  27233344 taaaa 27233348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 125; Significance: 2e-64; HSPs: 2)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 17 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 21642 - 21442
Alignment:
Q  17 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 116  Q
    |||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||| |||||||||| | | | ||||||||||| | |||||| |  ||||||||||||||||    
T  21642 ctcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgattatttgatgttgttgttgctaagtcatgttgttgatgataattcatg 21543  T
Q  117 gcttgggtttgcatgattcatg-attgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgaatttgatgatg 215  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21542 gcttgggtttgcatgattcatgaattgttgttaagaaatgagttgttgttggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgattttgatgatg 21443  T
Q  216 t 216  Q
    |    
T  21442 t 21442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 17 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 31341 - 31141
Alignment:
Q  17 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 116  Q
    |||||||||| |||||| |   |||||||||||||| ||||| ||||||| |||||| | |||| |||||| | |||||| |  ||||||||||||||||    
T  31341 ctcaattggtaaattatactatgttgttgatgaattgtgataagtttcattatcaattgatgtttttgttgctaagtcatgttgttgatgataattcatg 31242  T
Q  117 gcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgaatttgatgatg 215  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  31241 gcttgggtttgcatgattcatgaattgttgttgagaaatgagttgttgttggtggttttgtaaaatgggttgataatgaaaaagtttgattttgatgatg 31142  T
Q  216 t 216  Q
    |    
T  31141 t 31141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0158 (Bit Score: 124; Significance: 6e-64; HSPs: 2)
Name: scaffold0158
Description:

Target: scaffold0158; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 17 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 25088 - 24890
Alignment:
Q  17 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 116  Q
    ||||||||||||||||||  | ||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||| ||||||||||||| |  | ||| |  ||||||||||||||||    
T  25088 ctcaattggtgaattatgttttgttgttgttgaattgtgataagtttcacgatcaattgttgttgttgttgatatggcatgttgttgatgataattcatg 24989  T
Q  117 gcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgaatttgatgatgt 216  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24988 gcttgggtt-gcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgttggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgattttgatgatgt 24890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0158; HSP #2
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 17 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 25341 - 25212
Alignment:
Q  17 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 116  Q
    ||||||||||||||||||  | ||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||| ||||||||||||| |  | ||| |  ||||||||||||||||    
T  25341 ctcaattggtgaattatgttttgttgttgttgaattgtgataagtttcacgatcaattgttgttgttgttgatatggcatgttgttgatgataattcatg 25242  T
Q  117 gcttgggtttgcatgattcatgattgttgtt 147  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25241 gcttggg-ttgcatgattcatgattgttgtt 25212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 119; Significance: 6e-61; HSPs: 37)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 11 - 173
Target Start/End: Original strand, 111388 - 111550
Alignment:
Q  11 attatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataa 110  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  111388 attatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatggttgatgataa 111487  T
Q  111 ttcatggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 173  Q
    |||||||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||| | ||||||| | ||||||    
T  111488 ttcatggcttgggtatgcatgattcaaatttgttgttgagaaataaattgttgttgttggttt 111550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 11 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 126551 - 126366
Alignment:
Q  11 attatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataa 110  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| |    
T  126551 attatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatactgttgatgatga 126452  T
Q  111 ttcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttg-taaaatgggttgataatga 194  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| |||| ||| |  ||||||||||||| ||||    
T  126451 tacatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtgttttggagaaaatgggttgattatga 126366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 20 - 216
Target Start/End: Original strand, 7284180 - 7284376
Alignment:
Q  20 aattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggct 119  Q
    |||||||||||||| | | ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |  ||||| |  ||||| |||||||||||||    
T  7284180 aattggtgaattatcctttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgataataattcatggct 7284279  T
Q  120 tgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgaatttgatgatgt 216  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||    
T  7284280 tgagtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgttggtggttttgttaaatgggttgataatggagaagtttgattttgacgatgt 7284376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 11 - 185
Target Start/End: Original strand, 32494165 - 32494341
Alignment:
Q  11 attatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataa 110  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  32494165 attatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgattaatggttgttgttgttgtttagtcatatgattgatgataa 32494264  T
Q  111 ttcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggt 185  Q
    ||||||||||| || |||||||||||| | ||||||||||||||| | ||||||| | |||||| || |||||||||    
T  32494265 ttcatggcttgtgtatgcatgattcataatttgttgttgagaaataaattgttgttgttggtttggtgaaaatgggt 32494341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 17 - 169
Target Start/End: Original strand, 39046740 - 39046893
Alignment:
Q  17 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 116  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  39046740 ctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaattgttgttgttgttgtttagtcatgttgttgatgataattcatg 39046839  T
Q  117 gcttgggtttgcatgattcatgat-tgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 169  Q
    |||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  39046840 gcttgggtttgcataattcttgatctgttgttgagaaatgagatgttgttggtg 39046893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 17 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 11287547 - 11287390
Alignment:
Q  17 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 116  Q
    |||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||| |||||||||||| | | ||||||||||| | |||||| |  ||||||||||||||||    
T  11287547 ctcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcagttgatgttgttgttgctaagtcatgttgttgatgataattcatg 11287448  T
Q  117 gcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 173  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  11287447 gcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatgagatgttgttggtggttt 11287390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 11 - 164
Target Start/End: Original strand, 42056408 - 42056563
Alignment:
Q  11 attatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataa 110  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| ||||  |  ||| |||    
T  42056408 attatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatattatgaatgctaa 42056507  T
Q  111 ttcatggcttgggtttgcatgattcatga--ttgttgttgagaaatgagttgttgt 164  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||| ||||| |||||||||    
T  42056508 ttcatggcttgggtatgcatgattcataattttgttgttgtgaaataagttgttgt 42056563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 17 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 35094946 - 35094794
Alignment:
Q  17 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 116  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||| | | ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |  |||||||||| |||||    
T  35094946 ctcaattggtgaattatgcactgttgttgatgaattgttaaatgtttcatgatcaatg-ttgctgttgttgtttagtcatgttgttgatgataaatcatg 35094848  T
Q  117 gcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 169  Q
    |||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  35094847 gcttgggtttgcataattcttgatttgttgttgagaaatgagatgttgttggtg 35094794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 11 - 164
Target Start/End: Original strand, 2190305 - 2190460
Alignment:
Q  11 attatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataa 110  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||| ||||||| ||| || |  | |||| |||    
T  2190305 attatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatagatgttgatgttgttaagtgatgttatggatgctaa 2190404  T
Q  111 ttcatggcttgggtttgcatgattcatga--ttgttgttgagaaatgagttgttgt 164  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||| ||| | |||||||||    
T  2190405 ttcatggcttgggtatgcatgattcataattttgttgttgtgaagtaagttgttgt 2190460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 17 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 12759117 - 12758965
Alignment:
Q  17 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 116  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |  ||| ||||||||||||    
T  12759117 ctcaattggtgaattatgctatgttgttggtgaattatgataagtttcatgatcaattgttgttgttgttgttaagtcatgttgttggtgataattcatg 12759018  T
Q  117 gcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 169  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||  ||| |||||||||| |||||| ||||    
T  12759017 gcttgggtttgcaggatttatgatttgtgtggagaaatgagatgttgttggtg 12758965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 11 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 3049719 - 3049565
Alignment:
Q  11 attatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataa 110  Q
    ||||| |||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||||| ||| || |  | |||| |||    
T  3049719 attatgctcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgttatggatgttaa 3049620  T
Q  111 ttcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgt 164  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||| |||||||||    
T  3049619 ttcatggcttgggtatgcatgattcataatttgttgttgtgaaataagttgttgt 3049565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 11 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 2029057 - 2028893
Alignment:
Q  11 attatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataa 110  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | |||||| |||||| ||| || |  | |||| |||    
T  2029057 attatgctcaattggtgaattatgcatgattgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgtcgttgttaagtgatgttatggatgctaa 2028958  T
Q  111 ttcatggcttgggtttgcatgattcatga--ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 173  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||| |  ||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||    
T  2028957 ttcatgacttgggtatgcatgattcataattttgttgttgtgaaataagttgttgttgttggttt 2028893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 17 - 169
Target Start/End: Original strand, 15822548 - 15822701
Alignment:
Q  17 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 116  Q
    ||||| ||||||||||||| | ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |  ||||| |  |||||||| |||||||    
T  15822548 ctcaaatggtgaattatgctttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgatcattcatg 15822647  T
Q  117 gcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 169  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||| |||||| ||||    
T  15822648 gcttgggtttgcatgattcatggtttgtggttgagaaatgagatgttgttggtg 15822701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 39 - 169
Target Start/End: Original strand, 45452305 - 45452435
Alignment:
Q  39 gttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatg 138  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||| |  ||||| |  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  45452305 gttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgtcgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggttggcatgattcatg 45452404  T
Q  139 attgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 169  Q
    |||  ||| |||||||||| |||||| ||||    
T  45452405 atttgtgtggagaaatgagatgttgttggtg 45452435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 17 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 3895155 - 3894998
Alignment:
Q  17 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 116  Q
    |||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||||| ||| || |  | |||| |||||||||    
T  3895155 ctcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgttatggatgctaattcatg 3895056  T
Q  117 gcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 173  Q
    |||||||| |||||||||||| | |||||||||  |||| ||||||||| | ||||||    
T  3895055 gcttgggtatgcatgattcataatttgttgttgtaaaataagttgttgttgttggttt 3894998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 17 - 180
Target Start/End: Original strand, 16570122 - 16570287
Alignment:
Q  17 ctcaattggt-gaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcat 115  Q
    |||||||||| |||||||||   ||||||| ||||||  |||| |||||||||||||| | ||||||||||| | ||| || |  | |||||||||||||    
T  16570122 ctcaattggttgaattatgctatgttgttgttgaattgagataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatgtcgtggatgataattcat 16570221  T
Q  116 ggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaa 180  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| ||| ||||||    
T  16570222 ggcttgggtatgcatgattcatgatttgttgttgagaaatgagatgttgtgggtgttttggtaaaa 16570287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 17 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 16595540 - 16595375
Alignment:
Q  17 ctcaattggt-gaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcat 115  Q
    |||||||||| |||||||||   ||||||| ||||||  |||| |||||||||||||| | ||||||||||| | ||| || |  | |||||||||||||    
T  16595540 ctcaattggttgaattatgctatgttgttgttgaattgagataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatgtcgtggatgataattcat 16595441  T
Q  116 ggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaa 180  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| ||| ||||||    
T  16595440 ggcttgggtatgcatgattcatgatttgttgttgagaaatgagatgttgtgggtgttttggtaaaa 16595375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 20 - 164
Target Start/End: Original strand, 26070384 - 26070529
Alignment:
Q  20 aattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggct 119  Q
    |||||||||||||||    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||| | ||| || |  | |||||| ||||||||||    
T  26070384 aattggtgaattatgttatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgtggatgattattcatggct 26070483  T
Q  120 tgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgt 164  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  26070484 tgggtatgcatgattcatgatttgttgttgagaaataagttgttgt 26070529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 20 - 164
Target Start/End: Original strand, 26094171 - 26094316
Alignment:
Q  20 aattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggct 119  Q
    |||||||||||||||    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||| | ||| || |  | |||||| ||||||||||    
T  26094171 aattggtgaattatgttatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgtggatgattattcatggct 26094270  T
Q  120 tgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgt 164  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  26094271 tgggtatgcatgattcatgatttgttgttgagaaataagttgttgt 26094316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 17 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 47289911 - 47289758
Alignment:
Q  17 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 116  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||| | |||||||||||||| |||| ||||| |||| |||||| |   |||||||||||||||    
T  47289911 ctcaattggtgaattatgctttgttgttgatgaattgtgaaaagtttcatgatcaattgttgctgttgctgttaagtcatgttgatgatgataattcatg 47289812  T
Q  117 gcttgggtttgcatgattcatga--ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 169  Q
    ||||| | |||||||||||||||  ||||| | |||||||||| |||||| ||||    
T  47289811 gcttgtg-ttgcatgattcatgattttgttatggagaaatgagatgttgttggtg 47289758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 11 - 181
Target Start/End: Original strand, 1937131 - 1937290
Alignment:
Q  11 attatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataa 110  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||            |||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||| |    
T  1937131 attatgctcaattggtgaattatgtatggttgttgatgaatt------------atgatcaatggttgttgttgatgtttagtcatattgttgatgatga 1937218  T
Q  111 ttcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaat 181  Q
    | |||| |||||||||||||||||||| | || |||||||||||||  || |||| ||||||||||| ||||    
T  1937219 tacatgacttgggtttgcatgattcataattttttgttgagaaatggattattgttggtggttttgtgaaat 1937290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 17 - 173
Target Start/End: Original strand, 12248237 - 12248395
Alignment:
Q  17 ctcaattggt-gaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcat 115  Q
    |||||||||| |||||||||   ||||||| |||||| ||||| | |||||||||||||| ||||||||||| | ||| || |  | ||||||||| |||    
T  12248237 ctcaattggttgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaatggatgttgttgttgctaagtgatgttgtggatgataatgcat 12248336  T
Q  116 ggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 173  Q
    | ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  12248337 gacttgggtatgcatgattcatgatttgttgttgagaaatgagatgttgttggtggttt 12248395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 17 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 44865360 - 44865204
Alignment:
Q  17 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgttt---agtcatatgtttgatgataattc 113  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||    |||||| |  || ||||||||||    
T  44865360 ctcaattggtgaattatgcatttttgttgatgaattgtgataagtttcatgattaattgttgttgttgttgttgttaagtcatgtagtttatgataattc 44865261  T
Q  114 atggcttgggtttgcatgattcatga--ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 169  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||  ||||| | |||||||||| |||||| ||||    
T  44865260 atggcttggg-ttgcataattcatgattttgttatggagaaatgagatgttgttggtg 44865204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 39 - 180
Target Start/End: Original strand, 49047813 - 49047955
Alignment:
Q  39 gttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatg 138  Q
    ||||||| |||||| ||||| | |||||||||||| | ||||||||||| | ||| || |  ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  49047813 gttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgctgataattcatggcttgggtatgcatgattcatg 49047912  T
Q  139 a-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaa 180  Q
    | |||||||||||||| ||| |||||| ||| |||| ||||||    
T  49047913 atttgttgttgagaaacgagatgttgttggtagtttggtaaaa 49047955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 17 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 13274918 - 13274753
Alignment:
Q  17 ctcaattggt-gaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcat 115  Q
    |||||||||| |||||||||   ||||||| |||||| ||||| | |||||||||||| | ||||||||||| | ||| || |  |||||||| ||||||    
T  13274918 ctcaattggttgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgatgattcat 13274819  T
Q  116 ggcttgggtttgcatgattcatg-attgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaa 180  Q
    ||||| ||| |||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||| ||| |||| ||||||    
T  13274818 ggctttggtatgcatgattcatgttttgttgttgagaaatgagatgttgttggtagtttggtaaaa 13274753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 63 - 216
Target Start/End: Original strand, 14272049 - 14272203
Alignment:
Q  63 tcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgt 161  Q
    ||||| ||||| | ||||||||||| | | | ||||  ||| |||| |||||||||||| || | ||| |||||||||| | || |||||||||||||||    
T  14272049 tcatgttcaattgatgttgttgttgctaaatgatattgttgttgatgattcatggcttgagtgttcataattcatgattagatgatgagaaatgagttgt 14272148  T
Q  162 tgtcggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgaatttgatgatgt 216  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||||||    
T  14272149 tggtggtggttttgtaaaatgggttgatgatgaagaagttttattttaatgatgt 14272203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 17 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 143769 - 143622
Alignment:
Q  17 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 116  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||| | |||||||||||||      ||||||||||| |||||| |  || |||||||||||||    
T  143769 ctcaattggtgaattatgctttgttgttgatgaattgtgaaaagtttcatgatcaa------ttgttgttgttaagtcatgttgttaatgataattcatg 143676  T
Q  117 gcttgggtttgcatgattcatga--ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 169  Q
    ||||||| |||||| ||||||||  ||||| | |||||||||| |||||| ||||    
T  143675 gcttggg-ttgcataattcatgattttgttatggagaaatgagatgttgttggtg 143622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 11 - 181
Target Start/End: Original strand, 17224048 - 17224220
Alignment:
Q  11 attatactcaa-ttggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgata 109  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||   ||||||| |||||| |  || |  ||||| ||||| | ||||||||||| | ||| || |  || |||||     
T  17224048 attatactcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgttgtaagagtcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttaatgatg 17224147  T
Q  110 attcatggcttgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaat 181  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17224148 attcatggcttgggtattcataattcatgatttgttgatgagaaatgagttgttgttggtggttttgtaaaat 17224220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 17 - 185
Target Start/End: Original strand, 12369957 - 12370127
Alignment:
Q  17 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 116  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||| |||||| |||||  ||||||||| ||| | ||||||||||| | ||| || |  |  || || |||||||    
T  12369957 ctcaattggtgaattatgccttgttgttgttgaattgtgataactttcatgattaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgtgcataattattcatg 12370056  T
Q  117 gcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggt 185  Q
    |||| ||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||| || | |||||| || |||||||||    
T  12370057 gcttaggtatgcatgattcatgatttgttattgagaaataagttgtagttgttggtttggtgaaaatgggt 12370127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 39 - 188
Target Start/End: Original strand, 16915067 - 16915217
Alignment:
Q  39 gttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatg 138  Q
    ||||||| |||||| ||||  | |||||| ||||| | ||||||||||| | ||||||||  ||| |||| ||||||||||||||| | ||| | |||||    
T  16915067 gttgttgttgaattatgatgagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtcatattgttgttgatgattcatggcttgggtgttcataaatcatg 16915166  T
Q  139 a-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttga 188  Q
    | ||| ||  ||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  16915167 atttgatgaagagaattgagttgttgttgttggttttgtaaaatgggttga 16915217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 39 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 48356752 - 48356602
Alignment:
Q  39 gttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatg 138  Q
    ||||||| |||||| ||||  | |||||| ||||| | ||||||||||| | ||| ||||  ||| |||| ||||||||||||||| | ||| | |||||    
T  48356752 gttgttgttgaattatgatgagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtgttcataaatcatg 48356653  T
Q  139 att-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttga 188  Q
    ||| | || |||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  48356652 atttgatgatgagaattgagttgttgttgttggttttgtaaaatgggttga 48356602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 11 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 13377666 - 13377485
Alignment:
Q  11 attatactcaa-ttggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgata 109  Q
    ||||||||||| ||| | ||||||||   ||||||| |||||| ||||| | |||||| ||||| | ||||||||||| | ||| || |  ||||||||     
T  13377666 attatactcaaattgattaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtaatgttgttgatgatg 13377567  T
Q  110 attcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggttgat 189  Q
    ||||||||||||||| | ||| | |||||| ||| || |||||||| ||||||||| | |||||| || |||||||||||||    
T  13377566 attcatggcttgggtgttcataaatcatgatttgatgatgagaaataagttgttgttgttggtttggtgaaaatgggttgat 13377485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 77 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 4484797 - 4484683
Alignment:
Q  77 tgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttg 175  Q
    ||||||||||||| ||  ||||  ||| |||| |||||| |||||||| | ||||| |||||| ||| || |||||||| |||||||||   ||||||||    
T  4484797 tgttgttgttgttaagagatattgttgttgatgattcatagcttgggtattcatgaatcatgatttgatgatgagaaataagttgttgtgcttggttttg 4484698  T
Q  176 t-aaaatgggttgat 189  Q
    | |||||||||||||    
T  4484697 taaaaatgggttgat 4484683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 110 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 4446249 - 4446168
Alignment:
Q  110 attcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggttgat 189  Q
    ||||||||||||||| | ||| | |||||| ||| || || ||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||    
T  4446249 attcatggcttgggtgttcataaatcatgaattgatgatgtgaaatgagttgttgttgttggttttgtaaaaatgggttgat 4446168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 110 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 14935400 - 14935319
Alignment:
Q  110 attcatggcttgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggttgat 189  Q
    |||||||| |||||| | ||| | |||||||| |||| |||||||| ||||||||| | ||||||||| |||||||||||||    
T  14935400 attcatggtttgggtgttcataaatcatgatttgttgatgagaaatcagttgttgttgttggttttgtaaaaatgggttgat 14935319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 110 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 15362993 - 15362912
Alignment:
Q  110 attcatggcttgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggttgat 189  Q
    |||||||| |||||| | ||| | |||||||| |||| |||||||| ||||||||| | ||||||||| |||||||||||||    
T  15362993 attcatggtttgggtgttcataaatcatgatttgttgatgagaaatcagttgttgttgttggttttgtaaaaatgggttgat 15362912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 105 - 188
Target Start/End: Original strand, 34241393 - 34241477
Alignment:
Q  105 tgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttga 188  Q
    |||| |||||||||||| || | ||| | |||||||| | || ||| |||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||    
T  34241393 tgatgattcatggcttgagtgttcataaatcatgatttgatgatgaaaaatgagttgttgttgttggttttgtaaaaagggttga 34241477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0686 (Bit Score: 116; Significance: 4e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0686
Description:

Target: scaffold0686; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 11 - 181
Target Start/End: Original strand, 6202 - 6373
Alignment:
Q  11 attatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataa 110  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| |    
T  6202 attatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtaatattgttgatgatga 6301  T
Q  111 ttcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaat 181  Q
    | |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||    
T  6302 tacatgacttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaat 6373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 116; Significance: 4e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 11 - 181
Target Start/End: Original strand, 31399 - 31570
Alignment:
Q  11 attatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataa 110  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |    
T  31399 attatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatgatga 31498  T
Q  111 ttcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaat 181  Q
    | |||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||    
T  31499 tacatggcttaggtttgcatgattcataatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaat 31570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 116; Significance: 4e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 11 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 41445 - 41274
Alignment:
Q  11 attatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataa 110  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |    
T  41445 attatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatgatga 41346  T
Q  111 ttcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaat 181  Q
    | |||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||    
T  41345 tacatggcttaggtttgcatgattcataatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaat 41274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 114; Significance: 6e-58; HSPs: 36)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 11 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 14951898 - 14951713
Alignment:
Q  11 attatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataa 110  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||| |    
T  14951898 attatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttatttagtcatattgttgatgatga 14951799  T
Q  111 ttcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggttgataatga 194  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| |||| ||| || ||||||||||||| ||||    
T  14951798 tatatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtgttttggtgaaaatgggttgattatga 14951713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 18 - 181
Target Start/End: Original strand, 25119333 - 25119498
Alignment:
Q  18 tcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatgg 117  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || || |||||    
T  25119333 tcaattggtgaattatgcatggtttttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgataatgatacatgg 25119432  T
Q  118 cttgggtttgcatgattcatga--ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaat 181  Q
    |||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||    
T  25119433 cttgggtttgcatgattcataattttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaat 25119498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 17 - 169
Target Start/End: Original strand, 53704850 - 53705003
Alignment:
Q  17 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  53704850 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaattgttgttgttgttgtttagtcatgttgttgatgataattcatg 53704949  T
Q  117 gcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 169  Q
    |||||||||||||| |||| | | |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  53704950 gcttgggtttgcataattcttggtttgttgttgagaaatgagatgttgttggtg 53705003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 11 - 181
Target Start/End: Original strand, 5682646 - 5682817
Alignment:
Q  11 attatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataa 110  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| ||||||  |||||||| |    
T  5682646 attatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgattattggttgttgttgttttttattcatattgttgatgatga 5682745  T
Q  111 ttcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaat 181  Q
    |  ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||    
T  5682746 tatatgtcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaat 5682817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 13 - 194
Target Start/End: Original strand, 55376710 - 55376893
Alignment:
Q  13 tatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataatt 112  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| | | || |  ||||||||||||    
T  55376710 tatactcaattggtgaattatacattgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgttgttgttgttgttaaattatgttgttgatgataatt 55376809  T
Q  113 catggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggttgataatga 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| |||| |||  | ||||||||||||| ||||    
T  55376810 catggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatgagatgatgttggtgttttgatgaaaatgggttgattatga 55376893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 17 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 34395387 - 34395222
Alignment:
Q  17 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 116  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |  ||||| |  ||||||||||||||||    
T  34395387 ctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatg 34395288  T
Q  117 gcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaat 181  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||    
T  34395287 gcttgagtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaat 34395222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 13 - 169
Target Start/End: Original strand, 23270047 - 23270204
Alignment:
Q  13 tatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataatt 112  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||||| | ||||||||||||| |||||| |  ||||||||||||    
T  23270047 tatactcaattgatgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataagtatcatgatcaattgatgttgttgttgttaagtcatgttgttgatgataatt 23270146  T
Q  113 catggcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 169  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||| |||||| ||||    
T  23270147 catggcttgggtttgcatgattcatggtttgtggttgagaaatgagatgttgttggtg 23270204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 17 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 44056045 - 44055892
Alignment:
Q  17 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 116  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||| |||||| ||| |  ||||||||||||||||    
T  44056045 ctcaattggtgaattatgcattattgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgtggtttagccatgttgttgatgataattcatg 44055946  T
Q  117 gcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 169  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  44055945 gcttgggtttgcatgattcatggtttgttgttgagaaatgagatgttgttggtg 44055892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 17 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 16732299 - 16732146
Alignment:
Q  17 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 116  Q
    |||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||| ||||||| | |||||| |  ||||||||||||||||    
T  16732299 ctcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgtcgttgttgctaagtcatgttgttgatgataattcatg 16732200  T
Q  117 gcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 169  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  16732199 gcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatgagatgttgttggtg 16732146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 17 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 44346957 - 44346816
Alignment:
Q  17 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 116  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||||    
T  44346957 ctcaattggtgaattatacattgttgttcatgaattgtgatatgtttcatgatcaaatgttgttgttgttgtttagtgatgtcgttgatgataattcatg 44346858  T
Q  117 gcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgag 157  Q
    |||||||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||    
T  44346857 gcttgggtttgcataattcttggtttgttgttgagaaatgag 44346816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 19 - 169
Target Start/End: Original strand, 53907818 - 53907966
Alignment:
Q  19 caattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggc 118  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||   |||||||||||| |||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  53907818 caattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgaaatgtttcatgatcaa---ttgttgttgttgattagtcatgttgttgatgataattcatggc 53907914  T
Q  119 ttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 169  Q
    |||||||||||| |||| | | |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  53907915 ttgggtttgcataattcttggtttgttgttgagaaatgagatgttgttggtg 53907966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 17 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 30458033 - 30457880
Alignment:
Q  17 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 116  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||    
T  30458033 ctcaattggtgaattacgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgttgttgttgttgttaagtcatgtggttgatgataattcatg 30457934  T
Q  117 gcttgggtttgcatgattcatga--ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 169  Q
    ||||||| |||||| |||||| |  ||||| | |||||||||| |||||| ||||    
T  30457933 gcttggg-ttgcataattcattattttgttatagagaaatgagatgttgttggtg 30457880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 17 - 154
Target Start/End: Original strand, 21959580 - 21959718
Alignment:
Q  17 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 116  Q
    |||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  21959580 ctcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgtttagtcatgttgttgatgataattcatg 21959679  T
Q  117 gcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaat 154  Q
    ||||||| ||||||||||||| | |||| ||||||||||    
T  21959680 gcttgggcttgcatgattcatagtttgtggttgagaaat 21959718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 11 - 164
Target Start/End: Original strand, 15272431 - 15272586
Alignment:
Q  11 attatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataa 110  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| | ||||||||||||| ||| || |  |  ||| |||    
T  15272431 attatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgttccatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgttatgaatgctaa 15272530  T
Q  111 ttcatggcttgggtttgcatgattcatga--ttgttgttgagaaatgagttgttgt 164  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||| ||||| |||||||||    
T  15272531 ttcatggcttgggtatgcatgattcataattttgttgttgtgaaataagttgttgt 15272586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 17 - 163
Target Start/End: Original strand, 820033 - 820177
Alignment:
Q  17 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 116  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||   |||||||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||    
T  820033 ctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaa---ttgttgttgttgttaagtcatgttgttgatgataattcatg 820129  T
Q  117 gcttgggtttgcatgattcatga--ttgttgttgagaaatgagttgttg 163  Q
    ||||||| |||||||||||||||  ||||| | |||||||||| |||||    
T  820130 gcttggg-ttgcatgattcatgattttgttatggagaaatgagatgttg 820177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 17 - 125
Target Start/End: Original strand, 8872588 - 8872699
Alignment:
Q  17 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaa---tggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattc 113  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||   | |||||||||||||||||||||| |  |||||||||| ||    
T  8872588 ctcaattggtgaattatgcgttgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaattgttgttgttgttgttgtttagtcatgttgttgatgataactc 8872687  T
Q  114 atggcttgggtt 125  Q
    ||||||||||||    
T  8872688 atggcttgggtt 8872699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 114 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 16522851 - 16522748
Alignment:
Q  114 atggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgag-aaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgaatttgatg 212  Q
    ||||||||||| | |||   ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  16522851 atggcttgggtgttcatatatcatgattgttgttgagaaaatgagttgttgttggtggttttgtaaaatgggttgataaagaagaagtttgattttgatg 16522752  T
Q  213 atgt 216  Q
    ||||    
T  16522751 atgt 16522748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 17 - 164
Target Start/End: Original strand, 12837317 - 12837464
Alignment:
Q  17 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 116  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||| | |||| ||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| ||| || |  | |||| |||||||||    
T  12837317 ctcaattggtgaattatgctatgttgttgttaaattgtgataagtttcatggtcaatggatgttgttgttgttaagtgatgttatggatgttaattcatg 12837416  T
Q  117 gcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgt 164  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||    
T  12837417 gcttgggtatgcatgattcatgatttgttg-tgagaaataagttgttgt 12837464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 17 - 164
Target Start/End: Original strand, 30232613 - 30232761
Alignment:
Q  17 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 116  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||| | |||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||| || |  | |||| |||||||||    
T  30232613 ctcaattggtgaattatgctatgttgttgttaaattgtgataagtttcatgatcaatggatgttgttgttgttaagtgatgttatggatgttaattcatg 30232712  T
Q  117 gcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgt 164  Q
    |||||||| ||||| |||||| | ||||||||| ||||| |||||||||    
T  30232713 gcttgggtatgcattattcataatttgttgttgtgaaataagttgttgt 30232761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 39 - 173
Target Start/End: Original strand, 18494467 - 18494602
Alignment:
Q  39 gttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatg 138  Q
    ||||||| |||||| || || | |||||||||||| |||| |||||||||| ||| || |  |||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  18494467 gttgttgttgaattgtgttaagattcatgatcaattgttgctgttgttgttaagtgatgttgttgatggtaactcatggcttgggtatgcatgattcatg 18494566  T
Q  139 a-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 173  Q
    | |||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  18494567 acttgttgttgagaaatgagatgttgttggtggttt 18494602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 114 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 9295727 - 9295624
Alignment:
Q  114 atggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgag-aaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgaatttgatg 212  Q
    ||||||||||| | |||   ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||    
T  9295727 atggcttgggtgttcatatatcatgattgttgttgagaaaatgagttgttgttggtggttatgtaaaatgagttgataaagaagaagtttgattttgatg 9295628  T
Q  213 atgt 216  Q
    ||||    
T  9295627 atgt 9295624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 26 - 164
Target Start/End: Original strand, 13809636 - 13809775
Alignment:
Q  26 tgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtt 125  Q
    ||||||||||   ||||||| |||||| ||||| | |||||||||||| | ||||||||||| | | | || |  |||||||||||||||||||||| |     
T  13809636 tgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgttgttgctaattgatgttgttgatgataattcatggcttggata 13809735  T
Q  126 tgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgttgt 164  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  13809736 tgcatgattcatgattggttgttgagaaatgagatgttgt 13809775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 18 - 141
Target Start/End: Original strand, 45458973 - 45459096
Alignment:
Q  18 tcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatgg 117  Q
    |||||||||||||||||| | | ||||| |||||| ||||| ||||||||| |||| | ||||||||||| |  ||||| |  |||| |||||| |||||    
T  45458973 tcaattggtgaattatgctttgctgttgttgaattgtgataagtttcatgaccaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgaagataatccatgg 45459072  T
Q  118 cttgggtttgcatgattcatgatt 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  45459073 cttgggtttgcatgattcatgatt 45459096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 40 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 27961078 - 27960938
Alignment:
Q  40 ttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga 139  Q
    |||||| |||||| | ||| | |||||||||||| | ||||||||||||| ||| || |  ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||    
T  27961078 ttgttgttgaattgttataagattcatgatcaattgatgttgttgttgttaagtgatgttgttgatgataattcatggtttgggtatgcatgatt-atga 27960980  T
Q  140 -ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaa 180  Q
     || ||||||||||||||| | |||| ||| |||| ||||||    
T  27960979 tttattgttgagaaatgagatattgttggtagtttggtaaaa 27960938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 105 - 188
Target Start/End: Original strand, 37957230 - 37957314
Alignment:
Q  105 tgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttga 188  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||    
T  37957230 tgataattcacggcttgggtgtgcataattcatgatttgttgatgataaatgagttgttgttggtgactttgtaaaatgggttga 37957314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 39 - 216
Target Start/End: Original strand, 7185983 - 7186159
Alignment:
Q  39 gttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatg 138  Q
    ||||||| |||||| ||||  | |||||| | ||| | ||||||||||| | ||  ||||  ||| |||| ||||||||||||||| |  || | |||||    
T  7185983 gttgttgttgaattgtgatgagattcatgtttaattgatgttgttgttgctaagagatattattgttgatgattcatggcttgggtgtttataaatcatg 7186082  T
Q  139 att-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggttgataatgaagaagtttgaatttgatgatgt 216  Q
    ||| | || ||||| ||||||||||||   || |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7186083 atttgatgatgagatatgagttgttgt---tgtttttgtgaaaatgggttgataatgaagaagtttgattttgatgatgt 7186159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 79 - 188
Target Start/End: Original strand, 7964890 - 7965000
Alignment:
Q  79 ttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgta 177  Q
    ||||||||| | ||| ||||  ||| |||| |||||||||||| || | ||| | |||||||| | || |||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  7964890 ttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgagtgttcataaatcatgatttgatgatgagaaatgagttgttgttgttggttttgta 7964989  T
Q  178 aaatgggttga 188  Q
    |||||||||||    
T  7964990 aaatgggttga 7965000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 20 - 141
Target Start/End: Original strand, 52265628 - 52265749
Alignment:
Q  20 aattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggct 119  Q
    ||||| |||||||||||  ||||||| |||||| ||||| | |||||| ||||| | ||||||||||| | ||| ||||   || |||| ||||||||||    
T  52265628 aattgttgaattatgcaatgttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgatgttgatgattcatggct 52265727  T
Q  120 tgggtttgcatgattcatgatt 141  Q
    ||||| | ||| ||||||||||    
T  52265728 tgggtgttcataattcatgatt 52265749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 105 - 188
Target Start/End: Original strand, 19821981 - 19822065
Alignment:
Q  105 tgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttga 188  Q
    |||| ||||||||||||||| | ||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| | ||||  ||||||||||| |||||    
T  19821981 tgatgattcatggcttgggtattcataattcatgatttgttgatgagaaatgagttgtttttggtgactttgtaaaatgagttga 19822065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 15044955 - 15044784
Alignment:
Q  20 aattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggct 119  Q
    ||||| ||||||||||   ||||||| |||||| ||||| | |||||| ||||| | ||||||||||| | ||| || |  |||||||| ||||||||||    
T  15044955 aattgatgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgatgattcatggct 15044856  T
Q  120 tgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggttgat 189  Q
    ||||| | ||| | |||||| ||| || |||||||| | ||||||| | || ||| || |||||||||||||    
T  15044855 tgggtgttcataaatcatgatttgatgatgagaaataaattgttgttgttgctttggtgaaaatgggttgat 15044784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 105 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 14901274 - 14901197
Alignment:
Q  105 tgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaat 181  Q
    |||| ||||||| | ||||| ||||| |||||||| ||| || ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  14901274 tgatgattcatgacatgggtgtgcataattcatgaattgatgatgagaaatgggttgttgttggtggttttgtaaaat 14901197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 189
Target Start/End: Original strand, 15109459 - 15109640
Alignment:
Q  11 attatactcaa-ttggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgata 109  Q
    ||||||||||| ||| | ||||||||   ||||||| |||||| ||||| | |||||| ||||| | ||||||||||| | ||| || |  ||||||||     
T  15109459 attatactcaaattgataaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtaatgttgttgatgatg 15109558  T
Q  110 attcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggttgat 189  Q
    ||||||||||||||| | ||| | |||||| ||| || |||||||| | ||||||| | || ||| || |||||||||||||    
T  15109559 attcatggcttgggtgttcataaatcatgatttgatgatgagaaataaattgttgttgttgctttggtgaaaatgggttgat 15109640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 105 - 181
Target Start/End: Original strand, 47535251 - 47535328
Alignment:
Q  105 tgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaat 181  Q
    |||| |||||||||||| || | ||| |||||||||| |||  |||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  47535251 tgatgattcatggcttgagtgttcataattcatgatttgttaatgagaaatgagttgttgttgatggttttgtaaaat 47535328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 63 - 181
Target Start/End: Original strand, 41166109 - 41166228
Alignment:
Q  63 tcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgt 161  Q
    ||||| ||||| | ||||||||||| | ||| || |  ||| |||| | ||||||||||||| | ||| | | |||||| |||| |||||||||||||||    
T  41166109 tcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgttgatgaatcatggcttgggtattcataacttatgatttgttgatgagaaatgagttgt 41166208  T
Q  162 tgtcggtggttttgtaaaat 181  Q
    ||| ||||||||||| ||||    
T  41166209 tgtgggtggttttgtgaaat 41166228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 77 - 189
Target Start/End: Original strand, 41256546 - 41256660
Alignment:
Q  77 tgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttg 175  Q
    ||||||||||||| ||  ||||  ||| |||| |||||||| |||||| | ||| | |||||||| | || |||||||||||||||||| | |||||||     
T  41256546 tgttgttgttgttaagagatattgttgttgatgattcatggtttgggtgttcataaatcatgatttgatgatgagaaatgagttgttgttgttggtttta 41256645  T
Q  176 t-aaaatgggttgat 189  Q
    | |||||||||||||    
T  41256646 taaaaatgggttgat 41256660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 40 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 18276541 - 18276392
Alignment:
Q  40 ttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga 139  Q
    |||||| |||||| ||||  | |||||| ||||| | |||||||||||   ||| ||||  ||| |||| ||| ||||||||||| | ||| | ||||||    
T  18276541 ttgttgttgaattgtgatgagattcatgttcaattgatgttgttgttgcaaagtgatattgttgttgatgattgatggcttgggtgttcataaatcatga 18276442  T
Q  140 tt-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttga 188  Q
    || |  | |||| | ||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  18276441 tttgacgatgagtattgagttgttgttgttggttttgtaaaatgggttga 18276392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310 (Bit Score: 113; Significance: 2e-57; HSPs: 2)
Name: scaffold0310
Description:

Target: scaffold0310; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 20 - 216
Target Start/End: Original strand, 234 - 430
Alignment:
Q  20 aattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggct 119  Q
    |||| ||||||||||  | ||||||| |||||| ||||| |||| ||||||||| | ||||||||||| |  ||||| |  ||||||||||||||| |||    
T  234 aattcgtgaattatgttttgttgttgttgaattgtgataagtttaatgatcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgataattcatagct 333  T
Q  120 tgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgaatttgatgatgt 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  334 tgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagcttttgttggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgattttgatgatgt 430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 140 - 216
Target Start/End: Original strand, 6603 - 6679
Alignment:
Q  140 ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgaatttgatgatgt 216  Q
    ||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6603 ttgttgttgagaattgagttgttcttggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgattttgatgatgt 6679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039 (Bit Score: 112; Significance: 9e-57; HSPs: 2)
Name: scaffold0039
Description:

Target: scaffold0039; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 11 - 173
Target Start/End: Original strand, 12639 - 12802
Alignment:
Q  11 attatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataa 110  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12639 attatgctcaattggtgaattatgcatgattgttgatgaattgtgatatgtttcatgattaatggttgttgttgttgtttagtcatatggttgatgataa 12738  T
Q  111 ttcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 173  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||| | ||||||| | ||||||    
T  12739 ttcatggcttgggtatgcatgattcataatttgttgttgagaaataaattgttgttgttggttt 12802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039; HSP #2
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 40 - 173
Target Start/End: Original strand, 19049 - 19183
Alignment:
Q  40 ttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga 139  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  19049 ttgttgatgaattgtgatatgtttcatgattaatggttgttgttgttgtttagtcatatggttgatgataattcatggcttgggtatgcatgattcataa 19148  T
Q  140 -ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 173  Q
     ||||||||||||||| | ||||||| | ||||||    
T  19149 tttgttgttgagaaataaattgttgttgttggttt 19183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 111; Significance: 3e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 36 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 30202 - 30056
Alignment:
Q  36 atggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattc 135  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30202 atggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattc 30103  T
Q  136 atga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaat 181  Q
    |||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||    
T  30102 atgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaat 30056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 111; Significance: 3e-56; HSPs: 3)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 11 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 80000 - 79846
Alignment:
Q  11 attatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataa 110  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  80000 attatgctcaattggtgaattatgcatgattgttgatgaattgtgatatgtttcatgattaatggttgttgttgttgtttagtcatatggttgatgataa 79901  T
Q  111 ttcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgt 164  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||| |||||||||    
T  79900 ttcatggcttgggtatgcatgattcataatttgttgttgtgaaataagttgttgt 79846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 17 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 46295 - 46171
Alignment:
Q  17 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 116  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||| | |||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||  | ||| ||||  ||| |||| |||||||    
T  46295 ctcaattggtgaattatgctatgttgttgttaaattgtgataagtttcatgatcaatggatgttgttgtttctaagtgatattgttgttgatgattcatg 46196  T
Q  117 gcttgggtttgcatgattcatgatt 141  Q
    |||||||| | ||| ||||||||||    
T  46195 gcttgggtgttcataattcatgatt 46171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #3
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 17 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 40788 - 40664
Alignment:
Q  17 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 116  Q
    |||||||||||||||||||    |||||| |  ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||| | ||| ||||  ||| |||| |||||||    
T  40788 ctcaattggtgaattatgctatattgttgttacattgtgataagtttcatgatcaatggatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatg 40689  T
Q  117 gcttgggtttgcatgattcatgatt 141  Q
    |||||||| | ||| ||||||||||    
T  40688 gcttgggtgttcataattcatgatt 40664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 110; Significance: 1e-55; HSPs: 25)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 11 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 22367154 - 22366970
Alignment:
Q  11 attatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataa 110  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |    
T  22367154 attatgctcaattggtgaat-atgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatgatga 22367056  T
Q  111 ttcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggttgataatga 194  Q
    | |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| |||| ||| || ||||||||||||| ||||    
T  22367055 tacatgacttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtgttttggtgaaaatgggttgattatga 22366970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 11 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 21860147 - 21859984
Alignment:
Q  11 attatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataa 110  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |    
T  21860147 attatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgattaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatgatga 21860048  T
Q  111 ttcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 173  Q
    | ||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| | ||||||    
T  21860047 tacatggctcgggtttgcatgattcataatttgttgttgagaaatgaattgttgttgttggttt 21859984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 11 - 194
Target Start/End: Original strand, 15861545 - 15861728
Alignment:
Q  11 attatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataa 110  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||||| |    
T  15861545 attatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgt--ttgtttagtcatattgttgatgatga 15861642  T
Q  111 ttcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggttgataatga 194  Q
    | |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| |||| ||| || ||||||||||||| ||||    
T  15861643 tgcatgacttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtgttttggtgaaaatgggttgattatga 15861728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 11 - 176
Target Start/End: Original strand, 44035090 - 44035255
Alignment:
Q  11 attatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataa 110  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |    
T  44035090 attatgctcatttggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatagttgatgatga 44035189  T
Q  111 ttcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt 176  Q
     | |||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||    
T  44035190 -taatggcttgagtttgcatgattcataatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgt 44035255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 17 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 49967780 - 49967628
Alignment:
Q  17 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 116  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||||| |||||| |  |||||||||||||||     
T  49967780 ctcaattggtgaattatacattgttgttgatgaattgtgatacgtttcatgatcaattgatgttgttgttgttaagtcatgttgttgatgataattcatt 49967681  T
Q  117 gcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 169  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||| ||||    
T  49967680 gcttcggtttgcatgattcatggttgttgttgaggaatgagatgttgttggtg 49967628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 17 - 169
Target Start/End: Original strand, 35522436 - 35522588
Alignment:
Q  17 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 116  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |  ||||| |  ||||||||||||||||    
T  35522436 ctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgatacgtcatgttgttgatgataattcatg 35522535  T
Q  117 gcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 169  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||| ||||    
T  35522536 gcttgggtttgcatgattcatgatttgtgttgagaaatgagatgttgttggtg 35522588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 17 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 41212202 - 41212046
Alignment:
Q  17 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgt---tgtttagtcatatgtttgatgataattc 113  Q
    ||||||| ||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||   ||||||||||| |  |||||||||||||    
T  41212202 ctcaattagtgaattatgcactgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaattgttgttgttgttgttgtttagtcatgttgttgatgataattc 41212103  T
Q  114 atggcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 169  Q
    ||||||||||||||||| |||| | | |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  41212102 atggcttgggtttgcataattcttggtttgttgttgagaaatgagatgttgttggtg 41212046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 17 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 21718358 - 21718206
Alignment:
Q  17 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 116  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |  ||||| |  ||||||||||||||||    
T  21718358 ctcaattggtgaattatgctatgttgttgatgatttgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgataattcatg 21718259  T
Q  117 gcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 169  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| ||||    
T  21718258 gcttgggtttgcatgattcatggttgttcttgagaaatgagatgttgttggtg 21718206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 17 - 164
Target Start/End: Original strand, 22403227 - 22403375
Alignment:
Q  17 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 116  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||  ||||||||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||    
T  22403227 ctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcatgattaactgttgttgttgttgttaagtcatgttgttgatgataattcatg 22403326  T
Q  117 gcttgggtttgcatgattcatga--ttgttgttgagaaatgagttgttgt 164  Q
    |||||||||| ||||||||||||  ||||| | |||||||||| ||||||    
T  22403327 gcttgggttt-catgattcatgattttgttatggagaaatgagatgttgt 22403375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 17 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 35054886 - 35054716
Alignment:
Q  17 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 116  Q
    |||||||||||||||||||   || ||||||||| | ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||| || |  | |||| |||||||||    
T  35054886 ctcaattggtgaattatgctatgtagttgatgaactgtgataagtttcatgatcaatggatgttgttgttgttaagtgatgttatggatgctaattcatg 35054787  T
Q  117 gcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggt 185  Q
    |||||||| |||||||||||| | ||||||||| | ||| ||||||||| | |||||| || |||||||||    
T  35054786 gcttgggtatgcatgattcataatttgttgttgtggaataagttgttgttgttggtttggtgaaaatgggt 35054716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 41 - 180
Target Start/End: Original strand, 51627805 - 51627945
Alignment:
Q  41 tgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcat-atgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga 139  Q
    ||||| |||||| ||||| | |||||||||||| | ||||||||||| | ||| || ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  51627805 tgttgttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatgatgtt-gatgataattcatggcttgggtatgcatgattcatga 51627903  T
Q  140 -ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaa 180  Q
     ||| |||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||    
T  51627904 tttgctgttgagaaatgagatgttgttggtggtttggtaaaa 51627945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 17 - 173
Target Start/End: Original strand, 27329872 - 27330026
Alignment:
Q  17 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 116  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||| | |||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||| || |  | |||| |||||||||    
T  27329872 ctcaattggtgaattatgctatgttgttgttaaattgtgataagtttcatgatcaatggatgttgttgttgttaagtgatgttatggatgttaattcatg 27329971  T
Q  117 gcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 173  Q
    |||||||| |||||||||||| ||  ||||||  |||| ||||||||| | ||||||    
T  27329972 gcttgggtatgcatgattcataat--ttgttgtcaaataagttgttgttgttggttt 27330026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 105 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 27674838 - 27674755
Alignment:
Q  105 tgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttga 188  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||    
T  27674838 tgataattcatggcttgggtgtgcataattcatgatttttgatgagaaatgagttgttgttggtgactttgtaaaatgggttga 27674755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 105 - 187
Target Start/End: Original strand, 22829629 - 22829712
Alignment:
Q  105 tgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttg 187  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||    
T  22829629 tgataattcatggcttgggtgtgcataattcatgatttgttgatgagaaatgagttgttgttggtgactttgtaaaatgggttg 22829712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 39 - 141
Target Start/End: Original strand, 9784239 - 9784341
Alignment:
Q  39 gttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatg 138  Q
    ||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||| | ||||||||||| |  ||||| |  |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9784239 gttgttgttgaattgtgataagtttcaagatcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgatcattcatggcttgggcttgcatgattcatg 9784338  T
Q  139 att 141  Q
    |||    
T  9784339 att 9784341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 39 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 17609036 - 17608886
Alignment:
Q  39 gttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatg 138  Q
    ||||||| |||||| ||||  | |||||| ||||| ||||||||||||||| ||| ||||  ||| |||| ||||||||||||||| | ||| | |||||    
T  17609036 gttgttgttgaattatgatgagattcatgttcaattgttgttgttgttgttaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtgttcataaatcatg 17608937  T
Q  139 a-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttga 188  Q
    | ||| |  |||||| ||||||||||| | |||||||| ||||||||||||    
T  17608936 atttgattatgagaattgagttgttgttgttggttttggaaaatgggttga 17608886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 105 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 19603139 - 19603055
Alignment:
Q  105 tgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttga 188  Q
    |||||||||||| ||||||| || || |||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||    
T  19603139 tgataattcatgacttgggtgtgaataattcatgatttgttgatgagaaatgagttgttgttggtgactttgtaaaatgggttga 19603055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 108 - 188
Target Start/End: Original strand, 38033882 - 38033962
Alignment:
Q  108 taattcatggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttga 188  Q
    ||||||||||||||||| |||||  |||| |||||||| |||||||| ||||||||| ||||  |||||||||||||||||    
T  38033882 taattcatggcttgggtgtgcatagttcacgattgttgatgagaaataagttgttgttggtgactttgtaaaatgggttga 38033962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 77 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 20177245 - 20177140
Alignment:
Q  77 tgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttg 175  Q
    ||||||||||| | ||| || |  |||||||| ||||||||||||| | | ||| |||||||| ||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20177245 tgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgatgattcatggcttggatattcataattcatgatttgttgaagagaaatgagttgttgttggtggttttg 20177146  T
Q  176 taaaat 181  Q
    | ||||    
T  20177145 tgaaat 20177140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 105 - 188
Target Start/End: Original strand, 20955644 - 20955728
Alignment:
Q  105 tgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttga 188  Q
    |||||||||||||||| ||| || || |||| ||| |||||| || ||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||    
T  20955644 tgataattcatggcttcggtgtgaataattcgtgaattgttggtgtgaaatgagttgttgtgggtgactttgtaaaaggggttga 20955728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 77 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 21195084 - 21194980
Alignment:
Q  77 tgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttg 175  Q
    ||||||||||||| ||  ||||  ||| |||| ||||||||||||||| | ||| | |||||||| | || |||||||||||||||||| | |||||||     
T  21195084 tgttgttgttgttaagagatattgttgttgatgattcatggcttgggtgttcataaatcatgatttgatgatgagaaatgagttgttgttgttggtttta 21194985  T
Q  176 taaaa 180  Q
    |||||    
T  21194984 taaaa 21194980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 63 - 181
Target Start/End: Original strand, 13377003 - 13377122
Alignment:
Q  63 tcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgt 161  Q
    ||||| ||||| | ||||||||||| | ||| || |  |||||| | |||||||||||| || | ||| |||||||| |||||| |||||||||| ||||    
T  13377003 tcatgctcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgttgattcatggcttgagtattcataattcatgatttgttgatgagaaatgaattgt 13377102  T
Q  162 tgtcggtggttttgtaaaat 181  Q
    ||| || |||||||| ||||    
T  13377103 tgttggcggttttgtgaaat 13377122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 62 - 188
Target Start/End: Original strand, 37234022 - 37234149
Alignment:
Q  62 ttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttg 160  Q
    |||||| ||||| | ||||||||||| | ||| ||||  ||| |||| ||||||| ||||||| | ||| | |||||||| | || ||| || ||||||     
T  37234022 ttcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatgacttgggtgtccataaatcatgatttgatgatgaaaattgagttt 37234121  T
Q  161 ttgtcggtggttttgtaaaatgggttga 188  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||    
T  37234122 ttgtggttggttttgtaaaatgggttga 37234149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 20 - 87
Target Start/End: Original strand, 9784184 - 9784248
Alignment:
Q  20 aattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttg 87  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||   ||| ||||| |||||||||||||| | |||||||||||    
T  9784184 aattggtgaattatgctttgttgttga---attgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttg 9784248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 110 - 181
Target Start/End: Original strand, 41229149 - 41229221
Alignment:
Q  110 attcatggcttgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaat 181  Q
    |||||||||||| || | ||| |||||||||| || | |||||||||||||||||| ||| |||| |||||||    
T  41229149 attcatggcttgagtgttcataattcatgatttgtggatgagaaatgagttgttgttggtagtttggtaaaat 41229221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 109; Significance: 5e-55; HSPs: 4)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 11 - 181
