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Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF17884_high_1 (Length: 708)

Name: NF17884_high_1
Description: NF17884
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF17884_high_1
NF17884_high_1
[»] chr3 (1 HSPs)
chr3 (53-691)||(30887792-30888430)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 485; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 485; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 53 - 691
Target Start/End: Original strand, 30887792 - 30888430
Alignment:
Q  53 caattttcagtcgttactattaagtctataatcttacaatactctatacatgtacatacaaaaccacaaattcagttaaacaacatttttctaaatatta 152  Q
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T  30887792 caattttcagtcgttacaattaagtctataatcttacaatactctatacatgtacatacaaaaccacaaattcagttaaacaacatttttctaaatatta 30887891  T
Q  153 gaaacaaaatgatctattatttaaagaaatttgatattttagtttacagatactctagttgcctcnnnnnnntacaagtagaaaagaaactctagcaaac 252  Q
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T  30887892 gaaacaaaatggtctattatttaaagaaatttgatattttagtttacagatactctagttgcctcaaaataatacaagtagaaaagaaattctagcaaac 30887991  T
Q  253 catttctattatcatccctagatgagtagccaaattatttgcataatggctatnnnnnnnttcaagccacaatttgaaatataaatgatannnnnnnnct 352  Q
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T  30887992 catttctattatcatccctagatgagtagccaaattatttgcataatggctataaaaaaattcaagccacaatttgaaatataaatgatattttttttct 30888091  T
Q  353 tttccattaaactaaaacaaaaaacattataagtacacatgtttggatgcacgatgagttttacaaaatcacaatgaattaccaaaattcacgataaaca 452  Q
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T  30888092 tttccattaaattaaaacaaaaaacattataagtacacatgtttggatgcacgatgagttttacaaaatcacaatgaactatcaaaattcacgataaaca 30888191  T
Q  453 acaattgaatttatcaaatcaccacagttttattatttatannnnnnnnagatagatggaataacaatagtgatnnnnnnnnctcaaacaaaatggtttt 552  Q
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T  30888192 acaattaaatttatcaaatcaccatagttttattatttatattttttttagatagatgaaataacaatagtgataaaaaaaactcaaacaaaatggtttt 30888291  T
Q  553 aaaatttttgtagaagttgtgcacattatttcttctttttatcatacaaaatggactactatttctcttcattctcgtatcattgtcttaaccatcttaa 652  Q
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T  30888292 aaaacttttgtagaagttgtgcacattatttcttctttttatcatacaaaatggactactatttctcttcattctcgtatcattgtcttaaccatcttaa 30888391  T
Q  653 ttcttctgtgattcgtatcataaaaatagacatttcaac 691  Q
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T  30888392 ttcttctgtgattcgtatcataaaaatagacatttcaac 30888430  T

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