View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF17861_low_19 (Length: 436)

Name: NF17861_low_19
Description: NF17861
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF17861_low_19
NF17861_low_19
[»] chr3 (118 HSPs)
chr3 (194-382)||(24100277-24100464)
chr3 (193-382)||(47257787-47257976)
chr3 (193-383)||(32234397-32234586)
chr3 (194-379)||(41464349-41464534)
chr3 (193-379)||(29625826-29626012)
chr3 (193-379)||(40130958-40131144)
chr3 (193-378)||(49330035-49330220)
chr3 (193-380)||(7855113-7855300)
chr3 (193-375)||(38416723-38416905)
chr3 (194-383)||(22399090-22399278)
chr3 (193-377)||(47809595-47809780)
chr3 (194-378)||(28048392-28048576)
chr3 (195-379)||(51170034-51170218)
chr3 (195-379)||(55453245-55453429)
chr3 (193-376)||(27066977-27067160)
chr3 (194-381)||(37313394-37313581)
chr3 (194-377)||(40643799-40643982)
chr3 (194-377)||(52628953-52629135)
chr3 (194-380)||(51102378-51102564)
chr3 (192-377)||(40419834-40420019)
chr3 (193-378)||(42291840-42292025)
chr3 (193-378)||(43612046-43612231)
chr3 (193-377)||(2665999-2666183)
chr3 (193-377)||(20754392-20754576)
chr3 (194-380)||(37324537-37324723)
chr3 (193-378)||(35594119-35594304)
chr3 (192-377)||(35748309-35748494)
chr3 (193-378)||(48739232-48739417)
chr3 (193-377)||(44806683-44806867)
chr3 (193-376)||(39634571-39634753)
chr3 (193-384)||(53943587-53943777)
chr3 (194-375)||(46134357-46134538)
chr3 (192-380)||(40804508-40804696)
chr3 (193-379)||(52638839-52639025)
chr3 (193-377)||(7755306-7755489)
chr3 (194-378)||(44222827-44223011)
chr3 (196-379)||(48609719-48609903)
chr3 (196-371)||(43183917-43184092)
chr3 (193-376)||(51452750-51452932)
chr3 (193-383)||(39053387-39053577)
chr3 (193-379)||(43125828-43126013)
chr3 (194-382)||(51146215-51146403)
chr3 (194-380)||(5560025-5560218)
chr3 (193-375)||(18946904-18947086)
chr3 (193-374)||(41293318-41293498)
chr3 (194-379)||(41732525-41732710)
chr3 (195-375)||(43021715-43021896)
chr3 (209-375)||(52215077-52215243)
chr3 (196-377)||(47894822-47895003)
chr3 (193-353)||(46126010-46126169)
chr3 (196-376)||(53832486-53832666)
chr3 (194-377)||(36368938-36369120)
chr3 (219-377)||(24376572-24376730)
chr3 (227-376)||(53637841-53637990)
chr3 (193-377)||(41216454-41216638)
chr3 (196-379)||(54159000-54159173)
chr3 (193-378)||(25641644-25641818)
chr3 (193-377)||(42589829-42590002)
chr3 (211-372)||(46949379-46949538)
chr3 (194-380)||(34279721-34279896)
chr3 (197-379)||(49130575-49130746)
chr3 (193-379)||(51415966-51416141)
chr3 (193-379)||(54707219-54707394)
chr3 (196-379)||(48546842-48547014)
chr3 (193-377)||(41635799-41635972)
chr3 (194-376)||(38156632-38156803)
chr3 (193-383)||(39141124-39141304)
chr3 (193-377)||(54401186-54401359)
chr3 (193-377)||(55000177-55000350)
chr3 (193-380)||(25353550-25353726)
chr3 (230-383)||(37758922-37759075)
chr3 (194-377)||(55379984-55380156)
chr3 (194-378)||(47510940-47511113)
chr3 (193-377)||(53115446-53115619)
chr3 (193-375)||(31286792-31286963)
chr3 (193-309)||(33550466-33550582)
chr3 (193-316)||(52864550-52864672)
chr3 (219-379)||(17665549-17665698)
chr3 (194-379)||(37028720-37028894)
chr3 (196-383)||(45058876-45059052)
chr3 (193-379)||(30251500-30251675)
chr3 (194-376)||(24688114-24688285)
chr3 (194-380)||(51224038-51224212)
chr3 (199-375)||(40022075-40022240)
chr3 (195-375)||(51143818-51143987)
chr3 (268-380)||(2227998-2228110)
chr3 (280-375)||(41882066-41882161)
chr3 (280-380)||(21597223-21597323)
chr3 (280-380)||(28576187-28576287)
chr3 (269-377)||(42998853-42998960)
chr3 (193-377)||(44945934-44946101)
chr3 (280-377)||(48726073-48726170)
chr3 (280-379)||(50731989-50732087)
chr3 (194-379)||(50780769-50780942)
chr3 (194-375)||(43176738-43176908)
chr3 (245-327)||(47182049-47182131)
chr3 (300-377)||(52434138-52434216)
chr3 (300-376)||(48752085-48752161)
chr3 (284-367)||(47402828-47402911)
chr3 (194-348)||(52756067-52756214)
chr3 (193-266)||(48534006-48534079)
chr3 (194-375)||(40165653-40165822)
chr3 (324-378)||(37741433-37741487)
chr3 (280-375)||(177162-177257)
chr3 (180-278)||(30429213-30429311)
chr3 (97-150)||(30860480-30860533)
chr3 (332-377)||(51942543-51942588)
chr3 (268-380)||(8847721-8847832)
chr3 (192-345)||(41609098-41609240)
chr3 (194-245)||(50731914-50731965)
chr3 (193-236)||(41882010-41882053)
chr3 (196-241)||(43260841-43260886)
chr3 (195-235)||(37760346-37760386)
chr3 (195-247)||(42998790-42998842)
chr3 (200-253)||(52434291-52434344)
chr3 (193-253)||(177273-177333)
chr3 (193-253)||(21597147-21597207)
chr3 (349-377)||(33550581-33550609)
[»] chr8 (69 HSPs)
chr8 (193-379)||(32984076-32984262)
chr8 (194-383)||(41862213-41862402)
chr8 (194-377)||(24079901-24080084)
chr8 (193-377)||(43328706-43328890)
chr8 (193-380)||(5946043-5946230)
chr8 (194-381)||(37419935-37420122)
chr8 (194-376)||(40435153-40435335)
chr8 (194-375)||(10646124-10646305)
chr8 (193-377)||(33730640-33730824)
chr8 (193-377)||(37956420-37956604)
chr8 (193-376)||(9303573-9303756)
chr8 (194-376)||(9734255-9734435)
chr8 (198-375)||(31830959-31831136)
chr8 (194-379)||(41653892-41654077)
chr8 (193-377)||(6365985-6366169)
chr8 (183-383)||(13356109-13356309)
chr8 (193-377)||(33981662-33981846)
chr8 (193-376)||(9013684-9013866)
chr8 (193-380)||(17718721-17718908)
chr8 (196-371)||(32114254-32114429)
chr8 (195-377)||(37301326-37301508)
chr8 (193-383)||(45236564-45236754)
chr8 (193-376)||(2275913-2276095)
chr8 (192-378)||(25185897-25186083)
chr8 (194-375)||(2714550-2714730)
chr8 (193-377)||(41231945-41232129)
chr8 (193-377)||(13760645-13760831)
chr8 (194-377)||(35628776-35628959)
chr8 (195-383)||(22878384-22878572)
chr8 (217-378)||(29048426-29048587)
chr8 (195-379)||(41639911-41640095)
chr8 (193-376)||(45066591-45066774)
chr8 (197-375)||(44088446-44088624)
chr8 (194-379)||(25248036-25248215)
chr8 (193-376)||(45258510-45258692)
chr8 (194-380)||(10378305-10378480)
chr8 (193-320)||(12032986-12033113)
chr8 (193-377)||(4447294-4447467)
chr8 (206-375)||(42701301-42701471)
chr8 (194-327)||(3904126-3904258)
chr8 (194-377)||(31940314-31940485)
chr8 (194-310)||(41981534-41981650)
chr8 (194-381)||(117329-117505)
chr8 (193-375)||(3211207-3211377)
chr8 (182-383)||(33896831-33897020)
chr8 (193-307)||(31336163-31336277)
chr8 (194-377)||(41843252-41843424)
chr8 (194-377)||(9713688-9713857)
chr8 (269-376)||(39915887-39915994)
chr8 (194-378)||(2379138-2379311)
chr8 (194-376)||(40458772-40458943)
chr8 (199-374)||(4975412-4975576)
chr8 (279-380)||(27243213-27243314)
chr8 (279-380)||(27254788-27254889)
chr8 (200-371)||(32373733-32373892)
chr8 (193-378)||(3490398-3490572)
chr8 (192-377)||(9509398-9509572)
chr8 (274-355)||(41981454-41981535)
chr8 (193-382)||(26196316-26196493)
chr8 (193-378)||(31148890-31149063)
chr8 (211-376)||(38631652-38631806)
chr8 (200-364)||(40649837-40649990)
chr8 (311-380)||(33622571-33622640)
chr8 (194-259)||(39901674-39901739)
chr8 (307-370)||(164728-164791)
chr8 (340-377)||(12032951-12032988)
chr8 (194-266)||(41425429-41425500)
chr8 (332-375)||(39901574-39901617)
chr8 (194-263)||(33622467-33622535)
[»] chr7 (96 HSPs)
chr7 (193-383)||(45482652-45482842)
chr7 (194-379)||(22979647-22979832)
chr7 (194-379)||(25893917-25894102)
chr7 (195-378)||(33423276-33423459)
chr7 (193-375)||(49171361-49171543)
chr7 (193-382)||(33332784-33332972)
chr7 (193-378)||(33839714-33839899)
chr7 (194-379)||(47740331-47740516)
chr7 (193-378)||(17855427-17855612)
chr7 (194-375)||(20165814-20165995)
chr7 (194-379)||(33695821-33696006)
chr7 (193-378)||(35355887-35356072)
chr7 (193-379)||(46913107-46913295)
chr7 (193-377)||(47066976-47067160)
chr7 (194-375)||(23393051-23393232)
chr7 (192-377)||(35328067-35328252)
chr7 (194-379)||(45690097-45690282)
chr7 (193-380)||(2341660-2341848)
chr7 (194-378)||(27018115-27018299)
chr7 (194-379)||(19563445-19563630)
chr7 (186-383)||(37846008-37846205)
chr7 (194-378)||(33411259-33411443)
chr7 (193-377)||(40670563-40670747)
chr7 (194-380)||(48609677-48609863)
chr7 (193-377)||(31586848-31587032)
chr7 (193-360)||(5183824-5183991)
chr7 (193-356)||(36389377-36389540)
chr7 (194-377)||(10028488-10028673)
chr7 (203-374)||(15877553-15877724)
chr7 (194-380)||(45063357-45063541)
chr7 (193-377)||(26579716-26579900)
chr7 (194-378)||(43499484-43499668)
chr7 (194-379)||(5712166-5712351)
chr7 (193-377)||(35757019-35757203)
chr7 (193-375)||(31625706-31625887)
chr7 (194-377)||(31429475-31429658)
chr7 (194-352)||(29446863-29447020)
chr7 (195-383)||(33870239-33870424)
chr7 (206-375)||(41990870-41991039)
chr7 (193-377)||(10618298-10618475)
chr7 (193-377)||(35767481-35767658)
chr7 (228-378)||(33720070-33720220)
chr7 (193-377)||(35752033-35752206)
chr7 (193-377)||(24923023-24923196)
chr7 (181-383)||(24228535-24228726)
chr7 (194-331)||(28233936-28234073)
chr7 (194-377)||(43489218-43489390)
chr7 (193-325)||(30076526-30076658)
chr7 (193-379)||(46817420-46817595)
chr7 (193-378)||(46898015-46898189)
chr7 (194-378)||(36816845-36817018)
chr7 (192-375)||(37127939-37128111)
chr7 (195-376)||(45502817-45502987)
chr7 (193-377)||(48085858-48086031)
chr7 (218-359)||(44564356-44564497)
chr7 (195-377)||(33393328-33393499)
chr7 (193-378)||(7876327-7876501)
chr7 (192-380)||(44003368-44003545)
chr7 (194-377)||(21718117-21718288)
chr7 (203-377)||(26941541-26941704)
chr7 (198-376)||(29098752-29098915)
chr7 (193-313)||(44405412-44405532)
chr7 (194-377)||(2332019-2332191)
chr7 (194-375)||(47460772-47460942)
chr7 (194-377)||(29610635-29610807)
chr7 (193-310)||(41904272-41904389)
chr7 (193-379)||(25037507-25037682)
chr7 (193-378)||(44659843-44660016)
chr7 (194-382)||(498188-498365)
chr7 (194-378)||(7257380-7257553)
chr7 (269-378)||(16482847-16482956)
chr7 (228-378)||(32556640-32556779)
chr7 (196-381)||(35484632-35484807)
chr7 (198-375)||(41855061-41855228)
chr7 (194-375)||(26371051-26371221)
chr7 (193-377)||(47906757-47906931)
chr7 (193-377)||(39323616-39323780)
chr7 (196-377)||(39453484-39453647)
chr7 (196-379)||(15643948-15644120)
chr7 (279-375)||(39866667-39866763)
chr7 (193-375)||(45237532-45237703)
chr7 (195-371)||(46103127-46103291)
chr7 (279-375)||(33455098-33455194)
chr7 (280-375)||(29863017-29863112)
chr7 (312-377)||(30077043-30077108)
chr7 (309-377)||(35557730-35557798)
chr7 (268-365)||(38448511-38448608)
chr7 (314-378)||(35823289-35823353)
chr7 (280-376)||(7720578-7720674)
chr7 (193-337)||(37443601-37443734)
chr7 (194-259)||(42272180-42272244)
chr7 (340-379)||(42272149-42272188)
chr7 (309-378)||(21649482-21649552)
chr7 (267-329)||(26456157-26456219)
chr7 (208-252)||(39866762-39866806)
chr7 (385-422)||(33473597-33473634)
[»] chr5 (74 HSPs)
chr5 (194-380)||(24253378-24253564)
chr5 (196-379)||(6901796-6901979)
chr5 (193-378)||(3466680-3466865)
chr5 (194-379)||(43326379-43326564)
chr5 (193-377)||(39932578-39932762)
chr5 (195-375)||(15398483-15398663)
chr5 (193-377)||(35626037-35626221)
chr5 (193-383)||(43262182-43262372)
chr5 (193-378)||(7722047-7722232)
chr5 (194-383)||(40886028-40886216)
chr5 (194-377)||(5184971-5185154)
chr5 (193-379)||(739703-739889)
chr5 (194-379)||(27938894-27939080)
chr5 (194-375)||(18479668-18479849)
chr5 (194-381)||(27501055-27501242)
chr5 (194-376)||(12648797-12648979)
chr5 (193-380)||(25831517-25831703)
chr5 (194-376)||(15683791-15683973)
chr5 (194-375)||(2484292-2484473)
chr5 (195-377)||(27278474-27278660)
chr5 (194-365)||(31938908-31939079)
chr5 (194-381)||(40278858-40279044)
chr5 (193-378)||(28424794-28424977)
chr5 (193-378)||(5137713-5137898)
chr5 (193-339)||(29789294-29789440)
chr5 (193-381)||(890901-891088)
chr5 (194-374)||(13504742-13504922)
chr5 (193-368)||(38756486-38756662)
chr5 (196-382)||(40110228-40110413)
chr5 (193-376)||(763723-763906)
chr5 (194-334)||(34451292-34451432)
chr5 (193-377)||(33617584-33617757)
chr5 (213-379)||(4149691-4149847)
chr5 (195-377)||(9424593-9424764)
chr5 (194-380)||(19295726-19295901)
chr5 (193-378)||(13957668-13957842)
chr5 (194-379)||(27503376-27503550)
chr5 (183-375)||(38015503-38015684)
chr5 (203-379)||(42658671-42658836)
chr5 (194-375)||(31293989-31294170)
chr5 (193-377)||(23195247-23195420)
chr5 (193-378)||(5497271-5497445)
chr5 (193-377)||(36365444-36365617)
chr5 (193-376)||(6973063-6973235)
chr5 (232-377)||(40632498-40632634)
chr5 (194-375)||(9374502-9374672)
chr5 (194-377)||(2585461-2585633)
chr5 (268-381)||(12558093-12558205)
chr5 (207-365)||(5120036-5120182)
chr5 (194-375)||(14971979-14972149)
chr5 (193-378)||(38637909-38638083)
chr5 (279-378)||(42247856-42247955)
chr5 (269-379)||(36472348-36472458)
chr5 (194-377)||(24167784-24167956)
chr5 (193-378)||(1402504-1402678)
chr5 (194-378)||(18327173-18327346)
chr5 (193-377)||(27390596-27390769)
chr5 (194-349)||(3656568-3656712)
chr5 (217-377)||(6206883-6207032)
chr5 (196-350)||(36948492-36948633)
chr5 (193-375)||(40686900-40687070)
chr5 (195-371)||(33623940-33624105)
chr5 (293-373)||(9171113-9171193)
chr5 (309-375)||(9527124-9527190)
chr5 (193-350)||(612756-612900)
chr5 (194-342)||(38492647-38492783)
chr5 (293-352)||(3940419-3940478)
chr5 (294-365)||(15300962-15301033)
chr5 (316-377)||(27584384-27584447)
chr5 (316-372)||(28756082-28756138)
chr5 (193-228)||(40633525-40633560)
chr5 (193-266)||(9171034-9171106)
chr5 (194-223)||(21786003-21786032)
chr5 (385-422)||(26637582-26637619)
[»] chr1 (115 HSPs)
chr1 (193-378)||(31307999-31308184)
chr1 (194-383)||(45538146-45538335)
chr1 (193-377)||(31040708-31040892)
chr1 (194-380)||(3611132-3611318)
chr1 (193-379)||(44661967-44662153)
chr1 (193-383)||(38331858-38332048)
chr1 (193-382)||(17994950-17995139)
chr1 (194-382)||(26277171-26277359)
chr1 (194-376)||(21139412-21139594)
chr1 (193-375)||(38790196-38790378)
chr1 (200-381)||(4068689-4068870)
chr1 (194-383)||(24245025-24245214)
chr1 (194-379)||(25058685-25058870)
chr1 (193-377)||(5981169-5981353)
chr1 (193-381)||(6327547-6327734)
chr1 (194-377)||(25678259-25678442)
chr1 (193-379)||(23984752-23984938)
chr1 (196-374)||(43251713-43251891)
chr1 (194-382)||(26085398-26085585)
chr1 (193-383)||(24885494-24885684)
chr1 (194-380)||(47671582-47671768)
chr1 (193-377)||(23932508-23932692)
chr1 (194-378)||(33112818-33113001)
chr1 (193-377)||(39646567-39646751)
chr1 (193-376)||(26524888-26525071)
chr1 (194-377)||(37620192-37620375)
chr1 (193-378)||(35692662-35692848)
chr1 (193-379)||(46616546-46616732)
chr1 (193-375)||(50774218-50774400)
chr1 (194-383)||(35273589-35273778)
chr1 (193-378)||(41999813-41999998)
chr1 (194-379)||(51057068-51057253)
chr1 (194-377)||(5980067-5980250)
chr1 (193-376)||(33884088-33884271)
chr1 (193-376)||(33959981-33960164)
chr1 (194-377)||(36566329-36566512)
chr1 (194-383)||(46967041-46967230)
chr1 (198-378)||(26794302-26794482)
chr1 (193-377)||(49253974-49254158)
chr1 (194-376)||(47383732-47383914)
chr1 (195-383)||(3285395-3285582)
chr1 (198-377)||(23220939-23221112)
chr1 (193-381)||(47187100-47187288)
chr1 (197-375)||(28888582-28888760)
chr1 (194-375)||(47317316-47317497)
chr1 (194-376)||(46784423-46784605)
chr1 (222-378)||(31844374-31844530)
chr1 (207-374)||(42863867-42864034)
chr1 (194-377)||(49398988-49399171)
chr1 (239-375)||(25518815-25518951)
chr1 (193-375)||(36003131-36003316)
chr1 (193-380)||(48373500-48373678)
chr1 (193-377)||(42313360-42313548)
chr1 (194-379)||(27983603-27983772)
chr1 (193-383)||(33073204-33073383)
chr1 (194-377)||(41467632-41467804)
chr1 (193-379)||(10928064-10928239)
chr1 (194-379)||(2657300-2657474)
chr1 (194-341)||(2450529-2450676)
chr1 (270-376)||(51403083-51403189)
chr1 (195-376)||(6626025-6626195)
chr1 (193-382)||(29770664-29770842)
chr1 (193-377)||(26685855-26686028)
chr1 (200-379)||(26472185-26472353)
chr1 (193-380)||(42234836-42235011)
chr1 (197-374)||(45475848-45476014)
chr1 (194-335)||(51045596-51045737)
chr1 (194-378)||(30289910-30290083)
chr1 (193-322)||(4808699-4808828)
chr1 (257-374)||(31979998-31980115)
chr1 (193-383)||(2954848-2955027)
chr1 (194-383)||(4243490-4243668)
chr1 (257-379)||(2556909-2557031)
chr1 (194-373)||(1388476-1388644)
chr1 (192-379)||(5961265-5961441)
chr1 (194-379)||(33187337-33187505)
chr1 (193-375)||(4953053-4953224)
chr1 (200-376)||(34752320-34752485)
chr1 (194-377)||(38716247-38716419)
chr1 (279-380)||(13313248-13313351)
chr1 (220-376)||(13281588-13281733)
chr1 (194-374)||(41895164-41895333)
chr1 (279-374)||(32448650-32448745)
chr1 (194-378)||(10920198-10920371)
chr1 (285-379)||(24649802-24649896)
chr1 (193-377)||(51155589-51155761)
chr1 (193-325)||(4156438-4156577)
chr1 (194-287)||(13312531-13312624)
chr1 (269-377)||(27924722-27924830)
chr1 (279-375)||(44544120-44544216)
chr1 (194-364)||(48683330-48683489)
chr1 (194-375)||(7561528-7561712)
chr1 (279-376)||(46428327-46428424)
chr1 (194-378)||(52323936-52324110)
chr1 (211-381)||(35991616-35991774)
chr1 (268-379)||(39475846-39475956)
chr1 (286-377)||(39637899-39637986)
chr1 (193-377)||(52367882-52368055)
chr1 (184-383)||(44293445-44293633)
chr1 (193-326)||(47772171-47772304)
chr1 (317-377)||(4156188-4156248)
chr1 (324-378)||(10919313-10919367)
chr1 (194-253)||(31286504-31286563)
chr1 (217-333)||(24215806-24215911)
chr1 (193-231)||(31844818-31844856)
chr1 (197-250)||(32448754-32448807)
chr1 (345-379)||(23994845-23994879)
chr1 (194-266)||(38718167-38718239)
chr1 (335-383)||(12891393-12891440)
chr1 (194-253)||(24649732-24649791)
chr1 (344-383)||(36030736-36030775)
chr1 (213-255)||(39359502-39359544)
chr1 (194-247)||(39475783-39475836)
chr1 (337-377)||(31286607-31286647)
chr1 (347-375)||(47772306-47772334)
[»] scaffold0076 (1 HSPs)
scaffold0076 (193-377)||(13761-13945)
[»] chr6 (46 HSPs)
chr6 (193-377)||(5882505-5882689)
chr6 (194-381)||(22551061-22551248)
chr6 (198-378)||(14891383-14891563)
chr6 (193-377)||(24168090-24168274)
chr6 (193-377)||(26377203-26377387)
chr6 (194-379)||(8615237-8615422)
chr6 (194-378)||(28947085-28947269)
chr6 (196-375)||(2892189-2892368)
chr6 (193-363)||(11988973-11989143)
chr6 (193-382)||(34527861-34528050)
chr6 (188-384)||(1970703-1970899)
chr6 (194-373)||(18101495-18101674)
chr6 (193-379)||(7393585-7393771)
chr6 (195-377)||(19281056-19281238)
chr6 (193-378)||(19415532-19415717)
chr6 (194-376)||(959904-960086)
chr6 (193-378)||(2593851-2594036)
chr6 (196-377)||(7345114-7345295)
chr6 (194-378)||(599890-600074)
chr6 (193-377)||(10507907-10508091)
chr6 (203-379)||(16703363-16703539)
chr6 (193-382)||(5294800-5294989)
chr6 (193-382)||(5299352-5299541)
chr6 (193-363)||(22341787-22341959)
chr6 (194-376)||(24224070-24224253)
chr6 (194-375)||(33452572-33452753)
chr6 (193-375)||(30743447-30743629)
chr6 (247-377)||(30467656-30467786)
chr6 (194-379)||(28948845-28949019)
chr6 (193-344)||(23261928-23262079)
chr6 (201-379)||(13329378-13329545)
chr6 (194-378)||(7167580-7167753)
chr6 (193-377)||(15965432-15965605)
chr6 (193-375)||(3291009-3291180)
chr6 (294-378)||(929657-929741)
chr6 (194-375)||(4487528-4487698)
chr6 (194-384)||(1398545-1398724)
chr6 (194-376)||(3786749-3786920)
chr6 (288-379)||(375807-375898)
chr6 (279-370)||(1939578-1939669)
chr6 (320-382)||(11743070-11743132)
chr6 (194-266)||(18661833-18661905)
chr6 (193-253)||(34262342-34262402)
chr6 (193-266)||(24913095-24913168)
chr6 (196-253)||(375729-375786)
chr6 (285-365)||(13844847-13844927)
[»] chr4 (132 HSPs)
chr4 (194-376)||(18462013-18462195)
chr4 (193-376)||(34276547-34276730)
chr4 (194-377)||(53854430-53854612)
chr4 (193-379)||(2826681-2826866)
chr4 (193-378)||(237475-237660)
chr4 (194-383)||(9798458-9798647)
chr4 (194-379)||(21366609-21366794)
chr4 (194-378)||(23437590-23437774)
chr4 (195-378)||(32366661-32366844)
chr4 (193-379)||(42085204-42085390)
chr4 (194-383)||(44984754-44984943)
chr4 (194-379)||(47344653-47344838)
chr4 (195-375)||(6019929-6020109)
chr4 (194-382)||(51363001-51363188)
chr4 (194-380)||(31532135-31532321)
chr4 (193-379)||(53461815-53462001)
chr4 (193-378)||(39077543-39077728)
chr4 (194-379)||(54574940-54575125)
chr4 (194-382)||(26091258-26091446)
chr4 (193-376)||(146428-146611)
chr4 (196-379)||(41702461-41702644)
chr4 (193-379)||(3170623-3170809)
chr4 (193-375)||(22618513-22618693)
chr4 (194-379)||(29478357-29478542)
chr4 (193-377)||(42765841-42766024)
chr4 (193-377)||(43471694-43471878)
chr4 (193-377)||(55056258-55056442)
chr4 (194-377)||(54607961-54608144)
chr4 (194-377)||(41949381-41949566)
chr4 (196-377)||(397401-397582)
chr4 (193-378)||(19387687-19387872)
chr4 (194-375)||(42222292-42222473)
chr4 (196-377)||(50457812-50457993)
chr4 (194-382)||(23609081-23609269)
chr4 (193-377)||(31070073-31070256)
chr4 (194-377)||(407753-407934)
chr4 (197-376)||(6285307-6285486)
chr4 (194-377)||(27373075-27373257)
chr4 (193-377)||(38591667-38591847)
chr4 (193-380)||(47662101-47662288)
chr4 (193-378)||(31914196-31914380)
chr4 (194-379)||(42033172-42033357)
chr4 (193-378)||(45797477-45797662)
chr4 (193-378)||(55776043-55776227)
chr4 (193-378)||(55840221-55840405)
chr4 (193-377)||(29777256-29777440)
chr4 (194-373)||(31972336-31972515)
chr4 (194-377)||(41560327-41560510)
chr4 (194-378)||(49881059-49881247)
chr4 (194-377)||(55519826-55520009)
chr4 (193-378)||(14017375-14017558)
chr4 (198-376)||(35446506-35446683)
chr4 (193-379)||(50233997-50234183)
chr4 (194-383)||(41632007-41632195)
chr4 (193-377)||(2243457-2243641)
chr4 (193-377)||(3692209-3692393)
chr4 (194-382)||(48313551-48313737)
chr4 (198-382)||(50536628-50536812)
chr4 (212-375)||(22468788-22468951)
chr4 (194-377)||(56022998-56023181)
chr4 (198-375)||(50534632-50534809)
chr4 (194-379)||(54086407-54086590)
chr4 (195-375)||(53834055-53834235)
chr4 (203-381)||(33897504-33897681)
chr4 (193-374)||(48657826-48658001)
chr4 (194-378)||(54424980-54425163)
chr4 (193-377)||(1932762-1932946)
chr4 (211-377)||(39587796-39587962)
chr4 (194-379)||(54805614-54805803)
chr4 (193-375)||(48259511-48259691)
chr4 (194-336)||(52728307-52728448)
chr4 (193-375)||(48654815-48655003)
chr4 (193-377)||(36532829-36533003)
chr4 (196-380)||(51951678-51951861)
chr4 (173-385)||(49014089-49014290)
chr4 (188-376)||(54715035-54715212)
chr4 (194-377)||(9997931-9998103)
chr4 (194-379)||(45633779-45633953)
chr4 (193-382)||(37239089-37239267)
chr4 (193-375)||(43890929-43891100)
chr4 (194-382)||(15060289-15060466)
chr4 (194-376)||(5117438-5117609)
chr4 (194-377)||(34552318-34552490)
chr4 (194-377)||(52688348-52688520)
chr4 (193-375)||(20351841-20352012)
chr4 (193-379)||(34835174-34835349)
chr4 (194-379)||(22620590-22620764)
chr4 (196-381)||(54216308-54216482)
chr4 (193-377)||(31881313-31881486)
chr4 (193-377)||(38547600-38547773)
chr4 (193-377)||(46720024-46720200)
chr4 (194-378)||(54216736-54216909)
chr4 (193-376)||(47811906-47812078)
chr4 (11-137)||(40491650-40491776)
chr4 (192-377)||(46708739-46708913)
chr4 (193-377)||(4486580-4486753)
chr4 (194-291)||(35595772-35595869)
chr4 (193-375)||(14335100-14335271)
chr4 (193-377)||(27873549-27873720)
chr4 (187-377)||(52461365-52461541)
chr4 (198-377)||(27398607-27398775)
chr4 (193-377)||(1662260-1662431)
chr4 (279-383)||(11972203-11972307)
chr4 (193-375)||(27580120-27580291)
chr4 (279-381)||(3293097-3293199)
chr4 (293-375)||(42557583-42557665)
chr4 (194-377)||(33289702-33289873)
chr4 (194-321)||(42509351-42509478)
chr4 (239-328)||(52396774-52396864)
chr4 (193-376)||(6371248-6371420)
chr4 (195-266)||(33048991-33049062)
chr4 (194-377)||(573802-573974)
chr4 (280-377)||(43231502-43231598)
chr4 (195-296)||(35344868-35344968)
chr4 (212-375)||(33557960-33558112)
chr4 (193-271)||(48259703-48259780)
chr4 (325-378)||(17555617-17555670)
chr4 (270-375)||(49057933-49058038)
chr4 (194-348)||(27872607-27872750)
chr4 (194-365)||(18206512-18206682)
chr4 (378-422)||(40491774-40491818)
chr4 (193-261)||(42558300-42558368)
chr4 (194-339)||(51981479-51981613)
chr4 (193-262)||(3291804-3291873)
chr4 (103-186)||(47786250-47786332)
chr4 (91-137)||(4901370-4901416)
chr4 (288-377)||(43478059-43478147)
chr4 (217-258)||(47105046-47105087)
chr4 (313-365)||(16738569-16738621)
chr4 (329-377)||(35195077-35195125)
chr4 (386-422)||(42885017-42885053)
chr4 (337-377)||(47105318-47105358)
[»] chr2 (88 HSPs)
chr2 (193-377)||(27651033-27651217)
chr2 (194-377)||(746464-746647)
chr2 (193-379)||(6594457-6594643)
chr2 (193-379)||(17600832-17601018)
chr2 (197-378)||(10424592-10424773)
chr2 (194-379)||(23901775-23901960)
chr2 (193-377)||(4034590-4034774)
chr2 (194-377)||(45370988-45371171)
chr2 (194-380)||(26710340-26710526)
chr2 (194-376)||(38997100-38997282)
chr2 (193-377)||(2324888-2325072)
chr2 (194-378)||(13815218-13815402)
chr2 (193-377)||(40635216-40635400)
chr2 (194-377)||(11184970-11185153)
chr2 (193-376)||(14660445-14660628)
chr2 (193-376)||(34518366-34518549)
chr2 (200-377)||(6430471-6430648)
chr2 (194-379)||(27400399-27400584)
chr2 (194-377)||(10244582-10244765)
chr2 (193-377)||(27024413-27024597)
chr2 (183-384)||(32327351-32327553)
chr2 (194-376)||(32948445-32948626)
chr2 (193-377)||(1091950-1092134)
chr2 (194-376)||(5726128-5726310)
chr2 (194-380)||(40735459-40735645)
chr2 (194-375)||(2914138-2914319)
chr2 (193-377)||(40037141-40037324)
chr2 (193-376)||(7892687-7892870)
chr2 (193-375)||(33427646-33427828)
chr2 (194-375)||(4609626-4609807)
chr2 (194-378)||(14697537-14697721)
chr2 (200-382)||(15925073-15925255)
chr2 (194-378)||(37620867-37621054)
chr2 (193-361)||(32856435-32856603)
chr2 (193-378)||(37255336-37255516)
chr2 (220-379)||(32608376-32608535)
chr2 (193-375)||(9444683-9444875)
chr2 (194-372)||(11159625-11159802)
chr2 (220-379)||(8432942-8433101)
chr2 (193-378)||(21734899-21735073)
chr2 (195-380)||(39103042-39103216)
chr2 (221-375)||(12842103-12842257)
chr2 (251-377)||(42899913-42900039)
chr2 (194-377)||(28641292-28641464)
chr2 (197-324)||(25294886-25295013)
chr2 (194-375)||(35158050-35158220)
chr2 (194-377)||(29687039-29687211)
chr2 (192-382)||(1229628-1229811)
chr2 (228-381)||(41172453-41172605)
chr2 (194-379)||(12333497-12333669)
chr2 (196-376)||(145281-145450)
chr2 (193-375)||(27331298-27331473)
chr2 (193-377)||(44481826-44481999)
chr2 (194-377)||(4258488-4258659)
chr2 (296-381)||(12814608-12814693)
chr2 (194-376)||(19428426-19428598)
chr2 (194-377)||(43898971-43899142)
chr2 (193-379)||(13543623-13543798)
chr2 (194-375)||(39301197-39301367)
chr2 (193-377)||(12730059-12730232)
chr2 (194-378)||(27764863-27765035)
chr2 (199-379)||(28566703-28566872)
chr2 (193-375)||(34249265-34249436)
chr2 (194-301)||(447633-447740)
chr2 (193-379)||(2688728-2688903)
chr2 (199-377)||(35126778-35126945)
chr2 (279-379)||(40544150-40544250)
chr2 (194-377)||(43356097-43356266)
chr2 (279-375)||(3266296-3266392)
chr2 (285-380)||(2000417-2000512)
chr2 (193-344)||(3711664-3711804)
chr2 (192-379)||(30545817-30545993)
chr2 (194-301)||(12827137-12827243)
chr2 (279-376)||(8056625-8056722)
chr2 (232-304)||(28014856-28014928)
chr2 (332-378)||(28019959-28020005)
chr2 (196-252)||(3266399-3266455)
chr2 (91-147)||(34237678-34237734)
chr2 (309-376)||(10176558-10176625)
chr2 (180-249)||(42900781-42900849)
chr2 (269-368)||(38985342-38985439)
chr2 (194-252)||(40544085-40544143)
chr2 (92-147)||(16242224-16242279)
chr2 (337-375)||(1897130-1897168)
chr2 (211-265)||(8056725-8056779)
chr2 (385-422)||(9792233-9792270)
chr2 (194-255)||(10176653-10176714)
chr2 (385-422)||(10862967-10863004)
[»] scaffold0949 (1 HSPs)
scaffold0949 (194-374)||(1871-2051)
[»] scaffold0092 (1 HSPs)
scaffold0092 (193-377)||(39555-39739)
[»] scaffold0372 (1 HSPs)
scaffold0372 (194-379)||(11133-11317)
[»] scaffold0035 (1 HSPs)
scaffold0035 (193-377)||(75243-75427)
[»] scaffold0155 (1 HSPs)
scaffold0155 (194-377)||(2432-2615)
[»] scaffold0007 (2 HSPs)
scaffold0007 (193-377)||(278005-278191)
scaffold0007 (193-364)||(176666-176837)
[»] scaffold0198 (1 HSPs)
scaffold0198 (193-377)||(18853-19037)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (222-377)||(32560-32715)
[»] scaffold0394 (1 HSPs)
scaffold0394 (193-375)||(3089-3262)
[»] scaffold0429 (1 HSPs)
scaffold0429 (194-380)||(4596-4776)
[»] scaffold0721 (1 HSPs)
scaffold0721 (194-382)||(7084-7262)
[»] scaffold0150 (1 HSPs)
scaffold0150 (194-381)||(14739-14915)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (194-376)||(20477-20648)
[»] scaffold2003 (1 HSPs)
scaffold2003 (194-381)||(97-272)
[»] scaffold0684 (1 HSPs)
scaffold0684 (194-379)||(4554-4729)
[»] scaffold0163 (1 HSPs)
scaffold0163 (194-379)||(3389-3564)
[»] scaffold0271 (2 HSPs)
scaffold0271 (295-377)||(17905-17987)
scaffold0271 (228-266)||(18005-18043)
[»] scaffold0323 (1 HSPs)
scaffold0323 (194-365)||(19228-19398)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 173; Significance: 7e-93; HSPs: 118)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 7e-93
Query Start/End: Original strand, 194 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 24100464 - 24100277
Alignment:
Q  194 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaacttt 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |    
T  24100464 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtggtatc-atgaactat 24100366  T
Q  294 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaaccttaaa 382  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24100365 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaaccttaaa 24100277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 193 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 47257976 - 47257787
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactt 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||     
T  47257976 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtattcatgaacta 47257877  T
Q  293 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaaccttaaa 382  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  47257876 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaaccataaa 47257787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 193 - 383
Target Start/End: Original strand, 32234397 - 32234586
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactt 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||     
T  32234397 aggtgacaactagggtacccatggaagaatagtgggtaatttaccctaaccaatacacattagccacataagcatatttt-aagtggtatccatgaacta 32234495  T
Q  293 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaaccttaaaa 383  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32234496 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaaccttaaaa 32234586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 194 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 41464534 - 41464349
Alignment:
Q  194 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaacttt 293  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |    
T  41464534 ggtgacaactagagtacccatggaagaatgctgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 41464435  T
Q  294 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 379  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41464434 cttgactccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 41464349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 193 - 379
Target Start/End: Original strand, 29625826 - 29626012
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactt 292  Q
    |||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  29625826 aggtgataattagggtacccatagaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattaaccacataagcatatttttaagtggtatccatgaacta 29625925  T
Q  293 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 379  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29625926 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 29626012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 193 - 379
Target Start/End: Original strand, 40130958 - 40131144
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactt 292  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||     
T  40130958 aggtgacaactagggtacctatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 40131057  T
Q  293 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 379  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40131058 tcttgaccccacagacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 40131144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 193 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 49330220 - 49330035
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactt 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||     
T  49330220 aggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgagtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 49330121  T
Q  293 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 378  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49330120 tcttgaccccaccaacaaattgctcatttttattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 49330035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 193 - 380
Target Start/End: Original strand, 7855113 - 7855300
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactt 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||     
T  7855113 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacatattagccacataagcacatttttaagtggtatccttgaacta 7855212  T
Q  293 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 380  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  7855213 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaagtaatctagaaaaaacctta 7855300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 193 - 375
Target Start/End: Original strand, 38416723 - 38416905
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactt 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||     
T  38416723 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacgtaagcacatttttaagtggtatccatgaacta 38416822  T
Q  293 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  38416823 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattatccaccatttttcaaaggtaatctagaaaaaa 38416905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 194 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 22399278 - 22399090
Alignment:
Q  194 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaacttt 293  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| | |||||||||| |    
T  22399278 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagctacataagcacatttt-aagtggtttccatgaactat 22399180  T
Q  294 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaaccttaaaa 383  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22399179 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctaaaaa 22399090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 193 - 377
Target Start/End: Original strand, 47809595 - 47809780
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctc-aaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaact 291  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||    
T  47809595 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacccccaaccaatacacattagccacataaacacatttttaagtggtatccatgaact 47809694  T
Q  292 ttcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 377  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  47809695 atcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacc 47809780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 194 - 378
Target Start/End: Original strand, 28048392 - 28048576
Alignment:
Q  194 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaacttt 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |    
T  28048392 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacccaaattaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 28048491  T
Q  294 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 378  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28048492 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacct 28048576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 195 - 379
Target Start/End: Original strand, 51170034 - 51170218
Alignment:
Q  195 gtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactttc 294  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||    
T  51170034 gtgacaactatggtacccatggaagaatggtgggtaatttactccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatc 51170133  T
Q  295 ttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 379  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  51170134 ttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaaggtaatctaaaaaaaacctt 51170218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 195 - 379
Target Start/End: Original strand, 55453245 - 55453429
Alignment:
Q  195 gtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactttc 294  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||    
T  55453245 gtgacaactagggtacctatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatc 55453344  T
Q  295 ttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 379  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  55453345 ttgaccccaccaataaattgctcattttcattggttgatgagtaaattacccaccattcttcaaaggtaacctagaaaaaacctt 55453429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 193 - 376
Target Start/End: Original strand, 27066977 - 27067160
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactt 292  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||     
T  27066977 aggtgacaactagggtatccatggaagaatgatgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatattcatgaacta 27067076  T
Q  293 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaac 376  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27067077 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggttggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaac 27067160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 194 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 37313581 - 37313394
Alignment:
Q  194 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaacttt 293  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||| |    
T  37313581 ggtgacacctagagtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacatttttaagtgatattcatgaactat 37313482  T
Q  294 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaaccttaa 381  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37313481 cttgaccccaccaacaaattgttcattttcattgattggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaaccttaa 37313394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 194 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 40643982 - 40643799
Alignment:
Q  194 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaacttt 293  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| |    
T  40643982 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaaatgatatccataaactat 40643883  T
Q  294 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 377  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  40643882 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaagataatttagaaaaaacc 40643799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 194 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 52629135 - 52628953
Alignment:
Q  194 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaacttt 293  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  52629135 ggtgacaactagggtacc-atggaagaatggtggataatttaccccaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtggtatccatgaactat 52629037  T
Q  294 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 377  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  52629036 cttgaccccaccaacaaattgttcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaataaacc 52628953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 194 - 380
Target Start/End: Original strand, 51102378 - 51102564
Alignment:
Q  194 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaacttt 293  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| |    
T  51102378 ggtgacaactagggtaccaacggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaatacatttttaagtgatatccatgaactat 51102477  T
Q  294 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 380  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51102478 cttgaccccaccaacaaattactcattttcattggttggtggataaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 51102564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 192 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 40420019 - 40419834
Alignment:
Q  192 gaggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaact 291  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  40420019 gaggtgacaactagggtacccatgaaagaatggtgagtaatttaccccaatcaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaact 40419920  T
Q  292 ttcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 377  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  40419919 atcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattgattggtgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 40419834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 193 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 42292025 - 42291840
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactt 292  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| |||| |||||||     
T  42292025 aggtgacaactagggtacctatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagtacattttcaagtggtatctatgaacta 42291926  T
Q  293 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 378  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42291925 tcttgaccccaccaacaaattgttcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 42291840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 193 - 378
Target Start/End: Original strand, 43612046 - 43612231
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactt 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||     
T  43612046 aggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagtcacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 43612145  T
Q  293 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 378  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  43612146 tcttgaccacgccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaatgtaatctagaaaaaacct 43612231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 193 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 2666183 - 2665999
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactt 292  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||     
T  2666183 aggtgacaactagagtacccatgaaagaatagtgggtaatttaccataaccaatacacattagccacataagcacagttttaagtggtatccatgaacta 2666084  T
Q  293 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 377  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2666083 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 2665999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 193 - 377
Target Start/End: Original strand, 20754392 - 20754576
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactt 292  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  20754392 aggtgacaactagggtactcatggaataatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataaacatatttttaagtgatatccatgaacta 20754491  T
Q  293 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 377  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20754492 tcttgactctaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacc 20754576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 194 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 37324723 - 37324537
Alignment:
Q  194 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaacttt 293  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||||| |    
T  37324723 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataaatatatttttaagtggtatacatgaactat 37324624  T
Q  294 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 380  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  37324623 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtggataaattacctaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacctta 37324537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 193 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 35594304 - 35594119
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactt 292  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  35594304 aggtaacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttatcccaactaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaacta 35594205  T
Q  293 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 378  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  35594204 tcttgaccccatcaacaaattgctcatttttattgattggtgggtaaattacccaccattcttcaaagataatctaaaaaaaacct 35594119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 192 - 377
Target Start/End: Original strand, 35748309 - 35748494
Alignment:
Q  192 gaggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaact 291  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  35748309 gaggtgacaactagggtatccatggaagaatgatgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtggtatccatgaact 35748408  T
Q  292 ttcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 377  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  35748409 atcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattatccactattcttcaaagctaatctaaaaaaaacc 35748494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 193 - 378
Target Start/End: Original strand, 48739232 - 48739417
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactt 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||      
T  48739232 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattaaccacataagcacatttttaagtggtatccatgaacaa 48739331  T
Q  293 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 378  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  48739332 tcttgaccccaccaacaaatttctcattttcattggttgatgggtaaattacccaccatttttcaaaagtaatctagaaaaaacct 48739417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 193 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 44806867 - 44806683
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactt 292  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||     
T  44806867 aggtgacaactagggtacccatgaaagaattgtggataatttacttcaaccaatacatattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 44806768  T
Q  293 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 377  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44806767 tcttgattccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 44806683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 193 - 376
Target Start/End: Original strand, 39634571 - 39634753
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactt 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||     
T  39634571 aggtgacaactagggtacccatggaagaattgtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 39634670  T
Q  293 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaac 376  Q
    | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  39634671 t-ttgaccccaccaacaaattactcattttcattggttggtgggtaaaatacccaccattcttcaaaagtaatctagaaaaaac 39634753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 193 - 384
Target Start/End: Original strand, 53943587 - 53943777
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactt 292  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||     
T  53943587 aggtgacaactagagtacc-atggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagctacataagtatatttttaagtggtatccatgaacta 53943685  T
Q  293 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaaccttaaaag 384  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  53943686 tcttgatcccaccaacaaattgctcattttcattggttggtggataaattatccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaaccataaaag 53943777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 194 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 46134538 - 46134357
Alignment:
Q  194 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaacttt 293  Q
    |||||||| ||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |    
T  46134538 ggtgacaattagggtatccatgaaagaatggtgaataatttacctcaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 46134439  T
Q  294 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 375  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  46134438 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtaggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatctagaaaaaa 46134357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 192 - 380
Target Start/End: Original strand, 40804508 - 40804696
Alignment:
Q  192 gaggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaact 291  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||    
T  40804508 gaggtgacaactagggtacccatggaaaaatggtgggtaatttaccctaactaatacacattagccacataaacacatttttaagtggtatccatgaact 40804607  T
Q  292 ttcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 380  Q
     |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  40804608 atcttgatcctaccaacaaattgctcattttcattggttgatgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaatctta 40804696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 193 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 52639025 - 52638839
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactt 292  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| |     
T  52639025 aggtgacaactagggtacccatagaataatggtgggtaatttacctcaatcaatacacattagccacagaagcacatttttaagtggtatccatgaatta 52638926  T
Q  293 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 379  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  52638925 tcttgatcccaccaacaaattgctcattttcattggttcgttggtaaattacccaccattctttaaaggtaatctagaaaaaacctt 52638839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 193 - 377
Target Start/End: Original strand, 7755306 - 7755489
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactt 292  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||| | ||     
T  7755306 aggtgacaagtagggtacccatggaagaatgatgggttatttaccccaagcaatacacattagccacataagcacatttt-aagtggtatccataatcta 7755404  T
Q  293 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 377  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7755405 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 7755489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 194 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 44223011 - 44222827
Alignment:
Q  194 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaacttt 293  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||  |    
T  44223011 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattaaccacataagcacatttttaagtggtattcatgaacaat 44222912  T
Q  294 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 378  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  44222911 cttgaccccaccaacaaatttctcattttcattggttgatgggtaaattacccactatttttcaaaggtaatttagaaaaaacct 44222827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 196 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 48609903 - 48609719
Alignment:
Q  196 tgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactttct 295  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||    
T  48609903 tgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccctaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatct 48609804  T
Q  296 tgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatc-tagaaaaaacctt 379  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| || ||||||||||    
T  48609803 taaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtggataaattatccaccattcttcgaaggtaatcttaaaaaaaacctt 48609719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 196 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 43184092 - 43183917
Alignment:
Q  196 tgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactttct 295  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||    
T  43184092 tgacaactagggtacctatggaagaatggtgagtaatttacctcaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatct 43183993  T
Q  296 tgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaa 371  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  43183992 tgatctcaccaacaaattgctcattttcattggttggtggataaattactcaccattcttcaaaggtaatctagaa 43183917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 193 - 376
Target Start/End: Original strand, 51452750 - 51452932
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactt 292  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||     
T  51452750 aggtgacaattagggtacc-atggaagaatgatgggtaatttaccctaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccataaacta 51452848  T
Q  293 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaac 376  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51452849 tcttgaccccaccaacaaattgttcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaac 51452932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 193 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 39053577 - 39053387
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactt 292  Q
    ||||||||||||| ||| ||||  || |||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||     
T  39053577 aggtgacaactagagtatccataaaaaaatgatgggtaatttaccccaacgaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 39053478  T
Q  293 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaaccttaaaa 383  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  39053477 tcttgaccccatcaacaaattgatcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaaccataaaa 39053387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 193 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 43126013 - 43125828
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactt 292  Q
    |||||||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||     
T  43126013 aggtgacaactagg-tacctataaaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagtcacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 43125915  T
Q  293 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 379  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43125914 tcttgaccccaccaataaattgctcattttcattgattagtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 43125828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 194 - 382
Target Start/End: Original strand, 51146215 - 51146403
Alignment:
Q  194 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaacttt 293  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |    
T  51146215 ggtggcaactagggtacccatgaaagaatggtgggtaatttacctcaatcaatacacattagccacataagcaaatttttaagtggtatccatgaactat 51146314  T
Q  294 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaaccttaaa 382  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||| || |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  51146315 cttgaccccaccaataaattgttcattttcattgattgatgtgtaaattacctaccattcttcaaagataatctagaaaaaaccataaa 51146403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 194 - 380
Target Start/End: Original strand, 5560025 - 5560218
Alignment:
Q  194 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacatta--gccacataagcatatttttaagtgatatccatgaact 291  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5560025 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtggataatttaccccaaccaatagacattatagtcacataagcatatttttaagtggtatccatgaact 5560124  T
Q  292 ttcttgaccccaccaacaaattgctcattt-----tcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 380  Q
     |||||||||||| ||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5560125 atcttgaccccacaaacaaattgctcatttaattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 5560218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 193 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 18947086 - 18946904
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactt 292  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| || ||||||||||||     
T  18947086 aggtgacaagtagggtacccatggaagaatggtgggtaatttgtctcaaccaatacacattagtcacataagcacatttttaactggtatccatgaacta 18946987  T
Q  293 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 375  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18946986 tcttgaccccacaaacaaattgttcattttcattggttggtaggtaaattacgcaccattcttcaaagataatctagaaaaaa 18946904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 193 - 374
Target Start/End: Original strand, 41293318 - 41293498
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactt 292  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| |||||| |     
T  41293318 aggtgacaattagggtacccatagaagaatggtgggtaatttaccctaaccaatacacattagccacataagcacatttt-aagtggtattcatgaatta 41293416  T
Q  293 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaa 374  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41293417 tcttgatcccaccaacaaattgttcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaa 41293498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 194 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 41732710 - 41732525
Alignment:
Q  194 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaacttt 293  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |    
T  41732710 ggtgacaactggggtatccatggaaggatggtgggtaatttaccccaatcaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 41732611  T
Q  294 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 379  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  41732610 cttgaccccactaacaaattgctcattttcattgattgatggataaattatccaccatttttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 41732525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 195 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 43021896 - 43021715
Alignment:
Q  195 gtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactttc 294  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| ||    
T  43021896 gtgacaactagggtacctatgaaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacatattagctacataagcacatttttaagtggtattcatgaactatc 43021797  T
Q  295 ttga-ccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 375  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  43021796 ttgacccccaccaacaaattgttcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctaaaaaaaa 43021715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 209 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 52215243 - 52215077
Alignment:
Q  209 acccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactttcttgaccccaccaac 308  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  52215243 acccatagaagaatggtgagtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgactccaccaac 52215144  T
Q  309 aaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 375  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  52215143 aaattgctcatgttcattagttggtgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 52215077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 196 - 377
Target Start/End: Original strand, 47894822 - 47895003
Alignment:
Q  196 tgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactttct 295  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||| ||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||    
T  47894822 tgacaactagggtacccatggaagaatggtggatgatttacctcaactaatatacattagtcacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatct 47894921  T
Q  296 tgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 377  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  47894922 tgaccccaccaacaaattgttcattttcattagttggtaggtaaattatccaccattctttaaaggtaatctaaaaaaaacc 47895003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 193 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 46126169 - 46126010
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactt 292  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||     
T  46126169 aggtgacaactagggtacc-atggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaaatggtatccatgaacta 46126071  T
Q  293 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattc 353  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  46126070 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattagttggtgggtaaattatccaccattc 46126010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 196 - 376
Target Start/End: Original strand, 53832486 - 53832666
Alignment:
Q  196 tgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactttct 295  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||   ||||||| || ||||||| |||| |||    
T  53832486 tgacaactagggaacacatggaagaatggtggataatttaccccaaccaatacatattagccacataagcccctttttaattggtatccataaactatct 53832585  T
Q  296 tgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaac 376  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  53832586 tgacaccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaagtaatctagaaaaaac 53832666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 194 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 36369120 - 36368938
Alignment:
Q  194 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaacttt 293  Q
    ||||| |||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |    
T  36369120 ggtgataactagagcacccatggaaga-tggtgggtaatttaccctaaccaatatacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 36369022  T
Q  294 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 377  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36369021 cttgaccccaccaacaaattgctcatttttattagttggtgggtaaattatcgaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 36368938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 219 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 24376730 - 24376572
Alignment:
Q  219 gaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactttcttgaccccaccaacaaattgctca 318  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  24376730 gaatggtgggtaatttaccccaacaaatacacataagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgatcccaccaacaaattgctca 24376631  T
Q  319 ttttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 377  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24376630 ttttcattggttggtgcgtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 24376572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 227 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 53637990 - 53637841
Alignment:
Q  227 ggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactttcttgaccccaccaacaaattgctcattttcatt 326  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| | || ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  53637990 ggtaatttacctcaaccaatacacattaaccacataagcacatttttaagtggtatccatgaattatcctgaccccactaacaaattgctcattttcatt 53637891  T
Q  327 ggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaac 376  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53637890 ggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaac 53637841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 193 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 41216638 - 41216454
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactt 292  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| | |||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||     
T  41216638 aggtgacaactagagtacctatggaagaatagtgggtaatttatcccaattaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 41216539  T
Q  293 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 377  Q
    | || ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  41216538 tattaaccccaccaacaaattgcttattttcattggttgatggataaattacccaccatcctttaaaggtaatctagaaaaaacc 41216454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 196 - 379
Target Start/End: Original strand, 54159000 - 54159173
Alignment:
Q  196 tgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactttct 295  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||         ||||| ||||||||||| |||| ||||||| |||    
T  54159000 tgacaactagggtacccatggaagaatggtgagtaatt-accccaaccaatacacat---------aagcacatttttaagtggtatctatgaactatct 54159089  T
Q  296 tgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 379  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  54159090 tgactccaccaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaagtaatctagaaaaaacctt 54159173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 193 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 25641818 - 25641644
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactt 292  Q
    ||||| |||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||           ||||||     
T  25641818 aggtggcaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatattta-----------tgaacta 25641730  T
Q  293 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 378  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  25641729 tcttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacct 25641644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 193 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 42590002 - 42589829
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactt 292  Q
    ||||| |||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||           ||||||||     
T  42590002 aggtggcaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatatt-----------catgaacta 42589914  T
Q  293 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 377  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  42589913 tcttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacc 42589829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 211 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 46949538 - 46949379
Alignment:
Q  211 ccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactttcttgaccccaccaacaa 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||| |||||| ||| |||||||    
T  46949538 ccatggaagaatggtgggtaatttatc-caaccaatacacattagccacataaacacatttttaagtggtatccatgaactatcttgatcccgccaacaa 46949440  T
Q  311 attgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaa 372  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||    
T  46949439 attgttcattttcattggtcggtgggtaaattacacacca-tcttcaaagataatctagaaa 46949379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 194 - 380
Target Start/End: Original strand, 34279721 - 34279896
Alignment:
Q  194 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaacttt 293  Q
    |||| |||||||| || ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||           |||||||| |    
T  34279721 ggtggcaactaggctatccatgaaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatatt-----------catgaactat 34279809  T
Q  294 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 380  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  34279810 cttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacctta 34279896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 197 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 49130746 - 49130575
Alignment:
Q  197 gacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactttctt 296  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||           |||||||| ||||    
T  49130746 gacaactagggtacccatagaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatatt-----------catgaactatctt 49130658  T
Q  297 gaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 379  Q
    |||| || ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  49130657 gacctcatcaataaattgctcatattcattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatttagaaaaaacctt 49130575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 193 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 51416141 - 51415966
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactt 292  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||           || ||||||||     
T  51416141 aggtgacaactaggctacccatgaaagaatgatgagtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacat-----------atacatgaacta 51416053  T
Q  293 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 379  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  51416052 tcttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtggataaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacctt 51415966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 193 - 379
Target Start/End: Original strand, 54707219 - 54707394
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactt 292  Q
    ||||| |||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||           ||||||||     
T  54707219 aggtggcaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatatt-----------catgaacta 54707307  T
Q  293 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 379  Q
    |||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  54707308 tcttgaccccacaaataaattgttcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacctt 54707394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 196 - 379
Target Start/End: Original strand, 48546842 - 48547014
Alignment:
Q  196 tgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactttct 295  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||         ||||| ||||||||||| |||||||||||| | |    
T  48546842 tgacaactagggtatccatggaagaatggtggataatttaccccaatcaatacacat---------aagcacatttttaagtggtatccatgaactat-t 48546931  T
Q  296 tgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 379  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  48546932 tgaccc-accaacaaattgctcattttcattgattggtgggtaaattacccaccattcttcaaagataatctagaaaaaacctt 48547014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 193 - 377
Target Start/End: Original strand, 41635799 - 41635972
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactt 292  Q
    |||||||||||||  |||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||           ||||||||     
T  41635799 aggtgacaactagattacccatgaaagaatgatgggtaatttacctcaatcaatacacattagccacataagcacatatt-----------catgaacta 41635887  T
Q  293 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 377  Q
    |||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  41635888 tcttgaccccacaaataaattgttcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacc 41635972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 194 - 376
Target Start/End: Original strand, 38156632 - 38156803
Alignment:
Q  194 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaacttt 293  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||           |||||||| |    
T  38156632 ggtgacaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatatt-----------catgaactat 38156720  T
Q  294 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaac 376  Q
    ||||||||||| || |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  38156721 cttgaccccacaaataaattgttcattttaattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaac 38156803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 193 - 383
Target Start/End: Original strand, 39141124 - 39141304
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactt 292  Q
    |||||| ||||||| |||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||         |||| ||||||||     
T  39141124 aggtgataactaggttacc-atgaaagaatgatgggtaatttaccccaatcaatacacattagccacataagcacat---------atattcatgaacta 39141213  T
Q  293 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaaccttaaaa 383  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  39141214 tcttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaagtaatttagaaaaaaccctaaaa 39141304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 193 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 54401359 - 54401186
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactt 292  Q
    ||||| ||| |||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||           ||||||||     
T  54401359 aggtggcaattaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatatt-----------catgaacta 54401271  T
Q  293 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 377  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  54401270 tcttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttaaaaaaaacc 54401186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 193 - 377
Target Start/End: Original strand, 55000177 - 55000350
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactt 292  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||           ||||||||     
T  55000177 aggtgacaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatatt-----------catgaacta 55000265  T
Q  293 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 377  Q
    ||||||||| || || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  55000266 tcttgaccctacaaataaattgctcattttcattggttagtgggtaaattacccaccattcttctaaggtaatttagaaaaaacc 55000350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 193 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 25353726 - 25353550
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactt 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||  ||           |||||| ||| ||||||| ||||     
T  25353726 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatgaacattcacc-----------tttttaggtggtatccataaacta 25353638  T
Q  293 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 380  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  25353637 tcttgaccccaccaataaattgcttattatgattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 25353550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 230 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 37759075 - 37758922
Alignment:
Q  230 aatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactttcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggt 329  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||| ||||||| |||||||  || |||||||||||||||||||||||||    
T  37759075 aatttaccccaaccaatacacattagccacataagtacatttttaagtggtatctatgaactatcttgacttcatcaacaaattgctcattttcattggt 37758976  T
Q  330 tggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaaccttaaaa 383  Q
    || ||| |||||||  |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  37758975 tgatggataaattattcaccattcttcaaaagcaatctagaaaaaaccttaaaa 37758922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 194 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 55380156 - 55379984
Alignment:
Q  194 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaacttt 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||  ||           |||||| ||| ||||||| |||| |    
T  55380156 ggtgacaactagggtacccatggaaaaatggtgggtaatttaccccaaccaataaacattcacc-----------tttttaggtggtatccataaactat 55380068  T
Q  294 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 377  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  55380067 cttgaccccaccaataaattgctcattatgattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatctagaaaaaacc 55379984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 194 - 378
Target Start/End: Original strand, 47510940 - 47511113
Alignment:
Q  194 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaacttt 293  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||| || |||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||| || ||           |||||||| |    
T  47510940 ggtgacaactaggctacccatgaaagaatgatgagtaatttactccaatcaatacacattagccacataagcacatatt-----------catgaactat 47511028  T
Q  294 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 378  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  47511029 cttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatttagaaaaaacct 47511113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 193 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 53115619 - 53115446
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactt 292  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| |||||  ||           |||||||||| ||||||| ||||     
T  53115619 aggtgacaactagggtacctatggaaaaatggtggataatttaccccaaccaataaacattcacc-----------tttttaagtggtatccataaacta 53115531  T
Q  293 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 377  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  53115530 tcttgaccccaccaataaattgctcattatgattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatctagaaaaaacc 53115446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 193 - 375
Target Start/End: Original strand, 31286792 - 31286963
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactt 292  Q
    |||||||||||||| ||| |||| ||||||| || |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| || ||           ||||||||     
T  31286792 aggtgacaactaggctactcatgaaagaatgatgagtaatttactccaaccaatacacattagccacataagcacatatt-----------catgaacta 31286880  T
Q  293 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 375  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  31286881 tcttgaccccacaaataaattgctcatttttattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaa 31286963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 193 - 309
Target Start/End: Original strand, 33550466 - 33550582
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactt 292  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |     
T  33550466 aggtgacaactagggtattcatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaatta 33550565  T
Q  293 tcttgaccccaccaaca 309  Q
    |||| ||||||||||||    
T  33550566 tcttaaccccaccaaca 33550582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 193 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 52864672 - 52864550
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactt 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||| || |||||||| || ||||||||||||     
T  52864672 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttac-tcaaccaatatacattagctacataaacacatttttaaatggtatccatgaacta 52864574  T
Q  293 tcttgaccccaccaacaaattgct 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  52864573 tcttgaccccaccaacaaattgct 52864550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 219 - 379
Target Start/End: Original strand, 17665549 - 17665698
Alignment:
Q  219 gaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactttcttgaccccaccaacaaattgctca 318  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||           |||||||| |||||||||||| || ||||||||||    
T  17665549 gaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattaaccacataagcatatatt-----------catgaactatcttgaccccacaaataaattgctca 17665637  T
Q  319 ttttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 379  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  17665638 ttttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcataggtaatttagaaaaaacctt 17665698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 194 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 37028894 - 37028720
Alignment:
Q  194 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaacttt 293  Q
    |||| |||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || ||           |||||||| |    
T  37028894 ggtggcaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacatatt-----------catgaactat 37028806  T
Q  294 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 379  Q
    |||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||    
T  37028805 cttgactccacaaataaattgctcattttcattggttggtggataaattacccaccattctttaaaggtaatttaaaaaaaacctt 37028720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 196 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 45059052 - 45058876
Alignment:
Q  196 tgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactttct 295  Q
    ||||||||||| | |||||| ||||||| ||||||||||||| ||| ||||| |||||||| ||||||||| || ||           |||||||| |||    
T  45059052 tgacaactaggctgcccatgaaagaatgatgggtaatttaccccaatcaatatacattagcaacataagcacatatt-----------catgaactatct 45058964  T
Q  296 tgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaaccttaaaa 383  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||| |||||    
T  45058963 tgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatttaaaaaaaaccataaaa 45058876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 193 - 379
Target Start/End: Original strand, 30251500 - 30251675
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactt 292  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||  |||||  ||           |||||| ||| ||||||| ||||     
T  30251500 aggtgacaactagggtatccatggaagaatggtgggtaatttagcccaaccaatgaacattcacc-----------tttttaggtggtatccataaacta 30251588  T
Q  293 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 379  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  30251589 tcttgaccccaccaataaattgctcattatgattggttggtgagtaaattacccaccatttttcaaaggtagtctagaaaaaacctt 30251675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 194 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 24688285 - 24688114
Alignment:
Q  194 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaacttt 293  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| ||||||||| |||||| || ||||||||||||||| || || ||           |||||||| |    
T  24688285 ggtgacaactaggttacccatgaaagaatgatggataatttaccccaaccagtagacattagccacataaacacatatt-----------catgaactat 24688197  T
Q  294 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaac 376  Q
     |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||    
T  24688196 tttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccacaatttttcaaaggtaatttagaaaaaac 24688114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 194 - 380
Target Start/End: Original strand, 51224038 - 51224212
Alignment:
Q  194 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaacttt 293  Q
    |||| |||||||| |||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||||||| | ||||| |||||||||| || ||           |||||||| |    
T  51224038 ggtggcaactaggctacccataaaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatatatattagtcacataagcacatatt-----------catgaactat 51224126  T
Q  294 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 380  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  51224127 cttgaccccacaaataaattgctcatttttattg-ttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacctta 51224212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 199 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 40022240 - 40022075
Alignment:
Q  199 caactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactttcttga 298  Q
    |||||| | |||||||| ||||||| || ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| || ||           |||||||| ||||||    
T  40022240 caactacgctacccatgaaagaatgatgagtaatttaccctaaccaatacacattagccacataagcacatatt-----------catgaactatcttga 40022152  T
Q  299 ccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 375  Q
    |||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  40022151 ccccacaaataaattgctcatttttattggttggtgggtaaattatccatcattcttcaaaggtaatttagaaaaaa 40022075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 195 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 51143987 - 51143818
Alignment:
Q  195 gtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactttc 294  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||| |||||  ||           |||||| ||| ||||||| |||| |     
T  51143987 gtgacaactagggtacccatgaaaaaatggtgggtaatttactccaaccaataaacattcacc-----------tttttaggtggtatccataaactata 51143899  T
Q  295 ttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 375  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  51143898 ttgaccccaccaataaattgctcattatgattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatctaaaaaaaa 51143818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 268 - 380
Target Start/End: Original strand, 2227998 - 2228110
Alignment:
Q  268 atttttaagtgatatccatgaactttcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatct 367  Q
    ||||| |||||||||| ||||||| |||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||| | |||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  2227998 attttgaagtgatatctatgaactatcttgacctcaccaataaattgcttattttcattggttgatcggtaaatttcccaccatttttcaaaggtaatct 2228097  T
Q  368 agaaaaaacctta 380  Q
    |||||||||||||    
T  2228098 agaaaaaacctta 2228110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 280 - 375
Target Start/End: Original strand, 41882066 - 41882161
Alignment:
Q  280 tatccatgaactttcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 375  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  41882066 tatccataaactatcttgaccccaccaataaattgctcattatgattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatctagaaaaaa 41882161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 280 - 380
Target Start/End: Original strand, 21597223 - 21597323
Alignment:
Q  280 tatccatgaactttcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 379  Q
    ||||||| |||| |||||| |||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21597223 tatccataaactatcttgatcccaccaataaattgctcattataattggttggtgggtaaattactcaccatttttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 21597322  T
Q  380 a 380  Q
    |    
T  21597323 a 21597323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 280 - 380
Target Start/End: Original strand, 28576187 - 28576287
Alignment:
Q  280 tatccatgaactttcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 379  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  28576187 tatccataaactatcttgaccccaccaataaattgttcattttcatcggttgatgggtaaattacccatcatacttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 28576286  T
Q  380 a 380  Q
    |    
T  28576287 a 28576287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 269 - 377
Target Start/End: Original strand, 42998853 - 42998960
Alignment:
Q  269 tttttaagtgatatccatgaactttcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatcta 368  Q
    |||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||||| |||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  42998853 tttttaggtggtatccataaactatcttgaccccaccaataaattgatcattatgattggttggtgggtaaattacccaccatt-ttcaaaggtaatcta 42998951  T
Q  369 gaaaaaacc 377  Q
    |||||||||    
T  42998952 gaaaaaacc 42998960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 193 - 377
Target Start/End: Original strand, 44945934 - 44946101
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactt 292  Q
    |||||||||||||| ||| |||| ||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||                 ||     
T  44945934 aggtgacaactaggctacgcatgaaagaatgatgaataatttacctcaaccaatacacattagccacataagcacatatt-----------------cta 44946016  T
Q  293 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 377  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||    
T  44946017 tcttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtggataaattacccaccattcttcaaagataatttaaaaaaaacc 44946101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 280 - 377
Target Start/End: Original strand, 48726073 - 48726170
Alignment:
Q  280 tatccatgaactttcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 377  Q
    |||||||||||| ||||||| | ||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  48726073 tatccatgaactgtcttgactctaccaataaattgcttattttcattgattggtgggtaaattacccaccattctttaaaggtaatttagaaaaaacc 48726170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 280 - 379
Target Start/End: Original strand, 50731989 - 50732087
Alignment:
Q  280 tatccatgaactttcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 379  Q
    ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  50731989 tatccataaactaccttgaccccaccaacaaattgctcattaagattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatcta-aaaaaacctt 50732087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 194 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 50780942 - 50780769
Alignment:
Q  194 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaacttt 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||   |||||           ||   |||||  || ||||||| ||||      
T  50780942 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggaaatttactccaaccaacgaacatt-----------caccgttttagatggtatccataaactac 50780854  T
Q  294 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 379  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  50780853 cttgaccccaccaacaaattgctcattaagattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatcta-aaaaaacctt 50780769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 194 - 375
Target Start/End: Original strand, 43176738 - 43176908
Alignment:
Q  194 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaacttt 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| | ||||||||| ||||   |||| |        ||||| ||| ||||||| |||| |    
T  43176738 ggtgacaactagggtacccatggaaaaatgatgggtaatttatcccaaccaataaacat---ccacct--------ttttaggtggtatccataaactat 43176826  T
Q  294 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 375  Q
    ||||||  |||||| |||||| ||||| | |||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  43176827 cttgacatcaccaataaattgttcattatgattggttggtggataaattatccaccatttttcaaaggtaatctagaaaaaa 43176908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 245 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 47182131 - 47182049
Alignment:
Q  245 atacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactttcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattg 327  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47182131 atacacattagccacataagtacatttttaagtggtatccataaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattg 47182049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 300 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 52434216 - 52434138
Alignment:
Q  300 cccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaa-ttacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 377  Q
    |||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  52434216 cccaccaataaattgctcattatgattggttggtgggtaaaattacccaccatttttcaaaggtaatctagaaaaaacc 52434138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 300 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 48752161 - 48752085
Alignment:
Q  300 cccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaac 376  Q
    |||||||| ||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  48752161 cccaccaataaattgcacattatgattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatctaaaaaaaac 48752085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 284 - 367
Target Start/End: Original strand, 47402828 - 47402911
Alignment:
Q  284 catgaactttcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatct 367  Q
    |||||||| ||||||||| ||||| |||||| |||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  47402828 catgaactatcttgaccctaccaataaattgttcattttcattgattgatggataaattacccaccattctttaaaggtaatct 47402911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 194 - 348
Target Start/End: Original strand, 52756067 - 52756214
Alignment:
Q  194 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacatta----gccacataagcatatttttaagtgatatccatgaa 289  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||    |||||||||||| || ||           ||||||    
T  52756067 ggtgacaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttacccaaaccaatacacattaattagccacataagcacatatt-----------catgaa 52756155  T
Q  290 ctttcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccac 348  Q
    || |||||||||||| || |||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  52756156 ctatcttgaccccacaaataaattgttcattttcattggttagtgggtaaataacccac 52756214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 193 - 266
Target Start/End: Original strand, 48534006 - 48534079
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagca 266  Q
    ||||| |||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  48534006 aggtggcaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttaccccaaccgatacacattagccacataagca 48534079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 194 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 40165822 - 40165653
Alignment:
Q  194 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaacttt 293  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| |||||           ||  |||||| ||| ||||||| |||| |    
T  40165822 ggtgacaaccagggtacccatggaaaaatggtggataatttaccccaaccaataaacatt-----------cacctttttaggtggtatccataaactat 40165734  T
Q  294 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 375  Q
    |||||| ||||||| ||||| |||||| | |||| ||||||||||||||| |||  ||| ||||||| |||| |||||||||    
T  40165733 cttgactccaccaataaattactcattatgattgcttggtgggtaaatta-ccattatttttcaaagataatttagaaaaaa 40165653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 324 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 37741487 - 37741433
Alignment:
Q  324 attggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 378  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  37741487 attggttggtgggtaaattacccaccattctttaaaggtaatctaaaaaaaacct 37741433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 280 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 177257 - 177162
Alignment:
Q  280 tatccatgaactttcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 375  Q
    ||||||| || | |||||| |||||||| ||||| ||| || | |||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  177257 tatccataaagtatcttgatcccaccaataaattactcgttatgattggttggtgactaaattacccaccatttttcaaaggtaatctaaaaaaaa 177162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 180 - 278
Target Start/End: Original strand, 30429213 - 30429311
Alignment:
Q  180 gatatttaaaaggaggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtg 278  Q
    ||||| |||||  ||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||| | |||  |||||| ||||| ||||||| || |||||||||||    
T  30429213 gatatataaaattaggtgacaactagggtacctacggaagaatggtggataatttatcccaattaatacatattagtcacataaacacatttttaagtg 30429311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 97 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 30860533 - 30860480
Alignment:
Q  97 caatattaaggaattagtgtaaatacaagctagtttaattacatgttttttagt 150  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  30860533 caatatcaaggaattagtgtaaatacaagttagtgtaattacatgttttttagt 30860480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 332 - 377
Target Start/End: Original strand, 51942543 - 51942588
Alignment:
Q  332 gtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 377  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51942543 gtgggtaaattacctaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 51942588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 268 - 380
Target Start/End: Original strand, 8847721 - 8847832
Alignment:
Q  268 atttttaagtgatatccatgaactttcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatct 367  Q
    ||||||||||| ||| | |||||| | |||| |||||||| |||||| ||||||| ||| ||||||  ||||||||  ||| |||||||||||||||| |    
T  8847721 atttttaagtggtattcgtgaactattttgatcccaccaataaattgttcatttttattagttggtatgtaaattatacactattcttcaaaggtaattt 8847820  T
Q  368 agaaaaaacctta 380  Q
    | |||||||||||    
T  8847821 a-aaaaaacctta 8847832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 192 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 41609240 - 41609098
Alignment:
Q  192 gaggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaact 291  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||  |||||           || ||||||| ||  ||||||||||||    
