View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF17850_low_7 (Length: 201)

Name: NF17850_low_7
Description: NF17850
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF17850_low_7
NF17850_low_7
[»] chr7 (62 HSPs)
chr7 (24-201)||(1085593-1085771)
chr7 (34-201)||(7517583-7517751)
chr7 (46-201)||(37533011-37533165)
chr7 (46-201)||(40094774-40094929)
chr7 (35-201)||(45433244-45433411)
chr7 (24-201)||(47129098-47129275)
chr7 (34-201)||(22567026-22567193)
chr7 (46-201)||(6054563-6054718)
chr7 (46-201)||(30244273-30244428)
chr7 (24-201)||(30245080-30245254)
chr7 (24-201)||(37533341-37533519)
chr7 (46-198)||(23377-23529)
chr7 (23-198)||(34218010-34218186)
chr7 (46-197)||(11845198-11845349)
chr7 (25-201)||(36622963-36623140)
chr7 (46-201)||(45434639-45434794)
chr7 (56-196)||(19122740-19122879)
chr7 (49-201)||(29157568-29157720)
chr7 (57-201)||(45754719-45754862)
chr7 (46-201)||(24177438-24177593)
chr7 (75-201)||(7554028-7554154)
chr7 (46-199)||(30032572-30032725)
chr7 (49-201)||(20599317-20599471)
chr7 (54-201)||(36939741-36939888)
chr7 (48-201)||(9901648-9901799)
chr7 (97-201)||(22566713-22566817)
chr7 (37-201)||(118290-118456)
chr7 (84-201)||(16569199-16569316)
chr7 (84-201)||(16596346-16596463)
chr7 (69-201)||(24838724-24838857)
chr7 (49-201)||(14681513-14681663)
chr7 (26-162)||(30253534-30253667)
chr7 (46-201)||(8128441-8128596)
chr7 (50-201)||(40230295-40230446)
chr7 (24-123)||(47129450-47129549)
chr7 (78-201)||(1085280-1085404)
chr7 (52-201)||(41910592-41910749)
chr7 (36-156)||(28300242-28300364)
chr7 (48-143)||(37167842-37167937)
chr7 (46-201)||(41854638-41854792)
chr7 (116-201)||(28301613-28301698)
chr7 (138-201)||(30244704-30244767)
chr7 (138-201)||(36109009-36109072)
chr7 (83-201)||(43241498-43241616)
chr7 (25-116)||(37532729-37532821)
chr7 (47-121)||(28300569-28300644)
chr7 (138-201)||(30245497-30245560)
chr7 (138-201)||(30255342-30255405)
chr7 (55-201)||(36534795-36534939)
chr7 (23-102)||(30244454-30244534)
chr7 (23-102)||(30253672-30253752)
chr7 (141-201)||(36967325-36967384)
chr7 (99-199)||(44361517-44361616)
chr7 (86-136)||(21416181-21416231)
chr7 (57-138)||(40094424-40094505)
chr7 (86-162)||(4124128-4124204)
chr7 (87-135)||(23569043-23569091)
chr7 (46-102)||(30245257-30245313)
chr7 (46-134)||(37393128-37393216)
chr7 (158-201)||(40094506-40094549)
chr7 (34-94)||(7517767-7517828)
chr7 (34-94)||(7518033-7518094)
[»] chr4 (84 HSPs)
chr4 (37-201)||(25483339-25483504)
chr4 (47-201)||(36629240-36629394)
chr4 (24-195)||(44620362-44620531)
chr4 (31-201)||(39792842-39793013)
chr4 (47-198)||(1731646-1731797)
chr4 (46-201)||(41370360-41370515)
chr4 (46-201)||(50002429-50002584)
chr4 (34-201)||(39404021-39404189)
chr4 (34-197)||(50630740-50630904)
chr4 (47-201)||(34646648-34646802)
chr4 (47-201)||(39404401-39404555)
chr4 (44-201)||(3340810-3340967)
chr4 (37-201)||(54017583-54017748)
chr4 (53-201)||(32941128-32941276)
chr4 (24-195)||(44621011-44621180)
chr4 (46-201)||(10245923-10246077)
chr4 (46-201)||(55933122-55933277)
chr4 (26-201)||(44620663-44620838)
chr4 (46-201)||(36608659-36608814)
chr4 (24-201)||(22027936-22028114)
chr4 (47-201)||(50459724-50459878)
chr4 (46-198)||(20825842-20825994)
chr4 (46-181)||(18932747-18932882)
chr4 (46-201)||(36572022-36572177)
chr4 (47-201)||(16889535-16889689)
chr4 (56-201)||(52884698-52884844)
chr4 (46-194)||(54343006-54343147)
chr4 (56-189)||(54108928-54109060)
chr4 (45-201)||(16888813-16888969)
chr4 (46-201)||(22183262-22183417)
chr4 (45-201)||(49302907-49303065)
chr4 (67-201)||(4955336-4955470)
chr4 (46-201)||(22028367-22028524)
chr4 (24-201)||(49076807-49076983)
chr4 (45-201)||(3244448-3244604)
chr4 (86-201)||(41707503-41707617)
chr4 (24-150)||(23817654-23817783)
chr4 (75-189)||(45496820-45496934)
chr4 (56-201)||(52884890-52885038)
chr4 (46-182)||(54936218-54936353)
chr4 (46-201)||(3341131-3341286)
chr4 (51-198)||(20826223-20826370)
chr4 (46-152)||(43827492-43827597)
chr4 (67-201)||(49880163-49880296)
chr4 (49-198)||(51768061-51768210)
chr4 (46-201)||(54108541-54108694)
chr4 (49-201)||(4390102-4390254)
chr4 (47-201)||(45489331-45489484)
chr4 (34-201)||(2740703-2740869)
chr4 (34-201)||(43174509-43174677)
chr4 (23-201)||(34004559-34004736)
chr4 (86-201)||(54741216-54741331)
chr4 (97-201)||(2741074-2741178)
chr4 (52-153)||(31691203-31691306)
chr4 (46-186)||(3271802-3271947)
chr4 (81-198)||(6975489-6975606)
chr4 (72-201)||(23556890-23557019)
chr4 (46-178)||(48111696-48111828)
chr4 (46-201)||(49076449-49076601)
chr4 (49-201)||(3700368-3700512)
chr4 (48-156)||(18879854-18879962)
chr4 (58-201)||(19504708-19504842)
chr4 (86-201)||(28034232-28034347)
chr4 (115-193)||(10246358-10246436)
chr4 (64-201)||(40067046-40067184)
chr4 (97-191)||(54017751-54017845)
chr4 (24-201)||(34544107-34544286)
chr4 (43-199)||(760194-760348)
chr4 (137-201)||(44621429-44621493)
chr4 (67-190)||(15841387-15841510)
chr4 (137-196)||(44620304-44620363)
chr4 (37-91)||(23817444-23817498)
chr4 (50-124)||(41370738-41370812)
chr4 (46-112)||(43174233-43174299)
chr4 (158-201)||(45050604-45050647)
chr4 (86-136)||(11197294-11197344)
chr4 (137-201)||(44620947-44621012)
chr4 (46-198)||(45489712-45489864)
chr4 (152-201)||(50788087-50788136)
chr4 (31-90)||(11702281-11702341)
chr4 (55-94)||(19895406-19895445)
chr4 (24-118)||(39698919-39699014)
chr4 (97-138)||(1868117-1868158)
chr4 (88-132)||(11706584-11706628)
[»] chr3 (76 HSPs)
chr3 (24-201)||(15772857-15773035)
chr3 (48-201)||(43346793-43346946)
chr3 (24-201)||(37990953-37991132)
chr3 (46-201)||(37990639-37990794)
chr3 (46-201)||(22304572-22304727)
chr3 (46-201)||(29644902-29645057)
chr3 (46-201)||(35946525-35946680)
chr3 (23-201)||(15773195-15773376)
chr3 (36-201)||(42342377-42342543)
chr3 (46-201)||(29644581-29644736)
chr3 (23-201)||(32589707-32589885)
chr3 (37-201)||(54017806-54017971)
chr3 (46-201)||(54018198-54018353)
chr3 (54-195)||(39934963-39935104)
chr3 (48-201)||(42342092-42342245)
chr3 (46-201)||(21832345-21832498)
chr3 (46-198)||(33803252-33803404)
chr3 (46-201)||(12114562-12114717)
chr3 (49-201)||(32462903-32463056)
chr3 (46-201)||(25739425-25739580)
chr3 (46-201)||(52634679-52634833)
chr3 (46-201)||(53577367-53577522)
chr3 (44-201)||(45901716-45901874)
chr3 (46-182)||(41359765-41359901)
chr3 (46-201)||(25755397-25755552)
chr3 (45-201)||(31190020-31190168)
chr3 (67-201)||(4823658-4823792)
chr3 (55-201)||(39389073-39389219)
chr3 (72-197)||(3135099-3135224)
chr3 (54-201)||(22303963-22304103)
chr3 (44-201)||(8327907-8328068)
chr3 (57-201)||(39914255-39914399)
chr3 (49-201)||(45395656-45395808)
chr3 (23-201)||(32462535-32462714)
chr3 (34-201)||(33175646-33175819)
chr3 (35-201)||(53117964-53118129)
chr3 (25-201)||(3135432-3135616)
chr3 (46-201)||(50612447-50612607)
chr3 (35-201)||(51886564-51886724)
chr3 (34-201)||(1634302-1634470)
chr3 (54-201)||(49336694-49336842)
chr3 (46-201)||(44160547-44160699)
chr3 (47-201)||(11661954-11662108)
chr3 (49-143)||(22303662-22303756)
chr3 (62-201)||(33362305-33362451)
chr3 (46-201)||(37726507-37726654)
chr3 (24-201)||(39336208-39336384)
chr3 (46-120)||(41359491-41359565)
chr3 (88-194)||(42584864-42584970)
chr3 (97-154)||(52634990-52635047)
chr3 (97-197)||(3384317-3384417)
chr3 (53-201)||(9240152-9240300)
chr3 (46-134)||(54017548-54017636)
chr3 (76-162)||(39336000-39336086)
chr3 (112-201)||(7767380-7767469)
chr3 (46-95)||(22304302-22304351)
chr3 (72-201)||(47964544-47964673)
chr3 (149-201)||(22304249-22304301)
chr3 (138-201)||(11661538-11661601)
chr3 (92-138)||(16871005-16871051)
chr3 (47-100)||(8328374-8328427)
chr3 (148-201)||(43346653-43346706)
chr3 (46-124)||(43978865-43978947)
chr3 (97-201)||(46546376-46546480)
chr3 (46-201)||(47964915-47965070)
chr3 (72-141)||(25317221-25317290)
chr3 (98-138)||(17735043-17735083)
chr3 (98-138)||(19036312-19036352)
chr3 (24-77)||(9239940-9239994)
chr3 (92-138)||(17731950-17731996)
chr3 (92-138)||(19033181-19033227)
chr3 (86-136)||(53596028-53596078)
chr3 (86-136)||(53596343-53596393)
chr3 (1-37)||(3134996-3135032)
chr3 (92-136)||(16143506-16143550)
chr3 (105-201)||(25991406-25991502)
[»] chr2 (65 HSPs)
chr2 (24-201)||(6421388-6421566)
chr2 (46-201)||(36178605-36178760)
chr2 (46-201)||(37105927-37106082)
chr2 (46-201)||(41283475-41283630)
chr2 (52-201)||(15880266-15880415)
chr2 (48-201)||(37106191-37106344)
chr2 (46-201)||(14745667-14745822)
chr2 (24-201)||(5542602-5542780)
chr2 (49-201)||(962601-962753)
chr2 (37-197)||(15511486-15511646)
chr2 (24-201)||(5542975-5543153)
chr2 (23-182)||(36178147-36178307)
chr2 (24-201)||(42514652-42514830)
chr2 (46-201)||(6712979-6713135)
chr2 (53-201)||(36005887-36006034)
chr2 (22-188)||(6422126-6422293)
chr2 (48-199)||(33731653-33731804)
chr2 (46-196)||(29676543-29676687)
chr2 (46-201)||(35580724-35580878)
chr2 (23-191)||(23346250-23346418)
chr2 (49-198)||(40679632-40679781)
chr2 (34-201)||(37632586-37632752)
chr2 (24-201)||(1769895-1770073)
chr2 (24-201)||(7598231-7598409)
chr2 (67-200)||(28254260-28254391)
chr2 (47-201)||(38796619-38796775)
chr2 (46-201)||(40733886-40734040)
chr2 (47-199)||(29676908-29677065)
chr2 (24-193)||(40163349-40163520)
chr2 (46-201)||(40733520-40733675)
chr2 (48-201)||(28531316-28531469)
chr2 (25-142)||(6421793-6421911)
chr2 (53-198)||(14745300-14745446)
chr2 (97-201)||(16542452-16542556)
chr2 (60-201)||(5367458-5367599)
chr2 (51-201)||(7598612-7598754)
chr2 (56-201)||(12529038-12529183)
chr2 (97-201)||(31468801-31468901)
chr2 (37-150)||(3673122-3673236)
chr2 (21-114)||(31899077-31899170)
chr2 (116-201)||(31899496-31899581)
chr2 (37-132)||(3672773-3672869)
chr2 (97-201)||(36178320-36178424)
chr2 (88-201)||(31259658-31259774)
chr2 (72-193)||(30313189-30313309)
chr2 (46-201)||(9231252-9231407)
chr2 (24-201)||(33561429-33561606)
chr2 (92-196)||(37895107-37895211)
chr2 (127-201)||(38796299-38796373)
chr2 (50-142)||(6421688-6421780)
chr2 (53-201)||(16590891-16591034)
chr2 (147-201)||(36785664-36785718)
chr2 (99-188)||(28254165-28254254)
chr2 (97-201)||(29874074-29874178)
chr2 (59-151)||(36784273-36784365)
chr2 (87-201)||(30323467-30323581)
chr2 (73-201)||(31385740-31385868)
chr2 (158-201)||(6421307-6421350)
chr2 (35-133)||(29873525-29873624)
chr2 (48-201)||(3594180-3594333)
chr2 (50-136)||(35580443-35580530)
chr2 (86-198)||(37894732-37894844)
chr2 (97-201)||(41678419-41678524)
chr2 (108-149)||(13091833-13091874)
chr2 (145-189)||(42515031-42515075)
[»] chr6 (45 HSPs)
chr6 (37-201)||(35210207-35210371)
chr6 (46-201)||(29518506-29518661)
chr6 (46-201)||(29518923-29519078)
chr6 (46-201)||(32741182-32741337)
chr6 (20-198)||(2843560-2843740)
chr6 (46-201)||(14748342-14748493)
chr6 (17-198)||(16454913-16455095)
chr6 (24-201)||(2579850-2580027)
chr6 (56-201)||(3409262-3409407)
chr6 (18-201)||(2578414-2578597)
chr6 (46-201)||(2377757-2377912)
chr6 (46-201)||(2378129-2378284)
chr6 (46-201)||(1846751-1846906)
chr6 (31-201)||(2578819-2578989)
chr6 (55-201)||(16107681-16107827)
chr6 (46-201)||(3058229-3058384)
chr6 (24-201)||(16454578-16454756)
chr6 (26-201)||(5832007-5832181)
chr6 (54-201)||(10074371-10074518)
chr6 (34-199)||(2579479-2579645)
chr6 (46-201)||(3409663-3409818)
chr6 (46-200)||(3415462-3415618)
chr6 (45-197)||(10073990-10074142)
chr6 (46-198)||(1127366-1127518)
chr6 (24-201)||(2579087-2579260)
chr6 (49-201)||(6999799-6999951)
chr6 (24-201)||(10073593-10073769)
chr6 (52-198)||(5958613-5958755)
chr6 (56-201)||(26544052-26544197)
chr6 (34-201)||(593694-593864)
chr6 (47-201)||(16108066-16108208)
chr6 (61-201)||(1950200-1950340)
chr6 (97-199)||(32460631-32460733)
chr6 (50-201)||(10911568-10911720)
chr6 (79-198)||(9062383-9062501)
chr6 (85-201)||(8481930-8482045)
chr6 (31-201)||(12071675-12071846)
chr6 (72-201)||(6071135-6071264)
chr6 (45-193)||(12092481-12092629)
chr6 (31-121)||(12085018-12085109)
chr6 (46-200)||(17135069-17135223)
chr6 (49-141)||(31714732-31714823)
chr6 (53-100)||(3409405-3409452)
chr6 (34-79)||(2975296-2975341)
chr6 (104-137)||(22605313-22605346)
[»] chr8 (74 HSPs)
chr8 (35-201)||(3670063-3670229)
chr8 (25-201)||(3669690-3669867)
chr8 (56-201)||(45122067-45122212)
chr8 (54-201)||(34834879-34835026)
chr8 (48-201)||(3038292-3038445)
chr8 (37-197)||(34835216-34835377)
chr8 (46-201)||(6876862-6877018)
chr8 (23-201)||(20870549-20870730)
chr8 (37-197)||(34835481-34835643)
chr8 (37-197)||(34835747-34835909)
chr8 (45-201)||(25561814-25561971)
chr8 (24-201)||(30441084-30441266)
chr8 (46-201)||(147454-147609)
chr8 (46-180)||(45122648-45122782)
chr8 (23-201)||(5915875-5916048)
chr8 (48-201)||(40518585-40518738)
chr8 (45-201)||(30359274-30359430)
chr8 (46-197)||(6651510-6651652)
chr8 (46-201)||(9309358-9309512)
chr8 (42-201)||(9608748-9608907)
chr8 (50-201)||(30359612-30359763)
chr8 (39-201)||(33113359-33113522)
chr8 (34-179)||(9483174-9483320)
chr8 (49-197)||(70277-70425)
chr8 (25-201)||(37544469-37544645)
chr8 (54-201)||(1014253-1014400)
chr8 (50-197)||(9482608-9482755)
chr8 (23-201)||(8918742-8918919)
chr8 (46-201)||(40518072-40518229)
chr8 (52-201)||(40579512-40579661)
chr8 (46-201)||(1513915-1514070)
chr8 (46-201)||(45121910-45122065)
chr8 (45-201)||(6731907-6732054)
chr8 (24-194)||(18371970-18372142)
chr8 (56-201)||(32640542-32640682)
chr8 (46-201)||(45123009-45123164)
chr8 (54-201)||(1013879-1014026)
chr8 (49-201)||(41972161-41972316)
chr8 (32-125)||(41129067-41129161)
chr8 (48-201)||(5420654-5420807)
chr8 (53-201)||(45121663-45121810)
chr8 (46-201)||(9308980-9309139)
chr8 (55-200)||(43398077-43398225)
chr8 (104-200)||(18372992-18373085)
chr8 (91-201)||(43274824-43274934)
chr8 (46-122)||(8919144-8919220)
chr8 (46-178)||(32305503-32305635)
chr8 (86-201)||(8794114-8794229)
chr8 (24-197)||(18371637-18371807)
chr8 (46-125)||(40579269-40579348)
chr8 (72-201)||(4154694-4154821)
chr8 (67-181)||(9609108-9609222)
chr8 (139-201)||(18372349-18372411)
chr8 (47-200)||(18380020-18380171)
chr8 (56-201)||(147832-147968)
chr8 (132-201)||(18372785-18372854)
chr8 (131-194)||(25561729-25561792)
chr8 (53-167)||(9507819-9507933)
chr8 (25-201)||(9620656-9620831)
chr8 (127-197)||(41416252-41416322)
chr8 (55-201)||(12283876-12284021)
chr8 (99-199)||(20130454-20130553)
chr8 (24-125)||(20995393-20995495)
chr8 (86-198)||(4154321-4154432)
chr8 (46-110)||(43274635-43274699)
chr8 (46-93)||(3037969-3038016)
chr8 (114-201)||(3037776-3037865)
chr8 (72-201)||(5274778-5274907)
chr8 (160-201)||(18372485-18372526)
chr8 (67-123)||(16524446-16524502)
chr8 (112-167)||(18373236-18373291)
chr8 (147-201)||(20995502-20995556)
chr8 (172-201)||(18645713-18645742)
chr8 (105-141)||(11442916-11442952)
[»] chr5 (63 HSPs)
chr5 (22-201)||(27502011-27502191)
chr5 (46-201)||(40296315-40296470)
chr5 (47-201)||(36492218-36492372)
chr5 (34-201)||(6500454-6500621)
chr5 (34-201)||(6500826-6500993)
chr5 (35-201)||(18603108-18603275)
chr5 (25-201)||(3294993-3295169)
chr5 (25-201)||(3295323-3295498)
chr5 (25-201)||(35150010-35150185)
chr5 (46-198)||(41170640-41170792)
chr5 (55-201)||(26074615-26074761)
chr5 (36-201)||(41632785-41632950)
chr5 (34-201)||(25327938-25328106)
chr5 (46-201)||(15370102-15370257)
chr5 (46-201)||(32487397-32487551)
chr5 (20-201)||(13415734-13415915)
chr5 (31-201)||(299492-299664)
chr5 (53-201)||(26075168-26075317)
chr5 (46-201)||(6224199-6224354)
chr5 (55-201)||(26074155-26074301)
chr5 (26-198)||(9498634-9498806)
chr5 (50-194)||(34753029-34753173)
chr5 (46-201)||(42405598-42405751)
chr5 (50-201)||(624199-624350)
chr5 (46-197)||(11416977-11417128)
chr5 (46-201)||(12662652-12662807)
chr5 (34-201)||(36568556-36568722)
chr5 (34-201)||(1028504-1028672)
chr5 (50-192)||(33747783-33747925)
chr5 (46-201)||(623821-623976)
chr5 (32-178)||(15370428-15370575)
chr5 (46-201)||(2411010-2411165)
chr5 (8-201)||(24489167-24489359)
chr5 (67-201)||(5723812-5723946)
chr5 (72-201)||(26074807-26074937)
chr5 (54-167)||(26590918-26591031)
chr5 (69-201)||(29549278-29549410)
chr5 (22-201)||(35914852-35915031)
chr5 (23-201)||(41635169-41635346)
chr5 (54-199)||(38427553-38427697)
chr5 (46-201)||(35167838-35167993)
chr5 (48-201)||(300962-301107)
chr5 (46-118)||(26900017-26900089)
chr5 (109-201)||(31509626-31509718)
chr5 (97-201)||(36521947-36522051)
chr5 (109-201)||(42508615-42508707)
chr5 (46-117)||(38427306-38427377)
chr5 (22-120)||(13785607-13785706)
chr5 (86-201)||(36522277-36522392)
chr5 (138-201)||(39309687-39309750)
chr5 (127-201)||(26074321-26074395)
chr5 (68-120)||(795254-795306)
chr5 (129-201)||(7768853-7768925)
chr5 (79-190)||(31509745-31509857)
chr5 (109-201)||(42524720-42524811)
chr5 (86-136)||(13042607-13042657)
chr5 (50-103)||(24489582-24489635)
chr5 (145-201)||(6225047-6225103)
chr5 (162-201)||(35150750-35150789)
chr5 (162-201)||(35151041-35151080)
chr5 (67-133)||(9498344-9498410)
chr5 (68-134)||(36527117-36527183)
chr5 (108-141)||(34103617-34103650)
[»] chr1 (62 HSPs)
chr1 (46-201)||(26661522-26661677)
chr1 (46-201)||(44290824-44290980)
chr1 (36-199)||(3537589-3537752)
chr1 (46-201)||(41156994-41157149)
chr1 (46-201)||(41142375-41142531)
chr1 (46-201)||(44290458-44290613)
chr1 (47-201)||(41157378-41157532)
chr1 (46-201)||(34649441-34649596)
chr1 (46-201)||(41759486-41759641)
chr1 (23-201)||(5319942-5320120)
chr1 (49-201)||(17294580-17294733)
chr1 (25-201)||(37850579-37850755)
chr1 (44-201)||(34364928-34365085)
chr1 (49-201)||(48588491-48588643)
chr1 (46-201)||(29798202-29798357)
chr1 (24-201)||(50052001-50052178)
chr1 (44-201)||(34364510-34364667)
chr1 (26-201)||(26661877-26662053)
chr1 (46-201)||(11977283-11977438)
chr1 (46-201)||(22077495-22077650)
chr1 (46-201)||(31767161-31767316)
chr1 (55-201)||(37556114-37556260)
chr1 (54-201)||(40082410-40082556)
chr1 (24-201)||(45084385-45084557)
chr1 (50-201)||(3550723-3550871)
chr1 (31-194)||(3875315-3875479)
chr1 (53-201)||(24600321-24600469)
chr1 (61-201)||(38804370-38804510)
chr1 (78-201)||(32594748-32594871)
chr1 (46-196)||(14318875-14319025)
chr1 (54-194)||(5528762-5528902)
chr1 (24-198)||(24131965-24132137)
chr1 (24-200)||(9955911-9956090)
chr1 (46-201)||(39066201-39066355)
chr1 (50-201)||(66476-66627)
chr1 (37-201)||(45493965-45494134)
chr1 (56-201)||(30630648-30630793)
chr1 (110-201)||(41184489-41184580)
chr1 (23-177)||(32168673-32168823)
chr1 (55-201)||(37555733-37555878)
chr1 (46-179)||(22077110-22077243)
chr1 (26-201)||(19283434-19283610)
chr1 (57-201)||(66100-66244)
chr1 (127-201)||(3537228-3537302)
chr1 (36-201)||(22077818-22077983)
chr1 (54-198)||(5575110-5575252)
chr1 (46-122)||(11977026-11977102)
chr1 (110-201)||(44685459-44685551)
chr1 (68-201)||(22793281-22793415)
chr1 (56-201)||(45839630-45839779)
chr1 (22-134)||(50051664-50051776)
chr1 (84-167)||(44043810-44043893)
chr1 (31-201)||(1188571-1188743)
chr1 (21-201)||(1187336-1187519)
chr1 (57-177)||(4956218-4956340)
chr1 (158-201)||(35154151-35154194)
chr1 (44-86)||(21378057-21378099)
chr1 (127-201)||(21378122-21378196)
chr1 (86-162)||(10351202-10351278)
chr1 (143-201)||(50469178-50469236)
chr1 (54-99)||(31767047-31767092)
chr1 (97-133)||(47380218-47380254)
[»] scaffold0702 (2 HSPs)
scaffold0702 (46-201)||(514-669)
scaffold0702 (46-201)||(147-297)
[»] scaffold0391 (3 HSPs)
scaffold0391 (50-201)||(1110-1261)
scaffold0391 (86-156)||(1731-1801)
scaffold0391 (153-199)||(3092-3138)
[»] scaffold0027 (1 HSPs)
scaffold0027 (46-201)||(47363-47518)
[»] scaffold0078 (2 HSPs)
scaffold0078 (53-201)||(4985-5133)
scaffold0078 (84-201)||(5360-5477)
[»] scaffold0734 (2 HSPs)
scaffold0734 (55-201)||(5399-5546)
scaffold0734 (55-201)||(5780-5931)
[»] scaffold0171 (1 HSPs)
scaffold0171 (109-201)||(17519-17611)
[»] scaffold0504 (1 HSPs)
scaffold0504 (127-201)||(10192-10266)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (72-201)||(39460-39588)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 119; Significance: 5e-61; HSPs: 62)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 24 - 201
Target Start/End: Original strand, 1085593 - 1085771
Alignment:
Q  24 tgttggatcatgaggggagccagggg-accgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggca 122  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||    
T  1085593 tgttgggtcatgaggggagccagggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagtaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggca 1085692  T
Q  123 atgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    ||| |||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1085693 atgggtttatgggtcctcttacttataaagtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacactt 1085771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 109; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 34 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 7517751 - 7517583
Alignment:
Q  34 tgaggggagcca-ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttat 132  Q
    |||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||  ||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  7517751 tgaggggagccaaggggaccacccacatcgaggctagaacaaccacacaagtgagacagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttat 7517652  T
Q  133 gggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    |||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  7517651 gggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtgggacatataactcacactt 7517583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 46 - 201
Target Start/End: Original strand, 37533011 - 37533165
Alignment:
Q  46 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 145  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  37533011 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaagcgcacaagcaagagagacaccacactt-tacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcctcttact 37533109  T
Q  146 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  37533110 tataaggtgttcaacctttactattttatccaatgtgggacatataactcacactt 37533165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 46 - 201
Target Start/End: Original strand, 40094774 - 40094929
Alignment:
Q  46 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 145  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| | ||| |||||||||| |||||| |    
T  40094774 ggggaccgaccacatcgaggctagaacaacctcacaagcaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaagacgatgggtttatgggtcctcttact 40094873  T
Q  146 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  40094874 tataaggtgttgaacctttactcttttattcgatgtgagacatataactcacactt 40094929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 35 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 45433411 - 45433244
Alignment:
Q  35 gaggggagccagggg-accgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatg 133  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||  |||||||    
T  45433411 gaggggagccagggggaccgaccacatcgaggctagaacaaccccacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaatcttaaggcaataggtttatg 45433312  T
Q  134 ggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
     ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  45433311 agttctcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtggatcatataactcacactt 45433244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 102; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 24 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 47129275 - 47129098
Alignment:
Q  24 tgttggatcatgaggggagccaggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaa 123  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||| |||| |||| ||||||||||||||  |  |||||||||| |||||||||||||||||||||| || |    
T  47129275 tgttggatcatgaggggagctcggggaccgtctacattgaggctagaacaaccacacttgtgagagagacaccacactcctacccaaaaccttaaagcga 47129176  T
Q  124 tgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    || |||||||||| |||||| |||||||  ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47129175 tgggtttatgggtcctcttacttataagaggttcaacctttactattttatccgatgtgagacatataactcacactt 47129098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 34 - 201
Target Start/End: Original strand, 22567026 - 22567193
Alignment:
Q  34 tgaggggagc-caggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttat 132  Q
    |||||||||| | ||||||| ||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22567026 tgaggggagctcgggggaccatccacatcgaggcccgaacaaccccacaagcaagagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaatgagtttat 22567125  T
Q  133 gggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    |||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  22567126 gggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtg-gacatattactcacactt 22567193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 46 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 6054718 - 6054563
Alignment:
Q  46 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 145  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |    
T  6054718 ggggaccgtccacatcaaggctagaacaaccatacaagtaggagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgtgtttatgggtcctcttact 6054619  T
Q  146 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    ||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6054618 tataaggtgttcaacatttactattttatccgatgtgagacatataactaacactt 6054563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 46 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 30244428 - 30244273
Alignment:
Q  46 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 145  Q
    ||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||  |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| |    
T  30244428 ggggaccatccacatcgaggcttgaacaaccacacaagtgagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgagtcctcttact 30244329  T
Q  146 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  30244328 tataaggtcttcaacctttactcttttatccgatgtgggacatataactcacactt 30244273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 24 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 30245254 - 30245080
Alignment:
Q  24 tgttggatcatgaggggagc-caggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggca 122  Q
    |||||| ||| ||||||||| | ||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||    |||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  30245254 tgttgggtcacgaggggagctcgggggaccatccacatcgaggcttgaacaaccacacaag----agagacaccacactcttacccaaaaccttaaggca 30245159  T
Q  123 atgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    ||||||||||||||  ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  30245158 atgagtttatgggtcgtcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtggaacatataactcacactt 30245080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 24 - 201
Target Start/End: Original strand, 37533341 - 37533519
Alignment:
Q  24 tgttggatcatgaggggagc-caggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggca 122  Q
    |||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  37533341 tgttgggtcacgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggca 37533440  T
Q  123 atgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    |||  ||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||| |||||| | ||||   |||||||||||||||||    
T  37533441 atggatttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttattcaatgtagaacatataactcacactt 37533519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 46 - 198
Target Start/End: Original strand, 23377 - 23529
Alignment:
Q  46 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 145  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| |    
T  23377 ggggaccgtccaaatcgaggctagaacaaccgcacatgcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaataggtttatgggtcctcttact 23476  T
Q  146 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcaca 198  Q
    ||||||||||| |||||||||| || |||||||||||  ||||||||||||||    
T  23477 tataaggtgttcaacctttactattgtatccgatgtggaacatataactcaca 23529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 23 - 198
Target Start/End: Original strand, 34218010 - 34218186
Alignment:
Q  23 ttgttggatcatgaggggagccagg-ggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggc 121  Q
    ||||||||| ||| |||||||  || |||||||||||||||||| | ||||||||| |||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||| |    
T  34218010 ttgttggattatggggggagctcggaggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacaccacactcttacccaaaaccttaagac 34218109  T
Q  122 aatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcaca 198  Q
    |||| ||||||| || |||| | |||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34218110 aatgggtttatgagtcctctcacttataaggtgttcaacatttacttttttatccgatgtgagacatataactcaca 34218186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 92; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 46 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 11845349 - 11845198
Alignment:
Q  46 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 145  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||  ||||||||| |||||| |    
T  11845349 ggggaccgtctacatcgaggctagaacaactgcacaagcaagagagacaccacactcttatccaaaaccttaaggcaatggatttatgggtcctcttact 11845250  T
Q  146 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcac 197  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||    
T  11845249 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtggaacatataactcac 11845198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 25 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 36623140 - 36622963
Alignment:
Q  25 gttggatcatgaggggagc-caggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaa 123  Q
    ||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||| ||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  36623140 gttgggtcatgaggggagctcaagggaccgtccacatcaaggtcagaacaatcacacaagtaagagaggcaccatactcctacccaaaaccttaaggcaa 36623041  T
Q  124 tgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    ||  ||||||| | ||| || ||||||  |||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  36623040 tggatttatggatcctcctacttataaaatgtttaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacactt 36622963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 46 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 45434794 - 45434639
Alignment:
Q  46 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 145  Q
    ||||||||  |||||||||| |||||||||  |||||| ||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||| |    
T  45434794 ggggaccgatcacatcgaggctagaacaactccacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaaggcagtaagtttatgggtcctcttact 45434695  T
Q  146 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  45434694 tataaggtgttcaacctttacttttttatccgatgtgggacatataacttacactt 45434639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 56 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 19122879 - 19122740
Alignment:
Q  56 cacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgt 155  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||  |||||| || |||||| |||||||||||    
T  19122879 cacatcgagactagaacaaccacacaagcaagatagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatggatttatgagtcctcttacttataaggtgt 19122780  T
Q  156 taaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactca 196  Q
    | |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  19122779 tcaacctttactattttatccgatgtg-gacatataactca 19122740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 49 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 29157720 - 29157568
Alignment:
Q  49 gaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttat 148  Q
    ||||||||||||| ||  |||| |||| |||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||| ||||    
T  29157720 gaccgtccacatcaagactagagcaactacacgagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatggatttatgggtcgtcttacttat 29157621  T
Q  149 aaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  29157620 aaggtgttcaacctttactattttatccggtgtgggacatataactcacactt 29157568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 57 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 45754862 - 45754719
Alignment:
Q  57 acatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgtt 156  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||| ||  ||||| ||||||||||||    
T  45754862 acatcgaggcttgaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggctatgggtttatgagtcatcttacttataaggtgtt 45754763  T
Q  157 aaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
     ||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  45754762 caacatttactattttatccgatgtg-gacatataactcacactt 45754719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 46 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 24177593 - 24177438
Alignment:
Q  46 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 145  Q
    ||||||||||||| |||||| ||  |||||| |||||||||||||||| | |||||| |||| ||||| ||||||||||| |||||||||| | |||| |    
T  24177593 ggggaccgtccacgtcgaggctaagacaaccgcacaagcaagagagacgccacactcttaccaaaaactttaaggcaatgggtttatgggtccgcttact 24177494  T
Q  146 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  24177493 tataaggtgttcagcctttactcttttatccgatgtgggacatataactcatactt 24177438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 75 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 7554154 - 7554028
Alignment:
Q  75 ccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttat 174  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||| | |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  7554154 ccacacaagcgagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggctatgggtttatggatcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttat 7554055  T
Q  175 ccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||    
T  7554054 ccgatgtgggacatataactcacactt 7554028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 82; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 46 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 30032725 - 30032572
Alignment:
Q  46 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 145  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    |||||| |||||||||||||||||| ||  |||||||| | |||||| |    
T  30032725 ggggaccgtccacatcgaggatagaacaaccgcacaagcaagagagatgtcacactcttacccaaaaccttaaggctataggtttatggatactcttact 30032626  T
Q  146 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacac 199  Q
    ||||||||||| |||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  30032625 tataaggtgttcaacacttactcttttattcgatgtgggacatataactcacac 30032572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 49 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 20599471 - 20599317
Alignment:
Q  49 gaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcc--tacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttattt 146  Q
    |||||| |||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||   |||||||||| ||||||||||||||||||  || |||||||||    
T  20599471 gaccgttcacatcaaggttaaaacaaccatacaagcaagagagacaccacactctcttacccaaaacgttaaggcaatgagtttatatgtcctcttattt 20599372  T
Q  147 ataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    |||| ||||| | |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  20599371 ataaagtgtttatcctttacttttttatccgatatgggacatataactcacactt 20599317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 54 - 201
Target Start/End: Original strand, 36939741 - 36939888
Alignment:
Q  54 tccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggt 153  Q
    |||||||||||| |||||||||| || |||||||||| |||| |||||  ||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||| |||||||||    
T  36939741 tccacatcgaggctagaacaaccgcataagcaagagaaacaccacacttttacccaaaaccttaaggcaatggatttatgggtcctcttacttataaggt 36939840  T
Q  154 gttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    ||| ||| |||||| |||||| |||| || ||||||||||||||||||    
T  36939841 gttcaacttttactattttatacgatttgggacatataactcacactt 36939888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 48 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 9901799 - 9901648
Alignment:
Q  48 ggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttattta 147  Q
    |||| ||||||| ||||| |||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| | ||| ||  ||    
T  9901799 ggacagtccacaccgaggctagaacaaccgcactagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaagacaatgagtttatggatcctc-tacgta 9901701  T
Q  148 taaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    |||| |||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9901700 taagatgttcaacctttactgttttatccgatgtg-gacatataactcacactt 9901648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 77; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 97 - 201
Target Start/End: Original strand, 22566713 - 22566817
Alignment:
Q  97 acactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactca 196  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  22566713 acactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtgggacatattactca 22566812  T
Q  197 cactt 201  Q
    |||||    
T  22566813 cactt 22566817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 76; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 37 - 201
Target Start/End: Original strand, 118290 - 118456
Alignment:
Q  37 ggggagccaggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacg--acactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgg 134  Q
    |||||||| |||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||| | |||  |||||| |||||||||||||| || |||| ||||||||    
T  118290 ggggagcctggggaccgtccacatcaaagctagaacaaccacacaagcaagagatagacgccacactcttacccaaaaccttacggtaatgggtttatgg 118389  T
Q  135 gttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
     | |||||| |||| ||||||| |||||||||| || |||| |||||| ||||||||||| ||||||    
T  118390 atcctcttacttattaggtgttcaacctttacttttctatctgatgtgggacatataacttacactt 118456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 84 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 16569316 - 16569199
Alignment:
Q  84 caagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtga 183  Q
    ||||||||||||  ||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||| || |||||||||| || ||||||||||||    
T  16569316 caagagagacaccgcactcttaccaaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtattcaacctttactgttctatccgatgtga 16569217  T
Q  184 gacatataactcacactt 201  Q
    ||||||||||||||||||    
T  16569216 gacatataactcacactt 16569199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 84 - 201
Target Start/End: Original strand, 16596346 - 16596463
Alignment:
Q  84 caagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtga 183  Q
    ||||||||||||  ||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||| || |||||||||| || ||||||||||||    
T  16596346 caagagagacaccgcactcttaccaaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtattcaacctttactgttctatccgatgtga 16596445  T
Q  184 gacatataactcacactt 201  Q
    ||||||||||||||||||    
T  16596446 gacatataactcacactt 16596463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 69 - 201
Target Start/End: Original strand, 24838724 - 24838857
Alignment:
Q  69 gaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttct-cttatttataaggtgttaaacctttact 167  Q
    |||||||||||||||||||||||||   |||||| |||||||||||||||| ||| | |||||||| | || |||| |||||||||||| ||||||||||    
T  24838724 gaacaaccacacaagcaagagagacgtcacactcttacccaaaaccttaagacaacgggtttatggatccttcttacttataaggtgttcaacctttact 24838823  T
Q  168 cttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  24838824 cttttattcgatgtgagacatataacttacactt 24838857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 70; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 49 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 14681663 - 14681513
Alignment:
Q  49 gaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttat 148  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||  |   ||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||  |||||| |||     
T  14681663 gaccgtccacatcaaggctagaacaaccacacttg--tgagagacaccacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgggccctcttacttac 14681566  T
Q  149 aaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||    
T  14681565 aaggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataacttacactt 14681513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 26 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 30253667 - 30253534
Alignment:
Q  26 ttggatcatgaggggagc-caggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaat 124  Q
    |||| ||| ||||||||| | ||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||    |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  30253667 ttgggtcacgaggggagctcgggggaccatccacatcgaggcttgaacaaccacacaag----agagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaat 30253572  T
Q  125 gagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacct 162  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||    
T  30253571 gagtttatgggttctcttacttataaggtcttcaacct 30253534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 68; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 46 - 201
Target Start/End: Original strand, 8128441 - 8128596
Alignment:
Q  46 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 145  Q
    |||||| || |||||||| | ||||||||||||| |||| |||| ||||| |||||| || ||||||||||||||  ||| |||||||||| ||||||      
T  8128441 ggggactgttcacatcgatgctagaacaaccacataagcgagagtgacaccacactcttaaccaaaaccttaaggttatgggtttatgggtcctcttaca 8128540  T
Q  146 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    ||||||||||| |||||||| | || |||||||| || ||||||||||||||||||    
T  8128541 tataaggtgttcaacctttatttttctatccgatatgggacatataactcacactt 8128596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 68; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 50 - 201
Target Start/End: Original strand, 40230295 - 40230446
Alignment:
Q  50 accgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttata 149  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||| ||||  ||||||||||||| | |||  |||||||||||||||| | ||| |||||||||| |||||| |||||    
T  40230295 accgtccacatagaggttagaataactacacttgcaagagagacaccagacttttacccaaaaccttaagactatgggtttatgggtcctcttacttata 40230394  T
Q  150 aggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    || |||| ||| |||||| |||||| ||||||| ||||||||||| ||||||    
T  40230395 agatgttcaacttttacttttttattcgatgtgggacatataacttacactt 40230446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 68; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 24 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 47129549 - 47129450
Alignment:
Q  24 tgttggatcatgaggggagccaggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaa 123  Q
    |||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  47129549 tgttgggtcatgaggggagctcggggaccgtccacatcgaggctagatcaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaa 47129450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 78 - 201
Target Start/End: Original strand, 1085280 - 1085404
Alignment:
Q  78 cacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccg 177  Q
    |||||| |||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||| ||| |||||| |||||||||    
T  1085280 cacaaggaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttacttatgagttgttcaacttttactattttatccg 1085379  T
Q  178 atgtgagacat-ataactcacactt 201  Q
    || || ||||| | |||||||||||    
