View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF1783_low_11 (Length: 578)

Name: NF1783_low_11
Description: NF1783
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF1783_low_11
NF1783_low_11
[»] chr6 (100 HSPs)
chr6 (15-567)||(27591422-27591974)
chr6 (15-566)||(27676022-27676573)
chr6 (345-566)||(28787806-28788027)
chr6 (345-566)||(28793927-28794148)
chr6 (17-461)||(26636877-26637309)
chr6 (17-461)||(26742843-26743275)
chr6 (17-469)||(26960356-26960802)
chr6 (345-566)||(27704671-27704892)
chr6 (345-563)||(27680515-27680733)
chr6 (351-563)||(27609531-27609743)
chr6 (351-555)||(27716918-27717122)
chr6 (350-536)||(31286114-31286300)
chr6 (345-563)||(27697000-27697218)
chr6 (342-562)||(27603106-27603327)
chr6 (17-562)||(26950974-26951510)
chr6 (346-539)||(26624816-26625009)
chr6 (346-539)||(26730793-26730986)
chr6 (17-313)||(26849943-26850239)
chr6 (350-560)||(26648028-26648241)
chr6 (350-560)||(26753996-26754209)
chr6 (18-472)||(26978612-26979060)
chr6 (17-221)||(27663961-27664165)
chr6 (352-566)||(26804018-26804232)
chr6 (17-207)||(25075098-25075288)
chr6 (17-313)||(26812759-26813055)
chr6 (17-261)||(31285790-31286034)
chr6 (17-218)||(27697336-27697537)
chr6 (17-219)||(27609869-27610071)
chr6 (17-209)||(26624502-26624694)
chr6 (17-209)||(26730479-26730671)
chr6 (344-510)||(26813101-26813267)
chr6 (345-507)||(27529774-27529936)
chr6 (17-227)||(27704995-27705205)
chr6 (345-541)||(26863124-26863320)
chr6 (18-261)||(27426319-27426562)
chr6 (17-219)||(27680181-27680383)
chr6 (21-318)||(26938264-26938561)
chr6 (17-217)||(26862811-26863011)
chr6 (349-539)||(27426049-27426240)
chr6 (17-222)||(27717245-27717450)
chr6 (345-461)||(26885635-26885751)
chr6 (348-495)||(25491786-25491933)
chr6 (17-230)||(26647710-26647923)
chr6 (17-230)||(26753678-26753891)
chr6 (18-219)||(28326710-28326911)
chr6 (18-219)||(28504346-28504547)
chr6 (349-510)||(26657531-26657688)
chr6 (349-510)||(26763502-26763659)
chr6 (344-512)||(26850276-26850440)
chr6 (17-227)||(26657193-26657403)
chr6 (17-227)||(26763164-26763374)
chr6 (345-461)||(2186370-2186486)
chr6 (345-461)||(25075432-25075548)
chr6 (18-261)||(25492026-25492269)
chr6 (348-562)||(27663618-27663829)
chr6 (345-462)||(25546533-25546650)
chr6 (345-462)||(26057472-26057589)
chr6 (345-462)||(26077442-26077559)
chr6 (49-230)||(26803709-26803890)
chr6 (345-510)||(26825378-26825543)
chr6 (17-222)||(26885298-26885503)
chr6 (98-261)||(27215764-27215927)
chr6 (98-311)||(25581034-25581247)
chr6 (18-168)||(28186626-28186776)
chr6 (345-462)||(25484609-25484726)
chr6 (95-311)||(26144177-26144393)
chr6 (345-462)||(26144418-26144535)
chr6 (45-229)||(27603443-27603627)
chr6 (95-311)||(25512200-25512416)
chr6 (124-311)||(26057260-26057447)
chr6 (124-311)||(26077230-26077417)
chr6 (18-209)||(28240589-28240776)
chr6 (95-261)||(25484368-25484534)
chr6 (18-219)||(28244027-28244228)
chr6 (346-462)||(25581273-25581389)
chr6 (350-510)||(27216007-27216167)
chr6 (345-416)||(29827542-29827613)
chr6 (345-415)||(28141091-28141161)
chr6 (63-217)||(29842743-29842897)
chr6 (345-462)||(25512441-25512558)
chr6 (18-75)||(28296633-28296690)
chr6 (18-75)||(28515383-28515440)
chr6 (345-469)||(28096954-28097078)
chr6 (348-415)||(28150731-28150798)
chr6 (18-221)||(28787470-28787673)
chr6 (18-221)||(28793591-28793794)
chr6 (95-261)||(27530011-27530177)
chr6 (132-216)||(26825165-26825249)
chr6 (345-436)||(29469759-29469850)
chr6 (24-74)||(2186064-2186114)
chr6 (132-318)||(2186172-2186358)
chr6 (18-208)||(28140767-28140957)
chr6 (63-217)||(29827263-29827417)
chr6 (345-416)||(29842547-29842618)
chr6 (29-75)||(28182361-28182407)
chr6 (95-184)||(25539852-25539941)
chr6 (43-88)||(28228209-28228254)
chr6 (43-75)||(27336988-27337020)
chr6 (43-75)||(27397728-27397760)
chr6 (345-469)||(29673520-29673644)
[»] chr4 (11 HSPs)
chr4 (18-414)||(18722635-18723031)
chr4 (18-414)||(18678122-18678506)
chr4 (18-414)||(18730060-18730450)
chr4 (18-414)||(18688179-18688572)
chr4 (18-313)||(18654128-18654423)
chr4 (18-313)||(18698051-18698346)
chr4 (18-261)||(18074993-18075236)
chr4 (349-539)||(18075315-18075506)
chr4 (342-414)||(18654042-18654114)
chr4 (343-414)||(18697965-18698036)
chr4 (18-313)||(5089605-5089900)
[»] scaffold1870 (2 HSPs)
scaffold1870 (345-566)||(334-555)
scaffold1870 (18-221)||(1-204)
[»] scaffold0419 (2 HSPs)
scaffold0419 (345-566)||(9052-9273)
scaffold0419 (17-221)||(8718-8922)
[»] chr1 (9 HSPs)
chr1 (345-566)||(266757-266978)
chr1 (17-469)||(26137119-26137559)
chr1 (18-261)||(267047-267290)
chr1 (345-564)||(28126095-28126313)
chr1 (17-261)||(28126382-28126626)
chr1 (42-257)||(28132212-28132427)
chr1 (348-469)||(5921980-5922101)
chr1 (153-219)||(5922218-5922284)
chr1 (345-457)||(28132012-28132124)
[»] scaffold0277 (4 HSPs)
scaffold0277 (346-566)||(3111-3331)
scaffold0277 (346-566)||(12074-12294)
scaffold0277 (17-230)||(3450-3663)
scaffold0277 (17-221)||(12422-12626)
[»] scaffold0349 (2 HSPs)
scaffold0349 (351-555)||(1957-2162)
scaffold0349 (17-222)||(2285-2490)
[»] chr8 (3 HSPs)
chr8 (354-563)||(29272249-29272458)
chr8 (17-217)||(29272589-29272789)
chr8 (345-435)||(16371673-16371763)
[»] scaffold0003 (2 HSPs)
scaffold0003 (18-261)||(60801-61044)
scaffold0003 (349-539)||(61123-61314)
[»] chr2 (3 HSPs)
chr2 (17-318)||(17991865-17992166)
chr2 (352-461)||(17991713-17991822)
chr2 (18-75)||(3280891-3280948)
[»] scaffold0019 (1 HSPs)
scaffold0019 (18-175)||(57087-57244)
[»] scaffold0038 (3 HSPs)
scaffold0038 (18-209)||(40751-40938)
scaffold0038 (18-219)||(44189-44390)
scaffold0038 (43-88)||(28707-28752)
[»] chr5 (2 HSPs)
chr5 (18-88)||(16692099-16692169)
chr5 (345-469)||(16692414-16692538)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 549; Significance: 0; HSPs: 100)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 549; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 567
Target Start/End: Complemental strand, 27591974 - 27591422
Alignment:
Q  15 gtatatgcttctggccttccattagcgatagaagtagtgggttctaacttgtttggaaagagtattgcagaatgtgagtctacattagataagtatggaa 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27591974 gtatatgcttctggccttccattagcgatagaagtagtgggttctaacttgtttggaaagagtattgcagaatgtgagtctacattagataagtatggaa 27591875  T
Q  115 gaattccacataaagatatccaaaagatacttagactcagctatgatgctttggaagaagaggagcagagtgtctttttggatattgcttgttgcatcaa 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27591874 gaattccacataaagatatccaaaagatacttagactcagctatgatgctttggaagaagaggagcagagtgtctttttggatattgcttgttgcatcaa 27591775  T
Q  215 aggatgtagattggagaaagtcaaacagatacttcatgctcattatgattattccatagaaagccacattggagtgttggttgataagtctctcataaat 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27591774 aggatgtagattggagaaagtcaaacagatacttcatgctcattatggttattccatagaaagccacattggagtgttggttgataagtctctcataaat 27591675  T
Q  315 attagttggtgctgtttcagtggtatcaaagtgacattacatgaattgatagaggtcatgggtaaagaagtcgtccgacaagaatcacctaaagagcctg 414  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27591674 attagttggtgctgtttcagtggtatcaaagtgacattacatgaattgatagaggtcatgggtaaagaagtcgtccgacaagaatcacctaaagagcctg 27591575  T
Q  415 gagaaagaagcaggttatggtctcaagatgatatagttcatgttttaaaagaaaacactgtgcgtaagattgatatctatgttcaatttgttatttagtt 514  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27591574 gagaaagaagcaggttatggtctcaagatgatatagttcatgttttaaaagaaaacactgtgcgtaagattgatatctatgttcaatttgttatttagtt 27591475  T
Q  515 ttaatacaactttgctcattttggactaaatatgaccatctcatactagtata 567  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27591474 ttaatacaactttgctcattttggactaaatatgaccatctcatactagtata 27591422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 472; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 566
Target Start/End: Complemental strand, 27676573 - 27676022
Alignment:
Q  15 gtatatgcttctggccttccattagcgatagaagtagtgggttctaacttgtttggaaagagtattgcagaatgtgagtctacattagataagtatggaa 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27676573 gtatatgcttctggccttccattagcgatagaagtagtgggttctaacttgtttggaaagagtattgcagaatgtgagtctacattagataagtatggaa 27676474  T
Q  115 gaattccacataaagatatccaaaagatacttagactcagctatgatgctttggaagaagaggagcagagtgtctttttggatattgcttgttgcatcaa 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27676473 gaattccacataaagatatccaaaagatacttagactgagctatgatgctttggacgaagaggagcagagtgtctttttggatattgcttgttgcatcaa 27676374  T
Q  215 aggatgtagattggagaaagtcaaacagatacttcatgctcattatgattattccatagaaagccacattggagtgttggttgataagtctctcataaat 314  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||  |||||||| ||||  |||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||     
T  27676373 aggatgtagattggaagaagtcgaacagatacttcatcatcattatggttatagcataaaaagccaccttagagtgttggttgataagtctctcataaag 27676274  T
Q  315 attagttggtgctgtttcagtggtatcaaagtgacattacatgaattgatagaggtcatgggtaaagaagtcgtccgacaagaatcacctaaagagcctg 414  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27676273 attagttggtgctttttcagtggtatcaaagtgacattacatgaattgatagaggtcatgggtaaagaagtggtccgacaagaatcacctaaagagcctg 27676174  T
Q  415 gagaaagaagcaggttatggtctcaagatgatatagttcatgttttaaaagaaaacactgtgcgtaagattgatatctatgttcaatttgttatttagtt 514  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27676173 gagaaagaagcaggttatggtctcaagatgatatagttcatgttttaacagaaaacactgtgagtaagattgatatctatgttcaatttgttatttagtt 27676074  T
Q  515 ttaatacaactttgctcattttggactaaatatgaccatctcatactagtat 566  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27676073 ttaatacaattttgctcattttggactaaatatgaccatctcatattagtat 27676022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 158; E-Value: 8e-84
Query Start/End: Original strand, 345 - 566
Target Start/End: Original strand, 28787806 - 28788027
Alignment:
Q  345 gtgacattacatgaattgatagaggtcatgggtaaagaagtcgtccgacaagaatcacctaaagagcctggagaaagaagcaggttatggtctcaagatg 444  Q
    |||| ||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  28787806 gtgagattacatgacttgatagaagacatgggtaaagaagtcgtccgacaagaatcgcctaaagagcctggagaaagaagtaggttatggtgtcaagatg 28787905  T
Q  445 atatagttcatgttttaaaagaaaacactgtgcgtaagattgatatctatgttcaatttgttatttagttttaatacaactttgctcattttggactaaa 544  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||||    
T  28787906 atatagttaatgttttaaaagaaaacaccgtgagtatgattgatatttatgttcaatttgttatttaattttgatacgactttgctctttttggactaaa 28788005  T
Q  545 tatgaccatctcatactagtat 566  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  28788006 tatgaccatctcatactagtat 28788027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 158; E-Value: 8e-84
Query Start/End: Original strand, 345 - 566
Target Start/End: Original strand, 28793927 - 28794148
Alignment:
Q  345 gtgacattacatgaattgatagaggtcatgggtaaagaagtcgtccgacaagaatcacctaaagagcctggagaaagaagcaggttatggtctcaagatg 444  Q
    |||| ||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  28793927 gtgagattacatgacttgatagaagacatgggtaaagaagtcgtccgacaagaatcgcctaaagagcctggagaaagaagtaggttatggtgtcaagatg 28794026  T
Q  445 atatagttcatgttttaaaagaaaacactgtgcgtaagattgatatctatgttcaatttgttatttagttttaatacaactttgctcattttggactaaa 544  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||||    
T  28794027 atatagttaatgttttaaaagaaaacaccgtgagtatgattgatatttatgttcaatttgttatttaattttgatacgactttgctctttttggactaaa 28794126  T
Q  545 tatgaccatctcatactagtat 566  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  28794127 tatgaccatctcatactagtat 28794148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 17 - 461
Target Start/End: Original strand, 26636877 - 26637309
Alignment:
Q  17 atatgcttctggccttccattagcgatagaagtagtgggttctaacttgtttggaaagagtattgcagaatgtgagtctacattagataagtatggaaga 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||  |||    
T  26636877 atatgcttctggccttccattagctttagaagtagtgggttccaacttgtttggaaagagtatagcagaatgtgagtctttattagataagtatgacaga 26636976  T
Q  117 attccacataaagatatccaaaagatacttagactcagctatgatgctttggaagaagaggagcagagtgtctttttggatattgcttgttgcatcaaag 216  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||| | | |||||||| |||||||| |||||  | |||||||||||||| ||||||||||||| | | ||||    
T  26636977 attccacatgaagatatccaaaagattcttaaagttagctatgacgctttggatgaagaacaacagagtgtctttttagatattgcttgtttctttaaag 26637076  T
Q  217 gatgtagattggagaaagtcaaacagatacttcatgctcattatgattattccatagaaagccacattggagtgttggttgataagtctctcataaatat 316  Q
       |||||  ||||   ||| || || ||||||||| |||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||| | |||||||| ||||| ||||| ||    
T  26637077 agcgtagaaaggagtttgtccaagaggtacttcatgatcattatggttattgcataaaaagccacattggagtgctagttgataaatctcttataaagat 26637176  T
Q  317 tagttggtgctgtttcagtggtatcaaagtgacattacatgaattgatagaggtcatgggtaaagaagtcgtccgacaagaatcacctaaagagcctgga 416  Q
    ||||      | ||   ||||       |||||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||| |||||||||||||||||| |||  ||||||||    
T  26637177 tagt------ttttatggtgg------ggtgacattacatgacttgatagaggatatgggtatagaaatcgtccgacaagaatcacgtaataagcctgga 26637264  T
Q  417 gaaagaagcaggttatggtctcaagatgatatagttcatgtttta 461  Q
    ||| | || ||||| |||| ||| || ||||||||||||||||||    
T  26637265 gaacgcagtaggttgtggtgtcatgacgatatagttcatgtttta 26637309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 17 - 461
Target Start/End: Original strand, 26742843 - 26743275
Alignment:
Q  17 atatgcttctggccttccattagcgatagaagtagtgggttctaacttgtttggaaagagtattgcagaatgtgagtctacattagataagtatggaaga 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||  |||    
T  26742843 atatgcttctggccttccattagctttagaagtagtgggttccaacttgtttggaaagagtatagcagaatgtgagtctttattagataagtatgacaga 26742942  T
Q  117 attccacataaagatatccaaaagatacttagactcagctatgatgctttggaagaagaggagcagagtgtctttttggatattgcttgttgcatcaaag 216  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||| | | |||||||| |||||||| |||||  | |||||||||||||| ||||||||||||| | | ||||    
T  26742943 attccacatgaagatatccaaaagattcttaaagttagctatgacgctttggatgaagaacaacagagtgtctttttagatattgcttgtttctttaaag 26743042  T
Q  217 gatgtagattggagaaagtcaaacagatacttcatgctcattatgattattccatagaaagccacattggagtgttggttgataagtctctcataaatat 316  Q
       |||||  ||||   ||| || || ||||||||| |||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||| | |||||||| ||||| ||||| ||    
T  26743043 agcgtagaaaggagtttgtccaagaggtacttcatgatcattatggttattgcataaaaagccacattggagtgctagttgataaatctcttataaagat 26743142  T
Q  317 tagttggtgctgtttcagtggtatcaaagtgacattacatgaattgatagaggtcatgggtaaagaagtcgtccgacaagaatcacctaaagagcctgga 416  Q
    ||||      | ||   ||||       |||||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||| |||||||||||||||||| |||  ||||||||    
T  26743143 tagt------ttttatggtgg------ggtgacattacatgacttgatagaggatatgggtatagaaatcgtccgacaagaatcacgtaataagcctgga 26743230  T
Q  417 gaaagaagcaggttatggtctcaagatgatatagttcatgtttta 461  Q
    ||| | || ||||| |||| ||| || ||||||||||||||||||    
T  26743231 gaacgcagtaggttgtggtgtcatgacgatatagttcatgtttta 26743275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 17 - 469
Target Start/End: Original strand, 26960356 - 26960802
Alignment:
Q  17 atatgcttctggccttccattagcgatagaagtagtgggttctaacttgtttggaaagagtattgcagaatgtgagtctacattagataagtatggaaga 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||  |||    
T  26960356 atatgcttctggccttccattagctttagaagtagtgggttccaacttgtttggcaagagtatagcagaatgtgagtctttattagataagtatgacaga 26960455  T
Q  117 attccacataaagatatccaaaagatacttagactcagctatgatgctttggaagaagaggagcagagtgtctttttggatattgcttgttgcatcaaag 216  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| | | |||||||| |||||||  |||||  | |||||||||||||||||||||||||||  | | ||||    
T  26960456 attccacatgaagatatccaaaagatacttaaagtaagctatgacgctttggctgaagaacaacagagtgtctttttggatattgcttgtgtctttaaag 26960555  T
Q  217 gatgtagattggagaaagtcaaacagatacttcatgctcattatgattattccatagaaagccacattggagtgttggttgataagtctctcataaatat 316  Q
    |  || ||  |||| | ||| || || ||||||||| |||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  26960556 ggcgtggaaaggagtatgtccaagaggtacttcatgatcattatggttattgcataaaaagccacattggagtgctggttgataagtctctcataaagat 26960655  T
Q  317 tagttggtgctgtttcagtggtatcaaagtgacattacatgaattgatagaggtcatgggtaaagaagtcgtccgacaagaatcacctaaagagcctgga 416  Q
    || | |    | | |  || ||      |||||||||||||| ||||||||||  |||||||  ||| | || ||||| ||||||  |||||||||||||    
T  26960656 taatggtaaatatattggtcgt------gtgacattacatgacttgatagaggatatgggtatggaaattgttcgacaggaatcaattaaagagcctgga 26960749  T
