View Alignment
This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.
| Legend |
| | Query |
| | Query hiting target |
| Query hiting target's complemental strand |
| | Query's complemental strand hiting target |
| Query's complemental strand hiting target's complemental strand |
|
Alignment Overview
Query: NF1787_low_3 (Length: 707)
Name: NF1787_low_3
Description: NF1787
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)
| [»] NF1787_low_3 |
 | |
|
Alignment Details
Target: chr2 (Bit Score: 663; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: chr2
Description:
Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 663; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 691
Target Start/End: Original strand, 31408738 - 31409428
Alignment:
| Q |
1 |
atcaataagagaattgaaataaaggagaaatagaagagttccttctgccagctgaagaagtttttaggattgagatacatgaggggagaatattgaaatc |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31408738 |
atcaataagagaattgaaataaaggagaaatagaagagttccttctgccagctgaagaagtttttaggattgagatacatgaggggagaatattgaaatc |
31408837 |
T |
|
| Q |
101 |
tgttttagtggcaaatgaccaaattgaagctagctatcataaactaaccacctaacactgccaagcatacaaaagcctcactaccatcccttaaacacac |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31408838 |
tgttttagtggcaaatgaccaaattgaagctagctatcataaactaaccacctaacattgccaagcatacaaaagcctcactaccatcccttaaacacac |
31408937 |
T |
|
| Q |
201 |
cacaggcagactatacnnnnnnnntgcacagcatgaataagtcttccgcaccaagcctcgatgagatacttatcaatctgcagcaaaacagtagcaggaa |
300 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31408938 |
cacaggcagactatacaaaaaaaatgcacagcatgaataagtcttccgcaccaagcctcgatgagatacttatcaatctgcagcaaaacagtagcaggaa |
31409037 |
T |
|
| Q |
301 |
aaagctcccagccccacgcaacccaccttagtaatatgcccttcaaatctaccaacggattcaccaccatgtattttacataagtggttttgaacgacgc |
400 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31409038 |
aaagctcccagccccacgcaacccaccttagtaatatgcccttcaaatctaccaacggattcaccaccatgtattttacataagtggttttgaacgacgc |
31409137 |
T |
|
| Q |
401 |
ataaacttccaataacatctgctacaaattgaaacataattggcaagtaacttgttaaagagttcattgaagaatgtaaaaagagtggagacaatttcac |
500 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31409138 |
ataaacttccaataacatctgctacaaattgaaacataattggcaagtaacttgttaaagagttcattgaagaatgtaaaaagagtggagacaatttcac |
31409237 |
T |
|
| Q |
501 |
aaataaatttatctctcatgtcatgtcagatagactatagacttcaaacaatttgaatgatgaaaagtaaaatttaaaatgttttggaagcatgacagag |
600 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31409238 |
aaataaatttatctctcatgtcatgtcagatagactatagacttcaaacaatttgaatgatgaaaagtaaaatttaaaatgttttggaagcatgacagag |
31409337 |
T |
|
| Q |
601 |
ttataaatataaagtaaacctacttaaatgtgattgaaacatactgctacactcactattactcatacttgcttctttcatggttagaatc |
691 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31409338 |
ttataaatataaagtaaacctacttaaatgtgattgaaacatactgctacactcactattactcatacttgcttctttcatggttagaatc |
31409428 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 457 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 32280638 - 32280598
Alignment:
| Q |
457 |
aaagagttcattgaagaatgtaaaaagagtggagacaattt |
497 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
32280638 |
aaagaattcattgaagaatgtaaaaggagtggagacaattt |
32280598 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4 (Bit Score: 600; Significance: 0; HSPs: 17)
Name: chr4
Description:
Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 600; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 691
Target Start/End: Original strand, 14208520 - 14209192
Alignment:
| Q |
1 |
atcaataagagaattgaaataaaggagaaatagaagagttccttctgccagctgaagaagtttttaggattgagatacatgaggggagaatattgaaatc |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14208520 |
atcaataagagaattgaaataaaggagaaatagaagagttccttctgccagctgaagaagtttttaggattgagatacatgaggggagaatattgaaatc |
14208619 |
T |
|
| Q |
101 |
tgttttagtggcaaatgaccaaattgaagctagctatcataaactaaccacctaacactgccaagcatacaaaagcctcactaccatcccttaaacacac |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14208620 |
tgttttagtggcaaatgaccaaattgaagctagctatcataaactaaccacctaacattgccaagcatacaaaagcctcactaccatcccttaaacacac |
14208719 |
T |
|
| Q |
201 |
cacaggcagactatacnnnnnnnntgcacagcatgaataagtcttccgcaccaagcctcgatgagatacttatcaatctgcagcaaaacagtagcaggaa |
300 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14208720 |
cacaggcagactatacaaaaaaaatgcacagcatgaataagtcttccgcaccaagcctcgatgagatacttatcaatctgcagcaaaacagtagcaggaa |
14208819 |
T |
|
| Q |
301 |
aaagctcccagccccacgcaacccaccttagtaatatgcccttcaaatctaccaacggattcaccaccatgtattttacataagtggttttgaacgacgc |
400 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14208820 |
aaagctcccagccccacgcaacccaccttagtaatatgcccttcaaatctaccaacggattcaccaccatgtattttacataagtggttttgaacgacgc |
14208919 |
T |
|
| Q |
401 |
ataaacttccaataacatctgctacaaattgaaacataattggcaagtaacttgttaaagagttcattgaagaatgtaaaaagagtggagacaatttcac |