T  1085380 atatgggacataaaaactcacactt 1085404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 52 - 201
Target Start/End: Original strand, 41910592 - 41910749
Alignment:
Q  52 cgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaacc--------ttaaggcaatgagtttatgggttctctta 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |  ||||| |||| |||||| |||| |||| |        ||||| ||||| |||||||||| |||| |    
T  41910592 cgtccacatcgaggttagaacaaccacacttgtgagagaaacaccacactcttaccaaaaatccaaaaatcttaagccaatgggtttatgggtcctctca 41910691  T
Q  144 tttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
     ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  41910692 gttataaggtattcaacctttactcttttatccgatgtgggacatataactcacactt 41910749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 59; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 36 - 156
Target Start/End: Original strand, 28300242 - 28300364
Alignment:
Q  36 aggggagccagg-ggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttat-g 133  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||   ||||||||||||  ||||||||||| | |||||| ||||||||| |||||||||||| |||||| |    
T  28300242 aggggagtcaggaggaccgtccacatcgaggcccgaacaaccacacttgcaagagagacgccacactcttacccaaaatcttaaggcaatgggtttatgg 28300341  T
Q  134 ggttctcttatttataaggtgtt 156  Q
    |||||||||| ||||||||||||    
T  28300342 ggttctcttacttataaggtgtt 28300364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 48 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 37167937 - 37167842
Alignment:
Q  48 ggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctctta 143  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||| |||||  ||||||| | ||||||    
T  37167937 ggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaactttaagtcaatggatttatggatcctctta 37167842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 46 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 41854792 - 41854638
Alignment:
Q  46 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 145  Q
    |||||||||| |||| |||| |||||||||| |||||| |||| ||||   |||||| ||||||||||||||||||| |   ||||| |||  ||||  |    
T  41854792 ggggaccgtctacattgaggctagaacaaccgcacaagtaagaaagacgtcacactcttacccaaaaccttaaggcattatatttataggtcatcttgct 41854693  T
Q  146 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||| ||||    
T  41854692 tataaggtgttcaacctttactctttta-ctgatgtgggacatataactcatactt 41854638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 54; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 116 - 201
Target Start/End: Original strand, 28301613 - 28301698
Alignment:
Q  116 taaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||| | | |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28301613 taaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcagcttttacttttctatccgatgtgagacatataactcacactt 28301698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 138 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 30244767 - 30244704
Alignment:
Q  138 ctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  30244767 ctcttatttataaggtgttcaacctttactcttttatccaatgtgggacatataactcacactt 30244704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 138 - 201
Target Start/End: Original strand, 36109009 - 36109072
Alignment:
Q  138 ctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  36109009 ctcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtgagaaatataactcacactt 36109072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 83 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 43241616 - 43241498
Alignment:
Q  83 gcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtg 182  Q
    ||||||||||||  | |||  |||| ||||||||||| |||| |||||||| || || ||| |||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||    
T  43241616 gcaagagagacatcatacttttacctaaaaccttaagtcaataagtttatgagtccttttacttataaggtgttcaacctttatttttttatccgatgtg 43241517  T
Q  183 agacatataactcacactt 201  Q
      |||||||||||||||||    
T  43241516 gaacatataactcacactt 43241498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 25 - 116
Target Start/End: Original strand, 37532729 - 37532821
Alignment:
Q  25 gttggatcatgaggggagccagg-ggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaacctt 116  Q
    ||||||||| |||||||||  || |||||||||||||||||| |||||||||  ||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  37532729 gttggatcacgaggggagcgcggaggaccgtccacatcgaggctagaacaacagcacaagctagagagacaccacactcttacccaaaacctt 37532821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 47 - 121
Target Start/End: Original strand, 28300569 - 28300644
Alignment:
Q  47 gggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactccta-cccaaaaccttaaggc 121  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||    
T  28300569 gggatcgtccacatcgaggctagaataaccacacaagcaagagagacaccacactcttaccccaaaaccttaaggc 28300644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 138 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 30245560 - 30245497
Alignment:
Q  138 ctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  30245560 ctcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatctgatgtgggacatataactcacactt 30245497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 138 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 30255405 - 30255342
Alignment:
Q  138 ctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  30255405 ctcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtgggacatataacgcacactt 30255342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 55 - 201
Target Start/End: Original strand, 36534795 - 36534939
Alignment:
Q  55 ccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtg 154  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||  |   ||||||| | |||||| |||||||||||||||| |  |  |||||||||| |||||| ||||||||||    
T  36534795 ccacatcgaggctggaacaaccacacttgt--gagagacgccacactcttacccaaaaccttaagactttaggtttatgggtcctcttacttataaggtg 36534892  T
Q  155 ttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    || ||||| |||| |||||||||| ||| ||||||||| | ||||||    
T  36534893 ttcaacctctactgttttatccgaggtgggacatataagttacactt 36534939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 23 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 30244534 - 30244454
Alignment:
Q  23 ttgttggatcatgaggggagccag-gggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactc 102  Q
    ||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  30244534 ttgttgggtcatgaggggagcctgagggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccacacaagtgagagagacaccacactc 30244454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 23 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 30253752 - 30253672
Alignment:
Q  23 ttgttggatcatgaggggagccagggg-accgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactc 102  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||| || ||||||||||||| | |||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  30253752 ttgttgggtcatgaggggagcctgggggacagtccacatcgaggcttgaacaaccacacaagtgagagagacaccacactc 30253672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 141 - 201
Target Start/End: Original strand, 36967325 - 36967384
Alignment:
Q  141 ttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    ||||||||||| |||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36967325 ttatttataag-tgtttaatctttacttttttatccgatgtgagacatataactcacactt 36967384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 99 - 199
Target Start/End: Original strand, 44361517 - 44361616
Alignment:
Q  99 actcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcaca 198  Q
    |||| |||| |||||| |||||  ||| |||||||| |  ||||| ||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  44361517 actcttacctaaaaccgtaaggttatgggtttatggatcatcttactta-aaggtgttcaacttttactcttttatccgatgtgagacatatatctcaca 44361615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 86 - 136
Target Start/End: Original strand, 21416181 - 21416231
Alignment:
Q  86 agagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggt 136  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  21416181 agagagacaccacactcttacccaaaaccctaaggcaatgggtttatgggt 21416231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 57 - 138
Target Start/End: Original strand, 40094424 - 40094505
Alignment:
Q  57 acatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttc 138  Q
    |||||| || ||||||||||||| ||| |||| ||||   |||||| |||||||||| |||| | |||||||||||||||||    
T  40094424 acatcggggctagaacaaccacataagtaagaaagacgtcacactcttacccaaaactttaaagtaatgagtttatgggttc 40094505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 86 - 162
Target Start/End: Original strand, 4124128 - 4124204
Alignment:
Q  86 agagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacct 162  Q
    |||||||||| |||||  || |||||||||||| ||||||||||||| ||| |||| | |||||| |||| ||||||    
T  4124128 agagagacaccacacttttatccaaaaccttaatgcaatgagtttattggtcctctcacttataaagtgtcaaacct 4124204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 87 - 135
Target Start/End: Original strand, 23569043 - 23569091
Alignment:
Q  87 gagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatggg 135  Q
    ||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23569043 gagagacatcacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatggg 23569091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 46 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 30245313 - 30245257
Alignment:
Q  46 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactc 102  Q
    ||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  30245313 ggggaccgtccacattgaggcttgaacaaccacacaagtgagagagacaccacactc 30245257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 46 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 37393216 - 37393128
Alignment:
Q  46 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgg 134  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||    |||||| | |||||  ||| |||||||| |||||| |||||||||||    
T  37393216 ggggatcgtccacatcgaggttagagcaaccacataagtggaagagacgccacacttttactcaaaacctcaaggcattgagtttatgg 37393128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 158 - 201
Target Start/End: Original strand, 40094506 - 40094549
Alignment:
Q  158 aacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    |||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  40094506 aacctttactcttttatctgatgttggacatataactcacactt 40094549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 34 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 7517828 - 7517767
Alignment:
Q  34 tgaggggagcca-ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagaca 94  Q
    |||||||||||| |||||||  ||| ||||||| |||||||||||||||||  |||||||||    
T  7517828 tgaggggagccaaggggaccacccatatcgaggctagaacaaccacacaagtgagagagaca 7517767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 34 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 7518094 - 7518033
Alignment:
Q  34 tgaggggagcca-ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagaca 94  Q
    |||||||||||| |||||||  ||| ||||||| |||||||||||||||||  |||||||||    
T  7518094 tgaggggagccaaggggaccacccatatcgaggctagaacaaccacacaagtgagagagaca 7518033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 118; Significance: 2e-60; HSPs: 84)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 37 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 25483504 - 25483339
Alignment:
Q  37 ggggagccaggg-gaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatggg 135  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  25483504 ggggagccagggagaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgga 25483405  T
Q  136 ttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    | |||||| ||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25483404 tcctcttacttataagatgttcaacctttactattttatccgatgtgagacatataactcacactt 25483339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 47 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 36629394 - 36629240
Alignment:
Q  47 gggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttattt 146  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  36629394 gggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcctcttactt 36629295  T
Q  147 ataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    |||||||||| ||| |||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  36629294 ataaggtgtttaacttttacttttctatccgatgtgggacatataactcacactt 36629240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 24 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 44620531 - 44620362
Alignment:
Q  24 tgttggatcatgaggggagccaggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaa 123  Q
    |||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| ||||||||||||||||||||    
T  44620531 tgttggatcatgagaggagc--ggggaccgtccacatcaaggttagaacaaccacacaagcaagagaaacatcacactcttacccaaaaccttaaggcaa 44620434  T
Q  124 tgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactc 195  Q
    || ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||    
T  44620433 tgggtttatgggctctcttatttataaggtgttcaacctttactgttttatccgatgtggaacatataactc 44620362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 31 - 201
Target Start/End: Original strand, 39792842 - 39793013
Alignment:
Q  31 tcatgaggggagc-caggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtt 129  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  39792842 tcatgaggggagctcagaggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtt 39792941  T
Q  130 tatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    || || | |||||  |||||||||||| ||| |||||| || |||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  39792942 tacggttcctctttcttataaggtgttcaacatttacttttctatctgatgtgggacatataactcacactt 39793013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 47 - 198
Target Start/End: Original strand, 1731646 - 1731797
Alignment:
Q  47 gggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttattt 146  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||    
T  1731646 gggaccgtccacattgaggctagaacaaccacacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaattggtttatgggtcctcttattt 1731745  T
Q  147 ataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcaca 198  Q
    ||||| |||| |||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  1731746 ataagatgttcaacctttactgttttatctgatgtgggacatataactcaca 1731797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 46 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 41370515 - 41370360
Alignment:
Q  46 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 145  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| |    
T  41370515 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacactacactcttacccaaaactttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 41370416  T
Q  146 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    |||||||| || ||| |||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  41370415 tataaggttttcaacatttactattttatccgatttgggacatataactcacactt 41370360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 46 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 50002584 - 50002429
Alignment:
Q  46 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 145  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||  ||||||||| |||||| |    
T  50002584 ggggaccgcccacatcgaggctagaacaaccgcacaagtaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaagacaatggatttatgggtcctcttact 50002485  T
Q  146 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    || || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50002484 taaaaagtgttcaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 50002429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 97; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 34 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 39404189 - 39404021
Alignment:
Q  34 tgaggggagc-caggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttat 132  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||| || ||||||||||    
T  39404189 tgaggggagctcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaatgctatgagtttat 39404090  T
Q  133 gggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    | || |||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||  ||||||||||||||||||    
T  39404089 gagtcctcttacttataaagtgttcaacctttactcttttattcaatgtaggacatataactcacactt 39404021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 97; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 34 - 197
Target Start/End: Original strand, 50630740 - 50630904
Alignment:
Q  34 tgaggggagccagg-ggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttat 132  Q
    |||||||||| ||| |||||| ||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  50630740 tgaggggagctaggcggaccgcccacatcgaggctaaaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttat 50630839  T
Q  133 gggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcac 197  Q
    |||| |||||| |||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||    
T  50630840 gggtcctcttacttataatgtgttcaacctttactattttatccgatgtaggacatataactcac 50630904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 47 - 201
Target Start/End: Original strand, 34646648 - 34646802
Alignment:
Q  47 gggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttattt 146  Q
    ||||||||||||| | ||| |||||||||||||||  | |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||    
T  34646648 gggaccgtccacaacaaggctagaacaaccacacagaccagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgagtcctcttagtt 34646747  T
Q  147 ataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    |||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  34646748 ataaggtgttcaacatttactgttttatccgatgtgggacatataactcacactt 34646802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 47 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 39404555 - 39404401
Alignment:
Q  47 gggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttattt 146  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| || | |||||||||||||||| ||  |||||||||| |||||| ||    
T  39404555 gggaccgttcacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacattcttgcccaaaaccttaaggctataggtttatgggtcctcttactt 39404456  T
Q  147 ataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  39404455 ataaggtgttccacctttactcttttatctgatgtgggacatataactcacactt 39404401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 94; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 44 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 3340967 - 3340810
Alignment:
Q  44 caggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctctta 143  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||    
T  3340967 caggagaccgtccacatcgaggctagaacaaccccacaagcaagaaagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcagtgggtttatgggtcctctta 3340868  T
Q  144 tttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
     |||||||||| | |||||||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||||||    
T  3340867 cttataaggtgctcaacctttactctttcatctgatgcgggacatataactcacactt 3340810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 94; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 37 - 201
Target Start/End: Original strand, 54017583 - 54017748
Alignment:
Q  37 ggggagccaggg-gaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatggg 135  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  54017583 ggggagctagggagaccgtccacatcgaggctagaacaaccacataagcaagagagacatcacactcttacctaaaaccttaaggcaatgggtttatggg 54017682  T
Q  136 ttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    | |||||| ||||||| |||| |||||||||| ||||||| || ||| ||||||||||||||||||    
T  54017683 tcctcttacttataagatgttcaacctttactattttatctgacgtgggacatataactcacactt 54017748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 53 - 201
Target Start/End: Original strand, 32941128 - 32941276
Alignment:
Q  53 gtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataagg 152  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||   |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  32941128 gtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacgtcacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgagccctcttatttataagg 32941227  T
Q  153 tgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    |||| |||||||||| || | |||||||| |||||||||||||||||||    
T  32941228 tgttcaacctttactgttctttccgatgtaagacatataactcacactt 32941276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 24 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 44621180 - 44621011
Alignment:
Q  24 tgttggatcatgaggggagccaggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaa 123  Q
    |||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||| |||    
T  44621180 tgttggatcatgagaggagc--ggggaccgtccacatcgaggctagaataaccgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaagacaa 44621083  T
Q  124 tgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactc 195  Q
    |||||||||| |  |||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| | |||| |||||    
T  44621082 tgagtttatgtgccctcttacttataaggtgttcaacctttactgttttatccgatgtgggtcatacaactc 44621011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 92; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 46 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 10246077 - 10245923
Alignment:
Q  46 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 145  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||  || |||||| ||| |||||| |    
T  10246077 ggggagcgtccacatcgaggctagaacaaccagacaagcaagggagacaccacactcttacccaaaaccttaaggctttgggtttat-ggtcctcttact 10245979  T
Q  146 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  10245978 tataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtggggcatataactcacactt 10245923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 92; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 46 - 201
Target Start/End: Original strand, 55933122 - 55933277
Alignment:
Q  46 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 145  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||   ||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| |    
T  55933122 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaactgtacaagtaagagagacaccacactcttacccaaaactttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 55933221  T
Q  146 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    ||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  55933222 tataaggtgttcaacccttactattttatccgatgtaggacatataactcacactt 55933277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 89; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 26 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 44620838 - 44620663
Alignment:
Q  26 ttggatcatgaggggagccagggg-accgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaat 124  Q
    ||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||  ||    
T  44620838 ttggatcatgaggggagcttgggggaccgtccacatcgaggatataacaaccgcacaagcaagagagaaaccacactcttacccaaaaccttaaggttat 44620739  T
Q  125 gagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    | |||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||| |||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  44620738 g-gtttatgggtcctcttacttataaagtgttcaacctctactatttcatccgatgtgggacatataactcacactt 44620663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 46 - 201
Target Start/End: Original strand, 36608659 - 36608814
Alignment:
Q  46 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 145  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||  |||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||  ||||||| | |||||| |    
T  36608659 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacactagtgagagagacaccacactcttacccaaaaccttaagacaatggatttatggatcctcttact 36608758  T
Q  146 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    ||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  36608759 tatgaggtgttcaacttttactcttttatccgatgttggacatataactcacactt 36608814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 87; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 24 - 201
Target Start/End: Original strand, 22027936 - 22028114
Alignment:
Q  24 tgttggatcatgaggggagccag-gggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggca 122  Q
    |||||| |||||||||||||| | ||||| ||||||||||||  || |||||||||| |||| |||||||||| ||| || |||||||||||||||||||    
T  22027936 tgttgggtcatgaggggagcctgagggactgtccacatcgagactaaaacaaccacataagcgagagagacaccacattcttacccaaaaccttaaggca 22028035  T
Q  123 atgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    ||  |||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||  | |||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  22028036 atatgtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttcgtattttatccgatgtgggacatataagtcacactt 22028114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 87; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 47 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 50459878 - 50459724
Alignment:
Q  47 gggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttattt 146  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||| |||||||||||  |||| ||||||| || |||||| ||    
T  50459878 gggaccgtgcacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacgctcttacctaaaaccttaagataatgggtttatgagtcctcttactt 50459779  T
Q  147 ataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||    
T  50459778 ataagatgttcaacctttactcttttaaccgatgtggaacatataactcacactt 50459724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 46 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 20825994 - 20825842
Alignment:
Q  46 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 145  Q
    |||||| ||||||||| ||| |||||||||| || ||| |||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| |   |||||||||| ||||||||    
T  20825994 ggggactgtccacatcaaggctagaacaaccgcataaggaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggctaaaggtttatgggtgctcttatt 20825895  T
Q  146 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcaca 198  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  20825894 tataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtggaacatataactcaca 20825842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 46 - 181
Target Start/End: Original strand, 18932747 - 18932882
Alignment:
Q  46 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 145  Q
    ||||||||| |||||||||| || ||||||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  18932747 ggggaccgtacacatcgaggctataacaaccactcaagtaagagagacaccacactcttacctaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttatt 18932846  T
Q  146 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgt 181  Q
    |||||||| || |||||||||| |||||||||||||    
T  18932847 tataaggtattcaacctttactattttatccgatgt 18932882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 46 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 36572177 - 36572022
Alignment:
Q  46 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 145  Q
    ||||||||| |||||||||| | |||||||| ||||||| |||||||||| | ||||  |||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||| |    
T  36572177 ggggaccgttcacatcgaggcttgaacaaccgcacaagcgagagagacaccatactctaacccaaaaccttaaggcaatggatttatgggtcttcttact 36572078  T
Q  146 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  36572077 tataaggtgttcaacatttactcttttattcgatgtgggacatataactcacactt 36572022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 47 - 201
Target Start/End: Original strand, 16889535 - 16889689
Alignment:
Q  47 gggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttattt 146  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| | |||| |||||||||| |||||||| |  |||||||  | |||||| ||    
T  16889535 gggaccgtccacatcgaggttagaacaatcacacaaggaagagagacaccatactcttacccaaaactttaaggcagtaggtttatgaatcctcttactt 16889634  T
Q  147 ataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    ||||||| || |||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16889635 ataaggtattcaacctttacttttctatccgatttgagacatataactcacactt 16889689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 56 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 52884844 - 52884698
Alignment:
Q  56 cacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctaccc-aaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtg 154  Q
    |||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| | |  ||||| ||||||||||    
T  52884844 cacatcgaggctagatcaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttaccccaaaaccttaaggcaatgggtttatcgatcatcttacttataaggtg 52884745  T
Q  155 ttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    || |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  52884744 ttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacactt 52884698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 46 - 194
Target Start/End: Original strand, 54343006 - 54343147
Alignment:
Q  46 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 145  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||       |||| |||||| |    
T  54343006 ggggaccatccacatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatg-------gggtcctcttact 54343098  T
Q  146 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataact 194  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  54343099 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataact 54343147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 82; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 56 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 54109060 - 54108928
Alignment:
Q  56 cacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgt 155  Q
    |||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||    
T  54109060 cacatcgaagctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaac-ttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgt 54108962  T
Q  156 taaacctttactcttttatccgatgtgagacata 189  Q
    | |||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  54108961 tcaacctttactattttatccgatgtgggacata 54108928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 81; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 45 - 201
Target Start/End: Original strand, 16888813 - 16888969
Alignment:
Q  45 aggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttat 144  Q
    ||||||||||| |||||||   |||||||| | ||||| |||||||||||  |||||| ||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||     
T  16888813 aggggaccgtctacatcgaaactagaacaatcgcacaaacaagagagacatcacactcttacccaaaaccgtaagacaatgagtttataggttctcttac 16888912  T
Q  145 ttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    ||||||||| || |||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16888913 ttataaggtattcaacctttacttttctatccgatgtgggacatataactcacactt 16888969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 46 - 201
Target Start/End: Original strand, 22183262 - 22183417
Alignment:
Q  46 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 145  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||  |||||||| | |||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||| || ||| |    
T  22183262 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgtacaagtgagagagacgccacactcttatccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtccttttact 22183361  T
Q  146 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    |||||  |||| ||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  22183362 tataaattgttcaacatttactcttttatccgatgtgggatatataactcacactt 22183417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 45 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 49303065 - 49302907
Alignment:
Q  45 aggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctctta- 143  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||| | || ||| |||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||     
T  49303065 aggggatcgtccacatcgaggatagaacaatcgcataagtaagagatacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttac 49302966  T
Q  144 -tttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
     |||||||| |||| |||||||||| ||||||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  49302965 ttttataagatgttcaacctttacttttttatttgatgtgggacatataactcacactt 49302907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 67 - 201
Target Start/End: Original strand, 4955336 - 4955470
Alignment:
Q  67 tagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttac 166  Q
    |||| ||||| |||||| ||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| |||||||||||| |||||| ||    
T  4955336 tagagcaaccgcacaagtaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaaccttaac 4955435  T
Q  167 tcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4955436 tattttatccgatatgagacatataactcacactt 4955470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 46 - 201
Target Start/End: Original strand, 22028367 - 22028524
Alignment:
Q  46 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 145  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||| |    
T  22028367 ggggaccgtccacattgaggctagaacaacctcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaacattaagacaatgagtttatgggtcctcttact 22028466  T
Q  146 tataaggtgttaaaccttta--ctcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
     |||||||||| ||||||||   | |||||||||||||  ||||||||| | ||||||    
T  22028467 aataaggtgttcaacctttatttttttttatccgatgtaggacatataagtaacactt 22028524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 24 - 201
Target Start/End: Original strand, 49076807 - 49076983
Alignment:
Q  24 tgttggatcatgaggggagc-caggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggca 122  Q
    |||||| ||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||  ||||||||||||||||      
T  49076807 tgttgggtcatgaggg-agctcaggggacagtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagaaagacaccacactctaacccaaaaccttaaggtt 49076905  T
Q  123 atgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    ||| |||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||| ||||| || || ||  |||||||||||||||||    
T  49076906 atgggtttatgggttctctta-ctataaggtgttcaacctttactattttagccaatatggaacatataactcacactt 49076983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 77; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 45 - 201
Target Start/End: Original strand, 3244448 - 3244604
Alignment:
Q  45 aggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttat 144  Q
    ||||||| | ||||||||||| | ||||||||| |||||  ||||||||   ||| || |||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||     
T  3244448 aggggactgcccacatcgaggctggaacaaccatacaagtgagagagacgacacattcttacccaaaactttaagacaatgagtttatgggtcctcttac 3244547  T
Q  145 ttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    ||||||| |||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3244548 ttataagatgttcaacctttacttttctatccgatgtgagacatataactcacactt 3244604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 76; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 86 - 201
Target Start/End: Original strand, 41707503 - 41707617
Alignment:
Q  86 agagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgaga 185  Q
    |||||||||| |||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  41707503 agagagacaccacactcttacc-aaaaccttaagacaatgagtttatgggttcttttacttatatggtgttcaacctttactcttttatccgatgtggga 41707601  T
Q  186 catataactcacactt 201  Q
    ||||||||||||||||    
T  41707602 catataactcacactt 41707617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 75; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 24 - 150
Target Start/End: Original strand, 23817654 - 23817783
Alignment:
Q  24 tgttggatcat-gaggggagcca--ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaagg 120  Q
    ||||||||||| ||||||||| |  |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  23817654 tgttggatcatcgaggggagctatgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacactagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaagg 23817753  T
Q  121 caatgagtttatgggttctcttatttataa 150  Q
    |||||||||||||  | |||||| ||||||    
T  23817754 caatgagtttatgaatcctcttacttataa 23817783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 75; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 75 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 45496934 - 45496820
Alignment:
Q  75 ccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttat 174  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||||||| |||||||||  ||||||    
T  45496934 ccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaagacaatgagtttataggtcctcttacttataaggtgttcaacctttacgattttat 45496835  T
Q  175 ccgatgtgagacata 189  Q
    |||||||| ||||||    
T  45496834 ccgatgtgggacata 45496820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 56 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 52885038 - 52884890
Alignment:
Q  56 cacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagaga--cacgacactcctaccc-aaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataagg 152  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||  ||| ||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| | |||||| ||||||||    
T  52885038 cacatcgaggctagatcaaccacacaaataagagagagacaccacattcttaccccaaaaccttaaggcaatgggtttatggatcctcttacttataagg 52884939  T
Q  153 tgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  52884938 tgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacactt 52884890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 73; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 46 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 54936353 - 54936218
Alignment:
Q  46 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 145  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||| | |  |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |    
T  54936353 ggggactgtccacatcgaggctagaacaaccacata-gtgagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 54936255  T
Q  146 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtg 182  Q
    || |||||||| |||||||||| ||||||| ||||||    
T  54936254 tacaaggtgttcaacctttactattttatctgatgtg 54936218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 46 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 3341286 - 3341131
Alignment:
Q  46 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 145  Q
    |||||||||| |||||||||||| || ||||||| ||  |||| |||||  |||||| ||||||||| |||||  ||||||  |||||||| |||||| |    
T  3341286 ggggaccgtctacatcgaggttaaaataaccacataattaagaaagacatcacactcttacccaaaatcttaaaacaatgatgttatgggtcctcttact 3341187  T
Q  146 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  3341186 tataaagtgtttaacctttactcttttatccaatgtgggacatataactcacactt 3341131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 51 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 20826370 - 20826223
Alignment:
Q  51 ccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataa 150  Q
    ||||||||||||||| |||||||| | || ||| ||||||||||  |||||| |||| ||||  ||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  20826370 ccgtccacatcgaggctagaacaatcgcataaggaagagagacatcacactcttacctaaaatgttaaggctatgggtttatgggttctcttacttataa 20826271  T
Q  151 ggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcaca 198  Q
     ||||| ||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20826270 cgtgttcaacttttactattttatccgatgtgggacatataactcaca 20826223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 71; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 46 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 43827597 - 43827492
Alignment:
Q  46 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 145  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  43827597 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccgcacaagtaagagagacaccacactcttatcc-aaaccttaaggcaatgaatttatgggtcctcttatt 43827499  T
Q  146 tataagg 152  Q
    |||||||    
T  43827498 tataagg 43827492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 71; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 67 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 49880296 - 49880163
Alignment:
Q  67 tagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttac 166  Q
    ||||||||| ||| || |||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||    
T  49880296 tagaacaac-acataaacaagagagacaccacgctcttacccaaaaccttaaggcagtgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttac 49880198  T
Q  167 tcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    | |||||| | ||||| ||||||||||||||||||    
T  49880197 tattttattcaatgtgggacatataactcacactt 49880163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 70; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 49 - 198
Target Start/End: Original strand, 51768061 - 51768210
Alignment:
Q  49 gaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttat 148  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | || ||| ||||||||||    |||  |||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||    
T  51768061 gaccgtccacatcgaggttagaacaatcccataagtaagagagacatcgtacttttacccaaaaccttaagacaatgagtttatgagtcctcttatttat 51768160  T
Q  149 aaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcaca 198  Q
    |||||||| ||| ||||||||| ||| |||| |  |||||||||||||||    
T  51768161 aaggtgttcaacatttactcttatattcgatataggacatataactcaca 51768210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 70; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 46 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 54108694 - 54108541
Alignment:
Q  46 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatg-agtttatgggttctcttat 144  Q
    |||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||| || ||||||||||||||||||| | ||||||||| || |||     
T  54108694 ggggaccg-ccacattgaggctagaacaaccacacaagcaagatagacaccacactcttagccaaaaccttaaggcaatgaattttatgggtccttttac 54108596  T
Q  145 ttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||| || || |||  |||||||||||||    
T  54108595 ttataaggtgttcaacctttactattttatcctatatgggac--ataactcacactt 54108541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 49 - 201
Target Start/End: Original strand, 4390102 - 4390254
Alignment:
Q  49 gaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttat 148  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||  ||||||||||||||||   |||||| ||||||||||||||| |||||| | | | || | |||||| ||||    
T  4390102 gaccgtccgcatcgaggctagaacaactgcacaagcaagagagacgtcacactcttacccaaaaccttaacgcaatgtgctaaaggatcctcttacttat 4390201  T
Q  149 aaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||| || || ||||||||||||    
T  4390202 aaggtgttcaacctttactcttttatctgatgtgggatatgtaactcacactt 4390254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 47 - 201
Target Start/End: Original strand, 45489331 - 45489484
Alignment:
Q  47 gggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttattt 146  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||  |||||| |||| |||| |||||  || |  ||||| | ||||||||| ||    
T  45489331 gggaccatccacatcgaggctagaacaatcacactagcaaaagagacatcacactcttaccaaaaatcttaaa-cagtaggtttaagagttctcttactt 45489429  T
Q  147 ataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  45489430 atatggtgttcaacctttactcttttatccgatgtgagacatataattcacactt 45489484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 34 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 2740869 - 2740703