Q  417 gaaagaagcaggttatggtctcaagatgatatagttcatgttttaaaagaaaa 469  Q
     || | || ||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26960750 aaacgcagtaggttgtggtgtcgtgatgatatagttcatgttttacaagaaaa 26960802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 345 - 566
Target Start/End: Complemental strand, 27704892 - 27704671
Alignment:
Q  345 gtgacattacatgaattgatagaggtcatgggtaaagaagtcgtccgacaagaatcacctaaagagcctggagaaagaagcaggttatggtctcaagatg 444  Q
    |||||||||||| | ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||| |  || ||||    
T  27704892 gtgacattacataacttgatagaggatatgggtaaagaagtcgtccgacaagaatcaattaaagagcctggagaaagaagtaggttatgctgccatgatg 27704793  T
Q  445 atatagttcatgttttaaaagaaaacactgtgcgtaagattgatatctatgttcaatttgttatttagttttaatacaactttgctcattttggactaaa 544  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||    
T  27704792 atatagttaatgtcttaaaagaaaacactgtgagtaagattgatatctatgatcattttgttatttagttttaatatgactttgctctttttggactaaa 27704693  T
Q  545 tatgaccatctcatactagtat 566  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  27704692 tatgaccatctcatactagtat 27704671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 143; E-Value: 8e-75
Query Start/End: Original strand, 345 - 563
Target Start/End: Original strand, 27680515 - 27680733
Alignment:
Q  345 gtgacattacatgaattgatagaggtcatgggtaaagaagtcgtccgacaagaatcacctaaagagcctggagaaagaagcaggttatggtctcaagatg 444  Q
    |||| ||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||  |||||| |    
T  27680515 gtgagattacatgacttgataaaggacatgggtaaagaagtcgtccgacaagaatcacctaaagagcctggagaacgaagtaggttatggcgtcaagaag 27680614  T
Q  445 atatagttcatgttttaaaagaaaacactgtgcgtaagattgatatctatgttcaatttgttatttagttttaatacaactttgctcattttggactaaa 544  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||    
T  27680615 atataattcatgttttaaaagaaaacactgtgagtatgattgatatctatgatcattttgttatttagttttaatacgactttgctctttttgcactaaa 27680714  T
Q  545 tatgaccatctcatactag 563  Q
    ||||| ||||| |||||||    
T  27680715 tatgatcatctgatactag 27680733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 351 - 563
Target Start/End: Complemental strand, 27609743 - 27609531
Alignment:
Q  351 ttacatgaattgatagaggtcatgggtaaagaagtcgtccgacaagaatcacctaaagagcctggagaaagaagcaggttatggtctcaagatgatatag 450  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| ||||||||||    
T  27609743 ttacatgacttgatagaggacatgggtaaagaagtcgtccgacaagaatcaattaaagagcctggagaaagaagtaggttatgctgtcaggatgatatag 27609644  T
Q  451 ttcatgttttaaaagaaaacactgtgcgtaagattgatatctatgttcaatttgttatttagttttaatacaactttgctcattttggactaaatatgac 550  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||     
T  27609643 ttcgtgttttaagagaaaacactgtgagtaagattgatatctatgatcattttgttatttagttttaatacgactttgctctttttgcactaaatatgat 27609544  T
Q  551 catctcatactag 563  Q
    ||||| |||||||    
T  27609543 catctgatactag 27609531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 351 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 27717122 - 27716918
Alignment:
Q  351 ttacatgaattgatagaggtcatgggtaaagaagtcgtccgacaagaatcacctaaagagcctggagaaagaagcaggttatggtctcaagatgatatag 450  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| ||||||||||    
T  27717122 ttacatgacttgatagaggacatgggtaaagaagtcgtccgacaagaatcaattaaagagcctggagaaagaagtaggttatgctgtcaggatgatatag 27717023  T
Q  451 ttcatgttttaaaagaaaacactgtgcgtaagattgatatctatgttcaatttgttatttagttttaatacaactttgctcattttggactaaatatgac 550  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||     
T  27717022 ttcgtgttttaagagaaaacactgtgagtaagattgatatctatgatcattttgttatttagttttaatacaactttgctctttttgaactaaatatgat 27716923  T
Q  551 catct 555  Q
    |||||    
T  27716922 catct 27716918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 350 - 536
Target Start/End: Original strand, 31286114 - 31286300
Alignment:
Q  350 attacatgaattgatagaggtcatgggtaaagaagtcgtccgacaagaatcacctaaagagcctggagaaagaagcaggttatggtctcaagatgatata 449  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||    
T  31286114 attacatgacttgatagaggacatgggtaaagaagtcgtccgacaagaatcacctaaagagccaggagaaagaagtaggctatggtgtcaagatgatata 31286213  T
Q  450 gttcatgttttaaaagaaaacactgtgcgtaagattgatatctatgttcaatttgttatttagttttaatacaactttgctcatttt 536  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||    
T  31286214 gttcatgctttaaatgaaaacactgtgagtaagattgatatctatgttcaatttgttatttagttttaaaacgactttgctcttttt 31286300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 345 - 563
Target Start/End: Complemental strand, 27697218 - 27697000
Alignment:
Q  345 gtgacattacatgaattgatagaggtcatgggtaaagaagtcgtccgacaagaatcacctaaagagcctggagaaagaagcaggttatggtctcaagatg 444  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| ||||    
T  27697218 gtgacattacatgacttgatagaggacatgggtaaagaagtcgtccgacaagaatcaactaaagagcctggagaaagaagtaggttatgctgtcaggatg 27697119  T
Q  445 atatagttcatgttttaaaagaaaacactgtgcgtaagattgatatctatgttcaatttgttatttagttttaatacaactttgctcattttggactaaa 544  Q
    |||||  ||  ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||  |||| ||||||    
T  27697118 atataactcgggttttaagagaaaacactgtgagtaagattgatatctatgatcattttgttatttagttttaatacgactttgctctatttgcactaaa 27697019  T
Q  545 tatgaccatctcatactag 563  Q
    ||||| ||||| |||||||    
T  27697018 tatgatcatctgatactag 27697000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 342 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 27603327 - 27603106
Alignment:
Q  342 aaagtgacattacatgaattgatagaggtcatgggtaaagaagtcgtccgacaagaatcacctaaagagcctggagaaagaagcaggttatggtctcaag 441  Q
    ||||||||| | ||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  27603327 aaagtgacactgcataacttgatagaggacatgggtaaagaagtcgtccgacaagaatcacctaaagagcctggagaaagaagtaggttatggtgtcaag 27603228  T
Q  442 atgatatagttcatgttttaaaagaaaacactgtgcgtaagattgatatctatgttcaatttgttatttagttttaatacaac-tttgctcattttggac 540  Q
    | ||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||||  || |||| || ||||||||    
T  27603227 acgatatagttcatgttctaacagaaaacactgtgagtaagattgatatataatatcaatttgttatttagttttaatatgacttttggtctttttggac 27603128  T
Q  541 taaatatgaccatctcatacta 562  Q
    ||||||||| ||||||||||||    
T  27603127 taaatatgatcatctcatacta 27603106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 17 - 562
Target Start/End: Original strand, 26950974 - 26951510
Alignment:
Q  17 atatgcttctggccttccattagcgatagaagtagtgggttctaacttgtttggaaagagtattgcagaatgtgagtctacattagataagtatggaaga 116  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||    
T  26950974 atatgctgctggccttccattagctttagaagtagtgggttctaacttgtttggaaagactatagcagaatgtgagtctttattagataagtatgaaaga 26951073  T
Q  117 attccacataaagatatccaaaagatacttagactcagctatgatgctttggaagaagaggagcagagtgtctttttggatattgcttgttgcatcaaag 216  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| | | |||| |||||||||||| || ||  | |||| ||||||||||||||||| ||||  | | ||||    
T  26951074 attccacatgaagatatccaaaagatacttaaagtaagctttgatgctttggacgaggaacaacagaatgtctttttggatattgtttgtgtctttaaag 26951173  T
Q  217 gatgtagattggagaaagtcaaacagatacttcatgctcattatgattattccatagaaagccacattggagtgttggttgataagtctctcataaatat 316  Q
    |   |  |  |||| |  || || |  ||||||||| |||||||| ||||| |||| |||||||| |  |||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  26951174 ggcatccagaggagtatatccaaaatttacttcatgatcattatggttattgcataaaaagccacctcagagtgttggttgataaatctctcataaagat 26951273  T
Q  317 tagttggtgctgtttcagtggtatcaaagtgacattacatgaattgatagaggtcatgggtaaagaagtcgtccgacaagaatcacctaaagagcctgga 416  Q
    ||        | ||   |||||      |||||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||| || ||||||||||||||  || ||| ||||||    
T  26951274 taaggctaattattattgtggt------gtgacattacatgacttgatagaggatatgggtatagaaatcatccgacaagaatcaattagagaacctgga 26951367  T
Q  417 gaaagaagcaggttatggtctcaagatgatatagttcatgttttaaaagaaaacactgtgcgtaagattgatatctatgttcaatttgttatttagtttt 516  Q
    ||| | || ||||| |||||||  |||||||| |||||||||||| ||||||||||     ||||||||||||||| ||  |||||| |||||||   ||    
T  26951368 gaacgcagtaggttgtggtctcgtgatgatattgttcatgttttacaagaaaacac----agtaagattgatatctgtgaacaatttattatttaaactt 26951463  T
Q  517 aatacaactttgctcattttggac-taaatatgaccatctcatacta 562  Q
    |  |  |||||||| ||||||||| || ||||||| |||||||||||    
T  26951464 accatgactttgcttattttggacttatatatgactatctcatacta 26951510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 346 - 539
Target Start/End: Original strand, 26624816 - 26625009
Alignment:
Q  346 tgacattacatgaattgatagaggtcatgggtaaagaagtcgtccgacaagaatcacctaaagagcctggagaaagaagcaggttatggtctcaagatga 445  Q
    |||| |||||||| |||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||| |||||||||    
T  26624816 tgaccttacatgacttgatagaggacatgggtaaagcaatcgtccgacaagaatcacctaaagagcctggagaacgaagtagattatggtgtcaagatga 26624915  T
Q  446 tatagttcatgttttaaaagaaaacactgtgcgtaagattgatatctatgttcaatttgttatttagttttaatacaactttgctcattttgga 539  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  26624916 tatatttcatgttttaaaagaaaacagtgtgagtaagattgatatctatgatcaatttattatttagttttaatactactttgctctttttgga 26625009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 346 - 539
Target Start/End: Original strand, 26730793 - 26730986
Alignment:
Q  346 tgacattacatgaattgatagaggtcatgggtaaagaagtcgtccgacaagaatcacctaaagagcctggagaaagaagcaggttatggtctcaagatga 445  Q
    |||| |||||||| |||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||| |||||||||    
T  26730793 tgaccttacatgacttgatagaggacatgggtaaagcaatcgtccgacaagaatcacctaaagagcctggagaacgaagtagattatggtgtcaagatga 26730892  T
Q  446 tatagttcatgttttaaaagaaaacactgtgcgtaagattgatatctatgttcaatttgttatttagttttaatacaactttgctcattttgga 539  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  26730893 tatatttcatgttttaaaagaaaacagtgtgagtaagattgatatctatgatcaatttattatttagttttaatactactttgctctttttgga 26730986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 17 - 313
Target Start/End: Original strand, 26849943 - 26850239
Alignment:
Q  17 atatgcttctggccttccattagcgatagaagtagtgggttctaacttgtttggaaagagtattgcagaatgtgagtctacattagataagtatggaaga 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  26849943 atatgcttctggccttccattagctttagaagtagtgggttccaacttgtttggaaagagtatagaagaatgcgagtctacattagataagtatgaaaga 26850042  T
Q  117 attccacataaagatatccaaaagatacttagactcagctatgatgctttggaagaagaggagcagagtgtctttttggatattgcttgttgcatcaaag 216  Q
    |||||||||  |||||| ||||||||||||||| | ||||||||  ||||||| |||||  | |||||||||||||||||||||||||||| | | |||     
T  26850043 attccacatgcagatattcaaaagatacttagaataagctatgactctttggatgaagaacaacagagtgtctttttggatattgcttgtttctttaaat 26850142  T
Q  217 gatgtagattggagaaagtcaaacagatacttcatgctcattatgattattccatagaaagccacattggagtgttggttgataagtctctcataaa 313  Q
    |   |  |   ||| |   | || || ||||||||| |||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26850143 ggcatgaaaaagagtatacccaagagttacttcatggtcattatggttattgcataaaaagccacattggagtgttggttgataaatctctcataaa 26850239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 128; E-Value: 7e-66
Query Start/End: Original strand, 350 - 560
Target Start/End: Original strand, 26648028 - 26648241
Alignment:
Q  350 attacatgaattgatagaggtcatgggtaaagaagtcgtccgacaagaatcacctaaagagcctggagaaagaagcaggttatggtctcaagatgatata 449  Q
    ||||||||| |||||| ||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| |||||||||| ||||||||| |||    
T  26648028 attacatgacttgataaaggacatgggtaaggaagtagtccgacaagaatcacgtaaagagcctggagaacaaagtaggttatggtgtcaagatgaaata 26648127  T
Q  450 gttcatgttttaaaagaaaacactgtgcgtaagattgatatctatgttcaatttgttatttagttttaatacaactttgctcattttgg---actaaata 546  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||   | || |||    
T  26648128 gttcatgttttaaaagaaaacactgtgagtaagattaatatctatgatcaatttgttatttagttttaatacgactttgctcaatttggataaatatata 26648227  T
Q  547 tgaccatctcatac 560  Q
    ||||||||||||||    
T  26648228 tgaccatctcatac 26648241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 128; E-Value: 7e-66
Query Start/End: Original strand, 350 - 560
Target Start/End: Original strand, 26753996 - 26754209
Alignment:
Q  350 attacatgaattgatagaggtcatgggtaaagaagtcgtccgacaagaatcacctaaagagcctggagaaagaagcaggttatggtctcaagatgatata 449  Q
    ||||||||| |||||| ||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| |||||||||| ||||||||| |||    
T  26753996 attacatgacttgataaaggacatgggtaaggaagtagtccgacaagaatcacgtaaagagcctggagaacaaagtaggttatggtgtcaagatgaaata 26754095  T
Q  450 gttcatgttttaaaagaaaacactgtgcgtaagattgatatctatgttcaatttgttatttagttttaatacaactttgctcattttgg---actaaata 546  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||   | || |||    
T  26754096 gttcatgttttaaaagaaaacactgtgagtaagattaatatctatgatcaatttgttatttagttttaatacgactttgctcaatttggataaatatata 26754195  T
Q  547 tgaccatctcatac 560  Q
    ||||||||||||||    
T  26754196 tgaccatctcatac 26754209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 128; E-Value: 7e-66
Query Start/End: Original strand, 18 - 472
Target Start/End: Original strand, 26978612 - 26979060
Alignment:
Q  18 tatgcttctggccttccattagcgatagaagtagtgggttctaacttgtttggaaagagtattgcagaatgtgagtctacattagataagtatggaagaa 117  Q
    ||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26978612 tatgcttctggtcttccattagctttagaagtagtgggttcaagcttgtttggaaagagtatagcagagtgtgagtctatattagataagtatggaagaa 26978711  T
Q  118 ttccacataaagatatccaaaagatacttagactcagctatgatgctttggaagaagaggagcagagtgtctttttggatattgcttgttgcatcaaagg 217  Q
    |||||| | || |||||||||||||||||| | | |||| |||||||||||| |||||  | |||||||||||||||||||||||||||  | | |||||    
T  26978712 ttccacctgaacatatccaaaagatacttaaagtaagctttgatgctttggacgaagaacaacagagtgtctttttggatattgcttgtgtctttaaagg 26978811  T
Q  218 atgtagattggagaaagtcaaacagatacttcatgctcattatgattattccatagaaagccacattggagtgttggttgataagtctctcataaatatt 317  Q
      || ||  |||| |  || || || ||||||||  |||||||| ||||| |||| |||||||| |  |||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  26978812 gcgtggagaggagtatatccaaaaggtacttcataatcattatggttattgcataaaaagccacctcagagtgttggttgataaatctctcataaagatt 26978911  T
Q  318 a--gttggtgctgtttcagtggtatcaaagtgacattacatgaattgatagaggtcatgggtaaagaagtcgtccgacaagaatcacctaaagagcctgg 415  Q
    |  | || |  | ||   |||||      || ||||||||| | ||||||||||  ||||||| |||| |||||||||||||||||  |||||| |||||    
T  26978912 aaggctgat--tattattgtggt------gttacattacattacttgatagaggatatgggtatagaaatcgtccgacaagaatcaattaaagaacctgg 26979003  T
Q  416 agaaagaagcaggttatggtctcaagatgatatagttcatgttttaaaagaaaacac 472  Q
    |||| | || ||||| |||| ||   ||  |||||||||||||||| ||||||||||    
T  26979004 agaacgcagtaggttgtggtgtcgtaatagtatagttcatgttttacaagaaaacac 26979060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 17 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 27664165 - 27663961
Alignment:
Q  17 atatgcttctggccttccattagcgatagaagtagtgggttctaacttgtttggaaagagtattgcagaatgtgagtctacattagataagtatggaaga 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||| ||||    
T  27664165 atatgcttctggccttccattagctttaaaagtagtgggttccaacttgtttggaaagagtatagcagattgtgagtcaaccttagataagtatgaaaga 27664066  T
Q  117 attccacataaagatatccaaaagatacttagactcagctatgatgctttggaagaagaggagcagagtgtctttttggatattgcttgttgcatcaaag 216  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||| | | |||| |||| |||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27664065 attccacctgaagatatccaaaagatacttaaagtaagctttgatactttggaagaagaacaacagagtgtctttttggatattgcttgttgcttcaaag 27663966  T
Q  217 gatgt 221  Q
    |||||    
T  27663965 gatgt 27663961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 352 - 566
Target Start/End: Original strand, 26804018 - 26804232
Alignment:
Q  352 tacatgaattgatagaggtcatgggtaaagaagtcgtccgacaagaatcacctaaagagcctggagaaagaagcaggttatggtctcaagatgatatagt 451  Q
    ||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | || |||| |||||||||  ||| || ||||||||    
T  26804018 tacatgacttgataaaggacatgggtaaagaagtcgtccgacaagaatcacctaaagatcctgaaaaacgaagtaggttatggcgtcatgaagatatagt 26804117  T
Q  452 tcatgttttaaaagaaaacactgtgcgtaagattgatatctatgttcaatttgttatttagttttaatacaactttgctcattttggactaaatatgacc 551  Q
    ||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||   ||| |||||| ||||||||    
T  26804118 tcatgttataaaagaaaacattgtgagtaagattgatatttatgttcaatttgttatttagtttagatacgactttgcatttttaggactacatatgacc 26804217  T
Q  552 atctcatactagtat 566  Q
    |||||||||||||||    