500 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14208920 |
aaaaacttccaataacatctgctacaaattgaaacataattggcaagtaacttgttaaagagttcattgaagaatgtaaaaagagtggagacaatttcac |
14209019 |
T |
|
| Q |
501 |
aaataaatttatctctcatgtcatgtcagatagactatagacttcaaacaatttgaatgatgaaaagtaaaatttaaaatgttttggaagcatgacagag |
600 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14209020 |
aaataaatttatctctcatgtcatg------------------tcaaacaatttgaatgatgaaaagtaaaatttaaaatgttttggaagcatgacagag |
14209101 |
T |
|
| Q |
601 |
ttataaatataaagtaaacctacttaaatgtgattgaaacatactgctacactcactattactcatacttgcttctttcatggttagaatc |
691 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14209102 |
ttataaatataaagtaaacctacttaaatgtgattgaaacatactgctacactcactattactcatacttgcttctttcatggttagaatc |
14209192 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 598; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 66 - 691
Target Start/End: Original strand, 14212407 - 14213032
Alignment:
| Q |
66 |
aggattgagatacatgaggggagaatattgaaatctgttttagtggcaaatgaccaaattgaagctagctatcataaactaaccacctaacactgccaag |
165 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
14212407 |
aggattgagatacatgaggggagaatattgaaatctgttttagtggcaaatgaccaaattgaagctagctatcataaactaaccacctaacattgccaag |
14212506 |
T |
|
| Q |
166 |
catacaaaagcctcactaccatcccttaaacacaccacaggcagactatacnnnnnnnntgcacagcatgaataagtcttccgcaccaagcctcgatgag |
265 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14212507 |
catacaaaagcctcactaccatcccttaaacacaccacaggcagactatacaaaaaaaatgcacagcatgaataagtcttccgcaccaagcctcgatgag |
14212606 |
T |
|
| Q |
266 |
atacttatcaatctgcagcaaaacagtagcaggaaaaagctcccagccccacgcaacccaccttagtaatatgcccttcaaatctaccaacggattcacc |
365 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14212607 |
atacttatcaatctgcagcaaaacagtagcaggaaaaagctcccagccccacgcaacccaccttagtaatatgcccttcaaatctaccaacggattcacc |
14212706 |
T |
|
| Q |
366 |
accatgtattttacataagtggttttgaacgacgcataaacttccaataacatctgctacaaattgaaacataattggcaagtaacttgttaaagagttc |
465 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14212707 |
accatgtattttacataagtggttttgaacgacgcataaacttccaataacatctgctacaaattgaaacataattggcaagtaacttgttaaagagttc |
14212806 |
T |
|
| Q |
466 |
attgaagaatgtaaaaagagtggagacaatttcacaaataaatttatctctcatgtcatgtcagatagactatagacttcaaacaatttgaatgatgaaa |
565 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14212807 |
attgaagaatgtaaaaagagtggagacaatttcacaaataaatttatctctcatgtcatgtcagatagactatagacttcaaacaatttgaatgatgaaa |
14212906 |
T |
|
| Q |
566 |
agtaaaatttaaaatgttttggaagcatgacagagttataaatataaagtaaacctacttaaatgtgattgaaacatactgctacactcactattactca |
665 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14212907 |
agtaaaatttaaaatgttttggaagcatgacagagttataaatataaagtaaacctacttaaatgtgattgaaacatactgctacactcactattactca |
14213006 |
T |
|
| Q |
666 |
tacttgcttctttcatggttagaatc |
691 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14213007 |
tacttgcttctttcatggttagaatc |
14213032 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 598; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 66 - 691
Target Start/End: Original strand, 14214344 - 14214969
Alignment:
| Q |
66 |
aggattgagatacatgaggggagaatattgaaatctgttttagtggcaaatgaccaaattgaagctagctatcataaactaaccacctaacactgccaag |
165 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
14214344 |
aggattgagatacatgaggggagaatattgaaatctgttttagtggcaaatgaccaaattgaagctagctatcataaactaaccacctaacattgccaag |
14214443 |
T |
|
| Q |
166 |
catacaaaagcctcactaccatcccttaaacacaccacaggcagactatacnnnnnnnntgcacagcatgaataagtcttccgcaccaagcctcgatgag |
265 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14214444 |
catacaaaagcctcactaccatcccttaaacacaccacaggcagactatacaaaaaaaatgcacagcatgaataagtcttccgcaccaagcctcgatgag |
14214543 |
T |
|
| Q |
266 |
atacttatcaatctgcagcaaaacagtagcaggaaaaagctcccagccccacgcaacccaccttagtaatatgcccttcaaatctaccaacggattcacc |
365 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14214544 |
atacttatcaatctgcagcaaaacagtagcaggaaaaagctcccagccccacgcaacccaccttagtaatatgcccttcaaatctaccaacggattcacc |
14214643 |
T |
|
| Q |
366 |
accatgtattttacataagtggttttgaacgacgcataaacttccaataacatctgctacaaattgaaacataattggcaagtaacttgttaaagagttc |
465 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14214644 |
accatgtattttacataagtggttttgaacgacgcataaacttccaataacatctgctacaaattgaaacataattggcaagtaacttgttaaagagttc |
14214743 |
T |
|
| Q |
466 |
attgaagaatgtaaaaagagtggagacaatttcacaaataaatttatctctcatgtcatgtcagatagactatagacttcaaacaatttgaatgatgaaa |
565 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14214744 |
attgaagaatgtaaaaagagtggagacaatttcacaaataaatttatctctcatgtcatgtcagatagactatagacttcaaacaatttgaatgatgaaa |
14214843 |
T |
|
| Q |
566 |
agtaaaatttaaaatgttttggaagcatgacagagttataaatataaagtaaacctacttaaatgtgattgaaacatactgctacactcactattactca |
665 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14214844 |