Alignment:
Q  34 tgaggggagc-caggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttat 132  Q
    |||||||||| | ||||||| |||| ||||||| |||||||||||||  ||  |||||||| | |||||| |||  |||||||||||||  || ||||||    
T  2740869 tgaggggagctcgggggaccatccatatcgaggctagaacaaccaca--agtgagagagacgccacactcttacgtaaaaccttaaggctctgggtttat 2740772  T
Q  133 gggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
     ||| |||||| |||||||||||| |||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2740771 aggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactgttctatccgatgtgggacatataactcacactt 2740703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 34 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 43174677 - 43174509
Alignment:
Q  34 tgaggggagccaggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatg 133  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||| ||| || |||||||| | || |||||||||| | |||||| ||||||| || ||||||  ||  |||||||    
T  43174677 tgaggggagctagggaaccgtccacatcaaggctacaacaaccatataaacaagagagacgccacactcttacccaacactttaaggtcataggtttatg 43174578  T
Q  134 ggttctcttatttataaggtgttaaacctttactc-ttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
     || |||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| | ||||||||||||||||    
T  43174577 tgtcctcttacttataaggtgttcaacctttactctttttatctgatgtgtggcatataactcacactt 43174509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 64; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 23 - 201
Target Start/End: Original strand, 34004559 - 34004736
Alignment:
Q  23 ttgttggatcatgaggggagccaggg-gaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggc 121  Q
    ||||||| ||||||| |||||  ||| |||||| |||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||||   |||||| || | ||||||||||||     
T  34004559 ttgttgggtcatgagaggagctcgggagaccgttcacatcgaggctagaacaaccgcacaagggagagagacggcacactcttatcgaaaaccttaagg- 34004657  T
Q  122 aatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||| |||| |||||||| | |||||||  ||||| ||||||||||||||||||    
T  34004658 aatgagtttatgggtcctcttacttataagttgttcaacctttagt-ttttatcatatgtgtgacatataactcacactt 34004736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 60; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 86 - 201
Target Start/End: Original strand, 54741216 - 54741331
Alignment:
Q  86 agagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgaga 185  Q
    ||||||| || |||||| || ||||||||||||| ||||  || ||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||    
T  54741216 agagagagactacactcttatccaaaaccttaagacaatctgtgtatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttacttttctatccgatgtgaga 54741315  T
Q  186 catataactcacactt 201  Q
    ||||||| ||||||||    
T  54741316 catataattcacactt 54741331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 57; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 97 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 2741178 - 2741074
Alignment:
Q  97 acactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactca 196  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||   |||||||| |||||| ||||||||| || |||||||||| || |||| |||||| |||||||||||||    
T  2741178 acactcttacccaaaaccttaaggcaatggagttatgggtcctcttacttataaggtattcaacctttactattctatctgatgtgggacatataactca 2741079  T
Q  197 cactt 201  Q
    |||||    
T  2741078 cactt 2741074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 57; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 52 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 31691306 - 31691203
Alignment:
Q  52 cgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacg--acactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttata 149  Q
    |||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||| | |||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  31691306 cgtccacatcgaggctagaacaatcgtacaagcaagagatagacgccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttata 31691207  T
Q  150 aggt 153  Q
    ||||    
T  31691206 aggt 31691203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 55; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 46 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 3271947 - 3271802
Alignment:
Q  46 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaa---gagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctctt 142  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||   ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  3271947 ggggactgtccacatcgaggctagaacaaccacataataaacgagagagacac-acactcttacccaaaaccttaaggcaataggtttatgggttctctt 3271849  T
Q  143 attt---ataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagac 186  Q
    | ||   |||||||||| ||| |||||| || |||| ||||||||||    
T  3271848 acttataataaggtgtttaacttttacttttctatctgatgtgagac 3271802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 54; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 81 - 198
Target Start/End: Original strand, 6975489 - 6975606
Alignment:
Q  81 aagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatg 180  Q
    ||||||||||||| | |||||| ||||||||| ||||||  ||||  |||||| || |||||| ||||||| | || |||||||||| ||||||| ||||    
T  6975489 aagcaagagagacgccacactcttacccaaaatcttaagataatggatttatgagtcctcttacttataagatattcaacctttactattttatcggatg 6975588  T
Q  181 tgagacatataactcaca 198  Q
    ||||||||||||||||||    
T  6975589 tgagacatataactcaca 6975606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 54; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 72 - 201
Target Start/End: Original strand, 23556890 - 23557019
Alignment:
Q  72 caaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttt 171  Q
    |||||||||||| |||||||||   |||||| || ||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||  |||| |||||  ||| ||     
T  23556890 caaccacacaagtaagagagacgtcacactcttatccaaaactttaaggcaatgattttatggattctcttatttataaaatgttcaacctccacttttc 23556989  T
Q  172 tatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    |||||||||| | |||| ||||||||||||    
T  23556990 tatccgatgtaaaacatttaactcacactt 23557019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 46 - 178
Target Start/End: Original strand, 48111696 - 48111828
Alignment:
Q  46 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 145  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||   |  |||||||||| |||||| |||| |||||||||||| ||||  |||||  || || ||| |    
T  48111696 ggggaccgtccacattgaggttagaaaaaccacatttgtgagagagacaccacactcatacctaaaaccttaaggtaatggatttataagtccttttact 48111795  T
Q  146 tataaggtgttaaacctttactcttttatccga 178  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  48111796 tataatgtgttcaacctttactcttttatccga 48111828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 46 - 201
Target Start/End: Original strand, 49076449 - 49076601
Alignment:
Q  46 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 145  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||| | || |||| ||| ||||||  | ||  |||||||| | ||||| ||||| |||||| ||| |||||| |    
T  49076449 ggggaccgtccacatcgaggctataacaatcgcataagcgagacagacaccgccct--tacccaaa-ctttaagacaatgggtttataggtcctcttact 49076545  T
Q  146 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  49076546 tataaggtgttcaacctttactgttttatccgatatggtacatataactcacactt 49076601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 49 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 3700512 - 3700368
Alignment:
Q  49 gaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttat 148  Q
    ||||||||||||||||| | ||| ||||||||||   |||||||||  | |||| || ||||||||||||||||||||||         || ||| ||||    
T  3700512 gaccgtccacatcgaggcttgaataaccacacaaatgagagagacatcatactcttatccaaaaccttaaggcaatgagtc--------cttttacttat 3700421  T
Q  149 aaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  3700420 aaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtaggacatataactcacactt 3700368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 48 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 18879962 - 18879854
Alignment:
Q  48 ggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttattta 147  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||| ||||||   |||||| ||||||||||||||||| |||  |||||| |||  ||||| |||    
T  18879962 ggaccgtccacatcgaagctagaacaaccacacaaccaaaagagacgtcacactcttacccaaaaccttaaggaaataggtttataggtcatcttactta 18879863  T
Q  148 taaggtgtt 156  Q
    |||||||||    
T  18879862 taaggtgtt 18879854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 58 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 19504842 - 19504708
Alignment:
Q  58 catcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgtta 157  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||| | |||||| |||||||||| ||||||||||   ||||||||| |||||         |||||     
T  19504842 catcgaggctagaacaaccacacaagcaagatagacgccacactcttacccaaaactttaaggcaatagatttatgggtcctctt---------gtgttc 19504752  T
Q  158 aacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    ||| |||||| ||||||||||| || ||||||||||||| ||||    
T  19504751 aacttttactattttatccgatatgggacatataactcatactt 19504708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 86 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 28034347 - 28034232
Alignment:
Q  86 agagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgaga 185  Q
    |||||||| | |||||| |||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||| |||||  ||| || ||||||||| | ||    
T  28034347 agagagacgccacactcttacctaaaaccttaaagcaataagtttatgggttctctcacttataaagtgttcaacctccacttttctatccgatgcggga 28034248  T
Q  186 catataactcacactt 201  Q
    ||||||| ||||||||    
T  28034247 catataattcacactt 28034232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 115 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 10246436 - 10246358
Alignment:
Q  115 ttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataac 193  Q
    ||||||| ||| |||||||||| |||| | ||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  10246436 ttaaggctatgggtttatgggtcctctaacttataagatgttcaacctttactcttttatccgatttgagacatataac 10246358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 64 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 40067184 - 40067046
Alignment:
Q  64 ggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaac-ct 162  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||  ||||||||| ||||||| | ||  | |||| || |||||| |||||| ||||| |||  |    
T  40067184 ggttagaacaaccacataagcaagagagacatcacacttttacccaaaatcttaaggtagtggatctatgtgtcctcttacttataatgtgttcaacttt 40067085  T
Q  163 ttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    |||| ||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  40067084 ttacacttttatccgatgtagaacatataactcacactt 40067046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 97 - 191
Target Start/End: Original strand, 54017751 - 54017845
Alignment:
Q  97 acactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatata 191  Q
    |||||| |||| ||||||||||| ||||| |  ||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| || |||||    
T  54017751 acactcttacctaaaaccttaagacaatgggaatatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactgttttatccgatgtgggatatata 54017845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 24 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 34544286 - 34544107
Alignment:
Q  24 tgttggatcatgaggggagccaggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaa-ccttaaggca 122  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||  |||||||  ||   || |||||  |||||  ||||||| || |||||| ||||||||| ||||||||||    
T  34544286 tgttgggtcacgaggggagccaggggaccacccacatcctgggg-gagcaaccgtacaagtgagagagataccacactcttacccaaaaaccttaaggca 34544188  T
Q  123 atgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgag--acatataactcacactt 201  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||| ||| | |||||  ||| || ||| |||||||||  | |||||||||||||||    
T  34544187 atgagtttatgggtcctctcatttataaagtgatcaacctccacttttctattcgatgtgagatatatataactcacactt 34544107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 43 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 760348 - 760194
Alignment:
Q  43 ccaggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctctt 142  Q
    ||||||||||  ||||||| || | ||| |||||||||||   |||||||||| |||||  |||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||     
T  760348 ccaggggaccacccacatccag-taagagcaaccacacaaatgagagagacaccacacttttacc-aaaatcttaaggcaatgagtttatgggtcctctc 760251  T
Q  143 atttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacac 199  Q
    | |||||| ||  | |||||| | | || ||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  760250 acttataaagttctcaaccttcatttttctattcgatgtgggacatataactcacac 760194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 137 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 44621493 - 44621429
Alignment:
Q  137 tctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||  ||||||||||||||||||    
T  44621493 tctcttacttataaggtgtttaacctttactgttttatcccatgttggacatataactcacactt 44621429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 67 - 190
Target Start/End: Original strand, 15841387 - 15841510
Alignment:
Q  67 tagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttac 166  Q
    |||| ||||||||||||  |||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||  | |||| | ||| || ||||| |||||  ||    
T  15841387 tagagcaaccacacaagtgagagagacatcacactcttacccaaaaccttaaggcaatgtgtttatgaatcctctcacttacaaagtgttcaacctccac 15841486  T
Q  167 tcttttatccgatgtgagacatat 190  Q
    | || |||  ||||||||||||||    
T  15841487 ttttctatttgatgtgagacatat 15841510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 137 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 44620363 - 44620304
Alignment:
Q  137 tctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactca 196  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||    
T  44620363 tctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatcccatgtgggacatataactca 44620304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 37 - 91
Target Start/End: Original strand, 23817444 - 23817498
Alignment:
Q  37 ggggagccaggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagag 91  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  23817444 ggggagcctgggaaccgtccacatcgaggctagaacaaccacactagcaagagag 23817498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 50 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 41370812 - 41370738
Alignment:
Q  50 accgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaat 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||  ||| |  |||| |||| |||||||||||    
T  41370812 accgtccacatcgaggttagaacaaccactcaagtaagagagacatcacatttttacctaaaatcttaaggcaat 41370738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 46 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 43174299 - 43174233
Alignment:
Q  46 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaa 112  Q
    |||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||  |||||||||| |||||| |||||||||    
T  43174299 ggggaccgtccacatcaaggcttgaacaaccacacaagtgagagagacaccacactcttacccaaaa 43174233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 158 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 45050647 - 45050604
Alignment:
Q  158 aacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  45050647 aacctttactcttttatttgatgtgagacatataactcacactt 45050604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 86 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 11197344 - 11197294
Alignment:
Q  86 agagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggt 136  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  11197344 agagagacaccacactcttacccaaaaccctaaggcaatgggtttatgggt 11197294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 137 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 44621012 - 44620947
Alignment:
Q  137 tctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatg-tgagacatataactcacactt 201  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||  |||||||||||| || ||||| ||||||||||||    
T  44621012 tctcttacttataaggtgttcaacctttacagttttatccgatgttgggacatctaactcacactt 44620947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 46 - 198
Target Start/End: Original strand, 45489712 - 45489864
Alignment:
Q  46 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatga-gtttatgggttctcttat 144  Q
    ||||| || ||||||||||  |||||||||||  ||||| |||||||||| |||||  |||||||||||||||  |  | | ||||| || |  |||||     
T  45489712 ggggatcggccacatcgagactagaacaaccatgcaagcgagagagacaccacactattacccaaaaccttaa-actttaaggtttaaggatcatcttac 45489810  T
Q  145 ttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcaca 198  Q
    ||||| | | || || |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  45489811 ttatatgatattcaatctttactcttttatccaatgtgatacatataactcaca 45489864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 152 - 201
Target Start/End: Original strand, 50788087 - 50788136
Alignment:
Q  152 gtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  50788087 gtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataacttacactt 50788136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 31 - 90
Target Start/End: Original strand, 11702281 - 11702341
Alignment:
Q  31 tcatgaggggagccagggg-accgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagaga 90  Q
    ||||||||||||| ||||| || || |||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  11702281 tcatgaggggagcgagggggactgttcacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagaga 11702341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 55 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 19895445 - 19895406
Alignment:
Q  55 ccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagaca 94  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  19895445 ccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagaca 19895406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 24 - 118
Target Start/End: Original strand, 39698919 - 39699014
Alignment:
Q  24 tgttggatcatgaggggagc-caggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaa 118  Q
    |||||||| |||||| |||| ||  |||| ||||||||||||  ||||| |||| |||||||||||||||  | |||||| ||| |||||||||||    
T  39698919 tgttggatgatgaggagagctcataggactgtccacatcgagactagaataaccgcacaagcaagagagatgctacactcttactcaaaaccttaa 39699014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 97 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 1868158 - 1868117
Alignment:
Q  97 acactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttc 138  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  1868158 acactcttacccaaaactttaaggcaatgggtttatgggttc 1868117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 88 - 132
Target Start/End: Original strand, 11706584 - 11706628
Alignment:
Q  88 agagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttat 132  Q
    |||||| | |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11706584 agagacgccacactcttacccaaaaccttaaagcaatgagtttat 11706628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 115; Significance: 1e-58; HSPs: 76)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 24 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 15773035 - 15772857
Alignment:
Q  24 tgttggatcatgaggggagccagg-ggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggca 122  Q
    |||||| |||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||| |||    
T  15773035 tgttgggtcatgaggggagtcaaaaggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttatccaaaaccttaaagca 15772936  T
Q  123 atgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  15772935 atgagtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacatttactcttttatccgatatgggacatataactcacactt 15772857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 114; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 48 - 201
Target Start/End: Original strand, 43346793 - 43346946
Alignment:
Q  48 ggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttattta 147  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  43346793 ggaccgtccacatagaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttactta 43346892  T
Q  148 taaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  43346893 taaggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacactt 43346946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 112; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 24 - 201
Target Start/End: Original strand, 37990953 - 37991132
Alignment:
Q  24 tgttggatcatgagggg-agccag-gggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggc 121  Q
    |||||| |||||||||| |||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  37990953 tgttgggtcatgagggggagcctgagggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacataagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggc 37991052  T
Q  122 aatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
     |||||||||| ||| |||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  37991053 gatgagtttataggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccaatgtgagacatataactcacactt 37991132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 46 - 201
Target Start/End: Original strand, 37990639 - 37990794
Alignment:
Q  46 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 145  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |    
T  37990639 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaatcacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgagtcctcttact 37990738  T
Q  146 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    ||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  37990739 tataaggtgttcaacatttactattttatccgatgtggaacatataactcacactt 37990794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 46 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 22304727 - 22304572
Alignment:
Q  46 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 145  Q
    |||||| ||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |    
T  22304727 ggggactgtccacatcgagactagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgtgtttatgggtcctcttact 22304628  T
Q  146 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    |||||||| || |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  22304627 tataaggtattcaacctttactattttatccgatgtgggacatatagctcacactt 22304572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 46 - 201
Target Start/End: Original strand, 29644902 - 29645057
Alignment:
Q  46 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 145  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||| || ||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| |    
T  29644902 ggggaccgtccacatcgaggctaaaacaaccgcataagcaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgggtcctcttact 29645001  T
Q  146 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  29645002 tataaggtgtttaacctttactcttttatccgatgtgggacatataacttacactt 29645057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 46 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 35946680 - 35946525
Alignment:
Q  46 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 145  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||| |    
T  35946680 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaattgcacaagcaagagagacaccacacttttacccaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctcttact 35946581  T
Q  146 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  35946580 tataaggtgttcaacctttactgttttatccgatgtgggacatataactcacactt 35946525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 99; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 23 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 15773376 - 15773195
Alignment:
Q  23 ttgttggatcatgaggggagccagg-ggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaag--agagacacgacactcctacccaaaaccttaag 119  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||  |||||| |||||||||| |||||    
T  15773376 ttgttggatcatgaggggagttaggaggatcgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagcaagagacatcacactcttacccaaaactttaag 15773277  T
Q  120 gcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    |||||||| ||||| || |||||| ||||||| |||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  15773276 gcaatgagcttatgagtcctcttacttataagatgttcaacttttactcttttattcgatgtgggacatataactcacactt 15773195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 99; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 36 - 201
Target Start/End: Original strand, 42342377 - 42342543
Alignment:
Q  36 aggggagccagggg-accgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgg 134  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||   |||||| |||||||||||||||| |||||  |||||||    
T  42342377 aggggagccagggggaccgtccacattgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacgtcacactcttacccaaaaccttaagacaatggatttatgg 42342476  T
Q  135 gttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    || |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  42342477 gtcctcttacttataaggtgttgaacctttactcttttatcggatgtgggacatataactcacactt 42342543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 46 - 201
Target Start/End: Original strand, 29644581 - 29644736
Alignment:
Q  46 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 145  Q
    ||||||| |||||||||| | || ||||||| || ||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |    
T  29644581 ggggaccatccacatcgaagctaaaacaaccgcataagcaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgggttctcttact 29644680  T
Q  146 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29644681 tataaggtgttcaacctttactctttaatccgatgtgggacatataactcacactt 29644736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 23 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 32589885 - 32589707
Alignment:
Q  23 ttgttggatcatgaggggagccagggg-accgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggc 121  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||    
T  32589885 ttgttggatcatgaagggagcgagggggaccgtccacatcgagcctagaacaaccacacaagcaagagagacatcgcactcttacccaaaaccttaaggc 32589786  T
Q  122 aatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    |||| |||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||| | |||||||  ||||| ||||||| ||||||||||    
T  32589785 aatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttattattttatcttatgtgggacatat-actcacactt 32589707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 94; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 37 - 201
Target Start/End: Original strand, 54017806 - 54017971
Alignment:
Q  37 ggggagccagggg-accgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatggg 135  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||  |  ||||||| |    
T  54017806 ggggagccagggggaccgcccacatcgaagctagaacaaccacacaagtaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcgttaggtttatgag 54017905  T
Q  136 ttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    | |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  54017906 tcctcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtaggacatataactcacactt 54017971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 92; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 46 - 201
Target Start/End: Original strand, 54018198 - 54018353
Alignment:
Q  46 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 145  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||  |  |||||||||| |||||| |    
T  54018198 ggggaccgcccacatcgaggctagaacaaccacacaagcatgagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcgttaggtttatgggtcctcttact 54018297  T
Q  146 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  54018298 tataaggtgttcaatctttactcttttatccgatgcaggacatataactcacactt 54018353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 54 - 195
Target Start/End: Original strand, 39934963 - 39935104
Alignment:
Q  54 tccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggt 153  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||| |||||| ||||||||||| |||||||| | |||||| |||||||||    
T  39934963 tccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacatcacactcttactcaaaactttaaggcaatgggtttatggatcctcttacttataaggt 39935062  T
Q  154 gttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactc 195  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  39935063 gttcaacctttactcttttatccgatgtaggacatataactc 39935104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 48 - 201
Target Start/End: Original strand, 42342092 - 42342245
Alignment:
Q  48 ggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttattta 147  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||    
T  42342092 ggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgagtcctcttactta 42342191  T
Q  148 taaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    |||||  || ||| |||||||||||||||||||||  |||||| | ||||||||    
T  42342192 taaggcattgaacatttactcttttatccgatgtggaacatatgaatcacactt 42342245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 89; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 46 - 201
Target Start/End: Original strand, 21832345 - 21832498
Alignment:
Q  46 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 145  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |  ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| |    
T  21832345 ggggactgtccacatcgaggctagaacaaccagacaagcaagagagacgc--cactcttacccaaaaccttaaggctatgagtttatgagtcctcttact 21832442  T
Q  146 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    ||||||||||| |||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  21832443 tataaggtgttcaacctttacttttctatccaatgtgggacatataactcacactt 21832498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 89; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 46 - 198
Target Start/End: Original strand, 33803252 - 33803404
Alignment:
Q  46 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 145  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  || ||||| | |||||| ||||||| ||||||| |||||| |||||||||| |||||| |    
T  33803252 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagagagggagacgccacactcttacccaataccttaatgcaatgggtttatgggtcctcttact 33803351  T
Q  146 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcaca 198  Q
    |||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  33803352 tatatggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcaca 33803404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 46 - 201
Target Start/End: Original strand, 12114562 - 12114717
Alignment:
Q  46 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 145  Q
    |||||||| |||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| |    
T  12114562 ggggaccgaccacatcgtggctagaacaaccgcacaagtaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgggtcctcttact 12114661  T
Q  146 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    ||||||||||| |||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||||||    
T  12114662 tataaggtgttcaacctttacttttctatccgatgtgggatatataacttacactt 12114717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 49 - 201
Target Start/End: Original strand, 32462903 - 32463056
Alignment:
Q  49 gaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttat 148  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||| ||  ||||| ||||    
T  32462903 gaccgtacacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttactcaaaaccttaaggcaatgggtttatgagtcttcttacttat 32463002  T
Q  149 aaggtgttaaacc-tttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    ||||| || |||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  32463003 aaggtattcaaccttttactcttctatccgatgtgggacatataactcacactt 32463056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 46 - 201
Target Start/End: Original strand, 25739425 - 25739580
Alignment:
Q  46 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 145  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||| ||||||||   |||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||| |    
T  25739425 ggggaccgtccacatcgaggctagaactaccgcacaagctagagagacgtcacactcttacccaaaacctaaaagcaatgagtttatgggtcctcttact 25739524  T
Q  146 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    |||| | |||| ||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25739525 tatatgatgttcaacttttactattttatccgatgtgggacatataactcacactt 25739580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 46 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 52634833 - 52634679
Alignment:
Q  46 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 145  Q
    |||||| ||| ||||| ||| |||||||||  ||||||||||||||||   |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |    
T  52634833 ggggacagtctacatcaaggctagaacaactgcacaagcaagagagacgtcacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatggg-tctcttact 52634735  T
Q  146 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    ||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  52634734 tataaggcgttcaacctttactgttttatccgatgtgggacatataactcacactt 52634679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 46 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 53577522 - 53577367
Alignment:
Q  46 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 145  Q
    ||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||  |||||||| | | ||||||    
T  53577522 ggggaccatccacaccgaggctagaacaaccacacttgcaagagagacaccacactcttacccaagaccttaaggcaatatgtttatggatccacttatt 53577423  T
Q  146 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    | |||| |||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  53577422 tttaagatgttcaacctttactgttttatccgatgtgtgacatataactcacactt 53577367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 44 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 45901874 - 45901716
Alignment:
Q  44 caggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctctta 143  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||  | ||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| ||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  45901874 caggggaccgtccacatcgaagttagaacaaccctataagtaagagagacaccacactcttaccaaaaactttaaggccatgagtttatgcgtcctctta 45901775  T
Q  144 tttataaggtgttaaacc-tttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
     |||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  45901774 cttataaggtgttcaacctttttttcttttatccgatgtgggacatataactcacactt 45901716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 81; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 46 - 182
Target Start/End: Original strand, 41359765 - 41359901
Alignment:
Q  46 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 145  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| | ||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |    
T  41359765 ggggaccgcccacatcgaggctagaacaaccacacaagcgagagagacgccacattcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 41359864  T
Q  146 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtg 182  Q
    |||||||| || |||||||||| || |||||||||||    
T  41359865 tataaggtattcaacctttactattgtatccgatgtg 41359901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 46 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 25755552 - 25755397
Alignment:
Q  46 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 145  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| | |||||  |||||| ||| ||| | |||||  |||||| || |||||| |    
T  25755552 ggggaccatccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacgccacacttttacccacaactttaggacaatggatttatgagtcctcttact 25755453  T
Q  146 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25755452 tataaggtattcaacctttactcttttatctgatgtgagacatataactcacactt 25755397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 76; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 45 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 31190168 - 31190020
Alignment:
Q  45 aggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttat 144  Q
    |||||| |||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||        ||||||| |||| |     
T  31190168 aggggagcgtccaaatcgaggctagaacaacccgacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggc--------tatgggtcctctaac 31190077  T
Q  145 ttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  31190076 ttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtgggacatatcactcacactt 31190020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 75; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 67 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 4823792 - 4823658
Alignment:
Q  67 tagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttac 166  Q
    ||||||| || || |||||| | |||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||| ||| |||||    
T  4823792 tagaacatccgcataagcaaaaaagacaccacactcttacccaaaatcttaaggcaatgagtttatgggtcctcctacttataaggtgtttaacttttac 4823693  T
Q  167 tcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4823692 tattttatccgatgtgagacttataactcacactt 4823658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 75; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 55 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 39389219 - 39389073
Alignment:
Q  55 ccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtg 154  Q
    ||||||| ||| ||||||||   |||| |||| |||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| || |||||||    
T  39389219 ccacatcaaggctagaacaattgcacaggcaaaagagacaccacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgggtcctcttagttttaaggtg 39389120  T
Q  155 ttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    || |||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  39389119 ttcaacctttactattttatccgatgtaggacatataactcacactt 39389073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 72 - 197
Target Start/End: Original strand, 3135099 - 3135224
Alignment:
Q  72 caaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttt 171  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||| |||| || ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| |||||| |||    
T  3135099 caaccgcacaagcaagagagacaccacactcttactcaaaaccttatggcagtgggtttatgggttcttttacttataaggtgttcaacatttactattt 3135198  T
Q  172 tatccgatgtgagacatataactcac 197  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||    
T  3135199 tatccgatgtgggacatataactcac 3135224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 54 - 201
Target Start/End: Original strand, 22303963 - 22304103
Alignment:
Q  54 tccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggt 153  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||| | |||| |||||||      
T  22303963 tccacatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacactcttatccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtccgcttacttataag-- 22304060  T
Q  154 gttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
         ||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  22304061 -----acctttactattttatctgatgtgggacatataactcacactt 22304103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 73; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 44 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 8328068 - 8327907
Alignment:
Q  44 caggggaccgtccacatcgaggttagaacaac----cacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttct 139  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||    | |||  |  |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |  |||||||||||||    
T  8328068 caggggagcgtccacatcgaggctagaacaactgcactcacttgtgagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcattacgtttatgggttct 8327969  T
Q  140 cttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    |||| ||||||| | || | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8327968 cttacttataagatattcatcctttactcttttatccgatgtgggacatataactcacactt 8327907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 73; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 57 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 39914399 - 39914255
Alignment:
Q  57 acatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgtt 156  Q
    ||||||||| |||||||||| || |||  |||||||||| |||||| || ||||||  |||||||| |  |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  39914399 acatcgaggctagaacaaccgcataagtgagagagacaccacactcttatccaaaatattaaggcattaggtttatgggtcctcttatttataaggtgtt 39914300  T
Q  157 aaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
     ||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  39914299 caacctctactgttttatctgatgtgagacatataactcacactt 39914255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 73; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 49 - 201
Target Start/End: Original strand, 45395656 - 45395808
Alignment:
Q  49 gaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttat 148  Q
    |||| |||||||||||| |||| ||||| ||||||  |||||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||| |||||||| | |||||| ||||    
T  45395656 gaccctccacatcgaggctagagcaaccccacaagtgagagagacaccacactcttacccaaaacattaagacaatgggtttatggatcctcttacttat 45395755  T
Q  149 aaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    || ||||| ||||||||||||||||| ||||||| || |||||||| ||||||    
T  45395756 aacgtgtttaacctttactcttttattcgatgtgggatatataacttacactt 45395808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 23 - 201
Target Start/End: Original strand, 32462535 - 32462714
Alignment:
Q  23 ttgttggatcatgaggggagccaggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggca 122  Q
    ||||||||||||||||||||   |||| ||||| ||||||||| || ||||| | ||||| |||||||||| | |||||| || |||||||||||| |||    
T  32462535 ttgttggatcatgaggggagtttgggggccgtctacatcgaggctaaaacaatcccacaaacaagagagaccccacactcttatccaaaaccttaaagca 32462634  T
Q  123 atgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacc-tttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    ||  |||||||| |  ||||| |||||||||||| |||| |||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||    
T  32462635 ataggtttatggatcatcttacttataaggtgttcaaccttttactctttcattcgatgtgggacatataactcacactt 32462714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 71; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 34 - 201
Target Start/End: Original strand, 33175646 - 33175819
Alignment:
Q  34 tgaggggagc-caggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagac---acgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtt 129  Q
    |||||||||| | |||||| | ||||| ||||| |||||||| ||||||||  ||||||||   || |||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  33175646 tgaggggagctcgggggactgcccacaccgaggctagaacaatcacacaagtgagagagacgtcac-acactcttacccaaaaccttaaggctatgagtt 33175744  T
Q  130 tat---gggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    |||   ||||||||||| |||||||||||| |||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33175745 tattatgggttctcttacttataaggtgttcaacctttacttttctatctgatgtgagacatataactcacactt 33175819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 71; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 35 - 201
Target Start/End: Original strand, 53117964 - 53118129
Alignment:
Q  35 gaggggagccaggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgg 134  Q