T  26804218 atctcatactagtat 26804232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 17 - 207
Target Start/End: Original strand, 25075098 - 25075288
Alignment:
Q  17 atatgcttctggccttccattagcgatagaagtagtgggttctaacttgtttggaaagagtattgcagaatgtgagtctacattagataagtatggaaga 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||   ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  25075098 atatgcttctggccttccattagctttagaagttgtgggttccaacttgtttggaatgagtacaacagaatgcgagtctacattagataagtatgaaaga 25075197  T
Q  117 attccacataaagatatccaaaagatacttagactcagctatgatgctttggaagaagaggagcagagtgtctttttggatattgcttgtt 207  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||| | | |||| ||| |||||||| |||||  | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25075198 attccacctgaagatatccaaaaaatacttaaagtaagctttgacgctttggacgaagaacaacagagtgtctttttggatattgcttgtt 25075288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 17 - 313
Target Start/End: Original strand, 26812759 - 26813055
Alignment:
Q  17 atatgcttctggccttccattagcgatagaagtagtgggttctaacttgtttggaaagagtattgcagaatgtgagtctacattagataagtatggaaga 116  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| || || ||||||||||||||||||| |||     
T  26812759 atatacttctggccttccattagctatagaagtagtgggttccaacttgtttggaaagagtattgaagagtgggaatctacattagataagtatgaaagg 26812858  T
Q  117 attccacataaagatatccaaaagatacttagactcagctatgatgctttggaagaagaggagcagagtgtctttttggatattgcttgttgcatcaaag 216  Q
    |  |||| | ||||||||||||| ||| | | | | |||| ||||||||||||  |||| ||  ||||||| |||||||||||||  |||||| | ||||    
T  26812859 acgccacctgaagatatccaaaatatattcaaagtaagctttgatgctttggacaaagaagaaaagagtgtttttttggatattgtatgttgctttaaag 26812958  T
Q  217 gatgtagattggagaaagtcaaacagatacttcatgctcattatgattattccatagaaagccacattggagtgttggttgataagtctctcataaa 313  Q
    | |||  |||||   | ||| || | ||||| |||  ||||||||  |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  26812959 ggtgtccattggcatatgtcgaaaaaatactccattttcattatggatattgcataaaaagccacattggagtgttggttgaaaaatctctcataaa 26813055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 17 - 261
Target Start/End: Original strand, 31285790 - 31286034
Alignment:
Q  17 atatgcttctggccttccattagcgatagaagtagtgggttctaacttgtttggaaagagtattgcagaatgtgagtctacattagataagtatggaaga 116  Q
    |||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || | | ||||  ||  ||||||||||  |||||  |      
T  31285790 atattcttctggccttccattagttatagaagtagtgggttcaaacttgtttggaaagagcatagaaaaatggaagagtacattagatgggtatgacaag 31285889  T
Q  117 attccacataaagatatccaaaagatacttagactcagctatgatgctttggaagaagaggagcagagtgtctttttggatattgcttgttgcatcaaag 216  Q
    |||||  ||||||| |||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||    
T  31285890 attcccaataaagagatccaaaagatacttaaagtaagctatgatgctttggaagaagaggagcagagtgtctttctggacattgcttgttgcttcaaag 31285989  T
Q  217 gatgtagattggagaaagtcaaacagatacttcatgctcattatg 261  Q
    ||||  ||| || | | |||||| | ||||| |||||||||||||    
T  31285990 gatgcggatgggcggatgtcaaagatatactccatgctcattatg 31286034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 17 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 27697537 - 27697336
Alignment:
Q  17 atatgcttctggccttccattagcgatagaagtagtgggttctaacttgtttggaaagagtattgcagaatgtgagtctacattagataagtatggaaga 116  Q
    ||||| |||||||||||| ||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||  || | ||||||  ||| || |||||||  |||||  ||     
T  27697537 atatgtttctggccttccgttagttatagaaatagtgggttctaacttgtttggaaagaacatagaagaatggaagtatatattagatgggtatgacagg 27697438  T
Q  117 attccacataaagatatccaaaagatacttagactcagctatgatgctttggaagaagaggagcagagtgtctttttggatattgcttgttgcatcaaag 216  Q
    |||||  ||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||| ||||||    
T  27697437 attcccaataaagagatccaaaagatacttagagtgagctatgatgctttggaagaagaggagcaaagtgtctttctggacattgcttgttgcttcaaag 27697338  T
Q  217 ga 218  Q
    ||    
T  27697337 ga 27697336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 17 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 27610071 - 27609869
Alignment:
Q  17 atatgcttctggccttccattagcgatagaagtagtgggttctaacttgtttggaaagagtattgcagaatgtgagtctacattagataagtatggaaga 116  Q
    |||||||||||||||||| ||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||  || |  |||||  ||| ||||||||||  |||||  ||     
T  27610071 atatgcttctggccttccgttagttatagaaatagtgggttctaacttgtttggaaagaacatagaggaatggaagtatacattagatgggtatgacagg 27609972  T
Q  117 attccacataaagatatccaaaagatacttagactcagctatgatgctttggaagaagaggagcagagtgtctttttggatattgcttgttgcatcaaag 216  Q
    |||||  ||||||| |||||||||||||||| | | ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||| ||||||    
T  27609971 attcccaataaagagatccaaaagatacttaaagtgagctatgattctttggaagaagaggagcaaagtgtctttctggacattgcttgttgcttcaaag 27609872  T
Q  217 gat 219  Q
    |||    
T  27609871 gat 27609869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 17 - 209
Target Start/End: Original strand, 26624502 - 26624694
Alignment:
Q  17 atatgcttctggccttccattagcgatagaagtagtgggttctaacttgtttggaaagagtattgcagaatgtgagtctacattagataagtatggaaga 116  Q
    |||||||||||||||||| ||||   ||||| | |||||||| ||||||||||||||||| || | ||||||  ||| ||||||||||  |||||  ||     
T  26624502 atatgcttctggccttccgttagttttagaaattgtgggttccaacttgtttggaaagagcatagaagaatggaagtatacattagatgggtatgacagg 26624601  T
Q  117 attccacataaagatatccaaaagatacttagactcagctatgatgctttggaagaagaggagcagagtgtctttttggatattgcttgttgc 209  Q
    |||||  ||||||| |||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  26624602 attcccaataaagagatccaaaagatacttaaagtgagctatgatgctttggaagaagaggagcagagtgtctttctagatattgcttgttgc 26624694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 17 - 209
Target Start/End: Original strand, 26730479 - 26730671
Alignment:
Q  17 atatgcttctggccttccattagcgatagaagtagtgggttctaacttgtttggaaagagtattgcagaatgtgagtctacattagataagtatggaaga 116  Q
    |||||||||||||||||| ||||   ||||| | |||||||| ||||||||||||||||| || | ||||||  ||| ||||||||||  |||||  ||     
T  26730479 atatgcttctggccttccgttagttttagaaattgtgggttccaacttgtttggaaagagcatagaagaatggaagtatacattagatgggtatgacagg 26730578  T
Q  117 attccacataaagatatccaaaagatacttagactcagctatgatgctttggaagaagaggagcagagtgtctttttggatattgcttgttgc 209  Q
    |||||  ||||||| |||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  26730579 attcccaataaagagatccaaaagatacttaaagtgagctatgatgctttggaagaagaggagcagagtgtctttctagatattgcttgttgc 26730671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 344 - 510
Target Start/End: Original strand, 26813101 - 26813267
Alignment:
Q  344 agtgacattacatgaattgatagaggtcatgggtaaagaagtcgtccgacaagaatcacctaaagagcctggagaaagaagcaggttatggtctcaagat 443  Q
    ||||||||||||||| |||||||||  || |||||||||| | |||| ||||||||||||| |||| || |||||| |||| ||| |||||| |||||||    
T  26813101 agtgacattacatgacttgatagagcacacgggtaaagaaattgtccaacaagaatcacctgaagaaccaggagaacgaagtaggctatggtgtcaagat 26813200  T
Q  444 gatatagttcatgttttaaaagaaaacactgtgcgtaagattgatatctatgttcaatttgttattt 510  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |  |||||||| ||||    
T  26813201 gatatagttcatgttttaaaagaaaacattgtgagtaagattgatatctagggacaatttgtcattt 26813267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 345 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 27529936 - 27529774
Alignment:
Q  345 gtgacattacatgaattgatagaggtcatgggtaaagaagtcgtccgacaagaatcacctaaagagcctggagaaagaagcaggttatggtctcaagatg 444  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||| | || ||||| |||| | |   ||    
T  27529936 gtgacattacatgacttgatagaggacatgggtaaagaagtcgtccgacaagaatcacccgatgagcctggagaacgcagtaggttgtggtttgagcgtg 27529837  T
Q  445 atatagttcatgttttaaaagaaaacactgtgcgtaagattgatatctatgttcaatttgtta 507  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |  ||||||||||    
T  27529836 atatagttcatgttttaaaaaaaaacactgtgagtaagattgatatctaggaacaatttgtta 27529774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 17 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 27705205 - 27704995
Alignment:
Q  17 atatgcttctggccttccattagcgatagaagtagtgggttctaacttgtttggaaagagtattgcagaatgtgagtctacattagataagtatggaaga 116  Q
    |||||||||||||||||| ||||   |||||||| ||||||||||||||||||| ||||  || | ||||||  ||  ||||||||||  |||||  ||     
T  27705205 atatgcttctggccttccgttagttttagaagtaatgggttctaacttgtttggcaagaacatagaagaatggaagaatacattagatgggtatgacagg 27705106  T
Q  117 attccacataaagatatccaaaagatacttagactcagctatgatgctttggaagaagaggagcagagtgtctttttggatattgcttgttgcatcaaag 216  Q
    |||||  ||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||| | ||||    
T  27705105 attcccaataaagagatccaaaagatacttagagtgagctatgatgctttggaagaagaggagcagagtgtctttcttgacattgcttgttgcttaaaag 27705006  T
Q  217 gatgtagattg 227  Q
    | | |||||||    
T  27705005 ggtatagattg 27704995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 345 - 541
Target Start/End: Original strand, 26863124 - 26863320
Alignment:
Q  345 gtgacattacatgaattgatagaggtcatgggtaaagaagtcgtccgacaagaatcacctaaagagcctggagaaagaagcaggttatggtctcaagatg 444  Q
    |||| ||||||||| |||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||| |||||||||| ||| ||||    
T  26863124 gtgagattacatgacttgatagaggacatgggcaaagaaatcgtccgacaagaatctcctaaagagccgggtgaacgaagtaggttatggtgtcatgatg 26863223  T
Q  445 atatagttcatgttttaaaagaaaacactgtgcgtaagattgatatctatgttcaatttgttatttagt-tttaatacaactttgctcattttggact 541  Q
    ||||| | || |||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||  |||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||| |||| ||||    
T  26863224 atataatccacgttttagaagaaaacactgtgagtaagattgatatttatgaacaatctgtta-ttagtctttaacacaactttgctcgttttagact 26863320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 18 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 27426562 - 27426319
Alignment:
Q  18 tatgcttctggccttccattagcgatagaagtagtgggttctaacttgtttggaaagagtattgcagaatgtgagtctacattagataagtatggaagaa 117  Q
    |||||||||||||||||  |||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||  || | ||||||  ||  ||||||||||  ||||| ||  |    
T  27426562 tatgcttctggccttccggtagttatagaaatagtgggttctaacttgtttggaaagaacatagaagaatgcaagaatacattagattggtatgaaaaga 27426463  T
Q  118 ttccacataaagatatccaaaagatacttagactcagctatgatgctttggaagaagaggagcagagtgtctttttggatattgcttgttgcatcaaagg 217  Q
    ||||  ||||||| |||||||  ||||||| | | ||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| | || |||||||||||| |||||||    
T  27426462 ttcccaataaagagatccaaagaatacttaaagtgagctatgattctttggaggaagaggagcaaagtgtctttctagacattgcttgttgcttcaaagg 27426363  T
Q  218 atgtagattggagaaagtcaaacagatacttcatgctcattatg 261  Q
     |||| || ||| || |||||| | |||||||||||||||||||    
T  27426362 ttgtaaatgggaaaaggtcaaagaaatacttcatgctcattatg 27426319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 17 - 219
Target Start/End: Original strand, 27680181 - 27680383
Alignment:
Q  17 atatgcttctggccttccattagcgatagaagtagtgggttctaacttgtttggaaagagtattgcagaatgtgagtctacattagataagtatggaaga 116  Q
    |||||||| ||||||||| ||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||| ||  ||  ||||||||||  |||||  ||     
T  27680181 atatgcttttggccttccgttagttttagaagtagtgggttctaacttgtttggaaagagcatagaagattggaagcatacattagatgggtatgacagg 27680280  T
Q  117 attccacataaagatatccaaaagatacttagactcagctatgatgctttggaagaagaggagcagagtgtctttttggatattgcttgttgcatcaaag 216  Q
    |||||  ||||||| ||||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || || ||||| ||| ||||||    
T  27680281 attcccaataaagagatccaaaagatacttaaggtgagctatgatgctttggaagaagaggagcagagtgtctttcttgacatcgcttgctgcttcaaag 27680380  T
Q  217 gat 219  Q
    |||    
T  27680381 gat 27680383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 21 - 318
Target Start/End: Original strand, 26938264 - 26938561
Alignment:
Q  21 gcttctggccttccattagcgatagaagtagtgggttctaacttgtttggaaagagtattgcagaatgtgagtctacattagataagtatggaagaattc 120  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||| || |||||  | |||||||||||| |||| |||||||| || |||||||||| |||||||| ||| ||||    
T  26938264 gcttctggccttccattagctttagaagttgtaggttcccatttgtttggaaagtgtatagcagaatgggaatctacattagctaagtatgaaaggattc 26938363  T
Q  121 cacataaagatatccaaaagatacttagactcagctatgatgctttggaagaagaggagcagagtgtctttttggatattgcttgttgcatcaaaggatg 220  Q
    ||||   | || | ||||||||||||||| | |||| ||||  |||||| ||||| || || ||||||||| |||||||| | |||||| |||| || ||    
T  26938364 cacacggacatgttcaaaagatacttagagtaagctttgattgtttggatgaagaagaacaaagtgtctttctggatattacgtgttgcttcaatgggtg 26938463  T
Q  221 tagattggagaaagtcaaacagatacttcatgctcattatgattattccatagaaagccacattggagtgttggttgataagtctctcataaatatta 318  Q
    ||||||||   | ||  || | | ||||||||||||||||| | ||| |||| |||  ||  |||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||    
T  26938464 tagattggctgaggttgaagataaacttcatgctcattatggtcattgcataaaaaatcatgttggagtgttggttaataaatctctcataaagatta 26938561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 17 - 217
Target Start/End: Original strand, 26862811 - 26863011
Alignment:
Q  17 atatgcttctggccttccattagcgatagaagtagtgggttctaacttgtttggaaagagtattgcagaatgtgagtctacattagataagtatggaaga 116  Q
    ||||||||| |||||||| ||||   | ||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||  | |  |||||||||  ||||| ||      
T  26862811 atatgcttccggccttccgttagttctcgaaatagtgggttctaacttgtttggaaagagcatggaagaatggcaatgcacattagatgggtatgaaaag 26862910  T
Q  117 attccacataaagatatccaaaagatacttagactcagctatgatgctttggaagaagaggagcagagtgtctttttggatattgcttgttgcatcaaag 216  Q
    |||||  ||||||| ||||||| |||||||| | | |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | ||||||||||||||  ||||||    
T  26862911 attcccaataaagagatccaaaggatacttaaagtaagctatgatgctttggaagaagagcagcaaagtgtctttctagatattgcttgttgtttcaaag 26863010  T
Q  217 g 217  Q
    |    
T  26863011 g 26863011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 349 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 27426240 - 27426049
Alignment:
Q  349 cattacatgaattgatagaggtcatgggtaaagaagtcgtccgacaagaatcacctaaagagcctggagaaagaagcaggttatggtctcaagatgatat 448  Q
    |||||||| | |||||||||  ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||| | || | |||||    
T  27426240 cattacataacttgatagagaacatgggtaaagaactcgtccgactagaatcaccttttgagcctggaaaaagaagcaggttatggtttgaaaaggatat 27426141  T
Q  449 agttcatgttttaaaagaaaacactgtgcgtaagattgatatctatgttcaatttgttatttag-ttttaatacaactttgctcattttgga 539  Q
    | || | ||| || |||||||||||||| |||||||||||||  | |  ||||||||||||||| |||||| |  ||||||||| |||||||    
T  27426140 atttgaagttctagaagaaaacactgtgagtaagattgatatgcaggaacaatttgttatttagcttttaacatgactttgctctttttgga 27426049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 17 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 27717450 - 27717245
Alignment:
Q  17 atatgcttctggccttccattagcgatagaagtagtgggttctaacttgtttggaaagagtattgcagaatgtgagtctacattagataagtatggaaga 116  Q
    |||||||||||||||||| ||||  |||||| |||||||||||||||| | ||||||||  || |  |||||  ||  ||||||||||  |||||  ||     
T  27717450 atatgcttctggccttccgttagttatagaaatagtgggttctaacttatctggaaagaacatagaggaatggaagaatacattagatgggtatgacagg 27717351  T
Q  117 attccacataaagatatccaaaagatacttagactcagctatgatgctttggaagaagaggagcagagtgtctttttggatattgcttgttgcatcaaag 216  Q
    |||||  ||||||| |||||||||||||||| | | || |||||||||||||| |||||| |||| ||||||||| | || |||||||||||| |||||     
T  27717350 attcccaataaagagatccaaaagatacttaaagtaagttatgatgctttggaggaagagcagcaaagtgtctttctagacattgcttgttgcttcaaaa 27717251  T
Q  217 gatgta 222  Q
    ||||||    
T  27717250 gatgta 27717245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 345 - 461
Target Start/End: Original strand, 26885635 - 26885751
Alignment:
Q  345 gtgacattacatgaattgatagaggtcatgggtaaagaagtcgtccgacaagaatcacctaaagagcctggagaaagaagcaggttatggtctcaagatg 444  Q
    |||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||| |||| || |||||||||  |||||||||||||||| | || |||||||||| ||| ||||    
T  26885635 gtgacattacatgacttggtagaggacatgggtaaagaaatcgttcggcaagaatcaagtaaagagcctggagaacgtagtaggttatggtgtcacgatg 26885734  T
Q  445 atatagttcatgtttta 461  Q
    |||||||||||||||||    
T  26885735 atatagttcatgtttta 26885751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 348 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 25491933 - 25491786
Alignment:
Q  348 acattacatgaattgatagaggtcatgggtaaagaagtcgtccgacaagaatcacctaaagagcctggagaaagaagcaggttatggtctcaagatgata 447  Q
    ||||||||| | |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| || ||||||||| | || ||||| |||| ||  |||||||    