agtaaaatttaaaatgttttggaagcatgacagagttataaatataaagtaaacctacttaaatgtgattgaaacatactgctacactcactattactca |
14214943 |
T |
|
| Q |
666 |
tacttgcttctttcatggttagaatc |
691 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14214944 |
tacttgcttctttcatggttagaatc |
14214969 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 598; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 66 - 691
Target Start/End: Original strand, 14219154 - 14219779
Alignment:
| Q |
66 |
aggattgagatacatgaggggagaatattgaaatctgttttagtggcaaatgaccaaattgaagctagctatcataaactaaccacctaacactgccaag |
165 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
14219154 |
aggattgagatacatgaggggagaatattgaaatctgttttagtggcaaatgaccaaattgaagctagctatcataaactaaccacctaacattgccaag |
14219253 |
T |
|
| Q |
166 |
catacaaaagcctcactaccatcccttaaacacaccacaggcagactatacnnnnnnnntgcacagcatgaataagtcttccgcaccaagcctcgatgag |
265 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14219254 |
catacaaaagcctcactaccatcccttaaacacaccacaggcagactatacaaaaaaaatgcacagcatgaataagtcttccgcaccaagcctcgatgag |
14219353 |
T |
|
| Q |
266 |
atacttatcaatctgcagcaaaacagtagcaggaaaaagctcccagccccacgcaacccaccttagtaatatgcccttcaaatctaccaacggattcacc |
365 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14219354 |
atacttatcaatctgcagcaaaacagtagcaggaaaaagctcccagccccacgcaacccaccttagtaatatgcccttcaaatctaccaacggattcacc |
14219453 |
T |
|
| Q |
366 |
accatgtattttacataagtggttttgaacgacgcataaacttccaataacatctgctacaaattgaaacataattggcaagtaacttgttaaagagttc |
465 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14219454 |
accatgtattttacataagtggttttgaacgacgcataaacttccaataacatctgctacaaattgaaacataattggcaagtaacttgttaaagagttc |
14219553 |
T |
|
| Q |
466 |
attgaagaatgtaaaaagagtggagacaatttcacaaataaatttatctctcatgtcatgtcagatagactatagacttcaaacaatttgaatgatgaaa |
565 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14219554 |
attgaagaatgtaaaaagagtggagacaatttcacaaataaatttatctctcatgtcatgtcagatagactatagacttcaaacaatttgaatgatgaaa |
14219653 |
T |
|
| Q |
566 |
agtaaaatttaaaatgttttggaagcatgacagagttataaatataaagtaaacctacttaaatgtgattgaaacatactgctacactcactattactca |
665 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14219654 |
agtaaaatttaaaatgttttggaagcatgacagagttataaatataaagtaaacctacttaaatgtgattgaaacatactgctacactcactattactca |
14219753 |
T |
|
| Q |
666 |
tacttgcttctttcatggttagaatc |
691 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14219754 |
tacttgcttctttcatggttagaatc |
14219779 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 594; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 66 - 691
Target Start/End: Original strand, 14210487 - 14211112
Alignment:
| Q |
66 |
aggattgagatacatgaggggagaatattgaaatctgttttagtggcaaatgaccaaattgaagctagctatcataaactaaccacctaacactgccaag |
165 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
14210487 |
aggattgagatacatgaggggagaatattgaaatctgttttagtggcaaatgaccaaattgaagctagctatcataaactaaccacctaacattgccaag |
14210586 |
T |
|
| Q |
166 |
catacaaaagcctcactaccatcccttaaacacaccacaggcagactatacnnnnnnnntgcacagcatgaataagtcttccgcaccaagcctcgatgag |
265 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
14210587 |
catacaaaagcctcactaccatcccttaaacacaccacaggcagactatacaaaaaaaatgcacagcatgaataagtcttccgcaccaagcctcaatgag |
14210686 |
T |
|
| Q |
266 |
atacttatcaatctgcagcaaaacagtagcaggaaaaagctcccagccccacgcaacccaccttagtaatatgcccttcaaatctaccaacggattcacc |
365 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14210687 |
atacttatcaatctgcagcaaaacagtagcaggaaaaagctcccagccccacgcaacccaccttagtaatatgcccttcaaatctaccaacggattcacc |
14210786 |
T |
|
| Q |
366 |
accatgtattttacataagtggttttgaacgacgcataaacttccaataacatctgctacaaattgaaacataattggcaagtaacttgttaaagagttc |
465 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14210787 |
accatgtattttacataagtggttttgaacgacgcataaacttccaataacatctgctacaaattgaaacataattggcaagtaacttgttaaagagttc |
14210886 |
T |
|
| Q |
466 |
attgaagaatgtaaaaagagtggagacaatttcacaaataaatttatctctcatgtcatgtcagatagactatagacttcaaacaatttgaatgatgaaa |
565 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14210887 |
attgaagaatgtaaaaagagtggagacaatttcacaaataaatttatctctcatgtcatgtcagatagactatagacttcaaacaatttgaatgatgaaa |
14210986 |
T |
|
| Q |
566 |
agtaaaatttaaaatgttttggaagcatgacagagttataaatataaagtaaacctacttaaatgtgattgaaacatactgctacactcactattactca |
665 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14210987 |
agtaaaatttaaaatgttttggaagcatgacagagttataaatataaagtaaacctacttaaatgtgattgaaacatactgctacactcactattactca |
14211086 |
T |
|
| Q |
666 |
tacttgcttctttcatggttagaatc |
691 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14211087 |
tacttgcttctttcatggttagaatc |
14211112 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 594; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 66 - 691
Target Start/End: Original strand, 14215313 - 14215938
Alignment:
| Q |
66 |
aggattgagatacatgaggggagaatattgaaatctgttttagtggcaaatgaccaaattgaagctagctatcataaactaaccacctaacactgccaag |
