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This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.
| Legend |
| | Query |
| | Query hiting target |
| Query hiting target's complemental strand |
| | Query's complemental strand hiting target |
| Query's complemental strand hiting target's complemental strand |
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Alignment Overview
Query: NF17837_high_14 (Length: 469)
Name: NF17837_high_14
Description: NF17837
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)
| [»] NF17837_high_14 |
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Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 391; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: chr8
Description:
Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 391; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 453
Target Start/End: Original strand, 2426663 - 2427082
Alignment:
| Q |
30 |
agaggagttctcaaactattatataacatatatatatgagttaattacacaagctgattgaattctctttttgtatattttgatacaaacaagcaggctt |
129 |
Q |
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| T |
2426663 |
agaggagttctcaaactattatacaacatat----atgagttaattacacaagctgattgaattctctttttgtatattttgatacaaacaagcaggctt |
2426758 |
T |
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| Q |
130 |
ctggggttaaaattagtaacattatataccaagatattcatggaacttcagcaacaaaggttgcacttaaattgaattgtagtccaacaaatccatgcac |
229 |
Q |
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| T |
2426759 |
ctggggttaaaattagtaacattatataccaagatattcatggaacttcagcaacaaaggttgcacttaaattgaattgtagtccaacaaatccatgcac |
2426858 |
T |
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| Q |
230 |
tggaataagcttggaagatgtgatgcttacatatgaaaacaaaaatgctgaagcgttatgcaatcatgctggaggagtcacatatggtgtagttcaaccc |
329 |
Q |
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| T |
2426859 |
tggaataagcttggaagatgtgatgcttacatatgaaaacaaaaatgctgaagcgttatgcaatcatgctggaggagtcacatatggtgtagttcaaccc |
2426958 |
T |
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| Q |
330 |
aacaattgtttctaagtatagtaaaacgttactaggacgaatcgttcagaagttctgagtttgatggaagaattcttgattatattatactcacctcaca |
429 |
Q |
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| T |
2426959 |
aacaattgtttctaagtatagtaaagcgttactaggacgaatcgttcaaaagttttgagtttgatggaagaattcttgattatattatactcacctcaca |
2427058 |
T |
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| Q |
430 |
accaaactctaaattataagaact |
453 |
Q |
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| T |
2427059 |
accaaactctaaattataagaact |
2427082 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 380; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 453
Target Start/End: Original strand, 1456948 - 1457371
Alignment:
| Q |
30 |
agaggagttctcaaactattatataacatatatatatgagttaattacacaagctgattgaattctctttttgtatattttgatacaaacaagcaggctt |
129 |
Q |
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| T |
1456948 |
agaggagttctcaaactattatacaacatatatatatgagttaattacacaagctgattgaattatctttttgtatattttgatacaaacaagcaggctt |
1457047 |
T |
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| Q |
130 |
ctggggttaaaattagtaacattatataccaagatattcatggaacttcagcaacaaaggttgcacttaaattgaattgtagtccaacaaatccatgcac |
229 |
Q |
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| T |
1457048 |
ctggggttaaaattagtaacattatataccaagatattcatggaacttctgcaacaaaggttgcacttaaattgaattgtagtccaacaaatccatgcac |
1457147 |
T |
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| Q |
230 |
tggaataagcttggaagatgtgatgcttacatatgaaaacaaaaatgctgaagcgttatgcaatcatgctggaggagtcacatatggtgtagttcaaccc |
329 |
Q |
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| T |
1457148 |
tggaataagcttggaagatgagatgcttacatatgaaaacaaaaatgctgaagcgttatgcaatcatgctggaggaatcacatatggtgtagttcaaccc |
1457247 |
T |
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| Q |
330 |
aacaattgtttctaagtatagtaaaacgttactaggacgaatcgttcagaagttctgagtttgatggaagaattcttgattatattatactcacctcaca |
429 |
Q |
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| T |
1457248 |
aacaattgtttctaagtacagtaaagcgttactaggacgaattgttcagaagttatgagtttgatggaagaattcttggtcatattatactcacctcaca |
1457347 |
T |
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| Q |
430 |
accaaactctaaattataagaact |
453 |
Q |
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| T |
1457348 |
accaaactctaaattataagaact |
1457371 |
T |
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