T  25491933 acattacataacttgatagagcacatgggtaaagaagtcgttcgacaagaatcacgtaatgatcctggagaacgtagtaggttgtggtgtcccgatgata 25491834  T
Q  448 tagttcatgttttaaaagaaaacactgtgcgtaagattgatatctatg 495  Q
    | ||||| ||||||| ||||||||| ||  ||||||||||||||||||    
T  25491833 tggttcaagttttaagagaaaacacggtaagtaagattgatatctatg 25491786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 17 - 230
Target Start/End: Original strand, 26647710 - 26647923
Alignment:
Q  17 atatgcttctggccttccattagcgatagaagtagtgggttctaacttgtttggaaagagtattgcagaatgtgagtctacattagataagtatggaaga 116  Q
    ||||||||| |||||||| ||||   ||||| |||||||||| ||||| | ||||||||| || | ||||||  ||  ||||||||||   |||| ||      
T  26647710 atatgcttcaggccttcccttagttttagaaatagtgggttccaacttatatggaaagagcatagaagaatggaagggtacattagatggatatgaaaag 26647809  T
Q  117 attccacataaagatatccaaaagatacttagactcagctatgatgctttggaagaagaggagcagagtgtctttttggatattgcttgttgcatcaaag 216  Q
    |||||  ||||| | |||||  ||||||||| | | ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| | || |||||||||||| ||||||    
T  26647810 attcccaataaaaagatccacgagatacttaaagtaagctatgatgctttggaggaagagcagcagagtgtctttctagacattgcttgttgcttcaaag 26647909  T
Q  217 gatgtagattggag 230  Q
    ||||||||| ||||    
T  26647910 gatgtagatgggag 26647923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 17 - 230
Target Start/End: Original strand, 26753678 - 26753891
Alignment:
Q  17 atatgcttctggccttccattagcgatagaagtagtgggttctaacttgtttggaaagagtattgcagaatgtgagtctacattagataagtatggaaga 116  Q
    ||||||||| |||||||| ||||   ||||| |||||||||| ||||| | ||||||||| || | ||||||  ||  ||||||||||   |||| ||      
T  26753678 atatgcttcaggccttcccttagttttagaaatagtgggttccaacttatatggaaagagcatagaagaatggaagggtacattagatggatatgaaaag 26753777  T
Q  117 attccacataaagatatccaaaagatacttagactcagctatgatgctttggaagaagaggagcagagtgtctttttggatattgcttgttgcatcaaag 216  Q
    |||||  ||||| | |||||  ||||||||| | | ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| | || |||||||||||| ||||||    
T  26753778 attcccaataaaaagatccacgagatacttaaagtaagctatgatgctttggaggaagagcagcagagtgtctttctagacattgcttgttgcttcaaag 26753877  T
Q  217 gatgtagattggag 230  Q
    ||||||||| ||||    
T  26753878 gatgtagatgggag 26753891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 18 - 219
Target Start/End: Original strand, 28326710 - 28326911
Alignment:
Q  18 tatgcttctggccttccattagcgatagaagtagtgggttctaacttgtttggaaagagtattgcagaatgtgagtctacattagataagtatggaagaa 117  Q
    |||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| | ||||||| | ||| ||||| || |||||| ||| |    
T  28326710 tatgcttctggccttccattggctttagaagtagtgggttccaacttgtttggaaagaatatagtagaatgtaaatctgcattatatcagtatgaaagga 28326809  T
Q  118 ttccacataaagatatccaaaagatacttagactcagctatgatgctttggaagaagaggagcagagtgtctttttggatattgcttgttgcatcaaagg 217  Q
    ||||   |||| | ||||||  |||||||| | | |||| |||||||||||| ||||| ||||||| ||| ||| | || |||||||| ||| |||| ||    
T  28326810 ttcccattaaaaagatccaagcgatacttaaagtaagctttgatgctttggatgaagatgagcagaatgtttttctcgacattgcttgctgcttcaatgg 28326909  T
Q  218 at 219  Q
    ||    
T  28326910 at 28326911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 18 - 219
Target Start/End: Original strand, 28504346 - 28504547
Alignment:
Q  18 tatgcttctggccttccattagcgatagaagtagtgggttctaacttgtttggaaagagtattgcagaatgtgagtctacattagataagtatggaagaa 117  Q
    |||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| | ||||||| | ||| ||||| || |||||| ||| |    
T  28504346 tatgcttctggccttccattggctttagaagtagtgggttccaacttgtttggaaagaatatagtagaatgtaaatctgcattatatcagtatgaaagga 28504445  T
Q  118 ttccacataaagatatccaaaagatacttagactcagctatgatgctttggaagaagaggagcagagtgtctttttggatattgcttgttgcatcaaagg 217  Q
    ||||   |||| | ||||||  |||||||| | | |||| |||||||||||| ||||| ||||||| ||| ||| | || |||||||| ||| |||| ||    
T  28504446 ttcccattaaaaagatccaagcgatacttaaagtaagctttgatgctttggatgaagatgagcagaatgtttttctcgacattgcttgctgcttcaatgg 28504545  T
Q  218 at 219  Q
    ||    
T  28504546 at 28504547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 349 - 510
Target Start/End: Original strand, 26657531 - 26657688
Alignment:
Q  349 cattacatgaattgatagaggtcatgggtaaagaagtcgtccgacaagaatcacctaaagagcctggagaaagaagcaggttatggtctcaagatgatat 448  Q
    ||||||| || |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||||| | || |||||||||| |||  |||| ||    
T  26657531 cattacacgatttgatagaggacatgggtaaagaaatcgtccgacaagaatcaagtaaagagcccggagaacgtagtaggttatggtgtcacaatgacat 26657630  T
Q  449 agttcatgttttaaaagaaaacactgtgcgtaagattgatatctatgttcaatttgttattt 510  Q
    ||||||||||||| |  || | ||    |||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  26657631 agttcatgttttacagaaagatac----cgtaagattgatatctatgaacaatttgttattt 26657688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 349 - 510
Target Start/End: Original strand, 26763502 - 26763659
Alignment:
Q  349 cattacatgaattgatagaggtcatgggtaaagaagtcgtccgacaagaatcacctaaagagcctggagaaagaagcaggttatggtctcaagatgatat 448  Q
    ||||||| || |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||||| | || |||||||||| |||  |||| ||    
T  26763502 cattacacgatttgatagaggacatgggtaaagaaatcgtccgacaagaatcaagtaaagagcccggagaacgtagtaggttatggtgtcacaatgacat 26763601  T
Q  449 agttcatgttttaaaagaaaacactgtgcgtaagattgatatctatgttcaatttgttattt 510  Q
    ||||||||||||| |  || | ||    |||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  26763602 agttcatgttttacagaaagatac----cgtaagattgatatctatgaacaatttgttattt 26763659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 344 - 512
Target Start/End: Original strand, 26850276 - 26850440
Alignment:
Q  344 agtgacattacatgaattgatagaggtcatgggtaaagaagtcgtccgacaagaatcacctaaagagcctggagaaagaagcaggttatggtctcaagat 443  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||    | || ||||| |||| |   |||    
T  26850276 agtgacattacatgacttgatagaggacatgggtaaagaaatcgtccgacaagaatcaattaaagagcctggaaggcgcagtaggttgtggtgttgtgat 26850375  T
Q  444 gatatagttcatgttttaaaagaaaacactgtgcgtaagattgatatctatgttcaatttgttatttag 512  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||     ||||||||||| ||||||  ||||||||| |||||    
T  26850376 gatattgttcatgttttacaagaaaacac----agtaagattgatttctatgaacaatttgttttttag 26850440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 17 - 227
Target Start/End: Original strand, 26657193 - 26657403
Alignment:
Q  17 atatgcttctggccttccattagcgatagaagtagtgggttctaacttgtttggaaagagtattgcagaatgtgagtctacattagataagtatggaaga 116  Q
    ||||||||| || ||||| ||||  ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| || | | ||||  ||  ||||||||||   |||| ||      
T  26657193 atatgcttcaggacttcccttagttatagaagtagtggcttcaaacttgtttggaaagagcatcgaaaaatggaagagtacattagatggatatgaaaag 26657292  T
Q  117 attccacataaagatatccaaaagatacttagactcagctatgatgctttggaagaagaggagcagagtgtctttttggatattgcttgttgcatcaaag 216  Q
    |||||  ||||| | || ||| ||||||||| | | |||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||   ||||||    
T  26657293 attcccaataaaaagattcaagagatacttaaagtaagctatgatgatttggaggaagaggagcaaagtgtctttttagatatagcttgttttttcaaag 26657392  T
Q  217 gatgtagattg 227  Q
    |||||||||||    
T  26657393 gatgtagattg 26657403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 17 - 227
Target Start/End: Original strand, 26763164 - 26763374
Alignment:
Q  17 atatgcttctggccttccattagcgatagaagtagtgggttctaacttgtttggaaagagtattgcagaatgtgagtctacattagataagtatggaaga 116  Q
    ||||||||| || ||||| ||||  ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| || | | ||||  ||  ||||||||||   |||| ||      
T  26763164 atatgcttcaggacttcccttagttatagaagtagtggcttcaaacttgtttggaaagagcatcgaaaaatggaagagtacattagatggatatgaaaag 26763263  T
Q  117 attccacataaagatatccaaaagatacttagactcagctatgatgctttggaagaagaggagcagagtgtctttttggatattgcttgttgcatcaaag 216  Q
    |||||  ||||| | || ||| ||||||||| | | |||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||   ||||||    
T  26763264 attcccaataaaaagattcaagagatacttaaagtaagctatgatgatttggaggaagaggagcaaagtgtctttttagatatagcttgttttttcaaag 26763363  T
Q  217 gatgtagattg 227  Q
    |||||||||||    
T  26763364 gatgtagattg 26763374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 345 - 461
Target Start/End: Original strand, 2186370 - 2186486
Alignment:
Q  345 gtgacattacatgaattgatagaggtcatgggtaaagaagtcgtccgacaagaatcacctaaagagcctggagaaagaagcaggttatggtctcaagatg 444  Q
    |||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||| || | || ||||| ||||| || || |    
T  2186370 gtgacattacatgacttgatagaggaaatgggtaaagaaatcgtacgacaagaatcaccaaaagagcctggaaaacgtagtaggttgtggtcccatgaag 2186469  T
Q  445 atatagttcatgtttta 461  Q
    ||||||||| |||||||    
T  2186470 atatagttcctgtttta 2186486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 345 - 461
Target Start/End: Original strand, 25075432 - 25075548
Alignment:
Q  345 gtgacattacatgaattgatagaggtcatgggtaaagaagtcgtccgacaagaatcacctaaagagcctggagaaagaagcaggttatggtctcaagatg 444  Q
    |||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||||||||||||||| | || ||||| |||| ||| ||||    
T  25075432 gtgacattacatgacttgttagaggacatgggtaaagaaatcgtccgacatgaatcaattaaagagcctggagaacgtagtaggttgtggtatcacgatg 25075531  T
Q  445 atatagttcatgtttta 461  Q
    ||||| || ||||||||    
T  25075532 atatatttgatgtttta 25075548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 18 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 25492269 - 25492026
Alignment:
Q  18 tatgcttctggccttccattagcgatagaagtagtgggttctaacttgtttggaaagagtattgcagaatgtgagtctacattagataagtatggaa-ga 116  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||| | || | || || || ||||||||||| || || | ||||||  ||| |||||||||| |||||| || ||    
T  25492269 tatgcttctggccttccattagctttagtaataatagggtcaaatttgtttggaaatagcatagaagaatggaagtgtacattagatgagtatgaaaaga 25492170  T
Q  117 attccacataaagatatccaaaagatacttagactcagctatgatgctttggaagaagaggagcagagtgtctttttggatattgcttgttgcatcaaag 216  Q
     || || ||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | || ||  |||||| | ||||||    
T  25492169 ttttca-ataaagagatccaaaagatacttagagtgagctatgatgctttggaggaaaaggagcagagtatctttctagacatgacttgtttcttcaaag 25492071  T
Q  217 gatgtagattggagaaagtcaaacagatacttcatgctcattatg 261  Q
    | || | || || | | |||||| | |||||||||| ||||||||    
T  25492070 gttggaaatgggcggatgtcaaaaatatacttcatgatcattatg 25492026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 348 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 27663829 - 27663618
Alignment:
Q  348 acattacatgaattgatagaggtcatgggtaaagaagtcgtccgacaagaatcacctaaagagcctggagaaagaagcaggttatggtctcaagatgata 447  Q
    ||||||||||| |||||||||   ||||||| |||| | |||||||||||||||  |||||||||||||||  | |  ||||| |||  ||| |||||||    
T  27663829 acattacatgacttgatagagtatatgggtatagaaatagtccgacaagaatcaattaaagagcctggagagcgcactaggttgtggcgtcatgatgata 27663730  T
Q  448 tagttcatgttttaaaagaaaacactgtgcgtaagattgatatctatgttcaatttgttatttagttttaatacaactttgctcattttggac-taaata 546  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||     ||||||||||||||||||  |||||||||||||    |||  |  ||||| ||| |||||||| || |||    
T  27663729 tagctcatgttttaaaacaaaacac----agtaagattgatatctatgaacaatttgttattttagcttaccatgactttcctctttttggacttatata 27663634  T
Q  547 tgaccatctcatacta 562  Q
    ||||||||||||||||    
T  27663633 tgaccatctcatacta 27663618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 345 - 462
Target Start/End: Original strand, 25546533 - 25546650
Alignment:
Q  345 gtgacattacatgaattgatagaggtcatgggtaaagaagtcgtccgacaagaatcacctaaagagcctggagaaagaagcaggttatggtctcaagatg 444  Q
    ||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||||||| | || ||||| |||| ||  ||||    
T  25546533 gtgaccttacatgacttgatagaggacatgggtaaagaagtcgtccgacaagaatctcccaacaagcctggagaacgcagtaggttgtggtttcgcgatg 25546632  T
Q  445 atatagttcatgttttaa 462  Q
    |||||||| | |||||||    
T  25546633 atatagttaacgttttaa 25546650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 345 - 462
Target Start/End: Original strand, 26057472 - 26057589
Alignment:
Q  345 gtgacattacatgaattgatagaggtcatgggtaaagaagtcgtccgacaagaatcacctaaagagcctggagaaagaagcaggttatggtctcaagatg 444  Q
    ||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||||||| | || ||||| |||| ||  ||||    
T  26057472 gtgaccttacatgacttgatagaggacatgggtaaagaagtcgtccgacaagaatctcccaataagcctggagaacgcagtaggttgtggtttcgcgatg 26057571  T
Q  445 atatagttcatgttttaa 462  Q
    |||||||| | |||||||    
T  26057572 atatagttaacgttttaa 26057589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 345 - 462
Target Start/End: Original strand, 26077442 - 26077559
Alignment:
Q  345 gtgacattacatgaattgatagaggtcatgggtaaagaagtcgtccgacaagaatcacctaaagagcctggagaaagaagcaggttatggtctcaagatg 444  Q
    ||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||||||| | || ||||| |||| ||  ||||    
T  26077442 gtgaccttacatgacttgatagaggacatgggtaaagaagtcgtccgacaagaatctcccaagaagcctggagaacgcagtaggttgtggtttcgcgatg 26077541  T
Q  445 atatagttcatgttttaa 462  Q
    |||||||| | |||||||    
T  26077542 atatagttaacgttttaa 26077559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 49 - 230
Target Start/End: Original strand, 26803709 - 26803890
Alignment:
Q  49 tagtgggttctaacttgtttggaaagagtattgcagaatgtgagtctacattagataagtatggaagaattccacataaagatatccaaaagatacttag 148  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||   ||||||  ||  ||||||||||   |||| ||  |||||  ||||| | |||||  |||||||||     
T  26803709 tagtgggttccaacttgtttggaaagagcataaaagaatggaagggtacattagatggatatgaaaagattcccaataaaaagatccacgagatacttaa 26803808  T
Q  149 actcagctatgatgctttggaagaagaggagcagagtgtctttttggatattgcttgttgcatcaaaggatgtagattggag 230  Q
    | | ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| | || |||||||||||| ||||||||||| ||| ||||    
T  26803809 agtaagctatgatgctttggaggaagagcagcagagtgtctttctagacattgcttgttgcttcaaaggatgtggatgggag 26803890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 345 - 510
Target Start/End: Original strand, 26825378 - 26825543
Alignment:
Q  345 gtgacattacatgaattgatagaggtcatgggtaaagaagtcgtccgacaagaatcacctaaagagcctggagaaagaagcaggttatggtctcaagatg 444  Q
    |||||||||||||| |||||| ||| |||||| |||||||| ||||||||| ||||| |||||||||| || ||| | |||||| | |||| |||  |||    
T  26825378 gtgacattacatgacttgataaaggacatgggcaaagaagtagtccgacaacaatcatctaaagagcccggtgaacgcagcaggctgtggtgtcacaatg 26825477  T
Q  445 atatagttcatgttttaaaagaaaacactgtgcgtaagattgatatctatgttcaatttgttattt 510  Q
    ||||  ||||||||||  | | |||||| ||| ||||||||||||| ||||  |||||| ||||||    
T  26825478 atattattcatgttttgcagggaaacacagtgagtaagattgatatttatgaacaattttttattt 26825543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 17 - 222
Target Start/End: Original strand, 26885298 - 26885503
Alignment:
Q  17 atatgcttctggccttccattagcgatagaagtagtgggttctaacttgtttggaaagagtattgcagaatgtgagtctacattagataagtatggaaga 116  Q
    ||||||||| |||||||| ||||  |||||| |||||||||| ||||||||||||||||| || | |  |||  ||  |||| |||||   |||| ||      
T  26885298 atatgcttcgggccttcctttagttatagaaatagtgggttccaacttgtttggaaagagcatagaaacatggaagagtacactagatggatatgaaaag 26885397  T
Q  117 attccacataaagatatccaaaagatacttagactcagctatgatgctttggaagaagaggagcagagtgtctttttggatattgcttgttgcatcaaag 216  Q
    |||||  ||| | | |||||| ||||||||| | | |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||    
T  26885398 attcctaatacaaagatccaagagatacttaaagtaagctatgatgctttagaggaagaggagcaaagtgtctttctggatatagcttgttgcttcaaag 26885497  T
Q  217 gatgta 222  Q
    | ||||    
T  26885498 ggtgta 26885503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 98 - 261
Target Start/End: Original strand, 27215764 - 27215927
Alignment:
Q  98 attagataagtatggaagaattccacataaagatatccaaaagatacttagactcagctatgatgctttggaagaagaggagcagagtgtctttttggat 197  Q
    ||||||| |||||| ||  |||||  ||||||| ||||||| |||||||| | |||||||||||||| |||| ||| ||||| ||||||||||| | ||     
T  27215764 attagatgagtatgaaaagattcccaataaagagatccaaaggatacttaaagtcagctatgatgctctggaggaaaaggagaagagtgtctttctagac 27215863  T
Q  198 attgcttgttgcatcaaaggatgtagattggagaaa-gtcaaacagatacttcatgctcattatg 261  Q
    |||||||||||| ||||||| |||| | |||| ||| |||||| | ||||||||||| |||||||    
T  27215864 attgcttgttgcttcaaagggtgta-aatggacaaaggtcaaagatatacttcatgcccattatg 27215927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 98 - 311
Target Start/End: Original strand, 25581034 - 25581247
Alignment:
Q  98 attagataagtatggaagaattccacataaagatatccaaaagatacttagactcagctatgatgctttggaagaagaggagcagagtgtctttttggat 197  Q
    ||||||| |||||| ||  |||||  ||||||||||||||| |||||||  | | ||||||||||||||||||  | ||||| ||||||||||| | ||     
T  25581034 attagatgagtatgaaaatattcccaataaagatatccaaaggatacttcaagttagctatgatgctttggaaccaaaggagaagagtgtctttctagac 25581133  T
Q  198 attgcttgttgcatcaaaggatgtagattggagaaa-gtcaaacagatacttcatgctcattatgattattccatagaaagccacattggagtgttggtt 296  Q
    |||||||||||| ||||||| |||| | |||| ||| || ||| | |||||||||||||||||||   ||| |||||||   ||  |||||||||||| |    
T  25581134 attgcttgttgcttcaaagggtgta-aatggacaaaggttaaaaaaatacttcatgctcattatggccattgcatagaacatcatgttggagtgttggct 25581232  T
Q  297 gataagtctctcata 311  Q
    || || |||||||||    
T  25581233 gaaaaatctctcata 25581247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 18 - 168
Target Start/End: Original strand, 28186626 - 28186776
Alignment:
Q  18 tatgcttctggccttccattagcgatagaagtagtgggttctaacttgtttggaaagagtattgcagaatgtgagtctacattagataagtatggaagaa 117  Q
    |||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| | ||||||  | ||| ||||| || |||||| ||| |    
T  28186626 tatgcttctggccttccattggctttagaagtagtgggttccaacttgtttggaaagaatataggagaatggaaatctgcattaaatcagtatgaaagga 28186725  T
Q  118 ttccacataaagatatccaaaagatacttagactcagctatgatgctttgg 168  Q
    ||||  ||||| | |||||| ||||||| | | | |||| |||||||||||    
T  28186726 ttcccgataaaaagatccaagagatactcaaagtaagctttgatgctttgg 28186776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 345 - 462
Target Start/End: Original strand, 25484609 - 25484726
Alignment:
Q  345 gtgacattacatgaattgatagaggtcatgggtaaagaagtcgtccgacaagaatcacctaaagagcctggagaaagaagcaggttatggtctcaagatg 444  Q
    ||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| || ||  ||||||||||| | || ||||| |||| ||| ||||    
T  25484609 gtgaccttacatgacttgatagaggacatgggtaaagaagtcgttcgacaagaatctcccaagaagcctggagaacgcagtaggttgtggtttcacgatg 25484708  T
Q  445 atatagttcatgttttaa 462  Q
    ||||| || | |||||||    
T  25484709 atatacttaacgttttaa 25484726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 95 - 311
Target Start/End: Original strand, 26144177 - 26144393
Alignment:
Q  95 tacattagataagtatggaagaattccacataaagatatccaaaagatacttagactcagctatgatgctttggaagaagaggagcagagtgtctttttg 194  Q
    |||||||||  |||||| ||  |||||  ||||||||||||||| |||||||  | | ||||||||||||||| | ||| |||| |||||||||||| |     
T  26144177 tacattagacgagtatgaaaatattcccgataaagatatccaaaggatacttcaagtaagctatgatgctttgaaggaaaaggatcagagtgtctttcta 26144276  T
Q  195 gatattgcttgttgcatcaaaggatgtagattggagaaa-gtcaaacagatacttcatgctcattatgattattccatagaaagccacattggagtgttg 293  Q
    || |||||||||||| ||||||| ||| || |||| ||| || ||| | |||||||||||||||||||   ||| |||||||   ||  |||||||||||    
T  26144277 gacattgcttgttgcttcaaagggtgt-gaatggacaaaggttaaaaaaatacttcatgctcattatggccattgcatagaacatcatgttggagtgttg 26144375  T
Q  294 gttgataagtctctcata 311  Q
    | ||| || |||||||||    
T  26144376 gctgaaaaatctctcata 26144393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 345 - 462
Target Start/End: Original strand, 26144418 - 26144535
Alignment:
Q  345 gtgacattacatgaattgatagaggtcatgggtaaagaagtcgtccgacaagaatcacctaaagagcctggagaaagaagcaggttatggtctcaagatg 444  Q
    ||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| || ||  ||||||||||| | || ||||| |||| ||  ||||    
T  26144418 gtgaccttacatgacttgatagaggacatgggtaaagaaatcgtccgacaagaatctcccaacaagcctggagaacgcagtaggttgtggtttcccgatg 26144517  T
Q  445 atatagttcatgttttaa 462  Q
    |||||||| | |||||||    
T  26144518 atatagttaacgttttaa 26144535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 45 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 27603627 - 27603443
Alignment:
Q  45 gaagtagtgggttctaacttgtttggaaagagtattgcagaatgtgagtctacattagataagtatg-gaagaattccacataaagatatccaaaagata 143  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| || | ||||||  ||  ||| |||||    |||| ||||| | ||| ||||| | |||||  ||||     
T  27603627 gaagtagtgggttccaacttgtttggaaagaggatagaagaatggaagggtacgttagaaggatatgagaagattccca-ataaaaagatccacgagatt 27603529  T
Q  144 cttagactcagctatgatgctttggaagaagaggagcagagtgtctttttggatattgcttgttgcatcaaaggatgtagattgga 229  Q
    |||| | | ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| | || |||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  27603528 cttaaagtaagctatgatgctttggaggaagagcagcagagtgtctttctagacattgcttgttgcttcaaaggatgtggattgga 27603443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 95 - 311
Target Start/End: Original strand, 25512200 - 25512416
Alignment:
Q  95 tacattagataagtatggaagaattccacataaagatatccaaaagatacttagactcagctatgatgctttggaagaagaggagcagagtgtctttttg 194  Q
    |||||||||| |||||| ||  |||||  ||||||||||||||| |||||||  | | ||||||||||||||| | ||| |||| |||||||||||| |     
T  25512200 tacattagatgagtatgaaaatattcccgataaagatatccaaaggatacttcaagtaagctatgatgctttgaaggaaaaggatcagagtgtctttcta 25512299  T
Q  195 gatattgcttgttgcatcaaaggatgtagattggagaaagtcaaacagatacttcatgctcattatgattattccatagaaagccacattggagtgttgg 294  Q
    || |||||||||| | ||||||| | || || |   ||||| ||| | |||||||||||||||||||   ||| |||||||   ||  ||||||||||||    
T  25512300 gacattgcttgttacttcaaagggtataaatggacaaaagtaaaaaaaatacttcatgctcattatggccattgcatagaacatcatgttggagtgttgg 25512399  T
Q  295 ttgataagtctctcata 311  Q
     ||| || |||||||||    
T  25512400 ctgaaaaatctctcata 25512416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 124 - 311
Target Start/End: Original strand, 26057260 - 26057447
Alignment:
Q  124 ataaagatatccaaaagatacttagactcagctatgatgctttggaagaagaggagcagagtgtctttttggatattgcttgttgcatcaaaggatgtag 223  Q
    ||||||||||||||| |||||||  | | ||||||||||||||| | ||| |||| |||||||||||| | || |||||||||||| ||||||| ||||     
T  26057260 ataaagatatccaaaggatacttcaagtaagctatgatgctttgaaggaaaaggatcagagtgtctttctagacattgcttgttgcttcaaagggtgta- 26057358  T
Q  224 attggagaaa-gtcaaacagatacttcatgctcattatgattattccatagaaagccacattggagtgttggttgataagtctctcata 311  Q
    | |||| ||| || ||| | |||||||||||||||||||   || ||||||||   ||  |||||||||||| ||| || |||||||||    
T  26057359 aatggacaaaggttaaaaaaatacttcatgctcattatggccatcccatagaacatcatgttggagtgttggctgaaaaatctctcata 26057447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 124 - 311
Target Start/End: Original strand, 26077230 - 26077417
Alignment:
Q  124 ataaagatatccaaaagatacttagactcagctatgatgctttggaagaagaggagcagagtgtctttttggatattgcttgttgcatcaaaggatgtag 223  Q
    ||||||||||||||| |||||||  | | ||||||||||||||| | ||| |||| |||||||||||| | || |||||||||||| ||||||| ||||     
T  26077230 ataaagatatccaaaggatacttcaagtaagctatgatgctttgaaggaaaaggatcagagtgtctttctagacattgcttgttgcttcaaagggtgta- 26077328  T
Q  224 attggagaaa-gtcaaacagatacttcatgctcattatgattattccatagaaagccacattggagtgttggttgataagtctctcata 311  Q
    | |||| ||| || ||| | |||||||||||||||||||   || ||||||||   ||  |||||||||||| ||| || |||||||||    
T  26077329 aatggacaaaggttaaaaaaatacttcatgctcattatggccatcccatagaacatcatgttggagtgttggctgaaaaatctctcata 26077417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 18 - 209
Target Start/End: Original strand, 28240589 - 28240776
Alignment:
Q  18 tatgcttctggccttccattagcgatagaagtagtgggttctaacttgtttgga-aagagtattgcagaatgtgagtctacattagataagtatggaaga 116  Q
    |||||||||||||| ||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||||||  ||| ||| | |||||| || || ||||||||  |||||| |||     
T  28240589 tatgcttctggcctaccattagctttagaagtagttggttccaacttgtttggattaga-tataggagaatgggaatccacattagaccagtatgaaagg 28240687  T
Q  117 attccacataaagatatccaaaagatacttagactcagctatgatgctttggaagaagaggagcagagtgtctttttggatattgcttgttgc 209  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||     || | ||||||||||||  |||| ||||| ||||| ||| | || ||||||||||||    
T  28240688 attccaaataaagagatccaaaagatactta----aagttttgatgctttggagaaagatgagcaaagtgtttttctcgacattgcttgttgc 28240776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 95 - 261
Target Start/End: Original strand, 25484368 - 25484534
Alignment:
Q  95 tacattagataagtatggaagaattccacataaagatatccaaaagatacttagactcagctatgatgctttggaagaagaggagcagagtgtctttttg 194  Q
    |||||||||| |||||| ||  |||||  ||||||||||||||| |||||||  | | ||||||||||||||| | ||| |||| |||||||||||| |     
T  25484368 tacattagatgagtatgaaaatattcccgataaagatatccaaaggatacttcaagtaagctatgatgctttgaaggaaaaggatcagagtgtctttcta 25484467  T
Q  195 gatattgcttgttgcatcaaaggatgtagattggagaaagtcaaacagatacttcatgctcattatg 261  Q
    || |||||||||| | ||||||| | || || |   ||||| ||| | |||||||||||||||||||    
T  25484468 gacattgcttgttacttcaaagggtataaatggacaaaagtaaaaaaaatacttcatgctcattatg 25484534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 18 - 219
Target Start/End: Original strand, 28244027 - 28244228
Alignment:
Q  18 tatgcttctggccttccattagcgatagaagtagtgggttctaacttgtttggaaagagtattgcagaatgtgagtctacattagataagtatggaagaa 117  Q
    |||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| ||||| |||||||| | ||| | ||||||  | ||| ||||||||  |||| |||| |    
T  28244027 tatgcttctggccttccattggctttagaagtagtgggttcaaacttatttggaaataatataggagaatggaaatctgcattagatcggtatagaagga 28244126  T
Q  118 ttccacataaagatatccaaaagatacttagactcagctatgatgctttggaagaagaggagcagagtgtctttttggatattgcttgttgcatcaaagg 217  Q
    ||||   |||| | || ||  ||||||||| | | |||| ||||||||||||  |||| ||||||| ||| ||| | || |||||||| ||| |||||||    
T  28244127 ttccgattaaaaagatacaggagatacttaaagtaagctttgatgctttggagaaagatgagcagaatgtttttctcgacattgcttgctgcttcaaagg 28244226  T
Q  218 at 219  Q
    ||    
T  28244227 at 28244228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 346 - 462
Target Start/End: Original strand, 25581273 - 25581389
Alignment:
Q  346 tgacattacatgaattgatagaggtcatgggtaaagaagtcgtccgacaagaatcacctaaagagcctggagaaagaagcaggttatggtctcaagatga 445  Q
    |||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| || ||  | ||||||||| | || ||||| |||| ||| |||||    
T  25581273 tgaccttacatgacttgatagaggacatgggtaaagaaatcgtccgacaagaatctcccaagaaccctggagaacgcagtaggttgtggtttcacgatga 25581372  T
Q  446 tatagttcatgttttaa 462  Q
    |||| || | |||||||    
T  25581373 tatatttgacgttttaa 25581389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 350 - 510
Target Start/End: Original strand, 27216007 - 27216167
Alignment:
Q  350 attacatgaattgatagaggtcatgggtaaagaagtcgtccgacaagaatcacctaaagagcctggagaaagaagcaggttatggtctcaagatgatata 449  Q
    ||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||| |||||||||||||||||  |  | ||||| ||| | || ||||| |||| ||| |||||||||    
T  27216007 attacatgacttgatagaggatatgggtagagaagttgtccgacaagaatcacccgacaatcctggggaacgcagtaggttgtggtttcacgatgatata 27216106  T
Q  450 gttcatgttttaaaagaaaacactgtgcgtaagattgatatctatgttcaatttgttattt 510  Q
    ||||| ||| |||||||||| |  ||| |||| | | |||| ||||  |||||||||||||    
T  27216107 gttcaagttctaaaagaaaatatcgtgagtaaaaataatatttatgaacaatttgttattt 27216167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 345 - 416
Target Start/End: Original strand, 29827542 - 29827613
Alignment:
Q  345 gtgacattacatgaattgatagaggtcatgggtaaagaagtcgtccgacaagaatcacctaaagagcctgga 416  Q
    |||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||||||||||    
T  29827542 gtgacattacatgacttgatagaagacatgggtaaagaaattgtacgacaagaatcaccgaaagagcctgga 29827613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 345 - 415
Target Start/End: Original strand, 28141091 - 28141161
Alignment:
Q  345 gtgacattacatgaattgatagaggtcatgggtaaagaagtcgtccgacaagaatcacctaaagagcctgg 415  Q
    |||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| | || |||||||||||||| |||||||||||    
T  28141091 gtgacattacatgacttgatagaggagatgggtaaagaaattgttcgacaagaatcaccaaaagagcctgg 28141161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 63 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 29842897 - 29842743
Alignment:
Q  63 ttgtttggaaagagtattgcagaatgtgagtctacattagataagtatggaagaattccacataaagatatccaaaagatacttagactcagctatgatg 162  Q
    ||||||||||||| ||| | ||||||  | ||||||||||||| ||||| ||| |||||  ||||||| ||||| || ||||||| | | |||| |||||    
T  29842897 ttgtttggaaagaatatagaagaatggaaatctacattagataggtatgaaaggattcctaataaagagatccacaatatacttaaaataagctttgatg 29842798  T
Q  163 ctttggaagaagaggagcagagtgtctttttggatattgcttgttgcatcaaagg 217  Q
    ||||||| ||||| || ||  |||| ||| | || |||||||||||| |||||||    
T  29842797 ctttggaggaagacgaacaaggtgtttttctcgacattgcttgttgcttcaaagg 29842743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 345 - 462
Target Start/End: Original strand, 25512441 - 25512558
Alignment:
Q  345 gtgacattacatgaattgatagaggtcatgggtaaagaagtcgtccgacaagaatcacctaaagagcctggagaaagaagcaggttatggtctcaagatg 444  Q
    ||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||| || ||  ||||||||||| | || ||||| |||| ||  ||||    
T  25512441 gtgaccttacatgacttgatagaggacatgggtaaagaaaccgtccgacaagaatctcccaacaagcctggagaacgcagtaggttgtggtttcgcgatg 25512540  T
Q  445 atatagttcatgttttaa 462  Q
    ||||| || | |||||||    
T  25512541 atatacttaacgttttaa 25512558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 18 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 28296690 - 28296633
Alignment:
Q  18 tatgcttctggccttccattagcgatagaagtagtgggttctaacttgtttggaaaga 75  Q
    |||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28296690 tatgcttctggccttccattggctttagaagtagtgggttccaacttgtttggaaaga 28296633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 18 - 75
Target Start/End: Original strand, 28515383 - 28515440
Alignment:
Q  18 tatgcttctggccttccattagcgatagaagtagtgggttctaacttgtttggaaaga 75  Q
    |||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28515383 tatgcttctggccttccattggctttagaagtagtgggttccaacttgtttggaaaga 28515440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 345 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 28097078 - 28096954
Alignment:
Q  345 gtgacattacatgaattgatagaggtcatgggtaaagaagtcgtccgacaagaatcacctaaagagcctggagaaagaagcaggttatggtctcaagatg 444  Q
    |||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||| | ||  ||||||||||||| ||||| |||||| || | |||||||| | ||  || || |    
T  28097078 gtgacattacatgacttgatagaagacatgggtaaagaaattgtaagacaagaatcaccaaaagaacctggaaaacgtagcaggttgtcgttccatgaag 28096979  T
Q  445 atatagttcatgttttaaaagaaaa 469  Q
    ||||| |||| |||||| |||||||    
T  28096978 atatatttcaagttttagaagaaaa 28096954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #84
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 348 - 415
Target Start/End: Original strand, 28150731 - 28150798
Alignment:
Q  348 acattacatgaattgatagaggtcatgggtaaagaagtcgtccgacaagaatcacctaaagagcctgg 415  Q
    ||||||||||| |||||||| | ||||||||||||| | || |||||||||||||| |||||||||||    
T  28150731 acattacatgacttgatagaagacatgggtaaagaaattgtacgacaagaatcaccaaaagagcctgg 28150798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #85
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 18 - 221
Target Start/End: Original strand, 28787470 - 28787673
Alignment:
Q  18 tatgcttctggccttccattagcgatagaagtagtgggttctaacttgtttggaaagagtattgcagaatgtgagtctacattagataagtatggaagaa 117  Q
    |||||||| |||||||| ||||   ||||| |||||||||| ||||||||||||||||  || | ||||||  ||  ||| ||||||   |||| ||  |    
T  28787470 tatgcttcgggccttcccttagttttagaaatagtgggttccaacttgtttggaaagacgatagaagaatggaagggtactttagatggatatgaaaaga 28787569  T
Q  118 ttccacataaagatatccaaaagatacttagactcagctatgatgctttggaagaagaggagcagagtgtctttttggatattgcttgttgcatcaaagg 217  Q
    ||||  ||||| | |||||  ||||||||| | | ||||||||||||||||| |||||| | || ||||| ||| | || ||||| |||||| |||||||    
T  28787570 ttcccaataaaaagatccacgagatacttaaagtaagctatgatgctttggaggaagagcaacaaagtgtttttctagacattgcatgttgcttcaaagg 28787669  T
Q  218 atgt 221  Q
    ||||    
T  28787670 atgt 28787673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #86
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 18 - 221
Target Start/End: Original strand, 28793591 - 28793794
Alignment:
Q  18 tatgcttctggccttccattagcgatagaagtagtgggttctaacttgtttggaaagagtattgcagaatgtgagtctacattagataagtatggaagaa 117  Q
    |||||||| |||||||| ||||   ||||| |||||||||| ||||||||||||||||  || | ||||||  ||  ||| ||||||   |||| ||  |    
T  28793591 tatgcttcgggccttcccttagttttagaaatagtgggttccaacttgtttggaaagacgatagaagaatggaagggtactttagatggatatgaaaaga 28793690  T
Q  118 ttccacataaagatatccaaaagatacttagactcagctatgatgctttggaagaagaggagcagagtgtctttttggatattgcttgttgcatcaaagg 217  Q
    ||||  ||||| | |||||  ||||||||| | | ||||||||||||||||| |||||| | || ||||| ||| | || ||||| |||||| |||||||    