165 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
14215313 |
aggattgagatacatgaggggagaatattgaaatctgttttagtggcaaatgaccaaattgaagctagctatcataaactaaccacctaacattgccaag |
14215412 |
T |
|
| Q |
166 |
catacaaaagcctcactaccatcccttaaacacaccacaggcagactatacnnnnnnnntgcacagcatgaataagtcttccgcaccaagcctcgatgag |
265 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14215413 |
catacaaaagcctcactaccatcccttaaacacaccacaggcagactatacaaaaaaaatgcacagcatgaataagtcttccgcaccaagcctcgatgag |
14215512 |
T |
|
| Q |
266 |
atacttatcaatctgcagcaaaacagtagcaggaaaaagctcccagccccacgcaacccaccttagtaatatgcccttcaaatctaccaacggattcacc |
365 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14215513 |
atacttatcaatctgcagcaaaacagtagcaggaaaaagctcccagccccacgcaacccaccttagtaatatgcccttcaaatctaccaacggattcacc |
14215612 |
T |
|
| Q |
366 |
accatgtattttacataagtggttttgaacgacgcataaacttccaataacatctgctacaaattgaaacataattggcaagtaacttgttaaagagttc |
465 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14215613 |
accatgtattttacataagtggttttgaacgacgcaaaaacttccaataacatctgctacaaattgaaacataattggcaagtaacttgttaaagagttc |
14215712 |
T |
|
| Q |
466 |
attgaagaatgtaaaaagagtggagacaatttcacaaataaatttatctctcatgtcatgtcagatagactatagacttcaaacaatttgaatgatgaaa |
565 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14215713 |
attgaagaatgtaaaaagagtggagacaatttcacaaataaatttatctctcatgtcatgtcagatagactatagacttcaaacaatttgaatgatgaaa |
14215812 |
T |
|
| Q |
566 |
agtaaaatttaaaatgttttggaagcatgacagagttataaatataaagtaaacctacttaaatgtgattgaaacatactgctacactcactattactca |
665 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14215813 |
agtaaaatttaaaatgttttggaagcatgacagagttataaatataaagtaaacctacttaaatgtgattgaaacatactgctacactcactattactca |
14215912 |
T |
|
| Q |
666 |
tacttgcttctttcatggttagaatc |
691 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14215913 |
tacttgcttctttcatggttagaatc |
14215938 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 587; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 66 - 691
Target Start/End: Original strand, 14218184 - 14218810
Alignment:
| Q |
66 |
aggattgagatacatgaggggagaatattgaaatctgttttagtggcaaatgaccaaattgaagctagctatcataaactaaccacctaacactgccaag |
165 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
14218184 |
aggattgagatacatgaggggagaatattgaaatctgttttagtggcaaatgaccaaattgaagctatctatcataaactaaccacctaacattgccaag |
14218283 |
T |
|
| Q |
166 |
catacaaaagcctcactaccatcccttaaacacaccacaggcagactatacnnnnnnnntgcacagcatgaataagtctt-ccgcaccaagcctcgatga |
264 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14218284 |
catacaaaagcctcactaccatcccttaaacacaccacaggcagactatacaaaaaaaatgcacagcatgaataagtctttccgcaccaagcctcgatga |
14218383 |
T |
|
| Q |
265 |
gatacttatcaatctgcagcaaaacagtagcaggaaaaagctcccagccccacgcaacccaccttagtaatatgcccttcaaatctaccaacggattcac |
364 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14218384 |
gatacttatcaatctgcagcaaaacagtagcaggaaaaagctcccagccccacgcaacccaccttagtaatatgcccttcaaatctaccaacggattcac |
14218483 |
T |
|
| Q |
365 |
caccatgtattttacataagtggttttgaacgacgcataaacttccaataacatctgctacaaattgaaacataattggcaagtaacttgttaaagagtt |
464 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14218484 |
caccatgtattttacataagtggttttgaacgacgcataaacttccaataacatctgctacaaattgaaacataattggcaagtaacttgttaaagagtt |
14218583 |
T |
|
| Q |
465 |
cattgaagaatgtaaaaagagtggagacaatttcacaaataaatttatctctcatgtcatgtcagatagactatagacttcaaacaatttgaatgatgaa |
564 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14218584 |
cattgaagaatgtaaaaagagtggagacaatttcacaaataaatttatctctcatgtcatgtcagatagactatagacttcaaacaatttgaatgatgaa |
14218683 |
T |
|
| Q |
565 |
aagtaaaatttaaaatgttttggaagcatgacagagttataaatataaagtaaacctacttaaatgtgattgaaacatactgctacactcactattactc |
664 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14218684 |
aagtaaaatttaaaatgttttggaagcatgacagagttataaatataaagtaaacctacttaaatgtgattgaaacatactgctacactcactattactc |
14218783 |
T |
|
| Q |
665 |
atacttgcttctttcatggttagaatc |
691 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14218784 |
atacttgcttctttcatggttagaatc |
14218810 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 586; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 66 - 691
Target Start/End: Original strand, 14213376 - 14214000
Alignment:
| Q |
66 |
aggattgagatacatgaggggagaatattgaaatctgttttagtggcaaatgaccaaattgaagctagctatcataaactaaccacctaacactgccaag |
165 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
14213376 |
aggattgagatacatgaggggagaatattgaaatctgttttagtggcaaatgaccaaattgaagctagctatcataaactaaccacctaacattgccaag |
14213475 |
T |
|
| Q |
166 |
catacaaaagcctcactaccatcccttaaacacaccacaggcagactatacnnnnnnnntgcacagcatgaataagtcttccgcaccaagcctcgatgag |
265 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14213476 |
catacaaaagcctcactaccatcccttaaacgcaccacaggcagactatacaaaaaaaatgcacagcatgaataagtcttccgcaccaagcctcgatgag |
14213575 |