    |||||||||  ||||||||| |||||||| | ||||||||||||||  |  |||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||| |||| ||     
T  53117964 gaggggagctgggggaccgttcacatcgatgctagaacaaccacacttgtgagagagacactacactcttacccaaaatcttaaggcaatgggttt-tga 53118062  T
Q  135 gttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
     | |||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  53118063 atcctctcacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatatggaacatataactcacactt 53118129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 70; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 25 - 201
Target Start/End: Original strand, 3135432 - 3135616
Alignment:
Q  25 gttggatcatgaggggagccagggg-accgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaa 123  Q
    ||||| |||||||| ||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| || | |||||||||||||||    
T  3135432 gttgggtcatgaggagagtcagggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttatctaaaaccttaaggcaa 3135531  T
Q  124 tgagtttat--gggttctctta-----tttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    || ||||||  |||| ||||||      | |||||||||| ||| |||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||    
T  3135532 tgggtttatgggggtcctcttactaatataataaggtgttcaacttttactcttttatctgaggtgggacatataactcacactt 3135616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 46 - 201
Target Start/End: Original strand, 50612447 - 50612607
Alignment:
Q  46 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgag-----tttatgggttctc 140  Q
    ||||||||||||| |||||| | |||||||||| |||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||  |||  |     |||||| || |||    
T  50612447 ggggaccgtccacgtcgaggatggaacaaccactcaagcaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagataatatgttagatttatgagtcctc 50612546  T
Q  141 ttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    ||| |||||||||||| || ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  50612547 ttacttataaggtgttcaatctttactattttatccgatgtgggacatataactcacactt 50612607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 68; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 35 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 51886724 - 51886564
Alignment:
Q  35 gaggggagccaggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgg 134  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||||| |||||  |||| |||||||  |||||| || |||||||      |||||||||||||||    
T  51886724 gaggggagtcagggtaccgttcacatcgagattagaacaatcacacttgcaaaagagacatcacactcttatccaaaac------gcaatgagtttatgg 51886631  T
Q  135 gttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    || |||||| ||||| | |||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  51886630 gtcctcttacttatatgatgttcaacctttactattttattcgatgtgagacatataactcacactt 51886564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 34 - 201
Target Start/End: Original strand, 1634302 - 1634470
Alignment:
Q  34 tgaggggagccagggg-accgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttat 132  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||| | | |  ||||||| ||  ||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  1634302 tgaggggagctagggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccatata-gtgagagagataccgcactcttacccaaaaccttaagccaatgggtttat 1634400  T
Q  133 gggttctcttatttataaggtgttaaacc-tttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    |||| |||||| |||||| ||||| |||| |||| | || ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1634401 gggtcctcttacttataatgtgtttaaccttttatttttctatccgatgtgggacatataactcacactt 1634470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 54 - 201
Target Start/End: Original strand, 49336694 - 49336842
Alignment:
Q  54 tccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaa-gagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataagg 152  Q
    ||||||| |||| |||||||||| |||||  || ||||||||| |||||| |||||| ||| ||||| | ||| |||||||||| |||||| ||||||||    
T  49336694 tccacattgaggatagaacaaccgcacaaaaaaagagagacaccacactcttacccagaactttaagactatgggtttatgggtcctcttacttataagg 49336793  T
Q  153 tgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    || | |||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  49336794 tggtcaacctttacttttctatccgatgtgagacatgtaactcacactt 49336842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 46 - 201
Target Start/End: Original strand, 44160547 - 44160699
Alignment:
Q  46 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 145  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| | ||  || ||||||||| | ||| || |||| ||||||||||| ||||| |||||||| | ||||||||    
T  44160547 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaatcgca--agtaagagagacgccacattcttacc-aaaaccttaagacaatgggtttatggatcctcttatt 44160643  T
Q  146 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    ||||||||||| |||||||| | |||||||| || ||| |||||||||| ||||||    
T  44160644 tataaggtgttcaacctttattgttttatccaatatgaaacatataactgacactt 44160699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 47 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 11662108 - 11661954
Alignment:
Q  47 gggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaa-ccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 145  Q
    ||||| || |||||||||| ||||||||||||||||  | |||||||||  ||||| ||||||||| ||||||||||||  ||||||| |  |||| | |    
T  11662108 gggactgttcacatcgaggctagaacaaccacacaatga-gagagacacctcactcttacccaaaaaccttaaggcaattggtttatgaggcctctcact 11662010  T
Q  146 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||||    
T  11662009 tttaaggtgttcaacctttactcttttatccaatgtggggcatttaactcacactt 11661954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 55; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 49 - 143
Target Start/End: Original strand, 22303662 - 22303756
Alignment:
Q  49 gaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctctta 143  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| | |||||| |||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  22303662 gaccgtctacatcgaggctagaacaatcgcacaagtaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctctta 22303756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 62 - 201
Target Start/End: Original strand, 33362305 - 33362451
Alignment:
Q  62 gaggttagaacaaccacacaag----caagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgtta 157  Q
    ||||||||||||| ||||||||    ||||||||| ||| ||| | ||||||||| ||||||| |||| |||||||||| |||||| ||||||||| ||     
T  33362305 gaggttagaacaatcacacaagcaagcaagagagagacgccacacttacccaaaatcttaaggaaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtattc 33362404  T
Q  158 aacctttactcttttatccgatgtgaga---catataactcacactt 201  Q
    |||||||| | ||||||||||  |||||   ||||||||||||||||    
T  33362405 aacctttattattttatccgacatgagatatcatataactcacactt 33362451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 46 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 37726654 - 37726507
Alignment:
Q  46 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 145  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||| |||| | ||   |||||| || ||||||||| |||||||||        | | |||||| |    
T  37726654 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaactatacaagtaagataaacgtcacactcttatccaaaacctaaaggcaatg--------gatcctcttact 37726563  T
Q  146 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    |||||||| || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37726562 tataaggtattcaacatttactattttatccgatgtgagacatataactcacactt 37726507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 50; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 24 - 201
Target Start/End: Original strand, 39336208 - 39336384
Alignment:
Q  24 tgttggatcatgaggggagcca--ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggc 121  Q
    |||||||||| |||||||||||  ||||||| |||||||| |||  ||| ||||||||| ||| |||||| ||  |||||  || |||||||||||| ||    
T  39336208 tgttggatcacgaggggagccaagggggaccatccacatccaggc-agagcaaccacacgagcgagagaggca--acactattatccaaaaccttaaagc 39336304  T
Q  122 aatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    ||||||||||||| | |||| | |||||| ||||| |||||  |   || ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  39336305 aatgagtttatggatcctctcacttataaagtgttcaacctccaactttctatccgatgtgggacatataactcacactt 39336384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 46 - 120
Target Start/End: Original strand, 41359491 - 41359565
Alignment:
Q  46 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaagg 120  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||| |||||| | |||||| |||||||||||||||||    
T  41359491 ggggaccgtccacattgaggctagaacaaccgcacaagcaaaagagacgccacactcttacccaaaaccttaagg 41359565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 88 - 194
Target Start/End: Original strand, 42584864 - 42584970
Alignment:
Q  88 agagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagaca 187  Q
    |||||||| |||||| | | ||||| |||||| ||||  |||||||| | |||||| |||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  42584864 agagacaccacactctttctcaaaatcttaagacaattggtttatggatcctcttacttataaggtgttcaatctttactcttctatccgatgtgggaca 42584963  T
Q  188 tataact 194  Q
    |||||||    
T  42584964 tataact 42584970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 97 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 52635047 - 52634990
Alignment:
Q  97 acactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtg 154  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  52635047 acactcttacccaaaatcttaaggcaatgagtttatgggtcctcttatttataaggtg 52634990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 97 - 197
Target Start/End: Original strand, 3384317 - 3384417
Alignment:
Q  97 acactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactca 196  Q
    |||||| |||||||||| |||||||| | ||||||||||| |||||  |||||| ||||| ||||| |||| |||||||  ||||| |||||||||||||    
T  3384317 acactcttacccaaaactttaaggcattaagtttatgggtcctcttccttataaagtgtttaacctatactgttttatcatatgtgggacatataactca 3384416  T
Q  197 c 197  Q
    |    
T  3384417 c 3384417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 53 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 9240300 - 9240152
Alignment:
Q  53 gtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataagg 152  Q
    ||||||||||||| ||||| |||| ||| |   |||||||||| ||| || || || ||| ||||||| ||||  ||||||||| |||||| ||||||||    
T  9240300 gtccacatcgaggctagaataaccgcactattgagagagacaccacattcttatccgaaatcttaaggtaatggatttatgggtcctcttacttataagg 9240201  T
Q  153 tgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    |||| | | ||||||  | |||||||||||  |||||||||||||||||    
T  9240200 tgttcagcttttacttctctatccgatgtggaacatataactcacactt 9240152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 46 - 134
Target Start/End: Original strand, 54017548 - 54017636
Alignment:
Q  46 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgg 134  Q
    |||||||| |||||||||||  | ||||| |||| ||| || |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  54017548 ggggaccgaccacatcgaggccaaaacaatcacataagtaatagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgg 54017636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 76 - 162
Target Start/End: Original strand, 39336000 - 39336086
Alignment:
Q  76 cacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacct 162  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||  | | |||||||| ||||| |||||    
T  39336000 cacacaagcgagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgattttatgagtcttatcatttataaagtgttcaacct 39336086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 112 - 201
Target Start/End: Original strand, 7767380 - 7767469
Alignment:
Q  112 accttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    |||||||| ||||| ||||||| || |||||| |||||| ||||  |||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  7767380 accttaagacaatgggtttatgagtcctcttagttataaagtgtccaacctttacttttctatccgatgtgggacatataactcagactt 7767469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 46 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 22304351 - 22304302
Alignment:
Q  46 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacac 95  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22304351 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacac 22304302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 72 - 201
Target Start/End: Original strand, 47964544 - 47964673
Alignment:
Q  72 caaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttt 171  Q
    ||||||||||||  |||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| |||| | |||||  | ||| |||||  ||  ||     
T  47964544 caaccacacaagtgagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggcaataggtttatgggtcctctcacttatatagcgttcaacctccacatttc 47964643  T
Q  172 tatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    ||||||||| | |||||| |||||||||||    
T  47964644 tatccgatgcgggacatacaactcacactt 47964673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 149 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 22304301 - 22304249
Alignment:
Q  149 aaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22304301 aaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacactt 22304249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 138 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 11661601 - 11661538
Alignment:
Q  138 ctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    |||||| ||||||| |||| |||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11661601 ctcttacttataagatgtttaaccgttactattttatccgatgtgggacatataactcacactt 11661538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 92 - 138
Target Start/End: Original strand, 16871005 - 16871051
Alignment:
Q  92 acacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttc 138  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16871005 acacgacactcttacctaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttc 16871051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 47 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 8328427 - 8328374
Alignment:
Q  47 gggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacac 100  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  8328427 gggaccgtccacatcgaggctaaaacaaccccacaagcaagagagacaccacac 8328374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 148 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 43346706 - 43346653
Alignment:
Q  148 taaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  43346706 taaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatacaactcacactt 43346653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 46 - 124
Target Start/End: Original strand, 43978865 - 43978947
Alignment:
Q  46 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcc----tacccaaaaccttaaggcaat 124  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||| | ||||||     |||||||||||||||||||||    
T  43978865 ggggacagtccacatcgaggttagaacaaacacacaagtgagagagacgccacactctagcttacccaaaaccttaaggcaat 43978947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 97 - 201
Target Start/End: Original strand, 46546376 - 46546480
Alignment:
Q  97 acactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactca 196  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||| | |||||| ||||| |||||  ||  ||  |||| ||||  |||||||||||||    
T  46546376 acactcttacacaaaaccttaaggcaatgggtttatggattctctaacttataaagtgttcaacctccacatttcaatccaatgtaggacatataactca 46546475  T
Q  197 cactt 201  Q
    |||||    
T  46546476 cactt 46546480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 46 - 201
Target Start/End: Original strand, 47964915 - 47965070
Alignment:
Q  46 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 145  Q
    ||||| |||||||||| |||  ||||||| || | |||  |||||||| | |||||| ||||||||| |||||||||||| | ||||| |  |||| | |    
T  47964915 ggggaacgtccacatctaggccagaacaatcatataagtgagagagacgccacactcttacccaaaatcttaaggcaatgggcttatgagccctctcact 47965014  T
Q  146 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    ||||   |||| |||||  ||| || |||||||||| | |||||||||||||||||    
T  47965015 tatataatgtttaacctccacttttctatccgatgtaaaacatataactcacactt 47965070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 72 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 25317290 - 25317221
Alignment:
Q  72 caaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctct 141  Q
    ||||||||||||  ||||| |||| |||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  25317290 caaccacacaagtgagagacacactacacttttacccaaaaccttaaggcaacaagtttatgggtcctct 25317221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 98 - 138
Target Start/End: Original strand, 17735043 - 17735083
Alignment:
Q  98 cactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttc 138  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17735043 cactcttacccaaaaccttaagtcaatgagtttatgggttc 17735083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 98 - 138
Target Start/End: Original strand, 19036312 - 19036352
Alignment:
Q  98 cactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttc 138  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19036312 cactcttacccaaaaccttaagtcaatgagtttatgggttc 19036352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 24 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 9239994 - 9239940
Alignment:
Q  24 tgttggatcatgaggggagccagggg-accgtccacatcgaggttagaacaacca 77  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||| ||||| |||||    
T  9239994 tgttggatcatgaggggagcttgggggaccgtccacatcgaggctagaaaaacca 9239940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 92 - 138
Target Start/End: Original strand, 17731950 - 17731996
Alignment:
Q  92 acacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttc 138  Q
    |||| |||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17731950 acaccacactcttactcaaaaccttaaggcaatgggtttatgggttc 17731996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 92 - 138
Target Start/End: Original strand, 19033181 - 19033227
Alignment:
Q  92 acacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttc 138  Q
    |||| |||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19033181 acaccacactcttactcaaaaccttaaggcaatgggtttatgggttc 19033227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 86 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 53596078 - 53596028
Alignment:
Q  86 agagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggt 136  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  53596078 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggtaacgggtttatgggt 53596028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 86 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 53596393 - 53596343
Alignment:
Q  86 agagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggt 136  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  53596393 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggtaacgggtttatgggt 53596343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 37
Target Start/End: Original strand, 3134996 - 3135032
Alignment:
Q  1 aaaactagaaaggtacaatattttgttggatcatgag 37  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3134996 aaaattagaaaggtacaatattttgttgggtcatgag 3135032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 92 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 16143550 - 16143506
Alignment:
Q  92 acacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggt 136  Q
    |||| |||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  16143550 acactacactcttacccaaaactttaaggcaatgagcttatgggt 16143506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 105 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 25991502 - 25991406
Alignment:
Q  105 acccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    |||||||||||||||||| |  |||||| |||||||| | ||||||  |||| ||| || |||  |||||  |||||| ||||||| ||||||||||    
T  25991502 acccaaaaccttaaggcattaggtttataggttctctcacttataaaatgtttaacattaacttgtttatttgatgtgggacatattactcacactt 25991406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 115; Significance: 1e-58; HSPs: 65)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 24 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 6421566 - 6421388
Alignment:
Q  24 tgttggatcatgaggggagc-caggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggca 122  Q
    |||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||    
T  6421566 tgttgggtcacgaggggagctcgggggaccgtccacatcgagactagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaacctcaaggca 6421467  T
Q  123 atgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    ||||||||||| || |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6421466 atgagtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtgggacatataactcacactt 6421388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 112; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 46 - 201
Target Start/End: Original strand, 36178605 - 36178760
Alignment:
Q  46 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 145  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |    
T  36178605 ggggatcgtccacatagaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 36178704  T
Q  146 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  36178705 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacactt 36178760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 46 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 37106082 - 37105927
Alignment:
Q  46 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 145  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||| |    
T  37106082 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgtacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaatcttaaggcaatgagtttatgggtccccttact 37105983  T
Q  146 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  37105982 tataaggtgttcaacctttactattttattcgatgtgggacatataactcacactt 37105927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 46 - 201
Target Start/End: Original strand, 41283475 - 41283630
Alignment:
Q  46 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 145  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||| | |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  41283475 ggggaccgtccacatcaaggctagaacaaccacacaaacaagagagacgccacactcttacctaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcctcttact 41283574  T
Q  146 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  41283575 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatatgggacatataactcacactt 41283630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 102; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 52 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 15880415 - 15880266
Alignment:
Q  52 cgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataag 151  Q
    |||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||    
T  15880415 cgtccacatcgaggctaaaacaaccgcacaagcaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataag 15880316  T
Q  152 gtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  15880315 gtgttcaacctttactcttttatccgatgtggaacatataactcacactt 15880266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 102; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 48 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 37106344 - 37106191
Alignment:
Q  48 ggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttattta 147  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||| |||    
T  37106344 ggaccgtccacatcgaggctagaacaatcgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggaaatgggtttatgggtcctcttactta 37106245  T
Q  148 taaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  37106244 taaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacactt 37106191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 46 - 201
Target Start/End: Original strand, 14745667 - 14745822
Alignment:
Q  46 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 145  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |    
T  14745667 ggggactgtccacatcgaggctagaacaaccacacttgcaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 14745766  T
Q  146 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  14745767 tataaggtgttcaacctttactattttatccaatgtgggacatataactcacactt 14745822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 99; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 24 - 201
Target Start/End: Original strand, 5542602 - 5542780
Alignment:
Q  24 tgttggatcatgaggggagc-caggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggca 122  Q
    |||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||  | |||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||    
T  5542602 tgttggatcatggggggagctcgggggaccgtccacatcgagacttgaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggca 5542701  T
Q  123 atgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    ||  |||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||| |||||| |||| || ||||||||||||||||||    
T  5542702 ataggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttattcgatatgggacatataactcacactt 5542780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 97; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 49 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 962753 - 962601
Alignment:
Q  49 gaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttat 148  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||| | ||||    
T  962753 gaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagtgacaacacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgggtcctctcacttat 962654  T
Q  149 aaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    |||||||| |||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  962653 aaggtgttcaacctttacttttctatccgatgtgggacatataactcacactt 962601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 97; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 37 - 197
Target Start/End: Original strand, 15511486 - 15511646
Alignment:
Q  37 ggggagccaggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggt 136  Q
    |||||||  ||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||    
T  15511486 ggggagctcggggatcgtccacatcgagactagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaatcttaagacaatgggtttatgggt 15511585  T
Q  137 tctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcac 197  Q
     |||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  15511586 cctcttacttataacgtgttcaacctttactcttttatccgttgtgtgacatataactcac 15511646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 24 - 201
Target Start/End: Original strand, 5542975 - 5543153
Alignment:
Q  24 tgttggatcatgaggggagc-caggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggca 122  Q
    |||||||||||| ||||||| || || |||||||||||||||| | |||||||| ||||||||| |||||||| |||||| ||||||||| |||||||||    
T  5542975 tgttggatcatggggggagctcaaggtaccgtccacatcgaggcttgaacaaccgcacaagcaatagagacaccacactcttacccaaaatcttaaggca 5543074  T
Q  123 atgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    ||  |||||||| | |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  5543075 ataggtttatggatcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatcggatgtgggacatataactcacactt 5543153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 23 - 182
Target Start/End: Original strand, 36178147 - 36178307
Alignment:
Q  23 ttgttggatcatgaggggagc-caggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggc 121  Q
    ||||||| ||| ||||||||| | |||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||| ||||||||    
T  36178147 ttgttgggtcacgaggggagcgcgggggaccgtctacatcgaggctataacaaccacacaagcaagagaggcaccacactcttacccaaaatcttaaggc 36178246  T
Q  122 aatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtg 182  Q
    |||| |||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  36178247 aatgggtttatgggttcccttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtg 36178307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 24 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 42514830 - 42514652
Alignment:
Q  24 tgttggatcatgaggggagc-caggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggca 122  Q
    |||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||| | |||||| ||||||||| ||||||||     
T  42514830 tgttgggtcacgaggggagctcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccccacaagtaagagagacgccacactcttacccaaaatcttaaggcg 42514731  T
Q  123 atgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    ||| |||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||| || |||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  42514730 atgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttacttttctatctgatgtaggacatataactcacactt 42514652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 89; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 46 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 6713135 - 6712979
Alignment:
Q  46 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaa-ccttaaggcaatgagtttatgggttctcttat 144  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| | || ||||||||||||||  |||||| ||||||||| |||||| |||||  |||||||||| ||||||     
T  6713135 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaatcccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaaccttaaagcaataggtttatgggtcctcttac 6713036  T
Q  145 ttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    |||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6713035 ttataaggtgttcaacatttactgttttatccgatgtgagacatataactcacactt 6712979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 89; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 53 - 201
Target Start/End: Original strand, 36005887 - 36006034
Alignment:
Q  53 gtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataagg 152  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| | |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  36005887 gtccacatcgaggctagaacaaccccacaagcaagagagacgccacacttttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttataagg 36005986  T
Q  153 tgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    |||| ||| |||||| || ||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  36005987 tgttcaacttttact-ttctattcgatgtgggacatataactcacactt 36006034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 22 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 6422293 - 6422126
Alignment:
Q  22 tttgttggatcatgaggggagccagggg-accgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaagg 120  Q
    |||||||| ||||| |||||  |||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||    
T  6422293 tttgttgggtcatggggggaatcagggggacagtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacctaaaaccttaagg 6422194  T
Q  121 caatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacat 188  Q
    | ||| |||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||||||| ||||||| |||||| |||||    
T  6422193 ctatgggtttatgggtcctcttaattataatgtgttcaacctttacttttttatctgatgtgggacat 6422126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 48 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 33731804 - 33731653
Alignment:
Q  48 ggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttattta 147  Q
    |||||||  ||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||  |||||||| | |||||| |||    
T  33731804 ggaccgtttacatcgaggctagaacaaccgcataagcaagagagacaccatactcttacccaaaaccttaaggcaataggtttatggatcctcttactta 33731705  T
Q  148 taaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacac 199  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  33731704 taaggtgctcaacctttactcttttatccgatgtgagatatataactcacac 33731653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 46 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 29676687 - 29676543
Alignment:
Q  46 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 145  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||      ||||||||||||||||||||||| | |    
T  29676687 ggggaccgtccacatcgaggtttgaataaccccacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaa------ggcaatgagtttatgggttctctcact 29676594  T
Q  146 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactca 196  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  29676593 tataatgtgttcaatctttactcttttatccaatgtgagacatataactca 29676543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 46 - 201
Target Start/End: Original strand, 35580724 - 35580878
Alignment:
Q  46 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 145  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||| |  ||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||| | |    
T  35580724 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccccacaaacaagagagacgccgcactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttat-ggtcctctcact 35580822  T
Q  146 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    ||||||||||| ||| |||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  35580823 tataaggtgttcaacatttattgttttatccgatgtgggacatataactcacactt 35580878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 82; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 23 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 23346418 - 23346250
Alignment:
Q  23 ttgttggatcatgaggggagccaggg-gaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggc 121  Q
    ||||||| |||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||  |||||| |||| |||||||||||||    
T  23346418 ttgttgggtcatgaggggagctcgggcgaccgtccacatctaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacatcacactcttaccgaaaaccttaaggc 23346319  T
Q  122 aatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatata 191  Q
     ||| |||||||||  |||||| |||||||||||| |||||||||| || ||| ||||||||||||||||    
T  23346318 tatgggtttatgggccctctta-ttataaggtgtttaacctttacttttctatacgatgtgagacatata 23346250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 82; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 49 - 198
Target Start/End: Original strand, 40679632 - 40679781
Alignment:
Q  49 gaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttat 148  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| |||||| ||||||||| | |||||| ||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||    
T  40679632 gaccgtccacatcgagactagaacaaccccacaagtaagagagacgccacactcttacccaaaatcttaaggcgatgggtttatgggttctcttacttat 40679731  T
Q  149 aaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcaca 198  Q
    |||||||| |||| ||||| || |||||||| || |||||||||||||||    
T  40679732 aaggtgttcaacccttacttttctatccgatatgggacatataactcaca 40679781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 34 - 201
Target Start/End: Original strand, 37632586 - 37632752
Alignment:
Q  34 tgaggggagccaggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatg 133  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||  | |||||| |||| |||||| ||||||||||||||| |  ||| |||||||    
T  37632586 tgaggggagccagggg-ccgtccacatcgaggctagaacaatcacacttgtaagagatacaccacactcttacccaaaaccttaaagttatgggtttatg 37632684  T
Q  134 ggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    ||| |||||| ||||||  ||| ||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  37632685 ggtcctcttacttataaaatgtcaaacctttactattttatccgatgtaggacatataactcacactt 37632752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 24 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 1770073 - 1769895
Alignment:
Q  24 tgttggatcatgaggggagccagg-ggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggca 122  Q
    |||||| ||||  ||||||| ||| ||| ||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||  |||| | | || ||     
T  1770073 tgttgggtcattgggggagctaggaggatcgttcacatcgaggctagaacaacctcacaagcaagagagacaccacactcttattcaaagcttcaaagct 1769974  T
Q  123 atgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    ||||||||||| || |||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1769973 atgagtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacttttactcttttatccgatgtgtgacatataactcacactt 1769895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 24 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 7598409 - 7598231
Alignment:
Q  24 tgttggatcatgaggggagc-caggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggca 122  Q
    |||||| ||| ||||||||  ||||||||||| |||||||||| | |||||||| ||||||  |||||||||| | | || ||||||||||||||||||     
T  7598409 tgttgggtcacgaggggagatcaggggaccgttcacatcgaggcttgaacaaccgcacaagtgagagagacaccatattcttacccaaaaccttaaggct 7598310  T
Q  123 atgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| || ||| ||||||   |||||||| ||||||||    
T  7598309 atgagtttatgggtcctcttatttataaggtgttgaacctttacttttctattcgatgtagaacatataattcacactt 7598231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 67 - 200
Target Start/End: Original strand, 28254260 - 28254391
Alignment:
Q  67 tagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttac 166  Q
    |||||||||| ||||||  |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||| |||||||||    
T  28254260 tagaacaaccccacaag--agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttataagatgttcaacctttac 28254357  T
Q  167 tcttttatccgatgtgagacatataactcacact 200  Q
    | || ||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  28254358 ttttctatccgatgtgggacatataagtcacact 28254391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 47 - 201
Target Start/End: Original strand, 38796619 - 38796775
Alignment:
Q  47 gggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgaca--ctcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttat 144  Q
    ||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| |||||| | |||  ||| ||||||||||||||||||| |  |||||||||| ||||||     
T  38796619 gggaccgtcgacatcgaggcttgaacaaccacacaagcaatagagacgccacatactcttacccaaaaccttaaggcattaggtttatgggtcctcttac 38796718  T
Q  145 ttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    |||||||||||| |||||||| | ||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  38796719 ttataaggtgttcaacctttattgttttatcagatgtgggacatataactcacactt 38796775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 76; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 46 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 40734040 - 40733886
Alignment:
Q  46 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 145  Q
    |||||||||||||||||||  | |||||||||||||||| ||| |||||| |||||| |||||||||| |||||||  | || ||||| |  |||||| |    
T  40734040 ggggaccgtccacatcgagacttgaacaaccacacaagcgagacagacaccacactcttacccaaaactttaaggctgt-aggttatgagccctcttact 40733942  T
Q  146 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  40733941 tataaggtgttaaatctttactcttttattcgatgtgggacatataactcacactt 40733886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 47 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 29677065 - 29676908
Alignment:
Q  47 gggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtt-----ctct 141  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||| |||||  ||||||||||| |||||| |||  ||| ||||||||||||| ||||||||||      ||||    
T  29677065 gggaccatccacatcgaggttggaacaaccccacaattaagagagacaccacactcttacttaaagccttaaggcaatgggtttatgggtcttctcctct 29676966  T
Q  142 tatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacac 199  Q
     |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29676965 cacctataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgggacatataactcacac 29676908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 24 - 193
Target Start/End: Original strand, 40163349 - 40163520
Alignment:
Q  24 tgttggatcatgaggggagc-caggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaacctt-aaggc 121  Q
    |||||| ||||  ||||||| |||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||| ||| |    
T  40163349 tgttgggtcatagggggagctcaggagaccatctacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacaccacacttttacccaaaaccttaaagac 40163448  T
Q  122 aatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataac 193  Q
    | |  ||| ||||||  ||||| |||||||||||| |||||||||| || ||||||||||| ||||||||||    
T  40163449 actaggttaatgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttacttttctatccgatgtgggacatataac 40163520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 46 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 40733675 - 40733520
Alignment:
Q  46 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 145  Q
    ||||||| |||||||||||  | |||| ||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||   |  |||||||||| |||||| |    
T  40733675 ggggaccatccacatcgagacttgaactaccacacaagcgagagagacaccacactcttacccaaaactttaaggttgtaggtttatgggtcctcttact 40733576  T
Q  146 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    ||||||||||| ||| |||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  40733575 tataaggtgttcaacatttacttttttatctgatgtgggacatataactcacactt 40733520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 70; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 48 - 201
Target Start/End: Original strand, 28531316 - 28531469
Alignment:
Q  48 ggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttattta 147  Q
    ||||| |||||||||||| |||| ||||  || ||   |||||| ||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||| |||    
T  28531316 ggaccatccacatcgaggctagagcaactgcataactgagagagtcaccacactcttacccaaaatcttaaggcaatgagtttatgggacctcttactta 28531415  T
Q  148 taaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    ||||||||| ||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28531416 taaggtgttcaacctttgcttttctatccgatgtgggacatataactcacactt 28531469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 25 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 6421911 - 6421793
Alignment:
Q  25 gttggatcatgaggggagc-caggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaa 123  Q
    ||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  6421911 gttgggtcatgaggggagctcgggggaccgtccacatcgaggccagaacaaccacacaagttagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaa 6421812  T
Q  124 tgagtttatgggttctctt 142  Q
    |  |||||||||| |||||    
T  6421811 taggtttatgggtcctctt 6421793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 53 - 198
Target Start/End: Original strand, 14745300 - 14745446
Alignment:
Q  53 gtccacatcgaggttagaacaaccac-acaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataag 151  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||   |||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| || ||| |||    
T  14745300 gtccacatcgaggctagaacaaccaccacttacaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcatacttacaag 14745399  T
Q  152 gtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcaca 198  Q
     |||| |||| ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  14745400 atgttcaaccattactattttattcgatgtgggacatataactcaca 14745446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 97 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 16542556 - 16542452
Alignment:
Q  97 acactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactca 196  Q
    |||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||    
T  16542556 acactcttactcaaaatcttaaggcaatgagtttataagtcctcttatttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacttataactca 16542457  T
Q  197 cactt 201  Q
    |||||    