T  28793691 ttcccaataaaaagatccacgagatacttaaagtaagctatgatgctttggaggaagagcaacaaagtgtttttctagacattgcatgttgcttcaaagg 28793790  T
Q  218 atgt 221  Q
    ||||    
T  28793791 atgt 28793794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #87
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 95 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 27530177 - 27530011
Alignment:
Q  95 tacattagataagtatggaagaattccacataaagatatccaaaagatacttagactcagctatgatgctttggaagaagaggagcagagtgtctttttg 194  Q
    ||||||||||  ||||| |  ||||||  ||||||| |||||||  ||||||| | | ||||||||| |||||||  |||| ||||| ||||||||| |     
T  27530177 tacattagatgggtatgaagaaattcccaataaagagatccaaagaatacttaaagtgagctatgattctttggagaaagaagagcaaagtgtctttcta 27530078  T
Q  195 gatattgcttgttgcatcaaaggatgtagattggagaaagtcaaacagatacttcatgctcattatg 261  Q
    || |||||||||||| ||||||| |||| || |    | |||||| | |||||||||||||||||||    
T  27530077 gacattgcttgttgcttcaaagggtgtaaatggccagaggtcaaagaaatacttcatgctcattatg 27530011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #88
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 132 - 216
Target Start/End: Original strand, 26825165 - 26825249
Alignment:
Q  132 atccaaaagatacttagactcagctatgatgctttggaagaagaggagcagagtgtctttttggatattgcttgttgcatcaaag 216  Q
    |||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| | || ||||| ||  | || |||||||||||| ||||||    
T  26825165 atccaagagatacttagagtaagctatgatgctttggaagaagagcaacaaagtgttttcctcgacattgcttgttgcttcaaag 26825249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #89
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 345 - 436
Target Start/End: Original strand, 29469759 - 29469850
Alignment:
Q  345 gtgacattacatgaattgatagaggtcatgggtaaagaagtcgtccgacaagaatcacctaaagagcctggagaaagaagcaggttatggtc 436  Q
    |||||||||||||| ||||||||||  ||||| |||||| | ||  |||||||||||||| |||| |||||| || | || |||||||||||    
T  29469759 gtgacattacatgatttgatagaggatatggggaaagaaattgttagacaagaatcacctgaagatcctggaaaacgcagtaggttatggtc 29469850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #90
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 24 - 74
Target Start/End: Original strand, 2186064 - 2186114
Alignment:
Q  24 tctggccttccattagcgatagaagtagtgggttctaacttgtttggaaag 74  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  2186064 tctggccttccattagctttagaagtagtgggttctgacttgtctggaaag 2186114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #91
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 132 - 318
Target Start/End: Original strand, 2186172 - 2186358
Alignment:
Q  132 atccaaaagatacttagactcagctatgatgctttggaagaagaggagcagagtgtctttttggatattgcttgttgcatcaaaggatgtagattggaga 231  Q
    |||||| ||||||||| | |||||| |||||||||| | || || ||  ||||| ||||| | || ||||||||||   |||||||||||||| ||||      
T  2186172 atccaacagatacttaaagtcagctttgatgctttgcaggaggaagataagagtctctttctcgacattgcttgttttttcaaaggatgtagactggaag 2186271  T
Q  232 aagtcaaacagatacttcatgctcattatgattattccatagaaagccacattggagtgttggttgataagtctctcataaatatta 318  Q
    |  || || | |||||| |||||||||||  ||||| |||  |||  || ||||||||||||||||| || || |||||||| ||||    
T  2186272 agttccaagatatacttgatgctcattatacttattgcatcaaaaatcatattggagtgttggttgaaaaatcactcataaagatta 2186358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #92
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 18 - 208
Target Start/End: Original strand, 28140767 - 28140957
Alignment:
Q  18 tatgcttctggccttccattagcgatagaagtagtgggttctaacttgtttggaaagagtattgcagaatgtgagtctacattagataagtatggaagaa 117  Q
    ||||| |||||||||||||| ||  |||||||||| ||||||| |||||||||||||  ||  |  || ||  | ||||||||||||  ||||| ||| |    
T  28140767 tatgcctctggccttccattggctttagaagtagttggttctagcttgtttggaaagcataaagatgagtggaaatctacattagatcggtatgaaagga 28140866  T
Q  118 ttccacataaagatatccaaaagatacttagactcagctatgatgctttggaagaagaggagcagagtgtctttttggatattgcttgttg 208  Q
    |||| ||||||||  |||  |||||||||| | | |||| ||||  ||||||  |||| ||||| ||||| ||| | || |||||||||||    
T  28140867 ttcctcataaagaggtcctgaagatacttaaagtgagctttgatagtttggagaaagatgagcaaagtgtttttctcgacattgcttgttg 28140957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #93
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 63 - 217
Target Start/End: Original strand, 29827263 - 29827417
Alignment:
Q  63 ttgtttggaaagagtattgcagaatgtgagtctacattagataagtatggaagaattccacataaagatatccaaaagatacttagactcagctatgatg 162  Q
    ||||||||||||| ||| | ||||||  | |||| ||||||||  |||| ||| |||||  ||||||| |||||||| ||||||| | | || | |||||    
T  29827263 ttgtttggaaagaatatagaagaatggaaatctatattagatagatatgaaaggattcctaataaagagatccaaaatatacttaaaataagttttgatg 29827362  T
Q  163 ctttggaagaagaggagcagagtgtctttttggatattgcttgttgcatcaaagg 217  Q
    ||||||| ||||| || ||  |||| ||| | || |||||||||||| |||||||    
T  29827363 ctttggaggaagatgaacaaggtgtttttctcgacattgcttgttgcttcaaagg 29827417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #94
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 345 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 29842618 - 29842547
Alignment:
Q  345 gtgacattacatgaattgatagaggtcatgggtaaagaagtcgtccgacaagaatcacctaaagagcctgga 416  Q
    |||||| ||||||| |||||||| | ||||||||||||| | || |||| ||||||| | ||||||||||||    
T  29842618 gtgacactacatgacttgatagaagacatgggtaaagaaattgtacgaccagaatcaacgaaagagcctgga 29842547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #95
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 29 - 75
Target Start/End: Original strand, 28182361 - 28182407
Alignment:
Q  29 ccttccattagcgatagaagtagtgggttctaacttgtttggaaaga 75  Q
    ||||||||| ||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28182361 ccttccattggctttagaagtagtgggttccaacttgtttggaaaga 28182407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #96
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 95 - 184
Target Start/End: Original strand, 25539852 - 25539941
Alignment:
Q  95 tacattagataagtatggaagaattccacataaagatatccaaaagatacttagactcagctatgatgctttggaagaagaggagcagag 184  Q
    |||||||||| |||||| ||  |||||  ||||||||||||||| |||||||  | | ||||||||||||||| | ||| |||| |||||    
T  25539852 tacattagatgagtatgaaaatattcccgataaagatatccaaaggatacttcaagtaagctatgatgctttgaaggaaaaggatcagag 25539941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #97
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 43 - 88
Target Start/End: Original strand, 28228209 - 28228254
Alignment:
Q  43 tagaagtagtgggttctaacttgtttggaaagagtattgcagaatg 88  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||||||    
T  28228209 tagaagtagtgggttcaaacttgtttgggaagaatattgaagaatg 28228254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #98
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 43 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 27337020 - 27336988
Alignment:
Q  43 tagaagtagtgggttctaacttgtttggaaaga 75  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27337020 tagaaatagtgggttctaacttgtttggaaaga 27336988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #99
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 43 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 27397760 - 27397728
Alignment:
Q  43 tagaagtagtgggttctaacttgtttggaaaga 75  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27397760 tagaaatagtgggttctaacttgtttggaaaga 27397728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #100
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 345 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 29673644 - 29673520
Alignment:
Q  345 gtgacattacatgaattgatagaggtcatgggtaaagaagtcgtccgacaagaatcacctaaagagcctggagaaagaagcaggttatggtctcaagatg 444  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||  ||||| |||||| | ||  |||||||| ||||| |||| |||||| || | || |||||||||| |   || |    
T  29673644 gtgacattacatgatttggtagaggatatgggaaaagaaattgttagacaagaagcacctgaagatcctggaaaacgtagtaggttatggttttccgaag 29673545  T
Q  445 atatagttcatgttttaaaagaaaa 469  Q
    ||||| |||| |||||| |||||||    
T  29673544 atataattcaagttttagaagaaaa 29673520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 11)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 18 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 18723031 - 18722635
Alignment:
Q  18 tatgcttctggccttccattagcgatagaagtagtgggttctaacttgtttggaaagagtattgcagaatgtgagtctacattagataagtatggaagaa 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  18723031 tatgcttctggccttccattagctatagaagtagtgggttccaacttgtttggaaagagtattgcagaatgtgagtctacattagatatgtatgaaagaa 18722932  T
Q  118 ttccacataaagatatccaaaagatacttagactcagctatgatgctttggaagaagaggagcagagtgtctttttggatattgcttgttgcatcaaagg 217  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||| | | |||| |||||||||||  |||||  | || ||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  18722931 ttccagatgaagatatccaaaagatacttaaagtaagctttgatgctttgggcgaagaacaacaaagtgtctttttggatattgcttgtttcttcaaagg 18722832  T
Q  218 atgtagattggagaaagtcaaacagatacttcatgctcattatgattattccatagaaagccacattggagtgttggttgataagtctctcataaatatt 317  Q
    |||||||||||   ||||| || ||||||||||    ||||||||||||| |||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  18722831 atgtagattggcagaagtcgaagagatacttcaacaacattatgattattgcataaagagccacattggagggttggttgataagtctctcataaaaatt 18722732  T
Q  318 agttggtgctg-tttcagtggtatcaaagtgacattacatgaattgatagaggtcatgggtaaagaagtcgtccgacaagaatcacctaaagagcctg 414  Q
    ||| |||| || |  || | || |  |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| || | ||  |||||||||||||||||||||    
T  18722731 agtgggtggtgctaccacttgtct-gaagtgacattacatgacttgctagaggtcatgggtaaagaaatcattcgtaaagaatcacctaaagagcctg 18722635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 18 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 18678506 - 18678122
Alignment:
Q  18 tatgcttctggccttccattagcgatagaagtagtgggttctaacttgtttggaaagagtattgcagaatgtgagtctacattagataagtatggaagaa 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18678506 tatgcttctggccttccattagctatagaagtagtgggttccaacttgtttggaaagaatatttcagaatgtgagtctacattagataagtatgaaagaa 18678407  T
Q  118 ttccacataaagatatccaaaagatacttagactcagctatgatgctttggaagaagaggagcagagtgtctttttggatattgcttgttgcatcaaagg 217  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| | | |||| |||||||||||| |||||  | || | ||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  18678406 ttccacatgaagatatccaaaagatacttaaagtaagctttgatgctttggacgaagaacaacaaattgtctttttggatattgcttgtttcttcaaagg 18678307  T
Q  218 atgtagattggagaaagtcaaacagatacttcatgctcattatgattattccatagaaagccacattggagtgttggttgataagtctctcataaatatt 317  Q
    |||||||||||   ||||| || ||||||||||   |||||||| ||||  |||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  18678306 atgtagattggcagaagtcgaagagatacttcaacgtcattatggttatcgcataaatagccacattggagggttggttgataagtctctcataaaaatt 18678207  T
Q  318 agttggtgctgtttcagtggtatcaaagtgacattacatgaattgatagaggtcatgggtaaagaagtcgtccgacaagaatcacctaaagagcctg 414  Q
    | |||||            | |  ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||||||    
T  18678206 atttggt------------ggaaaaaagtgacattacatgacttgctagaggtcatgggtaaagaaatcgtccggaaagaatcacccaaagagcctg 18678122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 18 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 18730450 - 18730060
Alignment:
Q  18 tatgcttctggccttccattagcgatagaagtagtgggttctaacttgtttggaaagagtattgcagaatgtgagtctacattagataagtatggaagaa 117  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  18730450 tatgcttctggccttccattagctctagaagtagtgggttccaacttgtttggaaagagttttgcagaatgtgattctacattagataagtatgaaagaa 18730351  T
Q  118 ttccacataaagatatccaaaagatacttagactcagctatgatgctttggaagaagaggagcagagtgtctttttggatattgcttgttgcatcaaagg 217  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| | | |||| |||||||||||| |||||  | || ||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  18730350 ttccacatgaagatatccaaaagatacttaaagtaagctttgatgctttggacgaagaacaacaaagtgtctttttggatattgcttgtttcttcaaagg 18730251  T
Q  218 atgtagattggagaaagtcaaacagatacttcatgctcattatgattattccatagaaagccacattggagtgttggttgataagtctctcataaatatt 317  Q
    |||||||||||   ||||| || ||||||||||    ||||||| ||||| |||| | ||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||| |||    
T  18730250 atgtagattggcagaagtcgaagagatacttcaacaacattatggttattgcataaagagccacattggagagctggttgatatgtctctcataaaaatt 18730151  T
Q  318 agttggtgctgtttcagtggtatcaaagtgacattacatgaattgatagaggtcatgggtaaagaagtcgtccgacaagaatcacctaaagagcctg 414  Q
    ||| ||||    || | ||      | |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||||||    
T  18730150 agtgggtggaacttgaatg------atgtgacattacatgacttgctagaggtcatgggtaaagaaatcgtccggaaagaatcacccaaagagcctg 18730060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 175; E-Value: 6e-94
Query Start/End: Original strand, 18 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 18688572 - 18688179
Alignment:
Q  18 tatgcttctggccttccattagcgatagaagtagtgggttctaacttgtttggaaagagtattgcagaatgtgagtctacattagataagtatggaagaa 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  18688572 tatgcttctggccttccattagctatagaagtagtgggttccaacttgtttggaaagagtatttcagaatgtgagtctacattagataagtatcaaagaa 18688473  T
Q  118 ttccacataaagatatccaaaagatacttagactcagctatgatgctttggaagaagaggagcagagtgtctttttggatattgcttgttgcatcaaagg 217  Q
    ||||| |  ||||||||||||||||||||| | | |||| |||||||||||| |||||  | || ||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  18688472 ttccaaacgaagatatccaaaagatacttaaagtaagctttgatgctttggacgaagaacaacaaagtgtctttttggatattgcttgtttcttcaaagg 18688373  T
Q  218 atgtagattggagaaagtcaaacagatacttcatgctcattatgattattccatagaaagccacattggagtgttggttgataagtctctcataaatatt 317  Q
    ||||| |||||  |||||| || |||||||| |   |||||||| ||||| |||| | |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||    
T  18688372 atgtatattggcaaaagtcgaagagatacttaaacttcattatggttattgcataaagagccacattggaggattggttgataagtctctcataaaaatt 18688273  T
Q  318 agttggtgctgtttcagtggtatcaaagtgacattacatgaattgatagaggtcatgggtaaagaagtcgtccgacaagaatcacctaaagagcctg 414  Q
    |||      |||| || |   |   |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||    
T  18688272 agt---gaatgttacactttgaatgaagtgacattacatgacttgctagaggtcatgggtaaagaaattgtccggaaagaatcacctaaagagcctg 18688179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 18 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 18654423 - 18654128
Alignment:
Q  18 tatgcttctggccttccattagcgatagaagtagtgggttctaacttgtttggaaagagtattgcagaatgtgagtctacattagataagtatggaagaa 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  18654423 tatgcttctggccttccattagctatagaagtcgtgggttccaacttgtttggaaagagtattgcagaatgtgaatctacattagataagtatgaaagaa 18654324  T
Q  118 ttccacataaagatatccaaaagatacttagactcagctatgatgctttggaagaagaggagcagagtgtctttttggatattgcttgttgcatcaaagg 217  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| | | || | |||||||||||| |||||  | || |||||||||||||||||||||||||   |||||||    
T  18654323 ttccacatgaagatatccaaaagatacttaaagtaagttttgatgctttggatgaagaacaacaaagtgtctttttggatattgcttgtttgttcaaagg 18654224  T
Q  218 atgtagattggagaaagtcaaacagatacttcatgctcattatgattattccatagaaagccacattggagtgttggttgataagtctctcataaa 313  Q
    |||||||||||   ||||| || ||||||||||   |||||||| ||||| |||| | ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18654223 atgtagattggcagaagtcgaagagatacttcaaagtcattatggttattgcataaagagccacattcgagggttggttgataagtctctcataaa 18654128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 18 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 18698346 - 18698051
Alignment:
Q  18 tatgcttctggccttccattagcgatagaagtagtgggttctaacttgtttggaaagagtattgcagaatgtgagtctacattagataagtatggaagaa 117  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  18698346 tatgcttctggccttccattagctctagaagtagtgggttccaacttgtttggaaagagttttgcagaatgtgactctacattagataagtatgaaagaa 18698247  T
Q  118 ttccacataaagatatccaaaagatacttagactcagctatgatgctttggaagaagaggagcagagtgtctttttggatattgcttgttgcatcaaagg 217  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| | | |||| |||||||||||| |||||  | || ||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  18698246 ttccacatgaagatatccaaaagatacttaaagtaagctttgatgctttggacgaagaacaacaaagtgtctttttggatattgcttgtttcttcaaagg 18698147  T
Q  218 atgtagattggagaaagtcaaacagatacttcatgctcattatgattattccatagaaagccacattggagtgttggttgataagtctctcataaa 313  Q