T  41609240 gaggtgacaactaatgtacccatggaagaatgacggataatttacctcaaccaatgaacatt-----------cacatttttaggtagtatccatgaact 41609152  T
Q  292 ttcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacc 345  Q
     | || || |||| || |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  41609151 attttaactccactaataaattgctcattttcattagttggtaggtaaattacc 41609098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 194 - 245
Target Start/End: Original strand, 50731914 - 50731965
Alignment:
Q  194 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaa 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||    
T  50731914 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggaaatttactccaaccaa 50731965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 193 - 236
Target Start/End: Original strand, 41882010 - 41882053
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttac 236  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  41882010 aggtgacaactagggtacccgtggaagaatggtggataatttac 41882053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 196 - 241
Target Start/End: Original strand, 43260841 - 43260886
Alignment:
Q  196 tgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaa 241  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  43260841 tgacaactagggtatccatggaaaaatagtgggtaatttacctcaa 43260886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 195 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 37760386 - 37760346
Alignment:
Q  195 gtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaattta 235  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  37760386 gtgataactagggtacctatggaagaatggtgggtaattta 37760346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 195 - 247
Target Start/End: Original strand, 42998790 - 42998842
Alignment:
Q  195 gtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaata 247  Q
    |||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| | |||||||||    
T  42998790 gtgacaactaaggtactcatggaaaaatggtgggtaatttatcccaaccaata 42998842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 200 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 52434344 - 52434291
Alignment:
Q  200 aactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacatt 253  Q
    |||||||||||| || ||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||||    
T  52434344 aactagggtacctatagaaaaatggtgggtaatttactccaaccaataaacatt 52434291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 193 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 177333 - 177273
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacatt 253  Q
    |||||||||||||| ||  ||||||| ||||||||||||||| |  ||||||||| |||||    
T  177333 aggtgacaactaggatattcatggaaaaatggtgggtaatttgctccaaccaataaacatt 177273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 193 - 253
Target Start/End: Original strand, 21597147 - 21597207
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacatt 253  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| ||| |||| |||||||||  |||||||| |||||    
T  21597147 aggtgacaactaaagtacccatggaaaaatagtggataatttacccaaaccaataaacatt 21597207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 349 - 377
Target Start/End: Original strand, 33550581 - 33550609
Alignment:
Q  349 cattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 377  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  33550581 cattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 33550609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 171; Significance: 1e-91; HSPs: 69)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 193 - 379
Target Start/End: Original strand, 32984076 - 32984262
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactt 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||     
T  32984076 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 32984175  T
Q  293 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 379  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32984176 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 32984262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 194 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 41862402 - 41862213
Alignment:
Q  194 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaacttt 293  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  41862402 ggtgacaattaggatacccatggaagaatggtgggtaatttactccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 41862303  T
Q  294 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaaccttaaaa 383  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  41862302 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctaaaaa 41862213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 194 - 377
Target Start/End: Original strand, 24079901 - 24080084
Alignment:
Q  194 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaacttt 293  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |    
T  24079901 ggtgacaactagggtacccatgaaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 24080000  T
Q  294 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 377  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24080001 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctacaaaaaacc 24080084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 193 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 43328890 - 43328706
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactt 292  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||     
T  43328890 aggtgacaattagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccctaatcaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 43328791  T
Q  293 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 377  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43328790 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 43328706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 193 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 5946230 - 5946043
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactt 292  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||     
T  5946230 aggtgacaactagggtacctatgaaagaatggtggataatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 5946131  T
Q  293 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 380  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5946130 tcttgaccccaccaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 5946043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 194 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 37420122 - 37419935
Alignment:
Q  194 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaacttt 293  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||  |||||||||||| |    
T  37420122 ggtgacaactagggtacctatggaagaatggtgggtaatttaccttaatcaatacacattagtcacataagcacatttttaagtagtatccatgaactat 37420023  T
Q  294 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaaccttaa 381  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37420022 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaaccttaa 37419935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 194 - 376
Target Start/End: Original strand, 40435153 - 40435335
Alignment:
Q  194 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaacttt 293  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |    
T  40435153 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 40435252  T
Q  294 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaac 376  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40435253 cttgacctcaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaagttacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaac 40435335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 194 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 10646305 - 10646124
Alignment:
Q  194 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaacttt 293  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||| |    
T  10646305 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagaacatttttaagtggtatccatgaactat 10646206  T
Q  294 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  10646205 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccactatttttcaaaggtaatctagaaaaaa 10646124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 193 - 377
Target Start/End: Original strand, 33730640 - 33730824
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactt 292  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||     
T  33730640 aggtgacaactagggtatccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 33730739  T
Q  293 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 377  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  33730740 tcttgaccccaccaacaaattgctcatattaattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaagataatctagaaaaaacc 33730824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 193 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 37956604 - 37956420
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactt 292  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||     
T  37956604 aggtgacaactagggtatccatgaaataatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 37956505  T
Q  293 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 377  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37956504 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattgattggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 37956420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 193 - 376
Target Start/End: Original strand, 9303573 - 9303756
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactt 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||     
T  9303573 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccgaccaatacacattagccacataaacacatttttaagtggtatccatgaacta 9303672  T
Q  293 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaac 376  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9303673 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttgatgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctaaaaaaaac 9303756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 194 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 9734435 - 9734255
Alignment:
Q  194 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaacttt 293  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |    
T  9734435 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatt-accccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtg-tatccatgaactat 9734338  T
Q  294 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaac 376  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9734337 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattactcaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaac 9734255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 198 - 375
Target Start/End: Original strand, 31830959 - 31831136
Alignment:
Q  198 acaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactttcttg 297  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  31830959 acaactagggtacccatggaagaatggtaggtaatttacccaaatcaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttg 31831058  T
Q  298 accccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31831059 accccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 31831136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 194 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 41654077 - 41653892
Alignment:
Q  194 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaacttt 293  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| | |    
T  41654077 ggtgacaactagggtacccatgaaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacatattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaattat 41653978  T
Q  294 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 379  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41653977 tttgaccccatcaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 41653892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 193 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 6366169 - 6365985
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactt 292  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||     
T  6366169 aggtgacaactagggtatccatgaaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 6366070  T
Q  293 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 377  Q
    | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6366069 tattgaccccaccaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 6365985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 183 - 383
Target Start/End: Original strand, 13356109 - 13356309
Alignment:
Q  183 atttaaaaggaggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatat 282  Q
    ||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||    
T  13356109 atttaaaacaaggtgacaactagagtacccatggaagaatgatggataatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacatttttaagtggtat 13356208  T
Q  283 ccatgaactttcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaaccttaaa 382  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  13356209 ccatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccacctttcttcaaatgtaatctaaaaaaaaccttaaa 13356308  T
Q  383 a 383  Q
    |    
T  13356309 a 13356309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 193 - 377
Target Start/End: Original strand, 33981662 - 33981846
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactt 292  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||     
T  33981662 aggtgacaactagggtacctatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccgcataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 33981761  T
Q  293 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 377  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  33981762 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtggataaattacccaccattcttcaaagataatctaaaaaaaacc 33981846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 193 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 9013866 - 9013684
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactt 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||     
T  9013866 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacct-aaccaatacacattagccacataagtacatttttaagtggtatccatgaacta 9013768  T
Q  293 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaac 376  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9013767 tcttgactccaccaacaaattgctcatttttattggttggtgggtaaattacctaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaac 9013684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 193 - 380
Target Start/End: Original strand, 17718721 - 17718908
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactt 292  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||     
T  17718721 aggtgacagctagggtacccatggaagaatggtgggtaatttactccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 17718820  T
Q  293 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 380  Q
    ||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17718821 tcttgaccccatcaataaattgttcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaatctta 17718908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 196 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 32114429 - 32114254
Alignment:
Q  196 tgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactttct 295  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | |    
T  32114429 tgacaactaggatacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagtcacataagcacatttttaagtggtatccatgaactattt 32114330  T
Q  296 tgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaa 371  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32114329 tgaccctaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaa 32114254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 195 - 377
Target Start/End: Original strand, 37301326 - 37301508
Alignment:
Q  195 gtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactttc 294  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||| |     
T  37301326 gtgacaactagggtacccatgaaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatatacattagccacataaacacatttttaagtggtatccatgaactatt 37301425  T
Q  295 ttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 377  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37301426 ttggccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 37301508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 193 - 383
Target Start/End: Original strand, 45236564 - 45236754
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactt 292  Q
    |||||||||||||| |||||||  ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||     
T  45236564 aggtgacaactaggatacccataaaagaatggtggataatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 45236663  T
Q  293 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaaccttaaaa 383  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  45236664 tcttgaccccaccaataaattgctcattttcattggttagtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctaaaaa 45236754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 193 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 2276095 - 2275913
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactt 292  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||     
T  2276095 aggtgacaactagtctacccatggaagaatgatgggtaatttaccctaatcaatacacattagccacataagcatatttt-aagtggtatccatgaacta 2275997  T
Q  293 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaac 376  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2275996 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaac 2275913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 192 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 25186083 - 25185897
Alignment:
Q  192 gaggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaact 291  Q
    |||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |    
T  25186083 gaggtgacgattagggtacctatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattaaccacataagcacatttttaagtggtatccatgaatt 25185984  T
Q  292 ttcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 378  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  25185983 atcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattctttaaaggtaatctagaaaatacct 25185897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 194 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 2714730 - 2714550
Alignment:
Q  194 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaacttt 293  Q
    |||||||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |    
T  2714730 ggtgacaactaaagtacc-atggaagaatggtggataatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 2714632  T
Q  294 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 375  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2714631 cttgaccctaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 2714550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 193 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 41232129 - 41231945
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactt 292  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||     
T  41232129 aggtgacaactagggtatccatggaggaatagtgggtaatttaccccaaccaatacacattggtcacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 41232030  T
Q  293 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 377  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  41232029 tcttgaccccaccaacaaattgttcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaagataatctagaaaaaacc 41231945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 193 - 377
Target Start/End: Original strand, 13760645 - 13760831
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtac--ccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaac 290  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||    
T  13760645 aggtgacaactagggtacacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaatcaatacacattagccacagaagcacatttttaaatggtatccatgaac 13760744  T
Q  291 tttcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 377  Q
    | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13760745 tatcttgaccccaccaacaaattgttcattttcattggttggtaggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatcttgaaaaaacc 13760831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 194 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 35628959 - 35628776
Alignment:
Q  194 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaacttt 293  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||| | |||||| |    
T  35628959 ggtgacaactagggtactcatagaagaatggtgggtaatttactccaaccaatacacattagtcacataagcacatttttaagtggtattcttgaactat 35628860  T
Q  294 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 377  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  35628859 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaagttaatctaaaaaaaacc 35628776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 195 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 22878572 - 22878384
Alignment:
Q  195 gtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactttc 294  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||    
T  22878572 gtgacaactagggtacccatagaagaattgtggataatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatc 22878473  T
Q  295 ttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaaccttaaaa 383  Q
    ||||||||| ||| |||||| |||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22878472 ttgaccccaacaaaaaattgatcattttcattggaaggtggataaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctaaaaa 22878384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 217 - 378
Target Start/End: Original strand, 29048426 - 29048587
Alignment:
Q  217 aagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactttcttgaccccaccaacaaattgct 316  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  29048426 aagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccactaacaaattgct 29048525  T
Q  317 cattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 378  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  29048526 cattttcattggttagtgggtaaattatccaccattcttcaaagataatctagaaaaaacct 29048587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 195 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 41640095 - 41639911
Alignment:
Q  195 gtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactttc 294  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||| ||||||| ||    
T  41640095 gtgacaactagggtatctatggaagaatggtgggtaatttatcccaactaatacacattagccacataaacatatttttaagcggtatctatgaactatc 41639996  T
Q  295 ttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 379  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41639995 ttgaccccaccaataaattgttcattttcattggttggtgggtaaattactcatcattcttcaaaggtaatctaaaaaaaacctt 41639911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 193 - 376
Target Start/End: Original strand, 45066591 - 45066774
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactt 292  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||    || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||     
T  45066591 aggtgagaattagggtacccatggaagaatgatgggtaatttattataatcaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 45066690  T
Q  293 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaac 376  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||    
T  45066691 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattatccattattcttcaaaggtaatctataaaaaac 45066774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 197 - 375
Target Start/End: Original strand, 44088446 - 44088624
Alignment:
Q  197 gacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactttctt 296  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  44088446 gacaattagagtatccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagtcacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatctt 44088545  T
Q  297 gaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 375  Q
    || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||    
T  44088546 gatcccaccaacaaattgctcatttttattggttggtgagtaaattattcatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 44088624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 194 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 25248215 - 25248036
Alignment:
Q  194 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaacttt 293  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||| |    
T  25248215 ggtgacaattagggtatccatggaagaatgatgggtaatttactccaaccaatacacattagcaacataagcacattttaaagtggtatccatgaactat 25248116  T
Q  294 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 379  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25248115 cttgaccccaccaacaaattgctcatttt------ttggtgggtaaattatccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 25248036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 193 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 45258692 - 45258510
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactt 292  Q
    |||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||| || |||||||| || ||||||||||||     
T  45258692 aggtgataactagagtacc-atggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagttacataaacacatttttaaatggtatccatgaacta 45258594  T
Q  293 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaac 376  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  45258593 tcttgacccctccaacaaattgctcatttacattggttggtgggtaaattaccgaccattcttcaaaagtaatctaaaaaaaac 45258510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 194 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 10378480 - 10378305
Alignment:
Q  194 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaacttt 293  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||           |||||||| |    
T  10378480 ggtgacaactaggatacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacatattagccacataagcacatatt-----------catgaactat 10378392  T
Q  294 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 380  Q
    |||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  10378391 cttgaccccacctataaattgctcatattcattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatttagaaaaaacctta 10378305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 193 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 12033113 - 12032986
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactt 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||     
T  12033113 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 12033014  T
Q  293 tcttgaccccaccaacaaattgctcatt 320  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||    
T  12033013 tcttgaccgcaccaacaaattgctcatt 12032986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 193 - 377
Target Start/End: Original strand, 4447294 - 4447467
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactt 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| || ||           ||||||||     
T  4447294 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatatacattagccacataagcacatatt-----------catgaacta 4447382  T
Q  293 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 377  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  4447383 tcttgaccccacctataaattgctcatattcattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatttagaaaaaacc 4447467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 206 - 375
Target Start/End: Original strand, 42701301 - 42701471
Alignment:
Q  206 ggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagca---tatttttaagtgatatccatgaactttcttgacccc 302  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||  |||||   | |||||||||| ||| |||||||| ||||||||||    
T  42701301 ggtacccatggaaggatggtggataatttaccccaaccaatacacattagtcac--aagcacattttttttaagtggtattcatgaactatcttgacccc 42701398  T
Q  303 accaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 375  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  42701399 actaacaaattgctcatttttattggttggtgggtaaattacccaccattattcaaaggtaatctagaaaaaa 42701471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 194 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 3904258 - 3904126
Alignment:
Q  194 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaacttt 293  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| |    
T  3904258 ggtgataactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccctaaccaatacacaatagccacataagcacatttttaagtggtat-catgaactat 3904160  T
Q  294 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattg 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3904159 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattg 3904126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 194 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 31940485 - 31940314
Alignment:
Q  194 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaacttt 293  Q
    |||| |||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||           |||||||| |    
T  31940485 ggtggcaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttacc-caaccaatacacattagccacataagcacatatt-----------catgaactat 31940398  T
Q  294 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 377  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  31940397 cttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacc 31940314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 194 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 41981650 - 41981534
Alignment:
Q  194 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaacttt 293  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |    
T  41981650 ggtgacaactagggtatccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 41981551  T
Q  294 cttgaccccaccaacaa 310  Q
    |||||||||||||||||    
T  41981550 cttgaccccaccaacaa 41981534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 194 - 381
Target Start/End: Original strand, 117329 - 117505
Alignment:
Q  194 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaacttt 293  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||| ||  |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| || ||           |||||||| |    
T  117329 ggtgacaactaggctacccatgaaagaatgatgaataatttacccgaaccaatacacattagccacataagcacatatt-----------catgaactat 117417  T
Q  294 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaaccttaa 381  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  117418 cttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaatcttaa 117505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 193 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 3211377 - 3211207
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactt 292  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||| || ||           ||||||||     
T  3211377 aggtgacaactatggtacccatggaagaatggtgggtaatttactccaacgaatacacattagccacataagcacatatt-----------catgaacta 3211289  T
Q  293 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 375  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  3211288 tcttaaccccaccaataaattgctcatattcattggttggtgggtaaattacccaccatt-ttcaaaggtaatttagaaaaaa 3211207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 182 - 383
Target Start/End: Original strand, 33896831 - 33897020
Alignment:
Q  182 tatttaaaaggaggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgata 281  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||| |||||           ||| |||||| ||| ||    
T  33896831 tatttaaaataaggtgacaactagggtacccatgaaaaaatggtgggtaatttactccaaccaataaacatt-----------catctttttaggtggta 33896919  T
Q  282 tccatgaactttcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaaccttaa 381  Q
    || || |||| ||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  33896920 tctataaactatcttgaccccaccaataaattgctcattatgattggttggtgggtaaattacccaccatt-ttcaaaggtaatctagaaaaaaccttaa 33897018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 193 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 31336277 - 31336163
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactt 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||     
T  31336277 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttgccccaaccaatacacattagccatataaacatatttttaagtggtatccatgaacta 31336178  T
Q  293 tcttgaccccaccaa 307  Q
    |||||||||||||||    
T  31336177 tcttgaccccaccaa 31336163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 194 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 41843424 - 41843252
Alignment:
Q  194 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaacttt 293  Q
    ||||| ||||| | |||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||           |||||||| |    
T  41843424 ggtgataactaagctacccatgaaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatatt-----------catgaactat 41843336  T
Q  294 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 377  Q
    || |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  41843335 ctggaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatttagaaaaaacc 41843252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 194 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 9713857 - 9713688
Alignment:
Q  194 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaacttt 293  Q
    |||| |||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||           |||||||| |    
T  9713857 ggtggcaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatatt-----------catgaactat 9713769  T
Q  294 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 377  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9713768 cttgatcccacaaataaattgctcattttcattggttgg---gtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacc 9713688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 269 - 376
Target Start/End: Original strand, 39915887 - 39915994
Alignment:
Q  269 tttttaagtgatatccatgaactttcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatcta 368  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  39915887 tttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaataaattgctcatttttattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaagataattta 39915986  T
Q  369 gaaaaaac 376  Q
    ||||||||    
T  39915987 gaaaaaac 39915994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 194 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 2379311 - 2379138
Alignment:
Q  194 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaacttt 293  Q
    ||||||||||||| || ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| || ||           |||||||| |    
T  2379311 ggtgacaactaggctatccatgaaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagtcacataagcacatatt-----------catgaactat 2379223  T
Q  294 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 378  Q
     |||| ||||| || |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  2379222 tttgatcccacaaataaattgttcattttcattagttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacct 2379138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 194 - 376
Target Start/End: Original strand, 40458772 - 40458943
Alignment:
Q  194 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaacttt 293  Q
    |||| |||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| | ||||||||||| |||||||||| || || || ||           |||||||| |    
T  40458772 ggtggcaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttatcccaaccaatacatattagccacaaaaacacatatt-----------catgaactat 40458860  T
Q  294 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaac 376  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  40458861 cttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaattgagaaaaaac 40458943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 199 - 374
Target Start/End: Original strand, 4975412 - 4975576
Alignment:
Q  199 caactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactttcttga 298  Q
    |||||||| |||||||| ||||||| ||| |||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||| || ||           |||||||| ||||||    
T  4975412 caactaggctacccatgaaagaatgatggataatttacccaaaccaatacacattagccatataagcacatatt-----------catgaactatcttga 4975500  T
Q  299 ccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaa 374  Q
    |||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  4975501 ccccacaaataaattgctcatttttattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttaaaaaaa 4975576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 279 - 380
Target Start/End: Original strand, 27243213 - 27243314
Alignment:
Q  279 atatccatgaactttcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 378  Q
    |||| |||||||| ||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27243213 atattcatgaactatcttggccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacct 27243312  T
Q  379 ta 380  Q
    ||    
T  27243313 ta 27243314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 279 - 380
Target Start/End: Original strand, 27254788 - 27254889
Alignment:
Q  279 atatccatgaactttcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 378  Q
    |||| |||||||| ||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27254788 atattcatgaactatcttggccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacct 27254887  T
Q  379 ta 380  Q
    ||    
T  27254888 ta 27254889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 200 - 371
Target Start/End: Original strand, 32373733 - 32373892
Alignment:
Q  200 aactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactttcttgac 299  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| || ||           |||||||| |||||||    
T  32373733 aactaggttatccatggaagaatggtgg-taatttaccccaaccaatacacattaatcacataagcacatatt-----------catgaactatcttgac 32373820  T
Q  300 cccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaa 371  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||    
T  32373821 cccaccaataaattgctcatattcattggttggtgggtaaattacccaccattttttaaaggtaatttagaa 32373892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 193 - 378
Target Start/End: Original strand, 3490398 - 3490572
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactt 292  Q
    ||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||| |||||| ||||||||| |||||  ||           |||||| ||| || |||| || |     
T  3490398 aggtgacaactagggtacctatgaaaaaatggtgggtagtttaccccaaccaataaacattcacc-----------tttttaggtggtaaccataaatta 3490486  T
Q  293 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 378  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  3490487 tcttgaccccaccaataaattgctcattataattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatttagaaaaaacct 3490572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 192 - 377
Target Start/End: Original strand, 9509398 - 9509572
Alignment:
Q  192 gaggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaact 291  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||| || || ||           ||||||||    
T  9509398 gaggtgaaaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttaccccaaccaataaaaatttgccacataaacacatatt-----------catgaact 9509486  T
Q  292 ttcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 377  Q
     |||| ||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  9509487 atcttaaccccacaaataaattgctcatttttattggttggtgggtaaattacacaccattctttaaaggtaatttagaaaaaacc 9509572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 274 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 41981535 - 41981454
Alignment:
Q  274 aagtgatatccatgaactttcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattctt 355  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  41981535 aagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacctaccattctt 41981454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 193 - 382
Target Start/End: Original strand, 26196316 - 26196493
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactt 292  Q
    |||||||||||||| ||  ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||  ||           |||||| ||| ||||||| ||||     
T  26196316 aggtgacaactaggatattcatggaaaaatggtgggtaatttaccccaaccaataaacattcacc-----------tttttaggtggtatccataaacta 26196404  T
Q  293 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaaccttaaa 382  Q
    | ||||||||||||| |||||| | ||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  26196405 ttttgaccccaccaataaattgtt-attatgattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatctaaaaaaaaccttaaa 26196493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 193 - 378
Target Start/End: Original strand, 31148890 - 31149063
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactt 292  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||| ||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||| ||           ||||||||||| |||| |||||||     
T  31148890 aggtgacaactagggtatctatggaaggatggtggataatttatctcaatcaataaacattcgc-----------atttttaagtggtatc-atgaacta 31148977  T
Q  293 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 378  Q
    |||| |||||| ||| |||| ||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  31148978 tcttaaccccatcaataaatagctcattttcattggttagtgaataaattacccaccatttttcaaaggtaatctagaaaaaacct 31149063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 211 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 38631806 - 38631652
Alignment:
Q  211 ccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactttcttgaccccaccaacaa 310  Q
    |||| |||||||||||| ||||||| | ||||||||||| |||| |||||||||||||| ||           |||||||| |||||||| |||||| ||    
T  38631806 ccattgaagaatggtggataatttatcccaaccaatacatattaaccacataagcatatatt-----------catgaactatcttgaccacaccaataa 38631718  T
Q  311 attgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaac 376  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  38631717 attgctcatattcattggttgatgggtaaattatccaccatttttcaaaggtaatttagaaaaaac 38631652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 200 - 364
Target Start/End: Original strand, 40649837 - 40649990
Alignment:
Q  200 aactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactttcttgac 299  Q
    ||||||| |||||||| ||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||            |||| |||||| | | ||||     
T  40649837 aactaggctacccatgaaagaatgatgggtagtttaccccaaccaatacacattagccacataagca-----------catattcatgaattattttgat 40649925  T
Q  300 cccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 364  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  40649926 cccacaaataaattgctcattttcattgattggtgggtaaattacccatcattctttaaaggtaa 40649990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 311 - 380
Target Start/End: Original strand, 33622571 - 33622640
Alignment:
Q  311 attgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 380  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||    
T  33622571 attgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttaaaaaaaagctta 33622640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 194 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 39901739 - 39901674
Alignment:
Q  194 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccac 259  Q
    ||||||||||| |||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  39901739 ggtgacaactaaggtatccattgaagaatggtggataatttacctcaaccaataaacattagccac 39901674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 307 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 164791 - 164728
Alignment:
Q  307 acaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctaga 370  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||    
T  164791 acaaattgctcatttttattggttggtggataaattacccatcattccttaaaggtaatctaga 164728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 340 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 12032988 - 12032951
Alignment:
Q  340 attacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 377  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12032988 attacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 12032951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 194 - 266
Target Start/End: Original strand, 41425429 - 41425500
Alignment:
Q  194 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagca 266  Q
    |||| |||||||| |||||||  ||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  41425429 ggtggcaactaggctacccataaaagaattatggataatttacc-caaccaatacacattagccacataagca 41425500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 332 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 39901617 - 39901574
Alignment:
Q  332 gtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 375  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  39901617 gtgggtaagttacccaccattctttaaaggtaatctagaaaaaa 39901574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 194 - 263
Target Start/End: Original strand, 33622467 - 33622535
Alignment:
Q  194 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataa 263  Q
    ||||||||||||| |||| ||| || |||| ||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||    
T  33622467 ggtgacaactaggctacc-atgaaaaaatgatgggtaatttatcccaaccaatacacattagtcacataa 33622535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 171; Significance: 1e-91; HSPs: 96)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 193 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 45482842 - 45482652
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactt 292  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  45482842 aggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacatcagtcacataagcatatttttaagtgatatccatgaacta 45482743  T
Q  293 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaaccttaaaa 383  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  45482742 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctaaaaa 45482652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 194 - 379
Target Start/End: Original strand, 22979647 - 22979832
Alignment:
Q  194 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaacttt 293  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  22979647 ggtgacaactagggtacccatgaaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatatacattagccacataagcatatttttaagtggtatccatgaactat 22979746  T
Q  294 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 379  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22979747 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 22979832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 194 - 379
Target Start/End: Original strand, 25893917 - 25894102
Alignment:
Q  194 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaacttt 293  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |    
T  25893917 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 25894016  T
Q  294 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 379  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  25894017 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacctt 25894102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 195 - 378
Target Start/End: Original strand, 33423276 - 33423459
Alignment:
Q  195 gtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactttc 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||    
T  33423276 gtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatc 33423375  T
Q  295 ttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 378  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33423376 ttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 33423459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 193 - 375
Target Start/End: Original strand, 49171361 - 49171543
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactt 292  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  49171361 aggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttaccctaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtggtatccatgaacta 49171460  T
Q  293 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 375  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49171461 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 49171543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 193 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 33332972 - 33332784
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactt 292  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||     
T  33332972 aggtgacaactagggtacccatgaaagaatggtgggtaatttacctcaatcaatacacattagccgcataagcatatttttaagtggtatc-atgaacta 33332874  T
Q  293 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaaccttaaa 382  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33332873 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaaccttaaa 33332784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 193 - 378
Target Start/End: Original strand, 33839714 - 33839899
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactt 292  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||     
T  33839714 aggtgacaactaaggtacccatggaagaatggtggataatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 33839813  T
Q  293 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 378  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33839814 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 33839899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 194 - 379
Target Start/End: Original strand, 47740331 - 47740516
Alignment:
Q  194 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaacttt 293  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |    
T  47740331 ggtgacaactagggtatccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatattcatgaactat 47740430  T
Q  294 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 379  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47740431 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattgattggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 47740516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 193 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 17855612 - 17855427
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactt 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||     
T  17855612 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaatcaatacacattagccacataagcacatttttaagtagtatccatgaacta 17855513  T
Q  293 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 378  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17855512 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattctttaaaggtaatctagaaaaaacct 17855427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 194 - 375
Target Start/End: Original strand, 20165814 - 20165995
Alignment:
Q  194 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaacttt 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||| |    
T  20165814 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgagtaatttacctcaacctatacacattagccacataagtacatttttaagtggtatccatgaactat 20165913  T
Q  294 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20165914 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 20165995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 194 - 379
Target Start/End: Original strand, 33695821 - 33696006
Alignment:
Q  194 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaacttt 293  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |    
T  33695821 ggtgacaactagggtatccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 33695920  T
Q  294 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 379  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33695921 cttgaccccaccaacaaattgttcattttcattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 33696006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 193 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 35356072 - 35355887
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactt 292  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||     
T  35356072 aggtgacaactaggatacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatctatgaacta 35355973  T
Q  293 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 378  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  35355972 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaagataatctagaaaaaacct 35355887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 193 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 46913295 - 46913107
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcata--tttttaagtgatatccatgaac 290  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||| |||||||||||    
T  46913295 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacacatttttaagtggtatccatgaac 46913196  T
Q  291 tttcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 379  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46913195 tatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtaggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 46913107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 193 - 377
Target Start/End: Original strand, 47066976 - 47067160
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactt 292  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||     
T  47066976 aggtgacaactagggtacccatgaaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 47067075  T
Q  293 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 377  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  47067076 tcttgaccccaccaacaaattgttcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattctttaaaggtaatctagaaaaaacc 47067160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 194 - 375
Target Start/End: Original strand, 23393051 - 23393232
Alignment:
Q  194 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaacttt 293  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||| |    
T  23393051 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtggataatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacatttttaagtggtatccatgaactat 23393150  T
Q  294 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  23393151 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccactattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 23393232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 192 - 377
Target Start/End: Original strand, 35328067 - 35328252
Alignment:
Q  192 gaggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaact 291  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  35328067 gaggtgacaactagggtacccatgaaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaact 35328166  T
Q  292 ttcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 377  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  35328167 atcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaatttacccaccattcttcataggtaatttagaaaaaacc 35328252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 194 - 379
Target Start/End: Original strand, 45690097 - 45690282
Alignment:
Q  194 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaacttt 293  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |    
T  45690097 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtggataatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 45690196  T
Q  294 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 379  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||    
T  45690197 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatttagaaaaaccctt 45690282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 193 - 380
Target Start/End: Original strand, 2341660 - 2341848
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtaccc-atggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaact 291  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||    
T  2341660 aggtgacaactagggtaccccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagtcacataagcacatttttaagttgtatccatgaact 2341759  T
Q  292 ttcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 380  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  2341760 atcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctaaaaaaaacctta 2341848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 194 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 27018299 - 27018115
Alignment:
Q  194 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaacttt 293  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |    
T  27018299 ggtgacaactaggatacccatggaagaatggtgggtaatttactccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 27018200  T
Q  294 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 378  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27018199 cttgaccacaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 27018115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 194 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 19563630 - 19563445
Alignment:
Q  194 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaacttt 293  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |    
T  19563630 ggtgacaattagagtacccatggaagaatggtgggtaatttaccttaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatattcatgaactat 19563531  T
Q  294 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 379  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19563530 cttgaccccaccaacaaattgttcattttcattggttggtggataaattatccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 19563445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 186 - 383
Target Start/End: Original strand, 37846008 - 37846205
Alignment:
Q  186 taaaaggaggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatcca 285  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  37846008 taaaaagaggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatcca 37846107  T
Q  286 tgaactttcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaaccttaaaa 383  Q
    | || | |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  37846108 taaattatcttgatcccaccaacaaattgttcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattctttaaaggtaatctagaaaaaaccataaaa 37846205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 194 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 33411443 - 33411259
Alignment:
Q  194 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaacttt 293  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||| |    
T  33411443 ggtgacaactagggtacttatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataaacacatttttaagtggtatccatgaactat 33411344  T
Q  294 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 378  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  33411343 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatcaagaaaaaacct 33411259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 193 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 40670747 - 40670563
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactt 292  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||     
T  40670747 aggtgacaactaaggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacatttttaagtggtatccatgaacta 40670648  T
Q  293 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 377  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40670647 tcttgaccccaccaataaattgctcattttcattggttggttggtaaattatccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 40670563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 194 - 380
Target Start/End: Original strand, 48609677 - 48609863
Alignment:
Q  194 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaacttt 293  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| | |    
T  48609677 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgtataatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatacatgaattat 48609776  T
Q  294 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 380  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48609777 cttgaccccaccaacaaattgttcattttcattggttggtggataaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 48609863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 193 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 31587032 - 31586848
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactt 292  Q
    |||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||     
T  31587032 aggtgagaactagggtacttatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 31586933  T
Q  293 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 377  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31586932 tcttgaccccaccaataaattgctcattttcattggttagtgggtaaattatccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 31586848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 193 - 360
Target Start/End: Original strand, 5183824 - 5183991
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactt 292  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||     
T  5183824 aggtgataactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgttatccatgaacta 5183923  T
Q  293 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaag 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5183924 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattctttaaag 5183991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 193 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 36389540 - 36389377
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactt 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||     
T  36389540 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatctatgaacta 36389441  T
Q  293 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttc 356  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36389440 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttc 36389377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 194 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 10028673 - 10028488
Alignment:
Q  194 ggtgacaactagggta--cccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaact 291  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| ||||    
T  10028673 ggtgacaactagggtatacccatggaagaatagtgggtaatttaccctaaccaatacacattagccacataaacacatttttaagtggtatccataaact 10028574  T
Q  292 ttcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 377  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10028573 atcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 10028488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 203 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 15877724 - 15877553
Alignment:
Q  203 tagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactttcttgacccc 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  15877724 tagggtacccatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacatattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgacccc 15877625  T
Q  303 accaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaa 374  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15877624 accaacaaattgctcattttcatttgttagtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaa 15877553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 194 - 380
Target Start/End: Original strand, 45063357 - 45063541
Alignment:
Q  194 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaacttt 293  Q
    |||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |    
T  45063357 ggtgacaactagagtaccaatgaaagaatggtggataatttacctcaac--atacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 45063454  T
Q  294 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 380  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45063455 cttgactccatcaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 45063541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 193 - 377
Target Start/End: Original strand, 26579716 - 26579900
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactt 292  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||     
T  26579716 aggtgacaactagggtatccatggaagaatggtgggtaatttaccccaatcaatacacattagccacataaacacatttttaagtggtatacatgaacta 26579815  T
Q  293 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 377  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26579816 tcttgatcccaccaacaaattgctcattttcattgatttgtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacc 26579900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 194 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 43499668 - 43499484
Alignment:
Q  194 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaacttt 293  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |    
T  43499668 ggtgagaactagggtatccatggaagaatggtgggtaatttaccccaactaatatacattggccacataagtatatttttaagtggtatccatgaactat 43499569  T
Q  294 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 378  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  43499568 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattactcaccattctttaaaggtaatctaaaaaaaacct 43499484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 194 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 5712351 - 5712166
Alignment:
Q  194 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaacttt 293  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| |    
T  5712351 ggtgacaactagggtacccatgaaaaaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccataaactat 5712252  T
Q  294 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 379  Q
    ||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5712251 cttgaccccactaataaattggtcattttcattggttggtgggtaaattacccactattcttcaaaggtaatttagaaaaaacctt 5712166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 193 - 377
Target Start/End: Original strand, 35757019 - 35757203
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctc-aaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaact 291  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||    
T  35757019 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgagtaatttacccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatc-atgaact 35757117  T
Q  292 ttcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 377  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  35757118 atcttgaccccaccaacaaattgctcattttcgttggttggtggataaattatccaccattcttcaaagttaatctagaaaaaacc 35757203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 193 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 31625887 - 31625706
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactt 292  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||     
T  31625887 aggtgacaactaggatacccatggaagaatggtgg-taatttactccaaccaatatacattagtcacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 31625789  T
Q  293 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 375  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  31625788 tcttgatcccaccaacaaattgctcattttcattagttggtgggtaaattacccaccattcttcgaaggtaatctagaaaaaa 31625706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 194 - 377
Target Start/End: Original strand, 31429475 - 31429658
Alignment:
Q  194 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaacttt 293  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||| |||||||| ||| |    
T  31429475 ggtgacaactagggtacccatgaaagaatgatgagtaatttacttcaaccaatacacattagtcacataaacacatttttaagtggtatccatgtactat 31429574  T
Q  294 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 377  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  31429575 cttgatcccaccaacaaattgctcattttcattggttggtggataaatcacccaccattcttcaaagataatctagaaaaaacc 31429658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 194 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 29447020 - 29446863
Alignment:
Q  194 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaacttt 293  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  29447020 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatt-actccaaccaatacacattagtcacataagcatatttttaagtggtatccatgaactat 29446922  T
Q  294 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccatt 352  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29446921 cttgaccccaccaacaaattgttcattttcattggttggtgggtaaattacccaccatt 29446863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 195 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 33870424 - 33870239
Alignment:
Q  195 gtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactttc 294  Q
    ||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| |||||||| ||    
T  33870424 gtgacaactagagtacccat---agaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaaatggtattcatgaactatc 33870328  T
Q  295 ttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaaccttaaaa 383  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||    
T  33870327 ttgaccccaccaacaaattgctcatttacattggttggtgggtaaattatccaccattctttaaaggtgatctagaaaaaacctaaaaa 33870239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 206 - 375
Target Start/End: Original strand, 41990870 - 41991039
Alignment:
Q  206 ggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactttcttgaccccacc 305  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||    
T  41990870 ggtacccatggaagaatggtgagtaatttatccaaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatctatgaactatcttgaccccacc 41990969  T
Q  306 aacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  41990970 aacaaattgctcattttcattggttggtgtgtaaattatccaccattcttcaaaggtaatctaaaaaaaa 41991039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 193 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 10618475 - 10618298
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactt 292  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||     
T  10618475 aggtgataactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataaacatatttttaagtggtattcatgaacta 10618376  T
Q  293 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 377  Q
    |       ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10618375 t-------ccaccaacaaattgctcattttcattggttggtggataaattacccaccattcttcaaatgtaatctagaaaaaacc 10618298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 193 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 35767658 - 35767481
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactt 292  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||| ||||||||||||     
T  35767658 aggtgacaactagggtatccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccatataaacacatttttaagtggtatccatgaacta 35767559  T
Q  293 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 377  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35767558 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattgattgggg-------tacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 35767481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 228 - 378
Target Start/End: Original strand, 33720070 - 33720220
Alignment:
Q  228 gtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactttcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattg 327  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||    
T  33720070 gtaatttaccctaaccaatacacattagccacataagtacatttttaagtggtatccatgaactatcttgactccatcaacaaattgctcatttttattg 33720169  T
Q  328 gttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 378  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  33720170 gttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaagtaatctagaaaaaacct 33720220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 193 - 377
Target Start/End: Original strand, 35752033 - 35752206
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactt 292  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||           ||||||||     
T  35752033 aggtgacaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatatt-----------catgaacta 35752121  T
Q  293 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 377  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  35752122 tcttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacc 35752206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 193 - 377
Target Start/End: Original strand, 24923023 - 24923196
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactt 292  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||           |||||| |     
T  24923023 aggtgacaactaggctacccatgaaagaaggatgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcacatatt-----------catgaatta 24923111  T
Q  293 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 377  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24923112 tcttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacc 24923196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 181 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 24228726 - 24228535
Alignment:
Q  181 atatttaaaaggaggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgat 280  Q
    ||||| |||| |||||||||| |||| |||||||| ||||||| ||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||            
T  24228726 atattaaaaatgaggtgacaattaggctacccatgaaagaatgatggataatttacccaaaccaatacacattagccacataagcatatatt-------- 24228635  T
Q  281 atccatgaactttcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 380  Q
       |||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  24228634 ---catgaactatcttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggttggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacctaa 24228538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 194 - 331
Target Start/End: Original strand, 28233936 - 28234073
Alignment:
Q  194 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaacttt 293  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |    
T  28233936 ggtgacaactagggtacccatgaaagaaaggtgggtagtttaccccaaccaatacacattagtcacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 28234035  T
Q  294 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttg 331  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28234036 cttaaccccaccaacaaattgctcattttcattagttg 28234073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 194 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 43489390 - 43489218
Alignment:
Q  194 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaacttt 293  Q
    ||||||||||||  |||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||           |||||||| |    
T  43489390 ggtgacaactagactacccatgaaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatatt-----------catgaactat 43489302  T
Q  294 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 377  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  43489301 cttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattattcaaaggtaatttagaaaaaacc 43489218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 193 - 325
Target Start/End: Original strand, 30076526 - 30076658
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactt 292  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||     
T  30076526 aggtgacaactagggtatccatggaagaatgatgggtaatttacgccaactaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 30076625  T
Q  293 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcat 325  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  30076626 tcttgaccccaccaacaaattgatcattttcat 30076658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 193 - 379
Target Start/End: Original strand, 46817420 - 46817595
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactt 292  Q
    ||||| |||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| || ||           ||||||||     
T  46817420 aggtggcaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatatt-----------catgaacta 46817508  T
Q  293 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 379  Q
    |||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  46817509 tcttgaccccacaaataaattactcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacctt 46817595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 193 - 378
Target Start/End: Original strand, 46898015 - 46898189
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactt 292  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||            |||| ||||||||     
T  46898015 aggtgacaactagggtatccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagca-----------catattcatgaacta 46898103  T
Q  293 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 378  Q
    | ||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  46898104 ttttgaccccatcaataaattgctcatatttattggttggtggataaattacccaccatttttcaaaggtaatttagaaaaaacct 46898189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 194 - 378
Target Start/End: Original strand, 36816845 - 36817018
Alignment:
Q  194 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaacttt 293  Q
    |||| |||||||| |||||||| ||||||| ||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| || ||           |||||||| |    
T  36816845 ggtggcaactaggctacccatgaaagaatgatggataatttaccccaaccaatacatattagccacataagcacatatt-----------catgaactat 36816933  T
Q  294 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 378  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  36816934 cttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacct 36817018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 192 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 37128111 - 37127939
Alignment:
Q  192 gaggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaact 291  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| || ||||           ||||||    
T  37128111 gaggtgacaactaggctacccatgaaagaatgatggataatttaccccaaccaatacacattagctacataagcacatattta-----------tgaact 37128023  T
Q  292 ttcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 375  Q
     |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  37128022 atcttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttaaaaaaaa 37127939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 195 - 376
Target Start/End: Original strand, 45502817 - 45502987
Alignment:
Q  195 gtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactttc 294  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| || ||           ||    
T  45502817 gtgacaactaaggtatccatggaagaacggtgggtaatttacctcaaccaatatacattagctacataagcatatttttaaatggta-----------tc 45502905  T
Q  295 ttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaac 376  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  45502906 ttgacccaactaacaaattgctcattttcattgattggtaggtaaattactcaccattcttcaaagttaatctagaaaaaac 45502987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 193 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 48086031 - 48085858
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactt 292  Q
    |||||| || |||| |||||||| ||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||           ||||||||     
T  48086031 aggtgataattaggctacccatgaaagaatgatggataatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatatt-----------catgaacta 48085943  T
Q  293 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 377  Q
    |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  48085942 tcttgatcccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacc 48085858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 218 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 44564497 - 44564356
Alignment:
Q  218 agaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactttcttgaccccaccaacaaattgctc 317  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||| |||| || ||||||||     
T  44564497 agaatggtggataatttaccccaaccaatacacattagtcacataagcatatttttaagtggtatctatgaactatcttgacaccactaataaattgctt 44564398  T
Q  318 attttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaa 359  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  44564397 atttttattgattggtgggtaaattatccaccattcttcaaa 44564356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 195 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 33393499 - 33393328
Alignment:
Q  195 gtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactttc 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||| ||           |||||| ||| ||||||| |||| ||    
T  33393499 gtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatgaacattaacc-----------tttttaggtggtatccataaactatc 33393411  T
Q  295 ttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 377  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||    
T  33393410 ttgaccccaccaataaattgctcattatgattggttggtgggtaaattacccactattttttaaaggtaatctagaaaaaacc 33393328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 193 - 378
Target Start/End: Original strand, 7876327 - 7876501
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactt 292  Q
    |||||||||||||| |||| ||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | || ||           ||||||||     
T  7876327 aggtgacaactaggctaccaatgaaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagtacatatt-----------catgaacta 7876415  T
Q  293 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 378  Q
    |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  7876416 tcttgatcccacaaataaattgctcattttcattggttggtggataaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaacaacct 7876501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 192 - 380
Target Start/End: Original strand, 44003368 - 44003545
Alignment:
Q  192 gaggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaact 291  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||  ||           |||||| ||| ||||||| ||||    
T  44003368 gaggtgacaactagggtacccatggaaaaatggtgggtaatttaccccaaccaataaacattcacc-----------tttttaggtggtatccataaact 44003456  T
Q  292 ttcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 380  Q
     ||||||| ||||||| |||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  44003457 atcttgactccaccaataaattgctcattatgattagttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatttagaaaaaacctta 44003545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 194 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 21718288 - 21718117
Alignment:
Q  194 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaacttt 293  Q
    ||||||||||||| |||||||| || |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||           |||||||| |    
T  21718288 ggtgacaactaggctacccatgaaa-aataatgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcacatatt-----------catgaactat 21718201  T
Q  294 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 377  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||    
T  21718200 cttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttgatgggtaaattacccaccgttattcaaaggtaatttagaaaaaacc 21718117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 203 - 377
Target Start/End: Original strand, 26941541 - 26941704
Alignment:
Q  203 tagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactttcttgacccc 302  Q
    |||| |||||||| ||||||| || ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| || ||           |||||||| ||||||||||    
T  26941541 taggctacccatgaaagaatgatgagtaatttaccctaaccaatacacattagccacataagcacatatt-----------catgaactatcttgacccc 26941629  T
Q  303 accaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 377  Q
    || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  26941630 acaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttataaaaaacc 26941704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 198 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 29098915 - 29098752
Alignment:
Q  198 acaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactttcttg 297  Q
    ||||||||| || ||||| || |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||               ||||||| |||||    
T  29098915 acaactaggctatccatgaaaaaatgatgagtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatat---------------atgaactatcttg 29098831  T
Q  298 accccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaac 376  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  29098830 accccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaatgtaatttagaaaaaac 29098752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 193 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 44405532 - 44405412
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactt 292  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||     
T  44405532 aggtgacaactagaatacccatggaagaatggtaggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataaacacatttttaagtggtatccatgaacta 44405433  T
Q  293 tcttgaccccaccaacaaatt 313  Q
    ||||||||| ||||| |||||    
T  44405432 tcttgaccctaccaataaatt 44405412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 194 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 2332191 - 2332019
Alignment:
Q  194 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaacttt 293  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||| || ||           |||||||| |    
T  2332191 ggtgacaacttgggtacccatggaaaaatggtggataatttaccccaaccaatacacagtaaccacataagcacatatt-----------catgaactat 2332103  T
Q  294 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 377  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||| |||||||||||    
T  2332102 cttgatcccaccaataaattgctcatattcattggttggtgggtaaattactcaccatttttcaaagataatttagaaaaaacc 2332019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 194 - 375
Target Start/End: Original strand, 47460772 - 47460942
Alignment:
Q  194 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaacttt 293  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||           ||| |||||| ||| ||||||| |||| |    
T  47460772 ggtgacaactagggtacccatgaaaaaatggtgggtaatttacctcaaccaataaacatt-----------catctttttaggtggtatccataaactat 47460860  T
Q  294 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 375  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||| || ||| |||||||| ||||||    
T  47460861 cttgaccccaccaataaattgctcattataattggttggtgggtaaattatccaccattttttaaaagtaatctaaaaaaaa 47460942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 194 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 29610807 - 29610635
Alignment:
Q  194 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaacttt 293  Q
    |||| |||||| | |||||||| ||||||| || |||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||| || ||           |||||||| |    
T  29610807 ggtggcaactatgctacccatgaaagaatgatgagtaatttactccaatcaatacacattagccacataagcacatatt-----------catgaactat 29610719  T
Q  294 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 377  Q
    ||| ||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  29610718 cttaaccccacaaataaattgctcattttcattgattggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacc 29610635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 193 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 41904389 - 41904272
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactt 292  Q
    |||||||||||||| |||  ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||     
T  41904389 aggtgacaactaggatacttatggaagaatggtggataatttaccccaaccaatacacattagtcacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 41904290  T
Q  293 tcttgaccccaccaacaa 310  Q
    |||||||| |||||||||    
T  41904289 tcttgacctcaccaacaa 41904272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 193 - 379
Target Start/End: Original strand, 25037507 - 25037682
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactt 292  Q
    ||||| || ||||| |||||||| ||||||| || |||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||| || ||           ||||||||     
T  25037507 aggtggcacctaggctacccatgaaagaatgatgagtaatttaccccaatcaatacacatcagccacataagcacatatt-----------catgaacta 25037595  T
Q  293 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 379  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  25037596 tcttgaccccaccaataaattgatcattttaattgattggtgggtaaattactcaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacctt 25037682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 193 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 44660016 - 44659843
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactt 292  Q
    ||||| |||||||| |||||||  ||||||| ||| ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||           ||||||||     
T  44660016 aggtggcaactaggctacccataaaagaatgatggataatttactccaaccgatacacattagccacataagcatatatt-----------catgaacta 44659928  T
Q  293 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 378  Q
    |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  44659927 tcttgaccccataaataaattgctcattttcattggttggtggataaatta-ccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacct 44659843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 194 - 382
Target Start/End: Original strand, 498188 - 498365
Alignment:
Q  194 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaacttt 293  Q
    |||| |||||||| || ||||| ||||||| ||| ||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||| || ||           |||||||| |    
T  498188 ggtggcaactaggctagccatgaaagaatgatggataatttatcccaaccaatacatattagccacataagcacatatt-----------catgaactat 498276  T
Q  294 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaaccttaaa 382  Q
    ||||||||||| || ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||    
T  498277 cttgaccccacaaataaattactcattttcattagttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttataaaaaaccataaa 498365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 194 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 7257553 - 7257380
Alignment:
Q  194 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaacttt 293  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||  ||||  ||           |||||| ||| ||| ||| |||| |    
T  7257553 ggtgacaactagggtacccatagaaaaatggtgggtaatttaccccaaccaataatcattcacc-----------tttttaggtggtattcataaactat 7257465  T
Q  294 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 378  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  7257464 cttgaccccaccaataaattgctcattatgattggttggtgggtaaattacccatcatttttcgaaggtaatctagaaaaaacct 7257380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 269 - 378
Target Start/End: Original strand, 16482847 - 16482956
Alignment:
Q  269 tttttaagtgatatccatgaactttcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatcta 368  Q
    |||||| ||| ||||||| |||  ||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16482847 tttttaggtggtatccataaaccatcttgaccccaccaataaattgctcattatcattgattggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatcta 16482946  T
Q  369 gaaaaaacct 378  Q
    ||||||||||    
T  16482947 gaaaaaacct 16482956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 228 - 378
Target Start/End: Original strand, 32556640 - 32556779
Alignment:
Q  228 gtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactttcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattg 327  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| || ||           |||||||| ||||| |||||| || |||||| ||||||||||||    
T  32556640 gtaatttaccccaaccaatacacattagtcacataagcacatatt-----------catgaactatcttgtccccacaaataaattgttcattttcattg 32556728  T
Q  328 gttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 378  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  32556729 gttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacct 32556779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 196 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 35484807 - 35484632
Alignment:
Q  196 tgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactttct 295  Q
    |||||| |||| |||||||| ||||||| || ||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||| || ||           |||||||| |||    
T  35484807 tgacaattaggctacccatgaaagaatgatgagtaatttacctcaaataatacacattagtcacataagcacatatt-----------catgaactatct 35484719  T
Q  296 tgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaa-ttacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaaccttaa 381  Q
    ||||||||  || ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  35484718 tgaccccataaataaattgctcattttcattgattggtgggtaaatttacccaccattcttcaaagataatttagaaaaaaccttaa 35484632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 198 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 41855228 - 41855061
Alignment:
Q  198 acaactagg-gtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactttctt 296  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||| |  ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||           |||||| ||||    
T  41855228 acaactaggagtatccatggaagaatgatgggtaatttatccaaactaatacacattagccacataagcatatattta-----------tgaactatctt 41855140  T
Q  297 gaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 375  Q
    ||| ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  41855139 gactccaccaataaattgctcacattcattggttggtgggtaaattatccaccatttttcaaaggtaatttagaaaaaa 41855061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 194 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 26371221 - 26371051
Alignment:
Q  194 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaacttt 293  Q
    |||| |||||||| |||||||| ||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| || ||           |||||||| |    
T  26371221 ggtggcaactaggctacccatgaaagaatgatgagtaatttaccccaaccaatacacattagtcacataagcacatatt-----------catgaactat 26371133  T
Q  294 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 375  Q
     |||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||    
T  26371132 tttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttgatggataaattacccaccattcttcaaagataatttaaaaaaaa 26371051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 193 - 377
Target Start/End: Original strand, 47906757 - 47906931
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaattt-acctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaact 291  Q
    ||||| |||||||| || ||||| || |||| |||||||||| |||  || |||||||||||||||||||||||| || ||           ||||||||    
T  47906757 aggtggcaactaggctatccatgaaaaaatgatgggtaattttaccctaatcaatacacattagccacataagcacatatt-----------catgaact 47906845  T
Q  292 ttcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 377  Q
     |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  47906846 atcttgatcccacaaataaattgctcattttcattggttggtaggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacc 47906931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 193 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 39323780 - 39323616
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactt 292  Q
    |||||||||||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||                   |||| ||||||||     
T  39323780 aggtgacaactaggctactcatgaaagaatgatgggtaatttacc-caaccaatacacattagccac-------------------atattcatgaacta 39323701  T
Q  293 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 377  Q
    |||||||||||| || |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  39323700 tcttgaccccacaaataaattgttcattttaattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacc 39323616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 196 - 377
Target Start/End: Original strand, 39453484 - 39453647
Alignment:
Q  196 tgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactttct 295  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||| || ||                  |||| |||    