T |
|
| Q |
266 |
atacttatcaatctgcagcaaaacagtagcaggaaaaagctcccagccccacgcaacccaccttagtaatatgcccttcaaatctaccaacggattcacc |
365 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14213576 |
atacttatcaatctgcagcaaaacagtagcaggaaaaagctcccagccccacgcaacccaccttagtaatatgcccttcaaatctaccaacggattcacc |
14213675 |
T |
|
| Q |
366 |
accatgtattttacataagtggttttgaacgacgcataaacttccaataacatctgctacaaattgaaacataattggcaagtaacttgttaaagagttc |
465 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14213676 |
accatgtattttacataagtggttttgaacgacgcataa-cttccaataacatctgctacaaattgaaacataattggcaagtaacttgttaaagagttc |
14213774 |
T |
|
| Q |
466 |
attgaagaatgtaaaaagagtggagacaatttcacaaataaatttatctctcatgtcatgtcagatagactatagacttcaaacaatttgaatgatgaaa |
565 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14213775 |
attgaagaatgtaaaaagagtggagacaatttcacaaataaatttatctctcatgtcatgtcagatagactatagacttcaaacaatttgaatgatgaaa |
14213874 |
T |
|
| Q |
566 |
agtaaaatttaaaatgttttggaagcatgacagagttataaatataaagtaaacctacttaaatgtgattgaaacatactgctacactcactattactca |
665 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14213875 |
agtaaaatttaaaatgttttggaagcatgacagagttataaatataaagtaaacctacttaaatgtgattgaaacatactgctacactcactattactca |
14213974 |
T |
|
| Q |
666 |
tacttgcttctttcatggttagaatc |
691 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14213975 |
tacttgcttctttcatggttagaatc |
14214000 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 582; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 66 - 691
Target Start/End: Original strand, 14222043 - 14222668
Alignment:
| Q |
66 |
aggattgagatacatgaggggagaatattgaaatctgttttagtggcaaatgaccaaattgaagctagctatcataaactaaccacctaacactgccaag |
165 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
14222043 |
aggattgagatacatgaggggagaatattgaaatctgttttagtggcaaatgaccaaattgaagctagctgtcataaactaaccacctaacattgccaag |
14222142 |
T |
|
| Q |
166 |
catacaaaagcctcactaccatcccttaaacacaccacaggcagactatacnnnnnnnntgcacagcatgaataagtcttccgcaccaagcctcgatgag |
265 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14222143 |
catacaaaagcctcactaccatcccttaaacacaccacaggcagactatacaaaaaaaatgcacagcatgaataagtcttacgcaccaagcctcgatgag |
14222242 |
T |
|
| Q |
266 |
atacttatcaatctgcagcaaaacagtagcaggaaaaagctcccagccccacgcaacccaccttagtaatatgcccttcaaatctaccaacggattcacc |
365 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14222243 |
atacttatcaatctgcagcaaaacagtagcaggaaaaagctcccagccccacgcaacccaccttagtaatatgcccttcaaatctaccaacggattcacc |
14222342 |
T |
|
| Q |
366 |
accatgtattttacataagtggttttgaacgacgcataaacttccaataacatctgctacaaattgaaacataattggcaagtaacttgttaaagagttc |
465 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14222343 |
accatgtatcttacataagtggttttgaacgacgcataaacttccaataacatctgctacaaattgaaacataattggcaagtaacttgttaaagagttc |
14222442 |
T |
|
| Q |
466 |
attgaagaatgtaaaaagagtggagacaatttcacaaataaatttatctctcatgtcatgtcagatagactatagacttcaaacaatttgaatgatgaaa |
565 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14222443 |
attgaagaatgtaaaaagagtggagacaatttcacaaataaatttatctctcatgtcatgtcagatagactatagacttcaaacaatttgaatgatgaaa |
14222542 |
T |
|
| Q |
566 |
agtaaaatttaaaatgttttggaagcatgacagagttataaatataaagtaaacctacttaaatgtgattgaaacatactgctacactcactattactca |
665 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14222543 |
agtaaaatttaaaatgtttaggaagcatgacagagttataaatataaagtaaacctacttaaatgtgattgaaacatactgctacactcactattactca |
14222642 |
T |
|
| Q |
666 |
tacttgcttctttcatggttagaatc |
691 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14222643 |
tacttgcttctttcatggttagaatc |
14222668 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 578; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 66 - 691
Target Start/End: Original strand, 14221074 - 14221699
Alignment:
| Q |
66 |
aggattgagatacatgaggggagaatattgaaatctgttttagtggcaaatgaccaaattgaagctagctatcataaactaaccacctaacactgccaag |
165 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
14221074 |
aggattgagatacatgaggggagaatattgaaatctgttttagtggcaaatgaccaaattgaagctagctatcataaactaaccacctaacattgccaag |
14221173 |
T |
|
| Q |
166 |
catacaaaagcctcactaccatcccttaaacacaccacaggcagactatacnnnnnnnntgcacagcatgaataagtcttccgcaccaagcctcgatgag |
265 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14221174 |
catacaaaagcctcactaccatcccttaaacacaccacaggcagactatacaaaaaaaatgcacagcatgaataagtcttacgcaccaagcctcgatgag |
14221273 |
T |
|
| Q |
266 |
atacttatcaatctgcagcaaaacagtagcaggaaaaagctcccagccccacgcaacccaccttagtaatatgcccttcaaatctaccaacggattcacc |
365 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14221274 |
atacttatcaatctgcagcaaaacagtagcaggaaaaagctcccagccccacacaacccaccttagtaatatgccgttcaaatctaccaacggattcacc |
14221373 |
T |
|
| Q |
366 |
accatgtattttacataagtggttttgaacgacgcataaacttccaataacatctgctacaaattgaaacataattggcaagtaacttgttaaagagttc |
465 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14221374 |