Target Start/End: Original strand, 162297 - 162469
Alignment:
Q  11 attatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttg-ttgtttagtcatatgtttgatgata 109  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||     
T  162297 attatgctcaattggtgaattctgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgtttgtttagtcatattgttgatgatg 162396  T
Q  110 attcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaat 181  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||    
T  162397 atatatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaat 162469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #2
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 17 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 164345 - 164204
Alignment:
Q  17 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 116  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |  |||||| |||||||||    
T  164345 ctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaaatgttgttgttgttgtttagtcatgttgttgatggtaattcatg 164246  T
Q  117 gcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgag 157  Q
    |||||||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||    
T  164245 gcttgggtttgcataattcttggtttgttgttgagaaatgag 164204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #3
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 11 - 181
Target Start/End: Original strand, 166383 - 166547
Alignment:
Q  11 attatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataa 110  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||       | ||||  |||||||| |    
T  166383 attatgctcaattggtgaattctgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgt-------taatattgttgatgatga 166475  T
Q  111 ttcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaat 181  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  ||||||| ||||||||||| ||||    
T  166476 tacatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgaaaaatggattgttgttggtggttttgtgaaat 166547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #4
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 77 - 181
Target Start/End: Original strand, 116690 - 116795
Alignment:
Q  77 tgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttg 175  Q
    ||||||||||| | ||| ||||  ||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||||| |||||| ||| |||||  ||||||| ||||||||||    
T  116690 tgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtgttcataattcatgatttgttgatgaaaaatggattgttgttggtggttttg 116789  T
Q  176 taaaat 181  Q
    ||||||    
T  116790 taaaat 116795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 104; Significance: 5e-52; HSPs: 27)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 11 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 22274858 - 22274688
Alignment:
Q  11 attatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataa 110  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||| |    
T  22274858 attatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatgtgtttcatgatcaatggttgttgttgatgtttagtcatattgttgatgatga 22274759  T
Q  111 ttcatggcttgggtttgcatgattcatg-attgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaat 181  Q
    |  |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||    
T  22274758 tagatggcttggg-ttgcatgattcatgaattgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaat 22274688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 17 - 169
Target Start/End: Original strand, 23836822 - 23836975
Alignment:
Q  17 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 116  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  23836822 ctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaattgttgttgttgttgtttagtcattttgttgatgataattcatg 23836921  T
Q  117 gcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 169  Q
     ||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  23836922 acttgggtttgcataattcttgatttgttgttgagaaatgagatgttgttggtg 23836975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 17 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 32465988 - 32465835
Alignment:
Q  17 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 116  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  32465988 ctcaattggtgaattatgcattgttcttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgtttagtcatgttgttgatgataattcatg 32465889  T
Q  117 gcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 169  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  32465888 gcttgggtttgcatgattcatggtttgttgttgagaaatgagatgttgttggtg 32465835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 11 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 22284091 - 22283921
Alignment:
Q  11 attatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataa 110  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||| |||  |||||||| |    
T  22284091 attatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatgtgtttcatgatcaatcgttgtttttgatgtttagtcttattgttgatgatga 22283992  T
Q  111 ttcatggcttgggtttgcatgattcatg-attgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaat 181  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||    
T  22283991 tacatggcttggg-ttgcatgattcatgaattgctgttgagaaatgaattgttgttggtggttttgtgaaat 22283921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 17 - 185
Target Start/End: Original strand, 25876036 - 25876206
Alignment:
Q  17 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 116  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||  ||||||||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  25876036 ctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgatatgcttcatgatcaaatgttgttgttattgtttagtcatgttgttgatgataattcatg 25876135  T
Q  117 gcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggt 185  Q
    |||||||||||||| |||| | | ||||| ||| ||||| ||||||||| | |||||| || |||||||||    
T  25876136 gcttgggtttgcataattcttggcttgttattgtgaaataagttgttgttgttggtttggtgaaaatgggt 25876206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 63 - 216
Target Start/End: Original strand, 19433495 - 19433649
Alignment:
Q  63 tcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgt 161  Q
    ||||| ||||| | ||||||||||| | ||  ||||  ||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  19433495 tcatgttcaattgatgttgttgttgctaagagatattgttgttgatgattcatggcttgggtgttcataattcatgatttgttgatgagaaatgagttgt 19433594  T
Q  162 tgtcggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgaatttgatgatgt 216  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19433595 tgttggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgattttgatgatgt 19433649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 11 - 173
Target Start/End: Original strand, 9653015 - 9653179
Alignment:
Q  11 attatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataa 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||| | ||||| ||||||| ||| || |  | |||| |||    
T  9653015 attatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgcgatatttttcatgatcaatagatgttgatgttgttaagtgatgttatggatgctaa 9653114  T
Q  111 ttcatggcttgggtttgcatgattcatga--ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 173  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||    
T  9653115 ttcatggcttgggtatgcatgattcataattttgttgttgtgaaataagttgttgttgttggttt 9653179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 18 - 169
Target Start/End: Original strand, 4448251 - 4448402
Alignment:
Q  18 tcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatgg 117  Q
    ||||||||||||| |||| | ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |  ||||| |  |||||||||||||||||    
T  4448251 tcaattggtgaatgatgctttgttgttgttgaattatgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgataattcatgg 4448350  T
Q  118 cttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 169  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| |||||| ||||    
T  4448351 cttgggtttgcatgattcatgatttgtgttgaaaaatgagatgttgttggtg 4448402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 13 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 6879571 - 6879414
Alignment:
Q  13 tatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataatt 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||| |  |||||||||||     
T  6879571 tatactcaattggtgaattatgcattgttattgatgaattgtgatatgtttaatgatcaattgttgttgttgttatttagtcatgttgttgatgataata 6879472  T
Q  113 catggcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 169  Q
    |||| |||||||||  || |||| | | ||||||||||||| |||| |||||| ||||    
T  6879471 catgtcttgggtttaaataattcttggtttgttgttgagaattgagatgttgttggtg 6879414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 11 - 161
Target Start/End: Original strand, 21274168 - 21274319
Alignment:
Q  11 attatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataa 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| || |  | |||| |||    
T  21274168 attatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtaatatgtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgttatggatgctaa 21274267  T
Q  111 ttcatggcttgggtttgcatgattcatga--ttgttgttgagaaatgagttgt 161  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||| |  ||||||||| ||||| ||||||    
T  21274268 ttcatggcttggg-tagcatgattcataattttgttgttgtgaaataagttgt 21274319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 17 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 28974179 - 28974026
Alignment:
Q  17 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 116  Q
    |||| |||| |||||||||   |||||||||||||| || || |||||||||||||| | ||||||||||| | |||||| |  ||||||||||||||||    
T  28974179 ctcatttggcgaattatgctatgttgttgatgaattgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtcatgttgttgatgataattcatg 28974080  T
Q  117 gcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 169  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  28974079 gcttgggtttgcatgattcatgatttgttgatgagaaatgagatgttgttggtg 28974026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 17 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 271300 - 271148
Alignment:
Q  17 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 116  Q
    ||||||||||||||||||  | ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |  ||||| |  |||||||||||||||     
T  271300 ctcaattggtgaattatgttttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgataattcata 271201  T
Q  117 gcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 169  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| |||||| ||||    
T  271200 gcttgggtttgcatgattcatgatttgtgttgaggaatgagatgttgttggtg 271148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 17 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 25602154 - 25601989
Alignment:
Q  17 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 116  Q
    |||||||||||| ||||||   || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |  ||||| |  || ||||||| |||||    
T  25602154 ctcaattggtgagttatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgtttatgataaatcatg 25602055  T
Q  117 gcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaat 181  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||    
T  25602054 gcttaggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaat 25601989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 20 - 185
Target Start/End: Original strand, 36890805 - 36890972
Alignment:
Q  20 aattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggct 119  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||| |||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||| | ||| || |  | |||||| ||||||||||    
T  36890805 aattggtgaattatgctatgttgttgataaattgtgataagtttcatgatcaattgttgttgttgttgctaagtgatgttgtggatgattattcatggct 36890904  T
Q  120 tgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggt 185  Q
    ||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| | |||||| || |||||||||    
T  36890905 tgggtatgcatgattcttgatttgttgttgagaaataagttgttgttgttggtttggtgaaaatgggt 36890972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 53 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 27261900 - 27261783
Alignment:
Q  53 ttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgaga 151  Q
    |||||| |||||||||||||| | | ||||||||| | |||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  27261900 ttgataagtttcatgatcaattgatattgttgttgctaagtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttaaga 27261801  T
Q  152 aatgagttgttgtcggtg 169  Q
    |||||| |||||| ||||    
T  27261800 aatgagatgttgttggtg 27261783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 134 - 216
Target Start/End: Original strand, 24826961 - 24827044
Alignment:
Q  134 tcatgattgttgttgagaaa-tgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgaatttgatgatgt 216  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  24826961 tcatgattgttgttgagaaaatgagctgttgttggtggttttgtaaaatgggttgataaagaagaagtttgatattgatgatgt 24827044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 62 - 188
Target Start/End: Original strand, 3403 - 3529
Alignment:
Q  62 ttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgt 161  Q
    |||||| ||||| | ||||||||||| | ||| || |  |||||||| ||||||||||||||| | ||| |||||||||||| | |||||||||||||||    
T  3403 ttcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgatgattcatggcttgggtgttcataattcatgattgtagatgagaaatgagttgt 3502  T
Q  162 tgtcggtggttttgtaaaatgggttga 188  Q
    ||| ||||  |||||||||||||||||    
T  3503 tgttggtgactttgtaaaatgggttga 3529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 40 - 180
Target Start/End: Original strand, 22579999 - 22580140
Alignment:
Q  40 ttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga 139  Q
    |||||| |||||| ||||| |||||||||||||| | ||||| || || |  || || |  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22579999 ttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgctgctgatatgtgatgttgttgatgataattcatggcttgggtatgcatgattcatga 22580098  T
Q  140 -ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaa 180  Q
     ||||||| |||||||||| |||||| |||| ||| ||||||    
T  22580099 tttgttgtggagaaatgagatgttgttggtgttttggtaaaa 22580140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 114 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 25213081 - 25212977
Alignment:
Q  114 atggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgag--aaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgaatttgat 211  Q
    ||||||||||| | |||   |||||||||||||||||  |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||    
T  25213081 atggcttgggtgttcatatatcatgattgttgttgagaaaaatgagttgttggtggtggttttgtaaaatgggttgataaagaagaaatttgattttgat 25212982  T
Q  212 gatgt 216  Q
    |||||    
T  25212981 gatgt 25212977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 17 - 180
Target Start/End: Original strand, 24571408 - 24571572
Alignment:
Q  17 ctcaattggt-gaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcat 115  Q
    |||||||||| |||||||||   ||| ||| |||||| || || | |||||||||||| | ||||||||||||| ||| || |  |||||||||| ||||    
T  24571408 ctcaattggttgaattatgctatgtttttgttgaattgtgttaagattcatgatcaattgatgttgttgttgttaagtgatgttgttgatgataactcat 24571507  T
Q  116 ggcttgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaa 180  Q
    | ||||| | || ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||    
T  24571508 g-cttggctatgtatgattcatgatttgttgttgagaaatgagatgttgttggtggtttggtaaaa 24571572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 154 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 43645886 - 43645824
Alignment:
Q  154 tgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgaatttgatgatgt 216  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||    
T  43645886 tgagttgttggtggtggttttgtaaaatgggttggtaatgaaaaagtttgattttgatgatgt 43645824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 105 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 722437 - 722353
Alignment:
Q  105 tgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttga 188  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||| ||||| |||||||||||| ||||  |||||||||| ||||||    
T  722437 tgataattcatggcttgggtgtgcataattcatgatttattgatgagatatgagttgttgttggtgactttgtaaaattggttga 722353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 68119 - 67952
Alignment:
Q  20 aattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggct 119  Q
    ||||| ||||||||||   ||||||| |||||| || || | |||||| ||||| | ||||||||||| | ||| ||||  ||| || | ||||||||||    
T  68119 aattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttggtgattcatggct 68020  T
Q  120 tgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggt 185  Q
    || || | ||| |||||||| ||| || |||||||| ||||||||| | ||||||||| |||||||||    
T  68019 tgcgtgttcataattcatgatttgatgatgagaaataagttgttgttgttggttttgtgaaaatgggt 67952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 148 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 24884684 - 24884643
Alignment:
Q  148 gagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttgat 189  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  24884684 gagaaatgagttgttgttgttggttttgtaaaatgggttgat 24884643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 105 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 25305487 - 25305416
Alignment:
Q  105 tgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttg 175  Q
    |||| ||||||||| ||||| | ||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  25305487 tgatgattcatggcctgggtattcataattcatgatttgttgatgagaaatgagttgttgttggtagttttg 25305416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 62 - 185
Target Start/End: Original strand, 23821767 - 23821892
Alignment:
Q  62 ttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttg 160  Q
    |||||| ||||| | ||||||||||| | ||| ||||  ||| |||| ||||||||| ||||| | ||| |||||||| ||| || || ||||| |||||    
T  23821767 ttcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcatgggtgttcataattcatgatttgatgatgtgaaataagttg 23821866  T
Q  161 ttgtcggtggttttgt-aaaatgggt 185  Q
    |||| | ||||||||| |||||||||    
T  23821867 ttgttgttggttttgtgaaaatgggt 23821892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 62 - 185
Target Start/End: Original strand, 23830846 - 23830971
Alignment:
Q  62 ttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttg 160  Q
    |||||| ||||| | ||||||||||| | ||| ||||  ||| |||| ||||||||| ||||| | ||| |||||||| ||| || || ||||| |||||    
T  23830846 ttcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcatgggtgttcataattcatgatttgatgatgtgaaataagttg 23830945  T
Q  161 ttgtcggtggttttgt-aaaatgggt 185  Q
    |||| | ||||||||| |||||||||    
T  23830946 ttgttgttggttttgtgaaaatgggt 23830971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 99; Significance: 5e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 11 - 176
Target Start/End: Original strand, 570 - 736
Alignment:
Q  11 attatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataa 110  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||  |||||||| |    
T  570 attatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgatatttactcatattgttgatgatga 669  T
Q  111 ttcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt 176  Q
    | |||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||  || |||| |||||||||||    
T  670 tacatggcttgggtttgcatgattaataatttgttgttgagaaatggattattgttggtggttttgt 736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0396 (Bit Score: 94; Significance: 5e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0396
Description:

Target: scaffold0396; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 17 - 162
Target Start/End: Original strand, 11825 - 11970
Alignment:
Q  17 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 116  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||| | |||||| |  ||||||||||||||||    
T  11825 ctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattttgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtcatgttgttgatgataattcatg 11924  T
Q  117 gcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgtt 162  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  11925 gcttgagtttgcatggttcatgattggtgttgagaaatgagatgtt 11970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0091 (Bit Score: 94; Significance: 5e-46; HSPs: 2)
Name: scaffold0091
Description:

Target: scaffold0091; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 17 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 32333 - 32180
Alignment:
Q  17 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 116  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  32333 ctcaattggtgaattatgaattgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaattgttgttgttgttgtttagtcatgttgttgatgataattcatg 32234  T
Q  117 gcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 169  Q
    |||||||||||||| || | | | |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  32233 gcttgggtttgcataatccttggtttgttgttgagaaatgagatgttgttggtg 32180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0091; HSP #2
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 17 - 169
Target Start/End: Original strand, 41970 - 42123
Alignment:
Q  17 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 116  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  41970 ctcaattggtgaattatgaattgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaattgttgttgttgttgtttagtcatgttgttgatgataattcatg 42069  T
Q  117 gcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 169  Q
    |||||||||||||| || | | | |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  42070 gcttgggtttgcataatccttggtttgttgttgagaaatgagatgttgttggtg 42123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 94; Significance: 5e-46; HSPs: 3)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 17 - 169
Target Start/End: Original strand, 132367 - 132520
Alignment:
Q  17 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 116  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||    
T  132367 ctcaattggtgaattatgcatcgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgttaagtcatgttgttgatgataattcatg 132466  T
Q  117 gcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 169  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||  |||||| ||||    
T  132467 gcttgggtttgcatgattcatggtttgttgttgagaaatgaaatgttgttggtg 132520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 17 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 11818 - 11660
Alignment:
Q  17 ctcaattggt-gaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcat 115  Q
    |||||||||| |||||||||   |||||||  ||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||| | ||| |  |  |||||||||||||||    
T  11818 ctcaattggttgaattatgctatgttgttgtagaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgacgttgttgatgataattcat 11719  T
Q  116 ggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 173  Q
    ||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  11718 ggcttggttatgcatgattcatgatttgttgttgagaaatgagatgttgttggtggttt 11660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 18 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 88404 - 88289
Alignment:
Q  18 tcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||| ||||||| ||| || |  | |||| |||||| |||    
T  88404 tcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgctgttgttaagtgatgttatggatgctaattcttgg 88305  T
Q  118 cttgggtttgcatgat 133  Q
    ||||||| ||||||||    
T  88304 cttgggtatgcatgat 88289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 94; Significance: 5e-46; HSPs: 2)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 17 - 169
Target Start/End: Original strand, 70739 - 70892
Alignment:
Q  17 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 116  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  70739 ctcaattggtgaattatgcattattgttgatgaattgtgataagtttcatgatcattggatgttgttgttgtttagtcatgttgttgatgataattcatg 70838  T
Q  117 gcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 169  Q
     |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  70839 acttgggtttgcatgattcatggtttgttgttgagaaatgagatgttgttggtg 70892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 13 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 60940 - 60784
Alignment:
Q  13 tatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataatt 112  Q
    |||||| |||||||||||||||| | ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |  ||||| |  ||||||||||||    
T  60940 tatacttaattggtgaattatgctttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgataatt 60841  T
Q  113 catggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 169  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| |||||| ||||    
T  60840 catgacttgggtttgcatgattcatgatttgtgtggagaaatgagatgttgttggtg 60784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0480 (Bit Score: 90; Significance: 1e-43; HSPs: 2)
Name: scaffold0480
Description:

Target: scaffold0480; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 17 - 169
Target Start/End: Original strand, 5363 - 5516
Alignment:
Q  17 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 116  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||| | |||||| |  ||||||||||||||||    
T  5363 ctcaattggtgaattaggcattgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtcatgttgttgatgataattcatg 5462  T
Q  117 gcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 169  Q
    | ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  5463 gtttgggtttgcatgattcatggtttgttgttgagaaatgagatgttgttggtg 5516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0480; HSP #2
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 17 - 173
Target Start/End: Original strand, 8998 - 9156
Alignment:
Q  17 ctcaattggt-gaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcat 115  Q
    |||||||||| |||||||||   ||||||| | |||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||| | ||| || |  |||||||||||||||    
T  8998 ctcaattggttgaattatgctatgttgttgttaaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgataattcat 9097  T
Q  116 ggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 173  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  9098 ggcttaggtatgcatgattcatgatttgttgttgagaaatgagatgttgtcggtggttt 9156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 90; Significance: 1e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 17 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 22821 - 22668
Alignment:
Q  17 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 116  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | |||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||    
T  22821 ctcaattggtgaattatgcatttttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgttttgtcatgttgttgatgataattcatg 22722  T
Q  117 gcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 169  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| |||||| ||||    
T  22721 gcttgggtttgcatgattcatggtttgttattgagaaatgagatgttgttggtg 22668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0673 (Bit Score: 87; Significance: 7e-42; HSPs: 2)
Name: scaffold0673
Description:

Target: scaffold0673; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 17 - 169
Target Start/End: Original strand, 6962 - 7118
Alignment:
Q  17 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaa---tggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattc 113  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||   | |||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||    
T  6962 ctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgttgttgttgttgttgtttagtcatgttgttgatgataattc 7061  T
Q  114 atggcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 169  Q
    ||||||||||||||||| |||| | | |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  7062 atggcttgggtttgcataattcttggtttgttgttgagaaatgagatgttgttggtg 7118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0673; HSP #2
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 17 - 169
Target Start/End: Original strand, 939 - 1092
Alignment:
Q  17 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 116  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |  ||||| |  ||||||||||||||||    
T  939 ctcaattggtgaattatgcattgttattgatgatttgtgataagtttcatgatcaattgttgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgataattcatg 1038  T
Q  117 gcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 169  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  1039 gcttgggtttgcatgattcatggtttgttgttgagaaatgagatgttgttggtg 1092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 87; Significance: 7e-42; HSPs: 2)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 20 - 173
Target Start/End: Original strand, 109582 - 109736
Alignment:
Q  20 aattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggct 119  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||| | |||||| |  |||||||||||||||||||    
T  109582 aattggtgaattatgctaagttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtcatgttgttgatgataattcatggct 109681  T
Q  120 tgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 173  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  109682 tgggattgcatgattcatgatttgttgttgagaaatgagatgttgttggtggttt 109736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #2
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 18 - 173
Target Start/End: Original strand, 118081 - 118237
Alignment:
Q  18 tcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||| |||||||||||| | | ||||||||||| | |||||| |  |||||||||||||||||    
T  118081 tcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcagttgatgttgttgttgctaagtcatgttgttgatgataattcatgg 118180  T
Q  118 cttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 173  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  118181 cttggggttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatgagatgttgttggtggttt 118237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0597 (Bit Score: 86; Significance: 3e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0597
Description:

Target: scaffold0597; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 11 - 173
Target Start/End: Original strand, 1097 - 1261
Alignment:
Q  11 attatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataa 110  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| || |  |  ||| |||    
T  1097 attatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgttatgaatgctaa 1196  T
Q  111 ttcatggcttgggtttgcatgattcatga--ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 173  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||| | ||||||    
T  1197 ttcatggcttgggtatgcatgattcataattttgttgttgagaaataagttgttgttgttggttt 1261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0251 (Bit Score: 86; Significance: 3e-41; HSPs: 2)
Name: scaffold0251
Description:

Target: scaffold0251; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 11 - 173
Target Start/End: Original strand, 13505 - 13669
Alignment:
Q  11 attatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataa 110  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| || |  | |||| |||    
T  13505 attatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgttatggatgctaa 13604  T
Q  111 ttcatggcttgggtttgcatgattcatga--ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 173  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||    
T  13605 ttcatggcttgggtatgcatgattcataattttgttgttgtgaaataagttgttgttgttggttt 13669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0251; HSP #2
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 11 - 164
Target Start/End: Original strand, 21479 - 21634
Alignment:
Q  11 attatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataa 110  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| || |  |  ||| |||    
T  21479 attatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgttatgaatgctaa 21578  T
Q  111 ttcatggcttgggtttgcatgattcatga--ttgttgttgagaaatgagttgttgt 164  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||| ||||| |||||||||    
T  21579 ttcatggcttgggtatgcatgattcataattttgttgttgtgaaataagttgttgt 21634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 86; Significance: 3e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 11 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 15085 - 14921
Alignment:
Q  11 attatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataa 110  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| || |  | |||| |||    
T  15085 attatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgttatggatgctaa 14986  T
Q  111 ttcatggcttgggtttgcatgattcatga--ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 173  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||    
T  14985 ttcatggcttgggtatgcatgattcataattttgttgttgtgaaataagttgttgttgttggttt 14921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 86; Significance: 3e-41; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 17 - 169
Target Start/End: Original strand, 254931 - 255084
Alignment:
Q  17 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 116  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |  ||||| |  ||||||||||||||||    
T  254931 ctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgataattcatg 255030  T
Q  117 gcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 169  Q
    ||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  255031 gcttgagtttgcatgattcatggtttgttgttgagaaatgagatgttgttggtg 255084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 17 - 169
Target Start/End: Original strand, 261537 - 261690
Alignment:
Q  17 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 116  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |  ||||| |  ||||||||||||||||    
T  261537 ctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgataattcatg 261636  T
Q  117 gcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 169  Q
    ||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  261637 gcttgagtttgcatgattcatggtttgttgttgagaaatgagatgttgttggtg 261690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234 (Bit Score: 84; Significance: 4e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0234
Description:

Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 11 - 173
Target Start/End: Original strand, 17523 - 17686
Alignment:
Q  11 attatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataa 110  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||||| ||| || |  | |||| |||    
T  17523 attatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgttatggatgctaa 17622  T
Q  111 ttcatggcttgggtttgcatgattcatgat-tgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 173  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||| | ||||||    
T  17623 ttcatggcttgggtatgcatgattcataatatgttgttgtgaaataagttgttgttgttggttt 17686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083 (Bit Score: 84; Significance: 4e-40; HSPs: 2)
Name: scaffold0083
Description:

Target: scaffold0083; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 17 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 15004 - 14854
Alignment:
Q  17 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 116  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  15004 ctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaattgttgttgt---tgtttagtcatgttgttgatgataattcatg 14908  T
Q  117 gcttgggtttgcatgattc-atgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 169  Q
    |||||||||||||| ||||   | |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  14907 gcttgggtttgcataattctcggtttgttgttgagaaatgagatgttgttggtg 14854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 76 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 14288 - 14194
Alignment:
Q  76 ttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattc-atgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 169  Q
    ||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||   | |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  14288 ttgttgttgttgtttagtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcataattctcggtttgttgttgagaaatgagatgttgttggtg 14194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0240 (Bit Score: 83; Significance: 2e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0240
Description:

Target: scaffold0240; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 17 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 7699 - 7556
Alignment:
Q  17 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 116  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||    
T  7699 ctcaattggtgaattatgcattgttgttgataaattatgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgttaagtcatgttgttgatgataattcatg 7600  T
Q  117 gcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgtt 162  Q
    |||||||||||||||||||  | | |||||||||||||||| ||||    
T  7599 gcttgggtttgcatgattc--gttggttgttgagaaatgagatgtt 7556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 83; Significance: 2e-39; HSPs: 2)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 20 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 85459 - 85321
Alignment:
Q  20 aattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggct 119  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||| | |||||| |  ||||||||||||||||| |    
T  85459 aattggtgaattatgctaggttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtcatgttgttgatgataattcatggtt 85360  T
Q  120 tgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgag 157  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  85359 tgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatgag 85321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 11 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 159436 - 159275
Alignment:
Q  11 attatactcaattggt-gaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgata 109  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||   |||| || |||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||| | ||| || |   ||||||||    
T  159436 attatgctcaattggttgaattatgctatgttgatgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatgt---tgatgata 159340  T
Q  110 attcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 173  Q
    |||  |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  159339 atttttggcttgggtatgcatgattcatgatttgttgttgagaaatgagatgttgttggtggttt 159275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0610 (Bit Score: 82; Significance: 7e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0610
Description:

Target: scaffold0610; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 17 - 169
Target Start/End: Original strand, 693 - 846
Alignment:
Q  17 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 116  Q
    |||| ||||||||||||||   |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||| | |||||| |  ||||||||||||||||    
T  693 ctcatttggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtcatgttgttgatgataattcatg 792  T
Q  117 gcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 169  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  793 gcttgggttggcatgattcatgatttgttgttgagaaatgagatgttgttggtg 846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 82; Significance: 7e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 17 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 38428 - 38287
Alignment:
Q  17 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 116  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||     
T  38428 ctcaattggcgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgacgttgttgttgtttagtcatgttgttgatgataattcata 38329  T
Q  117 gcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgag 157  Q
     |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  38328 acttgggtttgcatgattcatggtttgttgttgagaaatgag 38287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 82; Significance: 7e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 17 - 181
Target Start/End: Original strand, 253106 - 253271
Alignment:
Q  17 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 116  Q
    |||||||||||||| |||| | ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||| |  |||||||||||||| |    
T  253106 ctcaattggtgaatcatgctttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgttgttgtttttgttaagtcatgttgttgatgataattcaag 253205  T
Q  117 gcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaat 181  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||    
T  253206 gcttgggtttgcatgattcatgatttcttgatgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaat 253271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0190 (Bit Score: 81; Significance: 3e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0190
Description:

Target: scaffold0190; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 17 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 10067 - 9903
Alignment:
Q  17 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 116  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |  ||||| |  |||||||| |||||||    
T  10067 ctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgattattcatg 9968  T
Q  117 gcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaa 180  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||| |||| ||| ||||||    
T  9967 gcttgggtttgcatgattcatgatttgttgtggagaaatgagatgttgttggtgttttggtaaaa 9903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 80; Significance: 1e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 17 - 185
Target Start/End: Original strand, 15588 - 15761
Alignment:
Q  17 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaa---tggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattc 113  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||   | |||||||||||||||||||||| |  | |||| ||||||    
T  15588 ctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaattgttgttgttgttgttgtttagtcatgttatagatgctaattc 15687  T
Q  114 atggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggt 185  Q
    ||||||||||| |||||||||||| | || |||||||||||| | ||||||| | |||||| || |||||||||    
T  15688 atggcttgggtatgcatgattcataattttttgttgagaaataaattgttgttgttggtttggtgaaaatgggt 15761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0338 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0338
Description:

Target: scaffold0338; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 17 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 9117 - 8960
Alignment:
Q  17 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 116  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||||||| || ||||| |||||| ||||| | | ||||||||||| | |||||| |  ||||||||||||||||    
T  9117 ctcaattggtgaattatgctatgttgttgatgatttgtgataagtttcaagatcacttgatgttgttgttgctaagtcatgttgttgatgataattcatg 9018  T
Q  117 gcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 173  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  9017 gcttgggtttgcttgattcatgatttgttgttgagaaatgagatgttgttggtggttt 8960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0195
Description:

Target: scaffold0195; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 17 - 169
Target Start/End: Original strand, 635 - 788
Alignment:
Q  17 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 116  Q
    |||| ||||||||||||||   |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||  | |||||| |  ||||||||||||||||    
T  635 ctcatttggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttactaagtcatgttgttgatgataattcatg 734  T
Q  117 gcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 169  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  735 gcttgggttggcatgattcatgatttgttgttgagaaatgagatgttgttggtg 788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 3)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 11 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 55717 - 55553
Alignment:
Q  11 attatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataa 110  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||||| ||| || |  | |||| |||    
T  55717 attatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgttatggatgctaa 55618  T
Q  111 ttcatggcttgggtttgcatgattcatga--ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 173  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |  |||||||||  |||| ||||||||| | ||||||    
T  55617 ttcatggcttgggtatgcatgattcataattttgttgttgtaaaataagttgttgttgttggttt 55553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 101 - 188
Target Start/End: Original strand, 93973 - 94061
Alignment:
Q  101 ttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttga 188  Q
    ||||||||||||||||  ||||||   ||| |||||||||| |||| ||||||||||| |||||| ||||  |||||||||||||||||    
T  93973 ttgatgataattcatgatttgggtgaacataattcatgatttgttggtgagaaatgagatgttgttggtgactttgtaaaatgggttga 94061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 77 - 164
Target Start/End: Original strand, 104799 - 104887
Alignment:
Q  77 tgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatg-attgttgttgagaaatgagttgttgt 164  Q
    ||||||||||| | ||| ||||  ||| |||| ||||||||||||||| | ||| ||||||| |||| || ||| ||||||||||||||    
T  104799 tgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtattcataattcatgaattgatgatgataaatgagttgttgt 104887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359 (Bit Score: 77; Significance: 7e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0359
Description:

Target: scaffold0359; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 20 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 1444 - 1300
Alignment:
Q  20 aattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggct 119  Q
    |||||||||||||||| | ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |  ||||| |  |||||||| ||||||||||    
T  1444 aattggtgaattatgctttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgatcattcatggct 1345  T
Q  120 tgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttg 163  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  1344 tgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatgagatgttg 1300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 17 - 169
Target Start/End: Original strand, 11771 - 11921
Alignment:
Q  17 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 116  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||||||||||||   |||||||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||    
T  11771 ctcaattagtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgaaaagtttcatgatcaa---ttgttgttgttgttaagtcatgttgttgatgataattcatg 11867  T
Q  117 gcttgggtttgcatgattcatga--ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 169  Q
    ||||||| |||||| | ||||||  ||||| | |||||||||| |||||| ||||    
T  11868 gcttggg-ttgcataactcatgattttgttatggagaaatgagatgttgttggtg 11921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0706 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0706
Description:

Target: scaffold0706; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 11 - 164
Target Start/End: Original strand, 6662 - 6816
Alignment:
Q  11 attatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataa 110  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| | | ||||||||||| ||| || |  | |||| |||    
T  6662 attatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgataagtttgatgatcaatagatcttgttgttgttaagtgatgttatggatgctaa 6761  T
Q  111 ttcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgt 164  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||| |||||||||    
T  6762 ttcatggcttgggtatgcatgattcataatttgttgttgtgaaataagttgttgt 6816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0465 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0465
Description:

Target: scaffold0465; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 20 - 173
Target Start/End: Original strand, 10094 - 10248
Alignment:
Q  20 aattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggct 119  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||| || |  | |||| ||||||||||||    
T  10094 aattggcgaattatgcttggttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatggatgttgttgttgttaagtgatgttatggatgctaattcatggct 10193  T
Q  120 tgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 173  Q
    ||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||    
T  10194 tgggtatgcatgattcataatttgttgttgtgaaataagttgttgttgatggttt 10248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 74; Significance: 4e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 11 - 173
Target Start/End: Original strand, 193607 - 193770
Alignment:
Q  11 attatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataa 110  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| || |  | |||| |||    
T  193607 attatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatta-ttgtgatatgtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgttatggatgctaa 193705  T
Q  111 ttcatggcttgggtttgcatgattcatga--ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 173  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||    
T  193706 ttcatggcttgggtatgcatgattcataattttgttgttgcgaaataagttgttgttgttggttt 193770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 11 - 164
Target Start/End: Original strand, 186645 - 186799
Alignment:
Q  11 attatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataa 110  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| || |  | |||| |||    
T  186645 attatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatta-ttgtgatatgtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgttatggatgctaa 186743  T
Q  111 ttcatggcttgggtttgcatgattcatga--ttgttgttgagaaatgagttgttgt 164  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||| ||||| |||||||||    
T  186744 ttcatggcttgggtatgcatgattcataattttgttgttgtgaaataagttgttgt 186799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0574 (Bit Score: 72; Significance: 6e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0574
Description:

Target: scaffold0574; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 11 - 173
Target Start/End: Original strand, 9626 - 9789
Alignment:
Q  11 attatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataa 110  Q
    ||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||||| ||| |  |  | |||| |||    
T  9626 attatgctcaattagtgacttatgcatggttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgacgttatggatgctaa 9725  T
Q  111 ttcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 173  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||    
T  9726 ttcatggcttgggtatgcatgattcataatttgttgttgtgaaataagttgttgttgttggttt 9789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150 (Bit Score: 72; Significance: 6e-33; HSPs: 2)
Name: scaffold0150
Description:

Target: scaffold0150; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 110 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 28573 - 28466
Alignment:
Q  110 attcatggcttgggtttgcatgattcatgattg-ttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgaattt 208  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||  ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  28573 attcatggcttgggtgttcataattcatgatttattggtgagaaatgagttgttgttggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgatttt 28474  T
Q  209 gatgatgt 216  Q
    ||||||||    
T  28473 gatgatgt 28466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 166 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 21687 - 21637
Alignment:
Q  166 ggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgaatttgatgatgt 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21687 ggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgattttgatgatgt 21637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 72; Significance: 6e-33; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 11 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 95111 - 94948
Alignment:
Q  11 attatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataa 110  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||| | ||| || |  | |||| |||    
T  95111 attatgctcaattagtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttgttgataagtgatgttatggatgctaa 95012  T
Q  111 ttcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 173  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||    
T  95011 ttcatggtttgggtatgcatgattcataatttgttgttgtgaaataagttgttgttgttggttt 94948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 17 - 173
Target Start/End: Original strand, 24845 - 25002
Alignment:
Q  17 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 116  Q
    |||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||||| ||| || |  | |||| |||||| ||    
T  24845 ctcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgttatggatgttaattcttg 24944  T
Q  117 gcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 173  Q
    |||||||| | |||||||||| | ||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||    
T  24945 gcttgggtattcatgattcataatttgttgttgtgaaataagttgttgttgttggttt 25002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 72; Significance: 6e-33; HSPs: 3)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 17 - 169
Target Start/End: Original strand, 112662 - 112812
Alignment:
Q  17 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 116  Q
    ||||||| |||||||||||   || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||   ||||||||||||| |||||| |   || ||||||||||||    
T  112662 ctcaattagtgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatttatgttgttgttgttaagtcatgt---tgttgataattcatg 112758  T
Q  117 gcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 169  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  112759 gcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatgagatgttgttggtg 112812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 39 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 109698 - 109556
Alignment:
Q  39 gttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatg 138  Q
    ||||||| |||||| ||||| | |||||||||| | | ||||||||||| | ||| || |  |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  109698 gttgttgttgaattgtgataagattcatgatcagttgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgataattcatggcttgggtatgcacgattcatg 109599  T
Q  139 a-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaa 180  Q
    | |||||| ||||||||||| |||||| ||| |||| ||||||    
T  109598 atttgttgatgagaaatgagatgttgttggtagtttggtaaaa 109556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 101 - 188
Target Start/End: Original strand, 103123 - 103211
Alignment:
Q  101 ttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttga 188  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||||| ||| |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||    
T  103123 ttgatgataattcatggtttgggtgtgcataattcatgaattgttggtgataaatgagttgttgttggtgactttgtaaaatgggttga 103211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 67; Significance: 6e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 17 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 146731 - 146561
Alignment:
Q  17 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 116  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||||| ||| || |  |  ||| |||||||||    
T  146731 ctcaattggtgaattatgctaggttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgttatgcatgttaattcatg 146632  T
Q  117 gcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggt 185  Q
    |||||||| |||||||||||| | ||||| ||| ||||| ||||||||| | |||||| || |||||||||    
T  146631 gcttgggtatgcatgattcataatttgtttttgtgaaataagttgttgttgttggtttggtgaaaatgggt 146561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1164 (Bit Score: 66; Significance: 2e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold1164
Description:

Target: scaffold1164; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 43 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 1485 - 1332
Alignment:
Q  43 ttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-tt 141  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||   ||||| ||||| |  ||||| |  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  1485 ttgatgaattgtgataagtttcatgatcaataaatgttgctgttgctatgtcatgttgttgatgataaatcatggcttgggtttgcatgattcatgattt 1386  T
Q  142 gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggttgataatga 194  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||| ||| || ||||||||||||| ||||    
T  1385 gttgttgagaaatgagatgttgttggtgttttggtgaaaatgggttgattatga 1332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0160 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0160
Description:

Target: scaffold0160; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 17 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 151 - 3
Alignment:
Q  17 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 116  Q
    ||||||| |||||||||||   || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |  ||||| |  ||||||||||||||||    
T  151 ctcaattcgtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatcttgttgatgataattcatg 52  T
Q  117 gcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgt 164  Q
    ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||  |||||||    
T  51 gcttgggtttgcatgtttcattatttgttgttgagaaatggattgttgt 3  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0160; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 77 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 3589 - 3492
Alignment:
Q  77 tgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 173  Q
    ||||||||||| |  ||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||   |||||| ||||||||    
T  3589 tgttgttgttgctatgtcatcttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgtttcattatttgttgttgagaaatggaatgttgttggtggttt 3492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 20 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 5068 - 4906
Alignment:
Q  20 aattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggct 119  Q
    |||||||||||||||  | ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||| | |||||| |  |||||||||||||||||||    
T  5068 aattggtgaattatgatttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtcatgttgttgatgataattcatggct 4969  T
Q  120 tgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaat 181  Q
    ||| | | ||| |||||||| ||| || |||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||    
T  4968 tggttgttcataattcatgatttgctgatgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaat 4906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 62; Significance: 6e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 20 - 169
Target Start/End: Original strand, 11688 - 11837
Alignment:
Q  20 aattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggct 119  Q
    |||||||||||||||| | ||||||| |||||| ||||  ||||||||||||||   ||||||||||| |  ||||| |  |||||||||||||||| ||    
T  11688 aattggtgaattatgctttgttgttgttgaattgtgatcagtttcatgatcaatttatgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgataattcatgact 11787  T
Q  120 tgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 169  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||| |||||||||| |||||| ||||    
T  11788 tgggtttgcataattcatgatttgtgtggagaaatgagatgttgttggtg 11837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 60; Significance: 9e-26; HSPs: 2)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 17 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 48277 - 48124
Alignment:
Q  17 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 116  Q
    ||||||||||||||||||  | |||||||||||||| ||| | |||||||||||||| ||| || |||||||| || ||| |  ||||||||||||||||    
T  48277 ctcaattggtgaattatgttttgttgttgatgaattgtgaaaagtttcatgatcaattgttattattgttgttaagccatgttgttgatgataattcatg 48178  T
Q  117 gcttgggtttgcatgattcatga--ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 169  Q
    ||||||| |||||| ||||||||  ||||| | |||||||||| |||||| ||||    
T  48177 gcttggg-ttgcataattcatgattttgttatggagaaatgagatgttgttggtg 48124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068; HSP #2
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 17 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 61725 - 61572
Alignment:
Q  17 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 116  Q
    ||||||||||||||||||  | |||||||||||||| ||| | |||||||||||||| ||| || |||||||| || ||| |  ||||||||||||||||    
T  61725 ctcaattggtgaattatgttttgttgttgatgaattgtgaaaagtttcatgatcaattgttattattgttgttaagccatgttgttgatgataattcatg 61626  T
Q  117 gcttgggtttgcatgattcatga--ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 169  Q
    ||||||| |||||| ||||||||  ||||| | |||||||||| |||||| ||||    
T  61625 gcttggg-ttgcataattcatgattttgttatggagaaatgagatgttgttggtg 61572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 60; Significance: 9e-26; HSPs: 3)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 114 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 130589 - 130486
Alignment:
Q  114 atggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgag-aaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgaatttgatg 212  Q
    ||||||||||| | |||   ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||    
T  130589 atggcttgggtgttcatatatcatgattgttgttgagaaaatgagttgttgttggtggttttgtaaaatgggttaataaagaagaagtttgattttgatg 130490  T
Q  213 atgt 216  Q
    ||||    
T  130489 atgt 130486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 39 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 79647 - 79521
Alignment:
Q  39 gttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatg 138  Q
    ||||||| |||||| |||| ||   |||| ||||| | ||||||||||| | ||| ||||  ||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||||    
T  79647 gttgttgttgaattatgatgtgaaccatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattattgttgatgattcatggcttgggtattcataattcatg 79548  T
Q  139 -attgttgttgagaaatgagttgttgt 164  Q
     |||| || ||||||||||||||||||    
T  79547 aattggtgatgagaaatgagttgttgt 79521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 86
Target Start/End: Original strand, 89586 - 89655
Alignment:
Q  17 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgtt 86  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||| | |||| ||||| ||||||||| |||| | ||||||||||    
T  89586 ctcaattggtgaattatgctttgttgttgttaaattgtgataagtttcatgaacaattgatgttgttgtt 89655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0095 (Bit Score: 56; Significance: 2e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0095
Description:

Target: scaffold0095; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 26 - 180
Target Start/End: Original strand, 33854 - 34008
Alignment:
Q  26 tgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtt 125  Q
    ||||||||||   ||||||| |||||| ||||| | |||||||||||| | ||||||||||| | ||| || |  ||||| ||||||||||||||||||     
T  33854 tgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgataataattcatggcttgggta 33953  T
Q  126 tgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaa 180  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||| ||| |||| ||||||    
T  33954 tgcatgatt-atgatttgttgttgagaaatgagatgttgttggtagtttggtaaaa 34008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0303 (Bit Score: 55; Significance: 9e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0303
Description:

Target: scaffold0303; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 11 - 164
Target Start/End: Original strand, 147 - 301
Alignment:
Q  11 attatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataa 110  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||  |  |||||||||| ||||| ||||||||||||||   ||||||||||||| ||| || |  | |||| |||    
T  147 attatgctcaattggtgaattatgcataataattgatgaattatgataagtttcatgatcaataaatgttgttgttgttaagtgatgttatggatgctaa 246  T
Q  111 ttcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgt 164  Q
    ||||||||||| || |||||||||||| | || |||||| ||||| |||||||||    
T  247 ttcatggcttgagtatgcatgattcataatttattgttgtgaaataagttgttgt 301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0103 (Bit Score: 54; Significance: 4e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0103
Description:

Target: scaffold0103; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 20 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 33789 - 33668
Alignment:
Q  20 aattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggct 119  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||| | ||| ||||  ||| |||| ||||||||||    
T  33789 aattggtgaattatgctatgttgttgatgaattttgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggct 33690  T
Q  120 tgggtttgcatgattcatgatt 141  Q
     |||| | ||| ||||||||||    
T  33689 agggtgttcataattcatgatt 33668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 52; Significance: 6e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 75 - 173
Target Start/End: Original strand, 24372 - 24471
Alignment:
Q  75 gttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 173  Q
    ||||||||||||| |  ||||| |  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||    
T  24372 gttgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatgtcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttt 24471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 52; Significance: 6e-21; HSPs: 3)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 42 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 31149 - 31010
Alignment:
Q  42 gttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-t 140  Q
    |||| |||||| ||||| |||||||||| ||| | |||||||| || |  || |  | ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |    
T  31149 gttgttgaattgtgataagtttcatgattaattgatgttgttgctgatatgtgaggtttttgatgataatttatggcttgggtatgcatgattcatgact 31050  T
Q  141 tgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaa 180  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||| ||| ||||||    
T  31049 tgttgttgagaaatgagatgttgttggtgttttggtaaaa 31010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 70734 - 70676
Alignment:
Q  26 tgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttg 84  Q
    |||||||||| | ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||    
T  70734 tgaattatgctttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttg 70676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 105 - 188
Target Start/End: Original strand, 97403 - 97487
Alignment:
Q  105 tgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttga 188  Q
    |||| ||||||| ||||||||| ||| | |||||||| | || | |||| |||||||||||   |||||||||||||||||||||    
T  97403 tgatgattcatgccttgggttttcataaatcatgatttgatgataagaattgagttgttgttattggttttgtaaaatgggttga 97487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0554 (Bit Score: 49; Significance: 3e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0554
Description:

Target: scaffold0554; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 62 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 2001 - 1889
Alignment:
Q  62 ttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttg 160  Q
    |||||||||||| | ||||||||||| | |||||| |   |||||||||||| ||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  2001 ttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtcatgttgatgatgataattcttggcttgagtatgcatgattcatgatttgttgttgagaaatgagatg 1902  T
Q  161 ttgtcggtggttt 173  Q
    ||||  |||||||    
T  1901 ttgttagtggttt 1889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 47; Significance: 5e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 20 - 181
Target Start/End: Original strand, 76967 - 77129
Alignment:
Q  20 aattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggct 119  Q
    ||||| ||||||||||   ||||||| |||||| || |  | |||||| ||||| | ||||||||||| | ||| ||||  ||  |||| ||||||||||    
T  76967 aattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtgagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttattgatgattcatggct 77066  T
Q  120 tgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaat 181  Q
    ||||| | ||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  77067 tgggtattcataattcatgatttgttgatgagaaatgagttgttgttggtggttttgtgaaat 77129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 45; Significance: 8e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 77 - 188
Target Start/End: Original strand, 43975 - 44087
Alignment:
Q  77 tgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttg 175  Q
    ||||||||||| | ||| ||||  ||| |||| ||||||||||||||| | ||| | |||||||| | || |||||||||||||||||| | ||||||||    
T  43975 tgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtgttcataaatcatgatttgatgatgagaaatgagttgttgttgttggttttg 44074  T
Q  176 taaaatgggttga 188  Q
    |||||||||||||    
T  44075 taaaatgggttga 44087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1272 (Bit Score: 44; Significance: 3e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold1272
Description:

Target: scaffold1272; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 63 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 393 - 270
Alignment:
Q  63 tcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgt 161  Q
    ||||| ||||| | ||||||||||| | ||| || | |||| |||| ||||||| |||||||   ||| |||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  393 tcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgtttttgttgattattcatgccttgggtgctcataattcatgatttgttgatgagaaatgagttgt 294  T
Q  162 tgtcggtggttttgtaaaatgggt 185  Q
    ||| |||||||||||||| |||||    
T  293 tgttggtggttttgtaaactgggt 270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0740 (Bit Score: 44; Significance: 3e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0740
Description:

Target: scaffold0740; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 18 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 4414 - 4351
Alignment:
Q  18 tcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttg 81  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||    
T  4414 tcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataagttttatgatcaattgttgttg 4351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0740; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 101 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 4353 - 4284
Alignment:
Q  101 ttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 169  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| | | |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  4353 ttgatgataattcatggtttgggtttgcataattcttggtttgttgttgagaaatgagatgttgttggtg 4284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0589 (Bit Score: 44; Significance: 3e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0589
Description:

Target: scaffold0589; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 103 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 7878 - 7807
Alignment:
Q  103 gatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 173  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  7878 gatgttaattcatggcttgggtatgcatgattcatgatttgttgttgagaaatgagatgttgttggtagttt 7807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0092 (Bit Score: 44; Significance: 3e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0092
Description:

Target: scaffold0092; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 47 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 3419 - 3308
Alignment:
Q  47 tgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttg 145  Q
    |||||| ||||| | |||||||||||| | ||||| ||||| | ||| || |  | |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  3419 tgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgatgttgctaagtgatgttgtggatgttaattcatggcttgggtatgcatgattcatgatttgttg 3320  T
Q  146 ttgagaaatgag 157  Q
    ||||||||||||    
T  3319 ttgagaaatgag 3308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0483 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0483
Description:

Target: scaffold0483; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 100 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 6708 - 6622
Alignment:
Q  100 tttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggt 185  Q
    |||| |||| |||||||||||||||   ||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  6708 tttgttgatgattcatggcttgggtggtcataattcatgatttgttgatgagaaatgagttgttgttggtggttttgtaaactgggt 6622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 39 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 69565 - 69415
Alignment:
Q  39 gttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatg 138  Q
    ||||||| |||||| ||||  | |||||| ||||| | ||||||||||| | ||| ||||  ||| |||| ||||||||||||||| | ||| | |||||    
T  69565 gttgttgttgaattgtgatgagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtgttcataaatcatg 69466  T
Q  139 a-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttga 188  Q
    | ||| || |||||| |||| |||||| | |||||||||||||||||||||    
T  69465 atttgatgatgagaattgaggtgttgttgttggttttgtaaaatgggttga 69415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0700 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0700
Description:

Target: scaffold0700; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 26 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 2646 - 2483
Alignment:
Q  26 tgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtt 125  Q
    ||||||||||   ||||||| |||||| ||||  | |||||| ||||| | ||||||||||| | ||| ||||  ||| |||| |||||||| ||||||     
T  2646 tgaattatgctatgttgttgttgaattatgatgagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggtttgggtg 2547  T
Q  126 tgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttga 188  Q
    | ||| | |||||||| | || |||||||||| ||||||| | ||||||| |||||||||||||    
T  2546 ttcataaatcatgatttgatgatgagaaatgacttgttgttgttggttttctaaaatgggttga 2483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0231 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0231
Description:

Target: scaffold0231; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 156 - 213
Target Start/End: Original strand, 12990 - 13048
Alignment:
Q  156 agttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggttgataatgaagaagtttgaatttgatga 213  Q
    ||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12990 agttgttgttgatggttttgtgaaaatgggttgataatgaagaagtttgattttgatga 13048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 105 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 35520 - 35444
Alignment:
Q  105 tgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaat 181  Q
    |||| ||||||||||||||| | ||| |||||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  35520 tgatgattcatggcttgggtattcataattcatgatttgttgatgagaaatgagttg-tgttggtggttttgtaaaat 35444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1734 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold1734
Description:

Target: scaffold1734; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 124 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 1422 - 1364
Alignment:
Q  124 tttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaat 181  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||    
T  1422 tttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaat 1364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 176 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 12734 - 12694
Alignment:
Q  176 taaaatgggttgataatgaagaagtttgaatttgatgatgt 216  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  12734 taaaatgggttgatagtgaagaagtttgattttgatgatgt 12694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0244 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0244
Description:

Target: scaffold0244; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 103 - 173
Target Start/End: Original strand, 22715 - 22786
Alignment:
Q  103 gatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 173  Q
    |||| |||||||||| |||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||    
T  22715 gatgctaattcatggtttgggtatgcatgattcataatttgttgttgtgaaataagttgttgttgttggttt 22786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 20 - 189
Target Start/End: Original strand, 2436 - 2607
Alignment:
Q  20 aattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggct 119  Q
    ||||| ||||||||||   ||||||| |||||| ||||| |  ||||| ||||| | ||||||||||  | ||| || |  |||||||| ||||||||||    
T  2436 aattgatgaattatgctatgttgttgttgaattatgataagactcatgttcaattgatgttgttgttcctaagtgatgttgttgatgatgattcatggct 2535  T
Q  120 tgggtttgcatgattcatg-attgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggttgat 189  Q
    ||||  | ||| |||||||  ||| || |||||||| ||||||||| | |||||| || |||||||||||||    
T  2536 tgggcgttcataattcatgttttgatgatgagaaataagttgttgttgttggtttggtgaaaatgggttgat 2607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 181 - 216
Target Start/End: Original strand, 3392 - 3427
Alignment:
Q  181 tgggttgataatgaagaagtttgaatttgatgatgt 216  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3392 tgggttgataatgaagaagtttgattttgatgatgt 3427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 77 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 108080 - 107967
Alignment:
Q  77 tgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt 176  Q
    ||||||||||||| ||  ||||  ||| |||| |||||| |||||||| | ||| | |||||| | ||| |||||||| ||||||||| | ||||||| |    
T  108080 tgttgttgttgttaagatatattgttgttgatgattcatagcttgggtgttcataaatcatgaattttgatgagaaataagttgttgttgttggtttttt 107981  T
Q  177 -aaaatgggttgat 189  Q
     |||||||||||||    
T  107980 aaaaatgggttgat 107967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0335 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0335
Description:

Target: scaffold0335; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 134 - 185
Target Start/End: Original strand, 5823 - 5875
Alignment:
Q  134 tcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgta-aaatgggt 185  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||| ||||||||    
T  5823 tcatgattgttggtgagaaatgagatgttgttggttgttttgtataaatgggt 5875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University