T  39453484 tgacaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttaccccaaccattacacattagtcacataaacacat------------------aactatct 39453565  T
Q  296 tgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 377  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  39453566 tgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaagtaatttagaaaaaacc 39453647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 196 - 379
Target Start/End: Original strand, 15643948 - 15644120
Alignment:
Q  196 tgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactttct 295  Q
    |||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| ||| ||||| |||||  ||           |||||| ||| ||||||| |||| | |    
T  15643948 tgacaactagtgtacccatgaaaaaatggtgggtaatttaccccaatcaataaacattcacc-----------tttttaggtggtatccataaactattt 15644036  T
Q  296 tgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 379  Q
    |||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||    
T  15644037 tgaccccaccaataaattgctcattatgattggttggtgggtaaattacccaccattttttaaagataatctagaaaaaacctt 15644120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 279 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 39866763 - 39866667
Alignment:
Q  279 atatccatgaactttcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 375  Q
    |||| |||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  39866763 atattcatgaactatcttgaccccacaaataaattgctcattttcattgattggtgagtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaa 39866667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 193 - 375
Target Start/End: Original strand, 45237532 - 45237703
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactt 292  Q
    |||||||||||| | |||||||  ||||||| || |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| || ||           |||||| |     
T  45237532 aggtgacaactaagctacccataaaagaatgatgagtaatttaccccaaccaatacacattaaccacataagcacatatt-----------catgaatta 45237620  T
Q  293 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 375  Q
    |||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||    
T  45237621 tcttgacctcacaaataaattgctcattttcattggttggtggataaattacctatcattcttcaaaggtaatttagaaaaaa 45237703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 195 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 46103291 - 46103127
Alignment:
Q  195 gtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactttc 294  Q
    |||||||||||  |||||||| ||||||| || |||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||| || ||           |||||||| |     
T  46103291 gtgacaactagactacccatgaaagaatgatgagtaatttactccaactaatacacattagccacataagcacatatt-----------catgaactatt 46103203  T
Q  295 ttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaa 371  Q
    |||||||||| || |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  46103202 ttgaccccacaaataaattgttcattttcattggttggt-ggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatttagaa 46103127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 279 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 33455194 - 33455098
Alignment:
Q  279 atatccatgaactttcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 375  Q
    |||| |||||||| |||||||||||| || |||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  33455194 atattcatgaactatcttgaccccacaaataaattgttcatttttattggttggtgggtaaattatccaccattcttcataggtaatttagaaaaaa 33455098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 280 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 29863112 - 29863017
Alignment:
Q  280 tatccatgaactttcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 375  Q
    |||||||||||| | ||||  ||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  29863112 tatccatgaactattttgattccaccaataaattattcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaagataatctaaaaaaaa 29863017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 312 - 377
Target Start/End: Original strand, 30077043 - 30077108
Alignment:
Q  312 ttgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 377  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  30077043 ttgcccattttcattggttggtgggtaaattacccaccattctttaaaggtaatctagaaaaaacc 30077108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 309 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 35557798 - 35557730
Alignment:
Q  309 aaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 377  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||    
T  35557798 aaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtattctaaaaaaaacc 35557730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 268 - 365
Target Start/End: Original strand, 38448511 - 38448608
Alignment:
Q  268 atttttaagtgatatccatgaactttcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaat 365  Q
    ||||||| ||||||| ||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||| | |||| ||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||    
T  38448511 atttttaggtgatattcataaactatcttgaccccaccaataaattgctcattatgattgattggtgggtaaattatccacaatttttcaaaggtaat 38448608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 314 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 35823353 - 35823289
Alignment:
Q  314 gctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 378  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  35823353 gctcattttcattggttggtggataaattacccaccattcttctaaggtaatttagaaaaaacct 35823289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 280 - 376
Target Start/End: Original strand, 7720578 - 7720674
Alignment:
Q  280 tatccatgaactttcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaac 376  Q
    |||||||||||| |||| |||| | | | |||||||| ||||| ||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  7720578 tatccatgaactatcttaacccaatctataaattgcttatttttattggttagtggataaattacccaccatttttcaaaggtaatcaagaaaaaac 7720674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 193 - 337
Target Start/End: Original strand, 37443601 - 37443734
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactt 292  Q
    ||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| ||||||||| |||||           ||  |||||| ||| |||| || ||||     
T  37443601 aggtgacaactagggtacccataaaaaaatggtgggtaatttaccccaaccaataaacatt-----------cacctttttaggtggtatctataaacta 37443689  T
Q  293 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggt 337  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||    
T  37443690 tcttgaccccaccaataaattgctcattatgattggttggtgggt 37443734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 194 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 42272244 - 42272180
Alignment:
Q  194 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccac 259  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  42272244 ggtgacaactagggtatc-atggaagaattatgggtaatttacctcaatcaatacacattagccac 42272180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 340 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 42272188 - 42272149
Alignment:
Q  340 attacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 379  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42272188 attagccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 42272149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 309 - 378
Target Start/End: Original strand, 21649482 - 21649552
Alignment:
Q  309 aaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccacca-ttcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 378  Q
    ||||||||||||||||||||||  |  |||||||||||| || || ||||||||||||||| |||||||||    
T  21649482 aaattgctcattttcattggttaataagtaaattacccatcattttttcaaaggtaatctaaaaaaaacct 21649552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 267 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 26456219 - 26456157
Alignment:
Q  267 tatttttaagtgatatccatgaactttcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggt 329  Q
    ||||||||||   ||| |||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26456219 tatttttaagaagtattcatgaactatcttgatcccaccaataaattgctcattttcattggt 26456157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 208 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 39866806 - 39866762
Alignment:
Q  208 tacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacat 252  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  39866806 tacccatgaaagaatggtggataatttaccccaaccaatacacat 39866762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 385 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 33473634 - 33473597
Alignment:
Q  385 gatgaaagtggatgtaaattaatgaggtgagtgtaaac 422  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  33473634 gatgaaagtgggtgtaaattaacgaggtgagtgtaaac 33473597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 171; Significance: 1e-91; HSPs: 74)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 194 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 24253564 - 24253378
Alignment:
Q  194 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaacttt 293  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |    
T  24253564 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 24253465  T
Q  294 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 380  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24253464 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 24253378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 196 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 6901979 - 6901796
Alignment:
Q  196 tgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactttct 295  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| |||    
T  6901979 tgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtattcatgaactatct 6901880  T
Q  296 tgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 379  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6901879 tgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaagataatctagaaaaaacctt 6901796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 193 - 378
Target Start/End: Original strand, 3466680 - 3466865
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactt 292  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  3466680 aggtgacaactagggtacccataaaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtggtatccatgaacta 3466779  T
Q  293 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 378  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3466780 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttagtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 3466865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 194 - 379
Target Start/End: Original strand, 43326379 - 43326564
Alignment:
Q  194 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaacttt 293  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| |    
T  43326379 ggtgccaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataggcacatttttaagtggtatccatgaactat 43326478  T
Q  294 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 379  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43326479 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 43326564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 193 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 39932762 - 39932578
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactt 292  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||     
T  39932762 aggtgacaactagagtacccatggaagaatggttggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 39932663  T
Q  293 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 377  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  39932662 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctaaaaaaaacc 39932578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 195 - 375
Target Start/End: Original strand, 15398483 - 15398663
Alignment:
Q  195 gtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactttc 294  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||    
T  15398483 gtgacaactagagtacctatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatc 15398582  T
Q  295 ttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 375  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15398583 ttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 15398663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 193 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 35626221 - 35626037
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactt 292  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||     
T  35626221 aggtgacaactagagtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 35626122  T
Q  293 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 377  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  35626121 tcttgatcccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacc 35626037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 193 - 383
Target Start/End: Original strand, 43262182 - 43262372
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactt 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||     
T  43262182 aggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 43262281  T
Q  293 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaaccttaaaa 383  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  43262282 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattgattggtaggttaattacccaccattcttcaaaggtaatatagaaaaaaccttaaaa 43262372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 193 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 7722232 - 7722047
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactt 292  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||     
T  7722232 aggtgacaattagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacccaaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 7722133  T
Q  293 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 378  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7722132 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgagtaaattacccaccattcttcaaaggcaatctagaaaaaacct 7722047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 194 - 383
Target Start/End: Original strand, 40886028 - 40886216
Alignment:
Q  194 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaacttt 293  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||| |    
T  40886028 ggtgaaaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccctaaccaatacacattagccacataagcacatttt-aagtggtatccatgaactat 40886126  T
Q  294 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaaccttaaaa 383  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  40886127 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaaccataaaa 40886216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 194 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 5185154 - 5184971
Alignment:
Q  194 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaacttt 293  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| |    
T  5185154 ggtgacaactaggatacccatggaagaatggtgagtaatttaccccaatcaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtattcatgaactat 5185055  T
Q  294 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 377  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5185054 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 5184971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 193 - 379
Target Start/End: Original strand, 739703 - 739889
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactt 292  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||     
T  739703 aggtgacaactagggtacccatagaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattaaccacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 739802  T
Q  293 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 379  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  739803 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattgattggtgggtaaattactcaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 739889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 194 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 27939080 - 27938894
Alignment:
Q  194 ggtgacaactagggta-cccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactt 292  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||     
T  27939080 ggtgacaactagggtaacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattaaccacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 27938981  T
Q  293 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 379  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  27938980 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaaataatctagaaaaaacctt 27938894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 194 - 375
Target Start/End: Original strand, 18479668 - 18479849
Alignment:
Q  194 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaacttt 293  Q
    |||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |    
T  18479668 ggtgactactagggtatccatagaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 18479767  T
Q  294 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 375  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18479768 tttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 18479849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 194 - 381
Target Start/End: Original strand, 27501055 - 27501242
Alignment:
Q  194 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaacttt 293  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |    
T  27501055 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaacaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 27501154  T
Q  294 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaaccttaa 381  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27501155 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattgattggtggataaattatccaccattcttcaaaggtaatctaaaaaaaaccttaa 27501242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 194 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 12648979 - 12648797
Alignment:
Q  194 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaacttt 293  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |    
T  12648979 ggtgacaactagggtatccatggaagaatggtgggtaatttaccccaatcaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 12648880  T
Q  294 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaac 376  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12648879 cttaaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaagataatctagaaaaaac 12648797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 193 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 25831703 - 25831517
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactt 292  Q
    ||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||     
T  25831703 aggtgacaaataaggtacccatgaaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaattggtatccatgaacta 25831604  T
Q  293 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 380  Q
    | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25831603 t-ttgaccccaccaacaaattgcttattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 25831517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 194 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 15683973 - 15683791
Alignment:
Q  194 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaacttt 293  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |    
T  15683973 ggtgacaactagggtacttatggaagaatggtggataatttaccccaaccaatacacattagccatataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 15683874  T
Q  294 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaac 376  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15683873 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacacatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaac 15683791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 194 - 375
Target Start/End: Original strand, 2484292 - 2484473
Alignment:
Q  194 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaacttt 293  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||  |||||||||||| |    
T  2484292 ggtgacaactaggatacccatggaagaatggtgggtaatttactccaaccaatacacattagccacataaacacatttttaagtagtatccatgaactat 2484391  T
Q  294 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 375  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2484392 cttgaccctaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaagataatctagaaaaaa 2484473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 195 - 377
Target Start/End: Original strand, 27278474 - 27278660
Alignment:
Q  195 gtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaa----c 290  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||    |    
T  27278474 gtgacaactagggtacctatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatatacattagccacgtaagcacatttttaagtggtatccatgaattatc 27278573  T
Q  291 tttcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 377  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27278574 tatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattactcaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 27278660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 194 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 31939079 - 31938908
Alignment:
Q  194 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaacttt 293  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||| || ||||||||||| |||||||||||| |    
T  31939079 ggtgacaattagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagtcatataaacacatttttaagtggtatccatgaactat 31938980  T
Q  294 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaat 365  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  31938979 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaat 31938908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 194 - 381
Target Start/End: Original strand, 40278858 - 40279044
Alignment:
Q  194 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaacttt 293  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| | |    
T  40278858 ggtgacaactagggtattcatggaagaatgatgggtaatttatctcaatcaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaattat 40278957  T
Q  294 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaaccttaa 381  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  40278958 gttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaat-taaaaaaaaccttaa 40279044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 193 - 378
Target Start/End: Original strand, 28424794 - 28424977
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactt 292  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||     
T  28424794 aggtgacaactagagtatccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtattcatgaacta 28424893  T
Q  293 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 378  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  28424894 tcttgaccccaccaacaaattg--cattttcattggttgatggataaattacccactatccttcaaaggtaatctagaaaaaacct 28424977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 193 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 5137898 - 5137713
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactt 292  Q
    |||||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||   || ||||||| ||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||     
T  5137898 aggtgacaactagggtattaatggaagaatggtggataatttactcaaatcaatacatattagccacataaacacatttttaagtggtatccatgaacta 5137799  T
Q  293 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 378  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5137798 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattgattggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 5137713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 193 - 339
Target Start/End: Original strand, 29789294 - 29789440
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactt 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  29789294 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatatacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaacta 29789393  T
Q  293 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaa 339  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29789394 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaa 29789440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 193 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 891088 - 890901
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactt 292  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||     
T  891088 aggtgacaattaggatacccatggaagaatggtaggtaatttaccctaaccaatacacattagccacataagcacatttt-aagtggtatccatgaacta 890990  T
Q  293 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaaccttaa 381  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  890989 tcttgactcgaccaacaaattgctcattttcattagttggtggataaattatccaccattcttcaaaagtaatctagaaaaaaccttaa 890901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 194 - 374
Target Start/End: Original strand, 13504742 - 13504922
Alignment:
Q  194 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaacttt 293  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| | |||| |||||| ||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |    
T  13504742 ggtgacaactagggtatccatggaagaatggtggataatttatcccaactaatacatattagtcacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 13504841  T
Q  294 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaa 374  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  13504842 cttgaccccaccaataaattgctcattttcattggttggtggataaattacccaccattcttcgatggtaatctagaaaaa 13504922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 193 - 368
Target Start/End: Original strand, 38756486 - 38756662
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatgg-aagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaact 291  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||    
T  38756486 aggtgacaactagggtacctatgggaagaattgtgggtaatttatctcaactaatacacattagccacataaacacatttttaagtggtatccatgaact 38756585  T
Q  292 ttcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatcta 368  Q
     |||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38756586 atcttgatcccaccaacaaattgctcattttcatttattggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatcta 38756662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 196 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 40110413 - 40110228
Alignment:
Q  196 tgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactttct 295  Q
    |||||| |||| ||| |||||||||||||| | |||||||||  ||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||| |||    
T  40110413 tgacaattaggatactcatggaagaatggtagataatttaccctaactaatatacattaaccacataagcacatttttaagtggtatctatgaactatct 40110314  T
Q  296 tgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaaccttaaa 382  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  40110313 tgaccc-accaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaatgtaatatagaaaaaaccttaaa 40110228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 193 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 763906 - 763723
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactt 292  Q
    ||||||||||||| ||| ||||  ||||||| ||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||     
T  763906 aggtgacaactagagtatccatcaaagaatgatgggtaatttaccccaactaatacatattagccacataagtacatttttaagtgatatccatgaacta 763807  T
Q  293 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaac 376  Q
    |||| || ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  763806 tcttaactccaccaacaaattactcatttttattggttggtgagtaaattacccaccattcttcaaaaataatctagaaaaaac 763723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 194 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 34451432 - 34451292
Alignment:
Q  194 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaacttt 293  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |    
T  34451432 ggtgacaactagggtatccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacatattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 34451333  T
Q  294 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtg 334  Q
     ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  34451332 attgaccccaccaataaattgctcattttcattggttggtg 34451292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 193 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 33617757 - 33617584
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactt 292  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||           ||||||||     
T  33617757 aggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgagtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatatt-----------catgaacta 33617669  T
Q  293 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 377  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  33617668 tcttgaccccaccaataaattgctcatattcattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatttagaaaaaacc 33617584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 213 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 4149847 - 4149691
Alignment:
Q  213 atggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactttcttgaccccaccaacaaat 312  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |          ||||||||||||||    
T  4149847 atggaagaatggtgagtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccataa----------ccccaccaacaaat 4149758  T
Q  313 tgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 379  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4149757 tgctcatttttattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatatagaaaaaacctt 4149691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 195 - 377
Target Start/End: Original strand, 9424593 - 9424764
Alignment:
Q  195 gtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactttc 294  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||           |||||||| ||    
T  9424593 gtgacaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcatatatt-----------catgaactatc 9424681  T
Q  295 ttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 377  Q
    |||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9424682 ttgaccccacaaataaattactcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacc 9424764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 194 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 19295901 - 19295726
Alignment:
Q  194 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaacttt 293  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||           || |||||||| |    
T  19295901 ggtgacaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacat-----------atacatgaactat 19295813  T
Q  294 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 380  Q
    ||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  19295812 cttaaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatttagaaaaaacctta 19295726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 193 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 13957842 - 13957668
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactt 292  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||           ||||||||     
T  13957842 aggtgacaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttacctcaaccaatacacattagtcacataagcgcatatt-----------catgaacta 13957754  T
Q  293 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 378  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13957753 tcttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtggataaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacct 13957668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 194 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 27503550 - 27503376
Alignment:
Q  194 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaacttt 293  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||           |||||||| |    
T  27503550 ggtgacaactaggctacccatgaaagaatgatgagtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatatt-----------catgaactat 27503462  T
Q  294 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 379  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27503461 cttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtggataaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacctt 27503376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 183 - 375
Target Start/End: Original strand, 38015503 - 38015684
Alignment:
Q  183 atttaaaaggaggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatat 282  Q
    ||||||||  ||||| |||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||              
T  38015503 atttaaaataaggtggcaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatatt---------- 38015592  T
Q  283 ccatgaactttcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 375  Q
     |||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  38015593 -catgaactatcttgaccccacaaataaattgctcattttcattagttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaa 38015684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 203 - 379
Target Start/End: Original strand, 42658671 - 42658836
Alignment:
Q  203 tagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactttcttgacccc 302  Q
    |||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||           |||||||| ||||||||||    
T  42658671 taggctacccatgaaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcatatatt-----------catgaactatcttgacccc 42658759  T
Q  303 accaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 379  Q
    || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  42658760 acaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaattttgaaaaaacctt 42658836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 194 - 375
Target Start/End: Original strand, 31293989 - 31294170
Alignment:
Q  194 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaacttt 293  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||  ||| |  ||| |||||||||||||||||| ||| |||| |||      
T  31293989 ggtgacaactagggtacccatgtaagaatggtgggtaatttactccaaccaataaccatcaatcacgtaagcatatttttaagtggtattcatggactac 31294088  T
Q  294 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 375  Q
    |  ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  31294089 ccggaccctaccaataatttgctcattttcattggttggtgggtaaattatccaccattctttaaaggtaatctagaaaaaa 31294170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 193 - 377
Target Start/End: Original strand, 23195247 - 23195420
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactt 292  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||  |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| || ||           ||||||||     
T  23195247 aggtgacaactaggctacccatgaaagaatgacgggtaatttactccaaccaatacacattagccacataagcacatatt-----------catgaacta 23195335  T
Q  293 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 377  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  23195336 tcttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattctttaaaggtaatttagaaaaaacc 23195420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 193 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 5497445 - 5497271
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactt 292  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| || ||           ||||||||     
T  5497445 aggtgacaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatatt-----------catgaacta 5497357  T
Q  293 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 378  Q
    | |||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  5497356 ttttgaccccacaaataaattgttcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaagataatttagaaaaaacct 5497271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 193 - 377
Target Start/End: Original strand, 36365444 - 36365617
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactt 292  Q
    ||||| |||||||  || ||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||           ||||||||     
T  36365444 aggtggcaactagactatccatgaaagaatgatggctaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcacatatt-----------catgaacta 36365532  T
Q  293 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 377  Q
    |||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  36365533 tcttgaccccacaaataaattgttcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacc 36365617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 193 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 6973235 - 6973063
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactt 292  Q
    ||||| |||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| || ||           ||||||||     
T  6973235 aggtgtcaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacatattagtcacataagcacatatt-----------catgaacta 6973147  T
Q  293 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaac 376  Q
    |||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6973146 tcttgaccccacaaataaattgttcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaac 6973063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 232 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 40632634 - 40632498
Alignment:
Q  232 tttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactttcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttg 331  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||         |  | |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40632634 tttaccccaaccaatacacattagccacataagc---------accggtatccatgaactatcttgatcccaccaacaaattgctcattttcattggttg 40632544  T
Q  332 gtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 377  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  40632543 gtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatctagaaaaaacc 40632498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 194 - 375
Target Start/End: Original strand, 9374502 - 9374672
Alignment:
Q  194 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaacttt 293  Q
    |||| |||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| || || ||           |||||||| |    
T  9374502 ggtggcaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacctaaacacatatt-----------catgaactat 9374590  T
Q  294 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 375  Q
    ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  9374591 cttgaccccataaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatttagaaaaaa 9374672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 194 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 2585633 - 2585461
Alignment:
Q  194 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaacttt 293  Q
    |||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||           ||  ||||||  || ||||||| |||| |    
T  2585633 ggtgacaattagggtatccatggaaaaatggtgggtaatttaccccaaccaataaacatt-----------caactttttagatggtatccataaactat 2585545  T
Q  294 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 377  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2585544 cttgaccccaccaataaattgctcattatgattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatctagaaaaaacc 2585461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 268 - 381
Target Start/End: Original strand, 12558093 - 12558205
Alignment:
Q  268 atttttaagtgatatccatgaactttcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatct 367  Q
    ||||||||||| |||| ||||||| |||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12558093 atttttaagtggtatc-atgaactatcttgaccacatcaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaaggtaatct 12558191  T
Q  368 agaaaaaaccttaa 381  Q
    ||||||||||||||    
T  12558192 agaaaaaaccttaa 12558205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 207 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 5120182 - 5120036
Alignment:
Q  207 gtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactttcttgaccccacca 306  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||           |||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||| ||||    
T  5120182 gtacccatgaaagaatggtggataatttacctcaaccaataaacatt-----------catatttttaagtggtatc-atgaactatcttgaccctacca 5120095  T
Q  307 acaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaat 365  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5120094 ataaattggtcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcatcaaaggtaat 5120036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 194 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 14972149 - 14971979
Alignment:
Q  194 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaacttt 293  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| |  || ||||||||||||| |||||||||| || ||           ||| |||| |    
T  14972149 ggtgacaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttatcctaatcaatacacattagtcacataagcacatatt-----------cataaactat 14972061  T
Q  294 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 375  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||    
T  14972060 cttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaagttaatttaaaaaaaa 14971979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 193 - 378
Target Start/End: Original strand, 38637909 - 38638083
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactt 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| |||| |||||  ||           ||||||  || ||||||| ||||     
T  38637909 aggtgacaactagggtacccatggaaaaattgtgggtaatttaccccaactaataaacattcacc-----------tttttagttggtatccataaacta 38637997  T
Q  293 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 378  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||| | |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  38637998 tcttgaccccaccaataaattactcattatgattggttggtggataaattacccaccatttttcaaaggtaatctagaaaaaacct 38638083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 279 - 378
Target Start/End: Original strand, 42247856 - 42247955
Alignment:
Q  279 atatccatgaactttcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 378  Q
    |||| ||| |||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  42247856 atattcataaactatcttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacct 42247955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 269 - 379
Target Start/End: Original strand, 36472348 - 36472458
Alignment:
Q  269 tttttaagtgatatccatgaactttcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatcta 368  Q
    |||| ||||| ||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  36472348 ttttaaagtggtatccataaactatcttgaccccaccaataaattgctcattatgattggttggtggataaattacccaccatttttcaaaggtaatcta 36472447  T
Q  369 gaaaaaacctt 379  Q
    |||||||||||    
T  36472448 gaaaaaacctt 36472458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 194 - 377
Target Start/End: Original strand, 24167784 - 24167956
Alignment:
Q  194 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaacttt 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||| ||||||||| |||||  ||           |||||| ||| ||||||| |||| |    
T  24167784 ggtgacaactagggtacccatggaaaaatgttgagtaatttaccccaaccaataaacattcacc-----------tttttaggtggtatccataaactat 24167872  T
Q  294 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 377  Q
    |||||||||||||| |||||| | ||| | |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24167873 cttgaccccaccaataaattgtttattatgattggttggtggataaattacccaccatttttcaaaggtaatctagaaaaaacc 24167956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 193 - 378
Target Start/End: Original strand, 1402504 - 1402678
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactt 292  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||| |||||  ||           |||||  ||| ||||||| ||||     
T  1402504 aggtgataactagggtacccatggaaaaatggtgggtaatttaccccaactaataaacattcacc-----------tttttgggtggtatccataaacta 1402592  T
Q  293 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 378  Q
    |||||| |||||||| ||||| |||||| | |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1402593 tcttgatcccaccaataaattactcattatgattggttggtggataaattacccaccatttttcaaaggtaatctagaaaaaacct 1402678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 194 - 378
Target Start/End: Original strand, 18327173 - 18327346
Alignment:
Q  194 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaacttt 293  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||  ||           |||||| ||| ||||||| |||| |    
T  18327173 ggtgataactaaggtacccatggaaaaatggtgggtaatttaccccaaccaataaacattcacc-----------tttttaggtggtatccataaactat 18327261  T
Q  294 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 378  Q
    |||||| ||||||| ||||||| |||| | |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  18327262 cttgactccaccaataaattgcgcattataattggttggtgggtaaattatccaccatttttcaaagataatctagaaaaaacct 18327346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 193 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 27390769 - 27390596
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactt 292  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||  |||||  ||           |||||| ||| ||||||| ||||     
T  27390769 aggtgacaactagggtactcatggaagaatggtggataatttaccccaaccaatgaacattcacc-----------tttttaggtggtatccataaacta 27390681  T
Q  293 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 377  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  27390680 tcttgaccccaccaataaattgctcattatgattggttggtgggtaaactatccaccatttttcaaaggtaatctaaaaataacc 27390596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 194 - 349
Target Start/End: Original strand, 3656568 - 3656712
Alignment:
Q  194 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaacttt 293  Q
    |||| |||||||| |||||||| ||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||           |||||||| |    
T  3656568 ggtggcaactaggctacccatgaaagaatgatgagtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatatt-----------catgaactat 3656656  T
Q  294 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccacc 349  Q
    ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3656657 cttgaccccaaaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccacc 3656712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 217 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 6207032 - 6206883
Alignment:
Q  217 aagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactttcttgaccccaccaacaaattgct 316  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||           |||||||| | |||||||| | || ||||||||    
T  6207032 aagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatatt-----------catgaactattttgaccccccaaataaattgct 6206944  T
Q  317 cattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 377  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| || ||||||||    
T  6206943 cattttaattggttggtgggtaaattacccactattcttcaaaagtaatttaaaaaaaacc 6206883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 196 - 350
Target Start/End: Original strand, 36948492 - 36948633
Alignment:
Q  196 tgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactttct 295  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||           ||||||||||| |||    
T  36948492 tgacagctagggtactcatgcaagaatggtgggtaatttacc-ctaccaatacacattagccacataagcacat-----------atccatgaactatct 36948579  T
Q  296 tgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccacca 350  Q
    | |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  36948580 t-accctaccaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattatccacca 36948633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 193 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 40687070 - 40686900
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactt 292  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||   |||         ||||||  || ||| ||| ||||     
T  40687070 aggtgacaattagggtacctatggaaaaatggtgggtaatttaccccaaccaataaacatt---cac---------tttttagatggtattcataaacta 40686983  T
Q  293 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 375  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  40686982 tcttgaccccaccaataaattactcattatgattggttggtggataaattacccaccatttctcaaaggtaatctagaaaaaa 40686900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 195 - 371
Target Start/End: Original strand, 33623940 - 33624105
Alignment:
Q  195 gtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactttc 294  Q
    ||||||| ||||||| |||| ||| |||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||           | ||||||| | |     
T  33623940 gtgacaattagggtatccattgaaaaatggtggataatttaccccaaccgatacacattagccacataagcacat-----------acccatgaattatt 33624028  T
Q  295 ttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaa 371  Q
    |||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||| |||||    
T  33624029 ttgatcccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattatctaccattattcaaaggtaatttagaa 33624105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 293 - 373
Target Start/End: Original strand, 9171113 - 9171193
Alignment:
Q  293 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaa 373  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9171113 tcttgaccccacaaataaattgctcattttcatttgttggtggataaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaa 9171193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 309 - 375
Target Start/End: Original strand, 9527124 - 9527190
Alignment:
Q  309 aaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 375  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  9527124 aaattgttcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctaaaaaaaa 9527190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 193 - 350
Target Start/End: Original strand, 612756 - 612900
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttac-ctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaact 291  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||             ||||| || ||||    
T  612756 aggtgacaactaggatacccatggaagaatactgagtaatttactcccaaccaatacacattagccacataagc-------------atatcaataaact 612842  T
Q  292 ttcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccacca 350  Q
     ||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  612843 atcttgaccccaccaataaattgttcattttca-tggttggtggttaaattacccacca 612900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 194 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 38492783 - 38492647
Alignment:
Q  194 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaacttt 293  Q
    |||| |||||||| |||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| || ||           |||||||| |    
T  38492783 ggtggcaactaggctacc-atgaaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagtcacataagcacatatt-----------catgaactat 38492696  T
Q  294 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaatt 342  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  38492695 cttgaccccacaaataaattgctcattttcattgattggtgggtaaatt 38492647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 293 - 352
Target Start/End: Original strand, 3940419 - 3940478
Alignment:
Q  293 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccatt 352  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  3940419 tcttgaccgcaccaataaattgctcattttcatttgttggtgggtaaattacccaccatt 3940478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 294 - 365
Target Start/End: Original strand, 15300962 - 15301033
Alignment:
Q  294 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaat 365  Q
    |||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| | |||||||||||||||||    
T  15300962 cttgactccaccgataaattgctcattttcattggttgatgtgtaaattaccaatcattcttcaaaggtaat 15301033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 316 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 27584447 - 27584384
Alignment:
Q  316 tcattttcattggttggtgggtaaatta--cccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 377  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  27584447 tcattttcactggttggtgggtaaactatacccaccattcttcaaaggaaatatagaaaaaacc 27584384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 316 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 28756138 - 28756082
Alignment:
Q  316 tcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaa 372  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| |||||||||    
T  28756138 tcattttcattgcttggtgggtaaattatccacctttctttaaaggtgatctagaaa 28756082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 193 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 40633560 - 40633525
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtggg 228  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  40633560 aggtgacaactagggtatccatggaagaatggtggg 40633525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 193 - 266
Target Start/End: Original strand, 9171034 - 9171106
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagca 266  Q
    |||||||||||||| |||| ||| |||||||    |||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||    
T  9171034 aggtgacaactaggctacctatgaaagaatgacaagtaatttacc-caatcaatacacattaaccacataagca 9171106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 194 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 21786032 - 21786003
Alignment:
Q  194 ggtgacaactagggtacccatggaagaatg 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21786032 ggtgacaactagggtacccatggaagaatg 21786003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 385 - 422
Target Start/End: Original strand, 26637582 - 26637619
Alignment:
Q  385 gatgaaagtggatgtaaattaatgaggtgagtgtaaac 422  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  26637582 gatgaaagtgggtgtaaattagtgaggtgagtgtaaac 26637619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 170; Significance: 4e-91; HSPs: 115)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 193 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 31308184 - 31307999
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactt 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||     
T  31308184 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 31308085  T
Q  293 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 378  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31308084 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 31307999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 194 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 45538335 - 45538146
Alignment:
Q  194 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaacttt 293  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |    
T  45538335 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 45538236  T
Q  294 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaaccttaaaa 383  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  45538235 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctaaaaa 45538146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 193 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 31040892 - 31040708
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactt 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  31040892 aggtgacaactagggtacccatggaataatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtggtatccatgaacta 31040793  T
Q  293 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 377  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31040792 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttagtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 31040708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 194 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 3611318 - 3611132
Alignment:
Q  194 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaacttt 293  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |    
T  3611318 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 3611219  T
Q  294 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 380  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3611218 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacctta 3611132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 193 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 44662153 - 44661967
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactt 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||     
T  44662153 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatctatgaacta 44662054  T
Q  293 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 379  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44662053 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 44661967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 193 - 383
Target Start/End: Original strand, 38331858 - 38332048
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactt 292  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  38331858 aggtgacaactagagtacccatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatattcatgaacta 38331957  T
Q  293 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaaccttaaaa 383  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38331958 tcttgaccccaccaacaaattgttcattttcattagttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaaccttaaaa 38332048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 193 - 382
Target Start/End: Original strand, 17994950 - 17995139
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactt 292  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |     
T  17994950 aggtgccaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaatta 17995049  T
Q  293 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaaccttaaa 382  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17995050 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaaccataaa 17995139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 194 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 26277359 - 26277171
Alignment:
Q  194 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaacttt 293  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||| |    
T  26277359 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataaacaaatttttaagtggtatccatgaactat 26277260  T
Q  294 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaaccttaaa 382  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26277259 cttgaccccaccaacaaattgttcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaaccttaaa 26277171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 194 - 376
Target Start/End: Original strand, 21139412 - 21139594
Alignment:
Q  194 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaacttt 293  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |    
T  21139412 ggtgacaactagggtacctatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 21139511  T
Q  294 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaac 376  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21139512 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccatacttcaaaggtaatctagaaaaaac 21139594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 193 - 375
Target Start/End: Original strand, 38790196 - 38790378
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactt 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||     
T  38790196 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtggtatccataaacta 38790295  T
Q  293 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  38790296 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattaccaaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 38790378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 200 - 381
Target Start/End: Original strand, 4068689 - 4068870
Alignment:
Q  200 aactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactttcttgac 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  4068689 aactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgac 4068788  T
Q  300 cccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaaccttaa 381  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4068789 cccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatctagaaaaagccttaa 4068870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 194 - 383
Target Start/End: Original strand, 24245025 - 24245214
Alignment:
Q  194 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaacttt 293  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |    
T  24245025 ggtgataactagggtacccatggaagaatggtggataatttaccccaactaatacacattagtcacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 24245124  T
Q  294 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaaccttaaaa 383  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24245125 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaaccttaaaa 24245214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 194 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 25058870 - 25058685
Alignment:
Q  194 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaacttt 293  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |    
T  25058870 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaatcaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 25058771  T
Q  294 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 379  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25058770 tttgatcccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 25058685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 193 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 5981353 - 5981169
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactt 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||     
T  5981353 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtggataatttactccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 5981254  T
Q  293 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 377  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5981253 tcttgaccccaccaacaaattgctcatttttattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 5981169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 193 - 381
Target Start/End: Original strand, 6327547 - 6327734
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactt 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||| ||||||||||||     
T  6327547 aggtgacaactagggtacccatggaagaatagtgggtaatttaccccaaccaatacacattagtca-ataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 6327645  T
Q  293 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaaccttaa 381  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6327646 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaaccttaa 6327734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 194 - 377
Target Start/End: Original strand, 25678259 - 25678442
Alignment:
Q  194 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaacttt 293  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |    
T  25678259 ggtgacaactatggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 25678358  T
Q  294 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 377  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  25678359 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaaggtaatctaaaaaaaacc 25678442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 193 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 23984938 - 23984752
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactt 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||     
T  23984938 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaatcaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 23984839  T
Q  293 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 379  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23984838 tcttgaccccaccaacaaattgctcatttttattggttgatgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 23984752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 196 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 43251891 - 43251713
Alignment:
Q  196 tgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactttct 295  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||    
T  43251891 tgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatct 43251792  T
Q  296 tgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaa 374  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  43251791 tgacctcaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattactcaccattcttcaaaggtaatctagaaaaa 43251713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 194 - 382
Target Start/End: Original strand, 26085398 - 26085585
Alignment:
Q  194 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaacttt 293  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| |    
T  26085398 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtattcatgaactat 26085497  T
Q  294 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaaccttaaa 382  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  26085498 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttc-aaggtaatctagtaaaaaccttaaa 26085585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 193 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 24885684 - 24885494
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactt 292  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||     
T  24885684 aggtgacaactagggtattcatggaagaatggtgggtaatttaccctaaccaatacacattatccacataaacatatttttaagtggtatccatgaacta 24885585  T
Q  293 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaaccttaaaa 383  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24885584 tcttgaccccaccaacaaattgatcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaaccctaaaa 24885494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 194 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 47671768 - 47671582
Alignment:
Q  194 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaacttt 293  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |    
T  47671768 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 47671669  T
Q  294 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 380  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47671668 cttgacccctccaacaaatagctcattttcattggttggtcggtaaattatccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 47671582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 193 - 377
Target Start/End: Original strand, 23932508 - 23932692
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactt 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||     
T  23932508 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccctgatcaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtgtccatgaacta 23932607  T
Q  293 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 377  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23932608 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatcaagaaaaaacc 23932692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 194 - 378
Target Start/End: Original strand, 33112818 - 33113001
Alignment:
Q  194 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaacttt 293  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||| |    
T  33112818 ggtgacaactagggtacc-atgaaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacatttttaagtggtatccatgaactat 33112916  T
Q  294 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 378  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33112917 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaatttacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 33113001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 193 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 39646751 - 39646567
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactt 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||     
T  39646751 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtggataatttaccccaaccaatacacattagttacataagcacatttttaagtggtatccatgaccta 39646652  T
Q  293 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 377  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  39646651 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggcaatctagaaaaaacc 39646567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 193 - 376
Target Start/End: Original strand, 26524888 - 26525071
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactt 292  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||     
T  26524888 aggtgacaactagggtatccatggaagaatagtgggtaatttaccccaatcaatacacattagccacataagcatatttttaagtggtatctataaacta 26524987  T
Q  293 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaac 376  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26524988 tcttgaccccaccaacaaattgttcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaac 26525071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 194 - 377
Target Start/End: Original strand, 37620192 - 37620375
Alignment:
Q  194 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaacttt 293  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||| |    
T  37620192 ggtgacaactagggtacacatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaggacatttttaagtggtatccatgaactat 37620291  T
Q  294 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 377  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  37620292 cttgaccccaccaacaaattgttcattttcattggttggtggataaattacccaccattcttcaaaggtaatctaaaaaaaacc 37620375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 193 - 378
Target Start/End: Original strand, 35692662 - 35692848
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactt 292  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| | ||||||||||||     
T  35692662 aggtgacaactagagtatccatggaagaacggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataaacacatttttaagcggtatccatgaacta 35692761  T
Q  293 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtggg-taaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 378  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35692762 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggataaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 35692848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 193 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 46616732 - 46616546
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactt 292  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||     
T  46616732 aggtgacacctagagtacccatggaagaatggtggataatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacatttttaagtgatattcatgaacta 46616633  T
Q  293 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 379  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46616632 tcttgaccccaccaacaaattgttcattttcattgattggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 46616546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 193 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 50774400 - 50774218
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactt 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  50774400 aggtgacaactagggtacccatggaagaaaggtgggtaatttatcccaaccaatacacattggtcacataagcatatttttaagtggtatccatgaacta 50774301  T
Q  293 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  50774300 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggttaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaa 50774218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 194 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 35273778 - 35273589
Alignment:
Q  194 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaacttt 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |    
T  35273778 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgtgtaatttacctcaatcaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 35273679  T
Q  294 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaaccttaaaa 383  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||    
T  35273678 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattatccaccattcttcaaagataatttagaaaaaaccataaaa 35273589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 193 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 41999998 - 41999813
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactt 292  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||      
T  41999998 aggtgataactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattaaccacataagcacatttttaagtggtatccatgaacaa 41999899  T
Q  293 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 378  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  41999898 tcttgaccccaccaacaaatttctcattttcattggttgatgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatctagaaaaaacct 41999813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 194 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 51057253 - 51057068
Alignment:
Q  194 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaacttt 293  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| || |    
T  51057253 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtggataatttacctcaactaatacacattaaccacataagcacatttttaagtggtatccatgatctat 51057154  T
Q  294 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 379  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  51057153 cttgaccctaccaacaaattgctcattttcattggttggttggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacctt 51057068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 194 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 5980250 - 5980067
Alignment:
Q  194 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaacttt 293  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| |||| |    
T  5980250 ggtgacagctagggtacctatggaaaaatggtgggtaatttaccccaaccaatacatattagccacataagctaatttttaagtggtatccattaactat 5980151  T
Q  294 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 377  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5980150 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 5980067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 193 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 33884271 - 33884088
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactt 292  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||| |||||||     
T  33884271 aggtgacaattagggtacccatggaaaaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaaatggtatctatgaacta 33884172  T
Q  293 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaac 376  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  33884171 tcttgaccccaccaacaaattgttcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattctttaaaggtaatctagaaaaaac 33884088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 193 - 376
Target Start/End: Original strand, 33959981 - 33960164
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactt 292  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||| |||||||     
T  33959981 aggtgacaattagggtacccatggaaaaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaaatggtatctatgaacta 33960080  T
Q  293 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaac 376  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  33960081 tcttgaccccaccaacaaattgttcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattctttaaaggtaatctagaaaaaac 33960164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 194 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 36566512 - 36566329
Alignment:
Q  194 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaacttt 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |    
T  36566512 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacccgaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 36566413  T
Q  294 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 377  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  36566412 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattgattggtgaatatattacccactattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 36566329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 194 - 383
Target Start/End: Original strand, 46967041 - 46967230
Alignment:
Q  194 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaacttt 293  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |  ||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |    
T  46967041 ggtgacaactagggtacccatgaaagaatgatgggtaatttatcctaacaaatacatattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 46967140  T
Q  294 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaaccttaaaa 383  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  46967141 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattgattggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaaccataaaa 46967230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 198 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 26794482 - 26794302
Alignment:
Q  198 acaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactttcttg 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||| | |||    
T  26794482 acaactagggtacccatggaagaatggtgagtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacatttttaagtggtatccatgaactattttg 26794383  T
Q  298 accccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 378  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  26794382 accccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaaggtaatttaaaaaaaacct 26794302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 193 - 377
Target Start/End: Original strand, 49253974 - 49254158
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactt 292  Q
    |||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||| ||||     
T  49253974 aggtgataattagggtatccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacatattagccatataagcacatttttaagtggtatccataaacta 49254073  T
Q  293 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 377  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49254074 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttgatgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 49254158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 194 - 376
Target Start/End: Original strand, 47383732 - 47383914
Alignment:
Q  194 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaacttt 293  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |    
T  47383732 ggtgacaactagggtaccaatgaaagaatggtgggtaatttatcccaatcaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 47383831  T
Q  294 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaac 376  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  47383832 cttgaccccaccaacaaattgctcatttttattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatatagaaaaaac 47383914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 195 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 3285582 - 3285395
Alignment:
Q  195 gtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactttc 294  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||| ||    
T  3285582 gtgacaattagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccctaatcaatacacattagccacataagcacatttt-aagtggtatccatgaactatc 3285484  T
Q  295 ttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaaccttaaaa 383  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3285483 ttgaccccaccaacaaattactcattttcattggttggtggataaattatccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctaaaaa 3285395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 198 - 377
Target Start/End: Original strand, 23220939 - 23221112
Alignment:
Q  198 acaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactttcttg 297  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||      | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  23220939 acaactagggtacccatggaagaatggtggata------cccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttg 23221032  T
Q  298 accccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 377  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23221033 accccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 23221112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 193 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 47187288 - 47187100
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactt 292  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||     
T  47187288 aggtgacaactacggtacccatgaaagaatggtggataatttaccataaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccataaacta 47187189  T
Q  293 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaaccttaa 381  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47187188 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgagtaaattactcatcaatcttcaaaggtaatctagaaaaaaccttaa 47187100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 197 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 28888760 - 28888582
Alignment:
Q  197 gacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactttctt 296  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  28888760 gacaactagggtactcatggaagaatggtggataatttatctcaatcaatacacattagccacataaacacatttttaagtggtatccatgaactatctt 28888661  T
Q  297 gaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 375  Q
    || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28888660 gatcccaccaacaaattgatcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaagttaatctagaaaaaa 28888582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 194 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 47317497 - 47317316
Alignment:
Q  194 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaacttt 293  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| |    
T  47317497 ggtgacaactagggtacccatagaagaatgatgagtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatacatgaactat 47317398  T
Q  294 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 375  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  47317397 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgaataaattacccaccattcttcaaaggtaatataaaaaaaa 47317316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 194 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 46784605 - 46784423
Alignment:
Q  194 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaacttt 293  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |    
T  46784605 ggtgacaattagggtacccatggaagaatgatgggtaatttactccaaccaatacacattagtcacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 46784506  T
Q  294 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaac 376  Q
    ||| ||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  46784505 ctttacttctccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcctcaaaggtaatctagaaaaaac 46784423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 222 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 31844530 - 31844374
Alignment:
Q  222 tggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactttcttgaccccaccaacaaattgctcattt 321  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  31844530 tggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgacctcaccaacaaattgctcattt 31844431  T
Q  322 tcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 378  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31844430 tcattggttggtgggtaaattatccaccattcctcaaaggtaatctagaaaaaacct 31844374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 207 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 42864034 - 42863867
Alignment:
Q  207 gtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactttcttgaccccacca 306  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  42864034 gtactcatggaagaatggtggataatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtagtatccatgaactatcttgaccccacca 42863935  T
Q  307 acaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaa 374  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  42863934 acaaatagctcattttcattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaaggtagtctagaaaaa 42863867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 194 - 377
Target Start/End: Original strand, 49398988 - 49399171
Alignment:
Q  194 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaacttt 293  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| |||| |    
T  49398988 ggtgacaactaggatacccatggaagaatagtgggtaatttaccccaaccaatagacattagccacataaacacatttttaagtggtatccataaactat 49399087  T
Q  294 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 377  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49399088 cttaactccaccaacaaattgctcattttcattgattggtggataaattacctaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 49399171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 239 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 25518951 - 25518815
Alignment:
Q  239 caaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactttcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggta 338  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25518951 caaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggta 25518852  T
Q  339 aattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 375  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25518851 aattacccaccatttttcaaaggtaatctagaaaaaa 25518815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 193 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 36003316 - 36003131
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatg---gaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaa 289  Q
    ||||||||||||||||||| |||   |||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  36003316 aggtgacaactagggtacctatgaaagaagaatggtgggtaatttatccgaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaa 36003217  T
Q  290 ctttcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 375  Q
    || ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  36003216 ctatcttgaccccaccagtaaattgctcattttcattgattggtgggtaaattactcaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaa 36003131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 193 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 48373678 - 48373500
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactt 292  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||         ||||| ||||||||||| ||||||||||||     
T  48373678 aggtgacaactaaggtatccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacat---------aagcacatttttaagtggtatccatgaacta 48373588  T
Q  293 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 380  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48373587 tcttgaccccaccaataaactgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 48373500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 193 - 377
Target Start/End: Original strand, 42313360 - 42313548
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactt 292  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||  |||||||     
T  42313360 aggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacatttttaagtggtattaatgaacta 42313459  T
Q  293 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac----ccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 377  Q
    ||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  42313460 tcttgactccaccaataaatttctcattttcattggttggtgggtaaattatatatccaccattcttcaaagataatctagaaaaaacc 42313548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 194 - 379
Target Start/End: Original strand, 27983603 - 27983772
Alignment:
Q  194 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaacttt 293  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||             
T  27983603 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaaatggtatcc--------- 27983693  T
Q  294 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 379  Q
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27983694 -------ccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 27983772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 193 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 33073383 - 33073204
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactt 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| || ||           ||||||||     
T  33073383 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatatacattagccacataagcacatatt-----------catgaacta 33073295  T
Q  293 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaaccttaaaa 383  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  33073294 tcttgaccccacctataaattgctcatattcattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatttagaaaaaaccttaaaa 33073204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 194 - 377
Target Start/End: Original strand, 41467632 - 41467804
Alignment:
Q  194 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaacttt 293  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||           |||||||| |    
T  41467632 ggtgacaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatatt-----------catgaactat 41467720  T
Q  294 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 377  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  41467721 cttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacc 41467804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 193 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 10928239 - 10928064
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactt 292  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||           ||||||||     
T  10928239 aggtgacaactagggtattcatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatatt-----------catgaacta 10928151  T
Q  293 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 379  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  10928150 tcttgaccccaccaataaattgttcatattcattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatttagaaaaaacctt 10928064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 194 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 2657474 - 2657300
Alignment:
Q  194 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaacttt 293  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||           |||||||| |    
T  2657474 ggtgacaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatatt-----------catgaactat 2657386  T
Q  294 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 379  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  2657385 cttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttaaaaaaaacctt 2657300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 194 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 2450676 - 2450529
Alignment:
Q  194 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaacttt 293  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||| |    
T  2450676 ggtgacaactaggatacccatggaagaatgataggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacatttttaagtggtatccatgaactat 2450577  T
Q  294 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaat 341  Q
    |||||  |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  2450576 cttgattccactaacaaattactcattttcattggttggtgggtaaat 2450529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 270 - 376
Target Start/End: Original strand, 51403083 - 51403189
Alignment:
Q  270 ttttaagtgatatccatgaactttcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctag 369  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51403083 ttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctag 51403182  T
Q  370 aaaaaac 376  Q
    |||||||    
T  51403183 aaaaaac 51403189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 195 - 376
Target Start/End: Original strand, 6626025 - 6626195
Alignment:
Q  195 gtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactttc 294  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||           |||||||| ||    
T  6626025 gtgacaactaggctacccatgaaagaatgatggataatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatatt-----------catgaactatc 6626113  T
Q  295 ttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaac 376  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6626114 ttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtggataaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaac 6626195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 193 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 29770842 - 29770664
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactt 292  Q
    ||||| |||||||| |||||||| || |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||           ||||||||     
T  29770842 aggtggcaactaggctacccatgaaaaaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatatt-----------catgaacta 29770754  T
Q  293 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaaccttaaa 382  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29770753 tcttgaccccacaaataaattgctcattttcattagttggtggataaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaaccttaaa 29770664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 193 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 26686028 - 26685855
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactt 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||           ||  |||||| ||| ||||||| ||||     
T  26686028 aggtgacaactagggtacccatggaaaaatggtgggtaatttacctcaaccaataaacatt-----------cacttttttaggtggtatccataaacta 26685940  T
Q  293 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 377  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26685939 tcttgaccctaccaataaattgctcattatgattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatctagaaaaaacc 26685855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 200 - 379
Target Start/End: Original strand, 26472185 - 26472353
Alignment:
Q  200 aactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactttcttgac 299  Q
    ||||||| |||||||| ||||||| || |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| || ||           |||||||| |||||||    
T  26472185 aactaggctacccatgaaagaatgatgagtaatttaccccaaccaagacacattagccacataagcacatatt-----------catgaactatcttgac 26472273  T
Q  300 cccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 379  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  26472274 cccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacctt 26472353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 193 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 42235011 - 42234836
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactt 292  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| || ||           ||||||||     
T  42235011 aggtgacaactaggctacccatgaaagaatgatggataatttacc-caaccaatacacattaaccacataagcacatatt-----------catgaacta 42234924  T
Q  293 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 380  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  42234923 tcttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtggataaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacctta 42234836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 197 - 374
Target Start/End: Original strand, 45475848 - 45476014
Alignment:
Q  197 gacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactttctt 296  Q