accatgtatcttacataagtggttttgaacgacgcataaacttccaataacatctgctacaaattgaaacataattggcaagtaacttgttaaagagttc |
14221473 |
T |
|
| Q |
466 |
attgaagaatgtaaaaagagtggagacaatttcacaaataaatttatctctcatgtcatgtcagatagactatagacttcaaacaatttgaatgatgaaa |
565 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14221474 |
attgaagaatgtaaaaagagtggagacaatttcacaaataaatttatctctcatgtcatgtcagatagactatagacttcaaacaatttgaatgatgaaa |
14221573 |
T |
|
| Q |
566 |
agtaaaatttaaaatgttttggaagcatgacagagttataaatataaagtaaacctacttaaatgtgattgaaacatactgctacactcactattactca |
665 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14221574 |
agtaaaatttaaaatgtttaggaagcatgacagagttataaatataaagtaaacctacttaaatgtgattgaaacatactgctacactcactattactca |
14221673 |
T |
|
| Q |
666 |
tacttgcttctttcatggttagaatc |
691 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14221674 |
tacttgcttctttcatggttagaatc |
14221699 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 535; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 66 - 691
Target Start/End: Original strand, 14216282 - 14216889
Alignment:
| Q |
66 |
aggattgagatacatgaggggagaatattgaaatctgttttagtggcaaatgaccaaattgaagctagctatcataaactaaccacctaacactgccaag |
165 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
14216282 |
aggattgagatacatgaggggagaatattgaaatctgttttagtggcaaatgaccaaattgaagctagctatcataaactaaccacctaacattgccaag |
14216381 |
T |
|
| Q |
166 |
catacaaaagcctcactaccatcccttaaacacaccacaggcagactatacnnnnnnnntgcacagcatgaataagtcttccgcaccaagcctcgatgag |
265 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14216382 |
catacaaaagcctcactaccatcccttaaacacaccacaggcagactatacaaaaaaaatgcacagcatgaataagtcttccgcaccaagcctcgatgag |
14216481 |
T |
|
| Q |
266 |
atacttatcaatctgcagcaaaacagtagcaggaaaaagctcccagccccacgcaacccaccttagtaatatgcccttcaaatctaccaacggattcacc |
365 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14216482 |
atacttatcaatctgcagcaaaacagtagcaggaaaaagctcccagccccacgcaacccaccttagtaatatgcccttcaaatctaccaacggattcacc |
14216581 |
T |
|
| Q |
366 |
accatgtattttacataagtggttttgaacgacgcataaacttccaataacatctgctacaaattgaaacataattggcaagtaacttgttaaagagttc |
465 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14216582 |
accatgtattttacataagtggttttgaacgacgcaaaaacttccaataacatctgctacaaattgaaacataattggcaagtaacttgttaaagagttc |
14216681 |
T |
|
| Q |
466 |
attgaagaatgtaaaaagagtggagacaatttcacaaataaatttatctctcatgtcatgtcagatagactatagacttcaaacaatttgaatgatgaaa |
565 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14216682 |
attgaagaatgtaaaaagagtggagacaatttcacaaataaatttatctctcatgtcatg------------------tcaaacaatttgaatgatgaaa |
14216763 |
T |
|
| Q |
566 |
agtaaaatttaaaatgttttggaagcatgacagagttataaatataaagtaaacctacttaaatgtgattgaaacatactgctacactcactattactca |
665 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14216764 |
agtaaaatttaaaatgttttggaagcatgacagagttataaatataaagtaaacctacttaaatgtgattgaaacatactgctacactcactattactca |
14216863 |
T |
|
| Q |
666 |
tacttgcttctttcatggttagaatc |
691 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14216864 |
tacttgcttctttcatggttagaatc |
14216889 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 535; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 66 - 691
Target Start/End: Original strand, 14217233 - 14217840
Alignment:
| Q |
66 |
aggattgagatacatgaggggagaatattgaaatctgttttagtggcaaatgaccaaattgaagctagctatcataaactaaccacctaacactgccaag |
165 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
14217233 |
aggattgagatacatgaggggagaatattgaaatctgttttagtggcaaatgaccaaattgaagctagctatcataaactaaccacctaacattgccaag |
14217332 |
T |
|
| Q |
166 |
catacaaaagcctcactaccatcccttaaacacaccacaggcagactatacnnnnnnnntgcacagcatgaataagtcttccgcaccaagcctcgatgag |
265 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14217333 |
catacaaaagcctcactaccatcccttaaacacaccacaggcagactatacaaaaaaaatgcacagcatgaataagtcttccgcaccaagcctcgatgag |
14217432 |
T |
|
| Q |
266 |
atacttatcaatctgcagcaaaacagtagcaggaaaaagctcccagccccacgcaacccaccttagtaatatgcccttcaaatctaccaacggattcacc |
365 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14217433 |
atacttatcaatctgcagcaaaacagtagcaggaaaaagctcccagccccacgcaacccaccttagtaatatgcccttcaaatctaccaacggattcacc |
14217532 |
T |
|
| Q |
366 |
accatgtattttacataagtggttttgaacgacgcataaacttccaataacatctgctacaaattgaaacataattggcaagtaacttgttaaagagttc |
465 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14217533 |
accatgtattttacataagtggttttgaacgacgcaaaaacttccaataacatctgctacaaattgaaacataattggcaagtaacttgttaaagagttc |
14217632 |
T |
|
| Q |
466 |
attgaagaatgtaaaaagagtggagacaatttcacaaataaatttatctctcatgtcatgtcagatagactatagacttcaaacaatttgaatgatgaaa |
565 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14217633 |
attgaagaatgtaaaaagagtggagacaatttcacaaataaatttatctctcatgtcatg------------------tcaaacaatttgaatgatgaaa |
14217714 |
T |
|
| Q |
566 |
agtaaaatttaaaatgttttggaagcatgacagagttataaatataaagtaaacctacttaaatgtgattgaaacatactgctacactcactattactca |