T  16542456 cactt 16542452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 62; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 60 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 5367599 - 5367458
Alignment:
Q  60 tcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaa 159  Q
    |||||| |||||||||  |||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||  ||| ||| |||| |  ||||| |||||||||||| ||    
T  5367599 tcgaggctagaacaactgcacaagcaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggttatgtgttcatggatcatcttacttataaggtgttcaa 5367500  T
Q  160 cctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||||||||  ||||||||    
T  5367499 cctttgctcttttatccgatctgggacatatatatcacactt 5367458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 62; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 51 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 7598754 - 7598612
Alignment:
Q  51 ccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataa 150  Q
    ||||||||||||| | | |||||||||||||||  |||||||||| |||||| |||| ||||| ||||||        |||||||| |||||| ||||||    
T  7598754 ccgtccacatcgatgcttgaacaaccacacaagtgagagagacaccacactcttaccaaaaacgttaagg--------ttatgggtcctcttacttataa 7598663  T
Q  151 ggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    |||||| |||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  7598662 ggtgttcaacctttacttttttatctgatgtgggacatataactcacactt 7598612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 62; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 56 - 201
Target Start/End: Original strand, 12529038 - 12529183
Alignment:
Q  56 cacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgt 155  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||  || || | ||||| ||||||||||||||||||| || |||||| ||||| |||||    
T  12529038 cacattgaggttagaacaaccgcacaaacaagagagacactacgttcttatctaaaactttaaggcaatgagtttatgagtcctcttacttatacggtgt 12529137  T
Q  156 taaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    | || ||||||| ||||||  |||||  ||||||||||||||||||    
T  12529138 tcaatctttactgttttatttgatgtaggacatataactcacactt 12529183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 60; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 97 - 201
Target Start/End: Original strand, 31468801 - 31468901
Alignment:
Q  97 acactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactca 196  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    ||| | || |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  31468801 acactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcctcttat----aagatattcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactca 31468896  T
Q  197 cactt 201  Q
    |||||    
T  31468897 cactt 31468901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 59; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 37 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 3673236 - 3673122
Alignment:
Q  37 ggggagccagggg-accgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatggg 135  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||  |||||| || |||||| ||||| |||||||||||||||     
T  3673236 ggggagccagggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacactagtaagagagacatcacactcttagccaaaatcttaaagcaatgagtttatgga 3673137  T
Q  136 ttctcttatttataa 150  Q
    | |||||| ||||||    
T  3673136 tcctcttacttataa 3673122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 21 - 114
Target Start/End: Original strand, 31899077 - 31899170
Alignment:
Q  21 ttttgttggatcatgaggggagccaggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaacc 114  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||||    
T  31899077 ttttgttggatcatgaggggagcttggggaccgttcacatcgaggttagaagaaccccacaagcaagagagatacctcactcttacccaaaacc 31899170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 116 - 201
Target Start/End: Original strand, 31899496 - 31899581
Alignment:
Q  116 taaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  31899496 taaggcaatgagtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacatttactattttatccgatgtggaacatataactcacactt 31899581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 57; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 37 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 3672869 - 3672773
Alignment:
Q  37 ggggagccagggga-ccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttat 132  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  3672869 ggggagccaggggaaccgtccacatcgagactagaacaaccacacaattaagagagacaccacactcttacccaaaatcttaaggcaatgggtttat 3672773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 57; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 97 - 201
Target Start/End: Original strand, 36178320 - 36178424
Alignment:
Q  97 acactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactca 196  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||| || | |||| ||||||||||||  ||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||    
T  36178320 acactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtccccttacttataaggtgttccacctttactattttatccgaagtgggacatataactca 36178419  T
Q  197 cactt 201  Q
    |||||    
T  36178420 cactt 36178424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 55; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 88 - 201
Target Start/End: Original strand, 31259658 - 31259774
Alignment:
Q  88 agagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatcc---gatgtgag 184  Q
    ||||| || |||||| |||||||||||||||||  ||  ||||||||||  ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||   ||||||||    
T  31259658 agagataccacactcttacccaaaaccttaaggtgataggtttatgggtcatcttacttataaggtgttgaacctttactcttttatccgatgatgtgag 31259757  T
Q  185 acatataactcacactt 201  Q
    ||||||||||| |||||    
T  31259758 acatataactcgcactt 31259774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 54; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 72 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 30313309 - 30313189
Alignment:
Q  72 caaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttt 171  Q
    ||||||||||||  |||||||| | |||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| | |||||| ||||| |||||  ||| ||     
T  30313309 caaccacacaagtgagagagacgccacactcttacccaaaatcttaaggcaatgagtttttgggtcctctcacttataa-gtgttcaacctccacttttc 30313211  T
Q  172 tatccgatgtgagacatataac 193  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  30313210 tatccgatgtgagacatataac 30313189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 46 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 9231407 - 9231252
Alignment:
Q  46 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 145  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||| |||| || |||  ||||||| || |||||| || ||||||| |||||||  || ||| |||| | ||||||||    
T  9231407 ggggatcgtccacatcaaggttagaataaccgcataagttagagagatactacactcttaaccaaaactttaaggcggtgggttgatggatcctcttatt 9231308  T
Q  146 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    |||||  |||| |||||||||| || |||| ||| |||||||||||||||| ||||    
T  9231307 tataatatgttcaacctttacttttctatctgatatgagacatataactcatactt 9231252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 50; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 24 - 201
Target Start/End: Original strand, 33561429 - 33561606
Alignment:
Q  24 tgttggatcatgaggggagccaggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaa 123  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||   | ||| |||  ||| ||| || | |||  ||||||| |  |||||| |||||||||||||||| |||    
T  33561429 tgttgggtcatgaggggagcccggggaccgcatatatctaggcaagagcaatcataaaagtgagagagatatcacactcttacccaaaaccttaagacaa 33561528  T
Q  124 tgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    ||||||||||||| |||| | |||||| ||||| |||||  ||| || |||| ||||||  |||||||||||||||||    
T  33561529 tgagtttatgggtcctctcacttataaagtgtttaacctccacttttctatctgatgtggaacatataactcacactt 33561606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 92 - 196
Target Start/End: Original strand, 37895107 - 37895211
Alignment:
Q  92 acacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatata 191  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| || |||||| || ||| |||| | || ||||||||||| ||||||||    
T  37895107 acaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgtgttcttttacttttaaggttttcaacttttatttttctatccgatgtgggacatata 37895206  T
Q  192 actca 196  Q
    |||||    
T  37895207 actca 37895211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 127 - 201
Target Start/End: Original strand, 38796299 - 38796373
Alignment:
Q  127 gtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    |||||| ||| |||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  38796299 gtttataggtcctcttacttataaggtgttcaacatttactgttttatccgatgtgggacatataactcacactt 38796373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 50 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 6421780 - 6421688
Alignment:
Q  50 accgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctctt 142  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||||||||  |||||||||| |||||| ||||||||||||| || ||||  |||||||||| |||||    
T  6421780 accgtccacatcgaggccggaacaaccacacaagttagagagacaccacactcttacccaaaacctttagtcaataggtttatgggtcctctt 6421688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 53 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 16591034 - 16590891
Alignment:
Q  53 gtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataagg 152  Q
    |||||||| |||| |||||||||| |||||| ||||||||||  | | || |||  ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||          
T  16591034 gtccacattgaggctagaacaaccccacaagtaagagagacattagattcttacttaaaaccttaaggcaatgtgtttatgggtcctcttactt------ 16590941  T
Q  153 tgttaaacctttac-tcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    |||| ||||||||| | ||||||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  16590940 tgttcaacctttactttttttatttgatgtgggacatataactcacactt 16590891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 147 - 201
Target Start/End: Original strand, 36785664 - 36785718
Alignment:
Q  147 ataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  36785664 ataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacactt 36785718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 99 - 188
Target Start/End: Original strand, 28254165 - 28254254
Alignment:
Q  99 actcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacat 188  Q
    |||| ||||| |||| ||||||||| | ||||||| || |||||| |||||| ||||| |||||||||| || |||||||||||||||||    
T  28254165 actcttaccctaaactttaaggcaaagtgtttatgagtcctcttacttataaagtgttcaacctttacttttctatccgatgtgagacat 28254254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 97 - 201
Target Start/End: Original strand, 29874074 - 29874178
Alignment:
Q  97 acactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactca 196  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||| |||  | |||||| ||||| |||||  ||| || |||| |||||| |||||||||| ||    
T  29874074 acactcttatccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcccaattataaagtgttcaacctccacttttctatctgatgtgggacatataacaca 29874173  T
Q  197 cactt 201  Q
    |||||    
T  29874174 cactt 29874178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 59 - 151
Target Start/End: Original strand, 36784273 - 36784365
Alignment:
Q  59 atcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataag 151  Q
    ||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||||||| ||| | ||||||||||  ||||| |||||||    
T  36784273 atcgaggcttgaataaccacacaagcaagagagacacaacacttttatccaaaaccttaagacaaagggtttatgggtcatcttacttataag 36784365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 87 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 30323581 - 30323467
Alignment:
Q  87 gagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagac 186  Q
    ||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| | || ||| ||||| |||||  | | || |||| ||| || |||    
T  30323581 gagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttataggtcctctcacttctaaagtgttcaacctccaattttctatctgatttgggac 30323482  T
Q  187 atataactcacactt 201  Q
    ||||||| |||||||    
T  30323481 atataacacacactt 30323467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 73 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 31385868 - 31385740
Alignment:
Q  73 aaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactctttt 172  Q
    |||||||||||  | |||||||| |||||  | |||||||||||||||||||| |||||||||| || | | |||||||||| | |||||  | | || |    
T  31385868 aaccacacaagtgaaagagacaccacacttattcccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctttcacttataaggtgctcaacctccatttttct 31385769  T
Q  173 atccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    | ||||||| |||| | ||||||||||||    
T  31385768 aaccgatgtcagacttctaactcacactt 31385740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 158 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 6421350 - 6421307
Alignment:
Q  158 aacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  6421350 aacctttactcttttatccgatgtgggacatataacttacactt 6421307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 133
Target Start/End: Original strand, 29873525 - 29873624
Alignment:
Q  35 gaggggagccagg-ggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatg 133  Q
    ||||||||||||| |||||| | ||||| ||   ||| ||||||||||||  ||||||||   |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  29873525 gaggggagccaggaggaccgcctacatccagaccagagcaaccacacaagtgagagagacgtcacactcttactcaaaaccttaaggcaatgagtttatg 29873624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 48 - 201
Target Start/End: Original strand, 3594180 - 3594333
Alignment:
Q  48 ggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttattta 147  Q
    ||||||| |||||||||||||||| || ||||| || | |||||| |  |||||| ||| ||||| ||||| |||||| |||||||| | || | | |||    
T  3594180 ggaccgttcacatcgaggttagaataaacacactagtatgagagatatcacactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctatcactta 3594279  T
Q  148 taaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    ||| |||||  ||||  ||| || ||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  3594280 taaagtgttcgacctccacttttctattcgttgtgaaacatacaactcacactt 3594333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 50 - 136
Target Start/End: Original strand, 35580443 - 35580530
Alignment:
Q  50 accgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcc--tacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggt 136  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||| | | | ||||||| | ||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35580443 accgtccacatcgaggctaaaacaatcacataggga-gagagacgccacactctcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggt 35580530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 86 - 198
Target Start/End: Original strand, 37894732 - 37894844
Alignment:
Q  86 agagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgaga 185  Q
    ||||| |||| |||||  || |||||| ||||||||||||  |||||| ||  ||||| ||||||||| || | |||||||| || ||| | ||||| ||    
T  37894732 agagacacaccacacttttaaccaaaatcttaaggcaatggatttatgagtcttcttacttataaggtttttagcctttacttttctattcaatgtggga 37894831  T
Q  186 catataactcaca 198  Q
    |||||||||||||    
T  37894832 catataactcaca 37894844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 97 - 201
Target Start/End: Original strand, 41678419 - 41678524
Alignment:
Q  97 acactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagac--atataact 194  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||| | |||||||||| |||| | |||||| ||||| |||||   || || |||| ||||||||||  ||||||||    
T  41678419 acactcttactcaaaaccttaaggcaaag-gtttatgggtcctctcacttataaagtgtttaacctccccttttctatctgatgtgagacatatataact 41678517  T
Q  195 cacactt 201  Q
    |||||||    
T  41678518 cacactt 41678524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 108 - 149
Target Start/End: Original strand, 13091833 - 13091874
Alignment:
Q  108 caaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttata 149  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||    
T  13091833 caaaaccttaagacattgagtttatgggttctctcatttata 13091874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 145 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 42515075 - 42515031
Alignment:
Q  145 ttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacata 189  Q
    |||||||||||| |||||||||| || ||||||||||| ||||||    
T  42515075 ttataaggtgtttaacctttacttttctatccgatgtgggacata 42515031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 113; Significance: 2e-57; HSPs: 45)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 37 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 35210371 - 35210207
Alignment:
Q  37 ggggagccaggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggt 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||| ||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  35210371 ggggagccaggggaccgtccacatcgaggctagagcaaccgcacaagcaaaagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatggttttatgggt 35210272  T
Q  137 tctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
     |||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35210271 cctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgagacatataactcacactt 35210207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 112; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 46 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 29518661 - 29518506
Alignment:
Q  46 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 145  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||| |    
T  29518661 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggtaatgggtttatgggtcctcttact 29518562  T
Q  146 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29518561 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacactt 29518506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 112; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 46 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 29519078 - 29518923
Alignment:
Q  46 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 145  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||| |    
T  29519078 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggtaatgggtttatgggtcctcttact 29518979  T
Q  146 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29518978 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacactt 29518923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 112; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 46 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 32741337 - 32741182
Alignment:
Q  46 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 145  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||| |    
T  32741337 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggtaatgggtttatgggtcctcttact 32741238  T
Q  146 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  32741237 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacactt 32741182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 109; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 20 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 2843740 - 2843560
Alignment:
Q  20 attttgttggatcatgaggggagccagggg-accgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaa 118  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||    
T  2843740 attttgttggatcatgaggggagttagggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagataccacactcttacccaaaaccttaa 2843641  T
Q  119 ggcaatgagtttat-gggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcaca 198  Q
    |||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2843640 ggcaatgagtttatggggtcctcttacttataaggtgttcaacttttattattttatccgatgtgaaacatataactcaca 2843560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 46 - 201
Target Start/End: Original strand, 14748342 - 14748493
Alignment:
Q  46 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 145  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    | |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  14748342 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagaga----ccacactcttacccaaaaccttaacgcaatgagtttatgggtcctcttatt 14748437  T
Q  146 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14748438 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacactt 14748493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 17 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 16455095 - 16454913
Alignment:
Q  17 aatattttgttggatcatgaggggagc-caggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaacct 115  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||    
T  16455095 aatatgttgttggattatgaggggagctcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacgccacactcttacccaaaacct 16454996  T
Q  116 taaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcaca 198  Q
    |||||||||  |||||||||| || ||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||    
T  16454995 taaggcaataggtttatgggtcctattacttataaggtgttcaacctttactcttttatctgatgtgggacacataactcaca 16454913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 24 - 201
Target Start/End: Original strand, 2579850 - 2580027
Alignment:
Q  24 tgttggatcatgaggggagccaggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaa 123  Q
    |||||| | |||||||||||  ||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||      
T  2579850 tgttgggtaatgaggggagcttggggaccttccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacattcttacccaaaaccttaaggctg 2579949  T
Q  124 tgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    || |||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2579950 tgggtttatgggtcctcttacttataatgtgttcaacctttactcttttatccgatgtgggacatataactcacactt 2580027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 56 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 3409407 - 3409262
Alignment:
Q  56 cacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgt 155  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  3409407 cacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttataaggtgt 3409308  T
Q  156 taaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    | |||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  3409307 tcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacactt 3409262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 18 - 201
Target Start/End: Original strand, 2578414 - 2578597
Alignment:
Q  18 atattttgttggatcatgaggggagccagggg-accgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaacctt 116  Q
    |||| ||||||| |||||||||| || ||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||    
T  2578414 atatattgttgggtcatgaggggggctagggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttacccaaaacctt 2578513  T
Q  117 aaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    ||||| ||| |||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  2578514 aaggctatgggtttatgggtcctcttacttataaagtgttcaacctttactcttttatccg-tgtgggacatataactcacactt 2578597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 46 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 2377912 - 2377757
Alignment:
Q  46 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 145  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |    
T  2377912 ggggaccttccacatcgaggctagaaaaaccactcaagcaagaaagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 2377813  T
Q  146 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  2377812 tataaggtgttcaacctttactcttttaaccgatgtgggacatataactcacactt 2377757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 46 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 2378284 - 2378129
Alignment:
Q  46 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 145  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||| || |||| |||||||||||| |||| |||||||||| |||||| |    
T  2378284 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacattcttacctaaaaccttaaggtaatgggtttatgggtcctcttact 2378185  T
Q  146 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2378184 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacactt 2378129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 46 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 1846906 - 1846751
Alignment:
Q  46 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 145  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| || |||||||||||||||||||  ||||||||| |||||| |    
T  1846906 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttatccaaaaccttaaggcaatggatttatgggtgctcttact 1846807  T
Q  146 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  1846806 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgagacatagaattcacactt 1846751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 31 - 201
Target Start/End: Original strand, 2578819 - 2578989
Alignment:
Q  31 tcatgaggggagccagggg-accgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtt 129  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  2578819 tcatgaggggagcctgggggaccgtccacatcgaggtcagaacaaccacacaagcaaaagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggtaatgagtt 2578918  T
Q  130 tatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    ||||| | |||||||||||||||| || ||| |||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  2578919 tatggatcctcttatttataaggtattcaacatttact-ttttatccgatgagggacatataaatcacactt 2578989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 99; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 55 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 16107827 - 16107681
Alignment:
Q  55 ccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtg 154  Q
    ||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||||||||    
T  16107827 ccacatcgaggctagagcaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgagtcctcttacttataaggtg 16107728  T
Q  155 ttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    || |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16107727 tttaacctttacttttttatccgatgtgacacatataactcacactt 16107681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 46 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 3058384 - 3058229
Alignment:
Q  46 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 145  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| || |    
T  3058384 ggggacggtccacatcgaggttagaaccaccctacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatggatcctcatact 3058285  T
Q  146 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  3058284 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactaacactt 3058229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 24 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 16454756 - 16454578
Alignment:
Q  24 tgttggatcatgaggggagc-caggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggca 122  Q
    |||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| | |||||| || |||||| |||||||||    
T  16454756 tgttgggtcacgaggggagctcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacgccacactcttatccaaaatcttaaggca 16454657  T
Q  123 atgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    ||| |||||||||| |||||| |||||||||||| ||| |||| ||||||||| |||||| |||| |||||||||||||    
T  16454656 atgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacttttattcttttatctgatgtgggacacataactcacactt 16454578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 92; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 26 - 201
Target Start/End: Original strand, 5832007 - 5832181
Alignment:
Q  26 ttggatcatgaggggagccaggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatg 125  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||  ||||||||| |||||||   ||    
T  5832007 ttgggtcatgaggggagcctggggaccgtctacatcgaggctagaacaaccacacaagtaagagagacaccacacttttacccaaaatcttaagg-ggtg 5832105  T
Q  126 agtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
      ||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||    
T  5832106 gctttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccaatgtgggacatataacttacactt 5832181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 92; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 54 - 201
Target Start/End: Original strand, 10074371 - 10074518
Alignment:
Q  54 tccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggt 153  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||  |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  10074371 tccacatcgaggctagaacaaccacactagtgagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttataaggt 10074470  T
Q  154 gttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    ||| |||||||||| || ||||||||||| ||| | ||||||||||||    
T  10074471 gttcaacctttacttttctatccgatgtgggacctctaactcacactt 10074518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 34 - 199
Target Start/End: Original strand, 2579479 - 2579645
Alignment:
Q  34 tgaggggagccagggga-ccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttat 132  Q
    ||||||||||| | ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2579479 tgaggggagcctgtggaaccatccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacaccatacttttacccaaaaccttaaggcaatgagtttat 2579578  T
Q  133 gggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacac 199  Q
    |||  |||||| ||||||||| |   ||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  2579579 gggccctcttacttataaggtatccgacctttacttttttgtccgatgtgggacatataactcacac 2579645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 46 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 3409818 - 3409663
Alignment:
Q  46 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 145  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||  | ||||||||| |||||||||| |||||| |    
T  3409818 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaaataaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 3409719  T
Q  146 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    |||||| |||| ||| |||||| ||||||| ||||||  |||||||||||||||||    
T  3409718 tataagatgttcaacttttactattttatctgatgtggtacatataactcacactt 3409663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 46 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 3415618 - 3415462
Alignment:
Q  46 ggggaccgtccacatcgaggttaga--acaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctctta 143  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||  |||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  3415618 ggggaccttccacatcgaggctagagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctctta 3415519  T
Q  144 tttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacact 200  Q
     ||||| |||||| |||||||||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  3415518 cttatatggtgttcaacctttactattttatgtgatgtgggacatataactcacact 3415462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 45 - 197
Target Start/End: Original strand, 10073990 - 10074142
Alignment:
Q  45 aggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttat 144  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||| | |||| |||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||     
T  10073990 aggggaccgtccacgtcgaggctagaacaaccaaataagcgagagagacaccacacttttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttac 10074089  T
Q  145 ttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcac 197  Q
    |||||||||||| ||| |||||| || ||||||||||| || |||||||||||    
T  10074090 ttataaggtgttcaacgtttacttttctatccgatgtgggatatataactcac 10074142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 81; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 46 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 1127518 - 1127366
Alignment:
Q  46 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 145  Q
    |||||||  |||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||| || |||||| |    
T  1127518 ggggaccacccacatcgaggttagagcaaccacataagtaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggtaatgggtttatgagtcctcttact 1127419  T
Q  146 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcaca 198  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||    
T  1127418 tataaggtgttcaacctttactattttacccgatgtgggatatataactcaca 1127366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 81; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 24 - 201
Target Start/End: Original strand, 2579087 - 2579260
Alignment:
Q  24 tgttggatcatgaggggagccaggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaa 123  Q
    |||||| |||||||||||||  ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||| || ||||| |||||| |  |    
T  2579087 tgttgggtcatgaggggagctcggggaccgtgcacatcgaggctagaacaaccacacgagcaagagagacaccacactcttagccaaagccttaaagtta 2579186  T
Q  124 tgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    || |||||||| | |||    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  2579187 tgggtttatggttcctc----ttataaggtgttcaacttttactcttttatccgatgtgggacatataactaacactt 2579260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 81; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 49 - 201
Target Start/End: Original strand, 6999799 - 6999951
Alignment:
Q  49 gaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttat 148  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||  |||||||||||| | |||||| || |||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||  |||    
T  6999799 gaccgtccacatcgagactagaacaaccacattagcaagagagacgccacactcttatccaaaaccttaaggcagtgagtttatggatcctcttacatat 6999898  T
Q  149 aaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    |||||||| ||| |||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  6999899 aaggtgttcaacttttacttttttatccgatgtaggacatataactcacactt 6999951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 24 - 201
Target Start/End: Original strand, 10073593 - 10073769
Alignment:
Q  24 tgttggatcatgaggggagccagg-ggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggca 122  Q
    |||||| ||| |||||||||| |  |||||||||||||||| | |||||||||||||| ||  |||||||||| |||||| ||||||||| |||||| ||    
T  10073593 tgttgggtcacgaggggagcctgaaggaccgtccacatcgatgctagaacaaccacactagtgagagagacaccacactcttacccaaaatcttaagcca 10073692  T
Q  123 atgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    |||||||||||| | |||||| |||||||||||| ||||||||  ||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  10073693 atgagtttatggatcctcttacttataaggtgttcaaccttta--cttttctccgatgtgggacatataactaacactt 10073769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 52 - 198
Target Start/End: Original strand, 5958613 - 5958755
Alignment:
Q  52 cgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataag 151  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||  ||||||   |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5958613 cgtccacatcgaggttagaacaatcacacaag----agagacatcacactctatcccaaaactttaagacaatgagtttatgagttctcttatttataag 5958708  T
Q  152 gtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcaca 198  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  5958709 gtgttcaacctttactgttttatccgatgtaacacatataactcaca 5958755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 56 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 26544197 - 26544052
Alignment:
Q  56 cacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgt 155  Q
    ||||| |||| |||||||| | |||||||||||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||  || |||||||||| |||||| |||||| ||||    
T  26544197 cacattgaggctagaacaatcgcacaagcaagagagacatcacactcttactcaaaaccttaaggcggtgggtttatgggtcctcttacttataacgtgt 26544098  T
Q  156 taaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26544097 tcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacactt 26544052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 34 - 201
Target Start/End: Original strand, 593694 - 593864
Alignment:
Q  34 tgaggggagc-caggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagaca--cgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagttt 130  Q
    |||||||||| | |||||||||| ||||||||  ||||||||||  ||||| |||||||| |  | |||||  ||||||||||||||||||| |  ||||    
T  593694 tgaggggagctcgggggaccgtcaacatcgagcctagaacaaccgtacaagtaagagagagataccacactattacccaaaaccttaaggcagtcggttt 593793  T
Q  131 atgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    ||| || |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  593794 atgagtcctcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtgggacatacaactcacactt 593864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 70; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 47 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 16108208 - 16108066
Alignment:
Q  47 gggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttattt 146  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||            ||||||||||||| |||||||||| |||||| ||    
T  16108208 gggaccgtccacatcgaggttataacaaccccacaagcaagagagacaccacac------------ccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactt 16108121  T
Q  147 ataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||    
T  16108120 ataaggtgttcaacatttactcttttatctgatgtggaacatataactcacactt 16108066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 61 - 201
Target Start/End: Original strand, 1950200 - 1950340
Alignment:
Q  61 cgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaac 160  Q
    ||||| |||||||||| |||||| |||||||||   |||||| ||| ||||||||||||||| |   ||||||| | |||||| || ||||||||| |||    
T  1950200 cgaggctagaacaaccgcacaagtaagagagacgtcacactcttactcaaaaccttaaggcattagatttatggctcctcttacttgtaaggtgttcaac 1950299  T
Q  161 ctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1950300 ctttactcttttatccgatgtgggacatataactcacactt 1950340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 97 - 199
Target Start/End: Original strand, 32460631 - 32460733
Alignment:
Q  97 acactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactca 196  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| |||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||    
T  32460631 acactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatacgatgtgggacatataactca 32460730  T
Q  197 cac 199  Q
    |||    
T  32460731 cac 32460733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 50 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 10911720 - 10911568
Alignment:
Q  50 accgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttata 149  Q
    |||||||||||||||| | ||||||| |||  || ||||||||||  |||||| ||  |||||| ||||||||||||||||||| || |||||| |||||    
T  10911720 accgtccacatcgaggcttgaacaacaacattagtaagagagacatcacactcttattcaaaactttaaggcaatgagtttatgagtcctcttacttata 10911621  T
Q  150 aggtgttaaacctttac-tcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    ||||||| ||||||||| | ||||||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  10911620 aggtgttcaacctttactttttttatctgatgtaggacatataactcacactt 10911568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 60; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 79 - 198
Target Start/End: Original strand, 9062383 - 9062501
Alignment:
Q  79 acaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccga 178  Q
    ||||| |||||||| || |||||  |||||||||| ||||| ||||||||||||| || |||||| ||||||| |||| |||||||||| ||||||||||    
T  9062383 acaagtaagagagataccacacttttacccaaaac-ttaagacaatgagtttatgagtcctcttacttataagatgttcaacctttactattttatccga 9062481  T
Q  179 tgtgagacatataactcaca 198  Q
    |||| |||||||||||||||    
T  9062482 tgtgggacatataactcaca 9062501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 85 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 8482045 - 8481930
Alignment:
Q  85 aagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgag 184  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||  ||| |||||||| ||||| |||||  ||| || |||| |||||| |    
T  8482045 aagagagacaccacactcttacccaaaatcttaaggcaatgagtttatgagtcatctcatttataaagtgttcaacctccacttttatatctgatgtg-g 8481947  T
Q  185 acatataactcacactt 201  Q
    |||||||||||||||||    
T  8481946 acatataactcacactt 8481930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 31 - 201
Target Start/End: Original strand, 12071675 - 12071846
Alignment:
Q  31 tcatgaggggagcc-aggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtt 129  Q
    |||||||||||||  |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||  |||||||| | |||||| |||||||||||||||||  ||  |||    
T  12071675 tcatgaggggagcttaggggaccgttcacatcgaggctagaacaaccacacaagtgagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggtcataggtt 12071774  T
Q  130 tatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    |||| || || |   |||||| ||||| || ||  | | || |||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  12071775 tatgagtcctttctattataaagtgttcaaactccatttttctatctgatgcgagacatataactcacactt 12071846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 72 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 6071264 - 6071135
Alignment:
Q  72 caaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttt 171  Q
    |||||| |||||| |||||||| | |||||| || |||||| ||||||||||||||||||||| |  ||| | |||||| ||||| |||||  ||| ||     
T  6071264 caaccatacaagcgagagagacgccacactcttatccaaaatcttaaggcaatgagtttatggatcatctcacttataaagtgttcaacctccacttttc 6071165  T
Q  172 tatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    ||| | ||||| ||||||||||||||||||    
T  6071164 tattcaatgtgggacatataactcacactt 6071135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 45 - 193
Target Start/End: Original strand, 12092481 - 12092629
Alignment:
Q  45 aggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttat 144  Q
    ||||||||  ||||||| |||  ||| ||||| ||||||  |||||||||| ||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||| |     
T  12092481 aggggaccacccacatccaggccagagcaacctcacaagtgagagagacaccacagtcttactcaaaaccttaaggcaatgagtttatggatcctctcac 12092580  T
Q  145 ttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataac 193  Q
    |||||| ||| | |||||  ||| || ||||||||||| ||||| ||||    
T  12092581 ttataaagtgctcaacctccacttttctatccgatgtgggacatctaac 12092629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 31 - 121
Target Start/End: Original strand, 12085018 - 12085109
Alignment:
Q  31 tcatgaggggagcc-aggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggc 121  Q
    |||||||||||||  ||| |||||| | |||||||| |||||||||||||||||  |||||||| | |||||| ||||||||||||||||||    
T  12085018 tcatgaggggagcttaggagaccgttcgcatcgaggctagaacaaccacacaagtgagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggc 12085109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 46 - 200
Target Start/End: Original strand, 17135069 - 17135223
Alignment:
Q  46 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 145  Q
    |||||||||||||||| |||   |||||||| ||||||| | |||| |   |||||| || ||||||| ||    |||||||||||||  | |||||  |    
T  17135069 ggggaccgtccacatcaaggccggaacaaccgcacaagcgaaagagccgtcacactcttatccaaaactttctaacaatgagtttatgaatcctcttgct 17135168  T
Q  146 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacact 200  Q
    |||||||| |||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17135169 tataaggtattaaacatttacttctctatccgatgtgagacatataactcacact 17135223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 49 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 31714823 - 31714732
Alignment:
Q  49 gaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctct 141  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| | | | || | |||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  31714823 gaccgtccacatcgaggctagagcaaccacacaagcgaaaaa-acgccacactcttactcaaaaccttaaggcaatgagttaatgggtcctct 31714732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 53 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 3409452 - 3409405
Alignment:
Q  53 gtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacac 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||| ||||    
T  3409452 gtccacatcgaggctagaacaaccgcataagcaagagagacaccacac 3409405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 34 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 2975341 - 2975296
Alignment:
Q  34 tgaggggagccaggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccaca 79  Q
    ||||||||| ||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  2975341 tgaggggagtcagaggactgtccacatcgaggctagaacaaccaca 2975296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 104 - 137
Target Start/End: Original strand, 22605313 - 22605346
Alignment:
Q  104 tacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtt 137  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22605313 tacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtt 22605346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 111; Significance: 3e-56; HSPs: 74)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 35 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 3670229 - 3670063
Alignment:
Q  35 gaggggagccaggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgg 134  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||  ||||||||    
T  3670229 gaggggagctagggaaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggaaataggtttatgg 3670130  T
Q  135 gttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    || ||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3670129 gtcctcatacttataaggtgttaaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacactt 3670063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 25 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 3669867 - 3669690
Alignment:
Q  25 gttggatcatgaggggagccagggg-accgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaa 123  Q
    ||||| ||| ||||||||| ||||| ||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  3669867 gttgggtcacgaggggagctagggggaccatccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaa 3669768  T
Q  124 tgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    |||||||||| || |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  3669767 tgagtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacactt 3669690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 56 - 201
Target Start/End: Original strand, 45122067 - 45122212
Alignment:
Q  56 cacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgt 155  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  45122067 cacatcgaggctagaacaaccccacaagtaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaagaaaatgagtttatgggttctcttacttataaggtgt 45122166  T
Q  156 taaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45122167 tcaacctttactattttatccgatgtgagacatataactcacactt 45122212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 54 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 34835026 - 34834879
Alignment:
Q  54 tccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggt 153  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||    
T  34835026 tccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgagtcatcttacttataaggt 34834927  T
Q  154 gttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    ||| |||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  34834926 gtttaacctttactattttatccaatgtgggacatataactcacactt 34834879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 102; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 48 - 201
Target Start/End: Original strand, 3038292 - 3038445
Alignment:
Q  48 ggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttattta 147  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  | |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||| |||    
T  3038292 ggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagatgccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtccttttactta 3038391  T
Q  148 taaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    ||| ||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3038392 taaagtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacactt 3038445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 102; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 37 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 34835377 - 34835216
Alignment:
Q  37 ggggagccagggg-accgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatggg 135  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  34835377 ggggagccagggggaccgtctacatcgaggctagaataaccacacaagcaagagtgacaccacactcttacccaaaactttaaggcaatgagtttatggg 34835278  T
Q  136 ttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcac 197  Q
    | |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  34835277 tcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatcggatgtgggacatataactcac 34835216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 97; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 46 - 201
Target Start/End: Original strand, 6876862 - 6877018
Alignment:
Q  46 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 145  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||| |||||||| |||||||  |||||||    
T  6876862 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaaacaagagaaacaccacactcttacccaaaaccctaagacaatgagtgtatgggtcatcttatt 6876961  T
Q  146 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagac-atataactcacactt 201  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  6876962 tataaggtgttcaacctttacttttttatccgatgtgggactatataactcacactt 6877018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 23 - 201
Target Start/End: Original strand, 20870549 - 20870730
Alignment:
Q  23 ttgttggatcatgaggggagccagg-ggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggc 121  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||| ||||||||    
T  20870549 ttgttgggtcatgaggggagccaggaggaccgtccatatcaaggttagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttatccaaaatcttaaggc 20870648  T
Q  122 aatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtg--agacatataactcacactt 201  Q
    | || |||||||||| |||||| ||||||| |||| |||||||||| ||||||| ||||||  | | |||||||||||||||    
T  20870649 agtgggtttatgggtcctcttacttataagatgttcaacctttactattttatctgatgtggaacatatataactcacactt 20870730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 37 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 34835643 - 34835481
Alignment:
Q  37 ggggagccagggg-accgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatggg 135  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  34835643 ggggagccagggggaccgtctacatcgaggctagaataaccacacaagcaagagtgacaccacactcttacccaaaactttaaggcaatgagtttatggg 34835544  T
Q  136 ttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatc-cgatgtgagacatataactcac 197  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  || ||| ||||||||||||||    
T  34835543 tcctcttacttataaggtgttaaacctttactattttatcgggacgtgggacatataactcac 34835481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 37 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 34835909 - 34835747
Alignment:
Q  37 ggggagccagggg-accgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatggg 135  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  34835909 ggggagccagggggaccgtctacatcgaggctagaataaccacacaagcaagagtgacaccacactcttacccaaaactttaaggcaatgagtttatggg 34835810  T
Q  136 ttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatc-cgatgtgagacatataactcac 197  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  || ||| ||||||||||||||    
T  34835809 tcctcttacttataaggtgttaaacctttactattttatcgggacgtgggacatataactcac 34835747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 94; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 45 - 201
Target Start/End: Original strand, 25561814 - 25561971
Alignment:
Q  45 aggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctaccc-aaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctctta 143  Q
    |||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    |||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  25561814 aggggaccttccacatcgaggctagagcaaccacacaagcaagagagatgtcacactcttaccccaaaaccttaagacaatgagtttatgggtcctctta 25561913  T
Q  144 tttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
     |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25561914 cttataaggtgttcaacgtttactcttttatccgatgtgggacatataactcacactt 25561971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 94; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 24 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 30441266 - 30441084
Alignment:
Q  24 tgttggatcatgaggggagccaggg-gaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggca 122  Q
    |||||| ||| ||||||||||| || ||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  30441266 tgttgggtcacgaggggagccaaggtgactgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggca 30441167  T
Q  123 atgagtttatgggttctcttattta----taaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    ||| |||||||||  |||||| |||    ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  30441166 atgggtttatgggccctcttacttataattaaggtgttcaacctttactattttagccgatgtgggacatataactcacactt 30441084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 92; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 46 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 147609 - 147454
Alignment:
Q  46 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 145  Q
    |||||||  ||||||| | | |||||| ||| |||||||||||||||| | |||||| |||||||||| ||||||||||  |||||||||| ||||||||    
T  147609 ggggaccacccacatcaatgctagaactaccgcacaagcaagagagacgccacactcttacccaaaactttaaggcaataggtttatgggtcctcttatt 147510  T
Q  146 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  147509 tataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtgggacatataactcacactt 147454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 46 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 45122782 - 45122648
Alignment:
Q  46 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 145  Q
    ||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |    
T  45122782 ggggaccttccacatcgaggcttgaacaaccacacaagcaagagagacgccacactcatacccaaaaccttaagacaatgagtttatgggtcctcttact 45122683  T
Q  146 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatg 180  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  45122682 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatg 45122648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 23 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 5916048 - 5915875
Alignment:
Q  23 ttgttggatcatgaggggagccaggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggca 122  Q
    ||||||||||||  ||||||   |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  5916048 ttgttggatcattgggggagttcggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggca 5915949  T
Q  123 atgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    |||||||||||||| |||    |||||| |||||||| ||||||  |||||||| ||||  ||||||||||||||||||    
T  5915948 atgagtttatgggtcctc----ttataaagtgttaaa-ctttacatttttatccaatgtaggacatataactcacactt 5915875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 48 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 40518738 - 40518585
Alignment:
Q  48 ggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttattta 147  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||   |||||| |||||||||||||||| || || |||||||||| ||||||||||    
T  40518738 ggaccgtccacattgaggctagaacaaccacacaagcaagagtgacgtcacactcttacccaaaaccttaagtcattgggtttatgggtcctcttattta 40518639  T
Q  148 taaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    ||||||||| |||||||||| || |||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  40518638 taaggtgttcaacctttacttttctatctgatgtgggacatataactcacactt 40518585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 89; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 45 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 30359430 - 30359274
Alignment:
Q  45 aggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttat 144  Q
    |||| ||| ||||||| |||| || ||||||  |||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||      
T  30359430 agggaaccatccacattgaggctaaaacaacatcacaagaaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggctatgggtttatgggtcctcttgc 30359331  T
Q  145 ttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30359330 ttataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 30359274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 46 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 6651652 - 6651510
Alignment:
Q  46 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 145  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6651652 ggggaccatccacatcgaggttagaacaatcgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgaatttatgggttctcttatt 6651553  T
Q  146 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcac 197  Q
             || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6651552 ---------ttcaacctttactattttatccgatgtgagacatataactcac 6651510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 46 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 9309512 - 9309358
Alignment:
Q  46 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 145  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |   | ||||||||| |||||| ||||| | |||||||||||||||||||| |||| |||||| |    
T  9309512 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacatactga-gagagacaccacactcttacccgacaccttaaggcaatgagtttaagggtcctcttact 9309414  T
Q  146 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9309413 tataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgggacatataactcacactt 9309358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 42 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 9608907 - 9608748
Alignment:
Q  42 gccaggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctct 141  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||  |||    
T  9608907 gccagggggccgtccacatcgaggctagaacaacctcactagcaagagagacgccacactcatacccaaaaccttaaggtgatgggtttatgggtcatct 9608808  T
Q  142 tatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    || |||||||||||| |||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||||    
T  9608807 tacttataaggtgttcaacctttacttttctatccgatatgggacatataactcacactt 9608748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 50 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 30359763 - 30359612
Alignment:
Q  50 accgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttata 149  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| || ||| ||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||  ||| ||||||| || |||||| |||||    
T  30359763 accgtccacatcgaagttagaacaaccgcataagtaagagagacaccacactcttacccaaaatcttaaggttatgggtttatgagtcctcttacttata 30359664  T
Q  150 aggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  30359663 aggtgttcaacttttactcttttatctgatgtgagacatataactcacactt 30359612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 39 - 201
Target Start/End: Original strand, 33113359 - 33113522
Alignment:
Q  39 ggagccag-gggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtt 137  Q
    |||||||| |||||||||| ||| |||  |||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  33113359 ggagccagagggaccgtccgcattgagcctagaacaaccacactagcaagagagacaccacactcttacccaaaatcttaaggcaatgagtttatgggtc 33113458  T
Q  138 ctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    |||||| |||||||  ||| |||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||| ||||    
T  33113459 ctcttacttataagacgttcaacctttactattttatccgatgtaggacatataactcaaactt 33113522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 87; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 34 - 179
Target Start/End: Original strand, 9483174 - 9483320
Alignment:
Q  34 tgaggggagccagggga-ccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttat 132  Q
    |||||||||| | |||| ||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  9483174 tgaggggagctatgggaaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacgagcaaaagagacaccacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttat 9483273  T
Q  133 gggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgat 179  Q
    |||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9483274 gggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgat 9483320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 49 - 197
Target Start/End: Original strand, 70277 - 70425
Alignment:
Q  49 gaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttat 148  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||   |||||| |||| |||||||||||||| || |||||||||| |||||| ||||    
T  70277 gaccgtccgcattgaggttagaacaaccacacaagcaagatagacgtcacactcttacctaaaaccttaaggcagtgggtttatgggtcctcttacttat 70376  T
Q  149 aaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcac 197  Q
    ||| |||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  70377 aagatgttcaacatttactcttttatccgatgtgggacatataactcac 70425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 25 - 201
Target Start/End: Original strand, 37544469 - 37544645
Alignment:
Q  25 gttggatcatgaggggagccaggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaat 124  Q
    ||||| ||||||||||| |  ||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||| |||| |||||| |||||| ||||||||||||||| | |||    
T  37544469 gttgggtcatgaggggaactcggggatcgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagtaagaaagacaccacactcttacccaaaaccttaaagtaat 37544568  T
Q  125 gagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    |  ||||||||| |||||  |||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  37544569 ggatttatgggtcctctttcttataatgtgttcaacctttactattttatccgatgtgcgacttataactcacactt 37544645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 54 - 201
Target Start/End: Original strand, 1014253 - 1014400
Alignment:
Q  54 tccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggt 153  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| |||||| || ||||||| |||| |||||| |||||||||    
T  1014253 tccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaggagagacaccacactcttacccaaaactttaaggtaacgagtttacgggtcctcttacttataaggt 1014352  T
Q  154 gttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    ||| |||||||||| ||||||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  1014353 gttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactcacactt 1014400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 50 - 197
Target Start/End: Original strand, 9482608 - 9482755
Alignment:
Q  50 accgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttata 149  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| || |||||| ||  ||||| ||| |||||||| |||||||||| |||||| |||||    
T  9482608 accgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagataccacactcttatacaaaatctttaggcaatgggtttatgggtcctcttacttata 9482707  T
Q  150 aggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcac 197  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||    
T  9482708 aggtgttcaacctttactcttttatcccatgtggaacatataactcac 9482755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 23 - 201
Target Start/End: Original strand, 8918742 - 8918919
Alignment:
Q  23 ttgttggatcatgaggggagccaggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggca 122  Q
    ||||||| ||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||   |||||| |||||||||||||||| ||    
T  8918742 ttgttgggtcacgaggggagct-ggggaccgtccacatcgaggttaaaacaaccacacacgcaagaaagacgtcacactcttacccaaaaccttaagtca 8918840  T
Q  123 atgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    ||  |||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||||  |||| |||||| ||||| ||||||||||||    
T  8918841 ataggtttatgggtcctcttacttataaagtgttcaacctttactctgctatctgatgtgggacatgtaactcacactt 8918919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 46 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 40518229 - 40518072
Alignment:
Q  46 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 145  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||| |  ||| |    
T  40518229 ggggaccgtccacatcaaggctagaacaaccacacaagcaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggcattgggtttatgggtccatttact 40518130  T
Q  146 tataaggtgttaaacctttac--tcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    ||||||||||| |||||||||  | |||||||| |||||  |||||||||||||||||    
T  40518129 tataaggtgttcaacctttacttttttttatccaatgtggaacatataactcacactt 40518072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 82; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 52 - 201
Target Start/End: Original strand, 40579512 - 40579661
Alignment:
Q  52 cgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataag 151  Q
    |||||||||||||| ||||||||||  |||||||| |||||||| |||||| |||| |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| |||||||    
T  40579512 cgtccacatcgaggatagaacaaccgtacaagcaatagagacaccacactcttacctaaaaccttaaagcaataagtttatgggtcctcttacttataag 40579611  T
Q  152 gtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    ||||| |||||||||| |||||||| || ||| |||||||| ||||||||    
T  40579612 gtgttcaacctttactattttatccaatatgaaacatataattcacactt 40579661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 46 - 201
Target Start/End: Original strand, 1513915 - 1514070
Alignment:
Q  46 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 145  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||| |||| | |||||||| || |||||  |||||||||||||||||  ||| ||||| |||| |||||| |    
T  1513915 ggggaccgtccacatcgaggctagaataaccccacatgtaagagagataccacacttttacccaaaaccttaaggttatgggtttaagggtcctcttact 1514014  T
Q  146 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||    
T  1514015 tataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtgggatatataactcatactt 1514070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 46 - 201
Target Start/End: Original strand, 45121910 - 45122065
Alignment:
Q  46 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 145  Q
    ||||||| |||||||||||| | ||| |||||||| ||||| |||||| | |||||  ||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||| |    
T  45121910 ggggaccttccacatcgaggcttgaataaccacacgagcaaaagagacgccacactgttacccaaaatcttaaggcaatgagtttatgagtcctcttact 45122009  T
Q  146 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    ||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  45122010 tataaagtgttcaacctttactattttatgcgatgtgggacatataactcacactt 45122065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 77; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 45 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 6732054 - 6731907
Alignment:
Q  45 aggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttat 144  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  6732054 aggggatcatccacatcgaggttagaacaaccgcataagcaagagagacaccacactcttactcaaaaccttaaggcaatgaatttatgggttctcttac 6731955  T
Q  145 ttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    |         || |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6731954 t---------ttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacactt 6731907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 24 - 194
Target Start/End: Original strand, 18371970 - 18372142
Alignment:
Q  24 tgttggatcatgaggggagccagggg--accgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggc 121  Q
    |||||| |||||||||||||  ||||  ||||| ||||| |||| |||| ||||| ||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||||||| ||    
T  18371970 tgttgggtcatgaggggagctcgggggaaccgttcacattgaggctagagcaaccgcacaagcgagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaagc 18372069  T
Q  122 aatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataact 194  Q
    ||||||||||||| | |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||  ||||||||||    
T  18372070 aatgagtttatggatcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttattggatgtggtacatataact 18372142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 56 - 201
Target Start/End: Original strand, 32640542 - 32640682
Alignment:
Q  56 cacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgt 155  Q
    |||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||  ||     |||    
T  32640542 cacatcgaggctagaacaatcacaaaagcaagagagacgcaacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatcggtcctcttaccta-----tgt 32640636  T
Q  156 taaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  32640637 tcaacctttactcttttatccgatgtgagacagataactcacactt 32640682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 46 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 45123164 - 45123009
Alignment:
Q  46 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcc--tacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctctta 143  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||  ||||||||||| ||||||   ||||||||||||||||  |||  ||||||||||  |||||    
T  45123164 ggggaccgtccacatcgagattagaacaaccccacaaataagagagacaccacactctcttacccaaaaccttaagaaaataggtttatgggtcatctta 45123065  T
Q  144 tttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
     |||  ||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  45123064 ctta--aggtgtttaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacactt 45123009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 68; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 54 - 201
Target Start/End: Original strand, 1013879 - 1014026
Alignment:
Q  54 tccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggt 153  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||| || |||||||  |||||| ||| ||||||  |||||||||| |||||| ||| |||||| ||||| |||    
T  1013879 tccacatcgaggctagaacaaccgcacaagtaaaagagacaacacactcttactcaaaactctaaggcaatgggtttattggtcctcttacttatagggt 1013978  T
Q  154 gttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    ||| ||| |||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  1013979 gttcaacttttactattttatccgatgtggaacatataactcacactt 1014026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 49 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 41972316 - 41972161
Alignment:
Q  49 gaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaa---aaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 145  Q
    ||||||||| || |||| | ||||||||||||||||||||| ||| | |||||| |||||||   ||| ||| ||||||| |||||||||| || | | |    
T  41972316 gaccgtccatattgaggctggaacaaccacacaagcaagagtgacgccacactcttacccaacaaaactttatggcaatgggtttatgggtcctatcact 41972217  T
Q  146 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    ||||||||||| |||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  41972216 tataaggtgttcaacctttacttttctatccgatgtgggacatataactcacactt 41972161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 63; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 32 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 41129161 - 41129067
Alignment:
Q  32 catgaggggagccagggg-accgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatg 125  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||    
T  41129161 catgaggggagcctgggggaccgtccacatcgaggtttgaacaaccacacaagtaagagagacaccacactcatacccaaaaccttaagacaatg 41129067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 62; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 48 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 5420807 - 5420654
Alignment:
Q  48 ggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttattta 147  Q
    |||| ||||||||||||| | |||||||||||||||  || |||||   |||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||| || |||||| |||    
T  5420807 ggacggtccacatcgaggcttgaacaaccacacaagtgagggagacgtcacactcttacaaaaaaccttaaggcaatgggtttatgagtcctcttactta 5420708  T
Q  148 taaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    |||| |||| |||||||||| || ||||||||||| |||||||||  |||||||    
T  5420707 taagatgttcaacctttactattctatccgatgtgggacatataatacacactt 5420654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 53 - 201
Target Start/End: Original strand, 45121663 - 45121810
Alignment:
Q  53 gtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataagg 152  Q
    ||||||||||||| |||||||||| || ||| |||||||| |  |||||| ||| ||||||||||||||  |  |||||||| | |||||| ||||||||    
T  45121663 gtccacatcgaggctagaacaaccccataagtaagagagatatcacactcttactcaaaaccttaaggctgtaggtttatggatcctcttacttataagg 45121762  T
Q  153 tgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||    
T  45121763 tgatcaacctttactcttttatccgatgtgggaca-acaactcacactt 45121810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 60; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 46 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 9309139 - 9308980
Alignment:
Q  46 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactccta---cccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctctt 142  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |  |||||||||| ||||| ||    ||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||    
T  9309139 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacata-gtgagagagacaccacactactcttgcccaaaacctttaggcaatgggtttatgggtcctctt 9309041  T
Q  143 atttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtg--agacatataactcacactt 201  Q
    | ||||||  |||| ||| |||||||||||||| ||||||   ||||||||||||||||||    
T  9309040 acttataacatgttcaacttttactcttttatctgatgtgtaggacatataactcacactt 9308980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 59; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 55 - 200
Target Start/End: Original strand, 43398077 - 43398225
Alignment:
Q  55 ccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctc---ttatttataag 151  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||| || || ||| || | ||| || || ||||||| |||||||||||| ||||||||| |||   |||||||||||    
T  43398077 ccacatcgaggttagagcaaccgcactagtaaaagaaacgccacattcttatccaaaactttaaggcaatgaatttatgggtcctcctcttatttataag 43398176  T
Q  152 gtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacact 200  Q
    ||||| |||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  43398177 gtgttcaacctttacttttctatccgatatgagatatataactcacact 43398225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 55; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 104 - 200
Target Start/End: Original strand, 18372992 - 18373085
Alignment:
Q  104 tacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacact 200  Q
    ||||||||||||   ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||| ||||||||| |||||||    
T  18372992 tacccaaaacct---ggcaatgagtttatgagtcctcttatttataaggtgttcaacctttactattttatccgaagtgggacatataaatcacact 18373085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 55; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 91 - 201
Target Start/End: Original strand, 43274824 - 43274934
Alignment:
Q  91 gacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatat 190  Q
    ||||| |||||| ||| |||||||||||| ||||  |||||||||| |||||| ||||||  | || |||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  43274824 gacaccacactcttactcaaaaccttaagacaataggtttatgggtcctcttacttataatatattcaacctttactcttttatctgatgtgaaacatat 43274923  T
Q  191 aactcacactt 201  Q
    |||||||||||    
T  43274924 aactcacactt 43274934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 46 - 122
Target Start/End: Original strand, 8919144 - 8919220
Alignment:
Q  46 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggca 122  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| || ||||||||||||||||    
T  8919144 ggggaccgtccacatcgaagctagaacaaccacacaagcaaaagagacaccacactcttatccaaaaccttaaggca 8919220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 46 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 32305635 - 32305503
Alignment:
Q  46 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 145  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||  || ||| || | |||| | |||||| || |||||| ||||||| |||| |||||| |||  ||||| |    
T  32305635 ggggaccgtccacatcaaggttagaacaactgcataagtaataaagacgccacactcttatccaaaatcttaaggtaatgggtttataggtcttcttact 32305536  T
Q  146 tataaggtgttaaacctttactcttttatccga 178  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  32305535 tataaggtgttcaacctttactattttatccga 32305503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 86 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 8794229 - 8794114
Alignment:
Q  86 agagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgaga 185  Q
    ||||||||||  |||||  |||||||||||||||  | |  ||||||| || |||||| ||||||| |||| ||| |||| |||||||||||||||||||    
T  8794229 agagagacaccgcactctcacccaaaaccttaagatattaggtttatgagtcctcttacttataagatgttcaacatttattcttttatccgatgtgaga 8794130  T
Q  186 catataactcacactt 201  Q
    ||||||||||||||||    
T  8794129 catataactcacactt 8794114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 24 - 197
Target Start/End: Original strand, 18371637 - 18371807
Alignment:
Q  24 tgttggatcatgaggggagccagggg--accgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggc 121  Q
    |||||| |||||||| ||||  ||||  |||||||||||||| | |||| ||||| |||||   ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  18371637 tgttgggtcatgaggagagctcgggggaaccgtccacatcgaagctagagcaaccgcacaaatgagagacacaccacactcttacccaaaaccttaaggc 18371736  T
Q  122 aatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcac 197  Q
     ||| ||||||||||  ||||| |||     |||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18371737 -atgggtttatgggtcttcttactta----atgttcaacctttactattttatccgatgtgtgacatataactcac 18371807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 46 - 125
Target Start/End: Original strand, 40579269 - 40579348
Alignment:
Q  46 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatg 125  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||| | ||||||||||    
T  40579269 ggggacagtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaatcctaaggcaatg 40579348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 72 - 201
Target Start/End: Original strand, 4154694 - 4154821
Alignment:
Q  72 caaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttt 171  Q
    |||||||||||||  ||||||| | |||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||| || | | |||||| ||||| |||||  ||| ||     
T  4154694 caaccacacaagc--gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctttcacttataaagtgttcaacctccacttttc 4154791  T
Q  172 tatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  4154792 tatcagatgtgggacatataactcacactt 4154821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 67 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 9609222 - 9609108
Alignment:
Q  67 tagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttac 166  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||| |||| ||||| ||||||| ||| ||||||||||  ||||| ||||||| |||| |||||||||    
T  9609222 tagaacaaccacactagcaagagagacgccacactcttaccgaaaacattaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataagatgttcaacctttac 9609123  T
Q  167 tcttttatccgatgt 181  Q
    | || |||| |||||    
T  9609122 ttttctatctgatgt 9609108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 139 - 201
Target Start/End: Original strand, 18372349 - 18372411
Alignment:
Q  139 tcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18372349 tcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgagacatataactcacactt 18372411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 47 - 200
Target Start/End: Original strand, 18380020 - 18380171
Alignment:
Q  47 gggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttattt 146  Q
    ||||| ||||||||||| | ||||| || | ||||||||||||   ||| |||||| ||| ||||||||||||| | || |||||| ||  | |||| ||    
T  18380020 gggactgtccacatcgaagctagaagaatcgcacaagcaagagg--caccacactcttactcaaaaccttaaggtagtgggtttataggcccccttactt 18380117  T
Q  147 ataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacact 200  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| || ||||||||||||||    
T  18380118 ataaggtgttcaacctttactattttattcgatgtgggatatataactcacact 18380171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 50; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 56 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 147968 - 147832
Alignment:
Q  56 cacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgt 155  Q
    ||||| |||| |||||||||  |||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||         ||||| | |||    
T  147968 cacattgaggctagaacaactgcacaagtaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaataggtttatggg---------ttatatgttgt 147878  T
Q  156 taaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    | ||| |||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  147877 tcaacatttacttttttatcagatgtgggacatataactcacactt 147832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 50; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 132 - 201
Target Start/End: Original strand, 18372785 - 18372854
Alignment:
Q  132 tgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    ||||| |||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18372785 tgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgtgacatataactcacactt 18372854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 131 - 194
Target Start/End: Original strand, 25561729 - 25561792
Alignment:
Q  131 atgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataact 194  Q
    |||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25561729 atgggtactcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtgggacatataact 25561792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 53 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 9507933 - 9507819
Alignment:
Q  53 gtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataagg 152  Q
    ||||||||||||| | ||||||||| | |||  | |||||| | |||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||| || |||||| ||||||||    
T  9507933 gtccacatcgaggcttgaacaaccatataagagatagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggtaatgggtttatgagtcctcttacttataagg 9507834  T
Q  153 tgttaaacctttact 167  Q
    | || ||||||||||    
T  9507833 tattcaacctttact 9507819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 25 - 201
Target Start/End: Original strand, 9620656 - 9620831
Alignment:
Q  25 gttggatcatgaggggagccagggg-accgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaa 123  Q
    ||||| ||| |||||||||| |||| |||||||||||| |||   || ||||||||||||  |||||||||  | |||| ||   |||| ||||||||||    
T  9620656 gttgggtcacgaggggagcccgggggaccgtccacatccaggcctgagcaaccacacaagtgagagagacatcaaactcttat--aaaatcttaaggcaa 9620753  T
Q  124 tgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    ||||||||||||| |||| | |||||| ||| | ||| | |||| || |||| | |||||||||||||||||||||||    
T  9620754 tgagtttatgggtcctctcacttataaagtgatcaacttctacttttctatctgttgtgagacatataactcacactt 9620831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 127 - 197
Target Start/End: Original strand, 41416252 - 41416322
Alignment:
Q  127 gtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcac 197  Q
    |||||||| | |||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  41416252 gtttatggatcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcac 41416322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 55 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 12284021 - 12283876
Alignment:
Q  55 ccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtg 154  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||  |||||||||| |||||| || ||||||||||||| |  |||||||||| ||  | ||| || |||| |     
T  12284021 ccacatagaggctagaacaaccacacaagtgagagagacactacactcttatccaaaaccttaagac-ttgagtttatgtgtcattttacttttaagata 12283923  T
Q  155 ttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    || ||| |||||| ||||||| || ||| ||||||||||| ||||||    
T  12283922 ttcaacatttacttttttatctgacgtgggacatataacttacactt 12283876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 99 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 20130553 - 20130454
Alignment:
Q  99 actcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcaca 198  Q
    |||| |||| |||||| |||||  ||| |||||||| |  ||||| ||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20130553 actcttacctaaaaccgtaaggttatgggtttatggatcatcttactta-aaggtgttcaacttttactcttttatccgatgtgagacatatatctcaca 20130455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 24 - 125
Target Start/End: Original strand, 20995393 - 20995495
Alignment:
Q  24 tgttggatcatgaggggagccag-gggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggca 122  Q
    |||||| ||| |||||||||||| ||||||  ||| ||| |||  ||| ||||||||||||  |||||||||| ||| || |||||||||||||||||||    
T  20995393 tgttgggtcacgaggggagccagagggaccacccatatctaggccagagcaaccacacaagtgagagagacaccacattcttacccaaaaccttaaggca 20995492  T
Q  123 atg 125  Q
    |||    
T  20995493 atg 20995495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 86 - 198
Target Start/End: Original strand, 4154321 - 4154432
Alignment:
Q  86 agagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgaga 185  Q
    |||||||||  |||| | |||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| | |||||| ||||| |||||  ||| || |||| |||||  ||    
T  4154321 agagagacatcacacacttacccaaaatattaaggcaatgagtttatggg-tctctcacttataaagtgttcaacctccacttttctatctgatgtagga 4154419  T
Q  186 catataactcaca 198  Q
    |||||||||||||    
T  4154420 catataactcaca 4154432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 46 - 110
Target Start/End: Original strand, 43274635 - 43274699
Alignment:
Q  46 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaa 110  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| || ||| ||||||||||| |||||| |||||||    
T  43274635 ggggaccgtccacatcgaggctggaacaaccccataagtaagagagacaccacactcatacccaa 43274699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 46 - 93
Target Start/End: Original strand, 3037969 - 3038016
Alignment:
Q  46 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagac 93  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||    
T  3037969 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagatagagagac 3038016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 114 - 201
Target Start/End: Original strand, 3037776 - 3037865
Alignment:
Q  114 cttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtg--agacatataactcacactt 201  Q
    |||||| ||||| ||||||| || |||||| |||||||||||| ||| |||||| ||| ||||||||||  | | |||||||||||||||    
T  3037776 cttaagacaatgggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacatttactatttcatccgatgtggaacatatataactcacactt 3037865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 72 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 5274907 - 5274778
Alignment:
Q  72 caaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttt 171  Q
    |||| |||||||| | |||||||  |||||| ||| ||||| ||||||||||||| |||||||||  ||  |||||||| ||||| ||||| | || |||    