    |||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||| |||| ||||    
T  45475848 gacaactagggtacca--gaaagaatggtgggtaatttacc-caaccaatacacattagccacataagcacatttgtaagtggtatccatcaactatctt 45475944  T
Q  297 gaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaa 374  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||    
T  45475945 gaccccaccaataaattgctcattttcattgattggtgggta--------accattcttcaaaggtaatctagaaaaa 45476014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 194 - 335
Target Start/End: Original strand, 51045596 - 51045737
Alignment:
Q  194 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaacttt 293  Q
    ||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| |||| |    
T  51045596 ggtgacaactaggatacccgtagaagaatggtgggtaatttaccctaatcaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtattcataaactat 51045695  T
Q  294 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgg 335  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  51045696 cttgaccccaccaacaaattactcattttcattggttggtgg 51045737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 194 - 378
Target Start/End: Original strand, 30289910 - 30290083
Alignment:
Q  194 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaacttt 293  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||           |||||||| |    
T  30289910 ggtgacaactaaggtactcatggaagaatggtggataatttacctcaaccaatacacattaaccacataagcacatatt-----------catgaactat 30289998  T
Q  294 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 378  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||    
T  30289999 cttgactccaccaataaattgctcatattcactggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatttagaaaacacct 30290083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 193 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 4808828 - 4808699
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactt 292  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||     
T  4808828 aggtgacaactagggtatccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagtcacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 4808729  T
Q  293 tcttgaccccaccaacaaattgctcatttt 322  Q
    ||||||||| | ||| |||||| |||||||    
T  4808728 tcttgaccctatcaataaattgttcatttt 4808699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 257 - 374
Target Start/End: Original strand, 31979998 - 31980115
Alignment:
Q  257 cacataagcatatttttaagtgatatccatgaactttcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttc 356  Q
    |||||||| | ||||||||||| |||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31979998 cacataaggacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccctaacaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttc 31980097  T
Q  357 aaaggtaatctagaaaaa 374  Q
    ||||||||||||||||||    
T  31980098 aaaggtaatctagaaaaa 31980115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 193 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 2955027 - 2954848
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactt 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||| |  ||           |||||||||| ||||||| ||||     
T  2955027 aggtgacaactagggtacccatggaaaaatggtgggtaatttaccccaaccaataaacaatcacc-----------tttttaagtggtatccattaacta 2954939  T
Q  293 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaaccttaaaa 383  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2954938 tcttgaccccaccaataaattgctcattatgattgattggtgggtaaattacccaccatttgtcaaaggtaatctagaaaaaaccctaaaa 2954848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 194 - 383
Target Start/End: Original strand, 4243490 - 4243668
Alignment:
Q  194 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaacttt 293  Q
    ||||||||||||  |||||||| ||||||  ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| || ||           ||| |||| |    
T  4243490 ggtgacaactagactacccatgaaagaattatgggtaatttaccccatccaatacacattagccacataagcacatatt-----------cataaactat 4243578  T
Q  294 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaaccttaaaa 383  Q
    ||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  4243579 cttgaccccacaaataaattactcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattattcaaaggtaatttagaaaaaacctaaaaa 4243668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 257 - 379
Target Start/End: Original strand, 2556909 - 2557031
Alignment:
Q  257 cacataagcatatttttaagtgatatccatgaactttcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttc 356  Q
    ||||||| || ||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||||    
T  2556909 cacataaacacatttttaagtggtattcatgaactatcttgaccccaccaacagattgctcattttcattagttagtggataaattatccaccattcttc 2557008  T
Q  357 aaaggtaatctagaaaaaacctt 379  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  2557009 aaaggtaatctagaaaaaacctt 2557031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 194 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 1388644 - 1388476
Alignment:
Q  194 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaacttt 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||           |||||| ||| ||||||| |||| |    
T  1388644 ggtgacaactagggtacccatggaaaaatggtgggtaatttacctcaaccaataaacattcacc-----------tttttaggtggtatccataaactat 1388556  T
Q  294 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaa 373  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  1388555 cttgaccctaccaataaattgctcatcatgattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaatgtaatctagaaaa 1388476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 192 - 379
Target Start/End: Original strand, 5961265 - 5961441
Alignment:
Q  192 gaggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaact 291  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||  ||           |||||| ||| ||||||| ||||    
T  5961265 gaggtgacaactagggtacccatggaaaaatgatgggtaatttacctcaaccaataaacattcacc-----------tttttaggtggtatccataaact 5961353  T
Q  292 ttcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 379  Q
     |||||| |||||||| |||||||||||| | ||| |||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  5961354 atcttgatcccaccaataaattgctcattatgatttgttggtgggtaaattatccaccatttttcaaaagtaatctagaaaaaacctt 5961441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 194 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 33187505 - 33187337
Alignment:
Q  194 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaacttt 293  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||                 |||||||||||| |||| || |||| |    
T  33187505 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaataca-----------------tatttttaagtggtatctataaactat 33187423  T
Q  294 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 379  Q
    ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  33187422 cttgatccaaccaataaattgctcattttcattggttggtgtgtaaattatccaccattctttaaagataatctagaaaaaacctt 33187337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 193 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 4953224 - 4953053
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactt 292  Q
    ||||||||| |||| || ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| || ||           ||||||||     
T  4953224 aggtgacaattaggctatccatgaaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattaaccacataagcacatatt-----------catgaacta 4953136  T
Q  293 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 375  Q
    |||||| ||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  4953135 tcttgatcccacaaataaattgctcattttcattgattggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagagaaaa 4953053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 200 - 376
Target Start/End: Original strand, 34752320 - 34752485
Alignment:
Q  200 aactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactttcttgac 299  Q
    ||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| || ||           |||||||| |||| |     
T  34752320 aactaggttacccatgaaagaatgatgggtaatttactccaaccaatacacattagccacataagcacatatt-----------catgaactatcttaag 34752408  T
Q  300 cccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaac 376  Q
    ||||| || ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  34752409 cccacaaataaattgctcattttatttggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaac 34752485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 194 - 377
Target Start/End: Original strand, 38716247 - 38716419
Alignment:
Q  194 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaacttt 293  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||  ||           |||||| ||| ||||||| || | |    
T  38716247 ggtgacaacaagggtacccatggaaaaatggtgggtaatttaccccaaccaataaacattcacc-----------tttttaggtggtatccataaattat 38716335  T
Q  294 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 377  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||    
T  38716336 cttgaccccaccaataaattgctcattatgattggttggtgggtaaattacccaccattttttaaagataatctagaaaaaacc 38716419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 279 - 380
Target Start/End: Original strand, 13313248 - 13313351
Alignment:
Q  279 atatccatgaactttcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaagg--taatctagaaaaaac 376  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||    
T  13313248 atatccatgaactatcttaaccccaccaacaaattgttcattttcattggttggtgggtaaattacccacaattcttcaaaggtataatctagaaaaaac 13313347  T
Q  377 ctta 380  Q
    ||||    
T  13313348 ctta 13313351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 220 - 376
Target Start/End: Original strand, 13281588 - 13281733
Alignment:
Q  220 aatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactttcttgaccccaccaacaaattgctcat 319  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||           |||||||| | |||||||||| || |||||| ||||    
T  13281588 aatgatggataatttacctcaaccaatacacattagccacataagcacatatt-----------catgaactattttgaccccacaaataaattgttcat 13281676  T
Q  320 tttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaac 376  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13281677 tgtcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaac 13281733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 194 - 374
Target Start/End: Original strand, 41895164 - 41895333
Alignment:
Q  194 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaacttt 293  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||            |||| |||||||| |    
T  41895164 ggtgacaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttacaccaaccaatacacattagccacataagca-----------catattcatgaactat 41895252  T
Q  294 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaa 374  Q
    ||||||| ||| || |||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||    
T  41895253 cttgacctcacaaataaattgctaattgttattggttggtgggtaaattacccacaattctttaaaggtaatttagaaaaa 41895333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 279 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 32448745 - 32448650
Alignment:
Q  279 atatccatgaactttcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaa 374  Q
    |||| |||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  32448745 atattcatgaactatcttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttgatgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaa 32448650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 194 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 10920371 - 10920198
Alignment:
Q  194 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaacttt 293  Q
    ||||||||||| |||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||| |||||  ||           |||||| ||| ||||||| |||| |    
T  10920371 ggtgacaactaaggtatccatggaaaaatggtcggtaatttaccccaaccaataaacattcacc-----------tttttaggtggtatccataaactat 10920283  T
Q  294 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 378  Q
    |||||||||||||| ||||||  |||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  10920282 cttgaccccaccaataaattgtgcattatgattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaagataatctagaaaaaacct 10920198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 285 - 379
Target Start/End: Original strand, 24649802 - 24649896
Alignment:
Q  285 atgaactttcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 379  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24649802 atgaactatcttgaccccaccaataaataactcattttcattggttggtgggtaaattatccaccatttttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 24649896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 193 - 377
Target Start/End: Original strand, 51155589 - 51155761
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactt 292  Q
    |||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||| ||||||| || || ||           ||||||||     
T  51155589 aggtgacagctaaggtacc-atggaagaatggtgggtaatttaccctaatcaatacacattagtcacataaacacatatt-----------catgaacta 51155676  T
Q  293 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 377  Q
    ||||||| ||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||    
T  51155677 tcttgactccaccaataaattgttcatattcattggttggtgggtaaattacccatcatttttcaaaggtaatttagaaaaaacc 51155761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 193 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 4156577 - 4156438
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaact- 291  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||||| ||||     
T  4156577 aggtgacaactagagtacccatggaaaaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaatacatttttaagtggtatccataaacta 4156478  T
Q  292 ------ttcttgaccccaccaacaaattgctcattttcat 325  Q
           |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4156477 tattgagtcttgaccccaccaacaaattggtcattttcat 4156438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 194 - 287
Target Start/End: Original strand, 13312531 - 13312624
Alignment:
Q  194 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatg 287  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||    
T  13312531 ggtgacaactagggtacccatagaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatatacattagccacataagcacatatttaagtggtatccatg 13312624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 269 - 377
Target Start/End: Original strand, 27924722 - 27924830
Alignment:
Q  269 tttttaagtgatatccatgaactttcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatcta 368  Q
    |||||| ||| ||||||| |||| |||||| |||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  27924722 tttttaggtggtatccataaactatcttgatcccaccaataaattgctcattatgattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaagtaatcta 27924821  T
Q  369 gaaaaaacc 377  Q
    |||||||||    
T  27924822 gaaaaaacc 27924830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 279 - 375
Target Start/End: Original strand, 44544120 - 44544216
Alignment:
Q  279 atatccatgaactttcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 375  Q
    |||| |||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  44544120 atattcatgaactatcttgaccccacaaataaattgctcattttcattgattggtgggtaaattatccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaa 44544216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 194 - 364
Target Start/End: Original strand, 48683330 - 48683489
Alignment:
Q  194 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaacttt 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||| |||||           ||| |||||| ||| ||||||| |||| |    
T  48683330 ggtgacaactagggtacccatggaaaaatggtgggtaatttatcccaaccaataaacatt-----------catctttttaggtggtatccataaactat 48683418  T
Q  294 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 364  Q
    |||||| ||||||| |||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  48683419 cttgactccaccaataaattgttcattatgattggttggtgggtaaattacccaccattttttaaaggtaa 48683489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 194 - 375
Target Start/End: Original strand, 7561528 - 7561712
Alignment:
Q  194 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccaca--taagcatatttttaagtgatatccatgaact 291  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||  |||||| || || | |   |||  || |       
T  7561528 ggtgacaactagggtatccatggaagaatgatgggtaatttatcccaaccaatacacattagccccacgtaagcacatattcatgaactataaattatgg 7561627  T
Q  292 ttc-ttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 375  Q
     |  ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||    
T  7561628 gtaattgaccccaccaataaattgctcatattcattggttggtgggtaaattacctaccatttttcaaaggtaatttagaaaaaa 7561712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 279 - 376
Target Start/End: Original strand, 46428327 - 46428424
Alignment:
Q  279 atatccatgaactttcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaac 376  Q
    |||| |||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  46428327 atattcatgaactatcttgaccccatcaataaattgctcatattcattggttgctgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatttagaaaaaac 46428424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 194 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 52324110 - 52323936
Alignment:
Q  194 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaacttt 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||| ||||  |||||           ||  |||||| ||| ||| ||| || | |    
T  52324110 ggtgacaactagggtacccatggaagattggtgggtaatttactccaatcaatgaacattt----------cacctttttaggtggtattcataaattat 52324021  T
Q  294 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 378  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  52324020 cttgaccccaccaataaattgttcattatgattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatctaaaaaaaacct 52323936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 211 - 381
Target Start/End: Original strand, 35991616 - 35991774
Alignment:
Q  211 ccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactttcttgaccccaccaacaa 310  Q
    ||||| ||||||| | | ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||           |||||||| |||||||||||| || ||    
T  35991616 ccatgaaagaatgatagctaatttaccccaaccaatacatattagccacataagcatatatt-----------catgaactatcttgaccccacaaataa 35991704  T
Q  311 attgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaaccttaa 381  Q
    |||||||||||||| | |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  35991705 attgctcattttcaattgttggtggataaattacccacaattcttcaaaggtaattta-aaaaaaccttaa 35991774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 268 - 379
Target Start/End: Original strand, 39475846 - 39475956
Alignment:
Q  268 atttttaagtgatatccatgaactttcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatct 367  Q
    ||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||| ||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||    
T  39475846 atttttaggtggtatccataaactatcttgaccc-accaataaattgctcattatgattggttggtgggtaaattacccatcatttttcaaaggtactct 39475944  T
Q  368 agaaaaaacctt 379  Q
    ||||||||||||    
T  39475945 agaaaaaacctt 39475956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 286 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 39637986 - 39637899
Alignment:
Q  286 tgaactttcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 377  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  39637986 tgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcatttttattggt----gggtaaattacccaccattcttcataggtaatctagaaaaaacc 39637899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 193 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 52368055 - 52367882
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactt 292  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||| || || ||||| |||||  ||           |||||| ||| ||||||| ||||     
T  52368055 aggtgacaactagggtacctatggaaaaatgatgggtaatttatctaaatcaataaacattcacc-----------tttttaggtggtatccataaacta 52367967  T
Q  293 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 377  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||| ||||||||||    
T  52367966 tcttgaccctaccaataaattgctcattatgattggttggtgggtaaattacccacaattttttaaaggtaatccagaaaaaacc 52367882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #99
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 184 - 383
Target Start/End: Original strand, 44293445 - 44293633
Alignment:
Q  184 tttaaaaggaggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatc 283  Q
    |||||||  ||||| |||||||| || ||||| ||||||| || |||||||||| |||| |||| | |||||||||||||| | || ||               
T  44293445 tttaaaataaggtggcaactaggctatccatgaaagaatgatgagtaatttaccccaactaatatatattagccacataagtacatatt----------- 44293533  T
Q  284 catgaactttcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaaccttaaaa 383  Q
    |||||||| |||||||||||| || |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||| |  ||||||||||||||    
T  44293534 catgaactatcttgaccccacaaataaattgttcattttcattggttgatgggtaaattacctactattcttcaaaggtaattttaaaaaaaccttaaaa 44293633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #100
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 193 - 326
Target Start/End: Original strand, 47772171 - 47772304
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactt 292  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||| ||||||| ||||||| || |||||||| || |||  || ||||     
T  47772171 aggtgacaattaaggtacccatggaagaatggtgtgtaatttactccaaccaatatacattagtcacataaacacatttttaaatggtatatataaacta 47772270  T
Q  293 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcatt 326  Q
    | ||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  47772271 ttttgaccctaccaacaaattgcttattttcatt 47772304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #101
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 317 - 377
Target Start/End: Original strand, 4156188 - 4156248
Alignment:
Q  317 cattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 377  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4156188 cattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 4156248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #102
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 324 - 378
Target Start/End: Original strand, 10919313 - 10919367
Alignment:
Q  324 attggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 378  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  10919313 attggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaagataatctagaaaaaacct 10919367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #103
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 194 - 253
Target Start/End: Original strand, 31286504 - 31286563
Alignment:
Q  194 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacatt 253  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||| ||||||||| |||||    
T  31286504 ggtgacaactagggtacccatagaaaaatggtggataatttaccccaaccaataaacatt 31286563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #104
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 217 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 24215911 - 24215806
Alignment:
Q  217 aagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactttcttgaccccaccaacaaattgct 316  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||           |||| |||||||| |||||| || || || ||||||||    
T  24215911 aagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagtcacataaacat-----------atattcatgaactatcttgatcctacaaataaattgct 24215823  T
Q  317 cattttcattggttggt 333  Q
    |||||||||||||||||    
T  24215822 cattttcattggttggt 24215806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #105
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 193 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 31844856 - 31844818
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaa 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31844856 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaa 31844818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #106
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 197 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 32448807 - 32448754
Alignment:
Q  197 gacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacac 250  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  32448807 gacaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacac 32448754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #107
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 345 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 23994879 - 23994845
Alignment:
Q  345 ccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 379  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23994879 ccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 23994845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #108
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 194 - 266
Target Start/End: Original strand, 38718167 - 38718239
Alignment:
Q  194 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttac-ctcaaccaatacacattagccacataagca 266  Q
    ||||||||||||| |||| ||| ||||||| |||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  38718167 ggtgacaactaggctacc-atgaaagaatgatgggtaatttactcccaaccgatatacattagccacataagca 38718239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #109
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 335 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 12891440 - 12891393
Alignment:
Q  335 ggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaaccttaaaa 383  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||    
T  12891440 ggtaaattacccaccattctttaaaggtaatttag-aaaaaccttaaaa 12891393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #110
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 194 - 253
Target Start/End: Original strand, 24649732 - 24649791
Alignment:
Q  194 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacatt 253  Q
    |||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||| ||||| |||| |||||    
T  24649732 ggtgacaactagggtatccttgaaagaatggtggataatttacatcaactaataaacatt 24649791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #111
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 344 - 383
Target Start/End: Original strand, 36030736 - 36030775
Alignment:
Q  344 cccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaaccttaaaa 383  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  36030736 cccaccattctttaaaggtaatttagaaaaaaccttaaaa 36030775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #112
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 213 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 39359544 - 39359502
Alignment:
Q  213 atggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattag 255  Q
    |||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  39359544 atggaataattgtgggtaatttaccccaaccaatacacattag 39359502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #113
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 194 - 247
Target Start/End: Original strand, 39475783 - 39475836
Alignment:
Q  194 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaata 247  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||| ||||| ||||| | |||||||||    
T  39475783 ggtgacaactagggtacccatgaaaaaatgatgggttatttatcccaaccaata 39475836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #114
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 337 - 377
Target Start/End: Original strand, 31286607 - 31286647
Alignment:
Q  337 taaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 377  Q
    |||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||    
T  31286607 taaattacccaccattttttaaaagtaatctagaaaaaacc 31286647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #115
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 347 - 375
Target Start/End: Original strand, 47772306 - 47772334
Alignment:
Q  347 accattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 375  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  47772306 accattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 47772334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 169; Significance: 2e-90; HSPs: 1)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 193 - 377
Target Start/End: Original strand, 13761 - 13945
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactt 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||     
T  13761 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 13860  T
Q  293 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 377  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13861 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 13945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 169; Significance: 2e-90; HSPs: 46)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 193 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 5882689 - 5882505
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactt 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||     
T  5882689 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 5882590  T
Q  293 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 377  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5882589 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 5882505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 194 - 381
Target Start/End: Original strand, 22551061 - 22551248
Alignment:
Q  194 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaacttt 293  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||| |    
T  22551061 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaggtggtatccatgaactat 22551160  T
Q  294 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaaccttaa 381  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22551161 cttgatcccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaaccttaa 22551248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 198 - 378
Target Start/End: Original strand, 14891383 - 14891563
Alignment:
Q  198 acaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactttcttg 297  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  14891383 acaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttg 14891482  T
Q  298 accccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 378  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14891483 accccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggcaatctagaaaaaacct 14891563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 193 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 24168274 - 24168090
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactt 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||     
T  24168274 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 24168175  T
Q  293 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 377  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24168174 tcttgaccccaccaacaaattgctcatttttattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 24168090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 193 - 377
Target Start/End: Original strand, 26377203 - 26377387
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactt 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||     
T  26377203 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 26377302  T
Q  293 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 377  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  26377303 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaagataatttagaaaaaacc 26377387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 194 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 8615422 - 8615237
Alignment:
Q  194 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaacttt 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |    
T  8615422 ggtgacaactagggtacccatggaagaatagtgggtaatttaccctaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 8615323  T
Q  294 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 379  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8615322 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttgatgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 8615237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 194 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 28947269 - 28947085
Alignment:
Q  194 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaacttt 293  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||| | |    
T  28947269 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataaacacatttttaagtggtatacatgaattat 28947170  T
Q  294 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 378  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28947169 cttgaccccaccaacaaattgttcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 28947085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 196 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 2892368 - 2892189
Alignment:
Q  196 tgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactttct 295  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||    
T  2892368 tgacaactagggtacccatagaagaatggtggataatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatct 2892269  T
Q  296 tgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2892268 tgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 2892189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 193 - 363
Target Start/End: Original strand, 11988973 - 11989143
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactt 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  11988973 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtggtatccatgaacta 11989072  T
Q  293 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggta 363  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11989073 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttagtgggtaaattacccaccattcttcaaaggta 11989143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 193 - 382
Target Start/End: Original strand, 34527861 - 34528050
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactt 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||| |     
T  34527861 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagtcacataagcacatttttaagtggtatccatgaatta 34527960  T
Q  293 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaaccttaaa 382  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  34527961 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatctaaaaaaaaccataaa 34528050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 188 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 1970899 - 1970703
Alignment:
Q  188 aaaggaggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatg 287  Q
    |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  1970899 aaagtaggtgacaactaaagtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagtcacataagcacatttttaagtgatattcatg 1970800  T
Q  288 aactttcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaaccttaaaag 384  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1970799 aactatcttgaccccaccaacaaattgtttattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctttaaag 1970703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 194 - 373
Target Start/End: Original strand, 18101495 - 18101674
Alignment:
Q  194 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaacttt 293  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |    
T  18101495 ggtgacaactaggatacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 18101594  T
Q  294 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaa 373  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18101595 tttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaa 18101674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 193 - 379
Target Start/End: Original strand, 7393585 - 7393771
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactt 292  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||     
T  7393585 aggtgacaattatggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacatattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 7393684  T
Q  293 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 379  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  7393685 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattactcaccattctttaaaggtaatctagaaaaaacctt 7393771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 195 - 377
Target Start/End: Original strand, 19281056 - 19281238
Alignment:
Q  195 gtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactttc 294  Q
    |||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  19281056 gtgacaactaggctacctatgaaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatattcatgaactatc 19281155  T
Q  295 ttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 377  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19281156 ttgaccccaccaacaaattgctcatttttattggttggtgggcaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 19281238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 193 - 378
Target Start/End: Original strand, 19415532 - 19415717
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactt 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||     
T  19415532 aggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttactccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgagcta 19415631  T
Q  293 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 378  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19415632 tcttgaccccaccaacaaattggtcattttcattagttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 19415717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 194 - 376
Target Start/End: Original strand, 959904 - 960086
Alignment:
Q  194 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaacttt 293  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||| ||||| | |    
T  959904 ggtgacaactagggtacccatgaaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacatttttaagtggtatctatgaattat 960003  T
Q  294 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaac 376  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  960004 cttgaccccaccaacaaattgctcatttccattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaac 960086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 193 - 378
Target Start/End: Original strand, 2593851 - 2594036
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactt 292  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||     
T  2593851 aggtgacaactagggtacctatggaagaatggtggataatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 2593950  T
Q  293 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 378  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2593951 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattatccacaattcttcaaagataatctagaaaaaacct 2594036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 196 - 377
Target Start/End: Original strand, 7345114 - 7345295
Alignment:
Q  196 tgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactttct 295  Q
    ||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | |    
T  7345114 tgacaactaaggtagacatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactattt 7345213  T
Q  296 tgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 377  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7345214 tgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccactattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 7345295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 194 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 600074 - 599890
Alignment:
Q  194 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaacttt 293  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| | ||||||||||| ||||| ||||||| || ||||||||||| |||||||||||| |    
T  600074 ggtgacaactagggtacccatgaaagaatggtggataatttatcccaaccaatacaaattagtcacataaacacatttttaagtggtatccatgaactat 599975  T
Q  294 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 378  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  599974 cttgaccccaccaacaaattgttcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 599890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 193 - 377
Target Start/End: Original strand, 10507907 - 10508091
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactt 292  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||     
T  10507907 aggtgacaactagggtagccatcgaagaatggtgggtagtttaccccaaccaatacacattagccacgtaagcacatttttaagtggtatccatgaacta 10508006  T
Q  293 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 377  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10508007 tcttgaccccaccaacaaattgctcattatcattggttggtggataaattacccaccattcttcaaagataatctagaaaaaacc 10508091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 203 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 16703539 - 16703363
Alignment:
Q  203 tagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactttcttgacccc 302  Q
    |||| |||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  16703539 taggatacccatggaagaatgatgcgtaatttaccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccataaactatcttgacccc 16703440  T
Q  303 accaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 379  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16703439 accaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 16703363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 193 - 382
Target Start/End: Original strand, 5294800 - 5294989
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactt 292  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||     
T  5294800 aggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgagtaatttacctcaatcaatatacattagtcacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 5294899  T
Q  293 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaaccttaaa 382  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  5294900 tcttgatcccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattatccactattcttcaaaagtaatctagaaaaaatcttaaa 5294989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 193 - 382
Target Start/End: Original strand, 5299352 - 5299541
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactt 292  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||     
T  5299352 aggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgagtaatttacctcaatcaatatacattagtcacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 5299451  T
Q  293 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaaccttaaa 382  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  5299452 tcttgatcccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattatccactattcttcaaaagtaatctagaaaaaatcttaaa 5299541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 193 - 363
Target Start/End: Original strand, 22341787 - 22341959
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactt 292  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||     
T  22341787 aggtgacaactaaggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 22341886  T
Q  293 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggt--tggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggta 363  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22341887 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttgtgttgggtaaattacccaccattcttcaaaggta 22341959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 194 - 376
Target Start/End: Original strand, 24224070 - 24224253
Alignment:
Q  194 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaacttt 293  Q
    ||||||||||||| ||| |||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |    
T  24224070 ggtgacaactaggatactcatgaaagaatagtaggtaatttacctcaaccaatacacattagtcacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 24224169  T
Q  294 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggt-aatctagaaaaaac 376  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24224170 cttgaccctaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaaatctagaaaaaac 24224253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 194 - 375
Target Start/End: Original strand, 33452572 - 33452753
Alignment:
Q  194 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaacttt 293  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||| |    
T  33452572 ggtgacaactaggatacccatggaagaatggtgagtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagtacatttttaagtggtatccatgaactat 33452671  T
Q  294 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 375  Q
    |||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  33452672 cttgaccccaacaacaaattattcattttcattggttggtggataaattacccaccattcttcaaagataatctagaaaaaa 33452753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 193 - 375
Target Start/End: Original strand, 30743447 - 30743629
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactt 292  Q
    |||||| || ||||||| ||||| ||||||||| ||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||     
T  30743447 aggtgataattagggtatccatgaaagaatggtaggtaatttatcccaaccaatacatattagccacataagcacatttttaagtggtatccataaacta 30743546  T
Q  293 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 375  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30743547 tcttgatctcaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 30743629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 247 - 377
Target Start/End: Original strand, 30467656 - 30467786
Alignment:
Q  247 acacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactttcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattaccc 346  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  30467656 acacattagccacataagcacatgtttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattgtttggtgggtaaattaccc 30467755  T
Q  347 accattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 377  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30467756 accattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 30467786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 194 - 379
Target Start/End: Original strand, 28948845 - 28949019
Alignment:
Q  194 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaacttt 293  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||           |||||| | |    
T  28948845 ggtgacaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcatatatt-----------catgaattat 28948933  T
Q  294 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 379  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28948934 cttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacctt 28949019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 193 - 344
Target Start/End: Original strand, 23261928 - 23262079
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactt 292  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||||||| |||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  23261928 aggtgacaactagggtacctatgaaagaacggtggataatttaccccaaccaatacatattaacctcataagcacatttttaagtgatatccatgaacta 23262027  T
Q  293 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 344  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23262028 tcttaaccccatcaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 23262079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 201 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 13329545 - 13329378
Alignment:
Q  201 actagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactttcttgacc 300  Q
    |||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||           |||||| |||| |||    
T  13329545 actaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatattta-----------tgaactatcttaacc 13329457  T
Q  301 ccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 379  Q
    |||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13329456 ccacaaataaattgttcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacctt 13329378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 194 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 7167753 - 7167580
Alignment:
Q  194 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaacttt 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||  ||           |||||| ||| ||||||| |||| |    
T  7167753 ggtgacaactagggtacccatggaaaaatggtgggtaatttaccccaaccaataaacattcacc-----------tttttaggtggtatccataaactat 7167665  T
Q  294 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 378  Q
    ||||||||||| || |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7167664 cttgaccccactaataaattgctcattatgattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatctagaaaaaacct 7167580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 193 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 15965605 - 15965432
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactt 292  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || ||           |||||| |     
T  15965605 aggtgacaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacatatt-----------catgaagta 15965517  T
Q  293 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 377  Q
    |||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  15965516 tcttaaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaagataatttagaaaaaacc 15965432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 193 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 3291180 - 3291009
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactt 292  Q
    ||||||||| |||| || ||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| || ||||           ||||||     
T  3291180 aggtgacaattaggctatccatgaaagaatgatgggtaatttacctcaatcaatacatattagccacataagcacatattta-----------tgaacta 3291092  T
Q  293 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 375  Q
    |||| ||||||| || |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  3291091 tcttaaccccacaaataaattgttcattttaattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaa 3291009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 294 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 929741 - 929657
Alignment:
Q  294 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 378  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  929741 cttgaccccaccaacaaattgttcattttcattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 929657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 194 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 4487698 - 4487528
Alignment:
Q  194 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaacttt 293  Q
    |||| |||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || | || ||           |||||||| |    
T  4487698 ggtggcaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacatgagtacatatt-----------catgaactat 4487610  T
Q  294 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 375  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| || ||||||    
T  4487609 cttgaccccacaaataaattgctcattttcattagttggtgggtaaattacccaccattcttcataggaaatttaaaaaaaa 4487528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 194 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 1398724 - 1398545
Alignment:
Q  194 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaacttt 293  Q
    ||||||||||||| |||| ||| |||||||  |||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||| || ||           ||| |||| |    
T  1398724 ggtgacaactaggctacctatgaaagaatgacgggtaatttactccaaccaatacatattagccacataagcacatatt-----------catcaactat 1398636  T
Q  294 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaaccttaaaag 384  Q
    ||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||| |||||||||||| |||||    
T  1398635 cttgacctcacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattatccaccatttttcaaagataatttagaaaaaacctaaaaag 1398545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 194 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 3786920 - 3786749
Alignment:
Q  194 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaacttt 293  Q
    |||| |||||||| |||||||| ||||||| ||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| || ||           |||||||| |    
T  3786920 ggtggcaactaggctacccatgaaagaatgatggataatttaccccaactaatacacattagccacataagcacatatt-----------catgaactat 3786832  T
Q  294 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaac 376  Q
     |||||||||| || |||||  |||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  3786831 attgaccccacaaataaattcttcattttcattgattggtaggtaaattatccaccattcttcaaaagtaatttagaaaaaac 3786749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 288 - 379
Target Start/End: Original strand, 375807 - 375898
Alignment:
Q  288 aactttcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 379  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||| |||| | ||| |||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||    
T  375807 aactatcttgaccccaccaataaattgcgcattatgattagttggtaggtaaattacccaccatttttcaaaagtaatctaaaaaaaacctt 375898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 279 - 370
Target Start/End: Original strand, 1939578 - 1939669
Alignment:
Q  279 atatccatgaactttcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctaga 370  Q
    ||||||||||| | |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||    
T  1939578 atatccatgaattatcttgaccccacaaataaattgctcattttcattggtttataggtaaattatccaccattcttcaaagataatttaga 1939669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 320 - 382
Target Start/End: Original strand, 11743070 - 11743132
Alignment:
Q  320 tttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaaccttaaa 382  Q
    |||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11743070 tttcattgattgatggataaattacccaccattcttcaagggtaatctagaaaaaaccttaaa 11743132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 194 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 18661905 - 18661833
Alignment:
Q  194 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagca 266  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| ||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18661905 ggtgacaactaggctacccatgaaagaatgatggataatttatcccaaccaatacatattagccacataagca 18661833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 193 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 34262402 - 34262342
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacatt 253  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||| |||||    
T  34262402 aggtgacaactagggtacccatggaaaaatggtgggtaatttatcacaaccaataaacatt 34262342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 193 - 266
Target Start/End: Original strand, 24913095 - 24913168
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagca 266  Q
    |||||||||||| | ||| |||| ||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24913095 aggtgacaactaagctactcatgaaagaatgatgagtaatttaccccaaccaatacatattagccacataagca 24913168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 196 - 253
Target Start/End: Original strand, 375729 - 375786
Alignment:
Q  196 tgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacatt 253  Q
    |||||| || ||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| |||||    
T  375729 tgacaattaaggtacccatggaaaaatggtggataatttaccccaaccaataaacatt 375786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 285 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 13844927 - 13844847
Alignment:
Q  285 atgaactttcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaat 365  Q
    ||||||| | ||||| ||| ||| |||||| ||||||||||| ||| |||| ||| ||| |||||||| ||||||||||||    
T  13844927 atgaactattttgactccatcaataaattgttcattttcatttgttagtggttaagttaaccaccatttttcaaaggtaat 13844847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 167; Significance: 3e-89; HSPs: 132)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 194 - 376
Target Start/End: Original strand, 18462013 - 18462195
Alignment:
Q  194 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaacttt 293  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  18462013 ggtgacaactagggtacccatagaagaatggtgggtgatttacctcaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 18462112  T
Q  294 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaac 376  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18462113 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaac 18462195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 193 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 34276730 - 34276547
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactt 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||     
T  34276730 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 34276631  T
Q  293 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaac 376  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  34276630 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaac 34276547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 194 - 377
Target Start/End: Original strand, 53854430 - 53854612
Alignment:
Q  194 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaacttt 293  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |    
T  53854430 ggtgacaactagggtacc-atggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 53854528  T
Q  294 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 377  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53854529 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 53854612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 193 - 379
Target Start/End: Original strand, 2826681 - 2826866
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactt 292  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  2826681 aggtgacaactagggtacc-atggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtggtatccatgaacta 2826779  T
Q  293 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 379  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2826780 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaagggaatctagaaaaaacctt 2826866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 193 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 237660 - 237475
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactt 292  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||     
T  237660 aggtgataactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgttatccatgaacta 237561  T
Q  293 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 378  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  237560 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattctttaaaggtaatctagaaaaaacct 237475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 194 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 9798647 - 9798458
Alignment:
Q  194 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaacttt 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |    
T  9798647 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccctaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 9798548  T
Q  294 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaaccttaaaa 383  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  9798547 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctaaaaaaaaccataaaa 9798458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 194 - 379
Target Start/End: Original strand, 21366609 - 21366794
Alignment:
Q  194 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaacttt 293  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |    
T  21366609 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtggataatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 21366708  T
Q  294 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 379  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21366709 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaccctt 21366794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 194 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 23437774 - 23437590
Alignment:
Q  194 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaacttt 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||| |    
T  23437774 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgagtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacatttttaagtggtatccatgaactat 23437675  T
Q  294 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 378  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23437674 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 23437590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 195 - 378
Target Start/End: Original strand, 32366661 - 32366844
Alignment:
Q  195 gtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactttc 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||    
T  32366661 gtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccacaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatc 32366760  T
Q  295 ttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 378  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  32366761 ttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgagtaaattacccaccattcttcaaagataatctagaaaaaacct 32366844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 193 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 42085390 - 42085204
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactt 292  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||     
T  42085390 aggtgacaactatggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaatcaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 42085291  T
Q  293 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 379  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  42085290 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattctttaaaggtaatctagaaaaaacctt 42085204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 194 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 44984943 - 44984754
Alignment:
Q  194 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaacttt 293  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |    
T  44984943 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 44984844  T
Q  294 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaaccttaaaa 383  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  44984843 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatttagaaaaacccttaaaa 44984754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 194 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 47344838 - 47344653
Alignment:
Q  194 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaacttt 293  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |    
T  47344838 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgaataatttaccccaaccaatacacattagccacataaacatatttttaagtggtatccatgaactat 47344739  T
Q  294 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 379  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47344738 cttgaccccaccaacaaattgttcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 47344653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 195 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 6020109 - 6019929
Alignment:
Q  195 gtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactttc 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |     
T  6020109 gtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatatacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatt 6020010  T
Q  295 ttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 375  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6020009 ttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 6019929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 194 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 51363188 - 51363001
Alignment:
Q  194 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaacttt 293  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |    
T  51363188 ggtgacaactagggtacc-atggaagaatggtgggtaatttactccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 51363090  T
Q  294 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaaccttaaa 382  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51363089 cttgactccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaaccttaaa 51363001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 194 - 380
Target Start/End: Original strand, 31532135 - 31532321
Alignment:
Q  194 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaacttt 293  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |    
T  31532135 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccctaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 31532234  T
Q  294 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 380  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31532235 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtaggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 31532321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 193 - 379
Target Start/End: Original strand, 53461815 - 53462001
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactt 292  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||     
T  53461815 aggtgacaactagggtacccatgaaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 53461914  T
Q  293 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 379  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  53461915 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaatttacccaccattcttcataggtaatttagaaaaaacctt 53462001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 193 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 39077728 - 39077543
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactt 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||     
T  39077728 aggtgacaactagggtacccatggaagaatgttgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacatttttaagtggtatccatgaacta 39077629  T
Q  293 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 378  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39077628 tcttaaccccaccaacaaattgctcattttcattagttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 39077543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 194 - 379
Target Start/End: Original strand, 54574940 - 54575125
Alignment:
Q  194 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaacttt 293  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |    
T  54574940 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattaaccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 54575039  T
Q  294 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 379  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  54575040 cttgaccccaccaccaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttctaagataatctagaaaaaacctt 54575125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 194 - 382
Target Start/End: Original strand, 26091258 - 26091446
Alignment:
Q  194 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaacttt 293  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||| |    
T  26091258 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttactccaaccaatacacattagccacataaacacatttttaagtggtatccatgaactat 26091357  T
Q  294 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaaccttaaa 382  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||    
T  26091358 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttccaagataatttagaaaaaaccttaaa 26091446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 193 - 376
Target Start/End: Original strand, 146428 - 146611
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactt 292  Q
    ||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||     
T  146428 aggtgacaactagagtacgcatagaagaatggtgggtaatttaccacaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 146527  T
Q  293 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaac 376  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  146528 tcttgaccccaccaacaaattgttcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaac 146611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 196 - 379
Target Start/End: Original strand, 41702461 - 41702644
Alignment:
Q  196 tgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactttct 295  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||    
T  41702461 tgacaactagggtatccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatct 41702560  T
Q  296 tgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 379  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41702561 taaccccaccaacaaattgttcattttcattggttggtgggtaagttacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 41702644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 193 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 3170809 - 3170623
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactt 292  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||     
T  3170809 aggtgacaactagagtatccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatattcatgaacta 3170710  T
Q  293 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 379  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3170709 tcttgaccccaccaacaaattgttcatttttattggttggtgggtaaattacacaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 3170623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 193 - 375
Target Start/End: Original strand, 22618513 - 22618693
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactt 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||     
T  22618513 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacct-aaccaatacatattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 22618611  T
Q  293 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 375  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22618612 tcttgaccc-accaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 22618693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 194 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 29478542 - 29478357
Alignment:
Q  194 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaacttt 293  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |    
T  29478542 ggtgacaactagggtacctatggaagaatggtgggtaatttaccccaactaatacacattagccatataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 29478443  T
Q  294 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 379  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29478442 cttgaccccaccaacaaattgttcattttcattggttagtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 29478357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 193 - 377
Target Start/End: Original strand, 42765841 - 42766024
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactt 292  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||| |||||||     
T  42765841 aggtgacaactaaggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacattagcacatttttaagtggtatc-atgaacta 42765939  T
Q  293 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 377  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42765940 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 42766024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 193 - 377
Target Start/End: Original strand, 43471694 - 43471878
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactt 292  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||     
T  43471694 aggtgacaactagggtatccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataatcacatttttaagtggtatccatgaacta 43471793  T
Q  293 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 377  Q
    |||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43471794 tcttgaccacaccaataaattgttcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 43471878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 193 - 377
Target Start/End: Original strand, 55056258 - 55056442
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactt 292  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||     
T  55056258 aggtgacaacaagggtacccatgaaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagtcacataagcacatttttaagttgtatccatgaacta 55056357  T
Q  293 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 377  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55056358 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtggataaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 55056442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 194 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 54608144 - 54607961
Alignment:
Q  194 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaacttt 293  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |    
T  54608144 ggtgactactagggtatccatggaagaatgatggataatttaccccaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtggtatacatgaactat 54608045  T
Q  294 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 377  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  54608044 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaagtaatctagaaaaaacc 54607961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 194 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 41949566 - 41949381
Alignment:
Q  194 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacata--agcatatttttaagtgatatccatgaact 291  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  41949566 ggtgacaactagggtacctatgaaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacatataagcacatttttaagtggtatccatgaact 41949467  T
Q  292 ttcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 377  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41949466 atcttgaccccaccaacaaattgctcatttttattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 41949381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 196 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 397582 - 397401
Alignment:
Q  196 tgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactttct 295  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||| |||||||||||| |||    
T  397582 tgacaactagggtatccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagtcacataaacacatttttaagtggtatccatgaactatct 397483  T
Q  296 tgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 377  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  397482 tgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttagtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctaaaaaaaacc 397401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 193 - 378
Target Start/End: Original strand, 19387687 - 19387872
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactt 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||      
T  19387687 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattaaccacataagcacatttttaagtggtatccatgaacaa 19387786  T
Q  293 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 378  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  19387787 tcttgaccccaccaacaaatttctcattttcattggttgatgggtaaattacccaccatttttcaaacgtaatctagaaaaaacct 19387872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 194 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 42222473 - 42222292
Alignment:
Q  194 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaacttt 293  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||| |    
T  42222473 ggtgacaactagggtacccataaaagaatggtgtgtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatcaatgaactat 42222374  T
Q  294 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 375  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42222373 cttgaccccaccaataaattgttcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 42222292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 196 - 377
Target Start/End: Original strand, 50457812 - 50457993
Alignment:
Q  196 tgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactttct 295  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||    
T  50457812 tgacaactagggtacccatggaagaatggtgtataatttacctcaaccaatacacattagcaacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatct 50457911  T
Q  296 tgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 377  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50457912 tgatcccaccaacaaattgctcattttcattgattggtggataaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 50457993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 194 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 23609269 - 23609081
Alignment:
Q  194 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaacttt 293  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||| |    
T  23609269 ggtgacaaatagggtacccatggaagaatggtgagtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccgtgaactat 23609170  T
Q  294 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaaccttaaa 382  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  23609169 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcgttgattggtgggtaaattacccactattcttcaaagataatctagaaaaaaccataaa 23609081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 193 - 377
Target Start/End: Original strand, 31070073 - 31070256
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactt 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| |||| |||||||     
T  31070073 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagtcacatgagcacatttttaagtggtatc-atgaacta 31070171  T
Q  293 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 377  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31070172 tcttgactccaccagcaaattgctcattttcattggttggtggataaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 31070256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 194 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 407934 - 407753
Alignment:
Q  194 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaacttt 293  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |    
T  407934 ggtgacaactagggtacccatgaaagaatggtggataatt-accccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtg-tatccatgaactat 407837  T
Q  294 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 377  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  407836 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattactcaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 407753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 197 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 6285486 - 6285307
Alignment:
Q  197 gacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactttctt 296  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | ||    
T  6285486 gacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagtcacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatttt 6285387  T
Q  297 gaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaac 376  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6285386 gaccccaccaataaattgctcatttttattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatatagaaaaaac 6285307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 194 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 27373257 - 27373075
Alignment:
Q  194 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaacttt 293  Q
    |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||| |    
T  27373257 ggtgacaattagagtacc-atggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatctatgaactat 27373159  T
Q  294 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 377  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27373158 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattctttaaaggtaatctagaaaaaacc 27373075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 193 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 38591847 - 38591667
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactt 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    | || ||||||||||||     
T  38591847 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcacatt----aatggtatccatgaacta 38591752  T
Q  293 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 377  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  38591751 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgagtaaattacccaccattcttcaaatgtaatctagaaaaaacc 38591667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 193 - 380
Target Start/End: Original strand, 47662101 - 47662288
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactt 292  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||     
T  47662101 aggtgacaactagggtacccatagaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtggtatccattaacta 47662200  T
Q  293 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 380  Q
    | ||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  47662201 tattgacaccactaacaaattactcattttcattggttggtgggtaaattatccaccattattcaaaggtaatctagaaaaaacctta 47662288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 193 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 31914380 - 31914196
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactt 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||     
T  31914380 aggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagcc-cataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 31914282  T
Q  293 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 378  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  31914281 tcttgaccccaccaacaaattgctcagtttcattggttggtgggtaaattatccacaattcttcaaaggtaatctaaaaaaaacct 31914196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 194 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 42033357 - 42033172
Alignment:
Q  194 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaacttt 293  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| || ||||||||||| |||||||||||| |    
T  42033357 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttatctcaaccaatatacattagctacataaacacatttttaagtggtatccatgaactat 42033258  T
Q  294 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 379  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  42033257 cttgactccaccaacaaattgctcattttaattagttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctaaaaaaaacctt 42033172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 193 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 45797662 - 45797477
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactt 292  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||     
T  45797662 aggtgacaactagggtacctatggaagaatggtaggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagtacatttttaagtggtatccatgaacta 45797563  T
Q  293 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 378  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  45797562 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattgattggtgggtaaattacccaccattcttcaaagataatctaaaaaaaacct 45797477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 193 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 55776227 - 55776043
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactt 292  Q
    ||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||     
T  55776227 aggtgacaactagggtacttatgaaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 55776128  T
Q  293 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 378  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  55776127 tcttga-cccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaagataatctaaaaaaaacct 55776043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 193 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 55840405 - 55840221
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactt 292  Q
    ||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||     
T  55840405 aggtgacaactagggtacttatgaaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 55840306  T
Q  293 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 378  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  55840305 tcttga-cccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaagataatctaaaaaaaacct 55840221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 193 - 377
Target Start/End: Original strand, 29777256 - 29777440
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactt 292  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| | ||||     
T  29777256 aggtgacaattagggtatccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatatacattagccacataagcacatttttaagtggtatccgtaaacta 29777355  T
Q  293 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 377  Q
    ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29777356 tctcgaccccaccaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 29777440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 194 - 373
Target Start/End: Original strand, 31972336 - 31972515
Alignment:
Q  194 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaacttt 293  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| |    
T  31972336 ggtgacaattagggtacccatgaaagaatggtgggtaatttaccccaatcaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtattcatgaactat 31972435  T
Q  294 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaa 373  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  31972436 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttgatgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatctagaaaa 31972515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 194 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 41560510 - 41560327
Alignment:
Q  194 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaacttt 293  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |    
T  41560510 ggtgacagctagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacatattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 41560411  T
Q  294 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 377  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  41560410 cttgatcccaccaacaaattgctcatttttattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaaggtaatttaaaaaaaacc 41560327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 194 - 378
Target Start/End: Original strand, 49881059 - 49881247
Alignment:
Q  194 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctc----aaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaa 289  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||    
T  49881059 ggtgacaactagagtacccatggaagaatggtgggtaatttatcccgcccaaccaatacacattagccacataaacacatttttaagtggtatccatgaa 49881158  T
Q  290 ctttcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 378  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49881159 ctatcttgactccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 49881247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 194 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 55520009 - 55519826
Alignment:
Q  194 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaacttt 293  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |    
T  55520009 ggtgacaactaggatacccatggaagaatggtgggtaatttaccacaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 55519910  T
Q  294 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 377  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  55519909 cttgatcccaccaaaaaattgctcattttcattagttggtggataaattatccaccattcttcaaaagtaatctagaaaaaacc 55519826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 193 - 378
Target Start/End: Original strand, 14017375 - 14017558
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactt 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||  ||||| ||||||||||||     
T  14017375 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggcaggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataaacacactt--aagtggtatccatgaacta 14017472  T
Q  293 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 378  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14017473 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcgttggttagtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 14017558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 198 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 35446683 - 35446506
Alignment:
Q  198 acaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactttcttg 297  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  35446683 acaactagggtacccatggaagaatggtggataatttaccccaaccaatacacattagccaaataagcacatttttaagtgatatccatgaactatcttg 35446584  T
Q  298 accccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaac 376  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  35446583 accccatcaacaaattgctcattttcattggtcggt-ggtaaattacccaccattcttaaaaggtaatctagaaaaaac 35446506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 193 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 50234183 - 50233997
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactt 292  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||     
T  50234183 aggtgacaactagggtatccatagaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccattaacta 50234084  T
Q  293 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 379  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50234083 tcttgatcccaccaacaaatttctcattttcattggttggtggataaattatccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 50233997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 194 - 383
Target Start/End: Original strand, 41632007 - 41632195
Alignment:
Q  194 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaacttt 293  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||| |    
T  41632007 ggtgacaactaggatacccatgaaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacatattagccatataagtacatttttaagcgatatccatgaactat 41632106  T
Q  294 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaaccttaaaa 383  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41632107 cttgaccc-accaacaaattgctcattttcattggttgatgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaaccttaaaa 41632195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 193 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 2243641 - 2243457
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactt 292  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||||||||||  | ||||||||||| ||||||||||||     
T  2243641 aggtgacaactagggtacccatagaagaatggtgggtaatttactccaactaatacacataagccacataaatacatttttaagtggtatccatgaacta 2243542  T
Q  293 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 377  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2243541 tcttgacccgaccaacaaattgctcattttcattggttggtggataaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 2243457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 193 - 377
Target Start/End: Original strand, 3692209 - 3692393
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactt 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||| || ||||     
T  3692209 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccctaaccaatacacattagccacataaacacatttttaagtggtatcaataaacta 3692308  T
Q  293 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 377  Q
    |||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3692309 tcttaatcccaccaacaaattactcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattattcaaaggtaatctagaaaaaacc 3692393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 194 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 48313737 - 48313551
Alignment:
Q  194 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaacttt 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||| | |||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |    
T  48313737 ggtgacaactagggtacccatggaaaaatggtgggtaatttaccctaaccaatatatattagctacataagcatatttt-aagtggtatccatgaactat 48313639  T
Q  294 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaaccttaaa 382  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  48313638 cttgaccc-accaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaaccctaaa 48313551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 198 - 382
Target Start/End: Original strand, 50536628 - 50536812
Alignment:
Q  198 acaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactttcttg 297  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| |||||    
T  50536628 acaactagggtacccatagaagaatggtgggtaatttaccccaactaatacacattagtcacataaacatatttttaagtggtatccattaactatcttg 50536727  T
Q  298 accccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaaccttaaa 382  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  50536728 accccaccaacaaatttctcattttcatcggttggtgggtaaattacccactattcttcaaaggtaatctaaaaaaaaccttaaa 50536812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 212 - 375
Target Start/End: Original strand, 22468788 - 22468951
Alignment:
Q  212 catggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactttcttgaccccaccaacaaa 311  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||| |||||| ||||||||||||    
T  22468788 catggaaaaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataaacatatttttaagtggtatctatgaactatcttgatcccaccaacaaa 22468887  T
Q  312 ttgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 375  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22468888 ttgctcattttcattggttggtggataaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 22468951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 194 - 377
Target Start/End: Original strand, 56022998 - 56023181
Alignment:
Q  194 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaacttt 293  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||| ||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |    
T  56022998 ggtgacaactagggtacccatgaaaaaatgatggataatttaccccaaccaatacacattaaccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 56023097  T
Q  294 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 377  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  56023098 cttgaccccactaacaaattggtcattttcattggttggtgggtaaattacccactattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 56023181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 198 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 50534809 - 50534632
Alignment:
Q  198 acaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactttcttg 297  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  50534809 acaactaaggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattaaccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttg 50534710  T
Q  298 accccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 375  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  50534709 accccaccaataaattgctcatttttattgattggtgggtaagttacccaccattcttcaaaggtaatctaaaaaaaa 50534632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 194 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 54086590 - 54086407
Alignment:
Q  194 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaacttt 293  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||| |    
T  54086590 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatgcacattagccacataagcacatttttaagcggtatccatgaactat 54086491  T
Q  294 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 379  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  54086490 cttga-cccaccaacaaattactcattttcattggttggtggataaattatccaccattcttcaaa-gtaatctagaaaaaacctt 54086407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 195 - 375