665 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14217715 |
agtaaaatttaaaatgttttggaagcatgacagagttataaatataaagtaaacctacttaaatgtgattgaaacatactgctacactcactattactca |
14217814 |
T |
|
| Q |
666 |
tacttgcttctttcatggttagaatc |
691 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14217815 |
tacttgcttctttcatggttagaatc |
14217840 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 531; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 66 - 691
Target Start/End: Original strand, 14211456 - 14212063
Alignment:
| Q |
66 |
aggattgagatacatgaggggagaatattgaaatctgttttagtggcaaatgaccaaattgaagctagctatcataaactaaccacctaacactgccaag |
165 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
14211456 |
aggattgagatacatgaggggagaatattgaaatctgttttagtggcaaatgaccaaattgaagctagctatcataaactaaccacctaacattgccaag |
14211555 |
T |
|
| Q |
166 |
catacaaaagcctcactaccatcccttaaacacaccacaggcagactatacnnnnnnnntgcacagcatgaataagtcttccgcaccaagcctcgatgag |
265 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
14211556 |
catacaaaagcctcactaccatcccttaaacacaccacaggcagactatacaaaaaaaatgcacagcatgaataagtcttccgcaccaagcctcaatgag |
14211655 |
T |
|
| Q |
266 |
atacttatcaatctgcagcaaaacagtagcaggaaaaagctcccagccccacgcaacccaccttagtaatatgcccttcaaatctaccaacggattcacc |
365 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14211656 |
atacttatcaatctgcagcaaaacagtagcaggaaaaagctcccagccccacgcaacccaccttagtaatatgcccttcaaatctaccaacggattcacc |
14211755 |
T |
|
| Q |
366 |
accatgtattttacataagtggttttgaacgacgcataaacttccaataacatctgctacaaattgaaacataattggcaagtaacttgttaaagagttc |
465 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14211756 |
accatgtattttacataagtggttttgaacgacgcaaaaacttccaataacatctgctacaaattgaaacataattggcaagtaacttgttaaagagttc |
14211855 |
T |
|
| Q |
466 |
attgaagaatgtaaaaagagtggagacaatttcacaaataaatttatctctcatgtcatgtcagatagactatagacttcaaacaatttgaatgatgaaa |
565 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14211856 |
attgaagaatgtaaaaagagtggagacaatttcacaaataaatttatctctcatgtcatg------------------tcaaacaatttgaatgatgaaa |
14211937 |
T |
|
| Q |
566 |
agtaaaatttaaaatgttttggaagcatgacagagttataaatataaagtaaacctacttaaatgtgattgaaacatactgctacactcactattactca |
665 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14211938 |
agtaaaatttaaaatgttttggaagcatgacagagttataaatataaagtaaacctacttaaatgtgattgaaacatactgctacactcactattactca |
14212037 |
T |
|
| Q |
666 |
tacttgcttctttcatggttagaatc |
691 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14212038 |
tacttgcttctttcatggttagaatc |
14212063 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 531; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 66 - 691
Target Start/End: Original strand, 14220123 - 14220730
Alignment:
| Q |
66 |
aggattgagatacatgaggggagaatattgaaatctgttttagtggcaaatgaccaaattgaagctagctatcataaactaaccacctaacactgccaag |
165 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
14220123 |
aggattgagatacatgaggggagaatattgaaatctgttttagtggcaaatgaccaaattgaagctagctatcataaactaaccacctaacattgccaag |
14220222 |
T |
|
| Q |
166 |
catacaaaagcctcactaccatcccttaaacacaccacaggcagactatacnnnnnnnntgcacagcatgaataagtcttccgcaccaagcctcgatgag |
265 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
14220223 |
catacaaaagcctcactaccatcccttaaacacaccacaggcagactatacaaaaaaaatgcacagcatgaataagtcttccgcaccaagcctcaatgag |
14220322 |
T |
|
| Q |
266 |
atacttatcaatctgcagcaaaacagtagcaggaaaaagctcccagccccacgcaacccaccttagtaatatgcccttcaaatctaccaacggattcacc |
365 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14220323 |
atacttatcaatctgcagcaaaacagtagcaggaaaaagctcccagccccacgcaacccaccttagtaatatgcccttcaaatctaccaacggattcacc |
14220422 |
T |
|
| Q |
366 |
accatgtattttacataagtggttttgaacgacgcataaacttccaataacatctgctacaaattgaaacataattggcaagtaacttgttaaagagttc |
465 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14220423 |
accatgtattttacataagtggttttgaacgacgcaaaaacttccaataacatctgctacaaattgaaacataattggcaagtaacttgttaaagagttc |
14220522 |
T |
|
| Q |
466 |
attgaagaatgtaaaaagagtggagacaatttcacaaataaatttatctctcatgtcatgtcagatagactatagacttcaaacaatttgaatgatgaaa |
565 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14220523 |
attgaagaatgtaaaaagagtggagacaatttcacaaataaatttatctctcatgtcatg------------------tcaaacaatttgaatgatgaaa |
14220604 |
T |
|
| Q |
566 |
agtaaaatttaaaatgttttggaagcatgacagagttataaatataaagtaaacctacttaaatgtgattgaaacatactgctacactcactattactca |
665 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14220605 |
agtaaaatttaaaatgttttggaagcatgacagagttataaatataaagtaaacctacttaaatgtgattgaaacatactgctacactcactattactca |
14220704 |
T |
|
| Q |
666 |
tacttgcttctttcatggttagaatc |
691 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14220705 |
tacttgcttctttcatggttagaatc |
14220730 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 527; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 66 - 691
Target Start/End: Original strand, 14209536 - 14210143