T  5274907 caacaacacaagcgatagagacatcacactcttactcaaaatcttaaggcaatgattttatgggtcttcccatttataaagtgttcaacctctccttttt 5274808  T
Q  172 tatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    ||| | ||||   |||||||||||| ||||    
T  5274807 tattcaatgtagaacatataactcatactt 5274778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 160 - 201
Target Start/End: Original strand, 18372485 - 18372526
Alignment:
Q  160 cctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18372485 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacactt 18372526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 16524502 - 16524446
Alignment:
Q  67 tagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaa 123  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  16524502 tagagcaaccacacaagtaagagagacaccacactcttactcaaaaccttaaagcaa 16524446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 112 - 167
Target Start/End: Original strand, 18373236 - 18373291
Alignment:
Q  112 accttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttact 167  Q
    |||||||| ||||| ||| |||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18373236 accttaagacaatgggttaatggatcctcttatttataaggtgttcaacctttact 18373291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 147 - 201
Target Start/End: Original strand, 20995502 - 20995556
Alignment:
Q  147 ataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    |||| ||||| |||||  ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20995502 ataaagtgttcaacctccacttttttatctgatgtgagacatataactcacactt 20995556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 172 - 201
Target Start/End: Original strand, 18645713 - 18645742
Alignment:
Q  172 tatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18645713 tatccgatgtgagacatataactcacactt 18645742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 105 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 11442952 - 11442916
Alignment:
Q  105 acccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctct 141  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  11442952 acccaaaaccttaaggcattgagtttatgggtcctct 11442916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 109; Significance: 5e-55; HSPs: 63)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 22 - 201
Target Start/End: Original strand, 27502011 - 27502191
Alignment:
Q  22 tttgttggatcatgaggggagccagggg-accgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaagg 120  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||| |||| |||||||    
T  27502011 tttgttgggtcatgaggggagctagggggaccgtccacatcgaggatagaacaaccacacaagcaagagagacaccacacttttaccaaaaatcttaagg 27502110  T
Q  121 caatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    ||||  |||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  27502111 caataggtttatgggtcctcttacttataaggtgtttaacctttactattttatccaatgtgggacatataactcacactt 27502191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 46 - 201
Target Start/End: Original strand, 40296315 - 40296470
Alignment:
Q  46 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 145  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||| |    
T  40296315 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaacctcaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 40296414  T
Q  146 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    ||||||||||| ||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  40296415 tataaggtgttcaaccttttctattttatccgatgtgggacatataactcacactt 40296470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 47 - 201
Target Start/End: Original strand, 36492218 - 36492372
Alignment:
Q  47 gggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttattt 146  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||| |||| |||| |||||| ||| |||||| ||    
T  36492218 gggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttatccaaaacctaaaggtaatgtgtttattggtcctcttactt 36492317  T
Q  147 ataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  36492318 ataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtgggacatataactcacactt 36492372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 34 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 6500621 - 6500454
Alignment:
Q  34 tgaggggagccagggg-accgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttat 132  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||     
T  6500621 tgaggggagcctgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttaa 6500522  T
Q  133 gggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
     ||| |||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6500521 aggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtg-gacatataactcacactt 6500454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 34 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 6500993 - 6500826
Alignment:
Q  34 tgaggggagccagggg-accgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttat 132  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  6500993 tgaggggagcctgggggaccgtccacatcgaggctagaataaccgcacaagtaagagagacaccacactcttatccaaaaccttaaggcaatgagtttat 6500894  T
Q  133 gggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    |||| || |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6500893 gggtccttttatttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtg-gacatataactcacactt 6500826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 35 - 201
Target Start/End: Original strand, 18603108 - 18603275
Alignment:
Q  35 gaggggagccagggga-ccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatg 133  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  | |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18603108 gaggggagccaggagaaccgtccacatcgaggctagaactaccacacaagcaagagagatgccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatg 18603207  T
Q  134 ggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    ||| |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  18603208 ggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacactt 18603275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 102; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 25 - 201
Target Start/End: Original strand, 3294993 - 3295169
Alignment:
Q  25 gttggatcatgaggggagccagggg-accgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaa 123  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||    
T  3294993 gttggatcatgaggggagcgagggggactgtccacatcgaggctacaacaaccacacaaccaagagagacaccacactcatacccaaaacctcaaggcaa 3295092  T
Q  124 tgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    || ||||||||||  ||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  3295093 tgggtttatgggtcttcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatat-actcacactt 3295169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 25 - 201
Target Start/End: Original strand, 3295323 - 3295498
Alignment:
Q  25 gttggatcatgaggggagccagggg-accgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaa 123  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||| |||||||||||||||    
T  3295323 gttggatcatgaggggagtgagggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaacacactcttacc-aaaaccttaaggcaa 3295421  T
Q  124 tgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    |  |||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||  |||||| ||||||||||    
T  3295422 ttggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtggaacatat-actcacactt 3295498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 97; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 25 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 35150185 - 35150010
Alignment:
Q  25 gttggatcatgaggggagccaggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaat 124  Q
    ||||| ||||| ||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||  |||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||    
T  35150185 gttgggtcatggggggagcaaggggacggtccacattgaggttagaacaaccacactagtgagagagacaccacacttttacccaaaaccttaagacaat 35150086  T
Q  125 gagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    |  |||||||| ||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  35150085 ggatttatggg-tctcttacttataaggtgttcaaccttgactcttttatccgatgtgggacatataactcacactt 35150010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 97; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 46 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 41170792 - 41170640
Alignment:
Q  46 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 145  Q
    |||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||| | |||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |    
T  41170792 ggggaccgtctacaccgaggctagaacaaccacacaagcaagaaaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 41170693  T
Q  146 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcaca 198  Q
    |||||| |||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  41170692 tataagatgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcaca 41170640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 55 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 26074761 - 26074615
Alignment:
Q  55 ccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtg 154  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||  |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||    
T  26074761 ccacatcgaggttagagcaaccacactagtgagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtg 26074662  T
Q  155 ttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    || |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  26074661 ttcaacctttactcttttatccgatatggaacatataactcacactt 26074615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 94; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 36 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 41632950 - 41632785
Alignment:
Q  36 aggggagccaggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatggg 135  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||  || ||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||| ||| || |||||||||    
T  41632950 aggggagctgggggaccgtccacatcgagactaaaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaatcttaaagcattgggtttatggg 41632851  T
Q  136 ttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    | |||||| |||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  41632850 tcctcttacttataaggtgttcaacctttacttttctatccgatgtgagacatataacttacactt 41632785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 34 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 25328106 - 25327938
Alignment:
Q  34 tgaggggagc-caggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttat 132  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||  ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |  ||||||    
T  25328106 tgaggggagctcgggggaccgtccacattgaggctagaacaaccacacttgcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcattaggtttat 25328007  T
Q  133 gggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    |||| |||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  25328006 gggtcctcttacttataaggtgttcaacttttactgttttatccgatgtaggacatataactcacactt 25327938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 92; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 46 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 15370257 - 15370102
Alignment:
Q  46 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 145  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||  ||  ||||||||| |||||| |    
T  15370257 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaatcccacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggctgtggatttatgggtcctcttact 15370158  T
Q  146 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    |||||| |||| |||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  15370157 tataagatgttcaacctttactattttattcgatgtgggacatataactcacactt 15370102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 92; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 46 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 32487551 - 32487397
Alignment:
Q  46 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 145  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||   |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |    
T  32487551 ggggaccatccacatcgaggctagaacaaccacataagcaagagatacgtcacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 32487452  T
Q  146 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    ||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  32487451 tat-aggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacactt 32487397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 20 - 201
Target Start/End: Original strand, 13415734 - 13415915
Alignment:
Q  20 attttgttggatcatgaggggagcca-ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaa 118  Q
    |||||||||| |||  |||||||||| |||||||| |||  |||||| |||||||||| |||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||    
T  13415734 attttgttgggtcaccaggggagccacggggaccg-ccatttcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaa 13415832  T
Q  119 ggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    || |||  |||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13415833 ggtaataggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactaatttatccgatgtgggacatataactcacactt 13415915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 31 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 299664 - 299492
Alignment:
Q  31 tcatgaggggagc--caggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagt 128  Q
    |||||||||||||  | |||||| ||||||||||| | ||||||||||  |||||||| |||||| | |||||| ||| |||||||||||||| ||||||    
T  299664 tcatgaggggagctccgggggactgtccacatcgatgctagaacaaccgtacaagcaatagagacgccacactcttacacaaaaccttaaggctatgagt 299565  T
Q  129 ttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    ||||||||  ||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  299564 ttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactgttttatccgatgtgggacatataactcacactt 299492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 53 - 201
Target Start/End: Original strand, 26075168 - 26075317
Alignment:
Q  53 gtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcct-acccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataag 151  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||  |||||||||||   |||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||    
T  26075168 gtccacatcgaggctaaaacaaccacacttgcaagagagacgacacactctttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataag 26075267  T
Q  152 gtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26075268 gtgttcaacctttactcttttatccgatgtgagacatataaatcacactt 26075317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 46 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 6224354 - 6224199
Alignment:
Q  46 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 145  Q
    |||||||||||| || |||| |||| ||||| |||||||||  ||| ||| |||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |    
T  6224354 ggggaccgtccatattgaggctagaccaaccgcacaagcaactgaggcaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgagtttatgggtcctcttact 6224255  T
Q  146 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  6224254 tataaggtgttcaacctttactcttttatccgaagtgggacatataactcacactt 6224199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 87; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 55 - 201
Target Start/End: Original strand, 26074155 - 26074301
Alignment:
Q  55 ccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtg 154  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||  |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||  ||| |||||    
T  26074155 ccacatcgaggttagagcaaccacactagtgagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggttcatgggtcctcttacatatgaggtg 26074254  T
Q  155 ttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    || |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26074255 ttcaacctttacttttttatccgatgtgtgacatataactcacactt 26074301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 82; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 26 - 198
Target Start/End: Original strand, 9498634 - 9498806
Alignment:
Q  26 ttggatcatgaggggagccagggg-accgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaat 124  Q
    |||| ||| ||||||||| ||||| ||||||||||| |||| |||| || | ||| || |||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||    
T  9498634 ttgggtcacgaggggagctagggggaccgtccacattgaggctagaccagc-acataaacaagagagacaccacactcttacccaaaatcttaaggcaat 9498732  T
Q  125 gagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcaca 198  Q
    | |||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||    
T  9498733 gggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattctatctgatgtgagacatataactcaca 9498806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 81; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 50 - 194
Target Start/End: Original strand, 34753029 - 34753173
Alignment:
Q  50 accgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttata 149  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||| |||||    
T  34753029 accgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggcaatcggtttatgggtcttcttacttata 34753128  T
Q  150 aggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataact 194  Q
    ||||||| ||| |||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  34753129 aggtgttcaacttttacttttctatccaatgtgggacatataact 34753173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 81; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 46 - 201
Target Start/End: Original strand, 42405598 - 42405751
Alignment:
Q  46 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 145  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||  ||| |||||| ||||||||||||||||||| |  ||||||| || || ||| |    
T  42405598 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagaga--caccacactcttacccaaaaccttaaggcattaggtttatgagtccttttact 42405695  T
Q  146 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    | ||||||||| |||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  42405696 tgtaaggtgttcaacctttactattttatccgatgttggacatataactcacactt 42405751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 50 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 624350 - 624199
Alignment:
Q  50 accgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttata 149  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| ||| ||||||||||  ||||| |||||    
T  624350 accgtccacatcgaggctagaacaaccccacaagtgagagagacaccacactcttacccaaaacctcaaggctatgggtttatgggtcatcttacttata 624251  T
Q  150 aggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    | ||||| |||||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||||||||    
T  624250 acgtgttcaacctttactattttatacaatgtgggacatataactcacactt 624199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 46 - 197
Target Start/End: Original strand, 11416977 - 11417128
Alignment:
Q  46 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 145  Q
    ||||||| |||||||||| | |||||||| | ||||||||||||||| |  |||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||| | |||||| |    
T  11416977 ggggaccatccacatcgaagctagaacaatcccacaagcaagagagagatcacactcttacacaaaaccttaaggcaatgggtttatggatcctcttact 11417076  T
Q  146 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcac 197  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||    
T  11417077 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtggaacatataactcac 11417128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 46 - 201
Target Start/End: Original strand, 12662652 - 12662807
Alignment:
Q  46 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 145  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| || ||| |||||| ||||||||| |||||| |||||  |||||||||| ||||| |    
T  12662652 ggggaccgaccacatcgaggctagaagaaccccacaagcaagaaaggcaccacactcttacccaaaaacttaagacaatggatttatgggttttcttact 12662751  T
Q  146 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    |||||  |||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12662752 tataaaatgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacactt 12662807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 34 - 201
Target Start/End: Original strand, 36568556 - 36568722
Alignment:
Q  34 tgaggggagc-caggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttat 132  Q
    |||||||||| | ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||| | |||||| |||| ||||||||||||||||| |||||     
T  36568556 tgaggggagctcgggggaccttccacatcgaggatagaacaaccacacaag--agagagacgccacactcttaccaaaaaccttaaggcaatgggtttac 36568653  T
Q  133 gggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    ||||  ||| | |||||||||||| ||| |||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  36568654 gggtcatctcacttataaggtgttcaacttttacttttctatccgatgtgggacatataactcacactt 36568722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 77; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 34 - 201
Target Start/End: Original strand, 1028504 - 1028672
Alignment:
Q  34 tgaggggagccagggg-accgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttat 132  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||||||| | |||||| |||| ||||||||||||  ||  ||||||    
T  1028504 tgaggggagctagggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagtgagagagacgccacactcttaccaaaaaccttaaggttataggtttat 1028603  T
Q  133 gggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    |||| |||||| |||||| ||||| | |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1028604 gggtcctcttacttataaagtgttcatcctttacttttctatccgatgtgggacatataactcacactt 1028672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 75; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 50 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 33747925 - 33747783
Alignment:
Q  50 accgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttata 149  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||| || ||| ||||||||||| |||||| || |||||| ||||||||||||||||||||| | |||||| |||||    
T  33747925 accgtccacatcaaggctagaacaaccgcataaggaagagagacaccacactcttatccaaaatcttaaggcaatgagtttatggatcctcttacttata 33747826  T
Q  150 aggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataa 192  Q
    | || || |||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  33747825 aagtatttaacctttactattttatccgatgtgggacatataa 33747783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 46 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 623976 - 623821
Alignment:
Q  46 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 145  Q
    |||||||||| |||| |||| |||||||||| ||||||  |||||||||| |||||| ||| |||||||||||||| || ||||||||| |   |||| |    
T  623976 ggggaccgtctacattgaggctagaacaaccccacaagtgagagagacaccacactcttactcaaaaccttaaggctataagtttatggctcaacttact 623877  T
Q  146 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    | ||| ||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  623876 tgtaaagtgttcaacctttactattatatccgatgtgagacatataactcacactt 623821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 32 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 15370575 - 15370428
Alignment:
Q  32 catgaggggagccagg-ggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagttt 130  Q
    ||||||||||||  || |||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||| | |||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||    
T  15370575 catgaggggagcatggaggaccgtccacatcgaggctagaacaaccccacaaacaagagagacgccacactcttacgcaaaaccttaaggctatgggttt 15370476  T
Q  131 atgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccga 178  Q
    |||||| |||||| |||||||||||| ||| |||||| ||| ||||||    
T  15370475 atgggtcctcttacttataaggtgttcaacatttactgtttcatccga 15370428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 68; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 46 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 2411165 - 2411010
Alignment:
Q  46 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 145  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||  |||| || ||||| || |||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  2411165 ggggaccgtccatatcgaggttagaacaatcattcaagtaatagagaaactacactcttactcaaaaccttaaggcaataagtttatgggttctcttact 2411066  T
Q  146 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    || ||| |||| ||| ||||||  | ||||| ||||  ||||||||||||||||||    
T  2411065 tacaagatgttcaacttttacttctctatccaatgtaggacatataactcacactt 2411010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 68; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 8 - 201
Target Start/End: Original strand, 24489167 - 24489359
Alignment:
Q  8 gaaaggtacaatattttgttggatcatgaggggagccag-gggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctac 106  Q
    ||||||||| | | |||||||| ||| |||||||| | | ||||||| ||||||||||  |||||||||| |||||| || |||||| | |||||| |||    
T  24489167 gaaaggtactaaagtttgttgggtcacgaggggagtctgagggaccgcccacatcgagactagaacaaccgcacaagtaaaagagacgccacactcttac 24489266  T
Q  107 ccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
     ||||| |||||||||||| ||||||||||  ||||| | |||||||||| ||||||| || || |||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  24489267 gcaaaatcttaaggcaatgggtttatgggt--tcttactaataaggtgtttaaccttttcttttctatctgatgtgggacatataactcacactt 24489359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 67 - 201
Target Start/End: Original strand, 5723812 - 5723946
Alignment:
Q  67 tagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttac 166  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| | |||| | |||||||||||||| |||| | || |||||||||||||  ||||| ||||| ||| ||||     
T  5723812 tagaacaaccgcacaagcaagagagacactatactctttcccaaaaccttaagacaataaattaatgggttctcttacatataatgtgttcaacttttat 5723911  T
Q  167 tcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5723912 tattttatccgatgtgggacatataactcacactt 5723946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 63; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 72 - 201
Target Start/End: Original strand, 26074807 - 26074937
Alignment:
Q  72 caaccacacaagcaagagagacacgacactcct-acccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactctt 170  Q
    |||||||||  ||||||||||| | |||||| | ||||||||||||||| ||||  |||||||||| ||| || |||||  ||||| |||||||||||||    
T  26074807 caaccacacttgcaagagagacgccacactctttacccaaaaccttaagacaataggtttatgggtcctcctacttatattgtgttcaacctttactctt 26074906  T
Q  171 ttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26074907 ttatccgatgtgggacatataactcacactt 26074937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 62; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 54 - 167
Target Start/End: Original strand, 26590918 - 26591031
Alignment:
Q  54 tccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggt 153  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||| | |||||| ||| ||||||||||||||| ||| ||||||| | |||||| |||||||||    
T  26590918 tccacatcgaggttagaacaaccacactagtgagagagacgccacactcttactcaaaaccttaaggcattgaatttatggatcctcttacttataaggt 26591017  T
Q  154 gttaaacctttact 167  Q
    ||| ||||||||||    
T  26591018 gttcaacctttact 26591031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 69 - 201
Target Start/End: Original strand, 29549278 - 29549410
Alignment:
Q  69 gaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactc 168  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| | |||||| || |||||||||||||| |||| ||||||||||  ||||| ||||| |||||| | ||||||||     
T  29549278 gaacaaccacataagcaagagagacgccacactcttatccaaaaccttaaggtaatgtgtttatgggtcttcttacttatatggtgttcatcctttacta 29549377  T
Q  169 ttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    ||||||| ||| ||  |||||||||||||||||    
T  29549378 ttttatctgatatggaacatataactcacactt 29549410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 60; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 22 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 35915031 - 35914852
Alignment:
Q  22 tttgttggatcatgaggggagccaggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggc 121  Q
    |||||||| ||||||| |||||  ||||||||||||||| |||||| || ||| || | |||||||||||| || ||| || || |||| |  ||| |||    
T  35915031 tttgttgggtcatgagcggagctgggggaccgtccacattgaggtttgaccaatcatataagcaagagagataccacattcttatccaataatttagggc 35914932  T
Q  122 aatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    ||||  |||| ||||  ||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  35914931 aatggatttacgggtcttcttacttataaaatgttcaacctttactcttttatccgatgtgtgacatataactcatactt 35914852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 59; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 23 - 201
Target Start/End: Original strand, 41635169 - 41635346
Alignment:
Q  23 ttgttggatcatgaggggagccaggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggca 122  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  | | |||| |||||| ||||| || ||||| || |||||| |||| ||||  ||||| ||    
T  41635169 ttgttggatcatgaggggagtgaggg-acagtccacattaaagatagagcaaccatacaagtaaaagagatactacactcttacctaaaattttaagaca 41635267  T
Q  123 atgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    |||  ||||||| | ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| || |||||||||||| ||||    
T  41635268 atggatttatggatcctcttatttataaggtgttcaacatttactcttttatctgatgggaaacatataactcatactt 41635346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 54 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 38427697 - 38427553
Alignment:
Q  54 tccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggt 153  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||   |||||| ||| |||||||||||| |||||  || |||||| ||| || ||||||| |    
T  38427697 tccacatcgaggttagaacaaccgcacaagtgagagagacgtcacactcttacacaaaaccttaagacaatggattaatgggtcctc-tacttataagat 38427599  T
Q  154 gttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacac 199  Q
    ||| |||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  38427598 gttcaacctttacttttctatccaatgtgggacatataactcacac 38427553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 46 - 201
Target Start/End: Original strand, 35167838 - 35167993
Alignment:
Q  46 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 145  Q
    |||||| ||||||||||| | |||||||||||||| ||   ||||||||  |||||| |||| ||||| | ||||||||   |||||||||  || || |    
T  35167838 ggggacagtccacatcgatgctagaacaaccacactagtgtgagagacatcacactcttaccaaaaacatcaaggcaatagatttatgggtcatcctact 35167937  T
Q  146 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||| ||||    
T  35167938 tataaggtgttcaacctttactcttttatctgatgtgagatacataactcatactt 35167993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 48 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 301107 - 300962
Alignment:
Q  48 ggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttattta 147  Q
    ||||||| ||| |||||  | ||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||| |||||||||        |||| |||||||| |||    
T  301107 ggaccgttcacgtcgagacttgaacagccacacaagcaagagagacaccacactcttaccaaaaatcttaaggca--------atggattctcttactta 301016  T
Q  148 taaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    |||||| || |||||||||| ||||||| |||||| |||||||||| |||||||    
T  301015 taaggtattcaacctttactgttttatctgatgtgggacatataacccacactt 300962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 46 - 118
Target Start/End: Original strand, 26900017 - 26900089
Alignment:
Q  46 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaa 118  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||| | |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  26900017 ggggaccgtccacatcaaggctagaacaaacccacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaa 26900089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 109 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 31509718 - 31509626
Alignment:
Q  109 aaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| || |||| | |||||| ||| | |||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31509718 aaaacctcaaggcaatgagtttatgagtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatccgatgtgagacatataactcacactt 31509626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 97 - 201
Target Start/End: Original strand, 36521947 - 36522051
Alignment:
Q  97 acactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactca 196  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| |||| ||||| |  ||||| |||||  ||| || |||| |||||| |||||||||||||    
T  36521947 acactcttacccaaaaccttaaggcaattggtttatgggtcctctcatttaaagagtgttcaacctcaacttttctatctgatgtgggacatataactca 36522046  T
Q  197 cactt 201  Q
    |||||    
T  36522047 cactt 36522051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 109 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 42508707 - 42508615
Alignment:
Q  109 aaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| || |||||| |||| || |||| |||||||||| || ||||||||||| || |||||| ||||||||    
T  42508707 aaaaccttaaggcaatgggtttatgagtcctcttacttattagatgtttaacctttacttttctatccgatgtgggatatataattcacactt 42508615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 46 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 38427377 - 38427306
Alignment:
Q  46 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaacctta 117  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||||| ||||    
T  38427377 ggggaccgccaacatcgaggttagaacaaccgcacaagcaagagagacgccacactcttacccaaaatctta 38427306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 22 - 120
Target Start/End: Original strand, 13785607 - 13785706
Alignment:
Q  22 tttgttggatcatgaggg-gagccaggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaagg 120  Q
    |||||||| |||||| || ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| | ||||| |||| |||||  |||  ||||||||||||    
T  13785607 tttgttgggtcatgaaggagagtcaggggaccgtccacatcgaagttagaacaaccatacaaacgagagaaacaccacacttttacttaaaaccttaagg 13785706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 86 - 201
Target Start/End: Original strand, 36522277 - 36522392
Alignment:
Q  86 agagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgaga 185  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||||  |||| |||||| ||| |||| | ||||||  |||| ||| |  | | || ||||| ||||||||    
T  36522277 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaagataatgggtttattggtcctctcacttataaaatgttcaacttccatttttctatccaatgtgaga 36522376  T
Q  186 catataactcacactt 201  Q
    ||||||||||||||||    
T  36522377 catataactcacactt 36522392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 138 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 39309750 - 39309687
Alignment:
Q  138 ctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    ||||||||||||| ||||| ||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  39309750 ctcttatttataatgtgttcaacatttacccttttatccgatgtgggacatataactcatactt 39309687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 127 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 26074395 - 26074321
Alignment:
Q  127 gtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||| || ||||| | || |||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  26074395 gtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaatctttagttttctatctgatgtgggacatataactcacactt 26074321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 68 - 120
Target Start/End: Original strand, 795254 - 795306
Alignment:
Q  68 agaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaagg 120  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||    
T  795254 agaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacctaaaaccttaagg 795306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 129 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 7768925 - 7768853
Alignment:
Q  129 ttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    |||||||| || ||| |||||||||||| |||||||| | |||||||||||||  || |||||||||||||||    
T  7768925 ttatgggtccttttacttataaggtgttcaacctttattattttatccgatgtaggatatataactcacactt 7768853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 79 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 31509857 - 31509745
Alignment:
Q  79 acaagcaagagagacacgacactcctacccaaaa-ccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccg 177  Q
    |||||| |||||||||| ||| || |||| |||| ||| ||||||||||||||||| || |||| | |||||| ||| | |||||  ||| || ||||||    
T  31509857 acaagcgagagagacaccacattcttaccaaaaaacctcaaggcaatgagtttatgagtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatccg 31509758  T
Q  178 atgtgagacatat 190  Q
    |||||||||||||    
T  31509757 atgtgagacatat 31509745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 109 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 42524811 - 42524720
Alignment:
Q  109 aaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    |||||||| || |||||  |||||| || |||||||| ||||| |||| ||| |||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  42524811 aaaaccttcagacaatggatttatgagtcctcttattcataagatgttcaac-tttacttttctatccgatgtgagacatataattcacactt 42524720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 86 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 13042657 - 13042607
Alignment:
Q  86 agagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggt 136  Q
    |||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13042657 agagagacaccacactcttatccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggt 13042607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 50 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 24489635 - 24489582
Alignment:
Q  50 accgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcc 103  Q
    ||||| || |||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||    
T  24489635 accgttcatatcgaggttagaacaactgcacaagcaagagagacaccacactcc 24489582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 145 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 6225103 - 6225047
Alignment:
Q  145 ttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||| || |||||||||| ||||    
T  6225103 ttataaggtgttcaacctttattcttttatctgatgtgggatatataactcagactt 6225047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 162 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 35150789 - 35150750
Alignment:
Q  162 tttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  35150789 tttactcttttattcgatgtgggacatataactcacactt 35150750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 162 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 35151080 - 35151041
Alignment:
Q  162 tttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  35151080 tttactcttttattcgatgtgggacatataactcacactt 35151041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 67 - 133
Target Start/End: Original strand, 9498344 - 9498410
Alignment:
Q  67 tagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatg 133  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||| | |||||| ||| ||||  |||||||||||| |||||||    
T  9498344 tagaacaaccacacttgcaagagagacgccacactcttactcaaatgcttaaggcaatgggtttatg 9498410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 68 - 134
Target Start/End: Original strand, 36527117 - 36527183
Alignment:
Q  68 agaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgg 134  Q
    |||||| |||||||||  |||||||||  |||||| || |||||| |||||||||||| ||||||||    
T  36527117 agaacagccacacaagtgagagagacagcacactcttatccaaaatcttaaggcaatgcgtttatgg 36527183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 108 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 34103650 - 34103617
Alignment:
Q  108 caaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctct 141  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  34103650 caaaaccttaaggcaatgagtttatgagttctct 34103617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 108; Significance: 2e-54; HSPs: 62)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 46 - 201
Target Start/End: Original strand, 26661522 - 26661677
Alignment:
Q  46 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 145  Q
    |||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |    
T  26661522 ggggaccgtccatatcgaggcttgaacaaccacacaagcgagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcctctcact 26661621  T
Q  146 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  26661622 tataaggtgttcaacctttactcttttacccgatgtgggacatataactcacactt 26661677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 46 - 201
Target Start/End: Original strand, 44290824 - 44290980
Alignment:
Q  46 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcct-acccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttat 144  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||| |||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||     
T  44290824 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagatacaccacactctttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttac 44290923  T
Q  145 ttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  44290924 ttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacactt 44290980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 36 - 199
Target Start/End: Original strand, 3537589 - 3537752
Alignment:
Q  36 aggggagccaggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatggg 135  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||| ||    
T  3537589 aggggagccaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaagccaatgggtttatagg 3537688  T
Q  136 ttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacac 199  Q
    | |||||| | |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  3537689 tcctcttactcataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactaacac 3537752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 46 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 41157149 - 41156994
Alignment:
Q  46 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 145  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |    
T  41157149 ggggaccgcccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaatagagacaccacactcttacccaaaaccttaaagcaatgagtttatgggtcctcttact 41157050  T
Q  146 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| | || ||||||||| ||||||||    
T  41157049 tataaggtgttcaacctttactcttttatccgttatgggacatataattcacactt 41156994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 46 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 41142531 - 41142375
Alignment:
Q  46 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcct-acccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttat 144  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| | ||| ||||||||||||||||| |||||||||| || |||     
T  41142531 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacgccacactctttaccaaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtccttttac 41142432  T
Q  145 ttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  41142431 ttataaggtgttcaacctttactgttttatccgatgtgggacatataactcacactt 41142375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 46 - 201
Target Start/End: Original strand, 44290458 - 44290613
Alignment:
Q  46 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 145  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| |||||| | |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |    