Target Start/End: Original strand, 53834055 - 53834235
Alignment:
Q  195 gtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactttc 294  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||    
T  53834055 gtgacaactagggtatccatggaagaatggtgggtaatttacttcaatcaatatacattagtcacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatc 53834154  T
Q  295 ttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 375  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  53834155 ttgaccgcaccaacaaattgctcattttcattgattgttgggtaaattacccaccattcttcaaaagtaatctagaaaaaa 53834235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 203 - 381
Target Start/End: Original strand, 33897504 - 33897681
Alignment:
Q  203 tagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactttcttgacccc 302  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||   |||  ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  33897504 tagggtacctatagaagaatggtgggtaatttattccaattaatacacattagccatataatcatatttttaagtggtatccatgaactatcttgacccc 33897603  T
Q  303 accaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaaccttaa 381  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  33897604 accaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatcta-aaaaaaccttaa 33897681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 193 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 48658001 - 48657826
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactt 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||     
T  48658001 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtggataatttaccccaaccaatacacattagtcacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 48657902  T
Q  293 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaa 374  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||      |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  48657901 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattagttggtggg------acccaccattcttcaaaggtaatctaaaaaaa 48657826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 194 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 54425163 - 54424980
Alignment:
Q  194 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaacttt 293  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||| |||| ||||||| |    
T  54425163 ggtgacaactagtgtacc-atggaagaatcgtgggtaatttaccccaaccaatagacattagtcacataagcacatttttaagtggtatctatgaactat 54425065  T
Q  294 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 378  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||    
T  54425064 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggtcggtgggtaaattacccaccattcttcatagggaatctagataaaacct 54424980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 193 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 1932946 - 1932762
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactt 292  Q
    |||||| |||||||||||||||| || |||| ||| ||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||     
T  1932946 aggtgataactagggtacccatgaaaaaatgatggataatttatcccaaccaatatacattagccacataagcacatttttaagtggtatctatgaacta 1932847  T
Q  293 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 377  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1932846 tcttgaccccactaacaaattggtcattttcattggttggtgggtaaattacctactattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 1932762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 211 - 377
Target Start/End: Original strand, 39587796 - 39587962
Alignment:
Q  211 ccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactttcttgaccccaccaacaa 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||  | ||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  39587796 ccatggaagaatggtgggtaatttaccctaaccaatatacattagttatataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaacaa 39587895  T
Q  311 attgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 377  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  39587896 attgctcatattcattggttggtaggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 39587962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 194 - 379
Target Start/End: Original strand, 54805614 - 54805803
Alignment:
Q  194 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataag----catatttttaagtgatatccatgaa 289  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||| || |||||||| | |||||||||||||||||||||||||     || ||||||||||| |||| |||||    
T  54805614 ggtgacatctagggtacccatggaacaatgatgagtaatttatcccaaccaatacacattagccacataaataaacacatttttaagtggtatctatgaa 54805713  T
Q  290 ctttcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 379  Q
    || |||| | ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54805714 ctatcttaatcccaccaacaaattgttcattttcattgattggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 54805803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 193 - 375
Target Start/End: Original strand, 48259511 - 48259691
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactt 292  Q
    |||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||  || ||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||     
T  48259511 aggtgataagtagggtacc-atggaagaatggtgggtaatttaccctaatcaatacatattagccacataagcacatttt-aagtggtattcatgaacta 48259608  T
Q  293 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 375  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  48259609 tcttgactccaccaactaattgctcatttttattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaagggtaatctagaaaaaa 48259691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 194 - 336
Target Start/End: Original strand, 52728307 - 52728448
Alignment:
Q  194 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaacttt 293  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| |    
T  52728307 ggtgacaactagggtacc-atggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacgcattagtcacataagcacatttttaagtggtattcatgaactat 52728405  T
Q  294 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtggg 336  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52728406 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtggg 52728448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 193 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 48655003 - 48654815
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacat------tagccacataagcatatttttaagtgatatccat 286  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||      |||||||||||| | ||||||||||| |||| ||    
T  48655003 aggtgacaattagggtagccatggaagaatggtaggtaatttaccccaaccaatacacatacacattagccacataagtacatttttaagtggtatctat 48654904  T
Q  287 gaactttcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 375  Q
     |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  48654903 caactatcttgactccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattatccaccatttttcaaaggtaatctaaaaaaaa 48654815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 193 - 377
Target Start/End: Original strand, 36532829 - 36533003
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactt 292  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||     
T  36532829 aggtgacaactaggatacccatggaagaatggtgggtaatttaccataaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 36532928  T
Q  293 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 377  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||     ||||      |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  36532929 tcttgaccccaccaacaaattgctcatt----gtggt------gtaaattacccatcattcttcaaaggtaatttagaaaaaacc 36533003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 196 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 51951861 - 51951678
Alignment:
Q  196 tgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactttct 295  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||    
T  51951861 tgacaattagggtatccatggaagaatggtgggtaatttaca-caaccaatatacattagccacataagcacatttttaactgatatccatgaactatct 51951763  T
Q  296 tgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 380  Q
    |||| |||  ||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  51951762 tgactccattaacaaattgttcattttcattgattggtggataaattactcatcattcttcaaaagtaatctagaaaaaatctta 51951678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 173 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 49014290 - 49014089
Alignment:
Q  173 agaaaacgatatttaaaaggaggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttt 272  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | || ||    
T  49014290 agaaaacaatatttaaaaggtggtgacaactaggctacccatgaaagaatgatgagtaatttacctcaatcaatacacattagccacataagtacatatt 49014191  T
Q  273 taagtgatatccatgaactttcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaa 372  Q
               |||||||| |||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||    
T  49014190 -----------catgaactatcttgaccccacaaataaattactcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtgatttaaaaa 49014102  T
Q  373 aaaccttaaaagg 385  Q
    |||||||||||||    
T  49014101 aaaccttaaaagg 49014089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 188 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 54715212 - 54715035
Alignment:
Q  188 aaaggaggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatg 287  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||           ||||    
T  54715212 aaagaaggtgataactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaactaatacacattagccacataagcacatatt-----------catg 54715124  T
Q  288 aactttcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaac 376  Q
    |||| | ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  54715123 aactatgttgaccccaccaataaattgctcatattcattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatttagaaaaaac 54715035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 194 - 377
Target Start/End: Original strand, 9997931 - 9998103
Alignment:
Q  194 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaacttt 293  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||            |||| |||||||| |    
T  9997931 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagca-----------catattcatgaactat 9998019  T
Q  294 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 377  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  9998020 cttgatcccaccaataaattactcatattcattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatttagaaaaaacc 9998103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 194 - 379
Target Start/End: Original strand, 45633779 - 45633953
Alignment:
Q  194 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaacttt 293  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||           |||||||| |    
T  45633779 ggtgacaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatatt-----------catgaactat 45633867  T
Q  294 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 379  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  45633868 cttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttaaaaaaaacctt 45633953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 193 - 382
Target Start/End: Original strand, 37239089 - 37239267
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactt 292  Q
    ||||| |||||||| |||||||| ||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||           ||||||||     
T  37239089 aggtggcaactaggctacccatgaaagaatgatggataatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatatt-----------catgaacta 37239177  T
Q  293 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaaccttaaa 382  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  37239178 tcttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtggataaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaaccttaaa 37239267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 193 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 43891100 - 43890929
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactt 292  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||           ||||||||     
T  43891100 aggtgacaactatggtatccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatatt-----------catgaacta 43891012  T
Q  293 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 375  Q
    | ||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  43891011 tattgactccaccaataaattgctcatattcattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatttagaaaaaa 43890929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 194 - 382
Target Start/End: Original strand, 15060289 - 15060466
Alignment:
Q  194 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaacttt 293  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||| || ||           |||||||| |    
T  15060289 ggtgacaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttatcccaaccaatacacattggccacataagcacatatt-----------catgaactat 15060377  T
Q  294 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaaccttaaa 382  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  15060378 cttgaccccacaaataaattgctcattttcattgattggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaaccataaa 15060466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 194 - 376
Target Start/End: Original strand, 5117438 - 5117609
Alignment:
Q  194 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaacttt 293  Q
    ||||||||||||  || ||||  ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||           |||||||| |    
T  5117438 ggtgacaactagactatccattaaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatatt-----------catgaactat 5117526  T
Q  294 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaac 376  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5117527 cttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaac 5117609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 194 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 34552490 - 34552318
Alignment:
Q  194 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaacttt 293  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||| || ||           |||||||| |    
T  34552490 ggtgacaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttactccaaccaatacacattagccgcataagcacatatt-----------catgaactat 34552402  T
Q  294 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 377  Q
    |||||| |||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  34552401 cttgacaccataaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacc 34552318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 194 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 52688520 - 52688348
Alignment:
Q  194 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaacttt 293  Q
    |||| |||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||           |||||||| |    
T  52688520 ggtggcaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcatatatt-----------catgaactat 52688432  T
Q  294 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 377  Q
     |||| ||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  52688431 tttgatcccacaaataaattgctcattttcattgattggtgggtaaattacccaccattcttctaaggtaatttagaaaaaacc 52688348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 193 - 375
Target Start/End: Original strand, 20351841 - 20352012
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactt 292  Q
    |||||||||||||  |||||||| ||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| || ||           ||||||||     
T  20351841 aggtgacaactagactacccatgaaagaatgatgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatatt-----------catgaacta 20351929  T
Q  293 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 375  Q
    |||||| ||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20351930 tcttgatcccacaaataaattgttcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaa 20352012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 193 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 34835349 - 34835174
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactt 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||  ||           ||||||  || ||| ||| ||||     
T  34835349 aggtgacaactagggtacccatggaaaaatggtgggtaatttaccccaaccaataaacattcacc-----------tttttagatggtattcataaacta 34835261  T
Q  293 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 379  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  34835260 tcttgaccccaccaataaattgctcattatgattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 34835174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 194 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 22620764 - 22620590
Alignment:
Q  194 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaacttt 293  Q
    |||| |||||||| |||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| || ||           |||||||| |    
T  22620764 ggtggcaactaggctacccataaaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatatacattagccacataagcacatatt-----------catgaactat 22620676  T
Q  294 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 379  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  22620675 cttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccatcattcttcaaagataatttagaaaaaacctt 22620590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 196 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 54216482 - 54216308
Alignment:
Q  196 tgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactttct 295  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||| | | ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| || ||           |||||||| |||    
T  54216482 tgacaactaggttacccatgaaagaatgatcgataatttaccccaaccaatacacattagcaacataagcacatatt-----------catgaactatct 54216394  T
Q  296 tgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaaccttaa 381  Q
    ||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  54216393 tgatcccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaaccttaa 54216308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 193 - 377
Target Start/End: Original strand, 31881313 - 31881486
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactt 292  Q
    ||||| |||||||| |||||||| ||||||| ||  |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| || ||           ||||||||     
T  31881313 aggtggcaactaggctacccatgaaagaatgatgaataatttaccctaaccaatacacattagccacataagcacatatt-----------catgaacta 31881401  T
Q  293 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 377  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  31881402 tcttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcataggtaatttagaaaaaacc 31881486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 193 - 377
Target Start/End: Original strand, 38547600 - 38547773
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactt 292  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||  ||           |||||| ||| ||||||| ||||     
T  38547600 aggtgacaactagggtacccatagaaaaatggtgggtaatttaccccaaccaataaacattcacc-----------tttttaggtggtatccataaacta 38547688  T
Q  293 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 377  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  38547689 tcttgaccccaccaataaattgctcattatgattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatctaaaaaaaacc 38547773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 193 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 46720200 - 46720024
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactt 292  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||       |||  ||  |||||| ||| ||||||| ||||     
T  46720200 aggtaacaactagggtacccatggaaaaatggtgggtaatttacctcaaccaataaacat-------atat-cacctttttaggtggtatccataaacta 46720109  T
Q  293 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 377  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  46720108 tcttgaccccatcaataaattgctcattatgattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaagttaatctagaaaaaacc 46720024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 194 - 378
Target Start/End: Original strand, 54216736 - 54216909
Alignment:
Q  194 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaacttt 293  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||  |||||||||| || ||           |||||||| |    
T  54216736 ggtgataactagggtatccatggaagaatggagggtaatttatcccaaccaatacacattaatcacataagcacatatt-----------catgaactat 54216824  T
Q  294 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 378  Q
    |||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  54216825 cttgaccccaccaataaattgttcatattcattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatttagaaaaaacct 54216909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 193 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 47812078 - 47811906
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactt 292  Q
    ||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||           ||||||||     
T  47812078 aggtgacaattagggtatccatagaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatatt-----------catgaacta 47811990  T
Q  293 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaac 376  Q
    ||||||| | | ||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  47811989 tcttgactcaatcaataaattgctcatattcattggttgatgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatttagaaaaaac 47811906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 11 - 137
Target Start/End: Original strand, 40491650 - 40491776
Alignment:
Q  11 attatcaatcatgtgtgtggggtattttggaataatgaaagtaggtgtnnnnnnnnntagatgttggcttatttatatagtgggaacaatattaaggaat 110  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40491650 attatcaatcatgtgtgtgggttattttggaataatgaaaggaggtataaaaaaaaatagatgttggcttatttatatagtgggaacaatattaaggaat 40491749  T
Q  111 tagtgtaaatacaagctagtttaatta 137  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||    
T  40491750 tagtgtaaatacaagctagtgtaatta 40491776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 192 - 377
Target Start/End: Original strand, 46708739 - 46708913
Alignment:
Q  192 gaggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaact 291  Q
    ||||||||||||||| || | ||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| || ||           ||||||||    
T  46708739 gaggtgacaactaggctatcaatgaaagaatgatgggtgatttaccccaaccaatacacattagtcacataagcacatatt-----------catgaact 46708827  T
Q  292 ttcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 377  Q
     |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  46708828 atcttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttgatgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaataacc 46708913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 193 - 377
Target Start/End: Original strand, 4486580 - 4486753
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactt 292  Q
    |||||||||||||  || | ||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||           |||||| |     
T  4486580 aggtgacaactagactatctatgaaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatatt-----------catgaatta 4486668  T
Q  293 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 377  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||    
T  4486669 tcttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccgttcttcaaagataatttagaaaaaacc 4486753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 194 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 35595869 - 35595772
Alignment:
Q  194 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaact 291  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  35595869 ggtgacaactagggtacctatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaact 35595772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 193 - 375
Target Start/End: Original strand, 14335100 - 14335271
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactt 292  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||   ||||  ||           |||||| ||| |||| |||||||     
T  14335100 aggtgacaactagagtacccatgaaagaatggtgggtaatttacctcaaacaatgagcattcacc-----------tttttaggtggtatctatgaacta 14335188  T
Q  293 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 375  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14335189 tcttgaccctaccaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacctaccatttttcaaaggtaatctagaaaaaa 14335271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 193 - 377
Target Start/End: Original strand, 27873549 - 27873720
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactt 292  Q
    |||||||||||||| ||||||   ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||           ||||||||     
T  27873549 aggtgacaactaggctacccaa--aagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatatt-----------catgaacta 27873635  T
Q  293 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 377  Q
    |||| ||||||| || ||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27873636 tcttaaccccacaaataaattactcattttcattgattggtggataaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacc 27873720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 187 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 52461541 - 52461365
Alignment:
Q  187 aaaaggaggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccat 286  Q
    |||| |||||| |||||||| || ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||           |||    
T  52461541 aaaaagaggtggcaactaggctatccatgaaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatatt-----------cat 52461453  T
Q  287 gaactttcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 377  Q
    ||||| |||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||   |||||||||||| |||||||||||    
T  52461452 gaactatcttgaccccacaaataaattgctcatttttattggttggtgggtaaattacacacca---ttcaaaggtaatttagaaaaaacc 52461365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 198 - 377
Target Start/End: Original strand, 27398607 - 27398775
Alignment:
Q  198 acaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactttcttg 297  Q
    |||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| ||||||||| |||||  |           ||||||||||| ||||||| |||| |||||    
T  27398607 acaactagggtaccaatgaaaaaatggtgggtaatttaccccaaccaataaacatttac-----------atttttaagtggtatccataaactatcttg 27398695  T
Q  298 accccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 377  Q
    |||||||||| ||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  27398696 accccaccaataaattgcgcattatgattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaagtaatctagaaaaaacc 27398775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 193 - 377
Target Start/End: Original strand, 1662260 - 1662431
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactt 292  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||| ||||||||  ||||             || |||||| ||| ||||||| ||||     
T  1662260 aggtgacaactagggtacctatggaagaatgatgagtaatttaccccaaccaatgaacat-------------atctttttaggtggtatccataaacta 1662346  T
Q  293 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 377  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1662347 tcttgaccccaccaataaattgctcattatgattggttggtaggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatctagaaaaaacc 1662431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 279 - 383
Target Start/End: Original strand, 11972203 - 11972307
Alignment:
Q  279 atatccatgaactttcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 378  Q
    |||| |||||||| |||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  11972203 atattcatgaactatcttgaccccacaaataaattgttcattttcattggttggtgagtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacct 11972302  T
Q  379 taaaa 383  Q
    |||||    
T  11972303 taaaa 11972307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 193 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 27580291 - 27580120
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactt 292  Q
    ||||||||| || | ||||||||||| |||| ||| ||||||||| ||||||||| |||||           ||| |||||| ||| ||||||| ||||     
T  27580291 aggtgacaaataagatacccatggaaaaatgatggataatttaccccaaccaataaacatt-----------catctttttaggtggtatccataaacta 27580203  T
Q  293 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 375  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27580202 tcttgaccccaccaataaattgctcattatgattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatctagaaaaaa 27580120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 279 - 381
Target Start/End: Original strand, 3293097 - 3293199
Alignment:
Q  279 atatccatgaactttcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 378  Q
    |||| |||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  3293097 atattcatgaactatcttgaccccacaaataaattgctcattttcattgattggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatttagaaaaaacct 3293196  T
Q  379 taa 381  Q
    |||    
T  3293197 taa 3293199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 293 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 42557665 - 42557583
Alignment:
Q  293 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 375  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42557665 tcttgaccccaccaacaaattactcatttttattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 42557583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 194 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 33289873 - 33289702
Alignment:
Q  194 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaacttt 293  Q
    |||||||| |||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  | ||           |||||||| |    
T  33289873 ggtgacaa-taggctacccatgaaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacgtatt-----------catgaactat 33289786  T
Q  294 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 377  Q
    ||||| || || || |||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  33289785 cttgatcctacaaataaattgctcattttcattagttggtggataaattatccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacc 33289702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 194 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 42509478 - 42509351
Alignment:
Q  194 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaacttt 293  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |  |||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||| |||||||||||| |    
T  42509478 ggtgataactagggtactcatggaagaatggtggataatttatcctaaccaatacacattagtcacataaacacatttttaagtggtatccatgaactat 42509379  T
Q  294 cttgaccccaccaacaaattgctcattt 321  Q
     ||||||||||||| |||||| ||||||    
T  42509378 tttgaccccaccaataaattggtcattt 42509351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 239 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 52396864 - 52396774
Alignment:
Q  239 caaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactttc-ttgaccccaccaacaaattgctcattttcattgg 328  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52396864 caaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtggtatccatgaactatctttaaccccaccaacaaattgctcattttcattgg 52396774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 193 - 376
Target Start/End: Original strand, 6371248 - 6371420
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactt 292  Q
    ||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| ||||||||| |||||  ||           |||||| ||| || || | || |     
T  6371248 aggtgacaactagggtacctatgaaaaaatggtgggtaatttaccccaaccaataaacattcacc-----------tttttaggtggtaaccctaaatta 6371336  T
Q  293 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaac 376  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  6371337 tcttgaccccaccaataaattgctcattataattggttggtgggtaaattacccactatttttcaaaggtaatctagaaaaaac 6371420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 195 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 33049062 - 33048991
Alignment:
Q  195 gtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagca 266  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  33049062 gtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagca 33048991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #112
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 194 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 573974 - 573802
Alignment:
Q  194 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaacttt 293  Q
    |||||||||||| |||| ||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||           ||  |||||| ||| ||||||| |||| |    
T  573974 ggtgacaactagtgtactcatggaaaaatagtgggtaatttaccccaaccaataaacatt-----------cacttttttaggtggtatccataaactat 573886  T
Q  294 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 377  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||| | |||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||    
T  573885 cttgaccccaccaataaattgttcattatgattggttggtaggtaaattacccaccattttttaaaggtaatctagaaacaacc 573802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #113
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 280 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 43231598 - 43231502
Alignment:
Q  280 tatccatgaactttcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 377  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  43231598 tatccataaactatcttgaccccaccaataaattgctcatttttattggttgatggataaattacccaccattcttcaaa-gtaatctagaaaaaacc 43231502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #114
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 195 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 35344968 - 35344868
Alignment:
Q  195 gtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactttc 294  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||| ||    
T  35344968 gtgacaactaggatacctatggaagaatggtggataatttacca-aaccaatacacattagccacataagcacattttcaagtggtatccatgaactatc 35344870  T
Q  295 tt 296  Q
    ||    
T  35344869 tt 35344868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #115
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 212 - 375
Target Start/End: Original strand, 33557960 - 33558112
Alignment:
Q  212 catggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactttcttgaccccaccaacaaa 311  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||  |||          |||| |||||||| ||||||||| || || |||    
T  33557960 catgaaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacatattagccacataa--atac---------atattcatgaactatcttgaccctacaaataaa 33558048  T
Q  312 ttgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 375  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  33558049 ttcctcattttcattggttggtggataaattatccaccattcttcaaagataatttagaaaaaa 33558112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #116
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 193 - 271
Target Start/End: Original strand, 48259703 - 48259780
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatattt 271  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  48259703 aggtgacaactagggtacc-atggaagaatggtgggtaatttaccccaatcaatacatattagccacataagcacattt 48259780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #117
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 325 - 378
Target Start/End: Original strand, 17555617 - 17555670
Alignment:
Q  325 ttggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 378  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17555617 ttggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 17555670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #118
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 270 - 375
Target Start/End: Original strand, 49057933 - 49058038
Alignment:
Q  270 ttttaagtgatatccatgaactttcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctag 369  Q
    |||||| || |||| ||||||| | || ||| || ||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  49057933 ttttaaatggtatctatgaactattttaacctcatcaataaattattcattttcattggttggtgggtaaattactcaccattctttaaaggtaatctag 49058032  T
Q  370 aaaaaa 375  Q
    ||||||    
T  49058033 aaaaaa 49058038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #119
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 194 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 27872750 - 27872607
Alignment:
Q  194 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaacttt 293  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||           ||  |||||| ||| ||||||| |||| |    
T  27872750 ggtgacaactacggtacccatggaaaaatggtgggtaatttaccccaaccaataaacatt-----------cacctttttaggtggtatccataaactat 27872662  T
Q  294 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccac 348  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||    
T  27872661 cttgatcccactaataaattgctcattatgattggttggtgggtaaattatccac 27872607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #120
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 194 - 365
Target Start/End: Original strand, 18206512 - 18206682
Alignment:
Q  194 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaacttt 293  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||  |||||||||  |||||   |||||     || ||||| ||| |||||||||||| |    
T  18206512 ggtgacaactaaggtacccatggaaaaatgatgggtaatttatttcaaccaatgaacatt---cacatttt--taattttaggtggtatccatgaactat 18206606  T
Q  294 ----cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaat 365  Q
        |||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||   ||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  18206607 atatcttgaccccaccaataaattgttcattttcattgattgagaggtaaattacccaccgttcttcaaaagtaat 18206682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #121
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 378 - 422
Target Start/End: Original strand, 40491774 - 40491818
Alignment:
Q  378 ttaaaaggatgaaagtggatgtaaattaatgaggtgagtgtaaac 422  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40491774 ttaaaaggatgaaagtggatgtaaattaatgaggtgagtgtaaac 40491818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #122
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 193 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 42558368 - 42558300
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacat 261  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||  || |||||||||||||||||||    
T  42558368 aggtgacaactaagatacccatggaagaatggtggataatttaccctaatcaatacacattagccacat 42558300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #123
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 194 - 339
Target Start/End: Original strand, 51981479 - 51981613
Alignment:
Q  194 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaacttt 293  Q
    ||||| ||||||  |||| ||| ||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||            |||| |||||||| |    
T  51981479 ggtgataactagtctaccaatgaaagaatgatgagtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagca-----------catattcatgaactat 51981567  T
Q  294 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaa 339  Q
    ||| | ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  51981568 cttaatcccacaaataaattgctcatttttattggttggtgggtaa 51981613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #124
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 193 - 262
Target Start/End: Original strand, 3291804 - 3291873
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacata 262  Q
    ||||||||| |||| || ||||| ||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3291804 aggtgacaattaggctatccatgaaagaatgatgagtaatttaccccaaccaatacacattagccacata 3291873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #125
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 103 - 186
Target Start/End: Original strand, 47786250 - 47786332
Alignment:
Q  103 taaggaattagtgtaaatacaagctagtttaattacatgttttttagttgcaagtcggaacaaacttttaagaaaacgatattt 186  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||   | || |||||||||||||||  |||| ||||||    
T  47786250 taaggaattagtgtaaatacaagctagtgcaattacatgttttctagtataaggt-ggaacaaacttttaaagaaacaatattt 47786332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #126
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 91 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 4901416 - 4901370
Alignment:
Q  91 tgggaacaatattaaggaattagtgtaaatacaagctagtttaatta 137  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  4901416 tgggaagaatattaaggaattagtgtaaatacaagttagtgtaatta 4901370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #127
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 288 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 43478147 - 43478059
Alignment:
Q  288 aactttcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 377  Q
    |||| |||||||| ||| || ||||||||||||| ||||||||| | | |||||||||||   |||||  || |||||||||||||||||    
T  43478147 aactatcttgaccacactaataaattgctcattt-cattggttgatcgataaattacccatggttctttgaaagtaatctagaaaaaacc 43478059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #128
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 217 - 258
Target Start/End: Original strand, 47105046 - 47105087
Alignment:
Q  217 aagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagcca 258  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  47105046 aagaaaggtgggtaatttacctcaaccattaaacattagcca 47105087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #129
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 313 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 16738621 - 16738569
Alignment:
Q  313 tgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaat 365  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||| |  |||||||||    
T  16738621 tgctcattttcattagttcgtgggtaagttacccaccattttataaaggtaat 16738569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #130
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 329 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 35195125 - 35195077
Alignment:
Q  329 ttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 377  Q
    |||||||||||  || ||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  35195125 ttggtgggtaaggtagccaccattctttaaatgtaatctagaaaaaacc 35195077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #131
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 386 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 42885053 - 42885017
Alignment:
Q  386 atgaaagtggatgtaaattaatgaggtgagtgtaaac 422  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  42885053 atgaaagtgggtgtaaattagtgaggtgagtgtaaac 42885017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #132
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 337 - 377
Target Start/End: Original strand, 47105318 - 47105358
Alignment:
Q  337 taaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 377  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||    
T  47105318 taaattacccaccattctttaaagataatctaaaaaaaacc 47105358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 165; Significance: 4e-88; HSPs: 88)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 193 - 377
Target Start/End: Original strand, 27651033 - 27651217
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactt 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||     
T  27651033 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 27651132  T
Q  293 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 377  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27651133 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattgggcggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 27651217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 194 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 746647 - 746464
Alignment:
Q  194 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaacttt 293  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||| |    
T  746647 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatctatgaactat 746548  T
Q  294 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 377  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  746547 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 746464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 193 - 379
Target Start/End: Original strand, 6594457 - 6594643
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactt 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||     
T  6594457 aggtgacaactagggtacccatggaaaaatggtgggtaatttaccccaaccaatatacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 6594556  T
Q  293 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 379  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6594557 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 6594643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 193 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 17601018 - 17600832
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactt 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||     
T  17601018 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 17600919  T
Q  293 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 379  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17600918 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttgatgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 17600832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 197 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 10424773 - 10424592
Alignment:
Q  197 gacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactttctt 296  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  10424773 gacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacatattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatctt 10424674  T
Q  297 gaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 378  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10424673 gaccccaccaacaaattgttcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 10424592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 194 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 23901960 - 23901775
Alignment:
Q  194 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaacttt 293  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |    
T  23901960 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtggataatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 23901861  T
Q  294 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 379  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23901860 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaccctt 23901775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 193 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 4034774 - 4034590
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactt 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||     
T  4034774 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 4034675  T
Q  293 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 377  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4034674 tcttaaccccaccaacaaattgttcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 4034590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 194 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 45371171 - 45370988
Alignment:
Q  194 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaacttt 293  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |    
T  45371171 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 45371072  T
Q  294 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 377  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45371071 cttgaccccgccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 45370988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 194 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 26710526 - 26710340
Alignment:
Q  194 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaacttt 293  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |    
T  26710526 ggtgacaactagggtacccatgaaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacatcagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 26710427  T
Q  294 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 380  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26710426 cttgaccccaccaacaaaatgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 26710340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 194 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 38997282 - 38997100
Alignment:
Q  194 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaacttt 293  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |    
T  38997282 ggtgacaactagggtatccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatagacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 38997183  T
Q  294 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaac 376  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38997182 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaac 38997100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 193 - 377
Target Start/End: Original strand, 2324888 - 2325072
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactt 292  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||     
T  2324888 aggtgacaactagggtattcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 2324987  T
Q  293 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 377  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2324988 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 2325072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 194 - 378
Target Start/End: Original strand, 13815218 - 13815402
Alignment:
Q  194 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaacttt 293  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |    
T  13815218 ggtgacaactagggtacccatgaaagaaaggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagtcacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 13815317  T
Q  294 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 378  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13815318 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 13815402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 193 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 40635400 - 40635216
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactt 292  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||     
T  40635400 aggtgacaactagggtacccatgaaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 40635301  T
Q  293 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 377  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  40635300 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaatttacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacc 40635216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 194 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 11185153 - 11184970
Alignment:
Q  194 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaacttt 293  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |    
T  11185153 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagtcatataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 11185054  T
Q  294 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 377  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11185053 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacctaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 11184970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 193 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 14660628 - 14660445
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactt 292  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||     
T  14660628 aggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttacaccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 14660529  T
Q  293 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaac 376  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14660528 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggcaatctagaaaaaac 14660445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 193 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 34518549 - 34518366
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactt 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||     
T  34518549 aggtgacaactagggtacccatggaagaatagtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 34518450  T
Q  293 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaac 376  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  34518449 tcttgatcccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctaaaaaaaac 34518366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 200 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 6430648 - 6430471
Alignment:
Q  200 aactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactttcttgac 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  6430648 aactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacatattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgac 6430549  T
Q  300 cccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 377  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6430548 cccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcgaaggtaatctagaaaaaacc 6430471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 194 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 27400584 - 27400399
Alignment:
Q  194 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaacttt 293  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||| |||||||||||| |    
T  27400584 ggtgacaactagggtacccatgaaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagctacataagtacatttttaagtggtatccatgaactat 27400485  T
Q  294 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 379  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27400484 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtggataaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 27400399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 194 - 377
Target Start/End: Original strand, 10244582 - 10244765
Alignment:
Q  194 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaacttt 293  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |    
T  10244582 ggtgacaactagggtacctatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatatacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 10244681  T
Q  294 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 377  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10244682 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctaaaaaaaacc 10244765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 193 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 27024597 - 27024413
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactt 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||     
T  27024597 aggtgacaactagggtacccatggaagaataatgggtaatttaccccaaccaatacacattagtcacataatcatatttttaagtggtatccatgaacta 27024498  T
Q  293 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 377  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27024497 tcttgaccccaccaataaattgctcattttcattggtttgtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 27024413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 183 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 32327553 - 32327351
Alignment:
Q  183 atttaaaaggaggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatat 282  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  32327553 atttaaaagatggtgacaactagggtacctatggaagaatgatggataatttaccctaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtat 32327454  T
Q  283 ccatgaactttcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaa-aaaaccttaa 381  Q
    | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  32327453 ctatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggctggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaaaccttaa 32327354  T
Q  382 aag 384  Q
    |||    
T  32327353 aag 32327351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 194 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 32948626 - 32948445
Alignment:
Q  194 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaacttt 293  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||     
T  32948626 ggtgacaactagagtacccatagaagaatgatgggtaatttacctcaaccaatacacattagtcacataagcacatttttaagtggtatccatgaactt- 32948528  T
Q  294 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaac 376  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  32948527 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattctttaaaggtaatctagaaaaaac 32948445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 193 - 377
Target Start/End: Original strand, 1091950 - 1092134
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactt 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||     
T  1091950 aggtgacaactagggtacccatggaaaaatggtgggtaatttaccccaaccaatacatattagccacataaacacatttttaagtggtatccatgaacta 1092049  T
Q  293 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 377  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1092050 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattagttggtgggtaaattatccaccattcttcaaaggtaatctaaaaaaaacc 1092134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 194 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 5726310 - 5726128
Alignment:
Q  194 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaacttt 293  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||| || ||||||||| |    
T  5726310 ggtgacaactagggtatccatggaagaatggtgggtaatttaccctaaccaatacacattagccatataaacacatttttaagtggtaaccatgaactat 5726211  T
Q  294 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaac 376  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5726210 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattactcaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaac 5726128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 194 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 40735645 - 40735459
Alignment:
Q  194 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaacttt 293  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| | ||||||||||| ||||||| |||| |    
T  40735645 ggtgacaattagggtactcatggaagaatgatgggtaatttacctcaatcaatacacattagccgcataagtacatttttaagtggtatccataaactat 40735546  T
Q  294 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 380  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40735545 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttgatgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 40735459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 194 - 375
Target Start/End: Original strand, 2914138 - 2914319
Alignment:
Q  194 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaacttt 293  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |    
T  2914138 ggtgacaactaggatatccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccgatacacatcagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 2914237  T
Q  294 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 375  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2914238 cttgactccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaaggtaatctaaaaaaaa 2914319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 193 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 40037324 - 40037141
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactt 292  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||     
T  40037324 aggtgacaactagggtacccatgaaa-aatgatgggtaatttacctcaaccaatacacattaaccacataagcacatttttaagtggtatctatgaacta 40037226  T
Q  293 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 377  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  40037225 tcttgaccccaccaacaaattggtcattttcattggttggtgggtaaattacccactattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 40037141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 193 - 376
Target Start/End: Original strand, 7892687 - 7892870
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactt 292  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||     
T  7892687 aggtgacaactagggtatctatggaagaatggtgggtaatttacccaaaccaatacacattagccacataaacacatttttaagtggtatccatgaacta 7892786  T
Q  293 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaac 376  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7892787 tattgaccccgccaacaaattgctcattttcattagttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaac 7892870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 193 - 375
Target Start/End: Original strand, 33427646 - 33427828
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactt 292  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||     
T  33427646 aggtgataactagggtacccatgaaagaatggtgtgtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatctatgaacta 33427745  T
Q  293 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  33427746 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttgatggataaattacccaccattattcaaaggtaatctagaaaaaa 33427828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 194 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 4609807 - 4609626
Alignment:
Q  194 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaacttt 293  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |    
T  4609807 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgttggataatttaccccaaccaatacacattaggcacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 4609708  T
Q  294 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 375  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4609707 cttgaccccaccaacaaattacttattttcattagttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctaaaaaaaa 4609626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 194 - 378
Target Start/End: Original strand, 14697537 - 14697721
Alignment:
Q  194 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaacttt 293  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |    
T  14697537 ggtgacaactagggtacccatagaagaatggtgggtaatttaccccgaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 14697636  T
Q  294 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 378  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  14697637 cttgatcacaccaacaaattgctcattttcattagttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaagtaatctaaaaaaaacct 14697721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 200 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 15925255 - 15925073
Alignment:
Q  200 aactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactttcttgac 299  Q
    |||||||||| | ||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  15925255 aactagggtatctatgaaagaatgatggataatttacctcaaccaatacacattagctacataagcatatttttaagtggtatccatgaactatcttgac 15925156  T
Q  300 cccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaaccttaaa 382  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15925155 cccaccaataaattactcattttcattggttgatgggtaaattacccaccattcttgaaaggtaatctagaaaaaaccttaaa 15925073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 194 - 378
Target Start/End: Original strand, 37620867 - 37621054
Alignment:
Q  194 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaacttt 293  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |  ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |    
T  37620867 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtggataatttatccaaaccaatacacataagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 37620966  T
Q  294 cttga---ccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 378  Q
    |||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  37620967 cttgagtaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctaaaaaaaacct 37621054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 193 - 361
Target Start/End: Original strand, 32856435 - 32856603
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactt 292  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||     
T  32856435 aggtgacaactagggtacctatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatatacattagccacataagcacatttgtaagtggtatccatgaacta 32856534  T
Q  293 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaagg 361  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  32856535 tcttgatcccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaagg 32856603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 193 - 378
Target Start/End: Original strand, 37255336 - 37255516
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactt 292  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||     
T  37255336 aggtgacaactagggtacccatagaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattaaccacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 37255435  T
Q  293 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 378  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37255436 tcttgatcccaccaacaaattgctcattttcattgattggtgggtaaatt-----ccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 37255516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 220 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 32608535 - 32608376
Alignment:
Q  220 aatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactttcttgaccccaccaacaaattgctcat 319  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  32608535 aatggtgagtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatacatgaactatcttgacaccaccaacaaattgctcat 32608436  T
Q  320 tttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 379  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32608435 tttcattggttggtggataaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 32608376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 193 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 9444875 - 9444683
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaat---ggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaa 289  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  9444875 aggtgacaactagggtatccatggaagaataatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaa 9444776  T
Q  290 ctttcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgg-------gtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 375  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  9444775 ctatcttgaccccaccagcaaattgctcattttcattggttggtgggtaattggtaaattacccaccattcttcaaatgtaatctagaaaaaa 9444683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 194 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 11159802 - 11159625
Alignment:
Q  194 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaacttt 293  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| || |||||||||||  ||||||||||| |    
T  11159802 ggtgacaactagggtacccatagaagaatggtgggtaatttaccccatccaatacacaatagccacataaacacatttttaagtggcatccatgaactat 11159703  T
Q  294 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaa 372  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||    
T  11159702 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtaggtaaatta-ccaccatttttcaaaggtaatcaagaaa 11159625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 220 - 379
Target Start/End: Original strand, 8432942 - 8433101
Alignment:
Q  220 aatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactttcttgaccccaccaacaaattgctcat 319  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  8432942 aatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagtatattttaaagtggtatccatgaactatcttgaccacaccaacaaattgctcat 8433041  T
Q  320 tttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 379  Q
    |||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8433042 tttcattggttggcaggtaaattatccaccattcttcaaagataatctagaaaaaacctt 8433101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 193 - 378
Target Start/End: Original strand, 21734899 - 21735073
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactt 292  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||           ||||||||     
T  21734899 aggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatatacattagccacataagcacatatt-----------catgaacta 21734987  T
Q  293 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 378  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  21734988 tcttgacccccccaataaattgctcatattcattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatttagaaaaaacct 21735073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 195 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 39103216 - 39103042
Alignment:
Q  195 gtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactttc 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||           |||||||| |     
T  39103216 gtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatatt-----------catgaactatt 39103128  T
Q  295 ttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 380  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  39103127 ttgaccccatcaataaattgctcatattcattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatttagaaaaaacctta 39103042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 221 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 12842257 - 12842103
Alignment:
Q  221 atggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactttcttgaccccaccaacaaattgctcatt 320  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  12842257 atggtgagtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacatttttaattggtatccaagaactatcttgactccaccaacaaattactcatt 12842158  T
Q  321 ttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 375  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12842157 ttcattggttggtggataaattacccaccattcttcaaaggtaatcaagaaaaaa 12842103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 251 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 42900039 - 42899913
Alignment:
Q  251 attagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactttcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccacca 350  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  42900039 attagccacataagcgcatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattaccaacca 42899940  T
Q  351 ttcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 377  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||    
T  42899939 ttcttcgaaggtaatctagaaaaaacc 42899913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 194 - 377
Target Start/End: Original strand, 28641292 - 28641464
Alignment:
Q  194 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaacttt 293  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||           |||||||| |    
T  28641292 ggtgacaactaggctacccatgaaagaataatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacatatatt-----------catgaactat 28641380  T
Q  294 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 377  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28641381 cttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacc 28641464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 197 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 25295013 - 25294886
Alignment:
Q  197 gacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactttctt 296  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  25295013 gacaactagggtactcatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacatttttaagtggtatccatgaactatctt 25294914  T
Q  297 gaccccaccaacaaattgctcattttca 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25294913 gaccccaccaacaaattgctcattttca 25294886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 194 - 375
Target Start/End: Original strand, 35158050 - 35158220
Alignment:
Q  194 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaacttt 293  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| || ||           |||||||| |    
T  35158050 ggtgacaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagtcacataagcacatatt-----------catgaactat 35158138  T
Q  294 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 375  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  35158139 cttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaa 35158220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 194 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 29687211 - 29687039
Alignment:
Q  194 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaacttt 293  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| || ||           |||||||| |    
T  29687211 ggtgacaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttaccataaccaatacacattagccacataagcacatatt-----------catgaactat 29687123  T
Q  294 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 377  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  29687122 cttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaagataatttagaaaaaacc 29687039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 192 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 1229811 - 1229628
Alignment:
Q  192 gaggtgacaactagggta-cccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaac 290  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| | |||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  1229811 gaggtgacaacttgggtaacccatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatatatattagccagataagcacatttttaagtggtatccatgaac 1229712  T
Q  291 tttcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaaccttaaa 382  Q
    | ||||||||||| |||||||||| |||||||||||        |  |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  1229711 tatcttgaccccatcaacaaattgttcattttcatt--------gacaaattacctaccattctttaaaggtaatctagaaaaaaccttaaa 1229628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 228 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 41172605 - 41172453
Alignment:
Q  228 gtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactttcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattg 327  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |  |||||| |||||||| |||||| ||||| |||||||||||||    
T  41172605 gtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtacctttgaactatcttgacctcaccaataaattactcattttcattg 41172506  T
Q  328 gttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaaccttaa 381  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||    
T  41172505 gttggtgggtaaattacccatcattcttcaaatgtaattta-aaaaaaccttaa 41172453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 194 - 379
Target Start/End: Original strand, 12333497 - 12333669
Alignment:
Q  194 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaacttt 293  Q
    ||||||||||||| |||| ||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||           || |||||||| |    
T  12333497 ggtgacaactaggctacc-atgaaagaatgatgggtaatttacc-caaccaatacacattagccacataagcacat-----------atacatgaactat 12333583  T
Q  294 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 379  Q
    ||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12333584 cttgaccccacaaataaattgttcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacctt 12333669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 196 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 145450 - 145281
Alignment:
Q  196 tgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactttct 295  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||  | ||           |||||||| |||    
T  145450 tgacaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacgtatt-----------catgaactatct 145362  T
Q  296 tgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaac 376  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  145361 tgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtggataaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaac 145281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 193 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 27331473 - 27331298
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactt 292  Q
    ||||||||| |||| |||||||| ||||||| ||| ||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||| || |       |||| ||||||||     
T  27331473 aggtgacaattaggctacccatgaaagaatgatggataatttaccccaactaatacatattagccacataagcacatat-------atattcatgaacta 27331381  T
Q  293 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 375  Q
    ||||||||| || || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27331380 tcttgaccctacaaataaattgctcattttcattagttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaa 27331298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 193 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 44481999 - 44481826
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactt 292  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| || ||  ||           |||||| ||| ||||||| ||||     
T  44481999 aggtgacaaccagggtacccatggaaaaatggtgggtaatttaccccaaccaataaactttcacc-----------tttttaggtggtatccataaacta 44481911  T
Q  293 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 377  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  44481910 tcttgaccccaccaataaattgctcattatgattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatctagaaaaaacc 44481826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 194 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 4258659 - 4258488
Alignment:
Q  194 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaacttt 293  Q
    ||||||||||||| |||||||| | ||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| || ||           |||||||| |    
T  4258659 ggtgacaactaggctacccatgaacgaatgatgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatatt-----------catgaactat 4258571  T
Q  294 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 377  Q
    |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  4258570 cttgaccc-acaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaagataatttagaaaaaacc 4258488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 296 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 12814693 - 12814608
Alignment:
Q  296 tgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaaccttaa 381  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12814693 tgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaaccttaa 12814608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 194 - 376
Target Start/End: Original strand, 19428426 - 19428598
Alignment:
Q  194 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaacttt 293  Q
    |||| |||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||           |||||||| |    
T  19428426 ggtggcaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatatt-----------catgaactat 19428514  T
Q  294 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaa-ggtaatctagaaaaaac 376  Q
    ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  19428515 cttgaccccacaagtaaattgctcattttcattggtcggtgggtaaattacccaccattcttcaaagggtaatttagaaaaaac 19428598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 194 - 377
Target Start/End: Original strand, 43898971 - 43899142
Alignment:
Q  194 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaacttt 293  Q
    |||| |||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||           |||||||| |    
T  43898971 ggtggcaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttacc-caaccaatacacattagccacataagcacatatt-----------catgaactat 43899058  T
Q  294 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 377  Q
    ||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  43899059 cttgaccccataaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattatccaccatttttcaaaggtaatttagaaaaaacc 43899142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 193 - 379
Target Start/End: Original strand, 13543623 - 13543798
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactt 292  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| || ||           ||||||||     
T  13543623 aggtgacaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttaccctaaccaatacacattagccacataagcacatatt-----------catgaacta 13543711  T
Q  293 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 379  Q
    |||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||| ||||||    
T  13543712 tcttgaccccacaaataaattgttcattttcattggttggtaggtaaattacccaccattcttcaaaagtaatttaaaaagaacctt 13543798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 194 - 375
Target Start/End: Original strand, 39301197 - 39301367
Alignment:
Q  194 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaacttt 293  Q
    ||||||||||||| || ||||| ||||||| ||| |||||||||  |||||||||||||||| || ||||||| || ||           |||||||| |    
T  39301197 ggtgacaactaggctatccatgaaagaatgatggataatttaccctaaccaatacacattagtcatataagcacatatt-----------catgaactat 39301285  T
Q  294 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 375  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  39301286 cttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaa 39301367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 193 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 12730232 - 12730059
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactt 292  Q
    ||||| |||||||| || ||||| ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||| || ||||           ||||||     
T  12730232 aggtggcaactaggctatccatgaaagaatgatgggtaatttaccataaccaatacacattagtcacataagcacatattta-----------tgaacta 12730144  T
Q  293 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 377  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12730143 tcttgaccccacaaataaattgctcattttcattgattggtgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatttagaaaaaacc 12730059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 194 - 378
Target Start/End: Original strand, 27764863 - 27765035
Alignment:
Q  194 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaacttt 293  Q
    |||| |||||||| |||||||| |||| || ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||           |||||||| |    
T  27764863 ggtggcaactaggctacccatgaaaga-tgatggttaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatatt-----------catgaactat 27764950  T
Q  294 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 378  Q
     |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  27764951 tttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaatgtaatttagaaaaaacct 27765035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 199 - 379
Target Start/End: Original strand, 28566703 - 28566872
Alignment:
Q  199 caactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactttcttga 298  Q
    |||||||| |||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||           |||||||| ||||||    
T  28566703 caactaggctacccatgaaagaatgatgagtaatttacctcaaccaatacacattagtcacataagcacatatt-----------catgaactatcttga 28566791  T
Q  299 ccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 379  Q
    |||||  || |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  28566792 ccccagaaataaattgctcattttcattagttggtgggtaaattatccaccattcttcaaaagtaatttagaaaaaacctt 28566872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 193 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 34249436 - 34249265
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactt 292  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| || ||           ||| ||||     
T  34249436 aggtgacaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttacctcaatcaatacacattagtcacataagcacatatt-----------cataaacta 34249348  T
Q  293 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 375  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||| || ||||||    
T  34249347 tcttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtaggtaaattactcaccattcttcaaagataatttaaaaaaaa 34249265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 194 - 301
Target Start/End: Original strand, 447633 - 447740
Alignment:
Q  194 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaacttt 293  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| |    
T  447633 ggtgacaactagggtacccatggatgaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatacatgaactat 447732  T
Q  294 cttgaccc 301  Q
    ||||||||    
T  447733 cttgaccc 447740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 193 - 379
Target Start/End: Original strand, 2688728 - 2688903
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactt 292  Q
    |||||||||||||| || ||||| ||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||           ||||||||     
T  2688728 aggtgacaactaggctatccatgaaagaatgatgagtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatatt-----------catgaacta 2688816  T
Q  293 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 379  Q
    ||||||||| || || |||||||| |||||||||  | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  2688817 tcttgaccctacaaataaattgctaattttcattaatcggtggataaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacctt 2688903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 199 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 35126945 - 35126778
Alignment:
Q  199 caactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactttcttga 298  Q
    ||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| | ||||||||| |||||           ||  |||||| ||| ||||||| |||| ||||||    
T  35126945 caactagggtatctatggaaaaatggtgggtaatttatcccaaccaataaacatt-----------cacctttttaggtggtatccataaactatcttga 35126857  T
Q  299 ccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 377  Q
    ||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  35126856 ccccaccaataaattgctcattatgattggttggtgggtaaattacccaccgtttttcaaaggtaatctagaaaaaacc 35126778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 279 - 379
Target Start/End: Original strand, 40544150 - 40544250
Alignment:
Q  279 atatccatgaactttcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 378  Q
    |||| |||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  40544150 atattcatgaactatcttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaactatccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacct 40544249  T
Q  379 t 379  Q
    |    
T  40544250 t 40544250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 194 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 43356266 - 43356097
Alignment:
Q  194 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaacttt 293  Q
    ||||||||||||| || ||||| ||||||  ||||||||||||   |||||||||| |||||||||||||||| || ||           |||||||| |    
T  43356266 ggtgacaactaggctaaccatgaaagaatcatgggtaatttactcaaaccaatacaaattagccacataagcacatatt-----------catgaactat 43356178  T
Q  294 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 377  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  43356177 cttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggt---ttacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacc 43356097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 279 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 3266392 - 3266296
Alignment:
Q  279 atatccatgaactttcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 375  Q
    |||| |||||||| |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  3266392 atattcatgaactatcttgaccccataaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaatgtaatttagaaaaaa 3266296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 285 - 380
Target Start/End: Original strand, 2000417 - 2000512
Alignment:
Q  285 atgaactttcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 380  Q
    ||||||| | |||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2000417 atgaactattttgatcccacaaataaattgctcattttcattggttggtggataaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacctta 2000512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 193 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 3711804 - 3711664
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactt 292  Q
    ||||| |||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||            |||| ||||||||     
T  3711804 aggtggcaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccgcataagca-----------catattcatgaacta 3711716  T
Q  293 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 344  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  3711715 tcttgaccccacaaataaattgctcattttcattgattggtaggtaaattac 3711664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 192 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 30545993 - 30545817
Alignment:
Q  192 gaggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaact 291  Q
    |||||||||||||||||| | ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||  |||||           ||||||||||  |  |||||| |||||    
T  30545993 gaggtgacaactagggtatctatggaggaatgatgggtaatttacctgaaccaatgaacatt-----------catatttttagattgtatccacgaact 30545905  T
Q  292 ttcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 379  Q
     ||||||||||||||| || ||||||||||| |||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  30545904 atcttgaccccaccaataagttgctcatttttattgtttggtaggtaaattatccaccattcttcaaaaataatctaaaaaaaacctt 30545817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 194 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 12827243 - 12827137
Alignment:
Q  194 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaacttt 293  Q
    |||||||||||| | |||  ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| |    
T  12827243 ggtgacaactagagcacctgtggaaaaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtat-catgaactat 12827145  T
Q  294 cttgaccc 301  Q
    ||| ||||    
T  12827144 cttaaccc 12827137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 279 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 8056722 - 8056625
Alignment:
Q  279 atatccatgaactttcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaac 376  Q
    |||| |||||||| |||| || |||| || |||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8056722 atattcatgaactatcttcactccacaaataaatagttcattttcattggttggtgggtaaattactcaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaac 8056625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 232 - 304
Target Start/End: Original strand, 28014856 - 28014928
Alignment:
Q  232 tttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactttcttgaccccac 304  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  28014856 tttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccac 28014928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 332 - 378
Target Start/End: Original strand, 28019959 - 28020005
Alignment:
Q  332 gtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 378  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28019959 gtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 28020005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 196 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 3266455 - 3266399
Alignment:
Q  196 tgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacat 252  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3266455 tgacaactaggttacccatgaaagaatgatgggtaatttacctcaaccaatacacat 3266399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 91 - 147
Target Start/End: Original strand, 34237678 - 34237734
Alignment:
Q  91 tgggaacaatattaaggaattagtgtaaatacaagctagtttaattacatgtttttt 147  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||    
T  34237678 tgggaacaatattaaggaattagtgtaaatatatgctagtataattacatgtttttt 34237734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 309 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 10176625 - 10176558
Alignment:
Q  309 aaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaac 376  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||  ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10176625 aaattgctcattttcattaattggtgaataagttacccaccattctttaaaggtaatctagaaaaaac 10176558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 180 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 42900849 - 42900781
Alignment:
Q  180 gatatttaaaaggaggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaataca 249  Q
    ||||| || ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  42900849 gatatatataagaaggtgacaactagg-tacacatggaagaatggtgggtaatttatctcaaccaataca 42900781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 269 - 368
Target Start/End: Original strand, 38985342 - 38985439
Alignment:
Q  269 tttttaagtgatatccatgaactttcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatcta 368  Q
    |||||| ||| |||||||||||| |||||||   | ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||| ||||| ||||||||    
T  38985342 tttttaggtggtatccatgaactatcttgacat-atcaataaattgctcattttcattggttggtgagtaaattactcaccgttc-tcaaatgtaatcta 38985439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 194 - 252
Target Start/End: Original strand, 40544085 - 40544143
Alignment:
Q  194 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacat 252  Q
    ||||||||||||  |||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  40544085 ggtgacaactagactacccatgaaagaatgatgtgtaatttacctcaaccaatacacat 40544143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 92 - 147
Target Start/End: Original strand, 16242224 - 16242279
Alignment:
Q  92 gggaacaatattaaggaattagtgtaaatacaagctagtttaattacatgtttttt 147  Q
    |||| |||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  16242224 gggaccaatatcaaggaattggtgtaaatacaagttagtttaattatatgtttttt 16242279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 337 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 1897168 - 1897130
Alignment:
Q  337 taaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 375  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1897168 taaattatccaccattctttaaaggtaatctagaaaaaa 1897130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 211 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 8056779 - 8056725
Alignment:
Q  211 ccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagc 265  Q
    ||||| ||||||| || |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||    
T  8056779 ccatgaaagaatgatgagtaatttactccaaccaatacacattagctacataagc 8056725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #86
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 385 - 422
Target Start/End: Original strand, 9792233 - 9792270
Alignment:
Q  385 gatgaaagtggatgtaaattaatgaggtgagtgtaaac 422  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  9792233 gatgaaagtggatgtaaattagtgaggtgggtgtaaac 9792270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #87
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 194 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 10176714 - 10176653
Alignment:
Q  194 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattag 255  Q
    ||||| |||||||||  ||||||||||||  ||| |||||||| |||||||||| |||||||    
T  10176714 ggtgataactagggtgtccatggaagaataatggttaatttacttcaaccaataaacattag 10176653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #88
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 385 - 422
Target Start/End: Original strand, 10862967 - 10863004
Alignment:
Q  385 gatgaaagtggatgtaaattaatgaggtgagtgtaaac 422  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  10862967 gatgaaagtgggtgtaaattagtgaggtgagtgtaaac 10863004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0949 (Bit Score: 161; Significance: 1e-85; HSPs: 1)
Name: scaffold0949
Description:

Target: scaffold0949; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 194 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 2051 - 1871
Alignment:
Q  194 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaacttt 293  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  2051 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttactccaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtggtatccatgaactat 1952  T
Q  294 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaa 374  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1951 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatctagaaaaa 1871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0092 (Bit Score: 161; Significance: 1e-85; HSPs: 1)
Name: scaffold0092
Description:

Target: scaffold0092; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 193 - 377
Target Start/End: Original strand, 39555 - 39739
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactt 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||     
T  39555 aggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattaaccacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 39654  T
Q  293 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 377  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39655 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 39739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0372 (Bit Score: 154; Significance: 2e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0372
Description:

Target: scaffold0372; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 194 - 379
Target Start/End: Original strand, 11133 - 11317
Alignment:
Q  194 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaacttt 293  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |    
T  11133 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtggataatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 11232  T
Q  294 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 379  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  11233 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattctt-aaaggtaatctagaaaaaccctt 11317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 145; Significance: 4e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 193 - 377
Target Start/End: Original strand, 75243 - 75427
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactt 292  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||     
T  75243 aggtgacaactaggttaccaatggaagaatggtgaataatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacatttttaagtggtatgcatgaacta 75342  T
Q  293 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 377  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  75343 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 75427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0155 (Bit Score: 144; Significance: 1e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0155
Description:

Target: scaffold0155; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 194 - 377
Target Start/End: Original strand, 2432 - 2615
Alignment:
Q  194 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaacttt 293  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |    
T  2432 ggtgataactagggtacccatggaagaatgatgagtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 2531  T
Q  294 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 377  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2532 cttgaccctaccaacaaattgctcattttcattggttggtggataatttacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 2615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 140; Significance: 3e-73; HSPs: 2)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 193 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 278191 - 278005
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtga--tatccatgaac 290  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||   |||||||||||    
T  278191 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataaacacatttttaagtggggtatccatgaac 278092  T
Q  291 tttcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 377  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  278091 tatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgagtaatttacccaccattcttcaaaggtaatctaaaaaaaacc 278005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #2
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 193 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 176837 - 176666
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactt 292  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| ||||||||||||     
T  176837 aggtgacaactaggatacccatagaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagtacattttcaagtggtatccatgaacta 176738  T
Q  293 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  176737 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtcggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 176666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198 (Bit Score: 133; Significance: 5e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0198
Description:

Target: scaffold0198; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 193 - 377
Target Start/End: Original strand, 18853 - 19037
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactt 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||   |||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||| |     
T  18853 aggtgacaactagggtacccatggaagaattgtggataatttattccaactaatacacattagtcacataagcacatttttaagtggtatccatgaatta 18952  T
Q  293 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 377  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18953 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattgattggtgggtaaattacccaccattcttcaaagataatctagaaaaaacc 19037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 120; Significance: 3e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 222 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 32715 - 32560
Alignment:
Q  222 tggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactttcttgaccccaccaacaaattgctcattt 321  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| || |||||||| || |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  32715 tggtgggtaatttaccccaaccaatacacattaaccacataaacacatttttaaatggtatccatgaactatcttgatcccaccaacaaattgctcattt 32616  T
Q  322 tcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 377  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32615 tcattggttggtgggttaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 32560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0394 (Bit Score: 111; Significance: 7e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0394
Description:

Target: scaffold0394; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 193 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 3262 - 3089
Alignment:
Q  193 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactt 292  Q
    |||||||||||| |||| |||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  3262 aggtgacaactaaggtatccatagaagaatggtgagtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaacta 3163  T
Q  293 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 375  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||         |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3162 tcttgatcccaccaacaaattgctcatttt---------gtgaataaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 3089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0429 (Bit Score: 108; Significance: 4e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0429
Description:

Target: scaffold0429; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 194 - 380
Target Start/End: Original strand, 4596 - 4776
Alignment:
Q  194 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaacttt 293  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| |    
T  4596 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccataaactat 4695  T
Q  294 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 380  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||      |||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||    
T  4696 ctttaccccaccaacaaattgttcatttttattagttggtg------ttacccaccattattcaaagttaatctagaaaaaatctta 4776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0721 (Bit Score: 88; Significance: 4e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0721
Description:

Target: scaffold0721; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 194 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 7262 - 7084
Alignment:
Q  194 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaacttt 293  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||| || ||           |||||||| |    
T  7262 ggtgacaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttatcccaaccaatacacattggccacataagcacatatt-----------catgaactat 7174  T
Q  294 cttgaccccaccaacaaattgctcatttt-cattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaaccttaaa 382  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  7173 cttgaccccacaaataaattgctcatttttcattgattggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaaccataaa 7084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150 (Bit Score: 86; Significance: 6e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0150
Description:

Target: scaffold0150; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 194 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 14915 - 14739
Alignment:
Q  194 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaacttt 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||| |||||  ||           |||||| ||| ||| ||| |||| |    
T  14915 ggtgacaactagggtacccatggaaaaatggtaggtaatttaccccaaccaataaacattcacc-----------tttttaggtggtattcataaactat 14827  T
Q  294 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaaccttaa 381  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14826 cttgaccccaccaataaattgctcattatgattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatctagacaaaaccttaa 14739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 194 - 376
Target Start/End: Original strand, 20477 - 20648
Alignment:
Q  194 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaacttt 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||  ||           |||||| ||| ||||||| || | |    
T  20477 ggtgacaactagggtacccatggaaaaatggtgggtaatttaccccaaccaataaacattcacc-----------tttttaggtggtatccataaattat 20565  T
Q  294 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaac 376  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20566 cttgaccccaccaataaattgctcattatgattggttgatgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatctagaaaaaac 20648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2003 (Bit Score: 82; Significance: 1e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold2003
Description:

Target: scaffold2003; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 194 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 272 - 97
Alignment:
Q  194 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaacttt 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||  |||||  ||           |||||| ||| ||| ||| |||| |    
T  272 ggtgacaactagggtacccatggaaaaatggtggg-aatttacctcaaccaattaacattcacc-----------tttttaggtggtattcataaactat 185  T
Q  294 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaaccttaa 381  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  184 cttgactccaccaataaattgctcattatgattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatctagaaaaaaccttaa 97  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0684 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0684
Description:

Target: scaffold0684; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 194 - 379
Target Start/End: Original strand, 4554 - 4729
Alignment:
Q  194 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaacttt 293  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  |||||  ||           ||||||| || |||||||||||| |    
T  4554 ggtgacaactagagtacccatggaagaatggtggataatttacttcaaccaatgaacattcacc-----------tttttaaatggtatccatgaactat 4642  T
Q  294 cttgaccccaccaacaaattgctcatttt-cattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 379  Q
    ||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  4643 cttgacctcaccaataaattactcatttttcattggttggtggataaattacccaccatttttgaaaggtaatctagaaaaaacctt 4729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0163 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0163
Description:

Target: scaffold0163; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 194 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 3564 - 3389
Alignment:
Q  194 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaacttt 293  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  |||||  ||           ||||||| || |||||||||||| |    
T  3564 ggtgacaactagagtacccatggaagaatggtggataatttacttcaaccaatgaacattcacc-----------tttttaaatggtatccatgaactat 3476  T
Q  294 cttgaccccaccaacaaattgctcatttt-cattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 379  Q
    ||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  3475 cttgacctcaccaataaattactcatttttcattggttggtggataaattacccaccatttttgaaaggtaatctagaaaaaacctt 3389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0271 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0271
Description:

Target: scaffold0271; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 295 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 17987 - 17905
Alignment:
Q  295 ttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 377  Q
    ||||| ||| ||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  17987 ttgactccatcaataaattgatcatattcattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatttagaaaaaacc 17905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0271; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 228 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 18043 - 18005
Alignment:
Q  228 gtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagca 266  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18043 gtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagca 18005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0323 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0323
Description:

Target: scaffold0323; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 194 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 19398 - 19228
Alignment:
Q  194 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaacttt 293  Q
    |||||||| ||| ||||||||| || ||||||||||||||||| | |||||||  |||||   |||||     || ||||| ||| |||||||||||| |    
T  19398 ggtgacaattagagtacccatgaaaaaatggtgggtaatttactttaaccaatgaacatt---cacatttt--taattttaggtggtatccatgaactat 19304  T
Q  294 ----cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaat 365  Q
        |||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||   ||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  19303 atatcttgaccccaccaataaattgttcattttcattgattgagaggtaaattacccaccgttcttcaaaagtaat 19228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University