Alignment:
| Q |
66 |
aggattgagatacatgaggggagaatattgaaatctgttttagtggcaaatgaccaaattgaagctagctatcataaactaaccacctaacactgccaag |
165 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
14209536 |
aggattgagatacatgaggggagaatattgaaatctgttttagtggcaaatgaccaaattgaagctagctatcataaactaaccacctaacatgcccaag |
14209635 |
T |
|
| Q |
166 |
catacaaaagcctcactaccatcccttaaacacaccacaggcagactatacnnnnnnnntgcacagcatgaataagtcttccgcaccaagcctcgatgag |
265 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14209636 |
catacaaaagcctcactaccatcccttaaacacaccacaggcagactatacaaaaaaaatgcacagcatgaataagtcttccgcaccaagcctcgatgag |
14209735 |
T |
|
| Q |
266 |
atacttatcaatctgcagcaaaacagtagcaggaaaaagctcccagccccacgcaacccaccttagtaatatgcccttcaaatctaccaacggattcacc |
365 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14209736 |
atacttatcaatctgcagcaaaacagtagcaggaaaaagctcccagccccacgcaacccaccttagtaatatgcccttcaaatctaccaacggattcacc |
14209835 |
T |
|
| Q |
366 |
accatgtattttacataagtggttttgaacgacgcataaacttccaataacatctgctacaaattgaaacataattggcaagtaacttgttaaagagttc |
465 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14209836 |
accatgtattttacataagtggttttgaacgacgcaaaaacttccaataacatctgctacaaattgaaacataattggcaagtaacttgttaaagagttc |
14209935 |
T |
|
| Q |
466 |
attgaagaatgtaaaaagagtggagacaatttcacaaataaatttatctctcatgtcatgtcagatagactatagacttcaaacaatttgaatgatgaaa |
565 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14209936 |
attgaagaatgtaaaaagagtggagacaatttcacaaataaatttatctctcatgtcatg------------------tcaaacaatttgaatgatgaaa |
14210017 |
T |
|
| Q |
566 |
agtaaaatttaaaatgttttggaagcatgacagagttataaatataaagtaaacctacttaaatgtgattgaaacatactgctacactcactattactca |
665 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14210018 |
agtaaaatttaaaatgttttggaagcatgacagagttataaatataaagtaaacctacttaaatgtgattgaaacatactgctacactcactattactca |
14210117 |
T |
|
| Q |
666 |
tacttgcttctttcatggttagaatc |
691 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14210118 |
tacttgcttctttcatggttagaatc |
14210143 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 252 - 563
Target Start/End: Original strand, 14234932 - 14235243
Alignment:
| Q |
252 |
caagcctcgatgagatacttatcaatctgcagcaaaacagtagcaggaaaaagctcccagccccacgcaacccaccttagtaatatgcccttcaaatcta |
351 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14234932 |
caagcctcgatgagatacttatcaatctgcagcaaaacagtagcaggaaaaagctcccagccccacgcaacccaccttagtaatatgcccttcaaatcta |
14235031 |
T |
|
| Q |
352 |
ccaacggattcaccaccatgtattttacataagtggttttgaacgacgcataaacttccaataacatctgctacaaattgaaacataattggcaagtaac |
451 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14235032 |
ccaacggattcaccaccatgtattttacataagtggttttgaacgacgcataaacttccaataacatctgctacaaattgaaacataattggcaagtaac |
14235131 |
T |
|
| Q |
452 |
ttgttaaagagttcattgaagaatgtaaaaagagtggagacaatttcacaaataaatttatctctcatgtcatgtcagatagactatagacttcaaacaa |
551 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14235132 |
ctgttaaagagttcattgaagaatgtaaaaagagtggagacaatttcacaaataaatttatctctcatgtcatgtcagatagactatagacttcaaacaa |
14235231 |
T |
|
| Q |
552 |
tttgaatgatga |
563 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |
|
|
| T |
14235232 |
tttgaatgatga |
14235243 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 66 - 256
Target Start/End: Original strand, 14223012 - 14223202
Alignment:
| Q |
66 |
aggattgagatacatgaggggagaatattgaaatctgttttagtggcaaatgaccaaattgaagctagctatcataaactaaccacctaacactgccaag |
165 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
14223012 |
aggattgagatacatgaggggagaatattgaaatctgttttagtggcaaatgaccaaattgaagctagctatcataaactaaccacctaacattgccaag |
14223111 |
T |
|
| Q |
166 |
catacaaaagcctcactaccatcccttaaacacaccacaggcagactatacnnnnnnnntgcacagcatgaataagtcttccgcaccaagc |
256 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14223112 |
catacaaaagcctcactaccatcccttaaacacaccacaggcagactatacaaaaaaaatgcacagcatgaataagtcttccgcaccaagc |
14223202 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000004; HSPs: 1)
Name: chr8
Description:
Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 457 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 14837035 - 14836995
Alignment:
| Q |
457 |
aaagagttcattgaagaatgtaaaaagagtggagacaattt |
497 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
14837035 |
aaagaattcattgaagaatgtaaaaggagtggagacaattt |
14836995 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7 (Bit Score: 29; Significance: 0.000001; HSPs: 1)
Name: chr7
Description:
Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 457 - 497
Target Start/End: Original strand, 27964654 - 27964694
Alignment:
| Q |
457 |
aaagagttcattgaagaatgtaaaaagagtggagacaattt |
497 |
Q |
| |
|
||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
27964654 |
aaagaattcattcaagaatgtaaaaggagtggagacaattt |
27964694 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
© Oklahoma State University