    |||||| ||||   ||||  || ||||||||||   |||||||| ||||  |||| | ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18698146 atgtagtttggcagaagttgaagagatacttcaacgtcattatggttatcgcataaatagccacattcgagggttggttgataagtctctcataaa 18698051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 18 - 261
Target Start/End: Original strand, 18074993 - 18075236
Alignment:
Q  18 tatgcttctggccttccattagcgatagaagtagtgggttctaacttgtttggaaagagtattgcagaatgtgagtctacattagataagtatggaagaa 117  Q
    |||||||||||||||||  |||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||  || | ||||||  ||  ||||||||||  ||||| ||  |    
T  18074993 tatgcttctggccttccggtagttatagaaatagtgggttctaacttgtttggaaagaacatagaagaatgcaagaatacattagattggtatgaaaaga 18075092  T
Q  118 ttccacataaagatatccaaaagatacttagactcagctatgatgctttggaagaagaggagcagagtgtctttttggatattgcttgttgcatcaaagg 217  Q
    ||||  ||||||| |||||||  ||||||| | | ||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| | || |||||||||||| |||||||    
T  18075093 ttcccaataaagagatccaaagaatacttaaagtgagctatgattctttggaggaagaggagcaaagtgtctttctagacattgcttgttgcttcaaagg 18075192  T
Q  218 atgtagattggagaaagtcaaacagatacttcatgctcattatg 261  Q
     |||| || ||| || |||||| | |||||||||||||||||||    
T  18075193 ttgtaaatgggaaaaggtcaaagaaatacttcatgctcattatg 18075236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 349 - 539
Target Start/End: Original strand, 18075315 - 18075506
Alignment:
Q  349 cattacatgaattgatagaggtcatgggtaaagaagtcgtccgacaagaatcacctaaagagcctggagaaagaagcaggttatggtctcaagatgatat 448  Q
    |||||||| | |||||||||  ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||| | || | |||||    
T  18075315 cattacataacttgatagagaacatgggtaaagaactcgtccgactagaatcaccttttgagcctggaaaaagaagcaggttatggtttgaaaaggatat 18075414  T
Q  449 agttcatgttttaaaagaaaacactgtgcgtaagattgatatctatgttcaatttgttatttag-ttttaatacaactttgctcattttgga 539  Q
    | || | ||| || |||||||||||||| |||||||||||||  | |  ||||||||||||||| |||||| |  ||||||||| |||||||    
T  18075415 atttgaagttctagaagaaaacactgtgagtaagattgatatgcaggaacaatttgttatttagcttttaacatgactttgctctttttgga 18075506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 342 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 18654114 - 18654042
Alignment:
Q  342 aaagtgacattacatgaattgatagaggtcatgggtaaagaagtcgtccgacaagaatcacctaaagagcctg 414  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||| ||||||    
T  18654114 aaagtgacattacatgacttgctagaggtcatgggtaaagaaatcgtccggaaagaatcacctaaacagcctg 18654042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 343 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 18698036 - 18697965
Alignment:
Q  343 aagtgacattacatgaattgatagaggtcatgggtaaagaagtcgtccgacaagaatcacctaaagagcctg 414  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||||||    
T  18698036 aagtgacattacatgacttgctagaggccatgggtaaagaaatcgtccggaaagaatcacccaaagagcctg 18697965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 18 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 5089900 - 5089605
Alignment:
Q  18 tatgcttctggccttccattagcgatagaagtagtgggttctaacttgtttggaaagagtattgcagaatgtgagtctacattagataagtatggaagaa 117  Q
    |||||||||||||||||||| ||  ||||||| |||||||| || ||||||||||||  ||| | | ||||  | |||  | ||||| |||||| ||| |    
T  5089900 tatgcttctggccttccattggctttagaagttgtgggttccaatttgtttggaaaggatatagaaaaatggaaatctttactagatgagtatgaaagga 5089801  T
Q  118 ttccacataaagatatccaaaagatacttagactcagctatgatgctttggaagaagaggagcagagtgtctttttggatattgcttgttgcatcaaagg 217  Q
    ||||  ||||||| |||||||||||||||| | | |||| | ||  ||| |  ||| | ||||||||||| ||  | || |||||||||||  |||||||    
T  5089800 ttcctaataaagaaatccaaaagatacttatagtgagctttaataatttaggtgaatatgagcagagtgttttcctcgacattgcttgttgtttcaaagg 5089701  T
Q  218 atgtagattggagaaagtcaaacagatacttcatgctcattatgattattccatagaaagccacattggagtgttggttgataagtctctcataaa 313  Q
    || ||| |||||  | ||| || | ||||||  ||||||||||| ||||| |||  ||   || || |||  |||||||||||| |||||||||||    
T  5089700 atatagcttggatgaggtcgaatatatactttgtgctcattatggttattgcatgaaatatcatataggaaagttggttgataaatctctcataaa 5089605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1870 (Bit Score: 166; Significance: 1e-88; HSPs: 2)
Name: scaffold1870
Description:

Target: scaffold1870; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 345 - 566
Target Start/End: Original strand, 334 - 555
Alignment:
Q  345 gtgacattacatgaattgatagaggtcatgggtaaagaagtcgtccgacaagaatcacctaaagagcctggagaaagaagcaggttatggtctcaagatg 444  Q
    |||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  334 gtgacattacatgactttatagaggacatgggtaaagaagtcgtacgacaagaatcgcctaaagagccaggagaaagaagtaggttatggtgtcaagatg 433  T
Q  445 atatagttcatgttttaaaagaaaacactgtgcgtaagattgatatctatgttcaatttgttatttagttttaatacaactttgctcattttggactaaa 544  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||| ||||||||||||    
T  434 atatagttaatgttttaaaagaaaacactgtgagtaagattgatatctatgttcaatttgttatttagttttgatatgactttgctctttttggactaaa 533  T
Q  545 tatgaccatctcatactagtat 566  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  534 tatgaccatctcatactagtat 555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1870; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 18 - 221
Target Start/End: Original strand, 1 - 204
Alignment:
Q  18 tatgcttctggccttccattagcgatagaagtagtgggttctaacttgtttggaaagagtattgcagaatgtgagtctacattagataagtatggaagaa 117  Q
    |||||||| |||||||| ||||   ||||| |||||||||| ||||||||||||||||  || | ||||||  ||  ||||||||||   |||| ||  |    
T  1 tatgcttcgggccttcccttagttttagaaatagtgggttccaacttgtttggaaagacgatagaagaatggaagggtacattagatggatatgaaaaga 100  T
Q  118 ttccacataaagatatccaaaagatacttagactcagctatgatgctttggaagaagaggagcagagtgtctttttggatattgcttgttgcatcaaagg 217  Q
    ||||  ||||| | |||||  ||||||||| | | ||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| ||| | || ||||| |||||| |||||||    
T  101 ttcccaataaaaagatccacgagatacttaaagtaagctatgatgctttggaggaagagcagcaaagtgtttttctagacattgcctgttgcttcaaagg 200  T
Q  218 atgt 221  Q
    ||||    
T  201 atgt 204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0419 (Bit Score: 162; Significance: 3e-86; HSPs: 2)
Name: scaffold0419
Description:

Target: scaffold0419; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 345 - 566
Target Start/End: Original strand, 9052 - 9273
Alignment:
Q  345 gtgacattacatgaattgatagaggtcatgggtaaagaagtcgtccgacaagaatcacctaaagagcctggagaaagaagcaggttatggtctcaagatg 444  Q
    |||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  9052 gtgacattacatgactttatagaggacatgggtaaagaagtcgtacgacaagaatcgcctaaagagccaggagaaagaagtaggttatggtgtcaagatg 9151  T
Q  445 atatagttcatgttttaaaagaaaacactgtgcgtaagattgatatctatgttcaatttgttatttagttttaatacaactttgctcattttggactaaa 544  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||| ||||||||||||    
T  9152 atatagttaatgttttaaaagaaaacactgtgagtaagattgatatctatgttcaatttgttatttagttttgatatgactttgctctttttggactaaa 9251  T
Q  545 tatgaccatctcatactagtat 566  Q
    ||||||||||||||| ||||||    
T  9252 tatgaccatctcatattagtat 9273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0419; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 17 - 221
Target Start/End: Original strand, 8718 - 8922
Alignment:
Q  17 atatgcttctggccttccattagcgatagaagtagtgggttctaacttgtttggaaagagtattgcagaatgtgagtctacattagataagtatggaaga 116  Q
    ||||||||| |||||||| ||||   ||||| |||||||||| ||||||||||||||||  || | ||||||  ||  ||||||||||   |||| ||      
T  8718 atatgcttcgggccttcccttagttttagaaatagtgggttccaacttgtttggaaagacgatagaagaatggaagggtacattagatggatatgaaaag 8817  T
Q  117 attccacataaagatatccaaaagatacttagactcagctatgatgctttggaagaagaggagcagagtgtctttttggatattgcttgttgcatcaaag 216  Q
    |||||  ||||| | |||||  ||||||||| | | || |||||||||||||| |||||| |||| ||||| ||| | || ||||| |||||| ||||||    
T  8818 attcccaataaaaagatccacgagatacttaaagtaagttatgatgctttggaggaagagcagcaaagtgtttttctagacattgcctgttgcttcaaag 8917  T
Q  217 gatgt 221  Q
    |||||    
T  8918 gatgt 8922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 158; Significance: 8e-84; HSPs: 9)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 8e-84
Query Start/End: Original strand, 345 - 566
Target Start/End: Complemental strand, 266978 - 266757
Alignment:
Q  345 gtgacattacatgaattgatagaggtcatgggtaaagaagtcgtccgacaagaatcacctaaagagcctggagaaagaagcaggttatggtctcaagatg 444  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||    
T  266978 gtgacattacatgacatgatagaggacatgggtaaagaagtggtccgccaagaatcacctaaagagcctggagaacgaagtaggttatggtgtcaagatg 266879  T
Q  445 atatagttcatgttttaaaagaaaacactgtgcgtaagattgatatctatgttcaatttgttatttagttttaatacaactttgctcattttggactaaa 544  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||    
T  266878 atatagttcatgttttaaataaaaacactgtgagtaagattgatatcaatgatcaatttgttatttagttttaatacgactttgctctttttggacaaaa 266779  T
Q  545 tatgaccatctcatactagtat 566  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  266778 tatgaccatctcatactagtat 266757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 138; E-Value: 7e-72
Query Start/End: Original strand, 17 - 469
Target Start/End: Original strand, 26137119 - 26137559
Alignment:
Q  17 atatgcttctggccttccattagcgatagaagtagtgggttctaacttgtttggaaagagtattgcagaatgtgagtctacattagataagtatggaaga 116  Q
    |||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| | ||||||||||||| |||   ||||||| || ||||||||| | ||||||| |||     
T  26137119 atatgcttctggccttccgttagctttagaagtagtgggttccagcttgtttggaaagtgtacaacagaatgggaatctacattacagaagtatgaaagg 26137218  T
Q  117 attccacataaagatatccaaaagatacttagactcagctatgatgctttggaagaagaggagcagagtgtctttttggatattgcttgttgcatcaaag 216  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |||||  | || ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26137219 attccacatgaagatatccaaaacatacttagagtaagctatgatgctttggacgaagaacaacaaagtgtatttttggatattgcttgttgcttcaaag 26137318  T
Q  217 gatgtagattggagaaagtcaaacagatacttcatgctcattatgattattccatagaaagccacattggagtgttggttgataagtctctcataaatat 316  Q
    | |||| ||||    ||||| || ||||||||||||||| ||||||  ||| |||| |||| ||  |||||||||||||||||||  ||||||| || ||    
T  26137319 ggtgtaaattgacagaagtccaaaagatacttcatgctcgttatgaccattgcataaaaagtcatgttggagtgttggttgataaagctctcatgaagat 26137418  T
Q  317 tagttggtgctgtttcagtggtatcaaagtgacattacatgaattgatagaggtcatgggtaaagaagtcgtccgacaagaatcacctaaagagcctgga 416  Q
    || ||       |||   |||| |    ||| |||||||||| ||||||||||  |||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  26137419 taatt-------ttt--atggttt---tgtggcattacatgacttgatagaggatatgggtaaagaaattgtccgacaagaatcacccaaagaacctgga 26137506  T
Q  417 gaaagaagcaggttatggtctcaagatgatatagttcatgttttaaaagaaaa 469  Q
     || | || ||||| |||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  26137507 aaacgcagtaggttgtggtttcatgaagatatagttcatgttttaaaagaaaa 26137559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 18 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 267290 - 267047
Alignment:
Q  18 tatgcttctggccttccattagcgatagaagtagtgggttctaacttgtttggaaagagtattgcagaatgtgagtctacattagataagtatggaagaa 117  Q
    ||||||||||||||||| ||||   ||||| | |||||||||||||||||||||||||| || | ||||||  ||  ||||||||||  |||||  |  |    
T  267290 tatgcttctggccttccgttagttttagaaattgtgggttctaacttgtttggaaagagcatagaagaatggaagggtacattagatgggtatgataaga 267191  T
Q  118 ttccacataaagatatccaaaagatacttagactcagctatgatgctttggaagaagaggagcagagtgtctttttggatattgcttgttgcatcaaagg 217  Q
    ||||  ||||||| |||||||||||||||| | | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||    
T  267190 ttcccaataaagagatccaaaagatacttaaagtgagctatgatggtttggaagaagaggagcagagtgtctttttagacattgcttgttgcttcaaagg 267091  T
Q  218 atgtagattggagaaagtcaaacagatacttcatgctcattatg 261  Q
    || |  || |||  | | |||||| ||||||||| |||||||||    
T  267090 atatgaatgggaagatgccaaacatatacttcattctcattatg 267047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 345 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 28126313 - 28126095
Alignment:
Q  345 gtgacattacatgaattgatagaggtcatgggtaaagaagtcgtccgacaagaatcacctaaagagcctggagaaagaagcaggttatggtctcaagatg 444  Q
    |||||||||||||| ||||||||||  | |||||||||| |||||||  ||||||||| |||||||||||||||| | | ||||||||||| |||  |||    
T  28126313 gtgacattacatgacttgatagaggatacgggtaaagaaatcgtccggaaagaatcacgtaaagagcctggagaacgcaacaggttatggtgtcacaatg 28126214  T
Q  445 atatagttcatgttttaaaagaaaacactgtgcgtaagattgatatctatgttcaatttgtta-tttagttttaat-acaactttgctcattttggac-t 541  Q
    |||||||||||||| || |  |||||||     ||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| |||||| |  ||||  ||| |||||||| |    
T  28126213 atatagttcatgttctacagaaaaacac----ggtaagattgatatctatgaacaatttgttattttagctttaatcatgacttcactctttttggactt 28126118  T
Q  542 aaatatgaccatctcatactagt 564  Q
    | ||||||||||||||| |||||    
T  28126117 atatatgaccatctcatgctagt 28126095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 17 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 28126626 - 28126382
Alignment:
Q  17 atatgcttctggccttccattagcgatagaagtagtgggttctaacttgtttggaaagagtattgcagaatgtgagtctacattagataagtatggaaga 116  Q
    ||||||||| |||||||| ||||  |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| || | ||||||  ||  ||||||||||   |||| ||      
T  28126626 atatgcttcaggccttcccttagttatagaaatagtgggttccaacttatttggaaagagcatagaagaatggaagggtacattagatggatatgaaaag 28126527  T
Q  117 attccacataaagatatccaaaagatacttagactcagctatgatgctttggaagaagaggagcagagtgtctttttggatattgcttgttgcatcaaag 216  Q
    |||||| ||||| | |||||| ||||| ||| ||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| | ||||| ||||| ||| ||||||    
T  28126526 attccaaataaaaagatccaagagatatttaaactaagctatgatgctttggaggaagatgagcaaagtgtctttctcgatatagcttgctgcttcaaag 28126427  T
Q  217 gatgtagattggagaaagtcaaacagatacttcatgctcattatg 261  Q
    | | |||||||    | ||  || |||||||||||||||||||||    
T  28126426 ggtatagattgacagaggttgaaaagatacttcatgctcattatg 28126382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 42 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 28132427 - 28132212
Alignment:
Q  42 atagaagtagtgggttctaacttgtttggaaagagtattgcagaatgtgagtctacattagataagtatggaagaattccacataaagatatccaaaaga 141  Q
    |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| || | ||||||  ||| ||||||||||   |||| ||  |||||  ||||| | |||||  |||    
T  28132427 atagaaatagtgggttcaaacttatttggaaagagcatagaagaatggaagtgtacattagatggatatgaaaagattcctaataaaaagatccatgaga 28132328  T
Q  142 tacttagactcagctatgatgctttggaagaagaggagcagagtgtctttttggatattgcttgttgcatcaaaggatgtagattggagaaagtcaaaca 241  Q
    || ||| | | || || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||| |||| || | |||||||   |  ||| || |    
T  28132327 tatttaaagtaagttacgatgctttggaggaagaggagcaaagtgtctttctggatatagcttgttgcttcaaggggtatagattgacaatggtcgaaga 28132228  T
Q  242 gatacttcatgctcat 257  Q
    ||||||||||||||||    
T  28132227 gatacttcatgctcat 28132212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 348 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 5922101 - 5921980
Alignment:
Q  348 acattacatgaattgatagaggtcatgggtaaagaagtcgtccgacaagaatcacctaaagagcctggagaaagaagcaggttatggtctcaagatgata 447  Q
    |||||||||||  ||||||||| |||||| |||||| | ||  ||||||||||||| |||||||||||| |  | || ||||||||||  |  || ||||    
T  5922101 acattacatgatgtgatagaggacatgggaaaagaaattgttagacaagaatcaccgaaagagcctggaaagcgcagtaggttatggtgccctgaagata 5922002  T
Q  448 tagttcatgttttaaaagaaaa 469  Q
    ||||||| |||||| |||||||    
T  5922001 tagttcaagttttagaagaaaa 5921980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 153 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 5922284 - 5922218
Alignment:
Q  153 agctatgatgctttggaagaagaggagcagagtgtctttttggatattgcttgttgcatcaaaggat 219  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||| | ||||| ||| | ||||||||||||||| |||||||||    
T  5922284 agctttgatgctttggaagaagaagagaaaagtgtttttcttgatattgcttgttgcttcaaaggat 5922218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 345 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 28132124 - 28132012
Alignment:
Q  345 gtgacattacatgaattgatagaggtcatgggtaaagaagtcgtccgacaagaatcacctaaagagcctggagaaagaagcaggttatggtctcaagatg 444  Q
    |||||||||||||| |||||||| | ||  ||||||||| ||||||   |||||||   ||| || ||||||||| | || |||||||||| |||  |||    
T  28132124 gtgacattacatgacttgatagaagacacaggtaaagaaatcgtccataaagaatcgtgtaaggaacctggagaacgcagtaggttatggtgtcacaatg 28132025  T
Q  445 atatagttcatgt 457  Q
    |||||||||||||    