T  44290458 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgtacaagcaagaaagacaccatactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 44290557  T
Q  146 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    |||||| |||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  44290558 tataagatgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacactt 44290613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 99; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 47 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 41157532 - 41157378
Alignment:
Q  47 gggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttattt 146  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||| |||||||| ||||||||| |||||||||| |||||| ||    
T  41157532 gggaccgcccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagacagacaccacactcttactcaaaacctaaaggcaatgggtttatgggtcctcttactt 41157433  T
Q  147 ataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  41157432 ataaggtgttcaacttttactcttttatctgatgtgggacatataactcacactt 41157378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 46 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 34649596 - 34649441
Alignment:
Q  46 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 145  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |  ||||| ||||||||||||||||||| |  |||||||||||||   | |    
T  34649596 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacactagcaagagagacgcctcactcttacccaaaaccttaaggcattaggtttatgggttcttgcact 34649497  T
Q  146 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  34649496 tataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtgggacatataactcacactt 34649441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 46 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 41759641 - 41759486
Alignment:
Q  46 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 145  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||| |  ||||| |    
T  41759641 ggggaccgtccacatcaaggctagaacaaccacataagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatggatttatggatcatcttact 41759542  T
Q  146 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    ||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  41759541 tataaggtgttcaacttttactattttatccgatgtgtgacatataactcacactt 41759486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 23 - 201
Target Start/End: Original strand, 5319942 - 5320120
Alignment:
Q  23 ttgttggatcatgaggggagccaggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggca 122  Q
    ||||||| ||| || ||||||  |||||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||     
T  5319942 ttgttgggtcacgaagggagcttggggaccgtctacattgaggctagaacaaccacataagcaagagagacactacactcttacccaaaaccttaaggct 5320041  T
Q  123 atgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    |||||||||||||| |||| | |||||||||||| ||| |||||| || |||||||||||  |||||||||||||||||    
T  5320042 atgagtttatgggtcctctcacttataaggtgttcaacttttacttttctatccgatgtggaacatataactcacactt 5320120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 94; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 49 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 17294733 - 17294580
Alignment:
Q  49 gaccgtccacatcgaggttagaacaacca-cacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttattta 147  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||  || |||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||    
T  17294733 gaccgtccacatcgaggctagagcaacctgcataagcgagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactta 17294634  T
Q  148 taaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17294633 taaagtgttcaacctttactcttttatccgatgtgggacatataactcacactt 17294580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 25 - 201
Target Start/End: Original strand, 37850579 - 37850755
Alignment:
Q  25 gttggatcatgaggggagccaggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaat 124  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||  |||||||||| |||||| || || |||||||||  || |    
T  37850579 gttggatcatgaggggagctaggggaccgtccacatcgaggctagagcaaccgcacaagtgagagagacaccacactcttatccgaaaccttaaaacatt 37850678  T
Q  125 gagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
      ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  37850679 aggtttatgggttctcttacttataaggtgttcaacctctactgttttatgcgatgtgggacatataactcacactt 37850755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 44 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 34365085 - 34364928
Alignment:
Q  44 caggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctctta 143  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||| ||||  || |||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||    
T  34365085 cagggaaccatccacatcgaggttagagcaactgcataagcgagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggctatgggtttatgggtcctctta 34364986  T
Q  144 tttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
     |||||||||||| |||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  34364985 cttataaggtgttcaacctttattattttatccgatgtgtgacatataactcacactt 34364928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 89; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 49 - 201
Target Start/End: Original strand, 48588491 - 48588643
Alignment:
Q  49 gaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttat 148  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||  ||||| ||||    
T  48588491 gaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagtaagagagacaccgcactcttacccaaaaccttaaggcaatgaatttacgggtcttcttacttat 48588590  T
Q  149 aaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||  |||||| |||||||||||    
T  48588591 aaggtgttcaacctttactattttatccgatgtcggacatagaactcacactt 48588643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 46 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 29798357 - 29798202
Alignment:
Q  46 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 145  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||| || |||| |||||||||||||| ||||||| || |||||| |    
T  29798357 ggggaccgtctatatcgaggttagaacaaccacacttgcaagagagacaccacactcttatccaagaccttaaggcaatgggtttatgagtcctcttact 29798258  T
Q  146 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||  ||||||||||||||||||    
T  29798257 tataaggtgttcaacctttactattttatccaatgtaggacatataactcacactt 29798202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 87; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 24 - 201
Target Start/End: Original strand, 50052001 - 50052178
Alignment:
Q  24 tgttggatcatgaggggagc-caggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggca 122  Q
    |||||| ||| ||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||| |||||| |||||||||| |||||  |    
T  50052001 tgttgggtcacgaggggagctcgggggactgtccacatcgaggttagaacaac-acataaacaagagagacaccacactcttacccaaaactttaagaaa 50052099  T
Q  123 atgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    ||  |||||||||| |||||| ||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  50052100 ataggtttatgggtcctcttacttataagatgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacactt 50052178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 44 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 34364667 - 34364510
Alignment:
Q  44 caggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctctta 143  Q
    ||||| ||| |||||||||||| |||| ||||| || |||| |||||||||  |||||| |||||||||||||||||| ||| ||||| || | ||||||    
T  34364667 cagggaaccatccacatcgaggctagagcaaccgcataagcgagagagacatcacactcttacccaaaaccttaaggctatgggtttacggatcctctta 34364568  T
Q  144 tttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
     |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34364567 cttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgagacatataactcacactt 34364510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 26 - 201
Target Start/End: Original strand, 26661877 - 26662053
Alignment:
Q  26 ttggatcatgaggggagccaggg-gaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaat 124  Q
    |||| ||| ||||||||| |||| |||| ||| |||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  26661877 ttgggtcacgaggggagctagggagaccatccgcatcaaggattgaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaat 26661976  T
Q  125 gagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
      ||||||||||  ||| | |||||||||||| |||||||||||||||||| ||| || || |||||||||||||||    
T  26661977 cggtttatgggtcttctcacttataaggtgttcaacctttactcttttatctgatatgggatatataactcacactt 26662053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 46 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 11977438 - 11977283
Alignment:
Q  46 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 145  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||  ||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||| |  ||||||| || |||||| |    
T  11977438 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacttgcaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaaggcattaggtttatgagtgctcttact 11977339  T
Q  146 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    ||||||||||| ||| |||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  11977338 tataaggtgttcaacatttactgttttacccgatgtgggacatataactcacactt 11977283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 46 - 201
Target Start/End: Original strand, 22077495 - 22077650
Alignment:
Q  46 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 145  Q
    |||||||||||| ||||| | | |||||||| || |||  |||||||| | |||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||| |    
T  22077495 ggggaccgtccatatcgatgcttgaacaaccgcataagtgagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggctacgagtttatgggtcctcttact 22077594  T
Q  146 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    ||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22077595 tataaggtgttcaacctttacttttctatccgatgtgagacatataactcacactt 22077650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 46 - 201
Target Start/End: Original strand, 31767161 - 31767316
Alignment:
Q  46 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 145  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||   |||||| ||||||||||||||||||| |  ||| |||||| |||||| |    
T  31767161 ggggaccgtccacatcgagtctagaacaaccacacaagcaagatagacgtcacactcttacccaaaaccttaaggcattaggttaatgggtcctcttact 31767260  T
Q  146 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||  ||||||||| |||||||    
T  31767261 tataaggtgttcaacctttactgttttatccgatgtggaacatataacccacactt 31767316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 55 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 37556260 - 37556114
Alignment:
Q  55 ccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtg 154  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||| ||||||| ||    
T  37556260 ccacatcgaggcttgaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggctatgggtttat-ggtcctcttacttataagatg 37556162  T
Q  155 ttaaacctttact-cttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    || ||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  37556161 ttcaacctttactatttttatccgatgtgggacatataactcacactt 37556114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 54 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 40082556 - 40082410
Alignment:
Q  54 tccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggt 153  Q
    |||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | | |||||| |||||||||    
T  40082556 tccacatcgaggctagaacaaacgcacaagcaagagagataccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgaatttat-gatcctcttacttataaggt 40082458  T
Q  154 gttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  40082457 gttcaacctttactattttatccgatgtaggacatataactcacactt 40082410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 24 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 45084557 - 45084385
Alignment:
Q  24 tgttggatcatgaggggagccagggg-accgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggca 122  Q
    |||||| ||||||||| |||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||        
T  45084557 tgttgggtcatgagggaagcctgggggaccgtccgcatcgaggttagaacaaccgcacaagcaagagagacaccactctcttacccaaaaccttaa---- 45084462  T
Q  123 atgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
      ||  |||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  45084461 --gacgttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactgttttatccgatgtgggagatataactcacactt 45084385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 82; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 50 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 3550871 - 3550723
Alignment:
Q  50 accgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttata 149  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  |   ||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||| || |||||| |||||    
T  3550871 accgtccacatcgaggctagaacaaccgta---gcaagagagacaccacactcttacccaaaactttaaggcaatgggtttatgagtcctcttacttata 3550775  T
Q  150 aggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  3550774 aggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacactt 3550723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 81; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 31 - 194
Target Start/End: Original strand, 3875315 - 3875479
Alignment:
Q  31 tcatgaggggagccagg-ggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtt 129  Q
    |||||||||||||  || |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||  |||||||| | ||| || |||| ||||||||||||||||| |||    
T  3875315 tcatgaggggagctcggaggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacactagtgagagagactccacattcttacctaaaaccttaaggcaatgggtt 3875414  T
Q  130 tatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataact 194  Q
    |||| || |||||| |||||||||||  |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  3875415 tatgagtcctcttacttataaggtgtacaacctttacttttttatccgatgtgtgacatataact 3875479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 81; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 53 - 201
Target Start/End: Original strand, 24600321 - 24600469
Alignment:
Q  53 gtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataagg 152  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||      
T  24600321 gtccacatcgaggctagaacaaccatactagcgagagagacaccacactcttacacaaaaccttaagacaatgagtttatgagttctcttacttataata 24600420  T
Q  153 tgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    |||| |||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||||    
T  24600421 tgttcaacctttacttttctatccgatatgggacatataactcacactt 24600469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 81; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 61 - 201
Target Start/End: Original strand, 38804370 - 38804510
Alignment:
Q  61 cgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaac 160  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||| | |||||| |||||| ||||| |||    
T  38804370 cgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacactacactcttacccaaaaccttaaggttatgggtttatggatcctcttacttataatgtgttcaac 38804469  T
Q  161 ctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||    
T  38804470 ctttactcttttattcgatgtgggacgtataactcacactt 38804510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 78 - 201
Target Start/End: Original strand, 32594748 - 32594871
Alignment:
Q  78 cacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccg 177  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||| |    
T  32594748 cacaagtaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaagacaatgagtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatctg 32594847  T
Q  178 atgtgagacatataactcacactt 201  Q
    ||||  ||||||||||||||||||    
T  32594848 atgtaggacatataactcacactt 32594871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 46 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 14319025 - 14318875
Alignment:
Q  46 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 145  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||  ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||   |||||||||  ||||| |    
T  14319025 ggggaccgtccacattgaggctagaacaaccgcacaaataagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatagatttatgggtcttcttact 14318926  T
Q  146 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactca 196  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||  ||||||||||||    
T  14318925 tataaggtgttcaacctttactattttatccgacgtggaacatataactca 14318875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 77; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 54 - 194
Target Start/End: Original strand, 5528762 - 5528902
Alignment:
Q  54 tccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggt 153  Q
    |||||||||||| |||||||||| || ||  ||||||||| | ||||   ||||||||||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||| |    
T  5528762 tccacatcgaggatagaacaaccgcataaagaagagagacgccacacatttacccaaaaccttaagaaaatgagtttatgagtcctcttatttataagat 5528861  T
Q  154 gttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataact 194  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5528862 gttcaacctttactcttttatccgatgtgagacatataact 5528902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 77; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 24 - 198
Target Start/End: Original strand, 24131965 - 24132137
Alignment:
Q  24 tgttggatcatgaggggagc-caggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggca 122  Q
    |||||| |||||||||| || |||| || |||| ||||||||| |||||||||||||| ||  |||||||||| |||||  |||||||| ||||||||||    
T  24131965 tgttgggtcatgaggggggctcaggagatcgtctacatcgaggctagaacaaccacactagtgagagagacaccacact--tacccaaa-ccttaaggca 24132061  T
Q  123 atgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcaca 198  Q
    |||||||||||| | | ||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||| | |||||||||||||||    
T  24132062 atgagtttatggatccccttatttataaggtgttcaacctttacttttctatccgatgagggacatataactcaca 24132137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 76; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 24 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 9956090 - 9955911
Alignment:
Q  24 tgttggatcatgaggggagcc-aggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggca 122  Q
    |||||| ||| |||| ||||| |||||||||  |||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||    
T  9956090 tgttgggtcacgaggagagcctaggggaccgctcacatcgaggctagagcaaccgcacaagcaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaaggca 9955991  T
Q  123 atgagttt-atgggttctcttatttataaggtgttaaacctttac-tcttttatccgatgtgagacatataactcacact 200  Q
    ||  |||| |||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||| | ||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  9955990 attggtttaatgggtcctcttacttataatgtgttcaacctttactttttttatctgatgtgggacatataactcacact 9955911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 76; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 46 - 201
Target Start/End: Original strand, 39066201 - 39066355
Alignment:
Q  46 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 145  Q
    |||||||||| ||||| ||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||| || ||||||||||||| |||||| |||||||||  ||||| |    
T  39066201 ggggaccgtc-acatcaaggctagaacaaccacataagtaagagagacaccacactcttatccaaaaccttaagacaatgattttatgggtcatcttagt 39066299  T
Q  146 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    ||||||||||| |||||||||| || |||||||||||  | |||||||||||||||    
T  39066300 tataaggtgttcaacctttacttttctatccgatgtggaatatataactcacactt 39066355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 50 - 201
Target Start/End: Original strand, 66476 - 66627
Alignment:
Q  50 accgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttata 149  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||| ||||||| |||||||| | | |||| |||||||||||||||||| ||  |||||||| | |||||| |||||    
T  66476 accgtccacattgaggctagaacaaccgcacaagcgagagagacgctatactcttacccaaaaccttaaggccatatgtttatggatcctcttacttata 66575  T
Q  150 aggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    ||||||| |||||||||| || |||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  66576 aggtgttcaacctttacttttctatccgatatggaacatataactcacactt 66627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 37 - 201
Target Start/End: Original strand, 45493965 - 45494134
Alignment:
Q  37 ggggagccaggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggt 136  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||| ||||||||||| |||||| || ||||||| ||||||||||| |||||||| |    
T  45493965 ggggagctgggggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccacataaggaagagagacaccacactcttatccaaaactttaaggcaatgggtttatggat 45494064  T
Q  137 --tct--cttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatat-aactcacactt 201  Q
      |||  ||||| |||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  45494065 catcttacttatatatatggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataaactcacactt 45494134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 70; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 56 - 201
Target Start/End: Original strand, 30630648 - 30630793
Alignment:
Q  56 cacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgt 155  Q
    ||||||||||  |||||||||||| |||  | || ||| |  ||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  30630648 cacatcgaggccagaacaaccacataagtgatagggacgccccactcttacccaaaactttaaggcaatgtgtttatgggttctcttacttataaagtgt 30630747  T
Q  156 taaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
     ||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  30630748 caaacctttaattttttatccgatgtgagacatataaatcacactt 30630793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 68; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 110 - 201
Target Start/End: Original strand, 41184489 - 41184580
Alignment:
Q  110 aaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41184489 aaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaagtgttcaacctttactattttatccgatgtgagacatataactcacactt 41184580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 23 - 177
Target Start/End: Original strand, 32168673 - 32168823
Alignment:
Q  23 ttgttggatcatgaggggagcc--aggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaagg 120  Q
    ||||||| |||  |||||||||  ||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| | |||||| |||||||||||| ||||    
T  32168673 ttgttgggtcactaggggagccttaggggactgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacgccacactcttacccaaaacctcaagg 32168772  T
Q  121 caatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccg 177  Q
    ||||| |||||||||| ||||      ||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  32168773 caatgggtttatgggtcctct------taaggtgttcaacctttactattttatccg 32168823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 55 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 37555878 - 37555733
Alignment:
Q  55 ccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtg 154  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| | |  ||||  ||| |||||| |||||| ||     
T  37555878 ccacatcgaggcttgaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggctaaggattta-aggtcctcttacttataatgta 37555780  T
Q  155 ttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    || |||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  37555779 ttcaaccttcactattttatccgatgtgggacttataactcacactt 37555733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 46 - 179
Target Start/End: Original strand, 22077110 - 22077243
Alignment:
Q  46 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 145  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| || |||  || |||||   |||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |    
T  22077110 ggggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccgcataagtgagggagacgtcacactcttatccaaaaccttagggcaatgagtttatgggtcctcttact 22077209  T
Q  146 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgat 179  Q
    |||||||| || |||||||||| || ||||||||    
T  22077210 tataaggtattcaacctttacttttctatccgat 22077243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 57; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 26 - 201
Target Start/End: Original strand, 19283434 - 19283610
Alignment:
Q  26 ttggatcatgaggggagcca-ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaat 124  Q
    |||| |||||||||||| || |||||||  ||||||| ||| |||| ||||| ||||||  |||||||| | |||||| || ||||||||||||||| ||    
T  19283434 ttgggtcatgaggggagtcaaggggacctcccacatccaggctagagcaaccgcacaagtgagagagacgccacactcttatccaaaaccttaaggcgat 19283533  T
Q  125 gagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    ||||||||| || |||| ||||| || ||| | |||||  ||| || |||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  19283534 gagtttatgtgtcctctcatttacaaagtgctcaacctccacttttctatccggtgtgggacatataactcacactt 19283610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 57 - 201
Target Start/End: Original strand, 66100 - 66244
Alignment:
Q  57 acatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgtt 156  Q
    |||||||||  |||||||||| |||||   ||||| | | |||||| |||||||||||||||||| ||  |||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  66100 acatcgaggccagaacaaccatacaagt--gagaggcgccacactcttacccaaaaccttaaggccataggtttatgggtcctcttacttataaggtgtt 66197  T
Q  157 -aaacctttactcttttatccgatgtgagacat-ataactcacactt 201  Q
     ||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  66198 caaacctttacttttctatccgatgtgagacatgattactcacactt 66244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 55; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 127 - 201
Target Start/End: Original strand, 3537228 - 3537302
Alignment:
Q  127 gtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3537228 gtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacactt 3537302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 55; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 36 - 201
Target Start/End: Original strand, 22077818 - 22077983
Alignment:
Q  36 aggggagccagg-ggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgg 134  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||| | | |||||||| || |||  | |||||| | |||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||||    
T  22077818 aggggagcctggaggaccgtccacatcgatgcttgaacaaccgcataagtgaaagagacgccacactcttaccccaaacctta-ggctatgagtttatgg 22077916  T
Q  135 gttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    || |||||| ||||||| |||| |||||||| | || |||||||| | | |||||||||||||||||    
T  22077917 gtcctcttacttataagatgttcaacctttatttttctatccgatttaaaacatataactcacactt 22077983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 54; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 54 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 5575252 - 5575110
Alignment:
Q  54 tccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggt 153  Q
    |||||||||||| |||||| ||| || |||  |||||||| | |||||| || |||||||||||| || |||  ||||| ||| |||||| |||||||||    
T  5575252 tccacatcgaggctagaactacctcataag--agagagacgccacactcttatccaaaaccttaaagctatggatttataggtcctcttacttataaggt 5575155  T
Q  154 gttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcaca 198  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||| |||||    
T  5575154 gttcaacctttactcttctatccgacgtgggacatataattcaca 5575110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 46 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 11977102 - 11977026
Alignment:
Q  46 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggca 122  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||| |||  ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  11977102 ggggaccgtccacatcgaggctagaactaccgcacttgcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggca 11977026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 110 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 44685551 - 44685459
Alignment:
Q  110 aaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgtt-aaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||| || ||||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||||    
T  44685551 aaacattaaggcaatgagtttattggtcctcttacttataaggttttcaaacctttacttttctatccgatatgggacatataactcacactt 44685459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 68 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 22793415 - 22793281
Alignment:
Q  68 agaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaa-tgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttac 166  Q
    |||||||||||||||| |||||||||   |||||| ||| ||||||| |||||||| || |||||||| | |||| | |||||| || || ||||| |||    
T  22793415 agaacaaccacacaagtaagagagacgtcacactcttactcaaaaccgtaaggcaaatgggtttatggatcctctcacttataaagttttcaacctctac 22793316  T
Q  167 tcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    | || ||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  22793315 ttttctatacgatgtgggacatataactcacactt 22793281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 56 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 45839779 - 45839630
Alignment:
Q  56 cacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtg- 154  Q
    ||||||||||  ||||||| | |||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||| |   |||||||||  ||||| ||||||||||     
T  45839779 cacatcgaggccagaacaatcccacaagcaagagagacaccacaatcttacccaaaaccttaaggcattacatttatgggtcttcttacttataaggtgt 45839680  T
Q  155 ----ttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
        || |||||||| | || ||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  45839679 tcgattcaaccttta-ttttctatccgatgtgggacatataactcatactt 45839630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 22 - 134
Target Start/End: Original strand, 50051664 - 50051776
Alignment:
Q  22 tttgttggatcatgaggggagccagggg-accgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaagg 120  Q
    |||||||| ||| ||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||| || |||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||     
T  50051664 tttgttgggtcacgaggggagctagggggaccgtccacatcgatgctagaacaac-acataaacaagagagacaccacactcttacgcaaaaccttaaga 50051762  T
Q  121 caatgagtttatgg 134  Q
     |||| ||||||||    
T  50051763 taatgggtttatgg 50051776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 84 - 167
Target Start/End: Original strand, 44043810 - 44043893
Alignment:
Q  84 caagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttact 167  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||  ||||| |||||||||||| ||| ||||||    
T  44043810 caagagagacaccacactcttacccaaaatcttaagacaatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacatttact 44043893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 201
Target Start/End: Original strand, 1188571 - 1188743
Alignment:
Q  31 tcatgaggggagcca--ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagt 128  Q
    ||||||||||||||   ||||||||  |||||| |||| ||| |||||||| |||  |||||||| | |||||  ||||||||||||||| |||||||||    
T  1188571 tcatgaggggagcccttggggaccgcacacatctaggtcagagcaaccacataagtgagagagacgccacacttttacccaaaaccttaaagcaatgagt 1188670  T
Q  129 ttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    ||||| ||  ||| | ||||||  | || |||||  ||| || |||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  1188671 ttatgagtcttctcacttataaaatattcaacctccacttttctatccgatatggaacatataactcacactt 1188743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 21 - 201
Target Start/End: Original strand, 1187336 - 1187519
Alignment:
Q  21 ttttgttggatcatgaggggagcc--aggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaa-gcaagagagacacgacactcctacccaaaacctta 117  Q
    ||||||||| | |||||||||||   ||||||||||||||||| |||| |||||||| | | || |  ||||||||   |||||  ||| ||||| ||||    
T  1187336 ttttgttgggtaatgaggggagctctaggggaccgtccacatctaggtcagaacaactataaaaagtgagagagacgtcacacttttactcaaaatctta 1187435  T
Q  118 aggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    ||| |||||||||||||||  ||| | ||||||  |||| |||||  ||| || ||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  1187436 aggtaatgagtttatgggtcttctcacttataaaatgtttaacctccacttttatattcgatgtgagacatataattcacactt 1187519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 57 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 4956340 - 4956218
Alignment:
Q  57 acatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacg--acactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtg 154  Q
    |||||||||||| | ||| | ||||||||||||| | |||  |||||  |||| ||||| |||  ||||||||||||||| | |||||| ||||||| ||    
T  4956340 acatcgaggttaaagcaatcgcacaagcaagagatagacgtcacacttttacctaaaactttagagcaatgagtttatggatcctcttacttataagatg 4956241  T
Q  155 ttaaacctttactcttttatccg 177  Q
    || |||||||||| || ||||||    
T  4956240 ttcaacctttacttttctatccg 4956218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 158 - 201
Target Start/End: Original strand, 35154151 - 35154194
Alignment:
Q  158 aacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  35154151 aacctttactcttttatctgatgtgggacatataactcacactt 35154194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 44 - 86
Target Start/End: Original strand, 21378057 - 21378099
Alignment:
Q  44 caggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaa 86  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  21378057 caggggaccgtccacattgaggctagaacaaccacacaagcaa 21378099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 127 - 201
Target Start/End: Original strand, 21378122 - 21378196
Alignment:
Q  127 gtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    |||||||||| |||||| ||||||| | || |||||||||| || |||||||| || ||||||||||| ||||||    
T  21378122 gtttatgggtcctcttacttataagatattcaacctttactgttctatccgatctgggacatataactgacactt 21378196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 86 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 10351278 - 10351202
Alignment:
Q  86 agagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacct 162  Q
    |||||||| | |||||| ||||||||| ||||| | |||| ||||||||||||||| | |||||| ||||| |||||    
T  10351278 agagagacgccacactcttacccaaaatcttaaagtaatgtgtttatgggttctctcacttataaagtgttcaacct 10351202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 143 - 201
Target Start/End: Original strand, 50469178 - 50469236
Alignment:
Q  143 atttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    |||||||| ||||| |||||||||| | ||||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  50469178 atttataaagtgttcaacctttactttattatctgatgtaggacatataactcacactt 50469236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 54 - 99
Target Start/End: Original strand, 31767047 - 31767092
Alignment:
Q  54 tccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgaca 99  Q
    |||||||||| |||||||||||| || ||| |||||||||||||||    
T  31767047 tccacatcgaagttagaacaaccgcataagtaagagagacacgaca 31767092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 97 - 133
Target Start/End: Original strand, 47380218 - 47380254
Alignment:
Q  97 acactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatg 133  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  47380218 acactcttacccaaaactttaaggcaatgagtttatg 47380254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0702 (Bit Score: 104; Significance: 5e-52; HSPs: 2)
Name: scaffold0702
Description:

Target: scaffold0702; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 46 - 201
Target Start/End: Original strand, 514 - 669
Alignment:
Q  46 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 145  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |    
T  514 ggggaccttccacatcgaggctagaaaaaccactcaagcaagaaagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 613  T
Q  146 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  614 tataaggtgttcaacctttactcttttaaccgatgtgggacatataactcacactt 669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0702; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 46 - 201
Target Start/End: Original strand, 147 - 297
Alignment:
Q  46 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 145  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||| || |||| ||| ||| |||   ||| |||||||| | |||||| |    
T  147 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacattcttacctaaa-cctaaagt--atg-gtttatgg-tcctcttact 241  T
Q  146 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  242 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacactt 297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0391 (Bit Score: 92; Significance: 7e-45; HSPs: 3)
Name: scaffold0391
Description:

Target: scaffold0391; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 50 - 201
Target Start/End: Original strand, 1110 - 1261
Alignment:
Q  50 accgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttata 149  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||| ||||||| || || ||  |||||    
T  1110 accgtccacatcgaggctagaacaaccacataaacaagagagacaccatactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgagtcctttttcttata 1209  T
Q  150 aggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  1210 aggtgttcaacctttactcttttatccaatgtgggacatataactcacactt 1261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0391; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 86 - 156
Target Start/End: Original strand, 1731 - 1801
Alignment:
Q  86 agagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgtt 156  Q
    |||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||| | ||||||||||||    
T  1731 agagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctctcacttataaggtgtt 1801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0391; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 153 - 199
Target Start/End: Original strand, 3092 - 3138
Alignment:
Q  153 tgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacac 199  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3092 tgttcaacctttactcttttatccgatgtgggacatataactcacac 3138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0027 (Bit Score: 92; Significance: 7e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0027
Description:

Target: scaffold0027; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 46 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 47518 - 47363
Alignment:
Q  46 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 145  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||| |  |||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| |    
T  47518 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccgcgcaagcaagagagacaccacatttttacccaaaactttaaggcaatgggtttatggattctcttact 47419  T
Q  146 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    ||||||||||| || ||||||| ||||||| |||||||||||| ||| ||||||||    
T  47418 tataaggtgttcaaactttactattttatcggatgtgagacatttaattcacactt 47363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 77; Significance: 6e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 53 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 5133 - 4985
Alignment:
Q  53 gtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataagg 152  Q
    ||||||||||||| |||| ||||| || |||| |||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||  | ||| |||||||     
T  5133 gtccacatcgaggctagagcaaccgcataagcgagagagacaccacactcttacccaaaaccataaggcaatgagtttatgggtctttttacttataaga 5034  T
Q  153 tgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    | ||||||||||||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5033 tattaaacctttactgttctctccgatgtgagacatataattcacactt 4985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 84 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 5477 - 5360
Alignment:
Q  84 caagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtga 183  Q
    |||||||||||| |||||| || |||||| |||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||| || |||||||||||     
T  5477 caagagagacaccacactcttatccaaaatcttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactgttctatccgatgtgg 5378  T
Q  184 gacatataactcacactt 201  Q
     |||||||||||||||||    
T  5377 aacatataactcacactt 5360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0734 (Bit Score: 76; Significance: 2e-35; HSPs: 2)
Name: scaffold0734
Description:

Target: scaffold0734; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 55 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 5546 - 5399
Alignment:
Q  55 ccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaacctt-aaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggt 153  Q
    ||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||| ||| ||||  |||||||||  |||||| |||||||||    
T  5546 ccacatcgaggcttgaacaaccccacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaactttaagacaatatgtttatgggccctcttacttataaggt 5447  T
Q  154 gttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  5446 gttcaacctttactattttatccgatgtaggacatataactcacactt 5399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0734; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 55 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 5931 - 5780
Alignment:
Q  55 ccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaac-----cttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttata 149  Q
    ||||||||| ||| |||||||| |||||| || |||||||| |||||| ||| |||||      |||||||||||| |||||||||| |||||| |||||    
T  5931 ccacatcgaagtttgaacaaccccacaagtaaaagagacaccacactcttactcaaaatttaatcttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttata 5832  T
Q  150 aggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5831 aggtgttcaacctttactattttatccgatgtgcgacatataactcacactt 5780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0171 (Bit Score: 57; Significance: 5e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0171
Description:

Target: scaffold0171; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 109 - 201
Target Start/End: Original strand, 17519 - 17611
Alignment:
Q  109 aaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  17519 aaaaccttaaggctatgggtttatgggtcctcttacttacaaggtgttcaacctttactattttatctgatgtgtgacatataactcacactt 17611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0504 (Bit Score: 51; Significance: 2e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0504
Description:

Target: scaffold0504; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 127 - 201
Target Start/End: Original strand, 10192 - 10266
Alignment:
Q  127 gtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10192 gtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacttttaccattttatccgatgtgagacatataactcacactt 10266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 72 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 39588 - 39460
Alignment:
Q  72 caaccacacaagcaagagagacacga-cactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactctt 170  Q
    |||||||||||||||||||||| | | ||||  |||||||||| |||||||||   |||||| | | |||| | |||||||| ||| |||||  ||| ||    
T  39588 caaccacacaagcaagagagacgccaacacttttacccaaaac-ttaaggcaacatgtttatagttcctctcacttataaggagttcaacctccactttt 39490  T
Q  171 ttatccgatgtgagacatataactcacactt 201  Q
     ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  39489 ctatgcg-tgtgagacatataactcacactt 39460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University