T  28132024 atatagttcatgt 28132012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0277 (Bit Score: 157; Significance: 3e-83; HSPs: 4)
Name: scaffold0277
Description:

Target: scaffold0277; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 346 - 566
Target Start/End: Complemental strand, 3331 - 3111
Alignment:
Q  346 tgacattacatgaattgatagaggtcatgggtaaagaagtcgtccgacaagaatcacctaaagagcctggagaaagaagcaggttatggtctcaagatga 445  Q
    ||||| ||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || ||||||| | |||||||    
T  3331 tgacactacatgacttgataaaggacatgggtaaagaagtcgtccgacaagaatcgcccaaagagcctggagaaagaagtagattatggtgtgaagatga 3232  T
Q  446 tatagttcatgttttaaaagaaaacactgtgcgtaagattgatatctatgttcaatttgttatttagttttaatacaactttgctcattttggactaaat 545  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||| |||||||||||||    
T  3231 tatagttaatgttttaaaagaaaacactgtgagtaagattgatatctatgttcaatttgttatttagttttgatatgactttgctctttttggactaaat 3132  T
Q  546 atgaccatctcatactagtat 566  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  3131 atgaccatctcatactagtat 3111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0277; HSP #2
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 346 - 566
Target Start/End: Complemental strand, 12294 - 12074
Alignment:
Q  346 tgacattacatgaattgatagaggtcatgggtaaagaagtcgtccgacaagaatcacctaaagagcctggagaaagaagcaggttatggtctcaagatga 445  Q
    ||||| ||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || ||||||| | |||||||    
T  12294 tgacactacatgacttgataaaggacatgggtaaagaagtcgtccgacaagaatcgcccaaagagcctggagaaagaagtagattatggtgtgaagatga 12195  T
Q  446 tatagttcatgttttaaaagaaaacactgtgcgtaagattgatatctatgttcaatttgttatttagttttaatacaactttgctcattttggactaaat 545  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||| |||||||||||||    
T  12194 tatagttaatgttttaaaagaaaacactgtgagtaagattgatatctatgttcaatttgttatttagttttgatatgactttgctctttttggactaaat 12095  T
Q  546 atgaccatctcatactagtat 566  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  12094 atgaccatctcatactagtat 12074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0277; HSP #3
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 17 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 3663 - 3450
Alignment:
Q  17 atatgcttctggccttccattagcgatagaagtagtgggttctaacttgtttggaaagagtattgcagaatgtgagtctacattagataagtatggaaga 116  Q
    ||||||||| |||||||| ||||   ||||| |||||||||| ||||||||||||||||  || | ||||||  ||  ||||||||||   |||| ||      
T  3663 atatgcttcgggccttcccttagttttagaaatagtgggttccaacttgtttggaaagacgatagaagaatggaagggtacattagatggatatgaaaag 3564  T
Q  117 attccacataaagatatccaaaagatacttagactcagctatgatgctttggaagaagaggagcagagtgtctttttggatattgcttgttgcatcaaag 216  Q
    |||||  ||||| | |||||  ||||||||| | | ||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| ||| | || ||||| |||||| ||||||    
T  3563 attcccaataaaaagatccaccagatacttaaagtaagctatgatgctttggaggaagagcagcaaagtgtttttctagacattgcctgttgcttcaaag 3464  T
Q  217 gatgtagattggag 230  Q
    ||||| ||| ||||    
T  3463 gatgtggatgggag 3450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0277; HSP #4
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 17 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 12626 - 12422
Alignment:
Q  17 atatgcttctggccttccattagcgatagaagtagtgggttctaacttgtttggaaagagtattgcagaatgtgagtctacattagataagtatggaaga 116  Q
    ||||||||| |||||||| ||||   ||||| |||||||||| ||||||||||||||||  || | ||||||  ||  ||||||||||   |||| ||      
T  12626 atatgcttcgggccttcccttagttttagaaatagtgggttccaacttgtttggaaagacgatagaagaatggaagggtacattagatggatatgaaaag 12527  T
Q  117 attccacataaagatatccaaaagatacttagactcagctatgatgctttggaagaagaggagcagagtgtctttttggatattgcttgttgcatcaaag 216  Q
    |||||  ||||| | |||||  ||||||||| | | ||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| ||| | || ||||| |||||| ||||||    
T  12526 attcccaataaaaagatccacgagatacttaaagtaagctatgatgctttggaggaagagcagcaaagtgtttttctagacattgcctgttgcttcaaag 12427  T
Q  217 gatgt 221  Q
    |||||    
T  12426 gatgt 12422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0349 (Bit Score: 134; Significance: 2e-69; HSPs: 2)
Name: scaffold0349
Description:

Target: scaffold0349; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 351 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 2162 - 1957
Alignment:
Q  351 ttacatgaattgatagaggtcatgggtaaagaagtcgtccgacaagaatcacctaaagagcctggagaaagaagcaggttatggtctcaagatgatatag 450  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| ||||||||||    
T  2162 ttacatgacttgatagaggacatgggtaaagaagtcgtccgacaagaatcaattaaagagcctggagaaagaagtaggttatgctgtcaggatgatatag 2063  T
Q  451 ttcatgttttaaaagaaaacactgtgcgtaagattgatatctatgttcaatttgttatttagttttaatacaactttgctcattttg-gactaaatatga 549  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  2062 ttcgtgttttaagagaaaacactgtgagtaagattgatatctatgatcattttgttatttagttttaatacaactttgctctttttgtaactaaatatga 1963  T
Q  550 ccatct 555  Q
     |||||    
T  1962 tcatct 1957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0349; HSP #2
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 17 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 2490 - 2285
Alignment:
Q  17 atatgcttctggccttccattagcgatagaagtagtgggttctaacttgtttggaaagagtattgcagaatgtgagtctacattagataagtatggaaga 116  Q
    |||||||||||||||||| ||||  |||||| |||||||||||||||| | ||||||||  || |  |||||  ||  ||||||||||  |||||  ||     
T  2490 atatgcttctggccttccgttagttatagaaatagtgggttctaacttatctggaaagaacatagaggaatggaagaatacattagatgggtatgacagg 2391  T
Q  117 attccacataaagatatccaaaagatacttagactcagctatgatgctttggaagaagaggagcagagtgtctttttggatattgcttgttgcatcaaag 216  Q
    |||||  ||||||| |||||||||||||||| | | || |||||||||||||| |||||| |||| ||||||||| | || |||||||||||| |||||     
T  2390 attcccaataaagagatccaaaagatacttaaagtaagttatgatgctttggaggaagagcagcaaagtgtctttctagacattgcttgttgcttcaaaa 2291  T
Q  217 gatgta 222  Q
    ||||||    
T  2290 gatgta 2285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 126; Significance: 1e-64; HSPs: 3)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 354 - 563
Target Start/End: Complemental strand, 29272458 - 29272249
Alignment:
Q  354 catgaattgatagaggtcatgggtaaagaagtcgtccgacaagaatcacctaaagagcctggagaaagaagcaggttatggtctcaagatgatatagttc 453  Q
    ||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||| |  || |||||| ||||||    
T  29272458 catgatttgataggggacatgggtaaagaagtcgtccgacaagaatcaattaaagagcctggagaaagaagtaggttatgctgccaggatgatctagttc 29272359  T
Q  454 atgttttaaaagaaaacactgtgcgtaagattgatatctatgttcaatttgttatttagttttaatacaactttgctcattttggactaaatatgaccat 553  Q
     |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| | |||    
T  29272358 gtgttttaagagaaaacactgtgagtaagattgatatctatgatcattttgttatttagttttaatacgactttgctctttttggactaaatattatcat 29272259  T
Q  554 ctcatactag 563  Q
    || |||||||    
T  29272258 ctgatactag 29272249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 17 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 29272789 - 29272589
Alignment:
Q  17 atatgcttctggccttccattagcgatagaagtagtgggttctaacttgtttggaaagagtattgcagaatgtgagtctacattagataagtatggaaga 116  Q
    ||||||||| |||||||| ||||   ||||| |||||||||| ||||||||||||||||| || | ||||||  ||  ||||||||||   |||| ||      
T  29272789 atatgcttcgggccttcccttagttttagaaatagtgggttccaacttgtttggaaagaggatagaagaatggaagggtacattagatggatatgaaaag 29272690  T
Q  117 attccacataaagatatccaaaagatacttagactcagctatgatgctttggaagaagaggagcagagtgtctttttggatattgcttgttgcatcaaag 216  Q
    |||||  |||||   |||||  ||||||||| | | || ||||||||||||||||||||| | || ||||||||| |||| |||||||||||| ||||||    
T  29272689 attcccaataaaaggatccaccagatacttaaagtaagttatgatgctttggaagaagagcaacaaagtgtctttctggacattgcttgttgcttcaaag 29272590  T
Q  217 g 217  Q
    |    
T  29272589 g 29272589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 345 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 16371763 - 16371673
Alignment:
Q  345 gtgacattacatgaattgatagaggtcatgggtaaagaagtcgtccgacaagaatcacctaaagagcctggagaaagaagcaggttatggt 435  Q
    |||||||||||| |  || |||| | ||||||||||||| | ||||||||||||||||| || ||||| || ||| | || ||||||||||    
T  16371763 gtgacattacataacctggtagaagacatgggtaaagaaattgtccgacaagaatcaccaaaggagccaggcgaacgtagtaggttatggt 16371673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 84; Significance: 1e-39; HSPs: 2)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 18 - 261
Target Start/End: Original strand, 60801 - 61044
Alignment:
Q  18 tatgcttctggccttccattagcgatagaagtagtgggttctaacttgtttggaaagagtattgcagaatgtgagtctacattagataagtatggaagaa 117  Q
    |||||||||||||||||  |||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||  || | ||||||  ||  ||||||||||  ||||| ||  |    
T  60801 tatgcttctggccttccggtagttatagaaatagtgggttctaacttgtttggaaagaacatagaagaatgcaagaatacattagattggtatgaaaaga 60900  T
Q  118 ttccacataaagatatccaaaagatacttagactcagctatgatgctttggaagaagaggagcagagtgtctttttggatattgcttgttgcatcaaagg 217  Q
    ||||  ||||||| |||||||  ||||||| | | ||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| | || |||||||||||| |||||||    
T  60901 ttcccaataaagagatccaaagaatacttaaagtgagctatgattctttggaggaagaggagcaaagtgtctttctagacattgcttgttgcttcaaagg 61000  T
Q  218 atgtagattggagaaagtcaaacagatacttcatgctcattatg 261  Q
     |||| || ||| || |||||| | |||||||||||||||||||    
T  61001 ttgtaaatgggaaaaggtcaaagaaatacttcatgctcattatg 61044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 349 - 539
Target Start/End: Original strand, 61123 - 61314
Alignment:
Q  349 cattacatgaattgatagaggtcatgggtaaagaagtcgtccgacaagaatcacctaaagagcctggagaaagaagcaggttatggtctcaagatgatat 448  Q
    |||||||| | |||||||||  ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||| | || | |||||    
T  61123 cattacataacttgatagagaacatgggtaaagaactcgtccgactagaatcaccttttgagcctggaaaaagaagcaggttatggtttgaaaaggatat 61222  T
Q  449 agttcatgttttaaaagaaaacactgtgcgtaagattgatatctatgttcaatttgttatttag-ttttaatacaactttgctcattttgga 539  Q
    | || | ||| || |||||||||||||| |||||||||||||  | |  ||||||||||||||| |||||| |  ||||||||| |||||||    
T  61223 atttgaagttctagaagaaaacactgtgagtaagattgatatgcaggaacaatttgttatttagcttttaacatgactttgctctttttgga 61314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 74; Significance: 1e-33; HSPs: 3)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 17 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 17992166 - 17991865
Alignment:
Q  17 atatgcttctggccttccattagcgatagaagtagtgggttctaacttgtttggaaagagtattgcagaatgtgagtctacattagataagtatggaaga 116  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| || | ||||| ||  | | | |||| |||||||||| |||     
T  17992166 atatgctgctggcctcccattagctttagaagtagtgggttccaacttgtttggaaagtgtttagcagattggaaatgtgcattggataagtatgaaagg 17992067  T
Q  117 attccacataaagatatccaaaagatacttagactcagctatgatgctttggaagaagaggagcagagtgtctttttggatattgcttgttgcatcaaag 216  Q
    || |||| | ||||||||||||| ||||| | | | |||| ||||||| |||| |||||  |  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17992066 ataccacctgaagatatccaaaatatactaaaaataagctttgatgctctggatgaagaacaaaagagtgtctttttggatattgcttgttgcttcaaag 17991967  T
Q  217 gatgtagattggagaaagtcaaacagatacttcatgctcattatgattattccatagaaagccacattggagtgttggttgataagtctctcataaatat 316  Q
        |  |||||   | ||| || | || ||||||| |||||||| | ||| |||| |||||||| | | ||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  17991966 agcatgtattggcatatgtcgaagaaatgcttcatggtcattatggtcattgcataaaaagccacctcgaagtgttggttgataaatctctcataaagat 17991867  T
Q  317 ta 318  Q
    ||    
T  17991866 ta 17991865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 352 - 461
Target Start/End: Complemental strand, 17991822 - 17991713
Alignment:
Q  352 tacatgaattgatagaggtcatgggtaaagaagtcgtccgacaagaatcacctaaagagcctggagaaagaagcaggttatggtctcaagatgatatagt 451  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||| | || || || |||| | |  |||| |||||    
T  17991822 tacatgacttgatagaggacatgggtaaagaaatcgttcggcaagaatcacctaaagagcctggagaacggagtagattgtggtgttataatgacatagt 17991723  T
Q  452 tcatgtttta 461  Q
    ||||||||||    
T  17991722 tcatgtttta 17991713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 18 - 75
Target Start/End: Original strand, 3280891 - 3280948
Alignment:
Q  18 tatgcttctggccttccattagcgatagaagtagtgggttctaacttgtttggaaaga 75  Q
    |||||||||||||||||||| ||  |||||||| | ||||| ||||||||||||||||    
T  3280891 tatgcttctggccttccattggcattagaagtattaggttccaacttgtttggaaaga 3280948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 18 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 57244 - 57087
Alignment:
Q  18 tatgcttctggccttccattagcgatagaagtagtgggttctaacttgtttggaaagagtattgcagaatgtgagtctacattagataagtatggaagaa 117  Q
    |||||||| ||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| | ||||||  | ||| ||||| || |||||| ||| |    
T  57244 tatgcttcaggccttccattggccttagaagtagtgggttcgaacttgtttggaaagaatataggagaatggaaatctgcattaaatcagtatgaaagga 57145  T
Q  118 ttccacataaagatatccaaaagatacttagactcagctatgatgctttggaagaaga 175  Q
    ||||   |||| | |||||| ||||||||| | | |||| |||||||||||| |||||    
T  57144 ttcccattaaaaagatccaagagatacttaaagtaagctttgatgctttggaggaaga 57087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 48; Significance: 4e-18; HSPs: 3)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 18 - 209
Target Start/End: Original strand, 40751 - 40938
Alignment:
Q  18 tatgcttctggccttccattagcgatagaagtagtgggttctaacttgtttgga-aagagtattgcagaatgtgagtctacattagataagtatggaaga 116  Q
    |||||||||||||| ||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||||||  ||| ||| | |||||| || || ||||||||  |||||| |||     
T  40751 tatgcttctggcctaccattagctttagaagtagttggttccaacttgtttggattaga-tataggagaatgggaatccacattagaccagtatgaaagg 40849  T
Q  117 attccacataaagatatccaaaagatacttagactcagctatgatgctttggaagaagaggagcagagtgtctttttggatattgcttgttgc 209  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||     || | ||||||||||||  |||| ||||| ||||| ||| | || ||||||||||||    
T  40850 attccaaataaagagatccaaaagatactta----aagttttgatgctttggagaaagatgagcaaagtgtttttctcgacattgcttgttgc 40938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 18 - 219
Target Start/End: Original strand, 44189 - 44390
Alignment:
Q  18 tatgcttctggccttccattagcgatagaagtagtgggttctaacttgtttggaaagagtattgcagaatgtgagtctacattagataagtatggaagaa 117  Q
    |||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| ||||| |||||||| | ||| | ||||||  | ||| ||||||||  |||| |||| |    
T  44189 tatgcttctggccttccattggctttagaagtagtgggttcaaacttatttggaaataatataggagaatggaaatctgcattagatcggtatagaagga 44288  T
Q  118 ttccacataaagatatccaaaagatacttagactcagctatgatgctttggaagaagaggagcagagtgtctttttggatattgcttgttgcatcaaagg 217  Q
    ||||   |||| | || ||  ||||||||| | | |||| ||||||||||||  |||| ||||||| ||| ||| | || |||||||| ||| |||||||    
T  44289 ttccgattaaaaagatacaggagatacttaaagtaagctttgatgctttggagaaagatgagcagaatgtttttctcgacattgcttgctgcttcaaagg 44388  T
Q  218 at 219  Q
    ||    
T  44389 at 44390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 43 - 88
Target Start/End: Original strand, 28707 - 28752
Alignment:
Q  43 tagaagtagtgggttctaacttgtttggaaagagtattgcagaatg 88  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||||||    
T  28707 tagaagtagtgggttcaaacttgtttgggaagaatattgaagaatg 28752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000004; HSPs: 2)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 18 - 88
Target Start/End: Original strand, 16692099 - 16692169
Alignment:
Q  18 tatgcttctggccttccattagcgatagaagtagtgggttctaacttgtttggaaagagtattgcagaatg 88  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||| || ||||||||||||||||||| ||| | ||||||    
T  16692099 tatgcttctggccttccattagctttagaagtagtaggatctaacttgtttggaaagaatatagaagaatg 16692169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 345 - 469
Target Start/End: Original strand, 16692414 - 16692538
Alignment:
Q  345 gtgacattacatgaattgatagaggtcatgggtaaagaagtcgtccgacaagaatcacctaaagagcctggagaaagaagcaggttatggtctcaagatg 444  Q
    |||||||| ||| | ||||| |||| ||||||||||||| | |||||| ||||||| || ||| | |||||  || | || ||||| |||| ||| || |    
T  16692414 gtgacattgcatcacttgattgaggacatgggtaaagaaattgtccgaaaagaatccccaaaacatcctggtaaacgcagtaggttgtggtttcacgaag 16692513  T
Q  445 atatagttcatgttttaaaagaaaa 469  Q
    |||||||||| |||||| |||||||    
T  16692514 atatagttcaagttttagaagaaaa 16692538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University